【手続補正書】
【提出日】平成20年5月15日(2008.5.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）配列番号１と１〜１６個のアミノ酸位置が異なり、そして
（ｂ）Ｆ４８Ａ／Ｌ；Ｖ５１Ｐ；Ｆ５５Ａ；Ｆ６５Ａ；Ｆ６８Ｐ；Ｌ１１１Ａ；およびＶ１１４Ｐからなる群より選択される配列番号１に対する１つ以上の置換を含む、
配列を含む、単離されたポリペプチドもしくは組換えポリペプチドであって、該ポリペプチドが抗ウイルス活性を示す、ポリペプチド。
【請求項２】
配列番号１と１〜１０個のアミノ酸位置が異なる配列を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
配列番号１と１〜８個のアミノ酸位置が異なる配列を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】
Ｈ４７Ｑ；Ｖ５１Ａ；Ｑ５２Ｐ／Ｅ；Ａ５３Ｔ；Ｆ５５Ｓ；Ｌ５６Ｖ；Ｆ５７Ｌ；Ｙ５８Ｈ；Ｍ６１Ｉ；Ｎ１１３Ｋ；Ｖ１１４Ｅ；およびＥ１６０Ｄからなる群より選択される１つ以上の置換をさらに含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項５】
配列番号２〜配列番号３５からなる群より選択される配列を含む、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項６】
請求項１に記載のポリペプチドであって、その配列が、配列番号１に対する置換Ｆ４８Ａ／Ｌを含む、ポリペプチド。
【請求項７】
配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４、配列番号２５、配列番号２６、配列番号２７、配列番号３０、配列番号３４および配列番号３５からなる群より選択される配列を含む、請求項６に記載のポリペプチド。
【請求項８】
（ａ）配列番号１３と０〜１６個のアミノ酸位置が異なり、そして
（ｂ）４８位にＡｌａまたはＬｅｕ；５１位にＰｒｏ；５５位にＡｌａ；６５位にＡｌａ；６８位にＰｒｏ；１１１位にＡｌａ；および１１４位にＰｒｏのうちの１つ以上を含む、
配列を含む、単離されたポリペプチドもしくは組換えポリペプチドであって、該ポリペプチドが抗ウイルス活性を示す、ポリペプチド。
【請求項９】
請求項８に記載のポリペプチドであって、その配列が４８位にＡｌａまたはＬｅｕを含む、ポリペプチド。
【請求項１０】
配列番号１３と０〜８個のアミノ酸位置が異なる配列を含む、請求項８に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
配列番号１３の配列を含む単離されたポリペプチドもしくは組換えポリペプチドであって、必要に応じて、Ｎ末端にメチオニンをさらに含み、該ポリペプチドが抗ウイルス活性を示す、ポリペプチド。
【請求項１２】
（ａ）配列番号３６と１〜１６個のアミノ酸位置が異なり、そして
（ｂ）Ｍ２１Ａ、Ｉ２４Ｐ、Ｆ４８Ａ／Ｌ、Ｔ５１Ｐ、Ｓ５５Ａ、Ｆ６５Ａ、Ｆ６８Ｐ、Ｆ９０Ａ、Ｍ９３Ｐ、Ｌ１１１Ａ、Ｖ１１４Ｐ、Ｆ１２４Ａ、Ｉ１２７Ｐ、およびＥ１６０Ｄからなる群より選択される配列番号３６に対する１つ以上の置換を含む、
配列を含む単離されたポリペプチドもしくは組換えポリペプチドであって、
該ポリペプチドが抗ウイルス活性を示す、ポリペプチド。
【請求項１３】
配列番号３６と１〜１０個のアミノ酸位置が異なる配列を含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
配列番号３６と１〜８個のアミノ酸位置が異なる配列を含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
Ｐ２６Ｌ、Ｈ４７Ｑ、Ｔ５１Ｖ、Ｓ５５Ｐ／Ｆ、Ｖ５６Ｌ、Ｈ５８Ｙ、Ｌ６０Ｍ、Ｆ９０Ｙ、Ｍ９３Ｌ、Ｎ９５Ｄ、Ｎ１１３Ｋ、Ｖ１１４Ｅ、Ｒ１２５Ｑ、Ｔ１３２Ｋ，およびＬ１５４Ｆからなる群より選択される１つ以上の置換をさらに含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
配列番号３７〜配列番号４４からなる群より選択される配列を含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
請求項１２に記載のポリペプチドであって、その配列が配列番号３６に対する置換Ｆ４８Ａ／Ｌを含む、ポリペプチド。
【請求項１８】
配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、配列番号４２，および配列番号４３からなる群より選択される配列を含む、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
配列番号４４の配列を含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項２０】
（ａ）配列番号３８と０〜１６個のアミノ酸位置が異なり、そして
（ｂ）２１位にＡｌａ；２４位にＰｒｏ；４８位にＡｌａまたはＬｅｕ；５１位にＰｒｏ；５５位にＡｌａ；６５位にＡｌａ；６８位にＰｒｏ；９０位にＡｌａ；９３位にＰｒｏ；１１１位にＡｌａ；１１４位にＰｒｏ；１２４位にＡｌａ；１２７位にＰｒｏ；および１６０位にＧｌｕのうちの１つ以上を含む、
配列を含む単離されたポリペプチドもしくは組換えポリペプチドであって、該ポリペプチドが抗ウイルス活性を示す、ポリペプチド。
【請求項２１】
請求項２０に記載のポリペプチドであって、その配列が４８位にＡｌａまたはＬｅｕを含む、ポリペプチド。
【請求項２２】
配列番号３８と０〜８個のアミノ酸位置が異なる配列を含む、請求項２０に記載のポリペプチド。
【請求項２３】
配列番号３８の配列を含む単離されたポリペプチドもしくは組換えポリペプチドであって、必要に応じて、Ｎ末端にメチオニンをさらに含み、該ポリペプチドが抗ウイルス活性を示す、ポリペプチド。
【請求項２４】
前記ポリペプチドの抗ウイルス活性が、ｈｕＩＦＮ−α  ２ｂまたはｈｕＩＦＮ−α  ２ａの抗ウイルス活性と等しいかまたはそれよりも大きい、請求項１〜２３に記載のポリペプチド。
【請求項２５】
前記ポリペプチドの抗ウイルス活性が、ｈｕＩＦＮ−α  ２ｂまたはｈｕＩＦＮ−α  ２ａの抗ウイルス活性よりも少なくとも２倍大きい、請求項２４に記載のポリペプチド。
【請求項２６】
前記ポリペプチドが、ｈｕＩＦＮ−α  ２ｂまたはｈｕＩＦＮ−α  ２ａによって示される抗ウイルス活性／抗増殖活性の比よりも少なくとも２倍大きい抗ウイルス活性／抗増殖活性の比を示す、請求項１〜２３に記載のポリペプチド。
【請求項２７】
（ａ）請求項１〜２６に記載のポリペプチド、および
（ｂ）該ポリペプチドに共有結合された非ポリペプチド部分
を含む、結合体。
【請求項２８】
少なくとも２つの非ポリペプチド部分を含む、請求項２７に記載の結合体。
【請求項２９】
システイン残基に共有結合された非ポリペプチド部分を含む、請求項２７に記載の結合体。
【請求項３０】
リジン残基またはＮ末端アミノ基に共有結合された非ポリペプチド部分を含む、請求項２７に記載の結合体。
【請求項３１】
リジン残基に共有結合された非ポリペプチド部分を含む、請求項２７に記載の結合体。
【請求項３２】
Ｎ末端アミノ基に結合された非ポリペプチド部分を含む、請求項２７に記載の結合体。
【請求項３３】
前記非ポリペプチド部分がポリマーである、請求項２７に記載の結合体。
【請求項３４】
前記ポリマーがポリエチレングリコールである、請求項３３に記載の結合体。
【請求項３５】
前記ポリエチレングリコールが、リジン残基に共有結合された４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分である、請求項３４に記載の結合体。
【請求項３６】
前記非ポリペプチド部分が糖である、請求項２７に記載の結合体。
【請求項３７】
前記糖が前記ポリペプチドのＮ−グリコシル化部位に結合される、請求項３６に記載の結合体。
【請求項３８】
（ａ）配列番号１３の配列を含むポリペプチドであって、必要に応じて、そのＮ末端にメチオニンをさらに含む、ポリペプチド；および
（ｂ）該ポリペプチドのリジン残基に共有結合されたＰＥＧ部分
を含む結合体であって、該結合体が抗ウイルス活性を示す、結合体。
【請求項３９】
前記ＰＥＧ部分が４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分である、請求項３８に記載の結合体。
【請求項４０】
前記４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分が、Ｌｙｓ１２２およびＬｙｓ１３５から選択されるリジン残基に共有結合される、請求項３９に記載の結合体。
【請求項４１】
（ａ）配列番号３８の配列を含むポリペプチドであって、必要に応じて、そのＮ末端にメチオニンをさらに含む、ポリペプチド；および
（ｂ）該ポリペプチドのリジン残基に共有結合されたＰＥＧ部分
を含む結合体であって、該結合体が抗ウイルス活性を示す、結合体。
【請求項４２】
前記ＰＥＧ部分が４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分である、請求項４１に記載の結合体。
【請求項４３】
前記４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分が、Ｌｙｓ３１、Ｌｙｓ１２２，およびＬｙｓ１３５から選択されるリジン残基に共有結合される、請求項４２に記載の結合体。
【請求項４４】
（ａ）必要に応じてそのＮ末端にメチオニンをさらに含む配列番号１３の配列を含むポリペプチド、およびＬｙｓ１２２に共有結合された４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分を含む結合体；ならびに
（ｂ）必要に応じてそのＮ末端にメチオニンをさらに含む配列番号１３の配列を含むポリペプチド、およびＬｙｓ１３５に共有結合された４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分を含む結合体
を含む組成物であって、該組成物が抗ウイルス活性を示す、組成物。
【請求項４５】
（ａ）必要に応じてそのＮ末端にメチオニンをさらに含む配列番号３８の配列を含むポリペプチド、およびＬｙｓ３１に共有結合された４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分を含む結合体；
（ｂ）必要に応じてそのＮ末端にメチオニンをさらに含む配列番号３８の配列を含むポリペプチド、およびＬｙｓ１２２に共有結合された４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分を含む結合体；ならびに
（ｃ）必要に応じてそのＮ末端にメチオニンをさらに含む配列番号３８の配列を含むポリペプチド、およびＬｙｓ１３５に共有結合された４０ｋＤａのｍＰＥＧ２部分を含む結合体
を含む組成物であって、該組成物が、抗ウイルス活性を示す、組成物。
【請求項４６】
請求項１〜２６に記載のポリペプチドと、薬学的に受容可能な賦形剤とを含む組成物。
【請求項４７】
請求項２７〜４３に記載の結合体と、薬学的に受容可能な賦形剤とを含む組成物。
【請求項４８】
薬学的に受容可能な賦形剤をさらに含む、請求項４４〜４５に記載の組成物。
【請求項４９】
請求項１〜２６に記載のポリペプチドをコードする核酸配列を含む、単離されたポリヌクレオチドもしくは組換えポリヌクレオチド。
【請求項５０】
配列番号１３の配列を含むポリペプチドをコードする核酸配列を含む、請求項４９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５１】
配列番号６２、配列番号６３、配列番号６４および配列番号８９から選択される核酸配列を含む、請求項５０に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５２】
配列番号３８の配列を含むポリペプチドをコードする核酸配列を含む、請求項４９に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５３】
配列番号８０、配列番号８１、配列番号８２および配列番号９０から選択される核酸配列を含む、請求項５２に記載のポリヌクレオチド。
【請求項５４】
請求項４９に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
【請求項５５】
請求項４９に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項５６】
プロモーターに作動可能に連結されたポリヌクレオチドを含む発現ベクターである、請求項５５に記載のベクター。
【請求項５７】
請求項５６に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項５８】
請求項４９に記載のポリヌクレオチドと賦形剤とを含む組成物。
【請求項５９】
請求項１〜２６に記載のポリペプチドを調製するための方法であって、該方法は、
宿主細胞を含む培養物を提供する工程であって、該宿主細胞は、ポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターを含む発現ベクターを含み、該ポリヌクレオチドは、該ポリペプチドをコードする核酸配列を含む、工程、
該ポリペプチドの発現を可能にする条件下で該培養物を培養する工程、および
該ポリペプチドを回収する工程
を包含する、方法。
【請求項６０】
前記宿主細胞がグリコシル化宿主細胞である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
前記宿主細胞が細菌宿主細胞である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６２】
前記細菌宿主細胞がＥ．ｃｏｌｉである、請求項５９に記載の方法。
【請求項６３】
前記ポリペプチドを回収する工程が、
（ａ）該ポリペプチドを含む封入体（ＩＢ）を単離する工程；
（ｂ）該ＩＢを可溶化し、それによって、アンフォールディングしたポリペプチドを得る工程；
（ｃ）該アンフォールディングしたポリペプチドをリフォールディングし、それによって、リフォールディングしたポリペプチドを得る工程；および
（ｄ）該リフォールディングしたポリペプチドを精製する工程
を包含する、請求項６２に記載の方法。
【請求項６４】
結合体を調製するための方法であって、該方法は、
（ｉ）請求項１〜２６に記載のポリペプチドを提供する工程、および
（ｉｉ）該ポリペプチドに少なくとも１つの非ポリペプチド部分を結合させる工程であって、得られる結合体が抗ウイルス活性を示す、工程
を包含する、方法。
【請求項６５】
前記ポリペプチドを提供する工程が、
宿主細胞を含む培養物を提供する工程であって、該宿主細胞はポリヌクレオチドに作動可能に連結されたプロモーターに含む発現ベクターを含み、該ポリヌクレオチドは該ポリペプチドをコードする核酸配列を含む、工程、
該ポリペプチドの発現を可能にする条件下で該培養物を培養する工程、および
該ポリペプチドを回収する工程
を包含する、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
前記宿主細胞が、グリコシル化宿主細胞または細菌宿主細胞である、請求項６５に記載の方法。
【請求項６７】
前記細菌宿主細胞がＥ．ｃｏｌｉである、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
前記ポリペプチドを回収する工程が、
（ａ）該ポリペプチドを含む封入体（ＩＢ）を単離する工程；
（ｂ）該ＩＢを可溶化し、それによって、アンフォールディングしたポリペプチドを得る工程；
（ｃ）該アンフォールディングしたポリペプチドをリフォールディングし、それによって、リフォールディングされたポリペプチドを得る工程；および
（ｄ）該リフォールディングされたポリペプチドを精製する工程
を包含する、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記ポリペプチドに少なくとも１つの非ポリペプチド部分を結合させる工程が、
該ポリペプチドを４０ｋＤａのｍＰＥＧ２−ＮＨＳと、約３：１〜５：１のｍＰＥＧ２−ＮＨＳ：ポリペプチドのモル比で、ｐＨ９および４℃で１時間〜一晩反応させる工程
を包含する、請求項６４に記載の方法。
【請求項７０】
ウイルスに感染した細胞中の該ウイルスのコピー数を減少させるための方法であって、該方法は、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物を、該細胞中の該ウイルスのコピー数を減少させるために有効な量で該細胞に投与し、それによって、該細胞中の該ウイルスのコピー数を減少させる工程を包含する、方法。
【請求項７１】
ＨＣＶに感染した患者の血清中のＨＣＶ  ＲＮＡレベルを低下させるための方法であって、該方法は、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物を、処置の開始前に存在するＨＣＶ  ＲＮＡレベルと比較して該ＨＣＶ  ＲＮＡレベルを低下させるために有効な量で該患者に投与する工程を包含する、方法。
【請求項７２】
ＨＢＶに感染した患者の血清中のＨＢＶ  ＤＮＡレベルを低下させるための方法であって、該方法は、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物を、処置の開始前に存在するＨＢＶ  ＤＮＡレベルと比較して該ＨＢＶ  ＤＮＡレベルを低下させるために有効な量で該患者に投与する工程を包含する、方法。
【請求項７３】
ＨＩＶに感染した患者の血清中のＨＩＶ  ＲＮＡレベルを低下させるための方法であって、該方法は、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物を、処置の開始前に存在するＨＩＶ  ＲＮＡレベルと比較して該ＨＩＶ  ＲＮＡレベルを低下させるために有効な量で該患者に投与する工程を包含する、方法。
【請求項７４】
医薬として使用するための、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物。
【請求項７５】
疾病の処置において使用するための医薬の製造のための、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物の使用。
【請求項７６】
ウイルス疾患の処置において使用するための医薬の製造のための、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物の使用。
【請求項７７】
ウイルスに感染した細胞中の該ウイルスのコピー数を減少させるための医薬の製造のための、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物の使用。
【請求項７８】
ウイルスに感染した患者の血清中の該ウイルスのレベルを低下させるための医薬の製造のための、請求項１〜２６に記載のポリペプチド、請求項２７〜４３に記載の結合体、または請求項４４〜４８に記載の組成物の使用。
【請求項７９】
前記ウイルスが、ＨＣＶ、ＨＢＶまたはＨＩＶである、請求項７６〜７８のいずれかに記載の使用。