【手続補正書】
【提出日】平成31年1月31日(2019.1.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者から採取された生物学的試料中のLYVE1、REG1、およびTFF1タンパク質の各々の発現レベルまたは濃度を決定する段階を含む、膵管腺癌を検査する方法。
【請求項２】
REG1タンパク質が、REG1Aおよび／またはREG1Bである、請求項1記載の方法。
【請求項３】
決定する段階が、発現レベルまたは濃度が決定される1つまたは複数のタンパク質に特異的な1つまたは複数の結合分子を用いて行われる、請求項1または2記載の方法。
【請求項４】
結合分子が、抗体もしくは抗体断片、タンパク質、またはアプタマーである、請求項3記載の方法。
【請求項５】
生物学的試料が、尿、全血、血清、または膵臓組織試料である、請求項1乃至4のいずれか一項記載の方法。
【請求項６】
試料が、ヒトに由来する、請求項1乃至5のいずれか一項記載の方法。
【請求項７】
膵管腺癌が、I期またはII期膵管腺癌である、請求項1乃至6のいずれか一項記載の方法。
【請求項８】
I期PDACと健常患者、I期PDACと慢性膵炎 (CP)、またはI期PDACとより後期のPDACを区別する鑑別診断を提供する、請求項1乃至7のいずれか一項記載の方法。
【請求項９】
1つまたは複数のmiRNAの発現レベルまたは濃度を参照と比較する段階をさらに含む、請求項1乃至8のいずれか一項記載の方法。
【請求項１０】
参照が、健常患者由来の生物学的試料である、請求項9記載の方法。
【請求項１１】
生物学的試料が、PDACを有するかまたは有する疑いのある患者に由来する、請求項1乃至10のいずれか一項記載の方法。
【請求項１２】
CA19.9タンパク質の発現レベルまたは濃度を決定する段階をさらに含む、請求項1乃至11のいずれか一項記載の方法。
【請求項１３】
膵管腺癌の診断の方法におけるLYVE1、REG1、およびTFF1タンパク質の各々の組み合わせの使用。
【請求項１４】
REG1タンパク質が、REG1Aおよび／またはREG1Bである、請求項13記載の使用。
【請求項１５】
前記タンパク質が、尿タンパク質である、請求項13または14記載の使用。
【請求項１６】
解析される1つまたは複数のタンパク質に特異的な1つまたは複数の結合分子を用いて、発現レベルまたは濃度が測定される、請求項13乃至15のいずれか一項記載の使用。
【請求項１７】
結合分子が、抗体もしくは抗体断片、タンパク質、またはアプタマーである、請求項16記載の使用。
【請求項１８】
膵管腺癌がI期またはII期膵管腺癌である、請求項13乃至17のいずれか一項記載の使用。
【請求項１９】
生物学的試料中のLYVE1、REG1、またはTFF1タンパク質の各々の発現または濃度を測定する手段を含む、膵管腺癌を検査するためのキット。
【請求項２０】
REG1タンパク質が、REG1Aおよび／またはREG1Bである、請求項19記載のキット。
【請求項２１】
測定する手段が、バイオセンサーである、請求項19または20記載のキット。
【請求項２２】
バイオセンサーが、電気化学バイオセンサー、電子バイオセンサー、圧電バイオセンサー、重量測定バイオセンサー、焦電バイオセンサー、イオンチャネルスイッチバイオセンサー、エバネッセント波バイオセンサー、表面プラズモン共鳴バイオセンサー、または生物学的バイオセンサーである、請求項21記載のキット。
【請求項２３】
検出する手段が、膜で被覆されたディップスティックを含み、該ディップスティックが、
(a) 発現または濃度が測定されるタンパク質に対して特異的親和性を有する非標識結合分子が結合している第1セクション；
(b) 非反応性タンパク質でブロッキングされている第2セクション；および
(c) 発現または濃度が測定される該タンパク質が結合している第3セクション
を含む、請求項21記載のキット。
【請求項２４】
生物学的試料を収容するための1つまたは複数の容器をさらに含む、請求項19乃至23のいずれか一項記載のキット。
【請求項２５】
生物学的試料からLYVE1、REG1、および／またはTFF1タンパク質を抽出するための1つまたは複数の溶媒をさらに含む、請求項19乃至24のいずれか一項記載のキット。
【請求項２６】
1つまたは複数のバイオマーカーの発現の量または濃度を検出する手段がマイクロアレイである、請求項19乃至25のいずれか一項記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
本発明の態様において、本発明において用いられるバイオマーカーは、別々に使用することができ（すなわち、LYVE1、REG1（例えば、REG1Aおよび／またはREG1B）、ならびにTFF1のうちの1つのみ）、それらは対で使用することができ（例えば、LYVE1ならびにREG1（例えば、REG1Aおよび／もしくはREG1B）、LYVE1ならびにTFF1、またはREG1（例えば、REG1Aおよび／もしくはREG1B）ならびにTFF1）、3つのバイオマーカーを共に使用してもよく（LYVE1およびTFF1の各々、ならびにREG1AまたはREG1Bのうちの1つ)、または4つすべてを使用してもよい（LYVE1、TFF1、REG1A、およびREG1B）。5つめのバイオマーカー、CA19.9もまた使用することができる。本発明の態様において、LYVE1、REG1（例えば、REG1Aおよび／もしくはREG1B）、ならび／またはTFF1の発現レベルは、遺伝子発現を定量化する（例えば、生物学的試料中のmRNAを定量化する）ことにより、またはタンパク質発現を定量化する（例えば、生物学的試料中のタンパク質濃度を定量化する）により、決定することができる。
[本発明1001]
生物学的試料中のLYVE1、REG1、およびTFF1、またはこれらの組み合わせからなる群より選択されるタンパク質の発現レベルまたは濃度を決定する段階を含む、膵管腺癌を検査する方法。
[本発明1002]
生物学的試料中のLYVE1、REG1、およびTFF1からなる群より選択される2つのタンパク質の発現レベルまたは濃度を決定する段階を含む、本発明1001の方法。
[本発明1003]
生物学的試料中のLYVE1、REG1、およびTFF1の各々の発現レベルまたは濃度を決定する段階を含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
REG1タンパク質がREG1Aおよび／またはREG1Bである、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1005]
決定する段階が、発現レベルまたは濃度が決定される1つまたは複数のタンパク質に特異的な1つまたは複数の結合分子を用いて行われる、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1006]
結合分子が、抗体もしくは抗体断片、タンパク質、またはアプタマーである、本発明1005の方法。
[本発明1007]
生物学的試料が、尿、全血、血清、または膵臓組織試料である、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1008]
試料がヒトに由来する、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1009]
膵管腺癌がI期またはII期膵管腺癌である、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1010]
I期PDACと健常患者、I期PDACと慢性膵炎 (CP)、またはI期PDACとより後期のPDACを区別する鑑別診断を提供する、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1011]
1つまたは複数のmiRNAの発現レベルまたは濃度を参照と比較する段階をさらに含む、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1012]
参照が健常患者由来の生物学的試料である、本発明1011の方法。
[本発明1013]
生物学的試料が、PDACを有するかまたは有する疑いのある患者に由来する、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1014]
CA19.9タンパク質の発現レベルまたは濃度を決定する段階をさらに含む、前記本発明のいずれかの方法。
[本発明1015]
膵管腺癌の診断における使用のためのLYVE1、REG1、およびTFF1、またはこれらの組み合わせからなる群より選択されるタンパク質。
[本発明1016]
膵管腺癌の診断における使用のためのLYVE1、REG1、およびTFF1からなる群より選択される2つのタンパク質の組み合わせ。
[本発明1017]
膵管腺癌の診断における使用のためのLYVE1、REG1、およびTFF1タンパク質の各々の組み合わせ。
[本発明1018]
REG1タンパク質がREG1Aおよび／またはREG1Bである、本発明1015〜1017のいずれかの使用のためのタンパク質またはタンパク質の組み合わせ。
[本発明1019]
前記タンパク質が尿タンパク質である、本発明1015〜1018のいずれかの使用のためのタンパク質またはタンパク質の組み合わせ。
[本発明1020]
解析される1つまたは複数のタンパク質に特異的な1つまたは複数の結合分子を用いて、発現レベルまたは濃度が測定される、本発明1015〜1019のいずれかの使用のためのタンパク質またはタンパク質の組み合わせ。
[本発明1021]
結合分子が、抗体もしくは抗体断片、タンパク質、またはアプタマーである、本発明1020の使用のためのタンパク質またはタンパク質の組み合わせ。
[本発明1022]
膵管腺癌がI期またはII期膵管腺癌である、本発明1015〜1021のいずれかのタンパク質またはタンパク質の組み合わせ。
[本発明1023]
生物学的試料中のLYVE1、REG1、もしくはTFF1、またはこれらの組み合わせの発現または濃度を測定する手段を含む、膵管腺癌を検査するためのキット。
[本発明1024]
LYVE1、REG1、またはTFF1のうちの2つの発現または濃度を測定する手段を含む、本発明1023の膵管腺癌を検査するためのキット。
[本発明1025]
LYVE1、REG1、またはTFF1の各々の発現または濃度を測定する手段を含む、本発明1023の膵管腺癌を検査するためのキット。
[本発明1026]
REG1タンパク質がREG1Aおよび／またはREG1Bである、本発明1023〜1025のいずれかの膵管腺癌を検査するためのキット。
[本発明1027]
測定する手段がバイオセンサーである、本発明1023〜1026のいずれかのキット。
[本発明1028]
バイオセンサーが、電気化学バイオセンサー、電子バイオセンサー、圧電バイオセンサー、重量測定バイオセンサー、焦電バイオセンサー、イオンチャネルスイッチバイオセンサー、エバネッセント波バイオセンサー、表面プラズモン共鳴バイオセンサー、または生物学的バイオセンサーである、本発明1027のキット。
[本発明1029]
検出する手段が、膜で被覆されたディップスティックを含み、該ディップスティックが、
(a) 発現または濃度が測定されるタンパク質に対して特異的親和性を有する非標識結合分子が結合している第1セクション；
(b) 非反応性タンパク質でブロッキングされている第2セクション；および
(c) 発現または濃度が測定される該タンパク質が結合している第3セクション
を含む、本発明1027のキット。
[本発明1030]
生物学的試料を収容するための1つまたは複数の容器をさらに含む、本発明1023〜1029のいずれかのキット。
[本発明1031]
生物学的試料からLYVE1、REG1、および／またはTFF1タンパク質を抽出するための1つまたは複数の溶媒をさらに含む、本発明1023〜1030のいずれかのキット。
[本発明1032]
1つまたは複数のバイオマーカーの発現の量または濃度を検出する手段がマイクロアレイである、本発明1023〜1031のいずれかのキット。