【手続補正書】
【提出日】平成20年9月26日(2008.9.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
混合物又は細胞において、in vitro で、タンパク質キナーゼ上のATP結合部位に保存された2つのアスパラギン酸残基の間に位置し且つ前記アスパラギン酸残基のうちの1つのすぐ隣に位置するシステイン（Cys）残基を有する1以上のタンパク質キナーゼを阻害する方法であって、
前記混合物は、タンパク質キナーゼ上のATP結合部位に保存された2つのアスパラギン酸残基の間に位置し且つ前記アスパラギン酸残基のうちの1つのすぐ隣に位置するCys残基を欠く更なるタンパク質キナーゼを含み、
前記Cys残基を有する前記1以上のタンパク質キナーゼを、前記Cys残基とマイケル付加物を形成することができる化合物に、その化合物と前記Cys残基との間でマイケル付加物が形成されて前記1以上のタンパク質キナーゼの阻害がもたらされる条件下において、接触させることを含む、前記方法。
【請求項２】
該Cys残基とマイケル付加物を形成することができる化合物が、該Cys残基とマイケル付加物を形成するエノン部分を含む、請求項1記載の方法。
【請求項３】
該Cys残基とマイケル付加物を形成することができる化合物が、下記の構造（I）を有する化合物、又はその医薬的に許容できる塩若しくは誘導体である、請求項2記載の方法
【化１】
2008514635.tif 000001
（式中、
R1は、水素、任意に置換された脂肪族部分、任意に置換された環式脂肪族部分、任意に置換された複素環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよいアリール部分、又は任意に置換されていてもよいヘテロアリール部分であり；
R2及びR3は、独立して、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、任意に置換されていてもよい脂肪族部分、任意に置換されていてもよい環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよい複素環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよいアリール部分、又は任意に置換されていてもよいヘテロアリール部分であり；又は、R1及びR2は、一緒になって、任意に置換されていてもよい炭素数3〜8の飽和若しくは不飽和環式環を形成するか；又は、R1及びR3は、一緒になって、任意に置換されていてもよい炭素数3〜8の飽和若しくは不飽和環式環を形成し；
R4は、水素又はハロゲンであり；
R5は、水素、C2〜C4アルキル、酸素保護基、又はプロドラッグ部分であり；
R6は、水素、ヒドロキシル、又は保護されたヒドロキシルであり；
ｎは、0、1又は2であり；
R7は、存在する各々が独立して、水素、ヒドロキシル、又は保護されたヒドロキシルであり；
R8は、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、又は脂肪族部分であり、前記脂肪族部分は、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、SR12又はNR12R13で置換されていてもよく；
R9は、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、OR12、SR12、NR12R13、−X1(CH2)pX2−R14、又はアルキルであり、前記アルキルは任意にヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、ハロゲン、アミノ、保護されたアミノ、又は−X1(CH2)pX2−R14で置換されていてもよく；
R12及びR13は、存在する各々が独立して、水素、任意に置換されていてもよい脂肪族部分、任意に置換されていてもよい環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよい複素環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよいアリール部分、任意に置換されていてもよいヘテロアリール部分、又はN若しくはS保護基であり；又は、R12及びR13は、一緒になって、1〜4の炭素原子及び1〜3の窒素原子若しくは酸素原子を含む飽和若しくは不飽和環式環を形成し；ここで、R12及びR13の各々は、１以上のヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、アミノ、保護されたアミノ、−NH(アルキル)、アミノアルキル、又はハロゲンで置換されていてもよく；
X1及びX2は、各々独立して、存在しないか、酸素、NH又は−N(アルキル)であり；又は、X2−R14が一緒になって、N3若しくは複素環式脂肪族部分であり；
ｐは、2〜10の整数であり；
R14は、水素、アリール部分、ヘテロアリール部分、アルキルアリール部分、アルキルヘテロアリール部分、−(C=O)NHR15、−(C=O)OR15、又は−(C=O)R15であり、式中、存在するR15の各々は独立して、水素、脂肪族部分、環式脂肪族部分、複素環式脂肪族部分、アリール部分、又はヘテロアリール部分であり；又は、R14は−SO2(R16)であり、式中、R16は脂肪族部分であり；ここで、R14、R15及びR16の1以上は、１以上のヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、アミノ、保護されたアミノ、−NH(アルキル)、アミノアルキル、又はハロゲンで置換されていてもよく；又は
R8及びR9が一緒になって、1〜4の炭素原子及び1〜3の窒素原子若しくは酸素原子を含む飽和若しくは不飽和環式環を形成し、前記環は、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、アミノ、保護されたアミノ、−NH(アルキル)、アミノアルキル、又はハロゲンで置換されていてもよく；
R10は、水素、ヒドロキシル、アルコキシ、ヒドロキシアルキル、ハロゲン、又は保護されたヒドロキシルであり；
R11は、水素、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アミノ、又は保護されたアミノであり；
R20は水素であるか、又はR20及びR2は組み合わさって結合を形成し；
Xは、存在しないか、又はO、NH、N−アルキル、CH2若しくはSであり；
Y及びZは、単結合又は二重結合によって連結されており、YはCHR17、O、C=O、CR17又はNR17であり、ZはCHR18、O、C=O、CR18、又はNR18であり；R17及びR18は、存在する各々が独立して、水素又は任意に置換されていてもよい脂肪族部分であり、又はR17及びR18が一緒になって−O−、−CH2−又は−NR19−であり；ここでR19は水素又はアルキルである）。
【請求項４】
タンパク質キナーゼ上のATP結合部位領域に保存された2つのアスパラギン酸残基に位置し且つ前記アスパラギン酸残基のうちの1つのすぐ隣に位置するシステイン（Cys）残基を有するタンパク質キナーゼを特異的に阻害する化合物の、疾患又は疾患症状を治療するための医薬組成物の調製の為の使用。
【請求項５】
化合物が下記の構造（I）の化合物、並びにその医薬的に許容できる塩及び誘導体を含む、請求項４記載の使用。
【化２】
2008514635.tif 000002
（式中、
R1は、水素、任意に置換されていてもよい脂肪族部分、任意に置換されていてもよい環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよい複素環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよいアリール部分、又は任意に置換されていてもよいヘテロアリール部分であり；
R2及びR3は、各々独立して、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、任意に置換されていてもよい脂肪族部分、任意に置換されていてもよい環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよい複素環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよいアリール部分、又は任意に置換されていてもよいヘテロアリール部分であり；又は、R1及びR2は、一緒になって、任意に置換されていてもよい炭素数3〜8の飽和若しくは不飽和環式環を形成し；又は、R1及びR3は、一緒になって、任意に置換されていてもよい炭素数3〜8の飽和若しくは不飽和環式環を形成し；
R4は、水素又はハロゲンであり；
R5は、水素、C2〜C4アルキル、酸素保護基、又はプロドラッグ部分であり；
R6は、水素、ヒドロキシル、又は保護されたヒドロキシルであり；
ｎは、0、1又は2であり；
R7は、存在する各々が独立して、水素、ヒドロキシル、又は保護されたヒドロキシルであり；
R8は、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、又は脂肪族部分であり、前記脂肪族部分はヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、SR12又はNR12R13で置換されていてもよく；
R9は、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、OR12、SR12、NR12R13、−X1(CH2)pX2−R14、又はアルキルであり、前記アルキルは、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、ハロゲン、アミノ、保護されたアミノ、又は−X1(CH2)pX2−R14で置換されていてもよく；
R12及びR13は、存在する各々が独立して、水素、任意に置換されていてもよい脂肪族部分、任意に置換されていてもよい環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよい複素環式脂肪族部分、任意に置換されていてもよいアリール部分、任意に置換されていてもよいヘテロアリール部分、又はN若しくはS保護基であり；又は、R12及びR13は、一緒になって、1〜4の炭素原子及び1〜3の窒素原子若しくは酸素原子を含む飽和若しくは不飽和環式環を形成し；ここで、R12及びR13の各々は、１以上のヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、アミノ、保護されたアミノ、−NH(アルキル)、アミノアルキル、又はハロゲンで置換されていてもよく；
X1及びX2は、各々独立して、存在しないか、酸素、NH、又は−N(アルキル)であり；又は、X2−R14が一緒になって、N3又は複素環式脂肪族部分であり；
ｐは、2〜10の整数であり；
R14は、水素、アリール部分、ヘテロアリール部分、アルキルアリール部分、アルキルヘテロアリール部分、−(C=O)NHR15、−(C=O)OR15、又は−(C=O)R15であり、式中、存在するR15の各々は、独立して、水素、脂肪族部分、環式脂肪族部分、複素環式脂肪族部分、アリール部分、又はヘテロアリール部分であり；又は、R14は−SO2(R16)であり、式中、R16は脂肪族部分であり；ここで、R14、R15及びR16の1以上は、１以上のヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、アミノ、保護されたアミノ、−NH(アルキル)、アミノアルキル、又はハロゲンで置換されていてもよく；又は
R8及びR9は、一緒になって、1〜4の炭素原子及び1〜3の窒素原子若しくは酸素原子を含む飽和若しくは不飽和環式環を形成し、前記環は、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アルコキシ、アミノ、保護されたアミノ、−NH(アルキル)、アミノアルキル、又はハロゲンで置換されていてもよく；
R10は、水素、ヒドロキシル、アルコキシ、ヒドロキシアルキル、ハロゲン、又は保護されたヒドロキシルであり；
R11は、水素、ヒドロキシル、保護されたヒドロキシル、アミノ、又は保護されたアミノであり；
R20は水素であり、又は、R20及びR2が組み合わさって結合を形成し；
Xは、存在しないか、又はO、NH、N−アルキル、CH2若しくはSであり；
Y及びZは、単結合又は二重結合によって連結されており、YはCHR17、O、C=O、CR17又はNR17であり、ZはCHR18、O、C=O、CR18、又はNR18であり；R17及びR18は、存在する各々が独立して、水素又は任意に置換されていてもよい脂肪族部分であり、又はR17及びR18が一緒になって−O−、−CH2−又は−NR19−であり、式中R19は水素又はアルキルである）。
【請求項６】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが以下から成る群より選択される、請求項1記載の方法：AAK1、キナーゼドメインを有するAPEG1スプライス変種（SPEG）、BMP2K（BIKE）、CDKL1、CDKL2、CDKL3、CDKL4、CDKL5（STK9）、ERK1（MAPK3）、ERK2（MAPK1）、FLT3、GAK、GSK3A、GSK3B、KIT（cKIT）、MAP3K14（NIK）、MAP3K7（TAK1）、MAPK15（ERK8）、MAPKAPK5（PRAK）、MEK1（MKK1, MAP2K1）、MEK2（MKK2, MAP2K2）、MEK3（MKK3, MAP2K3）、MEK4（MKK4, MAP2K4）、MEK5（MKK5, MAP2K5）、MEK6（MKK6, MAP2K6）、MEK7（MKK7, MAP2K7）、MKNK1（MNK1）、MKNK2（MNK2, GPRK7）、NLK、PDGFRα、PDGFRβ、PRKD1（PRKCM）、PRKD2、PRKD3（PRKCN）、PRPF4B（PRP4K）、RPS6KA1（RSK1, MAPKAPK1A）、RPS6KA2（RSK3, MAPKAP1B）、RPS6KA3（RSK2, MAPKAP1C）、RPS6KA6（RSK4）、STK36（FUSED_STK）、STYK1、TGFBR2、TOPK、VEGFR1（FLT1）、VEGFR2（KDR）、VEGFR3（FLT4）及びZAK。
【請求項７】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼの少なくとも2つが阻害される、請求項６記載の方法。
【請求項８】
1以上の該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがERK経路キナーゼであり、前記ERK経路キナーゼの少なくとも2つが阻害される、請求項1記載の方法。
【請求項９】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、MEK1、MEK2、ERK1及びERK2である、請求項８記載の方法。
【請求項１０】
阻害される1以上の該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、少なくとも2つのERK MAPKカスケード経路キナーゼとマイトジェンレセプターキナーゼとを含む、請求項1記載の方法。
【請求項１１】
マイトジェンレセプターキナーゼが、VEGFレセプター；PDGFレセプター；c-KIT(肥満細胞増殖因子レセプター)；FLT3（FL（Flt-3リガンド）のレセプター）；及び、VEGFレセプター、PDGFレセプター、cKIT又はFLT3の構成的に活性化された変異体；から成る群より選択される、請求項１０記載の方法。
【請求項１２】
医薬組成物が微小管安定化剤又は微小管脱安定化剤と一緒に投与される、請求項４記載の使用。
【請求項１３】
医薬組成物がHsp90阻害剤と一緒に投与される、請求項４記載の使用。
【請求項１４】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、PDGFRα、PDGFRβ、VEGFレセプター（Flt-1、Flt-4及びKdr）、MEK1/2及びERK1/2から成る群より選択され、疾患が、加齢が関係する筋変性又は緑内障である、請求項４記載の使用。
【請求項１５】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、Flt-3、c-Kit MEK、ERK又はVEGFRのいずれかであり、疾患が急性骨髄性白血病である、請求項４記載の使用。
【請求項１６】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、c-Kit、PDGFR、MEK1/2又はERK1/2のいずれかであり、疾患が消化管間質腫瘍である、請求項４記載の使用。
【請求項１７】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、野生型c-Kit、構成的に活性なc-Kit V816D変異体、MEK1/2又はERK1/2のいずれかであり、疾患が肥満細胞症である、請求項４記載の使用。
【請求項１８】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがc-Kit、MEK又はERKであり、疾患が肥満細胞によって影響される又は引き起こされる炎症性症候群である、請求項４記載の使用。
【請求項１９】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがMEK1/2又はERK1/2のいずれかであり、疾患が乳癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２０】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがKdr、c-Kit、MEK1/2、又はERK1/2のいずれかであり、疾患が非小細胞肺癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２１】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがPDGFRA、MEK1/2、又はERK1/2のいずれかであり、疾患が卵巣癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２２】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがPDGFR、MEK1/2、又はERK1/2のいずれかであり、疾患が膵臓癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２３】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、変異体Raf-1タンパク質キナーゼによって活性化されるキナーゼであり、疾患が前立腺癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２４】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがPDGFR、MEK1/2、又はERK1/2のいずれかであり、疾患が基底細胞癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２５】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、MEK1/2、ERK1/2、Tak1、又はJNKシグナル伝達経路を活性化するキナーゼのいずれかであり、疾患が炎症性症候群である、請求項４記載の使用。
【請求項２６】
炎症性症候群がアレルギー性皮膚炎である、請求項２５記載の使用。
【請求項２７】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがMEK1/2、又はERK1/2のいずれかであり、疾患がRas変異体依存性癌腫である、請求項４記載の使用。
【請求項２８】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがVEGFR、PDGFR、MEK1/2、又はERK1/2のいずれかであり、疾患が腎細胞癌である、請求項４記載の使用。
【請求項２９】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼがMEK1/2、ERK1/2、又はTak1のいずれかであり、疾患が慢性関節リウマチである、請求項４記載の使用。
【請求項３０】
該Cys残基を有するタンパク質キナーゼが、変異したB-Rafによって活性化される細胞シグナル伝達経路のキナーゼである、請求項1記載の方法。
【請求項３１】
疾患が急性骨髄性白血病である、請求項４記載の使用。
【請求項３２】
疾患が血管形成を伴う、請求項４記載の使用。
【請求項３３】
疾患が血管透過性の誘導を伴う、請求項４記載の使用。
【請求項３４】
疾患が変異B-Rafを有する細胞の増殖によって特徴付けられる、請求項４記載の使用。
【請求項３５】
疾患がメラノーマである、請求項４記載の使用。
【請求項３６】
該Cys残基とマイケル付加物を形成することができる化合物が、天然に存在するレゾルシル酸ラクトン、ヒポテマイシン、(5Z)-7-オキソゼアネオール、Ro-09-2210及びL-783,277以外のものである、請求項1記載の方法。
【請求項３７】
下記式（II）の構造を有する化合物。
【化３】
2008514635.tif 000003
【請求項３８】
生物ヒポミセス・スビキュロサス（Hypomyces subiculosus）DSM 11931を、培養液1Lあたり約10〜100mgの量のD,L-エチオニンを含む培養液中で培養する工程を含む、下記式（II）の構造を有する化合物の調製方法。
【化４】
2008514635.tif 000004