【手続補正書】
【提出日】平成20年5月14日(2008.5.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
タンパク質凝集またはコンフォメーションの疾患に関連するポリペプチドからのポリペプチドモチーフであって、ハイブリッドポリペプチド中にあって、該ポリペプチドの凝集形態または該ポリペプチドの疾患関連配座異性体に結合するのに十分な数の連続するアミノ酸残基を含むポリペプチドモチーフ;および、
該モチーフが由来するポリペプチド以外のポリペプチドからのさらなるアミノ酸を含む骨格
を含むハイブリッドポリペプチドであって、
該ポリペプチドモチーフが該骨格からのものでなく、
該ポリペプチドモチーフが該骨格に挿入されており、あるいは該足場に結合されており、
タンパク質凝集またはコンフォーメーションの疾患が、少なくとも２つの形態を有するタンパク質に関連するものであり、該少なくとも２つの形態のうちの１つがタンパク質凝集の疾患に関連する形態であり、
結果として得られるハイブリッドポリペプチドが、該ポリペプチドモチーフのソースである凝集形態のタンパク質に対して、ポリペプチドの良性形態と比較してより高いアフィニティーで結合する、ハイブリッドポリペプチド。
【請求項２】
多量体である請求項１のポリペプチド。
【請求項３】
さらなるアミノ酸が、モチーフ部分のＮ−末端に少なくとも約５アミノ酸およびＣ−末端に少なくとも約５アミノ酸含む、請求項１のポリペプチド。
【請求項４】
さらなるアミノ酸が、モチーフ部分のＮ−末端に少なくとも約１５アミノ酸およびＣ−末端に少なくとも約１５アミノ酸含む、請求項１のポリペプチド。
【請求項５】
二量体である、請求項１のポリペプチド。
【請求項６】
三量体である、請求項１のポリペプチド。
【請求項７】
ポリペプチドモチーフのソースである疾患関連形態のタンパク質または感染性配座異性体のタンパク質に、単量体または多量体単位として特異的に結合する請求項１のハイブリッドポリペプチド。
【請求項８】
ポリペプチドモチーフが骨格に挿入されている請求項１のハイブリッドポリペプチド。
【請求項９】
良性のアイソフォームと比較して少なくとも１０倍高いアフィニティーにてタンパク質の疾患関連アイソフォームに結合する、請求項１、請求項７または請求項８のハイブリッドポリペプチド。
【請求項１０】
良性のアイソフォームと比較して少なくとも１００倍高いアフィニティーにてタンパク質の疾患関連アイソフォームに結合する、請求項１または請求項８のハイブリッドポリペプチド。
【請求項１１】
疾患がアミロイド疾患からなる群から選択される、請求項１または請求項８のポリペプチド。
【請求項１２】
疾患が、クロイツフェルトヤコブ病、スクレイピーおよびウシ海綿状脳症、アルツハイマー病、ＩＩ型糖尿病、ハンチントン病、免疫グロブリンアミロイド症、慢性炎症性疾患を伴う反応性アミロイド症、変異体トランスサイレチン遺伝子の常染色体優性遺伝を伴う遺伝性全身性アミロイド症、ＡＬＳ、ピック病、パーキンソン病、前頭側頭骨痴呆、ＩＩ型糖尿病、多発性骨髄腫、形質細胞悪液質、家族性アミロイド神経障害、甲状腺髄様癌；慢性腎不全、うっ血性心不全、老人性心臓および全身性アミロイド症、慢性炎症、アテローム性動脈硬化症および家族性アミロイド症からなる群から選択される請求項１または請求項８のポリペプチド。
【請求項１３】
骨格がＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤまたはＩｇＥ免疫グロブリンからの定常領域を含む請求項７のポリペプチド。
【請求項１４】
骨格が、Ｆａｂ、およびＦ（ａｂ）２または一本鎖Ｆｖである請求項７のポリペプチド。
【請求項１５】
骨格が免疫グロブリンである請求項７のポリペプチド。
【請求項１６】
ポリペプチドモチーフが、ＡＰＰ、Ａβ、α１−抗キモトリプシン、タウ（ｔａｕ）、非−Ａβ成分、プレセニリン１、プレセニリン２、ａｐｏＥ、スーパーオキシドジスムターゼ（ＳＯＤ）および神経フィラメント、ピック体、α−シヌクレイン、原繊維におけるタウ（ｔａｕ）、アミリン、ＩｇＧＬ−鎖、トランスサイレチン、プロカルシトニン、β２−ミクログロブリン、心房性ナトリウム利尿因子、血清アミロイドＡ、ＡｐｏＡＩ、ゲルソリン、ハンチントンタンパク質からなる群から選択されるポリペプチドの全部または一部を含む、請求項１−８、１４および１５のいずれかのポリペプチド。
【請求項１７】
疾患関連タンパク質がプリオンタンパク質である請求項１−８、１５および１６のいずれかのポリペプチド。
【請求項１８】
タンパク質が、ヒト、ハムスター、マウス、ラット、シカ、ヒツジ、ヤギ、オオジカ、クドゥ、ウマ、イヌ、ネコ、ラクダおよびブタからなる群から選択される動物からのプリオンである、請求項１７のポリペプチド。
【請求項１９】
疾患が遺伝的疾患であり、タンパク質がプリオンをコードするアレルの突然変異体形態によってコードされるプリオンである、請求項１８のポリペプチド。
【請求項２０】
骨格がポリペプチドモチーフを提示するのに十分な、抗体、酵素、色素生産性タンパク質、蛍光タンパク質およびそれらのフラグメントからなる群から選択されるタンパク質の全部または十分な部分であって、それによってモチーフの優先的または特異的結合が保持される請求項７または請求項８のポリペプチド。
【請求項２１】
骨格が酵素、抗体または蛍光または色素生産性ポリペプチドの全部または一部を含む請求項２０のポリペプチド。
【請求項２２】
骨格が抗体の全部または一部を含む請求項２０のポリペプチド。
【請求項２３】
ＰｒＰｃ形態のプリオンからの少なくとも１つのαヘリックスを含む残基を含む請求項１７のポリペプチド。
【請求項２４】
感染性形態のプリオンタンパク質（ＰｒＰ）に特異的に結合する、単離された実質的に純粋な請求項１のポリペプチド。
【請求項２５】
ポリペプチドが少なくとも１０８ｌ／ｍｏｌのアフィニティーにて結合する請求項２４のポリペプチド。
【請求項２６】
ポリペプチドモチーフが、そのネイティブな非感染性コンフォメーションに存在する、少なくとも５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００残基から全長のプリオンポリペプチドを含む請求項１、請求項７または請求項８のポリペプチド。
【請求項２７】
シリアンハムスタープリオンポリペプチドの残基８７−１６９に対応するＰｒＰの部分からの残基を含む請求項２４のポリペプチド。
【請求項２８】
プリオンポリペプチドの少なくとも残基１２１−１３１、１２１−１４１、１２１−１３６、１２１−１４４、１２１−１５８、８７−１１２、８７−１１８、８７−１３０、１２６−１５８、１３１−１５８、１３６−１５８または１４１−１５８を含む請求項２４のポリペプチド。
【請求項２９】
ポリペプチドのプリオン部分が実質的に残基１２１−１３１、１２１−１４１、１２１−１３６、１２１−１４４、１２１−１５８、８７−１１２、８７−１１８、８７−１３０、１２６−１５８、１３１−１５８、１３６−１５８、１４１−１５８からなる請求項２８のポリペプチド。
【請求項３０】
プリオンポリペプチドの少なくとも残基１３６−１５８、８９−１０５、８９−１１２または９５−１１２を含む請求項２４のポリペプチド。
【請求項３１】
ポリペプチドのプリオン部分が実質的にプリオンポリペプチドの残基１３６−１５８、８９−１０５、８９−１１２または９５−１１２からなる請求項２８のポリペプチド。
【請求項３２】
ＰｒＰｃ形態のプリオンからの少なくとも１つのαヘリックスを含む残基を含む請求項２４のポリペプチド。
【請求項３３】
抗体ｂ１２またはそのフラグメントを含み、プリオンの残基１２１−１５８またはその結合部分が配列番号４の残基１１９−１３１の代わりに挿入されている請求項１、請求項７または請求項８のポリペプチド。
【請求項３４】
抗体ｂ１２またはそのフラグメントを含み、プリオンの残基８７−１１２またはその結合部分が配列番号４の残基１１９−１３１の代わりに挿入されている請求項１、請求項７または請求項８のポリペプチド。
【請求項３５】
抗体ｂ１２の重鎖および軽鎖を含み、重鎖が配列番号４のアミノ酸配列を含み、軽鎖が配列番号２のアミノ酸配列を含む請求項３３のポリペプチド。
【請求項３６】
プリオンポリペプチドの残基１１９−１５８の領域からの少なくとも５、１０、１５、２０、２５、３０、３５の連続する残基を含む請求項９のポリペプチドであって：
該領域からの残基がポリペプチドにおけるプリオン由来の残基のみであり、
残基がプリオン配列とシリアンハムスタープリオン配列とのアラインメントにより、配列番号５に示すシリアンハムスターの残基１１９−１５８に対応するポリペプチド。
【請求項３７】
プリオンがヒト、ハムスター、マウス、ラット、シカ、ヒツジ、ヤギ、オオジカ、クドゥ、ウマ、イヌ、ネコ、ラクダおよびブタからなる群から選択される動物プリオンである請求項１または請求項３６のポリペプチド。
【請求項３８】
免疫グロブリンポリペプチドである請求項１のハイブリッドポリペプチドであって、ポリペプチドモチーフが免疫グロブリン分子の第３相補性決定領域（ＣＤＲ）に挿入されているハイブリッドポリペプチド。
【請求項３９】
タンパク質凝集の疾患に関連するポリペプチドからの少なくとも１０、１５、２０、２５、３０、３５、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００またはそれ以上の連続するアミノ酸残基を含む請求項３８のポリペプチド。
【請求項４０】
疾患がアミロイド疾患からなる群から選択される請求項３８のポリペプチド。
【請求項４１】
タンパク質凝集の疾患に関連するポリペプチドがプリオンである請求項３８のポリペプチド。
【請求項４２】
疾患が、クロイツフェルトヤコブ病、スクレイピーおよびウシ海綿状脳症、アルツハイマー病、ＩＩ型糖尿病、ハンチントン病、免疫グロブリンアミロイド症、慢性炎症性疾患を伴う反応性アミロイド症、変異体トランスサイレチン遺伝子の常染色体優性遺伝を伴う遺伝性全身性アミロイド症、ＡＬＳ、ピック病、パーキンソン病、前頭側頭骨痴呆、ＩＩ型糖尿病、多発性骨髄腫、形質細胞悪液質、家族性アミロイド神経障害、甲状腺髄様癌；慢性腎不全、うっ血性心不全、老人性心臓および全身性アミロイド症、慢性炎症、アテローム性動脈硬化症および家族性アミロイド症からなる群から選択される請求項３９のポリペプチド。
【請求項４３】
ポリペプチドモチーフが、ＡＰＰ、Ａβ、α１−抗キモトリプシン、タウ（ｔａｕ）、非−Ａβ成分、プレセニリン１、プレセニリン２、ａｐｏＥ、スーパーオキシドジスムターゼ（ＳＯＤ）および神経フィラメント、ピック体、α−シヌクレイン、原繊維におけるタウ（ｔａｕ）、アミリン、ＩｇＧＬ−鎖、トランスサイレチン、プロカルシトニン、β２−ミクログロブリン、心房性ナトリウム利尿因子、血清アミロイドＡ、ＡｐｏＡＩ、ゲルソリン、ハンチントンタンパク質からなる群から選択されるポリペプチドの全部または一部を含む請求項３８のポリペプチド。
【請求項４４】
良性のアイソフォームと比較してタンパク質の疾患関連アイソフォームに対して少なくとも１０倍高いアフィニティーにて結合する請求項３８のポリペプチド。
【請求項４５】
良性のアイソフォームと比較してタンパク質の疾患関連アイソフォームに対して少なくとも１００倍高いアフィニティーにて結合する請求項３８のポリペプチド。
【請求項４６】
モチーフがプリオンポリペプチド由来であって、プリオンがヒト、ハムスター、マウス、ラット、シカ、ヒツジ、ヤギ、オオジカ、クドゥ、ウマ、イヌ、ネコ、ラクダおよびブタからなる群から選択される動物プリオンである請求項３８のポリペプチド。
【請求項４７】
請求項１、請求項７、請求項８および請求項３８のいずれかのポリペプチドをコードする核酸分子。
【請求項４８】
請求項４７の核酸分子を含むベクター。
【請求項４９】
発現ベクターである請求項４８のベクター。
【請求項５０】
真核ベクターである請求項４８のベクター。
【請求項５１】
作動可能にリンクしたヌクレオチド配列にコードされるポリペプチドの分泌を促すヌクレオチド配列を含む請求項４８のベクター。
【請求項５２】
哺乳類ベクター、酵母ベクターまたは細菌ベクターである請求項４８のベクター。
【請求項５３】
ウイルスベクター、ピチアベクターまたは大腸菌ベクターである請求項４８のベクター。
【請求項５４】
請求項４８のベクターを含む細胞。
【請求項５５】
原核細胞である請求項５４の細胞。
【請求項５６】
真核細胞である請求項５４の細胞。
【請求項５７】
細菌細胞、酵母細胞、植物細胞、昆虫細胞および動物細胞から選択される請求項５４の細胞。
【請求項５８】
哺乳類細胞である請求項５６の細胞。
【請求項５９】
以下の工程を含むタンパク質凝集の疾患に関連するアイソフォームのポリペプチドの検出方法:
該アイソフォームを含むと考えられるサンプルと請求項１、７、８および３８のいずれかのハイブリッドポリペプチドとを接触させる工程;および、
ポリペプチドの結合を検出し、それによって疾患に関連するアイソフォームのポリペプチドを検出する工程。
【請求項６０】
ハイブリッドポリペプチドが検出可能に標識されている請求項５９の方法。
【請求項６１】
以下の工程を含むＰｒＰＳｃ形態のプリオンポリペプチドの検出方法：
感染性アイソフォームのプリオンポリペプチドを含むと考えられるサンプルと、ＰｒＰｃ形態のプリオンポリペプチドまたはその部分を含み、感染性形態に結合する請求項２４のポリペプチドとを接触させる工程；および、
サンプル中のＰｒＰＳｃに対する結合を検出する工程。
【請求項６２】
サンプルが体液、組織または器官である請求項６１の方法。
【請求項６３】
感染性アイソフォームのプリオンポリペプチドを含むと考えられるサンプルと、ＰｒＰｃ形態のプリオンポリペプチドの全てまたは少なくとも約２０、２５、３０、３５、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００またはそれ以上の連続するアミノ酸残基から実質的になるポリペプチドとを接触させる請求項６１の方法。
【請求項６４】
プリオンがヒト、ハムスター、マウス、ラット、シカ、ヒツジ、ヤギ、オオジカ、クドゥ、ウマ、イヌ、ネコ、ラクダおよびブタからなる群から選択される動物プリオンである請求項６１の方法。
【請求項６５】
以下の工程を含むＰｒＰＳｃ形態のプリオンポリペプチドの検出方法：
プリオンポリペプチドを含むサンプルを請求項１、７、８および３８のいずれかのポリペプチドと接触させる工程、および、
サンプルにおけるＰｒＰＳｃへの結合を検出し、それによってＰｒＰＳｃの存在を検出する工程。
【請求項６６】
サンプルが体液、組織または器官である請求項６５の方法。
【請求項６７】
サンプルが、血液、尿、汗、唾液、脳脊髄液、精子サンプル、血清、血漿および滑液からなる群から選択される体液である請求項６６の方法。
【請求項６８】
体液が血液、尿、汗、唾液、脳脊髄液、精子サンプル、血清、血漿および滑液からなる群から選択される請求項６６の方法。
【請求項６９】
骨格が酵素、抗体または蛍光または色素生産性分子の全部または一部を含む請求項６５の方法。
【請求項７０】
以下の工程：
ネイティブなＰｒＰＳｃを含むと考えられるサンプルと、単量体または二量体としてネイティブなＰｒＰＳｃにインサイチュで特異的に結合する請求項１のハイブリッドポリペプチドとを接触させる工程；および、
その結果得られる複合体を検出する工程
を含むサンプル中のＰｒＰＳｃを検出する方法であって、該ハイブリッドポリペプチドがＰｒＰＳｃに特異的に結合するのに十分なＰｒＰの部分を含むものである、方法。
【請求項７１】
骨格が酵素、色素生産性タンパク質、蛍光タンパク質、抗体および抗体フラグメントからなる群から選択される請求項７０の方法。
【請求項７２】
ポリペプチドモチーフが少なくとも５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５または５０アミノ酸を含む請求項７１の方法。
【請求項７３】
ポリペプチドモチーフが骨格の１以上のアミノ酸の代わりに挿入されている請求項７１の方法。
【請求項７４】
請求項１、７、８および３８のいずれかのポリペプチドの複数を含む固体支持体。
【請求項７５】
以下の工程を含むタンパク質凝集の疾患に関連するタンパク質配座異性体を含む細胞の検出方法:
動物または組織からの細胞を請求項１、７または８のハイブリッドポリペプチドと接触させる工程、ここでハイブリッドポリペプチドは検出可能に標識されているか、検出可能な骨格を含む;および、
標識された細胞を検出する工程。
【請求項７６】
標識が蛍光標識である請求項７５の方法。
【請求項７７】
検出をフローサイトメトリーまたはスキャニングサイトメトリーによって行う請求項７６の方法。
【請求項７８】
細胞を複数の異なるハイブリッドポリペプチドと接触させる請求項７５の方法。
【請求項７９】
ハイブリッドポリペプチドが標的ポリペプチド上の異なるエピトープに結合する請求項７８の方法。
【請求項８０】
ハイブリッドポリペプチドが検出可能な骨格を含む請求項７５の方法。
【請求項８１】
検出可能な骨格が発光タンパク質またはその発光部分を含む請求項８０の方法。
【請求項８２】
発光タンパク質が蛍光タンパク質（ＦＰ）である請求項８１の方法。
【請求項８３】
ＦＰが異なる発光スペクトルを有する、緑色ＦＰ、赤色ＦＰ、青色ＦＰおよびそれらの変異体からなる群から選択される請求項８２の方法。
【請求項８４】
細胞がプリオン感染細胞である請求項７５の方法。
【請求項８５】
疾患がクロイツフェルトヤコブ病、スクレイピーおよびウシ海綿状脳症、アルツハイマー病、ＩＩ型糖尿病、ハンチントン病、免疫グロブリンアミロイド症、慢性炎症性疾患を伴う反応性アミロイド症、変異体トランスサイレチン遺伝子の常染色体優性遺伝を伴う遺伝性全身性アミロイド症、ＡＬＳ、ピック病、パーキンソン病、前頭側頭骨痴呆、ＩＩ型糖尿病、多発性骨髄腫、形質細胞悪液質、家族性アミロイド神経障害、甲状腺髄様癌；慢性腎不全、うっ血性心不全、老人性心臓および全身性アミロイド症、慢性炎症、アテローム性動脈硬化症および家族性アミロイド症からなる群から選択される請求項７５の方法。
【請求項８６】
以下の工程を含むタンパク質凝集またはコンフォメーションの疾患に関与するタンパク質の１つの配座異性体に特異的に相互作用する請求項１のハイブリッド分子の調製方法：
疾患関連配座異性体と良性形態の配座異性体との相互作用または凝集反応に関与する疾患関連配座異性体の部分を同定する工程；および、
同定された部分の全部または一部を骨格に挿入する工程、ここで、その結果得られるハイブリッド分子はタンパク質凝集またはコンフォメーションの疾患に関与するタンパク質の１つの配座異性体に対して良性の配座異性体に比べて高いアフィニティーで相互作用する方法。
【請求項８７】
以下の工程を含むＰｒＰＳｃ形態のプリオンポリペプチドの検出方法：
感染性アイソフォームのプリオンポリペプチドを含むと考えられるサンプルと、ＰｒＰｃ形態のプリオンポリペプチドまたはその部分を含み、感染性形態に結合するポリペプチドとを接触させる工程；および、
サンプル中のＰｒＰＳｃに対する結合を検出する工程。
【請求項８８】
サンプルが体液、組織または器官である請求項８７の方法。
【請求項８９】
感染性アイソフォームのプリオンポリペプチドを含むと考えられるサンプルと、ＰｒＰｃ形態のプリオンポリペプチドの全てまたは少なくとも約２０、２５、３０、３５、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００またはそれ以上の連続するアミノ酸残基から実質的になるポリペプチドとを接触させる請求項８７の方法。
【請求項９０】
プリオンがヒト、ハムスター、マウス、ラット、シカ、ヒツジ、ヤギ、オオジカ、クドゥ、ウマ、イヌ、ネコ、ラクダおよびブタからなる群から選択される動物プリオンである請求項８７の方法。
【請求項９１】
以下の工程を含むサンプル中の標的ポリペプチドのアイソフォームの検出方法：
ａ）標的ポリペプチドを含むと考えられるサンプルと、単量体または二量体としてそれに特異的に結合する試薬を接触させる工程：
ここで標的ポリペプチドはその凝集体を形成するコンフォメーションである；
試薬は骨格およびそれに挿入されたポリペプチドモチーフを含むハイブリッドポリペプチドである；
ポリペプチドモチーフは標的ポリペプチドに結合する；および、
ｂ）その結果得られる標的ポリペプチドと試薬との複合体を検出する工程。
【請求項９２】
サンプルが生物サンプルである請求項９１の方法。
【請求項９３】
サンプルが体液、組織または器官である請求項９２の方法。
【請求項９４】
サンプルが血液または血液由来組成物である請求項９２の方法。
【請求項９５】
サンプルが組織または器官あるいはそれら由来である請求項９１の方法。
【請求項９６】
サンプルが薬物またはその他の組織または器官から調製された生理活性分子あるいは食品である請求項９１の方法。
【請求項９７】
薬物または生理活性分子がホルモンまたは成長因子である請求項９６の方法。
【請求項９８】
標的ポリペプチドの存在がタンパク質凝集を伴う疾患を示す請求項９１の方法。
【請求項９９】
疾患がアミロイド疾患からなる群から選択される請求項９８の方法。
【請求項１００】
疾患がクロイツフェルトヤコブ病、スクレイピーおよびウシ海綿状脳症、アルツハイマー病、ＩＩ型糖尿病、ハンチントン病、免疫グロブリンアミロイド症、慢性炎症性疾患を伴う反応性アミロイド症、変異体トランスサイレチン遺伝子の常染色体優性遺伝を伴う遺伝性全身性アミロイド症、ＡＬＳ、ピック病、パーキンソン病、前頭側頭骨痴呆、ＩＩ型糖尿病、多発性骨髄腫、形質細胞悪液質、家族性アミロイド神経障害、甲状腺髄様癌；慢性腎不全、うっ血性心不全、老人性心臓および全身性アミロイド症、慢性炎症、アテローム性動脈硬化症および家族性アミロイド症からなる群から選択される請求項９８の方法。
【請求項１０１】
アッセイが同種アッセイである請求項９１の方法。
【請求項１０２】
試薬またはハイブリッドポリペプチドがさらに第２の結合部位を含み、方法が固体支持体上での試薬と標的ポリペプチドとの間に形成される複合体を捕捉して検出を行うものである、請求項１０１の方法。
【請求項１０３】
アッセイが異種アッセイである請求項１０１の方法。
【請求項１０４】
試薬またはハイブリッドポリペプチドが固体支持体に直接的または間接的に結合している請求項１０３の方法。
【請求項１０５】
以下の工程を含むサンプル中のＰｒＰＳｃを検出する方法：
ネイティブなＰｒＰＳｃを含むと考えられるサンプルと、単量体または二量体としてネイティブなＰｒＰＳｃにインサイチュで特異的に結合する試薬とを接触させる工程；および、
その結果得られる複合体を検出する工程。
【請求項１０６】
試薬がＰｒＰＳｃに特異的に結合するのに十分なＰｒＰの部分を含むハイブリッドポリペプチドである請求項１０５の方法。
【請求項１０７】
試薬が以下を含むハイブリッドポリペプチドを含む請求項１０６の方法:
骨格;および、
単量体または二量体単位として疾患関連形態のタンパク質に特異的に結合するポリペプチドモチーフ、
ここで、疾患がタンパク質凝集の疾患である方法。
【請求項１０８】
骨格が酵素、色素生産性タンパク質、蛍光タンパク質、抗体および抗体フラグメントからなる群から選択される請求項１０７の方法。
【請求項１０９】
ポリペプチドモチーフが少なくとも５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５または５０アミノ酸を含む請求項１０８の方法。
【請求項１１０】
ポリペプチドモチーフが骨格の１以上のアミノ酸の代わりに挿入されている請求項１０８の方法。
【請求項１１１】
以下の工程を含むタンパク質凝集またはコンフォメーションの疾患に関与するタンパク質の１つの配座異性体に特異的に相互作用するハイブリッド分子の調製方法：
疾患関連配座異性体と良性形態の配座異性体との相互作用または凝集反応に関与する疾患関連配座異性体の部分を同定する工程；および、
同定された部分の全部または一部を骨格に挿入する工程、ここで、その結果得られるハイブリッド分子はタンパク質凝集またはコンフォメーションの疾患に関与するタンパク質の１つの配座異性体に対して良性の配座異性体に比べて高いアフィニティーで相互作用する方法。
【請求項１１２】
体液が血液、尿、汗、唾液、脳脊髄液、精子サンプル、血清、血漿および滑液からなる群から選択される請求項８８の方法。
【請求項１１３】
感染性形態のプリオンタンパク質に特異的に結合する抗−イディオタイプ抗体。
【請求項１１４】
Ｆａｂ  Ｄ１３またはＦａｂ  Ｄ１８あるいは骨格に挿入された細胞のプリオンポリペプチドの複製インターフェイスからのモチーフを含むハイブリッドポリペプチドによって免疫することによって得られる請求項１１３の抗−イディオタイプ抗体。