【手続補正書】
【提出日】平成20年3月7日(2008.3.7)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ボルデテラ（Bordetella）属のペルタクチンの混合物を含む免疫原性組成物であって、
該免疫原性組成物を投与された動物に、パラ百日咳菌（Bordetella parapertussis）および気管支敗血症菌（Bordetella bronchiseptica）に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量の
（ａ）パラ百日咳菌のペルタクチンと、
（ｂ）気管支敗血症菌のペルタクチンと
を含む免疫原性組成物。
【請求項２】  免疫原性組成物を投与された動物に、百日咳菌（Bordetella pertussis）に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量の百日咳菌のペルタクチンも含む、請求項１記載の免疫原性組成物。
【請求項３】  ボルデテラ属のペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物を含む免疫原性組成物であって、該ペルタクチンまたはそのフラグメントが、気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型を含み、該ボルデテラ属のペルタクチンまたはそのフラグメントが、該組成物を投与された動物に気管支敗血症菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量で存在する免疫原性組成物。
【請求項４】  ボルデテラ属のペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物を含み、該ペルタクチンまたはそのフラグメントが、気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型を含み、気管支敗血症菌ペルタクチンの該少なくとも２種類の変異型が、少なくともその第２領域において互いに異なる、請求項３記載の免疫原性組成物。
【請求項５】  ボルデテラ属のペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物を含む免疫原性組成物であって、該ペルタクチンまたはそのフラグメントが、気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型の混合物を含み、気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型が、それぞれ、その第２領域に６、７、８または９回反復するＰＱＰアミノ酸配列を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型が、該免疫原性組成物を投与された動物に、気管支敗血症菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量で存在する免疫原性組成物。
【請求項６】  気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型が、少なくともその第２領域中の反復するＰＱＰアミノ酸配列の数において互いに異なる、請求項５記載の免疫原性組成物。
【請求項７】  免疫原性組成物を投与された動物に、パラ百日咳菌または百日咳菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量の、パラ百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、またはそれらの混合物も含む、請求項５または６に記載の免疫原性組成物。
【請求項８】  ボルデテラ属のペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物を含み、該ペルタクチンまたはその変異型が、気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型を含み、気管支敗血症菌ペルタクチンの該少なくとも２種類の変異型が、少なくともその第１領域において互いに異なる、請求項３記載の免疫原性組成物。
【請求項９】  ボルデテラ属のペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物を含む免疫原性組成物であって、該ペルタクチンまたはそのフラグメントが、気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型の混合物を含み、気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型が、それぞれ、その第１領域に１、２または３回反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型が、それぞれ、該免疫原性組成物を投与された動物に、気管支敗血症菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量で存在する免疫原性組成物。
【請求項１０】  気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型が、少なくともその第１領域中の反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列の数において異なる、請求項９記載の免疫原性組成物。
【請求項１１】  免疫原性組成物を投与された動物に、パラ百日咳菌または百日咳菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量の、パラ百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、またはそれらの混合物も含む、請求項９項記載の免疫原性組成物。
【請求項１２】  気管支敗血症菌の種のペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物を含む免疫原性組成物であって、該ペルタクチンまたはそのフラグメントの混合物が、気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型の混合物を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも一つの変異型が、その第２領域に６、７、８または９回反復するＰＱＰアミノ酸配列を有する、気管支敗血症菌のペルタクチンの第２領域を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとももう一つの変異型が、その第１領域に１、２または３回反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列を有する、気管支敗血症菌のペルタクチンの第１領域を含む免疫原性組成物。
【請求項１３】  ボルデテラ属のペルタクチンのフラグメントの混合物を含む免疫原性組成物であって、
該免疫原性組成物を投与された動物に、パラ百日咳菌および気管支敗血症菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量の
（ａ）パラ百日咳菌のペルタクチンまたはそのフラグメントと、
（ｂ）気管支敗血症菌のペルタクチン、または第１領域、第２領域、もしくは第１領域および第２領域の双方を含むそのフラグメントと
を含む免疫原性組成物。
【請求項１４】  免疫原性組成物を投与された動物に、百日咳菌に対する体液性または細胞性免疫応答を誘導するのに充分な量の、百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメントもまた含む、請求項１３記載の免疫原性組成物。
【請求項１５】  気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型の混合物を含む組成物であって、該変異型が、それぞれ、気管支敗血症菌のペルタクチンの第２領域を含み、かつ少なくともそれぞれに含まれる第２領域において互いに異なる組成物。
【請求項１６】  気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型の混合物を含む組成物であって、気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型が、それぞれ、その第２領域に６、７、８または９回反復するＰＱＰアミノ酸配列を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型が、それに含まれる該反復するＰＱＰアミノ酸配列の数において異なる組成物。
【請求項１７】  パラ百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、またはそれらの混合物も含む、請求項１６記載の組成物。
【請求項１８】  気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型の混合物を含む組成物であって、気管支敗血症菌のペルタクチンの変異型が、それぞれ、気管支敗血症菌のペルタクチンの第１領域を含み、かつ該変異型が、少なくともそれぞれに含まれる第１領域において互いに異なる組成物。
【請求項１９】  気管支敗血症菌のペルタクチンの変異型の混合物を含む組成物であって、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型が、それぞれ、その第１領域に１、２または３回反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの少なくとも２種類の変異型が、それに含まれる該反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列の数において異なる組成物。
【請求項２０】  パラ百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、またはそれらの混合物も含む、請求項１９記載の組成物。
【請求項２１】  気管支敗血症菌のペルタクチンの変異型の混合物を含む組成物であって、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型の一つが、気管支敗血症菌ペルタクチンの第２領域を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型のもう一つが、気管支敗血症菌ペルタクチンの第１領域を含む組成物。
【請求項２２】  第２領域が、６、７、８または９回反復するＰＱＰアミノ酸配列を有する、請求項２１記載の組成物。
【請求項２３】  該第１領域が、１、２または３回反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列を有する、請求項２１記載の組成物。
【請求項２４】  気管支敗血症菌のペルタクチンの変異型の混合物を含む組成物であって、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型の一つが、その第２領域中に６、７、８または９回反復するＰＱＰアミノ酸配列を有する気管支敗血症菌ペルタクチンの第２領域を含み、該気管支敗血症菌ペルタクチンの変異型のもう一つが、その第１領域中に１、２または３回反復するＧＧＸＸＰアミノ酸配列を有する気管支敗血症菌ペルタクチンの第１領域を含む組成物。
【請求項２５】  パラ百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、百日咳菌のペルタクチンもしくはそのフラグメント、またはそれらの混合物も含む、請求項２４記載の組成物。
【請求項２６】  配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１および配列番号２２からなる群より選ばれる配列、または該配列のフラグメントを含むポリペプチド。
【請求項２７】  配列番号７、配列番号８、配列番号９、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１または配列番号２２中のアミノ酸からなるポリペプチド。
【請求項２８】  請求項２６に記載のポリペプチドをコードしているポリヌクレオチド。
【請求項２９】  請求項２８に記載のポリヌクレオチド、またはそのうちの少なくとも１５のヌクレオチドと中程度のか、もしくは高い緊縮度の条件下でハイブリダイズする、精製されたＤＮＡもしくはＲＮＡ配列。
【請求項３０】  請求項２７に記載のポリペプチドをコードしているポリヌクレオチド。
【請求項３１】  請求項３０に記載のポリヌクレオチド、またはそのうちの少なくとも１５のヌクレオチドと中程度のか、もしくは高い緊縮度の条件下でハイブリダイズする、精製されたＤＮＡもしくはＲＮＡ配列。
【請求項３２】  請求項２６に記載のポリペプチドと結合する、精製された抗体。
【請求項３３】  抗体がモノクローナル抗体である、請求項３２記載の精製抗体。
【請求項３４】  抗体がポリクローナル抗体である、請求項３２記載の精製抗体。
【請求項３５】  請求項２６に記載のポリペプチドと、該ポリペプチドを特異的に認識する抗体とを含む免疫学的複合体。
【請求項３６】  ボルデテラ属による感染を検出する方法であって、ボルデテラ属に感染していると推測される生物学的材料を含む組成物を提供する工程と、請求項２６に記載のポリペプチドの存在について検定する工程とを含む方法。
【請求項３７】  ポリペプチドを、該ポリペプチドと免疫学的反応性である抗体を用いる電気泳動または免疫アッセイによって検定する、請求項３６記載の方法。
【請求項３８】  請求項２６に記載のポリペプチドを含む抗原と結合する抗体の存否を検出するインビトロ診断の方法であって、生物学的流体中の抗体および抗原が抗原抗体複合体を形成するのに充分な時間かつ条件で、該抗原を該生物学的流体に接触させる工程と、該複合体の形成を検出する工程とを含む方法。
【請求項３９】  抗原抗体複合体の形成を測定する工程をさらに含む、請求項３８記載の方法。
【請求項４０】  抗原抗体複合体の形成を、ウエスタンブロット手法、ＥＬＩＳＡ、間接免疫蛍光アッセイまたは免疫沈降アッセイに基づく免疫アッセイによって検出する、請求項３８記載の方法。
【請求項４１】  請求項２６に記載のポリペプチドまたはその混合物と結合する抗体の存否を検出するための診断キットであって、請求項２６に記載のポリペプチド、または該ポリペプチドの混合物を含む抗原と、抗原と抗体との間の免疫複合体の形成を検出するための、該検出を実施するのに充分な量で存在する手段とを含むキット。
【請求項４２】  免疫原性または防御性応答をインビボで誘導するのに充分な量の請求項２６に記載の少なくとも１種類のポリペプチドと、そのための薬学的に許容され得る担体とを含む免疫原性組成物。
【請求項４３】  請求項２６に記載の少なくとも１種類のポリペプチドの中和量を含む、請求項１〜１４に記載の免疫原性組成物。
【請求項４４】  請求項２８〜３１のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含む免疫原性組成物。
【請求項４５】  請求項１〜１４、４２、４３または４４のいずれか一項に記載の免疫原性組成物を、薬学的に許容され得る賦形剤とともに含むワクチン。
【請求項４６】  ボルデテラ属の存否を検出する方法であって、
（１）ボルデテラ属の遺伝学的材料を含有すると推測されるサンプルを、少なくとも１種類のヌクレオチドプローブに接触させる工程と、
（２）該ヌクレオチドプローブと、サンプル中の遺伝学的材料との間のハイブリダイゼーションを検出する工程と
を含み、該ヌクレオチドプローブが、請求項２８または３０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド配列に相補的である方法。
【請求項４７】  少なくとも請求項１〜１４、または４２〜４４に記載の免疫原性組成物と、動物へ該組成物を投与する手段とを含む予防接種用キット。
【請求項４８】  （Ａ）百日咳菌のペルタクチンの、第１領域および第２領域を含むポリペプチド、または第１領域を含む一つのポリペプチドおよび第２領域を含む一つのポリペプチド；
（Ｂ）パラ百日咳菌のペルタクチンの、第１領域および第２領域を含むポリペプチド、または第１領域を含む一つのポリペプチドおよび第２領域を含む一つのポリペプチド；
（Ｃ）気管支敗血症菌９．７３株のペルタクチンの、第１領域および第２領域を含むポリペプチド、または第１領域を含む一つのポリペプチドおよび第２領域を含む一つのポリペプチド、ならびに気管支敗血症菌ＳＥＩ株のペルタクチンの、第１領域および第２領域を含むポリペプチド、または第１領域を含む一つのポリペプチドおよび第２領域を含む一つのポリペプチド
から本質的になる免疫原性組成物。
【請求項４９】  （Ａ）気管支敗血症菌のペルタクチン；
（Ｂ）気管支敗血症菌のＦＨＡおよび；
（Ｃ）パラ百日咳菌のペルタクチン
から本質的になる免疫原性組成物。
【請求項５０】  気管支敗血症菌のペルタクチンが９．７３株に由来する、請求項４９記載の免疫原性組成物。
【請求項５１】  気管支敗血症菌のＦＨＡが９．７３株に由来する、請求項４９記載の免疫原性組成物。
【請求項５２】  ＦＨＡ、ＡＧＧ２、ＡＧＧ３からなる群より選ばれる、ボルデテラ属の少なくとも１種類のアドへシン、および／またはＰＴＸ、ＤＮＴ、ＴＣＴ、Ａｃ−Ｈｌｙからなる群より選ばれる、ボルデテラ属の少なくとも１種類の毒素をさらに含む、請求項１〜１４、４２〜４４、または４８〜５１のいずれか一項に記載の免疫原性組成物。
【請求項５３】  請求項２８〜３１に記載の少なくとも１種類のポリペプチド、またはそのフラグメントを含むＤＮＡチップ。
【請求項５４】  ボルデテラ属の感染を処置するための、請求項３３記載のモノクローナル抗体の使用。
【請求項５５】  マイクロビーズを含むマイクロアレーであって、該マイクロビーズが、それぞれ、請求項２８〜３１のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドまたはそのフラグメントの複数の複製物を担持し、該ポリヌクレオチドまたはそのフラグメントが、マイクロビーズごとに互いに異なるマイクロアレー。