(57)【要約】配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質を有効成分として含有してなるＣＴＬの誘導剤、または前記タンパク質由来の腫瘍抗原ペプチド等を提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質を有効成分として含有してなる、細胞傷害性Ｔ細胞（以下、ＣＴＬ）の誘導剤。
【請求項２】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質の部分ペプチドであって、かつＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるペプチド。
【請求項３】
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４またはＨＬＡ−Ｂ５５である、請求項２記載のペプチド。
【請求項４】
配列番号：６〜配列番号：４６のいずれかに記載のアミノ酸配列を含有する、請求項３記載のペプチド。
【請求項５】
配列番号：６〜配列番号：４５のいずれかに記載のアミノ酸配列の第２位のアミノ酸をチロシン、フェニルアラニン、メチオニンまたはトリプトファンに置換し、及び／又はＣ末端のアミノ酸をフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンに置換したアミノ酸配列を含有する、請求項３記載のペプチド。
【請求項６】
請求項２〜５のいずれかに記載のペプチドを含有するエピトープペプチド。
【請求項７】
請求項２〜６のいずれかに記載のペプチドを有効成分として含有してなるＣＴＬの誘導剤。
【請求項８】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸を含有してなる、ＣＴＬの誘導剤。
【請求項９】
ポリヌクレオチドが配列番号：１、配列番号：１の第３３７位〜第１８７８位、または配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチドである、請求項８記載のＣＴＬの誘導剤。
【請求項１０】
請求項２〜６のいずれかに記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸。
【請求項１１】
請求項１０記載の核酸を含有してなるＣＴＬの誘導剤。
【請求項１２】
以下の（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質、
（ｂ）上記（ａ）記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
（ｃ）請求項２〜６のいずれかに記載のペプチド、および
（ｄ）上記（ｃ）記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
のいずれかと、抗原提示能を有する細胞とをイン・ビトロで接触させることを特徴とする、抗原提示細胞の製造方法。
【請求項１３】
請求項１２記載の製造方法により製造される抗原提示細胞。
【請求項１４】
以下の（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質、
（ｂ）上記（ａ）記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
（ｃ）請求項２〜６のいずれかに記載のペプチド、および
（ｄ）上記（ｃ）記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
のいずれかと、末梢血リンパ球とをイン・ビトロで接触させることを特徴とする、ＣＴＬの誘導方法。
【請求項１５】
請求項１４記載の誘導方法により誘導されるＣＴＬ。
【請求項１６】
請求項２〜５のいずれかに記載のペプチドに特異的に結合する抗体。
【請求項１７】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列において、連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／または該ポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドからなる腫瘍マーカー。
【請求項１８】
配列番号：１または配列番号：３に記載の塩基配列において、連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／または該ポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドからなる、請求項１７記載の腫瘍マーカー。
【請求項１９】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質のアミノ酸配列において、連続する少なくとも８アミノ酸を含有するポリペプチドからなる腫瘍マーカー。
【請求項２０】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列において、連続する少なくとも８アミノ酸を含有するポリペプチドからなる、請求項１９記載の腫瘍マーカー。
【請求項２１】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質に対する抗体、若しくは請求項１６に記載の抗体からなる腫瘍マーカー。
【請求項２２】
配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質に対する抗体からなる、請求項２１記載の腫瘍マーカー。
【請求項２３】
請求項２〜５のいずれかに記載のペプチドとＨＬＡ抗原とを含有するＨＬＡテトラマー。
【請求項２４】
請求項２３記載のＨＬＡテトラマーからなる腫瘍マーカー。
【請求項２５】
腫瘍が肉腫または腎癌である、請求項１７〜２２および請求項２４のいずれかに記載の腫瘍マーカー。
【請求項２６】
請求項１７〜２２、請求項２４および請求項２５のいずれかに記載の腫瘍マーカーを含有してなる腫瘍の診断薬。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】  本発明は、腫瘍抗原タンパク質に関する。さらに詳しくは、本発明は、腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦおよびその遺伝子の、癌免疫分野における利用に関する。
【背景技術】  生体による腫瘍細胞やウイルス感染細胞等の排除には細胞性免疫、とりわけ細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬと称する）が重要な働きをしている。ＣＴＬは、腫瘍細胞上の抗原ペプチド（腫瘍抗原ペプチド）とＭＨＣ（Ｍａｊｏｒ  Ｈｉｓｔｏｃｏｍｐａｔｉｂｉｌｉｔｙ  Ｃｏｍｐｌｅｘ）クラスＩ抗原（ヒトの場合はＨＬＡ抗原と称する）との複合体を認識し、腫瘍細胞を攻撃・破壊する。
腫瘍抗原ペプチドは、腫瘍に特有のタンパク質、すなわち腫瘍抗原タンパク質が細胞内で合成された後、プロテアーゼにより細胞内で分解されることによって生成される。生成された腫瘍抗原ペプチドは、小胞体内でＭＨＣクラスＩ抗原（ＨＬＡ抗原）と結合して複合体を形成し、細胞表面に運ばれて抗原提示される。この抗原提示された複合体を腫瘍特異的なＣＴＬが認識し、細胞傷害作用やリンフォカインの産生を介して抗腫瘍効果を示す。このような一連の作用の解明に伴い、腫瘍抗原タンパク質または腫瘍抗原ペプチドをいわゆる癌免疫療法剤（癌ワクチン）として利用することにより、腫瘍患者の体内の腫瘍特異的ＣＴＬを増強させる治療法が可能となった。
腫瘍抗原タンパク質は、Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，ｖｏｌ．１０：２８１，１９９９のｔａｂｌｅｌに記載のものが代表例として挙げられる。具体的にはメラノサイト組織特異的タンパク質であるｇｐ１００（Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１７９：１００５，１９９４）、ＭＡＲＴ−１（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９１：３５１５，１９９４）、およびチロシナーゼ（Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１７８：４８９，１９９３）などのメラノソーム抗原、メラノーマ以外の腫瘍抗原タンパク質としてはＨＥＲ２／ｎｅｕ（Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１８１：２１０９，１９９５）、ＣＥＡ（Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ．Ｉｎｓｔ．，８７：９８２，１９９５）、およびＰＳＡ（Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ．Ｉｎｓｔ．，８９：２９３，１９９７）などの腫瘍抗原タンパク質が挙げられる。しかしながら、骨肉腫等の肉腫を含む癌（腫瘍）に対して幅広く適用可能な腫瘍抗原タンパク質は、未だ見出されていない。
パピローマウイルスのＥ２結合部位を認識する因子として、パピローマウイルス結合因子（Ｐａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｕｓ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ：ＰＢＦ、ＧｅｎＢａｎｋデータベースＡｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＦ２６３９２８）が同定されている（Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ２９３，１０３−１１７，２００２）。しかしながら、該ＰＢＦと腫瘍との関係は何も知られていない。
【発明の開示】
本発明の目的は、腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦおよびその遺伝子の、癌免疫分野における利用などを提供することにある。
本発明者らは、骨肉腫患者由来の骨肉種細胞株ＯＳ２０００を樹立し、また該ＯＳ２０００に対して細胞傷害活性を有するＣＴＬ株ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３を樹立した。
続いてアッセイ用細胞として、２９３−ＥＢＮＡ細胞にＨＬＡ−Ｂ５５０２遺伝子（ＨＬＡ−Ｂ５５の１種）を導入した２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞、および２９３−ＥＢＮＡ細胞にＨＬＡ−Ａ２４０２遺伝子（ＨＬＡ−Ａ２４の１種）を導入した２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４細胞を作製した。これら２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞または２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４細胞に対して、ＯＳ２０００から調製したｃＤＮＡライブラリーのｃＤＮＡクローンプールをトランスフェクトし、そのトランスフェクタントにＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３を作用させ、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３が反応したか否かを、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３が有する細胞傷害活性により遊離したＬＤＨ量を測定することにより検討した。膨大なスクリーニングを繰り返した結果、最終的に、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＦ２６３９２８として登録されているパピローマウイルス結合因子（Ｐａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｕｓ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ：ＰＢＦ）（配列番号：１及び２）が、ＣＴＬ誘導活性を有する新規な腫瘍抗原タンパク質であることを見出した。当該ＰＢＦが腫瘍抗原タンパク質としての機能を有することは従来全く知られておらず、また予想もされていなかった新規な知見である。
さらに本発明者らは、ＰＢＦが、ＨＬＡ抗原に結合する腫瘍抗原ペプチド領域を含んでいることを確認した。また当該ＰＢＦは、肉腫および腎癌において幅広く高発現していることも明らかにした。
本発明において見出された腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦ又はその腫瘍抗原ペプチド、若しくはそれらの遺伝子は、ｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏにおいてＣＴＬの誘導剤、すなわち癌ワクチンとして用いることができ、骨肉腫や腎癌等の腫瘍に対して治療または改善効果を発揮する。また当該ＰＢＦは肉腫や腎癌等の腫瘍に対する腫瘍マーカーとして有用である。
本発明は、以上のような知見に基づき完成するに至ったものである。
すなわち本発明は下記に掲げるものである。
項１．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質を有効成分として含有してなるＣＴＬの誘導剤、
項２．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質が、以下の（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列を含有するタンパク質、
（ｂ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
（ｃ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と７０％以上の配列同一性を示すアミノ酸配列を含有するタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、および
（ｄ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
のいずれかである、項１に記載のＣＴＬの誘導剤、
項３．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質の部分ペプチドであって、かつＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるペプチド、
項４．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質が、以下の（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列を含有するタンパク質、
（ｂ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
（ｃ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と７０％以上の配列同一性を示すアミノ酸配列を含有するタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、および
（ｄ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
のいずれかである、項３に記載のペプチド、
項５．  ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４またはＨＬＡ−Ｂ５５である、項３または４に記載のペプチド、
項６．  配列番号：６〜配列番号：５５のいずれかに記載のアミノ酸配列を含有する、項５に記載のペプチド、
項７．  配列番号：６〜配列番号：４５のいずれかに記載のアミノ酸配列の第２位のアミノ酸をチロシン、フェニルアラニン、メチオニンまたはトリプトファンに置換し、及び／又はＣ末端のアミノ酸をフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンに置換したアミノ酸配列を含有する、項５に記載のペプチド、
項８．  項３〜７のいずれかに記載のペプチドを含有するエピトープペプチド、
項９．  項３〜８のいずれかに記載のペプチドを有効成分として含有してなるＣＴＬの誘導剤、
項１０．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸を含有してなる、ＣＴＬの誘導剤、
項１１．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドが、以下の（ａ）〜（ｇ）：
（ａ）配列番号：１に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号：１に記載の塩基配列の第３３７位〜第１８７８位を含有するポリヌクレオチド、
（ｃ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチド、
（ｄ）配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、
（ｅ）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
（ｆ）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと７０％以上の配列同一性を示す塩基配列を含有するポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
（ｇ）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドによリコードされるタンパク質において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
のいずれかである、項１０に記載のＣＴＬの誘導剤、
項１２．  ポリヌクレオチドが配列番号：１、配列番号：１の第３３７位〜第１８７８位、または配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチドである、項１０または１１に記載のＣＴＬの誘導剤、
項１３．  項３〜８のいずれかに記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
項１４．  項１３に記載の核酸を含有してなるＣＴＬの誘導剤、
項１５．  以下の（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質、
（ｂ）上記（ａ）記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
（ｃ）項３〜８のいずれかに記載のペプチド、および
（ｄ）上記（ｃ）記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
のいずれかと、抗原提示能を有する細胞とをイン・ビトロで接触させることを特徴とする、抗原提示細胞の製造方法、
項１６．  項１５記載の製造方法により製造される抗原提示細胞、
項１７．  以下の（ａ）〜（ｄ）：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質、
（ｂ）上記（ａ）記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
（ｃ）項３〜８のいずれかに記載のペプチド、および
（ｄ）上記（ｃ）記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸、
のいずれかと、末梢血リンパ球とをイン・ビトロで接触させることを特徴とする、ＣＴＬの誘導方法、
項１８．  項１７に記載の誘導方法により誘導されるＣＴＬ、
項１９．  項３〜７のいずれかに記載のペプチドに特異的に結合する抗体、
項２０．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドの塩基配列において、連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／または該ポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドからなる腫瘍マーカー、
項２１．  配列番号：１または配列番号：３に記載の塩基配列において、連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／または該ポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチドからなる、項２０に記載の腫瘍マーカー、
項２２．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質のアミノ酸配列において、連続する少なくとも８アミノ酸を含有するポリペプチドからなる腫瘍マーカー、
項２３．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列において、連続する少なくとも８アミノ酸を含有するポリペプチドからなる、項２２に記載の腫瘍マーカー、
項２４．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質に対する抗体、若しくは項１９に記載の抗体からなる腫瘍マーカー、
項２５．  配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質に対する抗体からなる、項２４に記載の腫瘍マーカー、
項２６．  項３〜７のいずれかに記載のペプチドとＨＬＡ抗原とを含有するＨＬＡテトラマー、
項２７．  項２６に記載のＨＬＡテトラマーからなる腫瘍マーカー、
項２８．  腫瘍が肉腫または腎癌である、項２０〜２５および項２７のいずれかに記載の腫瘍マーカー、
項２９．  項２０〜２５、項２７および項２８のいずれかに記載の腫瘍マーカーを含有してなる腫瘍の診断薬、
項３０．  癌ワクチンとして使用される、項１、２、９、１０、１１、１２または１４に記載のＣＴＬの誘導剤。
【図面の簡単な説明】  図１は、１Ｂ９．１Ｈ４のｃＤＮＡを、２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５または２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４に導入して発現させた時のＣＴＬ（ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３）の反応性を、ＬＤＨリリースアッセイにより測定した結果を示したグラフである。図中、横軸は４９０ｎｍの吸光度を示す。
図２は、１Ｂ９．１Ｈ４のｃＤＮＡを、２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５または２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４に導入して発現させた時のＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３の反応性を５１Ｃｒリリースアッセイにより測定した結果を示したグラフである。（Ａ）は２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４細胞を用いた時の結果を、また（Ｂ）は２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞を用いた時の結果を示す。図中、横軸はＥ／Ｔ比を、また縦軸は細胞傷害性活性を示す。
図３は、１Ｂ９．１Ｈ４またはＰＢＦ遺伝子を、２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４に導入して発現させた時のＣＴＬ（ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３）の反応性を、ＬＤＨリリースアッセイにより測定した結果を示したグラフである。図中、横軸は４９０ｎｍの吸光度を示す。
図４は、１Ｂ９．１Ｈ４またはＰＢＦ遺伝子を、２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５に導入して発現させた時のＣＴＬ（ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３）の反応性を、ＬＤＨリリースアッセイにより測定した結果を示したグラフである。図中、横軸は４９０ｎｍの吸光度を示す。
図５は、配列番号：４６に記載のペプチドをパルスした２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５に対するＣＴＬ（ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３）の反応性を、ＬＤＨリリースアッセイにより測定した結果を示したグラフである。図中、横軸は４９０ｎｍの吸光度を示す。
図６は、腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦをコードする遺伝子の各種細胞での発現を、ＲＴ−ＰＣＲにより解析した結果を示す写真である。図中、ＯＳ２０００は骨肉種細胞株を、ＰＢＬは正常末梢血リンパ球を、ＥＢ−ＢはＥＢＶトランスフォームＢ細胞を、Ｋ５６２は慢性骨髄性白血病細胞株を、２９３ＥＢＮＡはアデノウイルスでトランスフォームしたヒト腎細胞株を指す。図中、ＳａＯＳ、ＨＯＳ、ＫＩＫＵ、Ｈｕｏ９およびＮＹは骨肉腫細胞株を指す。図中、ＨＳ−ＳＹＩＩ、ＳＷ９８２およびＦｕｊｉは滑膜肉腫細胞株を指す。図中、ＨＴ１０８０は線維肉腫細胞株を指す。図中、ＨＳ７２９Ｔ、Ａ２０４およびＲＤは横紋筋肉腫細胞株を指す。また図中、Ａ６７３、Ｗ−ＥＳ、ＮＣＲ−ＥＷ２、ＳＣＣＨ１９６、ＳＫ−ＥＳ１およびＲＤ−ＥＳ１はユーイング肉腫細胞株を指す。ＰＢＦ遺伝子の発現結果を上段に、また陽性コントロールであるＧ３ＰＤＨ遺伝子の発現結果を下段に、それぞれ示す。
【発明を実施するための最良の形態】１）本発明のタンパク質
本発明のＣＴＬの誘導剤に含有されるタンパク質（以下、本発明のタンパク質と称する場合がある）は、配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有する。本発明のタンパク質は、天然物（例えば骨肉種細胞株）に由来するタンパク質であってもよく、また組換えタンパク質であっても良い。
ここで配列番号：２に記載のアミノ酸配列は、ＧｅｎＢａｎｋデータベースにおいてＡｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＦ２６３９２８として登録されており、またＶｉｒｏｌｏｇｙ  ２９３，１０３−１１７（２００２）に開示されたヒトパピローマウイルス結合因子（Ｐａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｕｓ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ：ＰＢＦ）のアミノ配列である。
前記において「配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質（配列番号：２に記載のアミノ酸配列を含有するタンパク質）」とは、具体的には、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質、または配列番号：２に記載のアミノ酸配列を含有し、そのＮ末端側及び／又はＣ末端側に他のアミノ酸配列の付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質などが挙げられる。
また前記において「配列番号：２に記載のアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質」とは、具体的には以下の（ａ）〜（ｃ）に挙げるタンパク質が挙げられる：
（ａ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
（ｂ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と７０％以上の配列同一性を示すアミノ酸配列を含有するタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
（ｃ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質。
好ましくは、配列番号：２に記載のアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列からなるタンパク質が挙げられる。当該配列番号：２に記載のアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列からなるタンパク質としては、以下の（ａ’）〜（ｃ’）に挙げるタンパク質が挙げられる：
（ａ’）配列番号：２に記載のアミノ酸配列において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
（ｂ’）配列番号：２に記載のアミノ酸配列と７０％以上の配列同一性を示すアミノ酸配列からなるタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質、
（ｃ’）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質であって、かつ当該タンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される特徴を有するタンパク質。
前記（ａ）における「配列番号：２に記載のアミノ酸配列において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質」とは、人為的に作製したいわゆる改変タンパク質や、生体内に存在するアレル変異体等のタンパク質を意味する。
ここでタンパク質におけるアミノ酸の変異数や変異部位は、本発明タンパク質の活性が保持される限り制限はない。このように活性を喪失することなくアミノ酸残基が、どのように、何個欠失、置換及び／又は付加されればよいかを決定する指標は、当業者に周知のコンピュータプログラム、例えばＤＮＡ  Ｓｔａｒ  ｓｏｆｔｗａｒｅを用いて見出すことができる。例えば変異数は、典型的には、全アミノ酸の１０％以内であり、好ましくは全アミノ酸の５％以内である。また置換されるアミノ酸は、タンパク質の構造保持の観点から、残基の極性、電荷、可溶性、疎水性、親水性並びに両親媒性など、置換前のアミノ酸と似た性質を有するアミノ酸であることが好ましい。例えば、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｒｏ、Ｍｅｔ、Ｐｈｅ及びＴｒｐは互いに非極性アミノ酸に分類されるアミノ酸であり、Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｃｙｓ、Ｔｙｒ、Ａｓｎ及びＧｌｎは互いに非荷電性アミノ酸に分類されるアミノ酸であり、Ａｓｐ及びＧｌｕは互いに酸性アミノ酸に分類されるアミノ酸であり、またＬｙｓ、Ａｒｇ及びＨｉｓは互いに塩基性アミノ酸に分類されるアミノ酸である。ゆえに、これらを指標として同群に属するアミノ酸を適宜選択することができる。
前記（ｂ）における「配列番号：２に記載のアミノ酸配列と７０％以上の配列同一性を示すアミノ酸配列を含有するタンパク質」とは、例えば配列番号：２に記載のアミノ酸配列と約７０％以上、より好ましくは約８０％以上、さらに好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の配列同一性を示すアミノ酸配列を含有するタンパク質が挙げられる。具体的には、配列番号：２に記載のアミノ酸配列の部分配列からなるタンパク質などが挙げられる。
ここで「配列同一性」とは、２つのタンパク質間の、配列の同一性及び相同性をいう。当該「配列同一性」は、比較対象の配列の領域にわたって、最適な状態にアラインメントされた２つの配列を比較することにより決定される。ここで、比較対象のタンパク質は、２つの配列の最適なアラインメントにおいて、付加又は欠失（例えばギャップ等）を有していてもよい。このような配列同一性に関しては、例えば、Ｖｅｃｔｏｒ  ＮＴＩを用いて、ＣｌｕｓｔａｌＷアルゴリズム（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．，２２（２２）：４６７３−４６８０（１９９４））を利用してアラインメントを作成することにより算出することができる。尚、配列同一性は、配列解析ソフト、具体的にはＶｅｃｔｏｒ  ＮＴＩ、ＧＥＮＥＴＹＸ−ＭＡＣや公共のデータベースで提供される解析ツールを用いて測定される。前記公共データベースは、例えば、ホームページアドレスｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｄｄｂｊ．ｎｉｇ．ａｃ．ｊｐにおいて、一般的に利用可能である。
前記（ｃ）における「配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド」とは、例えば配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドと約４０％以上、好ましくは約６０％以上、より好ましくは約７０％以上、より好ましくは約８０％以上、さらに好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の配列同一性を有する塩基配列を含有するポリヌクレオチドが挙げられる。具体的には、配列番号：１、配列番号：１の第３３７位〜第１８７８位、または配列番号：３に記載の塩基配列と、約４０％以上、好ましくは約６０％以上、より好ましくは約７０％以上、より好ましくは約８０％以上、さらに好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の配列同一性を有する塩基配列を含有するポリヌクレオチドが挙げられる。より具体的には、配列番号：１、配列番号：１の第３３７位〜第１８７８位、または配列番号：３に記載の塩基配列の部分配列からなる核酸などが挙げられる。
ハイブリダイゼーションは、自体公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えばＭｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  Ｅｄｔ．Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）等の基本書に記載の方法に従って行うことができる。また市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行うことができる。
ここで「ストリンジェントな条件」とは、Ｂｅｒｇｅｒ  ａｎｄ  Ｋｉｍｍｅｌ（１９８７，Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．１５２，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ  ＣＡ）や前記Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  Ｅｄｔ．Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）に教示されるように、複合体或いはプローブを結合する核酸の融解温度（Ｔｍ）に基づいて決定することができる。
ハイブリダイゼーションの条件としては、例えば、６×ＳＳＣ（２０×ＳＳＣは、３３３ｍＭ  Ｓｏｄｉｕｍ  ｃｉｔｒａｔｅ、３３３ｍＭ  ＮａＣｌを示す）、０．５％ＳＤＳおよび５０％ホルムアミドを含む溶液中で４２℃にてハイブリダイズさせる条件、または６×ＳＳＣを含む（５０％ホルムアミドは含まない）溶液中で６５℃にてハイブリダイズさせる条件などが挙げられる。
またハイブリダイゼーション後の洗浄の条件としては、「１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、３７℃」程度の条件を挙げることができる。相補鎖はかかる条件で洗浄しても対象とする正鎖とハイブリダイズ状態を維持するものであることが好ましい。特に制限されないが、より厳しいハイブリダイズ条件として「０．５×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、４２℃」程度、さらに厳しいハイブリダイズ条件として「０．１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、６５℃」程度の洗浄条件を挙げることができる。
本発明のタンパク質は、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質と実質的に同質の活性を有する。ここで実質的に同質の活性とは、本発明のタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識される、すなわち当該細胞がＣＴＬに反応性を示す、換言すれば本発明のタンパク質若しくは該タンパク質に由来する抗原ペプチドがＣＴＬを活性化する若しくはＣＴＬを誘導するという性質を示す。
前記において細胞とは、ＨＬＡ抗原を発現する細胞であることが好ましい。従って前記実質的に同質の活性とは、より具体的には、例えばＨＬＡ−Ａ２４やＨＬＡ−Ｂ５５等のＨＬＡ抗原を発現する細胞において本発明のタンパク質を発現させることにより、本発明タンパク質由来の抗原ペプチドとＨＬＡ抗原との複合体が細胞表面に提示され、その結果、当該細胞がＣＴＬに認識される、すなわちＣＴＬが活性化される（ＣＴＬが誘導される）という性質を指す。
このような本発明タンパク質の性質は、自体公知の方法あるいはそれに準じる方法（例えば５１Ｃｒリリースアッセイ（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５９：４７５３，１９９７）、ＬＤＨリリースアッセイ（ＬＤＨ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃｉｔｙ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（タカラバイオ）、サイトカイン量の測定等）により容易に測定することができる。以下に具体的なアッセイ法を例示する。
まず、２９３−ＥＢＮＡ細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）等の宿主細胞に対し、本発明タンパク質をコードするＤＮＡを含有する発現ベクターと、ＨＬＡ抗原をコードするＤＮＡを含有する発現ベクターとをトランスフェクトする。ここで用いるＨＬＡ抗原をコードするＤＮＡとしては、例えばＨＬＡ−Ａ２４抗原をコードするＤＮＡ若しくはＨＬＡ−Ｂ５５抗原をコードするＤＮＡが挙げられる。ＨＬＡ−Ａ２４抗原をコードするＤＮＡとしてはＨＬＡ−Ａ２４０２のｃＤＮＡ（Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５５：４２４８−４２５２（１９９５）、Ｇｅｎｂａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．Ｍ６４７４０）が挙げられる。またＨＬＡ−Ｂ５５抗原をコードするＤＮＡとしてはＨＬＡ−Ｂ５５０２のｃＤＮＡ（ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｍ７７７７７、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４８（４），１１５５−１１６２（１９９２））が挙げられる。
前記トランスフェクトは、例えばリポフェクトアミン試薬（ＧＩＢＣＯ  ＢＲＬ社製）を用いたリポフェクチン法などにより行うことができる。その後、用いたＨＬＡ抗原に拘束性のＣＴＬを加えて作用させ、該ＣＴＬが反応（活性化）して産生する種々のサイトカイン、例えばＩＦＮ−γの量を、例えばＥＬＩＳＡ法などで測定することにより調べることができる。ここでＣＴＬとしては、ヒトの末梢血リンパ球を配列番号：２に記載の本発明タンパク質で刺激することにより調製されたＣＴＬや、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，３９，３９０−３９６，１９８７，Ｎ．Ｅｎｇ．Ｊ．Ｍｅｄ，３３３，１０３８−１０４４，１９９５等に記載の方法により樹立したＣＴＬを用いることができる。
また本発明のタンパク質は、例えばヒトモデル動物を用いたアッセイ（ＷＯ  ０２／４７４７４号公報、Ｉｎｔ  Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ：１００，５６５−５７０（２００２））に供することにより、ｉｎ  ｖｉｖｏでのＣＴＬ誘導活性を調べることができる。
本発明のタンパク質は、天然物（例えば骨肉種細胞株、腎癌細胞株など）から自体公知のタンパク質の精製方法によって製造することもできるし、また後述する本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含有する核酸を含有する形質転換体を培養することによっても製造することができる。
２）本発明のペプチド
本発明のＣＴＬの誘導剤に含有されるペプチド（以下、本発明のペプチドと称する場合がある）とは、前記本発明のタンパク質の部分ペプチドであって、かつＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識される腫瘍抗原ペプチドである。すなわち、前記した本発明のタンパク質のアミノ酸配列の一部よりなるペプチドであって、かつ、該ペプチドとＨＬＡ抗原との結合複合体がＣＴＬにより認識されるようなペプチドであれば、本発明のタンパク質のアミノ酸配列中の如何なる位置に存する如何なる長さのペプチドであっても良い。
このような本発明のペプチドは、本発明のタンパク質の一部よりなる候補ペプチドを合成し、該候補ペプチドとＨＬＡ抗原との複合体がＣＴＬにより認識されるか否か、すなわち候補ペプチドが腫瘍抗原ペプチドとしての活性を有するか否かをアッセイすることにより、同定することができる。
ここで、ペプチドの合成については、通常のペプチド化学において用いられる方法に準じて行うことができる。該公知方法としては文献（ペプタイド・シンセシス（Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ），Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９６６；ザ・プロテインズ（Ｔｈｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ），Ｖｏｌ  ２，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９７６；ペプチド合成，丸善（株），１９７５；ペプチド合成の基礎と実験、丸善（株），１９８５；医薬品の開発続  第１４巻・ペプチド合成，広川書店，１９９１）などに記載されている方法が挙げられる。
次に、本発明の腫瘍抗原ペプチドの同定方法につき、以下に記述する。
ＨＬＡ−Ａ１，−Ａ０２０１，−Ａ０２０４，−Ａ０２０５，−Ａ０２０６，−Ａ０２０７，−Ａ１１，−Ａ２４，−Ａ３１，−Ａ６８０１，−Ｂ７，−Ｂ８，−Ｂ２７０５，−Ｂ３７，−Ｃｗ０４０１，−Ｃｗ０６０２などのＨＬＡの型については、該ＨＬＡに結合して提示される抗原ペプチドの配列の規則性（モチーフ）が判明している（例えばＩｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ，４１：ｐ１７８，１９９５などを参照のこと）。例えばＨＬＡ−Ａ２４のモチーフとしては、８〜１１アミノ酸よりなるペプチドのうちの第２位のアミノ酸がチロシン、フェニルアラニン、メチオニンまたはトリプトファンであり、Ｃ末端のアミノ酸がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンとなることが知られている（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５２，ｐ３９１３，１９９４、Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ，４１：ｐ１７８，１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５５：ｐ４３０７，１９９４）。またＨＬＡ−Ａ２のモチーフについては、以下の表１に示したモチーフが知られている（Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ，４１，ｐ１７８，１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５５：ｐ４７４９，１９９５）。
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さらに近年、ＨＬＡ抗原に結合可能と予想されるペプチド配列を、インターネット上、ＮＩＨのＢＩＭＡＳのソフトを使用することにより検索することができる（ｈｔｔｐ：／／ｂｉｍａｓ．ｄｃｒｔ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｍｏｌｂｉｏ／ｈｌａ＿ｂｉｎｄ／）。
ペプチドの長さとしては、各種ＨＬＡ分子に結合している抗原ペプチドの解析により（Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ，４１：１７８，１９９５）、通常８から１４アミノ酸程度であることが明らかにされている（ただしＨＬＡ−ＤＲ、−ＤＰ、−ＤＱについては、１４アミノ酸以上の長さの抗原ペプチドも認められる）。
これらのモチーフに関わるペプチド部分を本発明のタンパク質のアミノ酸配列中から選び出すのは容易である。例えば、前記ＢＩＭＡＳソフトでの検索により、ＨＬＡ抗原に結合可能と予想される配列を容易に選び出すことができる。選び出された候補ペプチドを前述の方法にて合成し、該候補ペプチドがＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるか否か、すなわち候補ペプチドが腫瘍抗原ペプチドとしての活性を有するか否かを測定することにより、本発明のペプチドを同定することができる。
本発明の腫瘍抗原ペプチドの具体的な同定法としては、例えばＪ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５４，ｐ２２５７，１９９５に記載の方法が挙げられる。すなわち、候補ペプチドを提示すると考えられるタイプのＨＬＡ抗原が陽性のヒトから末梢血リンパ球を単離し、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで該候補ペプチドを添加して刺激した場合に、該候補ペプチドをパルスしたＨＬＡ抗原陽性細胞を特異的に認識するＣＴＬが誘導された場合は、該候補ペプチドが腫瘍抗原ペプチドに成り得ることが示される。ここでＣＴＬの誘導の有無は、例えば、抗原ペプチド提示細胞に反応してＣＴＬが産生する種々のサイトカイン（例えばＩＦＮ−γ）の量を、例えばＥＬＩＳＡ法などによって測定することにより、調べることができる。また５１Ｃｒで標識した抗原ペプチド提示細胞に対するＣＴＬの傷害性を測定する方法（５１Ｃｒリリースアッセイ、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，５８：ｐ３１７，１９９４）によっても調べることができる。
さらに、候補ペプチドを提示すると考えられるタイプのＨＬＡ抗原をコードするｃＤＮＡを発現する発現プラスミドを、例えば２９３−ＥＢＮＡ細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）に導入した細胞に対して候補ペプチドをパルスし、この細胞に対して、前記候補ペプチドを提示すると考えられるタイプのＨＬＡ抗原に拘束性のＣＴＬを反応させ、該ＣＴＬが産生する種々のサイトカイン（例えばＩＦＮ−γ）の量を測定することによっても、調べることができる（Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１８７：２７７，１９９８）。
ここでＨＬＡ抗原としては、ＨＬＡ−Ａ２４抗原若しくはＨＬＡ−Ｂ５５抗原が挙げられる。ＨＬＡ−Ａ２４拘束性の腫瘍抗原ペプチドを選択する場合には、前記ＨＬＡ抗原をコードするｃＤＮＡとしてはＨＬＡ−Ａ２４０２のｃＤＮＡ（Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５５：４２４８−４２５２（１９９５）、Ｇｅｎｂａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．Ｍ６４７４０）を用いることができる。またＨＬＡ−Ｂ５５拘束性の腫瘍抗原ペプチドを選択する場合は、前記ＨＬＡ抗原をコードするｃＤＮＡとしてはＨＬＡ−Ｂ５５０２遺伝子（ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｍ７７７７７、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４８（４），１１５５−１１６２（１９９２））を用いることができる。
また前記ＣＴＬとしては、ヒトの末梢血リンパ球のペプチド刺激により調製される場合の他、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，３９，３９０−３９６，１９８７，Ｎ．Ｅｎｇ．Ｊ．Ｍｅｄ，３３３，１０３８−１０４４，１９９５等に記載の方法により樹立したＣＴＬを用いることができる。
また本発明のペプチドは、例えばヒトモデル動物を用いたアッセイ（ＷＯ  ０２／４７４７４号公報、Ｉｎｔ  Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ：１００，５６５−５７０（２００２））に供することにより、ｉｎ  ｖｉｖｏでの活性を調べることができる。
前記のように腫瘍抗原ペプチドの配列の規則性（モチーフ）が判明している場合と異なり、例えばＨＬＡ−Ｂ５５のようにそのペプチドのモチーフが明らかでない場合は、該ＨＬＡ−Ｂ５５と腫瘍抗原ペプチドとの複合体を認識するＣＴＬ株が存在する場合には、例えばＷＯ９７／４６６７６や後述の実施例３に記載の方法に準じて本発明の腫瘍抗原ペプチドを同定することができる。
以上のような本発明のペプチドの具体例としては、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなる本発明タンパク質の部分ペプチドであって、かつＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるペプチドが挙げられる。また、本発明のペプチドが結合するＨＬＡ抗原の観点からは、ＨＬＡ−Ａ２４抗原またはＨＬＡ−Ｂ５５抗原に結合する本発明のペプチドを挙げることができる。
より具体的には、例えばＨＬＡ−Ａ２４結合性の腫瘍抗原ペプチドとしては、ＢＩＭＡＳソフトを用いた検索により同定される、以下の表２（９アミノ酸）および表３（１０アミノ酸）に記載のいずれかのアミノ酸配列からなるペプチド（配列番号：６〜４５のいずれかに記載のアミノ酸配列からなるペプチド）であって、ＨＬＡ−Ａ２４抗原に結合してＣＴＬに認識されるペプチドが挙げられる。
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また、ＨＬＡ−Ｂ５５結合性の腫瘍抗原ペプチドとしては、Ｃｙｓ  Ｔｈｒ  Ａｌａ  Ｃｙｓ  Ａｒｇ  Ｔｒｐ  Ｌｙｓ  Ｌｙｓ  Ａｌａ  Ｃｙｓ  Ｇｌｎ  Ａｒｇ（配列番号：４６）のアミノ酸配列からなるペプチドが挙げられる。さらに、前記ペプチドの９、１０若しくは１１アミノ酸部分からなるペプチド、すなわち、
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のいずれかに記載のアミノ酸からなるペプチドであって、ＨＬＡ−Ｂ５５抗原に結合してＣＴＬに認識されるペプチドが挙げられる。
本発明においては、前記の如き配列番号：２に記載のアミノ酸配列の一部からなるペプチドのみならず、配列番号：２に記載のアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列を含有する本発明タンパク質の一部からなるペプチドも、ＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるという性質を有する限り、本発明のペプチドの範疇に含まれる。すなわち、配列番号：２に記載のアミノ酸配列の一部を改変（欠失、置換及び／又は付加）したタンパク質の一部からなる改変ペプチド（以下、当該改変に係るペプチドを「改変ペプチド」と称する場合がある）であっても、ＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるという性質を有する限り、本発明のペプチドの範疇に含まれる。具体的には、本発明タンパク質のアミノ酸配列、より具体的には配列番号：２に記載のアミノ酸配列の一部からなる本発明のペプチドのアミノ酸配列に対して、１又はそれ以上のアミノ酸残基の改変を施した改変ペプチドであって、かつＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるという腫瘍抗原ペプチドとしての活性を有するものは、本発明のペプチドの範疇に含まれる。
ここで、アミノ酸残基の「改変」とは、アミノ酸残基の置換、欠失、及び／又は付加（ペプチドのＮ末端、Ｃ末端へのアミノ酸の付加も含む）を意味し、好ましくはアミノ酸残基の置換が挙げられる。アミノ酸残基の置換に係る改変の場合、置換されるアミノ酸残基の数および位置は、腫瘍抗原ペプチドとしての活性が維持される限り、任意であるが、前記したように通常、腫瘍抗原ペプチドの長さが８〜１４アミノ酸程度であることから、１個から数個の範囲が好ましい。
本発明の改変ペプチドの長さとしては、８〜１４アミノ酸程度が好ましい（ただしＨＬＡ−ＤＲ、−ＤＰ、−ＤＱについては、１４アミノ酸以上の長さの場合もある。）
先に記載したように、ＨＬＡ−Ａ１，−Ａ０２０１，−Ａ０２０４，−Ａ０２０５，−Ａ０２０６，−Ａ０２０７，−Ａ１１，−Ａ２４，−Ａ３１，−Ａ６８０１，−Ｂ７，−Ｂ８，−Ｂ２７０５，−Ｂ３７，−Ｃｗ０４０１，−Ｃｗ０６０２などのＨＬＡの型については、該ＨＬＡに結合して提示される抗原ペプチドの配列の規則性（モチーフ）が判明している。また前記したように、ＨＬＡ抗原に結合可能と予想されるペプチド配列をインターネット上検索することができる（ｈｔｔｐ：／／ｂｉｍａｓ．ｄｃｒｔ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｍｏｌｂｉｏ／ｈｌａ＿ｂｉｎｄ／）。従って、該モチーフ等に基づき、前記改変ペプチドを作製することが可能である。
例えばＨＬＡ−Ａ２４に結合して提示される抗原ペプチドのモチーフとしては、前記したように、８〜１１アミノ酸よりなるペプチドのうちの第２位のアミノ酸がチロシン、フェニルアラニン、メチオニンまたはトリプトファンであり、Ｃ末端のアミノ酸がフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンであることが知られている（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５２：ｐ３９１３，１９９４、Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ，４１：ｐ１７８，１９９５、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５５：ｐ４３０７，１９９４）。またＨＬＡ−Ａ２の場合は、前記の表１に記載のモチーフが知られている。またインターネット上でＨＬＡ抗原に結合可能と予想されるペプチド配列が示されており（ｈｔｔｐ：／／ｂｉｍａｓ．ｄｃｒｔ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｍｏｌｂｉｏ／ｈｌａ＿ｂｉｎｄ／）、例えば前記モチーフ上とり得るアミノ酸に類似の性質を持つアミノ酸が許容される。従って、これらモチーフ上アミノ酸の置換が可能な位置（ＨＬＡ−Ａ２４、ＨＬＡ−Ａ２においてはペプチドの第２位とＣ末端）にあるアミノ酸を他のアミノ酸（好ましくは前記インターネット上で結合可能と予想されているアミノ酸）に置換したアミノ酸配列を含むものであって、かつＨＬＡ抗原と結合してＣＴＬにより認識されるという活性を持つ改変ペプチドを挙げることができる。
より好ましくは、該位置において、前記モチーフ上知られたアミノ酸残基のいずれかに置換したアミノ酸配列を含有するペプチドであって、かつ前記活性を有する改変ペプチドが挙げられる。すなわち配列番号：６〜４５に示されるようなＨＬＡ−Ａ２４結合性のペプチドの場合、その第２位のアミノ酸をチロシン、フェニルアラニン、メチオニンまたはトリプトファンに置換し、及び／又はＣ末端のアミノ酸をフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファンまたはメチオニンに置換した改変ペプチドであって、かつ前記活性を有する改変ペプチドが挙げられる。このうち第２位のアミノ酸をチロシンに置換したペプチドがより好ましい。
本発明のペプチドには、さらに、前記本発明のペプチドを含有するエピトープペプチドも含まれる。
近年、複数のＣＴＬエピトープ（抗原ペプチド）を連結したペプチド（エピトープペプチド）が、効率的にＣＴＬ誘導活性を有することが示されている。例えばＪｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １９９８，１６１：３１８６−３１９４には、癌抗原タンパク質ＰＳＡ由来のＨＬＡ−Ａ２，−Ａ３，−Ａ１１，Ｂ５３拘束性ＣＴＬエピトープを連結した約３０ｍｅｒのペプチドが、イン・ビボでそれぞれのＣＴＬエピトープに特異的なＣＴＬを誘導したことが記載されている。
またＣＴＬエピトープとヘルパーエピトープとを連結させたペプチド（エピトープペプチド）により、効率的にＣＴＬが誘導されることも示されている。ここでヘルパーエピトープとはＣＤ４陽性Ｔ細胞を活性化させる作用を有するペプチドを指すものであり（Ｉｍｍｕｎｉｔｙ．，１：７５１，１９９４）、例えばＢ型肝炎ウイルス由来のＨＢＶｃ１２８−１４０や破傷風毒素由来のＴＴ９４７−９６７などが知られている。当該ヘルパーエピトープにより活性化されたＣＤ４陽性Ｔ細胞は、ＣＴＬの分化の誘導や維持、およびマクロファージなどのエフェクター活性化などの作用を発揮するため、抗腫瘍免疫応答に重要であると考えられている。このようなヘルパーエピトープとＣＴＬエピトープとを連列したペプチドの具体例として、例えばＪｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １９９９，１６２：３９１５−３９２５には、ＨＢＶ由来ＨＬＡ−Ａ２拘束性抗原ペプチド６種類、ＨＬＡ−Ａ１１拘束性抗原ペプチド３種類、およびヘルパーエピトープより構成されるペプチドをコードするＤＮＡ（ミニジーン）が、イン・ビボでそれぞれのエピトープに対するＣＴＬを効果的に誘導したことが記載されている。また実際に、ＣＴＬエピトープ（メラノーマ抗原ｇｐ１００の第２８０位〜２８８位からなる癌抗原ペプチド）とヘルパーエピトープ（破傷風毒素由来Ｔヘルパーエピトープ）とを連結したペプチドが臨床試験に供されている（Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，２００１，７：３０１２−３０２４）。
従って、前記本発明のペプチドを含む複数のエピトープを連結したペプチド（エピトープペプチド）であって、ＣＴＬ誘導活性を有するペプチドも、本発明のペプチドの具体例として例示することができる。
ここに、エピトープペプチドとは、▲１▼複数のＣＴＬエピトープ（腫瘍抗原ペプチド）を連結したペプチド、若しくは▲２▼ＣＴＬエピトープとヘルパーエピトープとを連結したペプチドであって、抗原提示細胞内にてプロセッシングを受け、生じた腫瘍抗原ペプチドが抗原提示細胞に提示され、ＣＴＬ誘導活性を導くペプチドとして定義される。
ここで、本発明のペプチドに連結させるエピトープがＣＴＬエピトープの場合、用いるＣＴＬエピトープとしては、配列番号：２に記載のアミノ酸配列由来のＨＬＡ−Ａ１，−Ａ０２０１，−Ａ０２０４，−Ａ０２０５，−Ａ０２０６，−Ａ０２０７，−Ａ１１，−Ａ２４，−Ａ３１，−Ａ６８０１，−Ｂ７，−Ｂ８，−Ｂ２７０５，−Ｂ３７，−Ｂ５５，−Ｃｗ０４０１，−Ｃｗ０６０２などに拘束性のＣＴＬエピトープが挙げられる。また、他の腫瘍抗原タンパク質由来のＣＴＬエピトープも挙げられる。これらＣＴＬエピトープは複数個連結することが可能であり、１つのＣＴＬエピトープの長さとしては、各種ＨＬＡ分子に結合している抗原ペプチドの解析により（Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ，４１：１７８，１９９５）、８〜１４アミノ酸程度を挙げることができる。
また本発明のペプチドに連結させるエピトープがヘルパーエピトープの場合、用いるヘルパーエピトープとしては、前述のようなＢ型肝炎ウイルス由来のＨＢＶｃ１２８−１４０や破傷風毒素由来のＴＴ９４７−９６７などが挙げられる。また当該ヘルパーエピトープの長さとしては、１３〜３０アミノ酸程度、好ましくは１３〜１７アミノ酸程度を挙げることができる。
このような複数のエピトープを連結させたペプチド（エピトープペプチド）は、前述のように一般的なペプチド合成法によって製造することができる。またこれら複数のエピトープを連結させたエピトープペプチドをコードするポリヌクレオチドの配列情報に基づいて、通常のＤＮＡ合成および遺伝子工学的手法を用いて製造することもできる。すなわち、当該ポリヌクレオチドを周知の発現ベクターに挿入し、得られた組換え発現ベクターで宿主細胞を形質転換して作製された形質転換体を培養し、培養物より目的の複数のエピトープを連結させたエピトープペプチドを回収することにより製造することができる。これらの手法は、前述のように文献（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｔ．Ｍａｎｉａｔｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，ＣＳＨ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ（１９８３）、ＤＮＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，ＤＭ．Ｇｌｏｖｅｒ，ＩＲＬ  ＰＲＥＳＳ（１９８５））に記載の方法などに準じて行うことができる。
以上のようにして製造された複数のエピトープを連結させたエピトープペプチドを、前述のｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイや、ＷＯ  ０２／４７４７４号公報およびＩｎｔ  Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ：１００，５６５−５７０（２００２）に記述のヒトモデル動物を用いたｉｎ  ｖｉｖｏアッセイに供すること等によりＣＴＬ誘導活性を測定することができる。
さらに、前記本発明のペプチドのＮ末端アミノ酸のアミノ基、またはＣ末端アミノ酸のカルボキシル基を修飾することも可能であり、このような修飾に係るペプチドも本発明のペプチドの範疇に含まれる。
ここでＮ末端アミノ酸のアミノ基の修飾基としては、例えば１〜３個の炭素数１から６のアルキル基、フェニル基、シクロアルキル基、アシル基が挙げられ、アシル基の具体例としては炭素数１から６のアルカノイル基、フェニル基で置換された炭素数１から６のアルカノイル基、炭素数５から７のシクロアルキル基で置換されたカルボニル基、炭素数１から６のアルキルスルホニル基、フェニルスルホニル基、炭素数２から６のアルコキシカルボニル基、フェニル基で置換されたアルコキシカルボニル基、炭素数５から７のシクロアルコキシで置換されたカルボニル基、フェノキシカルボニル基等が挙げられる。
Ｃ末端アミノ酸のカルボキシル基を修飾したペプチドとしては、例えばエステル体およびアミド体が挙げられ、エステル体の具体例としては、炭素数１から６のアルキルエステル、フェニル基で置換された炭素数０から６のアルキルエステル、炭素数５から７のシクロアルキルエステル等が挙げられ、アミド体の具体例としては、アミド、炭素数１から６のアルキル基の１つまたは２つで置換されたアミド、フェニル基で置換された炭素数０から６のアルキル基の１つまたは２つで置換されたアミド、アミド基の窒素原子を含んで５から７員環のアザシクロアルカンを形成するアミド等が挙げられる。
３）本発明のポリヌクレオチド及びそれを含有する核酸
本発明のＣＴＬの誘導剤に含有される核酸（以下、本発明の核酸と称する場合がある）は、前記本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチド（以下、本発明のポリヌクレオチドと称する場合がある）を含有する。
本発明のポリヌクレオチドは、種々の細胞や組織、例えば骨肉種や腎癌等に由来する細胞や組織のｃＤＮＡやｍＲＮＡ、ｃＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、または合成ＤＮＡのいずれであっても良い。また１本鎖、２本鎖のいずれの形態であっても良い。具体的には、
（ａ）配列番号：１に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、
（ｂ）配列番号：１に記載の塩基配列の第３３７位〜第１８７８位を含有するポリヌクレオチド、
（ｃ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチド、
（ｄ）配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、
またはこれら（ａ）〜（ｄ）のポリヌクレオチドと実質的に同一の塩基配列を含有するポリヌクレオチドが挙げられる。
ここで配列番号：１に記載の塩基配列は、ＧｅｎＢａｎｋデータベースにおいてＡｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＦ２６３９２８として登録されており、またＶｉｒｏｌｏｇｙ  ２９３，１０３−１１７（２００２）に開示されたヒトパピローマウイルス結合因子（Ｐａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｕｓ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ：ＰＢＦ、配列番号：２）をコードする塩基配列であり、その第３３７位〜第１８７８位がオープンリーディングフレームに該当する。また配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチドは、配列番号：１に記載の塩基配列と同一の塩基配列部分を含有する類似のポリヌクレオチドである。具体的には、配列番号：３に記載の塩基配列の第１位〜第１４６９位の部分と、配列番号：１に記載の塩基配列の第７０４位〜１８７８位の部分とは、配列番号：３にのみ存在する２９４ｂｐを除けば１００％の配列同一性を有している。
前記において（ａ）配列番号：１に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチド、（ｂ）配列番号：１に記載の塩基配列の第３３７位〜第１８７８位を含有するポリヌクレオチド、（ｃ）配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチド、若しくは（ｄ）配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチドとは、より具体的には、これら配列番号：１、配列番号：１の第３３７位〜第１８７８位、若しくは配列番号：３のいずれかに記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、または配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列からなるポリヌクレオチドが例示される。さらに、これら配列番号：１、配列番号：１の第３３７位〜第１８７８位、若しくは配列番号：３のいずれかに記載の塩基配列、または配列番号：２に記載のアミノ酸配列をコードする塩基配列の５’末端側及び／又は３’末端側に他の塩基配列の付加された塩基配列からなるポリヌクレオチドが例示される。
当該ポリヌクレオチドは、当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質が、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質と実質的に同質の活性を有する。ここで実質的に同質の活性とは、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識されるという性質を指す。当該活性およびその測定法については、前記「１）本発明のタンパク質」において記載したとおりである。
配列番号：１または配列番号：３に記載の塩基配列を含有するポリヌクレオチドは、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＦ２６３９２８において開示されている塩基配列、あるいは本明細書の配列表の配列番号：１または３に開示されている塩基配列の適当な部分をハイブリダイゼーションのプローブあるいはＰＣＲのプライマーに用いて、例えば骨肉腫細胞株（例えばＳａＯＳ−２）由来のｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングすることなどによりクローニングすることができる。該クローニングは、例えばＭｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  Ｅｄｔ．Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）等の基本書に従い、当業者ならば容易に行うことができる。
また前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと実質的に同一の塩基配列を含有するポリヌクレオチドとは、具体的には、
（ｅ）前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
（ｆ）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと７０％以上の配列同一性を示す塩基配列を含有するポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
（ｇ）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
が挙げられる。
好ましくは、前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと実質的に同一の塩基配列からなるポリヌクレオチドが挙げられる。前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと実質的に同一の塩基配列からなるポリヌクレオチドとしては、以下の（ｅ’）〜（ｇ’）に挙げるポリヌクレオチドが挙げられる：
（ｅ’）前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
（ｆ’）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと７０％以上の配列同一性を示す塩基配列からなるポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド、
（ｇ’）上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列からなるタンパク質をコードするポリヌクレオチドであって、かつ当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬに認識される特徴を有するポリヌクレオチド。
前記において「前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの相補鎖に対してストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド」とは、例えば前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの塩基配列と約４０％以上、好ましくは約６０％以上、より好ましくは約７０％以上、より好ましくは約８０％以上、さらに好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の配列同一性を有する塩基配列を含有するポリヌクレオチドが挙げられる。具体的には、前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの部分配列からなるポリヌクレオチドなどが挙げられる。
ハイブリダイゼーションは、自体公知の方法あるいはそれに準じる方法、例えばＭｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  Ｅｄｔ．Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）等の基本書に記載の方法に従って行うことができる。また市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行うことができる。
ここで「ストリンジェントな条件」とは、Ｂｅｒｇｅｒ  ａｎｄ  Ｋｉｍｍｅｌ（１９８７，Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．１５２，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ  ＣＡ）や前記Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  Ｅｄｔ．Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）に教示されるように、複合体或いはプローブを結合する核酸の融解温度（Ｔｍ）に基づいて決定することができる。
ハイブリダイゼーションの条件としては、例えば、６×ＳＳＣ（２０×ＳＳＣは、３３３ｍＭ  Ｓｏｄｉｕｍ  ｃｉｔｒａｔｅ、３３３ｍＭ  ＮａＣｌを示す）、０．５％ＳＤＳおよび５０％ホルムアミドを含む溶液中で４２℃にてハイブリダイズさせる条件、または６×ＳＳＣを含む（５０％ホルムアミドは含まない）溶液中で６５℃にてハイブリダイズさせる条件などが挙げられる。
またハイブリダイゼーション後の洗浄の条件としては、「１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、３７℃」程度の条件を挙げることができる。相補鎖はかかる条件で洗浄しても対象とする正鎖とハイブリダイズ状態を維持するものであることが好ましい。特に制限されないが、より厳しいハイブリダイズ条件として「０．５×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、４２℃」程度、さらに厳しいハイブリダイズ条件として「０．１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、６５℃」程度の洗浄条件を挙げることができる。
前記において「上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドと７０％以上の配列同一性を示す塩基配列を含有するポリヌクレオチド」とは、例えば前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの塩基配列と約７０％以上、より好ましくは約８０％以上、さらに好ましくは約９０％以上、最も好ましくは約９５％以上の配列同一性を示す塩基配列を含有するポリヌクレオチドが挙げられる。具体的には、前記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドの部分配列からなるポリヌクレオチドなどが挙げられる。
ここで「配列同一性」とは、２つのポリヌクレオチド間の、配列の同一性及び相同性をいう。当該「配列同一性」は、比較対象の配列の領域にわたって、最適な状態にアラインメントされた２つの配列を比較することにより決定される。ここで、比較対象のポリヌクレオチドは、２つの配列の最適なアラインメントにおいて、付加又は欠失（例えばギャップ等）を有していてもよい。このような配列同一性に関しては、例えば、Ｖｅｃｔｏｒ  ＮＴＩを用いて、ＣｌｕｓｔａｌＷアルゴリズム（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．，２２（２２）：４６７３−４６８０（１９９４））を利用してアラインメントを作成することにより算出することができる。尚、配列同一性は、配列解析ソフト、具体的にはＶｅｃｔｏｒ  ＮＴＩ、ＧＥＮＥＴＹＸ−ＭＡＣや公共のデータベースで提供される解析ツールを用いて測定される。前記公共データベースは、例えば、ホームページアドレスｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｄｄｂｊ．ｎｉｇ．ａｃ．ｊｐにおいて、一般的に利用可能である。
このような配列同一性を有するポリヌクレオチドは、前述のハイブリダイゼーション反応や通常のＰＣＲ反応により、または後述するポリヌクレオチドの改変（欠失、付加、置換）反応により作製することができる。
前記において「上記（ａ）〜（ｄ）のいずれかのポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質において１若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換及び／又は付加されたアミノ酸配列を含有するタンパク質」とは、人為的に作製したいわゆる改変タンパク質や、生体内に存在するアレル変異体等のタンパク質をコードする核酸を意味する。
ここでタンパク質におけるアミノ酸の変異数や変異部位は、本発明タンパク質の活性が保持される限り制限はない。このように活性を喪失することなくアミノ酸残基が、どのように、何個欠失、置換及び／又は付加されればよいかを決定する指標は、当業者に周知のコンピュータプログラム、例えばＤＮＡ  Ｓｔａｒ  ｓｏｆｔｗａｒｅを用いて見出すことができる。例えば変異数は、典型的には、全アミノ酸の１０％以内であり、好ましくは全アミノ酸の５％以内である。また置換されるアミノ酸は、タンパク質の構造保持の観点から、残基の極性、電荷、可溶性、疎水性、親水性並びに両親媒性など、置換前のアミノ酸と似た性質を有するアミノ酸であることが好ましい。例えば、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｒｏ、Ｍｅｔ、Ｐｈｅ及びＴｒｐは互いに非極性アミノ酸に分類されるアミノ酸であり、Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｃｙｓ、Ｔｙｒ、Ａｓｎ及びＧｌｎは互いに非荷電性アミノ酸に分類されるアミノ酸であり、Ａｓｐ及びＧｌｕは互いに酸性アミノ酸に分類されるアミノ酸であり、またＬｙｓ、Ａｒｇ及びＨｉｓは互いに塩基性アミノ酸に分類されるアミノ酸である。ゆえに、これらを指標として同群に属するアミノ酸を適宜選択することができる。
この改変タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、例えば、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  ２ｎｄ  Ｅｄｔ．Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（１９８９）等の基本書に記載の種々の方法、例えば部位特異的変異誘発やＰＣＲ法等によって製造することができる。また市販のキットを用いて、Ｇａｐｐｅｄ  ｄｕｐｌｅｘ法やＫｕｎｋｅｌ法などの公知の方法に従って製造することもできる。
以上のような本発明のポリヌクレオチドは、当該ポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質が、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるタンパク質と実質的に同質の活性を有するタンパク質である。ここで実質的に同質の活性とは、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質を発現させた細胞がＣＴＬにより認識されるという性質を指す。当該活性およびその測定法については、前記「１）本発明のタンパク質」において記載したとおりである。
本発明のポリヌクレオチドを含有する核酸は、１本鎖および２本鎖のいずれの形態もとることができる。本発明のポリヌクレオチドが２本鎖の場合、前記本発明のポリヌクレオチドを発現ベクターに挿入することにより、本発明のタンパク質を発現するための組換え発現ベクターを作製することができる。すなわち本発明の核酸の範疇には、本発明の２本鎖型ポリヌクレオチドを発現ベクターに挿入して作製された組換え発現ベクターも含まれる。
ここで用いる発現ベクターとしては、用いる宿主や目的等に応じて適宜選択することができ、プラスミド、ファージベクター、ウイルスベクター等が挙げられる。
例えば、宿主が大腸菌の場合、ベクターとしては、ｐＵＣ１１８、ｐＵＣ１１９、ｐＢＲ３２２、ｐＣＲ３等のプラスミドベクター、λＺＡＰＩＩ、λｇｔ１１などのファージベクターが挙げられる。宿主が酵母の場合、ベクターとしては、ｐＹＥＳ２、ｐＹＥＵｒａ３などが挙げられる。宿主が昆虫細胞の場合には、ｐＡｃＳＧＨｉｓＮＴ−Ａなどが挙げられる。宿主が動物細胞の場合には、ｐＣＥＰ４、ｐＫＣＲ、ｐＣＤＭ８、ｐＧＬ２、ｐｃＤＮＡ３．１、ｐＲｃ／ＲＳＶ、ｐＲｃ／ＣＭＶなどのプラスミドベクターや、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ関連ウイルスベクターなどのウイルスベクターが挙げられる。
前記ベクターは、発現誘導可能なプロモーター、シグナル配列をコードする遺伝子、選択用マーカー遺伝子、ターミネーターなどの因子を適宜有していても良い。
また、単離精製が容易になるように、チオレドキシン、Ｈｉｓタグ、あるいはＧＳＴ（グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ）等との融合タンパク質として発現する配列が付加されていても良い。この場合、宿主細胞内で機能する適切なプロモーター（ｌａｃ、ｔａｃ、ｔｒｃ、ｔｒｐ、ＣＭＶ、ＳＶ４０初期プロモーターなど）を有するＧＳＴ融合タンパクベクター（ｐＧＥＸ４Ｔなど）や、Ｍｙｃ、Ｈｉｓなどのタグ配列を有するベクター（ｐｃＤＮＡ３．１／Ｍｙｃ−Ｈｉｓなど）、さらにはチオレドキシンおよびＨｉｓタグとの融合タンパク質を発現するベクター（ｐＥＴ３２ａ）などを用いることができる。
前記で作製された発現ベクターで宿主を形質転換することにより、当該発現ベクターを含有する形質転換細胞を作製することができる。
ここで用いられる宿主としては、大腸菌、酵母、昆虫細胞、動物細胞などが挙げられる。大腸菌としては、Ｅ．ｃｏｌｉ  Ｋ−１２系統のＨＢ１０１株、Ｃ６００株、ＪＭ１０９株、ＤＨ５α株、ＡＤ４９４（ＤＥ３）株などが挙げられる。また酵母としては、サッカロミセス・セルビジエなどが挙げられる。動物細胞としては、Ｌ９２９細胞、ＢＡＬＢ／ｃ３Ｔ３細胞、Ｃ１２７細胞、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、Ｖｅｒｏ細胞、Ｈｅｌａ細胞、２９３−ＥＢＮＡ細胞などが挙げられる。昆虫細胞としてはｓｆ９などが挙げられる。
宿主細胞への発現ベクターの導入方法としては、前記宿主細胞に適合した通常の導入方法を用いれば良い。具体的にはリン酸カルシウム法、ＤＥＡＥ−デキストラン法、エレクトロポレーション法、遺伝子導入用リピッド（Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ、Ｌｉｐｏｆｅｃｔｉｎ；Ｇｉｂｃｏ−ＢＲＬ社）を用いる方法などが挙げられる。導入後、選択マーカーを含む通常の培地にて培養することにより、前記発現ベクターが宿主細胞中に導入された形質転換細胞を選択することができる。
以上のようにして得られた形質転換細胞を好適な条件下で培養し続けることにより、本発明のタンパク質を製造することができる。得られたタンパク質は、一般的な生化学的精製手段により、さらに単離・精製することができる。ここで精製手段としては、塩析、イオン交換クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー等が挙げられる。また本発明のタンパク質を、前述のチオレドキシンやＨｉｓタグ、ＧＳＴ等との融合タンパク質として発現させた場合は、これら融合タンパク質やタグの性質を利用した精製法により単離・精製することができる。
本発明の核酸の範疇には、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸も含まれる。
本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドは、ＤＮＡの形態であってもＲＮＡの形態であっても良い。これら本発明のポリヌクレオチドは、本発明のペプチドのアミノ酸配列情報およびそれによりコードされるＤＮＡの配列情報に基づき容易に製造することができる。具体的には、通常のＤＮＡ合成やＰＣＲによる増幅などによって、製造することができる。
本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドは、具体的には、前記エピトープペプチドをコードするポリヌクレオチドが挙げられる。
本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する核酸は、１本鎖および２本鎖のいずれの形態もとることができる。本発明のポリヌクレオチドが２本鎖の場合、前記本発明のポリヌクレオチドを発現ベクターに挿入することにより、本発明のペプチド（エピトープペプチド）を発現するための組換え発現ベクターを作製することができる。
ここで用いる発現ベクターや宿主細胞、宿主細胞の形質転換方法等については、前述の記載と同様である。
４）本発明のタンパク質を有効成分とするＣＴＬの誘導剤
本発明のタンパク質を含有する細胞はＣＴＬに認識されるという特徴を有する。すなわち本発明のタンパク質はＣＴＬの誘導剤である。誘導されたＣＴＬは、細胞傷害作用やリンフォカインの産生を介して抗腫瘍作用を発揮することができる。従って本発明のタンパク質は、腫瘍の治療または予防のための医薬（癌ワクチン）の有効成分とすることができる。本発明のタンパク質を有効成分として含有するＣＴＬの誘導剤は、本発明のタンパク質を腫瘍患者に投与することで、腫瘍を治療または予防し得るものである。当該タンパク質を腫瘍患者に投与すると、抗原提示細胞内に取り込まれ、その後、細胞内分解を受けて生じた腫瘍抗原ペプチドがＨＬＡ抗原と結合して複合体を形成し、該複合体が抗原提示細胞表面に提示され、この複合体に特異的なＣＴＬが体内で効率的に増殖し、腫瘍細胞を破壊する。以上のようにして、腫瘍の治療又は予防が達成される。
本発明のタンパク質を有効成分とするＣＴＬの誘導剤は、配列番号：２に記載のＰＢＦ陽性の如何なる腫瘍患者に対しても使用することができる。具体的には、例えば骨肉腫などの肉腫全般、又は腎癌などの癌（腫瘍）の予防または治療のために使用することができる。
本発明のタンパク質を有効成分として含有するＣＴＬの誘導剤は、細胞性免疫が効果的に成立するように、医薬として許容されるキャリアー、例えば適当なアジュバントと混合して投与、又は併用して投与することができる。
アジュバントとしては、文献（Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．，７：２７７−２８９，１９９４）に記載のものなどが応用可能であり、具体的には、菌体由来成分又はその誘導体、サイトカイン、植物由来成分又はその誘導体、海洋生物由来成分又はその誘導体、水酸化アルミニウムの如き鉱物ゲル、リソレシチン、プルロニックポリオールの如き界面活性剤、ポリアニオン、ペプチド、または油乳濁液（エマルション製剤）などを挙げることができる。また、リポソーム製剤、直径数μｍのビーズに結合させた粒子状の製剤、リピッドを結合させた製剤、マイクロスフェアー製剤、マイクロカプセル製剤なども考えられる。
前記において菌体由来成分又はその誘導体とは、具体的には、例えば▲１▼細菌の死菌、▲２▼細菌由来の細胞壁骨格（Ｃｅｌｌ  Ｗａｌｌ  Ｓｋｅｌｅｔｏｎ，ＣＷＳと略する）、▲３▼菌体由来の特定の成分又はその誘導体等に分類される。ここで▲１▼細菌の死菌としては、例えば溶連菌粉末（例えばピシバニール；中外製薬株式会社）、死菌浮遊物カクテル（例えばブロンカスマ・ベルナ；三和化学研究所）、あるいはヒト型結核菌の死菌等が挙げられる。
▲２▼細菌由来のＣＷＳとしては、マイクバクテリア属由来のＣＷＳ（例えばマイコバクテリア属ウシ型結核菌であるＢＣＧ株のＣＷＳ）、ノカルディア属由来のＣＷＳ（例えばノカルディア・ノブラのＣＷＳ）、あるいはコリネバクテリア属由来のＣＷＳ等が挙げられる。
▲３▼菌体由来の特定の成分又はその誘導体としては、例えば菌体由来多糖類であるヒト型結核菌由来多糖類成分（例えばアンサー；ゼリア新薬工業株式会社）や担子菌由来多糖類（例えばレンチナン；味の素、クレスチン；三共株式会社、担子菌カワラタケ）、またムラミルジペプチド（ＭＤＰ）関連化合物、リポ多糖（ＬＰＳ）、リピドＡ関連化合物（ＭＰＬ）、糖脂質トレハロースジマイコレート（ＴＤＭ）、細菌由来のＤＮＡ（例えばＣｐＧオリゴヌクレオチド）、あるいはこれらの誘導体などが挙げられる。
これら菌体由来成分及びその誘導体は、既に市販されているものであればそれを入手するか、又は公知文献（例えばＣａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，３３，２１８７−２１９５（１９７３）、Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．，４８，８３１−８３５（１９７２）、Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．，９４，１７３６−１７４５（１９６７）、Ｇａｎｎ，６９，６１９−６２６（１９７８）、Ｊ．Ｂａｃｔｅｒｉｏｌ．，９２，８６９−８７９（１９６６）、Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．，５２，９５−１０１（１９７４））等に基き単離又は製造することが可能である。
前記において「サイトカイン」とは、例えばＩＦＮ−α、ＩＬ−１２、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−２、ＩＦＮ−γ、ＩＬ−１８、あるいはＩＬ−１５などが挙げられる。これらのサイトカインは、天然品であっても遺伝子組換え品であっても良い。これらのサイトカインは、既に市販されていればそれを入手して使用することができる。また遺伝子組換え品であれば、例えばＧｅｎＢａｎｋ、ＥＭＢＬ、あるいはＤＤＢＪ等のデータベースにおいて登録されている各塩基配列に基き、常法により所望の遺伝子をクローニングし、適当な発現ベクターに連結して作製された組換え発現ベクターで宿主細胞を形質転換することにより、発現・生産することができる。
前記において「植物由来成分又はその誘導体」とは、例えばサポニン由来成分であるＱｕｉｌ  Ａ（Ａｃｃｕｒａｔｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ＆Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｃｏｒｐ）、ＱＳ−２１（Ａｑｕｉｌａ  Ｂｉｏｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ  ｉｎｃ．）、あるいはグリチルリチン（ＳＩＧＭＡ−ＡＬＤＲＩＣＨなど）などが挙げられる。
前記において「海洋生物由来成分又はその誘導体」とは、例えば海綿由来の糖脂質であるα−ガラクトシルセラミドなどが挙げられる。
前記において油乳濁液（エマルション製剤）とは、例えば油中水型（ｗ／ｏ）エマルション製剤、水中油型（ｏ／ｗ）エマルション製剤、水中油中水型（ｗ／ｏ／ｗ）エマルション製剤などが挙げられる。
ここで油中水型（ｗ／ｏ）エマルション製剤は、有効成分を水の分散相に分散させた形態をとる。水中油型（ｏ／ｗ）エマルション製剤は、有効成分を水の分散媒に分散させた形態をとる。また水中油中水型（ｗ／ｏ／ｗ）エマルション製剤は、有効成分を最内相の水の分散相に分散させた形態をとる。このようなエマルション製剤の調製は、例えば、特開平８−９８５号公報、特開平９−１２２４７６号公報等を参考にして行うことができる。
前記においてリポソーム製剤とは、有効成分を脂質二重膜構造のリポソームで水相内または膜内に包み込んだ形の微粒子である。リポソームを作るための主要な脂質としては、ホスファチジルコリン、スフィンゴミエリン等が挙げられ、これにジセチルホスフェート、ホスファチジン酸、ホスファチジルセリン等を加えてリポソームに荷電を与えて安定化させる。リポソームの調製方法としては、超音波法、エタノール注入法、エーテル注入法、逆相蒸発法、フレンチプレスエクストラクション法等が挙げられる。
前記においてマイクロスフェアー製剤は、均質な高分子マトリックスから構成され、該マトリックス中に有効成分が分散された形の微粒子である。マトリックスの材料としては、アルブミン、ゼラチン、キチン、キトサン、デンプン、ポリ乳酸、ポリアルキルシアノアクリレート等の生分解性高分子が挙げられる。マイクロスフェアー製剤の調製方法としては公知の方法（Ｅｕｒ．Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｂｉｏｐｈａｒｍ．５０：１２９−１４６，２０００、Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．Ｓｔａｎｄ．９２：６３−７８，１９９８、Ｐｈａｒｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１０：１−４３，１９９７）等に従えばよく特に限定されない。
前記においてマイクロカプセル製剤は、有効成分を芯物質として被膜物質で覆った形の微粒子である。被膜物質に用いられるコーティング材料としては、カルボキシメチルセルロース、セルロースアセテートフタレート、エチルセルロース、ゼラチン、ゼラチン・アラビアゴム、ニトロセルロース、ポリビニルアルコール、ヒドロキシプロピルセルロース等の膜形成性高分子が挙げられる。マイクロカプセル製剤の調製方法は、コアセルベーション法、界面重合法等が挙げられる。
投与方法としては、皮内投与、皮下投与、筋肉内投与、静脈内投与などが挙げられる。製剤中の本発明のタンパク質の投与量は、治療目的の疾患、患者の年齢、体重等により適宜調整することができるが、通常０．０００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、好ましくは０．００１ｍｇ〜１００ｍｇ、より好ましくは０．０１ｍｇ〜１０ｍｇであり、これを数日ないし数月に１回投与するのが好ましい。
５）本発明のペプチドを有効成分とするＣＴＬの誘導剤
本発明のペプチドはＣＴＬ誘導活性を有するＣＴＬの誘導剤である。誘導されたＣＴＬは、細胞傷害作用やリンフォカインの産生を介して抗腫瘍作用を発揮することができる。従って本発明のペプチドは、腫瘍の治療または予防のための医薬の有効成分とすることができる。本発明のペプチドを有効成分として含有するＣＴＬの誘導剤を腫瘍患者に投与すると、抗原提示細胞のＨＬＡ抗原に本発明のペプチドが提示され、提示されたＨＬＡ抗原とペプチドとの結合複合体特異的ＣＴＬが増殖して腫瘍細胞を破壊することができ、従って、患者の腫瘍を治療又は予防することができる。
本発明のペプチドを有効成分とするＣＴＬの誘導剤は、配列番号：２に記載のＰＢＦタンパク陽性の如何なる腫瘍患者に対しても使用することができる。具体的には、例えば骨肉腫などの肉腫全般または腎癌などの癌（腫瘍）の予防または治療のために使用することができる。
本発明のペプチドを有効成分とするＣＴＬの誘導剤は、単一のＣＴＬエピトープ（本発明のペプチド）を有効成分とするものであっても、また他のペプチド（ＣＴＬエピトープやヘルパーエピトープ）と連結したエピトープペプチドを有効成分とするものであっても良い。近年、複数のＣＴＬエピトープ（抗原ペプチド）を連結したエピトープペプチドが、イン・ビボで効率的にＣＴＬ誘導活性を有することが示されている。例えばＪｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １９９８，１６１：３１８６−３１９４には、癌抗原タンパク質ＰＳＡ由来のＨＬＡ−Ａ２，−Ａ３，−Ａ１１，Ｂ５３拘束性ＣＴＬエピトープ（抗原ペプチド）を連結した約３０ｍｅｒのエピトープペプチドが、イン・ビボでそれぞれのＣＴＬエピトープに特異的なＣＴＬを誘導したことが記載されている。またＣＴＬエピトープとヘルパーエピトープとを連結させたエピトープペプチドにより、効率的にＣＴＬが誘導されることも示されている。このようなエピトープペプチドの形態で投与した場合、抗原提示細胞内に取り込まれ、その後、細胞内分解を受けて生じた個々の抗原ペプチドがＨＬＡ抗原と結合して複合体を形成し、該複合体が抗原提示細胞表面に高密度に提示され、この複合体に特異的なＣＴＬが体内で効率的に増殖し、腫瘍細胞を破壊する。このようにして腫瘍の治療または予防が達成される。
本発明のペプチドを有効成分とするＣＴＬの誘導剤は、細胞性免疫が効果的に成立するように、医薬として許容されるキャリアー、例えば適当なアジュバントと混合して投与、又は併用して投与することができる。
アジュバントとしては、文献（Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．Ｒｅｖ．，７：２７７−２８９，１９９４）に記載のものなどが応用可能であり、具体的には、菌体由来成分又はその誘導体、サイトカイン、植物由来成分又はその誘導体、海洋生物由来成分又はその誘導体、水酸化アルミニウムの如き鉱物ゲル、リソレシチン、プルロニックポリオールの如き界面活性剤、ポリアニオン、ペプチド、または油乳濁液（エマルション製剤）などを挙げることができる。また、リポソーム製剤、直径数μｍのビーズに結合させた粒子状の製剤、リピッドを結合させた製剤、マイクロスフェアー製剤、マイクロカプセル製剤なども考えられる。これらアジュバントの具体例については、前記「４）本発明のタンパク質を有効成分とするＣＴＬの誘導剤」の項を参照されたい。
投与方法としては、皮内投与、皮下投与、筋肉内投与、静脈内投与などが挙げられる。製剤中の本発明のペプチドの投与量は、治療目的の疾患、患者の年齢、体重等により適宜調整することができるが、通常０．０００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、好ましくは０．００１ｍｇ〜１０００ｍｇ、より好ましくは０．１ｍｇ〜１０ｍｇであり、これを数日ないし数月に１回投与するのが好ましい。
６）本発明の核酸を有効成分とするＣＴＬの誘導剤
本発明の核酸を発現させた細胞は、ＣＴＬに認識されるという特徴を有する。すなわち本発明の核酸はＣＴＬの誘導剤である。誘導されたＣＴＬは、細胞傷害作用やリンフォカインの産生を介して抗腫瘍作用を発揮することができる。従って本発明の核酸は、腫瘍の治療または予防のための医薬の有効成分とすることができる。本発明の核酸を有効成分として含有するＣＴＬの誘導剤は、例えば、本発明の核酸を腫瘍患者に投与し発現させることで、腫瘍を治療または予防し得るものである。
例えば発現ベクターに組み込まれた本発明の核酸を以下の方法により腫瘍患者に投与すると、抗原提示細胞内で腫瘍抗原タンパク質が高発現する。その後、細胞内分解を受けて生じた腫瘍抗原ペプチドがＨＬＡ抗原と結合して複合体を形成し、該複合体が抗原提示細胞表面に高密度に提示されることにより、腫瘍特異的ＣＴＬが体内で効率的に増殖し、腫瘍細胞を破壊する。以上のようにして、腫瘍の治療または予防が達成される。
本発明の核酸を有効成分とするＣＴＬの誘導剤は、配列番号：１に記載のＰＢＦ遺伝子および当該遺伝子の発現産物であるＰＢＦ陽性の如何なる腫瘍患者に対しても使用することができる。具体的には、例えば骨肉腫などの肉腫全般または腎癌などの癌の予防または治療のために使用することができる。
本発明の核酸を投与し細胞内に導入する方法としては、ウイルスベクターによる方法およびその他の方法（日経サイエンス，１９９４年４月号，２０−４５頁、月刊薬事，３６（１），２３−４８（１９９４）、実験医学増刊，１２（１５），（１９９４）、およびこれらの引用文献等）のいずれの方法も適用することができる。
ウイルスベクターによる方法としては、例えばレトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス、ポリオウイルス、シンビスウイルス等のＤＮＡウイルス又はＲＮＡウイルスに本発明のＤＮＡを組み込んで導入する方法が挙げられる。この中で、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス、ワクシニアウイルス等を用いた方法が特に好ましい。
その他の方法としては、発現プラスミドを直接筋肉内に投与する方法（ＤＮＡワクチン法）、リポソーム法、リポフェクチン法、マイクロインジェクション法、リン酸カルシウム法、エレクトロポレーション法等が挙げられ、特にＤＮＡワクチン法、リポソーム法が好ましい。
本発明の核酸を実際に医薬として作用させるには、当該核酸を直接体内に導入するｉｎ  ｖｉｖｏ法、およびヒトからある種の細胞を採集し体外で核酸を該細胞に導入しその細胞を体内に戻すｅｘ  ｖｉｖｏ法がある（日経サイエンス，１９９４年４月号，２０−４５頁、月刊薬事，３６（１），２３−４８（１９９４）実験医学増刊，１２（１５），（１９９４）、およびこれらの引用文献等）。ｉｎ  ｖｉｖｏ法がより好ましい。
ｉｎ  ｖｉｖｏ法により投与する場合は、治療目的の疾患、症状等に応じた適当な投与経路により投与され得る。例えば、静脈、動脈、皮下、皮内、筋肉内等に投与することができる。ｉｎ  ｖｉｖｏ法により投与する場合は、例えば、液剤等の製剤形態をとりうるが、一般的には有効成分である本発明の核酸を含有する注射剤等とされ、必要に応じて、医薬上許容されるキャリアー（担体）を加えてもよい。また、本発明の核酸を含有するリポソームまたは膜融合リポソーム（センダイウイルス（ＨＶＪ）−リポソーム等）においては、懸濁剤、凍結剤、遠心分離濃縮凍結剤等のリポソーム製剤の形態とすることができる。
製剤中の本発明の核酸の含量は、治療目的の疾患、患者の年齢、体重等により適宜調整することができるが、通常、核酸中のポリヌクレオチドの含量として、０．０００１ｍｇ〜１００ｍｇ、好ましくは０．００１ｍｇ〜１０ｍｇの本発明の核酸を、数日ないし数月に１回投与するのが好ましい。
また近年、複数のＣＴＬエピトープ（腫瘍抗原ペプチド）を連結したエピトープペプチドをコードするポリヌクレオチド、あるいはＣＴＬエピトープとヘルパーエピトープとを連結させたエピトープペプチドをコードするポリヌクレオチドが、ｉｎ  ｖｉｖｏで効率的にＣＴＬ誘導活性を有することが示されている。例えばＪｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １９９９，１６２：３９１５−３９２５には、ＨＢＶ由来ＨＬＡ−Ａ２拘束性抗原ペプチド６種類、ＨＬＡ−Ａ１１拘束性抗原ペプチド３種類、およびヘルパーエピトープを連結したエピトープペプチドをコードするＤＮＡ（ミニジーン）が、イン・ビボでそれぞれのエピトープに対するＣＴＬを効果的に誘導したことが記載されている。
従って、本発明のペプチドをコードするポリヌクレオチドを１種または２種以上連結させることにより、また場合によっては他のペプチドをコードするポリヌクレオチドも連結させることにより作製されたポリヌクレオチドを、適当な発現ベクターに組み込むことにより、ＣＴＬの誘導剤の有効成分とすることができる。このようなＣＴＬの誘導剤も、前記と同様の投与方法および投与形態をとることができる。
７）本発明の抗原提示細胞
前記した本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸は、腫瘍患者の治療において、以下のようにイン・ビトロで利用することができる。すなわち本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸のいずれかと抗原提示能を有する細胞とをイン・ビトロで接触させることにより、抗原提示細胞を作製することができる。具体的には本発明は、腫瘍患者由来の単離された抗原提示能を有する細胞と、本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸のいずれかとをイン・ビトロで接触させることにより、当該細胞の細胞表面にＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を提示させた抗原提示細胞、およびその製造方法を提供するものである。
ここで「抗原提示能を有する細胞」とは、本発明のペプチドを提示することの可能なＨＬＡ抗原を細胞表面に発現する細胞であれば特に限定されないが、特に抗原提示能が高いとされる樹状細胞が好ましい。
また、前記抗原提示能を有する細胞から本発明の抗原提示細胞を調製するために添加される物質としては、本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸のいずれであっても良い。
本発明の抗原提示細胞は、腫瘍患者から抗原提示能を有する細胞を単離し、該細胞に本発明のタンパク質またはペプチドをイン・ビトロでパルスして、ＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体を提示させることにより得られる（Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．，４６：８２，１９９８、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５８，ｐ１７９６，１９９７、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５９，ｐ１１８４，１９９９）。樹状細胞を用いる場合は、例えば、腫瘍患者の末梢血からフィコール法によりリンパ球を分離し、その後非付着細胞を除き、付着細胞をＧＭ−ＣＳＦおよびＩＬ−４存在下で培養して樹状細胞を誘導し、当該樹状細胞を本発明のタンパク質またはペプチドと共に培養してパルスすることなどにより、本発明の抗原提示細胞を調製することができる。
また、前記抗原提示能を有する細胞に本発明の核酸を導入することにより本発明の抗原提示細胞を調製する場合は、当該核酸は、ＤＮＡの形態であっても、ＲＮＡの形態であっても良い。具体的には、ＤＮＡの場合はＣａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５６：ｐ５６７２，１９９６やＪ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１６１：ｐ５６０７，１９９８などを参考にして行うことができ、またＲＮＡの場合はＪ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１８４：ｐ４６５，１９９６などを参考にして行うことができる。
前記抗原提示細胞はＣＴＬの誘導剤の有効成分とすることができる。当該抗原提示細胞を有効成分として含有するＣＴＬの誘導剤は、抗原提示細胞を安定に維持するために、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）、培地等を含むことが好ましい。投与方法としては、静脈内投与、皮下投与、皮内投与が挙げられる。このような抗原提示細胞を有効成分として含有してなるＣＴＬの誘導剤を患者の体内に戻すことにより、本発明のＰＢＦ陽性の患者の体内で効率良く特異的なＣＴＬが誘導され、腫瘍を治療することができる。
８）本発明のＣＴＬ
本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸は、腫瘍患者の治療において、以下のようにイン・ビトロで利用することができる。すなわち本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸のいずれかと末梢血リンパ球とをイン・ビトロで接触させることにより、ＣＴＬを誘導することができる。具体的には本発明は、腫瘍患者由来の末梢血リンパ球と、本発明のタンパク質、ペプチドおよび核酸のいずれかとをイン・ビトロで接触させることにより誘導されたＣＴＬ、およびその誘導方法を提供するものである。
例えばメラノーマにおいては、患者本人の腫瘍内浸潤Ｔ細胞を体外で大量に培養して、これを患者に戻す養子免疫療法に治療効果が認められている（Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ．Ｉｎｓｔ．，８６：１１５９、１９９４）。またマウスのメラノーマにおいては、脾細胞をイン・ビトロで腫瘍抗原ペプチドＴＲＰ−２で刺激し、腫瘍抗原ペプチドに特異的なＣＴＬを増殖させ、該ＣＴＬをメラノーマ移植マウスに投与することにより、転移抑制が認められている（Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，１８５：４５３，１９９７）。これは、抗原提示細胞のＨＬＡ抗原と腫瘍抗原ペプチドとの複合体を特異的に認識するＣＴＬをイン・ビトロで増殖させた結果に基づくものである。従って、本発明のタンパク質、ペプチドまたは核酸を用いて、イン・ビトロで患者末梢血リンパ球を刺激して腫瘍特異的ＣＴＬを増やした後、このＣＴＬを患者に戻す治療法は有用であると考えられる。
当該ＣＴＬは腫瘍の治療剤または予防剤の有効成分とすることができる。該治療剤または予防剤は、ＣＴＬを安定に維持するために、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）、培地等を含むことが好ましい。投与方法としては、静脈内投与、皮下投与、皮内投与が挙げられる。このようなＣＴＬを有効成分として含有してなる腫瘍の治療または予防剤を患者の体内に戻すことにより、本発明のＰＢＦ陽性の患者の体内でＣＴＬによる腫瘍細胞の傷害作用が促進され、腫瘍細胞を破壊することにより、腫瘍を治療することができる。
９）本発明のペプチドに対する抗体
本発明は、本発明のペプチドに特異的に結合する抗体を提供する。本発明の抗体は、その形態に特に制限はなく、本発明のペプチドを免疫抗原とするポリクローナル抗体であっても、またモノクローナル抗体であっても良い。
本発明の抗体は前記のように本発明のペプチドに特異的に結合するものであれば特に制限されないが、具体的には、配列番号：６〜５５のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる腫瘍抗原ペプチドに特異的に結合する抗体を挙げることができる。
これらの抗体の製造方法は、すでに周知であり、本発明の抗体もこれらの常法に従って製造することができる（Ｃｕｒｒｅｎｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｅｄｉｔ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７）Ｐｕｂｌｉｓｈ．Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ．Ｓｅｃｔｉｏｎ  １１．１２〜１１．１３、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ；Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｌａｎｅ，Ｈ，Ｄ．ら編，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ出版Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  １９８９）。
具体的には、本発明のペプチド（例えば配列番号：６〜５５のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる腫瘍抗原ペプチド）を免疫原として用い、家兎等の非ヒト動物を免疫し、該免疫動物の血清から常法に従って得ることが可能である。一方、モノクローナル抗体の場合には、本発明のペプチド（例えば配列番号：６〜５５のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる腫瘍抗原ペプチド）をマウス等の非ヒト動物に免疫し、得られた脾臓細胞と骨髄腫細胞とを細胞融合させて調製したハイブリドーマ細胞の中から得ることができる（Ｃｕｒｒｅｎｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｅｄｉｔ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７）Ｐｕｂｌｉｓｈ．Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ．Ｓｅｃｔｉｏｎ  １１．４〜１１．１１）。
本発明のペプチドに対する抗体の作製は、宿主に応じて種々のアジュバントを用いて免疫学的反応を高めることによって行うこともできる。そのようなアジュバントには、フロイントアジュバント、水酸化アルミニウムのようなミネラルゲル、並びにリゾレシチン、プルロニックポリオル、ポリアニオン、ペプチド、油乳剤、キーホールリンペットヘモシアニンおよびジニトロフェノールのような表面活性物質、ＢＣＧ（カルメット−ゲラン桿菌）やコリネバクテリウム−パルヴムなどのヒトアジュバントなどがある。
以上のように本発明のペプチドを用いて常法により適宜動物を免疫することにより、ペプチドを認識する抗体、さらにはその活性を中和する抗体が容易に作製できる。抗体の用途としては、アフィニティークロマトグラフィー、免疫学的診断等が挙げられる。免疫学的診断は、イムノブロット法、放射免疫測定法（ＲＩＡ）、酵素免疫測定法（ＥＬＩＳＡ）、蛍光あるいは発光測定法等より適宜選択できる。このような免疫学的診断は、本発明のＰＢＦ遺伝子が発現している癌、例えば肉腫や腎癌等の診断において有効である。
１０）腫瘍マーカー
▲１▼本発明のポリヌクレオチドに関する腫瘍マーカー
本発明においては、配列番号：１に記載のＰＢＦ遺伝子が、正常細胞に比して肉腫および腎癌において特異的に高発現しているという知見を得た。よって、当該遺伝子発現の有無や発現の程度を検出することによって、腫瘍、特に肉腫や腎癌の有無や程度が特異的に検出でき、該疾患の診断を行うことができる。
本発明のポリヌクレオチドは、従って、被験者におけるＰＢＦ遺伝子の発現の有無またはその程度を検出することによって、該被験者が腫瘍に罹患しているか否かまたはその罹患の程度を診断することのできるツール（腫瘍マーカー）として有用である。
本発明の腫瘍マーカーは、前記本発明ポリヌクレオチド（配列番号：２に記載のアミノ酸配列と同一または実質的に同一のアミノ酸配列を含有するタンパク質をコードするポリヌクレオチド）の塩基配列において、連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／またはそれに相補的なポリヌクレオチドからなることを特徴とするものである。
具体的には、本発明の腫瘍マーカーは、配列番号：１または３に記載の塩基配列において、連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／またはそれに相補的なポリヌクレオチドからなるものを挙げることができる。
ここで相補的なポリヌクレオチド（相補鎖、逆鎖）とは、前記配列番号：１または３に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドの全長配列、または該塩基配列において少なくとも連続した１５塩基長の塩基配列を含有するその部分配列（ここでは便宜上、これらを「正鎖」ともいう）に対して、Ａ：ＴおよびＧ：Ｃといった塩基対関係に基づいて、塩基的に相補的な関係にあるポリヌクレオチドを意味するものである。ただし、かかる相補鎖は、対象とする正鎖の塩基配列と完全に相補配列を形成する場合に限らず、対象とする正鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズすることができる程度の相補関係を有するものであってもよい。なお、ここでストリンジェントな条件は、Ｂｅｒｇｅｒ  ａｎｄ  Ｋｉｍｍｅｌ（１９８７，Ｇｕｉｄｅ  ｔｏ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．１５２，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ  ＣＡ）に教示されるように、複合体或いはプローブを結合する核酸の融解温度（Ｔｍ）に基づいて決定することができる。例えばハイブリダイズ後の洗浄条件として、通常「１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、３７℃」程度の条件を挙げることができる。相補鎖はかかる条件で洗浄しても対象とする正鎖とハイブリダイズ状態を維持するものであることが好ましい。特に制限されないが、より厳しいハイブリダイズ条件として「０．５×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、４２℃」程度、さらに厳しいハイブリダイズ条件として「０．１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ、６５℃」程度の洗浄条件を挙げることができる。具体的には、このような相補鎖として、対象の正鎖の塩基配列と完全に相補的な関係にある塩基配列からなる鎖、並びに該鎖と少なくとも９０％、好ましくは９５％の相同性を有する塩基配列からなる鎖を例示することができる。
ここで、正鎖側のポリヌクレオチドには、配列番号：１または３に記載の塩基配列、またはその部分配列を含有するものだけでなく、上記相補鎖の塩基配列に対してさらに相補的な関係にある塩基配列からなる鎖を含めることができる。
さらに上記正鎖のポリヌクレオチド及び相補鎖（逆鎖）のポリヌクレオチドは、各々一本鎖の形態で腫瘍マーカーとして使用されても、また二本鎖の形態で腫瘍マーカーとして使用されてもよい。
本発明の腫瘍マーカーは、具体的には、前記配列番号：１または３に記載の塩基配列（全長配列）からなるポリヌクレオチドであってもよいし、その相補配列からなるポリヌクレオチドであってもよい。またこれら本発明遺伝子もしくは該遺伝子に由来するポリヌクレオチドを選択的に（特異的に）認識するものであれば、上記全長配列またはその相補配列の部分配列からなるポリヌクレオチドであってもよい。この場合、部分配列としては、上記全長配列またはその相補配列の塩基配列から任意に選択される少なくとも１５個の連続した塩基長を含有するポリヌクレオチドを挙げることができる。
なお、ここで「選択的に（特異的に）認識する」とは、例えばノーザンブロット法においては、本発明のＰＢＦ遺伝子、またはこれらに由来するポリヌクレオチドが特異的に検出できること、またＲＴ−ＰＣＲ法においては、本発明のＰＢＦ遺伝子、またはこれらに由来するポリヌクレオチドが特異的に生成されることを意味するが、それに限定されることなく、当業者が上記検出物または生成物がＰＢＦ遺伝子に由来するものであると判断できるものであればよい。
本発明の腫瘍マーカーは、例えば配列番号１又は３に記載の塩基配列をもとに、例えばｐｒｉｍｅｒ３（ＨＹＰＥＲＬＩＮＫ  ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｇｅｎｏｍｅ．ｗｉ．ｍｉｔ．ｅｄｕ／ｃｇｉ−ｂｉｎ／ｐｒｉｍｅｒ／ｐｒｉｍｅｒ３．ｃｇｉ）あるいはベクターＮＴＩ（Ｉｎｆｏｍａｘ社製）を利用して設計することができる。具体的には前記本発明遺伝子の塩基配列をｐｒｉｍｅｒ３またはベクターＮＴＩのソフトウエアにかけて得られる、プライマーまたはプローブの候補配列、若しくは少なくとも該配列を一部に含む配列をプライマーまたはプローブとして使用することができる。このような本発明の腫瘍マーカーの具体例としては、例えば配列番号：４または５に記載のプライマーを挙げることができる。
本発明の腫瘍マーカーは、上述するように連続する少なくとも１５塩基の長さを含有するものであればよいが、具体的にはマーカーの用途に応じて、長さを適宜選択し設定することができる。
本発明において腫瘍の検出（診断）は、被験者の生体組織、特に腫瘍（肉腫や腎癌）が疑われる被験組織におけるＰＢＦ遺伝子の発現の有無または発現レベル（発現量）を評価することによって行われる。この場合、上記本発明の腫瘍マーカーは、ＰＢＦ遺伝子の発現によって生じたＲＮＡまたはそれに由来するポリヌクレオチドを特異的に認識し増幅するためのプライマーとして、または該ＲＮＡまたはそれに由来するポリヌクレオチドを特異的に検出するためのプローブとして利用することができる。
本発明腫瘍マーカーを腫瘍の検出においてプライマーとして用いる場合には、通常１５ｂｐ〜１００ｂｐ、好ましくは１５ｂｐ〜５０ｂｐ、より好ましくは１５ｂｐ〜３５ｂｐの塩基長を含有するものが例示できる。また検出プローブとして用いる場合には、通常１５ｂｐ〜全配列の塩基数、好ましくは１５ｂｐ〜１ｋｂ、より好ましくは１００ｂｐ〜１ｋｂの塩基長を含有するものが例示できる。
本発明の腫瘍マーカーは、ノーザンブロット法、ＲＴ−ＰＣＲ法、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダーゼーション法などといった、特定遺伝子を特異的に検出する公知の方法において、常法に従ってプライマーまたはプローブとして利用することができる。
本発明の腫瘍マーカーは、腫瘍の診断、検出（罹患の有無や罹患の程度の診断）に有用である。具体的には、該腫瘍マーカーを利用した腫瘍の診断は、被験者における生体組織（腫瘍が疑われる組織）と正常者における同様の組織におけるＰＢＦ遺伝子の遺伝子発現レベルの違いを判定することによって行うことができる。この場合、遺伝子発現レベルの違いには、発現のある／なしの違いだけでなく、被験者の組織と正常者の組織の両者ともに発現がある場合でも、両者間の発現量の格差が２倍以上、好ましくは３倍以上の場合が含まれる。具体的にはＰＢＦ遺伝子は腫瘍で発現誘導を示すので、被験者の組織で発現しており、該発現量が正常者の対応組織の発現量と比べて２倍以上、好ましくは３倍以上多ければ、被験者について腫瘍の罹患が疑われる。
▲２▼本発明の抗体に関する腫瘍マーカー
本発明は腫瘍マーカーとして、本発明のタンパク質又はその部分ペプチド（本発明のペプチドを含む）を特異的に認識することのできる抗体（以下、本発明の抗体と称する場合がある）を提供する。より具体的には、本発明は、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなる本発明のタンパク質またはその部分ペプチド（本発明のペプチドを含む）を特異的に認識する抗体からなる腫瘍マーカーを提供する。
本発明においては、種々の肉腫および腎癌において、本発明のＰＢＦ遺伝子が特異的に高発現しているという知見を得た。よってこれらの遺伝子の発現産物（タンパク質）の有無やその発現の程度を検出することによって、上記腫瘍（肉腫、腎癌等）の有無やその程度が特異的に検出でき、該疾患の診断を行うことができる。
上記抗体は、従って、被験者における上記タンパク質の発現の有無またはその程度を検出することによって、該被験者が腫瘍に罹患しているか否かまたはその疾患の程度を診断することのできるツール（腫瘍マーカー）として有用である。
本発明の抗体は、その形態に特に制限はなく、本発明タンパク質（具体的には配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなるＰＢＦタンパク質）を免疫抗原とするポリクローナル抗体であっても、またそのモノクローナル抗体であってもよい。さらにこれら本発明タンパク質のアミノ酸配列のうち少なくとも連続する、通常８アミノ酸、好ましくは１５アミノ酸、より好ましくは２０アミノ酸からなるポリペプチドに対して抗原結合性を有する抗体も、本発明の抗体に含まれる。
これらの抗体の製造方法は、すでに周知であり、本発明の抗体もこれらの常法に従って製造することができる（Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｃｈａｐｔｅｒ  １１．１２〜１１．１３（２０００））。具体的には、本発明の抗体がポリクローナル抗体の場合には、常法に従って大腸菌等で発現し精製した本発明タンパク質を用いて、あるいは常法に従ってこれら本発明タンパク質の部分アミノ酸配列を含有するオリゴペプチドを合成して、家兎等の非ヒト動物に免疫し、該免疫動物の血清から常法に従って得ることが可能である。一方、モノクローナル抗体の場合には、常法に従って大腸菌等で発現し精製した本発明タンパク質、あるいはこれらタンパク質の部分アミノ酸配列を含有するオリゴペプチドをマウス等の非ヒト動物に免疫し、得られた脾臓細胞と骨髄腫細胞とを細胞融合させて調製したハイブリドーマ細胞の中から得ることができる（Ｃｕｒｒｅｎｔ  ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ｅｄｉｔ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７）Ｐｕｂｌｉｓｈ．Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ．Ｓｅｃｔｉｏｎ  １１．４〜１１．１１）。
抗体の作製に免疫抗原として使用される本発明タンパク質（具体的には配列番号：２に記載のアミノ酸配列よりなるＰＢＦタンパク質）は、本発明により提供される遺伝子の配列情報（配列番号１，３）に基づいて、ＤＮＡクローニング、各プラスミドの構築、宿主へのトランスフェクション、形質転換体の培養および培養物からのタンパク質の回収の操作により得ることができる。これらの操作は、当業者に既知の方法、あるいは文献記載の方法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｔ．Ｍａｎｉａｔｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，ＣＳＨ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ（１９８３），ＤＮＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，ＤＭ．Ｇｌｏｖｅｒ，ＩＲＬ  ＰＲＥＳＳ（１９８５））などに準じて行うことができる。また本発明タンパク質の部分ペプチドは、本発明により提供されるアミノ酸配列の情報（配列番号：２）に従って、一般的な化学合成法（ペプチド合成）によって製造することもできる。詳しくは前述の１）〜３）の項を参照されたい。
本発明の抗体は、また、本発明タンパク質の部分アミノ酸配列を含有するオリゴペプチドを用いて調製されるものであってよい。かかる抗体の製造のために用いられるオリゴ（ポリ）ペプチドは、機能的な生物活性を有することは要しないが、本発明タンパク質と同様な免疫原特性を有するものであることが望ましい。好ましくはこの免疫原特性を有し、且つ本発明タンパク質のアミノ酸配列において少なくとも連続する８アミノ酸、好ましくは１５アミノ酸、より好ましくは２０アミノ酸からなるオリゴ（ポリ）ペプチドを例示することができる。
かかるオリゴ（ポリ）ペプチドに対する抗体の製造は、宿主に応じて種々のアジュバントを用いて免疫学的反応を高めることによって行うこともできる。限定はされないが、そのようなアジュバントには、フロイントアジュバント、水酸化アルミニウムのようなミネラルゲル、並びにリゾレシチン、プルロニックポリオル、ポリアニオン、ペプチド、油乳剤、キーホールリンペットヘモシアニン及びジニトロフェノールのような表面活性物質、ＢＣＧ（カルメット−ゲラン桿菌）やコリネバクテリウム−パルヴムなどのヒトアジュバントが含まれる。
本発明の抗体は、ＰＢＦタンパクに特異的に結合する性質を有することから、該抗体を利用することによって、被験者の組織内に発現した上記タンパク質を特異的に検出することができる。すなわち、当該抗体は被験者の組織内におけるＰＢＦ発現の有無を検出するためのプローブとして有用である。
具体的には、腫瘍が疑われる被験組織や血液をバイオプシ等で採取し、そこから常法に従ってタンパク質を調製して、例えばウェスタンブロット法、ＥＬＩＳＡ法など公知の検出方法において、上記抗体を常法に従ってプローブとして使用することによってＰＢＦを検出することができる。
腫瘍の診断に際しては、被験者組織におけるＰＢＦタンパクの量と正常な対応組織におけるＰＢＦタンパク量の違いを判定すればよい。この場合、タンパク量の違いには、タンパクのある／なし、あるいはタンパク量の違いが２倍以上、好ましくは３倍以上の場合が含まれる。具体的にはＰＢＦ遺伝子は腫瘍（肉腫、腎癌）で発現誘導を示すので、被験者組織で該遺伝子の発現産物（ＰＢＦ）が存在しており、該量が正常な組織の発現産物量と比べて２倍以上、好ましくは３倍以上多いことが判定されれば、腫瘍の罹患が疑われる。
▲３▼本発明のタンパク質またはペプチドに関する腫瘍マーカー
本発明は腫瘍マーカーとして、本発明のタンパク質又はその部分ペプチドに対する抗体を特異的に認識することのできるタンパク質またはペプチドを提供する。より具体的には、本発明は、配列番号：２に記載のアミノ酸配列からなる本発明のタンパク質またはその部分ペプチドからなる腫瘍マーカーを提供する。
ここで腫瘍マーカーの成分とされる本発明タンパク質の部分ペプチドとしては、本発明タンパク質のアミノ酸配列のうち少なくとも連続する、通常８アミノ酸、好ましくは１５アミノ酸、より好ましくは２０アミノ酸からなるポリペプチドを挙げることができる。
本発明のタンパク質やペプチド（ポリペプチド）を診断薬として用い、腫瘍が疑われる患者から得た試料（例えば血液、腫瘍が疑われる組織など）中の抗体の存在を検出することにより、腫瘍を診断することが可能である。ここで用いる本発明タンパク質およびペプチドの製造法については、前記１）および２）の項で述べたとおりである。
具体的には、患者の血液を採取するか、若しくは腫瘍が疑われる被験組織をバイオプシ等で採取し、そこから常法に従ってタンパク質を調製して、例えばウェスタンブロット法、ＥＬＩＳＡ法など公知の検出方法において、上記本発明タンパク質またはペプチドを常法に従ってプローブとして使用することによって、ＰＢＦに対する抗体を検出することができる。
腫瘍の診断に際しては、被験者組織における抗ＰＢＦ抗体の量と正常な対応組織における抗ＰＢＦ抗体の量の違いを判定すればよい。この場合、タンパク量の違いには、タンパクのある／なし、あるいはタンパク量の違いが２倍以上、好ましくは３倍以上の場合が含まれる。具体的にはＰＢＦ遺伝子は腫瘍（肉腫、腎癌）で発現誘導を示すので、被験者組織で該遺伝子の発現産物（ＰＢＦ）に対する抗体が存在しており、この抗ＰＢＦ抗体の量が正常な組織での抗ＰＢＦ抗体量と比べて２倍以上、好ましくは３倍以上多いことが判定されれば、腫瘍の罹患が疑われる。
▲４▼ＨＬＡテトラマーに関する腫瘍マーカー
本発明はまた、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原とを含有するＨＬＡテトラマー、および当該ＨＬＡテトラマーからなる腫瘍マーカーを提供する。
ここでＨＬＡテトラマーとは、ＨＬＡ抗原のα鎖とβ２ミクログロブリンをペプチド（抗原ペプチド）と会合させた複合体（ＨＬＡモノマー）をビオチン化し、アビジンに結合させることにより４量体化したものを指す（Ｓｃｉｅｎｃｅ２７９：２１０３−２１０６（１９９８）、Ｓｃｉｅｎｃｅ２７４：９４−９６（１９９６））。現在では種々の抗原ペプチドを含有するＨＬＡテトラマーが市販されており（例えば（株）医学生物学研究所）、本発明のペプチドとＨＬＡ抗原とを含有するＨＬＡテトラマーを容易に作製することができる。
具体的には、例えば配列番号：６〜４５のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる腫瘍抗原ペプチドとＨＬＡ−Ａ２４抗原とを含有するＨＬＡテトラマー、または、配列番号：４６〜５５のいずれかに記載のアミノ酸配列からなる腫瘍抗原ペプチドとＨＬＡ−Ｂ５５抗原とを含有するＨＬＡテトラマーが挙げられる。
当該ＨＬＡテトラマーは、フローサイトメトリー、蛍光顕微鏡等の公知の検出手段により結合したＣＴＬを容易に選別または検出することが出来るように蛍光標識されていることが好ましい。具体的には、例えばフィコエリスリン（ＰＥ）、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、ペリジニンクロロフィルプロテイン（ＰｅｒＣＰ）などにより標識されたＨＬＡテトラマーが挙げられる。
ＨＬＡテトラマーの成分であるＨＬＡ−Ａ２４抗原（ＨＬＡ−Ａ２４抗原のα鎖）は、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５５：４２４８−４２５２（１９９５）およびＧｅｎｂａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．Ｍ６４７４０に開示されているＨＬＡ−Ａ２４０２遺伝子の公知の塩基配列の情報に基づき、ＰＣＲ法等の常法により容易にクローニングすることができる。またＨＬＡ−Ｂ５５抗原の場合も、ＨＬＡ−Ｂ５５０２遺伝子（ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｍ７７７７７、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４８（４），１１５５−１１６２（１９９２））の公知の塩基配列の情報に基づきクローニングすることができる。
ＨＬＡテトラマーの成分であるβ２ミクログロブリンは、ヒト由来のβ２ミクログロブリンが好ましい。当該ヒトβ２ミクログロブリンはＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．ＡＢ０２１２８８に開示されているヒトβ２ミクログロブリンの公知の塩基配列情報に基づき、ＰＣＲ法等の常法により容易にクローニングすることができる。
以上のＨＬＡテトラマーの成分を含有するＨＬＡテトラマーの作製法については、文献（Ｓｃｉｅｎｃｅ２７９：２１０３−２１０６（１９９８）、Ｓｃｉｅｎｃｅ２７４：９４−９６（１９９６）等）により周知であるが、ＨＬＡ−Ａ２４抗原を例にとり簡単に述べると以下のようになる。
まずタンパク質を発現可能な大腸菌や哺乳動物細胞に、ＨＬＡ−Ａ２４α鎖発現ベクターおよびβ２ミクログロブリン発現ベクターを導入し発現させる。ここでは大腸菌（例えばＢＬ２１）を用いることが好ましい。得られた単量体ＨＬＡ−Ａ２４複合体と本発明ペプチドとを混合し、可溶性のＨＬＡ−ペプチド複合体を形成させる。次にＨＬＡ−ペプチド複合体におけるＨＬＡ−Ａ２４α鎖のＣ末端部位の配列をＢｉｒＡ酵素によりビオチン化する。このビオチン化されたＨＬＡ−ペプチド複合体と蛍光標識されたアビジンとを４：１のモル比で混合することにより、ＨＬＡテトラマーを調製することができる。なお、前記各ステップにおいて、ゲルろ過等によるタンパク精製を行うことが好ましい。
▲５▼腫瘍の検出方法（診断方法）
本発明は、前述した本発明腫瘍マーカーを利用した腫瘍の検出方法（診断方法）を提供するものである。
具体的には、本発明の検出方法（診断方法）は、被験者の血液を採取するか、若しくは腫瘍が疑われる被験組織の一部をバイオプシ等で採取し、そこに含まれるＰＢＦ遺伝子の遺伝子発現レベル、これらの遺伝子に由来するＰＢＦタンパク質の量、当該ＰＢＦに対する抗体の量、若しくはＰＢＦ由来の腫瘍抗原ペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識するＣＴＬの量を、検出・測定することにより、肉腫や腎癌等の腫瘍の罹患の有無またはその程度を診断するものである。また本発明の検出（診断）方法は、例えば腫瘍患者において、該腫瘍の改善のために治療薬を投与した場合における、該疾患の改善の有無またはその程度を検出（診断）することもできる。さらに本発明の検出（診断）方法は、本発明のタンパク質、ペプチドまたは核酸を有効成分とする医薬の適応可能な腫瘍患者の選択や、当該医薬による治療効果の判定などにも利用できる。
本発明の検出方法は次の（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）の工程を含むものである：
（ａ）被験者の生体試料と本発明の腫瘍マーカーを接触させる工程、
（ｂ）生体試料中のＰＢＦ遺伝子発現レベル、ＰＢＦタンパク質量、抗ＰＢＦ抗体量、またはＰＢＦ由来の腫瘍抗原ペプチドとＨＬＡ抗原との複合体を認識するＣＴＬの量を、上記腫瘍マーカーを指標として測定する工程、
（ｃ）（ｂ）の結果をもとに、腫瘍の罹患を判断する工程。
ここで用いられる生体試料としては、被験者の生体組織（腫瘍が疑われる組織及びその周辺組織、または血液など）から調製される試料を挙げることができる。具体的には、該組織から調製されるＲＮＡ含有試料、若しくはそれからさらに調製されるポリヌクレオチドを含む試料、または上記組織から調製されるタンパク質、抗体を含む試料、あるいは上記組織から調製される末梢血リンパ球を含む試料を挙げることができる。
本発明の診断方法は、測定対象として用いる生体試料の種類に応じて、具体的には下記のようにして実施される。
（▲５▼−１）測定対象の生体試料としてＲＮＡを利用する場合
測定対象物としてＲＮＡを利用する場合、腫瘍の検出は、具体的に下記の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含む方法によって実施することができる：
（ａ）被験者の生体試料から調製されたＲＮＡまたはそれから転写された相補的ポリヌクレオチドと、前記本発明の腫瘍マーカー（本発明のポリヌクレオチドの塩基配列において連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／又は該ポリヌクレオチドに相補的なポリヌクレオチド）とを結合させる工程、
（ｂ）該腫瘍マーカーに結合した生体試料由来のＲＮＡまたは該ＲＮＡから転写された相補的ポリヌクレオチドを、上記腫瘍マーカーを指標として測定する工程、
（ｃ）上記（ｂ）の測定結果に基づいて、腫瘍の罹患を判断する工程。
測定対象物としてＲＮＡを利用する場合は、本発明の検出方法（診断方法）は、該ＲＮＡ中のＰＢＦ遺伝子の発現レベルを検出し、測定することによって実施される。具体的には、前述のポリヌクレオチドからなる本発明の腫瘍マーカー（本発明のポリヌクレオチドの塩基配列において連続する少なくとも１５塩基を含有するポリヌクレオチド及び／又はその相補的なポリヌクレオチド）をプライマーまたはプローブとして用いて、ノーザンブロット法、ＲＴ−ＰＣＲ法、ＤＮＡチップ解析法、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション解析法などの公知の方法を行うことにより実施できる。
ノーザンブロット法を利用する場合は、本発明の上記腫瘍マーカーをプローブとして用いることによって、ＲＮＡ中のＰＢＦ遺伝子の発現の有無やその発現レベルを検出、測定することができる。具体的には、本発明の腫瘍マーカー（相補鎖）を放射性同位元素（３２Ｐ、３３Ｐなど：ＲＩ）や蛍光物質などで標識し、それを、常法に従ってナイロンメンブレン等にトランスファーした被験者の生体組織由来のＲＮＡとハイブリダイズさせた後、形成された腫瘍マーカー（ＤＮＡ）とＲＮＡとの二重鎖を、腫瘍マーカーの標識物（ＲＩ若しくは蛍光物質）に由来するシグナルを放射線検出器（ＢＡＳ−１８００ＩＩ、富士フィルム社製）または蛍光検出器で検出、測定する方法を例示することができる。また、ＡｌｋＰｈｏｓ  Ｄｉｒｅｃｔ  Ｌａｂｅｌｌｉｎｇ  ａｎｄ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ社製）を用いて、該プロトコールに従って腫瘍マーカー（プローブＤＮＡ）を標識し、被験者の生体組織由来のＲＮＡとハイブリダイズさせた後、腫瘍マーカーの標識物に由来するシグナルをマルチバイオイメージャーＳＴＯＲＭ８６０（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ社製）で検出、測定する方法を使用することもできる。
ＲＴ−ＰＣＲ法を利用する場合は、本発明の上記腫瘍マーカーをプライマーとして用いることによって、ＲＮＡ中のＰＢＦ遺伝子の発現の有無や発現レベルを検出、測定することができる。具体的には、被験者の生体組織由来のＲＮＡから常法に従ってｃＤＮＡを調製して、これを鋳型として標的のＰＢＦ遺伝子の領域が増幅できるように、本発明の腫瘍マーカーから調製した一対のプライマー（上記ｃＤＮＡ（−鎖）に結合する正鎖、＋鎖に結合する逆鎖）をこれとハイブリダイズさせて、常法に従ってＰＣＲ法を行い、得られた増幅二本鎖ＤＮＡを検出する方法を例示することができる。なお、増幅された二本鎖ＤＮＡの検出は、上記ＰＣＲを予めＲＩや蛍光物質で標識しておいたプライマーを用いて行うことによって産生される標識二本鎖ＤＮＡを検出する方法、産生された二本鎖ＤＮＡを常法に従ってナイロンメンブレン等にトランスファーさせて、標識した腫瘍マーカーをプローブとして使用してこれとハイブリダイズさせて検出する方法などを用いることができる。なお、生成された標識二本鎖ＤＮＡ産物はアジレント２１００バイオアナライザ（横河アナリティカルシステムズ社製）などで測定することができる。また、ＳＹＢＲ  Ｇｒｅｅｎ  ＲＴ−ＰＣＲ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）で該プロトコールに従ってＲＴ−ＰＣＲ反応液を調製し、ＡＢＩ  ＰＲＩＳＭ  ７７００  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）で反応させて、該反応物を検出することもできる。
ＤＮＡチップ解析を利用する場合は、本発明の上記腫瘍マーカーをＤＮＡプローブ（１本鎖または２本鎖）として貼り付けたＤＮＡチップを用意し、これに被験者の生体組織由来のＲＮＡから常法によって調製されたｃＲＮＡとハイブリダイズさせて、形成されたＤＮＡとｃＲＮＡとの二本鎖を、本発明の腫瘍マーカーから調製される標識プローブと結合させて検出する方法を挙げることができる。
（▲５▼−２）測定対象の生体試料としてタンパク質を用いる場合
測定対象物としてタンパク質を用いる場合は、本発明の腫瘍の検出方法（診断方法）は、生体試料中のＰＢＦを検出し、その量を測定することによって実施される。具体的には下記の工程（ａ）、（ｂ）及び（ｃ）を含む方法によって実施することができる：
（ａ）被験者の生体試料から調製されたタンパク質と抗体に関する本発明の腫瘍マーカー（ＰＢＦを認識する抗体）とを結合させる工程、
（ｂ）該腫瘍マーカーに結合した生体試料由来のタンパク質を、上記腫瘍マーカーを指標として測定する工程、
（ｃ）上記（ｂ）の測定結果に基づいて、腫瘍の罹患を判断する工程。
より具体的には、本発明の腫瘍マーカーとして抗体（ＰＢＦを認識する抗体）を用いて、ウエスタンブロット法などの公知方法でＰＢＦを検出、定量する方法を挙げることができる。
ウエスタンブロット法は、一次抗体として本発明腫瘍マーカーを用いた後、二次抗体として１２５Ｉなどの放射性同位元素、蛍光物質、ホースラディッシュペルオキシターゼ（ＨＲＰ）などの酵素等で標識した標識抗体（一次抗体に結合する抗体）を用い、得られる標識化合物の放射性同位元素、蛍光物質などに由来するシグナルを放射線測定器（ＢＡＳ−１８００ＩＩ：富士フィルム社製など）、蛍光検出器などで検出し、測定することによって実施できる。また、一次抗体として本発明腫瘍マーカーを用いた後、ＥＣＬ  Ｐｌｕｓ  Ｗｅｓｔｅｒｎ  Ｂｌｏｔｔｉｎｇ  Ｄｅｔｃｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ（アマシャム  ファルマシアバイオテク社製）を用いて、該プロトコールに従って検出し、マルチバイオイメージャーＳＴＯＲＭ８６０（アマシャム  ファルマシアバイオテク社製）で測定することもできる。
（▲５▼−３）測定対象の生体試料として抗体を用いる場合
測定対象物としてタンパク質中に存在する抗体を用いる場合は、本発明の腫瘍の検出方法（診断方法）は、生体試料中の抗ＰＢＦ抗体を検出し、その量を測定することによって実施される。具体的にはタンパク質またはペプチドに関する本発明の腫瘍マーカーを用い、前記（▲５▼−２）と同様の手法にて行うことができる。
（▲５▼−４）測定対象の生体試料として腫瘍抗原特異的ＣＴＬを用いる場合
測定対象物として末梢血リンパ球中に存在する腫瘍抗原特異的ＣＴＬを用いる場合は、本発明の腫瘍の検出方法（診断方法）は、生体試料中のＰＢＦ特異的ＣＴＬを検出し、その量を測定することによって実施される。具体的には、文献（Ｓｃｉｅｎｃｅ，２７４：ｐ９４，１９９６）に記載の方法に従って蛍光標識したＨＬＡ抗原と本発明のペプチドとの複合体の４量体（ＨＬＡテトラマー）を作製し、これを用いて腫瘍が疑われる患者の末梢血リンパ球中の抗原ペプチド特異的ＣＴＬをフローサイトメーターにより定量することにより行うことができる。
（▲５▼−５）腫瘍の診断
腫瘍の診断は、例えば、被験者の血液や腫瘍が疑われる被験組織におけるＰＢＦ遺伝子の遺伝子発現レベル、これらの遺伝子の発現産物であるＰＢＦタンパク質の量、抗ＰＢＦ抗体の量、またはＰＢＦ特異的ＣＴＬの量を測定することにより行うことができる。その際、場合によっては正常な対応組織における当該遺伝子発現レベルまたは当該タンパク質レベル等と比較し、両者の違いを判定することによって行うことができる。
ここで被験者の被験組織と正常な対応組織との遺伝子、タンパク質、抗体、またはＣＴＬの量（レベル）の比較は、被験者の生体試料と正常者の生体試料を対象とした測定を並行して行うことで実施できる。並行して行わない場合は、複数（少なくとも２つ、好ましくは３以上、より好ましくは５以上）の正常な組織を用いて均一な測定条件で測定して得られたＰＢＦ遺伝子の遺伝子発現レベル、ＰＢＦの量、抗ＰＢＦ抗体の量、またはＰＢＦ特異的ＣＴＬの量の平均値または統計的中間値を、正常者の値として、比較に用いることができる。
被験者が、腫瘍であるかどうかの判断は、例えば該被験者の組織におけるＰＢＦ遺伝子の遺伝子発現レベル、ＰＢＦの量、抗ＰＢＦ抗体の量、またはＰＢＦ特異的ＣＴＬの量が、正常者のそれらのレベルと比較して２倍以上、好ましくは３倍以上多いことを指標として行うことができる。
【実施例】  以下、実施例により本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例によりなんら限定されるものではない。
【実施例１】骨肉腫細胞株とそれに対する細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）の樹立
骨肉腫患者より生検で取り出された骨肉腫組織から、骨肉腫細胞株を樹立し、ＯＳ２０００と命名した。同じ骨肉腫患者より採取した血液から、Ｌｙｍｐｈｏｐｒｅｐ（Ｎｙｃｏｍｅｄ社）を用いた比重遠心法により末梢血単核球を回収し、放射線照射して不活化したＯＳ２０００を１０日おきに６回添加して、刺激を加えながら培養した。その後、抗ＣＤ８抗体を結合した磁気ビーズ（Ｍａｃｓ，Ｍｉｌｔｅｎｙｉ社）を用いてＣＤ８陽性の細胞を濃縮し、限界希釈法を用いてＣＴＬ株の樹立を行った（Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，３９，３９０−３９６，１９８７，Ｎ．Ｅｎｇ．Ｊ．Ｍｅｄ，３３３，１０３８−１０４４，１９９５）。ＯＳ２０００に対する細胞傷害活性を指標に選別を行い、３種類のＣＴＬを得た。その中からＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３と命名されたＣＴＬを用いてその後の実験を行った。ＯＳ２０００のＨＬＡクラスＩ分子のタイプは、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２、−Ｂ＊５５０２、−Ｂ４０、Ｃｗｌであることを確認した。
【実施例２】新規な腫瘍抗原タンパク質遺伝子のスクリーニング
１）ＨＬＡ−Ｂ５５遺伝子導入細胞を用いたスクリーニング
ＯＳ２０００からＦｉｒｓｔ  ｔｒａｃｋ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）を用いてｍＲＮＡを調製した。次にこのｍＲＮＡをもとにして、Ｓｕｐｅｒｓｃｒｉｐｔ  Ｃｈｏｉｃｅ  Ｓｙｓｔｅｍ  ｆｏｒ  ｃＤＮＡ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｇｉｂｃｏ−ＢＲＬ社）を用いてｃＤＮＡを作製し、これを発現ベクターｐＣＥＰ４（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）に組み込んでｃＤＮＡライブラリーを調製した。
また、ＯＳ２０００細胞からＰＣＲにより単離したＨＬＡ−Ｂ＊５５０２遺伝子（ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｍ７７７７７、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４８（４），１１５５−１１６２（１９９２））を２９３−ＥＢＮＡ細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）に導入した細胞２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５を準備した。
第１回目のスクリーニングとして以下の操作を行った。２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞を９６ウェルマイクロプレートにウェル当たり８×１０４個加え、約１００個のｃＤＮＡクローンのプール（１００〜２００μｇ）を、Ｌｉｐｏｆｅｃｔｉｏｎ法（Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ  ２０００，Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）により遺伝子導入した。遺伝子導入に用いたｃＤＮＡクローンのプールは別に保存しておいた。２４時間後にＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３細胞を８×１０４個加えてさらに２４時間後に培養上清を回収し、ＬＤＨ  Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃｉｔｙ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（タカラバイオ）を用い、細胞傷害により遊離したＬＤＨを定量して、ＣＴＬの反応性を調べた。１０００個のウェルから最も強いＣＴＬ反応性が得られたウェル１Ｂ９を選択した。次に１Ｂ９の遺伝子導入に用いたｃＤＮＡクローンプールから調製した４００個のｃＤＮＡから８０個のｃＤＮＡクローンプール（プール当たり８〜１２のｃＤＮＡクローンを含む）を用意し、上記と同様に２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞にｃＤＮＡクローンプールを遺伝子導入し、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３細胞の反応性を指標に第２回目のスクリーニングを行った。その結果、２０ウェルに反応性が認められた。さらに２０ウェルのｃＤＮＡクローンプールからウェル当たり１クローンのｃＤＮＡとして上記と同様に２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞にｃＤＮＡクローンを遺伝子導入し、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３細胞の反応性を指標に第３回目のスクリーニングを行った。その結果４ウェルに反応性が認められた。４ウェルのｃＤＮＡの塩基配列を解析したところ、同じｃＤＮＡを含んでいることが明らかとなった。このｃＤＮＡクローンを１Ｂ９．１Ｈ４と命名した。
２）ＨＬＡ−Ａ２４遺伝子導入細胞を用いたスクリーニング
先のＨＬＡ−Ｂ＊５５０２遺伝子の場合と同様にして、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２遺伝子（Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，５５：４２４８−４２５２（１９９５）、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．Ｍ６４７４０）を２９３−ＥＢＮＡ細胞（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）に導入した細胞２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４を準備した。先の２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞を用いたスクリーニングと同様にスクリーニングを行い、第１回目のスクリーニングで選択したウェル２Ｅ４から、第２回目のスクリーニングで２２個の反応性のウェルが得られ、第３回目のスクリーニングで４ウェルが選ばれた。４ウェルのｃＤＮＡの塩基配列を解析したところ、ＨＬＡ−Ｂ＊５５０２で選ばれたｃＤＮＡクローン１Ｂ９．１Ｈ４と同じｃＤＮＡを含んでいることが明らかとなった。
３）ｃＤＮＡクローン１Ｂ９．１Ｈ４の解析
１Ｂ９．１Ｈ４のｃＤＮＡを、２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５または２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４に導入して発現させた時のＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３の反応性を、前述のＬＤＨリリースアッセイ（遊離ＬＤＨの定量）により測定した結果を図１に示す。またＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３の反応性を５１Ｃｒリリースアッセイ（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５９：４７５３，１９９７）により測定した結果を図２（Ａ、Ｂ）に示す。ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３は、ｃＤＮＡクローン１Ｂ９．１Ｈ４を導入して発現させた細胞を認識し、特異的に傷害活性を示した。このことより、ｃＤＮＡクローン１Ｂ９．１Ｈ４は、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３が認識する腫瘍抗原タンパク質の遺伝子をコードしていることが明らかとなった。
ｃＤＮＡクローン１Ｂ９．１Ｈ４についてＢｉｇＤｙｅ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ  Ｃｙｃｌｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ  Ｒｅａｄｙ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社）を使用して塩基配列を決定した。決定された塩基配列を、配列表の配列番号：３に示す。該ｃＤＮＡの全長は１９０１塩基対であった。配列番号：３に記載した塩基配列を、公共のデータベースを使用して既知の配列と比較した結果、該ｃＤＮＡは、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＦ２６３９２８として登録されているパピローマウイルス結合因子（Ｐａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｕｓ  ｂｉｎｄｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ：ＰＢＦ、またＰａｐｉｌｌｏｍａｖｉｒｕｓ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ  ｆａｃｔｏｒ：ＰＲＦ−１とも称する）（Ｖｉｒｏｌｏｇｙ２９３，１０３−１１７（２００２））と大部分が同じ塩基配列を有していた。当該ＰＢＦの塩基配列を配列番号：１に、また対応するアミノ酸配列を配列番号：２に、それぞれ示す。
次に、ＰＢＦ自身が先の１Ｂ９．１Ｈ４と同様の腫瘍抗原タンパク質活性（ＣＴＬ反応性）を有するか否かを検討した。まず、ＯＳ２０００細胞から抽出したＲＮＡからｃＤＮＡを調製し、配列番号：４および配列番号：５に示すプライマーを用いてＰＣＲを行い、ＰＢＦのｃＤＮＡを増幅した。増幅断片を発現ベクターｐＣＥＰ４に組み込んで作製されたＰＢＦ遺伝子発現ベクターを、先の２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５または２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４に導入して発現させた時のＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３の反応性を、ＬＤＨリリースアッセイにより測定した。結果を図３及び図４に示す。図より明らかなように、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３は、ＰＢＦ遺伝子発現ベクターを導入して発現させた細胞に対しても傷害活性を示した。このことより、ＰＢＦはＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３が認識する腫瘍抗原タンパク質であることが明らかとなった。
【実施例３】ＨＬＡ−Ｂ＊５５０２に結合する抗原ペプチドの同定
腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦのアミノ酸配列（配列番号：２）を元にして種々のペプチドを合成し、ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３の反応性を指標にして、ＨＬＡ−Ｂ＊５５０２に結合する抗原ペプチド領域の同定を試みた。配列番号：２の４９９位〜５１０位からなるペプチド：Ｃｙｓ  Ｔｈｒ  Ａｌａ  Ｃｙｓ  Ａｒｇ  Ｔｒｐ  Ｌｙｓ  Ｌｙｓ  Ａｌａ  Ｃｙｓ  Ｇｌｎ  Ａｒｇ（配列番号：４６）  １ｍＭで１時間パルスした８×１０４個の２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞を、４×１０４個のＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３細胞と混合培養し、実施例２に記載の方法と同様にＬＤＨリリースアッセイにより反応性を調べた。結果を図５に示す。ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３細胞は、ペプチドをパルスしていない２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞には反応しなかったが、配列番号：４６のペプチドをパルスした２９３−ＥＢＮＡ−Ｂ５５細胞に対しては反応した。よって、配列番号：４６のペプチドはＨＬＡ−Ｂ＊５５０２に結合する抗原ペプチド領域を含んでいることが明らかとなった。
【実施例４】各種細胞や組織でのＰＢＦ遺伝子の発現解析
腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦをコードする遺伝子の各種細胞や組織での発現を、ＲＴ−ＰＣＲ法により解析した。各細胞からＩｓｏｇｅｎ  ｒａｇｅｎｔ（Ｎｉｐｐｏｎ  Ｇｅｎｅ）を用いて抽出したＲＮＡをもとに、オリゴｄＴプライマーを用いてｃＤＮＡを調製し、配列番号：４および配列番号：５に示すプライマーを用いてＰＣＲを行い、ＰＢＦのｃＤＮＡを増幅した。その後、この増幅遺伝子を電気泳動で分離し、解析した。陽性コントロールとしてＧＰＤＨ遺伝子の発現を、前記と同様にＲＴ−ＰＣＲ法を行い確認した。結果を図６に示す。ＰＢＦ遺伝子は正常末梢血リンパ球やスクリーニングに使用した２９３−ＥＢＮＡ細胞では発現が認められなかったが、ＯＳ２０００を含む多くの肉腫由来の細胞で発現が確認された。
【実施例５】腎癌組織でのＰＢＦ遺伝子の発現解析
腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦをコードする遺伝子の腎癌組織と正常腎組織での発現を、ＤＮＡチップを用いて解析した。ＤＮＡチップ解析はＷＯ  ０３／０４８３５９号公報等に記載の常法により行った。その結果、腎癌組織９１例の発現量の中央値が７８０であったのに対し、正常腎組織６７例の発現量の中央値は８９であり、腎癌組織では癌特異的に約８．７倍ＰＢＦ遺伝子の発現が増加していることが示された。
【実施例６】ＨＬＡ−Ａ＊２４０２に結合する抗原ペプチドの同定
腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦのアミノ酸配列（配列番号：２）中、ＨＬＡ−Ａ２４結合性のモチーフ構造を有するペプチドである配列番号：６、７、８、１０、２６、２７、２８、２９、３０および３２に記載のアミノ酸配列からなるペプチドを合成した。ＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３の反応性を指標にして、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２に結合する抗原ペプチドの同定を試みた。前記いずれかのペプチドをパルスした２９３−ＥＢＮＡ−Ａ２４細胞をＴｃＯＳ２０００ｃｌ−３０３細胞と混合培養し、実施例２に記載の方法と同様にＬＤＨリリースアッセイにより反応性を調べることにより、ＨＬＡ−Ａ＊２４０２に結合する抗原ペプチドを同定することができる。
【産業上の利用可能性】  本発明により、腫瘍抗原タンパク質ＰＢＦおよびその遺伝子の、ＣＴＬの誘導剤としての用途などが提供される。本発明のＣＴＬの誘導剤は、肉腫や腎癌等の患者を処置することができる。
【配列表】
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【図１】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【国際調査報告】
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