【手続補正書】
【提出日】平成20年5月28日(2008.5.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数の反応チャンバ（１３）と少なくとも１つのタンク（１１）とを含む反応カートリッジであって、
・  各反応チャンバが、直径３ｍｍ未満の円内に含まれる断面を有する流路（１２）を介してタンクに接続されていること；
・  タンクの容量が１０ｍｌ未満であること；
・  タンクに対する反応チャンバ及び流路の配置によって、タンクから反応チャンバ内に流体を均等に分配できるようになっていること、
を特徴とする反応カートリッジ。
【請求項２】
流路（１２）の直径が０．２ｍｍ以下である、請求項１に記載のカートリッジ。
【請求項３】
タンク（１１）の容量が０．１ｍｌ〜１ｍｌの範囲内にある、請求項１又は２に記載のカートリッジ。
【請求項４】
２０〜５００個の反応チャンバを含むことを特徴とする請求項１〜３に記載のカートリッジ。
【請求項５】
反応チャンバの容積が、０．２μｌ〜５０μｌの範囲、好ましくは１μｌ〜１０μｌの範囲内にあることを特徴とする請求項１〜４に記載のカートリッジ。
【請求項６】
流路（１２）とタンク（１１）との間の接合部が、タンクの周囲に形成され、かつ、前記タンクのベースが傾斜しかつ／又は凸状になっており、タンクの中に入った流体を流路の入口へと確実に分配する請求項１〜５に記載のカートリッジ。
【請求項７】
タンク（１１）が実質的に前記カートリッジの中心に設置され、反応チャンバ（１３）が前記タンクのまわりの円状に配置され、前記タンクを前記チャンバに連結する流路（１２）が基本的に放射状である、回転幾何学的配置を有することを特徴とする請求項１〜６に記載のカートリッジ。
【請求項８】
タンク（１１）のベースが円錐形である、請求項７に記載のカートリッジ。
【請求項９】
反応チャンバ（１３）が前記カートリッジの周囲に設置されている、請求項７又は８に記載のカートリッジ。
【請求項１０】
１〜１０ｃｍの範囲内の直径を有する請求項７〜９に記載のカートリッジ。
【請求項１１】
タンク（１１）が前記カートリッジの一方の側に設置され、カートリッジのもう一方の側に反応カートリッジ（１３）が整列され、タンクを前記チャンバに連結する流路（１２）が基本的に互いに平行である、平行移動幾何学的配置を有することを特徴とする、請求項１〜６に記載のカートリッジ。
【請求項１２】
タンク（１１）のベースが傾斜した平面である、請求項１１に記載のカートリッジ。
【請求項１３】
タンク（１１）が２〜８個のサブタンク（１１１〜１１８）に分割され、かつ、反応チャンバ（１３）の各々が流路（１２）を介して前記サブタンクの１つのみに連結されている、請求項１〜１２のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項１４】
反応チャンバの深さが０．５〜１．５ｍｍの範囲内にある、請求項１〜１３のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項１５】
プラスチック材料、好ましくはポリカーボネートから製造されていることを特徴とする請求項１〜１４のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項１６】
厚みが０．５〜５ｍｍの範囲内にある、請求項１〜１５のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項１７】
反応チャンバ（１３）の底が０．０５〜０．５ｍｍの範囲内、好ましくは約０．２５ｍｍの厚みをもつ請求項１〜１６のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項１８】
反応チャンバ（１３）が上部透明壁（１７）によって閉じられる、請求項１〜１７のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項１９】
反応チャンバ（１３）には、ベント（１４）が設けられている、請求項１〜１８のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２０】
反応チャンバ（１３）が閉じられている、請求項１〜１８のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２１】
タンク（１１）が、前記タンク内の圧力を調整するための手段（４）に適合されうる開口部を含む、請求項１〜２０のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２２】
各流路（１２）が、異なる直径（１２１及び１２２）を有する少なくとも２つの部分によって構成され、第２の部分（１２２）の直径が、流路（１２）内の圧力降下が生じるように第１の部分（１２１）の直径よりも小さい、請求項１〜２１のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２３】
タンク（１１）との接合部において各流路（１２）に逆流防止キャビティ（１２３）が具備され、前記逆流防止キャビティが流路（１２）の直径以上の直径を有する実質的に垂直な流路部分により構成されていることを特徴とする請求項１〜２２のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２４】
反応チャンバ（１３）の少なくとも一部分がオリゴヌクレオチドを含む、請求項１〜２３のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２５】
各反応チャンバ（１３）が、増幅すべき核酸配列に特異的な２つのプライマー、及び場合により前記配列に特異的な標識付けされたプローブを含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２６】
反応チャンバ（１３）の少なくとも１部分は、液体を置いた後に乾燥させることで内部に置かれている試薬を収容しており、かくして前記反応チャンバ内に流体が到達したことで前記試薬が再び溶液内に取込まれるようになっている、請求項１〜２５のいずれか１項に記載のカートリッジ。
【請求項２７】
少なくとも２つの異なるインキュベーション温度を必要とする、酵素及び／又は分子生物学反応を実施するための装置であって：
・  複数の反応チャンバ（１３）及びタンク（１１）を有し、前記反応チャンバが流路（１２）を介してタンクに連結されている、少なくとも１つのカートリッジ（１）と；
・  少なくとも２つの異なる温度まで加熱され得る少なくとも２つの別個のゾーンを有する少なくとも１つの加熱用プレート（２）と；
・  反応チャンバの温度の周期的変動を可能にする、前記カートリッジと前記プレートの間の相対的変位用手段と、
を含むことを特徴とする装置。
【請求項２８】
酵素反応は、核酸配列の熱依存性連鎖増幅であり、かつ、加熱用プレート（２）のゾーンは、核酸増幅サイクル内の段階に対応する少なくとも２つの異なる温度まで加熱され得る請求項２７に記載の装置。
【請求項２９】
・  増幅すべき標的配列に特異的なプライマーが、反応チャンバ（１３）内で予め分配されること、
・  タンク（１１）は、分析対象核酸の標本と、プライマーを除いて、ポリメラーゼ連鎖増幅反応のために必要とされる試薬と、で構成された流体を収容することを意図されたものであること；
・  加熱用プレート（２）が、ポリメラーゼ連鎖増幅サイクルの３つの段階に対応する３つの異なる温度まで加熱できる３つの別個のゾーンを有すること、
を特徴とする請求項２８に記載の装置。
【請求項３０】
各サイクル内で反応チャンバの中味の蛍光を励起しかつ測定するべく配置された蛍光励起／測定用の光学手段（５）を含むことを特徴とする、核酸配列の実時間熱依存性連鎖増幅のための請求項２８又は２９に記載の装置。
【請求項３１】
カートリッジ（１）が請求項１〜２６のいずれか１項に記載のカートリッジである、請求項２７〜３０のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３２】
プレート（２）を加熱するための別個のゾーンが、少なくとも２つ又は３つの円盤部分内に配置される、請求項２７〜３１のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３３】
前記加熱用プレート（２）が固定され、かつ、前記カートリッジ（１）が、変位手段（３）を用いて移動させられる請求項２７〜３２のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３４】
前記カートリッジ（１）が固定され、かつ、前記加熱用プレート（２）が変位手段（３）により移動させられる、請求項２７〜３２のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３５】
前記変位手段（３）が前記カートリッジ（１）及び／又は前記加熱用プレート（２）の回転を生じさせる、請求項２７〜３４のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３６】
カートリッジ（１）が加熱用プレート（２）と直接接触している、請求項２７〜３５のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３７】
プレート（２）には、前記カートリッジ（１）と前記プレート（２）との間の相対的変位を促進するコーティングが設けられている、請求項２７〜３６のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３８】
加熱用プレート（２）が、その温度をプログラミングするための手段に接続された２つ又は３つの別個のサーモブロック（２１，２２又は必要とあらば２３）を含む、請求項２７〜３７のいずれか１項に記載の装置。
【請求項３９】
カートリッジ（１）の底面が、切欠き（１８２）を含む中央突出部分（１８１）を有し、かつ、変位手段（３）が前記カートリッジ（１）を回転運動で移動させるように前記切欠き（１８２）と連動する少なくとも１つの駆動機構（３２）を含む、請求項２７〜３８のいずれか１項に記載の装置。
【請求項４０】
カートリッジの上に又は側面に配置された蛍光励起／測定のための光学手段（５）を含む、請求項２７〜３９のいずれか１項に記載の装置。
【請求項４１】
タンク（１１）内に存在する流体を反応チャンバ（１３）に供給するための手段（４）をさらに含む、請求項２７〜４０のいずれか１項に記載の装置。
【請求項４２】
前記供給手段（４）がピストン装置（４１）を含み、かつ、圧力を増大させることにより反応チャンバに対し流体が供給される、請求項４１に記載の装置。
【請求項４３】
前記供給手段（４）がポンプ（４１）を含み、かつ、負圧を確立した後に圧力を回復することにより反応チャンバに流体が供給される請求項４１に記載の装置。
【請求項４４】
カートリッジ（１）の反応チャンバ（１３）が閉鎖される、請求項４３に記載の装置。
【請求項４５】
・  プライマーそして任意には蛍光核酸リポーターを除いて、増幅反応を実施するのに必要な成分及び分析対象核酸標本を含む流体をタンク（１１）に少なくとも部分的に充填する段階と；
・  プライマー及び任意の１以上の標識づけされたプローブが中で位置付けられたカートリッジ（１）の反応チャンバまで前記流体を分配する段階；
・  カートリッジと加熱用プレートとの間の相対的変位のための手段（３）を利用して、所望の回数だけ前記加熱用プレートの２つ、３つ又はそれ以上のゾーンにより画定された２つ、３つ又はそれ以上の温度まで各反応チャンバの中味を連続的に導く段階と、
を含む、請求項２７〜４４のいずれか１項に記載の装置を用いて核酸を増幅するための方法。
【請求項４６】
反応チャンバ（１３）に流体を分配するための段階が、カートリッジ内部で負圧を加えその後圧力を回復することによって実施される、請求項４５に記載の増幅方法。
【請求項４７】
・  タンク（１１）に少なくとも部分的に流体を充填する段階と；
・  圧力を調整するための手段（４）にカートリッジ（１）を接続する段階と；
・  カートリッジの内部に負圧を加え、次に圧力を回復する段階と、
を含み、請求項２１に記載のカートリッジ（１）内の反応チャンバ（１３）の閉鎖システム充填のためのプロセス。