(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＳＥＱ  ＩＤ  Ｎｏ：６及びその塩から選ばれるアミノ酸配列から成る、ＩＬ−６アンタゴニストペプチド。
【請求項２】
ＳＥＱ  ＩＤ  Ｎｏ：６のアミノ酸配列から成る請求項１記載のペプチド。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
発明の分野
本発明はｇｐ１３０の細胞内ドメインに結合するその能力により２−ハイブリドシステムを通じてペプチドライブラリーから単離可能であり、且つ少なくとも５個のアミノ酸を含むＩＬ−６アンタゴニストに関連する。詳しくは、かかるペプチドはSEQ ID NO:１，SEQ ID NO:３，SEQ ID NO:４，SEQ ID NO:５，SEQ ID NO:６，SEQ ID NO:７，SEQ ID NO:８、並びにその塩、機能性誘導体、前駆体及び類似体から成る群から選ばれるアミノ酸配列を含んで成る。
【０００２】
本発明のその他の目的はＩＬ−６活性阻害を要する病理における医薬組成物中で活性成分として利用するのに適当となるために実質的に純粋な形態においてペプチドを提供することにある。
【０００３】
発明の背景
２−ハイブリドシステム（ＴＨＳ）はタンパク質−タンパク質相互作用を検出するために転写活性をシステムとして利用する方法である。酵母転写因子ＧＡＬ４のＤＮＡ結合ドメインを任意のタンパク質「Ｘ」（通常は「つりえさ」結合標的である一定の哺乳動物タンパク質）とのハイブリドとしてコードするように構築される。Ｘ−Ｙ相互作用が起こると、それは活性ドメインをＧＡＬ４  ＤＮＡ結合ドメインにより認識されるＤＮＡ上の部位に近づけ、かくしてこのようなＤＮＡ部位により調節される隣接リポーター遺伝子の発現がもたらされる。一般に利用されるこのリポーター遺伝子は：１）Ｘ−ＧａＬを含むプレート又はフィルター上に青色のコロニーを生成するｌａｃＺ；及び宿主酵母細胞の増殖のために必要なヒスチジン生合成に関与する酵母遺伝子Ｈｉｓ３；を含む。
【０００４】
最近、Fields及びそのチームは網膜芽腫タンパク質（Ｒｂ）に結合できるペプチドを探すため、ｃＤＮＡライブラリーの代わりに、ランダムペプチドのライブラリーをスクリーニングするのにＴＨＳを使用した（Yangら、1995）。
【０００５】
インターロイキン−６（ＩＬ−６）のためのレセプターシステムはｇｐ８０及びｇｐ１３０と称される２つの異なるレポーター「サブユニット」から成る（Hiranoら、1994）。
【０００６】
ＩＬ−６型サイトカインはｇｐ１３０タンパク質を共有するレセプターを通じてそのシグナルを誘導する。リガンドの結合によりｇｐ１３０はＬＩＦ及びＯＳＭレセプターとホモ−又はヘテロ−二量化し、かくして集合したＪＡＫチロシンキナーゼを活性化する。ＪＡＫはＳＴＡＴファミリーのシグナルトランスデューサー（ｇｐ１３０）及び潜伏転写因子（シグナルトランスデューサー及び転写アクチベーター）、例えばＩＬ−６の場合はＳＴＡＴ１及びＳＴＡＴ３をホスホリル化する。ＳＴＡＴ因子は二量化し、核へと転位し、そしてＩＬ−６応答遺伝子のエンハンサー要素に結合する（Luttikenら、1993）。
【０００７】
ｇｐ１３０の細胞内ドメインの欠失分析は分裂促進活性及びＪＡＫタンパク質の結合の双方に衝撃を及ぼすのに十分なｂｏｘ１及びｂｏｘ２として知られる規定の短いアミノ酸ストレッチを有する（Vanderkuurら、1994）。これらの活性はＳＴＡＴの結合部位が欠失しているときにも観察された。従って、２つの機能がＪＡＫキナーゼに寄与しうる：１）ＳＴＡＴ−媒介遺伝子発現の活性化；２）少なくとも一部の造血細胞におけるＳＴＡＴ−非依存性分裂促進活性の活性化。
【０００８】
更なるキナーゼ、例えばＨｃｋ，Ｆｅｓ，Ｂｔｋ及びＴｅｃがｇｐ１３０の細胞内部に結合することで知られている（Matsuda ら、1995）。しかしながら、これらの相互作用は分子レベルでは明らかにされていない。更に、Tannerらはサイトカインレセプターのｂｏｘ１ドメインがＪＡＫキナーゼとの相互作用のために必要ではあるが、十分ではないことを実証し、そしてｂｏｘ１配列はＪＡＫキナーゼ会合を及ぼすのにその他のサイトプラズマドメイン配列と協力し合うことが示唆される（Tannerら、1995）。ｂｏｘ１及びｂｏｘ２のＪＡＫキナーゼに対する分子カウンターパートでさえも特定されていない。
【０００９】
ＩＬ−６活性を阻害する合成ペプチドは国際特許出願ＷＯ９７／１３７８１（ＹＥＤＡ）に記載され、それはｇｐ８０タンパク質に由来するペプチドに関連する。
【００１０】
発明の説明
ＴＨＳにおける標的として、我々はヒトＩＬ−６レセプターの細胞内部分（ｇｐ１３０−ＩＣＤ）を分析した。このＴＨＳスクリーニングは従ってホスホリル化非依存式にｇｐ１３０−ＩＣＤと直接相互作用できるペプチド候補を同定するであろう。ｇｐ１３０−ＩＣＤとのホスホリル化非依存相互作用はＩＬ−６型サイトカインにより誘導されるシグナルの変換において起こることが知られている。このタイプのｇｐ１３０−ＩＣＤ相互作用カウンターパートにはＪＡＫファミリーのタンパク質キナーゼが挙げられる（Darnell ら、1994）。
【００１１】
従って、本発明の主要目的はｇｐ１３０の細胞内ドメインに結合する能力により２−ハイブリドシステムを通じてペプチドライブラリーから単離可能であり、且つ少なくとも５個のアミノ酸を含むＩＬ−６アンタゴニストペプチドにある。本発明の好適な態様によれば、かかるペプチドは３０個までのアミノ酸、より好ましくは５〜２０個、最も好ましくは８〜１６個のアミノ酸を含む。
【００１２】
本発明によれば、ＴＨＳスクリーニングにおいて利用する「つりえさ」（「Ｘ」）はｇｐ１３０タンパク質の細胞内ドメイン（ＩＣＤ）である。かかるドメインはＩＬ６−Ｒ（ｇｐ１３０）の６４２位のアミノ酸から９１８位のアミノ酸に至る領域に対応する（Yamasaki K. ら、1988）。ＴＨＳスクリーニングにおける［魚」はランダムペプチドのライブラリーである。かかるライブラリーは任意の慣用のライブラリーであるか、又は公知の方法により「イン・ハウス」で製造できる。
【００１３】
上記のスクリーニングに由来する偽陽性は論文に記載の通りにして排除されうる（Bartelら、1993）。
【００１４】
更なる好適な態様に従うと、かかるペプチドはSEQ ID NO:１，SEQ ID NO:３，SEQ ID NO:４，SEQ ID NO:５，SEQ ID NO:６，SEQ ID NO:７，SEQ ID NO:８、並びにその塩、機能性誘導体、前駆体及び及び類似体から成る群から選ばれる。
【００１５】
SEQ ID NO:１で、Ｘａａ3 がＧｌｙ、そしてＸａａ4 がＬｅｕのとき、本発明のペプチドはSEQ ID NO:２のアミノ酸配列を含んで成る。
【００１６】
本明細書において用いる「類似体」とは、上記の配列における１又は複数個のアミノ酸がＩＬ−６アンタゴニスト活性に実質的な影響を及ぼすことなく変えられているペプチドを意味する。詳しくは、本発明に係る類似体についての好適な改変は「保存］置換として知られるものである。保存アミノ酸置換には同一のグループ内の同義アミノ酸であって同グループの構成員間での置換が分子の生物学的機能を保持せしめるのに十分似ている物理化学特性を有するアミノ酸によるアミノ酸変換が含まれる。 Grantham, Science, Vol. 185, pp.862-864 (1974)。
【００１７】
同義アミノ酸のグループは表Ｉに規定のものである。より好ましくは、同義アミノ酸のグループは表IIに規定のものである；そして最も好ましくは、同義アミノ酸は表III に規定のものである。
【００１８】
【表１】
0004468578.tif 000002
【００１９】
【表２】
0004468578.tif 000003
【００２０】
【表３】
0004468578.tif 000004
【００２１】
本明細書における用語「塩」とは、本発明のペプチド又はその類似体のカルボキシル基の塩及びアミノ基の酸付加塩の双方を意味する。カルボキシル基の塩は当業界において公知の手段により形成され得、そして無機塩、例えばナトリウム、カルシウム、アンモニウム、第二鉄又は亜鉛塩等、並びに例えばアミン、例えばトリエタノールアミン、アルギニン又はリジン、ピペリジン、プロカイン等とで形成されるような有機塩基との塩が挙げられる。酸塩には例えば鉱酸、例えば塩酸又は硫酸との塩、有機酸、例えば酢酸又はシュウ酸との塩が挙げられる。むろん、任意のかかる塩は本発明のペプチド又はその類似体と実質的に類似の活性を有さねばならない。
【００２２】
本明細書で用いる定義「機能性誘導体」とは、公知の方法に従ってアミノ酸成分の側鎖又は末端Ｎ−もしくはＣ−基上に存在する官能基から調製でき、そしてそれらが医薬的に許容されるとき、即ち、それらがタンパク質活性を破壊しない又はそれらを含む医薬組成物に毒性を授けないときに本発明に包含される。かかる誘導体には例えばカルボキシル基のエステルもしくは脂肪族アミド及び遊離アミノ基のＮ−アシル誘導体又は遊離ヒドロキシル基のＯ−アシル誘導体が挙げられ、そして例えばアルカノイル−又はアロイル−基としてアシル基で形成される。
【００２３】
「前駆体」はヒト又は動物の体内で本発明のペプチドへと変換される化合物をいう。
【００２４】
「ＩＬ−６アンタゴニスト活性」はＩＬ−６のそのレセプターに対する結合と拮抗することにより及び／又はＩＬ−６依存性細胞、例えばミエローマ細胞における遺伝子活性化に結びつく分子シグナルを細胞内的に変換するレセプターシステムの機能を妨害する能力を意味する。従って、かかる活性は当業界公知の任意のアッセイにより測定できうる。かかるアッセイにはネズミプラスマ細胞腫Ｔ１１６５細胞の増殖、マウスＭ１骨髄様白血病細胞の増殖阻害、又は肝癌細胞からの急性期タンパク質の生産が挙げられる。
【００２５】
本発明のペプチドは当業界における任意の周知の手順、例えば固相合成又は液相合成に調製できうる。固相合成としては、例えば合成すべきペプチドのＣ末端に対応するアミノ酸を有機溶媒中で不溶性である支持体に結合させ、そして反応の交互反復により、アミノ酸におけるそのα−アミノ基及び側鎖官能基が適当な保護基で保護されているものを一つずつＣ末端からＮ末端へと順々に縮合させ、そしてアミノ酸が樹脂に結合しているものか又はペプチドのα−アミノ基の保護基を遊離させ、ペプチドをかのようにして伸長させる。固相合成法は使用する保護基のタイプに依存し、ｔＢｏｃ法及びＦｍｏｃ法に大きく分類される。
【００２６】
典型的に利用される保護基には、アミノ基の場合にはｔＢｏｃ（ｔ−ブトキシカルボニル）、ＣＬ−Ｚ（２−クロロベンジルオキシカルボニル）、Ｂｒ−Ｚ（２−ブロモベンジルオキシカルボニル）、ＢｚＬ（ベンジル）、Ｆｍｏｃ（９−フルオレニルメトキシカルボニル）、Ｍｂｈ（４，４’−ジメトキシジベンズヒドリル）、Ｍｔｒ（４−メトキシ−２，３，６−トリメチルベンゼンスルホニル）、Ｔｒｔ（トリチル）、Ｔｏｓ（トシル）、Ｚ（ベンジルオキシカルボニル）及びＣｌ2 −Ｂｚｌ（２，６−ジクロロベンジル）；グルアニジノ基の場合にはＮＯ2 （ニトロ）及びＰｍｃ（２，２，５，７，８−ペンタメチルクロマン−６−スルホニル）；そしてヒドロキシル基の場合にはｔＢｕ（ｔ−ブチル）が挙げられる。
【００２７】
所望のペプチドの合成後、それを脱保護反応にかけ、そして固相支持体から切断する。かかるペプチド切断反応はＢｏｃ法の場合はフッ化水素又はトリフルオロメタンスルホン酸で実施し、そしてＦｍｏｃ法の場合はＴＦＡで実施してよい。
【００２８】
このようにして得られた粗ペプチドを精製にかける。精製はこの目的のために知られている任意の方法のいずれか、即ち、抽出、沈殿、クロマトグラフィー、電気泳動等を包含する任意の慣用の手順により実施する。例えば、ＨＰＬＣ（高性能液体クロマトグラフィー）を利用してよい。この溶出はタンパク質精製のために一般に利用されている水−アセトニトリル系溶媒を利用して実施してよい。
【００２９】
従って、本発明の別の目的はＩＬ−６活性阻害を要する病理における医薬組成物において活性成分として利用するのに適当となるために実質的に純粋な形態においてペプチドを提供することにある。
【００３０】
本発明に係る新規のペプチドが予防、治療又は診断用途のために好適に利用される病理には、血液疾患、免疫系疾患、骨疾患、腫瘍及び自己免疫疾患、並びに固体器官及び細胞の移植等の移植のための治療が挙げられる。
【００３１】
上記のカテゴリーの特定の例には、以下の疾患が挙げられる：慢性リンパ球白血病（ＣＬＬ）、プラスマ細胞腫／多発性骨髄腫、Ｃａｓｔｌｅｍａｎ病（ＣＤ）、骨粗しょう症、乾癬、多発性硬化症、エリテマトーデス、糖尿病、リウマチ様関節炎、並びに慢性疾患における貧血及びるいそうが挙げられる。
【００３２】
本発明の更なる目的及び利点は下記の説明で明らかとなるであろう。
【００３３】
本発明の態様はＩＬ−６活性阻害を要する病理の発症のおそれのある被検体又はかかる病理を既に示している被検体に本発明のペプチドを医薬的に活性な量で投与することにある。
【００３４】
この活性物質に適合する任意の投与ルートが利用されうるが、特に好適なのは非経口投与であり、なぜならそれは短時間で全身作用を奏することを可能にするからである。
【００３５】
投与するペプチドの用量は患者の年令、体重及び個別の応答に従って医療処方せんを基準に依存する。
【００３６】
非経口利用のための医薬組成物は活性物質及び適当なビヒクルを含んで成る注射形態で調製できる。非経口投与のためのビヒクルは当業界において周知であり、そして例えば水、食塩水溶液及び生理学的バッファーを含んで成る。このビヒクルは溶液の安定性及び等張性を保つために少量の賦形剤を含んでよい。
【００３７】
記載の溶液の調製は通常の手段に従って実施できる。
【００３８】
実施例
実施例１：ペプチドライブラリーのスクリーニング
１６−ｍｅｒランダムペプチドライブラリーを２−ハイブリドシステム（ＴＨＳ）でスクリーニングした。酵母ＧＡＬ４活性化ドメイン（ＡＤ）コード配列をイン・フレームでかかるペプチドをコードする合成オリゴヌクレオチドのランダムライブラリーにライゲーションした。使用したベクターｐＧＡＤＧＨはＡＤＨ１プロモーター及び選択マーカーとして酵母Ｌｅｕ２遺伝子を担持するセントロマープラスミドである（図１）。このランダムペプチドライブラリーは約１０7 通りの独立クローンを含むものと推定された（材料及び方法を参照のこと）。
【００３９】
ＲＴ−ＰＣＲを、ヒトｇｐ１３０の細胞内部分を単離するためにＨｅｐＧ２細胞の中で実施した。対応のｃＤＮＡをイン・フレームでプラスミドｐＡＳ２−１内の酵母ＧＡＬ４結合ドメイン（ＢＤ）コード配列でクローニングした。これはＡＤＨ１プロモーター及び選択マーカーとして酵母ＴＲＰ１遺伝子を担持するセントロマープラスミドである。
融合タンパク質の発現はウェスタンブロッティングにより確認した（図２）。
【００４０】
我々の実験において、我々は２つのリポーター遺伝子ｌａｃＺ及びＨｉｓ３を担持する酵母株ＣＧ−１９４５を利用した（Estojak ら、1995）。
【００４１】
我々は融合タンパク質ｇｐ１３０ｉｃ−ＧＡＬ４ＢＤをコードするプラスミドで予め形質転換された受容酵母細胞の各形質転換体について６０μｇのペプチドライブラリーを使用した。ＡＤライブラリーにおいて所望の相互作用クローンを探すため、我々は約２×１０6 のクローンをスクリーニングした。
【００４２】
我々は５通りの形質転換を実施し、そしてこれらの形質転換体全ての結果を以下に表にまとめる：
【００４３】
スクリーニングした総クローン数                    １．８×１０6
形質転換効率                                          １×１０4
（細胞／ＤＮＡのμｇ）
Ｈｉｓ３選択だけで得た総クローン数                      ２５０
ｌａｃＺによる２回のスクリーニング後に
得た総クローン数                                          ２６
【００４４】
ヒスチジン栄養要件についての選択（即ち、Ｈｉｓ３リポーター遺伝子とのＴＨＳ相互作用）についての選択の後、全部で２５０のクローンが１．８×１０6 個の形質転換クローンから生存した。第二リポーター遺伝子ｌａｃ−Ｚについてのスクリーニングにより、我々は２６の陽性クローンを見つけるのに成功した（図３）。
【００４５】
実施例２：真性陽性クローンの単離
残っている偽陽性の大半を排除するため、当該ペプチドライブラリーをコードするＴＨＳ選択プラスミドを下記の条件でもとのスクリーニング株ＣＧ−１９４５へともどし形質転換した：１）追加のプラスミドなしで；２）ＧＡＬ４  ＤＮＡ結合ドメインのみをコードするプラスミドで（ｐＡＳ２−１）；３）完全「つりえさ」プラスミドで、又は４）無関係の融合タンパク質で（ＧＡＬ４−ＢＤに融合したヒトラミニン−Ｃの如き）（Bartelら、1993）。
【００４６】
真性陽性クローンは上記の第三の条件でのみ陽性シグナルを生成する。
【００４７】
上記の研究を完成させるため、我々は陽性「魚」プラスミドを均質とするまで単離し、そしてそれらをＥ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）に形質転換した。これらのＡＤ／ライブラリープラスミドをそのＬＥＵ２マーカーを用いてＥ．コリ内で選択的に増幅させ、株ＨＢ１０１のＥ．コリＬｅｕＢ突然変異を補完した。
【００４８】
これらのプラスミドを酵母株のもどし形質転換に用い、上記の通りにして偽陽性を排除した。これらの手順の後、我々は９つの陽性クローンを単離した（図４）。
【００４９】
配列分析から得られるデーターは（ｉ）スクリーニングしたクローン全てが−より多くの（ＮＮＫ）16オリゴヌクレオチドを含むにもかかわらず、第一オリゴヌクレオチド配列だけが全てのオリゴヌクレオチドの末端にあるイン−フレーム停止コドンに基づきＧＡＬ４  ＡＤ／ペプチド融合体として発現される；（ii）単離したペプチドのほとんどが予想通り１６個のアミノ酸の全長を有する；（iii ）いくつかのペプチドは既知のｇｐ１３０−ＩＣＤ相互作用タンパク質との相同性を示す；ことを示唆した。
【００５０】
ｇｐ１３０−ＩＣＤ−ペプチド相互作用を確認するため、我々はライブラリーインサートをＡＤからＤＮＡ−ＢＤベクターへと移動させることにより及びその逆を行うことによりクローニングベクターをスイッチすることもした。ついで我々はＴＨＳアッセイを繰り返した（Van Aelst ら、1993）。
【００５１】
我々は更に転写活性を定量するために液体β−ガラクトシダーゼアッセイも実施した。図５に示す通り、ｇｐ１３０−ＩＣＤ／ＧＡＬ４ＡＤの存在下で、融合タンパク質クローンＥ／ＧＡＬ４ＢＤはｇｐ１３０−ＩＣＤ／ＧＡＬ４ＡＤの非存在下でよりも約２〜３倍高くｌａｃＺ遺伝子の転写活性を供することができ、従って第一選択後に検出される相互作用が確認できた。
【００５２】
相同性
タンパク質データーベースサーチは極めて興味深いものと示され、なぜならそれは単離されたペプチドと、ｇｐ１３０の細胞質内ドメインで構成的に結合したＪＡＫ１及びＴｅｃの如きタンパク質との間での相同性を示したからである。このような相同性が小ストレッチに限られたとしても、このような結果は我々の将来の研究の案内となるのに有用でありうる（図６）。
【００５３】
我々はクローンＥを２通りの独立の形質転換で選択した：このクローンはＪＡＫ１との相同性を示した。Harpur及び共同研究者はＪＡＫキナーゼを７つのドメインに分類している。それらはＪＡＫ相同体（ＪＨ）ドメイン１〜７と命名されている（Harpurら、1992）。
【００５４】
ＪＨ１はチロシンキナーゼドメインに相当し、そしてＪＨ２は推定セリン−スレオニンキナーゼドメインに相当する。このドメインＪＨ３〜ＪＨ７は非触媒性ドメインであり、そして既知の機能はもたない。クローンＥはＪＡＫ１との相同性を有する領域をわずかにしかもたない：この相同性はＪＨ４ドメイン内にある。
【００５５】
Harpur及び共同研究者はＪＡＫ２とＧＨレセプターとの結合が非触媒ドメインＪＨ３〜ＪＨ７により媒介されるにちがいないと示唆している。これらのドメインはＪＡＫファミリーの構成員内で構造的及び機能的に保存されている。ＪＨ４はこれらのドメインの中で最も保存されている。従って、我々はデーターはペプチドＥにより規定されるＪＡＫ１のストレッチが機能的な役割を果たしうることを示唆する。それはｇｐ１３０上のＪＡＫ１結合部位を擬態しうる。また、クローンＣはＴｙｋ２との興味深い相同性を示す。この相同性はＪＨ７内にある。
【００５６】
その他のクローンはその他のキナーゼ、例えばＬＴＫＲ、又タンパク質ＡＮＫ１であって、その機能が必須の膜タンパク質の細胞骨格要素への付加を含むものとの同一性を示す。
【００５７】
考察
サイトカインシグナル生成経路の研究は、シグナルが小モジュラータンパク質ドメインと短く且つ特異的なアミノ酸配列との結合により媒介されるタンパク質−タンパク質相互作用により生ずることを示唆する。例えば、Ｓｒｃ相同体２（ＳＨ２）及びＳｒｃ相同体３（ＳＨ３）ドメインはホスホリル化チロシン残基又はプロリンリッチ領域のそれぞれと相互作用する６０〜１００の領域である。
【００５８】
従って、ＪＡＫキナーゼ又はこれらのレセプターの各々のドメインがＪＡＫキナーゼの結合のために必要であり、そしてある場合にはそれらはかかる結合の特異性を決定しうる。
【００５９】
公開データーはこのような相互作用のいくつかに関与するｇｐ１３０−ＩＣＤの正確な部位を示唆する。例えば、ｇｐ１３０のｂｏｘ１ドメインはプロリン残基に富む８個のアミノ酸のモチーフである。このドメインは、ｂｏｘ１配列がＪＡＫキナーゼとサイトカインレセプターとの相互作用のために必要な二次構造の構築において重要な役割を果たすおそれが高い場合でも、ＪＡＫキナーゼとの相互作用に直接関与するであろう（Murakamiら、1991）。タンパク質−タンパク質相互作用に関与するｇｐ１３０のその他のドメインはＳＴＡＴ３及びＳＴＡＴ１活性化に関与する共通配列ＹＸＰＱである（Gerhartzら、1996）。
【００６０】
我々はＴＨＳによりｇｐ１３０−ＩＣＤとランダムペプチドライブラリーとの結合を検討した。我々は、９つの独立のクローン／ペプチドを同定した。これらのペプチドはデーターバンクの中にあるタンパク質と相同性を示した。たとえこれらの相同性が小ストレッチに限定されようと、これらの結果は我々の将来の研究の案内のために有用でありうる。
【００６１】
これらの予備データーが確認できたら、我々はｇｐ１３０−ＩＣＤに結合するＪＡＫ１の如きキナーゼの正確な領域を同定できうる。我々のデーターは２−ハイブリドシステムペプチドスクリーニングが類似の結果を達成するための適当な技術であることも示唆する。
【００６２】
材料及び方法
ハイブリドタンパク質をコードするプラスミドの構築
全てのハイブリド構築体をＲＴ−ＰＣＲによる増幅を利用して作った。
【００６３】
ＰＣＲ反応は１０μｌのＨｅｐＧ２細胞のｃＤＮＡ，５０pmole づつの各プライマー（下記参照）、２．５ユニットのＳｔｒａｔａｇｅｎｅ  Ｐｆｕポリメラーゼ、０．２mMづつの４種のデオキシヌクレオチド三リン酸、１０μｌのＰｆｕバッファーを１００μｌの反応容量の中に含み、５０μｌの鉱油をかぶせた。
【００６４】
増幅は９４℃で４５秒、６０℃で４５秒、及び７２℃で６分の温度プロファイルを３０サイクル実施した。
【００６５】
ＰＣＲフラグメント全てを適当な制限酵素（ｈｇｐ１３０についてＥｃｏＲＩ／ＢａｍＨＩ）で３７℃で一夜かけて消化した。
【００６６】
消化したＰＣＲ生成物を低融点アガロースゲル電気泳動及びＭｉｃｒｏｃｏｎ  １００（Ａｍｉｃｏｎ）により精製した。これらのフラグメントをＲａｐｉｄ  ＤＮＡライゲーションキット（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ  Ｍａｎｎｈｅｉｍ）によりｐＡＳ２−１及びｐＧＡＤＧＨベクターの双方にライゲーションし、そしてＥ．コリＴｏｐ１０Ｆコンピテント細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）に形質転換した。
【００６７】
ＭＡＴＣＨＭＡＫＥＲランダムペプチドライブラリー（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）は、ＢａｍＨＩ及びＥｃｏＲＩ部位にはさまれ、末端停止コドンを含み、高発現性ＧＡＬ４活性化ドメイン（ＡＤ）ベクターｐＧＡＤＧＨに指向性クローニングされた合成（ＮＮＫ）16オリゴヌクレオチド（Ｎ＝Ａ，Ｇ，Ｃ又はｔ；Ｋ＝Ｔ又はＧ）から成る。ＧＡＬ４ＡＤに融合したランダム１６−コドンペプチドの混合物をこのベクターから作った。
【００６８】
【化１】
0004468578.tif 000005
【００６９】
ヒトＧＰ１３０−ＩＣＤ  ｃＤＮＡをＵｐｇｐ１３０及びＬｏｇｐ１３０を用いてＰＣＲ増幅させた。
【００７０】
ＤＮＡ配列決定
ＤＮＡ配列決定はＡＢＩモデル３７３Ａ自動シーケンサーでDNA Sequencing Kit, Dye Primer Cycle Sequencing (Perkin Elmer, Applied Biosystems Division, Foster City, CA, USA) を用い、製造者の仕様に従い、双方の鎖に対して実施した。
【００７１】
相同性探索はＧｅｎＢａｎｋ，ＥＭＢＬ及びＳｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔデーターベースに対して実施した。
【００７２】
【化２】
0004468578.tif 000006
【００７３】
ＬＢ（１Ｌ）：１０ｇのバクトトリプトン
５ｇの酵母抽出物
１０ｇのＮａＣｌ
ＬＢアガー（１Ｌ）：１０ｇのバクトトリプトン
５ｇの酵母抽出物
１０ｇのＮａＣｌ
１．５ｇのアガー
【００７４】
酵母株及び培地
アッセイ全てにサッカロマイセス・セレビジエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）株ＣＧ−１９４５（Ｍａｔ  ａ，ｕｒａ  ３−５２，ｈｉｓ  ３−２００，Ｌｙｓ  ２−８０１，ａｄｅ  ２−１０１，ｔｒｐ  １−９０１，Ｌｅｕ  ２−３，１１２，ｇａｌ  ４−５４２，ｇａｌ  ８０−５３８，ｃｙｈr ２，ＬＹＳ：：ＧＡＬ１UASs−ＧＡＬ１TATA−ＨＩＳ３，ＵＲＡ３：：ＧＡＬ４17-mer(x3)−  ＣｙＣ１TATA−ｌａｃＺ）（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ  Ｍａｔｃｈｍａｋｅｒ）を使用した。ＣＧ−１９４５は種々のプロモーターのコントロール下にある２つのリポーター遺伝子を担持する：それ自体の上流活性化配列がＧＡＬ４結合部位で置き換えられたＣＹＣ１プロモーターのコントロール下にあるｌａｃＺ遺伝子及びＧａｌＩプロモーターのコントロール下にあるＨｉｓ３遺伝子。
【００７５】
従って、これらのプロモーターはＧＡＬ４結合部位以外をわずかに共有し、そして同じ酵母細胞で両リポーター遺伝子により実施するスクリーニングは数多くの偽陽性を排除するであろう。酵母培養物を３０℃においてＹＰＤ培地（１％の酵母抽出物、２％のペプトン及び２％のグルコース）又はＳＤ最小培地（アミノ酸抜きの０．５％の酵母窒素ベース、２％のグルコース及び１％の所望のアミノ酸抜きの溶液）の中で増殖させた。
【００７６】
酵母形質転換及びβ−ガラクトシダーゼアッセイ
融合遺伝子をＣＧ−１９４５株の中に酢酸リチウム形質転換手順により導入した（１６）。我々は全ての細胞の上にＳＤ／−Ｔｒｐ−Ｌｅｕ−Ｈｉｓ＋３ＡＴ  １０mMアガー培地を第一選択の実施のためにまいた。ｇｐ１３０−ＩＣＤとペプチドとの間で相互作用が起こると、２つのＧＡＬ４機能性ドメインはつながり、ヒスチジン発現がもたらされる。相互作用ハイブリドタンパク質を有する酵母細胞はかくしてこのアミノ酸を欠如した培地の中で増殖できる。
【００７７】
酵母ＨＩＳ３タンパク質（イミダゾールグリセロールリン酸デヒドラターゼ）の競合阻害剤である３−ＡＴ（３−アミノ１，２，４−トリアゾール）をいくつかのリポーター株内で漏出発現する低レベルのＨｉｓ３ｐを阻害するのに用いた。形質転換体を通常は２〜４日間３０℃で増殖させ、コロニーがβ−ガラクトシダーゼ活性のアッセイのために十分大きくなるようにする。
【００７８】
形質転換体を選択増殖培地の上に重ねた無菌Ｗｈａｔｍａｎナンバー１フィルターの上にレプリケートさせた。コロニーを増殖させた後、我々は２回以上の凍結／融解サイクルを実施した。これはフィルターを液体窒素の中、次いで室温に０．５〜１分置くことから成る。
【００７９】
このフィルターを清浄な１００mmプレート中の５mlのＺ−バッファー／Ｘ−ｇａｌ溶液の中に入れ、そして３０℃で一般に３０分〜８時間インキュベーションした。このフィルターを乾かし、そして写真撮影してデーターを記録した。
【００８０】
マウスｐ５３タンパク質及びＳＶ４０大型Ｔ−抗原はＴＨＳと相互作用することがわかっている。
【００８１】
ＧＡＬ４  ＤＮＡ結合ドメイン−ネズミｐ５３ハイブリドをコードするプラスミドｐＶＡ３−１及びＧＡＬ４活性化ドメイン−ＳＶ４０大型Ｔ−抗原ハイブリドをコードするプラスミドｐＴＤ１−１をβ−ガラクトシダーゼアッセイにおける陽性コントロールとして用いた。
【００８２】
液体β−ガラクトシダーゼアッセイ
我々はプラスミドのために適当な液体ＳＤ選択培地の中で５ml一夜培養物を調製した。
【００８３】
我々はこの培養物２mlを８mlのＹＰＤに移し、そして細胞が中対数増殖となるまで（Ｏ．Ｄ．600 ＝０．５〜０．８）３０℃で３〜５時間インキュベーションした。
【００８４】
この培養物を１４，０００rpm で３０秒遠心分離した。次の工程において、我々は上清液を取り出し、所定容量のＺ−バッファーで細胞を洗い、そして９００mlのＺ−バッファーの中でこのペレットを再懸濁した。
【００８５】
その直後に２回以上の凍結／融解サイクルを実施し、それはチューブを液体窒素、次いで３７℃の湯浴の中に０．５〜１分入れておくことから成る。最後に、我々は０．７mlのβ−メルカプトエタノール−Ｚバッファー溶液及びＺバッファーの中に４mg／mlで溶解させたＯＮＰＧ（ｏ−ニトロフェニルβ−ガラクトピラノシド、Ｓｉｇｍａ）１６０μｌを各チューブに加えた。これらのチューブを３０℃でインキュベーションし、黄色を発色させた。
【００８６】
反応は０．４mlの１ＭのＮａ2 ＣＯ3 の添加により停止させた。我々は結果を得るのにかかる時間及びサンプルのＯ．Ｄ．420 を記録した。
【００８７】
β−ガラクトシダーゼ単位は次式により計算した：
β−ガラクトシダーゼ単位＝１，０００×Ｏ．Ｄ．420 ／（ｔ×Ｖ×Ｏ．Ｄ．600 ）
ここで、ｔ＝インキュベーションの経過分；Ｖ＝０．１mL；Ｏ．Ｄ．600 ＝１mlの培養物のＡ600 。
【００８８】
酵母タンパク質抽出物及びウェスタンブロッティング
各形質転換酵母株について、我々は我々のプラスミドのために適当なＳＤ選択培地中の５mlの一夜培養物を調製した。我々は陰性コントロールとしての未形質転換ＣＧ−１９４５の１０mlの培養物も調製した。アッセイすべき各クローン（及び陰性コントロール）について、各々５０mlの適当な培地において一夜培養物に移し入れた。
【００８９】
我々はこの培養物をＯ．Ｄ．600 が０．４〜０．６に達するまで３０℃で振盪させながらインキュベーションした。この培養物を予備冷却した１００mlの遠沈管に注ぎ入れることにより急冷し、そして直ちに１，０００×ｇで５分、４℃で遠心分離した。我々は上清液を捨て、そして細胞ペレットを５０mlの氷冷水に再懸濁した。我々は細胞ペレットをクラッキングバッファー（尿素  ８Ｍ，ＳＤＳ  ５％，Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ  ４０mM，ＥＤＴＡ  ０．１mM、ブロモフェノールブルー、プロテアーゼインヒビター溶液）で再懸濁した。我々は８０mlのガラスビーズ（４２５−６００μｍ，ＳＩＧＭＡ）を加えた。これらのサンプルを７０℃で１０分加熱し、そして１分間ボルテックスにかけた。ペレット塊及びこわれていない細胞をマイクロ遠心器で１４，０００rpm にて５分間遠心した。その上清液を新しい１．５mlのスクリューキャップに移し、そして軽く煮沸した。サンプルを直ちにゲルに載せるか、又は−７０℃で保存した。
【００９０】
我々は１５％のアクリルアミドゲルい載せた形質転換体からの可溶性タンパク質抽出物を用いてウェスタンブロッティングを実施した。我々はこれらのブロットをＧＡＬ４ドメイン特異的モノクローナル抗体、例えばＣｌｏｎｔｅｃｈ由来のＧＡＬ４  ＢＤ及びＡＤｍＡｂでブロッティングした。我々は二次抗体ＨＲＰ接合ヤギ抗マウスＩｇＧ（ＢＩＯＲＡＤ）を検出のために用いた。
【００９１】
【表４】
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【００９２】
【表５】
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【００９３】
【表６】
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【００９４】
【表７】
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【００９５】
【表８】
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【００９６】
【表９】
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【００９７】
【表１０】
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【００９８】
【表１１】
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【００９９】
【表１２】
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【図面の簡単な説明】
【図１】  ｇｐ１３０結合ペプチドのスクリーニングに利用するためのベクター。このプラスミドｐＡＳｇｐ１３０はｇｐ１３０−ＩＣＤに融合されたＧＡＬ４
ＤＮＡ結合ドメイン（残基１〜１４７ａ．ａ．）をコードする；プラスミドｐＧＡＤＧＨはＧＡＬ４活性化ドメイン（残基７６８−８８１ａ．ａ．）に融合したランダム１６−ｍｅｒペプチド（ＮＮＫ）16のライブラリーをコードする。
【図２】  酵母抽出物のウェスタンブロッティング。ＣＧ−１９４５（レーン１及び２）はＧＡＬ４ＢＤをコードするｐＡＳ２−１（レーン３）又はｇｐ１３０−ＧＡＬ４ＢＤをコードするｐＡＳｇｐ１３０（レーン４）で形質転換した。タンパク質抽出物を１５％のアクリルアミド−ＳＤＳゲルで分離し、そしてケミルミネッセンス検出システムにより分析した。分子量を表示してある（キロダルトン）。黒矢印はｇｐ１３０−ＧＡＬ４ＢＤを示す；灰矢印はＧＡＬ４ＢＤを示す。
【図３】  ペプチドライブラリー形質転換。酵母株ＣＧ−１９４５は６０μｇのライブラリープラスミドで形質転換した。細胞をＳＤ／−Ｔｒｐ／−Ｌｅｕ／−Ｈｉｓ／＋１０mMの３−ＡＴアガー培地上で３０℃で増殖させた。４日後、いくつかのＨｉｓ+ コロニーがプレート上に出現した。第一形質転換において、我々は２０のＨｉｓ+ クローンを単離した。図の中で番号付けしたそのうちの９つだけがｌａｃＺ+ でもった。
【図４】  ペプチド。ＴＨＳにより単離されたペプチドのこれらは５つのホモロジーグループにまとめた。
【図５】  液体アッセイにおけるβ−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）活性。酵母細胞内でのクローンＥ及びｇｐ１３０−ＩＣＤの組合せは約３０ユニット／mlのＬａｃＺ活性を供した。この値は３通りの独立の実験から得た。
【図６】  関連ホモロジー。ペプチドＥ（Ｅ1 ）及びＣといくつかのｇｐ１３０結合チロシンキナーゼとの配列アラインメント。同一性はイタリック文字で示す。塩基性アミノ酸は（* ）で示す。酸性アミノ酸には下線を付した。
【配列表】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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