【手続補正書】
【提出日】平成19年12月4日(2007.12.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
溶解有効量の、約８〜約６０％ｖ／ｖのホルムアミド、約０．０１〜約０．５％ｖ／ｖのＳＤＳおよび０．５〜６ＸＳＳＣ緩衝液を含む、溶解液。
【請求項２】
ホルムアルデヒドの量が、約１０〜約３０％ｖ／ｖである、請求項１に記載の溶解液。
【請求項３】
ＳＤＳの量が、約０．０３〜約０．１０％ｖ／ｖである、請求項１に記載の溶解液。
【請求項４】
緩衝液が、約２〜約４ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項１に記載の溶解液。
【請求項５】
ＳＤＳの量が、約０．０３〜約０．１０％ｖ／ｖである、請求項２に記載の溶解液。
【請求項６】
緩衝液が、約２〜約４ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項５に記載の溶解液。
【請求項７】
緩衝液が、約３ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項１に記載の溶解液。
【請求項８】
緩衝液が、約３ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項６に記載の溶解液。
【請求項９】
少なくとも１つの核酸標的を検出する方法であって、
該標的を含んでいるかもしれないサンプルを該標的に特異的で該標的と結合するヌクレアーゼ保護断片と接触させること、
サンプルを、一本鎖核酸を有効に消化するヌクレアーゼと接触させること、および、
得られるサンプルを、該サンプル添加前に、
ｉ）空間的に区別された、少なくともその２個が実質的に同一な領域を多数含む表面；ここにその各領域は次項を含む：
ｉｉ）オリゴヌクレオチドアンカーの少なくとも２個の異なるロカス；各アンカーは次項と会合している：
ｉｉｉ）オリゴヌクレオチドアンカーに特異的な第一部分および該ヌクレアーゼ保護断片に特異的なプローブを含む第二部分を有する双官能性リンカー；
を含むコンビネーションと、
該ヌクレアーゼ保護断片が該コンビネーションに結合するために有効な条件下で接触させること、
を含み、
ここで、少なくとも１個のロカスにあるアンカーが、異なるヌクレアーゼ保護断片、および、よって異なる標的、特異性を有する、約２〜約４個の異なる双官能性リンカーに接触し、そして、該サンプルを、溶解有効量の、約８〜約６０％ｖ／ｖのホルムアミド、約０．０１〜約０．５％ｖ／ｖのＳＤＳおよび０．５−６ＸＳＳＣ緩衝液を含む溶解液に接触させる、方法。
【請求項１０】
該溶解液において、ホルムアミドの量が、約１０から約３０％ｖ／ｖである、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
該溶解液において、ＳＤＳの量が、約０．０３から約０．０１％ｖ／ｖである、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
少なくとも１つの核酸標的を検出する方法であって、
該標的を含んでいるかもしれないサンプルを該標的に特異的で該標的と結合するヌクレアーゼ保護断片と接触させること、
サンプルを、一本鎖核酸を有効に消化するヌクレアーゼと接触させること、および、
得られるサンプルを、該サンプル添加前に、
ｉ）空間的に区別された、少なくともその２個が実質的に同一な領域を多数含む表面；ここにその各領域は次項を含む：
ｉｉ）オリゴヌクレオチドアンカーの少なくとも２個の異なるロカス；各アンカーは次項と会合している：
ｉｉｉ）オリゴヌクレオチドアンカーに特異的な第一部分および該ヌクレアーゼ保護断片に特異的なプローブを含む第二部分を有する双官能性リンカー；
を含むコンビネーションと、
該ヌクレアーゼ保護断片が該コンビネーションに結合するために有効な条件下で接触させること、
を含み、
ここで、該サンプルを、実質的にｍＲＮＡだけがＤＮＡなしで該保護断片に結合する形態で放出される１０５℃またはそれ以下の温度で溶解液に接触させ、および／または、ｍＲＮＡおよびＤＮＡの両方が該保護断片に結合する形態で放出される約１０５℃またはそれ以上の温度で溶解液に接触させる、方法。
【請求項１３】
少なくとも１個のロカスにあるアンカーが、異なるヌクレアーゼ保護断片、および、よって異なる標的、特異性を有する、約２〜約４個の異なる双官能性リンカーに接触する、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
少なくとも１つの核酸標的を検出する方法であって、
該標的を含んでいるかもしれないサンプルを該標的に特異的で該標的と結合するヌクレアーゼ保護断片と接触させること、
サンプルを、一本鎖核酸を有効に消化するヌクレアーゼと接触させること、および、
得られるサンプルを、該ヌクレアーゼ保護断片に特異的なプローブを含む表面と、該ヌクレアーゼ保護断片が該表面に結合するために有効な条件下で接触させること、
を含み、
ここで、該サンプルを、実質的にｍＲＮＡだけがＤＮＡなしで該保護断片に結合する形態で放出される１０５℃またはそれ以下の温度で溶解液に接触させ、および／または、ｍＲＮＡおよびＤＮＡの両方が該保護断片に結合する形態で放出される約１０５℃またはそれ以上の温度で溶解液に接触させる、方法。
【請求項１５】
該溶解液が、請求項１−８のいずれかに記載の溶解液である、請求項１２−１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
該溶解液を含む該サンプル溶液が、該溶液が一本鎖核酸を消化する該ヌクレアーゼの機能を阻害するように希釈される、請求項１２−１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
少なくとも１つの核酸標的を検出する方法であって、
該標的を含んでいるかもしれないサンプルを該標的に特異的で該標的と結合するヌクレアーゼ保護断片と接触させること、
サンプルを、一本鎖核酸を有効に消化するヌクレアーゼと接触させること、および、
得られるサンプルを、該サンプル添加前に、
ｉ）空間的に区別された、少なくともその２個が実質的に同一な領域を多数含む表面；ここにその各領域は次項を含む：
ｉｉ）オリゴヌクレオチドアンカーの少なくとも２個の異なるロカス；各アンカーは次項と会合している：
ｉｉｉ）オリゴヌクレオチドアンカーに特異的な第一部分および該ヌクレアーゼ保護断片に特異的なプローブを含む第二部分を有する双官能性リンカー；
を含むコンビネーションと、
該ヌクレアーゼ保護断片が該コンビネーションに結合するために有効な条件下で接触させること、
を含み、
ここで、該サンプルを、溶解有効量の、約８〜約６０％ｖ／ｖのホルムアミド、約０．０１〜約０．５％ｖ／ｖのＳＤＳおよび０．５−６ＸＳＳＣ緩衝液を含む溶解液に接触させる、方法。
【請求項１８】
該溶解液において、ホルムアミドの量が約１０〜約３０％ｖ／ｖである、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
該溶解液において、ＳＤＳの量が約０．０３〜約０．１０％ｖ／ｖである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
該溶解液において、緩衝液が約２〜約４ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２１】
該溶解液において、ＳＤＳの量が約０．０３〜約０．１０％ｖ／ｖである、請求項１８に記載の方法。
【請求項２２】
該溶解液において、緩衝液が約２〜約４ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
緩衝液が約３ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項１７に記載の方法。
【請求項２４】
緩衝液が約３ＸＳＳＣ緩衝液である、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
少なくとも１つの核酸標的を検出する方法であって、
該標的を含んでいるかもしれないサンプルを該標的に特異的で該標的と結合するヌクレアーゼ保護断片と接触させること、
サンプルを、一本鎖核酸を有効に消化するヌクレアーゼと接触させること、および、
得られるサンプルを、該ヌクレアーゼ保護断片に特異的なプローブを含む表面と、該ヌクレアーゼ保護断片が該表面に結合するために有効な条件下で接触させること、
を含み、
ここで、該サンプルを、溶解有効量の、約８〜約６０％ｖ／ｖのホルムアミド、約０．０１〜約０．５％ｖ／ｖのＳＤＳおよび０．５−６ＸＳＳＣ緩衝液を含む溶解液に接触させる、方法。