(57)【要約】２型糖尿病（ＤＭ）感受性遺伝子を同定するために、ケースコントロール試験を用いて候補遺伝子７０４個に由来する一塩基多型（ＳＮＰｓ）２０３９個について、２型糖尿病との関連を調べた。その結果、２型糖尿病に関連する２９個の遺伝子の同定に成功した。これらの遺伝子上の多型変異の有無を指標とすることにより、２型糖尿病の検査を行うことが可能である。【特許請求の範囲】
【請求項１】
被検者について、下記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子における変異を検出することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法。
（１）ＭＥＴ、（２）ＮＰＨＳ１、（３）ＳＬＣ１Ａ１、（４）ＳＥＲＰＩＮＢ２、（５）ＦＡＢＰ２、（６）ＺＮＦ２６３、（７）ＴＮＦＡ、（８）ＴＨＢＳ３、（９）ＡＢＣＡ１、（１０）ＳＥＲＰＩＮＢ１０、（１１）ＡＬＤＯＢ、（１２）ＣＴＳＤ、（１３）ＳＴＥ、（１４）ＡＢＣＣ８、（１５）ＳＥＲＰＩＮＡ３、（１６）ＲＣＶ１、（１７）ＴＦＲＣ、（１８）ＭＭＰ１９、（１９）ＭＹＬ２、（２０）ＶＬＤＬＲ、（２１）Ｐ２ＲＸ７、（２２）ＤＬＧ５、（２３）ＬＤＬＣ、（２４）ＡＱＰ８、（２５）ＬＡＲＧＥ、（２６）ＢＬＺＦ１、（２７）ＲＧＳ５、（２８）ＦＲＡＰ１、（２９）ＬＥＰ
【請求項２】
変異が一塩基多型変異である、請求項１に記載の検査方法。
【請求項３】
被検者について、請求項１の（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位の塩基種を決定することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法。
【請求項４】
多型部位が、それぞれ以下の（１ａ）〜（２９ａ）に記載の多型部位である、請求項３に記載の方法。
（１ａ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における７６５位、１３８３位、１８９０位、２０９９位、２８１４位、３２９３位、３７５２位、３７７４位、３９２７位、４６９０位、７４１９位、８２１４位、１０００１位、１０３１８位、１３７６６位、１３９８９位、１４２５８位、１５４２７位、１６２７５位、１６５９７位、１６９３２位、１９７６８位、１９８３５位、２００３２位、２０２４０位、２０５３７位、２０８８５位、２１５４６位、２４２０９位、２４２７１位、２４３７６位、２４６４２位、２６０２８位、２６２２６位、または３４２０９位のいずれかの多型部位
（２ａ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１７２位、１８６位、２１１位、２５５４位、２５５８位、１０００１位、１００６７位、１０１７６位、１１８４０位、１３７５９位、１４６４５位、１４９６７位、１６１９８位、１６４３９位、１７６３５位、１７６８５位、１７７９４位、１７８０５位、１７８４８位、１７８４９位、１８４９１位、１９９５５位、２００８８位、２０６１３位、２１５３３位、２１５８２位、２１８１１位、２１８１２位、２２１９０位、２２９６５位、２２９８２位、２３６６０位、２３７８０位、２４０４０位、２４１７２位、２５３３４位、または２６５８５位のいずれかの多型部位
（３ａ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１１４２位、２７３２位、２７３４位、７２２０位、１０００１位、１２２７６位、１２９２２位、または１８０４９位のいずれかの多型部位
（４ａ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２８５３位、２８９１、５２１８位、５３１７位、７５６０位、８０５４位、８７７１位、１０００１位、１０３２９位、１１７８１位、１２０６３位、１２７０５位、１３１２５位、１３６９１位、１３９１３位、１３９１６位、１３９１７位、１４１２３位、１４１６９位、１４４５３位、１４４５６位、１４４８３位、１６５２６位、１６５５６位、１７６４３位、１７７２５位、１７８２４位、１８０７６位、１８２２７位、１８５００位、１８６８７位、１８７４１位、１８７４４位、１８８７５位、１９０４５位、１９１４１位、１９１４９位、１９１９０位、１９４２９位、１９５４８位、１９５６７位、１９６２４位、１９６４５位、１９８１４位、２００４９位、２００８２位、２００９７位、２０２４３位、２２１２２位、２２４９５位、２２５１６位、２２６９１位、２２８１６位、２３００７位、２３９０４位、２４００５位、２４４１８位、２４５７８位、２４８５５位、２４８８５位、２５５０５位、２５５３８位、２５５６４位、２５５８６位、２６０１７位、２６２３４位、２６５５７位、２６６２１位、３０１５５位、３０２６７位、または３０６０７位のいずれかの多型部位
（５ａ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における２９７０位、３１７４位、３１７５位、４５２５位、４５５６位、４５５８位、４６３６位、４６４６位、４７７４位、５７２６位、５７３６位、５８５２位、７２０３位、７２５３位、７３１０位、８２３９位、８２５１位、８２９６位、８３１２位、８９７４位、１０００１位、１０１０７位、１０４２４位、１０４６４位、１０４９１位、１０７９４位、１１９２２位、１１９５７位、１２８２０位、１６００６位、１６２５６位、１６３０９位、１６３１２位、１６３６０位、１６９２３位、１７８７７位、１８４０８位、１８６４９位、１８７１５位、１８７８３位、または１９８７８位のいずれかの多型部位
（６ａ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における８７６位、１５５２位、３２１３位、３２６９位、６４０１位、６４２５位、６６０２位、９５９５位、１０００１位、１０２５２位、１０２６９位、１０２９４位、１１３７７位、１２４６９位、１３６４２位、１３６４３位、１３８７９位、１４３６７位、１６１３３位、１７０８４位、１７６５２位、または１９２６３位のいずれかの多型部位
（７ａ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１７５位、２４０１位、２９７３位、４４５２位、４６７１位、４６７２位、５１８４位、５６０９位、５８２０位、５９４１位、５９４２位、５９４２位、６２４５位、６３１５位、６３１６位、６４８７位、６６０３位、６７３０位、６８６７位、６９３１位、６９３５位、６９５８位、７９５３位、８０２２位、８１３３位、８４８２位、８６２８位、８６５０位、８６５６位、８８２７位、８８２９位、８８６５位、８９３８位、８９４５位、８９９４位、９２０５位、９２６９位、９２７５位、１０００１位、１０２０２位、１０３６３位、１０３９９位、１０６８０位、１０７６５位、１０８１６位、１１０９２位、１１５６５位、１１９４１位、１２６６９位、１２９３６位、１２９６３位、１３０２４位、１３１２８位、１３１５４位、１３２８９位、１３５３８位、１３５３９位、１３５９４位、１３６３２位、１３６４６位、１３６８８位、１３８２２位、１３８５５位、１３８６３位、１３９６６位、１３９９３位、１４３７０位、１４５４２位、１４６２５位、１５０３０位、１５０６４位、１５５８１位、１５７３０位、１５９７５位、１６６２６位、１６７１３位、１６７３４位、１７２４０位、１７３６９位、１７６９８位、１７７１１位、または１９３４８位のいずれかの多型部位
（８ａ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における３０９８位、３１０３位、３１４３位、３１７８位、４５４３位、６９７７位、７１５８位、１０００１位、１０４４５位、１１７２８位、１３０１２位、１３５１４位、１６４０４位、１８０８８位、１８７０８位、１８７７６位、１８９８９位、１９４６５位、１９７６９位、または１９７８６位のいずれかの多型部位
（９ａ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における９９３位、１７７９位、１８１３位、３４５０位、４２８７位、４３８２位、７２７０位、７５２８位、８３８３位、８７８３位、８７９８位、９２５４位、１０００１位、１０９９９位、１１１２２位、１１７２０位、１２４７３位、１２５６０位、１２５９１位、１２６６４位、１２９１６位、１３４０３位、１３６０５位、１３６９１位、１４４５７位、１４７３７位、１５２７８位、１５３４５位、１５３４５位、１５６３６位、１５６３６位、１５８２４位、１６７９３位、１７０２２位、１７０３７位、１７２８３位、１７５７６位、１８１６７位、１８６１９位、１８６３２位、１８８４２位、１８８４３位、１８９２６位、１９４０４位、１９４０４位、１９８０９位、２０４４７位、２０５１４位、２０５１５位、２１９６３位、２２９８８位、２３０８１位、２３１５７位、２３５７７位、２３９５３位、２４３８９位、２５８１４位、２６１９８位、２６６５５位、２６９０２位、２７３６７位、２７５３５位、２７７０１位、２８１７５位、２８４６７位、２８５６４位、２８６６９位、２８７７４位、２８８３９位、２８９３７位、２８９４４位、２９０３７位、３００９１位、３０６１３位、３０９７５位、３２８０３位、３２８０３位、３３４３５位、３４２６３位、３４２６４位、３４８１２位、３５３０６位、３５３３９位、３５４７３位、３６２１７位、３７５９６位、または３７８５５位のいずれかの多型部位
（１０ａ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１４５位、４８４５位、６７５７位、６８５９位、７１５１位、７８２７位、８０６６位、１０００１位、１２８８５位、１３２２７位、１３４３２位、１３５６３位、１５４３９位、１５４４７位、１５７２９位、１５７５９位、１５８８５位、１６０９４位、１６３３０位、または１８５６５位のいずれかの多型部位
（１１ａ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における９９位、３８０位、３９６位、３９９位、７１２位、９３４位、１５３４位、１６１２位、１９４８位、２０７９位、２１０１位、４１６１位、４３１８位、４３１８位、５０９１位、６６２３位、６７１８位、７７９６位、７８５９位、８１９０位、８２０３位、９１０４位、９６２１位、９６４２位、１０００１位、１０４８９位、１１４４３位、１１５９２位、１１５９３位、１１６１６位、１１６１７位、１２２８１位、１２４５７位、１２８０２位、１３９９３位、１４０２６位、１４８００位、１６６５４位、１６８２２位、１７１３３位、１７２３９位、１８２１６位、１８７０９位、１９６１０位、または１９６１３位のいずれかの多型部位
（１２ａ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における８１３位、８１５位、８４４位、８６１位、９５４位、１０２６位、１１５９位、１２９９位、５４６４位、５６００位、７１４４位、７７０７位、７７２６位、７７３９位、７７７８位、７８０３位、７８４１位、７８４２位、７８８６位、７９３９位、７９６３位、８０５８位、８３３３位、９９４８位、１０００１位、１１９９０位、１２３４２位、１２８０７位、１６２６６位、または１６７７１位のいずれかの多型部位
（１３ａ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における５７位、４６８位、１８８１位、２９５５位、３４６０位、３９７６位、４５３７位、４５３８位、４７２２位、４８６７位、４８７３位、４９４７位、５０２５位、７０４３位、７６７６位、８５８１位、９０３５位、９３４７位、９６８６位、９８８２位、９８９４位、１０００１位、１０００３位、１２１４２位、１３５２０位、１３５５１位、１３７９７位、１４４９２位、１４７５３位、１４９３３位、１５６８４位、１７０２２位、１８２６４位、１８５６８位、１８９５８位、１９１９４位、１９３３０位、１９３５４位、１９３５５位、１９５６７位、１９７８５位、２０５１１位、２０６１２位、２０６２７位、２０９３６位、２０９６１位、２０９７１位、２１２１３位、２１３３６位、２１６０９位、２１９１４位、または２１９８３位のいずれかの多型部位
（１４ａ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における６９７８位、７３５８位、７３５９位、７６４９位、７７５５位、８０６８位、８２１４位、８２１５位、８３０８位、９６５８位、９７６１位、９８１１位、９８２８位、１０００１位、１００９５位、１０１２５位、１１６５８位、１１６７４位、１１７０８位、１１７６７位、１１８８３位、１１９９８位、１２１０９位、１２３０８位、１３６２０位、１３６６４位、１３９１２位、１４２９７位、１４３０９位、１４３２０位、１４３２３位、１４３６７位、１４３９３位、１４４７５位、１４５９１位、１４７２２位、１５２９４位、１５６０１位、１５６５７位、１６１６０位、１６２３０位、１６３６７位、１６４１７位、１７６９５位、１８２１３位、１８８１５位、１９０９３位、２００８２位、２０２１１位、２０４６１位、２１５４７位、２１９９５位、２２８２５位、または２３９０１位のいずれかの多型部位
（１５ａ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における９３７位、１１４５位、１８７８位、２３４５位、２５５９位、３２５０位、３５１３位、４４０２位、５７７６位、６６５９位、７４５３位、７９３４位、８０００位、８０４９位、８２０４位、８５４３位、８５５４位、８９３５位、９９２８位、１０００１位、１０２３３位、１０４７２位、１０４７９位、１０５２５位、１０５４４位、１０６２９位、１３３３９位、１３３４８位、１６２８７位、１６３８９位、１６６２６位、または１７８８０位のいずれかの多型部位
（１６ａ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における２５位、４９位、４６９位、５５７位、５９２位、２７３０位、２７５４位、５７６１位、６１５４位、６１８３位、８５１０位、８５２９位、８５４２位、８５９０位、９８３８位、１０００１位、１０１３２位、１０１３３位、１０６４９位、１０７０２位、１０８６６位、１２５６０位、１５６３２位、１５８２７位、１５８５３位、１５９９４位、１６６１７位、１６７９０位、１６８４１位、１７０１０位、１７３４８位、１７６５６位、１７６５６位、１７８１６位、１７８２０位、１７８８２位、１７８８２位、１８０６１位、１８１０１位、１９３０４位、または１９４８５位のいずれかの多型部位（１７ａ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における８３６位、１０１９位、２５１１位、４０１６位、４０６８位、４１６９位、４２６９位、４４８１位、５３９８位、５４３６位、５４５０位、５７３０位、５９３７位、６０４４位、６３１３位、６７１３位、６７５９位、６７９４位、６８３３位、７５２８位、８０４７位、８０４８位、８０８０位、９２４８位、９３６１位、９４１７位、９７３４位、１０００１位、１１４６１位、１１８４５位、１１８５２位、１２０８６位、１２５９６位、１２８６４位、１２９３０位、１３９６９位、１３９６９位、１４１１９位、１４２８０位、１６８３３位、または１７０４７位のいずれかの多型部位
（１８ａ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における６３２９位、７３２９位、７７１５位、８１３８位、８５０７位、８５５１位、８５７４位、１０００１位、１１１３８位、１１３４３位、１３１５１位、１３８６８位、または１８９２３位のいずれかの多型部位
（１９ａ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における３１４７位、３２１３位、４６８６位、７３４３位、７８９２位、１０００１位、１０１２３位、１１２６４位、１１９９２位、１５５３２位、１５６８１位、１５９５７位、１５９８８位、１６６４１位、１８３８６位、１８７８２位、２０３５４位、２１５３１位、２３２４５位、２７７４０位、３０６６９位、３０６７０位、３２０７７位、３２７３２位、３２９０７位、３２９５５位、４２５８９位、４３０２９位、４７３５４位、６４７７７位、７１８６９位、７１９６１位、７４２７４位、７５５５１位、７６３４３位、７６３４４位、７８２７０位、７８３３９位、７８６８９位、７８７４３位、７８８０６位、７８８０７位、７９２１５位、７９３１９位、７９３５７位、７９４６０位、７９４６３位、８００３４位、８００６２位、８００７６位、８０４０１位、８０４７５位、８０５９９位、８０７１５位、８０８６５位、８０９４３位、８０９５２位、８０９７４位、８０９９１位、８１１３０位、８１３７３位、８１４２８位、８１５４３位、８１６８２位、８２４２２位、８２５４５位、８２７９２位、８２９３８位、８３２６５位、８３２６６位、８３３９４位、８３４６３位、８３５００位、８３５７８位、８３６１２位、８３６５０位、８４７９０位、８４９２１位、８４９４５位、８５２１４位、８５３８３位、８５３８４位、８５５５０位、８５９８４位、８６１０９位、８６５３９位、８６５４２位、８７１６９位、８７１７０位、８７３５３位、８７６７１位、８７９５３位、８７９５４位、８８０５７位、８８１７８位、８８２４０位、８８２５８位、８８２７１位、８８２７２位、８８３０７位、８８５１２位、８８６９５位、８８７７８位、８８７９８位、８９１２４位、または９１０８１位のいずれかの多型部位
（２０ａ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における６２９７位、６７３３位、７９９４位、９２４２位、９９５２位、１０００１位、１１８３８位、１２９９５位、１３２２４位、１３２７７位、１８７０２位、１８８９６位、または１９２１４位のいずれかの多型部位
（２１ａ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における９９位、６９４位、２７６５位、２７６５位、３１０１位、３１１７位、３１２７位、３３０９位、３３４６位、３８０２位、３９１６位、４２０６位、４４３０位、５９３７位、６７０５位、７３７８位、８３１２位、８３９９位、９９２８位、１０００１位、１００４２位、１０２７７位、１０４４０位、１０４６１位、１０４７９位、１０５２７位、１０５３４位、１０５５０位、１０７０１位、１０９０９位、１１０６６位、１１１９８位、１１５７５位、１１６３１位、１１７６５位、１１９７６位、１２１１９位、１２１５８位、１２２０７位、１２２７２位、１２３６６位、１２４９８位、１２５６３位、１２７９１位、１２８５６位、１２８６０位、１３２０７位、１３４８３位、１３５９０位、１３８６０位、１３８６９位、１３８８０位、１３８８１位、１３９８４位、１４０４８位、１４０５９位、１４２１０位、１４８０６位、１４９２１位、１５３３１位、１５４８８位、１５５５８位、１５６５１位、１５６８６位、１５７９１位、１６０５１位、１６０８２位、１６１３７位、１６４９２位、１６６４９位、１６７８４位、１６７８８位、１７０７２位、１７０７６位、１７３７９位、１７５２７位、１７５９３位、１７６２３位、１７７１９位、１７９９８位、１８００５位、１８０４８位、１８２８８位、１８４１２位、１８５８８位、１８６４０位、１９３４０位、１９５４５位、１９６７６位、または１９６８５位のいずれかの多型部位
（２２ａ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２位、１２１位、１４３８位、１６６９位、２１８０位、２４３６位、２５４３位、２６１９位、３７１５位、３７２７位、５２５６位、５３３５位、５３３９位、５６８８位、５７５２位、６３０４位、６６２７位、７１９５位、７３４２位、７６０３位、８２７３位、８９０５位、８９８８位、９０１３位、９０５７位、１０００１位、１０３７２位、１０４５３位、１０４６８位、１０４６８位、１０５１２位、１１０３８位、１１０５５位、１１５９７位、１１６８１位、１１７１９位、１１９２２位、１２０３４位、１２０４９位、１２１７６位、１２５５４位、１３４８１位、１３８６４位、１４３９０位、１５０４４位、１５５９８位、１６１７６位、１６８７０位、１７４７５位、１７７４９位、１８０７７位、１８５８５位、１８６１９位、１８６７７位、１９２２２位、１９７３１位、１９７５０位、２０７５８位、２０９６２位、２１０７３位、２１６８０位、２１８６７位、２２３８５位、２２８７４位、２３１９１位、２４０１６位、２４５２０位、２４９９３位、２５４６０位、２６１５５位、２６８０４位、２６９８０位、２７９８８位、２９２３４位、２９４６９位、３０２５４位、３０７４２位、３０７４２位、３０７５６位、３０７５６位、３１６７１位、３１８７４位、３１９４０位、３２６２６位、３３３９３位、３３５８１位、３４２４０位、３５２９４位、３５６６６位、３６５８７位、３６６５３位、３６９４１位、３７４０８位、３７５８３位、３７６１２位、３８４６２位、３８４７０位、３８４８５位、３９０６５位、３９１４６位、４０６１２位、４０６４１位、４１２４２位、４２２１７位、４２５３９位、４５９３４位、４６０３３位、または４６８９５位のいずれかの多型部位
（２３ａ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１５８０位、１７５４位、１８８２位、３０６２位、３５０７位、４８００位、４９０５位、５５６９位、５６０８位、５６４３位、５６６５位、５６９３位、５８６４位、５８８４位、５９８１位、６１６９位、６８０８位、６８５８位、７１９４位、７２８３位、７７２８位、７８３５位、８０４９位、８０４９位、８２６５位、９２０９位、９４４５位、９６４６位、９６４７位、９７１６位、９７７５位、１０００１位、１００２９位、１００５４位、１０１９３位、１０２０８位、１０８２６位、１０９０８位、１０９９７位、１１３３６位、１１７５４位、１１８９５位、１２０３１位、１２３２７位、１２４６４位、１２５６１位、１４０５１位、１５３６６位、１５７７８位、１７７２３位、１７７７２位、１７７８３位、１７８１１位、１７８１５位、１７８６２位、１７９００位、１７９６２位、１８１８４位、１８１８９位、１８２９７位、１８４１１位、１８５１２位、１８５６３位、１９１２５位、１９１５２位、２００９２位、２１２２７位、２１５０６位、２１６１７位、２１８５５位、２３０９０位、２５７００位、２６４６８位、２６６３８位、２７６８２位、２７７５５位、２７８８８位、２７９７３位、２７９９５位、２８１２３位、２８１２７位、２８１４４位、２８１５３位、または２８２７１位のいずれかの多型部位
（２４ａ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における６７２２位、９６４３位、９９３４位、１０００１位、１３７８２位、１４６２９位、１５３７６位、１５８０８位、または１６０８２位のいずれかの多型部位
（２５ａ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１８１６位、３１１６位、３１１７位、３１１８位、３１５４位、３１５７位、３１９１位、３１９７位、３２０５位、３２９１位、３６２２位、３６５２位、３７９２位、４４８８位、５０７６位、５４７４位、５４８１位、５４９２位、５５０３位、５６５４位、５６７２位、６５６３位、６８４３位、６９０８位、７１１９位、７５３８位、７５３８位、７７２１位、８４０３位、８６２６位、１０００１位、１２６３６位、１３１０３位、１４７９４位、１５３７０位、１５４４８位、１５５９９位、１５７６４位、１６０４５位、１６２６１位、１６２７７位、１６８６１位、１７３６０位、１７６１１位、１７７１４位、１７８０９位、１８２２１位、１８２２１位、１８３７６位、１８５３６位、１９０６３位、２２９４２位、２３４０４位、２３６１２位、２５１２５位、２５１３４位、２５６６２位、２５７０５位、２５７５１位、２７４０７位、２８１６６位、２８５６７位、３０３０２位、３０３１６位、３０３５３位、３０３５４位、３０３９１位、３３５９４位、３３６５０位、３３７５４位、３６６９０位、３７７５３位、３７８９５位、３７９００位、３９１０４位、３９７４５位、４１４０４位、４１６４６位、４１７１１位、４２０２０位、４２０８０位、４２９７４位、４３０５２位、４３２４０位、４３６２１位、４４７３４位、４４９５８位、４６９２０位、４７４３１位、４７５７３位、４８１０１位、４８１２７位、４８３０６位、４８８０７位、４９０４９位、４９８４８位、４９８６０位、４９９０３位、５０１１４位、５０２２３位、５２０５７位、５２５４３位、５２６９３位、または５３０６１位のいずれかの多型部位
（２６ａ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１２８３位、４２８８位、７５２０位、７５９９位、７７４０位、８７４５位、９０５０位、９８６２位、１０００１位、１０１２４位、１０１６８位、１０３３９位、１１０１７位、１３７３６位、１３７４７位、１８３５４位、２００３１位、２０１７２位、２２０９４位、２４０８２位、２４３０５位、２４４７８位、２４５５２位、２５２７３位、２５３５１位、２９０９６位、２９１００位、２９７６４位のいずれかの多型部位
（２７ａ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における７３３位、８４８位、１０３９位、１３５１位、１５６９位、１８３１位、２０７８位、２７０７位、２７９４位、２９０４位、２９９５位、３１２２位、３５２０位、４３５１位、４８２４位、５１８９位、５２０５位、５２０６位、５５２５位、５７７９位、６４８７位、７７１２位、１０００１位、１０２０８位、１０２３５位、１０８６８位、１１０９２位、１１６１７位、１１６６６位、１２２１６位、１２３２６位、１２７４１位、１３３９６位、１３８９０位、１４７０２位、１５８２３位、１６７０５位、または１９０８６位のいずれかの多型部位
（２８ａ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における３４５５位、７８２６位、８７１５位、８７８３位、９０４２位、９３９０位、９４６２位、９７０９位、１０００１位、１０６３５位、１０７４８位、１２７９４位、１２８４９位、１２９１５位、１３１６９位、１７０２０位、１８５８６位、２１１２３位、または２１１２８位のいずれかの多型部位、
または、
（２８ａ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における９５９８位、１０００１位、１０３０６位、１１１８１位、１１４８０位、１３５９３位、１３７２１位、１３７９２位、１５３１４位、１５６２３位、１５７８２位、１６７０８位、１６７４８位、または１９６３０位のいずれかの多型部位
（２９ａ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における２４４位、５７５位、６７９位、１４８７位、１６４４位、２３４３位、２７１５位、２７６３位、３０９８位、３５８９位、３８８０位、５７８７位、５８６５位、６４３６位、７３９２位、７９９５位、８１６１位、８５４４位、９２３０位、９７９５位、１０００１位、１０１９９位、１０５０３位、１１９７５位、１４９８１位、１５６８１位、または１９３００位のいずれかの多型部位
【請求項５】
多型部位が、それぞれ以下の（１ｂ）〜（２９ｂ）に記載の多型部位である、請求項３に記載の方法。
（１ｂ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１４２５８位、または１９７６８位の部位
（２ｂ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、または１７８４８位の部位
（３ｂ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（４ｂ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（５ｂ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（６ｂ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（７ｂ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（８ｂ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（９ｂ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１７２８３位の部位
（１０ｂ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１１ｂ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１２ｂ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１１９９０位、または１６７７１位の部位
（１３ｂ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１８９５８位、または２１２１３位の部位
（１４ｂ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の部位
（１５ｂ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１６ｂ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１７ｂ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１８ｂ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１９ｂ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２０ｂ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２１ｂ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２２ｂ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、または３７５８３位の部位
（２３ｂ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１８５６３位の部位
（２４ｂ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２５ｂ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、または１５４４８位の部位
（２６ｂ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における２００３１位の部位
（２７ｂ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２８ｂ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の部位
（２８ｂ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２９ｂ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０５０３位の部位
【請求項６】
請求項５の（１ｂ）〜（２９ｂ）に記載の多型部位における塩基種が、それぞれ以下の（１ｃ）〜（２９ｃ）である場合に、２型糖尿病であるものと判定される請求項５に記載の方法。
（１ｃ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１４２５８位の塩基種がＴ、または１９７６８位の塩基種がＴ
（２ｃ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ、または１７８４８位の塩基種がＡ
（３ｃ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（４ｃ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２４５７８位の塩基種がＡ
（５ｃ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（６ｃ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（７ｃ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（８ｃ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＣ
（９ｃ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１７２８３位の塩基種がＴ
（１０ｃ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（１１ｃ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（１２ｃ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１１９９０位の塩基種がＡ、または１６７７１位の塩基種がＣ
（１３ｃ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１８９５８位の塩基種がＧ、または２１２１３位の塩基種がＣ
（１４ｃ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の塩基種がＡ
（１５ｃ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（１６ｃ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（１７ｃ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（１８ｃ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（１９ｃ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（２０ｃ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（２１ｃ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＣ
（２２ｃ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ、または３７５８３位の塩基種がＣ
（２３ｃ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１８５６３位の塩基種がＧ
（２４ｃ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２５ｃ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ、１３１０３位の塩基種がＧ、または１５４４８位の塩基種がＧ
（２６ｃ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における２００３１位の塩基種がＣ
（２７ｃ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２８ｃ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の塩基種がＧ
（２８ｃ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２９ｃ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０５０３位の塩基種がＧ
【請求項７】
以下の工程（ａ）および（ｂ）を含む、２型糖尿病の検査方法。
（ａ）  被検者における以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位について、塩基種を決定する工程、
（１）ＭＥＴ、（２）ＮＰＨＳ１、（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２、（４）ＡＢＣＡ１、（５）ＣＴＳＤ、（６）ＳＴＥ、（７）ＡＢＣＣ８、（８）ＭＹＬ２、（９）ＤＬＧ５、（１０）ＬＤＬＣ、（１１）ＬＡＲＧＥ、（１２）ＢＬＺＦ１、（１３）ＦＲＡＰ１、（１４）ＬＥＰ
（ｂ）  工程（ａ）により決定された塩基種を、以下の（１’）〜（１４’）のいずれかに記載のハプロタイプを示す前記遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位の塩基種と、比較する工程
（１’）ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｔ、およびＴであるハプロタイプ、
ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれ、Ｇ、Ｃ、およびＣであるハプロタイプ、または、
ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１９７６８位および２４２０９位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプ
（２’）ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｃ、およびＡであるハプロタイプ、
ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｇ、およびＧであるハプロタイプ、または、
ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｃ、およびＧであるハプロタイプ
（３’）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＡであるハプロタイプ、または
ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプ
（４’）ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、および２８５６４位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ａ、Ｃ、Ｔ、およびＧであるハプロタイプ、または
ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＣであるハプロタイプ
（５’）ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、および１６７７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプ
（６’）ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、および２０９７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｇ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプ、または
ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における２０９７１位、および２１２１３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＣであるハプロタイプ
（７’）ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の多型部位の塩基種がＡであるハプロタイプ
（８’）ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、および８３５００位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプ
（９’）ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｃ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプ、
ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプ、または
ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプ
（１０’）ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプ、または
ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＧであるハプロタイプ
（１１’）ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、および４３２４０位の多型部位の塩基種が、それぞれＴ、Ｇ、Ｇ、Ｔ、およびＡであるハプロタイプ
（１２’）ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位および２００３１位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＴであるハプロタイプ
（１３’）ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の多型部位の塩基種がＧであるハプロタイプ
（１４’）ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位および１０５０３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプ
【請求項８】
請求項７（ａ）の（１）〜（１４）に記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位が、それぞれ以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の多型部位である、請求項７に記載の検査方法。
（１）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における７６５位、１３８３位、１８９０位、２０９９位、２８１４位、３２９３位、３７５２位、３７７４位、３９２７位、４６９０位、７４１９位、８２１４位、１０００１位、１０３１８位、１３７６６位、１３９８９位、１４２５８位、１５４２７位、１６２７５位、１６５９７位、１６９３２位、１９７６８位、１９８３５位、２００３２位、２０２４０位、２０５３７位、２０８８５位、２１５４６位、２４２０９位、２４２７１位、２４３７６位、２４６４２位、２６０２８位、２６２２６位、または３４２０９位のいずれかの多型部位
（２）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１７２位、１８６位、２１１位、２５５４位、２５５８位、１０００１位、１００６７位、１０１７６位、１１８４０位、１３７５９位、１４６４５位、１４９６７位、１６１９８位、１６４３９位、１７６３５位、１７６８５位、１７７９４位、１７８０５位、１７８４８位、１７８４９位、１８４９１位、１９９５５位、２００８８位、２０６１３位、２１５３３位、２１５８２位、２１８１１位、２１８１２位、２２１９０位、２２９６５位、２２９８２位、２３６６０位、２３７８０位、２４０４０位、２４１７２位、２５３３４位、または２６５８５位のいずれかの多型部位
（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２８５３位、２８９１、５２１８位、５３１７位、７５６０位、８０５４位、８７７１位、１０００１位、１０３２９位、１１７８１位、１２０６３位、１２７０５位、１３１２５位、１３６９１位、１３９１３位、１３９１６位、１３９１７位、１４１２３位、１４１６９位、１４４５３位、１４４５６位、１４４８３位、１６５２６位、１６５５６位、１７６４３位、１７７２５位、１７８２４位、１８０７６位、１８２２７位、１８５００位、１８６８７位、１８７４１位、１８７４４位、１８８７５位、１９０４５位、１９１４１位、１９１４９位、１９１９０位、１９４２９位、１９５４８位、１９５６７位、１９６２４位、１９６４５位、１９８１４位、２００４９位、２００８２位、２００９７位、２０２４３位、２２１２２位、２２４９５位、２２５１６位、２２６９１位、２２８１６位、２３００７位、２３９０４位、２４００５位、２４４１８位、２４５７８位、２４８５５位、２４８８５位、２５５０５位、２５５３８位、２５５６４位、２５５８６位、２６０１７位、２６２３４位、２６５５７位、２６６２１位、３０１５５位、３０２６７位、または３０６０７位のいずれかの多型部位
（４）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における９９３位、１７７９位、１８１３位、３４５０位、４２８７位、４３８２位、７２７０位、７５２８位、８３８３位、８７８３位、８７９８位、９２５４位、１０００１位、１０９９９位、１１１２２位、１１７２０位、１２４７３位、１２５６０位、１２５９１位、１２６６４位、１２９１６位、１３４０３位、１３６０５位、１３６９１位、１４４５７位、１４７３７位、１５２７８位、１５３４５位、１５３４５位、１５６３６位、１５６３６位、１５８２４位、１６７９３位、１７０２２位、１７０３７位、１７２８３位、１７５７６位、１８１６７位、１８６１９位、１８６３２位、１８８４２位、１８８４３位、１８９２６位、１９４０４位、１９４０４位、１９８０９位、２０４４７位、２０５１４位、２０５１５位、２１９６３位、２２９８８位、２３０８１位、２３１５７位、２３５７７位、２３９５３位、２４３８９位、２５８１４位、２６１９８位、２６６５５位、２６９０２位、２７３６７位、２７５３５位、２７７０１位、２８１７５位、２８４６７位、２８５６４位、２８６６９位、２８７７４位、２８８３９位、２８９３７位、２８９４４位、２９０３７位、３００９１位、３０６１３位、３０９７５位、３２８０３位、３２８０３位、３３４３５位、３４２６３位、３４２６４位、３４８１２位、３５３０６位、３５３３９位、３５４７３位、３６２１７位、３７５９６位、または３７８５５位のいずれかの多型部位、または
ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１２０６位、１９０５位、１９７９位、２００８位、２０５４位、２２８６位、２３０３位、２８０８位、３１７６位、３４１３位、３４１５位、３５４８位、３６６９位、３７５６位、３９８３位、４５２１位、４５４４位、４５７７位、４６０９位、５２２６位、５８３３位、５８６８位、６４２２位、６５３２位、６５８３位、６６９６位、７０４３位、７１９８位、７３２４位、７３９５位、７４８４位、７７１６位、７７８７位、８１９７位、８３５０位、９５４１位、９６４３位、９７９３位、１０００１位、１０３４８位、１０４１５位、１０７４１位、１０８２６位、１１０００位、１１０２４位、１１１２９位、１１１８５位、１１２８６位、１１４５２位、１１４７１位、１１６５３位、１１７４６位、１１８５８位、１２１１４位、１２２２５位、１２５２０位、１２７２５位、１２８９６位、１２８９９位、１２９０５位、１３１１８位、１３４９２位、１３５８９位、１３８３６位、１４２２６位、１４３９１位、１４４８９位、１４５３６位、１４８１３位、１５０７１位、１５２１５位、１５３７７位、１５３９９位、１５６４４位、１５６８７位、１５８３０位、１６１０３位、１６１１２位、１６１３９位、１６７５４位、１７３０３位、１８２３７位、１８３７９位、１８６１８位、１８９０３位、１８９２１位、１９０１４位、１９０３４位、１９０７４位、１９１４９位、１９１６５位、１９１６７位、１９３６５位、１９３７３位、１９３７６位、１９３８６位、１９４８７位または１９６５９位のいずれかの多型部位
（５）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における８１３位、８１５位、８４４位、８６１位、９５４位、１０２６位、１１５９位、１２９９位、５４６４位、５６００位、７１４４位、７７０７位、７７２６位、７７３９位、７７７８位、７８０３位、７８４１位、７８４２位、７８８６位、７９３９位、７９６３位、８０５８位、８３３３位、９９４８位、１０００１位、１１９９０位、１２３４２位、１２８０７位、１６２６６位、または１６７７１位のいずれかの多型部位
（６）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における５７位、４６８位、１８８１位、２９５５位、３４６０位、３９７６位、４５３７位、４５３８位、４７２２位、４８６７位、４８７３位、４９４７位、５０２５位、７０４３位、７６７６位、８５８１位、９０３５位、９３４７位、９６８６位、９８８２位、９８９４位、１０００１位、１０００３位、１２１４２位、１３５２０位、１３５５１位、１３７９７位、１４４９２位、１４７５３位、１４９３３位、１５６８４位、１７０２２位、１８２６４位、１８５６８位、１８９５８位、１９１９４位、１９３３０位、１９３５４位、１９３５５位、１９５６７位、１９７８５位、２０５１１位、２０６１２位、２０６２７位、２０９３６位、２０９６１位、２０９７１位、２１２１３位、２１３３６位、２１６０９位、２１９１４位、または２１９８３位のいずれかの多型部位
（７）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における６９７８位、７３５８位、７３５９位、７６４９位、７７５５位、８０６８位、８２１４位、８２１５位、８３０８位、９６５８位、９７６１位、９８１１位、９８２８位、１０００１位、１００９５位、１０１２５位、１１６５８位、１１６７４位、１１７０８位、１１７６７位、１１８８３位、１１９９８位、１２１０９位、１２３０８位、１３６２０位、１３６６４位、１３９１２位、１４２９７位、１４３０９位、１４３２０位、１４３２３位、１４３６７位、１４３９３位、１４４７５位、１４５９１位、１４７２２位、１５２９４位、１５６０１位、１５６５７位、１６１６０位、１６２３０位、１６３６７位、１６４１７位、１７６９５位、１８２１３位、１８８１５位、１９０９３位、２００８２位、２０２１１位、２０４６１位、２１５４７位、２１９９５位、２２８２５位、または２３９０１位のいずれかの多型部位
（８）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における３１４７位、３２１３位、４６８６位、７３４３位、７８９２位、１０００１位、１０１２３位、１１２６４位、１１９９２位、１５５３２位、１５６８１位、１５９５７位、１５９８８位、１６６４１位、１８３８６位、１８７８２位、２０３５４位、２１５３１位、２３２４５位、２７７４０位、３０６６９位、３０６７０位、３２０７７位、３２７３２位、３２９０７位、３２９５５位、４２５８９位、４３０２９位、４７３５４位、６４７７７位、７１８６９位、７１９６１位、７４２７４位、７５５５１位、７６３４３位、７６３４４位、７８２７０位、７８３３９位、７８６８９位、７８７４３位、７８８０６位、７８８０７位、７９２１５位、７９３１９位、７９３５７位、７９４６０位、７９４６３位、８００３４位、８００６２位、８００７６位、８０４０１位、８０４７５位、８０５９９位、８０７１５位、８０８６５位、８０９４３位、８０９５２位、８０９７４位、８０９９１位、８１１３０位、８１３７３位、８１４２８位、８１５４３位、８１６８２位、８２４２２位、８２５４５位、８２７９２位、８２９３８位、８３２６５位、８３２６６位、８３３９４位、８３４６３位、８３５００位、８３５７８位、８３６１２位、８３６５０位、８４７９０位、８４９２１位、８４９４５位、８５２１４位、８５３８３位、８５３８４位、８５５５０位、８５９８４位、８６１０９位、８６５３９位、８６５４２位、８７１６９位、８７１７０位、８７３５３位、８７６７１位、８７９５３位、８７９５４位、８８０５７位、８８１７８位、８８２４０位、８８２５８位、８８２７１位、８８２７２位、８８３０７位、８８５１２位、８８６９５位、８８７７８位、８８７９８位、８９１２４位、または９１０８１位のいずれかの多型部位
（９）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２位、１２１位、１４３８位、１６６９位、２１８０位、２４３６位、２５４３位、２６１９位、３７１５位、３７２７位、５２５６位、５３３５位、５３３９位、５６８８位、５７５２位、６３０４位、６６２７位、７１９５位、７３４２位、７６０３位、８２７３位、８９０５位、８９８８位、９０１３位、９０５７位、１０００１位、１０３７２位、１０４５３位、１０４６８位、１０４６８位、１０５１２位、１１０３８位、１１０５５位、１１５９７位、１１６８１位、１１７１９位、１１９２２位、１２０３４位、１２０４９位、１２１７６位、１２５５４位、１３４８１位、１３８６４位、１４３９０位、１５０４４位、１５５９８位、１６１７６位、１６８７０位、１７４７５位、１７７４９位、１８０７７位、１８５８５位、１８６１９位、１８６７７位、１９２２２位、１９７３１位、１９７５０位、２０７５８位、２０９６２位、２１０７３位、２１６８０位、２１８６７位、２２３８５位、２２８７４位、２３１９１位、２４０１６位、２４５２０位、２４９９３位、２５４６０位、２６１５５位、２６８０４位、２６９８０位、２７９８８位、２９２３４位、２９４６９位、３０２５４位、３０７４２位、３０７４２位、３０７５６位、３０７５６位、３１６７１位、３１８７４位、３１９４０位、３２６２６位、３３３９３位、３３５８１位、３４２４０位、３５２９４位、３５６６６位、３６５８７位、３６６５３位、３６９４１位、３７４０８位、３７５８３位、３７６１２位、３８４６２位、３８４７０位、３８４８５位、３９０６５位、３９１４６位、４０６１２位、４０６４１位、４１２４２位、４２２１７位、４２５３９位、４５９３４位、４６０３３位、または４６８９５位のいずれかの多型部位
（１０）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１５８０位、１７５４位、１８８２位、３０６２位、３５０７位、４８００位、４９０５位、５５６９位、５６０８位、５６４３位、５６６５位、５６９３位、５８６４位、５８８４位、５９８１位、６１６９位、６８０８位、６８５８位、７１９４位、７２８３位、７７２８位、７８３５位、８０４９位、８０４９位、８２６５位、９２０９位、９４４５位、９６４６位、９６４７位、９７１６位、９７７５位、１０００１位、１００２９位、１００５４位、１０１９３位、１０２０８位、１０８２６位、１０９０８位、１０９９７位、１１３３６位、１１７５４位、１１８９５位、１２０３１位、１２３２７位、１２４６４位、１２５６１位、１４０５１位、１５３６６位、１５７７８位、１７７２３位、１７７７２位、１７７８３位、１７８１１位、１７８１５位、１７８６２位、１７９００位、１７９６２位、１８１８４位、１８１８９位、１８２９７位、１８４１１位、１８５１２位、１８５６３位、１９１２５位、１９１５２位、２００９２位、２１２２７位、２１５０６位、２１６１７位、２１８５５位、２３０９０位、２５７００位、２６４６８位、２６６３８位、２７６８２位、２７７５５位、２７８８８位、２７９７３位、２７９９５位、２８１２３位、２８１２７位、２８１４４位、２８１５３位、または２８２７１位のいずれかの多型部位
（１１）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１８１６位、３１１６位、３１１７位、３１１８位、３１５４位、３１５７位、３１９１位、３１９７位、３２０５位、３２９１位、３６２２位、３６５２位、３７９２位、４４８８位、５０７６位、５４７４位、５４８１位、５４９２位、５５０３位、５６５４位、５６７２位、６５６３位、６８４３位、６９０８位、７１１９位、７５３８位、７５３８位、７７２１位、８４０３位、８６２６位、１０００１位、１２６３６位、１３１０３位、１４７９４位、１５３７０位、１５４４８位、１５５９９位、１５７６４位、１６０４５位、１６２６１位、１６２７７位、１６８６１位、１７３６０位、１７６１１位、１７７１４位、１７８０９位、１８２２１位、１８２２１位、１８３７６位、１８５３６位、１９０６３位、２２９４２位、２３４０４位、２３６１２位、２５１２５位、２５１３４位、２５６６２位、２５７０５位、２５７５１位、２７４０７位、２８１６６位、２８５６７位、３０３０２位、３０３１６位、３０３５３位、３０３５４位、３０３９１位、３３５９４位、３３６５０位、３３７５４位、３６６９０位、３７７５３位、３７８９５位、３７９００位、３９１０４位、３９７４５位、４１４０４位、４１６４６位、４１７１１位、４２０２０位、４２０８０位、４２９７４位、４３０５２位、４３２４０位、４３６２１位、４４７３４位、４４９５８位、４６９２０位、４７４３１位、４７５７３位、４８１０１位、４８１２７位、４８３０６位、４８８０７位、４９０４９位、４９８４８位、４９８６０位、４９９０３位、５０１１４位、５０２２３位、５２０５７位、５２５４３位、５２６９３位、または５３０６１位のいずれかの多型部位
（１２）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１２８３位、４２８８位、７５２０位、７５９９位、７７４０位、８７４５位、９０５０位、９８６２位、１０００１位、１０１２４位、１０１６８位、１０３３９位、１１０１７位、１３７３６位、１３７４７位、１８３５４位、２００３１位、２０１７２位、２２０９４位、２４０８２位、２４３０５位、２４４７８位、２４５５２位、２５２７３位、２５３５１位、２９０９６位、２９１００位、２９７６４位のいずれかの多型部位
（１３）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における３４５５位、７８２６位、８７１５位、８７８３位、９０４２位、９３９０位、９４６２位、９７０９位、１０００１位、１０６３５位、１０７４８位、１２７９４位、１２８４９位、１２９１５位、１３１６９位、１７０２０位、１８５８６位、２１１２３位、または２１１２８位のいずれかの多型部位
（１４）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における２４４位、５７５位、６７５位、１４８７位、１６４４位、２３４３位、２７１５位、２７６３位、３０９８位、３５８９位、３８８０位、５７８７位、５８６５位、６４３６位、７３９２位、７９９５位、８１６１位、８５４４位、９２３０位、９７９５位、１０００１位、１０１９９位、１０５０３位、１１９７５位、１４９８１位、１５６８１位、または１９３００位のいずれかの多型部位
【請求項９】
請求項７（ａ）の（１）〜（１４）に記載の遺伝子における多型部位が、それぞれ以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の多型部位である、請求項７に記載の検査方法。
（１）ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、１９７６８位、または２４２０９位の多型部位
（２）ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位または１７８４８位の多型部位
（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、または２４５７８位の多型部位
（４）ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、または２８５６４位の多型部位、または
ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位
（５）ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、または１６７７１位の多型部位
（６）ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、２０９７１位、または２１２１３位の多型部位
（７）ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１０００１位、または１４４７５位の多型部位
（８）ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、または８３５００位の多型部位
（９）ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、２４０１６位、２９４６９位、または３７５８３位の多型部位
（１０）ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、または１８５６３位の多型部位
（１１）ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、または４３２４０位の多型部位
（１２）ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位、または２００３１位の多型部位
（１３）ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１０００１位または１７０２０位の多型部位
（１４）ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位、または１０５０３位の多型部位
【請求項１０】
さらに、被検者の生体試料から多型部位を含むＤＮＡを調製する工程、を含む請求項３〜９のいずれかに記載の検査方法。
【請求項１１】
請求項４の（１ａ）〜（２９ａ）のいずれかに記載の多型部位を含むＤＮＡにハイブリダイズし、少なくとも１５ヌクレオチドの鎖長を有するオリゴヌクレオチドを含む、２型糖尿病の検査薬。
【請求項１２】
請求項４の（１ａ）〜（２９ａ）のいずれかに記載の多型部位を含むＤＮＡとハイブリダイズするヌクレオチドプローブが固定された固相からなる２型糖尿病の検査薬。
【請求項１３】
請求項４の（１ａ）〜（２９ａ）のいずれかに記載の多型部位を含むＤＮＡを増幅するためのプライマーオリゴヌクレオチドを含む、２型糖尿病の検査薬。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】  本発明は、２型糖尿病に関連する遺伝子、および該遺伝子を用いた２型糖尿病の検査方法に関する。
【背景技術】  ２型糖尿病（ＤＭ）は、インスリン抵抗性および膵臓β細胞機能障害の双方を特徴とする不均一なグルコース代謝障害である。先進諸国では、ＤＭに関連した血管合併症の高い発生率（３％〜１０％）および臨床的重症度のために、この疾患は主要な健康問題となっている。ＤＭの遺伝性パターンは、疾患の多遺伝子性の特徴、および遺伝子と環境要因との複雑な相互作用を示唆している（非特許文献１参照）。しかし、ＤＭの一般的な形成に関連する遺伝子はこれまでのところ分かっていない。マイクロサテライトマーカーを用いるゲノム全体の研究および罹患同胞対解析によって、異なる集団からの様々なゲノム領域においてＤＭに関連する遺伝子座が同定された（非特許文献１〜７参照）。この集団特異的マッピングの相違から、ＤＭの形成における様々なゲノム領域からの複合作用が示唆される。これらの座におけるＤＭ関連遺伝子を同定するために、精力的な試みがなされているものの、これまでのところＮＩＤＤＭ１座からのカルパイン−１０遺伝子は、ＤＭに関して報告された唯一のＤＭ関連遺伝子である（非特許文献８参照）。また、ＤＭ関連経路における候補遺伝子アプローチによって、疾患のリスクが増加するいくつかの遺伝子が同定されているに過ぎない（非特許文献１参照）。
ＤＭは多因子性疾患であり、環境因子の影響を受け、しかも各個体間の病気の成因は不均一で、複数の原因遺伝子（疾患感受性遺伝子）により発症するため、遺伝素因の存在は確実であると考えられているにもかかわらず、原因遺伝子を同定する事が困難な疾病の１つといえる。特に糖尿病では健常者と糖尿病の素因を持つものを明確に区別することが困難である事、発症が中年以降である事が多く、遺伝学的に重要な家系のデータが得にくい等の条件が原因遺伝子の同定をより困難にしている。
従来の研究により、単一遺伝子の異常により発症する特殊な糖尿病（２型糖尿病の５％以下）の原因遺伝子や、候補遺伝子アプローチ、疾患モデル動物により同定された遺伝子等がいくつか挙げられる。罹患同胞対解析は世界中で行われたが、人種・民族により結果が異なり、また、連鎖が認められた染色体領域はゲノム全体に渡り、絞り込んだ染色体領域より遺伝子を特定するのは非常に困難であった。
上記のように、ＤＭに関連する遺伝子は、これまでのところほとんど報告されていない。
【非特許文献１】Ｂａｒｎｅｔｔ，Ａ．Ｈ．ら著，「Ｄｉａｂｅｔｏｌｏｇｉａ」，１９８１年，Ｖｏｌ．２０，ｐ．８７−９３
【非特許文献２】Ｋｎｏｗｌｅｒ，Ｗ．Ｃ．ら著，「Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．」，１９８８年，Ｖｏｌ．４３，ｐ．５２０−５２６
【非特許文献３】Ｂｅｌｌ，Ｇ．Ｉ．ら著，「Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ」，１９９１年，Ｖｏｌ．８８，ｐ．１４８４−１４８８
【非特許文献４】Ｖａｎ  ｄｅｎ  ＯｕｗｅｎｌおよびＪ．Ｍ．Ｗ．ら著，「Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔ．」，１９９２年，Ｖｏｌ．１，ｐ．３６８−３７１
【非特許文献５】Ｖｉｏｎｎｅｔ，Ｎ．ら著，「Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．」，２０００年，Ｖｏｌ．６７，ｐ．１４７０−１４８０
【非特許文献６】Ｌａｎｄｅｒ，Ｅ．Ｓ．およびＫｒｕｇｌｙａｋ，Ｌ．著，「Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔ．」，１９９５年，Ｖｏｌ．１１，ｐ．２４１−２４７
【非特許文献７】Ｗｉｌｔｓｈｉｒｅ，Ｓ．ら著，「Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．」，２００１年，Ｖｏｌ．６９，ｐ．５５３−５６９
【非特許文献８】Ｇｈｏｓｈ，Ｓ．ら著，「Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．」，２０００年，Ｖｏｌ．６７，ｐ．１１７４−１１８５
【発明の開示】
本発明は、このような状況に鑑みてなされたものであり、その目的は、２型糖尿病に関連する遺伝子を見出し、さらに該遺伝子上に存在する２型糖尿病に関連する多型を同定することにより、２型糖尿病の検査方法を提供することにある。
本発明者らは、上記課題を解決すべく鋭意研究を行った。まず本発明者らは、２型糖尿病（ＤＭ）関連遺伝子を同定するために、ケースコントロール試験を用いて候補遺伝子７０４個に由来する一塩基多型（ＳＮＰｓ）２０３９個について、ＤＭとの関連性を調べた。試験群は症例１４８人および対照被検者２２７人からなる。その結果、遺伝子２９個がＤＭに有意に関連することが判明した。これらの遺伝子、および該遺伝子の塩基配列自体は、既に知られているものの、ＤＭと関連することは本発明者らによって初めて示された。また本発明者らは、ＤＭと有意に関連する多型部位（ＳＮＰｓ）、およびこれら複数の多型部位を含むＤＭと関連するハプロタイプを見出すことに成功した。これらのＳＮＰｓまたはハプロタイプを指標とすることにより、ＤＭに罹患する可能性が高いか低いか、およびすでにＤＭに罹患している場合にはその原因や病型の検査を行うことが可能である。
以上、本発明者らによってＤＭに関連する遺伝子が同定されたことにより、ＤＭの発症メカニズムの解明、およびＤＭの予防または治療のための薬剤の開発が大いに期待される。
上記の如く本発明者らは、ＤＭに関連する２９個の遺伝子、およびＤＭと関連するＳＮＰｓ、並びにハプロタイプの同定に成功し、該遺伝子上のＳＮＰｓもしくはハプロタイプを指標とするＤＭの検査方法を完成させた。即ち本発明は、２型糖尿病に関連する遺伝子、および該遺伝子上の多型部位またはハプロタイプを指標とする２型糖尿病の検査方法に関し、より具体的には、
上記の如く本発明者らは、ＤＭに関連する２９個の遺伝子、およびＤＭと関連するＳＮＰｓ、並びにハプロタイプの同定に成功し、該遺伝子上のＳＮＰｓもしくはハプロタイプを指標とするＤＭの検査方法を完成させた。即ち本発明は、２型糖尿病に関連する遺伝子、および該遺伝子上の多型部位またはハプロタイプを指標とする２型糖尿病の検査方法に関し、より具体的には、
〔１〕  被検者について、下記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子における変異を検出することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法、
（１）ＭＥＴ、（２）ＮＰＨＳ１、（３）ＳＬＣ１Ａ１、（４）ＳＥＲＰＩＮＢ２、（５）ＦＡＢＰ２、（６）ＺＮＦ２６３、（７）ＴＮＦＡ、（８）ＴＨＢＳ３、（９）ＡＢＣＡ１、（１０）ＳＥＲＰＩＮＢ１０、（１１）ＡＬＤＯＢ、（１２）ＣＴＳＤ、（１３）ＳＴＥ、（１４）ＡＢＣＣ８、（１５）ＳＥＲＰＩＮＡ３、（１６）ＲＣＶ１、（１７）ＴＦＲＣ、（１８）ＭＭＰ１９、（１９）ＭＹＬ２、（２０）ＶＬＤＬＲ、（２１）Ｐ２ＲＸ７、（２２）ＤＬＧ５、（２３）ＬＤＬＣ、（２４）ＡＱＰ８、（２５）ＬＡＲＧＥ、（２６）ＢＬＺＦ１、（２７）ＲＧＳ５、（２８）ＦＲＡＰ１、（２９）ＬＥＰ
上記検査方法は、例えば、被検者から取得される被検試料について、上記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子における変異を検出し、被検者が２型糖尿病に対して感受性もしくは抵抗性の素因を有するか否かの検査方法である、
〔２〕  変異が一塩基多型変異（ＳＮＰ）である、〔１〕に記載の検査方法、
〔３〕  被検者について、〔１〕の（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位の塩基種を決定することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法、
上記検査方法は、例えば、被検者から取得される被検試料について、上記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位の塩基種を決定し、被検者が２型糖尿病に対して感受性もしくは抵抗性の素因を有するか否かの検査方法である、
〔４〕  多型部位が、それぞれ以下の（１ａ）〜（２９ａ）に記載の多型部位である、〔３〕に記載の方法、
（１ａ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における７６５位、１３８３位、１８９０位、２０９９位、２８１４位、３２９３位、３７５２位、３７７４位、３９２７位、４６９０位、７４１９位、８２１４位、１０００１位、１０３１８位、１３７６６位、１３９８９位、１４２５８位、１５４２７位、１６２７５位、１６５９７位、１６９３２位、１９７６８位、１９８３５位、２００３２位、２０２４０位、２０５３７位、２０８８５位、２１５４６位、２４２０９位、２４２７１位、２４３７６位、２４６４２位、２６０２８位、２６２２６位、または３４２０９位のいずれかの多型部位
（２ａ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１７２位、１８６位、２１１位、２５５４位、２５５８位、１０００１位、１００６７位、１０１７６位、１１８４０位、１３７５９位、１４６４５位、１４９６７位、１６１９８位、１６４３９位、１７６３５位、１７６８５位、１７７９４位、１７８０５位、１７８４８位、１７８４９位、１８４９１位、１９９５５位、２００８８位、２０６１３位、２１５３３位、２１５８２位、２１８１１位、２１８１２位、２２１９０位、２２９６５位、２２９８２位、２３６６０位、２３７８０位、２４０４０位、２４１７２位、２５３３４位、または２６５８５位のいずれかの多型部位
（３ａ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１１４２位、２７３２位、２７３４位、７２２０位、１０００１位、１２２７６位、１２９２２位、または１８０４９位のいずれかの多型部位
（４ａ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２８５３位、２８９１、５２１８位、５３１７位、７５６０位、８０５４位、８７７１位、１０００１位、１０３２９位、１１７８１位、１２０６３位、１２７０５位、１３１２５位、１３６９１位、１３９１３位、１３９１６位、１３９１７位、１４１２３位、１４１６９位、１４４５３位、１４４５６位、１４４８３位、１６５２６位、１６５５６位、１７６４３位、１７７２５位、１７８２４位、１８０７６位、１８２２７位、１８５００位、１８６８７位、１８７４１位、１８７４４位、１８８７５位、１９０４５位、１９１４１位、１９１４９位、１９１９０位、１９４２９位、１９５４８位、１９５６７位、１９６２４位、１９６４５位、１９８１４位、２００４９位、２００８２位、２００９７位、２０２４３位、２２１２２位、２２４９５位、２２５１６位、２２６９１位、２２８１６位、２３００７位、２３９０４位、２４００５位、２４４１８位、２４５７８位、２４８５５位、２４８８５位、２５５０５位、２５５３８位、２５５６４位、２５５８６位、２６０１７位、２６２３４位、２６５５７位、２６６２１位、３０１５５位、３０２６７位、または３０６０７位のいずれかの多型部位
（５ａ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における２９７０位、３１７４位、３１７５位、４５２５位、４５５６位、４５５８位、４６３６位、４６４６位、４７７４位、５７２６位、５７３６位、５８５２位、７２０３位、７２５３位、７３１０位、８２３９位、８２５１位、８２９６位、８３１２位、８９７４位、１０００１位、１０１０７位、１０４２４位、１０４６４位、１０４９１位、１０７９４位、１１９２２位、１１９５７位、１２８２０位、１６００６位、１６２５６位、１６３０９位、１６３１２位、１６３６０位、１６９２３位、１７８７７位、１８４０８位、１８６４９位、１８７１５位、１８７８３位、または１９８７８位のいずれかの多型部位
（６ａ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における８７６位、１５５２位、３２１３位、３２６９位、６４０１位、６４２５位、６６０２位、９５９５位、１０００１位、１０２５２位、１０２６９位、１０２９４位、１１３７７位、１２４６９位、１３６４２位、１３６４３位、１３８７９位、１４３６７位、１６１３３位、１７０８４位、１７６５２位、または１９２６３位のいずれかの多型部位
（７ａ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１７５位、２４０１位、２９７３位、４４５２位、４６７１位、４６７２位、５１８４位、５６０９位、５８２０位、５９４１位、５９４２位、５９４２位、６２４５位、６３１５位、６３１６位、６４８７位、６６０３位、６７３０位、６８６７位、６９３１位、６９３５位、６９５８位、７９５３位、８０２２位、８１３３位、８４８２位、８６２８位、８６５０位、８６５６位、８８２７位、８８２９位、８８６５位、８９３８位、８９４５位、８９９４位、９２０５位、９２６９位、９２７５位、１０００１位、１０２０２位、１０３６３位、１０３９９位、１０６８０位、１０７６５位、１０８１６位、１１０９２位、１１５６５位、１１９４１位、１２６６９位、１２９３６位、１２９６３位、１３０２４位、１３１２８位、１３１５４位、１３２８９位、１３５３８位、１３５３９位、１３５９４位、１３６３２位、１３６４６位、１３６８８位、１３８２２位、１３８５５位、１３８６３位、１３９６６位、１３９９３位、１４３７０位、１４５４２位、１４６２５位、１５０３０位、１５０６４位、１５５８１位、１５７３０位、１５９７５位、１６６２６位、１６７１３位、１６７３４位、１７２４０位、１７３６９位、１７６９８位、１７７１１位、または１９３４８位のいずれかの多型部位
（８ａ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における３０９８位、３１０３位、３１４３位、３１７８位、４５４３位、６９７７位、７１５８位、１０００１位、１０４４５位、１１７２８位、１３０１２位、１３５１４位、１６４０４位、１８０８８位、１８７０８位、１８７７６位、１８９８９位、１９４６５位、１９７６９位、または１９７８６位のいずれかの多型部位
（９ａ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における９９３位、１７７９位、１８１３位、３４５０位、４２８７位、４３８２位、７２７０位、７５２８位、８３８３位、８７８３位、８７９８位、９２５４位、１０００１位、１０９９９位、１１１２２位、１１７２０位、１２４７３位、１２５６０位、１２５９１位、１２６６４位、１２９１６位、１３４０３位、１３６０５位、１３６９１位、１４４５７位、１４７３７位、１５２７８位、１５３４５位、１５３４５位、１５６３６位、１５６３６位、１５８２４位、１６７９３位、１７０２２位、１７０３７位、１７２８３位、１７５７６位、１８１６７位、１８６１９位、１８６３２位、１８８４２位、１８８４３位、１８９２６位、１９４０４位、１９４０４位、１９８０９位、２０４４７位、２０５１４位、２０５１５位、２１９６３位、２２９８８位、２３０８１位、２３１５７位、２３５７７位、２３９５３位、２４３８９位、２５８１４位、２６１９８位、２６６５５位、２６９０２位、２７３６７位、２７５３５位、２７７０１位、２８１７５位、２８４６７位、２８５６４位、２８６６９位、２８７７４位、２８８３９位、２８９３７位、２８９４４位、２９０３７位、３００９１位、３０６１３位、３０９７５位、３２８０３位、３２８０３位、３３４３５位、３４２６３位、３４２６４位、３４８１２位、３５３０６位、３５３３９位、３５４７３位、３６２１７位、３７５９６位、または３７８５５位のいずれかの多型部位
（１０ａ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１４５位、４８４５位、６７５７位、６８５９位、７１５１位、７８２７位、８０６６位、１０００１位、１２８８５位、１３２２７位、１３４３２位、１３５６３位、１５４３９位、１５４４７位、１５７２９位、１５７５９位、１５８８５位、１６０９４位、１６３３０位、または１８５６５位のいずれかの多型部位
（１１ａ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における９９位、３８０位、３９６位、３９９位、７１２位、９３４位、１５３４位、１６１２位、１９４８位、２０７９位、２１０１位、４１６１位、４３１８位、４３１８位、５０９１位、６６２３位、６７１８位、７７９６位、７８５９位、８１９０位、８２０３位、９１０４位、９６２１位、９６４２位、１０００１位、１０４８９位、１１４４３位、１１５９２位、１１５９３位、１１６１６位、１１６１７位、１２２８１位、１２４５７位、１２８０２位、１３９９３位、１４０２６位、１４８００位、１６６５４位、１６８２２位、１７１３３位、１７２３９位、１８２１６位、１８７０９位、１９６１０位、または１９６１３位のいずれかの多型部位
（１２ａ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における８１３位、８１５位、８４４位、８６１位、９５４位、１０２６位、１１５９位、１２９９位、５４６４位、５６００位、７１４４位、７７０７位、７７２６位、７７３９位、７７７８位、７８０３位、７８４１位、７８４２位、７８８６位、７９３９位、７９６３位、８０５８位、８３３３位、９９４８位、１０００１位、１１９９０位、１２３４２位、１２８０７位、１６２６６位、または１６７７１位のいずれかの多型部位
（１３ａ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における５７位、４６８位、１８８１位、２９５５位、３４６０位、３９７６位、４５３７位、４５３８位、４７２２位、４８６７位、４８７３位、４９４７位、５０２５位、７０４３位、７６７６位、８５８１位、９０３５位、９３４７位、９６８６位、９８８２位、９８９４位、１０００１位、１０００３位、１２１４２位、１３５２０位、１３５５１位、１３７９７位、１４４９２位、１４７５３位、１４９３３位、１５６８４位、１７０２２位、１８２６４位、１８５６８位、１８９５８位、１９１９４位、１９３３０位、１９３５４位、１９３５５位、１９５６７位、１９７８５位、２０５１１位、２０６１２位、２０６２７位、２０９３６位、２０９６１位、２０９７１位、２１２１３位、２１３３６位、２１６０９位、２１９１４位、または２１９８３位のいずれかの多型部位
（１４ａ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における６９７８位、７３５８位、７３５９位、７６４９位、７７５５位、８０６８位、８２１４位、８２１５位、８３０８位、９６５８位、９７６１位、９８１１位、９８２８位、１０００１位、１００９５位、１０１２５位、１１６５８位、１１６７４位、１１７０８位、１１７６７位、１１８８３位、１１９９８位、１２１０９位、１２３０８位、１３６２０位、１３６６４位、１３９１２位、１４２９７位、１４３０９位、１４３２０位、１４３２３位、１４３６７位、１４３９３位、１４４７５位、１４５９１位、１４７２２位、１５２９４位、１５６０１位、１５６５７位、１６１６０位、１６２３０位、１６３６７位、１６４１７位、１７６９５位、１８２１３位、１８８１５位、１９０９３位、２００８２位、２０２１１位、２０４６１位、２１５４７位、２１９９５位、２２８２５位、または２３９０１位のいずれかの多型部位
（１５ａ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における９３７位、１１４５位、１８７８位、２３４５位、２５５９位、３２５０位、３５１３位、４４０２位、５７７６位、６６５９位、７４５３位、７９３４位、８０００位、８０４９位、８２０４位、８５４３位、８５５４位、８９３５位、９９２８位、１０００１位、１０２３３位、１０４７２位、１０４７９位、１０５２５位、１０５４４位、１０６２９位、１３３３９位、１３３４８位、１６２８７位、１６３８９位、１６６２６位、または１７８８０位のいずれかの多型部位
（１６ａ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における２５位、４９位、４６９位、５５７位、５９２位、２７３０位、２７５４位、５７６１位、６１５４位、６１８３位、８５１０位、８５２９位、８５４２位、８５９０位、９８３８位、１０００１位、１０１３２位、１０１３３位、１０６４９位、１０７０２位、１０８６６位、１２５６０位、１５６３２位、１５８２７位、１５８５３位、１５９９４位、１６６１７位、１６７９０位、１６８４１位、１７０１０位、１７３４８位、１７６５６位、１７６５６位、１７８１６位、１７８２０位、１７８８２位、１７８８２位、１８０６１位、１８１０１位、１９３０４位、または１９４８５位のいずれかの多型部位
（１７ａ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における８３６位、１０１９位、２５１１位、４０１６位、４０６８位、４１６９位、４２６９位、４４８１位、５３９８位、５４３６位、５４５０位、５７３０位、５９３７位、６０４４位、６３１３位、６７１３位、６７５９位、６７９４位、６８３３位、７５２８位、８０４７位、８０４８位、８０８０位、９２４８位、９３６１位、９４１７位、９７３４位、１０００１位、１１４６１位、１１８４５位、１１８５２位、１２０８６位、１２５９６位、１２８６４位、１２９３０位、１３９６９位、１３９６９位、１４１１９位、１４２８０位、１６８３３位、または１７０４７位のいずれかの多型部位
（１８ａ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における６３２９位、７３２９位、７７１５位、８１３８位、８５０７位、８５５１位、８５７４位、１０００１位、１１１３８位、１１３４３位、１３１５１位、１３８６８位、または１８９２３位のいずれかの多型部位
（１９ａ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における３１４７位、３２１３位、４６８６位、７３４３位、７８９２位、１０００１位、１０１２３位、１１２６４位、１１９９２位、１５５３２位、１５６８１位、１５９５７位、１５９８８位、１６６４１位、１８３８６位、１８７８２位、２０３５４位、２１５３１位、２３２４５位、２７７４０位、３０６６９位、３０６７０位、３２０７７位、３２７３２位、３２９０７位、３２９５５位、４２５８９位、４３０２９位、４７３５４位、６４７７７位、７１８６９位、７１９６１位、７４２７４位、７５５５１位、７６３４３位、７６３４４位、７８２７０位、７８３３９位、７８６８９位、７８７４３位、７８８０６位、７８８０７位、７９２１５位、７９３１９位、７９３５７位、７９４６０位、７９４６３位、８００３４位、８００６２位、８００７６位、８０４０１位、８０４７５位、８０５９９位、８０７１５位、８０８６５位、８０９４３位、８０９５２位、８０９７４位、８０９９１位、８１１３０位、８１３７３位、８１４２８位、８１５４３位、８１６８２位、８２４２２位、８２５４５位、８２７９２位、８２９３８位、８３２６５位、８３２６６位、８３３９４位、８３４６３位、８３５００位、８３５７８位、８３６１２位、８３６５０位、８４７９０位、８４９２１位、８４９４５位、８５２１４位、８５３８３位、８５３８４位、８５５５０位、８５９８４位、８６１０９位、８６５３９位、８６５４２位、８７１６９位、８７１７０位、８７３５３位、８７６７１位、８７９５３位、８７９５４位、８８０５７位、８８１７８位、８８２４０位、８８２５８位、８８２７１位、８８２７２位、８８３０７位、８８５１２位、８８６９５位、８８７７８位、８８７９８位、８９１２４位、または９１０８１位のいずれかの多型部位
（２０ａ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における６２９７位、６７３３位、７９９４位、９２４２位、９９５２位、１０００１位、１１８３８位、１２９９５位、１３２２４位、１３２７７位、１８７０２位、１８８９６位、または１９２１４位のいずれかの多型部位
（２１ａ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における９９位、６９４位、２７６５位、２７６５位、３１０１位、３１１７位、３１２７位、３３０９位、３３４６位、３８０２位、３９１６位、４２０６位、４４３０位、５９３７位、６７０５位、７３７８位、８３１２位、８３９９位、９９２８位、１０００１位、１００４２位、１０２７７位、１０４４０位、１０４６１位、１０４７９位、１０５２７位、１０５３４位、１０５５０位、１０７０１位、１０９０９位、１１０６６位、１１１９８位、１１５７５位、１１６３１位、１１７６５位、１１９７６位、１２１１９位、１２１５８位、１２２０７位、１２２７２位、１２３６６位、１２４９８位、１２５６３位、１２７９１位、１２８５６位、１２８６０位、１３２０７位、１３４８３位、１３５９０位、１３８６０位、１３８６９位、１３８８０位、１３８８１位、１３９８４位、１４０４８位、１４０５９位、１４２１０位、１４８０６位、１４９２１位、１５３３１位、１５４８８位、１５５５８位、１５６５１位、１５６８６位、１５７９１位、１６０５１位、１６０８２位、１６１３７位、１６４９２位、１６６４９位、１６７８４位、１６７８８位、１７０７２位、１７０７６位、１７３７９位、１７５２７位、１７５９３位、１７６２３位、１７７１９位、１７９９８位、１８００５位、１８０４８位、１８２８８位、１８４１２位、１８５８８位、１８６４０位、１９３４０位、１９５４５位、１９６７６位、または１９６８５位のいずれかの多型部位
（２２ａ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２位、１２１位、１４３８位、１６６９位、２１８０位、２４３６位、２５４３位、２６１９位、３７１５位、３７２７位、５２５６位、５３３５位、５３３９位、５６８８位、５７５２位、６３０４位、６６２７位、７１９５位、７３４２位、７６０３位、８２７３位、８９０５位、８９８８位、９０１３位、９０５７位、１０００１位、１０３７２位、１０４５３位、１０４６８位、１０４６８位、１０５１２位、１１０３８位、１１０５５位、１１５９７位、１１６８１位、１１７１９位、１１９２２位、１２０３４位、１２０４９位、１２１７６位、１２５５４位、１３４８１位、１３８６４位、１４３９０位、１５０４４位、１５５９８位、１６１７６位、１６８７０位、１７４７５位、１７７４９位、１８０７７位、１８５８５位、１８６１９位、１８６７７位、１９２２２位、１９７３１位、１９７５０位、２０７５８位、２０９６２位、２１０７３位、２１６８０位、２１８６７位、２２３８５位、２２８７４位、２３１９１位、２４０１６位、２４５２０位、２４９９３位、２５４６０位、２６１５５位、２６８０４位、２６９８０位、２７９８８位、２９２３４位、２９４６９位、３０２５４位、３０７４２位、３０７４２位、３０７５６位、３０７５６位、３１６７１位、３１８７４位、３１９４０位、３２６２６位、３３３９３位、３３５８１位、３４２４０位、３５２９４位、３５６６６位、３６５８７位、３６６５３位、３６９４１位、３７４０８位、３７５８３位、３７６１２位、３８４６２位、３８４７０位、３８４８５位、３９０６５位、３９１４６位、４０６１２位、４０６４１位、４１２４２位、４２２１７位、４２５３９位、４５９３４位、４６０３３位、または４６８９５位のいずれかの多型部位
（２３ａ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１５８０位、１７５４位、１８８２位、３０６２位、３５０７位、４８００位、４９０５位、５５６９位、５６０８位、５６４３位、５６６５位、５６９３位、５８６４位、５８８４位、５９８１位、６１６９位、６８０８位、６８５８位、７１９４位、７２８３位、７７２８位、７８３５位、８０４９位、８０４９位、８２６５位、９２０９位、９４４５位、９６４６位、９６４７位、９７１６位、９７７５位、１０００１位、１００２９位、１００５４位、１０１９３位、１０２０８位、１０８２６位、１０９０８位、１０９９７位、１１３３６位、１１７５４位、１１８９５位、１２０３１位、１２３２７位、１２４６４位、１２５６１位、１４０５１位、１５３６６位、１５７７８位、１７７２３位、１７７７２位、１７７８３位、１７８１１位、１７８１５位、１７８６２位、１７９００位、１７９６２位、１８１８４位、１８１８９位、１８２９７位、１８４１１位、１８５１２位、１８５６３位、１９１２５位、１９１５２位、２００９２位、２１２２７位、２１５０６位、２１６１７位、２１８５５位、２３０９０位、２５７００位、２６４６８位、２６６３８位、２７６８２位、２７７５５位、２７８８８位、２７９７３位、２７９９５位、２８１２３位、２８１２７位、２８１４４位、２８１５３位、または２８２７１位のいずれかの多型部位
（２４ａ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における６７２２位、９６４３位、９９３４位、１０００１位、１３７８２位、１４６２９位、１５３７６位、１５８０８位、または１６０８２位のいずれかの多型部位
（２５ａ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１８１６位、３１１６位、３１１７位、３１１８位、３１５４位、３１５７位、３１９１位、３１９７位、３２０５位、３２９１位、３６２２位、３６５２位、３７９２位、４４８８位、５０７６位、５４７４位、５４８１位、５４９２位、５５０３位、５６５４位、５６７２位、６５６３位、６８４３位、６９０８位、７１１９位、７５３８位、７５３８位、７７２１位、８４０３位、８６２６位、１０００１位、１２６３６位、１３１０３位、１４７９４位、１５３７０位、１５４４８位、１５５９９位、１５７６４位、１６０４５位、１６２６１位、１６２７７位、１６８６１位、１７３６０位、１７６１１位、１７７１４位、１７８０９位、１８２２１位、１８２２１位、１８３７６位、１８５３６位、１９０６３位、２２９４２位、２３４０４位、２３６１２位、２５１２５位、２５１３４位、２５６６２位、２５７０５位、２５７５１位、２７４０７位、２８１６６位、２８５６７位、３０３０２位、３０３１６位、３０３５３位、３０３５４位、３０３９１位、３３５９４位、３３６５０位、３３７５４位、３６６９０位、３７７５３位、３７８９５位、３７９００位、３９１０４位、３９７４５位、４１４０４位、４１６４６位、４１７１１位、４２０２０位、４２０８０位、４２９７４位、４３０５２位、４３２４０位、４３６２１位、４４７３４位、４４９５８位、４６９２０位、４７４３１位、４７５７３位、４８１０１位、４８１２７位、４８３０６位、４８８０７位、４９０４９位、４９８４８位、４９８６０位、４９９０３位、５０１１４位、５０２２３位、５２０５７位、５２５４３位、５２６９３位、または５３０６１位のいずれかの多型部位
（２６ａ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１２８３位、４２８８位、７５２０位、７５９９位、７７４０位、８７４５位、９０５０位、９８６２位、１０００１位、１０１２４位、１０１６８位、１０３３９位、１１０１７位、１３７３６位、１３７４７位、１８３５４位、２００３１位、２０１７２位、２２０９４位、２４０８２位、２４３０５位、２４４７８位、２４５５２位、２５２７３位、２５３５１位、２９０９６位、２９１００位、２９７６４位のいずれかの多型部位
（２７ａ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における７３３位、８４８位、１０３９位、１３５１位、１５６９位、１８３１位、２０７８位、２７０７位、２７９４位、２９０４位、２９９５位、３１２２位、３５２０位、４３５１位、４８２４位、５１８９位、５２０５位、５２０６位、５５２５位、５７７９位、６４８７位、７７１２位、１０００１位、１０２０８位、１０２３５位、１０８６８位、１１０９２位、１１６１７位、１１６６６位、１２２１６位、１２３２６位、１２７４１位、１３３９６位、１３８９０位、１４７０２位、１５８２３位、１６７０５位、または１９０８６位のいずれかの多型部位
（２８ａ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における３４５５位、７８２６位、８７１５位、８７８３位、９０４２位、９３９０位、９４６２位、９７０９位、１０００１位、１０６３５位、１０７４８位、１２７９４位、１２８４９位、１２９１５位、１３１６９位、１７０２０位、１８５８６位、２１１２３位、または２１１２８位のいずれかの多型部位、
または、
（２８ａ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における９５９８位、１０００１位、１０３０６位、１１１８１位、１１４８０位、１３５９３位、１３７２１位、１３７９２位、１５３１４位、１５６２３位、１５７８２位、１６７０８位、１６７４８位、または１９６３０位のいずれかの多型部位
（２９ａ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における２４４位、５７５位、６７５位、１４８７位、１６４４位、２３４３位、２７１５位、２７６３位、３０９８位、３５８９位、３８８０位、５７８７位、５８６５位、６４３６位、７３９２位、７９９５位、８１６１位、８５４４位、９２３０位、９７９５位、１０００１位、１０１９９位、１０５０３位、１１９７５位、１４９８１位、１５６８１位、または１９３００位のいずれかの多型部位
〔５〕  多型部位が、それぞれ以下の（１ｂ）〜（２９ｂ）に記載の多型部位である、〔３〕に記載の方法、
（１ｂ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１４２５８位、または１９７６８位の部位
（２ｂ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、または１７８４８位の部位
（３ｂ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（４ｂ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（５ｂ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（６ｂ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（７ｂ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（８ｂ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（９ｂ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１７２８３位の部位
（１０ｂ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１１ｂ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１２ｂ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１１９９０位、または１６７７１位の部位
（１３ｂ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１８９５８位、または２１２１３位の部位
（１４ｂ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の部位
（１５ｂ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１６ｂ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１７ｂ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１８ｂ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１９ｂ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２０ｂ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２１ｂ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２２ｂ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、または３７５８３位の部位
（２３ｂ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１８５６３位の部位
（２４ｂ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２５ｂ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、または１５４４８位の部位
（２６ｂ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における２００３１位の部位
（２７ｂ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２８ｂ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の部位
（２８ｂ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２９ｂ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０５０３位の部位
〔６〕  〔５〕の（１ｂ）〜（２９ｂ）に記載の多型部位における塩基種が、それぞれ以下の（１ｃ）〜（２９ｃ）である場合に、２型糖尿病である（２型糖尿病感受性である、もしくは２型糖尿病感受性の素因を有する）ものと判定される〔５〕に記載の方法、
（１ｃ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１４２５８位の塩基種がＴ、または１９７６８位の塩基種がＴ
（２ｃ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ、または１７８４８位の塩基種がＡ
（３ｃ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（４ｃ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２４５７８位の塩基種がＡ
（５ｃ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（６ｃ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（７ｃ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（８ｃ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＣ
（９ｃ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１７２８３位の塩基種がＴ
（１０ｃ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（１１ｃ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（１２ｃ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１１９９０位の塩基種がＡ、または１６７７１位の塩基種がＣ
（１３ｃ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１８９５８位の塩基種がＧ、または２１２１３位の塩基種がＣ
（１４ｃ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の塩基種がＡ
（１５ｃ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（１６ｃ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（１７ｃ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（１８ｃ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（１９ｃ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（２０ｃ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（２１ｃ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＣ
（２２ｃ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ、または３７５８３位の塩基種がＣ
（２３ｃ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１８５６３位の塩基種がＧ
（２４ｃ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２５ｃ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ、１３１０３位の塩基種がＧ、または１５４４８位の塩基種がＧ
（２６ｃ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における２００３１位の塩基種がＣ
（２７ｃ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２８ｃ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の塩基種がＧ
（２８ｃ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２９ｃ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０５０３位の塩基種がＧ
〔７〕  以下の工程（ａ）および（ｂ）を含む、２型糖尿病（２型糖尿病感受性であるか否か、もしくは２型糖尿病感受性の素因を有するか否か）の検査方法、
（ａ）  被検者における以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位について、塩基種を決定する工程、
（１）ＭＥＴ、（２）ＮＰＨＳ１、（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２、（４）ＡＢＣＡ１、（５）ＣＴＳＤ、（６）ＳＴＥ、（７）ＡＢＣＣ８、（８）ＭＹＬ２、（９）ＤＬＧ５、（１０）ＬＤＬＣ、（１１）ＬＡＲＧＥ、（１２）ＢＬＺＦ１、（１３）ＦＲＡＰ１、（１４）ＬＥＰ
（ｂ）  工程（ａ）により決定された塩基種を、以下の（１’）〜（１４’）のいずれかに記載のハプロタイプを示す前記遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位（ハプロタイプブロック上の多型部位）の塩基種と、比較する工程
（１’）ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｔ、およびＴであるハプロタイプ、
ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれ、Ｇ、Ｃ、およびＣであるハプロタイプ、または、
ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１９７６８位および２４２０９位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプ
（２’）ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｃ、およびＡであるハプロタイプ、
ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｇ、およびＧであるハプロタイプ、または、
ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｃ、およびＧであるハプロタイプ
（３’）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＡであるハプロタイプ、または
ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプ
（４’）ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、および２８５６４位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ａ、Ｃ、Ｔ、およびＧであるハプロタイプ、または
ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＣであるハプロタイプ
（５’）ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、および１６７７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプ
（６’）ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、および２０９７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｇ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプ、または
ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における２０９７１位、および２１２１３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＣであるハプロタイプ
（７’）ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の多型部位の塩基種がＡであるハプロタイプ
（８’）ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、および８３５００位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプ
（９’）ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｃ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプ、ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプ、または
ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプ
（１０’）ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプ、または
ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＧであるハプロタイプ
（１１’）ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、および４３２４０位の多型部位の塩基種が、それぞれＴ、Ｇ、Ｇ、Ｔ、およびＡであるハプロタイプ
（１２’）ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位および２００３１位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＴであるハプロタイプ
（１３’）ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の多型部位の塩基種がＧであるハプロタイプ
（１４’）ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位および１０５０３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプ
上記方法は、例えば、被検者から取得される被検試料について、上記（１’）〜（１４’）のいずれかに記載のハプロタイプ（ブロック）の有無を指標とした、被検者が２型糖尿病に対して感受性もしくは抵抗性の素因を有するか否かの検査方法である、
〔８〕  〔７〕（ａ）の（１）〜（１４）に記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位が、それぞれ以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の多型部位である、〔７〕に記載の検査方法、
（１）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における７６５位、１３８３位、１８９０位、２０９９位、２８１４位、３２９３位、３７５２位、３７７４位、３９２７位、４６９０位、７４１９位、８２１４位、１０００１位、１０３１８位、１３７６６位、１３９８９位、１４２５８位、１５４２７位、１６２７５位、１６５９７位、１６９３２位、１９７６８位、１９８３５位、２００３２位、２０２４０位、２０５３７位、２０８８５位、２１５４６位、２４２０９位、２４２７１位、２４３７６位、２４６４２位、２６０２８位、２６２２６位、または３４２０９位のいずれかの多型部位
（２）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１７２位、１８６位、２１１位、２５５４位、２５５８位、１０００１位、１００６７位、１０１７６位、１１８４０位、１３７５９位、１４６４５位、１４９６７位、１６１９８位、１６４３９位、１７６３５位、１７６８５位、１７７９４位、１７８０５位、１７８４８位、１７８４９位、１８４９１位、１９９５５位、２００８８位、２０６１３位、２１５３３位、２１５８２位、２１８１１位、２１８１２位、２２１９０位、２２９６５位、２２９８２位、２３６６０位、２３７８０位、２４０４０位、２４１７２位、２５３３４位、または２６５８５位のいずれかの多型部位
（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２８５３位、２８９１、５２１８位、５３１７位、７５６０位、８０５４位、８７７１位、１０００１位、１０３２９位、１１７８１位、１２０６３位、１２７０５位、１３１２５位、１３６９１位、１３９１３位、１３９１６位、１３９１７位、１４１２３位、１４１６９位、１４４５３位、１４４５６位、１４４８３位、１６５２６位、１６５５６位、１７６４３位、１７７２５位、１７８２４位、１８０７６位、１８２２７位、１８５００位、１８６８７位、１８７４１位、１８７４４位、１８８７５位、１９０４５位、１９１４１位、１９１４９位、１９１９０位、１９４２９位、１９５４８位、１９５６７位、１９６２４位、１９６４５位、１９８１４位、２００４９位、２００８２位、２００９７位、２０２４３位、２２１２２位、２２４９５位、２２５１６位、２２６９１位、２２８１６位、２３００７位、２３９０４位、２４００５位、２４４１８位、２４５７８位、２４８５５位、２４８８５位、２５５０５位、２５５３８位、２５５６４位、２５５８６位、２６０１７位、２６２３４位、２６５５７位、２６６２１位、３０１５５位、３０２６７位、または３０６０７位のいずれかの多型部位
（４）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における９９３位、１７７９位、１８１３位、３４５０位、４２８７位、４３８２位、７２７０位、７５２８位、８３８３位、８７８３位、８７９８位、９２５４位、１０００１位、１０９９９位、１１１２２位、１１７２０位、１２４７３位、１２５６０位、１２５９１位、１２６６４位、１２９１６位、１３４０３位、１３６０５位、１３６９１位、１４４５７位、１４７３７位、１５２７８位、１５３４５位、１５３４５位、１５６３６位、１５６３６位、１５８２４位、１６７９３位、１７０２２位、１７０３７位、１７２８３位、１７５７６位、１８１６７位、１８６１９位、１８６３２位、１８８４２位、１８８４３位、１８９２６位、１９４０４位、１９４０４位、１９８０９位、２０４４７位、２０５１４位、２０５１５位、２１９６３位、２２９８８位、２３０８１位、２３１５７位、２３５７７位、２３９５３位、２４３８９位、２５８１４位、２６１９８位、２６６５５位、２６９０２位、２７３６７位、２７５３５位、２７７０１位、２８１７５位、２８４６７位、２８５６４位、２８６６９位、２８７７４位、２８８３９位、２８９３７位、２８９４４位、２９０３７位、３００９１位、３０６１３位、３０９７５位、３２８０３位、３２８０３位、３３４３５位、３４２６３位、３４２６４位、３４８１２位、３５３０６位、３５３３９位、３５４７３位、３６２１７位、３７５９６位、または３７８５５位のいずれかの多型部位、または
ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１２０６位、１９０５位、１９７９位、２００８位、２０５４位、２２８６位、２３０３位、２８０８位、３１７６位、３４１３位、３４１５位、３５４８位、３６６９位、３７５６位、３９８３位、４５２１位、４５４４位、４５７７位、４６０９位、５２２６位、５８３３位、５８６８位、６４２２位、６５３２位、６５８３位、６６９６位、７０４３位、７１９８位、７３２４位、７３９５位、７４８４位、７７１６位、７７８７位、８１９７位、８３５０位、９５４１位、９６４３位、９７９３位、１０００１位、１０３４８位、１０４１５位、１０７４１位、１０８２６位、１１０００位、１１０２４位、１１１２９位、１１１８５位、１１２８６位、１１４５２位、１１４７１位、１１６５３位、１１７４６位、１１８５８位、１２１１４位、１２２２５位、１２５２０位、１２７２５位、１２８９６位、１２８９９位、１２９０５位、１３１１８位、１３４９２位、１３５８９位、１３８３６位、１４２２６位、１４３９１位、１４４８９位、１４５３６位、１４８１３位、１５０７１位、１５２１５位、１５３７７位、１５３９９位、１５６４４位、１５６８７位、１５８３０位、１６１０３位、１６１１２位、１６１３９位、１６７５４位、１７３０３位、１８２３７位、１８３７９位、１８６１８位、１８９０３位、１８９２１位、１９０１４位、１９０３４位、１９０７４位、１９１４９位、１９１６５位、１９１６７位、１９３６５位、１９３７３位、１９３７６位、１９３８６位、１９４８７位または１９６５９位のいずれかの多型部位
（５）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における８１３位、８１５位、８４４位、８６１位、９５４位、１０２６位、１１５９位、１２９９位、５４６４位、５６００位、７１４４位、７７０７位、７７２６位、７７３９位、７７７８位、７８０３位、７８４１位、７８４２位、７８８６位、７９３９位、７９６３位、８０５８位、８３３３位、９９４８位、１０００１位、１１９９０位、１２３４２位、１２８０７位、１６２６６位、または１６７７１位のいずれかの多型部位
（６）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における５７位、４６８位、１８８１位、２９５５位、３４６０位、３９７６位、４５３７位、４５３８位、４７２２位、４８６７位、４８７３位、４９４７位、５０２５位、７０４３位、７６７６位、８５８１位、９０３５位、９３４７位、９６８６位、９８８２位、９８９４位、１０００１位、１０００３位、１２１４２位、１３５２０位、１３５５１位、１３７９７位、１４４９２位、１４７５３位、１４９３３位、１５６８４位、１７０２２位、１８２６４位、１８５６８位、１８９５８位、１９１９４位、１９３３０位、１９３５４位、１９３５５位、１９５６７位、１９７８５位、２０５１１位、２０６１２位、２０６２７位、２０９３６位、２０９６１位、２０９７１位、２１２１３位、２１３３６位、２１６０９位、２１９１４位、または２１９８３位のいずれかの多型部位
（７）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における６９７８位、７３５８位、７３５９位、７６４９位、７７５５位、８０６８位、８２１４位、８２１５位、８３０８位、９６５８位、９７６１位、９８１１位、９８２８位、１０００１位、１００９５位、１０１２５位、１１６５８位、１１６７４位、１１７０８位、１１７６７位、１１８８３位、１１９９８位、１２１０９位、１２３０８位、１３６２０位、１３６６４位、１３９１２位、１４２９７位、１４３０９位、１４３２０位、１４３２３位、１４３６７位、１４３９３位、１４４７５位、１４５９１位、１４７２２位、１５２９４位、１５６０１位、１５６５７位、１６１６０位、１６２３０位、１６３６７位、１６４１７位、１７６９５位、１８２１３位、１８８１５位、１９０９３位、２００８２位、２０２１１位、２０４６１位、２１５４７位、２１９９５位、２２８２５位、または２３９０１位のいずれかの多型部位
（８）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における３１４７位、３２１３位、４６８６位、７３４３位、７８９２位、１０００１位、１０１２３位、１１２６４位、１１９９２位、１５５３２位、１５６８１位、１５９５７位、１５９８８位、１６６４１位、１８３８６位、１８７８２位、２０３５４位、２１５３１位、２３２４５位、２７７４０位、３０６６９位、３０６７０位、３２０７７位、３２７３２位、３２９０７位、３２９５５位、４２５８９位、４３０２９位、４７３５４位、６４７７７位、７１８６９位、７１９６１位、７４２７４位、７５５５１位、７６３４３位、７６３４４位、７８２７０位、７８３３９位、７８６８９位、７８７４３位、７８８０６位、７８８０７位、７９２１５位、７９３１９位、７９３５７位、７９４６０位、７９４６３位、８００３４位、８００６２位、８００７６位、８０４０１位、８０４７５位、８０５９９位、８０７１５位、８０８６５位、８０９４３位、８０９５２位、８０９７４位、８０９９１位、８１１３０位、８１３７３位、８１４２８位、８１５４３位、８１６８２位、８２４２２位、８２５４５位、８２７９２位、８２９３８位、８３２６５位、８３２６６位、８３３９４位、８３４６３位、８３５００位、８３５７８位、８３６１２位、８３６５０位、８４７９０位、８４９２１位、８４９４５位、８５２１４位、８５３８３位、８５３８４位、８５５５０位、８５９８４位、８６１０９位、８６５３９位、８６５４２位、８７１６９位、８７１７０位、８７３５３位、８７６７１位、８７９５３位、８７９５４位、８８０５７位、８８１７８位、８８２４０位、８８２５８位、８８２７１位、８８２７２位、８８３０７位、８８５１２位、８８６９５位、８８７７８位、８８７９８位、８９１２４位、または９１０８１位のいずれかの多型部位
（９）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２位、１２１位、１４３８位、１６６９位、２１８０位、２４３６位、２５４３位、２６１９位、３７１５位、３７２７位、５２５６位、５３３５位、５３３９位、５６８８位、５７５２位、６３０４位、６６２７位、７１９５位、７３４２位、７６０３位、８２７３位、８９０５位、８９８８位、９０１３位、９０５７位、１０００１位、１０３７２位、１０４５３位、１０４６８位、１０４６８位、１０５１２位、１１０３８位、１１０５５位、１１５９７位、１１６８１位、１１７１９位、１１９２２位、１２０３４位、１２０４９位、１２１７６位、１２５５４位、１３４８１位、１３８６４位、１４３９０位、１５０４４位、１５５９８位、１６１７６位、１６８７０位、１７４７５位、１７７４９位、１８０７７位、１８５８５位、１８６１９位、１８６７７位、１９２２２位、１９７３１位、１９７５０位、２０７５８位、２０９６２位、２１０７３位、２１６８０位、２１８６７位、２２３８５位、２２８７４位、２３１９１位、２４０１６位、２４５２０位、２４９９３位、２５４６０位、２６１５５位、２６８０４位、２６９８０位、２７９８８位、２９２３４位、２９４６９位、３０２５４位、３０７４２位、３０７４２位、３０７５６位、３０７５６位、３１６７１位、３１８７４位、３１９４０位、３２６２６位、３３３９３位、３３５８１位、３４２４０位、３５２９４位、３５６６６位、３６５８７位、３６６５３位、３６９４１位、３７４０８位、３７５８３位、３７６１２位、３８４６２位、３８４７０位、３８４８５位、３９０６５位、３９１４６位、４０６１２位、４０６４１位、４１２４２位、４２２１７位、４２５３９位、４５９３４位、４６０３３位、または４６８９５位のいずれかの多型部位
（１０）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１５８０位、１７５４位、１８８２位、３０６２位、３５０７位、４８００位、４９０５位、５５６９位、５６０８位、５６４３位、５６６５位、５６９３位、５８６４位、５８８４位、５９８１位、６１６９位、６８０８位、６８５８位、７１９４位、７２８３位、７７２８位、７８３５位、８０４９位、８０４９位、８２６５位、９２０９位、９４４５位、９６４６位、９６４７位、９７１６位、９７７５位、１０００１位、１００２９位、１００５４位、１０１９３位、１０２０８位、１０８２６位、１０９０８位、１０９９７位、１１３３６位、１１７５４位、１１８９５位、１２０３１位、１２３２７位、１２４６４位、１２５６１位、１４０５１位、１５３６６位、１５７７８位、１７７２３位、１７７７２位、１７７８３位、１７８１１位、１７８１５位、１７８６２位、１７９００位、１７９６２位、１８１８４位、１８１８９位、１８２９７位、１８４１１位、１８５１２位、１８５６３位、１９１２５位、１９１５２位、２００９２位、２１２２７位、２１５０６位、２１６１７位、２１８５５位、２３０９０位、２５７００位、２６４６８位、２６６３８位、２７６８２位、２７７５５位、２７８８８位、２７９７３位、２７９９５位、２８１２３位、２８１２７位、２８１４４位、２８１５３位、または２８２７１位のいずれかの多型部位
（１１）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１８１６位、３１１６位、３１１７位、３１１８位、３１５４位、３１５７位、３１９１位、３１９７位、３２０５位、３２９１位、３６２２位、３６５２位、３７９２位、４４８８位、５０７６位、５４７４位、５４８１位、５４９２位、５５０３位、５６５４位、５６７２位、６５６３位、６８４３位、６９０８位、７１１９位、７５３８位、７５３８位、７７２１位、８４０３位、８６２６位、１０００１位、１２６３６位、１３１０３位、１４７９４位、１５３７０位、１５４４８位、１５５９９位、１５７６４位、１６０４５位、１６２６１位、１６２７７位、１６８６１位、１７３６０位、１７６１１位、１７７１４位、１７８０９位、１８２２１位、１８２２１位、１８３７６位、１８５３６位、１９０６３位、２２９４２位、２３４０４位、２３６１２位、２５１２５位、２５１３４位、２５６６２位、２５７０５位、２５７５１位、２７４０７位、２８１６６位、２８５６７位、３０３０２位、３０３１６位、３０３５３位、３０３５４位、３０３９１位、３３５９４位、３３６５０位、３３７５４位、３６６９０位、３７７５３位、３７８９５位、３７９００位、３９１０４位、３９７４５位、４１４０４位、４１６４６位、４１７１１位、４２０２０位、４２０８０位、４２９７４位、４３０５２位、４３２４０位、４３６２１位、４４７３４位、４４９５８位、４６９２０位、４７４３１位、４７５７３位、４８１０１位、４８１２７位、４８３０６位、４８８０７位、４９０４９位、４９８４８位、４９８６０位、４９９０３位、５０１１４位、５０２２３位、５２０５７位、５２５４３位、５２６９３位、または５３０６１位のいずれかの多型部位
（１２）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１２８３位、４２８８位、７５２０位、７５９９位、７７４０位、８７４５位、９０５０位、９８６２位、１０００１位、１０１２４位、１０１６８位、１０３３９位、１１０１７位、１３７３６位、１３７４７位、１８３５４位、２００３１位、２０１７２位、２２０９４位、２４０８２位、２４３０５位、２４４７８位、２４５５２位、２５２７３位、２５３５１位、２９０９６位、２９１００位、２９７６４位のいずれかの多型部位
（１３）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における３４５５位、７８２６位、８７１５位、８７８３位、９０４２位、９３９０位、９４６２位、９７０９位、１０００１位、１０６３５位、１０７４８位、１２７９４位、１２８４９位、１２９１５位、１３１６９位、１７０２０位、１８５８６位、２１１２３位、または２１１２８位のいずれかの多型部位
（１４）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における２４４位、５７５位、６７５位、１４８７位、１６４４位、２３４３位、２７１５位、２７６３位、３０９８位、３５８９位、３８８０位、５７８７位、５８６５位、６４３６位、７３９２位、７９９５位、８１６１位、８５４４位、９２３０位、９７９５位、１０００１位、１０１９９位、１０５０３位、１１９７５位、１４９８１位、１５６８１位、または１９３００位のいずれかの多型部位
〔９〕  〔７〕（ａ）の（１）〜（１４）に記載の遺伝子における多型部位が、それぞれ以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の多型部位である、〔７〕に記載の検査方法、
（１）ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、１９７６８位、または２４２０９位の多型部位
（２）ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位または１７８４８位の多型部位
（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、または２４５７８位の多型部位
（４）ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、または２８５６４位の多型部位、または
ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位
（５）ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、または１６７７１位の多型部位
（６）ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、２０９７１位、または２１２１３位の多型部位
（７）ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１０００１位、または１４４７５位の多型部位
（８）ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、または８３５００位の多型部位
（９）ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、２４０１６位、２９４６９位、または３７５８３位の多型部位
（１０）ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、または１８５６３位の多型部位
（１１）ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、または４３２４０位の多型部位
（１２）ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位、または２００３１位の多型部位
（１３）ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１０００１位または１７０２０位の多型部位
（１４）ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位、または１０５０３位の多型部位
〔１０〕  さらに、被検者の生体試料から多型部位を含むＤＮＡを調製する工程、を含む〔３〕〜〔９〕のいずれかに記載の検査方法、を提供するものである。
また本発明は、上記検査方法に用いるための２型糖尿病検査用オリゴヌクレオチドを提供する。
より具体的には、例えば、上記検査方法に用いられるオリゴヌクレオチドプライマー、またはオリゴヌクレオチドプローブ、が挙げられる。より具体的には、
〔１１〕  〔４〕の（１ａ）〜（２９ａ）のいずれかに記載の多型部位を含むＤＮＡにハイブリダイズし、少なくとも１５ヌクレオチドの鎖長を有するオリゴヌクレオチドを含む、２型糖尿病の検査薬（検査用試薬）、
〔１２〕  〔４〕の（１ａ）〜（２９ａ）のいずれかに記載の多型部位を含むＤＮＡとハイブリダイズするヌクレオチドプローブが固定された固相からなる２型糖尿病の検査薬（検査用試薬）、
〔１３〕  〔４〕の（１ａ）〜（２９ａ）のいずれかに記載の多型部位を含むＤＮＡを増幅するためのプライマーオリゴヌクレオチドを含む、２型糖尿病の検査薬（検査用試薬）、を提供するものである。
本発明者らによって、２型糖尿病（ＤＭ）に関連する遺伝子（ＤＭ関連遺伝子）が同定された。ＤＭの患者においては、有意に該遺伝子上に変異が見出されることから、該遺伝子上の変異の有無を調べることにより、被検者についてＤＭであるか否かの検査を行うことが可能である。
本発明のＤＭ関連遺伝子の名称、該遺伝子の染色体上の位置、および該遺伝子のＧｅｎＢａｎｋのアクセッション番号を表１に示す。これら遺伝子の塩基配列、および該遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列についての情報は、表１に示されたＧｅｎＢａｎｋのアクセッション番号から、容易に取得することが可能である。また当業者においては、表１に示す遺伝子表記（遺伝子名）を基に、公共の遺伝子データベースあるいは文献データベース等から遺伝子の塩基配列、および該遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列に関する情報を容易に入手することが可能である。
2004084797.tif 000002
本発明は、被検者について、下記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子における変異を検出することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法を提供する。
（１）ＭＥＴ、（２）ＮＰＨＳ１、（３）ＳＬＣ１Ａ１、（４）ＳＥＲＰＩＮＢ２、（５）ＦＡＢＰ２、（６）ＺＮＦ２６３、（７）ＴＮＦ、（８）ＴＨＢＳ３、（９）ＡＢＣＡ１、（１０）ＳＥＲＰＩＮＢ１０、（１１）ＡＬＤＯＢ、（１２）ＣＴＳＤ、（１３）ＳＴＥ、（１４）ＡＢＣＣ８、（１５）ＳＥＲＰＩＮＡ３、（１６）ＲＣＶ１、（１７）ＴＦＲＣ、（１８）ＭＭＰ１９、（１９）ＭＹＬ２、（２０）ＶＬＤＬＲ、（２１）Ｐ２ＲＸ７、（２２）ＤＬＧ５、（２３）ＬＤＬＣ、（２４）ＡＱＰ８、（２５）ＬＡＲＧＥ、（２６）ＢＬＺＦ１、（２７）ＲＧＳ５、（２８）ＦＲＡＰ１、（２９）ＬＥＰ
なお、本発明の上記「いずれかに記載の遺伝子」とは、上記（１）〜（２９）のいずれか少なくとも１以上の遺伝子を意味する。即ち、上記（１）〜（２９）に記載の複数の遺伝子における変異を検出することによって２型糖尿病の検査を行う場合も、本発明に含まれる。
本発明において「２型糖尿病の検査」とは、被検者が、２型糖尿病に罹患する可能性が高いか低いか、およびすでにＤＭに罹患している場合にはその原因や病型の判定をするための検査が含まれる。本発明の方法においては、上記（１）〜（２９）の各遺伝子において変異が検出された場合に、被検者は２型糖尿病を罹患しやすい、あるいはしにくいものと判定される。２型糖尿病にすでに罹患した被検者であっても２型糖尿病を発症した原因および病型を判定することができ、治療方針の決定等に利用する事ができる。
本発明の上記方法における「変異」の位置について、予め規定することは困難であるが、通常、上記遺伝子のＯＲＦ中、あるいは上記遺伝子の発現を制御する領域（例えば、プロモーター領域、エンハンサー領域等）中である。また、この「変異」とは、上記遺伝子の発現量を変化させる、ｍＲＮＡの安定性等の性質を変化させる、あるいは上記遺伝子によってコードされるタンパク質の有する活性を変化させるような変異であれば、特に制限されず、例えば、塩基の付加、欠失、置換、挿入変異等を挙げることができる。
本発明者らは、ＤＭ患者における上記（１）〜（２９）の各遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域においてＤＭと有意に関連する多型変異を見出すことに成功した。従って、上記（１）〜（２９）の各遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位について変異の有無を指標とする（塩基種を決定する）ことにより、ＤＭの検査を行うことが可能である。尚、上記の「遺伝子の近傍ＤＮＡ領域」とは、通常、該遺伝子の近傍の染色体上に領域を指す。近傍とは、特に制限されるものではないが、通常、本発明の多型部位を含むＤＮＡ領域であり、好ましくは、遺伝子の末端部分から１０ｋｂ以内の領域を指す。
前後１０ｋｂすなわち２０ｋｂの範囲にある多型は、Ｇａｂｒｉｅｌらの報告の通り連鎖している可能性が高い（Ｇａｂｒｉｅｌ  ＳＢ，Ｓｃｈａｆｆｎｅｒ  ＳＦ，Ｎｇｕｙｅｎ  Ｈ  ｅｔ  ａｌ．Ｔｈｅ  ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ｏｆ  ｈａｐｌｏｔｙｐｅ  ｂｌｏｃｋｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｈｕｍａｎ  ｇｅｎｏｍｅ．Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２９６，２２２５−９．２００２）。
上記（１）〜（２９）の各遺伝子および該遺伝子の近傍ＤＮＡ配列を、それぞれ配列番号：１〜２９に示す。（即ち、配列番号：１に記載の塩基配列は、ＭＥＴ遺伝子および該遺伝子の近傍のＤＮＡ配列を示す。）また、配列番号：３０には、配列番号：２８で示したＦＲＡＰ遺伝子および該遺伝子の近傍のＤＮＡ領域以外の、ＦＲＡＰ遺伝子および該遺伝子の近傍のＤＮＡ配列を示す。
本発明の好ましい態様においては、上記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子における一塩基多型変異を検出することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法である。
多型とは、遺伝学的には、人口中１％以上の頻度で存在している１遺伝子におけるある塩基の変化と一般的に定義されるが、本発明における「多型」は、この定義に制限されない。本発明における多型の種類としては、例えば、一塩基多型、一から数十塩基（時には数千塩基）が欠失あるいは挿入している多型等が挙げられるが、これらに特に限定されない。さらに、多型部位の数も、１個に限定されず、複数個の多型を有していてもよい。
また本発明の別の態様においては、上記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位の塩基種を決定することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法である。
本発明の上記方法における「多型部位」は、上記（１）〜（２９）の各遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上に存在する多型であれば、特に制限されない。具体的には、本発明の検査方法に利用可能な多型部位として、上記（１）〜（２９）の各遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上に存在する以下の（１ａ）〜（２９ａ）多型部位を挙げることができる。（尚、本明細書においては、これらの多型部位を単に『本発明の多型部位』と記載する場合がある。）
（１ａ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における７６５位、１３８３位、１８９０位、２０９９位、２８１４位、３２９３位、３７５２位、３７７４位、３９２７位、４６９０位、７４１９位、８２１４位、１０００１位、１０３１８位、１３７６６位、１３９８９位、１４２５８位、１５４２７位、１６２７５位、１６５９７位、１６９３２位、１９７６８位、１９８３５位、２００３２位、２０２４０位、２０５３７位、２０８８５位、２１５４６位、２４２０９位、２４２７１位、２４３７６位、２４６４２位、２６０２８位、２６２２６位、または３４２０９位のいずれかの多型部位
（２ａ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１７２位、１８６位、２１１位、２５５４位、２５５８位、１０００１位、１００６７位、１０１７６位、１１８４０位、１３７５９位、１４６４５位、１４９６７位、１６１９８位、１６４３９位、１７６３５位、１７６８５位、１７７９４位、１７８０５位、１７８４８位、１７８４９位、１８４９１位、１９９５５位、２００８８位、２０６１３位、２１５３３位、２１５８２位、２１８１１位、２１８１２位、２２１９０位、２２９６５位、２２９８２位、２３６６０位、２３７８０位、２４０４０位、２４１７２位、２５３３４位、または２６５８５位のいずれかの多型部位
（３ａ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１１４２位、２７３２位、２７３４位、７２２０位、１０００１位、１２２７６位、１２９２２位、または１８０４９位のいずれかの多型部位
（４ａ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２８５３位、２８９１、５２１８位、５３１７位、７５６０位、８０５４位、８７７１位、１０００１位、１０３２９位、１１７８１位、１２０６３位、１２７０５位、１３１２５位、１３６９１位、１３９１３位、１３９１６位、１３９１７位、１４１２３位、１４１６９位、１４４５３位、１４４５６位、１４４８３位、１６５２６位、１６５５６位、１７６４３位、１７７２５位、１７８２４位、１８０７６位、１８２２７位、１８５００位、１８６８７位、１８７４１位、１８７４４位、１８８７５位、１９０４５位、１９１４１位、１９１４９位、１９１９０位、１９４２９位、１９５４８位、１９５６７位、１９６２４位、１９６４５位、１９８１４位、２００４９位、２００８２位、２００９７位、２０２４３位、２２１２２位、２２４９５位、２２５１６位、２２６９１位、２２８１６位、２３００７位、２３９０４位、２４００５位、２４４１８位、２４５７８位、２４８５５位、２４８８５位、２５５０５位、２５５３８位、２５５６４位、２５５８６位、２６０１７位、２６２３４位、２６５５７位、２６６２１位、３０１５５位、３０２６７位、または３０６０７位のいずれかの多型部位
（５ａ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における２９７０位、３１７４位、３１７５位、４５２５位、４５５６位、４５５８位、４６３６位、４６４６位、４７７４位、５７２６位、５７３６位、５８５２位、７２０３位、７２５３位、７３１０位、８２３９位、８２５１位、８２９６位、８３１２位、８９７４位、１０００１位、１０１０７位、１０４２４位、１０４６４位、１０４９１位、１０７９４位、１１９２２位、１１９５７位、１２８２０位、１６００６位、１６２５６位、１６３０９位、１６３１２位、１６３６０位、１６９２３位、１７８７７位、１８４０８位、１８６４９位、１８７１５位、１８７８３位、または１９８７８位のいずれかの多型部位
（６ａ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における８７６位、１５５２位、３２１３位、３２６９位、６４０１位、６４２５位、６６０２位、９５９５位、１０００１位、１０２５２位、１０２６９位、１０２９４位、１１３７７位、１２４６９位、１３６４２位、１３６４３位、１３８７９位、１４３６７位、１６１３３位、１７０８４位、１７６５２位、または１９２６３位のいずれかの多型部位
（７ａ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１７５位、２４０１位、２９７３位、４４５２位、４６７１位、４６７２位、５１８４位、５６０９位、５８２０位、５９４１位、５９４２位、５９４２位、６２４５位、６３１５位、６３１６位、６４８７位、６６０３位、６７３０位、６８６７位、６９３１位、６９３５位、６９５８位、７９５３位、８０２２位、８１３３位、８４８２位、８６２８位、８６５０位、８６５６位、８８２７位、８８２９位、８８６５位、８９３８位、８９４５位、８９９４位、９２０５位、９２６９位、９２７５位、１０００１位、１０２０２位、１０３６３位、１０３９９位、１０６８０位、１０７６５位、１０８１６位、１１０９２位、１１５６５位、１１９４１位、１２６６９位、１２９３６位、１２９６３位、１３０２４位、１３１２８位、１３１５４位、１３２８９位、１３５３８位、１３５３９位、１３５９４位、１３６３２位、１３６４６位、１３６８８位、１３８２２位、１３８５５位、１３８６３位、１３９６６位、１３９９３位、１４３７０位、１４５４２位、１４６２５位、１５０３０位、１５０６４位、１５５８１位、１５７３０位、１５９７５位、１６６２６位、１６７１３位、１６７３４位、１７２４０位、１７３６９位、１７６９８位、１７７１１位、または１９３４８位のいずれかの多型部位
（８ａ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における３０９８位、３１０３位、３１４３位、３１７８位、４５４３位、６９７７位、７１５８位、１０００１位、１０４４５位、１１７２８位、１３０１２位、１３５１４位、１６４０４位、１８０８８位、１８７０８位、１８７７６位、１８９８９位、１９４６５位、１９７６９位、または１９７８６位のいずれかの多型部位
（９ａ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における９９３位、１７７９位、１８１３位、３４５０位、４２８７位、４３８２位、７２７０位、７５２８位、８３８３位、８７８３位、８７９８位、９２５４位、１０００１位、１０９９９位、１１１２２位、１１７２０位、１２４７３位、１２５６０位、１２５９１位、１２６６４位、１２９１６位、１３４０３位、１３６０５位、１３６９１位、１４４５７位、１４７３７位、１５２７８位、１５３４５位、１５３４５位、１５６３６位、１５６３６位、１５８２４位、１６７９３位、１７０２２位、１７０３７位、１７２８３位、１７５７６位、１８１６７位、１８６１９位、１８６３２位、１８８４２位、１８８４３位、１８９２６位、１９４０４位、１９４０４位、１９８０９位、２０４４７位、２０５１４位、２０５１５位、２１９６３位、２２９８８位、２３０８１位、２３１５７位、２３５７７位、２３９５３位、２４３８９位、２５８１４位、２６１９８位、２６６５５位、２６９０２位、２７３６７位、２７５３５位、２７７０１位、２８１７５位、２８４６７位、２８５６４位、２８６６９位、２８７７４位、２８８３９位、２８９３７位、２８９４４位、２９０３７位、３００９１位、３０６１３位、３０９７５位、３２８０３位、３２８０３位、３３４３５位、３４２６３位、３４２６４位、３４８１２位、３５３０６位、３５３３９位、３５４７３位、３６２１７位、３７５９６位、または３７８５５位のいずれかの多型部位
（１０ａ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１４５位、４８４５位、６７５７位、６８５９位、７１５１位、７８２７位、８０６６位、１０００１位、１２８８５位、１３２２７位、１３４３２位、１３５６３位、１５４３９位、１５４４７位、１５７２９位、１５７５９位、１５８８５位、１６０９４位、１６３３０位、または１８５６５位のいずれかの多型部位
（１１ａ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における９９位、３８０位、３９６位、３９９位、７１２位、９３４位、１５３４位、１６１２位、１９４８位、２０７９位、２１０１位、４１６１位、４３１８位、４３１８位、５０９１位、６６２３位、６７１８位、７７９６位、７８５９位、８１９０位、８２０３位、９１０４位、９６２１位、９６４２位、１０００１位、１０４８９位、１１４４３位、１１５９２位、１１５９３位、１１６１６位、１１６１７位、１２２８１位、１２４５７位、１２８０２位、１３９９３位、１４０２６位、１４８００位、１６６５４位、１６８２２位、１７１３３位、１７２３９位、１８２１６位、１８７０９位、１９６１０位、または１９６１３位のいずれかの多型部位
（１２ａ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における８１３位、８１５位、８４４位、８６１位、９５４位、１０２６位、１１５９位、１２９９位、５４６４位、５６００位、７１４４位、７７０７位、７７２６位、７７３９位、７７７８位、７８０３位、７８４１位、７８４２位、７８８６位、７９３９位、７９６３位、８０５８位、８３３３位、９９４８位、１０００１位、１１９９０位、１２３４２位、１２８０７位、１６２６６位、または１６７７１位のいずれかの多型部位
（１３ａ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における５７位、４６８位、１８８１位、２９５５位、３４６０位、３９７６位、４５３７位、４５３８位、４７２２位、４８６７位、４８７３位、４９４７位、５０２５位、７０４３位、７６７６位、８５８１位、９０３５位、９３４７位、９６８６位、９８８２位、９８９４位、１０００１位、１０００３位、１２１４２位、１３５２０位、１３５５１位、１３７９７位、１４４９２位、１４７５３位、１４９３３位、１５６８４位、１７０２２位、１８２６４位、１８５６８位、１８９５８位、１９１９４位、１９３３０位、１９３５４位、１９３５５位、１９５６７位、１９７８５位、２０５１１位、２０６１２位、２０６２７位、２０９３６位、２０９６１位、２０９７１位、２１２１３位、２１３３６位、２１６０９位、２１９１４位、または２１９８３位のいずれかの多型部位
（１４ａ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における６９７８位、７３５８位、７３５９位、７６４９位、７７５５位、８０６８位、８２１４位、８２１５位、８３０８位、９６５８位、９７６１位、９８１１位、９８２８位、１０００１位、１００９５位、１０１２５位、１１６５８位、１１６７４位、１１７０８位、１１７６７位、１１８８３位、１１９９８位、１２１０９位、１２３０８位、１３６２０位、１３６６４位、１３９１２位、１４２９７位、１４３０９位、１４３２０位、１４３２３位、１４３６７位、１４３９３位、１４４７５位、１４５９１位、１４７２２位、１５２９４位、１５６０１位、１５６５７位、１６１６０位、１６２３０位、１６３６７位、１６４１７位、１７６９５位、１８２１３位、１８８１５位、１９０９３位、２００８２位、２０２１１位、２０４６１位、２１５４７位、２１９９５位、２２８２５位、または２３９０１位のいずれかの多型部位
（１５ａ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における９３７位、１１４５位、１８７８位、２３４５位、２５５９位、３２５０位、３５１３位、４４０２位、５７７６位、６６５９位、７４５３位、７９３４位、８０００位、８０４９位、８２０４位、８５４３位、８５５４位、８９３５位、９９２８位、１０００１位、１０２３３位、１０４７２位、１０４７９位、１０５２５位、１０５４４位、１０６２９位、１３３３９位、１３３４８位、１６２８７位、１６３８９位、１６６２６位、または１７８８０位のいずれかの多型部位
（１６ａ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における２５位、４９位、４６９位、５５７位、５９２位、２７３０位、２７５４位、５７６１位、６１５４位、６１８３位、８５１０位、８５２９位、８５４２位、８５９０位、９８３８位、１０００１位、１０１３２位、１０１３３位、１０６４９位、１０７０２位、１０８６６位、１２５６０位、１５６３２位、１５８２７位、１５８５３位、１５９９４位、１６６１７位、１６７９０位、１６８４１位、１７０１０位、１７３４８位、１７６５６位、１７６５６位、１７８１６位、１７８２０位、１７８８２位、１７８８２位、１８０６１位、１８１０１位、１９３０４位、または１９４８５位のいずれかの多型部位
（１７ａ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における８３６位、１０１９位、２５１１位、４０１６位、４０６８位、４１６９位、４２６９位、４４８１位、５３９８位、５４３６位、５４５０位、５７３０位、５９３７位、６０４４位、６３１３位、６７１３位、６７５９位、６７９４位、６８３３位、７５２８位、８０４７位、８０４８位、８０８０位、９２４８位、９３６１位、９４１７位、９７３４位、１０００１位、１１４６１位、１１８４５位、１１８５２位、１２０８６位、１２５９６位、１２８６４位、１２９３０位、１３９６９位、１３９６９位、１４１１９位、１４２８０位、１６８３３位、または１７０４７位のいずれかの多型部位
（１８ａ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における６３２９位、７３２９位、７７１５位、８１３８位、８５０７位、８５５１位、８５７４位、１０００１位、１１１３８位、１１３４３位、１３１５１位、１３８６８位、または１８９２３位のいずれかの多型部位
（１９ａ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における３１４７位、３２１３位、４６８６位、７３４３位、７８９２位、１０００１位、１０１２３位、１１２６４位、１１９９２位、１５５３２位、１５６８１位、１５９５７位、１５９８８位、１６６４１位、１８３８６位、１８７８２位、２０３５４位、２１５３１位、２３２４５位、２７７４０位、３０６６９位、３０６７０位、３２０７７位、３２７３２位、３２９０７位、３２９５５位、４２５８９位、４３０２９位、４７３５４位、６４７７７位、７１８６９位、７１９６１位、７４２７４位、７５５５１位、７６３４３位、７６３４４位、７８２７０位、７８３３９位、７８６８９位、７８７４３位、７８８０６位、７８８０７位、７９２１５位、７９３１９位、７９３５７位、７９４６０位、７９４６３位、８００３４位、８００６２位、８００７６位、８０４０１位、８０４７５位、８０５９９位、８０７１５位、８０８６５位、８０９４３位、８０９５２位、８０９７４位、８０９９１位、８１１３０位、８１３７３位、８１４２８位、８１５４３位、８１６８２位、８２４２２位、８２５４５位、８２７９２位、８２９３８位、８３２６５位、８３２６６位、８３３９４位、８３４６３位、８３５００位、８３５７８位、８３６１２位、８３６５０位、８４７９０位、８４９２１位、８４９４５位、８５２１４位、８５３８３位、８５３８４位、８５５５０位、８５９８４位、８６１０９位、８６５３９位、８６５４２位、８７１６９位、８７１７０位、８７３５３位、８７６７１位、８７９５３位、８７９５４位、８８０５７位、８８１７８位、８８２４０位、８８２５８位、８８２７１位、８８２７２位、８８３０７位、８８５１２位、８８６９５位、８８７７８位、８８７９８位、８９１２４位、または９１０８１位のいずれかの多型部位
（２０ａ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における６２９７位、６７３３位、７９９４位、９２４２位、９９５２位、１０００１位、１１８３８位、１２９９５位、１３２２４位、１３２７７位、１８７０２位、１８８９６位、または１９２１４位のいずれかの多型部位
（２１ａ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における９９位、６９４位、２７６５位、２７６５位、３１０１位、３１１７位、３１２７位、３３０９位、３３４６位、３８０２位、３９１６位、４２０６位、４４３０位、５９３７位、６７０５位、７３７８位、８３１２位、８３９９位、９９２８位、１０００１位、１００４２位、１０２７７位、１０４４０位、１０４６１位、１０４７９位、１０５２７位、１０５３４位、１０５５０位、１０７０１位、１０９０９位、１１０６６位、１１１９８位、１１５７５位、１１６３１位、１１７６５位、１１９７６位、１２１１９位、１２１５８位、１２２０７位、１２２７２位、１２３６６位、１２４９８位、１２５６３位、１２７９１位、１２８５６位、１２８６０位、１３２０７位、１３４８３位、１３５９０位、１３８６０位、１３８６９位、１３８８０位、１３８８１位、１３９８４位、１４０４８位、１４０５９位、１４２１０位、１４８０６位、１４９２１位、１５３３１位、１５４８８位、１５５５８位、１５６５１位、１５６８６位、１５７９１位、１６０５１位、１６０８２位、１６１３７位、１６４９２位、１６６４９位、１６７８４位、１６７８８位、１７０７２位、１７０７６位、１７３７９位、１７５２７位、１７５９３位、１７６２３位、１７７１９位、１７９９８位、１８００５位、１８０４８位、１８２８８位、１８４１２位、１８５８８位、１８６４０位、１９３４０位、１９５４５位、１９６７６位、または１９６８５位のいずれかの多型部位
（２２ａ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２位、１２１位、１４３８位、１６６９位、２１８０位、２４３６位、２５４３位、２６１９位、３７１５位、３７２７位、５２５６位、５３３５位、５３３９位、５６８８位、５７５２位、６３０４位、６６２７位、７１９５位、７３４２位、７６０３位、８２７３位、８９０５位、８９８８位、９０１３位、９０５７位、１０００１位、１０３７２位、１０４５３位、１０４６８位、１０４６８位、１０５１２位、１１０３８位、１１０５５位、１１５９７位、１１６８１位、１１７１９位、１１９２２位、１２０３４位、１２０４９位、１２１７６位、１２５５４位、１３４８１位、１３８６４位、１４３９０位、１５０４４位、１５５９８位、１６１７６位、１６８７０位、１７４７５位、１７７４９位、１８０７７位、１８５８５位、１８６１９位、１８６７７位、１９２２２位、１９７３１位、１９７５０位、２０７５８位、２０９６２位、２１０７３位、２１６８０位、２１８６７位、２２３８５位、２２８７４位、２３１９１位、２４０１６位、２４５２０位、２４９９３位、２５４６０位、２６１５５位、２６８０４位、２６９８０位、２７９８８位、２９２３４位、２９４６９位、３０２５４位、３０７４２位、３０７４２位、３０７５６位、３０７５６位、３１６７１位、３１８７４位、３１９４０位、３２６２６位、３３３９３位、３３５８１位、３４２４０位、３５２９４位、３５６６６位、３６５８７位、３６６５３位、３６９４１位、３７４０８位、３７５８３位、３７６１２位、３８４６２位、３８４７０位、３８４８５位、３９０６５位、３９１４６位、４０６１２位、４０６４１位、４１２４２位、４２２１７位、４２５３９位、４５９３４位、４６０３３位、または４６８９５位のいずれかの多型部位
（２３ａ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１５８０位、１７５４位、１８８２位、３０６２位、３５０７位、４８００位、４９０５位、５５６９位、５６０８位、５６４３位、５６６５位、５６９３位、５８６４位、５８８４位、５９８１位、６１６９位、６８０８位、６８５８位、７１９４位、７２８３位、７７２８位、７８３５位、８０４９位、８０４９位、８２６５位、９２０９位、９４４５位、９６４６位、９６４７位、９７１６位、９７７５位、１０００１位、１００２９位、１００５４位、１０１９３位、１０２０８位、１０８２６位、１０９０８位、１０９９７位、１１３３６位、１１７５４位、１１８９５位、１２０３１位、１２３２７位、１２４６４位、１２５６１位、１４０５１位、１５３６６位、１５７７８位、１７７２３位、１７７７２位、１７７８３位、１７８１１位、１７８１５位、１７８６２位、１７９００位、１７９６２位、１８１８４位、１８１８９位、１８２９７位、１８４１１位、１８５１２位、１８５６３位、１９１２５位、１９１５２位、２００９２位、２１２２７位、２１５０６位、２１６１７位、２１８５５位、２３０９０位、２５７００位、２６４６８位、２６６３８位、２７６８２位、２７７５５位、２７８８８位、２７９７３位、２７９９５位、２８１２３位、２８１２７位、２８１４４位、２８１５３位、または２８２７１位のいずれかの多型部位
（２４ａ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における６７２２位、９６４３位、９９３４位、１０００１位、１３７８２位、１４６２９位、１５３７６位、１５８０８位、または１６０８２位のいずれかの多型部位
（２５ａ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１８１６位、３１１６位、３１１７位、３１１８位、３１５４位、３１５７位、３１９１位、３１９７位、３２０５位、３２９１位、３６２２位、３６５２位、３７９２位、４４８８位、５０７６位、５４７４位、５４８１位、５４９２位、５５０３位、５６５４位、５６７２位、６５６３位、６８４３位、６９０８位、７１１９位、７５３８位、７５３８位、７７２１位、８４０３位、８６２６位、１０００１位、１２６３６位、１３１０３位、１４７９４位、１５３７０位、１５４４８位、１５５９９位、１５７６４位、１６０４５位、１６２６１位、１６２７７位、１６８６１位、１７３６０位、１７６１１位、１７７１４位、１７８０９位、１８２２１位、１８２２１位、１８３７６位、１８５３６位、１９０６３位、２２９４２位、２３４０４位、２３６１２位、２５１２５位、２５１３４位、２５６６２位、２５７０５位、２５７５１位、２７４０７位、２８１６６位、２８５６７位、３０３０２位、３０３１６位、３０３５３位、３０３５４位、３０３９１位、３３５９４位、３３６５０位、３３７５４位、３６６９０位、３７７５３位、３７８９５位、３７９００位、３９１０４位、３９７４５位、４１４０４位、４１６４６位、４１７１１位、４２０２０位、４２０８０位、４２９７４位、４３０５２位、４３２４０位、４３６２１位、４４７３４位、４４９５８位、４６９２０位、４７４３１位、４７５７３位、４８１０１位、４８１２７位、４８３０６位、４８８０７位、４９０４９位、４９８４８位、４９８６０位、４９９０３位、５０１１４位、５０２２３位、５２０５７位、５２５４３位、５２６９３位、または５３０６１位のいずれかの多型部位
（２６ａ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１２８３位、４２８８位、７５２０位、７５９９位、７７４０位、８７４５位、９０５０位、９８６２位、１０００１位、１０１２４位、１０１６８位、１０３３９位、１１０１７位、１３７３６位、１３７４７位、１８３５４位、２００３１位、２０１７２位、２２０９４位、２４０８２位、２４３０５位、２４４７８位、２４５５２位、２５２７３位、２５３５１位、２９０９６位、２９１００位、２９７６４位のいずれかの多型部位
（２７ａ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における７３３位、８４８位、１０３９位、１３５１位、１５６９位、１８３１位、２０７８位、２７０７位、２７９４位、２９０４位、２９９５位、３１２２位、３５２０位、４３５１位、４８２４位、５１８９位、５２０５位、５２０６位、５５２５位、５７７９位、６４８７位、７７１２位、１０００１位、１０２０８位、１０２３５位、１０８６８位、１１０９２位、１１６１７位、１１６６６位、１２２１６位、１２３２６位、１２７４１位、１３３９６位、１３８９０位、１４７０２位、１５８２３位、１６７０５位、または１９０８６位のいずれかの多型部位
（２８ａ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における３４５５位、７８２６位、８７１５位、８７８３位、９０４２位、９３９０位、９４６２位、９７０９位、１０００１位、１０６３５位、１０７４８位、１２７９４位、１２８４９位、１２９１５位、１３１６９位、１７０２０位、１８５８６位、２１１２３位、または２１１２８位のいずれかの多型部位、
または、
（２８ａ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における９５９８位、１０００１位、１０３０６位、１１１８１位、１１４８０位、１３５９３位、１３７２１位、１３７９２位、１５３１４位、１５６２３位、１５７８２位、１６７０８位、１６７４８位、または１９６３０位のいずれかの多型部位
（２９ａ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における２４４位、５７５位、６７５位、１４８７位、１６４４位、２３４３位、２７１５位、２７６３位、３０９８位、３５８９位、３８８０位、５７８７位、５８６５位、６４３６位、７３９２位、７９９５位、８１６１位、８５４４位、９２３０位、９７９５位、１０００１位、１０１９９位、１０５０３位、１１９７５位、１４９８１位、１５６８１位、または１９３００位のいずれかの多型部位
より詳細には、以下の表２〜３１に示す。
なお、ゲノムにおけるＤＮＡは、通常、互いに相補的な二本鎖ＤＮＡ構造を有している。従って、本明細書においては、便宜的に一方の鎖におけるＤＮＡ配列を示した場合であっても、当然の如く、当該配列（塩基）に相補的な配列も開示したものと解釈される。当業者にとって、一方のＤＮＡ配列（塩基）が判れば、該配列（塩基）に相補的な配列（塩基）は自明である。
〔ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000003
尚、表中「Ｂａｓｅ１」および「Ｂａｓｅ２」のカラムにて掲載した塩基種は、当該部位の相補鎖側を記載しているものもあるが、当業者においては、掲載された多型バンクのアクセッション番号等を基に、当該部位についての塩基種の情報を、適宜取得することが可能である。
〔ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000004
〔ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000005
〔ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000006
2004084797.tif 000007
2004084797.tif 000008
〔ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000009
〔ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000010
〔ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000011
2004084797.tif 000012
〔ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000013
〔ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000014
2004084797.tif 000015
2004084797.tif 000016
2004084797.tif 000017
上記表１０−２中、＊印はアッセイ済みＳＮＰ、＊＊印は単ＳＮＰ有意であるものを表し、二重網掛けの範囲は連鎖不平衡ブロック、点網掛けの範囲は連鎖不平衡が予測される領域を表す。
〔ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000018
〔ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000019
〔ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000020
〔ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000021
2004084797.tif 000022
〔ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000023
〔ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000024
〔ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000025
〔ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000026
〔ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000027
〔ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000028
2004084797.tif 000029
〔ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000030
〔Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000031
2004084797.tif 000032
〔ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000033
2004084797.tif 000034
〔ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000035
2004084797.tif 000036
〔ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000037
〔ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000038
2004084797.tif 000039
〔ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000040
〔ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000041
〔ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000042
上記表中に記載の「配列番号中の通しＮｏ．」は、配列番号：２８の通し番号に相当する。
〔ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000043
〔ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位〕
2004084797.tif 000044
上記表中に記載の「配列番号中の通しＮｏ．」は、配列番号：３０の通し番号に相当する。
尚、上記表中、ＳＮＰＩＤ＊欄の記載内容は、先頭にｒｓが付くものはｄｂＳＮＰデータベースの登録ＩＤ、ＩＭＳ−ＪＳＴが付くものはＪＳＮＰデータベースの登録ＩＤである。また、ｄｂＳＮＰデータベースはウェブサイト（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＳＮＰ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌ）に、ＪＳＮＰデータベースはウェブサイト（ｈｔｔｐ：／／ｓｎｐ．ｉｍｓ．ｕ−ｔｏｋｙｏ．ａｃ．ｊｐ）に公開されており、ＳＮＰＩＤ＊欄に記載された登録ＩＤ番号を用いてウェブサイト上で検索することにより、各塩基配列におけるＳＮＰｓの詳細な情報（例えば、染色体上の位置、多型部位の塩基の種類、前後の配列等）が入手できる。これらの情報を用いた場合、当業者においては、本発明に記載する検査を容易に行うことができる。上記表中に示した多型部位の塩基種は配列表に示した配列に対して相補鎖側にある塩基種を示している場合があるが、ｄｂＳＮＰおよびＪＳＮＰデータベースにて公開される前後配列を用いれば異同を確認する事は当業者にとって容易であり、検査を行うにあたってはプラス鎖とマイナス鎖のどちらを調べても必然的にもう一方の結果を決定する事ができる。
また、当業者においては、通常、本明細書において開示された多型に付与された登録ＩＤ番号、例えばｄｂＳＮＰデータベースにおけるｒｓ番号、ＪＳＮＰデータベースにおけるＩＭＳ−ＪＳＴ番号、ｓｓｊ番号によって、本発明の多型部位について実際のゲノム上の位置および前後の配列等を容易に知ることができる。これによって、知ることができない場合であっても、当業者においては、配列番号：１〜３０で示される塩基配列および多型部位等に関する情報から、適宜、該多型部位に相当する実際のゲノム上の位置を知ることは容易である。例えば、公開されているゲノムデータベース等と照会することにより、本発明の多型部位のゲノム上の位置を知ることができる。即ち、配列表に掲げた塩基配列とゲノム上の実際の塩基配列との間に若干の塩基配列の相違がみられた場合であっても、配列表に掲げた塩基配列を基にゲノム配列と相同検索等を行うことにより、本発明の多型部位について、実際のゲノム上の位置を正確に知ることが可能である。また、ゲノム上の位置が特定できない場合でも、本明細書に記載の配列表および多型部位の情報から本発明に記載する検査を行うことは容易である。
本発明の多型部位の前後の（５’側および３’側の）配列の一例として、一部の多型部位について、その前後の配列を以下の表３２および表３３に例示する。
2004084797.tif 000045
2004084797.tif 000046
本発明の検査方法においては、以下（１ｂ）〜（２９ｂ）のいずれかに記載の多型部位について塩基種の決定を行うことが好ましい。
（１ｂ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１４２５８位、または１９７６８位の部位
（２ｂ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、または１７８４８位の部位
（３ｂ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（４ｂ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（５ｂ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（６ｂ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（７ｂ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（８ｂ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（９ｂ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１７２８３位の部位
（１０ｂ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１１ｂ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１２ｂ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１１９９０位、または１６７７１位の部位
（１３ｂ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１８９５８位、または２１２１３位の部位
（１４ｂ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の部位
（１５ｂ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１６ｂ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１７ｂ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１８ｂ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（１９ｂ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２０ｂ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２１ｂ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２２ｂ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、または３７５８３位の部位
（２３ｂ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１８５６３位の部位
（２４ｂ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２５ｂ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、または１５４４８位の部位
（２６ｂ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における２００３１位の部位
（２７ｂ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２８ｂ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の部位
（２８ｂ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における１０００１位の部位
（２９ｂ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０５０３位の部位
また本発明の好ましい態様においては、上記（１ｂ）〜（２９ｂ）に記載の多型部位における塩基種がそれぞれ以下の（１ｃ）〜（２９ｃ）である場合に、２型糖尿病を罹患しているものと判定される。２型糖尿病に罹患していない被検者であっても２型糖尿病を発症する疑いがある、あるいは２型糖尿病に罹患し易いものと判定される。
（１ｃ）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１４２５８位の塩基種がＴ、または１９７６８位の塩基種がＴ
（２ｃ）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ、または１７８４８位の塩基種がＡ
（３ｃ）ＳＬＣ１Ａ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（４ｃ）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２４５７８位の塩基種がＡ
（５ｃ）ＦＡＢＰ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（６ｃ）ＺＮＦ２６３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：６に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（７ｃ）ＴＮＦＡ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（８ｃ）ＴＨＢＳ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：８に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＣ
（９ｃ）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１７２８３位の塩基種がＴ
（１０ｃ）ＳＥＲＰＩＮＢ１０遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（１１ｃ）ＡＬＤＯＢ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１１に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（１２ｃ）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１１９９０位の塩基種がＡ、または１６７７１位の塩基種がＣ
（１３ｃ）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１８９５８位の塩基種がＧ、または２１２１３位の塩基種がＣ
（１４ｃ）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の塩基種がＡ
（１５ｃ）ＳＥＲＰＩＮＡ３遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（１６ｃ）ＲＣＶ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１６に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（１７ｃ）ＴＦＲＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（１８ｃ）ＭＭＰ１９遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１８に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＡ
（１９ｃ）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（２０ｃ）ＶＬＤＬＲ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ
（２１ｃ）Ｐ２ＲＸ７遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２１に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＣ
（２２ｃ）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ、または３７５８３位の塩基種がＣ
（２３ｃ）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１８５６３位の塩基種がＧ
（２４ｃ）ＡＱＰ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２４に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２５ｃ）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＴ、１３１０３位の塩基種がＧ、または１５４４８位の塩基種がＧ
（２６ｃ）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における２００３１位の塩基種がＣ
（２７ｃ）ＲＧＳ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２７に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２８ｃ）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の塩基種がＧ
（２８ｃ−２）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：３０に記載の塩基配列における１０００１位の塩基種がＧ
（２９ｃ）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０５０３位の塩基種がＧ
本発明においては、上記多型部位以外であっても、該多型部位とその周辺のＤＮＡ領域は強く連鎖しているものと考えられることから、上記多型部位の近傍の多型部位について塩基種を決定することによっても、ＤＭの検査が可能である。即ち、多型部位の塩基種が上記（１ｃ）〜（２９ｃ）に記載の塩基種であるようなＤＭ患者を含むヒトの小集団について、この「近傍の多型部位」（例えば、表２〜３１に記載の多型部位）における塩基種を予め決定する。次いで、この「近傍の多型部位」について被検者における塩基種を決定し、予め決定された前記塩基種と比較することにより、２型糖尿病の検査を行うことができる。予め決定された塩基種と同一の塩基種である場合に、被検者は２型糖尿病を罹患し易い／しにくいと判定される。２型糖尿病にすでに罹患している被検者の場合には２型糖尿病を発症した原因や病型を判定することができ、治療方針の決定等に利用することができる。
以下、ＭＥＴ遺伝子の場合を例にとって説明する。まず、例えば、ＭＥＴ遺伝子上の配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位の多型部位の塩基種がＧであるＤＭ患者を含むヒトの小集団について、近傍の多型部位、例えば８２１４位の多型部位の塩基種を決定する。この部位の塩基種がＤＭ患者群においてＴであったとすると、被検者について８２１４位の多型部位の塩基種を調べ、この部位の塩基種が同様にＴであった場合には、被検者は２型糖尿病に罹患し易いものと判定される。
以上のように、本発明によりＤＭ関連遺伝子上の領域が明らかになった後には、当業者に過度の負担を強いる事なくＤＭに関する検査を行うことができる。
また、ヒトゲノムの解析が進み全塩基配列やＳＮＰ、マイクロサテライト、ＶＮＴＲ、ＲＦＬＰｓなどの多型情報も充実してきた。ゲノムの塩基配列について詳細が明らかになりつつある現在、最大の関心事は遺伝子あるいは特定の配列と機能（疾患・薬剤応答性などの表現型）との関連を解析する事である。特に糖尿病、高血圧等の生活習慣病では、複数の疾患感受性遺伝子と環境因子により発症するため解析は非常に困難である。これを解決するための有力な手法の一つが連鎖不平衡を用いた遺伝統計学的解析である。
ヒトの染色体は２本１組で存在し、それぞれ父親と母親から由来している。ハプロタイプとは、その一方に関する個体の遺伝子型の組み合わせをいい、それぞれ父母由来の１本の染色体上に遺伝子座がどのように並んでいるかを示すものである。染色体を父母から１本ずつ受け継ぐので、配偶子形成の際に組み換えが起きないとすれば１本の染色体上にのっている遺伝子は必ず一緒に子に伝えられる、すなわち連鎖する事になる。しかし、実際は減数分裂の際に組み換えが起きるため、１本の染色体上にのっている遺伝子であっても必ずしも連鎖しているわけではない。しかし逆に、遺伝的組み換えが起きた場合であっても同一染色体上の距離が近い遺伝子座は強く連鎖する。
このような現象を集団において観察し、アリルの非独立が認められる事を連鎖不平衡という。例えば、３つの遺伝子座を観察した場合、これらの間に連鎖不平衡がないとすると存在するハプロタイプは２３通りと予測され、それぞれの頻度は各遺伝子座の頻度から予測される値となるが、連鎖不平衡がある場合には２３通りより少ないハプロタイプしか存在せず、その頻度も予測と異なる値を示す結果となる。
近年、ハプロタイプが連鎖不平衡解析に有用である事が示されており（Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ  ２３：２２１−２３３）研究が行われているが、ゲノム上には組換えが起きやすい部位と起きにくい部位があり、１つの領域として先祖から子孫へと伝えられる部分（ハプロタイプ）は人種を越えて共通性がある事が明らかになっている（Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２２６，５５７６：２２２５−２２２９）。
つまり、２型糖尿病と関連するハプロタイプが見出されれば、該ハプロタイプを検出することにより、２型糖尿病の検査が可能となる。本発明者らは、鋭意研究により、２型糖尿病と関連するハプロタイプを見出すことに成功した。
従って、本発明は、以下の（１）〜（１４）のいずれかに記載の遺伝子および／または該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域に存在する２型糖尿病と関連するハプロタイプを検出することを特徴とする、２型糖尿病の検査方法を提供する。
（１）ＭＥＴ、（２）ＮＰＨＳ１、（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２、（４）ＡＢＣＡ１、（５）ＣＴＳＤ、（６）ＳＴＥ、（７）ＡＢＣＣ８、（８）ＭＹＬ２、（９）ＤＬＧ５、（１０）ＬＤＬＣ、（１１）ＬＡＲＧＥ、（１２）ＢＬＺＦ１、（１３）ＦＲＡＰ１、（１４）ＬＥＰ
本方法においては、被検者について、「２型糖尿病と関連するハプロタイプ」が検出された場合に、２型糖尿病を罹患し易い／しにくいものと判定される。２型糖尿病にすでに罹患している被検者の場合には、発症した原因および病型を判定することができ、治療方針の決定等に利用するとができる。
上記「２型糖尿病と関連するハプロタイプ」とは、具体的には、以下のようなハプロタイプを示すことができる。なお、「感受性（ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｌｅ）」とは２型糖尿病に罹患し易い、「抵抗性（ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ）」とは２型糖尿病に罹患しにくいことを指す。
（１’）ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｔ、およびＴであるハプロタイプ、
ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれ、Ｇ、Ｃ、およびＣであるハプロタイプ、または、
ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１９７６８位および２４２０９位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプ
より詳しくは、ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、および１９７６８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｔ、およびＴであるハプロタイプは２型糖尿病感受性であり、該塩基種がそれぞれＧ、Ｃ、およびＣであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。また、ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１９７６８位および２４２０９位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（２’）ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｃ、およびＡであるハプロタイプ、
ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｇ、およびＧであるハプロタイプ、または、
ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｃ、およびＧであるハプロタイプ
より詳しくは、ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位、および１７８４８位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｇ、およびＧであるハプロタイプは２型糖尿病感受性であり、該塩基種がＧ、Ｃ、およびＧであるハプロタイプは２型糖尿病感受性であり、該塩基種がＡ、Ｃ、およびＡであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。
（３’）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＡであるハプロタイプ、または
ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＴおよびＴであるハプロタイプ
より詳しくは、ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、および２４５７８位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＡであるハプロタイプは２型糖尿病感受性であり、該塩基種がＴおよびＴであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。
（４’）ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、および２８５６４位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ａ、Ｃ、Ｔ、およびＧであるハプロタイプ、または
ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＣであるハプロタイプ
より詳しくは、ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、および２８５６４位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ａ、Ｃ、Ｔ、およびＧであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性であり、ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＣであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（５’）ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、および１６７７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプ
より詳しくは、ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、および１６７７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。
（６’）ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、および２０９７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｇ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプ、または
ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における２０９７１位、および２１２１３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＣであるハプロタイプ
より詳しくは、ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、および２０９７１位の多型部位の塩基種が、それぞれＡ、Ｇ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。また、ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における２０９７１位、および２１２１３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣおよびＣであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（７’）ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の多型部位の塩基種がＡであるハプロタイプ
より詳しくは、ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１４４７５位の多型部位の塩基種がＡであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（８’）ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、および８３５００位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプ
より詳しくは、ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、および８３５００位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｔ、Ｔ、およびＣであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（９’）ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧ、Ｃ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプ
ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプ、または
ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプ
より詳しくは、ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２４０１６位、２９４６９位、および３７５８３位の多型部位の塩基種が、それぞれＣ、Ｇ、およびＣであるハプロタイプは２型糖尿病感受性であり、該塩基種がそれぞれＣ、Ｇ、およびＴであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。
（１０’）ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプ、または
ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＧであるハプロタイプ
より詳しくは、ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、および１８５６３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＧであるハプロタイプは２型糖尿病感受性であり、該塩基種がそれぞれＧおよびＡであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。
（１１’）ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、および４３２４０位の多型部位の塩基種が、それぞれＴ、Ｇ、Ｇ、Ｔ、およびＡであるハプロタイプ
より詳しくは、ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、および４３２４０位の多型部位の塩基種が、それぞれＴ、Ｇ、Ｇ、Ｔ、およびＡであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（１２’）ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位および２００３１位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＴであるハプロタイプ
より詳しくは、ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位および２００３１位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＴであるハプロタイプは２型糖尿病抵抗性である。
（１３’）ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の多型部位の塩基種がＧであるハプロタイプ
より詳しくは、ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１７０２０位の多型部位の塩基種がＧであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
（１４’）ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位および１０５０３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプ
より詳しくは、ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位および１０５０３位の多型部位の塩基種が、それぞれＧおよびＡであるハプロタイプは２型糖尿病感受性である。
上記方法の好ましい態様においては、以下の工程（ａ）および（ｂ）を含む、２型糖尿病の検査方法である。
（ａ）  被検者における上記（１）〜（１４）のいずれかに記載の遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の多型部位について、塩基種を決定する工程、
（ｂ）  工程（ａ）により決定された塩基種を、上記（１’）〜（１４’）のいずれかに記載のハプロタイプを示す前記遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域における多型部位の塩基種と、比較する工程
上記工程（ａ）における多型部位としては、好ましくは、以下の多型部位を示すことができる。
（１）ＭＥＴ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における７６５位、１３８３位、１８９０位、２０９９位、２８１４位、３２９３位、３７５２位、３７７４位、３９２７位、４６９０位、７４１９位、８２１４位、１０００１位、１０３１８位、１３７６６位、１３９８９位、１４２５８位、１５４２７位、１６２７５位、１６５９７位、１６９３２位、１９７６８位、１９８３５位、２００３２位、２０２４０位、２０５３７位、２０８８５位、２１５４６位、２４２０９位、２４２７１位、２４３７６位、２４６４２位、２６０２８位、２６２２６位、または３４２０９位のいずれかの多型部位
（２）ＮＰＨＳ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１７２位、１８６位、２１１位、２５５４位、２５５８位、１０００１位、１００６７位、１０１７６位、１１８４０位、１３７５９位、１４６４５位、１４９６７位、１６１９８位、１６４３９位、１７６３５位、１７６８５位、１７７９４位、１７８０５位、１７８４８位、１７８４９位、１８４９１位、１９９５５位、２００８８位、２０６１３位、２１５３３位、２１５８２位、２１８１１位、２１８１２位、２２１９０位、２２９６５位、２２９８２位、２３６６０位、２３７８０位、２４０４０位、２４１７２位、２５３３４位、または２６５８５位のいずれかの多型部位
（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における２８５３位、２８９１、５２１８位、５３１７位、７５６０位、８０５４位、８７７１位、１０００１位、１０３２９位、１１７８１位、１２０６３位、１２７０５位、１３１２５位、１３６９１位、１３９１３位、１３９１６位、１３９１７位、１４１２３位、１４１６９位、１４４５３位、１４４５６位、１４４８３位、１６５２６位、１６５５６位、１７６４３位、１７７２５位、１７８２４位、１８０７６位、１８２２７位、１８５００位、１８６８７位、１８７４１位、１８７４４位、１８８７５位、１９０４５位、１９１４１位、１９１４９位、１９１９０位、１９４２９位、１９５４８位、１９５６７位、１９６２４位、１９６４５位、１９８１４位、２００４９位、２００８２位、２００９７位、２０２４３位、２２１２２位、２２４９５位、２２５１６位、２２６９１位、２２８１６位、２３００７位、２３９０４位、２４００５位、２４４１８位、２４５７８位、２４８５５位、２４８８５位、２５５０５位、２５５３８位、２５５６４位、２５５８６位、２６０１７位、２６２３４位、２６５５７位、２６６２１位、３０１５５位、３０２６７位、または３０６０７位のいずれかの多型部位
（４）ＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における９９３位、１７７９位、１８１３位、３４５０位、４２８７位、４３８２位、７２７０位、７５２８位、８３８３位、８７８３位、８７９８位、９２５４位、１０００１位、１０９９９位、１１１２２位、１１７２０位、１２４７３位、１２５６０位、１２５９１位、１２６６４位、１２９１６位、１３４０３位、１３６０５位、１３６９１位、１４４５７位、１４７３７位、１５２７８位、１５３４５位、１５３４５位、１５６３６位、１５６３６位、１５８２４位、１６７９３位、１７０２２位、１７０３７位、１７２８３位、１７５７６位、１８１６７位、１８６１９位、１８６３２位、１８８４２位、１８８４３位、１８９２６位、１９４０４位、１９４０４位、１９８０９位、２０４４７位、２０５１４位、２０５１５位、２１９６３位、２２９８８位、２３０８１位、２３１５７位、２３５７７位、２３９５３位、２４３８９位、２５８１４位、２６１９８位、２６６５５位、２６９０２位、２７３６７位、２７５３５位、２７７０１位、２８１７５位、２８４６７位、２８５６４位、２８６６９位、２８７７４位、２８８３９位、２８９３７位、２８９４４位、２９０３７位、３００９１位、３０６１３位、３０９７５位、３２８０３位、３２８０３位、３３４３５位、３４２６３位、３４２６４位、３４８１２位、３５３０６位、３５３３９位、３５４７３位、３６２１７位、３７５９６位、または３７８５５位のいずれかの多型部位、またはＡＢＣＡ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１２０６位、１９０５位、１９７９位、２００８位、２０５４位、２２８６位、２３０３位、２８０８位、３１７６位、３４１３位、３４１５位、３５４８位、３６６９位、３７５６位、３９８３位、４５２１位、４５４４位、４５７７位、４６０９位、５２２６位、５８３３位、５８６８位、６４２２位、６５３２位、６５８３位、６６９６位、７０４３位、７１９８位、７３２４位、７３９５位、７４８４位、７７１６位、７７８７位、８１９７位、８３５０位、９５４１位、９６４３位、９７９３位、１０００１位、１０３４８位、１０４１５位、１０７４１位、１０８２６位、１１０００位、１１０２４位、１１１２９位、１１１８５位、１１２８６位、１１４５２位、１１４７１位、１１６５３位、１１７４６位、１１８５８位、１２１１４位、１２２２５位、１２５２０位、１２７２５位、１２８９６位、１２８９９位、１２９０５位、１３１１８位、１３４９２位、１３５８９位、１３８３６位、１４２２６位、１４３９１位、１４４８９位、１４５３６位、１４８１３位、１５０７１位、１５２１５位、１５３７７位、１５３９９位、１５６４４位、１５６８７位、１５８３０位、１６１０３位、１６１１２位、１６１３９位、１６７５４位、１７３０３位、１８２３７位、１８３７９位、１８６１８位、１８９０３位、１８９２１位、１９０１４位、１９０３４位、１９０７４位、１９１４９位、１９１６５位、１９１６７位、１９３６５位、１９３７３位、１９３７６位、１９３８６位、１９４８７位または１９６５９位のいずれかの多型部位
（５）ＣＴＳＤ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における８１３位、８１５位、８４４位、８６１位、９５４位、１０２６位、１１５９位、１２９９位、５４６４位、５６００位、７１４４位、７７０７位、７７２６位、７７３９位、７７７８位、７８０３位、７８４１位、７８４２位、７８８６位、７９３９位、７９６３位、８０５８位、８３３３位、９９４８位、１０００１位、１１９９０位、１２３４２位、１２８０７位、１６２６６位、または１６７７１位のいずれかの多型部位
（６）ＳＴＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における５７位、４６８位、１８８１位、２９５５位、３４６０位、３９７６位、４５３７位、４５３８位、４７２２位、４８６７位、４８７３位、４９４７位、５０２５位、７０４３位、７６７６位、８５８１位、９０３５位、９３４７位、９６８６位、９８８２位、９８９４位、１０００１位、１０００３位、１２１４２位、１３５２０位、１３５５１位、１３７９７位、１４４９２位、１４７５３位、１４９３３位、１５６８４位、１７０２２位、１８２６４位、１８５６８位、１８９５８位、１９１９４位、１９３３０位、１９３５４位、１９３５５位、１９５６７位、１９７８５位、２０５１１位、２０６１２位、２０６２７位、２０９３６位、２０９６１位、２０９７１位、２１２１３位、２１３３６位、２１６０９位、２１９１４位、または２１９８３位のいずれかの多型部位
（７）ＡＢＣＣ８遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における６９７８位、７３５８位、７３５９位、７６４９位、７７５５位、８０６８位、８２１４位、８２１５位、８３０８位、９６５８位、９７６１位、９８１１位、９８２８位、１０００１位、１００９５位、１０１２５位、１１６５８位、１１６７４位、１１７０８位、１１７６７位、１１８８３位、１１９９８位、１２１０９位、１２３０８位、１３６２０位、１３６６４位、１３９１２位、１４２９７位、１４３０９位、１４３２０位、１４３２３位、１４３６７位、１４３９３位、１４４７５位、１４５９１位、１４７２２位、１５２９４位、１５６０１位、１５６５７位、１６１６０位、１６２３０位、１６３６７位、１６４１７位、１７６９５位、１８２１３位、１８８１５位、１９０９３位、２００８２位、２０２１１位、２０４６１位、２１５４７位、２１９９５位、２２８２５位、または２３９０１位のいずれかの多型部位
（８）ＭＹＬ２遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における３１４７位、３２１３位、４６８６位、７３４３位、７８９２位、１０００１位、１０１２３位、１１２６４位、１１９９２位、１５５３２位、１５６８１位、１５９５７位、１５９８８位、１６６４１位、１８３８６位、１８７８２位、２０３５４位、２１５３１位、２３２４５位、２７７４０位、３０６６９位、３０６７０位、３２０７７位、３２７３２位、３２９０７位、３２９５５位、４２５８９位、４３０２９位、４７３５４位、６４７７７位、７１８６９位、７１９６１位、７４２７４位、７５５５１位、７６３４３位、７６３４４位、７８２７０位、７８３３９位、７８６８９位、７８７４３位、７８８０６位、７８８０７位、７９２１５位、７９３１９位、７９３５７位、７９４６０位、７９４６３位、８００３４位、８００６２位、８００７６位、８０４０１位、８０４７５位、８０５９９位、８０７１５位、８０８６５位、８０９４３位、８０９５２位、８０９７４位、８０９９１位、８１１３０位、８１３７３位、８１４２８位、８１５４３位、８１６８２位、８２４２２位、８２５４５位、８２７９２位、８２９３８位、８３２６５位、８３２６６位、８３３９４位、８３４６３位、８３５００位、８３５７８位、８３６１２位、８３６５０位、８４７９０位、８４９２１位、８４９４５位、８５２１４位、８５３８３位、８５３８４位、８５５５０位、８５９８４位、８６１０９位、８６５３９位、８６５４２位、８７１６９位、８７１７０位、８７３５３位、８７６７１位、８７９５３位、８７９５４位、８８０５７位、８８１７８位、８８２４０位、８８２５８位、８８２７１位、８８２７２位、８８３０７位、８８５１２位、８８６９５位、８８７７８位、８８７９８位、８９１２４位、または９１０８１位のいずれかの多型部位
（９）ＤＬＧ５遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における２位、１２１位、１４３８位、１６６９位、２１８０位、２４３６位、２５４３位、２６１９位、３７１５位、３７２７位、５２５６位、５３３５位、５３３９位、５６８８位、５７５２位、６３０４位、６６２７位、７１９５位、７３４２位、７６０３位、８２７３位、８９０５位、８９８８位、９０１３位、９０５７位、１０００１位、１０３７２位、１０４５３位、１０４６８位、１０４６８位、１０５１２位、１１０３８位、１１０５５位、１１５９７位、１１６８１位、１１７１９位、１１９２２位、１２０３４位、１２０４９位、１２１７６位、１２５５４位、１３４８１位、１３８６４位、１４３９０位、１５０４４位、１５５９８位、１６１７６位、１６８７０位、１７４７５位、１７７４９位、１８０７７位、１８５８５位、１８６１９位、１８６７７位、１９２２２位、１９７３１位、１９７５０位、２０７５８位、２０９６２位、２１０７３位、２１６８０位、２１８６７位、２２３８５位、２２８７４位、２３１９１位、２４０１６位、２４５２０位、２４９９３位、２５４６０位、２６１５５位、２６８０４位、２６９８０位、２７９８８位、２９２３４位、２９４６９位、３０２５４位、３０７４２位、３０７４２位、３０７５６位、３０７５６位、３１６７１位、３１８７４位、３１９４０位、３２６２６位、３３３９３位、３３５８１位、３４２４０位、３５２９４位、３５６６６位、３６５８７位、３６６５３位、３６９４１位、３７４０８位、３７５８３位、３７６１２位、３８４６２位、３８４７０位、３８４８５位、３９０６５位、３９１４６位、４０６１２位、４０６４１位、４１２４２位、４２２１７位、４２５３９位、４５９３４位、４６０３３位、または４６８９５位のいずれかの多型部位
（１０）ＬＤＬＣ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１５８０位、１７５４位、１８８２位、３０６２位、３５０７位、４８００位、４９０５位、５５６９位、５６０８位、５６４３位、５６６５位、５６９３位、５８６４位、５８８４位、５９８１位、６１６９位、６８０８位、６８５８位、７１９４位、７２８３位、７７２８位、７８３５位、８０４９位、８０４９位、８２６５位、９２０９位、９４４５位、９６４６位、９６４７位、９７１６位、９７７５位、１０００１位、１００２９位、１００５４位、１０１９３位、１０２０８位、１０８２６位、１０９０８位、１０９９７位、１１３３６位、１１７５４位、１１８９５位、１２０３１位、１２３２７位、１２４６４位、１２５６１位、１４０５１位、１５３６６位、１５７７８位、１７７２３位、１７７７２位、１７７８３位、１７８１１位、１７８１５位、１７８６２位、１７９００位、１７９６２位、１８１８４位、１８１８９位、１８２９７位、１８４１１位、１８５１２位、１８５６３位、１９１２５位、１９１５２位、２００９２位、２１２２７位、２１５０６位、２１６１７位、２１８５５位、２３０９０位、２５７００位、２６４６８位、２６６３８位、２７６８２位、２７７５５位、２７８８８位、２７９７３位、２７９９５位、２８１２３位、２８１２７位、２８１４４位、２８１５３位、または２８２７１位のいずれかの多型部位
（１１）ＬＡＲＧＥ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１８１６位、３１１６位、３１１７位、３１１８位、３１５４位、３１５７位、３１９１位、３１９７位、３２０５位、３２９１位、３６２２位、３６５２位、３７９２位、４４８８位、５０７６位、５４７４位、５４８１位、５４９２位、５５０３位、５６５４位、５６７２位、６５６３位、６８４３位、６９０８位、７１１９位、７５３８位、７５３８位、７７２１位、８４０３位、８６２６位、１０００１位、１２６３６位、１３１０３位、１４７９４位、１５３７０位、１５４４８位、１５５９９位、１５７６４位、１６０４５位、１６２６１位、１６２７７位、１６８６１位、１７３６０位、１７６１１位、１７７１４位、１７８０９位、１８２２１位、１８２２１位、１８３７６位、１８５３６位、１９０６３位、２２９４２位、２３４０４位、２３６１２位、２５１２５位、２５１３４位、２５６６２位、２５７０５位、２５７５１位、２７４０７位、２８１６６位、２８５６７位、３０３０２位、３０３１６位、３０３５３位、３０３５４位、３０３９１位、３３５９４位、３３６５０位、３３７５４位、３６６９０位、３７７５３位、３７８９５位、３７９００位、３９１０４位、３９７４５位、４１４０４位、４１６４６位、４１７１１位、４２０２０位、４２０８０位、４２９７４位、４３０５２位、４３２４０位、４３６２１位、４４７３４位、４４９５８位、４６９２０位、４７４３１位、４７５７３位、４８１０１位、４８１２７位、４８３０６位、４８８０７位、４９０４９位、４９８４８位、４９８６０位、４９９０３位、５０１１４位、５０２２３位、５２０５７位、５２５４３位、５２６９３位、または５３０６１位のいずれかの多型部位
（１２）ＢＬＺＦ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１２８３位、４２８８位、７５２０位、７５９９位、７７４０位、８７４５位、９０５０位、９８６２位、１０００１位、１０１２４位、１０１６８位、１０３３９位、１１０１７位、１３７３６位、１３７４７位、１８３５４位、２００３１位、２０１７２位、２２０９４位、２４０８２位、２４３０５位、２４４７８位、２４５５２位、２５２７３位、２５３５１位、２９０９６位、２９１００位、２９７６４位のいずれかの多型部位
（１３）ＦＲＡＰ１遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における３４５５位、７８２６位、８７１５位、８７８３位、９０４２位、９３９０位、９４６２位、９７０９位、１０００１位、１０６３５位、１０７４８位、１２７９４位、１２８４９位、１２９１５位、１３１６９位、１７０２０位、１８５８６位、２１１２３位、または２１１２８位のいずれかの多型部位
（１４）ＬＥＰ遺伝子もしくは該遺伝子の近傍ＤＮＡ領域上の部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における２４４位、５７５位、６７５位、１４８７位、１６４４位、２３４３位、２７１５位、２７６３位、３０９８位、３５８９位、３８８０位、５７８７位、５８６５位、６４３６位、７３９２位、７９９５位、８１６１位、８５４４位、９２３０位、９７９５位、１０００１位、１０１９９位、１０５０３位、１１９７５位、１４９８１位、１５６８１位、または１９３００位のいずれかの多型部位
さらに好ましくは、上記工程（ａ）の多型部位として、以下の多型部位を示すことができる。
（１）ＭＥＴ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１に記載の塩基配列における１０００１位、１４２５８位、１９７６８位、または２４２０９位の多型部位
（２）ＮＰＨＳ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２に記載の塩基配列における１０００１位、１６１９８位または１７８４８位の多型部位
（３）ＳＥＲＰＩＮＢ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：４に記載の塩基配列における１０００１位、または２４５７８位の多型部位
（４）ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：９に記載の塩基配列における１０００１位、１５８２４位、１７２８３位、２０５１５位、または２８５６４位の多型部位、または
ＡＢＣＡ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：７１に記載の塩基配列における１０００１位および１１０００位の多型部位
（５）ＣＴＳＤ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１２に記載の塩基配列における１０００１位、１１９９０位、または１６７７１位の多型部位
（６）ＳＴＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１３に記載の塩基配列における１０００１位、１８９５８位、１９３５４位、１９５６７位、２０９７１位、または２１２１３位の多型部位
（７）ＡＢＣＣ８遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１４に記載の塩基配列における１０００１位、または１４４７５位の多型部位
（８）ＭＹＬ２遺伝子上の多型部位であって、配列番号：１９に記載の塩基配列における１０００１位、１８３８６位、４２５８９位、または８３５００位の多型部位
（９）ＤＬＧ５遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２２に記載の塩基配列における１０００１位、２４０１６位、２９４６９位、または３７５８３位の多型部位
（１０）ＬＤＬＣ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２３に記載の塩基配列における１０００１位、または１８５６３位の多型部位
（１１）ＬＡＲＧＥ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２５に記載の塩基配列における１０００１位、１３１０３位、１５４４８位、３６６９０位、または４３２４０位の多型部位
（１２）ＢＬＺＦ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２６に記載の塩基配列における１０００１位、または２００３１位の多型部位
（１３）ＦＲＡＰ１遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２８に記載の塩基配列における１０００１位または１７０２０位の多型部位
（１４）ＬＥＰ遺伝子上の多型部位であって、配列番号：２９に記載の塩基配列における１０００１位、または１０５０３位の多型部位
本発明の多型部位における塩基種の決定は、当業者においては種々の方法によって行うことができる。一例を示せば、本発明の多型部位を含むＤＮＡの塩基配列を直接決定することによって行うことができる。この方法においては、まず、被検者からＤＮＡ試料を調製する。本発明においてＤＮＡ試料は、例えば被検者の血液、皮膚、口腔粘膜、手術により採取あるいは切除した組織または細胞、検査等の目的で採取された体液等から抽出した染色体ＤＮＡ、あるいはＲＮＡを基に調製することができる。
本方法においては、次いで、本発明の多型部位を含むＤＮＡを単離する。該ＤＮＡの単離は、本発明の多型部位を含むＤＮＡにハイブリダイズするプライマーを用いて、染色体ＤＮＡ、あるいはＲＮＡを鋳型としたＰＣＲ等によって行うことも可能である。
本方法においては、次いで、単離したＤＮＡの塩基配列を決定する。単離したＤＮＡの塩基配列の決定は、当業者においては、ＤＮＡシークエンサー等を用いて容易に実施することができる。
本発明の多型部位は、通常、その部位の塩基種のバリエーションが既に明らかになっている。本発明における「塩基種の決定」とは、必ずしもその多型部位についてＡ、Ｇ、Ｔ、Ｃのいずれかの塩基種であるかを判別することを意味するものではない。例えば、ある多型部位について塩基種のバリエーションがＡまたはＧであることが判明している場合には、その部位の塩基種が「Ａでない」もしくは「Ｇでない」ことが判明すれば充分である。
予め塩基のバリエーションが明らかにされている多型部位について、その塩基種を決定するための様々な方法が公知である。本発明の塩基種の決定のための方法は、特に限定されない。例えば、ＰＣＲ法を応用した解析方法として、ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲ法、Ａｃｙｃｌｏ  Ｐｒｉｍｅ法、およびＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法等が実用化されている。またＰＣＲに依存しない塩基種の決定法としてＩｎｖａｄｅｒ法やＲＣＡ法が知られている。更にＤＮＡアレイを使って塩基種を決定することもできる。以下にこれらの方法について簡単に述べる。ここに述べた方法は、いずれも本発明における多型部位の塩基種の決定に応用できる。
［ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲ法］
ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲ法の原理は次のとおりである。ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲ法は、アレルを含む領域を増幅することができるプライマーセットと、ＴａｑＭａｎプローブを利用した解析方法である。ＴａｑＭａｎプローブは、このプライマーセットによって増幅されるアレルを含む領域にハイブリダイズするように設計される。
ＴａｑＭａｎプローブのＴｍに近い条件で標的塩基配列にハイブリダイズさせれば、１塩基の相違によってＴａｑＭａｎプローブのハイブリダイズ効率は著しく低下する。ＴａｑＭａｎプローブの存在下でＰＣＲ法を行うと、プライマーからの伸長反応は、いずれハイブリダイズしたＴａｑＭａｎプローブに到達する。このときＤＮＡポリメラーゼの５’−３’エキソヌクレアーゼ活性によって、ＴａｑＭａｎプローブはその５’末端から分解される。ＴａｑＭａｎプローブをレポーター色素とクエンチャーで標識しておけば、ＴａｑＭａｎプローブの分解を、蛍光シグナルの変化として追跡することができる。つまり、ＴａｑＭａｎプローブの分解が起きれば、レポーター色素が遊離してクエンチャーとの距離が離れることによって蛍光シグナルが生成する。１塩基の相違のためにＴａｑＭａｎプローブのハイブリダイズが低下すればＴａｑＭａｎプローブの分解が進まず蛍光シグナルは生成されない。
多型に対応するＴａｑＭａｎプローブをデザインし、更に各プローブの分解によって異なるシグナルが生成されるようにすれば、同時に塩基種の判定を行うこともできる。例えば、レポーター色素として、あるアレルのアレルＡのＴａｑＭａｎプローブに６−ｃａｒｂｏｘｙ−ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｉｎ（ＦＡＭ）を、アレルＢのプローブにＶＩＣを用いる。プローブが分解されない状態では、クエンチャーによってレポーター色素の蛍光シグナル生成は抑制されている。各プローブが対応するアレルにハイブリダイズすれば、ハイブリダイズに応じた蛍光シグナルが観察される。すなわち、ＦＡＭまたはＶＩＣのいずれかのシグナルが他方よりも強い場合には、アレルＡまたはアレルＢのホモであることが判明する。他方、アレルをヘテロで有する場合には、両者のシグナルがほぼ同じレベルで検出されることになる。ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲ法の利用によって、ゲル上での分離のような時間のかかる工程無しで、ゲノムを解析対象としてＰＣＲと塩基種の決定を同時に行うことができる。そのため、ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲ法は、多くの被検者についての塩基種を決定できる方法として有用である。
［Ａｃｙｃｌｏ  Ｐｒｉｍｅ法］
ＰＣＲ法を利用した塩基種を決定する方法として、Ａｃｙｃｌｏ  Ｐｒｉｍｅ法も実用化されている。Ａｃｙｃｌｏ  Ｐｒｉｍｅ法では、ゲノム増幅用のプライマー１組と、多型検出用の１つのプライマーを用いる。まず、ゲノムの多型部位を含む領域をＰＣＲで増幅する。この工程は、通常のゲノムＰＣＲと同じである。次に、得られたＰＣＲ産物に対して、多型検出用のプライマーをアニールさせ、伸長反応を行う。多型検出用のプライマーは、検出対象となっている多型部位に隣接する領域にアニールするようにデザインされている。
このとき、伸長反応のためのヌクレオチド基質として、蛍光偏光色素でラベルし、かつ３’−ＯＨをブロックしたヌクレオチド誘導体（ターミネータ）を用いる。その結果、多型部位に相当する位置の塩基に相補的な塩基が１塩基だけ取りこまれて伸長反応が停止する。ヌクレオチド誘導体のプライマーへの取りこみは、分子量の増大による蛍光偏光（Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ  ｐｏｌａｒｉｚａｔｉｏｎ；ＦＰ）の増加によって検出することができる。蛍光偏光色素に波長の異なる２種類のラベルを用いれば、特定のＳＮＰｓが２種類の塩基のうちのいずれであるのかを特定することができる。蛍光偏光のレベルは定量することができるので、１度の解析でアレルがホモかヘテロかを判定することもできる。
［ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ法］
ＰＣＲ産物をＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳで解析することによって塩基種の決定を行うこともできる。ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳは、分子量をきわめて正確に知ることができるため、タンパク質のアミノ酸配列や、ＤＮＡの塩基配列のわずかな相違を明瞭に識別することができる解析手法として様々な分野で利用されている。ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳによる塩基種の決定のためには、まず解析対象であるアレルを含む領域をＰＣＲで増幅する。次いで増幅産物を単離してＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳによってその分子量を測定する。アレルの塩基配列は予めわかっているので、分子量に基づいて増幅産物の塩基配列は一義的に決定される。
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳを利用した塩基種の決定には、ＰＣＲ産物の分離工程などが必要となる。しかし標識プライマーや標識プローブを使わないで、正確な塩基種の決定が期待できる。また複数の場所の多型の同時検出にも応用することができる。
［ＩＩｓ型制限酵素を利用したＳＮＰｓ特異的な標識方法］
ＰＣＲ法を利用した更に高速な塩基種の決定が可能な方法も報告されている。例えば、ＩＩｓ型制限酵素を利用して多型部位の塩基種の決定が行われている。この方法においては、ＰＣＲにあたり、ＩＩｓ型制限酵素の認識配列を有するプライマーが用いられる。遺伝子組み換えに利用される一般的な制限酵素（ＩＩ型）は、特定の塩基配列を認識して、その塩基配列中の特定部位を切断する。これに対してＩＩｓ型の制限酵素は、特定の塩基配列を認識して、認識塩基配列から離れた部位を切断する。酵素によって、認識配列と切断個所の間の塩基数は決まっている。従って、この塩基数の分だけ離れた位置にＩＩｓ型制限酵素の認識配列を含むプライマーがアニールするようにすれば、ＩＩｓ型制限酵素によってちょうど多型部位で増幅産物を切断することができる。
ＩＩｓ型制限酵素で切断された増幅産物の末端には、ＳＮＰｓの塩基を含む付着末端（ｃｏｎｈｅｓｉｖｅ  ｅｎｄ）が形成される。ここで、増幅産物の付着末端に対応する塩基配列からなるアダプターをライゲーションする。アダプターは、多型変異に対応する塩基を含む異なる塩基配列からなり、それぞれ異なる蛍光色素で標識しておくことができる。最終的に、増幅産物は多型部位の塩基に対応する蛍光色素で標識される。
前記ＩＩｓ型制限酵素認識配列を含むプライマーに、捕捉プライマー（ｃａｐｔｕｒｅ  ｐｒｉｍｅｒ）を組み合せてＰＣＲ法を行えば、増幅産物は蛍光標識されるとともに、捕捉プライマーを利用して固相化することができる。例えばビオチン標識プライマーを捕捉プライマーとして用いれば、増幅産物はアビジン結合ビーズに捕捉することができる。こうして捕捉された増幅産物の蛍光色素を追跡することにより、塩基種を決定することができる。
［磁気蛍光ビーズを使った多型部位における塩基種の決定］
複数のアレルを単一の反応系で並行して解析することができる技術も公知である。複数のアレルを並行して解析することは、多重化と呼ばれている。一般に蛍光シグナルを利用したタイピング方法では、多重化のために異なる蛍光波長を有する蛍光成分が必要である。しかし実際の解析に利用することができる蛍光成分は、それほど多くない。これに対して、樹脂等に複数種の蛍光成分を混合した場合には、限られた種類の蛍光成分であっても、相互に識別可能な多様な蛍光シグナルを得ることができる。更に、樹脂中に磁気で吸着される成分を加えれば蛍光を発するとともに、磁気によって分離可能なビーズとすることができる。このような磁気蛍光ビーズを利用した、多重化多型タイピングが考え出された（バイオサイエンスとバイオインダストリー，Ｖｏｌ．６０  Ｎｏ．１２，８２１−８２４）。
磁気蛍光ビーズを利用した多重化多型タイピングにおいては、各アレルの多型部位に相補的な塩基を末端に有するプローブが磁気蛍光ビーズに固定化される。各アレルにそれぞれ固有の蛍光シグナルを有する磁気蛍光ビーズが対応するように、両者は組み合せられる。一方、磁気蛍光ビーズに固定されたプローブが相補配列にハイブリダイズしたときに、当該アレル上で隣接する領域に相補的な塩基配列を有する蛍光標識オリゴＤＮＡを調製する。
アレルを含む領域を非対称ＰＣＲによって増幅し、上記の磁気蛍光ビーズ固定化プローブと蛍光標識オリゴＤＮＡをハイブリダイズさせ、更に両者をライゲーションする。磁気蛍光ビーズ固定化プローブの末端が、多型部位の塩基に相補的な塩基配列であった場合には効率的にライゲーションされる。逆にもしも多型のために末端の塩基が異なれば、両者のライゲーション効率は低下する。その結果、各磁気蛍光ビーズには、試料が当該磁気蛍光ビーズに相補的な塩基種であった場合に限り、蛍光標識オリゴＤＮＡが結合する。
磁気によって磁気蛍光ビーズを回収し、更に各磁気蛍光ビーズ上の蛍光標識オリゴＤＮＡの存在を検出することにより、塩基種が決定される。磁気蛍光ビーズは、フローサイトメーターでビーズ毎に蛍光シグナルを解析できるので、多種類の磁気蛍光ビーズが混合されていてもシグナルの分離は容易である。つまり、多種類の多型部位について、単一の反応容器で並行して解析する「多重化」が達成される。
［Ｉｎｖａｄｅｒ法］
ＰＣＲ法に依存しないジェノタイピングのための方法も実用化されている。例えば、Ｉｎｖａｄｅｒ法では、アレルプローブ、インベーダープローブ、およびＦＲＥＴプローブの３種類のオリゴヌクレオチドと、ｃｌｅａｖａｓｅと呼ばれる特殊なヌクレアーゼのみで、塩基種の決定を実現している。これらのプローブのうち標識が必要なのはＦＲＥＴプローブのみである。
アレルプローブは、検出すべきアレルに隣接する領域にハイブリダイズするようにデザインされる。アレルプローブの５’側には、ハイブリダイズに無関係な塩基配列からなるフラップが連結されている。アレルプローブは多型部位の３’側にハイブリダイズし、多型部位の上でフラップに連結する構造を有する。
一方インベーダープローブは、多型部位の５’側にハイブリダイズする塩基配列からなっている。インベーダープローブの塩基配列は、ハイブリダイズによって３’末端が多型部位に相当するようにデザインされている。インベーダープローブにおける多型部位に相当する位置の塩基は任意で良い。つまり、多型部位を挟んでインベーダープローブとアレルプローブとが隣接してハイブリダイズするように両者の塩基配列はデザインされている。
多型部位がアレルプローブの塩基配列に相補的な塩基であった場合には、インベーダープローブとアレルプローブの両者がアレルにハイブリダイズすると、アレルプローブの多型部位に相当する塩基にインベーダープローブが侵入（ｉｎｖａｓｉｏｎ）した構造が形成される。ｃｌｅａｖａｓｅは、このようにして形成された侵入構造を形成したオリゴヌクレオチドのうち、侵入された側の鎖を切断する。切断は侵入構造の上で起きるので、結果としてアレルプローブのフラップが切り離されることになる。一方、もしも多型部位の塩基がアレルプローブの塩基に相補的でなかった場合には、多型部位におけるインベーダープローブとアレルプローブの競合は無く、侵入構造は形成されない。したがってｃｌｅａｖａｓｅによるフラップの切断が起こらない。
ＦＲＥＴプローブは、こうして切り離されたフラップを検出するためのプローブである。ＦＲＥＴプローブは５’末端側に自己相補配列を有し、３’末端側に１本鎖部分が配置されたヘアピンループを構成している。ＦＲＥＴプローブの３’末端側に配置された１本鎖部分は、フラップに相補的な塩基配列からなっていて、ここにフラップがハイブリダイズすることができる。フラップがＦＲＥＴプローブにハイブリダイズすると、ＦＲＥＴプローブの自己相補配列の５’末端部分にフラップの３’末端が侵入した構造が形成されるように両者の塩基配列がデザインされている。ｃｌｅａｖａｓｅは侵入構造を認識して切断する。ＦＲＥＴプローブのｃｌｅａｖａｓｅによって切断される部分を挟んで、ＴａｑＭａｎ  ＰＣＲと同様のレポーター色素とクエンチャーで標識しておけば、ＦＲＥＴプローブの切断を蛍光シグナルの変化として検知することができる。
なお、理論的には、フラップは切断されない状態でもＦＲＥＴプローブにハイブリダイズするはずである。しかし実際には、切断されたフラップとアレルプローブの状態で存在しているフラップとでは、ＦＲＥＴに対する結合効率に大きな差が有る。そのため、ＦＲＥＴプローブを利用して、切断されたフラップを特異的に検出することは可能である。
Ｉｎｖａｄｅｒ法に基づいて塩基種を決定するためには、アレルＡとアレルＢのそれぞれに相補的な塩基配列を含む、２種類のアレルプローブを用意すれば良い。このとき両者のフラップの塩基配列は異なる塩基配列とする。フラップを検出するためのＦＲＥＴプローブも２種類を用意し、それぞれのレポーター色素を識別可能なものとしておけば、ＴａｃＭａｎ  ＰＣＲ法と同様の考え方によって、塩基種を決定することができる。
Ｉｎｖａｄｅｒ法の利点は、標識の必要なオリゴヌクレオチドがＦＲＥＴプローブのみであることである。ＦＲＥＴプローブは検出対象の塩基配列とは無関係に、同一のオリゴヌクレオチドを利用することができる。従って、大量生産が可能である。一方アレルプローブとインベーダープローブは標識する必要が無いので、結局、ジェノタイピングのための試薬を安価に製造することができる。
［ＲＣＡ法］
ＰＣＲ法に依存しない塩基種の決定方法として、ＲＣＡ法を挙げることができる。鎖置換作用を有するＤＮＡポリメラーゼが、環状の１本鎖ＤＮＡを鋳型として、長い相補鎖を合成する反応に基づくＤＮＡの増幅方法が、Ｒｏｌｌｉｎｇ  Ｃｉｒｃｌｅ  Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ（ＲＣＡ）法である（Ｌｉｚａｒｄｒｉ  ＰＭ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  １９，２２５，１９９８）。ＲＣＡ法においては、環状ＤＮＡにアニールして相補鎖合成を開始するプライマーと、このプライマーによって生成する長い相補鎖にアニールする第２のプライマーを利用して、増幅反応を構成している。
ＲＣＡ法には、鎖置換作用を有するＤＮＡポリメラーゼが利用されている。そのため、相補鎖合成によって２本鎖となった部分は、より５’側にアニールした別のプライマーから開始した相補鎖合成反応によって置換される。例えば、環状ＤＮＡを鋳型とする相補鎖合成反応は、１周分では終了しない。先に合成した相補鎖を置換しながら相補鎖合成は継続し、長い１本鎖ＤＮＡが生成される。一方、環状ＤＮＡを鋳型として生成した長い１本鎖ＤＮＡには、第２のプライマーがアニールして相補鎖合成が開始する。ＲＣＡ法において生成される１本鎖ＤＮＡは、環状のＤＮＡを鋳型としていることから、その塩基配列は同じ塩基配列の繰り返しである。従って、長い１本鎖の連続的な生成は、第２のプライマーの連続的なアニールをもたらす。その結果、変性工程を経ることなく、プライマーがアニールすることができる１本鎖部分が連続的に生成される。こうして、ＤＮＡの増幅が達成される。
ＲＣＡ法に必要な環状１本鎖ＤＮＡが多型部位の塩基種に応じて生成されれば、ＲＣＡ法を利用して塩基種の決定をすることができる。そのために、直鎖状で１本鎖のパドロックプローブが利用される。パドロックプローブは、５’末端と３’末端に検出すべき多型部位の両側に相補的な塩基配列を有している。これらの塩基配列は、バックボーンと呼ばれる特殊な塩基配列からなる部分で連結されている。多型部位がパドロックプローブの末端に相補的な塩基配列であれば、アレルにハイブリダイズしたパドロックプローブの末端をＤＮＡリガーゼによってライゲーションすることができる。その結果、直鎖状のパドロックプローブが環状化され、ＲＣＡ法の反応がトリガーされる。ＤＮＡリガーゼの反応は、ライゲーションすべき末端部分が完全に相補的でない場合には反応効率が著しく低下する。従って、ライゲーションの有無をＲＣＡ法で確認することによって、多型部位の塩基種の決定が可能である。
ＲＣＡ法は、ＤＮＡを増幅することはできるが、そのままではシグナルを生成しない。また増幅の有無のみを指標とするのでは、アレル毎に反応を行わなければ、通常、塩基種を決定することができない。これらの点を塩基種の決定のために改良した方法が公知である。例えば、モレキュラービーコンを利用して、ＲＣＡ法に基づいて１チューブで塩基種の決定を行うことができる。モレキュラービーコンは、ＴａｑＭａｎ法と同様に、蛍光色素とクエンチャーを利用したシグナル生成用プローブである。モレキュラービーコンの５’末端と３’末端は相補的な塩基配列で構成されており、単独ではヘアピン構造を形成する。両端付近を蛍光色素とクエンチャーで標識しておけば、ヘアピン構造を形成している状態では蛍光シグナルが検出できない。モレキュラービーコンの一部を、ＲＣＡ法の増幅産物に相補的な塩基配列としておけば、モレキュラービーコンはＲＣＡ法の増幅産物にハイブリダイズする。ハイブリダイズによってヘアピン構造が解消されるため、蛍光シグナルが生成される。
モレキュラービーコンの利点は、パドロックプローブのバックボーン部分の塩基配列を利用することによって、検出対象とは無関係にモレキュラービーコンの塩基配列を共通にできる点である。アレル毎にバックボーンの塩基配列を変え、蛍光波長が異なる２種類のモレキュラービーコンを組み合せれば、１チューブで塩基種の決定が可能である。蛍光標識プローブの合成コストは高いので、測定対象に関わらず共通のプローブを利用できることは、経済的なメリットである。
これらの方法はいずれも多量のサンプルを高速にジェノタイピングするために開発された方法である。ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳを除けば、通常、いずれの方法にも何らかの形で標識プローブなどを用意する必要がある。これに対して、標識プローブなどに頼らない塩基種決定法も古くから行われている。このような方法の一つとして、例えば、制限酵素断片長多型（Ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ  Ｆｒａｇｍｅｎｔ  Ｌｅｎｇｔｈ  Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ／ＲＦＬＰ）を利用した方法やＰＣＲ−ＲＦＬＰ法等が挙げられる。
ＲＦＬＰは、制限酵素の認識部位の変異、あるいは制限酵素処理によって生じるＤＮＡ断片内における塩基の挿入または欠失が、制限酵素処理後に生じる断片の大きさの変化として検出できることを利用している。検出対象となる多型を含む塩基配列を認識する制限酵素が存在すれば、ＲＦＬＰの原理によって多型部位の塩基を知ることができる。
標識プローブを必要としない方法として、ＤＮＡの二次構造の変化を指標として塩基の違いを検出する方法も公知である。ＰＣＲ−ＳＳＣＰでは、１本鎖ＤＮＡの二次構造がその塩基配列の相違を反映することを利用している（Ｃｌｏｎｉｎｇ  ａｎｄ  ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  ｃｈａｉｎ  ｒｅａｃｔｉｏｎ−ｓｉｎｇｌｅ−ｓｔｒａｎｄ  ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ａｎｏｎｙｍｏｕｓ  Ａｌｕ  ｒｅｐｅａｔｓ  ｏｎ  ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  １１．Ｇｅｎｏｍｉｃｓ．１９９２  Ｊａｎ  １；１２（１）：１３９−１４６．、Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｐ５３  ｇｅｎｅ  ｍｕｔａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ｈｕｍａｎ  ｂｒａｉｎ  ｔｕｍｏｒｓ  ｂｙ  ｓｉｎｇｌｅ−ｓｔｒａｎｄ  ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  ｃｈａｉｎ  ｒｅａｃｔｉｏｎ  ｐｒｏｄｕｃｔｓ．Ｏｎｃｏｇｅｎｅ．１９９１  Ａｕｇ  １；６（８）：１３１３−１３１８．、Ｍｕｌｔｉｐｌｅ  ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ−ｂａｓｅｄ  ＰＣＲ−ＳＳＣＰ  ａｎａｌｙｓｉｓ  ｗｉｔｈ  ｐｏｓｔｌａｂｅｌｉｎｇ．、ＰＣＲ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ａｐｐｌ．１９９５  Ａｐｒ  １；４（５）：２７５−２８２．）。ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法は、ＰＣＲ産物を１本鎖ＤＮＡに解離させ、非変性ゲル上で分離する工程により実施される。ゲル上の移動度は、１本鎖ＤＮＡの二次構造によって変動するので、もしも多型部位における塩基の相違があれば、移動度の違いとして検出することができる。
その他、標識プローブを必要としない方法として、例えば、変性剤濃度勾配ゲル（ｄｅｎａｔｕｒａｎｔ  ｇｒａｄｉｅｎｔ  ｇｅｌ  ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ：ＤＧＧＥ法）等を例示することができる。ＤＧＧＥ法は、変性剤の濃度勾配のあるポリアクリルアミドゲル中で、ＤＮＡ断片の混合物を泳動し、それぞれの不安定性の違いによってＤＮＡ断片を分離する方法である。ミスマッチのある不安定なＤＮＡ断片が、ゲル中のある変性剤濃度の部分まで移動すると、ミスマッチ周辺のＤＮＡ配列はその不安定さのために、部分的に１本鎖へと解離する。部分的に解離したＤＮＡ断片の移動度は、非常に遅くなり、解離部分のない完全な二本鎖ＤＮＡの移動度と差がつくことから、両者を分離することができる。
具体的には、まずＰＣＲ法等によって多型部位を含む領域を増幅する。増幅産物に、塩基配列がわかっているプローブＤＮＡをハイブリダイズさせて２本鎖とする。これを尿素などの変性剤の濃度が移動するに従って徐々に高くなっているポリアクリルアミドゲル中で電気泳動し、対照と比較する。プローブＤＮＡとのハイブリダイズによってミスマッチを生じたＤＮＡ断片では、より低い変性剤濃度位置でＤＮＡ断片が一本鎖になり、極端に移動速度が遅くなる。こうして生じた移動度の差を検出することによりミスマッチの有無を検出することができる。
更にＤＮＡアレイを使って塩基種を決定することもできる（細胞工学別冊「ＤＮＡマイクロアレイと最新ＰＣＲ法」，秀潤社，２０００．４／２０発行，ｐｐ９７−１０３「オリゴＤＮＡチップによるＳＮＰの解析」，梶江慎一）。ＤＮＡアレイは、同一平面上に配置した多数のプローブに対してサンプルＤＮＡ（あるいはＲＮＡ）をハイブリダイズさせ、当該平面をスキャンすることによって、各プローブに対するハイブリダイズが検出される。多くのプローブに対する反応を同時に観察することができることから、例えば、多数の多型部位について同時に解析するには、ＤＮＡアレイは有用である。
一般にＤＮＡアレイは、高密度に基板にプリントされた何千ものヌクレオチドで構成されている。通常これらのＤＮＡは非透過性（ｎｏｎ−ｐｏｒｏｕｓ）の基板の表層にプリントされる。基板の表層は、一般的にはガラスであるが、透過性（ｐｏｒｏｕｓ）の膜、例えばニトロセルロースメンブレムを使用することもできる。
本発明において、ヌクレオチドの固定（アレイ）方法として、Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社開発によるオリゴヌクレオチドを基本としたアレイが例示できる。オリゴヌクレオチドのアレイにおいて、オリゴヌクレオチドは通常インビトロ（ｉｎ  ｖｉｔｒｏ）で合成される。例えば、ｐｈｏｔｏｌｉｔｈｏｇｒａｐｈｉｃの技術（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ社）、および化学物質を固定させるためのインクジェット（Ｒｏｓｅｔｔａ  Ｉｎｐｈａｒｍａｔｉｃｓ社）技術等によるオリゴヌクレオチドのインサイチュ合成法が既に知られており、いずれの技術も本発明の基板の作製に利用することができる。
オリゴヌクレオチドは、検出すべきＳＮＰｓを含む領域に相補的な塩基配列で構成される。基板に結合させるヌクレオチドプローブの長さは、オリゴヌクレオチドを固定する場合は、通常１０〜１００ベースであり、好ましくは１０〜５０ベースであり、さらに好ましくは１５〜２５ベースである。更に、一般にＤＮＡアレイ法においては、クロスハイブリダイゼーション（非特異的ハイブリダイゼーション）による誤差を避けるために、ミスマッチ（ＭＭ）プローブが用いられる。ミスマッチプローブは、標的塩基配列と完全に相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとのペアを構成している。ミスマッチプローブに対して、完全に相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドはパーフェクトマッチ（ＰＭ）プローブと呼ばれる。データ解析の過程で、ミスマッチプローブで観察されたシグナルを消去することによって、クロスハイブリダイゼーションの影響を小さくすることができる。
ＤＮＡアレイ法によるジェノタイピングのための試料は、被検者から採取された生物学的試料をもとに当業者に周知の方法で調製することができる。生物学的試料は特に限定されない。例えば被検者の末梢血白血球、皮膚、口腔粘膜等の組織または細胞、涙、唾液、尿、糞便または毛髪から抽出した染色体ＤＮＡから、ＤＮＡ試料を調製することができる。判定すべき多型部位を含む領域を増幅するためのプライマーを用いて、染色体ＤＮＡの特定の領域が増幅される。このとき、マルチプレックスＰＣＲ法によって複数の領域を同時に増幅することができる。マルチプレックスＰＣＲ法とは、複数組のプライマーセットを、同じ反応液中で用いるＰＣＲ法である。複数の多型部位を解析するときには、マルチプレックスＰＣＲ法が有用である。
一般にＤＮＡアレイ法においては、ＰＣＲ法によってＤＮＡ試料を増幅するとともに、増幅産物が標識される。増幅産物の標識には、標識を付したプライマーが利用される。例えば、まず多型部位を含む領域に特異的なプライマーセットによるＰＣＲ法でゲノムＤＮＡを増幅する。次に、ビオチンラベルしたプライマーを使ったラベリングＰＣＲ法によって、ビオチンラベルされたＤＮＡを合成する。こうして合成されたビオチンラベルＤＮＡを、チップ上のオリゴヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる。ハイブリダイゼーションの反応液および反応条件は、基板に固定するヌクレオチドプローブの長さや反応温度等の条件に応じて、適宜調整することができる。当業者は、適切なハイブリダイゼーションの条件をデザインすることができる。ハイブリダイズしたＤＮＡを検出するために、蛍光色素で標識したアビジンが添加される。アレイをスキャナで解析し、蛍光を指標としてハイブリダイズの有無を確認する。
上記方法をより具体的に示せば、被検者から調製した本発明の多型部位を含むＤＮＡ、およびヌクレオチドプローブが固定された固相、を取得した後、次いで、該ＤＮＡと該固相を接触させる。さらに、固相に固定されたヌクレオチドプローブにハイブリダイズしたＤＮＡを検出することにより、本発明の多型部位の塩基種を決定する。
本発明において「固相」とは、ヌクレオチドを固定することが可能な材料を意味する。本発明の固相は、ヌクレオチドを固定することが可能であれば特に制限はないが、具体的には、マイクロプレートウェル、プラスチックビーズ、磁性粒子、基板などを含む固相等を例示することができる。本発明の「固相」としては、一般にＤＮＡアレイ技術で使用される基板を好適に用いることができる。本発明において「基板」とは、ヌクレオチドを固定することが可能な板状の材料を意味する。また、本発明においてヌクレオチドには、オリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが含まれる。
上記の方法以外にも、特定部位の塩基を検出するために、アレル特異的オリゴヌクレオチド（Ａｌｌｅｌｅ  Ｓｐｅｃｉｆｉｃ  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ／ＡＳＯ）ハイブリダイゼーション法が利用できる。アレル特異的オリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）は、検出すべき多型部位が存在する領域にハイブリダイズする塩基配列で構成される。ＡＳＯを試料ＤＮＡにハイブリダイズさせるとき、多型によって多型部位にミスマッチが生じるとハイブリッド形成の効率が低下する。ミスマッチは、サザンブロット法や、特殊な蛍光試薬がハイブリッドのギャップにインターカレーションすることにより消光する性質を利用した方法等によって検出することができる。また、リボヌクレアーゼＡミスマッチ切断法によって、ミスマッチを検出することもできる。
本発明はまた、本発明の多型部位を含むＤＮＡにハイブリダイズし、少なくとも１５ヌクレオチドの鎖長を有するオリゴヌクレオチドを含む、２型糖尿病の検査薬を提供する。これらはそれぞれ遺伝子発現を指標とする検査、または遺伝子多型を指標とする検査に使用される。
該オリゴヌクレオチドは、本発明の多型部位を含むＤＮＡに特異的にハイブリダイズするものである。ここで「特異的にハイブリダイズする」とは、通常のハイブリダイゼーション条件下、好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下（例えば、サムブルックら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｕｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ＵＳＡ，第２版  １９８９に記載の条件）において、他のタンパク質をコードするＤＮＡとクロスハイブリダイゼーションを有意に生じないことを意味する。特異的なハイブリダイズが可能であれば、該オリゴヌクレオチドは、検出する上記（１）〜（２９）記載の各塩基配列に対し、完全に相補的である必要はない。
該オリゴヌクレオチドは、上記本発明の検査方法におけるプローブやプライマーとして用いることができる。該オリゴヌクレオチドをプライマーとして用いる場合、その長さは、通常１５ｂｐ〜１００ｂｐであり、好ましくは１７ｂｐ〜３０ｂｐである。プライマーは、本発明の多型部位を含むＤＮＡの少なくとも一部を増幅しうるものであれば、特に制限されない。
本発明は、本発明の多型部位を含む領域を増幅するためのプライマー、および多型部位を含むＤＮＡ領域にハイブリダイズするプロープを提供する。本発明において、多型部位を含む領域を増幅するためのプライマーには、多型部位を含むＤＮＡを鋳型として、多型部位に向かって相補鎖合成を開始することができるプライマーも含まれる。該プライマーは、多型部位を含むＤＮＡにおける、多型部位の３’側に複製開始点を与えるためのプライマーと表現することもできる。プライマーがハイブリダイズする領域と多型部位との間隔は、任意である。両者の間隔は、多型部位の塩基の解析手法に応じて、好適な塩基数を選択することができる。たとえば、ＤＮＡチップによる解析のためのプライマーであれば、多型部位を含む領域として、２０〜５００、通常５０〜２００塩基の長さの増幅産物が得られるようにプライマーをデザインすることができる。当業者においては、多型部位を含む周辺ＤＮＡ領域についての塩基配列情報を基に、解析手法に応じたプライマーをデザインすることができる。本発明のプライマーを構成する塩基配列は、ゲノムの塩基配列に対して完全に相補的な塩基配列のみならず、適宜改変することができる。
本発明のプライマーには、ゲノムの塩基配列に相補的な塩基配列に加え、任意の塩基配列を付加することができる。例えば、ＩＩｓ型の制限酵素を利用した多型の解析方法のためのプライマーにおいては、ＩＩｓ型制限酵素の認識配列を付加したプライマーが利用される。このような、塩基配列を修飾したプライマーは、本発明のプライマーに含まれる。更に、本発明のプライマーは、修飾することができる。例えば、蛍光物質や、ビオチンまたはジゴキシンのような結合親和性物質で標識したプライマーが各種のジェノタイピング方法において利用される。これらの修飾を有するプライマーも本発明に含まれる。
一方本発明において、多型部位を含む領域にハイブリダイズするプローブとは、多型部位を含む領域の塩基配列を有するポリヌクレオチドとハイブリダイズすることができるプローブを言う。より具体的には、プローブの塩基配列中に多型部位を含むプローブは本発明のプローブとして好ましい。あるいは、多型部位における塩基の解析方法によっては、プローブの末端が多型部位に隣接する塩基に対応するように、デザインされる場合もある。従って、プローブ自身の塩基配列には多型部位が含まれないが、多型部位に隣接する領域に相補的な塩基配列を含むプローブも、本発明における望ましいプローブとして示すことができる。
言いかえれば、ゲノムＤＮＡ上の本発明の多型部位、または多型部位に隣接する部位にハイブリダイズすることができるプローブは、本発明のプローブとして好ましい。本発明のプローブには、プライマーと同様に、塩基配列の改変、塩基配列の付加、あるいは修飾が許される。例えば、Ｉｎｖａｄｅｒ法に用いるプローブは、フラップを構成するゲノムとは無関係な塩基配列が付加される。このようなプローブも、多型部位を含む領域にハイブリダイズする限り、本発明のプロープに含まれる。本発明のプローブを構成する塩基配列は、ゲノムにおける本発明の多型部位の周辺ＤＮＡ領域の塩基配列をもとに、解析方法に応じてデザインすることができる。
本発明のプライマー、またはプローブは、それを構成する塩基配列をもとに、任意の方法によって合成することができる。本発明のプライマーまたはプローブの、ゲノムＤＮＡに相補的な塩基配列の長さは、通常１５〜１００、一般に１５〜５０、通常１５〜３０である。与えられた塩基配列に基づいて、当該塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを合成する手法は公知である。更に、オリゴヌクレオチドの合成において、蛍光色素やビオチンなどで修飾されたヌクレオチド誘導体を利用して、オリゴヌクレオチドに任意の修飾を導入することもできる。あるいは、合成されたオリゴヌクレオチドに、蛍光色素などを結合する方法も公知である。
本発明はまた、本発明の検査方法に使用するための試薬を提供する。本発明の試薬は、前記本発明のプライマーおよび／またはプローブを含む。本発明の試薬には、塩基種の決定方法に応じて、各種の酵素、酵素基質、および緩衝液などを組み合せることができる。酵素としては、ＤＮＡポリメラーゼ、ＤＮＡリガーゼ、あるいはＩＩｓ制限酵素などの、上記の塩基種決定方法として例示した各種の解析方法に必要な酵素を示すことができる。緩衝液は、これらの解析に用いる酵素の活性の維持に好適な緩衝液が、適宜選択される。更に、酵素基質としては、例えば、相補鎖合成用の基質等が用いられる。
更に本発明の試薬には、多型部位における塩基が明らかな対照を添付することができる。対照は、予め多型部位の塩基種が明らかなゲノム、あるいはゲノムの断片を用いることができる。ゲノムは、細胞から抽出されたものでもよいし、細胞あるいは細胞の分画を用いることもできる。細胞を対照として用いれば、対照の結果によってゲノムＤＮＡの抽出操作が正しく行われたことを証明することができる。あるいは、多型部位を含む塩基配列からなるＤＮＡを対照として用いることもできる。具体的には、本発明の多型部位における塩基種が明らかにされたゲノム由来のＤＮＡを含むＹＡＣベクターやＢＡＣベクターは、対照として有用である。あるいは多型部位に相当する数百ベースのみを切り出して挿入したベクターを対照として用いることもできる。
さらに、本発明における検査薬の別の態様は、本発明の多型部位を含むＤＮＡとハイブリダイズするヌクレオチドプローブが固定された固相からなる２型糖尿病の検査薬である。これらは本発明の多型部位を指標とする検査に使用される。これらの調製方法に関しては、上述の通りである。
【図面の簡単な説明】  図１は、中央にＡＢＣＡ１遺伝子の構造を示す。エクソンを垂直方向の線またはボックスで示した。翻訳領域はエクソン２から始まりエクソン５０までである。解析に用いたＳＮＰｓを「解析に用いたＳＮＰ」に１〜３１番として示したがこれらのＪＳＮＰＩＤは（）内の通りである（ＳＮＰ番号：ＪＳＮＰ  ＩＤ（ｓｓｊ０００−））；１：１１７６，２：１１７９，３：１１８４，４：１１９１，５：１１９４，６：１１９５，７：１１９８，８：１２０５，９：１２０９，１０：１２１２，１１：１２１７，１２：１２３５，１３：１２４１，１４：１２４２，１５：１２５９，１６：１２６４，１７：１２７１，１８：１２７６，１９：１２７９，２０：１２８０，２１：１２８９，２２：１２９６，２３：１３００，２４：１３０４，２５：１３０５，２６：１３０６，２７：１３１１，２８：１３２２，２９：１３２６，３０：１３３３、３１：１３３７）。予測されたＬＤブロックを「ＬＤブロック」に水平方向の線と白丸（○）で示した。白丸はハプロタイプを構成するＳＮＰを示す。上部の矢印（▼）は、過去に血清脂質値または冠動脈疾患（ＣＡＤ）と関連が報告されたＳＮＰの位置を示す。
【発明を実施するための最良の形態】  以下、本発明を実施例により、さらに具体的に説明するが本発明はこれら実施例に制限されるものではない。
［実施例１］  ２型糖尿病（ＤＭ）関連遺伝子の同定
ＤＭ感受性遺伝子を同定するために候補遺伝子アプローチを適用した関連解析を行った。ＤＭとの関連に関して調べたＳＮＰ２０３９個は候補遺伝子７０４個から選択した。遺伝子タイピングはタクマン法によって行った。症例１４８例と正常耐糖能（ＮＧＴ）対照２２７人からなる試験群は、フナガタ糖尿病試験（Ｏｉｚｕｍｉ，Ｔ．ｅｔ  ａｌ．Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ  ２４，１５７９−１５８３（２００１））から募集した。症例（ＤＭ）群は、ＷＨＯ  １９８５の基準によって判定された耐糖能障害（ＩＧＴ）患者７４人およびＤＭ患者７４人とした。年齢および性別比は、症例群と正常耐糖能（ＮＧＴ）対照群とで一致させた（年齢、６５．３±１０．２対６５．１±７．７歳；性別比（女性／男性）、８０／６８対１２８／９９）。慢性的な血糖値を推定するための基準であるＨｂＡ１ｃレベルは、ＤＭ群ではＮＧＴ群より当然高かった（５．８８±１．１８対４．９８±０．３２、ｐ＜０．０００１）。さらに、肥満指数（ＢＭＩ）および血清グリセリドレベルのような臨床特性は、ＮＧＴ群よりＤＭ群において高かった（ＢＭＩ（ｋｇ／ｍ２）、２４．７±３．５対２３．３±３．２４、ｐ＜０．０００１；トリグリセリド（ｍｇ／ｄｌ）、１４４．０±１５２．８対１１５．２±１２０．７、ｐ＝０．０４７）（表３４）。
2004084797.tif 000047
数値は平均値±ＳＤ．である。統計学的有意はスチューデントのｔ検定によって決定した。Ｐ＜０．０５はアスタリスク＊で表中に示した。
関連解析は、症例群と正常耐糖能（ＮＧＴ）対照群のジェノタイプをカイ二乗検定によって検定し、ｐ＜０．０１を統計学的に有意であるとした。ＤＭ母集団の高い発生率（ＤＭおよびＩＧＴに関してそれぞれ、１０．５％および１４．５％）を考慮すると（Ｓｅｋｉｋａｗａ，Ａ．ｅｔ  ａｌ．Ｊ  Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃｏｍｐｌｉｃａｔｉｏｎ  １４，７８−８３（２０００））、試験の検出力は相対危険度２および対立遺伝子頻度０．１で、ＤＭ感受性遺伝子を検出するために５％有意水準で８０％を超える。表３５〜３７は、ＤＭ関連ＳＮＰを含む遺伝子、有意差を示したＳＮＰのＪＳＮＰＩＤ、ＳＮＰｓの有リスク対立遺伝子、ｐ値、オッズ比（ＯＲ）および９５％信頼区間を示す。一般的な意味において、有リスク対立遺伝子の遺伝は、優性または劣性のいずれかに従い、本実施例の試験結果から認めることができる。優性型の対立遺伝子は、そのホモ接合状態およびヘテロ接合状態の双方に関して統計学的に有意となる傾向があるが（表３６）、劣性型の対立遺伝子は、そのホモ接合型の場合に限って統計学的に有意となる傾向がある（表３７）。
2004084797.tif 000048
〔優性型〕
2004084797.tif 000049
ＳＮＰｓの詳細は、″ＪＳＮＰ  ＩＤ″として記載したＩＤナンバーをもってウェブサイト（ｈｔｔｐ：／／ｓｎｐ．ｉｍｓ．ｕ−ｔｏｋｙｏ．ａｃ．ｊｐ）に公開されている。なお、Ｐ値および９５％ＣＩはカイ二乗検定によって決定した。†はｐ＜０．０１のマルチプルＳＮＰｓを持つ遺伝子を表す。
〔劣性型〕
2004084797.tif 000050
ＳＮＰｓの詳細は、″ＪＳＮＰ  ＩＤ″として記載したＩＤナンバーをもってウェブサイト（ｈｔｔｐ：／／ｓｎｐ．ｉｍｓ．ｕ−ｔｏｋｙｏ．ａｃ．ｊｐ）に公開されている。なお、Ｐ値および９５％ＣＩはカイ二乗検定によって決定した。＊は、対象群の有リスク遺伝子型の数が０であったためＯＲが決定不可であったものを表し、†はｐ＜０．０１のマルチプルＳＮＰｓを持つ遺伝子を表す。
また、症例と対照群のあいだの遺伝距離（ハプロタイプに基づくＦｓｔ）を測定したが、母集団におけるサブストラクチャーは検出されなかった。興味深いことに、推定のＤＭ関連遺伝子であるＭＥＴ遺伝子（表３６）は、ＤＭとの関連の証拠を有しない遺伝的に連鎖していない遺伝子（ＧＲＭ８）と１０Ｍｂ離れていた。遺伝距離を測定することによって、ＭＥＴは、症例群と対照群のあいだで統計学的に有意な差を示した（Ｆｓｔ＝０．００６２５、ｐ＝０．０１６５）のに対し、ＧＲＭ８は２群が識別不能であることが示された（Ｆｓｔ＝０．０００２７、ｐ＝０．９０８７３）。
これらの上記２つの表における遺伝子をｐ値に従って分類した。全体的に、有意な遺伝子の上位５個は、ＭＥＴ、ＮＰＨＳ１、ＴＦＲＣ、ＭＭＰ１９およびＳＬＣ１Ａであり、ｐ値はそれぞれ、０．０００８、０．００１１、０．００２２、０．００２２、および０．００２４であった。統計学的に有意な試験において２つまたはそれ以上のＳＮＰｓを含む遺伝子は、ＤＬＧ５、ＦＲＡＰ１、ＬＡＲＧＥおよびＭＥＴであった。さらに、これまでに報告されたＤＭまたはその関連疾患に対する感受性座に存在する遺伝子は、ＴＨＢＳ３、ＲＧＳ５、ＢＬＺＦ１、ＴＦＲＣおよびＬＡＲＧＥ（Ｖｉｏｎｎｅｔ，Ｎ．ｅｔ  ａｌ．Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．６７，１４７０−１４８０（２０００），Ｌｉｎｄｇｒｅｎ，Ｃ．Ｍ．ｅｔ  ａｌ．Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．７０，５０９−５１６（２００２），Ｌａｎｄｅｒ，Ｅ．Ｓ．＆  Ｋｒｕｇｌｙａｋ，Ｌ．Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔ．１１，２４１−２４７（１９９５），Ｗｉｌｔｓｈｉｒｅ，Ｓ．ｅｔ  ａｌ．Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．６９，５５３−５６９（２００１），Ｇｈｏｓｈ，Ｓ．ｅｔ  ａｌ．Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．６７，１１７４−１１８５（２０００），Ｗａｔａｎａｂｅ，Ｒ．Ｍ．ｅｔ  ａｌ．Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．６７，１１８６−１２００（２０００），Ｐｒａｔｌｅｙ，Ｒ．Ｅ．ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１０１，１７５７−１７６４（１９９８））であった。
ＤＭに関わりがあることが知られている遺伝子は３個だけであった（ＡＢＣＣ８（ＳＵＲ）、ＬＥＰ、およびＴＮＦ）（Ｅｌｂｅｉｎ，Ｓ．Ｃ．ｅｔ  ａｌ．Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ  ２４，４７２−４７８（２００１），Ｏｚａｔａ，Ｍ．ｅｔ  ａｌ．Ｊ  Ｃｌｉｎ．Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ．Ｍｅｔａｂ．８６，３６５９−３６６４（２００１），Ｄａｙ，Ｃ．Ｐ．ｅｔ  ａｌ．Ｄｉａｂｅｔｏｌｏｇｉａ  ４１，４３０−４３４（１９９８））。本発明において認められた遺伝子の大多数は、グルコース代謝以外の機能または経路に関係している。ＤＭに間接的に関与しているそれらの遺伝子は、以下の領域に割付することができる：脂質代謝（ＡＢＣＡ１、ＦＡＢＰ２、ＬＤＬＣ、およびＶＬＤＬＲ）、免疫系（ＦＲＡＰ１およびＰ２ＲＸ７）、神経系（ＣＴＳＤおよびＳＬＣ１Ａ１）、恒常性（ＳＥＲＰＩＮＡ３およびＳＥＲＰＩＮＢ２）、細胞構造の維持（ＤＬＧ５およびＬＡＲＧＥ）、組織再モデリング（ＭＭＰ１９）等。
［実施例２］  ２型糖尿病に関連する多型部位の連鎖不平衡についての解析
（ａ）有意差を示したＳＮＰの周辺のＳＮＰをタイピングし、これらのＳＮＰ間に連鎖不平衡が成り立つか否かを検討した。ＳＮＰ間に連鎖不平衡が認められた場合の解析結果を表３８〜５１に示す。
（ａ−１）ＭＥＴ
2004084797.tif 000051
（ａ−２）ＮＰＨＳ１
2004084797.tif 000052
（ａ−３）ＳＥＲＰＩＮＢ２
2004084797.tif 000053
（ａ−４）ＡＢＣＡ１
2004084797.tif 000054
（ａ−５）ＣＴＳＤ
2004084797.tif 000055
（ａ−６）ＳＴＥ
2004084797.tif 000056
（ａ−７）ＡＢＣＣ８
2004084797.tif 000057
（ａ−８）ＭＹＬ２
2004084797.tif 000058
（ａ−９）ＤＬＧ５
2004084797.tif 000059
（ａ−１０）ＬＤＬＣ
2004084797.tif 000060
（ａ−１１）ＬＡＲＧＥ
2004084797.tif 000061
（ａ−１２）ＢＬＺＦ１
2004084797.tif 000062
（ａ−１３）ＦＲＡＰ１
2004084797.tif 000063
（ａ−１４）ＬＥＰ
2004084797.tif 000064
（ｂ）ＳＮＰ間について連鎖不平衡が認められた場合には、ハプロタイプ型を用いた疾患関連解析を行った。見出された個々のハプロタイプにおいて症例群と正常耐糖能（ＮＧＴ）対照群をカイ二乗検定を用いて解析し、ｐ＜０．０５を有意差ありとした。結果を表５２に示す。
2004084797.tif 000065
さらに、カイ二乗検定と異なる意味を持つ検定方法として、症例群と正常耐糖能（ＮＧＴ）対照群の分布全体の差を検定する手法（ＦＡＳＴＥＨＰＬＵＳ）（Ｚｈａｏ  ＪＨ，Ｓｈａｍ  ＰＣ．Ｆａｓｔｅｒ  ｈａｐｌｏｔｙｐｅ  ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ  ｅｓｔｉｍａｔｉｏｎ  ｕｓｉｎｇ  ｕｎｒｅｌａｔｅｄｓｕｂｊｅｃｔｓ．Ｈｕｍ  Ｈｅｒｅｄ  ２００２；５３（１）：３６−４１）を用いて統計解析を行い、ｐ＜０．０５を有意差ありとした。ＦＡＳＴＥＨＰＬＵＳは全体を比較する方法であり、例えば複数のアリルが疾患感受性／抵抗性を持つ場合などに異なる結果をもたらす可能性がある。個々のハプロタイプ、および、ハプロタイプ領域に含まれるＳＮＰについてＦＡＳＴＥＨＰＬＵＳを適用したところ、カイ二乗検定では有意差が認められなかった以下のハプロタイプおよびＳＮＰが有意に転じた。
以下にＦＡＳＴＥＨＰＬＵＳにて新たに有意と認められた４つのＳＮＰを示す。
（１）ＩＭＳ−ＪＳＴ０３５６５６（ＮＰＨＳ１）  ｐ値＝０．０２９３、（２）ＩＭＳ−ＪＳＴ０１７２２２（ＣＴＳＤ）  ｐ値＝０．０２８２、（３）ＩＭＳ−ＪＳＴ０７５５６３（ＳＴＥ）  ｐ値＝０．０１１９、（４）ＩＭＳ−ＪＳＴ０２０６０７（ＬＡＲＧＥ）  ｐ値＝０．０２２２
以下にＦＡＳＴＥＨＰＬＵＳにて新たに有意と認められた５つのハプロタイプを示す。
（１）ＭＥＴ．ｈａｐｌｏ２  ｐ値＝０．０２５５、（２）ＣＴＳＤ．ｈａｐｌｏ１  ｐ値＝０．０４０１、（３）ＳＴＥ．．ｈａｐｌｏ１  ｐ値＝０．０１１５、（４）ＡＢＣＣ８．ｈａｐｌｏ１  ｐ値＝０．００７６、（５）ＭＹＬ２．ｈａｐｌｏ１  ｐ値＝０．００７６
（ｃ）各のハプロタイプの観察例は下記の表５３〜６６に示される。
（ｃ−１）ＭＥＴ
2004084797.tif 000066
（ｃ−２）ＮＰＨＳ１
2004084797.tif 000067
（ｃ−３）ＳＥＲＰＩＮＢ２
2004084797.tif 000068
（ｃ−４）ＡＢＣＡ１
2004084797.tif 000069
（ｃ−５）ＣＴＳＤ
2004084797.tif 000070
（ｃ−６）ＳＴＥ
2004084797.tif 000071
（ｃ−７）ＡＢＣＣ８
2004084797.tif 000072
（ｃ−８）ＭＹＬ２
2004084797.tif 000073
（ｃ−９）ＤＬＧ５
2004084797.tif 000074
（ｃ−１０）ＬＤＬＣ
2004084797.tif 000075
（ｃ−１１）ＬＡＲＧＥ
2004084797.tif 000076
（ｃ−１２）ＢＬＺＦ１
2004084797.tif 000077
（ｃ−１３）ＦＲＡＰ１
2004084797.tif 000078
（ｃ−１４）ＬＥＰ
2004084797.tif 000079
表６７にＭＥＴのハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000080
表６８にＭＥＴのディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000081
表６９にＭＥＴのｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000082
表７０にＭＥＴの有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000083
表７１にＮＰＨＳ１のハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000084
表７２にＮＰＨＳ１のディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000085
表７３にＮＰＨＳ１のｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000086
表７４にＮＰＨＳ１の有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000087
表７５にＳＥＲＰＩＮＢ２のハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000088
表７６にＳＥＲＰＩＮＢ２のディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000089
表７７にＳＥＲＰＩＮＢ２のｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000090
表７８にＳＥＲＰＩＮＢ２の有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000091
表７９にＳＴＥのハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000092
表８０にＳＴＥのディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000093
表８１にＳＴＥのｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000094
表８２にＳＴＥの有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000095
表８３にＤＬＧ５のハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000096
表８４にＤＬＧ５のディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000097
表８５にＤＬＧ５のｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000098
表８６にＤＬＧ５の有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000099
表８７にＬＤＬＣのハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000100
表８８にＬＤＬＣのディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000101
表８９にＬＤＬＣのｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000102
表９０にＬＤＬＣの有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000103
表９１にＢＬＺＦ１のハプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000104
表９２にＢＬＺＦ１のディプロタイプ解析の結果を示す。
2004084797.tif 000105
表９３にＢＬＺＦ１のｓｎｐ解析ｐ−ｖａｌｕｅを示す。
2004084797.tif 000106
表９４にＢＬＺＦ１の有意なハプロタイプについて示す。
2004084797.tif 000107
〔実施例３〕  解析対象
本発明者らは、ネフリンは膵ベータ細胞で重要な役割を果たし、その機能障害はＤＭの進行をもたらすと推測した。
フィンランド型先天性ネフローゼ症候群（ＮＰＨＳ１）はまれな常染色体劣性遺伝疾患であり、生後すぐにネフローゼ症候群をきたす（Ｒａｐｏｌａ  Ｊ著、「Ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」、Ｐｅｄｉａｔｒ  Ｎｅｐｈｒｏｌ、１：４４１−４４６，１９８７年）。フィンランド型先天性ネフローゼ症候群の原因である遺伝子はポジショナルクローニングがなされており、その産物はネフリンと名づけられた（Ｋｅｓｔｉｌａ  Ｍ，ら著、「Ｐｏｓｉｔｉｏｎａｌｌｙ  ｃｌｏｎｅｄ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｎｅｐｈｒｉｎ−ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」、Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ．１：５７５−５８２，１９９８年）。
ネフリン遺伝子（ＮＰＨＳ１）は２６ｋｂであり、２９のエキソンを持ち、タンパク質をコードする３７２６塩基からなるｍＲＮＡが得られている（Ｋｅｓｔｉｌａ  Ｍら著、「Ｐｏｓｉｔｉｏｎａｌｌｙ  ｃｌｏｎｅｄ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｎｅｐｈｒｉｎ−ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」、Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ．１：５７５−５８２，１９９８年、Ｌｅｎｋｅｒｉ  Ｕら著、「Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｆｉｎｎｉｓｈ  ｔｙｐｅ（ＮＰＨＳ１）ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｍｕｔａｔｉｏｎ．」、Ａｍ  Ｊ  Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅｔ．、６４：５１−６１，１９９９年）。ネフリンは８個のイムノグロブリン様ドメインを含む細胞外部分と１つの３型フィブロネクチンドメイン様モジュール、１回膜貫通ドメインと１つの細胞質Ｃ末ドメインからなり、イムノグロブリンスーパーファミリーの膜貫通タンパクと推定される（Ｋｅｓｔｉｌａ  Ｍら著、「Ｐｏｓｉｔｉｏｎａｌｌｙ  ｃｌｏｎｅｄ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｎｅｐｈｒｉｎ−ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」  Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ．１：５７５−５８２，１９９８．、Ｌｅｎｋｅｒｉ  Ｕら著、「Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｆｉｎｎｉｓｈ  ｔｙｐｅ（ＮＰＨＳ１）ａｎｄ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｍｕｔａｔｉｏｎ．」、Ａｍ  Ｊ  Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅｔ．６４：５１−６１，１９９９．）。したがって、ネフリンの機能はイムノグロブリンスーパーファミリーの他のメンバーと類似していると考えられ、他のメンバーの機能としては細胞接着、シグナリング、細胞移動等の様々な機能が知られている（Ｂｒｕｍｍｅｎｄｏｒｆ  Ｔ，Ｒａｔｈｊｅｎ  ＦＤ著、「Ｔｈｅ  ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｉｎ  ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ．」、Ｉｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｒｏｆｉｌｅ，ｖｏｌ  １，Ｓｈｅｔｅｒｌｉｎｅ  Ｐ，Ｈｙｍｐｈｒｉｅｓ  Ｍ，Ｌａｔｃｈｍａｎ  Ｄ，Ｄｏｗｎｅｓ  Ｐ，編、Ｌｏｎｄｏｎ，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  Ｌｉｍｉｔｅｄ，１９９４年、ｐ．９５１−１０５８．）。
ＮＰＨＳ１でネフリンに変異がみられるということから、ネフリンの腎機能維持に果たす役割は重大と考えられ、広汎な研究がなされてきた。ネフリンは有足細胞のスリット膜領域に局在すると報告されており（Ｈｏｌｔｈｏｆｅｒ  Ｈら著、「Ｎｅｐｈｒｉｎ  ｌｏｃａｌｉｚｅｓ  ａｔ  ｔｈｅ  ｐｏｄｏｃｙｔｅ  ｆｉｌｔｒａｔｉｏｎ  ｓｌｉｔ  ａｒｅａ  ａｎｄ  ｉｓ  ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃａｌｌｙ  ｓｐｌｉｃｅｄ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｈｕｍａｎ  ｋｉｄｎｅｙ．」、Ａｍ  Ｊ  Ｐａｔｈｏｌ．、１５５：１６８１−１６８７，１９９９年、Ｈｏｌｚｍａｎ  ＬＢら著、「Ｎｅｐｈｒｉｎ  ｌｏｃａｌｉｚｅｓ  ｔｏ  ｔｈｅ  ｓｌｉｔ  ｐｏｒｅ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｅｐｉｔｈｅｌｉａｌ  ｃｅｌｌ．」、Ｋｉｄｎｅｙ  Ｉｎｔ．、５６：１４８１−１４９１，１９９９年、Ｒｕｏｔｓａｌａｉｎｅｎ  Ｖら著、「Ｎｅｐｈｒｉｎ  ｉｓ  ｓｐｅｃｉｆｉｃａｌｌｙ  ｌｏｃａｔｅｄ  ａｔ  ｔｈｅ  ｓｌｉｔ  ｄｉａｐｈｒａｇｍ  ｏｆ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｏｄｏｃｙｔｅｓ．」、Ｐｒｏｃ  ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ．、９６：７９６２−７９６７，１９９９年）、同種親和性の細胞間相互作用を持ち、腎糸球体ろ過のバリア機能に重要な役割をもつと考えられる（Ｋｅｓｔｉｌａ  Ｍら著、「Ｐｏｓｉｔｉｏｎａｌｌｙ  ｃｌｏｎｅｄ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｎｅｐｈｒｉｎ−ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」、Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ．、１：５７５−５８２，１９９８年、Ｒｕｏｔｓａｌａｉｎｅｎ  Ｖら著、「Ｎｅｐｈｒｉｎ  ｉｓ  ｓｐｅｃｉｆｉｃａｌｌｙ  ｌｏｃａｔｅｄ  ａｔ  ｔｈｅ  ｓｌｉｔ  ｄｉａｐｈｒａｇｍ  ｏｆ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｏｄｏｃｙｔｅｓ．」、Ｐｒｏｃ  ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ．、９６：７９６２−７９６７，１９９９年、Ｔｒｙｇｇｖａｓｏｎ  Ｋ著、「Ｕｎｒａｖｅｌｉｎｇ  ｔｈｅ  ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ  ｏｆ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｕｌｔｒａｆｉｌｔｒａｔｉｏｎ：ｎｅｐｈｒｉｎ，ａ  ｋｅｙ  ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｓｌｉｔ  ｄｉａｐｈｒａｇｍ．」、Ｊ  Ａｍ  Ｓｏｃ  ｎｅｐｈｒｏｌ．、１０：２４４０−２４４５，１９９９年）。
ネフリンは腎糸球体の有足細胞に特異的に発現すると報告されている（Ｋｅｓｔｉｌａ  Ｍら著、「Ｐｏｓｉｔｉｏｎａｌｌｙ  ｃｌｏｎｅｄ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｎｅｐｈｒｉｎ−ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ．１：５７５−５８２，１９９８．）。しかし、ヒトの膵ベータ細胞において、ネフリン遺伝子およびタンパク質が発現することが最近報告された（Ｐａｌｍｅｎ  Ｔら著、「Ｎｅｐｈｒｉｎ  ｉｓ  ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｐａｎｃｒｅａｔｉｃ  ｂｅｔａ  ｃｅｌｌｓ．」、Ｄｉａｂｅｔｏｌｏｇｉａ．４４：１２７４−１２８０，２００１年）。これはネフリンが膵ベータ細胞の維持に何らかの機能を持つことを示している。膵臓では、腎臓と同様に、細胞相互作用および／または細胞質Ｃ末ドメインの８つのチロシンから示唆されるように、シグナル伝達の作用が予測される（Ｋｅｓｔｉｌａ  Ｍら著、「Ｐｏｓｉｔｉｏｎａｌｌｙ  ｃｌｏｎｅｄ  ｇｅｎｅ  ｆｏｒ  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｇｌｏｍｅｒｕｌａｒ  ｐｒｏｔｅｉｎ−ｎｅｐｈｒｉｎ−ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  ｃｏｎｇｅｎｉｔａｌ  ｎｅｐｈｒｏｔｉｃ  ｓｙｎｄｒｏｍｅ．」Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ．１：５７５−５８２，１９９８．）。しかし、膵ベータ細胞におけるネフリンの役割を明らかにした報告はない。
ＤＭはありふれた病気であるため、いくつかのネフリン遺伝子の多型が、ＤＭ進行のリスク因子になっていると推測した。そこで、本発明者らは本発明において、ネフリン遺伝子のＳＮＰと２型糖尿病（ＤＭ）が関連しているかどうかを、日本人の地域を基盤としたケースコントロール試験において検討した。
７２例のＤＭ、７５例の耐糖能障害（ＩＧＴ）、２２７例の正常耐糖能（ＮＧＴ）群を第１群として最初に解析した。次に３０例のＤＭ、７６例のＩＧＴ、２４４例のＮＧＴ群を第１群に追加し、第２群として解析した。これらのサンプルはフナガタ研究（Ｏｉｚｕｍｉ  Ｔら著、「Ｇｅｎｏｔｙｐｅ  Ａｒｇ／Ａｒｇ，ｂｕｔ  ｎｏｔ  Ｔｒｐ／ａｒｇ，ｏｆ  ｔｈｅ  Ｔｒｐ６４Ａｒｇ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ  ｏｆ  ｔｈｅ  β３−ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｉｓ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｗｉｔｈ  ｔｙｐｅ  ２  ｄｉａｂｅｔｅｓ  ａｎｄ  ｏｂｅｓｉｔｙ  ｉｎ  ａ  ｌａｒｇｅ  Ｊａｐａｎｅｓｅ  ｓａｍｐｌｅ．」、Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ．、２４：１５７９−１５８３，２００１年）のコホートより選択された。フナガタ研究は東京より約４００ｋｍ北の農業地帯において行われたポピュレーションベーススタディである。また、本研究は山形大学の倫理審査委員会の承認、および、対象者より文書によるインフォームドコンセントを得た上で実施された。全工程は、ガイドラインに従い実施した。なお、研究対象となった地域は何十年かの間ほとんど人の移動はない。したがって、本発明者らの研究は、集団の層別化が擬陽性をもたらすリスクを最小化するという意味で、遺伝的背景を研究するにはふさわしい設定である。
ＤＭ、ＩＧＴ、ＮＧＴの各群は年齢・性別を一致させて解析した（年齢６５．８±９．３ｖｓ．６５．１±９．８ｖｓ．６４．８±８．８、性別比（女性／男性），５６／４６ｖｓ．７７／７４ｖｓ．２６３／２０８）。遺伝子型と共に次の形質も解析した。
身長、体重、７５ｇ経口糖負荷試験、ＨｂＡ１ｃ、ウエスト周囲径、ヒップ周囲径、ウエスト／ヒップ比、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、体脂肪率、収縮期血圧、拡張期血圧、血清総コレステロール（ＣＨＯ）、中性脂肪（ＴＧ）、高比重リポタンパク（ＨＤＬ）コレステロール。尿タンパクは試験紙（ライフスティックス、バイエルメディカル社、東京）による半定量測定を行った。
〔実施例４〕  遺伝子型および遺伝子型解析
ネフリン遺伝子におけるＳＮＰｓ（翻訳開始コドンＡＴＧからヌクレオチド位置２９４のエキソン３におけるＣからＴ（Ｃ２９４Ｔ）（ＪＳＮＰデータベースＩＤ：ＩＭＳ−ＪＳＴ０３５６５６）；イントロン５／エキソン６スプライシング部位からヌクレオチド位置６１上流のイントロン５におけるＣからＧ（−６１Ｃ／Ｇ）（ＩＭＳ−ＪＳＴ０２１０６１）；エキソン１７におけるヌクレオチド位置２２８９のＣからＴ（２２８９Ｔ）（ＩＭＳ−ＪＳＴ０００５４１）が解析された。Ｃ２９４ＴおよびＣ２２８９ＴのＳＮＰｓは、サイレントな多型である。ゲノムＤＮＡを末梢血白血球より抽出した。遺伝子タイピングは、先に記載されているように、フルオロジェニックＰＣＲで行った（Ｒａｎａｄｅ  Ｋら著、「Ｈｉｇｈ−ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ  ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ  ｗｉｔｈ  ｓｉｎｇｌｅ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ．」、Ｇｅｎｏｍｅ  ｒｅｓｅａｒｃｈ．、１１：１２６２−１２６８，２００１年）。増幅に使用したＴａｑＭａｎプライマーセットは以下のとおりである。
ＳＮＰ  Ｃ２９４Ｔには５’−ＣＣＣＣＴＧＣＡＧＧＴＧＡＡＴＴＣＣＡ−３’（配列番号：３１）および５’−ＧＣＡＣＴＣＡＴＡＣＴＣＣＧＣＧＴＣＡＴＣ−３’（配列番号：３２）、ＳＮＰ  −６１Ｃ／Ｇには５’−ＣＣＴＧＧＡＴＣＣＣＡＧＡＧＧＡＧＡＴＣＡ−３’（配列番号：３３）および５’−ＣＡＧＧＧＴＴＡＴＡＧＡＧＴＣＡＧＡＧＴＣＡＴＣＡＴＣＴ−３’（配列番号：３４）、ＳＮＰ  Ｃ２２８９Ｔには５’−ＧＡＣＣＣＣＡＣＴＧＡＧＧＴＧＡＡＣＧＴ−３’（配列番号：３５）および５’−ＧＡＡＣＡＴＧＣＣＣＧＧＧＡＧＧＡＴ−３’（配列番号：３６）。
ＦＡＭあるいはＶＩＣレポーター分子で標識したＴａｑＭａｎプローブは以下のとおりである。ＳＮＰ  Ｃ２９４Ｔには５’−ＴＧＣＡＣＡＴＴＧＡＧＧＣＣＴ−３’（配列番号：３７）および５’−ＣＡＣＡＴＣＧＡＧＧＣＣＴＧ−３’（配列番号：３８）、ＳＮＰ  −６１Ｃ／Ｇには５’−ＴＣＡＧＧＣＡＧＡＡＧＡＧＧ−３’（配列番号：３９）および５’−ＴＣＡＧＧＧＡＧＡＡＧＡＧＧＴ−３’（配列番号：４０）、ＳＮＰ  Ｃ２２８９Ｔには５’−ＴＧＧＣＡＴＣＡＡＣＡＧＴＧＣ−３’（配列番号：４１）および５’−ＡＴＴＧＧＣＡＴＣＧＡＣＡＧＴＧ−３’（配列番号：４２）。
クエリーの多型塩基は、プローブの三分割した真ん中および下線部において設計した。蛍光の増加は、ＡＢＩ  ７９００  ＨＴシーケンスディテクションシステムを用いて計測した。
〔実施例５〕  ＳＮＰｓの遺伝子型とＤＭの関連
本発明者らは３つのＳＮＰｓ（Ｃ２９４Ｔ、Ｃ６５０Ｇ、Ｃ２２８９Ｔ）の遺伝子型とＤＭとの関連を第１サンプル群（ｎ＝３７４）を用いて解析した。関連解析はＦｉｓｈｅｒ’ｓ  ｅｘａｃｔ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ  ｔｅｓｔにより、ＳＮＰ遺伝子型頻度と優性遺伝形式あるいは劣性遺伝形式を想定したケースとコントロールの比較により行った。表９５に示す通り、調査した全ＳＮＰは優性遺伝様式においてＤＭと有意な関連性が示された。表９５はネフリン遺伝子におけるＳＮＰｓとＤＭの関連を示す。
2004084797.tif 000108
データは数値（％）で示す。ＩＧＴ群およびＤＭ群における有リスク遺伝子型の頻度をそれぞれＮＧＴ群と比較した。Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。
すなわち、Ｃ２９４ＴにおいてＴＴおよびＣＴの遺伝子型を持つ人、−６１Ｃ／ＧにおいてＧＧおよびＣＧの遺伝子型を持つ人、Ｃ２２８９ＴにおいてＴＴおよびＣＴの遺伝子型を持つ人は、他の遺伝子型を持つ人より糖尿病性が強かった。従って、これらの遺伝子型はＤＭの進行における有リスク遺伝子型であるといえる。逆に、ＤＭ群では健常群より有リスク遺伝子型を持つ人が多くみられた。
〔実施例６］  ハプロタイプ解析
本発明者らは、さらに３ＳＮＰを用いてハプロタイプ解析を行った。
各ＳＮＰ間の連鎖不平衡を、ＬＤサポート（Ｋｉｔａｍｕｒａ  Ｙら著、「Ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ  ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ  ｏｆ  ｄｉｐｌｏｔｙｐｅ  ｃｏｎｆｉｇｕｒａｔｉｏｎ（ｄｉｐｌｏｔｙｐｅ  ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ）ｆｏｒ  ｅａｃｈ  ｓｕｂｊｅｃｔ  ｆｒｏｍ  ｇｅｎｏｔｙｐｉｃ  ｄａｔａ  ｕｓｉｎｇ  ｔｈｅ  ＥＭ  ａｌｇｏｒｉｔｈｍ．」、Ａｎｎ  Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅｔ．、６６：１８３−９３，２００２年）というハプロタイプ予測プログラムによって評価した。各ＳＮＰ間で強い連鎖不平衡を示すＳＮＰは、ハプロタイプブロックとした。ハプロタイプ頻度の決定は、ＬＤサポートを用いて行った。
ハプロタイプと疾患の表現型との関連評価には、マルチカラム表を用いたカイ二乗検定を行った。マルチカラム分割表におけるカイ二乗検定は通常、漸近平衡の正常な分布を示さない。
本発明者らはｃｌｕｍｐというプログラムを用いてＭｏｎｔｅ  Ｃａｒｌｏ  Ｍａｒｋｏｖ−Ｃｈａｉｎ（ＭＣＭＣ法）によるｐｅｒｍｕｔａｔｉｏｎを適用して解析を行った。
このプログラムのＣｌａｍｐ  Ｔ１  ｔｅｓｔは列とカラムにおける辺縁の固定されたセルの数がランダムな分割表を生成する。１０，０００回シミュレートされた表では、カイ二乗統計解析量の帰無仮説下分布（ｎｕｌｌ  ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ）が得られ、これは実際のデータセットにおけるカイ二乗値に対応する経験ｐ値を求めるのに利用した。
Ｃｌｕｍｐ  Ｔ３は存在する２×２の分割表すべてにおけるカイ二乗値の最大値を求めるプログラムである。すなわち、あるカラムとその他のすべてのカラムの和で２×２分割表を作成する。そして、カイ二乗値が最大値を示す表を選択し、ＭＣＭＣ化法によりｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ値を前述のように計算した。ＭＣＭＣ法は、従来のボンフェローニ補正をした多重２×２分割表検定より、実質的な検定力において有利である。
結果、６ハプロタイプからなる１つのハプロタイプブロックが見つかった。ネフリン遺伝子におけるＳＮＰｓのハプロタイプの頻度および解析の結果を表９６に示す。
2004084797.tif 000109
データは数値（％）で示す。２ｘ２フィッシャーの直接確率検定（Ｆｉｓｈｅｒ）を示す。Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。
２×６分割表のｃｌｕｍｐ分析のＴ１  ｔｅｓｔによるｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ値は０．００３４を示した。ｃｌｕｍｐのＴ３  ｔｅｓｔによる結果は、ハプロタイプ１がｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ値０．００２２（１００００ｐｅｒ  ｍｕｔａｔｉｏｎｓ）を示した。さらに、２×２分割表を用いたフィッシャーの直接確率検定では、ハプロタイプ１（ｐ＝０．０００８）はオッズ比（ＯＲ）１以下という、有意な関連性を示した。ボンフェローニの補正後も０．００４７というとても低いｐ値を示した。ハプロタイプ１は非有リスクアリルである各ＳＮＰから構成され、オッズ比１以下で有意差が認められる。以上の結果より、ハプロタイプ１は明らかに疾患抵抗性の指標となる事を示している。逆に、ハプロタイプ１以外のハプロタイプはＤＭ進行における有リスクの指標であると考えられる。実際、ハプロタイプ３はオッズ比が１以上であり有意差を示している。
〔実施例７〕  各個人のハプロタイプコンビネーション（ディプロタイプ形質）の決定
各個人のディプロタイプ形質の決定は、ＬＤサポートを用いて行った。予測の８０％以上の事後確率が認められたものを、ディプロタイプ構築に用いた。ディプロタイプと疾患の表現型との関連評価には、マルチカラム表を用いたカイ二乗検定を行った。
観察された９ディプロタイプは表９７のように２×９分割表に示される。表９７にネフリン遺伝子のハプロタイプのディプロタイプ分析の結果を示す。
2004084797.tif 000110
データは数値（％）で示す。２ｘ２フィッシャーの直接確率検定（Ｆｉｓｈｅｒ）を示す。Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。
ｃｌｕｍｐのＴ１  ｔｅｓｔによるｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ値は０．０１１０であり、ｃｌｕｍｐのＴ３  ｔｅｓｔによる結果ではディプロタイプ１／１が最も高いカイ二乗値と最も低いｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ値０．０００９（１０，０００ｐｅｒｍｕｔａｔｉｏｎ）を示し３た。フィッシャーの直接確率検定においてもディプロタイプ１／１がオッズ比１以下であり、有意差を示した。したがって、有リスクアリルを持たないハプロタイプブロックのみを持つことは、ＤＭの進行を抑止する指標となると考えられる。逆に、ディプロタイプ１／１以外のものは１／１のものよりも２．８７倍（９５％信頼区間１．６１−５．１１）ＤＭを発症しやすいといえる。
〔実施例８〕  ＤＭ群とＮＧＴ群で異なる形質の検討
関連解析の性質として、上記の結果は、ＳＮＰｓはＤＭ群とＮＧＴ群で異なる何らかの形質に関連すると解釈できる。これらの形質は、ＤＭそのものの本来の形質ではなく、むしろＤＭに関連した形質と考えられる。したがって、本発明者らは、ＤＭ群とＮＧＴ群で異なる形質を検討するため、以下の形質を解析した。
身長、体重、７５ｇ経口糖負荷試験、ＨｂＡ１ｃ、ウエスト周囲径、ヒップ周囲径、ウエスト／ヒップ比、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、体脂肪率、収縮期血圧、拡張期血圧、血清総コレステロール（ＣＨＯ）、中性脂肪（ＴＧ）、高比重リポタンパク（ＨＤＬ）コレステロール。尿タンパクは試験紙（ライフスティックス、バイエルメディカル社、東京）による半定量測定を行った。
ＤＭで見られる形質の値の違いによって、統計学的有意差が認められた。フィッシャーの直接確率検定に対するｐ値、ＯＲ、および９５％信頼区間は、２Ｘ２プログラム（ｈｔｔｐ：／／ｌｉｎｋａｇｅ．ｒｏｃｋｅｆｅｌｌｅｒ．ｅｄｕ／ｏｔｔ／ｌｉｎｋｕｔｉｌ．ｈｔｍ）により算出した。表入力の１つにゼロがある場合、″Ｓｈｅｅｈｅ″ＯＲ（Ｓｈｅｅｈｅ  ＰＲ著、「Ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｌｏｇ  ｒｅｌａｔｉｖｅ  ｒｉｓｋ  ｉｎ  ｒｅｔｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ  ｓｔｕｄｉｅｓ  ｏｆ  ｄｉｓｅａｓｅ．」、Ａｍ  Ｊ  Ｐｕｂｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ．、５６：１７４５−１７５０，１９６６年）が算出される。ＤＭ、ＩＧＴ、およびＮＧＴ群間の形質値の有意差は、分散分析によって評価した。多重比較分析（ｐｏｓｔ  ｈｏｃ  ａｎａｌｙｓｉｓ）のためにＳｃｈｅｆｆｅ’ｓ  Ｆ検定を行った。
予測した通り、体重、ウエスト周囲径、ヒップ周囲径、ウエスト周囲径／ヒップ周囲径、ＢＭＩはＤＭ群でより高く、血清トリグリセライド（ＴＧ）値もまたＤＭ群でＮＧＴ群より高かった（１５３．９±１７９．３ｖｓ．１１０．６±９５．６，ｐ＝０．００５０）。しかし、血清コレステロール値、ＨＤＬコレステロール値には有意な差は認められなかった。また、収縮期および拡張期血圧でも両群に差は認められなかった。ネフリンの機能障害はタンパク尿を起こすことが知られていることから、両群の排泄尿中に１５ｍｇ／ｄｌ以上のタンパクを有する人のタンパク尿の頻度を比べてみたが、有意差は認められなかった（ｐ＞０．９９９９）。
【実施例９】  以上の結果を総合すると、これらのＳＮＰは肥満や高ＴＧと関連する可能性も考えられる。これらの可能性を排除するために、本発明者らは多変量ロジスティック解析を行い、これらのＳＮＰがＢＭＩやＴＧから独立していることを示そうと試みた。本発明者らはＳＮＰｓとしてＣ２２８９Ｔを用い、第２サンプル群（ｎ＝７２４）にて解析を行った。Ｐ＜０．０５を有意差ありとした。ＴＧおよびＢＭＩ値補正後も、なおＳＮＰの有リスク遺伝子型は、ＩＧＴ群およびＤＭ群とＮＧＴ群との比較において有意差を示した（表９８）。表９８に、ＤＭの進行におけるネフリン遺伝子のＳＮＰ（Ｃ２２８９Ｔ）の有リスク遺伝子型の寄与について示した。
2004084797.tif 000111
データは数値（％）である。ＩＧＴおよびＤＭ群における有リスク遺伝子型の頻度を、それぞれＮＧＴ群と比較した。Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。ＯＲは血清トリグリセリドレベル（ＴＧ）およびボディマスインデックス（ＢＭＩ）で調整した。
以上のように、遺伝子におけるＳＮＰｓとＤＭとの関連が、地域を基盤とした日本人のケースコントロール試験において認められた。
本発明者らは、遺伝子におけるＳＮＰｓがＤＭ発症リスクを評価する有用な指標であることを明らかにし、本発明の結果はさらに、ネフリンが基礎的な機能において重要な役割を果たし、ネフリンの機能障害がＤＭの発症に関連することを示している。
〔実施例１０〕  解析対象
本発明者らは、末梢細胞からＨＤＬへの脂質の輸送を調節するもとのして重要なＡＴＰ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ  ｔｒａｎｓｏｒｔｏｒ１（ＡＢＣＡ１）が、ＤＭの進行に関与すると推測した。
ＡＢＣＡ１遺伝子の欠損は、Ｔａｎｇｉｅｒ病や家族性低アルファリポタンパク血症（ＦＨＡ）のような遺伝性のＨＤＬ欠損症を起こす（Ｓｃｈｍｉｔｚ  Ｇ，Ｂｕｅｃｈｌｅｒ  Ｃ：ＡＢＣＡ１：ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ，ｔｒａｆｆｉｃｋｉｎｇ  ａｎｄ  ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｗｉｔｈ  ｈｅｔｅｒｏｍｅｒｉｃ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ．Ａｎｎ  Ｍｅｄ  ３４：３３４−３４７，２００２、Ｏｒａｍ  ＪＦ，Ｌａｗｎ  ＲＭ：ＡＢＣＡ１：ｔｈｅ  ｇａｔｅｋｅｅｐｅｒ  ｆｏｒ  ｅｌｉｍｉｎａｔｉｎｇ  ｅｘｃｅｓｓ  ｔｉｓｕｕｅ  ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ．Ｊ  Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ  ４２：１１７３−１１７９，２００１、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ  Ｎ：ＡＴＰ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  Ａ１−ｋｅｙ  ｒｏｌｅｓ  ｉｎ  ｃｅｌｌｕｌａｒ  ｌｉｐｉｄ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔ  ａｎｄ  ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ．Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｃｈｅｍ  ２３７：１５５−１６４，２００２、Ｓａｎｔａｍａｒｉｎａ−Ｆｏｊｏ  Ｓ，Ｒｅｍａｌｅｙ  ＡＴ，Ｎｅｕｆｅｌｄ  ＥＢ，Ｂｒｅｗｅｒ  ＨＢ：Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ  ｔｒａｆｆｉｃｋｉｎｇ  ｏｆ  ｔｈｅ  ＡＢＣＡ１  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ．Ｊ  Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ  ４２：１３３９−１３４５，２００１、Ｂｒｏｏｋｓ−Ｗｉｌｓｏｎ  Ａ，Ｍａｒｃｉｌ  Ｍ，Ｃｌｅｅ  ＳＭ，Ｚｈａｎｇ  ＬＨ，Ｒｏｏｍｐ  Ｋ，ｖａｎ  Ｄａｍ  Ｍ，Ｙｕ  Ｌ，Ｂｒｅｗｅｒ  Ｃ，Ｃｏｌｌｉｎｓ  ＪＡ，Ｍｏｌｈｕｉｚｅｎ  ＨＯＦ，Ｌｏｕｂｓｅｒ  Ｏ，Ｏｕｒｌｒｔｔｒ  ＢＦＦ，Ｆｉｃｈｔｅｒ  Ｋ，Ａｓｈｂｏｕｒｎｅ−Ｅｘｃｏｆｆｏｎ  ＫＪＤ，Ｓｅｎｓｅｎ  ＣＷ，Ｓｃｈｅｒｅｒ  Ｓ，Ｍｏｔｔ  Ｓ，Ｄｅｎｉｓ  Ｍ，Ｍａｒｔｉｎｄａｌｅ  Ｄ，Ｆｒｏｈｌｉｃｈ  Ｊ，Ｍｏｒｇａｎ  Ｋ，Ｋｏｏｐ  Ｂ，Ｐｉｍｓｔｏｎｅ  Ｓ，Ｋａｓｔｅｌｅｉｎ  ＪＪＰ，Ｇｅｎｅｓｔ  Ｊ，Ｈａｙｄｅｎ  ＭＲ：Ｍｕｔａｔｉｏｍｓ  ｉｎ  ＡＢＣ１  ｉｎ  Ｔａｎｇｉｅｒ  ｄｉｓｅａｓｅ  ａｎｄ  ｆａｍｉｌｉａｌ  ｈｉｇｈ−ｄｅｎｓｉｔｙ  ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ．Ｎａｔ  Ｇｅｎｅｔ  ２２：３３６−３４５，１９９９、Ｂｏｄｚｉｏｃｈ  Ｍ，Ｏｒｓｏ  Ｅ，Ｋｌｕｃｋｅｎ  Ｔ，Ｌａｎｇｍａｎｎ  Ｔ，Ｂｏｔｔｃｈｅｒ  Ｌ，Ｄｉｅｄｅｒｉｃｈ  Ｗ，Ｄｒｏｂｎｉｋ  Ｗ，Ｂａｒｌａｇｅ  Ｓ，Ｂｕｃｈｌｅｒ  Ｃ，Ｐｏｒｓｃｈ−Ｏｚｃｕｒｕｍｅｚ  Ｍ，ｋａｍｉｎｓｋｉ  ＷＥ，Ｈａｈｍａｎｎ  ＨＷ，Ｏｅｔｔｅ  Ｋ，Ｒｏｔｈｅ  Ｇ，Ａｓｌａｎｉｄｉｓ  Ｃ，Ｌａｃｋｎｅｒ  ＫＪ，Ｓｃｈｍｉｔｚ  Ｇ：Ｔｈｅ  ｇｅｎｅ  ｅｎｃｏｄｉｎｇ  ＡＴＰ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  １  ｉｓ  ｍｕｔａｔｅｄ  ｉｎ  Ｔａｎｇｉｅｒ  ｄｉｓｅａｓｅ．Ｎａｔ  Ｇｅｎｅｔ  ２２：３４７−３５１，１９９９、Ｒｕｓｔ  Ｓ，Ｒｏｓｉｅｒ  Ｍ，Ｆｕｎｋｅ  Ｈ，Ｒｅａｌ  Ｊ，Ａｍｏｕｒａ  Ｚ，Ｐｉｅｔｔｅ  ＪＣ，Ｄｅｌｅｕｚｅ  ＪＦ，Ｂｒｅｗｅｒ  ＨＢ，Ｄｕｖｅｒｇｅｒ  Ｎ，Ｄｅｎｅｆｌｅ  Ｐ，Ａｓｓｍａｎｎ  Ｇ：Ｔａｎｇｉｅｒ  ｄｉｓｅａｓｅ  ｉｓ  ｃａｕｓｅｄ  ｂｙ  ｍｕｔａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｇｅｎｅ  ｅｏｎｃｏｄｉｎｇ  ＡＴＰ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  １．Ｎａｔ  Ｇｅｎｅｔ  ２２：３５２−３５５，１９９９、Ｍｉｌｌｅｒ  Ｍ，Ｒｈｙｎｅ  Ｊ，Ｈａｍｌｅｔｔｅ  Ｓ，Ｂｉｒｎｂａｕｍ  Ｊ，Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ  Ａ：Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  ｏｆ  ＨＤＬ  ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ  ｉｎ  ｈｕｍａｎｓ．Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｌｉｐｉｄｏｌ  １４：２７３−２７９，２００３、Ｓｉｎｇａｒａｊａ  ＲＲ，Ｂｒｕｎｈａｍ  ＬＲ，Ｖｉｓｓｃｈｅｒ  Ｈ，Ｋａｓｔｅｌｅｉｎ  ＪＪＰ，Ｈａｙｄｅｎ  ＭＲ：Ｅｆｆｌｕｘ  ａｎｄ  ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ−ｔｈｅ  ｃｌｉｎｉｃａｌ  ａｎｄ  ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  ｉｍｐａｃｔ  ｏｆ  ｖａｒｉａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ＡＢＣＡ１  ｇｅｎｅ．Ａｒｔｅｒｉｓｃｌｅｒ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｖａｓｃ  Ｂｉｏｌ  ２００：１３２２−１３３２，２００３）。ＡＢＣＡ１遺伝子の一般的な多型として、血清脂質値、特にＨＤＬコレステロール値、冠動脈疾患（ＣＡＤ）と関連するものは数多く報告されているが（Ｍｉｌｌｅｒ  Ｍ，Ｒｈｙｎｅ  Ｊ，Ｈａｍｌｅｔｔｅ  Ｓ，Ｂｉｒｎｂａｕｍ  Ｊ，Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ  Ａ：Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  ｏｆ  ＨＤＬ  ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ  ｉｎ  ｈｕｍａｎｓ．Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｌｉｐｉｄｏｌ  １４：２７３−２７９，２００３、Ｓｉｎｇａｒａｊａ  ＲＲ，Ｂｒｕｎｈａｍ  ＬＲ，Ｖｉｓｓｃｈｅｒ  Ｈ，Ｋａｓｔｅｌｅｉｎ  ＪＪＰ，Ｈａｙｄｅｎ  ＭＲ：Ｅｆｆｌｕｘ  ａｎｄ  ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ−ｔｈｅ  ｃｌｉｎｉｃａｌ  ａｎｄ  ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  ｉｍｐａｃｔ  ｏｆ  ｖａｒｉａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ＡＢＣＡ１  ｇｅｎｅ．Ａｒｔｅｒｉｓｃｌｅｒ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｖａｓｃ  Ｂｉｏｌ  ２００：１３２２−１３３２，２００３、Ｃｌｅｅ  ＳＭ，Ｚｗｉｎｄｅｒｍａｎ  ＡＨ，Ｅｎｇｅｒｔ  ＪＣ，Ｚｗａｒｔｓ  ＫＹ，Ｍｏｌｈｕｉｚｅｎ  ＨＯＦ，Ｒｏｏｍｐ  Ｋ，Ｊｕｋｅｍａ  ＪＷ，ｖａｎ  Ｗｉｊｌａｎｄ  Ｍ，ｖａｎ  Ｄａｍ  Ｍ，Ｈｕｄｓｏｎ  ＴＪ，Ｂｒｏｏｋｓ−Ｗｉｌｓｏｎ  Ａ，Ｇｅｎｅｓｔ  Ｊ  Ｊｒ，Ｋａｓｔｅｌｅｉｎ  ＪＪＰ，Ｈａｙｄｅｎ  ＭＲ：Ｃｏｍｍｏｎ  ｇｅｎｅｔｉｃ  ｖａｒｉａｔｉｏｎ  ｉｎ  ＡＢＣＡ１  ｉｓ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｗｉｔｈ  ａｌｔｅｒｅｄ  ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  ｌｅｖｅｌｓ  ａｎｄ  ａ  ｍｉｄｉｆｉｅｄ  ｒｉｓｋ  ｆｏｒ  ｃｏｅｏｎａｒｙ  ａｒｔｅｒｙ  ｄｉｓｅａｓｅ．Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ  １０３：１１９８−１２０５，２００１、Ｌｕｔｕｃｕｌｔａ  Ｓ，Ｂａｌｌａｎｔｙｎｅ  ＣＭ，Ｅｌｇｈａｎｎａｍ  Ｈ，Ｇｏｔｔｏ  ＡＭ  Ｊｒ，Ｍａｒｉａｎ  ＡＪ：Ｎｏｖｅｌ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ  ｉｎ  ｐｒｏｍｏｔｅｒ  ｒｅｇｉｏｎ  ｏｆ  ＡＴＰ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  ｇｅｎｅ  ａｎｄ  ｐｌａｓｍａ  ｌｉｐｉｄｓ，ｓｅｖｅｒｉｔｙ，ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ，ａｎｄ  ｒｅｇｒｅｓｓｉｏｎ  ｏｆ  ｃｏｒｏｎａｒｙ  ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ  ａｎｄ  ｒｅｓｐｏｎｓｅ  ｔｏ  ｔｈｅｒａｐｙ．Ｃｉｒｃ  Ｒｅｓ  ８８：９６９−９７３，２００１、Ｂｒｏｕｓｓｅａｕ  ＭＥ，Ｂｏｄｚｉｏｃｈ  Ｍ，Ｓｃｈａｅｆｅｒ  ＥＪ，Ｇｏ���ｄｋａｍｐ  ＡＬ，Ｋｉｅｌａｒ  Ｄ，Ｐｒｏｂｓｔ  Ｍ，Ｏｒｄｏｖａｓ  ＪＭ，Ａｓｌａｎｉｄｉｓ  Ｃ，Ｌａｃｋｎｅｒ  ＫＪ，Ｒｕｂｉｎｓ  ＨＢ，Ｃｏｌｌｉｎｓ  Ｄ，Ｒｏｂｉｎｓ  ＳＪ，Ｗｉｌｓｏｎ  ＰＷＦ，Ｓｃｈｍｉｔｚ  Ｇ：Ｃｏｍｍｏｎ  ｖａｒｉａｎｔｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｇｅｎｅ  ｅｎｃｏｄｉｎｇ  ＡＴＰ−ｂｉｎｄｉｎｇ  ｃａｓｓｅｔｔｅ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ  １  ｉｎ  ｍｅｎ  ｗｉｔｈ  ｌｏｗ  ＨＤＬ  ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ  ｌｅｖｅｌｓ  ａｎｄ  ｃｏｒｏｎａｒｙ  ｈｅａｒｔ  ｄｉｓｅａｓｅ．Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ  １５４：６０７−６１１，２００１、Ｚｗａｒｔｓ  ＫＹ，Ｃｌｅｅ  ＳＭ，Ｚｗｉｎｄｅｒｍａｎ  ＡＨ，Ｅｎｇｅｒｔ  ＪＣ，Ｓｉｎｇａｒａｊａ  Ｒ，Ｌｏｕｂｓｅｒ  Ｏ，Ｊａｍｅｓ  Ｅ，Ｒｏｏｍｐ  Ｋ，Ｈｕｄｓｏｎ  ＴＪ，Ｊｕｋｅｍａ  ＪＷ，Ｋａｓｔｅｌｅｉｎ  ＪＪＰ，Ｈａｙｄｅｎ  ＭＲ：ＡＢＣＡ１  ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ  ｖａｒｉａｎｔｓ  ｉｎｆｌｕｅｎｃｅ  ｃｏｒｏｎａｒｙ  ａｒｔｅｒｙ  ｄｉｓｅａｓｅ  ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ  ｏｆ  ｅｆｆｅｃｔｓ  ｏｎ  ｐｌａｓｍａ  ｌｉｐｉｄ  ｌｅｖｅｌｓ．Ｃｌｉｎ  Ｇｅｎｅｔ  ６１：１１５−１２５，２００２、Ｈｏｎｇ  ＳＨ，Ｒｈｙｎｅ  Ｊ，Ｍｉｌｌｅｒ  Ｍ：Ｎｏｖｅｌ  ｐｏｌｙｐｙｒｉｍｉｄｉｎｅ  ｖａｒｉａｔｉｏｎ（ＩＶＳ４６：ｄｅｌ  Ｔ−３９．．．−４６）ｉｎ  ＡＢＣＡ１  ｃａｕｓｅｓ  ｅｘｏｎ  ｓｋｉｐｐｉｎｇ  ａｎｄ  ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｅｓ  ｔｏ  ＨＤＬ  ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ  ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ  ｉｎ  ａ  ｆａｍｉｌｙ  ｗｉｔｈ  ｐｒｅｍａｔｕｒｅ  ｃｏｒｏｎａｒｙ  ｄｉｓｅａｓｅ．Ｃｉｒｃ  Ｒｅｓ  ９３：１００６−１０１２，２００３、Ｔａｎ  ＪＨ−Ｈ，Ｌｏｗ  Ｐ−Ｓ，Ｔａｎ  Ｙ−Ｓ，Ｔｏｎｇ  Ｍ−Ｃ，Ｓａｈａ  Ｎ，Ｙａｎｇ  Ｈ，Ｈｅｎｇ  Ｃ−Ｋ：ＡＢＣＡ１  ｇｅｎｅ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ  ａｎｄ  ｔｈｅｉｒ  ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓ  ｗｉｔｈ  ｃｏｒｏｎａｒｙ  ａｒｔｅｒｙ  ｄｉｓｅａｓｅ  ａｎｄ  ｐｌａｓｍａ  ｌｉｐｉｄｓ  ｉｎ  ｍａｌｅｓ  ｆｒｏｍ  ｔｈｒｅｅ  ｅｔｈｎｉｃ  ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ｓｉｎｇａｐｏｒｅ．Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅｔ  １１３：１０６−１１７，２００３）、糖尿病との関連を示すものはない。
血清ＨＤＬコレステロール値の低下は２型糖尿病患者にしばしば認められ、インスリン抵抗性にも関与するといわれている事から、ＡＢＣＡ１遺伝子と２型糖尿病の関連を推測した。本発明においてＡＢＣＡ１遺伝子上のＳＮＰ（ＩＭＳ−ＪＳＴ１０５３２２）がＤＭと関連することを既に示したが（表３６）、発明者らは更なる解析を行なうために、ＡＢＣＡ１遺伝子のＳＮＰと２型糖尿病（ＤＭ）が関連しているかどうかを、日本人の地域を基盤としたハプロタイプ解析を用いたケースコントロール試験において検討した。
７２例のＤＭ、７５例の耐糖能障害（ＩＧＴ）、２２７例の正常耐糖能（ＮＧＴ）群を解析した。これらのサンプルはフナガタ研究（Ｏｉｚｕｍｉ  Ｔら著、「Ｇｅｎｏｔｙｐｅ  Ａｒｇ／Ａｒｇ，ｂｕｔ  ｎｏｔ  Ｔｒｐ／ａｒｇ，ｏｆ  ｔｈｅ  Ｔｒｐ６４Ａｒｇ  ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ  ｏｆ  ｔｈｅ  β３−ａｄｒｅｎｅｒｇｉｃ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  ｉｓ  ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｗｉｔｈ  ｔｙｐｅ  ２  ｄｉａｂｅｔｅｓ  ａｎｄ  ｏｂｅｓｉｔｙ  ｉｎ  ａ  ｌａｒｇｅ  Ｊａｐａｎｅｓｅ  ｓａｍｐｌｅ．」、Ｄｉａｂｅｔｅｓ  Ｃａｒｅ．、２４：１５７９−１５８３，２００１年）のコホートより選択された。フナガタ研究は東京より約４００ｋｍ北の農業地帯において行われたポピュレーションベーススタディである。また、本研究は山形大学の倫理審査委員会の承認、および、対象者より文書によるインフォームドコンセントを得た上で実施された。全工程は、ガイドラインに従い実施した。なお、対象集団をＳＴＲＵＣＴＵＲＥというソフトウェア（Ｐｒｉｔｃｈａｒｄ  ＪＫ，Ｓｔｅｐｈｅｎｓ  Ｍ，Ｄｏｎｎｅｌｌｙ  Ｐ：Ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ  ｏｆ  ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ  ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ｕｓｉｎｇ  ｍｕｌｔｉｌｏｃａｌ  ｇｅｎｏｔｙｐｅ  ｄａｔａ．Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  １５５：９４５−９５９，２０００）で分析したところ層別化は認められなかった（Ｄａｉｍｏｎ  Ｍ，Ｊｉ  Ｇ，Ｓａｉｔｏｈ  Ｔ，Ｏｉｚｕｍｉ  Ｔ，Ｔｏｍｉｎａｇａ  Ｍ，Ｎａｋａｍｕｒａ  Ｔ，Ｉｓｈｉｉ  Ｋ，Ｍａｔｓｕｕｒａ  Ｔ，Ｉｎａｇｅｄａ  Ｋ，Ｍａｔｓｕｍｉｎｅ  Ｈ，Ｋｉｄｏ  Ｔ，Ｈｔａｙ  Ｌ，Ｋａｍａｔａｎｉ  Ｎ，Ｍｕｒａｍａｔｓｕ  Ｍ，Ｋａｔｏ  Ｔ：Ｌａｒｇｅ−ｓｃａｌｅ  ｓｅａｒｃｈ  ｏｆ  ＳＮＰｓ  ｆｏｒ  ｔｙｐｅ  ２  ＤＭ  ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ  ｇｅｎｅｓ  ｉｎ  ａ  Ｊａｐａｎｅｓｅ  ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ．Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  Ｒｅｓ  Ｃｏｍｍｕｎ  ３０２：７５１−７５８，２００３）。
ＤＭ、ＩＧＴ、ＮＧＴの各群は年齢・性別を一致させて解析し、遺伝子型と共に身長、体重、７５ｇ経口糖負荷試験、ＨｂＡ１ｃ、ウエスト周囲径、ヒップ周囲径、ウエスト／ヒップ比、ボディマスインデックス（ＢＭＩ）、体脂肪率、収縮期血圧、拡張期血圧、血清総コレステロール（ＣＨＯ）、中性脂肪（ＴＧ）、高比重リポタンパク（ＨＤＬ）コレステロール等の形質を解析した。
連鎖不平衡ブロック（ＬＤブロック）はペアワイズ法によりＬＯＤ−ｐ値が０．０１以下のＳＮＰのセットを抽出した。ＬＤブロック毎のハプロタイプとディプロタイプの頻度はＥＭアルゴリズムに基づいたＬＤサポートというソフトウェア（Ｋｉｔａｍｕｒａ  Ｙ，Ｍｏｒｉｇｕｃｈｉ  Ｍ，Ｋａｎｅｋｏ  Ｈ，Ｍｏｒｉｓａｋｉ  Ｔ，Ｔｏｙａｍａ  Ｋ，Ｋａｍａｔａｎｉ  Ｎ：Ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ  ｏｆ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ  ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ  ｏｆ  ｄｉｐｌｏｔｙｐｅ  ｃｏｎｆｉｇｕｒａｔｉｏｎ（ｄｉｐｌｏｔｙｐｅ  ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ）ｆｏｒ  ｅａｃｈ  ｓｕｂｊｅｃｔ  ｆｒｏｍ  ｇｅｎｏｔｙｐｉｃ  ｄａｔａ  ｕｓｉｎｇ  ｔｈｅ  ＥＭ  ａｌｇｏｒｉｔｈｍ．Ａｎｎ  Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅｔ  ６６：１８３−９３，２００２）を用いて予測し、事後確率が８０％以上の場合のみ解析対象とした。
ＥＭアルゴリズム（ｅｘｐｅｃｔａｔｉｏｎ−ｍａｘｉｍｉｚａｔｉｏｎ（ＥＭ）ａｌｇｏｒｉｔｈｍ）を用いたＬＤｓｕｐｐｏｒｔにより個人のハプロタイプ型を決定し、連鎖不平衡が認められた領域について疾患関連解析を行なった。有意差の評価は、並べ替え検定（ｐｅｒｍｕｔａｔｉｏｎ  ｔｅｓｔ）により行い、得られた経験的ｐ値（ｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ）が０．０５未満であった場合に有意差ありと判断した。疾患にリスクを持つハプロタイプを特定するために、Ｅｍｐｉｒｉｃａｌ  ｐ＜０．０５を示したＬＤブロックについて、ハプロタイプ毎に疾患群と対照群とのアリル頻度をフィッシャーの直接確率検定により検定し、ボンフェローニの補正を行い、ｐ＜０．０５を有意差ありとした。９５％信頼区域（９５％ＣＩ）も２ＢＹ２プログラム
（ｈｔｔｐ：／／ｌｉｎｋａｇｅ．ｒｏｃｋｅｆｅｌｌｅｒ．ｅｄｕ／ｏｔｔ／ｌｉｎｋｕｔｉｌ．ｈｔｍ）により計算し、その結果を表９９および１００に示す。なお、ハプロタイプ型と各形質との関連をスチューデントのｔ−検定で検定し、ａｔ−ｒｉｓｋディプロタイプはＴＧ、ＢＭＩ、ＨＤＬ−コレステロール値とは独立して有意であることが多重ロジスティック解析により確認している。
ＡＢＣＡ１遺伝子上のＳＮＰｓの連鎖不平衡について検討した結果、図１の通りであった。対象全体では８つのＬＤブロック（１，２，３，４，５，９，１０）、ＮＧＴ＋ＤＭ群では９つのＬＤブロック（１，２，３，４，５，７，８，９，１０）が見られた。ＡＢＣＡ１遺伝子のほぼ全領域が１０のＬＤブロックでカバーされており、ＬＤブロック６は集団により７と８に分かれていた。ＬＤブロック９のＳＮＰ２８（Ｔ／Ｃイントロン４５上）はＳＮＰを用いて行なった疾患関連解析において有意差を示したＳＮＰである。
＜ブロック１とＤＭの関連＞
ケース群（ＩＧＴ＋ＤＭ、またはＤＭ群のみ）とコントロール群（ＮＧＴ）のハプロタイプ分布の検定結果を表９９に示した。ＬＤブロック１はどちらのケースコントロール解析（ＮＧＴ  ｖｓ．ＩＧＴ＋ＤＭ、ＮＧＴ  ｖｓ．ＤＭ）においても有意差を示したが、ＤＭ群を単独でケース群とした場合（ＮＧＴ  ｖｓ．ＤＭ）においてより低いｐ値（ｐ＝０．０００５）を示した。
表１００（ＬＤブロック１に観察された各ハプロタイプの疾患関連解析結果）に示すＬＤブロック１のハプロタイプ３はボンフェローニの補正後もｐ＝０．０００６と高い有意差を示した。ハプロタイプ３のオッズ比は２．３０、９５％信頼区域は１．５−３．５３であり、ハプロタイプ３はａｔ−ｒｉｓｋハプロタイプ、すなわち疾患感受性のハプロタイプであると結論づけられる。ＬＤブロック１を構成するＳＮＰであるＳＮＰ１とＳＮＰ２はいずれもＳＮＰを用いた疾患関連解析では有意差を示さなかった。従って、ハプロタイプ３と連鎖する領域（ＬＤブロック１またはその近傍）の遺伝的多型がＤＭ疾患易罹患性との関連していると考えられる。
2004084797.tif 000112
上記表９９において、Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。ＮＤは、ケース群またはコントロール群のどちらかにおいて当該ハプロタイプが０と推定されたために解析を”実施していない”ことを指す。
2004084797.tif 000113
上記表１００において、Ｐ値は、２ｘ２  Ｆｉｓｈｅｒ’ｓ  ｅｘａｃｔ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ  ｔｅｓｔ（Ｆｉｓｈｅｒ）、およびそれらの補正（Ｂｏｎｆｅｒｒｏｎｉ）により得たものを示す。Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。
＜ＬＤブロック１のディプロタイプ解析＞
ディプロタイプ１／２、１／３、３／３が有意差を示した。１／２は疾患抵抗性であり、１／３、３／３は疾患感受性であった。これはハプロタイプを用いた疾患関連解析の結果ハプロタイプ３が疾患感受性ハプロタイプであったという結果と矛盾しない。さらにハプロタイプ３を持つ個体と持たない個体で検定を行なった結果、ｐ＝０．０００５とやはり有意な結果であり、オッズ比は２．６１であった。ＬＤブロック１の各ディプロタイプの疾患関連解析の結果を表１０１に示す。
2004084797.tif 000114
Ｐ値は、２ｘ２  Ｆｉｓｈｅｒ’ｓ  ｅｘａｃｔ  ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ  ｔｅｓｔ（Ｆｉｓｈｅｒ）、およびそれらの補正（Ｂｏｎｆｅｒｒｏｎｉ）により得たものを示す。Ｐ＜０．０５および０．０１はそれぞれ＊および＊＊によって示す。
＜疾患感受性ハプロタイプ（３）を持つ群の臨床的特徴＞
表３４に示す通り、ＤＭ群はＮＧＴ群に比べてＢＭＩ、血清ＴＧ値が高い傾向がある。従って、ａｔ−ｒｉｓｋよびディプロタイプとＢＭＩ、血清ＴＧ値との関連を検定する必要がある。そこで、ＬＤブロック１がＢＭＩまたはＴＧと独立してＤＭと関連している事を示すために、多重ロジスティック分析を行なったところ、ＴＧおよびＢＭＩ補正後においてもｐ＝０．００１１、オッズ比２．５１、９５％信頼区域１．４５−４．３６と疾患易罹患性において有意差を示した。
ＡＢＣＡ１遺伝子とＨＤＬコレステロール値の関連についての報告があることから、ａｔ−ｒｉｓｋハプロタイプであるハプロタイプ３を持つ個体と持たない個体の血清ＨＤＬコレステロール値の比較を行なった。ハプロタイプ３を持つ個体のＨＤＬコレステロール値は６２．８±１５．５ｍｇ／ｄｌと、ハプロタイプ３を持たない個体のＨＤＬコレステロール値５８．３±１４．７ｍｇ／ｄｌより高い傾向があった（ｐ＝０．０１４０）。そこで、ＨＤＬコレステロール値を多重ロジスティック解析で補正した後にハプロタイプ３を持つ群と持たない群の疾患関連解析を行なったところ、ｐ＝０．０００４、オッズ比２．７０、９５％信頼区域１．５６−４．６７と疾患感受性において有意差を示した。従って、ＡＢＣＡ１遺伝子はＤＭの発症にＨＤＬコレステロール値への影響とは異なる機序で影響を与えていると考えられる。
他の形質についてはＨｂＡ１ｃのようなＤＭと直接関連する項目以外はケースとコントロール群で差は認められなかった。
【産業上の利用の可能性】
本発明によって、２型糖尿病（ＤＭ）の検査方法、および検査試薬が提供された。上記（１）〜（２９）のいずれかに記載の遺伝子の多型、該遺伝子の発現、あるいは該遺伝子によってコードされるタンパク質の活性を検出することで、２型糖尿病の発症を予測することが可能となり、２型糖尿病の予防および治療のためのより経済的かつ効率的な戦略を立てることができるものと大いに期待される。
また、本発明者らによって提供された知見は、ＤＭの発症メカニズムの解明に寄与するものと考えられる。
【図１】
2004084797.tif 000115
【配列表】
2004084797000001.app