【手続補正書】
【提出日】平成31年3月29日(2019.3.29)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較してグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に選択的に結合して、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１への結合を阻害する単離抗体。
【請求項２】
組み換えにより改変された、キメラ、ヒト化、または完全ヒト抗体である、請求項１に記載の単離抗体。
【請求項３】
非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して、配列番号１における３５、１９２、２００、および／または２１９位のアミノ酸を含むＰＤ−Ｌ１タンパク質の領域内のアミノ酸残基に選択的に結合する、請求項１または２に記載の単離抗体。
【請求項４】
非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への抗体結合によって示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する、請求項１から３のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項５】
非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への抗体結合によって示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する、請求項４に記載の単離抗体。
【請求項６】
５〜２０ｎＭの親和性でグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する、請求項１から５のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項７】
前記抗体が、蛍光標識によって直接または間接的に検出可能であり、細胞フローサイトメトリーアッセイにおいて非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への抗体結合によって示される平均蛍光強度（ＭＦＩ）より２倍から１０倍高いＭＦＩでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に優先的に結合する、請求項１から３のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項８】
非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への抗体結合によって示されるＭＦＩより３倍〜５倍、またはそれより高いＭＦＩでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に優先的に結合する、請求項７に記載の単離抗体。
【請求項９】
配列番号１の５６、６２、６９、および７５位のアミノ酸の少なくとも１つを含むグリコシル化ＰＤ−Ｌ１のエピトープに特異的に結合する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１０】
前記エピトープが、配列番号１のＬ４８〜Ｈ７８の領域内のアミノ酸を含む、請求項９に記載の単離抗体。
【請求項１１】
前記エピトープが、配列番号１のＤ６１〜Ｈ７８の領域内のアミノ酸を含む、請求項９に記載の単離抗体。
【請求項１２】
モノクローナル抗体（ＭＡｂ）ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５によって認識されるＰＤ−Ｌ１のエピトープに特異的に結合する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１３】
グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への特異的結合に関して、ＭＡｂ  ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５と競合するかまたは交叉競合する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１４】
ＭＡｂ  ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５の重鎖可変（ＶＨ）ドメインまたは軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１５】
ＭＡｂ  ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５の重鎖ＣＤＲ１〜３および／または軽鎖ＣＤＲ１〜３を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１６】
ＶＨドメインが、配列番号３または配列番号１９のアミノ酸配列を有する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１７】
ＶＬドメインが、配列番号１１または配列番号２７のアミノ酸配列を有する、請求項１から８または１６のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１８】
ＶＨドメインが配列番号３のアミノ酸配列を有し、ＶＬが配列番号１１のアミノ酸配列を有する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項１９】
ＶＨドメインが配列番号１９のアミノ酸配列を有し、ＶＬドメインが配列番号２７のアミノ酸配列を有する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２０】
ＶＨドメインが、配列番号３または配列番号１９のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する、請求項１から８または１７のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２１】
ＶＬドメインが、配列番号１１または配列番号２７のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する、請求項１から８、１６または２０のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２２】
ヒト定常ドメインを含む、請求項１４または１６から２１のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２３】
配列番号４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメイン、または配列番号５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号７のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号９のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメインを有する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２４】
配列番号１２のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、配列番号１４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ２、および配列番号１６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ３を含むＶＬドメインを有する、請求項１から８、または２３のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２５】
配列番号２０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号２２のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号２４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメイン、または配列番号２１のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号２３のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号２５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメインを有する、請求項１から８のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２６】
配列番号２８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、配列番号３０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ２、および配列番号３２のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ３を含むＶＬドメインを有する、請求項１から８または２５のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２７】
配列番号４、配列番号６、および配列番号８のアミノ酸配列をそれぞれ有する、または配列番号５、配列番号７、および配列番号９のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、Ｈ２、およびＨ３を含むＶＨドメインを有する、請求項１から８または２４のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２８】
配列番号１２、配列番号１４、および配列番号１６のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、Ｌ２およびＬ３を含むＶＬドメインを有する、請求項１から８、２３、または２６のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項２９】
配列番号２０、配列番号２２、および配列番号２４のアミノ酸配列をそれぞれ有する、または配列番号２１、配列番号２３、および配列番号２５のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、Ｈ２、およびＨ３を含むＶＨドメインを有する、請求項１から８または２６のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項３０】
配列番号２８、配列番号３０、および配列番号３２のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、Ｌ２およびＬ３を含むＶＬドメインを有する、請求項１から８、２５、または２９のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項３１】
ヒトフレームワーク領域を有する、請求項１５、または２３から３０のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項３２】
１、２、３、４、５、または６個のアミノ酸置換を有する重鎖または軽鎖ヒトフレームワーク領域を有する、請求項１５、または２３から３０のいずれか一項に記載の単離抗体。
【請求項３３】
ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ抗体、またはその抗原結合断片である、請求項１から３２のいずれか一項に記載の抗体。
【請求項３４】
Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆ（ａｂ’）３、一価ｓｃＦｖ、二価ｓｃＦｖ、または単一ドメイン抗体である、請求項１から３２のいずれか一項に記載の抗体。
【請求項３５】
造影剤、化学療法剤、毒素、または放射性核種にコンジュゲートされる、請求項１から３４のいずれか一項に記載の抗体。
【請求項３６】
配列番号２または１８のヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
【請求項３７】
配列番号１０または２６のヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
【請求項３８】
請求項１から３５のいずれか一項に記載の抗体のＶＨドメインおよび／またはＶＬドメインをコードするヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
【請求項３９】
請求項１から３５のいずれか一項に記載の抗体および薬学的に許容される担体、希釈剤、賦形剤、またはビヒクルを含む組成物。
【請求項４０】
有効量の請求項１から３５のいずれか一項に記載の抗体を含む、それを必要とする対象におけるＰＤ−Ｌ１陽性がんを処置するための医薬組成物。
【請求項４１】
前記対象がヒトである、請求項４０に記載の医薬組成物。
【請求項４２】
前記がんが、乳がん、肺がん、頭頚部がん、前立腺がん、食道がん、気管がん、皮膚がん、脳がん、肝臓がん、膀胱がん、胃がん、膵臓がん、卵巣がん、子宮がん、子宮頚がん、精巣がん、結腸がん、直腸がん、または皮膚がんである、請求項４０または請求項４１に記載の医薬組成物。
【請求項４３】
がんが、血液のがんである、請求項４０から４２のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項４４】
前記医薬組成物が、全身、静脈内、皮内、腫瘍内、筋肉内、腹腔内、皮下、または局所投与するためのものである、請求項４０から４３のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項４５】
生物試料中のグリコシル化ＰＤ−Ｌ１の存在をアッセイする方法であって、請求項１から３５のいずれか一項に記載の抗体を生物試料に接触させることを含み、前記抗体の結合の検出は、試料がグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を含むことを示す、方法。
【請求項４６】
前記試料が細胞試料である、請求項４５に記載の方法。
【請求項４７】
前記細胞試料が、対象のがんまたは腫瘍に由来する、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
配列番号１のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、またはＮ２１９位に対応する少なくとも１つのアミノ酸を含むヒトＰＤ−Ｌ１の少なくとも７つの連続したアミノ酸の断片を含む単離ポリペプチドであって、ＰＤ−Ｌ１のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、またはＮ２１９位に対応するアミノ酸の少なくとも１つがグリコシル化されている、単離ポリペプチド。
【請求項４９】
ヒトＰＤ−Ｌ１の少なくとも８〜２０個の連続したアミノ酸を含む、請求項４８に記載の単離ポリペプチド。
【請求項５０】
配列番号１のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、および／またはＮ２１９位に対応するグリコシル化アミノ酸を含む、請求項４８または請求項４９に記載の単離ポリペプチド。
【請求項５１】
そのアミノ末端またはカルボキシ末端で免疫原性ポリペプチドに融合またはコンジュゲートされる、請求項４８から５０のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項５２】
薬学的に許容される担体、賦形剤、希釈剤、またはビヒクル中に請求項４８から５１のいずれか一項に記載のポリペプチドを含む組成物。
【請求項５３】
免疫原性組成物である、請求項５２に記載の組成物。
【請求項５４】
アジュバントをさらに含む、請求項５３に記載の免疫原性組成物。
【請求項５５】
配列番号２または１８のヌクレオチド配列と少なくとも９０〜９８％同一である、請求項１に記載の抗体のＶＨドメインをコードするヌクレオチド配列、および／または配列番号１９または２６のヌクレオチド配列と少なくとも９０〜９８％同一である、請求項１に記載の抗体のＶＬドメインをコードするヌクレオチド配列を含む、単離核酸分子。
【請求項５６】
前記ＶＨドメインをコードするヌクレオチド配列が、配列番号２または１８と９５〜９９％同一であり、および／または前記ＶＬドメインをコードするヌクレオチド配列が、配列番号１０または２６と９５〜９９％同一である、請求項５５に記載の単離核酸分子。
【請求項５７】
ＰＤ−Ｌ１とＰＤ−１との結合を遮断する薬剤による処置のための候補がん患者を同定する方法であって、請求項１から３５のいずれか一項に記載の抗体を使用して、患者のがん細胞の試料に由来する細胞上のグリコシル化ＰＤ−Ｌ１の存在に関して試験することを含み、前記細胞がグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に関して陽性であれば、前記患者は前記処置の候補である、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００７】
本発明者らはさらに、ヒトＰＤ−Ｌ１が、例えば配列番号１に記載されるヒトＰＤ−Ｌ１タンパク質の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）におけるアミノ酸Ｎ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、および／またはＮ２１９位の４つの部位でグリコシル化されることを見出した。記載の抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、これらの部位の１つまたは複数に結合しうるが、例えばこれらのグリコシル化部位の１つまたは複数において変異（例えば、グリコシル化コンセンサス配列内のアスパラギンのグルタミンへの置換）を有し、このためこれらの部位の１つまたは複数でグリコシル化されないＰＤ−Ｌ１には結合しない。したがって、いくつかの実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−Ｌ１グリコポリペプチドまたはそのペプチドにおける１つまたは複数のグリコシル化モチーフに特異的に結合する。いくつかの実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、グリコシル化モチーフおよび隣接ペプチドを含むＰＤ−Ｌ１グリコペプチドに結合する。いくつかの実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、３次元で１つまたは複数のグリコシル化モチーフの近傍に位置するペプチド配列に結合する。したがって、実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１のコンフォメーションエピトープを認識して、これに選択的に結合する。例として、ある特定の実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの８５％より小さい、８０％より小さい、７５％より小さい、７０％より小さい、６５％より小さい、６０％より小さい、５５％より小さい、５０％より小さい、４５％より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−１に結合するが、実施形態において、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの５％、１０％、１５％、２０％、または２５％以下で結合する。前述のＫｄ値の間の値および前述のＫｄ値に等しい値が包含されると理解すべきである。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合するが、それでもなお二重の抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１機能を示す。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄより少なくとも５倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質と比較して示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。ある特定の実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、例えば、細胞フローサイトメトリーアッセイにおいてアッセイした場合、ＷＴグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞より少なくとも１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、または１０倍大きい頻度で優先的に結合し、このアッセイにおいて、ＷＴ  ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞と非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞とを混合して、識別的に標識した後、例えば実施例５に記載される検出可能なマーカーによって標識された、アッセイされる抗体���接触させて、抗体が、ＦＩＴＣなどの蛍光標識またはマーカーによって直接または間接的に検出可能であるときの二つの細胞集団に関して測定された蛍光強度（ＭＦＩ）によって測定する。一実施形態において、抗体は、ＦＩＴＣなどの蛍光標識またはマーカーによって直接標識される。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に、５〜２０ｎＭ、５〜１０ｎＭ、または１０〜２０ｎＭの親和性で選択的に結合する。一実施形態において、抗体は、モノクローナル抗体であり、より好ましくは、キメラまたはヒト化またはヒト抗体である。用語「特異的に結合する」および「選択的に結合する」は、本明細書において互換的に使用される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１４】
結合親和性または他のパラメータを改善するために、ヒト化抗体のＣＤＲおよび／またはフレームワーク領域に１つまたは複数のアミノ酸置換を行ってもよいことは、当業者に認識されると予想される。実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への特異的結合に関して、上記のＶＨおよびＶＬドメインならびにそのＣＤＲを含む抗体と競合する。実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への抗体の結合によって示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄより少なくとも５分の１のＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質への抗体の結合によって示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、実施例５に記載する細胞フローサイトメトリー結合アッセイにおいて、抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合に対するＭＦＩより１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、または１０倍大きいＭＦＩとして表される、ＷＴ  ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合を示す。一実施形態において、抗体は、蛍光標識またはマーカーによって直接または間接的に検出可能である。一実施形態において、抗体は、ＦＩＴＣなどの蛍光標識またはマーカーによって直接標識される。一実施形態において、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１に対するＳＴＭ００４  ＭＡｂ、またはそのキメラもしくはヒト化形態の結合親和性は、その下限および上限値を含む、５〜２０ｎＭまたは５〜１０ｎＭである。一実施形態において、抗体は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害し、特にエフェクターＴ細胞によって発現したＰＤ−１と、腫瘍細胞によって発現したＰＤ−Ｌ１、特にグリコシル化ＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害する。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１９】
実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への特異的結合に関して、上記のＶＨおよびＶＬドメインならびにそのＣＤＲを含む抗体と競合する。好ましくは、これらの抗体は、ヒトフレームワーク領域を有し、すなわちＳＴＭ１１５のヒト化形態であり、任意選択で、例えばヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４からのヒト定常ドメインを含む。結合親和性または他のパラメータを改善するために、ヒト化抗体のＣＤＲまたはフレームワーク領域に、１つまたは複数のアミノ酸置換を行ってもよいことは当業者に認識されると予想される。実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への抗体の結合によって示されるＫｄより少なくとも５倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質への抗体の結合によって示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、実施例５に記載する細胞フローサイトメトリー結合アッセイにおいて、抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合に対するＭＦＩより１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、または１０倍大きいＭＦＩとして表される、ＷＴ  ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合を示す。一実施形態において、抗体は、蛍光標識またはマーカーによって直接または間接的に検出可能である。一実施形態において、抗体は、ＦＩＴＣなどの蛍光標識またはマーカーによって直接標識される。一実施形態において、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１に対するＳＴＭ１１５  ＭＡｂ、または結合ドメイン、またはそのヒト化もしくはキメラ形態の結合親和性は、その下限および上限値を含む、５〜２０ｎＭまたは５〜１０ｎＭである。一実施形態において、抗体は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害し、特にエフェクターＴ細胞によって発現したＰＤ−１と、腫瘍細胞によって発現したＰＤ−Ｌ１、特にグリコシル化ＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害する。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６７】
抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１抗体または抗野生型ＰＤ−Ｌ１（ＰＤ−Ｌ１  ＷＴ）抗体を含み、野生型ＰＤ−Ｌ１タンパク質はグリコシル化されており、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１に対して特異的である。好ましい実施形態において、抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較してグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に特異的に結合する抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体である。いくつかの実施形態において、抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−Ｌ１の線形グリコシル化モチーフに結合する。いくつかの実施形態において、抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１抗体は、３次元でグリコシル化モチーフの１つまたは複数の近傍に位置するペプチド配列に結合する。いくつかの実施形態において、抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して、ＰＤ−Ｌ１の１つもしくは複数のグリコシル化モチーフまたはＰＤ−Ｌ１のグリコシル化モチーフを有するＰＤ−Ｌ１ペプチドに選択的に結合する。他の実施形態において、抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１抗体（抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体）は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸を含む線形エピトープに結合する。いくつかの実施形態において、抗グリコシル化ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−Ｌ１の１つまたは複数のグリコシル化モチーフに選択的に結合し、グリコシル化モチーフは、配列番号１のＰＤ−Ｌ１ポリペプチドのＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、および／またはＮ２１９を含む。なお他の実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸を含むコンフォメーション（非線形）エピトープに結合する。いくつかの実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体またはその結合部分は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの少なくとも３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、または９０％より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。ある特定の実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体またはその結合部分は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄより５０％より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。いくつかの実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体またはその結合部分は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、２０％、３０％、４０％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、または９０％より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。さらなる態様において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体またはその結合部分は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの少なくとも５〜１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体またはその結合部分は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。ある特定の実施形態において、抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への結合によって示されるＫｄの１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１５％、または２０％以下であるＫｄでグリコシル���ＰＤ−Ｌ１に結合する。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２３】
特定の実施形態において、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質と比較してグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に特異的かつ優先的に結合する抗体、例えばモノクローナル抗体が提供される。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、例えば配列番号１に記載されるＰＤ−Ｌ１タンパク質のアミノ酸配列のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、および／またはＮ２１９位でグリコシル化されているＰＤ−Ｌ１タンパク質に特異的または優先的に結合する。あるいは、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、３次元空間においてＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、またはＮ２１９位の１つまたは複数の近位に結合し、例えば、グリコシル化残基または複数の残基を隠すまたは遮断しうる。例えば、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体の特異的または選択的結合は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの半分より小さいＫｄでＰＤ−Ｌ１抗原への抗体の結合を伴う。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄより少なくとも５倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、実施例５に記述される細胞フローサイトメトリー結合アッセイにおいて、抗体は、ＷＴ  ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合に対するＭＦＩより１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、または１０倍高いＭＦＩとして表される結合を示す。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１２９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１２９】
前述の抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄより少なくとも５倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質と比較して示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１に対する抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体の結合親和性は、下限および上限値を含む、５〜２０ｎＭまたは５〜１０ｎＭである。一実施形態において、実施例５に記述される細胞フローサイトメトリー結合アッセイにおいて、抗体は、ＷＴ  ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合に対するＭＦＩより１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、または１０倍大きいＭＦＩとして表される結合を示す。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３４】
実施形態において、前述の抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して示されるＫｄより少なくとも５倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質と比較して示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１タンパク質に結合する。一実施形態において、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１に対するＳＴＭ１１５の結合親和性は、下限および上限値を含む、５〜２０ｎＭまたは５〜１０ｎＭである。一実施形態において、実施例５に記述される細胞フローサイトメトリー結合アッセイにおいて、抗体は、ＷＴ  ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に、非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への結合に対するＭＦＩより１．５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、または１０倍大きいＭＦＩとして表される結合を示す。これらの抗ｇｌｙｃＰＤ−Ｌ１抗体は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害し、特にエフェクターＴ細胞によって発現されるＰＤ−１と、腫瘍細胞によって発現されるＰＤ−Ｌ１、特にグリコシル化ＰＤ−Ｌ１との相互作用を阻害する。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２３４】
本明細書において引用した全ての特許、刊行された特許出願、およびその他の刊行物は、参照により全体が本出願に組み込まれる。
本発明は次の実施態様を含む。
［１］非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較してグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に選択的に結合して、グリコシル化ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１への結合を阻害する単離抗体。
［２］組み換えにより改変された、キメラ、ヒト化、または完全ヒト抗体である、上記［１］に記載の単離抗体。
［３］非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１と比較して、配列番号１における３５、１９２、２００、および／または２１９位のアミノ酸を含むＰＤ−Ｌ１タンパク質の領域内のアミノ酸残基に選択的に結合する、上記［１］または［２］に記載の単離抗体。
［４］非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への抗体結合によって示されるＫｄの半分より小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する、上記［１］から［３］のいずれかに記載の単離抗体。
［５］非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への抗体結合によって示されるＫｄの少なくとも１０倍小さいＫｄでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する、上記［４］に記載の単離抗体。
［６］５〜２０ｎＭの親和性でグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に結合する、上記［１］から［５］のいずれかに記載の単離抗体。
［７］前記抗体が、蛍光標識によって直接または間接的に検出可能であり、細胞フローサイトメトリーアッセイにおいて非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への抗体結合によって示される平均蛍光強度（ＭＦＩ）より２倍から１０倍高いＭＦＩでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に優先的に結合する、上記［１］から［３］のいずれかに記載の単離抗体。
［８］非グリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への抗体結合によって示されるＭＦＩより３倍〜５倍、またはそれより高いＭＦＩでグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に優先的に結合する、上記［７］に記載の単離抗体。
［９］配列番号１の５６、６２、６９、および７５位のアミノ酸の少なくとも１つを含むグリコシル化ＰＤ−Ｌ１のエピトープに特異的に結合する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１０］前記エピトープが、配列番号１のＬ４８〜Ｈ７８の領域内のアミノ酸を含む、上記［９］に記載の単離抗体。
［１１］前記エピトープが、配列番号１のＤ６１〜Ｈ７８の領域内のアミノ酸を含む、上記［９］に記載の単離抗体。
［１２］モノクローナル抗体（ＭＡｂ）ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５によって認識されるＰＤ−Ｌ１のエピトープに特異的に結合する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１３］グリコシル化ＰＤ−Ｌ１への特異的結合に関して、ＭＡｂ  ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５と競合するかまたは交叉競合する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１４］ＭＡｂ  ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５の重鎖可変（ＶＨ）ドメインまたは軽鎖可変（ＶＬ）ドメインを含む、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１５］ＭＡｂ  ＳＴＭ００４またはＭＡｂ  ＳＴＭ１１５の重鎖ＣＤＲ１〜３および／または軽鎖ＣＤＲ１〜３を含む、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１６］ＶＨドメインが、配列番号３または配列番号１９のアミノ酸配列を有する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１７］ＶＬドメインが、配列番号１１または配列番号２７のアミノ酸配列を有する、上記［１］から［８］または［１６］のいずれかに記載の単離抗体。
［１８］ＶＨドメインが配列番号３のアミノ酸配列を有し、ＶＬが配列番号１１のアミノ酸配列を有する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［１９］ＶＨドメインが配列番号１９のアミノ酸配列を有し、ＶＬドメインが配列番号２７のアミノ酸配列を有する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［２０］ＶＨドメインが、配列番号３または配列番号１９のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する、上記［１］から［８］または［１７］のいずれかに記載の単離抗体。
［２１］ＶＬドメインが、配列番号１１または配列番号２７のアミノ酸配列と少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を有する、上記［１］から［８］、［１６］または［２０］のいずれかに記載の単離抗体。
［２２］ヒト定常ドメインを含む、上記［１４］または［１６］から［２１］のいずれかに記載の単離抗体。
［２３］配列番号４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメイン、または配列番号５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号７のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号９のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメインを有する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［２４］配列番号１２のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、配列番号１４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ２、および配列番号１６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ３を含むＶＬドメインを有する、上記［１］から［８］または［２３］のいずれかに記載の単離抗体。
［２５］配列番号２０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号２２のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号２４のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメイン、または配列番号２１のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、配列番号２３のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ２、および配列番号２５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ３を含むＶＨドメインを有する、上記［１］から［８］のいずれかに記載の単離抗体。
［２６］配列番号２８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、配列番号３０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ２、および配列番号３２のアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ３を含むＶＬドメインを有する、上記［１］から［８］または［２５］のいずれかに記載の単離抗体。
［２７］配列番号４、配列番号６、および配列番号８のアミノ酸配列をそれぞれ有する、または配列番号５、配列番号７、および配列番号９のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、Ｈ２、およびＨ３を含むＶＨドメインを有する、上記［１］から［８］または［２４］のいずれかに記載の単離抗体。
［２８］配列番号１２、配列番号１４、および配列番号１６のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、Ｌ２およびＬ３を含むＶＬドメインを有する、上記［１］から［８、２３］または［２６］のいずれかに記載の単離抗体。
［２９］配列番号２０、配列番号２２、および配列番号２４のアミノ酸配列をそれぞれ有する、または配列番号２１、配列番号２３、および配列番号２５のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｈ１、Ｈ２、およびＨ３を含むＶＨドメインを有する、上記［１］から［８］または［２６］のいずれかに記載の単離抗体。
［３０］配列番号２８、配列番号３０、および配列番号３２のアミノ酸配列をそれぞれ有する１、２、または３個のＣＤＲにおいて１、２、３、４、または５個のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を有するＣＤＲ  Ｌ１、Ｌ２およびＬ３を含むＶＬドメインを有する、上記［１］から［８、２５］または［２９］のいずれかに記載の単離抗体。
［３１］ヒトフレームワーク領域を有する、上記［１５］または［２３］から［３０］のいずれかに記載の単離抗体。
［３２］１、２、３、４、５、または６個のアミノ酸置換を有する重鎖または軽鎖ヒトフレームワーク領域を有する、上記［１５］または［２３］から［３０］のいずれかに記載の単離抗体。
［３３］ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ抗体、またはその抗原結合断片である、上記［１］から［３２］のいずれかに記載の抗体。
［３４］Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆ（ａｂ’）３、一価ｓｃＦｖ、二価ｓｃＦｖ、または単一ドメイン抗体である、上記［１］から［３２］のいずれかに記載の抗体。
［３５］造影剤、化学療法剤、毒素、または放射性核種にコンジュゲートされる、上記［１］から［３４］のいずれかに記載の抗体。
［３６］配列番号２または１８のヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
［３７］配列番号１０または２６のヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
［３８］上記［１］から［３５］のいずれかに記載の抗体のＶＨドメインおよび／またはＶＬドメインをコードするヌクレオチド配列を含む単離核酸分子。
［３９］薬学的に許容される担体、希釈剤、賦形剤、またはビヒクル中に上記［１］から［３５］のいずれかに記載の抗体を含む組成物。
［４０］上記［１］から［３５］のいずれかに記載の抗体の有効量を、がんを有する対象に投与することを含む、それを必要とする対象におけるＰＤ−Ｌ１陽性がんを処置する方法。
［４１］前記対象がヒトである、上記［４０］に記載の方法。
［４２］前記がんが、乳がん、肺がん、頭頚部がん、前立腺がん、食道がん、気管がん、皮膚がん、脳がん、肝臓がん、膀胱がん、胃がん、膵臓がん、卵巣がん、子宮がん、子宮頚がん、精巣がん、結腸がん、直腸がん、または皮膚がんである、上記［４０］または上記［４１］に記載の方法。
［４３］がんが、血液のがんである、上記［４０］から［４２］のいずれかに記載の方法。
［４４］前記抗体が、薬学的に許容される組成物中で投与される、上記［４０］から［４３］のいずれかに記載の方法。
［４５］前記抗体が、全身、静脈内、皮内、腫瘍内、筋肉内、腹腔内、皮下、または局所投与される、上記［４４］に記載の方法。
［４６］少なくとも第２の抗がん剤および／または抗がん治療を対象に投与することをさらに含む、上記［３８］から［４５］のいずれかに記載の方法。
［４７］前記第２の抗がん治療が、外科療法、化学療法、放射線療法、凍結療法、ホルモン療法、免疫療法、またはサイトカイン療法である、上記［４６］に記載の方法。
［４８］生物試料中のグリコシル化ＰＤ−Ｌ１の存在をアッセイする方法であって、上記［１］から［３５］のいずれかに記載の抗体を生物試料に接触させることを含み、前記抗体の結合の検出は、試料がグリコシル化ＰＤ−Ｌ１を含むことを示す、方法。
［４９］前記試料が細胞試料である、上記［４８］に記載の方法。
［５０］前記細胞試料が、対象のがんまたは腫瘍に由来する、上記［４９］に記載の方法。
［５１］配列番号１のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、またはＮ２１９位に対応する少なくとも１つのアミノ酸を含むヒトＰＤ−Ｌ１の少なくとも７つの連続したアミノ酸の断片を含む単離ポリペプチドであって、ＰＤ−Ｌ１のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、またはＮ２１９位に対応するアミノ酸の少なくとも１つがグリコシル化されている、単離ポリペプチド。
［５２］ヒトＰＤ−Ｌ１の少なくとも８〜２０個の連続したアミノ酸を含む、上記［５１］に記載の単離ポリペプチド。
［５３］配列番号１のＮ３５、Ｎ１９２、Ｎ２００、および／またはＮ２１９位に対応するグリコシル化アミノ酸を含む、上記［５１］または上記［５２］に記載の単離ポリペプチド。
［５４］そのアミノ末端またはカルボキシ末端で免疫原性ポリペプチドに融合またはコンジュゲートされる、上記［５１］から［５３］のいずれかに記載のポリペプチド。
［５５］薬学的に許容される担体、賦形剤、希釈剤、またはビヒクル中に上記［５１］から［５４］のいずれかに記載のポリペプチドを含む組成物。
［５６］免疫原性組成物である、上記［５５］に記載の組成物。
［５７］アジュバントをさらに含む、上記［５６］に記載の免疫原性組成物。
［５８］配列番号２または１８のヌクレオチド配列と少なくとも９０〜９８％同一である、上記［１］に記載の抗体のＶＨドメインをコードするヌクレオチド配列、および／または配列番号１９または２６のヌクレオチド配列と少なくとも９０〜９８％同一である、上記［１］に記載の抗体のＶＬドメインをコードするヌクレオチド配列を含む、単離核酸分子。
［５９］前記ＶＨドメインをコードするヌクレオチド配列が、配列番号２または１８と９５〜９９％同一であり、および／または前記ＶＬドメインをコードするヌクレオチド配列が、配列番号１０または２６と９５〜９９％同一である、上記［５８］に記載の単離核酸分子。
［６０］ＰＤ−Ｌ１とＰＤ−１との結合を遮断する薬剤による処置のための候補がん患者を同定する方法であって、上記［１］から［３５］のいずれかに記載の抗体を使用して、患者のがん細胞の試料に由来する細胞上のグリコシル化ＰＤ−Ｌ１の存在に関して試験することを含み、前記細胞がグリコシル化ＰＤ−Ｌ１に関して陽性であれば、前記患者は前記処置の候補である、方法。
［６１］グリコシル化ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１への結合を防止する薬剤の有効量を、候補がん患者として同定された患者に投与することをさらに含む、上記［６０］に記載の方法。
［６２］グリコシル化ＰＤ−Ｌ１のＰＤ−１への結合を防止する前記薬剤が、上記［１］から［３４］のいずれかに記載の単離抗体である、上記［６１］に記載の方法。
［６３］前記単離抗体が、別の抗がん剤または治療薬と併用して投与される、上記［６２］に記載の方法。