【手続補正書】
【提出日】平成20年3月21日(2008.3.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  ＶＥＧＦ調節遺伝子ポリペプチドの活性を調節することができる治療用分子を含んでなる、血管形成の調節のための医薬。
【請求項２】  上記血管形成の調節が血管形成の増大であり、上記活性の調節が、ネキシン、胎盤タンパク５（ＰＰ５）、アミロイド前駆体様タンパク２（ＡＰＬＰ２）、Ｇタンパク質シグナル伝達調節因子-３（ＲＧＳ３）、グラビン、アルギニンリッチタンパク質（ＡＲＰ）、ダウン症必須領域タンパク-１（ＤＳＣＲ１）、インスリン誘導遺伝子-１（ＩＮＳＩＧ１）、プロゲステロン誘導脱落タンパク（ＤＥＰＰ）、ＮＡＤＨ-ユビキノンオキシドレダクターゼ鎖１（ＮＤ１）、ヘパリン結合ＥＧＦ様成長因子（ＨＢ-ＥＧＦ）、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、オステオニドジェン及び結合組織成長因子（ＣＴＧＦ）からなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を増加させることを含む、請求項１に記載の医薬。
【請求項３】  上記血管形成の調節が血管形成の低減であり、上記活性の調節が、アミロイド前駆体タンパク（ＡＰＰ）、酵母ＶＰＳ４１に類似のヒト遺伝子（ｈＶＰＳ４１ｐ）、チトクロムオキシダーゼサブユニットＩ（ＭＴＣＯ１）、ＮＡＤＨ-ユビキノンオキシドレダクターゼ鎖４（ＮＤ４）からなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を増加させることを含む、請求項１に記載の医薬。
【請求項４】  上記血管形成の調節が血管形成の低減であり、上記活性の調節が、ネキシン、ＰＰ５、ＡＰＬＰ２、ＲＧＳ３、グラビン、ＡＲＰ、ＤＳＣＲ１、ＩＮＳＩＧ１、ＤＥＰＰ、ＮＤ１、ＨＢ-ＥＧＦ、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、オステオニドジェン及びＣＴＧＦからなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を減少させることを含む、請求項１に記載の医薬。
【請求項５】  上記血管形成の調節が血管形成の増大であり、上記活性の調節が、ＡＰＰ、ｈＶＰＳ４１ｐ、ＭＴＣＯ１及びＮＤ４からなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を減少させることを含む、請求項１に記載の医薬。
【請求項６】  アミロイド前駆体タンパク（ＡＰＰ）、酵母ＶＰＳ４１に類似のヒト遺伝子（ｈＶＰＳ４１ｐ）、チトクロムオキシダーゼサブユニットＩ（ＭＴＣＯ１）、ＮＡＤＨ-ユビキノンオキシドレダクターゼ鎖４（ＮＤ４）からなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を増加させることができる治療用分子を含む、腫瘍又は癌を治療するための医薬。
【請求項７】  ネキシン、ＰＰ５、ＡＰＬＰ２、ＲＧＳ３、グラビン、ＡＲＰ、ＤＳＣＲ１、ＩＮＳＩＧ１、ＤＥＰＰ、ＮＤ１、ＨＢ-ＥＧＦ、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、オステオニドジェン及びＣＴＧＦからなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を減少させることができる治療用分子を含む、腫瘍又は癌を治療するための医薬。
【請求項８】  腫瘍又は癌が、肺腺癌、管性乳癌、腎臓細胞上皮癌、肝細胞癌、扁平上皮癌、骨肉腫、軟骨肉腫及び卵巣上皮癌からなる群から選択される、請求項６又は７に記載の医薬。
【請求項９】  ネキシン、胎盤タンパク５（ＰＰ５）、アミロイド前駆体様タンパク２（ＡＰＬＰ２）、Ｇタンパク質シグナル伝達調節因子-３（ＲＧＳ３）、グラビン、アルギニンリッチタンパク質（ＡＲＰ）、ダウン症必須領域タンパク-１（ＤＳＣＲ１）、インスリン誘導遺伝子-１（ＩＮＳＩＧ１）、プロゲステロン誘導脱落タンパク（ＤＥＰＰ）、ＮＡＤＨ-ユビキノンオキシドレダクターゼ鎖１（ＮＤ１）、ヘパリン結合ＥＧＦ様成長因子（ＨＢ-ＥＧＦ）、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、オステオニドジェン及び結合組織成長因子（ＣＴＧＦ）からなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を増加させることができる治療用分子を含む、心筋梗塞又は創傷を治療するための医薬。
【請求項１０】  ＡＰＰ、ｈＶＰＳ４１ｐ、ＭＴＣＯ１及びＮＤ４からなる群から選択される少なくとも１種のポリペプチドの活性を減少させることができる治療用分子を含む、心筋梗塞又は創傷を治療するための医薬。
【請求項１１】  創傷がただれ、潰瘍又は切開を含む、請求項９又は１０に記載の医薬。
【請求項１２】  上記活性の増加が、上記少なくとも１種のポリペプチドの発現を増加させることを含む、請求項２、３、６又は９のいずれか一に記載の医薬。
【請求項１３】  治療用分子が、上記少なくとも１種のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、請求項２、３、６、９又は１２のいずれか一に記載の医薬。
【請求項１４】  上記活性の減少が、上記少なくとも１種のポリペプチドの発現を減少させることを含む、請求項４、５、７又は１０のいずれか一に記載の医薬。
【請求項１５】  上記治療用分子が、上記少なくとも１種のポリペプチドをコードする内因性ポリヌクレオチドの少なくとも一部に対してアンチセンスなポリヌクレオチドを含む、請求項４、５、７又は１０のいずれか一に記載の医薬。
【請求項１６】  治療用分子が、上記少なくとも１種のポリペプチドのアンタゴニストを含む、請求項４、５、７又は１０のいずれか一に記載の医薬。
【請求項１７】  アンタゴニストが、上記少なくとも１種のポリペプチドに選択的に結合するアプタマー、又は上記少なくとも１種のポリペプチドに選択的に結合する抗体ないしは抗体断片を含む、請求項１６に記載の医薬。
【請求項１８】  上記少なくとも１種のポリペプチドが、ネキシン、ＰＰ５、ＡＰＬＰ２、ＲＧＳ３、グラビン、ＡＲＰ、ＤＳＣＲ１、ＩＮＳＩＧ１、ＤＥＰＰ、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、オステオニドジェン、ＡＰＰ、ｈＶＰＳ４１ｐ、ＭＴＣＯ１及びＮＤ４からなる群から選択される、請求項１７に記載の医薬。
【請求項１９】  配列番号：３又は配列番号：２２と少なくとも８０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
【請求項２０】  請求項１９に記載のポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド、又は該ポリヌクレオチドの相補鎖。
【請求項２１】  請求項２０に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２２】  請求項２１に記載のベクターを含む単離された細胞。
【請求項２３】  被検体における少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子の発現の変化に関連する疾病又は疾患を検出する方法であって、上記少なくとも１種の遺伝子がネキシン、胎盤タンパク５（ＰＰ５）、アミロイド前駆体様タンパク２（ＡＰＬＰ２）、Ｇタンパク質シグナル伝達調節因子-３（ＲＧＳ３）、グラビン、アルギニンリッチタンパク質（ＡＲＰ）、ダウン症必須領域タンパク-１（ＤＳＣＲ１）、インスリン誘導遺伝子-１（ＩＮＳＩＧ１）、プロゲステロン誘導脱落タンパク（ＤＥＰＰ）、ＮＡＤＨ-ユビキノンオキシドレダクターゼ鎖１（ＮＤ１）、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、オステオニドジェン、アミロイド前駆体タンパク（ＡＰＰ）、酵母ＶＰＳ４１に類似のヒト遺伝子（ｈＶＰＳ４１ｐ）、チトクロムオキシダーゼサブユニットＩ（ＭＴＣＯ１）、及びＮＡＤＨ-ユビキノンオキシドレダクターゼ鎖４（ＮＤ４）からなる群から選択されるものであり、
ａ）被検体からの生物学的サンプルを上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子又はポリペプチドの存在を検出することができる薬剤と接触させ；そして
ｂ）生物学的サンプル中の上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子又はポリペプチドの量を検出し、このときこの遺伝子又はポリペプチドの量の増加又は低減が上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子又はポリペプチドの発現の変化に関連する疾病又は疾患を示す
ことを含む方法。
【請求項２４】  薬剤が、上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子又は上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子をコードするｍＲＮＡにハイブリダイズすることができる標識されたプローブである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】  薬剤が、上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子ポリペプチドに結合することができる抗体である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】  前記疾病又は疾患が癌又は腫瘍である、請求項２３ないし２５の何れか１項に記載の方法。
【請求項２７】  腫瘍又は癌が、肺腺癌、管性乳癌、腎臓細胞上皮癌、肝細胞癌、扁平上皮癌、骨肉腫、軟骨肉腫及び卵巣上皮癌からなる群から選択される、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】  癌が卵巣癌である、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】  上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子又はポリペプチドが、ＤＳＣＲ-１、ＡＲＰ及びその組み合わせからなる群から選択される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】  生物学的サンプル中における少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子の発現を、コントロールサンプル中における上記少なくとも１種の遺伝子の発現と比較することを含む、腫瘍の臨床病期を決定する方法。
【請求項３１】  上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子が、ＤＳＣＲ１とＡＲＰからなる群から選択される少なくとも一のメンバーを含む、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】  上記サンプルが卵巣腫瘍のサンプルである請求項３０に記載の方法。
【請求項３３】  ＶＥＧＦ調節遺伝子によってコードされる少なくとも１種のポリペプチドの発現又は活性に対するアンタゴニストである薬剤を同定する方法であって、
ａ）ＰＰ５、ＡＰＬＰ２、ＲＧＳ３、グラビン、ＡＲＰ、ＩＮＳＩＧ１、ＤＥＰＰ、ＮＤ１、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、ＡＰＰ、ｈＶＰＳ４１ｐ、ＭＴＣＯ１、ＤＳＣＲ１、ＮＤ４及びオステオニドジェンからなる群から選択されるポリペプチドを発現する単離された細胞又は組織を薬剤と接触させ；そして
ｂ）接触させた細胞又は組織による該ポリペプチドの発現又は活性の変化を検出し、このとき該ポリペプチドの発現又は活性を低減する薬剤がアンタゴニストとして同定される
ことを含む方法。
【請求項３４】  ＶＥＧＦ調節遺伝子によってコードされる少なくとも１種のポリペプチドの発現又は活性のアゴニストである薬剤を同定する方法であって、
ａ）ＰＰ５、ＡＰＬＰ２、ＲＧＳ３、グラビン、ＡＲＰ、ＩＮＳＩＧ１、ＤＥＰＰ、ＮＤ１、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、ＡＰＰ、ｈＶＰＳ４１ｐ、ＭＴＣＯ１、ＤＳＣＲ１、ＮＤ４及びオステオニドジェンからなる群から選択されるポリペプチドを発現する単離された細胞又は組織を薬剤と接触させ；そして
ｂ）接触させた細胞又は組織による該ポリペプチドの発現又は活性の変化を検出し、このとき該ポリペプチドの発現又は活性を増加する薬剤がアゴニストとして同定される
ことを含む方法。
【請求項３５】  薬剤が、小分子、小ペプチド、抗体ないしその誘導体、ＶＥＧＦ調節遺伝子によってコードされるポリペプチドに極めて関連性の強いポリペプチド、アンチセンスＤＮＡないしＲＮＡ、リボザイム、三重鎖ＤＮＡらせん、及び核酸アプタマーからなる群から選択される、請求項３３又は３５に記載の方法。
【請求項３６】  腫瘍発生の可能性について組織サンプルをスクリーニングする方法であって、少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子の発現を測定することを含み、このとき上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子がＰＰ５、ＡＰＬＰ２、ＲＧＳ３、グラビン、ＡＲＰ、ＩＮＳＩＧ１、ＤＥＰＰ、ＮＤ１、ＭＫＰ-１様プロテインチロシンホスファターゼ、ＡＰＰ、ｈＶＰＳ４１ｐ、ＭＴＣＯ１、ＤＳＣＲ１、ＮＤ４及びオステオニドジェンからなる群から選択されるポリペプチドをコードする方法。
【請求項３７】  上記測定が、上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子によってコードされるポリペプチドの量を測定することである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３８】  上記の発現の測定が、上記少なくとも１種のＶＥＧＦ調節遺伝子に対応するｍＲＮＡの量を測定することである、請求項３６に記載の方法。
【請求項３９】  化合物のＶＥＧＦ調節遺伝子の転写の上方制御又は下方制御の活性を測定する方法であって、該化合物を、ＲＮＡポリメラーゼと該遺伝子を含有する組成物に接触させ、ＶＥＧＦ調節遺伝子転写の量を測定することを含む方法。
【請求項４０】  化合物のＶＥＧＦ調節遺伝子の翻訳の上方制御又は下方制御の活性を測定する方法であって、該化合物を、該遺伝子のｍＲＮＡに対応するポリヌクレオチドとリボソームを含有する組成物に接触させ、ＶＥＧＦ調節遺伝子翻訳の量を測定することを含む方法。
【請求項４１】  上記組成物が細胞中にある、請求項３９又は４０に記載の方法。
【請求項４２】  上記化合物がカルシウムチャネル調節因子である、請求項３９ないし４１の何れか１項に記載の方法。
【請求項４３】  上記カルシウムチャネル調節因子が、ニカルジフィン、ニフェジピン、ベラパミル及びジルチアゼムからなる群から選択される、請求項４２に記載の方法。