【手続補正書】
【提出日】平成18年9月20日(2006.9.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００１】
１．序論
本発明は、第一に、ＨＩＶ−１LAI膜貫通タンパク質（ＴＭ）ｇｐ４１のアミノ酸６３８から６７３に対応するペプチドであるＤＰ１７８（配列番号１）およびＤＰ１７８（配列番号１）の部分または類似体に関し、これらのペプチドは抗膜融合能、抗ウイルス活性（例えば、未感染ＣＤ４+細胞へのＨＩＶ伝播を阻害する能力）、または超らせんペプチド構造を必要とする細胞内プロセスをモジュレートする能力を示す。さらに、本発明は、抗融合誘導または抗ウイルス化合物としての、あるいは超らせんペプチド構造を必要とする細胞内現象の阻害剤としての、ＤＰ１７８（配列番号１）およびＤＰ１７８部分および／または類似体の使用に関する。本発明はまた、ＨＩＶ−１LAI膜貫通タンパク質（ＴＭ）ｇｐ４１のアミノ酸５５８から５９５に対応するペプチドであるＤＰ１０７（配列番号８９）に類似したペプチドに関し、これらのペプチドは他のウイルス（例えば、エンベロープをもつウイルス）および／または他の生物中に存在するアミノ酸配列を有する。本発明はさらに、かかるペプチドの使用に関する。こうしたペプチドは抗膜融合能、抗ウイルス活性、または超らせんペプチド構造を必要とする細胞内プロセスをモジュレートする能力を示す。本発明はさらに、ＤＰ１７８とＤＰ１０７間の、および／またはＤＰ１０７様ペプチドとＤＰ１７８様ペプチド間の相互作用を破壊する化合物の同定方法に関する。さらに、本発明は診断薬としての本発明ペプチドの使用に関する。例えば、ＤＰ１７８ペプチドはＨＩＶサブタイプに特異的な診断薬として使用することができる。本発明は、第一に、ＤＰ１７８（配列番号１）ペプチドとＤＰ１７８に相同な配列のペプチドが未感染ＣＤ４+細胞へのＨＩＶ−１伝播の強力な非細胞毒性の阻害剤であることを示す実施例により実証される。本発明はさらに、ＤＰ１０７とＤＰ１７８に対して構造および／またはアミノ酸モチーフ類似性を有するペプチドを種々のウイルスおよび非ウイルス生物において同定する実施例により実証され、また、このように同定されたいくつかの異なるウイルス系に由来する多数のペプチドが抗ウイルス活性をもつことを示す実施例において検証される。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１６】
本発明はさらに、ペプチドＤＰ１０７（配列番号８９）類似体に関する。ＤＰ１０７はＨＩＶ−１LAI 膜貫通タンパク質（ＴＭ）ｇｐ４１のアミノ酸５５８−５９５に対応するペプチドである。本明細書中で用いる「ＤＰ１０７類似体」とは、ＨＩＶ−１LAIのｇｐ４１タンパク質内に存在するＤＰ１０７ペプチド配列に対応するアミノ酸配列を含むが、ＨＩＶ−１LAI 以外のウイルスおよび／または生物中に見いだされるペプチドを指す。それゆえ、このようなＤＰ１０７類似体ペプチドは、例えばＨＩＶ−１LAI以外のレトロウイルスのようなエンベロープをもつウイルスやエンベロープをもたないウイルスなどの、他のウイルス中に存在するＤＰ１０７様アミノ酸配列に相当しうる。さらに、こうしたＤＰ１０７類似体ペプチドは非ウイルス生物中に存在するＤＰ１０７様アミノ酸配列に相当するものであってもよい。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００８２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００８２】
さらに、ここに記載する本発明のペプチドには、ＤＰ１０７の類似体であるペプチドが含まれる。ＤＰ１０７（配列番号８９）はＨＩＶ−１LAI 膜貫通（ＴＭ）ｇｐ４１タンパク質の残基５５８から５９５に対応する３８アミノ酸からなるペプチドである。このようなＤＰ１０７類似体は抗融合能、抗ウイルス活性または超らせん構造が関与する細胞内プロセスをモジュレートする能力を示すことができる。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０６】
2006176529.tif 000001
全長ＤＰ１０７（配列番号８９）の３８mer のほかに、本発明のペプチドは、抗融合活性、抗ウイルス活性、および／または超らせんペプチド構造が関与する細胞内プロセスをモジュレートする能力を示すＤＰ１０７（配列番号８９）ペプチドの末端切断体を包含する。ＤＰ１０７（配列番号８９）ペプチドの末端切断体は、下記の表IIおよびIIＡに示すような、３〜３８個のアミノ酸残基のペプチド（すなわち、トリペプチドから３８mer ポリペプチドまでの大きさのペプチド）を含むことができる。これらの表に示されるペプチド配列はアミノ末端（左）からカルボキシ末端（右）へ記載してある。「Ｘ」はアミノ基（-NH2）を、そして「Ｚ」はカルボキシル基（-COOH ）を表す。また、「Ｘ」はカルボベンジル、ダンシルまたはＴ−ブトキシカルボニルを含むがこれらに限らない疎水性基；アセチル基；９−フルオレニルメトキシ−カルボニル（ＦＭＯＣ）基；または脂質−脂肪酸複合体、ポリエチレングリコール、炭水化物またはペプチド基を含むがこれらに限らない共有結合された巨大分子基を表すことができる。さらに、「Ｚ」はアミド基；Ｔ−ブトキシカルボニル基；または脂質−脂肪酸複合体、ポリエチレングリコール、炭水化物またはペプチド基を含むがこれらに限らない共有結合された巨大分子基を表すことができる。好適な「Ｘ」または「Ｚ」巨大分子基はペプチド基である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１５】
アミノ酸置換は保存性のものも非保存性のものもあり得る。保存アミノ酸置換は、たとえば、グルタミン酸（Ｅ）をアスパラギン酸（Ｄ）にするアミノ酸置換のように、ＤＰ１０７（配列番号８９）ペプチド配列の１個以上のアミノ酸を同様な電荷、サイズおよび／または疎水性を有するアミノ酸と置き換えることから成る。非保存置換は、たとえば、グルタミン酸（Ｅ）をバリン（Ｖ）にする置換のように、ＤＰ１０７（配列番号８９）ペプチド配列の１個以上のアミノ酸を異なる電荷、サイズおよび／または疎水性を有するアミノ酸と置き換えることから成る。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１６】
アミノ酸挿入は単一のアミノ酸残基または一連の残基から成り得る。挿入はＤＰ１０７またはＤＰ１０７末端切断ペプチドのカルボキシ末端またはアミノ末端で、またそのペプチドの内部のある位置で生起し得る。このような挿入は通常アミノ酸２〜１５個の長さである。対象とするペプチドのカルボキシ末端またはアミノ末端で生起した挿入はより広いサイズ範囲であり得ると考えられ、約２〜約５０個のアミノ酸が好ましい。このような挿入は１つまたはそれ以上、ＤＰ１０７（配列番号８９）またはＤＰ１０７末端切断体中に導入することができる。ただし、このような挿入によって得られるペプチドは、本明細書中に説明した107x178x4、ALLMOTI5またはPLZIP検索モチーフによって認識されなければならず、あるいは、抗融合誘導または抗ウイルス活性を示すか、または超らせんペプチド構造が関与する細胞内プロセスをモジュレートする能力を示さなければならない。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１１８】
ＤＰ１０７（配列番号８９）またはＤＰ１０７末端切断体の欠失もまた本発明の範囲内である。このような欠失はＤＰ１０７またはＤＰ１０７様ペプチド配列から１個以上のアミノ酸が除去されることであり、得られるペプチド配列の下限の長さはアミノ酸４〜６個である。このような欠失はペプチド配列の単一の連続部分または１つより多くの不連続部分を含み得る。このような欠失は１つまたはそれ以上、ＤＰ１０７（配列番号８９）またはＤＰ１０７末端切断体中に導入することができる。ただし、このような欠失によって得られるペプチドは、本明細書中に説明した107x178x4、ALLMOTI5またはPLZIP検索モチーフによって認識されなければならず、あるいは、抗融合誘導または抗ウイルス活性を示すか、または超らせんペプチド構造が関与する細胞内プロセスをモジュレートする能力を示さなければならない。