【手続補正書】
【提出日】平成31年4月12日(2019.4.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を含む、対象における骨髄増殖性障害を処置するための組成物であって、
前記対象が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含む、骨髄増殖性障害を有すると決定されている、組成物。
【請求項２】
前記骨髄増殖性障害が、骨髄線維症を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記骨髄線維症が、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症後の骨髄線維症または本態性血小板血症後の骨髄線維症を含む、請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
前記骨髄増殖性障害が、真性赤血球増加症、本態性血小板増加症または慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記対象が、ＪＡＫ２のコドン６１７に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６】
前記突然変異が、ＪＡＫ２におけるＶ６１７Ｆアミノ酸置換をもたらす、請求項５に記載の組成物。
【請求項７】
前記対象が、ＪＡＫ２のエクソン１２またはエクソン１４に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項８】
前記対象が、ＭＰＬのコドン５１５に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜７のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項９】
前記突然変異が、ＭＰＬにおけるＷ５１５Ｌ、Ｗ５１５Ｋ、Ｗ５１５ＡまたはＷ５１５Ｒアミノ酸置換をもたらす、請求項８に記載の組成物。
【請求項１０】
前記対象が、ＭＰＬのエクソン１０に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜７のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１１】
前記対象が、ＣＡＬＲのエクソン９に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１２】
前記対象が、ＡＳＸＬ１のエクソン１２に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１３】
前記対象が、ＩＤＨ１のエクソン４に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１４】
前記対象が、ＩＤＨ１のコドン１３２に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１５】
前記対象が、ＩＤＨ２のエクソン４に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１６】
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１４０に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１７】
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１７２に突然変異を含むと決定されている、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１８】
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、欠失、挿入、点突然変異または転座である、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１９】
前記突然変異が、前記１種もしくは複数の遺伝子によってコードされる１種もしくは複数のタンパク質の発現をもたらさないか、またはトランケートされたタンパク質の発現をもたらす、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、前記１種または複数の遺伝子の一方または両方の対立遺伝子に存在する、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２１】
骨髄増殖性障害に関連する１種または複数の遺伝子における突然変異の突然変異型対立遺伝子荷重における差を、血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質による骨髄増殖性障害の処置の有効性の指標とする方法であって、
（ｉ）ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される前記骨髄増殖性障害に関連する１種または複数の遺伝子における突然変異の第１の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップであって、前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重が、前記ＳＡＰタンパク質の投与前に測定される、ステップと、
（ｉｉ）（ｉ）で測定された同じ突然変異の第２の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップであって、前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重が、前記ＳＡＰタンパク質の投与後に測定される、ステップと、
（ｉｉｉ）前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の差を同定するステップと
を含み、前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の減少が、前記ＳＡＰタンパク質の前記投与が、前記骨髄増殖性障害の処置において有効であることを示す、方法。
【請求項２２】
前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の前記減少が、１０％〜９０％である、または前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の前記差が、１０％〜９０％の低下である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の前記減少が、２５％〜５０％である、または前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の前記差が、２５％〜５０％の低下である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】
前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の前記減少が、少なくとも５０％である、または前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の前記差が、少なくとも５０％の低下である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２５】
前記差が、完全な分子応答である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２６】
第１の生体試料における前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップと、第２の生体試料における前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップとを含む、請求項２１〜２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記第１の生体試料および前記第２の生体試料が、血液試料および／または骨髄試料を含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記測定するステップが、前記骨髄増殖性障害に関連する前記１種または複数の遺伝子の全体または部分を含む核酸を増幅することを含む、請求項２１〜２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記測定するステップが、前記骨髄増殖性障害に関連する前記１種または複数の遺伝子の、野生型核酸に対する突然変異型核酸の割合を決定することを含む、請求項２１〜２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記処置の有効性に基づき前記ＳＡＰタンパク質の投与レジメンを増加、減少または維持するステップをさらに含む、請求項２１〜２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＪＡＫ２のコドン６１７における突然変異である、請求項２１〜３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
前記突然変異が、ＪＡＫ２におけるＶ６１７Ｆアミノ酸置換をもたらす、請求項３１に記載の方法。
【請求項３３】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＪＡＫ２のエクソン１２またはエクソン１４に存在する、請求項２１〜３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＭＰＬのコドン５１５に存在する、請求項２１〜３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
前記突然変異が、ＭＰＬにおけるＷ５１５Ｌ、Ｗ５１５Ｋ、Ｗ５１５ＡまたはＷ５１５Ｒアミノ酸置換をもたらす、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＭＰＬのエクソン１０に存在する、請求項２１〜３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＣＡＬＲのエクソン９に存在する、請求項２１〜３６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＡＳＸＬ１のエクソン１２に存在する、請求項２１〜３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ１のエクソン４に存在する、請求項２１〜３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ１のコドン１３２に存在する、請求項２１〜３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４１】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ２のエクソン４に存在する、請求項２１〜４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４２】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ２のコドン１４０に存在する、請求項２１〜４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４３】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ２のコドン１７２に存在する、請求項２１〜４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４４】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異が、欠失、挿入、点突然変異または転座である、請求項２１〜４３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４５】
前記突然変異が、前記１種もしくは複数の遺伝子によってコードされる１種もしくは複数のタンパク質の発現をもたらさないか、またはトランケートされたタンパク質の発現をもたらす、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
１種または複数の遺伝子における前記突然変異が、前記１種または複数の遺伝子の一方または両方の対立遺伝子に存在する、請求項２１〜４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を含む、骨髄増殖性障害の処置を必要とする対象における骨髄増殖性障害を処置するための組成物であって、前記対象の細胞の一部が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含む、組成物。
【請求項４８】
有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を含む、骨髄増殖性障害の処置を必要とする対象における骨髄増殖性障害を処置するための組成物であって、前記対象の細胞の一部が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含み、前記ＳＡＰタンパク質が、前記対象における前記遺伝子の突然変異型対立遺伝子荷重を低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与されることを特徴とする、組成物。
【請求項４９】
前記骨髄増殖性障害が、骨髄線維症を含む、請求項４７または４８に記載の組成物。
【請求項５０】
前記骨髄線維症が、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症後の骨髄線維症または本態性血小板血症後の骨髄線維症を含む、請求項４９に記載の組成物。
【請求項５１】
前記骨髄増殖性障害が、真性赤血球増加症、本態性血小板増加症または慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）を含む、請求項４７または４８に記載の組成物。
【請求項５２】
前記対象が、ＪＡＫ２のコドン６１７に突然変異を含む、請求項４７〜５１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５３】
前記突然変異が、ＪＡＫ２におけるＶ６１７Ｆアミノ酸置換をもたらす、請求項５２に記載の組成物。
【請求項５４】
前記対象が、ＪＡＫ２のエクソン１２またはエクソン１４に突然変異を含む、請求項４７〜５１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５５】
前記対象が、ＭＰＬのコドン５１５に突然変異を含む、請求項４７〜５４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５６】
前記突然変異が、ＭＰＬにおけるＷ５１５Ｌ、Ｗ５１５Ｋ、Ｗ５１５ＡまたはＷ５１５Ｒアミノ酸置換をもたらす、請求項５５に記載の組成物。
【請求項５７】
前記対象が、ＭＰＬのエクソン１０に突然変異を含む、請求項４７〜５４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５８】
前記対象が、ＣＡＬＲのエクソン９に突然変異を含む、請求項４７〜５７のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５９】
前記対象が、ＡＳＸＬ１のエクソン１２に突然変異を含む、請求項４７〜５８のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６０】
前記対象が、ＩＤＨ１のエクソン４に突然変異を含む、請求項４７〜５９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６１】
前記対象が、ＩＤＨ１のコドン１３２に突然変異を含む、請求項４７〜５９のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６２】
前記対象が、ＩＤＨ２のエクソン４に突然変異を含む、請求項４７〜６１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６３】
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１４０に突然変異を含む、請求項４７〜６１のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６４】
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１７２に突然変異を含む、請求項４７〜６３のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６５】
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、欠失、挿入、点突然変異または転座である、請求項４７〜６４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６６】
前記突然変異が、前記１種もしくは複数の遺伝子によってコードされる１種もしくは複数のタンパク質の発現をもたらさないか、またはトランケートされたタンパク質の発現をもたらす、請求項６５に記載の組成物。
【請求項６７】
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、前記１種または複数の遺伝子の一方または両方の対立遺伝子に存在する、請求項４７〜６６のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項６８】
有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を含む、骨髄増殖性障害を有する対象における突然変異型対立遺伝子荷重を低下させるための組成物であって、前記対象が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含む、組成物。
【請求項６９】
前記骨髄増殖性障害が、骨髄線維症を含む、請求項６８に記載の組成物。
【請求項７０】
前記骨髄線維症が、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症後の骨髄線維症または本態性血小板血症後の骨髄線維症を含む、請求項６９に記載の組成物。
【請求項７１】
前記ＳＡＰタンパク質が、配列番号１に対し少なくとも８５％同一であるアミノ酸配列を含むＳＡＰポリペプチドを含む、請求項１〜２０もしくは４７もしくは７０のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７２】
前記ＳＡＰタンパク質が、Ｎ結合型オリゴ糖鎖を含むグリコシル化された組換えヒトＳＡＰポリペプチドを含み、前記オリゴ糖鎖の少なくとも１本の分枝が、α２，３結合型シアル酸部分で終結する、請求項１〜２０もしくは４７もしくは７１のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７３】
前記オリゴ糖鎖のシアル酸付加された分枝の全てが、α２，３結合型シアル酸部分で終結する、請求項７２に記載の組成物または方法。
【請求項７４】
前記オリゴ糖鎖が、α２，６結合型シアル酸部分を実質的に含まない、請求項７２に記載の組成物または方法。
【請求項７５】
前記ポリペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項７１〜７４のいずれか一項に記載の組成物または方法。
【請求項７６】
前記ポリペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項７１〜７４のいずれか一項に記載の組成物または方法。
【請求項７７】
前記ポリペプチドが、ＳＡＰドメインおよび１個または複数の異種ドメインを含む融合タンパク質である、請求項７１〜７６のいずれか一項に記載の組成物または方法。
【請求項７８】
前記１個または複数の異種ドメインが、ｉｎ  ｖｉｖｏ安定性、ｉｎ  ｖｉｖｏ半減期、取り込み／投与、組織局在もしくは分布、タンパク質複合体の形成、および／または精製のうちの１種または複数を増強する、請求項７７に記載の組成物または方法。
【請求項７９】
前記ポリペプチドが、１個または複数の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項７１〜７７のいずれか一項に記載の組成物または方法。
【請求項８０】
前記１個または複数の修飾されたアミノ酸残基が、ペグ化アミノ酸、プレニル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、および／または有機誘導体化剤にコンジュゲートされたアミノ酸を含む、請求項７９に記載の組成物または方法。
【請求項８１】
前記ＳＡＰタンパク質が、注射による、静脈内注射もしくは注入による、皮下注射による、デポーもしくはポンプによる連続的放出による、またはこれらの組合せから選択される機序によって投与されることを特徴とする、請求項１〜２０もしくは４７〜８０のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８２】
追加的な抗がん療法薬が、前記患者にさらに投与されることを特徴とする、請求項１〜２０もしくは４７〜８１のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８３】
前記追加的な抗がん療法薬が、化学療法剤、抗体に基づく薬剤、キナーゼ阻害剤（例えば、ルキソリチニブ）、免疫調節剤、生物学的薬剤、またはこれらの組合せから選択される、請求項８２に記載の組成物または方法。
【請求項８４】
前記化学療法剤が、アクチノマイシンＤ、アルデスロイキン、アリトレチノイン、オールトランスレチノイン酸／ＡＴＲＡ、アルトレタミン、アムサクリン、アスパラギナーゼ、アザシチジン、アザチオプリン、カルメット・ゲラン桿菌／ＢＣＧ、ベンダムスチン塩酸塩、ベキサロテン、ビカルタミド、ブレオマイシン、ボルテゾミブ、ブスルファン、カペシタビン、カルボプラチン、カルフィルゾミブ、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン／シスプラチナム、クラドリビン、シクロホスファミド／サイトホスファン、シタラビン、ダカルバジン、ダウノルビシン／ダウノマイシン、デニロイキンジフチトクス、デクスラゾキサン、ドセタキセル、ドキソルビシン、エピルビシン、エトポシド、フルダラビン、フルオロウラシル（５−ＦＵ）、ゲムシタビン、ゴセレリン、ヒドロコルチゾン、ヒドロキシウレア、イダルビシン、イホスファミド、インターフェロンアルファ、イリノテカンＣＰＴ−１１、ラパチニブ、レナリドミド、リュープロリド、メクロレタミン／クロルメチン／ムスチン／ＨＮ２、メルカプトプリン、メトトレキセート、メチルプレドニゾロン、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、オクトレオチド、オプレルベキン、オキサリプラチン、パクリタキセル、パミドロネート、ペグアスパルガーゼ、ペグフィルグラスチム、ペグインターフェロン、ペメトレキセド、ペントスタチン、フェニルアラニンマスタード、プリカマイシン／ミスラマイシン、プレドニゾン、プレドニゾロン、プロカルバジン、ラロキシフェン、ロミプロスチム、サルグラモスチム、ストレプトゾシン、タモキシフェン、テモゾロミド、テムシロリムス、テニポシド、サリドマイド、チオグアニン、チオホスホアミド／チオテパ、チオテパ、トポテカン塩酸塩、トレミフェン、トレチノイン、バルルビシン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビノレルビン、ボリノスタット、ゾレドロン酸、またはこれらの組合せから選択される、請求項８３に記載の組成物または方法。
【請求項８５】
前記抗体に基づく薬剤が、アレムツズマブ、ベバシズマブ、セツキシマブ、フレソリムマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、イブリツモマブチウキセタン、イピリムマブ、オファツムマブ、パニツムマブ、リツキシマブ、トシツモマブ、トラスツズマブ、トラスツズマブＤＭ１、またはこれらの組合せから選択される、請求項８３に記載の組成物または方法。
【請求項８６】
前記キナーゼ阻害剤が、アキシチニブ、バフェチニブ、ボスチニブ、セジラニブ、クリゾチニブ、ダサチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、イマチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、ニロチニブ、パゾパニブ、ポナチニブ、キザルチニブ、レゴラフェニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、バンデタニブ、バタラニブ、ベムラフィニブ、またはこれらの組合せから選択される、請求項８３に記載の組成物または方法。
【請求項８７】
前記免疫調節剤が、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、メトトレキセート、レフルノミド、シクロホスファミド、シクロスポリンＡ、ミノサイクリン、アザチオプリン、タクロリムス、メチルプレドニゾロン、ミコフェノール酸モフェチル、ラパマイシン、ミゾリビン、デオキシスパガリン、ブレキナル、５，６−ジメチルキサンテノン−４−酢酸（ＤＭＸＡＡ）、ラクトフェリン、ポリＡＵ、ポリＩ：ポリＣ１２Ｕ、ポリ−ＩＣＬＣ、イミキモド、レシキモド、非メチル化ＣｐＧジヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）またはイピリムマブから選択される、請求項８３に記載の組成物または方法。
【請求項８８】
前記キナーゼ阻害剤が、ＡＣ−４３０、ＡＺＤ１４８０、バリシチニブ、ＢＭＳ−９１１４５３、ＣＥＰ−３３７７９、ＣＹＴ３８７、ＧＬＰＧ−０６３４、ＩＮＣＢ１８４２４、レスタウルチニブ、ＬＹ２７８４５４４、ＮＳ−０１８、パクリチニブ、ルキソリチニブ、ＴＧ１０１３４８（ＳＡＲ３０２５０３）、トファシチニブ、ＶＸ−５０９、Ｒ−３４８、Ｒ７２３、またはこれらの組合せから選択されるヤヌスキナーゼ阻害剤である、請求項８３に記載の組成物または方法。
【請求項８９】
前記生物学的薬剤が、ＩＬ−２、ＩＬ−３、エリスロポエチン、Ｇ−ＣＳＦ、フィルグラスチム、インターフェロンアルファ、ボルテゾミブ、またはこれらの組合せから選択される、請求項８３に記載の組成物または方法。
【請求項９０】
前記追加的な抗がん療法薬が、ＡＢ００２４、ＡＺＤ１４８０、ＡＴ−９２８３、ＢＭＳ−９１１５４３、ＣＹＴ３８７、エベロリムス、ギビノスタット、イメテルスタット、レスタウルチニブ、ＬＹ２７８４５４４、ＮＳ−０１８、経口ヒ素、パクリチニブ、パノビノスタット、ペグインターフェロンアルファ−２ａ、ポマリドミド、プラシノスタット、ルキソリチニブ、ＴＡＫ−９０１またはＴＧ１０１４３８（ＳＡＲ３０２５０３）から選択される、請求項８２に記載の組成物または方法。
【請求項９１】
前記ＳＡＰタンパク質が、脾臓体積をベースラインと比べて少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９０のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９２】
前記ＳＡＰタンパク質が、単独でまたは追加的な抗がん療法薬と組み合わせて、脾臓体積をベースラインと比べて少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項９１に記載の組成物または方法。
【請求項９３】
前記ＳＡＰタンパク質が、ＭＰＮ−ＳＡＦ合計症状スコアをベースラインと比べて少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９２のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９４】
前記ＳＡＰタンパク質が、ＭＰＮ−ＳＡＦ合計症状スコアをベースラインと比べて少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項９３に記載の組成物または方法。
【請求項９５】
前記ＳＡＰタンパク質が、ヘモグロビンレベルをベースラインと比べて少なくとも１ｇ／Ｌ増加させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９４のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９６】
前記ＳＡＰタンパク質が、少なくとも１００ｇ／Ｌへのヘモグロビンレベルの増加に有効な投与レジメンに従って投与され、ベースラインヘモグロビンが、ベースラインにおいて１００ｇ／Ｌ未満であった、請求項１〜２０もしくは４７〜９５のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９７】
前記ＳＡＰタンパク質が、赤血球（ＲＢＣ）輸血をベースラインと比べて少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９６のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９８】
前記ＳＡＰタンパク質が、赤血球（ＲＢＣ）輸血をベースラインと比べて少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９７のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９９】
前記ＳＡＰタンパク質が、ＲＢＣ輸血非依存性の達成に有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９８のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１００】
前記ＳＡＰタンパク質が、血小板輸血を少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜９９のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜９９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０１】
前記ＳＡＰタンパク質が、単独でまたは追加的な抗がん療法薬と組み合わせて、血小板輸血を少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜１００のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜１００のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０２】
前記ＳＡＰタンパク質が、単独でまたは追加的な抗がん療法薬と組み合わせて、骨髄線維症の１グレードの減少を引き起こすのに有効な投与レジメンに従って投与される、請求項１〜２０もしくは４７〜１０１のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜１０１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０３】
１種または複数の副作用が、追加的な抗がん療法薬単独による処置と比べて低下されるような投与レジメンに従って、前記ＳＡＰタンパク質が、追加的な抗がん療法薬と組み合わせて投与されることを特徴とする、請求項１〜２０もしくは４７〜１０２のいずれか一項に記載の組成物、または請求項２１〜４６もしくは７１〜１０２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０４】
ａ）ＳＡＰタンパク質；ｂ）ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１およびＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子の領域を増幅することができる１種または複数のオリゴヌクレオチド；ならびにｃ）使用のための指示を含む、キット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４７】
本開示は、本明細書に記載されている態様および実施形態のいずれかの組合せなどの、本発明の特色のいずれかのあらゆる適した組合せを企図する。例えば、本開示は、前述の態様および実施形態のいずれかを、互いに、および／または本明細書に開示されている実施形態のいずれかと組み合わせることができることを企図する。例えば、機能および／または構造的な特色のいずれかの組合せを使用して記載されているＳＡＰタンパク質は、本明細書に記載されている方法のいずれかにおいて、単独でまたは併用療法において使用して、いずれか１種または複数の症状に基づき記載されている患者などの、本明細書に記載されている患者の状態、患者集団または亜集団のいずれかを処置することができる。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
骨髄増殖性障害を処置するための方法であって、
（ｉ）骨髄増殖性障害を有する対象の細胞が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含むかどうかを決定するステップと、
前記対象が、前記突然変異型対立遺伝子を含む場合、
（ｉｉ）前記対象に有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を投与するステップと
を含む、方法。
（項目２）
前記骨髄増殖性障害が、骨髄線維症を含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記骨髄線維症が、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症後の骨髄線維症または本態性血小板血症後の骨髄線維症を含む、項目２に記載の方法。
（項目４）
前記骨髄増殖性障害が、真性赤血球増加症、本態性血小板増加症または慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）を含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記対象が、ＪＡＫ２のコドン６１７に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜４のいずれか一項に記載の方法。
（項目６）
前記突然変異が、ＪＡＫ２におけるＶ６１７Ｆアミノ酸置換をもたらす、項目５に記載の方法。
（項目７）
前記対象が、ＪＡＫ２のエクソン１２またはエクソン１４に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜４のいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
前記対象が、ＭＰＬのコドン５１５に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜７のいずれか一項に記載の方法。
（項目９）
前記突然変異が、ＭＰＬにおけるＷ５１５Ｌ、Ｗ５１５Ｋ、Ｗ５１５ＡまたはＷ５１５Ｒアミノ酸置換をもたらす、項目８に記載の方法。
（項目１０）
前記対象が、ＭＰＬのエクソン１０に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
前記対象が、ＣＡＬＲのエクソン９に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
前記対象が、ＡＳＸＬ１のエクソン１２に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３）
前記対象が、ＩＤＨ１のエクソン４に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４）
前記対象が、ＩＤＨ１のコドン１３２に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
前記対象が、ＩＤＨ２のエクソン４に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６）
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１４０に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７）
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１７２に突然変異を含むかどうかを決定するステップを含む、項目１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、欠失、挿入、点突然変異または転座である、項目１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
前記突然変異が、前記１種もしくは複数の遺伝子によってコードされる１種もしくは複数のタンパク質の発現をもたらさないか、またはトランケートされたタンパク質の発現をもたらす、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、前記１種または複数の遺伝子の一方または両方の対立遺伝子に存在する、項目１〜１９のいずれか一項に記載の方法。
（項目２１）
血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質によって骨髄増殖性障害を処置するための方法であって、
（ｉ）ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される前記骨髄増殖性障害に関連する１種または複数の遺伝子における突然変異の第１の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップであって、前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重が、前記ＳＡＰタンパク質の投与前に測定される、ステップと、
（ｉｉ）（ｉ）で測定された同じ突然変異の第２の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップであって、前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重が、前記ＳＡＰタンパク質の投与後に測定される、ステップと、
（ｉｉｉ）前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の差を同定するステップと
を含み、前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の減少が、前記ＳＡＰタンパク質の前記投与が、前記骨髄増殖性障害の処置において有効であることを示す、方法。
（項目２２）
前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の前記減少が、１０％〜９０％である、または前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の前記差が、１０％〜９０％の低下である、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の前記減少が、２５％〜５０％である、または前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の前記差が、２５％〜５０％の低下である、項目２１に記載の方法。
（項目２４）
前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重と比べた前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重の前記減少が、少なくとも５０％である、または前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重および前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重の間の前記差が、少なくとも５０％の低下である、項目２１に記載の方法。
（項目２５）
前記差が、完全な分子応答である、項目２１に記載の方法。
（項目２６）
第１の生体試料を得るステップと、前記第１の生体試料における前記第１の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップと、第２の生体試料を得るステップと、前記第２の生体試料における前記第２の突然変異型対立遺伝子荷重を測定するステップとを含む、項目２１〜２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７）
前記第１の生体試料および前記第２の生体試料が、血液試料および／または骨髄試料を含む、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記測定するステップが、前記骨髄増殖性障害に関連する前記１種または複数の遺伝子の全体または部分を含む核酸を増幅することを含む、項目２１〜２７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９）
前記測定するステップが、前記骨髄増殖性障害に関連する前記１種または複数の遺伝子の、野生型核酸に対する突然変異型核酸の割合を決定することを含む、項目２１〜２８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０）
前記処置の有効性に基づき前記ＳＡＰタンパク質の投与レジメンを増加、減少または維持するステップをさらに含む、項目２１〜２９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３１）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＪＡＫ２のコドン６１７における突然変異である、項目２１〜３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
前記突然変異が、ＪＡＫ２におけるＶ６１７Ｆアミノ酸置換をもたらす、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＪＡＫ２のエクソン１２またはエクソン１４に存在する、項目２１〜３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３４）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＭＰＬのコドン５１５に存在する、項目２１〜３３のいずれか一項に記載の方法。
（項目３５）
前記突然変異が、ＭＰＬにおけるＷ５１５Ｌ、Ｗ５１５Ｋ、Ｗ５１５ＡまたはＷ５１５Ｒアミノ酸置換をもたらす、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＭＰＬのエクソン１０に存在する、項目２１〜３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＣＡＬＲのエクソン９に存在する、項目２１〜３６のいずれか一項に記載の方法。
（項目３８）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＡＳＸＬ１のエクソン１２に存在する、項目２１〜３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３９）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ１のエクソン４に存在する、項目２１〜３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目４０）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ１のコドン１３２に存在する、項目２１〜３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目４１）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ２のエクソン４に存在する、項目２１〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ２のコドン１４０に存在する、項目２１〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４３）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異のうち少なくとも１種が、ＩＤＨ２のコドン１７２に存在する、項目２１〜４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異が、欠失、挿入、点突然変異または転座である、項目２１〜４３のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記突然変異が、前記１種もしくは複数の遺伝子によってコードされる１種もしくは複数のタンパク質の発現をもたらさないか、またはトランケートされたタンパク質の発現をもたらす、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
１種または複数の遺伝子における前記突然変異が、前記１種または複数の遺伝子の一方または両方の対立遺伝子に存在する、項目２１〜４５のいずれか一項に記載の方法。
（項目４７）
骨髄増殖性障害を処置する方法であって、それを必要とする対象に有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を投与するステップを含み、前記対象の細胞の一部が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含む、方法。
（項目４８）
骨髄増殖性障害を処置する方法であって、それを必要とする対象に有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を投与するステップを含み、前記対象の細胞の一部が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含み、前記ＳＡＰタンパク質が、前記対象における前記遺伝子の突然変異型対立遺伝子荷重を低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、方法。
（項目４９）
前記骨髄増殖性障害が、骨髄線維症を含む、項目４７または４８に記載の方法。
（項目５０）
前記骨髄線維症が、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症後の骨髄線維症または本態性血小板血症後の骨髄線維症を含む、項目４９に記載の方法。
（項目５１）
前記骨髄増殖性障害が、真性赤血球増加症、本態性血小板増加症または慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）を含む、項目４７または４８に記載の方法。
（項目５２）
前記対象が、ＪＡＫ２のコドン６１７に突然変異を含む、項目４７〜５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目５３）
前記突然変異が、ＪＡＫ２におけるＶ６１７Ｆアミノ酸置換をもたらす、項目５２に記載の方法。
（項目５４）
前記対象が、ＪＡＫ２のエクソン１２またはエクソン１４に突然変異を含む、項目４７〜５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目５５）
前記対象が、ＭＰＬのコドン５１５に突然変異を含む、項目４７〜５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目５６）
前記突然変異が、ＭＰＬにおけるＷ５１５Ｌ、Ｗ５１５Ｋ、Ｗ５１５ＡまたはＷ５１５Ｒアミノ酸置換をもたらす、項目５５に記載の方法。
（項目５７）
前記対象が、ＭＰＬのエクソン１０に突然変異を含む、項目４７〜５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目５８）
前記対象が、ＣＡＬＲのエクソン９に突然変異を含む、項目４７〜５７のいずれか一項に記載の方法。
（項目５９）
前記対象が、ＡＳＸＬ１のエクソン１２に突然変異を含む、項目４７〜５８のいずれか一項に記載の方法。
（項目６０）
前記対象が、ＩＤＨ１のエクソン４に突然変異を含む、項目４７〜５９のいずれか一項に記載の方法。
（項目６１）
前記対象が、ＩＤＨ１のコドン１３２に突然変異を含む、項目４７〜５９のいずれか一項に記載の方法。
（項目６２）
前記対象が、ＩＤＨ２のエクソン４に突然変異を含む、項目４７〜６１のいずれか一項に記載の方法。
（項目６３）
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１４０に突然変異を含む、項目４７〜６１のいずれか一項に記載の方法。
（項目６４）
前記対象が、ＩＤＨ２のコドン１７２に突然変異を含む、項目４７〜６３のいずれか一項に記載の方法。
（項目６５）
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、欠失、挿入、点突然変異または転座である、項目４７〜６４のいずれか一項に記載の方法。
（項目６６）
前記突然変異が、前記１種もしくは複数の遺伝子によってコードされる１種もしくは複数のタンパク質の発現をもたらさないか、またはトランケートされたタンパク質の発現をもたらす、項目６５に記載の方法。
（項目６７）
１種または複数の遺伝子における前記骨髄増殖性障害に関連する前記突然変異が、前記１種または複数の遺伝子の一方または両方の対立遺伝子に存在する、項目４７〜６６のいずれか一項に記載の方法。
（項目６８）
骨髄増殖性障害を有する対象における突然変異型対立遺伝子荷重を低下させるための方法であって、それを必要とする対象に有効量の血清アミロイドＰ（ＳＡＰ）タンパク質を投与するステップを含み、前記対象が、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１またはＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子において前記骨髄増殖性障害に関連する突然変異を含む、方法。
（項目６９）
前記骨髄増殖性障害が、骨髄線維症を含む、項目６８に記載の方法。
（項目７０）
前記骨髄線維症が、原発性骨髄線維症、真性赤血球増加症後の骨髄線維症または本態性血小板血症後の骨髄線維症を含む、項目６９に記載の方法。
（項目７１）
前記ＳＡＰタンパク質が、配列番号１に対し少なくとも８５％同一であるアミノ酸配列を含むＳＡＰポリペプチドを含む、項目１〜７０のいずれか一項に記載の方法。
（項目７２）
前記ＳＡＰタンパク質が、Ｎ結合型オリゴ糖鎖を含むグリコシル化された組換えヒトＳＡＰポリペプチドを含み、前記オリゴ糖鎖の少なくとも１本の分枝が、α２，３結合型シアル酸部分で終結する、項目１〜７１のいずれか一項に記載の方法。
（項目７３）
前記オリゴ糖鎖のシアル酸付加された分枝の全てが、α２，３結合型シアル酸部分で終結する、項目７２に記載の方法。
（項目７４）
前記オリゴ糖鎖が、α２，６結合型シアル酸部分を実質的に含まない、項目７２に記載の方法。
（項目７５）
前記ポリペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、項目７１〜７４のいずれか一項に記載の方法。
（項目７６）
前記ポリペプチドが、配列番号１に対して少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む、項目７１〜７４のいずれか一項に記載の方法。
（項目７７）
前記ポリペプチドが、ＳＡＰドメインおよび１個または複数の異種ドメインを含む融合タンパク質である、項目７１〜７６のいずれか一項に記載の方法。
（項目７８）
前記１個または複数の異種ドメインが、ｉｎ  ｖｉｖｏ安定性、ｉｎ  ｖｉｖｏ半減期、取り込み／投与、組織局在もしくは分布、タンパク質複合体の形成、および／または精製のうちの１種または複数を増強する、項目７７に記載の方法。
（項目７９）
前記ポリペプチドが、１個または複数の修飾されたアミノ酸残基を含む、項目７１〜７７のいずれか一項に記載の方法。
（項目８０）
前記１個または複数の修飾されたアミノ酸残基が、ペグ化アミノ酸、プレニル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、および／または有機誘導体化剤にコンジュゲートされたアミノ酸を含む、項目７９に記載の方法。
（項目８１）
前記ＳＡＰタンパク質が、注射による、静脈内注射もしくは注入による、皮下注射による、デポーもしくはポンプによる連続的放出による、またはこれらの組合せから選択される機序によって投与される、項目１〜８０のいずれか一項に記載の方法。
（項目８２）
患者に追加的な抗がん療法薬を投与するステップをさらに含む、項目１〜８１のいずれか一項に記載の方法。
（項目８３）
前記追加的な抗がん療法薬が、化学療法剤、抗体に基づく薬剤、キナーゼ阻害剤（例えば、ルキソリチニブ）、免疫調節剤、生物学的薬剤、またはこれらの組合せから選択される、項目８２に記載の方法。
（項目８４）
前記化学療法剤が、アクチノマイシンＤ、アルデスロイキン、アリトレチノイン、オールトランスレチノイン酸／ＡＴＲＡ、アルトレタミン、アムサクリン、アスパラギナーゼ、アザシチジン、アザチオプリン、カルメット・ゲラン桿菌／ＢＣＧ、ベンダムスチン塩酸塩、ベキサロテン、ビカルタミド、ブレオマイシン、ボルテゾミブ、ブスルファン、カペシタビン、カルボプラチン、カルフィルゾミブ、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン／シスプラチナム、クラドリビン、シクロホスファミド／サイトホスファン、シタラビン、ダカルバジン、ダウノルビシン／ダウノマイシン、デニロイキンジフチトクス、デクスラゾキサン、ドセタキセル、ドキソルビシン、エピルビシン、エトポシド、フルダラビン、フルオロウラシル（５−ＦＵ）、ゲムシタビン、ゴセレリン、ヒドロコルチゾン、ヒドロキシウレア、イダルビシン、イホスファミド、インターフェロンアルファ、イリノテカンＣＰＴ−１１、ラパチニブ、レナリドミド、リュープロリド、メクロレタミン／クロルメチン／ムスチン／ＨＮ２、メルカプトプリン、メトトレキセート、メチルプレドニゾロン、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、オクトレオチド、オプレルベキン、オキサリプラチン、パクリタキセル、パミドロネート、ペグアスパルガーゼ、ペグフィルグラスチム、ペグインターフェロン、ペメトレキセド、ペントスタチン、フェニルアラニンマスタード、プリカマイシン／ミスラマイシン、プレドニゾン、プレドニゾロン、プロカルバジン、ラロキシフェン、ロミプロスチム、サルグラモスチム、ストレプトゾシン、タモキシフェン、テモゾロミド、テムシロリムス、テニポシド、サリドマイド、チオグアニン、チオホスホアミド／チオテパ、チオテパ、トポテカン塩酸塩、トレミフェン、トレチノイン、バルルビシン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビノレルビン、ボリノスタット、ゾレドロン酸、またはこれらの組合せから選択される、項目８３に記載の方法。
（項目８５）
前記抗体に基づく薬剤が、アレムツズマブ、ベバシズマブ、セツキシマブ、フレソリムマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、イブリツモマブチウキセタン、イピリムマブ、オファツムマブ、パニツムマブ、リツキシマブ、トシツモマブ、トラスツズマブ、トラスツズマブＤＭ１、またはこれらの組合せから選択される、項目８３に記載の方法。
（項目８６）
前記キナーゼ阻害剤が、アキシチニブ、バフェチニブ、ボスチニブ、セジラニブ、クリゾチニブ、ダサチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、イマチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、ニロチニブ、パゾパニブ、ポナチニブ、キザルチニブ、レゴラフェニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、バンデタニブ、バタラニブ、ベムラフィニブ、またはこれらの組合せから選択される、項目８３に記載の方法。
（項目８７）
前記免疫調節剤が、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、メトトレキセート、レフルノミド、シクロホスファミド、シクロスポリンＡ、ミノサイクリン、アザチオプリン、タクロリムス、メチルプレドニゾロン、ミコフェノール酸モフェチル、ラパマイシン、ミゾリビン、デオキシスパガリン、ブレキナル、５，６−ジメチルキサンテノン−４−酢酸（ＤＭＸＡＡ）、ラクトフェリン、ポリＡＵ、ポリＩ：ポリＣ１２Ｕ、ポリ−ＩＣＬＣ、イミキモド、レシキモド、非メチル化ＣｐＧジヌクレオチド（ＣｐＧ−ＯＤＮ）またはイピリムマブから選択される、項目８３に記載の方法。
（項目８８）
前記キナーゼ阻害剤が、ＡＣ−４３０、ＡＺＤ１４８０、バリシチニブ、ＢＭＳ−９１１４５３、ＣＥＰ−３３７７９、ＣＹＴ３８７、ＧＬＰＧ−０６３４、ＩＮＣＢ１８４２４、レスタウルチニブ、ＬＹ２７８４５４４、ＮＳ−０１８、パクリチニブ、ルキソリチニブ、ＴＧ１０１３４８（ＳＡＲ３０２５０３）、トファシチニブ、ＶＸ−５０９、Ｒ−３４８、Ｒ７２３、またはこれらの組合せから選択されるヤヌスキナーゼ阻害剤である、項目８３に記載の方法。
（項目８９）
前記生物学的薬剤が、ＩＬ−２、ＩＬ−３、エリスロポエチン、Ｇ−ＣＳＦ、フィルグラスチム、インターフェロンアルファ、ボルテゾミブ、またはこれらの組合せから選択される、項目８３に記載の方法。
（項目９０）
前記追加的な抗がん療法薬が、ＡＢ００２４、ＡＺＤ１４８０、ＡＴ−９２８３、ＢＭＳ−９１１５４３、ＣＹＴ３８７、エベロリムス、ギビノスタット、イメテルスタット、レスタウルチニブ、ＬＹ２７８４５４４、ＮＳ−０１８、経口ヒ素、パクリチニブ、パノビノスタット、ペグインターフェロンアルファ−２ａ、ポマリドミド、プラシノスタット、ルキソリチニブ、ＴＡＫ−９０１またはＴＧ１０１４３８（ＳＡＲ３０２５０３）から選択される、項目８２に記載の方法。
（項目９１）
前記ＳＡＰタンパク質が、脾臓体積をベースラインと比べて少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９０のいずれか一項に記載の方法。
（項目９２）
前記ＳＡＰタンパク質が、単独でまたは追加的な抗がん療法薬と組み合わせて、脾臓体積をベースラインと比べて少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目９１に記載の方法。
（項目９３）
前記ＳＡＰタンパク質が、ＭＰＮ−ＳＡＦ合計症状スコアをベースラインと比べて少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９２のいずれか一項に記載の方法。
（項目９４）
前記ＳＡＰタンパク質が、ＭＰＮ−ＳＡＦ合計症状スコアをベースラインと比べて少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目９３に記載の方法。
（項目９５）
前記ＳＡＰタンパク質が、ヘモグロビンレベルをベースラインと比べて少なくとも１ｇ／Ｌ増加させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９４のいずれか一項に記載の方法。
（項目９６）
前記ＳＡＰタンパク質が、少なくとも１００ｇ／Ｌへのヘモグロビンレベルの増加に有効な投与レジメンに従って投与され、ベースラインヘモグロビンが、ベースラインにおいて１００ｇ／Ｌ未満であった、項目１〜９５のいずれか一項に記載の方法。
（項目９７）
前記ＳＡＰタンパク質が、赤血球（ＲＢＣ）輸血をベースラインと比べて少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９６のいずれか一項に記載の方法。
（項目９８）
前記ＳＡＰタンパク質が、赤血球（ＲＢＣ）輸血をベースラインと比べて少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９７のいずれか一項に記載の方法。
（項目９９）
前記ＳＡＰタンパク質が、ＲＢＣ輸血非依存性の達成に有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１００）
前記ＳＡＰタンパク質が、血小板輸血を少なくとも２５％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜９９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０１）
前記ＳＡＰタンパク質が、単独でまたは追加的な抗がん療法薬と組み合わせて、血小板輸血を少なくとも５０％低下させるのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜１００のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０２）
前記ＳＡＰタンパク質が、単独でまたは追加的な抗がん療法薬と組み合わせて、骨髄線維症の１グレードの減少を引き起こすのに有効な投与レジメンに従って投与される、項目１〜１０１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０３）
１種または複数の副作用が、追加的な抗がん療法薬単独による処置と比べて低下されるような投与レジメンに従って、ＳＡＰタンパク質および前記追加的な抗がん療法薬を投与するステップを含む、項目１〜１０１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０４）
ａ）ＳＡＰタンパク質；ｂ）ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、ＡＳＸＬ１、ＥＺＨ２、ＳＲＳＦ２、ＩＤＨ１およびＩＤＨ２から選択される１種または複数の遺伝子の領域を増幅することができる１種または複数のオリゴヌクレオチド；ならびにｃ）使用のための指示を含む、キット。