【手続補正書】
【提出日】平成31年2月26日(2019.2.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
割り当てられたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．ステータス、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓステータス、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．ステータスの組合せを被験体における細菌性膣炎（ＢＶ）の存在または非存在の指標とする方法であって、該割り当てられたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．ステータス、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓステータス、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．ステータスの組合せが、
（ａ）ＢＶを有することが疑われる被験体からの試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の検出のためのアッセイを行うステップ；ならびに
（ｂ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．のそれぞれに陽性または陰性のいずれかのステータスを該検出アッセイに基づいて割り当てるステップであって、
（ｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓとＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．両方について陰性のステータスが、該被験体におけるＢＶの非存在を示し、
（ｉｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓとＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．両方について陽性のステータスが、該被験体におけるＢＶの存在を示し、
（ｉｉｉ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．のステータスが陽性である場合には、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａの少なくとも一方について陰性のステータスが、該被験体におけるＢＶの非存在を示し、
（ｉｖ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．のステータスが陰性である場合には、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａの少なくとも一方について陽性のステータスが、該被験体におけるＢＶの存在を示す、ステップ
によって決定される、方法。
【請求項２】
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の検出のための前記アッセイが、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の１６Ｓ  ｒＲＮＡを標的とする、核酸に基づく検出アッセイであり、
該核酸に基づく検出アッセイが、
（ｉ）配列番号１の約９１位のヌクレオチドから約２６５位のヌクレオチドの領域に対応するＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域、
（ｉｉ）配列番号３の約９６４位のヌクレオチドから約１０３６位のヌクレオチドの領域に対応するＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ  １６Ｓ  ｒＲＮＡ領域、および／または
（ｉｉｉ）配列番号４の約１６５位のヌクレオチドから約２５９位のヌクレオチドの領域に対応するＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域
を標的とする、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．のそれぞれについての存在または非存在を決定するための多重方法であって、
（１）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の少なくとも１つを含有することが疑われる試料を、
（ａ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号７の残基２８〜４５または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー、
（ｂ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー、ならびに
（ｃ）Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマー
と接触させるステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
【請求項４】
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号６のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１２のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列を含み；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１６のヌクレオチド配列を含む、
請求項３に記載の方法。
【請求項５】
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．のそれぞれについての存在または非存在を決定するためのオリゴマーの組合せであって、
(a)Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１お
よび第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；
(b)Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ
．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー、ならびに
(c)Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および
第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマー
を含む、オリゴマーの組合せ。
【請求項６】
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列を含み；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列を含む、
請求項５に記載のオリゴマーの組合せ。
【請求項７】
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するための方法であって、
（１）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．を含有することが疑われる試料を、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーと接触させるステップであって、該第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、該第１および第２の増幅オリゴマーが、配列番号１の約９１位のヌクレオチドから約２６５位のヌクレオチドの領域に対応するＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、ステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
【請求項８】
試料中のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの存在または非存在を決定するための方法であって、
（１）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓを含有することが疑われる試料を、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーと接触させるステップであって、該第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、該第１および第２の増幅オリゴマーが、配列番号３の約９６４位のヌクレオチドから約１０３６位のヌクレオチドの領域に対応するＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ  １６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、ステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
【請求項９】
試料中のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するための方法であって、
（１）Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．を含有することが疑われる試料を、Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーと接触させるステップであって、該第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、該第１および第２の増幅オリゴマーが、配列番号４の約１６５位のヌクレオチドから約２５９位のヌクレオチドの領域に対応するＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、ステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）前記１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより前記試料中のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
【請求項１０】
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのそれぞれについての存在または非存在を決定するための多重方法であって、
（１）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの少なくとも一方を含有することが疑われる試料を、
(a)Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；ならびに
(b)Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー
と、接触させるステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
【請求項１１】
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのそれぞれについての存在または非存在を決定するためのオリゴマーの組合せであって、
(a)Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；ならびに
(b)Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー
を含む、オリゴマーの組合せ。
【請求項１２】
割り当てられたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．ステータスおよびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓステータスの組合せを被験体における細菌性膣炎（ＢＶ）の存在または非存在の指標とする方法であって、前記割り当てられたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．ステータスおよびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓステータスの組合せが、
（ａ）ＢＶを有することが疑われる被験体からの試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの検出のためのアッセイを行うステップ；ならびに
（ｂ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのそれぞれに陽性または陰性のいずれかのステータスを該検出アッセイに基づいて割り当てるステップであって、
（ｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓについて陰性のステータスが、該被験体におけるＢＶの非存在を示し、
（ｉｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのステータスが陽性である場合には、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．について陽性のステータスが該被験体におけるＢＶの非存在を示し、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．について陰性のステータスが該被験体におけるＢＶの存在を示す、ステップ
によって決定される、方法。
【請求項１３】
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸に特異的にハイブリダイズする第１の検出プローブ、および
Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸に特異的にハイブリダイズする第２の検出プローブ
を含む組成物であって、
該第１および第２の検出プローブの少なくとも一方が標識を含み、
（ｉ）いずれの真菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まず、（ｉｉ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．またはＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ以外のいずれの細菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まない、組成物。
【請求項１４】
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸に特異的にハイブリダイズする第１の検出プローブ、および
Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸に特異的にハイブリダイズする第２の検出プローブ
を含むキットであって、
該第１および第２の検出プローブの少なくとも一方が標識を含み、
（ｉ）いずれの真菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まず、（ｉｉ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．またはＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ以外のいずれの細菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まない、キット。
【請求項１５】
前記第１の検出プローブが、配列番号１の約９１位のヌクレオチドから約２６５位のヌクレオチドの領域に対応するＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とし、および／または
前記第２の検出プローブが、配列番号３の約９６４位のヌクレオチドから約１０３６位のヌクレオチドの領域に対応するＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ  １６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とし、または
該第１の検出プローブが、配列番号９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、および／または
該第２の検出プローブが、配列番号１４の残基１〜１９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、
請求項１３に記載の組成物または請求項１４に記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１５６】
以上のことから、本発明の具体的な実施形態が例示の目的のために本明細書に記載されているが、種々の改変が本発明の趣旨および範囲から逸脱することなくなされ得ることが理解される。したがって、本発明は、添付の特許請求の範囲による場合を除き、限定されるものではない。本明細書において引用された全ての刊行物、特許および特許出願は、全ての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．のそれぞれについての存在または非存在を決定するための多重方法であって、
（１）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の少なくとも１つを含有することが疑われる試料を、
（ａ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号７の残基２８〜４５または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー、
（ｂ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー、ならびに
（ｃ）Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマー
と接触させるステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
（項目２）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１に記載の方法。
（項目３）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号６のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１２のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列を含み；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１６のヌクレオチド配列を含む、
項目１に記載の方法。
（項目４）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含む、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１または３に記載の方法。
（項目５）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号６のヌクレオチド配列からなり；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１２のヌクレオチド配列からなり；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列からなり；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１６のヌクレオチド配列からなる、
項目１または３に記載の方法。
（項目６）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなる、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１、３および５のいずれかに記載の方法。
（項目７）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーの少なくとも１つが、それぞれの、標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目１〜６のいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーであり、該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含む、
項目１、３、５および７のいずれか一項に記載の方法。
（項目９）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目２、４および６のいずれかに記載の方法。
（項目１０）
前記プロモーター配列が、Ｔ７プロモーター配列である、項目７または９に記載の方法。
（項目１１）
前記プロモーター配列が、配列番号７の残基１〜２７のヌクレオチド配列を有する、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号７のヌクレオチド配列を有し；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１３のヌクレオチド配列を有し；および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１７のヌクレオチド配列を有する、
項目７に記載の方法。
（項目１３）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８のヌクレオチド配列を有する、項目９に記載の方法。
（項目１４）
ステップ（２）の前に前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸を、存在する場合、前記試料中の他の構成成分から精製するステップをさらに含む、項目１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
前記精製するステップが、前記試料を、固定化プローブに結合する配列または部分に共有結合した、標的にハイブリダイズする配列を含む少なくとも１つの捕捉プローブオリゴマーと接触させるステップを含む、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記試料を、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマー、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマー、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーと接触させ、
該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーのそれぞれが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓまたはＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸内の標的配列に特異的にハイブリダイズする、捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、
該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列のそれぞれが、前記固定化プローブに結合する前記配列または部分に共有結合されている、
項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号５の残基１〜１２のヌクレオチド配列に実質的に対応し、
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１１の残基１〜１７のヌクレオチド配列に実質的に対応し、および／または
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１５の残基１〜２１のヌクレオチド配列に実質的に対応する、
項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号５のヌクレオチド配列を有し、
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１１のヌクレオチド配列を有し、および／または
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１５のヌクレオチド配列を有する、
項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記検出するステップ（３）が、
前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブ、および前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブと接触させるステップ、ならびに
標的にハイブリダイズした任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的および／またはＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブの存在または非存在を検出するステップ
を含む、項目１〜１８のいずれかに記載の方法。
（項目２０）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４の残基１〜１９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９のヌクレオチド配列を有し；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４のヌクレオチド配列を有し；および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８のヌクレオチド配列を有する、
項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記検出するステップ（３）が、前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブと接触させるステップをさらに含み、前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０の残基６〜２１に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目２０または２１に記載の方法。
（項目２３）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０のヌクレオチド配列を有する、項目２２に記載の方法。
（項目２４）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブのそれぞれが標識を含む、項目１９または２０に記載の方法。
（項目２５）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが標識を含む、項目２２に記載の方法。
（項目２６）
前記標識が、化学発光標識または蛍光標識である、項目２４または２５に記載の方法。
（項目２７）
前記検出するステップ（３）が、前記増幅するステップ（２）の間に行われる、項目２４または２５に記載の方法。
（項目２８）
各検出プローブが、蛍光標識およびクエンチャーを含む、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
各検出プローブが、分子トーチ、分子ビーコン、またはＴａｑＭａｎ検出プローブである、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブの少なくとも１つが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目１９または２０に記載の方法。
（項目３１）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブのそれぞれが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目２２に記載の方法。
（項目３３）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
ステップ（２）での前記増幅反応が、等温増幅反応である、項目１〜３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
前記増幅反応が、転写媒介性増幅（ＴＭＡ）反応である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記増幅反応が、リアルタイム増幅反応である、項目３４または３５に記載の方法。
（項目３７）
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．のそれぞれについての存在または非存在を決定するためのオリゴマーの組合せであって、
(a)Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１お
よび第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；
(b)Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ
．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー、ならびに
(c)Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および
第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマー
を含む、オリゴマーの組合せ。
（項目３８）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記オリゴマーの組合せが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーをさらに含み、
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目３７に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目３９）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列を含み；  前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；  前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列を含み；および／または  前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列を含む、項目３７に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４０）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記オリゴマーの組合せが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーをさらに含み、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含む、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目３７または３９に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４１）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列からなり；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列からなり；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列からなり；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列からなる、
項目３７または３９に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４２）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記オリゴマーの組合せが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーをさらに含み、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなる、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目３７、３９および４１のいずれかに記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４３）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーの少なくとも１つが、それぞれの、標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目３７〜４２のいずれか一項に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４４）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、オリゴマーの組合せが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーをさらに含み、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーであり、該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含む、
項目３７、３９、４１および４３のいずれか一項に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４５）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目３８、４０および４２のいずれかに記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４６）
前記プロモーター配列が、Ｔ７プロモーター配列である、項目４３または４５に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４７）
前記プロモーター配列が、配列番号７の残基１〜２７のヌクレオチド配列を有する、項目４６に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４８）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号７のヌクレオチド配列を有し；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１３のヌクレオチド配列を有し；および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１７のヌクレオチド配列を有する、
４３に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目４９）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８のヌクレオチド配列を有する、項目４５に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５０）
固定化プローブに結合する配列または部分に共有結合した、標的にハイブリダイズする配列を含む少なくとも１つの捕捉プローブオリゴマーをさらに含む、項目３７〜４９のいずれかに記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５１）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマー、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマー、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーを含み、
該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーのそれぞれが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓまたはＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸内の標的配列に特異的にハイブリダイズする、捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、
該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列のそれぞれが、前記固定化プローブに結合する前記配列または部分に共有結合されている、
項目５０に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５２）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号５の残基１〜１２のヌクレオチド配列に実質的に対応し、
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１１の残基１〜１７のヌクレオチド配列に実質的に対応し、および／または
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１５の残基１〜２１のヌクレオチド配列に実質的に対応する、
項目５１に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５３）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号５のヌクレオチド配列を有し、
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１１のヌクレオチド配列を有し、および／または
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１５のヌクレオチド配列を有する、
項目５２に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５４）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブ、および前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブをさらに含む、項目３７〜５３のいずれかに記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５５）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４の残基１〜１９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目５４に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５６）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９のヌクレオチド配列を有し；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４のヌクレオチド配列を有し；および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８のヌクレオチド配列を有する、
項目５５に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５７）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブをさらに含み、該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０の残基６〜２１に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目５５または５６に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５８）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０のヌクレオチド配列を有する、項目５７に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目５９）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブのそれぞれが標識を含む、項目５４または５５に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６０）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが標識を含む、項目５７に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６１）
前記標識が、化学発光標識または蛍光標識である、項目５９または６０に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６２）
各検出プローブが、蛍光標識およびクエンチャーを含む、項目５９または６０に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６３）
各検出プローブが、分子トーチ、分子ビーコン、またはＴａｑＭａｎ検出プローブである、項目６２に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６４）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブの少なくとも１つが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目５４または５５に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６５）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブのそれぞれが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目６４に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６６）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目５７に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６７）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目６６に記載のオリゴマーの組合せ。
（項目６８）
被験体における細菌性膣炎（ＢＶ）の存在または非存在を決定するための方法であって、
（ａ）ＢＶを有することが疑われる被験体からの試料を用意するステップ；
（ｂ）該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の検出のためのアッセイを行うステップ；
（ｃ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．のそれぞれに陽性または陰性のいずれかのステータスを該検出アッセイに基づいて割り当てるステップ；ならびに
（ｄ）ステップ（ｃ）からの該割り当てられたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．ステータス、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓステータス、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．ステータスの組合せに基づいて該被験体におけるＢＶの存在または非存在を決定するステップであって、
（ｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓとＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．両方について陰性のステータスが、該被験体におけるＢＶの非存在を示し、
（ｉｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓとＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．両方について陽性のステータスが、該被験体におけるＢＶの存在を示し、
（ｉｉｉ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．のステータスが陽性である場合には、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａの少なくとも一方について陰性のステータスが、該被験体におけるＢＶの非存在を示し、
（ｉｖ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．のステータスが陰性である場合には、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａの少なくとも一方について陽性のステータスが、該被験体におけるＢＶの存在を示す、ステップ
を含む方法。
（項目６９）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の検出のための前記アッセイが、核酸に基づく検出アッセイである、項目６８に記載の方法。
（項目７０）
前記核酸に基づく検出アッセイが、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の１６Ｓ  ｒＲＮＡを標的とする、項目６９に記載の方法。
（項目７１）
前記核酸に基づく検出アッセイが、
（ｉ）配列番号１の約９１位のヌクレオチドから約２６５位のヌクレオチドの領域に対応するＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域、
（ｉｉ）配列番号３の約９６４位のヌクレオチドから約１０３６位のヌクレオチドの領域に対応するＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ  １６Ｓ  ｒＲＮＡ領域、および／または
（ｉｉｉ）配列番号４の約１６５位のヌクレオチドから約２５９位のヌクレオチドの領域に対応するＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域
を標的とする、項目７０に記載の方法。
（項目７２）
前記核酸に基づく検出アッセイが、増幅に基づくアッセイである、項目７０〜７１のいずれかに記載の方法。
（項目７３）
前記増幅に基づくアッセイが、等温増幅反応を含む、項目７２に記載の方法。
（項目７４）
前記増幅反応が、転写媒介性増幅（ＴＭＡ）反応である、項目７３に記載の方法。
（項目７５）
前記増幅反応が、リアルタイム増幅反応である、項目７３または７４に記載の方法。
（項目７６）
前記核酸に基づく検出アッセイが、
（１）前記試料を、
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー、ならびに
Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマー
と接触させるステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出するステップ
を含む、増幅に基づくアッセイである、項目７０に記載の方法。
（項目７７）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目７６に記載の方法。
（項目７８）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列を含み；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列を含み；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列を含む、
項目７６に記載の方法。
（項目７９）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含む、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目７６または７８に記載の方法。
（項目８０）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列からなり；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列からなり；
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列からなり；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列からなる、
項目７６または７８に記載の方法。
（項目８１）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなる、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目７６、７８および８０のいずれかに記載の方法。
（項目８２）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーの少なくとも１つが、それぞれの、標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目７６〜８１のいずれか一項に記載の方法。
（項目８３）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーであり、該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含む、
項目７６、７８、８０および８２のいずれか一項に記載の方法。
（項目８４）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目７７、７９および８１のいずれかに記載の方法。
（項目８５）
前記プロモーター配列が、Ｔ７プロモーター配列である、項目８２または８４に記載の方法。
（項目８６）
前記プロモーター配列が、配列番号７の残基１〜２７のヌクレオチド配列を有する、項目８５に記載の方法。
（項目８７）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号７のヌクレオチド配列を有し；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１３のヌクレオチド配列を有し；および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１７のヌクレオチド配列を有する、
項目８２に記載の方法。
（項目８８）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８のヌクレオチド配列を有する、項目８４に記載の方法。
（項目８９）
ステップ（２）の前に前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸を、存在する場合、前記試料中の他の構成成分から精製するステップをさらに含む、項目７６〜８８のいずれか一項に記載の方法。
（項目９０）
前記精製するステップが、前記試料を、固定化プローブに結合する配列または部分に共有結合した、標的にハイブリダイズする配列を含む少なくとも１つの捕捉プローブオリゴマーと接触させるステップを含む、項目８９に記載の方法。
（項目９１）
前記試料を、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマー、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマー、およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーと接触させ、
該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーのそれぞれが、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓまたはＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸内の標的配列に特異的にハイブリダイズする、捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、
該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的およびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列のそれぞれが、前記固定化プローブに結合する前記配列または部分に共有結合されている、
項目９０に記載の方法。
（項目９２）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号５の残基１〜１２のヌクレオチド配列に実質的に対応し、
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１１の残基１〜１７のヌクレオチド配列に実質的に対応し、および／または
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１５の残基１〜２１のヌクレオチド配列に実質的に対応する、
項目９１に記載の方法。
（項目９３）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号５のヌクレオチド配列を有し、
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１１のヌクレオチド配列を有し、および／または
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１５のヌクレオチド配列を有する、
項目９２に記載の方法。
（項目９４）
前記検出するステップ（３）が、
前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブ、および前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブと接触させるステップ、ならびに
標的にハイブリダイズした任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的および／またはＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブの存在または非存在を検出するステップ
を含む、項目７６〜９３のいずれかに記載の方法。
（項目９５）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４の残基１〜１９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目９４に記載の方法。
（項目９６）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９のヌクレオチド配列を有し；
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４のヌクレオチド配列を有し；および／または
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８のヌクレオチド配列を有する、
項目９５に記載の方法。
（項目９７）
前記検出するステップ（３）が、前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブと接触させるステップをさらに含み、前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０の残基６〜２１に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目９５または９６に記載の方法。
（項目９８）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０のヌクレオチド配列を有する、項目９７に記載の方法。
（項目９９）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブのそれぞれが標識を含む、項目９４または９５に記載の方法。
（項目１００）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが標識を含む、項目９７に記載の方法。
（項目１０１）
前記標識が、化学発光標識または蛍光標識である、項目９９または１００に記載の方法。
（項目１０２）
前記検出するステップ（３）が、前記増幅するステップ（２）の間に行われる、項目９９または１００に記載の方法。
（項目１０３）
各検出プローブが、蛍光標識およびクエンチャーを含む、項目１０２に記載の方法。
（項目１０４）
各検出プローブが、分子トーチ、分子ビーコン、またはＴａｑＭａｎ検出プローブである、項目１０３に記載の方法。
（項目１０５）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブの少なくとも１つが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目９４または９５に記載の方法。
（項目１０６）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブ、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブおよび前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブのそれぞれが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目１０５に記載の方法。
（項目１０７）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目９７に記載の方法。
（項目１０８）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目１０７に記載の方法。
（項目１０９）
ステップ（２）での前記増幅反応が、等温増幅反応である、項目７６〜１０８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１０）
前記増幅反応が、転写媒介性増幅（ＴＭＡ）反応である、項目１０９に記載の方法。
（項目１１１）
前記増幅反応が、リアルタイム増幅反応である、項目１０９または１１０に記載の方法。
（項目１１２）
ＢＶに関連する１０以下の細菌属の検出を含む、項目６８〜１１１のいずれかに記載の方法。
（項目１１３）
ＢＶに関連する５以下の細菌属の検出を含む、項目６８〜１１１のいずれかに記載の方法。
（項目１１４）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、ＧａｒｄｎｅｒｅｌｌａおよびＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ以外のＢＶに関連する細菌属の検出を含まない、項目６８〜１１１のいずれかに記載の方法。
（項目１１５）
ＢＶの存在が前記被験体において示された場合には、ＢＶのための処置レジメンを該被験体に施すステップをさらに含む、項目６８〜１１４のいずれかに記載の方法。
（項目１１６）
該被験体におけるＢＶを監視するための方法であり、該被験体がステップ（ａ）の前にＢＶのための処置レジメンを受けている、項目６８〜１１４のいずれかに記載の方法。
（項目１１７）
ＢＶの存在が前記被験体において示された場合には、（ｉ）ＢＶのための前記処置レジメンを該被験体に施すステップまたは（ｉｉ）ＢＶのための異なる処置レジメンを該被験体に施すステップのいずれかをさらに含む、項目１１６に記載の方法。
（項目１１８）
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するための方法であって、
（１）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．を含有することが疑われる試料を、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーと接触させるステップであって、該第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、該第１および第２の増幅オリゴマーが、配列番号１の約９１位のヌクレオチドから約２６５位のヌクレオチドの領域に対応するＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、ステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
（項目１１９）
（ｉ）前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、（ｉｉ）前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する、項目１１８に記載の方法。
（項目１２０）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１１８または１１９に記載の方法。
（項目１２１）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含み；および／または前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列を含む、項目１１８または１１９に記載の方法。
（項目１２２）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含む、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１１８、１１９または１２１に記載の方法。
（項目１２３）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号７の残基２８〜４５もしくは配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；および／または
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号６のヌクレオチド配列からなる、
項目１１８、１１９または１２１に記載の方法。
（項目１２４）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなる、第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目１１８、１１９、１２１または１２３のいずれかに記載の方法。
（項目１２５）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、前記第１のＬａｃｔａｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目１１８〜１２４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２６）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域を増幅させるための第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーとさらに接触させ、
該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーであり、該第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含む、
項目１１８、１１９、１２１、１２３および１２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２７）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目１２０、１２２および１２４のいずれかに記載の方法。
（項目１２８）
前記プロモーター配列が、Ｔ７プロモーター配列である、項目１２５または１２７に記載の方法。
（項目１２９）
前記プロモーター配列が、配列番号７の残基１〜２７のヌクレオチド配列を有する、項目１２８に記載の方法。
（項目１３０）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号７のヌクレオチド配列を有する、
項目１２５に記載の方法。
（項目１３１）
前記第３のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号８のヌクレオチド配列を有する、項目１２７に記載の方法。
（項目１３２）
ステップ（２）の前に前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ標的核酸を、存在する場合、前記試料中の他の構成成分から精製するステップをさらに含む、項目１１８〜１３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３３）
前記精製するステップが、前記試料を、固定化プローブに結合する配列または部分に共有結合した、標的にハイブリダイズする配列を含む少なくとも１つの捕捉プローブオリゴマーと接触させるステップを含む、項目１３２に記載の方法。
（項目１３４）
前記試料を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ標的核酸内の標的配列に特異的にハイブリダイズする、捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列を含むＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマーと接触させ、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、前記固定化プローブに結合する前記配列または部分に共有結合されている、項目１３３に記載の方法。
（項目１３５）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号５の残基１〜１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する、項目１３４に記載の方法。
（項目１３６）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号５のヌクレオチド配列を有する、
項目１３５に記載の方法。
（項目１３７）
前記検出するステップ（３）が、
前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブと接触させるステップ、および
標的にハイブリダイズした任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブの存在または非存在を検出するステップ
を含む、項目１１８〜１３６のいずれかに記載の方法。
（項目１３８）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目１３７に記載の方法。
（項目１３９）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号９のヌクレオチド配列を有する、項目１３８に記載の方法。
（項目１４０）
前記検出するステップ（３）が、前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブと接触させるステップをさらに含み、前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０の残基６〜２１に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目１３８または１３９に記載の方法。
（項目１４１）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、配列番号１０のヌクレオチド配列を有する、項目１４０に記載の方法。
（項目１４２）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが標識を含む、項目１３７または１３８に記載の方法。
（項目１４３）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが標識を含む、項目１４０に記載の方法。
（項目１４４）
前記標識が、化学発光標識または蛍光標識である、項目１４２または１４３に記載の方法。
（項目１４５）
前記検出するステップ（３）が、前記増幅するステップ（２）の間に行われる、項目１４２または１４３に記載の方法。
（項目１４６）
各検出プローブが、蛍光標識およびクエンチャーを含む、項目１４５に記載の方法。
（項目１４７）
各検出プローブが、分子トーチ、分子ビーコン、またはＴａｑＭａｎ検出プローブである、項目１４６に記載の方法。
（項目１４８）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目１３７に記載の方法。
（項目１４９）
前記第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目１３７または１３８に記載の方法。
（項目１５０）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目１４０に記載の方法。
（項目１５１）
前記第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目１４０または１５０に記載の方法。
（項目１５２）
試料中のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの存在または非存在を決定するための方法であって、
（１）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓを含有することが疑われる試料を、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーと接触させるステップであって、該第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、該第１および第２の増幅オリゴマーが、配列番号３の約９６４位のヌクレオチドから約１０３６位のヌクレオチドの領域に対応するＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ  １６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、ステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
（項目１５３）
（ｉ）前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応し、（ｉｉ）前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する、項目１５２に記載の方法。
（項目１５４）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列を含む；および／または
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列を含む、項目１５２または１５３に記載の方法。
（項目１５５）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列からなり；および／または
前記第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１２のヌクレオチド配列からなる、項目１５２〜１５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５５）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目１５２〜１５５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５６）
前記プロモーター配列が、Ｔ７プロモーター配列である、項目１５５に記載の方法。
（項目１５７）
前記プロモーター配列が、配列番号７の残基１〜２７のヌクレオチド配列を有する、項目１５６に記載の方法。
（項目１５８）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１３のヌクレオチド配列を有する、項目１５５に記載の方法。
（項目１５９）
ステップ（２）の前に前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸を、存在する場合、前記試料中の他の構成成分から精製するステップをさらに含む、項目１５２〜１５８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６０）
前記精製するステップが、前記試料を、固定化プローブに結合する配列または部分に共有結合した、標的にハイブリダイズする配列を含む少なくとも１つの捕捉プローブオリゴマーと接触させるステップを含む、項目１５９に記載の方法。
（項目１６１）
前記試料を、前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸内の標的配列に特異的にハイブリダイズする、捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列を含むＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマーと接触させ、該Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、前記固定化プローブに結合する前記配列または部分に共有結合されている、項目１６０に記載の方法。
（項目１６２）
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１１の残基１〜１７のヌクレオチド配列に実質的に対応する、項目１６１に記載の方法。
（項目１６３）
前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１１のヌクレオチド配列を有する、項目１６２に記載の方法。
（項目１６４）
前記検出するステップ（３）が、
前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブと接触させるステップ、および
標的にハイブリダイズした任意のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブの存在または非存在を検出するステップ
を含む、項目１５２〜１６３のいずれかに記載の方法。
（項目１６５）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４の残基１〜１９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目１６４に記載の方法。
（項目１６６）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、配列番号１４のヌクレオチド配列を有する、項目１６５に記載の方法。
（項目１６７）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブ検出プローブが標識を含む、項目１６４または１６５に記載の方法。
（項目１６８）
前記標識が、化学発光標識または蛍光標識である、項目１６７に記載の方法。
（項目１６９）
前記検出するステップ（３）が、前記増幅するステップ（２）の間に行われる、項目１６７に記載の方法。
（項目１７０）
前記検出プローブが、蛍光標識およびクエンチャーを含む、項目１６９に記載の方法。
（項目１７１）
前記検出プローブが、分子トーチ、分子ビーコン、またはＴａｑＭａｎ検出プローブである、項目１７０に記載の方法。
（項目１７２）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目１６４または１６５に記載の方法。
（項目１７３）
前記第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目１６４または１７２に記載の方法。
（項目１７４）
試料中のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するための方法であって、
（１）Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．を含有することが疑われる試料を、Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーと接触させるステップであって、該第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、第１および第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列をそれぞれ含み、該第１および第２の増幅オリゴマーが、配列番号４の約１６５位のヌクレオチドから約２５９位のヌクレオチドの領域に対応するＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、ステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；ならびに
（３）前記１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより前記試料中のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．の存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
（項目１７５）
（ｉ）前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列に実質的に対応し、（ｉｉ）前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１６のヌクレオチド配列に実質的に対応する、項目１７４に記載の方法。
（項目１７６）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列を含み；および／または  前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列を含む、
項目１７４または１７５に記載の方法。
（項目１７７）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１７の残基２８〜５１のヌクレオチド配列からなり；および／または
前記第２のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的な標的にハイブリダイズする配列は、配列番号１６のヌクレオチド配列からなる、
項目１７４〜１７６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７８）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、前記それぞれの標的にハイブリダイズする配列の５’側に位置するプロモーター配列をさらに含むプロモータープライマーまたはプロモータープロバイダーである、項目１７４〜１７７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７９）
前記プロモーター配列が、Ｔ７プロモーター配列である、項目１７８に記載の方法。
（項目１８０）
前記プロモーター配列が、配列番号７の残基１〜２７のヌクレオチド配列を有する、項目１７９に記載の方法。
（項目１８１）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的増幅オリゴマーが、配列番号１７のヌクレオチド配列を有する、項目１７８に記載の方法。
（項目１８２）
ステップ（２）の前に前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸を、存在する場合、前記試料中の他の構成成分から精製するステップをさらに含む、項目１７４〜１８１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８３）
前記精製するステップが、前記試料を、固定化プローブに結合する配列または部分に共有結合した、標的にハイブリダイズする配列を含む少なくとも１つの捕捉プローブオリゴマーと接触させるステップを含む、項目１８２に記載の方法。
（項目１８４）
前記試料を、前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ標的核酸内の標的配列に特異的にハイブリダイズする、捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列を含むＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーと接触させ、該Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、前記固定化プローブに結合する前記配列または部分に共有結合されている、項目１８３に記載の方法。
（項目１８５）
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブの標的にハイブリダイズする配列が、配列番号１５の残基１〜２１のヌクレオチド配列に実質的に対応する、項目１８４に記載の方法。
（項目１８６）
前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的捕捉プローブオリゴマーが、配列番号１５のヌクレオチド配列を有する、項目１８５に記載の方法。
（項目１８７）
前記検出するステップ（３）が、
前記１つまたは複数の増幅産物を、前記Ｅｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ  ｓｐ．標的領域に特異的にハイブリダイズする第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブと接触させるステップ、および
標的にハイブリダイズした任意のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブの存在または非存在を検出するステップ
を含む、項目１７４〜１８６のいずれかに記載の方法。
（項目１８８）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目１８７に記載の方法。
（項目１８９）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、配列番号１８のヌクレオチド配列を有する、項目１８８に記載の方法。
（項目１９０）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが標識を含む、項目１８７または１８８に記載の方法。
（項目１９１）
前記標識が、化学発光標識または蛍光標識である、項目１９０に記載の方法。
（項目１９２）
前記検出するステップ（３）が、前記増幅するステップ（２）の間に行われる、項目１９０に記載の方法。
（項目１９３）
前記検出プローブが、蛍光標識およびクエンチャーを含む、項目１９２に記載の方法。
（項目１９４）
前記検出プローブが、分子トーチ、分子ビーコン、またはＴａｑＭａｎ検出プローブである、項目１９３に記載の方法。
（項目１９５）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、標的にハイブリダイズしない配列をさらに含む、項目１８７に記載の方法。
（項目１９６）
前記第１のＥｇｇｅｒｔｈｅｌｌａ特異的検出プローブが、分子トーチまたは分子ビーコンである、項目１８７または１９５に記載の方法。
（項目１９７）
ステップ（２）での前記増幅反応が、等温増幅反応である、項目１１８〜１９６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９８）
前記増幅反応が、転写媒介性増幅（ＴＭＡ）反応である、項目１９７に記載の方法。
（項目１９９）
前記増幅反応が、リアルタイム増幅反応である、項目１９７または１９８に記載の方法。
（項目２００）
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのそれぞれについての存在または非存在を決定するための多重方法であって、
（１）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの少なくとも一方を含有することが疑われる試料を、
(a)Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１お
よび第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；ならびに
(b)Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ
．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー
と、接触させるステップ；
（２）ｉｎ  ｖｉｔｒｏ核酸増幅反応を行うステップであって、任意のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸が、該試料中に存在する場合、該Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的領域に対応する１つまたは複数の増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップ；な
らびに
（３）該１つまたは複数の増幅産物の存在または非存在を検出し、それにより該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの存在または非存在を決定するステップ
を含む方法。
（項目２０１）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．が前記試料中で検出されず、Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓが該試料中で検出される、項目２００に記載の方法。
（項目２０２）
Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓが、前記試料中で１．４×１０１０コピー／ｍＬより多く検出される、項目２００に記載の方法。
（項目２０３）
試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのそれぞれについての存在または非存在を決定するためのオリゴマーの組合せであって、
(a)Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸の標的領域を増幅させるための第１お
よび第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号７の残基２８〜４５のヌクレオチド配列または配列番号８の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号６のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ特異的増幅オリゴマー；ならびに
(b)Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸の標的領域を増幅させるための第１および第２のＧ
．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーであって、（ｉ）該第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１３の残基２８〜４５のヌクレオチド配列に実質的に対応する第１のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含み、（ｉｉ）該第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマーは、配列番号１２のヌクレオチド配列に実質的に対応する第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的な標的にハイブリダイズする配列を含む、第１および第２のＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ特異的増幅オリゴマー
を含む、オリゴマーの組合せ。
（項目２０４）
被験体における細菌性膣炎（ＢＶ）の存在または非存在を決定するための方法であって、
（ａ）ＢＶを有することが疑われる被験体からの試料を用意するステップ；
（ｂ）該試料中のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓの検出のためのアッセイを行うステップ；
（ｃ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．およびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのそれぞれに陽性または陰性のいずれかのステータスを該検出アッセイに基づいて割り当てるステップ；ならびに
（ｄ）ステップ（ｃ）からの該割り当てられたＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．ステータスおよびＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓステータスの組合せに基づいて該被験体におけるＢＶの存在または非存在を決定するステップであって、
（ｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓについて陰性のステータスが、該被験体におけるＢＶの非存在を示し、
（ｉｉ）Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓのステータスが陽性である場合には、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．について陽性のステータスが該被験体におけるＢＶの非存在を示し、Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．について陰性のステータスが該被験体におけるＢＶの存在を示す、ステップ
を含む方法。
（項目２０５）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸に特異的にハイブリダイズする第１の検出プローブ、および
Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸に特異的にハイブリダイズする第２の検出プローブ
を含む組成物であって、
該第１および第２の検出プローブの少なくとも一方が標識を含み、
（ｉ）いずれの真菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まず、（ｉｉ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．またはＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ以外のいずれの細菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まない、組成物。
（項目２０６）
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸に特異的にハイブリダイズする第１の検出プローブ、および
Ｇ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ標的核酸に特異的にハイブリダイズする第２の検出プローブ
を含むキットであって、
該第１および第２の検出プローブの少なくとも一方が標識を含み、
（ｉ）いずれの真菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まず、（ｉｉ）Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．またはＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ以外のいずれの細菌種からの標的核酸に特異的にハイブリダイズする検出プローブも含まない、キット。
（項目２０７）
前記第１の検出プローブが、Ｌ．ｇａｓｓｅｒｉ標的核酸、Ｌ．ｃｒｉｓｐａｔｕｓ標的核酸およびＬ．ｊｅｎｓｅｎｉｉ標的核酸の少なくとも１つに特異的にハイブリダイズする、項目２０５に記載の組成物または項目２０６に記載のキット。
（項目２０８）
前記第１の検出プローブが、配列番号１の約９１位のヌクレオチドから約２６５位のヌクレオチドの領域に対応するＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．１６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とし、および／または
前記第２の検出プローブが、配列番号３の約９６４位のヌクレオチドから約１０３６位のヌクレオチドの領域に対応するＧ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ  １６Ｓ  ｒＲＮＡ領域を標的とする、
項目２０５に記載の組成物または項目２０６に記載のキット。
（項目２０９）
前記第１の検出プローブが、配列番号９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含み、および／または
前記第２の検出プローブが、配列番号１４の残基１〜１９に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、
項目２０５に記載の組成物または項目２０６に記載のキット。
（項目２１０）
前記第１の検出プローブが、配列番号９のヌクレオチド配列を有し、および／または
前記第２の検出プローブが、配列番号１４のヌクレオチド配列を有する、
項目２０５に記載の組成物または項目２０６に記載のキット。
（項目２１１）
前記Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．標的核酸に特異的にハイブリダイズする第３の検出プローブをさらに含み、該第３の検出プローブが、配列番号１０の残基６〜２１に実質的に対応する、標的にハイブリダイズする配列を含む、項目２０９または２１０に記載の組成物またはキット。
（項目２１２）
前記第３の検出プローブが、配列番号１０のヌクレオチド配列を有する、項目２１１に記載の組成物またはキット。