【手続補正書】
【提出日】平成19年4月23日(2007.4.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号（SEQ ID NO)179に示されたヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子、またはその相補物。
【請求項２】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、単離された核酸分子、またはその相補物。
【請求項３】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドの自然に発生する対立性変異体をコードする単離された核酸分子、またはその相補物。
【請求項４】
配列番号（SEQ ID NO)179に示されたヌクレオチド配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を持つヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子、またはその相補物。
【請求項５】
配列番号（SEQ ID NO)179に示されたヌクレオチド配列の少なくとも１５個の連続したヌクレオチドフラグメントを含む、単離された核酸分子または、その相補物。
【請求項６】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする単離された核酸分子またはその相補物。
【請求項７】
請求項１から６のいずれか１項に記載の核酸分子、および異種ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子。
【請求項８】
請求項１から７のいずれか１項に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項９】
発現ベクターである、請求項８に記載のベクター。
【請求項１０】
請求項９に記載の発現ベクターによりトランスフェクションされた宿主細胞。
【請求項１１】
前記細胞が微生物である請求項１０に記載の宿主細胞。
【請求項１２】
前記細胞が、コリネバクテリウム属またはブレビバクテリウム属に属する請求項１１に記載の宿主細胞。
【請求項１３】
前記核酸分子の発現により、前記細胞からのファインケミカルの製造が調節される請求項１０に記載の宿主細胞。
【請求項１４】
ファインケミカルが、有機酸、タンパク原アミノ酸および非タンパク原アミノ酸、プリンおよびピリミジン塩基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、脂質、飽和および不飽和の脂肪酸、ジオール、炭水化物、芳香族化合物、ビタミン、補助因子、ポリケチド、および酵素からなる群より選択される請求項１３に記載の宿主細胞。
【請求項１５】
適当な培地中で請求項１０に記載の宿主細胞を培養し、これによりポリペプチドを製造することを含む、ポリペプチドの製造方法。
【請求項１６】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
【請求項１７】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドの自然に発生する対立性変異体を含む単離されたポリペプチド。
【請求項１８】
配列番号（SEQ ID NO)179に示されたヌクレオチド配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を持つヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされた単離されたポリペプチド。
【請求項１９】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列全体に対し、少なくとも５０％の相同性を持つアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。      
【請求項２０】
配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドフラグメントを含む単離されたポリペプチドであって、前記ポリペプチドフラグメントが配列番号（SEQ ID NO)180に示されたアミノ酸配列を含むポリペプチドの生物学的活性を保持している単離されたポリペプチド。
【請求項２１】
配列番号（SEQ ID NO)179に示されたヌクレオチド配列を含む核酸分子によりコードされたアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
【請求項２２】
異種アミノ酸配列を含む、請求項１６〜２１のいずれか１項に記載の単離されたポリペプチド。
【請求項２３】
請求項１０に記載の細胞を培養してファインケミカルを製造する、ファインケミカルの製造方法。
【請求項２４】
培養物からファインケミカルを回収する工程を含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記細胞が、コリネバクテリウム属またはブレビバクテリウム属に属する請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
当該細胞が、コリネバクテリウム−グルタミカム、コリネバクテリウム−ヘルキュリス、コリネバクテリウム−リリウム、コリネバクテリウム−アセトアシドフィリウム、コリネバクテリウム−アセトグルタミカム、コリネバクテリウム−アセトフィリウム、コリネバクテリウム−アンモニアゲン、 コリネバクテリウム−フジオケンス、コリネバクテリウム−ニトリロフィリウス、 ブレビバクテリウム−アンモニアゲン、ブレビバクテリウム−ブタニカム、 ブレビバクテリウム−ジバリカツム、ブレビバクテリウム−フラビウム、ブレビバクテリウム−ヘアリ、ブレビバクテリウム−ケトグルタミカム、ブレビバクテリウム−ケトソレダクタム、ブレビバクテリウム−ラクトフェルメンツム、ブレビバクテリウム−リネンス、ブレビバクテリウム−パラフィノリツカム、および表３に記載の株からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】
前記ベクターによる核酸分子の発現により、前記ファインケミカルの製造が調節される請求項２３に記載の方法。
【請求項２８】
当該ファインケミカルが、有機酸、タンパク質原アミノ酸および非タンパク質原アミノ酸、プリンおよびピリミジン塩基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、脂質、飽和および不飽和の脂肪酸、ジオール、炭水化物、芳香族化合物、ビタミン、補助因子、ポリケチド、および酵素からなる群より選択される、請求項２３に記載の方法。
【請求項２９】
ファインケミカルがアミノ酸である、請求項２３に記載の方法。
【請求項３０】
アミノ酸が、リジン、グルタマート、グルタミン、アラニン、アスパルタート、グリシン、セリン、トレオニン、メチオニン、システイン、バリン、ロイシン、イソロイシン、アルギニン、プロリン、ヒスチジン、チロシン、フェニルアラニン、およびトリプトファンから成る群より選択される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
請求項１から６のいずれかに記載の核酸分子の導入によってゲノムＤＮＡが変異した細胞を培養する工程を含むファインケミカルの製造方法。
【請求項３２】
サンプルにおけるin vitroでのコリネバクテリウム−ジフテリアの存在または活性を検出する方法であって、請求項１から６のいずれか1項に記載の少なくとも１個の核酸分子、または請求項１６から２１のいずれか1項に記載の少なくとも１個のポリペプチド分子の存在をサンプルから検出することによりサンプルのコリネバクテリウム−ジフテリアの存在または活性を検出する、コリネバクテリウム−ジフテリアの存在または活性を検出する方法。
【請求項３３】
核酸分子が混乱している、配列番号（SEQ ID NO)179に示された核酸分子を含む宿主細胞。
【請求項３４】
核酸分子が、配列番号（SEQ ID NO)179に示された配列と比較して１個以上の核酸の修飾を含む、配列番号（SEQ ID NO)179に示された核酸分子を含む宿主細胞。
【請求項３５】
核酸分子の調節領域が、分子の野生種の調節領域に対して修飾されている、配列番号（SEQ ID NO)179に示された核酸分子を含む宿主細胞。
【請求項３６】
サンプルが患者から得られたものである請求項３２に記載の検出方法。