【手続補正書】
【提出日】平成20年8月19日(2008.8.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
マイコバクテリウム・ツベルクローシス(Mycobacterium tuberculosis)の単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項２】
配列番号1に記載のアミノ酸配列を含む、または配列番号1に少なくとも約95％同一なアミノ酸配列を有する、請求項１に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質。
【請求項３】
前記ペプチドが合成ペプチドである、請求項１または２に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項４】
前記ペプチド、断片もしくはエピトープが、配列番号1に記載の配列の少なくとも約5連続アミノ酸残基を含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項５】
前記ペプチド、断片もしくはエピトープが、N末端および／またはC末端において約1〜5個の追加アミノ酸残基と融合した配列番号1に記載の配列の少なくとも約5連続アミノ酸残基を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項６】
前記ペプチド、断片もしくはエピトープが、配列番号2〜53のいずれか1つに記載のアミノ酸配列、または前記配列のいずれか１つと少なくとも約95％同一なアミノ酸配列を含む前記配列のいずれか１つの免疫学的交差反応性変異体を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項７】
前記ペプチド、断片もしくはエピトープが、配列番号1の約残基65と約残基84との間に位置する少なくとも約5連続アミノ酸残基のアミノ酸配列を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項８】
前記ペプチド、断片もしくはエピトープが、配列番号45に記載の配列の少なくとも5連続残基を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項９】
長さにして最大約5アミノ酸残基のN末端伸長および／または長さにして最大約5アミノ酸残基のC末端伸長をさらに含む、請求項６〜８のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項１０】
配列番号24、25もしくは45に記載のアミノ酸配列、または配列番号24、25もしくは45と少なくとも約95％同一なアミノ酸配列を含むその免疫学的交差反応性変異体を含む、請求項１〜９のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項１１】
前記タンパク質、ペプチド、断片もしくはエピトープが、検出または単離または固定化を促進するための１以上の標識または検出可能部分を含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項１２】
標識がビオチン、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)、FLAGエピトープ、ヘキサ-ヒスチジン、またはβ-ガラクトシダーゼである、請求項１１に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ。
【請求項１３】
１以上の請求項１〜１２のいずれか１項に記載の免疫原性BSXペプチド、断片もしくはエピトープを含む、融合タンパク質。
【請求項１４】
１以上の請求項１〜１２のいずれか１項に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離もしくは組換え免疫原性BSXタンパク質、または１以上のその免疫原性BSXペプチド、断片もしくはエピトープを含む、単離されたタンパク質会合体。
【請求項１５】
免疫グロブリンを含む、請求項１４に記載の単離されたタンパク質会合体。
【請求項１６】
請求項１〜１２のいずれか１項に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープに、あるいは前記免疫原性BSXタンパク質、ペプチド、断片もしくはエピトープを含有する融合タンパク質もしくはタンパク質会合体に特異的に結合する単離もしくは組換え抗体または抗体の免疫反応性フラグメント。
【請求項１７】
抗体がポリクローナル抗体である、請求項１６に記載の単離された抗体。
【請求項１８】
抗体がモノクローナル抗体である、請求項１６に記載の単離された抗体。
【請求項１９】
請求項１８に記載のモノクローナル抗体を産生する、単離された抗体産生細胞または抗体産生細胞集団。
【請求項２０】
請求項１６に記載の単離または組換え抗体、および製薬上許容される担体、希釈剤または賦形剤を含む組成物。
【請求項２１】
被験体における結核症またはマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症の診断方法であって、前記被験体由来の生物学的サンプル中の、免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープに対する抗体を検出することを含み、該サンプル中の前記抗体の存在は感染を示し、かつ前記方法が被験体由来の生物学的サンプルと、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープとを、抗原抗体複合体が形成されるのに十分な時間および条件下で接触させること、およびその後抗原抗体複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
【請求項２２】
抗原抗体複合体の形成の検出が、該抗原抗体複合体中のヒト免疫グロブリンを検出することを含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
ヒト免疫グロブリンを検出することが、前記抗原抗体複合体と抗ヒト免疫グロブリンを含む第２抗体とを、前記第２抗体が複合体中のヒト免疫グロブリンと結合するのに十分な時間および条件下で接触させること、およびその後結合抗ヒト免疫グロブリンを検出することを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
第２抗体が検出可能マーカーまたはレポーター分子で標識されている、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
被験体由来の生物学的サンプルと、単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ以外のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの免疫原性タンパク質またはペプチドとを接触させることをさらに含む、請求項２１〜２４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
被験体が免疫低下しているまたは免疫不全である、請求項２１〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
被験体がHIV+である、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
サンプルが被験体から得られた血液または血清または免疫グロブリン画分を含む、請求項２１〜２７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
被験体における結核症またはマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症の診断方法であって、前記被験体由来の生物学的サンプル中の免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープを検出することを含み、該サンプル中の前記タンパク質または免疫原性断片もしくはエピトープの存在は疾患、疾患進行または感染を示し、かつ前記方法が被験体由来の生物学的サンプルと、請求項１６〜１８のいずれか１項に記載の１以上の抗体とを接触させること、および抗原抗体複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
【請求項３０】
結核症またはマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症を有する被験体の、前記結核症または感染症用治療化合物での治療に対する応答を決定する方法であって、前記被験体由来の生物学的サンプル中のBSXタンパク質またはその免疫原性断片もしくはエピトープを検出することを含み、該タンパク質または断片もしくはエピトープのレベルが正常または健康被験体中で検出可能なそのタンパク質または断片もしくはエピトープのレベルと比較して増大していることは、該被験体が前記治療に応答していないまたは疾患もしくは感染症を免れていないことを示し、かつ前記方法が被験体由来の生物学的サンプルと、請求項１６〜１８のいずれか１項に記載の１以上の抗体とを接触させること、および抗原抗体複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
【請求項３１】
結核症またはマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症を有する被験体の、前記結核症または感染症用治療化合物での治療に対する応答を決定する方法であって、前記被験体由来の生物学的サンプル中のBSXタンパク質またはその免疫原性断片もしくはエピトープを検出することを含み、該タンパク質または断片もしくはエピトープのレベルが結核症またはマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症を罹患している被験体中で検出可能な該タンパク質または断片もしくはエピトープのレベルよりも低いことは、該被験体が前記治療に応答しているまたは疾患もしくは感染症を免れていることを示し、かつ前記方法が被験体由来の生物学的サンプルと、請求項１６〜１８のいずれか１項に記載の１以上の抗体とを接触させること、および抗原抗体複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
【請求項３２】
被験体におけるマイコバクテリウム・ツベルクローシスによる疾患進行、治療応答性または感染状態のモニター方法であって、前記被験体由来の生物学的サンプル中のBSXタンパク質またはその免疫原性断片もしくはエピトープのレベルを異なる時点で測定することを含み、該BSXタンパク質、断片もしくはエピトープのレベルの変化は被験体における疾患進行、治療応答性または感染状態の変化を示し、かつ前記方法が被験体由来の生物学的サンプルと、請求項１６〜１８のいずれか１項に記載の１以上の抗体とを接触させること、および抗原抗体複合体の形成を検出することを含む、前記方法。
【請求項３３】
抗体がポリクローナル抗体である、請求項２９〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
抗体がモノクローナル抗体である、請求項２９〜３２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３５】
被験体が免疫低下しているまたは免疫不全である、請求項２９〜３４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３６】
被験体がHIV+である、請求項２９〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３７】
サンプルが脳、乳房、卵巣、肺、結腸、膵臓、精巣、肝臓、筋肉、骨およびその混合物からなる群より選択される組織由来の抽出物を含む、請求項２９〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３８】
サンプルが、痰、血清、血漿、全血液、唾液、尿、胸膜液およびその混合物からなる群より選択される体液を含む、請求項２９〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
サンプルが、痰、血清、血漿、全血液、唾液、尿、胸膜液およびその混合物からなる群より選択される体液由来である、請求項２９〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４０】
被験体由来の生物学的サンプルと、配列番号45に記載のアミノ酸配列を含む免疫原性BSXペプチドに結合する抗体、および配列番号1に記載のアミノ酸配列を含むマイコバクテリウム・ツベルクローシスの免疫原性BSXタンパク質に結合する抗体とを、抗原抗体複合体が形成されるのに十分な時間および条件下で接触させること、およびその後抗原抗体複合体の形成を検出することを含む、請求項２９〜３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
被験体由来の生物学的サンプルと、単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ以外のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの免疫原性タンパク質またはペプチドに結合する抗体とを接触させることをさらに含む、請求項２９〜４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
被験体由来サンプルが、マイコバクテリウム・ツベルクローシスのBSXタンパク質または１以上のその免疫原性BSXペプチド、断片もしくはエピトープに結合した免疫グロブリン(Ig)を含む１以上の循環免疫複合体を含み、かつ、抗原抗体複合体の形成を検出することが、抗Ig抗体と、該循環免疫複合体の免疫グロブリン部分とを、複合体形成に十分な時間および条件下で接触させること、およびその後結合型抗Ig抗体を検出することを含む、請求項２９〜４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
生物学的サンプル中のマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染検出用キットであって、
(i)  請求項１〜１２のいずれか１項に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープに、あるいは前記免疫原性BSXタンパク質、ペプチド、断片もしくはエピトープを含有する融合タンパク質またはタンパク質会合体に特異的に結合する１以上の単離された抗体またはその免疫反応性フラグメント、ならびに
(ii)  抗原抗体複合体の形成を検出する手段、
を含み、使用説明書と一緒に包装されているまたはされていない、前記キット。
【請求項４４】
生物学的サンプル中のマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染検出用キットであって、
(i)  請求項１〜１２のいずれか１項に記載のマイコバクテリウム・ツベルクローシスの単離または組換え免疫原性BSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドもしくは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ、ならびに
(ii)  抗原抗体複合体の形成を検出する手段、
を含み、使用説明書と一緒に包装されているまたはされていない、前記キット。
【請求項４５】
請求項１〜１２のいずれか１項に記載の単離または組換えBSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープ、あるいは前記免疫原性BSXタンパク質、ペプチド、断片もしくはエピトープを含有する融合タンパク質またはタンパク質会合体を吸着させた固体マトリックス。
【請求項４６】
請求項１〜１２のいずれか１項に記載の単離または組換えBSXタンパク質またはその免疫原性BSXペプチドまたは免疫原性BSX断片もしくはエピトープに、あるいは前記免疫原性BSXタンパク質、ペプチド、断片もしくはエピトープを含有する融合タンパク質またはタンパク質会合体に結合する抗体を吸着させた固体マトリックス。
【請求項４７】
膜を含んでなる、請求項４５または４６に記載の固体マトリックス。
【請求項４８】
膜がナイロンまたはニトロセルロースを含む、請求項４７に記載の固体マトリックス。
【請求項４９】
ポリスチレン製またはポリカーボネート製マイクロウェルプレートを含んでなる、請求項４５または４６に記載の固体マトリックス。
【請求項５０】
ディップスティックを含んでなる、請求項４５または４６に記載の固体マトリックス。
【請求項５１】
ガラス製支持体を含む、請求項４５または４６に記載の固体マトリックス。
【請求項５２】
クロマトグラフィー用樹脂を含んでなる、請求項４５または４６に記載の固体マトリックス。