【手続補正書】
【提出日】平成31年3月13日(2019.3.13)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生体分子を表面に取り付ける方法であって、以下の工程を含む、方法：
該表面に取り付けられた複数の取り付け基を備える表面を得る工程；
該取り付け基に、光活性化可能な結合体化化合物を取り付ける工程；
該表面を生体分子と接触させる工程；および
該表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、該電磁放射線が、該取り付けられた光活性化可能な結合体化化合物を活性化し、該取り付けられ、活性化された光活性化可能な結合体化化合物が該生体分子に結合し、それによって、該生体分子が該表面に取り付けられる、工程。
【請求項２】
光活性化可能な結合体化化合物が、NHSエステル、スルホ-NHSエステル、アミン、第一級アルコール、第二級アルコール、フェノール、チオール、アニリン、ヒドロキサム酸、第一級アミド、脂肪族アミン、およびスルホンアミドからなる群より選択される官能基を含む、請求項1記載の方法。
【請求項３】
光活性化可能な結合体化化合物がエステルを含む、請求項1記載の方法。
【請求項４】
光活性化可能な結合体化化合物がカルボン酸基を含む、請求項1記載の方法。
【請求項５】
カルボキシル基が活性化される、請求項4記載の方法。
【請求項６】
光活性化可能な結合体化化合物がN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、請求項1記載の方法。
【請求項７】
光活性化可能な結合体化化合物がアミン基を含む、請求項1記載の方法。
【請求項８】
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン、アリールアジド、およびベンゾフェノンからなる群より選択される光活性化可能な基を含む、請求項1記載の方法。
【請求項９】
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される光活性化された結合体化部分を含む、請求項1記載の方法。
【請求項１０】
光活性化可能な結合体化化合物が、エステルに取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、請求項1記載の方法。
【請求項１１】
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される部分に機能的に取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミドエステルを含む、請求項1記載の方法。
【請求項１２】
取り付け基がアミン基である、請求項1記載の方法。
【請求項１３】
取り付け基がカルボン酸基である、請求項1記載の方法。
【請求項１４】
カルボキシル基が、アミン基に結合するように活性化される、請求項13記載の方法。
【請求項１５】
生体分子がポリペプチドである、請求項1記載の方法。
【請求項１６】
ポリペプチドを表面に取り付ける方法であって、以下の工程を含む、方法：
該表面に取り付けられた複数の遊離アミン基を備える表面を得る工程；
該表面を、結合体化化合物を含む結合体化溶液と接触させることによって、該表面に結合体化化合物を取り付ける工程であって、該結合体化化合物が、活性化されたカルボン酸基を含み、該活性化されたカルボン酸基が、該表面に取り付けられた遊離アミン基に結合する、工程；
該表面をポリペプチドと接触させる工程；および
該表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、該電磁放射線が、該取り付けられた結合体化化合物を活性化し、該取り付けられ、活性化された結合体化化合物が該ポリペプチドに結合し、それによって、該ポリペプチドが該表面に取り付けられる、工程。
【請求項１７】
ポリペプチドを表面に取り付ける方法であって、以下の工程を含む、方法：
該表面に取り付けられた複数の遊離カルボン酸基を備える表面を得る工程；
該表面をカルボン酸活性化溶液と接触させ、それによって、アミン基との結合のために該カルボン酸基を活性化する工程；
該表面を、結合体化化合物を含む結合体化溶液と接触させることによって、該表面に結合体化化合物を取り付ける工程であって、該結合体化化合物がアミン基を含み、該アミン基が、該表面に取り付けられた活性化されたカルボン酸基に結合する、工程；
該表面をポリペプチドと接触させる工程；および
該表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、該電磁放射線が、該取り付けられた結合体化化合物を活性化し、該取り付けられ、活性化された結合体化化合物が該ポリペプチドに結合し、それによって、該ポリペプチドが該表面に取り付けられる、工程。
【請求項１８】
アレイ表面に複数の取り付け基を含むアレイであって、該複数の取り付け基のうち少なくとも1つが、光活性化可能な結合体化化合物に共有結合的に連結される、アレイ。
【請求項１９】
試料中の生体分子を検出する方法であって、以下の工程を含む、方法：
アレイ表面に複数の取り付け基を含むアレイを準備する工程であって、該複数の取り付け基が、光活性化可能な結合体化化合物に共有結合的に連結され、該光活性化可能な結合体化化合物が、該アレイの生体分子に取り付けられている、工程；
該アレイを試料と接触させる工程；および
該試料内にある生体分子と、該アレイの生体分子との結合事象を検出する工程。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００９】
本明細書において開示された方法はまた、表面に取り付けられた複数の遊離カルボン酸基を含む表面を得る工程；前記表面をカルボン酸活性化溶液と接触させ、それによって、アミン基との結合のために前記カルボン酸基活性化する工程；前記表面を、結合体化化合物を含む結合体化溶液と接触させることによって、前記表面に結合体化化合物を取り付ける工程であって、前記結合体化化合物がアミン基を含み、前記アミン基が、前記表面に取り付けられた活性化されたカルボン酸基に結合する、工程；前記表面をポリペプチドと接触させる工程；および前記表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、前記電磁放射線が、前記取り付けられた結合体化化合物を活性化し、前記取り付けられ、活性化された結合体化化合物が前記ポリペプチドに結合し、それによって、前記ポリペプチドが前記表面に取り付けられる、工程、を含む、ポリペプチドを表面に取り付ける工程も含む。
[本発明1001]
生体分子を表面に取り付ける方法であって、以下の工程を含む、方法：
該表面に取り付けられた複数の取り付け基を備える表面を得る工程；
該取り付け基に、光活性化可能な結合体化化合物を取り付ける工程；
該表面を生体分子と接触させる工程；および
該表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、該電磁放射線が、該取り付けられた光活性化可能な結合体化化合物を活性化し、該取り付けられ、活性化された光活性化可能な結合体化化合物が該生体分子に結合し、それによって、該生体分子が該表面に取り付けられる、工程。
[本発明1002]
光活性化可能な結合体化化合物が、NHSエステル、スルホ-NHSエステル、アミン、第一級アルコール、第二級アルコール、フェノール、チオール、アニリン、ヒドロキサム酸、第一級アミド、脂肪族アミン、およびスルホンアミドからなる群より選択される官能基を含む、本発明1001の方法。
[本発明1003]
光活性化可能な結合体化化合物がエステルを含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
光活性化可能な結合体化化合物がカルボン酸基を含む、本発明1001の方法。
[本発明1005]
カルボキシル基が活性化される、本発明1004の方法。
[本発明1006]
光活性化可能な結合体化化合物がN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、本発明1001の方法。
[本発明1007]
光活性化可能な結合体化化合物がアミン基を含む、本発明1001の方法。
[本発明1008]
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン、アリールアジド、およびベンゾフェノンからなる群より選択される光活性化可能な基を含む、本発明1001の方法。
[本発明1009]
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される光活性化された結合体化部分を含む、本発明1001の方法。
[本発明1010]
光活性化可能な結合体化化合物が、エステルに取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、本発明1001の方法。
[本発明1011]
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される部分に機能的に取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミドエステルを含む、本発明1001の方法。
[本発明1012]
取り付け基がアミン基である、本発明1001の方法。
[本発明1013]
取り付け基がカルボン酸基である、本発明1001の方法。
[本発明1014]
カルボキシル基が、アミン基に結合するように活性化される、本発明1013の方法。
[本発明1015]
生体分子がポリペプチドである、本発明1001の方法。
[本発明1016]
ポリペプチドがタンパク質である、本発明1015の方法。
[本発明1017]
生体分子が、低分子、タンパク質、炭水化物、オリゴマー、ペプチド、細胞溶解産物に由来する生体分子、抗体、プロテアーゼ、および酵素からなる群より選択される、本発明1001の方法。
[本発明1018]
電磁放射線の波長が248nmである、本発明1001の方法。
[本発明1019]
電磁放射線の波長が330〜370nmである、本発明1001の方法。
[本発明1020]
表面が多孔性であり、取り付け基が複数の方向に向けられている、本発明1001の方法。
[本発明1021]
表面が、支持体の平面層の位置が定められた場所に機能的にカップリングされたピラーの表面である、本発明1001の方法。
[本発明1022]
それぞれのピラーが、支持体の平面層から伸ばされた平らな上面を有する、本発明1021の方法。
[本発明1023]
支持体のそれぞれのピラーの上面と平面層との間の距離が1,000〜5,000オングストロームである、本発明1022の方法。
[本発明1024]
ピラーが、支持体上に存在する複数のピラーのうちの1つである、本発明1021の方法。
[本発明1025]
複数のピラーが10,000/cm2を超える密度で存在する、本発明1024の方法。
[本発明1026]
それぞれのピラーの中心が他の任意のピラーの中心から少なくとも2,000オングストローム離れている、本発明1024の方法。
[本発明1027]
それぞれのピラーの表面が平面層の上面と平行である、本発明1024の方法。
[本発明1028]
それぞれのピラーの表面が平面層の上面と実質的に平行である、本発明1024の方法。
[本発明1029]
それぞれのピラーの表面積が少なくとも1μm2である、本発明1021の方法。
[本発明1030]
それぞれのピラーの表面の表面積の総面積が10,000μm2未満である、本発明1021の方法。
[本発明1031]
それぞれのピラーが二酸化ケイ素または窒化ケイ素を含む、本発明1021の方法。
[本発明1032]
それぞれのピラーが少なくとも98〜99重量％の二酸化ケイ素である、本発明1021の方法。
[本発明1033]
位置が定められた場所がそれぞれ、複数の同一の生体分子を含む、本発明1021の方法。
[本発明1034]
位置が定められた場所がそれぞれ、他の位置が定められた場所とは異なる複数の同一の配列を含む、本発明1033の方法。
[本発明1035]
位置が定められた場所がそれぞれ、位置が区別できる場所である、本発明1021の方法。
[本発明1036]
生体分子が表面に共有結合的に取り付けられる、本発明1001の方法。
[本発明1037]
選択的に露光された表面における生体分子の取り付けの取り付け効率が、少なくとも90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、または99％である、本発明1001の方法。
[本発明1038]
アレイへの生体分子の取り付けの安定性が高い、本発明1001の方法。
[本発明1039]
表面の選択された場所に取り付けられた複数のユニークな生体分子を備える表面を生じるように任意で繰り返される、本発明1001の方法。
[本発明1040]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも2種類のユニークな生体分子を含む、本発明1001の方法。
[本発明1041]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも10種類のユニークな生体分子を含む、本発明1040の方法。
[本発明1042]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも100種類のユニークな生体分子を含む、本発明1041の方法。
[本発明1043]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも1,000種類のユニークな生体分子を含む、本発明1042の方法。
[本発明1044]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも10,000種類のユニークな生体分子を含む、本発明1043の方法。
[本発明1045]
ポリペプチドを表面に取り付ける方法であって、以下の工程を含む、方法：
該表面に取り付けられた複数の遊離アミン基を備える表面を得る工程；
該表面を、結合体化化合物を含む結合体化溶液と接触させることによって、該表面に結合体化化合物を取り付ける工程であって、該結合体化化合物が、活性化されたカルボン酸基を含み、該活性化されたカルボン酸基が、該表面に取り付けられた遊離アミン基に結合する、工程；
該表面をポリペプチドと接触させる工程；および
該表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、該電磁放射線が、該取り付けられた結合体化化合物を活性化し、該取り付けられ、活性化された結合体化化合物が該ポリペプチドに結合し、それによって、該ポリペプチドが該表面に取り付けられる、工程。
[本発明1046]
ポリペプチドを表面に取り付ける方法であって、以下の工程を含む、方法：
該表面に取り付けられた複数の遊離カルボン酸基を備える表面を得る工程；
該表面をカルボン酸活性化溶液と接触させ、それによって、アミン基との結合のために該カルボン酸基を活性化する工程；
該表面を、結合体化化合物を含む結合体化溶液と接触させることによって、該表面に結合体化化合物を取り付ける工程であって、該結合体化化合物がアミン基を含み、該アミン基が、該表面に取り付けられた活性化されたカルボン酸基に結合する、工程；
該表面をポリペプチドと接触させる工程；および
該表面を電磁放射線に選択的に露光する工程であって、該電磁放射線が、該取り付けられた結合体化化合物を活性化し、該取り付けられ、活性化された結合体化化合物が該ポリペプチドに結合し、それによって、該ポリペプチドが該表面に取り付けられる、工程。
[本発明1047]
結合体化化合物を表面に取り付けた後に、該表面を洗浄する工程をさらに含む、本発明1045または1046の方法。
[本発明1048]
表面に取り付けられたカルボン酸基を活性化した後に、該表面を洗浄する工程をさらに含む、本発明1046の方法。
[本発明1049]
活性化された結合体化化合物が、ペプチドバックボーン、側鎖、アミン基、カルボン酸基からなる群より選択されるポリペプチドの部位に結合する、本発明1045または1046の方法。
[本発明1050]
表面を結合体化溶液と接触させる工程が、該結合体化溶液を該表面上にスピンコーティングする工程を含む、本発明1045または1046の方法。
[本発明1051]
電磁放射線の波長が248nmである、本発明1045または1046の方法。
[本発明1052]
電磁放射線の波長が330〜370nmである、本発明1045または1046の方法。
[本発明1053]
結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される光活性化された結合体化部分を含む、本発明1045または1046の方法。
[本発明1054]
結合体化化合物が、エステルに取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、本発明1046の方法。
[本発明1055]
結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される部分に機能的に取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミドエステルを含む、本発明1046の方法。
[本発明1056]
結合体化溶液がポリマーを含む、本発明1045または1046の方法。
[本発明1057]
ポリマーがポリビニルピロリドンである、本発明1056の方法。
[本発明1058]
カルボン酸活性化溶液がカルボジイミドまたはN-ヒドロキシスクシンイミドを含む、本発明1046の方法。
[本発明1059]
カルボン酸活性化溶液が、1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド、N,N'-ジイソプロピルカルボジイミド、(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスファート、ブロモ(トリピロリジン-1-イル)ホスホニウムヘキサフルオロホスファート、O-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N',N'-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスファート、O-ベンゾトリアゾール-N,N,N',N'-テトラメチル-ウロニウム-ヘキサフルオロ-ホスファート、およびO-(ベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N',N'-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボラートからなる群より選択される化合物を含む、本発明1046の方法。
[本発明1060]
カルボン酸活性化溶液が、N,N-ジイソプロピルエチルアミン、1-ヒドロキシ-7-アザベンゾトリアゾール、およびヒドロキシベンゾトリアゾールからなる群より選択される化合物を含む、本発明1045または1046の方法。
[本発明1061]
ポリペプチドがタンパク質である、本発明1045または1046の方法。
[本発明1062]
選択的に露光された表面における生体分子の取り付けの取り付け効率が、少なくとも90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、または99％である、本発明1045または1046の方法。
[本発明1063]
アレイへの生体分子の取り付けの安定性が高い、本発明1045または1046の方法。
[本発明1064]
表面の選択された場所に取り付けられた複数のユニークな生体分子を備える表面を生じるように任意で繰り返される、本発明1045または1046の方法。
[本発明1065]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも2種類のユニークな生体分子を含む、本発明1045または1046の方法。
[本発明1066]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも10種類のユニークな生体分子を含む、本発明1065の方法。
[本発明1067]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも100種類のユニークな生体分子を含む、本発明1066の方法。
[本発明1068]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも1,000種類のユニークな生体分子を含む、本発明1067の方法。
[本発明1069]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも10,000種類のユニークな生体分子を含む、本発明1068の方法。
[本発明1070]
アレイ表面に複数の取り付け基を含むアレイであって、該複数の取り付け基のうち少なくとも1つが、光活性化可能な結合体化化合物に共有結合的に連結される、アレイ。
[本発明1071]
光活性化可能な結合体化化合物に取り付けられた生体分子を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1072]
生体分子がポリペプチドである、本発明1071のアレイ。
[本発明1073]
ポリペプチドがタンパク質である、本発明1072のアレイ。
[本発明1074]
生体分子が、低分子、タンパク質、炭水化物、オリゴマー、ペプチド、細胞溶解産物に由来する生体分子、抗体、プロテアーゼ、および酵素からなる群より選択される、本発明1071のアレイ。
[本発明1075]
1cm2あたり少なくとも100個、1,000個、10,000個、100,000個、1,000,000個、または10,000,000個の生体分子を含む、本発明1071のアレイ。
[本発明1076]
アレイの表面積が1μm2〜10mm2である、本発明1070のアレイ。
[本発明1077]
光活性化可能な結合体化化合物が、NHSエステル、スルホ-NHSエステル、アミン、第一級アルコール、第二級アルコール、フェノール、チオール、アニリン、ヒドロキサム酸、第一級アミド、脂肪族アミン、およびスルホンアミドからなる群より選択される官能基を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1078]
光活性化可能な結合体化化合物がエステルを含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1079]
光活性化可能な結合体化化合物がカルボン酸基を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1080]
カルボン酸基が活性化される、本発明1079のアレイ。
[本発明1081]
光活性化可能な結合体化化合物がN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1082]
光活性化可能な結合体化化合物がアミン基を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1083]
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン、アリールアジド、およびベンゾフェノンからなる群より選択される光活性化可能な基を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1084]
光活性化可能な結合体化化合物が、248nmの波長を含む電磁放射線によって活性化される、本発明1070のアレイ。
[本発明1085]
光活性化可能な結合体化化合物が、330〜360nmの波長を含む電磁放射線によって活性化される、本発明1070のアレイ。
[本発明1086]
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される光活性化された結合体化部分を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1087]
光活性化可能な結合体化化合物が、エステルに取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミド部分を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1088]
光活性化可能な結合体化化合物が、ジアジリン部分、アリールアジド部分、およびベンゾフェノン部分からなる群より選択される部分に機能的に取り付けられたN-ヒドロキシスクシンイミドエステルを含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1089]
表面が多孔性であり、取り付け基が複数の方向に向けられている、本発明1070のアレイ。
[本発明1090]
表面が、支持体の平面層の位置が定められた場所に機能的にカップリングされたピラーの表面である、本発明1070のアレイ。
[本発明1091]
それぞれのピラーが、支持体の平面層から伸ばされた平らな上面を有する、本発明1090のアレイ。
[本発明1092]
それぞれのピラーの上面と支持体の平面層との間の距離が1,000〜5,000オングストロームである、本発明1091のアレイ。
[本発明1093]
ピラーが、支持体上に存在する複数のピラーのうちの1つである、本発明1090のアレイ。
[本発明1094]
ピラーが10,000/cm2を超える密度で存在する、本発明1093のアレイ。
[本発明1095]
それぞれのピラーの中心が他の任意のピラーの中心から少なくとも2,000オングストローム離れている、本発明1093のアレイ。
[本発明1096]
それぞれのピラーの表面が平面層の上面と平行である、本発明1093のアレイ。
[本発明1097]
それぞれのピラーの表面が平面層の上面と実質的に平行である、本発明1093のアレイ。
[本発明1098]
それぞれのピラーの表面積が少なくとも1μm2である、本発明1090のアレイ。
[本発明1099]
それぞれのピラーの表面の表面積の総面積が10,000μm2未満である、本発明1090のアレイ。
[本発明1100]
それぞれのピラーが二酸化ケイ素または窒化ケイ素を含む、本発明1090のアレイ。
[本発明1101]
それぞれのピラーが少なくとも98〜99重量％の二酸化ケイ素である、本発明1090のアレイ。
[本発明1102]
位置が定められた場所がそれぞれ、複数の同一の生体分子を含む、本発明1090のアレイ。
[本発明1103]
位置が定められた場所がそれぞれ、他の位置が定められた場所とは異なる複数の同一の配列を含む、本発明1102のアレイ。
[本発明1104]
位置が定められた場所がそれぞれ、位置が区別できる場所である、本発明1090のアレイ。
[本発明1105]
1cm2あたり少なくとも100個、1,000個、10,000個、100,000個、1,000,000個、または10,000,000個のピラーを含む、本発明1090のアレイ。
[本発明1106]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも2種類のユニークな生体分子を含む、本発明1070のアレイ。
[本発明1107]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも10種類のユニークな生体分子を含む、本発明1106のアレイ。
[本発明1108]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも100種類のユニークな生体分子を含む、本発明1107のアレイ。
[本発明1109]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも1,000種類のユニークな生体分子を含む、本発明1108のアレイ。
[本発明1110]
表面が、該表面の選択された場所に取り付けられた少なくとも10,000種類のユニークな生体分子を含む、本発明1109のアレイ。
[本発明1111]
取り付け基がアミン基である、本発明1070のアレイ。
[本発明1112]
取り付け基がカルボン酸基である、本発明1070のアレイ。
[本発明1113]
カルボキシル基が、アミン基に結合するように活性化される、本発明1112のアレイ。
[本発明1114]
試料中の生体分子を検出する方法であって、以下の工程を含む、方法：
本発明1070〜1113のいずれかの支持体を準備する工程；
該支持体を該試料と接触させる工程；および
該試料内にある生体分子と、該支持体に取り付けられた生体分子との結合事象を検出する工程。