【手続補正書】
【提出日】平成17年11月16日(2005.11.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の構造を有するジベンゾローダミン化合物であり：
【化１】
2004107331.tif 000001
この窒素置換形態およびアリール置換形態を含む、ジベンゾローダミン化合物。
【請求項２】
Ｃ−１２に結合される窒素ならびにＣ−１２炭素およびＣ−１３炭素とともに４〜７員を有する第１の環構造を形成する第１の架橋基；ならびに／または
Ｃ−２に結合される窒素ならびにＣ−１炭素およびＣ−２炭素とともに４〜７員を有する第２の環構造を形成する第２の架橋基を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項３】
前記第１の環構造および前記第２の環構造の一方または両方が５員を有する、請求項２に記載の化合物。
【請求項４】
前記５員環構造が１つのジェミナル二置換炭素を含む、請求項３に記載の化合物。
【請求項５】
低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、フェニル、芳香族、複素環、多環式芳香族、水可溶化基、結合基、ならびにそれらの置換形態からなる群より選択される、１以上の窒素置換基を含む、請求項４に記載の化合物。
【請求項６】
前記窒素置換基が、置換低級アルキル、置換多環式芳香族、および置換フェニルからなる群より選択され、ここで該置換基が結合基またはスルホネートである、請求項５に記載の化合物。
【請求項７】
前記窒素置換基が、カルボキシレート、スルホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、および水溶性ポリマーからなる群より選択される水可溶化基である、請求項５に記載の化合物。
【請求項８】
前記ジェミナル置換基が低級アルキルである、請求項４に記載の化合物。
【請求項９】
前記５員環が芳香族ではない、請求項３に記載の化合物。
【請求項１０】
前記５員環が結合基または水可溶化基で置換される、請求項３に記載の化合物。
【請求項１１】
前記第１および第２の環構造が同一であるかまたは異なる、請求項２に記載の化合物。
【請求項１２】
アセチレン、低級アルキル、低級アルケン、シアノ、フェニル、複素環、およびそれらの置換形態からなる群より選択されるＣ−７置換基を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項１３】
前記Ｃ−７置換基が、以下の構造：
【化２】
2004107331.tif 000002
を有するフェニルであり、このアリール置換形態を含む、請求項１２に記載の化合物。
【請求項１４】
Ｃ−１４位〜Ｃ−１８位の任意の１つにおける置換基が、塩素、フッ素、低級アルキル、カルボン酸、スルホン酸、−ＣＨ２ＯＨ、アルコキシ、フェノキシ、結合基、水可溶化基、およびそれらの置換形態からなる群より選択される、請求項１３に記載の化合物。
【請求項１５】
Ｃ−１８位における置換基が、カルボン酸およびスルホネートからなる群より選択される、請求項１４に記載の化合物。
【請求項１６】
Ｃ−１４位およびＣ−１７位における置換基が、塩素である、請求項１４に記載の化合物。
【請求項１７】
Ｃ−１４位〜Ｃ−１７位における置換基が、塩素またはフッ素である、請求項１４に記載の化合物。
【請求項１８】
Ｃ−１５位およびＣ−１６位の一方における置換基が結合基であり、そして他方が水素であり、Ｃ−１４位およびＣ−１７位における置換基が塩素であり、そしてＣ−１８位における置換基がカルボキシである、請求項１４に記載の化合物。
【請求項１９】
低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、フェニル、芳香族、複素環、多環式芳香族、水可溶化基、結合基、ならびにそれらの置換形態からなる群より選択される、１以上の窒素置換基を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項２０】
前記窒素置換基が、置換低級アルキル、置換多環式芳香族、および置換フェニルからなる群より選択され、ここで該置換基が結合基またはスルホネートである、請求項１９に記載の化合物。
【請求項２１】
前記窒素置換基が、スルホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、および水溶性ポリマーからなる群より選択される水可溶化基である、請求項１９に記載の化合物。
【請求項２２】
前記Ｃ−１２に結合される窒素ならびに前記Ｃ−１１炭素および前記Ｃ−１２炭素とともに５〜７員を有する第３の環構造を形成する、第３の架橋基；および／または
前記Ｃ−２に結合される窒素ならびに前記Ｃ−２炭素および前記Ｃ−３炭素とともに５〜７員を有する第４の環構造を形成する、第４の架橋基、
を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項２３】
前記第３および第４の環構造の１つまたは両方が６員を有する、請求項２２に記載の化合物。
【請求項２４】
前記６員環構造が１つのジェミナル二置換炭素を含む、請求項２３に記載の化合物。
【請求項２５】
前記ジェミナル置換基が低級アルキルである、請求項２４に記載の化合物。
【請求項２６】
前記６員環が芳香族ではない、請求項２３に記載の化合物。
【請求項２７】
フッ素、塩素、低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、スルフェート、スルホネート、スルホン、スルホンアミド、スルホキシド、アミノ、アンモニウム、アミド、ニトリル、低級アルコキシ、フェノキシ、芳香族、フェニル、多環式芳香族、複素環、水可溶化基、および結合基、ならびにそれらの置換形態からなる群より選択される、Ｃ−１位、Ｃ−３位〜Ｃ−６位、Ｃ−８位〜Ｃ−１１位、およびＣ−１３位の１以上において１以上の置換基を含む、請求項１に記載の化合物。
【請求項２８】
前記Ｃ−３炭素およびＣ−４炭素、前記Ｃ−４炭素およびＣ−５炭素、前記Ｃ−９炭素およびＣ−１０炭素、ならびに／または前記Ｃ−１０炭素およびＣ−１１炭素にわたって結合された、縮合芳香族環、ならびにそれらの置換形態を含む、請求項２７に記載の化合物。
【請求項２９】
前記１以上の置換基がスルホネートである、請求項２７に記載の化合物。
【請求項３０】
以下の構造：
【化３】
2004107331.tif 000003
【化４】
2004107331.tif 000004
【化５】
2004107331.tif 000005
【化６】
2004107331.tif 000006
【化７】
2004107331.tif 000007
【化８】
2004107331.tif 000008
および
【化９】
2004107331.tif 000009
のうち一つを有する請求項１に記載の化合物。
【請求項３１】
以下の構造：
【化１０】
2004107331.tif 000010
を有する請求項１に記載の化合物であって、
ここで、
Ｌ1およびＬ2が、
【化１１】
2004107331.tif 000011
および−（ＣＨ2）ｎ−（ここで、ｎは１〜８の範囲である）からなる群より選択され；ならびに
Ｒ1およびＲ2が、結合基および水可溶化基からなる群より選択される、化合物。
【請求項３２】
前記水可溶化基が、カルボキシレート、スルホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、および水溶性ポリマーからなる群より選択される、請求項３１に記載の化合物。
【請求項３３】
前記Ｃ−３炭素およびＣ−４炭素、前記Ｃ−４炭素およびＣ−５炭素、前記Ｃ−９炭素およびＣ−１０炭素、ならびに／または前記Ｃ−１０炭素およびＣ−１１炭素にわたって結合された、縮合芳香族環、ならびにそれらの置換形態を含む、請求項３１に記載の化合物。
【請求項３４】
以下の構造：
【化１２】
2004107331.tif 000012
【化１３】
2004107331.tif 000013
【化１４】
2004107331.tif 000014
【化１５】
2004107331.tif 000015
および
【化１６】
2004107331.tif 000016
のうち一つを有する、請求項１に記載の化合物。
【請求項３５】
以下の構造：
【化１７】
2004107331.tif 000017
を有する、ジベンゾローダミン化合物の合成のために有用な中間体であり、ここで、 Ｒ１がＨまたは
【化１８】
2004107331.tif 000018
であり、ここでＹがＨ、低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、芳香族、フェニル、多環式芳香族、複素環、水可溶化基、および結合基からなる群より選択され；
ここで、Ｒ１がＨである場合、前記Ｃ−１２に結合された窒素および該Ｃ−１２炭素およびＣ−１３炭素が４〜７員を有する第１の環構造を形成し、ならびに／または該Ｃ−１２に結合された窒素および前記Ｃ−１１炭素およびＣ−１２炭素が５〜７員を有する第２の環構造を形成し；ならびに
それらのアリール置換形態および窒素置換形態を含む、中間体。
【請求項３６】
Ｙが、
【化１９】
2004107331.tif 000019
である、請求項３５に記載の化合物。
【請求項３７】
Ｃ−１４位〜Ｃ−１８位の任意の１つにおける置換基が、塩素、フッ素、低級アルキル、カルボン酸、スルホン酸、−ＣＨ２ＯＨ、アルコキシ、フェノキシ、結合基、水可溶化基およびそれらの置換形態からなる群より選択される、請求項３６に記載の化合物。
【請求項３８】
Ｃ−１８位における置換基が、カルボン酸およびスルホネートからなる群より選択される、請求項３７に記載の化合物。
【請求項３９】
Ｃ−１４位およびＣ−１７位における置換基が塩素である、請求項３７に記載の化合物。
【請求項４０】
Ｃ−１４位〜Ｃ−１７位における置換基が塩素またはフッ素である、請求項３７に記載の化合物。
【請求項４１】
Ｃ−１５位およびＣ−１６位の一方における置換基が結合基であり、そして他方が水素であり、Ｃ−１４位およびＣ−１７位における置換基が塩素であり、ならびにＣ−１８位における置換基がカルボキシである、請求項３７に記載の化合物。
【請求項４２】
前記Ｃ−１２に結合された窒素および該Ｃ−１２およびＣ−１３炭素が４〜７員を有する第１の環構造を形成し、ならびに／または該Ｃ−１２に結合された窒素および前記Ｃ−１１およびＣ−１２炭素が５〜７員を有する第２の環構造を形成する、請求項３５に記載の化合物。
【請求項４３】
前記第１および／または第２の環構造が５員を有する、請求項３５に記載の化合物。
【請求項４４】
前記５員環構造が１つのジェミナル二置換炭素を含む、請求項４３に記載の化合物。
【請求項４５】
前記ジェミナル置換基が低級アルキルである、請求項４４に記載の化合物。
【請求項４６】
前記５員環が芳香族ではない、請求項４３に記載の化合物。
【請求項４７】
前記５員環が結合基で置換される、請求項４３に記載の化合物。
【請求項４８】
低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、フェニル、芳香族、複素環、多環式芳香族、水可溶化基、結合基、およびそれらの置換形態からなる群より選択される、１以上の窒素置換基を含む、請求項３５に記載の化合物。
【請求項４９】
前記窒素置換基が、置換低級アルキルおよび置換フェニルからなる群より選択され、ここで該置換基が結合基またはスルホネートである、請求項４８に記載の化合物。
【請求項５０】
前記窒素置換基が、カルボキシレート、スルホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、および水溶性ポリマーからなる群より選択される水可溶化基である、請求項４８に記載の化合物。
【請求項５１】
前記窒素置換基が、−Ｌ−Ｒであり、
ここで、Ｌが：
【化２０】
2004107331.tif 000020
および、−（ＣＨ２）n−（ここでｎは１〜８の範囲である）からなる群より選択され；ならびに
Ｒが、結合基および水可溶化基からなる群より選択される、請求項４８に記載の化合物。
【請求項５２】
前記水可溶化基が、スルホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、および水溶性ポリマーからなる群より選択される、請求項５１に記載の化合物。
【請求項５３】
フッ素、塩素、低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、スルフェート、スルホネート、スルホン、スルホンアミド、スルホキシド、アミノ、アンモニウム、アミド、ニトリル、低級アルコキシ、フェノキシ、芳香族、フェニル、多環式芳香族、水可溶化基、複素環、および結合基、ならびにそれらの置換形態からなる群より選択される、１以上のＣ−８位〜Ｃ−１１位およびＣ−１３位における１以上の置換基を含む、請求項３５に記載の化合物。
【請求項５４】
前記Ｃ−９炭素およびＣ−１０炭素、ならびに／または前記Ｃ−１０炭素およびＣ−１１炭素にわたって結合された、縮合芳香族環、ならびにそれらの置換形態を含む、請求項５３に記載の化合物。
【請求項５５】
１以上の置換基がスルホネートである、請求項５３に記載の化合物。
【請求項５６】
以下の構造：
【化２１】
2004107331.tif 000021
【化２２】
2004107331.tif 000022
（ここで、Ｒはメチルおよび−（ＣＨ２）３ＳＯ３−からなる群より選択される）
【化２３】
2004107331.tif 000023
および
【化２４】
2004107331.tif 000024
（ここで、Ｒは低級アルキルである）
のうち一つを有する、請求項３５に記載の化合物。
【請求項５７】
エネルギー移動色素であって、以下：
第１の波長において光を吸収し得、そして応答の際に励起エネルギーを放出し得るドナー色素；
該ドナー色素によって放出される励起エネルギーを吸収し得、そして応答の際に第２の波長において蛍光を発し得る、アクセプター色素；ならびに
該ドナー色素および該アクセプター色素を連結し、該ドナー色素と該アクセプター色素との間のエネルギーの効率的な移動を促進するために役立つ、リンカー；
ここで、少なくとも１つの該ドナー色素および該アクセプター色素が、請求項１に記載のジアゾベンゾローダミン化合物である、
を含む、エネルギー移動色素。
【請求項５８】
前記リンカーが、アルケン、ジエン、アルキン、少なくとも１つの不飽和結合を有する５および６員環、ならびに縮合環構造からなる群より選択される官能基を含む、請求項５７に記載のエネルギー移動色素。
【請求項５９】
前記第１の波長が約６００ｎｍよりも大きい、請求項５７に記載のエネルギー移動色素。
【請求項６０】
前記リンカーが以下：
【化２５】
2004107331.tif 000025
の構造を有し、
ここで、
Ｚ１が−ＮＨ、硫黄および酸素からなる群より選択され；
Ｒ２１がドナー色素に結合された低級アルキルであり；
Ｒ２２がアルケン、ジエン、アルキン、少なくとも１つの不飽和結合を有する５および６員環ならびに縮合環構造からなる群より選択される置換基であり、該置換基がカルボニル炭素に結合され；そして Ｒ２８がアクセプター色素に対して該リンカーと結合する官能基を含む、請求項５７に記載のエネルギー移動色素。
【請求項６１】
Ｒ２２が、シクロペンテン、シクロヘキセン、シクロペンタジエン、シクロヘキサジエン、フラン、チオフラン、ピロール、イソピロール（ｉｓｏｐｙｒｏｌｅ）、イソアゾール、ピラゾール、イソイミダゾール、ピラン、ピロン、ベンゼン、ピリジン、ピリダジン、ピリミジン、ピラジン オキサジン、インデン、ベンゾフラン、チオナフテン、インドールおよびナフタレンからなる群より選択される、５員環または６員環である、請求項６０に記載のエネルギー移動色素。
【請求項６２】
前記リンカーが、以下の構造：
【化２６】
2004107331.tif 000026
を有する請求項６０に記載のエネルギー移動色素であり ここで、 Ｚ2
が、−ＮＨ、硫黄および酸素からなる群より選択され；ならびに Ｒ２９が、低級アルキルである、エネルギー移動色素。
【請求項６３】
前記リンカーが、以下：
【化２７】
2004107331.tif 000027
の構造を有する、請求項５７に記載のエネルギー移動色素。
【請求項６４】
式：
ＮＵＣ−Ｄ
を有する、標識ヌクレオシド／シドであり、
ここで、
ＮＵＣは、ヌクレオシド／チドまたはヌクレオシド／チドアナログであり；
Ｄは、請求項１に記載のジベンゾローダミン色素化合物であって、ＮＵＣおよびＤは連結によって連結されており；
ここで、ＮＵＣがプリン塩基を含む場合、該連結が該プリンの８位に結合され、ＮＵＣが７−デアザプリン塩基を含む場合、該連結は該７−デアザプリンの７位に結合され、そしてＮＵＣがピリミジン塩基を含む場合、該連結は該ピリミジンの５位に結合される、標識ヌクレオシド／シド。
【請求項６５】
ＮＵＣが、ウラシル、シトシン、デアザアデニン、およびデアザグアノシンからなる群より選択される塩基を含む、請求項６４に記載の標識ヌクレオシド／チド。
【請求項６６】
前記連結が、以下：
【化２８】
2004107331.tif 000028
である、請求項６４に記載の標識ヌクレオシド／チド。
【請求項６７】
ポリヌクレオチド配列決定方法であり、以下の工程：
第１クラス、第２クラス、第３クラス、および第４クラスのポリヌクレオチドの混合物を形成する工程であって、これによって：
該第１クラスにおける各々のポリヌクレオチドが、３’−末端ジデオキシアデノシンを含み、そして第１の色素で標識され；
該第２クラスにおける各々のポリヌクレオチドが、３’−末端ジデオキシシチジンを含み、そして第２の色素で標識され；
該第３クラスにおける各々のポリヌクレオチドが、３’−末端ジデオキシグアノシンを含み、そして第３の色素で標識され；
該第４クラスにおける各々のポリヌクレオチドが、３’−末端ジデオキチミジンを含み、そして第４の色素で標識され；
ここで、該第１、該第２、該第３または該第４の色素の少なくとも１つが、請求項１に記載のジベンゾローダミン化合物であり；
該色素の他方は、該ジベンゾローダミン色素および互いからスペクトル的に分解可能であり；
該ポリヌクレオチドを電気泳動的に分離し、それによって様似の大きさのポリヌクレオチドのバンドを形成する工程；
該色素に蛍光を引き起こさせ得る照射光を用いて該バンドを照射する工程；ならびに、  該色素の蛍光スペクトルによる該バンドにおける該ポリヌクレオチドのクラスを同定する工程、
を含む、方法。
【請求項６８】
フラグメント分析方法であり、以下の工程：
標識されたポリヌクレオチドフラグメントを形成する工程であり、該フラグメントが、請求項１に記載のジベンゾローダミン化合物で標識される、工程；
該標識されたポリヌクレオチドフラグメントを、サイズ依存性分離プロセスに供する工程；および
該分離プロセスに引き続いて、該標識されたポリヌクレオチドを検出する工程、
を包含する、方法。
【請求項６９】
前記サイズ依存性分離プロセスが電気泳動であり、そして該標識されたポリヌクレオチドフラグメントが蛍光によって検出される、請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
以下の構造を有する、ジベンゾローダミン化合物：
【化２９】
2004107331.tif 000029
ここで、該化合物は、その窒素置換形態およびアリール置換形態を含むが、ただし、Ｃ−７は水素に結合している。
【請求項７１】
Ｃ−１２に結合した窒素と、Ｃ−１２およびＣ−１３炭素が一緒になる場合、４〜７員を有する第１の環構造を形成する第１の架橋基；
および／または、
Ｃ−２に結合した窒素と、Ｃ−１およびＣ−２炭素が一緒になる場合、４〜７員を有する第２の環構造を形成する第２の架橋基、
を含む、請求項７０に記載される化合物。
【請求項７２】
前記第１および第２の環構造の一方または両方が５員を有する、請求項７１に記載される化合物。
【請求項７３】
前記５員環構造物が、１個のジェミナル二置換炭素を有する、請求項７２に記載される化合物。
【請求項７４】
低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、フェニル、ベンジル、アリール、複素環、多環式芳香族、水可溶化基および結合基ならびにそれらの置換形態からなる群より選択される、１個以上の窒素置換基を有する、請求項７０に記載される化合物。
【請求項７５】
前記結合基が、イソチオシアナート、塩化スルホニル、４,６−ジクロロトリアジニル、スクシンイミジルエステル、活性型エステル、ペンタフルオロフェニルエステル、マレイミド、ハロアセチル、ヨードアセトアミドおよびＮ−ヒドロキシスクシンイミジルエステルである、請求項７４に記載される化合物。
【請求項７６】
前記水可溶化基が、カルボキシレート、スルホネート、スルフェート、ホスホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、または水可溶性ポリマーである、請求項７４に記載される化合物。
【請求項７７】
前記ジェミナル置換基が低級アルキルである、請求項７３に記載される化合物。
【請求項７８】
前記５員環が芳香族ではない、請求項７２に記載される化合物。
【請求項７９】
前記５員環が結合基または水可溶化基で置換される、請求項７２に記載される化合物。
【請求項８０】
前記第１および第２の環構造が同一であるかまたは異なる、請求項７１に記載される化合物。
【請求項８１】
１個以上の窒素置換形態−Ｌ−Ｒを含む、請求項７０に記載される化合物：
ここで、Ｌは、低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、フェニル、ベンジル、アリール、複素環および多環式芳香族からなる群から選択され；そして、
Ｒは、Ｈ、水可溶化基または結合基である。
【請求項８２】
前記水可溶化基が、カルボキシレート、スルホネート、スルフェート、ホスホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、または水可溶性ポリマーである、請求項８１に記載される化合物。
【請求項８３】
前記結合基が、イソチオシアナート、塩化スルホニル、４,６−ジクロロトリアジニル、スクシンイミジルエステル、活性型エステル、ペンタフルオロフェニルエステル、マレイミド、ハロアセチル、ヨードアセトアミドまたはＮ−ヒドロキシスクシンイミジルエステルである、請求項８１に記載される化合物。
【請求項８４】
Ｃ−１２に結合した窒素と、Ｃ−１１およびＣ−１２炭素が一緒になる場合、５〜７員を有する第３の環構造を形成する第３の架橋基；
および／または、
Ｃ−２に結合した窒素と、Ｃ−２およびＣ−３炭素が一緒になる場合、５〜７員を有する第４の環構造を形成する第４の架橋基、
を有する、請求項７０に記載される化合物。
【請求項８５】
前記第３および第４の環構造の一方または両方が６員を有する、請求項８４に記載される化合物。
【請求項８６】
前記６員環構造が、１個のジェミナル二置換炭素を有する、請求項８５に記載される化合物。
【請求項８７】
前記ジェミナル置換基が低級アルキルである、請求項８６に記載の化合物。
【請求項８８】
前記６員環が芳香族ではない、請求項８５に記載の化合物。
【請求項８９】
前記第３および第４の環構造の一方または両方が５員を有する、請求項８４に記載される化合物。
【請求項９０】
前記５員環構造が、１個のジェミナル二置換炭素を有する、請求項８９に記載される化合物。
【請求項９１】
前記ジェミナル置換基が低級アルキルである、請求項９０に記載の化合物。
【請求項９２】
Ｃ−１位、Ｃ−３位〜Ｃ−６位、Ｃ−８位〜Ｃ−１１位、およびＣ−１３位の１以上において、フッ素、塩素、低級アルキル、低級アルケン、低級アルキン、スルフェート、スルホネート、スルホン、スルホンアミド、スルホキシド、アミノ、アンモニウム、アミド、ニトリル、低級アルコキシ、フェノキシ、フェニル、アリール、多環式芳香族、複素環、水可溶化基、および結合基、ならびにそれらの置換形態からなる群より選択される、１以上の置換基を含む、請求項７０に記載の化合物。
【請求項９３】
前記Ｃ−３炭素およびＣ−４炭素、前記Ｃ−４炭素およびＣ−５炭素、前記Ｃ−９炭素およびＣ−１０炭素、ならびに／または前記Ｃ−１０炭素およびＣ−１１炭素にわたって結合された、縮合芳香族環、ならびにそれらの置換形態を含む、請求項９２に記載の化合物。
【請求項９４】
前記１つ以上の置換基がスルホネートである、請求項９２に記載される化合物。
【請求項９５】
以下の構造：
【化３０】
2004107331.tif 000030
を有する請求項７０に記載の化合物であって、
ここで、
Ｌ１およびＬ２が、
【化３１】
2004107331.tif 000031
、二置換フェニル、二置換ビフェニル、二置換ナフチル、および−（ＣＨ２）ｎ−（ここで、ｎは１〜８の範囲である）からなる群より選択され；ならびに
Ｒ１およびＲ２が、結合基および水可溶化基からなる群より選択される、化合物。
【請求項９６】
前記水可溶化基が、カルボキシレート、スルホネート、スルフェート、ホスホネート、ホスフェート、四級アミン、スルフェート、ポリヒドロキシル、または水可溶性ポリマーである、請求項９５に記載される化合物。
【請求項９７】
前記結合基が、イソチオシアナート、塩化スルホニル、４,６−ジクロロトリアジニル、スクシンイミジルエステル、活性型エステル、ペンタフルオロフェニルエステル、マレイミド、ハロアセチル、ヨードアセトアミドまたはＮ−ヒドロキシスクシンイミジルエステルである、請求項９５に記載される化合物。
【請求項９８】
前記Ｃ−３炭素およびＣ−４炭素、前記Ｃ−４炭素およびＣ−５炭素、前記Ｃ−９炭素およびＣ−１０炭素、ならびに／または前記Ｃ−１０炭素およびＣ−１１炭素にわたって結合された、縮合芳香族環、ならびにそれらの置換形態を含む、請求項９５に記載の化合物。
【請求項９９】
以下の構造：
【化３２】
2004107331.tif 000032
【化３３】
2004107331.tif 000033
【化３４】
2004107331.tif 000034
【化３５】
2004107331.tif 000035
【化３６】
2004107331.tif 000036
【化３７】
2004107331.tif 000037
【化３８】
2004107331.tif 000038
および
【化３９】
2004107331.tif 000039
のうち一つを有する、請求項７０に記載の化合物。
【請求項１００】
以下の構造：
【化４０】
2004107331.tif 000040
を有する請求項７０に記載の化合物であって、
ここで、
Ｌ１およびＬ２が、
【化４１】
2004107331.tif 000041
、二置換フェニル、二置換ビフェニル、二置換ナフチル、および−（ＣＨ２）ｎ−（ここで、ｎは１〜８の範囲である）からなる群より選択され；ならびに
Ｒ１およびＲ２が、結合基および水可溶化基からなる群より選択される、化合物。
【請求項１０１】
前記水可溶化基が、カルボキシレート、スルホネート、スルフェート、ホスホネート、ホスフェート、四級アミン、ポリヒドロキシル、または水可溶性ポリマーである、請求項１００に記載される化合物。
【請求項１０２】
前記結合基が、イソチオシアナート、塩化スルホニル、４,６−ジクロロトリアジニル、スクシンイミジルエステル、活性型エステル、ペンタフルオロフェニルエステル、マレイミド、ハロアセチル、ヨードアセトアミドまたはＮ−ヒドロキシスクシンイミジルエステルである、請求項１００に記載される化合物。
【請求項１０３】
以下の構造：
【化４２】
2004107331.tif 000042
【化４３】
2004107331.tif 000043
および
【化４４】
2004107331.tif 000044
のうち一つを有する、請求項７０に記載の化合物。