【手続補正書】
【提出日】平成20年5月2日(2008.5.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】 オートインデューサー2 受容体の活性を調節する方法であって、オートインデューサー2 受容体をAI-2アゴニストまたはアンタゴニストと接触させることを含む方法。
【請求項２】前記AI-2アゴニストまたはアンタゴニスト化合物が
【化１】
2003532698.tif 000001
［式中、X は酸素、硫黄または窒素であり、 R1a は水素、ヒドロキシ、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、チオ、またはアリールであり、 R1b は水素、ヒドロキシ、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、メルカプト、チオ、またはアリールであるか、またはR1a およびR1b は共に二重結合を形成することができ、 R2は水素、アルキル、またはハロゲンであり、 R3は水素、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、チオ、またはアリールであり、 X が窒素である場合R4は水素であり、X が酸素または硫黄である場合R4は存在せず、 C4およびC5はさらに二重結合によって連結されていてもよい］
の構造、または
【化２】
2003532698.tif 000002
［式中、C2は、水素、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシ、ヘテロアリールから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC3と共に二重結合を形成し、C3は、水素、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC2と共に二重結合を形成し、C4は、水素、C1-5アルキル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC5と共に二重結合を形成し、C5は、水素、C1-5アルキル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC4と共に二重結合を形成し、C2、C3、C4またはC5のうち少なくとも1 つは、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、およびヘテロアリールから選択される置換基に結合しており、環内に存在する炭素- 炭素二重結合は多くとも1 つである］
の構造、または
【化３】
2003532698.tif 000003
［式中、R はC1-5アルコキシル基である］
の構造を持つ請求項１記載の方法。
【請求項３】前記オートインデューサー２受容体が、LuxPおよびLuxQからなる群より選択される請求項１記載の方法。
【請求項４】 前記AI-2受容体が、ビブリオ・ハーベイ（Vibrio harveyi）、コレラ菌（Vibrio cholerae ）、腸炎ビブリオ（Vibrio parahaemolyticus ）、ビブリオ・アルギノリチカス（Vibrio alginolyticus）、シュードモナス・ホスホレウム（Pseudomonas phosphoreum ）、エルシニア・エンテロコリチカ（Yersinia enterocolitica ）、大腸菌（Escherichia coli）、ネズミチフス菌（Salmonella typhimurium）、インフルエンザ菌（Haemophilus influenzae）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori ）、枯草菌（Bacillus subtilis ）、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgfdorferi ）、髄膜炎菌（Neisseria meningitidis）、淋菌（Neisseria gonorrhoeae ）、ペスト菌（Yersinia pestis ）、カンピロバクター・ジェジュニ（Campylobacter jejuni）、デイノコックス・ラジオデュランス（Deinococcus radiodurans ）、結核菌（Mycobacterium tuberculosis）、エンテロコッカス・フェカリス（Enterococcus faecalis ）、肺炎レンサ球菌（Streptococcus pneumoniae）、化膿性レンサ球菌（Streptococcus pyogenes）および黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus ）からなる群より選択される細菌細胞上に見いだされる請求項１記載の方法。
【請求項５】 オートインデューサー2 の活性を調節する化合物を同定する方法であって、（a ）オートインデューサー2 を化合物と接触させること、および（b ）オートインデューサー2 の産生または活性に与える化合物の影響を測定すること、を含む方法。
【請求項６】前記接触させる工程が、生物発光の細菌細胞またはその抽出物に前記化合物を接触させることを含む、請求項５記載の方法。
【請求項７】前記細菌細胞またはその抽出物が、さらに、オートインデューサー経路に関与する遺伝子座に少なくとも1 つの変化を含み、その変化がオートインデューサーの産生または検出を阻害する、請求項６記載の方法。
【請求項８】前記遺伝子座中の変化がLuxS遺伝子中の変化である請求項７記載の方法。
【請求項９】遺伝子座中の変化がオートインデューサー2 の産生を阻害する請求項７記載の方法。
【請求項１０】遺伝子座中の変化がLuxN遺伝子中の変化である請求項７記載の方法。
【請求項１１】遺伝子座中の変化がオートインデューサー1 の検出を阻害する請求項７記載の方法。
【請求項１２】 前記細菌細胞がビブリオ・ハーベイ（V.harveyi ）MM32株である請求項７記載の方法。
【請求項１３】 オートインデューサー2 の産生または活性を調節する化合物を同定する方法であって、 オートインデューサー2 を産生する細菌細胞を化合物と接触させること、および オートインデューサー2 活性が細菌細胞中に存在するかどうかを決定すること、を含む方法。
【請求項１４】前記細菌株がビブリオ（Vibrio）属の細菌株である請求項１３記載の方法。
【請求項１５】前記細菌株がビブリオ・ハーベイ（Vibrio harveyi）BB170 である請求項１４記載の方法。
【請求項１６】前記細菌株がビブリオ・ハーベイ（Vibrio harveyi）MM32である請求項１４記載の方法。
【請求項１７】オートインデューサー関連細菌バイオマーカーを検出する方法であって、（a ）少なくとも1 つの細菌細胞を、オートインデューサーと接触させること、および（b ）細菌バイオマーカーを検出すること、を含む方法。
【請求項１８】前記オートインデューサーが、オートインデューサー2 である請求項１７記載の方法。
【請求項１９】前記オートインデューサー2が、オートインデューサー2 受容体との複合体を形成するようにされ、かつ該オートインデューサー2/オートインデューサー2 受容体複合体が固形支持体に結合される請求項１記載の方法。
【請求項２０】オートインデューサー2 を製造する方法であって、S-リボシルホモシステイン（SRH ）をLuxSポリペプチドと接触させ、それによってS-リボシルホモシステインをオートインデューサー2 に変換することを含む方法。
【請求項２１】請求項２０記載の方法によって調製される単離されたオートインデューサー2。
【請求項２２】請求項２０記載の方法であって、さらに、S-アデノシルホモシステイン（SAH ）を5'- メチルチオアデノシン/S- アデノシルホモシステインヌクレオシダーゼ（pfs ）タンパク質と接触させ、よってS-アデノシルホモシステインをS-リボシルホモシステインに変換することを含む方法。
【請求項２３】抗生物質と微生物のAI-1定数感知経路を阻害する阻害剤とを含む相乗的抗生組成物。
【請求項２４】前記AI-1定数感知経路を阻害する阻害剤が
【化４】
2003532698.tif 000004
［式中、X は酸素、硫黄または窒素であり、 R1a は水素、ヒドロキシ、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、チオ、またはアリールであり、 R1b は水素、ヒドロキシ、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、メルカプト、チオ、またはアリールであるか、またはR1a およびR1b は共に二重結合を形成することができ、 R2は水素、アルキル、またはハロゲンであり、 R3は水素、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、チオ、またはアリールであり、 X が窒素である場合、R4は水素であり、X が酸素または硫黄である場合、R4は存在せず、 C4およびC5はさらに二重結合によって連結されていてもよい］
の構造、または
【化５】
2003532698.tif 000005
［式中、C2は、水素、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシ、ヘテロアリールから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC3と共に二重結合を形成し、C3は、水素、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC2と共に二重結合を形成し、C4は、水素、C1-5アルキル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC5と共に二重結合を形成し、C5は、水素、C1-5アルキル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC4と共に二重結合を形成し、C2、C3、C4またはC5のうち少なくとも1 つは、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、およびヘテロアリールから選択される置換基に結合しており、環内に存在する炭素- 炭素二重結合は多くとも1 つである］
の構造、または
【化６】
2003532698.tif 000006
［式中、R はC1-5アルコキシル基である］
の構造を含む請求項２３記載の相乗的抗生組成物。
【請求項２５】抗生物質と微生物のAI-1定数感知経路の阻害剤またはその医薬的に許容できる塩とを含む相乗的抗生組成物および1 または複数の医薬的に許容できる担体、アジュバントまたは賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項２６】前記AI-2定数感知経路を阻害する阻害剤が、
【化７】
2003532698.tif 000007
［式中、X は酸素、硫黄または窒素であり、 R1a は水素、ヒドロキシ、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、チオ、またはアリールであり、 R1b は水素、ヒドロキシ、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、メルカプト、チオ、またはアリールであるか、またはR1a およびR1b は共に二重結合を形成することができ、 R2は水素、アルキル、またはハロゲンであり、 R3は水素、アルキル、アシル、アミド、ヒドロキシル、アミノ、チオ、またはアリールであり、 X が窒素である場合、R4は水素であり、X が酸素または硫黄である場合、R4は存在せず、 C4およびC5はさらに二重結合によって連結されていてもよい］
の構造、または
【化８】
2003532698.tif 000008
［式中、C2は、水素、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシ、ヘテロアリールから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC3と共に二重結合を形成し、C3は、水素、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC2と共に二重結合を形成し、C4は、水素、C1-5アルキル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC5と共に二重結合を形成し、C5は、水素、C1-5アルキル、C2-5アルカノイル、C2-5アルカノイルオキシから選択される少なくとも1 つの置換基にさらに結合しているか、または酸素原子もしくはC4と共に二重結合を形成し、C2、C3、C4またはC5のうち少なくとも1 つは、ヒドロキシル、C1-5アルキル、C2-5アルケニル、C2-5アルカノイル、およびヘテロアリールから選択される置換基に結合しており、環内に存在する炭素- 炭素二重結合は多くとも1 つである］
の構造、または
【化９】
2003532698.tif 000009
［式中、R はC1-5アルコキシル基である］
の構造を含む請求項２５記載の医薬組成物。
【請求項２７】請求項２３記載の相乗的抗生組成物の、温血動物中で定数感知機構を有する微生物によって引き起こされる感染症の治療用医薬の製造の為の使用。
【請求項２８】請求項２３記載の相乗的抗生組成物が、治療上効果のある濃度で存在する、請求項２７記載の使用。
【請求項２９】少なくとも1 つの請求項２３記載の相乗的抗生組成物を含み、ここで、該組成物が局所的抗微生物効果をもたらすのに十分な濃度で存在する医療用デバイス。