(57)【要約】成長ホルモン受容体（ＧＨＲ）タンパク質に結合可能な薬剤に対する対象の反応を生成する方法は、ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象に存在するか不存在であるかを判定して、それによって、この薬剤による治療に対して反応する可能性が増大または減少している対象を特定することを含み、上記アレルは、この薬剤に対する陽性反応の増大または減少がある可能性と相関している。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項２】
対象の身長または成長速度を増大させる薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項３】
肥満症を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項４】
感染症を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項５】
糖尿病を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項６】
先端巨大症または巨人症状態を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項７】
ナトリウム貯留または水貯留に関連した状態を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項８】
代謝症候群を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項９】
気分障害または睡眠障害を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項１０】
癌を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項１１】
心臓病を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項１２】
高血圧を処置する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子のアレルが該対象中に存在するか不存在であるかを判定することを含み、該アレルは、該薬剤に対する増大又は減少した陽性反応をもつ可能性と相関しており、それによって、該対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認することを特徴とする予測方法。
【請求項１３】
ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による障害または状態の処置の可能性が増大または減少している対象を確認する方法であって、
ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルの存在を、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤に対する対象の反応と相関させること；及び、
ｂ）対象におけるステップａ）のアレルを検出して、それによって、対象が該薬剤による処置に対して反応する可能性の増大または減少をもつことを確認すること
を含む確認方法。
【請求項１４】
ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による障害または状態の処置の増大または減少している可能性に相関したＧＨＲ遺伝子中のアレルを確認する方法であって、
ａ）対象におけるＧＨＲ遺伝子のアレルの存在を判定すること；及び、
ｂ）ステップ（ａ）のアレルの存在を、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による障害または状態の処置の増大または減少している可能性と相関させて、それによって、該薬剤による処置に対する反応の増大または減少している可能性に相関したアレルを確認すること
を含む確認方法。
【請求項１５】
ＧＨＲタンパク質に結合可能な前記薬剤が、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；先端巨大症もしくは巨人症状態、またはそれに関連した乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響；ナトリウム貯留または水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された障害を治療できる薬剤である請求項１、１３または１４に記載の方法。
【請求項１６】
対象の成長を増進させる方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する対象の成長を増進できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、対象の成長を増進できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする対象の成長を増進させる方法。
【請求項１７】
肥満症に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する肥満症またはその症候を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、肥満症またはその症候を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする肥満症に罹患している対象を治療する方法。
【請求項１８】
糖尿病に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する糖尿病またはその症候を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、糖尿病またはその症候を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする糖尿病に罹患している対象を治療する方法。
【請求項１９】
感染症に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する感染症またはその症候を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、感染症またはその症候を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする感染症に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２０】
先端巨大症または巨人症状態に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する先端巨大症もしくは巨人症状態、またはそれに関連した乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、先端巨大症もしくは巨人症状態、またはそれに関連した乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする先端巨大症または巨人症状態に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２１】
ナトリウム貯留異常または水貯留異常に関連した状態に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する該ナトリウム貯留異常または水貯留異常に関連した状態を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、該ナトリウム貯留異常または水貯留異常に関連した状態を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とするナトリウム貯留異常または水貯留異常に関連した状態に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２２】
代謝症候群に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する該代謝症候群またはその症候を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、該代謝症候群またはその症候を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする代謝症候群に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２３】
気分障害または睡眠障害に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する該気分障害もしくは睡眠障害、またはその症候を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、該気分障害もしくは睡眠障害、またはその症候を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする気分障害または睡眠障害に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２４】
癌に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する癌を治療できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、癌を治療できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする癌に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２５】
心臓病または高血圧に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象中に存在するか不存在であるかを判定すること；及び、
（ｂ）該対象に投与する該心臓病もしくは高血圧、またはその症候を改善できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、該アレルは、該心臓病もしくは高血圧、またはその症候を改善できる薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関していることを特徴とする心臓病または高血圧に罹患している対象を治療する方法。
【請求項２６】
（ｃ）前記薬剤の前記有効量を前記対象に投与することをさらに含む請求項１６乃至２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
前記方法が、対象のＤＮＡがエキソン３に欠失を有するＧＨＲポリペプチドをエンコードするかどうか判定することを含む前記請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
前記方法が、対象中にＧＨＲｄ３アレルが存在するか不存在であるかを判定することを含む前記請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
対象が、ＧＨＲｄ３アレルに関してへテロ接合体であるかホモ接合体であるかを判定することを含む請求項２７または２８記載の方法。
【請求項３０】
前記判定ステップが、試料中におけるＧＨＲｄ３核酸の検出を含む請求項２７乃至２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記判定ステップが、ハイブリダイゼーションアッセイの実施をさらに含む請求項３０記載の方法。
【請求項３２】
前記判定が、試料中におけるＧＨＲｄ３ポリペプチドの検出を含む請求項２７乃至２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３３】
前記判定ステップが、試料中のＧＨＲｄ３ポリペプチドに対する抗体の結合を検出することを含む請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記対象がヒト対象である、前記請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３５】
前記対象がＩＳＳを有する、請求項１６記載の方法。
【請求項３６】
前記対象の身長が、その年齢および性別における正常値より標準偏差の約２倍分低い身長よりさらに低い請求項１６記載の方法。
【請求項３７】
前記対象の身長が、その年齢および性別における正常値より標準偏差の約２倍分低い身長よりさらに低いかどうか検出することをさらに含む請求項１６または２６記載の方法。
【請求項３８】
前記薬剤が、組換え成長ホルモンポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは変種である前記請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
ＧＨの有効量が、約０．２ｍｇ／ｋｇ／週より多い量である請求項３８記載の方法。
【請求項４０】
ＧＨの有効量が、約０．２５ｍｇ／ｋｇ／週より多い量である請求項３８記載の方法。
【請求項４１】
ＧＨの前記有効量が、約０．３ｍｇ／ｋｇ／週以上である請求項３８記載の方法。
【請求項４２】
ＧＨの有効量が、約０．００１ｍｇ／ｋｇ／日と約０．２ｍｇ／ｋｇ／日との間である請求項３８記載の方法。
【請求項４３】
ＧＨの有効量が、約０．０１ｍｇ／ｋｇ／日と約０．１ｍｇ／ｋｇ／日との間である請求項３８記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、成長ホルモン受容体に作用する薬剤に対する、対象(subject)の治療反応の程度を予測する方法に関する。好ましい態様には、低身長のヒト対象における身長を増大させる方法と、肥満症および先端巨大症を治療する方法とが含まれる。
【背景技術】
【０００２】
有意に低身長である子供の大部分は、誘発的な刺激に対するＧＨ反応によって、古典的に定義される成長ホルモン欠乏症（ＧＨＤ）ではない。公知である低身長の原因が除外されると、その後、これらの対象は、家族性低身長、体質性発育遅延、「特発性」低身長（ＩＳＳ）を含めた様々な用語で分類される。標準的な大きさの両親に生まれた背の低い子供の場合は、「子宮内発育遅延」（ＩＵＧＲ）と呼ばれる。出産予定日に生まれた背の低い子供は、「不当軽小児」（ＳＧＡ）と呼ばれる。大規模な経時的研究による結果は報告されていないが、これらの子供の一部、そして、おそらく多数は、彼らにとって遺伝的に可能な身長に達しない。正常な発育および発達に寄与する因子は多数あるので、定義によってＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡとされている対象も、彼らの低身長の病因に関しては種々様々なようである。古典的にはＧＨ欠損ではないが、ＩＳＳの子供のほとんどが、すべてが同様に良い反応を示すのではないにしても、ＧＨによる治療に反応する。
【０００３】
このセットの対象における自発性ＧＨ分泌障害を、多くの研究者が探索している。これらの対象の一部は、生理的条件下における内在性ＧＨの分泌が不適切であるが、伝統的なＧＨ刺激テストで見られるように、薬理刺激に反応したＧＨの上昇を示すことができると示唆する仮説もある。この障害は「ＧＨ神経分泌機能不全」と呼ばれており、その診断は、持続的な血清試料採取を行った際の循環ＧＨパターンの異常を実証することに基づいて行われる。多数の研究者がそのような研究の結果を報告しており、このような異常がまれにしかないと判明した。他の研究者は、これらの対象が「生物不活性（ｂｉｏｉｎａｃｔｉｖｅ）ＧＨ」を有すると仮定したが、これはまだ最終的に実証されていない。
【０００４】
成長ホルモン受容体（ＧＨＲ）がクローニングされた際に、血中の主要なＧＨ結合活性が、ＧＨＲと同一の遺伝子に由来した、完全長ＧＨＲの細胞外ドメインに対応するタンパク質によることが示された。成長ホルモン非感受性（または、ラロン）症候群（ＧＨＩＳ）の対象はほとんどすべてが、成長ホルモン受容体結合活性を欠損しており、さらに血中のＧＨ結合タンパク質（ＧＨＢＰ）活性をもたないか、ごくわずかにしかもたない。そのような対象は、平均身長標準偏差スコア（ＳＤＳ）が約−５から−６であり、ＧＨ治療に対して耐性を有し、そして、ＧＨ血清中濃度の増大と、インシュリン様成長因子（ＩＧＦ−Ｉ）血清中濃度の低下とを示す。彼らはＩＧＦ−Ｉによる治療に反応を示す。ＧＨＲの細胞外ドメインに欠損を有する対象では、循環中の機能的ＧＨＢＰの欠如を、ＧＨ非感受性のマーカーとして用いることができる。
【０００５】
外来性のＧＨで治療されたＩＳＳの対象は、治療に対して、様々な程度の反応を示した。詳細には、多くの子供は、ＧＨ治療にある程度反応を示すが、完全には示さない。これらの対象には、成長速度に増大があるが、それは完全な反応を示す子供の約半分の増大にすぎない。したがって、一連の治療の後における子供の身長の全増加は、完全な反応を示す子供に比べて減少しているが、これは治療時間に応じたものとなっている。完全な反応を示さない対象のおける治療を改善する１つの方法は、ＧＨ用量を増大させることであり、それによって、成長速度と、身長の全増加とがいくらか改善される結果となった。しかし、副作用の可能性があるので、ＧＨ用量の増大がすべての対象に望ましいわけではない。また、ＧＨ用量の増大には、費用の増加も伴う。残念ながら、現在のところ、長期にわたる治療期間および観測期間の前に、反応性が乏しいであろう対象を確認する方法はない。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
したがって、ＧＨによる治療に対して反応率が低下している対象サブセットを特定するのに使用できる方法が、当技術分野で必要とされている。また、外来性ＧＨに対する反応性が低下した対象を治療する改善された薬物の開発を可能にする方法も必要である。また、当技術分野では、ＧＨに対して反応率が増大している対象サブセットの特定に使用できる方法の必要性、および、ＧＨに対する反応が増大している対象を治療する改善された薬物の開発を可能にする方法の必要性もある。
【０００７】
対象には、例えば、低身長の個体、または肥満症、感染症、もしくは糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響と関連するかもしれない先端巨大症もしくは巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧に罹患している個体が含まれうる。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明は、エキソン（ｅｘｏｎ）３欠失を有する成長ホルモン受容体（ＧＨＲ）アレル（ＧＨＲｄ３）を保持するヒト対象が、ＧＨＲｄ３アレルを保持しない対象より、ＧＨＲ経路を介して作用する薬剤による治療に対して、より大きな陽性反応を示すという発見に基づいている。詳細には、ＧＨＲｄ３アレルを保持する対象は、組換え成長ホルモン（ＧＨ）による治療に対して、ＧＨＲｄ３アレルを保持しない対象より大きな陽性反応を示した。組換えＧＨによる一連の治療によって、ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合であるＩＳＳ対象に比べて、ほぼ倍の成長速度の増加が、ＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡの対象、およびＧＨＲｄ３を保持する対象にもたらされた。これらの対象の全身長変化は、この効果に比例して増加している。
【０００９】
ＧＨ活性は、上記に論じたＧＨ受容体（ＧＨＲ）によって媒介される。２分子のＧＨＲが、１分子のＧＨと相互作用することが示されている（Cunninghamら（1991年）、Science、第254巻、821〜825ページ；de Vosら（1992年）、Science、第255巻、306〜312ページ；Sundstromら（1996年）、J.Biol.Chem.、第271巻、32197〜32203ページ；および、Clacksonら（1998年）、J.Mol.Biol.、第277巻、1111〜1128ページ）。結合は、ＧＨ表面にある２箇所の特異的なＧＨＲ結合部位と、２つの受容体の細胞外ドメインにある共通の結合ポケットとで起こる。ＧＨ分子の部位１は、部位２より高い親和性を有し、受容体二量体化は逐次的に、ＧＨの部位１に受容体の１つが結合し、それに続いて第２の受容体が部位２に動員されて起こると考えられている。Cunninghamら（1991年、同上）は、受容体二量体化がシグナル活性化を導く主要イベントであること、そして、この二量体化がＧＨ結合によって駆動されると提案した（Rossら、J.Clin.Endocrinol.& Metabolism（2001年）、第86(4)巻、1716〜171723ページ）。リガンドの結合によって、ＧＨＲは迅速に内部移行し（Maamraら（1999年）、J.Biol.Chem.、第274巻、14791〜14798ページ；および、Hardingら（1996年）、J.Biol.Chem.、第271巻、6708〜6712ページ）、その一部は細胞表面に再循環される（Roupasら（1987年）、Endocrinol.、第121巻、1521〜1530ページ）。
【００１０】
さらに最近になって、エキソン３の欠失を含有する、ＧＨＲｄ３と呼ばれるＧＨＲアイソフォームが発見された（Urbanek Mら、Mol Endocrinol、1992年2月、第6(2)巻、279〜87ページ；Godowskiら（1989年）、PNAS USA、第86巻、8083〜8087ページ）。この欠失は、完全長ＧＨＲｆｌアイソフォームまたはエキソン３が除外されているＧＨＲｄ３アイソフォームに対応する、エキソン３の除外または保持を導く選択的スプライシングイベントの結果であると考えられていた。ＧＨＲｄ３アイソフォームの同定の後、いくつかの相容れない結果が続いた。いくつかの報告は、発現パターンが発生に応じて調節される組織特異的なスプライシングをＧＨＲｄ３アイソフォームが受けたと提案し、他の報告は、ＧＨＲｄ３アイソフォームが個体に特有のものであったと提案した。別の報告は、メンデル形質として伝達され、スプライシングを変化させる遺伝的多型からスプライシングが生じたことを示唆した（Stallings-Mannら（1996年）、P.N.A.S U.S.A.、第94巻、12394〜12399ページ）。最後に、Pantelら（（2000年）、J.Biol.Chem.、第275(25)巻、18664〜18669）は、ＧＨＲ遺伝子座の分析において、ヒトでは、エキソン３にまたがる２．７ｋｂのゲノム欠失を有するＧＨＲアレルから、ＧＨＲｄ３アイソフォームが転写されることを実証した。さらにＰａｎｔｅｌは、ＧＨＲｆｌのみを発現する個体からのゲノムＤＮＡ試料には、２つのフランキングレトロエレメントを同定したが、ＧＨＲｄ３を発現する個体のＤＮＡには、１つのレトロエレメントのみを同定しており、このことは、エキソン３欠失が、同一のＧＨＲｆｌアレルに位置する２つのレトロエレメント間の相同組換イベントの結果であることを示唆する。
【００１１】
ｈＧＨＲｄ３タンパク質は、受容体細胞外ドメイン内に２２アミノ酸の欠失がある点で完全長ｈＧＨＲ（ＧＨＲｆｌ）と相違している。ＧＨＲｄ３アイソフォームは、安定かつ機能的なＧＨＲタンパク質（Ｕｒｂａｎｅｋら（１９９３年）、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．、第２６８（２５）巻、１９０２５〜１９０３２ページ）をエンコードする。Ｕｒｂａｎｅｋら（１９９３年）は、ＧＨＲｄ３アイソフォームが細胞膜に安定に組み込まれ、ｈＧＨＲと同様に効率的にリガンドに結合して、内部移行すると報告したが、ＧＨＲｆｌアイソフォームとの機能的な相違は特定されなかった。
【００１２】
本発明は、外来性ＧＨに対する陽性反応の相違に寄与する重要因子として、ＧＨＲアレルおよびアイソフォームを同定することに関する。したがって、本発明は、ＧＨＲ経路を介して作用する化合物、または、好ましくは、ＧＨ組成物など、ＧＨＲに結合する化合物による治療に対する陽性反応の程度を予測する方法を提供する。これらの方法は、患者を先験的に、例えば、反応性の高い患者、または反応性の低い患者として分類することを可能にするものである。特定の対象に適応させた治療が可能となることによって、経済的利益および／または副作用の軽減がもたらされる（例えば、適切な用量のＧＨ組成物の使用から、または、対象がそれに対して低減したＧＨＲ反応を示さない化合物の使用から）。
【００１３】
本発明は、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌアレルのヘテロ接合である対象が、ＧＨによる治療に反応して、ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合である対象より大きな、成長速度および身長の変化を示すことも実証する。したがって、本発明は、ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合である個体におけるＧＨＲ反応またはＧＨＲ活性の低減を検出して、診断する方法を提供する。ＧＨＲ活性の低減は、例えば、ＧＨＲレベル、発現、またはタンパク質活性の低減の結果でありうる。また、ＧＨＲｄ３アレルに関してホモ接合またはヘテロ接合である個体におけるＧＨＲ反応またはＧＨＲ活性の増大を検出して、診断する方法も提供する。ＧＨＲ活性の増大または低減を検出することは、ＧＨＲ経路を介して作用する治療薬を用いて治療可能な様々な障害の治療に有用であると予測されている。例としては、低身長（例えば、好ましくはＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡ）、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧の治療が含まれる。好ましい例には、ＧＨＲアゴニストまたはアンタゴニストとして作用する組換えＧＨ組成物など、ＧＨＲタンパク質に結合する薬剤が含まれる。
【００１４】
したがって、本発明は、治療に対するＧＨＲ反応を予測する方法、およびＧＨＲ活性の低減に関連した状態を診断する方法、またはその危険性がある対象を確認する方法を含めた、ＧＨＲに媒介された活性を測定または予測する方法を提供する。本発明は、ＧＨＲポリペプチドと相互作用（例えば、結合）可能な薬剤に対する対象の反応を予測する方法を提供することが好ましい。
【００１５】
したがって一態様では、本発明は、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子アレルが対象に存在するか、存在しないかを判定して、それによって、上記薬剤による治療に反応する可能性が増大または低減しているものとして上記対象を確認することを含み、上記薬剤に対する陽性反応の増大または低減がある可能性と、上記アレルが相関している方法を開示する。
【００１６】
本発明は、低身長（例えば、好ましくは、ＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡ）、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連しうる先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された状態を治療する薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子アレルが対象に存在するか、存在しないかを判定して、それによって、上記薬剤による治療に反応する可能性が増大または低減しているものとして上記対象を確認することを含み、上記薬剤に対する陽性反応が増大または低減している可能性と、上記アレルが相関している方法も提供する。好ましい態様では、本発明は、対象の身長を増大させる薬剤に対する対象の反応を予測する方法であって、ＧＨＲ遺伝子アレルが対象に存在するか、存在しないかを判定して、それによって、上記薬剤による治療に反応する可能性が増大または低減しているものとして上記対象を確認することを含み、上記薬剤に対する陽性反応が増大または低減している可能性と、上記アレルが相関している方法を提供する。
【００１７】
本発明の方法は、好ましくは、１つもしくは複数の核酸の欠失、挿入または置換をエキソン３に有するＧＨＲアレル、また、最も好ましくは、実質上エキソン３全体の欠失を有するＧＨＲアレルが対象に存在するか、存在しないか判定することを含む。
【００１８】
また、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による、障害または状態の治療の可能性が増大または減少している対象を確認する方法であって、
ａ）ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤に対する対象の反応と、ＧＨＲ遺伝子のアレルの存在を相関させること；および、
ｂ）対象におけるステップａ）のアレルを検出して、それによって、上記薬剤による治療に反応する可能性が増大または低減している対象を確認すること
を含む方法も提供する。
【００１９】
さらに別の態様では、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による、障害または状態の治療の可能性が増大または減少していることに関連した、ＧＨＲ遺伝子中のアレルを確認する方法であって、
ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象に存在するか判定すること；および、
ｂ）ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による、障害または状態の治療の可能性の増大または低減と、ステップ（ａ）のアレルの存在を相関させ、それによって、上記薬剤による治療に対する反応が増大または減少している可能性と関連したアレルを確認すること
を含む方法が包含される。
【００２０】
上記障害または状態は、低身長（例えば、好ましくは、ＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡ）、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された状態でありうる。
【００２１】
最も好ましくは、本発明の方法は、ＧＨＲ遺伝子エキソン３における対象の遺伝子型を判定することを含み、ＧＨＲ反応の低減に関連した状態を上記対象が患っているか、もしくはその危険性が増大していることを、エキソン３の存在が示すか、または、ＧＨＲ反応の低減に関連した状態を上記対象が患う危険性が低下していることを、エキソン３の欠失が示す。
【００２２】
本発明の方法は、治療方法で特に有利に用いることができる。上記遺伝子型は、上記治療の有効性または治療効果を示すものが好ましい。一例において、本発明の方法は、対象に投与される薬物の量を決定するのに用いられる。別の例において、この方法は、臨床試験における対象の治療反応を評価するか、または臨床試験に含まれる対象を選択するのに用いられる。例えば、本発明の方法は、ＧＨＲ遺伝子のエキソン３における対象の遺伝子型を判定して、上記遺伝子型によって、上記対象を、臨床試験におけるサブグループか、または臨床試験に含めるためのサブグループに割り振ることが含まれうる。
【００２３】
また、本発明は、対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子アレルが対象に存在するか、存在しないか判定すること；  及び、
（ｂ）上記対象に投与するＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤、またはＧＨＲ経路を介して作用可能な薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、上記アレルが、該薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関している対象を治療する方法を提供する。
【００２４】
本発明のいずれの方法による、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤、またはＧＨＲ経路を介して作用可能な薬剤も、低身長（例えば、好ましくは、ＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡ）、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧かなる群から選択された状態の治療において有効な薬剤であることが好ましい。
【００２５】
詳細には、本発明は、対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象に存在するか、存在しないかを判定すること；および、
（ｂ）上記対象に投与する低身長（例えば、好ましくは、ＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡ）、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された状態を治療できる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、上記アレルが、該薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関している対象を治療する方法を提供する。
【００２６】
特に好ましい実施形態では、本発明は、対象の成長を増進させる方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子アレルが対象に存在するか、存在しないかを判定すること；および、
（ｂ）上記対象に投与する対象の成長を増進させることのできる薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、上記アレルが、該薬剤に対する増大または減少した陽性反応をもつ可能性と相関している対象の成長を増進させる方法を開示する。
【００２７】
好ましい態様では、本発明は、ヒト対象の成長速度を増大させる方法であって、
（ａ）上記対象の身長が、その年齢および性別における正常値より標準偏差の約１倍分、より好ましくは約２倍分低い身長よりさらに低いかどうか検出すること；
（ｂ）対象のＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードするかどうか検出すること；および、
（ｃ）上記対象の成長速度を増大させるＧＨを有効量を対象に投与すること
を含む方法を開示する。上記対象は、ラロン症候群の対象ではないことが好ましいだろう。
【００２８】
ヒト対象を治療する上記方法は、薬剤の有効用量を、ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合である対象に投与することを含み、上記有効量が、その対象のＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードすることを除いて同一である対象に投与するであろう有効用量より多いことが好ましい。
【００２９】
好ましい態様では、上記薬剤がＧＨ分子である。好ましくは、対象に投与されるＧＨの有効量が約０．００１ｍｇ／ｋｇ／日および約０．２ｍｇ／ｋｇ／日の間にあり；より好ましくは、ＧＨの有効量が約０．０１ｍｇ／ｋｇ／日および約０．１ｍｇ／ｋｇ／日の間にある。他の態様では、対象に投与されるＧＨの有効量が少なくとも約０．２ｍｇ／ｋｇ／週である。別の態様では、ＧＨの有効量が少なくとも約０．２５ｍｇ／ｋｇ／週である。別の態様では、ＧＨの有効量は少なくとも約０．３ｍｇ／ｋｇ／週である。ＧＨは、１日に一度投与することが好ましい。ＧＨは、皮下注射で投与することが好ましい。成長ホルモンは、ｐＨ約７．４から７．８で処方するのが最も好ましい。
【００３０】
本発明の別の態様は、対象からＤＮＡ試料を取得すること；上記薬物に対する陽性反応の増大に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを、上記ＤＮＡ試料が含有しているかどうか、および／または、上記薬物に対する陽性反応の低減に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを、上記ＤＮＡ試料が含有しているかどうか判定すること；ならびに、上記薬物に対する陽性反応の増大に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを上記ＤＮＡ試料が含有している場合、および／または、上記薬物に対する陽性反応の低減に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを上記ＤＮＡ試料が含有しない場合に、有効量の上記薬物を対象に投与することを含む薬物の使用方法に関する。
【００３１】
別の態様では、本発明は、外来性ＧＨに対する反応の低減に苦しむ対象の治療を含む。この態様では、本発明は、対象からＤＮＡ試料を取得すること；上記薬物に対する陽性反応の増大に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを、上記ＤＮＡ試料が含有しているかどうか、および／または、上記薬物に対する陽性反応の減少に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを、上記ＤＮＡ試料が含有しているかどうか判定すること；ならびに、上記薬物に対する陽性反応の低減に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを上記ＤＮＡ試料が含有している場合、および／または、上記薬物に対する陽性反応の増大に関連したＧＨＲ遺伝子アレルを上記ＤＮＡ試料が含有しない場合に、有効量の上記薬物を上記対象に投与することを含む薬物の使用方法を提供する。
【００３２】
既に論じたように、これら方法は、１つもしくは複数の核酸の欠失、挿入または置換をエキソン３に有するＧＨＲアレル、また、最も好ましくは、実質上エキソン３全体の欠失を有するＧＨＲアレルが対象に存在するか、存在しないか判定することを含む。上記薬物に対する陽性反応の増大に関連したＧＨＲ遺伝子アレルは、エキソン３を欠失したＧＨＲアレルであり、好ましくはＧＨＲｄ３アレルである。上記薬物に対する陽性反応の低減に関連したＧＨＲ遺伝子アレルは、エキソン３を含有するＧＨＲアレル（ＧＨＲｆｌ）であることが好ましい（対象がこのアレルに関してホモ接合体である場合）。
【００３３】
本発明は、薬物の臨床試験の方法であって、
・薬物を個体の集団に投与するステップと、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドアイソフォームをエンコードする個体の第１の亜集団と、そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドアイソフォームをエンコードしない個体の第２の亜集団とを、上記集団から特定するステップと
を含む方法にも関する。
【００３４】
上記方法は、（ａ）上記第１の亜集団の個体における、上記薬物に対する反応を評価すること；および／または、（ｂ）上記第２の亜集団の個体における、上記薬物に対する反応を評価することをさらに含んでもよい。上記薬物に対する反応は、上記第１の亜集団の個体、および上記第２の亜集団の個体の両方で評価することが好ましい。上記反応は、上記第１の亜集団の個体、および上記第２の亜集団の個体で別々に評価することが好ましい。上記薬物に対する反応の評価は、対象における身長変化の測定を含むことが好ましい。
【００３５】
本発明は、薬物の臨床試験の方法であって、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードする個体の第１の集団と、そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードしない個体の第２の集団とを特定するステップと、
・上記第１の集団の個体、および／または、上記第２の集団の個体に薬物を投与するステップと
を含む方法にも関する。一実施形態では、薬物を、上記第１の集団の個体には投与するが、上記第２の集団の個体には投与しない。一実施形態では、薬物を、上記第２の集団の個体には投与するが、上記第１の集団の個体には投与しない。別の実施形態では、薬物を、上記第１の集団の個体、および上記第１の集団の個体の両方に投与する。
【００３６】
前述の方法による薬物は、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧を治療する薬物であることが好ましい。
【００３７】
本発明の好ましい態様は、薬物、好ましくは、ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬物の臨床試験の方法に関する。この方法は、
・薬物、好ましくは、ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬物を、個体の集団に投与するステップと、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドアイソフォームをエンコードする個体の第１の亜集団と、そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドアイソフォームをエンコードしない個体の第２の亜集団とを、上記集団から特定するステップと
を含む。
【００３８】
別の好ましい態様では、薬物、好ましくは、ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬物、またはＩＳＳ、ＩＵＧＲ、もしくはＳＧＡを改善できる薬物の臨床試験の方法に関する。この方法は、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードする個体の第１の集団と、そのＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードしない個体の第２の集団とを特定するステップと、
・薬物、好ましくは、ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬物、またはＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡを改善できる薬物を、上記第１の集団の個体、および／または、上記第２の集団の個体に投与するステップと
を含む。一実施形態では、薬物を、上記第１の集団の個体には投与するが、上記第２の集団の個体には投与しない。一実施形態では、薬物を、上記第２の集団の個体には投与するが、上記第１の集団の個体には投与しない。別の実施形態では、薬物を、上記第１の集団の個体、および上記第１の集団の個体の両方に投与する。
【００３９】
ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬剤、またはＩＳＳ、ＩＵＧＲ、またはＳＧＡを改善できる薬物に対する反応の評価は、個体における身長変化の評価を含む。ヒト対象の成長速度を増大させることには、その対象の最終身長が少なくとも、ＧＨで治療されたＧＨ欠損の対象（すなわち、ＧＨＤと診断された対象）と同じ身長に達する状況のみが含まれるのではなく、その対象が、ＧＨで治療されたＧＨ欠損の対象と同じ成長速度で身長を増大させる状況、または、目標とする身長の範囲内にある成人身長に達する状況、すなわち、最終身長が、両親の中間値に基づく目標身長によって決定される対象の遺伝的可能性と一致する状況も指す。
【００４０】
本発明のいずれの方法の一態様でも、ＧＨＲ核酸分子に特異的に結合する核酸分子を用いることで、対象のＤＮＡが、特定のＧＨＲポリペプチドアイソフォームをエンコードするかどうか判定するステップを実施できる。別の態様では、ＧＨＲ核酸分子に特異的に結合する核酸分子を用いて、対象のＤＮＡが、ＧＨＲポリペプチドアイソフォームをエンコードするかどうか判定するステップを実施する。本発明の方法は、個体のＤＮＡが、ＧＨＲｄ３タンパク質またはポリペプチドをエンコードするかどうかの判定を含むことが好ましい。したがって、これは個体のゲノムＤＮＡがＧＨＲｄ３アレルを含むかどうか、個体から得られたｍＲＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードするかどうか、または、対象がＧＨＲｄ３ポリペプチドを発現するかどうかの判定を含むものでもよい。
【００４１】
例えば、上記実施形態のいずれにおいても、個体のＤＮＡがＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードするかどうかの判定は、
ａ）生物試料を提供するステップと、
ｂ）上記生物試料を、
ｉｉ）ストリンジェント(stringent)な条件下でＧＨＲ核酸、好ましくはＧＨＲｄ３核酸にハイブリッド形成するポリヌクレオチド、または、
ｉｉｉ）ＧＨＲポリヌクレオチド、好ましくはＧＨＲｄ３ポリペプチドに選択的に結合する検出可能なポリペプチド
と接触させるステップと、
ｃ）上記試料中のＲＮＡ種、および上記ポリヌクレオチド相互のハイブリッド形成の存在もしくは不在、または、上記試料中のポリペプチドに対する上記検出可能なポリペプチドの結合の存在もしくは不在を検出するステップと
を含みうる。
【００４２】
生物試料は、ストリンジェントな条件下でＧＨＲｄ３核酸にハイブリッド形成するポリヌクレオチド、または、ＧＨＲｄ３ポリペプチドに選択的に結合する検出可能なポリペプチドと接触させられ、上記ハイブリッド形成または上記結合の検出が、上記試料における上記ＧＨＲｄ３の発現を示すものであることが好ましい。
【００４３】
上記ポリヌクレオチドがプライマーであり、上記ハイブリッド形成が、上記プライマー配列を含む増幅産物(amplification product)の存在を検出することによって、検出されることが好ましい。上記検出可能なポリペプチドは抗体であることが好ましい。ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌのポリペプチドまたは核酸の検出は、適切な方法のいずれでも実行できる。例えば、ＧＨＲｄ３またはＧＨＲｆｌの細胞外ドメインの血清中レベルを評価してもよい（例えば、高親和性ＧＨ結合タンパク質）。また、ＧＨＲｄ３ゲノム配列またはｃＤＮＡ配列に特異的にハイブリッド形成するオリゴヌクレオチドプローブまたはプライマーも、上記プライマーおよびプローブを用いたＤＮＡ増幅法および検出法と同様に、本発明の一部である。
【００４４】
本発明は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドの候補変調因子(candidate modulators)を同定する方法にも関する。そのような方法は、例えば、ＧＨＲｄ３アレルに関してホモ接合またはヘテロ接合である個体に対して有効なＧＨＲアゴニストまたは阻害剤を同定する方法として実施されうる。これらの方法は、例えばＧＥＮＯＴＲＯＰＩＴＮ（商標）、ＰＲＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、ＮＵＴＲＯＰＩＮ（商標）、ＳＯＭＡＶＥＲＴ（商標）（ペグビソマント）など、公知のＧＨ組成物から治療に最も有効な化合物を同定するのに用いることができる。したがって、これらの方法は、ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬物、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧を改善できる薬物を同定するのに有用でありうる。
【００４５】
一態様では、本発明は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法であって、
ａ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドを提供すること；
ｂ）上記混合物を試験化合物と接触させること；および、
ｂ）上記化合物が上記ＧＨＲｄ３ポリペプチドに選択的に結合するかどうか判定すること
を含み、上記ポリペプチドに対する上記化合物の選択的な結合を検出することで、上記化合物が上記ＧＨＲｄ３ポリペプチドの候補変調因子であることを示す方法に関する。試験化合物は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種であることが好ましい。この化合物は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドのアゴニストまたは阻害剤であってもよい。好ましい実施形態では、上記ＧＨＲｄ３ポリペプチドが膜中に組み込まれている。
【００４６】
本発明は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法であって、
ａ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドを提供すること；
ｂ）上記混合物を試験化合物と接触させること；および、
ｃ）上記化合物がＧＨＲ活性を選択的に変調するかどうか判定すること
を含み、上記化合物によるＧＨＲ活性の選択的な変調を検出することで、上記化合物がＧＨＲｄ３ポリペプチド活性の候補変調因子であることを示す方法も提供する。試験化合物は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種であることが好ましい。この化合物は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドのアゴニストまたは阻害剤であってもよい。試験化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは試験化合物が候補アゴニストであることを示す。試験化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは試験化合物が候補阻害物質であることを示す。好ましい実施形態では、上記ＧＨＲｄ３ポリペプチドが膜中に組み込まれている。
【００４７】
本発明は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法であって、
ａ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドを含む細胞を提供すること；
ｂ）上記細胞を試験化合物と接触させること；および、
ｃ）上記化合物がＧＨＲ活性を選択的に変調するかどうか判定すること
を含み、上記化合物によるＧＨＲ活性の選択的な変調を検出することで、上記化合物がＧＨＲｄ３ポリペプチド活性の候補変調因子であることを示す方法も提供する。試験化合物は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種であることが好ましい。この化合物は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドのアゴニストまたは阻害剤であってもよい。試験化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは試験化合物が候補アゴニストであることを示す。試験化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは試験化合物が候補阻害物質であることを示す。上記細胞はヒト２９３細胞であることが好ましい。上記方法の別の態様では、細胞がアフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞であり、ステップａ）は、上記細胞にＧＨＲｄ３  ｃＲＮＡを導入することを含む。
【００４８】
本発明は、ＧＨＲが、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌのヘテロ二量体ポリペプチドとして存在しうることも提供する。したがって、別の態様では、本発明は、ＧＨＲヘテロ二量体（ＧＨＲｄ３／ｆｌ）ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法にも関する。そのような方法は、例えば、ＧＨＲアゴニストまたは阻害剤を同定する方法として実施されうる。そのような方法は、ヒト対象の成長速度を増大させることが可能な薬物、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧を改善できる薬物を同定する方法としても実施されうる。
【００４９】
一態様では、本発明は、ＧＨＲヘテロ二量体ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法であって、
ｃ）ＧＨＲｆｌポリペプチドおよびＧＨＲｄ３ポリペプチドを混合すること；
ｄ）上記混合物を試験化合物と接触させること；および、
ｂ）上記化合物がＧＨＲｆｌポリペプチドまたはＧＨＲｄ３ポリペプチドに選択的に結合するかどうか判定すること
を含み、上記ポリペプチドに対する上記化合物の選択的な結合を検出することで、上記化合物が上記ＧＨＲヘテロ二量体ポリペプチドの候補変調因子であることを示す方法に関する。試験化合物は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種であることが好ましい。この化合物は、ＧＨＲヘテロ二量体のアゴニストまたは阻害剤であってもよい。好ましい実施形態では、上記ＧＨＲｆｌポリペプチドおよびＧＨＲｄ３ポリペプチドが膜中に組み込まれている。
【００５０】
本発明は、ＧＨＲヘテロ二量体ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法であって、
ｃ）ＧＨＲｆｌポリペプチドおよびＧＨＲｄ３ポリペプチドを混合すること；
ｄ）上記混合物を試験化合物と接触させること；および、
ｃ）上記化合物がＧＨＲ活性を選択的に変調するかどうか判定すること
を含み、上記化合物によるＧＨＲ活性の選択的な変調を検出することで、上記化合物がＧＨＲヘテロ二量体活性の候補変調因子であることを示す方法も提供する。試験化合物は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種であることが好ましい。この化合物は、ＧＨＲヘテロ二量体のアゴニストまたは阻害剤であってもよい。試験化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは試験化合物が候補アゴニストであることを示す。試験化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは試験化合物が候補阻害物質であることを示す。好ましい実施形態では、上記ＧＨＲｆｌポリペプチドおよびＧＨＲｄ３ポリペプチドが膜中に組み込まれている。
【００５１】
本発明は、ＧＨＲヘテロ二量体ポリペプチドの候補変調因子を同定する方法であって、
ｃ）ＧＨＲｆｌポリペプチドおよびＧＨＲｄ３ポリペプチドを含む細胞を提供すること；
ｄ）上記細胞を試験化合物と接触させること；および、
ｃ）上記化合物がＧＨＲ活性を選択的に変調するかどうか判定すること
を含み、上記化合物によるＧＨＲ活性の選択的な変調を検出することで、上記化合物がＧＨＲヘテロ二量体活性の候補変調因子であることを示す方法も提供する。試験化合物は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種であることが好ましい。この化合物は、ＧＨＲヘテロ二量体のアゴニストまたは阻害剤であってもよい。試験化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは試験化合物が候補アゴニストであることを示す。試験化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは試験化合物が候補阻害物質であることを示す。上記細胞はヒト２９３細胞であることが好ましい。上記方法の別の態様では、細胞がアフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞であり、ステップａ）は、上記細胞にＧＨＲｄ３  ｃＲＮＡを導入することを含む。
【００５２】
細胞は、ＧＨＲｆｌポリペプチドおよびＧＨＲｄ３ポリペプチドを発現する細胞であることが好ましい。好ましい態様では、ステップａ）は、ＧＨＲｄ３ヌクレオチド配列を含む核酸と、ＧＨＲｆｌヌクレオチド配列を含む核酸とを上記細胞に導入することを含む。他の態様では、ステップａ）は、ＧＨＲｆｌ核酸を発現する細胞に、ＧＨＲｄ３ヌクレオチド配列を含む核酸を導入することを含む。さらに他の態様では、ステップａ）は、ＧＨＲｄ３核酸を発現する細胞に、ＧＨＲｆｌヌクレオチド配列を含む核酸を導入することを含む。
【００５３】
本発明は、ＧＨＲｄ３ポリヌクレオチドおよびＧＨＲｆｌポリヌクレオチドをエンコードするポリヌクレオチドを含む組換えベクターも提供する。本発明による組換えベクターを含む宿主細胞も、本発明に包含される。本発明は、少なくとも２つの組換えベクターからなるベクターセットであって、ＧＨＲｄ３ポリヌクレオチドを含む第１の組換えベクターと、ＧＨＲｆｌポリヌクレオチドを含む第２の組換えベクターとを含むベクターセットも提供する。本発明は、上記第１の組換えベクター、および上記第２の組換えベクターを含む宿主細胞、ならびに上記組換えベクターを含む非ヒト宿主動物または哺乳動物も提供する。
【００５４】
本発明は、ＧＨＲｄ３ポリヌクレオチドを含むノックアウトベクターを用いた相同組換によって破壊されたＧＨＲ遺伝子を含む哺乳類宿主細胞も提供する。本発明は、ＧＨＲｄ３ポリヌクレオチドを含むノックアウトベクターを用いた相同組換によって破壊されたＧＨＲ遺伝子を含む非ヒト宿主哺乳動物をさらに提供する。
【００５５】
既に論じたように、アッセイを実施する上記の方法、ならびにＧＨＲヘテロ二量体の変調因子、組換えベクター、宿主細胞、および非ヒト宿主哺乳動物を同定する方法は、実質上エキソン３全体を欠失したＧＨＲｄ３アレルを用いても、代わりに、いかなる適当なＧＨＲアレル、または１つもしくは複数の核酸の欠失、挿入もしくは置換をエキソン３に有するＧＨＲ核酸でエンコードされたＧＨＲアイソフォームを用いてもよいことを理解されたい。
【発明を実施するための最良の形態】
【００５６】
組換え型ＧＨによる治療の治験に登録された９７人の特発性低身長（ＩＳＳ）の子供において、ＧＨＲエキソン３の一般的な変種と、ＧＨによる治療に対する成長速度の反応との関連を検査した。４７人の患者にＧＨＲｄ３アレルが存在し、そのうち、３人がＧＨＲｄ３／ｄ３ホモ接合体であり、４４人がＧＨＲｄ３／ｆｌヘテロ接合体であった。年齢、性別、およびｒＧＨの用量に関して調節を行った後、ＧＨＲｄ３変種を保持する子供が、ｒＧＨで治療された際に優れた速度で成長したことが判明した。ＧＨＲｄ３／ｆｌまたはＧＨＲｄ３／ｄ３遺伝子型を有する子供の成長速度は、治療の最初の年が９．０＋／−０．３ｃｍ／年であり、２年目が７．８＋／−０．２ｃｍ／年であったが、これと比較して、ＧＨＲｆｌ／ｆｌ遺伝子型を有する子供では、それぞれ、７．４＋／−０．２および６．５＋／−０．２ｃｍ／年であった（Ｐ＜０．０００１）。これらの遺伝子型グループは、他の医学上および治療上の特性と一致するものであった。したがって、ＧＨＲ配列のゲノム変異は、ｒＧＨ有効性の顕著な相違と関連している。
【００５７】
上記で論じたように、本発明は、薬理遺伝学および予測医学の分野に関し、この分野では、診断検査、予後検査、およびモニタリング臨床試験が、それによって個体を治療する予後の（予測的な）目的で用いられる。したがって、本発明の一態様は、それによって個体のＧＨＲ反応、特に外来性ＧＨ組成物による治療に対するＧＨＲ反応の本質を判定するために行う、生物試料（例えば、血液、血清、細胞、組織）のコンテクストにおけるＧＨＲタンパク質発現および／または核酸発現を判定する診断検査に関する。これは、ある個体が、ＧＨＲ反応または活性の低減に関連した疾患または障害に罹患しているかどうか、または障害を発症する危険にあるかどうか検出するのにも有用でありうる。ＧＨＲ活性と関連した障害または状態には、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧が含まれる。また、本発明は、ある個体が、ＧＨＲタンパク質活性に関連した障害を発症する危険にあるかどうか判定する予後（すなわち、予測的）検査も提供する。例えば、生物試料中のＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌアイソフォームを検査することができる。そのような検査は、ＧＨＲ反応の低減に関連した障害、またはこれを特徴とする障害が発症する前に、それによって、例えば、対象がその遺伝的可能性と一致した最終身長に達するように、有効量のＧＨを投与することによって、個体を予防的に治療する予後または予測的な目的で使用できる。他の態様では、本発明は、ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体活性を変調する薬剤を検出する方法を提供する。そのような薬剤は、ＧＨＲ活性が関与する前述の状態または障害を治療するのに有用でありうる。
【００５８】
（定義）
本明細書において、「薬剤」という用語は、化学化合物、化学化合物の混合物、生体高分子、好ましくはペプチドもしくはタンパク質、または、細菌、植物、菌類、もしくは動物（特に哺乳類）の細胞もしくは組織など、生体物質から調製した抽出物を意味する。
【００５９】
本発明のコンテクストでは、薬物または薬剤に対する「陽性反応」または「陽性治療反応」とは、疾患または状態に関連した症候の軽減を含むものとして定義できる。例えば、陽性反応は、薬剤を投与した際の身長または成長速度の増大でありうる。本発明のコンテクストでは、薬物に対する「陰性反応」とは、その薬物に対する陽性反応の欠如、またはその薬物を投与した後で観測される副作用の誘導を含むものとして定義できる。
【００６０】
「ポリペプチド」という用語は、重合体の長さに関係なく、アミノ酸の重合体のことをいう。したがって、ペプチド、オリゴペプチド、およびタンパク質は、ポリペプチドの定義に含まれる。この用語は、ポリペプチドの発現後修飾に関しても、特定も、除外もせず、例えば、グリコシル基、アセチル基、リン酸基、脂質基、および同様のものの共有結合を含むポリペプチドは、ポリペプチドという用語に、明示的に包含される。また、この定義の中には、１つまたは複数のアミノ酸類似体（例えば、天然に存在しないアミノ酸、関連性のない生物学系でのみ天然に存在するアミノ酸、哺乳類システムなどに由来する改変されたアミノ酸が含まれる）を含有するポリペプチド、置換された結合を有するポリペプチド、ならびに、天然に存在するものと、存在しないものとの両方を含めた当技術分野で公知の他の改変を有するポリペプチドが含まれる。
【００６１】
「単離された」タンパク質もしくは「精製された」タンパク質、またはその生物学的活性部分は、このタンパク質が得られた細胞または組織に由来する細胞性物質または他の夾雑(contaminating)タンパク質を実質上含まず、また化学合成された場合には、化学前駆体または他の化学物質を実質上含まない。「細胞性物質を実質上含まない」という言葉には、ＧＨタンパク質もしくはＧＨＲタンパク質を単離した細胞、または組換え体として生成した細胞の細胞組成から、このタンパク質がその中に分離されているＧＨタンパク質もしくはＧＨＲタンパク質の調製物が含まれる。一実施形態では、「細胞性物質を実質上含まない」という言葉には、約３０％（乾燥重量で）未満の非ＧＨタンパク質もしくは非ＧＨＲタンパク質（本明細書では「夾雑タンパク質」とも呼ばれる）、より好ましくは約２０％未満の非ＧＨタンパク質もしくは非ＧＨＲタンパク質、さらにより好ましくは約１０％未満の非ＧＨタンパク質もしくは非ＧＨＲタンパク質、そして、最も好ましくは約５％未満の非ＧＨタンパク質もしくは非ＧＨＲタンパク質を有するＧＨタンパク質もしくはＧＨＲタンパク質の調製物が含まれる。ＧＨタンパク質もしくはＧＨＲタンパク質、またはその生物学的に活性な部分が、組換えによって生成された場合、これも培養液を実質上含まないこと、すなわち、培養液がタンパク質調製物の容積の約２０％未満であることが好ましく、より好ましくは約１０％未満であり、そして、最も好ましくは約５％未満である。
【００６２】
「化学前駆体または他の化学物質を実質上含まない」という言葉には、このタンパク質の合成に用いられた化学前駆体または他の化学物質から、このタンパク質がその中に分離されているＧＨタンパク質調製物またはＧＨＲタンパク質調製物が含まれる。一実施形態では、「化学前駆体または他の化学物質を実質上含まない」という言葉は、約３０％（乾燥重量で）未満の化学前駆体または非ＧＨ化学物質もしくは非ＧＨＲ化学物質、より好ましくは約２０％未満の化学前駆体または非ＧＨ化学物質もしくは非ＧＨＲ化学物質、さらにより好ましくは約１０％未満の化学前駆体または非ＧＨ化学物質もしくは非ＧＨＲ化学物質、そして、最も好ましくは約５％未満の化学前駆体または非ＧＨ化学物質もしくは非ＧＨＲ化学物質を有するＧＨタンパク質調製物もしくはＧＨＲタンパク質調製物が含まれる。
【００６３】
本明細書において、「組換えポリペプチド」という用語は、それらの配列があった最初の自然環境では連続したポリペプチド配列として見いだされない少なくとも２つのポリペプチド配列を含む、人工的に設計されたポリペプチド、または、組換えポリヌクレオチドから発現されたポリペプチドをいう。
【００６４】
核酸が「作用可能に連結される」とは、その核酸が別の核酸配列と機能的関係をもつように配置された場合をいう。例えば、プロモーターまたはエンハンサーは、それがコード配列の転写に影響を与える場合、そのコード配列に作用可能に連結している。作用可能に連結しているとは、転写調節配列に関しては、それらのＤＮＡ配列が連続的に連結されていることを意味し、２つのタンパク質コード領域を連結する必要がある場合には、連続的かつインフレームに連結されていることを意味する。
【００６５】
「プライマー」という用語は、標的ヌクレオチド配列にハイブリッド形成させるのに使用される、標的ヌクレオチド配列に相補的な特異的オリゴヌクレオチド配列を意味する。プライマーは、ＤＮＡポリメラーゼ、ＲＮＡポリメラーゼ、または逆転写酵素によって触媒されるヌクレオチドポリメリゼーションの開始点として機能する。
【００６６】
「プローブ」という用語は、試料中に存在する特定のポリヌクレオチド配列を同定するのに使用できる特定の核酸セグメント（またはヌクレオチド類似体セグメント、例えば、本明細書に定義されるポリヌクレオチド）を意味し、上記核酸セグメントは、同定される特定のポリヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を含む。
【００６７】
本明細書において、「試験試料」とは、注目している対象から取得した生物試料をいう。例えば、試験試料は、生物体液（例えば、血清）、細胞試料、または組織でありうる。
【００６８】
本明細書において、「形質」および「表現型」という用語は、互換性をもって使用され、例えば、疾患の症候、または罹病性など、生物が有する臨床的に識別可能、検出可能、または他の方法で測定可能な特性のいかなるものも指す。本明細書において、「形質」または「表現型」という用語は、通常、ＧＨＲに作用する薬剤に対する個体の反応をいうのに使用される。
【００６９】
本明細書において、「遺伝子型」という用語は、個体または試料中に存在するアレルのアイデンティティのことをいう。本発明のコンテクストにおいて、遺伝子型は、個体または試料中に存在するアレルに関する記述をいうのが好ましい。あるアレルに関して試料または個体を「遺伝子型決定する」という用語には、個体に保持されている特定のアレルを判定することが含まれる。
【００７０】
本明細書において、「アレル」という用語は、ヌクレオチド配列の変種をいうのに使用される。例えば、ＧＨＲヌクレオチド配列のアレルには、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌが含まれる。
【００７１】
本明細書において、「アイソフォーム」および「ＧＨＲアイソフォーム」とは、ＧＨＲ遺伝子の少なくとも１つのエキソンによってエンコードされるポリペプチドのことをいう。ＧＨＲアイソフォームの例には、ＧＨＲｄ３ポリペプチドおよびＧＨＲｆｌポリペプチドが含まれる。
【００７２】
本明細書において、「多型(polymorphism)」という用語は、異なったゲノムもしくは個体相互、またはそれらの間にある２つ以上の択一的なゲノム配列またはアレルの存在をいう。「多型」であるとは、特定のゲノム配列に２つ以上の変種が集団で見いだされうる状態をいう。「多型部位」とは、変異が存在する遺伝子座である。多型は、１つまたは複数のヌクレオチドの置換、欠失、または挿入を含みうる。一塩基多型は、単一塩基対の変化である。
【００７３】
本明細書において、「エキソン」は、成熟したＲＮＡ産物中にある、分断された遺伝子セグメントのいかなるものも指す。
【００７４】
本明細書において、「イントロン(intron)」は、成熟したＲＮＡ産物中にない分断された遺伝子セグメントを指す。イントロンは、初期核転写産物の一部であるが、ｍＲＮＡを生成するためにスプライシングによって除去され、ｍＲＮＡはその後、細胞質に輸送される。
【００７５】
本明細書において、「成長ホルモン」または「ＧＨ」とは、いかなる出所から得られたものであっても、天然か、合成か、組換え型かにかかわらず、天然の配列、または変種型の成長ホルモンをいう。例としては、限定されるものではないが、ヒト成長ホルモン（ｈＧＨ）、すなわち、天然のＧＨ、または天然のヒト配列を有する組換えＧＨ（例えば、ＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、ソマトトロピン、またはソマトロピン）と、組換え成長ホルモン（ｒＧＨ）とが含まれ、ここで、組換え成長ホルモンは、ソマトレム、ソマトトロピン、ソマトロピン、およびペグビソマントを含めた、組換えＤＮＡ技術によって生成されたいかなるＧＨまたはＧＨ変種も指す。ＧＨ分子は、ＧＨＲのアゴニストまたはアンタゴニストでありうる。
【００７６】
本明細書において、「成長ホルモン受容体」または「ＧＨＲ」とは、いかなる出所から得られたものであっても、天然か、合成か、組換え型かにかかわらず、天然の配列、または変種型の成長ホルモン受容体をいう。「ＧＨＲ」という用語は、ＧＨＲｆｌアイソフォームと同様に、ＧＨＲｄ３アイソフォームも包含する。例には、ヒト成長ホルモン受容体（ｈＧＨＲ）、すなわち、天然のＧＨＲ、または天然のヒト配列を有する組換えＧＨＲが含まれる。本明細書において、「ＧＨＲｄ３」は、ＧＨＲのエキソン３欠失アイソフォームを指す。「ＧＨＲｆｌ」という用語は、エキソン３を含有するＧＨＲアイソフォームを指す。ＧＨＲｄ３という用語には、参照により本明細書に組み込まれているUrbanek Mら、Mol.Endocrinol.、1992年2月、第6(2)巻、279〜87ページに記載されたポリペプチドが含まれるが、これらに限定されない。ＧＨＲｆｌという用語には、参照により本明細書に組み込まれているLeungら、Nature、第330巻、537〜543ページ（1987年）に記載されたポリペプチドが含まれるが、これらに限定されない。
【００７７】
本明細書において、「ＧＨＲ遺伝子」という用語は、ゲノムＤＮＡの非翻訳調節領域も含めた、ＧＨＲタンパク質をエンコードするゲノム配列、ｍＲＮＡ配列、およびｃＤＮＡ配列のいかなるものも包含する。「ＧＨＲ遺伝子」という用語は、ＧＨＲｄ３アレルおよびＧＨＲｆｌアレルなどの、ＧＨＲ遺伝子のアレルも包含する。
【００７８】
（ヒトＧＨＲ遺伝子およびタンパク質）
ヒトＧＨＲ遺伝子は、９０ｋｂの５ｐ１３−１２染色体領域にまたがる単一コピー遺伝子である。この遺伝子は、９つのコーディングエキソン（２から１０まで付番されている）と、いくつかの翻訳されないエキソンとを含有し、エキソン２はシグナルペプチドをコードし、エキソン３から７は細胞外ドメインをエンコードし、エキソン８は膜貫通ドメインをエンコードし、エキソン９および１０は細胞質ドメインをエンコードする。上記に論じたように、ｈＧＨＲｄ３タンパク質は、この受容体の細胞外ドメインにある２２アミノ酸の欠失によって、肝臓のｈＧＨＲと相違している（Godowskiら、1989年）。Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ１５５９１２は、ＧＨＲ遺伝子（例えば、ＧＨＲｆｌアレル）エキソン３周辺のゲノムＤＮＡ領域におけるヌクレオチド配列を提供するものであり、この配列の開示を参照により本明細書に組み込む。エキソン３と、イントロン２および３の一部とを含むこの６．８ｂｐフラグメントは、２つの２５１ｂｐ反復エレメントも含む。これらの反復エレメントはエキソン３の両側にあり、５’反復エレメントおよび３’反復エレメントは、このエキソンの５７７ｂｐ上流と、１８２１ｂｐ下流とに位置する。このエレメントは、ＨＥＲＶ−Ｐファミリー（Boeke,J.D.及びStoye,J.P.（1997年）に属するヒト内在性レトロウイルスに由来する１７１ｂｐの長末端反復（ＬＴＲ）フラグメントで構成されている（「Retroviruses」（Coffin,J.M.、Hughes,S.H.、及びVarmus,H.E.編集）、343〜435ページ、Cold Spring Harbor Laboratory、Cold Spring Harbor、NY）。ＬＴＲの後には、中程度の反復頻度を有するＭＥＲ４型配列に由来する８０ｂｐが続いている（Smit,A.F.（1996年）、Curr.Opin.Genet.Dev.、第６巻、743〜748ページ）。５’反復および３’反復と呼ばれる、長さ２５１ｂｐの２つのコピーの配列は、９９％同一であり、この反復の位置１４、２４５、および２４６における３つのヌクレオチドが相違するのみである。詳細には、Pantelら（2000年）によって報告されたように、エキソン３の上流に位置するエレメントは、位置１４にシトシンを、位置２４５および２４５にチミンを有し、一方、エキソン３の下流に位置するエレメントは、これらの位置にグアニン、シトシン、およびアデニンを有する。さらに、エキソン３周辺には、ウイルス由来の他の配列もある。
【００７９】
ＧＨＲｄ３アレルは、エキソン３と、周囲にあるイントロン２および３の部分との欠失を含む。ＧＨＲｄ３アレルは、ＧＨＲｆｌアレルとは異なり、単一の２５１ｂｐ  ＬＴＲを含有し、このＬＴＲの配列は、ＧＨＲｆｌアレルで同定された３’コピーのＬＴＲエレメントと同一である。欠失したエキソン３の領域におけるＧＨＲｄ３アレルのゲノムＤＮＡ配列は、Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ２１０６３３に示されており、この配列の開示を参照により本明細書に組み込む。ＧＨＲｄ３配列およびＧＨＲｆｌ配列に基づいて、ある個体がＧＨＲｄ３アレルを保持するかどうかの判定を、ＧＨＲ核酸またはポリペプチドを検出する公知の方法を用いて行うことができる。
【００８０】
エキソン３の欠失を有するＧＨＲｄ３タンパク質は、この受容体の細胞外ドメインにある２２アミノ酸の欠失によって、完全長ｈＧＨＲ（ＧＨＲｆｌ）と相違している。したがって、ＧＨＲｄ３またはＧＨＲｆｌタンパク質の存在を検出するには、公知のいかなる方法を用いることもできる。ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌの検出は、それらの非切断型で行っても、「高親和性成長ホルモン結合タンパク質」、「高親和性ＧＨＢＰ」、または「ＧＨＢＰ」として、切断型で行ってもよいが、これらの切断型は、ヒトを含めた（Baumannら、J.Clin.Endocrinol.Metab.、第62巻、134〜141ページ（1986年）；欧州特許第３６６７１０号；Heringtonら、J.Clin.Invest.、第77巻、1817〜1823ページ（1986年）；Leungら、Nature、第330巻、537〜543ページ（1987年））、いくつかの種（Ymer及びHerington（1985年）、Mol.Cell.Endocrinol.、第41巻、153ページ；Smith及びTalamantes（1988年）、Endocrinology、第123巻、1489〜1494ページ；EmtnerおよびRoos、Acta Endocrinologica(Copenh)、第122巻、296〜302ページ（1990年））において血中で循環して、ＧＨＢＰとしての機能するＧＨＲの細胞外ドメインのことをいう。血清中の機能的ＧＨＢＰを測定する様々な方法が利用可能であるが、米国特許第５２１００１７号と、さらに本明細書とに記載されているリガンド媒介免疫機能アッセイ（ligand-mediated immunofunctional assay）（ＬＩＦＡ）が好ましい方法である。
【００８１】
（診断、治療、および薬理遺伝学におけるＧＨＲｄ３）
好ましい実施形態では、本発明は、治療に対する反応の増大または低減に関連したＧＨＲアレル、またはＧＨＲ活性の増大または低減に関連したＧＨＲアレルを、対象が発現しているかどうか判定するものである。対象がＧＨＲアレルを発現しているかどうかの判定は、ＧＨＲタンパク質または核酸を検出することで実行できる。
【００８２】
対象を治療、診断、または評価する方法は、対象がＧＨＲｄ３および／またはＧＨＲｆｌアレルを発現しているかどうかの評価または判定、例えば、対象がＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合体（ＧＨＲｆｌ／ｆｌ）であるか、ＧＨＲｄ３アレルに関してホモ接合体（ＧＨＲｄ３／ｄ３）であるか、またはヘテロ接合体（ＧＨＲｄ３／ｆｌ）であるかの判定を含むことが好ましい。したがって本発明は、好ましくは、生物試料中にＧＨＲｄ３が発現されているかどうかの判定であって、ａ）上記生物試料を、ｉ）ストリンジェントな条件下でＧＨＲｄ３核酸とハイブリッド形成するポリヌクレオチド、またはｉｉ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドに選択的に結合する検出可能なポリペプチドと接触させること；ならびに、ｂ）上記試料中における上記ポリヌクレオチドおよびＲＮＡ種の間のハイブリッド形成の存在もしくは不在、または、上記試料中のポリペプチドに対する上記検出可能なポリペプチドの結合の存在もしくは不在を検出することを含む判定を行うものである。上記ハイブリッド形成、または上記結合の検出は、上記ＧＨＲｄ３アレルまたはアイソフォームが上記試料中に発現されていることを示すものである。上記ポリヌクレオチドがプライマーであり、上記ハイブリッド形成が、上記プライマー配列を含む増幅産物の存在を検出することによって、検出されること、または、検出可能なポリペプチドが抗体であることが好ましい。
【００８３】
哺乳動物、好ましくはヒトで、ＧＨＲｄ３発現のレベルが上昇しているか、低下しているか判定する方法であって、ａ）上記哺乳動物に由来する生物試料を提供すること；および、ｂ）上記生物試料中におけるＧＨＲｄ３ポリペプチド、またはＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードするＧＨＲｄ３ＲＮＡ種の量を、対照試料で検出されるレベル、または対照試料から予想されるレベルと比較することを含む方法も想定されている。上記生物試料中における上記ＧＨＲｄ３ポリペプチドまたは上記ＧＨＲｄ３  ＲＮＡ種が、上記対照試料で検出されるレベル、または上記対照試料から予想されるレベルと比較して、上昇している場合、これは上記哺乳動物におけるＧＨＲｄ３発現のレベルが上昇していることを示し、上記生物試料中における上記ＧＨＲｄ３ポリペプチドまたは上記ＧＨＲｄ３  ＲＮＡ種が、上記対照試料で検出されるレベル、または上記対照試料から予想されるレベルと比較して、低下している場合、これは上記哺乳動物におけるＧＨＲｄ３発現のレベルが低下していることを示す。
【００８４】
生物試料中のＧＨＲｄ３タンパク質または核酸の存在または不在を検出する例示的方法では、試験対象から生物試料を取得し、さらに、生物試料中におけるＧＨＲｄ３タンパク質または核酸の存在が検出されるように、ＧＨＲｄ３タンパク質、またはＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする核酸（例えば、ｍＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ）を検出できる化合物または薬剤と、生物試料を接触させる。ＧＨＲｄ３  ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出する好ましい薬剤は、ＧＨＲｄ３  ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡにハイブリッド形成できる標識された核酸プローブである。例えば、核酸プローブは、ヒト核酸、またはその部分でありうるが、これは、ストリンジェントな条件下でＧＨＲｄ３  ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡに特異的にハイブリッド形成するのに十分な、長さが少なくとも１５、３０、５０、１００、２５０、もしくは５００ヌクレオチドのオリゴヌクレオチドなどである。本明細書に、本発明の診断検査で使用に供する他の適当なプローブを記載する。
【００８５】
ＧＨＲｄ３タンパク質を検出する好ましい薬剤は、ＧＨＲｄ３タンパク質に結合可能な抗体、好ましくは検出可能な標識を有する抗体である。抗体は、ポリクローナルでもよく、より好ましくはモノクローナルである。完全な抗体を用いることも、そのフラグメント（例えば、ＦａｂまたはＦ（ａｂ’）２）を用いることもできる。プローブまたは抗体に関して、「標識された」という用語は、プローブまたは抗体に検出可能な物質を結合させる（すなわち、物理的に連結する）ことによる、プローブまたは抗体の直接標識と、直接標識された別の試薬との反応性によるプローブまたは抗体の間接標識とを包含するものである。間接標識の例には、蛍光標識された二次抗体を用いた一次抗体の検出、および、蛍光標識されたストレプトアビジンで検出できるようにビオチンで末端標識されたＤＮＡプローブが含まれる。
【００８６】
「生物試料」という用語には、対象から単離された組織、細胞、および生物体液と、対象の内部に存在する組織、細胞、および流体とが含まれるものとする。すなわち、本発明の検出方法は、生物試料中の候補(candidate)ｍＲＮＡ、タンパク質、またはゲノムＤＮＡを、in vitroで、また、同様にin vivoで検出するのに用いることができる。例えば、候補ｍＲＮＡを検出するin vitro法には、ノーザンハイブリダイゼーションおよびin situハイブリダイゼーションが含まれる。候補タンパク質を検出するin vitro法には、酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）、ウエスタンブロット、免疫沈降反応、および免疫螢光法が含まれる。候補ゲノムＤＮＡを検出するin vitro法には、サザンハイブリダイゼーションが含まれる。さらに、ＧＨＲｄ３タンパク質を検出するin vivo法には、標識された抗体を対象に導入することが含まれる。例えば、対象内部における、その存在および位置を標準的な映像化手法で検出することが可能な放射性マーカーで抗体を標識することができる。
【００８７】
一実施形態では、生物試料は、試験対象に由来するタンパク質分子を含有する。別法では、生物試料は、試験対象に由来するｍＲＮＡ分子、または試験対象に由来するゲノムＤＮＡ分子を含有しうる。好ましい生物試料は、従来の方法で対象から単離された血清試料である。
【００８８】
別の実施形態では、この方法は、対照とする対象から対照生物試料を取得すること、ＧＨＲｄ３タンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの存在が生物試料で検出されるように、ＧＨＲｄ３タンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡを検出できる化合物または薬剤に対照試料を接触させること、そして、対照試料中におけるＧＨＲｄ３タンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの存在を、試験試料中におけるＧＨＲｄ３タンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの存在と比較することをさらに伴う。
【００８９】
本発明は、生物試料中におけるＧＨＲｄ３タンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの存在を検出するキットも包含する。例えば、キットは、生物試料中のＧＨＲｄ３タンパク質またはｍＲＮＡの検出が可能な、標識された化合物または薬剤；試料中のＧＨＲｄ３タンパク質またはｍＲＮＡの量を測定する手段；および、試料中のＧＨＲｄ３タンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの量を標準物質と比較する手段を含みうる。化合物または薬剤は、適当な容器に梱包できる。キットは、ＧＨＲｄ３タンパク質または核酸を検出するキットを使用するための説明書を含みうる。
【００９０】
前出の診断検査および以下のアッセイなど、本明細書に記載のアッセイは、ＧＨＲ反応が低減しているか、またはそれを引き起こす危険がある対象を確認するのに利用できることが最も好ましい。詳細には、ＧＨＲｆｌホモ接合体である対象は、ＧＨＲ反応が低減しているか、またはそれを引き起こす危険がある対象として確認される。他の態様では、本明細書に記載の診断方法は、ＧＨＲレベル、発現、または活性の異常、または、より詳細には低減に関連した疾患、障害、または形質を有するか、あるいはそれを引き起こす危険がある対象を確認するのに利用されうる。例えば、前出の診断検査および以下のアッセイなど、本明細書に記載のアッセイは、ＧＨＲレベル、発現、または活性の低減に関連した形質を有するか、あるいはそれを引き起こす危険がある対象を確認するのに利用することができる。別の例では、本明細書に記載のアッセイは、ＧＨＲレベル、発現、または活性の低減に関連した形質を有するか、あるいはそれを引き起こす危険がある対象を確認するのに利用することができる。既に論じたように、ＧＨＲｄ３／ｆｌヘテロ接合体は、ＧＨＲｆｌ／ｆｌホモ接合体と比較して、ＧＨＲ反応またはＧＨＲ活性が増大していると予測される。
【００９１】
本明細書に記載の予後検査は、ＧＨＲ経路を介して作用して疾患または障害を治療する薬剤を、対象に投与するかどうか、および／または、どの投与計画に従ってこれを行うかを決定するのに用いることができる。したがって、本発明は、ＧＨＲ経路を介して作用する薬剤で、対象を効果的に治療できるか判定する方法であって、試験試料の取得と、ＧＨＲｄ３タンパク質発現、核酸発現、または活性の検出とを行う方法を提供する。既に論じたように、ＧＨＲｄ３タンパク質または核酸を表出する対象は、ＧＨＲｄ３タンパク質または核酸を表出しない対象に比べて、上記薬剤に対する陽性反応が増大していると予測される。
【００９２】
ＧＨＲ活性の低減に対する個体の感受性を検出することは非常に重要であるが、これは主として、ＧＨＲ介在経路を介して作用する薬剤の投与を、この薬剤に対する反応性が増大または低下している対象に適応させることが可能であるためである。上記薬剤は、必ずしも、ＧＨＲタンパク質に直接作用する必要はなく、ＧＨＲタンパク質の上流に作用してもよいのであって、例えば、最終的にはＧＨＲタンパク質と相互作用する別の分子に作用してもよい。好ましい実施形態では、この薬剤は、ＧＨＲタンパク質に直接作用する薬剤である。この薬剤は、ＧＨＲタンパク質に結合して、さらにアゴニストまたはアンタゴニストとして作用する薬剤であることが最も好ましい。この薬剤は、ＧＨＲタンパク質を活性化できるＧＨタンパク質であることが最も好ましい。他の実施形態では、この薬剤は、ＧＨＲタンパク質に結合できるが、これを活性化できないＧＨタンパク質である。
【００９３】
ＧＨＲに関連した疾患には、例えば、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧が含まれる。したがって、本発明の方法は、これらの障害のいずれの１つに対する薬剤でも、それを用いた治療に対する対象の反応を予測するのに使用されうる。
【００９４】
既に論じたように、本発明は、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された状態に罹患している対象を治療する方法であって、
（ａ）ＧＨＲ遺伝子のアレルが対象に存在するか、存在しないかを判定すること；および
（ｂ）前記対象に投与する前記薬剤の有効量を選択または決定すること
を含み、上記状態を改善できる薬剤に対する陽性反応が増大または低減している可能性と、上記アレルが相関している方法を開示する。
【００９５】
したがって、本発明は、哺乳動物、好ましくはヒトを治療する方法であって、
・任意選択で、個体のＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードするかどうか判定するステップと、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードしていない個体を選択するステップと、
・ＧＨＲ反応の低減に関連した症候の出現（そして、任意選択で発症）に関して上記個体の経過観察を行うステップと、
・ＧＨＲ反応の低減、またはその症候に対して作用する、有効量の治療を適切な病期に、上記個体に施すステップと
を含む方法にも関する。
【００９６】
本発明の別の実施形態は、哺乳動物、好ましくはヒトを治療する方法であって、
・任意選択で、個体のＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードするかどうか判定するステップと、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードしていない個体を選択するステップと、
・ＧＨＲ反応の低減に対する予防的治療を上記個体に施すステップと
を含む方法を含む。
【００９７】
さらに別の実施形態では、本発明は、哺乳動物、好ましくはヒトを治療する方法であって、
・任意選択で、個体のＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードするかどうか判定するステップと、
・そのＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードしていない個体を選択するステップと、
・ＧＨＲ反応の低減に対する予防的治療を上記個体に施すステップと、
・ＧＨＲ反応の低減に関連した症候の出現、および発症に関して上記個体の経過観察を行うステップと、
・ＧＨＲ反応の低減、またはその症候に対して作用する治療を、適切な病期に、上記個体に施すステップと
を含む方法に関する。
【００９８】
個体の治療過程決定に使用するために、本発明は、
・ＧＨＲ反応、活性、もしくは発現の低減、またはその症候に関連したタンパク質を、そのＤＮＡがエンコードする個体を選択するステップと、
・ＧＨＲ反応の低減またはその症候に対して有効な治療を、上記個体に施すステップと
を含む治療方法にも関する。好ましい実施形態では、上記ＧＨＲ反応の低減またはその症候に関連したタンパク質は、ＧＨＲタンパク質であり、より好ましくは、ＧＨＲｆｌタンパク質である。個体は、ＧＨＲｆｌ／ｆｌアイソフォームに関してホモ接合体であることが最も好ましいだろう。
【００９９】
本発明の方法による個体は、低身長（例えば、好ましくはＩＳＳ）、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された状態に罹患しているか、またはそれに罹病性がある個体でありうる。
【０１００】
ＧＨＲ反応の低減は、好ましくは、ＧＨＲ経路を介して作用可能な薬剤、より好ましくは、ＧＨＲタンパク質に結合可能な薬剤による治療に対する反応の低減である。好ましい薬剤の例には、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧の治療用薬剤が含まれる。
【０１０１】
ＧＨＲ反応の低減またはその症候に対して有効な治療は、いかなる適当な側面で、ＧＨＲ反応が低減していない個体に施される治療と相違してもよい。一態様では、この治療は、投与される薬剤の量が相違する。別の態様では、この治療は、剤形が相違する。別の態様では、組成物を投与する方法または時間が相違する。さらに別の態様では、ＧＨＲ反応の低減またはその症候に対して有効な治療に用いられる薬剤は、基礎となる状態（例えば、低身長、肥満症）を治療するのに用いられる薬剤と、構造が相違する。好ましい態様では、ＧＨタンパク質、またはその変種もしくはフラグメントを含む組成物が、ＧＨＲｆｌに関してホモ接合である個体に、そのＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする個体に投与される量より多量に投与される。
【０１０２】
上記薬剤は、好ましくは、ＧＨポリペプチドまたはそのフラグメントであり、より好ましくは、組換えＧＨポリペプチドまたはそのフラグメントであるが、本明細書において、これらの例をさらに論じる。組換えＧＨポリペプチドは、ＧＨＲアゴニスト（例えば、成長を増進させるため、または肥満症を治療するために）でも、ＧＨＲアンタゴニスト（例えば、先端巨大症または巨人症状態を治療するために）でもよい。反応は、本明細書でさらに論じるように、身長または成長速度の変化、肥満症（例えば、ボディマスインデックス（ＢＭＩ））、感染症、または糖尿病の症候の改善；先端巨大症または巨人症状態の症候の改善；または、ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態、代謝症候群、気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧の症候の改善でありうる。
【０１０３】
一態様では、個体は、既に障害に罹患しているか、またはそれに罹病性があってもよく、かつ、既に治療されていても、治療の実行中でも、または、将来治療を受ける候補であってもよい。最も好ましくは、個体は、低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧からなる群から選択された状態に罹患しているか、それに罹病性があるだろう。したがって、好ましい態様では、本発明は前記障害の１つまたは複数を有する個体を治療する方法を提供する。したがって、本発明は、特定の治療方法に従って、上記に定義したような、ＧＨ反応が低減した対象の治療を標的とする(targeting for treatment)のを可能にする。
【０１０４】
そのＤＮＡがＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードするかどうか判定するために、ＤＮＡ試料を、試験される個体から取得する。ＤＮＡ試料を分析して、それがＧＨＲｄ３配列を含むかどうか、または、個体がＧＨＲｆｌアイソフォームに関してホモ接合体であるかどうかの判定を行う。ＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードするＤＮＡの存在は、薬物による治療に対する、より大きな陽性反応に関連しているだろう。また、ＧＨＲｄ３アレルをエンコードするＤＮＡの不在は、ＧＨＲｄ３の個体と比較して低減している陽性反応に関連しているだろう。
【０１０５】
本発明の方法は、薬物の評価および臨床試験の実行にも有用であろう。この方法は、したがって、上記薬物に陽性反応を示す個体の第１の集団と、上記薬物に陰性反応を示す個体、すなわち上記薬物に対する陽性反応が、前記第１の集団の個体と比較して低減している個体の第２の集団とを特定することを含む。一実施形態では、この薬物は、この薬物による治療に対する陽性反応に関連した１つまたは複数のアレルを、ＤＮＡ試料が含有しているかどうか、および／または、この薬物による治療に対する陰性反応、もしくは陽性反応の低減に関連した１つまたは複数のアレルがＤＮＡ試料で不在であるかどうかに関する臨床試験で対象に投与することができる。別の実施形態では、この薬物は、この薬物による治療に対する陰性反応、もしくは陽性反応の低減に関連した１つまたは複数のアレルを、ＤＮＡ試料が含有しているかどうか、および／または、この薬物による治療に対する陽性反応、もしくは陽性反応の増大に関連した１つまたは複数のアレルがＤＮＡ試料で不在であるかどうかに関する臨床試験で対象に投与することができる。
【０１０６】
したがって、本発明の方法を用いて、薬物治験対象相互のＧＨＲ反応の相違を考慮に入れることによって、薬効評価を行うことができる。必要に応じて、薬効評価の治験は、実質上、薬物に対して望ましい反応を示す可能性の高い個体からなる集団、または、実質上、薬物に対して別の集団より望ましくない反応を示す可能性の高い個体からなる集団で行われてもよい。例えば、ＧＨタンパク質を含有する組成物を、ＧＨＲｄ３個体の集団、またはＧＨＲｆｌ／ｆｌ個体の集団で評価してもよい。別の態様では、ＧＨ反応の低減に苦しむ個体を治療するように設計された薬物の評価が、ＧＨＲｆｌ／ｆｌ個体の集団で有利に行われる場合がある。
【０１０７】
（ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌの検出）
特定の核酸におけるヌクレオチド変化を検出することによって、本発明に従って、ＧＨＲ遺伝子における他の変異も同定されうると企図する（米国特許第４９８８６１７号、この開示を参照により本明細書に組み込む）。これに関連して、限定されるものではないが、蛍光ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ；米国特許第５６３３３６５号、および米国特許第５６６５５４９号、これらの開示のそれぞれを参照により本明細書に組み込む）、直接ＤＮＡシーケンシング、ＰＦＧＥ分析、サザンまたはノーザンブロッティング、一本鎖高次構造分析（ＳＳＣＡ）、ＲＮＡｓｅプロテクションアッセイ、アレル特異的オリゴヌクレオチド（ＡＳＯ、例えば、米国特許第５６３９６１１号）、ドットブロット分析、変性勾配ゲル電気泳動（例えば、米国特許第５１９０８５６号、この開示を参照により本明細書に組み込む）、ＲＦＬＰ、（例えば、米国特許第５３２４６３１号、この開示を参照により本明細書に組み込む）、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法を含めた様々な異なったアッセイが企図される。例えば生物体液中の遺伝子配列を検出および定量する方法は、参照により本明細書に組み込まれている米国特許第５４９６６９９号に記載されている。
【０１０８】
（プライマーおよびプローブ）
本明細書に定義するように、プライマーという用語は、テンプレート依存性の過程における、新生核酸の合成をプライミングできるいかなる核酸も包含するものである。プライマーは、通常、長さが１０から２０塩基対までのオリゴヌクレオチドであるが、より長い配列も利用することができる。プライマーは、一本鎖形態が好ましいが、二本鎖形態で提供しても、一本鎖形態で提供してもよい。プローブは、プライマーとしても機能しうるが、異なって定義されるものである。プローブは、おそらくプライミングを行うこともできるが、標的ＤＮＡまたはＲＮＡに結合するように設計され、増幅プロセスで使用される必要がない。
【０１０９】
図３および４は、それぞれ、ＧＨＲ遺伝子におけるエキソン３周辺、またはエキソン３欠失部位周辺のゲノムＤＮＡ配列を提供する。ＧＨＲｆｌ  ｃＤＮＡ配列を配列番号１に示す。ヌクレオチド配列における、ＧＨＲｄ３アレルとＧＨＲｆｌアレルとの間のいかなる相違も、個体における特定のＧＨＲアレルを検出して、識別するために、本発明の方法で使用されうる。ＧＨＲｆｌゲノムＤＮＡまたはｃＤＮＡ分子を同定するために、エキソン３核酸にハイブリッド形成するプライマーを設計してもよい。ＧＨＲｄ３ゲノムＤＮＡを同定するために、ＧＨＲｄ３アレルのゲノムＤＮＡ配列に見られるように、プライマーまたはプローブを、それがＧＨＲ遺伝子のイントロン２とイントロン３との接合部にまたがるように設計して、それによって、エキソン３を含有するＧＨＲｆｌアレルと、エキソン３を含有しないＧＨＲｄ３アレルとを識別してもよい。別の実施例では、エキソン２とエキソン４との接合部にまたがるプライマーまたはプローブを設計して、それによって、エキソン３を含有するＧＨＲｆｌ  ｃＤＮＡ分子と、エキソン３を含有しないＧＨＲｄ３  ｃＤＮＡ分子とを識別することによって、ＧＨＲｄ３  ｃＤＮＡ分子を同定してもよい。ＧＨＲｄ３を検出するのに適したプライマーの他の例は、Ｐａｎｔｅｌら（同上）、および下記実施例１に記載されている。
【０１１０】
本発明は、本発明の方法においてプライマーおよびプローブとして使用に供するポリヌクレオチドも包含する。これらのポリヌクレオチドは、本明細書に提供する配列、およびそれに相補的な配列（「その相補鎖」）のいずれに由来する配列を有するヌクレオチドの連続的な領域からなるものでも、本質的にそのような領域からなるものでも、そのような領域を含むものでもよい。「連続的な領域」は、少なくとも２５、３５、４０、５０、７０、８０、１００、２５０、５００、または１０００ヌクレオチドの長さでありうるが、その上限は、これら、連続的な領域の長さが、特定の配列番号の長さと一致する程度までである。本発明のポリヌクレオチドは、配列表に示す所定の標的配列を取り囲む正確な隣接配列を有するものに限定されないことに留意されたい。むしろ、多型を取り囲む隣接配列、またはマーカーからより遠方にある本発明のプローブもしくはプライマーのいかなるものも、それらの所期の使用に適合するいかなる程度にでも、伸長または短縮されうることが理解されよう。そして、本発明は、そのような配列を明確に企図するものである。本明細書に記載のポリヌクレオチドは、それらの所期の使用に適合するいかなる長さのものでもよいことが理解されよう。また、連続的な領域の外にある隣接領域は、実際にヒト対象に存在する天然の隣接配列に相同である必要はない。ヌクレオチドの所期の使用に適合するいかなるヌクレオチド配列の付加も、明確に企図するものである。好ましいポリヌクレオチドは、配列番号１、４、または６、およびそれに相補的な配列に由来する配列を有するヌクレオチドの連続的な領域からなるか、本質的にそのような領域からなるか、そのような領域を含むものでありうる。「連続的な領域」は、少なくとも８、１０、１２、１５、５０、７０、８０、１００、２５０、５００、または１０００ヌクレオチドの長さでありうる。
【０１１１】
本発明のプローブは、当技術分野で公知のいかなる方法のための、開示されている配列から設計してもよく、詳細には、本明細書に開示する特定の配列またはマーカーが存在するかどうか試験するのを可能にする方法のための配列から設計できる。好ましいプローブのセットは、当技術分野で公知である任意の方法による、本発明のハイブリダイゼーションアッセイで使用するために、それらが、多型における１つのアレルに選択的に結合し、他のアレルにはいかなる特定のセットのアッセイ条件下でも結合しないように設計してもよい。
【０１１２】
必要に応じて、本発明のいずれのポリヌクレオチドも、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的な方法で検出可能な標識を組み込むことによって標識することができる。例えば、有用な標識には、放射性物質、蛍光色素、またはビオチンが含まれる。ポリヌクレオチドは、それらの３’末端および５’末端で標識することが好ましい。標識は、プライマー、または、増幅されたＤＮＡなどのプライマー伸長産物が固形担体上に固定されるのを促進するように、プライマーを捕捉するのに用いることができる。捕捉標識は、プライマーまたはプローブに結合され、固相試薬の特異的結合部（例えば、ビオチン、およびストレプトアビジン）と結合ペアを形成する特異的結合部となりうる。したがって、それは、ポリヌクレオチドまたはプローブに保持される標識のタイプに応じて、標的ＤＮＡを捕捉するか、または検出するのに利用されうる。さらに、本発明が提供するポリヌクレオチド、プライマー、またはプローブは、それら自体が捕捉標識として機能しうることも理解されよう。例えば、固相試薬の結合部が核酸配列である場合には、それが、プライマーまたはプローブにおける相補的な部分に結合して、それによって固相にプライマーまたはプローブが固定されるように選択してもよい。ポリヌクレオチドプローブ自体が結合部として機能する場合には、そのプローブは、標的に相補的ではない配列または「テール(tail)」を含有するであろうと、当業者は認識するであろう。ポリヌクレオチドプライマー自体が捕捉標識として機能する場合には、プライマーの少なくとも一部は、固相上の核酸とハイブリッド形成するように遊離した状態にあるだろう。ＤＮＡ標識の方法は、当業者に周知のものである。
【０１１３】
本発明のポリヌクレオチド、プライマー、およびプローブはいずれも、好都合に固形担体上に固定することができる。固形担体は、当業者に公知であり、これには反応トレーにおけるウェルの壁、試験管、ポリスチレンビーズ、磁性ビーズ、ニトロセルロース細片、膜、ラテックス粒子などのマイクロ粒子、ヒツジ（または、他の動物）赤血球、ドュラサイト(duracyte)などが含まれる。固形担体はあまり重要ではなく、当業者ならば選択することができる。したがって、ラテックス粒子、マイクロ粒子、磁性または非磁性ビーズ、膜、プラスチック管、マイクロタイターウェルの壁、ガラスまたはシリコンチップ、ヒツジ（または、他の適切な動物の）赤血球、およびドュラサイトは、すべて適したものの例である。固相に核酸を固定する適切な方法には、イオン性、疎水性、共有結合性相互作用、および同様のものが含まれる。本明細書において、固形担体は、不溶性であるか、または後続の反応で不溶性にすることができるいかなる物質も指す。固形担体は、捕捉試薬を誘引して、固定する固有の性能によって選択できる。別法では、捕捉試薬を誘引して、固定する性能を有する追加の受容体を保持することができる。追加の受容体には、捕捉試薬自体、または、捕捉試薬に結合された荷電された物質に対して、反対の荷電を有する荷電物質が含まれうる。さらに別の別法では、受容体分子は、固形担体に固定され（結合し）、かつ、特異的な結合反応によって捕捉試薬を固定する性能を有するいかなる特異的結合部でもありうる。受容体分子は、アッセイの実施中、またはアッセイの実施前に、捕捉試薬が固形担体物質に間接的に結合するのを可能にする。したがって、固相は、試験管、マイクロタイターウェル、シート、ビーズ、マイクロ粒子、チップのプラスチック、変性プラスチック、磁性もしくは非磁性金属、ガラス、またはシリコン表面、ヒツジ（または、他の適当な動物）赤血球、ドュラサイト、および当業者に公知の他の構成でありうる。本発明のポリヌクレオチドは、１つの固形担体に個別に、または、少なくとも２、５、８、１０、１２、１５、２０、または２５種類の本発明の異なったポリヌクレオチドのグループで、結合または固定されうる。さらに、本発明のポリヌクレオチドではないポリヌクレオチドが、本発明の１つまたは複数のポリヌクレオチドと同じ固形担体に結合してもよい。
【０１１４】
本発明が提供するいかなるポリヌクレオチドも、固形担体上の重複した領域、または無作為な位置に結合しうる。別法では、本発明のポリヌクレオチドは、各ポリヌクレオチドが固形担体における、他のいずれのポリヌクレオチドの結合部位とも重ならない個別の領域に結合するように、規則的なアレイとして結合させてもよい。ポリヌクレオチドのそのような規則的なアレイは、個別の位置が、記録され、アッセイ手順の一部として利用できるように、「アドレス可能(addressable)」に設計されることが好ましい。通常、アドレス可能なポリヌクレオチドアレイは、既知である異なった位置で基質表面と結合する複数の異なったオリゴヌクレオチドプローブを含む。各ポリヌクレオチド位置の正確な位置を知ることによって、これらの「アドレス可能」なアレイがハイブリダイゼーションアッセイで特に有用なものとなる。本発明のポリヌクレオチドを用いて、当技術分野で公知のいかなるアドレス可能なアレイ技術を利用することもできる。これらポリヌクレオチドアレイの特定の一実施形態が、Genechips（登録商標）として知られているものであり、米国特許第５１４３８５４号；国際公開ＷＯ９０／１５０７０号およびＷＯ９２／１００９２号に概ね記載されている。これらのアレイは、通常、機械的合成法、または、光リソグラフィー法および固相オリゴヌクレオチド合成の組合せを取り入れた光誘導合成法（light directed synthesis method）（Fodorら、Science、第251巻、767〜777ページ、1991年）を用いて生成されうる。固形担体上でのオリゴヌクレオチドアレイの固定は、プローブが通常、チップの固形表面に高密度アレイとして固定される「非常に大きい規模の固定化されたポリマーの合成」（ＶＬＳＩＰＳ）として通常、特定される技術の開発によって可能となった。ＶＬＳＩＰＳ技術の例は、光誘導合成法などの技法によってオリゴヌクレオチドアレイを生成する方法を記載した、米国特許第５１４３８５４号、第５４１２０８７号、国際公開ＷＯ９０／１５０７０号、ＷＯ９２／１００９２号、およびＷＯ９５／１１９９５号に提供されている。固形担体に固定されたヌクレオチドアレイの提供を目的とするストラテジーを設計する際に、ハイブリダイゼーションパターンおよび配列情報を最大にする試みとして、チップ上のオリゴヌクレオチドアレイを整列させて、表示する、さらなるプレゼンテーションストラテジーが開発された。そのようなプレゼンテーションストラテジーの例は、国際公開ＷＯ９４／１２３０５号、ＷＯ９４／１１５３０号、ＷＯ９７／２９２１２号、およびＷＯ９７／３１２５６号に開示されている。
【０１１５】
（テンプレート依存性の増幅方法）
所与のテンプレート試料に存在するマーカー配列を増幅するのに、多くのテンプレート依存過程が利用可能である。最もよく知られている増幅方法の１つは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲと呼ばれる）であり、これは、参照によりそれぞれが全体として本明細書に組み込まれている米国特許第４６８３１９５号、第４６８３２０２号、および第４８００１５９号、ならびにInnisら、PCR Protocols、Academic Press、San Diego Calif.、1990年に詳細に記載されている。
【０１１６】
簡潔には、ＰＣＲでは、マーカー配列における対向した相補鎖上の領域に相補的な２つのプライマー配列を調製する。過剰量のデオキシヌクレオシド３リン酸を、ＤＮＡポリメラーゼ、例えばＴａｑポリメラーゼと共に反応混合液に添加する。マーカー配列が試料に存在する場合には、プライマーがマーカーに結合して、ポリメラーゼがヌクレオチドを付加することによって、マーカー配列に則したプライマーの伸長が引き起こされるだろう。反応混合物の温度を上昇させ、そして低下させることによって、伸長したプライマーがマーカーから解離して、反応生成物が形成され、過剰量のプライマーがマーカーおよび反応生成物に結合することによって、この過程が反復されることになる。
【０１１７】
逆転写酵素ＰＣＲ増幅法を行って、増幅されるｍＲＮＡの量を定量してもよい。ＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写する方法は、Sambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual、第２版、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.、1989年に詳細に記載されている。逆転写を行う別法では、熱安定性のＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼを利用する。これらの方法は国際公開ＷＯ９０／０７６４１号に記載されている。ポリメラーゼ連鎖反応法は、当技術分野で周知のものである。
【０１１８】
増幅を行う別の方法には、リガーゼ連鎖反応がある（「ＬＣＲ」、米国特許第５４９４８１０号、第５４８４６９９号、欧州特許第３２０３０８号、これらの開示のそれぞれを参照により本明細書に組み込む）。ＬＣＲでは、２対の相補的なプローブ対が調製されて、標的配列の存在下で、各対が標的における対向した相補鎖に、それらが隣接するように結合することになる。リガーゼの存在下で、２対のプローブ対が連結され、単一ユニットを形成することになる。
【０１１９】
ＰＣＲと同様に温度サイクルを実行することによって、結合している連結済みユニットが標的から解離して、過剰量のプローブ対が連結するための「標的配列」として機能する。米国特許第４８８３７５０号は、プローブ対を標的配列に結合させる、ＬＣＲと同様の方法を記載する。
【０１２０】
本発明におけるさらに別の増幅方法として、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼであるQbeta Replicaseを用いることができる。この方法では、標的の配列に相補的な領域を有する複製ＲＮＡ配列を、ＲＮＡポリメラーゼの存在下で試料に添加する。その後、ポリメラーゼは、検出可能な複製配列をコピーすることになる。ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼが相補的一本鎖分子を生成するためのテンプレートとして機能しうる組換えＲＮＡ分子を用いた同様の方法も、米国特許第４７８６６００号に記載されており、この開示を参照により本明細書に組み込む。このように形成された生成物分子も、元の組換えＲＮＡ分子のさらなるコピーを生成するためのテンプレートとして機能しうる。
【０１２１】
制限部位における一方のストランドにヌクレオチド５’−［α−チオ］−三リン酸を含有する標的分子の増幅を実現するために、制限エンドヌクレアーゼおよびリガーゼを用いる等温増幅法も、本発明における核酸の増幅に有用でありうる（Walkerら（1992年）、Proc Nat'l Acad Sci.USA、第89巻、392〜396ページ；米国特許第５２７０１８４号、これらの開示を参照により本明細書に組み込む）。米国特許第５７４７２５５号（参照により本明細書に組み込む）は、ポリヌクレオチドの検出に切断可能なオリゴヌクレオチドを用いる等温増幅を記載する。そこに記載された方法では、相互に相補的な配列を含有し、かつ少なくとも１つの切断可能な連結を含有するオリゴヌクレオチドの別々の集合が提供され、これらの連結は、それを含有する完全一致した二本鎖分子が形成されたときにはいつでも切断されるものである。標的ポリヌクレオチドが接触したときに、第１のオリゴヌクレオチド切断が起こり、第２のオリゴヌクレオチドとハイブリッド形成しうる第１のフラグメントが生成される。このハイブリダイゼーションによって、第２のオリゴヌクレオチドが切断されて、次に、標的ポリヌクレオチドと同様にして、第１のオリゴヌクレオチドにハイブリッド形成しうる第２のフラグメントが放出される。
【０１２２】
核酸の等温増幅を実行する別の方法には、複数回の鎖置換および鎖生成、すなわちニック翻訳を行う鎖置換増幅（ＳＤＡ）がある（例えば、米国特許第５７４４３１１号；第５７３３７５２号；第５７３３７３３号；第５７１２１２４号）。
【０１２３】
修復連鎖反応(Repair Chain Reaction）(ＲＣＲ)と呼ばれる同様の方法は、増幅の標的にされた領域全体にわたっていくつかのプローブをアニーリングさせ、その後、４種類の塩基のうち２種類のみが存在する修復反応を行うものである。残り２種類の塩基は、容易な検出が行えるようにビオチン化された誘導体として添加することができる。同様のアプローチはＳＤＡでも用いられる。標的に特異的な配列の検出は、循環プローブ反応(cyclic probe reaction)(ＣＰＲ)を用いて行うこともできる。ＣＰＲでは、３’側および５’側に非特異的配列のＤＮＡを有し、かつ中央に特異的配列のＲＮＡを有するプローブを、試料中にあるＤＮＡにハイブリッド形成させる。ハイブリダイゼーションの際に、反応物をＲＮアーゼＨで処理し、消化後に放出される特有の産物として、プローブの産物を検出する。元のテンプレートが別の循環プローブ（cycling probe）にアニーリングして、反応が反復される。
【０１２４】
それぞれが参照により全体として本明細書に組み込まれている英国出願第２２０２３２８号、およびＰＣＴ出願第ＵＳ８９／０１０２５号に記載されているさらに別の増幅方法も、本発明に従って使用されうる。前者の出願では、ＰＣＲ様のテンプレート依存性および酵素依存性合成に、「修飾」されたプライマーを用いる。これらのプライマーは、捕捉部分（例えば、ビオチン）および／または検出部分（例えば、酵素）で標識することによって修飾してもよい。後者の出願では、過剰量の標識プローブを試料に添加する。これらのプローブは、標的配列の存在下で結合し、触媒によって切断される。プローブの切断後、標的配列は完全な状態のままで放出され、過剰量のプローブがこれに結合する。標識プローブの切断は標的配列の存在を示すものである。
【０１２５】
他の核酸増幅法には、核酸配列依存性増幅(nucleic acid sequence based amplification)(ＮＡＳＢＡ)および３ＳＲを含めた転写依存性増幅システム(transcription-based amplification systems)(ＴＡＳ)が含まれる（Kwokら、Proc.Nat'l.Acad.Sci.USA（1989年）、第86巻、1173ページ；国際公開ＷＯ８８／１０３１５号、これらの開示を参照により全体として本明細書に組み込む）。ＮＡＳＢＡでは、標準的なフェノール／クロロホルム抽出、臨床試料の加熱変性、溶解緩衝液での処理、ならびに、ＤＮＡおよびＲＮＡ単離用ミニスピンカラム、またはＲＮＡの塩化グアニジニウム抽出で核酸を調製することができる。これらの増幅技法は、標的特異的な配列を有するプライマーをアニーリングさせるものである。ポリメリゼーションの後、ＤＮＡ／ＲＮＡハイブリットは、ＲＮアーゼＨで消化され、一方、二本鎖ＤＮＡ分子は、再度、熱変性される。いずれの場合でも、一本鎖ＤＮＡは、第２の標的特異的プライマーの添加と、それに続くポリメリゼーションとによって、完全な二本鎖となる。二本鎖ＤＮＡ分子は、その後、Ｔ７またはＳＰ６などのＲＮＡポリメラーゼによって転写され、増幅される。等温環状反応(isothermal cyclic reaction)の１つでは、ＲＮＡが一本鎖ＤＮＡに逆転写され、次に、この一本鎖ＤＮＡが二本鎖ＤＮＡに変換され、さらに、Ｔ７またはＳＰ６などのＲＮＡポリメラーゼで、再度、転写される。この結果生成される、末端を欠如しているか、または完全長の産物によって、標的特異的な配列の存在が示される。
【０１２６】
Ｄａｖｅｙら、欧州特許第３２９８２２号（参照により全体として本明細書に組み込む）は、一本鎖ＲＮＡ（「ｓｓＲＮＡ」）、ｓｓＤＮＡ、および二本鎖ＤＮＡ（ｄｓＤＮＡ）の循環的合成を行う核酸増幅過程を開示するものであるが、この過程も本発明に従って使用されうる。ｓｓＲＮＡは、第１のプライマーオリゴヌクレオチドのテンプレートであり、逆転写酵素（ＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼ）によって伸長される。ＲＮＡは、この結果生成されるＤＮＡ：ＲＮＡ二本鎖から、リボヌクレアーゼＨ（ＲＮアーゼＨ、ＤＮＡまたはＲＮＡとの二本鎖分子中にあるＲＮＡに特異的なＲＮアーゼ）の作用で除去される。この結果生成されるｓｓＤＮＡは、第２のプライマーのテンプレートであり、ＲＮＡポリメラーゼプロモーター（Ｔ７ＲＮＡポリメラーゼを例とする）の配列も、テンプレートに相同性を有する部分の５’側に含有する。次に、このプライマーがＤＮＡポリメラーゼ（大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）ＤＮＡポリメラーゼＩの「クレノウ(Klenow)」ラージフラグメントを例とする）によって伸長され、この結果、元のＲＮＡにおけるプライマーの間の配列と同一の配列を有し、さらにこれに加えて末端の１つにプロモーター配列を有する二本鎖ＤＮＡ（「ｄｓＤＮＡ」）分子が生成する。このプロモーター配列は、適当なＲＮＡポリメラーゼがこのＤＮＡのＲＮＡコピーを多数生成するのに使用できる。これらのコピーは、サイクルへの再入が可能であり、それによって、非常に迅速な増幅が行われる。酵素を適切に選択することで、酵素を各サイクルで添加しないでも、等温増幅を行うことができる。この過程は循環性を特徴とするので、開始配列は、ＤＮＡの形態、またはＲＮＡの形態のいずれかに選択することができる。
【０１２７】
ＰＣＴ出願ＷＯ８９／０６７００（参照により全体として本明細書に組み込む）は、標的一本鎖ＤＮＡ（「ｓｓＤＮＡ」）にプロモーター／プライマー配列をハイブリッド形成させ、それに続いて、その配列のＲＮＡコピーを多数転写させることに基づく核酸配列増幅スキームを開示する。このスキームは、循環性ではなく、したがって、結果として生成されるＲＮＡ転写産物から新規のテンプレートが生成されることはない。他の増幅方法には、「ＲＡＣＥ」および「片側ＰＣＲ(one-sided PCR)」が含まれる（Frohman、PCR Protocols.A Guide To Methods And Applications、Academic Press、N.Y.、1990年；（O'haraら（1989年）、Proc.Nat'l.Acad.Sci.USA、第86巻、5673〜5677ページ；これらの開示のそれぞれを参照により全体として本明細書に組み込む）。
【０１２８】
結果として生成される「ジ−オリゴヌクレオチド(di-oligonucleotide)」の配列を有する核酸の存在下で、２つ（またはさらに多く）のオリゴヌクレオチドを連結して、それによってジ−オリゴヌクレオチドを増幅することに基づいた方法も、本発明の増幅ステップで使用されうる（Wuら（1989年）、Genomics、第４巻、560ページ、参照により本明細書に組み込む）。
【０１２９】
（サザン／ノーザンブロッティング）
ブロッティングは、当業者に周知のものである。サザーンブロッティングは標的としてＤＮＡを使用する。一方ノーザンブロッティングは標的としてＲＮＡを使用する。それぞれ異なったタイプの情報を提供するものであるが、ｃＤＮＡブロッティングは、多くの側面においてＲＮＡ種のブロッティングに類似性を有する。
【０１３０】
簡潔には、プローブを用いて、適当なマトリクス、多くの場合ニトロセルロースフィルターに固定されたＤＮＡまたはＲＮＡ種を標的とする。分析を容易にするために、異なった分子種のものは、空間的に分離するべきである。これは、フィルターで「ブロッティング」を行う前に、核酸種のゲル電気泳動を行うことによって実現する。
【０１３１】
次に、変性およびリハイブリダイゼーションを促進する条件下で、ブロットされた標的をプローブ（通常、標識されている）とインキュベートする。プローブは標的と塩基対形成するように設計されるので、リハイブリダイゼーション条件下では、標的配列の一部にプローブが結合することになる。その後、結合しなかったプローブを除去し、上述の通りに検出が行われる。
【０１３２】
（分離方法）
特異的な増幅が起きたかどうか判定するためには、通常、テンプレートと、過剰量のプライマーとを、いずれかの段階で増幅産物から分離することが望ましい。一実施形態では、標準法を用いて、アガロース、アガロースアクリルアミド、またはポリアクリルアミドゲル電気泳動を行うことによって、増幅産物を分離する。Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９年を参照のこと。
【０１３３】
別法として、クロマトグラフィー法を用いて分離を行ってもよい。本発明で使用されうるクロマトグラフィーには、吸着、分配、イオン交換、および分子ふるいなど、多くの種類のものがあり、また、カラム、ペーパー、薄層、およびガスクロマトグラフィーを含めた、それらを用いるための多くの専門技術もある（Freifelder、Physical Biochemistry Applications to Biochemistry and Molecular Biology、第２版、Wm.Freeman and Co.、New York、N.Y.、1982年）。
【０１３４】
（検出方法）
マーカー配列の増幅を確認するために、産物を可視化してもよい。可視化を行う典型的な方法の１つは、エチジウムブロマイドでゲルを染色し、ＵＶ光の下で可視化するものである。別法として、放射性標識または蛍光標識されたヌクレオチドによって、標識が増幅産物に組み込まれている場合には、分離の後、エックス線フィルムに増幅産物を曝露するか、または適切な励起スペクトルの下で可視化することができる。
【０１３５】
一実施形態では、可視化は間接的に行われる。増幅産物を分離した後、標識された核酸プローブを、増幅されたマーカー配列と接触させる。プローブは、発色団に結合させるのが好ましいが、放射性標識してもよい。別の実施形態では、プローブは、抗体またはビオチンなどの結合パートナーに結合され、結合ペアのもう一方のメンバーが検出可能な部分を保持する。
【０１３６】
一実施形態では、標識されたプローブによって検出を行う。これに関する方法は、当業者にとって周知のものであり、分子生物学プロトコールに関する多くの標準的な文献に見いだすことができる。Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９年を参照のこと。例えば、発色団または放射性標識されたプローブまたはプライマーは、増幅中または増幅後に標的を同定する。
【０１３７】
上述のものの一例が、参照により本明細書に組み込まれている米国特許第５２７９７２１号に記載されており、これは、自動化された核酸の電気泳働およびトランスファーを行う装置および方法を開示する。この装置は、外部でのゲルの操作なしで、電気泳働およびブロッティングを可能にし、本発明による方法を実行するのに適した理想的なものである。
【０１３８】
さらに、特定の種類の変異を同定するために、標準的な配列分析法を用いて、上述した増幅産物の配列分析を行ってもよい。ある種の方法では、最適なシーケンシングが行われるように設計されたプライマーセットを用いた配列分析によって、遺伝子の網羅的分析を行う（Pignonら、Hum.Mutat.、第３巻、126〜132ページ、1994年）。本発明は、それによって、これらのタイプの分析のいずれも、または全てが用いられうる方法を提供する。本明細書に開示した配列を用いて、ＧＨＲ遺伝子全体にわたりその配列の増幅が可能となるように、オリゴヌクレオチドプライマーを設計することができ、増幅したＧＨＲ遺伝子は、その後、直接配列決定によって分析されうる。
【０１３９】
ＧＨＲ遺伝子の直接配列決定には、当技術分野で公知の様々なシーケンシング反応のいずれを用いることもでき、これは、対応する野生型（対照）配列と、試料の配列とを比較することによって行われる。シーケンシング反応の例には、Maxam及びGilbert（（1977年）、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、第74巻、560ページ）、またはSanger（（1977年）、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、第74巻、5463ページ）によって開発された技法に基づくものが含まれる。診断検査を行う際に、様々な自動シーケンシング法のいかなるものも使用できることも企図する。
【０１４０】
（キットコンポーネント）
ＧＨＲ、およびその変種を検出して、配列決定するのに必要なすべての必須物質および試薬を、１つのキットに併せて組み込んでもよい。通常、これは、予め選択されたプライマーおよびプローブを含むであろう。様々なポリメラーゼ（ＲＴ、Ｔａｑ、Ｓｅｑｕｅｎａｓｅ（商標）など）を含めた、核酸の増幅に適した酵素、デオキシヌクレオチド、および、必要な増幅用反応混合物を提供するための緩衝液も含まれうる。そのようなキットは、個々の試薬および酵素それぞれ、および各プライマーまたはプローブのための個別の容器を、通常、適切な方法で含むだろう。
【０１４１】
（相対的定量的ＲＴ−ＰＣＲ（商標）の設計および理論上の要件）
対象から単離された特定のｍＲＮＡ種の相対濃度を測定するために、ＲＮＡのｃＤＮＡへの逆転写（ＲＴ）、および、それに続く相対的定量的ＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）を用いることができる。特定のｍＲＮＡ種の濃度が異なっていることを測定することで、特定のｍＲＮＡ種をエンコードする遺伝子が異なって発現されていることが示される。例えば、定量的ＰＣＲは、ＧＨＲ経路を介して作用する薬剤で治療されることになっている対象、ＧＨＲ活性が低減している疑いがある対象、または、好ましくは低身長、肥満症、感染症、または糖尿病；乳腺刺激性、糖尿病誘発性、脂肪分解性、およびタンパク質同化性の影響に関連するかもしれない先端巨大症または巨人症状態；ナトリウム貯留および水貯留に関連した状態；代謝症候群；気分障害および睡眠障害、癌、心臓病、ならびに高血圧に罹患している対象におけるＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌ  ｍＲＮＡの相対的レベルを検査するのに有用でありうる。
【０１４２】
ＰＣＲでは、なんらかの試薬が律速になるまで、増幅された標的ＤＮＡ分子の数が、反応の各サイクルごとに２倍に近い倍率で増大する。その後、増幅速度は、ますます低減し、ついには、増幅された標的の数がサイクル間で増大しなくなる。サイクル数がｘ軸にあり、増幅された標的ＤＮＡ濃度の対数がｙ軸にあるグラフをプロットすると、プロットされた点を接続することによって、独特の形の曲線が形成される。第１のサイクルに始まって、線の勾配は、正の一定値となる。これを、曲線の線形部分という。ある試薬が律速になった後では、線の勾配が低減し始めて、最終的にはゼロになる。この時点では、増幅された標的ＤＮＡの濃度が、ある一定値に漸近する。これを曲線のプラトー部分という。
【０１４３】
ＰＣＲ増幅の線形部分における標的ＤＮＡの濃度は、反応が始まる前における対象の開始濃度に正比例している。線形部分にあって、同じ数のサイクルを完了したＰＣＲ反応における標的ＤＮＡの増幅された産物の濃度を測定することによって、元のＤＮＡ混合物中にあった特定の標的配列の相対濃度を測定することが可能である。ＤＮＡ混合物が異なった組織または細胞から単離されたＲＮＡから合成されたｃＤＮＡである場合、それぞれの組織または細胞について、標的配列が由来する特定のｍＲＮＡの相対的量を測定することができる。ＰＣＲ産物の濃度と、相対的なｍＲＮＡ存在量との間にあるこの直接的比例性は、ＰＣＲ反応の直線領域においてのみ成り立つ。
【０１４４】
曲線のプラトー部分における標的ＤＮＡの最終濃度は、反応混合物中で利用可能な試薬の量によって決定され、標的ＤＮＡの元の濃度とは関係ない。したがって、一群のＲＮＡ集合におけるｍＲＮＡ種の相対量が、ＲＴ−ＰＣＲで測定可能となる前に満たされなければならない第１の条件は、ＰＣＲ反応が曲線の線形部分にあるときに、増幅されたＰＣＲ産物の濃度を抽出検査しなければならないということである。
【０１４５】
特定のｍＲＮＡ種の相対量を成功裡に測定するためにＲＴ−ＰＣＲ実験が満たさなければならない第２の条件は、増幅可能なｃＤＮＡの相対濃度を、なんらかの独立した標準物質に対して正規化しなければならないということである。ＲＴ−ＰＣＲ実験の目標は、試料中にある全ｍＲＮＡ種の平均存在量と比較した特定のｍＲＮＡ種の存在量を測定することである。以下に記載された実験では、ＧＨＲｄ３  ｍＲＮＡの相対量を、それに対して比較する標準物質として、ＧＨＲｆｌのｍＲＮＡを用いることができる。
【０１４６】
競合的ＰＣＲのほとんどのプロトコールでは、標的とほぼ同程度の存在量である内部ＰＣＲ標準物質を用いる。これらのストラテジーは、ＰＣＲ増幅の産物が、それらの線形フェーズ中に抽出検査された場合には有効である。反応がプラトー期に接近しているときに、産物を抽出検査した場合、存在量がより少ない産物が、相対的に過大表示される。ＲＮＡ試料の示差的発現を検査する場合など、多くの異なったＲＮＡ試料に関する相対量の比較では、ＲＮＡの相対量における相違が実際に存在する相違より小さく現れるような曲解が生じる。内部標準の存在量が標的よりはるかに多い場合には、これは大きな問題ではない。内部標準の存在量が標的より多い場合には、ＲＮＡ試料間で直接的な線形比較を行うことができる。
【０１４７】
上記の考察は、臨床的に由来する物質のＲＴ−ＰＣＲアッセイに関する理論上の要件を説明したものである。臨床試料固有の問題は、それらの量が様々であること（正規化を難しくする）、および、それらの質も様々であること（好ましくは標的よりサイズが大きい信頼できる内部対照の同時増幅を必要とする）である。これらの問題は両方とも、ＲＴ−ＰＣＲを相対的定量的ＲＴ−ＰＣＲとして内部標準を用いて行い、内部標準が、標的ｃＤＮＡ断片より大きい増幅可能なｃＤＮＡ断片であり、かつ、内部標準をエンコードするｍＲＮＡの存在量が、標的をエンコードするｍＲＮＡより約５〜１００倍多い場合には克服される。このアッセイは、それぞれのｍＲＮＡ種の絶対量ではなく、相対量を測定するものである。
【０１４８】
他の研究は、外部標準プロトコールによる、より従来的な相対的定量的ＲＴ−ＰＣＲアッセイを用いて行われうる。これらのアッセイでは、その増幅曲線の線形部分でＰＣＲ産物を抽出検査する。抽出検査に最適のＰＣＲサイクル数は、それぞれの標的ｃＤＮＡ断片について経験的に決定するべきである。さらに、様々な組織試料から単離された各ＲＮＡ集団の逆転写酵素産物は、増幅可能なｃＤＮＡが等しい濃度となるように慎重に正規化するべきである。このアッセイは絶対ｍＲＮＡ存在量を測定するので、この要件は非常に重要である。絶対ｍＲＮＡ存在量は、正規化した試料においてのみ示差的遺伝子発現の尺度として用いることができる。増幅曲線における直線領域の経験的決定、およびｃＤＮＡ試料の正規化は退屈で時間のかかる過程であるが、この結果行われるＲＴ−ＰＣＲ分析は、内部標準を用いた相対的定量的ＲＴ−ＰＣＲアッセイで得られたものより優れている場合がある。
【０１４９】
この利点の１つの理由は、内部標準／競合物質がなければ、試薬のすべてを、増幅曲線の直線領域にある単一のＰＣＲ産物に変換でき、したがって、アッセイの感受性が増大されることにある。別の理由は、ＰＣＲ産物が１つだけなら、電気泳動ゲルでの産物の提示、または別の提示方法がより単純になり、バックグランドが低下し、解釈しやすくなることである。
【０１５０】
（チップ技術）
本発明者らは、Haciaら（（1996年）、Nature Genetics、第14巻、441〜447ページ）、およびShoemakerら（（1996年）Nature Genetics、14巻、450〜456ページ）によって記載されたものなどのチップベースのＤＮＡ技術を明確に企図する。簡潔には、これらの技術は、多数の遺伝子を迅速かつ正確に分析する定量方法を用いる。オリゴヌクレオチドで遺伝子にタグを付けることによって、または、固定されたプローブアレイを用いることによって、チップ技術を用いて、標的分子を高密度アレイとして分離し、ハイブリダイゼーションに基づいて、これらの分子をスクリーニングすることができる。Peaseら（（1994年）Proc.Nat'l.Acad.Sci.USA、第91巻、5022〜5026ページ）；Fodorら（（1991年）、Science、第251巻、767〜773ページ）も参照のこと。
【０１５１】
（ＧＨＲｄ３またはＧＨＲｆｌタンパク質を検出する方法）
抗体は、健康組織または疾患組織におけるＧＨＲｄ３および／またはＧＨＲｆｌ含量の特徴付けを行うのに、ＥＬＩＳＡおよびウェスタンブロッティングなどの技法で用いることができる。ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを取得する方法は、本明細書にさらに記載するものであり、公知の方法を用いて実行できる。同様に、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌアイソフォームに選択的に結合可能な抗体を調製する方法も、本明細書にさらに記載するものである。
【０１５２】
一例において、ＧＨＲｄ３とＧＨＲｆｌとを識別しないＧＨＲｄ３抗体、ＧＨＲｆｌ抗体、およびＧＨＲ抗体を含めたＧＨＲ抗体がＥＬＩＳＡアッセイに使用されうることが企図される。例えば、抗ＧＨＲ抗体は、選択された表面、好ましくは、ポリスチレンマイクロタイタープレートのウェルなど、タンパク質親和性を示す表面に固定する。洗浄によって、完全に吸着されていない物質を除去した後、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）、カゼイン、または粉乳溶液など、試験抗血清に関して抗原として中立であることが判明している非特異的なタンパク質をアッセイプレートウェルに結合させるか、またはそれを用いてコーティングを行うことが望ましい。これは、固定する表面における非特異的な吸着部位のブロッキングを可能にし、したがって、抗原の表面への非特異的結合によって引き起こされるバックグランドを低下させる。
【０１５３】
ウェルに抗体を結合させ、バックグランドを低下させるために非反応性物質でコーティングし、そして、結合しなかった物質を除去するために洗浄した後、試験試料を、免疫複合体（抗原／抗体）形成に寄与するような方法で固定する表面に接触させる。
【０１５４】
試験試料と結合抗体と間の特異的免疫複合体を形成させ、それに続いて洗浄を行った後、第１の抗体とは異なったＧＨＲに対する特異性を有する第２の抗体で同様の処理をすることによって、免疫複合体形成の存在および量さえも測定されうる。適切な条件には、好ましくは、ＢＳＡ、ウシガンマグロブリン（ＢＧＧ）、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）／Ｔｗｅｅｎ（登録商標）などの希釈剤で試料を希釈することが含まれている。これらの添加される薬剤は、非特異的なバックグランドの低減にも役立つ傾向がある。その後、抗血清を上層し、好ましくは順番に温度約２５℃で、そして約２７℃で、約２から約４時間インキュベートする。インキュベーションの後、抗血清を接触させた表面を洗浄し、免疫複合体を形成しなかった物質を除去する。好ましい洗浄操作には、ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎ（登録商標）またはホウ酸塩緩衝液などの溶液による洗浄が含まれる。
【０１５５】
二次抗体は、好ましくは、適当な発色基質でインキュベートしたときに発色する随伴酵素を有し、それによって検出方法を提供する。したがって、例えば、二次抗体が結合した表面に、ウレアーゼまたはペルオキシダーゼ結合抗ヒトＩｇＧを接触させ、免疫複合体の形成に有利な条件で一定時間インキュベートすること（例えば、ＰＢＳ／Ｔｗｅｅｎ（登録商標）などのＰＢＳ含有溶液中、室温で、２時間のインキュベーション）が望まれよう。
【０１５６】
酵素でタグ付けされた二次抗体でインキュベートし、それに続いて洗浄して、結合しなかった物質を除去した後、酵素標識がペルオキシダーゼである場合には、尿素およびブロムクレゾールパープル、または２，２’−アジノ−ジ−（３−エチル−ベンズチアゾリン）−６−スルホン酸（ＡＢＴＳ）およびＨ２Ｏ２など発色基質とインキュベートすることによって標識の量を定量化する。その後、生じた色の度合いを、例えば、可視スペクトル分光光度計を用いて測定することによって定量を行う。
【０１５７】
上記のフォーマットを改変して、最初に試料をアッセイプレートに結合させてもよい。その後、一次抗体をアッセイプレートとインキュベートし、それに続いて、結合した一次抗体の検出を、一次抗体に特異性を有する標識された二次抗体を用いて行う。
【０１５８】
他の様々な有用な免疫検出方法におけるステップは、例えば、参照により本明細書に組み込まれているNakamuraら、Handbook of Experimental Immunology（第４版）、Weir.E.、Herzenberg、L.A.Blackwell、C.、Herzenberg、L.（編集）、第１巻、第27章、Blackwell Scientific Publ.、Oxford、1987年などの、科学的文献に記載されている。イムノアッセイは、その最も単純かつ直接的な意味において、結合アッセイである。特定の好ましいイムノアッセイは、様々なタイプのラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）およびイムノビーズ捕捉アッセイである。組織切片を用いる免疫組織学的検出も特に有用である。しかし、検出法は、そのような技法に限定されないことが容易に理解されよう。ウェスタンブロッティング、ドットブロッティング、ＦＡＣＳ分析、および同様のものも、本発明に関連して使用されうる。
【０１５９】
好ましい例では、上記に記載の方法を用い、ＧＨＲｄ３特異的抗体を使用して、ＧＨＲｄ３レベルを検出することができる。他の方法では、ＧＨＲの総量がＧＨＲｄ３とＧＨＲｆｌとの識別をせずに測定され、さらに、ＧＨＲｆｌの量が測定される。無差別のＧＨＲ量と、ＧＨＲｆｌの量との差が、存在するＧＨＲｄ３の量を示す。
【０１６０】
そのような方法は、循環しているＧＨＢＰ（例えば、ＧＨＲｄ３またはＧＨＲｆｌの細胞外部分）を検出することが好ましい。操作法の好ましい例は、無差別のＧＨＲの検出（例えば、ＧＨＲｆｌと比較した無差別の総ＧＨＲからＧＨＦｄ３を推定するため）、ＧＨＲｄ３の検出、および／またはＧＨＲｆｌの検出を可能にするものである。そのような操作法には、ＥＬＩＳＡアッセイ、リガンド媒介免疫機能アッセイ（ＬＩＦＡ）、およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）が含まれる。
【０１６１】
無差別のＧＨＲ（例えば、ＧＨＲｄ３またはＧＨＲｆｌ）を検出するためのＬＩＦＡは、Pflaumら（（1993年）、Exp.Clin.Endocrinol、第101（補１）巻、44ページ）及びKratzschら（（2001年）、Clin.Endocrinol、第54巻、61〜68ページ）の方法に従って実行できる。簡潔には、一例において、マイクロタイタープレートをコーティングするのに、抗ｒＧＨＢＰモノクローナル抗体を用いて、無差別のＧＨＲを検出する。血清試料またはグリコシル化されたｒＧＨＢＰ標準物質を、１０ｎｇ／ウェルのｈＧＨ、およびｈＧＨに対するモノクローナル抗体と共にインキュベートする。このモノクローナル抗体は、ビオチン化されたトレーサーとして機能する。シグナルは、ユウロピウム標識されたストレプトアビジンシステムによって増幅され、蛍光計を用いて測定される。別の例では、無差別のＧＨＢＰを検出するために、Kratschら（（1995年）、Eur.J.Endocrinol、第132巻、306〜312ページ）の記載の通りに、抗ｒｈＧＨＢＰ抗体と、ｒｈＧＨＢＰ標準物質と、標識された抗原として１２５Ｉ−ｒｈＧＨＢＰとを用いて競合的ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）を行う。
【０１６２】
Kratzschら（（2001年）、Clin.Endocrinol.、第54巻、61〜68ページ）に記載されている別の例では、ｈＧＨ結合部位の外側でＧＨＢＰに結合するモノクローナル抗体１０Ｂ８（Rowlinsonら（1999年））の５０ｍｍｏｌ／ｌリン酸水素ナトリウム緩衝液（ｐＨ９．６）溶液１００μｌでマイクロタイタープレートをコーティングすることによって、無差別のＧＨＢＰを検出する。洗浄ステップの後、試料または標準物質２５μｌと、ビオチン標識された抗ｒｈＧＨＢＰ  ｍＡｂ  ５Ｃ６（この抗体は、ｈＧＨ結合部位の内部でＧＨＢＰに結合する（Rowlinsonら（1999年））５０ｎｇを含むアッセイ緩衝液（５０ｍＭトリス−（ヒドロキシメチル）−アミノメタン、１５０、ｍＭ  ＮａＣｌ、０．０５％  ＮａＮ３、０．０１％  Ｔｗｅｅｎ（登録商標）４０、０．５％  ＢＳＡ、０．０５％ウシガンマグロブリン、２０μｍｏｌ／ｌジエチレントリアミンペンタ酢酸）７５μｌを添加して、終夜インキュベートする。その後、エキソン３を含有するＧＨＢＰのｆｌ形態に特異的な抗体を用いて、ＧＨＲｆｌの量を測定する。簡潔には、無差別のＧＨＢＰの場合と同様にして、ｍＡｂ  １０Ｂ８をマイクロタイタープレートに固定する。洗浄ステップの後、試料または標準物質２５μｌと、Kratzschら（2001年）に記載されている、ＧＨＲｄ３ペプチドに対するウサギポリクロナール抗体（１：１００００希釈）７５μｌとを添加して、終夜インキュベートする。２０ｎｇのビオチン化されたマウス抗ウサギＩｇＧを各ウェルに添加して、２時間インキュベートした後、繰り返しリンスする。シグナルは、ユウロピウム標識されたストレプトアビジンシステムによって増幅され、蛍光計を用いて測定される。ヒツジ血清で希釈された組換え非グリコシル化ｈＧＨＢＰを標準物質として用いる。
【０１６３】
本発明による使用に供する、ＧＨＲｄ３に特異的な抗体は、公知の方法を用いて取得できる。単離されたＧＨＲｄ３タンパク質、またはその部分もしくはフラグメントを免疫原として使用して、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体を調製する標準的な技法を用いて、ＧＨＲｄ３に結合する抗体を産生することができる。ＧＨＲｄ３タンパク質を使用することもできるが、その代替として、本発明は、免疫原として使用するために、ＧＨＲｄ３の抗原性ペプチド断片を提供する。
【０１６４】
ＧＨＲｄ３ポリペプチドは、個体から得られた生物試料から精製することによって、また、より好ましくは組換えポリペプチドとして、公知の方法を用いて調製することができる。ＧＨＲｆｌアミノ酸配列を配列番号２および３に示すが、ＧＨＲｄ３は、エキソン３によってエンコードされる２２アミノ酸が欠失している点で、これとは相違している。ＧＨＲｄ３の抗原性ペプチドは、配列番号２および３に示すアミノ酸配列のうち、少なくとも８アミノ酸残基を含み、少なくとも１つのアミノ酸は、上記エキソン３にエンコードされているアミノ酸残基の外にあることが好ましい。上記抗原性ペプチドは、ＧＨＲｄ３のエピトープの１つを包含し、それによって、このペプチドに対して生成された抗体は、ＧＨＲｄ３と特異的な免疫複合体を形成する。抗体は、ＧＨＲｄ３に選択的または優先的に結合し、ＧＨＲｆｌには実質上結合しないことが好ましい。抗原性ペプチドは、好ましくは少なくとも１０アミノ酸残基、より好ましくは少なくとも１５アミノ酸残基、さらにより好ましくは少なくとも２０アミノ酸残基、そして最も好ましくは少なくとも３０アミノ酸残基を含む。
【０１６５】
抗原性ペプチドによって包含される好ましいエピトープは、このタンパク質の表面に位置するＧＨＲｄ３の領域（例えば、親水性領域）である。
【０１６６】
ＧＨＲｄ３免疫原は、通常、この免疫原で適当な対象（例えば、ウサギ、ヤギ、マウス、または他の哺乳動物）を免疫処置することによって抗体を調製するのに用いられる。適当な免疫原性試料は、例えば、組換え発現されたＧＨＲｄ３タンパク質、または化学的に合成されたＧＨＲｄ３ポリペプチドを含有しうる。この試料は、フロイントの完全アジュバントもしくは不完全アジュバント、または同様の免疫活性化薬剤などのアジュバントをさらに含みうる。免疫原性ＧＨＲｄ３試料で適当な対象を免疫処置すると、ポリクローナル抗ＧＨＲｄ３抗体反応が誘導される。
【０１６７】
したがって、本発明の別の態様は、抗ＧＨＲｄ３抗体に関する。本明細書において、「抗体」という用語は、免疫グロブリン分子と、免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、ＧＨＲｄ３などの抗原に特異的に結合（免疫反応）する抗原結合部位を含有する分子のことをいう。免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分の例には、ペプシンなどの酵素で抗体を処理することによって生成されうるＦ（ａｂ）フラグメントおよびＦ（ａｂ’）２フラグメントが含まれる。本発明は、ＧＨＲｄ３に結合するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を提供する。本明細書において、「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、特定のＧＨＲｄ３エピトープと免疫反応できる抗原結合部位の単一種のみを含有する抗体分子の集団を指す。したがって、モノクローナル抗体組成物は、通常、それが免疫反応する特定のＧＨＲｄ３タンパク質に対する単一結合親和性を示す。
【０１６８】
本発明は、配列番号２または３における、少なくとも６アミノ酸、好ましくは少なくとも８から１０アミノ酸、より好ましくは少なくとも１２、１５、２０、２５、３０、４０、５０、または１００アミノ酸の連続的な領域を含むエピトープ含有ポリペプチドに選択的に結合可能であるか、または選択的に結合するポリクローナルまたはモノクローナルの抗体組成物であって、好ましくは、上記連続的な領域が、ＧＨＲ遺伝子のエキソン３にエンコードされる上記２２アミノ酸の領域の外にある少なくとも１つのアミノ酸を含んでいる抗体組成物に関する。
【０１６９】
ポリクローナル抗ＧＨＲｄ３抗体は、上述のように、ＧＨＲｄ３免疫原で適当な対象を免疫処置することによって、調製することができる。免疫処置された対象の抗ＧＨＲｄ３抗体価は、固定したＧＨＲｄ３を用いた酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）などの標準的な技法によって、一定期間にわたってモニターすることができる。必要に応じて、ＧＨＲｄ３に対する抗体分子は、哺乳動物（例えば、血液）から単離して、ＩｇＧ画分を得るためのプロテインＡクロマトグラフィーなどの周知の技法によって、さらに精製することができる。免疫処置後の適当なとき、例えば、抗ＧＨＲｄ３抗体価が最も高いときに、対象から抗体産生細胞を得て、Kohler及びMilstein（1975年）、Nature、第256巻、495〜497ページによって最初に記載されたハイブリドーマ技法（Brownら（1981年）、J.Immunol.、第127巻、539〜46ページ；Brownら（1980年）、J.Biol.Chem.、第255巻、4980〜83ページ；Yehら（1976年）、PNAS、第76巻、2927〜31ページ；及び、Yehら（1982年）、Int.J.Cancer、第29巻、269〜75ページも参照のこと）、より最近のヒトＢ細胞ハイブリドーマ技法（Kozborら（1983年）、Immunol Today、第４巻、７２ページ）、ＥＢＶハイブリドーマ技法（Coleら（1985年）、Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy、Alan R.Liss,Inc.、77〜96ページ）、またはトリオーマ技法などの標準的な技法によってモノクローナル抗体を調製するのに使用することができる。モノクローナル抗体ハイブリドーマを産生する技法は周知である（全般的には、R.H.Kenneth、Monoclonal Antibodies：A New Dimension In Biological Analyses、Plenum Publishing Corp.、New York、N.Y.(1980年)；E.A.Lerner(1981年)、Yale J.Biol.Med.、第54巻、387〜402ページ；およびM.L.Gefterら（1977年）、Somatic Cell Genet.、第３巻、231〜36ページを参照のこと）。簡潔には、上述の通りに、ＧＨＲｄ３免疫原によって免疫処置された哺乳動物から得たリンパ球（通常、脾細胞）に、不死化細胞系（通常、骨髄腫）を融合し、この結果得られたハイブリドーマ細胞の培養上清をスクリーニングして、ＧＨＲｄ３に結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを特定する。
【０１７０】
リンパ球と不死化細胞系とを融合させるのに用いられる多数ある周知の方法のいずれもが、抗ＧＨＲｄ３モノクローナル抗体を産生するために適用されうる（例えば、G.Galfreら（1977年）、Nature、第266巻、550〜52ページ；Gefterら、Somatic Cell Genet、同上；Lerner、Yale J Biol.Med、同上；Kenneth、Monoclonal Antibodies、同上を参照）。さらに、そのような方法の変法には、有用であるだろうものも多数あることが、当業者には理解されよう。不死化細胞系（例えば、骨髄腫細胞系）は、通常、リンパ球と同じ哺乳動物種から得る。例えば、本発明の免疫原性試料によって免疫処置されたマウスから得たリンパ球を、不死化されたマウス細胞系と融合させることによって、マウスハイブリドーマを産生することができる。好ましい不死化細胞系は、ヒポキサンチン、アミノプテリン、およびチミジンを含有する培養液（「ＨＡＴ培養液」）に感受性のマウス骨髄腫細胞系である。多数ある骨髄腫細胞系、例えば、Ｐ３−ＮＳ１／１−Ａｇ４−１、Ｐ３−×６３−Ａｇ８．６５３、またはＳｐ２／Ｏ−Ａｇ１４骨髄腫系のいずれもが、標準的な技法による融合パートナーとして使用されうる。これらの骨髄腫系はＡＴＣＣから入手できる。通常は、ポリエチレングリコール（「ＰＥＧ」）を用いて、ＨＡＴ感受性マウス骨髄腫細胞をマウス脾細胞に融合させる。その後、融合によって生じたハイブリドーマ細胞を、ＨＡＴ培養液を用いて選択する。ＨＡＴ培養液は、融合しなかった骨髄腫細胞、および非生産的に融合した骨髄腫細胞を殺す（融合しなかった脾細胞は、形質転換していないので、数日後に死ぬ）。本発明のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞は、例えば、標準的なＥＬＩＳＡアッセイを用いて、ＧＨＲｄ３に結合する抗体に関してハイブリドーマの培養上清をスクリーニングすることによって検出される。
【０１７１】
モノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマを調製する代わりに、コンビナトリアル組換え免疫グロブリンライブラリー（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリー）をＧＨＲｄ３でスクリーニングして、それによって、ＧＨＲｄ３に結合する免疫グロブリンライブラリーメンバーを単離することによって、モノクローナル抗ＧＨＲｄ３抗体を同定し、単離することができる。ファージディスプレイライブラリーの生成およびスクリーニングを行うキットが市販されている（例えば、Pharmacia Recombinant Phage Antibody System、カタログ番号27-9400-01；及びStratagene SurfZAP（商標）Phage Display Kit、カタログ番号240612）。さらに、抗体ディスプレイライブラリーの生成およびスクリーニングに使用するのに特に適した方法および試薬の例は、例えば、Ladnerら、米国特許第５２２３４０９号；Kangら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９２／１８６１９；Dowerら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９１／１７２７１；Winterら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９２／２０７９１；Marklandら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９２／１５６７９；Breitlingら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９３／０１２８８；McCaffertyら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９２／０１０４７；Garrardら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９２／０９６９０；Ladnerら、ＰＣＴ国際公開ＷＯ９０／０２８０９；Fuchsら（1991年）、Bio/Technology、第９巻、1370〜1372ページ；Hayら（1992年）、Hum.Antibod.Hybridomas、第３巻、81〜85ページ；Huseら（1989年）、Science、第246巻、1275〜1281ページ；Griffithsら（1993年）、EMBO J、第12巻、725〜734ページ；Hawkinsら（1992年）、J.Mot.Biol.、第２２６巻、889〜896ページ；Clarksonら（1991年）、Nature、第352巻、624〜６２８ページ；Gramら（1992年）、PNAS、第89巻、3576〜3580ページ；Garradら（1991年）、Bio/Technology、第９巻、1373〜1377ページ；Hoogenboomら（1991年）、Nuc.Acid Res.、第19巻、4133〜4137ページ；Barbasら（1991年）、PNAS、第88巻、7978〜7982ページ；およびMcCaffertyら（１９９０年）、Nature、第348巻、552〜554ページに見いだすことができる。
【０１７２】
抗ＧＨＲｄ３抗体（例えば、モノクローナル抗体）は、アフィニティークロマトグラフィーおよび免疫沈降反応などの標準的な技法によってＧＨＲｄ３を単離するのに使用できる。抗ＧＨＲｄ３抗体は、天然のＧＨＲｄ３と、宿主細胞中で発現された組換え生成されたＧＨＲｄ３とを細胞から精製するのを容易にできる。さらに、抗ＧＨＲｄ３抗体は、ＧＨＲｄ３タンパク質の存在量および発現パターンを評価するために、ＧＨＲｄ３タンパク質（例えば、細胞溶解物または細胞上清中の）を検出するのに用いることができる。抗ＧＨＲｄ３抗体は、診断において、例えば、所与の治療計画の有効性を判定するための臨床試験手順の一部として、組織におけるタンパク質レベルをモニターするのに使用できる。検出可能な物質に抗体を結合する（すなわち、物理的に連結する）ことによって、検出を容易にすることができる。検出可能な物質の例には、様々な酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、および放射性物質が含まれる。適当な酵素の例には、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリ性ホスファターゼ、ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼが含まれる；適当な補欠分子族複合体の例には、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが含まれる；適当な蛍光物質の例には、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリド、またはフィコエリトリンが含まれる；発光物質の例には、ルミノールが含まれる；生物発光性物質の例には、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、およびエクオリンが含まれる；そして、適当な放射性物質の例には、125Ｉ、131Ｉ、35Ｓ、または3Ｈが含まれる。
【０１７３】
好ましい実施例では、実質上純粋なＧＨＲｄ３タンパク質またはポリペプチドを取得する。最終試料中のタンパク質濃度は、例えば、Ａｍｉｃｏｎフィルター装置で濃縮することによって、１ｍｌあたり数マイクログラムのレベルに調整する。その後、このタンパク質に対するモノクローナルまたはポリクローナル抗体を、以下の通りに調製することができる。（ハイブリドーマ融合によるモノクローナル抗体産生）ＧＨＲｄ３またはその部分のエピトープに対するモノクローナル抗体は、Kohler及びMilstein（Nature、第256巻、495ページ、1975年）の古典的方法、またはその派生法（HarlowおよびLane、Antibodies A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory、53〜242ページ、1988年を参照）に従って、マウスハイブリドーマから調製することができる。
【０１７４】
簡潔には、数週間にわたり、数マイクログラムのＧＨＲｄ３またはその部分を、マウスに繰り返し接種する。その後、マウスを屠殺して、脾臓の抗体産生細胞を単離する。この脾細胞を、ポリエチレングリコールによって、マウス骨髄腫細胞と融合させ、アミノプテリンを含む選択培地（ＨＡＴ培地）によるシステムで増殖させることによって、過剰の非融合細胞を破壊する。うまく融合した細胞を希釈し、希釈物のアリコートをマイクロタイタープレートのウェルに移し、そこで培養の増殖を継続させる。抗体を産生するクローンは、Engvall,E., Meth.Enzymol.、第70巻、419ページ（1980年）によって最初に記載されたＥＬＩＳＡなどの免疫検定法によって、ウェルの上清流体中の抗体を検出することによって特定する。選択された陽性クローンを拡張することが可能であり、それらのモノクローナル抗体産物を、使用するために回収する。モノクローナル抗体を産生する詳細な手順は、Davis,L.ら、Basic Methods in Molecular Biology Elsevier, New York、第２１−２節に記載されている。
【０１７５】
本発明の抗体組成物は、免疫ブロットまたはウエスタンブロット分析において、極めて有用であろう。この抗体は、ニトロセルロース、ナイロン、またはこれらの組合せなどの固形担体マトリクスに固定されたタンパク質を同定するための高親和性一次試薬として使用されうる。抗原を検出する際、その抗原を検出するのに使用する二次試薬が不利なバックグランドを引き起こす場合、免疫沈降反応と組み合わせ、続いてゲル電気泳動を行うことによって、これらの抗体は、その抗原を検出するのに使用するシングルステップ試薬として使用されうる。ウェスタンブロッティングと組み合わせて使用する免疫学ベースの検出方法は、この点において、特に有用であると考えられ、酵素、放射性標識、または蛍光によってタグ付けをされた、毒素部分に対する二次抗体を含む。そのような標識の使用に関する米国特許には、米国特許第３８１７８３７号；第３８５０７５２号；第３９３９３５０号；第３９９６３４５号；第４２７７４３７号；第４２７５１４９号；および第４３６６２４１号が含まれ、これらの開示のそれぞれを参照により本明細書に組み込む。当然ながら、当技術分野で公知なように、二次抗体またはビオチン／アビジンリガンド結合法など、２次結合リガンドを使用することによって、追加の利点があることもある。
【０１７６】
（ＧＨ組成物の投与）
本発明によって使用されるＧＨは、いかなる出所から得られたものであっても、天然か、合成か、組換え型かにかかわらず、天然の配列、または変種型のものでありうる。例には、ヒト成長ホルモン（ｈＧＨ）、すなわち、天然のＧＨ、または天然のヒト配列を有する組換えＧＨ（ＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、ソマトトロピン、またはソマトロピン）と、組換え成長ホルモン（ｒＧＨ）とが含まれ、ここで、組換え成長ホルモンは、ソマトレム、ソマトトロピン、およびソマトロピンを含めた、組換えＤＮＡ技術によって生成されたいかなるＧＨまたはＧＨ変種も指す。Ｎ末端にメチオニンを有するか、または有しない組換えヒト天然配列成熟ＧＨが、本発明でヒトに使用するのに好ましいものである。組換えヒトＧＨポリペプチドであるＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標）（Ｐｈａｒｍａｃｉａ、米国）が最も好ましい。１９８８年７月５日出願の米国特許第４７５５４６５号、およびＧｏｅｄｄｅｌら、Ｎａｔｕｒｅ、第２８２巻、５４４ページ（１９７９年）に記載の方法によって、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）で生成されたメチオニルヒト成長ホルモン（ｍｅｔ−ｈＧＨ）も好ましい。ｍｅｔ−ｈＧＨは、ＰＲＯＴＲＯＰＩＮ（商標）（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．、米国）として販売され、Ｎ末端にメチオニン残基があることを除けば、天然のポリペプチドと同一である。別の例には、ＮＵＴＲＯＰＩＮ（商標）（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．、米国）として販売されている組換えｈＧＨがある。この後者のｈＧＨは、このメチオニン残基をもたず、天然ホルモンと同一のアミノ酸配列を有する。Ｇｒａｙら、Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、第２巻、１６１ページ（１９８４年）を参照のこと。別のＧＨの例は、米国特許第４６７０３９３号に記載されているように、純粋に体細胞起原で乳腺刺激性の活性をもたない胎盤型ＧＨであるｈＧＨ変種である。例えば、国際公開ＷＯ９０／０４７８８号およびＷＯ９２／０９６９０号に記載のものなどのＧＨ変種も含まれる。他の例には、先端巨大症の治療に使用できるペグビソマント（ＳＯＭＡＶＥＲＴ（商標）、Ｐｈａｒｍａｃｉａ、米国）など、ＧＨＲアンタゴニストとして作用するＧＨ組成物が含まれる。
【０１７７】
ＧＨは、非経口投与、鼻腔内投与、肺内投与、経口投与、または皮膚を通した吸収を含めたいかなる適当な技法によってでも、対象に直接投与することができる。ＧＨは、局所投与することも、全身投与することもできる。非経口投与の例には、皮下投与、筋肉内投与、静脈内投与、動脈内投与、および腹腔内投与が含まれる。ＧＨは、皮下注入で毎日投与することが好ましい。
【０１７８】
治療に使用されるＧＨの処方および投薬は、個々の対象の臨床症状（特にＧＨのみの治療による副作用）、ＧＨ組成物の送達部位、投与方法、投与計画、および開業医に公知の他の因子を考慮に入れて、正しい医療行為に一致した方法で行われるだろう。したがって、本明細書において、各構成成分の「有効量」は、そのような要件によって決定され、対象の成長速度を増大させる量である。
【０１７９】
用いられるＧＨの用量は、好ましくは約０．２ｍｇ／ｋｇ／週超、より好ましくは約０．２５ｍｇ／ｋｇ／週超、そして、さらにより好ましくは約０．３ｍｇ／ｋｇ／週超である。一実施形態では、ＧＨの用量は、約０．３から１．０ｍｇ／ｋｇ／週の範囲にあり、別の実施形態では、０．３５から１．０ｍｇ／ｋｇ／週の範囲にある。
【０１８０】
ＧＨは、１日に１回、皮下投与することが好ましい。好ましい態様では、ＧＨの用量は約０．００１から０．２ｍｇ／ｋｇ／日である。ＧＨの用量は、約０．０１０ｍｇ／ｋｇ／日と、０．１０ｍｇ／ｋｇ／日との間であることが、さらにより好ましい。
【０１８１】
既に論じたように、ＧＨＲｄ３アレルに関してホモ接合またはヘテロ接合である対象は、ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合である対象より、ＧＨによる治療に対する陽性反応が大きいと予測される。好ましい態様では、ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合である対象に投与される用量は、ＧＨＲｄ３アレルに関してホモ接合またはヘテロ接合である対象に投与される用量より多いだろう。
【０１８２】
ＧＨは、連続的に投与するのにも、非連続的に投与するのにも適しており、非連続的な投与は、特定の時間（例えば、１日に１回）に、特定の用量を注射するものなどであり、この場合、注射を行った時点で、血漿中ＧＨ濃度が上昇することになり、そしてその後、次の注射の時間まで血漿中ＧＨ濃度が低下することになる。別の非連続投与法は、ＰＬＧＡミクロスフェアと、有効成分の非連続的な放出を提供するのに利用可能な多くのインプラント装置とを使用することで行われ、有効成分の初期バースト、そして、次に放出前のラグなどが提供される。例えば、米国特許第４７６７６２８号参照。
【０１８３】
ＧＨは、血中でＧＨが連続的に存在し、それがＧＨを投与する期間を通じて維持されるように投与することもできる。これは、例えば、浸透圧ミニポンプなどのミニポンプによる持続注入によって行われるのが最も好ましい。別法では、ＧＨを頻繁に注射する（すなわち、１日１回より多く、例えば、１日に２回または３回）ことで、これが適切に達成される。
【０１８４】
さらに別の実施形態では、血液からのＧＨのクリアランスを遅延させるか、例えば、注射部位からのＧＨの遅延放出を引き起こす長時間作用型のＧＨ製剤を用いてＧＨを投与してもよい。ＧＨの血漿クリアランスを延長する長時間作用型製剤は、１つまたは複数の結合タンパク質（国際公開ＷＯ９２／０８９８５号）、またはＰＥＧ、ポリプロピレングリコールホモポリマー、およびポリオキシエチレンポリオールからなる群から選択された水溶性高分子、すなわち室温で水に可溶性である高分子などの高分子にＧＨが複合体化または共有結合した（可逆的または不可逆的な結合形成による）形態のものでありうる。別法として、その循環半減期を延長するために、ＧＨを重合体に複合体化または結合させてもよい。この目的に有用なポリエチレンポリオールおよびポリオキシエチレンポリオールの例には、ポリオキシエチレングリセロール、ポリエチレングリコール、ポリオキシエチレンソルビトール、ポリオキシエチレングルコース、または同様のものが含まれる。ポリオキシエチレングリセロールのグリセロールバックボーンは、例えば、動物およびヒトに存在するモノ−、ジ−、およびトリグリセリドのバックボーンと同じである。
【０１８５】
重合体は、特定の分子量である必要はないが、好ましくは、分子量が約３５００と１０００００との間であり、より好ましくは５０００と４００００との間である。ＰＥＧホモポリマーは非置換型であることが好ましいが、一末端がアルキル基で置換されているものでもよい。好ましくは、アルキル基はＣ１〜Ｃ４アルキル基であり、最も好ましくはメチル基である。重合体は、ＰＥＧの非置換型ホモポリマー、ＰＥＧのモノメチル置換ホモポリマー（ｍＰＥＧ）、またはポリオキシエチレングリセロール（ＰＯＧ）であり、かつ分子量が約５０００から４００００であることが最も好ましい。
【０１８６】
ＧＨは、主として反応条件、重合体分子量などに応じて、ＧＨのアミノ酸残基１つまたは複数を介して、重合体の一末端にある反応基に共有結合によって結合される。反応基を有する重合体は、本明細書において、活性重合体と呼ばれる。反応基は、ＧＨ上の遊離アミノ基、または他の反応基と選択的に反応する。しかし、最適の結果を得るために選択される反応基のタイプおよび量、ならびに利用される重合体のタイプは、反応基がＧＨ上で特に活性な基と過多に反応するのを避けるために、利用される特定のＧＨに依存したものであろうことが理解されよう。これを完全に避けることは可能でありえないので、タンパク質濃度に応じて、タンパク質の１モルあたりの活性重合体を、概ね約０．１から１０００モル、好ましくは２〜２００モルにすることが推奨される。タンパク質の１モルあたりにおける活性重合体の最終量は、至適活性を維持し、かつ同時に、できればタンパク質の循環の半減期を最適化する均衡のとれている量である。
【０１８７】
この残基は、１つまたは２つのシステインまたはＮ末端アミノ酸基など、このタンパク質上のいかなる反応性アミノ酸でもよいが、反応性アミノ酸はリジン、またはグルタミン酸もしくはアスパラギン酸であることが好ましく、リジンは、その遊離エプシロンアミノ基を介して活性重合体の反応基に連結され、グルタミン酸またはアスパラギン酸は、アミド結合を介して重合体に連結される。
【０１８８】
共有結合修飾反応は、生物学的に活性な物質を、不活性な重合体と反応させる際に通常使用するいかなる適切な方法でも起こりうるが、ＧＨ上の反応基がリジン基である場合には、好ましくはｐＨが約５〜９であり、より好ましくは７〜９である。この方法では、通常、活性重合体（少なくとも１つの端末水酸基を有する）を調製し、この重合体から活性基質を調製し、その後、剤形に適したＧＨを生成するために活性基質とＧＨとを反応させる。上記の修飾反応は、いくつかの方法で行うことができ、それらは１つまたは複数のステップを行うものでありうる。ワンステップ反応で活性重合体を生成するのに使用できる変性剤の例には、塩化シアヌル酸（２，４，６−トリクロロ−Ｓ−トリアジン）、およびフッ化シアヌル酸が含まれる。
【０１８９】
一実施形態では、修飾反応が２ステップで起こり、まず重合体を、無水コハク酸、無水グルタル酸などの酸無水物と反応させてカルボン酸を生成し、次に、そのカルボン酸を、カルボン酸と反応できる化合物と反応させて、ＧＨと反応できる反応性エステル基を有する活性重合体を形成させる。そのような化合物の例には、Ｎ−ヒドロキシサクシンイミド、４−ヒドロキシ−３−ニトロベンゼンスルホン酸、および同様のものが含まれ、好ましくは、Ｎ−ヒドロキシサクシンイミドまたは４−ヒドロキシ−３−ニトロベンゼンスルホン酸が使用される。例えば、モノメチル置換されたＰＥＧは、グルタル酸無水物と昇温下、好ましくは約１００〜１１０℃で、４時間反応させてもよい。こうして生成されたモノメチルＰＥＧグルタル酸を、次に、ジシクロヘキシルまたはイソプロピルカルボジイミドなどのカルボジイミド試薬の存在下で、Ｎ−ヒドロキシサクシンイミドと反応させて、次にＧＨと反応できる活性重合体、メトキシポリエチレングリコリル−Ｎ−サクシニミジルグルタル酸を生成する。この方法は、Abuchowskiら、Cancer Biochem.Biophys.、第７巻、175〜186ページ（１９８４年）に詳細に記載されている。別の例では、モノメチル置換されたＰＥＧを無水グルタル酸と反応させ、それに続いて、ジシクロヘキシルカルボジイミドの存在下で、４−ヒドロキシ−３−ニトロベンゼンスルホン酸（ＨＮＳＡ）と反応させて、活性重合体を生成する。ＨＮＳＡに関しては、Bhatnagarら、Peptides: Synthesis-Structure-Function,Proceedings of the Seventh American Peptide Symposium、Richら（編集）(Pierce Chemical Co., Rockford, Ill., 1981年)、97〜100ページ；及びNiteckiら、High-Technology Route to Virus Vaccines (American Society for Microbiology:1986年)、標題「Novel Agent for Coupling Synthetic Peptides to Carriers and Its Applications」に記載されている。
【０１９０】
ＰＥＧに結合されたＧＨを生成する特定の方法には、ＰＥＧ−ＧＨに関する米国特許第４１７９３３７号と、ＧＨに可逆的に、しかし共有結合によって連結されたＰＥＧを開示する米国特許第４９３５４６５号とに記載されている方法が含まれる。
【０１９１】
ＧＨは、持続放出システムによっても適切に投与されうる。本発明に有用な持続放出組成物の例には、造形品、例えばフィルムまたはマイクロカプセルの形態にある準透過性の重合体マトリックスが含まれる。持続放出マトリクスには、ポリラクチド（米国特許第３７７３９１９号、欧州特許第５８４８１号）、Ｌ−グルタミン酸およびガンマ−エチル−Ｌ−グルタミン酸の共重合体、（Sidmanら、Biopolymers、第22巻、547〜556ページ（1983年）、ポリ（２−ヒドロキシエチルメタクリル酸）（Langerら、J.Biomed.Mater.Res.、第15巻、167〜277ページ（1981年）；Langer、Chem.Tech、12巻、98〜105ページ（1982年）エチレン酢酸ビニル（Ｌａｎｇｅｒら、同上）、ポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸（欧州特許第１３３９８８号）、またはＰＬＧＡミクロスフェアが含まれる。
【０１９２】
持続放出ＧＨ組成物には、リポソームに捕捉されているＧＨも含まれる。ＧＨを含有するリポソームは、それ自体公知の方法によって調製される：独国特許第３２１８１２１号；Epsteinら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、第82巻、3688〜3692ページ（1985年）；Hwangら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、第77巻、4030〜4034ページ（1980年）；欧州特許第５２３２２号；欧州特許第３６６７６号；欧州特許第８８０４６号；欧州特許第１４３９４９号；欧州特許第１４２６４１号；日本特許出願８３−１１８００８号；米国特許第４４８５０４５号および第４５４４５４５号；および欧州特許第１０２３２４号。通常、このリポソームは、小さい（約２００〜８００オングストローム）単ラメラタイプのものであり、これは、脂質含量が約３０モルパーセントコレステロールを越えるが、選択される比率は最適の治療のために調整される。さらに、米国特許第４８５７５０５号に記載されているように、生物学的に活性な持続放出製剤は、活性多糖に共有結合で結合したＧＨの付加物から調製することができる。さらに、米国特許第４８３７３８１号は、脂肪、ワックス、およびそれらの混合物によるミクロスフェア組成物と、遅延放出用のＧＨとを記載する。
【０１９３】
別の実施形態では、上記に特定された対象が有効量のＩＧＦ−Ｉでも治療される。一般的に言って、非経口的に投与されるＩＧＦ−Ｉの薬学的に有効な量は、単位用量あたり合計で、対象の体重あたり５０から２４０μｇ／ｋｇ／日の範囲、好ましくは１００から２００μｇ／ｋｇ／日の範囲にあるだろう。ただし、上述の通り、これは治療上の判断に大きく依存するするだろう。また、ＩＧＦ−Ｉは１日１回または２回、皮下注射で投与することが好ましい。別の実施形態では、ＩＧＦ−ＩおよびＧＨの両方が、それぞれ有効量で、または、それぞれ最適以下の量であるが、併用した際には有効である量で、対象に投与されうる。好ましくは約０．００１から０．２ｍｇ／ｋｇ／日で、より好ましくは約０．０１から０．１ｍｇ／ｋｇ／日でＧＨを投与する。ＩＧＦ−ＩおよびＧＨを両方投与するには、注射によって、例えば、静脈内または皮下に行うのが好ましい。ＩＧＦ−ＩおよびＧＨ両方の投与は、より好ましくは皮下注射によって、最も好ましくは毎日の注射で行う。
【０１９４】
ＩＧＦ−ＩおよびＧＨ両方の用量を考慮する開業医は、これらのホルモンによる治療における公知の副作用を考慮に入れるべきであることに注意されたい。ＧＨの副作用には、ナトリウム貯留および細胞外容積の膨張（Ikkosら、Acta.Endocrinol.(Copenhagen)、第32巻、341〜361ページ（1959年）；Biglieriら、J.Clin.Endocrinol.Metab.、第21巻、361〜370ページ（1961年））、ならびに高インシュリン血症および高血糖が含まれる。ＩＧＦ−Ｉの主要な顕性副作用は低血糖である（Gulerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、第86巻、2868〜2872ページ（1989年））。実際のところ、ＧＨの分泌はＩＧＦ−Ｉによって抑制され、ＩＧＦ−ＩおよびＧＨの併用は、両方の薬剤の好ましくない副作用（例えば、ＩＧＦ−Ｉによる低血糖、およびＧＨによる高インシュリン血症）の軽減と、ＧＨの血中濃度の回復とを導きうる。
【０１９５】
非経口投与用には、ＧＨは、一実施形態において、通常、所望の純度のＧＨを、注入可能な単位用量形態（溶液、懸濁液、またはエマルジョン）で、薬学的に許容される担体、すなわち、使用される用量および濃度において、受容者に非毒性であり、その製剤の他の成分と適合性がある担体と混合することによって処方される。例えば、製剤は、酸化剤、およびポリペプチドに有害であることが知られている他の化合物を含んでいないことが好ましい。通常、製剤は、ＧＨを液体担体、細粉化された固形担体、またはその両方と接触させることによって調製される。その後、必要に応じて、この産物を所望の剤形に形成する。担体は、好ましくは非経口担体であり、より好ましくは受容者の血液と等張な溶液である。そのような担体賦形剤の例には、水、食塩水、リンゲル液、およびブドウ糖溶液が含まれる。また、不揮発性油およびオレイン酸エチルなどの非水性賦形剤も、リポソームと同様に本発明で有用である。
【０１９６】
担体は、等張性および化学安定性を促進する物質など、小量の添加物を含有するのが適当である。そのような物質は、使用される用量および濃度において受容者に対して非毒性であり、これには、リン酸、クエン酸、コハク酸、酢酸、および他の有機酸またはその塩などの緩衝剤；アスコルビン酸などの酸化防止剤；低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド、例えば、ポリアルギニンまたはトリペプチド；血清アルブミン、ゼラチンなどのタンパク質；免疫グロブリン；ポリビニルピロリドンなどの親水性重合体；グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、アルギニンなどのアミノ酸；セルロースもしくはその誘導体、グルコース、マンノース、またはデキストリンを含めた単糖、二糖、および他の炭化水素；ＥＤＴＡなどのキレート剤；マンニトールまたはソルビトールなどの糖アルコール；ナトリウムなどの対イオン；および／またはポリソルベート、ポロキサマ、またはＰＥＧなどの非イオン性界面活性剤が含まれる。
【０１９７】
通常、ＧＨは、そのような賦形剤に、ｐＨ約４．５から８、濃度約０．１ｍｇ／ｍＬから１００ｍｇ／ｍＬ、好ましくは約１〜１０ｍｇ／ｍＬで、個々に処方される。ＧＨのｐＨは７．４〜７．８であることが好ましい。上記の賦形剤、担体、または安定化剤のあるものを使用することによってＧＨ塩が形成されることが理解されよう。
【０１９８】
ＧＨは、いかなる適切な方法でも処方されうるが、ＧＨの好ましい製剤は以下の通りである。好ましいｈＧＨ（ＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標））では、０．２ｍｇ、０．４ｍｇ、０．６ｍｇ、０．８ｍｇ、１．０ｍｇ、１．２ｍｇ、１．４ｍｇ、１．６ｍｇ、１．８ｍｇ、または２．０ｍｇの組換えソマトロピンを含有する１回投与シリンジ。上記ＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標）シリンジは、全０．２５ｍｌに０．２１ｍｇグリシン、１２．５ｍｇマンニトール、０．０４５ｍｇリン酸一ナトリウム、０．０２５ｍｇリン酸二ナトリウム、および水も含有している。
【０１９９】
ｍｅｔ−ＧＨ（ＰＲＯＴＲＯＰＩＮ（商標））では、２．０ｍｇ／ｍＬ  ｍｅｔ−ＧＨ、１６．０ｍｇ／ｍＬマンニトール、０．１４ｍｇ／ｍＬリン酸ナトリウム、および１．６ｍｇ／ｍＬリン酸ナトリウム（一塩基一水和物）、ｐＨ７．８を含有する凍結乾燥前のバルク溶液。ｍｅｔ−ＧＨの５ｍｇバイアルは、５ｍｇ  ｍｅｔ−ＧＨ、４０ｍｇ  マンニトール、および１．７ｍｇ全リン酸ナトリウム（乾燥重量）（２塩基無水）、ｐＨ７．８を含有する。１０ｍｇバイアルは、１０ｍｇ  ｍｅｔ−ＧＨ、８０ｍｇマンニトール、および３．４ｍｇの全リン酸ナトリウム（乾燥重量）（２塩基無水）、ｐＨ７．８を含有する。
【０２００】
ｍｅｔｌｅｓｓ−ＧＨ（ＮＵＴＲＯＰＩＮ（商標））では、２．０ｍｇ／ｍＬ  ＧＨ、１８．０ｍｇ／ｍＬマンニトール、０．６８ｍｇ／ｍＬグリシン、０．４５ｍｇ／ｍＬリン酸ナトリウム、および１．３ｍｇ／ｍＬリン酸ナトリウム（一塩基一水和物）、ｐＨ７．４を含有する凍結乾燥前のバルク溶液。５ｍｇバイアルは、５ｍｇ  ＧＨ、４５ｍｇマンニトール、１．７ｍｇグリシン、および１．７ｍｇ全リン酸ナトリウム（乾燥重量）（２塩基無水）、ｐＨ７．４を含有する。１０ｍｇバイアルは、１０ｍｇ  ＧＨ、９０ｍｇマンニトール、３．４ｍｇグリシン、および３．４ｍｇ全リン酸ナトリウム（乾燥重量）（２塩基無水）を含有する。
【０２０１】
別法として、ＮＵＴＲＯＰＩＮ（商標）ｈＧＨの液体製剤、例えば、５．０＋−０．５ｍｇ／ｍＬ  ｒｈＧＨ；８．８＋−０．９ｍｇ／ｍＬ塩化ナトリウム；２．０＋−０．２ｍｇ／ｍＬポリソルベート２０；２５＋−０．３ｍｇ／ｍＬフェノール；２．６８＋−０．３ｍｇ／ｍＬクエン酸ナトリウム二水和物；および０．１７＋−０．０２ｍｇ／ｍｌクエン酸無水（全無水クエン酸ナトリウム／クエン酸は、２．５ｍｇ／ｍＬ、または１０ｍＭである）；ｐＨ６．０＋−０．３を用いることができる。この製剤は、１０ｍｇバイアルに入れるのが適切であり、この場合、３ｃｃのガラスバイアル中に上記製剤２．０ｍＬが入れられる。別法として、上記製剤を含有する１０ｍｇ（２．０ｍＬ）カートリッジを、対象に液体ＧＨを注射するための注射ペンに設置することもできる。
【０２０２】
治療上の投薬に使用されるＧＨ組成物は無菌であることが好ましい。無菌性は、無菌濾過膜（例えば、０．２ミクロン膜）を通す濾過によって容易に達成される。治療用ＧＨ組成物は、通常、無菌アクセスポートを有する容器、例えば、静脈注射用の溶液バッグ、または皮下注射針で貫通可能な栓を有するバイアルに入れられる。
【０２０３】
ＧＨは、通常、水溶液として、または再構成用凍結乾燥製剤として、単位用量または複数用量容器、例えば、密封されたアンプルまたはバイアル中に保存されるだろう。凍結乾燥製剤の一例は、バイアルに無菌濾過した水性ＧＨ溶液を入れ、その結果得られた混合物を凍結乾燥したものである。輸液剤は、静菌性注射用蒸留水を用いて、凍結乾燥したＧＨを再構成することによって調製される。
【０２０４】
（薬物スクリーニングアッセイ）
ＧＨＲｆｌアレルに関してホモ接合である個体と比較して、ＧＨＲｄ３アレルを保持する個体は、ＧＨＲ経路を介して作用する薬剤による治療に対する陽性反応が増大しているという発見は、ＧＨＲ経路を介して作用する治療薬を評価するのに使用できるアッセイを提供した。例えば、ＧＨＲｄ３ベースのスクリーニングアッセイでは、ＧＨＲ活性、または、ＧＨＲｄ３に対する結合が評価されるが、そのようなアッセイを用いて、ＧＨＲｄ３アレルを発現する個体を治療するのに最も有用であろう薬剤の同定を行うことができる。以下にさらに記載するように、試験される薬剤には、ソマトトロピンまたはソマトロピン、好ましくはＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、ＰＲＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、もしくはＮＵＴＲＯＰＩＮ（商標）、またはペグビソマント、好ましくはＳＯＭＡＶＥＲＴ（商標）を含めたＧＨ組成物など、疾患を治療するのに有用であることが公知である薬剤、または、疾患の治療に有用であることがまだ知られていない薬剤が含まれる。
【０２０５】
一態様において、本発明は細胞ベースのアッセイを提供するが、このアッセイでは、試験化合物を、ＧＨＲｄ３タンパク質またはその生物学的に活性な部分を発現する細胞と接触させ、この試験化合物がもつＧＨＲ活性を変調する能力を測定する。ＧＨＲ活性を変調する（例えば、刺激または阻害する）、試験化合物の能力は、ＧＨＲポリペプチドの活性をモニターすることによって測定することができる。ＧＨＲ活性の検出は、適当かつ検出可能ないかなる活性の評価も含みうるが、これには、以下でさらに論じるように、例えば、試験化合物によって誘発される細胞増殖、ＧＨＲの細胞内移行、および／またはシグナル伝達が含まれる。
【０２０６】
好ましい実施形態では、本発明は、候補ＧＨＲ変調因子（例えば、アゴニストまたはアンタゴニスト）を同定する方法であって、ａ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドを含む細胞を提供すること；ｂ）上記細胞を試験化合物と接触させること；および、ｃ）上記化合物がＧＨＲ活性を選択的に刺激または阻害するかどうか判定することを含む方法を提供する。一実施形態では、この方法は、ａ）ヒト細胞（好ましくは２９３細胞）を提供すること；ｂ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードする核酸配列を含むベクターを、上記細胞に導入すること；ｃ）上記細胞を試験化合物と接触させること；および、ｄ）ＧＨＲ活性を検出することを含む。上記化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３阻害物質であることを示す。上記化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３アゴニストであることを示す。別の実施例では、この方法は、ａ）アフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞を提供すること；ｂ）ＧＨＲｄ３  ｃＲＮＡを上記アフリカツメガエル卵母細胞に導入すること；ｃ）上記アフリカツメガエル卵母細胞を試験化合物と接触させること；および、ｄ）上記アフリカツメガエル卵母細胞でＧＨＲ活性を検出することを含む。ここでも、上記化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３アゴニストであることを示す。上記化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３アンタゴニストであることを示す。スクリーニングアッセイに関しては、ＧＨＲｄ３／ｆｌヘテロ二量体のコンテクストにおいて、下記でより詳細に説明する。
【０２０７】
（ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体）
（ＧＨＲｄ３／ｆｌヘテロ二量体活性を評価する方法）
既に論じたように、本発明は、ＧＨＲｆｌポリペプチドとのヘテロ二量体としてＧＨＲｄ３ポリペプチドが天然に存在しうることを提供する。したがって、本発明はＧＨＲｄ３ポリペプチドの活性を評価する方法を提供する。好ましい態様では、本発明は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドおよびＧＨＲｆｌポリペプチドを含むポリペプチド複合体の活性を検出することを含む。したがって、本発明は、ＧＨＲｄ３ポリペプチドを含むＧＨＲポリペプチド複合体の活性を評価する方法を提供する。好ましくは、この複合体は、ＧＨＲｄ３ポリペプチド、ＧＨＲｆｌポリペプチド、およびＧＨポリペプチドを含む複合体である。
【０２０８】
本発明は、機能的な変種ＧＨＲｄ３ヌクレオチド配列を取得するか、またはその活性を試験する方法であって、変種または改変ＧＨＲｄ３核酸を提供し、さらに、ポリペプチドがエンコードされているかどうか評価して、それによって、ＧＨＲ活性を提示する方法を提供する。したがって、ＧＨＲｄ３ポリペプチドの機能を評価する方法であって、（ａ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドおよびＧＨＲｆｌポリペプチドを提供すること；および、（ｂ）ＧＨＲ活性を評価することを含む方法も包含される。無細胞（例えば、膜ベース）、細胞ベース、およびｉｎ  ｖｉｖｏフォーマットを含めたいかなる適当なフォーマットを用いてもよい。例えば、上記アッセイは、宿主細胞中でＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌ核酸を発現すること、および、上記細胞でＧＨＲ活性を観測することを含みうる。別の例では、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを細胞に導入して、ＧＨＲ活性を観測する。別の例では、ＧＨＲｆｌポリペプチドを発現する細胞にＧＨＲｄ３ポリペプチドを導入して、ＧＨＲ活性を観測する。
【０２０９】
好ましい実施形態では、ＧＨＲ活性の検出は、ＧＨＲタンパク質が下流エフェクター（例えば、ＧＨＲ媒介シグナル伝達経路のコンポーネント）の活性をさらに変調する能力の測定を含む。例えば、上記に記載したように、適当な標的上でのエフェクター分子の活性を測定することができ、さもなくば、適当な標的に対するエフェクターの結合を測定することができる。Ｊａｋ−２／Ｓｔａｔ−５シグナリングを評価することが好ましい。他の好ましい実施形態では、ＧＨＲ活性の検出は、ＧＨＲリガンドによって誘発される細胞増殖、ＧＨＲリガンドに対するＧＨＲの結合、ＧＨＲおよび／またはリガンドの細胞内移行を含めた、適当かつ検出可能ないかなる活性の評価を含んでもよい。上記ＧＨＲリガンドは、ＧＨポリペプチドであることが最も好ましい。これらの方法は、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを含むＧＨＲヘテロ二量体の活性の試験を可能にするものである。
【０２１０】
ＧＨＲｄ３活性を評価する方法は、改変されたＧＨＲｄ３ポリペプチドを特徴付けるのに有用でありうる。例えば、必須アミノ酸残基または必須ではないアミノ酸残基に変異を有するＧＨＲｄ３ポリペプチドを特徴付けすることができる。「必須ではない」アミノ酸残基でアミノ酸置換を引き起こすヌクレオチド置換は、ＧＨＲｄ３配列中に導入することができる。「必須ではない」アミノ酸残基は、生物活性を変化させずに、ＧＨＲｄ３ポリペプチドの野生型配列から改変できる残基であり、一方、「必須な」アミノ酸残基は、生物活性に必要な残基である。例えば、本発明のＧＨＲｄ３タンパク質の間で保存されているアミノ酸残基は、改変によって影響を受け難いことが予測される。さらに、追加保存されたアミノ酸残基は、本発明のＧＨＲｄ３タンパク質の間で保存されているアミノ酸であるかもしれない。他の例として、ＧＨＲｄ３配列の集団内で天然に存在しうるアレル変種では、変異によって、ＧＨＲｄ３核酸のヌクレオチド配列が変化し、それによって、エンコードしているＧＨＲｄ３タンパク質のアミノ酸配列が変化しており、その結果、ＧＨＲｄ３タンパク質の機能が変化していることも、変化していないこともある。
【０２１１】
（薬物スクリーニング．アッセイ）
本発明は、ＧＨＲ経路を介して作用するＧＨＲアゴニストおよびアンタゴニスト、すなわち、候補または試験化合物または薬剤（例えば、ペプチド、ペプチドミメティック、小分子、または他の薬物、好ましくはポリペプチド）を同定および／または評価する方法を提供する。ＧＨＲアゴニストおよびアンタゴニストは、好ましくはＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質に結合する化合物であり、好ましくはそれによって、ＧＨＲｄ３ポリペプチド、ＧＨＲｆＩポリペプチド、および上記化合物を含む複合体を形成する。アッセイは、細胞ベースアッセイでも、非細胞ベースアッセイでもよい。好ましい非細胞ベースアッセイは、膜ベースアッセイである。本明細書において、アッセイは、「スクリーニングアッセイ」と呼ばれることもある。スクリーニングアッセイは、結合アッセイでも、他の機能アッセイでもよく、同様に、適当かつ公知のいかなるＧＨＲ活性アッセイに基づくものであってもよい。
【０２１２】
一態様では、アッセイは、細胞ベースアッセイであり、このアッセイでは、ＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を発現する細胞を、試験物質に接触させ、ＧＨＲ活性を変調するテスト化合物の能力を測定する。ＧＨＲ活性を変調する（例えば、刺激または阻害する）、試験化合物の能力は、ＧＨＲポリペプチド（例えば、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌタンパク質を含むＧＨＲポリペプチド複合体）の活性をモニターすることによって測定することができる。ＧＨＲ活性の検出は、適当かつ検出可能ないかなる活性の評価も含みうるが、これには、例えば、試験化合物によって誘発される細胞増殖、ＧＨＲの細胞内移行、および／またはシグナル伝達が含まれる。
【０２１３】
好ましい実施形態では、本発明は、候補ＧＨＲ変調因子（例えば、アゴニストまたはアンタゴニスト）を同定する方法であって、ａ）ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを含む細胞を提供すること；ｂ）上記細胞を試験化合物と接触させること；および、ｃ）上記化合物がＧＨＲ活性を選択的に刺激または阻害するかどうか判定することを含む方法を提供する。一実施形態では、この方法は、ａ）ヒト細胞（好ましくは２９３細胞）を提供すること；ｂ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードする核酸配列を含むベクターを、上記細胞に導入すること、および任意選択で、ＧＨＲｆｌポリペプチドをエンコードする核酸配列を含むベクターを上記細胞に導入すること；ｃ）上記細胞を試験化合物と接触させること；ならびに、ｄ）ＧＨＲ活性を検出することを含む。上記化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体阻害物質であることを示す。上記化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体アゴニストであることを示す。別の実施例では、この方法は、ａ）アフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞を提供すること；ｂ）ＧＨＲｄ３  ｃＲＮＡ、および任意選択でＧＨＲｆｌ  ｃＲＮＡを上記アフリカツメガエル卵母細胞に導入すること；ｃ）上記アフリカツメガエル卵母細胞を試験化合物と接触させること；および、ｄ）上記アフリカツメガエル卵母細胞でＧＨＲ活性を検出することを含む。ここでも、上記化合物がＧＨＲ活性を刺激することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体アゴニストであることを示す。上記化合物がＧＨＲ活性を阻害することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体アンタゴニストであることを示す。
【０２１４】
ＧＨＲ活性の検出は、適当かつ検出可能ないかなる活性の評価も含みうるが、これには、細胞増殖、ＧＨＲリガンド（例えば、ＧＨポリペプチド）に対するＧＨＲの結合、ＧＨＲおよび／またはＧＨＲリガンドの細胞内移行、ならびに／あるいはＧＨＲ媒介シグナル伝達が含まれる。
【０２１５】
２９３細胞におけるＧＨＲ媒介Ｊａｋ２−Ｓｔａｔ５シグナル伝達のＧＨＲ機能アッセイの一例は、Maamraら（1999年）、J.Biol.Chem.、第274巻、14791〜14798ページに記載されており、この開示を参照により本明細書に組み込む。アフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞におけるＧＨＲ機能アッセイの一例は、Urbanekら（1993年）、J.Biol.Chem.、第268(25)巻、19025〜19032ページに記載されており、この開示を参照により本明細書に組み込む。ｃＤＮＡテンプレートの生成、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ転写および翻訳、卵母細胞注入、注入されたｍＲＮＡ安定性分析、ＧＨＲに対するＧＨ結合の測定、ならびに受容体内部移行分析の方法は、本質的にはUrbanekら（1993年）に記載されている通りに実行することができる。
【０２１６】
別の好ましい態様では、アッセイは、細胞ベースの結合アッセイであり、このアッセイでは、ＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を発現する細胞を、試験化合物と接触させ、ＧＨＲポリペプチドに対する試験化合物の結合能を測定する。別の態様では、アッセイは、非細胞ベースの結合アッセイであり、ＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を含む膜を、試験化合物と接触させ、ＧＨＲポリペプチドに対する試験化合物の結合能を測定する。ＧＨＲ（例えば、ＧＨＲｄ３またはＧＨＲｆｌ）ポリペプチドに対する試験化合物の結合能は、公知の方法を用いて測定することができる。
【０２１７】
結合アッセイは、例えば、ａ）ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを含む細胞を提供すること；ｂ）上記細胞を試験化合物と接触させること；およびｃ）上記化合物がＧＨＲポリペプチドに選択的に結合するかどうか測定することを含みうる。一実施形態では、この方法は、ａ）ヒト細胞（好ましくは２９３細胞）を提供すること；ｂ）ＧＨＲｄ３ポリペプチドをエンコードする核酸配列を含むベクターを、上記細胞に導入すること、および、任意選択で、ＧＨＲｆｌポリペプチドをエンコードする核酸配列を含むベクターを、上記細胞に導入すること；ｃ）上記細胞を試験化合物と接触させること；およびｄ）上記化合物がＧＨＲポリペプチドに選択的に結合するかどうか検出することを含む。上記化合物がＧＨＲポリペプチドに結合することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体変調因子であることを示す。別の例では、この方法は、ａ）アフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞を提供すること；ｂ）ＧＨＲｄ３  ｃＲＮＡ、および任意選択でＧＨＲｆ１  ｃＲＮＡを上記アフリカツメガエル卵母細胞に導入すること；ｃ）上記アフリカツメガエル卵母細胞を試験化合物と接触させること；およびｄ）上記化合物がＧＨＲポリペプチドに選択的に結合するかどうか検出することを含む。ここでも、上記化合物がＧＨＲポリペプチドに結合することを検出すれば、それは上記化合物が候補ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体変調因子であることを示す。
【０２１８】
２９３細胞ベースのＧＨＲ結合アッセイの一例は、Rossら（2001年）、J.Clin.Endocrinol.Metabol.、第86(4)巻、1716〜1723ページに記載されており、この開示を参照により本明細書に組み込む。
【０２１９】
上記アッセイで用いられる細胞は、ＧＨＲｆｌポリペプチドを発現する２９３細胞であることが好ましい。ＧＨＲを発現する２９３細胞は、Maamraら（1999年）、J.Biol.Chem.、第274巻、14791〜14798ページに記載されており、この開示を参照により本明細書に組み込む。
【０２２０】
そのようなアッセイは、ＧＨポリペプチド、またはそのフラグメントもしくは変種を試験するのに特に有用でありうる。例えば、ポリエチレングリコール分子を連結することによって、血液循環時間が延長されるように改変されているＧＨポリペプチドが特に好ましい。他の実施形態では、ＧＨポリペプチドは、ＧＨＲタンパク質に結合する（例えば、好ましくは、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆ１タンパク質を含む複合体を形成する）が、ＧＨＲ活性を刺激しないＧＨポリペプチドなどのＧＨＲアンタゴニストでありうる。
【０２２１】
別の実施形態では、このアッセイは、ＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を発現する細胞を、ＧＨＲリガンドと接触させて、アッセイ混合物を形成させること、アッセイ混合物を試験化合物と接触させること、およびＧＨＲ活性を検出することを含む。この方法は、ＧＨＲタンパク質（例えば、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を含むＧＨＲ二量体）の活性を刺激または阻害する試験化合物の能力を測定することを含み、ＧＨＲタンパク質の活性を阻害する、試験化合物の能力を測定することが、ＧＨＲｄ３とＧＨＲｆｌとを発現する細胞の生物活性を阻害する、試験化合物の能力を測定する（例えば、シグナル伝達またはタンパク質間相互作用を阻害する、試験化合物の能力を測定する）ことを含むものであることが好ましい。
【０２２２】
ＧＨＲリガンドと結合または相互作用する、ＧＨＲタンパク質の能力は、直接結合を測定する上記の方法の１つによって測定することができる。他の実施形態では、ＧＨＲリガンド分子と結合または相互作用する、ＧＨＲｄ３タンパク質、またはＧＨＲｄ３タンパク質を含む複合体の能力は、標的の細胞性セカンドメッセンジャー（すなわち、細胞内Ｃａ2+、ジアシルグリセロール、ＩＰ3など）の誘導を検出することによって、または適切な基質に対する触媒活性／酵素活性を検出することによって、またはレポーター遺伝子（検出可能なマーカー、例えばルシフェラーゼをエンコードする核酸に作用可能に連結された反応性調節エレメントを含む）の誘導を検出することによって、またはＧＨＲ調節性の細胞反応、例えば、シグナル伝達またはタンパク質間相互作用を検出することによって測定することができる。
【０２２３】
さらに別の実施形態では、本発明のアッセイは無細胞アッセイであり、このアッセイでは、ＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を膜に提供し、ＧＨＲタンパク質または膜を試験化合物と接触させ、ＧＨＲタンパク質（例えば、ＧＨＲｄ３および／またはＧＨＲｆｌタンパク質）またはその生物学的に活性な部分に対する試験化合物の結合能を測定する。ＧＨＲｄ３タンパク質に対する試験化合物の結合は、上記の通り、直接的または間接的に測定することができる。好ましい実施形態では、このアッセイは、ＧＨＲタンパク質（例えば、ＧＨＲヘテロ二量体）またはその生物学的に活性な部分を、ＧＨポリペプチドなど、ＧＨＲに結合する公知の化合物と接触させて、アッセイ混合物を形成し、このアッセイ混合物を試験化合物と接触させ、ＧＨＲタンパク質と相互作用する、試験化合物の能力を測定することを含み、ＧＨＲヘテロ二量体タンパク質と相互作用する、試験化合物の能力を測定することが、公知の化合物と比較して、ＧＨＲタンパク質またはその生物学的に活性な部分に選択的に結合する、試験化合物の能力を測定することを含むものである。
【０２２４】
別の実施形態では、このアッセイは無細胞アッセイであり、このアッセイでは、ＧＨＲｄ３タンパク質およびＧＨＲｆｌタンパク質、またはこれらの生物学的に活性な部分を膜に提供し、このポリペプチドまたは膜を試験化合物と接触させ、ＧＨＲタンパク質またはその生物学的に活性な部分の活性を変調する（例えば、刺激または阻害する）、試験化合物の能力を測定する。ＧＨＲ活性を変調する、試験化合物の能力は、例えば、細胞増殖、ＧＨＲリガンド（例えば、ＧＨポリペプチド）に対するＧＨＲの結合、ＧＨＲおよび／またはＧＨＲリガンドの細胞内移行、ならびに／あるいはＧＨＲ媒介シグナル伝達を含めた、適当かつ検出可能なＧＨＲ活性のいずれを評価することによっても測定できる。
【０２２５】
ＧＨＲ活性を阻害する、試験化合物の能力の測定は、例えば、ＧＨ分子タンパク質、またはその部分もしくは誘導体などの試験化合物を、放射性同位元素または酵素標識に結合させることによっても実施できる。これによって、ＧＨＲヘテロ二量体に対するＧＨ分子の結合を、複合体中にある標識されたＧＨタンパク質またはその生物学的に活性な部分を検出することで測定できるようになる。例えば、化合物（例えば、ＧＨタンパク質またはその生物学的に活性な部分）は、125Ｉ、35Ｓ、14Ｃ、または3Ｈで、直接的または間接的に標識することができ、放射性同位元素は、放射線の直接計数またはシンチレーション計測で検出できる。別法として、化合物は、例えば、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリ性ホスファターゼ、またはルシフェラーゼを用いて酵素で標識することもでき、酵素標識は、適当な基質が産物に転換されるのを測定することによって検出できる。
【０２２６】
ＧＨＲポリペプチド（例えば、ＧＨＲｄ３／ＧＨＲｆｌヘテロ二量体）と相互作用する、化合物（例えば、ＧＨタンパク質またはその部分もしくはフラグメント）の能力を、いかなる反応体も標識せずに測定することも、本発明に包含される。化合物と、それによって認識される標的分子との相互作用を、化合物も、受容体も標識せずに検出するには、例えば、マイクロフィジオメータを用いることができる。McConnell,H.M.ら（1992年）、Science、第257巻、1906〜1912ページ。細胞センサなどのマイクロフィジオメータは、細胞が環境を酸性化する速度を、光でアドレス可能な電位差測定センサ（ＬＡＰＳ）を用いて測定する分析装置である。この酸性化速度における変化を、化合物と受容体との相互作用の指標として用いることができる。
【０２２７】
ＧＨＲリガンドまたは試験化合物に対する、ＧＨＲタンパク質の結合能は、リアルタイム生体分子間相互作用分析（ＢＩＡ）などの技術を用いることによっても測定できる。Sjolander,S.及びUrbaniczky,C.（1991年）、Anal.Chem.、第63巻、2338〜2345ページ、及びSzaboら、（1995年）、Curr.Opin.Struct.Biol.、第５巻、699〜705ページ。本明細書において、「ＢＩＡ」は、いかなる反応体も標識せずに、リアルタイムで生物特異性相互作用を研究する技術である（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ）。表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）における光学現象の変化は、生物分子間のリアルタイム反応の指標として用いることができる。
【０２２８】
（試験化合物）
「候補」または「試験」化合物または「薬剤」（例えば、試験ＧＨＲアゴニストおよびアンタゴニスト）は、ポリペプチド、ペプチド、ペプチドミメティック、小分子、および他の薬物を含めた、いかなる適当な形態のものでもありうる。上記化合物または薬剤には、疾患の治療に有用であることが公知のものも、疾患の治療に有用であることがまだ知られていない薬剤も含まれる。
【０２２９】
好ましい実施形態では、試験化合物はＧＨポリペプチドである。好ましいＧＨは、いかなる出所から得られたものであっても、天然か、合成か、組換え型かにかかわらず、天然の配列、または変種型のものでありうる。例には、ヒト成長ホルモン（ｈＧＨ）、すなわち、天然のＧＨ、または天然のヒト配列を有する組換えＧＨと、組換え成長ホルモン（ｒＧＨ）とが含まれ、ここで、組換え成長ホルモンは、組換えＤＮＡ技術によって生成されたいかなるＧＨまたはＧＨ変種も指す。一態様では、ＧＨは、ＧＨＲ受容体を刺激でき、例には、ソマトトロピンまたはソマトロピン、好ましくはＧＥＮＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、またはＰＲＯＴＲＯＰＩＮ（商標）、ＮＵＴＲＯＰＩＮ（商標）が含まれる。
【０２３０】
別の態様では、ＧＨポリペプチドは、ＧＨＲアンタゴニストとして作用できるＧＨ変種である。ＧＨＲアンタゴニストは、ＧＨＲポリペプチドに結合するが、ＧＨＲの機能を阻害することが意図されている薬物の種類である。ＧＨＲアンタゴニストの一例は、Rossら（2001年）、J.Clin.Endocrinol.Metabol、第86(4)巻、1716〜1723ページに記載されている。Ｒｏｓｓらによって開示されたＧＨＲアンタゴニストは、Ｂ２０３６−ＰＥＧと呼ばれ、部位１にＧＨＲ結合を促進する変異、そして、部位２に受容体二量体化を阻止する変異を有するペグ化ＧＨ変種ポリペプチドである。好ましいＧＨＲアンタゴニストまたは阻害剤は、ペグビソマント、好ましくはＳＯＭＡＶＥＲＴ（商標）である。ＧＨＲアンタゴニストは、先端巨大症の治療に有用であるが、これは、通常、脳下垂体アデノーマからの過度のＧＨ分泌によって引き起こされる状態である。
【０２３１】
本発明の試験化合物は、生物ライブラリー；空間的にアドレス可能なパラレル固相ライブラリーまたは溶液相ライブラリー；デコンボリューションを必要とする合成ライブラリー方法；「１ビーズ１化合物」ライブラリー法；およびアフィニティークロマトグラフィー選択を用いた合成ライブラリー法を含めた、当技術分野で公知のコンビナトリアルライブラリー法における多数のアプローチのうちいずれを用いても得ることができる。生物ライブラリーアプローチは、ペプチドライブラリーと共に用いられ、一方、他の４つのアプローチは、化合物のペプチド、非ペプチド性オリゴマー、または小分子ライブラリーに適している（Lam,K.S.（1997年）、Anticancer Drug Des.、第12巻、145ページ）。
【０２３２】
分子ライブラリーを合成する方法の例は、当技術分野で、例えば、DeWittら（1993年）、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.、第90巻、6909ページ；Erbら（1994年）、Proc.Natl.Acad.Sci USA、第91巻、11422ページ；Zuckermannら（1994年）、J.Med.Chem.、第37巻、2678ページ；Choら（1993年）、Science、第261巻、1303ページ；Carrellら（1994年）、Angew.Chem.Int.Ed.Engl、第33巻、2059ページ；Carellら（1994年）、Angew.Chem.Int.Ed.Engl、第33巻、2061ページ；Gallopら（1994年）、J.Med.Chem.、第37巻、1233ページに見られる。
【０２３３】
化合物ライブラリーは、溶液中（例えば、Houghten(1992年)、Biotechniques、第13巻、412〜421ページ）、またはビーズ上（Lam(1991年)、Nature、第354巻、82〜84ページ）、チップ（Fodor(1993年)、Nature、第364巻、555〜556ページ）、細菌（Ladner、米国特許第５２２３４０９号）、胞子（Ladner、米国特許第’４０９）、プラスミド（Cullら(1992年)、Proc Natl Acad Sci USA、第89巻、1865〜1869ページ）、またはファージ上（Scott及びSmith(1990年)、Science、第249巻、386〜390ページ）；（Devin(1990年)、Science、第249巻、404〜406ページ)；(Cwirlaら(1990年)、Proc.Natl.Acad.Sci、第87巻、6378〜6382ページ)；(Felici(1991年）、J.Mol Biol、第222巻、301〜310ページ)；(Ladner、同上)に提示されうる。
【０２３４】
本発明は、さらに、上記のスクリーニングアッセイによって同定された新規の薬剤、およびこれらのアッセイを用いてそのような薬剤を生成する方法にも関する。したがって、一実施形態において、本発明は、上記スクリーニングアッセイ（例えば、細胞ベースアッセイまたは無細胞アッセイ）のいずれのステップを含む方法で入手可能な化合物または薬剤も含む。上記化合物または薬剤は、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種を含むものが好ましい。
【０２３５】
したがって、本明細書に記載のように同定された薬剤の適切な動物モデルでの使用も、本発明に包含される。例えば、本明細書に記載のように同定された薬剤（例えば、ＧＨポリペプチド、またはその部分もしくは変種、アンチセンスＧＨＲｄ３核酸分子、ＧＨＲｄ３特異的抗体、ＧＨＲｄ３結合パートナーなどのＧＨＲ変調剤）は、そのような薬剤による治療の有効性、毒性、または副作用を測定するために、動物モデルで用いることができる。別法として、本明細書に記載のように同定された薬剤は、そのような薬剤の作用機序を決定するために、動物モデルで用いることができる。さらに、本発明は、本明細書に記載のように、上記のスクリーニングアッセイによって同定される新規薬剤の、治療用の使用にも関する。
【０２３６】
本発明は、本明細書に記載のように、上記のスクリーニングアッセイによって同定される新規薬剤の、診断、予後、および治療用の使用にも関する。したがって、本明細書に記載のように、薬物の設計、製剤、合成、製造、および／または生産における、そのような薬剤の使用、または、診断、予後、もしくは治療における使用に供する医薬組成物も、本発明に包含される。例えば、一実施形態において、本発明は、上記のスクリーニングアッセイの１つで入手可能な化合物の構造および／または特性を参照して薬物または医薬組成物を合成または生成する方法も含む。例えば、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを発現する細胞を、試験化合物と接触させ、ＧＨＲポリペプチド（好ましくは、ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆｌポリペプチドを含む複合体）に結合するか、またはその活性を変調する、試験化合物の能力を測定することを含む方法で得られた化合物の構造および／または特性に基づいて薬物または医薬組成物を合成することができる。別の例示的実施形態では、本発明は、ＧＨＲｄ３タンパク質またはその生物学的に活性な部分を試験化合物と接触させ、ＧＨＲタンパク質、好ましくはＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆ１タンパク質を含むＧＨＲ二量体、またはその生物学的に活性な部分に結合するか、またはその活性を変調する（例えば、刺激または阻害する）、試験化合物の能力を測定することを含む方法で入手可能な化合物の構造および／または特性に基づいて薬物または医薬組成物を合成または生成する方法を含む。
【０２３７】
（ＧＨＲｄ３核酸およびタンパク質）
本明細書で論じたように、本発明は、ＧＨＲｄ３核酸およびポリペプチドの使用に関する。
【０２３８】
好ましい実施形態では、ＧＨＲｄ３タンパク質は、少なくとも６アミノ酸、好ましくは少なくとも８から１０のアミノ酸、より好ましくは少なくとも１２、１５、２０、２５、３０、４０、５０、１００、２００、３００、４００、５００、または６００アミノ酸の連続的な領域を含む。他の好ましい実施形態では、このアミノ酸の連続的な領域は、ＧＨＲｄ３タンパク質配列におけるアミノ酸の欠失、付加、置換、または切断を含めた、変異部位または機能的変異部位を含む。したがって、本発明のコンテクストでは、ＧＨＲｄ３タンパク質のアミノ酸配列に十分に相同であるか、またはこれに由来するアミノ酸配列を含み、完全長ＧＨＲｄ３タンパク質より少ない数のアミノ酸を含み、かつＧＨＲタンパク質の少なくとも１つの活性を示すペプチドを含めたＧＨＲｄ３タンパク質の生物学的に活性な部分も有用である。他の実施形態では、ＧＨＲｄ３タンパク質は、実質上天然のＧＨＲｄ３配列に相同であり、天然のＧＨＲｄ３タンパク質の機能活性を保有するが、それでもなお、自然なアレル変異、または突然変異によってアミノ酸配列が相違している。したがって、別の実施形態では、ＧＨＲｄ３タンパク質は、（Urbanekら(1992年)に記載のアミノ酸配列に少なくとも約６０％相同なアミノ酸配列を含み、さらに、それぞれＧＨＲｄ３タンパク質の機能活性を保持するタンパク質である。このタンパク質は、Urbanekら(1992年)の配列に少なくとも約３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％、または９９．８％相同であることが好ましい。
【０２３９】
２つのアミノ酸配列、または２つの核酸のパーセント相同性を決定するには、最適の比較が行われるように、それらの配列を整列させる（例えば、第２のアミノ酸または核酸配列との整列を最適にするために、第１のアミノ酸または核酸配列にギャップを導入し、比較のために相同でない配列を無視することができる）。好ましい実施形態では、比較のために整列させる参照配列の長さが、参照配列の長さの少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、さらにより好ましくは少なくとも６０％、さらにより好ましくは少なくとも７０％、８０％、９０％、または９５％である（例えば、ＧＨＲｄ３アミノ酸配列に第２の配列を整列させる際、少なくとも１００アミノ酸残基、好ましくは少なくとも２００アミノ酸残基が整列させられる）。その後、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第１の配列におけるある位置が、第２の配列における対応する位置に対して、同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められている場合、その分子は、その位置において相同である（すなわち、本明細書において、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と等価である）。２つの配列間のパーセント相同性は、それらの配列によって共有される、同一な位置の数の関数である（すなわち、％相同性は、１００×同一な位置の数／合計位置数）。
【０２４０】
配列の比較、および２つの配列間のパーセント相同性の決定は、数学的アルゴリズムを用いて実行できる。配列の比較に用いられる数学的アルゴリズムの非限定的な好ましい例が、KarlinおよびAltschul(1990年)、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、第８７巻、2264〜68ページのアルゴリズムであり、その改良法がKarlinおよびAltschul(1993年)、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、第90巻、5873〜77ページのアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、Altschulら(1990年)、J.Mol.Biol.、第215巻、403〜10ページのＮＢＬＡＳＴおよびＸＢＬＡＳＴプログラム（バージョン２．０）に組み込まれている。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索は、本発明のＧＨＲｄ３核酸分子に相同なヌクレオチド配列を取得するために、ＮＢＬＡＳＴプログラムで、スコア(score)＝１００、語長(wordlength)＝１２として実行できる。ＢＬＡＳＴタンパク質検索は、本発明のＧＨＲｄ３タンパク質分子に相同なアミノ酸配列を取得するために、ＸＢＬＡＳＴプログラムで、スコア(score)＝５０、語長(wordlength)＝３として実行できる。比較のためにギャップ付きの整列を取得するには、Altschulら(1997年)、Nucleic Acids Research、第25(17)巻、3389〜3402ページに記載のGapped BLASTを利用することができる。ＢＬＡＳＴおよびGapped BLASTプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム（例えば、ＸＢＬＡＳＴおよびＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメータを用いることができる。http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照のこと。配列の比較に利用される数学的アルゴリズムの非限定な好ましい別の例が、ＭｙｅｒｓおよびＭｉｌｌｅｒ（１９８９年）のＣＡＢＩＯＳアルゴリズムである。そのようなアルゴリズムは、ＧＣＧ配列アラインメントソフトウェアパッケージの一部であるＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）に組み込まれている。アミノ酸配列を比較するのにＡＬＩＧＮプログラムを用いる場合、ＰＡＭ１２０ウエイトレジジューテーブル(weight residue table)、ギャップ長ペナルティ１２、ギャップペナルティ４を用いることができる。
【０２４１】
（組換え発現ベクターおよび宿主細胞）
ＧＨＲｄ３タンパク質（またはその部分）をエンコードする核酸を含有するベクター、好ましくは発現ベクターは、いかなる適当な方法によっても調製できる。同様に、好ましい態様では、ＧＨＲｆｌタンパク質（または、その部分）をエンコードする核酸を含む発現ベクターも調製することができる。任意選択で、発現ベクターは、ＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする核酸だけではなく、ＧＨＲｆｌタンパク質をエンコードする核酸も含むだろう。本明細書において、「ベクター」という用語は、それに連結された別の核酸を輸送することができる核酸分子のことをいう。ベクターの１つのタイプが「プラスミド」であり、これは、別のＤＮＡセグメントを追加して連結できる環状の二本鎖ＤＮＡループを指す。別のタイプのベクターにはウイルスベクターがあり、この場合、追加されるＤＮＡセグメントは、ウイルスゲノムに連結されうる。特定のベクターには、それらが導入される宿主細胞内で自律的な複製を行うことができるものもある（例えば、細菌の複製開始点を有する細菌ベクター、および哺乳類エピソームベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム哺乳類ベクター）は、宿主細胞に導入された際に宿主細胞のゲノムに組み込まれ、それによって、宿主ゲノムと共に模写される。さらに、ある特定のベクターには、それらが作用可能に連結される遺伝子の発現を指示できるものがある。そのようなベクターは、本明細書において、「発現ベクター」と呼ばれる。一般的に、組換えＤＮＡ技法で有用な発現ベクターは、プラスミドの形態にあることが多い。プラスミドは、ベクターの最も一般的に使用される形態であるため、本明細書では、「プラスミド」と「ベクター」とは互換性をもって使用することができる。しかし、本発明では、ウイルスベクター（例えば、複製欠損性レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス）など、他の形態の発現ベクターも含まれるものとし、それらも同等な機能を果たす。
【０２４２】
本発明の組換え発現ベクターは、宿主細胞内で核酸を発現するのに適した形態でＧＨＲｄ３および／またはＧＨＲｆｌ核酸を含むが、これはすなわち、発現に用いられる宿主細胞に応じて選択され、発現される核酸配列に作用可能に連結された１つまたは複数の調節配列を、組換え発現ベクターが含有することを意味する。組換え発現ベクターの中で、「作用可能に連結される」とは、注目しているヌクレオチド配列が、そのヌクレオチド配列の発現が可能となる（例えば、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ転写／翻訳システムで、または、ベクターが宿主細胞に導入される場合には、宿主細胞内で）ように、調節配列に連結されることを意味するものとする。「調節配列」という用語には、プロモーター、エンハンサー、および他の発現調節エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）が含まれるものとする。そのような調節配列は、例えば、Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology、第１８５巻、Academic Press, San Diego, Calif.(1990年)に記載されている。調節配列には、多くのタイプの宿主細胞で、ヌクレオチド配列の構成的発現を指示するもの、およびある特定の宿主細胞内のみでヌクレオチド配列の発現を指示するもの（例えば、組織特異的調節配列）が含まれる。発現ベクターの設計は、形質転換される宿主細胞の選択や、所望のタンパク質発現レベルなどの因子に依存しうることが、当業者には理解されよう。宿主細胞に発現ベクターを導入して、それによってタンパク質またはペプチドを生成させることができる。
【０２４３】
本発明の組換え発現ベクターは、原核細胞または真核細胞におけるＧＨＲｄ３タンパク質の発現用に設計することができる。例えば、ＧＨＲｄ３タンパク質は、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）などの細菌細胞、昆虫細胞（バキュロウイルス発現ベクターを用いて）、酵母細胞、または哺乳類細胞で発現することができる。適当な宿主細胞に関しては、Goeddel; Gene Expression Technology: Methods in Enzymology、第１８５巻、Academic Press、San Diego, Calif.(1990年)で、さらに論じられている。別法として、組換え発現ベクターは、例えば、Ｔ７プロモーター調節配列およびＴ７ポリメラーゼを用いて、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで転写および翻訳することができる。
【０２４４】
原始核生物におけるタンパク質の発現は、ほとんどの場合、融合タンパク質または非融合タンパク質の発現を指示する構成的プロモーターまたは誘導性プロモーターを含有するベクターを用いて大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）で行われる。融合ベクターは、それにエンコードされたタンパク質、通常、組み換えタンパク質のアミノ末端に、いくつかのアミノ酸を付加する。そのような融合ベクターは、通常、次の３つの目的において有用である。すなわち、１）組み換えタンパク質の発現を増強する；２）組み換えタンパク質の溶解性を増強する；３）アフィニティー精製におけるリガンドとして機能して、組み換えタンパク質の精製を補助する。融合発現ベクターでは、多くの場合、融合部分と組み換えタンパク質との接合部にタンパク分解性の切断部位を導入し、融合タンパク質を精製した後に、融合部分から組み換えタンパク質を分離できるようにする。そのような酵素、およびそれによって認識される認識配列には、因子Ｘａ、トロンビン、およびエンテロキナーゼが含まれる。典型的な融合発現ベクターには、ｐＧＥＸ（Pharmacia Biotech Inc; Smith,D.B.及びJohnson, K.S.(1988年)、Gene、第67巻、31〜40ページ）、ｐＭＡＬ(New England Biolabs, Beverly、Mass.)、およびｐＲＩＴ５(Pharmacia, Piscataway, N.J.)が含まれ、これらはそれぞれ、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合タンパク質、またはプロテインＡを標的組換えタンパク質に融合させる。
【０２４５】
適当な誘導性非融合大腸菌発現ベクターの例には、ｐＴｒｃ（Amannら(1988年)、Gene、第69巻、301〜315ページ）およびｐＥＴ  １１ｄ(Studierら、Gene Expression Technology: Methods in Enzymology、第185巻、Academic Press、San Diego, Calif.(1990年)、60〜89ページ)が含まれる。ｐＴｒｃベクターからの標的遺伝子発現は、ｔｒｐ−ｌａｃハイブリッド融合プロモーターからの宿主ＲＮＡポリメラーゼ転写に依存している。ｐＥＴ  １１ｄベクターからの標的遺伝子発現は、同時発現されるウイルスＲＮＡポリメラーゼ（Ｔ７  ｇｎ  １）によって媒介されるＴ７  ｇｎ  １０−ｌａｃ融合プロモーターからの転写に依存している。このウイルスポリメラーゼは、宿主株ＢＬ２１（ＤＥ３）またはＨＭＳ１７４（ＤＥ３）によって、ｌａｃＵＶ５プロモーターの転写調節下にＴ７  ｇｎ  ｌ遺伝子を有する常在のプロファージから提供される。
【０２４６】
大腸菌における組換えタンパク質発現を最大にするストラテジーの１つは、組み換えタンパク質に対するタンパク質分解能が低下している宿主細菌でタンパク質を発現するものである(Gottesman,S., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, Calif.(1990年)、119〜128ページ）。別のストラテジーは、各アミノ酸のそれぞれのコドンが大腸菌で優先的に利用されるものとなるように発現ベクターに挿入される核酸の配列を変化させるものである（Wadaら（1992年）、Nucleic Acids Res.、第20巻、2111〜2118ページ）。本発明の核酸配列のそのような改変は、標準的なＤＮＡ合成技法によって実行できる。
【０２４７】
別の実施形態では、ＧＨＲｄ３発現ベクターは酵母発現ベクターである。酵母(S.cerivisae)での発現用のベクターの例には、pYepSec I(Baldariら(1987年)、Embo J.、第６巻、229〜234ページ）、ｐＭＦａ（KurjanおよびHerskowitz(1982年)、Ｃｅｌｌ、第30巻、933〜943ページ）、ｐＪＲＹ８８（Schultzら(1987年)、Gene、第５４巻、113〜123ページ）、ｐＹＥＳ２(Invitrogen Corporation、San Diego、Calif.)、及びpicZ(InVitrogen Corp、San Diego、Calif.)が含まれる。
【０２４８】
別法として、ＧＨＲｄ３タンパク質は、バキュロウイルス発現ベクターを用いて、昆虫細胞内で発現することもできる。培養昆虫細胞（例えば、Ｓｆ９細胞）でタンパク質の発現に使用できるバキュロウイルスベクターには、ｐＡｃシリーズ（Ｓｍｉｔｈら（１９８３年）、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．、第３巻、２１５６〜２１６５ページ）およびｐＶＬシリーズ（Lucklow及びSummer（1989年）、Virology、第170巻、31〜39ページ）が含まれる。特に好ましい実施形態では、Karniskiら、Am.J.Physiol.（1998年）、第275巻、Ｆ７９〜８７ページに従って、ＧＨＲｄ３タンパク質を発現する。
【０２４９】
さらに別の実施形態では、本発明の核酸は、哺乳類発現ベクターを用いて、哺乳類細胞内で発現される。哺乳類発現ベクターの例には、ｐＣＤＭ８（Ｓｅｅｄ，Ｂ．（１９８７年）、Ｎａｔｕｒｅ、第３２９巻、８４０ページ）、およびｐＭＴ２ＰＣ（Ｋａｕｆｍａｎら（１９８７年）、ＥＭＢＯ  Ｊ．、第６巻、１８７〜１９５ページ）が含まれる。哺乳類細胞で使用される場合、発現ベクターの調節機能は、ウイルス性の調節エレメントによって提供されることが多い。例えば、一般的に使用されるプロモーターは、ポリオーマウイルス、アデノウイルス２、サイトメガロウイルス、およびシミアンウイルス４０に由来するものである。原核細胞および真核細胞に適した他の発現システムに関しては、Sambrook,J.、Fritsh,E.F.、及びManiatis,T.、Molecular Cloning: A Laboratory Manual、第２版、編、Cold Spring Harbor Laboratory、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.、1989年の第16章および第17章を参照のこと。
【０２５０】
本発明の別の態様は、本発明の組換体発現ベクターが導入された宿主細胞に関する。「宿主細胞」および「組換え型宿主細胞」という用語は、本明細書において、互換性をもって使用される。そのような用語は、特定の対象の細胞を指すだけではなく、そのような細胞の子孫または潜在的子孫も指すことが理解されよう。継代を続けると、変異または環境の影響によってある種の改変が生じうるので、そのような子孫は、親細胞と実際には同一でないかもしないが、それらも、なお、本明細書では、この用語に包含されるものとする。
【０２５１】
宿主細胞はいかなる原核細胞または核細胞でもよい。例えば、ＧＨＲｄ３タンパク質は、大腸菌(E.coli)などの細菌細胞、昆虫細胞、酵母、または哺乳類細胞（好ましくは、ヒト２９３細胞）で発現することができる。他の適当な宿主細胞は当業者に公知であり、それにはアフリカツメガエル(Xenopus laevis)卵母細胞も含まれる。
【０２５２】
ベクターＤＮＡは、従来の形質転換または形質移入の方法で、原核細胞または真核細胞に導入することができる。本明細書において、「形質転換」および「形質移入」という用語は、リン酸カルシウム法、塩化カルシウム共沈、ＤＥＡＥデキストラン媒介トランスフェクション、リポフェクション、またはエレクトロポレーションを含めた、外来の核酸（例えば、ＤＮＡ）を宿主細胞に導入する様々な、当技術分野において承認されている方法のことをいうものとする。宿主細胞を形質転換または形質移入する適当な方法は、Sambrookら(Molecular Cloning:A Laboratory Manual、第２版、編、Cold Spring Harbor Laboratory、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.、1989年)および他の実験室マニュアルに記載されている。
【０２５３】
哺乳類細胞の安定な形質移入に関しては、使用した形質移入法および発現ベクターによって、ごくわずかな割合の細胞のみが外来ＤＮＡをそれらのゲノムに組み込むということが公知である。このように組み込んだものを同定および選択するために、通常、選択的マーカー（例えば、抗生物質に対する耐性）をエンコードする遺伝子を、注目している遺伝子と共に宿主細胞に導入する。好ましい選択的マーカーには、Ｇ４１８、ハイグロマイシン、メトトレキセートなどの薬物に対する耐性を付与するものが含まれる。選択的マーカーをエンコードする核酸は、ＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする同一のベクターで宿主細胞に導入することもできるか、別々のベクターで導入することもできる。導入された核酸で安定に形質移入された細胞は、薬剤による選択で特定することができる（例えば、選択的マーカー遺伝子を組み込んだ細胞は生き残り、他の細胞は死ぬ）。
【０２５４】
原核または真核の培養宿主細胞などの本発明の宿主細胞は、ＧＨＲｄ３タンパク質を生成（すなわち、発現）するのに使用できる。したがって、本発明は、本発明の宿主細胞を用いてＧＨＲｄ３タンパク質を生成する方法をさらに提供する。一実施形態において、この方法は、本発明の宿主細胞（ＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする組換え発現ベクターをその中に導入する）を適当な培地中で、ＧＨＲｄ３タンパク質が生成されるように培養することを含む。
【０２５５】
本発明の宿主細胞は、ＧＨＲｄ３アレルに関してホモ接合またはヘテロ接合である非ヒトトランスジェニック動物を産生するのに用いることもできる。例えば、一実施形態において、本発明の宿主細胞は、ＧＨＲｄ３コード配列がその中に導入された授精卵胞卵または胚幹細胞である。そのような宿主細胞を用いることで、次に、外来ＧＨＲｄ３配列がそれらのゲノムに導入されている非ヒトトランスジェニック動物、または内在性ＧＨＲｆｌ配列が改変されている相同組換え型動物を産生することができる。そのような動物は、ＧＨＲｄ３の機能および／または活性を研究するのに、そして、ＧＨＲｄ３活性の変調因子を同定および／または評価するのに有用である。本明細書において、「トランスジェニック動物」とは、その動物の１つまたは複数の細胞が導入遺伝子を含む非ヒト動物、好ましくは哺乳動物、より好ましくはラットまたはマウスなどの齧歯動物である。トランスジェニック動物の他の例には、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワトリ、両生類などが含まれる。導入遺伝子は、トランスジェニック動物がそれから発生する細胞のゲノムに組み込まれている外因性ＤＮＡであって、成熟した動物のゲノム中に残存し、それによって、トランスジェニック動物の１つまたは複数の細胞型または組織で、エンコードしている遺伝子産物の発現を誘導する外因性ＤＮＡである。本明細書において、「相同組換え型動物」とは、内因性遺伝子間の相同組換えによって内在性ＧＨＲ遺伝子（例えば、ＧＨＲｆｌアレル）が改変されており、かつその動物の細胞に外因性ＤＮＡ分子が導入されている、例えば、その動物が発生する前に、その動物の胎児性細胞に導入されている非ヒト動物、好ましくは哺乳動物、より好ましくはマウスである。
【０２５６】
本発明のトランスジェニック動物は、授精卵母細胞の雄性前核に、例えば、マイクロインジェクションまたはレトロウイルス感染によってＧＨＲｄ３をエンコードする核酸を導入し、卵母細胞を偽妊娠の養母動物中で発生させることによって産生することができる。ＧＨＲｄ３ｃＤＮＡ配列は、導入遺伝子として非ヒト動物のゲノムに導入することができる。導入遺伝子の発現効率を増大させるために、導入遺伝子にイントロン配列およびポリアデニル化シグナルを含有させることができる。組織特異的な調節配列をＧＨＲｄ３導入遺伝子に作用可能に連結させることによって、特定の細胞におけるＧＨＲｄ３タンパク質の発現を指示することができる。胚操作およびマイクロインジェクション法によってトランスジェニック動物を産生する方法は、特にマウスなどの動物では、当技術分野における従来法となっており、例えば、Lederらによる米国特許第４７３６８６６号および第４８７０００９号、Wagnerらによる米国特許第４８７３１９１号、ならびにHogan,B.、Manipulating the Mouse Embryo（Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.、1986年）に記載されている。他のトランスジェニック動物の産生にも、同様の方法が用いられる。トランスジェニックファウンダー動物(transgenic founder animal)は、ゲノム中におけるＧＨＲｄ３導入遺伝子の存在および／または動物組織中または細胞中のＧＨＲｄ３  ｍＲＮＡの発現に基づいて特定することができる。その後、このトランスジェニックファウンダー動物を用いて、導入遺伝子を保持するさらに多くの動物を繁殖させることができる。さらに、ＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする導入遺伝子を保持するトランスジェニック動物を、他の導入遺伝子を保持する他のトランスジェニック動物と交配させることもできる。
【０２５７】
相同組換え型動物を産生するためには、ＧＨＲｄ３核酸の少なくとも一部を含有し、それによって内在性ＧＨＲ（ＧＨＲｆｌ）遺伝子を改変するベクターを調製する。ＧＨＲｄ３の遺伝子は、ヒト遺伝子でも、ヒトＧＨＲ遺伝子の非ヒト相同体（例えば、配列番号１、４または６に由来するヌクレオチド配列とのストリンジェントハイブリダイゼーションで単離されるｃＤＮＡ）でもよい。この非ヒト相同体は、非ヒトＧＨＲ配列を改変して、エキソン３核酸を除去することによって生成することが好ましい。例えば、マウスでは、ＧＨＲｄ３アレルが観測されていないため、マウスＧＨＲｄ３核酸は公知の方法を用いることによって調製してもよい。したがって、ある特定の態様では、マウスゲノム中の内在性ＧＨＲ遺伝子を改変するのに適した相同組換ベクターに合成マウスＧＨＲｄ３遺伝子を用いることができる。好ましい実施形態では、相同組換えによって内在性ＧＨＲ遺伝子がＧＨＲｄ３遺伝子で置換されるようにベクターを設計し、上記ＧＨＲｄ３遺伝子は機能的なＧＨＲｄ３タンパク質をエンコードする（例えば上流調節領域を変化させ、それによって、内在性ＧＨＲｄ３タンパク質の発現を変化させることができる）。相同組換えベクターでは、ＧＨＲｄ３の遺伝子の５’末端および３’末端に、ＧＨＲ遺伝子の別の核酸配列が追加されており、それによって、ベクターが保持する外来性ＧＨＲｄ３遺伝子と、胚幹細胞中の内在性ＧＨＲ遺伝子との間の相同組換えが起こりうるようになっている。追加される隣接ＧＨＲ核酸配列は、内因性遺伝子との相同組換えが成功裡に行われるように、十分な長さのものとなっている。通常、数キロベースの隣接ＤＮＡ（５’および３’両端において）がベクターに含まれる（相同組換えベクターの記載に関しては、例えば、Thomas,K.R.およびCapecchi,M.R.（1987年）、Cell、第51巻、503ページを参照されたし）。ベクターを胚幹細胞系に導入（例えば、エレクトロポレーションによって）し、導入されたＧＨＲｄ３遺伝子が内在性ＧＨＲ遺伝子と相同組換えを行った細胞を選択する（例えば、Li,E.ら（1992年）、Cell、第69巻、915ページ参照）。その後、選択された細胞を動物（例えば、マウス）の胚盤胞に注入し、キメラ集合体を形成させる（例えば、Bradley,A.、Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells.A Practical Approach、E.J.Robertson，編集、（IRL、Oxford、1987年）、113〜152ページを参照）。その後、キメラ胚を適当な偽妊娠の養母動物に着床させ、出産まで胚をおく。生殖細胞に相同組換えＤＮＡを保持する子孫を繁殖させることによって、導入遺伝子の生殖系列伝搬によって、体内の全ての細胞に相同組換えＤＮＡを含有する動物を生み出すことができる。相同組換えベクターを構築する方法、および相同組換え型動物に関しては、Bradley，Ａ．（1991年）、Current Opinion in Biotechnology、第２巻、823〜829ページ、ならびにLe MouellecらによるＰＣＴ国際公開ＷＯ９０／１１７５４号；SmithiesらによるＷＯ９１／０１１４０号；ZijlstraらによるＷＯ９２／０９６８号；およびBernsらによるＷＯ９３／４１６９号にさらに記載されている。
【０２５８】
別の実施形態では、導入遺伝子の調節発現を可能にする選択されたシステムを含有するトランスジェニック非ヒト動物を産生することができる。そのようなシステムの一例には、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼシステムがある。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼシステムの記載に関しては、例えば、Laksoら（1992年）、ＰＮＡＳ、第89巻、6232〜6236ページを参照されたし。リコンビナーゼシステムの別の例には、発芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)のＦＬＰリコンビナーゼシステムがある（O'Gormanら（1991年）、Science、第251巻、1351〜1355ページ）。導入遺伝子の発現を調節するために、ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼシステムを使用する場合には、Ｃｒｅリコンビナーゼと、選択されたタンパク質をエンコードする導入遺伝子との両方を含有する動物が必要である。例えば、２頭のトランスジェニック動物を交配させて、一方が、選択されたタンパク質をエンコードする導入遺伝子を含有し、もう一方が、リコンビナーゼをエンコードする導入遺伝子を含有する「二重」トランスジェニック動物を構築することによって、そのような動物を提供することができる。
【０２５９】
本発明は以下の実施例を参照することにより、より完全に理解されよう。しかし、それらは、本発明の範囲を限定するものとして理解するべきではない。すべての文献および特許の引用を参照により明確に本明細書に組み込む。
【実施例１】
【０２６０】
（ＧＨＲｄ３およびＧＨＲｆ１のＰＣＲ  ＲＦＬＰ遺伝子型決定）
（ＰＣＲ  ＲＦＬＰ）
ＰＣＲ増幅は、９６ウェルマイクロタイタープレート（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ）で行った。各ウェルは、ＤＮＡ  ２００ｎｇ、ＭｇＣｌ２  １．５ｍＭ、１０Ｘ反応緩衝液（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ）５μｌ、各ｄＮＴＰ  ０．２ｍＭ、各プライマー０．２μＭ、およびＴａｑポリメラーゼ（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ）１．２５Ｕを含有する反応混合物５０μｌを含む。
【０２６１】
９７００  Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒサーモサイクラーを用いて、ＰＣＲサイクルを３５サイクル行った。ＰＣＲ産物はアガロースゲル上で検出した。
【０２６２】
【表１】
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【実施例２】
【０２６３】
（ＧＨ反応に関連したＧＨＲｄ３アレルの検出）
組換えＧＨによる治療に関する治験に登録された９７人の特発性低身長の子供（ＩＳ）で、一般的なＧＨＲエキソン３変種と、ＧＨによる治療に対する成長速度の反応との関連を検査した。表１に示すように、４７人の患者にＧＨＲｄ３アレルが存在し、そのうち３人がＧＨＲｄ３／ｄ３ホモ接合体であり、４４人がＧＨＲｄ３／ｆｌヘテロ接合体であった。
【０２６４】
【表２】
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【０２６５】
正常な低身長の患者が選択された。除外されたのは、「真に」成長ホルモン欠損症（ＧＨＤ）である患者、ＣＮＳ腫瘍を有する患者、ＧＨＲ遺伝子に変異を有する患者、他のホルモン欠損を有する患者、ターナー症候群、ＰＨＰ、低軟骨形成症もしくは他の骨異形成症、ラロン病または他の疾患を有する患者である。最後に、選択された患者は、２年後のＧＨ治療終了時に、思春期の徴候（胸、精巣）を示さなかった。
【０２６６】
遺伝子型グループは、他の医学上および治療上の特性と一致するものであった。年齢、性別、ｒＧＨの用量、出生時の大きさ、両親の身長を含めた患者の特徴も考慮に入れた（表２、３、および４）。
【０２６７】
【表３】
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【０２６８】
【表４】
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【０２６９】
【表５】
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【０２７０】
２年間にわたるｒｈＧＨによる治療の間、成長速度を観測した（表５）。年齢、性別、およびｒＧＨの用量に関して調整を行った結果は、ＧＨＲｄ３変種を保持した子供が、ｒＧＨで治療された際に、優れた速度で成長したことを示した。ＧＨＲｄ３／ｆｌまたはＧＨＲｄ３／ｄ３遺伝子型を有する子供の成長速度は、治療の最初の年が９．０＋／−０．３ｃｍ／年であり、２年目が７．８＋／−０．２ｃｍ／年であったが、これと比較して、ＧＨＲｆｌ／ｆｌ遺伝子型を有する子供では、それぞれ、７．４＋／−０．２および６．５＋／−０．２ｃｍ／年であった（Ｐ＜０．０００１）。したがって、ＧＨＲ配列のゲノム変異は、ｒＧＨ効率の顕著な相違と関連している。
【０２７１】
【表６】
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【０２７２】
成長速度の多変量解析では、混合線形モデルを用いて、個体内測定値相互の相関関係をモデル化した（表６）。考慮された共変量には、年齢、性別、組換えＧＨによる治療前の成長速度（ＶＣ０）（乗馬効果（ｈｏｒｓｅ  ｒｉｄｉｎｇ  ｅｆｆｅｃｔ））、開始時の身長、ＧＨ用量、ＧＨＲ遺伝子型、および対象（インターセプト（ｉｎｔｅｒｃｅｐｔ））が含まれる。
【０２７３】
共変量に関して調整を行った後の結果は、エキソン３を欠失したＧＨＲを有する患者（ＧＨＲｄ３）の成長速度が、完全長ＧＨＲアイソフォーム（ＧＨＲｆ１）に関してホモ接合体である患者より優れていることを示した。相関行列は、この効果が他の共変量から独立したものであることを示す。
【０２７４】
【表７】
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【図面の簡単な説明】
【０２７５】
【図１Ａ】ＧＨＲｆｌアイソフォームをエンコードするｃＤＮＡ配列（配列番号１）を示す図である。
【図１Ｂ】ＧＨＲｆｌアイソフォームをエンコードするｃＤＮＡ配列（配列番号１）を示す図である。
【図１Ｃ】ＧＨＲｆｌアイソフォームをエンコードするｃＤＮＡ配列（配列番号１）を示す図である。
【図１Ｄ】ＧＨＲｆｌアイソフォームをエンコードするｃＤＮＡ配列（配列番号１）を示す図である。
【図２】ＧＨＲｆｌアイソフォームのアミノ酸配列（配列番号２および３）を示す図である。
【図３Ａ】エキソン３周辺のヒトＧＨＲ遺伝子ゲノムＤＮＡ配列（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ１５５９１２）（配列番号４）を示す図である。
【図３Ｂ】エキソン３周辺のヒトＧＨＲ遺伝子ゲノムＤＮＡ配列（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ１５５９１２）（配列番号４）を示す図である。
【図３Ｃ】エキソン３周辺のヒトＧＨＲ遺伝子ゲノムＤＮＡ配列（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ１５５９１２）（配列番号４）を示す図である。
【図３Ｄ】エキソン３周辺のヒトＧＨＲ遺伝子ゲノムＤＮＡ配列（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ１５５９１２）（配列番号４）を示す図である。
【図４】エキソン３欠失部位周辺におけるヒトＧＨＲ遺伝子ＧＨＲｄ３アレルのゲノムＤＮＡ配列（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号ＡＦ２１０６３３）（配列番号６）を示す図である。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図１Ｃ】
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【図１Ｄ】
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【図２】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図３Ｃ】
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【図３Ｄ】
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【図４】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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