【手続補正書】
【提出日】平成30年11月21日(2018.11.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ハイブリダイズした標的分子サンプルを精製し、ハイブリダイズした標的分子を画像化するように構成されるカートリッジであって、
標的分子サンプルを保持するように構成されるサンプル投入エリア；
ここで、該サンプルは、
第１のプローブおよび第２のプローブとそれぞれハイブリダイズした複数の標的分子を含む複数のハイブリダイズした複合体、
複数のハイブリダイズしていない第１のプローブ、および
複数のハイブリダイズしていない第２のプローブを含む；
第１の親和性マトリックスを受容および／または含有し、かつサンプルを受容するように構成される第１の結合チャンバ；
ここで、該第１の親和性マトリックスは、第１の期間の間に、サンプルのハイブリダイズしていない第１のプローブおよびハイブリダイズした複合体と結合するように構成される第１の分子で官能化され；
前記第１の結合チャンバは、追加的に、サンプルのハイブリダイズしていない第１のプローブおよびハイブリダイズした複合体が第１の親和性マトリックスと結合した後で、サンプルからハイブリダイズしていない第２のプローブを除去するための第１のバッファを受容するように構成され；
第１の期間の後で第１の親和性マトリックスを受容し、かつ複数のハイブリダイズした複合体および複数のハイブリダイズしていない第１のプローブを含む第１の溶出サンプルを溶出するように第１の親和性マトリックスを加熱するように構成され、かつ第１のヒーターに対し動作可能に構成される第１の溶出チャネル；
第２の親和性マトリックスを受容および／または含有し、かつ第１の溶出サンプルを受容するように構成される第２の結合チャンバ；
ここで、該第２の親和性マトリックスは、第２の期間の間に、ハイブリダイズした複合体と結合するように構成される第２の分子で官能化され；
前記第２の結合チャンバは、追加的に、少なくともハイブリダイズしていない第１のプローブを除去するための第２のバッファを受容するように構成され；
第２の期間の後で第２の親和性マトリックスを受容し、かつ複数のハイブリダイズした複合体を含む第２の溶出サンプルを溶出するように第２の親和性マトリックスを加熱するように構成され、かつ第２のヒーターに対し動作可能に構成される第２の溶出チャネル；並びに、
第２の溶出サンプルを受容し、かつハイブリダイズした複合体に結合するように構成される活性結合表面を有する結合エリア；
を備える、前記カートリッジ。
【請求項２】
前記標的分子は、核酸またはタンパク質である、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項３】
前記第１の親和性マトリックスおよび前記第２の親和性マトリックスは、それぞれ、第１の磁性ビーズのセットおよび第２の磁性ビーズのセットに対応する、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項４】
前記活性結合表面は、ストレプトアビジン、アビジン、およびオリゴヌクレオチドのうちの１つを含む、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項５】
前記カートリッジは、
バブルベント、
複数のバッファ投入エリア、
複数の第１の結合チャンバ、
複数の廃棄物排出エリア、および
複数のビーズパッド、を更に備え；
場合により、前記複数のバッファ投入エリアは、流体マニホールドに動作可能に連結された複数のオフカードバッファ投入弁であり、前記複数のオフカードバッファ投入弁は、流体マニホールドから第１のバッファおよび第２のバッファを受容し、かつ第１および第２のバッファをカートリッジに供給するように構成され；かつ、前記複数の廃棄物排出エリアは、第１および第２のバッファをカートリッジから回収するように構成される複数の廃棄弁である、請求項３に記載のカートリッジ。
【請求項６】
前記第１のプローブは、捕捉プローブを含む、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項７】
前記第２のプローブは、レポータープローブを含む、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項８】
バブルベントは、サンプル投入および第１の結合チャンバを分離し、かつ気泡を除去するように構成される、請求項５に記載のカートリッジ。
【請求項９】
前記第１の磁性ビーズは、オリゴヌクレオチド結合磁性ビーズを含む、請求項３に記載のカートリッジ。
【請求項１０】
前記オリゴヌクレオチド結合磁性ビーズは、Ｆ磁性ビーズを含む、請求項９に記載のカートリッジ。
【請求項１１】
前記第２の磁性ビーズは、オリゴヌクレオチド結合磁性ビーズを含む、請求項３に記載のカートリッジ。
【請求項１２】
前記オリゴヌクレオチド結合磁性ビーズは、Ｇ磁性ビーズを含む、請求項１１に記載のカートリッジ。
【請求項１３】
前記カートリッジは、
流体マニホールドに動作可能に連結された複数のオフカードバッファ投入弁；および、
複数の廃棄弁；
に動作可能に連結されている、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項１４】
前記カートリッジは、流体マニホールドに動作可能に連結された複数のオンカードバッファ投入弁を更に備える、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項１５】
前記複数のオフカードバッファ投入弁は、流体マニホールドから第１のバッファおよび第２のバッファを受容し、かつバッファをカートリッジに供給するように構成される、請求項１３に記載のカートリッジ。
【請求項１６】
前記結合エリア上への第２の溶出サンプルの流れは、圧力プロファイルに基づいて再配列される小さな段階的に行われる、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項１７】
前記結合エリアは、更に、流動により広がった後に第２の溶出サンプルを活性結合表面上に固定するように調合された溶液を受容するように構成される、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項１８】
前記溶液は、Ｇフック、抗退色媒体、および基準物を含む、請求項１７に記載のカートリッジ。
【請求項１９】
複数のハイブリダイズした複合体を画像化するためのシステムであって、
請求項１〜１６のいずれか１項に記載のカートリッジ；
該システムに動作可能に連結し、かつカートリッジを保持するように構成されるカートリッジトレイ；
前記カートリッジトレイの下で画像化デバイスに動作可能に連結した磁石；
前記カートリッジトレイの上で前記システムに動作可能に連結し、かつ複数のバッファの流れを保持し制御するように構成される流体マニホールド；
前記流体マニホールドおよびカートリッジに動作可能に連結した複数のオフカードバッファ投入弁；
前記カートリッジトレイの上で前記システムに動作可能に連結した複数の廃棄弁；および、
前記カートリッジトレイの上で前記画像化デバイスに動作可能に連結した撮像基準面、を備える、前記システム。
【請求項２０】
前記画像化デバイスに動作可能に連結し、かつ少なくとも１つの接触パッドに対し予備充填を可能にするように構成されるカム接触パッド；
前記画像化デバイスの移動クランプとベース間の少なくとも１つの調節可能な接触部であって、測量基準Ａの調節を可能にするよう構成される少なくとも１つの調節可能な接触部；並びに、
前記画像化デバイスに動作可能に連結し、前記移動クランプを移動するように構成されるクランプモータ；
を更に備える、請求項１９に記載のシステム。
【請求項２１】
前記カートリッジトレイの上で前記システムに動作可能に連結した前記複数のオフカードバッファ投入弁および前記複数の廃棄弁の少なくとも一方は、空気圧により調節される、請求項１９に記載のシステム。
【請求項２２】
ハイブリダイズした標的分子サンプルを精製し、ハイブリダイズした標的分子を画像化する方法であって、
請求項１〜１６のいずれかに記載のカートリッジを設けること；
ハイブリダイズしたサンプルを受け取ること、ここで、該サンプルは、第１のプローブと第２のプローブにハイブリダイズした標的分子を含む複数のハイブリダイズした複合体、複数のハイブリダイズしていない第１のプローブ、および複数のハイブリダイズしていない第２のプローブを含む；
第１の期間内に、第１の結合チャンバにおいて、サンプルのハイブリダイズしていない第１のプローブとハイブリダイズした複合体を第１の親和性マトリックスに結合すること；
サンプルのハイブリダイズしていない第１のプローブとハイブリダイズした複合体を第１の親和性マトリックスに結合させた後、第１のバッファを第１の結合チャンバに流し、ハイブリダイズしていない第２のプローブをサンプルから除去すること；
前記第１の親和性マトリックスを第１の溶出チャネル内へ方向付けること；
前記第１の親和性マトリックスを加熱し、複数のハイブリダイズした複合体と複数のハイブリダイズしていない第１のプローブを含む第１の溶出サンプルを溶出すること；
第２の期間内に、第２の結合チャンバにおいて、第１の溶出サンプルのハイブリダイズした複合体を第２の親和性マトリックスに結合すること；
ハイブリダイズした複合体が第２の親和性マトリックスに結合した後、第２のバッファを第２の結合チャンバ内に流し、ハイブリダイズしていない第１のプローブを第１の溶出サンプルから除去すること；
前記第２の親和性マトリックスを加熱して複数のハイブリダイズした複合体を含む第２の溶出サンプルを溶出すること；並びに、
前記ハイブリダイズした複合体を画像化するために活性結合表面に結合すること：を含む、前記方法。
【請求項２３】
一定量の第１の溶出サンプルを親和性マトリックスパッドを介して第１の方向および第２の方向に移動させることを更に含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記第１のバッファは、サンプル／ビーズ混合物を第１のビーズパッドを介して第１の方向および第２の方向に移動させるようにポンピングされる、請求項２２に記載の方法。