【事件の表示】
　特願２０１５−５０９２０７「上皮成長因子受容体を結合する活性化可能抗体及びその使用方法」拒絶査定不服審判事件〔平成２５年１０月３１日国際公開、ＷＯ２０１３／１６３６３１、平成２７年　６月１８日国内公表、特表２０１５−５１６８１３〕について、次のとおり審決する。
【結　論】
　本件審判の請求は、成り立たない。
【理　由】
第１　手続の経緯
　本願は、平成２５年　４月２６日（パリ条約による優先権主張　２０１２年　４月２７日　（ＵＳ）アメリカ合衆国、２０１２年　６月２０日　（ＵＳ）アメリカ合衆国、２０１３年　１月　４日　（ＵＳ）アメリカ合衆国、２０１３年　１月　７日　（ＵＳ）アメリカ合衆国、２０１３年　２月１１日　（ＵＳ）アメリカ合衆国）を国際出願日とする出願であって、平成３０年　９月２５日付けで拒絶査定がなされ、これに対して、平成３１年　２月　１日に拒絶査定不服審判請求がなされるとともに手続補正がなされたものである。その後の当審における手続の経緯は、以下のとおりである。
　　　令和　１年　８月２９日付け　上申書
　　　令和　２年　２月２８日付け　拒絶理由通知書
　　　令和　２年　５月２９日付け　意見書
第２　本願発明
　本願の請求項１〜７０に係る発明は、平成３１年　２月　１日付け手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１〜７０に記載されたとおりのものであるところ、その請求項１に係る発明は、次のとおりのものである（以下、「本願発明」という。）。
「【請求項１】上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）を、活性化された状態下で結合する活性化可能抗体であって、抗体又はその抗原結合フラグメント（ＡＢ）、マスキング部分（ＭＭ）、及び、前記ＡＢと前記ＭＭとを連結する切断可能部分（ＣＭ）とを含み、
　前記ＡＢは、ＥＧＦＲに対して特異的に結合すると共に、（ｉ）配列番号２６を含むＨ鎖アミノ酸配列及び配列番号６８を含むＬ鎖アミノ酸配列、又は（ii）配列番号２を含むＨ鎖アミノ酸配列及び配列番号６８を含むＬ鎖アミノ酸配列を含み；
　前記ＭＭは、前記ＣＭが切断されていない状態で、前記活性化可能抗体のＥＧＦＲに対する結合を阻害し、ここで、前記マスキング部分はアミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹ（配列番号１４）を含み；及び
　前記ＣＭは、プロテアーゼのための基質として機能するポリペプチドであり、そしてアミノ酸配列ＬＳＧＲＳＤＮＨ（配列番号１３）を含み、
　ここで、前記活性化可能抗体は、前記ＣＭが切断されていない状態で、次のようなＮ−末端からＣ−末端への構造配置：ＭＭ−ＣＭ−ＡＢ又はＡＢ−ＣＭ−ＭＭを有する、活性化可能抗体。」
第３　当審で通知した拒絶の理由
　令和　２年　２月２８日付けで当審が通知した拒絶理由の概要は、請求項１〜７０に係る発明は、本願優先日前に頒布された刊行物である引用文献１〜３に記載された発明に基いて、当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない、というものである。
第４　引用文献の記載事項
　当審の拒絶理由で引用文献１として引用した、本願優先日前に頒布された刊行物である国際公開第２０１０／０８１１７３号（以下、「引用文献１」という。）には、以下の事項が記載されている（英語で記載されているため、日本語訳で摘記する。下線は合議体による。）。
ア．「請求項１０４．
活性化可能抗体（ＡＡ）であって、
　（ａ）その標的と特異的に結合することができる抗体または抗体フラグメント（ＡＢ）と、
　（ｂ）前記ＡＢとその標的との特異的結合を阻害することができる、前記ＡＢとカップリングしたマスキング部分（ＭＭ）と、
　（ｃ）酵素によって特異的に切断することができる前記ＡＢとカップリングした切断可能部分（ＣＭ）と
を含み、
　前記ＡＡが前記ＣＭを切断するために十分な酵素活性の存在下にない場合に、前記ＭＭが、前記ＡＡが前記ＣＭを切断するために十分な酵素活性の存在下にあって前記ＭＭが前記ＡＢとその標的との特異的結合を阻害しない場合と比較して、前記ＡＢとその標的との特異的結合を少なくとも９０％低下させる、活性化可能抗体（ＡＡ）
・・・・・・・・・・・・
請求項１１８．前記ＡＢが表２の抗体からなる群より選択される、請求項１０４に記載のＡＡ。
請求項１１９．前記ＡＢが、
セツキシマブ
請求項１２０．前記標的が表１の標的からなる群より選択される、請求項１０４に記載のＡＡ。
請求項１２１．前記標的が、
ＥＧＦＲ
・・・・・・・・・・・・
請求項１２４．前記ＣＭが表３の酵素からなる群より選択される酵素の基質である、請求項１０４に記載のＡＡ。
請求項１２５．前記ＣＭが、レグマイン、プラスミン、ＴＭＰＲＳＳ−３／４、ＭＭＰ−９、ＭＴ１−ＭＭＰ、カテプシン、カスパーゼ、ヒト好中球エラスターゼ、ベータ−セクレターゼ、
ｕＰＡ
　
イ．「例えば、ＡＡは、以下の式（
アミノ（Ｎ）末端領域からカルボキシル（Ｃ）末端領域への順序
　　
（ＭＭ）−（ＣＭ）−（ＡＢ）
　　
（ＡＢ）−（ＣＭ）−（ＭＭ）
によって表すことができ、ＭＭはマスキング部分であり、ＣＭは切断可能部分であり、ＡＢは抗体またはそのフラグメントである。ＭＭおよびＣＭは上記式中で明確な構成要素として示すが、本明細書中に開示するすべての例示的な実施形態（式が含まれる）において、ＭＭおよびＣＭのアミノ酸配列が、たとえばＣＭが完全にまたは部分的にＭＭ内に含有されるように重なることができることが企図されることに注意されたい。さらに、上記式は、ＡＡ要素のＮ末端またはＣ末端側に位置し得るさらなるアミノ酸配列を提供する。」（［００１２７］）
　
ウ．「
」（表２）
　
エ．「実施例１６：抗ＥＧＦＲ　ＩｇＧ　ＡＡの構築
抗ＥＧＦＲ　ＩｇＧ抗体の構築
　Ｂｅｓｓｅｔｔｅら、Ｍｅｔｈｏｄｓ　ｉｎ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｌｏｇｙ、第２３１巻に記載のように、オリゴＣＸ６３８〜ＣＸ６５５を用いてＣ２２５軽鎖可変領域の遺伝子をアセンブリＰＣＲによって合成した。生じた生成物をＢａｍＨＩ／ＮｏｔＩで消化し、ＢａｍＨＩ／ＮｏｔＩで消化したｐＸＭａｌの大きな断片とライゲーションさせ、プラスミドｐＸ−ｓｃＦｖ２２５−Ｖｋを作製した。同様に、オリゴＣＸ６５６〜ＣＸ６７７を用いてＣ２２５重鎖可変領域の遺伝子をアセンブリＰＣＲによって合成し、ＢｇｌＩＩ／ＮｏｔＩで消化し、ｐＸＭａｌのＢａｍＨＩ／ＮｏｔＩとライゲーションさせて、プラスミドｐＸ−ｓｃＦｖ２２５−Ｖｈを作製した。その後、可変軽鎖遺伝子をｐＸ−ｓｃＦｖ２２５−ＶｋからＢａｍＨＩ／ＮｏｔＩ断片としてｐＸ−ｓｃＦｖ２２５−Ｖｈプラスミド内にＢａｍＨＩ／Ｎｏｔでクローニングして、Ｃ２２５に基づくｓｃＦｖ遺伝子を含有するプラスミドｐＸ−ｓｃＦｖ２２５ｍ−ＨＬを作製した。
　ＩＬ２シグナル配列をｐＩＮＦＵＳＥ−ｈＩｇＧ１−Ｆｃ２（ＩｎｖｉｖｏＧｅｎ）からＫａｓＩ／ＮｃｏＩ断片として、ＫａｓＩ／ＮｃｏＩで消化したｐＦＵＳＥ２−ＣＬＩｇ−ｈｋ（ＩｎｖｉｖｏＧｅｎ）に移動させ、プラスミドｐＦＩＬ２−ＣＬ−ｈｋがもたらされた。また、ＩＬ２シグナル配列をｐＩＮＦＵＳＥ−ｈＩｇＧ１−Ｆｃ２からＫａｓＩ／ＥｃｏＲＩ断片として、ＫａｓＩ／ＥｃｏＲＩで消化したｐＦＵＳＥ−ＣＨＩｇ−ｈＧ１（ＩｎｖｉｖｏＧｅｎ）（大きなおよび中程度の断片）に３方向ライゲーションで移動させ、プラスミドｐＦＩＬ−ＣＨＩｇ−ｈＧ１がもたらされた。
　ヒトＩｇＧ軽鎖定常領域を、プラスミドｐＦＩＬ２−ＣＬ−ｈｋからのオリゴＣＸ３２５／ＣＸ６８８を用いた増幅、ＢｓｉＷＩ／ＮｈｅＩでの消化、およびｐＦＩＬ２−ＣＬ−ｈｋのＢｓｉＷＩ／ＮｈｅＩ内へのクローニングによって、部位特異的に突然変異させて、プラスミドｐＦＩＬ２−ＣＬ２２５がもたらされた。
　ヒトＩｇＧ重鎖定常領域を、プラスミドｐＦＩＬ−ＣＨＩｇ−ｈＧ１からのオリゴＣＸ３２５／ＣＸ６８９、ＣＸ６９０／ＣＸ６９２、およびＣＸ６９３／ＣＸ６９４を用いた３つのセグメントでの増幅、次いで外部プライマーＣＸ３２５／ＣＸ６９４を用いた３つすべての生成物の重複ＰＣＲによって、部位特異的に突然変異させた。生じた生成物をＥｒｏＲＩ（合議体注：「ＥｃｏＲＩ」の誤記と認める。）／ＡｖｒＩＩで消化し、ｐＩＮＦＵＳＥ−ｈＩｇＧ１−Ｆｃ２のＥｃｏＲＩ／ＮｈｅＩ内にクローニングして、プラスミドｐＦＩＬ−ＣＨ２２５がもたらされた。
　可変軽鎖遺伝子セグメントをｐＸ−ｓｃＦｖ２２５ｍ−ＨＬからオリゴＣＸ６９５／ＣＸ６９６を用いて増幅し、ＢｓａＩで消化し、ｐＦＩＬ２−ＣＬ２２５のＥｃｏＲＩ／ＢｓｉＷＩ内にクローニングして、Ｃ２２５軽鎖発現ベクターｐＦＩＬ２−Ｃ２２５−軽がもたらされた。
　可変重鎖遺伝子セグメントをｐＸ−ｓｃＦｖ２２５ｍ−ＨＬからオリゴＣＸ６９７／ＣＸ６９８を用いて増幅し、ＢｓａＩで消化し、ｐＦＩＬ−ＣＨ２２５のＥｃｏＲＩ／ＮｈｅＩ内にクローニングして、Ｃ２２５重鎖発現ベクターｐＦＩＬ−Ｃ２２５−重がもたらされた。
・・・・・・・・・・・・
抗ＥＧＦＲ　ＡＡの発現ベクターの構築
　プラスミドｐＸ−ｓｃＦｖ２２５ｍ−ＨＬを、プライマーＣＸ７３０／ＣＸ７３１およびＣＸ７３２／ＣＸ７３３を用いた別々の反応でＰＣＲ増幅し、生じた生成物を、外部プライマーＣＸ７３０／ＣＸ７３３を用いた重複ＰＣＲによって増幅し、ＢｇｌＩＩ／ＮｏｔＩで消化し、ｐＸＭａｌのＢａｍＨＩ／ＮｏｔＩ内にクローニングして、プラスミドｐＸ−ｓｃＦｖ２２５ｍ−ＬＨがもたらされた。
　リンカー配列を、重複順方向プライマーＣＸ７４０、ＣＸ７４１および逆方向プライマーＣＸ３７０を用いた反応において、ｐＦＵＳＥ−ｈＩｇＧ−Ｆｃ２のＰＣＲ増幅によって、ヒトＩｇＧ　Ｆｃ断片の遺伝子のＮ末端側に付加した。生じた生成物をＥｃｏＲＩ／ＢｇｌＩＩで消化し、約１１５ｂｐの断片をｐＦＵＳＥ−ｈＩｇＧ−Ｆｃ２のＥｃｏＲＩ／ＢｇｌＩＩ内にクローニングした。生じたプラスミドをＫｐｎＩ／ＢｇｌＩＩで消化し、大きな断片を、ＫｐｎＩ／ＢａｍＨＩで消化した、ｐＸ−ｓｃＦｖ２２５ｍ−ＬＨをオリゴＣＸ７３６／ＣＸ７３５を用いて増幅したＰＣＲの産物とライゲーションさせて、プラスミドｐＰＨＢ３７３４がもたらされた。
　生じたプラスミドをＳｆｉＩ／ＸｈｏＩで消化し、
マスキングペプチド３６９０
　生じたプラスミドをＢａｍＨＩ／ＫｐｎＩで消化し、アニーリングの産物であるリン酸化オリゴＣＸ７４７／ＣＸ７４８とライゲーションさせることによって、
プロテアーゼ基質ＳＭ９８４
　生じたプラスミドをＸｈｏＩで消化し、５’末端を脱リン酸化し、ＸｈｏＩで消化した、ｐＰＨＢ３５７９をプライマーＣＸ２６８／ＣＸ４４８を用いて増幅したＰＣＲ産物をクローニングすることによって、タンデムペプチドマスキングを構築して、プラスミドｐＰＨＢ３８８９がもたらされた。
　ｐＰＨＢ３７８３、ｐＰＨＢ３８２２、およびｐＰＨＢ３８８９のマスキング領域、リンカー、基質、および軽鎖可変領域を、プライマーＣＸ３２５／ＣＸ６９６を用いたＰＣＲによって増幅し、ＥｃｏＲＩ／ＢｓｉＷＩで消化し、ｐＦＩＬ２−ＣＬ２２５のＥｃｏＲＩ／ＢｓｉＷＩ内にクローニングして、それぞれＡＡ軽鎖発現ベクターｐＰＨＢ４００７、ｐＰＨＢ３９０２、およびｐＰＨＢ３９１３がもたらされた。
　親和性成熟したマスキングペプチドを、ＳｆｉＩ／ＸｈｏＩ断片としてクローニングすることによってＡＡ軽鎖発現ベクター内に交換した。プロテアーゼ基質はＢａｍＨＩ／ＫｐｎＩに適合性のある断片として交換した。
　
抗ＥＧＦＲ抗体およびＡＡの発現および精製
　３μｇのｐＦＩＬ−ＣＨ２２５−ＨＬおよび３μｇのｐＦＩＬ２−ＣＨ２２５−軽を、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ２００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用いて、製造者のプロトコルに従って、ＣＨＯ−Ｓ細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）内に同時トランスフェクトした。トランスフェクトした細胞をＦｒｅｅｓｔｙｌｅ　ＣＨＯ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で培養し、ゼオシンおよびブラストサイジンに対する耐性について選択した。個々のクローンを限界希釈によって単離し、ＥＬＩＳＡによってＥＧＦＲと結合することができるヒトＩｇＧの発現について選択した。すべての抗体およびＡＡは、標準の技法を用いたタンパク質Ａクロマトグラフィーによって精製した。
　同様に、３μｇのＡＡの軽鎖のそれぞれの発現ベクターを、３μｇのｐＦＩＬ−ＣＨ２２５−ＨＬと共にＣＨＯ−Ｓ細胞内に同時トランスフェクトした。トランスフェクトした細胞をＦｒｅｅｓｔｙｌｅ　ＣＨＯ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で培養し、ゼオシンおよびブラストサイジンに対する耐性について選択した。個々のクローンを限界希釈によって単離し、ＥＬＩＳＡによってＥＧＦＲと結合することができるヒトＩｇＧの発現について選択した。
　
親和性成熟した抗ＥＧＦＲ　ＭＭライブラリのスクリーニング
　初回のＭＡＣＳラウンドは、ＳＡ　ｄｙｎａｂｅａｄｓおよびｅｃｐＸ３−７５５ライブラリからの１．４×１０８個の細胞を用いて行った。磁気選択の前に、細胞を３ｎＭのビオチン標識したＣ２２５Ｍａｂと共にインキュベーションした。磁気選択により、６×１０６個の細胞の単離がもたらされた。第１ラウンドのＦＡＣＳ分別は、０．１ｎＭのＤｙＬｉｇｈｔ（ｆｌｕｏｒ　５３０　ｎＭ）−Ｃ２２５Ｍａｂで標識した２×１０７個の細胞上で行い、１．５×１０５個の陽性結合を有する細胞の単離がもたらされた。集団に増加した選択圧をかけるために、第２ラウンドのＦＡＣＳは、１０ｎＭのＤｙＬｉｇｈｔ−Ｃ２２５Ｍａｂで標識した細胞上で、１００ｕＭの３６９０ペプチド（ＣＩＳＰＲＧＣ）の存在下、３７℃で行った。選択圧をさらに増加させるために、第３および第４ラウンドは、１００ｎＭのＤｙＬｉｇｈｔ−Ｃ２２５Ｆａｂで標識した細胞上で、１００ｕＭの３６９０ペプチド（ＣＩＳＰＲＧＣ）の存在下、３７℃で行った。陽性集団の最も明るい１％を収集し、これは、３６９０ペプチドによって競合されない結合を表す。上記スクリーニングから単離された個々のクローンの細胞上親和性測定により、
Ｃ２２５に対する親和性が３６９０（ＣＩＳＰＲＧＣ）よりも少なくとも１００倍高い３つのペプチド、すなわち、３９５４（ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭ）
　
Ｃ２２５　ＭＭの親和性測定
　Ｃ２２５　ＦａｂとＭＭ３６９０、３９５４および３９５７との結合の細胞上親和性測定。ｅＣＰＸ３．０クローン３６９０、３９５４および３９５７の結合を、ＦＡＣＳ上にて、３つの異なる濃度のＤｙＬｉｇｈｔで標識した抗ＥＧＦＲ　Ｆａｂで分析した。結合曲線を図２３に示す。
ＭＭ３９５４および３９５７は３６９０よりも少なくとも１００倍高い親和性を示した
　
抗ＥＧＦＲ　ＡＡの標的置換アッセイ
　ＥＧＦＲを９６ウェルマイクロタイタープレートのウェル上に吸着させ、乳タンパク質で洗浄および遮断した。２ｎＭの抗ＥＧＦＲ抗体またはＭＭ３６９０、３９５７、３９５４および３９６０／３５７９を含有する抗ＥＧＦＲ　ＡＡを含有する２５ｍｌの培養培地をコーティングしたウェルに加え、１、２、４、８または２４時間インキュベーションした。インキュベーション後、ウェルを洗浄し、結合したＡＡの程度を抗ｈｕＩｇＧ免疫検出によって測定した。ＡＡのコンテキストにおけるマスキング効率を直接比較するために、抗ＥＧＦＲ　ＡＡの結合を抗ＥＧＦＲ抗体結合（１００％）に対して正規化した。親または改変していない抗体結合のパーセントとしての平衡結合の程度を表３４および図２４に示す。
ＭＭ３９５４および３９５７は、３６０９（合議体注：表３４、図２４、表４２等から、「３６９０」の誤記と認める。）よりも１００倍高い、同じ親和性を示す一方で、３９５４は標的結合の阻害が少なくとも２倍、より効率的である
」（［００４１４］〜［００４３１］、表３４）
　
オ．「
」（表３５）
　
カ．「
」（表３６）
　
キ．「
」（表３９）
　
ク．「
」（表４２）
　
ケ．「実施例１７：選択的基質／ＣＭの発見および試験
　下のセクションは、いくつかの例示的な酵素のための選択的基質の発見および試験のための方法を示す。
ｕＰＡ選択的基質の発見
　ｕＰＡ選択的基質は、Ｅ．ｃｏｌｉの表面のＮ末端融合物として発現される、約１０８個のランダムな８量体基質からなる８ｅＣＬｉＰＳ細菌ライブラリから単離した。ｕＰＡによる切断のために最適化され、標的外セリンプロテアーゼｋｌｋ５および７による切断に抵抗性である基質について濃縮するために、交互に実行したＦＡＣＳによる陽性および陰性の選択を用いた。ナイーブなライブラリを８ｕｇ／ｍｌ　ｕＰＡと共に３７℃で１時間インキュベーションし、続いてＳＡＰＥ（赤色）およびｙＰＥＴ　ｍｏｎａ（緑色）で標識した。ｕＰＡによる切断は、ＳＡＰＥ標識の消失を生じ、ｕＰＡ基質を発現する細菌（緑色だけ、陽性選択）の、未切断のペプチドを発現する細菌（赤色＋緑色）からの選別を可能にする。ｕＰＡ基質をＦＡＣＳによって選別し、濃縮されたプールを増幅し、次に５ｎｇ／ｍｌ　ＫＬＫ５および７と共に３７℃で１時間インキュベーションし、ＳＡＰＥおよびｙＰＥＴ　ｍｏｎａで標識し、これらの標的外プロテアーゼによる切断の欠如について選別した（赤色＋緑色、陰性選択）。プールを増幅し、暫減濃度のｕＰＡ（４ｕｇ／ｍｌ、２ｕｇ／ｍｌ）および暫増濃度のｋｌｋ５および７（５ｎｇ／ｍｌ、１０ｎｇ／ｍｌ）を用いて、さらなる４ラウンドの陽性および陰性交互ＦＡＣＳで選別した。ＦＡＣＳの最後の３ラウンドからの個々のクローンを配列決定し、いくつかのコンセンサスに分類した（表４４）。次に、表４４の標的対標的外プロテアーゼによる切断の特異性について、各コンセンサスからのクローンを、ｕＰＡ、ｋｌｋ５および７、ならびにプラスミンの様々な濃度による切断について個々に分析した。図２５は、
ｕＰＡ対照および基質ＳＭ１６と違って、ＫＫ１２０３、１２０４および１２１４は、ＫＬＫ５、ＫＬＫ７およびプラスミンによる切断に抵抗性を示すことを示す
」（［００４３３］、表４４）
（合議体注：表４４の下線部のアミノ酸配列は「ＬＳＧＲＳＤＮＨ」と記載されている。）
コ．「実施例１９：ＡＡの投与による副作用の低減
　通常のＥＧＦＲ抗体治療薬を一般に投与した患者の８０％超が、体の最大の器官である皮膚の毒性を示す。
患者にＥＧＦＲに対するＡＡが投与されると、ＡＡは疾患特異的ＣＭを欠くため皮膚において活性化されないので、皮膚の毒性がほとんどまたは全くないと考えられる
　当審の拒絶理由で引用文献２として引用した、本願優先日前に頒布された刊行物である国際公開第２００８／１０１１７７号（以下、「引用文献２」という。）には、ＣＨＯ細胞で産生されたセツキシマブの２つの変異体、１）ＣＨＯ−Ｃ２２５、２）アミノ酸置換によりＮ８８位にグリコシル化を欠くＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８Ｑが記載されており、また、これら２つのモノクローナル抗体が、市販の抗体と同じＥＧＦＲに対する親和性を有することも記載されている（第３５頁第１３行〜第２１行）。
　当審の拒絶理由で引用文献３として引用した、本願優先日前に頒布された刊行物である特表２０１１−５０４７４２号公報（以下、「引用文献３」という。）には、アービタックス（セツキシマブ）の重鎖のアミノ酸配列（配列番号１３９）、軽鎖のアミノ酸配列（配列番号１３７）が記載されている（第１１０頁及び第１８４頁）。
　引用文献１の上記記載事項ア．の「活性化可能抗体（ＡＡ）」の具体例として、上記記載事項エ．に記載されている「抗ＥＧＦＲ　ＡＡ」は、上記記載事項エ．〜カ．の記載から、Ｃ２２５抗体を基に作製され、マスキング部分（ＭＭ）は、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣの３６９０であり、切断可能部分（ＣＭ）は、アミノ酸配列ＰＳＰＰＶＫＭＭＰＥのプロテアーゼ基質ＳＭ９８４であって、表３５に記載のＨ鎖アミノ酸配列と表３６に記載のＬ鎖アミノ酸配列を含むものと認められる。
　よって、上記記載事項ア．〜カ．及びク．によると、引用文献１には、「上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）を、活性化された状態下で結合する活性化可能抗体であって、抗体又はその抗原結合フラグメント（ＡＢ）、マスキング部分（ＭＭ）、及び、前記ＡＢと前記ＭＭとを連結する切断可能部分（ＣＭ）とを含み、
　前記ＡＢは、ＥＧＦＲに対して特異的に結合すると共に、表３５に記載のＨ鎖アミノ酸配列及び表３６に記載のＬ鎖アミノ酸配列を含み；
　前記ＭＭは、前記ＣＭが切断されていない状態で、前記活性化可能抗体のＥＧＦＲに対する結合を阻害し、ここで、前記マスキング部分はアミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣを含み；及び
　前記ＣＭは、プロテアーゼのための基質として機能するポリペプチドであり、そしてアミノ酸配列ＰＳＰＰＶＫＭＭＰＥを含み、
　ここで、前記活性化可能抗体は、前記ＣＭが切断されていない状態で、次のようなＮ−末端からＣ−末端への構造配置：ＭＭ−ＣＭ−ＡＢ又はＡＢ−ＣＭ−ＭＭを有する、活性化可能抗体。」の発明（以下、「引用発明」という。）が記載されていると認められる。
第５　対比
　本願発明と引用発明とを対比すると、引用発明の「表３５に記載のＨ鎖アミノ酸配列」は、本願発明の配列番号２６のアミノ酸配列の１位〜８７位、８９位〜２１５位、２１７位〜４４９位のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有し、また、引用発明の「表３６に記載のＬ鎖アミノ酸配列」は、本願発明の配列番号６８のアミノ酸配列の１位〜２１２位のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有する。
　そうすると、本願発明と引用発明とは、「上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）を、活性化された状態下で結合する活性化可能抗体であって、抗体又はその抗原結合フラグメント（ＡＢ）、マスキング部分（ＭＭ）、及び、前記ＡＢと前記ＭＭとを連結する切断可能部分（ＣＭ）とを含み、
　前記ＡＢは、ＥＧＦＲに対して特異的に結合すると共に、配列番号２６のアミノ酸配列の１位〜８７位、８９位〜２１５位、２１７位〜４４９位のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含むＨ鎖アミノ酸配列及び配列番号６８のアミノ酸配列の１位〜２１２位のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含むＬ鎖アミノ酸配列を含み；
　前記ＭＭは、前記ＣＭが切断されていない状態で、前記活性化可能抗体のＥＧＦＲに対する結合を阻害し、；及び
　前記ＣＭは、プロテアーゼのための基質として機能するポリペプチドであり、
　ここで、前記活性化可能抗体は、前記ＣＭが切断されていない状態で、次のようなＮ−末端からＣ−末端への構造配置：ＭＭ−ＣＭ−ＡＢ又はＡＢ−ＣＭ−ＭＭを有する、活性化可能抗体。」である点で一致し、両者は以下の点で相違する。
相違点１：本願発明は、ＭＭがアミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹ（配列番号１４）であるのに対し、引用発明は、ＭＭがアミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣである点。
相違点２：本願発明は、ＣＭがアミノ酸配列ＬＳＧＲＳＤＮＨ（配列番号１３）であるのに対し、引用発明は、ＣＭがアミノ酸配列ＰＳＰＰＶＫＭＭＰＥである点。
相違点３：本願発明は、Ｈ鎖の８８位のアミノ酸がＱであるのに対し、引用発明は、Ｈ鎖の８８位のアミノ酸がＮであり、本願発明は、Ｈ鎖の２１６位のアミノ酸がＫであるのに対し、引用発明は、Ｈ鎖の２１６位のアミノ酸がＲであり、また、本願発明は、Ｌ鎖のＣ末端のアミノ酸配列がＮＲＧＥＣであるのに対し、引用発明は、Ｌ鎖のＣ末端のアミノ酸配列がＮＲＧＡである点。
第６　当審の判断
　以下、上記相違点について検討する。
相違点１について
　引用文献１には、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹの３９５４が、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣの３６９０よりもＣ２２５に対する親和性が少なくとも１００倍高いことが記載されており（上記記載事項エ．）、また、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹの３９５４をＣ２２５の軽鎖に連結させたアミノ酸配列も記載されている（上記記載事項キ．）から、引用発明において、ＭＭとして、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣの代わりに、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹを使用することは、当業者が適宜なし得ることである。
相違点２について
　引用文献１には、ＣＭとして、ｕＰＡの基質を使用することが記載されており（上記記載事項ア．）、また、ｕＰＡの基質であるアミノ酸配列ＬＳＧＲＳＤＮＨのｋｋ１２０４は、ＫＬＫ５、ＫＬＫ７およびプラスミンによる切断に抵抗性を示し、ｕＰＡによる切断に対して特異性が高いアミノ酸配列であることが記載されている（上記記載事項ケ．）から、引用発明において、ＣＭとして、ＰＳＰＰＶＫＭＭＰＥの代わりに、アミノ酸配列ＬＳＧＲＳＤＮＨを使用することは、当業者が適宜なし得ることである。
相違点３について
　引用文献２には、ＣＨＯ細胞で産生されたセツキシマブの変異体であって、アミノ酸置換によりＮ８８位にグリコシル化を欠くＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８Ｑが記載されており、また、該モノクローナル抗体が、市販の抗体と同じＥＧＦＲに対する親和性を有することも記載されている（第３５頁第１３行〜第２１行）から、引用発明において、グリコシル化部位を除去することを目的として、Ｈ鎖の８８位のアミノ酸ＮをＱに置換することは、当業者が容易に想到し得ることである。
　また、引用文献３には、セツキシマブのＨ鎖のアミノ酸配列として、Ｈ鎖の２１６位のアミノ酸がＫであるアミノ酸配列（配列番号１３９）が、セツキシマブのＬ鎖のアミノ酸配列として、Ｌ鎖のＣ末端のアミノ酸配列がＮＲＧＥＣであるアミノ酸配列（配列番号１３７）が記載されている（第１１０頁及び第１８４頁）から、引用発明において、Ｈ鎖の２１６位のアミノ酸ＲをＫに置換し、Ｌ鎖のＣ末端のアミノ酸配列ＮＲＧＡをＮＲＧＥＣに置換することは、当業者が適宜なし得ることである。
　そして、本願発明が奏する効果は、引用文献１〜３の記載から予測可能なものであり、格別顕著なものとは認められない。
　したがって、本願発明は、引用文献１〜３に記載された発明に基いて、当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない。
第７　審判請求人の主張
　審判請求人は、令和　２年　５月２９日付け意見書において、以下のア．〜ウ．の点を主張しているので、以下この点について検討する。
ア．引用文献１には、有効なＭＭを見出すためにはアフィニティのみではなく、標的置換アッセイ（ＴＤＡ）によるマスキング効率の経験的測定も考慮する必要がある旨が明記されており、これらの基準を考慮すると、引用文献１に記載の種々のマスキングペプチドの中から、当業者が特にペプチド３９５４を選択するとは考えられない。
　引用文献１の段落［００４３０］及び図２３の結合親和性の試験結果によると、ペプチド３９５７及びペプチド３９５８も、ペプチド３９６０と同等以上の結合親和性を示しており、また、ＴＤＡを用いたマスキング効率（段落［００４３１］、図２４、表３４）によると、ペプチド３６９０／３５７９は、ＥＧＦＲ結合の阻害に関するマスキング効率において最も優れており、標的結合に関する経時安定性を有しているから、当業者が引用文献１の記載の中から、ペプチド３９５７やペプチド３９５８ではなくペプチド３９５４を選択するという認定は、後知恵によるものと言わざるを得ない。
イ．引用文献１に記載のＣＭは、段落［００１５］から明らかなように、表３の酵素群から選択される酵素の基質と定義されており、表３には５４種もの酵素・プロテアーゼが列挙されており、ｕＰＡはあくまでもそのうちのプロテアーゼの一例にすぎない。仮に、当業者がプロテアーゼとしてｕＰＡを選択し、その基質をＣＭとして選択し得たと仮定しても、引用文献１の表４４には、ＣＭの候補となりうるｕＰＡの基質が１４種も列挙されており、図２５にデータが示されている３種類の基質（即ち、ペプチドｋｋ１２０３、１２０４、１２１４）の全てが、ｕＰＡによる高い切断性を示し、ＫＬＫ５／７及びプラスミンに対する耐性に優れているから、引用文献１には、５４種もの酵素・プロテアーゼの中からｕＰＡを選択し、その１４種の基質の中からペプチドｋｋ１２０４を選択することを当業者に示唆又は動機づける記載はない。
ウ．引用文献２では、マウスメラノーマ株ＳＰ２／０で産生されたセツキシマブ（Ｃ２２５）を、ＣＨＯ細胞で産生されたセツキシマブ（ＣＨＯ−Ｃ２２５）及びＣＨＯ細胞で産生されたＮ８８Ｑ変異を有するセツキシマブ（ＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８Ｑ）と比較しており、表３（第４９頁）の結果をみると、ＳＰ２／０細胞で産生されたＣ２２５は何れも陽性の結果（過敏反応）を示し、グリコシル化の存在を示しているのに対し、ＣＨＯ細胞で産生されたＣＨＯ−Ｃ２２５及びＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８Ｑは何れも陰性の結果を示している。
　引用文献２には、ＳＰ２／０細胞で産生されたＣ２２５のグリコシル化抗体が、対象の「既存のＩｇＥ ＡｂのａｌｐｈａＧａｌに対する反応」により「重度のアナフィラキシー反応」を引き起こすおそれがあると明記しており（第３８頁第２３行〜第２７行）、セツキシマブ（Ｃ２２５）が、他のほとんどのｍＡｂとは異なり、α−１，３−ガラクトシルトランスフェラーゼ遺伝子を発現しているＳＰ２／０マウス骨髄腫細胞で産生されることが記載されている（第３８頁第２９行〜第３１行）から、引用文献２の著者等は、ＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８ＱのようにＮ８８Ｑ変異を導入するのではなく、ＳＰ２／０マウス骨髄腫細胞の代わりにＣＨＯ細胞を宿主細胞として使用することによって、セツキシマブ等の抗体からグリコシル化部位を除去することを示唆しているから、当業者は、変異を導入するのではなく、宿主細胞を変更することでグリコシル化部位を除去しようという、本願発明の発想とは逆の動機づけを受けるはずである。
主張ア．について
　引用文献１には、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹの３９５４が、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣの３６９０よりもＣ２２５に対する親和性が少なくとも１００倍高いことが記載されており（上記記載事項エ．）、また、３９５４以外にも同程度の機能を有するアミノ酸配列が記載されていたとしても、そのことが３６９０よりもＣ２２５に対する特異性の高い３９５４の使用を妨げる理由になるとはいえないので、引用文献１には、ＭＭとして、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣの３６９０の代わりに、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹの３９５４を使用する動機付けとなる記載が示されているといえる。
　また、引用文献１には、「ＭＭ３９５４および３９５７は、３６０９（合議体注：表３４、図２４、表４２等から、「３６９０」の誤記と認める。）よりも１００倍高い、同じ親和性を示す一方で、３９５４は標的結合の阻害が少なくとも２倍、より効率的である。」と記載されており、表３４も合わせ見るとマスキング効率についても、３９５４は３６９０よりも効率的であることが示されているから、３９５４以外にマスキング効率が効率的なアミノ酸配列が記載されていたとしても、そのことが３６９０よりも効率性の高い３９５４の使用を妨げる理由になるとはいえないので、効率性の点からも、引用文献１は、ＭＭとして、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣの３６９０の代わりに、アミノ酸配列ＣＩＳＰＲＧＣＰＤＧＰＹＶＭＹの３９５４を使用することを動機付けるものといえる。
　したがって、審判請求人の上記主張ア．は採用できない。
主張イ．について
　審判請求人が指摘する引用文献１の段落［００１５］には、「関連する実施形態では、ＣＭは表３の酵素からなる群より選択される酵素の基質である。具体的な実施形態では、ＣＭは、レグマイン、プラスミン、ＴＭＰＲＳＳ−３／４、ＭＭＰ−９、ＭＴ１−ＭＭＰ、カテプシン、カスパーゼ、ヒト好中球エラスターゼ、ベータ−セクレターゼ、ｕＰＡ、またはＰＳＡの基質である。」と記載されており、ＣＭは、表３の酵素からなる群より選択される酵素の基質であると記載されているものの、具体的な実施形態として記載されているのは、レグマイン、プラスミン、ＴＭＰＲＳＳ−３／４、ＭＭＰ−９、ＭＴ１−ＭＭＰ、カテプシン、カスパーゼ、ヒト好中球エラスターゼ、ベータ−セクレターゼ、ｕＰＡ、またはＰＳＡの１１種の酵素の基質であって、しかも、ｕＰＡの基質は、実施例において具体的に記載されている（上記記載事項ケ．）ものである。
　そして、引用文献１には、ｕＰＡの基質であるアミノ酸配列ＬＳＧＲＳＤＮＨのｋｋ１２０４は、ＫＬＫ５、ＫＬＫ７およびプラスミンによる切断に抵抗性を示し、ｕＰＡによる切断に対して特異性が高いアミノ酸配列であることが記載されているから（上記記載事項ケ．）、ｋｋ１２０４以外にも同程度の機能を有するｕＰＡの基質が記載されていたとしても、そのことがｕＰＡによる切断に対して特異性の高いｋｋ１２０４の使用を妨げる理由になるとはいえないので、引用文献１には、ＣＭとして、アミノ酸配列ＬＳＧＲＳＤＮＨを使用する動機付けとなる記載が示されているといえる。
　したがって、審判請求人の上記主張イ．は採用できない。
主張ウ．について
　引用文献２には、ＣＨＯ細胞で産生されたセツキシマブの変異体であって、アミノ酸置換によりＮ８８位にグリコシル化を欠くＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８Ｑが明記されており、また、該モノクローナル抗体が、市販の抗体と同じＥＧＦＲに対する親和性を有することも記載されている（第３５頁第１３行〜第２１行）から、当業者は、セツキシマブ等の抗ＥＧＦＲ抗体のＨ鎖の８８位のアミノ酸ＮをＱに置換させても、市販の抗体と同様の抗ＥＧＦＲ結合能を有しつつ、グリコシル化部位を除去できることを理解する。ゆえに、引用文献２の記載から、哺乳動物細胞で産生させた場合のセツキシマブ等の抗ＥＧＦＲ抗体のＨ鎖の８８位のアミノ酸ＮをＱに置換させる動機付けはあるといえるので、引用文献２の記載が阻害要因になるとはいえない。
　一方、本願明細書には、「いくつかの実施態様によれば、ＥＧＦＲを結合する抗体又はその抗体結合フラグメントの配列は、グリコシル化の可能性ある部位を除くために、少なくとも１つのアミノ酸置換を含む。例えば、ＥＧＦＲを結合する抗体又はその抗原結合フラグメントは、グリコシル化の可能性ある部位を除くためにＨ鎖及び／又はＬ鎖にアミノ酸置換を含む。いくつかの実施態様によれば、ＥＧＦＲを結合する抗体又はその抗原結合フラグメントは、配列番号３０のアミノ酸配列を有するＨ鎖の位置８８でアスパラギンに対応するアスパラギン（Ｎ）が、配列番号２６のアミノ酸を有するＨ鎖を生成するために、グルタミン（Ｑ）残基により置換されているＨ鎖を有する。」と記載されている（段落【０３３４】）だけで、Ｈ鎖の８８位のアスパラギン（Ｎ）をグルタミン（Ｑ）に置換させて、「グリコシル化の可能性ある部位を除く」ことにより、抗ＥＧＦＲ抗体にどのような効果を生じさせるのか何ら具体的に記載されていない。
　そして、審判請求人も、引用文献２に記載されている過敏反応について、「ＣＨＯ細胞で産生されたＣＨＯ−Ｃ２２５及びＣＨＯ−Ｃ２２５−Ｎ８８Ｑは何れも陰性の結果を示して」いると述べているように、ＣＨＯ細胞で産生されたセツキシマブのＨ鎖の８８位におけるグリコシル化の有無が、「重度のアナフィラキシー反応」に関連していないことが示されているから、Ｈ鎖の８８位のアスパラギン（Ｎ）をグルタミン（Ｑ）に置換させることによる本願発明の活性化可能抗体の効果は、グリコシル化部位を除いた時に通常期待される効果を超えるものではない。
　したがって、審判請求人の上記主張ウ．は採用できない。
第８　むすび
　以上のとおり、本願の請求項１に係る発明は、引用文献１〜３に記載された発明に基いて、当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができないので、本願は、他の請求項について検討するまでもなく、拒絶すべきものである。
　よって、結論のとおり審決する。