【手続補正書】
【提出日】令和1年8月23日(2019.8.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが
（ｉ）配列番号６２、配列番号２２〜３６、図１８、配列番号４１〜６１、もしくは配列番号６３〜１１９に記載のアミノ酸配列、または
（ｉｉ）配列番号６２、配列番号２２〜３６、図１８、配列番号４１〜６１、もしくは配列番号６３〜１１９に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９７％同一であるアミノ酸配列
を含む、ポリペプチド。
【請求項２】
式Ｉ：
【化１】
2018534240.tif 000001
［式中、
（ａ）
（ｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＥＶＥＳＡＴＱＬＲ（配列番号１３７）、Ｒ9−ＡＴＱＬＲ（配列番号１３８）、Ｒ9−ＶＥＳＡＴＱＬＲ（配列番号１３９）、Ｒ9−ＥＳＡＴＱＬＲ（配列番号１４０）、およびＲ9−ＳＡＴＱＬＲ（配列番号１４１）からなる群から選択され；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＦＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＬＮＦＲ（配列番号１４２）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱ（配列番号１４３）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱＫ（配列番号１４４）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号１４５）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱＫＬ（配列番号１７２）−Ｒ10、およびＬＮＦＲＱＫＬＬＫ−Ｒ10（配列番号１４６）からなる群から選択されるか；または
（ｉｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＩＡＱＥＬＲ（配列番号１４７）、Ｒ9−ＡＱＥＬＲ（配列番号１４８）、およびＲ9−ＡＱＥＬＲ（配列番号１４９）からなる群から選択され；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＩＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＦＮＡＹＹＡＲＫ（配列番号１５０）−Ｒ10またはＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１５１）−Ｒ10であるか；または
（ｉｉｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＬＳＥＳＬＫ（配列番号１５２）またはＲ9−ＳＥＳＬＫ（配列番号１５３）であり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＩＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＬＤＳＮＫ（配列番号１５４）−Ｒ10またはＬＤＳＮ（配列番号１５５）−Ｒ10であるか；または
（ｉｖ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＶＧまたはＲ9−Ｇであり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＱＬＡであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＩＧＤＤＩＮＲＲ（配列番号１５６）−Ｒ10またはＩＧＤＤＩＮＲ（配列番号１５７）−Ｒ10であるか；または
（ｖ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＰＧＧＲＬＡＥＶＣＴＶＬＬＲ（配列番号１５８）またはＲ9−ＧＧＲＬＡＥＶＣＴＶＬＬＲ（配列番号１５９）であり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＬＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＥＬＥＱＩＲＰＳ（配列番号１６０）−Ｒ10またはＥＬＥＱＩＲ（配列番号１６１）−Ｒ10であるか；または
（ｖｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＤＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡ（配列番号１６２）またはＲ9−ＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡ（配列番号１６３）であり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＶＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＢＤＲＳＩ（配列番号１６４）−Ｒ10またはＢＤＲＳＩＲ（配列番号１６５）−Ｒ10であり、ここで、Ｂは、ノルロイシンであるか；または
（ｖｉｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＥＱＷＡＲＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６６）、Ｒ9−ＱＷＡＲＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６７）、Ｒ9−ＲＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６８）、およびＲ9−ＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６９）からなる群から選択され；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＭＡＤであり、ここで、Ｍはメチオニンまたはノルロイシンであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＬＮＡＱＹ（配列番号１７０）−Ｒ10またはＬＮＡＱＹＥ（配列番号１７１）−Ｒ10であり；
（ｂ）
Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｃ1〜Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり；
Ｒ3は、Ｃ8アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、エポキシド、１個もしくは２個の−ＯＨ、または１個もしくは２個のアミノヒドロキシル基で置換されていてもよく；
ここで、（ａ）（ｉ）〜（ｖｉｉ）において、
Ｒ9は、非天然求電子基含有アミノ酸であり；
Ｒ10は、細胞透過性増強基または安定性増強基であり；
具体的なアミノ酸のうち１、２、３、４または５つは別のアミノ酸によって置換されていてもよい］
で示される化合物。
【請求項３】
（ｉ）Ｒ9が、アクリルアミドの末端にある３Ｓ−１−ピロリジン−３−カルボン酸；アクリルアミドの末端にあるＤ−ホモプロリン；アクリルアミドの末端にあるＬ−ホモプロリン；アクリルアミドの末端にあるイソニペコチン酸；アクリルアミドの末端にあるＤ−ニペコチン酸；アクリルアミドの末端にあるＬ−ニペコチン酸；アクリルアミドの末端にあるＤ−プロリン；アクリルアミドの末端にあるＬ−プロリン；アクリルアミドの末端にあるtrans−４−ジメチルアミノクロトン酸；およびアクリル酸からなる群から選択されるか、
（ｉｉ）Ｒ3がＣ8アルキレンであるか、または
（ｉｉｉ）当該化合物がＢＦＬ−１と結合するか、もしくは、好ましくは、当該化合物がＢＦＬ−１と共有結合するか、または
（ｉｖ）Ｒ9が、構造式：
【化２】
2018534240.tif 000002
［式中、
Ｒ4およびＲ5のうち１つは、アミン、エーテル、チオエーテル、カルボニル、アミド、炭素または水素から選択される化合物の残部との結合であり、他方はＨであり、
ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択され；
Ｒ6は、アミン、エーテル、チオエーテル、アミドおよび炭素からなる群から選択され；
Ｒ7は、窒素含有複素環、置換アニリン、およびアミンからなる群から選択され；
Ｒ8は、アクリロイル、β−メチルアクリロイル、β−アルキルアクリロイル、α−シアノアクリロイル、ビニルスルホニル、α−フルオロアセチル、α−クロロアセチル、α−ブロモアセチル、およびα−ヨードアセチルからなる群から選択され、ここで、Ｒ8は、Ｒ7のＮと結合する］
を有する、
請求項２記載の化合物。
【請求項４】
Ｂｆｌ−１と結合する内部架橋ペプチドであって、当該ペプチドが下記ペプチド：
（ｉ）ＡＥＬＥＶＥＣＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬＮ（配列番号１２２）；
（ｉｉ）ＥＩＷＩＡＱＥＬＲＲＩＧＤＥＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１２３）；
（ｉｉｉ）ＤＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡＱＶＧＤＳＭＤＲＳＩ（配列番号１２４）；
（ｉｖ）ＳＳＴＭＧＱＶＧＲＱＬＡＩＩＧＤＤＩＮＲＲＹ（配列番号１２５）；
（ｖ）ＱＤＡＳＴＫＫＬＳＥＳＬＫＲＩＧＤＥＬＤＳＮＭＥＬ（配列番号１２６）；または
（ｖｉ）ＲＬＡＥＶＣＡＶＬＬＲＬＧＤＥＬＥＭＩＲ（配列番号１２７）
のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面の少なくとも１〜１０個のアミノ酸を含み、
ここで、
（ａ）２、３または６アミノ酸離れている少なくとも一対のアミノ酸の側鎖が連結基Ｒ3に置き換わっており、該連結基はこの一対のアミノ酸のα炭素を連結しており、ここで、
各Ｒ3は、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、エポキシド、１個もしくは２個の−ＯＨ、または１個もしくは２個のアミノヒドロキシル基で置換されていてもよく、
連結基Ｒ3に置き換えられているそれらの側鎖を有する各対のアミノ酸のα炭素のＨは、独立して、Ｃ1〜Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルに置き換えられていてもよく；
（ｂ）配列番号１２２〜１２７の少なくとも１個のアミノ酸は、非天然求電子基含有アミノ酸に置き換えられており；
（ｃ）配列番号１２２〜１２７の１、２、３、４または５個のアミノ酸は、他の天然または非天然アミノ酸によって置換されている、
内部架橋ペプチド。
【請求項５】
（ｉ）Ｒ3がＣ8アルキレンであるか、
（ｉｉ）当該化合物がＢＦＬ−１と結合するか、または
（ｉｉｉ）求電子基が、構造式：
【化３】
2018534240.tif 000003
［式中、
ｎは、０、１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択され；
Ｒ6は、アミン、エーテル、チオエーテル、アミド、カルボニル、酸素、硫黄および炭素からなる群から選択され；
Ｒ7は、窒素含有複素環、置換アニリン、アミンおよびアミノ酸からなる群から選択され；
Ｒ8は、アクリロイル、β−メチルアクリロイル、β−アルキルアクリロイル、α−シアノアクリロイル、ビニルスルホニル、α−フルオロアセチル、α−クロロアセチル、α−ブロモアセチルおよびα−ヨードアセチルからなる群から選択され、ここで、
Ｒ6は、Ｒ7窒素複素環の炭素と結合するアミドであり；
Ｒ7は、カルボニルを介してＲ8と複素環の窒素を介して結合する］
を有する、
請求項４記載の内部架橋ペプチド。
【請求項６】
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、ＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱ（配列番号１２１）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み、ここで、配列番号１２１における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、配列番号１２１の位置７のＦが、より嵩高い側鎖を有するアミノ酸と置換されている、ポリペプチド。
【請求項７】
（ｉ）より嵩高い側鎖を有するアミノ酸が、チロシン、Ｐｈｅ(３−Ｉ)−ＯＨ、Ｐｈｅ(４−Ｉ)−ＯＨおよびＰｈｅ(３,４−Ｃｌ２)−ＯＨからなる群から選択されるか、
（ｉｉ）ポリペプチドが、配列番号１２１における少なくとも２個のアミノ酸がオレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されていることを除けば配列番号１２１のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と同一であるアミノ酸配列を含み、配列番号１２１の位置７のＦがより嵩高い側鎖を有するアミノ酸で置換されているか、
（ｉｉｉ）オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンであるか、または
（ｉｖ）配列番号１２１における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されている、
請求項６記載のポリペプチド。
【請求項８】
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、下記アミノ酸配列：
（ｉ）ＡＥＬＥＶＥＣＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬＮ（配列番号１２２）；
（ｉｉ）ＥＩＷＩＡＱＥＬＲＲＩＧＤＥＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１２３）；
（ｉｉｉ）ＤＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡＱＶＧＤＳＭＤＲＳＩ（配列番号１２４）；
（ｉｖ）ＳＳＴＭＧＱＶＧＲＱＬＡＩＩＧＤＤＩＮＲＲＹ（配列番号１２５）；
（ｖ）ＱＤＡＳＴＫＫＬＳＥＳＬＫＲＩＧＤＥＬＤＳＮＭＥＬ（配列番号１２６）；または
（ｖｉ）ＲＬＡＥＶＣＡＶＬＬＲＬＧＤＥＬＥＭＩＲ（配列番号１２７）
のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９７％同一であるアミノ酸配列を含み、
ここで、当該ポリペプチドは、ＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合し；
ここで、各アミノ酸配列における少なくとも２個のアミノ酸は、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、
ここで、当該ポリペプチド中の少なくとも１個のシステインは、存在する場合には、セリンに置き換えられることができ、ここで、当該ポリペプチド中の少なくとも１個のメチオニンは、存在する場合には、ノルロイシンに置き換えられることができ；
ここで、当該ポリペプチドは、求電子基を担持する非天然アミノ酸、または非アミノ酸ウォーヘッドを含む、
ポリペプチド。
【請求項９】
（ｉ）当該ポリペプチドが、少なくとも５アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満であるか、
（ｉｉ）オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンであるか、
（ｉｉｉ）少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されているか、
（ｉｖ）求電子基を担持する非天然アミノ酸が、当該ポリペプチドのＮ末端にあるか、または
（ｖ）非天然アミノ酸が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有しており、リンカーが、窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、
請求項８記載のポリペプチド。
【請求項１０】
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、
（ｉ）ＪＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号１２８）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み；Ｂｆｌ−１のＣｙｓ５５との共有結合を形成し；配列番号１２８における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、Ｊが、求電子基を担持する非天然アミノ酸、またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドであるか、
（ｉｉ）ＪＥＶＥＳＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号１２９）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み；Ｂｆｌ−１のＣｙｓ５５との共有結合を形成し；配列番号１２９における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、Ｊが、求電子基を担持する非天然アミノ酸、またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドであるか、または
（ｉｉｉ）ＪＩＡＱＥＬＲＲＩＧＤＥＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１３０）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み；Ｂｆｌ−１のＣｙｓ５５との共有結合を形成し；配列番号１３０における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、Ｊが、求電子基を担持する非天然アミノ酸、またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドである、
ポリペプチド。
【請求項１１】
アミノ酸配列が、配列番号１３０、配列番号１２９または配列番号１２８に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも７０％または少なくとも８０％同一であり、
（ｉ）オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンであるか、
（ｉｉ）少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されているか、または
（ｉｉｉ）求電子基を担持する非天然アミノ酸が、(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−３−カルボキサミド；１−アクリロピペリジン−４−カルボキサミド；(Ｒ)−１−アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｒ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｅ)−４−(ジメチルアミノ)ブタ−２−エンアミド；およびアクリルアミドからなる群から選択される、
請求項１０記載のポリペプチド。
【請求項１２】
アミノ酸配列：
（ｉ）ＪＥＶＥＳＡＴＱＬＲＸＦＧＤＸＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号２４）；
（ｉｉ）ＪＩＡＱＥＬＲＸＩＧＤＸＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号３０）；または
（ｉｉｉ）ＪＡＴ８ＬＲＲＦＧＤＸＬＮＦＲＱ（配列番号６２）
［ここで、Ｊは、非天然の求電子基含有アミノ酸またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドであり、Ｘは、非天然アミノ酸であり、８は、Ｒ−オクテニルアラニンである］
を含む、請求項４記載のポリペプチド。
【請求項１３】
（ｉ）ポリペプチドが、少なくとも１０アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満であるか、または
（ｉｉ）非天然求電子基が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有し、リンカーが、窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、
請求項１１または１２記載のポリペプチド。
【請求項１４】
（ｉ）各Ｘが、同一の非天然アミノ酸であるか、
（ｉｉ）Ｘが、異なる非天然アミノ酸を示すか、または
（ｉｉｉ）各Ｘが、Ｓ−ペンテニルアラニンである、
請求項１２または１３記載のポリペプチド。
【請求項１５】
請求項１記載のポリペプチド、請求項２もしくは３記載の化合物、請求項４もしくは５記載の内部架橋ペプチド、または請求項６〜１４いずれか１項記載のポリペプチド、および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
【請求項１６】
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１発現癌またはＢＦＬ−１依存癌（ここで、該癌は、メラノーマ、リンパ腫または白血病であってもよい）の処置に用いるための、請求項１記載のポリペプチド、請求項２もしくは３記載の化合物、請求項４もしくは５記載の内部架橋ペプチド、請求項６〜１４いずれか１項記載のポリペプチド、または請求項１５記載の医薬組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００９】
いくつかの実施態様において、内部架橋ペプチドは、配列番号１〜７または３７〜４０からなる群から選択されるポリペプチドを修飾することによって（例えば、アミノ酸置換によって）調製され得る。いくつかの実施態様において、内部ステープルは、２個のアミノ酸の側鎖と置き換わり、すなわち、各ステープルは、例えば３、４または６アミノ酸離れている、２個のアミノ酸の間にある。いくつかの実施態様において、内部ステッチは、３個のアミノ酸の側鎖と置き換わり、すなわち、該ステッチは、例えば３および６アミノ酸離れている、３個のアミノ酸の間の一対の架橋である。いくつかの実施態様において、該内部ステープルおよび／または内部ステッチは、（４個のアミノ酸の側鎖と置き換わり、すなわち、各ステープルが、例えば３アミノ酸離れている、２個のアミノ酸の間にある）少なくとも２つの内部ステープルを含む。いくつかの実施態様において、該内部ステープルおよび／または内部ステッチは、少なくとも１つの内部ステープルと内部ステッチとの組み合わせを含む。いくつかの実施態様において、該内部ステッチは、第１のアミノ酸の側鎖ならびに第２および第３のアミノ酸と置き換わり、これによって、（第２のアミノ酸と第３のアミノ酸の間にある）第１のアミノ酸と第２および第３のアミノ酸とを内部架橋を介して架橋する（ここで、第１のアミノ酸と第２のアミノ酸は、２、３または６アミノ酸離れており、第１のアミノ酸と第３のアミノ酸は、２、３または６アミノ酸離れており、第２のアミノ酸と第３のアミノ酸は、別々のアミノ酸である。いくつかの実施態様において、本開示の４個のアミノ酸の側鎖は、２つの別々の内部ステープルに置き換えられている。いくつかの実施態様において、当該２つの別々の内部ステープルの１つ目は、２、３または６アミノ酸離れている第１の対のアミノ酸と架橋し、少なくとも２つの別々の内部ステープルのうち２つ目は、２、３または６アミノ酸離れている第２の対のアミノ酸を架橋する。いくつかの実施態様において、本開示の内部架橋ポリペプチドは、配列番号１〜７または３７〜４０からなる群；配列番号１〜７または３７〜４０からなり、アミノ末端またはカルボキシ末端修飾を有する群；ならびに配列番号１〜７または３７〜４０からなり、１、２、３、４または５つのアミノ酸置換（例えば、１、２、３、４または５個のアミノ酸が保存的にまたは非保存的に置換されている）群から選択されるポリペプチドから調製される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３９】
アミノ酸配列の間の同一性率を決定する方法は、当該技術分野で知られている。例えば、当該配列は、最適な比較目的のために整列される（例えば、最適な整列のために第１および第２のアミノ酸または核酸配列の１つまたは両方にギャップを導入することができ、非相同配列は、比較目的のために無視され得る）。好ましい実施態様において、比較目的のために整列された参照配列の長さは、当該参照配列の長さの少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、さらに好ましくは少なくとも６０％、さらにより好ましくは少なくとも７０％、８０％、９０％、または１００％である。次に、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置でのアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第１の配列における位置が第２の配列における対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められている場合、当該分子は、その位置で同一である。２個のアミノ酸配列の間の同一性率の決定は、ＢＬＡＳＴ  ２.０プログラムを用いて行われる。配列比較は、非ギャップ整列を使用し、かつ、デフォルトパラメータ（Ｂｌｏｓｓｏｍ６２マトリックス、ギャップ存在コスト（gap existence cost）１１、残基ごとのギャップコスト（per residue gapped cost）１、およびラムダ比０.８５）を使用して行われる。ＢＬＡＳＴプログラムにおいて使用される数学アルゴリズムは、Altschul et al. によって記載されている（Nucleic Acids Res. 25:3389-3402, 1997）。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１５６】
他の実施態様
本発明は、その詳細な説明と共に記載されているが、前述の説明は、添付の特許請求の範囲によって定義される本発明の範囲を例示するものであって限定するものではないことを理解されるべきである。他の態様、利点、および改変は、下記の発明および以下の特許請求の範囲の範囲内である。
［発明１］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが配列番号２２〜３６、図１８、または配列番号４１〜１１９に記載のアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
［発明２］
式Ｉ：
【化２】
2018534240.tif 000004
［式中、
（ａ）
（ｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＥＶＥＳＡＴＱＬＲ（配列番号１３７）、Ｒ9−ＡＴＱＬＲ（配列番号１３８）、Ｒ9−ＶＥＳＡＴＱＬＲ（配列番号１３９）、Ｒ9−ＥＳＡＴＱＬＲ（配列番号１４０）、およびＲ9−ＳＡＴＱＬＲ（配列番号１４１）からなる群から選択され；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＦＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＬＮＦＲ（配列番号１４２）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱ（配列番号１４３）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱＫ（配列番号１４４）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号１４５）−Ｒ10、ＬＮＦＲＱＫＬ（配列番号１７２）−Ｒ10、およびＬＮＦＲＱＫＬＬＫ−Ｒ10（配列番号１４６）からなる群から選択されるか；または
（ｉｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＩＡＱＥＬＲ（配列番号１４７）、Ｒ9−ＡＱＥＬＲ（配列番号１４８）、およびＲ9−ＡＱＥＬＲ（配列番号１４９）からなる群から選択され；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＩＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＦＮＡＹＹＡＲＫ（配列番号１５０）−Ｒ10またはＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１５１）−Ｒ10であるか；または
（ｉｉｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＬＳＥＳＬＫ（配列番号１５２）またはＲ9−ＳＥＳＬＫ（配列番号１５３）であり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＩＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＬＤＳＮＫ（配列番号１５４）−Ｒ10またはＬＤＳＮ（配列番号１５５）−Ｒ10であるか；または
（ｉｖ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＶＧまたはＲ9−Ｇであり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＱＬＡであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＩＧＤＤＩＮＲＲ（配列番号１５６）−Ｒ10またはＩＧＤＤＩＮＲ（配列番号１５７）−Ｒ10であるか；または
（ｖ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＰＧＧＲＬＡＥＶＣＴＶＬＬＲ（配列番号１５８）またはＲ9−ＧＧＲＬＡＥＶＣＴＶＬＬＲ（配列番号１５９）であり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＬＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＥＬＥＱＩＲＰＳ（配列番号１６０）−Ｒ10またはＥＬＥＱＩＲ（配列番号１６１）−Ｒ10であるか；または
（ｖｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＤＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡ（配列番号１６２）またはＲ9−ＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡ（配列番号１６３）であり；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＶＧＤであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＢＤＲＳＩ（配列番号１６４）−Ｒ10またはＢＤＲＳＩＲ（配列番号１６５）−Ｒ10であり、ここで、Ｂは、ノルロイシンであるか；または
（ｖｉｉ）
[Ｘａａ]ｗは、Ｒ9−ＥＱＷＡＲＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６６）、Ｒ9−ＱＷＡＲＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６７）、Ｒ9−ＲＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６８）、およびＲ9−ＥＩＧＡＱＬＲ（配列番号１６９）からなる群から選択され；
[Ｘａａ]ｘは、アミノ酸配列ＭＡＤであり、ここで、Ｍはメチオニンまたはノルロイシンであり；
[Ｘａａ]ｙは、ＬＮＡＱＹ（配列番号１７０）−Ｒ10またはＬＮＡＱＹＥ（配列番号１７１）−Ｒ10であり；
（ｂ）
Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｃ1〜Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり；
Ｒ3は、Ｃ8アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、エポキシド、１個もしくは２個の−ＯＨ、または１個もしくは２個のアミノヒドロキシル基で置換されていてもよく；
ここで、（ａ）（ｉ）〜（ｖｉｉ）において、
Ｒ9は、非天然求電子基含有アミノ酸であり；
Ｒ10は、細胞透過性増強基（例えば、荷電の分布または疎水特性を変化またはシフトさせるアミノ酸）または安定性増強基（例えば、非天然、Ｄ、またはαメチルアミノ酸点変異）であり；
具体的なアミノ酸のうち１、２、３、４または５つは別のアミノ酸によって置換されていてもよい］
で示される化合物。
［発明３］
Ｒ9が、アクリルアミドの末端にある３Ｓ−１−ピロリジン−３−カルボン酸；アクリルアミドの末端にあるＤ−ホモプロリン；アクリルアミドの末端にあるＬ−ホモプロリン；アクリルアミドの末端にあるイソニペコチン酸；アクリルアミドの末端にあるＤ−ニペコチン酸；アクリルアミドの末端にあるＬ−ニペコチン酸；アクリルアミドの末端にあるＤ−プロリン；アクリルアミドの末端にあるＬ−プロリン；アクリルアミドの末端にあるtrans−４−ジメチルアミノクロトン酸；およびアクリル酸からなる群から選択される、発明２記載の化合物。
［発明４］
Ｒ3がＣ8アルキレンである、発明２記載の化合物。
［発明５］
当該化合物がＢＦＬ−１と結合し、好ましくは、当該化合物がＢＦＬ−１と共有結合する、発明２記載の化合物。
［発明６］
Ｂｆｌ−１と結合する内部架橋ペプチドであって、当該ポリペプチドが下記ポリペプチド：
（ｉ）ＡＥＬＥＶＥＣＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬＮ（配列番号１２２）；
（ｉｉ）ＥＩＷＩＡＱＥＬＲＲＩＧＤＥＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１２３）；
（ｉｉｉ）ＤＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡＱＶＧＤＳＭＤＲＳＩ（配列番号１２４）；
（ｉｖ）ＳＳＴＭＧＱＶＧＲＱＬＡＩＩＧＤＤＩＮＲＲＹ（配列番号１２５）；
（ｖ）ＱＤＡＳＴＫＫＬＳＥＳＬＫＲＩＧＤＥＬＤＳＮＭＥＬ（配列番号１２６）；または
（ｖｉ）ＲＬＡＥＶＣＡＶＬＬＲＬＧＤＥＬＥＭＩＲ（配列番号１２７）
のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面の少なくとも１〜１０（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０）個のアミノ酸を含み、
ここで、
（ａ）２、３または６アミノ酸離れている少なくとも一対のアミノ酸の側鎖が連結基Ｒ3に置き換わっており、該連結基はこの一対のアミノ酸のα炭素を連結しており、ここで、
各Ｒ3は、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、エポキシド、１個もしくは２個の−ＯＨ、または１個もしくは２個のアミノヒドロキシル基で置換されていてもよく、
連結基Ｒ3に置き換えられているそれらの側鎖を有する各対のアミノ酸のα炭素のＨは、独立して、Ｃ1〜Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルに置き換えられていてもよく；
（ｂ）配列番号１〜７、３７〜４０、または１２０の少なくとも１個のアミノ酸は、非天然求電子基含有アミノ酸に置き換えられており；
（ｃ）配列番号１〜７、３７〜４０、または１２０の１、２、３、４または５個のアミノ酸は、他の天然または非天然アミノ酸によって置換されている、
内部架橋ペプチド。
［発明７］
Ｒ3がＣ8アルキレンである、発明６記載の内部架橋ペプチド。
［発明８］
当該化合物がＢＦＬ−１と結合する、発明６記載の内部架橋ペプチド。
［発明９］
ＢＦＬ−１の発現を示す癌に罹患している患者を処置する方法であって、当該方法が当該患者に発明１記載の化合物の治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明１０］
癌がメラノーマまたは他の固形腫瘍である、発明９記載の方法。
［発明１１］
癌が白血病またはリンパ腫である、発明９記載の方法。
［発明１２］
ＢＦＬ−１の発現を示す癌に罹患している患者を処置する方法であって、当該方法が当該患者に発明６記載の内部架橋ペプチドの治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明１３］
ＢＦＬ−１への依存性を示す癌に罹患している患者を処置する方法であって、当該方法が当該患者に発明１記載の化合物の治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明１４］
癌がメラノーマまたは他の固形腫瘍である、発明１３記載の方法。
［発明１５］
癌が白血病またはリンパ腫である、発明１３記載の方法。
［発明１６］
癌がＢＦＬ−１の発現を示す、発明１３記載の方法。
［発明１７］
Ｒ9が、構造式：
【化３】
2018534240.tif 000005
［式中、
Ｒ4およびＲ5のうち１つは、アミン、エーテル、チオエーテル、カルボニル、アミド、炭素または水素から選択される化合物の残部と結合し、他方はＨであり、
ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択され；
Ｒ6は、アミン、エーテル、チオエーテル、アミドおよび炭素からなる群から選択され；
Ｒ7は、窒素含有複素環、置換アニリン、およびアミンからなる群から選択され；
Ｒ8は、アクリロイル、β−メチルアクリロイル、β−アルキルアクリロイル、α−シアノアクリロイル、ビニルスルホニル、α−フルオロアセチル、α−クロロアセチル、α−ブロモアセチル、およびα−ヨードアセチルからなる群から選択され、ここで、Ｒ8は、Ｒ7のＮと結合する］
を有する、発明１記載の化合物。
［発明１８］
求電子基が、構造式：
【化４】
2018534240.tif 000006
［式中、
ｎは、０、１、２、３、４、５、６、７、８および９からなる群から選択され；
Ｒ6は、アミン、エーテル、チオエーテル、アミド、カルボニル、酸素、硫黄および炭素からなる群から選択され；
Ｒ7は、窒素含有複素環、置換アニリン、アミンおよびアミノ酸からなる群から選択され；
Ｒ8は、アクリロイル、β−メチルアクリロイル、β−アルキルアクリロイル、α−シアノ アクリロイル、ビニルスルホニル、α−フルオロアセチル、α−クロロアセチル、α−ブロモアセチルおよびα−ヨードアセチルからなる群から選択され、ここで、
Ｒ6は、Ｒ7窒素複素環の炭素と結合するアミドであり；
Ｒ7は、カルボニルを介してＲ8と複素環の窒素を介して結合する］
を有する、発明６記載の化合物。
［発明１９］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、ＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱ（配列番号１２１）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み、ここで、配列番号１２１における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、配列番号１２１の位置７のＦが、より嵩高い側鎖を有するアミノ酸と置換されている、ポリペプチド。
［発明２０］
より嵩高い側鎖を有するアミノ酸が、チロシン、Ｐｈｅ(３−Ｉ)−ＯＨ、Ｐｈｅ(４−Ｉ)−ＯＨおよびＰｈｅ(３,４−Ｃｌ２)−ＯＨからなる群から選択される、発明１９記載のポリペプチド。
［発明２１］
ポリペプチドが、配列番号１２１における少なくとも２個のアミノ酸がオレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されていることを除けば配列番号１２１のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と同一であるアミノ酸配列を含み、配列番号１２１の位置７のＦがより嵩高い側鎖を有するアミノ酸で置換されている、発明１９または２０記載のポリペプチド。
［発明２２］
オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンである、発明１９〜２１いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明２３］
配列番号１２１における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されている、発明１９〜２１いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明２４］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、下記アミノ酸配列：
（ｉ）ＡＥＬＥＶＥＣＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬＮ（配列番号１２２）；
（ｉｉ）ＥＩＷＩＡＱＥＬＲＲＩＧＤＥＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１２３）；
（ｉｉｉ）ＤＩＩＲＮＩＡＲＨＬＡＱＶＧＤＳＭＤＲＳＩ（配列番号１２４）；
（ｉｖ）ＳＳＴＭＧＱＶＧＲＱＬＡＩＩＧＤＤＩＮＲＲＹ（配列番号１２５）；
（ｖ）ＱＤＡＳＴＫＫＬＳＥＳＬＫＲＩＧＤＥＬＤＳＮＭＥＬ（配列番号１２６）；または
（ｖｉ）ＲＬＡＥＶＣＡＶＬＬＲＬＧＤＥＬＥＭＩＲ（配列番号１２７）
のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％ ７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または９７％同一であるアミノ酸配列を含み、
ここで、当該ポリペプチドは、ＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合し；
ここで、各アミノ酸配列における少なくとも２個のアミノ酸は、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、
ここで、当該ポリペプチド中の少なくとも１個のシステインは、存在する場合には、セリンに置き換えられることができ、ここで、当該ポリペプチド中の少なくとも１個のメチオニンは、存在する場合には、ノルロイシンに置き換えられることができ；
ここで、当該ポリペプチドは、求電子基を担持する非天然アミノ酸、または非アミノ酸ウォーヘッドを含む、
ポリペプチド。
［発明２５］
当該ポリペプチドが、少なくとも５アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満である、発明２４記載のポリペプチド。
［発明２６］
オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンである、発明２４または２５記載のポリペプチド。
［発明２７］
少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されている、発明２４または２５記載のポリペプチド。
［発明２８］
求電子基を担持する非天然アミノ酸が、当該ポリペプチドのＮ末端にある、発明２４〜２７いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明２９］
非天然アミノ酸が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有しており、リンカーが、窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、発明２４〜２８いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明３０］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、配列番号２２−３６、図１８または配列番号４１−１１９に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％ ７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列を含む、ポリペプチド。
［発明３１］
発明３０記載のポリペプチド、および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
［発明３２］
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１発現癌の処置方法であって、当該方法が、当該ヒト対象体に発明３０記載のポリペプチドまたは発明３１記載の医薬組成物の治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明３３］
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１依存癌の処置方法であって、当該方法が、当該ヒト対象体に発明３０記載のポリペプチドまたは発明３１記載の医薬組成物の治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明３４］
ヒト対象体が、さらに、化学療法、放射線療法、免疫療法もしくは他の癌処置様式、またはその組み合わせを施される、発明３２または３３記載の方法。
［発明３５］
癌が、メラノーマ、リンパ腫および白血病からなる群から選択される、発明３２〜３４いずれか１つ記載の方法。
［発明３６］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、ＪＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号１２８）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み；Ｂｆｌ−１のＣｙｓ５５との共有結合を形成し；配列番号１２８における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、Ｊが、求電子基を担持する非天然アミノ酸、またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドである、ポリペプチド。
［発明３７］
アミノ酸配列が、配列番号１２８に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも７０％同一である、発明３６記載のポリペプチド。
［発明３８］
アミノ酸配列が、配列番号１２８に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも８０％である、発明３６記載のポリペプチド。
［発明３９］
ポリペプチドが、少なくとも５アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満である、発明３６〜３８いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明４０］
オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンである、発明３６〜３９いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明４１］
少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されている、発明３６〜３９いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明４２］
非天然アミノ酸が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有しており、リンカーが、窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、発明３６〜４１いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明４３］
求電子基を担持する非天然アミノ酸が、(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−３−カルボキサミド；１−アクリロピペリジン−４−カルボキサミド,(Ｒ)−１ アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｒ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｅ)−４−(ジメチルアミノ)ブタ−２−エンアミド；およびアクリルアミドからなる群から選択される、発明３６〜４１いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明４４］
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１発現癌またはＢｆｌ−１依存癌の処置方法であって、当該方法が、ヒト対象体に発明３６〜４３いずれか１つ記載のポリペプチドの治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明４５］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、ＪＥＶＥＳＡＴＱＬＲＲＦＧＤＫＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号１２９）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み；Ｂｆｌ−１のＣｙｓ５５との共有結合を形成し；配列番号１２９における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、Ｊが、求電子基を担持する非天然アミノ酸、またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドである、ポリペプチド。
［発明４６］
アミノ酸配列が、配列番号１２９に記載のアミノ酸配列のヘリックスのＢｆｌ−１相互作用面と少なくとも６０％同一である、発明４５記載のポリペプチド。
［発明４７］
アミノ酸配列が、配列番号１２９に記載のアミノ酸配列のヘリックスのＢｆｌ−１相互作用面と少なくとも８０％同一である、発明４５記載のポリペプチド。
［発明４８］
ポリペプチドが、少なくとも５アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満である、発明４５〜４７いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明４９］
オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンである、発明４５〜４８いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明５０］
少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されている、発明４５〜４８いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明５１］
非天然アミノ酸が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有し、リンカーが窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、発明４５〜５０いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明５２］
求電子基を担持する非天然アミノ酸が、(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−３−カルボキサミド；１−アクリロピペリジン−４−カルボキサミド；(Ｒ)−１−アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｒ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｅ)−４−(ジメチルアミノ)ブタ−２−エンアミド；およびアクリルアミドからなる群から選択される、発明４５〜５０いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明５３］
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１発現癌またはＢｆｌ−１依存癌の処置方法であって、当該方法が、当該ヒト対象体に発明４５〜５２いずれか１つ記載のポリペプチドの治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明５４］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、ＪＩＡＱＥＬＲＲＩＧＤＥＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号１３０）のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％または９７％同一であるアミノ酸配列であってＭＣＬ−１よりもＢｆｌ−１と選択的に結合するアミノ酸配列を含み；Ｂｆｌ−１のＣｙｓ５５との共有結合を形成し；配列番号１３０における少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸によって置換されており、Ｊが、求電子基を担持する非天然アミノ酸、またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドである、ポリペプチド。
［発明５５］
アミノ酸配列が、配列番号１３０に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも７０％同一である、発明５４記載のポリペプチド。
［発明５６］
アミノ酸配列が、配列番号１３０に記載のアミノ酸配列のＢｆｌ−１相互作用αヘリックス面と少なくとも８０％同一である、発明５４記載のポリペプチド。
［発明５７］
ポリペプチドが、少なくとも１０アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満である、発明５４〜５６いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明５８］
オレフィン側鎖を有する非天然アミノ酸がともにＳ−ペンテニルアラニンである、発明５４〜５７いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明５９］
少なくとも２個のアミノ酸が、オレフィン側鎖を有する別の非天然アミノ酸によって置換されている、発明５４〜５７いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明６０］
非天然アミノ酸が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有しており、リンカーが、窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、発明５４〜５９いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明６１］
求電子基を担持する非天然アミノ酸が、(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−３−カルボキサミド；１−アクリロピペリジン−４−カルボキサミド,(Ｒ)−１ アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピペリジン−３−カルボキサミド；(Ｓ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｒ)−１−アクリロイルピロリジン−２−カルボキサミド；(Ｅ)−４−(ジメチルアミノ)ブタ−２−エンアミド；およびアクリルアミドからなる群から選択される、発明５４〜５９いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明６２］
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１発現癌またはＢｆｌ−１依存癌の処置方法であって、当該方法が、当該ヒト対象体に発明５４〜６１いずれか１つ記載のポリペプチドの治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明６３］
Ｂｆｌ−１と結合するポリペプチドであって、当該ポリペプチドが、アミノ酸配列：
（ｉ）ＪＥＶＥＳＡＴＱＬＲＸＦＧＤＸＬＮＦＲＱＫＬＬ（配列番号２４）；
（ｉｉ）ＪＩＡＱＥＬＲＸＩＧＤＸＦＮＡＹＹＡＲＲ（配列番号３０）；または
（ｉｉｉ）ＪＡＴ８ＬＲＲＦＧＤＸＬＮＦＲＱ（配列番号６２）
［ここで、Ｊは、非天然の求電子基含有アミノ酸またはアミノ酸を含まない求電子ウォーヘッドであり、Ｘは、非天然アミノ酸であり、８は、Ｒ−オクテニルアラニンである］
を含む、ポリペプチド。
［発明６４］
ポリペプチドが、少なくとも１０アミノ酸長であって、１００、７５、５０または３０アミノ酸長未満である、発明６３記載のポリペプチド。
［発明６５］
非天然求電子基が、当該ポリペプチド骨格と連結されている求電子アクリルアミドまたは置換アクリルアミドを有し、リンカーが、窒素含有複素環窒素含有複素環アミノ酸またはアミノ官能化ベンゼン環、炭素環、多環またはヘテロ環である、発明６３または６４記載のポリペプチド。
［発明６６］
各Ｘが、同一の非天然アミノ酸である、発明６３〜６５いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明６７］
Ｘが、異なる非天然アミノ酸を示す、発明６３〜６５いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明６８］
各Ｘが、Ｓ−ペンテニルアラニンである、発明６３〜６５いずれか１つ記載のポリペプチド。
［発明６９］
発明６３〜６８いずれか１つ記載のポリペプチド、および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
［発明７０］
ヒト対象体におけるＢＦＬ−１発現癌またはＢｆｌ−１依存癌の処置方法であって、当該方法が、当該ヒト対象体に発明６３〜６８いずれか１つ記載のポリペプチドまたは発明６９記載の医薬組成物の治療有効量を投与することを含む、方法。
［発明７１］
癌が、メラノーマ、リンパ腫または白血病である、発明７０記載の方法。
［発明７２］
発明３０記載のポリペプチドによる処置のためにヒト対象体を選択する方法であって、当該方法が、
（ａ）ヒト対象体から腫瘍を含む生体試料を得ること；
（ｂ）当該腫瘍試料がＢｆｌ−１を発現することを決定すること、および
（ｃ）発明３０に記載のポリペプチドによる処置のために当該対象体を選択すること
を含む、方法。
［発明７３］
対象体がＢｆｌ−１発現または依存癌を有するかどうかを決定する方法であって、当該方法が、
（ａ）ヒト対象体から腫瘍を含む生体試料を得ること；
（ｂ）発明３０記載のポリペプチドが腫瘍由来のタンパク質を共有結合的に修飾することを決定すること；および
（ｃ）当該対象体がＢｆｌ−１発現または依存癌を有することを決定すること
を含む、方法。
［発明７４］
さらに、ヒト対象体に発明３０記載のポリペプチドを投与することを含む、発明７２または７３記載の方法。