【手続補正書】
【提出日】平成30年12月4日(2018.12.4)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
イン・サイチュー・ハイブリダイゼーションおよび免疫組織化学への適用のために染色品質を評価する方法であって、
-組織標本のマルチスペクトル画像データを分離して、検体強度画像を得るステップ（１４１０）であって、各検体強度画像が１つの染色からのシグナルを含む、ステップと、
-前記検体強度画像における画素強度値に基づいて、均一性メトリックを計算し（１４２０）、および／または分布メトリックを計算し（１４３０）、および／または散布度メトリックを計算する（１４４０）ステップと、
-前記計算したメトリックを、画素強度の均一性、分布、および／または散布度に関する所定のカットオフ値と比較することによって、スライドの染色品質を評価するステップ（１４５０）であって、前記計算したメトリックが前記所定のカットオフ値と一致するまたはそれを超過する場合、前記スライドの染色品質が受入可能であると評価され、前記計算したメトリックが前記所定のカットオフ値と一致しない場合、前記スライドの染色品質が受入不可能であると評価される、ステップと、を含み、
前記検体強度画像における画素強度値の均一性および分布の前記メトリックが、前記検体強度画像のエントロピー計算によって導き出され、前記検体強度画像における画素強度値の散布度の前記メトリックが、平均-分散値の計算によって導き出される、方法。
【請求項２】
請求項１記載の染色品質を評価する方法において、前記エントロピー値が、前記検体強度画像（５２０）の各々から強度値の画像ヒストグラムを導き出し、検体強度画像からサンプリングされた画素がそれぞれのヒストグラムにおいて特定の値を有する確率を計算することによって、計算される、方法。
【請求項３】
請求項２記載の染色品質を評価する方法において、前記強度値の画像ヒストグラムが、各検体強度画像からの画素をビンにソートすることによって導き出される、方法。
【請求項４】
請求項３記載の染色品質を評価する方法において、検体強度画像からサンプリングされた画素が前記それぞれのヒストグラムにおいて特定の値を有する前記確率が、前記導き出されたヒストグラムの全てのビンにおける画素の総数を合計して（５５０）、前記導き出されたヒストグラムにおける画素の総数を求め、前記ヒストグラムの各ビンにおける画素数を、前記ヒストグラムにおける画素の総数で除算して（５６０）、画素が特定のビン内に属する確率を求め、画素が特定のビンに属する各確率に、前記確率の２を基底とする対数を乗算して（５７０）ビット単位の値を求め、前記ビット単位の値を合計する（５８０）ことによって、計算される、方法。
【請求項５】
請求項１から４までのいずれか１項記載の染色品質を評価する方法において、前記平均-分散比の値が、前記検体強度画像の各々から強度値の画像ヒストグラムを導き出し（５２０）、前記導き出したヒストグラムからモード値および分散値を判定し（５３０）、前記導き出したヒストグラムから、測定強度モード値および測定強度分散値の比を計算する（５４０）ことによって、計算される、方法。
【請求項６】
請求項１から５までのいずれか１項記載の染色品質を評価する方法において、前記染色が、量子ドット、蛍光体、酵素沈着蛍光体、および色原体からなる群から選択される、方法。
【請求項７】
請求項１から６までのいずれか１項記載の染色品質を評価する方法において、前記マルチスペクトル画像データがスペクトル・キューブから導き出される、方法。
【請求項８】
請求項１から７までのいずれか１項記載の染色品質を評価する方法において、前記マルチスペクトル画像データが、線形最小二乗アルゴルズムを適用することによって分離される、方法。
【請求項９】
請求項１から８までのいずれか１項記載の染色品質を評価する方法において、前記検体強度画像が、前記エントロピー値および平均-分散比の値を計算する前に、篩にかけられる、方法。
【請求項１０】
イン・サイチュー・ハイブリダイゼーションおよび免疫組織化学への適用のために、染色品質を評価する客観的判断基準を確立する方法であって、
-１組の基準スライドを選択し、基準スライド毎にマルチスペクトル画像データを得るステップであって、各基準スライドに染色品質を定量化する評定データが注釈として付けられる、ステップと、
-組織標本のマルチスペクトル画像データを分離して検体強度画像を得るステップ（１４１０）であって、各検体強度画像が１つの染色からのシグナルを含む、ステップと、
-前記検体強度画像における画素強度値に基づいて、均一性メトリックを計算し（１４２０）、分布メトリックを計算し（１４３０）、および散布度メトリックを計算する（１４４０）ステップであって、
前記検体強度画像における画素強度値の均一性および分布の前記メトリックが、前記検体強度画像のエントロピー計算によって導き出され、前記検体強度画像における画素強度値の散布度の前記メトリックが、平均-分散値の計算によって導き出される、
ステップと、
-前記検体強度画像と、前記染色品質を定量化する評定データとに基づいて、前記計算したメトリックを組み合わせることによって、前記染色品質を評価するために、画素強度の均一性、分布、および／または散布度に対してカットオフ値を導き出すステップと、
を含む、方法。
【請求項１１】
請求項１０記載の方法において、前記カットオフ値が、サポート・ベクトル・マシン、下判別分析および／またはロジスティック回帰を適用することによって導き出される、方法。
【請求項１２】
客観的染色評価のためのコンピュータ・デバイス（１４）であって、１つ以上のプロセッサ（１２０）と少なくとも１つのメモリ（１１０）とを含み、前記少なくとも１つのメモリ（１１０）が、前記１つ以上のプロセッサによる実行のための非一時的コンピュータ読み取り可能命令を格納し、前記１つ以上のプロセッサ（１１０）に、
免疫組織化学アッセイまたはイン・サイチュー・ハイブリダイゼーションアッセイにおいて、特定のバイオマーカの存在を求めて染色された組織標本のマルチスペクトル画像データを分離して、検体強度画像を得させ、各検体強度画像が１つの染色からのシグナルを含み、
（ｉ）前記検体強度画像の各々から強度値の画像ヒストグラムを導き出し、（ｉｉ）検体強度画像からサンプリングされた画素がそれぞれのヒストグラムにおいて特定の値を有する確率を計算することによって、前記検体強度画像の各々についてエントロピー値を計算させ、
（ｉ）前記検体強度画像の各々から強度値の画像ヒストグラムを導き出し、（ｉｉ）前記強度ヒストグラムから測定強度モード値および測定強度分散値の比を計算することによって、前記検体強度画像の各々について平均-分散比を計算させ、
前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値を、所定のエントロピー・カットオフ値および平均-分散比カットオフ値と比較することによって、染色の均一性および／または異常バックグラウンド染色の存在を評価させ、前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値が前記所定のカットオフ値と一致するまたはそれを超過する場合、前記染色の均一性および／または異常バックグラウンド染色の存在が、受入可能であると評価され、前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値が前記所定のカットオフ値と一致しない場合に前記染色の均一性および／または異常バックグラウンド染色の存在が、受入不可能であると評価される、
コンピュータ・デバイス（１４）。
【請求項１３】
請求項１２記載のコンピュータ・デバイス（１４）と、マルチスペクトル撮像システム（１２）とを含む、システム（１０）。
【請求項１４】
コンピュータ実装染色評価方法であって、
マルチスペクトル画像データを分離して検体強度画像を得るステップであって、前記検体強度画像が、各々、特定の染色からのシグナルに対応する１つの画像チャネルを含む、ステップと、
前記検体強度画像の各々について、エントロピー値を計算するステップと、
前記検体強度画像の各々について、平均-分散比を計算するステップと、
前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値を所定のエントロピー・カットオフ値および平均-分散比カットオフ値と比較することによって、スライドの染色品質を評価するステップであって、前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値が前記所定のカットオフ値と一致するまたはそれを超過する場合、染色品質が受入可能であると評価され、前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値が前記所定のカットオフ値と一致しない場合、前記染色品質が、受入不可能であると評価される、ステップと、
を含む、コンピュータ実装方法。
【請求項１５】
染色評価に対する客観的判断基準を確立するためのコンピュータ実装方法であって、
複数の基準スライドからの組織標本のマルチスペクトル画像データを分離して、一連の検体強度画像を得るステップであって、各検体強度画像が、１つの染色からのシグナルを含み、前記基準スライドが、各々、受入可能または受入不可能であると識別される、ステップと、
前記得られた検体強度画像の各々に基づいて、エントロピー値および平均-分散比の値を計算するステップと、
前記計算したエントロピー値および平均-分散比の値に基づいて、染色品質評価に対するカットオフ値を導き出すステップであって、前記染色品質評価に対するカットオフ値が、前記免疫組織化学アッセイまたはイン・サイチュー・ハイブリダイゼーション・アッセイにおいて使用された染色に対応する、ステップと、
を含む、コンピュータ実装方法。