【手続補正書】
【提出日】平成19年12月11日(2007.12.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ＩＲＡＫ−４ポリペプチドをコードする単離された核酸であって、該ポリペプチドが、配列番号１またはその部分配列に対する少なくとも約９８％のアミノ酸配列の同一性を有し、ここで、該ポリペプチドのアミノ酸配列が、配列番号１のアミノ酸第８１位に対応するアミノ酸位置にアラニン残基を含み、そしてここで、該核酸が、少なくとも約４００ヌクレオチドを含む、核酸。
【請求項２】  請求項１に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、以下：
（ｉ）配列番号１のアミノ酸第４３２位に対応するアミノ酸位置のバリン残基；
（ｉｉ）配列番号１のアミノ酸第４３７位に対応するアミノ酸位置のロイシン残基；
（ｉｉｉ）配列番号１のアミノ酸第４４４位に対応するアミノ酸位置のアルギニン残基；および
（ｉｖ）配列番号１のアミノ酸第４５１位に対応するアミノ酸位置のグルタミン残基
からなる群より選択されるアミノ酸をさらに含む、核酸。
【請求項３】  請求項２に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、（ｉ）〜（ｉｖ）に列挙された各前記アミノ酸を含む、核酸。
【請求項４】  請求項１に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含む、核酸。
【請求項５】  請求項１に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、少なくとも約１００アミノ酸を含む、核酸。
【請求項６】  請求項１に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、少なくとも約４５０アミノ酸を含む、核酸。
【請求項７】  請求項１に記載の核酸であって、該核酸が、配列番号２のヌクレオチド第２４２位に対応するヌクレオチド位置にシトシンを含む、核酸。
【請求項８】  請求項７に記載の核酸であって、該核酸が、以下：
（ｉ）配列番号２のヌクレオチド第１２９５位に対応するヌクレオチド位置のチミン；
（ｉｉ）配列番号２のヌクレオチド第１３０２位に対応するヌクレオチド位置のチミン；
（ｉｉｉ）配列番号２のヌクレオチド第１３１０位に対応するヌクレオチド位置のチミン；
（ｉｖ）配列番号２のヌクレオチド第１３３２位に対応するヌクレオチド位置のアデニン；および
（ｖ）配列番号２のヌクレオチド第１３５３位に対応するヌクレオチド位置のアデニン
からなる群より選択されるヌクレオチドをさらに含む、核酸。
【請求項９】  請求項８に記載の核酸であって、該核酸が、（ｉ）〜（ｖ）に列挙された各前記ヌクレオチドを含む、核酸。
【請求項１０】  請求項１に記載の核酸であって、該核酸が、配列番号２のヌクレオチド配列を含む、核酸。
【請求項１１】  請求項１に記載の核酸であって、該核酸が、少なくとも約１３５０ヌクレオチドを含む、核酸。
【請求項１２】  請求項１に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対して作製された抗体に特異的に結合する、核酸。
【請求項１３】  請求項１に記載の核酸であって、該核酸が、プロモーターに作動可能に連結されている、核酸。
【請求項１４】  請求項１３に記載の核酸を含む、発現カセット。
【請求項１５】  請求項１４に記載の発現カセットを含む、単離された細胞。
【請求項１６】  単離されたＩＲＡＫ−４ポリペプチドであって、該ポリペプチドが、配列番号１またはその部分配列に対する少なくとも約９８％のアミノ酸配列の同一性を有し、ここで、該ポリペプチドのアミノ酸配列が、配列番号１のアミノ酸第８１位に対応するアミノ酸位置にアラニン残基を含み、そしてここで、該ポリペプチドが、少なくとも約１００アミノ酸を含む、ポリペプチド。
【請求項１７】  請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、以下：
（ｉ）配列番号１のアミノ酸第４３２位に対応するアミノ酸位置のバリン残基；
（ｉｉ）配列番号１のアミノ酸第４３７位に対応するアミノ酸位置のロイシン残基；
（ｉｉｉ）配列番号１のアミノ酸第４４４位に対応するアミノ酸位置のアルギニン残基；および
（ｉｖ）配列番号１のアミノ酸第４５１位に対応するアミノ酸位置のグルタミン残基
からなる群より選択されるアミノ酸をさらに含む、ポリペプチド。
【請求項１８】  請求項１７に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、（ｉ）〜（ｉｖ）に列挙された全ての前記アミノ酸を含む、ポリペプチド。
【請求項１９】  請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
【請求項２０】  請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、配列番号２のヌクレオチド配列を含む核酸によってコードされる、ポリペプチド。
【請求項２１】  請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対して作製された抗体に特異的に結合する、ポリペプチド。
【請求項２２】  請求項１６に記載のポリペプチドであって、該ポリペプチドが、少なくとも約４５０アミノ酸を含む、ポリペプチド。
【請求項２３】  ＩＲＡＫ−４ポリペプチドをコードする単離された核酸であって、該ポリペプチドが、配列番号３またはその部分配列に対する少なくとも約７０％のアミノ酸配列の同一性を有する、核酸。
【請求項２４】  請求項２３に記載の核酸であって、前記ポリペプチドが、配列番号３のアミノ酸配列を含む、核酸。
【請求項２５】  請求項２３に記載の核酸であって、該核酸が、配列番号４またはその部分配列に対する少なくとも約７０％のヌクレオチド配列の同一性を有する、核酸。
【請求項２６】  請求項２３に記載の核酸であって、該核酸が、配列番号４のヌクレオチド配列を含む、核酸。
【請求項２７】  請求項２３に記載の核酸であって、該核酸が、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、配列番号４のヌクレオチド配列を含む核酸にハイブリダイズする、核酸。
【請求項２８】  請求項２３に記載の核酸であって、該核酸が、プロモーターに作動可能に連結されている、核酸。
【請求項２９】  請求項２８に記載の核酸を含む、発現カセット。
【請求項３０】  請求項２９に記載の発現カセットを含む、単離された細胞。
【請求項３１】  ＩＲＡＫ−４ポリペプチドを作製する方法であって、該方法は、以下：
（ｉ）請求項１または請求項１９に記載の核酸を、宿主細胞または細胞抽出物に導入する工程；
（ｉｉ）該ＩＲＡＫ−４ポリペプチドが、該宿主細胞または細胞抽出物中で発現されるような条件下で、該宿主細胞または細胞抽出物をインキュベートする工程；および
（ｉｉｉ）該宿主細胞または細胞抽出物から該ＩＲＡＫ−４ポリペプチドを回収する工程
を包含する、方法。
【請求項３２】  炎症疾患を処置する際に有用な化合物を同定する方法であって、該方法は、以下：
（ｉ）ＩＲＡＫ−４ポリペプチドと該化合物を接触させる工程であって、ここで、該ＩＲＡＫ−４ポリペプチドが、配列番号１または配列番号３に対する少なくとも約７０％のアミノ酸配列の同一性を有する、工程；および
（ｉｉ）該ＩＲＡＫ−４ポリペプチドに対する該化合物の機能的な効果を決定する工程
を包含する、方法。
【請求項３３】  請求項３２に記載の方法であって、前記ＩＲＡＫ−４が、配列番号１または配列番号３として示されるアミノ酸配列を含む、方法。
【請求項３４】  請求項３２に記載の方法であって、前記化合物が、ＩＲＡＫ−４キナーゼ活性を阻害する、方法。
【請求項３５】  請求項３２に記載の方法であって、前記ＩＲＡＫ−４が、真核生物細胞内に存在する、方法。
【請求項３６】  患者における炎症疾患を処置するための組成物であって、該組成物が、
ＩＲＡＫ−４を調節する化合物
を含む、組成物。
【請求項３７】  請求項３６に記載の組成物であって、前記化合物が、ＩＲＡＫ−４キナーゼ活性を阻害する、組成物。
【請求項３８】  請求項３６に記載の組成物であって、前記化合物が、請求項３２に記載の方法を用いて同定される、組成物。
【請求項３９】  請求項３６に記載の組成物であって、前記炎症疾患が、肺疾患および気道の疾患、移殖片拒絶、自己免疫疾患、癌、心臓血管疾患、中枢神経系の疾患、ＣＤ１４媒介性敗血症、非ＣＤ１４媒介性敗血症、変形性関節症、骨粗鬆症、乾癬、皮膚の疾患、炎症性腸疾患、ベーチェット症候群、強直性脊椎炎、類肉腫症、痛風、ならびに眼の疾患および状態からなる群より選択される、組成物。
【請求項４０】  請求項３９に記載の組成物であって、前記肺疾患および気道の疾患が、成人呼吸促進症候群（ＡＲＤＳ）、慢性閉塞性肺疾患（ＯＰＤ）、肺線維症、間質性肺疾患、ぜん息、慢性咳、およびアレルギー性鼻炎からなる群より選択される、組成物。
【請求項４１】  請求項３９に記載の組成物であって、前記自己免疫疾患が、慢性関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、多発性硬化症、および糖尿病からなる群より選択される、組成物。
【請求項４２】  請求項３９に記載の組成物であって、前記癌が、固形腫瘍、皮膚癌、およびリンパ腫からなる群より選択される、組成物。
【請求項４３】  請求項３９に記載の組成物であって、前記心臓血管疾患が、発作およびアテローム硬化症からなる群より選択される、組成物。
【請求項４４】  請求項３９に記載の組成物であって、前記中枢神経系の疾患が、神経変性疾患である、組成物。
【請求項４５】  請求項３９に記載の組成物であって、前記皮膚の疾患が、発疹、接触皮膚炎、およびアトピー性皮膚炎からなる群より選択される、組成物
【請求項４６】  請求項３９に記載の組成物であって、前記炎症性腸疾患が、クローン病および潰瘍性大腸炎からなる群より選択される、組成物。
【請求項４７】  細胞においてＩＬ−１Ｒ／Ｔｏｌｌレセプターの活性化により生じるシグナルの伝達を阻害するための組成物であって、該組成物が、
ＩＲＡＫ−４の活性または発現のインヒビター
を含む、組成物。
【請求項４８】  請求項４７に記載の組成物であって、前記ＩＬ−１Ｒ／Ｔｏｌｌレセプターが、ＩＬ−１によって活性化される、組成物。
【請求項４９】  請求項４７に記載の組成物であって、前記インヒビターが、ＩＲＡＫ−４のドミナントネガティブ形態を含む、組成物。
【請求項５０】  請求項４９に記載の組成物であって、前記ＩＲＡＫ−４のドミナントネガティブ形態が、ＡＴＰ結合ポケットのリジン残基における変異を含む、組成物。
【請求項５１】  請求項５０に記載の組成物であって、前記変異が、前記ＩＲＡＫ−４内にある配列番号１の第２１３位および第２１４位に対応するアミノ酸位置のリジン残基をアラニン残基にする、置換を含む、組成物。
【請求項５２】  請求項４９に記載の組成物であって、前記ＩＲＡＫ−４のドミナントネガティブ形態が、ＩＲＡＫ−４の切断型形態である、組成物。
【請求項５３】  請求項５２に記載の組成物であって、前記ＩＲＡＫ−４の切断型形態が、本質的に配列番号１のアミノ酸１〜１９１からなる、組成物。
【請求項５４】  請求項４７に記載の組成物であって、前記インヒビターが、請求項３２に記載の方法を用いて同定される化合物を含む、組成物。
【請求項５５】  請求項４５に記載の組成物であって、前記インヒビターが、少なくとも１つの転写因子の活性化を阻害する、組成物。
【請求項５６】  請求項５３に記載の組成物であって、前記転写因子が、前記細胞においてＮＦκＢを活性化する、組成物。
【請求項５７】  内因性ＩＲＡＫ−４遺伝子における変異を含む、非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項５８】  請求項５７に記載のトランスジェニック動物であって、前記変異が、前記内因性ＩＲＡＫ−４遺伝子を不活性化する、トランスジェニック動物。
【請求項５９】  請求項５８の変異であって、前記変異が、前記内因性ＩＲＡＫ−４遺伝子の全てかまたは一部の欠失を含む、変異。
【請求項６０】  請求項５７に記載のトランスジェニック動物であって、該動物がマウスである、トランスジェニック動物。
【請求項６１】  内因性ＩＲＡＫ−４遺伝子における変異を含む、単離された変異体哺乳動物細胞。
【請求項６２】  請求項６１に記載の単離された変異体哺乳動物細胞であって、前記変異が、前記内因性ＩＲＡＫ−４遺伝子を不活性化する、単離された変異体哺乳動物細胞。