(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現し、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現する、水疱性口内炎ウイルス感染した腫瘍細胞の表面上で水疱性口内炎ウイルス抗原を有するＭＨＣクラスＩ分子の発現をＩＦＮ−γ非処理下に増強する方法であって、適切なプロモーターの制御下でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子を該腫瘍細胞に導入し、ついで適切な条件下で該腫瘍細胞中でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２を発現させ、それによって水疱性口内炎ウイルス抗原を有するＭＨＣクラスＩ分子のプロセッシングおよび提示を増強し、宿主中での該水疱性口内炎ウイルス抗原の高められた免疫監視を可能にすることを特徴とする方法。
【請求項２】
該腫瘍細胞がさらにプロテアソーム成分が不足している請求項１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
発明の技術分野
本発明は概して、標的細胞の表面で内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子の発現を増強する方法および内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子の発現レベルが低いまたは検出できない腫瘍細胞への哺乳類の免疫応答を増大させる方法に関する。さらに、本発明は治療学的に腫瘍に対して活性である腫瘍特異的Ｔ細胞を調製する方法に関する。
発明の背景
細胞障害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）応答は免疫系の主要な要素であり、感染した細胞または悪性の細胞およびその表面に在外抗原を発現する侵入生物体の免疫監視および破壊において活性である。抗原特異的Ｔ細胞レセプターのリガンドは主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子に結合した外来抗原のペプチド断片からなる複合体である。特に細胞障害性Ｔリンパ球はＭＨＣクラスＩ分子に結合したペプチドを認識する。
ＭＨＣクラスＩ分子は通常細胞の表面に、４６kＤの重鎖、１２Ｋdのβ2−ミクログロブリン（β2ｍ）と呼ばれる軽鎖および８−１０アミノ酸からなるペプチドにより形成された３者からなる複合体として発現される（ヴァン ブリーク（van Ｂleek, Ｇ.Ｍ.）およびナゼンソン（Ｓ.Ｇ.Ｎathenson）、Ｎature ３４８：２１３、１９９０；ザン（Ｚhang, Ｗ.）ら、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ ８９：８４０３、１９９２；マツムラ（Ｍatsumura, Ｍ.）ら、Ｓcience ２５７：９２７、１９９２；およびラトロン（Ｌatoron, Ｆ.）ら、Ｓcience ２５７：９６４、１９９２）。３者からなる複合体の形成は細胞質内でのタンパク質分解によって産生されるペプチドの小胞体（ＥＲ）の管腔中への輸送に関与すると考えられている（ナッハターン（Ｎuchtern, Ｊ.Ｇ.）ら、Ｎature ３３９：２２３、１９８９；イェウデル（Ｙewdell, Ｊ.Ｗ.）およびベニンク（Ｊ. Ｒ. Ｂennink）、Ｓcience ２４４：１０７２、１９８９；およびコックス（Ｃox, Ｊ.Ｈ.）ら、Ｓcience ２４７：７１５、１９９０）。細胞表面でのＭＨＣクラスＩ分子の発現の低さについて選択された突然変異細胞株の研究は、抗原プロセッシングに必要な分子事象への洞察を提供する。これらの研究はＡＴＰ結合カセット（ＡＢＣ）ファミリーのタンパク質をコードするＭＨＣ領域に位置する２つの遺伝子の同定を可能にした。ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２と呼ばれるこれらの遺伝子は、細胞質からＥＲの管腔中へのペプチド輸送と関係がある（デバーソン（Ｄeverson, Ｅ.Ｖ.）ら、Ｎature ３４８：７３８、１９９０；トロウスデール（Ｔrowsdale, Ｊ.）ら、Ｎature ３４８：７４１、１９９０；スピース（Ｓpies, Ｔ.）ら、Ｎature ３４８：７４４、１９９０；モナコ（Ｍonaco, Ｊ.Ｊ.）ら、Ｓcience ２５０：１７２３、１９９０；スピースおよびデマルス（Ｒ.ＤeＭars）、Ｎature ３５１：３２３、１９９１；バーラム（Ｂahram, Ｓ.）ら、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ ８８：１００９４、１９９１；スピースら、Ｎature ３５５：６４４、１９９２；ケリー（Ｋelly, Ａ.）ら、Ｎature ３５５：６４１、１９９２；ポウィス（Ｐowis, Ｓ.Ｈ.）ら、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ ８９：１４６３、１９９２；およびコロンナ（Ｃolonna, Ｍ.）ら、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ ８９：３９３２、１９９２）。他の２つのＭＨＣ結合遺伝子、ＬＭＰ−２および−７（モナコおよびマックデビット（ＭcＤevitt）、１９８２、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ ７９：３００１）はプロテアソーム（細胞質性触媒複数性プロテアーゼ複合体（a cytoplasmic multicatalytic protease complex））の成分であり、該プロテアソームは抗原プロセッシングのためのタンパク質分解のいくつかの面に関与しているようである（オリッツ−ナバレッテ（Ｏritiz-Ｎavarette, Ｖ.）ら、Ｎature ３５３：６６２、１９９１；ブラウン（Ｂrown, Ｍ.Ｇ.）ら、Ｎature ３５３：３５５、１９９１；グリン（Ｇlynne, Ｒ.）ら、Ｎature ３５３：３５７、１９９１；マルチネ（Ｍartinez, Ｃ.Ｋ.）およびモナコ、Ｎature ３５３：６６４、１９９１；ケリーら、Ｎature ３５３：６６７、１９９１；ヤン（Ｙang, Ｙ.）ら、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ ８９：４９２８、１９９２；ゴールドバーグ（Ｇoldberg, Ａ. Ｌ.）およびロック（Ｋ. Ｌ. Ｒock）、Ｎature ３５７：３７５、１９９２）。
マウス突然変異リンパ腫細胞株ＲＭＡ−Ｓは、野生型ＲＭＡ細胞に比較して細胞表面でクラスＩ分子の発現レベルが低い（リュングレン（Ｌjunggren, Ｈ.−Ｇ.）ら、Ｊ. Ｉmmunol. １４２：２９１１、１９８９；およびタウンゼンド（Ｔownsend, Ａ.）ら、Ｎature ３４０：４４３、１９８９）。インフルエンザウイルス感染ＲＭＡ−Ｓ細胞はＤb分子の文脈中で非効率的にインフルエンザペプチドを提示し、特異的なＣＴＬによって弱くしか認識されない（タウンゼンドら、Ｎature ３４０：４４３、１９８９）。推定トランスポーター遺伝子ＴＡＰ−２でのトランスフェクションはこの欠乏を補う（ポウィスら、Ｎature ３５４：５２８、１９９１；およびアッタヤ（Ａttaya, Ｍ.）ら、Ｎature ３５５：６４７、１９９２）。ＲＭＡ−Ｓ細胞の内在性ＴＡＰ−２遺伝子は不完全および欠陥ＴＡＰ−２タンパク質となる翻訳終止コドンを導く点突然変異を含むことが示された（ヤンら、Ｊ. Ｂiol. Ｃhem. ２６７：１１６６９、１９９２）。ＲＭＡ−Ｓ細胞中の欠陥ＴＡＰ−２タンパク質にもかかわらず、水疱性口内炎ウイルス（ＶＳＶ）からの抗原ペプチドは該欠陥を無視し、ＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＫb分子によって特異的ＣＴＬに提示される（エスクイベル（Ｅsquivel, Ｆ.）ら、Ｊ. Ｅxp. Ｍed. １７５：１６３、１９９２；およびホスケン（Ｈosken, Ｎ.Ａ.）およびベバン（Ｍ. Ｊ. Ｂevan）、Ｊ. Ｅxp. Ｍed. １７５：７１９、１９９２）。ＶＳＶ−ヌクレオカプシド（Ｎ）ペプチド、ＶＳＶ−Ｎ ５２−５９はＶＳＶ感染細胞上にＫb分子によって提示される主要なペプチドであることが示されている（ヴァン ブリークおよびナゼンソン、Ｎature ３４８：２１３、１９９０）。ＲＭＡ−Ｓ細胞における野生型ＴＡＰ−１タンパク質の存在はＥＲ管腔中へのＶＳＶ−Ｎ ５２−５９ペプチドの輸送に十分であるかもしれない（ポウィスら、Ｎature ３５４：５２８、１９９１；アッタヤら、Ｎature ３５５：６４７、１９９２；およびヤンら、Ｊ. Ｂiol. Ｃhem. ２６７：１１６６９、１９９２）。それとも、ＶＳＶ−Ｎ ５２−５９ペプチドはＥＲの管腔中への輸送のための機能的なトランスポーターを必要としないかもしれない。Ｔ２細胞中の微小遺伝子（minigene）−コードウイルスペプチドエピトープの発現（ツウィリンク（Ｚweerink, Ｈ. Ｊ.））ら、Ｊ. Ｉmmunol. １５０：１７６３、１９９３）およびＴ２細胞からのミクロソームを使用したイン・ビトロ翻訳および輸送（レビー
0004418965.tif 000002
ら、Ｃell ６７：２６５、１９９１）はこの主張を支持する。
抗原プロセッシング変異体の別個のクラスはＭＨＣクラスＩ分子の集合および表面発現がＩＦＮ−γによって完全に誘発できるものである（クラー（Ｋlar, Ｄ.）およびヘンマリング
0004418965.tif 000003
ＥＭＢＯ Ｊ. ８：４７５、１９８９）。例えば、小肺癌細胞株、ＣＭＴ. ６４においてインフルエンザウイルス特異的ＣＴＬによる認識はＩＦＮ−γで誘発しない限り起こらない（シビル（Ｓibille, Ｃ.）ら、Ｅur. Ｊ. Ｉmmunol. ２２：４３３、１９９２）。誘発していないＣＭＴ. ６４細胞にすべてのプロテアソーム成分が非常に低量で存在することは、その表現型を決定していると推定される（オリッツ−ナバレッテら、Ｎature ３５３：６６２、１９９１）。外在性インフルエンザペプチドはＣＭＴ. ６４細胞上のＤb分子に結合でき、インフルエンザ特異的ＣＴＬによる認識を補足できる（シビルら、Ｅur. Ｊ. Ｉmmunol. ２２：４３３、１９９２）。さらに、β2ｍおよびＶＳＶ−Ｎ ５２−５９ペプチドは、これらの細胞に対して外在的に加えたときにＫbに限られたＶＳＶ特異的ＣＴＬによる認識を補足することがわかった（ジェファリーズ（Ｊefferies, Ｗ. Ａ.）ら、１９９３、Ｊ. Ｉmmunol. １５１：２９７４）。これらの細胞内で合成されたβ2ｍおよび重鎖の量は細胞表面のＭＨＣクラスＩ発現の量を制限する（ジェファリーズ、上記、１９９３）。推定ペプチドトランスポーターの機能障害および／またはペプチド産生における機能障害は、多くの癌に共通の特徴であるＭＨＣクラスＩ発現をダウンレギュレートする機構を示すＣＭＴ. ６４表現型をもたらす。
レスティホ（Ｒestifo, Ｎ.Ｒ.）ら（Ｊ. Ｅxp. Ｍed. １７７：２６５−２７２、１９９３）は、Ｋd分子を一過性に発現する組換えワクシニアウイルス（Ｖac）を用いて２６の異なるヒト腫瘍細胞株の抗原プロセッシング効率を研究した。３つの細胞株（すべてヒト小細胞性肺癌）は一貫して、Ｋd−限定、Ｖac−特異的Ｔ細胞への提示のための内在的に合成されたタンパク質をプロセッシングできなかった。パルスチェイス実験はＭＨＣクラスＩ分子は小胞体（ＥＲ）から細胞の表面まで細胞株によって輸送されないことを示した。該細胞のノーザンブロット分析はＭＨＣ−コードプロテアソーム成分ＬＭＰ−７およびＬＭＰ−２ならびに推定ペプチドトランスポーターＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２のｍＲＮＡｓのレベルが低いか検出できないことを明らかにした。
発明の概要
本発明者らはＣＭＴ. ６４細胞における複数抗原プロセッシング欠陥（multiple antigen processing deficiencies）にもかかわらず、該細胞にトランスフェクションしたＴＡＰ−１は、単独でもＩＦＮ−γ誘発の不在下でＶＳＶ感染細胞のＣＴＬ認識を誘発するのに十分であるという驚くべきことを見い出した。重要なことに、該トランスフェクションした細胞はＴＡＰ−２の発現について陰性のままであるので、ＴＡＰ−１はペプチド輸送においてＴＡＰ−２と独立して機能することが示された。ＴＡＰ−１単独で特定のペプチドをＭＨＣ集合体の部位に送達し、その結果、細胞表面に輸送および発現されるため安定な複合体を形成でき、細胞障害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）による免疫監視が可能となることも証明された。
さらに、いくつかのペプチドはＴＡＰ−２単独によりＥＲに輸送されることも証明された。例えば、ＴＡＰ−１の不在下でＴＡＰ−２は単独でインフルエンザＮＰ３６６−３７４ペプチドのプロセッシングおよび提示を増強するのに十分であることが示された。
本発明は、重要なことに、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞の高い負荷を注入されたマウスが、野生型ＣＭＴ. ６４細胞を注入したマウスに比較して生存率を増加させ、および病理および転移を有意に減少させたことを示した。
ゆえに、本発明は、ＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現し、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現する標的細胞の表面での内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子の発現を増強する方法であって、適切なプロモーターの制御下でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子を該標的細胞に導入し、ついで適切な条件下で該標的細胞中でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２を発現することにより内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子のプロセッシングおよび提示を増強することを特徴とする方法である。好ましくは、該標的細胞はさらにプロテアソーム成分が不足している腫瘍細胞であり、より好ましくは小肺細胞性癌細胞である。一態様において、モチーフＲＧＹＶＹＱＧＬ（Ｋbに限定されている）を有する内在性ペプチドのプロセッシングおよび提示はＴＡＰ−１をコードする核酸分子の導入によって増強される。第二態様において、モチーフＡＳＮＥＮＭＥＴＭ（Ｈ−２Ｄbに結合する）を有する内在性ペプチドのプロセッシングおよび提示はＴＡＰ−２をコードする核酸分子を導入することによって増強される。
本方法の一態様において、ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子および抗原ペプチドをコードする配列を含む第二の核酸分子、好ましくはＴ−細胞レセプター相互作用抗原を適切なプロモーターの制御下で該標的細胞に導入する。
本発明はまた、ＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現しＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現する腫瘍細胞内で内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子の細胞表面の発現を増強するための、ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードするヌクレオチド配列および抗原ペプチドベクターをコードするヌクレオチド配列を含む組換えウイルスベクターの使用にも関する。
本発明はさらに、内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現する腫瘍細胞に対する哺乳類の免疫応答を増強する方法であって、適切なプロモーターの制御下で該腫瘍細胞にＴＡＰ−１および／またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子を導入し、ついで適切な条件下で該腫瘍細胞中でＴＡＰ−１および／またはＴＡＰ−２を発現させ、それによって内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子のプロセッシングおよび提示を増強し、哺乳類の免疫応答による認識、特に細胞溶解Ｔ細胞による認識を可能にする方法を提供する。
該方法の一態様において、該核酸分子をワクシニアウイルス中にて腫瘍細胞に導入する。好ましい態様は、別の核酸分子を該腫瘍細胞に導入し、その際、該別の核酸分子は適切なプロモーターの制御下で抗原ペプチドをコードする配列を含み、ついで適切な条件下で該腫瘍細胞中で該抗原ペプチドを発現し、それによって該抗原ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子のプロセッシングおよび提示を増強し、哺乳類の免疫応答、最も好ましくは、細胞溶解性Ｔリンパ球応答による認識を可能にすることを含む。特に、一態様において、該ウイルスは抗原ペプチドへの免疫応答を増強するためのワクチンとして使用されてよい。
本発明はさらに、被験体から腫瘍細胞を採り、適切なプロモーターの制御下でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする核酸分子を該腫瘍細胞に導入し、該腫瘍細胞を被験体または該被験体の再構築された免疫系を有する哺乳類に移植し、ついで腫瘍特異的Ｔ細胞を回収することを特徴とする、抗腫瘍特性を有する腫瘍特異的Ｔ細胞を調製する方法にも関する。該腫瘍特異的Ｔ細胞は該被験体にイン・ビボで治療剤として使用されてよい。
本発明のこれらおよび他の面は以下の詳細な記載および添付の図面を参照することにより明らかとなるであろう。さらに、本明細書において多様な刊行物（その全体を参照のため本明細書に包含されている）が参照されている。
【図面の簡単な説明】
図１Ａは、ＶＳＶ感染ＲＭＡおよびＲＭＡ−ＳのＩＦＮ−γ誘発（＋）または誘発していない細胞ＣＭＴ. ６４細胞（略語：Ｃ）のＣＴＬ認識を示すヒストグラムを示す。
図１Ｂは、ＶＳＶ感染ＣＭＴ. ６４細胞（略語：Ｃ）のＩＦＮ−γ誘発（＋）または誘発していない細胞のＣＴＬ認識を示すヒストグラムを示す。
図２は、ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４のＩＦＮ−γ誘発（＋）または誘発していない（−）細胞において合成されたβ2ｍの量を示すオートラジオグラムである。
図３は、ワクシニアおよびワクシニア−β2ｍ組換え体（Ｖ−Ｖｂ２）、ワクシニアおよびＶＳＶ（Ｖ−ＶＳＶ）、またはワクシニア−β2ｍおよびＶＳＶ（Ｖｂ２−ＶＳＶ）、でスーパーインフェクションした（superinfectioned）ＣＭＴ. ６４細胞に対するＣＴＬ応答へのβ2ｍの効果を示すヒストグラムであり、該インサートは抗−ｈβ2ｍウサギ血清で免疫沈降した後合成されたβ2ｍのレベルを示す。
図４は、ＭＨＣクラスＩ分子、ＤbおよびＫbの細胞内輸送を示すオートラジオグラムを示す。
図５は、誘発していないおよびＩＦＮ−γ−誘発したＣＭＴ. ６４細胞におけるＫb分子の遊離および集合形態の細胞内輸送を示すオートラジオグラムを示す。
図６は、ＣＭＴ. ６４細胞（ＣＭＴ）、ＣＭＴ. ６４＋ＩＦＮ−γ（ＣＭＴ＋ＴＦＮ−γ）およびＲＭＡ−Ｓ細胞（ＲＭＡ−Ｓ）に関するＣＴＬ認識におけるＶＳＶ−Ｎ ５２−５９ペプチドの用量応答を示すヒストグラムである。
図７は、ＲＭＡ、ＲＭＡ−Ｓ、ＣＭＴ. ６４ ＩＦＮ−γ誘発および誘発していない細胞からの細胞質ＲＮＡのノーザンブロット分析を示す。
図８は、ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４ ＩＦＮ−γ誘発または誘発していない細胞からのプロテアソーム成分の二次元ゲル分析を示す。
図９は、ＶＳＶありまたはなしで８時間、ＭＯＩが５で感染させた、またはＮ ５２−５９ペプチドを２時間、５００Ｐｍで（５０％投与応答）処理したＣＭＴ  ６４（ＣＭＴ）、およびＴＡＰ−１でトランスフェクションしたＣＭＴ  ６４（ＣＭＴ ＴＡＰ １）を示す。
図１０は、ＣＭＴ. ６４およびＣＭＴ６４／ｒ１−４のＴＡＰ遺伝子発現プロフィルを示す。
図１１は、ＴＡＰ−１発現がＣＭＴ. ６４細胞の細胞表面でＫbおよびＤbのレベルを増加させるのに十分であることを示すフローサイトメトリー分析を示す。
図１２は、ＣＭＴ. ６４およびＴＡＰ−１でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞（ＣＭＴ６４／ｒ１−４）からのＫbおよびＤb分子のパルスチェイス分析を示す。
図１３は、ＴＡＰ−１でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞（ＣＭＴ−ｒ１. ４）が効果的にＶＳＶ特異的ＣＴＬに抗原を提示することを示すヒストグラムである。
図１４は、ＴＡＰ−１でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞が効果的にＶＳＶ特異的ＣＴＬに抗原を提示することを示すヒストグラムである。
図１５は、ＴＡＰ−１でトランスフェクションしたクローンが効果的にＶＳＶ特異的ＣＴＬに抗原を提示することを示すヒストグラムである。
図１６は、ＩＦＮ−γで処理したＲＭＡ細胞およびＣＭＴ. ６４細胞がインフルエンザ感染後に効果的に認識されることおよびラットＴＡＰ−１遺伝子でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞が認識されないことを示すヒストグラムである。
図１７は、ＩＦＮ−γで処理したＲＭＡ細胞およびＣＭＴ. ６４細胞がインフルエンザ感染後に効果的に認識されることおよびラットＴＡＰ−１遺伝子でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞が認識されないことを示すヒストグラムである。
図１８は、ＩＦＮ−γで処理したＲＭＡ細胞およびＣＭＴ. ６４細胞、両方のラットＴＡＰ遺伝子でトランスフェクションしたＣＭＴ. ６４細胞がインフルエンザウイルス感染後に認識されることを示すヒストグラムである。
図１９は、ＨＳＶ感染細胞がラットＴＡＰ−１および／またはＴＡＰ−２トランスポーター遺伝子の発現と独立して特異的ＣＴＬによって認識されることを示すヒストグラムである。
図２０は、５×１０5のＣＭＴ. ６４またはＣＭＴ. １２. １２細胞を注入したＣ５７Ｂｌ／６およびＢａｌｂ／Ｃマウスの生存を示すグラフである。
発明の詳細な説明
本明細書に前記したように、本発明者らは驚くべきことに、ＴＡＰ−２の不在下でＴＡＰ−１単独でＶＳＶペプチドのプロセッシングおよびＭＨＣ集合体の細胞内部位への提示を増強するのに十分であり、安定なＭＨＣクラスＩ分子−内在性ペプチド複合体が形成され、輸送され、ついで細胞表面で発現されるのを可能にすることを示した。本発明者らはまた、ＴＡＰ−１の不在下でＴＡＰ−２単独でインフルエンザＮＰ３６６−３７４ペプチドのプロセッシングおよび提示を増強するのに十分であることも示した。
従って、本発明は、ＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現し、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現する標的細胞の表面での内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子の発現を増強する方法であって、適切なプロモーターの制御下でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子を該標的細胞に導入し、ついで適切な条件下で該標的細胞中でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２を発現することにより内在性ペプチドを有するＭＨＣクラスＩ分子のプロセッシングおよび提示を増強することを特徴とする方法を提供する。
ＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現しＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現する標的細胞は当該技術分野において公知の方法によって選択されてよい。例えば、標的細胞をＶＳＶなどの組換え体ウイルスベクターで感染させ、ついでＶＳＶ特異的細胞障害性Ｔ細胞による溶解に関して試験すればよい。ＦＡＣＳ分析もまた、推定標的細胞の表面でＭＨＣクラスＩ分子を検出するのに使用されてよい。ＭＨＣクラスＩ分子の生合成および細胞内輸送はまた、生化学的に特徴付けられる。例えば、ＥＲおよびシス−ゴルジ（Ｃis−Ｇolgi）複合体に存在するタンパク質に特徴的である高マンノース形態にある場合にのみＮ−結合したオリゴ糖を開裂させるendo Ｈを細胞内輸送を測定するのに使用してよい。パルスチェイス法もまた、ＭＨＣクラスＩ分子の発現レベルが低い標的細胞を確認するために利用されてよい。上記の方法は本明細書の実施例に示す。レスティホら、上記、１９９３も参照。
ＭＨＣクラスＩ分子の発現レベルが低い細胞の例は、結腸癌、乳癌、肺中皮腫癌および肺癌の小細胞組織由来の腫瘍細胞である（レスティホ、上記、１９９３参照）。
ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現する細胞は、例えば本明細書の実施例に記載されるようなノーザンブロット分析を使用して、これらのタンパク質をコードするｍＲＮＡをアッセイして検出してよい。ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の発現レベルが低い細胞の例は肺癌の小細胞組織由来の腫瘍細胞である。
標的細胞はＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスポータータンパク質の低いまたは検出できないレベルを発現するのに加えて、例えば、ＬＭＰ−７およびＬＭＰ−２などのプロテアソームの１つまたはそれ以上の成分の低いまたは検出できないレベルを発現してよい。
本発明の方法を使用してその発現が増強されてよい内在性ペプチドの例には、細胞障害性Ｔ細胞と相互作用し、該細胞を活性化させる抗原、例えばＶＳＶ  Ｎ５２−５９ペプチド、インフルエンザＮＰ  ３６６−３７４などのウイルス抗原および腫瘍関連抗原を含む。本明細書に記載されている実験は、モチーフＡＳＮＥＮＭＥＴＭを有しＤbに結合する内在性ペプチドはＴＡＰ−２によって輸送され、モチーフＲＧＹＶＹＱＧＬを有しＫbに結合する内在性ペプチドはＴＡＰ−１によって輸送されることを示唆している。それゆえ、前者の内在性ペプチドの発現を増強することはＴＡＰ−２をコードする配列を有する核酸分子を使用して本明細書に記載された方法に従って達成され、後者の発現を増強することはＴＡＰ−１をコードする配列を有する核酸分子を使用して達成される。
適切なプロモーターの制御下でＴＡＰ−１をコードする配列を含む核酸分子は当該技術分野において公知の技術を使用して容易に合成されてよい。ＴＡＰ−１をコードする配列はトロウスデールら、Ｎature ３４８：７４１、１９９０および１９９２年３月１９日に公開された国際出願番号 ＰＣＴ／ＵＳ９１／０６１０５号に開示されたアミノ酸配列を有するタンパク質をコードする配列を含む。ＴＡＰ−１をコードする配列を含む核酸分子は、例えばＲＮＡからＴＡＰ−１に特異的なオリゴヌクレオチドを使用したｃＤＮＡ末端の迅速な増幅を使用してｃＤＮＡｓを合成し、（ＲＡＣＥ、フローマン（Ｆrohman）ら、１９８８））、ついで増幅後に得た該クローンの配列を分析することによって単離およびシークエンシングされてよい。ＴＡＰ−１特異的なオリゴヌクレオチドは、本発明の核酸分子の核酸配列と公知のＴＡＰ−１の配列とを比較することによって同定されてよい。ＴＡＰ−１をコードする本発明の方法において使用される核酸分子は当該技術分野において公知の方法を使用して化学的合成および酵素的ライゲーション反応によって構築されてもよい。ＴＡＰ−１をコードする配列はまた、組換えＤＮＡ方法を使用して調製されてもよい。
本明細書において想定される方法のいくつかは、ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２の切断された機能的ではない形態をコードする配列を含む核酸分子を使用する。ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の切断された機能的ではない形態は、ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２遺伝子の一部を欠失させて断片を産生することによって同定されてよい。このような断片はストリンジェントハイブリダイゼーション条件下でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２にハイブリダイズするはずである。ストリンジェントハイブリダイゼーション条件とは特異性を与えるのに十分な厳格であって、ミスマッチの数を減少させ、しかもなお許容可能な速度で安定なハイブリッドの形成を可能にするのに十分適応性があるものをいう。このような条件は当業者には公知であり、例えばサンブルック（Ｓambrook）ら、（１９８９、モレキュラー・クローニング（Ｍolecular Ｃloning）、ア・ラボラトリー・マニュアル（Ａ Ｌaboratory Ｍanual）、コールド・スプリング・ハーバー（Ｃold Ｓpring Ｈarbor））に記載されている。ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の切断された形態が内在性ペプチドを輸送する能力は本明細書に記載される方法を使用して決定されてよい。
ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を有する核酸分子は、該タンパク質またはその一部の十分な発現を確実にする適切な発現ベクターに公知の方法で組込まれてよい。発現ベクターとなり得るものには、以下に限られるものではないが、コスミド、プラスミドまたは修飾したウイルスが挙げられる（使用された標的細胞と該ベクターが適合する限り）。
本明細書に記載された核酸分子は、挿入された配列の転写および翻訳に必要な要素を含むことが想定される。適切な転写および翻訳要素は細菌、真菌、ウイルス、哺乳類または昆虫の遺伝子を含む多様な源より得られてよい。適当な転写および翻訳要素の選択は以下で議論されるように選択される標的細胞に依存しており、当業者によって容易に達成されてよい。このような要素の例には以下が含まれる：転写プロモーターおよびエンハンサーまたはＲＮＡポリメラーゼ結合配列、リボソーム結合配列（翻訳開始シグナルを含む）。さらに、選択した宿主細胞および使用されたベクターに依存して、複製起点などの他の遺伝子要素、別のＤＮＡ制限部位、エンハンサー、および転写を誘発することができる能力を与える配列は発現ベクターに包含されてよい。必要な転写および翻訳要素は、天然に存在するＴＡＰ−１遺伝子、ＴＡＰ−２遺伝子および／またはそのフランキング領域によって供給されてよいことも認識されるであろう。
該核酸分子はまた、形質転換したまたはトランスフェクションした宿主細胞の選択を容易にするリポーター遺伝子を含んでいてよい。リポーター遺伝子の例はβ−ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、ホタルルシフェラーゼなどのタンパク質または免疫グロブリン、好ましくはＩｇＧのＦｃ部位などの免疫グロブリンまたはその一部をコードする遺伝子である。好ましい態様において、該リポーター遺伝子はlac Ｚである。リポーター遺伝子の転写はβ−ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼまたはホタルルシフェラーゼなどのリポータータンパク質の濃度の変化によってモニターされる。これはＴＡＰ−１の発現を可視化およびアッセイすることを可能にする。
ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子は形質転換、トランスフェクション、感染、エレクトロポレーションなどを介して標的細胞に導入されることができる。外来ＤＮＡを発現させるよう宿主細胞を形質転換、トランスフェクション等させる方法は当該技術分野においてよく知られている（例えば、イタクラ（Ｉtakura）ら、米国特許第４,７０４,３６２号；ヒンネン（Ｈinnen）ら、ＰＮＡＳ ＵＳＡ ７５：１９２９−１９３３、１９７８；ムレイ（Ｍurray）ら、米国特許第４,８０１,５４２号；アップシャル（Ｕpshall）ら、米国特許第４,９３５,３４９号；ハーゲン（Ｈagen）ら、米国特許第４,７８４,９５０号；アクセル（Ａxel）ら、米国特許第４,３９９,２１６号；ゲッデル（Ｇoeddel）ら、米国特許第４,７６６,０７５号；およびサンブルックら、モレキュラー・クローニング・ア・ラボラトリー・マニュアル、第２版、コールドスプリング・ハーバー・ラボラトリー・プレス、１９８９を参照、全ては参照のため本明細書に引用する）。
哺乳動物細胞中に発現させるのに適した発現ベクターは、一般的にプロモーターならびに他の転写および翻訳制御配列を含む。通常のプロモーターにはＳＶ４０、ＭＭＴＶ、メタロチオネイン−１、アデノウイルス Ｅla、ＣＭＶ、即初期、免疫グロブリン重鎖プロモーターおよびエンハンサー、およびＲＳＶ−ＬＴＲを含む。哺乳動物細胞のトランスフェクションのプロトコールは当業者によく知られている。
好ましい態様において、該核酸分子はウイルスベクター、好ましくはワクシニアウイルスベクター、最も好ましくは減毒したワクシニアウイルスベクター中にて標的細胞に導入される。ワクシニアウイルスに使用するのに適切なプロモーターにはＰ７.５（コクラン（Ｃochran, Ｍ. Ａ.）ら、１９８５、Ｊ. Ｖiol. ５４：３０）、Ｐ１１（バートレット（Ｂertholet, Ｃ.）ら、１９８５、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ  ８２：２０９６）、ＣＡＥ−１（パテル（Ｐatel, Ｄ.Ｄ.）ら、１９８８、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ  ８５：９４３１）が含まれる。
該核酸分子はワクシニアウイルスベクターの非必須部位に挿入されてよい。このような非必須部位はよく知られており、例えばパーキンス（Ｐerkins）ら、１９８６、Ｖirology  １５２：２８５；ルービー（Ｈruby）ら、１９８３、Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ  ８０：３４１１および；ヴァイル（Ｗeir）およびモス（Ｍoss）、１９８３、Ｊ. Ｖirol. ４６：５３０に記載されている。ＴＡＰ−１を発現する組換えウイルスは当該技術分野で公知の技術を使用し、例えばモス、１９９２（Ｃurr. Ｔopics Ｍicrobiol. Ｉmmunol. １５８：２５）にて議論されているように容易に同定されてよい。
好ましい態様において、さらに適切なプロモーターの制御下で抗原ペプチド、好ましくは病原性ペプチドをコードする配列を含む核酸分子を該標的細胞に導入する。
本明細書において前記したように、本発明者らはＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２が単独で標的細胞の表面上にＭＨＣクラスＩ分子−内在性ペプチド複合体の発現を増強することができ、それによって該標的細胞にＣＴＬによる免疫監視を受けるようにさせることができることを示した。
従って、本発明はＭＨＣクラスＩ分子の低いまたは検出できないレベルを発現しＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の低いまたは検出できないレベルを発現する腫瘍細胞への哺乳類の免疫応答を増強する方法であって、ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする配列を含む核酸分子を適切なプロモーターの制御下で腫瘍細胞に導入し、ついで適切な条件下で該腫瘍細胞中でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２を発現し、それによって１つまたはそれ以上の内在性ペプチドのプロセッシングおよび提示を増強し、哺乳類の免疫応答による認識を可能にすることを特徴とする方法を提供する。
好ましい態様において、該方法はさらに、別の核酸分子を腫瘍細胞に導入し、その際、該別の核酸分子は適切なプロモーターの制御下で抗原性ペプチドをコードする配列を含み、ついで適切な条件下で該腫瘍細胞中で該抗原ペプチドを発現し、それによって該抗原ペプチドの提示およびプロセッシングを増強し、哺乳類の免疫応答による認識が可能になることを含む。
本発明はさらに、被験体から腫瘍細胞を採り、適切なプロモーター制御下でＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２をコードする核酸分子を該腫瘍細胞に導入し；該被験体または該被験体の再構築された免疫系を有する哺乳類に該腫瘍細胞を移植し、ついで腫瘍特異的Ｔ細胞を回収することよりなる抗腫瘍特性を有する腫瘍特異的Ｔ細胞を調製する方法にも関する。一態様において該核酸分子はまたＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２両方をコードしてもよいこと、またはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２をコードする別個の核酸分子が該腫瘍細胞に導入されてよいことが認識されるであろう。該腫瘍特異的Ｔ細胞は該被験体においてイン・ビボで治療剤として使用されてよい。レスティホら、Ｊ. Ｅxp. Ｍed  １７５：１４２３−１４３１に記載されているような方法は、ＩＦＮ−γでトランスフェクションした腫瘍細胞を使用してイン・ビボで抗腫瘍特性を有する特異的Ｔ細胞を調製するのに使用されてよい。養子免疫療法モデルはイン・ビボでの確立された修飾されていない腫瘍細胞に対する調製物の有用性を確認するために使用することができる。
本発明はまた、ＴＡＰ−１および／またはＴＡＰ−２をコードする核酸分子が病原体または腫瘍に対する免疫応答を増強することにおける使用および癌、特に転移性小細胞肺癌を治療することにおける使用のため組換えウイルスベクターワクチンに包含されていてよい。このようなワクチンは特に、そのＨＬＡの構成が関連抗原ペプチドの適切なプロセッシングおよび提示を認めない、ある種のウイルスまたは腫瘍抗原への免疫応答を開始することができないヒトを含む哺乳類のために特に有用な応用を有すると期待されている。例えば、ヒトにおける使用、またはＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２およびプロテアソーム成分などの抗原提示系の成分が欠如している腫瘍細胞では、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２をコードするヌクレオチド配列は、別個のプロモーターの制御下かまたは同じプロモーターの制御下で、別個に使用されるかまたは一緒に含まれるかしてよいことが認識されるであろう。
組換えワクシニアウイルスワクチンは当該技術分野において公知の技術を使用して構築されてよい。例えば、２つの初期／後期複合プロモーターを含むｐＪＳ５シャトルベクターは感染細胞において同時にＴＡＰおよび関連抗原を両方発現するのに使用されてよい。該１または複数のＴＡＰ遺伝子は１つのプロモーターの後でクローニングされてよく、該タンパク質またはペプチド遺伝子は第２のプロモーターの後または第２のワクチンにおいてクローニングされることができる。ＴＡＰ−１を１つのプロモーターの後でクローニングし、ＴＡＰ−２を第２プロモーターの後でクローニングしてよい。該クローニングされた遺伝子はチミジンキナーゼ遺伝子によってフランキングされてよい。該ｐＪＳ５−ＴＡＰ−抗原ベクターは、ワクシニア感染細胞にトランスフェクションされることができ、かくして相同組換えがワクシニアおよびクローニングされたシャトルベクターの両者においてチミジンキナーゼ配列間に起こり得て、その結果、ＴＡＰおよび該抗原を含む組換えワクシニアウイルスかまたはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の両者を含む組換えワクシニアウイルスが得られ、これらは特定のペプチドが輸送され、提示されることを可能にするであろう。
本発明はまた、移植された組織の受容体動物による拒絶反応を抑制する方法であって、該組織の細胞においてＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２またはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の両方の発現を修飾、排除、またはマスキングして、該動物におけるＴ−リンパ球媒介応答を引き起こす該組織の細胞の表面での内在性抗原のプロセッシングおよび提示を抑制することを特徴とする方法をも想定する。ＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２またはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の両方の発現は、ＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２および／またはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２アンチセンスを使用することによって修飾、排除、またはマスキングできる。クラスＩ ＭＨＣ分子はまた、移植組織の細胞から排除されてもよく、ＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２および／またはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の切断された形態は、機能的なトランスポーターと競合させるのに使用し、ＴＡＰ−１および／またはＴＡＰ−２の発現のダウンレギュレーションとなるようにしてよい。
以下の実施例は例示のために提供するのであって、限定することを意図するものではない。
実施例
以下の材料および方法を実施例１から８に列挙された研究において利用した。
動物およびウイルス
Ｃ５７Ｂｌ／６マウスをブリティッシュ・コロンビア大学飼育施設で飼育させた。マウスは６−１２週齢であり、動物管理に関するカナダ議会のガイドラインに従って維持した。ＶＳＶはベロ（vero）細胞単層において増殖させた。ワクシニアおよびヒトβ2ｍ（ｈβ2ｍ）ワクシニア組換え体はイェウデル（Ｊ. Ｙewdell）博士から贈られた。
細胞株および抗体
ＣＭＴ. ６４細胞（Ｈ−２b）はフランクス（Ｌ. Ｍ. Ｆranks）博士（フランクスら  １９７６、Ｃancer. Ｒes. ３６：１０４９）により提供された。ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞を１０％加熱活性化したＦＣＳ、２０mＭ Ｈepes、２mＭ グルタミンおよび抗生物質を補ったＤＭＥＭに維持した。使用したｍＡＢＳは以下の通りであった：１４２−２３.３ 抗Ｈ−２ Ｋb、２８−１１−５ｓ 抗Ｈ−２ Ｄb（α１＋α２）、２８−１４−８ｓ 抗Ｈ−２ Ｄb（α３）およびヒトβ2ｍに対するＢＢＭ.１（ブロッドスキー（Ｂrodsky, Ｆ.Ｍ.）ら、１９７９、Ｅur. Ｊ. Ｉmmunol. ９：５３６）。ｈβ2ｍに対するウサギ抗血清（ビコッフ（Ｂikoff, Ｅ. Ｋ.）ら、１９９１、Ｎature ３５４：２３５）、Ｈ−２Ｋbのエクソン−８に対するウサギ抗血清（ウイリアムズ（Ｗilliams, Ｄ.）ら、１９８９、Ｊ. Ｉmmunol. １４２：２７９６）およびラットプロテアソームに対するウサギ抗血清（ブラウンら、１９９１、Ｎature  ３５３：３５７）をも使用した。
トランスフェクション
pＨb Ａpr−１−neo発現ベクター（ブッチャー（Ｇ. Ｂutcher）博士より提供された）中のラットＴＡＰ−１からのｃＤＮＡでのＣＭＴ. ６４細胞のトランスフェクションを１０μgのＤＮＡを使用してリポフェクチン（リポフェクチン、ギブコ（Ｇibco ＢＲＬ）、ゲイザーズバーグ（Ｇeithersburg）、メリーランド）によって行った。１mg／ml Ｇ４１８（ギブコ）において選択した。陽性クローンを選択し、ついでラットＴＡＰ−１遺伝子の発現に関してノーザンブロットによりスクリーニングした。代表的なクローンで得られた結果を報告する（図９参照）。ネガティブコントロールとして、ベクターＤＮＡトランスフェクションから得たクローンをノーザンブロットにより分析した。代表的なクローンで得られた結果を報告する（図９参照）。
フローサイトメトリー分析
ＭＨＣ−クラスＩ分子の細胞表面発現を決定するため、蛍光活性化セルソーター（ＦＡＣＳ（登録商標））分析（ベクトン・ディキンソン（Ｂecton Ｄickinson）アンド・コ（＆Ｃｏ.）、マウンテン・ビュー（Ｍountain Ｖiew）、カリフォルニア）を使用した。ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞を４８時間１５０−３００単位／mlで組換えマウスガンマインターフェロン（ＩＦＮ−γ）（ゲンザイム・サイトカイン・リサーチ・プロダクツ（Ｇenzyme Ｃytokine Ｒesearch Ｐroducts）で処理するかまたはしなかった。該細胞を回収し、ついでＦＣＳなし、ＶＳＶ−Ｎ ５２−５９ペプチド（５０μＭ）および／またはｈβ2ｍ（２.５μg）を有する培地で一晩インキュベートした。ペプチドはビクトリア大学、ペプチド合成施設（ビクトリア、ブリティッシュ・コロンビア、カナダ）から購入した。該細胞を続いて培養物から除去し、洗浄しついで１４２−２３.３腹水の１：５０希釈、または２８−１１−５ｓおよび２８−１４−８ｓ細胞からの２００μｌの細胞培養上清で氷上で４５分インキュベートした。２回洗浄した後、該細胞を１００μlのヤギ抗ウサギまたはヤギ抗マウスＦＩＴＣコンジュゲート第二抗体の１：２０希釈でさらに氷上で４５分インキュベートした。ついで該サンプルをパラホルムアルデヒド（リン酸緩衝食塩水中１.５％）で固定し、ついでＦＡＣＳcan（登録商標）プログラム（ベクトン・ディキンソン・アンド・コ）を使用してＦＡＣＳcan（登録商標）セルソーター上で分析した。表１に報告した値は５,０００細胞の平均を表わす線形の語句である。補正した値（第一抗体なしのときの値を差し引いたもの）を報告する。
細胞標識、パルスチェイス実験、免疫沈降、等電点電気泳動およびＳＤＳ−ＰＡＧＥ
細胞をメチオニンなしで標識の１時間前にＭＥＭ培地において洗浄し、ついで１時間または指示されたとおりに、１５０μＣi／mlの35Ｓ−メチオニンで標識した。パルスチェイス実験のため、細胞を１５分標識し、ついで放射性標識していないメチオニンの過剰量を含む通常の培地で追跡した。標識した細胞を０.１２Ｍ ＮaＣl、４Ｍm ＭgＣl2および１％ ノニデット Ｐ−４０（Ｎonidet Ｐ−４０）を含む２０Ｍm トリス−ＨＣl（ｐＨ７.６）の１mlで可溶化し、使用前に２０μg／mlの最終濃度にフェニルメチルスルホニルフルオライドを添加した。氷上で１５分後、粒子性物質を遠心分離によって除去した。該上清を標識した抗原の免疫沈降に使用した。標識した可溶化抗原を最初に２μlの正常ウサギ血清で４℃で４５分前清浄化し、ついで５０μlのプロテインＡ−セファロース（可溶化バッファー中１：１）で４℃でさらに４５分清浄化した。プロテインＡ−セファロースを急速な遠心によって除去した。該前清浄化した上清を４℃で１時間適当な抗体、または免疫血清と反応させた。３５μlのプロテインＡ−セファロースを添加しついでさらに３０分間インキュベーションを続けた。遠心後、該ビーズを１０ｍＭトリス−ＨＣl（ｐＨ ７.５）、０.１５Ｍ ＮaＣlおよび２mＭ ＥＤＴＡ中で０.２％ ＮＰ−４０で２回、１０Ｍm トリス−ＨＣl（ｐＨ ７.５）、０.５Ｍ ＮaＣlおよび２mＭ ＥＤＴＡ中で０.２％ ＮＰ−４０で１回、最終的に１０ｍＭトリス−ＨＣl（ｐＨ ７.５）で洗浄した。一次元等電点電気泳動をセリス（Ｃelis, Ｊ. Ｅ.）ら（１９９０、Ｅlectrophoresis １１：９８９）に以前に記載されているように行った。ＳＤＳ−ＰＡＧＥをクビスト（Ｋvist, Ｓ.）ら、（１９８２、Ｃell ２９：６１）に記載されたように行った。
ＶＳＶ−感染した、ＩＦＮ−γ誘発細胞に対するＣＴＬ応答
ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞を４８時間１ｍｌあたり２００単位のＩＦＮ−γでまたはなしで処理した。それらを続いてＰＢＳで３回洗浄し、１時間０.５mlの培地中での５分の感染の多重度（ＭＯＩ）でＶＳＶで処理した。ついで該培養物を感染をさらに進めることができるようさらに４−８時間（指示されたとおり）、総量３mlの増殖培地でインキュベーションした。単一細胞懸濁液を２時間、ウシ胎児血清（ＦＢＳ）および重炭酸ナトリウムの不在下でＬ−グルタミンおよびペニシリン／ストレプトマイシンを補ったＲＰＭＩ １６４０中の１０6細胞あたり１００μＣi 51Ｃｒで処理した。別に、ＣＭＴ. ６４細胞を、５時間、５のＭＯＩでワクシニア（Ｖ）、および／またはワクシニア−ｂ２ｍ（Ｖｂ２）で感染させた後、さらに４時間ＶＳＶ（ＭＯＩ、５）でスーパーインフェクションした。該細胞を３回洗浄し、ついでエフェクター密度が１２.５に対する１００の割合で９６−ウェルプレート中、１ウェルあたり１０4細胞でインキュベートした。Ｍock 感染細胞をネガティブコントロールとして使用した。該エフェクターＣＴＬ集団を足の趾および耳において５×１０6−１×１０7ＴＣＩＤ50でＶＳＶでＣ５７Ｂｌ／６マウスを免疫することによって産生した。免疫５日後に水気を切ったリンパ節（咽後および膝窩）を回収し、培養を６−ウェルプレートで総量５mlで１mlあたり４×１０6細胞で開始した。該培地は、５×１０-5Ｍ ２−メルカプトエタノール（ＭＥ）、１０％加熱不活性化したＦＢＳ、ピルビン酸ナトリウム、ペニシリン、ストレプトマイシン、Ｌ−グルタミン、ＨＥＰＥＳ、重炭酸ナトリウムおよび５０％ ＮＣＴＣ−１０９を補ったＲＰＭＩ−１６４０からなった。培養物を３７℃で３日間、外在性刺激の不在下で５％ ＣＯ2でインキュベートした。51Ｃｒの放出をコンピュガンマカウンター（compugamma counter）（モデル１２８２ＣＳ；ＬＫＢ インストルメンツ（ＬＫＢ Ｉnstruments）、ゲイザーズバーグ、メリーランド）によって測定し、ついで51Ｃr比放出を［（実験値−培地コントロール）／（合計−培地コントロール）］×１００％として計算した。自発的放出は決して最大放出の１７％を越えることはなかった。
ＲＮＡ抽出およびノーザン分析
総細胞ＲＮＡをグアニジウムイソチオシアネート（ＧＩＴＣ）を使用して細胞株から調製した。簡単には、該細胞を４Ｍ ＧＩＴＣに溶解させ、ついで塩化セシウムのクッションを通して遠心した（１３０,０００g、２３℃で１６時間）。エタノール沈澱の後、その精製したＲＮＡをＤＥＰＣ処理したＨ2Ｏに再懸濁した。各サンプルの１０μgをロードし、２.２Ｍ ホルムアルデヒドを含む１％ アガロースゲル上で分離した。そのゲルをハイボンドＮ（Ｈybond Ｎ）（アマシャム（Ａmersham Ｃorp.）、アーリントン・ハイツ（Ａrlington Ｈeights）、イリノイ）上にブロットし、ついでハイブリダイゼーションの前にＵ／Ｖ固定した。ハイブリダイゼーションに使用した32Ｐ−標識プローブは以下のとおりであった：ＭＴＰ１およびＭＴＰ２（それぞれＴＡＰ−１および−２、ジョフ・ブッチャー（Ｇeoff Ｂutcher）博士によるご厚意の提供）（ランダムプライミングによる調製）、および末端トランスフェラーゼにより標識されたβ−アクチンに特異的なオリゴヌクレオチド。ハイブリダイゼーションを０.４Ｍ Ｎa2ＨＰＯ4、５０％ ホルムアミドおよび７％ ＳＤＳを含むバッファー中で４２℃で行った。ストリンジェンシーを増大させる条件下で４２℃にて数回洗浄し、ついでそのフィルターを一晩Ｘ−ＯＭＡＴ ＡＲフィルム（コダック（Ｋodak））で露光した。
実施例１
ＣＭＴ. ６４とＲＭＡ−Ｓ細胞の表現型の比較
小肺癌細胞系、ＣＭＴ. ６４は、ＩＦＮ−γ処理後、細胞表面上にＭＨＣクラスＩ分子を発現し、集合させる（assemble）ことが示されている（Ｋlar Ｄ. およびＨammering, ＥＭＢＯ  Ｊ., ８：４７５；Ｓibille, Ｃら, １９９２, Ｅur. Ｊ. Ｉmmunol. ２２：４３３；およびＪefferies Ｗ. Ａ.ら, １９９３：Ｊ. Ｉmmuol. １５１：２９７４）。ＣＭＴ. ６４細胞の抗原プロセッシングにおける分子の欠落を理解するために、ＲＭＡ−Ｓ細胞に対するＣＭＴ. ６４細胞の対照的な表現型について分析した。ＶＳＶ感染した、ＩＦＮ−γ誘発または非誘発のＲＭＡ、ＲＭＡ−Ｓ、ＣＭＴ. ６４細胞のＣＴＬ認識を、一般に、本明細書の方法論の項において概説する方法に従って調べた。さらに具体的には、標的細胞を、４８時間のＩＦＮ−γ処理または非処理の後、ＶＳＶで感染させた。その結果を図１に示す。図１のパネルＡは、標的としてＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞を使用した代表的な実験を説明し、一方、パネルＢは、ＣＭＴ. ６４細胞（略号：Ｃ）による同じ実験を表している。細胞はすべてＭＯＩ １０でＶＳＶで４時間感染させた。ＩＦＮ−γ処理は、図１において細胞系の表示の後に＋印で表している。自然放出は、１５％を越えなかった。
ＩＦＮ−γにより誘発されなければ特異的なＣＴＬによって認識されないＶＳＶ感染ＣＭＴ. ６４細胞と比較して、ＶＳＶ感染したＲＭＡ−Ｓ細胞は、ＩＦＮ−γ処理されていてもされていなくても野生型ＲＭＡ細胞と同じくらい効率良く認識される（図１Ｂ）。ＲＭＡ−Ｓ、ＲＭＡおよびＣＭＴ. ６４細胞は、ＴＣＩＤ50アッセイ（データは示していない）により測定される感染後に生じた感染粒子の数によって示されるように、ＶＳＶによる感染を同等に許容しているということに注目すべきである。従って、誘発されていないＣＭＴ. ６４細胞は、ＲＭＡ−Ｓ細胞に存在する機能的に欠陥のあるペプチドトランスポーターＴＡＰ−２とは異なるかまたはさらに付加された欠陥を有している。
実施例２
ＣＭＴ. ６４およびＲＭＡ−Ｓ細胞の表現型に対する外在性および内在性ペプチドの効果
過去の実験により、外在性ペプチドおよび／またはヒトβ2ｍによる変異細胞の処理が“無意味な（empty）”クラスＩ分子を、細胞表面で安定化できることが示された（Ｔownsend, Ａ.ら, １９８９, Ｎature ３４０：４４３；Ｖitiello, Ａ.ら, １９９０, Ｓcience ２５０：１４２３；およびＬjunggren, Ｈ.−Ｇ.ら, １９９０, Ｎature  ３４６：４７６）。ＩＦＮ−γで誘発されたまたは誘発されていないＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞を、ヒトβ2ｍの存在下または不在下、外在性ペプチドＶＳＶ−Ｎ ５２−５９の５０μＭで一晩処理した。ＶＳＶ−Ｎ ５２−２９ペプチドとヒトβ2ｍは、ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞において１４２. ２３. ３ｍＡｂ（表１）によって認識されるＫb形態特異的エピトープの発現を相乗的に増加させる。ＶＳＶ−Ｎ ５２−５９ペプチドは、Ｋb分子の安定性と形態に特異的に影響を及ぼし、Ｄb分子には影響を及ぼさない。ＢＢＭ. １（抗−ヒトβ2ｍ ｍＡb）によって検出されるヒトβ2ｍはＫbおよびＤb分子に結合し、細胞表面で分解できるよりも前に重鎖を安定化するようである。ペプチドまたはβ2ｍ単独でのＣＭＴ. ６４処理後には、安定化効果はみられなかった。ＣＭＴ. ６４をさらにＩＦＮ−γで処理することが、ＫbおよびＤb形態特異的エピトープの細胞表面での高度な発現には必要であった（表１）。従って、ＣＭＴ. ６４細胞は、ＲＭＡ−Ｓ細胞よりも、ずっと低い量の“無意味な”クラスＩ分子を細胞表面に発現している。
初期の研究によって、ＥＲの管腔内のβ2ｍおよびペプチドの存在は、ＭＨＣクラスＩ分子の効果的な集合と細胞表面発現に必要であることが示されている（Ｒock, Ｋ.ら, １９９１, Ｃell  ６５：６１１）。図２は、ＩＦＮ−γ誘発または非誘発の、ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞内で合成されたβ2ｍの量を示している。細胞を35Ｓ−メチオニンで２時間標識し、細胞溶解し、ウサギ抗−ｈβ2ｍ血清で免疫沈降させ、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した。放射性タンパク質を、ＸＡＲフィルムに６時間暴露させた後に検出した。ＩＦＮ−γ処理（＋）または非処理（−）ＣＭＴ. ６４細胞、ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞を使用した（図２）。分子量マーカーの移動を、図２の左に示した。
図２に示したように、ＣＭＴ. ６４細胞は、低レベルの外在性β2ｍを発現している（図２レーン１）。ＩＦＮ−γ誘発ＣＭＴ. ６４細胞は、ずっと高レベルの量のβ2ｍを発現し、これはＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞において発現するレベルに匹敵している（図２、レーン２〜４）。
ＣＭＴ. ６４細胞におけるβ2ｍの効果を調べるために、組換え種痘ウイルスを用いて外在性β2ｍの量を増加させた。ＣＭＴ. ６４細胞に対するＣＴＬ応答に及ぼすβ2ｍの効果を図３に示す。感染したＣＭＴ. ６４細胞を、ワクシニアとワクシニア−β2ｍ組換え体（Ｖ−Ｖｂ２）、ワクシニアとＶＳＶ（Ｖ−ＶＳＶ）、またはワクシニア−β2ｍとＶＳＶ（Ｖｂ２−ＶＳＶ）で、ＦＢＳを含まない培地（ＭＯＩ ３）中、さらに１２時間までの間重感染させた。図３の枠内には、抗−ｈβ2ｍウサギ血清で免疫沈降後に合成されたβ2ｍのレベルが示されている。ペプチドＶＳＶ−Ｎ５２−２９で５００ｐＭで２時間処理したＣＭＴ. ６４細胞（ＣＭＴ＋ｐ）を正の対照として使用し、モック処理したＣＭＴ. ６４細胞（ＣＭＴ＋−−−）を負の対照として使用した。放出された放射能は４つ一組のウェルの平均値である。自然放出は、１６％を越えない。
図３に示したように、組換え種痘ウイルスを使用して合成されたβ2ｍの量の増加は、ＶＳＶ感染ＣＭＴ. ６４細胞のＣＴＬ認識を回復させなかった。従って、β2ｍの発現の増加は、Ｋb分子に関するＶＳＶ−Ｎペプチドの提示を誘発しない。ＣＭＴ. ６４抗原をプロセッシングする表現型は小量の外在性β2ｍによっては生じない。
実施例３
ＭＨＣクラスＩ分子ＤbおよびＫbの細胞内輸送
ＣＭＴ. ６４、ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞のパルスチェイス標識と免疫沈降した物質のＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析後、ＫbおよびＤb分子の輸送について試験した（Ｋbについては、１４２.２３.３mＡbを使用し、Ｄbについては、２８−１４−８sおよびα3特異的mＡbを使用した）。ＭＨＣクラスＩ分子、ＤbおよびＫbの細胞内輸送を図４に示す。細胞を35Ｓ−メチオニンで標識し、過剰量の冷却メチオニン中で図４上部に、時間で示した間で追跡（chase）した。可溶化した抗原を、Ｋbについては１４２.２３.３mＡbsで、あるいはＤbについては２８−１４−８s mＡbsで免疫沈降させた。処理は上部に、分子量マーカーの移動は図１５の左に示した。重鎖（４６kＤ）とβ2ｍ（１２kＤ）の共免疫沈降が、ＣＭＴ. ６４非誘発細胞以外のすべての細胞においてみられた。放射性タンパク質を、ＲＭＡ−Ｓ細胞については８日間、ＲＭＡおよびＣＭＴ. ６４細胞については４日間、ＸＡＲフィルムに暴露した後に検出した。
ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞において合成されたＫb分子の量は同程度であるにもかかわらず（図４、追跡時間０）、非常に少ない量のＫbしか高分子量型にプロセッシングされない。高分子量型はＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＫbの表面発現を説明する輸送レベルを示すものである。プロセッシング型は、エンドグリコシダーゼＨによる消化に対して耐性（データは示していない）であり、ＥＲの外への輸送を示している。ＲＭＡ−Ｓ細胞において、Ｄb分子の場合よりも、Ｋb分子によって遥かに多量のβ2ｍが免疫沈降したという観察は、mＡb １４２.２３.３１が、集合した型、即ちＫb分子の重鎖と軽鎖のみを認識し、他方、mＡb ２８−１４−８sがＤb分子のα3領域を認識することを示すものであろう。機能性ＴＡＰ−１タンパク質のＲＭＡ−Ｓ細胞における存在（Ｙang, Ｙ.ら, １９９２, Ｊ. Ｂiol. Ｃhem., ２６７：１１６６９）は、幾つかのペプチドが、ＥＲ膜を通過し、少数のＫb分子に結合し、それらを細胞表面へ移動させることを可能にし得るのに十分である。Ｋb分子に対してより低い親和性を有するペプチドも、結合し、分子の集合を助け、細胞表面へ移動し、そこで分離する。４時間の追跡後、ずっと少ない量の、成熟した、プロセッシングされたＤb分子がＲＭＡ−Ｓ細胞において検出された（図４）。このことは、β2ｍおよび／またはＤb結合に利用し得るより少ないペプチドに対する、Ｄbのより低い親和性を示すものであろう。ＲＭＡ細胞においては、Ｋb分子は１時間以内にプロセシングされた。対照的に、Ｄb分子のプロセシングはそれよりも遅かった（２時間）（図４）。これらの結果は、ＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＫbおよびＤbの相対的な輸送速度と一致する。ＩＦＮ−γ処理は、重鎖の合成を増大させ、より多くのＫbおよびＤb分子をＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞表面へ輸送させる。ＫbおよびＤb分子の輸送速度は、ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＩＦＮ−γ処理によっては影響を受けない。対照的に、Ｋb分子はＣＭＴ. ６４細胞においては、１４２.２３.３mＡbを用いて検出されなかった。
実施例４
ＩＦＮ−γ非誘発および誘発ＣＭＴ. ６４細胞におけるＫb分子の遊離型および集合型の細胞内輸送
上で議論したように、１４２.２３.３mＡbは、Ｋb分子の集合されていないペプチドフリーの重鎖を認識できない（図４）。この問題に取り組むために、Ｈ−２Ｋb分子の細胞質末端にあるペプチドを認識する形態非依存性エピトープに対するウサギ抗−エクソン８血清（Ｗilliams, Ｄ.ら, １９８９  Ｊ. Ｉmmunol. １４２：２７９６）を用いて、ＩＮＦ−γ非誘発または誘発ＣＭＴ. ６４細胞におけるＫb分子のプロセッシングを検出し、追跡した。
細胞を35Ｓ−メチオニンで標識し、過剰の冷却メチオニン中、図５上部に時間で示した間追跡した。可溶化した抗原を、ここに記載するように、遊離の、および集合したＫb重鎖の細胞質末端を認識する、Ｈ−２Ｋb血清のウサギ抗−エクソン８で免疫沈降させた。処理を上部に示し、分子量マーカーの移動を図５の左に示した。放射性タンパク質をＲＰＮ−３０フィルム（アマシャム）に４日間暴露した後に検出した。
非誘発ＣＭＴ. ６４細胞において、Ｋb分子は、合成後初期に検出可能であった（図５、追跡時間０時間、０. ５時間、および１時間）が、不安定であり、大部分は８時間の追跡後分解し、非常に少ない分子が高分子量にプロセッシングされた（第５図の追跡時間８時間）。誘発細胞においては、Ｋb分子がより多量で合成され、より大きい割合の分子が高分子量にプロセッシングされた（図５）。追跡中のこの抗血清によって免疫沈降された物質の量の減少は説明できなかった。抗血清によって認識されるエピトープの、輸送中の損失または分解が可能である。さらに、Ｄb分子も合成され、次に分解または変性する（図４）。非誘発ＣＭＴ. ６４細胞においては、４時間の追跡の後でもプロセッシングされたＤb分子は検出されなかった。ＩＦＮ−γによる処理のみが、ＣＭＴ. ６４細胞における、ＫbおよびＤb分子の高度な発現、輸送量の増加、輸送速度の上昇をもたらした。従って、ＣＭＴ. ６４細胞においては、Ｋb重鎖とβ2ｍの集合と輸送に必要な成分は、ＩＦＮ−γによって誘発された。他方、ＲＭＡまたはＲＭＡ−Ｓ細胞においては、同様の誘発によってＤbおよびＫbの輸送は有意に変化しなかった。このことは恐らく、ＣＭＴ. ６４細胞は、ＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＴＡＰ−２欠損と異なる、ＭＨＣクラスＩ集合に必要な成分に欠損があることを示している。
実施例５
ＣＴＬ認識におけるＶＳＶ−Ｎ ５２−２９ペプチド応答
ＭＨＣクラスＩ分子の機能を分析するために、外在性ペプチドで処理されたＩＦＮ−γ誘発または非誘発ＣＭＴ. ６４細胞、およびＲＭＡ−Ｓ細胞のＣＴＬ認識を調べた。ＣＭＴ. ６４細胞（ＣＭＴ）、ＣＭＴ. ６４＋ＩＦＮ−γ（ＣＭＴ＋ＩＦＮ−γ）およびＲＭＡ−Ｓ細胞（ＲＭＡ−Ｓ）を、図６に示した濃度のペプチドＮ５２−５９で処理した。放射能が特異的なＣＴＬ認識によって放出され、溶解を測定し、前記の実験材料および方法に示したように表した。図６に示す放出された放射能は、４つ一組のウェルの平均値である。自然放出は１３％を越えない。
用量依存的に、ＩＦＮ−γ処理されたＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞は、外在性ペプチドによる２時間処理後の、特異的なＣＴＬによる殺傷に対して、ＣＭＴ. ６４細胞より１０００倍敏感であった（図６）。これらの結果は、非誘発ＣＭＴ. ６４細胞の表面上のペプチド受容体ＭＨＣクラスＩ分子の発現が低いことの証拠となる。特異的ＣＴＬによる５０％殺傷を達成するためには、ＲＭＡ−Ｓ細胞における用量−応答において、細胞１個当たり最大１５. ０００個のペプチド分子が必要である。他方、細胞１個当たり１５０分子という低い閾値は51Ｃrの５〜１０％の放出をもたらす。これらのデータは、大量の受容分子、またはＲＭＡ−ＳおよびＩＦＮ−γ誘発されたＣＭＴ. ６４細胞の表面上のペプチドに対するＭＨＣクラスＩ分子の高い親和性によって説明でき得る。外在性β2ｍが存在しないこのアッセイの条件下では、外的に添加されたペプチドが、ＲＭＡ−Ｓの細胞表面に達する無意味なＫb分子を、それらがβ2ｍから解離する前に、安定化する傾向にある（Ｒock, Ｋ. ら, １９９１, Ｃell  ６５：６１１およびＪefferies Ｗ.ら, 前掲, １９９３）。誘発されていないＣＭＴ. ６４細胞において輸送される少量の無意味なＫbによって、外在性ペプチドに対する増感の相違が説明されよう。
実施例６
ＣＭＴ. ６４およびＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２遺伝子の発現
図２〜図６に示した結果は、低い発現にもかかわらず、β単独では、示した細胞における抗原提示の欠失の原因ではないことを示している。さらにＫbおよびＤb分子はこれら細胞内で合成されるが、ごく少数が細胞表面へと輸送され、そこで外的に加えられたペプチドに結合する。重鎖と軽鎖に加え、ＥＲにおけるＭＨＣクラスＩ分子の効果的な集合にペプチドが必要である（Ｓpies, Ｔ.ら, １９９０, Ｎature  ３４８：７４４；Ｍonaco, Ｊ.Ｊ.ら, １９９０, Ｓcience ２５０：１７２３；Ｓpies, Ｔ.およびＤeＭars, Ｒ., １９９１, Ｎature  ３５１：３２３；およびＴownsend, Ａ.ら, Ｎature  ３４０：４４３）。ＥＲ内でのこれらペプチドの産生および輸送の原因となる成分が存在しないことが、ＣＭＴ. ６４表現型の原因であり得る可能性について調べた。
ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２と呼ばれる、２つの半−ＡＢＣタイプのトランスポーターのヘテロダイマーから構成されると考えられる推定ペプチドトランスポーターは、ＭＨＣクラスＩ集合のための、ＥＲ中へのトランスローションペプチドに関係している（Ｋelly, Ａ.ら, １９９２, Ｎature  ３５５：６４１；およびＰowis, Ｓ.Ｈ.ら, １９９２, Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ  ８９：１４６３）。ＲＭＡ−ＳとＣＭＴ. ６４細胞との間の表現型の相違を特徴づけるために、これら細胞系におけるＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２遺伝子の発現を、ＲＭＡ、ＲＭＡ−Ｓ、ＩＮＦ−γ誘発または非誘発のＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞に由来する全細胞ＲＮＡのノーザン・ブロット分析によって試験した（図７）。ＩＮＦ−γ誘発（＋）または非誘発（−）ＣＭＴ. ６４、ＲＭＡ、およびＲＭＡ−Ｓ細胞由来の細胞質ＲＮＡ１０μgを分析し、その結果を図７に示す。ＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２およびβ−アクチンプローブを膜とハイブリダイスした。特定のＲＮＡ配列に結合した放射能を、膜をＸＲＡフィルムに一晩露光した後に検出した。
図７において、ノーザン・ブロット分析により、非誘発ＣＭＴ. ６４細胞が検出可能な量のＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２ｍＲＮＡを発現しなかったこと、およびこれらｍＲＮＡの量は、これら細胞のＩＮＦ−γ処理の後に大きく増加したことを示している。さらに図７は、ＲＭＡ−ＳとＲＭＡ細胞におけるＴＡＰ−１とＴＡＰ−２遺伝子発現の間に大きな違いはないこと、そして、ＩＮＦ−γ処理が、これら細胞いおけるＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２発現に僅かにしか影響しないことを示している。アクチンｍＲＮＡの量は、ノーザン・ブロッティングのゲル上に乗せたｍＲＮＡとほぼ等しい量の指標を示すものである。ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２のＩＮＦ−γ誘発性は、マウスの組織中で以前に示されている（Ｇakin, Ｈ. Ｒ. ら, １９９２, Ｓcience  ２５６：１８２６）。しかし、これは本研究より以前にＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳまたはＣＭＴ. ６４について試験されたことはない。ここに報告された結果は、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２遺伝子がＣＭＴ. ６４細胞において、ＩＮＦ−γ誘発可能であり、ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞では、より低い程度で誘発可能であることを示している。ＣＭＴ. ６４におけるこのＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２ｍＲＮＡ発現しないことは恐らく、ＭＨＣクラスＩ分子に結合し集合するための、ＥＲにおける抗原ペプチドの欠損をもたらす。このことは、ＶＳＶ感染したＣＭＴ. ６４細胞が認識されないという結果をもたらす。対照的にＲＭＡ−Ｓ細胞は、ペプチドのＥＲ膜の貫通を助ける機能的ＴＡＰ−１分子を発現する。このことによって、ＲＭＡ−Ｓ細胞におけるＭＨＣクラスＩの集合と輸送、およびＶＳＶ感染後の細胞のＣＴＬ認識を説明することができよう。非誘発ＣＭＴ. ６４中のＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の欠失は、不安定で非効率的に輸送されるＭＨＣクラスＩ複合体の形成によって特徴付けられるＣＭＴ. ６４細胞の表現型の原因となる因子の１つとなり得よう。
実施例７
ＩＮＦ−γ誘発または非誘発ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞由来のプロテアソーム成分
ＴＡＰ欠損が、ＣＭＴ. ６４細胞におけるありそうなまたは唯一の欠損であると結論付ける前に、これら細胞におけるプロテアソーム成分の存在について試験した。ウイルスペプチドは、ＥＲ膜を貫通する前にプロテアソームによって細胞質で産生されると考えられている（Ｏrtiz−Ｎavarette, Ｖ.ら, Ｎature, ３５３：６６２, １９９１；Ｂrown, Ｍ.Ｇ.ら, Ｎature, ３５３：３５５, １９９１；Ｇlynne, Ｒ.ら, Ｎature, ３５３：３５７, １９９１；Ｍartinez, Ｃ. Ｋ.およびＪ.Ｊ. Ｍonaco, Ｎature, ３５３：６６４, １９９１；Ｋelly, Ａ.ら, Ｎature, ３５３：６６７, １９９１；Ｙang, Ｙ.ら, Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ, ８９：４９２８, １９９２；およびＧoldberg, Ａ. Ｌ.およびＫ. Ｌ. Ｒock, Ｎature, ３５７：３７５, １９９２）。プロテアソーム成分は、これら細胞に存在しないであろう抗原プロセッシングにおいて、恐らく重要な役割を担っている。マウスプロテアソームを認識するウサギ抗−ラットプロテアソーム血清を使用した。プロテアソームの免疫沈降の後に、これらマウス細胞において産生した低分子量の種々のポリペプチド（ＬＭＰ）は、二次元ゲル電気泳動によって分析できる。
ＩＮＦ−γ誘発または非誘発ＲＭＡ、ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞に由来するプロテアソーム成分の二次元ゲル電気泳動を図８に示す。細胞は、35Ｓ−メチオニンで２時間標識した。可溶化した抗原をウサギ抗−ラットプロテアソーム血清で免疫沈降し、１次元で等電点フォーカシング、二次元で１０〜１５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥ後に分析した。放射性タンパク質をＸＡＲフィルムに１０日間露光した後に検出した。細胞処理については、図８の上部に示している。ゲルの酸性側は右側、塩基性側は左側である。分子量マーカーの移動をゲルの左側に示す。消失したタンパク質を矢印で示し、番号を付している（図８）。１番と７番のタンパク質はそれぞれ、ＬＭＰ−７およびＬＭＰ−２に対応する。プロテアソームのＬＭＰ−２、ＬＭＰ−７と他の５つの成分は、ＲＭＡおよびＲＭＡ−Ｓ細胞ではＩＮＦ−γによって僅かに上方調節を受け、ＩＮＦ−γ処理されたＣＭＴ. ６４細胞において、検出不可能な発現の状態から高い検出可能レベルの発現へと誘発された（図８）。ＬＭＰ−７（図８, １）は、ＩＮＦ−γ処理されたＣＭＴ. ６４細胞において特に高度に誘発された。これらの結果は、ＣＭＴ. ６４細胞はプロテアソーム成分をすべて低いレベルで発現すると示唆している他の結果（Ｏrtiz−Ｎavarette, Ｖ.ら, １９９１, Ｎature  ３５３：６６２）とは対照的なものであり、これらの新たな結果は、これらの誘発されたプロテアソームの活性に影響を及ぼし、誘発ＣＭＴ. ６４細胞においてＶＳＶ−Ｎペプチドの産生を可能にすることを示している。近年のデータ（Ａrnold, Ｄ.ら, １９９２, Ｎature ３６０：１７１およびＭomburg, Ｆ. ら, １９９２, Ｎature  ３６０：１７４）は、ＬＭＰ−２およびＬＭＰ−７は、ＴＡＰ−１および−２遺伝子でトランスフェクトされた変異細胞におけるインフルエンザウイルス抗原提示には必要でないことを示唆している。
前記の結果は、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２遺伝子の転写の誘発に加え、ＩＮＦ−γ処理は、ＬＭＰ−２およびＬＭＰ−７を含むプロテアソームの７つの構成要素の合成も上方調節していることを示している。他の文献にはＬＭＰ−２およびＬＭＰ−７以外の成分がＨela細胞プロテアソームにおいてＩＮＦ−γ処理によって上方調節されることが記載されている（Ｙang, Ｙ.ら, Ｐroc. Ｎatl. Ａcad. Ｓci. ＵＳＡ, ８９：４９２８, １９９２および
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１９９２, Ｊ. Ｂiol. Ｃhem. ２６７：２２１３１）。しかし、これらの細胞は機能的には野生型であるため、この調節についての機能的な影響については、検討されていなかった。さらに、ＬＭＰ−２およびＬＭＰ−７は、より小さな生成物へと分解する前駆体タンパク質として最初に合成される
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ので、誘発されていないＣＭＴ. ６４細胞から消失するさらに５つのタンパク質の幾つかはＬＭＰ−２およびＬＭＰ−７の前駆体タンパク質である可能性がある。
実施例８
ＶＳＶ感染したＴＡＰ−１陽性ＣＭＴ. ６４細胞の認識
ＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４細胞における抗原プロセシングに関する蓄積されたデータを考察から、機能性ＴＡＰ−１タンパク質ホモダイマー単独で、細胞質ゾルから、重鎖への結合が起こる場所であるＥＲ孔への、ＶＳＶ−Ｎ５２−２９ペプチドの輸送を増強し得るという主張が導かれる。もう１つの説明は、このペプチドがＥＲ膜を通過するトランスロケーションにはトランスポーターを必要とせず、ＣＭＴ. ６４細胞内では産生されないというものである。特異的なＣＴＬによるＶＳＶ感染ＣＭＴ. ６４細胞の認識に影響を及ぼす欠損を、より明確に定義するために、ラットＴＡＰ−１遺伝子をＣＭＴ. ６４細胞に誘発した。
ＣＭＴ. ６４（ＣＭＴ）、ＴＡＰ−１でトランスフェクトされたＣＭＴ. ６４（ＣＭＴＴＡＰ−１）、およびベクターのみでトランスフェクトされたＣＭＴ. ６４（ＣＭＴ Ｖec）をＶＳＶにより、ＭＯＩ ５で８時間感染するかもしくは感染させず、またはＮ５２−２９ペプチド ５００ｐＭ（５０％用量応答）で処理した。自然放出は１２％を越えなかった。図９は、ＶＳＶ感染したＴＡＰ−１陽性ＣＭＴ. ６４細胞が特異的なＣＴＬによって認識されたことを示している。この結果は、ＲＭＡ−Ｓ表現型とＶＳＶ提示に関するその見かけの“漏出（leakiness）”を説明するものである（Ｅquivel, Ｆ.ら, Ｊ. Ｅxp. Ｍed., １７５：１６３, １９９２；Ｈosken, Ｎ.Ａ.およびＭ.Ｊ. Ｂevan, Ｊ. Ｅxp. Ｍed., １７５：７１９, １９９２）。ＲＭＡ−Ｓ細胞およびトランスフェクトされたＣＭＴ. ６４細胞において、ＶＳＶ提示には、ＴＡＰ−１単独で十分であると思われ、ＥＲの孔へ特異的なペプチドを輸送することが可能なホモダイマーを形成し得る。トランスポーター以外にＲＭＡ−ＳおよびＣＭＴ. ６４の表現型の相違を、ＲＭＡ−Ｓ細胞において産生される多量のウイルスペプチドによって、ある程度説明し得る。興味深いことに、クラスIIの同一の領域に局在しているＬＭＰおよびＴＡＰの両方の発現の全体的な抑制は、細胞表面でのクラスＩのいかなる発現の回避にも十分であるらしい。癌細胞が免疫学的監視を回避するような方法を提供することによって、このことは幾つかの癌細胞に対しては極めて重要となろう（Ｅrodsky, Ｆ. Ｎ. , ら, Ｅur. Ｊ. Ｉmmunol., ９：５３６, １９７９；Ｒestifo  Ｎ. Ｆ. ら, Ｊ. Ｅxp. Ｍed., １７７：２６５, １９９３およびＢikoff  Ｅ. Ｋ. ら, Ｅur. Ｊ. Ｉmmunol. ２１：１９９１）。
実施例９
ＣＭＴ. ６４およびＣＭＴ６４／Ｒ１−４のＴＡＰ遺伝子発現プロファイル
ペプチド輸送において独立に機能するＴＡＰ−１の能力を調べるために、外在性ＴＡＰ−１またはＴＡＰ−２ｍＲＮＡを発現しない、マウス小肺癌細胞系ＣＭＴ. ６４にラットＴＡＰ−１ ｃＤＮＡを誘発した（図１０）。外在性ＴＡＰ遺伝子、並びに推定のプロテアソーム成分ＬＭＰ２および７をコードする遺伝子は、ＩＮＦ−γ処理後にのみ発現する（図１０）。陽性のトランスフェクト体をネオホスホトランスフェラーゼ選択系を用いて選択し、ＴＡＰ−１遺伝子の構成性発現をノーザン・ブロッティングにより確認した。
具体的には、ラットｃＤＮＡ ＴＡＰ−１によるＣＭＴ. ６４細胞のトランスフェクション（Ｐowis, Ｓ.Ｊ.ら, Ｎature  ３５４, ５２８〜５３１（１９９１）に記載のpＨbＡＰr−１−neo 発現ベクター中）は、ＤＮＡ１０μgを用いるリポフェクション（Ｌipofectin, ＢＲＬ）によって達成された。１mg／mＬ Ｇ４１８（Ｇibco）中で選択を行った。全ＲＮＡをグアニジンイソチオシアネートを用いて単離し、２.２Ｍホルムアルデヒド（１０μg／レーン）を含む１％アガロースゲル上で電気泳動した。ブロッティング、および［32Ｐ］−標識ｃＤＮＡ（ＴＡＰ−１および２）またはオリゴヌクレオチド（アクチン）とのハイブリダイゼーションを本明細書に記載のように行った。
ＴＡＰ−１および２ｍＲＮＡ転写物は、非誘発ＣＭＴ. ６４細胞には存在しなかったがマウス組換えＩＮＦ−γ ２００単位／mLの存在下で４８時間培養したＣＭＴ. ６４細胞においては検出された。ＣＭＴ６４／ｒ１−４はベクター由来ＴＡＰ−１ｍＲＮＡを高いレベルで発現したが、ＴＡＰ−２については、ネガティブのままだった。アクチンｍＲＮＡは、等量のＲＮＡがロードされていたことを示すために用いた。
３種類の高度な発現クローンを後の実験のために選択した（図１０）。ベクター単独でトランスフェクトされた３種のクローンも、後の実験の対照として選択し使用した。
実施例１０
ＴＡＰ−１発現は、ＣＭＴ. ６４細胞の細胞表面のＫbおよびＤbのレベルの増加に十分である
ＣＭＴ. ６４細胞は、ＤbおよびＫb重鎖を両方とも合成にもかかわらず、実質的に表面ＭＨＣクラスＩ分子を発現しない（Ｊefferies, Ｗ.Ａ.ら, 前掲, １９９３）。表面クラスＩ発現に対するＴＡＰ−１の影響を測定するために、ＤbおよびＫbに対する抗体を用いてフローサイトメトリーを行った。具体的には、細胞を１次抗体有りかまたは無しで１時間インキュベートした。インキュベーションはすべて４℃で行った。洗浄した後、細胞を蛍光イソチオシアナート−コンジュゲートヤギ抗マウスＩｇ抗体（２０mg／mＬ）とさらに１時間インキュベートした。２回洗浄した後、細胞を１.５％パラホルムアルデヒド中で固定した。蛍光プロファイルは、ＦＡＣＳｃａｎ（登録商標）プログラムを使用して半対数プロット中、５,０００個の細胞を分析することによって得た。
図１１に示すように、フローサイトメトリー分析により、ＴＡＰ−１発現が、ＣＭＴ. ６４細胞の細胞表面のＫbおよびＤbのレベルを増加させるに十分であるということが示された。抗体２８.１４.８ＳおよびＹ−３は、ＤbおよびＫbをそれぞれ認識する。すべての欄において、示した１次抗体によって得られた結果を実線で表している。破線は、１次抗体非存在下で得られた値を表している。結果は、３回の独立した実験の代表的なものを示している。
試験した抗体の両方について、ＣＭＴ. ６４およびベクター対照と比較して、ＣＭＴ−ＴＡＰ−１トランスフェクト体における表面発現の検出可能な増加があり、ＴＡＰ−１単独でペプチドを、ＭＨＣ集合の部位へと輸送し、細胞表面上での安定な複合体の形成、輸送および発現を可能にしていることを示唆している。細胞表面で発現したトランスフェリンレセプターの量は、ＴＡＰ−１のトランスフェクションによっては変化せず、血漿膜タンパク質に対する一般的な効果ではないことを示している（データを示していない）。ペプチド輸送に関する他の機構の関与を無視することができなかった他の系（Ｈosken, Ｎ.Ａ. ＆  Ｂevan, Ｍ.Ｊ., Ｊ. Ｅxp. Ｍed. １７５：７１９〜７２９  １９９２；Ｅsquivel, Ｆ., Ｙewdell, Ｊ. ＆  Ｂennink, Ｊ.Ｊ. Ｅxp. Ｍed. １７５：１６３〜１６８, １９９２；Ｚweerick, Ｈ.Ｊ.ら, Ｊ. Ｉmmunol. １５０：１７６３〜１７７１, １９９３）とは対照的に、これらの結果は、ＣＭＴ. ６４細胞のＴＡＰ−２の不在下で表面クラスＩ発現を増加させるＴＡＰ−１の能力を明確に示している。
実施例１１
ＣＭＴ. ６４およびＴＡＰ−１トランスフェクトされたＣＭＴ. ６４細胞に由来するＫbおよびＤb分子のパルス−チェイス分析
クラスＩ重鎖の細胞表面への細胞内輸送は、ゴルジ特異的な酵素への連続的な暴露中のＮ−結合グリカンの修飾によって高分子量の形態へとプロセッシングされることにより行われる。パルス−チェイス分析は、このようなプロセシングがＣＭＴ−ＴＡＰ−１トランスフェクト体において達成されたかどうかを決定するために行い、ＫbおよびＤbの表面発現の増加によってこれは予測される。
35Ｓ−メチオニン（アマシャム）および免疫沈降２８.１４.８Ｓ（抗−Ｄb）およびＹ−３（抗−Ｋb）モノクローナル抗体による１５分間のパルスを使用して、前記の方法に従って、ＫbおよびＤbのパルス−チェイスおよび免疫沈降を行った。試料を１０〜１５％ゲル上のＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析し、増幅液で処理した。オートラジオグラムを１０日後に現像した。
オリゴ糖側鎖のプロセッシング中に重鎖の分子量の増加によって示されるように、ＴＡＰ−１トランスフェクトされた細胞において、ＫbおよびＤb分子の細胞表面への輸送が起こった（図１２）。トランスフェクトされなかったＣＭＴ. ６４細胞においては、プロセッシングは観察されず（図１２）、小胞体またはシスゴルジ内での保持を示した。このことはエンドグリコシダーゼＨに対する感受性によって確認された（データは示していない）。
総括すると、ＣＭＴ. ６４とＣＭＴ６４／Ｒ１−４との比較により、ＴＡＰ−１の存在がＤbとＫbのプロセッシングを生じさせるに十分であることが示された。さらに、エンドグリコシダーゼＨ処理によって、ＫbおよびＤbの高分子量のプロセッシング型は分解に対して耐性（データは示していない）であることが分かった。これらの結果は、これらの細胞におけるＭＨＣクラスＩ分子の輸送および表面発現に対するＴＡＰ−１の重要性をさらに確認する。
実施例１２
ＴＡＰ−１トランスフェクトされたＣＭＴ. ６４細胞はＶＳＶ特異的ＣＴＬに対して効果的に抗原を提示する
以前の実験において、ＣＭＴ. ６４細胞は、ＩＮＦ−γで前処理するか、ＶＳＶ Ｎタンパク質に由来する合成ペプチドと共に直接インキュベーションしない限り、細胞障害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）に対してＶＳＶペプチドを提示することができないということが確立された（Ｊefferiesら, Ｊ. Ｉmmunol. １５１：２９７４〜２９８５, １９９３）。機能性抗原のプロセッシングおよび提示を補うＴＡＰ−１発現の能力を試験するために、標的としてＣＭＴ. ６４およびＣＭＴ−ＴＡＰ−１およびＣＭＴベクタートランスフェクト体を用いて、ＶＳＶ−特異的ＣＴＬでクロム放出分析を行った。
具体的には、ＣＭＴ. ６４（ＣＭＴ）およびＣＭＴ−ＴＡＰ−１トランスフェクト体を、ＶＳＶ（ＭＯＩ：２）で８〜１０時間感染させるか、またはインフルエンザ株Ａ／ＰＲ／８／３４で４８時間処理した（ＲＮＡの場合は、３００ＨＡ単位、ＣＭＴ. ６４およびその誘発体の場合は５００ＨＡ単位）。
Ｃ５７ｂ１／６マウスをＶＳＶで足の肉趾および耳に感染させるかまたは７００ＨＡunitsのインフルエンザ腹腔内投与によって、エフェクターＣＴＬ集団を生じさせた。ＶＳＶＣＴＬを、免疫後５日目に集めたリンパ節の排出により得、単細胞懸濁液を４×１０6個／ｍLで３日間、いかなる再刺激（restimulation）もなしに培養した。インフルエンザＣＴＬを、免疫後４〜５週間後に脾細胞から得、インフルエンザ感染刺激剤の存在下で６日間培養した。培地は、１０％ＦＢＳ、Ｌ−グルタミン、Ｐen／Ｓtrep、および２ＭＥを添加した、１：１の割合のＲＰＭＩ−１６４０とＮＣＴＣ−１０９からなる。標的とエフェクターを混合し、４時間インキュベートした。偽（mock）感染細胞（＋−−−）を負の対照として使用した。結果を、Ｊefferies, Ｗ. Ａ., Ｋolaitis, Ｇ. ＆  Ｇabathuler, Ｒ., Ｊ. Ｉmmunol. １５１, ２９７４〜２９８５（１９９３）で詳述されているように、比放出％によって示した。
図１３に示した結果は、ＴＡＰ−１トランスフェクトされたＣＭＴ.６４細胞（ＣＭＴ−ｒ１.１、ｒ１−４およびｒ１−１０クローン）は、ＶＳＶ特異的ＣＴＬに対して抗原を効果的に提示していることを示している。ＴＡＰ−１のＣＭＴ.６４細胞への導入により、ＶＳＶ感染後の抗原提示が回復した。ＶＳＶで感染された、野生型のＣＭＴ.６４細胞およびベクタートランスフェクトされたＣＭＴ細胞は、ＣＴＬによって認識されない。図１７は、ＣＭＴ−ＴＡＰ１細胞によって、インフルエンザウイルスが特異的ＣＴＬに対して提示されないということを示している。ＣＭＴ.６４、ＲＭＡおよびＣＭＴｒ１.４細胞をインフルエンザウイルスで感染させ、インフルエンザ特異的ＣＴＬに暴露した。しかし、この場合には、ＣＭＴ−ＴＡＰ−１細胞の認識はなかった。正の対照、ＲＭＡおよびＣＭＴ.６４＋Ｉnf、は両方ともＣＴＬによって効果的に溶解された。
実験をさらに行い、ＶＳＶ発現がＴＡＰ−１トランスポーターの発現のみを必要とすること、そしてラットＴＡＰ−１遺伝子を発現するＣＭＴ.６４細胞の認識だけで、両方のトランスポーターＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２を発現する細胞とほぼ同じくらい効果的であることが示された。ＴＡＰ−２単独の発現は効果的ではないようである（図１４）。種々のＴＡＰ−１クローンも分析し、これまでの結論を確認した（図１５）。
インフルエンザウイルスで感染された細胞は、両方のＴＡＰ遺伝子が存在する場合にのみ効果的に認識されることが分かった（図１６または図１８）。図１６は、ＩＮＦ−γで処理されたＲＭＡ細胞およびＣＭＴ.６４細胞がインフルエンザ感染後に効果的に認識されることを示している。ラットＴＡＰ−１遺伝子でトランスフェクトされたＣＭＴ.６４細胞は認識されなかった。図１７は第２の独立した実験で観察された同じ結果を示している。図１８は、ＩＮＦ−γで処理されたＲＭＡ細胞およびＣＭＴ.６４細胞の外に、両方のラットＴＡＰ遺伝子でトランスフェクトされたＣＭＴ.６４細胞は、インフルエンザウイルス感染後に認識されることを示している。図１９は、ＨＳＶ感染された細胞が、特異的ＣＴＬによって、ラットＴＡＰ−１および／またはＴＡＰ−２トランスポーター遺伝子の発現とは独立して認識されることを示している。
これらの結果は、個々のＴＡＰ−１トランスポーター分子が、ＴＡＰ−２不在の場合に欠損細胞に対する抗原提示能力を回復できるという証拠を提供するものである。この発見は、ＴＡＰ−２を発現しない細胞内で、ＴＡＰ−１タンパク質がＭＨＣクラスＩ重鎖と相互作用するという最近の観察（Ｓuh, Ｗ. Ｈ.ら, Ｓcience ２６４：１３２２〜１３２６, １９９４）と関連している。このことは２つの推定トランスポーター分子間のヘテロ二量体形成のための絶対的な必要条件に異論を唱えるものであり、トランスポーター複合体の異なった形態が機能的で、ＭＨＣクラスＩ分子との集合のための抗原ペプチドプールの別個のサブセットの輸送を媒介することを示している。
実施例１３
腫瘍生存に対するＴＡＰの効果
マウスにＣＭＴ.６４細胞またはＣＭＴ.１２.１２細胞（ラットＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２トランスフェクトされたクローン）を、マウス１匹当たり２×１０5および５×１０5個で腹腔内注射した。受容マウスへの接種の前にこの細胞系をＰＢＳ中に再懸濁した。結果を表２に表す。５×１０5個のＣＭＴ.６４細胞で処置したマウスの１匹を屠殺し、解剖により注射の部位に固形の腫瘍の存在がはっきりと認められた。さらに、腸間膜リンパ節が大いに拡大した。
実施例１４
ＴＡＰ−１トランスポーター、ＴＡＰ−２トランスポーターおよびＴＡＰ１−ＴＡＰ−２トランスポーターによってＥＲ内で転送されたペプチドを見いだすための実験アプローチを以下に示す。
１. ＴＡＰ−１、ＴＡＰ−２、およびＴＡＰ−１ＴＡＰ−２トランスポーターを発現する細胞系の使用；例えば、ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２に由来するｃＤＮＡでトランスフェクトされたＣＭＴ. ６４細胞、ＣＭＴ. ６４、ＣＭＴ.１.４、ＣＭＴ. ２−１０、ＣＭＴ. １２−１２
２. これら細胞のサブ細胞分別
３. ＥＲ（小胞体）の単離
４. ０.１％ＴＦＡ中のＥＲからのペプチドの抽出
５. ゲル濾過
６. 逆相ＨＰＬＣ
７. 画分を集めてＣＴＬ感作について試験するかまたは細胞が標識されていれば放射能について試験する
８. 最後に、アミノ酸の配列決定
異なるＴＡＰトランスポーターを発現する種々の細胞系に由来するＨＰＬＣプロファイルの比較により、ＴＡＰ分子に対するペプチド輸送の依存性についての情報が得られよう。ペプチドのピークは単離し、分析できる。ペプチドの配列決定により、ＴＡＰ−１単独、ＴＡＰ−２単独、またはＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２分子を用いる輸送に必要なモチーフについての情報が得られよう。ペプチド分析および配列決定のためのプロトコールは標準的で、Ｒammenseeの文献やＥngeｌhardの文献に記載されている。
実施例１６
ＲＭＡ−Ｓ細胞におけるアンチセンスノックアウト
細胞集団から一部を選択し、これついて予備実験を行った。用いたコンストラクトは、ＭＴＰ１および２クローンがすべて前記のように得られる、同一のｐＨβＡ−neoであった。この実験において、ＭＴＰ１ｃＤＮＡ挿入体を切り出し、反対方向の配列で置換した。ＲＭＡ−Ｓ細胞は、ＴＡＰ−１のみを有し、ＴＡＰ−２は有さないので、ＭＴＰ１アンチセンスのみを使用した。以下のデータは、単色ＦＡＣＳ分析により得られたものであり、数字は線形である（試料あたり５０００回計測）。２８２１４.８ｓ抗体はＤbに特異的であり、Ｙ−３抗体はＫbに特異的である。アンチセンスコンストラクトをＲＭＡ−Ｓ.ptm１と呼ぶ。
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実施例１７
腫瘍細胞を注入したマウスの生存に対するＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２の効果
ＣＭＴ. ６４細胞（Ｃ５７ＢＬ／６マウスに由来）またはＣＭＴ. １２.１２細胞（ＴＡＰ−１およびＴＡＰ−２でトランスフェクトされたＣＭＴ. ６４に由来）を非常に高い投与量で注射した、同系（syngeneic）のＣ５７ＢＬ／６と対照の同種異系（allogeneic）のＢalb／Ｃマウスの生存について、以下のようにして調べた。
５×１０5のＣＭＴ. ６４またはＣＭＴ. １２.１２細胞をマウスの腹腔内に注射して、このマウスを９０日間追跡した。死後または９０日後にマウスを解剖した。マウスの生存を図２０に示す。解剖の結果を表３にまとめた。ＣＭＴ. ６４細胞を注射された同系Ｃ５７ＢＬ／６マウスはすべて６０日目より前に死んだ。これらのマウスは、全身にわたって侵襲性の広汎な転移性腫瘍が存在していることが分かり、破裂した器官および／または腹腔内の過剰の体液と共に穿孔した腸がみられた。これは、Ｂ型の病態として分類された。ＣＭＴ. １２.１２細胞を注射された同系のマウスのおよそ２０％は、６０日目に生存しており、２０匹のうち３匹は９０日目に生存していた。以下に記載するように、これらのマウスの合計２０匹のうち１７匹はＢ型の病態を有し、２匹は明らかな病態は見られず、１匹はＡ型の病態を有していた。
ＣＭＴ. ６４細胞を注射した同種異系の対照マウスのおよそ７０％は、９０日目で生存していたが、有意の病態は認められなかった。この内の数匹のマウスはいかなる病態も認められず、注射した部位に小さな腫瘍（４〜１５mm）を有するにすぎなかった。これをＡ型の病態として分類した。ＣＭＴ. １２.１２細胞を注射した同種異系マウスは、９０日目で１００％生存しており、病態は認められなかった。
これらの結果は、ＣＭＴ.１２.１２細胞を注射された同系マウスが、ＣＭＴ. ６４細胞でトランスフェクトされたマウスよりも長く生存したことを示しており、これは恐らく宿主の免疫系による改善されたＭＨＣクラスＩ抗原提示と、認識によるものであろう。ＣＭＴ.１２.１２細胞でトランスフェクトされた同系マウスのうち、９０日目で生存していたものはいないかまたはほとんどいなかった。
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【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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