【手続補正書】
【提出日】令和1年7月3日(2019.7.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
胎座および／または子室から果実の果皮を横切って表皮に及ぶ黄色−赤色部分のＡｒｌｅｃｃｈｉｎｏ表現型を有する果実を生産するトマト栽培品種であって、前記表現型が、少なくとも１つのｒａｒｌ対立遺伝子に関連しており、前記ｒａｒｌ対立遺伝子が、前記対立遺伝子のイントロン内に挿入を含むフィトエン合成酵素１（Ｐｓｙ１）対立遺伝子であり、前記挿入が、Ｐｓｙ１の非機能的スプライスバリアントをもたらす、トマト栽培品種。
【請求項２】
黄色部分の細胞が、ｒａｒｌ対立遺伝子に関してホモ接合型である、請求項１に記載のトマト栽培品種。
【請求項３】
前記挿入が、トランスポゾン３’末端で配列番号１および配列番号２からなる群より選択される核酸配列と隣接しているトランスポゾンを含む、請求項１〜２のいずれか１項に記載のトマト栽培品種。
【請求項４】
前記トランスポゾンが、配列番号３に記載される核酸配列と少なくとも９０％相同の核酸配列を含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載のトマト栽培品種。
【請求項５】
前記Ｐｓｙ１対立遺伝子内の前記挿入が、配列番号４に記載される核酸配列と少なくとも９０％相同の核酸配列を含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載のトマト栽培品種。
【請求項６】
前記ｒａｒｌ対立遺伝子が、配列番号５に記載される核酸配列を含む、請求項４〜５のいずれか１項に記載のトマト栽培品種。
【請求項７】
前記トマト栽培品種が、前記ｒａｒｌ対立遺伝子に関してホモ接合型である少なくとも１つの果皮細胞と、少なくとも１つの野生型Ｐｓｙ１対立遺伝子またはトランスポゾン除去フットプリントを含む少なくとも１つのＰｓｙ１対立遺伝子を含む少なくとも１つの果皮細胞と、を含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載のトマト栽培品種。
【請求項８】
前記トランスポゾン除去フットプリントが、配列番号７に記載される核酸配列内に少なくとも１つのヌクレオチド欠失を含む、請求項７に記載のトマト栽培品種。
【請求項９】
前記栽培品種が、小さい「チェリー」果実を生産する、請求項１〜８のいずれか１項に記載のトマト栽培品種。
【請求項１０】
前記栽培品種が、そのゲノム内に、黄色果肉表現型をコードする追加のＰｓｙ１変異対立遺伝子をさらに含む、請求項１に記載のトマト栽培品種。
【請求項１１】
黄色部分の細胞が、１つのｒａｒｌ対立遺伝子と、前記黄色果肉表現型をコードする１つのＰｓｙ１変異対立遺伝子と、を含み、赤色部分が、野生型Ｐｓｙ１対立遺伝子、トランスポゾン除去フットプリントを含むＰｓｙ１対立遺伝子、またはその組み合わせを含む、請求項１０に記載のトマト栽培品種。
【請求項１２】
ｒａｒｌ対立遺伝子に関してホモ接合型であるトマト栽培品種であって、前記ｒａｒｌ対立遺伝子が、トランスポゾン３’末端で配列番号２に記載される核酸配列と隣接しているトランスポゾンの挿入を含むフィトエン合成酵素１（Ｐｓｙ１）対立遺伝子であり、前記トマト栽培品種が、全体的に黄色の果実を生産する、トマト栽培品種。
【請求項１３】
請求項１〜１０のいずれか１項に記載のトマト栽培品種の種子であって、前記種子から生長した植物が、胎座および／または子室から果実の果皮を横切って表皮に及ぶ黄色−赤色部分の表現型を有する果実を生産し、前記表現型が、少なくとも１つのｒａｒｌ対立遺伝子に関連しており、前記ｒａｒｌ対立遺伝子が、前記対立遺伝子のイントロン内に挿入を含むフィトエン合成酵素１（Ｐｓｙ１）対立遺伝子であり、前記挿入が、Ｐｓｙ１の非機能的スプライスバリアントをもたらす、種子。
【請求項１４】
請求項１〜１０のいずれか１項に記載のトマト栽培品種の植物部位であって、葉、花粉、胚、根、根端、葯、花、単離細胞、単離組織およびそれらの任意の部分からなる群から選択される、植物部位。
【請求項１５】
胎座および／または子室から果実の果皮を横切って表皮に及ぶ黄色−赤色部分の表現型を有するトマト果実であって、前記表現型が、前記果実を生産する栽培トマト植物における少なくとも１つのｒａｒｌ対立遺伝子に関連しており、前記ｒａｒｌ対立遺伝子が、前記対立遺伝子のイントロン内に挿入を含むフィトエン合成酵素１（Ｐｓｙ１）対立遺伝子であり、前記挿入が、Ｐｓｙ１の非機能的スプライスバリアントをもたらし、黄色部分の細胞が、ｒａｒｌ対立遺伝子に関してホモ接合型である、トマト果実。
【請求項１６】
胎座および／または子室から果実の果皮を横切って表皮に及ぶ黄色−赤色部分のＡｒｌｅｃｃｈｉｎｏ表現型を有する果実を生産するトマト栽培品種を作製するための方法であって、前記方法は、フィトエン合成酵素１のｒａｒｌ対立遺伝子を含む遺伝因子を、赤色果実を生産するトマト栽培品種またはその一部に導入することを含み、前記ｒａｒｌ対立遺伝子が、前記対立遺伝子のイントロン内に挿入を含み、前記挿入が、Ｐｓｙ１の非機能的スプライスバリアントをもたらす、方法。
【請求項１７】
前記赤色果実を生産するトマト栽培品種を、前記遺伝因子を含むドナートマト植物と交雑させて子孫栽培トマト植物を作製することによって、前記遺伝因子が導入される、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
（ａ）ｒａｒｌ対立遺伝子の存在について、各子孫栽培トマト植物またはその部分から得られた核酸試料を調べるステップ；
（ｂ）前記ｒａｒｌ対立遺伝子を含む子孫栽培トマト植物を選抜するステップ；および
（ｃ）ステップ（ｂ）で選抜した植物によって生産される果実を調べて、Ａｒｌｅｃｃｈｉｎｏ表現型を有する果実を生産する栽培トマト植物を選抜するステップ；
をさらに含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記遺伝因子が、前記赤色果実を生産するトマト栽培品種の複数の細胞を前記遺伝因子で形質転換することによって導入される、請求項１６に記載の方法。
【請求項２０】
（ａ）ｒａｒｌ対立遺伝子の存在について、各形質転換細胞から得られた核酸試料を調べること；
（ｂ）前記ｒａｒｌ対立遺伝子を含む複数の細胞を選抜すること；
（ｃ）複数の形質転換細胞を再生させて、前記ｒａｒｌ対立遺伝子を含む複数のトランスジェニック植物を得ること；および
（ｄ）前記トランスジェニック植物によって生産された果実を調べて、Ａｒｌｅｃｃｈｉｎｏ表現型を有する果実を生産する植物を選抜すること；
をさらに含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記ｒａｒｌ対立遺伝子の存在について核酸試料を調べることが、配列番号７に記載される核酸配列を含むｒａｒｌ対立遺伝子マーカー；配列番号３に記載される核酸配列を有するトランスポゾン配列；Ｐｓｙ１対立遺伝子内のトランスポゾン挿入の３’ゲノム接合部；およびＰｓｙ１対立遺伝子内のトランスポゾン挿入の５’ゲノム接合部、のうちの少なくとも１つを増幅することによって行われる、請求項１８および２０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２２】
胎座および／または子室から果実の果皮を横切って表皮に及ぶ黄色−赤色部分のＡｒｌｅｃｃｈｉｎｏ表現型を有する果実を生産するトマト栽培品種を生産するための方法であって、少なくとも１つのフィトエン合成酵素１対立遺伝子を挿入変異によって変異させることを含む、方法。
【請求項２３】
前記挿入が、非機能的Ｐｓｙ１対立遺伝子をもたらすイントロン内にある、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記挿入が、トランスポゾンの挿入である、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
配列番号５に記載される核酸配列を含む変異フィトエン合成酵素１をコードする単離ポリヌクレオチド。