【手続補正書】
【提出日】令和1年9月12日(2019.9.12)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
固体支持体をデコードする方法であって、
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）の中の固体支持体の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを検出することと、
複数の固体支持体の中のそれぞれの固体支持体の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを比較し、それぞれの固体支持体の第２のエンコードシグナルが、固体支持体に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の間又は後に検出され、それぞれの固体支持体の第１及び第２のエンコードシグナルが異なり、前記固体支持体に関連する前記少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化は、光源及び／又は熱源によって活性化されることと、
第１及び第２のエンコードシグナルの比較に少なくとも部分的に基づいて、複数の固体支持体をデコードすることと、
を含む、
固体支持体をデコードする方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第１のエンコードシグナルが検出可能ではなく（例えば、光学的に検出可能ではなく）且つ第２のエンコードシグナルが検出可能（例えば、光学的に検出可能）である固体支持体の少なくとも１つの集団を含み、及び／又は、
複数の固体支持体が、その第１のエンコードシグナルが検出可能（例えば、光学的に検出可能）であり且つ第２のエンコードシグナルが検出可能ではない（例えば、光学的に検出可能ではない）固体支持体の少なくとも１つの集団を含む、方法。
【請求項３】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第１のエンコードシグナルが第２のエンコードシグナルよりも大きい値（例えば、大きいシグナル振幅、蛍光強度値、又は直径）を有する固体支持体の少なくとも１つの集団を含み、及び／又は、
複数の固体支持体が、その第２のエンコードシグナルが第１のエンコードシグナルよりも大きい値（例えば、大きいシグナル振幅、蛍光強度値、又は直径）を有する固体支持体の少なくとも１つの集団を含む、方法。
【請求項４】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、固体支持体の少なくとも２つの集団の中のそれぞれの固体支持体上の少なくとも１つのエンコード物質の異なる濃度を有する固体支持体の少なくとも２つの集団を含み、
任意に、複数の固体支持体が、固体支持体の少なくとも２つの集団の中のそれぞれの固体支持体上の２つ以上のエンコード物質の異なる濃度及び／又は比を有する固体支持体の少なくとも２つの集団を含み、少なくとも２つの集団の１つの第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルの少なくとも１つが検出可能であり、他方の集団の第１のエンコードシグナル又は第２のエンコードシグナルから識別可能である、
方法。
【請求項５】
請求項１に記載の方法であって、
固体支持体に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、固体支持体及び／又は固体支持体に取り付けられた化合物の化学的及び／又は物理的変化であり、
任意に、固体支持体に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、固体支持体に取り付けられたエンコード物質及び／又はエンコード物質に取り付けられた化合物の化学的及び／又は物理的変化である、方法。
【請求項６】
請求項１に記載の方法であって、
第１のエンコードシグナル及び／又は第２のエンコードシグナルの検出することが、光学的測定を得ることを含み、
任意に、光学的測定の得ることが、複数の固体支持体について蛍光放出測定を得ることを含む、
方法。
【請求項７】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体を光学的入力に暴露することを更に含み、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、光学的入力に対する複数の固体支持体の暴露することの間又は後に起こる、
方法。
【請求項８】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中の少なくともいくつかの固体支持体に取り付けられたエンコード物質（例えば、色素又は標識）をフォトブリーチングすることを更に含み、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、複数の固体支持体のフォトブリーチングの間又は後に起こる、
方法。
【請求項９】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体を加熱又は冷却することの少なくとも１つを更に含み、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、複数の固体支持体を加熱又は冷却することの少なくとも１つの間又は後に起こる、
方法。
【請求項１０】
請求項１に記載の方法であって、
第２のエンコードシグナルの検出することが、第１のエンコードシグナルが検出された後の１ｍｓよりも長い時間において第２のエンコードシグナルを得ることを含み、
任意に、第２のエンコードシグナルが、第１のエンコードシグナルが得られた後の５分未満である時間において得られる、方法。
【請求項１１】
請求項１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルの検出することが、ある期間の複数の固体支持体のエンコードシグナルを連続的に検出することを含む、方法。
【請求項１２】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中のある固体支持体に取り付けられたエンコード物質の蛍光減衰率の変化を測定することを更に含む、方法。
【請求項１３】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、オーバーラップする蛍光励起バンド及び蛍光放出バンドを有する少なくとも２つのエンコード物質（例えば、色素又は標識）によってエンコードされた固体支持体を有する少なくとも１つの集団を含み、
任意に、少なくとも２つのエンコード物質が異なる光安定性を有し、及び／又は、少なくとも２つのエンコード物質の少なくとも１つが安定であると共に他方が不安定である、方法。
【請求項１４】
請求項１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中の第１の固体支持体に関連する第１の化学的及び／又は物理的変化を発生して、複数の固体支持体の中の第１の集団を定義することと、複数の固体支持体の中の第２の固体支持体に関連する第２の化学的及び／又は物理的変化を発生して、複数の固体支持体の中の第２の集団を定義することとを更に含み、
任意に、第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、固体支持体に関連するエンコード物質をフォトブリーチングすること及び／又は変性させることを含む、
方法。
【請求項１５】
請求項１４に記載の方法であって、
第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、同時に及び／又は同じ条件（例えば、同じ波長帯、温度、化学的環境、及び／又は圧力）を用いて起こり、又は、
第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、異なる時間において、及び／又は異なる条件（例えば、異なる波長帯、温度、化学的環境、及び／又は圧力）を用いて起こる、方法。
【請求項１６】
アッセイデコードシステム（１００）であって、
少なくとも１つのプロセッサを含む回路と、
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット２５）を含む流体分析チップ（２０）と、
複数の固体支持体と連通した熱源又は光源（１２５）の少なくとも１つと、
を含み、
回路が、熱源又は光源の少なくとも１つを作動させて、複数の固体支持体の少なくともいくつかに関連する少なくとも１つの検出可能な物理的及び／又は化学的変化を引き起こし、複数の固体支持体の中のそれぞれの固体支持体の第１及び第２のエンコードシグナルを比較して、複数の固体支持体の中の固体支持体の異なる集団をデコードする、
アッセイデコードシステム。
【請求項１７】
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット２５）であって、
第１の濃度及び／又は比の少なくとも１つのエンコード物質を含む固体支持体の第１の集団と、
第２の濃度及び／又は比の少なくとも１つのエンコード物質並びに少なくとも１つの追加のエンコード物質を含む固体支持体の第２の集団と、
を含み、
少なくとも１つのエンコード物質及び少なくとも１つの追加のエンコード物質の蛍光励起及び放出波長がオーバーラップし、
少なくとも１つのエンコード物質の第１及び第２の濃度が異なり、第１及び第２の集団の中のそれぞれの固体支持体上の少なくとも１つのエンコード物質の異なる濃度及び／又は比が、複数のエンコード状態を提供する、
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０２１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０２１６】
前述は本発明を例示しており、その限定として解釈されるべきではない。本発明の少しばかりの例示的な実施形態が記載されてきたが、当業者は、例示的な実施形態の多くの改変が、本発明の新規の教示及び利点から実質的に外れることなしに可能であるということを難なく理解するであろう。従って、全てのかかる改変は、請求項において定義される本発明の範囲内に包含されることが意図される。そのため、前述は本発明を例示しており、開示される具体的な実施形態に限定されるとは解釈されないということと、開示される実施形態の改変及び他の実施形態は添付の請求項の範囲内に包含されることが意図されるということとが理解されるべきである。本発明は次の請求項によって定義され、請求項の均等物はそれに包含される。
〔付記１〕
固体支持体をデコードする方法であって、
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）の中の固体支持体の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを検出することと、
複数の固体支持体の中のそれぞれの固体支持体の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを比較し、それぞれの固体支持体の第２のエンコードシグナルが、固体支持体に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の間又は後に検出され、それぞれの固体支持体の第１及び第２のエンコードシグナルが異なることと、
第１及び第２のエンコードシグナルの比較に少なくとも部分的に基づいて、複数の固体支持体をデコードすることと、
を含む、
固体支持体をデコードする方法。
〔付記２〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第１のエンコードシグナルが検出可能ではなく（例えば、光学的に検出可能ではなく）且つ第２のエンコードシグナルが検出可能（例えば、光学的に検出可能）である固体支持体の少なくとも１つの集団を含む、方法。
〔付記３〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第１のエンコードシグナルが検出可能（例えば、光学的に検出可能）であり且つ第２のエンコードシグナルが検出可能ではない（例えば、光学的に検〔付記４〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第１のエンコードシグナルが第２のエンコードシグナルよりも大きい値（例えば、大きいシグナル振幅、蛍光強度値、又は直径）を有する固体支持体の少なくとも１つの集団を含む、方法。
〔付記５〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第２のエンコードシグナルが第１のエンコードシグナルよりも大きい値（例えば、大きいシグナル振幅、蛍光強度値、又は直径）を有する固体支持体の少なくとも１つの集団を含む、方法。
〔付記６〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、固体支持体の少なくとも２つの集団の中のそれぞれの固体支持体上の少なくとも１つのエンコード物質の異なる濃度を有する固体支持体の少なくとも２つの集団を含む、方法。
〔付記７〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、固体支持体の少なくとも２つの集団の中のそれぞれの固体支持体上の２つ以上のエンコード物質の異なる濃度及び／又は比を有する固体支持体の少なくとも２つの集団を含み、
少なくとも２つの集団の１つの第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルの少なくとも１つが検出可能であり、他方の集団の第１のエンコードシグナル又は第２のエンコードシグナルから識別可能である、
方法。
〔付記８〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、その第１及び第２のエンコードシグナルが異ならない固体支持体の少なくとも１つの集団を含む、方法。
〔付記９〕
付記１に記載の方法であって、
固体支持体に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、固体支持体及び／又は固体支持体に取り付けられた化合物の化学的及び／又は物理的変化である、方法。
〔付記１０〕
付記１に記載の方法であって、
固体支持体に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、固体支持体に取り付けられたエンコード物質及び／又はエンコード物質に取り付けられた化合物の化学的及び／又は物理的変化である、方法。
〔付記１１〕
付記１に記載の方法であって、
第１のエンコードシグナル及び／又は第２のエンコードシグナルの検出することが、光学的測定を得ることを含み、
任意に、光学的測定の得ることが、複数の固体支持体について蛍光放出測定を得ることを含む、
方法。
〔付記１２〕
付記１に記載の方法であって、
第１のエンコードシグナル及び／又は第２のエンコードシグナルの検出することが、３つ以上の画像を得ることを含み、
任意に、３つ以上の画像が、２つ以上の異なる波長帯で得られる、
方法。
〔付記１３〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体を光学的入力に暴露することを更に含み、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、光学的入力に対する複数の固体支持体の暴露することの間又は後に起こる、
方法。
〔付記１４〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中の少なくともいくつかの固体支持体に取り付けられたエンコード物質（例えば、色素又は標識）をフォトブリーチングすることを更に含み、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、複数の固体支持体のフォトブリーチングの間又は後に起こる、
方法。
〔付記１５〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体を加熱又は冷却することの少なくとも１つを更に含み、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、複数の固体支持体を加熱又は冷却することの少なくとも１つの間又は後に起こる、
方法。
〔付記１６〕
付記１に記載の方法であって、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が、能動的に誘導される変化であり、永久的である、方法。
〔付記１７〕
付記１に記載の方法であって、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化が可逆的である、方法。
〔付記１８〕
付記１に記載の方法であって、
第２のエンコードシグナルの検出することが、第１のエンコードシグナルが検出された後の１ｍｓよりも長い時間において第２のエンコードシグナルを得ることを含む、方法。
〔付記１９〕
付記１８に記載の方法であって、
第２のエンコードシグナルが、第１のエンコードシグナルが得られた後の５分未満である時間において得られる、方法。
〔付記２０〕
付記１に記載の方法であって、
第１のエンコードシグナルの検出することが、アレイ（例えばビーズウェルアレイ）中の複数の固体支持体の第１の画像を得ることを含み、
第２のエンコードシグナルを検出することが、アレイ中の複数の固体支持体の第２の画像を得ることを含む、
方法。
〔付記２１〕
付記１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルが蛍光強度値を含む、方法。
〔付記２２〕
付記１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルを比較することが、少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化前の複数の固体支持体の中のそれぞれの固体支持体の色（例えば、色相、輝度、及び／又は明度）を、少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の間又は後のそれぞれの固体支持体の色と比較することを含む、方法。
〔付記２３〕
付記１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルの検出することが、ある期間の複数の固体支持体のエンコードシグナルを連続的に検出することを含む、方法。
〔付記２４〕
付記１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルの比較することが、少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化前のそれぞれの固体支持体のサイズ及び／又は形状を、少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の間又は後のそれぞれの固体支持体のサイズ及び／又は形状と比較することを含む、方法。
〔付記２５〕
付記１に記載の方法であって、
検出ステップに先行して複数の固体支持体を提供することを更に含む、方法。
〔付記２６〕
付記１に記載の方法であって、
第１のエンコードシグナル及び／又は第２のエンコードシグナルの検出することが、複数の固体支持体の画像を得ることを含む、方法。
〔付記２７〕
付記１に記載の方法であって、
第１のエンコードシグナル及び／又は第２のエンコードシグナルの検出することが、複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）の中のそれぞれの固体支持体の光学的又は電気的シグナルを検出することを含む、方法。
〔付記２８〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中の固体支持体の第１の集団が、第１の集団の中のそれぞれの固体支持体に取り付けられた１つのエンコード物質を含み、
複数の固体支持体の中の固体支持体の第２の集団が、第２の集団の中のそれぞれの固体支持体に結合された２つ以上のエンコード物質を含む、
方法。
〔付記２９〕
付記１に記載の方法であって、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化を発生することを更に含む、方法。
〔付記３０〕
付記１に記載の方法であって、
少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の発生することが、ある期間が経過することを待つことを含む、方法。
〔付記３１〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中のある固体支持体に関連する化合物（例えば、ペプチド又は蛋白質）を変性させることを更に含む、方法。
〔付記３２〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中のある固体支持体に関連するクエンチャーを除去することを更に含む、方法。
〔付記３３〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中のある固体支持体に取り付けられたエンコード物質の蛍光減衰率の変化を測定することを更に含む、方法。
〔付記３４〕
付記１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルの比較することが、電子的に実施される、方法。
〔付記３５〕
付記１に記載の方法であって、
第１及び第２のエンコードシグナルの検出することが、複数の固体支持体の第１及び第２の画像を得ることを含み、
第１及び第２の画像のそれぞれを得ることが、約２ミリ秒間から約５秒間の画像化を含む、
方法。
〔付記３６〕
付記３５に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中の少なくともいくつかの固体支持体に関連するエンコード物質（例えば、色素又は標識）を、約５秒間から約５分間フォトブリーチングすることを更に含み、
任意に、フォトブリーチングが、第１の画像が得られる間及び／又は後に起こる、
方法。
〔付記３７〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の下位集合の中の固体支持体のそれぞれが動的素子及びエンコード物質を含み、
複数の固体支持体の下位集合の中のそれぞれの固体支持体上のエンコード物質及び動的素子の異なる比及び／又は濃度が、複数の固体支持体をデコードする為に用いられる複数のエンコード状態を提供する、
方法。
〔付記３８〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体が、オーバーラップする蛍光励起バンド及び蛍光放出バンドを有する少なくとも２つのエンコード物質（例えば、色素又は標識）によってエンコードされた固体支持体を有する少なくとも１つの集団を含み、
任意に、少なくとも２つのエンコード物質が異なる光安定性を有する、
方法。
〔付記３９〕
付記３８に記載の方法であって、
少なくとも２つのエンコード物質の少なくとも１つが安定であり、他方が不安定である、方法。
〔付記４０〕
付記１に記載の方法であって、
複数の固体支持体の中の第１の固体支持体に関連する第１の化学的及び／又は物理的変化を発生して、複数の固体支持体の中の第１の集団を定義することと、複数の固体支持体の中の第２の固体支持体に関連する第２の化学的及び／又は物理的変化を発生して、複数の固体支持体の中の第２の集団を定義することとを更に含み、
任意に、第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、固体支持体に関連するエンコード物質をフォトブリーチングすること及び／又は変性させることを含む、
方法。
〔付記４１〕
付記４０に記載の方法であって、
第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、同時に及び／又は同じ条件（例えば、同じ波長帯、温度、化学的環境、及び／又は圧力）を用いて起こる、方法。
〔付記４２〕
付記４０に記載の方法であって、
第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、異なる時間において、及び／又は異なる条件（例えば、異なる波長帯、温度、化学的環境、及び／又は圧力）を用いて起こる、方法。
〔付記４３〕
付記４０に記載の方法であって、
第１及び／又は第２の化学的及び／又は物理的変化の発生することが、第１及び／又は第２の集団の中の部分集団を更に定義する、方法。
〔付記４４〕
付記４０に記載の方法であって、
第１の集団及び／又は第２の集団の中の部分集団の中の固体支持体が、それぞれの固体支持体上の少なくとも２つのエンコード物質の異なる比及び／又は濃度を有して、複数の固体支持体をデコードする為に用いられる複数のエンコード状態を提供する、方法。
〔付記４５〕
アッセイデコードシステムであって、
少なくとも１つのプロセッサを含む回路と、
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）を含む流体分析チップと、
複数の固体支持体と連通した熱源又は光源の少なくとも１つと、
を含み、
回路が、熱源又は光源の少なくとも１つを作動させて、複数の固体支持体の少なくともいくつかに関連する少なくとも１つの検出可能な物理的及び／又は化学的変化を引き起こし、複数の固体支持体の中のそれぞれの固体支持体の第１及び第２のエンコードシグナルを比較して、複数の固体支持体の中の固体支持体の異なる集団をデコードする、
アッセイデコードシステム。
〔付記４６〕
付記４５に記載のシステムであって、
熱源又は光源の少なくとも１つがフォトブリーチング光源である、システム。
〔付記４７〕
付記４５に記載のシステムであって、
熱源又は光源の少なくとも１つが熱源である、システム。
〔付記４８〕
付記４５に記載のシステムであって、
複数の固体支持体のある部分が、第１の色素及び第２の色素を異なる濃度及び／又は比で有する固体支持体を含み、
任意に、第１及び第２の色素が異なる光安定性及び／又は熱安定性を有する、
システム。
〔付記４９〕
付記４８に記載のシステムであって、
第１及び第２の色素の異なる濃度及び／又は比が、少なくとも５つの異なる集団を提供する、システム。
〔付記５０〕
付記４９に記載のシステムであって、
少なくとも５つの異なる集団が光学的に及び／又は電子的に検出可能である、システム。
〔付記５１〕
付記４８に記載のシステムであって、
第１の色素が光安定性であり、第２の色素が光不安定性（脆弱性）である、システム。
〔付記５２〕
付記４５に記載のシステムであって、
回路及び流体分析チップと連通した、１つ以上の定義された波長の光を放出するように構成された光学検出器を更に含む、システム。
〔付記５３〕
付記５２に記載のシステムであって、
回路が、複数の固体支持体の第１の画像を得ることと複数の固体支持体の第２の画像を得ることとを光学検出器に指図し、
少なくとも１つの検出可能な物理的及び／又は化学的変化が、第２の画像と比較して、第１の画像に少なくとも１つの差異を引き起こす、
システム。
〔付記５４〕
付記５３に記載のシステムであって、
第１の画像が、少なくとも１つの検出可能な物理的及び／又は化学的変化が起こる前であり、第２の画像が、少なくとも１つの検出可能な物理的又は化学的変化が起こる間又は後である、システム。
〔付記５５〕
付記５３に記載のシステムであって、
第２の画像が、回路が熱源又は光源の少なくとも１つを作動させた後である、システム。
〔付記５６〕
付記５３に記載のシステムであって、
光学検出器が第１の波長の光を複数の固体支持体に放出して、第１及び第２の画像を得、
複数の固体支持体の中の固体支持体の下位集合が、第１及び第２の画像において異なる蛍光強度を発生して、デコードシグナルを提供する、
システム。
〔付記５７〕
付記４５に記載のシステムであって、
熱源又は光源の少なくとも１つが、少なくとも１つの検出可能な物理的又は化学的変化として、複数の固体支持体の中の固体支持体の下位集合において不可逆的な検出可能な物理的及び／又は化学的変化を引き起こす、システム。
〔付記５８〕
付記５３に記載のシステムであって、
光学検出器が、第１及び／又は第２の画像の為の励起波長の光を複数の固体支持体に放出し、少なくとも１つの検出可能な物理的又は化学的変化を引き起こす異なる波長の光を伝達する、システム。
〔付記５９〕
付記４５に記載のシステムであって、
複数の固体支持体の中の少なくともいくつかの固体支持体が、第１の時点において第１及び第２のスペクトル的に類似のエンコード物質（例えば、色素）を含み、
第１及び第２のスペクトル的に類似のエンコード物質の１つが安定であり、他方が不安定（例えば、脆弱性）であり、
固体支持体の異なるもの同士が、第１及び第２のエンコード物質を異なる比及び／又は濃度で有して、少なくとも１つの検出可能な物理的及び／又は化学的変化前及び／又は後に複数の（例えば、１つ〜５つの）異なる識別可能な蛍光強度レベルを提供して、複数のエンコード状態を提供する、
システム。
〔付記６０〕
付記５９に記載のシステムであって、
光源を用いるフォトブリーチングイベントが、少なくとも１つの検出可能な物理的及び／又は化学的変化を引き起こす、システム。
〔付記６１〕
付記５９に記載のシステムであって、
複数のエンコード状態が約２つから約１０，０００個である、システム。
〔付記６２〕
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）であって、
第１の濃度及び／又は比の少なくとも１つのエンコード物質を含む固体支持体の第１の集団と、
第２の濃度及び／又は比の少なくとも１つのエンコード物質並びに少なくとも１つの追加のエンコード物質を含む固体支持体の第２の集団と、
を含み、
少なくとも１つのエンコード物質及び少なくとも１つの追加のエンコード物質の蛍光励起及び放出波長がオーバーラップし、
少なくとも１つのエンコード物質の第１及び第２の濃度が異なり、第１及び第２の集団の中のそれぞれの固体支持体上の少なくとも１つのエンコード物質の異なる濃度及び／又は比が、複数のエンコード状態を提供する、
複数の固体支持体（例えば、多重化ビーズセット）。
〔付記６３〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
固体支持体の第１及び第２の集団の中のそれぞれの固体支持体が、検出可能ではない（例えば、光学的に検出可能ではない）第１のエンコードシグナルを発生する、複数の固体支持体。
〔付記６４〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
固体支持体の第１及び第２の集団の中のそれぞれの固体支持体が、検出可能（例えば、光学的に検出可能）である第１のエンコードシグナルを発生し、
固体支持体の第１及び第２の集団の第１のエンコードシグナルが識別可能ではない、
複数の固体支持体。
〔付記６５〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つのエンコード物質が、少なくとも１つの追加のエンコード物質の安定性と比較して異なる安定性を有し、
少なくとも１つの追加のエンコード物質の異なる安定性が、第２の集団の中のそれぞれの固体支持体が第１のエンコードシグナルとは異なる第２のエンコードシグナルを発生することを引き起こす、
複数の固体支持体。
〔付記６６〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つのエンコード物質が安定であり、少なくとも１つの追加のエンコード物質が不安定（例えば、脆弱性）であり、
少なくとも１つの追加のエンコード物質の不安定性が、第２の集団の中のそれぞれの固体支持体が第１のエンコードシグナルとは異なる第２のエンコードシグナルを発生することを引き起こす、
複数の固体支持体。
〔付記６７〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
固体支持体の第３の集団を更に含み、
第３の集団の中のそれぞれの固体支持体が、少なくとも１つのエンコード物質又は少なくとも１つの追加のエンコード物質とオーバーラップする蛍光励起及び放出波長を有さないエンコード物質を含む、
複数の固体支持体。
〔付記６８〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つのエンコード物質及び少なくとも１つの追加のエンコード物質が、異なる光安定性を有する、複数の固体支持体。
〔付記６９〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つのエンコード物質及び／又は少なくとも１つの追加のエンコード物質が色素を含む、複数の固体支持体。
〔付記７０〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
第１及び第２の集団の中のそれぞれの固体支持体が、類似の初期蛍光強度を発生する、複数の固体支持体。
〔付記７１〕
付記６５に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つの追加のエンコード物質が、温度、時間、光暴露、及び／又は化学的環境に応答して、少なくとも１つのエンコード物質とは異なる安定性を有する、複数の固体支持体。
〔付記７２〕
付記７１に記載の複数の固体支持体であって、
第２の集団の中のそれぞれの固体支持体の第２のエンコードシグナルが、第２の集団の中のそれぞれの固体支持体の第１のエンコードシグナルとは異なる（例えば、縮減又は増大した）蛍光放出強度を有する、複数の固体支持体。
〔付記７３〕
付記７１に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つの追加のエンコード物質が温度、時間、光暴露、及び／又は化学的環境に応答して物理的に及び／又は化学的に変化する、複数の固体支持体。
〔付記７４〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つのエンコード物質及び少なくとも１つの追加のエンコード物質が、固体支持体の第２の集団の中のそれぞれの固体支持体に別個に取り付けられる、複数の固体支持体。
〔付記７５〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つの追加のエンコード物質が有機色素及び／又は量子ドットを含む、複数の固体支持体。
〔付記７６〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つの追加のエンコード物質がクエンチャーを含む、複数の固体支持体。
〔付記７７〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
少なくとも１つの追加のエンコード物質及び少なくとも１つのエンコード物質が異なるフォトブリーチング動態を有する、複数の固体支持体。
〔付記７８〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
複数の固体支持体が、いくつものエンコード状態をエンコードし、
エンコード状態の数は式（１）によって決定され、
【数１】
2018538514.tif 000001
式中、ｉ、ｊ、及びｋはそれぞれ励起／放出バンドＩ、Ｊ、及びＫの強度レベルであり、ｎｉ、ｎｊ、及びｎｋそれぞれは、それぞれ励起／放出バンドＩ、Ｊ、及びＫのエンコードされた強度レベルの数である、
複数の固体支持体。
〔付記７９〕
付記６２に記載の複数の固体支持体であって、
複数の固体支持体が、少なくとも２０個の差次的にエンコードされた固体支持体を含む、複数の固体支持体。
〔付記８０〕
付記７９に記載の複数の固体支持体であって、
複数の固体支持体が、検出可能（例えば、光学的に及び／又は電子的に検出可能）である少なくとも１，０００個のエンコード状態をエンコードする、複数の固体支持体。
〔付記８１〕
付記６２〜８０の何れか一項に記載の複数の固体支持体を含む、キット。
〔付記８２〕
更にマイクロ流体デバイスを含む、付記８１に記載のキット。
〔付記８３〕
キットが無菌パッケージ中にある、付記８１に記載のキット。
〔付記８４〕
付記８１〜８３の何れか一項に記載のキットであって、
複数の固体支持体が付記１〜４４の何れか一項に記載の方法に用いられる、キット。
〔付記８５〕
付記８１〜８３の何れか一項に記載のキットであって、
複数の固体支持体がフォレンジック・バーコーディング及び／又は模倣品検出の為に用いられる、キット。
〔付記８６〕
固体支持体をデコードする方法であって、
複数の分子認識素子を提供し、複数の分子認識素子の少なくともいくつかが１つ以上のエンコード物質を含むことと、
複数の分子認識素子の少なくともある部分を固体支持体の少なくともある部分に結合することと、
複数の分子認識素子の中の分子認識素子の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを検出することと、
複数の分子認識素子の中のそれぞれの分子認識素子の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを比較し、それぞれの分子認識素子の第２のエンコードシグナルが、分子認識素子に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の間又は後に検出され、それぞれの分子認識素子の第１及び第２のエンコードシグナルが異なることと、
第１及び第２のエンコードシグナルの比較に少なくとも部分的に基づいて、複数の分子認識素子をデコードすることと、
を含む、固体支持体をデコードする方法。
〔付記８７〕
試料をデコードする方法であって、
複数のエンコードされた素子の中のエンコードされた素子（例えば、エンコードされた固体支持体及び／又はエンコードされた分子認識素子）の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを検出することと、
複数のエンコードされた素子の中のそれぞれのエンコードされた素子の第１のエンコードシグナル及び第２のエンコードシグナルを比較し、それぞれのエンコードされた素子の第２のエンコードシグナルが、エンコードされた素子に関連する少なくとも１つの化学的及び／又は物理的変化の間又は後に検出され、それぞれのエンコードされた素子の第１及び第２のエンコードシグナルが異なることと、
第１及び第２のエンコードシグナルの比較に少なくとも部分的に基づいて、複数のエンコードされた素子をデコードすることと、
を含む、
試料をデコードする方法。
〔付記８８〕
複数のエンコードされた分子認識素子であって、
第１の濃度及び／又は比の少なくとも１つのエンコード物質を包含する分子認識素子の第１の集団と、
第２の濃度及び／又は比の少なくとも１つのエンコード物質並びに少なくとも１つの追加のエンコード物質を含む分子認識素子の第２の集団と、
を含み、
少なくとも１つのエンコード物質及び少なくとも１つの追加のエンコード物質の蛍光励起及び放出波長がオーバーラップし、
少なくとも１つのエンコード物質の第１及び第２の濃度が異なり、第１及び第２の集団の中のそれぞれの分子認識素子上の少なくとも１つのエンコード物質の異なる濃度及び／又は比が、複数のエンコード状態を提供する、
複数のエンコードされた分子認識素子。