【手続補正書】
【提出日】平成20年10月31日(2008.10.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ポリペプチドＸ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＰＦＨＳＰＳＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＤＱＦＦＧＥＨＬ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＦＧＥＨＬＬＥ−Ｘ２、もしくはＸ１−ＩＡＩＨＨＰＷＩ−Ｘ２、またはその機能的な改変体もしくは模倣物であって、
各々のＸ１、Ｘ２はお互いに独立して、ｎアミノ酸の任意のアミノ酸配列に相当し、ｎが０〜５０にわたって変化し、かつｎがＸ１およびＸ２において同一であるかまたは異なる、ポリペプチドまたはその機能的な改変体もしくは模倣物。
【請求項２】
前記機能的改変体または模倣物が、保存的アミノ酸置換またはペプチド模倣置換である、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
前記機能的改変体がＸ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＰＦＨＳＰＳＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＤＱＦＦＧＥＨＬ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＦＧＥＨＬＬＥ−Ｘ２、またはＸ１−ＩＡＩＨＨＰＷＩ−Ｘ２に対して約７０％以上のアミノ酸配列同一性を有する、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
ポリペプチドＸ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２Ｘ１−ＳＰＦＹＬＲＰＰ−Ｘ２Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲ−Ｘ２Ｘ１−ＦＹＬＲＰＰＳＦ−Ｘ２Ｘ１−ＬＲＰＰＳＦＬＲ−Ｘ２Ｘ１−ＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２Ｘ１−ＳＦＬＲＡＰＳＷ−Ｘ２Ｘ１−ＬＲＡＰＳＷＦＤ−Ｘ２、またはその機能的な改変体もしくは模倣物であって、
各々のＸ１、Ｘ２はお互いに独立して、ｎアミノ酸の任意のアミノ酸配列に相当し、ｎは０〜５０にわたって変化し、かつｎはＸ１およびＸ２において同一であるかまたは異なる、ポリペプチドまたはその機能的な改変体もしくは模倣物。
【請求項５】
前記機能的改変体または模倣物が、保存的アミノ酸置換またはペプチド模倣置換である、請求項４に記載のポリペプチド。
【請求項６】
前記機能的改変体がＸ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２Ｘ１−ＳＰＦＹＬＲＰＰ−Ｘ２Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲ−Ｘ２Ｘ１−ＦＹＬＲＰＰＳＦ−Ｘ２Ｘ１−ＬＲＰＰＳＦＬＲ−Ｘ２Ｘ１−ＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２Ｘ１−ＳＦＬＲＡＰＳＷ−Ｘ２Ｘ１−ＬＲＡＰＳＷＦＤ−Ｘ２に対して約７０％以上のアミノ酸配列同一性を有する、請求項４に記載のポリペプチド。
【請求項７】
ポリペプチドＸ１−ＲＬＥＫＤＲＦＳ−Ｘ２Ｘ１−ＦＳＶＮＬＤＶＫ−Ｘ２Ｘ１−ＬＫＶＫＶＬＧＤ−Ｘ２Ｘ１−ＦＩＳＲＥＦＨＲ−Ｘ２Ｘ１−ＨＧＦＩＳＲＥＦ−Ｘ２Ｘ１−ＫＹＲＩＰＡＤＶ−Ｘ２Ｘ１−ＥＦＨＲＫＹＲＩ−Ｘ２Ｘ１−ＳＲＥＦＨＲＫＹ−Ｘ２Ｘ１−ＬＴＩＴＳＳＬＳ−Ｘ２Ｘ１−ＧＶＬＴＶＮＧＰ−Ｘ２、もしくはＸ１−ＬＴＶＮＧＰＲＫ−Ｘ２、またはその機能的な改変体もしくは模倣物であって、
各々のＸ１およびＸ２はお互いに独立して、ｎアミノ酸の任意のアミノ酸配列に相当し、ｎは０〜５０にわたって変化し、かつｎはＸ１およびＸ２において同一であるかまたは異なる、ポリペプチドまたはその機能的な改変体もしくは模倣物。
【請求項８】
前記機能的改変体または模倣物が、保存的アミノ酸置換またはペプチド模倣置換を含む、請求項７に記載のポリペプチド。
【請求項９】
前記機能的改変体がＸ１−ＲＬＥＫＤＲＦＳ−Ｘ２Ｘ１−ＦＳＶＮＬＤＶＫ−Ｘ２Ｘ１−ＬＫＶＫＶＬＧＤ−Ｘ２Ｘ１−ＦＩＳＲＥＦＨＲ−Ｘ２Ｘ１−ＨＧＦＩＳＲＥＦ−Ｘ２Ｘ１−ＫＹＲＩＰＡＤＶ−Ｘ２Ｘ１−ＥＦＨＲＫＹＲＩ−Ｘ２Ｘ１−ＳＲＥＦＨＲＫＹ−Ｘ２Ｘ１−ＬＴＩＴＳＳＬＳ−Ｘ２Ｘ１−ＧＶＬＴＶＮＧＰ−Ｘ２、もしくはＸ１−ＬＴＶＮＧＰＲＫ−Ｘ２に対して約７０％以上のアミノ酸配列同一性を有する、請求項７に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
ポリペプチドＸ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２またはその機能的な改変体もしくは模倣物であって、
各々のＸ１、Ｘ２はお互いに独立して、ｎアミノ酸の任意のアミノ酸配列に相当し、ｎは０〜５０にわたって変化し、かつｎはＸ１およびＸ２において同一であるかまたは異なる、ポリペプチドまたはその機能的な改変体もしくは模倣物。
【請求項１１】
前記機能的改変体または模倣物が、保存的アミノ酸置換またはペプチド模倣置換を含む、請求項１０に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
前記機能的改変体がＸ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２に対して約７０％以上のアミノ酸配列同一性を含む、請求項１０に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
前記機能的改変体がＩ−Ｘ−Ｉ／Ｖのアミノ酸モチーフを含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
タンパク質を安定化するための方法であって、
該タンパク質と、ポリペプチドＸ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＰＦＨＳＰＳＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＤＱＦＦＧＥＨＬ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＦＧＥＨＬＬＥ−Ｘ２、Ｘ１−ＩＡＩＨＨＰＷＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＰＦＹＬＲＰＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＹＬＲＰＰＳＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＰＰＳＦＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＦＬＲＡＰＳＷ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＡＰＳＷＦＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＲＬＥＫＤＲＦＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＳＶＮＬＤＶＫ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＫＶＫＶＬＧＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＩＳＲＥＦＨＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＨＧＦＩＳＲＥＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＫＹＲＩＰＡＤＶ−Ｘ２、Ｘ１−ＥＦＨＲＫＹＲＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＲＥＦＨＲＫＹ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＩＴＳＳＬＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＧＶＬＴＶＮＧＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＶＮＧＰＲＫ−Ｘ２、もしくはＸ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２、またはその機能的な改変体もしくは模倣物とを接触させる工程
を包含し、各々のＸ１およびＸ２がお互いに独立して、ｎアミノ酸の任意のアミノ酸配列に相当し、ｎが０〜５０にわたって変化し、かつｎがＸ１およびＸ２において同一であるかまたは異なる、方法。
【請求項１５】
前記タンパク質が治療タンパク質である、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記治療タンパク質が、ワクチン、インスリン、成長因子または抗体である、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
哺乳動物被験体における疾患状態を処置するために治療タンパク質の安定性を増大する工程をさらに包含する、請求項１５に記載の方法。
【請求項１８】
前記タンパク質が組換え産生されるタンパク質である、請求項１４に記載の方法。
【請求項１９】
タンパク質の誤まった折り畳みを阻害する工程、またはタンパク質凝集を軽減する工程をさらに包含する、請求項１４に記載の方法。
【請求項２０】
タンパク質に対する正確な折り畳みまたは天然の折り畳みを回復する工程をさらに包含する、請求項１４に記載の方法。
【請求項２１】
前記機能的改変体または模倣物が、保存的アミノ酸置換またはペプチド模倣置換を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項２２】
前記機能的改変体がＸ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＰＦＨＳＰＳＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＤＱＦＦＧＥＨＬ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＦＧＥＨＬＬＥ−Ｘ２、Ｘ１−ＩＡＩＨＨＰＷＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＰＦＹＬＲＰＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＹＬＲＰＰＳＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＰＰＳＦＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＦＬＲＡＰＳＷ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＡＰＳＷＦＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＲＬＥＫＤＲＦＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＳＶＮＬＤＶＫ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＫＶＫＶＬＧＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＩＳＲＥＦＨＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＨＧＦＩＳＲＥＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＫＹＲＩＰＡＤＶ−Ｘ２、Ｘ１−ＥＦＨＲＫＹＲＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＲＥＦＨＲＫＹ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＩＴＳＳＬＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＧＶＬＴＶＮＧＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＶＮＧＰＲＫ−Ｘ２、またはＸ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２に対して約７０％以上のアミノ酸配列同一性を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項２３】
前記Ｘ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２ポリペプチドがＩ−Ｘ−Ｉ／Ｖアミノ酸モチーフを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
タンパク質の誤まった折り畳み、タンパク質が折り畳まれないこと、またはタンパク質の凝集の活性の調節因子についてスクリーニングするインビトロの方法であって：
標的タンパク質と、ポリペプチドＸ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＰＦＨＳＰＳＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＤＱＦＦＧＥＨＬ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＦＧＥＨＬＬＥ−Ｘ２、Ｘ１−ＩＡＩＨＨＰＷＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＰＦＹＬＲＰＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＹＬＲＰＰＳＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＰＰＳＦＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＦＬＲＡＰＳＷ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＡＰＳＷＦＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＲＬＥＫＤＲＦＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＳＶＮＬＤＶＫ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＫＶＫＶＬＧＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＩＳＲＥＦＨＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＨＧＦＩＳＲＥＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＫＹＲＩＰＡＤＶ−Ｘ２、Ｘ１−ＥＦＨＲＫＹＲＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＲＥＦＨＲＫＹ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＩＴＳＳＬＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＧＶＬＴＶＮＧＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＶＮＧＰＲＫ−Ｘ２、もしくはＸ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２、またはその機能的な改変体もしくは模倣物とを接触させる工程であって、各々のＸ１およびＸ２がお互いに独立して、ｎアミノ酸の任意のアミノ酸配列に相当し、ｎが０〜５０にわたって変化し、かつｎがＸ１およびＸ２において同一であるかまたは異なる工程と、
タンパク質凝集活性の量の減少を検出する工程であって；これによってタンパク質の誤まった折り畳み、タンパク質が折り畳まれないこと、またはタンパク質凝集活性の調節因子として該ポリペプチドを同定する工程と、
を包含する、方法。
【請求項２５】
前記標的タンパク質が、アミロイドβ、β／γクリスタリン、アクチン、デスミン、ビメンチン、インスリン、クエン酸シンターゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ、グリア細胞繊維性酸性タンパク質、αラクトアルブミン、線維芽細胞成長因子、インスリン様成長因子、トランスフォーミング成長因子β、神経成長因子β、上皮細胞成長因子、血管内皮増殖因子、βカテニン、腫瘍壊死因子α、Ｂｃｌ−２，Ｂｃｌ−Ｘ１またはカスパーゼである、請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記機能的改変体または模倣物が、保存的アミノ酸置換またはペプチド模倣置換を含む、請求項２４に記載の方法。
【請求項２７】
前記機能的改変体がＸ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＷＩＲＲＰＦＦＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＦＦＰＦＨＳＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＰＦＨＳＰＳＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＤＱＦＦＧＥＨＬ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＦＧＥＨＬＬＥ−Ｘ２、Ｘ１−ＩＡＩＨＨＰＷＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＰＦＹＬＲＰＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＬＳＰＦＹＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＹＬＲＰＰＳＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＰＰＳＦＬＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＰＰＳＦＬＲＡＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＦＬＲＡＰＳＷ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＲＡＰＳＷＦＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＲＬＥＫＤＲＦＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＳＶＮＬＤＶＫ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＫＶＫＶＬＧＤ−Ｘ２、Ｘ１−ＦＩＳＲＥＦＨＲ−Ｘ２、Ｘ１−ＨＧＦＩＳＲＥＦ−Ｘ２、Ｘ１−ＫＹＲＩＰＡＤＶ−Ｘ２、Ｘ１−ＥＦＨＲＫＹＲＩ−Ｘ２、Ｘ１−ＳＲＥＦＨＲＫＹ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＩＴＳＳＬＳ−Ｘ２、Ｘ１−ＧＶＬＴＶＮＧＰ−Ｘ２、Ｘ１−ＬＴＶＮＧＰＲＫ−Ｘ２、またはＸ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２に対して約７０％以上のアミノ酸配列同一性を含む、請求項２４に記載の方法。
【請求項２８】
前記Ｘ１−ＲＴＩＰＩＴＲＥ−Ｘ２ポリペプチドがＩ−Ｘ−Ｉ／Ｖアミノ酸モチーフを含む、請求項２７に記載の方法。