【手続補正書】
【提出日】平成18年4月19日(2006.4.19)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】請求項１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【請求項１】
光学的に記録情報の読み取りが可能とされた円盤状基板の上に、
少なくとも次の（１）〜（３）を備える検出部が設けられたことを特徴とする
バイオアッセイ用基板。
（１）検出用ヌクレオチド鎖の末端部位が固定可能に表面処理が施された検出
表面。
（２）前記検出表面に固定された状態の前記検出用ヌクレオチド鎖に対して電界を印加する電極。
（３）前記検出用ヌクレオチド鎖と標的ヌクレオチド鎖との間のハイブリダイ
ゼーション反応の場となる反応領域。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は、バイオインフォマティクス（生命情報科学）分野において特に有用なバイオアッセイツールとなる円盤状の情報記録媒体に関する。より詳細には、検出用のヌクレオチド鎖が固定された基板表面部位に、標的ヌクレオチド鎖を含む溶液を滴下することによって、ハイブリダイゼーション反応が高精度に行われるように工夫されたバイオアッセイ用基板に関する。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
本発明に係る「バイオアッセイ用基板」は、光学的に記録情報の読み取りが可能とされた円盤状基板上に、少なくとも、（１）検出用ヌクレオチド鎖の末端部位が固定可能に表面処理が施された検出表面、（２）前記検出表面に固定された状態の出用ヌクレオチド鎖に対して電界を印加する電極、（３）前記検出用ヌクレオチド鎖と標的ヌクレオチド鎖との間のハイブリダイゼーション反応の場となる反応領域、を備える「検出部」が設けられている。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１４】
この「検出部」を有するバイオアッセイ基板では、検出表面に固定された検出用ヌクレオチドに電界を印加した上で、標的ヌクレオド鎖を含むサンプル溶液を、検出部の前記反応領域を狙って正確に滴下し、検出用ヌクレオチド鎖と標的ヌクレオチド鎖との間のハイブリダイゼーション反応を進行させることができる。この結果、ハイブリダイゼーション反応を短時間で効率良く行うことができるという有利な効果が得られる。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２０】
「反応領域」は、液相中でのハイブリダイゼーション反応の場を提供できる区画された領域又は空間であって、かつ対向する電極間に電位差が生じることで、液相に電場が形成される領域である。
【手続補正６】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４３】
セル検出部２には、符号Ｄで示す検出用ヌクレオチド鎖の末端部位が固定できるように表面処理が施されている検出表面２１と、この検出表面２１に予め固定された検出用ヌクレオチド鎖Ｄに対して電界を印加する対向電極２２ａ、２２ｂと、前記検出用ヌクレオチド鎖Ｄと標的ヌクレオチド鎖Ｔとの間のハイブリダイゼーション反応の場となる反応領域２３とを備えている。この反応領域２３は、上方に開口する上方視矩形状のセル、例えば、深さ１μｍ、長さ１００μｍ、幅５０μｍのセルとして形成されているが、図示された形状、サイズに限定されない。
【手続補正７】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４４】
検出表面２１は、一方の電極２２ｂの反応領域２３側に向く内壁面部位に形成されている。この検出表面２１は、検出用ヌクレオチド鎖Ｄの末端がカップリング反応等の化学結合によって固定されるように表面処理されている。
【手続補正８】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４６】
具体的には、前記検出表面２１に電気力線が集中するような電界を印加すると、高周波高電圧の印加によって伸長処理されたヌクレオチド鎖が検出表面２１に向かって移動し、その末端部位が検出表面２１に衝突することによって、検出用ヌクレオチド鎖Ｄを検出表面２１に確実に固定化することができる。このため、一方の電極２２ｂが櫛形とされている（図２参照）。
【手続補正９】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４９】
そこで、本発明では、セル検出部２に配設された上記対向する電極２２ａ，２２ｂ間に電位差を生ぜしめることによって、反応領域２３に貯留保持されている液相（塩溶液）に電場（電界）を形成し、電界の向きに沿って検出用ヌクレオチド鎖Ｄが直鎖状に伸長する作用を得る。なお、電界の条件は、１×１０６Ｖ／ｍ、約１ＭＨｚという条件が、好適条件例と考えられる（Masao Washizu and Osamu Kurosawa:“Electrostatic Manipulation of DNA in Microfabricated Structures”,IEEE Transaction on Industrial Application Vol.26,No.26,P.1165-1172(1990)参照）。
【手続補正１０】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５０】
なお、基板１上にセル検出部２が列設された場合においては、セル検出部２ごとに対向する電極２２ａ,２２ｂを設ける構成、対向する電極２２ａ,２２ｂをそれぞれ共通電極とする構成のいずれを採用してもよい。
【手続補正１１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５８】
図４に符号４で示された基板は、条溝検出部５を備える。条溝検出部５は、反応領域５３が円盤状基板上に放射状に延設された条溝を備え、該条溝を形成する長手方向の片側の内壁面Ｉには、上記検出表面２１と同様の構成を備える検出表面５１が、所定間隔で配設されている。また、検出表面５１が形成された各部位には、反応領域５３を挟むように対向する電極５２ａ，５２ｂが対設されている（図４（Ｂ）参照）。なお、互いに離間するように配設された一方の電極５２ａ，５２ａ・・・（図４（Ｂ）参照）を共通電極化することも可能であり、同様に、互いに離間するように配設された他方の電極５２ｂ，５２ｂ・・・（図４（Ｂ）参照）についても共通電極化することができる。即ち、一方の共通電極と他方の共通電極を、反応領域５３を挟むように対向させて、基板上に、放射状をなすように並設することができる。この構成により、針状のプローブを両共通電極に上方から押し当てて、通電させることができる。
【手続補正１２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６８】
「インクジェットプリンティング法」は、インクジェットプリンターで用いられるノズルを応用する方法であって、電気を用いてインクジェットプリンターのようにプリンターヘッドから基板に検出用物質を噴射し、固定する方法である。この方法には、圧電式インクジェット法、バブルジェット（登録商標）法、超音波ジェット法がある。
【手続補正１３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００６９
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００６９】
圧電式インクジェット法は、圧電体にパルスを印加することによって生じる変位の圧力によって液滴を飛ばす方法である。バブルジェット（登録商標）法は、熱方式であって、ノズル中のヒーターを熱して発生させた気泡の圧力によって液滴を飛ばす方式である。ノズル内にヒーターとなるシリコン基板を埋め込み、約３００℃／ｓで制御して一様な気泡を作成し、液滴を押し出す。しかしながら、高温に液体が曝されることになることから、生体物質試料に用いる際には注意を要する。超音波ジェット法は、超音波ビームを液体の自由面に当てて、局所的に高い圧力を与えることによってその箇所から小滴を放出させる方式である。ノズルを必要とせず、高速で直径約１μｍの小滴を形成できる。
【手続補正１４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７３】
（２）検出部の検出表面に固定された検出用ヌクレオチドに電界を印加した上で、標的ヌクレオド鎖を含むサンプル溶液を、検出部の前記反応領域を狙って正確に滴下し、検出用ヌクレオチド鎖と標的ヌクレオチド鎖との間のハイブリダイゼーション反応を進行させる構成であるので、ハイブリダイゼーション反応を短時間で効率良く行うことができる。