【手続補正書】
【提出日】平成20年6月26日(2008.6.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
次式の構成物、及びその多量体：
【化１】
2008514201.tif 000001
［式中、
Ｆ１はループ領域中に少なくとも１個のＸ３を含むように修飾されたＦｃドメインであり、前記ループ領域はＦｃドメインの非末端ドメインに存在している、
Ｘ１及びＸ２は−（Ｌ１）ｃ−Ｐ１、−（Ｌ１）ｃ−Ｐ１−（Ｌ２）ｄ−Ｐ２、−（Ｌ１）ｃ−Ｐ１−（Ｌ２）ｄ−Ｐ２−（Ｌ３）ｅ−Ｐ３及び−（Ｌ１）ｃ−Ｐ１−（Ｌ２）ｄ−Ｐ２−（Ｌ３）ｅ−Ｐ３−（Ｌ４）ｆ−Ｐ４から各々独立に選択され、
Ｘ３は−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５、−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５−（Ｌ６）ｄ−Ｐ６、−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５−（Ｌ６）ｄ−Ｐ６−（Ｌ７）ｅ−Ｐ７及び−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５−（Ｌ６）ｄ−Ｐ６−（Ｌ７）ｅ−Ｐ７−（Ｌ８）ｆ−Ｐ８から独立に選択され、
Ｐ１、Ｐ２、Ｐ３及びＰ４は各々独立に薬理学的に活性なポリペプチド又は薬理学的に活性なペプチドの配列であり、
Ｐ５、Ｐ６、Ｐ７及びＰ８は各々独立に薬理学的に活性なペプチドの配列であり、
Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３、Ｌ４、Ｌ５、Ｌ６、Ｌ７及びＬ８は各々独立にリンカーであり、および
ａ、ｂ、ｃ、ｄ、ｅ及びｆは各々独立に０又は１である］。
【請求項２】
ａ及びｂが各々０である、請求項１に記載の構成物。
【請求項３】
ＦｃドメインがＩｇＧ  Ｆｃドメインを含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項４】
Ｆｃドメインが配列番号５９９及び配列番号６０３〜６０７から選択される配列を含む、請求項３に記載の構成物。
【請求項５】
ＦｃドメインがＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項６】
ＩｇＧ１  Ｆｃドメインが配列番号５９９を含み、Ｘ３が配列番号６２１、６２２、６２４、６２５、６２７、６２８、６３０、６３２、６３４及び６３６から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項５に記載の構成物。
【請求項７】
Ｘ３が配列番号６２３、６２６、６２９、６３１、６３３、６３５及び６３７から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項６に記載の構成物。
【請求項８】
Ｘ３がＬｅｕ１３９／Ｔｈｒ１４０において挿入されている、請求項７に記載の構成物。
【請求項９】
ＩｇＧ１  Ｆｃドメインが配列番号６０３を含み、Ｘ３が配列番号６２１、６２２、６２４、６２５、６２７、６２８、６３０、６３２、６３４及び６３６から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項５に記載の構成物。
【請求項１０】
Ｘ３がＨ５３／Ｅ５４、Ｙ８１／Ｎ８２、Ｎ１１０／Ｋ１１１、Ｌ１４３／Ｔ１４４、Ｑ１７１／Ｐ１７２、Ｅ１７３／Ｎ１７４、Ｓ１８５／Ｄ１８６、Ｇ１８７／Ｓ１８８又はＧ２０５／Ｎ２０６において挿入されている、請求項９に記載の構成物。
【請求項１１】
ＩｇＧ１  Ｆｃドメインが配列番号６０４を含み、Ｘ３が配列番号６２１、６２２、６２４、６２５、６２７、６２８、６３２、６３４、６３６及び６４４から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項５に記載の構成物。
【請求項１２】
Ｘ３がＨ５３／Ｅ５４、Ｙ８１／Ｎ８２、Ｎ１１０／Ｋ１１１、Ｍ１４３／Ｔ１４４、Ｑ１７１／Ｐ１７２、Ｅ１７３／Ｎ１７４、Ｓ１８５／Ｄ１８６、Ｇ１８７／Ｓ１８８又はＧ２０５／Ｎ２０６において挿入されている、請求項１１に記載の構成物。
【請求項１３】
ＦｃドメインがＩｇＧ３  Ｆｃドメインを含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項１４】
ＩｇＧ３  Ｆｃドメインが配列番号６０５を含み、Ｘ３が配列番号６１４、６２１、６２２、６２４、６２７、６３９、６４１、６４４、６４５及び６４６から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項１３に記載の構成物。
【請求項１５】
Ｘ３がＨ１００／Ｅ１０１、Ｆ１２８／Ｎ１２９、Ｎ１５７／Ｋ１５８、Ｍ１９０／Ｔ１９１、Ｑ２１８／Ｐ２１９、Ｅ２２０／Ｎ２２１、Ｓ２３２／Ｄ２３３、Ｇ２３４／Ｓ２３５又はＧ２５２／Ｎ２５３において挿入されている、請求項１４に記載の構成物。
【請求項１６】
ＦｃドメインがＩｇＧ２  Ｆｃドメインを含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項１７】
Ｆｃドメインが配列番号６０６を含み、Ｘ３が配列番号６２１、６２２、６２４、６３２、６３６、６３９、６４０、６４２、６４４及び６４６から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項１６に記載の構成物。
【請求項１８】
Ｘ３がＨ４９／Ｅ５０、Ｆ７７／Ｎ７８、Ｎ１０６／Ｋ１０７、Ｍ１３９／Ｔ１４０、Ｑ１６７／Ｐ１６８、Ｅ１６９／Ｎ１７０、Ｓ１８１／Ｄ１８２、Ｇ１８３／Ｓ１８４又はＧ２０１／Ｎ２０２において挿入されている、請求項１７に記載の構成物。
【請求項１９】
ＦｃドメインがＩｇＧ４  Ｆｃドメインを含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項２０】
Ｆｃドメインが配列番号６０７を含み、Ｘ３が配列番号６２０、６２１、６２４、６２７、６３２、６３４、６３８、６３９、６４３及び６４４から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する請求項１９に記載の構成物。
【請求項２１】
Ｘ３がＱ５０／Ｅ５１、Ｆ７８／Ｎ７９、Ｎ１０７／Ｋ１０８、Ｍ１４０／Ｔ１４１、Ｑ１６８／Ｐ１６９、Ｅ１７０／Ｎ１７１、Ｓ１８２／Ｄ１８３、Ｇ１８４／Ｓ１８５又はＧ２０２／Ｎ２０３において挿入されている、請求項２０に記載の構成物。
【請求項２２】
Ｆｃドメインが配列番号６０８を含み、Ｘ３が配列番号６２１、６２２、６２８、６２４、６２７、６３２、６３６、６３９、６４４及び６４６から選択される配列の全部若しくは一部に挿入されている、又は該配列の全部若しくは一部を置換する、請求項１に記載の構成物。
【請求項２３】
Ｘ３がＨ６５／Ｅ６６、Ｆ９３／Ｎ９４、Ｎ１２２／Ｋ１２３、Ｍ１５７／Ｔ１５８、Ｑ１８５／Ｐ１８８、Ｅ１８９／Ｎ１９０、Ｓ２０１／Ｄ２０２、Ｇ２０３／Ｓ２０７又はＧ２２４／Ｎ２２５において挿入されている、請求項２２に記載の構成物。
【請求項２４】
Ｘ３がアンジオテンシン−２（ａｎｇ−２）結合ペプチド配列を含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項２５】
ａｎｇ−２結合ペプチド配列が配列番号１００〜１８９から選択される、請求項２４に記載の構成物。
【請求項２６】
ａｎｇ−２結合ペプチド配列が配列番号１４７である、請求項２５に記載の構成物。
【請求項２７】
Ｆ１がＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む、請求項２６に記載の構成物。
【請求項２８】
配列番号６１８の配列を有する、請求項２７に記載の構成物。
【請求項２９】
Ｘ３がミオスタチン結合ペプチド配列を含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項３０】
ミオスタチン結合ペプチド配列が配列番号２１８〜５０９から選択される、請求項２９に記載の構成物。
【請求項３１】
ミオスタチン結合ペプチド配列が配列番号３６５である、請求項３０に記載の構成物。
【請求項３２】
Ｆ１がＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む、請求項３１に記載の構成物。
【請求項３３】
配列番号６１２の配列を有する、請求項３２に記載の構成物。
【請求項３４】
Ｘ３がエリスロポイエチン様（ＥＰＯ様）ペプチド配列を含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項３５】
ＥＰＯ様ペプチド配列が配列番号１〜２７から選択される、請求項３４に記載の構成物。
【請求項３６】
ＥＰＯ様ペプチド配列が配列番号２である、請求項３５に記載の構成物。
【請求項３７】
Ｆ１がＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む、請求項３６に記載の構成物。
【請求項３８】
配列番号６１５の配列を有する、請求項３７に記載の構成物。
【請求項３９】
Ｘ３がトロンボポイエチン様（ＴＰＯ様）ペプチド配列を含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項４０】
ＴＰＯ様ペプチド配列が配列番号２８〜９９から選択される、請求項３９に記載の構成物。
【請求項４１】
ＴＰＯ様ペプチド配列が配列番号２８である、請求項４０に記載の構成物。
【請求項４２】
Ｆ１がＩｇＧ１  Ｆｃドメインを含む、請求項４１に記載の構成物。
【請求項４３】
配列番号６１６の配列を有する、請求項４２に記載の構成物。
【請求項４４】
Ｘ３が神経成長因子（ＮＧＦ）結合ペプチド配列を含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項４５】
ＮＧＦ結合ペプチド配列が配列番号１９０〜２１８から選択される、請求項４４に記載の構成物。
【請求項４６】
Ｘ３がＢ細胞活性化因子（ＢＡＦＦ）結合ペプチド配列を含む、請求項１に記載の構成物。
【請求項４７】
ＢＡＦＦ結合ペプチド配列が配列番号５１０〜５９４から選択される、請求項４６に記載の構成物。
【請求項４８】
請求項１に記載の構成物をコードするＤＮＡ。
【請求項４９】
請求項４８に記載のＤＮＡを含む発現ベクター。
【請求項５０】
請求項４９に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項５１】
細胞がＥ．コリ（Ｅ．  ｃｏｌｉ）細胞である、請求項５０に記載の細胞。
【請求項５２】
ａ）目的タンパク質の活性を調節する少なくとも１種類のランダム化ペプチドを選択すること、及び
ｂ）Ｆｃドメインの内部非末端配列として選択ペプチドのアミノ酸配列を含む薬剤を調製すること
を含む、薬理学的に活性な化合物を調製する方法。
【請求項５３】
Ｆｃドメインの内部領域がループ領域である、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
ペプチドが、酵母スクリーニング、合理的設計、タンパク質構造解析又はファージディスプレイライブラリー、Ｅ．コリディスプレイライブラリー、リボソームライブラリー若しくは化学ペプチドライブラリーのスクリーニングから選択される１つ以上の技術を含む方法において選択される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５５】
ａ）選択ペプチドのアミノ酸配列が、Ｆｃドメイン内の１個以上のアミノ酸に挿入されている、又はＦｃドメイン内の１個以上のアミノ酸を置換する、Ｆｃドメインをコードする核酸配列を含む遺伝子構築体を調製すること、及び
ｂ）前記遺伝子構築体を発現させること
によって薬剤調製が実施される、請求項５２に記載の方法。
【請求項５６】
遺伝子構築体がＥ．コリ細胞中で発現される、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
目的タンパク質が細胞表面受容体である、請求項５２に記載の方法。
【請求項５８】
目的タンパク質が線状エピトープを有する、請求項５２に記載の方法。
【請求項５９】
目的タンパク質がサイトカイン受容体である、請求項５２に記載の方法。
【請求項６０】
ＦｃドメインがＩｇＧ  Ｆｃドメインである、請求項５２に記載の方法。
【請求項６１】
少なくとも１個のＸ３をループ領域中に含むように修飾されたＦｃドメインを含む修飾抗体であって、前記ループ領域はＦｃドメインの非末端ドメインに存在しており、
Ｘ３が−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５、−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５−（Ｌ６）ｄ−Ｐ６、−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５−（Ｌ６）ｄ−Ｐ６−（Ｌ７）ｅ−Ｐ７及び−（Ｌ５）ｃ−Ｐ５−（Ｌ６）ｄ−Ｐ６−（Ｌ７）ｅ−Ｐ７−（Ｌ８）ｆ−Ｐ８から独立に選択され、
Ｐ５、Ｐ６、Ｐ７及びＰ８が各々独立に薬理学的に活性なペプチドの配列であり、
Ｌ５、Ｌ６、Ｌ７及びＬ８が各々独立にリンカーであり、
ｃ、ｄ、ｅ及びｆが各々独立に０又は１である、
前記修飾抗体。
【請求項６２】
ａ）目的タンパク質の活性を調節する少なくとも１種類のペプチドを選択すること、及び
ｂ）抗体のＦｃドメインのループ領域中に選択ペプチドのアミノ酸配列を含む抗体を調製すること
を含む、修飾抗体を調製する方法であって、ここで前記ループ領域はＦｃドメインの非末端ドメインに存在している、前記調製方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１０】
【表２】
2008514201.tif 000002
2008514201.tif 000003
2008514201.tif 000004
2008514201.tif 000005
2008514201.tif 000006
2008514201.tif 000007
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３０】
図２Ｂ及び２Ｃの配列アラインメントは、（図２Ａ中の配列番号５９９の付番を用いて）Ｑ１６７／Ｐ１６８及び／又はＧ１８３／Ｓ１８４におけるさらに可能な２個の挿入部位を示唆する。これらの位置は、並べられたＩｇＡとＩｇＭの配列中に存在する２及び３個の挿入残基があるＩｇＧ配列中のギャップに相当する。他の好ましい挿入部位は図２Ａ中の配列に対応する。好ましい挿入部位は図２Ｂ及び２Ｃの下線部であり、以下の通りである。
・  配列番号６０３及び６０４中のＨ５３／Ｅ５４、
・  配列番号６０５中のＨ１００／Ｅ１０１、
・  配列番号６０６中のＨ４９／Ｅ５０、
・  配列番号６０７中のＱ５０／Ｅ５１、
・  配列番号６０８中のＨ６５／Ｅ６６、
・  配列番号６０３及び６０４中のＹ８１／Ｎ８２、
・  配列番号６０５中のＦ１２８／Ｎ１２９、
・  配列番号６０６中のＦ７７／Ｎ７８、
・  配列番号６０７中のＦ７８／Ｎ７９、
・  配列番号６０８中のＦ９３／Ｎ９４、
・  配列番号６０３及び６０４中のＮ１１０／Ｋ１１１、
・  配列番号６０５中のＮ１５７／Ｋ１５８、
・  配列番号６０６中のＮ１０６／Ｋ１０７、
・  配列番号６０７中のＮ１０７／Ｋ１０８、
・  配列番号６０８中のＮ１２２／Ｋ１２３、
・  配列番号６０３及び６０４各中の、Ｌ１４３／Ｔ１４４及びＭ１４３／Ｔ１４４、
・  配列番号６０５中のＭ１９０／Ｔ１９１、
・  配列番号６０６中のＭ１３９／Ｔ１４０、
・  配列番号６０７中のＭ１４０／Ｔ１４１、
・  配列番号６０８中のＭ１５７／Ｔ１５８、
・  配列番号６０３及び６０４中のＱ１７１／Ｐ１７２、
・  配列番号６０５中のＱ２１８／Ｐ２１９、
・  配列番号６０６中のＱ１６７／Ｐ１６８、
・  配列番号６０７中のＱ１６８／Ｐ１６９、
・  配列番号６０８中のＱ１８５／Ｐ１８８、
・  配列番号６０３及び６０４中のＥ１７３Ｎ１７４、
・  配列番号６０５中のＥ２２０／Ｎ２２１、
・  配列番号６０６中のＥ１６９／Ｎ１７０、
・  配列番号６０７中のＥ１７０／Ｎ１７１、
・  配列番号６０８中のＥ１８９／Ｎ１９０、
・  配列番号６０３及び６０４中のＳ１８５／Ｄ１８６、
・  配列番号６０５中のＳ２３２／Ｄ２３３、
・  配列番号６０６中のＳ１８１／Ｄ１８２、
・  配列番号６０７中のＳ１８２／Ｄ１８３、
・  配列番号６０８中のＳ２０１／Ｄ２０２、
・  配列番号６０３及び６０４中のＧ１８７／Ｓ１８８、
・  配列番号６０５中のＧ２３４／Ｓ２３５、
・  配列番号６０６中のＧ１８３／Ｓ１８４、
・  配列番号６０７中のＧ１８４／Ｓ１８５、
・  配列番号６０８中のＧ２０３／Ｓ２０７、
・  配列番号６０３及び６０４中のＧ２０５／Ｎ２０６、
・  配列番号６０５中のＧ２５２／Ｎ２５３、
・  配列番号６０６中のＧ２０１／Ｎ２０２、
・  配列番号６０７中のＧ２０２／Ｎ２０３、並びに
・  配列番号６０８中のＧ２２４／Ｎ２２５。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
2008514201000001.app
【手続補正５】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図２Ｂ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図２Ｂ】
2008514201.tif 000008
【手続補正６】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図２Ｃ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図２Ｃ】
2008514201.tif 000009
【手続補正７】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図２Ｄ
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図２Ｄ】
2008514201.tif 000010