(57)【要約】本発明は、新規ケモカイン様ポリペプチド、並びに前記ポリペプチドの変異体、突然変異体及びフラグメントを含むそれらに関連する試薬、並びにそれらに対するリガンド及びアンタゴニスト、をコードするヒトゲノムにおけるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を開示する。本発明は、これらの分子を同定して生成する方法、それらを含む医薬組成物を調製する方法、及び疾患の診断、予防及び処置においてそれらを使用する方法、を提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
走化活性を有する単離されたポリペプチドであって：
ａ）配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のポリペプチドの成熟型；
ｃ）図９及び１０に示すような、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のシステインリッチ領域を含んで成るポリペプチド；
ｄ）配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６が示すアミノ酸配列の活性変異体であって、選択された配列において特定される任意のアミノ酸が非保存的に置換されているが、但し、当該配列内の１５％未満のアミノ酸残基がそのように変化しているもの；
ｅ）ａ）〜ｄ）で示すアミノ酸配列の活性フラグメント、前駆体、塩、又は誘導体、
から成る群から選択されるポリペプチド。
【請求項２】
配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６が示す配列の自然発生的な対立遺伝子変異体である、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
変異体が一塩基多型の翻訳である、請求項２に記載のポリペプチド。
【請求項４】
ポリペプチドが、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６あるいはそれらのフラグメントにに対して生成する抗体又は結合タンパク質と特異的に結合する、請求項１〜３のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれか1項に記載のポリペプチドを含んで成る融合タンパク質。
【請求項６】
前記タンパク質が、これらのタンパク質配列：膜結合タンパク質、イムノグロブリン定常領域、多量体化ドメイン、細胞外タンパク質、シグナルペプチド含有タンパク質、エクスポートシグナル含有タンパク質、に属する１又は複数のアミノ酸配列、を更に含んで成る、請求項６に記載の融合タンパク質。
【請求項７】
前記アンタゴニストが、前記ポリペプチドの１又は複数の残基の修飾から生じるアミノ酸配列を含んで成る、請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドのアンタゴニスト。
【請求項８】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドに特異的に結合するリガンド。
【請求項９】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの走化活性を拮抗又は阻害する、請求項８に記載のリガンド。
【請求項１０】
モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、抗原結合フラグメント、又は膜結合タンパク質の細胞外ドメイン、である、請求項１１に記載のリガンド。
【請求項１１】
放射性標識、蛍光標識、ビオチン、又は細胞毒性物質の中から選択される分子との活性な接合体(conjugate)又は複合体(complex)の形態のものである、請求項１〜７及び１０のいずれか１項に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの配列及び／又は構造に基づいて設計されるペプチドミメティクス。
【請求項１３】
ａ）請求項１〜４のいずれか１項に記載の走化活性を有するポリペプチド；
ｂ）請求項５又は６に記載の融合タンパク質；又は
ｃ）請求項７に記載のアンタゴニスト、
から成る群から選択される単離されたポリペプチドをコードする単離された核酸。
【請求項１４】
配列番号１，３，５，７，９，１１，１３，又は１５から成る群から選択されるＤＮＡ配列、又は当該ＤＮＡ配列の相補体、を含んで成る、請求項１３に記載の核酸。
【請求項１５】
ａ）高ストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、又は
ｂ）配列番号１，３，５，７，９，１１，１３，又は１５から成る群から選択される核酸、又は前記ＤＮＡ配列の相補体と、少なくとも約３０個のヌクレオチドの長さにわたり少なくとも約８５％の同一性を示す、
精製された核酸。
【請求項１６】
請求項１３〜１５のいずれか１項に記載の核酸を含んで成るベクター。
【請求項１７】
前記核酸分子が、原核又は真核宿主細胞におけるコードポリペプチドの発現を可能にする発現制御配列と作用可能に連結している、請求項１６に記載のベクター。
【請求項１８】
請求項１５に記載の精製された核酸によりコードされたポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１〜７又は請求項１８のいずれか１項に記載のポリペプチドを発現することができる細胞を産生する方法であって、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載のベクター又は核酸で細胞を遺伝子操作することを含んで成る方法。
【請求項２０】
請求項１３〜１７のいずれか１項に記載のベクター又は核酸で形質転換した宿主細胞。
【請求項２１】
請求項１３〜１７のいずれか１項に記載のベクター又は核酸で形質転換されたトランスジェニック動物細胞であって、請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの構成的な又は誘導性の変化した発現レベルを有する細胞。
【請求項２２】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの増強又は低下された発現レベルを有するよう形質転換された、トランスジェニックなヒト以外の動物。
【請求項２３】
請求項２０又は２１に記載の細胞を核酸又はベクターが発現する条件下で培養し、そして前記核酸又はベクターによってコードされるポリペプチドを培養物から回収することを含んで成る、請求項１〜７のいずれか１項に記載のポリペプチドを生成するための方法。
【請求項２４】
細胞又は動物における請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの発現レベルを増強させる化合物。
【請求項２５】
細胞又は動物における請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの発現レベルを低下させる化合物。
【請求項２６】
アンチセンスオリゴヌクレオチド又は低分子干渉ＲＮＡである、請求項２４に記載の化合物。
【請求項２７】
請求項１〜６又は１８のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項７に記載のアンタゴニスト、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンド、請求項１２に記載のペプチドミメティクス、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸、請求項２０又は２１に記載の細胞、あるいは請求項２４〜２６のいずれか１項に記載の化合物を含む、精製された調製物。
【請求項２８】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの走化活性の増大が必要とされる場合の疾患の治療又は予防における、請求項１〜６又は１８のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２に記載のペプチドミメティクス、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸、請求項２０又は２１に記載の細胞、あるいは請求項２４に記載の化合物、の使用。
【請求項２９】
走化活性の増大を必要とする疾患の処置又は予防のための医薬組成物であって、請求項１〜６又は１８のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２に記載のペプチドミメティクス、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸、請求項２０又は２１に記載の細胞、あるいは請求項２４に記載の化合物を活性成分として含む医薬組成物。
【請求項３０】
請求項１〜６又は１８のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２に記載のペプチドミメティクス、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸、請求項２０又は２１に記載の細胞、あるいは請求項２４に記載の化合物を、医薬として許容される担体と組み合わせることを含んで成る、医薬組成物の調製方法。
【請求項３１】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの走化活性の増大を必要とする疾患の処置又は予防のための方法であって、治療的に有効量の、請求項１〜６又は１８のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項１２に記載のペプチドミメティクス、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸、請求項２０又は２１に記載の細胞、あるいは請求項２４に記載の化合物の投与を含んで成る方法。
【請求項３２】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの過剰な走化活性に関連する疾患の治療又は予防における、請求項７に記載のアンタゴニスト、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンド、あるいは請求項２５又は２６に記載の化合物の使用。
【請求項３３】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの過剰な走化活性に関連する疾患の治療又は予防のための医薬組成物であって、請求項７に記載のアンタゴニスト、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンド、あるいは請求項２５又は２６に記載の化合物を活性成分として含む医薬組成物。
【請求項３４】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの過剰な走化活性に関連する疾患の処置又は予防のための医薬組成物の調製のための方法であって、請求項７に記載のアンタゴニスト、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンド、あるいは請求項２５又は２６に記載の化合物を、医薬として許容される担体と組み合わせることを含んで成る方法。
【請求項３５】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドに関連する疾患の処置又は予防のための方法であって、治療的に有効量の、請求項７に記載のアンタゴニスト、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンド、あるいは請求項２５又は２６に記載の化合物の投与を含んで成る方法。
【請求項３６】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のケモカイン様ポリペプチドに関連する疾患を処置するのに有効な候補化合物をスクリーニングするための方法であって：
（ａ）前記ポリペプチドの増強又は低下された発現レベルを有する、請求項２０に記載の細胞、請求項２１に記載のトランスジェニック動物細胞、又は請求項２２に記載のトランスジェニックなヒト以外の動物を、候補化合物と接触させること、及び
（ｂ）前記動物又は細胞に対する前記化合物の効果を決定すること、
を含んで成る方法。
【請求項３７】
請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドのアンタゴニスト／阻害物質又はアゴニスト／活性化物質としての候補化合物を同定するための方法であって：
（ａ）前記ポリペプチドを、前記化合物、及び当該ポリペプチドに結合することができる、哺乳類細胞又は哺乳類細胞膜とを接触させること；及び
（ｂ）前記の分子が、前記ポリペプチドと前記哺乳類細胞又は哺乳類細胞膜との相互作用、又は当該相互作用から生じる応答、を阻止又は増強するか否かを決定すること、
を含んで成る方法。
【請求項３８】
試料中の請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドの活性及び／又は存在を決定するための方法であって：
（ａ）タンパク質含有試料を準備すること；
（ｂ）前記試料と請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンドとを接触させること；及び
（ｃ）前記ポリペプチドに結合した前記リガンドの存在を決定すること、
を含んで成る方法。
【請求項３９】
試料中の請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードする転写物又は核酸の存在又は量を決定するための方法であって：
（ａ）核酸含有試料を準備すること；
（ｂ）前記試料と請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸とを接触させること；及び
（ｃ）前記核酸と前記試料中の核酸とのハイブリダイゼーションを決定すること、
を含んで成る方法。
【請求項４０】
ポリメラーゼ連鎖反応により試料中の請求項１〜４のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードする転写物又は核酸の存在又は量を決定するための配列番号１７〜２８の配列を含むプライマー配列の使用。
【請求項４１】
試料中の請求項１〜４のいずれか１項に記載のケモカイン様ポリペプチドの活性及び／又は存在を測定するためのキットであって、１又は複数の以下の試薬：請求項１〜６又は１８のいずれか１項に記載のポリペプチド、請求項８〜１０のいずれか１項に記載のリガンド、請求項１１に記載のポリペプチド、請求項１２に記載のペプチドミメティクス、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載の核酸、請求項２０又は２１に記載の細胞、請求項２４〜２６のいずれか１項に記載の化合物、請求項２９又は３３に記載の医薬組成物、又は配列番号１７〜２８の配列を含むプライマー配列、を含んで成るキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、新規ポリペプチド、更に具体的にはケモカイン様ポリペプチドをコードするものとしてヒトゲノムにおいて同定された核酸配列に関する。
【背景技術】
【０００２】
哺乳類の免疫応答は、一連の複雑なネットワーク様の相互作用に基づいており、これらには、細胞活動（移動、増殖、分化等）を調節することができる細胞成分（例えばリンパ球又は顆粒球）及び可溶性タンパク質が関与している。従って、ヒトの障害、特に免疫系に関連するものの診断、予防、及び治療における重大な進歩を提供する目的での、細胞調節因子の単離及び特徴づけに大きな関心が存在している。
【０００３】
ケモカインは、それらが細胞の方向付けられた遊走及び活動に関与しているため、これらの可溶性タンパク質の中に含まれる。この小さい（７０〜１３０アミノ酸）分泌型のヘパリン結合炎症誘発性タンパク質のスーパーファミリーは、これらの細胞の補充を必要とする、血液から組織への白血球の血管外遊走における役割が特に知られている（Baggiolini M et al., 1997; Yoshie OF et al., 2001; Fernandez EJ and Lolis E, 2002）。
【０００４】
ケモカインは、それらが全て、保存されたシステインが分子内結合を形成している中心領域を含んでいるため、機能的に関連しているだけでなく、構造的に関連している。特に、成熟ポリペプチドにおけるこれらの保存されたシステインの多くのＮ末端の数及び位置は、一般的に認識されているケモカイン分類の基礎的な基準であり、これらは単一の又は隣接するシステインを有するケモカイン（Ｃ−Ｃケモカイン）間、又は１〜３個のアミノ酸によって分離されている２つのシステインを有するケモカイン（Ｃ−Ｘ−Ｃケモカイン）間で本質的に分類される。
【０００５】
一連の膜受容体は、全て７回膜貫通Ｇタンパク質共役受容体であって、ケモカインに対して、それらの生物学的活性を標的細胞に発揮させるようにする結合パートナーである。ケモカインの生理学的作用は、同時発生の相互作用の複雑で且つ統合された系に起因する。異なる細胞は、それらの状態及び／又は型に従い、受容体の特定の組み合わせを提示することができる。更に、ケモカイン受容体は、しばしば重複しているリガンド特異性を有し、その結果、単一の受容体は、単一のケモカインが異なる受容体に結合することができるのと同様に、異なるケモカインにより高い親和性で結合することができる。
【０００６】
通常ケモカインは、損傷、炎症、又は他の組織変化の部位で産生され、そしてパラ分泌又は自己分泌の様式でそれらの活性を発揮する。しかしながら、炎症及び免疫反応における細胞型特異的な遊走及び活性化はケモカイン単独での活性ではない。他の生理学的活性、例えば造血又は血管形成、及び病理学的症状、例えば転移、移植片拒絶、アルツハイマー病又はアテローム性動脈硬化症は、少なくとも、これらのタンパク質のうちの幾つかによって制御されているようである。事実、ケモカイン及び／又はそれらの受容体は、複数の動物モデル又は臨床試料においてかなり過剰発現され、そして／あるいは活性化されていることが明らかとなっている（Haskell CA et al., 2002; Lucas AD and Greaves DR, 2001; Frederick MJ and Clayman GL, 2001; Godessart N and Kunkel SL, 2001; Reape TJ and Groot PH, 1999）。
【０００７】
治療剤としてケモカインを用いることには潜在的な欠点（特に、凝集する傾向及び無差別な結合）があるが、ケモカインに対してアンタゴニスト的な特性を有する分子は、過剰なケモカイン活性に関連する疾患における治療的介入の価値のある機会を提供すると広く考えられる。特異的なケモカイン及びそれらの受容体の阻害は、不所望な又は制御されない細胞過程、例えば補充又は活性化を防ぐ解決策とみなされている(Baggiolini M, 2001; Proudfoot A, 2000; Rossi DF and Zlotnik A, 2000)。
【０００８】
広範囲の配列決定プログラム及びバイオインフォマティクスにより、ヒトゲノム及び生理学に対する大規模なツール及び情報が利用可能となっている(Quinn- Senger KE et al., 2002; Browne MJ, 2000)。そのような技術はまた、新規で且つ有用な治療分子及び治療標的を提供するかもしれない新規なケモカイン及び受容体を発見するために有用であった。最初に、ケモカイン遺伝子は、ヒトゲノムのジーンリッチ領域の、第４及び第１７染色体上に規則正しくマッピングされたが(Nomiyama H et al., 2001)、この文献は、転写物の組織分布を比較することによって新規なケモカインを特徴付けるための種々のアプローチを提供している。ケモカインは、通常リンパ様組織及び他の組織において発現しているが、新規ケモカインは特異的な発現パターンを有することがあり、そして伝統的な遺伝子クラスターと異なる染色体の座位にマッピングされうる(WO 02/70706; Wells TN and Peitsch MC, 2000; Chantry DF et al., 1998; Rossi D et al., 1997)。
【０００９】
新規ケモカインは、既知のケモカインに対し厳しいホモロジー基準を適用することによって同定された。しかしながら、ケモカインについてのヒトゲノムにおけるポリペプチドコード配列の実際の含量（あらゆるほかのタンパク質ファミリーに関してのもの）は未だに知られておらず、オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ、すなわち、ヌクレオチドの連続的にコードしているトリプレットを含み、終止コドンによって中断されておらず、且つ潜在的にポリペプチドに翻訳されうるＤＮＡ配列）の解析において別の基準を適用することにより、走化活性を有するポリペプチドをコードするＤＮＡ配列を同定することの可能性は尚も存在している。
【００１０】
本発明の要約
本発明は、新規ケモカイン様ポリペプチドをコードするヒトゲノム内のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）の同定に基づいている。
【００１１】
従って、本発明は、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６が示すアミノ酸配列を有する、単離されたポリペプチド、並びに、走化活性を有するポリペプチドとしての、それらの成熟型、変異体、及びフラグメント、を提供する。本発明はまた、それらをコードする核酸、当該核酸を含むベクター、及びこれらのベクター又は核酸を含む細胞、並びに他の関連する試薬、例えば融合タンパク質、リガンド、及びアンタゴニスト、を含む。
【００１２】
本発明は、これらの分子を同定し、且つ生成するための方法、それらを含む医薬組成物を調製するための方法、並びに、疾患の診断、予防及び処置においてそれらを使用するための方法、を提供する。
【００１３】
本発明の詳細な説明
本発明の主要な目的は、
ａ）配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のアミノ酸配列；
ｂ）配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のポリペプチドの成熟型；
ｃ）図９及び１０に示すような、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のシステインリッチ領域を含んで成るポリペプチド；
ｄ）配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６が示すアミノ酸配列の活性変異体であって、選択された配列において特定される任意のアミノ酸が非保存的に置換されているが、但し、当該配列内の１５％未満のアミノ酸残基がそのように変化しているもの；
ｅ）ａ）〜ｄ）で示すアミノ酸配列の活性なフラグメント、前駆体、塩、又は誘導体、
から成る群から選択される、走化活性を有する新規の単離されたポリペプチドを提供することである。
【００１４】
新規ポリペプチドｐ１７５４（配列番号２）、ｐ０７１１（配列番号４）、ｐ２８８２（配列番号６）、ｐ４７１１（配列番号８）、ｐ４３２０（配列番号１０）、ｐ５００８（配列番号１２）、ｐ０２１０（配列番号１４）、及びｐ４９２２（配列番号１６）は、選択したアミノ酸（開始メチオニン、システイン、及び疎水性残基）の数及び位置が既知のケモカインに匹敵する長さを有するタンパク質配列について規定されているヒトケモカインの共通配列に基づいて定義された。
【００１５】
ヒトゲノムにおける既知のＯＲＦ配列を翻訳することによって得られるアミノ酸配列の全体が、この共通配列を用いて挑戦され、そしてポジティブなヒットは、予測される構造的且つ機能的な「サイン」（Ｎ末端のシグナル配列及びＣ末端のアルファヘリックス）の存在について更にスクリーニングされ、そして最終的に、配列の特徴を既知のケモカインと比較することによって選択される。従って、本発明の新規ポリペプチドは走化活性を有することが予想されうる。
【００１６】
用語「活性な」及び「活性」は、本願における配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４，又は１６のケモカイン様アミノ酸配列について予測される走化性様の特性を意味する。
【００１７】
非保存的置換の指示番号を有するタンパク質配列は、一般的に利用可能なバイオインフォマティクスツールを用いて同定されうる(Mulder NJ and Apweiler R, 2002; Rehm BH, 2001)。
【００１８】
そのような配列に加えて、一連のポリペプチドは、本発明の開示部分を形成する。ケモカインはＮ末端配列のタンパク質分解的な除去（シグナルペプチダーゼ及び他のタンパク質分解酵素によるもの）を含む成熟過程を経験することが知られているので、本願はまた、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６のポリペプチドの成熟型をも主張する。成熟型としては、走化活性を示し、且つin vivo（発現細胞又は動物によるもの）又はin vitro（特定の酵素を用いて精製されたポリペプチドを修飾することによるもの）での翻訳後成熟過程から生じるあらゆるポリペプチドが意図される。Ｃ末端のプロセシングから生じるケモカインの成熟型も知られている(Ehlert JE et al., 1998)。他の別の成熟型も化学基、例えば糖又はリン酸塩の付加から生じることがある。
【００１９】
本発明のポリペプチドの更なる群は、図９及び１０に示すような、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４，又は１６のシステインリッチ領域を含んで成るポリペプチドであり、これは、中心のシステインリッチ領域がケモカインの必須な構造的且つ機能的な群を含むためである。
【００２０】
他の主張されるポリペプチドは、配列番号２，４，６，８，１０，１２，１４又は１６によって示されるアミノ酸配列の活性変異体であって、選択した配列において特定される任意のアミノ酸が非保存的に置換されているが、但し、当該配列内の１５％未満のアミノ酸残基がそのように変化しているものである。指定したパーセンテージは、図１〜８において加持されている新規アミノ酸配列全体、特に図９及び１０で示すようなシステインリッチ領域を含む少なくとも４０個のアミノ酸配列のセグメント全体で測定されなければならない。
【００２１】
本発明によると、あらゆる置換が、分子の構造及び生物学的機能を保存するために、好ましくは「保存的」置換又は「安全」置換であるべきであり、これは、十分に類似の化学的特性を有するアミノ酸を導入する、一般的に定義されている置換のことである（例えば、塩基性正電荷アミノ酸は別の塩基性正電荷アミノ酸によって置換されるべきである）。
【００２２】
文献は、保存的アミノ酸置換の選択が、タンパク質の配列及び／又は構造に対する統計的及び／又は物理化学的研究に基づいて実施されうる多数のモデルを提供している(Rogov Si and Nekrasov AN, 2001)。タンパク質デザイン実験は、アミノ酸の特異的なサブセットの使用が、折りたたみ可能で且つ活性なタンパク質を生成することができ、その結果、タンパク質構造内に容易に適合され且つ、機能的且つ構造的ホモログ及びパラログを検出するために使用されうるアミノ酸の「同義」置換の分類に役立つ(Murphy LR et al., 2000)。同義アミノ酸群及び更に好ましい同義アミノ酸群を表１に示す。
【００２３】
相当のケモカインに関して、それに匹敵する、又はそれよりも更に向上した活性を有する活性変異体は、コードＤＮＡの常用の突然変異誘発技術、コードＤＮＡ配列のレベルでのコンビナトリアル技術（例えば、ＤＮＡシャッフリング、ファージディスプレー／セレクション）から、あるいはコンピューター支援設計研究、続く従来技術において説明されているような所望の活性についての確認、から生じることがある。
【００２４】
特異的な非保存的突然変異も、異なる目的で本発明のポリペプチド内に導入されることがある。受容体についてのケモカイン様ポリペプチドの親和性を低下させる突然変異は、再使用され、そしてリサイクルされるその能力を増大させることができ、潜在的にその治療の効力を増大させる(Robinson CR, 2002)。本発明のポリペプチド内に結果として存在する免疫原性エピトープは、ワクチンを開発するために活用することができ(Stevanovic S, 2002)、あるいはタンパク質の安定性を増大させるための突然変異を選択し、そしてそれらを修正するための既知の方法に従いそれらの配列を修飾することによって排除することができる(van den Burg B and Eijsink V, 2002; WO 02/05146, WO 00/34317, WO 98/52976)。
【００２５】
本発明の更に別のポリペプチドは、上述の配列のアミノ酸配列の活性なフラグメント、前駆体、塩、又は誘導体である。
【００２６】
フラグメントは、それらの機能を変化することなく末端又は内部のアミノ酸の欠失を提示すべきであり、そして、前記タンパク質の機能的な高次構造に必須のアミノ酸を除去又は置換することなく、一般的に数個のアミノ酸、例えば１０個以下、好ましくは３個以下のものを包含すべきである。
【００２７】
「前駆体」は、細胞又は身体への投与前又は後に代謝的で且つ酵素的なプロセシングにより本発明の化合物へと変換されうる化合物である。
【００２８】
用語「塩」は、本明細書では、本発明のポリペプチドのカルボキシル基の塩及びアミノ基の酸付加塩の両方を意味する。カルボキシル基の塩は、当業界で知られている手段によって形成することができ、そして無機塩、例えばナトリウム、カルシウム、アンモニウム、第二鉄又は亜鉛の塩など、及び、例えばアミンで形成されるような有機性塩、例えばトリエタノールアミン、アルギニン又はリジン、ペピリジン、プロカインなどを含む。酸付加塩には、例えば、鉱酸、例えば塩酸又は硫酸との塩、及び有機酸、例えば酢酸又はシュウ酸との塩、が含まれる。そのような塩のいずれも、本発明のペプチド及びポリペプチド又はそれらの類似体と実質的に同様の活性を有するはずである。
【００２９】
用語「誘導体」は、本明細書で使用する場合、アミノ酸部分の側鎖又はアミノ末端又はカルボキシ末端の基の上に存在する官能基から、既知の方法に従い調製されうる誘導体を意味する。そのような分子は、通常一次配列を変化させない他の修飾、例えば、ポリペプチドのin vivo又はin vitroでの化学的誘導体化（アセチル化又はカルボキシル化）であって、ペプチドの合成及びプロセシングの間に又は更なるプロセシング段階において、当該ペプチドのリン酸化（ホスホチロシン、ホスホセリン、又はホスホスレオニン残基の導入）又はグリコシル化（哺乳類のグリコシル化酵素にポリペプチドを曝露することによるもの）のパターンを修飾することによって生成されるもの、からも生じることがある。あるいは、誘導体は、前記カルボキシル基のエステル又は脂肪族アミド及び遊離アミノ基のＮ−アシル誘導体又は遊離ヒドロキシル基のＯ−アシル誘導体を含み、且つ、例えばアルカノイル基又はアリール基として、アシル基により形成される。
【００３０】
前記誘導体の生成は、内部又は末端の位置において、適切な残基の部位指定の修飾を包含してもよい。付着に使用する残基は、ポリマーの付着が可能な側鎖（すなわち、官能基を有する側鎖、例えばリジン、アスパラギン酸、グルタミン酸、システイン、ヒスチジン等）を有するはずである。あるいは、ポリマーの付着が可能な側鎖を有する残基は、前記ポリペプチドのアミノ酸を置換することができ、あるいは前記ポリペプチドの内部又は末端の位置で付加することができる。また、遺伝学的にコードされているアミノ酸の側鎖は、ポリマー付着のために化学的に修飾されることがあり、あるいは適切な側鎖の官能基を有する非天然アミノ酸も利用されることがある。好ましい付着方法は、ペプチド合成と化学的ライゲーションの組み合わせを利用する。有利には、水溶性ポリマーの付着が、生分解性リンカーを介して、特にタンパク質のアミノ末端領域でなされる。そのような修飾は、前記リンカーの分解時にポリマーの修飾無しに前記タンパク質を放出する前駆体（又は「プロドラッグ」）型のタンパク質を提供するように働く。
【００３１】
ポリマー付着は、アンタゴニストの特定の位置で自然に発生するアミノ酸の側鎖又はアンタゴニストの特定の位置で自然に発生するアミノ酸を置換する天然若しくは非天然の側鎖に対してだけでなく、標的の位置でアミノ酸の側鎖に付着する炭水化物又は他の部分に対してもなされうる。希少な又は非天然のアミノ酸も、特異的に操作された菌種においてタンパク質を発現することによって導入されうる(Bock A, 2001)。
【００３２】
上文で示したポリペプチドの変異体は、自然に発生するものでも、ヒト以外の生物において同定されるものでも、又は一塩基多型の翻訳から生じるものであってもよい。あるいは、人工変異体は、化学合成、部位指定突然変異導入技術、又はそれらの任意な他の既知の技術によって調製されてもよく、これらは当業界で提示されている技術を用いて当業者によってルーチンに得ることができ、そして試験することができる、実質的に相当の突然変異型又は短縮型のペプチドの有限集合を提供する。
【００３３】
本願で開示されている新規アミノ酸配列は、異なる種類の試薬及び分子を提供するために使用されうる。これらの化合物の例は、それらの完全配列又は特異的フラグメント、例えば抗原決定基を用いて同定されうる結合タンパク質又は抗体である。ペプチドライブラリーは、特許請求の範囲のアミノ酸配列に結合する抗体又は他のタンパク質をスクリーニングし、そして特徴付けるための、そして同様の結合特性を有する前記ポリペプチドの別の型を同定するための既知の方法(Tribbick G, 2002)において使用されうる。
【００３４】
本願はまた、上述のポリペプチドのいずれかを含んで成る融合タンパク質を開示する。これらのポリペプチドは、走化活性を有意に害し、そして場合によっては追加の特性を提供することなく本願で開示するものと異種のタンパク質配列を含むはずである。そのような特性の例は、より容易な精製手順、より長く持続する体液中での半減期、追加の結合部分、エンドプロテアーゼ消化による成熟、又は細胞外局在、である。この後者の特徴は、上文の定義に含まれる融合タンパク質又はキメラタンパク質の特定の群を定義するために特に重要なものであり、それは、これが特許を請求する分子を、これらのポリペプチドの単離及び精製が容易となるだけでなく、通常ケモカインとそれらの受容体が相互作用する空間内に局在化させるからである。
【００３５】
前記部分、リガンド及びリンカーの設計は、融合タンパク質の構築、精製、検出及び使用のための方法及び戦略同様、文献において開示されている(Nilsson J et al., 1997; Methods Enzymol, Vol. 326-328, Academic Press, 2000)。本発明の融合タンパク質に含まれうる好ましいタンパク質配列は、これらのタンパク質配列：膜結合タンパク質、イムノグロブリンの定常領域、多量体化ドメイン、細胞外タンパク質、シグナルペプチド含有タンパク質、エクスポートシグナル含有タンパク質、に属する。これらの配列の特徴及びそれらの特異的な使用は詳細に開示されており、例えばアルブミンタン融合タンパク質（ＷＯ０１／７７１３７）、多量体化ドメインを含む融合タンパク質（ＷＯ０１／０２２４０、ＷＯ００／２４７８２、ＷＯ９４／１０３０８、ＷＯ９７／３０１６１）、免疫複合体(Garnett MC, 2001)、又はアフィニティークロマトグラフィーによる組み換え産物の精製を可能にする配列を含む融合タンパク質(Constans A, 2002; Burgess RR and Thompson NE, 2002; Lowe CR et al., 2001; Sheibani N, 1999)である。
【００３６】
ケモカインの構造−活性の特徴に対する複数の研究は、これらのタンパク質が、アミノ末端領域を利用することによって受容体に結合し、そしれ受容体を活性化することを示唆している。この領域のアミノ酸に対してのタンパク質分解による消化、突然変異誘発、又は化学修飾は、拮抗活性を有する化合物を生成することができる(Loetscher P and Clark-Lewis I, 2001; Lambeir A et al., 2001, Proost P et al., 2001)。従って、相当するケモカインの末端領域又は他の領域における１又は複数の残基の特異的な修飾（欠失、非保存的置換、化学基の付加）から生じる拮抗分子は、炎症性及び自己免疫疾患についての治療的な能力を有すると考えられている（ＷＯ０２／２８４１９；ＷＯ００／２７８８０；ＷＯ９９／３３９８９；Schwarz MK and Wells T, 1999）。従って、本願の更なる目的は、本発明のポリペプチドを修飾することによって生成するそのような種類のアンタゴニストによって表される。
【００３７】
本発明のポリペプチドは、それらに特異的に結合するリガンドを生成し、そして特徴付けるために使用されうる。これらの分子は、天然又は人工の、化学的観点（結合タンパク質、抗体、分子インプリンティングポリマー）から非常に異なるものであってもよく、そして当業界の技術(WO 02/74938 ; Kuroiwa Y et al., 2002; Haupt K, 2002; van Dijk MA and van de Winkel JG, 2001; Gavilondo JV and Larrick JW, 2000)を適用することによって生成されてもよい。そのようなリガンドは、それらを生成せしめたポリペプチドの走化活性を拮抗化し、又は阻害することができる。特に、共通で且つ効率的なリガンドは、膜結合タンパク質又は抗体の細胞外ドメインで表され、これは、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、ヒト化抗体、又は抗原結合フラグメントの形態であってもよい。
【００３８】
上述のポリペプチド及びポリペプチドベースの誘導体化された試薬は、所望の使用方法及び／又は製造方法に従い、別の型、例えば、放射性標識、蛍光標識、ビオチン、又は細胞毒性物質の中から選択される分子との活性のある接合体又は複合体であってもよい。
【００３９】
特定の分子、例えばペプチドミメティクス(peptide mimetic)も、本発明のポリペプチドの配列及び／又は構造を基に設計されることがある。ペプチドミメティクス(peptidomimeticとも称される)は、アミノ酸の側鎖の、アミノ酸のキラリティーの、及び／又はペプチド主鎖のレベルで化学的に修飾されたペプチドである。これらの変更は、向上した調製、性能及び／又は薬物動態の特徴を有する本発明のポリペプチドのアゴニスト又はアンタゴニストを提供することが意図される。
【００４０】
例えば、前記ペプチドが、問題のある対象へのインジェクションの後にペプチダーゼによる開裂を受けやすい場合、非開裂性のペプチドミメティクスによる特に感受性のあるペプチド結合の置換は、より安定で且つその結果治療薬として更に有用なペプチドを提供することができる。同様に、Ｌ−アミノ酸残基の置換は、タンパク質分解に対してほとんど感受性がないペプチドであって、最終的にペプチド以外の有機化合物により類似のペプチドを賦与する標準的な方法である。アミノ末端のブロッキング基、例えばｔ−ブチルオキシカルボニル、アセチル、テイル(theyl)、スクシニル、メトキシスクシニル、スベリル(suberyl)、アジピル、アゼライル(azelayl)、ダンシル、ベンジルオキシカルボニル、フルオレニルメトキシカルボニル、メトキシアゼライル、メトキシアジピル、メトキシスベリル、及び２，４−ジニトロフェニルも有用である。増大した性能、延長された活性、精製の容易さ、及び／又は増大した半減期を提供する多くの他の修飾が従来技術で開示されている(WO 02/10195; Villain M et al., 2001)。
【００４１】
ペプチドミメティクスに含まれるアミノ酸誘導体にとって好ましい別の同義な基は、表ＩＩに規定されているものである。アミノ酸誘導体の非限定的なリストには、アミノイソ酪酸(Aib)、ヒドロキシプロリン(Hyp)、１，２，３，４−テトラヒドロ−イソキノリン−３−ＣＯＯＨ、インドリン−２カルボン酸、４−ジフルオロ−プロリン、Ｌ−チアゾリジン−４−カルボン酸、Ｌ−ホモプロリン、３，４−デヒドロプロリン、３，４−ジヒドロキシ−フェニルアラニン、シクロヘキシル−グリシン、及びフェニルグリシンも含まれる。
【００４２】
「アミノ酸誘導体」とは、２０個の遺伝子でコードされる天然のアミノ酸とは異なるアミノ酸又はアミノ酸様の化学的存在物を意図する。特に、アミノ酸誘導体は、置換型又は非置換型の直鎖若しくは分枝、又は環状のアルキル部分を含むことがあり、且つ１又は複数のヘテロ原子を含むことがある。アミノ酸誘導体は、新規に生成されてもよく、又は商業的供給源(Calbiochem-Novabiochem AG, Switzerland; Bachem, USA)から入手してもよい。
【００４３】
タンパク質の構造及び機能をプローブし、そして／あるいは改善させるために、in vitro及びin vivo両方の翻訳系を用いて非天然アミノ酸誘導体をタンパク質に組み込む種々の方法論が文献において開示されている(Dougherty DA, 2000)。非ペプチドミメティクスと同様、ペプチドミメティクスの合成及び開発のための技術も当業界で周知である(Golebiowski A et al., 2001; Hruby VJ and Balse PM, 2000; Sawyer TK, in "Structure Based Drug Design", edited by Veerapandian P, Marcel Dekker Inc., pg. 557-663,1997)。
【００４４】
本発明の別の目的は、走化活性を有する本発明のポリペプチド、ポリペプチドに対して生成される抗体若しくは結合タンパク質に結合する当該ポリペプチド、相当の融合タンパク質、又は上文で開示したような拮抗活性を有する突然変異体、である。好ましくは、これらの核酸は、配列番号１，３，５，７，９，１１，１３，又は１５から成る群から選択されるＤＮＡ配列、又は当該ＤＮＡ配列の相補体、を含んで成るべきである。
【００４５】
あるいは、本発明の核酸は、配列番号１，３，５，７，９，１１，１３，若しくは１５から成る群から選択される核酸、又は前記ＤＮＡ配列の相補体と、高ストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、あるいは少なくとも約３０個のヌクレオチドの長さにわたり少なくとも約８５％の同一性を示すはずである。本発明の更なる目的は、それ故にこれらの精製した核酸によってコードされるポリペプチドである。
【００４６】
用語「高ストリンジェントな条件」は、非常に類似の分子の会合を容易にするハイブリダイゼーション反応における条件であって、５０％ホルムアルデヒド、５ｘＳＳＣ（１５０ｍＭのＮａＣｌ、１５ｍＭのクエン酸三ナトリウム）、５０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ７．６）、５ｘデンハルト溶液、１０％硫酸デキストラン、及び２０μｇ／ｍｌの変性してせん断されたサケ精子ＤＮＡを含んで成る溶液中で６０〜６５℃一晩インキュベーションし、続いて０．１ｘＳＳＣ中フィルターを同一の温度で洗浄することに存するものを意味する。
【００４７】
実質的に同一のヌクレオチド配列を含むこれらの核酸は、コードされたポリペプチドを維持し、修飾し、導入し、又は発現するために使用されうるプラスミド、ベクター及び任意な他のＤＮＡコンストラクトに含まれることがある。特に、前記核酸分子が発現制御配列と作用可能に連結しているベクターは、原核又は真核宿主細胞における、コードされたポリペプチドの発現を可能にしうる。
【００４８】
用語「実質的に同一のヌクレオチド配列」は、遺伝コードの縮重が原因で、所定のアミノ酸配列をもコードする全ての他の核酸配列を含む。この意味で、文献は、組換え体の発現にとって好ましい又は最適化されたコドンに対する示唆を提供している(Kane JF et al., 1995)。
【００４９】
核酸及びベクターは、異なる目的で細胞内に導入されることがあり、その結果トランスジェニック細胞及び動物を生成せしめる。本発明のポリペプチドを発現することができる細胞の産生方法は、そのようなベクター及び核酸で細胞を遺伝子操作することを含んで成る。
【００５０】
特に、宿主細胞（例えば、細菌細胞）は、本発明の核酸及びベクターによってコードされたポリペプチドの一過性又は安定性の発現を可能にする形質転換によって修飾されることがある。あるいは、前記分子は、正常な発現レベルと比較した場合に、本発明のポリペプチドの構成的な又は誘導性の変化した発現レベル（すなわち増強又は低下されたもの）を有するトランスジェニック動物細胞又はヒト以外の動物を生成させるために（非相同組換え／相同組換え又はそれらの安定な組込み及び維持を可能にする任意な他の方法による）使用されることがある。そのような正確な修飾は、本発明の核酸及び、例えば遺伝子治療(Meth. Enzymol., vol. 346,2002)又は部位特異的なリコンビナーゼ(Kolb AF, 2002)に関連する技術、を利用することによって得ることができる。本願で開示するケモカイン様ポリペプチドを基にしたそれらの機能の系統だった研究のためのモデル系も、ヒト細胞系へのジーンターゲティングによって生成されうる(Bunz F, 2002)。
【００５１】
本発明のポリペプチドは、当業界で知られている任意な方法、例えば組換えＤＮＡ関連技術、及び化学合成技術、によって調製されることもある。特に、本発明のポリペプチドを生成する方法は、上述のように、核酸又はベクターが発現する条件下で宿主細胞又はトランスジェニック細胞を培養し、そして培養物から前記核酸又はベクターによってコードされるポリペプチドを回収することを含んで成ることもある。例えば、ベクターが、細胞外又はシグナルペプチド含有タンパク質との融合タンパク質としてポリペプチドを発現する場合、組換え産物は細胞外空間に分泌されることがあり、そして、培養細胞から、更なる処理の観点で更に容易に回収され、且つ精製されることがあり、あるいは、当該細胞は直接使用され、又は投与されることがある。
【００５２】
本発明のタンパク質をコードするＤＮＡ配列は、任意の適当な手段（形質転換、トランスフェクション、接合、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈殿、直接的なマイクロインジェクション等）によって適切な宿主細胞に導入されうる、適当なエピソームの又は非相同／相同組換えのベクター内に挿入され、そしてライゲーションされることがある。特定のプラスミド又はウイルスベクターを選択するのに重要な因子は、ベクターを含むレシピエント細胞が当該ベクターを含まないそれらのレシピエント細胞から容易に認識され、且つ選択されうることの容易さ；特定の宿主で望まれるベクターのコピー数；及び異なる主の宿主細胞間でベクターを「シャトル」し得ることが望ましいか否か、を含む。
【００５３】
ベクターは、転写開始／終結制御配列の支配下での原核又は真核宿主細胞による本発明のポリペプチドを含む単離されたポリペプチド又は融合ポリペプチドの発現を可能にするはずであり、これらは、前記細胞において構成的に活性又は誘導性のものが選択される。前記細胞が実質的に豊富な細胞系は、続いて安定な細胞系を提供するよう単離されうる。
【００５４】
異なる転写制御配列及び翻訳制御配列は、真核生物宿主（例えば、酵母、昆虫、植物、又は哺乳類の細胞）に対し、その宿主の性質に依存して利用することができる。それらは、ウイルス源、例えばアデノウイルス、ウシパピローマウイルス、シミアンウイルス等に由来してもよく、ここでは、制御シグナルが、高レベルで発現する特定の遺伝子と関連している。例としてはヘルペスウイルスのＴＫプロモーター、ＳＶ４０初期プロモーター、酵母ＧＡＬ４遺伝子プロモーター等がある。転写開始制御シグナルは、抑制及び活性を可能にして、その結果前記遺伝子発現が調節されうるようなものが選択されうる。導入されたＤＮＡによって安定して形質転換された細胞は、前記発現ベクターを含む宿主細胞の選択を可能にする１又は複数のマーカーを導入することによって選択されうる。当該マーカーはまた、栄養要求宿主に対する光合成栄養、殺生物耐性、例えば抗生物質、又は重金属、例えば銅、等をも提供しうる。選択マーカー遺伝子は、発現されるＤＮＡ遺伝子配列に直接連結されるか、あるいは同時トランスフェクションによって同一の細胞内に導入されうる。
【００５５】
宿主細胞は原核生物又は真核生物のいずれかのものでありうる。好ましいものは、真核生物宿主、例えば哺乳類細胞、例えばヒト、サル、マウス、及びチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞であり、それは、それらがタンパク質に対する翻訳後修飾、例えば正確な折りたたみ及びグリコシル化を提供するためである。酵母もグリコシル化を含む翻訳後ペプチド修飾を実施しうる。多くの組換えＤＮＡストラテジーが存在しており、これらは、酵母内で所望のタンパク質の産生に利用されうる強力なプロモーター配列及び高コピー数のプラスミドを利用する。酵母は、クローン化哺乳類遺伝子産物のリーダー配列を認識し、そしてリーダー配列を有するペプチド（すなわち、プレペプチド）を分泌する。
【００５６】
本発明の上文で言及した態様は、新規ケモカイン様ポリペプチドの配列に対して本願が提示する開示を、一般的な分子生物学的技術の知識と組み合わせることによって達成されうる。
【００５７】
多数の本及び概説が、ベクター及び原核生物又は真核生物宿主細胞を用いて組換えタンパク質をどのようにクローン化し、そして産生するかについての技術を提供しており、例えばオックスフォード大学出版局によって発行されている「A Practical Approach」のシリーズの中の幾つかのタイトルである ("DNA Cloning 2: Expression Systems", 1995;"DNA Cloning 4: Mammalian Systems", 1996;"Protein Expression", 1999;"Protein Purification Techniques", 2001).。
【００５８】
更に、最新のより重点的な文献は、ハイスループットな様式でポリペプチドを発現する技術(Chambers SP, 2002; Coleman TA, et al., 1997)、治療的用途を有する組換えタンパク質の大規模産生のために産業上利用される細胞系及び方法(Andersen DC and Krummen L, 2002; Chu L and Robinson DK, 2001)、及び注目のポリペプチドを発現する別の真核生物発現系であって、所望のタンパク質の経済的な産生についてかなりの可能性を有すると考えられるもの、例えばトランスジェニック植物を基にしたもの(Giddings G, 2001)又は酵母ピキア・パストリス(Pichia pastors)を基にしたもの(Lin Cereghino GP et al., 2002)、の概論を提供する。組換えタンパク質産物は、発現したポリペプチドの量及び質を証明するため(Baker KN et al., 2002)、生物学的同等性及び免疫原性の問題があるか否かを調べるのと同様に(Schellekens H, 2002; Gendel SM, 2002)、種々の分析技術により迅速にモニタリングされうる。
【００５９】
全体として合成のケモカインは文献において開示されており(Brown A et al., 1996)、そして、短い長さを与える本発明のケモカイン様ポリペプチドに効果的に利用されうる化学合成技術の多数の例は、固層又は液層合成技術として、文献において利用可能となっている。例えば、合成されるポリペプチドのカルボキシ末端に相当するアミノ酸は、有機溶媒中で不溶の支持体に結合し、そして、適切な保護基で保護されたそれらのアミノ基及び側鎖の官能基を有するアミノ酸がカルボキシ末端からアミノ末端へと順番に１つずつ縮合するものと、樹脂又は前記ペプチドのアミノ基の保護基と結合したアミノ酸が放出されるものとの交互の反復反応によって、ペプチド鎖はその結果この様式で伸長される。
【００６０】
固層合成法は、使用する保護基の型に依存して、ｔＢｏｃ法及びＦｍｏｃ法に大きく分類される。典型的に使用される保護基には、ｔＢｏｃ（ｔ−ブトキシカルボニル）、Ｃｌ−Ｚ（２−クロロベンジルオキシカルボニル）、Ｂｒ−Ｚ（２−ブロモベンジルオキシカルボニル）、Ｂｚｌ（ベンジル）、Ｆｍｏｃ（９−フルオレニルメトキシカルボニル）、Ｍｂｈ（４，４’−ジメトキシジベンズヒドリル）、Ｍｔｒ（４−メトキシ−２，３，６−トリメチルベンゼンスルホニル）、Ｔｒｔ（トリチル）、Ｔｏｓ（トシル）、Ｚ（ベンジルオキシカルボニル）及びＣｌ２−Ｂｚｌ（２，６−ジクロロベンジル）がアミノ基の場合に含まれ；ＮＯ２（ニトロ）及びＰｍｃ（２，２，５，７，８−ペンタメチルクロマン−６−スルホニル）がグアミジノ基の場合に含まれ；そしてｔＢｕ（ｔ−ブチル）がヒドロキシル基の場合に含まれる。所望のペプチドの合成後、それは脱保護反応にかけられ、そして固体の支持体から切り離される。そのようなペプチド切断反応は、Ｂｏｃ法の場合フッ化水素又はトリフルオロメタンスルホン酸を用いて、そしてＦｍｏｃ法の場合ＴＦＡを用いて実施されうる。
【００６１】
本発明のポリペプチドの精製は、この目的のために知られている方法、すなわち、抽出、沈殿、クロマトグラフィー、電気泳動等の任意な常用の方法、のうちのいずれか１つによって実施されうる。本発明のタンパク質を精製するために優先して使用されうる追加の精製手順は、標的タンパク質に結合し、且つ、産生され、そしてカラム内に含まれるゲルマトリックス上に固定される、モノクローナル抗体又は親和性の基を用いるアフィニティークロマトグラフィーである。タンパク質は、ヘパリン又は特異的抗体によりカラムと結合し、一方、不純物はカラムを通過する。洗浄後、タンパク質はｐＨ又はイオン強度の変化によってゲルから溶出される。あるいは、ＨＰＬＣ（高性能液体クロマトグラフィー）を使用することができる。溶出は、タンパク質精製に一般的に利用される水−アセトニトリルベースの溶媒を用いて実施されうる。
【００６２】
本発明の新規ポリペプチドの開示、及びそれらに関連して開示されている試薬（抗体、核酸、細胞）の開示はまた、細胞への又は動物内でのそれらの発現レベルを増強し、又は低下させる化合物をスクリーニングし、そして特徴付けることを可能にする。ケモカイン様ポリペプチドの発現を減少又は阻害しうる化合物の例は、アンチセンスオリゴヌクレオチド(Stein CA, 2001)又は低分子干渉、ＲＮＡ干渉媒介サイレンシングを引き起こしうる二本鎖ＲＮＡ分子(Paddison PJ et al., 2002; Lewis DL et al., 2002)である。これらの化合物は、文献(Choy EH and Panayi GS, 2001; Dower SK, 2000)において規定されているようなサイトカイン／ケモカイン制御型経路を阻止すると考えられる拮抗作用機構との関連で、アンタゴニストとして（突然変異体及びリガンドに関連して記載したような上述のものに加えて）意図されている。
【００６３】
「オリゴヌクレオチド」は、化学合成されうる一本鎖ポリデオキシヌクレオチド又は二本の相補的なポリデオキシヌクレオチド鎖のいずれかを意味する。そのような合成オリゴヌクレオチドは、５’ホスフェートを有さず、そのためキナーゼの存在下ホスフェートをＡＴＰと一緒に添加しないことには別のオリゴヌクレオチドとライゲーションしないであろう。合成オリゴヌクレオチドは、脱リン酸されていないフラグメントにライゲーションするであろう。
【００６４】
本発明は、本発明の化合物の精製された調製物（ポリペプチド、核酸、細胞等）を含む。精製された調製物とは、本明細書で使用する場合、乾燥重量当たり少なくとも１％、好ましくは少なくとも５％本発明の化合物を含む調製物を意味する。
【００６５】
本願は、一連の新規ケモカイン様ポリペプチド及び複数の可能性のある用途を有する関連試薬を開示する。特に、本発明のポリペプチドの走化活性の増大が疾患の治療又は予防において望まれる場合はいつでも、試薬、例えば開示されているケモカイン様ポリペプチド、相当の融合タンパク質及びペプチドミメティクス、コード核酸、発現細胞、又はそれらの発現を増強する化合物が使用されうる。
【００６６】
従って、本発明は、本発明のポリペプチドの走化活性の増大を必要とする疾患の処置又は予防のための医薬組成物であって、開示されるケモカイン様ポリペプチド、相当の融合タンパク質及びペプチドミメティクス、コード核酸、発現細胞、又はそれらの発現を増強する化合物のうちの１つを活性成分として含む医薬組成物を開示する。
【００６７】
これらの医薬組成物の調製方法は、開示されるケモカイン様ポリペプチド、相当の融合タンパク質及びペプチドミメティクス、コード核酸、発現細胞、又はそれらの発現を増強する化合物を、医薬として許容される担体と一緒に組み合わせることを含んで成る。
【００６８】
本発明のポリペプチドの走化活性の増大を必要とする疾患の処置又は予防のための方法は、治療として有効量の、開示されるケモカイン様ポリペプチド、相当の融合タンパク質及びペプチドミメティクス、コード核酸、発現細胞、又はそれらの発現を増強する化合物、の投与を含んで成る。
【００６９】
本願で開示されている試薬の中でも、本発明のポリペプチドの発現又は活性を低下させるリガンド、アンタゴニスト又は化合物は、複数の用途を有し、特に、それらは本発明のポリペプチドの過剰な走化活性に関連する疾患の治療又は診断に使用されうる。
【００７０】
従って、本発明は、本発明のポリペプチドの過剰な走化活性に関連する疾患の処置又は予防のための医薬組成物であって、そのようなポリペプチドの発現又は活性を低下させるリガンド、アンタゴニスト又は化合物のうちの１つを活性成分として含む医薬組成物を開示する。
【００７１】
これらの医薬組成物の調製方法は、前記のリガンド、アンタゴニスト、又は化合物を、医薬として許容される担体と一緒に組み合わせることを含んで成る。
【００７２】
本発明のポリペプチドの過剰な走化活性に関連する疾患の処置又は予防のための方法は、治療的に有効量のアンタゴニスト、リガンド又は化合物の投与を含んで成る。
【００７３】
本発明の医薬組成物は、ケモカイン様ポリペプチド又は関連試薬に加え、医薬として許容される適当な担体、生物学的に適合性のある媒体及び添加物を含んでもよく、これらは動物への投与に適したものであり（例えば、生理学的食塩水）、且つ、活性化合物を医薬として使用されうる調製物へと処理するのを容易にする助剤（賦形剤、安定化剤、佐剤、又は希釈剤）を最終的に含んで成るものである。
【００７４】
医薬組成物は、投与形態の要求に合致する任意の許容される方法で製剤化されうる。例えば、生体材料、糖−高分子複合体、ポリエチレングリコール及び他の天然又は合成ポリマーは、薬物送達の有効性に関して活性成分を改善するのに使用されうる。特定の投与形態を評価する技術及びモデルは文献に開示されている(Davis BG and Robinson MA, 2002; Gupta P et al., 2002; Luo B and Prestwich GD, 2001; Cleland JL et al., 2001; Pillai O and Panchagnula R, 2001)。
【００７５】
これらの目的に適したポリマーは生体適合性があり、すなわち、それらは生物系に対して非毒性であり、そして多数のそのようなポリマーは既知である。そのようなポリマーは天然で疎水性又は親水性であっても、生分解性、非生分解性、又はそれらの組み合わせであってもよい。これらのポリマーには、天然ポリマー（例えばコラーゲン、ゼラチン、セルロース、ヒアルロン酸）、並びに合成ポリマー（例えばポリエステル、ポリオルトエステル、ポリ無水物）が含まれる。疎水性の非分解性ポリマーの例には、ポリジメチルシロキサン、ポリウレタン、ポリテトラフルオロエチレン、ポリエチレン、ポリ塩化ビニル、及びポリメチルメタエリラート(methaerylate)が含まれる。親水性の非分解性ポリマーの例には、ポリ（２−ヒドロキシエチルメタクリラート）、ポリビニルアルコール、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）、ポリアルキレン、ポリアクリルアミド、及びそれらのコポリマーが含まれる。連続反復単位として好ましいポリマーには、エチレンオキシド、例えばポリエチレングリコール（ＰＥＧ）がある。
【００７６】
任意の許容される投与形態は、活性成分の所望の血液レベルを確立するために、当業者によって使用され、そして決定されうる。例えば、投与は、種々の非経口経路、例えば皮下、静脈内、皮内、筋肉内、腹腔内、経鼻、経皮、経口、又は頬側でなされることがある。本発明の医薬組成物はまた、維持又は制御放出剤形、例えば蓄積注射、浸透ポンプ等を含むものであって、既定の速度での前記ポリペプチドの長期投与のためのもので、好ましくは正確な投与量の単回投与に適した単位剤形で投与されてもよい。
【００７７】
非経口投与は、ボーラス注入又は時間をかけての漸進的な潅流によってもよい。非経口投与のための調製物には、滅菌水溶液又は非水溶液、懸濁液、及び乳濁液が含まれ、これらは当業界で知られている佐剤又は賦形剤を含むことがあり、且つルーチンな方法に従い調製されうる。尚、適切な油性注射懸濁液としての活性化合物の懸濁液が投与されることがある。適当な親油性溶媒又は媒体には、脂肪油、例えばごま油、又は合成脂肪酸エステル、例えばごま油、例えば合成脂肪酸エステル、例えばオレイン酸エチル又はトリグリセリドが含まれる。懸濁液の粘性を増大させる物質を含みうる水性注射懸濁液は、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、及び／又はデキストランが含まれる。任意に、懸濁液はまた安定化剤を含んでもよい。医薬組成物は注射による投与に適した溶液を含み、且つ、賦形剤と一緒に約０．０１〜９９．９９パーセント、好ましくは約２０〜７５パーセントの活性化合物を含む。
【００７８】
用語「治療的に有効量」とは、疾患の経過及び重症度に影響を及ぼし、そのような病状の緩和又は寛解を導くのに十分な量の活性成分を意味する。有効量は、投与経路及び患者の症状に依存する。
【００７９】
用語「医薬として許容される」は、活性成分の生物学的活性の有効性を妨げず、且つ投与される宿主にとって毒性でない任意の担体を包含することを意味する。例えば、非経口投与の場合、上記活性成分は、単位剤形で、生理食塩水、デキストロース溶液、血清アルブミン及びリンガー液のような媒体中で製剤化されうる。担体はまた、デンプン、セルロース、タルク、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、コメ、コムギ、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、塩化ナトリウム、乾燥スキムミルク、グリセロール、プロピレングリコール、水、エタノール、及び種々の油から選択することができ、これらは、石油、動物、植物又は合成起源のもの（ピーナッツ油、大豆油、鉱油、ごま油）を含む。
【００８０】
投与される用量は、レシピエントの年齢、性別、健康、及び体重、併用の処置の種類、もしあるのであれば、処置の頻度、及び所望の効果の性質、に依存する。用量は、当業者によって理解され、且つ決定可能なように、個々の対象者に合わせられる。各処置に必要とされる総量は、複数回投与又は単回投与によって投与されうる。本発明の医薬組成物は、単独で、又はその症状に対する、又は当該症状のほかの症候に対する他の治療薬と一緒に投与されうる。通常、活性成分の一日量は、０．０１〜１００ミリグラム／キログラム体重／日含まれる。通常、分割量又は維持放出形態で与えると、１〜４０ミリグラム／キログラム／日が所望の結果を得るのに有効である。第二又はその後の投与は、個体に対して投与された最初又は前回の用量と同一、それ未満、又はそれ以上の用量で実施されうる。
【００８１】
治療目的又は製造目的を有する方法とは異なる複数のほかの方法が、本願で開示されているケモカイン様ポリペプチド及び関連試薬を利用することができる。
【００８２】
最初の例において、本発明のケモカイン様ポリペプチドに関連する疾患を処置するのに有効な候補化合物をスクリーニングする方法は：
（ａ）そのようなポリペプチドを発現する宿主細胞、当該ポリペプチドの増大した又は低下した発現レベルを有するトランスジェニックなヒト以外の動物、又はトランスジェニック動物細胞を、候補化合物と接触させること；及び
（ｂ）前記動物又は細胞に対する化合物の効果を決定すること、
を含んで成る。
【００８３】
第二の例において、本発明のポリペプチドのアンタゴニスト／阻害物質又はアゴニスト／活性化物質としての候補化合物を同定する方法は：
（ａ）前記ポリペプチドと、前記化合物、及び哺乳類細胞又は哺乳類細胞膜と
を接触させること；及び
（ｂ）前記の分子が、前記ポリペプチドと前記哺乳類細胞又は哺乳類細胞膜との相互作用、又は当該相互作用から生じる応答、を阻止又は増強するか否かを決定すること、
を含んで成る。
【００８４】
第三の例において、試料中の本発明のポリペプチドの活性及び／又は存在を決定する方法は、当該ポリペプチド又はそのコードＲＮＡ／ＤＮＡのいずれかを検出することができる。従って、そのような方法は：
（ａ）タンパク質含有試料を準備すること；
（ｂ）前記試料と本発明のリガンドとを接触させること；及び
（ｃ）前記ポリペプチドに結合した前記リガンドの存在を決定し、それにより前記試料中のポリペプチドの活性及び／又は存在を決定すること、
を含んで成る。
【００８５】
あるいは、前記方法は：
（ａ）核酸含有試料を準備すること；
（ｂ）前記試料と本発明の核酸とを接触させること；及び
（ｃ）当該核酸と前記試料中の核酸とのハイブリダイゼーションを決定し、それにより前記試料中の核酸の存在を決定すること、
を含んで成る。
【００８６】
これに関連して、配列番号１７〜２８の配列を含むプライマー配列（表ＩＩＩ）は、ポリメラーゼ連鎖反応増幅により、試料中の本発明のポリペプチドをコードする転写物又は核酸の存在又は量を決定するためにも同様に使用されうる。
【００８７】
本発明の更なる目的は、試料中の本発明のケモカイン様ポリペプチドの活性及び／又は存在を測定するためのキットであって、本願で開示されている１又は複数の試薬：本発明のケモカイン様ポリペプチド、アンタゴニスト、リガンド又はペプチドミメティクス、単離された核酸又はベクター、医薬組成物、発現細胞、発現レベルを増大又は低下させる化合物、及び／又は配列番号１７〜２８の配列を含むプライマー配列、を含んで成るキットである。
【００８８】
これらのキットは、in vitroでの診断又はスクリーニング方法に使用することができ、そしてそれらの実際の組成物は、試料の特定の形式（例えば、患者からの生物学的試料組織）、及び測定される分子種に適合されるはずである。例えば、ケモカイン様ポリペプチドの濃度を測定することが望まれる場合、キットは、ウェスタンブロットで得られるシグナルを比較するために、精製された形態において、抗体及びそれに相当するタンパク質を含むことがある。あるいは、ケモカイン様ポリペプチドについての転写物の濃度を測定することが望まれる場合、キットは、対応のＯＲＦ配列に基づいて設計された特定も核酸プローブを含むことがあり、又はそのようなプローブ、又は配列番号１７〜２８として開示されているプライマー配列（表ＩＩＩ）を含む核酸アレイの形態であってもよい。当該キットはまた、タンパク質−、ペプチドミメティクス−、又は細胞−ベースのマイクロアレイの形態であって(Templin MF et al., 2002; Pellois JP et al., 2002; Blagoev B and Pandey A, 2001)、本願で開示されているタンパク質、ペプチドミメティクス及び細胞を利用することによりハイスループットプロテオミクス研究を可能にするものであってもよい。
【００８９】
本発明の新規ケモカイン様ポリペプチド及び、医薬組成物中の活性成分として有用であり得る関連の試薬は、細胞増殖性疾患、自己免疫／炎症性疾患、心臓血管疾患、神経疾患、発達障害、代謝性疾患、感染及び他の病状の処置又は予防において処方される。特に、ケモカインの既知の特性を考慮すると、開示されたポリペプチド及び試薬は、異常な又は欠陥のある細胞遊走に関与する症状に対処するはずである。そのような症状の非限定的な例は以下のものである：関節炎、関節リウマチ（ＲＡ）、乾癬性関節炎、変形性関節症、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、全身性硬化症、強皮症、多発性筋炎、糸球体腎炎、線維症、肺線維症及び炎症、アレルギー性又は過敏性疾患、皮膚炎、喘息、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、クローン病、潰瘍性大腸炎、多発性硬化症、敗血性ショック、ＨＩＶ感染、移植片拒絶、創傷治癒、転移、子宮内膜症、肝炎、肝線維症、ガン、無痛覚症、及びアテローム性動脈硬化症に関連する血管の炎症。
【００９０】
本発明のポリペプチド及び関連試薬の治療的利用は、動物細胞、組織及びモデルを利用するin vivo又はin vitroでのアッセイ(Coleman RA et al., 2001; Li AP, 2001; Methods Mol. Biol vol. 138, "Chemokines Protocols", edited by Proudfoot A et al., Humana Press Inc., 2000; Methods Enzymol, vol. 287 and 288, Academic Press, 1997)、又はin silicoでのコンピューターによるアプローチ(Johnson DE and Wolfgang GH, 2000)、であって、創薬及び臨床前の開発の間のケモカイン及び他の生物学的産物の評価のために知られているものによって、（安全性、薬物動態学及び有効性の観点から）評価されうる。
【００９１】
本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願が、全ての目的のために引用によって全て本明細書に組み入れられる。
【００９２】
本発明は、以降、以下の実施例により特定の態様を参照して説明されるが、これらは本発明を何ら限定するものとして解されるべきではない。当該説明の内容は、上文の教示に照らして、そしてそれ故に、特許請求の範囲の意味及び目的を超えて広げることなく、当業者によって実施されうる全ての改変及び置換を含んで成る。
【実施例】
【００９３】
実施例１：ヒトゲノムからのケモカイン様オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）の選択
Perl(Practical Extraction and Report Language)は、既定の共通配列を説明するアルファベットや数字の表現から出発して、ゲノムＤＮＡ配列からの情報の抽出を可能にする、大規模なテキストデータへの強力なパターンマッチング機能を有するプログラム言語である(Stein LD, 2001)。
【００９４】
Perlスクリプトは、ＦＡＳＴＡフォーマットの配列を含むＮＣＢＩゲノム（ビルド２８）において、ケモカイン様の特徴を有する新規オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）を検索するために使用された。ゲノムＤＮＡ配列を６個の可能性のあるリーディングフレーム（３個のフォワード及び３個のリバース）に翻訳した後、これらの翻訳された配列のそれぞれが、既知のケモカインの多数の配列アラインメントを比較して作り上げられた、ケモカイン様タンパク質を検出するために設計されたパターンに対するマッチについて試験された。全てのアラインされた配列に適合する以下のパターンを採用した：
【数１】
2006517388.tif 000002
【００９５】
括弧内の文字は、下付きの文字で示した度数で存在しているはずの代替アミノ酸を表した。線形配列上の開始メチオニン、疎水性残基、及び保存されたシステインのそれぞれの位置に基づいて、全体的な配列ファミリーを説明するこの表現は、Perl言語で以下のように翻訳されうる：
【数２】
2006517388.tif 000003
【００９６】
前記パターンにマッチするＦＡＳＴＡフォーマットの合計７９７４個のＯＲＦは、タンパク質データベース(SwissProt/Trembl及びDerwent GENESEQ)に存在する既知のタンパク質と、ベーシックローカルアラインメントサーチツール(BLAST, BLASTX)及びClustalWアルゴリズム(Altschul SF et al., 1990; Pearson WR及びMiller W, 1992; Gish W and States DJ, 1993)に基づいたクエリー配列とヒット配列との間のローカルアラインメントについての迅速なサーチプログラムを用いて比較された。使用したBLASTパラメーターは、比較マトリックス＝BLOSUM62；ワードレングス＝３；．Ｅ値カットオフ＝１０；ギャップオープニング及びエクステンション＝デフォルト；フィルター無し、である。
【００９７】
この最初のスクリーニングから得られた配列は、追加の基準を用いて更に選択された。タンパク質データベース内の既知のタンパク質と少なくとも７０％のホモロジーを示す２４４１個のＯＲＦが排除された。残りの５５３３個のＯＲＦは、高い信頼での、Ｎ末端のシグナルペプチド及びＣ末端の３０個のアミノ酸内に少なくとも５個のアミノ酸を有するαヘリックスの２次構造（ＩＬ−８様の折り畳みの特徴）、の予測（少なくとも０．７の確率）のための開発された２つの神経回路網ベースのアルゴリズムを用いてフィルターにかけられた。これらの特徴を含むものとして予測された、生じた２５３個のＯＲＦは、テキストフォーマットに変換され、そして既知のケモカインと比較して手作業で最良のアラインメントがサーチされた。当該アラインメントの定性的評価を基にしたこの更なるリファインメントは、当該予測についての、既知のケモカインに匹敵するとして全ての基準（配列の長さ、システインの間隔、Ｎ末端シグナル配列、Ｃ末端のアルファヘリックス）が満たされた８個のケモカイン様コードＯＲＦの選択へと導いた。
【００９８】
ヒト第１３染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿１７５４（配列番号１）は、９８個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ１７５４（配列番号２）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、２２個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基７０〜７９をカバーするアルファヘリックスを提示する（図１）。
【００９９】
ヒト第１６染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿０７１１（配列番号３）は、１０９個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ０７１１（配列番号４）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、１７個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基９８〜１０６をカバーするアルファヘリックスを提示する（図２）。
【０１００】
ヒト第６染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿２８８２（配列番号５）は、１０７個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ２８８２（配列番号６）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、１８個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基９６〜１０４をカバーするアルファヘリックスを提示する（図３）。
【０１０１】
ヒト第３染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿４７１１（配列番号７）は、１０２個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ４７１１（配列番号８）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、２２個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基８３〜９７をカバーするアルファヘリックスを提示する（図４）。
【０１０２】
ヒト第３染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿４３２０（配列番号９）は、１０１個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ４３２０（配列番号１０）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、１６個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基９０〜９８をカバーするアルファヘリックスを提示する（図５）。
【０１０３】
ヒト第１２染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿５００８（配列番号１１）は、１１２個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ５００８（配列番号１２）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、１７個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基９５〜１０９をカバーするアルファヘリックスを提示する（図６）。
【０１０４】
ヒト第７染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿０２１０（配列番号１３）は、１２７個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ０２１０（配列番号１４）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、１６個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基９４〜１１３をカバーするアルファヘリックスを提示する（図７）。
【０１０５】
ヒト第１０染色体に属する、ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿４９２２（配列番号１５）は、９１個のアミノ酸長のタンパク質配列ｐ４９２２（配列番号１４）をコードするＯＲＦを含み、これは、前記予測によると、２３個のアミノ酸長のシグナル配列及び残基６７〜７４をカバーするアルファヘリックスを提示する（図８）。
【０１０６】
ケモカイン様ポリペプチドをコードするとして特徴付けられたこれらの配列のうち、それらの中の５個（ｐ１７５４、ｐ０７１１、ｐ２８８２、ｐ０２１０、及びｐ４９２２）は、最初の２つのシステインが１〜３アミノ酸離れている中心のＣｙｓリッチ領域を提示し、そして既知のＣ−Ｘ−Ｃケモカインと比較することができる（図９）。残りの３個の配列（ｐ４７１１、ｐ４３２０、及びｐ５００８）は、前記領域の始めに２個の隣接しているシステインを提示し、そしてそれ故に既知のＣ−Ｃケモカインと比較することができる（図１０）。
【０１０７】
実施例２：ヒトゲノムＤＮＡからの新規ケモカイン様ＯＲＦのクローニング
８個の上文で定義したケモカイン様ＯＲＦのうちの６個（ＧＮＳＱ＿１７５４、ＧＮＳＱ＿４９２２、ＧＮＳＱ＿５００８、ＧＮＳＱ＿０２１０、ＧＮＳＱ＿０７１１、及びＧＮＳＱ＿４３２０）が、最初に、ヒトゲノムＤＮＡからクローニングベクター内にクローニングされ、そして次に、各ＯＲＦに特異的なフォワード／リバースプライマー対（図１，２及び５〜８の矢印を参照のこと）によるポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）を用いて発現ベクター内に移された。
【０１０８】
１９〜２５個の塩基を含んで成る長さを有するクローニングプライマー（ＣＬシリーズ；表ＩＩＩ）は、鋳型としてヒトゲノムＤＮＡを用いて、各ＯＲＦを増幅させるために設計された。フォワードプライマーは、開始ＡＴＧ又はその数個前のヌクレオチドから開始する。リバースプライマーは、終止コドンを含むＯＲＦの３’末端と相補的である。
【０１０９】
ＰＣＲは、各ＯＲＦに特異的な反応において以下の成分を混合することによって実施した（二回蒸留した水の中で合計５０μｌの体積）：
１５０ｎｇのヒトゲノムＤＮＡ(Clontech)
１．２μＭのプライマー（０．６μＭの各プライマー）
２４０μＭのｄＮＴＰ(Invitrogen)
０．５μｌのＡｍｐｌｉＴａｑ（２．５ユニット；Applied Biosystems）
５μｌのＡｍｐｌｉＴａｑバッファー１０ｘ(Applied Biosystems)
【０１１０】
当該ＰＣＲ反応は、９４℃で２分間の最初の変性段階、続いて、
９４℃で３０秒間
５５℃で３０秒間
７２℃で３０秒間
の３０サイクル、を用いて実施した。
【０１１１】
７２℃で１０分間の最後の伸長段階の後、ＰＣＲ産物は、ＴＯＰＯ（商標）クローニングシステム(Invitrogen)を製品のメーカーのプロトコールに従い用いることによりｐＣＲＩＩ−ＴＯＰＯベクター内にサブクローニングされた。ＴＯＰＯクローニングシステムは、ＴａｑポリメラーゼがＰＣＲ産物の３’末端に１つのアデノシンを残すという事実を利用してＰＣＲ産物の迅速なクローニングを可能にする、ＴＡクローニングシステムの変形である。ＴＯＰＯベクターは一本鎖のチミンオーバーハングを有するので、トポイソメラーゼＩ酵素は、当該ベクターのＴ末端を前記ＰＣＲ産物のＡ−オーバーハングに連結させることができ、これは全く精製段階無しに使用することができる。
【０１１２】
生じたプラスミド（ｐＣＲＴＯＰＯ−ＯＲＦシリーズ）は、Ｅ．コリ細胞（ＴＯＰ１０Ｆ’、Invitrogen、ＴＯＰＯ  ＴＡクローニングキットに同封）を形質転換して各ＯＲＦについての複数のクローンを得るために使用された。プラスミドＤＮＡは、市販のキット（ＷＩＺＡＲＤプラスミドミニプレップ；Promega）を用いて単離され、そして増幅してクローニングした配列と、最初に選択されたヒトゲノムＤＮＡ配列との同一性を確認するために配列決定された。
【０１１３】
所望の配列を含むプラスミドは、ＥＦ−１αプロモーターの制御下で且つ６−ヒスチジンタグ配列を有するフレーム内での、Ｇａｔｅｗａｙクローニングシステム(Invitrogen)を用いた発現を可能にするＯＲＦを発現ベクターｐＥＡＫ１２ｄ（図１１）内に、当該ＯＲＦを移すのに必要な追加の一連のＰＣＲ反応において使用された。
【０１１４】
発現ベクターｐＥＡＫ１２Ｄは、ｐＥＡＫ１２(Edge Biosystems)を改変することによって構築された。このベクターは、ＨｉｎｄＩＩＩ及びＮｏｔＩで消化され、クレノーを用いて平滑末端にされ、そしてウシ小腸由来アルカリホスファターゼを用いて脱リン酸された。脱リン酸の後、ベクターは、ＡｔｔＲ組換え部位と隣接するｃｃｄＢ遺伝子（非組換えプラスミドのネガティブ選択マーカー）及びクロラムフェニコール耐性遺伝子を含む平滑末端のＧａｔｅｗａｙリーディングフレームカセットＣ（Ｇａｔｅｗａｙベクター変換系、Invitrogenカタログ番号１１８２８−０１９）にライゲーションされた。生じたプラスミドは、ｃｃｄＢ遺伝子を含むベクターの増殖を可能にするＤＢ３．１Ｅ．コリ細胞を形質転換するために使用された。ミニプレップＤＮＡは、生じたコロニーのうちの幾つかから単離され、そしてＡｓｅＩ／ＥｃｏＲＩで消化され、カセットが正確な配向で挿入された場合に得ることができる６７０ｂｐのフラグメントを生成するクローンが同定された。２つのプライマーのシリーズ（表ＩＶ）は、ＡＴＴＢ１とＡＴＴＢ２の組換え部位（前記発現ベクター内に組み込むのに必要）を、ＯＲＦを含むインサートのそれぞれ５’末端と３’末端に付加するために設計された。最初のプライマーのシリーズ（ＥＸ１シリーズ）において、独自(original)のＯＲＦ特異的ＣＬプライマーは、５’末端に配列AAGCAGGCTTCGCCACC（フォワードプライマー用）又はGTGATGGTGATGGTG（リバースプライマー用であるが、終止コドンに相補的なヌクレオチドを排除した後のためもの）を５’末端に付加することによって改変された。第二のプライマーのシリーズ（ＥＸ２シリーズ）において、独自のＯＲＦ特異的ＣＬプライマーは、GGGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTTCGCCACC（フォワードプライマー用）又はGGGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTTTCAATGGTGATGGTGATGGTG（リバースプライマー用であるが、終止コドンに相補的なヌクレオチドを排除した後のためもの）を５’末端に付加することによって改変された。これらのリバースプライマーは６−ヒスチジンタグ用のコドンを含み、これは続いて、それらのＣ末端でのＯＲＦとのインフレームでの融合をもたらす。
【０１１５】
ＰＣＲ増幅は、２つの連続反応で実施された。最初のものは、以下の成分を混合することによって実施した（二回蒸留した水の中で合計５０μｌの体積）：
２５ｎｇのｐＣＲＴＯＰＯ−ＯＲＦベクター
５ｍＭのｄＮＴＰ(Invitrogen)
０．５μｌのＰｆｘＤＮＡポリメラーゼ(Invitrogen)
０．５μｌの各ＥＸ１プライマー（１００μＭ）
５μｌのＰｆｘポリメラーゼバッファー１０ｘ(Invitrogen)
【０１１６】
当該ＰＣＲ反応は、９５℃で２分間の最初の変性段階、続いて、
９４℃で１５秒間
６８℃で３０秒間
の１０サイクル、を用いて実施した。
【０１１７】
ＰＣＲ産物は、Ｗｉｚａｒｄ  ＰＣＲプレップＤＮＡ精製システム(Promega)を用いて精製され、そして、鋳型として以下の成分を含む第二のＰＲＣ反応に添加された（二回蒸留した水の中で合計５０μｌの体積）：
１０μｌの精製ＰＣＲ産物
５ｍＭのｄＮＴＰ(Invitrogen)
０．５μｌのＰｆｘＤＮＡポリメラーゼ(Invitrogen)
０．５μｌの各ＥＸ２プライマー（１００μＭ）
５μｌのＰｆｘポリメラーゼバッファー１０ｘ(Invitrogen)
【０１１８】
当該ＰＣＲ反応は、９５℃で１分間の最初の変性段階、続いて、
９４℃で１５秒間
５０℃で３０秒間
６８℃で３分３０秒間
の４サイクル、を用いて実施した。
【０１１９】
続いて、以下の条件が２５サイクル適用された：
９４℃で１５秒間
５５℃で３０秒間
６８℃で３分３０秒間。
【０１２０】
前記ＰＣＲ反応から生じるＤＮＡフラグメントは、前述のように精製され、そしてＧａｔｅｗａｙシステムを用いてｐＥＡＫ１２ｄベクター内にて組み換えられた。
【０１２１】
最初に、以下の１０μｌの反応液を構築した：
ｐＤＯＮＲ−２０１（０．１μｇ／μｌ）            １．５μｌ
ＰＣＲ産物                                        ５    μｌ
ＢＰバッファー                                    ２    μｌ
ＢＰ酵素ミックス                                  １．５μｌ
【０１２２】
室温で１時間インキュベートした後、プロテイナーゼＫ（１μｌ、２μｇ）を添加し、そして３７℃で更に１０分間インキュベートすることによって反応を停止させた。
【０１２３】
この反応液のアリコート（２μｌ）を、エレクトロポレーションによりＥ．コリ細胞（菌株ＤＨ１０Ｂ）を形質転換するのに使用した。プラスミドＤＮＡは、各ＯＲＦにつき４個のクローンが調製され、そして：
ｐＥＡＫ１２ｄ（０．１μｇ／μｌ）                １．５μｌ
プラスミドＤＮＡ                                  １．５μｌ
ｄｄＨ2Ｏ                                         ３．５μｌ
ＬＲバッファー                                    ２    μｌ
ＬＲ酵素ミックス                                  １．５μｌ
を含む、対応する１０μｌの組換え反応に使用した。
【０１２４】
室温で１時間インキュベートした後、プロテイナーゼＫ（１μｌ、２μｇ）を添加し、そして３７℃で更に１０分間インキュベートすることによって反応を停止させた。この反応液のアリコート（１μｌ）を、エレクトロポレーションによりＤＨ１０Ｂ  Ｅ．コリ細胞を形質転換するのに使用した。正確なインサートを含むクローンは、フォワード及びリバースベクタープライマーｐＥＡＫ１２ｄ  Ｆ１(GCCAGCTTGGCACTTGATGT)及びｐＥＡＫ１２ｄ  Ｒ１(GATGGAGGTGGACGTGTCAG)を用いて、３個のコロニー上でコロニーＰＣＲを実施することによって最初に同定し、続いて当該インサートを同じプライマーで配列決定することによって確認した。
【０１２５】
実施例３：６−ヒスチジンタグ付きケモカイン様ポリペプチドの哺乳類細胞における発現及び精製
エプスタイン−バーウイルス核抗原を発現するヒト胚性腎細胞（ＨＥＫ２９３−ＥＢＮＡ）を、トランスフェクション前に１６〜２０時間、Ｔ２２５フラスコ（５０ｍｌ、２ｘ１０5細胞／ｍｌの密度）中に播種し、陽イオン性ポリマー試薬ＪｅｔＰＥＩ（商標）（PolyPlus−トランスフェクション；２μｌ／μｇのプラスミドＤＮＡ）を用いてトランスフェクションを実施した。各フラスコにつき、ＣｓＣｌを用いて調製した(Sambrook, J et al."Molecular Cloning, a laboratory manual"; 2nd edition. 1989; Cold Spring Harbor Laboratory Press)、１１３μｇのＯＲＦ特異的ｐＲＡＫ１２ｄプラスミドを、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）を発現するポジティブコントロールとしての２．３μｇのプラスミドと一緒に同時トランスフェクションした。２３０μｌのＪｅｔＰＥＩ（商標）溶液中で希釈したプラスミドを、４．６ｍｌのＮａＣｌ１５０ｍＭに添加し、ボルテックスにかけ、そして室温で３０分間インキュベートした。このトランスフェクションミックスを、続いてＴ２２５フラスコに添加し、そして６日間３７℃でインキュベートした。培養液のアリコートを続いてＵＶ照射に曝露させ、ＧＦＰ蛍光を評価することによってトランスフェクション効率を調べた。
【０１２６】
前記プラスミドでトランスフェクションしたＨＥ２９３−ＥＢＮＡ細胞からの培養液をプールし、そして１００ｍｌの培養液を、１００ｍｌの氷冷バッファーＡ（５０ｍＭのＮａＨ2ＰＯ4；６００ｍＭのＮａＣｌ；８．７％（ｗ／ｖ）のグリセロール、ｐＨ７．５）（これは、Ｈｉｓタグ付きタンパク質がその後固定化され、そして溶出されたアフィニティーカラムを平衡化するために使用する同一のバッファーである）で２００ｍｌに希釈した。溶液を０．２２μｍの滅菌フィルター(Millipore)を通過させて濾過し、そして次の処理まで２５０ｍｌの四角い滅菌培養瓶中で４℃で維持した。
【０１２７】
２つの連続的なクロマトグラフィー手順が、ＶＩＳＩＯＮワークステーション（ＢｉｏＣＡＤ（商標）シリーズ）、ＰＯＲＯＳ（商標）クロマトグラフィー媒体、及び外付け２５０ｍｌサンプルローダー(Labomatic)を含むＨＰＬＣベースの系（パーフュージョンクロマトグラフィー（商標）、PerSeptive Biosystems）を用いて４℃で試料に適用された。
【０１２８】
最初のクロマトグラフィー段階において、Ｎｉ−金属アフィニティーカラム（０．８３ｍｌ、ＰＯＲＯＳ  ２０ＭＣ）を最初に３０カラムボリュームのＥＤＴＡ溶液（１００ｍＭのＥＤＴＡ；１ＭのＮａＣｌ；ｐＨ８．０）で再生し、そして次に１５カラムボリュームのＮｉ溶液（１００ｍＭのＮｉＳＯ4）で洗浄しながらＮｉイオンを再充填した。カラムを続いて１０カラムボリュームのバッファーＡ、７カラムボリュームのバッファーＢ（５０ｍＭのＮａＨ2ＰＯ4；６００ｍＭのＮａＣｌ；８．７％（ｗ／ｖ）のグリセロール、４００ｍＭ；イミダゾール、ｐＨ７．５）で洗浄し、そして最終的に１５ｍＭのイミダゾールを含む１５カラムボリュームのバッファーＡで平衡化した。サンプルローダーは、タンパク質含有溶液を、Ｎｉ金属アフィニティーカラム上に１０ｍｌ／分の流速で充填した。カラムは、続いて１２カラムボリュームのバッファーＡ、その後、Ｎｉカラムにゆるく付着している混入タンパク質の溶出を可能にする濃度のイミダゾール（２０ｍＭ）を含む２８カラムボリュームのバッファーＡで洗浄した。Ｈｉｓタグ付きタンパク質は、最終的に、１０カラムボリュームのバッファーＢにより２ｍｌ／分の流速で溶出され、１．６ｍｌの画分で回収される。
【０１２９】
第二のクロマトグラフィー段階において、ゲル濾過カラム（１０ｍｌのＧ−２５セファデックス）を２ｍｌのバッファーＤ（１３７ｍＭのＮａＣｌ；２．７ｍＭのＫＣｌ；１．５ｍＭのＫＨ2ＰＯ4；８ｍＭのＮａ2ＨＰＯ4；１ｍＭのＮａＣｌ；ｐＨ７．２）で再生し、そして次に、Ｎｉカラムピーク画分をこのカラム上に注入する前に２カラムボリュームのバッファーＣ（１３７ｍＭのＮａＣｌ；２．７ｍＭのＫＣｌ；１．５ｍＭのＫＨ2ＰＯ4；８ｍＭのＮａ2ＨＰＯ4；２０％（ｗ／ｖ）のグリセロール；ｐＨ７．４）で平衡化した。試料をバッファーＣで溶出し、そして脱塩された試料を２．２ｍｌの画分で回収する。当該ゲル濾過カラム由来のピーク画分を０．２２μｍの滅菌遠心フィルター(Millipore)を介して濾過し、そして平行して、アリコート（２０μｌ）をＳＤＳ−ＰＡＧＥ（４〜１２％ＮｕＰＡＧＥゲル；Novex）上でクーマシー染色により、そしてヒスチジンタグを認識する抗体を用いるウェスタンブロットにより解析した。タンパク質濃度は、ＢＣＡタンパク質アッセイキット(Pierce)及びウシ血清アルブミンをスタンダードとして用いて、クーマシー染色により検出可能なタンパク質バンドを示す試料中で決定された。
【０１３０】
ウェスタンブロット解析用のゲルは、２９０ｍＡで、4℃で1時間ニトロセルロース膜にエレクトロトランスファーした。膜を５％スキムミルク／ＰＢＳ（１３７ｍＭのＮａＣｌ；２．７ｍＭ  のＫＣｌ；１．５ｍＭのＫＨ2ＰＯ4；８ｍＭのＮａ2ＨＰＯ4；ｐＨ７．４）でブロッキングし、そしてその後２つのウサギポリクローナル抗ヒスチジンタグ抗体（Ｇ−１８及びＨ−１５、各０．２μｇ／ｍｌ；Santa Cruz）の混合物と一緒に４℃で一晩インキュベートした。更に1時間室温でインキュベーションした後、膜を０．１％Ｔｗｅｅｎ−２０含有ＰＢＳで洗浄し（３ｘ１０分）、そして次に二次ＨＲＰ−複合抗ウサギ抗体（ＤＡＫＯ）に対し室温で２時間暴露した。０．１％Ｔｗｅｅｎ−２０含有ＰＢＳ中で洗浄（３ｘ１０分）した後、ＥＣＬキット(Amersham Pharmacia)を使用して膜に固定された抗体を検出し、フィルムとクーマシー染色したゲルのイメージとを比較した。
【０１３１】
実施例４：ケモカイン様ポリペプチドの確認及び特徴付けのための細胞−及び動物−ベースのアッセイ
細胞培養物又は動物モデルを用いてケモカインの特異性、効力、及び有効性を試験するために複数のアッセイ、例えば、in vitro走化性アッセイ(Proudfoot AE et al., 2001; Lusti-Narasimhan M et al., 1995)、又はマウス耳介膨脹(Garrigue JL et al., 1994)が展開された。有用なツール及び生成物（抗体、トランスジェニック動物、放射性標識タンパク質等）をもたらすための多数の他のアッセイ及び技術は、ケモカインに対して貢献する概説及び本において記載されており(Methods Mol. Biol vol. 138, "Chemokines Protocols", edited by Proudfoot Al et al., Humana Press Inc., 2000; Methods Enzymol, vol. 287 and 288, Academic Press, 1997)、そして、より正確には、本発明のケモカイン様ポリペプチド及び関連試薬の生物学的活性を、可能性のある治療又は診断方法及び使用と関連して証明するために使用されうる。
【０１３２】
【表１】
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【０１３３】
【表２】
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【０１３４】
【表３】
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【０１３５】
【表４】
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【０１３６】
【表５】
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【０１３７】
【表６】
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【０１３８】
【表７】
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【０１３９】
【表８】
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【図面の簡単な説明】
【０１４０】
【図１】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿１７５４（配列番号１）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ１７５４（配列番号２）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。矢印は、ＯＲＦ配列におけるプライマーＣＬ＿１７５４＿５（フォワード）及びＣＬ＿１７５４＿３（リバース）の位置を示す。
【図２】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿０７１１（配列番号３）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ０７１１（配列番号４）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。矢印は、ＯＲＦ配列におけるプライマーＣＬ＿０７１１＿５（フォワード）及びＣＬ＿０７１１＿３（リバース）の位置を示す。
【図３】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿２８８２（配列番号５）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ２８８２（配列番号６）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。
【図４】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿４７１１（配列番号７）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ４７１１（配列番号８）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。
【図５】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿４３２０（配列番号９）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ４３２０（配列番号１０）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。矢印は、ＯＲＦ配列におけるプライマーＣＬ＿４３２０＿５（フォワード）及びＣＬ＿４３２０＿３（リバース）の位置を示す。
【図６】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿５００８（配列番号１１）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ５００８（配列番号１２）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。矢印は、ＯＲＦ配列におけるプライマーＣＬ＿５００８＿５（フォワード）及びＣＬ＿５００８＿３（リバース）の位置を示す。
【図７】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿０２１０（配列番号１３）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ０２１０（配列番号１４）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。矢印は、ＯＲＦ配列におけるプライマーＣＬ＿０２１０＿５（フォワード）及びＣＬ＿０２１０＿３（リバース）の位置を示す。
【図８】ＤＮＡ配列ＧＮＳＱ＿４９２２（配列番号１５）に含まれるＯＲＦとタンパク質配列ｐ４９２２（配列番号１６）のアラインメント。予測されるＮ末端のシグナル配列を四角で囲む。予測されるＣ末端のアルファヘリックスに下線を引く。独自の選択基準に合致しているコドンを§で示す。矢印は、ＯＲＦ配列におけるプライマーＣＬ＿４９２２＿５（フォワード）及びＣＬ＿４９２２＿３（リバース）の位置を示す。
【図９】ヒトＣＸＣＬケモカインと、本発明のＣＸＣケモカイン様タンパク質配列ｐ１７５４（配列番号２）、ｐ０７１１（配列番号４）、ｐ２８８２（配列番号６）、ｐ０２１０（配列番号１４）、及びｐ４９２２（配列番号１６）、とのアラインメント。以下のヒトＣＸＣＬケモカインを考慮した：ＣＸＣＬ１（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ０９３４１）、ＣＸＣＬ２（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ１９８７５）、ＣＸＣＬ３（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号ＮＰ＿００２０８１）、ＣＸＣＬ４（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号ＮＰ＿００２６１０）、ＣＸＣＬ５（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ４２８３０）、ＣＸＣＬ６（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ８０１６２）、ＣＸＣＬ７（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ０２７７５）、ＣＸＣＬ８（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ１０１４５）、ＣＸＣＬ９（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｑ０７３２５）、ＣＸＣＬ１０（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ０２７７８）、ＣＸＣＬ１１（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｏ１４６２５）。タンパク質配列は、３つの主要な領域：Ｎ末端領域（シグナル配列を含む）、中心のＣｙｓリッチ領域（独自の選択基準に合致し、且つ§で示す保存されたシステインを含む）、及びＣ末端領域（予測されるアルファヘリックスを含む）に従い分けられる。
【図１０】ヒトＣＣＬケモカインと、本発明のＣＸＣケモカイン様タンパク質配列ｐ４７１１（配列番号８）、ｐ４３２０（配列番号１０）及びＧＮＳＱ＿５００８（配列番号１２）、とのアラインメント。以下のヒトＣＣＬケモカインを考慮した：ＣＣＬ１（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ２２３６２）、ＣＣＬ２（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ１３５００）、ＣＣＬ３（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ１０１４７）、ＣＣＬ４（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ１３２３６）、ＣＣＬ５（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ１３５０１）、ＣＣＬ７（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ８００９８）、ＣＣＬ８（ＳＷＩＳＳＰＲＯＴアクセッション番号Ｐ８００７５）。タンパク質配列は、３つの主要な領域：Ｎ末端領域（シグナル配列を含む）、中心のＣｙｓリッチ領域（独自の選択基準に合致し、且つ§で示す保存されたシステインを含む）、及びＣ末端領域（予測されるアルファヘリックスを含む）に従い分けられる。
【図１１】ｐＥＡＫ１２ｄ発現ベクターのマップ。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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