【手続補正書】
【提出日】平成31年2月1日(2019.2.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体における、癌、特にBC、OvaCa及び／又はPaCAの予後判定及び／又は診断のための検査方法であって、被験体において、
a）HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベルを測定する工程と、
b）miR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAマーカーの存在、特にその量を測定する工程と、
を含み、ここで少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAの存在が、前記被験体の予後及び／又は診断の指標である、検査方法。
【請求項２】
癌の予後及び／又は診断には、
i.  癌、特にBC、OvaCa及び／又はPaCAの発症のリスク、
ii.  癌、特にBC、OvaCa及び／又はPaCAの存在、及び／又は、
iii.  癌、特にBC、OvaCa及び／又はPaCAの進行、特に悪化若しくは好転、
が含まれる、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
a）メチル化マーカーRPTOR、MGRN1及びRAPSN並びに任意にHYAL2のメチル化状態及び／又は発現レベルを測定し、及び／又は、
b）miRNAマーカーmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bの存在を測定する、請求項1又は2に記載の方法。
【請求項４】
a）メチル化マーカーDYRK4、S100P、FUT7及びSLC22A18並びに任意にHYAL2のメチル化状態及び／又は発現レベルを測定し、及び／又は、
b）miRNAマーカーmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bの存在を測定する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
a）メチル化マーカーMGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4及び任意にHYAL2のメチル化状態及び／又は発現レベルを測定し、及び／又は、
b）miRNAマーカーmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bの存在を測定する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
被験体における癌の変化又は癌の予防若しくは治療のための医薬品の投与量を決定するための検査方法であって、
（a）被験体の試料における、HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びにmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定し、任意に、参照における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定し、対象となる試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量と比較する工程と、
（b）医薬品の投与量を、対象となる試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量に応じて、任意に、対象となる試料及び参照又は参照試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量の比較に応じて決定する工程と、
を含む、検査方法。
【請求項７】
癌の変化又は癌の予防若しくは治療のための医薬品の投与量を適合するための検査方法であって、
（a）試料における、HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びにmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定する工程と、
（b）1つ以上の参照又は参照試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定する工程と、
（c）試験される試料を、対象となる試料中に存在する少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量が、1つ以上の参照又は参照試料におけるレベルと異なるかどうかについて試験する工程と、
（d）医薬品の投与量を、対象となる試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量が、1つ以上の参照又は参照試料におけるレベルと異なるかどうかに応じて適合させる工程と、
を含む、検査方法。
【請求項８】
癌又は癌の発症に対する物質の有益な効果及び／又は不利な効果を測定するための検査方法であって、
（a）対象となる試料における、HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びにmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定する工程と、
（b）1つ以上の参照又は参照試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定する工程と、
（c）対象となる試料を、前記対象となる試料中に存在する少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量が、1つ以上の参照又は参照試料におけるレベルと異なるかどうかについて試験する工程と、
を含み、ここで対象となる試料が、前記物質に1つ以上の参照又は参照試料とは異なるように曝露されたものである、検査方法。
【請求項９】
癌治療に対する応答者としての患者を特定するための検査方法であって、第1の試料及び該第1の試料に引き続いて採取された1つ以上の更なる試料における、HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びにmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定することを含み、ここで少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態の増加及び／又は少なくとも1種のメチル化マーカーのより低い発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの不存在又は量の減少が、治療に対する応答を示す、検査方法。
【請求項１０】
癌治療に対する非応答者としての患者を特定するための検査方法であって、第1の試料及び該第1の試料に引き続いて採取された1つ以上の更なる試料における、HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベル、並びにmiR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAマーカーの量を測定することを含み、ここで少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態の減少及び／又は少なくとも1種のメチル化マーカーの発現レベルの増加、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの存在又は量の増加が、治療に対する応答の欠如を示す、検査方法。
【請求項１１】
癌の治療剤であって、
（i）被験体の第1の試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は少なくとも1種のメチル化マーカーの発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAの量を測定する工程、
（ii）1種以上の抗癌剤又は療法を含む第1の治療レジメンで前記患者の治療を開始する工程、
（iii）前記被験体の引き続き採取された1つ以上の更なる試料における、少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は少なくとも1種のメチル化マーカーの発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAの量を測定する工程、
（iv）任意に、工程（ii）及び（iii）を1回以上繰り返す工程、
（v）少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態の本質的な増加及び／又は少なくとも1種のメチル化マーカーのより低い発現レベル、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量の減少若しくは不存在が見られる場合に、該患者の第1の治療レジメンによる治療を継続する工程、又は、
（vi）少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態の減少及び／又は少なくとも1種のメチル化マーカーの発現レベルの増加、並びに少なくとも1種のmiRNAマーカーの量の増加若しくは存在が見られる場合に、該患者の第1の治療レジメンによる治療を修正するか、又は停止し、そしてその代わりに該患者を、第1の治療レジメンに含まれない1種以上の抗癌剤若しくは療法を含む第2の治療レジメンで治療する工程、
を含む、治療剤。
【請求項１２】
vii.  癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの発症のリスク、
viii.  癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの存在、及び／又は、
ix.  癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの進行、
の予後判定及び／又は診断のための検査手段であって、
a）少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベルを検出する1つ以上の検査手段と、
b）少なくとも1種のmiRNAマーカーの量の検出のための1つ以上の検査手段と、
を含む、検査手段。
【請求項１３】
請求項12に記載の検査手段を含むキット。
【請求項１４】
請求項12に記載の検査手段又は請求項13に記載のキットの、
vii.  癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの発症のリスク、
viii.  癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの存在、及び／又は、
ix.  癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの進行、
の予後判定及び／又は診断のための使用。
【請求項１５】
癌、BC、OvaCa及び／又はPaCAの特定のための検査装置であって、
（a）被験体の試料における、
（i）HYAL2、MGRN1、RPTOR、SLC22A18、FUT7、RAPSN、S100P、DYRK4からなる群から選択される少なくとも1種のメチル化マーカーのメチル化状態及び／又は発現レベルを測定するための検出剤と、
（ii）miR-652、miR-801、miR-376c、miR-376a、miR-127、miR-409、miR-148bからなる群から選択される少なくとも1種のmiRNAの存在を測定するための検出剤と、
を含む分析ユニットと、
（b）分析ユニットによって測定された量と参照との比較を実施するためのアルゴリズムが有形に組み込まれたデータプロセッサを含み、かつ前記比較に基づいて確立された診断を含む出力ファイルを生成することができる評価ユニットと、
を備える、検査装置。