【手続補正書】
【提出日】令和1年6月28日(2019.6.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質を含む、Ｂｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項２】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がＶＬＰ膜に局在する、請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項３】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がウイルスタンパク質である、請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項４】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が、オルトミクソウイルス、フィロウイルス、コロナウイルスおよびレトロウイルスからなる群より選択される、請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項５】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がインフルエンザウイルスである、請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項６】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が、Ｈ１〜Ｈ１８およびＮＡ１〜１１からなる群より選択される、請求項５に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項７】
４つの異なる標的病原体タンパク質が、Ｈ１〜Ｈ１８およびＮＡ１〜１１からなる群より選択される、請求項５に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項８】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が、Ｈ５、Ｈ７、Ｈ９およびＨ１０からなる群より選択される、請求項７に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項９】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が遺伝子改変されている、請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項１０】
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がＥｂｏＭａｙ  ＴＭＣＴである、請求項９に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項１１】
被験体における１つまたはそれを超える異なる病原体から保護することができるか、またはそれらに対する免疫応答を誘発することができる、請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項１２】
請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰを含む、ワクチン。
【請求項１３】
請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰを作製するための移入ベクタープラスミドであって、Ｂｇａｇ遺伝子と、異なる標的病原体タンパク質の１つまたはそれを超える遺伝子と、１つまたはそれを超えるプロモーターとを含む、移入ベクタープラスミド。
【請求項１４】
請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰを作製するための方法であって、
（ｉ）Ｂｇａｇ遺伝子と、異なる標的病原体タンパク質の１つまたはそれを超える遺伝子とを、それぞれプロモーター、好ましくはポリヘドリンプロモーターの制御下でタンデムに、移入ベクタープラスミド、好ましくはｒＢＶ移入ベクタープラスミドにクローニングする工程；
（ｉｉ）前記移入ベクタープラスミドを使用して、キャリアウイルス、好ましくはｒＢＶを調製する工程；
（ｉｉｉ）前記ｒＢＶを真核細胞、好ましくはＳｆ９に感染させて、前記Ｂｇａｇ  ＶＬＰを生産する工程；および
（ｉｖ）前記Ｂｇａｇ  ＶＬＰを精製する工程
を含む、方法。
【請求項１５】
標的病原体が動物、好ましくは哺乳動物または鳥、さらに好ましくはヒトにおいて疾患を引き起こすことを予防または阻害するための、請求項１２に記載のワクチン。
【請求項１６】
請求項１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰと、ワクチン投与に適切な１つまたはそれを超えるアジュバントとを混合することによって、請求項１２に記載のワクチンを作製する方法。
【請求項１７】
被験体におけるＢｇａｇ遺伝子またはＢｇａｇタンパク質の存在を、前記被験体が請求項１２に記載のワクチンを以前に投与されたかの指標とする方法であって、Ｂｇａｇ遺伝子またはＢｇａｇタンパク質の存在が、前記被験体において測定され、ワクチン接種が、Ｂｇａｇ遺伝子またはＢｇａｇタンパク質の存在と相関される、方法。
【請求項１８】
１つまたはそれを超える異なる核酸を含むＢｇａｇ  ＶＬＰであって、前記１つまたはそれを超える異なる核酸が標的病原体に対する被験体の免疫応答を誘導または増強する、Ｂｇａｇ  ＶＬＰ。
【請求項１９】
前記異なる核酸の１つまたはそれよりも多くがＲＮＡである、請求項１８に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１７】
Ｂｇａｇ  ＶＬＰワクチン接種被験体と非ワクチン接種被験体とを識別する方法も記載される。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質を含む、Ｂｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目２）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がＶＬＰ膜に局在する、項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目３）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がウイルスタンパク質である、項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目４）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が、オルトミクソウイルス、フィロウイルス、コロナウイルスおよびレトロウイルスからなる群より選択される、項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目５）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がインフルエンザウイルスである、項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目６）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が、Ｈ１〜Ｈ１８またはＮＡ１〜１１からなる群より選択される、項目５に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目７）
４つの異なる標的病原体タンパク質が、Ｈ１〜Ｈ１８およびＮＡ１〜１１からなる群より選択される、項目５に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目８）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が、Ｈ５、Ｈ７、Ｈ９およびＨ１０を含む、項目７に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目９）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質が遺伝子改変されている、項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目１０）
前記１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質がＥｂｏＭａｙ  ＴＭＣＴである、項目９に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目１１）
被験体における１つまたはそれを超える異なる病原体から保護することができるか、またはそれらに対する免疫応答を誘発することができる、項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目１２）
項目１０に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰを含む、ワクチン。
（項目１３）
項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰを作製するための移入ベクタープラスミドであって、Ｂｇａｇ遺伝子と、異なる標的病原体タンパク質の１つまたはそれを超える遺伝子と、１つまたはそれを超えるプロモーターとを含む、移入ベクタープラスミド。
（項目１４）
前記１のＢｇａｇ  ＶＬＰを作製するための方法であって、
Ｂｇａｇ遺伝子と、異なる標的病原体タンパク質の１つまたはそれを超える遺伝子とを、それぞれプロモーター、好ましくはポリヘドリンプロモーターの制御下でタンデムに、移入ベクタープラスミド、好ましくはｒＢＶ移入ベクタープラスミドにクローニングする工程；
前記移入ベクタープラスミドを使用して、キャリアウイルス、好ましくはｒＢＶを調製する工程；
前記ｒＢＶを真核細胞、好ましくはＳｆ９に感染させて、前記Ｂｇａｇ  ＶＬＰを生産する工程；および
前記Ｂｇａｇ  ＶＬＰを精製する工程
を含む、方法。
（項目１５）
有効量の項目１２に記載のワクチンの有効量を動物、好ましくは哺乳動物または鳥、さらに好ましくはヒトに投与することによって、標的病原体が前記動物、好ましくは哺乳動物または鳥、さらに好ましくはヒトにおいて疾患を引き起こすことを予防または阻害する方法。
（項目１６）
項目１に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰと、ワクチン投与に適切な１つまたはそれを超えるアジュバントとを混合することによって、項目１２に記載のワクチンを作製する方法。
（項目１７）
Ｂｇａｇ遺伝子またはＢｇａｇタンパク質が被験体に存在するかを測定すること、およびワクチン接種を前記Ｂｇａｇ遺伝子またはＢｇａｇタンパク質の存在と相関させることによって、前記被験体が項目１２に記載のワクチンを以前に投与されたかを識別する方法。
（項目１８）
１つまたはそれを超える異なる核酸を含むＢｇａｇ  ＶＬＰであって、前記核酸が標的に対する被験体の免疫応答を誘導または増強する、Ｂｇａｇ  ＶＬＰ。
（項目１９）
前記異なる核酸の１つまたはそれよりも多くがＲＮＡである、項目１７に記載のＢｇａｇ  ＶＬＰ。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６０】
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、以下の一般規則が適用される。文脈上特に明確な指示がない限り、「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」という単数形は、複数の指示対象を含む。遺伝子およびタンパク質の一般命名規則も適用される。すなわち、特段指定されない限り、遺伝子は斜体または下線付きであるが、タンパク質は斜体または下線付きではなく標準フォントである（例えば、Ｂｇａｇタンパク質）。生物分類のための一般命名規則も適用される。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１８】
しかしながら、Ｍ１  ＶＬＰは、ワクチン、特にヒトワクチンの理想的な候補ではない。例えば、いくつかのインフルエンザウイルスのＭ１タンパク質は、より低いレベルで発現される。また、上記で議論されているように、新興インフルエンザウイルスについては、Ｍ１遺伝子またはＭ１タンパク質の配列は容易に利用可能ではないことが多い。さらに、ほとんどの人々はＭ１に曝露されている；したがっておそらく、人々の間には、Ｍ１を発現するＶＬＰに対する既存の宿主免疫がある。したがって、これは、ヒトにおける特異的免疫応答の誘導におけるＭ１  ＶＬＰの有効性を大きく損なうであろう。
新規Ｍ１不含Ｂｇａｇ  ＶＬＰ
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１９】
本明細書において、本発明者らは、ウシ免疫不全ウイルス（「ＢＩＶ」）ｇａｇタンパク質（「Ｂｇａｇ」）を使用したＭ１不含ＶＬＰ（本明細書では、Ｂｇａｇ  ＶＬＰと称される）であって、１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質を発現するＭ１不含ＶＬＰを初めて作製および記載した（例えば、実施例１を参照のこと）。本明細書に開示される新規Ｂｇａｇ  ＶＬＰは、内部コアタンパク質としてＢｇａｇを使用する。ウイルスのＲｅｔｒｏｖｉｒｉｄａｅ科のＬｅｎｔｉｖｉｒｕｓ属に属するＢＩＶは、ワクチン開発研究において以前に使用されており、ＢＩＶベクターの使用は以前に記載されている（Ｌｕｏ，２０１２）。しかしながら、本開示の前において、Ｂｇａｇ  ＶＬＰを使用して１つまたはそれを超える異なる標的病原体タンパク質、例えば様々なインフルエンザタンパク質を発現または共発現させること；ワクチン候補としてＢｇａｇ  ＶＬＰを使用すること；または診断ツールとしてＢｇａｇタンパク質もしくはＢｇａｇ遺伝子を使用することは開示されていない。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１５６】
実施例１
Ｂｇａｇ  ＶＬＰおよびＭ１  ＶＬＰの生産のための組換え移入ベクタープラスミドの作製
内部コアタンパク質および標的病原体タンパク質のタンパク質配列を取得した。示されているタンパク質配列に基づいて、Ｓｆ９細胞における高レベルの発現のために遺伝子をコドン最適化し（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）、生化学的に合成する（Ｇｅｎｓｃｒｉｐｔ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）。ＶＬＰを作製するために、内部コアタンパク質Ｂｇａｇ遺伝子またはＭ１遺伝子の遺伝子と、インフルエンザＨＡ遺伝子およびＮＡ遺伝子などの異なる標的病原体タンパク質の１つまたはそれを超える遺伝子とを、各遺伝子がそれ自体の転写カセット（これは、各遺伝子の上流にポリヘドリンプロモーターを含む）内にあるように、バキュロウイルス移入ベクタープラスミドにタンデムにクローニングする。４つの例示的な概略図が図１に示されている。構築物を、Ｓｐｏｄｏｐｔｅｒａ  ｆｒｕｇｉｐｅｒｄａ（「Ｓｆ９」）細胞中の組換えバキュロウイルス（「ｒＢＶ」）にクローニングする。昆虫細胞における高レベルの発現のために、内部コアタンパク質、ＮＡ遺伝子およびＨＡ遺伝子の遺伝子をコドン最適化し、示されているようにタンデムにｒＢＶにクローニングする。第１の構築物では、矢印として代表的に示されているように、各構築物は、ポリヘドリンプロモーターのセットを含有する。前記プロセスは、本質的には（Ｐｕｓｈｋｏら、２００５）（これは、参照により本明細書に組み込まれる）に記載されているとおりである。示されている例では、ＨＡ遺伝子はすべてＨＡ１遺伝子（「Ｈ１」遺伝子）であり、（黒色のボックスとして示されている）同じインフルエンザＡ／プエルトリコ／８／１９３４（Ｈ１Ｎ１）（「ＰＲ８」）ウイルスに由来する。しかしながら、ここでは、このような状況は不要である。ＮＡ遺伝子と同様に、ＨＡ遺伝子は、（黒色のボックスとして示されている）同じＰＲ８ウイルスまたは異なるウイルス、例えば（灰色のボックスとして示されている）インフルエンザＡ／インドネシア／５／２００５（Ｈ５Ｎ１）（「ＩＮ／５」）ウイルスから選択され得る。内部コアタンパク質ＢＩＶ  ｇａｇ遺伝子（「Ｂｇａｇ」遺伝子）またはＭ１遺伝子を含有する構築物を作製する。Ｍ１  ＶＬＰは、対照として機能する。示されている例では、（破線枠で示されている）Ｍ１遺伝子は、ＩＮ／５ウイルスから選択される。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１９４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１９４】
本質的には実施例１〜実施例３に記載されているように、Ｓｆ９細胞媒介性組換えバキュロウイルス（ｒＢＶ）発現系においてＢｇａｇおよびインフルエンザＰＲ８タンパク質を使用することによって、ＶＬＰを調製する。本質的には図１に示されているように、全長Ｂｇａｇ遺伝子およびＮＡ遺伝子と一緒に、インフルエンザＰＲ８  Ｈ１遺伝子をｒＢＶにクローニングする。ＮＡ遺伝子は、インフルエンザＰＲ８またはＩＮ／０５ウイルスに由来する。比較のために、本発明者らはまた、Ｂｇａｇ遺伝子に代えてＭ１遺伝子を有するｒＢＶを作製した。まとめると、本質的には図１に示されているように、４つのｒＢＶベクターを調製する。各ｒＢＶは、３つの遺伝子をタンデムに含有しており、各遺伝子は、それ自体のポリヘドリンプロモーターの制御下のそれ自体の発現カセット内にある。ｒＢＶを３のＭＯＩでＳｆ９細胞に感染させ、７２時間インキュベートしてＶＬＰの発現を可能にする。感染細胞の成長培地からＶＬＰを回収し、濃縮し、超遠心分離によって部分的に精製する。ＶＬＰの評価は、本質的には実施例４に記載されている方法を使用して図２〜７に示されている。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２００
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２００】
３つの遺伝子（ＪＸ／１３インフルエンザウイルス由来のＨ１０遺伝子、ＮＡ遺伝子およびＢｇａｇ遺伝子）を発現するようにｒＢＶを構成する。Ｓｆ９細胞におけるＨＡ１０（「Ｈ１０」）から構成されるインフルエンザＶＬＰを発現するｒＢＶ構築物の例示的な概略図は、図１に示されている。昆虫細胞における高レベルの発現のために、内部コアタンパク質Ｂｇａｇ遺伝子、ＮＡ遺伝子およびＨＡ遺伝子の遺伝子をコドン最適化し、示されているようにタンデムにｒＢＶにクローニングする。各構築物は、矢印で示されているポリヘドリンプロモーターのセットを含有する。示されている例では、ＨＡ遺伝子は、（黒色のボックスとして示されている）Ａ／江西省／ＩＰＢ１３ａ／２０１３（Ｈ１０Ｎ８）（「ＪＸ／１３」）ウイルスに由来し、ＮＡ遺伝子は、（灰色のボックスとして示されている）ＩＮ／５ウイルスに由来する。ＪＸ／１３  Ｈ１０  ＶＬＰを調製するために、得られたｒＢＶを使用してＳｆ９細胞を感染させる。Ｈ１０遺伝子、ＮＡ遺伝子およびＢｇａｇ遺伝子を含むＶＬＰを２ＬのＳｆ９成長培地から回収し、イオン交換クロマトグラフィーによって精製する。インフルエンザＶＬＰの形態ならびにＨＡおよびＮＡタンパク質の発現および機能プロファイルは、本質的には実施例４に記載されている方法を使用して、図９〜１２および１５に示されている。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２１９】
Ｓｆ９細胞においてインフルエンザ四サブタイプＨ５／７／９／１０  Ｂｇａｇ  ＶＬＰを発現するｒＢＶ構築物の例示的な概略図は、図１３に示されている。昆虫細胞における高レベルの発現のために、内部コアタンパク質Ｂｇａｇ遺伝子、ＮＡ遺伝子およびＨＡ遺伝子の遺伝子をコドン最適化し、示されているようにｒＢＶにタンデムにクローニングする。各構築物は、矢印で示されているポリヘドリンプロモーターのセットを含有する。示されている例では、Ｈ１０遺伝子はＪＸ／１３ウイルスに由来し、ＨＡ９（「Ｈ９」）遺伝子はＡ／香港／３３９８２／２００９（Ｈ９Ｎ２）（「ＨＫ０９」）ウイルスに由来し、ＨＡ５（「Ｈ５」）遺伝子はＡ（Ｈ５Ｎ１）Ａ／ベトナム／１２０３／２００４（Ｈ５Ｎ１）（「ＶＮ／０４」）ウイルスに由来し、ＨＡ７（「Ｈ７」）遺伝子はＡ／上海／２／２０１３（Ｈ７Ｎ９）（「ＳＨ／１３」）ウイルスに由来し、ＮＡ遺伝子はＩＮ／５ウイルスに由来する。ＨＡ遺伝子はすべて黒色のボックスとして示されており、ＮＡ遺伝子は灰色のボックスとして示されている。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２３１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２３１】
本質的には実施例６に記載されているように、ＪＸ／１３鳥類起源インフルエンザＨ１０Ｎ８ウイルス由来のＨ１０を使用して、ワクチン接種のためにＨ１０  Ｂｇａｇ  ＶＬＰを調製する。２０１３年に、ＪＸ／１３インフルエンザウイルスは、中国において、高齢患者の致命的なヒト感染を引き起こし、パンデミック懸念の病原体として同定された。本質的には実施例１〜実施例５に記載されているように、３つの遺伝子Ｈ１０遺伝子、ＮＡ遺伝子およびＢｇａｇ遺伝子を共発現するようにｒＢＶベクターを構成する。得られたｒＢＶをＳｆ９細胞の感染に使用して、例えば、図２８のパネルＡに示されているユニサブタイプＨ１０  Ｂｇａｇ  ＶＬＰを調製する。