【手続補正書】
【提出日】平成20年8月22日(2008.8.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
宿主における免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性を準備する回路と；
宿主における免疫反応の少なくとも一部を変調するために操作することが可能な１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する回路と；
を具えるシステム。
【請求項２】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
１種又はそれ以上の介在因子によって提示される１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性を含むセットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項３】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
少なくとも２のコピー数として存在し、１種又はそれ以上の介在因子によって提示される、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性を含むセットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項４】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
１種又はそれ以上の介在因子の少なくとも２種に存在する１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能属性を含むセットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項５】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
宿主に対し配列マッチを有する、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能属性を含むセットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項６】
請求項５に記載のシステムにおいて、前記配列マッチが：
アミノ酸、核酸、糖配列マッチの内の少なくとも一つを含むステップ；
を具えることを特徴とするシステム。
【請求項７】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
１種又はそれ以上の介在因子と、実質的に近似の機能作用を有する少なくとも１個のコンピュータ分析可能な属性を含むセットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項８】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
アッセイにおいて、１種又はそれ以上の介在因子と、実質的に近似の結果を有する少なくとも１個のコンピュータ分析可能な属性を含むセットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項９】
請求項１に記載のシステムが：
１種又はそれ以上の介在因子の１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能属性に一致する１種又はそれ以上の配列を表示する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項１０】
請求項１に記載のシステムが：
１種又はそれ以上の介在因子の１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性と関連する、宿主の免疫反応の少なくとも一部の１種又はそれ以上の選択コースを投影する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項１１】
請求項１に記載のシステムにおいて、宿主の免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性を準備する前記回路が：
宿主の免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性の少なくとも１個の変化パターンを投影する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項１２】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
抗体、組み換え抗体、遺伝子工学的に加工された抗体、キメラ抗体、単一特異性抗体、二重特異性抗体、多重特異性抗体、ダイアボディ、ヒト化抗体、ヒト抗体、ヘテロ抗体、モノクロナール抗体、ポリクロナール抗体、ラクダ化抗体、脱免疫化抗体、抗イディオタイプ抗体、又は抗体断片の内の少なくとも１種の少なくとも１部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１３】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
マクロファージ、好中球、細胞傷害性細胞、リンパ球、Ｔ−リンパ球、キラーＴ−リンパ球、免疫反応モジュレーター、ヘルパーＴ−リンパ球、抗原受容体、抗原提示細胞、樹状細胞、細胞傷害性Ｔ−リンパ球、Ｔ−８リンパ球、ＣＤ分子、ＣＤ３分子、又はＣＤ１分子の内の少なくとも１種の少なくとも１部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１４】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
抗体、組み換え抗体、遺伝子工学的に加工された抗体、キメラ抗体、単一特異性抗体、二重特異性抗体、多重特異性抗体、ダイアボディ、ヒト化抗体、ヒト抗体、ヘテロ抗体、モノクロナール抗体、ポリクロナール抗体、ラクダ化抗体、脱免疫化抗体、抗イディオタイプ抗体、又は抗体断片の内の少なくとも１種のモジュレーターの少なくとも１個の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１５】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
マクロファージ、好中球、細胞傷害性細胞、リンパ球、Ｔ−リンパ球、キラーＴ−リンパ球、免疫反応モジュレーター、ヘルパーＴ−リンパ球、抗原受容体、抗原提示細胞、樹状細胞、細胞傷害性Ｔ−リンパ球、Ｔ−８リンパ球、ＣＤ分子、ＣＤ３分子、又はＣＤ１分子の内の少なくとも１種のモジュレーターの少なくとも１個の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１６】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
Ｂリンパ球の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１７】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
Ｂリンパ球の少なくとも一部のモジュレーターの少なくとも１個の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１８】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
合成抗体又は合成抗体のモジュレーターの内の少なくとも１種の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項１９】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
Ｆａｂ領域の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２０】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
Ｆａｂ’領域の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２１】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
Ｆｖ領域の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２２】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
Ｆ（ａｂ’）．ｓｕｂ．２領域の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２３】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
パラトープの少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２４】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
補体の少なくとも一部を活性化するために操作することが可能な抗体の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２５】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
抗体依存性又は抗体促進性細胞傷害性を仲介するために操作することが可能な抗体の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２６】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
生物種依存性又は生物種特異的抗体の少なくとも一部の処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２７】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
細胞外分子に向けた処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２８】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
細胞表面分子又は細胞関連分子の内の少なくとも１種に向けられた処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項２９】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
分泌タンパク、ポリペプチド、糖タンパク、受容体、又は受容体リガンドの内の少なくとも１種に向けられた処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項３０】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
少なくとも１種の抗体の少なくとも一部に結合するための処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項３１】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記処置が：
１種又はそれ以上の介在因子に予測される（ａ）エピトープシフト、又は（ｂ）エピトープドリフトの少なくとも１個のモジュレーターを含む処置；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項３２】
請求項３１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上の介在因子に予測される（ａ）エピトープシフト、又は（ｂ）エピトープドリフトの少なくとも１個のモジュレーターを含む前記処置が：
１種又はそれ以上の介在因子の突然変異変化の少なくとも１個のサプレッサー；
を含むことを特徴とするシステム。
【請求項３３】
請求項３１に記載の方法において、１種又はそれ以上の介在因子に予測される（ａ）エピトープシフト、又は（ｂ）エピトープドリフトの少なくとも１個のモジュレーターを含む前記処置が：
少なくとも１個の干渉性核酸；
を含むことを特徴とする方法。
【請求項３４】
請求項１に記載のシステムにおいて、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する前記回路が：
少なくとも１個のメタ署名を含む１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な属性セットを形成する回路；
を更に具えることを特徴とするシステム。
【請求項３５】
少なくとも１個の信号担持媒体を含み、前記信号担持媒体が：
宿主における免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能なエピトープを準備するための１個又はそれ以上の指令と；
宿主の免疫反応の少なくとも一部を変調するために操作することが可能な１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能なエピトープセットを形成するための１個又はそれ以上の指令と；
を具えることを特徴とするプログラム製品。
【請求項３６】
宿主における免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の１種又はそれ以上のエピトープを準備する手段と；
宿主における免疫反応の少なくとも一部を変調するために操作することが可能な１種又はそれ以上のエピトープセットを形成する手段と；
を具えることを特徴とするシステム。
【請求項３７】
少なくとも１個の信号担持媒体を含み、前記信号担持媒体が：
宿主における免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の、１個又はそれ以上のエピトープを準備するための１個又はそれ以上の指令と；
宿主の免疫反応の少なくとも一部を変調するために操作することが可能な、セットの１種又はそれ以上のエピトープを形成するための１個又はそれ以上の指令と；
を具えることを特徴とするプログラム製品。
【請求項３８】
宿主における免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な抗原を準備する手段と；
宿主における免疫反応の少なくとも一部を変調するために操作することが可能な１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な抗原セットを形成する手段と；
を具えることを特徴とするシステム。
【請求項３９】
少なくとも１個の信号担持媒体を含み、前記信号担持媒体が：
宿主における免疫反応の少なくとも一部と関連する１種又はそれ以上の介在因子の、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な抗原を準備するための１個又はそれ以上の指令と；
宿主の免疫反応の少なくとも一部を変調するために操作することが可能な、１種又はそれ以上のコンピュータ分析可能な抗原セットを形成するための１個又はそれ以上の指令と；
を具えることを特徴とするプログラム製品。