【手続補正書】
【提出日】平成20年1月25日(2008.1.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  配列番号：３のヌクレオチド４１２からヌクレオチド４７７を包含する配列、又はその相補性配列に対して、少なくとも６５％の相同性を有する配列を含んで成る単離された核酸。
【請求項２】  相同性が少なくとも７５％である、請求項１の単離された核酸。
【請求項３】  相同性が少なくとも８５％である、請求項１の単離された核酸。
【請求項４】  相同性が少なくとも９０％である、請求項１の単離された核酸。
【請求項５】  相同性が少なくとも９６％である、請求項１の単離された核酸。
【請求項６】  配列番号：３のヌクレオチド４１２からヌクレオチド４７７を包含する配列、又はその相補性配列を含んでなる請求項１の単離された核酸。
【請求項７】  配列番号：３を含んでなる、請求項１の単離された核酸。
【請求項８】  配列番号：３のヌクレオチド４４６からヌクレオチド４６３を包含する配列、又はその相補性配列を含んでなる請求項１の単離された核酸。
【請求項９】  核酸が抗原性ポリペプチドをコードする、請求項１の単離された核酸。
【請求項１０】  配列が細胞外ドメインである、請求項１の単離された核酸。
【請求項１１】  配列番号：１９に対して、少なくとも６５％の相同性を有する配列を含んでなる単離されたポリペプチド。
【請求項１２】  相同性が少なくとも７５％である、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項１３】  相同性が少なくとも８５％である、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項１４】  相同性が少なくとも９０％である、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項１５】  相同性が少なくとも９６％である、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項１６】  配列番号：１９を含んでなる請求項１１の単離された核酸。
【請求項１７】  配列番号：１７に対して、少なくとも５０％の相同性を有する配列を含んでなる請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項１８】  配列番号：１７を含んでなる、請求項１１の単離されたポリペプチド。    
【請求項１９】  配列番号：１８に対して、少なくとも２０％の相同性を有する配列を含んでなる単離されたポリペプチド。
【請求項２０】  配列番号：４を含んでなる請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項２１】  ポリペプチドが抗原性である、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項２２】  配列が細胞外ドメインの一部分を含む、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項２３】  ポリペプチドが水溶性である、請求項１１の単離されたポリペプチド。
【請求項２４】  配列番号：４のアミノ酸１からアミノ酸３２７を包含する配列に対して、少なくとも９８％の相同性を有する単離されたポリペプチド。
【請求項２５】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９４５．２Ｇ１．１Ｃ７．２Ｆ１０）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項２６】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８２．４Ａ１２．１Ｅ８．１Ｃ４）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項２７】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８３．３Ｇ９．１Ｄ４．１Ｄ７）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項２８】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８４．６Ｄ６．１Ｈ１０．２Ｃ１）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項２９】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８５．４Ｆ３．２Ｄ６．１Ｄ７）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項３０】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８７．１Ｄ８．１Ｃ１１．２Ｂ７）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項３１】  ポリペプチドがモノクローナル抗体と結合し、その抗体が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション  寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８８．１Ａ７．１Ｆ２．１Ｈ７）によって生産された抗体が結合するのと同じエピトープに結合する、単離されたポリペプチド。
【請求項３２】  配列番号：４のアミノ酸１からアミノ酸３２７を包含する配列に対して、少なくとも８０％の相同的な配列を含むポリペプチドと結合するモノクローナル抗体。
【請求項３３】  相同性が少なくとも９８％である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項３４】  配列番号：１９に対して、少なくとも６５％相同的である配列を含むポリペプチドと結合するモノクローナル抗体。
【請求項３５】  相同性が少なくとも７５％である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項３６】  相同性が少なくとも８５％である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項３７】  相同性が少なくとも９０％である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項３８】  相同性が少なくとも９６％である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項３９】  ポリペプチドが配列番号：１９を含む、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４０】  ポリペプチドが配列番号：１７を含む、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４１】  抗体がＬＩＶ-１-１６４６４７である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４２】  抗体が腫瘍細胞の増殖を阻害する、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４３】  腫瘍細胞が、ＬＩＶ-１-１６４６４７タンパク質を発現する、乳房、肺、前立腺、結腸、卵巣、子宮、腎臓、胃、及び唾液腺癌、或いはその他の細胞型から成る群から選択される、請求項４２のモノクローナル抗体。
【請求項４４】  抗体が、ＬＩＶ-１を過剰発現する腫瘍細胞のインビトロでの増殖を阻害する、請求項４２のモノクローナル抗体。
【請求項４５】  抗体がマウスモノクローナル抗体である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４６】  抗体がマウス-ヒトハイブリッド抗体である、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４７】  抗体が、ＬＩＶ-１タンパク質のリガンドのリガンド結合部位との結合に関して競合する、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４８】  抗体がＬＩＶ-１の発現を減じる、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項４９】  抗体が補体を活性化する、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項５０】  抗体が抗体依存性細胞性細胞障害を媒介する、請求項３２のモノクローナル抗体。
【請求項５１】  エピトープが、配列番号：１９に対して少なくとも６５％の相同性を有するアミノ酸配列を含むエピトープと結合するモノクローナル抗体。
【請求項５２】  エピトープが、配列番号：１７に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含む、請求項４９のモノクローナル抗体。
【請求項５３】  エピトープが配列番号：１７を含む、請求項５２のモノクローナル抗体。
【請求項５４】  ハイブリドーマ細胞株が、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション寄託番号  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９４５．２Ｇ１．１Ｃ７．２Ｆ１０）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８２．４Ａ１２．１Ｅ８．１Ｃ４）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８３．３Ｇ９．１Ｄ４．１Ｄ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８４．６Ｄ６．１Ｈ１０．２Ｃ１）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８５．４Ｆ３．２Ｄ６．１Ｄ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８７．１Ｄ８．１Ｃ１１．２Ｂ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８８．１Ａ７．１Ｆ２．１Ｈ７）へ寄託したハイブリドーマ細胞株から成る群から選択され、ハイブリドーマ細胞株によって生産されるモノクローナル抗体が結合するエピトープと同じエピトープに結合するモノクローナル抗体。
【請求項５５】  細胞障害性成分と請求項３２のモノクローナル抗体のコンジュゲートである免疫毒素。
【請求項５６】  請求項３２のモノクローナル抗体を生産するハイブリドーマ。
【請求項５７】  ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９４５．２Ｇ１．１Ｃ７．２Ｆ１０）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８２．４Ａ１２．１Ｅ８．１Ｃ４）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８３．３Ｇ９．１Ｄ４．１Ｄ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８４．６Ｄ６．１Ｈ１０．２Ｃ１）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８５．４Ｆ３．２Ｄ６．１Ｄ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８７．１Ｄ８．１Ｃ１１．２Ｂ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８８．１Ａ７．１Ｆ２．１Ｈ７）から成る群から選択されたハイブリドーマ。
【請求項５８】  （ａ）哺乳動物からの試料を、配列番号：４のアミノ酸１からアミノ酸３２７を包含する配列に対して、少なくとも８０％の相同性を有する配列を含んでなるポリペプチドと特異的に結合する抗体へ曝露すること；並びに
（ｂ）試料中のポリペプチドへの結合の程度を測定することを含んでなる方法である、腫瘍を検出するためのアッセイ。
【請求項５９】  試料中のポリペプチドが哺乳動物からの細胞上にある、請求項５８のアッセイ。
【請求項６０】  試料は哺乳動物の体液であり、ポリペプチドは可溶性ポリペプチドである、請求項５８のアッセイ。
【請求項６１】  抗体がモノクローナル抗体である、請求項５８のアッセイ。
【請求項６２】  インビトロでおこなわれ、そしてアッセイがＥＬＩＳＡアッセイである、請求項５８のアッセイ。
【請求項６３】  細胞が哺乳動物の体の中にとどまる複数個の細胞であり、抗体が放射活性アイソトープで標識され、哺乳動物へ投与される複数個の抗体であり、抗体の細胞との結合の程度が放射活性に関する外部スキャンニングによって観察される、請求項５９のアッセイ。
【請求項６４】  更に二次放射活性アイソトープで標識され、そして哺乳動物へ投与される抗-ＥｒｂＢ２抗体を含み、標識抗-ＥｒｂＢ２抗体による抗体の細胞への結合の程度が、放射活性に関する外部スキャンニングによって観察される、請求項５８のアッセイ。
【請求項６５】  配列番号：４のアミノ酸１からアミノ酸３２７を包含する配列に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列と結合することができ、ＬＩＶ-１-１６４６４７発現細胞の増殖を阻害する抗体の治療的有効量を哺乳動物へ投与することを含んでなる方法である、腫瘍細胞の成長を阻害する方法。
【請求項６６】  抗体が補体を活性する、請求項６５の方法。
【請求項６７】  抗体が抗体依存性細胞性細胞障害を媒介する、請求項６５の方法。
【請求項６８】  抗体がモノクローナル抗体である、請求項６５の方法。
【請求項６９】  腫瘍細胞が、ＬＩＶ-１-１６４６４７タンパク質を発現する、乳房、肺、前立腺、結腸、卵巣、子宮、腎臓、胃、及び唾液腺癌、或いはその他の細胞型から成る群から選択される癌を含む、請求項６５の方法。
【請求項７０】  腫瘍細胞が乳房組織細胞である、請求項６９の方法。
【請求項７１】  哺乳動物がヒトである、請求項６９の方法。
【請求項７２】  細胞障害性因子の治療的有効量を投与することを更に含む方法である、請求項６５の方法。
【請求項７３】  抗体及び細胞障害性因子を同時に投与する、請求項７２の方法。
【請求項７４】  細胞障害剤の前に抗体を患者へ投与する、請求項７２の方法。
【請求項７５】  抗体の前に細胞障害剤を投与する、請求項７２の方法。
【請求項７６】  細胞障害剤を抗体とコンジュゲートさせた、請求項７２の方法。
【請求項７７】  配列番号：４のアミノ酸１からアミノ酸３２７を包含する配列に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列と特異的に結合する抗体、並びに製薬的に許容される担体を含んでなる組成物。
【請求項７８】  抗体が、ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９４５．２Ｇ１．１Ｃ７．２Ｆ１０）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８２．４Ａ１２．１Ｅ８．１Ｃ４）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８３．３Ｇ９．１Ｄ４．１Ｄ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８４．６Ｄ６．１Ｈ１０．２Ｃ１）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８５．４Ｆ３．２Ｄ６．１Ｄ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８７．１Ｄ８．１Ｃ１１．２Ｂ７）；ＡＴＣＣ          （ＬＩＶ-１．２９８８．１Ａ７．１Ｆ２．１Ｈ７）から成る群から選択されるハイブリドーマ細胞株によって生産されるモノクローナル抗体である、抗体及び製薬的に許容される担体を含んでなる組成物。
【請求項７９】  細胞障害性因子を更に含んでなる、請求項７７の組成物。
【請求項８０】  被験試料における高発現レベルが、被験試料が得られた哺乳動物における腫瘍の存在を示し、配列番号：３のヌクレオチド４１２からヌクレオチド４７７を包含する配列に対して少なくとも６５％の相同性を有する配列を含んでなる核酸配列、又はその相補性配列の発現のレベルを、哺乳動物から得た被験試料、及びコントロール試料で検出することを含んでなる、哺乳動物での腫瘍を診断する方法。
【請求項８１】  （ａ）抗体を哺乳動物から得た被験試料と接触させ；並びに（ｂ）配列番号：４のアミノ酸１からアミノ酸３２７を包含する配列に対して少なくとも８０％の相同性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペプチドであって、抗体が該ポリペプチドと結合し、抗体と被験試料のポリペプチドとの間の複合体の形成を検出することを含んでなる、哺乳動物での腫瘍を診断する方法。
【請求項８２】  前記被験試料が、腫瘍性細胞の成長又は増殖を有すると思われる個体から得られる、請求項８０の方法。
【請求項８３】  前記被験試料が、腫瘍性細胞の成長又は増殖を有すると思われる個体から得られる、請求項８１の方法。
【請求項８４】  容器；及び
容器内に含有される請求項７７の組成物を含んでなる製造品。
【請求項８５】  容器；及び
容器に含有される請求項７８の組成物を含んでなる製造品。
【請求項８６】  容器；
容器上の標識；及び
請求項７７の組成物を含んでなり、組成物が腫瘍細胞の成長を阻害するために効果的であり、容器上の標識がＬＩＶ-１-１６４６４７ポリペプチドの過剰発現によって特徴付けられる症状を治療するために組成物を使用することができることを示す、製造品。
【請求項８７】  容器；
容器上の標識；及び
請求項７８の組成物を含んでなり、組成物が腫瘍細胞の成長を阻害するために効果的であり、並びに容器上の標識がＬＩＶ-１-１６４６４７ポリペプチドの過剰発現によって特徴付けられる症状を治療するために組成物を使用することができることを示す、製造品。
【請求項８８】  候補化合物と配列番号：１９に対して少なくとも６５％の相同性を有する配列を含んでなるポリペプチドを接触せしめることを含んでなる、ＬＩＶ-１-１６４６４７ポリペプチドの発現又は活性を阻害することができる化合物を同定するための方法。
【請求項８９】  候補化合物又はポリペプチドが固体支持体へ固定されている、請求項８８の方法。
【請求項９０】  非固定化成分が検出可能な標識を保持する、請求項８９の方法。
【請求項９１】  配列番号：３のヌクレオチド４１２からヌクレオチド４７７を包含する配列又はその相補配列に対して、少なくとも６５％の核酸配列相同性を有する核酸配列を含んでなる宿主細胞。
【請求項９２】  細胞がチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞である、請求項９１の宿主細胞。
【請求項９３】  細胞が大腸菌である、請求項９１の宿主細胞。
【請求項９４】  細胞が酵母細胞である、請求項９１の宿主細胞。
【請求項９５】  細胞が昆虫細胞である、請求項９１の宿主細胞。
【請求項９６】  抗体がキメラ抗体である、請求項３２の抗体。
【請求項９７】  抗体がヒト化抗体である、請求項３２の抗体。
【請求項９８】  抗体がヒト抗体である、請求項３２の抗体。
【請求項９９】  抗体が、Ｆａｂ，Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ断片、二重特異性抗体、単鎖抗体、及び多特異性抗体から成る群から選択された抗体断片である、請求項３２の抗体。
【請求項１００】  宿主細胞が、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、大腸菌、酵母、及び昆虫細胞から成る群から選択される、請求項３２の抗体を生産する宿主細胞。