【手続補正書】
【提出日】平成31年4月26日(2019.4.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
構造化照明システムであって、
筐体、
フォトマスク（１０８）上のパターンに対応する焦点の合った光のパターンがサンプル上に投射されるように照明源（１０２）からの照明を焦点合わせするよう構成された、前記筐体内に取り付けられたイメージング光学系（１０６）、
前記筐体内に取り付けられ、前記照明をサンプルに反射するよう構成されたリフレクタ（１１０）、
前記照明されたサンプルからの放射のみがセンサ（１２０）を透過することを可能にするよう構成された、前記筐体内に取り付けられた１つ以上のフィルタ（１１８）を含むフィルタ装置（１１８）、および
前記装置がイメージングシステム内に設置されることを可能にするよう構成された、前記筐体上の取り付け機構
を備えるイメージング装置と、
複数のイメージング装置が前記システム上または前記システム内に取り付けられることを可能にするよう構成された取り付け機構と
を備え、
前記筐体は、フォトマスク（１０８）を含むスライドを前記照明源（１０２）と前記イメージング光学系（１０６）との間の前記筐体内に挿入することを可能にする開口をさらに備える、システム。
【請求項２】
前記筐体に取り付けられ、前記照明源（１０２）からの照明をフォトマスク（１０８）上に焦点合わせするよう構成された照明源光学系（２０４）をさらに備える、請求項１に記載のシステム。
【請求項３】
照明源（１０２）をさらに備える、請求項１に記載のシステム。
【請求項４】
前記照明源（１０２）は、前記筐体内に取り付けられる、請求項３に記載のシステム。
【請求項５】
前記照明源（１０２）は、発光ダイオード（ＬＥＤ）である、請求項３に記載のシステム。
【請求項６】
前記スライドは、１つ以上のピンホールマスクまたはクリア窓を含む、請求項１に記載のシステム。
【請求項７】
前記１つ以上のピンホールマスク（１０８）は、座標系によって規定されるピンホールのパターンを含む、請求項１に記載のシステム。
【請求項８】
合成画像を生成するのに必要な複数の画像をキャプチャする必要に応じて、前記スライドを動かすよう構成された移動装置をさらに備える、請求項１に記載のシステム。
【請求項９】
前記リフレクタ（１１０）は、ダイクロイックミラーである、請求項１に記載のシステム。
【請求項１０】
前記筐体上または前記筐体内に取り付けられ、前記装置が制御システムと通信することを可能にするよう構成された回路（２０２）をさらに備える、請求項１に記載のシステム。
【請求項１１】
前記回路は、前記装置についての情報を前記制御システム（４００）に提供するよう構成される、請求項１０に記載のシステム。
【請求項１２】
前記照明源（１０２）およびフィルタ装置（１１８）は、特定の種類のサンプル色素に対して最適化される、請求項１に記載のシステム。
【請求項１３】
前記複数のイメージング装置それぞれは、特定の種類の色素に対して最適化され、前記システムは、前記複数のイメージング装置の特定の１つを、前記関連する色素を含むサンプルを撮像するのに使用される位置とすることを可能にする機構を備える、請求項１２に記載のシステム。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１５】
別の態様によると、照明源と特定のサンプル色素に対して最適化された光学系とを含む筐体を備えるイメージングシステムを構成する方法は、筐体内にイメージング光学系を取り付けることと、フォトマスク上のパターンに対応する焦点の合った光のパターンがサンプル上に投射されるように照明源からの照明を焦点合わせするようイメージング光学系を構成することと、照明サンプルからの放射のみがセンサを通過することを可能にするよう構成された、１つ以上のフィルタを有するフィルタ装置を筐体内に取り付けることと、サンプルを照明するために照明源、イメージング光学系、およびフィルタ装置を較正することと、筐体を取り付け構造に取り付けることと、を含む。
本発明は、例えば、以下を提供する。
（項目１）
構造化照明画像を生成する装置であって、
筐体と、
フォトマスク上のパターンに対応する焦点の合った光のパターンがサンプル上に投射されるように照明源からの照明を焦点合わせするよう構成された、前記筐体内に取り付けられたイメージング光学系と、
前記筐体内に取り付けられ、前記照明をサンプルに反射するよう構成されたリフレクタと、
前記照明されたサンプルからの放射のみがセンサを透過することを可能にするよう構成された、前記筐体内に取り付けられた１つ以上のフィルタを含むフィルタ装置と、
前記装置がイメージングシステム内に設置されることを可能にするよう構成された、前記筐体上の取り付け機構と、を備える、装置。
（項目２）
前記筐体は、フォトマスクを含むスライドを前記照明源と前記イメージング光学系との間の前記筐体内に挿入することを可能にする開口をさらに備える、項目１に記載の装置。
（項目３）
前記筐体内に取り付けられ、前記照明源からの照明をフォトマスク上に焦点合わせするよう構成された照明源光学系をさらに備える、項目１に記載の装置。
（項目４）
前記筐体内に取り付けられた照明源をさらに備える、項目１に記載の装置。
（項目５）
前記照明源は、発光ダイオード（ＬＥＤ）である、項目４に記載の装置。
（項目６）
前記スライドは、１つ以上のピンホールマスクまたはクリア窓を含む、項目２に記載の装置。
（項目７）
前記１つ以上のピンホールマスクは、座標系によって規定されるピンホールのパターンを含む、項目２に記載の装置。
（項目８）
合成画像を生成するのに必要な複数の画像をキャプチャする必要に応じて、前記スライドを動かすよう構成された移動装置をさらに備える、項目２に記載の装置。
（項目９）
前記リフレクタは、ダイクロイックミラーである、項目１に記載の装置。
（項目１０）
前記筐体上または前記筐体内に取り付けられ、前記装置が制御システムと通信することを可能にするよう構成された回路をさらに備える、項目１に記載の装置。
（項目１１）
前記回路は、前記装置についての情報を前記制御システムに提供するよう構成される、項目９に記載の装置。
（項目１２）
前記照明源およびフィルタ装置は、特定の種類のサンプル染色に対して最適化される、項目１に記載の装置。
（項目１３）
前記取り付け機構は、前記装置が設置されるたびに、前記装置に関連付けられた光路内の同じ位置および方向に前記リフレクタを位置付けるように、前記装置の前記位置を少なくとも部分的に制約するよう構成される、項目１に記載の装置。
（項目１４）
前記取り付け機構は、運動ガイド、ダブテールガイド、または他の機械的ガイドのうちの少なくとも１つを含む、またはこれと協働するよう構成される、項目１に記載の装置。
（項目１５）
構造化照明システムであって、
筐体、
フォトマスク上のパターンに対応する焦点の合った光のパターンがサンプル上に投射されるように照明源からの照明を焦点合わせするよう構成された、前記筐体内に取り付けられたイメージング光学系、
前記筐体内に取り付けられ、前記照明をサンプルに反射するよう構成されたリフレクタ、前記照明されたサンプルからの放射のみがセンサを透過することを可能にするよう構成された、前記筐体内に取り付けられた１つ以上のフィルタを含むフィルタ装置、および
前記装置がイメージングシステム内に設置されることを可能にするよう構成された、前記筐体上の取り付け機構、を備えるイメージング装置と、
複数のイメージング装置が前記システム上または前記システム内に取り付けられることを可能にするよう構成された取り付け機構と、を備えるシステム。
（項目１６）
前記筐体は、フォトマスクを含むスライドを前記筐体内の前記照明源と前記イメージング光学系との間の前記筐体内に挿入することを可能にする開口をさらに備える、項目１５に記載のシステム。
（項目１７）
前記筐体に取り付けられ、前記照明源からの照明をフォトマスク上に焦点合わせするよう構成された照明源光学系をさらに備える、項目１５に記載のシステム。
（項目１８）
照明源をさらに備える、項目１５に記載のシステム。
（項目１９）
前記照明源は、前記筐体内に取り付けられる、項目１８に記載のシステム。
（項目２０）
前記照明源は、発光ダイオード（ＬＥＤ）である、項目１８に記載のシステム。
（項目２１）
前記スライドは、１つ以上のピンホールマスクまたはクリア窓を含む、項目１６に記載のシステム。
（項目２２）
前記１つ以上のピンホールマスクは、座標系によって規定されるピンホールのパターンを含む、項目１６に記載のシステム。
（項目２３）
合成画像を生成するのに必要な複数の画像をキャプチャする必要に応じて、前記スライドを動かすよう構成された移動装置をさらに備える、項目１６に記載のシステム。
（項目２４）
前記リフレクタは、ダイクロイックミラーである、項目１５に記載のシステム。
（項目２５）
前記筐体上または前記筐体内に取り付けられ、前記装置が制御システムと通信することを可能にするよう構成された回路をさらに備える、項目１５に記載のシステム。
（項目２６）
前記回路は、前記装置についての情報を前記制御システムに提供するよう構成される、項目２５に記載のシステム。
（項目２７）
前記照明源およびフィルタ装置は、特定の種類のサンプル色素に対して最適化される、項目１５に記載のシステム。
（項目２８）
前記複数のイメージング装置それぞれは、特定の種類の色素に対して最適化され、前記システムは、前記複数のイメージング装置の特定の１つを、前記関連する色素を含むサンプルを撮像するのに使用される位置とすることを可能にする機構を備える、項目２７に記載のシステム。
（項目２９）
照明源および特定のサンプル色素に対して最適化された光学系を含む筐体を備えるイメージングシステムを構成する方法であって、
イメージング光学系を前記筐体内に取り付けて、前記イメージング光学系を、フォトマスク上のパターンに対応する焦点の合った光のパターンがサンプル上に投射されるように、照明源からの照明を焦点合わせするよう構成することと、
１つ以上のフィルタを含むフィルタ装置を前記筐体内に取り付けることであって、前記フィルタ装置は前記照明されたサンプルからの放射のみが前記センサを透過することを可能にするよう構成される、取り付けることと、
前記照明源、イメージング光学系、およびフィルタ装置を、前記サンプルを照明するために較正することと、
前記筐体を取り付け構造に取り付けることと、を含む方法。
（項目３０）
照明源光学系を前記筐体に取り付けることと、前記照明源光学系を、前記照明源、イメージング光学系、およびフィルタと共に較正することと、をさらに含む、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
リフレクタを前記筐体に取り付けることと、前記リフレクタを、前記照明源、イメージング光学系、およびフィルタと共に較正することと、をさらに含む、項目２９に記載の方法。
（項目３２）
前記筐体が前記取り付け機構上に取り付けられると、照明源を用いて、ピンホールパターンを含むフォトマスクを通してサンプルを照明することと、
センサを用いて、前記サンプルの画像をキャプチャすることと、
前記画像をデータに変換することと、
処理モジュールにおいて、
前記ピンホールパターンのピンホールの既知の間隔を用いて前記データをフィルタして、前記間隔に対応するデータを取得することと、
閾値を用いて、ピンホールに関連付けるのに十分に明るい残存データの領域を特定することと、
前記領域の重心を算出することと、
前記ピンホールパターンに対する既知のパターンを、前記データに対する最良適合を特定するために前記領域に適合させることと、
記憶媒体に、前記最良適合データを以後の画像キャプチャルーチンで使用するために保存することと、をさらに含む、項目２９に記載の方法。
（項目３３）
前記処理モジュールにおいて、前記キャプチャした画像に対応する前記データを高めることをさらに含む、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記データを高めることが、前記データの鮮明度およびコントラストをブーストすることを含む、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
前記データをフィルタすることが、前記データを周波数ドメインに変換し、バンドパスフィルタを前記変換したデータに適用することを含む、項目３２に記載の方法。
（項目３６）
前記処理モジュールにおいて、雑音を除去し、前記フィルタされたデータにおける輝度変化を算出することをさらに含む、項目３２に記載の方法。
（項目３７）
前記処理モジュールにおいて、輝度閾値を上回る前記フィルタされたデータにおけるデータのみを維持することをさらに含む、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
ヒストグラムビニング技法を用いて、前記輝度閾値を上回るデータを特定する、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記処理モジュールにおいて、回転、スケールおよびオフセット係数のうちの少なくとも１つを、反復プロセスにおいて一対の重心に適用して、前記最良適合を特定することを助けることをさらに含む、項目３２に記載の方法。
（項目４０）
前記最良適合データを用いて前記サンプルの合成画像を取得することをさらに含む、項目３２に記載の方法。
（項目４１）
前記筐体に照明源を取り付けることをさらに含む、項目２９に記載の方法。