【手続補正書】
【提出日】平成20年4月28日(2008.4.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
記憶媒体であって、
オリゴヌクレオチドの予め決定されたプールから２またはそれより多くのオリゴヌクレオチドの組み合わせを含む容器；および
該容器に付けられた識別指標
を備え、該オリゴヌクレオチドの組み合わせは、該プールからのオリゴヌクレオチドの存在および非存在の表示をあたえ、該表示は、コードを構成し、
該プールのオリゴヌクレオチドが、互いに異なるものであり、
該識別指標は、該オリゴヌクレオチドの組み合わせにより表示された該コードを同定する、記憶媒体。
【請求項２】
請求項１に記載の記憶媒体であって、前記プールからの少なくとも５つのオリゴヌクレオチドの組み合わせを含み、該組み合わせは、以下の式：
Ａ１−Ａ２−Ａ３−Ａ４−Ａ５−Ｂ１−Ｂ２−Ｂ３−Ｂ４−Ｂ５−Ｃ１−Ｃ２−Ｃ３−Ｃ４−Ｃ５−Ｄ１−Ｄ２−Ｄ３−Ｄ４−Ｄ５−Ｅ１−Ｅ２−Ｅ３−Ｅ４−Ｅ５
を有し、
ここで、該式において数字である添え字を有する文字の各々は、該組み合わせに存在しているかまたは存在していないかのいずれかであるオリゴヌクレオチドを表示し、
同じ文字で表わされたオリゴヌクレオチドは、１つのセットに属しており、そして
同じセットに属するオリゴヌクレオチドは、その共通するセットの特徴を有している、
記憶媒体。
【請求項３】
請求項１に記載の記憶媒体であって、前記プールからの少なくとも５つのオリゴヌクレオチドの組み合わせを含み、該組み合わせは、以下の式：
Ａ１−Ａ２−Ａ３−Ａ４−Ｂ１−Ｂ２−Ｂ３−Ｂ４−Ｃ１−Ｃ２−Ｃ３−Ｃ４−Ｄ１−Ｄ２−Ｄ３−Ｄ４−Ｅ１−Ｅ２−Ｅ３−Ｅ４−Ｆ１−Ｆ２−Ｆ３−Ｆ４
を有し、
ここで、該式において数字である添え字を有する文字の各々は、該組み合わせに存在しているかまたは存在していないかのいずれかであるオリゴヌクレオチドを表示し、
同じ文字で表わされたオリゴヌクレオチドは、１つのセットに属しており、そして
同じセットに属するオリゴヌクレオチドは、その共通するセットの特徴を有している、
記憶媒体。
【請求項４】
請求項１に記載の記憶媒体であって、前記プールからの少なくとも５つのオリゴヌクレオチドの組み合わせを含み、該組み合わせは、以下の式：
Ａ１−Ａ２−Ａ３−Ａ４−Ａ５−Ｂ１−Ｂ２−Ｂ３−Ｂ４−Ｂ５−Ｃ１−Ｃ２−Ｃ３−Ｃ４−Ｃ５−Ｄ１−Ｄ２−Ｄ３−Ｄ４−Ｄ５−Ｅ１−Ｅ２−Ｅ３−Ｅ４−Ｅ５−Ｆ１−Ｆ２−Ｆ３−Ｆ４−Ｆ５
を有し、
ここで、該式において数字である添え字を有する文字の各々は、該組み合わせに存在しているかまたは存在していないかのいずれかであるオリゴヌクレオチドを表示し、
同じ文字で表わされたオリゴヌクレオチドは、１つのセットに属しており、そして
同じセットに属するオリゴヌクレオチドは、その共通するセットの特徴を有している、
記憶媒体。
【請求項５】
前記組み合わせが、前記プールからの５またはそれより多くのオリゴヌクレオチドを含む、請求項１、２、３または４に記載される記憶媒体。
【請求項６】
前記組み合わせからの前記オリゴヌクレオチドは、２またはそれより多くのセットに属する、請求項１に記載の記憶媒体。
【請求項７】
前記組み合わせのオリゴヌクレオチドが、互いに異なる長さである、請求項１、２、３または４に記載される記憶媒体。
【請求項８】
１つのセットにあるオリゴヌクレオチドが、互いに異なる長さである、請求項２、３、４または６に記載される記憶媒体。
【請求項９】
前記組み合わせにおけるオリゴヌクレオチドの各々が、約８〜５０００ヌクレオチド長である、請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体。
【請求項１０】
前記組み合わせにおけるオリゴヌクレオチドの各々が、プライマーハイブリダイズ配列のペアを有する、請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体。
【請求項１１】
前記組み合わせにおけるオリゴヌクレオチドの各々が、プライマーハイブリダイズ配列のペアを有し、同じセットに属するオリゴヌクレオチドの各々が、プライマーハイブリダイズ配列の同じペアを有しており、かつ、該プライマーハイブリダイズ配列のペアは、セットごとに異なっている、請求項２、３、４または６に記載の記憶媒体。
【請求項１２】
前記組み合わせにおけるオリゴヌクレオチドの各々が、プライマーハイブリダイズ配列のペアを有し、プライマーハイブリダイズ配列の該ペアは、該組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々の各末端に位置づけられる、請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体。
【請求項１３】
１またはそれより多くのペアのプライマーをさらに含む、請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体であって、該１またはそれより多くのペアのプライマーが、前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、記憶媒体。
【請求項１４】
２またはそれより多くのペアのプライマーをさらに含む、請求項１、２，３、または４に記載の記憶媒体であって、該ペアのプライマーが、前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、記憶媒体。
【請求項１５】
５またはそれより多くのペアのプライマーをさらに含む、請求項１、２または３に記載の記憶媒体であって、ここで、前記ペアのプライマーが、前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、記憶媒体。
【請求項１６】
６またはそれより多くのペアのプライマーをさらに含む、請求項３に記載の記憶媒体であって、該ペアのプライマーが、前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、記憶媒体。
【請求項１７】
前記容器として、複数の容器またはマルチウェルプレートを備える、請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体。
【請求項１８】
前記容器が、生物学的分子の保存のための基材を含み、該基材が、オリゴヌクレオチドの組み合わせを含む、請求項１、２、３または４に記載されるような記憶媒体。
【請求項１９】
前記基材が、乾燥固体媒体である、請求項１８に記載の記憶媒体。
【請求項２０】
前記基材が、セルロース、ポリエステル、プラスチックまたはそれらの組み合わせを含む、請求項１８に記載の記憶媒体。
【請求項２１】
前記基材が、吸着性フォームである、請求項１８に記載の記憶媒体。
【請求項２２】
生物学的サンプルをさらに含む、請求項１に記載に記憶媒体。
【請求項２３】
生物学的サンプルをさらに含む、請求項２、３、または４に記載に記憶媒体。
【請求項２４】
前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々が、前記サンプルに特異的にハイブリダイズすることができない、請求項２２に記載の記憶媒体。
【請求項２５】
前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々が、前記サンプルに特異的にハイブリダイズすることができない、請求項２３に記載の記憶媒体。
【請求項２６】
サンプルの各々が、請求項１に記載の記憶媒体の容器に保存されている、生物学的サンプルのアーカイブ。
【請求項２７】
サンプルの各々が、請求項２、３または４に記載の記憶媒体の容器に保存されている、生物学的サンプルのアーカイブ。
【請求項２８】
請求項１に記載の記憶媒体の容器にサンプルを追加する工程を包含する、サンプルをコードするための方法。
【請求項２９】
請求項２、３または４に記載の記憶媒体の容器にサンプルを追加する工程を包含する、サンプルをコードするための方法。
【請求項３０】
複数の別個のサンプルをコードするための方法であって、
請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体の容器に該複数のものを追加する工程
を包含する、方法。
【請求項３１】
請求項１、２、３または４に記載の記憶媒体の容器に含まれるサンプルをデコードするための方法であって、
前記容器にある前記プールの１以上のオリゴヌクレオチドの存在または非存在を検出する工程を包含し、
該容器にある該プールの１以上のオリゴヌクレオチドの存在および非存在の集合的な結果が、該容器により該サンプルに提供されたコードを示すものである、方法。
【請求項３２】
前記容器における前記プールのオリゴヌクレオチドの各々の存在および非存在を検出する工程を包含する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
前記１以上ペアのプライマーが、前記プールのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、請求項１３に記載の記憶媒体。
【請求項３４】
前記ペアのプライマーが、前記プールのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、請求項１４に記載の記憶媒体。
【請求項３５】
前記ペアのプライマーが、前記プールのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、請求項１５に記載の記憶媒体。
【請求項３６】
前記ペアのプライマーが、前記プールのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズする、請求項１６に記載の記憶媒体。
【請求項３７】
プライマーの各々のペアが、前記同じセットにおけるオリゴヌクレオチドの各々に特異的に結合する、請求項１４、１５または１６に記載の記憶媒体。
【請求項３８】
前記識別指標が、バーコードである、請求項１に記載の記憶媒体。
【請求項３９】
少なくとも５つのペアのプライマーを含むキットであって、
該ペアのプライマーは、以下の式：
Ａ１−Ａ２−Ａ３−Ａ４−Ａ５−Ｂ１−Ｂ２−Ｂ３−Ｂ４−Ｂ５−Ｃ１−Ｃ２−Ｃ３−Ｃ４−Ｃ５−Ｄ１−Ｄ２−Ｄ３−Ｄ４−Ｄ５−Ｅ１−Ｅ２−Ｅ３−Ｅ４−Ｅ５
により表示されるオリゴヌクレオチドのプールからのオリゴヌクレオチドの各々に特異的にハイブリダイズし、該式における数字である添え字を有する文字の各々は、
該組み合わせに存在しているかまたは存在していないかのいずれかであるオリゴヌクレオチドを表示し、
同じ文字で表わされたオリゴヌクレオチドは、１つのセットに属しており、そして
同じセットに属するオリゴヌクレオチドは、その共通するプライマーハイブリダイゼーション配列を有している、キット。
【請求項４０】
請求項３９に記載のキットであって、
前記ペアのプライマーが、各々セットの前記プライマーハイブリダイゼーション配列に特異的にハイブリダイズする、キット。
【請求項４１】
前記ペアのプライマーを前記オリゴヌクレオドのプールに結合する指示書をさらに備える、請求項３９に記載されるキット。
【請求項４２】
キットであって、
オリゴヌクレオチドの予め決定されたプールからの２またはそれより多くのオリゴヌクレオチドの組み合わせを含む容器；および
該容器に付けられた識別指標
を備え、該プールのオリゴヌクレオチドが互いに異なっており、かつ、オリゴヌクレオチドの組み合わせが、該プールからのオリゴヌクレオチドの存在および非存在を表示するものであり、かつこのような表示がコードを構成する、
キット。
【請求項４３】
１またそれより多くのペアのプライマーをさらに含む、請求項４２に記載のキットであって、前記組み合わせのオリゴヌクレオチドの各々が、ハイブリダイゼーション配列のペアを有し、かつ、該１またはそれより多くのペアのプライマーが、該組み合わせからの少なくとも１つのオリゴヌクレオチドに特異的にハイブリダイズする、キット。
【請求項４４】
前記識別指標が、前記容器に付いている、請求項４２に記載のキット。
【請求項４５】
前記容器が、生物学的分子の保存のための基材を含む、請求項４２に記載のキット。