【手続補正書】
【提出日】平成20年3月26日(2008.3.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  （ａ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305,
307-315, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 5
26, 530, 531, 533, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 7
09-774, 777, 789, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-9
19, 929-931, 938, 939 及び 942で提供される配列; 
（ｂ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 3
28, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 530, 531, 53
3, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774, 777, 789
, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 929-931, 938
, 939 及び 942で提供される配列の相補体; 
（ｃ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 3
28, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 530, 531, 53
3, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774, 777, 789
, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 929-931, 938
, 939 及び 942で提供される配列の少なくとも20の連続した残基から成る配列;
（ｄ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 3
28, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 530, 531, 53
3, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774, 777, 789
, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 929-931, 938
, 939 及び 942 で提供される配列に対して、中位の緊縮条件下でハイブリダイ
ズする配列; 
（ｅ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 3
28, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 530, 531, 53
3, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774, 777, 789
, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 929-931, 938
, 939 及び 942の配列に対して少なくとも75％の同一性を有する配列;
（ｆ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 3
28, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 530, 531, 53
3, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774, 777, 789
, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 929-931, 938
, 939 及び 942の配列に対して少なくとも90％の同一性を有する配列; 及び
（ｇ）配列番号: 1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-315, 326, 3
28, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 530, 531, 53
3, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774, 777, 789
, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 929-931, 938
, 939 及び 942で提供される配列の縮重変異体；
から成る群から選択された配列を含んで成る単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２】  （ａ）配列番号: 112-114, 172, 176, 178, 327, 329, 331,
336, 339, 376-380, 383, 477-483, 496, 504, 505, 519, 520, 522, 525, 527
, 532, 534, 537-551, 553-568, 573-586, 588-590, 592, 706-708, 775, 776, 
778, 780, 781, 811, 814, 818, 826, 827, 853, 855, 858, 860-862, 866-877,
879, 883-893, 895, 897, 898, 909-915, 920-928, 932-934, 940, 941 及び 9
43で示される配列；
（ｂ）配列番号: 112-114, 172, 176, 178, 327, 329, 331, 336, 339, 376-3
80, 383, 477-483, 496, 504, 505, 519, 520, 522, 525, 527, 532, 534, 537-
551, 553-568, 573-586, 588-590, 592, 706-708, 775, 776, 778, 780, 781, 8
11, 814, 818, 826, 827, 853, 855, 858, 860-862, 866-877, 879, 883-893, 8
95, 897, 898, 909-915, 920-928, 932-934, 940, 941 及び 943の配列に対して
少なくとも70％の同一性を有する配列; 
（ｃ）配列番号: 112-114, 172, 176, 178, 327, 329, 331, 336, 339, 376-3
80, 383, 477-483, 496, 504, 505, 519, 520, 522, 525, 527, 532, 534, 537-
551, 553-568, 573-586, 588-590, 592, 706-708, 775, 776, 778, 780, 781, 8
11, 814, 818, 826, 827, 853, 855, 858, 860-862, 866-877, 879, 883-893, 8
95, 897, 898, 909-915, 920-928, 932-934, 940, 941 及び 943の配列に対して
少なくとも90％の同一性を有する配列;
（ｄ）請求項１記載のポリヌクレオチドによりコードされる配列；
（ｅ）請求項１記載のポリヌクレオチドによりコードされる配列に対して少な
くとも70％の同一性を有する配列；及び
（ｆ）請求項１記載のポリヌクレオチドによりコードされる配列に対して少な
くとも90％の同一性を有する配列；
から成る群から選択されたアミノ酸配列を含んで成る単離されたポリペプチド
。
【請求項３】  発現制御配列に操作可能的に連結される請求項１記載のポリ
ヌクレオチドを含んで成る発現ベクター。
【請求項４】  請求項２記載のポリペプチドに対して特異的に結合する単離
された抗体、又はその抗原−結合フラグメント。
【請求項５】  患者における癌の存在を検出するための方法であって、
（ａ）前記患者から生物学的サンプルを獲得し：
（ｂ）前記生物学的サンプルと、請求項２記載のポリペプチドに結合する結合
剤とを接触せしめ；
（ｃ）前記結合剤に結合するポリペプチドの量を、前記サンプルにおいて検出
し；そして
（ｄ）前記ポリペプチドの量を、前もって決定されたカット−オフ値に比較し
、そしてそれから、患者における癌の存在を決定する段階を含んで成る方法。
【請求項６】  配列番号：1-111, 115-171, 173-175, 177, 179-305, 307-3
15, 326, 328, 330, 332-335, 340-375, 381, 382 及び 384-476, 524, 526, 53
0, 531, 533, 535, 536, 552, 569-572, 587, 591, 593-606, 618-705, 709-774
, 777, 789, 817, 823, 824, 878, 880-882, 894, 896, 907, 908, 916-919, 92
9-931, 938, 939 及び 942で表される配列に対して、中位の緊縮条件下でハイブ
リダイズするオリゴヌクレオチド。
【請求項７】  生物学的サンプルにおける癌の存在を決定するための方法であって、
（ａ）ポリヌクレオチドを含有する生物学的サンプルを獲得し；
（ｂ）前記生物学的サンプルと、請求項６記載のオリゴヌクレオチドとを接触
せしめ；
（ｃ）前記オリゴヌクレオチドに対してハイブリダイズするポリヌクレオチド
の量を、前記サンプルにおいて検出し；そして
（ｄ）前記オリゴヌクレオチドに対してハイブリダイズするポリヌクレオチド
の量を、前もって決定されたカットオフ値に比較し、そしてそれから、前記サンプル
における癌の存在を決定する段階を含んで成る方法。
【請求項８】  請求項６記載の少なくとも１つのオリゴヌクレオチドを含
んで成る診断用キット。
【請求項９】  請求項４記載の少なくとも１つの抗体、及び受容体グルー
プを含んで成る検出試薬を含んで成る診断用キット。