【手続補正書】
【提出日】令和1年5月27日(2019.5.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
がんを有する対象を処置する方法において使用するための、Ｔｒｋ阻害剤を含む組成物であって、前記方法は、
（ａ）２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
を有するがん細胞を有する対象を同定するステップと、
（ｂ）前記同定された対象に治療有効量のＴｒｋ阻害剤を投与するステップと
を含む、組成物。
【請求項２】
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するがん細胞を有すると同定された対象を処置する方法において使用するための、Ｔｒｋ阻害剤を含む組成物であって、前記方法は、前記対象に治療有効量のＴｒｋ阻害剤を投与するステップを含む、組成物。
【請求項３】
ＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異を、がんを有する対象のための処置を選択するための指標とする方法であって、
対象のがん細胞において、
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異
を同定するステップを含み、
治療有効量のＴｒｋ阻害剤を含む処置が、同定されたＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する前記がん細胞を有する前記対象に対して選択される、方法。
【請求項４】
ＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異を、がんを有する対象がＴｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性を判定するための指標とする方法であって、
前記対象から得た試料中のがん細胞が、
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップを含み、
ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有するがん細胞を有する対象が、Ｔｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性の増大を有することが示される、方法。
【請求項５】
ＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異を、がんを有する対象におけるＴｒｋ阻害剤の効力を予測するための指標とする方法であって、
対象から得た試料中のがん細胞が、
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップを含み、
Ｔｒｋ阻害剤が、ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する対象から得た試料中のがん細胞を有する前記対象において有効となる可能性が高いことが示される、方法。
【請求項６】
前記がんが、腺癌、副腎皮質癌、副腎神経芽細胞腫、肛門扁平上皮癌、虫垂腺癌、膀胱尿路上皮癌、胆管腺癌、膀胱癌、膀胱尿路上皮癌、骨脊索腫、リンパ球性慢性骨髄白血病、非リンパ球性急性骨髄球性骨髄白血病、骨髄リンパ増殖性疾患、骨髄多発性骨髄腫、骨肉腫、脳星細胞腫、脳神経膠芽腫、脳髄芽腫、脳髄膜腫、脳乏突起膠腫、乳房腺様嚢胞癌、乳癌、乳管内癌、乳房浸潤性乳管癌、乳房浸潤性小葉癌、乳房化生性癌、子宮頸神経内分泌癌、子宮頸部扁平上皮癌、結腸腺癌、結腸カルチノイド腫瘍、十二指腸腺癌、子宮内膜性腫瘍（ｅｎｄｏｍｅｔｒｉｏｉｄ  ｔｕｎｏｒ）、食道腺癌、食道および胃癌、眼内黒色腫、眼内扁平上皮癌、眼涙管癌、ファロピウス管漿液性癌、胆嚢腺癌、胆嚢グロムス腫瘍、胃食道接合部腺癌、頭頸部腺様嚢胞癌、頭頸部癌、頭頸部神経芽細胞腫、頭頸部扁平上皮癌、腎臓色素嫌性癌、腎髄様癌、腎細胞癌、腎乳頭癌、腎肉腫様癌、腎尿路上皮癌、腎癌、リンパ球性白血病、慢性リンパ球性白血病、肝臓胆管癌、肝細胞癌、肝癌、肺腺癌、肺腺扁平上皮癌、肺非定型カルチノイド、肺癌肉腫、肺大細胞神経内分泌癌、肺非小細胞肺癌、肺肉腫、肺肉腫様癌、肺小細胞癌、肺小細胞未分化癌、肺扁平上皮癌、上気道消化管扁平上皮癌、上気道消化管癌、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫濾胞性リンパ腫、縦隔Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫形質芽球性肺腺癌、リンパ腫濾胞性リンパ腫、リンパ腫、非ホジキン、上咽頭および副鼻腔未分化癌、卵巣癌、卵巣癌肉腫、卵巣明細胞癌、卵巣上皮癌、卵巣顆粒膜細胞腫瘍、卵巣漿液性癌、膵臓癌、膵管腺癌、膵臓神経内分泌癌、腹膜中皮腫、腹膜漿液性癌、胎盤絨毛癌、胸膜中皮腫、前立腺腺房腺癌、前立腺癌、直腸腺癌、直腸扁平上皮癌、皮膚付属器癌、皮膚基底細胞癌、皮膚黒色腫、皮膚メルケル細胞癌、皮膚扁平上皮癌、小腸腺癌、小腸消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、大腸／結腸癌、大腸腺癌、軟組織血管肉腫、軟組織ユーイング肉腫、軟組織血管内皮腫、軟組織炎症性筋線維芽細胞腫瘍、軟組織平滑筋肉腫、軟組織脂肪肉腫、軟組織神経芽細胞腫、軟組織傍神経節腫、軟組織血管周囲類上皮細胞腫瘍、軟組織肉腫、軟組織滑膜肉腫、胃腺癌、びまん型胃腺癌、腸型胃腺癌、腸型胃腺癌、胃平滑筋肉腫、胸腺癌、リンパ球性胸腺腫、甲状腺乳頭癌、原発不明腺癌、原発不明癌、原発不明悪性新生物、リンパ様新生物、原発不明黒色腫、原発不明肉腫様癌、原発不明扁平上皮癌、未知未分化神経内分泌癌、原発不明未分化小細胞癌、子宮癌肉腫、子宮内膜腺癌、類内膜性子宮内膜腺癌、乳頭漿液性子宮内膜腺癌、および子宮平滑筋肉腫からなる群から選択される、請求項１もしくは２に記載の組成物、または請求項３から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記対象が、前記がんを有すると以前に同定または診断される、請求項１、２、および６のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３から６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
対象のがん細胞において、ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を同定する前記ステップが、前記対象由来の試料中のがん細胞内のＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異の存在を判定するアッセイを実施することを含む、請求項１に記載の組成物、または請求項３、４、および５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記アッセイが、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）、温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）、温度勾配キャピラリー電気泳動、一本鎖高次構造多型アッセイ、分子ビーコンアッセイ、動的ハイブリダイゼーションアッセイ、ＰＣＲに基づくアッセイ、および変性高速液体クロマトグラフィーからなる群から選択される、請求項８に記載の組成物または方法。
【請求項１０】
前記アッセイが、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント、および／または前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ３遺伝子のセグメントをシーケンシングするステップを含む、請求項８に記載の組成物または方法。
【請求項１１】
前記Ｔｒｋ阻害剤が、式Ｉ：
【化１０１】
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の化合物の結晶形、またはその硫酸水素塩である、請求項１、２、および６から１０のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３から１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記同定された対象は、治療有効量の前記選択された処置を投与することができる、請求項３に記載の方法。
【請求項１３】
前記同定された対象のカルテに前記選択された処置を記録するステップをさらに含む、請求項３または１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記対象のカルテが、コンピューター可読媒体である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
Ｔｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性の増大を有することが示された前記対象は、治療有効量のＴｒｋ阻害剤を投与することができる、請求項４に記載の方法。
【請求項１６】
ＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異を、がんを発症する対象のリスクを判定するための指標とする方法であって、
前記対象から得た試料中の細胞が、
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップを含み、
ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する細胞を有する対象が、がんを発症する可能性の増大を有することが示される、方法。
【請求項１７】
ＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異を、対象におけるがんの診断を支援するための指標とする方法であって、
前記対象から得た試料中の細胞が、
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップを含み、
ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する細胞を有する対象が、がんを有する可能性の増大を有することが示される、方法。
【請求項１８】
前記対象が、著しいレベルの発癌物質に曝露されていると同定される、請求項１６から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記対象が、がんを有すると疑われる、請求項１６から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記対象が、がんの１つまたは複数の症状を有する、請求項１６から１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記がんが、腺癌、副腎皮質癌、副腎神経芽細胞腫、肛門扁平上皮癌、虫垂腺癌、膀胱尿路上皮癌、胆管腺癌、膀胱癌、膀胱尿路上皮癌、骨脊索腫、リンパ球性慢性骨髄白血病、非リンパ球性急性骨髄球性骨髄白血病、骨髄リンパ増殖性疾患、骨髄多発性骨髄腫、骨肉腫、脳星細胞腫、脳神経膠芽腫、脳髄芽腫、脳髄膜腫、脳乏突起膠腫、乳房腺様嚢胞癌、乳癌、乳管内癌、乳房浸潤性乳管癌、乳房浸潤性小葉癌、乳房化生性癌、子宮頸神経内分泌癌、子宮頸部扁平上皮癌、結腸腺癌、結腸カルチノイド腫瘍、十二指腸腺癌、子宮内膜性腫瘍（ｅｎｄｏｍｅｔｒｉｏｉｄ  ｔｕｎｏｒ）、食道腺癌、食道および胃癌、眼内黒色腫、眼内扁平上皮癌、眼涙管癌、ファロピウス管漿液性癌、胆嚢腺癌、胆嚢グロムス腫瘍、胃食道接合部腺癌、頭頸部腺様嚢胞癌、頭頸部癌、頭頸部神経芽細胞腫、頭頸部扁平上皮癌、腎臓色素嫌性癌、腎髄様癌、腎細胞癌、腎乳頭癌、腎肉腫様癌、腎尿路上皮癌、腎癌、リンパ球性白血病、慢性リンパ球性白血病、肝臓胆管癌、肝細胞癌、肝癌、肺腺癌、肺腺扁平上皮癌、肺非定型カルチノイド、肺癌肉腫、肺大細胞神経内分泌癌、肺非小細胞肺癌、肺肉腫、肺肉腫様癌、肺小細胞癌、肺小細胞未分化癌、肺扁平上皮癌、上気道消化管扁平上皮癌、上気道消化管癌、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫濾胞性リンパ腫、縦隔Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫形質芽球性肺腺癌、リンパ腫濾胞性リンパ腫、リンパ腫、非ホジキン、上咽頭および副鼻腔未分化癌、卵巣癌、卵巣癌肉腫、卵巣明細胞癌、卵巣上皮癌、卵巣顆粒膜細胞腫瘍、卵巣漿液性癌、膵臓癌、膵管腺癌、膵臓神経内分泌癌、腹膜中皮腫、腹膜漿液性癌、胎盤絨毛癌、胸膜中皮腫、前立腺腺房腺癌、前立腺癌、直腸腺癌、直腸扁平上皮癌、皮膚付属器癌、皮膚基底細胞癌、皮膚黒色腫、皮膚メルケル細胞癌、皮膚扁平上皮癌、小腸腺癌、小腸消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、大腸／結腸癌、大腸腺癌、軟組織血管肉腫、軟組織ユーイング肉腫、軟組織血管内皮腫、軟組織炎症性筋線維芽細胞腫瘍、軟組織平滑筋肉腫、軟組織脂肪肉腫、軟組織神経芽細胞腫、軟組織傍神経節腫、軟組織血管周囲類上皮細胞腫瘍、軟組織肉腫、軟組織滑膜肉腫、胃腺癌、びまん型胃腺癌、腸型胃腺癌、腸型胃腺癌、胃平滑筋肉腫、胸腺癌、リンパ球性胸腺腫、甲状腺乳頭癌、原発不明腺癌、原発不明癌、原発不明悪性新生物、リンパ様新生物、原発不明黒色腫、原発不明肉腫様癌、原発不明扁平上皮癌、未知未分化神経内分泌癌、原発不明未分化小細胞癌、子宮癌肉腫、子宮内膜腺癌、類内膜性子宮内膜腺癌、乳頭漿液性子宮内膜腺癌、および子宮平滑筋肉腫からなる群から選択される、請求項１６から２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記対象から得た試料中の細胞が、ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有するか否かを判定する前記ステップが、前記試料中の細胞内のＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異の存在、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異の存在、および／または前記ＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異の存在を判定するアッセイを実施することを含む、請求項１７または１８に記載の方法。
【請求項２３】
前記アッセイが、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）、温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）、温度勾配キャピラリー電気泳動、一本鎖高次構造多型アッセイ、分子ビーコンアッセイ、動的ハイブリダイゼーションアッセイ、ＰＣＲに基づくアッセイ、変性高速液体クロマトグラフィーからなる群から選択される、請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記アッセイが、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント、および／または前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ３遺伝子のセグメントをシーケンシングするステップを含む、請求項２２に記載の方法。
【請求項２５】
がんを有する可能性が増大すると判定された対象におけるがんの前記診断を確認するステップをさらに含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項２６】
前記ＴｒｋＡタンパク質が、Ｓ２４１Ｆ、Ｓ２４１Ｈ、Ｓ２４１Ｙ、Ｒ３１４Ｇ、Ｒ３１４Ｈ、Ｒ３１４Ｌ、Ｒ３１４Ｐ、Ｎ３１８Ｓ、Ｇ３１９Ｓ、Ｓ３２０Ｆ、Ｖ３２１Ｍ、Ｉ５１０Ｔ、Ｖ５１１Ｍ、Ｌ５１２Ｆ、Ｌ５１２Ｒ、Ｓ５５２Ｒ、Ａ５５３Ｔ、Ｒ５５４Ｐ、Ｒ５５４Ｑ、Ｒ５５４Ｗ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｔ、Ａ６３６Ｖ、Ｇ６３７Ｅ、Ｇ６３７Ｗ、Ｍ６３８Ｖ、Ｒ６４９Ｌ、Ｒ６４９Ｗ、Ｒ６５４Ｃ、Ｒ６５４Ｈ、Ｎ６５５Ｙ、Ｄ６７９Ｎ、Ｄ６７９Ｙ、Ｙ６８０Ｈ、Ｔ６８７Ｉ、Ｍ６８８Ｉ、Ｌ６８９Ｍ、Ｐ６９０Ｈ、Ｒ６９２Ｃ、Ｒ６９２Ｈ、Ｐ６９５Ｓ、Ｐ６９６Ｌ、Ｅ６９７Ｋ、Ｅ７４７Ｋ、Ｒ７４８Ｌ、Ｒ７４８Ｑ、Ｒ７４８Ｗ、Ｐ７４９Ｑ、Ｒ７５０Ｃ、Ｒ７５０ＨおよびＲ７５０Ｌからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸位置で変異を含み；
前記ＴｒｋＢタンパク質が、Ｍ２４０Ｉ、Ｎ２４１Ｄ、Ｅ２４２Ｋ、Ｒ２５１Ｇ、Ｒ２５１Ｋ、Ｉ２５２Ｖ、Ｓ２５６Ｌ、Ｓ２５７Ｆ、Ｄ２５８Ｎ、Ｉ２６４Ｍ、Ａ３１４Ｅ、Ａ３１４Ｇ、Ａ３１４Ｖ、Ｌ３１５Ｆ、Ｇ４０１Ａ、Ｇ４０１Ｅ、Ｇ４０１Ｒ、Ｔ４２６Ｉ、Ｇ４２７Ｓ、Ｒ４２８Ｑ、Ａ４４０Ｓ、Ａ４４０Ｔ、Ａ４４０Ｖ、Ｒ５９８Ｃ、Ｒ５９８Ｓ、Ｋ５９９Ｍ、Ｄ６００Ｈ、Ｈ６０２Ｎ、Ｒ６０３Ｓ、Ｌ６６４Ｍ、Ｔ６６５Ｍ、Ｔ６６５Ｓ、Ｑ６６６Ｌ、Ｑ６６６Ｒ、Ａ６７７Ｔ、Ａ６７８Ｔ、Ａ６７８Ｖ、Ｇ６７９Ｄ、Ｍ６８０Ｉ、Ｖ６８９Ｍ、Ｒ６９１Ｃ、Ｄ６９２Ｎ、Ｆ７４６Ｉ、Ｔ７４７Ｍ、Ｔ７４８Ｍ、Ｅ７４９Ｋ、Ｑ７８４Ｈ、Ｇ７８５Ｖ、Ｒ７８６Ｑ、Ｖ７８７Ｆ、Ｌ７８８Ｍ、Ｑ７８９Ｅ、Ｇ８０４Ｅ、Ｃ８０５ＲおよびＣ８０５Ｙからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸位置で変異を含み；かつ／または
前記ＴｒｋＣタンパク質が、Ｖ２２１Ｉ、Ｒ２２２Ｑ、Ｅ２２３Ｄ、Ｄ２４２Ｎ、Ｗ２４３Ｃ、Ｉ２４４Ｔ、Ｔ２６９Ａ、Ｔ２６９Ｍ、Ｔ２７０Ｍ、Ｔ２７０Ｑ、Ｔ２７０Ｖ、Ｖ２７１Ｌ、Ｖ２７１Ｍ、Ｅ２７６Ｄ、Ｄ２７７Ｅ、Ｄ２７７Ｇ、Ｄ２７７Ｎ、Ｔ２８１Ｉ、Ｔ２８１Ｐ、Ｔ２８２Ｍ、Ｔ２８３Ａ、Ｔ２８３Ｋ、Ｔ２８３Ｍ、Ｓ２９６Ｉ、Ｓ２９６Ｒ、Ｖ２９７Ｉ、Ｖ３２５Ｍ、Ｒ３２６Ｃ、Ｒ３２６Ｇ、Ｒ３２６Ｈ、Ｒ３２６Ｌ、Ｒ３２６Ｐ、Ｎ３２８Ｓ、Ｐ３２９Ｎ、Ｐ３２９Ｓ、Ｐ３３０Ｑ、Ｅ３４４Ｇ、Ｅ３４４Ｖ、Ｓ３４５Ｆ、Ｋ３４６Ｎ、Ｈ３４９Ｙ、Ｖ３５０Ｅ、Ｅ３５１Ｄ、Ｙ３５３Ｆ、Ｑ３５４Ｋ、Ｄ５３７Ｅ、Ｄ５３７Ｙ、Ｉ５３８Ｎ、Ｖ５３９Ｍ、Ｌ５４０Ｍ、Ｇ５４５Ｃ、Ｇ５４５Ｄ、Ｇ５５０Ｒ、Ｋ５５１Ｅ、Ｌ５６０Ｖ、Ｐ５６２Ｌ、Ｐ５６２Ｑ、Ｐ５６２Ｒ、Ｐ５６２Ｔ、Ｋ５７５Ｅ、Ｄ５７６Ｎ、Ｐ５７７Ｓ、Ｐ５８２Ｑ、Ｐ５８２Ｗ、Ｋ５８３％、Ｄ５８４Ｅ、Ｄ５８４Ｎ、Ｖ６０１Ａ、Ｖ６０１Ｉ、Ｋ６０２Ｒ、Ｆ６０３Ｌ、Ｙ６０４Ｆ、Ｙ６０４Ｈ、Ｙ６０４Ｎ、Ｃ６０７Ｆ、Ｇ６０８Ｃ、Ｇ６０８Ｅ、Ｇ６０８Ｓ、Ｄ６０９Ｇ、Ｄ６０９Ｈ、Ｄ６０９Ｎ、Ｄ６０９Ｖ、Ｇ６１０Ｒ、Ｐ６１２Ａ、Ｐ６１２Ｌ、Ｐ６１２Ｓ、Ｐ６１２Ｔ、Ｄ６２４Ｙ、Ｌ６２５Ｍ、Ｎ６２６Ｋ、Ｋ６２７Ｎ、Ｋ６２７Ｒ、Ｆ６２８Ｌ、Ｌ６２９Ｆ、Ｌ６２９Ｉ、Ｐ６３４Ｌ、Ｐ６３４Ｔ、Ｄ６３５Ｈ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｖ、Ｍ６３７Ｉ、Ｍ６３７Ｋ、Ｍ６３７Ｖ、Ｅ６５０Ｖ、Ｌ６５１Ｐ、Ｇ６５２Ｒ、Ｇ６５２Ｖ、Ｌ６５３Ｆ、Ｌ６５３Ｐ、Ｈ６７７Ｙ、Ｒ６７８Ｑ、Ｄ６７９Ｇ、Ｄ６７９Ｎ、Ｖ６８７Ａ、Ｖ６８７Ｉ、Ｇ６８８Ｒ、Ａ６８９Ｅ、Ａ６８９Ｖ、Ｙ７０５Ｎ、Ｓ７０６Ｉ、Ｔ７０７Ｍ、Ｄ７０８Ｎ、Ｐ７１５Ｌ、Ｐ７１５Ｓ、Ｓ７１６Ｙ、Ｇ７１７Ｒ、Ｔ７３０Ｎ、Ｍ７３１Ｉ、Ｍ７３１Ｌ、Ｌ７３２Ｉ、Ｐ７３８Ｈ、Ｐ７３８Ｓ、Ｙ７４４Ｆ、Ｒ７４５Ｐ、Ｒ７４５Ｗ、Ｋ７４６Ｒ、Ｋ７４６Ｔ、Ｇ７８６Ｃ、Ｇ７８６Ｓ、Ｒ７８７Ｃ、Ｒ７８７Ｈ、Ｒ７８７Ｓ、Ｐ７９６Ｌ、Ｐ７９６Ｓ、Ｄ８０１Ｎ、Ｑ８０８Ｈ、Ｒ８０９ＷおよびＥ８１０Ｋからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸位置で変異を含む、請求項１、２、および６から１１のいずれか一項に記載の組成物、または請求項３から２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
それぞれが、
ＴｒｋＡタンパク質中のアミノ酸位置２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０の１つで変異をコードするＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント；
ＴｒｋＢタンパク質中のアミノ酸位置２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５の１つで変異をコードするＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント；または
ＴｒｋＣタンパク質中のアミノ酸位置２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０の１つで変異をコードするＮＴＲＫ３遺伝子のセグメント
に特異的にハイブリダイズする１つまたは複数のプローブを含むキット。
【請求項２８】
それぞれが、
ＴｒｋＡタンパク質中のＳ２４１Ｆ、Ｓ２４１Ｈ、Ｓ２４１Ｙ、Ｒ３１４Ｇ、Ｒ３１４Ｈ、Ｒ３１４Ｌ、Ｒ３１４Ｐ、Ｎ３１８Ｓ、Ｇ３１９Ｓ、Ｓ３２０Ｆ、Ｖ３２１Ｍ、Ｉ５１０Ｔ、Ｖ５１１Ｍ、Ｌ５１２Ｆ、Ｌ５１２Ｒ、Ｓ５５２Ｒ、Ａ５５３Ｔ、Ｒ５５４Ｐ、Ｒ５５４Ｑ、Ｒ５５４Ｗ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｔ、Ａ６３６Ｖ、Ｇ６３７Ｅ、Ｇ６３７Ｗ、Ｍ６３８Ｖ、Ｒ６４９Ｌ、Ｒ６４９Ｗ、Ｒ６５４Ｃ、Ｒ６５４Ｈ、Ｎ６５５Ｙ、Ｄ６７９Ｎ、Ｄ６７９Ｙ、Ｙ６８０Ｈ、Ｔ６８７Ｉ、Ｍ６８８Ｉ、Ｌ６８９Ｍ、Ｐ６９０Ｈ、Ｒ６９２Ｃ、Ｒ６９２Ｈ、Ｐ６９５Ｓ、Ｐ６９６Ｌ、Ｅ６９７Ｋ、Ｅ７４７Ｋ、Ｒ７４８Ｌ、Ｒ７４８Ｑ、Ｒ７４８Ｗ、Ｐ７４９Ｑ、Ｒ７５０Ｃ、Ｒ７５０ＨおよびＲ７５０Ｌからなる群から選択される変異をコードするＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント；
ＴｒｋＢタンパク質中のＭ２４０Ｉ、Ｎ２４１Ｄ、Ｅ２４２Ｋ、Ｒ２５１Ｇ、Ｒ２５１Ｋ、Ｉ２５２Ｖ、Ｓ２５６Ｌ、Ｓ２５７Ｆ、Ｄ２５８Ｎ、Ｉ２６４Ｍ、Ａ３１４Ｅ、Ａ３１４Ｇ、Ａ３１４Ｖ、Ｌ３１５Ｆ、Ｇ４０１Ａ、Ｇ４０１Ｅ、Ｇ４０１Ｒ、Ｔ４２６Ｉ、Ｇ４２７Ｓ、Ｒ４２８Ｑ、Ａ４４０Ｓ、Ａ４４０Ｔ、Ａ４４０Ｖ、Ｒ５９８Ｃ、Ｒ５９８Ｓ、Ｋ５９９Ｍ、Ｄ６００Ｈ、Ｈ６０２Ｎ、Ｒ６０３Ｓ、Ｌ６６４Ｍ、Ｔ６６５Ｍ、Ｔ６６５Ｓ、Ｑ６６６Ｌ、Ｑ６６６Ｒ、Ａ６７７Ｔ、Ａ６７８Ｔ、Ａ６７８Ｖ、Ｇ６７９Ｄ、Ｍ６８０Ｉ、Ｖ６８９Ｍ、Ｒ６９１Ｃ、Ｄ６９２Ｎ、Ｆ７４６Ｉ、Ｔ７４７Ｍ、Ｔ７４８Ｍ、Ｅ７４９Ｋ、Ｑ７８４Ｈ、Ｇ７８５Ｖ、Ｒ７８６Ｑ、Ｖ７８７Ｆ、Ｌ７８８Ｍ、Ｑ７８９Ｅ、Ｇ８０４Ｅ、Ｃ８０５ＲおよびＣ８０５Ｙからなる群から選択される変異をコードするＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント；または
ＴｒｋＣタンパク質中のＶ２２１Ｉ、Ｒ２２２Ｑ、Ｅ２２３Ｄ、Ｄ２４２Ｎ、Ｗ２４３Ｃ、Ｉ２４４Ｔ、Ｔ２６９Ａ、Ｔ２６９Ｍ、Ｔ２７０Ｍ、Ｔ２７０Ｑ、Ｔ２７０Ｖ、Ｖ２７１Ｌ、Ｖ２７１Ｍ、Ｅ２７６Ｄ、Ｄ２７７Ｅ、Ｄ２７７Ｇ、Ｄ２７７Ｎ、Ｔ２８１Ｉ、Ｔ２８１Ｐ、Ｔ２８２Ｍ、Ｔ２８３Ａ、Ｔ２８３Ｋ、Ｔ２８３Ｍ、Ｓ２９６Ｉ、Ｓ２９６Ｒ、Ｖ２９７Ｉ、Ｖ３２５Ｍ、Ｒ３２６Ｃ、Ｒ３２６Ｇ、Ｒ３２６Ｈ、Ｒ３２６Ｌ、Ｒ３２６Ｐ、Ｎ３２８Ｓ、Ｐ３２９Ｎ、Ｐ３２９Ｓ、Ｐ３３０Ｑ、Ｅ３４４Ｇ、Ｅ３４４Ｖ、Ｓ３４５Ｆ、Ｋ３４６Ｎ、Ｈ３４９Ｙ、Ｖ３５０Ｅ、Ｅ３５１Ｄ、Ｙ３５３Ｆ、Ｑ３５４Ｋ、Ｄ５３７Ｅ、Ｄ５３７Ｙ、Ｉ５３８Ｎ、Ｖ５３９Ｍ、Ｌ５４０Ｍ、Ｇ５４５Ｃ、Ｇ５４５Ｄ、Ｇ５５０Ｒ、Ｋ５５１Ｅ、Ｌ５６０Ｖ、Ｐ５６２Ｌ、Ｐ５６２Ｑ、Ｐ５６２Ｒ、Ｐ５６２Ｔ、Ｋ５７５Ｅ、Ｄ５７６Ｎ、Ｐ５７７Ｓ、Ｐ５８２Ｑ、Ｐ５８２Ｗ、Ｋ５８３％、Ｄ５８４Ｅ、Ｄ５８４Ｎ、Ｖ６０１Ａ、Ｖ６０１Ｉ、Ｋ６０２Ｒ、Ｆ６０３Ｌ、Ｙ６０４Ｆ、Ｙ６０４Ｈ、Ｙ６０４Ｎ、Ｃ６０７Ｆ、Ｇ６０８Ｃ、Ｇ６０８Ｅ、Ｇ６０８Ｓ、Ｄ６０９Ｇ、Ｄ６０９Ｈ、Ｄ６０９Ｎ、Ｄ６０９Ｖ、Ｇ６１０Ｒ、Ｐ６１２Ａ、Ｐ６１２Ｌ、Ｐ６１２Ｓ、Ｐ６１２Ｔ、Ｄ６２４Ｙ、Ｌ６２５Ｍ、Ｎ６２６Ｋ、Ｋ６２７Ｎ、Ｋ６２７Ｒ、Ｆ６２８Ｌ、Ｌ６２９Ｆ、Ｌ６２９Ｉ、Ｐ６３４Ｌ、Ｐ６３４Ｔ、Ｄ６３５Ｈ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｖ、Ｍ６３７Ｉ、Ｍ６３７Ｋ、Ｍ６３７Ｖ、Ｅ６５０Ｖ、Ｌ６５１Ｐ、Ｇ６５２Ｒ、Ｇ６５２Ｖ、Ｌ６５３Ｆ、Ｌ６５３Ｐ、Ｈ６７７Ｙ、Ｒ６７８Ｑ、Ｄ６７９Ｇ、Ｄ６７９Ｎ、Ｖ６８７Ａ、Ｖ６８７Ｉ、Ｇ６８８Ｒ、Ａ６８９Ｅ、Ａ６８９Ｖ、Ｙ７０５Ｎ、Ｓ７０６Ｉ、Ｔ７０７Ｍ、Ｄ７０８Ｎ、Ｐ７１５Ｌ、Ｐ７１５Ｓ、Ｓ７１６Ｙ、Ｇ７１７Ｒ、Ｔ７３０Ｎ、Ｍ７３１Ｉ、Ｍ７３１Ｌ、Ｌ７３２Ｉ、Ｐ７３８Ｈ、Ｐ７３８Ｓ、Ｙ７４４Ｆ、Ｒ７４５Ｐ、Ｒ７４５Ｗ、Ｋ７４６Ｒ、Ｋ７４６Ｔ、Ｇ７８６Ｃ、Ｇ７８６Ｓ、Ｒ７８７Ｃ、Ｒ７８７Ｈ、Ｒ７８７Ｓ、Ｐ７９６Ｌ、Ｐ７９６Ｓ、Ｄ８０１Ｎ、Ｑ８０８Ｈ、Ｒ８０９Ｗ、およびＥ８１０Ｋからなる群から選択される変異をコードするＮＴＲＫ３遺伝子のセグメント
に特異的にハイブリダイズする１つまたは複数のプローブを含む、請求項２７に記載のキット。
【請求項２９】
前記１つまたは複数のプローブが、検出可能なプローブで標識される、請求項２７または２８に記載のキット。
【請求項３０】
前記１つまたは複数のプローブが、基材に共有結合的に付着される、請求項２７から２９に記載のキット。
【請求項３１】
前記基材が、フィルム、プレート、またはビーズである、請求項３０に記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１９０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１９０】
他の実施形態
本発明は、その詳述された記載と併せて記載されているが、前述の記載は、例示することを意図し、添付の特許請求の範囲により定義されている本発明の範囲を制限するものではないことを理解されたい。他の態様、利点、および修正は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
がんを有する対象を処置する方法であって、
（ａ）２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
を有するがん細胞を有する対象を同定するステップと、
（ｂ）前記同定された対象に治療有効量のＴｒｋ阻害剤を投与するステップと
を含む、方法。
（項目２）
２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するがん細胞を有すると同定された対象を処置する方法であって、前記対象に治療有効量のＴｒｋ阻害剤を投与するステップを含む、方法。
（項目３）
がんを有する対象のための処置を選択する方法であって、
（ａ）２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するがん細胞を有する対象を同定するステップと；
（ｂ）前記同定された対象のための治療有効量のＴｒｋ阻害剤を含む処置を選択するステップと
を含む、方法。
（項目４）
がんを有する対象のための処置を選択する方法であって、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するがん細胞を有すると同定された対象のための治療有効量のＴｒｋ阻害剤を含む処置を選択するステップを含む、方法。
（項目５）
がんを有する対象がＴｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性を判定する方法であって、
（ａ）前記対象から得た試料中のがん細胞が、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップと、
（ｂ）ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有するがん細胞を有する対象が、Ｔｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性が増大すると判定するステップと
を含む、方法。
（項目６）
がんを有する対象がＴｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性を判定する方法であって、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するがん細胞を有する対象が、Ｔｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性が増大すると判定するステップを含む、方法。
（項目７）
がんを有する対象におけるＴｒｋ阻害剤の効力を予測する方法であって、
（ａ）対象から得た試料中のがん細胞が、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップと、
（ｂ）Ｔｒｋ阻害剤が、ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する対象から得た試料中のがん細胞を有する前記対象において有効となる可能性が高いと判定するステップとを含む、方法。
（項目８）
がんを有する対象におけるＴｒｋ阻害剤の効力を予測する方法であって、Ｔｒｋ阻害剤が、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有する対象から得た試料中のがん細胞を有する前記対象において有効となる可能性が高いと判定するステップを含む、方法。
（項目９）
前記がんが、腺癌、副腎皮質癌、副腎神経芽細胞腫、肛門扁平上皮癌、虫垂腺癌、膀胱尿路上皮癌、胆管腺癌、膀胱癌、膀胱尿路上皮癌、骨脊索腫、リンパ球性慢性骨髄白血病、非リンパ球性急性骨髄球性骨髄白血病、骨髄リンパ増殖性疾患、骨髄多発性骨髄腫、骨肉腫、脳星細胞腫、脳神経膠芽腫、脳髄芽腫、脳髄膜腫、脳乏突起膠腫、乳房腺様嚢胞癌、乳癌、乳管内癌、乳房浸潤性乳管癌、乳房浸潤性小葉癌、乳房化生性癌、子宮頸神経内分泌癌、子宮頸部扁平上皮癌、結腸腺癌、結腸カルチノイド腫瘍、十二指腸腺癌、子宮内膜性腫瘍（ｅｎｄｏｍｅｔｒｉｏｉｄ  ｔｕｎｏｒ）、食道腺癌、食道および胃癌、眼内黒色腫、眼内扁平上皮癌、眼涙管癌、ファロピウス管漿液性癌、胆嚢腺癌、胆嚢グロムス腫瘍、胃食道接合部腺癌、頭頸部腺様嚢胞癌、頭頸部癌、頭頸部神経芽細胞腫、頭頸部扁平上皮癌、腎臓色素嫌性癌、腎髄様癌、腎細胞癌、腎乳頭癌、腎肉腫様癌、腎尿路上皮癌、腎癌、リンパ球性白血病、慢性リンパ球性白血病、肝臓胆管癌、肝細胞癌、肝癌、肺腺癌、肺腺扁平上皮癌、肺非定型カルチノイド、肺癌肉腫、肺大細胞神経内分泌癌、肺非小細胞肺癌、肺肉腫、肺肉腫様癌、肺小細胞癌、肺小細胞未分化癌、肺扁平上皮癌、上気道消化管扁平上皮癌、上気道消化管癌、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫濾胞性リンパ腫、縦隔Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫形質芽球性肺腺癌、リンパ腫濾胞性リンパ腫、リンパ腫、非ホジキン、上咽頭および副鼻腔未分化癌、卵巣癌、卵巣癌肉腫、卵巣明細胞癌、卵巣上皮癌、卵巣顆粒膜細胞腫瘍、卵巣漿液性癌、膵臓癌、膵管腺癌、膵臓神経内分泌癌、腹膜中皮腫、腹膜漿液性癌、胎盤絨毛癌、胸膜中皮腫、前立腺腺房腺癌、前立腺癌、直腸腺癌、直腸扁平上皮癌、皮膚付属器癌、皮膚基底細胞癌、皮膚黒色腫、皮膚メルケル細胞癌、皮膚扁平上皮癌、小腸腺癌、小腸消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、大腸／結腸癌、大腸腺癌、軟組織血管肉腫、軟組織ユーイング肉腫、軟組織血管内皮腫、軟組織炎症性筋線維芽細胞腫瘍、軟組織平滑筋肉腫、軟組織脂肪肉腫、軟組織神経芽細胞腫、軟組織傍神経節腫、軟組織血管周囲類上皮細胞腫瘍、軟組織肉腫、軟組織滑膜肉腫、胃腺癌、びまん型胃腺癌、腸型胃腺癌、腸型胃腺癌、胃平滑筋肉腫、胸腺癌、リンパ球性胸腺腫、甲状腺乳頭癌、原発不明腺癌、原発不明癌、原発不明悪性新生物、リンパ様新生物、原発不明黒色腫、原発不明肉腫様癌、原発不明扁平上皮癌、未知未分化神経内分泌癌、原発不明未分化小細胞癌、子宮癌肉腫、子宮内膜腺癌、類内膜性子宮内膜腺癌、乳頭漿液性子宮内膜腺癌、および子宮平滑筋肉腫からなる群から選択される、項目１から８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０）
前記対象が、前記がんを有すると以前に同定または診断される、項目１から９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有するがん細胞を有する対象を同定する前記ステップが、前記対象由来の試料中のがん細胞内のＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異の存在を判定するアッセイを実施することを含む、項目１、３、５、および７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
前記アッセイが、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）、温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）、温度勾配キャピラリー電気泳動、一本鎖高次構造多型アッセイ、分子ビーコンアッセイ、動的ハイブリダイゼーションアッセイ、ＰＣＲに基づくアッセイ、および変性高速液体クロマトグラフィーからなる群から選択される、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
前記アッセイが、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント、および／または前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ３遺伝子のセグメントをシーケンシングするステップを含む、項目１１に記載の方法。
（項目１４）
前記Ｔｒｋ阻害剤が、式Ｉ：
【化１０１】
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の化合物の結晶形、またはその硫酸水素塩である、項目１から１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
前記同定された対象に治療有効量の前記選択された処置を投与するステップをさらに含む、項目３または４に記載の方法。
（項目１６）
前記同定された対象のカルテに前記選択された処置を記録するステップをさらに含む、項目３、４、および１５に記載の方法。
（項目１７）
前記対象のカルテが、コンピューター可読媒体である、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
Ｔｒｋ阻害剤を用いた処置に対して陽性の応答を有する可能性が増大すると判定された対象に治療有効量のＴｒｋ阻害剤を投与するステップをさらに含む、項目５または６に記載の方法。
（項目１９）
がんを発症する対象のリスクを判定する方法であって、
（ａ）前記対象から得た試料中の細胞が、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップと、
（ｂ）ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する細胞を有する対象が、がんを発症する可能性が増大すると同定するステップと
を含む、方法。
（項目２０）
がんを発症する対象のリスクを判定する方法であって、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
を有する細胞を有する対象が、がんを発症する可能性が増大すると同定するステップを含む、方法。
（項目２１）
対象におけるがんの診断を支援する方法であって、
（ａ）前記対象から得た試料中の細胞が、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有するか否かを判定するステップと、
（ｂ）ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有する細胞を有する対象が、がんを有する可能性が増大すると判定するステップと
を含む、方法。
（項目２２）
対象におけるがんの診断を支援する方法であって、２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＡタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ１遺伝子中の少なくとも１個の点変異；
２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＢタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ２遺伝子中の少なくとも１個の点変異；ならびに／または
２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０からなる群から選択される１つもしくは複数のアミノ酸位置で変異を含むＴｒｋＣタンパク質の発現をもたらすＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異
を有する細胞を有する対象が、がんを有する可能性が増大すると判定するステップを含む、方法。
（項目２３）
前記対象が、著しいレベルの発癌物質に曝露されていると同定される、項目１９から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４）
前記対象が、がんを有すると疑われる、項目１９から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
前記対象が、がんの１つまたは複数の症状を有する、項目１９から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
前記がんが、腺癌、副腎皮質癌、副腎神経芽細胞腫、肛門扁平上皮癌、虫垂腺癌、膀胱尿路上皮癌、胆管腺癌、膀胱癌、膀胱尿路上皮癌、骨脊索腫、リンパ球性慢性骨髄白血病、非リンパ球性急性骨髄球性骨髄白血病、骨髄リンパ増殖性疾患、骨髄多発性骨髄腫、骨肉腫、脳星細胞腫、脳神経膠芽腫、脳髄芽腫、脳髄膜腫、脳乏突起膠腫、乳房腺様嚢胞癌、乳癌、乳管内癌、乳房浸潤性乳管癌、乳房浸潤性小葉癌、乳房化生性癌、子宮頸神経内分泌癌、子宮頸部扁平上皮癌、結腸腺癌、結腸カルチノイド腫瘍、十二指腸腺癌、子宮内膜性腫瘍（ｅｎｄｏｍｅｔｒｉｏｉｄ  ｔｕｎｏｒ）、食道腺癌、食道および胃癌、眼内黒色腫、眼内扁平上皮癌、眼涙管癌、ファロピウス管漿液性癌、胆嚢腺癌、胆嚢グロムス腫瘍、胃食道接合部腺癌、頭頸部腺様嚢胞癌、頭頸部癌、頭頸部神経芽細胞腫、頭頸部扁平上皮癌、腎臓色素嫌性癌、腎髄様癌、腎細胞癌、腎乳頭癌、腎肉腫様癌、腎尿路上皮癌、腎癌、リンパ球性白血病、慢性リンパ球性白血病、肝臓胆管癌、肝細胞癌、肝癌、肺腺癌、肺腺扁平上皮癌、肺非定型カルチノイド、肺癌肉腫、肺大細胞神経内分泌癌、肺非小細胞肺癌、肺肉腫、肺肉腫様癌、肺小細胞癌、肺小細胞未分化癌、肺扁平上皮癌、上気道消化管扁平上皮癌、上気道消化管癌、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫濾胞性リンパ腫、縦隔Ｂ細胞リンパ節リンパ腫、リンパ節リンパ腫形質芽球性肺腺癌、リンパ腫濾胞性リンパ腫、リンパ腫、非ホジキン、上咽頭および副鼻腔未分化癌、卵巣癌、卵巣癌肉腫、卵巣明細胞癌、卵巣上皮癌、卵巣顆粒膜細胞腫瘍、卵巣漿液性癌、膵臓癌、膵管腺癌、膵臓神経内分泌癌、腹膜中皮腫、腹膜漿液性癌、胎盤絨毛癌、胸膜中皮腫、前立腺腺房腺癌、前立腺癌、直腸腺癌、直腸扁平上皮癌、皮膚付属器癌、皮膚基底細胞癌、皮膚黒色腫、皮膚メルケル細胞癌、皮膚扁平上皮癌、小腸腺癌、小腸消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、大腸／結腸癌、大腸腺癌、軟組織血管肉腫、軟組織ユーイング肉腫、軟組織血管内皮腫、軟組織炎症性筋線維芽細胞腫瘍、軟組織平滑筋肉腫、軟組織脂肪肉腫、軟組織神経芽細胞腫、軟組織傍神経節腫、軟組織血管周囲類上皮細胞腫瘍、軟組織肉腫、軟組織滑膜肉腫、胃腺癌、びまん型胃腺癌、腸型胃腺癌、腸型胃腺癌、胃平滑筋肉腫、胸腺癌、リンパ球性胸腺腫、甲状腺乳頭癌、原発不明腺癌、原発不明癌、原発不明悪性新生物、リンパ様新生物、原発不明黒色腫、原発不明肉腫様癌、原発不明扁平上皮癌、未知未分化神経内分泌癌、原発不明未分化小細胞癌、子宮癌肉腫、子宮内膜腺癌、類内膜性子宮内膜腺癌、乳頭漿液性子宮内膜腺癌、および子宮平滑筋肉腫からなる群から選択される、項目１９から２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７）
前記対象から得た試料中の細胞が、ＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異、および／またはＮＴＲＫ３遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異を有するか否かを判定する前記ステップが、前記試料中の細胞内のＮＴＲＫ１遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異の存在、ＮＴＲＫ２遺伝子中の前記少なくとも１個の点変異の存在、および／または前記ＮＴＲＫ３遺伝子中の少なくとも１個の点変異の存在を判定するアッセイを実施することを含む、項目２１または２３に記載の方法。
（項目２８）
前記アッセイが、変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）、温度勾配ゲル電気泳動（ＴＧＧＥ）、温度勾配キャピラリー電気泳動、一本鎖高次構造多型アッセイ、分子ビーコンアッセイ、動的ハイブリダイゼーションアッセイ、ＰＣＲに基づくアッセイ、変性高速液体クロマトグラフィーからなる群から選択される、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記アッセイが、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント、前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント、および／または前記少なくとも１個の点変異を含む前記ＮＴＲＫ３遺伝子のセグメントをシーケンシングするステップを含む、項目２７に記載の方法。
（項目３０）
がんを有する可能性が増大すると判定された対象におけるがんの前記診断を確認するステップをさらに含む、項目２２に記載の方法。
（項目３１）
前記ＴｒｋＡタンパク質が、Ｓ２４１Ｆ、Ｓ２４１Ｈ、Ｓ２４１Ｙ、Ｒ３１４Ｇ、Ｒ３１４Ｈ、Ｒ３１４Ｌ、Ｒ３１４Ｐ、Ｎ３１８Ｓ、Ｇ３１９Ｓ、Ｓ３２０Ｆ、Ｖ３２１Ｍ、Ｉ５１０Ｔ、Ｖ５１１Ｍ、Ｌ５１２Ｆ、Ｌ５１２Ｒ、Ｓ５５２Ｒ、Ａ５５３Ｔ、Ｒ５５４Ｐ、Ｒ５５４Ｑ、Ｒ５５４Ｗ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｔ、Ａ６３６Ｖ、Ｇ６３７Ｅ、Ｇ６３７Ｗ、Ｍ６３８Ｖ、Ｒ６４９Ｌ、Ｒ６４９Ｗ、Ｒ６５４Ｃ、Ｒ６５４Ｈ、Ｎ６５５Ｙ、Ｄ６７９Ｎ、Ｄ６７９Ｙ、Ｙ６８０Ｈ、Ｔ６８７Ｉ、Ｍ６８８Ｉ、Ｌ６８９Ｍ、Ｐ６９０Ｈ、Ｒ６９２Ｃ、Ｒ６９２Ｈ、Ｐ６９５Ｓ、Ｐ６９６Ｌ、Ｅ６９７Ｋ、Ｅ７４７Ｋ、Ｒ７４８Ｌ、Ｒ７４８Ｑ、Ｒ７４８Ｗ、Ｐ７４９Ｑ、Ｒ７５０Ｃ、Ｒ７５０ＨおよびＲ７５０Ｌからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸位置で変異を含み；
前記ＴｒｋＢタンパク質が、Ｍ２４０Ｉ、Ｎ２４１Ｄ、Ｅ２４２Ｋ、Ｒ２５１Ｇ、Ｒ２５１Ｋ、Ｉ２５２Ｖ、Ｓ２５６Ｌ、Ｓ２５７Ｆ、Ｄ２５８Ｎ、Ｉ２６４Ｍ、Ａ３１４Ｅ、Ａ３１４Ｇ、Ａ３１４Ｖ、Ｌ３１５Ｆ、Ｇ４０１Ａ、Ｇ４０１Ｅ、Ｇ４０１Ｒ、Ｔ４２６Ｉ、Ｇ４２７Ｓ、Ｒ４２８Ｑ、Ａ４４０Ｓ、Ａ４４０Ｔ、Ａ４４０Ｖ、Ｒ５９８Ｃ、Ｒ５９８Ｓ、Ｋ５９９Ｍ、Ｄ６００Ｈ、Ｈ６０２Ｎ、Ｒ６０３Ｓ、Ｌ６６４Ｍ、Ｔ６６５Ｍ、Ｔ６６５Ｓ、Ｑ６６６Ｌ、Ｑ６６６Ｒ、Ａ６７７Ｔ、Ａ６７８Ｔ、Ａ６７８Ｖ、Ｇ６７９Ｄ、Ｍ６８０Ｉ、Ｖ６８９Ｍ、Ｒ６９１Ｃ、Ｄ６９２Ｎ、Ｆ７４６Ｉ、Ｔ７４７Ｍ、Ｔ７４８Ｍ、Ｅ７４９Ｋ、Ｑ７８４Ｈ、Ｇ７８５Ｖ、Ｒ７８６Ｑ、Ｖ７８７Ｆ、Ｌ７８８Ｍ、Ｑ７８９Ｅ、Ｇ８０４Ｅ、Ｃ８０５ＲおよびＣ８０５Ｙからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸位置で変異を含み；かつ／または
前記ＴｒｋＣタンパク質が、Ｖ２２１Ｉ、Ｒ２２２Ｑ、Ｅ２２３Ｄ、Ｄ２４２Ｎ、Ｗ２４３Ｃ、Ｉ２４４Ｔ、Ｔ２６９Ａ、Ｔ２６９Ｍ、Ｔ２７０Ｍ、Ｔ２７０Ｑ、Ｔ２７０Ｖ、Ｖ２７１Ｌ、Ｖ２７１Ｍ、Ｅ２７６Ｄ、Ｄ２７７Ｅ、Ｄ２７７Ｇ、Ｄ２７７Ｎ、Ｔ２８１Ｉ、Ｔ２８１Ｐ、Ｔ２８２Ｍ、Ｔ２８３Ａ、Ｔ２８３Ｋ、Ｔ２８３Ｍ、Ｓ２９６Ｉ、Ｓ２９６Ｒ、Ｖ２９７Ｉ、Ｖ３２５Ｍ、Ｒ３２６Ｃ、Ｒ３２６Ｇ、Ｒ３２６Ｈ、Ｒ３２６Ｌ、Ｒ３２６Ｐ、Ｎ３２８Ｓ、Ｐ３２９Ｎ、Ｐ３２９Ｓ、Ｐ３３０Ｑ、Ｅ３４４Ｇ、Ｅ３４４Ｖ、Ｓ３４５Ｆ、Ｋ３４６Ｎ、Ｈ３４９Ｙ、Ｖ３５０Ｅ、Ｅ３５１Ｄ、Ｙ３５３Ｆ、Ｑ３５４Ｋ、Ｄ５３７Ｅ、Ｄ５３７Ｙ、Ｉ５３８Ｎ、Ｖ５３９Ｍ、Ｌ５４０Ｍ、Ｇ５４５Ｃ、Ｇ５４５Ｄ、Ｇ５５０Ｒ、Ｋ５５１Ｅ、Ｌ５６０Ｖ、Ｐ５６２Ｌ、Ｐ５６２Ｑ、Ｐ５６２Ｒ、Ｐ５６２Ｔ、Ｋ５７５Ｅ、Ｄ５７６Ｎ、Ｐ５７７Ｓ、Ｐ５８２Ｑ、Ｐ５８２Ｗ、Ｋ５８３％、Ｄ５８４Ｅ、Ｄ５８４Ｎ、Ｖ６０１Ａ、Ｖ６０１Ｉ、Ｋ６０２Ｒ、Ｆ６０３Ｌ、Ｙ６０４Ｆ、Ｙ６０４Ｈ、Ｙ６０４Ｎ、Ｃ６０７Ｆ、Ｇ６０８Ｃ、Ｇ６０８Ｅ、Ｇ６０８Ｓ、Ｄ６０９Ｇ、Ｄ６０９Ｈ、Ｄ６０９Ｎ、Ｄ６０９Ｖ、Ｇ６１０Ｒ、Ｐ６１２Ａ、Ｐ６１２Ｌ、Ｐ６１２Ｓ、Ｐ６１２Ｔ、Ｄ６２４Ｙ、Ｌ６２５Ｍ、Ｎ６２６Ｋ、Ｋ６２７Ｎ、Ｋ６２７Ｒ、Ｆ６２８Ｌ、Ｌ６２９Ｆ、Ｌ６２９Ｉ、Ｐ６３４Ｌ、Ｐ６３４Ｔ、Ｄ６３５Ｈ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｖ、Ｍ６３７Ｉ、Ｍ６３７Ｋ、Ｍ６３７Ｖ、Ｅ６５０Ｖ、Ｌ６５１Ｐ、Ｇ６５２Ｒ、Ｇ６５２Ｖ、Ｌ６５３Ｆ、Ｌ６５３Ｐ、Ｈ６７７Ｙ、Ｒ６７８Ｑ、Ｄ６７９Ｇ、Ｄ６７９Ｎ、Ｖ６８７Ａ、Ｖ６８７Ｉ、Ｇ６８８Ｒ、Ａ６８９Ｅ、Ａ６８９Ｖ、Ｙ７０５Ｎ、Ｓ７０６Ｉ、Ｔ７０７Ｍ、Ｄ７０８Ｎ、Ｐ７１５Ｌ、Ｐ７１５Ｓ、Ｓ７１６Ｙ、Ｇ７１７Ｒ、Ｔ７３０Ｎ、Ｍ７３１Ｉ、Ｍ７３１Ｌ、Ｌ７３２Ｉ、Ｐ７３８Ｈ、Ｐ７３８Ｓ、Ｙ７４４Ｆ、Ｒ７４５Ｐ、Ｒ７４５Ｗ、Ｋ７４６Ｒ、Ｋ７４６Ｔ、Ｇ７８６Ｃ、Ｇ７８６Ｓ、Ｒ７８７Ｃ、Ｒ７８７Ｈ、Ｒ７８７Ｓ、Ｐ７９６Ｌ、Ｐ７９６Ｓ、Ｄ８０１Ｎ、Ｑ８０８Ｈ、Ｒ８０９ＷおよびＥ８１０Ｋからなる群から選択される１つまたは複数のアミノ酸位置で変異を含む、項目１から３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
それぞれが、
ＴｒｋＡタンパク質中のアミノ酸位置２４１、３１４、３１８、３１９、３２０、３２１、５１０、５１１、５１２、５５２、５５３、５５４、６３６、６３７、６３８、６４９、６５４、６５５、６７９、６８０、６８７、６８８、６８９、６９０、６９２、６９５、６９６、６９７、７４７、７４８、７４９および７５０の１つで変異をコードするＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント；
ＴｒｋＢタンパク質中のアミノ酸位置２４０、２４１、２４２、２５１、２５２、２５６、２５７、２５８、２６４、３１４、３１５、４０１、４２６、４２７、４２８、４４０、５９８、５９９、６００、６０２、６０３、６６４、６６５、６６６、６７７、６７８、６７９、６８０、６８９、６９１、６９２、７４６、７４７、７４８、７４９、７８４、７８５、７８６、７８７、７８８、７８９、８０４および８０５の１つで変異をコードするＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント；または
ＴｒｋＣタンパク質中のアミノ酸位置２２１、２２２、２２３、２４２、２４３、２４４、２６９、２７０、２７１、２７６、２７７、２８１、２８２、２８３、２９６、２９７、３２５、３２６、３２８、３２９、３４４、３４５、３４６、３４９、３５０、３５１、３５３、３５４、５３７、５３８、５３９、５４０、５４５、５５０、５５１、５６０、５６２、５７５、５７６、５７７、５８２、５８３、５８４、６０１、６０２、６０３、６０４、６０７、６０８、６０９、６１０、６１２、６２４、６２５、６２６、６２７、６２８、６２９、６３４、６３５、６３６、６３７、６５０、６５１、６５２、６５３、６７７、６７８、６７９、６８７、６８８、６８９、７０５、７０６、７０７、７０８、７１５、７１６、７１７、７３０、７３１、７３２、７３８、７４４、７４５、７４６、７８６、７８７、７９６、８０１、８０８、８０９および８１０の１つで変異をコードするＮＴＲＫ３遺伝子のセグメント
に特異的にハイブリダイズする１つまたは複数のプローブを含むキット。
（項目３３）
それぞれが、
ＴｒｋＡタンパク質中のＳ２４１Ｆ、Ｓ２４１Ｈ、Ｓ２４１Ｙ、Ｒ３１４Ｇ、Ｒ３１４Ｈ、Ｒ３１４Ｌ、Ｒ３１４Ｐ、Ｎ３１８Ｓ、Ｇ３１９Ｓ、Ｓ３２０Ｆ、Ｖ３２１Ｍ、Ｉ５１０Ｔ、Ｖ５１１Ｍ、Ｌ５１２Ｆ、Ｌ５１２Ｒ、Ｓ５５２Ｒ、Ａ５５３Ｔ、Ｒ５５４Ｐ、Ｒ５５４Ｑ、Ｒ５５４Ｗ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｔ、Ａ６３６Ｖ、Ｇ６３７Ｅ、Ｇ６３７Ｗ、Ｍ６３８Ｖ、Ｒ６４９Ｌ、Ｒ６４９Ｗ、Ｒ６５４Ｃ、Ｒ６５４Ｈ、Ｎ６５５Ｙ、Ｄ６７９Ｎ、Ｄ６７９Ｙ、Ｙ６８０Ｈ、Ｔ６８７Ｉ、Ｍ６８８Ｉ、Ｌ６８９Ｍ、Ｐ６９０Ｈ、Ｒ６９２Ｃ、Ｒ６９２Ｈ、Ｐ６９５Ｓ、Ｐ６９６Ｌ、Ｅ６９７Ｋ、Ｅ７４７Ｋ、Ｒ７４８Ｌ、Ｒ７４８Ｑ、Ｒ７４８Ｗ、Ｐ７４９Ｑ、Ｒ７５０Ｃ、Ｒ７５０ＨおよびＲ７５０Ｌからなる群から選択される変異をコードするＮＴＲＫ１遺伝子のセグメント；
ＴｒｋＢタンパク質中のＭ２４０Ｉ、Ｎ２４１Ｄ、Ｅ２４２Ｋ、Ｒ２５１Ｇ、Ｒ２５１Ｋ、Ｉ２５２Ｖ、Ｓ２５６Ｌ、Ｓ２５７Ｆ、Ｄ２５８Ｎ、Ｉ２６４Ｍ、Ａ３１４Ｅ、Ａ３１４Ｇ、Ａ３１４Ｖ、Ｌ３１５Ｆ、Ｇ４０１Ａ、Ｇ４０１Ｅ、Ｇ４０１Ｒ、Ｔ４２６Ｉ、Ｇ４２７Ｓ、Ｒ４２８Ｑ、Ａ４４０Ｓ、Ａ４４０Ｔ、Ａ４４０Ｖ、Ｒ５９８Ｃ、Ｒ５９８Ｓ、Ｋ５９９Ｍ、Ｄ６００Ｈ、Ｈ６０２Ｎ、Ｒ６０３Ｓ、Ｌ６６４Ｍ、Ｔ６６５Ｍ、Ｔ６６５Ｓ、Ｑ６６６Ｌ、Ｑ６６６Ｒ、Ａ６７７Ｔ、Ａ６７８Ｔ、Ａ６７８Ｖ、Ｇ６７９Ｄ、Ｍ６８０Ｉ、Ｖ６８９Ｍ、Ｒ６９１Ｃ、Ｄ６９２Ｎ、Ｆ７４６Ｉ、Ｔ７４７Ｍ、Ｔ７４８Ｍ、Ｅ７４９Ｋ、Ｑ７８４Ｈ、Ｇ７８５Ｖ、Ｒ７８６Ｑ、Ｖ７８７Ｆ、Ｌ７８８Ｍ、Ｑ７８９Ｅ、Ｇ８０４Ｅ、Ｃ８０５ＲおよびＣ８０５Ｙからなる群から選択される変異をコードするＮＴＲＫ２遺伝子のセグメント；または
ＴｒｋＣタンパク質中のＶ２２１Ｉ、Ｒ２２２Ｑ、Ｅ２２３Ｄ、Ｄ２４２Ｎ、Ｗ２４３Ｃ、Ｉ２４４Ｔ、Ｔ２６９Ａ、Ｔ２６９Ｍ、Ｔ２７０Ｍ、Ｔ２７０Ｑ、Ｔ２７０Ｖ、Ｖ２７１Ｌ、Ｖ２７１Ｍ、Ｅ２７６Ｄ、Ｄ２７７Ｅ、Ｄ２７７Ｇ、Ｄ２７７Ｎ、Ｔ２８１Ｉ、Ｔ２８１Ｐ、Ｔ２８２Ｍ、Ｔ２８３Ａ、Ｔ２８３Ｋ、Ｔ２８３Ｍ、Ｓ２９６Ｉ、Ｓ２９６Ｒ、Ｖ２９７Ｉ、Ｖ３２５Ｍ、Ｒ３２６Ｃ、Ｒ３２６Ｇ、Ｒ３２６Ｈ、Ｒ３２６Ｌ、Ｒ３２６Ｐ、Ｎ３２８Ｓ、Ｐ３２９Ｎ、Ｐ３２９Ｓ、Ｐ３３０Ｑ、Ｅ３４４Ｇ、Ｅ３４４Ｖ、Ｓ３４５Ｆ、Ｋ３４６Ｎ、Ｈ３４９Ｙ、Ｖ３５０Ｅ、Ｅ３５１Ｄ、Ｙ３５３Ｆ、Ｑ３５４Ｋ、Ｄ５３７Ｅ、Ｄ５３７Ｙ、Ｉ５３８Ｎ、Ｖ５３９Ｍ、Ｌ５４０Ｍ、Ｇ５４５Ｃ、Ｇ５４５Ｄ、Ｇ５５０Ｒ、Ｋ５５１Ｅ、Ｌ５６０Ｖ、Ｐ５６２Ｌ、Ｐ５６２Ｑ、Ｐ５６２Ｒ、Ｐ５６２Ｔ、Ｋ５７５Ｅ、Ｄ５７６Ｎ、Ｐ５７７Ｓ、Ｐ５８２Ｑ、Ｐ５８２Ｗ、Ｋ５８３％、Ｄ５８４Ｅ、Ｄ５８４Ｎ、Ｖ６０１Ａ、Ｖ６０１Ｉ、Ｋ６０２Ｒ、Ｆ６０３Ｌ、Ｙ６０４Ｆ、Ｙ６０４Ｈ、Ｙ６０４Ｎ、Ｃ６０７Ｆ、Ｇ６０８Ｃ、Ｇ６０８Ｅ、Ｇ６０８Ｓ、Ｄ６０９Ｇ、Ｄ６０９Ｈ、Ｄ６０９Ｎ、Ｄ６０９Ｖ、Ｇ６１０Ｒ、Ｐ６１２Ａ、Ｐ６１２Ｌ、Ｐ６１２Ｓ、Ｐ６１２Ｔ、Ｄ６２４Ｙ、Ｌ６２５Ｍ、Ｎ６２６Ｋ、Ｋ６２７Ｎ、Ｋ６２７Ｒ、Ｆ６２８Ｌ、Ｌ６２９Ｆ、Ｌ６２９Ｉ、Ｐ６３４Ｌ、Ｐ６３４Ｔ、Ｄ６３５Ｈ、Ａ６３６Ｅ、Ａ６３６Ｖ、Ｍ６３７Ｉ、Ｍ６３７Ｋ、Ｍ６３７Ｖ、Ｅ６５０Ｖ、Ｌ６５１Ｐ、Ｇ６５２Ｒ、Ｇ６５２Ｖ、Ｌ６５３Ｆ、Ｌ６５３Ｐ、Ｈ６７７Ｙ、Ｒ６７８Ｑ、Ｄ６７９Ｇ、Ｄ６７９Ｎ、Ｖ６８７Ａ、Ｖ６８７Ｉ、Ｇ６８８Ｒ、Ａ６８９Ｅ、Ａ６８９Ｖ、Ｙ７０５Ｎ、Ｓ７０６Ｉ、Ｔ７０７Ｍ、Ｄ７０８Ｎ、Ｐ７１５Ｌ、Ｐ７１５Ｓ、Ｓ７１６Ｙ、Ｇ７１７Ｒ、Ｔ７３０Ｎ、Ｍ７３１Ｉ、Ｍ７３１Ｌ、Ｌ７３２Ｉ、Ｐ７３８Ｈ、Ｐ７３８Ｓ、Ｙ７４４Ｆ、Ｒ７４５Ｐ、Ｒ７４５Ｗ、Ｋ７４６Ｒ、Ｋ７４６Ｔ、Ｇ７８６Ｃ、Ｇ７８６Ｓ、Ｒ７８７Ｃ、Ｒ７８７Ｈ、Ｒ７８７Ｓ、Ｐ７９６Ｌ、Ｐ７９６Ｓ、Ｄ８０１Ｎ、Ｑ８０８Ｈ、Ｒ８０９Ｗ、およびＥ８１０Ｋからなる群から選択される変異をコードするＮＴＲＫ３遺伝子のセグメント
に特異的にハイブリダイズする１つまたは複数のプローブを含む、項目３２に記載のキット。
（項目３４）
前記１つまたは複数のプローブが、検出可能なプローブで標識される、項目３２または３３に記載のキット。
（項目３５）
前記１つまたは複数のプローブが、基材に共有結合的に付着される、項目３２から３４に記載のキット。
（項目３６）
前記基材が、フィルム、プレート、またはビーズである、項目３５に記載のキット。