【手続補正書】
【提出日】平成20年6月27日(2008.6.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
質量分析の方法であって、
第１の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比を決定するステップであって、前記正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比が第１の整数質量若しくは質量電荷比成分及び第１の小数質量若しくは質量電荷比成分を含むステップと、
小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウを質量スペクトルデータ又は質量スペクトルに適用することにより、その小数質量若しくは質量電荷比成分が前記第１の小数質量若しくは質量電荷比成分よりも０〜ｘ1ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位大きい、及び／又は、０〜ｘ2ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位小さい１つ以上の第２の物質又はイオンを検索するステップであって、前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウが、前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウから外れる小数質量若しくは質量電荷比成分を有する第２の物質又はイオンの有意性をフィルタで取り除くか、除去するか、減衰させるか又は少なくとも低減するステップと、を含み、
前記第１の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比から第２の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比を差し引いたものがΔＭダルトン若しくは質量電荷比単位の値を有し、前記ｘ1及び／又はｘ2がΔＭの関数として対称又は非対称に変化する質量分析方法。
【請求項２】
１つ以上の前記第２の物質又はイオンを検索する前記ステップが、１つ以上の前記第２の物質又はイオンの小数質量若しくは質量電荷比成分にのみ基づき、１つ以上の前記第２の物質又はイオンの整数質量若しくは質量電荷比成分には基づかずに検索すること、及び／又は、前記第１の整数質量若しくは質量電荷比成分と異なる整数質量若しくは質量電荷比成分を有する一部又はすべての第２の物質又はイオンを検索することを含む、請求項１記載の質量分析方法。
【請求項３】
前記ｘ1が、（ｉ）＜１、（ｉｉ）１〜５、（ｉｉｉ）５〜１０、（ｉｖ）１０〜１５、（ｖ）１５〜２０、（ｖｉ）２０〜２５、（ｖｉｉ）２５〜３０、（ｖｉｉｉ）３０〜３５、（ｉｘ）３５〜４０、（ｘ）４０〜４５、（ｘｉ）４５〜５０、（ｘｉｉ）５０〜５５、（ｘｉｉｉ）５５〜６０、（ｘｉｖ）６０〜６５、（ｘｖ）６５〜７０、（ｘｖｉ）７０〜７５、（ｘｖｉｉ）７５〜８０、（ｘｖｉｉｉ）８０〜８５、（ｘｉｘ）８５〜９０、（ｘｘ）９０〜９５、（ｘｘｉ）９５〜１００、及び、（ｘｘｉｉ）＞１００からなる群から選択される範囲に入り、
前記ｘ2が、（ｉ）＜１、（ｉｉ）１〜５、（ｉｉｉ）５〜１０、（ｉｖ）１０〜１５、（ｖ）１５〜２０、（ｖｉ）２０〜２５、（ｖｉｉ）２５〜３０、（ｖｉｉｉ）３０〜３５、（ｉｘ）３５〜４０、（ｘ）４０〜４５、（ｘｉ）４５〜５０、（ｘｉｉ）５０〜５５、（ｘｉｉｉ）５５〜６０、（ｘｉｖ）６０〜６５、（ｘｖ）６５〜７０、（ｘｖｉ）７０〜７５、（ｘｖｉｉ）７５〜８０、（ｘｖｉｉｉ）８０〜８５、（ｘｉｘ）８５〜９０、（ｘｘ）９０〜９５、（ｘｘｉ）９５〜１００、及び、（ｘｘｉｉ）＞１００からなる群から選択される範囲に入る、請求項１又は２に記載の質量分析方法。
【請求項４】
（ｉ）前記第１の物質又はイオンが、製薬化合物、薬物若しくは活性成分を含むか又はそれに関係し、かつ／又は、１つ以上の前記第２の物質又はイオンが、前記第１の物質又はイオンの１つ以上の代謝産物若しくは誘導体を含むか又はそれに関係し、あるいは、
（ｉｉ）前記第１の物質又はイオンが、生体高分子、タンパク質、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、アミノ酸、炭水化物、糖、脂質、脂肪酸、ビタミン、ホルモン、ＤＮＡの部分又はフラグメント、ｃＤＮＡの部分又はフラグメント、ＲＮＡの部分又はフラグメント、ｍＲＮＡの部分又はフラグメント、ｔＲＮＡの部分又はフラグメント、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、リボヌクレアーゼ、酵素、代謝産物、多糖類、リン酸化ペプチド、リン酸化タンパク質、糖ペプチド、糖タンパク質、又はステロイドを含み、かつ／又は、１つ以上の前記第２の物質又はイオンが、生体高分子、タンパク質、ペプチド、ポリペプチド、オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、アミノ酸、炭水化物、糖、脂質、脂肪酸、ビタミン、ホルモン、ＤＮＡの部分又はフラグメント、ｃＤＮＡの部分又はフラグメント、ＲＮＡの部分又はフラグメント、ｍＲＮＡの部分又はフラグメント、ｔＲＮＡの部分又はフラグメント、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、リボヌクレアーゼ、酵素、代謝産物、多糖類、リン酸化ペプチド、リン酸化タンパク質、糖ペプチド、糖タンパク質、又はステロイドを含む、請求項１から３のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項５】
分析される試料が、異なるアイデンティティを有するか若しくは異なる種を含む少なくとも２、５、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１５００、２０００、２５００、３０００、３５００、４０００、４５００若しくは５０００個の成分、分子又は検体を含む請求項１から４のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項６】
前記ｘ1及び／又はｘ2が、（ｉ）０、（ｉｉ）±０〜５、（ｉｉｉ）±５〜１０、（ｉｖ）±１０〜１５、（ｖ）±１５〜２０、（ｖｉ）±２０〜２５、（ｖｉｉ）±２５〜３０、（ｖｉｉｉ）±３０〜３５、（ｉｘ）±３５〜４０、（ｘ）±４０〜４５、（ｘｉ）±４５〜５０、（ｘｉｉ）±５０〜５５、（ｘｉｉｉ）±５５〜６０、（ｘｉｖ）±６０〜６５、（ｘｖ）±６５〜７０、（ｘｖｉ）±７０〜７５、（ｘｖｉｉ）±７５〜８０、（ｘｖｉｉｉ）±８０〜８５、（ｘｉｘ）±８５〜９０、（ｘｘ）±９０〜９５、（ｘｘｉ）±９５〜１００、（ｘｘｉｉ）＞１００、及び、（ｘｘｉｉｉ）＜−１００からなる群から選択されたΔＭの値について対称にΔＭの関数として変化する請求項１から５のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項７】
前記ｘ1及び／又はｘ2が、Ｍlower＜ΔＭ及び／又はΔＭ＜Ｍupperの場合に、実質的に一定値を有し、Ｍlower＞ΔＭ及び／又はΔＭ＞Ｍupperの場合に、ΔＭの関数として実質的に非一定値を有する、請求項１から６のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項８】
前記ｘ1及び／又はｘ2が、Ｍlower＞ΔＭ及び／又はΔＭ＞Ｍupperの場合に、ΔＭの関数として実質的に直線的に変化し、前記ｘ1及び／又はｘ2が、Ｍlower＞ΔＭ及び／又はΔＭ＞Ｍupperの場合に、実質的に曲線的、段階的又は非直線的にΔＭの関数として変化する、請求項７記載の質量分析方法。
【請求項９】
前記ｘ1及び／又はｘ2がΔＭ値の少なくともある範囲にわたりｙ％＊ΔＭの率で増加するか又は減少し、前記ｙが（ｉ）＜０．０１、（ｉｉ）０．０１〜０．０２、（ｉｉｉ）０．０２〜０．０３、（ｉｖ）０．０３〜０．０４、（ｖ）０．０４〜０．０５、（ｖｉ）０．０５〜０．０６、（ｖｉｉｉ）０．０６〜０．０７、（ｉｘ）０．０７〜０．０８、（ｘ）０．０８〜０．０９、（ｘｉ）０．０９〜０．１０、（ｘｉｉ）０．１０〜０．１１、（ｘｉｉｉ）０．１１〜０．１２、（ｘｉｖ）０．１２〜０．１３、（ｘｖ）０．１３〜０．１４、（ｘｖｉ）０．１４〜０．１５、（ｘｖｉｉ）０．１５〜０．１６、（ｘｖｉｉｉ）０．１６〜０．１７、（ｘｉｘ）０．１７〜０．１８、（ｘｘ）０．１８〜０．１９、（ｘｘｉ）０．１９〜０．２０、及び、（ｘｘｉｉ）＞０．２０からなる群から選択される請求項１から８のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１０】
前記Ｍupperが、ダルトン若しくは質量電荷比単位の値であり、（ｉ）＜１、（ｉｉ）１〜５、（ｉｉｉ）５〜１０、（ｉｖ）１０〜１５、（ｖ）１５〜２０、（ｖｉ）２０〜２５、（ｖｉｉ）２５〜３０、（ｖｉｉｉ）３０〜３５、（ｉｘ）３５〜４０、（ｘ）４０〜４５、（ｘｉ）４５〜５０、（ｘｉｉ）５０〜５５、（ｘｉｉｉ）５５〜６０、（ｘｉｖ）６０〜６５、（ｘｖ）６５〜７０、（ｘｖｉ）７０〜７５、（ｘｖｉｉ）７５〜８０、（ｘｖｉｉｉ）８０〜８５、（ｘｉｘ）８５〜９０、（ｘｘ）９０〜９５、（ｘｘｉ）９５〜１００、及び、（ｘｘｉｉ）＞１００からなる群から選択される範囲に入り、かつ／又は、前記Ｍlowerが、ダルトン若しくは質量電荷比単位の値であり、（ｉ）＜−１００、（ｉｉ）−１００〜−９５、（ｉｉｉ）−９５〜−９０、（ｉｖ）−９０〜−８５、（ｖ）−８５〜−８０、（ｖｉ）−８０〜−７５、（ｖｉｉ）−７５〜−７０、（ｖｉｉｉ）−７０〜−６５、（ｉｘ）−６５〜−６０、（ｘ）−６０〜−５５、（ｘｉ）−５５〜−５０、（ｘｉｉ）−５０〜−４５、（ｘｉｉｉ）−４５〜−４０、（ｘｉｖ）−４０〜−３５、（ｘｖ）−３５〜−３０、（ｘｖｉ）−３０〜−２５、（ｘｖｉｉ）−２５〜−２０、（ｘｖｉｉｉ）−２０〜−１５、（ｘｉｘ）−１５〜−１０、（ｘｘ）−１０〜−５、（ｘｘｉ）−５〜−１、及び、（ｘｘｉｉ）＞−１からなる群から選択される範囲に入る、請求項７から９のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１１】
さらなる分析のために、その小数質量若しくは質量電荷比成分が前記第１の小数質量若しくは質量電荷比成分よりも０〜ｘ1ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位大きい、及び／又は、０〜ｘ2ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位小さい１つ以上の第２の物質又はイオンを選択するステップをさらに含み、
さらなる分析のために選択する前記ステップが、１つ以上の前記第２の物質又はイオンをフラグメンテーションすること、並びに／又は、その小数質量若しくは質量電荷比成分が前記第１の小数質量若しくは質量電荷比成分よりも０〜ｘ1ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位大きい、及び／又は、０〜ｘ2ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位小さい１つ以上の第２の物質又はイオンを、衝突又はフラグメンテーションセルへ前方向にトランスミットすることを含む、請求項１から１０のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１２】
分析される試料中の成分、検体又は分子を、分離プロセスによって分離するステップをさらに含み、
前記分離プロセスが、液体クロマトグラフィ、又は、（ｉ）高速液体クロマトグラフィ（「ＨＰＬＣ」）、（ｉｉ）陰イオン変換、（ｉｉｉ）陰イオン変換クロマトグラフィ、（ｉｖ）陽イオン変換、（ｖ）陽イオン変換クロマトグラフィ、（ｖｉ）イオン対逆相クロマトグラフィ、（ｖｉｉ）クロマトグラフィ、（ｖｉｉｉ）１次元電気泳動、（ｉｘ）多次元電気泳動、（ｘ）サイズ排除、（ｘｉ）親和性、（ｘｉｉ）逆相クロマトグラフィ、（ｘｉｉｉ）キャピラリ電気泳動クロマトグラフィ（「ＣＥＣ」）、（ｘｉｖ）電気泳動、（ｘｖ）イオン移動度分離、（ｘｖｉ）フィールド非対称なイオン移動度分離又はスペクトロメトリ（「ＦＡＩＭＳ」）、（ｘｖｉｉ）キャピラリ電気泳動、（ｘｖｉｉｉ）ガスクロマトグラフィ、及び（ｘｉｘ）超臨界流体クロマトグラフィから選択される１つを含む、請求項１から１１のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１３】
分析される試料中の成分、検体又は分子をイオン化するステップをさらに含み、
成分、検体又は分子をイオン化する前記ステップが、パルス化イオン源若しくは連続イオン源を使用して、かつ／又は、（ｉ）エレクトロスプレーイオン化（「ＥＳＩ」）イオン源、（ｉｉ）大気圧光イオン化（「ＡＰＰＩ」）イオン源、（ｉｉｉ）大気圧化学イオン化（「ＡＰＣＩ」）イオン源、（ｉｖ）マトリックス支援レーザ脱離イオン化（「ＭＡＬＤＩ」）イオン源、（ｖ）レーザ脱離イオン化（「ＬＤＩ」）イオン源、（ｖｉ）大気圧イオン化（「ＡＰＩ」）イオン源、（ｖｉｉ）シリコンを用いた脱離イオン化（「ＤＩＯＳ」）イオン源、（ｖｉｉｉ）電子衝突（「ＥＩ」）イオン源、（ｉｘ）化学イオン化（「ＣＩ」）イオン源、（ｘ）電界イオン化（「ＦＩ」）イオン源、（ｘｉ）電界脱離（「ＦＤ」）イオン源、（ｘｉｉ）誘導結合プラズマ（「ＩＣＰ」）イオン源、（ｘｉｉｉ）高速原子衝撃（「ＦＡＢ」）イオン源、（ｘｉｖ）液体二次イオン質量分析（「ＬＳＩＭＳ」）イオン源、（ｘｖ）脱離エレクトロスプレーイオン化（「ＤＥＳＩ」）イオン源、及び（ｘｖｉ）ニッケル−６３放射性イオン源からなる群から選択されたイオン源を使用して前記成分、検体又は分子をイオン化するステップを含む、請求項１から１２のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１４】
質量分析部を使用して前記第１の物質又はイオン及び／又は１つ以上の前記第２の物質又はイオン及び／又はフラグメント産物又はイオンを質量分析するステップをさらに含み、
質量分析する前記ステップが、四重極質量分析部、又は、（ｉ）フーリエ変換（「ＦＴ」）質量分析部、（ｉｉ）フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴（「ＦＴＩＣＲ」）質量分析部、（ｉｉｉ）飛行時間（「ＴＯＦ」）質量分析部、（ｉｖ）直交加速飛行時間（「ｏａＴＯＦ」）質量分析部、（ｖ）軸方向加速飛行時間質量分析部、（ｖｉ）扇形磁場質量分析計、（ｖｉｉ）ポール又は３Ｄ四重極質量分析部、（ｖｉｉｉ）２Ｄ又は直線四重極質量分析部、（ｉｘ）ペニングトラップ質量分析部、（ｘ）イオントラップ質量分析部、（ｘｉ）フーリエ変換オービトラップ（ｏｒｂｉｔｒａｐ）、（ｘｉｉ）静電イオンサイクロトロン共鳴質量分析計、及び、（ｘｉｉｉ）静電フーリエ変換質量分析計からなる群から選択される質量分析部を使用して質量分析することを含む、請求項１から１３のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１５】
前記第１の物質又はイオン及び／又は１つ以上の前記第２の物質又はイオンの厳密な若しくは正確な質量若しくは質量電荷比が、２０ｐｐｍ、１９ｐｐｍ、１８ｐｐｍ、１７ｐｐｍ、１６ｐｐｍ、１５ｐｐｍ、１４ｐｐｍ、１３ｐｐｍ、１２ｐｐｍ、１１ｐｐｍ、１０ｐｐｍ、９ｐｐｍ、８ｐｐｍ、７ｐｐｍ、６ｐｐｍ、５ｐｐｍ、４ｐｐｍ、３ｐｐｍ、２ｐｐｍ、１ｐｐｍ又は＜１ｐｐｍ以内に決定され、かつ／又は、０.０１質量単位、０.００９質量単位、０.００８質量単位、０.００７質量単位、０.００６質量単位、０.００５質量単位、０.００４質量単位、０.００３質量単位、０.００２質量単位、０.００１質量単位又は＜０.００１質量単位以内に決定される、請求項１から１４のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１６】
分析される試料が、疾患生体、非疾患生体、処置生体、非処置生体、変異生体又は野生型生体から取られる、請求項１から１５のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１７】
さらに、
（ｉ）１つ以上の前記第２の物質又はイオンの組成を同定又は決定するステップ、並びに／又は、
（ｉｉ）前記第１の物質又はイオンの強度、濃度又は発現レベルを定量又は決定するステップ、及び／若しくは、１つ以上の前記第２の物質又はイオンの強度、濃度又は発現レベルを定量又は決定するステップ、並びに／又は、
（ｉｉｉ）前記第１の物質又はイオンの相対強度、濃度又は発現レベルを決定又は定量するステップ、及び／若しくは、１つ以上の前記第２の物質又はイオンの相対強度、濃度又は発現レベルを決定又は定量するステップを含む、請求項１から１６のいずれか一項に記載の質量分析方法。
【請求項１８】
質量分析の方法であって、
親イオンの正確な質量電荷比を決定するステップであって、前記正確な質量電荷比は第１の整数値及び第１の小数値を含むステップと、
前記親イオンの１つ以上の代謝産物を検索するステップとを含み、
検索する前記ステップが、
（ｉ）第２の整数値及び第２の小数値を含む潜在的な対象のイオンの正確な質量電荷比の決定すること、及び、
（ｉｉ）小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウを質量スペクトルデータ又は質量スペクトルに適用し、イオンが正確な質量電荷比を有することに基づき、前記潜在的な対象のイオンのうちのイオンを認識、選択、優先質量フィルタリング又はトランスミット、決定又はフラグメンテーションすること、を含み、
前記第２の小数値が前記第１の小数値のｘ ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位以内であり、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウが、前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウから外れる小数質量若しくは質量電荷比成分を有する第２の物質又はイオンの有意性をフィルタで取り除くか、除去するか、減衰させるか又は少なくとも低減し、
前記第１の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比から第２の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比を差し引いたものがΔＭダルトン若しくは質量電荷比単位の値を有し、前記ｘがΔＭの関数として対称又は非対称に変化する、質量分析方法。
【請求項１９】
前記ｘが、（ｉ）＜１、（ｉｉ）１〜５、（ｉｉｉ）５〜１０、（ｉｖ）１０〜１５、（ｖ）１５〜２０、（ｖｉ）２０〜２５、（ｖｉｉ）２５〜３０、（ｖｉｉｉ）３０〜３５、（ｉｘ）３５〜４０、（ｘ）４０〜４５、（ｘｉ）４５〜５０、（ｘｉｉ）５０〜５５、（ｘｉｉｉ）５５〜６０、（ｘｉｖ）６０〜６５、（ｘｖ）６５〜７０、（ｘｖｉ）７０〜７５、（ｘｖｉｉ）７５〜８０、（ｘｖｉｉｉ）８０〜８５、（ｘｉｘ）８５〜９０、（ｘｘ）９０〜９５、（ｘｘｉ）９５〜１００、及び、（ｘｘｉｉ）＞１００からなる群から選択される範囲に入る、請求項１８記載の質量分析方法。
【請求項２０】
質量分析計であって、
第１の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比を決定するように構成及び適合された手段であって、前記正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比が、第１の整数質量若しくは質量電荷比成分及び第１の小数質量若しくは質量電荷比成分を含む手段と、
小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウを質量スペクトルデータ又は質量スペクトルに適用することにより、その小数質量若しくは質量電荷比成分が前記第１の小数質量若しくは質量電荷比成分よりも０〜ｘ1ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位大きい、及び／又は、０〜ｘ2ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位小さい１つ以上の第２の物質又はイオンを検索するように構成及び適合された手段と、を含み、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウが、前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウから外れる小数質量若しくは質量電荷比成分を有する第２の物質又はイオンの有意性をフィルタで取り除くか、除去するか、減衰させるか又は少なくとも低減し、
前記第１の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比から第２の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比を差し引いたものがΔＭダルトン若しくは質量電荷比単位の値を有し、前記ｘ1及び／又はｘ2がΔＭの関数として対称又は非対称に変化する、質量分析計。
【請求項２１】
質量分析計であって、
親イオンの正確な質量電荷比を決定するように構成及び適合された手段であって、前記正確な質量電荷比が、第１の整数値及び第１の小数値を含む手段と、
前記親イオンの１つ以上の代謝産物を検索するように構成及び適合された手段とを備え、
前記検索する手段が
（ｉ）第２の整数値及び第２の小数値を含む潜在的な対象のイオンの正確な質量電荷比の決定、及び、
（ｉｉ）イオンが正確な質量電荷比を有することに基づく、前記潜在的な対象のイオンのうちのイオンを認識、選択、優先質量フィルタリング又はトランスミット、決定又はフラグメンテーションを行い、
小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウを質量スペクトルデータ又は質量スペクトルに適用することにより、前記第２の小数値が前記第１の小数値のｘ ｍＤａ若しくはミリ質量電荷比単位以内であり、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウが、前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウから外れる小数質量若しくは質量電荷比成分を有する第２の物質又はイオンの有意性をフィルタで取り除くか、除去するか、減衰させるか又は少なくとも低減し、
前記第１の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比から第２の物質又はイオンの正確な若しくは厳密な質量若しくは質量電荷比を差し引いたものがΔＭダルトン若しくは質量電荷比単位の値を有し、前記ｘがΔＭの関数として対称又は非対称に変化するように構成及び適合される手段である、質量分析計。
【請求項２２】
前記ｘが、（ｉ）＜１、（ｉｉ）１〜５、（ｉｉｉ）５〜１０、（ｉｖ）１０〜１５、（ｖ）１５〜２０、（ｖｉ）２０〜２５、（ｖｉｉ）２５〜３０、（ｖｉｉｉ）３０〜３５、（ｉｘ）３５〜４０、（ｘ）４０〜４５、（ｘｉ）４５〜５０、（ｘｉｉ）５０〜５５、（ｘｉｉｉ）５５〜６０、（ｘｉｖ）６０〜６５、（ｘｖ）６５〜７０、（ｘｖｉ）７０〜７５、（ｘｖｉｉ）７５〜８０、（ｘｖｉｉｉ）８０〜８５、（ｘｉｘ）８５〜９０、（ｘｘ）９０〜９５、（ｘｘｉ）９５〜１００、及び（ｘｘｉｉ）＞１００からなる群から選択される範囲に入る、請求項２１記載の質量分析計。
【請求項２３】
質量分析の方法であって、
小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウを質量スペクトルデータ又は質量スペクトルに適用するステップと、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウ内に入る小数質量若しくは質量電荷比を有するイオンを決定するステップと、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウ内に入る小数質量若しくは質量電荷比を有するイオンの少なくとも一部をフラグメンテーションして複数のフラグメントイオンを生成するステップと、
前記複数のフラグメントイオンの少なくとも一部を質量分析するステップとを含み、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウが、ΔＭの関数として変化するプロファイルを有し、前記ΔＭが、第１の物質又はイオンと第２の物質又はイオンとの間の質量若しくは質量電荷比おける差である、質量分析方法。
【請求項２４】
前記第１の物質又はイオンが製薬化合物を含み、前記第２の物質又はイオンが前記第１の物質又はイオンの代謝産物を含む、請求項２３記載の質量分析方法。
【請求項２５】
質量分析計であって、
小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウを質量スペクトルデータ又は質量スペクトルに適用するように構成及び適合された手段と、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウ内に入る小数質量若しくは質量電荷比を有するイオンを決定するように構成及び適合された手段と、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウ内に入る小数質量若しくは質量電荷比を有するイオンの少なくとも一部をフラグメンテーションして複数のフラグメントイオンを生成するように構成及び適合された手段と、
前記複数のフラグメントイオンの少なくとも一部を質量分析するように構成及び適合された手段とを備え、
前記小数質量若しくは質量電荷比ウィンドウが、ΔＭの関数として変化するプロファイルを有し、前記ΔＭが、第１の物質又はイオンと第２の物質又はイオンとの間の質量若しくは質量電荷比おける差である、質量分析計。