(57)【要約】画像解析装置（１００）は、予め定めた倍率で各ウェル内を一括して撮影する。画像管理装置（２００）は、画像解析装置（１００）とネットワーク（３００）を介して通信を行い、撮影完了した画像を取得し、サムネイル表示する。作業者は、画像管理装置（２００）を通して、各ウェルについて撮影したい検体の位置を画像上で指定する。画像管理装置（２００）は、該指定された条件に従って画像解析装置（１００）に撮影指示を通知する。画像解析装置（１００）は、画像管理装置（２００）により指定された箇所を指定された撮影条件で個別に撮影する。
2004036283.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
顕微鏡を用いて検体保持体の各検体保持部を予め定めた倍率で一括して撮影する一括撮影手段と、
上記一括撮影手段にて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示手段と、
上記サムネイル表示手段にて表示された上記画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定手段と、
上記個別撮影情報により指定された位置および倍率により上記検体保持部内を個別に撮影する個別撮影手段と、
を備えたことを特徴とする顕微鏡画像処理システム。
【請求項２】
上記個別撮影情報指定手段は、
上記個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、上記利用者が入力装置を介して上記個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から上記個別撮影情報を作成すること、
を特徴とする請求の範囲第１項に記載の顕微鏡画像処理システム。
【請求項３】
上記個別撮影情報指定手段は、
撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して上記個別撮影情報を作成すること、
を特徴とする請求の範囲第１項または第２項に記載の順微鏡画像処理システム。
【請求項４】
顕微鏡を用いて検体保持体の各検体保持部を予め定めた倍率で一括して撮影する一括撮影ステップと、
上記一括撮影ステップにて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示ステップと、
上記サムネイル表示ステップにて表示された上記画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定ステップと、
上記個別撮影情報により指定された位置および倍率により上記検体保持部内を個別に撮影する個別撮影ステップと、
を含むことを特徴とする顕微鏡画像処理方法。
【請求項５】
上記個別撮影情報指定ステップは、
上記個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、上記利用者が入力装置を介して上記個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から上記個別撮影情報を作成すること、
を特徴とする請求の範囲第４項に記載の顕微鏡画像処理方法。
【請求項６】
上記個別撮影情報指定ステップは、
撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して上記個別撮影情報を作成すること、
を特徴とする請求の範囲第４項または第５項に記載の顕微鏡画像処理方法。
【請求項７】
顕微鏡を用いて検体保持体の各検体保持部を予め定めた倍率で一括して撮影する一括撮影ステップと、
上記一括撮影ステップにて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示ステップと、
上記サムネイル表示ステップにて表示された上記画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定ステップと、
上記個別撮影情報により指定された位置および倍率により上記検体保持部内を個別に撮影する個別撮影ステップと、
を含む顕微鏡画像処理方法をコンピュータに実行させることを特徴とするプログラム。
【請求項８】
上記個別撮影情報指定ステップは、
上記個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、上記利用者が入力装置を介して上記個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から上記個別撮影情報を作成すること、
を特徴とする請求の範囲第７項に記載のプログラム。
【請求項９】
上記個別撮影情報指定ステップは、
撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して上記個別撮影情報を作成すること、
を特徴とする請求の範囲第７項または第８項に記載のプログラム。
【請求項１０】
上記請求の範囲第７項から第９項のいずれか一つに記載されたプログラムを記録したことを特徴とするコンピュータ読み取り可能な記録媒体。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】  本発明は、顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体に関し、特に、作業者の意図したように顕微鏡画像撮影を自動化することができる顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体に関する。
【背景技術】  マルチウェルプレートなどに整列された検体等を顕微鏡で撮影する場合、以下の６つの手順をほぼ手作業で繰り返し実行しなければならない。
（１）ウェル間ステージ移動
（２）ウェル内ステージ移動（検体フレーミング）
（３）対物レンズ倍率設定
（４）フォーカス調整
（５）撮影条件設定（露出時間、ホワイトバランス、光量調節など）
（６）画像の保存（ファイル名付け）
ここで、市販の顕微鏡を用いた画像解析システムには上記の手順のいくつかについて自動で実行可能なものが存在している。
しかしながら、上記の手順について作業者の意図したように顕微鏡画像撮影を完全に自動化することができる画像解析システムは存在していないという問題点を有していた。
特に、上記の手順のうち、（２）ウェル内ステージ移動について自動化できるものはなく、完全に手作業で行う、または、ウェル内について広範囲に渡り自動的に撮影を行いその画像の中から適切な範囲で撮影された画像を選択する、のいずれかであった。その結果、手作業で行う場合には撮影中作業者が拘束されることになり、また、ウェル内を自動で網羅的に撮影する場合には無駄な撮影を多数行うことになるため、時間的、費用的なコストがかかっていた。
また、従来の顕微鏡を用いた画像解析システムでは、プレート単位で撮影画像、撮影状況、サンプル内撮影箇所を確認しながら、撮影作業をすることができないという問題点を有していた。
このように、従来のシステム等は数々の問題点を有しており、その結果、顕微鏡を用いた画像解析システムの利用者および管理者のいずれにとっても、利便性が悪く、また、利用効率が悪いものであった。
なお、これまで説明した従来の技術および発明が解決しようとする課題は、マルチウェルプレートなどに整列された検体等を顕微鏡で撮影する場合に限られず、複数の検体を顕微鏡で撮影する全てのシステムにおいて、同様に考えることができる。
本発明は上記問題点に鑑みてなされたもので、作業者の意図したように顕微鏡画像撮影を自動化することができる、顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体を提供することを目的としている。
【発明の開示】
このような目的を達成するため、本発明にかかる顕微鏡画像処理システムは、顕微鏡を用いて検体保持体の各検体保持部を予め定めた倍率で一括して撮影する一括撮影手段と、上記一括撮影手段にて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示手段と、上記サムネイル表示手段にて表示された上記画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定手段と、上記個別撮影情報により指定された位置および倍率により上記検体保持部内を個別に撮影する個別撮影手段とを備えたことを特徴とする。
このシステムによれば、顕微鏡を用いて検体保持体（例えば、マルチウェルプレートなど）の各検体保持部（例えば、マルチウェルプレートの各ウェルなど）を予め定めた倍率（低倍率乃至高倍率のいずれでもよい）で一括して撮影し、撮影された画像ファイルをサムネイル表示し、表示された画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定し、個別撮影情報により指定された位置および倍率により検体保持部内を個別に撮影するので、プレート中の各ウェル内の所望の場所の撮影を自動化することができるようになる。
また、このシステムによれば、各ウェル内を一括して撮影するのと同時または並行的に利用者が注目する場所を優先的に撮影してもよい。
つぎの発明にかかる顕微鏡画像処理システムは、上記に記載の顕微鏡画像処理システムにおいて、上記個別撮影情報指定手段は、上記個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、上記利用者が入力装置を介して上記個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から上記個別撮影情報を作成することを特徴とする。
これは個別撮影情報指定を一層具体的に示すものである。このシステムによれば、個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、利用者が入力装置を介して個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から個別撮影情報を作成するので、利用者が所望の位置を指定して個別撮影を行うことができるようになる。
また、本システムによりモニタに表示される個別撮影情報指定画面において、公知のマップ・ビューイング機能（８方向や１６方向に移動するキー、倍率の設定変更ボタンなど）などの各種の入力支援機能を持ち、かかる機能を用いて利用者が個別撮影情報を指定してもよい。
つぎの発明にかかる顕微鏡画像処理システムは、上記に記載の顕微鏡画像処理システムにおいて、上記個別撮影情報指定手段は、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して上記個別撮影情報を作成することを特徴とする。
これは個別撮影情報指定を一層具体的に示すものである。このシステムによれば、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して個別撮影情報を作成するので、例えば既知の画像処理手法（例えば、重心計算など）により個別撮影の撮影位置を自動的に決定することができるようになる。
また、本発明は顕微鏡画像処理方法に関するものであり、本発明にかかる顕微鏡画像処理方法は、顕微鏡を用いて検体保持体の各検体保持部を予め定めた倍率で一括して撮影する一括撮影ステップと、上記一括撮影ステップにて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示ステップと、上記サムネイル表示ステップにて表示された上記画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定ステップと、上記個別撮影情報により指定された位置および倍率により上記検体保持部内を個別に撮影する個別撮影ステップとを含むことを特徴とする。
この方法によれば、顕微鏡を用いて検体保持体（例えば、マルチウェルプレートなど）の各検体保持部（例えば、マルチウェルプレートの各ウェルなど）を予め定めた倍率（低倍率乃至高倍率のいずれでもよい）で一括して撮影し、撮影された画像ファイルをサムネイル表示し、表示された画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定し、個別撮影情報により指定された位置および倍率により検体保持部内を個別に撮影するので、プレート中の各ウェル内の所望の場所の撮影を自動化することができるようになる。
また、この方法によれば、各ウェル内を一括して撮影するのと同時または並行的に利用者が注目する場所を優先的に撮影してもよい。
つぎの発明にかかる顕微鏡画像処理方法は、上記に記載の顕微鏡画像処理方法において、上記個別撮影情報指定ステップは、上記個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、上記利用者が入力装置を介して上記個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から上記個別撮影情報を作成することを特徴とする。
これは個別撮影情報指定を一層具体的に示すものである。この方法によれば、個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、利用者が入力装置を介して個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から個別撮影情報を作成するので、利用者が所望の位置を指定して個別撮影を行うことができるようになる。
また、本方法によりモニタに表示される個別撮影情報指定画面において、公知のマップ・ビューイング機能（８方向や１６方向に移動するキー、倍率の設定変更ボタンなど）などの各種の入力支援機能を持ち、かかる機能を用いて利用者が個別撮影情報を指定してもよい。
つぎの発明にかかる顕微鏡画像処理方法は、上記に記載の顕微鏡画像処理方法において、上記個別撮影情報指定ステップは、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して上記個別撮影情報を作成することを特徴とする。
これは個別撮影情報指定を一層具体的に示すものである。この方法によれば、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して個別撮影情報を作成するので、例えば既知の画像処理手法（例えば、重心計算など）により個別撮影の撮影位置を自動的に決定することができるようになる。
また、本発明はプログラムに関するものであり、本発明にかかるプログラムは、顕微鏡を用いて検体保持体の各検体保持部を予め定めた倍率で一括して撮影する一括撮影ステップと、上記一括撮影ステップにて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示ステップと、上記サムネイル表示ステップにて表示された上記画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定ステップと、上記個別撮影情報により指定された位置および倍率により上記検体保持部内を個別に撮影する個別撮影ステップとを含むことを特徴とする。
このプログラムによれば、顕微鏡を用いて検体保持体（例えば、マルチウェルプレートなど）の各検体保持部（例えば、マルチウェルプレートの各ウェルなど）を予め定めた倍率（低倍率乃至高倍率のいずれでもよい）で一括して撮影し、撮影された画像ファイルをサムネイル表示し、表示された画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定し、個別撮影情報により指定された位置および倍率により検体保持部内を個別に撮影するので、プレート中の各ウェル内の所望の場所の撮影を自動化することができるようになる。
また、このプログラムによれば、各ウェル内を一括して撮影するのと同時または並行的に利用者が注目する場所を優先的に撮影してもよい。
つぎの発明にかかるプログラムは、上記に記載のプログラムにおいて、上記個別撮影情報指定ステップは、上記個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、上記利用者が入力装置を介して上記個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から上記個別撮影情報を作成することを特徴とする。
これは個別撮影情報指定を一層具体的に示すものである。このプログラムによれば、個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、利用者が入力装置を介して個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から個別撮影情報を作成するので、利用者が所望の位置を指定して個別撮影を行うことができるようになる。
また、本プログラムによりモニタに表示される個別撮影情報指定画面において、公知のマップ・ビューイング機能（８方向や１６方向に移動するキー、倍率の設定変更ボタンなど）などの各種の入力支援機能を持ち、かかる機能を用いて利用者が個別撮影情報を指定してもよい。
つぎの発明にかかるプログラムは、上記に記載のプログラムにおいて、上記個別撮影情報指定ステップは、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して上記個別撮影情報を作成することを特徴とする。
これは個別撮影情報指定を一層具体的に示すものである。このプログラムによれば、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して個別撮影情報を作成するので、例えば既知の画像処理手法（例えば、重心計算など）により個別撮影の撮影位置を自動的に決定することができるようになる。
また、本発明は記録媒体に関するものであり、本発明にかかる記録媒体は、上記に記載されたプログラムを記録したことを特徴とする。
この記録媒体によれば、当該記録媒体に記録されたプログラムをコンピュータに読み取らせて実行することによって、上記に記載されたプログラムをコンピュータを利用して実現することができ、これら各方法と同様の効果を得ることができる。
【図面の簡単な説明】  第１図は、本発明のシステム構成を示す原理構成図であり、第２図は、本発明が適用される画像解析装置１００のシステム構成の一例を示すブロック図であり、第３図は、本発明が適用される画像管理装置２００のシステム構成の一例を示すブロック図であり、第４図は、本実施形態における本システムのメイン処理の一例を示すフローチャートであり、第５図は、本実施例における本システムの構成の一例を示す図であり、第６図は、本実施例における画像ビューワ（ユーザインターフェース）の撮影設定画面の一例を示す図であり、第７図は、本実施例におけるマクロプログラムの処理概要の一例を示す図であり、第８図は、本実施例における画像ビューワの処理概要の一例を示す図であり、第９図は、本実施例における初期設定マクロプログラムにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１０図は、本実施例におけるキャリブレーション用マクロプログラムにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１１図は、本実施例における撮影マクロプログラムにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１２図は、本実施例における、画像取得および閲覧の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１３図は、本実施例における、個別撮影の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１４図は、本実施例における、キャリブレーション実行の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１５図は、本実施例における、指定プレートＩＤ画像の取り込み実行の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１６図は、本実施例における、撮影済画像の消去実行の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートであり、第１７図は、本実施例における、キャリブレーション設定の際の連携動作の一例を示す処理シーケンスであり、第１８図は、本実施例における、低倍率一括撮影の際の連携動作の一例を示す処理シーケンスであり、第１９図は、本実施例における、個別撮影の際の連携動作の一例を示す処理シーケンスであり、第２０図は、本実施形態における本システムのキャリブレーション初期設定処理の一例を示すフローチャートであり、第２１図は、本実施形態における本システムの一括撮影処理の一例を示すフローチャートであり、第２２図は、モニタに表示されるサムネイル表示画面の一例を示す図であり、第２３図は、モニタに表示される個別撮影情報指定画面の別の一例を示す図であり、第２４図は、本実施例における画像ビューワ（ユーザインターフェース）のサムネイル一覧画面の一例を示す図であり、第２５図は、本実施例における画像ビューワ（ユーザインターフェース）のフルサイズ画像画面の一例を示す図であり、第２６図は、撮影された２枚のキャリブレーション画像ファイルの一例を示す図であり、第２７図は、撮影された２枚のキャリブレーション画像ファイルの一例を示す図であり、第２８図は、２枚のキャリブレーション画像ファイルを重ねて表示した場合の一例を示す図であり、第２９図は、モニタに表示される個別撮影情報指定画面の一例を示す���である。
【発明を実施するための最良の形態】  以下に、本発明にかかる顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体の実施の形態を図面に基づいて詳細に説明する。なお、この実施の形態によりこの発明が限定されるものではない。
特に、以下の実施の形態においては、本発明を、マルチウェルプレートなどに整列された検体等を顕微鏡で撮影する場合に適用した例について説明するが、この場合に限られず、複数の検体を顕微鏡で撮影する全ての場合において、同様に適用することができる。
［本発明の概要］
以下、本発明の概要について説明し、その後、本発明の構成および処理等について詳細に説明する。第１図は本発明のシステム構成を示す原理構成図であり、該構成のうち本発明に関係する部分のみを概念的に示している。
本発明は、概略的に、以下の基本的特徴を有する。すなわち、第１図に示すように、本発明の顕微鏡画像処理システムは、概略的に、順微鏡装置４００を制御して顕微鏡画像撮影を行う画像解析装置１００と、画像管理装置２００とを、ネットワーク３００を介して通信可能に接続して構成されている（但し、画像解析装置１００および画像管理装置２００を同一筐体として実現するように構成してもよい。）。ここで、画像解析装置１００は、低倍率で各ウェル内を一括して撮影する。画像管理装置２００は、画像解析装置１００とネットワーク３００を介して通信を行い、撮影完了した低倍率画像を取得し、サムネイル表示する。作業者は、画像管理装置２００を通して、各ウェルについて撮影したい検体の位置を画像上で指定する。ここで、画像管理装置２００は、該指定された条件に従って画像解析装置１００に撮影指示を通知する。画像解析装置１００は、画像管理装置２００により指定された箇所を指定された撮影条件で個別に撮影する。
ここで、画像解析装置１００は、低倍率に限らず、任意の倍率（例えば高倍率など）で各ウェル内を一括して撮影してもよい。
また、画像解析装置１００は、各ウェル内を一括して撮影するのと同時または並行的に作業者が注目する場所を優先的に撮影してもよい。
また、画像解析装置１００は、例えば、撮影された各ウェルを合成して、ウェル全体を高解像度で撮影してもよい。
また、画像管理装置２００は、高解像度で撮影した画像を、例えば、公知のマップ・ビューイング機能（例えば、周知の地図参照機能（例えば、８方向・１６方向に移動するキーや、倍率の設定変更ボタンなど））など撮影対象および探索目的に応じていかなる入力支援機能を用いて入力・表示してもよい。
例えば、脳の切片をウェルプレートの各ウェルに固定して観測、撮影する場合、切片の全体像を眺める必要があるが、画像解析装置１００により、ウェル全体を高解像度で部分撮影した後、自動的に合成することができるようになる。
［システム構成−画像解析装置１００］
まず、本システムの構成について説明する。第２図は、本発明が適用される画像解析装置１００のシステム構成の一例を示すブロック図であり、該構成のうち本発明に関係する部分のみを概念的に示している。
第２図において画像解析装置１００は、概略的に、画像解析装置１００の全体を統括的に制御するＣＰＵ等の制御部１０２、通信回線等に接続されるルータ等の通信装置（図示せず）に接続される通信制御インターフェース部１０４、入力装置１１２や出力装置１１４に接続される入出力制御インターフェース部１０８、および、各種のデータベースやテーブルなどを格納する記憶部１０６を備えて構成されており、これら各部は任意の通信路を介して通信可能に接続されている。さらに、この画像解析装置１００は、ルータ等の通信装置および専用線等の有線または無線の通信回線を介して、ネットワーク３００に通信可能に接続されている。
記憶部１０６に格納される各種のデータベースやテーブル（画像ファイル情報データベース１０６ａ〜キャリブレーション初期設定用ファイル１０６ｅ）は、固定ディスク装置等のストレージ手段であり、各種処理に用いる各種のプログラムやテーブルやファイルやデータベースやウェブページ用ファイル等を格納する。
これら記憶部１０６の各構成要素のうち、画像ファイル情報データベース１０６ａは、画像ファイル（画像ＩＤ、画像データなどを含む。）や、画像情報（画像ＩＤ、プレートＩＤ、ウェルＩＤ、座標情報、倍率情報、生物名などを含む。）を格納したデータベースである。
また、システム設定情報ファイル１０６ｂは、顕微鏡ハードウェア構成情報（インストールされている対物レンズの倍率などに関する情報）、撮影パラメータ情報（対物レンズごとに、露出時間、明るさ、光源電圧などのパラメータに関する情報）、プレートフォーマット情報（マルチウェルプレートの配列情報、ウェル間の距離などに関する情報）等を格納するシステム設定情報格納手段である。
また、ステータス情報ファイル１０６ｃは、プレートごとの作業状況（撮影中、撮影指示待機中、など）や撮影済みの画像ファイルに対する画像情報などを格納する。
また、個別撮影情報ファイル１０６ｄは、どのウェルのどの座標を何倍の対物レンズでどのように個別撮影し、どの名前で保存するかなどの個別撮影の各種の条件を設定するための個別撮影情報を格納する。
また、キャリブレーション初期設定用ファイル１０６ｅは、キャリブレーション画像ファイルおよびキャリブレーション情報ファイルを格納する。
また、第２図において、通信制御インターフェース部１０４は、画像解析装置１００とネットワーク３００（またはルータ等の通信装置）との間における通信制御を行う。すなわち、通信制御インターフェース部１０４は、他の端末と通信回線を介してデータを通信する機能を有する。
また、第２図において、入出力制御インターフェース部１０８は、入力装置１１２や出力装置１１４の制御を行う。ここで、出力装置１１４としては、モニタ（家庭用テレビを含む）の他、スピーカを用いることができる（なお、以下においては出力装置１１４をモニタとして記載する場合がある）。また、入力装置１１２としては、キーボード、マウス、および、マイク等を用いることができる。また、モニタも、マウスと協働してポインティングデバイス機能を実現する。
また、第２図において、制御部１０２は、ＯＳ（Ｏｐｅｒａｔｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ）等の制御プログラム、各種の処理手順等を規定したプログラム、および所要データを格納するための内部メモリを有し、これらのプログラム等により、種々の処理を実行するための情報処理を行う。制御部１０２は、機能概念的に、一括撮影部１０２ａ、個別撮影部１０２ｂ、顕微鏡ステージ初期設定部１０２ｃ、キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄ、および、ステータス管理部１０２ｅを備えて構成されている。
このうち、一括撮影部１０２ａは、顕微鏡を用いて検体保持体（例えば、マルチウェルプレートなど）の各検体保持部（例えば、マルチウェルプレートの各ウェルなど）を予め定めた倍率（低倍率乃至高倍率のいずれでもよい）で一括して撮影する一括撮影手段である。
また、個別撮影部１０２ｂは、個別撮影情報により指定された位置および倍率により検体保持部内（例えば、マルチウェルプレートの各ウェルなど）を個別に撮影する個別撮影手段である。
また、顕微鏡ステージ初期設定部１０２ｃは、ハイブリダイゼーション用のマルチウェルプレートのウェル座標の中心位置を求め、座標の原点とする作業を行う顕微鏡ステージ初期設定手段である。
また、キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄは、キャリブレーション初期設定用ファイルを作成するキャリブレーション初期設定用ファイル作成手段である。
また、ステータス管理部１０２ｅは、各プレートの作業の進捗状況を示すステータス情報を管理するステータス管理手段である。
なお、これら各部によって行なわれる処理の詳細については、後述する。
［システム構成−画像管理装置２００］
まず、本システムの構成について説明する。第３図は、本発明が適用される画像管理装置２００のシステム構成の一例を示すブロック図であり、該構成のうち本発明に関係する部分のみを概念的に示している。
第３図において画像管理装置２００は、概略的に、画像管理装置２００の全体を統括的に制御するＣＰＵ等の制御部２０２、通信回線等に接続されるルータ等の通信装置（図示せず）に接続される通信制御インターフェース部２０４、入力装置２１２や出力装置２１４に接続される入出力制御インターフェース部２０８、および、各種のデータベースやテーブルなどを格納する記憶部２０６を備えて構成されており、これら各部は任意の通信路を介して通信可能に接続されている。さらに、この画像管理装置２００は、ルータ等の通信装置および専用線等の有線または無線の通信回線を介して、ネットワーク３００に通信可能に接続されている。
記憶部２０６に格納される各種のデータベースやテーブル（個別撮影情報ファイル２０６ａ）は、固定ディスク装置等のストレージ手段であり、各種処理に用いる各種のプログラムやテーブルやファイルやデータベースやウェブページ用ファイル等を格納する。
これら記憶部２０６の各構成要素のうち、個別撮影情報ファイル２０６ａは、利用者が指定した個別撮影情報（例えば、撮影する検体の位置（座標情報）や撮影倍率などを含む）を格納したデータベースである。
また、第３図において、通信制御インターフェース部２０４は、画像管理装置２００とネットワーク３００（またはルータ等の通信装置）との間における通信制御を行う。すなわち、通信制御インターフェース部２０４は、他の端末と通信回線を介してデータを通信する機能を有する。
また、第３図において、入出力制御インターフェース部２０８は、入力装置２１２や出力装置２１４の制御を行う。ここで、出力装置２１４としては、モニタ（家庭用テレビを含む）の他、スピーカを用いることができる（なお、以下においては出力装置２１４をモニタとして記載する場合がある）。また、入力装置２１２としては、キーボード、マウス、および、マイク等を用いることができる。また、モニタも、マウスと協働してポインティングデバイス機能を実現する。
また、第３図において、制御部２０２は、ＯＳ（Ｏｐｅｒａｔｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ）等の制御プログラム、各種の処理手順等を規定したプログラム、および所要データを格納するための内部メモリを有し、これらのプログラム等により、種々の処理を実行するための情報処理を行う。制御部２０２は、機能概念的に、サムネイル表示部２０２ａ、個別撮影情報指定部２０２ｂ、および、キャリブレーション初期設定部２０２ｃを備えて構成されている。
このうち、サムネイル表示部２０２ａは、一括撮影手段にて撮影された画像ファイルをサムネイル表示するサムネイル表示手段である。
また、個別撮影情報指定部２０２ｂは、サムネイル表示手段にて表示された画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定する個別撮影情報指定手段である。ここで、個別撮影情報指定部２０２ｂは、個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、利用者が入力装置を介して個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から個別撮影情報を作成してもよい。また、個別撮影情報指定部２０２ｂは、撮影する座標情報および／または倍率情報を既知の画像処理手法（例えば、重心計算など）により自動的に決定して個別撮影情報を作成してもよい。
また、キャリブレーション初期設定部２０２ｃは、画像ビューワ上のピクセルからステージ移動量に変換するためのパラメータを決定するキャリブレーション初期設定手段である。
なお、これら各部によって行なわれる処理の詳細については、後述する。
［システム構成−ネットワーク３００］
次に、ネットワーク３００の構成について説明する。ネットワーク３００は、画像解析装置１００と画像管理装置２００とを相互に接続する機能を有し、例えば、インターネット等である。
［システムの処理］
次に、このように構成された本実施の形態における本システムの処理の一例について、以下に図を参照して詳細に説明する。
［キャリブレーション初期設定処理］
まず、キャリブレーション初期設定処理の詳細について第２０図、第２６図〜第２８図等を参照して説明する。第２０図は、本実施形態における本システムのキャリブレーション初期設定処理の一例を示すフローチャートである。
まず、画像解析装置１００は、顕微鏡ステージ初期設定部１０２ｃの処理により、マルチウェルプレートの基準となるウェル座標の中心位置を求め、座標の原点とする作業を行う（ステップＳＢ−１）。具体的には、利用者が顕微鏡装置４００にマルチウェルプレートをセットすると、顕微鏡ステージ初期設定部１０２ｃは、基準となるウェル（例えば、最初のウェル）の中心点を原点として設定する。
ついで、画像解析装置１００は、キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄの処理により、キャリブレーション初期設定用ファイルを作成する（ステップＳＢ−２）。具体的には、利用者がキャリブレーション初期設定用マルチウェルプレート（例えば、クロスヘアなどの調整用画像を最初のウェルの中心に描いたプレートなど）を顕微鏡装置４００にセットすると、キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄは、調整用画像についてｘｙ座標をずらした２枚の画像を撮影する。そして、キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄは、撮影された２枚の画像ファイル（キャリブレーション画像ファイル）と、その座標情報などのキャリブレーション情報ファイルを、キャリブレーション初期設定用ファイル１０６ｅとして作成する。
ここで、第２６図および第２７図は、撮影された２枚のキャリブレーション画像ファイルの一例を示す図である。第２６図および第２７図に示す２つの画像は、キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄが同一のキャリブレーション初期設定用マルチウェルプレートをｘ方向に３ｍｍ、ｙ方向に３ｍｍずらして撮影した画像である。キャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄはこの２枚の画像のファイル名と撮影に使用した対物レンズの倍率、さらには２枚の画像の実距離に関する情報をキャリブレーション初期設定用ファイル１０６ｅのキャリブレーション情報ファイルに格納する。
再び第２０図に戻り、画像管理装置２００は、キャリブレーション初期設定部２０２ｃの処理により、画像解析装置１００からキャリブレーション初期設定用ファイル１０６ｅを取得する（ステップＳＢ−３）。
ついで、画像管理装置２００は、キャリブレーション初期設定部２０２ｃの処理により、取得したキャリブレーション初期設定用ファイルに含まれる２枚のキャリブレーション画像ファイルを重ねて表示し、双方の調整用画像のずれの距離（表示ピクセル数）を計測する（ステップＳＢ−４）。
ここで、第２８図は、２枚のキャリブレーション画像ファイルを重ねて表示した場合の一例を示す図である。作業者は、２枚のキャリブレージョン画像ファイルに表示されたクロスヘアの中心点をマウスで指定すると（ＭＦ−１およびＭＦ−２）、キャリブレーション初期設定部２０２ｃは、２つの中心点の間のピクセル数を測定する。
また、キャリブレーション初期設定部２０２ｃは、２枚の画像ファイルのクロスヘアの表示位置が一致するように一方の画像ファイルを自動的または手動により移動し、その移動距離のピクセル数を測定してもよい。
再び第２０図に戻り、画像管理装置２００は、キャリブレーション初期設定部２０２ｃの処理により、双方の調整用画像のずれの距離（表示ピクセル数）と、キャリブレーション情報ファイル中のｘｙ座標の差（ステージ移動距離）とに基づいて、表示ピクセル数とステージ移動距離との比を計算し、その比の値を画像ビューワ上のピクセル数からステージ移動距離に変換するためのパラメータとして記憶部２０６の所定の記憶領域に記憶する（ステップＳＢ−５）。
これにて、キャリブレーション初期設定処理が終了する。
［メイン処理］
次に、メイン処理の詳細について第４図、第２１図〜第２３図等を参照して説明する。
第４図は、本実施形態における本システムのメイン処理の一例を示すフローチャートである。
まず、画像解析装置１００は、一括撮影部１０２ａの処理により、顕微鏡装置４００を用いて低倍率で各ウェル内を一括して撮影する（ステップＳＡ−１）。
ここで、第２１図は、本実施形態における本システムの一括撮影処理の一例を示すフローチャートである。
まず、画像解析装置１００は、ステータス管理部１０２ｅの処理により、モニタにプレートＩＤ入力画面を表示し、利用者にプレートＩＤを入力させる（ステップＳＣ−１）。そして、画像解析装置１００は、ステータス管理部１０２ｅの処理により、利用者が入力したプレートＩＤをステータス情報ファイル１０６ｃの所定の記憶領域に格納する。
ついで、画像解析装置１００は、ステータス管理部１０２ｅの処理によりステータス情報ファイル１０６ｃにアクセスして、当該プレートＩＤのステータス情報を「初回一括撮影」に更新する（ステップＳＣ−２）。
ついで、画像解析装置１００は、一括撮影部１０２ａの処理により、顕微鏡装置４００にセットされたマルチウェルプレートの最初のウェルから順番に各ウェルについて低倍率で撮影を行う（ステップＳＣ−３）。
ついで、画像解析装置１００は、一括撮影部１０２ａの処理により、一枚または所定の枚数の撮影が完了したときに、全てのウェルの撮影が完了したかを判定する（ステップＳＣ−４）。ここで、全てのウェルの撮影が完了していない場合には、ステータス管理部１０２ｅは、ステータス情報ファイル１０６ｃにアクセスして当該プレートＩＤのステータス情報を「一括撮影再開」に更新して（ステップＳＣ−５）、ステップＳＣ−３に戻り、続きのウェルの撮影を継続する。
一方、ステップＳＣ−４において全てのウェルの撮影が完了した場合には、画像解析装置１００は、ステータス管理部１０２ｅの処理によりステータス情報ファイル１０６ｃにアクセスして、当該プレートＩＤのステータス情報を「一括撮影完了」に更新する（ステップＳＣ−６）。
このように、何らかの事情によりマルチウェルプレートの一括撮影が完了していない場合には、当該プレートＩＤのステータス情報が「一括撮影再開」になっているので、次回一括撮影処理を実行する場合に、未撮影のウェルのみを撮影することができるようになる。
再び第４図に戻り、画像管理装置２００は、サムネイル表示部２０２ａの処理により、ネットワーク３００を介して画像解析装置１００から撮影された画像ファイルおよび画像情報を取得し（ステップＳＡ−２）、モニタにサムネイル表示する（ステップＳＡ−３）。
ここで、第２２図は、モニタに表示されるサムネイル表示画面の一例を示す図である。第２２図に示すように、サムネイル表示画面は、プレートＩＤ入力領域ＭＡ−１、プレートＩＤ選択ボタンＭＡ−２、サムネイル画像取得ボタンＭＡ−３、サムネイル画像表示領域ＭＡ−４、および、個別撮影ボタンＭＡ−７を含んで構成される。
第２２図において、利用者が入力装置２１２を介してプレートＩＤ入力領域ＭＡ−１に所望のプレートＩＤを入力し、サムネイル画像取得ボタンＭＡ−３をマウス等でクリックなどすることにより選択すると、サムネイル表示部２０２ａは、サムネイル画像表示領域ＭＡ−４に当該プレートＩＤに対応する一括撮影された各ウェルの低倍率画像（ＭＡ−５）と、ウェルＩＤなどの関連情報（ＭＡ−６）を表示する。
また、利用者が入力装置２１２を介してプレートＩＤ選択ボタンＭＡ−２をマウス等でクリックなどすることにより選択すると、サムネイル表示部２０２ａは、プレートＩＤの一覧を表示するウィンドウを開く。
再び第４図に戻り、画像管理装置２００は、個別撮影情報指定部２０２ｂの処理により、モニタにサムネイル表示された画像ファイルの中から利用者に所望の画像ファイルを選択させる。
そして、画像管理装置２００は、個別撮影情報指定部２０２ｂの処理により、利用者が選択した画像ファイルついて、利用者に撮影したい検体の位置や撮影倍率に関する個別撮影情報を指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示する（ステップＳＡ−４）。
ここで、第２９図は、モニタに表示される個別撮影情報指定画面の一例を示す図である。第２９図に示すように、個別撮影情報指定画面は、利用者が選択した画像の表示領域ＭＧ−１、プレートＩＤやウェルＩＤなどの画像ファイルに関連する情報の表示領域ＭＧ−２、選択された画像に設定された個別撮影枠一覧表示領域ＭＧ−３、撮影条件表示領域ＭＧ−４、撮影位置情報の表示領域ＭＧ−５、個別撮影削除ボタンＭＧ−６、個別撮影枠配置ボタンＭＧ−７、および、個別撮影枠自動配置ボタンＭＧ−８を含んで構成される。
画面左の撮影枠一覧表示領域ＭＧ−３は、選択された画像ファイルに設定された個別撮影をリスト表示する。また、個々の撮影の撮影枠情報（ＭＧ−９〜ＭＧ−１２）は画像表示領域に重畳して表示される。これにより、利用者は設定された個別撮影の撮影枠情報の一覧をウェルごとに確認することができる。
利用者が、撮影枠一覧表示領域ＭＧ−３から所望の撮影枠情報に対する項目を選択するか、画像表示領域（ＭＧ−１）上のいずれかの撮影枠情報（ＭＧ−９〜ＭＧ−１２）を直接選択すると、選択された個別撮影の撮影枠情報に関する撮影条件、位置情報がそれぞれ画面右の撮影条件表示領域ＭＧ−４、および、撮影位置情報表示領域ＭＧ−５に表示される。
第２９図の例では、４つの個別撮影に対する撮影枠情報（１０倍ｘ１（ＭＧ−１１）、２０倍ｘ２（ＭＧ−９およびＭＧ−１０）、４０倍ｘ１（ＭＧ−１１））が設定されており、ｆｒａｍｅｌ（ＭＧ−９）が利用者により選択された状態である。
また、利用者は各個別撮影に対する撮影枠情報を選択した状態で、撮影条件表示領域ＭＧ−４、撮影位置情報表示領域ＭＧ−５を編集・選択することによって任意に変更することができる。撮影位置を変更する場合は、画像表示領域（ＭＧ−１）上で撮影枠情報をドラッグ等することにより直接移動することによっても変更可能である。
また、利用者は撮影枠情報を選択した状態で個別撮影削除ボタンＭＧ−６を選択することにより、所望の撮影枠情報を削除することができる。
また、利用者は撮影枠情報を選択していない状態で、撮影条件表示領域ＭＧ−４を編集し、配置ボタンＭＧ−７、または、自動配置ボタンＭＧ−８を選択することによって、新規に撮影枠情報を作成することができる。ここで、利用者が配置ボタンＭＧ−７を選択した場合は、利用者が所望の撮影位置を画像上で指定することができる。一方、利用者が自動配置ボタンＭＧ−８を選択した場合は既存の画像処理手法を用いて所望の画像の重心位置に撮影枠情報が自動配置される。
また、各個別撮影に対する撮影条件は、撮影条件表示領域ＭＧ−４を介して撮影枠情報ごとに自由に設定することができる。撮影条件表示領域ＭＧ−４の「対物レンズ倍率」は、撮影に使用する対物レンズ倍率を選択する場合に用いる。画像解析装置１００は、個別撮影実行時にここで指定された所定の対物レンズに切り替えて撮影する。撮影条件表示領域ＭＧ−４の「フォーカス」は、Ｚ軸調整を自動で行うか手動で行うかを選択する場合に用いる。Ｚ軸調整を「自動」で行う場合は、画像解析装置１００は、Ｚ軸をずらしながら画像を取り込み、最適なＺ座標を見つけたのち撮影を実行する。ここで、自動フォーカス機能は多くの市販の顕微鏡装置およびその付属の画像解析装置に備わっている機能を用いてもよい。一方、「手動」のフォーカスが設定された場合は、画像解析装置１００は、個別撮影実行時に所定のＸ、Ｙ座標に移動した後、一時停止し利用者にフォーカスを設定するように促すメッセージを表示する。利用者は、顕微鏡装置４００を操作してＺ座標を調整した後、「個別撮影再開」を画像解析装置１００に通知する。撮影条件表示領域ＭＧ−４の「露出」は、撮影時の露出時間を設定し、露出を「自動」で決定するか、また、「指定」した露出時間を使用するようにするかを選択できる。撮影条件表示領域ＭＧ−４の「撮影位置」は、原点からの距離を座標値としており、第２９図の例ではマイクロメートル単位で表示している。
また、第２３図は、モニタに表示される個別撮影情報指定画面の別の一例を示す図である。第２３図に示すように、個別撮影情報指定画面は、利用者が選択した画像ファイルの表示領域ＭＢ−１、プレートＩＤやウェルＩＤなどの画像ファイルに関連する情報の表示領域ＭＢ−２、個別撮影時の倍率を指定するための倍率指定ボタンＭＢ−３、ウェル撮影ボタンＭＢ−４、自動撮影モードを選択するための自動ボタンＭＢ−５、利用者が倍率や撮影位置などを調整することができる半自動撮影モードを選択するための半自動ボタンＭＢ−６、処理をキャンセルするためのキャンセルボタンＭＢ−７等を含んで構成される。
第２３図において、利用者が入力装置２１２を介して所望の倍率指定ボタンＭＢ−３をマウス等でクリックなどすることにより選択すると、個別撮影情報指定部２０２ｂは、画像ファイルの表示領域ＭＢ−１上に、選択された倍率に対応する撮影枠情報を重畳して表示する。第２３図に示す例では、４０倍に対応する２つの撮影枠情報ＭＢ−８と、２０倍に対応する１つの撮影枠情報ＭＢ−９が表示されている。そして、利用者が入力装置２１２を介して表示された撮影枠情報を移動することにより、撮影位置（座標情報）を指定することができる。
そして、利用者が入力装置２１２を介して、自動ボタンＭＢ−５または半自動ボタンＭＢ−６を選択すると、個別撮影情報指定部２０２ｂは、利用者が指定した撮影位置（座標情報）、倍率情報、自動撮影または半自動撮影のいずれかを示す撮影モード情報を個別撮影情報として作成する。
また、利用者が入力装置２１２を介して、ウェル撮影ボタンＭＢ−４を選択すると、画面上に表示されているウェルに対する個別撮影情報に基づいて撮影を行うことができる。すなわち、全てのウェルについて指定された個別撮影情報に基づいて個別撮影を行う前に、表示されたウェルについて指定した個別撮影情報に基づいてリアルタイムで撮影を行うことができる。
そして、画像管理装置２００は、個別撮影情報指定部２０２ｂの処理により、個別撮影情報を画像解析装置１００に対して通知する（ステップＳＡ−５）。本ステップ以降は、第２３図においてウェル撮影ボタンＭＢ−４が選択された場合には、指定されたウェル毎に実行される。一方、ウェル撮影ボタンＭＢ−４が選択されなかった場合には、各ウェルについて個別撮影情報が設定された後に、第２２図に示す個別撮影ボタンＭＡ−７が選択されたことを契機として、個別撮影情報が設定された全てのウェルについて実行される。
そして、画像解析装置１００は、個別撮影部１０２ｂの処理により、画像管理装置２００から通知された個別撮影情報により指定された位置を指定された倍率で、指定された撮影モード（自動、半自動）等の撮影条件により顕微鏡装置４００を制御して個別に撮影する（ステップＳＡ−６）。
ここで、画像解析装置１００は、低倍率に限らず、任意の倍率（例えば高倍率など）で各ウェル内を一括して撮影してもよい。
また、画像解析装置１００は、各ウェル内を一括して撮影するのと同時または並行的に作業者が注目する場所を優先的に撮影してもよい。
また、画像解析装置１００は、例えば、撮影された各ウェルを合成して、ウェル全体を高解像度で撮影してもよい。
また、画像管理装置２００は、高解像度で撮影した画像を、例えば、公知のマップ・ビューイング機能（例えば、周知の地図参照機能（例えば、８方向・１６方向に移動するキーや、倍率の設定変更ボタンなど））など撮影対象および探索目的に応じていかなる入力支援機能を用いて入力・表示してもよい。
例えば、脳の切片をウェルプレートの各ウェルに固定して観測、撮影する場合、切片の全体像を眺める必要があるが、画像解析装置１００により、ウェル全体を高解像度で部分撮影した後、自動的に合成することができるようになる。
これにて、メイン処理が終了する。
［実施例；ハイブリダイゼーション実験におけるプレート撮影処理］
次に、ハイブリダイゼーション実験におけるマルチウェルプレート撮影を行う場合の実施例の詳細について第５図から第１９図等を参照して説明する。
なお、本実施例では、ハイブリダイゼーション実験のマルチウェルプレート撮影過程において、ライカマイクロシステムズ（会社名）の顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）と連携し、撮影作業を効率的に支援する場合を一例として実施例を説明する。
［実施例の構成］
第５図は、本実施例における本システムの構成の一例を示す図である。この図において、画像解析装置１００は、初期設定マクロプログラム（第２図における顕微鏡ステージ初期設定部１０２ｃに該当）、キャリブレーションマクロプログラム（第２図におけるキャリブレーション初期設定用ファイル作成部１０２ｄに該当）、撮影マクロプログラム（第２図における一括撮影部１０２ａ、個別撮影部１０２ｂ、および、ステータス管理部１０２ｅに該当）、ＦＴＰＤ（第２図における通信制御インターフェース部１０４に該当）、撮影画像ディレクトリ（第２図における画像ファイル情報データベース１０６ａに該当）、および、システムファイル（第２図におけるシステム設定情報ファイル１０６ｂ、ステータス情報ファイル１０６ｃ、個別撮影情報ファイル１０６ｄなどに該当）などを含んで構成される。
第５図において、画像解析装置１００のシステムファイルは、プレートＩＤファイル、ステータスファイル、ログファイル、個別撮影設定ファイル、指示通知ファイル、システム設定ファイルなどを含んで構成される。ここで、プレートＩＤファイルは、現在作業中のプレートＩＤ（カレントＩＤ）を格納する。また、ステータスファイルは、プレートごとの作業状況（撮影中、撮影指示待機中、など）や撮影済画像ファイル情報を格納する。また、ログファイルは、制御部の動作ログを保存するものであり、デバッグ用のファイルで、本システムが動作する上で本質的に必要なファイルではない。また、個別撮影設定ファイルは、どのウェルのどの座標を何倍の対物レンズでどのように撮影し、どの名前で保存するかといった情報を格納する。また、指示通知ファイルは、個別撮影開始の同期を取るためのファイルである。また、システム設定ファイルは、顕微鏡ハードウェア構成情報（インストールされている対物レンズの倍率など）、撮影パラメータ（対物レンズごとに、露出時間、明るさ、光源電圧など）、プレートフォーマット情報（マルチウェルプレートの配列情報、ウェル間の距離など）といった情報を格納する。
また、画像管理装置２００は、画像ビューワ（画像閲覧、撮影支援用ビューワ）としてユーザインターフェースの役割を果たす。さらに、画像ビューワは、画像閲覧、撮影支援のためのプログラム（第３図におけるサムネイル表示部２０２ａ、個別撮影情報指定部２０２ｂ、および、キャリブレーション初期設定部２０２ｃに該当）やファイル（第３図における個別撮影情報ファイル２０６ａに該当）などを含んで構成される。
また、ネットワーク３００は、画像解析装置１００と画像管理装置２００とを相互に接続する機能を有し、例えば、ローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）等である。
また、顕微鏡装置４００は、画像解析装置１００の制御下にある、検体を撮影するための顕微鏡装置であり、本実施例におけるライカマイクロシステムズ（会社名）の顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）の構成装置の一つである。
［実施例の概要］
１．初期設定
プレートの種類が変更された場合には以下の設定作業を行う。
（１）顕微鏡ステージの初期化
ハイブリダイゼーション用のマルチウェルプレートのウェル座標の中心位置を求め、座標の原点とする作業を行う。専用のマクロプログラムを起動して行う。
（２）画像ビューワのキャリブレーション
画像ビューワ上のピクセルからステージ移動量に変換するためのパラメータを決定する。専用マクロプログラムを起動し、情報ファイルと画像を作成した後、画像ビューワのキャリブレーション機能を使って作業する。
２．プレートの撮影
撮影は以下の２フェーズで行う。
（１）低倍率一括撮影
プレートの全ウェルを低倍率で高速に自動撮影する。個別撮影のための前準備段階である。
（２）個別撮影
指定ウェルについて倍率、位置を指定して撮影する。１つのウェルについて撮影箇所は複数指定することができ、それぞれについて撮影倍率、撮影位置が設定できる。低倍率レンズを指定することで、「低倍率一括撮影」分の画像を撮りなおすことができる。また、個別撮影では、撮影モードに「自動」と「半自動」があり、そのモードを撮影箇所毎に設定でき、「半自動」モードでは利用者がフォーカス、照明、位置の微調整などを手動で行って撮影することができる。個別撮影は、マクロプログラムを終了させるまで繰り返し行うことができる。
３．画像閲覧と個別撮影指示
撮影した画像の閲覧および撮影マクロプログラムへの個別撮影指示には、画像ビューワアプリケーションを使用する。画像ビューワはプレートＩＤを入力することで、そのプレートＩＤ作業の状態に応じた動作を行う。プレートＩＤが顕微鏡に現在セットされているプレートであった場合には、撮影された画像を逐次取得して表示し、個別撮影設定や撮影指示を出すことができる。顕微鏡に現在セットされているプレートでなかった場合には、ローカルに保存されている画像を表示し、閲覧することができる。
４．マクロとビューワ間の連携
マクロプログラムと画像ビューワは、ファイルを介して連携動作を行う。顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）上のファイル（通信用ファイル、設定ファイル、画像ファイル）は全てＦＴＰでアクセス可能なディレクトリに置かれ、画像ビューワはＦＴＰを介してこれらのファイルにアクセスする。ＦＴＰクライアントからのアクセスについて、ＦＴＰサーバで制限をかけることができる。設定によって、画像ビューワが動作する複数クライアントから同時に顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）へのアクセスが可能である。
５．撮影処理の中断と再開
マクロプログラムはステータスファイルに処理状況を記録しており、起動時にステータスファイルを読んで低倍率一括撮影作業中に中断された作業であれば、その続きから処理を行う（回復処理）。個別撮影の指示待ち、あるいは撮影途中で中断された作業であれば、個別撮影指示待ち状態で作業を再開する。
６．完全手動処理
撮影にマクロプログラムを用いずに、手動にて撮影することができる。撮影画像は保存ディレクトリおよびファイル名をマクロプログラムが保存するファイルと同じ形式で保存し、画像ビューワからプレートＩＤを入力すると画像ファイルの取り込みが行われ画像ビューワに表示される。
また、以下に本実施例における操作シナリオを説明する。
（１）利用者は顕微鏡にプレートをセットし、撮影マクロプログラムを起動する。プレートＩＤを入力する。
（２）マクロプログラムは低倍率一括撮影を自動的に行う。
（３）作業者は画像ビューワにプレートＩＤを入力する、あるいはカレントＩＤを指定する。
（４）画像ビューワはＦＴＰで顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）サーバにアクセスして、新規ファイルがあればローカルに転送する。
（５）画像ビューワはステータスファイルを読み込み、マクロプログラムの作業状況に応じて動作する。マクロプログラムが撮影動作中であれば、ステータスファイルを監視して撮影が完了した画像ファイルは逐次転送してサムネイルを作成し一覧表示する。
（６）利用者は、低倍率撮影画像をフルサイズウィンドウで見ながら、各ウェルについて個別撮影の設定を行う。各ウェルについて倍率、撮影領域の指定を複数設定できる。設定が終わったら個別撮影開始の指示をだす。
（７）マクロプログラムは、指示通知ファイルを監視して、個別撮影の指示を待つ。撮影指示を確認すると、撮影設定をファイルから取得してウェルを個別に再撮影する。
（８）画像ビューワは、ステータスファイルを監視し、撮影が完了した画像を逐次取得して表示する。
（９）利用者は、（６）、（７）、（８）の作業を繰り返す。
（１０）マクロプログラムの実行を停止して撮影作業を完了する。
これにて、実施例の概要の説明が終了する。
［実施例の表示画面］
第６図は、本実施例における画像ビューワ（ユーザインターフェース）の撮影設定画面の一例を示す図である。画像ビューワの撮影設定画面は、利用者が選択した画像ファイルの表示領城ＭＣ−１、画像ファイルの表示領域ＭＣ−１上に重畳して表示される設定済の個別撮影に対応する撮影枠情報（第６図に示す例では、４０倍に対応する撮影枠情報ＭＣ−２、２０倍に対応する撮影枠情報ＭＣ−３が表示されている。）を含んで構成される。
画像ビューワの撮影設定画面は、低倍率一括撮影の画像をフルサイズで表示する（個別撮影の設定を行えるのは、この画面のみ）。そして、利用者がマウスをドラッグすると撮影倍率に応じた枠が表示される。そして、利用者は、枠をドラッグして撮影したい箇所を指定する。そして、利用者は、必要なすべてのウェルの撮影箇所を設定し終わったら撮影ボタンを押して撮影する。ここで、利用者は、撮影が終了したら、条件を変えて複数回撮影することができる。また、１回の撮影で１つのウェルに複数の撮影設定を行うことができる。
第２４図は、本実施例における画像ビューワ（ユーザインターフェース）のサムネイル一覧画面の一例を示す図である。画像ビューワのサムネイル一覧画面は、プレートＩＤの入力領域ＭＤ−１、プレートＩＤ選択ボタンＭＤ−２、サムネイル表示領域ＭＤ−３、サムネイル表示領域ＭＤ−３に表示された画像ＭＤ−４、同一ウェル上で撮影された全画像のサムネイルを表示するためのウェル表示ボタンＭＤ−５、選択されたウェル内で撮影された全画像を消去するための消去ボタンＭＤ−６、個別撮影を開始するためのキャプチャーボタンＭＤ−７、同一ウェルの全撮影画像を表示するための画像表示領域ＭＤ−８、画像表示領域ＭＤ−８に表示された画像ＭＤ−９、および、画像表示領域ＭＤ−８に表示された画像のうち選択された画像を消去するための消去ボタンＭＤ−１０を含んで構成される。
利用者は、入力装置２１２を介してプレートＩＤ入力領域ＭＤ−１に所望のプレートＩＤを入力する、または、画像ビューワのサムネイル一覧画面上のプレートＩＤ選択ボタン（「Ｓｅｌｅｃｔ  ＰｌａｔｅＩＤ」ボタン）ＭＤ−２をマウス等でクリックなどすることにより選択し、サムネイル表示部２０２ａの処理により開かれる、プレートＩＤの一覧を表示するウインドウからプレートＩＤを入力（選択）する。そして、利用者は、倍率指定タブ（第２４図の例では、２．５倍、５倍、１０倍、２０倍、そして、４０倍の倍率を指定可能である）を選択すると、各ウェルで撮影された同一倍率の撮影画像（画像ＭＤ−４）をサムネイル表示領域ＭＤ−３にサムネイル表示する（同一ウェル、同一倍率で複数の画像が合った場合には、最新の画像のサムネイルを表示する）。
そして、利用者は、サムネイルを選択し、ウェル表示ボタン（「ｓｈｏｗｗｅｌｌｓ」ボタン）ＭＤ−５を押すと、シート（画像表示領域ＭＤ−８）が開き、同一ウェル上で撮影された全画像のサムネイル（画像ＭＤ−９）をシート上に表示する。ここで、利用者がシート上のサムネイルを選択すると、フルサイズ画面に画像が表示される（下記で説明する第２５図の画像表示領域ＭＥ−１）。また、利用者がシート上のサムネイルを選択し、消去ボタン（「ｄｅｌｅｔｅ」ボタン）ＭＤ−１０を押すと、選択した画像１枚のみを消去する。
そして、利用者がサムネイル（画像ＭＤ−４）を選択し、消去ボタン（「ｄｅｌｅｔｅ」ボタン）ＭＤ−６を押すと、選択したウェル、倍率の画像をすべて消去する。そして、利用者は、撮影設定を行い、キャプチャーボタンＭＤ−７を押すと、個別撮影を開始する。
第２５図は、本実施例における画像ビューワ（ユーザインターフェース）のフルサイズ画像画面の一例を示す図である。画像ビューワのフルサイズ画像画面は、画像表示領域ＭＥ−１を含んで構成される。
利用者は、入力装置２１２のカーソルキーにより、他ウェルの同一倍率の画像を画像ビューワのフルサイズ画像画面上で切り替えて表示することができる。また、利用者は、入力装置２１２のシフトキーとカーソルキーを両方押すことにより、同一ウェルの異なる倍率で撮影された複数の画像を画像ビューワのフルサイズ画像画面上で切り替えて表示することができる。
これにて、実施例の表示画面の説明が終了する。
［実施例の処理概要］
第７図は、本実施例におけるマクロプログラムの処理概要の一例を示す図である。まず、初期設定マクロプログラムは、ステージの原点を設定する（ステップＳＤ−１）。また、キャリブレーションマクロプログラムは、ビューワキャリブレーション用の画像を撮影する（ステップＳＤ−２）。
そして、撮影マクロプログラムは、プレート撮影などを行う（ステップＳＤ−３）。ここで、第７図に示す各処理の詳細は後述する。
第８図は、本実施例における画像ビューワの処理概要の一例を示す図である。画像ビューワは、サムネイル画像の表示、個別撮影の設定などを行う。ここで、第８図に示す各処理の詳細は後述する。
［実施例の処理の詳細］
（初期設定マクロプログラムの処理）
第９図は、本実施例における初期設定マクロプログラムにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、利用者は、顕微鏡装置４００にマルチウェルプレートをセットする（ステップＳＦ−１）。そして、利用者は、画像解析装置１００の所定の操作を行うことにより初期設定マクロプログラムを起動する（ステップＳＦ−２）。
そして、初期設定マクロプログラムは、顕微鏡確認ダイアログを出力装置１１４に表示する（ステップＳＦ−３）。そして、利用者が顕微鏡装置４００の支柱を倒した後（ステップＳＦ−４）、初期設定マクロプログラムは、顕微鏡ステージの初期化、具体的にはウェル座標の中心への移動を行う（ステップＳＦ−５）。
そして、利用者は、画像解析装置１００の出力装置１１４に出力された表示画像を見ながらウェル座標の中心の微調整を行う（ステップＳＦ−６）。そして、初期設定マクロプログラムは、利用者からの微調整完了の指示を受けた後、マルチウェルプレート座標の原点をウェル座標の中心に設定する（ステップＳＦ−７）。
（キャリブレーション用マクロプログラムの処理）
第１０図は、本実施例におけるキャリブレーション用マクロプログラムにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、利用者は、顕微鏡装置４００にキャリブレーション専用プレート（例えば、ウェル座標の中心にクロスヘアを描いたもの等）をセットする（ステップＳＧ−１）。そして、利用者は、画像解析装置１００の所定の操作を行うことによりキャリブレーション用マクロプログラムを起動する（ステップＳＧ−２）。
そして、キャリブレーション用マクロプログラムは、ウェル座標の中心へのステージの移動、次いで、ｘｙ座標をずらした二枚の画像の撮影を顕微鏡装置４００に指示する（ステップＳＧ−３）。そして、キャリブレーション用マクロプログラムは、ビューワキャリブレーション用情報ファイル、および、画像ファイルを作成する（ステップＳＧ−４）。
（撮影マクロプログラムの処理）
第１１図は、本実施例における撮影マクロプログラムにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、利用者は、プレートを顕微鏡装置４００にセットする（ステップＳＨ−１）。そして、利用者は、画像解析装置１００の所定の操作を行うことにより撮影マクロプログラムを起動する（ステップＳＨ−２）。
そして、撮影マクロプログラムは、プレートＩＤ入力ダイアログを出力装置１１４に表示する（ステップＳＨ−３）。そして、利用者は、出力装置１１４に表示されたプレートＩＤ入力ダイアログに対し、プレートＩＤを入力装置１１２を介して入力する（ステップＳＨ−４）。
そして、撮影マクロプログラムは、利用者からのプレートＩＤ入力完了の指示を受けた後、ステータスファイルを参照する（ステップＳＨ−５）。そして、撮影マクロプログラムは、参照したステータスファイルに基づいて、これから行う撮影が初回または低倍率撮影再開時であるか否かを判定する（ステップＳＨ−６）。
そして、撮影マクロプログラムは、これから行う撮影が初回または低倍率撮影再開時であると判定された場合には、低倍率一括撮影を行い、１ウェル撮影毎にステータスをステータスファイルへ記録し、撮影画像を撮影画像ディレクトリに保存する（ステップＳＨ−７）。そして、撮影マクロプログラムは、低倍率撮影完了を受けて、指示通知ファイルを監視し、指示を受信する（ステップＳＨ−８）。
そして、撮影マクロプログラムは、受信した指示が個別撮影指示であれば（ステップＳＨ−９）、個別撮影を行い、撮影毎にステータスをステータスファイルに記録する（ステップＳＨ−１０）。そして、撮影マクロプログラムは、ステップＳＨ−１０による個別撮影完了後、指示通知ファイルを監視し指示を受信し続け（ステップＳＨ−８）、ステップＳＨ−９、そして必要ならば、ステップＳＨ−１０の処理を行う。
（画像ビューワの処理）
第１２図は、本実施例における、画像取得および閲覧の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、利用者は、画像管理装置２００の所定の操作を行うことにより画像ビューワを起動する（ステップＳＪ−１）。そして、画像ビューワは、ウィンドウを出力装置２１４に表示する（ステップＳＪ−２）。
そして、作業者は、出力装置２１４に表示されたウィンドウに対してプレートＩＤを入力装置２１２を介して入力する（ステップＳＪ−３）。そして、画像ビューワは、プレートＩＤファイルからカレントＩＤを取得する（ステップＳＪ−４）。
そして、画像ビューワは、入力されたプレートＩＤと取得したカレントＩＤが同じか否かを判定する（ステップＳＪ−５）。そして、画像ビューワは、入力されたプレートＩＤと取得したカレントＩＤが同じでない場合（ステップＳＪ−５）、取得済みローカル画像を出力装置２１４に表示する（ステップＳＪ−６）。この場合は、個別撮影設定は行わない。
そして、画像ビューワは、入力されたプレートＩＤと取得したカレントＩＤが同じである場合（ステップＳＪ−５）、システム設定ファイルからシステム設定を取得する（ステップＳＪ−７）。そして、画像ビューワは、同一のプレートＩＤの画像を取り込む（ステップＳＪ−８）。
そして、画像ビューワは、撮影マクロプログラムのステータスをステータスファイルから取得する（ステップＳＪ−９）。そして、画像ビューワは、取得した撮影マクロプログラムのステータスに基づいて、撮影中であるか、または、指示待ちであるかを判定する（ステップＳＪ−１０）。
そして、画像ビューワは、撮影中である場合（ステップＳＪ−１０）、ステータスを監視し、撮影済の画像を逐次取得し表示する（ステップＳＪ−１１）。そして、画像ビューワは、指示待ちである場合（ステップＳＪ−１０）、取得済み画像を表示する（ステップＳＪ−１２）。この場合は、個別撮影設定が可能である。
第１３図は、本実施例における、個別撮影の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、画像ビューワは、画像を出力装置２１４に表示する（ステップＳＫ−１）。このとき、個別撮影設定は可能である。そして、利用者は、個別撮影対象ウェルを選択する（ステップＳＫ−２）。
そして、画像ビューワは、低倍率撮影画像をフルサイズ画面で出力装置２１４に表示する（ステップＳＫ−３）。そして、利用者は、撮影箇所、および、倍率を指定してウェル毎に撮影設定を行う（ステップＳＫ−４）。
ここで、撮影箇所、および、倍率の設定を以下の手順により行ってもよい。利用者が表示画面上の所望の位置（例えば、第６図における画像ファイルの表示領域ＭＣ−１内）においてマウスによりドラッグ操作を行うと、その位置を中心とした撮影枠情報（第６図におけるＭＣ−２など）が表示画面上に重畳して表示される。ここで、ドラッグ距離により異なる倍率の撮影枠情報を表示してもよい（例えば、短距離をドラッグすると８０倍の撮影枠情報、中距離をドラッグすると４０倍の撮影枠情報、長距離をドラッグすると２０倍の撮影枠情報など）。利用者は、撮影枠情報を所望の位置に調整することにより撮影箇所を設定する。
そして、画像ビューワは、撮影設定操作を待つ（ステップＳＫ−５）。
そして、利用者は、個別撮影開始を指示すると（ステップＳＫ−６）、画像ビューワは、撮影マクロプログラムの状態をステータスファイルに対して確認する（ステップＳＫ−７）。そして、画像ビューワは、撮影マクロプログラムのステータスが「撮影中」または「撮影指示待ち」であるかを判定し（ステップＳＫ−８）、「撮影中」である場合、再びステップＳＫ−５の処理に戻る。
そして、画像ビューワは、撮影マクロプログラムの状態が「撮影指示待ち」である場合、撮影開始を顕微鏡装置４００に指示する（ステップＳＫ−９）。そして、画像ビューワは、ステータスを監視して撮影済み画像を逐次取得し表示する（ステップＳＫ−１０）。
第１４図は、本実施例における、キャリブレーション実行の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、利用者は、所定の処理により画像ビューワのキャリブレーション機能をスタートする（ステップＳＬ−１）。そして、画像ビューワは、キャリブレーション情報ファイルを読み込む（ステップＳＬ−２）。
そして、画像ビューワは、キャリブレーション画像ファイルを取得する（ステップＳＬ−３）。そして、画像ビューワは、二枚の画像を重ね合わせて出力装置２１４に表示する（ステップＳＬ−４）。そして、利用者は、表示された二枚の画像の基準点（例えばクロスヘアの中心点など）をクリックする（ステップＳＬ−５）。そして、画像ビューワは、表示ピルセル数とステージの移動距離との比を計算してファイルに保持する（ステップＳＬ−６）。
第１５図は、本実施例における、指定プレートＩＤ画像の取り込み実行の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、画像ビューワは、画像を出力装置２１４に表示する（ステップＳＭ−１）。このとき、個別撮影設定は可能とする。そして、利用者は、「画像同期」ボタンを入力装置２１２を介して指定する（ステップＳＭ−２）。
そして、画像ビューワは、顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）の撮影画像ディレクトリを検索する（ステップＳＭ−３）。そして、画像ビューワは、撮影画像ディレクトリに新規画像があるか否かを判定し（ステップＳＭ−４）、新規画像がある場合、新規画像を取得し（ステップＳＭ−５）、サムネイルを作成して該当倍率指定タブに表示する（ステップＳＭ−６）。
第１６図は、本実施例における、撮影済画像の消去実行の際の画像ビューワにより実行される処理の一例を示すフローチャートである。まず、画像ビューワは、画像を出力装置２１４に表示する（ステップＳＮ−１）。そして、利用者は、サムネイル画面で消去対象画像を選択する（ステップＳＮ−２）。そして、利用者は、「消去」ボタンを入力装置２１２を介して指定する（ステップＳＮ−３）。
そして、画像ビューワは、削除確認ダイアログを出力装置２１４に開く（ステップＳＮ−４）。そして、利用者は、出力装置２１４に開かれた削除確認ダイアログの「ＯＫ」ボタンを入力装置２１２を介して指定する（ステップＳＮ−５）。
そして、画像ビューワは、ローカルの指定画像を消去する（ステップＳＮ−６）。そして、画像ビューワは、顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）の指定画像を撮影画像ディレクトリから消去する（ステップＳＮ−７）。（連携動作の処理シーケンス）
第１７図は、本実施例における、キャリブレーション設定の際の連携動作の一例を示す処理シーケンスである。まず、利用者は、画像管理装置２００の所定の操作を行うことにより画像ビューワを起動すると、画像ビューワは、システム設定ファイルから設定を取得する（ステップＳＲ−１）。そして、利用者は、専用プレートを顕微鏡装置４００にセットする（ステップＳＲ−２）。
そして、利用者は、画像解析装置１００の所定の操作を行うことによりマクロプログラムを起動する（ステップＳＲ−３）。そして、マクロプログラムは、システム設定ファイルから設定を取得する（ステップＳＲ−４）。そして、マクロプログラムは、画像を撮影する（ステップＳＲ−５）。
そして、マクロプログラムは、撮影画像ディレクトリに撮影画像を保存する（ステップＳＲ−６）。そして、マクロプログラムは、キャリブレーション設定ファイルにキャリブレーション設定を保存する（ステップＳＲ−７）。そして、利用者は、画像ビューワにキャリブレーション開始を指示する（ステップＳＲ−８）。
そして、画像ビューワは、キャリブレーション設定ファイルから設定を取得する（ステップＳＲ−９）。そして、画像ビューワは、撮影画像ディレクトリから画像を取得する（ステップＳＲ−１０）。そして、画像ビューワは、二重写し画像を表示する（ステップＳＲ−１１）。
そして、利用者は、２画像の基準点を入力装置２１２を介してクリックする（ステップＳＲ−１２）。そして、画像ビューワは、ステージ移動量とピクセルの比を求めて保存する（ステップＳＲ−１３）。
第１８図は、本実施例における、低倍率一括撮影の際の連携動作の一例を示す処理シーケンスである。まず、利用者が画像管理装置２００の所定の操作を行うことにより画像ビューワを起動すると、画像ビューワはシステム設定ファイルの設定を参照する（ステップＳＰ−１）。
そして、利用者は、顕微鏡装置４００にプレートをセットする（ステップＳＰ−２）。利用者は、画像解析装置１００の所定の操作を行うことによりマクロプログラムを起動する（ステップＳＰ−３）。そして、マクロプログラムは、システム設定ファイルの設定を参照する（ステップＳＰ−４）。そして、利用者は、マクロプログラムに入力装置１１２を介してプレートＩＤを入力する（ステップＳＰ−５）。
そして、マクロプログラムは、プレートＩＤファイルにプレートＩＤを保存する（ステップＳＰ−６）。そして、マクロプログラムは、ステータスファイルからステータスを取得する（ステップＳＰ−７）。そして、利用者は、画像ビューワに入力装置２１２を介してプレートＩＤを入力する（ステップＳＰ−８）。
そして、画像ビューワは、プレートＩＤファイルからプレートＩＤを取得する（ステップＳＰ−９）。そして、画像ビューワは、ステータスファイルからステータス情報を取得する（ステップＳＰ−１０）。そして、マクロプログラムは、低倍率画像を撮影する（ステップＳＰ−１１）。
そして、マクロプログラムは、撮影画像を逐次撮影画像ディレクトリに保存する（ステップＳＰ−１２）。そして、マクロプログラムは、ステータスファイルにステータスを記録する（ステップＳＰ−１３）。そして、画像ビューワは、低倍率画像を撮影画像ディレクトリから取得して（ステップＳＰ−１４）、サムネイルを作成し、表示する（ステップＳＰ−１５）。
第１９図は、本実施形態における、個別撮影の際の連携動作の一例を示す処理シーケンスである。まず、マクロプログラムは、画像ビューワからの指示を確認するために指示通知ファイルを監視する（ステップＳＱ−１）。そして、利用者は、画像ビューワの入力装置２１２を介して個別撮影設定を入力する（ステップＳＱ−２）。そして、画像ビューワは、入力された設定を記憶する（ステップＳＱ−３）。
そして、利用者は、入力装置２１２を介して撮影開始指示を出す（ステップＳＱ−４）。そして、画像ビューワは、撮影設定ファイルに撮影設定情報を書き込む（ＦＴＰ転送）（ステップＳＱ−５）。そして、画像ビューワは、指示通知ファイルに個別撮影指示を書き込む（ＦＴＰ転送）（ステップＳＱ−６）。
そして、マクロプログラムは、画像ビューワからの撮影指示が書き込まれた指示通知ファイルから撮影指示を受信する（ステップＳＱ−７）。そして、画像ビューワは、撮影済み画像の有無を確認するために撮影画像ディレクトリを監視する（ステップＳＱ−８）。
そして、マクロプログラムは、撮影設定ファイルから撮影設定情報を取得する（ステップＳＱ−９）。そして、マクロプログラムは、個別ウェル画像を撮影する（ステップＳＱ−１０）。そして、マクロプログラムは、撮影画像を撮影画像ディレクトリに逐次保存する（ステップＳＱ−１１）。
そして、画像ビューワは、撮影画像ディレクトリから撮影済画像を逐次取得する（ステップＳＱ−１２）。そして、画像ビューワは、サムネイルを作成して出力装置２１４に表示する（ステップＳＱ−１３）。そして、利用者は、画像ビューワの出力装置２１４に表示された撮影画像を閲覧する（ステップＳＱ−１４）。なお、ステップＳＱ−１からＳＱ−１４は、個別撮影サイクルとして繰り返される。
そして、利用者は、マクロプログラムに撮影作業の終了を指示する（ステップＳＱ−１５）。
これにて、ハイブリダイゼーション実験におけるプレート撮影処理の実施例の説明を終了する。
［他の実施の形態］
さて、これまで本発明の実施の形態について説明したが、本発明は、上述した実施の形態以外にも、上記特許請求の範囲に記載した技術的思想の範囲内において種々の異なる実施の形態にて実施されてよいものである。
例えば、画像解析装置１００がスタンドアローンの形態で処理を行う場合を一例に説明したが、画像解析装置１００とは別筐体で構成されるクライアント端末からの要求に応じて処理を行い、その処理結果を当該クライアント端末に返却するように構成してもよい。
また、画像解析装置１００および画像管理装置２００を同一筐体として実現するように構成してもよい。
また、上述した実施例では、ライカマイクロシステムズ（会社名）の顕微鏡システム（ＤＭ−ＩＲＥ２）（製品名）を用いた場合を一例に説明したが、本発明はこれに限定されるものではなく、本顕微鏡に相当する代替機種としては、カールツァイス（会社名）のＡｘｉｏｖｅｒｔ  ２００Ｍ（製品名）や、ニコン（会社名）のＴＥ２０００Ｅ（製品名）、オリンパス（会社名）のＩＸ８１（製品名）などを用いてもよい。また、上述した実施例において画像解析装置１００は、ライカマイクロシステムズ（会社名）の顕微鏡システムに付属のＰＣと画像計測ソフトウェアＱｗｉｎ（製品名）、さらにその上に実装されたマクロプログラム群を利用して実現されたものであるが、本発明はこれらに限定されるものではなく、例えば、Ｑｗｉｎ（製品名）に相当する代替ソフトとしては、Ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  Ｉｍａｇｉｎｇ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ（会社名）のＭｅｔａＭｏｒｐｈ（製品名）や、三谷商事（会社名）のＬｕｍｉｎａ  Ｖｉｓｉｏｎ（製品名）などを用いてもよい。また、本発明の画像解析装置１００は、このような既製の画像計測ソフトウェアなどの上に実装するという形態が必須の条件ではない。
また、上述した低倍率画像の取得（ステップＳＡ−２）、個別撮影情報の通知（ステップＳＡ−５）は、既存の電子メール送信技術を用いて実現してもよく、また、画像解析装置１００または画像管理装置２００が提供するＷｅｂサイトの提供する機能により、所定の入力フォーマットを提示して利用者等に情報を入力させ、その入力情報を送信することにより実現してもよく、さらに、ＦＴＰ等の既存のファイル転送技術等により実現してもよい。
また、実施形態において説明した各処理のうち、自動的に行なわれるものとして説明した処理の全部または一部を手動的に行うこともでき、あるいは、手動的に行なわれるものとして説明した処理の全部または一部を公知の方法で自動的に行うこともできる。
この他、上記文書中や図面中で示した処理手順、制御手順、具体的名称、各種の登録データや検索条件等のパラメータを含む情報、画面例、データベース構成については、特記する場合を除いて任意に変更することができる。
また、画像解析装置１００に関して、図示の各構成要素は機能概念的なものであり、必ずしも物理的に図示の如く構成されていることを要しない。
例えば、画像解析装置１００の各部または各装置が備える処理機能、特に制御部１０２にて行なわれる各処理機能については、その全部または任意の一部を、ＣＰＵ（Ｃｅｎｔｒａｌ  Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ  Ｕｎｉｔ）および当該ＣＰＵにて解釈実行されるプログラムにて実現することができ、あるいは、ワイヤードロジックによるハードウェアとして実現することも可能である。なお、プログラムは、後述する記録媒体に記録されており、必要に応じて画像解析装置１００に機械的に読み取られる。
すなわち、ＲＯＭまたはＨＤなどの記憶部１０６などには、ＯＳ（Ｏｐｅｒａｔｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ）と協働してＣＰＵに命令を与え、各種処理を行うためのコンピュータプログラムが記録されている。このコンピュータプログラムは、ＲＡＭ等にロードされることによって実行され、ＣＰＵと協働して制御部１０２を構成する。また、このコンピュータプログラムは、画像解析装置１００に対して任意のネットワーク３００を介して接続されたアプリケーションプログラムサーバに記録されてもよく、必要に応じてその全部または一部をダウンロードすることも可能である。
また、本発明にかかるプログラムを、コンピュータ読み取り可能な記録媒体に格納することもできる。ここで、この「記録媒体」とは、フレキシブルディスク、光磁気ディスク、ＲＯＭ、ＥＰＲＯＭ、ＥＥＰＲＯＭ、ＣＤ−ＲＯＭ、ＭＯ、ＤＶＤ等の任意の「可搬用の物理媒体」や、各種コンピュータシステムに内蔵されるＲＯＭ、ＲＡＭ、ＨＤ等の任意の「固定用の物理媒体」、あるいは、ＬＡＮ、ＷＡＮ、インターネットに代表されるネットワークを介してプログラムを送信する場合の通信回線や搬送波のように、短期にプログラムを保持する「通信媒体」を含むものとする。
また、「プログラム」とは、任意の言語や記述方法にて記述されたデータ処理方法であり、ソースコードやバイナリコード等の形式を問わない。なお、「プログラム」は必ずしも単一的に構成されるものに限られず、複数のモジュールやライブラリとして分散構成されるものや、ＯＳ（Ｏｐｅｒａｔｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ）に代表される別個のプログラムと協働してその機能を達成するものをも含む。なお、実施の形態に示した各装置において記録媒体を読み取るための具体的な構成、読み取り手順、あるいは、読み取り後のインストール手順等については、周知の構成や手順を用いることができる。
記憶部１０６に格納される各種のデータベース等は、ＲＡＭ、ＲＯＭ等のメモリ装置、ハードディスク等の固定ディスク装置、フレキシブルディスク、光ディスク等のストレージ手段であり、各種処理やウェブサイト提供に用いる各種のプログラムやテーブルやファイルやデータベースやウェブページ用ファイル等を格納する。
また、画像解析装置１００は、既知のパーソナルコンピュータ、ワークステーション等の情報処理端末等の情報処理装置にプリンタやモニタやイメージスキャナ等の周辺装置を接続し、該情報処理装置に本発明の方法を実現させるソフトウェア（プログラム、データ等を含む）を実装することにより実現してもよい。
さらに、画像解析装置１００の分散・統合の具体的形態は図示のものに限られず、その全部または一部を、各種の負荷等に応じた任意の単位で、機能的または物理的に分散・統合して構成することができる。例えば、各データベースを独立したデータベース装置として独立に構成してもよく、また、処理の一部をＣＧＩ（Ｃｏｍｍｏｎ  Ｇａｔｅｗａｙ  Ｉｎｔｅｒｆａｃｅ）を用いて実現してもよい。
また、画像管理装置２００は、既知のパーソナルコンピュータ、ワークステーション、家庭用ゲーム装置、インターネットＴＶ、ＰＨＳ端末、携帯端末、移動体通信端末またはＰＤＡ等の情報処理端末等の情報処理装置にプリンタやモニタやイメージスキャナ等の周辺装置を必要に応じて接続し、該情報処理装置にウェブ情報のブラウジング機能や電子メール機能を実現させるソフトウェア（プログラム、データ等を含む）を実装することにより実現してもよい。
この画像管理装置２００の制御部２０２は、その全部または任意の一部を、ＣＰＵおよび当該ＣＰＵにて解釈実行されるプログラムにて実現することができる。すなわち、ＲＯＭまたはＨＤには、ＯＳ（Ｏｐｅｒａｔｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍ）と協働してＣＰＵに命令を与え、各種処理を行うためのコンピュータプログラムが記録されている。このコンピュータプログラムは、ＲＡＭにロードされることによって実行され、ＣＰＵと協働して制御部を構成する。
しかしながら、このコンピュータプログラムは、画像管理装置２００に対して任意のネットワークを介して接続されたアプリケーションプログラムサーバに記録されてもよく、必要に応じてその全部または一部をダウンロードすることも可能である。あるいは、各制御部の全部または任意の一部を、ワイヤードロジック等によるハードウェアとして実現することも可能である。
また、ネットワーク３００は、画像解析装置１００と画像管理装置２００とを相互に接続する機能を有し、例えば、インターネットや、イントラネットや、ＬＡＮ（有線／無線の双方を含む）や、ＶＡＮや、パソコン通信網や、公衆電話網（アナログ／デジタルの双方を含む）や、専用回線網（アナログ／デジタルの双方を含む）や、ＣＡＴＶ網や、ＩＭＴ２０００方式、ＧＳＭ方式またはＰＤＣ／ＰＤＣ−Ｐ方式等の携帯回線交換網／携帯パケット交換網や、無線呼出網や、Ｂｌｕｅｔｏｏｔｈ等の局所無線網や、ＰＨＳ網や、ＣＳ、ＢＳまたはＩＳＤＢ等の衛星通信網等のうちいずれかを含んでもよい。すなわち、本システムは、有線・無線を問わず任意のネットワークを介して、各種データを送受信することができる。
以上詳細に説明したように、本発明によれば顕微鏡を用いて検体保持体（例えば、マルチウェルプレートなど）の各検体保持部（例えば、マルチウェルプレートの各ウェルなど）を予め定めた倍率（低倍率乃至高倍率のいずれでもよい）で一括して撮影し、撮影された画像ファイルをサムネイル表示し、表示された画像ファイルから利用者が選択した画像ファイルについて利用者が撮影したい検体の位置および倍率に関する個別撮影情報を指定し、個別撮影情報により指定された位置および倍率により検体保持部内を個別に撮影するので、プレート中の各ウェル内の所望の場所の撮影を自動化することができる顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体を提供することができる。また、本発明によれば、各ウェル内を一括して撮影するのと同時または並行的に利用者が注目する場所を優先的に撮影してもよい。
また、本発明によれば、個別撮影情報を利用者に指定させるための個別撮影情報指定画面をモニタに表示し、利用者が入力装置を介して個別撮影情報指定画面上で指定した座標情報および倍率情報から個別撮影情報を作成するので、利用者が所望の位置を指定して個別撮影を行うことができる顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体を提供することができる。また、本発明によりモニタに表示される個別撮影情報指定画面において、公知のマップ・ビューイング機能（８方向や１６方向に移動するキー、倍率の設定変更ボタンなど）などの各種の入力支援機能を持ち、かかる機能を用いて利用者が個別撮影情報を指定してもよい。
さらに、本発明によれば、撮影する座標情報および／または倍率情報を画像処理手法により自動的に決定して個別撮影情報を作成するので、例えば既知の画像処理手法（例えば、重心計算など）により個別撮影の撮影位置を自動的に決定することができる顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体を提供することができる。
【産業上の利用可能性】  以上のように、顕微鏡画像処理システム、顕微鏡画像処理方法、プログラム、および、記録媒体は、作業者の意図したように顕微鏡画像撮影を自動化することができる。
本発明は、産業上多くの分野、特に医薬品、食品、化粧品、医療等の分野で広く実施することができ、極めて有用である。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【国際調査報告】
2004036283.tif 000032
2004036283.tif 000033
2004036283.tif 000034
2004036283.tif 000035