【誤訳訂正書】
【提出日】平成19年11月19日(2007.11.19)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２４】
１．定義
本発明で用いられるように、「プロテアーゼ」、および「蛋白分解活性」という用語は、ペプチド結合をもつペプチドまたは基質を加水分解する能力を示すタンパク質またはペプチドのことをいう。蛋白分解活性を測定するための多くの周知の操作法が存在している（フリーチャー編「生化学工学／バイオテクノロジーの進歩」（１９８８年）中のカリツ（Kalisz）著「微生物プロテイナーゼ」）。例えば、蛋白分解活性は、市販の基質を加水分解するプロテアーゼのそれぞれの性能を分析する比較アッセイにより確認することができる。プロテアーゼまたは蛋白分解活性のそのような分析に有用な具体的な基質には、ジメチルカゼイン（シグマ社Ｃ−９８０１）、ウシ・コラーゲン（シグマ社Ｃ−９８７９）、ウシ・エラスチン（シグマ社Ｅ−１６２５）、およびウシ・ケラチン（ＩＣＮバイオメディカル社：９０２１１１）が含まれるが、これらに限定されない。これらの基質を利用した比色試験は当該技術分野において周知である。（例えば、ＷＯ９９／３４０１１および米国特許６，３７６，４５０号を参照されたい。本文献は参照により本発明に取り込まれる。）ｐＮＡ試験（例えば、デル・マル他著、アナリティカル・バイオケミストリー（Anal. Biochem.）９９巻、３１６−３２０頁、１９７９年を参照されたい。）もグラジエント溶出時に回収される分画の活性酵素濃度を測定するために利用される。この試験は、酵素が溶解性合成基質であるスクシニル−アラニン−アラニン−プロリン−フェニルアラニン−ｐ−ニトロアニリド（ｓＡＡＰＦ−ｐＮＡ）を加水分解する際にｐ−ニトロアニリンが放出される速度を測定する。加水分解反応による黄色の生成速度は分光光度計により４１０ｎｍで測定され、活性酵素濃度に比例する。さらに２８０ｎｍにおける吸光度測定は総蛋白濃度を測定するために用いられる。活性酵素／総蛋白比により酵素純度がわかる。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１３６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１３６】
本発明で用いられるように、細胞に核酸を導入するという文脈において「導入される」という用語は、細胞に核酸を移転させるのに好適な任意の方法のことをいう。そのような導入のための方法には、プロトプラスト融合、形質移入（transfection）、形質転換（transformation）、接合（conjugation）、および誘導（transduction）が含まれるが、これらに限定されない（例えば、ハードウッド他編「バチルス」（プレナム出版）中のフェラーリ他著「遺伝学」、５７−７２頁、１９８９年を参照されたい。）。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１６９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１６９】
本発明で用いられるように、「ポリメラーゼ鎖反応（「ＰＣＲ」）」という用語は、米国特許４，６８３，１９５号、４，６８３，２０２号、および４，９６５，１８８号の方法（ここで参照により取り込まれる）であり、クローニングまたは精製を除き、ゲノムＤＮＡ混合物において標的配列の領域の濃度を上昇させるための方法をふくむもののことをいう。標的配列を増幅するためのこの方法は、所望の標的配列を含むＤＮＡ混合物に２つのオリゴヌクレオチド・プライマーを導入する工程、つぎにＤＮＡポリメラーゼ存在下における温度サイクルの正確な継続の工程からなる。前記２つのプライマーは二本鎖標的配列のそれぞれの鎖に相補的である。増幅を奏功するために、前記混合物は変性され、前記プライマーは次に標的分子内の相補的配列にアニール（anneal）される。アニーリング（annealing）に続いて、プライマーは相補鎖の新しい対を形成するようにポリメラーゼで延長される。変性工程、プライマーのアニーリングおよびポリメラーゼによる延長は所望の標的配列の増幅領域の高濃度を達成するために多数回（すなわち、変性、アニーリング、および延長は１つのサイクルを構成し、多数のサイクルがあり得る）繰り返すことができる。所望の標的配列の増幅領域の長さはプライマー相互の相対的位置により決定することができ、このためこの長さは制御可能なパラメータである。前記工程の繰り返される点から、前記方法は「ポリメラーゼ鎖反応（以下、「ＰＣＲ」という。）」と呼ばれる。所望の標的配列の増幅領域が混合物中の主要な配列（濃度という点から）となるため、それらは「ＰＣＲ増幅された」と言われる。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１８４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１８４】
当該技術分野で知られているように、ＤＮＡはＲＮＡポリメラーゼにより転写されてＲＮＡを生成するが、ＲＮＡは逆転写酵素により逆転写されてＤＮＡを生成する、したがって、ＤＮＡはＲＮＡをコードし、およびその逆も成り立つ。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０２１９
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０２１９】
本発明で用いられるように、「標的（target）特性」という用語は、変更されるべき出発遺伝子の特性のことをいう。本発明は任意の特定の標的特性に限定されることを意図していない。しかしながら、いくつかの好ましい態様において標的特性は遺伝子生産物の安定性（例えば、変性、蛋白分解、他の分解性因子に対する抵抗性）であり、他の態様において宿主が変化する生産における生産レベルである。実際、出発遺伝子の任意の特性が本発明において用いられることになると考えられる。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０３２５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０３２５】
幾つかの態様において、転写に必要とされる追加的な部分には、当該技術分野で知られている制限部分（例えば、プロモータ、分泌部分、インヒビター、全体レギュレーター）が含まれる。１つの具体例には、選択される宿主細胞において転写活性を示し、宿主細胞の同種または異種のいずれかのタンパク質をコードする遺伝子由来の任意のＤＮＡが含まれる。具体的には、細菌宿主細胞において用いるのに好適なプロモータの例には、バチルス・ステアロテルモフィリスのマルトース源性アミラーゼ遺伝子、バチルス・アミロリケファシエンス（ＢＡＮ）アミラーゼ遺伝子、バチルス・スブチリスのアルカリプロテアーゼ遺伝子、バチルス・クラウシのアルカリプロテアーゼ遺伝子、バチルス・プミリス（pumilis）キシロシダーゼ遺伝子、バチルス・スリンジエンシスｃｒｙＩＩＩＡ、およびバチルス・リケニフォルミスのフルファ−アミラーゼ遺伝子のプロモータが含まれるが、これらに限定されない。追加的なプロモータには、本発明で記載されるようにＡ４プロモータが含まれる。本発明で用いられる他のプロモータには、大腸菌（E. coli）のｌａｃ、ｔｒｐ、またはｔａｃプロモータばかりでなく、ファージラムダＰRまたはＰLプロモータが含まれるが、これらに限定されない。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０３３３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０３３３】
本発明に用いられる細菌宿主細胞の具体例には、エンテロバクテリアシアエ（例えば、エシェリヒア・コリ）のなかまのようなグラム陰性菌と同様に、バチルス、ストレプトマイセス、およびテルモビフィダ（Thermobifida）のようなグラム陽性菌、例えばＢ．スブチリス、Ｂ．リケニフォルミス、Ｂ．レントゥス、Ｂ．ブレビス、Ｂ．ステアロテルモフィルス、Ｂ．クラウシ、Ｂ．アミロリケファシエンス、Ｂ．コアグランス、Ｂ．シルクランス、Ｂ．ラウトゥス、Ｂ．メガテリウム、Ｂ．スリンジエンシス、Ｓ．グリセウス、Ｓ．リビダンス、Ｓ．コエリコロル、Ｓ．アベルミティリスおよびＴ．フスカ株が含まれるが、これらに限定されない。幾つかの特に好ましい態様において、前記宿主細胞はＢ．スブチリス、Ｂ．クラウシ、および／またはＢ．リケニフォルミスである。追加の好ましい態様において、前記宿主細胞はＳ．リビダンス（例えば、ＴＫ２３および／またはＴＫ２１）株である。当該技術分野で知られているプロトプラスト形質転換、コンピテント（competent）細胞の利用等を含むがこれらに限定されない、細菌の形質転換ために好適な任意の方法が本発明において用いられる。幾つかの態様において、米国特許５，２６４，３６６号で提供される方法は本発明において用いられる。Ｓ．リビダンスについて、形質転換およびタンパク質発現のための１つの好ましい手段はフェルナンデス−アバロス（Fernandez-Abalos）他によって記述されている（フェルナンデス−アバロス他著、マイクロバイオロジー、１４９巻、１６２３−１６３２頁、２００３年を参照されたい；ホップウッド（Hopwood）他著、ストレプトマイセスの遺伝子操作、ラボラトリーマニュアル、イニス、１９８５年も参照されたい；両文献とも参照により本発明に取り込まれる）。もちろん、本発明の実施例に記載される方法は本発明において用いられる。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０３７０
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０３７０】
本発明の幾つかの態様において、スブチリシン・プロテアーゼと比べると異なるｐＨで修飾された酵素活性を示す自然発生のプロテアーゼが提供される。ｐＨ−活性プロフィールは酵素活性に対するｐＨのプロットであり、実施例で記載されるようにおよび／または当該技術分野の既知の方法で構築される。幾つかの態様において、広いプロフィールを有する（すなわち、匹敵するスブチリシン・プロテアーゼよりもpＨ範囲でより高い活性を有するもの）自然発生のプロテアーゼを得ることが望ましい。他の態様において、前記酵素はいかなるｐＨでも有意により高い活性を持たない、またはより鋭いプロフィールをもつ自然発生のホモログである（すなわち、一定のｐＨでスブチリシンと比べて増強した活性を有し、かつ他のｐＨでより低い活性を有するもの）。したがって、様々な態様において、本発明のプロテアーゼは異なる至適ｐＨおよび／または範囲を有する。本発明は任意の特定のｐＨまたはｐＨ範囲に限定されることを意図していない。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０３８１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０３８１】
アルカリ溶液での使用に好適な任意のセルラーゼは、本発明の幾つかの態様において用いられる。好適なセルラーゼには細菌または真菌起源のものが含まれるが、これらに限定されない。化学的または遺伝子的に修飾された変異体は幾つかの態様に含まれる。好適なセルラーゼには、フミコラ・インソレンス(Humicola insolens)・セルラーゼ（例えば、ＵＳ４，４３５，３０７号を参照されたい）が含まれるが、これに限定されない。特に好適なセルラーゼは色ケアで利点を有するセルラーゼ（例えば、ＥＰ０４９５２５７号を参照されたい）である。
【誤訳訂正１０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０４５１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０４５１】
以下に示す実験的な開示において、以下の省略記号が適用される。すなわち、PI(プロテイナーゼ阻害剤),ppm(parts  per  million);  M(モル);  mM(ミリモル);  μM(マイクロモル);  nM (ナノモル);  mol(モル);  mmol(ミリモル);  μmol(マイクロモル);  nmol(ナノモル);  gm(グラム);  mg(ミリグラム);  μg(マイクログラム);  pg(ピコグラム);  L(リットル);  ml  and  mL(ミリリットル);  μl  and  μL (マイクロリットル);  cm(センチメータ);  mm(ミリメータ);  μm(マイクロメータ);  nm(ナノメータ);  U(単位);  V(ボルト);  MW(分子量);  sec(秒);  min(s)(分);  h(s)  and   hr(s)(時間);  ℃(摂氏度);  QS(quantity  sufficient);  ND(not  done);  NA(not  applicable);  rpm(revolutions  per  minute);  H20(水、water);  dH20(脱イオン水、deionized  water);  HCl(塩酸);  aa(アミノ酸);  bp(塩基対);  kb(キロ塩基対);  kD(キロダルトン、kilodaltons);  cDNA (copy  or  complementary  DNA);  DNA(デオキシリボ核酸、deoxyribonucleic acid);  SSDNA(単鎖ＤＮＡ、single  stranded  DNA);  dsDNA(二重鎖ＤＮＡ、double stranded  DNA);  dNTP (デオキシリボ核酸三燐酸、deoxyribonucleotide  triphosphate);  RNA(リボ核酸、ribonucleic  acid);  MgCl2(塩化マグネシウム);  NaCl(塩化ナトリウム);  w/v(重量／容量);  v/v(容量／容量);  g(gravity);  OD(光学密度);  ダルベッコリン酸緩衝溶液(DPBS);  SOC(バクト-トリプトン、バクテリア酵母抽出物、IC  mM  NaCl;  2.5mM  KCl);  テリフィック・ブロス、Terrific Broth (TB;  12g/1  Bacto  Tryptone,  24g/1  glycerol, 2.31g/1  KH2PIO4,  and  12.54g/[K2HP04];  OD80(280nmにおける光学密度);  OD600(600nmにおける光学密度);  A405(405nmにおける吸光度);  Vmax(酵素触媒反応における最大初期速度);  PAGE(ポリアクリルアミドゲル電気泳動);  PBS(リン酸緩衝生理食塩水 [150mM  NaCl, 10mMリン酸ナトリウム緩衝液pH7.2]);  PBST(PBS+0.25TWEENR 20);  PEG(ポリエチレングリコール);  PCR(ポリメルラーゼ・チェイン反応); RT-PCR (逆転写PCR);  SDS(ドデシル硫酸ナトリウム);  Tris(トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン);  HEPES(N-[2-ヒドロキシエチル]ピペリジン-N-[2-エタン硫酸]);  HBS(HEPES緩衝生理食塩水);SDS  (ドデシル硫酸ナトリウム);  Tris-HCI(tris-塩酸);  Tricine(N-[トリス-(ヒドロキシメチル)-メチル]-グリシン);  CHES(2-(N-シクロ-ヘキシルアミノ)エタン硫酸);  TAPS(3-{[トリス-(ヒドロキシメチル)-メチル]-アミノ}-プロパン硫酸);  CAPS(3-(シクロ-ヘキシルチミノ)-プロパン硫酸);  DMSO(ジメチルスルホキシド);  DTT(1,4-ジチオ-DL-スレイトール);  SA(シナピン酸、sinapinic  acid(s,5-ジメトキシ-4-ヒドロキシ桂皮酸);  TCA(トリクロロ酢酸);  Glut  and  GSH(還元グルタチオン);  GSSG(酸化グルタチオン);  TCEP(トリス[2-カルボキシエチル]ホスフィン);  Ci(キューリー、Curies);  mCi(ミリキューリー); μCi (マイクロキューリー);  HPLC(高速液体クロマトグラフィー);  RP-HPLC(逆相高速液体クロマトグラフィー);  TLC(薄層クロマトグラフィー);  MALDI-TOF(マトリクス支援レーザー解離／イオン化時間飛行型質量分析);  Ts(トシル);  Bn(ベンジル);  Ph(フェニル);  Ms(メシル);  Et(エチル);  Me(メチル);  Taq(Thermus  aquaticus  DNAポリメラーゼ);  Klenow(DNAポリメラーゼI  large(Klenow)断片);  rpm(revolutions per minute);  EGTA(エチレングリコール-ビス(β-アミノエチルエーテル);  N,N,N',N'-四酢酸);  EDTA(エチレンジアミン四酢酸);bla(β-ラクタマーゼ又はアンピシリン耐性遺伝子);  HDL(heavy  duty液体界面活性剤、すなわち、洗濯洗剤);  ＭＪリサーチ社(MJ Research、Reno、NV);  ベースクリア社(Baseclear BV  Inc.、Leiden、the  Netherlands);  パーセプティブ社(PerSeptive  Biosystems、Framingham、MA);  サーモ・フィネガン社(ThermoFinnigan、 San  Jose、CA);  アルゴ社(Argo  BioAnalytica、Morris  Plains、NJ);  サイツＥＫＳ社(SeitzSchenk  Filtersystems  GmbH、Bad  Kreuznach、Germany);  ポール社(Pall Corp.、East  Hills、NY);  スペクトラム社(Spectrum  Laboratories、Dominguez  Rancho、CA);  モレキュラー・ストラクチャ社(Molecular  Structure  Corp.、WoodIands、TX);  アクセルリス社  (Accelrys  Inc.、San  Diego、CA);  ケミカル・コナンピューティング社(Chemical  Computing  Corp.、Montreal、Canada);  ニュー・ブランズウィック社(New  Brunswick  Scientific  Co.、Edisan、 NJ);  ＣＦＴ社(Center  for  Test  Materials、Vlaardingeng、the  Netherlands);  プロクター＆ギャンブル社(Procter  &  Gamble  Inc.、Cincinnati、OH);  ＧＥヘルスケア社(GE  Healthcare、Chalfont  St.Giles、United  Kingdom);  ＤＮＡ２．０社(DNA2.0、Menlo  Park、CA);  オキソイド社(Oxoid、Basingstoke、Hampshire、UK);  メガザイム社(Megazyme  International  lreland  Ltd.、Bray  Business  Park、Bray、Co.、Wicklow、Ireland);  フィンザイム社(Finnzymes  Oy、Espoo、Finland);  ケルコ社(CP  Kelco、Wilmington、DE);  コーニング社  (Corning  Life  Sciences、Corning、NY);  ＮＥＮ社(NEN  Life  Science  Products、Boston、MA);  ファーマＡＳ社(Pharma  AS、Oslo、Norway);  ディナル社(Dynal、Oslo、Norway);  バイオ・シンセシス社(Bio-Synthesis、Lewisville、TX);  ＡＴＣＣ(American  Type  Culture  Collection、Rockville、MD);  ギブコ／ＢＲＬ社(Gibco/BRL、Grand  Island、NY);  シグマ社(Sigma  Chemical  Co.、St.Louis、MO);  ファルマシア社(Pharmacia  Biotech、Piscataway、NJ); ＮＣＢＩ(National  Center  for  Biotechnology  Information);  アプライド・バイオシステムズ社(Applied  Biosystems、Foster  City、CA);  ＢＤバイオサイエンス・アンド・クローンテック社(BD  Biosciences  CLONTECH  Laboratories、Palo  Alto、CA);  オペロン・テクノロジーズ社(Operon  Technologies  Inc.、Alameda、CA);  ＭＷＧバイオテック社(MWG  Biotech、High  Point、NC);  オリゴズＥｔｃ社(Oligos  Etc  Inc.、Wilsonville、OR);  バケム社(Bachem  Biosdience  Inc.、King  of  Prussia、PA);  ディフコ社(Difco  Laboratories、Detroit、MI);  メディアテック社(Mediatech、Herndon、VA);  サンタ・クルツ社(Santa  Cruz  Biotechnology  Inc.、Santa  Cruz、CA);  オキソイド社(Oxoid  Inc.、Ogdensburg、NY);  ワシントン社(Worthington  Biochemical  Corp.、Freehoid、NJ);  ギブコＢＲＬ社(Life  Technologies  Inc.、Gaithersburg、MD);  ミリポア社(Millipore、Billerica、MA);  バイオ・ラッド社(Bio-Rad、Hercules、CA);  インビトロジェン社(Invitrogen  Corp.、San  Diego、CA);  ＮＥＢ社(New  England  Biolabs、Beverly、MA);  シグマ社(Sigma  Chemical  Co.、St.Louis、MO);  ビアース社(Pierce  Biotechnology、Rockford、IL);  株式会社タカラ(Takara  Bio  Inc.、Otsu、Japan);  ロシュ社(Hoffmann-La  Roche、Basel、Switzerland);  ＥＭサイエンス社(EM  Science、Gibbstown、NJ);  キアジェン社(Qiagen  Inc.、Valencia、CA);  バイオデザイン社(Biodesign  Intl.、Saco、Maine);  アプタジェン社(Aptagen  Inc.、Herndon、VA);  ソーバル社(Sorvall  brand、from  Kendro  Laboratory  Products、Asheville、NC);  モレキュラー・デバイシーズ社(Molecular  Devices  Corp.、Sunnyvale、CA);  Ｒ＆Ｄシステムズ社(R&D  Systems、Minneapolis、MN);  ストラタジーン社(Stratagene  Cloning  Systems、La  Jolia、CA);  マーシュ社(Marsh  Biosciences、Rochester、NY);  バイオ・テック社(Bio-Tek  Instruments、Winooski、VT);  バイオコア社(Biacore  Inc.、Piscataway、NJ);  ペプロテック社(PeproTech、Rocky  Hill、NJ);  シンペプ社(SynPep、Dublin、CA);  ニュー・オブシェクティブ社(New  Objective  brand;  Scientific;  Instrument  Services  Inc.、Ringoes、NJ);  ウォーターズ社(Waters  Inc.、Milford、MA);  マトリクス・サイエンス社(Matrix  Science、Boston、MA);  ディオネックス社(Dionex  Corp.、Sunnyvale、CA);モンサント社(Monsanto  Co.、St.Louis、MO);  ウィンターシャル社(Wintershall  AG、Kassel、Germany);  ＢＡＳＦ社(BASF  Co.、Florham  Park、NJ);  ハンツマン社(Huntsman  etrochemical  Corp.、Salt  Lake  City、UT);  エニケム社(Enichem  iberica、Barcelona、Spain);  フルカ・ヘミー社(Fluka  Chemie  AG、Buchs、Switzerland);ギスト・ブロケイズ社(Gist-Brocades、NV、Delft、the Netherlands);  ダウ・コーニング社(DOW  Corning  Corp.、Midland、Ml);およびマイクロソフト社(Microsoft  Inc.、Redmond、WA)