【手続補正書】
【提出日】令和1年11月7日(2019.11.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料中の各成分をクロマトグラフにより時間方向に分離した後に、質量分析計により各成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するクロマトグラフ質量分析方法において、
a)複数の生体試料の各々に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより、複数の分析用生体試料を準備する第１準備工程と、
b)標準試料に前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記生体試料と同じ前処理を行うことにより分析用標準試料を準備する第２準備工程と、
c)前記複数の分析用生体試料を一組として、まとめて分析する第１分析工程と、
d)前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に、前記分析用標準試料を分析する第２分析工程と、
e)前記複数の分析用生体試料をそれぞれ分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルから、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度を求めるとともに、複数の分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬のうち少なくとも１種に対応するピーク強度の中央値又は平均値を求め、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度が、前記中央値又は前記平均値を中心とする所定範囲内にあるか否かに基づき、各生体試料の質及び前記第１準備工程を評価する第１評価工程と、
f)前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に、前記分析用標準試料を分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルにより、前記前処理の質及び／又は分析の質を評価する第２評価工程と、
を備える、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項２】
試料中の各成分をクロマトグラフにより時間方向に分離した後に、質量分析計により各成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出するクロマトグラフ質量分析方法において、
a)複数の生体試料の各々に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより、複数の分析用生体試料を準備する第１準備工程と、
b)標準試料に前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記生体試料と同じ前処理を行うことにより分析用標準試料を準備する第２準備工程と、
c)前記複数の分析用生体試料を一組として、まとめて分析する第１分析工程と、
d)前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に、前記分析用標準試料を分析する第２分析工程と、
e)前記複数の分析用生体試料をそれぞれ分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルに、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するイオンのピークが現れているか否かに基づき、各生体試料の質を評価する第１評価工程と、
f)前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に、前記分析用標準試料を分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルにより、前記前処理の質及び／又は分析の質を評価する第２評価工程と、
を備える、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項３】
請求項１に記載のクロマトグラフ質量分析方法において、
前記第１準備工程では、さらに、前記複数の生体試料の各々に、生体内に含まれない内部標準試薬を添加し、
前記第１評価工程では、前記分析用標準試料と前記複数の分析用生体試料をそれぞれ分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルから、前記分析用標準試料と各分析用生体試料に含まれる前記内部標準試薬又は前記安定同位体試薬に対応するピーク強度を求めるとともに、複数の分析用生体試料に含まれる前記内部標準試薬又は前記安定同位体試薬の少なくとも１種に対応するピーク強度の中央値又は平均値を求め、各分析用生体試料に含まれる前記内部標準試薬又前記安定同位体試薬に対応するピーク強度が、前記中央値又は前記平均値を中心とする所定範囲内にあるか否かに基づき、各生体試料の質及び前記第１準備工程を評価する、
クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項４】
請求項２に記載のクロマトグラフ質量分析方法において、
前記第１準備工程では、さらに、前記複数の生体試料の各々に、生体内に含まれない内部標準試薬を添加し、
前記第１評価工程では、前記複数の分析用生体試料をそれぞれ分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルに、各分析用生体試料に含まれる前記内部標準試薬又は前記安定同位体試薬に対応するイオンのピークが現れているか否かに基づき、各生体試料の質を評価する、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれかに記載のクロマトグラフ質量分析方法において、
前記安定同位体試薬が、１３Ｃ３-乳酸、１３Ｃ２-シュウ酸、２Ｈ３-サルコシン、２Ｈ８-バリン、１３Ｃ３-ジヒドロキシアセトン、２Ｈ１０-イソロイシン、１３Ｃ４-フマル酸、１３Ｃ４-リンゴ酸、２Ｈ３-アスパラギン酸、１３Ｃ５-グルタミン酸、１３Ｃ６-４−ヒドロキシ安息香酸、２Ｈ３-ラウリン酸、１３Ｃ５-リボース、１３Ｃ２-タウリン、２Ｈ４-クエン酸、２Ｈ７-オルニチン、１３Ｃ６-チロシン、１３Ｃ6-dopa、２Ｈ６-キヌレニン、２Ｈ８-シスタミン、１３Ｃ１１-トリプトファン、２Ｈ３-２−ヒドロキシ酪酸のうちの少なくとも１種である、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項６】
請求項１〜５のいずれかに記載のクロマトグラフ質量分析方法において、さらに、
前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に装置評価用試料を分析する第３分析工程と、
前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に前記装置評価用試料を分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマスクロマトグラム又はマススペクトルにより、分析に用いられたクロマトグラフ又は質量分析計の異常を評価する第３評価工程と  
を備える、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項７】
請求項６に記載のクロマトグラフ質量分析方法において、
前記装置評価用試料が、炭素数が７〜３３のノルマルアルカンから選択される複数種のノルマルアルカンを含み、
前記第第３評価工程が、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に前記装置評価用試料を分析することにより得られたデータに基づいて作成されるクロマトグラムから前記ノルマルアルカンの保持時間を求め、これら保持時間を比較することにより前記クロマトグラフのカラムの異常を評価する、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項８】
請求項６に記載のクロマトグラフ質量分析方法において、
前記装置評価用試料が、オクタフルオロナフタレン溶液を含み、
前記第３評価工程が、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に前記装置評価用試料を分析することにより得られたデータに基づいて作成される、前記オクタフルオロナフタレンに対応する質量電荷比のマスクロマトグラムを比較することにより、前記質量分析計の異常を評価する、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項９】
請求項１〜８のいずれかに記載のクロマトグラフ質量分析方法において、
前記分析用生体試料及び前記分析用標準試料が、前記安定同位体試薬として、１３Ｃ６-４−ヒドロキシ安息香酸を含む、クロマトグラフ質量分析方法。
【請求項１０】
試料中の各成分を時間方向に分離するクロマトグラフと、該クロマトグラフにより時間方向に分離された成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出する質量分析計とを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置において、
a)複数の生体試料の各々に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより準備された複数の分析用生体試料を一組としてまとめて分析する手順と、標準試料に、前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記分析用生体試料と同じ前処理を行うことにより準備された分析用標準試料を、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析する手順とからなる分析メソッドファイルを記憶するメソッドファイル記憶部と、
b)前記メソッドファイル記憶部に記憶されている前記分析メソッドファイル中の手順に従い分析を実行する分析実行部と、
c)前記質量分析計により得られたデータに基づいてマスクロマトグラム及びマススペクトルを作成するグラフ作成部と、
d)前記グラフ作成部によって作成された、前記分析用標準試料と前記複数の分析用生体試料のマススペクトルから、該分析用標準試料と各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度を求めるとともに、前記複数の分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬の少なくとも１種に対応するピーク強度の中央値又は平均値を求め、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度が、前記中央値又は前記平均値を中心とする所定範囲内にあるか否かに基づき、生体試料の質、及び前記分析実行部が実行する前記複数の分析用生体試料の分析を評価する第１評価部と、
e)前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析された前記分析用標準試料のマススペクトルから、前記前処理の質及び／又は分析の質を評価する第２評価部と、
を備える、クロマトグラフ質量分析装置。
【請求項１１】
試料中の各成分を時間方向に分離するクロマトグラフと、該クロマトグラフにより時間方向に分離された成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出する質量分析計とを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置において、
a)複数の生体試料の各々に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより準備された複数の分析用生体試料を一組としてまとめて分析する手順と、標準試料に、前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記分析用生体試料と同じ前処理を行うことにより準備された分析用標準試料を、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析する手順とからなる分析メソッドファイルを記憶するメソッドファイル記憶部と、
b)前記メソッドファイル記憶部に記憶されている前記分析メソッドファイル中の手順に従い分析を実行する分析実行部と、
c)前記質量分析計により得られたデータに基づいてマスクロマトグラム及びマススペクトルを作成するグラフ作成部と、
d)前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料のマススペクトルから、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するイオンのピークが検出されているか否かに基づき、各生体試料の質を評価する第１評価部と
e)前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析された前記分析用標準試料のマススペクトルから、前記前処理及び／又は分析の質を評価する第２評価部と
を備える、クロマトグラフ質量分析装置。
【請求項１２】
前記複数の分析用生体試料が、複数の生体試料に、生体内に含まれない内部標準試薬と前記安定同位体試薬の少なくとも１種を添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより準備されたものであることを特徴とする請求項１０又は１１に記載のクロマトグラフ質量分析装置。
【請求項１３】
前記安定同位体試薬が、１３Ｃ３-乳酸、１３Ｃ２-シュウ酸、２Ｈ３-サルコシン、２Ｈ８-バリン、１３Ｃ３-ジヒドロキシアセトン、２Ｈ１０-イソロイシン、１３Ｃ４-フマル酸、１３Ｃ４-リンゴ酸、２Ｈ３-アスパラギン酸、１３Ｃ５-グルタミン酸、１３Ｃ６-４−ヒドロキシ安息香酸、２Ｈ３-ラウリン酸、１３Ｃ５-リボース、１３Ｃ２-タウリン、２Ｈ４-クエン酸、２Ｈ７-オルニチン、１３Ｃ６-チロシン、１３Ｃ6-dopa、２Ｈ６-キヌレニン、２Ｈ８-シスタミン、１３Ｃ１１-トリプトファン、２Ｈ３-２−ヒドロキシ酪酸のうちの少なくとも１種である、請求項１０〜１２のいずれかに記載のクロマトグラフ質量分析装置。
【請求項１４】
前記分析メソッドファイルが、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に装置評価用試料を分析する手順を含み、
前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析された前記装置評価用試料のマスクロマトグラム又はマススペクトルから、分析に用いられたクロマトグラフ又は質量分析計の異常を評価する第３評価部を、さらに備えることを特徴とする請求項１０〜１３のいずれかに記載のクロマトグラフ質量分析装置。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
上記課題を解決するために成された本発明の第１態様に係るクロマトグラフ質量分析方法は、試料中の各成分をクロマトグラフにより時間方向に分離した後に、質量分析計により各成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出する方法であって、
a)複数の生体試料の各々に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより、複数の分析用生体試料を準備する第１準備工程と、
b)標準試料に前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記生体試料と同じ前処理を行うことにより分析用標準試料を準備する第２準備工程と、
c)前記複数の分析用生体試料を一組として、まとめて分析する第１分析工程と、
d)前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に、前記分析用標準試料を分析する第２分析工程と、
e)前記複数の分析用生体試料をそれぞれ分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルから、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度を求めるとともに、複数の分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬のうち少なくとも１種に対応するピーク強度の中央値又は平均値を求め、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度が、前記中央値又は前記平均値を中心とする所定範囲内にあるか否かに基づき、各生体試料の質及び前記第１準備工程を評価する第１評価工程と、
f)前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に、前記分析用標準試料を分析することにより得られたデータに基づいて作成されるマススペクトルにより、前記前処理の質及び／又は分析の質を評価する第２評価工程と
を備えることを特徴とする。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
本発明に係る質量分析方法において、安定同位体試薬とは、生体試料に含まれる生体内代謝産物として知られている物質を構成するいくつかの原子をその原子の安定同位体元素で置き換えたものをいう。安定同位体試薬としては、１３Ｃ３-乳酸、１３Ｃ２-シュウ酸、２Ｈ３-サルコシン、２Ｈ８-バリン、１３Ｃ３-ジヒドロキシアセトン、２Ｈ１０-イソロイシン、１３Ｃ４-フマル酸、１３Ｃ４-リンゴ酸、２Ｈ３-アスパラギン酸、１３Ｃ５-グルタミン酸、１３Ｃ６-４−ヒドロキシ安息香酸、２Ｈ３-ラウリン酸、１３Ｃ５-リボース、１３Ｃ２-タウリン、２Ｈ４-クエン酸、２Ｈ７-オルニチン、１３Ｃ６-チロシン、１３Ｃ6-dopa、２Ｈ６-キヌレニン、２Ｈ８-シスタミン、１３Ｃ１１-トリプトファン、２Ｈ３-２−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。生体試料に添加する安定同位体試薬は１種類でも良く複数種類でも良い。添加する安定同位体試薬の種類や数は、分析対象となる生体試料の種類、該生体試料に含まれる生体内代謝産物のうち解析対象となる生体内代謝産物の種類や数に応じて決定される。生体内代謝産物は、被検者から生体試料を採取する際に行われる様々な処理（例えば生体試料が血清や血漿の場合は抗凝血剤の混合、遠心分離、冷蔵保存等）、及びクロマトグラフ質量分析のための前処理（除タンパク質処理、オキシム化等）の条件や手順等の違いによって、その含有量が変動し易い。本発明においては、このような安定同位体試薬を少なくとも１種、添加された分析用生体試料を複数準備し、これら複数の分析用生体試料を一組としてまとめて分析する。「まとめて分析する」とは、複数の分析用生体試料を並行して分析する場合、連続的に分析する場合のいずれの場合をも含む。一組の分析用生体試料は、同じグループに属する被検者から採取された複数の生体試料から構成されていても良く、異なるグループに属する被検者から採取された複数の生体試料から構成されていても良い。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１９】
また、そもそも生体試料に問題がある場合には、その生体試料に対応する分析用生体試料のマススペクトルに現れるはずのピーク（つまり分析用生体試料に含まれる安定同位体試薬に対応するイオンのピーク）が現れない。そこで、本発明の第２態様では第１評価工程において、前記複数の分析用生体試料をまとめて分析することにより得られた各データに基づき該分析用生体試料のマススペクトルを作成し、該マススペクトルに、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するイオンのピークが現れているか否かに基づき、各生体試料の質を評価する。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
さらに、一組の分析用生体試料の分析の前後に装置評価用試料を分析し、これにより得られたデータに基づいて作成されるマスクロマトグラム又はマススペクトルを比較することにより、クロマトグラフ又は質量分析計の異常を評価することができる。ここで、装置評価用試料としては、炭素数が７〜３３のノルマルアルカンから選択される複数種を含む溶液、又はオクタフルオロナフタレンを含む溶液を採用することができる。前者を用いることにより、クロマトグラフのカラムの異常を評価することができ、後者を用いることにより、質量分析計の異常を評価することができる。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２６】
また、本発明の対象にはクロマトグラフ質量分析装置が含まれる。
すなわち、本発明の第１態様に係る質量分析装置は、試料中の各成分を時間方向に分離するクロマトグラフと、該クロマトグラフにより時間方向に分離された成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出する質量分析計とを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置であって、
a)複数の生体試料の各々に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより準備された複数の分析用生体試料を一組としてまとめて分析する手順と、標準試料に、前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記分析用生体試料と同じ前処理を行うことにより準備された分析用標準試料を、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析する手順とからなる分析メソッドファイルを記憶するメソッドファイル記憶部と、
b)前記メソッドファイル記憶部に記憶されている前記分析メソッドファイル中の手順に従い分析を実行する分析実行部と、
c)前記質量分析計により得られたデータに基づいてマスクロマトグラム及びマススペクトルを作成するグラフ作成部と、
d)前記グラフ作成部によって作成された、前記分析用標準試料と前記複数の分析用生体試料のマススペクトルから、前記分析用標準試料と各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度を求めるとともに、前記複数の分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬の少なくとも１種に対応するピーク強度の中央値又は平均値を求め、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するピーク強度が、前記中央値又は前記平均値を中心とする所定範囲内にあるか否かに基づき、生体試料の質、及び前記分析実行部が実行する前記複数の分析用生体試料の分析を評価する第１評価部と、
e)前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析された前記分析用標準試料のマススペクトルを比較することにより、前記前処理及び／又は分析の質を評価する第２評価部とを備えることを特徴としている。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２７】
また、本発明の第２態様に係る質量分析装置は、試料中の各成分を時間方向に分離するクロマトグラフと、該クロマトグラフにより時間方向に分離された成分由来のイオンを質量電荷比に応じて分離して検出する質量分析計とを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置であって、
a)複数の生体試料に、該生体試料に含まれる所定の生体内代謝産物を同位体で標識した安定同位体試薬を少なくとも１種添加し、クロマトグラフ質量分析のための所定の前処理を行うことにより準備された複数の分析用生体試料を一組としてまとめて分析する手順と、標準試料に、前記分析用生体試料に添加されたものと同じ安定同位体試薬を添加し、前記分析用生体試料と同じ前処理を行うことにより準備された分析用標準試料を、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析する手順とからなる分析メソッドファイルを記憶するメソッドファイル記憶部と、
b)前記メソッドファイル記憶部に記憶されている前記分析メソッドファイル中の手順に従い分析を実行する分析実行部と、
c)前記質量分析計により得られたデータに基づいてマスクロマトグラム及びマススペクトルを作成するグラフ作成部と、
d)前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料のマススペクトルから、各分析用生体試料に含まれる前記安定同位体試薬に対応するイオンのピークが検出されているか否かに基づき、各生体試料の質を評価する第１評価部と
e)前記グラフ作成部によって作成された、前記複数の分析用生体試料の分析の前及び後に分析された前記分析用標準試料のマススペクトルから、前記前処理の質及び／又は分析の質を評価する第２評価部とを備えることを特徴としている。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３４】
分析情報記憶部６は、メソッドファイルを記憶するメソッドファイル記憶部６１と、バッチファイルを記憶するバッチファイル記憶部６２と、試料に含まれる全ての目的成分について、保持時間、標準マススペクトル、特徴的な質量電荷比（例えば定量イオン及び確認イオンの質量電荷比）、試料の質等を評価するために用いられる情報（安定同位体試薬由来の検出イオンや、装置評価用試料に含まれる基準化合物由来の検出イオン等の質量電荷比及び／又は保持時間、試料や装置自身を評価するためのマスピーク強度閾値など）が格納された評価情報記憶部６３と、分析結果データベース６４と、評価結果データベース６５等を備えている。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３５】
バッチファイル記憶部６２に記憶されているバッチファイルは、連続的に実行される複数の試料の分析について該試料が収容されたバイアルのＩＤと分析に適用するメソッドファイルとが記述されたファイルから成る。バッチファイルは、これに記述される、バイアルのＩＤやメソッドファイルの種類等をユーザが入力部７を介して入力することにより図示しない制御部が作成するようにしても良く、分析に供される試料が収容されたバイアルがＧＣ−ＭＳにセットされると、該バイアルに付与されたＩＤが読み取られ、制御部が自動的に作成するようにしても良い。後述するように、本実施形態に係るＧＣ−ＭＳでは、１又は２種類の装置評価用試料、１個の標準生体試料、複数の生体試料の分析を１バッチとして、これら複数の試料を連続的に実行する。メソッドファイルには、分析に用いられるＧＣ部１の試料気化室１０の温度、カラムオーブン１３の温度、カラム１２の径及び長さ、固定相の種類及び粒子径、移動相の種類及び流量、ＭＳ部２のイオン源２０の温度、イオン検出器２２の種類、質量電荷比の範囲、等が含まれる。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３６】
データ収集部４１は、分析の実行に伴って上述したように入力されるデータを収集して実測データ記憶部５に格納する。測定終了後に、入力部７を介してデータ評価処理（目的の定量処理）の実行の指示を受けると、評価処理部４５は実測データ記憶部５から装置評価用試料、標準試料、生体試料の実測データを読み出すとともに、評価情報記憶部６３からデータの評価に関する情報を読み出し、各バッチの分析データに基づいて、後述する特徴的な評価処理を実行する。評価処理部４５が、本発明の第１〜第３評価部に相当する。また、結果表示処理部４６はその評価処理の結果を評価結果データベース６５に格納するとともに該評価結果を表示部８に表示する。成分抽出部４２は、生体試料に含まれる目的成分について、定量イオン又は確認イオンの質量電荷比におけるマスクロマトグラムに基づいて、該成分の定量を行い、結果表示処理部４６はその定量分析結果を表示部８に表示する。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４５】
＜３  評価基準＞
評価処理部４５は、各バッチの分析結果に基づき作成されるマススペクトル及びマスクロマトグラムから、以下に示す評価基準に従って一組の分析用血漿のデータの質を評価した。
＜３．１  分析用血漿のデータの除外基準＞
（１）一組の分析用血漿の各々の分析結果に基づき作成されたマススペクトルにおいて、所定の内部標準試薬（例えば２-イソプロピルリンゴ酸）、１種又は複数種の安定同位体試薬（例えば、１３Ｃ６-４−ヒドロキシ安息香酸）に対応するイオンのピーク強度が、一組の分析用血漿のデータのうち中央の４個のデータの平均値の±５０％の範囲から外れていること。
（２）一組の分析用血漿の各々の分析結果に基づき作成されたマススペクトルにおいて、分析用血漿に添加されている安定同位体試薬に対応するイオンのピークが検出されないこと。
（３）１バッチの分析が途中で停止したこと。
（４）或るバッチの一組の分析用血漿の分析の前及び後に行われた、分析用標準血漿の分析結果に基づき作成されたマスクロマトグラムから求められる安定同位体試薬のピーク強度が所定の範囲からはずれていること。
（５）或るバッチの一組の分析用血漿の分析の前及び後に行われた、nアルカンの分析結果に基づき作成されたマスクロマトグラムから求められる、炭素数が同じnアルカンの保持時間の差が１．５秒以上あること。
（６）或るバッチの一組の分析用血漿の分析の前及び後に行われた、ＯＦＮの分析結果に基づき作成される、所定の保持時間のマススペクトルに現れるピーク強度が所定の範囲からはずれていること。
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４８】
表１に、７２９個の分析用血漿のバッチ構成及び分析スケジュールを示す。表１には、分析用血漿（検体）及び分析用標準血漿（ＱＣ）のみ示しているが、１つのバッチ分析には、装置評価用試料（nアルカン、ＯＦＮ）の分析が含まれる。例えばステージ２の大腸がん患者１３５人分の分析用血漿は、健常者１３５人分の分析用血漿と合わせて２７組に分け、これら２７組の分析用血漿を、それぞれ装置評価用試料（nアルカン、ＯＦＮ）、分析用標準血漿（ＱＣ）とともにバッチ分析した。
【表１】
2018169377.tif 000001
【手続補正１３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５４】
さらに、解析対象となる生体内代謝産物が３種類である場合でも、それら３種の生体内代謝産物の特性が類似する場合は、１種類の安定同位体試薬を生体試料に添加して分析用生体試料としても良い。
【手続補正１４】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図４】
2018169377.tif 000002