【手続補正書】
【提出日】令和1年10月8日(2019.10.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
その位置での突然変異が第１の抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置と、その位置での突然変異が第２の抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置とにおける野生型ヌクレオチド配列の存在を、微生物により引き起こされる感染性疾患を患うかまたはこれを患うことが疑われる対象が、前記第１の抗微生物剤または前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかの指標とする方法であって、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株と、前記第２の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株とが存在し、
前記対象に感染する前記微生物の前記株の核酸が、その位置における突然変異が耐性である前記異なる株の核酸内で前記第１の抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含み、ここで、前記保存的ヌクレオチド位置において、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出されている場合、前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示され、
前記対象に感染する前記微生物の前記株の核酸が、その位置における突然変異が耐性である前記異なる株の核酸内で前記第２の抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含み、ここで、前記保存的ヌクレオチド位置において、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出されている場合、前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示される、方法。
【請求項２】
前記野生型ヌクレオチド配列について、前記対象から得られた生体試料から、前記保存的ヌクレオチド位置において特異的に検出される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記第１および第２の抗微生物剤について示されることが、同時に、または単一の試験においてなされる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記対象が前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが示される場合、前記第２の抗微生物剤に対する耐性に関連する前記保存的ヌクレオチド位置における野生型ヌクレオチド配列について、前記対象が前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているかどうかの指標として特異的に検出される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
その位置での突然変異が抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置における野生型ヌクレオチド配列の存在を、微生物により引き起こされる感染性疾患を患うかまたはこれを患うことが疑われる対象が、前記抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかの指標とする方法であって、前記抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在し、
前記対象に感染する前記微生物の前記株の核酸が、その位置における突然変異が耐性である前記異なる株の核酸内で第１の抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含み、ここで、前記保存的ヌクレオチド位置において、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出されている場合、前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示され、
前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが示される場合に、
前記対象に感染する前記微生物の前記株の核酸が、その位置における突然変異が耐性である前記異なる株の核酸内で前記第２の抗微生物剤に対する耐性と関連する保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含み、ここで、前記保存的ヌクレオチド位置において、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出されている場合、前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示される、方法。
【請求項６】
前記野生型ヌクレオチド配列について、前記対象から得られた生体試料から、前記保存的ヌクレオチド位置において特異的に検出される、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記野生型ヌクレオチド配列のみについて、特異的に検出される、請求項１から６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記対象に感染する前記株が、第１の保存的ヌクレオチド位置および異なる第２の保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示され、ここで、前記第１の保存的ヌクレオチド位置が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株の第１のサブセット内で突然変異しており、前記第２の保存的ヌクレオチド位置が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株の第２のサブセット内で突然変異している、請求項１から７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記対象から得られた、前記対象に感染する前記株の核酸の増幅を含む方法を使用して、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出される、請求項１から８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
ディップスティックを使用して、前記核酸の増幅から生じる産物についてさらに検出される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
厳密な条件下で、前記野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズするが、厳密な条件下で、前記抗微生物剤に対する耐性と関連する前記保存的ヌクレオチド位置において突然変異を含むヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチドを使用して、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出される、請求項１から１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記感染性疾患が、性感染疾患である、請求項１から１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記感染性疾患が、淋病である、請求項１から１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡの保存的ヌクレオチド位置における野生型ヌクレオチド配列の存在が、淋病を患う対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染しているのかどうかを示す、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示される、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列をさらに含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示される、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのシプロフロキサシン感受性株に感染していることが示される、請求項１４から１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、および任意選択で、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする突然変異体ヌクレオチド配列を含まない場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示される、請求項１４から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列をさらに含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示される、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子の保存的位置、好ましくは、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、淋病を患う対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示される、請求項１３に記載の方法。
【請求項２１】
ｉ）請求項１４から２０のいずれか一項に記載の方法を使用するステップであって、前記対象が、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択される第１の抗微生物剤に対して感受性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染しているのかどうかが示される、ステップと；前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染していることが示される場合、
ｉｉ）請求項１４から２０のいずれか一項に記載の方法を使用するステップであって、前記対象が、セファロスポリン（Cephalopsorin）、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択される異なる第２の抗微生物剤に対して感受性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染しているのかどうかが示される、ステップと；前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して耐性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染していることが示される場合、
ｉｉｉ）請求項１４から２０のいずれか一項に記載の方法を使用するステップであって、前記対象が、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択される異なる第３の抗微生物剤に対して感受性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染しているのかどうかが示される、ステップと
を含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項２２】
前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示される場合、単剤療法として有効量の前記第１の抗微生物剤を含む処置が処方されるべきであることが示されるか；あるいは
前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが示され、前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示される場合、単剤療法として有効量の前記第２の抗微生物剤を含む処置が処方されるべきであることが示されるか；または
前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが示される場合、組合せ療法として有効量の前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤を含む処置が処方されるべきであることが示される、請求項１から１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記感染性疾患が、淋病であり、
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡをコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染していることが示され；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法としてセファロスポリンを含む処置が処方されるべきであることが示されるか；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法としてシプロフロキサシンを含む処置が処方されるべきであることが示されるか；または
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法としてアジスロマイシンを含む処置が処方されるべきであることが示される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記感染性疾患が、淋病であり、
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／またはｍｔｒＲプロモーターをコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染していることが示され；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子またはｐｅｎＡ非モザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法としてセファロスポリンを含む処置が処方されるべきであることが示されるか；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法としてシプロフロキサシンを含む処置が処方されるべきであることが示されるか；または
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／もしくはｍｔｒＲプロモーターの野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法としてアジスロマイシンを含む処置が処方されるべきであることが示される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
前記感染性疾患が、淋病であり、前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤が各々、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、セファロスポリン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、シプロフロキサシン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、アジスロマイシン感受性株に感染していることが示される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２６】
前記感染性疾患が、淋病であり、前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤が各々、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子またはｐｅｎＡ非モザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、セファロスポリン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、シプロフロキサシン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／またはｍｔｒＲプロモーターの野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、アジスロマイシン感受性株に感染していることが示される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２７】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、単剤療法として有効量のセファロスポリンを含む処置が処方されるべきであることが示される、請求項２３から２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列と、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列と、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合に、単剤療法として有効量のセファロスポリンを含む処置が処方されるべきであることが示される、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のセファロスポリンの前記対象への単剤療法としての投与が処方されるべきであることが示される、請求項２４または２６に記載の方法。
【請求項３０】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのシプロフロキサシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のシプロフロキサシンの前記対象への単剤療法としての投与が処方されるべきであることが示される、請求項２３から２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のアジスロマイシンの単剤療法としての投与が処方されるべきであることが示される、請求項２３から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
さらに、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含み、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列と、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合に、有効量のアジスロマイシンの単剤療法としての投与が処方されるべきであることが示される、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合であって、かつＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする突然変異体ヌクレオチド配列を含まない場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含み、２３ＳリボソームＲＮＡの突然変異体ヌクレオチド配列を含まない場合に、有効量のアジスロマイシンの単剤療法としての投与が処方されるべきであることが示される、請求項２４から３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列と、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含み、２３ＳリボソームＲＮＡの突然変異体ヌクレオチド配列を含まず、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のアジスロマイシンの単剤療法としての投与が処方されるべきであることが示される、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
淋病を患う対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのキットであって、
ｉ）厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／もしくはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／もしくはＡ５１０位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｉｉ）厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｉｉｉ）厳密な条件下で、ｇｙｒＡ遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｉｖ）厳密な条件下で、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｖ）厳密な条件下で、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド
を含むキット。
【請求項３６】
（ｉｖ）の前記オリゴヌクレオチドを含み、
ｖｉ）厳密な条件下で、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５位における野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５における野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５位における突然変異を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；および／または
ｖｉｉ）厳密な条件下で、ｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド
をさらに含む、請求項３５に記載のキット。
【請求項３７】
厳密な条件下で、
ＡＡＡＣＣＧＧＣＡＣＧＧＣＧＣＧＣＡＡＧＴＴＣＧＴＣＡＡＣＧＧＧＣＧＴ（配列番号１）；
ＴＡＴＧＣＣＧＡＣＡＡＣＡＡＡＣＡＣＧＴＣＧＣＴＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧ（配列番号２）；
ＡＡＡＴＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＣＧＧＣＧＡＴＴＣＣＧＣＡＧＴＴＴＡＣＧＡＣ（配列番号３）；
ＡＣＣＡＴＣＧＴＣＣＧＴＡＴＧＧＣＧＣＡＡＡＡＴＴＴＣＧＣＴＡＴＧＣＧＴ（配列番号４）；
ＧＡＡＧＡＴＧＣＡＡＴＣＴＡＣＣＣＧＣＴＧＣＴＡＧＡＣＧＧＡＡＡＧＡＣＣＣＣＧＴＧＡＡＣＣＴＴＴＡＣＴＧＴＡＧＣＴＴＴＧＣ（配列番号５）；または
ＣＡＴＴＴＡＡＡＧＴＧＧＴＡＣＧＴＧＡＧＣＴＧＧＧＴＴＴＡＡＡＡＣＧＴＣＧＴＧＡＧＡＣＡＧＴＴＴＧＧＴＣＣＣＴＡＴＣＴＧＣＡＧＴＧＧＧ（配列番号６）；または
ＡＡＡＣＣＧＧＣＡＣＧＧＣＧＣＧＣＡＡＧＴＴＣＧＴＣＡＡＣＧＧＧＣＧＴＴＡＴＧＣＣＧＡＣＡＡＣＡＡＡＣＡＣＧＴＣＧＣＴＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧ（配列番号７）；または
ＡＡＡＴＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＣＧＧＣＧＡＴＴＣＣＧＣＡＧＴＴＴＡＣＧＡＣＡＣＣＡＴＣＧＴＣＣＧＴＡＴＧＧＣＧＣＡＡＡＡＴＴＴＣＧＣＴＡＴＧＣＧＴ（配列番号８）
のヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドから選択されるオリゴヌクレオチドを含む、請求項３５または３６に記載のキット。
【請求項３８】
ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位；ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位；または２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに含む、請求項３５から３７のいずれか一項に記載のキット。
【請求項３９】
ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／もしくはＡ５１０位、ならびに、任意選択で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位；ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位；または２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに含む、請求項３５から３７のいずれか一項に記載のキット。
【請求項４０】
ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位、ならびに、任意選択で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位；ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位；ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位；２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５位および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに含む、請求項３５から３８のいずれか一項に記載のキット。
【請求項４１】
第１の抗微生物剤または第２の抗微生物剤を含む、微生物により引き起こされる感染性疾患を患うかまたはこれを患うことが疑われる対象を処置するための組成物であって、請求項１から９のいずれか一項に記載の方法によって、前記対象は、前記第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示され、ここで、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在するか、または、前記対象は、前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが示され、ここで、前記第２の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在しており、ここで、有効量の前記第１の抗微生物剤または第２の抗微生物剤が単剤療法として前記対象に投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項４２】
前記感染性疾患が、淋病であり、
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡをコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染していることが示され、ここで、
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、セファロスポリンが単剤療法として前記対象に投与されるか；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、シプロフロキサシンが単剤療法として前記対象に投与されるか；または
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、アジスロマイシンが単剤療法として前記対象に投与されることを特徴とする、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４３】
前記感染性疾患が、淋病であり、
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／またはｍｔｒＲプロモーターをコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染していることが示され、ここで、
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子またはｐｅｎＡ非モザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、セファロスポリンが単剤療法として前記対象に投与されるか；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、シプロフロキサシンが単剤療法として前記対象に投与されるか；または
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／もしくはｍｔｒＲプロモーターの野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、アジスロマイシンが単剤療法として前記対象に投与されることを特徴とする、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４４】
前記感染性疾患が、淋病であり、前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤が各々、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、セファロスポリン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、シプロフロキサシン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、アジスロマイシン感受性株に感染していることが示される、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４５】
前記感染性疾患が、淋病であり、前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤が各々、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子またはｐｅｎＡ非モザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、セファロスポリン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、シプロフロキサシン感受性株に感染していることが示され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／またはｍｔｒＲプロモーターの野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、アジスロマイシン感受性株に感染していることが示される、請求項４１に記載の組成物。
【請求項４６】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のセファロスポリンが前記対象に単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項４２から４５のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項４７】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列と、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列と、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合に、有効量のセファロスポリンが前記対象に単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項４６に記載の組成物。
【請求項４８】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のセファロスポリンが前記対象に単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項４３または４５に記載の組成物。
【請求項４９】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのシプロフロキサシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のシプロフロキサシンが前記対象に単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項４２から４８のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５０】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のアジスロマイシンが単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項４２から４９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５１】
さらに、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含み、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列と、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合に、有効量のアジスロマイシンが単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項５０に記載の組成物。
【請求項５２】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合であって、かつＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする突然変異体ヌクレオチド配列を含まない場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含み、２３ＳリボソームＲＮＡの突然変異体ヌクレオチド配列を含まない場合に、有効量のアジスロマイシンが単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項４３から５０のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５３】
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列と、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列とを含む場合、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染していることが示され；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含み、２３ＳリボソームＲＮＡの突然変異体ヌクレオチド配列を含まず、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含む場合に、有効量のアジスロマイシンが単剤療法として投与されることを特徴とする、請求項５２に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１８】
特に、本発明の方法は、対象に感染する微生物の株の核酸が、保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップを含んでもよく、その位置における突然変異は、異なる耐性株の核酸内で、抗微生物剤に対する耐性と関連する。
本発明の実施形態の例として、以下の項目が挙げられる。
（項目１）
微生物により引き起こされる感染性疾患を患うかまたはこれを患うことが疑われる対象が、抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかを決定するための方法であって、前記抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在し、前記方法は、前記対象に感染する前記微生物の前記株の核酸が、保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップを含み、保存的ヌクレオチド位置における突然変異が、耐性である前記異なる株の核酸内で、前記抗微生物剤に対する耐性と関連する、方法。
（項目２）
前記対象に感染する前記株の核酸が、第１の保存的ヌクレオチド位置および異なる第２の保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定し、この場合、前記第１の保存的ヌクレオチド位置が、前記抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株の第１のサブセット内で突然変異しており、前記第２の保存的ヌクレオチド位置が、前記抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株の第２のサブセット内で突然変異している、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記抗微生物剤が、第１の抗微生物剤であり、前記方法が、前記対象が、第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかを決定するステップをさらに含み、前記第２の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在し、前記対象に感染する前記微生物の前記株の核酸が、保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップを含み、保存的ヌクレオチド位置における突然変異が、耐性の前記異なる株の核酸内で、前記第２の抗微生物剤に対する耐性と関連する、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが決定される場合に、前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかを決定する、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出することにより、前記対象に感染する前記微生物の前記株が、前記野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップを含む、前記項目のいずれかに記載の方法。
（項目６）
前記対象から得られた、前記対象に感染する前記株の核酸の増幅を含む方法を使用して、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出するステップを含む、項目５に記載の方法。
（項目７）
ディップスティックを使用して、前記核酸の増幅から生じる産物について検出するステップをさらに含む、項目６に記載の方法。
（項目８）
厳密な条件下で、前記野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズするが、厳密な条件下で、前記抗微生物剤に対する耐性と関連する前記保存的ヌクレオチド位置において突然変異を含むヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチドを使用して、前記野生型ヌクレオチド配列について特異的に検出するステップを含む、項目５から７のいずれかに記載の方法。
（項目９）
前記感染性疾患が、性感染疾患である、前記項目のいずれかに記載の方法。
（項目１０）
前記感染性疾患が、淋病である、前記項目のいずれかに記載の方法。
（項目１１）
淋病を患う対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのものであり、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡの保存的ヌクレオチド位置において、野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップを含む、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのものであり、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定する、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップをさらに含む、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
淋病を患う対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのものであり、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子の保存的位置、好ましくは、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップを含む、項目１０に記載の方法。
（項目１５）
前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのシプロフロキサシン感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのものであり、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定する、項目１１から１４のいずれかに記載の方法。
（項目１６）
前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのものであり、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定し、任意選択で、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする突然変異体ヌクレオチド配列を含まないのかどうかを決定する、項目１１から１５のいずれかに記載の方法。
（項目１７）
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップをさらに含む、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
ｉ）項目１１から１７のいずれかに記載の方法を使用して、前記対象が、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択される第１の抗微生物剤に対して感受性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染しているのかどうかを決定するステップと；前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染していることが決定される場合、
ｉｉ）項目１１から１７のいずれかに記載の方法を使用して、前記対象が、セファロスポリン（Cephalopsorin）、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択さ
れる異なる第２の抗微生物剤に対して感受性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染しているのかどうかを決定するステップと；前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して耐性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染していることが決定される場合、
ｉｉｉ）項目１１から１７のいずれかに記載の方法を使用して、前記対象が、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択される異なる第３の抗微生物剤に対して感受性であるＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの株に感染しているのかどうかを決定するステップと
を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１９）
微生物により引き起こされる感染性疾患を患うかまたはこれを患うことが疑われる対象を処置するかまたはこの処置を処方する方法であって、
項目１から８のいずれかに記載の方法を使用して、抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかを決定するステップであり、前記抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在する、ステップと；
前記対象が、前記抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが決定される場合に、前記対象へ、有効量の前記抗微生物剤を単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップと
を含む方法。
（項目２０）
項目１から８のいずれかに記載の方法を使用して、前記対象が、第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかを決定するステップであり、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在する、ステップと；
前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが決定される場合に、前記対象へ、有効量の前記第１の抗微生物剤を単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップと
を含むか；あるいは
項目１から８のいずれかに記載の方法を使用して、前記対象が、前記第１の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが決定される場合、前記対象が、異なる第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染しているのかどうかを決定するステップであり、前記第２の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の異なる株が存在する、ステップと；
前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して感受性である前記微生物の株に感染していることが決定される場合に、前記対象へ、有効量の前記第２の抗微生物剤を単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するか；または
前記対象が、前記第２の抗微生物剤に対して耐性である前記微生物の株に感染していることが決定される場合に、前記対象へ、有効量の前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤を、組合せ療法として投与するかもしくは投与するために処方するステップとを含む、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記感染性疾患が、淋病であり、前記方法が、
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡをコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染しているのかどうかを決定するステップと；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、セファロスポリンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するか；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、シプロフロキサシンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するか；または
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、アジスロマイシンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するステップと
を含む、項目１９に記載の方法。
（項目２２）
前記感染性疾患が、淋病であり、前記方法が、
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子、ｇｙｒＡ遺伝子、または２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／またはｍｔｒＲプロモーターをコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染しているのかどうかを決定するステップと；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子またはｐｅｎＡ非モザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、セファロスポリンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するか；
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、シプロフロキサシンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するか；または
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡ、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／もしくはｍｔｒＲプロモーターの野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、アジスロマイシンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかもしくは投与するために処方するステップと
を含む、項目１９に記載の方法。
（項目２３）
前記感染性疾患が、淋病であり、前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤が各々、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、セファロスポリン感受性株に感染しているのかどうかを決定し、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、シプロフロキサシン耐性株に感染しているのかどうかを決定し、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、アジスロマイシン耐性株に感染しているのかどうかを決定する、項目２０に記載の方法。
（項目２４）
前記感染性疾患が、淋病であり、前記第１の抗微生物剤および前記第２の抗微生物剤が各々、セファロスポリン、シプロフロキサシン、およびアジスロマイシンから選択され、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子またはｐｅｎＡ非モザイク遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、セファロスポリン感受性株に感染しているのかどうかを決定し、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、シプロフロキサシン耐性株に感染しているのかどうかを決定し、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲ遺伝子および／またはｍｔｒＲプロモーターを含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、アジスロマイシン耐性株に感染しているのかどうかを決定する、項目２０に記載の方法。
（項目２５）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染しているのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、有効量のセファロスポリンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとを含む、項目２１から２４のいずれかに記載の方法。
（項目２６）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、有効量のセファロスポリンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとをさらに含む、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのセファロスポリン感受性株に感染しているのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、有効量のセファロスポリンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとを含む、項目２２または２４に記載の方法。
（項目２８）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのシプロフロキサシン感受性株に感染しているのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、有効量のシプロフロキサシンを、前記対象へ、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとを含む、項目２１から２７のいずれかに記載の方法。
（項目２９）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定することにより、前記対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅのアジスロマイシン感受性株に感染しているのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、有効量のアジスロマイシンを、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとを含む、項目２１から２８のいずれかに記載の方法。
（項目３０）
Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位をコードする突然変異体ヌクレオチド配列を含まないのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含み、２３ＳリボソームＲＮＡの突然変異体ヌクレオチド配列を含まないことが決定される場合に、有効量のアジスロマイシンを、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとをさらに含む、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むのかどうかを決定するステップと；Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列を含み、任意選択で、２３ＳリボソームＲＮＡの突然変異体ヌクレオチド配列を含まず、Ｎ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの前記株が、野生型のｍｔｒＲプロモーター配列および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むことが決定される場合に、有効量のアジスロマイシンを、単剤療法として投与するかまたは投与するために処方するステップとをさらに含む、項目２９または３０に記載の方法。
（項目３２）
淋病を患う対象が、Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの抗生剤感受性株に感染しているのかどうかを決定するためのキットであって、
ｉ）厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／もしくはＡ５１０位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／もしくはＡ５１０位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｉｉ）厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｉｉｉ）厳密な条件下で、ｇｙｒＡ遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；ならびに／または
ｉｖ）厳密な条件下で、２３ＳリボソームＲＮＡの野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド
を含むキット。
（項目３３）
（ｉ）および／もしくは（ｉｉ）および／もしくは（ｉｉｉ）および／もしくは（ｉｖ）の前記オリゴヌクレオチド、ならびに／または
ｖ）厳密な条件下で、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子の野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチドを含む、項目３２に記載のキット。
（項目３４）
（ｉｖ）の前記オリゴヌクレオチドを含み、
ｖｉ）厳密な条件下で、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５位における野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５における野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５位における突然変異を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド；および／または
ｖｉｉ）厳密な条件下で、ｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドであり、ｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列と相補的であるかもしくはこれと同じ配列であるヌクレオチド配列を含み、厳密な条件下で、ｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位における突然変異をコードするＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅの耐性株のヌクレオチド配列と同じ配列であるかもしくはこれと相補的な配列を含むＮ．ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸とハイブリダイズしないオリゴヌクレオチド
をさらに含む、項目３２または３３に記載のキット。
（項目３５）
前記オリゴヌクレオチドが、厳密な条件下で、
ＡＡＡＣＣＧＧＣＡＣＧＧＣＧＣＧＣＡＡＧＴＴＣＧＴＣＡＡＣＧＧＧＣＧＴ（配列番号１）；
ＴＡＴＧＣＣＧＡＣＡＡＣＡＡＡＣＡＣＧＴＣＧＣＴＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧ（配列番号２）；
ＡＡＡＴＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＣＧＧＣＧＡＴＴＣＣＧＣＡＧＴＴＴＡＣＧＡＣ（配列番号３）；
ＡＣＣＡＴＣＧＴＣＣＧＴＡＴＧＧＣＧＣＡＡＡＡＴＴＴＣＧＣＴＡＴＧＣＧＴ（配列番号４）；
ＧＡＡＧＡＴＧＣＡＡＴＣＴＡＣＣＣＧＣＴＧＣＴＡＧＡＣＧＧＡＡＡＧＡＣＣＣＣＧＴＧＡＡＣＣＴＴＴＡＣＴＧＴＡＧＣＴＴＴＧＣ（配列番号５）；または
ＣＡＴＴＴＡＡＡＧＴＧＧＴＡＣＧＴＧＡＧＣＴＧＧＧＴＴＴＡＡＡＡＣＧＴＣＧＴＧＡＧＡＣＡＧＴＴＴＧＧＴＣＣＣＴＡＴＣＴＧＣＡＧＴＧＧＧ（配列番号６）
のヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドから選択される、項目３２から３４のいずれかに記載のキット。
（項目３６）
厳密な条件下で、
ＡＡＡＣＣＧＧＣＡＣＧＧＣＧＣＧＣＡＡＧＴＴＣＧＴＣＡＡＣＧＧＧＣＧＴ（配列番号１）；
ＴＡＴＧＣＣＧＡＣＡＡＣＡＡＡＣＡＣＧＴＣＧＣＴＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧ（配列番号２）；
ＡＡＡＴＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＣＧＧＣＧＡＴＴＣＣＧＣＡＧＴＴＴＡＣＧＡＣ（配列番号３）；
ＡＣＣＡＴＣＧＴＣＣＧＴＡＴＧＧＣＧＣＡＡＡＡＴＴＴＣＧＣＴＡＴＧＣＧＴ（配列番号４）；
ＧＡＡＧＡＴＧＣＡＡＴＣＴＡＣＣＣＧＣＴＧＣＴＡＧＡＣＧＧＡＡＡＧＡＣＣＣＣＧＴＧＡＡＣＣＴＴＴＡＣＴＧＴＡＧＣＴＴＴＧＣ（配列番号５）；または
ＣＡＴＴＴＡＡＡＧＴＧＧＴＡＣＧＴＧＡＧＣＴＧＧＧＴＴＴＡＡＡＡＣＧＴＣＧＴＧＡＧＡＣＡＧＴＴＴＧＧＴＣＣＣＴＡＴＣＴＧＣＡＧＴＧＧＧ（配列番号６）；または
ＡＡＡＣＣＧＧＣＡＣＧＧＣＧＣＧＣＡＡＧＴＴＣＧＴＣＡＡＣＧＧＧＣＧＴＴＡＴＧＣＣＧＡＣＡＡＣＡＡＡＣＡＣＧＴＣＧＣＴＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧ（配列番号７）；または
ＡＡＡＴＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＣＧＧＣＧＡＴＴＣＣＧＣＡＧＴＴＴＡＣＧＡＣＡＣＣＡＴＣＧＴＣＣＧＴＡＴＧＧＣＧＣＡＡＡＡＴＴＴＣＧＣＴＡＴＧＣＧＴ（配列番号８）
のヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドから選択されるオリゴヌクレオチドを含む、項目３２から３４のいずれかに記載のキット。
（項目３７）
厳密な条件下で、
ＧＡＡＧＡＴＧＣＡＡＴＣＴＡＣＣＣＧＣＴＧＣＴＡＧＡＣＧＧＡＡＡＧＡＣＣＣＣＧＴＧＡＡＣＣＴＴＴＡＣＴＧＴＡＧＣＴＴＴＧＣ（配列番号５）；
ＣＡＴＴＴＡＡＡＧＴＧＧＴＡＣＧＴＧＡＧＣＴＧＧＧＴＴＴＡＡＡＡＣＧＴＣＧＴＧＡＧＡＣＡＧＴＴＴＧＧＴＣＣＣＴＡＴＣＴＧＣＡＧＴＧＧＧ（配列番号６）；
ＡＡＡＣＣＧＧＣＡＣＧＧＣＧＣＧＣＡＡＧＴＴＣＧＴＣＡＡＣＧＧＧＣＧＴＴＡＴＧＣＣＧＡＣＡＡＣＡＡＡＣＡＣＧＴＣＧＣＴＡＣＣＴＴＴＡＴＣＧＧ（配列番号７）；または
ＡＡＡＴＡＣＣＡＣＣＣＣＣＡＣＧＧＣＧＡＴＴＣＣＧＣＡＧＴＴＴＡＣＧＡＣＡＣＣＡＴＣＧＴＣＣＧＴＡＴＧＧＣＧＣＡＡＡＡＴＴＴＣＧＣＴＡＴＧＣＧＴ  （配列番号８）のヌクレオチド配列と同じ配列であるかまたはこれと相補的な配列を含む核酸とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドから選択されるオリゴヌクレオチドを含む、項目３２から３４のいずれかに記載のキット。
（項目３８）
ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位；ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位；または２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに含む、項目３２から３７のいずれかに記載のキット。
（項目３９）
ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／もしくはＡ５１０位、ならびに、任意選択で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／もしくはＡ５１６位；ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／もしくはＤ９５位；または２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／もしくはＡ２０５９位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに含む、項目３２から３７のいずれかに記載のキット。
（項目４０）
ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＦ５０４位および／またはＡ５１０位、ならびに、任意選択で、ｐｅｎＡモザイク遺伝子のＡ５０１位および／またはＡ５１６位；ｐｅｎＡ非モザイク遺伝子のＡ５０１位；ｇｙｒＡ遺伝子のＳ９１位および／またはＤ９５位；２３ＳリボソームＲＮＡのＣ２６１１位および／またはＡ２０５９位、ならびに、任意選択で、ｍｔｒＲプロモーターの−１０〜−３５位および／またはｍｔｒＲ遺伝子のＧ４５位をコードする野生型ヌクレオチド配列を含むＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｒｒｈｏｅａｅ核酸を増幅するためのオリゴヌクレオチドプライマーをさらに含む、項目３２から３８のいずれかに記載のキット。