(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素。
配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、又は付加を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
【請求項２】
スクロース及びガラクチノールに請求項１に記載のラフィノース合成酵素を作用させてラフィノースを生成させることを特徴とするラフィノースの製造方法。
【請求項３】
請求項１に記載のラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡ。
【請求項４】
下記に示すタンパク質をコードするＤＮＡ。
配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、又は付加を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
【請求項５】
下記に示すＤＮＡである請求項４記載のＤＮＡ。
配列表の配列番号２３に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項６】
配列表の配列番号２３に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ。
【請求項７】
ラフィノース合成酵素遺伝子と、植物細胞で発現可能な転写制御領域とを含むキメラ遺伝子であって、前記ラフィノース合成酵素遺伝子が、請求項３〜５のいずれか一項に記載のＤＮＡである前記キメラ遺伝子。
【請求項８】
請求項７記載のキメラ遺伝子で形質転換された植物。
【請求項９】
請求項７記載のキメラ遺伝子で植物を形質転換し、この遺伝子を植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を増加させる方法。
【請求項１０】
請求項３〜５のいずれか一項に記載のＤＮＡで形質転換された植物。
【請求項１１】
請求項３〜５のいずれか一項に記載のＤＮＡで植物を形質転換し、このＤＮＡを植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を増加させる方法。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は、ラフィノース合成酵素、ラフィノース合成酵素もしくはラフィノース合成酵素を含む細胞抽出物を用いたラフィノースを合成する方法、ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡ、及びこのＤＮＡの植物における利用に関する。ラフィノースは、ビフィズス菌増殖活性を有し食品原料として、あるいは臓器保存液などの医薬品として様々な分野で利用されている。
【０００２】
【従来の技術】
ラフィノースは、スクロースのグルコシル基にガラクトースがα−１，６結合したラフィノース族オリゴ糖の一つである。ラフィノース属オリゴ糖には、ラフィノースの他に、ガラクトースが２つ結合したスタキオース、３つ結合したベルバスコースなどがある。これらの糖は、豆類、ナタネ、綿実など様々な植物の種子中の貯蔵糖と、キュウリやメロンなどウリ科植物にみられる転流糖として、また耐冷性を獲得したロゼット葉、甜菜（サトウダイコン）など植物に広く存在する。
【０００３】
ラフィノース族オリゴ糖の生合成は、次のようであり、
UDP-ガラクトース ＋ ミオイノシトール → ガラクチノール ＋ UDP  ・・・(ａ)
ガラクチノール ＋ スクロース → ラフィノース ＋ ミオイノシトール     ・・・(ｂ)
ガラクチノール ＋ ラフィノース → スタキオース ＋ ミオイノシトール    ・・・(ｃ)
各々の反応は（ａ）ガラクチノール合成酵素（ＧＳ：EC2.4.1.123）、（ｂ）ラフィノース合成酵素（ＲＳ：EC2.4.1.82）（ｃ）スタキオース合成酵素（ＳＴＳ：EC2.4.1.67）により触媒される。
【０００４】
現在、ラフィノースは、甜菜から抽出され、スクロース精製過程において分離精製されている。しかし、ラフィノースはスクロースの結晶性を低下させるので、甜菜は低ラフィノースを目標に育種、改良され、甜菜中のラフィノース含量は０．０３％から０．１６％（Enzyme Microb. Technol., Vol.4 May, 130-135(1982)）と低い。従って、このような低含量の甜菜より効率的にラフィノースを得るのは容易ではない。
【０００５】
先に述べたように、ラフィノースは、ダイズをはじめとするマメ科の成熟種子に含まれているほか、甜菜、あるいはキュウリなどのウリ科植物に含まれている。ダイズの成熟種子中には、ダイズオリゴ糖として、スクロース（含有量約５％）、スタキオース（同約４％）、ラフィノース（同約１％）が含まれている。これらのダイズオリゴ糖は、脱脂ダイズから除蛋白した画分に回収され、濃縮後、機能性食品などに利用されている。しかし、オリゴ糖全体の中でもラフィノースは１０％であり、量的にも少ない。
【０００６】
一方、ラフィノースの酵素的合成法も報告されている（Trends in Glycoscience and Glycotechnology 7.34, 149-158(1995)）。これは、α-ガラクトシダー ゼの縮合反応によりガラクトビオースを合成し、さらにこのガラクトビオースをガラクトシル基の供与体としてスクロースにガラクトシル転移反応により転移させて、ラフィノースを合成する方法である。しかし、この反応は、乳糖加水分解物１．９ｋｇよりガラクトビオースが３５０ｇ合成され、ガラクトビオース１９０ｇとスクロース７６０ｇよりラフィノース１００ｇが得られる反応であり、生成するラフィノースの収率が低く、効率的な合成法には至っていない。
【０００７】
以上のような方法の他に、生合成系酵素遺伝子の形質転換により、ラフィノース含量の高い植物を育種する方法も考えられる。例えば、Ｋｅｒｒらはガラクチノール合成酵素遺伝子をクローニングし、ナタネを形質転換した（WO93/02196）。しかし、その結果、ＧＳ活性は増加したが、ラフィノース族オリゴ糖は逆に低下し、ガラクチノール合成酵素を導入することによるラフィノース族オリゴ糖の生合成を増加させるという目的は達成されなかった。したがって、植物のラフィノース族オリゴ糖の含量を増加させるする方法は提供されていない。
【０００８】
一方、ラフィノ―ス族オリゴ糖を低減化することも求められている。先に述ベたように、ラフィノース族オリゴ糖は、主に、ダイズなど豆類、ナタネ、綿実など様々な植物の種子中の貯蔵糖と、キュウリやメロンなどウリ科植物にみられる転流糖として、また、耐冷性を獲得したロゼット葉、甜菜、など植物に広く存在しており、ダイズ、ナタネ、綿実などの搾油されたミールには、これらのラフィノース族オリゴ糖が含まれている。これらミールのほとんどは、飼料として利用されているが、α−ガラクトシダーゼを持たないヒトや動物は、直接ラフィノース族オリゴ糖を消化することはできない。さらに、ラフィノース族オリゴ糖は、腸内細菌が資化しガスを発生させるなどにより、飼料の代謝エネルギー効率を低下させることが知られており、飼料中のラフィノース族オリゴ糖を除くことで、トリの飼料効率が上昇したと報告されている（Coon, Proceeding Soybean Utilization Alternatives. Univrsity of Minnesota, 203-211 (1989)）。このようなことから、ラフィノース族オリゴ糖の減少したダイズ、ナタネ、綿実などの飼料作物が望まれている。
【０００９】
また、これらの植物の中では、油の含量を多くする育種がなされてきた。光合成産物は、油脂、タンパク質、ラフィノース族オリゴ糖を含む糖質に分配されている。ダイズでは、油脂量と糖質量に負の相関があることが報告されている。ラフィノース族オリゴ糖の生成を抑制することにより、同じ光合成の能カのダイズにおいて油脂含量を増加させることが期待できる。
【００１０】
以上の観点から、Ｋｅｒｒらは、交配選抜育種により、ラフィノース族オリゴ糖が８０％から９０％低下した低ラフィノース族オリゴ糖ダイズ品種を作出したと報告している（WO93/00742）。しかしこれは、品種の作出であり、栽培適性や、耐病性などに対応した様々な品種に応用できるものではない。また、広く様々な植物に適用できるものではない。
【００１１】
甜菜、サトウキビなどにも含まれるラフィノースは、砂糖の結晶性を低下させることが知られている。従って、ラフィノースの生成がなければ、これら植物での砂糖の生成効率が上がることが期待できるが、ラフィノースを含まないテンサイは作出されていない。
【００１２】
上述したように、従来精製されたラフィノース合成酵素は、酵素活性として確認されているのみであり、酵素の同定はなされていなかった。また、その活性も低いものであり、活性の高いラフィノース合成酵素が望まれていた。また、従来のラフィノースの製造法は収率が低く、効率のよいラフィノースの製造法が望まれていた。その一方で、ラフィノ―ス族オリゴ糖が低減化された植物を育種することも望まれている。
【００１３】
【発明が解決しようとする課題】
本発明は、上記観点からなされたものであり、活性の高いラフィノース合成酵素及びこれをコードするＤＮＡの取得、効率的なラフィノースの酵素的合成法、及びラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの植物における利用法を提供することを課題とする。
【００１４】
【課題を解決するための手段】
本発明者は、上記課題を解決するために鋭意検討を行った結果、キュウリからラフィノース合成酵素を精製することに成功した。また、このラフィノース合成酵素をコードする遺伝子をクローニングするために、本発明者らは鋭意検討を行った。その結果、キュウリのラフィノース合成酵素ペプチド断片のアミノ酸配列より推定した塩基配列をもとに一本鎖ＤＮＡを化学合成し、この一本鎖合成ＤＮＡをプライマーとして、キュウリから抽出したｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡより作製したｃＤＮＡを鋳型としてＰＣＲを行い、ラフィノース合成酵素遺伝子に特異的なＤＮＡ断片を得た。さらに、このＤＮＡ断片をプローブとしてキュウリ由来ｃＤＮＡライブラリーに対しハイブリダイゼーションを行い、ラフィノース合成酵素遺伝子を単離する方法を採用し、ラフィノース合成酵素遺伝子を単離した。また、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子の情報をもとにダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子をクローニングするために鋭意研究を行い、その結果、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子を単離した。この単離したラフィノース合成酵素遺伝子断片を用い、植物で発現可能な制御領域を有するキメラ遺伝子を作成し、植物を形質転換した。さらに、導入したラフィノース合成酵素遺伝子により、ラフィノース族オリゴ糖の低減化した植物を作出するに至った。
【００１５】
すなわち本発明は、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するラフィノース合成酵素を提供する。
好ましくは、本発明は、下記（Ａ）、（Ｂ）、（Ｃ）又は（Ｄ）に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素を提供する。
（Ａ）配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｂ）配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
（Ｃ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｄ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
【００１６】
また、本発明は、下記性質を有するラフィノース合成酵素を提供する。
（１）作用及び基質特異性：スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する。
（２）至適ｐＨ：約６〜８
（３）至適温度：約３５〜４０℃
（４）分子量：
▲１▼ゲルろ過クロマトグラフィーにより測定される分子量：約７５ｋＤａ〜９５ｋＤａ
▲２▼ポリアクリルアミドゲル電気泳動（Ｎａｔｉｖｅ  ＰＡＧＥ）により測定される分子量：約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａ
▲３▼還元条件下におけるＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）により測定される分子量：約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａ
（５）阻害：
ヨードアセトアミド、Ｎ−エチルマレイミド、ミオイノシトールにより阻害される。
【００１７】
本発明は、上記ラフィノース合成酵素の具体的な態様として、アミノ酸配列中に、配列表配列番号２８〜３０に示す各アミノ酸配列を含むラフィノース合成酵素を提供する。
【００１８】
また、本発明は、下記（Ｃ）又は（Ｄ）に示すタンパク質であるラフィノース合成酵素を提供する。
（Ｃ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｄ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
【００１９】
本発明はまた、スクロース及びガラクチノールに上記ラフィノース合成酵素を作用させてラフィノースを生成させることを特徴とするラフィノースの製造方法を提供する。
【００２０】
本発明はさらに、上記ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡ、及び、特に、下記（Ａ）、（Ｂ）、（Ｃ）又は（Ｄ）に示すタンパク質をコードするＤＮＡを提供する。
（Ａ）配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｂ）配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
（Ｃ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｄ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
【００２１】
本発明は、上記ＤＮＡの具体的態様として、下記（ａ）、（ｂ）、（ｃ）又は（ｄ）に示すＤＮＡを提供する。
（ａ）配列表の配列番号４に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号５６〜２４０７からなる塩基配列を含むＤＮＡ。
（ｂ）配列表の配列番号４に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号５６〜２４０７からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
（ｃ）配列表の配列番号２３に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列を含むＤＮＡ。
（ｄ）配列表の配列番号２３に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【００２２】
また、本発明は、ラフィノース合成酵素のアンチセンスＲＮＡまたはセンスＲＮＡを発現させるために使用できるＤＮＡ、すなわち、下記（ｅ）又は（ｆ）に示すＤＮＡを提供する。
（ｅ）配列表の配列番号４に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号５６〜２４０７からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ。
（ｆ）配列表の配列番号２３に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ。
【００２３】
さらに本発明は、ラフィノース合成酵素遺伝子又はその一部と、植物細胞で発現可能な転写制御領域とを含むキメラ遺伝子、及び、このキメラ遺伝子で形質転換された植物を提供する。
【００２４】
また本発明は、前記キメラ遺伝子で植物を形質転換し、この遺伝子を植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させる方法を提供する。
【００２５】
以下、上記（１）〜（５）に記載の性質を有するラフィノース合成酵素、又は、上記（Ａ）、（Ｂ）、（Ｃ）及び（Ｄ）のタンパク質であるラフィノース合成酵素を、単に「ラフィノース合成酵素」ということがある。また、ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡ、又はラフィノース合成酵素をコードし、さらに非翻訳領域を含むＤＮＡを、「ラフィノース合成酵素遺伝子」ということがある。
【００２６】
【発明の実施の形態】
以下、本発明を詳細に説明する。
＜１＞本発明のラフィノース合成酵素
本発明のラフィノース合成酵素は、下記（Ａ）、（Ｂ）、（Ｃ）又は（Ｄ）に示すタンパク質である。
（Ａ）配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｂ）配列表の配列番号５に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
（Ｃ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
（Ｄ）配列表の配列番号２４に記載のアミノ酸配列において、１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性を有するタンパク質。
【００２７】
本発明のラフィノース合成酵素には、下記性質を有するものが含まれる。
（１）作用及び基質特異性：スクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する。
（２）至適ｐＨ：約６〜８
（３）至適温度：約３５〜４０℃
（４）分子量：
▲１▼ゲルろ過クロマトグラフィーにより測定される分子量：約７５ｋＤａ〜９５ｋＤａ
▲２▼ポリアクリルアミドゲル電気泳動（Ｎａｔｉｖｅ  ＰＡＧＥ）により測定される分子量：約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａ
▲３▼還元条件下におけるＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）により測定される分子量：約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａ
（５）阻害：
ヨードアセトアミド、Ｎ−エチルマレイミド、ミオイノシトールにより阻害される。
【００２８】
上記の性質を有するラフィノース合成酵素は、キュウリ本葉より単離、精製されたものであり、発明者により初めて同定された。このキュウリ由来のラフィノース合成酵素は、後記実施例に示すように、その酵素タンパク質のアミノ酸配列中に、配列表配列番号１〜３、または、２８〜３０に示す各アミノ酸配列を含んでいる。また、その全アミノ酸配列を、配列表配列番号５に示す。
【００２９】
ラフィノース合成酵素は、ウリ科植物、例えばメロン（Cucumis melo）、キュウリ（Cucumis sativus）などの植物から得られる。特に、これらの植物の葉、 特に葉脈部分、及び種子等の組織がラフィノース合成酵素の含有量が多い。
【００３０】
次に、本発明のラフィノース合成酵素の製造法の例として、キュウリからラフィノース合成酵素を単離・精製する方法を説明する。
播種後６〜１０週間のキュウリ本葉より、葉脈部分を集め、液体窒素下で乳鉢等を用いて磨砕し、緩衝液を加えてタンパク質を抽出する。その際、ラフィノース合成酵素の分解、失活等を防ぐための物質、例えばＰＭＳＦ（フェニルメタンスルフォニルフルオリド）等のプロテアーゼ阻害剤や、ポリクラールＡＴ（セルバ(Ｓｅｒｖａ)社製）等を加えてもよい。この抽出液から濾過及び遠心分離により不溶物を除去し、粗抽出液を得る。
【００３１】
上記のようにして得られる粗抽出液を、通常のタンパク質の精製法、例えば、陰イオン交換クロマトグラフィー、ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィー、ゲル濾過、塩析等を組み合わせて分画することによって、ラフィノース合成酵素を精製することができる。
【００３２】
陰イオン交換クロマトグラフィーは、例えば、ＨｉＴｒａｐＱ（ファルマシア社製）等の強塩基性陰イオン交換体や、ＤＥＡＥ−ＴＯＹＯＰＥＡＲＬ（東ソー社製）等の弱塩基性陰イオン交換体を充填したカラムを用いることによって行うことができる。ラフィノース合成酵素を含む抽出液をこれらのカラムに通液させて酵素をカラムに吸着させ、カラムを洗浄した後に、高塩濃度の緩衝液を用いて酵素を溶出させる。その際、段階的に塩濃度を高めてもよく、濃度勾配をかけてもよい。例えば、ＨｉＴｒａｐＱカラムを用いた場合には、カラムに吸着したラフィノース合成酵素活性は、０．３Ｍ程度のＮａＣｌで溶出される。また、ＤＥＡＥ−ＴＯＹＯＰＥＡＲＬでは溶出液として０．０５Ｍ〜０．３５ＭのＮａＣｌ濃度勾配が、ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィーでは溶出液として０．０１Ｍ〜０．３Ｍのリン酸濃度勾配が好ましい。
【００３３】
上記の操作の順は特に問わず、また、各操作は２回又はそれ以上繰り返してもよい。また、それぞれのカラムに試料液を通液する前に、透析等によって試料液を適当な緩衝液に交換しておくことが望ましい。さらに、それぞれの段階で試料液を濃縮してもよい。
【００３４】
精製の各段階においては、分画されたフラクション中に含まれるラフィノース合成酵素活性を測定し、活性の高いフラクションを集めて次の段階に供試することが好ましい。ラフィノース合成酵素活性を測定する方法としては、例えば、Lehle,H らにより報告されている放射性同位体を用いる方法（Eur.J.Biochem.,38,103-110(1973)）が挙げられる。また、この変法として、反応温度と基質濃度を 変更してもよい。例えば、最終濃度として、１０ｍＭ 14Ｃ-スクロース、２０ｍＭ ガラクチノール、２５ｍＭ ＨＥＰＥＳ（2-(4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジニル)エタンスルホン酸）-ＮａＯＨ，ｐＨ７．０、５ｍＭ ＤＴＴ（ジチオスレイトール）を含む反応液に、１０μｌの酵素液を加えて５０μｌとする。これを、３２℃、１時間インキュベートして反応を行い、２００μｌのエタノールを加え、９５℃で３０秒間加熱して、反応を停止する。この反応液の遠心上清をワットマン３ＭＭ濾紙にスポットし、ｎ−プロパノール：酢酸エチル：水＝４：１：２にて展開した。14Ｃのラフィノースへの取り込みを調べ、これをラフィノース合成酵素活性（ｎｍｏｌ／時間）とする。
【００３５】
本発明者は、上記の方法に代わる方法として、ラフィノース合成反応により生成するラフィノースをＨＰＬＣ（高速液体クロマトグラフィー）により定量することによって、ラフィノース合成酵素活性を測定する方法を開発した。この方法によれば、Lehle,Hらの方法に比べて簡便かつ迅速に測定することができ、特に 精製操作における活性フラクションの検出には好適である。以下に本方法を説明する。
【００３６】
ラフィノース合成反応は、最終濃度が下記の組成になるように調製した反応液に１０〜５０μｌのラフィノース合成酵素液を添加して１００μｌとし、３２℃で６０分間、反応を行う。
〔反応液組成（最終濃度）〕
2.5 mM  スクロース
5 mM  ガラクチノール
5 mM  ＤＴＴ
20 mM  トリス塩酸緩衝液（ｐＨ７．０）
【００３７】
上記のようにして反応を行った後、反応液の４倍容のエタノールを加え、９５℃で３０秒間加熱して反応を停止する。これを遠心し、遠心上清を減圧乾固した後、蒸留水に溶解し、ＨＰＬＣにて反応生成物中のラフィノースを定量し、ラフィノース酵素活性とする。ＨＰＬＣは、例えば、糖分析システムＤＸ５００（CarboPac PA1カラム、パルスドアンペロメトリー検出器（ダイオネクス社製））を用いて行うことができる。
【００３８】
反応時間を変化させたときの生成ラフィノース量を上記の方法により測定した結果を図１に示す。図から明らかなように、本方法により、ラフィノース合成酵素活性を直線性よく、かつ簡便に測定することができる。
【００３９】
精製されたラフィノース合成酵素の精製度の確認や分子量の測定は、ゲル電気泳動、ゲルろ過クロマトグラフィー等によって行うことができる。また、酵素学的性質は、反応温度あるいは反応ｐＨを変化させて酵素活性を測定し、あるいは種々の酵素阻害剤や金属イオン等を反応液に添加し、残存酵素活性を測定することによって、検討すればよい。さらに、ラフィノース合成酵素を種々のｐＨ条件下又は温度条件下に一定時間さらした後に酵素活性を測定することにより、安定ｐＨ範囲及び安定温度範囲を調べることができる。
【００４０】
前記したラフィノース合成酵素の性質は、このようにして決定されたものであるが、測定条件によって異なる結果が得られる場合があることに留意すべきである。例えば、ゲルろ過クロマトグラフィーによる分子量の測定は、用いるゲルろ過担体や緩衝液の種類、あるいは分子量マーカーによって、影響される。また、酵素活性は、同じｐＨであっても緩衝液の種類又は塩濃度によって異なることが多い。したがって、ラフィノース合成酵素の同定に際しては、個々の性質のみではなく、総合的な検討を行うことが好ましい。
【００４１】
本発明のラフィノース合成酵素は、上記のようにキュウリから単離・精製することによって得られるが、異種タンパク質の醗酵生産に通常用いられている方法によって、後述するキュウリ由来、ダイズ由来あるいはその他の植物由来のラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを適当な宿主に導入し、発現させることによっても製造することができる。
【００４２】
ラフィノース合成酵素遺伝子を発現させるための宿主としては、エシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）をはじめとする種々の原核細胞、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）をはじめとする種々の真核細胞が考えられるが、植物細胞、特にタバコ、キュウリ、シロイヌナズナ（アラビドプシス）等の植物由来の細胞が望ましい。
【００４３】
形質転換に用いる組み換えプラスミドは、発現させようとする細胞の種類に応じた発現ベクターに、ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを挿入することで調製可能である。植物の発現ベクターは、植物で働くプロモーターＤＮＡ配列、またはそれらを複数個組み合わせたものと、植物で働くターミネーターＤＮＡ配列を持ち、その間に外来遺伝子を挿入できる配列を有するものであればよい。
【００４４】
このようなプロモーターには、植物体全体で発現するＣａＭＶ  ３５ＳＲＮＡプロモーター、ＣａＭＶ  １９ＳＲＮＡプロモーター、ノパリン合成酵素プロモーター等、緑色組織で発現するＲｕｂｉｓＣＯ小サブユニットプロモーター等、種子などの部位特異的に発現するナピン（ｎａｐｉｎ）、ファセオリン（ｐｈａｓｅｏｌｉｎ）等の遺伝子のプロモーター等が挙げられる。さらに、上記のようなターミネーターとしてはノパリン合成酵素ターミネーター、ＲｕｂｉｓＣＯ小サブユニット３’側部位等が挙げられる。
【００４５】
植物用の発現ベクターとしてｐＢＩ１２１、ｐ３５Ｓ−ＧＦＰ（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社製）等が市販されているのでこれを用いてもよい。ウイルスＲＮＡを発現するベクターを用い、そのコードしている外皮タンパク質などの遺伝子をラフィノース合成酵素遺伝子に置換してもよい。
【００４６】
形質転換には通常用いられている方法、アグロバクテリウム法、パーティクルガン法、エレクトロポレーション法、ＰＥＧ法等を、供試する宿主細胞に応じて用いればよい。ラフィノース合成酵素活性の検出には、ラフィノース合成酵素精製を行った方法を用いることができる。その際、試料を陰イオン交換カラムに通すなどして、あらかじめα‐ガラクトシダーゼを除いておくことが望ましい。
【００４７】
キュウリ由来のラフィノース合成酵素をコードする遺伝子とは、発現した時にラフィノース合成酵素活性を有するものであればすべて含まれるが、好ましくは、配列表の配列番号５記載のアミノ酸配列をコードするＤＮＡを有する遺伝子、又は配列表の配列番号４記載の塩基配列を有する遺伝子が挙げられる。また、ダイズ由来のラフィノース合成酵素をコードする遺伝子とは、発現した時にラフィノース合成酵素活性を有するものであればすべて含まれるが、好ましくは、配列表の配列番号２４記載のアミノ酸配列をコードするＤＮＡを有する遺伝子、又は配列表の配列番号２３記載の塩基配列を有する遺伝子が挙げられる。尚、配列表の配列番号５又は２４記載のアミノ酸配列をコードする遺伝子とは、コドンの縮重を考慮すると種々の塩基配列が包含される。即ち、このような種々の塩基配列の中から、遺伝子発現系の諸要素、たとえば宿主細胞の種類等による優先コドン、転写されたＲＮＡにより形成される高次構造の回避などを考慮して選択すればよい。選択された塩基配列は、自然界からクローニングされたＤＮＡであっても、人為的に化学合成されたＤＮＡであってもよい。
【００４８】
＜２＞本発明のラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡ
ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡは、キュウリなどの植物体から単離したｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡからｃＤＮＡライブラリーを調製し、このｃＤＮＡライブラリーをハイブリダイゼーションによってスクリーニングすることによって、取得することができる。ハイブリダイゼーションに用いるプローブは、ラフィノース合成酵素タンパク質の部分アミノ酸配列に基づいて合成されたオリゴヌクレオチドをプライマーとするＰＣＲ（polymerase chain reaction）によって増幅することによって、取得することができる。
【００４９】
以下に、キュウリ由来のｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡから本発明のＤＮＡを取得する方法を具体的に説明する。
ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡの抽出部位としては、ラフィノース合成酵素遺伝子が発現していればキュウリ植物体のどこを用いても良く、様々な生長段階の葉、茎、蕾、果実、種子等より得ることができるが、望ましくは果実をつけた後の展開葉、特に葉脈部分を材料とするのがよい。
【００５０】
キュウリ組織から全ＲＮＡを抽出するには、効率よく損傷の少ないＲＮＡが得られるならば方法は制限されず、例えば、フェノール／ＳＤＳ法、グアニジンイソチオシアネート／塩化セシウム法等、公知のいずれの方法によっても可能である。こうして得た全ＲＮＡからオリゴ（ｄＴ）担体を用いてｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡを分離できる。また、全ＲＮＡを抽出せずにｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡを得ることのできるキット（ＭＰＧ  Ｄｉｒｅｃｔ  ｍＲＮＡ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｋｉｔ、ＣＰＧ，ＩＮＣ．社等）を使用しても良い。
【００５１】
ｃＤＮＡライブラリーのスクリーニングに使用するプローブのＤＮＡ断片は、ＰＣＲを行うことで得ることができる。既にわかっているペプチド断片のアミノ酸配列、例えば配列表配列番号１〜３に示すアミノ酸配列より推定される塩基配列を有する一本鎖ＤＮＡを化学合成し、これをプライマーに用いてＰＣＲを行う。プライマーには、得られているペプチド断片のアミノ酸配列のどの部分を用いてもよいが、コドンの縮重が少なく、複雑な高次構造を形成しないと思われる配列を選ぶのが望ましい。また、ＲＡＣＥ（Ｒａｐｉｄ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｃＤＮＡ  Ｅｎｄ：ＰＣＲ  ＰＲＯＴＯＣＯＬＳ  Ａ  Ｇｕｉｄｅｔｏ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、ＡＣＡＤＥＭＩＣ  ｐｒｅｓｓ  ＩＮＣ．ｐ２８〜３８）を行っても良い。
【００５２】
このようなＰＣＲの鋳型には、ｃＤＮＡライブラリー、一本鎖ｃＤＮＡを用いることが望ましい。ＰＣＲ反応に逆転写酵素活性を有する耐熱性ＤＮＡポリメラーゼを用いる場合には、ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡ、場合によっては全ＲＮＡを用いても良い。
【００５３】
ｃＤＮＡライブラリーを作製するためには、まずｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡを鋳型にし、オリゴ（ｄＴ）プライマー、ランダムプライマー等を用い、逆転写酵素によって一本鎖ｃＤＮＡを合成し、次にグブラ−ホフマン（Ｇｕｂｌｅｒ  ａｎｄ  Ｈｏｆｆｍａｎ）法、オカヤマ−バーグ（Ｏｋａｙａｍａ−Ｂｅｒｇ）法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  ｅｄｉｔｉｏｎ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  ｐｒｅｓｓ、１９８９）等により二本鎖ｃＤＮＡを合成する。ラフィノース合成酵素遺伝子の発現量が少ない場合には、ＰＣＲを利用したｃＤＮＡライブラリー作製キット（Ｃａｐｆｉｎｄｅｒ  ＰＣＲ  ｃＤＮＡ  Ｌｉｂｒａｒｙ  Ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社）等）を用いて、ＰＣＲによってｃＤＮＡを増幅してもよい。このようにして合成したｃＤＮＡは、平滑末端化、リンカーの付加、ＰＣＲによる制限酵素サイトの付加等を行うことにより、ファージベクター、プラスミド等のクローニングベクターにクローニングできる。
【００５４】
ハイブリダイゼーション用のプローブには、上記のＰＣＲで得られたＤＮＡ断片のうち、ラフィノース合成酵素ｃＤＮＡに特徴的な部分を選ぶ。また、５’末端側に近いＤＮＡ断片を選ぶのが望ましい。このように選んだ増幅ＤＮＡ断片を、ＰＣＲ反応液から精製する。この際、増幅したＤＮＡ断片をプラスミドを用いてサブクローニングし、プラスミドを大量調製してから制限酵素で切断し、電気泳動後にゲルを切り出して精製しても、また、プラスミドを鋳型にＰＣＲを行って、目的部分だけを増幅して用いてもよい。さらには、最初に増幅したＤＮＡ断片の量が十分に多い場合には、増幅したＤＮＡ断片をサブクローニングせずに電気泳動し、目的ＤＮＡ断片のバンドを含むゲル断片を切り出し、そのゲル断片から精製してもよい。
【００５５】
ｃＤＮＡライブラリーから目的クローンを得るためのスクリーニングにはハイブリダイゼーションを行う。上記の方法で得られたＤＮＡ断片はラベルしてハイブリダイゼーションのプローブとすることができる。ラベルにはラジオアイソトープ、ビオチン等、種々のものを用いることができるが、ランダムプライミング法でラベルすることが望ましい。また、スクリーニングにはハイブリダイゼーションではなくＰＣＲを用いてもよい。さらに、ハイブリダイゼーションとＰＣＲを組み合わせてもよい。
上記のようにして得られたキュウリ由来のラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの塩基配列、及びこの塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列表配列番号４に例示する。また、このアミノ酸配列のみを配列番号５に示す。後記実施例３で得られたラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを含むＤＮＡ断片を含むプラスミドｐＭｏｓｓｌｏｘＣＲＳを保持するエシェリヒア・コリＪＭ１０９の形質転換体ＡＪ１３２６３は、平成８年１１月１９日より、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所（郵便番号３０５  日本国茨城県つくば市東一丁目１番３号）にブダペスト条約に基づき国際寄託されており、受託番号ＦＥＲＭ  ＢＰ−５７４８が付与されている。
【００５６】
さらに、上記のようにして一つの植物から得られたラフィノース合成酵素遺伝子を利用して、他の植物からラフィノース合成酵素遺伝子を取得できる。ラフィノース合成酵素を得るための植物としては先に述べたラフィノースを合成している植物であれば何でもよく、例えば、ダイズ、ソラマメ、ナタネ、ヒマワリ、ワタ、シュガービートなどがある。例として、キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを利用した、ダイズのラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの取得について説明する。
【００５７】
ダイズのラフィノース合成酵素遺伝子は、ダイズ由来のｐｏｌｙ（Ａ）＋ＲＮＡからｃＤＮＡライブラリーを調製し、キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの塩基配列に基づいて選択されたプローブを用いてｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングすることによって取得することができる。
【００５８】
ＲＮＡの抽出部位としては、ラフィノース合成酵素が発現していればダイズ植物体のどこでもよいが、望ましくは種子、特に、開花後の未熟種子でラフィノース族オリゴ糖が生成している時期のものがよい。
【００５９】
ダイズ未熟種子より全ＲＮＡを抽出するには、効率よく損傷の少ないＲＮＡが得られるならば方法は特に制限されず、先のキュウリに関して述べた方法のいずれによっても可能である。
【００６０】
ハイブリダイゼーションのプローブは、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と相同性が高い配列を有する必要がある。ハイブリダイゼーションに用いるプローブは、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子とすることもできるが、そのなかのラフィノース合成酵素の保存された領域をプローブにすることが望ましい。しかし、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子の情報からでは、そのような配列を特定することはできない。このような配列を有するハイブリダイゼーションのプローブを得るには以下のようないくつかの方法による必要がある。簡便には、キュウリのラフィノース合成酵素遺伝子を適当な制限酵素で切断して得た断片を、それぞれ、ダイズＲＮＡに対しノーザンハイブリダイゼーションを行い、ハイブリダイズするＤＮＡ断片をプローブとしてもよい。また、キュウリ由来ラフィノース合成酵素のアミノ酸配列に基づいて合成されたプライマーを用いダイズＲＮＡを鋳型としたＲＴ−ＰＣＲによって得ることもできる。また、キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡと相同性のあるシロイヌナズナＥＳＴ配列に基づいて合成されたオリゴヌクレオチドをプライマーとして、シロイヌナズナＲＮＡのＲＴ−ＰＣＲによって取得することができる。
【００６１】
好ましくは、次のようにして、目的の遺伝子と相同性の高いものを得る。まず、Ｇｅｎ Ｂａｎｋデータベースよりキュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子に対し相同性を有するシロイヌナズナなどのＥＳＴ配列をＧｅｎｅｔｉｘ Ｍａｃ等のソフトウェアを用いて検索する。得られた配列と、キュウリラフィノース合成酵素遺伝子との間で相同性の高い領域は、様々な種に由来するラフィノース合成酵素間において保存されている配列を含むと考えられる。この領域のＤＮＡ断片を得るには、例えば、シロイヌナズナのＲＮＡより調製した一本鎖ＤＮＡを鋳型とし、相同性の高い領域の配列に基づいて合成したオリゴヌクレオチドをプライマーとしてＰＣＲにて増幅して得ることができる。この増幅断片の塩基配列を解析し、キュウリと相同性の高い配列を有するものを選ぶ。得られたＤＮＡ断片は、先に記載のように、ラベルし、プローブとして用いる。
【００６２】
ｃＤＮＡライブラリーから目的クローンを得るためのスクリーニングには、キュウリ遺伝子のクローニングと同様にハイブリダイゼーションを行う。
上述のようにして得られたダイズ由来ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの塩基配列、及びこの塩基配列から推定されるアミノ酸配列を配列表配列番号２３に示す。また、このアミノ酸配列のみを配列番号２４に示す。上記方法で取得したキュウリ由来ラフィノース合成酵素に対するダイズ由来ラフィノース合成酵素の相同性は、ギャップを考慮したマキシマム・マッチングにより、アミノ酸配列では３８％、塩基配列では５０％であった。後記実施例４で得られたラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを含むＤＮＡ断片を含むプラスミドｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳを保持するエシェリヒア・コリＪＭ１０９の形質転換体ＡＪ１３３７９は、平成９年１０月２０日から、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所（郵便番号３０５  日本国茨城県つくば市東一丁目１番３号）にブタペスト条約に基づき国際寄託されており、受託番号ＦＥＲＭ  ＢＰ−６１４９が付与されている。
【００６３】
キュウリ由来ラフィノース合成酵素と、ダイズ由来ラフィノース合成酵素の情報を利用して、さらに他の植物からラフィノース合成酵素遺伝子を取得することができる。両タンパク質で保存されたアミノ酸配列、例えば、配列表配列番号２８（配列番号２４のアミノ酸番号１９９〜２０８）、２９（配列番号２４のアミノ酸番号３０２〜３１４）、３０（配列番号２４のアミノ酸番号５１３〜５２７）などから推定される塩基配列を有する一本鎖ＤＮＡ、及び、推定される塩基配列と相補的塩基配列を有する一本鎖ＤＮＡを合成し、これらをプライマーに用いてＲＴ−ＰＣＲを行う。プライマーには上記配列のどの部分を用いてもよいが、コドンの縮重が少なく、複雑な高次構造を形成しないと思われる配列を選ぶのが望ましい。遺伝子を取得しようとする植物の全ＲＮＡ、場合によっては、ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡよりｃＤＮＡを合成し、これを鋳型にしてＰＣＲを行う。得られたＤＮＡ断片は適当なベクターにクローニングし塩基配列を解析し、この塩基配列がキュウリもしくはダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と相同性を有するか、または、翻訳したアミノ酸配列がキュウリ及びダイズ由来ラフィノース合成酵素のアミノ酸配列と相同性を有するかどうか確認すればよい。これにより得られたＤＮＡ断片はｃＤＮＡライブラリーのスクリーニングに用いることができる。また、遺伝子を取得しようとする植物の全ＲＮＡ、場合によっては、ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡより合成した一本鎖ｃＤＮＡを鋳型にして、ＲＡＣＥを行ってもよい。
【００６４】
本発明のＤＮＡは、コードされるラフィノース合成酵素の活性、すなわちスクロースとガラクチノールからラフィノースを生成する活性が損なわれない限り、１若しくは複数の位置での１若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、又は付加を含むラフィノース合成酵素タンパク質をコードするものであってもよい。ここで、「数個」とは、アミノ酸残基のタンパク質の立体構造における位置や種類によっても異なる。それは、イソロイシンとバリンのように、アミノ酸によっては、類縁性の高いアミノ酸が存在し、そのようなアミノ酸の違いが、タンパク質の立体構造に大きな影響を与えないことに由来する。従って、キュウリ由来ラフィノース合成酵素を構成する７８４アミノ酸残基全体に対し、３５から４０％以上の相同性を有し、ラフィノース合成酵素活性を有するものであってもよい。さらに、好ましくは、５１０番目のアミノ酸から６１０番目のアミノ酸の間において、６５％以上の相同性を有することである。さらに好ましくは、「数個」が、２から１０個である。また、好ましくは、ダイズ由来ラフィノース合成酵素を構成する７５０残基の４７８番目のアミノ酸から５７７番目のアミノ酸の間において、６５％以上の相同性を有することである。ここでいう相同性とは、ギャップを考慮したマキシマム・マッチングを行ったときの値をいう。
【００６５】
遺伝子全長において、約５０％以上の相同性があり、かつ、その中で約３００塩基にわたる６５％以上の相同性がある遺伝子を含む。そのような遺伝子は、ＧｅｎＢａｎｋなどのデータベースを用いて、キュウリ由来ラフイノース合成酵素遺伝子に対し相同性を有する遺伝子を検索することによって、塩基配列情報を得ることができる。ホモロジー解析プログラムはＬｉｐｍａｎ−Ｐｅａｒｓｏｎ法を採用したＧＥＮＥＴＩＸ−ＭＡＣ（遺伝子情報処理ソフトウエア、ソフトウエア開発社）などを用いてもよく、また、インターネット上に公開されているものを使用してもよい。このような方法により得られた塩基配列は遺伝子全長を含む場合と、遺伝子全長を含まない場合がある。遺伝子全長を含まない場合は、目的植物組織より抽出したＲＮＡを鋳型に、キュウリ由来ラフイノース合成酵素遺伝子と相同性の高い部位に対応するプライマーを用い、５’ＲＡＣＥ法、３’ＲＡＣＥ法にて、容易に全長遺伝子を取得することができる。得られた全長遺伝子は、先に述べたような、Soluble Protein Expression System(INVITROGEN社)や、Tight Control Expression System (INVITROGEN社）や、QIAexpress System(QIAGEN社)などのキットが提供する適当な発現ベクターに組み込み、遺伝子を発現させ、記載の方法でラフィノース合成酵素活性を測定し、活性を有するクローンを選抜すればよい。遺伝子の発現方法については、Plant Molecular Biology, A Laboratory Manual (Melody S. Clark (Ed.), Springer)などに詳しく記載されている。
【００６６】
このようなラフィノース合成酵素と実質的に同一のタンパク質をコードするＤＮＡは、例えば部位特異的変異法によって、特定の部位のアミノ酸が置換、欠失、挿入、付加されるように塩基配列を改変することによって得られる。また、上記のような改変されたＤＮＡは、従来知られている突然変異処理によっても取得され得る。突然変異処理としては、ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡをヒドロキシルアミン等でインビトロ処理する方法、及びラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを保持するエシェリヒア属細菌を、紫外線照射またはN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン（NTG）もしくは亜硝酸等の通常人工突然変異に用いられている変異剤によって処理する方法が挙げられる。
【００６７】
また、上記のような塩基の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位等には、キュウリまたはダイズの個体差、品種間差、遺伝子の多コピー化、各器官、組織の違いに基づく場合などの天然に生じる変異も含まれる。
【００６８】
上記のような変異を有するＤＮＡを、適当な細胞で発現させ、発現産物のラフィノース合成酵素活性を調べることにより、ラフィノース合成酵素と実質的に同一のタンパク質をコードするＤＮＡが得られる。また、変異を有するラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡまたはこれを保持する細胞から、例えば配列表の配列番号４に記載の塩基配列のうち、塩基番号５６〜２４０７からなる塩基配列、または、配列番号２３に記載の塩基配列のうち、塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列を有するＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、ラフィノース合成酵素活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡを単離することによっても、ラフィノース合成酵素タンパク質と実質的に同一のタンパク質をコードするＤＮＡが得られる。ここでいう「ストリンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。この条件を明確に数値化することは困難であるが、一例を示せば、相同性が高いＤＮＡ同士がハイブリダイズし、それより相同性が低いＤＮＡ同士がハイブリダイズしない条件、あるいは通常のサザンハイブリダイゼーションの洗いの条件である６０℃、１×ＳＳＣ，０．１％ＳＤＳ、好ましくは、０．１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳに相当する塩濃度でハイブリダイズする条件が挙げられる。このような条件でハイブリダイズする遺伝子の中には途中にストップコドンが発生したものや、活性中心の変異により活性を失ったものも含まれるが、それらについては、市販の活性発現ベクターにつなぎラフィノ―ス合成酵素活性を記述の方法で測定することによって容易に取り除くことができる。
【００６９】
尚、本発明のＤＮＡを、ラフィノース合成酵素のアンチセンスＲＮＡを発現させるために用いる場合には、このＤＮＡは活性のあるラフィノース合成酵素をコードしている必要はない。また、センスＲＮＡによっても、相同性のある内在性遺伝子の機能を抑制することができる。このような場合も、ＤＮＡが活性あるラフイノース合成酵素遺伝子をコードしている必要はなく、また、全長を含まなくてもよく、好ましくは、６０％以上の相同性を有する翻訳領域が５００塩基対程度あればよい。このようなＤＮＡの例としては、下記（ｅ）又は（ｆ）のＤＮＡが挙げられる。
（ｅ）配列表の配列番号４に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号５６〜２４０７からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ。
（ｆ）配列表の配列番号２３に記載の塩基配列のうち、少なくとも塩基番号１５６〜２４０５からなる塩基配列若しくはその相補的塩基配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ。
【００７０】
本発明者らが、目的とする、キュウリ由来またはダイズ由来のラフィノース合成酵素のｃＤＮＡのクローニングに成功した方法は上述の通りであるが、それ以外に下記の方法が挙げられる。
（１）キュウリ由来またはダイズ由来のラフィノース合成酵素を単離精製し、決定されるアミノ酸配列、または配列番号５または配列番号２４に示すアミノ酸配列を基に全塩基配列を化学合成する。
（２）キュウリまたはダイズの植物体から染色体ＤＮＡを調製し、プラスミドベクター等を用いて染色体ＤＮＡライブラリーを作製し、このライブラリーからラフィノース合成酵素遺伝子を、ハイブリダイゼーンション又はＰＣＲによって取得する。尚、染色体由来のラフィノース合成酵素遺伝子は、コード領域にイントロンが含まれることが予想されるが、このようなイントロンによって分断されたＤＮＡであっても、ラフィノース合成酵素をコードする限り本発明のＤＮＡに含まれる。
（３）ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡを分子量等によって分画し、ホイートジャーム又はウサギ網状赤血球を用いたインビトロ翻訳系に供し、ラフィノース合成酵素活性を有するポリペプチドをコードするｍＲＮＡが存在する画分を決定し、それより目的のｃＤＮＡ断片を作製、取得する。
（４）抗キュウリラフィノース合成酵素抗体または抗ダイズラフィノース合成酵素抗体を作製し、タンパク質発現ベクターにｃＤＮＡライブラリーを乗せ、適当な宿主に感染させてｃＤＮＡがコードするタンパク質を発現させ、先程の抗体を用いて目的のｃＤＮＡをスクリーニングしても良い。
（５）ペプチド断片のアミノ酸配列から適当なプライマーを合成し、ＲＡＣＥ法によって、末端を含む配列を増幅し、これをクローニングしてもよい。
【００７１】
ラフィノース合成酵素遺伝子を発現させるには、酵素をコードする領域のＤＮＡを種々の発現ベクターに組み込み遺伝子を発現させればよく、詳しくは、Ｐｌａｎｔ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ−Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｍ．Ｓ．Ｃｌａｒｋ（ｅｄｓ．），Ｓｐｒｉｎｇｅｒ）などに記載されている。ベクターとしては、市販の発現ベクターを使用してもよい。発現の確認は、本明細書に記載の方法によって活性を測定することによって行うことができる。
【００７２】
例として、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子によるラフィノース合成酵素の活性発現方法について説明する。ｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳのラフィノース合成酵素遺伝子の１５６番目の塩基のＡＴＧを含む上流すぐにＮｄｅＩの制限酵素サイトを、また２４０５番目の塩基の下流にＢａｍＨＩサイトを、それぞれの制限酵素サイトを含むようにデザインしたプライマーを用いたＰＣＲによって付加する。次に、フェノールクロロホルムにて精製した先のラフィノース合成酵素遺伝子とｐＥＴ３ａをＮｄｅＩ、ＢａｍＨＩにて消化する。消化したそれぞれのＤＮＡは、アガロースゲル電気泳動によって精製する。ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子の内部にはＢａｍＨＩサイトが存在するので、あらかじめ、ＰＣＲなどによって変異を入れておくか、アガロース電気泳動によって目的サイズの断片を選ぶ。精製したラフィノース合成酵素断片と、ベクターはライゲーションし、ゲルで確認する。さらにラフィノース合成酵素遺伝子がＡＴＧコドンから開始することを塩基配列解析により確認する。このベクターをＥ．ｃｏｌｉ ＢＬ２１（ＤＥ３）ｐＬｙｓＥに形質転換しクロラムフェニコールとアンピシリンを含むＬＢ培地で選抜をする。形質転換体はＰＣＲなどによってその挿入断片を確認し、目的の形質転換体をＬＢ培地で培養し菌体を得る。菌体はＳＤＳを含むゲルローディング緩衝液にて１００℃、３分間インキュベートし、ＳＤＳポリアクリルアミドゲルにて電気泳動し、目的のサイズのタンパク質のバンドを確認する。この選抜された菌を培養し、菌体をソニックなどにより壊し、タンパク質を抽出する。このタンパク質抽出液のラフィノース合成酵素活性を本明細書に記載の方法で測定すればよい。
【００７３】
＜３＞本発明のラフィノースの製造法
本発明のラフィノースの製造法においては、スクロース及びガラクチノールに上記ラフィノース合成酵素を作用させてラフィノースを生成させる。ラフィノース合成酵素は、スクロースとガラクチノールに作用させると、ガラクチノールを構成するガラクトース残基がスクロースに転移し、ラフィノースが生成する。その際、ガラクチノールを構成するミオイノシトールが生成する。
【００７４】
ラフィノースの製造に使用するラフィノース合成酵素は、植物体から抽出した酵素であっても、本発明のＤＮＡを用いた遺伝子組換え法によって製造した酵素であってもよい。
【００７５】
スクロース及びガラクチノールにラフィノース合成酵素を作用させるには、ラフィノース合成酵素又はラフィノース合成酵素生産能を有する細胞をアルギン酸ゲルやポリアクリルアミドゲル等の担体に固定化した固定化酵素又は固定化細胞をカラムに充填し、このカラムにスクロース及びガラクチノールを含む溶液を通液してもよい。担体及びラフィノース合成酵素又は細胞を担体に固定化する方法は、通常のバイオリアクターに用いられる材料及び方法を採用することができる。
【００７６】
ラフィノース合成反応は、例えば、スクロース及びガラクチノールを含む水溶液又は緩衝液等の溶液に、ラフィノース合成酵素を添加することによって行われる。前記溶液のｐＨは、約６〜８の範囲内、特にｐＨ７前後に調整されることが好ましい。また、反応温度は約２８〜４２℃、好ましくは３５〜４０゜Ｃの範囲 内、特に３８℃前後であることが好ましい。尚、本発明のラフィノース合成酵素は、約ｐＨ５〜８の範囲、特にｐＨ６付近で安定である。また、本酵素は少なくとも約４０℃以下の温度範囲で安定である。
【００７７】
本発明のラフィノース合成酵素は、ヨードアセトアミド、Ｎ−エチルマレイミド、ＭｎＣｌ2、ＺｎＣｌ2、ＮｉＣｌ2によって酵素活性が阻害されるので、こ れらの物質が反応液に含まれないことが望ましい。
【００７８】
反応液に加えるガラクチノール及びスクロースの濃度は、ガラクチノール ５ ｍＭ以上、スクロース １．５ｍＭ以上が好適である。また、反応液に加えるラ フィノース合成酵素の添加量は、基質量に応じて添加すればよい。
【００７９】
反応液に含まれる未反応のスクロース、ガラクチノール及び酵素反応により生じるミオイノシトールからラフィノースを分離する方法としては、例えばゲル濾過クロマトグラフィーが挙げられる。
【００８０】
＜４＞本発明のキメラ遺伝子及び形質転換植物
本発明のキメラ遺伝子は、ラフィノース合成酵素遺伝子又はその一部と、植物細胞で発現可能な転写制御領域とを含む。ラフィノース合成酵素遺伝子としては、前記＜２＞に記載した本発明のラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡが挙げられる。さらに、本発明のキメラ遺伝子をアンチセンス遺伝子として利用する場合には、ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの他に、ラフィノース合成酵素遺伝子の非翻訳領域又はその一部であっても、使用できる場合がある。非翻訳領域としては、例えば配列表配列番号４において塩基番号１〜５５（５’非翻訳領域）、あるいは２４０８〜２５１７に示す配列（３’非翻訳領域）、また、配列表配列番号２３においては塩基番号１〜１５５、あるいは２４０６〜２７６５が挙げられる。
【００８１】
本発明のキメラ遺伝子において、転写制御領域が、ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡに、このＤＮＡコード鎖に相同なｍＲＮＡ（センスＲＮＡ）を発現するように連結されている場合は、このキメラ遺伝子が導入された植物細胞はラフィノース合成酵素を発現し、ラフィノース族オリゴ糖含量が増加する。一方、前記転写制御領域が、前記ＤＮＡのコード鎖に相補的な配列を有するＲＮＡ（アンチセンスＲＮＡ）を発現するように前記ＤＮＡに連結されている場合、および、ラフィノース合成酵素遺伝子の一部の断片、好ましくは、上流コード領域の約２００塩基対以上に対するセンスＲＮＡを発現するように連結されている場合、これらのキメラ遺伝子が導入された植物細胞は、内在性ラフィノース合成酵素の発現が抑制され、ラフィノース族オリゴ糖が低減化する。
【００８２】
上記のように、本発明のキメラ遺伝子で植物を形質転換し、この遺伝子を植物細胞内で発現させることにより、前記植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させることができる。
【００８３】
本発明を適用する植物としては、油糧植物であるダイズ、ナタネ、ワタ、砂糖を生産するテンサイ、サトウキビ、モデル植物としてシロイヌナズナ等が挙げられる。
【００８４】
また、植物細胞で発現可能な転写制御領域としては、前述したような、植物全体で発現するＣａＭＶ  ３５ＳＲＮＡプロモーター、ＣａＭＶ  １９ＳＲＮＡプロモーター、ノパリン合成酵素プロモーター等、緑色組織で発現するＲｕｂｉｓＣＯ小サブユニットプロモーター等、種子などの部位特異的に発現するナピン（ｎａｐｉｎ）、ファセオリン（ｐｈａｓｅｏｌｉｎ）等の遺伝子のプロモーター領域等が挙げられる。また、キメラ遺伝子の３’末端には、ノパリン合成酵素ターミネーター、ＲｕｂｉｓＣＯ小サブユニット３’側部位等のターミネーターが連結されてもよい。
【００８５】
キメラ遺伝子で植物を形質転換には通常用いられている方法、アグロバクテリウム法、パーティクルガン法、エレクトロポレーション法、ＰＥＧ法等を、供試する宿主細胞に応じて用いればよい。
【００８６】
植物にキメラ遺伝子を導入する形質転換法としては、アグロバクテリウム法、パーティクルガン法、エレクトロポレーション法、ＰＥＧ法等が挙げられる。
アグロバクテリウム法として具体的には、バイナリーベクターを用いる方法がある。すなわち、Ｔｉプラスミド由来のＴ−ＤＮＡ、大腸菌などの微生物で機能可能な複製起点、及びベクターを保持する植物細胞または微生物細胞を選択するためのマーカー遺伝子を含むベクターを植物に感染させ、この植物から採取した種子を生育させ、マーカー遺伝子の発現を指標としてベクターが導入された植物を選択する。得られた植物について、ラフィノース合成酵素活性を測定するか、あるいはラフィノース族オリゴ糖の含量が変化したものを選択することによって、目的とする形質転換植物を取得することができる。
【００８７】
以下に、ダイズにキメラ遺伝子を導入する方法について説明する。ダイズ形質転換には、パーティクルガン法（Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 145 (1989)、TIBTECH, 8, 145 (1990)、Bio/Technology, 6, 923 (1988)、Plant Physiol., 87, 671 (1988)、Develop. Genetics, 11, 289 (1990)、Plant cell Tissue & Organ Culture, 33, 227 (1993)）、アグロバクテリウム法（Plant Physiol., 91, 1212 (1989)、 WO94/02620、 Plant Mol. Biol., 9, 135 (1987)、Bio/Technology, 6, 915 (1988)）、エレクトロポレーション法（Plant Physiol., 99, 81 (1992)、Plant Physiol., 84, 856 (1989)、Plant Cell Reports, 10, 97 (1991)）のいずれの方法も用いることができる。
【００８８】
パーティクルガン法においては、エンブリオジェニック（embryogenic）組織、あるいは、開やく後３０日から４０日の未熟種子の胚軸を用いればよい。約１ｇのエンブリオジェニック組織をペトリ皿に広げ、日的のキメラ遺伝子をコーテイングした金粒子、タングステン粒子などを打ち込めばよい。組織は、１時間から２時問後液体培地に移し、培養する。２週間後、形質転換体選抜のための抗生物質入りの培地に移し、培養する。６週間後に、緑色の耐性不定胚が得られるので、これをさらに新しい培地に移して培養し、植物体を再生させる。あるいは、胚軸を用いた場合には、胚軸を無菌的に摘出し、パーティクルガンで処理した後、高濃度のサイトカイニンを含むＭＳ培地（Murashige and Skoog, Physiologia Plantrum, 15, 473-497 (1962)）にて培養をする。暗黒下で、２週間培養した後、サイトカイニンの含量を低下させたＭＳ培地にて１２時間から１６時間、光照射下で室温で培養する。このとき、選抜マーカーとして用いた抗生物質を培地に添加しておくことが望ましい。移植組織より多芽体が形成したら、ホルモン無添加の培地に移すことで、発根させる。この幼植物体を温室に移し、栽培する。
【００８９】
アグロバクテリウムを用いる方法では、植物組織としてコチルドナリーノッド（Cotyldonary nod）を用いることが望ましい。アグロパクテリウムは、市販のＬＢＡ４４０４、Ｃ５８、Ｚ７０７などを用いることができるが、望ましくは、Ｚ７０７がよい。ベクターは、ｐＭＯＮ５３０（Monsanto Co.）に目的遺伝子を挿入したプラスミドなどを用いることができる。ダイレクト・フリーズ・ソー（Direct freeze thaw）方法（An et al., Plant Mol. Biol. Mannual A3:1-19, 1988）などによって、アグロバクテリウム  ツメファシエンス（Agrobacterium tumefaciens）Ｚ７０７（Hepburn et al., J, Gen. Microbiol, 131, 2961 (1985)）にプラスミドを導入する。このキメラ遺伝子で形質転換したアグロバクテリウムは、一晩培養し、５０００ｒｐｍ、５分間遠心し、Ｂ５懸濁培地に懸濁する。ダイズ種子は滅菌し１／１０濃度のＢ５培地にて３日間培養し、発芽させる。子葉を切り出し、アグロバクテリウムの懸濁液で、２時間供培養する。この子葉をＢ５培地（ガンボルグ(Gamborg)Ｂ５塩(Exp. Cell. Res., 50, 151 (1968)、ガンボルグＢ５ビタミン、３％スクロース。５μＭベンジルアミノプリン、１０μＭ  ＩＢＡ、１００μＭ  アセトシリンゴン含有）に移し、２５℃、２３時間光照射（６０μEm-2S-1）の条件下で３日問培養する。次に、アグロバクテリウムを除去するためにＢ５培地（５μＭ ベンジルアミノプリン、１００ｍｇ／Ｌ カルベニシリン、１００ｍｇ／Ｌ  バンコマイシン、５００ｍｇ／Ｌ セファタキシム(cefotaxime)）にて４日間２５℃で毎日培地を交換しながら培養する。その後、Ｂ５培地（２００ｍｇ／Ｌカナマイシン）にて培養する。１から２カ月でマルチシュートが形成される。これを、Ｂ５培地（０．５８ｍｇ／Ｌ ジベレリン、５０ｍｇ／Ｌ カナマイシン）で培養し、シュートを伸長させる。次に、Ｂ５培地（１０μＭ  ＩＢＡ）に移し、発根させる。発根した幼植物体は、馴化し、温室にて栽培することによって形質転換体を得ることができる。
【００９０】
ラフィノース合成酵素遺伝子を導入した形質転換体植物の確認は、形質転換体より、ＤＮＡを抽出し、ラフィノース合成酵素遺伝子をプローブに用いてサザンハイブリダイゼーションを行えば容易に確認できる。
【００９１】
【実施例】
以下に、本発明を実施例によりさらに具体的に説明する。
はじめに、以下の実施例において、各精製工程における活性画分の確認及び酵素の特性検討に用いたラフィノース合成酵素活性の測定法を説明する。
【００９２】
＜ラフィノース合成酵素活性測定法＞
ラフィノース合成酵素の活性は、ラフィノース合成反応により生成したラフィノースをＨＰＬＣ（高速液体クロマトグラフィー）により定量することによって行った。ＨＰＬＣは、糖分析システムＤＸ５００（CarboPac PA1カラム、パルスドアンペロメトリー検出器（ダイオネクス社製））を用いて行った。
【００９３】
ラフィノース合成反応は、最終濃度が下記の組成になるように調製した反応液に１０〜５０μｌのラフィノース合成酵素液を添加して１００μｌとし、３２℃で６０分間、反応を行った。
〔反応液組成（最終濃度）〕
2.5 mM  スクロース
5 mM  ガラクチノール
5 mM  ＤＴＴ
20 mM  トリス塩酸緩衝液（ｐＨ７．０）
【００９４】
上記のようにして反応を行った後、反応液の４倍容のエタノールを加え、９５℃で３０秒間加熱して反応を停止した。これを遠心し、遠心上清を減圧乾固した後、蒸留水に溶解し、糖分析システムにて反応生成物中のラフィノースを定量し、ラフィノース酵素活性とした。
【００９５】
【実施例１】
キュウリからのラフィノース合成酵素の精製
＜１＞キュウリからのラフィノース合成酵素の抽出
播種後６〜１０週間のキュウリ（品種「ＳＵＹＯＵ」）本葉より、葉脈系を集め、液体窒素にて凍結し、−８０℃にて保存した。凍結した葉脈系約２００ｇを液体窒素下で乳鉢にて磨砕し、緩衝液１（４０ｍＭ トリス塩酸緩衝液(ｐＨ７．０)、５ｍＭ ＤＴＴ、１ｍＭ ＰＭＳＦ（フェニルメタンスルフォニルフルオリ ド）、１％ポリクラールＡＴ；セルバ社製）を加え、タンパク質を抽出した。抽出液は、ガーゼやミラクロス（カルバイオケム−ノボバイオケム(Calbiochem- Novobiochem)社）などのフィルターにて濾過し、濾液を４℃、約３０，０００×ｇで６０分間遠心した。得られた遠心上清を粗抽出液とした。
【００９６】
＜２＞陰イオン交換クロマトグラフィー（１）
上記で得られた粗抽出液約５６０ｍｌを、緩衝液２（２０ｍＭ トリス塩酸緩 衝液(ｐＨ７．０)、５ｍＭ ＤＴＴ）にて平衡化した強塩基性陰イオン交換クロ マトグラフィーカラム（ＨｉＴｒａｐＱ；ファルマシア社製、１．６ｃｍ×２．５ｃｍ）を５本連結したカラムに供し、ラフィノース合成酵素活性をカラムに吸着させた。続いてカラムの５倍容の緩衝液３（２０ｍＭ トリス塩酸緩衝液(ｐＨ７．０)、０．２Ｍ ＮａＣｌ、５ｍＭ ＤＴＴ）にてカラムを洗浄して非吸着タンパク質を洗い流した後、５０ｍｌの緩衝液４（２０ｍＭ トリス塩酸緩衝液(ｐＨ７．０)、０．３Ｍ ＮａＣｌ、５ｍＭ ＤＴＴ）にてラフィノース合成酵素活性を カラムから容出させた。
【００９７】
＜３＞陰イオン交換クロマトグラフィー（２）
上記の溶出液約７５ｍｌを透析チューブ（Ｐｏｒｍｅｍｂｒａｎｅｓ ＭＷＣ Ｏ：１０，０００；スペクトラ(Ｓｐｅｃｔｒａ)社製）に入れ、１０Ｌの緩衝液５（２０ｍＭ トリス塩酸緩衝液(ｐＨ７．０)、０．０５Ｍ ＮａＣｌ、５ｍＭ  ＤＴＴ）に対して、４℃で一晩透析した。透析した試料を緩衝液５で平衡化した弱塩基性陰イオン交換クロマトグラフィーカラム（ＤＥＡＥ−ＴＯＹＯＰＥＡＲＬ；東ソー社製、２．２×２０ｃｍ）に供し、ラフィノース合成酵素活性をカラムに吸着させた。続いてカラムの５倍容の緩衝液５にてカラムを洗浄して非吸着タンパク質を洗い流した後、２０カラム容に対し０．０５Ｍ〜０．３５ＭのＮａＣｌ濃度勾配を直線的にかけて酵素活性を溶出し分画した。
【００９８】
＜４＞ゲル濾過クロマトグラフィー
上記で得られた溶出液約１６０ｍｌを、濃縮器（セントリプレップ１０；Ａｍｉｃｏｎ社製）を用いて６．５ｍｌに濃縮した。この濃縮液３ｍｌずつをゲルろ過クロマトグラフィーカラム（Ｓｕｐｅｒｄｅｘ ２００ｐｇ；ファルマシア社 製、２．６ｃｍ×６０ｃｍ）に供した。カラムの平衡化と溶出は、緩衝液６（２０ｍＭ トリス塩酸緩衝液(ｐＨ７．０)、０．１Ｍ ＮａＣｌ、５ｍＭ ＤＴＴ、 ０．０２％ Ｔｗｅｅｎ ２０）を用いて行った。分画した各画分のうち、ラフィノース合成酵素活性を有する画分を集めた。
【００９９】
＜５＞ハイドロキシアパタイトクロマトグラフィー
ゲル濾過で分画したラフィノース合成酵素活性画分約２５ｍｌを、セントリプレップ１０にて濃縮し、さらに、緩衝液７（０．０１Ｍ リン酸ナトリウム緩衝 液(ｐＨ７．０)、５ｍＭ ＤＴＴ、０．０２％ Ｔｗｅｅｎ ２０）を用いて緩衝 液交換を行った。得られた濃縮液約１．２ｍｌを、あらかじめ同緩衝液にて平衡化したハイドロキシアパタイトカラム（Ｂｉｏ−Ｓｃａｌｅ ＣＨＴ−１；バイ オラッド社製、０．７×５．２）に供し、ラフィノース合成酵素活性を吸着させた。カラムを、カラム体積の５倍量（１０ｍｌ）の同緩衝液にて洗浄した後、２０カラム容に対し、０．０１Ｍ〜０．３Ｍのリン酸濃度勾配を直線的にかけて酵素活性を溶出し分画した。
【０１００】
＜６＞ハイドロキシアパタイトリクロマトグラフィー
上記のようにして得られたハイドロキシアパタイトクロマトグラフィーによる活性画分を同様にしてリクロマトし、精製ラフィノース合成酵素画分（約２ｍｌ）とした。
【０１０１】
本活性画分のタンパク質量は約２００μｇであった。また、全活性は５７００ｎｍｏｌ／時間であり、タンパク質当たりの比活性は約２８μｍｏｌ／時間／ｍｇであった。この活性画分は、後述するように電気泳動上で分子量約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａの単一バンドを示すタンパク質のみを含んでいた。得られた精製酵素標品の比活性は、粗抽出液の約２０００倍であり、ＨｉＴｒａｐＱによる強塩基性陰イオン交換クロマトグラフィー後の酵素量に対する回収率は１２％であった。精製の結果を表１にまとめた。
【０１０２】
【表１】
0004410318.tif 000002
【０１０３】
【実施例２】
ラフィノース合成酵素の特性の検討
実施例１で得られた精製ラフィノース合成酵素の特性を検討した。
【０１０４】
＜１＞分子量測定
（１）ゲルろ過クロマトグラフィー
精製ラフィノース合成酵素を１０μｌとり、この試料および分子量マーカー（ゲル濾過用分子量マーカーキット：ファルマシア社製）をゲルろ過クロマトグラフィーカラム（Ｓｕｐｅｒｄｅｘ ２００ｐｇ；ファルマシア社製）に供した。 カラムの平衡化と溶出は、緩衝液６（２０ｍＭ トリス塩酸緩衝液(ｐＨ７．０) 、０．１Ｍ ＮａＣｌ、５ｍＭ ＤＴＴ、０．０２％ Ｔｗｅｅｎ ２０）を用いて行った。その結果、ラフィノース合成酵素の分子量は、約７５ｋＤａ〜９５ｋＤａと推定された。
【０１０５】
（２）ポリアクリルアミドゲル電気泳動（Ｎａｔｉｖｅ  ＰＡＧＥ）
精製ラフィノース合成酵素を１０μｌとり、同量のサンプル緩衝液（０．０６２５Ｍ トリス−塩酸(ｐＨ６．８)、１５％グリセロール、０．００１％ＢＰＢ）を加え、電気泳動サンプルとした。このサンプル１０μｌを１０％ポリアクリルアミドゲル（第一化学薬品製、マルチゲル１０）に供し、０．０２５Ｍ トリ ス−０．１９２Ｍ グリシン緩衝液(ｐＨ８．４)で４０ｍＡ、約６０分泳動した。泳動後、シルベストステイン銀染色キット（ナカライテスク社製）にて染色した。その結果、分子量は約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａと推定された。
【０１０６】
（３）ＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）
精製ラフィノース合成酵素を１０μｌとり、同量のサンプル緩衝液（０．０６２５Ｍ トリス−塩酸(ｐＨ６．８)、２％ ＳＤＳ、１０％グリセロール、５％メルカプトエタノール、０．００１％ＢＰＢ）を加え沸騰浴中で１分間加熱し、電気泳動サンプルとした。このサンプル１０μｌを１０〜２０％グラジエントポリアクリルアミドゲル（第一化学薬品製）に供し、０．１％ＳＤＳを含む０．０２５Ｍ トリス−０．１９２Ｍ グリシン緩衝液（ｐＨ８．４）で４０ｍＡ、約７０分泳動した。泳動後、シルベストステイン銀染色キット（ナカライテスク社製）にて染色した。結果を図２に示す。その結果、分子量は約９０ｋＤａ〜１００ｋＤａと推定された。
【０１０７】
＜２＞反応至適温度
前記のラフィノース合成酵素活性測定法にしたがって、種々の温度条件下（２８℃、３２℃、３６℃、４０℃、４４℃、４８℃、５２℃）でラフィノース合成酵素活性を測定した。各反応液に加えた酵素液は、２μｌとした。３２℃での酵素活性を１００としたときの各温度での相対活性を図３に示す。その結果、ラフィノース合成酵素は、約２５〜４２゜Ｃにわたる範囲で活性を示し、反応至適温 度は、３５〜４０℃付近であった。
【０１０８】
＜３＞至適反応ｐＨ
前記のラフィノース合成酵素活性測定法にしたがって、種々のｐＨ条件下（ｐＨ４〜１１）でラフィノース合成酵素活性を測定した。各反応には、５０ｍＭ  クエン酸緩衝液（ｐＨ４〜６）、５０ｍＭ リン酸カリウム緩衝液（ｐＨ５．５ 〜７．５）、５０ｍＭ ビス−トリス緩衝液（ｐＨ６〜７）、２０ｍＭ トリス−塩酸緩衝液（ｐＨ７〜８．５）、５０ｍＭ グリシン−ＮａＯＨ緩衝液（ｐＨ９ 〜１１）を用いた。また、各反応液に加えた酵素液は、２μｌとした。結果を図４に示す。
【０１０９】
その結果、ラフィノース合成酵素はｐＨ５〜１０の範囲で活性を示し、反応至適ｐＨは、用いた緩衝液の種類によっても異なるが、６〜８付近であった。
【０１１０】
＜４＞阻害剤及び金属イオンの検討
精製ラフィノース合成酵素の反応液に、各種の酵素阻害剤又は金属イオンを終濃度で１ｍＭとなるように添加し、ラフィノース合成酵素活性を前記と同様にして測定した。阻害剤又は金属イオンを添加しない場合の酵素活性に対する残存活性を表２に示す。ヨードアセトアミドは酵素活性を顕著に阻害し、Ｎ−エチルマレイミドも阻害効果を示した。また、ＣａＣｌ2、ＣｕＣｌ2、ＭｇＣｌ2は阻害 効果がほとんど認められなかったが、ＭｎＣｌ2、ＺｎＣｌ2、ＮｉＣｌ2は阻害 効果を示した。
【０１１１】
【表２】
0004410318.tif 000003
【０１１２】
＜５＞ミオイノシトールによる阻害
ラフィノース合成反応の反応生成物であるミオイノシトールによる阻害を調べた。各種濃度のミオイノシトールを反応液に添加し、ラフィノース合成酵素活性を測定した。結果を図５に示す。添加したミオイノシトールの濃度とともに酵素活性は阻害された。
【０１１３】
＜６＞安定ｐＨ
５０ｍＭ ビストリス塩酸緩衝液（ｐＨ５〜８、０．５ｍＭ ＤＴＴを含む）、又は２０ｍＭ トリス−塩酸緩衝液（ｐＨ７〜８、０．５ｍＭ ＤＴＴを含む）中で、前記陰イオン交換クロマトグラフィー（２）で得られたラフィノース合成酵素画分を４時間、４℃にてインキュベートした後、ラフィノース合成酵素活性を測定した。インキュベートに用いた緩衝液のｐＨに対する酵素活性を図６に示す。いずれのインキュベート条件においてもラフィノース合成活性が認められ、特にｐＨ５〜７．５の範囲で安定であった。
【０１１４】
＜７＞安定温度
２０ｍＭ トリス−塩酸緩衝液（ｐＨ７、５ｍＭ ＤＴＴを含む）にて、前記陰イオン交換クロマトグラフィー（２）で得られたラフィノース合成酵素画分を２８℃、３２℃、３７℃又は４０℃で６０分インキュベートした後、ラフィノース合成酵素活性を測定した。その結果、本酵素は、２８℃〜４０℃の範囲で前記インキュベート処理を行わなかった対照区と比較して８０％〜１００％の活性を有し、安定であった。
【０１１５】
＜８＞アミノ酸配列の解析
精製ラフィノース合成酵素のシステイン残基を還元ピリジルエチル化し、脱塩した。これをリジルエンドペプチダーゼ（Achromobacter protease 1、和光純薬工業社製）にて３７℃、１２時間消化し、ペプチド断片化した。得られたペプチド混合液を逆相ＨＰＬＣ（カラム：ウォーターズ μBondasphere(φ2.1×150 mm、C18、300  )、ウォーターズ社製(ミリポア社)）に供し、各ペプチド断片を分離取得した。溶媒には０．１％ＴＦＡ（トリフルオロ酢酸）を用い、アセトニトリルの濃度勾配により溶出を行った。取得したペプチド断片のうち、３つの断片について、アミノ酸配列をプロテインシークエンーサーにより決定した。決定された各ペプチドのアミノ酸配列を配列表配列番号１〜３に示す。以下、これらのペプチドを、それぞれ順にペプチド１、２、及び３という。
【０１１６】
【実施例３】
キュウリ由来ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの取得
＜１＞ＰＣＲ法によるラフィノース合成酵素ｃＤＮＡの部分断片の単離
キュウリの主葉脈２２ｇを液体窒素中で乳鉢を用いて磨砕した。この磨砕物を、８０℃に余熱した抽出バッファー（１００ｍＭ塩化リチウム、１００ｍＭトリス−塩酸(ｐＨ８．０)、１０ｍＭ ＥＤＴＡ、１％ＳＤＳ）と等量のフェノールを混合したものに加え、撹拌後、フェノールと等量のクロロホルム：イソアミルアルコール（２４：１）を加え、再び撹拌を行い、この混合液を４℃で９２５０×ｇ、１５分間遠心処理し、上清を採取した。この上清に対して繰り返しフェノール処理、クロロホルム：イソアミルアルコール処理を行い、遠心上清を得た。この上清に等量の４Ｍ塩化リチウムを加え、−７０℃で１時間静置した。
【０１１７】
室温にて解凍後、４℃で９２５０×ｇ、３０分間遠心処理し沈殿を得た。この沈殿を２Ｍ塩化リチウム、８０％エタノールにより１回ずつ洗浄し、乾燥後２ｍｌのジエチルピロカーボネート処理水に溶解し、精製全ＲＮＡとした。得られた全ＲＮＡは２．３８ｍｇであった。
【０１１８】
この全ＲＮＡ全量を、オリゴ（ｄＴ）セルロースカラムを用いたｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡ精製キット（ＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ  ＣＬＯＮＩＮＧ  ＳＹＳＴＥＭＳ社製）に供し、ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡ分子を精製し、４２．５μｇのｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡを得た。
【０１１９】
上記のようにして得られたｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡから逆転写酵素ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔＩＩ（ＧＩＢＣＯ  ＢＲＬ社製）を用いて一本鎖ｃＤＮＡを合成した。このｃＤＮＡ混合物からラフィノース合成酵素ｃＤＮＡを単離するために、ＰＣＲ法による増幅を行った。ＰＣＲに用いるプライマーは、実施例２で決定したキュウリ由来のラフィノース合成酵素のペプチド断片のアミノ酸配列から、図７に示す一本鎖オリゴヌクレオチド（配列番号６〜２２）を合成した。各プライマーの配列において、ＲはＡ又はＧを、ＹはＣ又はＴを、ＭはＡ又はＣを、ＫはＧ又はＴを、ＤはＧ、Ａ又はＴを、ＨはＡ、Ｔ又はＣを、ＢはＧ、Ｔ又はＣを、ＮはＧ、Ａ、Ｔ若しくはＣ、又はイノシン（塩基はヒポキサンチン）を、それぞれ表す。
【０１２０】
プライマーとして、５’側プライマーにＡ（Ａ１（配列番号６）、Ａ２（配列番号７）、Ａ３（配列番号８）、Ａ４（配列番号９））、３’側プライマーにＤ’（Ｄ’１（配列番号２１）、Ｄ’２（配列番号２２））の組み合わせと、５’側プライマーにＣ２（配列番号１４））、及び３’プライマーにＢ’１(配列番号１８)、あるいはＢ’２(配列番号１９)を用いたときに、約５４０塩基対のＤＮＡが増幅された。この断片をＴＡクローニングキット（ＩＮＶＩＴＲＯＧＥＮＢＶ社製）を用いてプラスミドｐＣＲＩＩにクローニングし、塩基配列を解析したところ、両末端のプライマー配列の内側にペプチド１、２のアミノ酸配列をコードしている塩基配列が存在し、前記増幅断片はラフィノース合成酵素遺伝子に由来するＤＮＡ断片であることがわかった。
【０１２１】
さらに、クローニングした上記ＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片のラフィノース合成酵素遺伝子上での位置を特定するために、ＲＡＣＥキット（３’Ａｍｐｉｆｉｎｄｅｒ  ＲＡＣＥ  Ｋｉｔ（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社製））を用いて、３’ＲＡＣＥを行った。
【０１２２】
前記ｃＤＮＡ混合物を鋳型に、５’側プライマーにＣ（Ｃ１(配列番号１３)、Ｃ２(配列番号１４)）、３’側プライマーにはオリゴ（ｄＴ）とアンカー配列を有するプライマーを用いてＰＣＲを行い、さらにこうして得られた増幅断片を鋳型に、Ｃより内側に位置するＤ（Ｄ１(配列番号１５)、Ｄ２(配列番号１６)）を５’側プライマーに、３’側プライマーにはオリゴ（ｄＴ）−アンカープライマーを用いてＰＣＲを行った。その結果、Ｃ１（配列番号１３）、Ｃ２（配列番号１４）とオリゴ（ｄＴ）−アンカープライマーで増幅したＤＮＡを鋳型に、Ｄ２（配列番号１６）とオリゴ（ｄＴ）−アンカープライマーでＰＣＲを行ったときのみ、約２４００塩基対のＤＮＡ断片が増幅した。また、５’側プライマーにＣ（Ｃ１(配列番号１３)、Ｃ２(配列番号１４)）、３’側プライマーにはオリゴ（ｄＴ）−アンカープライマーを用いてＰＣＲを行い、さらにこうして得られた増幅断片を鋳型に、５’側プライマーにＥ（配列番号１７）、３’側プライマーにはオリゴ（ｄＴ）−アンカープライマーを用いてＰＣＲを行った。その結果、いずれの場合も、約３００塩基対のＤＮＡ断片を増幅した。
【０１２３】
同様に、前記ｃＤＮＡ混合物を鋳型に、５’側プライマーにＡ（Ａ１(配列番号６)、Ａ２(配列番号７)、Ａ３(配列番号８)あるいはＡ４(配列番号９)）、３’側プライマーにはオリゴ（ｄＴ）とアンカー配列を有するプライマーを用いてＰＣＲを行い、さらにこうして得られた増幅断片を鋳型に、Ａより内側に位置するＢ（Ｂ１(配列番号１０)、Ｂ２(配列番号１１)あるいはＢ３(配列番号１２)）、３’側に同じオリゴ（ｄＴ）−アンカープライマーを用いてＰＣＲを行った。その結果、Ａのいずれのプライマーを用いたときも、Ｂ２プライマーを用いたときに約２０００塩基対のＤＮＡ断片を得た。そこで、Ａ２、Ｂ２プライマーを用いて増幅したＤＮＡ断片をクローニングした。塩基配列を解析したところ、５’側にプライマー作成に用いたペプチド断片１のアミノ酸配列をコードする塩基配列が存在した。また、３’側にはｐｏｌｙ（Ａ）配列と、その上流にペプチド断片３に対応する塩基配列が存在した。
【０１２４】
先のＰＣＲの結果と合わせると、ラフィノース合成酵素ペプチド断片は、そのＮ末端側から２、１、３の順に並んでおり、先にＰＣＲによって得られた約５４０塩基対のＤＮＡ断片は、ラフィノース合成酵素遺伝子上の５’末端に近い部分であることがわかった。ラフィノース合成遺伝子全長を含むｃＤＮＡクローンをスクリーニングするためには、プローブとするＤＮＡが５’末端側に近い部分を検出できることが望ましいため、このＤＮＡ断片をプローブとしてｃＤＮＡライブラリーのスクリーニングに使用した。
【０１２５】
＜２＞ラフィノース合成酵素ｃＤＮＡのコード領域全長のクローニング
まず、以下のようにしてｃＤＮＡライブラリーを作製した。＜１＞で得られたｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡ  ３．８μｇからＴｉｍｅ  Ｓａｖｅｒ  ｃＤＮＡ合成キット（Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ社製）を用いて、２本鎖ｃＤＮＡを合成した。得られたｃＤＮＡを、λファージベクターλＭＯＳＳｌｏｘ（Ａｍｅｒｓｈａｍ社製）のＥｃｏＲＩ制限酵素切断部位に組み込んだ後、ＧｉｇａｐａｃｋII  Ｇｏｌｄパッケージングキット（ＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ  ＣＬＯＮＩＮＧ  ＳＹＳＴＥＭＳ社製）を用いて、ファージタンパク質中に取り込ませ、キュウリのｃＤＮＡライブラリーを調製した。なお、本ライブラリーのタイターは１．４６×１０7ｐｆｕ／μｇベクターであった。
【０１２６】
上記のキュウリのｃＤＮＡライブラリーから１．４×１０5ｐｆｕに相当するファージを宿主細胞エシェリヒア・コリ ＥＲ１６４７に感染させた後、直径９０ｍｍの寒天プレート１４枚に、プレートあたり１．０×１０4ｐｆｕとなるように蒔いた。これを３７℃で約６．５時間培養した後、プレート上に形成されたファージプラークをナイロンメンブレン（Ａｍｅｒｓｈａｍ社製Ｈｙｂｏｎｄ−Ｎ＋）に転写した。
【０１２７】
次に、上記ナイロンメンブレンを、アルカリで処理して転写されたＤＮＡを変性させ、中和した後に洗浄した。その後、このナイロンメンブレンを８０℃で２時間処理することでＤＮＡをメンブレン上に固定した。
【０１２８】
得られたナイロンメンブレンに対し、＜１＞で得た約５４０塩基対のＤＮＡ断片をプローブに用い、陽性クローンのスクリーニングを行った。上記の約５４０塩基対のＤＮＡ断片を、制限酵素ＥｃｏＲＩで消化後に電気泳動し、約５４０塩基対のインサートのみを切り出して精製したものを、ＤＮＡラベル・検出システム（Ｇｅｎｅ  Ｉｍａｇｅｓ ラベリング・検出システム（Ａｍｅｒｓｈａｍ社製））を用いてフルオレセインラベルし、プローブとした。前記のナイロンメンブレンを６０℃で３０分間、プレハイブリダイゼーションを行い、次いでラベルしたプローブを加えて６０℃で１６時間のハイブリダイゼーションを行った。ラベルされたＤＮＡを検出するための抗体（アルカリフォスファターゼ標識抗フルオレセイン抗体）は、５００００倍に希釈して用いた。このスクリーニングにおいて陽性クローンの候補株を得た。得られた候補株について上記と同様にしてスクリーニングをさらに２回繰返し、純化した陽性クローンを取得した。
【０１２９】
上記の陽性クローンをエシェリヒア・コリＢＭ２５．８に感染させ、カルベニシリンを含む選択培地上で培養することで、ｃＤＮＡを含むプラスミドベクターｐＭＯＳＳｌｏｘ−ＣＲＳを切り出した。このプラスミドの挿入ｃＤＮＡの長さは約２．５ｋｂであった。さらにこのプラスミドで腸菌ＪＭ１０９を形質転換し、形質転換体からプラスミドＤＮＡを調製し、これを塩基配列を解析するための試料とした。
【０１３０】
挿入ｃＤＮＡの塩基配列の解析にはＴａｑ  ＤｙｅＤｅｏｘｙ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ  Ｃｙｃｌｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ  Ｋｉｔ（Ｐｅｒｋｉｎ−Ｅｌｍｅｒ社製）を用いる従来公知の方法で行った。
【０１３１】
その結果、配列表の配列番号４に示す２３５２塩基対よりなる塩基配列が明らかとなった。この配列中には、本発明者らが用いたＤＮＡプローブの塩基配列と一致する部分が存在した。また、塩基配列から翻訳されるアミノ酸配列を配列番号４及び配列番号５に示した。このアミノ酸配列中には、本発明者らが得たキュウリ由来のラフィノースシンターゼのペプチド１（配列番号５中、アミノ酸番号２１５〜２４４）、２（配列番号５中、アミノ酸番号６１〜７９）及び３（配列番号５中、アミノ酸番号７５６〜７６９）と一致する部分が存在し、ラフィノース合成酵素をコードすることが確認された。
【０１３２】
上記のようにして得られたラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを含むプラスミドｐＭｏｓｓｌｏｘＣＲＳを保持するエシェリヒア・コリＪＭ１０９の形質転換体ＡＪ１３２６３は、平成８年１１月１９日より、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所（郵便番号３０５  日本国茨城県つくば市東一丁目１番３号）にブダペスト条約に基づき国際寄託されており、受託番号ＦＥＲＭ  ＢＰ−５７４８が付与されている。
【０１３３】
【実施例４】
ダイズ由来ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡの取得
＜１＞ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子クローニングのためのプローブの検索
キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子全長をプローブとして用いて、ダイズ全ＲＮＡに対しノーザンハイブリダイゼーションを行った。プローブは、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片を、実施例３で得られたプラスミドｐＭｏｓｓｌｏｘＣＲＳを制限酵素ＮｏｔＩで消化し、アガロースゲル電気泳動に付し、挿入断片を単離し、単離したＤＮＡ断片をα−Ｐ32ｄＣＴＰにてラベルすることによって得た。全ＲＮＡとしてはダイズ未熟種子（開花後５〜６週間）よりＳＤＳ−フェノール法にて調製した全ＲＮＡ３０μｇを用いた。３０分間のプレハイブリダイゼーションの後、プローブを加えて４２℃、一晩、ハイブリダイゼーションを行った。１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、６０℃の条件で洗浄した。コントロールのキュウリ由来ラフィノース合成酵素のシグナルは認められたが、ダイズ由来ＲＮＡに対してははっきりしたシグナルが得られなかった。キュウリ全長をプローブにするよりも、より保存された領域をプローブにすることが望ましいと判断した。
【０１３４】
＜２＞シロイヌナズナのラフィノース合成酵素遺伝子の部分断片の単離
シロイヌナズナの開花後１７〜２０日の莢１２５ｍｇを液体窒素中で乳鉢を用いて磨砕した。この磨砕物に３ｍｌの２×ＣＴＡＢ（２％セチルトリメチルアンモニウム ブロマイド、０．１Ｍ トリス塩酸緩衝液（ｐＨ９．５）、１．４Ｍ ＮａＣｌ、０．５％ メルカプトエタノール）を加え拡散させ、６５℃で１０分間振盪した。これをファルコンチューブのブルーマックス（５０ｍｌ）に移し、３ｍｌのクロロホルム：イソアミルアルコール（２４：１(v/v)）を加え穏やかに混和し、１２０００ｒｐｍで１０分間遠心した。上清を３ｍｌのクロロホルム：イソアミルアルコール（２４：１(v/v)）にて再度抽出し、１００００ｒｐｍで２５分間遠心した。遠心上清１．８ｍｌに対し、１．５ｍｌのイソアミルアルコールを加え混和し、１２０００ｒｐｍで１５分間、４℃にて遠心し沈殿を得た。沈殿を７０％エタノールで洗浄し沈殿を乾燥し、１ｍｌのＴＥ緩衝液に溶解した。４分の１量の１０Ｍ 塩化リチウム溶液を加えて混和し氷中で４時間静置し１２０００ｒｐｍで１５分間、４℃にて遠心した。沈殿を２Ｍ 塩化リチウム、７０％エタノールにて洗浄し、乾燥後、１００μｌのＴＥ緩衝液に溶解した。フェノール：クロロホルム（１：１(v/v)）を加え攪拌し、１２０００ｒｐｍで１５分間、４℃にて遠心し、水層を得た。この水層をエタノール沈殿に付し、沈殿を７０％エタノールで洗浄後、乾燥し、１０μｌのジエチルピロカーボネート処理水に溶解し全ＲＮＡとした。得られた全ＲＮＡは１８．７μｇであった。この全ＲＮＡから逆転写酵素ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔII（ＧＩＢＣＯ ＢＲＬ社製）を用いて一本鎖ｃＤＮＡを合成した。
【０１３５】
このｃＤＮＡ混合物からラフィノース合成酵素遺伝子部分断片をＰＣＲにより増幅させるためにプライマーを合成した。プライマーは、キュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と相同性を有するＤＮＡをジーンバンクより検索し、保存されている領域より一本鎖オリゴヌクレオチド（配列番号２５、２６）として合成した。先の一本鎖ｃＤＮＡを鋳型にして、このプライマーによりＰＣＲを行ったところ、約２５０塩基対のＤＮＡ断片が増幅された。この断片をＴＡクローニングキット（ＩＮＶＩＴＲＯＧＥＮ ＢＶ社製）を用いてプラスミドｐＣＲ２．１にクローニングし塩基配列を解析したところ、配列番号２７に示す塩基配列が得られた。キュウリ由来ラフィノース合成酵素と相同性を有するシロイヌナズナ由来ラフィノース合成酵素ｃＤＮＡ部分断片が得られたと認められた。
【０１３６】
＜３＞ダイズ由来ラフィノース合成酵素ｃＤＮＡのクローニング
ダイズの開花後５〜６週間の種子４．５ｇを液体窒素中で乳鉢にて磨砕した。磨砕物より、ＳＤＳ−フェノール法にて１．３ｍｇの全ＲＮＡを抽出した。抽出物をオリゴｄＴセルロースカラム（ｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡ精製キット：ＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ ＣＬＯＮＩＮＧ ＳＹＳＴＥＭＳ社製）に供し、約６μｇのｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡを単離した。このうち約２μｇのｐｏｌｙ（Ａ）+ＲＮＡからＴｉｍｅＳａｖｅｒ ｃＤＮＡ合成キット（Ｐｈａｒｍａｃｉａ ｂｉｏｔｅｃｈ社製）にて、オリゴｄＴプライマーにより二本鎖ｃＤＮＡを合成した。得られたｃＤＮＡをλファージベクターλＭＯＳＳｌｏｘ（Ａｍｅｒｓｈａｍ社製）のＥｃｏＲＩ制限酵素切断部位に組み込んだ後、Ｇｉｇａｐａｃｋ III Ｇｏｌｄパッケージングキット（ＳＴＲＡＴＡＧＥＮＥ ＣＬＯＮＩＮＧ ＳＹＳＴＥＭＳ社製）を用いてファージ粒子中に取り込ませダイズのｃＤＮＡライブラリーを調製した。なお、本ライブラリーのタイターは１．４２×１０7ｐｆｕ／μｇベクターＤＮＡであった。
【０１３７】
ダイズｃＤＮＡライブラリーから１．５×１０5ｐｆｕに相当するファージを、キュウリｃＤＮＡライブラリーと同様に、ナイロンメンブレン（Ｈｙｂｏｎｄ−Ｎ+；Ａｍｅｒｓｈａｍ社製）に転写し固定した。１枚のプレートに対し、２枚のメンブレンを転写し２セットを用意した。得られたメンブレンに対し、＜２＞で得られたシロイヌナズナ由来ラフィノース合成酵素ｃＤＮＡ遺伝子部分断片を用いてスクリーニングを行った。このＤＮＡ断片は、Ｇｅｎｅ Ｉｍａｇｅｓラベリング検出システム（Ａｍｅｒｓｈａｍ社製）を用いてフルオレセインラベルしプローブとした。ハイブリダイゼーション及び検出は、キュウリｃＤＮＡライブラリースクリーニングと同様に行った。ただし、メンブランの洗浄は、１セットを１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳで、１セットを０．１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳで６０℃にて行った。両条件下で陽性のクローンの候補株を１５個得、候補株について上記と同様にスクリーニングをさらに１回繰り返し純化したクローン５株を取得した。
【０１３８】
上記陽性クローンをＥ．ｃｏｌｉ ＢＭ２５．８に感染させ、ｃＤＮＡを含むプラスミドを切り出した。さらに、このプラスミドで、Ｅ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９を形質転換し、形質転換体よりプラスミドＤＮＡを調製し塩基配列解析試料とした。塩基配列解析はキュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子と同様に行った。５クローンのうちの一つであるｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳは、塩基配列解析より、ダイズ由来ラフィノース合成酵素遺伝子全長を含むことが確認された。
【０１３９】
ｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳの挿入断片は、配列番号２３に示す２７８０塩基対よりなる配列を有しており、７５０アミノ酸からなるラフィノース合成酵素をコードしていた。他のクローンの挿入断片は、ｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳのものより短くラフィノース合成酵素遺伝子の５’側を欠失していた。
【０１４０】
上記のようにして得られたラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを含むＤＮＡ断片を含むプラスミドｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳを保持するエシェリヒア・コリＪＭ１０９の形質転換体ＡＪ１３３７９は、平成９年１０月２０日から、通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所（郵便番号３０５  日本国茨城県つくば市東一丁目１番３号）にブタペスト条約に基づき国際寄託されており、受託番号ＦＥＲＭ  ＢＰ−６１４９が付与されている。
【０１４１】
【実施例５】
ラフィノース合成酵素をコードするＤＮＡを含むキメラ遺伝子及び形質転換植物
＜１＞キメラ遺伝子を含むプラスミドの構築
アグロバクテリウムとしてＬＢＡ４４０４、バイナリーベクターとしてｐＢＩ１２１（ＣＬＯＮＴＥＣＨ社）を用いて、シロイヌナズナにラフィノース合成酵素のＤＮＡ断片を導入した。ｐＢＩ１２１は、ｐＢＩＮ１９由来のプラスミドであり、ノパリン合成酵素遺伝子プロモーター、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ構造遺伝子（ＮＰＴII）、ノパリン合成酵素遺伝子ターミネーター（Ｎｏｓ−ｔｅｒ）、ＣａＭＶ ３５Ｓプロモーター、ＧＵＳ（β−グルクロニダーゼ）遺伝子、及びＮｏｓ−ｔｅｒが接続し、これらの両側に植物への移行が可能な配列を有する。ＣａＭＶ ３５Ｓプロモーターの下流にはＳｍａＩ部位があり、この部位に挿入されたインサートは該プロモーターの制御下で発現する。
【０１４２】
バイナリーベクターｐＢＩ１２１に、実施例３で得られたキュウリ由来ラフィノース合成酵素遺伝子断片を挿入した。ラフィノース合成酵素遺伝子をＤｒａＩ消化し、配列表配列番号４において１３８２番目から２５２９番目までの塩基を含むＤＮＡ断片をアガロースゲル電気泳動により調製した。この断片をｐＢＩ１２１のＳｍａＩサイトにライゲーションした。このライゲーション反応液を用いてエシェリヒア・コリＨＢ１０１を形質転換し、形質転換株から組換えプラスミドを調製した。得られた組換えプラスミドのうち、ＣａＭＶ ３５Ｓプロモーターにラフィノース合成酵素ＤＮＡ断片が逆向きに接続したもの（アンチセンス）、正の向きに接続したもの（センス）ものを２種選択し、それぞれ、ｐＢＩｃＲＳ１及びｐＢＩｃＲＳ９と命名した。
【０１４３】
また、ラフィノース合成酵素を発現させるキメラ遺伝子を含むプラスミドを構築した。ラフィノース合成酵素遺伝子を含むｐＭＯＳＳｌｏｘＳＲＳをＮｏｔＩ消化し、ラフィノース合成酵素遺伝子断片をアガロースゲル電気泳動により調製した。このＤＮＡ断片のＮｏｔＩ切断部位をｄＮＴＰを用いたＴａｑポリメラーゼ反応によってフィルインし、３’側にＡ塩基を突出させたＳＲＳ断片を得た。一方、ｐＢＩ１２１はＳｍａＩ消化し、アガロースゲル電気泳動にて直鎖状のＤＮＡを精製し、ｄＴＴＰを用いてＴａｑポリメラーゼ反応により、３’側にＴ塩基を付加させたｐＢＩ１２１／ＳｍａＩを得た。精製した後、ＳＲＳ断片をｐＢＩ１２１／ＳｍａＩにライゲーションした。このライゲーション反応液を用いてエシェリヒア・コリＨＢ１０１を形質転換した。得られた形質転換株よりプラスミドＤＮＡを調製し、これを制限酵素ＥｃｏＲＩ、ＢａｍＨＩ、ＸｈｏＩのそれぞれ、及び、組み合わせによる消化を行った。得られた断片の分子量をアガロース電気泳動で測定し、物理的地図を作成した。作成した物理的地図から、組換えプラスミドのうち、ＣａＭＶ ３５Ｓプロモーターに対し、ラフィノース合成酵素遺伝子が正方向に接続したものを選び、ｐＢＩｓＲＳ１と名付けた。
【０１４４】
上記のようにして得られたプラスミドを、これらを含むシェリヒア・コリＨＢ１０１とアグロバクテリウムＬＢＡ４４０４をトリペアレンタルメイティングすることによりアグロバクテリウムＬＢＡ４４０４に導入した。
【０１４５】
＜２＞形質転換
シロイヌナズナの形質転換は以下のように行った。シロイヌナズナ（Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ）の種子は、吸水処理後、１％Ｔｗｅｅｎ２０を含む８０％エタノールにて５分間、同じく１％Ｔｗｅｅｎ２０を含む１０％次亜塩素酸ナトリウムで１０分間処理し、滅菌水で５回洗浄して殺菌した。これを、１％低融点アガロースに懸濁し、ＭＳ培地（ＭＳ基本培地(Murashige and Skoog, Physiologia Plantrum, 15, 473-497 (1962))、Ｂ５ビタミン、１０ｇ／Ｌ スクロース ０．５ｇ／Ｌ ＭＥＳ、ｐＨ５．８）にまいた。これを、２２℃、１６時間光照射、８時間暗期の培養室にて１週間培養し、双葉が展開したものをロックウールに定植した。同条件で培養を続け、約３週間後、植物が抽台し、茎の高さが数ｃｍになったところで摘心をした。摘心後１週間し、伸長した側枝の最初の花が開花した状態まで生育させた。
【０１４６】
ラフィノース合成酵素遺伝子を含む組換えプラスミドを導入したアグロバクテリウムの前培養を２ｍｌのＬＢ培地で行った。これを、５０ｍｇ／Ｌカナマイシン、２５ｍｇ／Ｌストレプトマイシン含有のＬＢ培地に接種し２８℃で、約１日培養した。室温で集菌し、浸潤用懸濁培地（１／２ＭＳ塩、１／２ガンボルグ(Gamborg)Ｂ５ビタミン、５％スクロース、０．５ｇ／Ｌ ＭＥＳ、ｐＨ５．７（ＫＯＨ）、使用直前にベンジルアミノプリンを最終濃度０．０４４μＭ、またシルウェット(ＳｉｌｗｅｔＬ７７)を１Ｌ当たり２００μｌ（最終濃度０．０２％）加える）に菌液のＯＤ600が０．８になるように懸濁した。
【０１４７】
浸潤を行う植物より開花結実している花を取り除いた。ロックウールを逆さにして、前記アグロバクテリウム懸濁液に結実していない花を漬け、デシケータに入れて、４０ｍｍＨＧで１５分間減圧した。２から４週間で、種子を集めた。収穫した種子は、デシケータで保存した。
【０１４８】
つぎに、選抜培地にて、形質転換体を選抜した。先に述ベたように種子を殺菌し、選抜培地（ＭＳ塩、ガンボルグＢ５ビタミン、１％スクロース、０．５ｇ／Ｌ ＭＥＳ、ｐＨ５．８、０．８％寒天；オートクレーブ後、選択用抗生物質、カルベニシリン（最終濃度１００ｍｇ／Ｌ、カナマイシン（最終濃度５０ｍｇ／Ｌ）を加える）にて２２℃で培養し、耐性植物を選抜した。耐性植物は新しい培地に移し、本葉が展開するまで育てた。ここの植物から種子を収穫した。同様の選抜を繰り返し、Ｔ３種子を獲得した。Ｔ３種子について、先に述ベた方法によりラフィノース含量を定量した。結果を３に示す。
【０１４９】
【表３】
0004410318.tif 000004
【０１５０】
【発明の効果】
本発明により、精製されたラフィノース合成酵素、ラフィノース合成酵素遺伝子、ラフィノース合成酵素遺伝子と植物で発現可能な制御領域を有するキメラ遺伝子、及びこのキメラ遺伝子が導入された植物が提供される。
【０１５１】
本発明のラフィノース合成酵素を用いることにより、スクロース及びガラクチノールから効率よくラフィノースを合成することができる。また、本発明のラフィノース合成酵素遺伝子又はキメラ遺伝子を利用することにより、植物のラフィノース族オリゴ糖含量を変化させることができる。
【０１５２】
【配列表】
0004410318.tif 000005
【０１５３】
0004410318.tif 000006
【０１５４】
0004410318.tif 000007
【０１５５】
0004410318.tif 000008
0004410318.tif 000009
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0004410318.tif 000012
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【０１５６】
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【０１５７】
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【０１５８】
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【０１５９】
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【０１６０】
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【０１６１】
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【０１６２】
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【０１６３】
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【０１６４】
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【０１６５】
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【０１６６】
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【０１６７】
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【０１６８】
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【０１６９】
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【０１７０】
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【０１７１】
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【０１７２】
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【０１７３】
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【０１７４】
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【０１７５】
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【０１７６】
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【０１７７】
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【０１７８】
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【０１７９】
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【０１８０】
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【０１８１】
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【図面の簡単な説明】
【図１】  ラフィノース合成反応によって生じるラフィノース生成量と反応時間との関係を示す図。
【図２】  ラフィノース合成酵素のＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動の結果を示す模式図。Ｍは分子量マーカーを、Ｓはラフィノース合成酵素を含む試料を示す。数字は分子量（ｋＤａ）を表す。
【図３】  ラフィノース合成酵素活性に対する反応温度の影響を示す図。
【図４】  ラフィノース合成酵素活性に対する反応ｐＨの影響を示す図。
【図５】  ラフィノース合成酵素活性に対するミオイノシトールの影響を示す図。
【図６】  ラフィノース合成酵素の安定ｐＨ範囲を示す図。
【図７】  合成プライマーとペプチドのアミノ酸配列との関係を示す図。ＲはＡ又はＧを、ＹはＣ又はＴを、ＭはＡ又はＣを、ＫはＧ又はＴを、ＤはＧ、Ａ又はＴを、ＨはＡ、Ｔ又はＣを、ＢはＧ、Ｔ又はＣを、ＮはＧ、Ａ、Ｔ若しくはＣを、Ｉはイノシンを表す。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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