【手続補正書】
【提出日】平成31年1月31日(2019.1.31)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
画像化ユニットとを備えており、画像化ユニットが、
第１の表面と、対向する第２の表面と；
センサレンズと；
前記センサレンズを少なくとも部分的に包み込むレンズケースと；
レンズケースに係合するような構成のギアを有する集光機構とを備えており、
前記第１の表面は、前記センサレンズの表面を有し；
前記第２の表面は、光学センサ回路基板を有し；
前記集光機構は、前記センサレンズの焦点を調節するためにエンクロージャーの外側から接近することができるような構成である、生物学的分析のための装置。
【請求項２】
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
前記生体サンプルの少なくとも一部からの発光を前記光学センサに向かわせるような構成のセンサレンズと；
前記励起光路に沿って配置される被照射表面であって、該被照射表面によって反射される前記励起源からの放射を含む反射された放射を生成するような構成の被照射表面と；
放射シールドとを備えており、放射シールドは、
前記発光光路に沿って配置されるセンサ開口部と；
前記反射された放射が前記光学センサによって受け入れられず、前記装置の別の表面にも反射しないように、前記センサ開口部と協働するように配置された遮断構造とを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項３】
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
エネルギーまたは力の検出ユニットとを備えており、エネルギーまたは力の検出ユニットは、
前記光路の外側に配置されたエネルギーまたは力のセンサと；
ビームスプリッターに隣接して配置され、該ビームスプリッターから前記力センサへと放射を移動させるような構成のライトパイプとを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項４】
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
放射を発するような構成の位置光源と、該位置光源からの放射を受け入れるような構成の対応する位置センサであって、該位置光源と該位置センサが、少なくとも１つの前記光路に沿って配置される光学要素の位置の指標となる位置シグナルを生成するような構成である、位置光源と位置センサと；
位置光源からの放射を少なくとも一部分遮断するような構成の放射シールドとを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項５】
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
前記光路を包み込む光学エンクロージャーであって、該エンクロージャーの外側の光が該エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、該エンクロージャーの外側の位置から該エンクロージャーの内側の位置までワイヤまたはケーブルを通すような構成のスプリットワイヤグロメットを備える光学エンクロージャーと；
前記エンクロージャーの外側の光が前記エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、センサレンズの三次元調節を行うような構成のレンズ穴カバーとを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項６】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムとを備えており、
前記光学センサが、相補型金属酸化物半導体センサである、生物学的分析のための装置。
【請求項７】
前記励起光路と、前記発光光路の両方に沿って配置されたビームスプリッターをさらに備えている、請求項１、２、４、５または６に記載の装置。
【請求項８】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成であり、分割された前記生体サンプルに対してポリメラーゼ連鎖反応アッセイを行うように構成されたサーマルサイクラーを含むベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置され、前記励起ビームを前記サンプルホルダの方に向かわせるような構成のサンプルレンズを含む、励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置されるビームスプリッターであって、第１の励起ビームを受け入れ、第２の励起ビームを受け入れるように配置され、前記サンプルレンズが、該ビームスプリッターと前記ベース部材との間の前記励起光路に沿って配置される、ビームスプリッターと；
前記ビームスプリッターからの励起ビームの放射を受け入れ、前記励起ビーム放射の１０％未満が反射して前記ビームスプリッターに戻される、ビームダンプと；
画像化ユニットであって、該画像化ユニットが、
第１の表面と、対向する第２の表面と；
センサレンズと；
前記センサレンズを少なくとも部分的に包み込むレンズケースと；
前記レンズケースに係合するような構成のギアを有する集光機構とを備えており、
前記第１の表面は、前記センサレンズの表面を有し；
前記第２の表面は、光学センサ回路基板を有し；
前記集光機構は、前記センサレンズの焦点を調節するためにエンクロージャーの外側から接近することができるような構成である、画像化ユニットと；
前記ビームスプリッターと前記ベース部材との間の前記励起光路に沿って配置される被照射表面であって、該被照射表面によって反射される前記励起源からの放射を含む、反射された放射を生成するような構成の被照射表面と；
放射場であって、該放射場は、
前記ビームスプリッターと前記センサレンズとの間の前記発光光路に沿って配置されるセンサ開口部と；
前記反射された放射が前記光学センサによって受け入れられず、装置の別の表面にも反射しないように、前記センサ開口部と協働するように配置された遮断構造とを備える、放射場と；
エネルギーまたは力の検出ユニットであって、該エネルギーまたは力の検出ユニットが、
光路の外側に配置されたエネルギーまたは力のセンサと；
前記ビームスプリッターに隣接して配置され、ビームスプリッターから上述の力センサへと放射を移動させるような構成のライトパイプとを含む、エネルギーまたは力の検出ユニットと；
放射を発するような構成の位置光源と、該位置光源からの放射を受け入れるような構成の対応する位置センサであって、該位置光源と該位置センサが、少なくとも１つの光路に沿って配置される光学要素の位置の指標となる位置シグナルを生成するような構成である、位置光源と位置センサと；
前記位置光源からの放射を少なくとも一部分遮断するような構成の放射シールドと；
前記光路を包み込む光学エンクロージャーであって、該エンクロージャーの外側の光が該エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、該エンクロージャーの外側の位置から該エンクロージャーの内側の位置までワイヤまたはケーブルを通すような構成のスプリットワイヤグロメットを備える光学エンクロージャーと；
前記エンクロージャーの外側の光が前記エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、センサレンズの三次元調節を行うような構成のレンズ穴カバーとを備え、
前記光学センサが、相補型金属酸化物半導体センサである、生物学的分析のための装置。
【請求項９】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起源とサンプルホルダとの間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサへと向かわせるような構成の発光光学システムと；
画像化ユニットとを備えており、該画像化ユニットが、
第１の表面と、対向する第２の表面と；
センサレンズと；
前記センサレンズを少なくとも部分的に包み込むレンズケースと；
レンズケースに係合するような構成のギアを有する集光機構とを備えており、
前記第１の表面は、前記センサレンズの表面を有し；
前記第２の表面は、光学センサ回路基板を有し；
前記集光機構は、前記センサレンズの焦点を調節するためにエンクロージャーの外側から接近することができるような構成である、生物学的分析のための装置。
【請求項１０】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記サンプルホルダとの間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記サンプルホルダと前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、生体サンプルからの発光を光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記生体サンプルの少なくとも一部からの発光を光学センサに向かわせるような構成のセンサレンズと；
ビームスプリッターと前記ベース部材との間の前記励起光路に沿って配置される被照射表面であって、該被照射表面によって反射される前記励起源からの放射を含む反射された放射を生成するような構成の被照射表面と；
放射シールドとを備えており、放射シールドは、
前記ビームスプリッターと前記センサレンズとの間の前記発光光路に沿って配置されるセンサ開口部と；
反射された放射が前記光学センサによって受け入れられず、装置の別の表面にも反射しないように、前記センサ開口部と協働するように配置された遮断構造とを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項１１】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して前記生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
エネルギーまたは力の検出ユニットとを備えており、該エネルギーまたは力の検出ユニットが、
光路の外側に配置されたエネルギーまたは力のセンサと；
ビームスプリッターに隣接して配置され、該ビームスプリッターから上述の力センサへと放射を移動させるような構成のライトパイプとを含む、生物学的分析のための装置。
【請求項１２】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して前記生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置されるビームスプリッターであって、前記第１の励起ビームを受け入れ、前記第２の励起ビームを受け入れるように配置され、前記サンプルレンズが、該ビームスプリッターとベース部材との間の励起光路に沿って配置される、ビームスプリッターと；
放射を発するような構成の位置光源と、該位置光源からの放射を受け入れるような構成の対応する位置センサであって、該位置光源と該位置センサが、少なくとも１つの光路に沿って配置される光学要素の位置の指標となる位置シグナルを生成するような構成である、位置光源と位置センサと；
前記位置光源からの放射を少なくとも一部分遮断するような構成の放射シールドとを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項１３】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して前記生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサへと向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置され、前記第１の励起ビームを受け入れ、前記第２の励起ビームを受け入れるように配置されるビームスプリッターと；
光路を包み込み、エンクロージャーの外側の光が該エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、該エンクロージャーの外側の位置から該エンクロージャーの内側の位置までワイヤまたはケーブルを通すような構成のスプリットワイヤグロメットを備える光学エンクロージャーと
前記エンクロージャーの外側の光が前記エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、センサレンズの三次元調節を行うような構成のレンズ穴カバーとを備えている、生物学的分析のための装置。
【請求項１４】
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサへと向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置され、前記第１の励起ビームを受け入れ、前記第２の励起ビームを受け入れるように配置される、ビームスプリッターとを備えており、
前記光学センサが、相補型金属酸化物半導体センサである、生物学的分析のための装置。
【請求項１５】
前記ベース部材と前記ビームスプリッターとの間の前記励起光路に沿って配置される温度制御されたカバーをさらに備えている、請求項１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３または１４に記載の装置。
【請求項１６】
ベース部材が、前記サンプルホルダまたは前記生体サンプルの温度を制御するような構成のサンプルブロックアセンブリを備えている、請求項１、２、３、４、５、６、８、９、１０、１１、１２、１３または１４に記載の装置。
【請求項１７】
前記励起光学システムが、前記励起ビームを前記ベース部材に向かわせるような構成のサンプルレンズを備えており、前記サンプルレンズが、複数の空間的に分けられた前記領域にわたって延びるような構成のフィールドレンズを備えている、請求項１、２、３、４、５、６、９、１０、１１、１２、１３または１４に記載の装置。
【請求項１８】
前記第１の励起ビームは、前記第１の励起ビームの強度、力またはエネルギーが第１の所定の値より大きくなるような第１の波長範囲を有し、前記第２の励起ビームは、前記第２の励起ビームの強度、力またはエネルギーが第２の所定の値より大きくなるような第２の波長範囲を有し、第１の波長は、（１）第１の波長範囲の中心波長、または（２）第１の波長範囲の最大電磁場強度、力またはエネルギーの波長のうち、少なくとも１つであり、第２の波長は、（１）第２の波長範囲の中心波長、または（２）第２の波長範囲の最大電磁場強度、力またはエネルギーの波長のうち、少なくとも１つである、請求項８、９、１０、１１、１２、１３または１４に記載の装置。
【請求項１９】
前記光学センサが、少なくとも２つのアレイセンサを含む、請求項１、２、３、４、５、６、８、９、１０、１１、１２、１３または１４に記載の装置。
【請求項２０】
前記反射された放射が、前記装置の別の表面にも反射せずに前記センサレンズに衝突しないように、前記遮断構造が、前記センサ開口部と協働するように配置される、請求項２または１０に記載の装置。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００２】
本発明の実施形態に係るデバイス、装置、システムおよび方法は、一般的に、ｄＰＣＲおよびｑＰＣＲに関するが、本発明の実施形態は、多数の反応領域が処理され、観察され、および／または測定される任意のＰＣＲプロセス、実験、アッセイまたはプロトコルに適用可能であろう。本発明の実施形態に係るｄＰＣＲアッセイまたは実験において、少なくとも１つの標的ポリヌクレオチドまたはヌクレオチド配列を含む希釈溶液は、複数の反応領域に分けられ、その結果、これらの反応領域の少なくとも一部が、標的ヌクレオチド配列の１つの分子を含むか、または標的ヌクレオチド配列をどれも含まない。反応領域が、その後、ＰＣＲプロトコル、手順、アッセイ、プロセスまたは実験の中で熱的に循環するとき、標的ヌクレオチド配列の１つ以上の分子を含有する反応領域は、大きく増幅され、陽性の検出可能な検出シグナルを生成し、一方、標的ヌクレオチド配列を含まない反応領域は、増幅されず、検出シグナルを生成せず、または所定の閾値より低いシグナルまたはノイズレベルのシグナルを生成する。Ｐｏｉｓｓｏｎ統計学を用い、反応領域の間に分布した元々の溶液の中の標的ヌクレオチド配列の数は、陽性検出シグナルを生成する反応領域の数と相関関係にあるだろう。ある実施形態において、検出されたシグナルを用いて、元々の溶液に含まれる標的分子の数または数範囲を決定してもよい。例えば、検出システムは、１つの標的分子を含有する反応領域と、２つまたは少なくとも２つの標的分子を含有する反応領域とを区別するような構成であってもよい。これに加えて、またはこれに代えて、検出システムは、所定量の数の標的分子を含むか、または所定量未満の数の標的分子を含む反応領域と、この所定量を超える数の標的分子を含む反応領域とを区別するような構成であってもよい。特定の実施形態において、ｑＰＣＲおよびｄＰＣＲ両方のためのプロセス、アッセイまたはプロトコルは、１個の同じデバイス、装置またはシステムおよび方法を用いて行われる。
本発明は、例えば、以下を提供する。
（項目１）
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
画像化ユニットとを備えており、画像化ユニットが、
第１の表面と、対向する第２の表面と；
センサレンズと；
前記レンズセンサを少なくとも部分的に包み込むレンズケースと；
レンズケースに係合するような構成のギアを有する集光機構とを備えており、
前記第１の表面は、前記センサレンズの表面を有し；
前記第２の表面は、光学センサ回路基板を有し；
前記集光機構は、前記センサレンズの焦点を調節するためにエンクロージャーの外側から接近することができるような構成である、生物学的分析のための装置。
（項目２）
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
前記生体サンプルの少なくとも一部からの発光を前記光学センサに向かわせるような構成のセンサレンズと；
前記励起光路に沿って配置される被照射表面であって、該被照射表面によって反射される前記励起源からの放射を含む反射された放射を生成するような構成の被照射表面と；
放射シールドとを備えており、放射シールドは、
前記発光光路に沿って配置されるセンサ開口部と；
前記反射された放射が前記光学センサによって受け入れられず、前記装置の別の表面にも反射しないように、前記センサ開口部と協働するように配置された遮断構造とを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目３）
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
エネルギーまたは力の検出ユニットとを備えており、エネルギーまたは力の検出ユニットは、
前記光路の外側に配置されたエネルギーまたは力のセンサと；
ビームスプリッターに隣接して配置され、該ビームスプリッターから前記力センサへと放射を移動させるような構成のライトパイプとを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目４）
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
放射を発するような構成の位置光源と、該位置光源からの放射を受け入れるような構成の対応する位置センサであって、該位置光源と該位置センサが、少なくとも１つの前記光路に沿って配置される光学要素の位置の指標となる位置シグナルを生成するような構成である、位置光源と位置センサと；
位置光源からの放射を少なくとも一部分遮断するような構成の放射シールドとを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目５）
生物学的分析のための装置であって、
励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムと；
前記光路を包み込む光学エンクロージャーであって、該エンクロージャーの外側の光が該エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、該エンクロージャーの外側の位置から該エンクロージャーの内側の位置までワイヤまたはケーブルを通すような構成のスプリットワイヤグロメットを備える光学エンクロージャーと；
前記エンクロージャーの外側の光が前記エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、センサレンズの三次元調節を行うような構成のレンズ穴カバーとを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目６）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
発光光路に沿って配置される発光光学システムとを備えており、
前記光学センサが、相補型金属酸化物半導体センサである、生物学的分析のための装置。
（項目７）
前記励起光路と、前記発光光路の両方に沿って配置されたビームスプリッターをさらに備えている、項目１、２、３、４、５または６に記載の装置。
（項目８）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成であり、分割された前記生体サンプルに対してポリメラーゼ連鎖反応アッセイを行うように構成されたサーマルサイクラーを含むベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置され、前記励起ビームを前記サンプルホルダの方に向かわせるような構成のサンプルレンズを含む、励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置されるビームスプリッターであって、第１の励起ビームを受け入れ、第２の励起ビームを受け入れるように配置され、前記サンプルレンズが、該ビームスプリッターと前記ベース部材との間の前記励起光路に沿って配置される、ビームスプリッターと；
前記ビームスプリッターからの励起ビームの放射を受け入れ、前記励起ビーム放射の１０％未満が反射して前記ビームスプリッターに戻される、ビームダンプと；
画像化ユニットであって、該画像化ユニットが、
第１の表面と、対向する第２の表面と；
センサレンズと；
前記レンズセンサを少なくとも部分的に包み込むレンズケースと；
前記レンズケースに係合するような構成のギアを有する集光機構とを備えており、
前記第１の表面は、前記センサレンズの表面を有し；
前記第２の表面は、光学センサ回路基板を有し；
前記集光機構は、前記センサレンズの焦点を調節するためにエンクロージャーの外側から接近することができるような構成である、画像化ユニットと；
前記ビームスプリッターと前記ベース部材との間の前記励起光路に沿って配置される被照射表面であって、該被照射表面によって反射される前記励起源からの放射を含む、反射された放射を生成するような構成の被照射表面と；
放射場であって、該放射場は、
前記ビームスプリッターと前記センサレンズとの間の前記発光光路に沿って配置されるセンサ開口部と；
前記反射された放射が前記光学センサによって受け入れられず、装置の別の表面にも反射しないように、前記センサ開口部と協働するように配置された遮断構造とを備える、放射場と；
エネルギーまたは力の検出ユニットであって、該エネルギーまたは力の検出ユニットが、
光路の外側に配置されたエネルギーまたは力のセンサと；
前記ビームスプリッターに隣接して配置され、ビームスプリッターから上述の力センサへと放射を移動させるような構成のライトパイプとを含む、エネルギーまたは力の検出ユニットと；
放射を発するような構成の位置光源と、該位置光源からの放射を受け入れるような構成の対応する位置センサであって、該位置光源と該位置センサが、少なくとも１つの光路に沿って配置される光学要素の位置の指標となる位置シグナルを生成するような構成である、位置光源と位置センサと；
前記位置光源からの放射を少なくとも一部分遮断するような構成の放射シールドと；
前記光路を包み込む光学エンクロージャーであって、該エンクロージャーの外側の光が該エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、該エンクロージャーの外側の位置から該エンクロージャーの内側の位置までワイヤまたはケーブルを通すような構成のスプリットワイヤグロメットを備える光学エンクロージャーと；
前記エンクロージャーの外側の光が前記エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、センサレンズの三次元調節を行うような構成のレンズ穴カバーとを備え、
前記光学センサが、相補型金属酸化物半導体センサである、生物学的分析のための装置。
（項目９）
前記遮断構造が、前記反射された放射が、前記装置の別の表面にも反射せずに前記センサレンズに衝突しないように、前記センサ開口部と協働するように配置される、項目８に記載の装置。
（項目１０）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
励起源とサンプルホルダとの間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサへと向かわせるような構成の発光光学システムと；
画像化ユニットとを備えており、該画像化ユニットが、
第１の表面と、対向する第２の表面と；
センサレンズと；
前記レンズセンサを少なくとも部分的に包み込むレンズケースと；
レンズケースに係合するような構成のギアを有する集光機構とを備えており、
前記第１の表面は、前記センサレンズの表面を有し；
前記第２の表面は、光学センサ回路基板を有し；
前記集光機構は、前記センサレンズの焦点を調節するためにエンクロージャーの外側から接近することができるような構成である、生物学的分析のための装置。
（項目１１）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記サンプルホルダとの間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記サンプルホルダと前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、生体サンプルからの発光を光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記生体サンプルの少なくとも一部からの発光を光学センサに向かわせるような構成のセンサレンズと；
ビームスプリッターと前記ベース部材との間の前記励起光路に沿って配置される被照射表面であって、該被照射表面によって反射される前記励起源からの放射を含む反射された放射を生成するような構成の被照射表面と；
放射シールドとを備えており、放射シールドは、
前記ビームスプリッターと前記センサレンズとの間の前記発光光路に沿って配置されるセンサ開口部と；
反射された放射が前記光学センサによって受け入れられず、装置の別の表面にも反射しないように、前記センサ開口部と協働するように配置された遮断構造とを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目１２）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して前記生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
エネルギーまたは力の検出ユニットとを備えており、該エネルギーまたは力の検出ユニットが、
光路の外側に配置されたエネルギーまたは力のセンサと；
ビームスプリッターに隣接して配置され、該ビームスプリッターから上述の力センサへと放射を移動させるような構成のライトパイプとを含む、生物学的分析のための装置。
（項目１３）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して前記生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサに向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置されるビームスプリッターであって、前記第１の励起ビームを受け入れ、前記第２の励起ビームを受け入れるように配置され、前記サンプルレンズが、該ビームスプリッターとベース部材との間の励起光路に沿って配置される、ビームスプリッターと；
放射を発するような構成の位置光源と、該位置光源からの放射を受け入れるような構成の対応する位置センサであって、該位置光源と該位置センサが、少なくとも１つの光路に沿って配置される光学要素の位置の指標となる位置シグナルを生成するような構成である、位置光源と位置センサと；
前記位置光源からの放射を少なくとも一部分遮断するような構成の放射シールドとを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目１４）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して前記生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサへと向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置され、前記第１の励起ビームを受け入れ、前記第２の励起ビームを受け入れるように配置されるビームスプリッターと；
光路を包み込み、エンクロージャーの外側の光が該エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、該エンクロージャーの外側の位置から該エンクロージャーの内側の位置までワイヤまたはケーブルを通すような構成のスプリットワイヤグロメットを備える光学エンクロージャーと
前記エンクロージャーの外側の光が前記エンクロージャーに入らないように遮断しつつ、センサレンズの三次元調節を行うような構成のレンズ穴カバーとを備えている、生物学的分析のための装置。
（項目１５）
生物学的分析のための装置であって、
１つ以上の生体サンプルを処理するための複数の空間的に分けられた反応領域を含むサンプルホルダを受け入れるような構成のベース部材と；
第１の波長によって特徴付けられる第１の励起ビームと、該第１の波長とは異なる第２の波長によって特徴付けられる第２の励起ビームを生成するような構成の励起源と；
前記励起源に応答して生体サンプルからの発光を受け入れるような構成の光学センサと；
前記励起源と前記ベース部材との間の励起光路に沿って配置される励起光学システムと；
前記ベース部材と前記光学センサとの間の発光光路に沿って配置され、前記生体サンプルからの発光を前記光学センサへと向かわせるような構成の発光光学システムと；
前記励起光路および前記発光光路の両方に沿って配置され、前記第１の励起ビームを受け入れ、前記第２の励起ビームを受け入れるように配置される、ビームスプリッターとを備えており、
前記光学センサが、相補型金属酸化物半導体センサである、生物学的分析のための装置。
（項目１６）
該発光光路に沿って配置される１つ以上の発光フィルターをさらに備えている、項目７、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目１７）
発光の少なくとも一部が、少なくとも１つの前記励起ビームに応答して、前記生体サンプルの少なくとも一部からの蛍光発光を含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目１８）
発光の少なくとも一部が、少なくとも１つの前記励起ビームに応答して、生体サンプルの少なくとも一部からの蛍光発光を含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目１９）
発光の少なくとも一部が、前記生体サンプルの少なくともいくつかによって反射され、屈折され、回折され、散乱され、または分極する前記励起ビームの少なくとも１つからの放射を含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目２０）
前記ベース部材と前記ビームスプリッターとの間の前記励起光路に沿って配置される温度制御されたカバーをさらに備えている、項目１、２、３、４、５、６、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目２１）
前記ベース部材と前記ビームスプリッターとの間の前記励起光路に沿って配置される鏡をさらに備えている、項目２０に記載の装置。
（項目２２）
前記ベース部材と前記ビームスプリッターとの間の前記励起光路に沿って配置される鏡をさらに備えている、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目２３）
ベース部材が、前記サンプルホルダまたは前記生体サンプルの温度を制御するような構成のサンプルブロックアセンブリを備えている、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目２４）
前記サンプルブロックアセンブリが、サンプルブロック、Ｐｅｌｔｉｅｒデバイスまたはヒートシンクのうち、１つ以上を備えている、項目２３に記載の装置。
（項目２５）
前記ベース部材が、サーマルコントローラーを備えている、項目１、２、３、４、５、６、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目２６）
前記サーマルコントローラーが、前記ベース部材、前記サンプルホルダまたは分割された前記生体サンプルのうち、少なくとも１つの温度を制御するような構成である、項目２５に記載の装置。
（項目２７）
前記サーマルコントローラーが、ＰＣＲアッセイを行うような構成のサーマルサイクラーを備えている、項目２５に記載の装置。
（項目２８）
前記装置が前記サンプルホルダを備えている、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目２９）
前記サンプルホルダが、マイクロタイタープレート、複数のウェルまたは貫通穴を含む基材、１つ以上のチャンネルを含む基材、または１つ以上の生体サンプルを含有する複数のビーズまたは球を含むチャンバのうち、１つ以上を備えている、項目２８に記載の装置。
（項目３０）
複数の空間的に分けられた前記反応領域は、基材中の複数のウェル、複数の貫通穴、基材の上またはチャンネルの中の複数の別個の位置、反応ボリューム内の複数のマイクロビーズまたは微小球などのうち、１つ以上を備えている、項目２８に記載の装置。
（項目３１）
空間的に分けられた前記反応領域の少なくとも一部が、１つ以上の前記生体サンプルを含む、項目２８に記載の装置。
（項目３２）
１つ以上の前記生体サンプルが、少なくとも１つの標的核酸配列、少なくとも１つのプライマー、少なくとも１つのバッファ、少なくとも１つのヌクレオチド、少なくとも１つの酵素、少なくとも１つの洗剤、少なくとも１つのブロッキング剤、または標的核酸配列または参照核酸配列を検出するのに適した少なくとも１つの染料、マーカー、および／またはプローブのうち、１つ以上を含む、項目３１に記載の装置。
（項目３３）
前記サンプルホルダが、マイクロタイタープレートを備えており、前記反応領域が、少なくとも９６ウェル、少なくとも３８４ウェルまたは少なくとも１５３６ウェルを含む、項目２８に記載の装置。
（項目３４）
前記サンプルホルダが、第１の表面と、対向する第２の表面と、これらの表面の間に配置された複数の貫通穴とを含む基材を備えており、複数の貫通穴が、１つ以上の生体サンプルを含むような構成である、項目２８に記載の装置。
（項目３５）
前記基材が、少なくとも３０９６の貫通穴または少なくとも２０，０００の貫通穴を含む、項目３４に記載の装置。
（項目３６）
前記サンプルホルダが、１つ以上の標的分子または一連の分子が通過するような構成の一連のキャピラリーを備えている、項目２８に記載の装置。
（項目３７）
前記サンプルホルダが、ポリメラーゼ連鎖反応、シークエンシングアッセイまたはキャピラリー電気泳動アッセイ、ブロットアッセイのうち、少なくとも１つを行うような構成である、項目２８に記載の装置。
（項目３８）
前記励起光学システムが、前記励起ビームを前記ベース部材に向かわせるような構成のサンプルレンズを備えている、項目１、２、３、４、５、６、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目３９）
前記サンプルレンズが、複数の空間的に分けられた前記領域にわたって延びるような構成のフィールドレンズを備えている、項目３８に記載の装置。
（項目４０）
複数のレンズをさらに備えており、それぞれのレンズが、それぞれ、複数の前記反応領域のそれぞれの１つの上に配置される、項目８、３８または３９に記載の装置。
（項目４１）
前記サンプルレンズは、混合レンズ、湾曲した鏡、屈折光学要素、またはホログラフィー光学要素のうち、少なくとも１つを備えている、項目８、３８または３９に記載の装置。
（項目４２）
前記サンプルレンズが、前記サンプルホルダ、空間的に分けられた前記反応領域または前記光学センサのうち、少なくとも１つのためのテレセントリック光学システムを与えるような構成である、項目８、３８または３９に記載の装置。
（項目４３）
前記サンプルレンズがＦｒｅｓｎｅｌレンズを含む、項目８、３８または３９に記載の装置。
（項目４４）
前記サンプルレンズが、複数の前記反応領域に対応する複数のレンズを備えている、項目８、３８または３９に記載の装置。
（項目４５）
前記ビームスプリッターが、前記励起ビームを伝えるような構成であるか、または、前記励起ビームを反射するような構成である、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目４６）
前記ビームスプリッターが、少なくとも１００ナノメートルの波長帯にわたって一定の反射率を特徴とする広帯域ビームスプリッターを含む、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目４７）
前記ビームスプリッターが、４５０ナノメートル〜６８０ナノメートルの波長帯にわたって一定の反射率を特徴とする、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目４８）
前記ビームスプリッターが、電磁スペクトルの可視光波長帯にわたって一定の反射率を特徴とする、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目４９）
前記ビームスプリッターが、ニュートラルデンシティーフィルターを備えている、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５０）
前記ビームスプリッターが、５０／５０ビームスプリッターを含む、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５１）
前記ビームスプリッターが、二色ビームスプリッターを含む、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５２）
前記ビームスプリッターが、複数波長帯のビームスプリッターを含む、項目７、８、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５３）
前記第１の励起ビームと前記第２の励起ビームが一時的に分割されており、および／または空間的に分けられている、項目８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５４）
前記第１の励起ビームと前記第２の励起ビームが同時に作られる、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５５）
前記励起光源が、少なくとも１つの白熱ランプ、少なくとも１つのガス放電ランプ、少なくとも１つの発光ダイオード、少なくとも１つの有機発光ダイオード、または少なくとも１つのレーザーのうち、１つ以上を含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５６）
少なくとも１つの前記ガス放電ランプが、ハロゲンランプ、キセノンランプ、アルゴンランプまたはクリプトンランプのうち、１つ以上を含む、項目５５に記載の装置。
（項目５７）
少なくとも１つの前記レーザーが、ダイオードレーザー、アルゴンレーザー、キセノンレーザー、エキシマレーザー、ソリッドステートレーザー、ヘリウム−ネオンレーザー、または染料レーザーのうち、１つ以上を含む、項目５５に記載の装置。
（項目５８）
前記第１の励起ビームは、前記第１の励起ビームの強度、力またはエネルギーが第１の所定の値より大きくなるような第１の波長範囲を有し、前記第２の励起ビームは、前記第２の励起ビームの強度、力またはエネルギーが第２の所定の値より大きくなるような第２の波長範囲を有し、第１の波長は、（１）第１の波長範囲の中心波長、または（２）第１の波長範囲の最大電磁場強度、力またはエネルギーの波長のうち、少なくとも１つであり、第２の波長は、（１）第２の波長範囲の中心波長、または（２）第２の波長範囲の最大電磁場強度、力またはエネルギーの波長のうち、少なくとも１つである、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目５９）
少なくとも１つの前記中心波長が、対応する波長範囲の平均波長である、項目５８に記載の装置。
（項目６０）
前記所定の値の少なくとも１つが、対応する波長範囲の対応する最大強度、力またはエネルギーの２０％未満である、項目５８に記載の装置。
（項目６１）
前記第２の所定の値が第１の所定の値と等しい、項目５８に記載の装置。
（項目６２）
前記第１の波長範囲が、前記第２の波長範囲と重なり合わないか、または前記第１の波長範囲が、前記第２の波長範囲と部分的にのみ重なり合う、項目５８に記載の装置。
（項目６３）
前記第２の波長が、前記第１の波長とは少なくとも２０ナノメートル異なっている、項目５８に記載の装置。
（項目６４）
前記第１の波長範囲および前記第２の波長範囲のうち、少なくとも１つは、少なくとも２０ナノメートルの値を有する、項目５８に記載の装置。
（項目６５）
前記第２の波長が、前記第１の波長とは少なくとも２０ナノメートル異なっている、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目６６）
前記励起源が光源を含み、前記第１の波長および前記第２の波長が、前記電磁スペクトルの可視光帯にある、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目６７）
前記励起源が、少なくとも１００ナノメートルの帯域幅を有する光源を含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目６８）
前記励起源が、前記励起光路の内側および外側を移動可能な複数の励起フィルターを備えている、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目６９）
少なくとも１つの前記励起フィルターが、少なくとも±１０ナノメートルの波長帯を有する、項目６８に記載の装置。
（項目７０）
前記励起フィルターは、少なくとも５個の励起フィルターを含む、項目６８に記載の装置。
（項目７１）
前記励起フィルターが、ＳＹＢＲ（登録商標）染料またはプローブ、ＦＡＭＴＭ染料またはプローブ、ＶＩＣ（登録商標）染料またはプローブ、ＲＯＸＴＭ染料またはプローブ、またはＴＡＭＲＡＴＭ染料またはプローブのうち１つ以上の蛍光を発するのに適した複数の帯域を通過させる複数のフィルターを含む、項目６８に記載の装置。
（項目７２）
前記励起フィルターが、回転可能なフィルターホイール構造に取り付けられ、それぞれのフィルターを前記励起光路の内側および外側に移動させる、項目６８に記載の装置。
（項目７３）
前記励起源が、複数の個々の励起源を含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目７４）
前記複数の個々の励起源が、二次元の一連の個々の励起源を形成する、項目７３に記載の装置。
（項目７５）
前記光学センサがアレイセンサを含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目７６）
前記アレイセンサが、相補型金属酸化物半導体センサまたは電荷結合素子センサのうち、少なくとも１つを含む、項目７５に記載の装置。
（項目７７）
前記光学センサが、少なくとも２つのアレイセンサを含む、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目７８）
さらに、前記生体サンプルの少なくとも一部からの直接発光を前記光学センサに向かわせるような構成のセンサレンズを備えている、項目２、３、４、６、１１、１２、１３または１５に記載の装置。
（項目７９）
前記光学センサが相補型金属酸化物半導体センサである、項目１、２、３、４、５、６、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。
（項目８０）
前記反射された放射が、前記装置の別の表面にも反射せずに前記センサレンズに衝突しないように、前記遮断構造が、前記センサ開口部と協働するように配置される、項目２または１１に記載の装置。
（項目８１）
さらに、複数の開口部を有する被加熱カバーを備えており、前記被照射領域が、該被加熱カバーの全ての開口部によって規定される領域を含む、項目２、８または１１に記載の装置。
（項目８２）
前記ベース部材に隣接して配置され、複数の前記反応領域に対応するような構成の複数の開口部を有する被加熱カバーをさらに備えている、項目１、２、３、４、５、６、８、１０、１１、１２、１３、１４または１５に記載の装置。