【手続補正書】
【提出日】平成19年12月17日(2007.12.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  配列番号２のポリペプチド配列をコードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項２】  配列番号１の配列を有する核酸を含む、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項３】  請求項１に記載される単離されたポリヌクレオチド分子を含む、ベクター。
【請求項４】  請求項３に記載されるベクターを含む、宿主細胞。
【請求項５】  請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド分子であって、
プロモーター配列
をさらに含み、該プロモーター配列は、配列番号１７に対して少なくとも９５％の配列同一性を有し、該プロモーター配列は、該ポリヌクレオチドの発現を制御する、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項６】  請求項５に記載のポリヌクレオチドであって、前記プロモーター配列が配列番号１７のヌクレオチド配列を有する、ポリヌクレオチド。
【請求項７】  請求項５に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む、ベクター。
【請求項８】  請求項７に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項９】  ＮＲＲＬ  Ｂ  ３０３５９である、請求項８に記載の宿主細胞。
【請求項１０】  Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種の宿主細胞を形質転換するための方法であって、
（ａ）Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種の宿主細胞を、請求項５に記載のポリヌクレオチド分子で形質転換する工程；および
（ｂ）形質転換された宿主細胞を選択する工程、
を包含する、方法。
【請求項１１】  単離されたポリヌクレオチド分子であって、
（ａ）請求項１に記載のポリヌクレオチド分子；ならびに
（ｂ）（ｉ）配列番号４のａｓｄポリペプチドをコードする、核酸分子；
（ｉｉ）配列番号６のｄａｐＡポリペプチドをコードする、核酸分子；
（ｉｉｉ）配列番号８のｄａｐＢポリペプチドをコードする、核酸分子；
（ｉｖ）配列番号１０のｄｄｈポリペプチドをコードする、核酸分子；
（ｖ）配列番号２１の’ｌｙｓＡポリペプチドをコードする、核酸分子；
（ｖｉ）配列番号１４のｌｙｓＡポリペプチドをコードする、核酸分子；および
（ｖｉｉ）配列番号１６のＯＲＦ２ポリペプチドをコードする、核酸分子、
からなる群より選択される、少なくとも１つのさらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子；
を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項１２】  請求項１１に記載のポリヌクレオチド分子を含む、ベクター。
【請求項１３】  請求項１２に記載のベクターを含む、宿主細胞。
【請求項１４】  請求項１３に記載の宿主細胞であって、該宿主細胞は、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｆｌａｖｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２１８、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｆｌａｖｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２１９、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｏｆｅｒｍｅｎｔｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２２０、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｏｆｅｒｍｅｎｔｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２２１、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｏｆｅｒｍｅｎｔｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２２２、Ｂｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｆｌａｖｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２３４およびＢｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｌａｃｔｏｆｅｒｍｅｎｔｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２３５からなる群より選択されるＢｒｅｖｉｂａｃｔｅｒｉｕｍである、宿主細胞。
【請求項１５】  請求項１３に記載の宿主細胞であって、該宿主細胞は、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ  ＤＨ５α  ＭＣＲ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２２８である、宿主細胞。
【請求項１６】  請求項１３に記載の宿主細胞であって、該宿主細胞は、Ｃ．ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２３６およびＣ．ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍ  ＮＲＲＬ−Ｂ３０２３７からなる群より選択されるＣ．ｇｌｕｔａｍｉｃｕｍである、宿主細胞。
【請求項１７】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号４のａｓｄポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１８】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号６のｄａｐＡポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１９】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号８のｄａｐＢポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２０】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号１０のｄｄｈポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２１】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号２１の’ｌｙｓＡポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２２】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号１４のｌｙｓＡポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２３】  請求項１１に記載の単離されたポリヌクレオチドであって、前記さらなるＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種リジン経路遺伝子が、配列番号１６のＯＲＦ２ポリペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２４】  単離されたポリヌクレオチド分子であって、
（ａ）請求項１に記載のポリヌクレオチド分子；
（ｂ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｅ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項２５】ｐＫ  １８４−ＫＤＡＢを含む、請求項２４に記載の単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項２６】  単離されたポリヌクレオチド分子であって、
（ａ）請求項１に記載のポリヌクレオチド分子；
（ｂ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｅ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｆ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項２７】  単離されたポリヌクレオチド分子であって、
（ａ）請求項１に記載のポリヌクレオチド分子；
（ｂ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｅ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｆ）配列番号２１の’ｌｙｓＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｇ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項２８】  ｐＤ１１−ＫＤＡＢＨ’Ｌを含む、請求項２７に記載の単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項２９】  単離されたポリヌクレオチド分子であって、
（ａ）請求項２に記載のポリヌクレオチド分子；
（ｂ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｅ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｆ）配列番号１４のｌｙｓＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｇ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
を含む、単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項３０】  ｐＤ２−ＫＤＡＢＨＬを含む、請求項２９に記載の単離されたポリヌクレオチド分子。
【請求項３１】  Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種の宿主細胞を形質転換するための方法であって、
（ａ）Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ種の宿主細胞を、配列番号２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチド分子で形質転換する工程；および
（ｂ）形質転換された宿主細胞を選択する工程、
を包含する、方法。
【請求項３２】  請求項３１に記載の方法であって、
前記形質転換されたポリヌクレオチド分子についてスクリーニングする工程；
をさらに包含する、方法。
【請求項３３】  請求項３１に記載の方法であって、
（ａ）前記形質転換された宿主細胞を培地中で増殖させる工程；および
（ｂ）該形質転換された宿主細胞によって産生されるアミノ酸を精製する工程、
をさらに包含する、方法。
【請求項３４】  請求項３１に記載の方法であって、前記ヌクレオチド配列が前記宿主細胞の染色体中に組み込まれる、方法。
【請求項３５】  請求項３１に記載の方法であって、前記宿主細胞が、
（ａ）アスパラギン酸−セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ活性；
（ｂ）ジヒドロジピコリン酸シンターゼ活性；
（ｃ）ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ活性；
（ｄ）ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ活性；および
（ｅ）ジアミノピメレート脱炭酸酵素活性；
のうちの少なくとも１つを保有する、方法。
【請求項３６】  請求項３５に記載の方法であって、
前記活性についてスクリーニングする工程；
をさらに包含する、方法。
【請求項３７】  請求項３５に記載の方法であって、前記活性がアスパラギン酸−セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ活性である、方法。
【請求項３８】  請求項３７に記載の方法であって、前記アスパラギン酸−セミアルデヒドデヒドロゲナーゼ活性が、配列番号３のポリヌクレオチドによりコードされるａｓｄポリペプチドによって生成される、方法。
【請求項３９】  請求項３５に記載の方法であって、前記活性がジヒドロジピコリン酸シンターゼ活性である、方法。
【請求項４０】  請求項３９に記載の方法であって、前記ジヒドロジピコリン酸シンターゼ活性が、配列番号５のポリヌクレオチドによりコードされるｄａｐＡポリペプチドによって生成される、方法。
【請求項４１】  請求項３５に記載の方法であって、前記活性がジヒドロジピコリン酸レダクターゼ活性である、方法。
【請求項４２】  請求項４１に記載の方法であって、前記ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ活性が、配列番号７のポリヌクレオチドによりコードされるｄａｐＢポリペプチドによって生成される、方法。
【請求項４３】  請求項３５に記載の方法であって、前記活性がジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ活性である、方法。
【請求項４４】  請求項４３に記載の方法であって、前記ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ活性が、配列番号９のポリヌクレオチドによりコードされるｄｄｈポリペプチドによって生成される、方法。
【請求項４５】  請求項３５に記載の方法であって、前記活性がジアミノピメレート脱炭酸酵素活性である、方法。
【請求項４６】  請求項４５に記載の方法であって、前記ジアミノピメレート脱炭酸酵素活性が、配列番号２０のポリヌクレオチドによりコードされる’ｌｙｓＡポリペプチドによって生成される、方法。
【請求項４７】  請求項４５に記載の方法であって、前記ジアミノピメレート脱炭酸酵素活性が、配列番号１３のポリヌクレオチドによりコードされるｌｙｓＡポリペプチドによって生成される、方法。
【請求項４８】  請求項３１に記載の方法であって、前記単離されたポリヌクレオチド分子が、
（ａ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｂ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｅ）配列番号２１の’ｌｙｓＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｆ）配列番号１４のｌｙｓＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｇ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
からなる群より選択される少なくとも１つの核酸分子をさらに含む、方法。
【請求項４９】  請求項３１に記載の方法であって、前記単離されたポリヌクレオチド分子が、
（ａ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｂ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｄ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
をさらに含む、方法。
【請求項５０】  請求項３１に記載の方法であって、前記単離されたポリヌクレオチド分子が、
（ａ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｂ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｅ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
をさらに含む、方法。
【請求項５１】  請求項３１に記載の方法であって、前記単離されたポリヌクレオチド分子が、
（ａ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｂ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｅ）配列番号２１の’ｌｙｓＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｆ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
をさらに含む、方法。
【請求項５２】  請求項３１に記載の方法であって、前記単離されたポリヌクレオチド分子が、
（ａ）配列番号４のａｓｄアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｂ）配列番号６のｄａｐＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｃ）配列番号８のｄａｐＢアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｄ）配列番号１０のｄｄｈアミノ酸配列をコードする、核酸分子；
（ｅ）配列番号１４のｌｙｓＡアミノ酸配列をコードする、核酸分子；および
（ｆ）配列番号１６のＯＲＦ２アミノ酸配列をコードする、核酸分子；
をさらに含む、方法。