【手続補正書】
【提出日】令和1年6月3日(2019.6.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
レトロウイルスが潜伏感染している宿主細胞のゲノムに組み込まれているレトロウイルスＤＮＡを不活性化することにおける使用のための組成物であって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼおよび上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡにおける標的配列に相補的な少なくとも１つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている単離された核酸を含んでおり、
上記レトロウイルスが、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）であり、
上記ｇＲＮＡが、上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡにおける標的配列に相補的な第１のｇＲＮＡ；および上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡにおける他の標的配列に相補的な第２のｇＲＮＡを少なくとも含んでおり、これによって、２つのｇＲＮＡの間にある介在配列が取り除かれる、組成物。
【請求項２】
複数の上記標的核酸配列が、上記ＨＩＶゲノムのコード核酸配列および非コード核酸配列における１つ以上の核酸配列を含んでおり、
当該１つ以上の核酸配列が、ロングターミナルリピート（ＬＴＲ）核酸配列、構造タンパク質をコードしている核酸配列、非構造タンパク質をコードしている核酸配列、またはそれらの組み合わせを含んでおり、
構造タンパク質をコードしている上記配列が、Ｇａｇ、Ｇａｇ−Ｐｏｌ前駆体、Ｐｒｏ（プロテアーゼ）、逆転写酵素（ＲＴ）、インテグラーゼ（Ｉｎ）、Ｅｎｖまたはそれらの組み合わせをコードしている核酸配列を含んでおり、
非構造タンパク質をコードしている上記配列が、制御タンパク質、アクセサリータンパク質またはこれらの組み合わせをコードしている核酸配列を含んでおり、
制御タンパク質が、Ｔａｔ、Ｒｅｖまたはそれらの組み合わせを含んでおり、
アクセサリータンパク質が、Ｎｅｆ、Ｖｐｒ、Ｖｐｕ、Ｖｉｆまたはそれらの組み合わせを含んでいる、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
ｇＲＮＡ核酸配列が、配列番号１〜５７に対する少なくとも７５％の配列同一性を有している核酸配列を含んでいる、請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
哺乳類細胞において、組み込まれているレトロウイルスＤＮＡを不活性化する方法であって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼを含んでいる遺伝子編集複合体をコードしている少なくとも１つの単離された核酸配列および上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡにおける標的配列に相補的な少なくとも１つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）を含んでいる組成物に、細胞をさらす工程；上記遺伝子編集複合体を発現させる工程；ならびに上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡを不活性化する工程を含んでおり、
上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡが、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）ＤＮＡであり、上記少なくとも１つの単離された核酸配列が、上記ＨＩＶ  ＤＮＡのＬＴＲ領域における標的核酸配列に相補的な第１のｇＲＮＡ、および上記ＨＩＶ  ＤＮＡの構造遺伝子における標的核酸配列に相補的な第２のｇＲＮＡをコードしている、方法。
【請求項５】
上記少なくとも１つのｇＲＮＡ核酸配列が、配列番号１〜５７を含んでいる核酸配列に対する少なくとも７５％の配列同一性を有している核酸配列を含んでいる、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
組み込まれているレトロウイルスＤＮＡの、哺乳類対象における不活性化のための薬学的組成物であって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼをコードしている、単離された核酸配列；およびレトロウイルスＤＮＡにおける標的配列に相補的な少なくとも１つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている、少なくとも１つの単離された核酸配列を含んでおり、上記単離された核酸配列のそれぞれが、少なくとも１つの発現ベクターに含まれており、
上記組み込まれているレトロウイルスＤＮＡが、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）ＤＮＡであり、上記ｇＲＮＡが、上記ＨＩＶ  ＤＮＡにおける第１の標的配列に相補的な第１のｇＲＮＡおよび上記ＨＩＶ  ＤＮＡにおける第２の標的配列に相補的な第２のｇＲＮＡを含んでいる、薬学的組成物。
【請求項７】
上記第１の標的配列が、上記ＨＩＶ  ＤＮＡのＬＴＲ領域に位置しており、上記第２の標的配列が、上記ＨＩＶ  ＤＮＡの構造遺伝子に位置しており、ｇＲＮＡ核酸配列が、配列番号１〜５７を含んでいる核酸配列に対する少なくとも７５％の配列同一性を有している配列を含んでいる、請求項６に記載の薬学的組成物。
【請求項８】
ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に感染している哺乳類対象を処置する方法であって、
哺乳類対象がＨＩＶに感染していることを決定する工程；請求項６に記載の薬学的組成物の有効量を投与する工程；およびＨＩＶ感染に関して上記哺乳類対象を処置する工程を含んでいる、方法。
【請求項９】
感染のリスクのある哺乳類対象におけるヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）感染のリスクを下げるための処置の方法であって、
哺乳類対象がＨＩＶ感染のリスクにさらされていることを決定する工程；請求項６に記載の薬学的組成物の有効量を投与する工程；および上記哺乳類対象におけるＨＩＶ感染のリスクを下げる工程を含んでいる、方法。
【請求項１０】
ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）感染の処置または予防のためのキットであって、
CRISPR関連エンドヌクレアーゼをコードしている少なくとも１つの単離された核酸配列およびＨＩＶゲノムにおける標的部位にそれぞれ相補的な１つ以上のガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている少なくとも１つの核酸配列；または上記単離された核酸配列の１つ以上をコードしているベクターを含んでいる組成物の適量；ならびに使用のための指示を含んでいるパッケージ挿入物、包装材料、滅菌液体、シリンジおよび滅菌容器からなる群から選択される１つ以上の物品を備えている、キット。
【請求項１１】
上記１つ以上のｇＲＮＡが、上記ＨＩＶゲノムにおける第１の標的配列に相補的な第１のｇＲＮＡおよび上記ＨＩＶゲノムにおける第２の標的配列に相補的な第２のｇＲＮＡを含んでおり、
上記第１の標的配列が上記ＨＩＶゲノムにおけるＬＴＲ領域に位置しており、上記第２の標的配列がＨＩＶゲノムにおける構造遺伝子および／または非構造遺伝子に位置している、請求項１０に記載のキット。
【請求項１２】
レトロウイルスが潜伏感染している宿主細胞のゲノムに組み込まれているプロウイルスＤＮＡを不活性化するための発現ベクターであって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼおよびプロウイルスＤＮＡにおける標的配列に相補的な少なくとも１つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている少なくとも１つの単離された核酸配列を、レトロウイルスが潜伏感染している宿主細胞のゲノムに組み込まれているプロウイルスＤＮＡを不活性化するために、含んでいる、発現ベクター。
【請求項１３】
上記ｇＲＮＡが、プロウイルスＤＮＡにおける第１の標的配列に相補的な第１のｇＲＮＡ；および当該プロウイルスＤＮＡにおける第２の標的配列に相補的な第２のｇＲＮＡを少なくとも含んでいる、請求項１２に記載の発現ベクター。
【請求項１４】
上記第１の標的配列がＨＩＶゲノムのＬＴＲ領域に位置しており、上記第２の標的配列が上記ＨＩＶゲノムの構造遺伝子および／または非構造遺伝子に位置している、請求項１３に記載の発現ベクター。
【請求項１５】
レトロウイルスが潜伏感染している宿主細胞のゲノムに組み込まれているレトロウイルスゲノムを不活性化するためのポリヌクレオチドであって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼおよび上記組み込まれているレトロウイルスゲノムにおける標的配列に相補的な少なくとも１つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている少なくとも１つの単離された核酸配列を、レトロウイルスが潜伏感染している宿主細胞のゲノムに組み込まれている上記レトロウイルスゲノムを不活性化するために、含んでいる、ポリヌクレオチド。
【請求項１６】
インビトロまたはインビボにおいてレトロウイルスを排除するための組成物であって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼおよびレトロウイルスゲノムにおける標的配列に相補的な少なくとも１つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている単離された核酸配列を含んでおり、上記レトロウイルスがヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）であり；
上記少なくとも１つのｇＲＮＡが、ＨＩＶゲノムにおける標的配列に相補的な第１のｇＲＮＡ；および当該ＨＩＶゲノムにおける他の標的配列に相補的な第２のｇＲＮＡを少なくとも含んでおり、これによって、２つのｇＲＮＡの間にある介在配列が取り除かれる、組成物。
【請求項１７】
上記標的核酸配列が、上記ＨＩＶゲノムのコード核酸配列および非コード核酸配列における１つ以上の核酸配列を含んでおり；
上記コード核酸配列における上記核酸配列が、Ｇａｇ、Ｇａｇ−Ｐｏｌ前駆体、Ｐｒｏ（プロテアーゼ）、逆転写酵素（ＲＴ）、インテグラーゼ（Ｉｎ）、Ｅｎｖ、Ｔａｔ、Ｒｅｖまたはそれらの組み合わせを含んでおり；
上記非コード核酸配列における上記核酸配列が、ロングターミナルリピート（ＬＴＲ）核酸配列、または遺伝子間ＤＮＡを含んでいる、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１８】
ｇＲＮＡ核酸配列が、配列番号１〜５７に対する少なくとも７５％の配列同一性を有している核酸配列を含んでいる、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１９】
インビトロまたはインビボにおいてレトロウイルスを排除するための組成物であって、
Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat（CRISPR）関連エンドヌクレアーゼおよびレトロウイルスゲノムにおける異なる標的配列にそれぞれ相補的な少なくとも２つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）をコードしている単離された核酸配列を含んでおり、
上記レトロウイルスは、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）であり；
上記少なくとも２つのガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）が、ＨＩＶゲノムにおける標的配列に相補的な第１のｇＲＮＡ；および当該ＨＩＶゲノムにおける他の標的配列に相補的な第２のｇＲＮＡを少なくとも含んでおり、これによって、２つのｇＲＮＡの間にある介在配列が取り除かれる、組成物。
【請求項２０】
上記標的核酸配列が、上記ＨＩＶゲノムにおけるコード核酸配列および非コード核酸配列における１つ以上の核酸配列を含んでおり；
上記コード核酸配列における核酸配列が、Ｇａｇ、Ｇａｇ−Ｐｏｌ前駆体、Ｐｒｏ（プロテアーゼ）、逆転写酵素（ＲＴ）、インテグラーゼ（Ｉｎ）、Ｅｎｖ、Ｔａｔ、Ｒｅｖまたはそれらの組み合わせを含んでおり；
上記非コード核酸配列における核酸配列が、ロングターミナルリピート（ＬＴＲ）核酸配列、または遺伝子間ＤＮＡを含んでいる、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
ｇＲＮＡ核酸配列が、配列番号１〜５７に対する少なくとも７５％の配列同一性を有している核酸配列を含んでいる、請求項１９に記載の組成物。