【手続補正書】
【提出日】平成31年2月21日(2019.2.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｎ末端からＣ末端に向かって、共有結合状態で、
ａ）特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインであって、該第一のメンバーが、Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチド中に天然には存在せずかつ特異的結合対の第二のメンバーに特異的に結合する、該細胞外ドメイン；
ｂ）Ｌｉｎ−１２  Ｎｏｔｃｈリピート、Ｓ２タンパク質分解切断部位、および、Ｓ３タンパク質分解切断部位を含む膜貫通ドメインを含む、Ｎｏｔｃｈ調節領域；及び
ｃ）該Ｎｏｔｃｈ調節領域に対して異種であり転写活性化因子または転写抑制因子を含む細胞内ドメインであって、該特異的結合対の第一のメンバーの、細胞または固体支持体上に存在する該特異的結合対の第二のメンバーへの結合が、Ｓ２およびＳ３タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより該細胞内ドメインが放出される、該細胞内ドメイン
を含む、キメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項２】
細胞外ドメイン、Ｎｏｔｃｈ調節領域、またはその両方が、機能的Ｎｏｔｃｈリガンド結合部位を含まない、請求項１に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項３】
特異的結合対の第一のメンバーが、抗体、抗体をベースとする認識足場、非抗体をベースとする認識足場、抗原、受容体に対するリガンド、受容体、非抗体をベースとする認識足場の標的、細胞外マトリックス成分、および接着分子からなる群より選択される、請求項１または２に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項４】
細胞内ドメインが、
（ｉ）転写活性化因子であって、該細胞内ドメインの放出が、該転写活性化因子に、細胞における内在性遺伝子産物または異種遺伝子産物の発現を誘導させる、該転写活性化因子；または
（ｉｉ）転写抑制因子であって、該細胞内ドメインの放出が、該転写抑制因子に、細胞における内在性遺伝子産物または異種遺伝子産物の発現を抑制させる、該転写抑制因子
のいずれかを含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項５】
Ｎｏｔｃｈ調節領域が、そのN末端に、１つまたは複数の上皮成長因子（ＥＧＦ）リピート、任意で２〜１１個のＥＧＦリピートをさらに含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項６】
合成リンカーを、任意で前記１つまたは複数のＥＧＦリピートと前記タンパク質分解切断部位の間に含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項７】
Ｎｏｔｃｈ調節領域が、Ｓ２タンパク質分解切断部位および/またはＳ１タンパク質分解切断部位を含むヘテロ二量体化ドメインをさらに含む、請求項１〜６のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項８】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチドを産生するように遺伝子改変されたｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｅｘ  ｖｉｖｏ細胞であって、任意で、造血性幹細胞（ＨＳＣ）もしくは胚性幹（ＥＳ）細胞などの幹細胞、始原細胞、幹細胞もしくは始原細胞に由来する細胞、または、Ｔリンパ球、ナチュラルキラー細胞、もしくは制御性Ｔ細胞などの免疫細胞からなる群より選択される、ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｅｘ  ｖｉｖｏ細胞。
【請求項９】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
【請求項１０】
請求項９に記載の核酸を含む組換え発現ベクターであって、任意で、コード配列に作動可能に連結し転写活性化因子または転写抑制因子に応答する転写制御エレメントをさらに含む、組換え発現ベクター。
【請求項１１】
細胞におけるコード配列の発現を誘導または抑制する方法であって、該細胞と特異的結合対の第二のメンバーを接触させることを含み、
該細胞が、請求項１〜７のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチドを産生するように遺伝子改変され、かつ、該コード配列に作動可能に連結し該キメラＮｏｔｃｈポリペプチドの転写活性化因子または転写抑制因子に応答する転写制御エレメントを含み、
該特異的結合対の第一のメンバーへの該特異的結合対の第二のメンバーの結合によって細胞内ドメインが放出され、それによって該コード配列の発現が誘導または抑制される、
前記方法。
【請求項１２】
請求項１〜７のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクターまたはＲＮＡでｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｅｘ  ｖｉｖｏにおいて細胞を遺伝子改変することを含む、請求項８に記載の細胞を作製する方法。
【請求項１３】
ａ）個体から得た細胞を、
ｉ）前記キメラＮｏｔｃｈポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、該キメラＮｏｔｃｈポリペプチドが転写活性化因子を含み、前記特異的結合対の第一のメンバーが、該個体の細胞によって発現される抗原上に存在するエピトープに対して特異的である、該ヌクレオチド配列；および
ｉｉ）治療物質をコードする配列に作動可能に連結し該転写活性化因子に応答する転写制御エレメント
を含む発現ベクターで遺伝子改変すること；ならびに
ｂ）該遺伝子改変細胞を該個体に導入することであって、該エピトープへの該結合対の第一のメンバーの結合が該治療物質の発現を提供し、それにより該疾患を処置する、こと
を含み、任意で、該疾患が癌であり該治療物質が癌治療物質である、個体における疾患を処置する方法
における使用のための、請求項１〜７のいずれか一項に記載のキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項１４】
前記治療物質が、抗体、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）、活性化免疫受容体、抑制性免疫受容体、免疫活性化因子、免疫抑制因子、アポトーシス誘導因子、アポトーシス抑制因子、毒素由来タンパク質、および部位特異的ヌクレアーゼからなる群より選択される、請求項１３に記載の使用のためのキメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【請求項１５】
Ｎ末端からＣ末端に向かって、共有結合状態で、
ａ）特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインであって、該第一のメンバーが、Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチド中に天然には存在せずかつ特異的結合対の第二のメンバーに特異的に結合する、該細胞外ドメイン；
ｂ）Ｌｉｎ−１２  Ｎｏｔｃｈリピート、Ｓ２タンパク質分解切断部位、および、Ｓ３タンパク質分解切断部位を含む膜貫通ドメインを含む、Ｎｏｔｃｈ調節領域；ならびに
ｃ）該Ｎｏｔｃｈ調節領域に対して異種であり分割転写因子の第一の半分を含む細胞内ドメインであって、該特異的結合対の第一のメンバーの、細胞または固体支持体上に存在する該特異的結合対の第二のメンバーへの結合が、Ｓ２およびＳ３タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより該細胞内ドメインが放出される、該細胞内ドメイン
を含む、キメラＮｏｔｃｈポリペプチド。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１０】
本開示は、本明細書に記載のとおりの本開示のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドを発現する細胞の活性を調節する方法であって、細胞と特異的結合対の第二のメンバーを接触させることを含み、ここで特異的結合対の第一のメンバーの、特異的結合対の第二のメンバーへの結合が、Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの１つまたは複数のリガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより細胞内ドメインが放出され、細胞内ドメインが、細胞の活性を調節するエフェクターポリペプチドをコードする核酸の転写を誘導する転写因子である、前記方法を提供する。いくつかの場合では、前記接触は、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される。いくつかの場合では、特異的結合対の第二のメンバーは、第二の細胞の表面上にあるか、不溶性基体上に固定されているか、細胞外マトリックス中に存在するか、人工マトリックス中に存在するか、または可溶性である。いくつかの場合では、エフェクターポリペプチドは、アポトーシス誘導因子、アポトーシス抑制因子、活性化免疫受容体、抑制性免疫受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、サイトカイン、成長因子、ホルモン、受容体、抗体、または部位特異的ヌクレアーゼである。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２０】
いくつかの場合では、細胞の異種遺伝子産物は、ケモカイン、ケモカイン受容体、キメラ抗原受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、病原体由来タンパク質、増殖誘導因子、受容体、ＲＮＡ誘導型ヌクレアーゼ、部位特異的ヌクレアーゼ、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、毒素由来タンパク質、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抗体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、操作Ｔ細胞受容体、免疫活性化因子、免疫抑制因子、抑制性免疫受容体、ＲＮＡ誘導型ＤＮＡ結合タンパク質及び第二の結合誘発型転写スイッチからなる群より選択される。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３０】
いくつかの場合では、細胞の遺伝子産物は、細胞の内在性遺伝子産物である。いくつかの場合では、細胞の遺伝子産物は、細胞の異種遺伝子産物である。いくつかの場合では、細胞の遺伝子産物は、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される細胞の遺伝子産物である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３２】
いくつかの場合では、細胞の遺伝子産物は、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３９】
いくつかの場合では、細胞の活性は、細胞の遺伝子産物の発現である。いくつかの場合では、細胞の遺伝子産物は、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される、細胞の遺伝子産物である。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３３】
いくつかの場合では、本開示のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの細胞内ドメインは、特異的結合対の第一のメンバーの特異的結合対の第二のメンバーへの結合の際に放出されるとき、キメラＮｏｔｃｈポリペプチドを発現する細胞において、内在性遺伝子産物の産生を誘導する。内在性遺伝子産物には、例えば、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子、及び抑制性免疫受容体が含まれる。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３４】
いくつかの場合では、本開示のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの細胞内ドメインは、特異的結合対の第一のメンバーの特異的結合対の第二のメンバーへの結合の際に放出されるとき、キメラＮｏｔｃｈポリペプチドを発現する細胞において、異種遺伝子産物の産生を誘導する。異種遺伝子産物には、細胞により通常は産生されない遺伝子産物が含まれる。例えば、細胞は、異種遺伝子産物をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で遺伝子改変することができる。異種遺伝子産物には、例えば、ケモカイン、ケモカイン受容体、キメラ抗原受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、病原体由来タンパク質、増殖誘導因子、受容体、ＲＮＡ誘導型ヌクレアーゼ、部位特異的ヌクレアーゼ、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、毒素由来タンパク質、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抗体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、操作Ｔ細胞受容体、免疫活性化因子、免疫抑制因子、抑制性免疫受容体、ＲＮＡ誘導型ＤＮＡ結合タンパク質、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）、ＭＥＳＡポリペプチド、ＴＡＮＧＯポリペプチド、及び第二のｓｙｎＮｏｔｃｈポリペプチド（ここで、第二のｓｙｎＮｏｔｃｈポリペプチドは、その細胞内ドメインが第二のｓｙｎＮｏｔｃｈポリペプチドの産生を誘導したｓｙｎＮｏｔｃｈポリペプチドとは異なる）が含まれる。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４８０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４８０】
いくつかの場合では、活性化された（または放出された）細胞内ドメインは、細胞における内在性遺伝子産物の発現を調節する。いくつかの場合では、細胞の内在性遺伝子産物は、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子、または抑制性免疫受容体である。いくつかの場合では、内在性遺伝子産物は、分泌された遺伝子産物である。いくつかの場合では、内在性遺伝子産物は、細胞表面遺伝子産物である。いくつかの場合では、内在性遺伝子産物は、細胞内遺伝子産物である。いくつかの場合では、活性化した細胞内ドメインは、細胞内の２つ以上の内在性遺伝子産物の発現を同時に調節する。「活性化した細胞内ドメイン」は、放出された細胞内ドメインであることができる（例えば、結合誘発型転写スイッチのタンパク質分解切断により放出される。「活性化した細胞内ドメイン」は、リン酸化細胞内ドメインであることができる、例えば、細胞内ドメインがその非リン酸化状態では不活性で、そのリン酸化状態で活性である場合である。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０４８１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０４８１】
いくつかの場合では、活性化された（または放出された）細胞内ドメインは、細胞における異種遺伝子産物の発現を調節する。異種遺伝子産物は、細胞により通常産生されないものである。例えば、細胞は、異種遺伝子産物をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で遺伝子改変されることができる。いくつかの場合では、異種遺伝子産物は、ケモカイン、ケモカイン受容体、キメラ抗原受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、病原体由来タンパク質、増殖誘導因子、受容体、ＲＮＡ誘導型ヌクレアーゼ、部位特異的ヌクレアーゼ、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、毒素由来タンパク質、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抗体、アポトーシス抑制因子、アポトーシス誘導因子、操作Ｔ細胞受容体、免疫活性化因子、免疫抑制因子、抑制性免疫受容体、ＲＮＡ誘導型ＤＮＡ結合タンパク質、本開示のｓｙｎＮｏｔｃｈポリペプチド、ＭＥＳＡポリペプチド、ＴＡＮＧＯポリペプチド、ＣＡＲ、ＴＣＲ、または第二の結合誘発型転写スイッチである。いくつかの場合では、異種遺伝子産物は、分泌された遺伝子産物である。いくつかの場合では、異種遺伝子産物は、細胞表面遺伝子産物である。いくつかの場合では、異種遺伝子産物は、細胞内遺伝子産物である。いくつかの場合では、活性化した細胞内ドメインは、細胞内の２つ以上の異種遺伝子産物の発現を同時に調節する。「活性化した細胞内ドメイン」は、放出された細胞内ドメインであることができる（例えば、結合誘発型転写スイッチのタンパク質分解切断により放出される。「活性化した細胞内ドメイン」は、リン酸化細胞内ドメインであることができる、例えば、細胞内ドメインがその非リン酸化状態では不活性で、そのリン酸化状態で活性である場合である。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
本開示は、第一の抗原に応答する第一の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；第一の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ特異的結合対の第一のメンバーに特異的に結合する細胞外ドメインを含むＣＡＲの第一の部分をコードする核酸に作動可能に連結している、第一のプロモーター；第二の抗原に応答する第二の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；及び第二の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ細胞内シグナル伝達ドメインを含むＣＡＲの第二の部分をコードする核酸に作動可能に連結している、第二のプロモーターを含み、第一の抗原及び第二の抗原の存在下で、ＣＡＲの第一及び第二の部分が発現され、ＣＡＲが特異的結合対の第二のメンバーにより活性化可能である、宿主細胞を提供する。いくつかの例では、細胞は、第三の抗原に応答する第三の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；及び第三の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ細胞内ＣＡＲ阻害ドメインをコードする核酸に作動可能に連結している、第三のプロモーターをさらに含み、第三の抗原の存在下で、細胞内ＣＡＲ阻害ドメインが発現されてＣＡＲによる細胞の活性化が阻害される。
[本発明1001]
Ｎ末端からＣ末端に向かって、共有結合状態で、
ａ）特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメイン；
ｂ）５０アミノ酸〜１０００アミノ酸の長さを有し、かつ１つまたは複数のリガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含む、Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチド；及び
ｃ）細胞内ドメイン
を含み、
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドに対して異種であり、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の第二のメンバーへの結合が、前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの前記１つまたは複数のリガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより前記細胞内ドメインが放出される、キメラポリペプチド。
[本発明1002]
前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドが、３００アミノ酸〜４００アミノ酸の長さを有する、本発明1001のキメラポリペプチド。
[本発明1003]
前記細胞外ドメインと前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの間に介在するリンカーを含む、本発明1001または本発明1002のキメラポリペプチド。
[本発明1004]
前記細胞内ドメインが、転写活性化因子である、本発明1001〜1003のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1005]
前記細胞内ドメインが、転写抑制因子である、本発明1001〜1003のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1006]
前記細胞内ドメインが、部位特異的ヌクレアーゼである、本発明1001〜1003のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1007]
前記部位特異的ヌクレアーゼが、Ｃａｓ９ポリペプチドである、本発明1006のキメラポリペプチド
[本発明1008]
前記細胞内ドメインが、リコンビナーゼである、本発明1001〜1003のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1009]
前記細胞内ドメインが、抑制性免疫受容体である、本発明1001〜1003のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1010]
前記細胞内ドメインが、活性化免疫受容体である、本発明1001〜1003のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1011]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、抗体をベースとする認識足場を含む、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1012]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、抗体を含む、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1013]
前記抗体が、腫瘍特異的抗原、疾患関連抗原、病原体関連抗原、自己免疫疾患関連抗原、または細胞外マトリックス成分と特異的に結合する、本発明1012のキメラポリペプチド。
[本発明1014]
前記抗体が、細胞表面抗原、可溶性抗原、または不溶性基体上に固定された抗原と特異的に結合する、本発明1012のキメラポリペプチド。
[本発明1015]
前記抗体が、一本鎖Ｆｖである、本発明1012のキメラポリペプチド。
[本発明1016]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、ナノボディ、単一ドメイン抗体、ダイアボディ、トリアボディ、またはミニボディである、本発明1011のキメラポリペプチド。
[本発明1017]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、非抗体をベースとする認識足場である、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1018]
前記非抗体をベースとする認識足場が、アビマー、ＤＡＲＰｉｎ、アドネクチン、アビマー、アフィボディ、アンチカリン、またはアフィリンである、本発明1017のキメラポリペプチド。
[本発明1019]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、抗原である、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1020]
前記抗原が、内在性抗原である、本発明1019のキメラポリペプチド。
[本発明1021]
前記抗原が、外来性抗原である、本発明1019のキメラポリペプチド。
[本発明1022]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、受容体に対するリガンドである、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1023]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、受容体である、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1024]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、細胞接着分子である、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1025]
前記特異的結合対の前記第一のメンバーが、第一の二量体化ドメインを含み、前記特異的結合対の前記第二のメンバーが、第二の二量体化ドメインを含む、本発明1001〜1010のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1026]
前記第一の二量体化ドメインの、前記第二の二量体化ドメインへの結合が、小分子二量体化剤により誘導される、本発明1025のキメラポリペプチド。
[本発明1027]
前記第一の二量体化ドメインの、前記第二の二量体化ドメインへの結合が、光により誘導される、本発明1025のキメラポリペプチド。
[本発明1028]
前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドが、図２Ａ〜２Ｇに示すアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも７５％アミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、本発明1001〜1027のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1029]
前記１つまたは複数のリガンド誘導性タンパク質分解切断部位が、Ｓ１、Ｓ２、及びＳ３タンパク質分解切断部位から選択される、本発明1001〜1028のいずれかのキメラポリペプチド。
[本発明1030]
前記Ｓ１タンパク質分解切断部位が、アミノ酸配列Ａｒｇ−Ｘ−（Ａｒｇ／Ｌｙｓ）−Ａｒｇを含むフューリン様プロテアーゼ切断部位であり、ここでＸは任意のアミノ酸である、本発明1029のキメラポリペプチド。
[本発明1031]
前記Ｓ２タンパク質分解切断部位が、Ａｌａ−Ｖａｌジペプチド配列を含むＡＤＡＭ−１７型プロテアーゼ切断部位である、本発明1029のキメラポリペプチド。
[本発明1032]
前記Ｓ３タンパク質分解切断部位が、Ｇｌｙ−Ｖａｌジペプチド配列を含むγ−セクレターゼ切断部位である、本発明1029のキメラポリペプチド。
[本発明1033]
本発明1001〜1032のいずれかのキメラポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸。
[本発明1034]
本発明1001〜1032のいずれかのキメラポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、組換え発現ベクター。
[本発明1035]
本発明1033の核酸または本発明1034の発現ベクターで遺伝子改変された宿主細胞。
[本発明1036]
真核細胞である、本発明1035の宿主細胞。
[本発明1037]
哺乳類細胞である、本発明1036の宿主細胞。
[本発明1038]
免疫細胞、ニューロン、上皮細胞、及び内皮細胞、または幹細胞である、本発明1037の宿主細胞。
[本発明1039]
前記免疫細胞が、Ｔ細胞、Ｂ細胞、単球、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、マクロファージ、制御性Ｔ細胞、ヘルパーＴ細胞、または細胞傷害性Ｔ細胞である、本発明1038の宿主細胞。
[本発明1040]
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）またはＴ細胞受容体（ＴＣＲ）をコードするヌクレオチド配列を含む核酸で遺伝子改変されており、前記キメラポリペプチドの前記細胞内ドメインが、転写活性化因子である、本発明1035〜1039のいずれかの宿主細胞。
[本発明1041]
前記ＣＡＲまたは前記ＴＣＲをコードする前記ヌクレオチド配列が、前記キメラポリペプチドの前記細胞内ドメインにより活性化される転写制御エレメントに作動可能に連結している、本発明1040の宿主細胞。
[本発明1042]
本発明1001〜1032のいずれかのキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドを発現する細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と前記特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合が、前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの前記１つまたは複数のリガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより前記細胞内ドメインが放出され、前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞の活性を調節する、前記方法。
[本発明1043]
前記接触が、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される、本発明1042の方法。
[本発明1044]
前記特異的結合対の前記第二のメンバーが、第二の細胞の表面上にあるか、不溶性基体上に固定されているか、細胞外マトリックス中に存在するか、人工マトリックス中に存在するか、または可溶性である、本発明1042の方法。
[本発明1045]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞の増殖を調節する、本発明1042の方法。
[本発明1046]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞におけるアポトーシスを調節する、本発明1042の方法。
[本発明1047]
前記細胞内ドメインの放出が、アポトーシス以外の機構による細胞死を誘導する、本発明1042の方法。
[本発明1048]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞における遺伝子発現を、転写調節、クロマチン制御、翻訳、トラフィッキングまたは翻訳後プロセシングを通して調節する、本発明1042の方法。
[本発明1049]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞の分化を調節する、本発明1042の方法。
[本発明1050]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞の遊走を調節する、本発明1042の方法。
[本発明1051]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞からの分子の発現及び分泌を調節する、本発明1042の方法。
[本発明1052]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞の、第二の細胞へのまたは細胞外マトリックスへの接着を調節する、本発明1042の方法。
[本発明1053]
前記細胞内ドメインの放出が、前記細胞における遺伝子産物のデノボ発現を誘導するまたは発現を調節する、本発明1042の方法。
[本発明1054]
前記遺伝子産物が、転写活性化因子、転写抑制因子、キメラ抗原受容体、第二のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチド、翻訳調節因子、サイトカイン、ホルモン、ケモカイン、または抗体である、本発明1053の方法。
[本発明1055]
本発明1001〜1032のいずれかのキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドを発現する細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と前記特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、ここで前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合が、前記Ｎｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの前記１つまたは複数のリガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより前記細胞内ドメインが放出され、前記細胞内ドメインが、前記細胞の活性を調節するエフェクターポリペプチドをコードする核酸の転写を誘導する転写因子である、前記方法。
[本発明1056]
前記接触が、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される、本発明1055の方法。
[本発明1057]
前記特異的結合対の前記第二のメンバーが、第二の細胞の表面上にあるか、不溶性基体上に固定されているか、細胞外マトリックス中に存在するか、人工マトリックス中に存在するか、または可溶性である、本発明1055の方法。
[本発明1058]
前記エフェクターポリペプチドが、アポトーシス誘導因子、抑制因子にあるアポトーシス、活性化免疫受容体、抑制性免疫受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、サイトカイン、成長因子、ホルモン、受容体、抗体、部位特異的ヌクレアーゼまたはリコンビナーゼである、本発明1055の方法。
[本発明1059]
細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と第一の特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、前記細胞が、
ｉ）第一の特異的結合対の第一のメンバーを含む、本発明1001〜1032のいずれかの第一のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチド；及び
ｉｉ）少なくとも、第二の特異的結合対の第一のメンバーを含む本発明1001〜1032のいずれかの第二のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチド
を発現し、
前記第一及び前記第二の特異的結合対が互いに異なり、
前記第一のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの前記細胞内ドメインが、第一のエフェクター機能を提供し；前記第二のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの前記細胞内ドメインが、前記第一のエフェクター機能と異なる第二のエフェクター機能を提供し、前記放出された第一及び前記第二の細胞内ドメインが、前記細胞の活性を調節する、前記方法。
[本発明1060]
前記接触が、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される、本発明1059の方法。
[本発明1061]
Ｔ細胞を活性化させる方法であって、
本発明1040のＴ細胞と固定化抗原を接触させること
を含み、
前記キメラポリペプチドの前記細胞外ドメインが、第一の抗原に特異的な抗体を含み、
前記接触が、前記転写活性化因子の放出、及び前記細胞中の前記ＣＡＲまたは前記ＴＣＲの産生をもたらし、前記ＣＡＲまたはＴＣＲが、第二の抗原の結合後に前記Ｔ細胞の活性化を提供する、前記方法。
[本発明1062]
細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と第一の特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、前記細胞が、
ｉ）第一の特異的結合対の第一のメンバーを含む、本発明1001〜1032のいずれかの第一のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチド；及び
ｉｉ）少なくとも、第二の特異的結合対の第一のメンバーを含む本発明1001〜1032のいずれかの第二のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチド
を発現し、
前記第一及び前記第二の特異的結合対が互いに異なり、
前記第二のキメラＮｏｔｃｈ受容体をコードする前記ヌクレオチド配列が、前記第一のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドの前記細胞内ドメインにより活性化または抑制される転写制御エレメントに作動可能に連結している、前記方法。
[本発明1063]
前記接触が、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される、本発明1062の方法。
[本発明1064]
Ｔ細胞を活性化させる方法であって、
本発明1040のＴ細胞と固定化抗原を接触させること
を含み、前記キメラポリペプチドの前記細胞外ドメインが、第一の抗原に特異的な抗体を含み、
前記接触が、前記転写活性化因子の放出、及び前記細胞における前記ＣＡＲまたはＴＣＲの産生をもたらし、前記ＣＡＲまたは前記ＴＣＲが、第二の抗原の結合後に前記Ｔ細胞の活性化を提供する、前記方法。
[本発明1065]
細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と表面上に固定されている抗原を接触させること
を含み、前記細胞が、本発明1001のキメラＮｏｔｃｈ受容体ポリペプチドを発現し、前記特異的結合対の前記第一のメンバーが前記抗原と結合し、
前記接触が、前記細胞内ドメインの放出及び前記細胞の活性の調節をもたらす、前記方法。
[本発明1066]
前記細胞内ドメインが、前記細胞の分化を調節する転写因子である、本発明1065の方法。
[本発明1067]
細胞の活性を局所的に調節する方法であって、
前記細胞内で、特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む結合誘発型転写スイッチを発現させること；及び
前記細胞と前記特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合が、前記細胞内ドメインを活性化するための結合シグナルを伝達するように前記結合トランスデューサを誘導し、それにより、活性化した細胞内ドメインが産生され、前記活性化した細胞内ドメインが、前記細胞の遺伝子産物の発現、前記細胞の増殖、前記細胞のアポトーシス、前記細胞の非アポトーシス性死、前記細胞の分化、前記細胞の脱分化、前記細胞の遊走、前記細胞からの分子の分泌及び前記細胞の細胞接着からなる群より選択される、前記細胞の活性を調節する、前記方法。
[本発明1068]
前記活性化した細胞内ドメインが、前記細胞の内在性遺伝子産物の発現を調節する、本発明1067の方法。
[本発明1069]
前記細胞の前記内在性遺伝子産物が、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抑制因子にあるアポトーシス、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される、本発明1068の方法。
[本発明1070]
前記細胞の前記内在性遺伝子産物が、分泌された遺伝子産物である、本発明1068〜1069のいずれかの方法。
[本発明1071]
前記細胞の前記内在性遺伝子産物が、表面発現遺伝子産物である、本発明1068〜1069のいずれかの方法。
[本発明1072]
前記活性化した細胞内ドメインが、前記細胞の２つ以上の内在性遺伝子産物の発現を同時に調節する、本発明1068〜1071のいずれかの方法。
[本発明1073]
前記活性化した細胞内ドメインが、前記細胞の異種遺伝子産物の発現を調節する、本発明1067の方法。
[本発明1074]
前記細胞の前記異種遺伝子産物が、ケモカイン、ケモカイン受容体、キメラ抗原受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、病原体由来タンパク質、増殖誘導因子、受容体、ＲＮＡ誘導型ヌクレアーゼ、部位特異的ヌクレアーゼ、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、毒素由来タンパク質、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抗体、抑制因子にあるアポトーシス、アポトーシス誘導因子、操作Ｔ細胞受容体、免疫活性化因子、免疫抑制因子、抑制性免疫受容体、ＲＮＡ誘導型ＤＮＡ結合タンパク質及び第二の結合誘発型転写スイッチからなる群より選択される、本発明1073の方法。
[本発明1075]
前記細胞の前記異種遺伝子産物が、抗体である、本発明1074の方法。
[本発明1076]
前記抗体が、８０６、９Ｅ１０、３Ｆ８、８１Ｃ６、８Ｈ９、アバゴボマブ、アバタセプト、アブシキシマブ、アビツズマブ、アブリルマブ、アクトクスマブ、アダリムマブ、アデカツムマブ、アデュカヌマブ、アフェリモマブ、アフツズマブ、アラシズマブ・ペゴル、ＡＬＤ５１８、アレファセプト、アレムツズマブ、アリロクマブ、アルツモマブ・ペンテテート、アマツキシマブ、ＡＭＧ  １０２、アナツモマブ・マフェナトクス、アネツマブ・ラブタンシン、アニフロルマブ、アンルキンズマブ、アポリズマブ、アルシツモマブ、アスクリンバクマブ（Ａｓｃｒｉｎｖａｃｕｍａｂ）、アセリズマブ、アタシセプト、アテゾリズマブ、アチヌマブ、アトリズマブ／トシリズマブ、アトロリムマブ、ＡＶＥ１６４２、バピネオズマブ、バシリキシマブ、バビツキシマブ、ベクツモマブ、ベゲロマブ、ベリムマブ、ベンラリズマブ、ベルチリムマブ、ベシレソマブ、ベバシズマブ、ベズロトクスマブ、ビシロマブ、ビマグルマブ、ビメキズマブ（Ｂｉｍｅｋｉｚｕｍａｂ）、ビバツズマブ・メルタンシン、ブリナツモマブ、ブロソズマブ、ＢＭＳ−９３６５５９、ボコシズマブ、ブレンツキシマブ・ベドチン、ブリアキヌマブ、ブロダルマブ、ブロルシズマブ、ブロンチクツズマブ（Ｂｒｏｎｔｉｃｔｕｚｕｍａｂ）、カナキヌマブ、カンツズマブ・メルタンシン、カンツズマブ・ラブタンシン、カプラシズマブ、カプロマブ・ペンデチド、カルルマブ、カツマクソマブ、ｃＢＲ９６−ドキソルビシン免疫複合体、ＣＣ４９、ＣＤＰ７９１、セデリズマブ、セルトリズマブ・ペゴル、セツキシマブ、ｃＧ２５０、Ｃｈ．１４．１８、シタツズマブ・ボガトクス、シクスツムマブ、クラザキズマブ、クレノリキシマブ、クリバツズマブ・テトラキセタン、コドリツズマブ、コルツキシマブ・ラブタンシン（Ｃｏｌｔｕｘｉｍａｂ  ｒａｖｔａｎｓｉｎｅ）、コナツムマブ、コンシズマブ、ＣＰ  ７５１８７１、ＣＲ６２６１、クレネズマブ、ＣＳ−１００８、ダセツズマブ、ダクリズマブ、ダロツズマブ、ダピロリズマブ・ペゴル（Ｄａｐｉｒｏｌｉｚｕｍａｂ  ｐｅｇｏｌ）、ダラツムマブ、デクトレクマブ（Ｄｅｃｔｒｅｋｕｍａｂ）、デムシズマブ、デニンツズマブ・マホドチン（Ｄｅｎｉｎｔｕｚｕｍａｂ  ｍａｆｏｄｏｔｉｎ）、デノスマブ、デルロツキシマブ・ビオチン（Ｄｅｒｌｏｔｕｘｉｍａｂ  ｂｉｏｔｉｎ）、デツモマブ、ジヌツキシマブ、ジリダブマブ、ドルリモマブ・アリトクス、ドロジツマブ、デュリゴツマブ、デュピルマブ、デュルバルマブ、デュシジツマブ、エクロメキシマブ、エクリズマブ、エドバコマブ、エドレコロマブ、エファリズマブ、エフングマブ、エルデルマブ、エルゲムツマブ（Ｅｌｇｅｍｔｕｍａｂ）、エロツズマブ、エルシリモマブ、エマクツズマブ（Ｅｍａｃｔｕｚｕｍａｂ）、エミベツズマブ、エナバツズマブ、エンフォルツマブ・ベドチン、エンリモマブ・ペゴル、エノブリツズマブ（Ｅｎｏｂｌｉｔｕｚｕｍａｂ）、エノキズマブ、エノチクマブ、エンシツキシマブ、エピツモマブ・シツキセタン、エプラツズマブ、エルリズマブ、エルツマクソマブ、エタネルセプト、エタラシズマブ、エトロリズマブ、エビナクマブ、エボロクマブ、エクスビビルマブ、Ｆ１９、ファノレソマブ、ファラリモマブ、ファーレツズマブ、ファシヌマブ、ＦＢＴＡ０５、フェルビズマブ、フェザキヌマブ、フィクラツズマブ、フィジツムマブ、フィリブマブ（Ｆｉｒｉｖｕｍａｂ）、フランボツマブ、フレチクマブ、フォントリズマブ、フォラルマブ、フォラビルマブ、フレソリムマブ、フルラヌマブ、フツキシマブ、ガリキシマブ、ガニツマブ、ガンテネルマブ、ガビリモマブ、ゲムツズマブ・オゾガマイシン、ゲボキズマブ、ギレンツキシマブ、グレムバツムマブ・ベドチン、ゴリムマブ、ゴミリキシマブ、グセルクマブ、ＨＧＳ−ＥＴＲ２、ｈｕ３Ｓ１９３、ｈｕＡ３３、イバリズマブ、イブリツモマブ・チウキセタン、イクルクマブ、イダルシズマブ、ＩＧＮ１０１、ＩｇＮ３１１、イゴボマブ、ＩＩＩＡ４、ＩＭ−２Ｃ６、ＩＭＡＢ３６２、イマルマブ（Ｉｍａｌｕｍａｂ）、ＩＭＣ−Ａ１２、イムシロマブ、イムガツズマブ、インクラクマブ、インダツキシマブ・ラブタンシン、インデュサツマブ・ベドチン（Ｉｎｄｕｓａｔｕｍａｂ  ｖｅｄｏｔｉｎ）、インフリキシマブ、イノリモマブ、イノツズマブ・オゾガマイシン、インテツムマブ、イピリムマブ、イラツムマブ、イサツキシマブ、イトリズマブ、イクセキズマブ、Ｊ５９１、ＫＢ００４、ケリキシマブ、ＫＷ−２８７１、ラベツズマブ、ラムブロリズマブ、ラムパリズマブ、レブリキズマブ、レマレソマブ、レンジルマブ（Ｌｅｎｚｉｌｕｍａｂ）、レルデリムマブ、レキサツムマブ、リビビルマブ、リファスツズマブ・ベドチン、リゲリズマブ、リロトマブ・サテトラキセタン（Ｌｉｌｏｔｏｍａｂ  ｓａｔｅｔｒａｘｅｔａｎ）、リンツズマブ、リリルマブ、ロデルシズマブ、ロキベトマブ（Ｌｏｋｉｖｅｔｍａｂ）、ロルボツズマブ・メルタンシン、ルカツムマブ、ルリズマブ・ペゴル、ルミリキシマブ、ルムレツズマブ（Ｌｕｍｒｅｔｕｚｕｍａｂ）、マパツムマブ、マルゲツキシマブ、マスリモマブ、マツズマブ、マブリリムマブ、ＭＥＤＩ４７３６、メポリズマブ、メテリムマブ、ＭＥＴＭＡＢ、ミラツズマブ、ミンレツモマブ、ミルベツキシマブ・ソラブタンシン（Ｍｉｒｖｅｔｕｘｉｍａｂ  ｓｏｒａｖｔａｎｓｉｎｅ）、ミツモマブ、ＭＫ−０６４６、ＭＫ−３４７５、ＭＭ−１２１、モガムリズマブ、ＭＯＲＡｂ−００３、モロリムマブ、モタビズマブ、ＭＯｖ１８、モキセツモマブ・パスドトクス、ＭＰＤＬ３３２８０Ａ、ムロモナブＣＤ３、ナコロマブ・タフェナトクス、ナミルマブ、ナプツモマブ・エスタフェナトクス、ナルナツマブ、ナタリズマブ、ネバクマブ、ネシツムマブ、ネモリズマブ、ネレリモマブ、ネスバクマブ、ニモツズマブ、ニボルマブ、ノフェツモマブ・メルペンタン、オビルトキサキシマブ、オビヌツズマブ、オカラツズマブ、オクレリズマブ、オヅリモマブ、オファツムマブ、オララツマブ、オロキズマブ、オマリズマブ、オナルツズマブ、オンツキシズマブ、オピシヌマブ、オポルツズマブ・モナトクス、オレゴボマブ、オルチクマブ、オテリキシズマブ、オトレルツズマブ、オキセルマブ、オザネズマブ、オゾラリズマブ、パギバキシマブ、パリビズマブ、パニツムマブ、パンコマブ（Ｐａｎｋｏｍａｂ）、パノバクマブ、パルサツズマブ、パスコリズマブ、パソツキシズマブ、パテクリズマブ、パトリツマブ、ペムブロリズマブ、ペムツモマブ、ペラキズマブ、ペルツズマブ、ペキセリズマブ、ピジリズマブ、ピナツズマブ・ベドチン、ピンツモマブ、プラクルマブ、ポラツズマブ・ベドチン、ポネズマブ、プリリキシマブ、プリトキサキシマブ、プリツムマブ、ＰＲＯ  １４０、キリズマブ、Ｒ１５０７、ラコツモマブ、ラドレツマブ、ラフィビルマブ、ラルパンシズマブ（Ｒａｌｐａｎｃｉｚｕｍａｂ）、ラムシルマブ、ラニビズマブ、ラキシバクマブ、レファネズマブ（Ｒｅｆａｎｅｚｕｍａｂ）、レガビルマブ、レスリズマブ、リロツムマブ、リヌクマブ（Ｒｉｎｕｃｕｍａｂ）、リツキシマブ、ロバツムマブ、ロレヅマブ、ロモソズマブ、ロンタリズマブ、ロベリズマブ、ルプリズマブ、サシツズマブ・ゴビテカン、サマリズマブ、サリルマブ、サツモマブ・ペンデチド、ＳＣＨ  ９００１０５、セクキヌマブ、セリバンツマブ、セトキサキシマブ、セビルマブ、ＳＧＮ−ＣＤ１９Ａ、ＳＧＮ−ＣＤ３３Ａ、シブロツズマブ、シファリムマブ、シルツキシマブ、シムツズマブ、シプリズマブ、シルクマブ、ソフィツズマブ・ベドチン、ソラネズマブ、ソリトマブ、ソネプシズマブ、ソンツズマブ、スタムルマブ、スレソマブ、スビズマブ、タバルマブ、タカツズマブ・テトラキセタン、タドシズマブ、タリズマブ、タネズマブ、タプリツモマブ・パプトクス、タレクスツマブ、テフィバズマブ、テリモマブ・アリトクス、テナツモマブ、テネリキシマブ、テプリズマブ、テプロツムマブ、テシドルマブ、テツロマブ（Ｔｅｔｕｌｏｍａｂ）、ＴＧＮ１４１２、チシリムマブ／トレメリムマブ、チガツズマブ、チルドラキズマブ、ＴＮＸ−６５０、トシリズマブ、トラリズマブ、トサトクスマブ（Ｔｏｓａｔｏｘｕｍａｂ）、トシツモマブ、トベツマブ、トラロキヌマブ、トラスツズマブ、ＴＲＢＳ０７、トレガリズマブ、トレメリムマブ、トレボグルマブ（Ｔｒｅｖｏｇｒｕｍａｂ）、ツコツズマブ・セルモロイキン、ツビルマブ、ウブリツキシマブ、ウロクプルマブ（Ｕｌｏｃｕｐｌｕｍａｂ）、ウレルマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ、バンドルツズマブ・ベドチン、バンチクツマブ、バヌシズマブ、バパリキシマブ、バルリルマブ、バテリズマブ、ベドリズマブ、ベルツズマブ、ベパリモマブ、ベセンクマブ、ビジリズマブ、ボロシキシマブ、ボルセツズマブ・マホドチン、ボツムマブ、ザルツムマブ、ザノリムマブ、ザツキシマブ、ジラリムマブ及びゾリモマブ・アリトクスからなる群より選択される、本発明1075の方法。
[本発明1077]
前記細胞の前記異種遺伝子産物が、分泌された遺伝子産物である、本発明1073〜1076のいずれかの方法。
[本発明1078]
前記細胞の前記異種遺伝子産物が、表面発現遺伝子産物である、本発明1073〜1076のいずれかの方法。
[本発明1079]
前記活性化した細胞内ドメインが、前記細胞の２つ以上の異種遺伝子産物の発現を同時に調節する、本発明1073〜1078のいずれかの方法。
[本発明1080]
前記接触が、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される、本発明1067〜1079のいずれかの方法。
[本発明1081]
前記特異的結合対の前記第二のメンバーが、第二の細胞の表面上にあるか、不溶性基体上に固定されているか、細胞外マトリックス中に存在するか、人工マトリックス中に存在するか、または可溶性である、本発明1067〜1080のいずれかの方法。
[本発明1082]
前記細胞内ドメインが、前記細胞の分化を調節する転写因子である、本発明1067の方法。
[本発明1083]
前記転写因子が、前記細胞の分化を直接調節する、本発明1082の方法。
[本発明1084]
前記転写因子が、前記細胞の分化を、第二の転写因子の発現を調節することにより間接的に調節する、本発明1082の方法。
[本発明1085]
前記細胞が免疫細胞であり、前記細胞の前記活性が、前記免疫細胞の分化である、本発明1067の方法。
[本発明1086]
前記細胞が免疫細胞であり、前記細胞内ドメインが、前記細胞の分化を調節する転写因子であり、前記細胞の前記活性が、前記免疫細胞の分化である、本発明1067の方法。
[本発明1087]
前記転写因子が、前記免疫細胞の分化を直接調節する、本発明1086の方法。
[本発明1088]
前記転写因子が、前記免疫細胞の分化を、第二の転写因子の前記発現を調節することにより間接的に調節する、本発明1086の方法。
[本発明1089]
前記細胞が幹細胞であり、前記細胞の前記活性が、前記幹細胞の分化である、本発明1067の方法。
[本発明1090]
前記細胞が始原細胞または前駆細胞であり、前記細胞の前記活性が、前記始原細胞または前駆細胞の分化である、本発明1067の方法。
[本発明1091]
前記細胞内ドメインの活性化が、前記細胞の内在性遺伝子の発現を、転写調節、クロマチン制御、翻訳、トラフィッキングまたは翻訳後プロセシングを通して調節する、本発明1067の方法。
[本発明1092]
前記細胞内ドメインの活性化が、前記細胞の、第二の細胞へのまたは細胞外マトリックスへの細胞接着を調節する、本発明1067の方法。
[本発明1093]
前記結合トランスデューサが、リガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含み、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合が、前記結合トランスデューサの前記リガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより、前記結合シグナルが伝達されかつ、前記細胞内ドメインが、前記細胞内ドメインをタンパク質分解的に放出することによって活性化される、本発明1067の方法。
[本発明1094]
前記細胞と、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合を競合的に阻害する可溶性阻害分子とを接触させることをさらに含み、それにより、前記細胞内ドメインを活性化させるための結合シグナルを伝達するように結合トランスデューサを誘導することを防ぐ、本発明1067〜1093のいずれかの方法。
[本発明1095]
前記細胞と前記可溶性阻害分子の接触が、前記可溶性阻害分子を第一の細胞に適用または投与することを含む、本発明1094の方法。
[本発明1096]
前記細胞と前記可溶性阻害分子の接触が、前記細胞を、前記可溶性阻害分子を発現する第二の細胞の存在下に置くことを含む、本発明1094の方法。
[本発明1097]
前記第二の細胞が、前記可溶性阻害分子を構成的に発現する、本発明1096の方法。
[本発明1098]
前記第二の細胞が、前記可溶性阻害分子を条件的に発現する、本発明1096の方法。
[本発明1099]
細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と第一の特異的結合対の第二のメンバー及び第二の特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、前記細胞が、
ｉ）前記第一の特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む第一の結合誘発型転写スイッチ；及び
ｉｉ）少なくとも、第二の特異的結合対の前記第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む第二の結合誘発型転写スイッチ
を発現し；
前記第一の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインが、第一のエフェクター機能を提供し、前記第二の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインが、前記第一のエフェクター機能と異なる第二のエフェクター機能を提供し、この時、前記第一及び第二の特異的結合対の前記第一及び第二のメンバーの結合が、前記第一及び第二の細胞内ドメインを活性化するための結合シグナルを伝達するように前記結合トランスデューサを誘導する、前記方法。
[本発明1100]
前記第一の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインの前記エフェクター機能が、前記細胞の遺伝子産物の発現を調節する、本発明1099の方法。
[本発明1101]
前記細胞の前記遺伝子産物が、前記細胞の内在性遺伝子産物である、本発明1100の方法。
[本発明1102]
前記細胞の前記遺伝子産物が、前記細胞の異種遺伝子産物である、本発明1100の方法。
[本発明1103]
前記細胞の前記遺伝子産物が、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抑制因子にあるアポトーシス、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される、本発明1100の方法。
[本発明1104]
前記第二の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインの前記エフェクター機能が、前記細胞の遺伝子産物の発現を調節する、本発明1100の方法。
[本発明1105]
前記細胞の前記遺伝子産物が、前記細胞の内在性遺伝子産物である、本発明1104の方法。
[本発明1106]
前記細胞の前記遺伝子産物が、前記細胞の異種遺伝子産物である、本発明1104の方法。
[本発明1107]
前記細胞の前記遺伝子産物が、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抑制因子にあるアポトーシス、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される、本発明1104の方法。
[本発明1108]
前記第一及び第二の結合誘発型転写スイッチの前記結合トランスデューサのうちの少なくとも１つが、リガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含み、それぞれの特異的結合対の前記第一及び第二のメンバーの結合が、前記結合トランスデューサの前記リガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより、前記結合シグナルが伝達されかつ、それぞれの細胞内ドメインが、前記細胞内ドメインをタンパク質分解的に放出することによって活性化される、本発明1099の方法。
[本発明1109]
前記第一及び第二の結合誘発型転写スイッチの前記結合トランスデューサが、両方ともリガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含む、本発明1108の方法。
[本発明1110]
細胞の活性を調節する方法であって、
前記細胞と第一の特異的結合対の第二のメンバーを接触させること
を含み、前記細胞が、
ｉ）前記第一の特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む第一の結合誘発型転写スイッチ；及び
ｉｉ）少なくとも、第二の特異的結合対の前記第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む第二の結合誘発型転写スイッチ
を発現し、
前記第二の結合誘発型転写スイッチをコードするヌクレオチド配列が、前記第一の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインにより活性化または抑制される転写制御エレメントに作動可能に連結している、前記方法。
[本発明1111]
前記接触が、ｉｎ  ｖｉｖｏ、ｅｘ  ｖｉｖｏ、またはｉｎ  ｖｉｔｒｏで実行される、本発明1110の方法。
[本発明1112]
前記第一の特異的結合対の前記第二のメンバーが、第二の細胞の表面上にあるか、不溶性基体上に固定されているか、細胞外マトリックス中に存在するか、人工マトリックス中に存在するか、または可溶性である、本発明1110の方法。
[本発明1113]
前記第二の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインの活性化が、前記細胞の遺伝子産物の発現、前記細胞の増殖、前記細胞のアポトーシス、前記細胞の非アポトーシス性死、前記細胞の分化、前記細胞の脱分化、前記細胞の遊走、前記細胞からの分子の分泌及び前記細胞の細胞接着からなる群より選択される、前記細胞の活性を調節する、本発明1110の方法。
[本発明1114]
前記細胞の前記活性が、前記細胞の遺伝子産物の発現である、本発明1113の方法。
[本発明1115]
前記細胞の前記遺伝子産物が、ケモカイン、ケモカイン受容体、サイトカイン、サイトカイン受容体、分化因子、成長因子、成長因子受容体、ホルモン、代謝酵素、増殖誘導因子、受容体、小分子セカンドメッセンジャー合成酵素、Ｔ細胞受容体、転写活性化因子、転写抑制因子、転写活性化因子、転写抑制因子、翻訳調節因子、翻訳活性化因子、翻訳抑制因子、活性化免疫受容体、抑制因子にあるアポトーシス、アポトーシス誘導因子、免疫活性化因子、免疫抑制因子及び抑制性免疫受容体からなる群より選択される、前記細胞の遺伝子産物である、本発明1114の方法。
[本発明1116]
前記第一及び第二の結合誘発型転写スイッチの前記結合トランスデューサの少なくとも１つが、リガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含み、前記それぞれの特異的結合対の前記第一及び第二のメンバーの結合が、前記結合トランスデューサの前記リガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより、前記結合シグナルが伝達されかつ、前記それぞれの細胞内ドメインが、前記細胞内ドメインをタンパク質分解的に放出することによって活性化される、本発明1110の方法。
[本発明1117]
細胞間接触を追跡する方法であって、
第一の複数の細胞の各細胞において、特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む結合誘発型転写スイッチを発現させること；
第二の複数の細胞の各細胞において、前記特異的結合対の第二のメンバーを発現させること；及び
前記第一の複数の細胞と前記第二の複数の細胞を接触させること
を含み、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合が、前記結合誘発型転写スイッチの結合シグナルを伝達するように結合トランスデューサを誘導し、それにより前記細胞内ドメインが活性化され、前記細胞内ドメインの活性化が、空間的な、時間的なまたはその組み合わせにおける細胞間接触を追跡するのに十分な検出可能レポーターの発現を誘導する、前記方法。
[本発明1118]
前記第一の複数の細胞、前記第二の複数の細胞または両方が、ニューロンである、本発明1117の方法。
[本発明1119]
前記結合トランスデューサが、リガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含み、前記特異的結合対の前記第一のメンバーの、前記特異的結合対の前記第二のメンバーへの結合が、前記結合トランスデューサの前記リガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより、前記結合シグナルが伝達されかつ、前記細胞内ドメインが、前記細胞内ドメインをタンパク質分解的に放出することによって活性化される、本発明1117の方法。
[本発明1120]
前記結合誘発型転写スイッチが、ＳｙｎＮｏｔｃｈポリペプチドである、本発明1067〜1119のいずれかの方法。
[本発明1121]
局在性細胞活性化システムであって、
第一の特異的結合対の第一のメンバーを含む細胞外ドメインと、結合トランスデューサと、細胞内ドメインとを含む発現された結合誘発型転写スイッチ；及び
前記第一の結合誘発型転写スイッチの前記細胞内ドメインにより誘導される転写制御エレメントに作動可能に連結した、第二の特異的結合対の第一のメンバーを含む結合誘発型活性化ポリペプチドをコードする核酸
を含む細胞を含み、
前記第一の特異的結合対の前記第二のメンバーとの接触の際に、前記結合誘発型活性化ポリペプチドが発現され、前記第二の特異的結合対の前記第二のメンバーとの接触の際に、前記結合誘発型活性化ポリペプチドが前記細胞を活性化させる、前記システム。
[本発明1122]
前記細胞が、免疫細胞、始原細胞または前駆細胞、幹細胞、及びニューロンからなる群より選択される、本発明1121のシステム。
[本発明1123]
前記細胞が免疫細胞であり、前記結合誘発型転写スイッチが抗原誘発型転写スイッチであり、前記結合誘発型活性化ポリペプチドが抗原誘発型活性化ポリペプチドであり、前記第一の特異的結合対の前記第二のメンバーとの接触の際に、前記抗原誘発型活性化ポリペプチドが発現され、前記第二の特異的結合対の前記第二のメンバーとの接触の際に、前記抗原誘発型活性化ポリペプチドが前記免疫細胞を活性化させて、前記第二の特異的結合対の前記第一のメンバーを発現する標的細胞を認識する、本発明1122のシステム。
[本発明1124]
前記抗原誘発型活性化ポリペプチドが、キメラ抗原受容体またはその変異体である、本発明1123のシステム。
[本発明1125]
前記抗原誘発型活性化ポリペプチドが、操作Ｔ細胞受容体またはその変異体である、本発明1123のシステム。
[本発明1126]
前記発現された結合誘発型転写スイッチが、ＳｙｎＮｏｔｃｈポリペプチドである、本発明1121〜1125のいずれかのシステム。
[本発明1127]
細胞の活性を局所的に調節する方法であって、
第一の細胞において、結合トランスデューサと、細胞内ドメインと、可溶性アダプター分子上の第一のエピトープと特異的に結合する第一のアダプター結合ドメインを含む第一の細胞外ドメインとを含む結合誘発型転写スイッチを発現させること；
前記第一の細胞と：
ｉ）前記可溶性アダプター分子上の第二のエピトープと特異的に結合する第二のアダプター結合ドメインを含む第二の細胞外ドメインを発現する第二の細胞；及び
ｉｉ）有効濃度の前記可溶性アダプター分子
を接触させること
を含み、前記第一のアダプター結合ドメイン及び前記第二のアダプター結合ドメインの、前記アダプター分子への結合が、前記細胞内ドメインを活性化するための結合シグナルを伝達するように前記結合トランスデューサを誘導し、それにより、活性化した細胞内ドメインが産生され、前記活性化した細胞内ドメインが、前記細胞の遺伝子産物の発現、前記細胞の増殖、前記細胞のアポトーシス、前記細胞の非アポトーシス性死、前記細胞の分化、前記細胞の脱分化、前記細胞の遊走、前記細胞からの分子の分泌及び前記細胞の細胞接着からなる群より選択される前記第一の細胞の活性を調節する、前記方法。
[本発明1128]
前記接触が、前記可溶性アダプター分子を前記細胞にｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｅｘ  ｖｉｖｏで適用することを含む、本発明1127の方法。
[本発明1129]
前記接触が、前記可溶性アダプター分子を前記細胞にｉｎ  ｖｉｖｏで投与することを含む、本発明1127の方法。
[本発明1130]
前記第一の細胞と有効濃度の前記可溶性アダプター分子を接触させることが、前記第一の細胞を、前記アダプター分子を発現する第三の細胞の存在下に置くことを含む、本発明1127の方法。
[本発明1131]
前記第三の細胞が、前記アダプター分子を構成的に発現する、本発明1130の方法。
[本発明1132]
前記第三の細胞が、前記アダプター分子を条件的に発現する、本発明1130の方法。
[本発明1133]
前記第一の細胞外ドメイン及び前記可溶性アダプター分子が、特異的対合対の第一及び第二のメンバーである、本発明1127〜1132のいずれかの方法。
[本発明1134]
前記第二の細胞外ドメイン及び前記可溶性アダプター分子が、特異的結合対の第一及び第二のメンバーである、本発明1127〜1132のいずれかの方法。
[本発明1135]
前記第一の細胞外ドメイン及び第二の細胞外ドメインが、抗体である、本発明1127〜1134のいずれかの方法。
[本発明1136]
前記第一の細胞外ドメイン及び第二の細胞外ドメインの一方または両方が、ナノボディである、本発明1135の方法。
[本発明1137]
前記細胞内ドメインが、転写因子である、本発明1127〜1136のいずれかの方法。
[本発明1138]
前記活性化した細胞内ドメインが、前記第一の細胞の内在性遺伝子産物の発現を調節する、本発明1127〜1137のいずれかの方法。
[本発明1139]
前記活性化した細胞内ドメインが、前記第一の細胞の異種遺伝子産物の発現を調節する、本発明1127〜1137のいずれかの方法。
[本発明1140]
前記結合トランスデューサが、リガンド誘導性タンパク質分解切断部位を含み、前記第一の細胞外ドメイン及び前記第二の細胞外ドメインの、前記可溶性アダプター分子への結合が、前記結合トランスデューサの前記リガンド誘導性タンパク質分解切断部位での切断を誘導し、それにより、前記結合シグナルが伝達されかつ、前記細胞内ドメインが、前記細胞内ドメインをタンパク質分解的に放出することによって活性化される、本発明1127〜1139のいずれかの方法。
[本発明1141]
第一の抗原に応答する第一の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；
前記第一の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ特異的結合対の第一のメンバーに特異的に結合する細胞外ドメインを含むＣＡＲをコードする核酸に作動可能に連結している、第一のプロモーター；
第二の抗原に応答する第二の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；及び
前記第二の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ細胞内ＣＡＲ阻害ドメインをコードする核酸に作動可能に連結している、第二のプロモーター
を含み、前記第二の抗原の存在下で、前記細胞内ＣＡＲ阻害ドメインが発現されて前記ＣＡＲによる前記細胞の活性化が阻害され、前記第一の抗原の存在下かつ前記第二の抗原の非存在下で、前記特異的結合対の前記第二のメンバーによりＣＡＲが発現されて活性化可能である、宿主細胞。
[本発明1142]
第一の抗原に応答する第一の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；
前記第一の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ特異的結合対の第一のメンバーに特異的に結合する細胞外ドメインを含むＣＡＲの第一の部分をコードする核酸に作動可能に連結している、第一のプロモーター；
第二の抗原に応答する第二の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；及び
前記第二の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ細胞内シグナル伝達ドメインを含むＣＡＲの第二の部分をコードする核酸に作動可能に連結している、第二のプロモーター
を含み、前記第一の抗原及び第二の抗原の存在下で、前記ＣＡＲの前記第一及び第二の部分が発現され、前記ＣＡＲが前記特異的結合対の前記第二のメンバーにより活性化可能である、宿主細胞。
[本発明1143]
第三の抗原に応答する第三の結合誘発型転写スイッチをコードする核酸；及び
前記第三の結合誘発型転写スイッチに応答し、かつ細胞内ＣＡＲ阻害ドメインをコードする核酸に作動可能に連結している、第三のプロモーター
をさらに含み、前記第三の抗原の存在下で、前記細胞内ＣＡＲ阻害ドメインが発現されて前記ＣＡＲによる前記細胞の活性化が阻害される、本発明1142の細胞。