(57)【要約】【課題】本発明の目的は、体表組織の解剖学的部位を判定する方法を提供することである。【解決手段】以下の工程（Ａ）、（Ｂ）及び（Ｃ）を含む、被験体表組織の解剖学的部位を判定する方法。（Ａ）Ｈｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子からなる群から少なくとも８種の遺伝子を選択する工程（Ｂ）被験体表組織を用いて、前記（Ａ）で選択した遺伝子の発現量を測定する工程（Ｃ）前記（Ｂ）で得られた発現量又は発現量の組合せに基づき、被験体表組織の解剖学的部位を判定する工程【選択図】図４
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の工程（Ａ）、（Ｂ）及び（Ｃ）を含む、被験体表組織の解剖学的部位を判定する方法。
（Ａ）ホメオボックス遺伝子群の少なくとも１種の遺伝子を選択する工程
（Ｂ）被験体表組織を用いて、前記（Ａ）で選択した遺伝子の発現量を測定する工程
（Ｃ）前記（Ｂ）で得られた発現量又は発現量の組合せに基づき、被験体表組織の解剖学的部位を判定する工程
【請求項２】
ホメオボックス遺伝子群の遺伝子が、Ｈｏｘ遺伝子群の遺伝子及びＰａｘ６遺伝子であることを特徴とする、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＨＯＸ遺伝子群の遺伝子が、Ｈｏｘａ１〜４、６、７、９〜１１及び１３、Ｈｏｘｂ３〜９、及び１３、Ｈｏｘｃ４〜６、８及び１０〜１３、並びにＨｏｘｄ４及び８〜１３であることを特徴とする、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記被験体表組織の解剖学的部位が、角膜−右側、角膜−左側、目蓋−右側、目蓋−左側、耳−右側、耳−左側、頬−右側、頬−左側、頭頂部、首−腹側、首−背側、胴体−上部腹側、胴体−上部背側、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前脚−右側、前脚−左側、前足−右側、前足−左側、後脚−右側、後脚−左側、後足−右側、後足−左側及び尾から選択される少なくとも１つの部位である、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
前記工程（Ａ）において、表６に示す下記の８種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表６に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘｂ４
３：Ｈｏｘｂ５
４：Ｈｏｘｂ８
５：Ｈｏｘｂ９
６：Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
７：Ｈｏｘｄ４
８：Ｐａｘ６
【請求項６】
前記工程（Ａ）において、表９に示す下記の１０種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表９に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘａ４
３：Ｈｏｘｂ４
４：Ｈｏｘｂ５、Ｈｏｘｂ６またはＨｏｘｂ７
５：Ｈｏｘｂ８
６：Ｈｏｘｂ９
７：Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
８：Ｈｏｘｄ４
９：Ｈｏｘｄ１２
１０：Ｐａｘ６
【請求項７】
第１の判定において、Ｈｏｘａ３およびＨｏｘａ６からなる群より選択される少なくとも１つの遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項５または６に記載の方法。
【請求項８】
前記工程（Ａ）において、表１２に示す１１種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表１２に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘａ９
３：Ｈｏｘａ１３、Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
４：Ｈｏｘｂ３またはＨｏｘｂ７
５：Ｈｏｘｂ４
６：Ｈｏｘｂ９
７：Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９またはＨｏｘｄ１０
８：Ｈｏｘｃ４
９：Ｈｏｘｄ４
１０：Ｈｏｘｄ１１
１１：Ｐａｘ６
【請求項９】
第１の判定において、Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９およびＨｏｘｄ１０からなる群より選択される少なくとも１つの遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘａ３遺伝子，Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子及びＨｏｘｂ７遺伝子からなる群から選択される一種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が後部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前部領域であると判定する、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘａ１１遺伝子、Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子、Ｈｏｘｄ１０遺伝子及びＨｏｘｄ１３遺伝子からなる群から選択される一種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が遠位部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が近位部領域であると判定する、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘｂ９遺伝子又はＨｏｘｄ４遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織が背部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織が腹部領域であると判定する、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記工程（Ａ）及び（Ｃ）において、被験体表組織の解剖学的部位を以下（１）〜（２５）に示すいずれかの方法で判定する、請求項４に記載の方法。
（１）Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２）Ｈｏｘｂ３遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の首−背側、胴体、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（３）Ｈｏｘｂ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の首、胴体、前脚、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（４）Ｈｏｘｂ５遺伝子又はＨｏｘｂ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の首−背側、胴体、後脚、後足−右側又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（５）Ｈｏｘａ９遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体−下部、前足−右側、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（６）Ｈｏｘａ１１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の前足−右側又は尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（７）Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の前足、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（８）Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子又はＨｏｘｄ１０遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（９）Ｈｏｘｄ１３遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１０）Ｈｏｘｂ９遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体−上部背側、胴体−下部背側、後脚又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１１）Ｈｏｘｄ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体−上部背側、胴体−下部背側又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１２）Ｈｏｘａ１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜であり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１３）Ｈｏｘａ２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、前足、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１４）Ｈｏｘａ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側、頬−左側、後足−右側及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１５）Ｈｏｘａ７遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側及び前脚−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１６）Ｈｏｘａ１０遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側、首−背側、胴体上部及び胴体−下部背側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１７）Ｈｏｘｂ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜及び耳−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１８）Ｈｏｘｃ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、目蓋、耳、頬、前足−左側、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１９）Ｈｏｘｃ５遺伝子又はＨｏｘｃ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２０）Ｈｏｘｃ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部、首−背側、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２１）Ｈｏｘｃ１３遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳及び胴体−下部腹側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２２）Ｈｏｘｄ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳、前足及び後足−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２３）Ｈｏｘｄ１１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳、首−腹側、胴体−上部腹側、前足−左側及び後足−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２４）Ｈｏｘｄ１２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側、頭頂部、首−背側及び胴体−上部背側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位であると判定する方法
（２５）Ｐａｘ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜及び目蓋−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
【請求項１４】
被験体表組織が、表皮又は角膜である、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
表皮又は角膜が、採取されたもの、作製されたもの、もしくは採取または作製され、さらに培養されたものである、請求項１〜１４のいずれかに記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、体表組織の解剖学的部位を判定する方法に関するものである。
【背景技術】
【０００２】
皮膚は、全身を一体的に覆っているが、それぞれの特定部位において、見た目も働きも異なる。例えば、上腕及び腹部の皮膚は、手のひらに比べ、弾性が高い（非特許文献１）。さらに、前胸部、肩、耳たぶ、上腕及び頬の皮膚は、それ以外の部位に比べ、ケロイドが形成されやすい（非特許文献２）。さらには、胴体由来の表皮を患者の傷害された掌蹠に移植すると、高頻度で潰瘍を生じる（非特許文献３）など、部位によって性質が異なることが知られている。【０００３】
生物の身体は、発生の過程において、ホメオボックス遺伝子によって位置情報を認識しており、部位に従って適切な分化誘導が行われている。このホメオボックス遺伝子は、ショウジョウバエにおいて初めて発見されたが、脊椎動物においても存在し、生物の種を超えてＤＮＡ配列が保存されており（非特許文献４）、生物個体の発生、形態形成にとって最も重要な遺伝子群の一つと考えられている。近年、成体においても、繊維芽細胞では一部のホメオボックス遺伝子の発現によって位置情報が維持されていることが報告されている（非特許文献５及び非特許文献６）。しかしながら、成体のその他の器官における位置情報としてのホメオボックス遺伝子の働きについて、詳細は不明である。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００４】
【非特許文献１】Arch Dermatol Res. 282, 283-288, 1990
【非特許文献２】Mol Med. 17, 113-125, 2011
【非特許文献３】J. Dermatol. Sci. 40, 1-9, 2005
【非特許文献４】Science. 249, 374-379, 1990
【非特許文献５】Genes Dev., 22, 303-307, 2008
【非特許文献６】J. Invest. Dermatol., 128, 776-782, 2008
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
本発明の目的は、体表組織の解剖学的部位を判定する方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、上記の課題を解決するため鋭意検討した結果、マウスの２４箇所の体表組織のホメオボックス遺伝子の発現量を測定した結果、採取した体表組織の解剖学的部位によって発現量及び発現パターンが異なることを見出し、さらに検討を重ねて、種々の新知見を得て、本発明を完成するに至った。
すなわち、本発明は以下の発明に関する。
［１］以下の工程（Ａ）、（Ｂ）及び（Ｃ）を含む、被験体表組織の解剖学的部位を判定する方法。
（Ａ）ホメオボックス遺伝子群の少なくとも１種の遺伝子を選択する工程
（Ｂ）被験体表組織を用いて、前記（Ａ）で選択した遺伝子の発現量を測定する工程
（Ｃ）前記（Ｂ）で得られた発現量又は発現量の組合せに基づき、被験体表組織の解剖学的部位を判定する工程
［２］ホメオボックス遺伝子群の遺伝子が、Ｈｏｘ遺伝子群の遺伝子及びＰａｘ６遺伝子であることを特徴とする、前記［１］に記載の方法。
［３］ＨＯＸ遺伝子群の遺伝子が、Ｈｏｘａ１〜４、６、７、９〜１１及び１３、Ｈｏｘｂ３〜９、及び１３、Ｈｏｘｃ４〜６、８及び１０〜１３、並びにＨｏｘｄ４及び８〜１３であることを特徴とする、前記［２］に記載の方法。
［４］前記被験体表組織の解剖学的部位が、角膜−右側、角膜−左側、目蓋−右側、目蓋−左側、耳−右側、耳−左側、頬−右側、頬−左側、頭頂部、首−腹側、首−背側、胴体−上部腹側、胴体−上部背側、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前脚−右側、前脚−左側、前足−右側、前足−左側、後脚−右側、後脚−左側、後足−右側、後足−左側及び尾から選択される少なくとも１つの部位である、前記［１］〜［３］のいずれかに記載の方法。
［５］前記工程（Ａ）において、表６に示す下記の８種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表６に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、前記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘｂ４
３：Ｈｏｘｂ５
４：Ｈｏｘｂ８
５：Ｈｏｘｂ９
６：Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
７：Ｈｏｘｄ４
８：Ｐａｘ６
［６］前記工程（Ａ）において、表９に示す下記の１０種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表９に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、前記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘａ４
３：Ｈｏｘｂ４
４：Ｈｏｘｂ５、Ｈｏｘｂ６またはＨｏｘｂ７
５：Ｈｏｘｂ８
６：Ｈｏｘｂ９
７：Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
８：Ｈｏｘｄ４
９：Ｈｏｘｄ１２
１０：Ｐａｘ６
［７］第１の判定において、Ｈｏｘａ３およびＨｏｘａ６からなる群より選択される少なくとも１つの遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、前記［５］または［６］に記載の方法。
［８］前記工程（Ａ）において、表１２に示す１１種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表１２に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、前記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘａ９
３：Ｈｏｘａ１３、Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
４：Ｈｏｘｂ３またはＨｏｘｂ７
５：Ｈｏｘｂ４
６：Ｈｏｘｂ９
７：Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９またはＨｏｘｄ１０
８：Ｈｏｘｃ４
９：Ｈｏｘｄ４
１０：Ｈｏｘｄ１１
１１：Ｐａｘ６
［９］第１の判定において、Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９およびＨｏｘｄ１０からなる群より選択される少なくとも１つの遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、前記［８］に記載の方法。
［１０］前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘａ３遺伝子，Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子及びＨｏｘｂ７遺伝子からなる群から選択される一種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が後部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前部領域であると判定する、前記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
［１１］前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘａ１１遺伝子、Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子、Ｈｏｘｄ１０遺伝子及びＨｏｘｄ１３遺伝子からなる群から選択される一種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が遠位部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が近位部領域であると判定する、前記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
［１２］前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘｂ９遺伝子又はＨｏｘｄ４遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織が背部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織が腹部領域であると判定する、前記［１］〜［４］のいずれかに記載の方法。
［１３］前記工程（Ａ）及び（Ｃ）において、被験体表組織の解剖学的部位を以下（１）〜（２５）に示すいずれかの方法で判定する、前記［４］に記載の方法。
（１）Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の胴体、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２）Ｈｏｘｂ３遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の首−背側、胴体、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（３）Ｈｏｘｂ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の首、胴体、前脚、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（４）Ｈｏｘｂ５遺伝子又はＨｏｘｂ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の首−背側、胴体、後脚、後足−右側又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（５）Ｈｏｘａ９遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の胴体−下部、前足−右側、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（６）Ｈｏｘａ１１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の前足−右側又は尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（７）Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の前足、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（８）Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子又はＨｏｘｄ１０遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（９）Ｈｏｘｄ１３遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１０）Ｈｏｘｂ９遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の胴体−上部背側、胴体−下部背側、後脚又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１１）Ｈｏｘｄ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の胴体−上部背側、胴体−下部背側又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１２）Ｈｏｘａ１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜であり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１３）Ｈｏｘａ２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、前足、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１４）Ｈｏｘａ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳−右側、頬−左側、後足−右側及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１５）Ｈｏｘａ７遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳−右側及び前脚−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１６）Ｈｏｘａ１０遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳−右側、首−背側、胴体上部及び胴体−下部背側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１７）Ｈｏｘｂ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜及び耳−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１８）Ｈｏｘｃ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、目蓋、耳、頬、前足−左側、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１９）Ｈｏｘｃ５遺伝子又はＨｏｘｃ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２０）Ｈｏｘｃ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部、首−背側、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２１）Ｈｏｘｃ１３遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳及び胴体−下部腹側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２２）Ｈｏｘｄ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳、前足及び後足−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２３）Ｈｏｘｄ１１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳、首−腹側、胴体−上部腹側、前足−左側及び後足−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２４）Ｈｏｘｄ１２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜、耳−右側、頭頂部、首−背側及び胴体−上部背側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位であると判定する方法
（２５）Ｐａｘ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の角膜及び目蓋−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前記［４］に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
［１４］被験体表組織が、表皮又は角膜である、前記［１］〜［１３］のいずれかに記載の方法。
［１５］表皮又は角膜が、採取されたもの、作製されたもの、もしくは採取または作製され、さらに培養されたものである、前記［１］〜［１４］のいずれかに記載の方法。
【発明の効果】
【０００７】
本発明により、体表組織の解剖学的部位を判定する方法を提供することができる。本発明の判定方法は、ホメオボックス遺伝子群から特定の遺伝子の組合せを選択し、それらの遺伝子の発現量を測定し、それらの測定結果に基づき、少ない遺伝子数で、簡便に、多数の解剖学的部位を判定できる点等において、特に顕著な効果を奏する。
【図面の簡単な説明】
【０００８】
【図１】図１は、体表組織の解剖学的部位の分類及び名称を示す図である。
【図２Ａ】図２Ａは、各部位由来の体表組織におけるＨｏｘａ遺伝子群の発現量の解析結果を示す図である。
【図２Ｂ】図２Ｂは、各部位由来の体表組織におけるＨｏｘｂ遺伝子群の発現量の解析結果を示す図である。
【図２Ｃ】図２Ｃは、各部位由来の体表組織におけるＨｏｘｃ遺伝子群の発現量の解析結果を示す図である。
【図２Ｄ】図２Ｄは、各部位由来の体表組織におけるＨｏｘｄ遺伝子群、Ｐａｘ６遺伝子及びＫ１４遺伝子の発現量の解析結果を示す図である。
【図３】図３は、体表組織の各解剖学的領域（前部又は後部領域、近位部又は遠位部領域、背部又は腹部領域、及びその他）を分類可能な遺伝子を示す図である。
【図４】図４は、最少８種類の遺伝子から最大１１箇所の体表組織の解剖学的部位を判定するためのフローチャートの図である。
【図５】図５は、最少１０種類の遺伝子から最大１４箇所の体表組織の解剖学的部位を判定するためのフローチャートの図である。
【図６】図６は、最少１１種類の遺伝子から最大１５箇所の体表組織の解剖学的部位を判定するためのフローチャートの図である。
【発明を実施するための形態】
【０００９】
本発明は、工程（Ａ）ホメオボックス遺伝子群の少なくとも１種の遺伝子を選択する工程、（Ｂ）被験体表組織を用いて、前記（Ａ）で選択した遺伝子の発現量を測定する工程及び（Ｃ）前記（Ｂ）で得られた発現量又は発現量の組合せに基づき、被験体表組織の解剖学的部位を判定する工程を含む、被験体表組織の解剖学的部位を判定する方法を提供する。
【００１０】
本発明において、体表組織は上皮組織であればよい。上皮組織としては、例えば、皮膚、角膜等であってもよい。
【００１１】
本発明において、被験体表組織としては、例えば、採取されたもの、作製されたもの等であってもよい。また、被験体表組織としては、例えば、採取、作製等されたものを、さらに培養したもの等であってもよい。
【００１２】
本発明において、体表組織の解剖学的部位の判定の対象となる動物としては、例えば、哺乳動物が挙げられる。哺乳動物としては、例えば、ヒト、サル、オランウータン、チンパンジー、ゴリラ等の霊長類、マウス、ラット、ハムスター、モルモット等のげっ歯類やウサギ等の実験動物、ウシ、ウマ、ブタ、ヒツジ、ヤギ等の家畜、イヌ、ネコ等のペット、ニワトリ、アヒル、ガチョウ等の鳥類等が挙げられる。哺乳動物は、好ましくはげっ歯類（マウス等）又は霊長類（ヒト等）であり、より好ましくはマウス又はヒトであり、さらに好ましくはマウスである。
【００１３】
本発明において、採取された被験体表組織としては、例えば、手術等により生体等から採取されたもの等が挙げられる。
【００１４】
本発明において、作製された被験体表組織としては、実験的に作製されたもの等であってもよく、例えば、人工多能性幹細胞（ｉＰＳ細胞）、胚性幹細胞（ＥＳ細胞）、間葉系幹細胞等を分化誘導等して作製されたものであってもよく、線維芽細胞等をリプログラミングして、その後に分化誘導等して作製されたもの等であってもよい。
【００１５】
本発明において、採取、作製等されたものを、さらに培養した被験体表組織は、例えば、培養前後でＨＯＸ遺伝子群の発現パターンが変化しないことが好ましい。被験体表組織においてＨＯＸ遺伝子群の発現パターンが変化しない培養方法としては、例えば、採取、作製されたものを、公知の培養器具（例えばｉＭａｔｒｉｘ−５１１コーティングディッシュ）を使用し、培地サプリメント（例えば、２％ Ｂ２７サプリメント）、ＲＯＣＫ阻害剤（例えば、１０μＭ Ｙ−２７６３２）、および細胞増殖因子（細胞成長因子）を添加したＤＭＥＭ／Ｆ１２培養培地で培養する方法等が挙げられる。採取、作製されたものが表皮ケラチノサイトである場合は、ＤＭＥＭ／Ｆ１２培養培地（２％ Ｂ２７サプリメント、１０μＭ Ｙ−２７６３２を含む）に細胞増殖因子としてＥＧＦを１０ｎｇ／ｍｌとなるように添加した培養培地を使用して培養する方法が好ましい。採取、作製されたものが角膜上皮細胞である場合は、ＤＭＥＭ／Ｆ１２培養培地（２％ Ｂ２７サプリメント、１０μＭ Ｙ−２７６３２を含む）に細胞増殖因子としてＫＧＦを２０ｎｇ／ｍｌとなるように添加した培養培地を使用して培養する方法が好ましい。
【００１６】
本発明において、解剖学的部位とは、例えば、解剖学的に分類できる部位であればよい。解剖学的に分類できる部位としては、例えば、角膜−右側、角膜−左側、目蓋−右側、目蓋−左側、耳−右側、耳−左側、頬−右側、頬−左側、頭頂部、首−腹側、首−背側、胴体−上部腹側、胴体−上部背側、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前脚−右側、前脚−左側、前足−右側、前足−左側、後脚−右側、後脚−左側、後足−右側、後足−左側、尾等が挙げられる。また、前部領域、後部領域、近位部領域、遠位部領域、背部領域、腹部領域等が挙げられる。
【００１７】
本発明において、解剖学的に分類できる部位の前部領域には、角膜−右側、角膜−左側、目蓋−右側、目蓋−左側、耳−右側、耳−左側、頬−右側、頬−左側、頭頂部、首−腹側、首−背側、前脚−右側、前脚−左側、前足−右側、前足−左側等が含まれる。
【００１８】
本発明において、解剖学的に分類できる部位の後部領域には、首−腹側、首−背側、胴体−上部腹側、胴体−上部背側、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前脚−右側、前脚−左側、後脚−右側、後脚−左側、後足−右側、後足−左側、尾等が含まれる。
【００１９】
本発明において、解剖学的に分類できる部位の近位部領域には、角膜−右側、角膜−左側、目蓋−右側、目蓋−左側、耳−右側、耳−左側、頬−右側、頬−左側、頭頂部、首−腹側、首−背側、胴体−上部腹側、胴体−上部背側、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前脚−右側、前脚−左側、後脚−右側、後脚−左側等が含まれる。
【００２０】
本発明において、解剖学的に分類できる部位の遠位部領域には、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前足−右側、前足−左側、後脚−右側、後脚−左側、後足−右側、後足−左側、尾等が含まれる。
【００２１】
本発明において、解剖学的に分類できる部位の背部領域には、胴体−上部背側、胴体−下部背側、後脚−右側、後脚−左側、尾等が含まれる。
【００２２】
本発明において、解剖学的に分類できる部位の腹部領域には、胴体−上部腹側、胴体−下部腹側等が含まれる。
【００２３】
工程（Ａ）では、ホメオボックス遺伝子群の少なくとも１種の遺伝子を選択する。
【００２４】
ホメオボックス遺伝子群の遺伝子は、その配列内にホメオボックスドメインを有する遺伝子である。ホメオボックス遺伝子群の遺伝子としては、例えば、Ｈｏｘ遺伝子群、Ｐａｘ遺伝子群、ＤＬＸ遺伝子群、ＩＲＸ遺伝子群、ＭＥＩＳ遺伝子群、ＭＫＸ遺伝子、ＰＢＸ遺伝子群、ＰＫＮＯＸ遺伝子群、ＡＤＮＦ遺伝子、ＡＬＸ遺伝子群、ＡＲＧＦＸ遺伝子、ＡＲＸ遺伝子、ＢＡＲＨＬ遺伝子群、ＢＡＲＸ遺伝子群、ＣＤＸ遺伝子群、ＣＲＸ遺伝子、ＣＵＴＬ遺伝子群、ＤＢＸ遺伝子群、ＤＭＢＸ遺伝子、ＤＰＲＸ遺伝子、ＤＲＧＸ遺伝子、ＤＵＸ遺伝子群、ＥＭＸ遺伝子群、ＥＮ遺伝子群、ＥＳＸ１Ｌ遺伝子、ＦＶＸ遺伝子群、ＧＢＸ遺伝子群、ＧＳＣ遺伝子群、ＧＳＸ遺伝子群、ＨＥＳＸ１遺伝子、ＨＨＥＸ遺伝子、ＨＬＸ１遺伝子、ＨＭＢＯＸ１遺伝子、ＨＭＸ遺伝子群、ＨＮＦ遺伝子群、ＨＯＭＥＺ遺伝子、ＨＯＰＸ遺伝子、ＩＳＬ遺伝子群、ＩＳＸ遺伝子、ＬＡＳＳ遺伝子群、ＬＢＸ遺伝子群、ＬＨＸ遺伝子群、ＬＭＸ遺伝子群、ＭＥＯＸ遺伝子群、ＭＩＸＬ１遺伝子、ＭＮＸ１遺伝子、ＭＳＸ遺伝子群、ＮＡＮＯＧ遺伝子、ＮＫＸ遺伝子群、ＮＯＢＯＸ遺伝子、ＮＯＴＯ遺伝子、ＯＮＥＣＵＴ遺伝子群、ＯＴＰ遺伝子、ＯＴＸ遺伝子群、ＰＤＸ１遺伝子、ＰＨＯＸ遺伝子群、ＰＩＴＸ遺伝子群、ＰＲＯＰ１遺伝子、ＰＲＲＸ遺伝子群、ＲＡＸ遺伝子群、ＲＨＯＸＦ遺伝子群、ＳＡＴＢ遺伝子群、ＳＥＢＯＸ遺伝子、ＳＨＯＸ遺伝子群、ＳＩＸ遺伝子群、ＴＧＩＦ遺伝子群、ＴＬＸ遺伝子群、ＴＳＨＺ遺伝子群、ＵＮＣＸ遺伝子、ＶＡＸ遺伝子群、ＶＥＮＴＸ遺伝子、ＶＳＸ遺伝子群、ＺＥＢ遺伝子群、ＺＦＨＸ遺伝子群、ＺＨＸ１遺伝子等が挙げられる。
【００２５】
ＤＬＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＤＬＸ１遺伝子、ＤＬＸ２遺伝子、ＤＬＸ３遺伝子、ＤＬＸ４遺伝子、ＤＬＸ５遺伝子、ＤＬＸ６遺伝子が挙げられ、ＩＲＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＩＲＸ３遺伝子、ＩＲＸ４遺伝子、ＩＲＸ５遺伝子、ＩＲＸ６遺伝子が挙げられ、ＭＥＩＳ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＭＥＩＳ１遺伝子、ＭＥＩＳ２遺伝子、ＭＥＩＳ３遺伝子が挙げられ、ＰＢＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＰＢＸ１遺伝子、ＰＢＸ２遺伝子、ＰＢＸ３遺伝子、ＰＢＸ４遺伝子が挙げられ、ＰＫＮＯＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＰＫＮＯＸ１遺伝子、ＰＫＮＯＸ２遺伝子が挙げられ、ＡＬＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＡＬＸ１（ＣＡＲＴ１）遺伝子、ＡＬＸ３遺伝子、ＡＬＸ４遺伝子が挙げられ、ＢＡＲＨＬ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＢＡＲＨＬ１遺伝子、ＢＡＲＨＬ２遺伝子が挙げられ、ＢＡＲＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＢＡＲＸ１遺伝子、ＢＡＲＸ２遺伝子が挙げられ、ＣＤＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＣＤＸ１遺伝子、ＣＤＸ２遺伝子、ＣＤＸ４遺伝子が挙げられ、ＣＵＴＬ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＣＵＴＬ１遺伝子、ＣＵＴＬ２遺伝子が挙げられ、ＤＢＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＤＢＸ１遺伝子、ＤＢＸ２遺伝子が挙げられ、ＤＵＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＤＵＸ１遺伝子、ＤＵＸ２遺伝子、ＤＵＸ３遺伝子、ＤＵＸ４遺伝子、ＤＵＸ５遺伝子、ＤＵＸＡ遺伝子が挙げられ、ＥＭＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＥＭＸ１遺伝子、ＥＭＸ２遺伝子が挙げられ、ＥＮ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＥＮ１遺伝子、ＥＮ２遺伝子が挙げられ、ＥＶＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＥＶＸ１遺伝子、ＥＶＸ２遺伝子が挙げられ、ＧＢＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＧＢＸ１遺伝子、ＧＢＸ２遺伝子が挙げられ、ＧＳＣ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＧＳＣ遺伝子、ＧＳＣ２遺伝子が挙げられ、ＧＳＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＧＳＸ１遺伝子、ＧＳＸ２遺伝子が挙げられ、ＨＭＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＨＭＸ１遺伝子、ＨＭＸ２遺伝子、ＨＭＸ３遺伝子が挙げられ、ＨＮＦ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＨＮＦ１Ａ遺伝子、ＨＮＦ１Ｂ遺伝子が挙げられ、ＩＳＬ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＩＳＬ１遺伝子、ＩＳＬ２遺伝子が挙げられ、ＬＡＳＳ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＬＡＳＳ２遺伝子、ＬＡＳＳ３遺伝子、ＬＡＳＳ４遺伝子、ＬＡＳＳ５遺伝子、ＬＡＳＳ６遺伝子が挙げられ、ＬＢＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＬＢＸ１遺伝子、ＬＢＸ２遺伝子が挙げられ、ＬＨＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＬＨＸ１遺伝子、ＬＨＸ２遺伝子、ＬＨＸ３遺伝子、ＬＨＸ４遺伝子、ＬＨＸ５遺伝子、ＬＨＸ６遺伝子、ＬＨＸ８遺伝子、ＬＨＸ９遺伝子が挙げられ、ＬＭＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＬＭＸ１Ａ遺伝子、ＬＭＸ１Ｂ遺伝子が挙げられ、ＭＥＯＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＭＥＯＸ１遺伝子、ＭＥＯＸ２遺伝子が挙げられ、ＭＳＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＭＳＸ１遺伝子、ＭＳＸ２遺伝子が挙げられ、ＮＫＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＮＫＸ２−１遺伝子、ＮＫＸ２−２遺伝子、ＮＫＸ２−４遺伝子、ＮＫＸ２−５遺伝子、ＮＫＸ２−８遺伝子、ＮＫＸ３−１遺伝子、ＮＫＸ３−２遺伝子、ＮＫＸ６−１遺伝子、ＮＫＸ６−２遺伝子、ＮＫＸ６−３遺伝子が挙げられ、ＯＮＥＣＵＴ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＯＮＥＣＵＴ１遺伝子、ＯＮＥＣＵＴ２遺伝子、ＯＮＥＣＵＴ３遺伝子が挙げられ、ＯＴＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＯＴＸ１遺伝子、ＯＴＸ２遺伝子が挙げられ、ＰＨＯＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＰＨＯＸ２Ａ遺伝子、ＰＨＯＸ２Ｂ遺伝子が挙げられ、ＰＩＴＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＰＩＴＸ１遺伝子、ＰＩＴＸ２遺伝子、ＰＩＴＸ３遺伝子が挙げられ、ＰＲＲＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＰＲＲＸ１遺伝子、ＰＲＲＸ２遺伝子が挙げられ、ＲＡＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＲＡＸ遺伝子、ＲＡＸ２遺伝子が挙げられ、ＲＨＯＸＦ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＲＨＯＸＦ１遺伝子、ＲＨＯＸＦ２遺伝子が挙げられ、ＳＡＴＢ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＳＡＴＢ１遺伝子、ＳＡＴＢ２遺伝子が挙げられ、ＳＨＯＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＳＨＯＸ遺伝子、ＳＨＯＸ２遺伝子が挙げられ、ＳＩＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＳＩＸ１遺伝子、ＳＩＸ２遺伝子、ＳＩＸ３遺伝子、ＳＩＸ４遺伝子、ＳＩＸ５遺伝子、ＳＩＸ６遺伝子が挙げられ、ＴＧＩＦ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＴＧＩＦ１遺伝子、ＴＧＩＦ２遺伝子、ＴＧＩＦ２ＬＸ遺伝子、ＴＧＩＦ２ＬＹ遺伝子が挙げられ、ＴＬＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＴＬＸ１遺伝子、ＴＬＸ２遺伝子、ＴＬＸ３遺伝子が挙げられ、ＴＳＨＺ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＴＳＨＺ１遺伝子、ＴＳＨＺ２遺伝子、ＴＳＨＺ３遺伝子が挙げられ、ＶＡＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＶＡＸ１遺伝子、ＶＡＸ２遺伝子が挙げられ、ＶＳＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＶＳＸ１遺伝子、ＶＳＸ２遺伝子が挙げられ、ＺＥＢ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＺＥＢ１遺伝子、ＺＥＢ２遺伝子が挙げられ、ＺＦＨＸ遺伝子群の遺伝子としては、例えば、ＺＦＨＸ２遺伝子、ＺＦＨＸ３遺伝子、ＺＦＨＸ４遺伝子が挙げられる。
【００２６】
Ｈｏｘ遺伝子群の遺伝子は、転写調節因子であり、動物の発生時等に機能し、個体の前後軸における分化特異性を決定する遺伝子であり、脊椎動物においてはＨｏｘａ遺伝子群、Ｈｏｘｂ遺伝子群、Ｈｏｘｃ遺伝子群及びＨｏｘｄ遺伝子群から構成される。
工程（Ａ）において選択されるＨｏｘａ遺伝子群の遺伝子としては、Ｈｏｘａ１遺伝子、Ｈｏｘａ２遺伝子、Ｈｏｘａ３遺伝子、Ｈｏｘａ４遺伝子、Ｈｏｘａ５遺伝子、Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘａ７遺伝子、Ｈｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘａ１０遺伝子、Ｈｏｘａ１１遺伝子及びＨｏｘａ１３遺伝子が挙げられる。なかでもＨｏｘａ１遺伝子、Ｈｏｘａ２遺伝子、Ｈｏｘａ３遺伝子、Ｈｏｘａ４遺伝子、Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘａ７遺伝子、Ｈｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘａ１０遺伝子、Ｈｏｘａ１１遺伝子及びＨｏｘａ１３遺伝子を選択するのが好ましい。工程（Ａ）において選択されるＨｏｘｂ遺伝子群の遺伝子としては、Ｈｏｘｂ１遺伝子、Ｈｏｘｂ２遺伝子、Ｈｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子、Ｈｏｘｂ７遺伝子、Ｈｏｘｂ８遺伝子、Ｈｏｘｂ９遺伝子及びＨｏｘｂ１３遺伝子が挙げられる。なかでもＨｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子、Ｈｏｘｂ７遺伝子、Ｈｏｘｂ８遺伝子、Ｈｏｘｂ９遺伝子及びＨｏｘｂ１３遺伝子を選択するのが好ましい。工程（Ａ）において選択されるＨｏｘｃ遺伝子群の遺伝子としては、Ｈｏｘｃ４遺伝子、Ｈｏｘｃ５遺伝子、Ｈｏｘｃ６遺伝子、Ｈｏｘｃ８遺伝子、Ｈｏｘｃ９遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子及びＨｏｘｃ１３遺伝子が挙げられる。なかでもＨｏｘｃ４遺伝子、Ｈｏｘｃ５遺伝子、Ｈｏｘｃ６遺伝子、Ｈｏｘｃ８遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子及びＨｏｘｃ１３遺伝子を選択するのが好ましい。工程（Ａ）において選択されるＨｏｘｄ遺伝子群の遺伝子としては、Ｈｏｘｄ１遺伝子、Ｈｏｘｄ３遺伝子、Ｈｏｘｄ４遺伝子、Ｈｏｘｄ８遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子、Ｈｏｘｄ１０遺伝子、Ｈｏｘｄ１１遺伝子、Ｈｏｘｄ１２遺伝子及びＨｏｘｄ１３遺伝子が挙げられる。なかでもＨｏｘｄ４遺伝子、Ｈｏｘｄ８遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子、Ｈｏｘｄ１０遺伝子、Ｈｏｘｄ１１遺伝子、Ｈｏｘｄ１２遺伝子及びＨｏｘｄ１３遺伝子を選択するのが好ましい。
【００２７】
Ｐａｘ遺伝子群の遺伝子は、動物の胎生期等に、組織や器官の発生において中心的な役割を果たす遺伝子であり、ＤＮＡ結合ドメインであるペアードドメインと呼ばれる領域を共通に持つ遺伝子である
工程（Ａ）において選択されるＰａｘ遺伝子群の遺伝子としては、Ｐａｘ１遺伝子、Ｐａｘ２遺伝子、Ｐａｘ３遺伝子、Ｐａｘ４遺伝子、Ｐａｘ５遺伝子、Ｐａｘ６遺伝子、Ｐａｘ７遺伝子、Ｐａｘ８遺伝子、Ｐａｘ９遺伝子が挙げられる。なかでもＰａｘ６遺伝子を選択するのが好ましい。
【００２８】
本発明の工程（Ａ）において、培養後の被験体表組織を用いた場合に選択される遺伝子は、例えば、培養前後で遺伝子の発現パターンが変化しない遺伝子であることが好ましい。培養前後で遺伝子の発現パターンが変化しない遺伝子としては、例えば、Ｈｏｘａ２遺伝子、Ｈｏｘａ３遺伝子、Ｈｏｘａ５遺伝子、Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘａ７遺伝子、Ｈｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子、Ｈｏｘｂ７遺伝子、Ｈｏｘｂ９遺伝子、Ｈｏｘｃ４遺伝子、Ｈｏｘｃ５遺伝子、Ｈｏｘｃ６遺伝子、Ｈｏｘｃ８遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子、Ｈｏｘｄ４遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子、ＰＡＸ６遺伝子等が挙げられる。例えば、培養後の被験体表組織を用いる場合は、これらの遺伝子を優先的に使用し、解剖学的部位の判定を行うことが好ましい。
【００２９】
本発明の工程（Ａ）において選択される少なくとも１種の遺伝子について、選択される遺伝子数の上限は特に限定されないが、選択される遺伝子数の上限は、例えば、１５個、１４個、１３個、１２個、１１個、１０個、９個、８個等が挙げられる。
【００３０】
本発明の工程（Ａ）において、解剖学的部位を判定するための遺伝子の組合わせに使用する遺伝子を選択する工程は、例えば、解剖学的部位において、発現量の高い解剖学的部位と発現量の低い解剖学的部位との発現量の差が大きい遺伝子を優先的に選択する工程等を含んでいてもよい。解剖学的部位間における発現量の差が大きい遺伝子を選択することで、例えば、結果の解析及び発現量の有無の判定が容易になる、部位特定の精度が上がる、広範囲の被験体表組織を対象とした場合においても判別しやすい等の効果を得ることができる。解剖学的部位間における発現量の差が大きい遺伝子としては、例えば、各遺伝子の発現量が最も高い部位の発現量を１．０として、相対値としての基準を０．１とした場合に、０．１の基準よりも高い値を示す部位の遺伝子発現量の中で、最も低い遺伝子発現量を示す部位の値と、０．１の基準よりも低い値を示す部位の遺伝子発現量の中で、最も高い遺伝子発現量を示す部位の値との差が、５．０以上、４．０以上、３．０以上、２．０以上、１．０以上、０．０８以上、０．０６以上、０．０４以上、０．０２以上等となる遺伝子が挙げられる。具体的には、例えば、遺伝子の発現量が最も高い部位の発現量を１．０として、相対値としての基準を０．１とした場合に、０．１の基準よりも高い値を示す部位の遺伝子発現量の中で、最も低い遺伝子発現量を示す部位の値と、０．１の基準よりも低い値を示す部位の遺伝子発現量の中で、最も高い遺伝子発現量を示す部位の値との差が０．０８以上となる場合における発現量の差が大きい遺伝子としては、Ｈｏｘａ１遺伝子、Ｈｏｘａ３、Ｈｏｘａ６、Ｈｏｘａ１３、Ｈｏｘｂ６、Ｈｏｘｂ７、Ｈｏｘｂ８、Ｈｏｘｂ９、Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｃ６、Ｈｏｘｃ８、Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１、Ｈｏｘｃ１２、Ｈｏｘｄ４、Ｈｏｘｄ９、Ｈｏｘｄ１０、Ｈｏｘｄ１３等が挙げられる。
さらに本発明の工程（Ａ）において、解剖学的部位を判定するための遺伝子の組合わせに使用する遺伝子を選択する工程は、例えば、遺伝子発現パターンに特徴を有する遺伝子を優先的に選択する工程等を含んでいてもよい。遺伝子発現パターンの特徴を有する遺伝子としては、例えば、解剖学的部位における前部と後部、近位部と遠位部、背部と腹部等を判定可能な遺伝子等が挙げられる。遺伝子発現パターンに特徴を有する遺伝子を選択することで、例えば、解剖学的部位を大まかに判定できる等の効果を得ることができる。解剖学的部位の前部と後部を判定可能な遺伝子としては、例えば、本明細書の図３のＡに記載の遺伝子などが挙げられる。解剖学的部位の近位部と遠位部を判定可能な遺伝子としては、例えば、本明細書の図３のＢに記載の遺伝子などが挙げられる。解剖学的部位の背部と腹部を判定可能な遺伝子としては、例えば、本明細書の図３のＣに記載の遺伝子などが挙げられる。
さらに本発明の工程（Ａ）において、解剖学的部位を判定するための遺伝子の組合わせに使用する遺伝子を選択する工程は、例えば、各解剖学的部位において発現が有りと判定される遺伝子と発現が無いと判定される遺伝子を少なくとも２種以上選択する工程等を含んでいてもよく、この方法により選択した遺伝子を組み合わせることで、各解剖学的部位をより詳細に分類することができる。具体的には、例えば、被験体表組織が角膜と同一の特徴を有するかどうかを判定するためには、Ｐａｘ６遺伝子と角膜での発現が見られないいずれかの遺伝子を組み合わせることで判定することができる。
【００３１】
工程（Ｂ）では、被験体表組織を用いて、工程（Ａ）で選択した遺伝子の発現量を測定する。
【００３２】
本発明において、遺伝子の発現量を測定する方法は、特に限定されるものでなく、公知の方法を使用することができる。例えば、プライマーセットを使用し、ＰＣＲ増幅法、ＴａｑＭａｎ法、ＬＡＭＰ増幅法、ＳＭＡＰ増幅法、ＩＣＡＮ増幅法等を好適に用いることができる。この場合、好ましくは、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）を直接に増幅する逆転写ＰＣＲ法、ＴａｑＭａｎ法等が使用されてよい。
【００３３】
本発明において、プライマーセットは、例えば、ホメオボックス遺伝子群の遺伝子を増幅可能なプライマーセットであればよい。例えば、公知のデータベース（ＧｅｎＢａｎｋ等）から、選択した遺伝子の塩基配列情報を取得して、その塩基配列情報に基づいて設計したプライマーセットを用いることができる。具体的には、例えば、表１に示すプライマーセット等が挙げられる。
【００３４】
本発明において、遺伝子の発現量を測定する順序は、特に限定されるものではなく、例えば、工程（Ａ）で選択した遺伝子の組合せの全ての遺伝子発現量をまとめて測定してもよいし、工程（Ａ）で選択した遺伝子の組合せの中から、解剖学的部位を順番に判定するために使用する遺伝子の判定順序に従い、各遺伝子の発現量を順番に測定する等してもよい。ここで用いる判定順序とは、以下工程（Ｃ）の説明において用いる判定順序と同じ内容を意味する。
【００３５】
工程（Ｃ）では、工程（Ｂ）で得られた発現量又は発現量の組合せに基づき、被験体表組織の解剖学的部位を判定する。
【００３６】
本発明における工程（Ｃ）において、被験体表組織の解剖学的部位の判定は、例えば、選択した遺伝子の組合せの全ての判定結果に基づいて、解剖学的部位を判定してもよいし、各遺伝子の判定順序に基づいて、第１の判定から解剖学的部位を判定する等してもよい。
【００３７】
本発明における遺伝子の判定順序とは、例えば、解剖学的部位を分類するための遺伝子を使用する順序のことであって、本発明においては、例えば、第１の判定、第２の判定、第３の判定、第４の判定、第５の判定等と示される。本発明では、解剖学的部位の分類を第１の判定から行うこととする。判定順序における判定の数は、判定する解剖学的部位の数により適宜調整することができる。
第１の判定とは、被験体表組織に対して行う１回目の解剖学的部位の判定のことであり、具体的には、例えば、本明細書の図４または図５に示すフローチャートの場合、Ｈｏｘａ３またはＨｏｘｂ６の基準値に基づき、全解剖学的部位における発現の有無を判定し、解剖学的部位を分類する判定のことであり、本明細書の図６に示すフローチャートの場合、Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９またはＨｏｘｄ１０の遺伝子発現量の解析結果に基づき、全解剖学的部位における発現の有無を判定し、解剖学的部位を分類する判定のことをいう。
第２の判定とは、第１の判定に続く２回目の解剖学的部位の判定のことであり、第１の判定により、発現有りと判断された解剖学的部位の中で、さらに発現有りの部位と発現無しの部位に解剖学的部位を分類するための判定、または第１の判定により、発現無しと判定された解剖学的部位の中で、さらに発現有りの部位と発現無しの部位に解剖学的部位を分類するための判定のことをいう。第２の判定とは、具体的には、例えば、本明細書の図４または図５に示すフローチャートの場合、第１の判定により、発現有りと判断された解剖学的部位である胴体（背側および腹側）、後脚、後足および尾に対して、Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２の基準値に基づき、発現の有無を判定し、解剖学的部位を分類する判定、または第１の判定により、発現無しと判定された解剖学的部位である角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部、首（背側および腹側）、前脚および前足について、Ｈｏｘｂ４の基準値に基づき、発現の有無を判定し、解剖学的部位を分類する判定のことをいい、本明細書の図６に示すフローチャートの場合、第１の判定により、発現有りと判定された解剖学的部位である尾以外の解剖学的部位、言い換えれば、発現無しと判定された解剖学的部位について、Ｈｏｘａ１３、Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２の遺伝子発現量の解析結果に基づき、発現の有無を判定し、解剖学的部位を分類する判定のこと等をいう。
第３以降の判定とは、第２の判定と同様に、例えば、それ以前の判定において発現有りまたは発現無しとして分類されたそれぞれの解剖学的部位に対して、遺伝子の基準値により、さらに遺伝子発現の有無を判定し、解剖学的部位を分類する判定のことをいう。
【００３８】
本発明において、遺伝子の発現量は、例えば、絶対値、相対値等で表してもよい。
【００３９】
工程（Ｃ）では、工程（Ｂ）で測定した遺伝子の発現量に基づき、選択した遺伝子の発現が有るのか無いのかを決定することができる。基準とする遺伝子の発現量としては、例えば、生体等から採取した解剖学的部位が明らかな体表組織サンプルを用いて予備的に測定し、得られたものを用いてもよいし、過去に測定され、蓄積された、解剖学的部位が明らかな体表組織サンプルの遺伝子発現量を用いてもよいし、公知のデータベース等に公開された解剖学的部位が明らかな体表組織サンプルの遺伝子発現量等を用いてもよい。
【００４０】
本発明において、遺伝子発現の有無を決定する方法としては、特に限定されないが、例えば、基準値を設定し、基準値と比較することにより、遺伝子の発現の有無を決定する方法等が挙げられる。より具体的には、例えば、多くの組織や細胞中に共通して一定量発現する遺伝子（ハウスキーピング遺伝子）の発現量に対して基準値を設定し、選択した遺伝子の発現量が基準値以上の場合を発現有りと決定し、選択した遺伝子の発現が基準値より低い場合を発現無しと決定する方法であってもよく、選択した遺伝子のいずれかの解剖学的部位であって、事前に測定された発現量を基準値として設定し、選択した遺伝子の発現が基準値以上の場合を発現有りと決定し、選択した遺伝子の発現が基準値より低い場合を発現無しと決定する方法等であってもよい。
本発明において、ハウスキーピング遺伝子は、例えば、ＧＡＰＤＨ遺伝子、β−ａｃｔｉｎ遺伝子等であってもよい。
【００４１】
本発明において、基準値は、遺伝子の発現の有無を決定する際の境界となる値等であればよく、例えば、ハウスキーピング遺伝子（ＧＡＰＤＨ遺伝子等）等の発現量を１００％とした場合の発現量５０％、４０％、３０％、２０％、１０％、５％、３％、１％、０．８％、０．６％、０．４％、０．３％、０．２％、０．１％、０．０５％、０．０１％等を基準値としてもよく、各遺伝子において最も高発現の解剖学的部位の発現量を１．０としたときの発現量０．５、０．４、０．３、０．２、０．１、０．０５、０．０１等を基準値としてもよく、体表組織の解剖学的部位から選択した２箇所の発現量の中央値等を基準値としてもよい。例えば、各遺伝子において最も高発現の解剖学的部位の発現量を１．０としたときの発現量０．１を基準値とした場合における遺伝子発現の有無は、表２〜５に示す判定結果になる。
【００４２】
本発明における遺伝子の発現の有無を決定する場合の基準値を、体表組織の解剖学的部位から選択した２箇所の発現量の中央値とする場合において、体表組織の解剖学的部位から２箇所の解剖学的部位を選択する方法としては、例えば、図２Ａ〜２Ｄのように事前に測定した各遺伝子の発現量の中で、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位の中で最も低い発現量を示す解剖学的部位、及び遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位の中で最も高い発現量を示す解剖学的部位を選択する方法等が挙げられる。具体的には、表７、表８、表１０又は表１１に示す２箇所の体表組織の解剖学的部位を選択する方法が挙げられる。
【００４３】
遺伝子の発現の有無を決定する場合の基準値としての中央値は、公知の方法により算出してもよく、例えば、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位の組合せの中で最も低い発現量を示す解剖学的部位の遺伝子発現量の測定値と、遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位の組合せの中で最も高い発現量を示す解剖学的部位の遺伝子発現量の測定値の中央値として求める方法等が挙げられる。
【００４４】
本発明において遺伝子の発現の有無を決定する場合の基準値としての中央値を算出する方法は、例えば、第１の判定においては、表２〜５に示した解剖学的部位全体での発現の有無の判定結果に基づき、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位の中で最も低い発現量を示す解剖学的部位、及び遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位の中で最も高い発現量を示す解剖学的部位を選択し、それらの遺伝子発現量の解析結果を用いて算出した中央値を第１の判定のための中央値として算出する方法が挙げられる。
第２以降の判定においては、例えば、第１の判定において、発現有りと判定された解剖学的部位の中から、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位の中で最も低い発現量を示す解剖学的部位、及び遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位の中で最も高い発現量を示す解剖学的部位を選択し、それらの遺伝子発現量の解析結果を用いて算出した中央値を第２以降の判定のための中央値として算出する方法が挙げられる。この方法により算出された中央値を基準値として、解剖学的部位を発現有り、又は発現無しと判定することができる。中央値は、段落［００４０］に記載の方法を用いて算出することができる。
【００４５】
第２以降の判定のための中央値を算出する方法の具体例としては、例えば、第３の判定である図４のフローチャート内のＨｏｘｂ５遺伝子について、第２の判定におけるＨｏｘｂ４遺伝子の基準値により発現有りと判定された解剖学的部位（首（背側）、首（腹側）及び前脚）の中から、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位として、表３の遺伝子発現の有無の判定結果及び図２ＢのＨｏｘｂ５遺伝子の遺伝子発現量解析結果に基づき、発現有りと判定される首（背側）を選択し、遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位として、発現無しと判定される首（腹側）及び前脚を選択する。さらに遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位の首（上部腹側及び下部腹側）及び前脚（右側及び左側）の中で、最も高い発現量の結果を示した前脚（左側）を選択する。続いて、首（背側）の遺伝子発現量の３つの値（0.58%、0.26%、0.85% of GAPDH；n=3）と前脚（左側）の３つの値（0.54%、0.058%、0.022% of GAPDH；n=3）の合計６つの値の中央値として0.40% of GAPDHの値を算出することができる。
【００４６】
遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位とは、例えば、表２〜５の作成に用いた基準値による判定において各遺伝子の発現が有りと判定された解剖学的部位のことである。例えば、判定の過程において解剖学的部位が数箇所に絞られた場合における遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位とは、絞られた数箇所の解剖学的部位の中で、表２〜５に示した発現有無の判定結果により、発現が有りと判定された解剖学的部位のことである。例えば、判定の過程において解剖学的部位が２箇所に絞られた場合における遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位とは、図２Ａ〜２Ｄのように事前に測定した遺伝子発現量解析結果において、遺伝子発現量が高い方の解剖学的部位のことであってもよい。例えば、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位は、表２〜５の遺伝子発現の有無にしたがって、図１に示した２４箇所の解剖学的部位、数箇所に絞られた解剖学的部位、２箇所に絞られた解剖学的部位等から選択することができる。
遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位とは、例えば、表２〜５の作成に用いた基準値による判定において各遺伝子の発現が無しと判定された解剖学的部位のことである。例えば、判定の過程において解剖学的部位が数箇所に絞られた場合における遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位とは、絞られた数箇所の解剖学的部位の中で、表２〜５に示した発現有無の判定結果により、発現が無しと判定された解剖学的部位のことである。判定の過程において解剖学的部位が２箇所に絞られた場合における遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位とは、図２Ａ〜２Ｄのように事前に測定した遺伝子発現量解析において、遺伝子発現量が低い方の解剖学的部位のことであってもよい。例えば、遺伝子の発現が低いと判断したい解剖学的部位は、表２〜５の遺伝子発現の有無にしたがって、図１に示した２４箇所の解剖学的部位、数箇所に絞られた解剖学的部位、２箇所に絞られた解剖学的部位等から選択することができる。
具体的には、例えば、図４においてＨｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子の基準値を使用した場合に、遺伝子の発現が高いと判断したい解剖学的部位は、表２の遺伝子発現の有無に基づき、胴体（腹側及び背側）、後脚、後足及び尾である。
【００４７】
本発明において遺伝子の発現の有無を決定する場合の基準値としての中央値を算出するために用いる解剖学的部位は、判定を行う段階にともなって適宜、その組合せが変動してもよく、例えば、図１に示した２４箇所の解剖学的部位からなる組合せであってもよいし、解剖学的部位の判定を進める途中又は最終の段階で、判断される解剖学的部位が２箇所又は数箇所に絞られた場合等においては、その２箇所の解剖学的部位を次の判定段階における中央値算出のための解剖学的部位の組合せとしてもよく、その数箇所の解剖学的部位を次の判定段階における中央値算出のための解剖学的部位の組合せとしてもよい。具体的には、例えば、遺伝子発現の特徴が未知の被験体表組織の第１の解剖学的部位の判定において、Ｈｏｘａ３遺伝子の基準値に基づいて解剖学的部位を判定し、発現有りと判断された場合、図４のフローチャートに基づいて、被験体表組織は胴体（腹側及び背側）、後脚、後足及び尾のいずれかであると判定される。この判定に続いてさらに解剖学的部位の第２の判定を行う場合、基準値を算出するために用いる解剖学的部位の組合せは、胴体（腹側及び背側）、後脚、後足及び尾の遺伝子発現解析結果を中央値算出のための解剖学的部位の組合せとして使用する。
【００４８】
本発明において解剖学的部位を判定するために使用する中央値は、例えば判定を行う段階にともなって変動する解剖学的部位の組合せの中から、２箇所の解剖学的部位を選択し、算出又は設定されるものであってもよい。
【００４９】
本発明において中央値を算出する際に使用する遺伝子発現量データは、例えば、事前に測定した各遺伝子の発現量解析結果を用いてもよく、用時的に実験ごとに取得した各遺伝子の発現量解析結果などを用いる等してもよい。
【００５０】
本発明において、解剖学的部位を判定する方法としては、選択した１種の遺伝子の発現の有無により判定する方法であってもよいし、２種以上の遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現パターンにより判定する方法等であってもよい。例えば、各遺伝子の発現パターン等に従って、被験体表組織がどの解剖学的部位由来であるかを判定、決定、又は特定することであってもよいし、作製された被験体表組織がどの解剖学的部位と同一又は類似の遺伝子の発現パターンを示すかを判定、決定、又は特定すること等であってもよい。
【００５１】
本発明において、発現量の組合せとしては、例えば、ホメオボックス遺伝子群から選択する少なくとも２種以上の遺伝子の発現量の有無の任意の組合せ等であってもよい。
例えば、ホメオボックス遺伝子群からＨｏｘａ１遺伝子及びＨｏｘａ２遺伝子を選択し、それらの発現量の組合せにより、Ｈｏｘａ１遺伝子及びＨｏｘａ２遺伝子両方の発現が有る場合に、被験体表組織の解剖学的部位が、目蓋、耳、頬、頭頂部、首、胴体、前脚又は後脚のいずれかであると判定でき、Ｈｏｘａ１遺伝子の発現が有り、Ｈｏｘａ２遺伝子の発現がない場合に、被験体表組織の解剖学的部位が、前足、後足又は尾のいずれかであると判定でき、Ｈｏｘａ１遺伝子及びＨｏｘａ２遺伝子両方の発現が無い場合に、被験体表組織の解剖学的部位が、角膜であると判定できる。本発明においては、同様にして任意に選択した少なくとも２種以上の遺伝子の発現量を組み合わせることにより、表２〜５に示す結果に基づいて、被験体表組織の解剖学的部位を判定することができる。
例えば、本発明における発現量の組合せにおいて、８種類の遺伝子の発現量の組合せは表６に示す遺伝子の組合せが好ましく、１０種類の遺伝子の発現量の組合せは表９に示す遺伝子の組合せが好ましく、１１種類の遺伝子の発現量の組合せは表１２に示す遺伝子の組合せが好ましい。
【００５２】
本発明において、解剖学的部位を判定するためのフローチャート等を作成する場合、例えば、選択した遺伝子の組合わせの中から、解剖学的部位間における発現量の差が大きく、かつ遺伝子発現パターンに特徴のある遺伝子について優先的に発現量を解析し、発現量の有無を判定し、解剖学的部位を大まかに分類することが好ましい。また、フローチャートの末端において、解剖学的部位を判定する場合には、例えば、特定の解剖学的部位における発現が有る遺伝子と発現が無い遺伝子を使用する等して、解剖学的部位の判定を行うことが好ましい。
【００５３】
本発明において、工程（Ｃ）で被験体表組織の解剖学的部位を判定した後に、再度、工程（Ａ）または工程（Ｂ）に戻って、被験体表組織の解剖学的部位の判定を行ってもよい。
【実施例】
【００５４】
以下実施例を用いて本発明を説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。【００５５】
［実施例１］（マウスの体表組織におけるＨｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子の部位特異的発現解析）
（体表組織の採取）
５週齢のＣ５７ＢＬ／６Ｊの雄マウス（チャールズリバー）を購入し、炭酸ガスで安楽死させた後、２４ヶ所の体表組織を採取した。採取した２４ヶ所の体表組織の解剖学的部位を図１に示した。採取した各体表組織は、２．４Ｕ／ｍｌのディスパーゼ（Ｄｉｓｐａｓｅ、Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製）を添加した、ペニシリン及びストレプトマイシン含有のＤｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ  ｍｏｄｉｆｉｅｄ  Ｅａｇｌｅ  ｍｅｄｉｕｍ（ＤＭＥＭ、Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製）中で、４℃、一晩処理した。処理後の表皮組織を取り出し、はさみを用いてキアゾール溶液（Ｑｉａｇｅｎ社製）中で細分化した。【００５６】
（ｑＲＴ−ＰＣＲ）
採取した表皮組織から、キアゾール溶液を用いて添付のプロトコールに従い、全ＲＮＡを抽出した。その後、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩＩ  Ｆｉｒｓｔ−Ｓｔｒａｎｄ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ＳｕｐｅｒＭｉｘ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製）を用いて、添付のプロトコールに従い、抽出した全ＲＮＡからｃＤＮＡを合成した。【００５７】
次にｑＲＴ−ＰＣＲにより、Ｈｏｘａ遺伝子群（Ｈｏｘａ１〜４、６、７、９〜１１及び１３）、Ｈｏｘｂ遺伝子群（Ｈｏｘｂ３〜９、及び１３）、Ｈｏｘｃ遺伝子群（Ｈｏｘｃ４〜６、８及び１０〜１３）、Ｈｏｘｄ遺伝子群（Ｈｏｘｄ４及び８〜１３）、Ｐａｘ６及びＫ１４の発現量を解析した。詳細には、ＳＹＢＲ  Ｐｒｅｍｉｘ  ＤｉｍｅｒＥｒａｓｅｒ  （Ｐｅｒｆｅｃｔ  Ｒｅａｌ  Ｔｉｍｅ）（タカラ社製）を用いて、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ  １２Ｋ  Ｆｌｅｘ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製）によりｑＲＴ−ＰＣＲを行った。ＰＣＲの条件は、９５℃を１０秒、［９５℃  ５秒、５５℃  ３０秒、７２℃  ３４秒］の反応を４５回繰り返した。ＰＣＲの後、融解曲線分析を行った。ｑＲＴ−ＰＣＲに使用したＨｏｘ遺伝子群のプライマー配列は表１に示した。ＧＡＰＤＨ遺伝子（Ｍｍ９９９９９９１５＿ｇｌ）、Ｐａｘ６遺伝子（Ｍｍ００４４３０８１＿ｍｌ）及びＫ１４遺伝子（Ｍｍ００５１６８７６＿ｍｌ）については、Ｔａｑｍａｎ遺伝子解析を用いて、７５００  ＦａｓｔリアルタイムＰＣＲシステム（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社製）により、添付のプロトコールに従いｑＲＴ−ＰＣＲを行った。【００５８】
【表１】
2018139618.tif 000003
【００５９】
（解析データ）
解析データは、Ｎ＝３の平均値±標準偏差で示した。【００６０】
（結果）
Ｈｏｘａ遺伝子群の発現量の解析結果を図２Ａに、Ｈｏｘｂ遺伝子群の発現量の解析結果を図２Ｂに、Ｈｏｘｃ遺伝子群の発現量の解析結果を図２Ｃに、並びにＨｏｘｄ遺伝子群、Ｐａｘ６遺伝子及びＫ１４遺伝子の発現量の解析結果を図２Ｄに示した。【００６１】
図２Ａ〜２Ｄに示したデータに基づき、各遺伝子において、マウス表皮におけるＧＡＰＤＨ遺伝子の発現量を１００％とした場合に、最も高発現の部位の発現量が０．２％以下の遺伝子であったＨｏｘａ５遺伝子、Ｈｏｘｂ１遺伝子、Ｈｏｘｂ２遺伝子、Ｈｏｘｃ９遺伝子、Ｈｏｘｄ１遺伝子及びＨｏｘｄ３遺伝子は、マウス表皮において発現が無いものとし、これ以降の解析には使用しなかった。
さらにマウス表皮の各部位における各遺伝子の発現の有無に関して、各遺伝子において最も高発現の部位の発現量を１．０としたときに、０．１以上の発現を示す部位を発現有りと判断して、Ｈｏｘａ遺伝子群の発現の判断結果を表２に、Ｈｏｘｂ遺伝子群の発現の判断結果を表３に、Ｈｏｘｃ遺伝子群の発現の判断結果を表４に、並びにＨｏｘｄ遺伝子群、Ｐａｘ６遺伝子及びＫ１４遺伝子の発現の判断結果を表５にまとめた。表２〜５中に記載の○は、発現が有ることを示し、×は発現が無いことを示す。【００６２】
【表２】
2018139618.tif 000004
【００６３】
【表３】
2018139618.tif 000005
【００６４】
【表４】
2018139618.tif 000006
【００６５】
【表５】
2018139618.tif 000007
【００６６】
［実施例２］（Ｈｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子発現パターンによる分類）
実施例１の表２〜５に示したマウス体表組織における発現パターンの結果に基づき、Ｈｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子を４つのグループ；１．被験体表組織の解剖学的部位が前部領域か後部領域かを分類可能な遺伝子、２．被験体表組織の解剖学的部位が近位部領域か遠位部領域かを分類可能な遺伝子、３．被験体表組織の解剖学的部位が背部領域か腹部領域かを分類可能な遺伝子、４．それ以外の遺伝子、に分類し、その分類結果を図３に示した。【００６７】
［実施例３］（合計８種類の遺伝子の組合せで１１箇所の体表組織の解剖学的部位を特定する方法）
Ｈｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子から、表６に示した（Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子）、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ８遺伝子、Ｈｏｘｂ９遺伝子、（Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子）、Ｈｏｘｄ４遺伝子及びＰａｘ６遺伝子からなる合計８種類の遺伝子を選択した。
選択した合計８種類の遺伝子について、図２Ａ〜２Ｄの遺伝子発現解析データに基づき、表６を作成した。表６に記載のマウス表皮の各部位における各遺伝子の発現の有無は、選択した遺伝子の発現量が該基準値以上の場合を発現有りとし、選択した遺伝子の発現量が該基準値より低い場合を発現無しとして決定した。
なお、表６中に記載の○は、該遺伝子の発現が有ることを示す。表６中に記載の×は、該遺伝子の発現が無いことを示す。表６中に記載の−は、該当する被験体表組織の解剖学的部位を判定する場合に、該遺伝子の発現解析データを調べなくてもよいことを示す。【００６８】
【表６】
2018139618.tif 000008
【００６９】
表６に示した合計８種類の遺伝子の発現の有無に基づいて、遺伝子発現の特徴が未知の被験体表組織を判定する際に用いる基準値を算出し、表７に示した。表７に示した基準値を算出するための体表組織の解剖学的部位（２箇所）は、図２Ａ〜２Ｄの解析結果及び表６の発現有り又は無しの判定結果に基づいて解剖学的部位全体を対象として選択したものである。【００７０】
【表７】
2018139618.tif 000009
【００７１】
表６及び表７を使用することにより、合計８種類の遺伝子の発現量を解析することにより、遺伝子発現の特徴が未知の被験体表組織と同一の特徴を有する解剖学的部位を容易に判定することができた。さらに表６に示す８種類の遺伝子の発現解析データに基づいて、太枠内の１種類の遺伝子の発現解析データを見れば、被験体表組織が、前部又は後部領域の体表組織かどうか、近位部又は遠位部領域の体表組織かどうか、若しくは背部又は腹部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。具体的には、Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が前部又は後部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。さらにＨｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が近位部又は遠位部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。さらには、Ｈｏｘｂ９遺伝子又はＨｏｘｄ４遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が背部又は腹部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。【００７２】
また、選択した合計８種類の遺伝子の組合せを使用して、フローチャートを作成した（図４）。フローチャートにおいて使用する遺伝子は、まず解剖学的部位を大別できるＨｏｘａ３又はＨｏｘａ６を解剖学的部位判別のスタートとした。選択した合計８種類の遺伝子の発現の有無を決定するための基準値を算出し、表８に記載した。前記基準値は表８に示した２箇所の体表組織の解剖学的部位の発現量（ｎ＝３）、計６つの数値の中央値とした。中央値は、公知の方法により算出した。また、フローチャート内において表８に記載の基準値を使用して、解剖学的部位を判定する順序を第１〜第５で表記し、判定順序が第１の基準値から判定に使用した。
スタートとなるＨｏｘａ３又はＨｏｘａ６の基準値は全ての解剖学的部位の遺伝子発現解析結果を対象として、胴体、後脚、後足及び尾を発現有りの解剖学的部位とし、それ以外の解剖学的部位を発現無しの解剖学的部位として、２箇所の体表組織の解剖学的部位を選択し、算出した。次の段階において、Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子の発現が有りと判断された場合は、次に胴体、後脚、後足及び尾を基準値算出のための解剖学的部位として選択し，後足及び尾を発現有りの解剖学的部位とし、胴体（腹側及び背側）及び後脚を発現無しの解剖学的部位として、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、又はＨｏｘｃ１２遺伝子の基準値を算出した。また、Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子の発現が無しと判断された場合は、首（背側及び腹側）及び前脚をＨｏｘｂ４遺伝子の発現が有る解剖学的部位として選択し，それ以外をＨｏｘｂ４遺伝子の発現が無い解剖学的部位として選択することで基準値を算出した。これ以降の判定も同様の方法に従って行った。【００７３】
【表８】
2018139618.tif 000010
【００７４】
表８及び図４より、最少８種類の遺伝子の発現量を調べることで、最大１１箇所の部位を判定することができた。【００７５】
［実施例４］（合計１０種類の遺伝子の組合せで１４箇所の体表組織の解剖学的部位を特定する方法）
Ｈｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子から、表９に示した（Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子）、Ｈｏｘａ４遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、（Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子）、Ｈｏｘｂ８遺伝子、Ｈｏｘｂ９遺伝子、（Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子）、Ｈｏｘｄ４遺伝子、Ｈｏｘｄ１２遺伝子及びＰａｘ６遺伝子からなる合計１０種類の遺伝子の組合せを選択した。
選択した合計１０種類の遺伝子について、図２Ａ〜２Ｄの遺伝子発現解析データに基づき、表９を作成した。表９に記載のマウス表皮の各部位における各遺伝子の発現の有無は、選択した遺伝子の発現量が該基準値以上の場合を発現有りとし、選択した遺伝子の発現量が該基準値より低い場合を発現無しとして決定した。
なお、表９中に記載の○は、該遺伝子の発現が有ることを示す。表９中に記載の×は、該遺伝子の発現が無いことを示す。表９中に記載の−は、該当する被験体表組織の解剖学的部位を判定する場合に、該遺伝子の発現解析データを調べなくてもよいことを示す。【００７６】
【表９】
2018139618.tif 000011
【００７７】
表９に示した合計１０種類の遺伝子の発現の有無に基づいて、遺伝子発現の特徴が未知の被験体表組織を判定する際に用いる基準値を算出し、表１０に示した。表１０に示した基準値を算出するための体表組織の解剖学的部位（２箇所）は、図２Ａ〜２Ｄの解析結果及び表９の発現有り又はなしの判定結果に基づいて、解剖学的部位全体を対象として選択したものである。【００７８】
【表１０】
2018139618.tif 000012
【００７９】
表９及び表１０を使用することにより、合計１０種類の遺伝子の発現量を解析することにより、遺伝子発現の特徴が未知の被験体表組織と同一の特徴を有する解剖学的部位を容易に判定することができた。さらに表９に示す１０種類の遺伝子の発現解析データに基づいて、太枠内の１種類の遺伝子の発現解析データを見れば、被験体表組織が、前部又は後部領域の体表組織かどうか、近位部又は遠位部領域の体表組織かどうか、若しくは背部又は腹部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。具体的には、Ｈｏｘａ３遺伝子、Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が前部又は後部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。さらにＨｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が近位部又は遠位部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。さらには、Ｈｏｘｂ９遺伝子又はＨｏｘｄ４遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が背部又は腹部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。【００８０】
また、選択した合計１０種類の遺伝子の組合せを使用して、フローチャートを作成した（図５）。フローチャートにおいて使用する遺伝子は、実施例３に記載の方法と同様の方法に従って使用し、各基準値を算出し、表１１に記載した。基準値算出のための２箇所の体表組織の解剖学的部位は、実施例３と同様の方法に従って選択したものを使用した。また、フローチャート内において表１１に記載の基準値を使用して、解剖学的部位を判定する順序を第１〜第５で表記し、判定順序が第１の基準値から判定に使用した。【００８１】
【表１１】
2018139618.tif 000013
【００８２】
表１１及び図５より、最少１０種類の遺伝子の発現量を調べることで、最大１４箇所の部位を判定することができた。【００８３】
［実施例５］（合計１１種類の遺伝子の組合せで１５箇所の体表組織の解剖学的部位を特定する方法）
Ｈｏｘ遺伝子群及びＰａｘ６遺伝子から、表１２に示した（Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子）、Ｈｏｘａ９遺伝子、（Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子）、（Ｈｏｘｂ３遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子）、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ９遺伝子、（Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子又はＨｏｘｄ１０遺伝子）、Ｈｏｘｃ４遺伝子、Ｈｏｘｄ４遺伝子、Ｈｏｘｄ１１遺伝子又はＰａｘ６遺伝子からなる合計１１種類の遺伝子の組合せを選択し、体表組織の各解剖学的部位における各遺伝子の発現を表２〜５に示す判定結果に基づいて表１２を作製した。表１２中に記載の○は、該遺伝子の発現が有ることを示し、表１２中に記載の×は、該遺伝子の発現が無いことを示す。なお、表１２中に記載の−は、該当する被験体表組織の解剖学的部位を判定する場合に、該遺伝子の発現解析データを調べなくてもよいことを示す。【００８４】
【表１２】
2018139618.tif 000014
【００８５】
表１２より、最少１１種類の遺伝子の発現量を調べることで、最大１５箇所の部位を判定することができた。さらに表１２に示す１１種類の遺伝子の発現解析データに基づいて、太枠内の１種類の遺伝子の発現解析データを見れば、被験体表組織が、前部又は後部領域の体表組織かどうか、近位部又は遠位部領域の体表組織かどうか、若しくは背部又は腹部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。具体的には、Ｈｏｘａ３遺伝子、Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が前部又は後部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。さらにＨｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子又はＨｏｘｄ１０遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が近位部又は遠位部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。さらには、Ｈｏｘｂ９遺伝子又はＨｏｘｄ４遺伝子の発現解析データにより、被験体表組織が背部又は腹部領域の体表組織かどうかを簡便に判定することができる。【００８６】
表１２に示す最少１１種類の遺伝子発現の解析データに基づいて作製した、被験体表組織の解剖学的部位１５箇所を判定するフローチャートを図６に示した。図６のフローチャートにおいて、まず近位部か遠位部領域の判定を行い、次にＨｏｘｃ４遺伝子を用いて、首・胴体・脚と頭部の解剖学的部位を判別した。
【図１】
2018139618.tif 000015
【図２Ａ−１】
2018139618.tif 000016
【図２Ａ−２】
2018139618.tif 000017
【図２Ａ−３】
2018139618.tif 000018
【図２Ｂ−１】
2018139618.tif 000019
【図２Ｂ−２】
2018139618.tif 000020
【図２Ｂ−３】
2018139618.tif 000021
【図２Ｃ−１】
2018139618.tif 000022
【図２Ｃ−２】
2018139618.tif 000023
【図２Ｃ−３】
2018139618.tif 000024
【図２Ｄ−１】
2018139618.tif 000025
【図２Ｄ−２】
2018139618.tif 000026
【図２Ｄ−３】
2018139618.tif 000027
【図３】
2018139618.tif 000028
【図４】
2018139618.tif 000029
【図５】
2018139618.tif 000030
【図６】
2018139618.tif 000031
【配列表】
2018139618000001.app
【手続補正書】
【提出日】平成30年7月26日(2018.7.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の工程（Ａ）、（Ｂ）及び（Ｃ）を含む、被験体表組織の解剖学的部位を判定する方法。
（Ａ）Ｈｏｘ遺伝子群の遺伝子及びＰａｘ６遺伝子を含むホメオボックス遺伝子群の少なくとも１種の遺伝子を選択する工程
（Ｂ）被験体表組織を用いて、前記（Ａ）で選択した遺伝子の発現量を測定する工程
（Ｃ）前記（Ｂ）で得られた発現量又は発現量の組合せに基づき、被験体表組織の解剖学的部位を判定する工程
【請求項２】
（削除）
【請求項３】
ＨＯＸ遺伝子群の遺伝子が、Ｈｏｘａ１〜４、６、７、９〜１１及び１３、Ｈｏｘｂ３〜９、及び１３、Ｈｏｘｃ４〜６、８及び１０〜１３、並びにＨｏｘｄ４及び８〜１３であることを特徴とする、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記被験体表組織の解剖学的部位が、角膜−右側、角膜−左側、目蓋−右側、目蓋−左側、耳−右側、耳−左側、頬−右側、頬−左側、頭頂部、首−腹側、首−背側、胴体−上部腹側、胴体−上部背側、胴体−下部腹側、胴体−下部背側、前脚−右側、前脚−左側、前足−右側、前足−左側、後脚−右側、後脚−左側、後足−右側、後足−左側及び尾から選択される少なくとも１つの部位である、請求項１又は３に記載の方法。
【請求項５】
前記工程（Ａ）において、表６に示す下記の８種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表６に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項１、３、４のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘｂ４
３：Ｈｏｘｂ５
４：Ｈｏｘｂ８
５：Ｈｏｘｂ９
６：Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
７：Ｈｏｘｄ４
８：Ｐａｘ６
【請求項６】
前記工程（Ａ）において、表９に示す下記の１０種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表９に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項１、３、４のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘａ４
３：Ｈｏｘｂ４
４：Ｈｏｘｂ５、Ｈｏｘｂ６またはＨｏｘｂ７
５：Ｈｏｘｂ８
６：Ｈｏｘｂ９
７：Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
８：Ｈｏｘｄ４
９：Ｈｏｘｄ１２
１０：Ｐａｘ６
【請求項７】
第１の判定において、Ｈｏｘａ３およびＨｏｘａ６からなる群より選択される少なくとも１つの遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項５または６に記載の方法。
【請求項８】
前記工程（Ａ）において、表１２に示す１１種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した各遺伝子の発現の有無を決定し、表１２に示す各遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項１、３、４のいずれかに記載の方法。
１：Ｈｏｘａ３またはＨｏｘａ６
２：Ｈｏｘａ９
３：Ｈｏｘａ１３、Ｈｏｘｃ１０、Ｈｏｘｃ１１またはＨｏｘｃ１２
４：Ｈｏｘｂ３またはＨｏｘｂ７
５：Ｈｏｘｂ４
６：Ｈｏｘｂ９
７：Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９またはＨｏｘｄ１０
８：Ｈｏｘｃ４
９：Ｈｏｘｄ４
１０：Ｈｏｘｄ１１
１１：Ｐａｘ６
【請求項９】
第１の判定において、Ｈｏｘｂ１３、Ｈｏｘｄ９およびＨｏｘｄ１０からなる群より選択される少なくとも１つの遺伝子の発現パターンに従って被験体表組織の解剖学的部位を判定する、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘａ３遺伝子、Ｈｏｘａ６遺伝子、Ｈｏｘｂ３遺伝子、Ｈｏｘｂ４遺伝子、Ｈｏｘｂ５遺伝子、Ｈｏｘｂ６遺伝子及びＨｏｘｂ７遺伝子からなる群から選択される一種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が後部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が前部領域であると判定する、請求項１、３、４のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘａ９遺伝子、Ｈｏｘａ１１遺伝子、Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子、Ｈｏｘｃ１２遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子、Ｈｏｘｄ１０遺伝子及びＨｏｘｄ１３遺伝子からなる群から選択される一種類の遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が遠位部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が近位部領域であると判定する、請求項１、３、４のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記工程（Ａ）において、Ｈｏｘｂ９遺伝子又はＨｏｘｄ４遺伝子を選択し、前記工程（Ｃ）において、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織が背部領域であると判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織が腹部領域であると判定する、請求項１、３、４のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記工程（Ａ）及び（Ｃ）において、被験体表組織の解剖学的部位を以下（１）〜（２５）に示すいずれかの方法で判定する、請求項４に記載の方法。
（１）Ｈｏｘａ３遺伝子又はＨｏｘａ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２）Ｈｏｘｂ３遺伝子又はＨｏｘｂ７遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の首−背側、胴体、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（３）Ｈｏｘｂ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の首、胴体、前脚、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（４）Ｈｏｘｂ５遺伝子又はＨｏｘｂ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の首−背側、胴体、後脚、後足−右側又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（５）Ｈｏｘａ９遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体−下部、前足−右側、後脚、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（６）Ｈｏｘａ１１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の前足−右側又は尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（７）Ｈｏｘａ１３遺伝子、Ｈｏｘｃ１０遺伝子、Ｈｏｘｃ１１遺伝子又はＨｏｘｃ１２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の前足、後足又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（８）Ｈｏｘｂ１３遺伝子、Ｈｏｘｄ９遺伝子又はＨｏｘｄ１０遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（９）Ｈｏｘｄ１３遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の尾であり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１０）Ｈｏｘｂ９遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体−上部背側、胴体−下部背側、後脚又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１１）Ｈｏｘｄ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の胴体−上部背側、胴体−下部背側又は尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１２）Ｈｏｘａ１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜であり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１３）Ｈｏｘａ２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、前足、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１４）Ｈｏｘａ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側、頬−左側、後足−右側及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１５）Ｈｏｘａ７遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側及び前脚−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１６）Ｈｏｘａ１０遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側、首−背側、胴体上部及び胴体−下部背側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１７）Ｈｏｘｂ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を判定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜及び耳−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１８）Ｈｏｘｃ４遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、目蓋、耳、頬、前足−左側、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（１９）Ｈｏｘｃ５遺伝子又はＨｏｘｃ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２０）Ｈｏｘｃ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、目蓋、耳、頬、頭頂部、首−背側、後足及び尾のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２１）Ｈｏｘｃ１３遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳及び胴体−下部腹側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２２）Ｈｏｘｄ８遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳、前足及び後足−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２３）Ｈｏｘｄ１１遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳、首−腹側、胴体−上部腹側、前足−左側及び後足−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
（２４）Ｈｏｘｄ１２遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜、耳−右側、頭頂部、首−背側及び胴体−上部背側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位であると判定する方法
（２５）Ｐａｘ６遺伝子を選択し、選択した遺伝子の発現の有無を決定し、選択した遺伝子の発現が有る場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の角膜及び目蓋−右側のいずれかであり、選択した遺伝子の発現が無い場合に被験体表組織の解剖学的部位が請求項４に記載の残りの解剖学的部位のいずれかであると判定する方法
【請求項１４】
被験体表組織が、表皮又は角膜である、請求項１、３〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
表皮又は角膜が、採取されたもの、作製されたもの、もしくは採取または作製され、さらに培養されたものである、請求項１、３〜１４のいずれかに記載の方法。
【国際調査報告】
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