【手続補正書】
【提出日】平成19年6月13日(2007.6.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】  単離されたポリペプチドであって、以下：
ａ）配列番号２によって提供されるアミノ酸配列；
ｂ）配列番号２によって提供されるアミノ酸配列の改変体であって、ここで、該選択された配列中の特定された任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に変更され、ただし、該配列中の１５％以下のアミノ酸残基が、そのように変更されている、改変体；
ｃ）配列番号２によって提供されるアミノ酸配列の成熟形態；
ｄ）配列番号２によって提供されるアミノ酸配列の成熟形態の改変体であって、ここで、該選択された配列の成熟形態中の任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に変更され、ただし、該配列の成熟形態中の１５％以下のアミノ酸残基が、そのように変更されている、改変体；および
ｅ）項（ａ）〜（ｄ）に記載されるアミノ酸配列のフラグメント
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、
単離されたポリペプチド。
【請求項２】  請求項１に記載のポリペプチドのフラグメント。
【請求項３】  前記ポリペプチドが、配列番号２の天然に存在する対立遺伝子改変体である、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項４】  前記改変体が、単一ヌクレオチド多型の翻訳物である、請求項３に記載のポリペプチド。
【請求項５】  請求項１に記載のポリペプチドであって、ここで、該ポリペプチドは改変体ポリペプチドであり、そしてここで、配列番号２に特定される１つ以上の任意のアミノ酸は、保存的置換を提供するように変更される、ポリペプチド。
【請求項６】  単離された核酸分子であって、以下：
ａ）配列番号２を含むポリペプチド；
ｂ）配列番号２の改変体であって、ここで、該選択された配列中の特定された任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に変更され、ただし、該配列中の１５％以下のアミノ酸残基が、そのように変更されている、改変体；
ｃ）配列番号２によって提供されるアミノ酸配列の成熟形態；
ｄ）配列番号２によって提供されるアミノ酸配列の成熟形態の改変体であって、ここで、該選択された配列の成熟形態中の任意のアミノ酸が異なるアミノ酸に変更され、ただし、該配列の成熟形態中の１５％以下のアミノ酸残基が、そのように変更されている、改変体；
ｅ）（ａ）〜（ｄ）に記載されるアミノ酸配列のフラグメント；および
ｆ）項（ａ）〜（ｅ）に記載される核酸分子のいずれか１つの相補鎖
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸配列を含む、
単離された核酸分子。
【請求項７】  請求項６に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子は、天然に存在する対立遺伝子核酸改変体のヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項８】  請求項６に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子は、天然に存在するポリペプチド改変体のポリペプチド配列を有する改変体ポリペプチドをコードする、核酸分子。
【請求項９】  請求項６に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子は、前記改変体ポリペプチドをコードする単一ヌクレオチド多型を含む、核酸分子。
【請求項１０】  請求項６に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子は、以下：
ａ）配列番号１によって提供されるヌクレオチド配列；
ｂ）ヌクレオチド配列であって、配列番号１によって提供されるヌクレオチド配列中の１つ以上のヌクレオチドが、該選択された配列によって提供されるヌクレオチドから異なるヌクレオチドに変更され、ただし２０％以下の該ヌクレオチドが、そのように変更されている、ヌクレオチド配列；
ｃ）（ａ）に記載される配列の核酸フラグメント；
ｄ）（ｂ）に記載される配列の核酸フラグメント；および
ｅ）該核酸分子のいずれか１つの相補鎖
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、
核酸分子。
【請求項１１】  請求項６に記載の核酸分子であって、ここで、該核酸分子は、前記選択されたヌクレオチド配列のコード配列中に特定される任意のヌクレオチドが、該選択された配列によって提供されるヌクレオチドから異なるヌクレオチドに変更され、ただし、該選択されたコード配列中の２０％以下のヌクレオチドが、そのように変更されるヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
【請求項１２】  ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドのフラグメントをコードする、単離された核酸分子。
【請求項１３】  前記ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドが、配列番号２の改変体である、請求項１２に記載の核酸分子。
【請求項１４】  前記ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドが、成熟ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドである、請求項１２に記載の核酸分子。
【請求項１５】  前記ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドが、配列番号２の成熟形態の改変体である、請求項１２に記載の核酸分子。
【請求項１６】  請求項６に記載の核酸分子を含む、ベクター。
【請求項１７】  請求項１６に記載のベクターを含む、細胞。
【請求項１８】  請求項１に記載のポリペプチドに免疫特異的に結合する、抗体。
【請求項１９】  前記抗体が、モノクローナル抗体である、請求項１８に記載の抗体。
【請求項２０】  前記抗体が、ヒト化抗体またはヒト抗体である、請求項１８に記載の抗体。
【請求項２１】  サンプル中の請求項１に記載のポリペプチドの存在または量を決定するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）該サンプルを提供する工程；
（ｂ）該サンプルを、該ポリペプチドに免疫特異的に結合する抗体と接触させる工程；および
（ｃ）該ポリペプチドに結合した抗体の存在または量を決定し、それによって、該サンプル中の該ポリペプチドの存在または量を決定する工程、
を包含する、
方法。
【請求項２２】  サンプル中の請求項６に記載の核酸分子の存在または量を決定するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）該サンプルを提供する工程；
（ｂ）該サンプルを、該核酸分子に結合するプローブと接触させる工程；および
（ｃ）該核酸分子に結合するプローブの存在または量を決定し、
それによって、該サンプル中の該核酸分子の存在または量を決定する工程、
を包含する、
方法。
【請求項２３】  請求項１に記載のポリペプチドに結合する因子を同定するための方法であって、該方法は、以下：
（ａ）該ポリペプチドを候補物質と接触させる工程；および
（ｂ）該候補物質が該ポリペプチドに結合するか否かを決定する工程；
を包含し、
ここで、結合する候補物質が該因子である、
方法。
【請求項２４】  前記候補物質が、約１５００Ｄａ以下の分子量を有する、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】  請求項１に記載のポリペプチドの活性を調節するための方法であって、該方法は、該ポリペプチドを、該ポリペプチドの活性を調節するのに十分な量で該ポリペプチドに結合する化合物と接触させる工程を包含する、方法。
【請求項２６】  病態の処置に使用するための有効な治療剤を同定するための方法であって、ここで、該病態は、請求項１に記載のポリペプチドの異常な発現、異常なプロセシングまたは異常な生理学的相互作用と関連し、該方法は、以下：
（ａ）該ポリペプチドを発現し、かつ該ポリペプチドに起因する特性または機能を有する細胞を提供する工程；
（ｂ）工程（ａ）で提供された該細胞を、試験薬剤と接触させる工程；および
（ｃ）該試験薬剤が、該ポリペプチドに起因する特性または機能を変更するか否かを決定する工程；
を包含し、
これによって、該試験薬剤の存在下で観察される該ポリペプチドの特性または機能の変更が、該試験薬剤は有効な治療剤であることを示す、
方法。
【請求項２７】  請求項２６に記載の方法であって、前記有効な治療剤をさらなる試験に供し、該治療剤を同定する工程をさらに包含する、方法。
【請求項２８】  請求項２６に記載の方法であって、前記候補物質が、抗体であるか、または約１５００Ｄａ以下の分子量を有する、方法。
【請求項２９】  前記特性または機能が、細胞成長または細胞増殖を含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項３０】  前記試験薬剤が、前記ポリペプチドに結合する、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】  請求項２６に記載の方法に従って同定された、治療剤。
【請求項３２】  請求項２７に記載の方法を用いて同定された、治療剤。
【請求項３３】  前記薬剤が、抗体であるか、または約１５００Ｄａ以下の分子量を有する、請求項３１に記載の治療剤。
【請求項３４】  請求項１に記載のポリペプチドと関連する障害の処置または予防のための組成物であって、ここで、該障害が、細胞または組織の不十分な増殖または無効な増殖によって特徴付けられ、該組成物は、該被験体における該ポリペプチド関連障害を処置または予防するのに十分な量で請求項１に記載のポリペプチドを含み、ここで、該組成物は該被験体に投与するのに適しており、該被験体は、該障害の傾向があるかまたは該障害を患っていると考えられている、組成物。
【請求項３５】  前記被験体がヒトである、請求項３４に記載の組成物。
【請求項３６】  請求項１に記載のタンパク質の異常な発現、異常なプロセシング、または異常な生理学的相互作用と関連する障害の処置または予防のための組成物であって、ここで、該障害が、細胞または組織の不十分な増殖または無効な増殖によって特徴付けられ、該組成物は、被験体における該障害を処置または予防するのに十分な量で請求項６に記載の核酸を投与する工程を包含し、ここで、該組成物は該被験体に投与するのに適しており、該被験体は、該障害の傾向があるかまたは該障害を患っていると考えられている、組成物。
【請求項３７】  前記被験体がヒトである、請求項３６に記載の組成物。
【請求項３８】  請求項１に記載のポリペプチドの異常な発現、異常なプロセシング、または異常な生理学的相互作用と関連する障害の処置または予防のための組成物であって、ここで、該障害が、細胞または組織の過形成または新形成によって特徴付けられ、該組成物は、被験体における該障害を処置または予防するのに十分な量で治療剤を含み、ここで、該組成物は該被験体に投与するのに適しており、該被験体は、該障害の傾向があるかまたは該障害を患っていると考えられている、組成物。
【請求項３９】  前記治療剤が請求項１８に記載の抗体である、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４０】  前記被験体がヒトである、請求項３８に記載の組成物。
【請求項４１】  請求項１に記載のポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
【請求項４２】  請求項６に記載の核酸分子および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
【請求項４３】  請求項１８に記載の抗体および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
【請求項４４】  請求項３１に記載の治療剤および薬学的に受容可能なキャリアを含む、薬学的組成物。
【請求項４５】  前記治療剤が、約１５００Ｄａ以下の分子量を有する、請求項４４に記載の薬学的組成物。
【請求項４６】  １つ以上の容器中に請求項４１に記載の薬学的組成物を含む、キット。
【請求項４７】  １つ以上の容器中に請求項４２に記載の薬学的組成物を含む、キット。
【請求項４８】  １つ以上の容器中に請求項４３に記載の薬学的組成物を含む、キット。
【請求項４９】  請求項１に記載のポリペプチドの異常な発現、異常なプロセシング、または異常な生理学的相互作用と関連する障害に対する潜伏期または素因のモジュレーターについてのスクリーニング方法であって、該方法は、以下：
ａ）該障害に対して高い危険性を有する試験動物を提供する工程であって、ここで、該試験動物は、請求項１に記載のポリペプチドを組換え発現する、工程；
ｂ）試験化合物を該試験動物に投与する工程；
ｃ）工程（ａ）の該化合物の投与後に該試験動物における該ポリペプチドの活性を測定する工程；および
ｄ）該試験動物における該タンパク質の活性を、該化合物が投与されていないコントロール動物における該ポリペプチドの活性と比較する工程；
を包含し、
ここで、該コントロール動物と比較した該試験動物における該ポリペプチドの活性の変化が、該試験化合物は該障害の潜伏期または素因のモジュレーターであることを示す、
方法。
【請求項５０】  請求項４９に記載の方法であって、ここで、前記試験動物は、試験タンパク質導入遺伝子を発現するか、または野生型の試験動物と比較して増加したレベルでプロモーターの制御下において該導入遺伝子を発現する組換え試験動物であり、そしてここで、該プロモーターは、該導入遺伝子のネイティブな遺伝子プロモーターではない、方法。
【請求項５１】  第１の哺乳動物被験体において変更されたレベルの請求項１に記載のポリペプチドと関連する疾患の存在または素因を決定するための方法であって、該方法は、以下：
ａ）該第１の哺乳動物被験体由来のサンプル中の該ポリペプチドの発現レベルを測定する工程；および
ｂ）工程（ａ）のサンプル中の該ポリペプチドの量を、該疾患を有していないかまたは該疾患を受けにくいことが既知の第２の哺乳動物被験体由来のコントロールサンプルに存在する該ポリペプチドの量と比較する工程、
を包含し、
ここで、該コントロールサンプルと比較した場合の該第１の被験体中の該ポリペプチドの発現レベルの変化が、該疾患の存在または素因を示す、
方法。
【請求項５２】  第１の哺乳動物被験体において変更されたレベルの請求項６に記載の核酸分子と関連する疾患の存在または素因を決定するための方法であって、該方法は、以下：
ａ）該第１の哺乳動物被験体由来のサンプル中の該核酸の量を測定する工程；および
ｂ）工程（ａ）のサンプル中の該核酸の量を、該疾患を有していないかまたは該疾患を受けにくいことが既知の第２の哺乳動物被験体由来のコントロールサンプルに存在する該核酸の量と比較する工程；
を包含し、
ここで、該コントロールサンプルと比較した場合の該第１の被験体中の該核酸のレベルの変化が、該疾患の存在または素因を示す、
方法。
【請求項５３】  哺乳動物における病態の処置のための組成物であって、ここで、該病態は、請求項１に記載のポリペプチドの異常な発現、異常なプロセシング、または異常な生理学的相互作用と関連し、該組成物は、該病態を緩和するのに十分な量でポリペプチドを含み、ここで、該組成物は、該哺乳動物に投与するのに適しており、該ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチドに少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチドであるか、またはその生物学的に活性なフラグメントである、組成物。
【請求項５４】  哺乳動物における病態の処置のための組成物であって、ここで、該病態は、ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドの異常な発現、異常なプロセシング、または異常な生理学的相互作用に関連し、該組成物は、該病態を緩和するのに十分な量で請求項１８に記載の抗体を含み、該組成物は、該哺乳動物に投与するのに適している、組成物。
【請求項５５】  被験体において細胞増殖を促進するための組成物であって、該組成物は、細胞増殖を促進するに有効な量で請求項１に記載のポリペプチドを含む、組成物。
【請求項５６】  前記被験体がヒトである、請求項５５に記載の組成物。
【請求項５７】  請求項５５に記載の組成物であって、増殖が促進される前記細胞が、創傷の近傍の細胞、脈管系の細胞、造血に関与する細胞、赤血球生成に関与する細胞、胃腸管の管壁細胞、および毛包の細胞からなる群より選択される、組成物。
【請求項５８】  被験体において細胞増殖を阻害するための組成物であって、ここで、該増殖は請求項１に記載のポリペプチドの発現に関連し、該組成物は、該被験体における細胞増殖を阻害するのに十分な量で存在する、組成物。
【請求項５９】  前記組成物が、ＦＧＦ−ＣＸポリペプチドの切断を阻害する、請求項５８に記載の組成物。
【請求項６０】  前記組成物が、抗ＦＧＦ−ＣＸ抗体またはＦＧＦ−ＣＸ治療剤を含む、請求項５８に記載の組成物。
【請求項６１】  前記被験体がヒトである、請求項５８に記載の組成物。
【請求項６２】  請求項５８に記載の組成物であって、ここで、増殖が阻害される前記細胞が、トランスフォーメーション細胞、過形成細胞、腫瘍細胞および新形成細胞からなる群より選択される、組成物。