【手続補正書】
【提出日】平成31年1月30日(2019.1.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
がんを有する患者の処置における使用のための組成物であって、該がんの細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照発現レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を示し、該組成物が治療有効量のＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を含み、該ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、組成物。
【請求項２】
前記ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、ＰＯＬＲ２Ａタンパク質の発現を阻害する核酸を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記抗体が、抗ＥｐＣＡＭ抗体である、請求項１または２のいずれかに記載の組成物。
【請求項４】
前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物が、ｍＲＮＡであり、該ｍＲＮＡの発現のレベルが、ノーザンブロッティング、逆転写定量的リアルタイムＰＣＲ（ＲＴ−ｑＰＣＲ）、ヌクレアーゼプロテクション、トランスクリプトーム解析、ハイブリダイゼーションアッセイ、チップに基づく発現プラットフォームまたはインベーダーＲＮＡアッセイプラットフォームによって決定され得るか、または、
前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物が、タンパク質であり、該タンパク質の発現のレベルが、質量分析、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡ、免疫沈降、免疫組織化学的検査またはラジオイムノアッセイによって決定され得る、請求項１〜３のいずれかに記載の組成物。
【請求項５】
前記参照発現レベルが、非がん性細胞における発現レベルである、請求項１〜４のいずれかに記載の組成物。
【請求項６】
前記ＴＰ５３遺伝子の前記ヘミ接合性喪失または前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子の前記ヘミ接合性喪失が、ゲノムハイブリダイゼーション技法、ＰＣＲ解析または制限断片解析によって決定される、請求項１〜５のいずれかに記載の組成物。
【請求項７】
前記がん細胞が、肺がん細胞、脳がん細胞、乳がん細胞、肝臓がん細胞、卵巣がん細胞、結腸直腸がん細胞、前立腺がん細胞または膵臓がん細胞である、ならびに／あるいは
前記がん細胞が、転移性、再発性または多剤耐性である、請求項１〜６のいずれかに記載の組成物。
【請求項８】
少なくとも第２の抗がん療法薬、好ましくは、化学療法剤、最も好ましくは、５−フルオロウラシル、オキサリプラチンまたはＳＮ−３８をさらに含む、請求項１〜７のいずれかに記載の組成物。
【請求項９】
前記患者が、ヒトまたは非ヒト哺乳動物である、請求項１〜８のいずれかに記載の組成物。
【請求項１０】
前記患者が、少なくとも１ラウンドの抗がん療法を以前に受けたことがある、請求項１〜９のいずれかに記載の組成物。
【請求項１１】
がんを有する患者を処置するための組成物であって、該組成物は、ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を含み、該患者は、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むがん細胞を有すると決定されており、
該組成物は、ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤の治療有効量で、該患者に投与されることを特徴とし、該ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、組成物。
【請求項１２】
（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を、ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤による処置のための患者の選択の指標とするｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法であって、該患者由来のがん細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップを含み、該ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法。
【請求項１３】
前記決定するステップに関する報告、好ましくは、書面または電子の報告を提供するステップをさらに含み、好ましくは、前記報告が、前記患者、医療費支払者、医師、保険代理人または電子システムに提供される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記方法が、前記がんの細胞が、（ｉ）前記ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定する検査の結果を得るステップを含む、請求項１２〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少の存在を、がん患者のための薬物療法の選択の指標とするｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法であって、
該がんの細胞における（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少の存在を検出するステップを含み、
該がんの細胞において（ｉ）該ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される；（ｉｉ）該ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少が検出される場合、そのことは、薬物療法としてＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が選択されることを示すことを特徴とし、
該ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法。
【請求項１６】
前記方法は、治療有効量の前記ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が前記患者に投与されることを示すことを特徴とする、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
被験体におけるがんの処置における使用のためのＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を含む組成物であって、該がんの細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されており、該ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、組成物。
【請求項１８】
がんの処置のための医薬の製造におけるＰＯＬＲ２Ａ阻害剤の使用であって、該がんの細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されており、該ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含み、該アマトキシンが、腫瘍関連抗原に特異的に結合する抗体にコンジュゲートされている、使用。
【請求項１９】
請求項１５〜１６のいずれかに記載の方法を実施するためのキットであって、ＰＯＬＲ２Ａ  ｍＲＮＡまたはタンパク質遺伝子産物の発現のレベルを決定するためのキットである、キット。
【請求項２０】
前記キットが、ノーザンブロッティング、逆転写定量的リアルタイムＰＣＲ（ＲＴ−ｑＰＣＲ）、ヌクレアーゼプロテクション、トランスクリプトーム解析、ハイブリダイゼーションアッセイ、チップに基づく発現プラットフォームまたはインベーダーＲＮＡアッセイ、質量分析、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡ、免疫沈降、免疫組織化学的検査またはラジオイムノアッセイからなる方法の群のうちの少なくとも１つを実施するために役立つ、請求項１９に記載のキット。
【請求項２１】
ＰＯＬＲ２Ａについての少なくとも１つの核酸プローブまたは少なくとも１つの抗体を含む、請求項２０に記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
本発明の他の目的、特色および利点は、次の詳細な説明から明らかである。しかし、本発明の精神および範囲内の様々な変更および修正が、この詳細な説明から当業者に明らかであり得るため、詳細な説明および具体例は、本発明の好ましい実施形態を示しているが、単なる例示として提示されていることを理解されたい。
特定の実施形態において、例えば、以下が提供される：
（項目１）
がんを有する患者の処置における使用のための組成物であって、該がんの細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照発現レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を示し、該組成物が治療有効量のＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を含む、組成物。
（項目２）
前記ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、ＰＯＬＲ２Ａタンパク質の発現を阻害する核酸を含む、項目１に記載の組成物。
（項目３）
前記ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤が、アマトキシンを含む、項目１に記載の組成物。
（項目４）
前記アマトキシンが、アルファ−アマニチンである、項目３に記載の組成物。
（項目５）
前記アマトキシンが、抗体にコンジュゲートされている、項目３に記載の組成物。
（項目６）
前記抗体が、抗ＥｐＣＡＭ抗体である、項目５に記載の組成物。
（項目７）
前記抗体が、腫瘍関連抗原に特異的に結合する、項目５に記載の組成物。
（項目８）
前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物が、ｍＲＮＡである、項目１に記載の組成物。
（項目９）
前記ｍＲＮＡの発現のレベルが、ノーザンブロッティング、逆転写定量的リアルタイムＰＣＲ（ＲＴ−ｑＰＣＲ）、ヌクレアーゼプロテクション、トランスクリプトーム解析、ハイブリダイゼーションアッセイ、チップに基づく発現プラットフォームまたはインベーダーＲＮＡアッセイプラットフォームによって決定される、項目８に記載の組成物。
（項目１０）
前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物が、タンパク質である、項目１に記載の組成物。
（項目１１）
前記タンパク質の発現のレベルが、質量分析、ウエスタンブロット、ＥＬＩＳＡ、免疫沈降、免疫組織化学的検査またはラジオイムノアッセイによって決定される、項目１０に記載の組成物。
（項目１２）
前記参照発現レベルが、非がん性細胞における発現レベルである、項目１に記載の組成物。
（項目１３）
前記ＴＰ５３遺伝子の前記ヘミ接合性喪失または前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子の前記ヘミ接合性喪失が、ゲノムハイブリダイゼーション技法、ＰＣＲ解析または制限断片解析によって決定される、項目１に記載の組成物。
（項目１４）
前記がん細胞が、前記ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失を示す、項目１に記載の組成物。
（項目１５）
前記がん細胞が、前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失を示す、項目１に記載の組成物。
（項目１６）
前記患者が、参照発現レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を示すがん細胞を有する、項目１に記載の組成物。
（項目１７）
前記がん細胞が、肺がん細胞、脳がん細胞、乳がん細胞、肝臓がん細胞、卵巣がん細胞
、結腸直腸がん細胞、前立腺がん細胞または膵臓がん細胞である、項目１に記載の組成物。
（項目１８）
前記がん細胞が、転移性、再発性または多剤耐性である、項目１に記載の組成物。
（項目１９）
少なくとも第２の抗がん療法薬をさらに含む、項目１に記載の組成物。
（項目２０）
前記第２の抗がん療法薬が、化学療法剤である、項目１９に記載の組成物。
（項目２１）
前記化学療法剤が、５−フルオロウラシル、オキサリプラチンまたはＳＮ−３８である、項目２０に記載の組成物。
（項目２２）
前記患者が、ヒトである、項目１に記載の組成物。
（項目２３）
前記患者が、非ヒト哺乳動物である、項目１に記載の組成物。
（項目２４）
前記患者が、少なくとも１ラウンドの抗がん療法を以前に受けたことがある、項目１に記載の組成物。
（項目２５）
（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照発現レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を示すがん細胞を有する患者を処置する方法であって、治療有効量のＰＯＬＲ２Ａ阻害剤をかかる患者に投与するステップを含む方法。
（項目２６）
前記患者が、少なくとも再度処置される、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記患者が、１週間〜６ヶ月間の期間にわたって処置される、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
少なくとも第２の抗がん療法を前記被験体に投与するステップをさらに含む、項目２５に記載の方法。
（項目２９）
前記第２の抗がん療法が、外科的療法、化学療法、放射線療法、寒冷療法、ホルモン療法、毒素療法、免疫療法またはサイトカイン療法である、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記化学療法が、５−フルオロウラシル、オキサリプラチンまたはＳＮ−３８である、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
がんを有する患者を処置する方法であって、
（ａ）（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むがん細胞を有すると決定された患者を選択するステップと、
（ｂ）治療有効量のＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を該患者に投与するステップと
を含む方法。
（項目３２）
ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤による処置のための患者を選択するｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法であって、該患者由来のがん細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップを含むｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法。
（項目３３）
患者を選択するステップが、前記がんの試料を得るステップと、該がんの細胞が、（ｉ）前記ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップとを含む、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記決定するステップに関する報告を提供するステップをさらに含む、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
前記報告が、書面または電子の報告である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記報告が、前記患者、医療費支払者、医師、保険代理人または電子システムに提供される、項目３４に記載の方法。
（項目３７）
患者を選択するステップが、前記がんの細胞が、（ｉ）前記ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定する検査の結果を得るステップを含む、項目３２に記載の方法。
（項目３８）
前記がん細胞が、前記ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失を含むかどうかを決定するステップを含む、項目３２に記載の方法。
（項目３９）
前記がん細胞が、前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失を含むかどうかを決定するステップを含む、項目３２に記載の方法。
（項目４０）
前記がん細胞が、参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むかどうかを決定するステップを含む、項目３２に記載の方法。
（項目４１）
がん患者のための薬物療法を選択するｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法であって、
（ａ）該がんの試料を得るステップと、
（ｂ）該がんの細胞における（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少の存在を検出するステップと、
（ｃ）該がんの細胞において（ｉ）該ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される；（ｉｉ）該ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失が検出される；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少が検出される場合、ＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を選択するステップと
を含むｉｎ  ｖｉｔｒｏ方法。
（項目４２）
治療有効量のＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を前記患者に投与するステップをさらに含む、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
前記がんの細胞が、前記ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失を含む、項目４１に記載の方法。
（項目４４）
前記がんの細胞が、前記ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失を含む、項目４１に記載の方法。
（項目４５）
前記がんの細胞が、参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含む、項目４１に記載の方法。
（項目４６）
被験体におけるがんの処置における使用のためのＰＯＬＲ２Ａ阻害剤を含む組成物であって、該がんの細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されている、組成物。
（項目４７）
がんの処置のための医薬の製造におけるＰＯＬＲ２Ａ阻害剤の使用であって、該がんの細胞が、（ｉ）ＴＰ５３遺伝子のヘミ接合性喪失；（ｉｉ）ＰＯＬＲ２Ａ遺伝子のヘミ接合性喪失；または（ｉｉｉ）参照レベルと比べたＰＯＬＲ２Ａ遺伝子産物の発現のレベル減少を含むことが決定されている、使用。