【手続補正書】
【提出日】平成20年5月21日(2008.5.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
リガンドであって、該リガンドは、ｕＰａ−ｕＰＡＲ複合体に結合するが、（ｉ）遊離のｕＰａに実質的には結合せず、（ｉｉ）ｕＰａ−ｕＰＡＲ結合を阻害もしない、リガンド。
【請求項２】
遊離のｕＰＡＲに実質的に結合しない、請求項１に記載のリガンド。
【請求項３】
ポリペプチドである、請求項１または２に記載のリガンド。
【請求項４】
抗体またはその抗原結合フラグメントである、請求項１〜３のうちのいずれか１項に記載のリガンド。
【請求項５】
ｍＡｂである、請求項４に記載のリガンド。
【請求項６】
前記抗体または抗原結合フラグメントが、キメラ抗体またはキメラ抗原結合フラグメントである、請求項４または５に記載のリガンド。
【請求項７】
前記抗体または抗原結合フラグメントが、ヒト化抗体、ヒト化抗原結合フラグメント、完全ヒト抗体、または完全ヒト抗原結合フラグメントである、請求項４または５に記載のリガンド。
【請求項８】
抗体の抗原結合フラグメントである請求項４または５に記載のリガンドであって、該フラグメントは、単鎖Ｆｖ（ｓｃＦＶ）、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２またはＦｖである、リガンド。
【請求項９】
前記抗体またはその抗原結合フラグメントが、
（ａ）配列番号３、配列番号４および配列番号５のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または配列番号１の配列を含む、ＶＬ鎖；ならびに
（ｂ）配列番号６、配列番号７および配列番号８のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または配列番号２の配列を含む、ＶＨ鎖
を含む、請求項４〜６および８のうちのいずれか１項に記載の抗体。
【請求項１０】
（ａ）配列番号１のアミノ酸配列を含むＶＬ鎖と、配列番号２のアミノ酸配列を含むＶＨ鎖とを含むか、または
（ｂ）配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬ鎖と、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＨ鎖とを含む、
精製されたモノクローナル抗体またはその抗原結合フラグメント。
【請求項１１】
前記抗体または抗原結合フラグメントが、
（ａ）配列番号１１、配列番号１２および配列番号１３のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または配列番号９の配列を含む、ＶＬ鎖；および
（ｂ）配列番号１４、配列番号１５および配列番号１６のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または配列番号１０の配列を含む、ＶＨ鎖
を含む、請求項４〜６および８のうちのいずれか１項に記載のリガンド。
【請求項１２】
請求項４〜９のうちのいずれか１項に記載のリガンドであって、
前記抗体または抗体フラグメントは、配列番号１のアミノ酸配列を含むＶＬ鎖と配列番号２のアミノ酸配列を含むＶＨ鎖とを含む抗体と同じエピトープを認識して該エピトープに結合する、リガンド。
【請求項１３】
請求項４〜９のうちのいずれか１項に記載のリガンドであって、
前記抗体または抗体フラグメントは、配列番号３のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１と、配列番号４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２と、配列番号５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３とを有するＶＬ鎖、および配列番号６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１と、配列番号７のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２と、配列番号８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３とを有するＶＨ鎖を含む抗体と、同じエピトープを認識して該エピトープに結合する、リガンド。
【請求項１４】
ｕＰＡ−ｕＰＡＲ複合体がこれらの複合体に対する第２の生物学的リガンドと結合することを阻害する、請求項１〜１３のうちのいずれか１項に記載のリガンド。
【請求項１５】
前記第２の生物学的リガンドがインテグリンである、請求項１４に記載のリガンド。
【請求項１６】
前記インテグリンが、α５β１、αｖβ３、αｖβ５、α３β１、α６β１、およびα４β１からなる群より選択される、請求項１５に記載のリガンド。
【請求項１７】
前記リガンドが、
（ａ）フィブロネクチンのｕＰＡＲ媒介性集合、
（ｂ）インテグリンα５β１に対するフィブロネクチンもしくはそのフラグメトの結合、または
（ｃ）ビトロネクチン成分の集合
に干渉し、阻害する、請求項１〜１６のうちのいずれか１項に記載のリガンド。
【請求項１８】
請求項１〜１７のうちのいずれかに記載のリガンドであって、
（ａ）診断的に検出可能に標識されているか、あるいは
（ｂ）治療的に活性な部分で標識されている、
リガンド。
【請求項１９】
（ａ）診断的に検出可能に標識された請求項１８に記載の標識リガンドと、
（ｂ）診断的に受容可能なキャリア
とを含む、診断用組成物。
【請求項２０】
前記リガンドが、放射性核種、ＰＥＴ造影剤、ＭＲＩ造影剤、蛍光剤、蛍光原、発色団、クロモゲン、リン光剤、化学発光剤または生物発光剤で標識された、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
前記リガンドが、放射性核種により標識されており、該放射性核種は、３Ｈ、１４Ｃ、３５Ｓ、６７Ｇａ、６８Ｇａ、７２Ａｓ、８９Ｚｒ、９７Ｒｕ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎ、１２３Ｉ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１６９Ｙｂおよび２０１Ｔｌからなる群より選択される、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２２】
前記リガンドが、蛍光剤または蛍光原により標識されており、該蛍光剤または蛍光原は、フルオレセイン、ローダミン、ダンシル、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、ｏ−フタルデヒド、フルオレサミン、フルオレセイン誘導体、Ｏｒｅｇｏｎ  Ｇｒｅｅｎ、Ｒｈｏｄａｍｉｎｅ  Ｇｒｅｅｎ、Ｒｈｏｄｏｌ  ＧｒｅｅｎおよびＴｅｘａｓ  Ｒｅｄからなる群より選択される、請求項２０に記載の組成物。
【請求項２３】
薬学的組成物であって、
（ａ）治療的に活性な部分により標識された、治療上有効な量の請求項１８に記載のリガンド；および
（ｂ）薬学的に受容可能なキャリア
を含む、薬学的組成物。
【請求項２４】
注入に適切な形態である、請求項２３に記載の薬学的組成物。
【請求項２５】
前記治療的に活性な部分が、前記リガンドに直接結合しているか、または間接的に結合している、請求項２３に記載の薬学的組成物。
【請求項２６】
前記治療的に活性な部分が、化学療法剤、毒素または治療的放射性核種である、請求項２３に記載の治療用薬学的組成物。
【請求項２７】
前記治療的に活性な部分が、ペプチドまたはポリペプチドである、請求項２３に記載の薬学的組成物。
【請求項２８】
前記ペプチドまたはポリペプチドが毒素である、請求項２４に記載の薬学的組成物。
【請求項２９】
細胞移動、細胞浸潤または細胞増殖を阻害する必要がある被験体において細胞移動、細胞浸潤または細胞増殖を阻害するための医薬の調製における、治療上有効な量の請求項１〜１７のうちのいずれか１項に記載のリガンドの使用。
【請求項３０】
新脈管形成を阻害する必要がある被験体において新脈管形成を阻害するための医薬の調製における、治療上有効な量の請求項１〜１７のうちのいずれか１項に記載のリガンドの使用。
【請求項３１】
腫瘍増殖または腫瘍転移を阻害する必要がある被験体において腫瘍増殖または腫瘍転移を阻害するための医薬の調製における、治療上有効な量の請求項１〜１７のうちのいずれか１項に記載のリガンドの使用。
【請求項３２】
第一の抗体もしくはそのフラグメントまたは他のリガンドを同定するための方法であって、該第一の抗体もしくはそのフラグメントまたは該他のリガンドは、配列番号１のアミノ酸配列を含むＶＬドメインと配列番号２のアミノ酸配列を含むＶＨドメインとを含む第二の抗体が結合するエピトープ、または配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬドメインと配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＨドメインとを含む第三の抗体が結合するエピトープと、同じエピトープに結合し、
該方法は、
該第一の抗体もしくはそのフラグメントまたは該リガンドが
（ｉ）固定されたｓｕＰＡＲ、
（ｉｉ）ｓｕＰＡＲの固定されたＤ２Ｄ３ドメインまたは
（ｉｉｉ）ｓｕＰＡＲもしくは該Ｄ２Ｄ３の、固定されたフラグメント
に対する検出可能に標識された該第二の抗体または第三の抗体の結合を競合的に阻害する能力を測定する工程
を包含し、
ここで、少なくとも約２０％の競合阻害は、該第一の抗体もしくはそのフラグメントまたは該他のリガンドが、該第二の抗体または第三の抗体が結合するのと同じエピトープに結合することを示す、
方法。
【請求項３３】
ペプチドを同定するための方法であって、該ペプチドは、（ａ）配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬドメインと配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＨドメインとを含む第一の抗体、（ｂ）配列番号１のアミノ酸配列を含むＶＬドメインと配列番号２のアミノ酸配列を含むＶＨドメインとを含む第二の抗体、あるいは（ｃ）該第一の抗体もしくは第二の抗体の結合特性を有する第三の抗体または他のリガンドによって、認識され、
該方法は、
該ペプチドが、
（ｉ）固定されたｓｕＰＡＲ、
（ｉｉ）ｓｕＰＡＲの固定されたＤ２Ｄ３ドメインまたは
（ｉｉｉ）ｓｕＰＡＲもしくは該Ｄ２Ｄ３ドメインの、固定されたフラグメント
に対する検出可能に標識された該第一の抗体、第二の抗体、あるいは第三の抗体または該他のリガンドの結合を競合的に阻害する能力を測定する工程
を包含し、
ここで、少なくとも約２０％の競合阻害は、該ペプチドが、該第一の抗体、第二の抗体、もしくは第三の抗体、または該他のリガンドによって認識されることを示す、
方法。
【請求項３４】
前記他のリガンドが、
（ａ）約５０Ｄａ〜約２５００Ｄａの分子量を有する有機低分子；
（ｂ）核酸分子；または
（ｃ）オリゴヌクレオチド、例えば、ｍＲＮＡｉ分子もしくはアプタマー；
である、請求項３２または３３に記載の方法。
【請求項３５】
単離されたペプチドであって、該ペプチドは、
（ａ）（ｉ）配列番号３、配列番号４および配列番号５のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または（ｉｉ）配列番号１のアミノ酸配列を含む、ＶＬ鎖；ならびに
（ｂ）（ｉ）配列番号６、配列番号７および配列番号８のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３を含むか、または（ｉｉ）配列番号２のアミノ酸配列を含む、ＶＨ鎖
を有するｍＡｂによって結合される、
単離されたペプチド。
【請求項３６】
単離されたペプチドであって、該ペプチドは、
（ａ）（ｉ）配列番号１１、配列番号１２および配列番号１３のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または（ｉｉ）配列番号９のアミノ酸配列を含む、ＶＬ鎖；ならびに
（ｂ）（ｉ）配列番号１４、配列番号１５および配列番号１６のそれぞれのアミノ酸配列を有するＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含むか、または（ｉｉ）配列番号１０のアミノ酸配列を含む、ＶＨ鎖
を有するｍＡｂによって結合される、単離されたペプチド。
【請求項３７】
細胞移動、細胞浸潤または細胞増殖を阻害するための組成物であって、
治療上有効な量の請求項１〜１７のうちのいずれか１項に記載のリガンド
を含む、組成物。
【請求項３８】
新脈管形成を阻害するための組成物であって、
治療上有効な量の請求項１〜１７のうちのいずれか１項に記載のリガンド
を含む、組成物。
【請求項３９】
腫瘍増殖または腫瘍転移を阻害するための組成物であって、
治療上有効な量の請求項１〜１７のうちのいずれか１項に記載のリガンド
を含む、組成物。