【手続補正書】
【提出日】令和1年8月6日(2019.8.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＮＲＲＬ  Ｂ−６７０７８として寄託されている単離オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
【請求項２】
作動可能に結合しているベクターを含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１であって、
ａ．目的配列をコードする核酸を植物細胞にＶｉｒＤ２に依存した方法で導入するように作用するｖｉｒ遺伝子領域を含む第１の核酸と；
ｂ．目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２の核酸と
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
【請求項３】
前記第１の核酸および前記第２の核酸は、
（ａ）単一のポリヌクレオチド分子上にあるか、もしくは
（ｂ）別個のポリヌクレオチド分子上にあり、
かつ／または選択マーカー遺伝子をさらに含み、好ましくは、前記選択マーカー遺伝子は、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシン、またはスペクチノマイシンに対する耐性を付与する、かつ／または前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子であり、より好ましくは、
（ｉ）前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉ）前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉｉ）前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｖ）前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｖ）前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有し、
かつ／または前記選択マーカー遺伝子は、
（ｖｉ）テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない、
（ｖｉｉ）ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない、または
（ｖｉｉｉ）対抗選択マーカー遺伝子であり、好ましくは、前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子であり、
かつ／または前記ｖｉｒ遺伝子領域は、
（ａ）それぞれ配列番号４〜１４、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１、あるいは、それぞれ配列番号８０〜９０、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｂ）それぞれ配列番号１６〜１７、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、あるいは、それぞれ配列番号９２〜９３、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子を含む、
（ｃ）それぞれ配列番号１８〜１９、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、あるいは、それぞれ配列番号９４〜９５、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｄ）配列番号１５、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＧ、あるいは、配列番号９１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＧを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｅ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦ、またはその変異体および誘導体の１つ以上を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含み、好ましくは、
（ｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号２６、または変異体および誘導体を有するｖｉｒＡ、あるいは、配列番号７９、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＡビルレンス遺伝子であり、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５は、それぞれ配列番号２０〜２２、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは前記ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号９６〜９８、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｉｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＥ１〜Ｅ３は、それぞれ配列番号２３〜２５、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは前記ｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子は、配列番号１００、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｉｖ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＨ〜Ｈ１は、それぞれ配列番号４２〜４３、またはその変異体および誘導体を有する、
（ｖ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＫは、配列番号４５、またはその変異体および誘導体を有する、
（ｖｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＬは、配列番号４６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｖｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＭは、配列番号４７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｖｉｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＰは、配列番号４８、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｘ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＱは、配列番号４９、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｘ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｖｉｒＥ１〜Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、または
（ｘｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３〜Ｄ５、およびｖｉｒＥ１−Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
請求項２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
【請求項４】
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含み、好ましくは、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、およびその変異体または誘導体に由来し、より好ましくは、
（ａ）Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｂ）ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｃ）ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｄ）Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含み、好ましくは、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、
（ｉ）高コピー数複製起点である、
（ｉｉ）中コピー数複製起点である、
（ｉｉｉ）低コピー数複製起点である、
（ｉｖ）ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来し、好ましくは、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、
（ａ）ｐＲＫ２複製起点の変異体である、
（ｂ）前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する、
（ｃ）前記ｐＶＳ１複製起点に由来する、
（ｄ）前記ｐＳａ複製起点に由来する、または
（ｅ）配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｖ）ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点であり、好ましくは、前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点、ならびに、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点であり、好ましくは、前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来し、より好ましくは、
（ａ）前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｂ）前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｃ）前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｄ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミクロｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｅ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｆ）前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含み、好ましくは、前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む、
かつ／またはｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含み、好ましくは、前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する、
請求項２または３に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
【請求項５】
形質転換植物細胞の作製方法であって、
ａ．植物細胞を、作動可能に結合している、ｖｉｒ遺伝子領域を含む第１の核酸と、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２の核酸とを含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１と接触させる工程と；
ｂ．オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）が目的配列を前記植物細胞に形質転換させることができる条件下で、前記植物細胞を培養する工程と；
ｃ．ゲノム中に前記目的配列を含む形質転換植物細胞を同定する工程と
を含む方法。
【請求項６】
（ａ）ゲノム中に前記目的配列を含む植物を再生する工程をさらに含み、好ましくは、前記植物細胞からの植物の再生は、前記植物細胞を含む外植体から１つ以上のシュートの形成を誘発し、少なくとも最初のシュートを稔性植物全体に育成することを含み、より好ましくは、植物の再生は、組織形成によって起こる、
かつ／または
前記植物細胞は、
（ｉ）単子葉植物または双子葉植物由来である、または
（ｉｉ）ダイズ、タバコ、ヒマワリ、シロイロナズナ属（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ）、ベニバナ、アルファルファ、トウモロコシ、コムギ、コメ、オオムギ、オートムギ、キビ、キャノーラ、アブラナ属（Ｂｒａｓｓｉｃａ）、ワタおよびサトウキビからなる群から選択される植物由来であり、
かつ／または前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、前記植物細胞に接触させる前に、アセトシリンゴンまたはｖｉｒもしくはｒ−ｖｉｒ遺伝子機能を誘発する他の化合物の存在下で増殖させる、
かつ／または前記植物細胞は、植物の種子、苗、カルス、細胞懸濁液、子葉、分裂組織、葉、根または茎からの外植体に含まれており、前記外植体を前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）と接触させ、好ましくは、前記外植体は、胚性分裂組織、体細胞分裂組織、カルス、細胞懸濁液、子葉、子葉節、または、葉、根もしくは茎の組織を含む、
（ｂ）目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の非存在下に行われる、
（ｃ）目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の存在下に前記植物細胞を培養することを含み、前記目的配列は、前記選択剤に対する耐性を与えるか、または前記選択剤に対する耐性を与える選択マーカーと共に送達され、好ましくは、
（ｉ）前記選択剤は、クロルスルフロン、エタメツルフロン、イマザピル、グリホサート、カナマイシン、スペクチノマイシン、ビアラホス、２，４−Ｄまたはジカンバである、または
（ｉｉ）前記目的配列は、選択マーカー遺伝子に物理的に結合しておらず、より好ましくは、前記マーカー遺伝子および前記目的配列は、前記目的配列を含む前記植物細胞から再生された植物の子孫においては、遺伝子的に分離している、
（ｄ）前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、第２の目的配列を含む第３の核酸を含み、前記形質転換細胞は、そのゲノム中に前記第２の目的配列を含む、
（ｅ）前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、選択マーカーをさらに含み、好ましくは、前記選択マーカーは、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシン、またはスペクチノマイシンに対する耐性を付与する、かつ／または前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子であり、より好ましくは、
（ｉ）前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉ）前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉｉ）前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｖ）前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｖ）前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記選択マーカー遺伝子は、
（ｖｉ）テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない、
（ｖｉｉ）ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない、または
（ｖｉｉｉ）対抗選択マーカー遺伝子であり、好ましくは、前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である、
かつ／または前記ｖｉｒ遺伝子領域は、
（ａ）それぞれ配列番号４〜１４、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１、あるいは、それぞれ配列番号８０〜９０、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｂ）それぞれ配列番号１６〜１７、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、あるいは、それぞれ配列番号９２〜９３、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子を含む、
（ｃ）それぞれ配列番号１８〜１９、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、あるいは、それぞれ配列番号９４〜９５、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｄ）配列番号１５、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＧ、あるいは、配列番号９１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＧを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、または
（ｅ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦまたはその変異体および誘導体の１種以上を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含み、好ましくは、
（ｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号２６、または変異体および誘導体を有するｖｉｒＡ、あるいは、配列番号７９、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＡビルレンス遺伝子であり、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５は、それぞれ配列番号２０〜２２、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５は、それぞれ配列番号９６〜９８、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
（ｉｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＥ１〜Ｅ３は、それぞれ配列番号２３〜２５、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは前記ｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子は、配列番号１００、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む
（ｉｖ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＨ〜Ｈ２は、それぞれ配列番号４２〜４３、またはその変異体および誘導体を有する、
（ｖ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号４５、またはその変異体および誘導体を有する、
（ｖｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＬは、配列番号４６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｖｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＭは、配列番号４７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｖｉｉｉ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＰは、配列番号４８、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｘ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＱは、配列番号４９、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｘ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｖｉｒＥ１〜Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、または
（ｘｉ）前記ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３〜Ｄ５、およびｖｉｒＥ１−Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む、
請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含み、好ましくは、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、およびその変異体または誘導体に由来し、より好ましくは、
（ａ）Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｂ）ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｃ）ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｃ）Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含み、好ましくは、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、
（ｉ）高コピー数複製起点である、
（ｉｉ）中コピー数複製起点である、
（ｉｉｉ）低コピー数複製起点である、
（ｉｖ）ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来し、好ましくは、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、
（ａ）ｐＲＫ２複製起点の変異体である、
（ｂ）前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する、
（ｃ）前記ｐＶＳ１複製起点に由来する、
（ｄ）前記ｐＳａ複製起点に由来する、
（ｅ）配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｖ）ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点であり、好ましくは、前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点、ならびに、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点であり、好ましくは、前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来し、より好ましくは、
（ａ）前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｂ）前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｃ）前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｄ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミクロｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｅ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含み、好ましくは、前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む、
かつ／またはｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含み、好ましくは、前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する、
請求項５または６に記載の方法。
【請求項８】
第１のベクターであって、作動可能に結合している、
ａ）エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｂ）オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｃ）選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１もしくはｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｖｉｒＣ１〜Ｃ２もしくはｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｖｉｒＤ１〜Ｄ２もしくはｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、およびｖｉｒＧもしくはｒ−ｖｉｒＧ、またはその変異体および誘導体（ここで、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２およびｒ−ｖｉｒＧを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む）
を含むベクターと；
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
【請求項９】
（Ａ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号４〜１４、またはその変異体および誘導体を有するｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１、あるいは、それぞれ配列番号８０〜９０、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１である、
（Ｂ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号１６〜１７、またはその変異体および誘導体を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２、あるいは、それぞれ配列番号９２〜９３、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２である、
（Ｃ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号１８〜１９、またはその変異体および誘導体を有するｖｉｒＤ１〜ｖｉｒＤ２、あるいは、それぞれ配列番号９４〜９５、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２である、
（Ｄ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号１５、または変異体および誘導体を有するｖｉｒＧ、あるいは、配列番号９１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＧである、
（Ｅ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子、ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦ、またはその変異体および誘導体の１種以上をさらに含む、
かつ／またはエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、あるいはその変異体または誘導体に由来し、好ましくは、
（ｉ）Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉ）ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉｉ）ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｉｖ）Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、
（ａ）高コピー数複製起点である、
（ｂ）中コピー数複製起点である、
（ｃ）低コピー数複製起点である、
（ｄ）ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来し、好ましくは、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点の変異体である
（ｅ）配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントである、
（ｆ）ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点であり、好ましくは、前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点であり、好ましくは、前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来し、より好ましくは、
（ｉ）前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する
（ｉｉ）前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する
（ｉｉｉ）前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する
（ｉｖ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニもしくはミクロｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する
（ｖ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含み、好ましくは、前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む、
かつ／またはｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含み、好ましくは、前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記選択マーカーは、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシンまたはスペクチノマイシンに対する耐性を付与し、好ましくは、前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子であり、より好ましくは、
（ａ）前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｂ）前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｃ）前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｄ）前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｅ）前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記選択マーカー遺伝子は、
（ｆ）テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない、
（ｇ）ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない、または
（ｈ）対抗選択マーカー遺伝子であり、好ましくは、前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である、
かつ／または前記第１のベクターは、配列番号６１、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
かつ／または前記第１のベクターは、配列番号６２、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
かつ／または前記第１のベクターは、ｔｒａオペロン配列もしくはｔｒｂオペロン配列、またはその変異体もしくはフラグメントを含まず、好ましくは、前記第１のベクターは、配列番号６３、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
（Ｆ）前記第１のベクターは、配列番号３４、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（Ｇ）前記第１のベクターは、配列番号３５、またはその変異体およびフラグメントを含まない、または
（Ｈ）前記第１のベクターは、配列番号３６、またはその変異体およびフラグメントを含まない、
請求項８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
【請求項１０】
オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１であって、
（Ａ）作動可能に結合している、
ａ．配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖のための複製起点、ｂ．配列番号３、またはその変異体およびフラグメントを有するオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖維持のための複製起点、
ｃ．配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ．アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種のビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜１９を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９５を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含むビルレンス遺伝子を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含む、
（Ｂ）作動可能に結合している、
ａ．配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖のための複製起点、
ｂ．配列番号３、またはその変異体およびフラグメントを有するオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖維持のための複製起点、
ｃ．配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ．アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種のビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜２２を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ５ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９８を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、およびそれぞれ配列番号２３〜２５を有するｖｉｒＥ１〜Ｅ３ビルレンス遺伝子、もしくは、配列番号１００を有するｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、ｒ−ｖｉｒＥ３、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む配列
を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含む、あるいは
（Ｃ）作動可能に結合している、
ａ．配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖のための複製起点、
ｂ．配列番号３、またはその変異体およびフラグメントを有するオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖維持のための複製起点、
ｃ．配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ．アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種のビルレンス遺伝子、配列番号２６を有するｖｉｒＡビルレンス遺伝子、もしくは配列番号７９を有するｒ−ｖｉｒＡビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜２２を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ５ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９８を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、およびそれぞれ配列番号２３〜２５を有するｖｉｒＥ１〜Ｅ３ビルレンス遺伝子、もしくは、配列番号１００を有するｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、および配列番号２７を有するｖｉｒＪビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、ｒ−ｖｉｒＥ３、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む配列
を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含む、
オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
【請求項１１】
形質転換植物細胞の作製方法であって、
作動可能に結合している、
ａ）エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｂ）オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｃ）選択マーカー遺伝子；ならびに
ｄ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜１９を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９５を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体（ここで、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む）
を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターとを含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１と植物細胞を接触させる工程と；
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）が目的配列を前記植物細胞に形質転換させることができる条件下で、前記植物細胞を培養する工程と；
ゲノム中に前記目的配列を含む形質転換植物細胞を同定する工程と
を含む方法。
【請求項１２】
（ａ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１は、それぞれ配列番号４〜１４、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１は、それぞれ配列番号８０〜９０、もしくはその変異体および誘導体を有する、
（ｂ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＣ１〜Ｃ２は、それぞれ配列番号１６〜１７、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２は、それぞれ配列番号９２〜９３、もしくはその変異体および誘導体を有する、
（ｃ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ１〜ｖｉｒＤ２は、それぞれ配列番号１８〜１９、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２は、それぞれ配列番号９４〜９５、もしくはその変異体および誘導体を有する、
（ｄ）前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＧは、配列番号１５、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＧは、配列番号９１、もしくはその変異体および誘導体を有する、または
（ｅ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦ、またはその変異体および誘導体の１種以上をさらに含む、
かつ／またはエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、あるいはその変異体または誘導体に由来し、好ましくは、
（ｉ）ＣｏｌＥ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉ）ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉｉ）ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｉｖ）Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、
（ａ）高コピー数複製起点である、
（ｂ）中コピー数複製起点である、
（ｃ）低コピー数複製起点である、
（ｄ）ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来する、
（ｅ）ｐＲＫ２複製起点の変異体である、
（ｆ）配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｇ）ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点であり、好ましくは、前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／またはエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点、ならびに、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点であり、好ましくは、前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来し、より好ましくは、
（ｉ）前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉ）前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉｉ）前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｖ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミクロｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｖ）前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点であり、好ましくは、前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含み、好ましくは、前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む、
かつ／またはｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含み、好ましくは、前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記選択マーカーは、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシンまたはスペクチノマイシンに対する耐性を付与し、好ましくは、前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子であり、より好ましくは、
（ａ）前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｂ）前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｃ）前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｄ）前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する、または
（ｅ）前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する、
かつ／または前記選択マーカー遺伝子は、
（ｆ）テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない、
（ｇ）ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない、または
（ｈ）対抗選択マーカー遺伝子であり、好ましくは、前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である、
かつ／または前記第１のベクターは、配列番号６１、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
かつ／または前記第１のベクターは、配列番号６２、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
かつ／または前記第１のベクターは、ｔｒａオペロン配列もしくはｔｒｂオペロン配列、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
かつ／または前記第１のベクターは、配列番号６３、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない、
かつ／または
（ｉ）前記第１のベクターは、配列番号３４、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉ）前記第１のベクターは、配列番号３５、またはその変異体およびフラグメントを有する、
（ｉｉｉ）前記第１のベクターは、配列番号３６、またはその変異体およびフラグメントを有する、
請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
（Ａ）ゲノム中に前記目的配列を含む植物を再生する工程をさらに含み、好ましくは、前記植物細胞からの植物の再生は、前記植物細胞を含む外植体から１つ以上のシュートの形成を誘発し、少なくとも最初のシュートを稔性植物全体に育成することを含み、より好ましくは、植物の再生は、組織形成によって起こる、
かつ／または前記植物細胞は、
（ａ）単子葉植物または双子葉植物由来である、または
（ｂ）ダイズ、タバコ、ヒマワリ、シロイロナズナ属（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ）、ベニバナ、アルファルファ、トウモロコシ、コムギ、コメ、オオムギ、オートムギ、キビ、キャノーラ、アブラナ属（Ｂｒａｓｓｉｃａ）、ワタおよびサトウキビからなる群から選択される植物由来である、
かつ／または前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、前記植物細胞に接触させる前に、アセトシリンゴンまたはｖｉｒもしくはｒ−ｖｉｒ遺伝子機能を誘発する他の化合物の存在下で増殖させる、
かつ／または前記植物細胞は、植物の種子、苗、カルス、細胞懸濁液、子葉、分裂組織、葉、根または茎からの外植体に含まれており、前記外植体を前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）と接触させ、好ましくは、前記外植体は、胚性分裂組織、体細胞分裂組織、カルス、細胞懸濁液、子葉、子葉節、または、葉、根もしくは茎の組織を含む、
（Ｂ）前記目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の非存在下に行われる、
（Ｃ）前記目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の存在下に前記植物細胞を培養することを含み、前記目的配列は、前記選択剤に対する耐性を与えるか、または前記選択剤に対する耐性を与える選択マーカーと共に供給され、好ましくは、前記選択剤は、クロルスルフロン、エタメツルフロン、イマザピル、グリホサート、カナマイシン、スペクチノマイシン、ビアラホス、２，４−Ｄまたはジカンバである、
（Ｄ）前記目的配列は、選択マーカー遺伝子に物理的に結合しておらず、好ましくは、前記マーカー遺伝子および前記目的配列は、前記目的配列を含む前記植物細胞から再生された植物の子孫においては、遺伝子的に分離している、または
（Ｅ）前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、作動可能に結合している、第２の目的配列を含む第３のベクターをさらに含む、
請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
（ａ）請求項２〜４または８〜１０のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）；および
（ｂ）植物の形質転換に使用するための説明書
を含むキット。
【請求項１５】
配列番号３４、３５、３６、１０６、１１３もしくは１１４、またはその変異体および誘導体のいずれか１つを含む請求項２、８、１０および１１のいずれか一項に記載のベクター。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３９】
本特許または本出願書類は、少なくとも１つのカラーで作成された図面を含む。カラー図面を有する本特許または本特許出願公開物のコピーは、請求があり、必要な料金が支払われば、特許庁から提供されるであろう。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
ＮＲＲＬ  Ｂ−６７０７８として寄託されている単離オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
（項目２）
作動可能に結合しているベクターを含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１であって、
ａ．目的配列をコードする核酸を植物細胞にＶｉｒＤ２に依存した方法で導入するように作用するｖｉｒ遺伝子領域を含む第１の核酸と；
ｂ．目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２の核酸と
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
（項目３）
前記第１の核酸および前記第２の核酸は、単一のポリヌクレオチド分子上にある項目２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４）
前記第１の核酸および前記第２の核酸は、別個のポリヌクレオチド分子上にある項目２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５）
選択マーカー遺伝子をさらに含む項目２〜４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６）
前記選択マーカー遺伝子は、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシン、またはスペクチノマイシンに対する耐性を付与する項目５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子である項目５または６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目８）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子である項目５〜７のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目９）
前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５〜８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１０）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｄＡ遺伝子である項目５〜９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１１）
前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５〜１０のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１２）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ１遺伝子である項目５〜１１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１３）
前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５〜１２のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１４）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ２遺伝子である項目５〜１３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１５）
前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５〜１４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１６）
前記選択マーカー遺伝子は、ｈｐｔ遺伝子である項目５〜１５のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７）
前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５〜１６のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８）
前記選択マーカー遺伝子は、テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない項目５〜１７のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９）
前記選択マーカー遺伝子は、ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない項目５〜１８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０）
前記選択マーカー遺伝子は、対抗選択マーカー遺伝子である項目５〜１９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１）
前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である項目２０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、それぞれ配列番号４〜１４、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１、あるいは、それぞれ配列番号８０〜９０、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２〜２１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２３）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、それぞれ配列番号１６〜１７、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、あるいは、それぞれ配列番号９２〜９３、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子を含む項目２〜２１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２４）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、それぞれ配列番号１８〜１９、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、あるいは、それぞれ配列番号９４〜９５、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２〜２１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２５）
前記遺伝子ｖｉｒ遺伝子領域は、配列番号１５、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＧ、あるいは、配列番号９１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＧを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２〜２１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２６）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦ、またはその変異体および誘導体の１つ以上を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２〜２１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２７）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号２６、または変異体および誘導体を有するｖｉｒＡ、あるいは、配列番号７９、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＡビルレンス遺伝子であり、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２８）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５は、それぞれ配列番号２０〜２２、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは前記ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号９６〜９８、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２９）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＥ１〜Ｅ３は、それぞれ配列番号２３〜２５、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは前記ｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子は、配列番号１００、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３０）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＨ〜Ｈ１は、それぞれ配列番号４２〜４３、またはその変異体および誘導体を有する項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３１）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＫは、配列番号４５、またはその変異体および誘導体を有する項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３２）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＬは、配列番号４６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３３）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＭは、配列番号４７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３４）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＰは、配列番号４８、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３５）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＱは、配列番号４９、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３６）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｖｉｒＥ１〜Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３７）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３〜Ｄ５、およびｖｉｒＥ１−Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目２６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３８）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含む項目２〜３７のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目３９）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、およびその変異体または誘導体に由来する項目３８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４０）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来する項目３９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４１）
Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目４０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４２）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＳＣ１０１複製起点に由来する項目３９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４３）
ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目４２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４４）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐ１５Ａ複製起点に由来する項目３９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４５）
ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目４４に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４６）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｒ６Ｋ複製起点に由来する項目３９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４７）
Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目４６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４８）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含む項目２〜４７のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目４９）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、高コピー数複製起点である項目４８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５０）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、中コピー数複製起点である項目４８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５１）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、低コピー数複製起点である項目４８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５２）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来する項目４８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５３）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点の変異体である項目５２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５４）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種は、前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目５２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５５）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、前記ｐＶＳ１複製起点に由来する項目５２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５６）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、前記ｐＳａ複製起点に由来する項目５２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５７）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５８）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点である項目４８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目５９）
前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目５８に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６０）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点、ならびに、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点である項目３８〜５９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６１）
前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目６０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６２）
前記複製起点は、前記ｐＲＫ２複製起点に由来する項目６０または６１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６３）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する項目６２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６４）
前記複製起点は、前記ｐＳａ複製起点に由来する項目６０または６１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６５）
前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する項目６４に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６６）
前記複製起点は、ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目６０または６１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６７）
前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目６６に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６８）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニもしくはミクロｐＲＫ２複製起点である項目６０〜６２のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目６９）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミクロｐＲＫ２複製起点である項目６０〜６２および６８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７０）
前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する項目６９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７１）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点である項目６０〜６２および６８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７２）
前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目７１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７３）
前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含む項目６０〜６２および６８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７４）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む項目７３に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７５）
ｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含む項目６０〜７４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７６）
前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する項目７５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目７７）
形質転換植物細胞の作製方法であって、
ａ．植物細胞を、作動可能に結合している、ｖｉｒ遺伝子領域を含む第１の核酸と、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２の核酸とを含むオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）と接触させる工程と；
ｂ．オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）が目的配列を前記植物細胞に形質転換させることができる条件下で、前記植物細胞を培養する工程と；
ｃ．ゲノム中に前記目的配列を含む形質転換植物細胞を同定する工程と
を含む方法。
（項目７８）
ゲノム中に前記目的配列を含む植物を再生する工程をさらに含む項目７７に記載の方法。
（項目７９）
前記植物細胞は、単子葉植物または双子葉植物由来である項目７７または７８に記載の方法。
（項目８０）
前記植物細胞は、ダイズ、タバコ、ヒマワリ、シロイロナズナ属（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ）、ベニバナ、アルファルファ、トウモロコシ、コムギ、コメ、オオムギ、オートムギ、キビ、キャノーラ、アブラナ属（Ｂｒａｓｓｉｃａ）、ワタおよびサトウキビからなる群から選択される植物由来である項目７７または７８に記載の方法。
（項目８１）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、前記植物細胞に接触させる前に、アセトシリンゴンまたはｖｉｒもしくはｒ−ｖｉｒ遺伝子機能を誘発する他の化合物の存在下で増殖させる項目７７〜８０のいずれか一項に記載の方法。
（項目８２）
前記植物細胞は、植物の種子、苗、カルス、細胞懸濁液、子葉、分裂組織、葉、根または茎からの外植体に含まれており、前記外植体を前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）と接触させる項目７７〜８１のいずれか一項に記載の方法。
（項目８３）
前記外植体は、胚性分裂組織、体細胞分裂組織、カルス、細胞懸濁液、子葉、子葉節、または、葉、根もしくは茎の組織を含む項目８２に記載の方法。
（項目８４）
目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の非存在下に行われる項目７７に記載の方法。
（項目８５）
目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の存在下に前記植物細胞を培養することを含み、前記目的配列は、前記選択剤に対する耐性を与えるか、または前記選択剤に対する耐性を与える選択マーカーと共に送達される項目７７に記載の方法。
（項目８６）
前記選択剤は、クロルスルフロン、エタメツルフロン、イマザピル、グリホサート、カナマイシン、スペクチノマイシン、ビアラホス、２，４−Ｄまたはジカンバである項目８５に記載の方法。
（項目８７）
前記目的配列は、選択マーカー遺伝子に物理的に結合していない項目８５に記載の方法。
（項目８８）
前記マーカー遺伝子および前記目的配列は、前記目的配列を含む前記植物細胞から再生された植物の子孫においては、遺伝子的に分離している項目８７に記載の方法。
（項目８９）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、第２の目的配列を含む第３の核酸を含み、前記形質転換細胞は、そのゲノム中に前記第２の目的配列を含む
項目７７に記載の方法。
（項目９０）
前記植物細胞からの植物の再生は、前記植物細胞を含む外植体から１つ以上のシュートの形成を誘導し、少なくとも最初のシュートを稔性植物全体に育成することを含む項目７８に記載の方法。
（項目９１）
再生は、組織形成によって起こる項目９０に記載の方法。
（項目９２）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１、オクロバクテリウム・サイティシ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｃｙｔｉｓｉ）、オクロバクテリウム・デジョネンス（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｄａｅｊｅｏｎｅｎｓｅ）、オクロバクテリウム・ルピネ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｌｕｐｉｎｅ）、オクロバクテリウム・オリゼ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｏｒｙｚａｅ）、オクロバクテリウム・トリティシ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｔｒｉｔｉｃｉ）、ＬＢＮＬ１２４−Ａ−１０、ＨＴＧ３−Ｃ−０７およびオクロバクテリウム・ペクトリス（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｐｅｃｔｏｒｉｓ）からなる群から選択される項目７７〜９１のいずれか一項に記載の方法。
（項目９３）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、選択マーカーをさらに含む項目７７に記載の方法。
（項目９４）
前記選択マーカーは、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシン、またはスペクチノマイシンに対する耐性を付与する項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子である項目９３または９４に記載の方法。
（項目９６）
前記選択マーカー遺伝子はａａｃＣ１遺伝子である項目９３〜９５のいずれか一項に記載の方法。
（項目９７）
前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目９３〜９６のいずれか一項に記載の方法。
（項目９８）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｄＡ遺伝子である項目９３〜９７のいずれか一項に記載の方法。
（項目９９）
前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する項目９３〜９８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１００）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ１遺伝子である項目９３〜９９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０１）
前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目９３〜１００のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０２）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ２遺伝子である項目９３〜１０１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０３）
前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目９３〜１０２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０４）
前記選択マーカー遺伝子は、ｈｐｔ遺伝子である項目９３〜１０３のいずれか一項に記載の方法。．
（項目１０５）
前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目９３〜１０４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０６）
前記選択マーカー遺伝子は、テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない項目９３〜１０５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０７）
前記選択マーカー遺伝子は、ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない項目９３〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０８）
前記選択マーカー遺伝子は、対抗選択マーカー遺伝子である項目９３〜１０７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０９）
前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である項目１０８に記載の方法。
（項目１１０）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、それぞれ配列番号４〜１４、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１、あるいは、それぞれ配列番号８０〜９０、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目７７〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１１）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、それぞれ配列番号１６〜１７、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、あるいは、それぞれ配列番号９２〜９３、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子を含む項目７７〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１２）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、それぞれ配列番号１８〜１９、またはその変異体および誘導体を有するリゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、あるいは、それぞれ配列番号９４〜９５、またはその変異体および誘導体を有するビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目７７〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１３）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、配列番号１５、またはその変異体および誘導体を有する、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＧ、あるいは、配列番号９１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＧを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目７７〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１４）
前記ｖｉｒ遺伝子領域は、リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦまたはその変異体および誘導体の１種以上を含み、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目７７〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１５）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号２６、または変異体および誘導体を有するｖｉｒＡ、あるいは、配列番号７９、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＡビルレンス遺伝子であり、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目１１４に記載の方法。
（項目１１６）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５は、それぞれ配列番号２０〜２２、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５は、それぞれ配列番号９６〜９８、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目１１４に記載の方法。
（項目１１７）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＥ１〜Ｅ３は、それぞれ配列番号２３〜２５、またはその変異体および誘導体を有し、あるいは前記ｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子は、配列番号１００、またはその変異体および誘導体を有し、前記ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目１１４に記載の方法。
（項目１１８）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＨ〜Ｈ２は、それぞれ配列番号４２〜４３、またはその変異体および誘導体を有する項目１１４に記載の方法。
（項目１１９）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号４５、またはその変異体および誘導体を有する項目１１４に記載の方法。
（項目１２０）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＬは、配列番号４６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１１４に記載の方法。
（項目１２１）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＭは、配列番号４７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１１４に記載の方法。
（項目１２２）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＰは、配列番号４８、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１１４に記載の方法。
（項目１２３）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＱは、配列番号４９、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１１４に記載の方法。
（項目１２４）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｖｉｒＥ１〜Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目１１４に記載の方法。
（項目１２５）
前記ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３〜Ｄ５、およびｖｉｒＥ１−Ｅ３、またはその変異体およびフラグメント、あるいは、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３〜Ｄ５およびｒ−ｖｉｒＥ３を含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む項目１１４に記載の方法。
（項目１２６）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含む項目７７〜１２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２７）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、およびその変異体または誘導体に由来する項目１２６に記載の方法。
（項目１２８）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来する項目１２７に記載の方法。
（項目１２９）
Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１２８に記載の方法。
（項目１３０）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＳＣ１０１複製起点に由来する項目１２７に記載の方法。
（項目１３１）
ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１３０に記載の方法。．
（項目１３２）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐ１５Ａ複製起点に由来する項目１２７に記載の方法。
（項目１３３）
ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１３２に記載の方法。
（項目１３４）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｒ６Ｋ複製起点に由来する項目１２７に記載の方法。
（項目１３５）
Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１３４に記載の方法。
（項目１３６）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための複製起点をさらに含む項目７７〜１３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３７）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、高コピー数複製起点である項目１３６に記載の方法。
（項目１３８）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、中コピー数複製起点である項目１３６に記載の方法。
（項目１３９）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、低コピー数複製起点である項目１３６に記載の方法。
（項目１４０）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来する項目１３６に記載の方法。
（項目１４１）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点の変異体である項目１４０に記載の方法。
（項目１４２）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種は、前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目１４０に記載の方法。
（項目１４３）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、前記ｐＶＳ１複製起点に由来する項目１４０に記載の方法。
（項目１４４）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、前記ｐＳａ複製起点に由来する項目１４０に記載の方法。
（項目１４５）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１４０に記載の方法。
（項目１４６）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点である項目１３６に記載の方法。
（項目１４７）
前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１４６に記載の方法。
（項目１４８）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点、ならびに、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点である項目１２６〜１４７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４９）
前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目１４８に記載の方法。
（項目１５０）
前記複製起点は、前記ｐＲＫ２複製起点に由来する項目１４８または１４９に記載の方法。
（項目１５１）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１５０に記載の方法。
（項目１５２）
前記複製起点は、前記ｐＳａ複製起点に由来する項目１４８または１４９に記載の方法。
（項目１５３）
前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１５２に記載の方法。
（項目１５４）
前記複製起点は、ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目１４８または１４９に記載の方法。
（項目１５５）
前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１５４に記載の方法。
（項目１５６）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニもしくはミクロｐＲＫ２複製起点である項目１４９〜１５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５７）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミクロｐＲＫ２複製起点である項目１４９〜１５１および１５６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５８）
前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１５７に記載の方法。
（項目１５９）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点である項目１４９〜１５１および１５６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６０）
前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１５９に記載の方法。
（項目１６１）
前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含む項目１４９〜１５１および１５６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６２）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む項目１６１に記載の方法。
（項目１６３）
ｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含む項目１３６〜１６２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６４）
前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６３に記載の方法。
（項目１６５）
第１のベクターであって、作動可能に結合している、
ａ）エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｂ）オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｃ）選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１もしくはｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｖｉｒＣ１〜Ｃ２もしくはｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｖｉｒＤ１〜Ｄ２もしくはｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、およびｖｉｒＧもしくはｒ−ｖｉｒＧ、またはその変異体および誘導体（ここで、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２およびｒ−ｖｉｒＧを含む前記ベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む）
を含むベクターと；
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
（項目１６６）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号４〜１４、またはその変異体および誘導体を有するｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１、あるいは、それぞれ配列番号８０〜９０、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１である項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１６７）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号１６〜１７、またはその変異体および誘導体を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２、あるいは、それぞれ配列番号９２〜９３、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２である項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１６８）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、それぞれ配列番号１８〜１９、またはその変異体および誘導体を有するｖｉｒＤ１〜ｖｉｒＤ２、あるいは、それぞれ配列番号９４〜９５、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２である項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１６９）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子は、配列番号１５、または変異体および誘導体を有するｖｉｒＧ、あるいは、配列番号９１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｖｉｒＧである項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７０）
リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子、ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦ、またはその変異体および誘導体の１種以上をさらに含む項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７１）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、あるいはその変異体または誘導体に由来する項目１６５〜１７０のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７２）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来する項目１６５〜１７１のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７３）
Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６５〜１７２のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７４）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＳＣ１０１複製起点に由来する項目１６５〜１７３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７５）
ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６５〜１７４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７６）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐ１５Ａ複製起点に由来する項目１６５〜１７５のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７７）
ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６５〜１７６のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７８）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｒ６Ｋ複製起点に由来する項目１６５〜１７７のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１７９）
Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６５〜１７８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８０）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、高コピー数複製起点である項目１６５〜１７９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８１）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、中コピー数複製起点である項目１６５〜１７９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８２）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、低コピー数複製起点である項目１６５〜１７９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８３）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来する項目１６５〜１７９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８４）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点の変異体である項目１６５〜１７９および１８３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８５）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目１６５〜１７９および１８３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８６）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＶＳ１複製起点に由来する項目１６５〜１７９および１８３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８７）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＳａ複製起点に由来する項目１６５〜１７９および１８３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８８）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６５〜１７９および１８３のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１８９）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点である項目１６５〜１７９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９０）
前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１８９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９１）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点である項目１６５〜１７０のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９２）
前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目１９１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９３）
前記複製起点は、前記ｐＲＫ２複製起点に由来する項目１９１または１９２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９４）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１９３に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９５）
前記複製起点は、前記ｐＳａ複製起点に由来する項目１９１または１９２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９６）
前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１９５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９７）
前記複製起点は、ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目１９１または１９２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９８）
前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１９７に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目１９９）
前記複製起点は、前記ｐＲＫ２複製起点に由来する項目１９１または１９２に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２００）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニもしくはミクロｐＲＫ２複製起点である項目１９２〜１９４および１９９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０１）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニもしくはミクロｐＲＫ２複製起点である項目１９２〜１９４および１９９〜２００のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０２）
前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２０１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０３）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点である項目１９２〜１９４および１９９〜２００のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０４）
前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２０３に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０５）
前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含む項目１９２〜１９４および１９９〜２０４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０６）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む項目２０５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０７）
ｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含む項目１８０〜２０６のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０８）
前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２０７に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２０９）
前記選択マーカーは、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシンまたはスペクチノマイシンに対する耐性を付与する項目１６５〜２０８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１０）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子である項目２０９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１１）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子である項目２１０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１２）
ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２１１に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１３）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｄＡ遺伝子である項目２１０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１４）
前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２１３に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１５）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ１遺伝子である項目２１０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１６）
前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２１５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１７）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ２遺伝子である項目２１０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１８）
前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２１７に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２１９）
前記選択マーカー遺伝子は、ｈｐｔ遺伝子である項目２１０に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２０）
前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２１９に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２１）
前記選択マーカー遺伝子は、テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない項目１６５〜２０８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２２）
前記選択マーカー遺伝子は、ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない項目１６５〜２０８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２３）
前記選択マーカー遺伝子は、対抗選択マーカー遺伝子である項目１６５〜２０８のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２４）
前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である項目２２３に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２５）
前記第１のベクターは、配列番号６１、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目１６５〜２２４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２６）
前記第１のベクターは、配列番号６２、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目１６５〜２２５のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２７）
前記第１のベクターは、ｔｒａオペロン配列もしくはｔｒｂオペロン配列、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目１６５〜２２６のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２８）
前記第１のベクターは、配列番号６３、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目２２７に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２２９）
前記第１のベクターは、配列番号３４、またはその変異体およびフラグメントを有する項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２３０）
前記第１のベクターは、配列番号３５、またはその変異体およびフラグメントを含まない項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２３１）
前記第１のベクターは、配列番号３６、またはその変異体およびフラグメントを含まない項目１６５に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２３２）
オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１であって、
作動可能に結合している、
ａ．配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖のための複製起点、ｂ．配列番号３、またはその変異体およびフラグメントを有するオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖維持のための複製起点、
ｃ．配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ．アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種のビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜１９を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９５を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含むビルレンス遺伝子を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
（項目２３３）
オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１であって、
作動可能に結合している、
ａ．配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖のための複製起点、
ｂ．配列番号３、またはその変異体およびフラグメントを有するオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖維持のための複製起点、
ｃ．配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ．アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種のビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜２２を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ５ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９８を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、およびそれぞれ配列番号２３〜２５を有するｖｉｒＥ１〜Ｅ３ビルレンス遺伝子、もしくは、配列番号１００を有するｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、ｒ−ｖｉｒＥ３、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む配列
を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
（項目２３４）
オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１であって、
作動可能に結合している、
ａ．配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖のための複製起点、
ｂ．配列番号３、またはその変異体およびフラグメントを有するオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖維持のための複製起点、
ｃ．配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する選択マーカー遺伝子、ならびに
ｄ．アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）種のビルレンス遺伝子、配列番号２６を有するｖｉｒＡビルレンス遺伝子、もしくは配列番号７９を有するｒ−ｖｉｒＡビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜２２を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ５ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９８を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、およびそれぞれ配列番号２３〜２５を有するｖｉｒＥ１〜Ｅ３ビルレンス遺伝子、もしくは、配列番号１００を有するｒ−ｖｉｒＥ３ビルレンス遺伝子、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、および配列番号２７を有するｖｉｒＪビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体を含み、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ５、ｒ−ｖｉｒＥ３、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む配列
を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターと
を含むオクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ）Ｈ１。
（項目２３５）
形質転換植物細胞の作製方法であって、
作動可能に結合している、
ａ）エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｂ）オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための複製起点、
ｃ）選択マーカー遺伝子；ならびに
ｄ）リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号４〜１４を有するｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号８０〜９０を有するｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１６〜１７を有するｖｉｒＣ１〜Ｃ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９２〜９３を有するｒ−ｖｉｒＣ１−Ｃ２ビルレンス遺伝子、それぞれ配列番号１８〜１９を有するｖｉｒＤ１〜Ｄ２ビルレンス遺伝子、もしくはそれぞれ配列番号９４〜９５を有するｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、および配列番号１５を有するｖｉｒＧビルレンス遺伝子、もしくは配列番号９１を有するｒ−ｖｉｒＧビルレンス遺伝子、またはその変異体および誘導体（ここで、ビルレンス遺伝子ｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１、ｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２、ｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２、およびｒ−ｖｉｒＧを含むベクターは、配列番号１０１、またはその変異体および誘導体を有するｒ−ｇａｌｌｓビルレンス遺伝子をさらに含む）
を含む第１のベクターと、
作動可能に結合している、目的配列に作動可能に結合する１つ以上のＴ−ＤＮＡボーダー配列を含む第２のベクターとを含むオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）と植物細胞を接触させる工程と；
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）が目的配列を前記植物細胞に形質転換させることができる条件下で、前記植物細胞を培養する工程と；
ゲノム中に前記目的配列を含む形質転換植物細胞を同定する工程と
を含む方法。
（項目２３６）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＢ１〜ｖｉｒＢ１１は、それぞれ配列番号４〜１４、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＢ１〜Ｂ１１は、それぞれ配列番号８０〜９０、もしくはその変異体および誘導体を有する項目２３５に記載の方法。
（項目２３７）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＣ１〜Ｃ２は、それぞれ配列番号１６〜１７、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＣ１〜Ｃ２は、それぞれ配列番号９２〜９３、もしくはその変異体および誘導体を有する項目２３５に記載の方法。
（項目２３８）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＤ１〜ｖｉｒＤ２は、それぞれ配列番号１８〜１９、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＤ１〜Ｄ２は、それぞれ配列番号９４〜９５、もしくはその変異体および誘導体を有する項目２３５に記載の方法。
（項目２３９）
前記リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＧは、配列番号１５、もしくはその変異体および誘導体を有し、またはｒ−ｖｉｒＧは、配列番号９１、もしくはその変異体および誘導体を有する項目２３５に記載の方法。
（項目２４０）
リゾビウム（Ｒｈｉｚｏｂｉａｃｅａｅ）ビルレンス遺伝子ｖｉｒＡ、ｖｉｒＤ３、ｖｉｒＤ４、ｖｉｒＤ５、ｖｉｒＥ１、ｖｉｒＥ２、ｖｉｒＥ３、ｖｉｒＨ、ｖｉｒＨ１、ｖｉｒＨ２、ｖｉｒＫ、ｖｉｒＬ、ｖｉｒＭ、ｖｉｒＰ、ｖｉｒＱ、ｒ−ｖｉｒＡ、ｒ−ｖｉｒＤ３、ｒ−ｖｉｒＤ４、ｒ−ｖｉｒＤ５、ｒ−ｖｉｒＥ３もしくはｒ−ｖｉｒＦ、またはその変異体および誘導体の１種以上をさらに含む項目２３５に記載の方法。
（項目２４１）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１、ｐＳＣ１０１、ｐ１５ＡまたはＲ６Ｋ複製起点、あるいはその変異体または誘導体に由来する項目２３５〜２４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４２）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｃｏｌ  Ｅ１複製起点に由来する項目２３５〜２４１のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４３）
ＣｏｌＥ１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４４）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＳＣ１０１複製起点に由来する項目２３５〜２４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４５）
ｐＳＣ１０１複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２４４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４６）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐ１５Ａ複製起点に由来する項目２３５〜２４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４７）
ｐ１５Ａ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２４６のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４８）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、Ｒ６Ｋ複製起点に由来する項目２３５〜２４７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４９）
Ｒ６Ｋ複製起点に由来するエシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号５２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２４８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５０）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、高コピー数複製起点である項目２３５〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５１）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、中コピー数複製起点である項目２３５〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５２）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、低コピー数複製起点である項目２３５〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５３）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲｉ、ｐＶＳ１、ｐＲＦＳ１０１０、ｐＲＫ２、ｐＳａまたはｐＢＢＲ１複製起点に由来する項目２３５〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５４）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点の変異体である項目２３５〜２４９および２５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５５）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目２３５〜２４９および２５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５６）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＶＳ１複製起点に由来する項目２３５〜２４９および２５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５７）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｐＳａ複製起点に由来する項目２３５〜２４９および２５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５８）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、配列番号３、３７、３８、５３、５７、５８、５９、６０もしくは１１２、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２４９および２５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５９）
オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点である項目２３５〜２４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６０）
前記ｒｅｐＡＢＣ適合複製起点は、配列番号５７、５８、５９もしくは６０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２５９に記載の方法。
（項目２６１）
エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）における増殖および安定した維持のための前記複製起点、ならびに、オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）種における増殖および安定した維持のための前記複製起点は、同じ複製起点である項目２３５〜２４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６２）
前記複製起点は、ｐＲＫ２複製起点、ｐＳａ複製起点、またはｐＲＦＳ１０１０複製起点に由来する項目２６１１９１に記載の方法。
（項目２６３）
前記複製起点は、前記ｐＲＫ２複製起点に由来する項目２６１または２６２に記載の方法。
（項目２６４）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号３８、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６３に記載の方法。
（項目２６５）
前記複製起点は、前記ｐＳａ複製起点に由来する項目２６１または２６２に記載の方法。
（項目２６６）
前記ｐＳａ複製起点は、配列番号５３、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６５に記載の方法。
（項目２６７）
前記複製起点は、前記ｐＲＦＡ１０１０複製起点に由来する項目２６１または２６２に記載の方法。
（項目２６８）
前記ｐＲＦＳ１０１０複製起点は、配列番号３７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２６７に記載の方法。
（項目２６９）
前記複製起点は、前記ｐＲＫ２複製起点に由来する項目２６１または２６２に記載の方法。
（項目２７０）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニもしくはミクロｐＲＫ２複製起点である項目２６２〜２６４および２６９のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）。
（項目２７１）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミクロｐＲＫ２複製起点である項目２６２〜２６４および２６９〜２７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７２）
前記ミクロｐＲＫ２複製起点は、配列番号５４、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２７１に記載の方法。
（項目２７３）
前記ｐＲＫ２複製起点は、ミニｐＲＫ２複製起点である項目２６２〜２６４および２６９〜２７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７４）
前記ミニｐＲＫ２は、配列番号６６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２７３に記載の方法。
（項目２７５）
前記ｐＲＫ２複製起点は、前記ｔｒｆＡおよびＯｒｉＶ配列を含む項目２６２〜２６４および２６９〜２７４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７６）
前記ｐＲＫ２複製起点は、配列番号６４および６５、またはその変異体およびフラグメントを含む項目２７５に記載の方法。
（項目２７７）
ｐａｒ  ＤＥオペロン由来の配列をさらに含む項目２５０〜２７６のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７８）
前記ｐａｒ  ＤＥオペロンは、配列番号５５、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２７７に記載の方法。
（項目２７９）
前記選択マーカーは、ゲンタマイシン、ネオマイシン／カナマイシン、ヒグロマイシンまたはスペクチノマイシンに対する耐性を付与する項目２３５〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２８０）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子、ｎｐｔ１遺伝子、ｎｐｔ２遺伝子、ｈｐｔ遺伝子、ＳｐｃＮ遺伝子、ａｐｈ遺伝子またはａａｄＡ遺伝子である項目２７９に記載の方法。
（項目２８１）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｃＣ１遺伝子である項目２８０に記載の方法。
（項目２８２）
前記ａａｃＣ１遺伝子は、配列番号１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２８１に記載の方法。
（項目２８３）
前記選択マーカー遺伝子は、ａａｄＡ遺伝子である項目２８０に記載の方法。
（項目２８４）
前記ａａｄＡ遺伝子は、配列番号３９、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２８３に記載の方法。
（項目２８５）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ１遺伝子である項目２８０に記載の方法。
（項目２８６）
前記ｎｐｔ１遺伝子は、配列番号４０、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２８５に記載の方法。
（項目２８７）
前記選択マーカー遺伝子は、ｎｐｔ２遺伝子である項目２８０に記載の方法。
（項目２８８）
前記ｎｐｔ２遺伝子は、配列番号４１、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２８７に記載の方法。
（項目２８９）
前記選択マーカー遺伝子は、ｈｐｔ遺伝子である項目２８０に記載の方法。
（項目２９０）
前記ｈｐｔ遺伝子は、配列番号６７、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２８９に記載の方法。
（項目２９１）
前記選択マーカー遺伝子は、テトラサイクリン選択マーカー遺伝子ではない項目２３５〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９２）
前記選択マーカー遺伝子は、ｔｅｔＡＲ遺伝子ではない項目２３５〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９３）
前記選択マーカー遺伝子は、対抗選択マーカー遺伝子である項目２３５〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９４）
前記対抗選択マーカー遺伝子は、ｓａｃＢ遺伝子、ｒｐｓＬ（ｓｔｒＡ）遺伝子、ｐｈｅＳ遺伝子、ｄｈｆｒ（ｆｏｌＡ）遺伝子、ｌａｃＹ遺伝子、Ｇａｔａ−１遺伝子、ｃｃｄＢ遺伝子またはｔｈｙＡ遺伝子である項目２９３に記載の方法。
（項目２９５）
前記第１のベクターは、配列番号６１、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目２３５〜２９４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９６）
前記第１のベクターは、配列番号６２、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目２３５〜２９５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９７）
前記第１のベクターは、ｔｒａオペロン配列もしくはｔｒｂオペロン配列、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目２３５〜２９６のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９８）
前記第１のベクターは、配列番号６３、またはその変異体もしくはフラグメントを含まない項目２３５または２９７に記載の方法。
（項目２９９）
前記第１のベクターは、配列番号３４、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２９８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３００）
前記第１のベクターは、配列番号３５、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２９８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０１）
前記第１のベクターは、配列番号３６、またはその変異体およびフラグメントを有する項目２３５〜２９８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０２）
ゲノム中に前記目的配列を含む植物を再生する工程をさらに含む項目２３５に記載の方法。
（項目３０３）
前記植物細胞は、単子葉植物または双子葉植物由来である項目２３５または３０２に記載の方法。
（項目３０４）
前記植物細胞は、ダイズ、タバコ、ヒマワリ、シロイロナズナ属（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ）、ベニバナ、アルファルファ、トウモロコシ、コムギ、コメ、オオムギ、オートムギ、キビ、キャノーラ、アブラナ属（Ｂｒａｓｓｉｃａ）、ワタおよびサトウキビからなる群から選択される植物由来である項目２３５または３０２に記載の方法。
（項目３０５）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、前記植物細胞に接触させる前に、アセトシリンゴンまたはｖｉｒもしくはｒ−ｖｉｒ遺伝子機能を誘発する他の化合物の存在下で増殖させる項目２３５〜３０４のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０６）
前記植物細胞は、植物の種子、苗、カルス、細胞懸濁液、子葉、分裂組織、葉、根または茎からの外植体に含まれており、前記外植体を前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）と接触させる項目２３５および３０３〜３０５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０７）
前記外植体は、胚性分裂組織、体細胞分裂組織、カルス、細胞懸濁液、子葉、子葉節、または、葉、根もしくは茎の組織を含む項目３０６に記載の方法。
（項目３０８）
前記目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の非存在下に行われる項目２３５に記載の方法。
（項目３０９）
前記目的配列を含む植物細胞を同定する工程は、選択剤の存在下に前記植物細胞を培養することを含み、前記目的配列は、前記選択剤に対する耐性を与えるか、または前記選択剤に対する耐性を与える選択マーカーと共に供給される項目２３５に記載の方法。
（項目３１０）
前記選択剤は、クロルスルフロン、エタメツルフロン、イマザピル、グリホサート、カナマイシン、スペクチノマイシン、ビアラホス、２，４−Ｄまたはジカンバである項目３０９に記載の方法。
（項目３１１）
前記目的配列は、選択マーカー遺伝子に物理的に結合していない項目２３５に記載の方法。
（項目３１２）
前記マーカー遺伝子および前記目的配列は、前記目的配列を含む前記植物細胞から再生された植物の子孫においては、遺伝子的に分離している項目３１１に記載の方法。
（項目３１３）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、作動可能に結合している、第２の目的配列を含む第３のベクターをさらに含む項目２３５に記載の方法。
（項目３１４）
前記植物細胞からの植物の再生は、前記植物細胞を含む外植体から１つ以上のシュートの形成を誘発し、少なくとも最初のシュートを稔性植物全体に育成することを含む項目３０２に記載の方法。
（項目３１５）
植物の再生は、組織形成によって起こる項目３１４に記載の方法。
（項目３１６）
前記オクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）は、オクロバクテリウム・ハイバルデンセ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｈａｙｗａｒｄｅｎｓｅ  Ｈ１）、オクロバクテリウム・サイティシ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｃｙｔｉｓｉ）、オクロバクテリウム・デジョネンス（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｄａｅｊｅｏｎｅｎｓｅ）、オクロバクテリウム・ルピネ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｌｕｐｉｎｅ）、オクロバクテリウム・オリゼ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｏｒｙｚａｅ）、オクロバクテリウム・トリティシ（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｔｒｉｔｉｃｉ）、ＬＢＮＬ１２４−Ａ−１０、ＨＴＧ３−Ｃ−０７およびオクロバクテリウム・ペクトリス（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ  ｐｅｃｔｏｒｉｓ）からなる群から選択される項目２３５〜３１５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３１７）
（ａ）項目２〜７６および１６５〜２３４のいずれか一項に記載のオクロバクテリウム（Ｏｃｈｒｏｂａｃｔｒｕｍ）；および
（ｂ）植物の形質転換に使用するための説明書
を含むキット。
（項目３１８）
配列番号３４、３５、３６、１０６、１１３もしくは１１４、またはその変異体および誘導体のいずれか１つを含む項目２、１６５、２３２、２３３、２３４および２３５のいずれか一項に記載のベクター。