【誤訳訂正書】
【提出日】令和1年10月30日(2019.10.30)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
流体試料中の検体と、バイオセンサのセンサ表面に固定されたリガンドとの間の相互作用を評価するための方法であって、
所定の取得サイクルに対する基準相互作用を表す基準結合曲線を提供するステップと、
所定の取得サイクルに対する検体リガンド相互作用の試料結合曲線を、バイオセンサを用いて取得するステップと、
試料結合曲線の基準結合曲線からの偏差を登録するステップと、
登録された偏差が所定の偏差基準より小さい場合には、基準相互作用と同等なものとして
検体リガンド相互作用を分類するステップと
を含み、
前記方法は、偏差を登録するステップ及び以降のステップから結合曲線の１以上の区間を除外するステップをさらに含み、除外された区間が、所定の取得サイクルにより規定される会合フェーズと解離フェーズとの間の遷移を含むことを特徴とする、方法。
【請求項２】
基準結合曲線に対して試料結合曲線を正規化するステップを含む、請求項１記載の方法。
【請求項３】
上側及び／又は下側基準閾値曲線を提供するステップを含んでいて、偏差基準が基準閾値曲線に対して定義される、請求項１又は請求項２記載の方法。
【請求項４】
基準結合曲線が、所定の取得条件で基準−検体リガンド相互作用の１以上の結合曲線をバイオセンサを用いて取得することによって提供される、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載の方法。
【請求項５】
基準−検体リガンド相互作用の２以上の結合曲線を取得し、基準結合曲線が２以上の結合曲線の平均曲線又は中央値曲線として定義される、請求項４記載の方法。
【請求項６】
２以上の結合曲線が、平均曲線又は中央値曲線が提供される前に正規化される、請求項５記載の方法。
【請求項７】
上側及び下側基準閾値曲線が、２以上の結合曲線の最小及び最大によって定義される、請求項５又は請求項６記載の方法。
【請求項８】
上側及び下側基準閾値曲線が、平均曲線からの所定の標準偏差によって定義される、請求項５又は請求項６記載の方法。
【請求項９】
所定の取得サイクルが１以上の会合フェーズを含んでおり、センサ表面が、所定の濃度で検体を含む流体試料に接触して置かれる、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載の方法。
【請求項１０】
所定の取得サイクルが、異なる検体濃度について２以上の連続した会合フェーズを含む、請求項９記載の方法。
【請求項１１】
所定の取得サイクルが１以上の解離フェーズを含んでおり、センサ表面が、検体を含まない流体に接触して置かれる、請求項１乃至請求項１０のいずれか１項記載の方法。
【請求項１２】
バイオセンサのセンサ表面がフローセル内に設けられ、所定の取得サイクルは、フローセルを通る流体の流量を規定する、請求項１乃至請求項３のいずれか１項記載の方法。
【請求項１３】
正規化が、会合フェーズの終了直前の所定の取得サイクル内のある時点における結合曲線値に基づく、請求項１乃至請求項１２のいずれか１項記載の方法。
【請求項１４】
リガンド及び検体の少なくとも一方が、薬物標的及び薬物標的を特徴付けるために用いられる天然の結合パートナーもしくは試薬の群から選択される、請求項１乃至請求項１３のいずれか１項記載の方法。
【請求項１５】
目視検査のために、以下：
・基準結合曲線、１以上の試料結合曲線、及び必要に応じて上側閾値曲線、下側基準閾値曲線、及び対照-検体リガンド相互作用の対照結合曲線のオーバーレイプロット、
・偏差プロットであって、登録された基準結合曲線からの偏差が１以上の試料結合曲線について表示される、偏差プロット、並びに
・基準閾値曲線プロットであって、１以上の試料結合曲線が基準閾値スケールで表示される、基準閾値曲線プロット
の１以上をグラフィックディスプレイ上に表示するステップを含む、請求項１乃至請求項１４のいずれか１項記載の方法。
【請求項１６】
基準閾値曲線の外側に位置する試料結合曲線のデータ点の割合を算出するステップを含んでおり、偏差基準が、基準閾値曲線の外側にあることが許容されるデータ点の最大割合である、請求項３乃至請求項１５のいずれか１項記載の方法。
【請求項１７】
基準曲線が最初に差し引かれた、閾値基準結合曲線又は試料結合曲線の二乗和を算出し、評価基準として二乗和の比を用いる、請求項３乃至請求項１６のいずれか１項記載の方法。
【請求項１８】
検体リガンド相互作用の分類のための所定の偏差基準が、所定の取得サイクルの異なるフェーズに応じて重み付けされる、請求項１乃至請求項１７のいずれか１項記載の方法。
【請求項１９】
請求項１乃至請求項１８のいずれか１項記載の方法を実行するように構成されたバイオセンサシステム。
【請求項２０】
コンピュータ上で実行された場合に、請求項１乃至請求項１９のいずれか１項記載の方法を実行するようにバイオセンサシステムの動作を制御するように構成されたコンピュータプログラム。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３６】
図８では、基準結合曲線を、図７の正規化された基準-検体リガンド相互作用の結合曲線に基づく平均曲線として概略的に示している。或いは、基準結合曲線は、中央の曲線として、又は所定の取得サイクルの基準相互作用を表す基準結合曲線を提供する他の任意の適切な統計的手法で提供することができる。基準結合曲線を定義するための統計的手法を用いることにより、例えば平均曲線からの偏差に関する情報も提供し、そのような情報は、例えば、登録された基準-検体リガンド相互作用の結合曲線が偏差のより広い範囲を示した所定の取得サイクルにおいて、１以上のフェーズ又は部分に対してより広い閾値範囲を可能にする基準閾値曲線を提供するために使用することができる。一実施形態では、上側及び下側基準閾値曲線は、２以上の基準-検体リガンド相互作用の結合曲線の最小及び最大によって定義される。別の実施形態が図８に概略的に開示され、実施例でさらに詳細に開示されるが、そこでは上側及び下側基準閾値曲線は、平均曲線からの所定の標準偏差によって定義される。標準偏差の概念を用いることにより、評価の妥当性を確実性の高いレベルに設定することができる。本発明による評価のための閾値を定義するために標準偏差を用いるという概念は、標準偏差プロットの形で評価結果を提示して、定義された基準閾値曲線に対する試料結合曲線の適合を明確に示すことをさらに可能にするが、これについては実施例１に関して図１４に示す。一実施形態によれば、本方法は、
目視検査のために、以下のうちの１以上をグラフィックディスプレイ上に表示するステップを含む。
・基準結合曲線、１以上の試料結合曲線、並びに必要に応じて上側閾値曲線、下側基準閾値曲線、及び対照結合曲線のオーバーレイプロット、
・偏差プロットであって、
登録された基準結合曲線からの偏差が１以上の試料結合曲線について表示される、偏差プロット、
・基準閾値曲線プロットであって、
１以上の試料結合曲線が基準閾値スケールで表示される、基準閾値曲線プロット。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３７
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３７】
さらに、すでに述べたように、試料結合曲線は、例えばバイオセンサの変動などの影響を回避するために、基準結合曲線に対して正規化することができる。そのうえ、バイオセンサ及び関係する検体リガンド相互作用の関数が妥当であることを確認するために、本方法は以下のステップを含むことができる。
・試料結合曲線に関連して、対照-検体リガンド相互作用の対照結合曲線を取得するステップ、
・対照結合曲線の基準結合曲線からの偏差を登録するステップ、
・対照結合曲線の偏差が所定の対照限界より小さい場合に、試料結合曲線の取得を確認するステップ。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３８】
上と同様に、対照結合曲線を基準結合曲線に対して正規化することもできる。一実施形態では、所定の対照限界は、基準閾値曲線と同じであってもよい。対照、検体リガンドとの相互作用を便宜的に基準相互作用と同じであってもよい。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００４６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００４６】
図１５は、これらのセグメント内の不確実性の影響を低減するために除外された、会合フェーズと解離フェーズとの間の遷移における区間の平均及び標準偏差曲線を示す。図１６は、図１５の基準結合曲線プロットにプロットされた試料結合曲線を示し、図から分かるように、すべてのデータが＋／-３倍標準偏差の曲線に含まれるわけではない。図１７は、標準偏差スケールで再プロットした試料結合曲線を示し、いくつかの時点で試料結合曲線が明確に基準結合曲線から３倍の標準偏差より多くずれていることが分かる。しかし、相互作用について登録された対照試料は、期待通りに振る舞うと結論づけられ、すべての時点において基準結合曲線から３倍の標準偏差の範囲内にある。