【手続補正書】
【提出日】平成19年12月28日(2007.12.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
フコシル化された糖タンパク質を生成するための方法であって、該方法は：
組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質を、フコース残基を含むドナー基質および糖タンパク質上のアクセプター基質を含む混合物と、該フコシルトランスフェラーゼがドナー基質から該糖タンパク質上の該アクセプター基質への該フコース残基の転移を触媒する条件下で接触させ、それによりフコシル化された糖タンパク質を生成する工程、
を包含し、
ここで、該組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質は、配列番号１６、配列番号１８、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７、配列番号８９および配列番号９１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して９０％を超える同一性を有しているポリペプチドを含む、
方法。
【請求項２】
前記ポリペプチドは、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７、配列番号８９および配列番号９１からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して９５％を超える同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ポリペプチドが、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７、配列番号８９および配列番号９１からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ポリペプチドがアミノ酸タグをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記方法が、前記フコシル化された糖タンパク質を精製する工程をさらに包含する、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記アクセプター基質が、グルコース残基およびＮ−アセチルグルコサミン残基から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記糖タンパク質上のアクセプター基質が、Ｇａｌβ１−ＯＲ、Ｇａｌβ，３／４ＧｌｃＮＡｃ−ＯＲ、ＮｅｕＡｃα２，３Ｇａｌβ１，３／４ＧｌｃＮＡｃ−Ｏｒを含み、ここで、Ｒはアミノ酸、糖、オリゴ糖、または少なくとも１つの炭素原子を有するアグリコン基である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
核酸配列を含む単離されたポリヌクレオチドであって、該核酸配列は、配列番号１５、配列番号１７、配列番号８２、配列番号８４、配列番号８６および配列番号８８からなる群より選択されるヌクレオチド配列に対して９０％を超える同一性を有し、該ヌクレオチド配列は、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒するフコシルトランスフェラーゼをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項９】
前記核酸配列が、配列番号１５、配列番号１７、配列番号８２、配列番号８４、配列番号８６および配列番号８８からなる群より選択される、請求項８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１０】
前記フコシルトランスフェラーゼが、Ｎ−アセチルグルコサミン残基およびグルコース残基から選択されるアクセプター分子へのフコースの転移を触媒する、請求項８に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１１】
核酸配列を含む単離されたポリヌクレオチドであって、該核酸配列が、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒するフコシルトランスフェラーゼをコードし、該フコシルトランスフェラーゼは、配列番号１６、配列番号１８、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７および配列番号８９からなる群より選択されるアミノ酸を含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１２】
前記フコシルトランスフェラーゼがアミノ酸タグを含む、請求項１１に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１３】
請求項８または請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
【請求項１４】
請求項１３に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項１５】
フコシルトランスフェラーゼタンパク質の発現に適切な条件下で、請求項１４に記載の宿主細胞を培養する工程を包含する、フコシルトランスフェラーゼタンパク質を生成する方法。
【請求項１６】
核酸配列を含む単離されたポリヌクレオチドであって、該核酸配列が、配列番号１９に対して９０％を超える同一性を有し、該ヌクレオチド配列が、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒するフコシルトランスフェラーゼをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１７】
前記核酸配列が配列番号１９からなる、請求項１６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１８】
前記フコシルトランスフェラーゼが、Ｎ−アセチルグルコサミン残基およびグルコース残基から選択されるアクセプター分子へのフコースの転移を触媒する、請求項１６に記載のポリヌクレオチド。
【請求項１９】
核酸配列を含む単離されたポリヌクレオチドであって、該核酸配列は、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒するフコシルトランスフェラーゼをコードし、該フコシルトランスフェラーゼは、配列番号２０に対して９３％を超える同一性を有する、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２０】
前記フコシルトランスフェラーゼが配列番号２０からなる、請求項１９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２１】
請求項１６または請求項１９に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
【請求項２２】
請求項２１に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項２３】
フコシルトランスフェラーゼタンパク質の発現に適切な条件下で、請求項２２に記載の宿主細胞を培養する工程を包含する、フコシルトランスフェラーゼタンパク質を生成する方法。
【請求項２４】
配列番号１６、配列番号１８、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７および配列番号８９からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して９０％を超える同一性を有するポリペプチドを含む組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質であって、該フコシルトランスフェラーゼが、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒する、組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質。
【請求項２５】
アミノ酸タグをさらに含む、請求項２４に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼ。
【請求項２６】
前記ポリペプチドが、配列番号１６、配列番号１８、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７および配列番号８９からなる群より選択される、請求項２４に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼ。
【請求項２７】
前記フコシルトランスフェラーゼが、Ｎ−アセチルグルコサミン残基およびグルコース残基から選択されるアクセプター分子へのフコースの転移を触媒する、請求項２４に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼ。
【請求項２８】
配列番号２０に対して９３％を超える同一性を有するポリペプチドを含む組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質であって、該フコシルトランスフェラーゼが、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒する、組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質。
【請求項２９】
前記ポリペプチドが配列番号２０からなる、請求項２８に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質。
【請求項３０】
前記フコシルトランスフェラーゼが、Ｎ−アセチルグルコサミン残基およびグルコース残基から選択されるアクセプター分子へのフコースの転移を触媒する、請求項２８に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼ。
【請求項３１】
フコシル化されたオリゴ糖を作製する方法であって、該方法は：
請求項２４に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼを、フコース残基を含むドナー基質、および糖またはオリゴ糖を含むアクセプター基質を含む混合物と、融合タンパク質が該ドナー基質から該アクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒する条件下で接触させ、それによりフコシル化されたオリゴ糖を生成する工程を包含する、
方法。
【請求項３２】
前記方法が、前記フコシル化されたオリゴ糖を精製する工程をさらに包含する、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
ドナー基質がＧＤＰ−フコースである、請求項３１に記載の方法。
【請求項３４】
前記フコシルトランスフェラーゼがアミノ酸タグを含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３５】
アクセプター基質が、Ｎ−アセチルグルコサミンおよびグルコースから選択されるメンバーを含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３６】
前記アクセプター基質が、ラクト−Ｎ−ネオ−テトラオース（ＬＮｎＴ）である、請求項３１に記載の方法。
【請求項３７】
前記フコシル化されたオリゴ糖が、ラクト−Ｎ−フコペンタオースＩＩＩ（ＬＮＦＰ  ＩＩＩ）である、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】
前記混合物が、ラクトース、β−１，３−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼおよびβ−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼをさらに含む、請求項３１に記載の方法。
【請求項３９】
前記β−１，３−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼが細菌の酵素である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４０】
前記β−１，３−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼがＮｅｉｓｓｅｒｉａ
ｇｏｎｏｃｏｃｃｕｓ由来である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記β−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼが細菌の酵素である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４２】
前記β−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼがＮｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｃｏｃｃｕｓ由来である、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記フコシル化されたオリゴ糖が、ラクト−Ｎ−フコペンタオースＩＩＩ（ＬＮＦＰ  ＩＩＩ）である、請求項３８に記載の方法。
【請求項４４】
フコシル化された糖脂質を生成するための方法であって、該方法は：
請求項２４に記載の組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質を、フコース残基を含むドナー基質および糖脂質上のアクセプター基質を含む混合物と、該フコシルトランスフェラーゼがドナー基質から該糖脂質上の該アクセプター基質への該フコース残基の転移を触媒する条件下で接触させ、それによってフコシル化された糖脂質を生成する工程を包含する、
方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１５】
本発明により、ドナー基質からアクセプター基質へのフコース残基の転移を触媒する、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）由来のさらなるα−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質および核酸が提供される。１つの実施形態においては、本発明により、配列番号１５、１７、８２、８４、８６、または８８から選択されるヌクレオチド配列に対して９０％を超える同一性を有しており、フコースをアクセプター基質へと転移させるα−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質をコードする、α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼ核酸が提供される。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
別の実施形態においては、α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼ核酸は、配列番号１５、１７、８２、８４、８６、または８８から選択される。本発明により、配列番号１６、１８、８３、８５、８７、または８９を含み、アクセプター基質（例えば、Ｎ−アセチルグルコサミン残基）へ、またはグルコース残基へのフコースの転移を触媒する、α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質をコードする核酸配列が提供される。１つの態様においては、コードされるα−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼには、アミノ酸タグもまた含まれる。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１９】
別の実施形態においては、本発明により、配列番号１６、１８、８３、８５、８７、または８９に対して９０％を超える同一性を有しているアミノ酸配列を含む、組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質が提供される。ここでは、フコシルトランスフェラーゼは、ドナー基質からアクセプター基質（例えば、Ｎ−アセチルグルコサミン残基またはグルコース残基）へのフコース残基の転移を触媒する。別の実施形態においては、本発明により、配列番号２０に対して９３％を超える同一性を有しているアミノ酸配列を含む、組換えフコシルトランスフェラーゼタンパク質が提供される。ここでは、フコシルトランスフェラーゼは、ドナー基質からアクセプター基質（例えば、Ｎ−アセチルグルコサミン残基またはグルコース残基）へのフコース残基の転移を触媒する。１つの態様においては、フコシルトランスフェラーゼタンパク質には、配列番号１６、１８、２０、８３、８５、８７、または８９が含まれる。別の態様においては、フコシルトランスフェラーゼタンパク質には、アミノ酸タグもまた含まれる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２０】
本発明により、また、フコシル化オリゴ糖を産生するために上記α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼ、例えば、配列番号１６、１８、２０、８３、８５、８７、または８９を使用するための方法も提供される。フコシル化オリゴ糖は、さらに精製することができる。アクセプター基質は、使用者の要望に応じて、Ｎ−アセチル化グルコサミンまたはグルコースのいずれかであり得る。１つの実施形態においては、アクセプター基質は、ラクト−Ｎ−ネオ−テトラオース（ＬＮｎＴ）であり、フコシル化産物は、ラクト−Ｎ−フコペンタオースＩＩＩ（ＬＮＦＰ  ＩＩＩ）である。α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼは、フコシル化オリゴ糖を産生するために他のグリコシルトランスフェラーゼと組み合わせて使用することができる。例えば、出発物質として乳糖を使用すると、フコースをＮ−アセチルグルコサミンに転移させるα−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼ、β−１，３−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ、およびβ−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼの作用によってＬＮＦＰを産生することができる。β−１，３−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼおよびβ−１，４−ガラクトシルトランスフェラーゼは細菌の酵素であり、好ましい実施形態においては、淋菌（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ  ｇｏｎｏｃｏｃｃｕｓ）由来の酵素である。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２１】
別の実施形態においては、本発明のα−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、配列番号１６、１８、２０、８３、８５、８７、または８９）が、フコシル化糖脂質を産生するために使用される。アクセプター基質は、使用者の要望に応じて、Ｎ−アセチルグルコサミンまたはグルコースのいずれかであり得る。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
別の実施形態においては、本発明により、本明細書中に記載されるα−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼ（例えば、配列番号１６、１８、２０、８３、８５、８７、８９、または９１）を、適切なアクセプター基質を含む糖タンパク質と、フコシル化糖タンパク質を生成するために適切な条件下で混合することによって、フコシル化糖タンパク質を生成するための方法が提供される。アクセプター基質は、Ｇａｌβ１−ＯＲ、Ｇａｌβ，３／４ＧｌｃＮＡｃ−ＯＲ、ＮｅｕＡｃα２，３Ｇａｌβ１，３／４ＧｌｃＮＡｃ−Ｏｒから選択することができる。ここでは、Ｒはアミノ酸、糖、オリゴ糖、または少なくとも１つの炭素原子を有しているアグリコン基である。アクセプター基質は、Ｎ−アセチルグルコサミン残基またはグルコース残基であり得る。α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼには、アミノ酸タグもまた含めることができる。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２４】
用語「α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼまたはフコシルトランスフェラーゼ」あるいは「α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼまたはフコシルトランスフェラーゼ」をコードする核酸は：（１）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号８２、配列番号８４、配列番号８６、配列番号８８、または配列番号９０から選択される核酸配列によってコードされるポリペプチドに対して、あるいは、配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７、配列番号８９、または配列番号９１のアミノ酸配列に対して、好ましくは、少なくとも約２５個、５０個、１００個、２００個、５００個、１０００個、またはそれ以上のアミノ酸の領域にわたって、約６０％を超えるアミノ酸配列同一性、６５％、７０％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、好ましくは、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％、あるいはそれ以上のアミノ酸配列同一性を有しているアミノ酸配列を有する；（２）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７、配列番号８９、または配列番号９１のアミノ酸配列を含む免疫原；それらの免疫原性断片；およびそれらの保存的に修飾された変異体に対して惹起させられた抗体（例えば、ポリクローナル抗体）に特異的に結合する；（３）配列番号２、配列番号４、配列番号６、配列番号８、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１４、配列番号１６、配列番号１８、配列番号２０、配列番号８３、配列番号８５、配列番号８７、配列番号８９、または配列番号９１をコードする核酸；例えば、配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号８２、配列番号８４、配列番号８６、配列番号８８、または配列番号９０；あるいは、それらの相補物、およびそれらの保存的に修飾された変異体に対して、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で特異的にハイブリダイズする；（４）配列番号１、配列番号３、配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号１９、配列番号８２、配列番号８４、配列番号８６、配列番号８８、または配列番号９０；あるいは列挙された核酸配列の１つの相補物に対して、好ましくは、少なくとも約２５個、５０個、１００個、２００個、５００個、１０００個、またはそれ以上のヌクレオチドの領域にわたって、約６０％を超えるヌクレオチド配列同一性、好ましくは、約６５％、７０％、７５％、７６％、７７％、７８％、７９％、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８９％、９０％、９１％、９２％��９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、あるいはそれ以上のヌクレオチド配列同一性を有している核酸配列を有する、核酸、およびポリペプチド多形変異体、対立遺伝子、突然変異体、ならびに種間ホモログを意味する。本発明の核酸およびタンパク質には、自然界に存在している分子、または組み換え分子の両方が含まれる。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４０】
融合タンパク質の成分には、「アクセサリー酵素」および／または「精製またはアミノ酸タグ」が含まれる。「アクセサリー酵素」は、本明細書中で言及される場合には、例えば、フコシルトランスフェラーゼの基質を形成する触媒反応に関係している酵素である。アクセサリー酵素は、例えば、フコシルトランスフェラーゼによってドナー部分として使用されるヌクレオチド糖、例えば、ＧＤＰ−フコースの形成を触媒する。アクセサリー酵素はまた、ヌクレオチド糖の形成に必要なヌクレオチド三リン酸の生成、またはヌクレオチド糖に取り込まれる糖（例えば、フコース）の生成において使用されるものでもあり得る。本発明の組換え融合タンパク質は、タンパク質の精製を容易にする分子「精製タグ」を一方の末端に有している融合タンパク質として構築し、発現させることができる。このようなタグもまた、グリコシル化反応の間に目的のタンパク質を固定するために使用することができる。適切なタグとしては、「エピトープタグ」が挙げられ、これは、抗体によって特異的に認識されるタンパク質配列である。エピトープタグは、一般的には、融合タンパク質を疑いなく検出または単離するために容易に入手できる抗体を使用することを可能にするために、融合タンパク質に組み込まれる。「ＦＬＡＧタグ」は、モノクローナル抗ＦＬＡＧ抗体によって特異的に認識される、一般的に使用されているエピトープタグであり、配列ＡｓｐＴｙｒＬｙｓＡｓｐＡｓｐＡｓｐＡｓｐＬｙｓ（配列番号８０）、またはその実質的に同じ変異体から構成されている。他の適切なタグが当業者には公知であり、例えば、ヘキサヒスチジン（配列番号８１）ペプチド（これは、ニッケルまたはコバルトイオンのような金属イオンに結合する）のようなアフィニティータグが挙げられる。精製タグには、マルトース結合ドメインおよびデンプン結合ドメインも含まれる。マルトース結合ドメインタンパク質の精製は当業者に公知である。デンプン結合ドメインは、本明細書中に参考として援用されるＷＯ９９／１５６３６に記載されている。β−シクロデキストリン（ＢＣＤ）誘導樹脂を使用するデンプン結合ドメインを含む融合タンパク質の親和的精製は、２００３年５月５日に提出された米国特許出願番号６０／４６８，３７４（その全体が本明細書中に参考として援用される）に記載されている。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７６】
【化１】
2007520220.tif 000001
（配列番号１７５）（ＢａｍＨＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中のチトクロームｃ生合成タンパク質｛遺伝子ｈｐ０３７８｝配列ヌクレオチド３８８６７４−３８８６９４を大文字で並べた））およびプライマー５６（
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７７】
【化２】
2007520220.tif 000002
（配列番号１７６）（ＥｃｏＲＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中のグルタミン酸デヒドロゲナーゼ｛遺伝子ｈｐ０３８０｝ヌクレオチド３９０４５５−３９０４７３を大文字で並べた））；または、ＦｕｔＢについては、プライマー５３（
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７８】
【化３】
2007520220.tif 000003
（配列番号１７７）（ＢａｍＨＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中のホスホセリンホスファターゼ｛遺伝子ｈｐ０６５２｝配列ヌクレオチド６９８４３６−６９８４５３を大文字で並べた））およびプライマー５４（
【手続補正１３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７９】
【化４】
2007520220.tif 000004
（配列番号１７８）（ＥｃｏＲＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中の仮想タンパク質｛遺伝子ｈｐ０６５０｝ヌクレオチド６９６４２３−６９６４４０を大文字で並べた））。ＵＡ７６３株については、ＦｕｔＢを、プライマーＢＨＩＳＤＦｕｃ１３（
【手続補正１４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８０】
【化５】
2007520220.tif 000005
（配列番号１７９）（ＢａｍＨＩ制限酵素部位に下線、最適なシャインダルガノ配列をイタリックで、そしてα１，３−フコシルトランスフェラーゼを大文字で並べた））とプライマー５４を使用してＰＣＲ増幅した。開示されるプライマー対は、また、他のピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）株からα１，３−フコシルトランスフェラーゼをコードする核酸をクローニングするために使用することもできる。したがって、本発明には、活性なフコシルトランスフェラーゼタンパク質をコードし、プライマー５５（５’ｃｇｇｇａｔｃｃｃｇＧＣＧＴＧＡＡＴＴＡＣＴＡＣＣＴＴＴＣＴＧ３’；配列番号１７５）とプライマー５６（５’ｃｇｇａａｔｔｃｃｇＣＡＡＡＡＣＣＣＴＣＣＴＴＴＣＴＡＣＴＡＡＴＧ３’；配列番号１７６）を使用して増幅することができる、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼＦｕｔＡ核酸、ならびに、プライマー５３（
【手続補正１５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８１】
【化６】
2007520220.tif 000006
；配列番号１７７）またはプライマーＢＨＩＳＤＦｕｃ１３（
【手続補正１６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８２】
【化７】
2007520220.tif 000007
；配列番号１７９）とプライマー５４（
【手続補正１７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８３】
【化８】
2007520220.tif 000008
；配列番号１７８）、あるいは、図３３より選択されるプライマー対を使用して増幅することができるピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼＦｕｔＢ核酸が含まれる（ただし、以下のピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼ核酸は、このグループから除外される：１１８２株由来のＦｕｔＢ、１１１１株由来のＦｕｔＡ、１２１８株由来のＦｕｔＢ、１９Ｃ２株由来のＦｕｃＢ、２６６９５株由来のＦｕｔＡ、および１９Ｃ２株由来のＦｕｔＡの短縮型（これらの配列のそれぞれは、２００３年７月２３日に提出された国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ／２００３／０２３１５５；２００３年７月２３日に提出された国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ／２００３／０２３０５７に開示されている））。アクセス番号  ＮＣ＿０００９１５．１、ＡＦ１９４９６３、ＡＦ００６０３９、ＡＹ４５０５９８、ＮＣ＿０００９２１、およびＡＦ００８５９６による核酸もまた、このグループから除外される。本発明には、また、プライマー５５とプライマー５６によって、そしてプライマー５３またはプライマーＢＨＩＳＤＦｕｃ１３とプライマー５４によって増幅することができる核酸によってコードされる活性なピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質もまた含まれる（ただし、以下のピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼタンパク質はこのグループから除外される：１１８２株由来のＦｕｔＢ、１１１１株由来のＦｕｔＡ、１２１８株由来のＦｕｔＢ、１９Ｃ２株由来のＦｕｔＢの短縮型、２６６９５株由来のＦｕｔＡ、および１９Ｃ２株由来のＦｕｔＡの短縮型（これらの配列のそれぞれは、２００３年７月２３日に提出された国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ／２００３／０２３１５５；２００３年７月２３日に提出された国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ／２００３／０２３０５７に開示されている））。アクセス番号ＮＰ＿２０７４４５、ＮＰ＿２０７１７７、ＡＡＦ３５２９１、ＡＡＢ９３９８５、ＡＡＲ８８２４３、ＮＰ＿２２３７１９、ＮＰ＿２２３３１４、およびＡＡＢ８１０３１による核酸もまた、このグループから除外される。
【手続補正１８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１４】
本発明のピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質の精製を容易にするために、融合タンパク質をコードする核酸に、それに対する親和的結合試薬を利用することができるエピトープまたは「タグ」（すなわち、精製タグ）のコード配列を含めることもできる。適切なエピトープの例としては、ｍｙｃおよびＶ−５レポーター遺伝子が挙げられる；これらのエピトープを有している融合タンパク質の組み換え産生に有用な発現ベクターは、市販により入手することができる（例えば、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ（Ｃａｒｌｓｂａｄ  ＣＡ）ベクターｐｃＤＮＡ３．１／Ｍｙｃ−ＨｉｓおよびｐｃＤＮＡ３．１／Ｖ５−Ｈｉｓが哺乳動物細胞の中での発現に適している）。本発明のピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質にタグをつけるために適しているさらなる発現ベクター、および対応する検出システムは当業者に公知であり、いくつかは市販により入手することができる（例えば、「ＦＬＡＧ」（Ｋｏｄａｋ，Ｒｏｃｈｅｓｔｅｒ  ＮＹ））。適切なタグの別の例は、ポリヒスチジン配列であり、これは、金属キレートアフィニティーリガンドに結合することができる。通常、６つの隣接しているヒスチジン（配列番号８１）が使用されるが、６個以上、または６個未満のものを使用することもできる。ポリヒスチジンタグについて結合部分としての役割を担うことができる適切な金属キレートアフィニティーリガンドとしては、ニトリロ三酢酸（ＮＴＡ）が挙げられる（Ｈｏｃｈｕｌｉ，Ｅ．（１９９０）「Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｗｉｔｈ  ｍｅｔａｌ  ｃｈｅｌａｔｉｎｇ  ａｂｓｏｒｂｅｎｔｓ」Ｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄｓ，Ｊ．Ｋ．Ｓｅｔｌｏｗ編、Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ；Ｑｉａｇｅｎ（Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒｉｔａ，ＣＡ）から市販により入手することができる））。
【手続補正１９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３０】
本発明の組換え融合タンパク質は、一方の末端に、タンパク質の精製を容易にする分子「タグ」、すなわち、精製タグを有している融合タンパク質として構築し、発現させることができる。このようなタグはまた、グリコシル化反応の間の目的のタンパク質の固定のために使用することもできる。適切なタグとしては、抗体によって特異的に認識されるタンパク質配列である「エピトープタグ」が挙げられる。エピトープタグは、一般的には、融合タンパク質を明らかに検出または単離するために容易に入手することができる抗体を使用することができるようにするために、融合タンパク質中に組み込まれる。「ＦＬＡＧタグ」が一般的に使用されるエピトープタグであり、これは、モノクローナル抗ＦＬＡＧ抗体によって特異的に認識され、配列ＡｓｐＴｙｒＬｙｓＡｓｐＡｓｐＡｓｐＡｓｐＬｙｓ（配列番号８０）またはその実質的に同一である変異体から構成される。ｍｃｙタグは、別の一般的に使用されているエピトープタグである。他の適切なタグが当業者に公知であり、これには、例えば、ヘキサヒスチジンペプチド（配列番号８１）のような親和性タグが含まれる。これは、ニッケルまたはコバルトイオンのような金属イオンに結合する。精製タグにはまた、マルトース結合ドメインおよびデンプン結合ドメインも含まれる。マルトース結合ドメインタンパク質の精製は当業者に公知である。デンプン結合ドメインは、本明細書中に参考として援用されるＷＯ９９／１５６３６に記載されている。β−シクロデキストリン（ＢＣＤ）誘導樹脂を使用するデンプン結合ドメインを含む融合タンパク質の親和的精製は、２００３年５月５日に提出された米国特許出願番号６０／４６８，３７４（その全体が本明細書中に参考として援用される）に記載されている。
【手続補正２０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２０３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２０３】
【化１１】
2007520220.tif 000009
（配列番号１７５）（ＢａｍＨＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中のチトクロームｃ生合成タンパク質｛遺伝子ｈｐ０３７８｝配列ヌクレオチド３８８６７４−３８８６９４を大文字で並べた））およびプライマー５６（
【手続補正２１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２０４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２０４】
【化１２】
2007520220.tif 000010
（配列番号１７６）（ＥｃｏＲＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中のグルタミン酸デヒドロゲナーゼ｛遺伝子ｈｐ０３８０｝ヌクレオチド３９０４５５−３９０４７３を大文字で並べた））、また、ＦｕｔＢについては、プライマー５３（
【手続補正２２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２０５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２０５】
【化１３】
2007520220.tif 000011
（配列番号１７７）（ＢａｍＨＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中のホスホセリンホスファターゼ｛遺伝子ｈｐ０６５２｝配列ヌクレオチド６９８４３６−６９８４５３を大文字で並べた））およびプライマー５４（
【手続補正２３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２０６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２０６】
【化１４】
2007520220.tif 000012
（配列番号１７８）（ＥｃｏＲＩ制限酵素部位に下線、２６６９５中の仮想タンパク質｛遺伝子ｈｐ０６５０｝ヌクレオチド６９６４２３−６９６４４０を大文字で並べた））のいずれかを使用してＰＣＲ増幅した。ＰＣＲ産物を、ＢａｍＨＩとＥｃｏＲＩで制限酵素処理し、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ  ＩＩ  ＫＳ＋中に、Ｔ７プロモーターの制御下にクローニングした。プラスミドＤＮＡを単離し、ＢａｍＨＩとＥｃｏＲＩで消化して、挿入断片の大きさを決定し、配列決定反応を行って挿入断片が正確なものであることを確認した。ＵＡ７６３  ＦｕｔＢを、ＢＨＩＳＤＦｕｃ１３（
【手続補正２４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２０７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２０７】
【化１５】
2007520220.tif 000013
（配列番号１７９）（ＢａｍＨＩ制限酵素部位に下線、最適なシャインダルガノ配列をイタリックで、そしてα１，３−フコシルトランスフェラーゼを大文字で並べた））とプライマー５４を使用してＰＣＲ増幅した。ＰＣＲ産物をＢａｍＨＩとＥｃｏＲＩで制限酵素処理し、ｐＭＳ１１９ＨＥにクローニングした。プラスミドＤＮＡを単離し、ＢａｍＨＩとＥｃｏＲＩで消化して、挿入断片の大きさを決定し、配列決定反応を行って挿入断片が正確なものであることを確認した。ピロリ菌（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）からフコシルトランスフェラーゼをクローニングするために有用な他のプライマーを図３３に開示する。
【手続補正２５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２１０】
【図１】図１により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１１８２Ｂ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号１）およびアミノ酸配列（配列番号２）が提供される。
【図２】図２により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１１１１Ａ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号３）およびアミノ酸配列（配列番号４）が提供される。
【図３】図３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１２１８Ｂ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号５）およびアミノ酸配列（配列番号６）が提供される。
【図４】図４により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１９Ｃ２Ｂ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号７）およびアミノ酸配列（配列番号８）が提供される。
【図５】図５により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）９１５Ａ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号９）およびアミノ酸配列（配列番号１０）が提供される。
【図６】図６により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）２６６９５Ａ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号１１）およびアミノ酸配列（配列番号１２）が提供される。
【図７】図７により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１９Ｃ２Ａ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（配列番号１３）およびアミノ酸配列（配列番号１４）が提供される。
【図８】図８により、１１８２  ｆｕｔＢアミノ酸配列（配列番号６４）と、グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０（すなわち、フコシルトランスフェラーゼファミリー）に由来するコンセンサス配列（配列番号６５）との間でのアライメントが提供される。１１８２  ｆｕｔＢのアミノ酸２３から３０５が上段に示され、これは、タンパク質の最も保存されている領域、すなわち、フコシルトランスフェラーゼ触媒ドメインを示す。
【図９】図９により、１１１１  ｆｕｔＡアミノ酸配列（配列番号６６）と、グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０（すなわち、フコシルトランスフェラーゼファミリー）に由来するコンセンサス配列（配列番号６７）との間でのアライメントが提供される。１１１１  ｆｕｔＡのアミノ酸２７から４１７が上段に示され、これは、タンパク質の最も保存されている領域、すなわち、フコシルトランスフェラーゼ触媒ドメインを示す。
【図１０】図１０により、１２１８  ｆｕｔＢアミノ酸配列（配列番号６８）と、グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０（すなわち、フコシルトランスフェラーゼファミリー）に由来するコンセンサス配列（配列番号６９）との間でのアライメントが提供される。１２１８  ｆｕｔＢのアミノ酸２３から３９９が上段に示され、これは、タンパク質の最も保存されている領域、すなわち、フコシルトランスフェラーゼ触媒ドメインを示す。
【図１１】図１１により、１９Ｃ２  ｆｕｔＢアミノ酸配列（配列番号７０）と、グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０（すなわち、フコシルトランスフェラーゼファミリー）に由来するコンセンサス配列（配列番号７１）との間でのアライメントが提供される。１９Ｃ２  ｆｕｔＢのアミノ酸２３から３７７が上段に示され、これは、タンパク質の最も保存されている領域、すなわち、フコシルトランスフェラーゼ触媒ドメインを示す。
【図１２】図１２により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）のアミノ酸配列１１８２  ＦｕｔＢ（配列番号７４）、１１１１  ＦｕｔＡ（配列番号７２）、１２１８  ＦｕｔＢ（配列番号７５）、１９Ｃ２  ＦｕｔＢ（配列番号７６）、９１５  ＦｕｔＡ（配列番号１０）、１９Ｃ２  ＦｕｔＡ（配列番号１４）、および２６６９５  ＦｕｔＡ（配列番号７３）の間でのアライメントが提供される。最下段の配列はコンセンサス配列（配列番号７７）である。
【図１３−１】図１３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）の核酸配列１１８２  ＦｕｔＢ（配列番号１）、１１１１  ＦｕｔＡ（配列番号３）、１２１８  ＦｕｔＢ（配列番号５）、１９Ｃ２  ＦｕｔＢ（配列番号７）、９１５  ＦｕｔＡ（配列番号７８）、１９Ｃ２  ＦｕｔＡ（配列番号１３）、および２６６９５  ＦｕｔＡ（配列番号１１）の間でのアライメントが提供される。最下段の配列はコンセンサス配列（配列番号７９）である。
【図１３−２】図１３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）の核酸配列１１８２  ＦｕｔＢ（配列番号１）、１１１１  ＦｕｔＡ（配列番号３）、１２１８  ＦｕｔＢ（配列番号５）、１９Ｃ２  ＦｕｔＢ（配列番号７）、９１５  ＦｕｔＡ（配列番号７８）、１９Ｃ２  ＦｕｔＡ（配列番号１３）、および２６６９５  ＦｕｔＡ（配列番号１１）の間でのアライメントが提供される。最下段の配列はコンセンサス配列（配列番号７９）である。
【図１３−３】図１３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）の核酸配列１１８２  ＦｕｔＢ（配列番号１）、１１１１  ＦｕｔＡ（配列番号３）、１２１８  ＦｕｔＢ（配列番号５）、１９Ｃ２  ＦｕｔＢ（配列番号７）、９１５  ＦｕｔＡ（配列番号７８）、１９Ｃ２  ＦｕｔＡ（配列番号１３）、および２６６９５  ＦｕｔＡ（配列番号１１）の間でのアライメントが提供される。最下段の配列はコンセンサス配列（配列番号７９）である。
【図１３−４】図１３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）の核酸配列１１８２  ＦｕｔＢ（配列番号１）、１１１１  ＦｕｔＡ（配列番号３）、１２１８  ＦｕｔＢ（配列番号５）、１９Ｃ２  ＦｕｔＢ（配列番号７）、９１５  ＦｕｔＡ（配列番号７８）、１９Ｃ２  ＦｕｔＡ（配列番号１３）、および２６６９５  ＦｕｔＡ（配列番号１１）の間でのアライメントが提供される。最下段の配列はコンセンサス配列（配列番号７９）である。
【図１３−５】図１３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）の核酸配列１１８２  ＦｕｔＢ（配列番号１）、１１１１  ＦｕｔＡ（配列番号３）、１２１８  ＦｕｔＢ（配列番号５）、１９Ｃ２  ＦｕｔＢ（配列番号７）、９１５  ＦｕｔＡ（配列番号７８）、１９Ｃ２  ＦｕｔＡ（配列番号１３）、および２６６９５  ＦｕｔＡ（配列番号１１）の間でのアライメントが提供される。最下段の配列はコンセンサス配列（配列番号７９）である。
【図１４】図１４により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼの基質であるラクト−Ｎ−ネオ−テトラオース（ＬＮｎＴ）と、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼの産物であるラクト−Ｎ−フコペンタオースＩＩＩ（ＬＮＦＰ  ＩＩＩまたはＬＮＦ  ＩＩＩ）のオリゴ糖構造が提供される。
【図１５】図１５により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼに対するアクセプター特異性の分析の結果が提供される。
【図１６】図１６により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼを使用するＬＮＦ  ＩＩＩ合成の収率が提供される。２つのイオン交換樹脂を試験した：ＭＲ３  ＮＨ４ＨＣＯ３およびＤｏｗｅｘ１／Ｄｏｗｅｘ５０樹脂。
【図１７】図１７により、フコースを糖タンパク質アシアリルトランスフェリンに変換するための、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１１８２株由来のＦｕｔＢ  α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼの使用が示される。上段のパネルには、シアル化トランスフェリンのＧＣ／ＭＳ分析が示される。下段のパネルには、酵素的にシアル化され、その後、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１１８２株ＦｕｔＢ  α−１，３／４−フコシルトランスフェラーゼを使用してフコシル化された、シアル化トランスフェリンのＧＣ／ＭＳ分析が示される。糖構造についての記号：黒四角−ＧｌｃＮＡｃ；白丸−マンノース；黒菱形−ガラクトース；三角−フコース；星型−シアル酸。
【図１８】図１８により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１１１１  ＦｕｔＢ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号１５）およびアミノ酸配列（下段；配列番号１６）が提供される。核酸配列は、小文字のＢａｍＨＩ部位で始まる。コード配列もまた、小文字（すなわち、ａｔｇ．．．ｔａａ）であり、配列は、小文字のＥｃｏＲＩ部位で終わる。
【図１９】図１９により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）８０２  ＦｕｔＡ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号１７）およびアミノ酸配列（下段；配列番号１８）が提供される。核酸配列は、小文字のＢａｍＨＩ部位で始まる。コード配列は、小文字のａｔｇで始まり、小文字の終止コドン（ｔａａ）で終わり、配列は小文字のＥｃｏＲＩ部位で終わる。
【図２０】図２０により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）９４８  ＦｕｔＡ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号１９）およびアミノ酸配列（下段；配列番号２０）が提供される。核酸配列は、小文字のＢａｍＨＩ部位で始まる。コード配列もまた、小文字（すなわち、ａｔｇ．．．ｔａａ）であり、配列は、小文字のＥｃｏＲＩ部位で終わる。
【図２１】図２１により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）９５５  ＦｕｔＡ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号２１）およびアミノ酸配列（下段；配列番号２２〜４６）が提供される。核酸配列は、小文字のＢａｍＨＩ部位で始まる。開始コドン（すなわち、ａｔｇ）は小文字であり、配列は小文字のＥｃｏＲＩ部位で終わる。
【図２２】図２２により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１２１８  ＦｕｔＡ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号４７）およびアミノ酸配列（下段；配列番号４８〜６３）が提供される。核酸配列は、小文字のＢａｍＨＩ部位で始まり、配列は、小文字のＥｃｏＲＩ部位で終わる。
【図２３】図２３により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）ＵＡ９５５  ＦｕｔＢ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号８２）およびアミノ酸配列（下段；配列番号８３）が提供される。
【図２４】図２４により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）ＵＡ７６３  ＦｕｔＢ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号８４）およびアミノ酸配列（下段；配列番号８５）が提供される。
【図２５】図２５により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１９Ｃ２  ＦｕｔＡ株由来の全長のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号８６）およびアミノ酸配列（下段；配列番号８７）が提供される。
【図２６】図２６により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）１９Ｃ２  ＦｕｔＢ株由来の全長のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号８８）およびアミノ酸配列（下段；配列番号８９）が提供される。
【図２７】図２７により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）２６６９５  ＦｕｔＡ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号９０）およびアミノ酸配列（下段；配列番号９１）が提供される。
【図２８】図２８によりにより、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）８０２  ＦｕｔＢ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号９２）およびアミノ酸配列（下段；配列番号９３）が提供される。
【図２９】図２９により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）ＵＡ９４８  ＦｕｔＢ株由来のフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号９４）およびアミノ酸配列（下段；配列番号９５）が提供される。
【図３０】図３０により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）ＵＡ９１５ＦｕｔＢフコシルトランスフェラーゼの核酸配列（上段；配列番号９６）およびアミノ酸配列（下段；配列番号９７）が提供される。
【図３１−１】図３１により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼ（１１１ＦｕｔＢ（配列番号９８）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１００）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号１０２）、ＵＡ９５５ＦｕｔＢ（配列番号１０３）、ＵＡ７６３ＦｕｔＢ（配列番号１０４）、全長の１９Ｃ２ＦｕｔＡ（配列番号１０５）、全長の１９Ｃ２ＦｕｔＢ（配列番号１０６）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号１０７））の、ｐｆａｍ００８５２，Ｇｌｙｃｏ＿ｔｒａｎｓｆ＿１０，グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０の配列（配列番号９９および配列番号１０１）とのアライメントが提供される。例えば、Ｍａｒｃｈｌｅｒ−Ｂａｕｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．３３：Ｄ１９２−６（２００５）およびｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ／ｃｄｄ／ｃｄｄ．ｓｈｔｍｌ．を参照のこと。保存されている残基と同じ残基は斜体の文字であり；保存されていない残基は太字の文字である。
【図３１−２】図３１により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼ（１１１ＦｕｔＢ（配列番号９８）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１００）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号１０２）、ＵＡ９５５ＦｕｔＢ（配列番号１０３）、ＵＡ７６３ＦｕｔＢ（配列番号１０４）、全長の１９Ｃ２ＦｕｔＡ（配列番号１０５）、全長の１９Ｃ２ＦｕｔＢ（配列番号１０６）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号１０７））の、ｐｆａｍ００８５２，Ｇｌｙｃｏ＿ｔｒａｎｓｆ＿１０，グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０の配列（配列番号９９および配列番号１０１）とのアライメントが提供される。例えば、Ｍａｒｃｈｌｅｒ−Ｂａｕｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．３３：Ｄ１９２−６（２００５）およびｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ／ｃｄｄ／ｃｄｄ．ｓｈｔｍｌ．を参照のこと。保存されている残基と同じ残基は斜体の文字であり；保存されていない残基は太字の文字である。
【図３１−３】図３１により、ピロリ菌（Ｈ．ｐｙｌｏｒｉ）フコシルトランスフェラーゼ（１１１ＦｕｔＢ（配列番号９８）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１００）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号１０２）、ＵＡ９５５ＦｕｔＢ（配列番号１０３）、ＵＡ７６３ＦｕｔＢ（配列番号１０４）、全長の１９Ｃ２ＦｕｔＡ（配列番号１０５）、全長の１９Ｃ２ＦｕｔＢ（配列番号１０６）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号１０７））の、ｐｆａｍ００８５２，Ｇｌｙｃｏ＿ｔｒａｎｓｆ＿１０，グリコシルトランスフェラーゼファミリー１０の配列（配列番号９９および配列番号１０１）とのアライメントが提供される。例えば、Ｍａｒｃｈｌｅｒ−Ｂａｕｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．３３：Ｄ１９２−６（２００５）およびｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ／ｃｄｄ／ｃｄｄ．ｓｈｔｍｌ．を参照のこと。保存されている残基と同じ残基は斜体の文字であり；保存されていない残基は太字の文字である。
【図３２−１】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−２】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−３】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−４】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−５】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−６】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−７】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−８】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−９】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−１０】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−１１】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−１２】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３２−１３】図３２により、α１，３／４−フコシルトランスフェラーゼタンパク質（例えば、１９Ｃ２ＡＦｕｔＡ（配列番号８７）、１９Ｃ２ＢＦｕｔＢ（配列番号８９）、７６３ＦｕｔＡ（配列番号１０８）、７６３ＦｕｔＢ（配列番号８５）、８０２ＦｕｔＡ（配列番号１８）、８０２ＦｕｔＢ（配列番号９３）、９１５ＦｕｔＡ（配列番号１０９）、９１５ＦｕｔＢ（配列番号９７）、９４８ＦｕｔＡ（配列番号２０）、９４８ＦｕｔＢ（配列番号９５）、９５５ＦｕｔＡ（配列番号２２）、９５５ＦｕｔＢ（配列番号８３）、１１１１ＦｕｔＡ（配列番号４）、１１１１ＦｕｔＢ（配列番号１６）、１１８２ＦｕｔＢ（配列番号２）、１２１８ＦｕｔＡ（配列番号４８）、１２１８ＦｕｔＢ（配列番号６）、２６６９５ＦｕｔＡ（配列番号１１０）、および２６６９５ＦｕｔＢ（配列番号９１））のアライメントが提供される。上段には、大多数であるか、またはコンセンサスである配列（配列番号１１１）が示される。アライメントは、ＣｌｕｓｔａｌＷ（Ｓｌｏｗ／Ａｃｃｕｒａｔｅ，Ｇｏｎｎｅｔ）を使用して行った。
【図３３−１】図３３により、ピロリ菌（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）由来のフコシルトランスフェラーゼ遺伝子（配列番号１１２〜１７４）を配列決定し、クローニングするために有用なプライマーが提供される。
【図３３−２】図３３により、ピロリ菌（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）由来のフコシルトランスフェラーゼ遺伝子（配列番号１１２〜１７４）を配列決定し、クローニングするために有用なプライマーが提供される。
【図３３−３】図３３により、ピロリ菌（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｙｌｏｒｉ）由来のフコシルトランスフェラーゼ遺伝子（配列番号１１２〜１７４）を配列決定し、クローニングするために有用なプライマーが提供される。