【手続補正書】
【提出日】平成20年3月10日(2008.3.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】細胞増殖を低減させる能力について候補化合物をスクリーニングする方法であって、
（ａ）細胞において、遺伝子産物をコードする核酸の少なくとも一部に相補的な、ほとんど致死量に近いアンチセンス核酸を提供して、前記細胞における前記遺伝子産物の活性または量を低減させ、それにより感作細胞を作製し、ここで、前記遺伝子産物は、その活性または量が、配列番号１４６３のヌクレオチド配列を含むアンチセンス核酸によって低減される遺伝子産物であり、ただし、前記細胞は原核生物細胞であり、
（ｂ）前記感作細胞を化合物と接触させ、
（ｃ）非感作細胞に比べて、前記感作細胞の増殖を前記化合物が抑制する度合いを決定すること
を含む方法。
【請求項２】細胞増殖を低減させる能力について候補化合物をスクリーニングする方法であって、
（ａ）細胞において、遺伝子産物をコードする核酸の少なくとも一部に相補的な、ほとんど致死量に近いレベルのアンチセンス核酸を提供して、前記細胞における前記遺伝子産物の活性または量を低減させて、それにより感作細胞を生産し、ただし、前記細胞は原核生物細胞であり、
ここで、前記遺伝子産物は、
ｉ）配列番号１４６３のアンチセンス核酸により発現が抑制されるポリペプチドをコードする核酸に対して、デフォルトパラメータでＢＬＡＳＴＮバージョン２．０を用いて決定される場合に少なくとも７０％のヌクレオチド配列同一性を有する核酸によってコードされ、
ｉｉ）配列番号１４６３のアンチセンス核酸により発現が抑制されるポリペプチドに対して、デフォルトパラメータでＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも２５％のアミノ酸同一性を有し、
ｉｉｉ）配列番号１４６３のヌクレオチド配列を含む核酸に、ストリンジェントな条件下にてハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む核酸によりコードされ、
ｉｖ）配列番号１４６３のヌクレオチド配列を含む核酸に、穏やかな条件下にてハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む核酸によりコードされ、あるいは
ｖ）配列番号１４６３のヌクレオチド配列を含む核酸により活性が抑制される遺伝子産物により補完され得る活性を有する、
のいずれかであり、
（ｂ）前記感作細胞を化合物と接触させ、
（ｃ）前記化合物が、非感作細胞に比べて、前記感作細胞の成長を抑制する度合いを決定すること
を含む方法。
【請求項３】前記化合物が、非感作細胞に比べて前記感作細胞の増殖を抑制する度合いを決定することは、前記化合物が、前記非感作細胞の増殖を抑制する化合物よりも、大きい度合いで前記感作細胞の増殖を抑制することを決定することを含む、請求項２に記載の方法。
【請求項４】前記遺伝子産物がエシェリヒア・コリ以外の生物由来である、請求項２または３に記載の方法。
【請求項５】前記細胞がエシェリヒア・コリ以外の生物の細胞である、請求項２〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】前記感作細胞が病原性微生物である、請求項２〜５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】前記感作細胞がグラム陽性細菌である、請求項２〜６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】前記グラム陽性細菌が、スタフィロコッカススピーシーズ、ストレプトコッカススピーシーズ、エンテロコッカススピーシーズ、ミコバクテリウムスピーシーズ、クロストリジウムスピーシーズ、およびバチルススピーシーズからなる群から選ばれる、請求項７に記載の方法。
【請求項９】前記細菌は、スタフィロコッカス・オーレウスである、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】前記スタフィロコッカススピーシーズは、コアグラーゼ陰性である、請求項８に記載の方法。
【請求項１１】前記細菌は、スタフィロコッカス・オーレウスＲＮ４５０およびスタフィロコッカス・オーレウスＲＮ４２２０からなる群から選ばれる、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】前記アンチセンス核酸は、誘導性プロモーターから転写される、請求項２〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】前記細胞を、前記アンチセンス核酸の転写をほとんど致死量に近いレベルに誘導する濃度の誘導物質と接触させる工程をさらに含む、請求項２〜１２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】成長抑制は、培養成長溶液の吸光度をモニターすることにより測定される、請求項２〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】前記遺伝子産物は、ポリペプチドである、請求項２〜１４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１６】前記遺伝子産物は、配列番号１２６００に対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも９９％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、または、その活性が配列番号１２６００のポリペプチドにより補完され得るポリペプチドである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】前記遺伝子産物は、配列番号１２６００に対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも９５％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、または、その活性が配列番号１２６００のポリペプチドにより補完され得るポリペプチドである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１８】前記遺伝子産物は、配列番号１２６００に対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも９０％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、または、その活性が配列番号１２６００のポリペプチドにより補完され得るポリペプチドである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１９】前記遺伝子産物は、配列番号１２６００に対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも８５％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、または、その活性が配列番号１２６００のポリペプチドにより補完され得るポ
リペプチドである、請求項１５に記載の方法。
【請求項２０】前記遺伝子産物は、配列番号１２６００に対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも８０％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、または、その活性が配列番号１２６００のポリペプチドにより補完され得るポリペプチドである、請求項１５に記載の方法。
【請求項２１】前記遺伝子産物は、配列番号１２６００に対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも７０％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、または、その活性が配列番号１２６００のポリペプチドにより補完され得るポリペプチドである、請求項１５に記載の方法。
【請求項２２】前記ポリペプチドが配列番号１２６００である、請求項１５に記載の方法。
【請求項２３】前記ポリペプチドは、配列番号１２６００を有するポリペプチドに対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも３４％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、配列番号１２６００を有するポリペプチドに対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも３９％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、配列番号１２６００を有するポリペプチドに対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも４２％のアミノ酸同一性を有するポリペプチド、および配列番号１２６００を有するポリペプチドに対して、ＦＡＳＴＡバージョン３．０ｔ７８を用いて決定される場合に少なくとも４３％のアミノ酸同一性を有するポリペプチドからなる群より選ばれるポリペプチドを含む、請求項１５に記載の方法。