(57)【要約】本発明は、血液障害の診断および処置のための方法に関する。特に本発明は、血液障害の感覚に関連する組織において、正常状態、または非血液障害疾患状態における発現と比較して、および／または血液障害に適切な操作に対する応答において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５および５０１４の遺伝子の差次的な発現を同定する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
血液障害を処置し得る化合物を同定する方法であって、該方法は、以下：
（ａ）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドと試験される化合物とを、該ポリペプチドに対する該試験化合物の結合に適切な条件下で合わせる工程；および
（ｂ）該ポリペプチドへの該試験化合物の結合を検出し、それによって該ポリペプチドに結合する化合物を同定し、血液障害を処置し得る化合物を同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
前記化合物が、以下：低分子、ペプチドまたは抗体からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ポリペプチドが、異種配列をさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ポリペプチドが、単離されたポリペプチド、単離されたポリペプチドの膜結合形態またはポリペプチドを含む細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記細胞が、血液細胞である、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記血液障害が、以下：貧血、好中球減少症または血小板減少症に限定されないが、これらに関連する障害である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
請求項１に記載の方法であって、前記ポリペプチドへの前記試験化合物の前記結合が、以下：
（ａ）競合結合アッセイ；
（ｂ）免疫アッセイ；および
（ｃ）酵母ツーハイブリッドアッセイ；
からなる群から選択される方法によって検出される、方法。
【請求項８】
血液障害を処置し得る化合物を同定する方法であって、該方法は、以下：
ａ）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドを発現する宿主細胞と試験される化合物とを、該ポリペプチドへの該試験化合物の結合に適切な条件下で合わせる工程；および
ｂ）該ポリペプチドへの試験化合物の結合を検出し、それによって該ポリペプチドに結合する化合物を同定し、血液障害を処置し得る化合物を同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項９】
前記化合物が、以下：低分子、ペプチド、抗体またはアンチセンス核酸分子からなる群から選択される、請求項８に記載される方法。
【請求項１０】
前記ポリペプチドが、異種配列をさらに含む。請求項８に記載の方法。
【請求項１１】
前記宿主細胞が、血液細胞である、請求項８に記載の方法。
【請求項１２】
前記血液障害が、以下：貧血、好中球減少症または血小板減少症に限定されないが、これらに関連する障害である、請求項８に記載の方法。
【請求項１３】
請求項８に記載の方法であって、前記ポリペプチドへの前記試験化合物の前記結合が、以下：
（ａ）競合結合アッセイ；
（ｂ）免疫アッセイ；および
（ｃ）酵母ツーハイブリッドアッセイ；
からなる群から選択される方法によって検出される、方法。
【請求項１４】
血液障害を被る被験体または血液障害を発症する危険性を有する被験体を同定する方法であって、該方法は、以下：
ａ）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の結合基質と、ポリペプチドを含む被験体から得られるサンプルを接触する工程；および
ｂ）該９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の結合基質に結合するサンプル中のポリペプチドの存在を検出し、それによって血液障害を被る被験体、または血液障害を発症する危険性を有する被験体を同定する工程、
を包含する、方法。
【請求項１５】
前記結合基質が、抗体である、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記結合基質が、検出可能に標識されている、請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９，  ５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチド活性もしくは異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸発現によって特徴付けられる血液障害を被る被験体を処置する方法であって、該方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターを該被験体に投与し、それによって血液障害を被る該被験体を処置する工程を包含する、方法。
【請求項１８】
前記障害が、以下：貧血、好中球減少症または血小板減少症に限定されないが、これらに関連する障害である、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
請求項１７に記載の方法であって、前記９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターが、薬学的に受容可能な処方物中で投与される、方法。
【請求項２０】
請求項１７に記載の方法であって、前記９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７，、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターが、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチド活性を調節し得る、方法。
【請求項２１】
請求項２０に記載の方法であって、前記９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７，、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターが、抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体である、方法。
【請求項２２】
請求項１７に記載の方法であって、前記９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７，、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターが、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸発現を調節し得る、方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願）
本願は、米国仮特許出願番号６０／４４５，２４１（２００３年２月５日出願）、米国仮特許出願番号６０／４４８，３８９（２００３年２月１８日出願）、米国仮特許出願番号６０／４５６，３２０（２００３年３月２０日出願）、米国仮特許出願番号６０／４６０，２７９（２００３年４月３日出願）、米国仮特許出願番号６０／４６５，９２４（２００３年４月２８日出願）、米国仮特許出願番号６０／４７０，０５２（２００３年５月１３日出願）、米国仮特許出願番号６０／４９８，１０６（２００３年８月２６日出願）、米国仮特許出願番号６０／５００，１７９（２００３年９月４日出願）、米国仮特許出願番号６０／５０２，９０９（２００３年９月１５日出願）、米国仮特許出願番号６０／５１０，３５１（２００３年１０月１０日出願）、米国仮特許出願番号６０／５１２，３８０（２００３年１０月１７日出願）の利益を主張する。これらの仮特許出願の全体の内容は、本明細書中で参考として援用される。
【背景技術】
【０００２】
骨髄発達の調節に関与する標的は、第１に、骨髄不全および骨髄機能不全、第２に毒性障害（ｔｏｘｉｃ  ｉｎｓｕｌｔ）（最も明白な化学治療誘導性血球減少症）の処置のための新規の治療アプローチを提供する。重篤なまだ対処されていないこの領域において必要な医療が存在し、現在利用可能なわずかな治療は組換えタンパク質であり、この組換えタンパク質は、系統分化の比較的後期で作用する。
【０００３】
造血（ｈｅｍａｔｏｐｏｅｔｉｃ）幹細胞が富化されたヒト起源およびマウス起源の骨髄集団ならびに骨髄ストローマ細胞集団は、前駆体集団の増殖および成熟に関与する遺伝子発見および標的に注釈のための物質の有用な供給源を提供する。種々の境遇下で培養され、インビボでヒトからか、またはインビボで動物モデルから単離された造血細胞は、血液障害に有用な新規な治療剤の同定をもたらす遺伝子発現分析のための原料物質の豊富な供給源を提供する。
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
（発明の詳細な説明）
本発明は、血液障害を有する患者の診断および処置のための方法および組成物を提供する。
【０００５】
本明細書中で使用される場合、「処置」は、疾患または障害、少なくとも１つの疾患または障害の症状あるいは疾患または障害に向かう素因を治癒（ｃｕｒｉｎｇ）する、治癒（ｈｅａｌｉｎｇ）する、緩和する、軽減（ｒｅｌｉｅｖｅ）する、変化させる、軽減（ｒｅｍｅｄｙ）する、回復する、改善するまたは影響する目的で、患者への治療剤の適用または投与、あるいは患者から単離された組織または細胞株への治療剤の適用または投与として規定され、患者は、疾患または障害、疾患または障害の症状あるいは疾患または障害に向かう素因を有する。治療剤としては、低分子、ペプチド、抗体、リボザイム、およびアンチセンスオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書中で使用される場合、治療剤はまた、モジュレーターとしても知られる。代表的な分子は、本明細書中に記載される。
【０００６】
本明細書中で使用される場合、血液障害としては、赤血球関連障害が挙げられるが、これに限定されない。本明細書中で使用される場合、用語「赤血球関連障害」は、異常な（増大したかまたは欠損した）赤芽球増殖（例えば、赤白血病）および異常な（増大したかまたは欠損した）赤芽球分化（例えば、貧血）を含む障害を含む。赤血球関連障害としては、以下が挙げられる：貧血（例えば、薬物（化学療法）誘導性貧血、遺伝的な細胞膜異常に起因する溶血性貧血（例えば、遺伝性球状赤血球症、遺伝性楕円赤血球症および遺伝性熱変形赤血球症）；後天的な細胞膜欠損に起因する溶血性貧血（例えば、発作性夜間血色素尿症および有棘細胞貧血）；抗体反応によって引き起こされる溶血性貧血（例えば、ＲＢＣ抗原に対する抗体、またはＡＢＯ系、Ｌｅｗｉｓ系、Ｉｉ系、Ｒｈ系、Ｋｉｄｄ系、Ｄｕｆｆｙ系およびＫｅｌｌ系の抗原に対する抗体）；メトヘモグロビン血症；赤血球生成の不全（例えば、再生不良性貧血、赤芽球癆、骨髄異形成症候群、鉄芽球性貧血および先天性異常赤血球生成貧血の結果としてのもの）；非溶血性障害における二次的貧血（例えば、化学療法、アルコール中毒症または肝臓疾患の結果としてのもの）；慢性疾患の貧血（例えば、慢性腎不全）；ならびに内分泌欠損疾患。
【０００７】
本発明のポリペプチドまたは核酸の活性または発現を調節する薬剤を使用して、貧血、特に、薬物誘導性貧血または癌化学療法、慢性腎不全、悪性疾患、成人性または若年性の慢性関節リウマチ、ヘモグロビン合成の障害、早熟およびＨＩＶ感染のジドブジン処置に関連する貧血を処置し得る。処置を受ける被験体は、さらに二次薬剤（例えば、エリスロポイエチン）でさらなる少なくとも１つの状態の症状まで処置され得る。処置のオーダーは、逆にされ得る。この２つの処置は、同時に投与され得る。処置の間のタイミングは、変化され得る。
【０００８】
本明細書中で使用される場合、用語「エリスロポイエチン」または「ＥＰＯ」は、腎臓において生産される糖タンパク質をいい、これは、赤血球生成（赤血球生成：ｅｒｙｔｈｒｏｇｅｎｅｓｉｓ）を刺激するのに責任がある主要なホルモンである。ＥＰＯは、骨髄における拘束された（ｃｏｍｍｉｔｔｅｄ）赤血球先祖の分裂および分化を刺激する。正常な血漿エリスロポイエチンレベルは、０．０１〜０．０３単位／ｍＬの範囲であり、そして低酸素症または貧血の間、１００〜１，０００倍まで上昇し得る。ＧｒａｂｅｒおよびＫｒａｎｔｚ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．２９：５１（１９７８）；ＥｓｃｈｂａｃｈおよびＡｄａｍｓｏｎ，Ｋｉｄｎｅｙ  Ｉｎｔｌ．２８：１（１９８５）。組換えヒトエリスロポイエチン（ｒＨｕＥｐｏまたはエポエチン（ｅｐｏｉｅｔｉｎ）α）は、ＥＰＯＧＥＮ．ＲＴＭ．（エポエチンα、組換えヒトエリスロポイエチン）（Ａｍｇｅｎ  Ｉｎｃ．，Ｔｈｏｕｓａｎｄ  Ｏａｋｓ，Ｃａｌｉｆ．）およびＰＲＯＣＲＩＴ．ＲＴＭ．（エポエチンα、組換えヒトエリスロポイエチン）（Ｏｒｔｈｏ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  Ｉｎｃ．，Ｒａｒｉｔａｎ，Ｎ．Ｊ．）として市販される。
【０００９】
赤血球関連障害の別の例は、赤血球増加症である。赤血球造血症（過剰および／または異所性のエリスロポイエチン生成によって引き起こされる赤血球過剰生産の障害）は、癌（例えば、腎細胞癌、悪性肝細胞癌および中枢神経系癌）によって引き起こされ得る。赤血球増加症（ｅｒｙｔｈｒｏｃｙｔｏｓｉｓ）に関連する疾患としては、赤血球増加症（ｐｏｌｙｃｙｔｈｅｍｉａ）（例えば、真性赤血球増加症、二次赤血球増加症および相対的赤血球増加症）が挙げられる。
【００１０】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、Ｂ細胞に関与する障害を含み、これらとしては、前駆体Ｂ細胞新生物（例えば、リンパ芽球性白血病／リンパ芽球性リンパ腫）が挙げられるが、これに限定されない。末梢Ｂ細胞新生物としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：慢性リンパ性白血病／小リンパ球性リンパ種、濾胞性リンパ腫、びまん性大Ｂ細胞リンパ腫（ｄｉｆｆｕｓｅ  ｌａｒｇｅ  Ｂ−ｃｅｌｌ  ｌｙｍｐｈｏｍａ）、バーキットリンパ腫、プラスマ細胞新生物、多発性骨髄腫および関連要素、リンパプラスマ細胞リンパ腫（ｌｙｍｐｈｏｐｌａｓｍａｃｙｔｉｃ  ｌｙｍｐｈｏｍａ）（ヴァルデンストレームマクログロブリン血症）、成熟細胞性リンパ腫、辺縁層リンパ腫（ＭＡＬＴｏｍａ）ならびに毛様細胞白血病。
【００１１】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、骨髄の障害を含み、これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：造血性（ｈｅｍａｔｏｐｏｅｉｔｉｃ）幹細胞に関与する疾患；拘束されたリンパ先祖細胞；Ｂ細胞およびＴ細胞を含むリンパ細胞；拘束された骨髄様先祖（単球、顆粒球および巨核球を含む）；および拘束された赤血球先祖。これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：白血病（Ｂ−リンパ性白血病、Ｔ−リンパ性白血病、未分化型白血病を含む）；赤白血病、巨核芽球白血病、単球；［白血病は、分化状態であるか分化状態でない］；慢性および急性リンパ芽球性白血病、慢性および急性リンパ性白血病、慢性および急性骨髄性白血病、リンパ腫、骨髄異形成症候群、慢性および急性骨髄性白血病、骨髄単球性白血病；慢性および急性骨髄芽球性白血病、慢性および急性骨髄性白血病、慢性および急性の前骨髄性白血病、慢性および急性の骨髄球白血病、単球マクロファージ直系の血液悪性疾患（例えば、若年性慢性骨髄性白血病）；二次ＡＭＬ、前駆体血液障害；不応性貧血；再生不良性貧血；反応性皮膚（ｒｅａｃｔｉｖｅ  ｃｕｔａｎｅｏｕｓ）血管内皮細胞腫症；樹状細胞における改変された発現に関与する線維性障害、全身性硬化症、Ｅ−Ｍ症候群、流行性毒性油症候群（ｅｐｉｄｅｍｉｃ  ｔｏｘｉｃ  ｏｉｌ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ）、強皮症の好酸球性筋膜炎の限局性形態、ケロイドおよび線維性大腸症を含む障害；血管腫様悪性線維性組織球腫；癌（原発性の頭部および頚部の扁平上皮細胞癌を含む）；肉腫（カポージ肉腫を含む）；線維腺腫および葉状腫瘍（乳房線維腺腫を含む）；間質腫瘍；葉状腫瘍（組織球腫を含む）；赤芽球症；神経線維腫症；血管内皮の疾患；古い外傷における粒状の脱髄；神経膠症、血管原性水腫、脈管性疾患、アルツハイマー病およびパーキンソン病；Ｔ細胞リンパ腫；Ｂ細胞リンパ腫。
【００１２】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、血小板障害を含み得、これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：減少した血小板の数に関する障害、血小板減少症（特発性血小板減少性紫斑病（急性特発性血小板減少性紫斑病を含む）、薬物誘導性血小板減少症、ＨＩＶ関連血小板減少症および血栓性細小血管症を含む）：血栓性血小板減少性紫斑病および溶血性尿毒症症候群。
【００１３】
血液障害はまた、血栓症を含み得る。血栓症は、血小板機能不全を生じ得る（例えば、心筋梗塞において見られる）、アンギナ、高血圧、脂質障害；真性糖尿病；骨髄異形成症候群；骨髄増殖性症候群（真性赤血球増加症および血小板血症（ｔｈｏｍｂｏｃｙｔｈｅｍｉａ）を含む）；血栓性血小板減少性紫斑病；ＨＩＶ誘導性血小板障害（ＡＩＤＳ血小板減少症）；ヘパリン誘導性血小板減少症；血小板凝集／脱顆粒をもたらす壁細胞の改変／相互作用、血管内皮細胞活性化／損傷、単球／マクロファージの溢血および平滑筋細胞の増殖；自己免疫疾患（例えば、これらに限定されないが、脈管炎、抗リン脂質症候群、全身性エリテマトーデス）；炎症性疾患（例えば、これらに限定されないが、免疫活性化）；対宿主性移植片病；放射線誘導性過剰凝固（ｈｙｐｅｒｃｏａｇｕｌａｔｉｏｎ）；遺伝性（常染色体優性または劣性）（例えば、限定されないが、タンパク質Ｃ／Ｓ、抗トロンビンＩＩＩ欠損およびＬｅｉｄｅｎ変異第Ｖ因子を含む凝固因子の経路）または後天性（例えば、限定されないが、凝固因子の自己免疫、癌関連異常調節（ｄｙｓｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ）および薬物誘導性異常調節）のいずれかの凝固因子の異常調節。
【００１４】
本明細書中で使用される場合、血液障害は、赤血球障害を含み得、これらとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：貧血（例えば、溶血性貧血（遺伝性球状赤血球症、赤血球酵素欠損：グルコース−６−ホスフェートデヒドロゲナーゼ欠損に起因する溶血性疾患を含む））、鎌状赤血球疾患、セラサミア症候群、発作性夜間血色素尿症、免疫溶血性貧血、および外傷から赤血球を生じる溶血性貧血；ならびに減少した赤血球生成の貧血（巨赤芽球性貧血を含む）（例えば、ビタミンＢ１２欠損の貧血）：悪性貧血および葉酸欠損の貧血、鉄欠損貧血、慢性疾患の貧血、再生不良性貧血、赤芽球癆および骨髄不全の他の形態。
【００１５】
本明細書中で使用される場合、血液障害としては、Ｔ細胞の疾患が挙げられ得、これには、以下が挙げられるが、これらに限定されない：細胞媒介性過敏症（例えば、遅延型過敏症およびＴ細胞媒介性細胞傷害性）および移植拒絶；自己免疫疾患（例えば、全身性エリテマトーデス、シェーグレン症候群、全身性硬化症、炎症性ミオパシー、混合型結合組織疾患および結節性多発性動脈炎）および他の脈管炎（ｖａｓｃｕｌｉｔｉｄｅｓ）；免疫欠損症候群（原発性免疫欠損（例えば、胸腺発育不全、重症複合型免疫不全疾患およびＡＩＤＳ）が挙げられるが、これらに限定されない）；白血球減少症；白血球の反応性（炎症性）増殖（白血球増加症、急性非特異的リンパ節炎および慢性非特異的リンパ節炎が挙げられるが、これらに限定されない）；白血球の腫瘍性増殖（リンパ新生物（例えば、前駆体Ｔ細胞新生物（例えば、急性リンパ芽球性白血病／リンパ腫、末梢Ｔ細胞およびナチュラルキラー細胞の新生物）（これには、末梢Ｔ細胞リンパ腫、不特定の成体Ｔ細胞白血病／リンパ腫、菌状息肉腫およびセザリー症候群が挙げられる））ならびにホジキン病が挙げられるが、これらに限定されない）。
【００１６】
血液細胞としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：骨髄細胞、造血幹細胞、赤血球を含む赤血球系細胞、Ｂ細胞およびＴ細胞を含むリンパ系細胞、単球、顆粒球、および巨核球を含む骨髄性（好中球）細胞ならびに血小板。
【００１７】
本発明の１つの局面は、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４媒介性障害または関連障害（例えば、造血障害（例えば、赤血球関連障害））を処置および診断するために適用可能なアッセイにおける試薬または標的として有用である９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドおよびその生物学的に活性なフラグメントまたは抗原性フラグメントを特徴とする。別の実施形態において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を有する９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４ポリペプチドを提供する。好ましいポリペプチドは、少なくとも１つの二重特異的ホスファターゼ触媒ドメインを含む、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質であり、好ましくは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性（例えば、本明細書中に記載されるような９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性）を有する９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質である。
【００１８】
関連する局面において、本発明は、融合タンパク質を形成するために９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドに作動可能に連結される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドまたはフラグメントを提供する。
【００１９】
別の局面において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドと反応する、またはより好ましくはそれらを特異的に結合する、抗体およびそれらの抗原結合フラグメントを特徴とする。
【００２０】
別の局面において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のポリペプチドまたは核酸の発現または活性を調節する化合物をスクリーニングする方法を提供する。
【００２１】
さらに別の局面において、本発明は、例えば、スクリーニングされた化合物を用いて、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４ポリペプチドまたは核酸の発現あるいは活性を調節するためのプロセスを提供する。特定の実施形態において、本方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のポリペプチドまたは核酸の減少した活性または発現に関連する状態（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球））の異常な細胞増殖を含む状態）の処置を含む。状態としては、白血病（例えば、赤白血病）の場合のような造血細胞の活性または増殖の増加；または例えば、貧血の場合のような、造血細胞の分化の減少が挙げられ得る。
【００２２】
さらに別の局面において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球））の増殖、生存および／または分化を調節（例えば、増強または阻害）するための方法を提供する。本方法は、その細胞を、細胞の増殖および／または分化を調節するのに有効な量の薬剤（この薬剤は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドまたは核酸の活性または発現を調節する）と接触させる工程を包含する。
【００２３】
好ましい実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドは、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８または８０と同一または実質的に同一なアミノ酸配列を有する。他の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドは、配列番号配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８または８０の、少なくとも１５、２０、５０、１００、１５０、１８０、２００またはそれ以上連続するアミノ酸のフラグメントである。
【００２４】
好ましい実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７または７９と同一または実質的に同一なヌクレオチド配列を有する。他の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７または７９の、少なくとも５０、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、５００、５５０、６００またはそれ以上連続するヌクレオチドのフラグメントである。
【００２５】
好ましい実施形態において、薬剤は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸の発現を、例えば、転写、ｍＲＮＡ安定性などを調節することによって、調節（例えば、増大または減少）する。
【００２６】
好ましい実施形態において、この薬剤は、ペプチド、ホスホペプチド、低分子（例えば、コンビナトリアルライブラリーのメンバー）または抗体、あるいはこれらの任意の組み合わせである。この抗体は、細胞毒、細胞傷害性剤および反応性金属イオンからなる群より選択される治療部分に結合体化され得る。
【００２７】
さらなる好ましい実施形態において、この薬剤は、アンチセンス、リボザイムまたは三重らせん分子、あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸、あるいはこれらの任意の組み合わせである。
【００２８】
好ましい実施形態において、この薬剤は、細胞傷害性剤と合わせて投与される。
【００２９】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞）は、造血細胞（例えば、骨髄細胞、リンパ細胞または赤血球細胞、あるいはその前駆細胞）である。このような細胞の例としては、骨髄細胞（多形核細胞）、赤血球細胞、リンパ球、単球、細網細胞、プラスマ細胞および巨核球、ならびに異なる系統への幹細胞、そして約束された先祖細胞への前駆体（例えば、赤血球細胞の前駆体（赤芽球）、マクロファージの前駆体（単芽球）、血小板の前駆体（巨核球）、多形核白血球の前駆体（骨髄芽球）およびリンパ球の前駆体（リンパ芽球））が挙げられる。
【００３０】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞）は、骨髄細胞（例えば、骨髄ＣＤ３４発現細胞）である。ＣＤ３４発現細胞の例としては、未成熟造血前駆細胞、骨髄中の造血コロニー形成細胞（単能性（ＣＦＵ−ＧＭ、ＢＦＵ−Ｅ）および多能性祖先細胞（ＣＦＵ−ＧＥＭＭ、ＣＦＵ−ＭｉｘおよびＣＦＵ−芽細胞））；ならびに間質細胞前駆体、末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ（ＴｄＴ）発現Ｂリンパ前駆体およびＴリンパ前駆体、初期骨髄細胞および初期赤血球細胞、が挙げられる。
【００３１】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞）は、骨髄赤血球系細胞（例えば、赤血球祖先細胞（例えば、ＧＰＡ（低）ＣＤ７１＋細胞）または分化した細胞（例えば、赤血球または巨核球））である。
【００３２】
好ましい実施形態において、細胞（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞）は、タンパク質（例えば、サイトカイン）と、さらに接触される。好ましくは、このタンパク質は、Ｇ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦ、幹細胞因子および好ましくはエリトロポイエチンからなる群より選択される。このタンパク質接触工程は、薬剤が接触される前か、それと同時か、またはその後で、生じ得る。このタンパク質接触工程は、インビトロまたはエキソビボで影響を与え得る。例えば、細胞（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞）は、被験体（例えば、患者）から獲得され、そしてタンパク質とエキソビボで接触される。処理された細胞は、被験体に再び導入され得る。あるいは、このタンパク質接触工程は、インビボで生じ得る。
【００３３】
好ましい実施形態において、この薬剤と、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドまたは核酸とは、インビトロまたはエキソビボで接触される。
【００３４】
好ましい実施形態において、この接触工程は、例えば、治療プロトコルまたは予防プロトコルの一部として、被験体においてインビボでもたらされる。好ましくは、被験体は、ヒト（例えば、造血障害（例えば、白血病または赤血球関連障害）を有する患者）である。例えば、この被験体は、貧血（例えば、溶血性貧血、異常な赤血球生成、非造血障害における二次的貧血、慢性疾患（例えば、慢性腎不全）の貧血）；内分泌欠損疾患；および／または赤血球増加症（例えば、多血症）を有する患者であり得る。あるいは、被験体は、癌患者（例えば、白血病性の癌（例えば、赤血球白血病）または癌腫（例えば、腎臓癌腫）を有する患者）であり得る。他の実施形態において、この被験体は、非ヒト動物（例えば、実験動物）である。
【００３５】
接触工程は、反復され得る。
【００３６】
好ましい実施形態において、この薬剤は、細胞（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球系細胞、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球）））の増殖を減少し、そして／またはこれらの分化を増強する。このような薬剤は、癌（例えば、白血病性癌）を処置または予防するために使用され得る。
【００３７】
好ましい実施形態において、この薬剤は、造血細胞（例えば、骨髄（好中球）細胞、単球、赤血球系細胞、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球）の数を、前駆細胞の増殖、生存を増大すること、そして／またはその分化を刺激することによって、増大させる。このような薬剤は、造血障害（例えば、貧血（例えば、溶血性貧血、異常な赤血球生成、非造血障害における二次的貧血、慢性疾患（例えば、慢性腎不全）の貧血）；内分泌欠損疾患；および／または赤血球増加症（例えば、多血症））を処置または予防するために使用され得る。
【００３８】
別の局面において、本発明は、造血（例えば、赤血球生成）を調節する方法を特徴とし、この方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を発現する細胞（例えば、造血細胞（例えば、骨髄性（好中球）細胞、単球、赤血球、骨髄細胞、ＣＤ３４発現細胞、巨核球）と、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４ポリペプチド、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４核酸の活性または発現を増大または減少させる薬剤とを接触させ、それにより、造血細胞の分化を調節する工程を包含する。
【００３９】
なお別の局面において、本発明は、被験体における造血障害（例えば、赤血球関連障害）を処置または予防する方法を特徴とする。この方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４ポリペプチド、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４核酸の活性または発現を調節する薬剤の有効量を、その被験体に投与し、その結果、この造血障害が緩和されるか、または血液障害の少なくとも１つの症状を低減させる工程を包含する。
【００４０】
（本発明の分子）
（遺伝子ＩＤ  ９１１８）
クロルデコンリダクターゼ相同体としても公知である、ヒト９１１８配列（配列番号１）は、非翻訳領域を含む約１１７５ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号１の核酸約１１〜９８２に位置する）は、３２３アミノ酸タンパク質（配列番号２）をコードする。
【００４１】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、９１１８  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４前駆細胞、プールされた赤血球系細胞および高ＧＰＡ細胞中に高いレベルで発現した。さらなるＴａｑＭａｎ実験から、９１１８  ｍＲＮＡは、肝臓、腎臓、肺、脾臓および胎児の肝細胞試料にも発現した。造血試料中では、９１１８  ｍＲＮＡの発現は、赤血球に続いてマクロファージおよび前駆細胞中で、最も高かった。
【００４２】
９１１８は、潜在的に、赤血球の分化および増殖において役割を果たす。それゆえ、９１１８機能の作用は、ＣＦＵ−Ｅから成熟赤血球へ赤血球の分化を伴う、赤血球の増殖の増加を引き起こす。
【００４３】
それらの機能の役割と共に、ＣＤ３４前駆細胞、プールされた赤血球系細胞および高ＧＰＡ細胞中の９１１８  ｍＲＮＡの発現パターンのために、９１１８は、血液学的障害に関した疾患を制御する役割を果たし得る。それゆえ、９１１８活性のモジュレーターは、血液学的障害を処置するのに有用である。本発明の９１１８ポリペプチドは、９１１８活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００４４】
（遺伝子ＩＤ  ９９０）
トリペプチジルペプチダーゼＩＩとしても公知である、ヒト９９０配列（配列番号３）は、非翻訳領域を含む約４６２６ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号３の核酸約２４〜３７７３に位置する）は、１２４９アミノ酸タンパク質（配列番号４）をコードする。
【００４５】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、９９０  ｍＲＮＡは、胎児の肝臓、１０日目の赤血球培養物およびＫ５６２赤白血球病細胞系中に発現した。赤血球パネルを使用して行われたＴａｑＭａｎ分析から、９９０  ｍＲＮＡの発現が、低ＧＰＡ細胞中および１〜１２日目の赤血球分化培養物中で高いことが示された。９９０  ｍＲＮＡの発現は、早期赤血球前駆細胞であるＢＦＵ−Ｅ培養物中でも、増加した。器官リサイタルパネルを使用するＴａｑＭａｎ分析は、赤血球前駆細胞、成熟赤血球およびマクロファージ細胞中で９９０  ｍＲＮＡの高い発現を示した。
【００４６】
９９０  ｍＲＮＡのマウスオルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）は、直系陰性前駆細胞中およびＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞中で発現することが示された。
【００４７】
９９０  ｍＲＮＡは、増殖する赤血球前駆細胞中で、高度に発現する。９９０は、成長因子または他のタンパク質の分解に作用して、これらの細胞の増殖速度を調整する。ニューロン中の９９０  ｍＲＮＡの阻害は、ＣＣＫ８のアベイラビリティを増加させる（Ｎａｔｕｒｅ  １９９６；３８０：４０３−４０９）。９９０はまた、アポトーシス経路中のタンパク質を加工するように作用し得る。感染したマクロファージ中の９９０の阻害は、アポトーシスを減少させる（Ｉｎｆｅｃｔ．Ｉｍｍｕｎ．２０００；６８：５５０２−５５０８）。それゆえ、９９０を阻害すると、赤血球系細胞を拡大させる。
【００４８】
その機能的役割と共に、胎児肝臓、１０日目赤血球培養物およびＫ５６２赤白血球病細胞系中の９９０  ｍＲＮＡの発現により、９９０活性のモジュレーターは、血液学的障害を処置するのに有用である。本発明の９９０ポリペプチドは、９９０活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００４９】
（遺伝子ＩＤ  １７６６２）
タンパク質様の卵黄形成のカルボキシペプチダーゼとしても公知である、ヒト１７６６２配列（配列番号５）は、非翻訳領域を含む約１６３８ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号５の核酸約７０〜１５００に位置する）は、４７６アミノ酸タンパク質（配列番号６）をコードする。
【００５０】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１７６６２  ｍＲＮＡは、胎児の肝臓、ＣＤ１４−／ＣＤ１９＋Ｂ細胞、ＣＤ３４＋細胞、高ＧＰＡ細胞、１０日目赤血球培養物および支質細胞中に発現した。赤血球パネルを使用して行われた、さらなるＴａｑＭａｎ分析から、１７６６２  ｍＲＮＡの発現は、低ＧＰＡ細胞中および６日目赤血球分化培養物中で高いことが示された。マウス細胞パネルを使用するＴａｑＭａｎ分析は、試験された全てのマウス細胞（例えば、直系の陰性単核細胞、ＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞およびＧＲ−１＋骨髄性細胞）で１７６６２  ｍＲＮＡの中程度の発現を示した。器官リサイタルパネルのＴａｑＭａｎ分析により、１７６６２  ｍＲＮＡの発現は、赤血球前駆細胞、成熟赤血球、単核細胞、心臓、腎臓および膀胱に制限されることが示された。
【００５１】
１７６６２は、カルボキシペプチダーゼであり、セリンカルボキシペプチダーゼに強い配列類似性を有する。１７６６２  ｍＲＮＡは、増殖する赤血球前駆細胞中で高度に発現する。１７６６２は、成長因子または他のタンパク質の分解経路において、機能的な役割をする。
【００５２】
それらの機能的役割と共に、胎児の肝臓、ＣＤ１４−／ＣＤ１９＋Ｂ細胞、ＣＤ３４＋細胞、高ＧＰＡ細胞、赤血球の１０日培養物および支質細胞中の１７６６２  ｍＲＮＡの発現により、１７６６２活性のモジュレーターは、血液学的障害を処置するのに有用である。本発明の１７６６２ポリペプチドは、１７６６２活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００５３】
（遺伝子ＩＤ  ８１９８２）
推定セリンプロテアーゼＨＴＲＡ４前駆体としても公知である、ヒト８１９８２配列（配列番号７）は、非翻訳領域を含む約１５４４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号７の核酸約８７〜１５１７に位置する）は、４７６アミノ酸タンパク質（配列番号８）をコードする。
【００５４】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、８１９８２  ｍＲＮＡの発現は、胎盤、ＣＤ１４−／ＣＤ１１ｂ−ＣＤ１５＋好中球前駆体、１０日目好中球培養物、支質細胞およびマクロファージに制限された。さらなるＴａｑＭａｎ分析から、８１９８２  ｍＲＮＡはまた、早期好中球前駆体（ＣＤ１４−、ＣＤ１１Ｂ−、ＣＤ１５＋）中および６日および１２日のＣＤ３４細胞中でも発現することが示された。器官リサイタルパネルを使用するＴａｑＭａｎ分析は、前駆細胞中の小発現する好中球中で８１９８２  ｍＲＮＡの高い発現レベルを示した。
【００５５】
８１９８２  ｍＲＮＡは、増殖する好中球の培養物中で、高度に発現する。８１９８２  ｍＲＮＡは、成長因子または他のタンパク質の分解経路において、機能的な役割をし得る。８１９８２の阻害は、インビボでの好中球細胞の拡大につながる。
【００５６】
それらの機能的役割と共に、胎盤、ＣＤ１４−／ＣＤ１１ｂ−ＣＤ１５＋好中球前駆体、好中球の１０日培養物、支質細胞およびマクロファージ中の８１９８２  ｍＲＮＡの発現により、８１９８２は、血液学的障害に関した疾患を制御する役割を果たし得る。それゆえ、８１９８２活性のモジュレーターは、血液学的障害（好中球減少および／または好中球増加によって特徴づけられる疾患が挙げられるが、これらに制限はしない）を処置するのに有用である。本発明の８１９８２ポリペプチドは、８１９８２活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００５７】
（遺伝子ＩＤ  ６３０）
電位型カリウムチャネルＫＣＮＡ３としても公知である、ヒト６３０配列（配列番号９）は、非翻訳領域を含む約３３０３ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号９の核酸約３８１〜１９５２に位置する）は、５２３アミノ酸タンパク質（配列番号１０）をコードする。
【００５８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、６３０  ｍＲＮＡは、インビトロで発生した巨核球中に高度に発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析から、６３０  ｍＲＮＡは、ＣＤ３およびＣＤ４  Ｔ細胞中ならびに脳中に高レベルで発現することが示された。６３０  ｍＲＮＡは、冠状動脈疾患を有する患者の血小板中および正常なボランティアからの血小板中で発現した。
【００５９】
電位型カリウムチャネルＫＣＮＡ３または６３０が、リンパ球中で発現することは公知である（ＰＮＡＳ  １９９０；８７：９４１１−９４１５）。発現データは、血小板および巨核球中での６３０  ｍＲＮＡの高いレベルを表わした。血小板凝集における６３０の役割を、ＫＣＮＡ３を阻害する公知のチャネルブロッカーであるカリブドトキシンを使用して試験した。実験から、カリブドトキシンは、ヒト血小板におけるトロンビン依存性のカルシウムの流出および凝集の両方を阻害することを明らかにした。インビトロでの研究および発現プロフィールに基づくと、６３０の阻害は、インビボでの血小板凝集および血栓形成を阻害する。
【００６０】
その機能的役割と共に、インビトロで発生した巨核球中の６３０の発現パターンにより、６３０は、血液学的障害に関した疾患を制御する役割を果たし得る。それゆえ、６３０活性のモジュレーターは、血液学的障害を処置するのに有用である。本発明の６３０ポリペプチドは、６３０活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００６１】
（遺伝子ＩＤ  ２１４７２）
ＮＡＤＰ依存性レチノールデヒドロゲナーゼ／リダクターゼとしても公知である、ヒト２１４７２配列（配列番号１１）は、非翻訳領域を含む約９６０ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号１１の核酸約１〜９６０に位置する）は、３１９アミノ酸タンパク質（配列番号１２）をコードする。
【００６２】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２１４７２  ｍＲＮＡの発現は、非常に制限されており、未成熟好中球（ＣＤ１４＋ＣＤ１５＋ＣＤ１１Ｂ−）と比べると、成熟好中球（ＣＤ１４＋ＣＤ１５＋ＣＤ１１ｂ＋）中でより高い発現レベルを有した。２１４７２  ｍＲＮＡはまた、分化している好中球および休止しているマクロファージ中にも発現した。
器官リサイタルパネルを使用するＴａｑＭａｎ分析から、２１４７２  ｍＲＮＡは、重要な好中球組成物を有する組織（例えば、腫瘍および炎症性の腸疾患を有する結腸組織および扁桃組織）中で高度に発現した。
【００６３】
２１４７２は、レチノールの生合成の第１段階に関与する。レチン酸が、骨髄前駆細胞の分化を促進させ、増殖サイクルを終わらせることは公知である。それゆえ、レチン酸の生成を阻害することは、骨髄の前駆細胞数の増加につながる。
【００６４】
成熟好中球における、その機能的な役割および発現パターンのために、２１４７２は、血液学的障害に関した疾患を制御する役割を果たす。それゆえ、２１４７２活性のモジュレーターは、血液学的障害（好中球減少および／または好中球増加に特徴づけられる疾患が挙げられるが、これらに制限はしない）を処置するのに有用である。本発明の２１４７２ポリペプチドは、２１４７２活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００６５】
（遺伝子ＩＤ  １７６９２）
カルボキシペプチダ−ゼＣＰＸ−１としても公知である、ヒト１７６９２配列（配列番号１３）は、非翻訳領域を含む約２２０５ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号１３の核酸約１〜２２０５に位置する）は、７３４アミノ酸タンパク質（配列番号１４）をコードする。
【００６６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１７６９２  ｍＲＮＡの発現は、ＣＤ３４＋前駆細胞に制限される。さらなるＴａｑＭａｎ分析により、１７６９２  ｍＲＮＡは、早期赤血球、巨核球および好中球の培養物中に発現するが、全ての直系においてそれらの分化により低く制御されることが示された。
【００６７】
カルボキシペプチダ−ゼが、他のペプチドを分解させることは公知である。科学文献では、カルボキシペプチダ−ゼは、成長因子およびサイトカインを分解させることによって成長を調節すると示されている。インビボでのＣＤ３４＋前駆細胞中の１７６９２の非常に制限された発現により、１７６９２は、刺激成長因子を分解させることによって、細胞の成長および分化を制御する。それゆえ、１７６９２を制御することは、造血の刺激につながる。
【００６８】
その機能的な役割と共に、ＣＤ３４＋前駆細胞中の１７６９２  ｍＲＮＡの発現のために、１７６９２のモジュレーターは、血液学的障害を処置するのに有用である。本発明の１７６９２ポリペプチドは、１７６９２活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００６９】
（遺伝子ＩＤ  １９２９０）
カルボキシペプチダ−ゼＣＰＸ−１としても公知である、ヒト１９２９０配列（配列番号１５）は、非翻訳領域を含む約２４１６ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号１５の核酸約２３〜１４８６に位置する）は、４８７アミノ酸タンパク質（配列番号１６）をコードする。
【００７０】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１９２９０  ｍＲＮＡは、赤血球直系、高ＧＰＡ細胞、低ＧＰＡ細胞および胎児肝臓中で発現した。
【００７１】
１９２９０は、イノシトールポリリン酸ホスファターゼである。１９２９０は、６Ｐ（Ｉｎｓ６Ｐ）およびＩｎｓ５Ｐを分解させる。Ｉｎｓ６ＰおよびＩｎｓ５Ｐが、シグナル導入に重要な役割を果たし、その結果、細胞タイプ数が増殖することは公知である。それゆえ、１９２９０を阻害すると、イノシトールホスファターゼの分解を減らすことによって、赤血球系細胞の増殖を刺激する。この結果、大多数の赤血球系細胞を生じて、貧血の効果的な処置となる。
【００７２】
その機能的な役割と共に、赤血球直系中の１９２９０  ｍＲＮＡの発現のために、１９２９０のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１９２９０ポリペプチドは、１９２９０活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００７３】
（遺伝子ＩＤ  ２１６２０）
短鎖デヒドロゲナーゼ／リダクターゼ（ＳＤＲ；アルコールデヒドロゲナーゼ）としても公知である、ヒト２１６２０配列（配列番号１７）は、非翻訳領域を含む約１９０９ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号１７の核酸約４２１〜１２０３に位置する）は、２６０アミノ酸タンパク質（配列番号１８）をコードする。
【００７４】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２１６２０  ｍＲＮＡは、赤血球直系、低ＧＰＡ細胞中、および培養された赤血球系細胞中に、高レベルで発現した。２１６２０  ｍＲＮＡの発現はまた、胎児の肝臓および高ＧＰＡ細胞中でも観察された。
【００７５】
アルコールデヒドロゲナーゼは、レチノールおよびステロイドホルモン（造血への有害な効果を有することが公知である）の代謝を担う。それゆえ、２１６２０を阻害すると、骨髄中のレチノールおよびステロイドホルモンを減少させ、これにより、造血を刺激する。
【００７６】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の２１６２０  ｍＲＮＡの発現のために、２１６２０のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２１６２０ポリペプチドは、２１６２０活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００７７】
（遺伝子ＩＤ  ２１６８９）
ＴＷＩＫの関連した酸感受性Ｋ＋チャネル２（ＴＡＳＫ２）としても公知である、ヒト２１６８９配列（配列番号１９）は、非翻訳領域を含む約３５１４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号１９の核酸約３４０〜１８３９に位置する）は、４９９アミノ酸タンパク質（配列番号２０）をコードする。
【００７８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２１６８９  ｍＲＮＡは、赤血球および脊髄の直系の細胞中に高いレベルで発現した。２１６８９  ｍＲＮＡの発現は、赤血球の分化の間で顕著に増加し、骨髄の分化の間で穏やかに発現し（および維持され）た。２１６８９  ｍＲＮＡはまた、赤血球造血細胞中および低ＧＰＡ細胞中でも発現した。
【００７９】
２１６８９はまた、ＴＡＳＫ２としても公知であり、外部調節性カリウムチャネルである。これらのチャネルは、細胞膜電位を維持し、多様な細胞の過程に作用するのに重要であることが公知である。２１６８９を阻害することによって、カリウムは、細胞から流出し、その結果、分化している赤血球系細胞上の膜電位が変わる。この膜電位の変化により、末梢の赤血球数を増加させ、赤血球の増殖を刺激し、それゆえ、貧血の効果的な処置となる。
【００８０】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の２１６８９  ｍＲＮＡの発現のために、２１６８９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２１６８９ポリペプチドは、２１６８９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００８１】
（遺伝子ＩＤ  ２８８９９）
リゾホスファチド酸アシルトランスフェターゼ−γ（ＬＰＡＡＴ−γ）としても公知である、ヒト２８８９９配列（配列番号２１）は、非翻訳領域を含む約１８３２ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号２１の核酸約１９２〜１３２２に位置する）は、３７６アミノ酸タンパク質（配列番号２２）をコードする。
【００８２】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２８８９９  ｍＲＮＡは、赤血球の分化の間に発現した。特に、２８８９９  ｍＲＮＡの発現は、赤血球系細胞において、インビトロでの培養６日目および１２日目の増加している赤血球が分化するとき、高かった。２８８９９  ｍＲＮＡの発現は、インビボでの低ＧＰＡ細胞および高ＧＰＡ細胞中で最も高かった。２８８９９  ｍＲＮＡの発現はまた、胎児の肝臓、赤血球生成器官でも高かった。
【００８３】
１−アシル−ｓｎ−グリセロール−３−リン酸アシルトランスフェターゼ（ＡＧＰＡＴｓ）は、様々な細胞のタイプにおいて、リゾホスファチド酸（ＬＰＡ）をホスファチド酸（ＰＡ）に変換する。ＬＰＡは、細胞増殖の制御因子である。それゆえ、２８８９９は、潜在的に、好中球の増殖／分化を調節することに関与する。２８８９９を阻害することにより、貧血で激減した赤血球系細胞を補給し得る、赤血球系細胞のプールを拡大させる。
【００８４】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の２８８９９  ｍＲＮＡの発現のために、２８８９９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２８８９９ポリペプチドは、２８８９９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００８５】
（遺伝子ＩＤ  ５３６５９）
ＯＡＴＰ−ＨまたはＯＡＴＰ−Ｍ１としても公知である、ヒト５３６５９配列（配列番号２３）は、非翻訳領域を含む約２６３４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号２３の核酸約１０４〜２２７８に位置する）は、７２４アミノ酸タンパク質（配列番号２４）をコードする。
【００８６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、５３６５９  ｍＲＮＡは、骨髄直系細胞、ＣＤ１１ｂ−ＣＤ１５＋細胞、ＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１５＋細胞、腎臓および肝臓中に発現した。５３６５９  ｍＲＮＡはまた、ＢＦＵ赤血球系細胞および培養された好中球中にも発現した。
【００８７】
５３６５９は、プロスタグランジン  トランスポーターである。プロスタグランジンは、造血に対して陽性効果および陰性効果の両方を有することが公知である。５３６５９を阻害することによって、骨髄直系細胞上のプロスタグランジンの阻害効果が減少する。この結果、大多数の分化している骨髄系細胞を生じ、それゆえ、化学療法で誘発される好中球減少症の処置に効果的である。
【００８８】
その機能的な役割と共に、骨髄直系細胞、ＣＤ１１ｂ−ＣＤ１５＋細胞、ＣＤ１１ｂ＋ＣＤ１５＋細胞、腎臓および肝臓中の５３６５９  ｍＲＮＡの発現のために、５３６５９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の５３６５９ポリペプチドは、５３６５９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００８９】
（遺伝子ＩＤ  ６４５４９）
Ｎａｒｃ１６ｂとしても公知である、ヒト６４５４９配列（配列番号２５）は、非翻訳領域を含む約２０１９ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号２５の核酸約１〜２０１９に位置する）は、６７２アミノ酸タンパク質（配列番号２６）をコードする。
【００９０】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、６４５４９  ｍＲＮＡは、赤血球直系細胞中に非常に高いレベルで発現した。培養されたヒト細胞において、６４５４９  ｍＲＮＡの発現は、分化とともに増加し、高ＧＰＡ細胞および低ＧＰＡ細胞中で最も高い発現が見られた。６４５４９  ｍＲＮＡの発現はまた、胎児の肝臓中でも見られた。
【００９１】
遺伝子のＮａｒｃファミリーは、潜在的に、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）を介してシグナルを送るのに関与すると公知である、グリセロホスホジエステラーゼである。培養された神経細胞および原始神経細胞中の過剰発現は、アポトーシスを引き起こすことが公知である。Ｎａｒｃの発現を阻害すると、誘発されたアポトーシスを減少させる。赤血球系細胞中の６４５４９を阻害することによって、分化している赤血球系細胞のアポトーシスが減少する。この結果、大多数の赤血球系細胞を生じる。
【００９２】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の６４５４９  ｍＲＮＡの発現のために、６４５４９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の６４５４９ポリペプチドは、６４５４９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００９３】
（遺伝子ＩＤ  ９４６５）
ＡＴＰ感受性内部整流カリウムチャネル１２としても公知である、ヒト９４６５配列（配列番号２７）は、非翻訳領域を含む約２２１３ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号２７の核酸約４５１〜１７５２に位置する）は、４３３アミノ酸タンパク質（配列番号２８）をコードする。
【００９４】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、９４６５  ｍＲＮＡの発現は、赤血球直系細胞に制限された。
【００９５】
内部整流カリウムチャネルは、カリウムを細胞内に流入させる傾向から特徴づけられる。カリウムチャネルの阻害の結果、細胞増殖を減少させることが、示されている。９４６５を開くと、細胞内のカリウムレベルが増加し、赤血球直系細胞の増殖を増加させる。
【００９６】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の９４６５  ｍＲＮＡの発現のために、９４６５のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の９４６５ポリペプチドは、９４６５活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【００９７】
（遺伝子ＩＤ  ２３５４４）
細胞サイクルタンパク質ｐ３８−２Ｇ４ホモローグ（ｈＧ４−１）としても公知である、ヒト２３５４４配列（配列番号２９）は、非翻訳領域を含む約１６９７ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号２９の核酸約９８〜１２８２に位置する）は、３９４アミノ酸タンパク質（配列番号３０）をコードする。
【００９８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２３５４４  ｍＲＮＡは、赤血球直系細胞および胎児の肝臓中に発現した。２３５４４  ｍＲＮＡの発現は、早期前駆細胞中の方が後の細胞中よりも高かった。
【００９９】
プロテアーゼは、成長因子および造血に必要な他の因子を分解させることが示されている。２３５４４の阻害は、特に赤血球直系細胞中での成長因子の分解をブロックし、造血を高める。
【０１００】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の２３５４４  ｍＲＮＡの発現のために、２３５４４のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２３５４４ポリペプチドは、２３５４４活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１０１】
（遺伝子ＩＤ  ７３６６）
塩化物チャネルタンパク質４（ＣｌＣ４）としても公知である、ヒト７３６６配列（配列番号３１）は、非翻訳領域を含む約４４５４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号３１の核酸約２７６〜２５５８に位置する）は、７６０アミノ酸タンパク質（配列番号３２）をコードする。
【０１０２】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、７３６６  ｍＲＮＡの発現は、赤血球直系細胞および骨髄直系細胞中で高かった。７３６６  ｍＲＮＡの発現は、脳および胎児の肝臓組織の試料を除く器官では低かった。７３６６  ｍＲＮＡの発現は、インビボでの赤血球系細胞中で増加し、低ＧＰＡ細胞中で最も高かった。７３６６  ｍＲＮＡの発現はまた、インビトロでの赤血球および巨核球の分化でも増加した。
【０１０３】
塩化物チャネルは、多様な細胞の過程に関与し、細胞容積および細胞内ｐＨといった基本的な機能を制御し得ることは、公知である。塩化物チャネルはまた、細胞増殖において必須の役割を果たすことが示されている。塩化物チャネルの阻害は、それらの増殖を著しく減少させ得る。７３６６を作用させると、細胞増殖を増加させる。早期赤血球系細胞に７３６６を作用させると、赤血球数を増加させ、それゆえ、貧血の効果的な処置となる。
【０１０４】
その機能的な役割と共に、赤血球および巨核球直系中の７３６６  ｍＲＮＡの発現のために、７３６６のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の７３６６ポリペプチドは、７３６６活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１０５】
（遺伝子ＩＤ  ２７４１７）
リゾホスファチド酸アシルトランスフェラーゼ−ε（ＬＰＡＡＴ−ε）としても公知である、ヒト２７４１７配列（配列番号３３）は、非翻訳領域を含む約３７２５ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号３３の核酸約３０６〜１４００に位置する）は、３６４アミノ酸タンパク質（配列番号３４）をコードする。
【０１０６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２７４１７  ｍＲＮＡは、胎児の肝臓および低ＧＰＡ細胞中に高レベルで発現した。２７４１７  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４＋細胞、好中球、Ｋ５６２およびＨＬ６０細胞系中に、適度なレベルで発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析から、２７４１７  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの赤血球の分化と共に増加し、１２日で最も高い発現を示した。
【０１０７】
２７４１７  ｍＲＮＡはまた、ＬＰＡＡＴ−εとしても公知である。これらの酵素は、ＬＰＡからＰＡへの変換を触媒することが、公知である。ＬＰＡは、種々の細胞のタイプの増殖を刺激することが公知である。２７４１７の発現を阻害することによって、より高いレベルのＬＰＡが得られ、増殖速度を増加させる。赤血球直系細胞中の２７４１７の阻害は、赤血球数を増加させ、それにより、貧血の効果的な処置となる。
【０１０８】
その機能的な役割と共に、ＣＤ３４＋細胞、好中球、Ｋ５６２およびＨＬ６０細胞系中の２７４１７  ｍＲＮＡの発現のために、２７４１７のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２７４１７ポリペプチドは、２７４１７活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１０９】
（遺伝子ＩＤ  ５７２５９）
有機イオン（糖）トランスポーターとしても公知である、ヒト５７２５９配列（配列番号３５）は、非翻訳領域を含む約１８５５ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号３５の核酸約３７７〜１５９４に位置する）は、４０５アミノ酸タンパク質（配列番号３６）をコードする。
【０１１０】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、５７２５９  ｍＲＮＡは、胎児の肝臓を含む、インビボでの赤血球直系の細胞および組織中に、高度に発現した。５７２５９  ｍＲＮＡの適度な発現がまた、脳および腎臓中で見られた。５７２５９  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの低ＧＰＡ赤血球系細胞および高ＧＰＡ赤血球系細胞中で、同様に高かった。
【０１１１】
５７２５９は、有機イオントランスポーターである。これらのタンパク質が、種々の有機分子（糖およびプロスタグランジンが挙げられる）を輸送することは、公知である。そのような分子は、赤血球直系細胞の成長および増殖に、決定的な制御の役割を果たす。それゆえ、５７２５９の活性を摂動させると、赤血球直系細胞の増殖の増大が生じる。この結果、赤血球数は増大し、それゆえ、貧血の効果的な処置となる。
【０１１２】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の５７２５９  ｍＲＮＡの発現のために、５７２５９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の５７２５９ポリペプチドは、５７２５９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１１３】
（遺伝子ＩＤ  ２１８４４）
２−アミノ−３−ケトブチレートコエンザイムＡ系としても公知である、ヒト２１８４４配列（配列番号３７）は、非翻訳領域を含む約１４５３ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号３７の核酸約４〜１２６３に位置する）は、４１９アミノ酸タンパク質（配列番号３８）をコードする。
【０１１４】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２１８４４  ｍＲＮＡは、脳皮質、心臓、ヒト臍静脈の内皮細胞（ＨＵＶＥＣ）、膵臓および赤血球系細胞中に高度に発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析から、インビトロでの２１８４４  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞中に最も高いレベルで発現した。２１８４４はまた、巨核球を増殖させることによっても非常に増殖したが、これらの細胞の発現は、成熟細胞への分化の際に減少した。２１８４４  ｍＲＮＡの発現はまた、大部分の赤血球系細胞を有する、胎児の肝臓でも見られた。２１８４４  ｍＲＮＡは、Ｔ細胞、骨髄性細胞および巨核球中で非常に低いレベルで発現した。
【０１１５】
２１８４４は、２−アミノ−３−ケトブチレートコエンザイムＡ系としても公知である。２１８４４は、Ｌ−スレオニンからグリシンへの変換に関与している。アンチセンス戦略では、アミノ−ケトブチレート系は、ＶＴ１処置後のＧ１フェーズにおける、ＮＳＣＬＣ−Ｎ６細胞の増殖停止に関与する（Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ  ２００２  Ｊｕｌ−Ａｕｇ；２２（４）：２２２９−３５）。それゆえ、２１８４４機能を阻害すると、細胞増殖が増加する。
【０１１６】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の２１８４４  ｍＲＮＡの発現のために、２１８４４のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２１８４４ポリペプチドは、２１８４４活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１１７】
（遺伝子ＩＤ  ９４３）
チロシンホスファターゼＭＥＧ１（ＰＴＰＭＥＧ１）タンパク質としても公知である、ヒト９４３配列（配列番号３９）は、非翻訳領域を含む約３６４３ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号３９の核酸約７７２〜３５５２に位置する）は、９２６アミノ酸タンパク質（配列番号４０）をコードする。
【０１１８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、９４３  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞中に高いレベルで発現し、低ＧＰＡ細胞、高ＧＰＡ細胞およびインビトロでの培養１０日目の赤血球系細胞中で、最も高い発現が観察された。９４３  ｍＲＮＡの発現はまた、胎児の肝臓、脳、骨格筋、腎臓およびＴ細胞でも観察された。９４３  ｍＮＭＲは、インビトロで培養された赤血球系細胞の分化により上方に制御された。９４３  ｍＮＭＲの上方制御はまた、インビトロでのＢＦＵ−Ｅ培養物中のＥＰＯ刺激への反応でも明らかだった。低ＧＰＡ細胞で観察された９４３  ｍＲＮＡの発現は、高ＧＰＡ細胞中で維持され、これは、ＥＰＯレセピターレベルは、特定の試料において制御されないという事実と一致する。最後に、９４３  ｍＲＮＡの発現は、マウスから得られた負の直系細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞で観察された。
【０１１９】
ＰＴＰＭＥＧ１としても公知である、９４３は、巨核球からクローン化され、グルタミンレセプターΔ２と相互作用すると記載されている。９４３の過剰発現は、ＣＯＳ細胞の成長を遅らせることが示された（ＰＮＡＳ  Ｕ．Ｓ．Ａ．  １９９６；９３（２３）：１２９８０−５）。赤血球細胞中の９４３の一部の高い発現および赤血球細胞中の分化の間での９４３の分化の発現に基づくと、９４３の阻害は、赤血球系細胞およびその前駆細胞の増殖を増加させる。それゆえ、９４３は、血液学的障害を処理するのに使用され得る。
【０１２０】
その機能的な役割と共に、９４３  ｍＲＮＡの発現のために、９４３のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の９４３ポリペプチドは、９４３活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１２１】
（遺伝子ＩＤ  ２０６１）
セリン／トレオニン  プロテインキナーゼ２５（Ｓｔｅ２０、酵母相同体）またはＳＯＫ１としても公知である、ヒト２０６１配列（配列番号４１）は、非翻訳領域を含む約１９７５ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号４１の核酸約１２７〜１４０７に位置する）は、４２６アミノ酸タンパク質（配列番号４２）をコードする。
【０１２２】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２０６１  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞、骨格筋、ＨＵＶＥＣｓおよび脳中で最も高く発現した。赤血球系細胞のパネルのＴａｑＭａｎ分析から、２０６１  ｍＲＮＡは、低ＧＰＡ細胞、プールされて１０日後の分化している赤血球系細胞、Ｋ５６２赤白血病細胞およびＨＵＶＥＣｓ中でも高度に発現したことが、示された。２０６１  ｍＲＮＡはまた、胎児の肝臓中でも発現した。２０６１  ｍＲＮＡの発現は、Ｔ細胞、骨髄性細胞および前駆細胞中で低かった。
【０１２３】
インビトロでの２０６１  ｍＲＮＡ発現のレベルは、赤血球系細胞が分化するにつれて増加し、６日後に最も高い発現レベル（ＣＦＵ−Ｅ活性のピークに相当する）を生じた。発現レベルは、１２日後培養物で再び減少した。２０６１  ｍＲＮＡ発現のレベルはまた、ＥＰＯ存在下でのＢＦＵ−Ｅ中でも増加した。２０６１  ｍＲＮＡ発現は、低ＧＰＡ細胞および高ＧＰＡ細胞の試料で検出された。
【０１２４】
マウス２０６１オルソログの２０６１  ｍＲＮＡ発現は、ＴＥＲ１１９＋陽性赤血球系細胞中および前駆細胞母集団に相当する骨髄の直系陰性分画中で検出された。これたまた、骨髄白血球細胞（直系陰性細胞を含む）中およびＧｒ−１＋好中球中でも検出された。
【０１２５】
２０６１は、ＧＣキナーゼ群由来のヒト相同体酵母ＳＴＥ２０である。これは、ストレス応答キナーゼとして同定される。ＳＯＫ−１は、活性酸素中間体によって３〜７倍に活性化される（ＥＭＢＯ  Ｊ．１９９６  Ｓｔｅｐ２；１５（１７）：４５３７−４６）。ＳＯＫ−１の活性化は、壊死細胞死の誘発因子との、細胞の最も初期の反応の１つである（Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．１９９７  Ｎｏｖ  １４；２７２（４６）：２９３７２−９）。ＳＯＫ−１機能の阻害は、ＣＦＵ−Ｅ段階での細胞死およびアポトーシスから保護し、赤血球系細胞数を増加させる。
【０１２６】
その機能的な役割と共に、２０６１  ｍＲＮＡの発現のために、２０６１のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２０６１ポリペプチドは、２０６１活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１２７】
（遺伝子ＩＤ  ５８９１）
プロリルエンドヌクレアーゼ（ＰＥＰ）としても公知である、ヒト５８９１配列（配列番号４３）は、非翻訳領域を含む約２５６２ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号４３の核酸約１〜２１３３に位置する）は、７１０アミノ酸タンパク質（配列番号４４）をコードする。
【０１２８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、５８９１  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞、ＨＵＶＥＣｓ、大脳皮質および骨格筋で高度に発現した。さらなるＴａｑＭａｎ分析から、５８９１  ｍＲＮＡ発現の最高レベルが、プールされた１０日目赤血球培養物、Ｋ５６２赤白血病細胞中およびＨＵＶＥＣｓ中で観察された。ＣＤ３４前駆細胞およびＴ細胞中で、検出可能だが、低い発現が見られた。インビトロでの赤血球系細胞の分化の間、５８９１  ｍＲＮＡの発現は、２４時間後以降、徐々に増加し、６日目培養物でピークに達した（ＣＦＵ−Ｅｓに相当する）。この高い発現レベルと一致して、赤血球前駆細胞で見られた、増殖能のある低ＧＰＡ細胞中の５８９１  ｍＲＮＡ発現が、分化した高ＧＰＡ細胞と比較して増加した。
【０１２９】
５８９１のマウスオルソログの発現が、直系陰性前駆細胞および赤血球ＴＥＲ＋１１９＋細胞を含む、マウス骨髄性細胞の分画中で検出された。
【０１３０】
Ｔ細胞からクローン化されたプロリルエンドペプチダーゼが、プロリル残基のＣ末端側のペプチド結合を開裂させることは、公知である。これは、ペプチドホルモンおよび神経ペプチドの分解に重要な役割を果たすと考えられる（Ｇｅｎｅ  １９９４；１４９（２）、３６３−３６６；Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ  １９９４；１１５（４）、７２４−７２９）。プロリルエンドペプチダーゼは、Ｔ細胞前駆細胞におけるアポトーシス性細胞死の誘発に関与することが示唆されている。この酵素のインヒビターは、細胞をアポトーシスから守る（ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．２００２  Ｆｅｂ  １３；５１２（１−３）：１６３−７）。この酵素の阻害は、赤血球前駆細胞の生存を増加させ、赤血球系細胞数を増加させる。
【０１３１】
その機能的な役割と共に、５８９１  ｍＲＮＡの発現のために、５８９１のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の５８９１ポリペプチドは、５８９１活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１３２】
（遺伝子ＩＤ  ９１３７）
アルデヒドデヒドロゲナーゼ７（ＡＬＤＨ７）としても公知である、ヒト９１３７配列（配列番号４５）は、非翻訳領域を含む約２７９０ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号４５の核酸約４８〜１４５４に位置する）は、４６８アミノ酸タンパク質（配列番号４６）をコードする。
【０１３３】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、９１３７  ｍＲＮＡは、多くの組織や器官に発現するが、赤血球系細胞、好中球、肺、脳および腎臓中に最も高く発現した。造血細胞中の９１３７  ｍＲＮＡの発現は、ＣＤ１１ｂ−、ＣＤ１５＋好中球およびインビトロでの分化している１０日目培養物、ＣＤ１４＋単球、低ＧＰＡ赤血球系細胞およびプールされた１０日目赤血球培養物に制限された。赤血球系細胞中の９１３７  ｍＲＮＡ発現は、インビトロでの分化の間に増加し、特に６日目および１２日目に増加した。同様に、９１３７  ｍＲＮＡ発現は、ＥＰＯを有するＢＦＵ−Ｅ培養物中で増加した。９１３７  ｍＲＮＡ発現レベルは、より成熟した高ＧＰＡ分画と比較すると、未成熟低ＧＰＡ分画中でより高かった。９１３７  ｍＲＮＡ発現はまた、骨髄性細胞においてインビトロでの骨髄の分化とともに増加したが、そのレベルは、赤血球系細胞中のものより低かった。９１３７  ｍＲＮＡ発現は、ＣＤ１１ｂ＋好中球（全てのＣＤ１４−、ＣＤ１５＋）中よりもより成熟したＣＤ１１ｂ−好中球中の方が高かった。
【０１３４】
９１３７のマウスオルソログの発現は、造血細胞中で検出され、その最も高い発現レベルが、ＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞およびＧＲ−１＋好中球で観察された。
【０１３５】
１２個のアルデヒドデヒドロゲナーゼ（ＡＬＤＨ）遺伝子が、ヒトにおいて同定されている。これらの遺伝子（異なる染色体に位置する）は、種々の脂肪族アルデヒドおよび芳香族アルデヒドを酸化する酵素の群をコードする。ヒトＡＬＤＨと比較すると、これらの間で、広範囲にわたる相違（タンパク質配列レベルで、＜１５％〜＞８０％の同定）が示される（Ｇｅｎｅ．１９９４  Ｄｅｃ  ３０；１５１（１−２）：２８５−９）。
【０１３６】
ＡＬＤＨ７の生成物は、赤血球前駆細胞および骨髄前駆細胞の分化を誘発する。この酵素の機能の阻害は、骨髄前駆細胞および赤血球前駆細胞の分化を減少させ、増殖を増加させる。
【０１３７】
その機能的な役割と共に、９１３７  ｍＲＮＡの発現のために、９１３７のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の９１３７ポリペプチドは、９１３７活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１３８】
（遺伝子ＩＤ  １３９０８）
セリンプロテアーゼＨＴＲＡ１としても公知である、ヒト１３９０８配列（配列番号４７）は、非翻訳領域を含む約２０３６ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号４７の核酸約４９〜１４９１に位置する）は、４８０アミノ酸タンパク質（配列番号４８）をコードする。
【０１３９】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１３９０８  ｍＲＮＡは、支質細胞の存在と一致して、滑膜中に最も高く発現した。１３９０８  ｍＲＮＡはまた、ＨＵＶＥＣｓ、卵巣、乳房、血管および肺にも発現した。造血前駆細胞または成熟細胞中の１３９０８  ｍＲＮＡの発現はなかった。１３９０８  ｍＲＮＡの発現は、インビトロで培養された最初の骨髄支質細胞試料、ＭＦ１１およびＭＦ１２に制限された。
【０１４０】
１３９０８のマウスオルソログは、造血細胞中に発現しなかったが、支質細胞を含む全骨髄試料中に検出された。
【０１４１】
骨髄支質は、成長因子を生成して、前駆細胞の生存および増殖を支持する。このシステムの制御は、支質が、過剰成長因子を分解するプロテアーゼを生成し、過剰の増殖から幹細胞プールを守ることに関与する。（Ｂｌｏｏｄ．２００１  Ｎｏｖ  １；９８（９）：２６９７−７０６）。ＨＴＲＡ１は、当初、インスリン成長因子（ＩＧＦ）結合タンパク質と相互作用するとして記載された分泌プロテアーゼであるが、このプロテアーゼの正確な機能は、知られてない（ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．１９９６  Ｄｅｃ  ２；３９８（２−３）：１８７−９２）。過剰発現は、メラノーマ細胞の増殖を阻害すると説明され、そのダウンレギュレーションは、メラノーマの発現に関連する（Ｏｎｃｏｇｅｎｅ．２００２  Ｓｅｐ  ２６；２１（４３）：６６８４−８）。ＨＴＲＡ２のフェミリーメンバーは、アポトーシスプロテインインヒビター（ＩＡＰ）を分解させることが報告されている。ＴＨＲＡ１は、支質細胞中で高度に発現する。それゆえ、１３９０８は、成長因子のプロセッシングまたは他のタンパク質の分解に作用して、それを取り囲む骨髄前駆細胞の増殖速度を制御し得る。この機能を阻害すると、インビボでの巨核球、好中球および赤血球系細胞は拡大する。
【０１４２】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の１３９０８  ｍＲＮＡの発現のために、１３９０８のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１３９０８ポリペプチドは、１３９０８活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１４３】
（遺伝子ＩＤ  １４３１０）
アセチルコエンザイムＡアセチルトランスフェラーゼ２（ＡＣＡＴ２）としても公知である、ヒト１４３１０配列（配列番号４９）は、非翻訳領域を含む約１４９０ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号４９の核酸約３８〜１２３１に位置する）は、３９７アミノ酸タンパク質（配列番号５０）をコードする。
【０１４４】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１４３１０  ｍＲＮＡは、制限された発現を示した。１４３１０  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞、前駆細胞及び脳中で高度に発現した。１４３１０  ｍＲＮＡは、他の組織や器官において非常に低いレベルで発現した。１４３１０  ｍＲＮＡは、造血細胞中に、ある程度制限されて発現し、プールされた１０日目赤血球培養物、巨核球培養物、およびＫ５６２赤白血病細胞中で発現が最も高かった。１４３１０  ｍＲＮＡのより低い発現レベルが、ＣＤ３４＋前駆細胞（赤血球前駆細胞も含む）中で観察された。インビトロでの赤血球系細胞の分化のときに、１４３１０  ｍＲＮＡの発現は増加し、６日目にピーク（細胞の最も高い赤血球の特異的増殖能に相当する）に達した。１４３１０  ｍＲＮＡはまた、より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、低ＧＰＡ細胞（未成熟細胞）では、より高いレベルで発現した。これらのデータは、この酵素が、赤血球系細胞の役割を果たしていることを示唆する。
【０１４５】
マウス造血細胞は、１４３１０のオルソログを発現する。最も高い１４３１０  ｍＲＮＡの発現レベルが、ＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞で観察された。赤血球系前駆細胞を含む直系陰性細胞もまた１４３１０を発現する。
【０１４６】
ＡＣＡＴ２は、脂質代謝に関与する酵素である。ＡＣＡＴ２の機能は、アテローム性動脈硬化症に関して研究され、コレステロールエステルのレベル減少を記した（Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ．２００３  Ｆｅｂ  ４；１００（３）１２６２−７．Ｅｐｕｂ２００３  Ｊａｎ  ２１）。造血細胞においては、実験されていない。この酵素を発現しないマウスは、生存能があり、健康であるのに注目すべきである。ＡＣＡＴ２は、赤血球増殖を制限し、分化を促進させる脂質の生成に関与する。この酵素の阻害により、増殖している細胞を増やし、最終的に、赤血球系細胞数を増加させる。
【０１４７】
その機能的な役割と共に、１４３１０  ｍＲＮＡの発現のために、１４３１０のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１４３１０ポリペプチドは、１４３１０活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１４８】
（遺伝子ＩＤ  １７６００）
ヒストンアセチルトランスフェラーゼタイプＢ触媒的サブユニットとしても公知である、ヒト１７６００配列（配列番号５１）は、非翻訳領域を含む約１５６８ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号５１の核酸約３７〜１２９６に位置する）は、４１９アミノ酸タンパク質（配列番号５１）をコードする。
【０１４９】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１７６００  ｍＲＮＡは、ほとんど独占的に造血細胞中に発現し、インビトロでの分化された１０日目培養物で最も高い発現レベルを有した。１７６００  ｍＲＮＡはまた、Ｋ５６２細胞および低ＧＰＡ赤血球系細胞中で顕著に発現した。１７６００  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの赤血球系細胞の分化とともに増加した。より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、１７６００  ｍＲＮＡの増加した発現レベルが、低ＧＰＡ赤血球系細胞中で観察された。１７６００発現は、直系陰性細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞（赤血球前駆細胞および成熟細胞に相当する）中で観察された。マウスＥＰＯモデルにおいて、１７６００  ｍＲＮＡの発現は、コントロールと比較すると、ＥＰＯで処理した試料で増加した。
【０１５０】
１７６００インヒビターが、血液学的障害を処置するのに使用され得るということが、本発明である。これは、部分的に、本明細書に記載される最初の研究およびこの分子における前の研究に基づいている。１７６００は、ヒストンアセチルトランスフェラーゼであり、ヒストンアセチル化は、遺伝子の活性化とつながっている（Ｃｅｌｌ．１９９６；８４（６）８４３−８５１）。ヒストンデアセチラーゼインヒビターは、現在、抗増殖的抗がん剤として発展している。ヒストンアセチラーゼは、ヒストンデアセチラーゼと反対の作用をするので、それらは、潜在的に増殖反応を阻害する。本明細書に記載される研究では、分化中の赤血球系細胞において、異なる制御を示す。それゆえ、１７６００  ｍＲＮＡインヒビターは、赤血球系細胞になる赤血球前駆細胞を阻害するのに関与する、遺伝子の活性化を阻害することによって、赤血球前駆細胞の増殖を増加させると考えられる。このように、本発明は、造血障害を改善するのに使用され得る。
【０１５１】
その機能的な役割と共に、１７６００  ｍＲＮＡの発現のために、１７６００のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１７６００ポリペプチドは、１７６００活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１５２】
（遺伝子ＩＤ  ２５５８４）
アミノアシラーゼ１としても公知である、ヒト２５５８４配列（配列番号５３）は、非翻訳領域を含む約１４１５ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号５３の核酸約６２〜１２８８に位置する）は、４０８アミノ酸タンパク質（配列番号５４）をコードする。
【０１５３】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２５５８４  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞および腎臓中で、最も高度に発現した。マウスの器官および組織中では、検出可能だが、低い発現だった。赤血球系細胞における２５５８４  ｍＲＮＡの発現は、プールされた１０日目赤血球培養物およびＫ５６２細胞に制限され、ＣＤ３４細胞では低い発現だった。赤血球系細胞における２５５８４  ｍＲＮＡの発現は、低ＧＰＡ細胞およびインビトロでの分化６日目赤血球系細胞中で最も高かった。同様に、２５５８４  ｍＲＮＡ発現レベルは、高ＧＰＡ細胞またはインビトロで１２日目培養物に成熟するにつれて減少した。これらは、ＥＰＯレセプターの高レベル発現を示す、増殖する赤血球系細胞を表わす。この発現は、コントロールと比較すると、ＥＰＯにさらされたＢＦＵ−Ｅ培養物で増加した。
【０１５４】
マウス２５５８４オルソログの発現は、直系陰性前駆細胞および赤血球ＴＥＲ１１９＋細胞中で最も高度な発現で示された。
【０１５５】
２５５８４は、Ｎ−アシル化またはＮ−アセチル化アミノ酸（Ｌ−アスパラギン酸を除く）の加水分解に関与する。アミノアシラーゼ１の減少レベルと肺がん細胞の増加した増殖レベルとの間の関連性が観察されている（Ｊ．Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．１９９３  Ａｕｇ  １５；２６８（２３）：１７０１０−７）。アミノアシラーゼ１の機能により、増殖（潜在的に、Ｎ−アシルアミノ酸の分解を介する）を減少させる。この酵素の阻害は、赤血球前駆細胞の増殖を増加させる。
【０１５６】
その機能的な役割と共に、２５５８４  ｍＲＮＡの発現のために、２５５８４のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２５５８４ポリペプチドは、２５５８４活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１５７】
（遺伝子ＩＤ  ２７８２４）
ユビキチン  カルボキシ末端ヒドロラーゼアイソザイムＬ５としても公知である、ヒト２７８２４配列（配列番号５５）は、非翻訳領域を含む約１７２８ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号５５の核酸約１３２〜１１２１に位置する）は、３２９アミノ酸タンパク質（配列番号５６）をコードする。
【０１５８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２７８２４  ｍＲＮＡは、発現を制限した。２７８２４  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞、前駆細胞および脳において、非常に高い発現レベルを有し、他の組織および器官においては低い発現レベルを有した。造血細胞において、２７８２４は、ある程度、非常に制限されて発現し、プールされた１０日目赤血球培養物およびＫ５６２赤白血病細胞中で高い発現を有した。ＣＤ３４＋前駆細胞（赤血球前駆細胞を含む）において、低い発現が観察された。インビトロでの赤血球系細胞の分化のときに、２７８２４  ｍＲＮＡの発現が、増加し、６日目にピーク（この細胞の最も高い赤血球特異的増殖能に相当する）に達した。２７８２４  ｍＲＮＡの発現はまた、より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、低ＧＰＡ細胞（未成熟細胞）では、より高いレベルであった。これらのデータは、この酵素が、赤血球前駆細胞の役割を果たすことを示唆する。
【０１５９】
マウス造血細胞は、２７８２４のオルソログを発現する。マウス２７８２４  ｍＲＮＡの最も高い発現レベルが、ＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞において観察された。直系陰性細胞（赤血球前駆細胞を含む）はまた、２７８２４  ｍＲＮＡを発現した。
【０１６０】
ＥＰＯレセプターのユビキチン化は、最大のシグナルに必要とされる（Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．２００３  Ｊｕｎ  １８；２７８（２９）：２６８５１−６１）。この酵素（命名的には、ユビキチンカルボキシ末端ヒドロラーゼアイソザイムＬ５）は、脱ユビキチン化に関与する。ユビキチンカルボキシ末端ヒドロラーゼアイソザイムＬ５は、ＥＰＯレセプターを脱ユビキチン化することによって、ＥＰＯレセプターを負に制御する。ユビキチン化は、ＥＰＯレセプターを介するシグナルを必要とするので、この酵素の阻害は、ＥＰＯレセプターを介するシグナルをより多くし、最終的に、赤血球系細胞数を増加させる。
【０１６１】
その機能的な役割と共に、２７８２４  ｍＲＮＡの発現のために、２７８２４のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２７８２４ポリペプチドは、２７８２４活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１６２】
（遺伝子ＩＤ  ２８４６９）
Ｏ−シアログリコプロテインエンドペプチダーゼとしても公知である、ヒト２８４６９配列（配列番号５７）は、非翻訳領域を含む約１００８ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号５７の核酸約１〜１００８に位置する）は、３３５アミノ酸タンパク質（配列番号５８）をコードする。
【０１６３】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、２８４６９  ｍＲＮＡは、ＨＵＶＥＣｓ、脳、巨核球および赤血球系細胞中に、高いレベルで発現した。造血細胞において、２８４６９  ｍＲＮＡの最も高い発現が、プールされた１０日目赤血球試料、プールされた１０日目巨核球培養物、胎児の肝臓およびＫ５６２細胞において観察された。２８４６９  ｍＲＮＡの発現は、Ｔ細胞、骨髄性細胞およびＣＤ３４前駆細胞中で、検出可能だが、より低かった。赤血球系細胞における２８４６９  ｍＲＮＡの発現レベルは、より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、低ＧＰＡ前駆細胞で、より高かった。２８４６９  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの赤血球分化の間に急速に増加し、培養４８時間目〜６日目の間にピーク（この細胞の最大増殖能に相当する）に達した。インビトロでの巨核球培養物はまた、２８４６９  ｍＲＮＡの発現を示したが、分化で制御されなかった。
【０１６４】
２８４６９のマウスオルソログは、マウス造血細胞中に発現し、赤血球ＴＥＲ１１９＋細胞において最も高い発現レベルを有した。２８４６９  ｍＲＮＡの発現は、直系陰性前駆細胞分画においても、顕著なレベルで存在した。
【０１６５】
Ｏ−シアログリコプロテインエンドペプチダーゼは、近年クローン化され、２９．７％の同一性で、ｇｃｐのホモローグ（バスツレラ属ヘモリチカ（ｈｅａｍｏｌｙｔｉｃａ）Ａ１グリコペプチダ−ゼ）として記載される（Ｇｅｎｅ．２００２  Ｆｅｂ  ２０；２８５（１−２）：１０１−８）。バスツレラ属グリコペプチダ−ゼの最もよく特徴づけられた基質は、グリコホリンＡである。幾つかの他のＯ−シアログリコプロテイン基質は、ヒト白血球抗原（例えば、ＣＤ４３、ＣＤ４５、ＣＤ４４およびＰ−セレクチンリガンドが挙げられる）である。この酵素はまた、ＣＤ３４（ヒト造血幹細胞の表面上のグリコプロテイン）を開裂させる。造血幹細胞および前駆細胞の接着性は、部分的にそれらの増殖と分化を制御し得る（Ａｎｎ  Ｎ  Ｙ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ．２００１  Ｊｕｎ；９３８：１９６−２０６；ｄｉｓｃｕｓｓｉｏｎ  ２０６−７）。ＣＤ３４の接着性の持続は、ＴＦ−１細胞の増殖と関連する（Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙ  Ｒｅｓ  Ｃｏｍｍｕｍ．２００１  Ｏｃｔ  １９；２８８（１）：８０−６）。Ｏ−シアログリコプロテインエンドペプチダーゼ機能の阻害は、生存に重要な赤血球抗原を維持させ、赤血球系細胞を増加させる。
【０１６６】
その機能的な役割と共に、２８４６９  ｍＲＮＡの発現のために、２８４６９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の２８４６９ポリペプチドは、２８４６９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１６７】
（遺伝子ＩＤ  ３８９４７）
プロテインホスファターゼ  メチルエステラーゼ−１としても公知である、ヒト３８９４７配列（配列番号５９）は、非翻訳領域を含む約２４８４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号５９の核酸約１００〜１２６０に位置する）は、３８６アミノ酸タンパク質（配列番号６０）をコードする。
【０１６８】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、３８９４７  ｍＲＮＡは、ほとんど独占的に、造血細胞中に発現し、低ＧＰＡ赤血球系細胞およびインビトロで分化された１０日目赤血球培養物中で最も高く発現した。３８９４７  ｍＲＮＡは、Ｋ５６２赤血球系細胞系においても高度に発現した。３８９４７  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの赤血球の分化とともに顕著に増加した。さらに、３８９４７  ｍＲＮＡの発現は、より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、低ＧＰＡ赤血球系細胞では、より高かった。最後に、３８９４７  ｍＲＮＡの発現は、直系陰性細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞（赤血球前駆細胞および成熟細胞に相当する）において観察された。
【０１６９】
３８９４７またはプロテインホスファターゼ  メチルエステラーゼ−１が、プロテインホスファターゼ２Ａ触媒的サブユニットを、脱メチル化して不活性化させることは公知である（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７４：１４３８２−１４３９１）。３８９４７の阻害は、赤血球前駆細胞の増殖を増加させ、それゆえ、血液学的障害の処置に有用であることが、本発明である。本発明は、少なくとも一部分は、本明細書中に記載された研究（赤血球系細胞における３８９４７の異なる発現および独占的な発現を証明する）ならびに前の研究（この酵素がＰＰ２Ａを阻害することを証明する）に基づく。
【０１７０】
その機能的な役割と共に、３８９４７  ｍＲＮＡの発現のために、３８９４７のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の３８９４７ポリペプチドは、３８９４７活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１７１】
（遺伝子ＩＤ  ５３００３）
アシル−ＣｏＡシンセターゼＭＡＣＳ１としても公知である、ヒト５３００３配列（配列番号６１）は、非翻訳領域を含む約２０７４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号６１の核酸約７９〜１８１２に位置する）は、５７７アミノ酸タンパク質（配列番号６２）をコードする。
【０１７２】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、５３００３  ｍＲＮＡの発現は、非常に制限され、赤血球系細胞、卵巣および膵臓でのみ検出可能であった。造血細胞における５３００３  ｍＲＮＡの発現は、プールされた分化１０日目の赤血球系細胞に非常に制限された。５３００３  ｍＲＮＡの発現は、ＣＤ３４＋前駆細胞中でも検出された。赤血球分化の間、５３００３  ｍＲＮＡの発現は、ＥＰＯレセプタ−の発現に非常に類似した形で、６日目に強度に上方制御された。低ＧＰＡ細胞においては、高ＧＰＡ細胞と比較すると、下方制御された。さらに、５３００３  ｍＲＮＡの発現は、ＥＰＯを有するＢＦＵ−Ｅ培養物において、ＥＰＯ無しのものと比べて増加した。
【０１７３】
５３００３のマウスオルソログの発現は、マウス造血細胞、特に直系陰性前駆細胞において検出可能であった。
【０１７４】
５３００３は、基質としてオクタノエートに対する優先性を有する、Ｃ４〜Ｃ１１までの酸ならびにそれに相当する３−ヒドロキシ、および２，３−または２，４−不飽和酸に作用する、中鎖アシル−ＣｏＡシンセターゼ（ブチリル−ＣｏＡシンセターゼとも呼ばれる）である（Ｊ．Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．２００１  Ｓｅｐ  ２１；２７６（３８）：３５９６１−６．Ｅｐｕｂ  ２００１  Ｊｕｌ  ２４）。ＭＡＣＳ１の基質が、赤血球系細胞を分化させ、この阻害により、ＣＦＵ−Ｅの増殖および、さらなる赤血球系細胞の生成を増加させる。
【０１７５】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞中の５３００３  ｍＲＮＡの発現のために、５３００３のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の３５３００３ポリペプチドは、５３００３活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１７６】
（遺伝子ＩＤ  ９６５）
プロテインチロシンホスファターゼΔ（Ｒ−ＰＴＰ−Δ）としても公知である、ヒト９６５配列（配列番号６３）は、非翻訳領域を含む約６２６３ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号６３の核酸約１５４〜５８９２に位置する）は、１９１２アミノ酸タンパク質（配列番号６２）をコードする。
【０１７７】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、９６５  ｍＲＮＡは、脳中で最も高いレベルで発現し、ほとんどの組織および器官においては、低いレベルで発現した。造血細胞において、９６５  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４前駆細胞中で最も高いレベルで発現したが、分化した前駆細胞中では発現しなかった。骨髄性細胞、赤血球系細胞および巨核球に分化された培養物において、９６５  ｍＲＮＡの発現は、培養２４時間後および４８時間後に減少した（キーとなる役割が、ＣＤ３４前駆細胞中にあることを示す）。
【０１７８】
９６５のマウスオルソログの発現は、前駆細胞母集団に相当する、骨髄の直系陰性分画中で検出された。これはまた、骨髄白血球細胞、骨髄ＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞およびＧｒ−１＋好中球中でも検出された。
【０１７９】
ＰＴＰ−Δは、腫瘍サプレッサーを示唆する、へパトームおよびへパトーム細胞系において、選択的に減少された。インヒビターを用いたＰＴＰ−Δ機能の阻害は、ＣＤ３４前駆細胞の増殖を増加させ、赤血球生成、骨髄造血および巨核球生成を増加させる。
【０１８０】
その機能的な役割と共に、９６５  ｍＲＮＡの発現のために、９６５のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の９６５ポリペプチドは、９６５活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１８１】
（遺伝子ＩＤ  ５６６３９）
プロプロテインコンバターゼ４（ＰＣ４）としても公知である、ヒト５６６３９配列（配列番号６５）は、非翻訳領域を含む約２６６９ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号６５の核酸約６１〜２３２８に位置する）は、７５５アミノ酸タンパク質（配列番号６６）をコードする。
【０１８２】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、５６６３９  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞、脳、下垂体および腎臓において、最も高いレベルで発現した。造血細胞において、５６６３９  ｍＲＮＡは、プールされた分化１０日目の赤血球系細胞、Ｋ５６２（赤白血病細胞系）およびＣＤ３４細胞において、非常に高レベルで発現した。赤血球系細胞において、５６６３９  ｍＲＮＡの発現は、ＥＰＯの存在下でのＢＦＵ−Ｅ培養物において増加した。５６６３９  ｍＲＮＡ発現は、低ＧＰＡ細胞中において、高ＧＰＡ細胞試料よりも、より高いレベルで検出された。５６６３９  ｍＲＮＡの低い発現が、巨核球および好中球の培養物中で検出された。
【０１８３】
５６６３９のマウスオルソログの発現が、前駆細胞母集団に相当する、骨髄の直系陰性分画中で検出された。
【０１８４】
プロプロテインコンバターゼは、バクテリアサブチリシンおよび酵母ケキシン（ｋｅｘｉｎ）に関したカルシウム依存性セリンプロテアーゼである。これらの酵素は、対塩基アミノ酸の後の部位でポリペプチドの選択的開裂によって、前駆体タンパク質からそれらの活性体に変換する。哺乳動物において、このファミリーは、ＰＣ１、ＰＣ２、ＰＣ４、ＰＣ５、フリン（ＦＵＲ）およびＰＡＣＥ４を含有する。これらの酵素の基質は、プロホルモンから細胞表面のレセプターおよび血管表面のグリコプロテインへの成長因子の前駆体までの範囲に及ぶ。この酵素は、赤血球前駆細胞を増殖させる際に、高度に発現する。これは、成長因子または他のタンパク質の分解において機能し、これらの細胞の増殖速度を制御するか、またはアポトーシス経路におけるタンパク質のプロセシングのために機能する。５６６３９の阻害は赤血球系細胞の拡張を導く。
【０１８５】
その機能的な役割と共に、５６６３９  ｍＲＮＡの発現のために、５６６３９のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の５６６３９ポリペプチドは、５６６３９活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
（遺伝子ＩＤ  ９６６１）
ヒト９６６１配列（配列番号６７）（サイクリン依存性キナーゼ関連ホスファター（ＫＡＰ）としてもまた公知）は、非翻訳領域を含む約８４４ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号６７の核酸約５２〜６９０に位置される）は、２１２アミノ酸のタンパク質（配列番号６８）をコードする。
【０１８６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価される場合、９６６１  ｍＲＮＡは、造血細胞中で制限された発現を有した。インビトロで分化された１０日目の赤血球培養物は、９６６１  ｍＲＮＡの最も高い発現レベルを示した。赤血球細胞において、９６６１  ｍＲＮＡ発現は、インビトロでの赤血球細胞分化で有意に増加し、そしてより成熟したＧＰＡ高細胞と比較した場合、ＧＰＡ低赤血球細胞においてより高いレベルで発現された。骨格筋においていくらかの発現もまた存在下した。
【０１８７】
９６６１のマウスオルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）は、赤血球増殖および成熟細胞に対応する、系統ネガティブ細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞において発現された。
【０１８８】
９６６１は、細胞周期調節において役割を果し得る。これは、ホスホチロシン残基またはホスホセリン残基のいずれかを含む基質に対して活性である、二重特異性ホスファターゼである。９６６１は、ＣＤＣ２、ＣＤＫ２およびＣＤＫ３のようなサイクリン依存性キナーゼと相互作用するが、ＣＤＫ４とは相互作用しない。このホスファタ−ゼが増殖のネガティブなレギュレーターであると考えられる。これは、特定の変異がもはや肝細胞癌においてＣｄｋ２と相互作用することを可能にするという知見に基づく（Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．２０００  Ｓｅｐ  １；６０（１７）：４６９７−７００；Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｒｅｓ  Ｃｏｍｍｕｎ．２００３  Ｍａｙ  ３０；３０５（２）：３１１−４）。このホスファターゼの阻害は、赤血球前駆体の増殖を生じる。
【０１８９】
９６６１  ｍＲＮＡ発現に起因して、その機能的役割と共に、９６６１のモジュレーターは、血液障害を処置するのに有用である。本発明の９６６１ポリペプチドは、９６６１活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１９０】
（遺伝子ＩＤ  １６０５２）
ヒト１６０５２配列（配列番号６９）（タンパク質−チロシンホスファターゼ、非レセプタータイプ２２またはＬＹＰ１としてもまた公知）は、非翻訳領域を含む約３０５８ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号６９の核酸約４２〜２４６８に位置する）は、８０８アミノ酸タンパク質（配列番号７０）をコードする。
【０１９１】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価される場合、１６０５２  ｍＲＮＡは、発達中のＣＤ１１ｂ−好中球、ＣＤ１４＋好中球、ＣＤ１５＋好中球およびＣＤ１１ｂ＋細胞、ＣＤ１４＋細胞、ＣＤ１５＋細胞において最も高いレベルで発現された。これはまた、インビトロでの好中球分化培養物においても見られた。１６０５２  ｍＲＮＡ発現は、インビトロでＣＤ３４細胞由来の赤血球先祖（ｐｒｏｇｅｎｉｔｏｒ）および巨核球の分化で増加した。１６０５２  ｍＲＮＡはまた、Ｔ細胞、Ｂ細胞および先祖においてより低いレベルで発現された。１６０５２  ｍＲＮＡはまた、組織および器官において低いレベルで発現されたが、リンパ組織、脾臓および皮膚において検出され得る。
【０１９２】
１６０５２のマウスオルソログはまた、造血細胞において発現され、骨髄白血球細胞ならびにＧｒ１＋好中球およびＴｅｒ１１９＋赤血球細胞において最も高レベルで発現された。１６０５２  ｍＲＮＡ発現は、骨髄系統ネガティブ細胞から好中球まで成熟して増加され、Ｇｒ１の低い画分よりも高レベルでＧｒ１培養物において見られた。
【０１９３】
１６０５２は、クローン化され、造血細胞タンパク質−チロシンホスファターゼ７０Ｚ−ＰＥＰまたはリンパホスファターゼとして記載された。これは、「主にリンパ組織および細胞中に発現する。アイソホーム１は、チモサイトならび成熟Ｂ細胞および成熟Ｔ細胞
において発現する」と記載されている（Ｂｌｏｏｄ．１９９９  Ｍａｒ  １５；９３（６）；２０１３−２４）。これは、Ｔ細胞活性化の負の制御因子として機能すると示されている（Ｅｘｐ  Ｈｅｎａｔｏｌ．２００２  Ｍａｒ；３０（３）：２３７−４４）。標準の前増殖シグナルの負の制御因子として作用し得ると示唆されている、このホスファターゼは、増殖シグナル（例えば、慢性骨髄白血病において観察される異常ＢＣＲ−ＡＢＬ）を負に制御すると示されている（Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．２００３  Ｊｕｌ  ２５；２７８（３０）：２７４１３−２０．Ｅｐｕｂ  ２００３  Ｍａｙ  ２１）。赤血球系細胞における、この酵素機能の阻害は、好中球増殖および好中球数の増加につながる。
【０１９４】
その機能的な役割と共に、１６０５２  ｍＲＮＡの発現のために、１６０５２のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１６０５２ポリペプチドは、１６０５２活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０１９５】
（遺伝子ＩＤ  １５２１）
グリコーゲンシンターゼキナーゼ３β（ＧＳＫβ）としても公知である、ヒト１５２１配列（配列番号７１）は、非翻訳領域を含む約１３８９ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号７１の核酸約４０〜１３０２に位置する）は、４２０アミノ酸タンパク質（配列番号７２）をコードする。
【０１９６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１５２１  ｍＲＮＡは、インビトロでの分化された１０日目赤血球培養物において、最も高いレベルで発現した。これはまた、赤血球系細胞系Ｋ５６２および低ＧＰＡ赤血球系細胞においても発現した。１５２１  ｍＲＮＡはＣＤ３４＋前駆細胞中に低レベルで発現し、ＣＤ３＋Ｔ細胞およびＣＤ１９＋Ｂ−細胞中で、検出可能だった。血球系細胞において、１５２１  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの赤血球分化の間に増加した（培養２４時間後から増加し、６日目にＥＰＯレセプター発現に相当するピークに達した）。より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、低ＧＰＡ細胞において、１５２１  ｍＲＮＡの発現は、より高レベルだった。器官リサイタル（ｒｅｃｉｔａｌ）において、１５２１  ｍＲＮＡの発現は、全く制限され、より低い前駆細胞の発現を有する赤血球系細胞において、最も高レベルだった。骨格筋および脳においても幾つかの発現があった。
【０１９７】
１５２１のマウスオルソログは、赤血球前駆細胞および成熟細胞に相当する直系陰性細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞中で発現した。細胞のＧｒ１分画においても発現した。
【０１９８】
ＧＳＫβは、前アポトーシスのシグナルに寄与すると記載されている（Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．２００１  Ｏｃｔ  ５；２７６（４０）：３７４３６−４２．Ｅｐｕｂ  ２００１  Ａｕｇ  ０８）。これはまた、ＡＫＴの下流にあり、ＡＫＴによって負に制御されると記載されている（Ｊ  Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ．２０００  Ｄｅｃ；７５（６）２４０１−８）。これはまた、ｗｎｔシグナルの負の制御因子として記載されている（Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ．１９９５  Ａｕｇ  ２９；９２（１８）：８４９８−５０２）。支質細胞から赤血球系細胞までのｗｎｔシグナルは、ＣＦＵ−Ｅの形成を増加させる。ＷＮＴ５ＡおよびＧＳＫ３βは、ＣＤ３４＋細胞中に発現する（Ｂｌｏｏｄ．１９９８  Ｎｏｖ  １；９２（９）：３１８９−２０２）。ＣＤ３４＋細胞および後の赤血球前駆細胞におけるこの酵素の阻害は、Ｗｎｔ経路およびＡＫＴを介するシグナルを増加し、赤血球系細胞の増殖を増加させる。
【０１９９】
その機能的な役割と共に、１５２１  ｍＲＮＡの発現のために、１５２１のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１５２１ポリペプチドは、１５２１活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０２００】
（遺伝子ＩＤ  ６６６２）
プロテインホスファターゼ２Ｃγイソホーム（ＰＰ２Ｃγ）としても公知である、ヒト６６６２配列（配列番号７３）は、非翻訳領域を含む約１９３２ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号７３の核酸約２５〜１６６５に位置する）は、５４６アミノ酸タンパク質（配列番号７４）をコードする。
【０２０１】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、６６６２  ｍＲＮＡは、造血細胞において制限された発現プロフィールを有し、インビトロで分化されて１０日目の赤血球培養物中で最も高い発現レベルが検出された。６６６２  ｍＲＮＡはまた、赤血球系細胞系Ｋ５６２および低ＧＰＡ赤血球系細胞中でも発現した。１６６６２  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４＋前駆細胞において低レベルで発現し、ＣＤ３＋Ｔ細胞およびＣＤ１９＋Ｂ細胞において検出可能だった。赤血球系細胞において、６６６２  ｍＲＮＡの発現は、インビトロでの培養２４時間後から増加して、赤血球の分化により顕著に増加した。より成熟した高ＧＰＡ細胞と比較すると、低ＧＰＡ細胞において、６６６２  ｍＲＮＡの発現は、より高レベルだった。器官リサイタル（ｒｅｃｉｔａｌ）において、６６６２  ｍＲＮＡの発現は、赤血球系細胞において、最も高レベルだった。骨格筋においても幾つかの発現があった。
【０２０２】
６６６２のマウスオルソログは、赤血球前駆細胞および成熟細胞に相当する直系陰性細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞中で発現した。６６６２  ｍＲＮＡの発現は、マウス「ＥＰＯ−ｏｎ」モデル（ここで、動物は、ＥＰＯで処理され、直系陰性母集団が研究されている）において増加する。６６６２  ｍＲＮＡの発現は、コントロール中よりもＥＰＯで処置した試料中で、より高レベルだった。発現レベルはまた、「静脈切開による貧血」のマウスモデルの群でも増加した。これらのモデル両方において、このホスファターゼ発現の増加は、ＥＰＯレセプターの発現の増加と関連する。
【０２０３】
ＰＰ２Ｃは、ＭＡＰＫキナーゼシグナリングの負の制御因子として記載されている（Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．２００３  Ｍａｙ  ２３；２７８（２１）：１８９４５−５２．Ｅｐｕｂ  ２００３  Ｍａｒ  １９；ＥＭＢＯ  Ｊ．１９９８  Ａｕｇ  １７；１７（１６）：４７４４−５２）。ＰＰ２Ｃのαアイソホームが、ｐ５３において記載されている（Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ．２００３  Ａｐｒ  １８；２７８（１６）：１４２９９−３０５．Ｅｐｕｂ  ２００３  Ｊａｎ  ０３）。ｐ５３欠乏細胞は、野生タイプのコントロールと比較して増加した増殖能を有する（Ｅｘｐ  Ｂｉｏｌ  Ｍｅｄ（Ｍａｙｗｏｏｄ）．２００２  Ｊｕｌ；２２７（７）：４７４−９）。ＰＰ２Ｃホスファターゼが、増殖制御の役割をすることは明らかである。ＰＰ２Ｃファミリーメンバーは、スプライシングの役割をすると記載され、γアイソホームが、この過程の役割を担うと示唆する証拠がある（Ｇｅｎｅｓ  Ｄｅｖ．１９９９  Ｊａｎ  １；１３（１）：８７−９７）。他のＰＰ２Ｃアイソホームのように、ＰＰ２Ｃγは、増殖シグナリングの負の制御の役割をし得る。ＰＰ２Ｃγの阻害は、赤血球前駆細胞の増殖を増加させる。
【０２０４】
その機能的な役割と共に６６６２  ｍＲＮＡの発現のために、６６６２のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の６６６２ポリペプチドは、６６６２活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０２０５】
（遺伝子ＩＤ  １３９１３）
メタロプロテアーゼ１としても公知である、ヒト１３９１３配列（配列番号７５）は、非翻訳領域を含む約３４３２ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号７５の核酸約１４〜３１３０に位置する）は、１０３８アミノ酸タンパク質（配列番号７６）をコードする。
【０２０６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１３９１３  ｍＲＮＡの発現は、造血細胞に制限され、インビトロでの分化１０日目の赤血球培養物中で、最も高い発現レベルを示した。１３９１３  ｍＲＮＡはまた、赤血球系細胞系Ｋ５６２および低ＧＰＡ赤血球系細胞においても発現した。さらに１３９１３  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４＋細胞中に低いレベルで発現し、好中球、単級、Ｔ細胞（ＣＤ３＋）およびＢ細胞（ＣＤ１９＋）において、検出可能だった。赤血球組織パネルで行われた、さらなるＴａｑＭａｎ実験は、１３９１３  ｍＲＮＡの発現が、インビトロでの赤血球の分化とともに顕著に増加することを説明した。発現は、培養２４時間後以降に増加し、培養６日目でピークに達した。１３９１３  ｍＲＮＡは、より成熟した高ＧＰＡ発現細胞に比べて低ＧＰＡ赤血球系細胞において、より高レベルで発現し、ＥＰＯへの反応においては、ＢＦＵ−Ｅ培養中で増加した。
【０２０７】
１３９１３のマウスオルソログは、ＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞および直系陰性前駆細胞（赤血球前駆細胞を含む）において、最も高度に発現した。これは、骨髄細胞（つまり、ＧＲ１＋好中球および単核細胞）において低レベルで発現した。細胞が、ＥＰＯで処置されたマウスモデルにおいて、このプロテアーゼの発現レベルは、ＥＰＯ処置された直系陰性細胞中で増加する。これは、観察されるＥＰＯレセプター発現の増加と同時である。
【０２０８】
このヒト  メタロプロテアーゼ１における触媒ドメインは、インスリン分解酵素のようなピトリリシン（ｐｉｔｒｉｌｙｓｉｎ）ファミリーのメンバーで保たれる（ＤＮＡ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．１９９９  Ｍａｙ；１８（５）：３６９−８０）。１３９１３は、赤血球前駆細胞を増殖する際に発現し、それゆえ、赤血球系細胞の増殖速度を調節するように、成長因子または他のタンパク質分解経路に作用し得る。１３９１３の阻害は、それゆえ赤血球系細胞を拡大させる。
【０２０９】
その機能的な役割と共に、１３９１３  ｍＲＮＡの発現のために、１３９１３のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１３９１３ポリペプチドは、１３９１３活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０２１０】
（遺伝子ＩＤ  １２４０５）
セリンパルミトイルタランスフェラーゼとしても公知である、ヒト１２４０５配列（配列番号７７）は、非翻訳領域を含む約２０２６ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号７７の核酸約４９〜１７３７に位置する）は、５６２アミノ酸タンパク質（配列番号７８）をコードする。
【０２１１】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、１２４０５  ｍＲＮＡは、造血細胞において、制限された発現プロフィールを有し、インビトロでの分化１０日目の赤血球培養物中で最も高い発現レベルを示した。１２４０５  ｍＲＮＡは、赤血球系細胞系Ｋ５６２中および低ＧＰＡ赤血球系細胞中でも発現した。さらに１２４０５  ｍＲＮＡは、ＣＤ３４＋細胞中に低いレベルで発現し、好中球、単級、Ｔ細胞（ＣＤ３＋）およびＢ細胞（ＣＤ１９＋）において、検出可能だった。赤血球組織パネルで行われたさらなるＴａｑＭａｎ実験は、１２４０５  ｍＲＮＡの発現が、インビトロでの赤血球の分化とともに顕著に増加することを説明した。発現は、培養２４時間後以降に増加し、培養６日目でピークに達した。１２４０５  ｍＲＮＡは、より成熟した高ＧＰＡ発現細胞に比べて低ＧＰＡ赤血球系細胞において、より高レベルで発現し、ＥＰＯへの反応においては、ＢＦＵ−Ｅ培養中で増加した。
【０２１２】
１２４０５のマウスオルソログは、赤血球前駆細胞および成熟細胞に対応する、直系陰性前駆細胞およびＴＥＲ１１９＋赤血球系細胞において、同レベルで発現した。これは
好中球（Ｇｒ＋１）中でも発現した。
【０２１３】
セリンパルミトイルタランスフェラーゼとしても公知である、１２４０５は、セラミド生成において、速度制限酵素である。セラミドは、細胞サイクル停止および分化を含む、前アポトーシス因子として記載され、これは、赤血球系細胞におけるアポトーシスにつながる（Ｃａｎｃｅｒ  Ｌｅｔｔ．２００３  Ａｐｒ  ２５；１９３（２）：１４９−５４；Ｅｘｐ  Ｈｅｍａｔｏｌ．１９９９  Ｊｕｌ；２７（７）１１３３−８）。それゆえ、セリンパルミトイルタランスフェラーゼの阻害は、セラミド生成を減少させ、赤血球前駆細胞の生存および増殖を増加させ得る。
【０２１４】
その機能的な役割と共に１２４０５  ｍＲＮＡの発現のために、１２４０５のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の１２４０５ポリペプチドは、１２４０５活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０２１５】
（遺伝子ＩＤ  ５０１４）
プロテインホスファターゼ２Ｃαアイソホーム（ＰＰ２Ｃα）としても公知である、ヒト５０１４配列（配列番号７９）は、非翻訳領域を含む約２３４６ヌクレオチド長である。コード配列（配列番号７９の核酸約３５８〜１５０６に位置する）は、３８２アミノ酸タンパク質（配列番号８０）をコードする。
【０２１６】
ＴａｑＭａｎ分析によって評価された場合、５０１４  ｍＲＮＡは、主に造血細胞に制限され、インビトロでの分化１０日目の赤血球培養物中で最も高レベルだった。低レベルの発現が、骨格筋中および脳試料中に観察された。５０１４  ｍＲＮＡはまた、赤血球系細胞系Ｋ５６２中、低ＧＰＡ赤血球系細胞中および胎児の肝臓中にも発現した。赤血球パネルを使用するさらなるＴａｑＭａｎ分析は、インビトロでの赤血球の分化とともに５０１４  ｍＲＮＡの発現が、顕著に増加することを説明した。５０１４  ｍＲＮＡの発現は、培養２４時間後以降に増加し、発現はまた、ＥＰＯ存在下でのＢＦＵ−Ｅ培養物中でも増加した。５０１４  ｍＲＮＡの発現は、低ＧＰＡ赤血球系細胞および高ＧＰＡ発現細胞の両方において発現した。
【０２１７】
５０１４のマウスオルソログは、赤血球前駆細胞および成熟細胞に対応する、直系陰性細胞およびＴＥＲ１１９＋細胞において、発現を示した。これはまた、単核細胞およびＧＲ１＋ｉｖｅ好中球においても発現した。
【０２１８】
５０１４は、プロテインホスファターゼ２Ｃαアイソホーム（ＰＰ２Ｃα）としても公知である。ＰＰ２Ｃは、ＭＡＰＫキナーゼシグナリングの負の制御因子として記載されている（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３  Ｍａｙ  ２３；２７８（２１）：１８９４５−５２．Ｅｐｕｂ  ２００３  Ｍａｒ  １９；およびＥＭＢＯ  Ｊ．１９９８  Ａｕｇ  １７；１７（１６）：４７４４−５２）。ＰＰ２Ｃαアイソホームは、ｐ５３活性化において記載されている（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００３  Ａｐｒ  １８；２７８（１６）：１４２９９−３０５．Ｅｐｕｂ  ２００３  Ｊａｎ  ０３）。ｐ５３欠乏細胞は、野生タイプのコントロールと比べると、増加した増殖能を有する（Ｅｘｐ  Ｂｉｏｌ  Ｍｅｄ（Ｍａｙｗｏｏｄ）．２００２  Ｊｕｌ；２２７（７）４７４−９）。それゆえ、ＰＰ２Ｃホスファターゼは、増殖制御の役割をすることは、明らかである。ＰＰ２Ｃαは、増殖シグナリングの負の制御の役割も担う。それゆえ、ＰＰ２Ｃγの阻害は、赤血球前駆細胞の増殖を増加させる。
【０２１９】
その機能的な役割と共に、赤血球系細胞における５０１４  ｍＲＮＡの発現のために、５０１４のモジュレーターは、血液学的障害の処置に有用である。本発明の５０１４ポリペプチドは、５０１４活性のモジュレーターをスクリーニングするのに有用である。
【０２２０】
本発明の種々の局面は、以下の小節において、さらに詳細に記載される：
（スクリーニングアッセイ：）
本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に結合するか、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性に対して刺激効果または阻害効果を有するか、あるいは例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質の発現または活性に対して刺激効果または阻害効果を有する、モジュレーター（すなわち、候補化合物もしくは試験化合物または候補薬剤もしくは試験薬剤（例えば、ペプチド、ペプチド模倣物、低分子（有機または無機）または他の薬物））を同定するための方法（これは、本明細書中で「スクリーニングアッセイ」とも呼ばれる）を提供する。本明細書中に記載のアッセイを使用して同定される化合物は、血液障害を処置するのに有用であり得る。
【０２２１】
これらのアッセイは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に結合する化合物、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質と相互作用する他の細胞内タンパク質または細胞外タンパク質に結合する化合物、および他の細胞内タンパク質または細胞外タンパク質と９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質との相互作用を妨害する化合物を同定するように設計されている。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質（これは、膜貫通レセプター型タンパク質である）の場合、このような技術は、このようなレセプターのためのリガンドを同定し得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のリガンドまたは基質は、例えば、血液障害の少なくとも１つの症状に対して使用され得る。このような化合物としては、ペプチド、抗体、または有機低分子化合物もしくは無機低分子化合物が挙げられ得るがこれらに限定されない。このような化合物はまた、他の細胞性タンパク質を含み得る。
【０２２２】
アッセイによって同定される化合物（例えば、本明細書に記載の化合物）は、例えば、血液障害を処置するのに有用であり得る。血液障害状態が、細胞または組織における、全体的に低いレベルの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現および／あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質により生じる場合、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質と相互作用する化合物は、結合した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の活性を強調するかまたは増幅する化合物を含み得る。このような化合物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質活性のレベルの効果的な増大を引き起し、したがって、症状を改善する。
【０２２３】
他の例において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における変異は、血液障害に至る有害な効果を有する、異常型または過剰量の、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を生じさせ得る。同様に、生理学的状態は、血液障害に至る、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現の過剰な増大を引き起こし得る。このような場合、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に結合する化合物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の活性を阻害するタンパク質として同定され得る。本節で記載されるような技術によって同定される化合物の有効性を試験するためのアッセイは、本明細書中に議論されている。
【０２２４】
１つの実施形態において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質またはポリペプチドあるいはそれらの生物学的に活性な部分の基質である候補化合物または試験化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。別の実施形態において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質またはポリペプチドまたはその生物学的活性な部分に結合するかまたはその活性を調節する候補化合物または試験化合物をスクリーニングするためのアッセイを提供する。本発明の試験化合物は、以下に挙げられる当該分野で公知のコンビナトリアルライブラリー法における多くのアプローチのうちの任意のものを使用して得られ得る：生物学的ライブラリー；空間的にアドレス可能な並列固相ライブラリーまたは液相ライブラリー；デコンボルーション処理を必要とする合成ライブラリー法；「１ビーズ１化合物」ライブラリー法；およびアフィニティクロマトグラフィー選択を使用する合成ライブラリー法。生物学的ライブラリーアプローチは、ペプチドライブラリーに限定されるが、他の４つのアプローチは、化合物の、ペプチドライブラリー、非ペプチドオリゴマーライブラリー、または低分子ライブラリーに適用可能である（Ｌａｍ，Ｋ．Ｓ．（１９９７）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｓ．１２：１４５）。
【０２２５】
分子ライブラリーの合成のための方法の例は、例えば、以下において、当該分野で見出され得る：ＤｅＷｉｔｔら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９０：６９０９；Ｅｒｂら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：１１４２２；Ｚｕｃｋｅｒｍａｎｎら（１９９４）、Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３７：２６７８；Ｃｈｏら（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６１：１３０３；Ｃａｒｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３３：２０５９；Ｃａｒｅｌｌら（１９９４）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．３３：２０６１；およびＧａｌｌｏｐら（１９９４）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．３７：１２３３。
【０２２６】
化合物のライブラリーは、溶液中（例えば、Ｈｏｕｇｈｔｅｎ（１９９２）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １３：４１２〜４２１）、またはビーズ上（Ｌａｍ（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ  ３５４：８２〜８４）、チップ上（Ｆｏｄｏｒ（１９９３）Ｎａｔｕｒｅ  ３６４：５５５〜５５６）、細菌上（Ｌａｄｎｅｒ、米国特許第５，２２３，４０９号）、芽胞上（Ｌａｄｎｅｒ、ＵＳＰ’４０９号）、プラスミド上（Ｃｕｌｌら（１９９２）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ８９：１８６５〜１８６９）またはファージ上（ＳｃｏｔｔおよびＳｍｉｔｈ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：３８６〜３９０）；（Ｄｅｖｌｉｎ（１９９０）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４９：４０４〜４０６）；（Ｃｗｉｒｌａら（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８７：６３７８〜６３８２）；（Ｆｅｌｉｃｉ（１９９１）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：３０１〜３１０）；（Ｌａｄｎｅｒ  前出）に提示され得る。
【０２２７】
１つの実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、ここで９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質またはその生物学的に活性な部分を発現する細胞を、試験化合物と接触させ、そして試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の活性を調節する能力を決定する。試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する能力の決定を、例えば、細胞内カルシウム、ＩＰ３、ｃＡＭＰ、またはジアシルグリセロール濃度、細胞内タンパク質のリン酸化プロフィール、細胞増殖および／または移動、例えば、細胞表面接着分子もしくは造血に関連する遺伝子の遺伝子発現、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４により調節される転写因子の活性をモニタリングすることによって達成し得る。この細胞は、哺乳動物由来（例えば、神経細胞由来）であり得る。１つの実施形態において、レセプタードメインと相互作用する化合物が、リガンドとして（すなわち、レセプターに結合し、シグナル伝達経路を調節するよう）機能するそれらの能力についてスクリーニングされ得る。リガンドの同定、およびリガンド−レセプター複合体の活性の測定は、この相互作用のモジュレーター（例えば、アンタゴニスト）の同定を導く。このようなモジュレーターは、血液障害の処置に有用であり得る。
【０２２８】
基質への９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の結合を調節する試験化合物の能力、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４に結合する試験化合物の能力もまた、決定され得る。基質への９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の結合を調節する試験化合物の能力の決定は、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質を、放射性同位体または酵素標識とカップリングさせることによって達成され得、その結果、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４への、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質の結合は、複合体中の標識された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質を検出することによって、決定され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４はまた、放射性同位体または酵素標識とカップリングされて、複合体中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質への９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の結合を調節する試験化合物の能力をモニタリングし得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と結合する試験化合物の能力の決定は、例えば、その化合物と、放射性同位体または酵素標識とをカップリングさせることによって達成され、その結果、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４へのこの化合物の結合は、複合体中の標識された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の化合物を検出することによって決定され得る。例えば、化合物（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のリガンドまたは基質）を、１２５Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ、または３Ｈで、直接的または間接的のいずれかで標識し得、そしてこの放射性同位体が、放射線の直接的な計数によってか、またはシンチレーション計数によってかで検出され得る。化合物はさらに、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、またはルシフェラーゼで酵素標識され得、そして適切な基質の産物への変換を測定することによって、この酵素標識を検出し得る。
【０２２９】
相互作用するもののいずれも標識することなく、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と相互作用する化合物（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のリガンドまたは基質）の能力を決定することもまた、本発明の範囲内である。例えば、微視的生理機能測定器を使用して、化合物も９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のいずれも標識することなく、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４との化合物の相互作用を検出し得る（ＭｃＣｏｎｎｅｌｌ，Ｈ．Ｍ．ら（１９９２）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５７：１９０６−１９１２）。本明細書中で使用される場合、「微視的生理機能測定器（ｍｉｃｒｏｐｈｙｓｉｏｍｅｔｅｒ）」（例えば、細胞センサー（Ｃｙｔｏｓｅｎｓｏｒ））は、光アドレス可能な電位差計センサー（ＬＡＰＳ）を使用して、細胞がその環境を酸性化する速度を測定する分析機器である。この酸性化速度の変化を、化合物と９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４���９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４との間の相互作用の指標として使用し得る。
【０２３０】
別の実施形態において、アッセイは、細胞ベースのアッセイであり、これは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の標的分子（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質）を発現する細胞を、試験化合物と接触させる工程、ならびにこの試験化合物が、この９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の標的分子の活性を調節（例えば、刺激または阻害）する能力を決定する工程を包含する。この試験化合物が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の標的分子の活性を調節する能力の決定は、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の標的分子と結合または相互作用する能力を決定することによって、達成され得る。
【０２３１】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質あるいはこれらの生物学的に活性なフラグメントが、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の標的分子と結合または相互作用する能力の決定は、直接結合の決定に関して上記の方法の１つによって、達成され得る。好ましい実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の標的分子と結合または相互作用する能力の決定は、その標的分子の活性を決定することによって、達成され得る。例えば、この標的分子の活性は、その標的の細胞セカンドメッセンジャー（すなわち、細胞内Ｃａ２＋、ジアシルグリセロール、ＩＰ３、ｃＡＭＰ）の誘導を検出すること、適切な基質への標的の触媒活性／酵素活性を検出すること、レポーター遺伝子（検出可能なマーカー（例えば、ルシフェラーゼ）をコードする核酸に作動可能に連結された標的応答性調節エレメントを含む）の誘導を検出すること、または標的で調節された細胞応答（例えば、遺伝子発現）を検出することにより、決定され得る。
【０２３２】
なお別の実施形態において、本発明のアッセイは無細胞アッセイであり、ここで、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質またはこれらの生物学的に活性な部分は、試験化合物と接触され、そして試験化合物が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質またはこれらの生物学的に活性な部分に結合する能力が決定される。本発明のアッセイにおいて使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質の好ましい生物学的に活性な部分は、非９１１８分子、非９９０分子、非１７６６２分子、非８１９８２分子、非６３０分子、非２１４７２分子、非１７６９２分子、非１９２９０分子、非２１６２０分子、非２１６８９分子、非２８８９９分子、非５３６５９分子、非６４５４９分子、非９４６５分子、非２３５４４分子、非７３６６分子、非２７４１７分子、非５７２５９分子、非２１８４４分子、非９４３分子、非２０６１分子、非５８９１分子、非９１３７分子、非１３９０８分子、非１４３１０分子、非１７６００分子、非２５５８４分子、非２７８２４分子、非２８４６９分子、非３８９４７分子、非５３００３分子、非９６５分子、非５６６３９分子、非９６６１分子、非１６０５２分子、非１５２１分子、非６６６２分子、非１３９１３分子、非１２４０５分子または非５０１４分子との相互作用に関与するフラグメント（例えば、高い表面確立スコアを有するフラグメント）を含む。試験化合物の、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質への結合は、上記のように直接的にかまたは間接的にかのいずれかで測定され得る。好ましい実施形態において、このアッセイは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質またはこれらの生物学的に活性な部分を、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４に結合する既知の化合物と接触させ、アッセイ混合物を形成する工程、このアッセイ混合物を試験化合物と接触させる工程、および試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程を包含し、ここで、試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程は、試験化合物が、既知の化合物と比較して優先的に９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４あるいはこれらの生物学的に活性な部分に結合する能力を決定する工程を含む。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の、既知の標的タンパク質との相互作用を調節する化合物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質（特に、変異体９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４タンパク質）の活性を調節するのに有用であり得る。
【０２３３】
別の実施形態において、アッセイは、無細胞アッセイであり、ここで、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質、またはその生物学的に活性な部分が試験化合物と接触され、そしてその試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパクまたはその生物学的に活性な部分の活性を調節（例えば、刺激または阻害）する能力が決定される。この試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質の活性を調節する能力の決定は、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的分子に結合する能力を、直接的結合の決定のための上記方法の１つによって決定することにより、達成され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的分子に結合する能力を決定することはまた、リアルタイムのＢｉｏｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ  Ａｎａｌｙｓｉｓ（ＢＩＡ）のような技術を用いて達成され得る（Ｓｊｏｌａｎｄｅｒ，Ｓ．およびＵｒｂａｎｉｃｚｋｙ，Ｃ．（１９９１）Ａｎａｌ．Ｃｈｅｍ．６３：２３３８〜２３４５およびＳｚａｂｏら（１９９５）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．５：６９９〜７０５）。本明細書において用いる場合、「ＢＩＡ」は、いずれの相互作用物（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ）も標識することなく、リアルタイムで生体特異的相互作用を研究するための技術である。表面プラズモン共鳴（ｓｕｒｆａｃｅ  ｐｌａｓｍｏｎ  ｒｅｓｏｒｎａｎｃｅ）（ＳＰＲ）の光学的現象（ｏｐｔｉｃａｌ  ｐｈｅｎｏｍｅｎｏｎ）における変化は、生物学的分子の間のリアルタイム反応の指標として用いられ得る。
【０２３４】
別の実施形態において、この試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質の活性を調節する能力の決定は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的分子の下流エフェクター活性をさらに調節する能力を決定することにより、達成され得る。例えば、このエフェクター分子の適切な標的に対する活性が決定され得るかまたはこのエフェクターの適切な標的に対する結合が、上に記載のように決定され得る。
【０２３５】
なお別の実施形態において、無細胞アッセイは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質またはその生物学的に活性な部分に、この９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質に結合する既知の化合物を接触させてアッセイ混合物を形成させる工程、このアッセイ混合物を、試験化合物と接触させる工程、およびこの試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程を包含し、ここで、この試験化合物が９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質と相互作用する能力を決定する工程は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的分子と優先的に結合するか、またはその９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的分子の活性を優先的に調節する能力を決定する工程を包含する。
【０２３６】
本発明の上記アッセイ方法の１つより多い実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４またはその標的分子のいずれかを固定して、そのタンパク質の一方または両方の非複合体化形態からの複合体化形態の分離を促進し、そしてそのアッセイの自動化に適用させることが、望ましくあり得る。試験化合物の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質への結合、または候補化合物の存在下および非存在下での９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質の標的分子との相互作用は、これらの反応物を収容するために適切な任意の容器内で、達成され得る。このような容器の例には、マイクロタイタープレート、試験管、および微小遠心管が挙げられる。１つの実施形態において、そのタンパク質の一方または両方がマトリックスに結合することを可能にするドメインを付加する融合タンパク質が、提供され得る。例えば、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の融合タンパク質またはグルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／標的融合タンパク質は、グルタチオンセファロースビーズ（Ｓｉｇｍａ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ、ＭＯ）またはグルタチオン誘導体化マイクロタイタープレート上に吸着され得、次いで���これらは、試験化合物と合わせられるか、あるいは試験化合物および非吸着の標的タンパク質または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質のいずれかと合わせられ、そしてこの混合物が、複合体形成に貢献する条件下（例えば、塩およびｐＨに関して生理学的条件）でインキュベートされる。インキュベーションに続いて、ビーズまたはマイクロタイタープレートウェルを洗浄して、結合していないあらゆる成分を除去し、ビーズの場合にはマトリックスを固定し、例えば、上記のように、複合体を直接的または間接的のいずれかで決定する。あるいは、複合体がマトリックスから解離され得、そして９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の結合レベルまたは活性レベルを、標準的な技術を使用して決定し得る。
【０２３７】
タンパク質をマトリックス上に固定するための他の技術もまた、本発明のスクリーニングアッセイにおいて使用され得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的分子のいずれかが、ビオチンとストレプトアビジンとの結合体化を利用して固定され得る。ビオチン化された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または標的分子は、当該分野において公知の技術を使用して、ビオチンＮＨＳ（Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド）から調製され得（例えば、ビオチン化キット、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ、Ｒｏｃｋｆｏｒｄ、ＩＬ）、そしてストレプトアビジン被覆した９６ウェルのプレート（Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ）のウェルに固定され得る。あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または標的分子と反応性であるが、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４��９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質の標的分子への結合を妨害しない抗体が、そのプレートのウェルに誘導体化され得、そして結合していない標的またはタンパク質が、抗体の結合体化によってウェル内にトラップされ得る。このような複合体を検出するための方法には、ＧＳＴ固定複合体に関しての上記のものに加えて、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または標的分子と反応性の抗体を使用する複合体の免疫検出、ならびに９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または標的分子に関する酵素活性の検出に依存する酵素結合アッセイが挙げられる。
【０２３８】
別の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現のモジュレーターは、細胞が候補化合物と接触され、そして細胞中での９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が決定される方法において同定される。候補化合物の存在下での９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のレベルは、候補化合物の非存在下での９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現のレベルと比較される。次いで、候補化合物は、この比較に基づき、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現のモジュレーターとして同定され得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が、候補化合物の非存在下よりも存在下で多い（統計的に有意に多い）場合、候補化合物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質発現の刺激物質として同定される。あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質の発現が、候補化合物の非存在下よりも存在下でより低い（統計学的に有意に低い）場合、候補化合物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質発現のインヒビターとして同定される。細胞中での９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡ発現またはタンパク質発現のレベルは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のｍＲＮＡまたはタンパク質の検出について本明細書中に記載される方法により決定され得る。
【０２３９】
本発明のなお別の局面において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質は、ツーハイブリッドアッセイまたはスリーハイブリッドアッセイ（例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら、（１９９３）Ｃｅｌｌ  ７２：２２３〜２３２；Ｍａｄｕｒａら（１９９３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：１２０４６〜１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら（１９９３）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １４：９２０〜９２４；Ｉｗａｂｕｃｈｉら（１９９３）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  ８：１６９３−１６９６；およびＢｒｅｎｔ  ＷＯ９４／１０３００を参照のこと）において「ベイト（ｂａｉｔ）タンパク質」として使用されて、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４（「９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の結合タンパク質」または「９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４−ｂｐ」）と結合または相互作用し、そして９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３���９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の活性に関与する他のタンパク質を同定し得る。このような９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の結合タンパク質はまた、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の媒介性シグナル伝達経路の下流エレメントとして、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の標的によるシグナル伝達に関与する可能性がある。あるいは、このような９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の結合タンパク質は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６���９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のインヒビターである可能性がある。
【０２４０】
ツーハイブリッドシステムは、別個のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインからなる大半の転写因子のモジュラー性質に基づく。手短には、このアッセイは、２つの異なるＤＮＡ構築物を利用する。１つの構築物において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質をコードする遺伝子は、公知の転写因子（例えば、ＧＡＬ−４）のＤＮＡ結合ドメインをコードする遺伝子に融合される。もう一方の構築物において、同定されていないタンパク質（「プレイ（ｐｒｅｙ）」または「サンプル」）をコードするＤＮＡ配列のライブラリー由来のＤＮＡ配列は、公知の転写因子の活性化ドメインをコードする遺伝子に融合される。「ベイト」タンパク質および「プレイ」タンパク質がインビボで相互作用して９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４に依存性の複合体を形成し得る場合、転写因子のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインは、近接する。このように近接することにより、転写因子に応答性の転写調節部位に作動可能に連結したレポーター遺伝子（例えば、ＬａｃＺ）の転写が可能になる。レポーター遺伝子の発現が、検出され得、そして機能的転写因子を含む細胞コロニーは、単離され得、そして９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質と相互作用するタンパク質をコードするクローン化遺伝子を得るために使用され得る。
【０２４１】
別の局面において、本発明は、本明細書中に記載されるアッセイの２つ以上の組み合わせに関する。例えば、調節剤は、細胞ベースのアッセイまたは無細胞アッセイを用いて同定され得、そして９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質の活性を調節する因子の能力は、例えば、動物（例えば、本明細書中に記載される、血液障害の動物モデル）においてインビボで確認され得る。
【０２４２】
本発明はさらに、上記のスクリーニングアッセイによって同定される新規薬剤に関する。従って、適切な動物モデルにおいて、本明細書中で記載されるように同定された薬剤をさらに使用することは本発明の範囲内である。例えば、本明細書中に記載されるように同定された薬剤（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の調節剤、アンチセンスの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の核酸分子、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４に特異的な抗体、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の結合パートナー）は、このような薬剤を用いる処置の効果、毒性、または副作用を決定するために、動物モデルにおいて使用され得る。あるいは、本明細書中に記載されるように同定される薬剤は、このような薬剤の作用の機構を決定するために、動物モデルにおいて使用され得る。さらに、本発明は、本明細書中に記載されるような処置についての上記スクリーニングアッセイによって同定された新規薬剤の使用に関する。
【０２４３】
任意の化合物（上記アッセイ系において同定されるような化合物が挙げられるがこれらに限定されない）が、血液障害を処置する能力について試験され得る。血液障害の少なくとも１つの症状に対するこのような能力を示す化合物の同定のための細胞ベースのアッセイおよび動物モデルベースのアッセイは、本明細書中に記載される。
【０２４４】
さらに、血液障害の動物ベースのモデル（例えば、本明細書中に記載されるようなモデル）は、血液障害を処置し得る化合物を同定するために使用され得る。このような動物モデルは、血液障害を処置する上で有効であり得る薬物、医薬品、治療、および介入の同定のための試験基質として使用され得る。例えば、動物モデルは、血液障害を処置する能力を示すことが予測される化合物に対して、曝露された動物における血液障害のこのような改善を導くのに十分な濃度および十分な時間、曝露され得る。この曝露に対する動物の応答は、処置の前および後の血液障害の症状の逆転を評価することによりモニタリングされ得る。
【０２４５】
介入に関して、血液障害の任意の局面を逆転する任意の処置が、ヒト血液障害治療介入の候補として考慮されるべきである。試験薬剤の投薬量は、用量応答曲線を得ることによって決定され得る。
【０２４６】
さらに、遺伝子発現パターンは、血液障害の少なくとも１つの症状に対する化合物の能力を評価するために使用され得る。例えば、１つ以上の遺伝子の発現パターンは、「遺伝子発現プロフィール」または「転写プロフィール」の一部を形成し得、次いで、このような評価において使用され得る。本明細書中で使用される場合、「遺伝子発現プロフィール」または「転写プロフィール」は、所定のセットの条件下で、所定の組織または細胞型について獲得されるｍＲＮＡ発現のパターンを含む。遺伝子発現プロフィールは、例えば、ディファレンシャルディスプレイ手順、ノーザン分析、および／またはＲＴ−ＰＣＲを使用することによって、作製され得る。１つの実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列は、このような遺伝子発現プロフィールの作製および確証のためのプローブおよび／またはＰＣＲプライマーとして使用され得る。
【０２４７】
遺伝子発現プロフィールは、細胞および／または動物ベースのモデル系における、既知の状態（心臓血管疾患または正常のいずれか）について特徴付けられ得る。その後、これらの既知の遺伝子発現プロフィールは、効果を確認するために比較され得、試験化合物は、このような遺伝子発現プロフィールを改変する必要があり、そしてそのプロフィールをより望ましいプロフィールの化合物とより緊密に類似させる必要がある。
【０２４８】
例えば、化合物の投与は、血液障害疾患モデル系の遺伝子発現プロフィールを、コントロール系とより緊密に類似させ得る。あるいは、化合物の投与は、コントロール系の遺伝子発現プロフィールに、血液障害または血液障害疾患状態を模倣させ始め得る。このような化合物は、例えば、目的の化合物のさらなる特徴付けにおいて使用され得るか、または、さらなる動物モデルの作製において使用され得る。
【０２４９】
（ＩＩ．細胞ベースおよび動物ベースのモデル系）
血液障害のためのモデルとして作用する、細胞ベースおよび動物ベースの系が、本明細書中に記載される。これらの系は、種々の適用において使用され得る。例えば、細胞ベースおよび動物ベースのモデル系を使用して、心臓血管疾患に関連する、差次的に発現される遺伝子（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４）をさらに特徴付けし得る。さらに動物ベースおよび細胞ベースのアッセイは、以下に記載されるような血液障害を回復させ得る化合物を同定するように設計された、スクリーニングストラテジーの一部として使用され得る。従って、動物ベースおよび細胞ベースのモデルを使用して、血液障害を処置する際に有効であり得る薬物、医薬品、治療および介入を同定し得る。さらに、このような動物モデルを使用して、動物被験体におけるＬＤ５０およびＥＤ５０を決定し得、そしてこのようなデータを使用して、潜在的な血液障害処置のインビボでの効力を決定し得る。
【０２５０】
（Ａ．動物ベースの系）
血液障害の動物ベースのモデル系としては、非組換え動物および操作されたトランスジェニック動物が挙げられ得るがこれらに限定されない。
【０２５１】
血液障害についての非組換え動物モデルとしては、例えば、遺伝的モデルが挙げられ得る。
【０２５２】
さらに、血液障害を示す動物モデルは、例えば、当業者に周知であるトランスジェニック動物を作製するための技術とともに、上記の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列を使用することによって、操作され得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列が、目的の動物のゲノムに導入され得、そしてこの目的の動物のゲノムにおいて過剰発現され得るか、あるいは内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列が存在する場合、これらは、過剰発現され得るか、また、あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現を過少発現させるかまたはこれらの遺伝子発現を不活化させるために破壊され得るかのいずれかであり得る。
【０２５３】
本発明の宿主細胞をまた使用して、非ヒトトランスジェニック動物を作製し得る。例えば、１つの実施形態において、本発明の宿主細胞は、受精卵または胚性幹細胞であり、この細胞に、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のコード配列が導入されている。次いで、このような宿主細胞を使用して、非ヒトトランスジェニック動物を作製し得、ここで、外因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列が、それらのゲノムまたは相同組換え動物に導入され、ここで、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列が、変更されている。このような動物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の機能および／または活性を研究するため、ならびに９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性のモジュレーターを同定および／または評価するために、有用である。本明細書中で使用される場合、「トランスジェニック動物」は、非ヒト動物であり、好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは、ラットまたはマウスのようなげっ歯類であり、ここで、これらの動物の１つ以上の細胞が、導入遺伝子を含む。トランスジェニック動物の他の例としては、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワトリ、両生類などが挙げられる。導入遺伝子は、外因性ＤＮＡであり、この外因性ＤＮＡは、トランスジェニック動物が成長する細胞のゲノムに取り込まれ、かつ成熟動物のゲノムにおいて維持され、それによってこのトランスジェニック動物の１つ以上の細胞型または組織における、コードされた遺伝子産物の発現を指向する。本明細書中で使用される場合、「相同組換え動物」は、非ヒト動物であり、好ましくは、哺乳動物であり、より好ましくは、マウスであり、ここで、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子は、この内因性遺伝子と、その動物の成長前にこの動物の細胞（例えば、動物の胎児性細胞）に導入された外因性ＤＮＡ分子との間の相同組換えによって変更されている。
【０２５４】
本発明の方法において使用されるトランスジェニック動物は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のコード核酸を、受精卵の雄前核に、例えば、マイクロインジェクション、レトロウイルス感染によって導入し、そして卵母細胞を偽妊娠雌養母動物において成長させることによって作製され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｃＤＮＡ配列は、導入遺伝子として、非ヒト動物のゲノムに導入され得る。あるいは、ヒトの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の非ヒトホモログ（例えば、マウスまたはラットの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子）が、導入遺伝子として使用され得る。あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子ホモログ（例えば、別の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のファミリーメンバー）は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｃＤＮＡ配列へのハイブリダイゼーションに基づいて単離され得、そして導入遺伝子として使用され得る。イントロン配列およびポリアデニル化シグナルもまた、導入遺伝子の発現の効力を増加させるように、この導入遺伝子に含まれ得る。組織特異的調節配列は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の導入遺伝子に作動可能に連結されて、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の発現を特定の細胞に指向し得る。胚操作およびマイクロインジェクションを介して、トランスジェニック動物（特に、マウスのような動物）を作製するための方法は、当該分野において慣習的であり、例えば、以下に記載されている：米国特許第４，７３６，８６６号および同第４，８７０，００９号（両方とも、Ｌｅｄｅｒらによる）、米国特許第４，８７３，１９１号（Ｗａｇｎｅｒらによる）、ならびにＨｏｇａｎ，Ｂ．，Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｍｏｕｓｅ  Ｅｍｂｒｙｏ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８６）。類似の方法が、他のトランスジェニック動物の作製のために使用される。トランスジェニック始原（ｆｏｕｎｄｅｒ）動物は、そのゲノムにおける９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の導入遺伝子の存在、および／あるいは動物の組織または細胞における９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡの発現に基づいて、同定され得る。次いで、トランスジェニック始原動物を使用して、導入遺伝子を保有するさらなる動物を育種し得る。さらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする導入遺伝子を有するトランスジェニック動物はさらに、他の導入遺伝子を有する他のトランスジェニック動物を産出し得る。
【０２５５】
相同組換え動物を作製するために、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の少なくとも一部を含むベクターが調製され、このベクターに、欠失、付加または置換が導入されて、それによって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子が変更される（例えば、機能的に破壊される）。この９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子は、ヒト遺伝子であり得るが、より好ましくは、ヒトの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の非ヒトホモログである。例えば、ラットの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子を使用して、マウスゲノムにおいて内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子を変更するのに適切な、相同組換え核酸分子（例えば、ベクター）を構築し得る。好ましい実施形態において、相同組換え核酸分子は、相同組換えの際に、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子が機能的に破壊される（すなわち、もはや機能的タンパク質をコードしない；「ノックアウト」ベクターとも呼ばれる）ように、設計される。あるいは、相同組換え核酸分子は、相同組換えの際に、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子が変異されるか、さもなければ変更されるが依然として機能的タンパク質をコードする（例えば、上流の調節領域が変更され、それによって内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の発現を変更し得る）ように、設計され得る。相同組換え核酸分子において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の変更された部分は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子のさらなる核酸配列によって、その５’末端および３’末端に隣接され、相同組換え核酸分子によって保有される外因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子と、細胞（例えば、胚性幹細胞）中の内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子との間に、相同組換えが生じることを可能にする。隣接するさらなる９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸配列は、内因性遺伝子との首尾よい相同組換えに十分な長さの核酸配列である。代表的には、隣接したＤＮＡ（５’末端と３’末端の両方）の数キロベースが、この相同組換え核酸分子に含まれる（例えば、相同組換えベクターの記載については、Ｔｈｏｍａｓ，Ｋ．Ｒ．およびＣａｐｅｃｃｈｉ，Ｍ．Ｒ．（１９８７）Ｃｅｌｌ  ５１：５０３を参照のこと）。相同組換え核酸分子は、細胞（例えば、胚性幹細胞株）に（例えば、エレクトロポレーションによって）導入され、そして導入された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４���２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子が、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子と相同に組み換わる細胞が、選択される（例えば、Ｌｉ，Ｅ．ら（１９９２）Ｃｅｌｌ  ６９：９１５を参照のこと）。次いで、これらの選択された細胞は、動物（例えば、マウス）の胚盤胞に注射され、凝集キメラを形成し得る。（例えば、Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．Ｔｅｒａｔｏｃａｒｃｉｎｏｍａｓ  ａｎｄ  Ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ  Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅ．Ｊ．Ｒｏｂｅｒｔｓｏｎ編（ＩＲＬ，Ｏｘｆｏｒｄ，１９８７）１１３−１５２頁）を参照のこと）。次いで、キメラ胚は、適切な偽妊娠雌養母動物に移植され得、そしてこの胚は、生殖（ｔｅｒｍ）され得る。生殖細胞において相同組換えされたＤＮＡを含む子孫を使用して、動物を繁殖させ得、ここで、この動物の全ての細胞は、導入遺伝子の生殖系列伝達によって相同組換えされたＤＮＡを含む。相同組換え核酸分子（例えば、ベクター）または相同組換え動物を構築するための方法は、以下にさらに記載される：Ｂｒａｄｌｅｙ，Ａ．（１９９１）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２：８２３−８２９、およびＬｅ  Ｍｏｕｅｌｌｅｃらによる、ＰＣＴ国際公開番号：ＷＯ  ９０／１１３５４；Ｓｍｉｔｈｉｅｓらによる、ＷＯ  ９１／０１１４０；Ｚｉｊｌｓｔｒａらによる、ＷＯ  ９２／０９６８；およびＢｅｒｎｓらによる、ＷＯ  ９３／０４１６９。
【０２５６】
別の実施形態において、本発明の方法において使用するためのトランスジェニック非ヒト動物が作製され得、この動物は、導入遺伝子の調節された発現を可能にする、選択された系を含む。このような系の１つの例は、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系である。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系の記載については、例えば、Ｌａｋｓｏら（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：６２３２−６２３６を参照のこと。リコンビナーゼ系の別の例は、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＦＬＰリコンビナーゼ系である（Ｏ’Ｇｏｒｍａｎら（１９９１）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５１：１３５１−１３５５）。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系を使用して導入遺伝子の発現を調節する場合、Ｃｒｅリコンビナーゼおよび選択されたタンパク質の両方をコードする導入遺伝子を含む動物が、必要とされる。このような動物は、「二重」トランスジェニック動物の構築によって（例えば、２種のトランスジェニック動物（一方は、選択されたタンパク質をコードする導入遺伝子を含み、他方は、リコンビナーゼをコードする導入遺伝子を含む）を交配させることによって）提供され得る。
【０２５７】
本明細書中に記載される非ヒトトランスジェニック動物のクローンはまた、以下に記載される方法に従って作製され得る：Ｗｉｌｍｕｔ，Ｉ．ら（１９９７）Ｎａｔｕｒｅ  ３８５：８１０−８１３およびＰＣＴ国際公開番号ＷＯ  ９７／０７６６８およびＷＯ  ９７／０７６６９。簡潔には、トランスジェニック動物由来の細胞（例えば、体細胞）が単離され得、そして増殖周期を出てＧｏ期に入るように誘導され得る。次いで、休止細胞が、例えば、電気パルスの使用を介して、この休止細胞が単離される同じ種の動物由来の除核された卵母細胞に融合され得る。次いで、この再構築された卵母細胞は、桑実胚または未分化胚芽細胞が成長するように培養され、次いで、偽妊娠雌養母動物に移される。この雌養母動物に由来する子孫は、細胞（例えば、体細胞）が単離される動物のクローンである。
【０２５８】
次いで、容易に検出可能なレベルの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡあるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のペプチド（９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のエピトープに対する抗体を使用して、免疫細胞化学的に検出される）を発現する、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のトランスジェニック動物は、特徴的な血液障害を示す動物を同定するために、さらに評価されるべきである。
【０２５９】
（Ｂ．細胞ベースの系）
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列を含み、かつこれらを発現し、そしてさらに例えば、造血（ｈｅｍａｔｏｐｏｉｅｓｉｓ）に関連する細胞表現型を示す細胞を使用して、効果を示す化合物を同定し得る。このような細胞としては、以下が挙げられ得る：非組換え単球細胞株（例えば、Ｕ９３７（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１５９３）、ＴＨＰ−１（ＡＴＣＣ番号ＴＩＢ−２０２）、およびＰ３８８Ｄ１（ＡＴＣＣ番号ＴＩＢ−６３））；内皮細胞（例えば、ヒト臍静脈内皮細胞（ＨＵＶＥＣ）、ヒト微小血管内皮細胞（ＨＭＶＥＣ）、およびウシ大動脈内皮細胞（ＢＡＥＣ））；ならびに、一般的な哺乳動物細胞株（例えば、ＨｅＬａ細胞およびＣＯＳ細胞（例えば、ＣＯＳ−７（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１６５１）、血液学に関連する細胞を構成する上記の細胞））。さらに、このような細胞としては、組換えトランスジェニック細胞株が挙げられ得る。例えば、上で議論される、本発明の血液障害の動物モデルを使用して、この障害に対する細胞培養モデルとして使用され得る細胞株（これは、例えば、造血に関与する１種以上の細胞型を含む）を作製し得る。本発明の血液障害モデルのトランスジェニック動物由来の一次培養物が利用され得るが、連続した細胞株の作製が、好ましい。トランスジェニック動物から連続した細胞株を誘導するために使用され得る技術の例については、Ｓｍａｌｌら（１９８５）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ．５：６４２−６４８を参照のこと。
【０２６０】
あるいは、例えば、造血に関与することが知られている細胞型の細胞は、細胞内での９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現の量を増加または減少させ得る配列でトランスフェクトされ得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列は、目的の細胞のゲノムに導入され得、そしてこの目的の細胞のゲノムにおいて過剰発現され得るか、あるいは内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列が存在する場合、これらは、過剰発現され得るか、またはあるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子を過少発現させるかまたはこれらの遺伝子発現を不活化させるために破壊され得るかのいずれかであり得る。
【０２６１】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子を過剰発現させるために、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子のコード部分は、目的の細胞型（例えば、内皮細胞）において遺伝子発現を駆動し得る調節配列に連結され得る。このような調節領域は、当業者に周知であり、そして過度な実験を行うことなく利用され得る。標的遺伝子を発現させるための組換え方法は、上に記載されている。
【０２６２】
内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列の過少発現のために、このような配列は、単離され得、そして目的の細胞型のゲノムに再導入された場合、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の対立遺伝子が不活性化されるように、操作され得る。好ましくは、この操作された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列は、遺伝子ターゲティングを介して導入され、その結果、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列は、操作された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列を、細胞のゲノムに組み込む際に破壊される。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４遺伝子を用いた、宿主細胞のトランスフェクションは、上に記載されている。
【０２６３】
化合物で処置されたかあるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４遺伝子を用いてトランスフェクトされた細胞は、例えば、造血に関連する表現型について試験され得る。
【０２６４】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸のトランスフェクションは、標準的な技術（例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ（１９８９）前出、に記載される）を使用することによって、達成され得る。トランスフェクトされた細胞は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の組換え遺伝子配列の存在について、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡの発現および蓄積について、ならびに９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の組換えタンパク質産物の存在について、評価されるべきである。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現の減少が望ましい例において、標準的な技術を使用して、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現および／あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質産生の低下が達成されるか否かを、実証し得る。
【０２６５】
内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４が、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の発現を正常に制御しない調節配列の制御下にある、細胞または精製されたその調製物（例えば、ヒト細胞）もまた提供される。細胞（例えば、細胞株または微生物）内の内因性遺伝子の発現特徴は、細胞のゲノム中に異種ＤＮＡ調節エレメントを挿入することによって調節され得、その結果、挿入された調節エレメントは、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子に作動可能に連結される。例えば、内因性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５，  ５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子（例えば、「転写性サイレント」である遺伝子、転写性サイレントとは、正常に発現されないか、または非常に低いレベルでのみ発現される）は、その細胞中で、正常に発現された遺伝子産物の発現を促進し得る調節エレメントを挿入することによって活性化され得る。標的化同種組換えのような技術を使用して、例えば、Ｃｈａｐｐｅｌ，米国特許第５，２７２，０７１号；ＷＯ  ９１／０６６６７（１９９１年５月１６日に公開された）に記載されるように、異種ＤＮＡを挿入し得る。
【０２６６】
（ＩＩＩ．予測医学）
本発明はまた、予測医学の分野に関し、ここにおいて、診断アッセイ、予後アッセイ、およびモニタリング臨床試験が、診断（予測）目的のために使用され、それによって個体を予防的に処置する。従って、本発明の１つの局面は、生物学的サンプル（例えば、血液、血清、細胞（例えば、内皮細胞）、または組織（例えば、血管組織））の状況において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質および／または核酸の発現、ならびに９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を決定し、それによって、個体が、血液障害の素因に罹患しているかまたは血液障害を被っているか否かを決定するための診断アッセイに関する。本発明はまた、個体が血液障害を発病する危険性があるか否かを決定するための、診断（または予測）アッセイを提供する。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４遺伝子における変異が、生物学的サンプルにおいてアッセイされ得る。このようなアッセイは、診断目的または予測目的のために使用され得、それによって個体は、血液障害の発症前に、予防的に（ｐｈｏｐｈｙｌａｃｔｉｃａｌｌｙ）処置される。
【０２６７】
本発明の別の局面は、臨床試験における、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性に対する、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーター（例えば、抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のリボザイム）の影響のモニタリングに関する。
【０２６８】
これらの因子および他の因子は、以下の節で、さらに詳細に記載される。
【０２６９】
（Ａ．診断アッセイ）
被験体が疾患に罹患しているか否かを決定するために、生物学的サンプルが被験体から得られ得、そしてこの生物学的サンプルは、この生物学的サンプル中で、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする核酸（例えば、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡ）を検出することができる、化合物または因子と接触され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出するために好ましい因子は、標識核酸プローブであり、このプローブは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡにハイブリダイズし得る。この核酸プローブは、例えば、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸またはそれらの一部（例えば、少なくとも１５ヌクレオチド長、２０ヌクレオチド長、２５ヌクレオチド長、３０ヌクレオチド長、３５ヌクレオチド長、４０ヌクレオチド長、４５ヌクレオチド長、５０ヌクレオチド長、１００ヌクレオチド長、２５０ヌクレオチド長または５００ヌクレオチド長であり、かつストリンジェントな条件下で、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡに特異的にハイブリダイズするに十分であるオリゴヌクレオチド）であり得る。本発明の診断アッセイにおいて使用するのに適切な他のプローブが、本明細書中に記載されている。
【０２７０】
サンプル中で、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を検出するのに好ましい因子は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に結合し得る抗体であり、好ましくは、検出可能な標識を有する抗体である。抗体は、ポリクローナル抗体であり得るかまたは、より好ましくは、モノクローナル抗体であり得る。インタクトな抗体、またはそのフラグメント（例えば、ＦａｂまたはＦ（ａｂ’）２）が、使用され得る。プローブまたは抗体に関して、用語「標識（された）」は、検出可能な物質をそのプローブまたは抗体にカップリング（すなわち、物理的に連結する）し、そして直接的に標識される別の試薬との反応性によってこのプローブまたは抗体を間接的に標識することによる、プローブまたは抗体の直接的な標識を含むことが意図される。間接的な標識の例は、蛍光標識されたストレプトアビジンで検出され得るように、蛍光標識された二次抗体を使用し、そしてビオチンでＤＮＡプローブを末端標識する、一次抗体の検出を含む。
【０２７１】
用語「生物学的サンプル」は、被験体から単離された組織、細胞、および生物学的流体、ならびに被験体内に存在する組織、細胞、および流体を含むことが意図される。すなわち、本発明の検出方法を使用して、インビトロおよびインビボで、生物学的サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡ、タンパク質、またはゲノムＤＮＡを検出し得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、ノーザンハイブリダイゼーションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を検出するためのインビトロ技術としては、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）、ウエスタンブロット、免疫沈降および免疫蛍光検査法が挙げられる。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のゲノムＤＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、サザンハイブリダイゼーションが挙げられる。さらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を検出するためのインビボ技術は、標識された抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体を、被験体に導入することを含む。例えば、抗体は、被験体における存在および位置が、標準的な画像化技術によって検出され得る放射標識マーカーで、標識され得る。
【０２７２】
別の実施形態において、本方法はさらに、以下の工程を包含する：コントロール被験体から、コントロールの生物学的サンプルを得る工程；このコントロールサンプルを、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡを検出することができる化合物または因子と接触させる工程であって、その結果、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在が、生物学的サンプル中で検出される、工程；ならびに、コントロールサンプルにおける９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在を、試験サンプルにおける９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡまたはゲノムＤＮＡの存在と比較する工程。
【０２７３】
（Ｂ．予後アッセイ）
本発明はさらに、異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性に関連する疾患を有するかまたはそのような疾患を発症する危険性のある被験体を同定するための方法に関する。
【０２７４】
本明細書中で使用される場合、用語「異常な」は、野生型の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性から逸脱した、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性を含む。異常な発現または活性は、発現または活性の増加または減少、ならびに野生型の発生的な発現パターンまたは亜細胞の発現パターンに従わない、発現または活性を含む。例えば、異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における変異により、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子が、過少発現または過剰発現される場合、ならびにこのような変異によって、非機能的な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質または野生型様式で機能しないタンパク質（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質と相互作用しないタンパク質、あるいは非９１１８基質、非９９０基質、非１７６６２基質、非８１９８２基質、非６３０基質、非２１４７２基質、非１７６９２基質、非１９２９０基質、非２１６２０基質、非２１６８９基質、非２８８９９基質、非５３６５９基質、非６４５４９基質、非９４６５基質、非２３５４４基質、非７３６６基質、非２７４１７基質、非５７２５９基質、非２１８４４基質、非９４３基質、非２０６１基質、非５８９１基質、非９１３７基質、非１３９０８基質、非１４３１０基質、非１７６００基質、非２５５８４基質、非２７８２４基質、非２８４６９基質、非３８９４７基質、非５３００３基質、非９６５基質、非５６６３９基質、非９６６１基質、非１６０５２基質、非１５２１基質、非６６６２基質、非１３９１３基質、非１２４０５基質または非５０１４基質と相互作用するタンパク質）が生じる状況、を含むことが意図される。
【０２７５】
本明細書中に記載されるアッセイ（例えば、前述の診断アッセイまたは以下のアッセイ）を使用して、疾患を有する被験体または疾患が発症する危険性のある被験体を同定し得る。生物学的サンプルを、被験体より取得し得、そして遺伝的変更の存在または非存在について試験し得る。例えば、このような遺伝的変更は、以下の少なくとも１つの存在を確認することにより検出され得る：１）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子由来の１つ以上のヌクレオチドの検出、２）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子への１つ以上のヌクレオチドの付加、３）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の１つ以上のヌクレオチドの置換、４）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の染色体再構築、５）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物のレベルにおける変更、６）ゲノムＤＮＡのメチル化パターンのような、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の異常な改変、７）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子のメッセンジャーＲＮＡ転写物の非野生型スプライシングパターンの存在、８）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の非野生型レベル、９）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の対立遺伝子喪失、および１０）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の不適切な翻訳後修飾。
【０２７６】
本明細書中で記載されるように、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における遺伝的変更を検出するために使用され得る当該分野において公知の多くのアッセイが存在する。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における遺伝的変更は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（例えば、米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号を参照のこと）（例えば、アンカーＰＣＲまたはＲＡＣＥ  ＰＣＲ）あるいは、ライゲーション連鎖反応（ＬＣＲ）（例えば、Ｌａｎｄｅｇｒａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４１：１０７７−１０８０；およびＮａｋａｚａｗａら（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：３６０−３６４を参照のこと）においてプローブ／プライマーを使用して検出され得、これらのうちの後者は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における点変異を検出するために特に有用であり得る（Ａｂｒａｖａｙａら（１９９５）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２３：６７５−６８２を参照のこと）。この方法は、被験体から生物学的サンプルを収集する工程、このサンプルから核酸（例えば、ゲノムＤＮＡ、ｍＲＮＡまたはこれらの両方）を単離する工程、（存在するならば）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２��０５または５０１４の遺伝子のハイブリダイゼーションおよび増幅が生じるような条件下で、この核酸サンプルを、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子に特異的にハイブリダイズする１つ以上のプライマーと接触させる工程；ならびに増幅産物の存在または非存在を検出するかあるいは増幅産物のサイズを検出しそしてコントロールサンプルと長さを比較する工程を包含する。ＰＣＲおよび／またはＬＣＲが、本明細書中に記載される変異を検出するために使用される任意の技術と組合わせて予備的増幅工程として使用するに望ましくあり得ることは、明白である。
【０２７７】
代替の増幅法としては以下が挙げられる：持続的配列増幅（Ｇｕａｔｅｌｌｉ，Ｊ．Ｃ．ら（１９９０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８７：１８７４−１８７８）、転写増幅系（Ｋｗｏｈ，Ｄ．Ｙ．ら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：１１７３−１１７７）、Ｑ−βレプリカーゼ（Ｌｉｚａｒｄｉ，Ｐ．Ｍ．ら（１９８８）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ６：１１９７）、または他の核酸増幅法のいずれか、その後の当業者に周知の技術を使用する増幅分子の検出。これらの検出スキームは、このような分子が非常に少数で存在する場合に、核酸分子の検出に特に有用である。
【０２７８】
代替の実施形態において、生物学的サンプル由来の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における変異は、制限酵素切断パターンにおける変更によって同定され得る。例えば、サンプルおよびコントロールＤＮＡが、単離され、（必要に応じて）増幅され、１つ以上の制限エンドヌクレアーゼで消化され、そしてフラグメント長サイズが、ゲル電気泳動によって決定され、そして比較される。サンプルとコントロールＤＮＡとの間のフラグメント長サイズの差異は、サンプルＤＮＡ中の変異を示す。さらに、配列特異的リボザイム（例えば、米国特許第５，４９８，５３１号を参照のこと）の使用は、リボザイム切断部位の発生または喪失によって、特異的変異の存在についてスコア付けするために使用され得る。
【０２７９】
他の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４における遺伝的変異は、生物学的サンプル由来の核酸およびコントロール核酸（例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ）を、何百個または何千個のオリゴヌクレオチドプローブを含む高密度アレイにハイブリダイズさせることによって同定され得る（Ｃｒｏｎｉｎ，Ｍ．Ｔ．ら（１９９６）Ｈｕｍａｎ  Ｍｕｔａｔｉｏｎ  ７：２４４−２５５；Ｋｏｚａｌ，Ｍ．Ｊ．ら（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ  ２：７５３−７５９）。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４における遺伝的変異は、Ｃｒｏｎｉｎ，Ｍ．Ｔ．ら（１９９６）（上述）に記載されるような光生成ＤＮＡプローブを含む２次元アレイにおいて同定され得る。簡単には、プローブの第１のハイブリダイゼーションアレイを使用して、連続的で重複するプローブの線状アレイを作製することによって、サンプルおよびコントロールにおけるＤＮＡの長鎖を通して走査して配列間の塩基変化を同定し得る。この工程は、点変異の同定を可能とする。この工程の後、検出される全ての改変体または変異に相補的なより小さな特定化されたプローブアレイを使用することによって、特異的変異の特徴付けを可能にする第２のハイブリダイゼーションアレイが続く。各変異アレイは、パラレルプローブセット、野生型遺伝子に対するある相補体および変異遺伝子に対する他の相補体から構成される。
【０２８０】
なお別の実施形態において、当該分野において公知の種々の配列決定反応のいずれかを使用して、生物学的サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子を直接的に配列決定し得、そして生物学的サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列を、対応する野生型（コントロール）配列と比較することによって変異を検出し得る。配列決定反応の例としては、ＭａｘａｍおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７４：５６０またはＳａｎｇｅｒ（１９７７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７４：５４６３によって開発された技術に基く反応が挙げられる。種々の自動化配列決定手順のいずれかが、質量分析法による配列決定（例えば、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９４／１６１０１；Ｃｏｈｅｎら（１９９６）Ａｄｖ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．３６：１２７−１６２；およびＧｒｉｆｆｉｎら（１９９３）Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３８：１４７−１５９を参照のこと）を含む診断アッセイ（Ｎａｅｖｅ，Ｃ．Ｗ．（１９９５）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １９：４４８−５３）を行う場合に利用され得ることもまた、企図される。
【０２８１】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における変異を検出するための他の方法としては、切断剤からの保護がＲＮＡ／ＲＮＡ異種二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡ異種二重鎖中でミスマッチした塩基を検出するために使用される方法が挙げられる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３０：１２４２）。一般に、「ミスマッチ切断」の分野の技術は、野生型９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４配列を含む（標識された）ＲＮＡまたはＤＮＡを、組織サンプルより得られた潜在的変異ＲＮＡまたはＤＮＡとハイブリダイズさせることによって形成される異種二重鎖を提供することによって開始する。二本鎖二重鎖は、コントロール鎖とサンプル鎖との間の塩基対ミスマッチに起因して存在するような二本鎖の一本鎖領域を切断する因子で処理される。例えば、ミスマッチ領域を酵素的に消化するために、ＲＮＡ／ＤＮＡ二重鎖はＲＮａｓｅで処理され得、ＤＮＡ／ＤＮＡハイブリッドはＳ１ヌクレアーゼで処理され得る。他の実施形態において、ＤＮＡ／ＤＮＡ二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡ二本鎖のいずれかが、ヒドロキシルアミンまたは四酸化オスミウムで処理され、そして、ミスマッチ領域を消化するためにピペリジンで処理される。ミスマッチ領域の消化後、次いで、生じた物質が、変異部位を決定するために変性ポリアクリルアミドゲル上でサイズで分けられる。例えば、Ｃｏｔｔｏｎら（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：４３９７およびＳａｌｅｅｂａら（１９９２）Ｍｅｔｈｏｄｓ
Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：２８６−２９５を参照のこと。好ましい実施形態において、コントロールＤＮＡまたはＲＮＡが、検出のために標識され得る。
【０２８２】
さらに別の実施形態において、ミスマッチ切断反応は、細胞のサンプルより得られた９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｃＤＮＡ中の点変異を検出およびマッピングするために規定された系において二本鎖ＤＮＡ中のミスマッチ塩基対を認識する１つ以上のタンパク質（「ＤＮＡミスマッチ修復」酵素と呼ばれる）を使用する。例えば、Ｅ．ｃｏｌｉのｍｕｔＹ酵素は、Ｇ／ＡミスマッチでＡを切断し、そしてＨｅＬａ細胞由来のチミジンＤＮＡグリコシラーゼは、Ｇ／ＴミスマッチでＴを切断する（Ｈｓｕら（１９９４）Ｃａｒｃｉｎｏｇｅｎｅｓｉｓ  １５：１６５７−１６６２）。例示的実施形態に従って、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列（例えば、野生９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４配列）に基くプローブは、試験細胞からのｃＤＮＡ産物または他のＤＮＡ産物にハイブリダイズされる。二重鎖は、ＤＮＡミスマッチ修復酵素で処理され、そして存在する場合、切断産物は、電気泳動的プロトコルなどから検出され得る。例えば、米国特許第５，４５９，０３９号を参照のこと。
【０２８３】
他の実施形態において、電気泳動的移動度の変更を使用して、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子における変異を同定する。例えば、一本鎖コンフォーメーション多型（ＳＳＣＰ）を使用して、変異体核酸と野生型核酸との間の電気泳動的移動度の差異を検出し得る（Ｏｒｉｔａら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ：８６：２７６６；Ｃｏｔｔｏｎ（１９９３）Ｍｕｔａｔ．Ｒｅｓ．２８５：１２５−１４４およびＨａｙａｓｈｉ（１９９２）Ｇｅｎｅｔ．Ａｎａｌ．Ｔｅｃｈ．Ａｐｐｌ．９：７３−７９もまた参照のこと）。サンプルおよびコントロールの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸の一本鎖ＤＮＡフラグメントは変性され、そして再生される。一本鎖核酸の二次構造は、配列に従って変化し、電気泳動的移動度において生じた変更は、単一の塩基変化の検出さえ可能にする。ＤＮＡフラグメントは、標識されたプローブで標識されても検出されてもよい。このアッセイの感度は、（ＤＮＡではなく）ＲＮＡを用いることにより増強され、ここで二次構造は、配列の変化により感受性である。好ましい実施形態において、目的の方法は、電気泳動的移動度の変化に基いて二本鎖へテロ二重鎖分子を分離するためにヘテロ二重鎖分析を利用する（Ｋｅｅｎら（１９９１）Ｔｒｅｎｄｓ  Ｇｅｎｅｔ  ７：５）。
【０２８４】
なお別の実施形態において、変性剤の勾配を含むポリアクリルアミドゲルにおける変異体または野生型フラグメントの移動は、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）を使用してアッセイされる（Ｍｙｅｒｓら（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ  ３１３：４９５）。ＤＧＧＥが分析の方法として使用される場合、ＤＮＡは、例えば、ＰＣＲによって約４０ｂｐの高融解ＧＣリッチＤＮＡのＧＣクランプを付加することによって、完全には変性しないことを保証するために改変される。さらなる実施形態において、温度勾配は、コントロールＤＮＡおよびサンプルＤＮＡの移動度における差異を同定するために、変性勾配の代わりに使用される（ＲｏｓｅｎｂａｕｍおよびＲｅｉｓｓｎｅｒ（１９８７）Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｃｈｅｍ  ２６５：１２７５３）。
【０２８５】
点変異を検出するための他の技術の例としては、選択的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション、選択的増幅、または選択的プライマー伸張が挙げられるがこれらに限定されない。例えば、オリゴヌクレオチドプライマーが調製され得、ここで、公知の変異が中心的におきかえられ、次いで完全な一致が見出される場合のみハイブリダイゼーションが可能となる条件下で標的ＤＮＡにハイブリダイズされる（Ｓａｉｋｉら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ  ３２４：１６３；Ｓａｉｋｉら（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：６２３０）。このような対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドは、このオリゴヌクレオチドがハイブリダイズする膜に結合され、標識された標的ＤＮＡとハイブリダイズされる場合に、ＰＣＲ増幅した標的ＤＮＡまたは多数の異なる変異にハイブリダイズされる。
【０２８６】
あるいは、選択的ＰＣＲ増幅に依存する対立遺伝子特異的増幅技術は、本発明と組み合わせて使用され得る。特異的増幅のためのプライマーとして使用されるオリゴヌクレオチドは、分子の中心において（その結果、増幅は差次的ハイブリダイゼーションに依存する）（Ｇｉｂｂｓら、（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１７：２４３７−２４４８）、または適切な条件下でミスマッチがポリメラーゼ伸張を防ぐかまたは減少し得る１つのプライマーの最も３’末端にて（Ｐｒｏｓｓｎｅｒ（１９９３）Ｔｉｂｔｅｃｈ  １１：２３８）目的の変異をもたらし得る。さらに、変異の領域に新規な制限部位を導入して、切断に基づく検出をおこすことが望ましくあり得る（Ｇａｓｐａｒｉｎｉら、（１９９２）Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ  ６：１）。特定の実施形態において、増幅はまた、増幅のためのＴａｑリガーゼを使用して行われ得ることが予期される（Ｂａｒａｎｙ（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：１８９）。このような場合において、連結は、増幅の存在または非存在について探索することによって特定の部位での既知の変異の存在を検出することを可能にする５’配列の３’末端にて、完全な一致が存在する場合にのみ生じる。
【０２８７】
さらに、本明細書中に記載される予後アッセイは、疾患を有効に処置するために９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーター（例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核酸、または低分子）を被験体に投与し得るか否かを決定するために使用され得る。
【０２８８】
（Ｃ．臨床試験の間の効果のモニタリング）
本発明はさらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーター（例えば、本明細書中において同定された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーター）の、疾患の処置における有効性を決定するための方法を提供する。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の発現増加、タンパク質レベル増加、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性のアップレギュレートにおける、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターの有効性は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の発現減少、タンパク質レベル減少、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性のダウンレギュレートを示す被験体の臨床試験においてモニタリングされ得る。あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の発現減少、タンパク質レベル減少、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性のダウンレギュレートにおける９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターの有効性は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の発現の増加、タンパク質レベル増加、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性の増加を示す被験体の臨床試験においてモニタリングされ得る。このような臨床試験において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子、および好ましくは、例えば、造血に関与した他の遺伝子の発現または活性が、「読み出し」すなわち特定の細胞の表現型のマーカーとして使用され得る。
【０２８９】
例えば（限定としてではなく）、（例えば、本明細書中に記載されるようなスクリーニングアッセイにおいて同定される）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子での処置によって細胞において調節される、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を含む遺伝子が、同定され得る。従って、血液障害に罹患した被験体に対する９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子の効果を（例えば、臨床試験において）研究するために、細胞が単離され得、そしてＲＮＡが調製され得、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４、および血液障害に関連する他の遺伝子の発現レベルについて分析され得る。遺伝子発現レベル（例えば、遺伝子発現パターン）は、本明細書中に記載されるようなノザンブロット分析またはＲＴ−ＰＣＲによって、あるいは本明細書中に記載される方法の１つによって生成されるタンパク質の量を測定することによって、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４もしくは他の遺伝子の活性レベルを測定することによって、定量され得る。この方法において、遺伝子発現パターンは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子に対する細胞の生理学的応答を示すマーカーとして作用し得る。この応答状態は、個体を９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子で処置する前、およびその間の種々の時点で決定され得る。
【０２９０】
好ましい実施形態において、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子（例えば、アゴニスト、アンタゴニスト、ペプチド模倣物、タンパク質、ペプチド、核酸、または本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定される低分子）での被験体の処置の有効性をモニタリングするための方法を提供し、以下の工程を包含する：（ｉ）この因子の投与前に被験体由来の投与前サンプルを得る工程；（ｉｉ）この投与前サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルを検出する工程；（ｉｉｉ）投与後の被験体由来の１つ以上のサンプルを得る工程；（ｉｖ）これらの投与後のサンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルを検出する工程；（ｖ）投与前サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルを、投与後サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、ｍＲＮＡ、またはゲノムＤＮＡの発現レベルまたは活性レベルと比較する工程；ならびに（ｖｉ）被験体に対するこの因子の投与を適宜変更する工程。例えば、因子の投与増加は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性を、検出された（すなわち、因子の有効性を増加させる）レベルよりも高いレベルに増加することが、好ましくあり得る。あるいは、因子の投与減少は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性を、検出された（すなわち、因子の有効性を減少させる）レベルよりも低いレベルに減少することが、望ましくあり得る。このような実施形態に従って、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現または活性は、観察可能な表現型応答の非存在下ですら、因子の有効性の指標として使用され得る。
【０２９１】
（処置方法）
本発明は、被験体（例えば、疾患の危険性のある（または疾患に罹患している疑いのある）ヒト）を処置する予防法および治療法の両方を提供する。処置の予防法および治療法の両方の観点で、このような処置は、薬理ゲノム学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ）の分野から得られる知識に基づいて、特異的に仕立てられ（ｔａｉｌｏｒｅ）得るかまたは改変され得る。「薬理ゲノム学」は、本明細書中で使用される場合、遺伝子配列決定、統計的遺伝学および遺伝子発現分析のようなゲノム技術の、臨床開発および市場での薬物に対する適用をいう。より詳細には、この用語は、患者の遺伝子がどのように薬物に対する患者の応答（例えば、患者の「薬物応答表現型」または「薬物応答遺伝子型」）を決定するのかについての研究をいう。
【０２９２】
従って、本発明の別の局面は、個々の薬物応答遺伝子型に従って、本発明の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の分子、または、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のモジュレーターのいずれかを用いる被験体の予防処置または治療処置を仕立てるための方法を提供する。薬理ゲノム学によって、臨床医（ｃｌｉｎｉｃｉａｎ）または内科医（ｐｈｙｓｉｃｉａｎ）は、この処置から最も利益を得る患者に対して予防処置または治療処置を標的化することが可能になり、そして毒性薬物関連副作用を被る患者の処置を避けることが可能になる。
【０２９３】
（Ａ．予防方法）
一局面において、本発明は９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する薬剤を患者に投与することによって、患者における疾患を防ぐ方法を提供する。血液障害に対する危険性のある患者は、例えば、本明細書中に記載の任意の診断的または予後的なアッセイまたはそれらの組み合わせによって同定され得る。予防薬の投与は、異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現あるいは異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性の特徴的症状の発生に先立って生じ得、これのよって疾患が予防されるか、あるいは、その進行が遅延される。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の異常の型に依存して、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアゴニストあるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアンタゴニスト薬剤が、患者の処置に関して使用され得る。適切な薬剤は、本明細書中に記載のスクリーニングアッセイに基づいて決定され得る。
【０２９４】
（Ｂ．治療的方法）
本明細書中に記載したのは、血液障害を回復し得る方法および組成物である。特定の血液障害は、少なくとも部分的に遺伝子産物の過度のレベルによって、あるいは異常または過剰な活性を示す遺伝子産物の存在によってもたらされる。このように、このような遺伝子産物のレベルおよび／または活性の減少は、血液障害の回復をもたらす。遺伝子発現のレベルまたはタンパク質の活性の減少に関する技術は、以下に議論される。
【０２９５】
あるいは、特定の他の血液障害は、少なくとも一部、遺伝子発現のレベルの欠損または減少、あるいはタンパク質の活性のレベルの減少によってもたらされる。このように、遺伝子の発現および／またはこのようなタンパク質の活性のレベルの増加は、血液障害の回復をもたらす。
【０２９６】
いくつかの場合において、疾患状態における遺伝子のアップレギュレーションは、疾患状態に対しての応答において、その遺伝子産物に対する保護的な役割を反映する。このような遺伝子発現または遺伝子産物の活性の促進は、それが影響する保護的な効果を強固にする。いくつかの血液障害の状態は、このような保護的遺伝子の活性の異常に低いレベルに起因し得る。これらの場合において、また、遺伝発現のレベルおよび／またはこのような遺伝子産物の活性の増加は、血液障害の回復をもたらす。標的遺伝子発現レベルまたは標的遺伝子産物活性レベルを増加させるための技術は本明細書中に議論される。
【０２９７】
従って、本発明の別の局面は、処置目的のために、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の活性を調節する方法に関係する。従って、例示的な実施例において、本発明の調節方法は、細胞と９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４との接触、あるいは、その細胞（例えば、内皮細胞または卵巣細胞）に関連した、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質活性の１つ以上の活性を調節する試薬との接触を含む。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質活性を調節する試薬は、本明細書で記載されるように、例えば、核酸またはタンパク質、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の天然に存在する標的分子（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のリガンドまたは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の基質）、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の抗体、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のアゴニスト、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のアンタゴニスト、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のアゴニストのペプチド模放物、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアンタゴニストのペプチド模放物、あるいは他の低分子のような試薬であり得る。１つの実施形態において、試薬は、１つ以上の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を刺激する。そのような刺激試薬の例としては、活性化された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質および細胞に導入される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４をコードする核酸分子が挙げられる。別の実施形態において、試薬は１つ以上の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を阻害する。そのような阻害剤の例としては、アンチセンス９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４核酸分子、抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体、および９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のインヒビターが挙げられる。これらの調節方法は、インビトロで（例えば、試薬と一緒の細胞培養によって）、あるいは、インビボで（例えば、試薬を被験体に投与することによって）行われ得る
。このように、本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４タンパク質、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４核酸分子の異常なまたは望まない発現または活性によって特徴付けられた疾患または障害に罹患した個体の処置方法を提供する。１つの実施形態において、この方法は、試薬（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイによって同定された試薬）、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の活性を調節する（例えば、アップレギュレートするかまたはダウンレギュレートする）試薬の組合せの投与を包含する。別の実施形態において、この方法は、減少した、異常な、または望まない９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の活性を補うための処置として、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の核酸分子の投与を包含する。
【０２９８】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性の刺激は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４が、異常にダウンレギュレートするおよび／または増加した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性が、有用な効果を有するようである状況において所望である。同様に、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性の阻害は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４が、異常にアップレギュレートされるおよび／または減少した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性が、有用な効果を有するようである状況において所望である。
【０２９９】
（標的遺伝子の発現、合成、または活性を阻害する方法）
上記で述べたように、循環器疾患に関係する遺伝子は、遺伝子活性の増加レベルを介して、このような異常を引き起こし得る。いくつかのケースでは、そのようなアップレギュレーションは、疾患状態における原因効果または増悪効果を有し得る。種々の技術が、そのような遺伝子および／またはタンパク質の発現、合成、または活性を阻害するために使用され得る。
【０３００】
例えば、阻害活性を示す化合物（例えば、上記に記載したアッセイで同定された化合物）は、血液疾患の少なくとも１つの徴候に対して、本発明に従って使用され得る。このような分子としては、有機低分子、ペプチド、抗体などが挙げられるが、それらに制限されない。
【０３０１】
例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に対する内因性リガンドと競合する化合物が投与され得る。リガンドに結合した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の得られた量の減少は、内皮細胞の生理学を調節する。この目的で特に有用であり得る化合物としては、例えば、可溶性タンパク質またはペプチド（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の１つ以上の細胞外ドメイン、または部分および／またはそのアナログを含むペプチド（例えば、Ｉｇ標識融合タンパク質のような可溶性融合タンパク質が挙げられる））が挙げられる。（Ｉｇ標識融合タンパク質の産生の議論については、例えば、米国特許第５，１１６，９６４号を参照のこと）。あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のレセプター部位と結合するが、タンパク質を活性化しない（例えば、レセプター−リガンドアンタゴニスト）化合物は（例えば、リガンドアナログまたは抗体）、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質活性の阻害において効果的であり得る。
【０３０２】
さらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の発現を阻害するアンチセンス分子およびリボザイム分子はまた、異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子活性を阻害するために、本発明に従って使用され得る。なおさらに、三重らせん分子が、異常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子活性を阻害するために使用され得る。
【０３０３】
本発明の方法で使用されるアンチセンス核酸分子は、被験体に代表的に投与されるかインサイチュで生成され、その結果、それらの分子は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする細胞性ｍＲＮＡおよび／またはゲノムＤＮＡとハイブリダイズするか結合し、それによって（例えば、転写および／または翻訳を阻害することによって）、タンパク質の発現を阻害する。ハイブリダイゼーションは、安定な二本鎖を形成するための従来のヌクレオチド相補性によって、または、例えば、ＤＮＡ二本鎖に結合するアンチセンス核酸分子の場合には、二重らせんの主要な溝における特異的な相互作用を介して、行われ得る。本発明のアンチセンス核酸分子の投与経路の例は、組織部位における直接注射を包含する。あるいは、アンチセンス核酸分子は、選択された細胞を標的にするために修飾され得、次に全身に投与され得る。例えば、全身投与では、アンチセンス分子が修飾され得、その結果、その分子は、例えば、アンチセンス核酸分子を、細胞表面レセプターまたは細胞表面抗原と結合するペプチドまたは抗体を結合することによって、選択された細胞表面に発現するレセプターまたは抗原と、特異的に結合する。アンチセンス核酸分子はまた、本明細書中で記載されるベクターを用いて、細胞に送達され得る。アンチセンス分子の十分な細胞内濃度を達成するために、アンチセンス核酸分子が、強力なｐｏｌ  ＩＩプロモーターまたは強力なｐｏｌ  ＩＩＩプロモーターの制御下に置かれるベクター構築物が好ましい。
【０３０４】
さらなる別の実施形態において、本発明の方法で使用されるアンチセンス核酸分子は、α−アノマー核酸分子である。α−アノマー核酸分子は、相補的ＲＮＡと特異的な二重鎖ハイブリッドを形成し、ここで、通常のβ−ユニットとは対照的に、これらの鎖は、互いに平行に並ぶ（Ｇａｕｌｔｉｅｒら（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．１５：６６２５〜６６４１）。アンチセンス核酸分子はまた、２’−Ｏ−メチルリボヌクレオチドを含み得る（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１５：６１３１〜６１４８）またはキメラＲＮＡ−ＤＮＡアナログ（Ｉｎｏｕｅら（１９８７）ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．２１５：３２７〜３３０）。
【０３０５】
さらに別の実施形態において、本発明の方法で使用されるアンチセンス核酸は、リボザイムである。リボザイムは、それらが相補的領域を有する一本鎖核酸（例えば、ｍＲＮＡ）を切断することができるリボヌクレアーゼ活性を有する触媒ＲＮＡ分子である。このように、リボザイム（例えば、ハンマーヘッドリボザイム（ＨａｓｅｌｈｏｆｆおよびＧｅｒｌａｃｈ（１９８８）Ｎａｔｕｒｅ  ３３４：５８５〜５９１に記載される））は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡ転写産物を触媒的に切断するために使用され得、それによって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡの翻訳を阻害する。５７７をコードする核酸、２０７３９をコードする核酸、または５７１４５をコードする核酸に特異性を有するリボザイムは、本明細書中で開示する９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｃＤＮＡのヌクレオチド配列（すなわち、配列番号１、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７または配列番号７９）に基づいて設計され得る。例えば、Ｔｅｔｒａｈｙｍｅｎａ  Ｌ−１９  ＩＶＳ  ＲＮＡ誘導体が構築され得、ここで、活性部位のヌクレオチド配列は、５７７をコードするｍＲＮＡ、２０７３９をコードす���ｍＲＮＡまたは５７１４５をコードするｍＲＮＡにおいて切断されるヌクレオチド配列に相補的である（例えば、Ｃｅｃｈら、米国特許第４，９８７，０７１号；およびＣｅｃｈら、米国特許第５，１１６，７４２号を参照のこと）。あるいは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡは、ＲＮＡ分子プールから特異的リボヌクレアーゼ活性を有する触媒ＲＮＡを選択するために使用され得る（例えば、Ｂａｒｔｅｌ，ＤおよびＳｚｏｓｔａｋ，Ｊ．Ｗ．（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６１：１４１１〜１４１８を参照のこと）。
【０３０６】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現はまた、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の制御領域と相補的なヌクレオチド配列（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のプロモーターおよび／またはエンハンサー）を標的することによって阻害され得、標的細胞中で９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子の転写を防ぐ三重らせん構造を形成する（例えば、Ｈｅｌｅｎｅ，Ｃ（１９９１）Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｓ．６（６）：５６９〜８４；Ｈｅｌｅｎｅ，Ｃら（１９９２）Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６６０：２７〜３６；およびＭａｈｅｒ，Ｌ．Ｊ．（１９９２）Ｂｉｏａｓｓａｙｓ  １４（１２）：８０７〜１５を参照のこと）。
【０３０７】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に特異的であり、その活性を妨害する抗体はまた、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質機能を調節するかまたは阻害するために使用され得る。そのような抗体は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質自体に対して、あるいはそのタンパク質の部分に対応するペプチドに対して、本明細書中に記載される標準的技術を用いて生成され得る。そのような抗体としては、ポリクローナル、モノクローナル、Ｆａｂフラグメント、単鎖抗体、またはキメラ抗体が挙げられるが、それらに制限されない。
【０３０８】
標的遺伝子タンパク質が細胞内であり、そして全抗体が使用される場合において、内在化抗体が好ましくあり得る。リポフェクチンリポソームが、抗体または標的エピトープに結合させるＦａｂ領域のフラグメントを細胞内に送達するために使用され得る。抗体のフラグメントが使用される場合、標的タンパク質の結合ドメインと結合する最小の阻害フラグメントが好ましい。例えば、標的遺伝子タンパク質に結合する抗体の可変領域のドメインに対応するアミノ酸配列を有するペプチドが使用され得る。そのようなペプチドは、化学合成され得るかまたは当該分野において周知の方法を用いる組み換えＤＮＡ技術を介して産生され得る（例えば、Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ（１９８３）、前出；およびＳａｍｂｒｏｏｋら（１９８９）前出に記載されている）。細胞内標的遺伝子エピトープと結合する単鎖中和抗体がまた、投与され得る。そのような単鎖抗体は、例えば、Ｍａｒａｓｃｏら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ９０：７８８９〜７８９３）に記載されるような技術を用いて、例えば、標的細胞集団内の単鎖抗体をコードするヌクレオチド配列を発現することによって投与され得る。
【０３０９】
いくつかの例では、標的遺伝子タンパク質は、細胞外であるか、あるいは、膜貫通タンパク質（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質）である。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の１つ以上の細胞外ドメインに特異的であり、そしてその活性を妨害する抗体は、血液疾患または血液障害の治療に特に有益である。そのような抗体は、その抗体が血流から標的ドメインに直接アクセスできるので、特に有用である。ペプチド投与に適切な下記に記載ある任意の投与技術は、阻害的標的遺伝子抗体を、それらの作用部位に効果的に投与するために使用され得る。
【０３１０】
（（ｉｉ）標的遺伝子活性を再生または増大させる方法）
血液障害を生じる遺伝子は、疾患状況内で過小発現され得る。あるいは、このような遺伝子のタンパク質産物の活性は、低下され得、血液障害の発症を導く。このような遺伝子発現のダウンレギュレートまたはタンパク質活性の低下は、疾患状態に対する原因的影響または悪化させる影響を有し得る。
【０３１１】
いくつかの場合、疾患状態においてアップレギュレートされる遺伝子は、予防効果を発揮し得る。種々の技術が、血液障害状態に対する予防効果を発揮する、遺伝子および／またはタンパク質の発現、合成、または活性を増大させるために用いられ得る。
【０３１２】
この節に記載されるものは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性のレベルを血液障害が改善されるレベルまで、増大させ得る方法である。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性のレベルは、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子発現のレベルを増加させるか、あるいは存在する活性な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のレベルを増加させることのいずれかによって、増加され得る。
【０３１３】
例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質は、血液障害の少なくとも１つの症状に対して十分なレベルで、このような症状を示す患者に投与され得る。以下で議論される技術のいずれかが、このような投与のために用いられ得る。当業者は、以下に記載されるような技術を利用して、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の有効な、非毒性用量の濃度を決定する方法を容易に知る。
【０３１４】
さらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードするＲＮＡ配列は、血液障害を示す患者に、血液障害が改善されるような９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のレベルを生じるのに十分な濃度で、直接投与され得る。化合物の細胞内投与を達成する、以下に議論される技術（例えば、リポソーム投与）のいずれかは、このようなＲＮＡ分子の投与のために用いられ得る。ＲＮＡ分子は、例えば、本明細書中に記載されるような組換え技術により作製され得る。
【０３１５】
さらに、被験体は、遺伝子置換治療により処置され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の機能を有する、正常な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の産生を指向する、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子、あるいはその一部の１以上のコピーは、ＤＮＡを細胞へと導入する他の粒子（例えば、リポソーム）に加えて、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、およびレトロウイルスベクターを含むが、これらに限定されない、ベクターを用いて細胞へと挿入され得る。さらに、上記のような技術は、ヒト細胞への、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子配列の導入のために用いられ得る。
【０３１６】
次いで、細胞、好ましくは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４発現遺伝子配列を含む自系の細胞は、血液障害の改善を可能にする位置で被験体へと導入または再導入され得る。このような細胞置換技術は、例えば、遺伝子産物が、分泌された、細胞外遺伝子産物である場合、好ましくあり得る。
【０３１７】
（Ｃ．薬学的組成物）
本発明の別の局面は、疾患に罹患した被験体を処置するための方法に関する。これらの方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現または活性を調節する因子（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイにより同定される因子）、またはこのような因子の組み合わせを、被験体に投与することを包含する。別の実施形態では、この方法は、低下した、異常な、または望ましくない、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の発現または活性を補償するための治療として、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質または核酸分子を、被験体に投与することを包含する。
【０３１８】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性の刺激は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４が異常にダウンレギュレートされる、そして／あるいは上昇した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性が、有益な効果を有すると考えられる状況において望ましい。同様に、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性の阻害は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４が、異常にアップレギュレートされる、そして／あるいは減少した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性が、有益な効果を有すると考えられる状況において望ましい。
【０３１９】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子は、このような投与に適切な薬学的組成物を用いて、被験体に投与され得る。このような組成物は、代表的には、因子（例えば、核酸分子、タンパク質、または抗体）および薬学的に受容可能なキャリアを含む。本明細書中で使用される場合、語「薬学的に受容可能なキャリア」は、薬学的投与に適合性の、任意および全ての溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌性および抗真菌性の薬剤、等張剤および吸収遅延剤などを含むことが意図される。このような媒体および薬剤の、薬学的に活性な物質のための使用は、当該分野で周知である。この活性な化合物と非適合性である任意の従来の媒体または薬剤の範囲を除いて、組成物におけるそれらの使用が企図される。補助的な活性化合物もまた、この組成物に組み込まれ得る。
【０３２０】
本発明の治療方法において使用される薬学的組成物は、その意図される投与経路と適合性となるように処方される。投与経路の例としては、非経口的（例えば、静脈内、皮内、皮下）、経口（例えば、吸入）、経皮（局所的）、経粘膜、および直腸投与が挙げられる。非経口、皮内、または皮下適用のために使用される溶液または懸濁液は、以下の成分を含み得る：滅菌希釈剤（例えば、注射のための水、生理食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコールまたは他の合成溶媒）；抗菌剤（例えば、ベンジルアルコールまたはメチルパラベン）；抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸または亜硫酸水素ナトリウム）；キレート試薬（例えば、エチレンジアミン四酢酸）；緩衝液（例えば、酢酸塩、クエン酸塩、またはリン酸塩）、および張性を調整するための薬剤（例えば、塩化ナトリウムまたはブドウ糖）。ｐＨは、酸または塩基（例えば、塩酸または水酸化ナトリウム）を用いて調整され得る。非経口的調製物は、ガラスまたはプラスチックから作製されるアンプル、使い捨てシリンジ、または複数用量のバイアルに封入され得る。
【０３２１】
注入用途のために適切な薬学的組成物としては、滅菌水溶液（水溶性の場合）または分散体、および滅菌注射可能な溶液または分散体の即席調製のための滅菌粉末が挙げられる。静脈内投与のために適切なキャリアとしては、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ  ＥＬＴＭ（ＢＡＳＦ，Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ，ＮＪ）またはリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。全ての場合において、この組成物は、無菌でなければならず、そして容易な注入性（ｓｙｒｉｎｇａｂｉｌｉｔｙ）が存在する程度に流動性であるべきである。この組成物は、製造および貯蔵の条件下で安定でなければならず、そして細菌および真菌のような微生物の混入作用に対して保護されなければならない。このキャリアは、例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど）、ならびにこれらの適切な混合物を含む溶媒または分散媒体であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンのようなコーティングの使用によって、分散体の場合において要求される粒子サイズを維持することによって、および界面活性剤の使用によって、維持され得る。微生物の作用の予防は、種々の抗菌剤および抗真菌剤（例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、アスコルビン酸、チメロサールなど）によって達成され得る。多くの場合、組成物中に等張剤（例えば、糖類、マンニトール、ソルビトールのようなポリアルコール、塩化ナトリウム）を含むことが好ましい。注入可能組成物の長期の吸収は、この組成物中に吸収を遅延する薬剤（例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチン）を含むことによってもたらされ得る。
【０３２２】
滅菌の注入可能な溶液は、上記に列挙された成分のうちの１つまたは組み合わせと共に、必要とされる量の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する因子（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質のフラグメントまたは抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体）を適切な溶媒に取り込み、続いて、必要に応じて濾過滅菌することによって調製され得る。一般に、分散体は、基礎分散媒体および上記に列挙される成分のうちの必要とされる他の成分を含む滅菌ビヒクルに、この活性化合物を取り込むことによって調製される。滅菌の注入可能な溶液の調製のための滅菌粉末の場合、好ましい調製方法は、活性成分の粉末および以前に滅菌濾過されたその溶液からの任意のさらなる所望の成分を得る、真空乾燥および凍結乾燥である。
【０３２３】
経口組成物は、一般に、不活性希釈剤または食用キャリアを含む。これらは、ゼラチンカプセルに封入され得るか、または錠剤に加圧され得る。経口治療投与の目的で、この活性化合物は、賦形剤と共に組み込まれ、そして錠剤、トローチ、またはカプセルの形態で使用される。経口組成物はまた、うがい薬としての使用のための流体キャリアを使用して調製され得、ここで、流体キャリア中の化合物は、経口的に適用され、そしてスウィッシュ（ｓｗｉｓｈ）され、そして吐き出されるかまたは飲み込まれる。薬学的に適合性の結合剤、および／またはアジュバント材料が、この組成物の一部として含まれ得る。錠剤、丸剤、カプセル剤、トローチ剤などが、以下の成分のいずれかまたは同様の性質を有する化合物を含み得る：結合剤（例えば、微結晶セルロース、ガムトラガントまたはゼラチン）；賦形剤（例えば、デンプンまたはラクトース）、崩壊剤（例えば、アルギン酸、Ｐｒｉｍｏｇｅｌ、またはコーンスターチ）；滑沢剤（例えば、ステアリン酸マグネシウムまたはＳｔｅｒｏｔｅｓ）；グライダント（ｇｌｉｄａｎｔ）（例えば、コロイド状二酸化ケイ素）；甘味剤（例えば、スクロースまたはサッカリン）；あるいは矯味矯臭剤（例えば、ペパーミント、サリチル酸メチル、またはオレンジフレーバー）。
【０３２４】
吸入による投与について、この化合物は、適切な噴霧剤（例えば、二酸化炭素のような気体）を含む圧縮容器またはディスペンサー、あるいは噴霧器から、エアロゾルスプレーの形態で送達される。
【０３２５】
全身的投与はまた、経粘膜手段または経皮手段により得る。経粘膜投与または経皮投与について、浸透されるバリアに対して適切な浸透剤が、処方物中で使用される。このような浸透剤は、一般的に、当該分野で公知であり、そして、例えば、経粘膜投与については、界面活性剤、胆汁酸塩、およびフシジン酸誘導体が挙げられる。経粘膜投与は、鼻スプレーまたは坐剤の使用によって達成され得る。経皮投与については、この活性化合物は、当該分野で一般的に公知である軟膏剤、軟膏、ゲル、またはクリーム剤へ処方される。
【０３２６】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する薬剤はまた、直腸送達のための坐剤（例えば、ココアバターおよび他のグリセリドのような従来の坐剤ベースと共に）または保持浣腸の形態で調製され得る。
【０３２７】
１つの実施形態において、この９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する薬剤は、身体からの迅速な排出に対してこの化合物を保護するキャリアを用いて調製され（例えば、制御放出処方物）、これには、移植片およびマイクロカプセル化された送達系が挙げられる。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸のような、生分解性、生体適合性ポリマーが使用され得る。このような処方物の調製のための方法は、当業者には明らかである。これらの材料はまた、Ａｌｚａ  ＣｏｒｐｏｒａｔｉｏｎおよびＮｏｖａ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．から商業的に入手可能である。リポソーム懸濁液（ウイルス抗原に対するモノクローナル抗体を用いて、感染させた細胞へ標的化されるリポソームを含む）がまた、薬学的に受容可能なキャリアとして使用され得る。これらは、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号に記載されるような、当業者に公知の方法に従って調製され得る。
【０３２８】
投与の容易さおよび投薬量の均一性のために、投薬単位形態で、経口組成物または非経口組成物を処方することが、特に有益である。本明細書で使用される場合、投薬単位形態は、処置される被験体のための単位投薬量として適切な、物理的に個々の単位をいい；各単位は、必要とされる薬学的キャリアと関連して、所望の治療的効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含む。本発明の投薬単位形態についての詳細は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する薬剤の固有の特性、および達成される特定の治療効果、ならびに被験体の処置のためのこのような薬剤を調合する当該分野に固有の制限によって影響を受け、これらに直接依存する。
【０３２９】
そのような薬剤の毒性および治療効力は、例えば、ＬＤ５０（集団の５０％に対して致死性である用量）およびＥＤ５０（集団のうちの５０％において治療上有効な用量）を決定するための、細胞培養物または実験動物における標準的薬学的手順によって決定され得る。毒性効果と治療効果との間の用量比は、治療指数であり、そしてそれは、比ＬＤ５０／ＥＤ５０として表され得る。大きな治療指数を示す薬剤が、好ましい。毒性副作用を示す薬剤が使用され得るが、非感染細胞に対して生じ得る損傷を最小にして副作用を低減するために、罹患した組織部位にそのような薬剤を標的化する送達システムを設計するために注意が払われるべきである。
【０３３０】
細胞培養アッセイおよび動物実験から得られるデータは、ヒトにおける使用のために一定範囲の投与量を処方する際に使用され得る。そのような９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４調節剤の投薬量は、好ましくは、毒性をほとんど伴わないかまたは全く伴わない、ＥＤ５０を含む一定範囲の循環濃度内に入る。その投薬量は、使用される投薬形態および利用される投与経路に依存して、この範囲内で変動し得る。本発明の治療方法において使用されるどの薬剤についても、治療上有効な用量は、細胞培養アッセイからまず推定され得る。細胞培養において決定されるようなＩＣ５０（すなわち、症状の最大阻害半分を達成する試験化合物濃度）を含む循環血漿濃度範囲を達成するための用量が、動物モデルにおいて処方され得る。そのような情報は、ヒトにおいて有用な用量をより正確に決定するために、使用され得る。血漿中のレベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーによって測定され得る。
【０３３１】
本明細書中で規定される場合、タンパク質またはポリペプチドの治療上有効な量（すなわち、有効投薬量）は、約０．００１〜３０ｍｇ／ｋｇ体重、好ましくは、約０．０１〜２５ｍｇ／ｋｇ体重、より好ましくは、約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重、およびなおより好ましくは、約１〜１０ｍｇ／ｋｇ体重、２〜９ｍｇ／ｋｇ体重、３〜８ｍｇ／ｋｇ体重、４〜７ｍｇ／ｋｇ体重、または５〜６ｍｇ／ｋｇ体重の範囲である。特定の要因が、被験体を有効に処置するために必要な投薬量に影響し得ることを当業者は認識し、そのような要因としては、疾患もしくは障害の重篤度、以前の処置、被験体の全身の健康および／または年齢、ならびに存在する他の疾患が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、治療上有効な量のタンパク質、ポリペプチド、または抗体を用いる被験体の処置は、単回処置を包含し得るか、または好ましくは、一連の処置を包含し得る。
【０３３２】
好ましい例において、被験体は、約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重の間の範囲にある抗体、タンパク質、またはポリペプチドを用いて、１週間に１回、約１〜１０週間の間、好ましくは２〜８週間の間、より好ましくは約３〜７週間の間、そしてなおより好ましくは約４週間、５週間、または６週間の間、処置される。処置に使用される抗体、タンパク質、またはポリペプチドの有効投薬量は、特定の処置経過にわたって増加または減少し得ることもまた、認識される。投薬量の変化は、本明細書中に記載される診断アッセイの結果から生じ得、そしてその結果から明らかになり得る。
【０３３３】
本発明は、発現または活性を調節する薬剤を包含する。薬剤は、例えば、低分子であり得る。例えば、そのような低分子としては、ペプチド、ペプチド模倣物、アミノ酸、アミノ酸アナログ、ポリヌクレオチド、ポリヌクレオチドアナログ、ヌクレオチド、ヌクレオチドアナログ、約１０，０００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物（すなわち、ヘテロ有機化合物および有機金属化合物を含む）、約５，０００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物、約１，０００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物、約５００グラム／モル未満の分子量を有する有機化合物もしくは無機化合物、ならびにそのような化合物の塩、エステル、および他の薬学的に受容可能な形態が挙げられるが、これらに限定されない。低分子薬剤の適切な用量は、当業者である医師、獣医師、または研究者の知識内にある多数の要因に依存することが理解される。この低分子の用量は、例えば、処置される被験体またはサンプルの身元、サイズおよび状態に依存して変化し、さらに、該当する場合は、その組成物が投与される経路、ならびに本発明の核酸もしくはポリペプチドに対してその低分子が有することを実施者が望む効果に依存して変化する。
【０３３４】
例示的な用量としては、被験体またはサンプルの重量１ｋｇあたり、ミリグラム量またはマイクログラム量の低分子（例えば、約１μｇ／ｋｇ〜約５００ｍｇ／ｋｇ、約１００μｇ／ｋｇ〜約５ｍｇ／ｋｇ、または約１μｇ／ｋｇ〜約５０μｇ／ｋｇ）が挙げられる。低分子の適切な用量は、調節されるべき発現または活性に関するその低分子の能力に依存することが、さらに理解される。そのような適切な用量は、本明細書中に記載されるアッセイを使用して決定され得る。これらの低分子のうちの１つ以上が、本発明のポリペプチドまたは核酸の発現もしくは活性を調節するために動物（例えば、ヒト）に投与される場合、医師、獣医師、または研究者は、例えば、最初に比較的低用量を処方し、その後、適切な応答が得られるまでその用量を増加させ得る。さらに、特定の任意の動物被験体についての特定の用量レベルは、種々の要因（使用される特定の化合物の活性、被験体の年齢、被験体の体重、被験体の全身の健康、被験体の性別、および被験体の食餌、投与時期、投与経路、排出速度、任意の薬物組み合わせ、ならびに調節されるべき発現または活性の程度を含む）に依存することが、理解される。
【０３３５】
さらに、抗体（またはそのフラグメント）は、治療部分（例えば、細胞毒）、治療剤、または放射性金属イオンに結合体化され得る。細胞毒または細胞傷害性薬剤は、細胞に対して有害な任意の薬剤を包む。例としては、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロパロノール、およびピューロマイシン、ならびにそれらのアナログまたはホモログが挙げられる。治療剤としては、代謝拮抗物質（例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルダカルバジン（ｄｅｃａｒｂａｚｉｎｅ））、アルキル化剤（例えば、メクロレタミン、チオエパクロラムブシル、メルファラン、カルムスチン（ＢＳＮＵ）、およびロムスチン（ＣＣＮＵ）、シクロホスファミド（ｃｙｃｌｏｔｈｏｓｐｈａｍｉｄｅ）、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣ、およびｃｉｓ−ジクロロジアミン白金（ＩＩ）（ＤＤＰ）シスプラチン）、アントラサイクリン（例えば、ダウノルビシン（前名ダウノマイシン）およびドキソルビシン）、抗生物質（例えば、ダクチノマイシン（前名アクチノマイシン）、ブレオマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン（ＡＭＣ））、ならびに抗有糸分裂薬（例えば、ビンクリスチンおよびビンブラスチン）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０３３６】
本発明の結合体は、所定の生物学的応答を改変するために使用され得、その薬物部分は、古典的な化学的治療剤に限定するように解釈されるべきではない。例えば、その薬物部分は、所望の生物学的活性を保有するタンパク質またはポリペプチドであり得る。そのようなタンパク質としては、例えば、トキシン（例えば、アブリン、リシンＡ、シュードモナス外毒素、またはジフテリアトキシン）；タンパク質（例えば、腫瘍壊死因子、α−インターフェロン、β−インターフェロン、神経成長因子、血小板由来増殖因子、組織プラスミノゲン活性化因子）；または生物学的応答改変因子（例えば、リンホカイン、インターロイキン−１（「ＩＬ−１」）、インターロイキン−２（「ＩＬ−２」）、インターロイキン−６（「ＩＬ−６」）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（「ＧＭ−ＣＳＦ」）、顆粒球コロニー刺激因子（「Ｇ−ＣＳＦ」）、あるいは他の増殖因子が挙げられ得る。
【０３３７】
そのような治療部分を抗体に結合体化するための技術は、周知である。例えば、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｒｅｉｓｆｅｌｄら編（Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，１９８５）、ｐｐ．２４３〜５６のＡｒｎｏｎら、「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ  Ｏｆ  Ｄｒｕｇｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ」；Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ（第２版）、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら編（Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，１９８７）ｐｐ．６２３〜５３のＨｅｌｌｓｔｒｏｍら「Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ」；Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｐｉｎｃｈｅｒａら編，ｐｐ．４７５〜５０６（１９８５）のＴｈｏｒｐｅ，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｃａｒｒｉｅｒｓ  Ｏｆ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ａｇｅｎｔｓ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ：Ａ  Ｒｅｖｉｅｗ」；Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ｆｏｒ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｔｈｅｒａｐｙ，Ｂａｌｄｗｉｎら編（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９８５）ｐｐ．３０３〜１６の「Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｓｕｌｔｓ，Ａｎｄ  Ｆｕｔｕｒｅ  Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ  Ｏｆ  Ｔｈｅ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ  Ｕｓｅ  Ｏｆ  Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ」；ならびにＴｈｏｒｐｅら「Ｔｈｅ  Ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ  Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ  Ｏｆ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ−Ｔｏｘｉｎ  Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ」Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．６２：１１９〜５８（１９８２）を参照のこと。あるいは、抗体は、Ｓｅｇａｌによって米国特許第４，６７６，９８０号中に記載されるように、抗体へテロ結合体を形成するために二次抗体と結合され得る。
【０３３８】
本発明の方法において使用される核酸分子は、ベクター中に挿入され得、そして遺伝子治療ベクターとして使用され得る。遺伝子治療ベクターは、例えば、静脈内注射、局所投与（米国特許第５，３２８，４７０号を参照のこと）または定位注射（例えば、Ｃｈｅｎら、（１９９４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９１：３０５４〜３０５７を参照のこと）によって、被験体に送達され得る。その遺伝子治療ベクターの薬学的調製物は、受容可能な希釈剤中に遺伝子治療ベクターを含み得るか、または遺伝子送達ビヒクルが組み込まれた徐放マトリクスを含み得る。あるいは、完全な遺伝子送達ベクター（例えば、レトロウイルスベクター）が組換え細胞からインタクトで産生され得る場合、その薬学的調製物は、遺伝子送達系を産生する１つ以上の細胞を含み得る。
【０３３９】
（Ｄ．薬理ゲノム学（ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ））
本発明の治療法と組み合わせて、薬理ゲノム学（すなわち、被験体の遺伝子型と、外来化合物または外来薬物に対するその被験体の応答との間の関連性の研究）が、考慮され得る。治療剤の代謝における差異は、薬理学的に活性な薬物の用量と血液濃度との間の関係を変更することによって、重篤な毒性または治療の失敗をもたらし得る。従って、医師または臨床医は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する薬剤を投与するか否か、ならびに９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を調節する薬剤を用いる処置の投薬量および／もしくは治療レジメンを調整するか否かを決定する際に、適切な薬理ゲノム学研究において得られる知識を適用することを考慮し得る。
【０３４０】
薬理ゲノム学は、罹患した個人における変化した薬物の性質および異常な作用に起因する、薬物に対する応答における臨床学的に有意な遺伝的変動を取り扱う。例えば、Ｅｉｃｈｅｌｂａｕｍ，Ｍ．ら、（１９９６）Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．２３（１０〜１１）：９８３〜９８５およびＬｉｎｄｅｒ，Ｍ．Ｗ．ら、（１９９７）Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．４３（２）：２５４〜２６６を参照のこと。一般に、２つの型の薬理ゲノム学的条件は、区別され得る。遺伝的条件は、薬物が身体に作用する様式を変更する（変化した薬物作用）単一因子として伝達したか、または遺伝的条件は、身体が薬物に作用する様式を変更する（変化した薬物代謝）単一因子として伝達した。これらの薬理ゲノム学的条件は、稀な遺伝子欠損または天然に存在する多型のいずれかとして、存在し得る。例えば、グルコース−６−リン酸アミノペプチダーゼ欠損（Ｇ６ＰＤ）は、一般的な遺伝性酵素病であり、ここで、主な臨床学的合併症は、酸化剤薬物（抗マラリア薬、スルホンアミド、鎮痛薬、ニトロフラン）の摂取後およびソラマメの消費後の溶血である。
【０３４１】
「ゲノムワイド相関解析（ｇｅｎｏｍｅ−ｗｉｄｅ  ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）」として知られている、薬物応答を予測する遺伝子を同定するための１つの薬理ゲノム学的アプローチは、すでに知られている遺伝子関連マーカー（例えば、「二座対立遺伝子」マーカーマップ（これは、ヒトゲノム上の６０，０００〜１００，０００の多型部位または変動部位からなり、その部位の各々は、２つの改変体を有する））からなるヒトゲノムの高分解能マップに、主に依存する。このような高分解能ゲノムマップは、特定の観察された薬物応答または副作用に関連したマーカーを同定するために、フェーズＩＩ／フェーズＩＩＩの薬物試験に参加した統計学的に有意な数の患者の各々のゲノムのマップと比較され得る。あるいは、このような高分解能マップは、ヒトゲノムにおいて、数千万個の公知の一塩基多型（ＳＮＰ）の組み合わせから生じ得る。本明細書中で使用される場合、「ＳＮＰ」とは、ＤＮＡストレッチにおいて、単一のヌクレオチド塩基において生じる共通の変化である。例えば、ＳＮＰは、１０００塩基のＤＮＡごとに１回生じ得る。ＳＮＰは、疾患プロセスに関与し得るが、大部分は、疾患に関連していないかもしれない。このようなＳＮＰの発生に基づく遺伝マップを考慮すると、個体は、個々のゲノムにおける特定のＳＮＰパターンに依存して、遺伝カテゴリーへと分類され得る。このような様式において、処置レジメンは、遺伝的に類似する個体の間で共通であり得る特性を考慮して、そのような遺伝的に類似する個体の群に合わせて変更され得る。
【０３４２】
あるいは、「候補遺伝子アプローチ」と呼ばれる方法が、薬物応答を予測する遺伝子を同定するために用いられ得る。この方法に従って、薬物標的をコードする遺伝子が既知である場合（例えば、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質）、その遺伝子の共通のすべての改変体は、その集団においてかなり容易に同定され得、そして別の遺伝子バージョンに対する１つの遺伝子バージョンを有することが特定の薬物応答に関連するか否かが決定され得る。
【０３４３】
例示的実施形態として、薬物代謝酵素の活性は、薬物作用の強度および持続時間の両方の主要な決定因子である。薬物代謝酵素（例えば、Ｎ−アセチルトランスフェラーゼ２（ＮＡＴ２）およびシトクロムＰ４５０酵素であるＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９）の遺伝子多型の発見は、標準的かつ安全な用量の薬物を摂取した後に、患者が予測される薬物効果を得ることも過大な薬物応答および重篤な毒性を示すこともない理由に関する説明を提供した。これらの多型は、その集団中で２つの表現型（代謝が速い者（ＥＭ）および代謝が遅い者（ＰＭ））の状態で発現される。ＰＭの普及率は、種々の集団間で異なる。例えば、ＣＹＰ２Ｄ６をコードする遺伝子は、非常に多型性であり、いくつかの変異が、ＰＭにおいて同定されており、そのすべてが、機能的ＣＹＰ２Ｄ６の不在をもたらす。ＣＹＰ２Ｄ６およびＣＹＰ２Ｃ１９の代謝速度が遅い者は、標準的用量を受けたときに、過大な薬物応答および副作用を非常に頻繁に経験する。代謝物が活性な治療部分である場合、ＰＭは、ＣＹＰ２Ｄ６が形成した代謝物であるモルヒネにより媒介されるコデインの鎮痛効果について示されるような、治療応答を示さない。その他の極端な者は、標準的用量に対して応答しない、いわゆる代謝が著しく速い者である。最近、著しく速い代謝の分子的基礎が、ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子増幅に起因することが同定された。
【０３４４】
あるいは、「遺伝子発現プロファイリング」と呼ばれる方法が、薬物応答を予測する遺伝子を同定するために用いられ得る。例えば、薬物（例えば、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４分子または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４モジュレーター）を投薬された動物の遺伝子発現は、毒性に関連する遺伝子経路が作動するかの指標を与え得る。
【０３４５】
上記薬理ゲノム学的アプローチのうちの１つより多くから得られる情報が、被験体の予防的処置または治療的処置のための、適切な投薬量および処置レジメンを決定するために使用され得る。この知識は、投薬または薬物選択に適用される場合、有害な反応または治療の失敗を回避し得、それによって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４活性を調節する薬剤で、心血管疾患（例えば、アテローム性動脈硬化症）に罹患している被験体を処置する場合、治療効果または予防効果を増強し得る。
【０３４６】
（（ｖ）本発明の方法において使用される、組換え発現ベクターおよび宿主細胞）
本発明の方法（例えば、本明細書中に記載されるスクリーニングアッセイ）は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質（またはその一部）をコードする核酸を含むベクター（好ましくは発現ベクター）の使用を包含する。本明細書中で使用される場合、用語「ベクター」とは、これが連結された別の核酸を輸送可能である、核酸分子を指す。１つの型のベクターは、「プラスミド」であり、「プラスミド」とは、さらなるＤＮＡセグメントが連結され得る、環状の二本鎖ＤＮＡのループを指す。別の型のベクターは、ウイルスベクターであり、そのベクターにおいて、さらなるＤＮＡセグメントが、ウイルスゲノム中に連結され得る。特定のベクターは、これらが導入される宿主細胞中で自律複製可能である（例えば、細菌複製起点を有する細菌ベクター、およびエピソーム性哺乳動物ベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム性哺乳動物ベクター）は、宿主細胞中に導入された際に、宿主細胞のゲノム中に組み込まれ、それによって、その宿主ゲノムとともに複製される。さらに、特定のベクターは、これらが作動可能に連結された遺伝子の発現を指向可能である。そのようなベクターは、本明細書中で「発現ベクター」と呼ばれる。一般に、組換えＤＮＡ技術において有用な発現ベクターは、しばしば、プラスミドの形態である。本明細書において、「プラスミド」と「ベクター」とは、互換可能に使用され得る。なぜなら、プラスミドは、ベクターの最も一般的に使用される形態であるからである。しかし、本発明は、等価な機能を提供する、そのような他の形態の発現ベクター（例えば、ウイルスベクター（例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、およびアデノ随伴ウイルス））を包含することが意図される。
【０３４７】
本発明の方法において使用される組換え発現ベクターは、宿主細胞中での核酸の発現に適切な形態にある本発明の核酸を含む。このことは、その組換え発現ベクターが、発現されるべき核酸配列に作動可能に連結された１つ以上の調節配列（発現のために使用される宿主細胞に基づいて選択される）を含むことを意味する。組換え発現ベクターにおいて、「作動可能に連結された」とは、目的のヌクレオチド配列が、（例えば、インビトロでの転写／翻訳系において、またはそのベクターが宿主細胞中に導入される場合は、その宿主細胞において）そのヌクレオチド配列の発現を可能にする様式で調節配列に連結されていることを意味することが意図される。用語「調節配列」は、プロモーター、エンハンサー、および他の発現制御エレメント（例えば、ポリアデニル化シグナル）を含むことが意図される。そのような調節配列は、例えば、Ｇｏｅｄｄｅｌ（１９９０）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８５：３〜７に記載される。調節配列とは、多くの型の宿主細胞においてヌクレオチド配列の構成的発現を指向する配列、および特定の宿主細胞においてのみそのヌクレオチド配列の発現を指向する配列（例えば、組織特異的調節配列）を包含する。発現ベクターの設計は、形質転換される宿主細胞の選択、所望されるタンパク質発現レベルなどのような因子に依存し得ることが、当業者により認識される。本発明の発現ベクターは、宿主細胞内に導入され得、それにより本明細書中に記載されるような核酸によってコードされるタンパク質またはペプチド（融合タンパク質または融合ペプチドを含む）（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の変異体形態、融合タンパク質など）を産生し得る。
【０３４８】
本発明の方法において使用される組換え発現ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞における９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の発現のために設計され得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質は、Ｅ．ｃｏｌｉのような細菌細胞、昆虫細胞（バキュロウイルス発現ベクターを使用する）、酵母細胞、または哺乳動物細胞において発現され得る。適切な宿主細胞は、Ｇｏｅｄｄｅｌ（１９９０）前出においてさらに記載される。あるいは、組換え発現ベクターは、例えば、Ｔ７プロモーター調節配列およびＴ７ポリメラーゼを使用して、インビトロで転写および翻訳され得る。
【０３４９】
原核生物におけるタンパク質の発現は、融合タンパク質または非融合タンパク質のいずれかの発現を指向する構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターを含むベクターを使用して、Ｅ．ｃｏｌｉにおいて最も頻繁に行われる。融合ベクターは、ベクター中にコードされるタンパク質に、通常は、組換えタンパク質のアミノ末端に、多くのアミノ酸を付加する。このような融合ベクターは、代表的には、３つの目的を果たす：１）組換えタンパク質の発現を増大させること；２）組換えタンパク質の可溶性を増大させること；および３）アフィニティー精製におけるリガンドとして作用することにより、組換えタンパク質の精製を補助すること。しばしば、融合発現ベクターにおいて、タンパク質分解性切断部位は、融合部分と組換えタンパク質の接合部に導入され、融合タンパク質の精製に続いて、組換えタンパク質を融合部分から分離することが可能になる。このような酵素、およびそれらのコグネイト認識配列は、第Ｘａ因子、トロンビンおよびエンテロキナーゼを含む。代表的な融合発現ベクターとしては、それぞれ、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合タンパク質、またはプロテインＡを、標的組換えタンパク質に融合させる、ｐＧＥＸ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ  Ｉｎｃ；Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｂ．およびＪｏｈｎｓｏｎ，Ｋ．Ｓ．（１９８８）Ｇｅｎｅ  ６７：３１−４０）、ｐＭＡＬ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）およびｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）が挙げられる。
【０３５０】
精製融合タンパク質は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４活性アッセイ（例えば、以下に詳細に記載される直接的アッセイまたは競合アッセイ）において、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質に特異的な抗体を生成するために利用され得る。好ましい実施形態において、本発明のレトロウイルス発現ベクターにおいて発現される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４融合タンパク質は、骨髄細胞に感染させるために利用され得る。続いて、この骨髄細胞は、照射されたレシピエントに移植される。次いで、被験体レシピエントの病態は、十分な時間（例えば、６週間）が経過した後に試験される。
【０３５１】
別の実施形態において、本発明の核酸は、哺乳動物発現ベクターを使用して、哺乳動物細胞において発現される。哺乳動物発現ベクターの例としては、ｐＣＤＭ８（Ｓｅｅｄ，Ｂ．（１９８７）Ｎａｔｕｒｅ  ３２９：８４０）およびｐＭＴ２ＰＣ（Ｋａｕｆｍａｎら（１９８７）ＥＭＢＯ  Ｊ．６：１８７−１９５）が挙げられる。哺乳動物細胞において使用される場合、発現ベクターの制御機能は、しばしば、ウイルス調節エレメントにより提供される。例えば、一般に使用されるプロモーターは、ポリオーマウイルス、アデノウイルス２、サイトメガロウイルスおよびシミアンウイルス４０に由来する。原核生物細胞および真核生物細胞両方について適切な他の発現系については、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．ら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ．第２版、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９の第１６章および第１７章を参照のこと。
【０３５２】
別の実施形態において、組換え哺乳動物発現ベクターは、特定の細胞型においてこの核酸の発現を優先的に指向し得る（例えば、組織特異的調節エレメントがこの核酸を発現させるために使用される）。
【０３５３】
本発明の方法は、本発明のＤＮＡ分子を含む組換え発現ベクター（このＤＮＡ分子は、この発現ベクターにアンチセンス方向にてクローニングされる）をさらに使用し得る。すなわち、このＤＮＡ分子は、（このＤＮＡ分子の転写による）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４ｍＲＮＡに対してアンチセンスであるＲＮＡ分子の発現を可能にする様式にて、調節配列に作動可能に連結される。種々の細胞型におけるアンチセンスＲＮＡ分子の連続的発現を指向する、アンチセンス方向にクローニングされる核酸に作動可能に連結される調節配列（例えば、ウイルスプロモーターおよび／またはエンハンサー）が選択され得るか、あるいはアンチセンスＲＮＡの構成的発現、組織特異的発現、または細胞型特異的発現を指向する調節配列が、選択され得る。このアンチセンス発現ベクターは、組換えプラスミド、ファージミド、または弱毒化ウイルスの形態にあり得、この中でアンチセンス核酸は、高効率調節領域の制御下で生成され、その活性は、ベクターが導入される細胞型により決定され得る。アンチセンス遺伝子を使用する遺伝子発現の調節の議論については、Ｗｅｉｎｔｒａｕｂ，Ｈ．ら，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  ＲＮＡ  ａｓ  ａ  ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｔｏｏｌ  ｆｏｒ  ｇｅｎｅｔｉｃ  ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｖｉｅｗｓ−Ｔｒｅｎｄｓ  ｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．１（１）１９８６を参照のこと。
【０３５４】
本発明の別の局面は、本発明の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸分子、あるいは宿主細胞ゲノムの特定の部位への相同組換えを可能にする配列を含む、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸分子）が導入される宿主細胞の使用に関する。用語「宿主細胞」および「組換え宿主細胞」は、本明細書中で交換可能に使用される。このような用語は、特定の被験体細胞のみならず、このような細胞の子孫または潜在的子孫もまた言及することが理解される。特定の改変が、変異または環境的影響のいずれかに起因して、次の世代に生じ得るので、このような子孫は、実際に、親細胞と同一でなくてもよいが、本明細書中で使用される用語の範囲内になお含まれる。
【０３５５】
宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質は、細菌細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）、昆虫細胞、酵母または哺乳動物細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）またはＣＯＳ細胞）で発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である。
【０３５６】
ベクターＤＮＡは、従来の形質転換技術またはトランスフェクション技術を介して、原核生物細胞または真核生物細胞に導入され得る。本明細書中で使用される場合、用語「形質転換」および「トランスフェクション」とは、外来性の核酸（例えば、ＤＮＡ）を宿主細胞中に導入するための当該分野で認識される種々の技術をいうことを意図し、これらとしては、リン酸カルシウムまたは塩化カルシウムの共沈殿、ＤＥＡＥデキストラン媒介性トランスフェクション、リポフェクション、またはエレクトロポレーションが挙げられる。宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトするための適切な方法は、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９）および他の実験室マニュアルに見出され得る。
【０３５７】
本発明の方法において使用される宿主細胞（例えば、培養物中の原核生物宿主細胞または真核生物宿主細胞）を使用して、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を生成（すなわち、発現）し得る。従って、本発明はさらに、本発明の宿主細胞を使用して９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を生成するための方法を提供する。１つの実施形態において、本方法は、本発明の宿主細胞（この細胞中に９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする組換え発現ベクターが導入されている）を適切な培地中で培養する工程、その結果９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を生成する工程を、包含する。別の実施形態において、本方法はさらに、培地または宿主細胞から９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を単離する工程を包含する。
【０３５８】
（（ｖｉ）本発明の方法において使用される、単離された核酸分子）
本発明の方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、またはその生物学的に活性な部分をコードする、単離された核酸分子、ならびに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４をコードする核酸分子（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡ）を同定するための、ハイブリダイゼーションプローブとしての使用に足りる核酸フラグメント、および９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸分子を増幅または変異誘発するためのＰＣＲプライマーとしての使用のためのフラグメントの使用を、包含する。本明細書中で使用される場合、用語「核酸分子」は、ＤＮＡ分子（例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ）およびＲＮＡ分子（例えば、ｍＲＮＡ）、ならびにヌクレオチドアナログを使用して作製されたＤＮＡアナログまたはＲＮＡアナログを含むことを意図される。この核酸分子は一本鎖または二本鎖であり得るが、好ましくは二本鎖ＤＮＡである。
【０３５９】
本発明の方法において使用される核酸分子（例えば、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９、またはその部分のヌクレオチド配列を有する核酸分子）を、標準的な分子生物学的技術および本明細書中に提供される配列情報を使用して単離し得る。ハイブリダイゼーションプローブとして、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９の核酸配列の全部または一部を使用して、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸分子を、（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ，Ｊ．Ｆｒｉｔｓｈ，Ｅ．Ｆ．，およびＭａｎｉａｔｉｓ，Ｔ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，１９８９に記載されるような）標準的なハイブリダイゼーション技術およびクローニング技術を使用して単離し得る。
【０３６０】
さらに、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９の全部または一部を含有する核酸分子を、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７または配列番号７９の配列に基づいて設計した合成オリゴヌクレオチドプライマーを使用するポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって、単離し得る。
【０３６１】
本発明の方法において使用される核酸を、標準的なＰＣＲ増幅技術に従って、テンプレートとしてのｃＤＮＡ、ｍＲＮＡあるいはゲノムＤＮＡ、および適切なオリゴヌクレオチドプライマーを使用して、増幅し得る。さらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のヌクレオチド配列に対応するオリゴヌクレオチドを、標準的な合成技術（例えば、自動ＤＮＡ合成機を使用すること）によって、調製し得る。
【０３６２】
好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される単離された核酸分子は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列の相補体、またはこれらのヌクレオチド配列の任意の部分を含む。配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列に相補的である核酸分子とは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列に十分に相補的である核酸分子であり、その結果、この核酸分子は配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列にハイブリダイズし得、それによって安定な二重鎖を形成する。
【０３６３】
なお別の好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される単離された核酸分子は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列の全長、またはこのヌクレオチド配列の任意の部分に、少なくとも約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％以上同一であるヌクレオチド配列を含有する。
【０３６４】
さらに、本発明の方法において使用される核酸分子は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９の核酸配列の部分（例えば、プローブもしくはプライマーとして使用され得るフラグメント）、または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の部分（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の生物学的に活性な部分）をコードするフラグメント）のみを含み得る。代表的に、プローブ／プライマーは、実質的に精製されたオリゴヌクレオチドを含む。代表的に、オリゴヌクレオチドは、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９のセンス配列、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９のアンチセンス配列、あるいは配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９の天然に存在する対立遺伝子の改変体または変異体の少なくとも約１２または１５、好ましくは約２０または２５、より好ましくは約３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５または７５個連続したヌクレオチドにストリンジェントな条件下で、ハイブリダイズするヌクレオチド配列の領域を含む。１つの実施形態において、本発明の方法において使用される核酸分子は、１００、１００〜２００、２００〜３００、３００〜４００、４００〜５００、５００〜６００、６００〜７００、７００〜８００、８００〜９００、９００〜１０００、１０００〜１１００、１１００〜１２００、１２００〜１３００以上のヌクレオチド長よりも長く、かつストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９の核酸分子にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【０３６５】
本明細書中で使用される場合、用語「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする」は、お互いに有意に同一または相同であるヌクレオチ配列が、お互いにハイブリダイズされたままである状態でハイブリダイゼーションおよび洗浄するための条件を記載することを意図する。好ましくは、この条件は、少なくとも約７０％、より好ましくは少なくとも約８０％、なおより好ましくは少なくとも約８５％または９０％で、互いに同一な配列が、互いにハイブリダイズしたままであるような条件である。このようなストリンジェントな条件は、当業者に公知であり、そしてＣｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆
Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（１９９５），２節，４節および６節に見出され得る。さらなストリンジェントな条件は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ（１９８９），７章、９章および１１章に見出され得る。好ましい、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約６５〜７０℃での、４×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）中でハイブリダイゼーション（または約４２〜５０℃での、４×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中でハイブリダイゼーション）、次いで約６５〜７０℃での、１×ＳＳＣで１回以上の洗浄が挙げられる。好ましい、高度にストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約６５〜７０℃での、１×ＳＳＣ中でハイブリダイゼーション（または約４２〜５０℃での、１×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中でハイブリダイゼーション）、次いで約６５〜７０℃での、０．３×ＳＳＣで１回以上の洗浄が挙げられる。好ましい、低いストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約５０〜６０℃での、４×ＳＳＣ中でハイブリダイゼーション（あるいは、約４０〜４５℃での、６×ＳＳＣ＋５０％ホルムアミド中でハイブリダイゼーション）、次いで約５０〜６０℃での、２×ＳＳＣで１回以上の洗浄が挙げられる。上記の値の中間の範囲（例えば、６５〜７０℃または４２〜５０℃）もまた、本発明に含まれることが意図される。ＳＳＰＥ（１×ＳＳＰＥは、０．１５Ｍ  ＮａＣｌ、１０ｍＭ  ＮａＨ２ＰＯ４および１．２５ｍＭ  ＥＤＴＡ、ｐＨ  ７．４である）は、ハイブリダイゼーションおよび洗浄緩衝液中でＳＳＣ（１×ＳＳＣは、０．１５Ｍ  ＮａＣｌおよび１５ｍＭクエン酸ナトリウムである）に置き換わり得る；洗浄は、各ハイブリダイゼーションが終了した後で、１５分間実行される。５０塩基対長未満であることが予測されるハイブリッドのハイブリダイゼーション温度は、ハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）より５〜１０℃低くあるべきであり、ここでＴｍが以下の式に従って決定される。１８塩基対長未満であるハイブリッドについて、Ｔｍ（℃）＝２（Ａ塩基＋Ｔ塩基の数）＋４（Ｇ塩基＋Ｃ塩基の数）。１８塩基対長と４９塩基対長の間のであるハイブリッドについて、Ｔｍ（℃）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ１０［Ｎａ＋］）＋０．４１（％Ｇ＋Ｃ）−（６００／Ｎ）、ここで、Ｎはハイブリッド中の塩基の数であり、そして［Ｎａ＋］は、ハイブリダイゼーション緩衝液中のナトリウムイオンの濃度である（１×ＳＳＣに対する［Ｎａ＋］＝０．１６５Ｍ）。膜（例えば、ニトロセルロース膜、またはナイロン膜）への核酸分子の非特異的ハイブリダイゼーションを減少させるために、さらなる試薬が、ハイブリダイゼーションおよび／または洗浄緩衝液に添加され得ることが当業者によってまた認識され、この試薬としては、限定されないが以下が挙げられる：ブロッキング剤（例えば、ＢＳＡ、もしくはサケまたはニシンの精子キャリアＤＮＡ）、界面活性剤（例えば、ＳＤＳ）、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡ）、Ｆｉｃｏ���ｌ、ＰＶＰなど。ナイロン膜が使用される場合、特にさらなる好ましい、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の非限定的な例としては、約６５℃での、０．２５〜０．５Ｍ  ＮａＨ２ＰＯ４、７％  ＳＤＳ中でハイブリダイゼーション、次いで６５℃での、０．０２Ｍ  ＮａＨ２ＰＯ４、１％  ＳＤＳで１回以上の洗浄である（例えば、ＣｈｕｒｃｈおよびＧｉｌｂｅｒｔ（１９８４）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８１：１９９１−１９９５，（または代替的に０．２×ＳＳＣ、１％  ＳＤＳ）。
【０３６６】
好ましい実施形態において、プローブは、プローブに結合した標識基をさらに含む（例えば、標識基は、放射性同位元素、蛍光化合物、酵素または酵素補因子であり得る）。このようなプローブは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を誤発現する（ｍｉｓｅｘｐｒｅｓｓ）細胞または組織を同定するための診断的試験キットの一部として使用され得る（例えば、被験体由来の細胞サンプル中の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のコード核酸のレベルを測定すること、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡレベルを検出するか、またはゲノムの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の遺伝子が変異されているか除去されているかを測定することによって）。
【０３６７】
本発明の方法は、遺伝暗号の縮重に起因して、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列とは異なり、従って、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９に示されるヌクレオチド配列によってコードされるタンパク質と同じ９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする核酸分子の使用をさらに含む。別の実施形態において、本発明の方法に含まれる単離された核酸分子は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８もしくは配列番号８０に示されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードするヌクレオチド配列を有する。
【０３６８】
本発明の方法は、ヒト９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の対立遺伝子改変体（例えば、機能的対立遺伝子改変体および非機能的対立遺伝子改変体）の使用をさらに含む。機能的対立遺伝子改変体は、ヒト９１１８タンパク質、ヒト９９０タンパク質、ヒト１７６６２タンパク質、ヒト８１９８２タンパク質、ヒト６３０タンパク質、ヒト２１４７２タンパク質、ヒト１７６９２タンパク質、ヒト１９２９０タンパク質、ヒト２１６２０タンパク質、ヒト２１６８９タンパク質、ヒト２８８９９タンパク質、ヒト５３６５９タンパク質、ヒト６４５４９タンパク質、ヒト９４６５タンパク質、ヒト２３５４４タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト２７４１７タンパク質、ヒト５７２５９タンパク質、ヒト２１８４４タンパク質、ヒト９４３タンパク質、ヒト２０６１タンパク質、ヒト５８９１タンパク質、ヒト９１３７タンパク質、ヒト１３９０８タンパク質、ヒト１４３１０タンパク質、ヒト１７６００タンパク質、ヒト２５５８４タンパク質、ヒト２７８２４タンパク質、ヒト２８４６９タンパク質、ヒト３８９４７タンパク質、ヒト５３００３タンパク質、ヒト９６５タンパク質、ヒト５６６３９タンパク質、ヒト９６６１タンパク質、ヒト１６０５２タンパク質、ヒト１５２１タンパク質、ヒト６６６２タンパク質、ヒト１３９１３タンパク質、ヒト１２４０５タンパク質またはヒト５０１４タンパク質の天然に存在するアミノ酸配列改変体であって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を維持するアミノ酸配列改変体である。機能的対立遺伝子改変体は、代表的に、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８もしくは配列番号８０の１つ以上のアミノ酸の保存的置換、またはそのタンパク質の非必須領域における非必須残基の置換、欠失、もしくは挿入のみを含む。
【０３６９】
非機能的対立遺伝子改変体は、ヒト９１１８タンパク質、ヒト９９０タンパク質、ヒト１７６６２タンパク質、ヒト８１９８２タンパク質、ヒト６３０タンパク質、ヒト２１４７２タンパク質、ヒト１７６９２タンパク質、ヒト１９２９０タンパク質、ヒト２１６２０タンパク質、ヒト２１６８９タンパク質、ヒト２８８９９タンパク質、ヒト５３６５９タンパク質、ヒト６４５４９タンパク質、ヒト９４６５タンパク質、ヒト２３５４４タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト２７４１７タンパク質、ヒト５７２５９タンパク質、ヒト２１８４４タンパク質、ヒト９４３タンパク質、ヒト２０６１タンパク質、ヒト５８９１タンパク質、ヒト９１３７タンパク質、ヒト１３９０８タンパク質、ヒト１４３１０タンパク質、ヒト１７６００タンパク質、ヒト２５５８４タンパク質、ヒト２７８２４タンパク質、ヒト２８４６９タンパク質、ヒト３８９４７タンパク質、ヒト５３００３タンパク質、ヒト９６５タンパク質、ヒト５６６３９タンパク質、ヒト９６６１タンパク質、ヒト１６０５２タンパク質、ヒト１５２１タンパク質、ヒト６６６２タンパク質、ヒト１３９１３タンパク質、ヒト１２４０５タンパク質またはヒト５０１４タンパク質の天然に存在するアミノ酸配列改変体であって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を有さないアミノ酸配列改変体である。非機能的対立遺伝子改変体は、代表的には、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８もしくは配列番号８０のアミノ酸配列の非保存的な置換、欠失、もしくは挿入または未成熟短縮化（ｐｒｅｍａｔｕｒｅ  ｔｒｕｎｃａｔｉｏｎ）、あるいはこのタンパク質の必須残基または必須領域の置換、挿入、または欠失を含む。
【０３７０】
本発明の方法は、ヒト９１１８タンパク質、ヒト９９０タンパク質、ヒト１７６６２タンパク質、ヒト８１９８２タンパク質、ヒト６３０タンパク質、ヒト２１４７２タンパク質、ヒト１７６９２タンパク質、ヒト１９２９０タンパク質、ヒト２１６２０タンパク質、ヒト２１６８９タンパク質、ヒト２８８９９タンパク質、ヒト５３６５９タンパク質、ヒト６４５４９タンパク質、ヒト９４６５タンパク質、ヒト２３５４４タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト２７４１７タンパク質、ヒト５７２５９タンパク質、ヒト２１８４４タンパク質、ヒト９４３タンパク質、ヒト２０６１タンパク質、ヒト５８９１タンパク質、ヒト９１３７タンパク質、ヒト１３９０８タンパク質、ヒト１４３１０タンパク質、ヒト１７６００タンパク質、ヒト２５５８４タンパク質、ヒト２７８２４タンパク質、ヒト２８４６９タンパク質、ヒト３８９４７タンパク質、ヒト５３００３タンパク質、ヒト９６５タンパク質、ヒト５６６３９タンパク質、ヒト９６６１タンパク質、ヒト１６０５２タンパク質、ヒト１５２１タンパク質、ヒト６６６２タンパク質、ヒト１３９１３タンパク質、ヒト１２４０５タンパク質またはヒト５０１４タンパク質の非ヒトオルソログをさらに使用し得る。ヒト９１１８タンパク質、ヒト９９０タンパク質、ヒト１７６６２タンパク質、ヒト８１９８２タンパク質、ヒト６３０タンパク質、ヒト２１４７２タンパク質、ヒト１７６９２タンパク質、ヒト１９２９０タンパク質、ヒト２１６２０タンパク質、ヒト２１６８９タンパク質、ヒト２８８９９タンパク質、ヒト５３６５９タンパク質、ヒト６４５４９タンパク質、ヒト９４６５タンパク質、ヒト２３５４４タンパク質、ヒト７３６６タンパク質、ヒト２７４１７タンパク質、ヒト５７２５９タンパク質、ヒト２１８４４タンパク質、ヒト９４３タンパク質、ヒト２０６１タンパク質、ヒト５８９１タンパク質、ヒト９１３７タンパク質、ヒト１３９０８タンパク質、ヒト１４３１０タンパク質、ヒト１７６００タンパク質、ヒト２５５８４タンパク質、ヒト２７８２４タンパク質、ヒト２８４６９タンパク質、ヒト３８９４７タンパク質、ヒト５３００３タンパク質、ヒト９６５タンパク質、ヒト５６６３９タンパク質、ヒト９６６１タンパク質、ヒト１６０５２タンパク質、ヒト１５２１タンパク質、ヒト６６６２タンパク質、ヒト１３９１３タンパク質、ヒト１２４０５タンパク質またはヒト５０１４タンパク質のオルソログは、非ヒト生物から単離され、そして同じ９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の活性を有するタンパク質である。
【０３７１】
本発明の方法は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９のヌクレオチド配列またはそれらの一部を含む核酸分子であって、変異が導入されている核酸分子の使用をさらに包含する。変異は、「非必須」アミノ酸残基または「必須」アミノ酸残基でのアミノ酸置換を導き得る。「非必須」アミノ酸残基とは、その生物学的活性を変化することなく９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の野生型配列（例えば、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８もしくは配列番号８０の配列）から変化され得る残基であり、一方、「必須」アミノ酸残基は、生物学的活性のために必要とされる。例えば、本発明の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の間で保存されたアミノ酸残基は、変化を受容する可能性は低い。
【０３７２】
変異は、標準技術（例えば、部位特異的変異誘発およびＰＣＲ媒介変異誘発）により配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８もしくは配列番号８０に導入され得る。好ましくは、保存的アミノ酸置換が、１つ以上の予想される非必須アミノ酸残基でなされる。「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基で置換されるアミノ酸置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーが、当該分野において規定されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、無荷電の極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β−分枝側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が挙げられる。従って、好ましくは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質において予想される非必須アミノ酸残基は、同じ側鎖のファミリーからの別のアミノ酸残基で置換される。あるいは、別の実施形態において、変異は、例えば、飽和変異誘発（ｓａｔｕｒａｔｉｏｎ  ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）によって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のコード配列の全てまたは一部に沿って、ランダムに導入され得、そして得られた��異体は、活性を保持する変異体を同定するために、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の生物学的活性についてスクリーニングされ得る。配配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９の変異誘発の後、コードされたタンパク質が、組換え発現され得、そしてそのタンパク質の活性が、本明細書中に記載されたアッセイを用いて決定され得る。
【０３７３】
本発明の別の局面は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号２１、配列番号２３、配列番号２５、配列番号２７、配列番号２９、配列番号３１、配列番号３３、配列番号３５、配列番号３７、配列番号３９、配列番号４１、配列番号４３、配列番号４５、配列番号４７、配列番号４９、配列番号５１、配列番号５３、配列番号５５、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６３、配列番号６５、配列番号６７、配列番号６９、配列番号７１、配列番号７３、配列番号７５、配列番号７７もしくは配列番号７９のヌクレオチド配列に対するアンチセンスである単離された核酸分子の使用に関する。「アンチセンス」核酸は、タンパク質をコードする「センス」核酸に相補的である（例えば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的であるかまたはｍＲＮＡ配列に相補的である）ヌクレオチド配列を含む。従って、アンチセンス核酸は、センス核酸に水素結合し得る。アンチセンス核酸は、全長の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のコード鎖または、それらの一部のみに相補的であり得る。一つの実施形態において、アンチセンス核酸分子は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４をコードするヌクレオチド配列のコード鎖の「コード領域」に対するアンチセンスである。用語「コード領域」とは、アミノ酸残基に翻訳されるコドンを含むヌクレオチド配列の領域をいう。別の実施形態において、このアンチセンス核酸分子は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４をコードするヌクレオチド配列のコード鎖の「非コード領域」に対するアンチセンスである。用語「非コード領域」とは、コード領域に隣接する５’配列および３’配列であって、アミノ酸に翻訳されない配列をいう（５’および３’の非翻訳領域ともいう）。
【０３７４】
本明細書中に開示される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４をコードするコード鎖配列を考慮して、本発明のアンチセンス核酸は、ＷａｔｓｏｎおよびＣｒｉｃｋの塩基対形成の法則に従って、設計され得る。アンチセンス核酸分子は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡの全コード領域に相補的であり得るが、より好ましくは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡのコード領域または非コード領域の一部のみに対してアンチセンスであるオリゴヌクレオチドである。例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のｍＲＮＡの翻訳開始部位の周辺領域に相補的であり得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、約５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５または５０ヌクレオチド長であり得る。本発明のアンチセンス核酸は、当該分野で公知の手順を使用して、化学的合成および酵素的連結反応を使用して構築され得る。例えば、アンチセンス核酸（例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド）は、天然に存在するヌクレオチド、あるいは分子の生物学的安定性を増大するように、またはアンチセンス核酸とセンス核酸との間に形成される二重鎖の物理的安定性を増大するように設計された、種々に改変されたヌクレオチドを使用して、化学的に合成され得る。例えば、ホスホロチオエート誘導体およびアクリジン置換ヌクレオチドが使用され得る。アンチセンス核酸を生成するために使用され得る改変ヌクレオチドの例としては、以下が挙げられる：５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−クロロウラシル、５−ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、４−アセチルシトシン、５−（カルボキシヒドロキシルメチル）ウラシル、５−カルボキシメチルアミノメチル−２−チオウリジン、５−カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、β−Ｄ−ガラクトシルキューオシン、イノシン、Ｎ６−イソペンテニルアデニン、１−メチルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチルグアニン、２−メチルアデニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−アデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキシアミノメチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルキューオシン、５’−メトキシカルボキシメチルウラシル、５−メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、ワイブトキソシン（ｗｙｂｕｔｏｘｏｓｉｎｅ）、プソイドウラシル、キューオシン、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、ウラシル−５−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸（ｖ）、５−メチル−２−チオウラシル、３−（３−アミノ−３−Ｎ−２−カルボキシプロピル）ウラシル、（ａｃｐ３）ｗおよび２，６−ジアミノプリン。あるいは、アンチセンス核酸は、核酸がアンチセンス方向でサブクローニングされた発現ベクターを使用して、生物学的に生成され得る（すなわち、挿入された核酸から転写されるＲＮＡは、目的の標的核酸に対してアンチセンス方向のＲＮＡである）。本発明の方法において使用されるアンチセンス核酸分子は、さらに、上記の第ＩＶ節において記載される。
【０３７５】
なお別の実施形態において、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４核酸分子は、塩基部分、糖部分またはリン酸骨格において改変されて、例えば、分子の安定性、ハイブリダイゼーションまたは可溶性を改善し得る。例えば、核酸分子のデオキシリボースリン酸骨格は、ペプチド核酸を生成するために改変され得る（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ４（１）：５−２３を参照のこと）。本明細書中で使用される場合、用語「ペプチド核酸」すなわち「ＰＮＡ」は、核酸模倣物（例えば、ＤＮＡ模倣物）をいい、ここで、デオキシリボースリン酸骨格は、偽ペプチド骨格によって置換され、そして４種の天然の核酸塩基だけが維持される。ＰＮＡの中性の骨格は、低イオン強度の条件下で、ＤＮＡおよびＲＮＡへの特異的ハイブリダイゼーションを可能にすることが示されている。ＰＮＡオリゴマーの合成は、標準的な固相ペプチド合成プロトコルを使用して、Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、（１９９６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９３：１４６７０−６７５に記載されるように実施され得る。
【０３７６】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４核酸分子のＰＮＡは、本明細書中に記載される治療適用および診断適用において使用され得る。例えば、ＰＮＡは、例えば、転写もしくは翻訳の停止を誘導するか、または複製を阻害することによって、遺伝子発現の配列特異的調節のためのアンチセンス因子またはアンチ遺伝子（ａｎｔｉｇｅｎｅ）因子として使用され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸分子のＰＮＡはまた、遺伝子中の単一塩基対の変異の分析において（例えば、ＰＮＡ指向性のＰＣＲクランピングによって）；他の酵素と組み合わせて使用する場合には、「人工制限酵素」として（例えば、Ｓ１ヌクレアーゼ（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出））；またはＤＮＡ配列決定もしくはハイブリダイゼーションのためのプローブもしくはプライマーとして（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出；Ｐｅｒｒｙ−Ｏ’Ｋｅｅｆｅら、（１９９６）前出）、使用され得る。
【０３７７】
別の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のＰＮＡは、（例えば、ＰＮＡの安定性または細胞取り込みを増強するために）、ＰＮＡに親油性もしくは他のヘルパー基を結合させることによってか、ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの形成によってか、またはリポソームもしくは当該分野で公知の他の薬物送達技術の使用によって、改変され得る。例えば、ＰＮＡおよびＤＮＡの有利な特性を組み合わせ得る９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の核酸分子のＰＮＡ−ＤＮＡキメラが、生成され得る。このようなキメラは、ＤＮＡ認識酵素（例えば、ＲＮＡｓｅ  ＨおよびＤＮＡポリメラーゼ）に、ＤＮＡ部分と相互作用させ、一方、ＰＮＡ部分は、高い結合親和性および結合特異性を提供する。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラは、塩基スタッキング、核酸塩基間の結合の数および方向に関して選択される、適切な長さのリンカーを使用して、連結され得る（Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出）。ＰＮＡ−ＤＮＡキメラの合成は、Ｈｙｒｕｐ  Ｂ．ら、（１９９６）前出およびＦｉｎｎ  Ｐ．Ｊ．ら、（１９９６）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２４（１７）：３３５７−６３に記載されるように実施され得る。例えば、ＤＮＡ鎖は、標準的なホスホロアミダイトカップリング化学および改変ヌクレオシドアナログを使用して、固体支持体上で合成され得る。例えば、５’−（４−メトキシトリチル）アミノ−５’−デオキシ−チミジンホスホラミダイトが、ＰＮＡとＤＮＡの５’末端との間として使用され得る（Ｍａｇ、Ｍ．ら、（１９８９）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１７：５９７３−８８）。次いで、ＰＮＡモノマーは、段階的な様式でカップリングされて、５’ＰＮＡセグメントおよび３’ＤＮＡセグメントを有するキメラ分子を生成する（Ｆｉｎｎ  Ｐ．Ｊ．ら、（１９９６）前出）。あるいは、キメラ分子は、５’ＤＮＡセグメントおよび３’ＰＮＡセグメントを用いて合成され得る（Ｐｅｔｅｒｓｅｒ、Ｋ．Ｈ．ら、（１９７５）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ  Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．５：１１１９−１１１２４）。
【０３７８】
他の実施形態において、本発明の方法において使用されるオリゴヌクレオチドは、他の付随的な基（例えば、（例えば、インビボで宿主細胞レセプターを標的化するための）ペプチド、または細胞膜を通る輸送を促進するための因子（例えば、Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら、（１９８９）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６：６５５３−６５５６；Ｌｅｍａｉｔｒｅら、（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：６４８−６５２；ＰＣＴ公開番号ＷＯ８８／０９８１０を参照のこと）もしくは血液脳関門を通る輸送を促進するための因子（例えば、ＰＣＴ公開番号ＷＯ８９／１０１３４を参照のこと）を含み得る。さらに、オリゴヌクレオチドは、ハイブリダイゼーション誘発性切断因子（例えば、Ｋｒｏｌら、（１９８８）Ｂｉｏ−Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ
６：９５８−９７６を参照のこと）またはインターカレート剤（例えば、Ｚｏｎ（１９８８）Ｐｈａｒｍ．  Ｒｅｓ．５：５３９−５４９を参照のこと）を用いて改変され得る。この目的で、オリゴヌクレオチドは、別の分子（例えば、ペプチド、ハイブリダイゼーション誘発性架橋剤、輸送因子またはハイブリダイゼーション誘発性切断因子）に結合体化され得る。
【０３７９】
（（ｖｉｉ）本発明の方法において使用される、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の単離タンパク質、および抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体）
本発明の方法は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４単離タンパク質およびこれらの生物学的に活性な部分、ならびに抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体を惹起するための免疫原として使用されるのに適切なポリペプチドフラグメントの使用を包含する。１つの実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のネイティブタンパク質は、標準的なタンパク質精製技術を使用する、適切な精製スキームによって、細胞供給源または組織供給源から単離され得る。別の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質は、組換えＤＮＡ技術によって生成される。組換え発現と代替的に、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４ポリペプチドは、標準的なペプチド合成技術を使用して、化学的に合成され得る。
【０３８０】
本明細書中で使用する場合、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の「生物学的に活性な部分」は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４活性を有する、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質のフラグメントを含む。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の生物学的に活性な部分は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質のアミノ酸配列に十分に同一であるかまたはこれらに由来する、アミノ酸配列（例えば、全長の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質より少ないアミノ酸を含み、かつ９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の少なくとも１つの活性を示す、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８または配列番号８０に示されるアミノ酸配列）を含むペプチドを含む。代表的には、生物学的に活性な部分は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の少なくとも１つの活性を有するドメインまたはモチーフ（例えば、アポトーシス活性の調節に関与すると考えられている、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質のＮ末端領域）を含む。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の生物学的に活性な部分は、例えば、２５、５０、７５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２５０、３００アミノ酸長以上である、ポリペプチドであり得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の生物学的に活性な部分は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４活性を調節する薬剤を開発するための標的として使用され得る。
【０３８１】
好ましい実施形態において、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８または配列番号８０に示されるアミノ酸配列を有する。他の実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８または配列番号８０に対して実質的に同一であり、そして配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８または配列番号８０のタンパク質の機能的活性を保持するが、上記第Ｖ節において詳細に記載されるように、天然の対立遺伝子バリエーションまたは変異誘発に起因して、アミノ酸配列が異なる。従って、別の実施形態において、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８または配列番号８０に対して少なくとも約５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはそれ以上同一なアミノ酸配列を含むタンパク質である。
【０３８２】
２つのアミノ酸配列または２つの核酸配列の同一性パーセントを決定するために、これらの配列は、最適比較目的で整列される（例えば、ギャップが、最適な整列のために、第１および第２のアミノ酸配列または核酸配列の一方または両方に導入され得、そして非同一配列は、比較目的で無視され得る）。好ましい実施形態において、比較目的で整列される参照配列の長さは、参照配列の少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、およびさらにより好ましくは少なくとも７０％、８０％または９０％の長さである（例えば、５００アミノ酸残基を有する、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８または配列番号８０の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４アミノ酸配列に、第二の配列を整列させる場合、少なくとも７５、好ましくは少なくとも１５０、より好ましくは少なくとも２２５、なおより好ましくは少なくとも３００およびなおより好ましくは少なくとも４００またはそれ以上のアミノ酸残基が整列される）。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが、比較される。第１の配列における位置が、第２の配列の対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められる場合、これらの分子は、その位置で同一である（本明細書中で使用される場合、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と等しい）。２つの配列間の同一性パーセントは、それらの配列により共有される同一の位置の数の関数である（２つの配列の最適なアラインメントのために導入される必要のある、ギャップの数、および、各ギャップの長さが考慮される）。
【０３８３】
配列の比較および２つの配列間の同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。好ましい実施形態において、２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムに組み込まれたＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４４−４５３（１９７０））のアルゴリズムを用い、Ｂｌｏｓｕｍ  ６２マトリクスまたはＰＡＭ２５０マトリクスのいずれか、ならびにギャップウェイト１６、１４、１２、１０、８、６、または４およびレングスウェイト（ｌｅｎｇｔｈ  ｗｅｉｇｈｔ）１、２、３、４、５、または６を用いて決定される。さらに別の好ましい実施形態において、２つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ中のＧＡＰプログラムを用い、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリクスならびにギャップウェイト４０、５０、６０、７０、または８０およびレングスウェイト１、２、３、４、５、または６を用いて決定される。別の実施形態において、２つのアミノ酸配列間または２つのヌクレオチド配列間の同一性パーセントは、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０または２．０Ｕ）に組みこまれたＥ．ＭｅｙｅｒｓおよびＷ．Ｍｉｌｌｅｒ（Ｃｏｍｐｕｔ．Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｓｃｉ．４：１１−１７（１９８８））のアルゴリズムを使用し、ＰＡＭ１２０ウェイトレジデューテーブル（ｗｅｉｇｈｔ  ｒｅｄｉｄｕｅ  ｔａｂｌｅ）、ギャップレングスペナルティー１２、およびギャップペナルティー４を用いて決定され得る。
【０３８４】
本発明の方法はまた、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４キメラタンパク質、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４融合タンパク質を使用し得る。本明細書中で使用される場合、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の「キメラタンパク質」または「融合タンパク質」は、非９１１８ポリペプチド、非９９０ポリペプチド、非１７６６２ポリペプチド、非８１９８２ポリペプチド、非６３０ポリペプチド、非２１４７２ポリペプチド、非１７６９２ポリペプチド、非１９２９０ポリペプチド、非２１６２０ポリペプチド、非２１６８９ポリペプチド、非２８８９９ポリペプチド、非５３６５９ポリペプチド、非６４５４９ポリペプチド、非９４６５ポリペプチド非２３５４４ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非２７４１７ポリペプチド、非５７２５９ポリペプチド、非２１８４４ポリペプチド、非９４３ポリペプチド、非２０６１ポリペプチド、非５８９１ポリペプチド、非９１３７ポリペプチド、非１３９０８ポリペプチド、非１４３１０ポリペプチド、非１７６００ポリペプチド、非２５５８４ポリペプチド、非２７８２４ポリペプチド、非２８４６９ポリペプチド、非３８９４７ポリペプチド、非５３００３ポリペプチド、非９６５ポリペプチド、非５６６３９ポリペプチド、非９６６１ポリペプチド、非１６０５２ポリペプチド、非１５２１ポリペプチド、非６６６２ポリペプチド、非１３９１３ポリペプチド、非１２４０５ポリペプチドまたは非５０１４ポリペプチドに作動可能に連結された、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドを含む。「９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４ポリペプチド」は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４分子に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドをいうが、一方、「非９１１８ポリペプチド、非９９０ポリペプチド、非１７６６２ポリペプチド、非８１９８２ポリペプチド、非６３０ポリペプチド、非２１４７２ポリペプチド、非１７６９２ポリペプチド、非１９２９０ポリペプチド、非２１６２０ポリペプチド、非２１６８９ポリペプチド、非２８８９９ポリペプチド、非５３６５９ポリペプチド、非６４５４９ポリペプチド、非９４６５ポリペプチド非２３５４４ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非２７４１７ポリペプチド、非５７２５９ポリペプチド、非２１８４４ポリペプチド、非９４３ポリペプチド、非２０６１ポリペプチド、非５８９１ポリペプチド、非９１３７ポリペプチド、非１３９０８ポリペプチド、非１４３１０ポリペプチド、非１７６００ポリペプチド、非２５５８４ポリペプチド、非２７８２４ポリペプチド、非２８４６９ポリペプチド、非３８９４７ポリペプチド、非５３００３ポリペプチド、非９６５ポリペプチド、非５６６３９ポリペプチド、非９６６１ポリペプチド、非１６０５２ポリペプチド、非１５２１ポリペプチド、非６６６２ポリペプチド、非１３９１３ポリペプチド、非１２４０５ポリペプチドまたは非５０１４ポリペプチド」は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質に実質的に相同でないタンパク質に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチド（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質とは異なり、かつ同じ生物または異なる生物由来のタンパク質）をいう。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４融合タンパク質において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の全てまたは一部に対応し得る。好ましい実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の融合タンパク質は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の少なくとも１つの生物学的に活性な部分を含む。別の好ましい実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の融合タンパク質は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の少なくとも２つの生物学的に活性な部分を含む。融合タンパク質において、用語「作動可能に連結した」は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドおよび非９１１８ポリペプチド、非９９０ポリペプチド、非１７６６２ポリペプチド、非８１９８２ポリペプチド、非６３０ポリペプチド、非２１４７２ポリペプチド、非１７６９２ポリペプチド、非１９２９０ポリペプチド、非２１６２０ポリペプチド、非２１６８９ポリペプチド、非２８８９９ポリペ
プチド、非５３６５９ポリペプチド、非６４５４９ポリペプチド、非９４６５ポリペプチド非２３５４４ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非２７４１７ポリペプチド、非５７２５９ポリペプチド、非２１８４４ポリペプチド、非９４３ポリペプチド、非２０６１ポリペプチド、非５８９１ポリペプチド、非９１３７ポリペプチド、非１３９０８ポリペプチド、非１４３１０ポリペプチド、非１７６００ポリペプチド、非２５５８４ポリペプチド、非２７８２４ポリペプチド、非２８４６９ポリペプチド、非３８９４７ポリペプチド、非５３００３ポリペプチド、非９６５ポリペプチド、非５６６３９ポリペプチド、非９６６１ポリペプチド、非１６０５２ポリペプチド、非１５２１ポリペプチド、非６６６２ポリペプチド、非１３９１３ポリペプチド、非１２４０５ポリペプチドまたは非５０１４ポリペプチドは、互いにインフレームで融合されることを示すことが意図される。非９１１８ポリペプチド、非９９０ポリペプチド、非１７６６２ポリペプチド、非８１９８２ポリペプチド、非６３０ポリペプチド、非２１４７２ポリペプチド、非１７６９２ポリペプチド、非１９２９０ポリペプチド、非２１６２０ポリペプチド、非２１６８９ポリペプチド、非２８８９９ポリペプチド、非５３６５９ポリペプチド、非６４５４９ポリペプチド、非９４６５ポリペプチド非２３５４４ポリペプチド、非７３６６ポリペプチド、非２７４１７ポリペプチド、非５７２５９ポリペプチド、非２１８４４ポリペプチド、非９４３ポリペプチド、非２０６１ポリペプチド、非５８９１ポリペプチド、非９１３７ポリペプチド、非１３９０８ポリペプチド、非１４３１０ポリペプチド、非１７６００ポリペプチド、非２５５８４ポリペプチド、非２７８２４ポリペプチド、非２８４６９ポリペプチド、非３８９４７ポリペプチド、非５３００３ポリペプチド、非９６５ポリペプチド、非５６６３９ポリペプチド、非９６６１ポリペプチド、非１６０５２ポリペプチド、非１５２１ポリペプチド、非６６６２ポリペプチド、非１３９１３ポリペプチド、非１２４０５ポリペプチドまたは非５０１４ポリペプチドは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４ポリペプチドのＮ末端またはＣ末端に融合され得る。
【０３８５】
例えば、１つの実施形態において、融合タンパク質は、ＧＳＴ−９１１８融合タンパク質、ＧＳＴ−９９０融合タンパク質、ＧＳＴ−１７６６２融合タンパク質、ＧＳＴ−８１９８２融合タンパク質、ＧＳＴ−６３０融合タンパク質、ＧＳＴ−２１４７２融合タンパク質、ＧＳＴ−１７６９２融合タンパク質、ＧＳＴ−１９２９０融合タンパク質、ＧＳＴ−２１６２０融合タンパク質、ＧＳＴ−２１６８９融合タンパク質、ＧＳＴ−２８８９９融合タンパク質、ＧＳＴ−５３６５９融合タンパク質、ＧＳＴ−６４５４９融合タンパク質、ＧＳＴ−９４６５融合タンパク質、ＧＳＴ−２３５４４融合タンパク質、ＧＳＴ−７３６６融合タンパク質、ＧＳＴ−２７４１７融合タンパク質、ＧＳＴ−５７２５９融合タンパク質、ＧＳＴ−２１８４４融合タンパク質、ＧＳＴ−９４３融合タンパク質、ＧＳＴ−２０６１融合タンパク質、ＧＳＴ−５８９１融合タンパク質、ＧＳＴ−９１３７融合タンパク質、ＧＳＴ−１３９０８融合タンパク質、ＧＳＴ−１４３１０融合タンパク質、ＧＳＴ−１７６００融合タンパク質、ＧＳＴ−２５５８４融合タンパク質、ＧＳＴ−２７８２４融合タンパク質、ＧＳＴ−２８４６９融合タンパク質、ＧＳＴ−３８９４７融合タンパク質、ＧＳＴ−５３００３融合タンパク質、ＧＳＴ−９６５融合タンパク質、ＧＳＴ−５６６３９融合タンパク質、ＧＳＴ−９６６１融合タンパク質、ＧＳＴ−１６０５２融合タンパク質、ＧＳＴ−１５２１融合タンパク質、ＧＳＴ−６６６２融合タンパク質、ＧＳＴ−１３９１３融合タンパク質、ＧＳＴ−１２４０５融合タンパク質またはＧＳＴ−５０１４融合タンパク質であり、ここで、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４配列が、ＧＳＴ配列のＣ末端に融合されている。このような融合タンパク質は、組換えの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の精製を容易にし得る。
【０３８６】
別の実施形態において、この融合タンパク質は、そのＮ末端において異種シグナル配列を含む９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質である。特定の宿主細胞（例えば、哺乳動物宿主細胞）において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の発現および／あるいは分泌は、異種シグナル配列の使用によって増大され得る。
【０３８７】
本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の融合タンパク質は、薬学的組成物中に組み込まれ得、そして被験体にインビボで投与され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４融合タンパク質は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４基質のバイオアベイラビリティーに影響を与えるために使用され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４融合タンパク質の使用は、例えば、以下によって引き起こされる障害の処置のために治療的に有用であり得る：（ｉ）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質をコードする遺伝子の異常な改変または変異；（ｉｉ）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４遺伝子の誤調節；ならびに（ｉｉｉ）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質の異常な翻訳後修飾。
【０３８８】
さらに、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４融合タンパク質は、被験体において抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体を産生するための免疫原として、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４リガンドを精製するために、そして９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４基質との相互作用を阻害する分子を同定するためのスクリーニングアッセイにおいて、使用され得る。
【０３８９】
好ましくは、本発明の方法において使用される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のキメラタンパク質または９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４の融合タンパク質は、標準的な組換えＤＮＡ技術によって産生される。例えば、異なるポリペプチド配列をコードするＤＮＡフラグメントは、従来技術に従って、例えば、連結のために平滑末端または付着末端を使用し、適切な末端を提供するための制限酵素消化を使用し、適切な場合粘着末端をフィルイン（ｆｉｌｌ−ｉｎ）し、所望でない連結を回避するためのアルカリホスファターゼ処理を使用し、そして酵素的連結を使用することによって一緒にインフレームで連結される。別の実施形態において、融合遺伝子は、自動化ＤＮＡ合成機を含む従来技術によって合成され得る。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ増幅は、引き続いてアニーリングおよび再増幅されてキメラ遺伝子配列を生成し得る２つの連続遺伝子フラグメント間の相補的突出を生じるアンカープライマーを使用して実施され得る（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ａｕｓｕｂｅｌら、編、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ：１９９２を参照のこと）。さらに、すでに融合部分（例えば、ＧＳＴポリペプチド）をコードしている多くの発現ベクターが市販されている。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４コード核酸は、この融合部分が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４��２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質にインフレームで連結されるように、このような発現ベクター中にクローニングされ得る。
【０３９０】
本発明はまた、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアゴニスト（模倣物）、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアンタゴニストのいずれかとして機能する、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の改変体の使用に関する。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の改変体は、変異誘発（例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の別個の点変異または短縮）によって生成され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４タンパク質のアゴニストは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の天然に存在する形態の生物学的活性と実質的に同じ生物学的活性またはそのサブセットを保持し得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のアンタゴニストは、例えば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の媒介性の活性を拮抗的に調節することによって、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の天然に存在する形態の活性の１以上を阻害し得る。従って、特定の生物学的効果は、機能が限定された改変体を用いる処置によって誘発され得る。１つの実施形態において、タンパク質の天然に存在する形態の生物学的活性のサブセットを有する改変体を用いる被験体の処置は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の天然に存在する形態を用いた処置と比較して、被験体における副作用がより小さい。
【０３９１】
１つの実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアゴニスト（模倣物）、あるいは９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のアンタゴニストのいずれかとして機能する、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の改変体は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のアゴニスト活性またはアンタゴニスト活性について、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の変異体（例えば、短縮変異体）のコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって、同定され得る。１つの実施形態において、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の改変体の多様なライブラリーは、核酸レベルでのコンビナトリアル変異誘発によって生成され、そして多様な遺伝子ライブラリーによってコードされる。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の改変体の多様なライブラリーは、例えば、合成オリゴヌクレオチドの混合物を遺伝子配列に酵素的に連結することによって生成され得、その結果、潜在的な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列の縮重セットは、個々のポリペプチドとしてか、あるいはその中に９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列のセットを含むより大きい融合タンパク質のセットとして（例えば、ファージディスプレイについて）発現可能である。縮重オリゴヌクレオチド配列から潜在的な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の改変体のライブラリーを生成するために使用され得る、種々の方法が存在する。縮重遺伝子配列の化学的合成は、自動化ＤＮＡ合成機において実施され得、次いで、この合成遺伝子は、適切な発現ベクター中に連結され得る。遺伝子の縮重セットの使用は、潜在的な９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の配列の所望のセットをコードする全ての配列を１つの混合物中で提供することを可能にする。縮重オリゴヌクレオチドを合成するための方法は、当該分野で公知である（例えば、Ｎａｒａｎｇ、Ｓ．Ａ．（１９８３）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  ３９：３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５３：３２３；Ｉｔａｋｕｒａら、（１９８４）Ｓｃｉｅｎｃｅ  １９８：１０５６；Ｉｋｅら、（１９８３）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１１：４７７を参照のこと）。
【０３９２】
さらに、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質コード配列のフラグメントのライブラリーは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のンパク質の改変体のスクリーニングおよび引き続く選択のために、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のフラグメントの多様な集団を生成するために使用され得る。１つの実施形態において、コード配列フラグメントのライブラリーは、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のコード配列の二本鎖ＰＣＲフラグメントを、ニック形成が１分子当たりほぼ１回だけ生じるような条件下でヌクレアーゼで処理し、二重鎖ＤＮＡを変性し、異なるニック形成産物由来のセンス／アンチセンス対を含み得る二本鎖ＤＮＡを形成するためにＤＮＡを再生し、Ｓ１ヌクレアーゼでの処理によって、再形成された二重鎖から一本鎖部分を除去し、そして得られたフラグメントライブラリーを発現ベクター中に連結することによって、生成され得る。この方法によって、種々のサイズの９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のＮ末端フラグメント、Ｃ末端フラグメントおよび内部フラグメントをコードする、発現ライブラリーが誘導され得る。
【０３９３】
点変異または短縮によって作成されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産物をスクリーニングするためのいくつかの技術、および選択された特性を有する遺伝子産物についてのｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングするためのいくつかの技術が、当該分野で公知である。このような技術は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質のコンビナトリアル変異誘発によって生成された遺伝子ライブラリーの迅速なスクリーニングのために適合可能である。大きい遺伝子ライブラリーをスクリーニングするための高スループットの分析に使用されやすい、最も広く使用される技術は、代表的に、遺伝子ライブラリーを複製可能な発現ベクター中にクローニングする工程、ベクターの得られたライブラリーで適切な細胞を形質転換する工程、および所望の活性の検出が、産物が検出された遺伝子をコードするベクターの単離を容易にする条件下でコンビナトリアル遺伝子を発現する工程を包含する。再帰的アンサンブル変異誘発（ｒｅｃｕｒｓｉｖｅ  ｅｎｓｅｍｂｌｅ  ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ（ＲＥＭ））（これは、ライブラリー中の機能的変異体の頻度を増強する新たな技術である）は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の改変体を同定するために、スクリーニングアッセイと組み合わせて使用され得る（ＡｒｋｉｎおよびＹｏｕｒｖａｎ（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：７８１１−７８１５；Ｄｅｌｇｒａｖｅら、（１９９３）Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ６（３）：３２７−３３１）。
【０３９４】
本発明の方法はさらに、抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体の使用を包含する。単離された９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５もしくは５０１４のタンパク質、またはその部分もしくはそのフラグメントは、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の調製のための標準的技術を用いて、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と結合する抗体を生成するための免疫原として使用され得る。全長の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質が使用され得るか、あるいは、代わりに９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の抗原性ペプチドフラグメントが、免疫原として使用され得る。９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の抗原性ペプチドは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、配列番号２８、配列番号３０、配列番号３２、配列番号３４、配列番号３６、配列番号３８、配列番号４０、配列番号４２、配列番号４４、配列番号４６、配列番号４８、配列番号５０、配列番号５２、配列番号５４、配列番号５６、配列番号５８配列番号６０、配列番号６２、配列番号６４、配列番号６６、配列番号６８、配列番号７０、配列番号７２、配列番号７４、配列番号７６、配列番号７８および配列番号８０に示されるアミノ酸配列の少なくとも８つのアミノ酸残基を含み、そしてそのペプチドに対して励起される抗体が、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質と特異的免疫複合体を形成するように、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のエピトープを含む。好ましくは、この抗原性ペプチドは、少なくとも１０個のアミノ酸残基を含み、より好ましくは、少なくとも１５個のアミノ酸残基を含み、よりさらに好ましくは、少なくとも２０個のアミノ酸残基を含み、そして、最も好ましくは、少なくとも３０個のアミノ酸残基を含む。
【０３９５】
抗原性ペプチドによって含まれる好ましいエピトープは、タンパク質の表面（例えば、親水性領域、および高い抗原性を有する領域）に位置する９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の領域である。
【０３９６】
９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の免疫原は、代表的には、適切な被験体（例えば、ウサギ、ヤギ、マウス、または他の哺乳動物）をその免疫原で免疫することによって抗体を調製するために使用される。適切な免疫原性製調製物は、例えば、組み換え発現される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質、あるいは化学合成される９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のポリペプチドを含み得る。調製物はさらに、フロインドの完全アジュバントまたは不完全アジュバント、あるいは同様な免疫刺激性試薬のようなアジュバントを含み得る。適切な被験体を、免疫原性の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の調製物で免疫することによって、ポリクローナル抗９１１８抗体応答、ポリクローナル抗９９０抗体応答、ポリクローナル抗１７６６２抗体応答、ポリクローナル抗８１９８２抗体応答、ポリクローナル抗６３０抗体応答、ポリクローナル抗２１４７２抗体応答、ポリクローナル抗１７６９２抗体応答、ポリクローナル抗１９２９０抗体応答、ポリクローナル抗２１６２０抗体応答、ポリクローナル抗２１６８９抗体応答、ポリクローナル抗２８８９９抗体応答、ポリクローナル抗５３６５９抗体応答、ポリクローナル抗６４５４９抗体応答、ポリクローナル抗９４６５抗体応答、ポリクローナル抗２３５４４抗体応答、ポリクローナル抗７３６６抗体応答、ポリクローナル抗２７４１７抗体応答、ポリクローナル抗５７２５９抗体応答、ポリクローナル抗２１８４４抗体応答、ポリクローナル抗９４３抗体応答、ポリクローナル抗２０６１抗体応答、ポリクローナル抗５８９１抗体応答、ポリクローナル抗９１３７抗体応答、ポリクローナル抗１３９０８抗体応答、ポリクローナル抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体応答、ポリクローナル抗２７８２４抗体応答、ポリクローナル抗２８４６９抗体応答、ポリクローナル抗３８９４７抗体応答、ポリクローナル抗５３００３抗体応答、ポリクローナル抗９６５抗体応答、ポリクローナル抗５６６３９抗体応答、ポリクローナル抗９６６１抗体応答、ポリクローナル抗１６０５２抗体応答、ポリクローナル抗１５２１抗体応答、ポリクローナル抗６６６２抗体応答、ポリクローナル抗１３９１３抗体応答、ポリクローナル抗１２４０５抗体またはポリクローナル抗５０１４抗体応答が誘導される。
【０３９７】
本明細書中で使用される用語「抗体」は、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン分子の免疫的に活性な部分（すなわち、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のような抗原と特異的に結合する（免疫反応する）抗原結合部位を含む分子）をいう。免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分の例は、ペプシンのような酵素で抗体を処理することによって生成され得る、Ｆ（ａｂ）フラグメントおよびＦ（ａｂ’）２フラグメントを包含する。本発明は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の分子と結合するポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体を提供する。本明細書中で使用される場合、用語「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の特定エピトープと免疫反応することができる抗原結合部位の１つの種のみを含む抗体分子の集団をいう。従って、モノクローナル抗体組成物は、代表的には、それが免疫反応する特定の９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質に対して単一の結合親和性を示す。
【０３９８】
ポリクローナル抗９１１８抗体、ポリクローナル抗９９０抗体、ポリクローナル抗１７６６２抗体、ポリクローナル抗８１９８２抗体、ポリクローナル抗６３０抗体、ポリクローナル抗２１４７２抗体、ポリクローナル抗１７６９２抗体、ポリクローナル抗１９２９０抗体、ポリクローナル抗２１６２０抗体、ポリクローナル抗２１６８９抗体、ポリクローナル抗２８８９９抗体、ポリクローナル抗５３６５９抗体、ポリクローナル抗６４５４９抗体、ポリクローナル抗９４６５抗体、ポリクローナル抗２３５４４抗体、ポリクローナル抗７３６６抗体、ポリクローナル抗２７４１７抗体、ポリクローナル抗５７２５９抗体、ポリクローナル抗２１８４４抗体、ポリクローナル抗９４３抗体、ポリクローナル抗２０６１抗体、ポリクローナル抗５８９１抗体、ポリクローナル抗９１３７抗体、ポリクローナル抗１３９０８抗体、ポリクローナル抗１４３１０抗体、ポリクローナル抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、ポリクローナル抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、ポリクローナル抗５３００３抗体、ポリクローナル抗９６５抗体、ポリクローナル抗５６６３９抗体、ポリクローナル抗９６６１抗体、ポリクローナル抗１６０５２抗体、ポリクローナル抗１５２１抗体、ポリクローナル抗６６６２抗体、ポリクローナル抗１３９１３抗体、ポリクローナル抗１２４０５抗体またはポリクローナル抗５０１４抗体は、上記に記載のように、適切な被験体を、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の免疫原で免疫することによって、調製され得る。免疫される被験体中における抗９１１８抗体力価、抗９９０抗体力価、抗１７６６２抗体力価、抗８１９８２抗体力価、抗６３０抗体力価、抗２１４７２抗体力価、抗１７６９２抗体力価、抗１９２９０抗体力価、抗２１６２０抗体力価、抗２１６８９抗体力価、抗２８８９９抗体力価、抗５３６５９抗体力価、抗６４５４９抗体力価、抗９４６５抗体力価、抗２３５４４抗体力価、抗７３６６抗体力価、抗２７４１７抗体力価、抗５７２５９抗体力価、抗２１８４４抗体力価、抗９４３抗体力価、抗２０６１抗体力価、抗５８９１抗体力価、抗９１３７抗体力価、抗１３９０８抗体力価、抗１４３１０抗体力価、抗１７６００抗体力価、抗２５５８４抗体力価、抗２７８２４抗体力価、抗２８４６９抗体力価、抗３８９４７抗体力価、抗５３００３抗体力価、抗９６５抗体力価、抗５６６３９抗体力価、抗９６６１抗体力価、抗１６０５２抗体力価、抗１５２１抗体力価、抗６６６２抗体力価、抗１３９１３抗体力価、抗１２４０５抗体力価または抗５０１４抗体力価は、標準的技術（例えば、免疫化した９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を用いる、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ））によって経時的にモニターされ得る。所望であれば、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４に対する抗体分子は、哺乳動物から（例えば、血液から）単離され得、さらに、ＩｇＧ画分を得るために、プロテインＡクロマトグラフィーのような、周知の技術によって精製され得る。免疫後の適切な時間で、例えば、抗９１１８抗体力価、抗９９０抗体力価、抗１７６６２抗体力価、抗８１９８２抗体力価、抗６３０抗体力価、抗２１４７２抗体力価、抗１７６９２抗体力価、抗１９２９０抗体力価、抗２１６２０抗体力価、抗２１６８９抗体力価、抗２８８９９抗体力価、抗５３６５９抗体力価、抗６４５４９抗体力価、抗９４６５抗体力価、抗２３５４４抗体力価、抗７３６６抗体力価、抗２７４１７抗体力価、抗５７２５９抗体力価、抗２１８４４抗体力価、抗９４３抗体力価、抗２０６１抗体力価、抗５８９１抗体力価、抗９１３７抗体力価、抗１３９０８抗体力価、抗１４３１０抗体力価、抗１７６００抗体力価、抗２５５８４抗体力価、抗２７８２４抗体力価、抗２８４６９抗体力価、抗３８９４７抗体力価、抗５３００３抗体力価、抗９６５抗体力価、抗５６６３９抗体力価、抗９６６１抗体力価、抗１６０５２抗体力価、抗１５２１抗体力価、抗６６６２抗体力価、抗１３９１３抗体力価、抗１２４０５抗体力価または抗５０１４抗体力価が最高のときに、抗体産生細胞は、被験体から得られ得、そして例えば、ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ（１９７５）Ｎａｔｕｒｅ２５６；４９５−４９７に初めに記載されるハイブリドーマ技術（Ｂｒｏｗｎら（１９８１）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１２７；５３９−４６；Ｂｒｏｗｎら（１９８０）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５５：４９８０−８３；Ｙｅｈら（１９７６）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７６：２９２７−３１；およびＹｅｈら（１９８２）Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ  ２９：２６９−７５）もまた参照のこと）、より最近のヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術（Ｋｏｚｂｏｒら（１９８３）Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｔｏｄａｙ  ４：７２）、ＥＢＶハイブリドーマ技術（Ｃｏｌｅら（１９８５）Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ、Ａｌａｎ  Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，７７−９６頁）またはトリオーマ技術のような標準的技術によって、モノクローナル抗体を調製するために使用され得る。モノクローナル抗体ハイブリドーマを産生するための技術は周知である（一般的に、Ｋｅｎｎｅｔｈ，Ｒ．Ｈ．Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｎｅｗ  Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎ  Ｉｎ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ  Ａｎａｌｙｓｅｓ，Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｒｐ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９８０）；Ｌｅｒｎｅｒ，Ｅ．Ａ．（１９８１）Ｙａｌｅ  Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｍｅｄ．５４：３８７−４０２；Ｇｅｆｔｅｒ，Ｍ．Ｌ．ら（１９７７）Ｓｏｍａｔｉｃ  Ｃｅｌｌ  Ｇｅｎｅｔ．３：２３１−３６を参照のこと）。要するに、不死化細胞株（代表的には骨髄腫細胞）が、上記に記載のように、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４の免疫原で免疫された哺乳動物からのリンパ球（代表的には脾臓細胞）と融合され、そして得られるハイブリドーマ細胞の培養物上清は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを同定するために、スクリーニングされる。
【０３９９】
リンパ球と不死化細胞株とを融合するために使用される任意の多くの周知のプロトコルが、抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体を生成する目的で使用され得る（例えば、Ｇ．Ｇａｌｆｒｅら（１９７７）Ｎａｔｕｒｅ  ２６６：５５０５２；Ｇｅｆｔｅｒら（１９７７）前述；Ｌｅｒｎｅｒ（１９８１）前述；およびＫｅｎｎｅｔｈ（１９８０）前述を参照のこと）。さらに、当業者は、これもまた有用であるような方法の多くのバリエーションがあることを認識する。代表的には、不死化細胞株（例えば、骨髄腫細胞）は、リンパ球と同じ哺乳動物種に由来する。例えば、マウスハイブリドーマは、本発明の免疫原性調製物で免疫されたマウスからのリンパ球と、不死化マウス細胞株とを融合することによって作製され得る。好ましい不死化細胞株は、ヒポキサンチン、アミノプテリンおよびチミジンを含む培養培地「ＨＡＴ培地」に感受性であるマウス骨髄細胞株である。任意の多くの骨髄細胞株（例えば、Ｐ３−ＮＳ１／１−Ａｇ４−１、Ｐ３−ｘ６３−Ａｇ８．６５３またはＳｐ２／Ｏ−Ａｇ１４骨髄細胞株）は、標準的技術に従って、融合パートナーとして使用され得る。このような骨髄細部株は、ＡＴＣＣから入手可能である。代表的に、ＨＡＴ感受性マウス骨髄細胞は、ポリエチレングリコール（「ＰＥＧ」）を用いて、マウス脾臓細胞と融合される。その融合から生じるハイブリドーマ細胞は、次にＨＡＴ培地を用いて選択され、その培地は、融合されない骨髄腫細胞および非増殖的に融合した骨髄細胞を殺す（融合しなかった脾臓細胞は、形質転換されていないので、数日後に死ぬ）。本発明のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞は、例えば、標準的なＥＬＩＳＡアッセイを用いて、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と結合する抗体のハイブリドーマ培養上清をスクリーニングすることによって、検出される。
【０４００】
モノクローナル抗体分泌ハイブリドーマを調製する代わりに、抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４を用いて組み換えコンビナトリアル免疫グロブリンライブラリー（例えば、抗体ファージディスプレイライブラリー）をスクリーニングすることによって、同定および単離され得、それによって９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４と結合する免疫グロブリンライブラリーメンバーを単離する。ファージディスプレイライブラリーを生成およびスクリーニングするためのキットは、市販されている（例えば、Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  Ｐｈａｇｅ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｓｙｓｔｅｍ，カタログ番号２７−９４００−０１；およびＳｔｒａｔａｇｅｎｅ  ＳｕｒｆＺＡＰ（登録商標）Ｐｈａｇｅ  Ｄｉｓｐｌａｙ  Ｋｉｔ，カタログ番号２４０６１２）。さらに、抗体ディスプレイライブラリーを生成およびスクリーニングする使用のために特に適した方法および試薬の例は、例えば、Ｌａｄｎｅｒら、米国特許第５，２２３，４０９号；Ｋａｎｇら、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／１８６１９；ＤｏｗｅｒらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９１／１７２７１；ＷｎｔｅｒらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／２０７９１；ＭａｒｋｌａｎｄらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／１５６７９；ＢｒｅｉｔｌｉｎｇらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９３／０１２８８；ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら，ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９２／０１０４７；ＧａｒｒａｒｄらＰＣ���国際公開番号ＷＯ９２／０９６９０；ＬａｄｎｅｒらＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９０／０２８０９；Ｆｕｃｈｓら（１９９１）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ９：１３７０−１３７２；Ｈａｙら（１９９２）Ｈｕｍ．Ａｎｔｉｂｏｄ．Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ  ３：８１−８５；Ｈｕｓｅら（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４６：１２７５−１２８１；Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓら（１９９３）ＥＭＢＯ  Ｊ  １２：７２５−７３４；Ｈａｗｋｉｎｓら（１９９２）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２６：８８９−８９６；Ｃｌａｒｋｓｏｎら（１９９１）Ｎａｔｕｒｅ  ３５２：６２４−６２８；Ｇｒａｍら（１９９２）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：３５７６−３５８０；Ｇａｒｒａｄら（１９９１）Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ９：１３７３−１３７７；Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍら（１９９１）Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１９：４１３３−４１３７；Ｂａｒｂａｓら（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８８：７９７８−７９８２；およびＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら（１９９０）Ｎａｔｕｒｅ  ３４８：５５２−５５４）において見られ得る。
【０４０１】
さらに、キメラ抗体およびヒト化モノクローナル抗体のような、ヒト部分および非ヒト部分の両方を包含し、標準的な組み換えＤＮＡ技術を用いて作製され得る、組み換え抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体は、本発明の方法の範囲内である。そのようなキメラ抗体およびヒト化モノクローナル抗体は、当該分野で公知の組み換えＤＮＡ技術、例えば、Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ８６／０２２６９；Ａｋｉｒａら、欧州特許出願第１８４，１８７号；Ｔａｎｉｇｕｃｈｉ，Ｍ．，欧州特許出願第１７１，４９６号；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら，欧州特許出願第１７３，４９４号；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら，ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ８６／０１５３３；Ｃａｂｉｌｌｙら，米国特許第４，８１６，５６７号；Ｃａｂｉｌｌｙら，欧州特許出願第１２５，０２３号；Ｂｅｔｔｅｒら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４０：１０４１−１０４３；Ｌｉｕら（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：３４３９−３４４３；Ｌｉｕら（１９８７）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３９：３５２１−３５２６；Ｓｕｎら（１９８７）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８４：２１４−２１８；Ｎｉｓｈｉｍｕｒａら（１９８７）Ｃａｎｃ．Ｒｅｓ．４７：９９９−１００５；Ｗｏｏｄら（１９８５）Ｎａｔｕｒｅ  ３１４：４４６−４４９；Ｓｈａｗら（１９８８）Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．８０：１５５３−１５５９；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｓ．Ｌ．（１９８５）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２９：１２０２−１２０７；Ｏｉら（１９８６）ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ４：２１４；Ｗｉｎｔｅｒ米国特許第５，２２５，５３９号；Ｊｏｈｎｅｓら（１９８６）Ｎａｔｕｒｅ  ３２１：５５２−５２５；Ｖｅｒｈｏｅｙａｎら（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ
２３９：１５３４；およびＢｅｉｄｌｅｒら（１９８８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４１：４０５３−４０６０に記載される方法を用いて産生され得る。
【０４０２】
抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体は、９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質の存在量および発現パターンを評価するために、（例えば、細胞溶解物または細胞上清中の）９１１８、９９０、１７６６２、８１９８２、６３０、２１４７２、１７６９２、１９２９０、２１６２０、２１６８９、２８８９９、５３６５９、６４５４９、９４６５、２３５４４、７３６６、２７４１７、５７２５９、２１８４４、９４３、２０６１、５８９１、９１３７、１３９０８、１４３１０、１７６００、２５５８４、２７８２４、２８４６９、３８９４７、５３００３、９６５、５６６３９、９６６１、１６０５２、１５２１、６６６２、１３９１３、１２４０５または５０１４のタンパク質を検出するために使用され得る。抗９１１８抗体、抗９９０抗体、抗１７６６２抗体、抗８１９８２抗体、抗６３０抗体、抗２１４７２抗体、抗１７６９２抗体、抗１９２９０抗体、抗２１６２０抗体、抗２１６８９抗体、抗２８８９９抗体、抗５３６５９抗体、抗６４５４９抗体、抗９４６５抗体、抗２３５４４抗体、抗７３６６抗体、抗２７４１７抗体、抗５７２５９抗体、抗２１８４４抗体、抗９４３抗体、抗２０６１抗体、抗５８９１抗体、抗９１３７抗体、抗１３９０８抗体、抗１４３１０抗体、抗１７６００抗体、抗２５５８４抗体、抗２７８２４抗体、抗２８４６９抗体、抗３８９４７抗体、抗５３００３抗体、抗９６５抗体、抗５６６３９抗体、抗９６６１抗体、抗１６０５２抗体、抗１５２１抗体、抗６６６２抗体、抗１３９１３抗体、抗１２４０５抗体または抗５０１４抗体は、臨床試験手順（例えば、所定の処置レジメンの効率を決定するために）の一部として、組織におけるタンパク質のレベルをモニタリングするために診断的に使用され得る。検出は、検出可能な物質に抗体を結合させる（すなわち、物理的連結）ことによって促進され得る。検出可能な物質の例としては、種々の酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、および放射性物質が挙げられる。適切な酵素の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、−ガラクトシダーゼまたはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ；適切な補欠分子団複合体の例としては、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられ；適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンが挙げられ；発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ；生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられ；そして適切な放射活物質の例としては、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓまたは３Ｈが挙げられる。
【０４０３】
本発明はさらに、限定と解釈されるべきではない以下の実施例によって例示される。本願、ならびに図面および配列表を通して引用される全ての参考文献、特許および公開された特許出願の内容は、本明細書中に参考として援用される。
【実施例】
【０４０４】
（実施例１）ＴＡＱＭＡＮＴＭ分析を使用しての組織配置
この実施例は、ＴａｑＭａｎＴＭの方法を記載する。ＴａｑＭａｎＴＭの方法は、定量的であり、ｍＲＮＡ検出に関して逆転写ＰＣＲに基づく研究方法である。ＲＴ−ＰＣＲ反応は、ＰＣＲの間、ＴａｑＭａｎＴＭのプローブを切断するために、ＡｍｐｌｉＴａｑ  ＧｏｌｄＴＭ  ＤＮＡポリメラーゼの５’ヌクレア−ゼ活性を活用する。簡単にいうと、ｃＤＮＡを、目的のサンプル（例えば、心臓、腎臓、肝臓、骨格筋および種々の血管）から生成し、そしてＰＣＲ増幅反応の開始材料として使用した。５’および３’の遺伝子特異的プライマーに加えて、遺伝子特異的オリゴヌクレオチドプローブ（増幅した領域に相補的）を反応に加えた（すなわち、ＴａｑＭａｎＴＭプローブ）。ＴａｑＭａｎＴＭプローブは、プローブの５’末端に共有結合した蛍光レポーター色素（例えば、ＦＡＭ（６−カルボキシフルオレセイン）、ＴＥＴ（６−カルボキシ−４，７，２’，７’−テトラクロロフルオレセイン）、ＪＯＥ（６−カルボキシ−４，５−ジクロロ−２，７−ジメトキシフルオレセイン）、またはＶＩＣ）、およびプローブの３’末端に失活色素（ＴＡＭＡＲＡ（６−カルボキシ−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチルローダミン））を有するオリゴヌクレオチドが挙げられる。
【０４０５】
ＰＣＲ反応の間、プローブの切断は、レポーター色素および失活色素を分離し、レポーターの蛍光の増加が生じる。ＰＣＲ産物の蓄積は、レポーター色素の蛍光の増加をモニタリングすることによって検出する。プローブが未処理の場合、レポーター色素が失活色素の近傍にあるのでレポーターの蛍光の制御が生じる。ＰＣＲの間、目的の標的が存在する場合、このプローブは、順方向プライマー部位と、逆方向プライマー部位との間に特異的にアニールする。ＡｍｐｌｉＴａｑ  ＧｏｌｄＴＭ  ＤＮＡポリメラーゼの５’−３’核酸分解活性は、プローブが標的にハイブリダイズする場合のみ、レポーターと失活剤との間のプローブを切断する。プローブ断片は、その後、標的からはがれ、そして鎖の重合が続く。プローブの３’末端は、ＰＣＲの間のプローブの伸長を防止するようブロックされる。この工程は、各サイクルで起こり、そして産物の指数関数的な蓄積を妨げない。ＲＮＡをトリゾール法を使用して調製し、そしてゲノムＤＮＡの混入を除くためにＤＮａｓｅで処置した。ｃＤＮＡを、標準的な技術を使用して合成した。逆転写酵素の非存在下でのモックｃＤＮＡ合成で、サンプル中にコントロール遺伝子のＰＣＲ増幅が検出されないことから、ゲノムＤＮＡの混入の除去が効果的であることを確認する。
【０４０６】
（等価物）
当業者は、過剰な実験を行うことなく、本発明の明細書中に記載の特定の実施例に対する多くの等価物を認識し、確認することができる。添付の特許請求の範囲は、このような等価物を包含する。
【配列表】
2006518593000001.app
【国際調査報告】
2006518593.tif 000002
2006518593.tif 000003
2006518593.tif 000004
2006518593.tif 000005