【手続補正書】
【提出日】平成20年4月18日(2008.4.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
組成物であって、
ブドウ球菌ポリ−Ｎ−アセチルグルコサミン（ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ）と選択的に結合し、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲのアミノ酸配列を含む単離ペプチド、または機能的に等価なその改変体を含む、組成物。
【請求項２】
請求項１に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲが、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３である、組成物。
【請求項３】
請求項２に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、配列番号９、配列番号１５、および配列番号２１からなる群から選択されるＨ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項４】
請求項２に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項５】
請求項２に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、配列番号１２、配列番号１８、および配列番号２４からなる群から選択されるＬ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６】
請求項２に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項７】
請求項１に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲが、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ２である、組成物。
【請求項８】
請求項７に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ２が、配列番号８、配列番号１１、配列番号１４、配列番号１７、配列番号２０、および配列番号２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、組成物。
【請求項９】
請求項７に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ２が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＣＤＲ２のアミノ酸配列番号を含む、組成物。
【請求項１０】
請求項１に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲが、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ１である、組成物。
【請求項１１】
請求項１０に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ１が、配列番号７、配列番号１０、配列番号１３、配列番号１６、配列番号１９、および配列番号２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、組成物。
【請求項１２】
請求項１０に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ１が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＣＤＲ１のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項１３】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、配列番号１、配列番号３、および配列番号５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項１４】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項１５】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、配列番号２、配列番号４、および配列番号６からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項１６】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域のアミノ酸配列含む、組成物。
【請求項１７】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、単離抗体または抗体フラグメントである、組成物。
【請求項１８】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来する、組成物。
【請求項１９】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、インタクトな可溶性モノクローナル抗体である、組成物。
【請求項２０】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、Ｆ（ａｂ’）２フラグメント、Ｆｄフラグメント、およびＦａｂフラグメントからなる群から選択される単離抗体フラグメントである、組成物。
【請求項２１】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、ＰＮＡＧ発現細菌株のオプソニン食菌作用を向上させる、組成物。
【請求項２２】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、ＰＮＡＧ発現ブドウ球菌のオプソニン食菌作用を向上させる、組成物。
【請求項２３】
請求項２２に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ発現ブドウ球菌が、Ｓ．ａｕｒｅｕｓまたはＳ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓである、組成物。
【請求項２４】
請求項２１に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ発現細菌株が、ＰＮＡＧ発現Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｒａｌｓｔｏｎｉａ  ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ（Ｒ．ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ）、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、またはＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａである、組成物。
【請求項２５】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、
Ｈ鎖ＣＤＲを含み、配列番号１、配列番号３、および配列番号５からなる群から選択されるアミノ酸配列、ならびに
Ｌ鎖ＣＤＲを含み、配列番号２、配列番号４、および配列番号６からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項２６】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体および抗体フラグメントが、
受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、およびＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域を含むアミノ酸配列、ならびに
受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、およびＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域を含むアミノ酸配列
を含む、組成物。
【請求項２７】
請求項２５に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、配列番号１のアミノ酸配列、および配列番号２のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項２８】
請求項２５に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、配列番号３のアミノ酸配列、および配列番号４のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項２９】
請求項２５に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、配列番号５のアミノ酸配列、および配列番号６のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項３０】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３１（Ｆ５９８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列、および受託番号ＰＴＡ−５９３１（Ｆ５９８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項３１】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３２（Ｆ６２８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列、および受託番号ＰＴＡ−５９３２（Ｆ６２８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項３２】
請求項１７に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３３（Ｆ６３０）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列、および受託番号ＰＴＡ−５９３３（Ｆ６３０）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項３３】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、検出可能な標識と結合体化している、組成物。
【請求項３４】
請求項３１に記載の組成物であって、前記検出可能な標識が、インビボで検出可能な標識である、組成物。
【請求項３５】
請求項１に記載の組成物であって、さらに薬学的に受容可能なキャリアを含む、組成物。
【請求項３６】
請求項３５に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、ＰＮＡＧ発現細菌株によって感染を阻害するための有効量で存在する、組成物。
【請求項３７】
請求項３６に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ発現細菌株が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｒａｌｓｔｏｎｉａ  ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ（Ｒ．ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ）、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、およびＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａからなる群から選択される、組成物。
【請求項３８】
請求項３５に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、ブドウ球菌感染を阻害するための有効量で存在する、組成物。
【請求項３９】
請求項３５に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、被験体中のサンプル中、または被験体からのサンプル中のＰＮＡＧ発現細菌株を検出するための有効量で存在する、組成物。
【請求項４０】
請求項３９に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ発現細菌株が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｒａｌｓｔｏｎｉａ  ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ（Ｒ．ｓｏｌａｎａｃｅａｒｕｍ）、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、およびＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａからなる群から選択される、組成物。
【請求項４１】
請求項３５に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、被験体中のサンプル中、または被験体からのサンプル中のブドウ球菌を検出するための有効量で存在する、組成物。
【請求項４２】
請求項４１に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌が、Ｓ．ａｕｒｅｕｓまたはＳ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓである、組成物。
【請求項４３】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、ブドウ球菌ＰＮＡＧと選択的に結合する、組成物。
【請求項４４】
請求項１に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、ブドウ球菌ｄＰＮＡＧと選択的に結合する、組成物。
【請求項４５】
被験体におけるＰＮＡＧ発現細菌株を検出するためのインビトロ方法であって、
単離ペプチドまたは機能的に等価なその改変体の、被験体由来のサンプルへの結合の試験レベルを決定する工程、ならびに
該結合の試験レベルを対照と比較する工程であって、
該単離ペプチドまたは機能的に等価なその改変体が、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧと選択的に結合し、かつブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲを含み、そして
該対照よりも大きな結合の試験レベルが、サンプル中のＰＮＡＧ発現細菌株の存在を示す、工程
を包含する、方法。
【請求項４６】
請求項４５に記載の方法であって、前記ＰＮＡＧ発現細菌株が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、およびＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａからなる群から選択される、方法。
【請求項４７】
請求項４６に記載の方法であって、前記方法が被験体におけるブドウ球菌を検出するための方法であり、
単離ペプチドまたは機能的に等価なその改変体の、被験体由来のサンプルへの結合の試験レベルを決定する工程、ならびに
該結合の試験レベルを対照と比較する工程であって、
該単離ペプチドまたは機能的に等価なその改変体が、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧと選択的に結合し、かつブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲを含み、そして
該対照よりも大きな結合の試験レベルが、サンプル中のブドウ球菌の存在を示す、工程を包含する、方法。
【請求項４８】
請求項４７に記載の方法であって、前記ブドウ球菌が、Ｓ．ａｕｒｅｕｓまたはＳ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓである、方法。
【請求項４９】
請求項４６または請求項４７に記載の方法であって、前記単離ペプチドが、検出可能な標識と結合体化している、方法。
【請求項５０】
請求項４９に記載の方法であって、前記検出可能な標識が、インビボで検出可能な標識である、方法。
【請求項５１】
請求項４６または請求項４７に記載の方法であって、前記結合の試験レベルが、インビトロで測定される、方法。
【請求項５２】
ＰＮＡＧ発現細菌株に感染しているか、またはＰＮＡＧ発現細菌株による感染を顕出する危険性のある被験体を処置するための組成物であって、
ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧと選択的に結合し、かつブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲを含む単離ペプチドまたは機能的に等価なその改変体
を、該感染を阻害するための有効量含む、組成物。
【請求項５３】
請求項５２に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ発現細菌株が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、およびＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａからなる群から選択される、組成物。
【請求項５４】
請求項５２に記載の組成物であって、該組成物は、ブドウ球菌に感染しているか、またはブドウ球菌感染を顕出する危険性のある被験体を処置するための組成物であり、該組成物は、
ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧと選択的に結合し、かつブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲを含む単離ペプチドまたは機能的に等価なその改変体
を、ブドウ球菌感染を阻害するための有効量含む、組成物。
【請求項５５】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲが、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３である、組成物。
【請求項５６】
請求項５５に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、配列番号９、配列番号１５、および配列番号２１からなる群から選択されるＨ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項５７】
請求項５５に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、配列番号１２、配列番号１８、および配列番号２４からなる群から選択されるＬ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項５８】
請求項５５に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ３が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖ＣＤＲ３のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項５９】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲが、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ２である、組成物。
【請求項６０】
請求項５９に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ２が、配列番号８、配列番号１１、配列番号１４、配列番号１７、配列番号２０、および配列番号２３からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、組成物。
【請求項６１】
請求項５９に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ２が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖ＣＤＲ２のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６２】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲが、ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ１である、組成物。
【請求項６３】
請求項６２に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ１が、配列番号７、配列番号１０、配列番号１３、配列番号１６、配列番号１９、および配列番号２２からなる群から選択されるアミノ酸配列を有する、組成物。
【請求項６４】
請求項６２に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲ１が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖ＣＤＲ１のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６５】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、配列番号１、配列番号３、および配列番号５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６６】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６７】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、配列番号２、配列番号４、および配列番号６からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６８】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項６９】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、単離抗体または抗体フラグメントである、組成物。
【請求項７０】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマから産生される、組成物。
【請求項７１】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、インタクトな可溶性モノクローナル抗体である、組成物。
【請求項７２】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、Ｆ（ａｂ’）２フラグメント、Ｆｄフラグメント、およびＦａｂフラグメントからなる群から選択される単離抗体フラグメントである、組成物。
【請求項７３】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、
Ｈ鎖ＣＤＲを含み、かつ配列番号１、配列番号３、および配列番号５からなる群から選択されるアミノ酸配列、ならびに
Ｌ鎖ＣＤＲを含み、かつ配列番号２、配列番号４、および配列番号６からなる群から選択されるアミノ酸配列
を含む、組成物。
【請求項７４】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、
受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域を含むアミノ酸配列、および
受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域を含むアミノ酸配列
を含む、組成物。
【請求項７５】
請求項７３に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、配列番号１のアミノ酸配列、および配列番号２のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項７６】
請求項７３に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、配列番号３のアミノ酸配列、および配列番号４のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項７７】
請求項７３に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、配列番号５のアミノ酸配列、および配列番号６のアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項７８】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３１（Ｆ５９８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列、および受託番号ＰＴＡ−５９３１（Ｆ５９８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域を含むアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項７９】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３２（Ｆ６２８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列、および受託番号ＰＴＡ−５９３２（Ｆ６２８）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域を含むアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項８０】
請求項６９に記載の組成物であって、前記単離抗体または抗体フラグメントが、受託番号ＰＴＡ−５９３３（Ｆ６３０）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域のアミノ酸配列、および受託番号ＰＴＡ−５９３３（Ｆ６３０）を有する寄託されたハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域を含むアミノ酸配列を含む、組成物。
【請求項８１】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記被験体が、ブドウ球菌感染を顕出する危険性のある、組成物。
【請求項８２】
請求項８１に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌感染が、Ｓ．ａｕｒｅｕｓ感染またはＳ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ感染である、組成物。
【請求項８３】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記被験体が、Ｅ．ｃｏｌｉ感染、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）感染、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ感染、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）感染、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）感染、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）感染、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ感染、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）感染、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ感染、またはＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａ感染を顕出する危険性のある、組成物。
【請求項８４】
請求項５２または請求項５４に記載の組成物であって、前記単離ペプチドが、細胞毒性因子と結合体化している、組成物。
【請求項８５】
ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ＣＤＲをコードしているヌクレオチド配列を含む、単離核酸分子。
【請求項８６】
請求項８５に記載の単離核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号９、配列番号１２、配列番号１５、配列番号１８、配列番号２１、および配列番号２４からなる群から選択される、単離核酸分子。
【請求項８７】
請求項８５に記載の単離核酸分子であって、前記ヌクレオチド配列が、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、および配列番号６からなる群から選択される、単離核酸分子。
【請求項８８】
請求項８５に記載の単離核酸分子であって、前記核酸が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有するハイブリドーマに由来するＨ鎖可変領域の核酸分子である、単離核酸分子。
【請求項８９】
請求項８５に記載の単離核酸分子であって、前記核酸が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有するハイブリドーマに由来するＬ鎖可変領域の核酸分子である、単離核酸分子。
【請求項９０】
請求項８５に記載の単離核酸分子であって、前記核酸が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有するハイブリドーマに由来するＨ鎖ＣＤＲの核酸分子である、単離核酸分子。
【請求項９１】
請求項８５に記載の単離核酸分子であって、前記核酸が、受託番号ＰＴＡ−５９３１、ＰＴＡ−５９３２、またはＰＴＡ−５９３３を有するハイブリドーマに由来するＬ鎖ＣＤＲの核酸分子である、単離核酸分子。
【請求項９２】
請求項８５〜９０または９１に記載される単離核酸分子を含み、プロモーターと作動可能に結合している、発現ベクター。
【請求項９３】
請求項９２に記載の発現ベクターで形質転換または形質導入される、宿主細胞。
【請求項９４】
抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体を産生し、かつＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−５９３１を有する、単離細胞。
【請求項９５】
抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体を産生し、かつＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−５９３２を有する、単離細胞。
【請求項９６】
抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体を産生し、かつＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−５９３３を有する、単離細胞。
【請求項９７】
請求項９４に記載の細胞によって産生される、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項９８】
請求項９５に記載の細胞によって産生される、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項９９】
請求項９６に記載の細胞によって産生される、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項１００】
請求項９７、９８または９９に記載の単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体、またはそのフラグメントであって、該フラグメントが、Ｆ（ａｂ’）２フラグメント、Ｆｄフラグメント、およびＦａｂフラグメントからなる群から選択される、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項１０１】
請求項９７、９８または９９に記載の単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体、またはそのフラグメントであって、該フラグメントが、ＰＮＡＧ発現細菌株のオプソニン食菌作用を向上させる、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項１０２】
請求項９７、９８または９９に記載の単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメントであって、該フラグメントが、ＰＮＡＧ発現ブドウ球菌のオプソニン食菌作用を向上させる、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項１０３】
請求項１０２に記載の単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメントであって、前記ＰＮＡＧ発現ブドウ球菌が、Ｓ．ａｕｒｅｕｓまたはＳ．ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓである、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項１０４】
請求項１０１に記載の単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメントであって、前記ＰＮＡＧ発現細菌が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ
ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、またはＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａである、単離抗ブドウ球菌ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧモノクローナル抗体またはそのフラグメント。
【請求項１０５】
ＰＮＡＧを発現する細菌株の感染を処置するための組成物であって、
ＰＮＡＧを発現する細菌への曝露から少なくとも４時間以内に被験体における細菌負荷を少なくとも５０％減少させるＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチド
を、該感染を処置するための有効量含む、組成物。
【請求項１０６】
請求項１０５に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧを発現する細菌株が、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ  ｐｅｓｔｉｓ（Ｙ．ｐｅｓｔｉｓ）、Ｙ．ｅｎｔｅｒｃｏｌｉｔｉｃａ、Ｘａｎｔｈｏｍｏｎａｓ  ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ（Ｘ．ａｘｏｎｏｐｏｄｉｓ）、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ（Ｐ．ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ）、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ（Ａ．ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｔｅｍｃｏｍｉｔａｎｓ）、Ａ．ｐｌｅｕｒｏｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ、Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ  ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ（Ｂ．ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、Ｂ．ｐａｒａｐｅｒｔｕｓｓｉｓ、またはＢ．ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａである、組成物。
【請求項１０７】
請求項１０５に記載の組成物であって、該組成物は、ブドウ球菌感染を処置するための組成物であり、該組成物は、
ブドウ球菌細菌に曝露してから少なくとも４時間以内に被験体における細菌負荷を少なくとも５０％減少させるＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチド
を、該感染を治療するための有効量含む、組成物。
【請求項１０８】
請求項１０７に記載の組成物であって、前記ブドウ球菌感染がＳ．ａｕｒｅｕｓ感染である、組成物。
【請求項１０９】
請求項１０５または請求項１０７に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが前記細菌への曝露前に投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項１１０】
請求項１０９に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが前記細菌への曝露の少なくとも４時間前に投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項１１１】
請求項１０９に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが前記細菌への曝露の少なくとも２４時間前に投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項１１２】
請求項１０５または請求項１０７に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが、前記細菌への曝露の少なくとも４時間以内に、被験体の細菌負荷を少なくとも６０％減少させる、組成物。
【請求項１１３】
請求項１０５または請求項１０７に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが、前記細菌への曝露後２時間以内に、被験体の細菌負荷を少なくとも５０％減少させる、組成物。
【請求項１１４】
請求項１０５または請求項１０７に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが、前記細菌への曝露後２時間以内に、被験体の細菌負荷を少なくとも６０％減少させる、組成物。
【請求項１１５】
請求項１０５または請求項１０７に記載の組成物であって、前記ＰＮＡＧ／ｄＰＮＡＧ結合ペプチドが単離抗体または抗体フラグメントである、組成物。