【手続補正書】
【提出日】平成20年6月16日(2008.6.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにする方法であって、前記個体のＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座、または、前記ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座と連鎖不平衡にある隣接遺伝子座における少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型のホモ接合形態またはヘテロ接合形態での存在または非存在を明らかにし、前記遺伝子型の前記存在により、個体における肝臓線維化の早い進行を発症させる増大した素因が示され、それにより、個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにすることを含む方法。
【請求項２】
前記個体はＣ型肝炎ウイルスに感染している請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座における前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は、配列番号１に示されるＣＹＰ２Ｄ６＊４ＳＮＰのアデノシンヌクレオチド含有対立遺伝子である請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は短縮型のＣＹＰ２Ｄ６ポリペプチドをコードする請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記遺伝子型の前記存在により、肝硬変を発症させる増大した素因がさらに示される請求項２に記載の方法。
【請求項６】
前記ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座と連鎖不平衡にある前記隣接遺伝子座は、配列番号１０に示されるゲノム配列に含まれる請求項１に記載の方法。
【請求項７】
個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにするためのキットであって、前記個体のＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座、または、前記ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座と連鎖不平衡にある隣接遺伝子座における少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型のホモ接合形態またはヘテロ接合形態での存在または非存在を明らかにするための少なくとも１つの試薬と、前記少なくとも１つの試薬を包装する包装材と、前記包装材内または前記包装材上における通知とを含み、前記通知により、個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにすることにおける使用についてキットが特定されるキット。
【請求項８】
ＣＹＰ２Ｄ６遺伝子座における前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は、配列番号１に示されるＣＹＰ２Ｄ６＊４ＳＮＰのアデノシンヌクレオチド含有対立遺伝子である請求項７に記載のキット。
【請求項９】
前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は短縮型のＣＹＰ２Ｄ６ポリペプチドをコードする請求項７に記載のキット。
【請求項１０】
前記遺伝子型の前記存在により、前記個体における肝臓線維化の早い進行を発症させる増大した素因が示される請求項７に記載のキット。
【請求項１１】
前記少なくとも１つの試薬は、配列番号１に示されるＣＹＰ２Ｄ６＊４ＳＮＰの少なくとも１つの対立遺伝子と特異的にハイブリダイズすることができる少なくとも１つのオリゴヌクレオチドである請求項７に記載のキット。
【請求項１２】
前記少なくとも１つの試薬は、配列番号４に示されるＣＹＰ２Ｄ６タンパク質の少なくとも１つの多型体と示差的に結合することができる抗体である請求項７に記載のキット。
【請求項１３】
必要性のある個体において肝臓線維化の早い進行を防止するための、肝臓組織におけるＣＹＰ２Ｄ６の発現および／または活性をアップレギュレーションすることができる薬剤の使用。
【請求項１４】
前記個体はＣ型肝炎ウイルスに感染している請求項１３に記載の使用。
【請求項１５】
前記個体は、肝炎ウイルス感染、肝毒性、肝臓ガン、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、自己免疫疾患、代謝性肝臓疾患、および、肝臓の二次的関与による疾患からなる群から選択される疾患に罹患している請求項１３に記載の使用。
【請求項１６】
前記薬剤は、
（ａ）ＣＹＰ２Ｄ６の少なくとも機能的な部分をコードする外因性ポリヌクレオチド；
（ｂ）個体の肝臓細胞における内因性ＣＹＰ２Ｄ６の発現を増大させる薬剤；
（ｃ）個体の肝臓細胞における内因性ＣＹＰ２Ｄ６の活性を増大させる薬剤；および
（ｄ）ＣＹＰ２Ｄ６発現細胞
からなる群から選択される請求項１３に記載の使用。
【請求項１７】
前記ＣＹＰ２Ｄ６は、初期設定済みパラメーターを使用するＮａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｏｆ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ）のＢｌａｓｔＰソフトウエアを使用して決定されたとき、配列番号４によって示されるポリペプチドに対して少なくとも７５％同一であるポリペプチドである請求項１６に記載の使用。
【請求項１８】
前記ＣＹＰ２Ｄ６は配列番号４によって示される請求項１６に記載の使用。
【請求項１９】
前記ポリヌクレオチドは配列番号５によって示される請求項１６に記載の使用。
【請求項２０】
薬物分子が個体において肝臓線維化の早い進行の発達を誘導または促進することができるかどうかを明らかにする方法であって、ＣＹＰ２Ｄ６および前記ＣＹＰ２Ｄ６の不良な代謝酵素変化体によるこの薬物分子の代謝率を比較することを含み、前記ＣＹＰ２Ｄ６ではなく、前記ＣＹＰ２Ｄ６の不良な代謝酵素変化体による前記薬物分子の不良な代謝により、前記薬物分子はこの個体における肝臓線維化の早い進行の発達を誘導または促進することができることが示される方法。
【請求項２１】
前記個体はＣ型肝炎ウイルスに感染している請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記個体は、肝炎ウイルス感染、肝毒性、肝臓ガン、非アルコール性脂肪肝疾患（ＮＡＦＬＤ）、自己免疫疾患、代謝性肝臓疾患、および、肝臓の二次的関与による疾患からなる群から選択される疾患に罹患している請求項２０に記載の方法。
【請求項２３】
前記ＣＹＰ２Ｄ６の前記不良な代謝酵素変化体は、ＣＹＰ２Ｄ６＊４、ＣＹＰ２Ｄ６＊３およびＣＹＰ２Ｄ６＊５からなる群から選択される請求項２０に記載の方法。
【請求項２４】
前記ＣＹＰ２Ｄ６は配列番号４によって示される請求項２０に記載の方法。
【請求項２５】
前記ＣＹＰ２Ｄ６は、配列番号５によって示されるポリヌクレオチドから発現される請求項２０に記載の方法。
【請求項２６】
前記ＣＹＰ２Ｄ６の前記不良な代謝酵素変化体は、短縮型のＣＹＰ２Ｄ６ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドから発現される請求項２０に記載の方法。
【請求項２７】
個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにする方法であって、前記個体のＣＹＰ３Ａ５、ＣＹＰ２Ｅ１およびＡＰＯ  Ｅからなる群から選択される遺伝子座、または、前記遺伝子座と連鎖不平衡にある隣接遺伝子座における少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型のホモ接合形態またはヘテロ接合形態での存在または非存在を明らかにし、それにより、前記個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにすることを含む方法。
【請求項２８】
個体が肝臓線維化の早い進行に対する素因を有するかどうかを明らかにするためのキットであって、前記個体のＣＹＰ３Ａ５、ＣＹＰ２Ｅ１およびＡＰＯ  Ｅからなる群から選択される遺伝子座、または、前記遺伝子座と連鎖不平衡にある隣接遺伝子座における、少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型のホモ接合形態またはヘテロ接合形態での存在または非存在を明らかにするための少なくとも１つの試薬を含むキット。
【請求項２９】
前記ＣＹＰ３Ａ５遺伝子座における前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は、配列番号１８のヌクレオチド座標１７４におけるアデノシンヌクレオチド含有対立遺伝子である請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
前記ＣＹＰ２Ｅ１遺伝子座における前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は、配列番号１７のヌクレオチド座標１７７２におけるチミジンヌクレオチド含有対立遺伝子である請求項２７に記載の方法。
【請求項３１】
前記ＡＰＯ  Ｅ遺伝子座における前記少なくとも１つの早い進行の肝臓線維化関連遺伝子型は、配列番号１９のヌクレオチド座標５５におけるシトシンヌクレオチド含有対立遺伝子である請求項２７に記載の方法。