【手続補正書】
【提出日】平成30年12月19日(2018.12.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の特性および遺伝子型を有する酵母細胞:
特性ＩＩ．パノースを唯一の炭素源として資化することができ、少なくとも１つの以下の遺伝子型を有する、
遺伝子型ＩＶ：ＩＭＡ１ｐをコードする少なくとも３つの遺伝子を含み、ＩＭＡ１ｐが、配列番号１２のＩＭＡ１ｐ、配列番号１３のＩＭＡ１ｐ、配列番号１４のＩＭＡ１ｐ、配列番号１５のＩＭＡ１ｐ、配列番号２１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２２のＩＭＡ１ｐ、配列番号２３のＩＭＡ１ｐ、配列番号２４のＩＭＡ１ｐ、配列番号２５のＩＭＡ１ｐ、及び、少なくとも８０％の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、および／または
遺伝子型ＶＩ：ＡＧＴ１をコードする少なくとも３つの遺伝子を含み、ＡＧＴ１が、配列番号１８のＡＧＴ１、配列番号１９のＡＧＴ１、配列番号２０のＡＧＴ１、配列番号２６のＡＧＴ１、配列番号２７のＡＧＴ１、配列番号２８のＡＧＴ１、配列番号２９のＡＧＴ１、配列番号３０のＡＧＴ１、配列番号３１のＡＧＴ１、配列番号３２のＡＧＴ１、及び少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％などの配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、ならびに／あるいは
特性ＩＩＩ．１つ以上のジペプチド類を唯一の窒素源として資化することができ、少なくとも１つの以下の遺伝子型を有する、
遺伝子型Ｉ：ＤＡＬ５をコードする遺伝子を含み、ＤＡＬ５をコードする対立遺伝子が、配列番号６のＤＡＬ５、配列番号３９のＤＡＬ５、配列番号４０のＤＡＬ５、及び、少なくとも８０％の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択されるＤＡＬ５をコードする、および／または
遺伝子型ＩＩ：ＰＴＲ２をコードする少なくとも２つの対立遺伝子を含み、ＰＴＲ２をコードする少なくとも２つの対立遺伝子が、個別に、配列番号７のＰＴＲ２、配列番号８のＰＴＲ２、配列番号９のＰＲＴ２、配列番号３７を含むＰＲＴ２、配列番号３８のＰＲＴ２、配列番号４３のＰＲＴ２、配列番号４４のＰＲＴ２、及び少なくとも８０％の配列同一性を上記配列と共有する、それらの各々の機能的相同体をコードする遺伝子からなる群から選択される。
【請求項２】
前記酵母細胞が、
特性Ｉ：イソマルトースを唯一の炭素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、請求項１に記載の酵母細胞。
【請求項３】
前記酵母細胞が、前記パノースが、１〜５ｇ/Ｌの範囲内、１〜３ｇ/Ｌの範囲など、例えば、２ｇ/Ｌの濃度で存在している場合に、パノースを唯一の炭素源として資化することができる、請求項１に記載の酵母細胞。
【請求項４】
前記酵母細胞が、さらにアラントインを唯一の窒素源として資化することができる、請求項１〜３のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項５】
前記酵母細胞が、
特性ＩＶ：１つ以上のトリペプチド類を唯一の窒素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項６】
前記酵母細胞が、
特性Ｖ：５日間、前記酵母細胞の成長を許容する条件下で、インキュベーションした後に、１つ以上のアミノ酸のレベルを出発濃度の１０％を超えないレベルにまで下げることができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜５のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項７】
前記酵母細胞が、
特性ＶＩ：前記酵母細胞が少なくとも１０度のプラート糖含量を有する麦汁組成物に対して添加され、ジアセチルが所定のレベルになるまでインキュベーションされる場合に、プラート度当たり、少なくとも４.７プロミルのエタノールを生成することができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜６のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項８】
前記酵母細胞が、
特性ＶＩＩ：前記酵母細胞が少なくとも１０度のプラート糖含量を有する麦汁組成物に対して添加され、ジアセチルが所定のレベルになるまでインキュベーションされる場合に、少なくとも７０など、少なくとも６８の真正発酵度で糖を発酵させることができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜７のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項９】
前記酵母細胞が特性ＶＩＩを有し、特性ＶＩＩが、前記酵母細胞がその親株の一つの株のＲＤＦより高い、少なくとも２など、少なくとも１のＲＤＦで糖を発酵させることができることである、請求項１〜８のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１０】
前記酵母細胞が、
特性ＶＩＩＩ：メリビオースを唯一の炭素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜９のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１１】
前記酵母細胞が、
特性Ｘ：前記酵母細胞が少なくとも１０度のプラート糖含量を有する麦汁組成物に対して添加され、及び、４日間インキュベーションされる場合に、多くとも１,０００万個の細胞/ｍｌなど、多くとも１,２００万個の細胞/ｍｌが懸濁するように、沈降することができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１２】
前記酵母細胞が、
特性ＩＸ：イソマルトース、パノース、及び/または、メリビオースに加えて、１つ以上の二糖及び/または三糖を資化することができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１３】
前記二糖が、コージビオース、ニゲロース、スクロース、ツラノース、ロイクロース、及び、パラチノースからなる群から選択される、請求項１２に記載の酵母細胞。
【請求項１４】
前記酵母細胞が、
特性ＸＩ：長くとも４日間、例えば、長くとも３日間の一次発酵で麦汁を発酵することができる、
という特性をさらに有する、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１５】
前記酵母細胞が、
遺伝子型ＩＩＩ：ＵＢＲ１をコードする遺伝子を含む、
遺伝子型を有し、ＵＢＲ１が、配列番号１０を含むＵＢＲ１、配列番号１１のＵＢＲ１、配列番号４１を含むＵＢＲ１、配列番号４２のＵＢＲ１、配列番号４５を含むＵＢＲ１、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％などの配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１６】
前記酵母細胞が、
遺伝子型ＩＶ：ＩＭＡ１ｐをコードする少なくとも４つの遺伝子を含む、
遺伝子型を有し、前記ＩＭＡ１ｐが、配列番号１２のＩＭＡ１ｐ、配列番号１３のＩＭＡ１ｐ、配列番号１４のＩＭＡ１ｐ、配列番号１５のＩＭＡ１ｐ、配列番号２１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２２のＩＭＡ１ｐ、配列番号２３のＩＭＡ１ｐ、配列番号２４のＩＭＡ１ｐ、配列番号２５のＩＭＡ１ｐ、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１７】
前記酵母細胞が、
遺伝子型Ｖ：ＩＭＡ５ｐをコードする遺伝子、好ましくはＩＭＡ５ｐをコードする少なくとも２つの対立遺伝子を含む、
遺伝子型を有し、ＩＭＡ５ｐが、配列番号１６のＩＭＡ５ｐ、配列番号１７のＩＭＡ５ｐ、配列番号３４のＩＭＡ５ｐ、配列番号３５のＩＭＡ５ｐ、配列番号３６のＩＭＡ５ｐ、及び、少なくとも８０％の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１８】
前記酵母細胞が、
遺伝子型ＶＩ：配列番号１８のＡＧＴ１、配列番号１９のＡＧＴ１、配列番号２０のＡＧＴ１、配列番号２６のＡＧＴ１、配列番号２７のＡＧＴ１、配列番号２８のＡＧＴ１、配列番号２９のＡＧＴ１、配列番号３０のＡＧＴ１、配列番号３１のＡＧＴ１、配列番号３２のＡＧＴ１、及び少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択されるＡＧＴ１をコードする少なくとも３つの遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の酵母細胞。
【請求項１９】
飲料を製造するための方法であって、前記方法が、
ａ.  出発液体を準備すること、
ｂ.  請求項１〜１８のいずれか１項に記載の酵母細胞を準備すること、
ｃ.  前記出発液体を、前記酵母細胞で発酵し、それにより、飲料を製造すること、
のステップを含む、方法。
【請求項２０】
前記出発液体が、大麦及び/または麦芽の水性エキスを含む、請求項１９に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
飲料を製造するための方法であって、当該方法が、
Ｉ．出発液体を準備すること、
ＩＩ．本願発明の酵母細胞を準備すること、
ＩＩＩ．当該出発液体を、当該酵母細胞で発酵させること、
のステップを含む方法を提供することも本願発明の態様である。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
（項目１）
少なくとも１つの以下の特性を有する酵母細胞:
ＩＩ．パノースを唯一の炭素源として資化することができる、
ＩＩＩ．１つ以上のジペプチド類を唯一の窒素源として資化することができる。
（項目２）
前記酵母細胞が、
Ｉ．イソマルトースを唯一の炭素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目３）
前記酵母細胞が、前記パノースが、１〜５ｇ/Ｌの範囲内、１〜３ｇ/Ｌの範囲など、例えば、２ｇ/Ｌの濃度で存在している場合に、パノースを唯一の炭素源として資化することができる、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目４）
前記酵母細胞が、麦汁に含まれるパノースの少なくとも４５％を除去することができる、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目５）
前記酵母細胞が、
ＩＩＩ．１つ以上のジペプチド類を唯一の窒素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目６）
前記酵母細胞が、さらにアラントインを唯一の窒素源として資化することができる、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目７）
前記酵母細胞が、
ＩＶ．１つ以上のトリペプチド類を唯一の窒素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目８）
前記酵母細胞が、
Ｖ．５日間、前記酵母細胞の成長を許容する条件下で、インキュベーションした後に、１つ以上のアミノ酸のレベルを出発濃度の１０％を超えないレベルにまで下げることができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目９）
前記酵母細胞が、
ＶＩ．前記酵母細胞が少なくとも１０度のプラート糖含量を有する麦汁組成物に対して添加され、ジアセチルが所定のレベルになるまでインキュベーションされる場合に、プラート度当たり、少なくとも４.７プロミルのエタノールを生成することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目１０）
前記酵母細胞が、
ＶＩＩ．前記酵母細胞が少なくとも１０度のプラート糖含量を有する麦汁組成物に対して添加され、ジアセチルが所定のレベルになるまでインキュベーションされる場合に、少なくとも７０など、少なくとも６８の真正発酵度で糖を発酵させることができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目１１）
前記酵母細胞が特性ＶＩＩを有し、特性ＶＩＩが、その親株の一つの株のＲＤＦより高い、少なくとも２など、少なくとも１のＲＤＦで糖を発酵させることができる、という特性を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目１２）
前記酵母細胞が、
ＶＩＩＩ．メリビオースを唯一の炭素源として資化することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目１３）
前記酵母細胞が、
Ｘ．前記酵母細胞が少なくとも１０度のプラート糖含量を有する麦汁組成物に対して添加され、及び、４日間インキュベーションされる場合に、多くとも１,０００万個の細胞/ｍｌなど、多くとも１,２００万個の細胞/ｍｌが懸濁するように、沈降できるようにする、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目１４）
懸濁液での前記細胞数/ｍｌが、前記細胞の成長が許容される条件下で５日間のインキュベーションを行った後、出発細胞数/ｍｌの多くとも８０％、多くとも７０％など、例えば、多くとも６０％、多くとも５０％など、例えば、多くとも４０％である、項目１３に記載の酵母細胞。
（項目１５）
前記酵母細胞が、
ＩＸ．イソマルトース、パノース、及び/または、メリビオースに加えて、１つ以上の二糖及び/または三糖を資化することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目１６）
前記二糖が、コージビオース、ニゲロース、スクロース、ツラノース、ロイクロース、及び、パラチノースからなる群から選択される、項目１５に記載の酵母細胞。
（項目１７）
前記二糖が、コージビオースである、項目１５に記載の酵母細胞。
（項目１８）
前記二糖が、マルツロースである、項目１５に記載の酵母細胞。
（項目１９）
前記酵母細胞が、
ＸＩ．長くとも４日間、例えば、長くとも３日間の一次発酵で麦汁を発酵することができる、
という特性をさらに有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目２０）
前記酵母細胞が、
Ｉ．ＤＡＬ５をコードする遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目２１）
前記遺伝子型Ｉが、前記酵母細胞が、ＤＡＬ５をコードする少なくとも１つの対立遺伝子を含むことであって、ＤＡＬ５をコードする前記対立遺伝子が、配列番号６のＤＡＬ５、配列番号３９のＤＡＬ５、配列番号４０のＤＡＬ５、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％などの配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択されるＤＡＬ５をコードする、項目２０に記載の酵母細胞。
（項目２２）
前記酵母細胞が、
ＩＩ．ＰＴＲ２をコードする少なくとも２つの対立遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目２３）
前記遺伝子型ＩＩが、前記酵母細胞がＰＴＲ２をコードする少なくとも２つの対立遺伝子を含むことであって、それらが個別に、配列番号７のＰＴＲ２、配列番号８のＰＴＲ２、配列番号９のＰＲＴ２、配列番号３７を含むＰＲＴ２、配列番号３８のＰＲＴ２、配列番号４３のＰＲＴ２、配列番号４４のＰＲＴ２、及び少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらの各々の機能的相同体をコードする遺伝子からなる群から選択される、項目２２に記載の酵母細胞。
（項目２４）
前記酵母細胞が、
ＩＩＩ．ＵＢＲ１をコードする遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目２５）
前記遺伝子型ＩＩＩが、前記酵母細胞がＵＢＲ１をコードする少なくとも２つの対立遺伝子を含むことであって、それらが個別に、配列番号１０を含むＵＢＲ１、配列番号１１のＵＢＲ１、配列番号４１を含むＵＢＲ１、配列番号４２のＵＢＲ１、配列番号４５を含むＵＢＲ１、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、項目２４に記載の酵母細胞。
（項目２６）
前記酵母細胞が、
ＩＶ．ＩＭＡ１ｐをコードする少なくとも４つなどの少なくとも３つの遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目２７）
ＩＶ．ＩＭＡ１ｐをコードする少なくとも４つなどの少なくとも３つの遺伝子を含む、
遺伝子型を有する酵母細胞。
（項目２８）
前記ＩＭＡ１ｐが、配列番号１２のＩＭＡ１ｐ、配列番号１３のＩＭＡ１ｐ、配列番号１４のＩＭＡ１ｐ、配列番号１５のＩＭＡ１ｐ、配列番号２１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２２のＩＭＡ１ｐ、配列番号２３のＩＭＡ１ｐ、配列番号２４のＩＭＡ１ｐ、配列番号２５のＩＭＡ１ｐ、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、項目２６及び２７のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目２９）
前記遺伝子型ＩＶが、前記酵母細胞がＩＭＡ１ｐをコードする少なくとも５つの遺伝子を含むことであって、前記遺伝子が個別に、配列番号１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２のＩＭＡ１ｐ、配列番号３のＩＭＡ１ｐ、配列番号４のＩＭＡ１ｐ、配列番号５のＩＭＡ１ｐ、配列番号１２のＩＭＡ１ｐ、配列番号１３のＩＭＡ１ｐ、配列番号１４のＩＭＡ１ｐ、配列番号１５のＩＭＡ１ｐ、配列番号２１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２２のＩＭＡ１ｐ、配列番号２３のＩＭＡ１ｐ、配列番号２４のＩＭＡ１ｐ、配列番号２５のＩＭＡ１ｐ、及び、配列番号３３のＩＭＡ１ｐ、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体をコードする遺伝子からなる群から選択される、項目２６〜２８のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目３０）
前記遺伝子型ＩＶが、前記酵母細胞が、ＩＭＡ１の少なくとも３つの短い対立遺伝子とＩＭＡ１の少なくとも２つの長い対立遺伝子とを含むことであって、
ａ)  前記ＩＭＡ１の３つの短い対立遺伝子が個別に、配列番号１２のＩＭＡ１ｐ、配列番号１３のＩＭＡ１ｐ、配列番号１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２のＩＭＡ１ｐ、配列番号３のＩＭＡ１ｐ、配列番号４のＩＭＡ１ｐ、配列番号５のＩＭＡ１ｐ、及び、配列番号３３のＩＭＡ１ｐ、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択されるＩＭＡ１ｐをコードする遺伝子であり、及び、
ｂ)  前記ＩＭＡ１の２つの長い対立遺伝子が個別に、配列番号１４のＩＭＡ１ｐ、配列番号１５のＩＭＡ１ｐ、配列番号２１のＩＭＡ１ｐ、配列番号２２のＩＭＡ１ｐ、配列番号２３のＩＭＡ１ｐ、配列番号２４のＩＭＡ１ｐ、配列番号２５のＩＭＡ１ｐ、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択されるＩＭＡ１ｐをコードする遺伝子である、
項目２６〜２９のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目３１）
前記酵母細胞が、
Ｖ．ＩＭＡ５ｐをコードする遺伝子、好ましくはＩＭＡ５ｐをコードする少なくとも２つの対立遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目３２）
ＩＭＡ５ｐが、配列番号１６のＩＭＡ５ｐ、配列番号１７のＩＭＡ５ｐ、配列番号３４のＩＭＡ５ｐ、配列番号３５のＩＭＡ５ｐ、配列番号３６のＩＭＡ５ｐ、及び、少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択される、項目３１に記載の酵母細胞。
（項目３３）
前記酵母細胞が、
ＶＩ．配列番号１８のＡＧＴ１、配列番号１９のＡＧＴ１、配列番号２０のＡＧＴ１、配列番号２６のＡＧＴ１、配列番号２７のＡＧＴ１、配列番号２８のＡＧＴ１、配列番号２９のＡＧＴ１、配列番号３０のＡＧＴ１、配列番号３１のＡＧＴ１、配列番号３２のＡＧＴ１、及び少なくとも８０％、好ましくは少なくとも９０％、さらにより好ましくは少なくとも９５％、少なくとも９８％など、の配列同一性を上記配列と共有する、それらのいずれかの機能的相同体からなる群から選択されるＡＧＴ１をコードする少なくとも３つの遺伝子を含む、
遺伝子型を有する、先行項目のいずれか１項に記載の酵母細胞。
（項目３４）
飲料を製造するための方法であって、前記方法が、
ａ.  出発液体を準備すること、
ｂ.  項目１〜３４のいずれか１項に記載の酵母細胞を準備すること、
ｃ.  前記出発液体を、前記酵母細胞で発酵し、それにより、飲料を製造すること、
のステップを含む、方法。
（項目３５）
前記出発液体が、大麦及び/または麦芽の水性エキスを含む、項目３４に記載の方法。