【手続補正書】
【提出日】令和1年9月24日(2019.9.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０５０５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０５０５】
６．配列表
本明細書は配列表のコンピュータ可読形式（ＣＲＦ）コピーと共に出願されている。２０１６年９月２２日に作成されたサイズが５０，８７０バイトの１０６２４−２９４−２２８＿ＳＥＱＬＩＳＴ．ｔｘｔという名称のＣＲＦは、配列表の紙のコピーと同一であり、その全内容を参照により本明細書に援用する。
本件出願は、以下の構成の発明を提供する。
（構成１）
（ａ）配列番号８のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域及び配列番号１３のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む抗体によって認識されるヒトＰＤ−１のエピトープに結合するか；または
（ｂ）ヒトＰＤ−１への結合において、配列番号８のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域及び配列番号１３のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む抗体と競合する
抗体またはその抗原結合断片。
（構成２）
（ａ）表１に記載の抗体ＰＤ１ＡＢ−１、ＰＤ１ＡＢ−２、ＰＤ１ＡＢ−３、ＰＤ１ＡＢ−４、ＰＤ１ＡＢ−５、もしくはＰＤ１ＡＢ−６の任意の１つのＶＬ相補性決定領域１（ＣＤＲ１）、ＶＬ  ＣＤＲ２、及びＶＬ  ＣＤＲ３を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）；及び／または
（ｂ）表２に記載の抗体ＰＤ１ＡＢ−１、ＰＤ１ＡＢ−２、ＰＤ１ＡＢ−３、ＰＤ１ＡＢ−４、ＰＤ１ＡＢ−５、もしくはＰＤ１ＡＢ−６の任意の１つのＶＨ相補性決定領域１（ＣＤＲ１）、ＶＨ  ＣＤＲ２、及びＶＨ  ＣＤＲ３を含む重鎖可変領域（ＶＨ）
を含む、ＰＤ−１に結合する抗体またはその抗原結合断片。
（構成３）
（ａ）表３に記載の抗体ＰＤ１ＡＢ−１、ＰＤ１ＡＢ−２、ＰＤ１ＡＢ−３、ＰＤ１ＡＢ−４、ＰＤ１ＡＢ−５、もしくはＰＤ１ＡＢ−６の任意の１つのＶＬフレームワーク１（ＦＲ１）、ＶＬ  ＦＲ２、ＶＬ  ＦＲ３、及びＶＬ  ＦＲ４をさらに含む軽鎖可変領域（ＶＬ）；及び／または
（ｂ）表４に記載の抗体ＰＤ１ＡＢ−１、ＰＤ１ＡＢ−２、ＰＤ１ＡＢ−３、ＰＤ１ＡＢ−４、ＰＤ１ＡＢ−５、もしくはＰＤ１ＡＢ−６の任意の１つのＶＨフレームワーク１（ＦＲ１）、ＶＨ  ＦＲ２、ＶＨ  ＦＲ３、及びＶＨ  ＦＲ４をさらに含む重鎖可変領域（ＶＨ）
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４）
前記ＶＬ  ＣＤＲ１、ＶＬ  ＣＤＲ２、及びＶＬ  ＣＤＲ３がそれぞれ配列番号１、２、及び３のアミノ酸配列を含み、前記ＶＨ  ＣＤＲ１、ＶＨ  ＣＤＲ２、及びＶＨ  ＣＤＲ３がそれぞれ配列番号４、５、及び６のアミノ酸配列を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５）
前記ＶＬ  ＣＤＲ１、ＶＬ  ＣＤＲ２、及びＶＬ  ＣＤＲ３がそれぞれ配列番号７、２、及び３のアミノ酸配列を含み、前記ＶＨ  ＣＤＲ１、ＶＨ  ＣＤＲ２、及びＶＨ  ＣＤＲ３がそれぞれ配列番号４、５、及び６のアミノ酸配列を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６）
配列番号８のアミノ酸配列を含むＶＬを含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成７）
配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬを含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成８）
配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＬを含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成９）
配列番号１１のアミノ酸配列を含むＶＨを含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１０）
配列番号１２のアミノ酸配列を含むＶＨを含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１１）
配列番号１３のアミノ酸配列を含むＶＨを含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１２）
（ａ）配列番号８のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１１のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１３）
（ａ）配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１１のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１４）
（ａ）配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１１のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１５）
（ａ）配列番号８のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１２のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１６）
（ａ）配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１２のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１７）
（ａ）配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１２のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１８）
（ａ）配列番号８のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１３のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成１９）
（ａ）配列番号９のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１３のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２０）
（ａ）配列番号１０のアミノ酸配列を含むＶＬ；及び
（ｂ）配列番号１３のアミノ酸配列を含むＶＨ
を含む、構成２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２１）
ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域またはその変異体を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２２）
ヒトＩｇＧ１−Ｋ３２２Ａ  Ｆｃ領域を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２３）
ヒトＩｇＧ４  Ｆｃ領域またはその変異体を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２４）
ヒトＩｇＧ４Ｐ  Ｆｃ領域を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２５）
ヒトＩｇＧ４ＰＥ  Ｆｃ領域を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２６）
配列番号３６〜４０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖Ｆｃ領域を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２７）
配列番号４１のアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域をさらに含む、構成２６に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２８）
（ａ）配列番号４１のアミノ酸配列を含む軽鎖定常領域；及び
（ｂ）配列番号３６〜４０からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖Ｆｃ領域
を含む、構成１〜２０のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成２９）
配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３０）
配列番号３２のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３１）
（ａ）配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖；及び
（ｂ）配列番号３２のアミノ酸配列を含む重鎖
を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３２）
配列番号３３のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３３）
（ａ）配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖；及び
（ｂ）配列番号３３のアミノ酸配列を含む重鎖
を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３４）
配列番号３４のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３５）
（ａ）配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖；及び
（ｂ）配列番号３４のアミノ酸配列を含む重鎖
を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３６）
配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３７）
（ａ）配列番号３１のアミノ酸配列を含む軽鎖；及び
（ｂ）配列番号３５のアミノ酸配列を含む重鎖
を含む、構成１〜２８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３８）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中の残基１００〜１０９の少なくとも１つに結合する、構成１〜３７のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成３９）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中の残基１００〜１０５の少なくとも１つに結合する、構成３８に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４０）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＮ３３、Ｔ５１、Ｓ５７、Ｌ１００、Ｎ１０２、Ｇ１０３、Ｒ１０４、Ｄ１０５、Ｈ１０７、及びＳ１０９からなる群から選択される少なくとも１つの残基に結合する、構成１〜３７のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４１）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＮ３３に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４２）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＴ５１に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４３）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＳ５７に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４４）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＬ１００に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４５）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＮ１０２に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４６）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＧ１０３に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４７）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＲ１０４に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４８）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＤ１０５に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成４９）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＨ１０７に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５０）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＳ１０９に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５１）
ＰＤ−１に結合した場合、配列番号４２のアミノ酸配列中のＧ１０３及びＲ１０４に結合する、構成４０に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５２）
（ａ）Ｔ細胞活性を減衰させる；及び／または
（ｂ）Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現を下方調節する
構成１〜５１のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５３）
ヒトＰＤ−１及び／またはサルＰＤ−１に特異的に結合するが、げっ歯類ＰＤ−１には結合しない、構成１〜５２のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５４）
ＡＤＣＣ活性及び／またはＣＤＣ活性が減衰している、構成１〜５３のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５５）
Ｔ細胞活性の前記減衰がヒトＰＢＭＣまたは全血試料において生じる、構成５２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５６）
Ｔ細胞活性の前記減衰がサイトカイン産生の阻害によって測定される、構成５２または５５に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５７）
前記抗体またはその抗原結合断片によって阻害される前記サイトカインが、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−６、ＩＬ−１２、ＩＬ−１７、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＮＦ−α、及び／またはＩＦＮ−γを含む、構成５６に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５８）
Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現の前記下方調節が
（ａ）早ければ前記抗体またはその抗原結合断片での処理の４時間後にでも生じる；及び／または
（ｂ）サイトカイン阻害と同時に、もしくはそれに先行して生じる
構成５２に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成５９）
精製ヒトＰＤ−１への結合についてのＫＤが約１００ｐＭ〜約１０ｎＭであり、細胞表面上に発現されるヒトＰＤ−１及び細胞表面上に発現されるサルＰＤ−１への結合についてのＫＤが約１００ｐＭ〜約１０ｎＭである、構成５３に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６０）
Ｔ細胞活性を減衰させるＥＣ５０が、約１ｐＭ〜約１０ｐＭ、約１０ｐＭ〜約１００ｐＭ、約１００ｐＭ〜約１ｎＭ、約１ｎＭ〜約１０ｎＭ、または約１０ｎＭ〜約１００ｎＭである、構成５６に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６１）
Ｔ細胞活性の最大減衰率が、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％である、構成５６に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６２）
ＰＤ−１発現の最大下方調節率が、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％である、構成５２または５８に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６３）
前記抗体がモノクローナル抗体である、構成１〜６２のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６４）
前記抗体がヒト化抗体、ヒト抗体、またはキメラ抗体である、構成１〜６３のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６５）
前記ヒト化抗体が脱免疫化抗体または複合ヒト抗体である、構成６４に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６６）
Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、ｄｓＦｖ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、または抗体断片から形成された多重特異性抗体である、構成１〜６５のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６７）
作用物質に結合している、構成１〜６６のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
（構成６８）
前記作用物質が、放射性同位体、金属キレート剤、酵素、蛍光化合物、生物発光化合物、及び化学発光化合物からなる群から選択される、構成６７に記載の抗体またはその抗原結合断片
（構成６９）
構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片、及び医薬品として許容可能な担体を含む組成物。
（構成７０）
構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体のＶＨ、ＶＬ、またはＶＨ及びＶＬの両方をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド。
（構成７１）
構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体の重鎖、軽鎖、または重鎖及び軽鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド。
（構成７２）
プロモーターに作用可能に連結している、構成７０または７１に記載のポリヌクレオチド。
（構成７３）
構成７１または７２に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
（構成７４）
構成７１または７２に記載のポリヌクレオチドを含む細胞。
（構成７５）
構成７３に記載のベクターを含む細胞。
（構成７６）
構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片を産生する単離細胞。
（構成７７）
構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片を含むキット。
（構成７８）
ヒトＰＤ−１のエピトープに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片の作製方法であって、構成７４〜７６のいずれか１項に記載の細胞を培養して前記抗体またはその抗原結合断片を発現させることを含む前記方法。
（構成７９）
構成７０〜７２のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを発現させることを含む、ヒトＰＤ−１のエピトープに特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片の作製方法。
（構成８０）
Ｔ細胞の活性の減衰方法であって、前記Ｔ細胞を有効量の構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片と接触させることを含む前記方法。
（構成８１）
Ｔ細胞活性の最大減衰率が、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％である、構成８０に記載の方法。
（構成８２）
Ｔ細胞活性の前記減衰がサイトカイン産生の阻害によって測定される、構成８０または８１に記載の方法。
（構成８３）
前記サイトカインが、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−６、ＩＬ−１２、ＩＬ−１７、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＮＦ−α、ＩＦＮ−γ、またはこれらの任意の組合せである、構成８０〜８２のいずれか１項に記載の方法。
（構成８４）
サイトカイン産生の前記阻害が、前記Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現の下方調節と同時に生じるか、またはこれに続いて生じる、構成８０〜８３のいずれか１項に記載の方法。
（構成８５）
前記Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現の前記下方調節が、早ければ有効量の抗体またはその抗原結合断片との接触の４時間後にでも生じる、構成８４に記載の方法。
（構成８６）
Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現を下方調節する方法であって、前記Ｔ細胞を有効量の構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片と接触させることを含む前記方法。
（構成８７）
前記抗体またはその抗原結合断片によるＰＤ−１発現の最大下方調節率が、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％である、構成８６に記載の方法。
（構成８８）
前記Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現の前記下方調節が、早ければ前記抗体またはその抗原結合断片との接触の４時間後にでも生じる、構成８６または８７に記載の方法。
（構成８９）
前記Ｔ細胞の表面上のＰＤ−１発現の前記下方調節がサイトカイン阻害に先行する、構成８６〜８８のいずれか１項に記載の方法。
（構成９０）
前記サイトカインが、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−６、ＩＬ−１２、ＩＬ−１７、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＮＦ−α、ＩＦＮ−γ、またはこれらの任意の組合せである、構成８９に記載の方法。
（構成９１）
Ｔ細胞によるサイトカイン産生を阻害する方法であって、前記Ｔ細胞を有効量の構成１〜６８のいずれか１項に記載の抗体またはその抗原結合断片と接触させることを含む前記方法。
（構成９２）
前記サイトカインが、ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−６、ＩＬ−１２、ＩＬ−１７、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、ＧＭ−ＣＳＦ、ＴＮＦ−α、ＩＦＮ−γ、またはこれらの任意の組合せである、構成９１に記載の方法。
（構成９３）
前記サイトカインが、ＩＬ−２、ＩＬ−１７、ＩＦＮ−γ、またはこれらの任意の組合せである、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成９４）
前記サイトカインがＩＬ−２である、構成９３に記載の方法。
（構成９５）
前記サイトカインがＩＬ−１７である、構成９３に記載の方法。
（構成９６）
前記サイトカインがＩＦＮ−γである、構成９３に記載の方法。
（構成９７）
前記サイトカインがＩＬ−１である、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成９８）
前記サイトカインがＩＬ−６である、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成９９）
前記サイトカインがＩＬ−１２である、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成１００）
前記サイトカインがＩＬ−１７である、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成１０１）
前記サイトカインがＩＬ−２２である、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成１０２）
前記サイトカインがＩＬ−２３である、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成１０３）
前記サイトカインがＧＭ−ＣＳＦである、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。
（構成１０４）
前記サイトカインがＴＮＦαである、構成８２、８９または９１のいずれか１項に記載の方法。