【手続補正書】
【提出日】令和1年9月6日(2019.9.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）配列番号１のアミノ酸位置３３５に対応するアミノ酸位置においてプロリン、（ｂ）配列番号１のアミノ酸位置３３６に対応する位置においてヒスチジンまたはアスパラギン酸、および（ｃ）配列番号１のアミノ酸位置３３７に対応する位置においてセリンを含んでなるアミノ酸配列からなる４−ヒドロキシフェニルピルビン酸ジオキシゲナーゼ（ＨＰＰＤ）ポリペプチドをコードする組換え核酸分子であって、前記ＨＰＰＤポリペプチドが１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対する耐性を有する、組換え核酸分子。
【請求項２】
前記コードされたＨＰＰＤポリペプチドが、
ｉ．配列番号１のアミノ酸位置２０４に対応するアミノ酸位置においてメチオニン、スレオニン、セリン、またはロイシン；および／または
ｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２１３に対応するアミノ酸位置においてリジンまたはロイシン；および／または
ｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６４に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、リジン、グルタミン、またはロイシン；および／または
ｉｖ．配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、グリシン、またはセリン；および／または
ｖ．配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、ロイシン、グルタミン酸、プロリンまたはセリン；および／または
ｖｉ．配列番号１のアミノ酸位置３１０に対応するアミノ酸位置においてセリン、ヒスチジン、またはリジン；および／または
ｖｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３１５に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、メチオニンまたはヒスチジン；および／または
ｖｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３０に対応するアミノ酸位置においてヒスチジン、アラニン、フェニルアラニン、バリン、またはグリシン；および／または
ｉｘ．配列番号１のアミノ酸位置３３１に対応するアミノ酸位置においてプロリン、ヒスチジン、セリン、イソロイシン、またはロイシン；および／または
ｘ．配列番号１のアミノ酸位置３３８に対応するアミノ酸位置においてバリン；および／または
ｘｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３９に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸、アルギニン、アラニン、またはスレオニン；および／または
ｘｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３４０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、グルタミン、メチオニン、グルタミン酸、グリシン、ロイシン、またはバリン；および／または
ｘｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３４４に対応するアミノ酸位置においてグルタミン、プロリン、またはアルギニン；および／または
ｘｉｖ．配列番号１のアミノ酸の位置３４５に対応するアミノ酸の位置においてリジン、アルギニン、メチオニン、アラニン、またはバリン、
をさらに含んでなるアミノ酸配列からなり、前記ＨＰＰＤタンパク質が１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対して耐性を有する、
請求項１に記載の組換え核酸分子。
【請求項３】
前記コードされたＨＰＰＤタンパク質が、
ｉ．配列番号１のアミノ酸位置２１３に対応するアミノ酸位置においてロイシンまたはリジン；および／または
ｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６４に対応するアミノ酸位置においてアルギニンまたはロイシン；および／または
ｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、グリシン、またはセリン；および／または
ｉｖ．配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸またはセリン；および／または
ｖ．配列番号１のアミノ酸位置３１５に対応するアミノ酸位置においてアルギニンまたはメチオニン；および／または
ｖｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３０に対応するアミノ酸位置においてヒスチジン；および／または
ｖｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３８に対応するアミノ酸位置においてバリン；および／または
ｖｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３４０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、またはバリン；および／または
ｉｘ．配列番号１のアミノ酸位置３４４に対応するアミノ酸位置においてグルタミン；および／または
ｘ．配列番号１のアミノ酸の位置３４５に対応するアミノ酸の位置においてリジン、バリン、またはメチオニン、
をさらに含んでなるアミノ酸配列からなり、前記ＨＰＰＤタンパク質が１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対して耐性を有する、
請求項１に記載の組換え核酸分子。
【請求項４】
前記コードされたＨＰＰＤタンパク質が、
ｉ．配列番号１のアミノ酸位置２１３に対応するアミノ酸位置においてリジン；および／または
ｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６４に対応するアミノ酸位置においてアルギニンまたはロイシン；および／または
ｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてグリシンまたはアルギニン；および／または
ｉｖ．配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸；および／または
ｖ．配列番号１のアミノ酸位置３１５に対応するアミノ酸位置においてアルギニン；および／または
ｖｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３０に対応するアミノ酸位置においてヒスチジン；および／または 
ｖｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３８に対応するアミノ酸位置においてバリン；および／または
ｖｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸の位置３４０に対応するアミノ酸の位置においてアルギニン、またはバリン；および／または
ｉｘ．配列番号１のアミノ酸位置３４４に対応するアミノ酸位置においてグルタミン；および／または
ｘ．配列番号１のアミノ酸の位置３４５に対応するアミノ酸の位置においてリジン、バリン、またはメチオニン
をさらに含んでなるアミノ酸配列からなり、前記ＨＰＰＤタンパク質が１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対して耐性を有する、
請求項１に記載の組換え核酸分子。
【請求項５】
前記コードされたＨＰＰＤタンパク質が、配列番号１に示されたアミノ酸配列と少なくとも５３％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる、請求項１、２、３、または４に記載の組換え核酸分子。
【請求項６】
前記ヌクレオチド配列が、植物内で発現するように設計された合成配列である、請求項１〜５のいずれかに記載の組換え核酸分子。
【請求項７】
前記ヌクレオチド配列が、植物細胞内でヌクレオチド配列の発現を誘導可能なプロモーターに操作可能に連結している、請求項１〜５のいずれかに記載の組換え核酸分子。
【請求項８】
前記ＨＰＰＤ阻害型除草剤が、トリケトン類、ジケトニトリル類、イソキサゾール類、ヒドロキシピラゾール類、Ｎ−（１，２，５−オキサジアゾール−３−イル）ベンズアミド類、Ｎ−（１，３，４−オキサジアゾール−２−イル）ベンズアミド類、Ｎ−（テトラゾール−５−イル）−またはＮ−（トリアゾール−５−イル）アリールカルボキサミド類、ピリダジノン誘導体、オキソピラジン誘導体、Ｎ−（トリアゾール−２−イル）アリールカルボキサミド類、トリアジノン類、ピラゾロン類からなる群から選択される、請求項１〜５のいずれかに記載の組換え核酸分子。
【請求項９】
前記ＨＰＰＤ阻害型除草剤が、ベンゾビシクロン、スルコトリオン、メソトリオン、テンボトリオン、テフリルトリオン、ビシクロピロン、フェンキノトリオン、イソキサフルトール、ジケトニトリル、ピラゾキシフェン、ベンゾフェナップ、ピラゾリネート、ピラスルホトール、トプラメゾン、トルピラレート、２−メチル−Ｎ−（５−メチル−１，３，４−オキサジアゾール−２−イル）−３−（メチルスルホニル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミド、２−クロロ−３−エトキシ−４−（メチルスルホニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ベンズアミド、４−（ジフルオロメチル）−２−メトキシ−３−（メチルスルホニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ベンズアミド、２−クロロ−３−（メチルスルファニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミド、および２−（メトキシメチル）−３−（メチルスルフィニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミドからなる群から選択される、請求項８に記載の組換え核酸分子。
【請求項１０】
請求項１、２、３または４に記載の組換え核酸分子を含む宿主細胞。
【請求項１１】
細菌宿主細胞である、請求項１０に記載の宿主細胞。
【請求項１２】
植物細胞である、請求項１０に記載の宿主細胞。
【請求項１３】
請求項１、２、３または４に記載の組換え核酸分子を含んでなるトランスジェニック植物。
【請求項１４】
前記植物が、トウモロコシ、モロコシ、コムギ、ヒマワリ、トマト、アブラナ科植物、コショウ、ジャガイモ、ワタ、コメ、ダイズ、サトウダイコン、サトウキビ、タバコ、オオムギ、およびアブラナからなる群より選択される、請求項１３に記載の植物。
【請求項１５】
請求項１、２、３または４に記載の組換え核酸分子を含んでなるトランスジェニック種子。
【請求項１６】
ＨＰＰＤポリペプチドを含んでなる組換えポリペプチドであって、前記ＨＰＰＤポリペプチドが１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対する耐性を有し、前記ＨＰＰＤポリペプチドが（ａ）配列番号１のアミノ酸位置３３５に対応するアミノ酸位置においてプロリン、（ｂ）配列番号１のアミノ酸位置３３６に対応する位置においてヒスチジンまたはアスパラギン酸、および（ｃ）配列番号１のアミノ酸位置３３７に対応する位置においてセリンを含んでなる、組換えポリペプチド。
【請求項１７】
前記ＨＰＰＤタンパク質が、
ｉ．配列番号１のアミノ酸位置２０４に対応するアミノ酸位置においてメチオニン、スレオニン、セリン、またはロイシン；および／または
ｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２１３に対応するアミノ酸位置においてリジンまたはロイシン；および／または
ｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６４に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、リジン、グルタミン、またはロイシン；および／または
ｉｖ．配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、グリシン、またはセリン；および／または
ｖ．配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、ロイシン、グルタミン酸、プロリンまたはセリン；および／または
ｖｉ．配列番号１のアミノ酸位置３１０に対応するアミノ酸位置においてセリン、ヒスチジン、またはリジン；および／または
ｖｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３１５に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、メチオニンまたはヒスチジン；および／または
ｖｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３０に対応するアミノ酸位置においてヒスチジン、アラニン、フェニルアラニン、バリン、またはグリシン；および／または
ｉｘ．配列番号１のアミノ酸位置３３１に対応するアミノ酸位置においてプロリン、ヒスチジン、セリン、イソロイシン、またはロイシン；および／または
ｘ．配列番号１のアミノ酸位置３３８に対応するアミノ酸位置においてバリン；および／または
ｘｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３９に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸、アルギニン、アラニン、またはスレオニン；および／または
ｘｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３４０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、グルタミン、メチオニン、グルタミン酸、グリシン、ロイシン、またはバリン；および／または
ｘｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３４４に対応するアミノ酸位置においてグルタミン、プロリン、またはアルギニン；および／または
ｘｉｖ．配列番号１のアミノ酸の位置３４５に対応するアミノ酸位置においてリジン、アルギニン、メチオニン、アラニン、またはバリン、
をさらに含んでなり、前記ＨＰＰＤポリペプチドが１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対して耐性を有する、
請求項１６に記載の組換えポリペプチド。
【請求項１８】
前記ＨＰＰＤタンパク質が、
ｉ．配列番号１のアミノ酸位置２１３に対応するアミノ酸位置においてロイシンまたはリジン；および／または
ｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６４に対応するアミノ酸位置においてアルギニンまたはロイシン；および／または
ｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、グリシン、またはセリン；および／または
ｉｖ．配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸またはセリン；および／または
ｖ．配列番号１のアミノ酸位置３１５に対応するアミノ酸位置においてアルギニンまたはメチオニン；および／または
ｖｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３０に対応するアミノ酸位置においてヒスチジン；および／または
ｖｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３８に対応するアミノ酸位置においてバリン；および／または 
ｖｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３４０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、またはバリン；および／または
ｉｘ．配列番号１のアミノ酸位置３４４に対応するアミノ酸位置においてグルタミン；および／または
ｘ．配列番号１のアミノ酸の位置３４５に対応するアミノ酸位置においてリジン、バリン、またはメチオニン、
をさらに含んでなり、前記ＨＰＰＤポリペプチドが１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対して耐性を有する、
請求項１６に記載の組換えポリペプチド。
【請求項１９】
前記ＨＰＰＤタンパク質が： 
ｉ．配列番号１のアミノ酸位置２１３に対応するアミノ酸位置においてリジン；および／または
ｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６４に対応するアミノ酸位置においてアルギニンまたはロイシン；および／または
ｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてグリシンまたはアルギニン；および／または
ｉｖ．配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸；および／または
ｖ．配列番号１のアミノ酸位置３１５に対応するアミノ酸位置においてアルギニン；および／または
ｖｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３０に対応するアミノ酸位置においてヒスチジン；および／または 
ｖｉｉ．配列番号１のアミノ酸位置３３８に対応するアミノ酸位置においてバリン；および／または
ｖｉｉｉ．配列番号１のアミノ酸の位置３４０に対応するアミノ酸位置においてアルギニン、またはバリン；および／または
ｉｘ．配列番号１のアミノ酸位置３４４に対応するアミノ酸位置においてグルタミン；および／または
ｘ．配列番号１のアミノ酸の位置３４５に対応するアミノ酸位置においてリジン、バリン、またはメチオニン、
をさらに含んでなり、前記ＨＰＰＤポリペプチドが１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対して耐性を有する、
請求項１６に記載の組換えポリペプチド。
【請求項２０】
ＨＰＰＤタンパク質を含んでなる組換えポリペプチドであって、前記ＨＰＰＤタンパク質が１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対する耐性を有し、前記ＨＰＰＤタンパク質が、配列番号１のアミノ酸位置２６８に対応するアミノ酸位置においてグリシンまたはアルギニン、配列番号１のアミノ酸位置２７０に対応するアミノ酸位置においてグルタミン酸、配列番号１のアミノ酸位置３３５に対応するアミノ酸位置においてプロリン、配列番号１のアミノ酸位置３３６に対応する位置においてヒスチジンまたはアスパラギン酸、配列番号１のアミノ酸位置３３７に対応する位置においてセリン、配列番号１のアミノ酸位置３４０に対応するアミノ酸位置においてバリン、および配列番号１のアミノ酸位置３４５に対応するアミノ酸位置においてバリンを含んでなる、組換えポリペプチド。
【請求項２１】
前記ＨＰＰＤタンパク質が、配列番号１に記載のアミノ酸配列と少なくとも５３％の配列同一性を有する、請求項１６〜２０のいずれかに記載の組換えポリペプチド。
【請求項２２】
ＨＰＰＤ阻害型除草剤が、トリケトン類、ジケトニトリル類、イソキサゾール類、ヒドロキシピラゾール類、Ｎ−（１，２，５−オキサジアゾール−３−イル）ベンズアミド類、Ｎ−（１，３，４−オキサジアゾール−２−イル）ベンズアミド類、Ｎ−（テトラゾール−５−イル）−またはＮ−（トリアゾール−５−イル）アリールカルボキサミド類、ピリダジノン誘導体、オキソピラジン誘導体、Ｎ−（トリアゾール−２−イル）アリールカルボキサミド類、トリアジノン類、およびピラゾロン類からなる群から選択される、請求項１６〜２０のいずれかに記載の組換えポリペプチド。
【請求項２３】
前記ＨＰＰＤ阻害型除草剤が、ベンゾビシクロン、スルコトリオン、メソトリオン、テンボトリオン、テフリルトリオン、ビシクロピロン、フェンキノトリオン、イソキサフルトール、ジケトニトリル、ピラゾキシフェン、ベンゾフェナップ、ピラゾリネート、ピラスルホトール、トプラメゾン、トルピラレート、２−メチル−Ｎ−（５−メチル−１，３，４−オキサジアゾール−２−イル）−３−（メチルスルホニル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミド、２−クロロ−３−エトキシ−４−（メチルスルホニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ベンズアミド、４−（ジフルオロメチル）−２−メトキシ−３−（メチルスルホニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ベンズアミド、２−クロロ−３−（メチルスルファニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミド、および２−（メトキシメチル）−３−（メチルスルフィニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミドからなる群から選択される、請求項２２に記載の組換えポリペプチド。
【請求項２４】
ＨＰＰＤ阻害型除草剤に耐性活性を有するポリペプチドの製造方法であって、該ポリペプチドをコードする核酸分子を発現する条件下で、請求項１０に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
【請求項２５】
そのゲノム内に安定に組み込まれたＤＮＡコンストラクトを有し、前記コンストラクトが請求項１、２、３、４、または５のいずれかに記載の核酸に操作可能に連結したプロモーターを含んでなる、植物。
【請求項２６】
前記植物が、植物細胞、植物組織、および植物種子からなる群から選択される、請求項２５に記載の植物。
【請求項２７】
前記植物が、トウモロコシ、モロコシ、コムギ、ヒマワリ、トマト、アブラナ科植物、コショウ、ジャガイモ、ワタ、コメ、ダイズ、サトウダイコン、サトウキビ、タバコ、オオムギ、およびアブラナからなる群から選択される、請求項２５に記載の植物。
【請求項２８】
そのゲノム内に安定に組み込まれたＤＮＡコンストラクトを有し、前記ＤＮＡコンストラクトが請求項１、２、３、４、または５のいずれかに記載の核酸に操作可能に連結したプロモーターを含んでなる、請求項２５に記載の植物のトランスジェニック種子。
【請求項２９】
請求項２５に記載の植物またはその種子を圃場に植え付けること、および前記圃場に有効濃度のＨＰＰＤ阻害型除草剤を施用することを含む、圃場の雑草の防除方法。
【請求項３０】
前記ＨＰＰＤ阻害型除草剤が、トリケトン類、ジケトニトリル類、イソキサゾール類、ヒドロキシピラゾール類、Ｎ−（１，２，５−オキサジアゾール−３−イル）ベンズアミド類、Ｎ−（１，３，４−オキサジアゾール−２−イル）ベンズアミド類、Ｎ−（テトラゾール−５−イル）−またはＮ−（トリアゾール−５−イル）アリールカルボキサミド類、ピリダジノン誘導体、オキソピラジン誘導体、Ｎ−（トリアゾール−２−イル）アリールカルボキサミド類、トリアジノン類、およびピラゾロン類からなる群から選択される、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
前記ＨＰＰＤ阻害型除草剤が、ベンゾビシクロン、スルコトリオン、メソトリオン、テンボトリオン、テフリルトリオン、ビシクロピロン、フェンキノトリオン、イソキサフルトール、ジケトニトリル、ピラゾキシフェン、ベンゾフェナップ、ピラゾリネート、ピラスルホトール、トプラメゾン、トルピラレート、２−メチル−Ｎ−（５−メチル−１，３，４−オキサジアゾール−２−イル）−３−（メチルスルホニル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミド、２−クロロ−３−エトキシ−４−（メチルスルホニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ベンズアミド、４−（ジフルオロメチル）−２−メトキシ−３−（メチルスルホニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）ベンズアミド、２−クロロ−３−（メチルスルファニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミド、および２−（メトキシメチル）−３−（メチルスルフィニル）−Ｎ−（１−メチル−１Ｈ−テトラゾール−５−イル）−４−（トリフルオロメチル）ベンズアミドからなる群から選択される、請求項２７に記載の方法。
【請求項３２】
１つ以上のＨＰＰＤ阻害型除草剤に対する耐性を植物に付与するための、請求項１〜４のいずれかに記載の核酸を含んでなる組成物。
【請求項３３】
請求項１〜４のいずれかの核酸分子、または請求項１６〜２０のいずれかに記載のタンパク質を含んでなる、商品生産物であって、前記生産物が、完全または加工した種子または穀物、動物飼料、コーンミールまたはダイズミール、トウモロコシ粉またはダイズ粉、コーンスターチ、ダイズミール、ダイズ粉、フレーク、ダイズタンパク質濃縮物、ダイズタンパク質分離物、組織化ダイズタンパク質濃縮物、化粧品、ヘアケア製品、ソイバター、納豆、テンペ、加水分解ダイズタンパク質、トッピング済クリーム、ショートニング、レシチン、食用全大豆、ダイズヨーグルト、ダイズチーズ、豆腐、湯葉、および、調理、精白、蒸した、焼いた、またはパーボイル穀物からなる群から選択される、前記生産物。