【手続補正書】
【提出日】平成31年3月20日(2019.3.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
関心対象の標的を精製するための方法であって、
(a)関心対象の標的を含む試料を、固体支持体にカップリングされたポリペプチド物質を含む組成物と接触させる工程であって、該ポリペプチド物質が、
(i)MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
(ii)MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:3)、
(iii)MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:4)、
(iv)MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:5)、
(v)MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
(vi)MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
(vii)MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
(viii)MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
(ix)MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、または
(x)MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)
を含むアミノ酸配列を有し、配列中、Xnが天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり、Z1およびZ2が約2〜約30個の天然アミノ酸または非天然アミノ酸を含み、任意で、Xnがシステインでもプロリンでもなく、
該ポリペプチドがSEQ ID NO:1とは異なるアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドが関心対象の標的に特異的に結合し、
該ポリペプチドと関心対象の標的との特異的結合が、SEQ ID NO:1のポリペプチドと関心対象の標的との結合より強く、
接触させる工程が、組成物と関心対象の標的との結合を可能にする条件下で行われ、
任意で、該ポリペプチド物質が、非共有性会合または共有結合を介して固体支持体にカップリングされており、該固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、工程；および
(b)該組成物に結合しなかった試料の一部を取り出す工程
を含み、
(c)任意で、関心対象の標的から該組成物を解離する工程と、関心対象の標的を回収する工程とをさらに含む、
方法。
【請求項２】
前記固体支持体がビーズを含み、前記組成物が、関心対象の標的を精製するためのアフィニティークロマトグラフィーにおける使用に適している、請求項1記載の方法。
【請求項３】
前記組成物から関心対象の標的を溶出することができる、請求項1または2記載の方法。
【請求項４】
ポリペプチドをコードする核酸分子が、細胞株に形質導入して細胞株に該ポリペプチドを発現させるために用いられる発現ベクターの中に入れられる、請求項1記載の方法。
【請求項５】
関心対象の標的を精製するための方法であって、
(a)関心対象の標的を含む試料を、固体支持体にカップリングされたウイルス様粒子を含む組成物と接触させる工程であって、該ウイルス様粒子が膜タンパク質としてポリペプチドを含み、該ポリペプチドが、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
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MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、および
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)
からなる群より選択されるアミノ酸配列を有し、配列中、Xnが天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり、Z1およびZ2が約2〜約30個の天然アミノ酸または非天然アミノ酸を含み、任意で、Xnがシステインでもプロリンでもなく、
該ポリペプチドがSEQ ID NO:1とは異なるアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドが関心対象の標的に特異的に結合し、
該ポリペプチドと関心対象の標的との特異的結合が、SEQ ID NO:1のポリペプチドと関心対象の標的との結合より強く、
接触させる工程が、組成物と関心対象の標的との結合を可能にする条件下で行われ、
任意で、該固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、工程；および
(b)該組成物に結合しなかった試料の一部を取り出す工程
を含み、
(c)任意で、該組成物に結合しなかった試料の一部を、該組成物のポリペプチドに対する抗体と接触させる工程をさらに含む、
方法。
【請求項６】
さらなる関心対象の標的を捕捉するために、前記組成物に結合しなかった試料の一部が前記組成物と再び接触される、請求項5記載の方法。
【請求項７】
関心対象の標的を含む試料から1種または複数種の汚染物質を除去するための方法であって、
(a)関心対象の標的を含む試料を、固体支持体にカップリングされたウイルス様粒子を含む組成物と接触させる工程であって、該ウイルス様粒子が膜タンパク質としてポリペプチドを含み、該ポリペプチドが、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:3)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:4)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:5)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、および
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)
からなる群より選択されるアミノ酸配列を有し、配列中、Xnが天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり、Z1およびZ2が約2〜約30個の天然アミノ酸または非天然アミノ酸を含み、任意で、Xnがシステインでもプロリンでもなく、
該ポリペプチドがSEQ ID NO:1とは異なるアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドが、関心対象の標的を含む試料から除去される1種または複数種の汚染物質に特異的に結合し、
該ポリペプチドと1種または複数種の汚染物質との特異的結合が、SEQ ID NO:1のポリペプチドと1種または複数種の汚染物質との結合より強く、
接触する工程が、組成物と1種または複数種の汚染物質との結合を可能にする条件下で行われ、
該固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含み、該ウイルス様粒子が、非共有性会合を介して該固体支持体にカップリングされている、工程；および
(b)該組成物に結合しなかった試料の一部を収集する工程
を含み、
(c)任意で、試料からさらなる汚染物質を除去するために、収集された試料の一部が該組成物と再び接触される工程をさらに含む、
方法。
【請求項８】
前記組成物のポリペプチドがペプチドタグをさらに含み、該ペプチドタグがヘキサヒスチンジン部分またはFLAGタグを含む、請求項1、5、または7記載の方法。
【請求項９】
ポリペプチド物質を含む、アフィニティー樹脂であって、
該ポリペプチド物質が、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:3)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:4)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:5)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、および
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)、およびその組み合わせ
からなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有し、配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/またはZ1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではない、
アフィニティー樹脂。
【請求項１０】
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有するか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、保存的置換を含むか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、非保存的置換を含むか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒接触性残基における置換を含むか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒非接触性残基における置換を含むか、または
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸欠失の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有する、
請求項9記載のアフィニティー樹脂。
【請求項１１】
アフィニティー樹脂を作製する方法であって、以下の工程を含む、方法:
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:3)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:4)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:5)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、および
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)、およびその組み合わせ
からなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有するポリペプチド物質を固体支持体に取り付ける工程であって、
配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/またはZ1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではなく、
任意で、該ポリペプチド物質が、非共有性会合または共有結合を介して固体支持体にカップリングされ、
任意で、該固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、工程。
【請求項１２】
ポリペプチド物質にカップリングされた固体支持体を含む、組成物であって、
該ポリペプチド物質が、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30EX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:3)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:4)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:5)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、および
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)、およびその組み合わせ
からなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有し、配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/またはZ1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではなく、
任意で、該固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、組成物。
【請求項１３】
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有するか
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、保存的置換を含むか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、非保存的置換を含むか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒接触性残基における置換を含むか、
該1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒非接触性残基における置換を含むか、
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸欠失の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有する、
請求項12記載の組成物。
【請求項１４】
検出可能な物質および/またはタグに結合体化されたポリペプチド物質を含む、組成物であって、
該ポリペプチド物質が、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:2)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:3)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAAFEKEIAAFESELQAYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:4)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALGGSEAELAAFX32X33EIX36AFX39X40ELX43AYKGKGNPEVEX55LRX58X59AAX62IRX65X66LQAYRHN (SEQ ID NO:5)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALGGSEAELAX30FEX33X34IAX37FEX40X41LQX44YKGKGNPEVEALX57X58EAX61AIX64X65ELX68AYRHN (SEQ ID NO:6)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALRKEAAAIRDELQAYRHN (SEQ ID NO:7)、
MGSWAEFKQRLAAIKTRLEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEALX52 X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:8)、
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAAFEKEIAAFESELQAYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:9)、
MGSWX5X6FKX9X10LAX13IKX16X17LEALZ1EAELAAFX30X31EIX34AFX37X38ELX41AYZ2NPEVEX50LRX53X54AAX57IRX60X61LQAYRHN (SEQ ID NO:10)、および
MGSWX5EFX8X9RLX12AIX15X16RLX19ALZ1EAELAX28FEX31X32IAX35FEX38X39LQX42YZ2NPEVEALX52X53EAX56AIX59X60ELX63AYRHN (SEQ ID NO:11)、およびその組み合わせ
からなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有し、配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/またはZ1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではなく、
任意で、該検出可能な物質が、色素原、蛍光色素、放射性核種を含み、任意で、該検出可能な物質が定量可能であり、
任意で、該タグが、ポリヒスチジルタグ、mycタグ、またはFLAGタグを含み、任意で、該タグが定量可能である、
任意で、該ポリペプチド物質が、共有結合によって、検出可能な物質またはタグに結合体化されている、
組成物。
【請求項１５】
ポリペプチド物質が、クロマトグラフィービーズ、樹脂、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースに結合体化されている、請求項14記載の組成物。
【請求項１６】
ポリペプチド物質が、融合タンパク質または多量体である、請求項1〜8および11のいずれか一項記載の方法、請求項9もしくは10記載のアフィニティー樹脂、または請求項12〜15のいずれか一項記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７３】
[本発明1001]
関心対象の標的を精製するための方法であって、以下の工程を含む、方法:
関心対象の標的を含む試料を、固体支持体に取り付けられた、ポリペプチド物質を含む組成物と接触させる工程であって、
該ポリペプチド物質が、
2018513212.tif 000001
を含むアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドがSEQ ID NO:1とは異なるアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドが関心対象の標的に特異的に結合し、
該ポリペプチドと関心対象の標的との特異的結合が、SEQ ID NO:1のポリペプチドと関心対象の標的との結合より強く、
接触させる工程が、組成物と関心対象の標的との結合を可能にする条件下で行われる、工程；および
組成物に結合しなかった試料の一部を取り出す工程。
[本発明1002]
関心対象の標的から前記組成物を解離する工程と、関心対象の標的を回収する工程とをさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1003]
固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
ポリペプチド物質が非共有性会合を介して固体支持体にカップリングされている、本発明1001の方法。
[本発明1005]
ポリペプチド物質が共有結合を介して固体支持体にカップリングされている、本発明1001の方法。
[本発明1006]
前記組成物のポリペプチド物質がペプチドタグをさらに含み、該ペプチドタグがヘキサヒスチジン部分またはFLAGタグを含む、本発明1001の方法。
[本発明1007]
前記組成物のポリペプチド物質がストレプトアビジン部分をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1008]
前記固体支持体がビーズを含み、前記組成物が、関心対象の標的を精製するためのアフィニティークロマトグラフィーにおける使用に適している、本発明1001の方法。
[本発明1009]
前記組成物から関心対象の標的を溶出することができる、本発明1001〜1008のいずれかの方法。
[本発明1010]
ポリペプチドをコードする核酸分子が、細胞株に形質導入して細胞株に該ポリペプチドを発現させるために用いられる発現ベクターの中に入れられる、本発明1001の方法。
[本発明1011]
関心対象の標的を精製するための方法であって、以下の工程を含む、方法:
関心対象の標的を含む試料を、固体支持体にカップリングされた、ウイルス様粒子を含む組成物と接触させる工程であって、
該ウイルス様粒子が膜タンパク質としてポリペプチドを発現し、該ポリペプチドが、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、および SEQ ID NO:6からなる群より選択されるアミノ酸配列を有し、
SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、およびSEQ ID NO:6のいずれにも、置換によってシステイン残基もプロリン残基も入れられておらず、
該ポリペプチドがSEQ ID NO:1とは異なるアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドが関心対象の標的に特異的に結合し、
該ポリペプチドと関心対象の標的との特異的結合が、SEQ ID NO:1のポリペプチドと関心対象の標的との結合より強く、
接触させる工程が、組成物と関心対象の標的との結合を可能にする条件下で行われる、工程；および
組成物に結合しなかった試料の一部を取り出す工程。
[本発明1012]
固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、本発明1011の方法。
[本発明1013]
前記組成物のポリペプチドがペプチドタグをさらに含み、該ペプチドタグがヘキサヒスチジン部分またはFLAGタグを含む、本発明1011の方法。
[本発明1014]
前記組成物に結合しなかった試料の一部が捨てられる、本発明1011の方法。
[本発明1015]
さらなる関心対象の標的を捕捉するために、前記組成物に結合しなかった試料の一部が前記組成物と再び接触される、本発明1011の方法。
[本発明1016]
前記組成物に結合しなかった試料の一部を、前記組成物のポリペプチドに対して作られた抗体と接触させる工程をさらに含み、
該抗体が、キメラ抗原受容体(CAR)と融合したポリペプチドを含む融合タンパク質を発現するように操作された哺乳動物細胞から放出された、ポリペプチドを発現する膜結合ウイルス様粒子(VLP)から作製され、該融合タンパク質が、生じたVLP上に発現され、
該抗体が、固体支持体から離れた残留ポリペプチドを検出するアッセイにおいて使用するのに適している、本発明1015の方法。
[本発明1017]
関心対象の標的を含む試料から1種または複数種の汚染物質を除去するための方法であって、以下の工程を含む、方法:
関心対象の標的を含む試料を、固体支持体にカップリングされたウイルス様粒子を含む組成物と接触させる工程であって、
該ウイルス様粒子が膜タンパク質としてポリペプチドを発現し、該ポリペプチドが、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、およびSEQ ID NO:6からなる群より選択されるアミノ酸配列を有し、
SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、およびSEQ ID NO:6のいずれにも、置換によってシステイン残基もプロリン残基も入れられておらず、
該ポリペプチドがSEQ ID NO:1とは異なるアミノ酸配列を有し、
該ポリペプチドが、関心対象の標的を含む試料から除去される1種または複数種の汚染物質に特異的に結合し、
該ポリペプチドと1種または複数種の汚染物質との特異的結合が、SEQ ID NO:1のポリペプチドと1種または複数種の汚染物質との結合より強く、
接触する工程が、組成物と1種または複数種の汚染物質との結合を可能にする条件下で行われる、工程；および
組成物に結合しなかった試料の一部を収集する工程。
[本発明1018]
前記組成物のポリペプチドがペプチドタグをさらに含み、該ペプチドタグがヘキサヒスチンジン部分またはFLAGタグを含む、本発明1017の方法。
[本発明1019]
固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含み、ウイルス様粒子が非共有性会合を介して固体支持体にカップリングされている、本発明1017の方法。
[本発明1020]
試料からさらなる汚染物質を除去するために、収集された試料の一部が前記組成物と再び接触される、本発明1017の方法。
[本発明1021]
2018513212.tif 000002
、およびその組み合わせからなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有するポリペプチド物質を含む、アフィニティー樹脂であって、
配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/または
配列中、Z1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではない、アフィニティー樹脂。
[本発明1022]
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有する、本発明1021のアフィニティー樹脂。
[本発明1023]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が保存的置換を含む、本発明1022のアフィニティー樹脂。
[本発明1024]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が非保存的置換を含む、本発明1022のアフィニティー樹脂。
[本発明1025]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒接触性残基における置換を含む、本発明1022〜1024のいずれかのアフィニティー樹脂。
[本発明1026]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒非接触性残基における置換を含む、本発明1022〜1024のいずれかのアフィニティー樹脂。
[本発明1027]
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸欠失の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有する、本発明1021のアフィニティー樹脂。
[本発明1028]
アフィニティー樹脂を作製する方法であって、以下の工程を含む、方法:
2018513212.tif 000003
、およびその組み合わせからなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有するポリペプチド物質を固体支持体に取り付ける工程であって、
配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/または
配列中、Z1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではない、工程。
[本発明1029]
ポリペプチド物質が共有結合によって固体支持体に取り付けられている、本発明1028の方法。
[本発明1030]
ポリペプチド物質が非共有性会合によって固体支持体に取り付けられている、本発明1028の方法。
[本発明1031]
固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、本発明1028〜1030のいずれかの方法。
[本発明1032]
2018513212.tif 000004
、およびその組み合わせからなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有するポリペプチド物質にカップリングされた固体支持体を含む、組成物であって、
配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/または
配列中、Z1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではない、組成物。
[本発明1033]
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有する、本発明1032の組成物。
[本発明1034]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が保存的置換を含む、本発明1033の組成物。
[本発明1035]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が非保存的置換を含む、本発明1033の組成物。
[本発明1036]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒接触性残基における置換を含む、本発明1033〜1035のいずれかの組成物。
[本発明1037]
1つまたは複数の残基におけるアミノ酸置換が、溶媒非接触性残基における置換を含む、本発明1033〜1035のいずれかの組成物。
[本発明1038]
ポリペプチド物質が、1つまたは複数の残基におけるアミノ酸欠失の分だけSEQ ID NO:1と異なるアミノ酸配列を有する、本発明1033の組成物。
[本発明1039]
固体支持体が、ビーズ、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースを含む、本発明1032〜1038のいずれかの組成物。
[本発明1040]
検出可能な物質および/またはタグに結合体化されたポリペプチド物質を含む、組成物であって、
該ポリペプチド物質が、
2018513212.tif 000005
、およびその組み合わせからなる群より選択される配列を含むアミノ酸配列を有し、
配列中、Xnが天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、それぞれのXnが、同じ、もしくは異なる天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、ならびに/または
配列中、Z1および/もしくはZ2が2〜30個の天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸であり、
該アミノ酸配列がSEQ ID NO:1ではない、組成物。
[本発明1041]
検出可能な物質が色素原を含む、本発明1040の組成物。
[本発明1042]
検出可能な物質が蛍光色素を含む、本発明1040の組成物。
[本発明1043]
検出可能な物質が放射性核種を含む、本発明1040の組成物。
[本発明1044]
検出可能な物質が定量可能である、本発明1040〜1043のいずれかの組成物。
[本発明1045]
ポリペプチド物質が、クロマトグラフィービーズ、樹脂、ガラススライド、チップ、ゼラチン、またはアガロースに結合体化されている、本発明1040〜1044のいずれかの組成物。
[本発明1046]
タグが、ポリヒスチジルタグ、mycタグ、またはFLAGタグを含む、本発明1040の組成物。
[本発明1047]
ポリペプチド物質が、共有結合によって、検出可能な物質またはタグに結合体化されている、本発明1040の組成物。
[本発明1048]
ポリペプチド物質が融合タンパク質である、本発明1040〜1047のいずれかの組成物。
[本発明1049]
ポリペプチド物質が多量体である、本発明1040〜1048のいずれかの組成物。
上記で要約され、下記でさらに詳細に説明される、ある特定の方法は、専門家が行った、ある特定の行為を示している。しかしながら、この方法は、別の人による行為の指示も含んでもよい。従って、「標的特異的結合ポリペプチド-CARを含むT細胞を投与する」のような行為は、「標的特異的結合ポリペプチド-CARを含むT細胞の投与を指示する」を含むことが理解されるはずである。