(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
次の一般式（１０）で表されるオリゴ核酸誘導体に、テトラブチルアンモニウムフロリド（ＴＢＡＦ）を作用させ、リボースの２’位水酸基の保護基である２−シアノエトキシメチルを脱離する工程において、テトラヒドロフランを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を反応溶媒として用いることを特徴とする、次の一般式（１１）で表されるオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【化１】
0005187189.tif 000038
式（１０）及び（１１）中、各Ｂは、それぞれ独立して、核酸塩基又はその修飾体を表す。ｎは、１〜２００の範囲内にある整数を表す。各Ｑは、それぞれ独立して、Ｏ又はＳを表す。各Ｒは、それぞれ独立して、Ｈ、水酸基、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ又はアルコキシアルキルオキシを表すが、少なくとも１つは水酸基を表す。Ｚは、Ｈ、リン酸基又はチオリン酸基を表す。
Ｒ1は、次の一般式（３）で表される置換基を表す。
【化２】
0005187189.tif 000039
式（３）中、Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13は、同一又は異なって、水素又はアルコキシを表す。
各Ｒ4は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ又はアルコキシアルキルオキシ又は次の一般式（４）で表される置換基を表す。
【化３】
0005187189.tif 000040
（式（４）中、ＷＧ1は、シアノを表す。）
但し、各Ｒ4の少なくとも１つは一般式（４）で表される置換基を表す。
【請求項２】
スルホキシド系溶媒が次の一般式（Ｉ）で表される化合物である、請求項１に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【化４】
0005187189.tif 000041
式（Ｉ）中、Ｒa、Ｒbは、同一又は異なって、アルキルを表す。
【請求項３】
次の一般式（Ｉ）で表される化合物がジメチルスルホキシドである、請求項２に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【請求項４】
アミド系溶媒が次の一般式（ＩＩ）で表される化合物である、請求項１に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【化５】
0005187189.tif 000042
式（ＩＩ）中、Ｒc、Ｒdは、同一若しくは異なって、アルキルを表し、Ｒeは、水素若しくはアルキルを表すか、又はＲdはアルキルを表し、ＲcとＲeは隣接する窒素原子と炭素原子とが一緒になって形成する、５若しくは６員の飽和環状アミド基を表す。
【請求項５】
一般式（ＩＩ）で表される化合物がＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミドである、請求項４に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【請求項６】
さらに、ニトロアルカン、アルキルアミン、アミジン、チオール若しくはチオール誘導体又はこれらの任意の混合物を含有する反応溶媒を用いることを特徴とする、請求項１〜５のいずれかに記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【請求項７】
下記工程を含む、次の一般式（Ａ）で表されるオリゴＲＮＡの製造方法。
【化６】
0005187189.tif 000043
式（Ａ）中、各Ｂは、それぞれ独立して、核酸塩基又は修飾体を表す。ｎは、１〜２００の範囲内にある整数を表す。各Ｑは、それぞれ独立して、Ｏ又はＳを表す。各Ｒは、それぞれ独立して、Ｈ、水酸基、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ又はアルコキシアルキルオキシを表すが、少なくとも１つは水酸基を表す。Ｚは、Ｈ、リン酸基又はチオリン酸基を表す。
工程：
次の一般式（１０）で表されるオリゴ核酸誘導体に、テトラブチルアンモニウムフロリド（ＴＢＡＦ）を作用させ、リボースの２’位水酸基である２−シアノエトキシメチルを脱離する工程において、テトラヒドロフランを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を反応溶媒として用いることを特徴とする、次の一般式（１１）で表されるオリゴ核酸誘導体を製造する工程。
【化７】
0005187189.tif 000044
式（１０）及び（１１）中、各Ｂ、各Ｑ、各Ｒは、それぞれ独立して、前記と同義である。ｎ、Ｚは、前記と同義である。
Ｒ1は、次の一般式（３）で表される置換基を表す。
【化８】
0005187189.tif 000045
式（３）中、Ｒ11、Ｒ12、Ｒ13は、同一又は異なって、水素又はアルコキシを表す。
各Ｒ4は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ又はアルコキシアルキルオキシ又は次の一般式（４）で表される置換基を表す。
【化９】
0005187189.tif 000046
（式（４）中、ＷＧ1は、シアノを表す。）
但し、各Ｒ4の少なくとも１つは一般式（４）で表される置換基を表す。
【請求項８】
スルホキシド系溶媒が次の一般式（Ｉ）で表される化合物である、請求項７に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【化１０】
0005187189.tif 000047
式（Ｉ）中、Ｒa、Ｒbは、同一又は異なって、アルキルを表す。
【請求項９】
一般式（Ｉ）で表される化合物がジメチルスルホキシドである、請求項８に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【請求項１０】
アミド系溶媒が次の一般式（ＩＩ）で表される化合物である、請求項７に記載のオリゴ核酸誘導体の製造方法。
【化１１】
0005187189.tif 000048
式（ＩＩ）中、Ｒc、Ｒdは、同一若しくは異なって、アルキルを表し、Ｒeは、水素若しくはアルキルを表すか、又はＲdはアルキルを表し、ＲcとＲeは隣接する窒素原子と炭素原子とが一緒になって形成する、５若しくは６員の飽和環状アミド基を表す。
【請求項１１】
一般式（ＩＩ）で表される化合物がＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミドである、請求項１０に記載のオリゴＲＮＡの製造方法。
【請求項１２】
さらに、ニトロアルカン、アルキルアミン、アミジン、チオール若しくはチオール誘導体又はこれらの任意の混合物を含有する反応溶媒を用いることを特徴とする、請求項７〜１１のいずれかに記載のオリゴＲＮＡの製造方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、オリゴ核酸誘導体の各リボースの２’位水酸基を保護している、中性条件下において脱離可能なエーテル型保護基、例えば、２−シアノエトキシメチル（以下、「ＣＥＭ基」という。）を再現性よく、また効率よく脱離するための方法に関するものである。
【背景技術】
【０００２】
オリゴリボ核酸（オリゴＲＮＡ）は、遺伝子解析のＲＮＡプローブ、ＲＮＡ医薬品素材（アンチセンスＲＮＡ、リボザイム、ＲＮＡｉを利用した遺伝子発現制御）、人工酵素、アプタマーとして有用であることは周知である。
オリゴＲＮＡを製造するための試薬の１つとして、リボースの２’位水酸基が中性条件において脱離可能なＣＥＭ基で置換され保護されているホスホロアミダイト化合物が知られている（非特許文献１）。
上記ホスホロアミダイト化合物を使用してオリゴＲＮＡを製造する場合、固相担体上で所望の鎖長のオリゴＲＮＡを製造した後、該オリゴＲＮＡから固相担体及び各置換基の保護基を除去する必要がある。かかる保護基を除去する工程の１つとして、オリゴＲＮＡの各リボースの２’位水酸基を保護している、中性条件下において脱離可能なエーテル型保護基を脱離する工程があるが、該工程では、脱保護剤としてテトラブチルアンモニウムフロリド（以下、「ＴＢＡＦ」という。）を、溶媒としてテトラヒドロフラン（以下、「ＴＨＦ」という。）を使用するのが一般的である（非特許文献１）。
【非特許文献１】大木ら，ＯＲＧＡＮＩＣ  ＬＥＴＴＥＲＳ，Ｖｏｌ．７，３４７７（２００５）
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００３】
本発明の目的は、主として、オリゴ核酸誘導体の各リボースの２’位水酸基を保護している、中性条件下において脱離可能なエーテル型保護基を再現性よく、また効率よく脱離する方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００４】
本発明者は、上記目的を達成するために、鋭意検討した結果、次の一般式（１０）で表されるオリゴ核酸誘導体にＴＢＡＦを作用させ、各リボースの２’位水酸基を保護している中性条件下において脱離可能なエーテル型保護基を脱離する工程において、ＴＨＦを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を反応溶媒として用いることによって、次の一般式（１１）で表されるオリゴ核酸誘導体を効率的に製造できることを見出し、本発明を完成するに至った。
【化１】
0005187189.tif 000002
式（１０）及び（１１）中、各Ｂは、それぞれ独立して、核酸塩基又はその修飾体を表す。ｎは、１〜２００の範囲内にある整数を表す。ｎは、１０〜１００の範囲内にある整数が好ましく、また、より好ましくは、１５〜５０の範囲内にある整数である。各Ｑは、それぞれ独立して、Ｏ又はＳを表す。各Ｒは、それぞれ独立して、Ｈ、水酸基、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ又はアルコキシアルキルオキシを表すが、少なくとも１つは水酸基を表す。Ｚは、Ｈ、リン酸基又はチオリン酸基を表す。
Ｒ１は、次の一般式（３）で表される置換基を表す。
【化２】
0005187189.tif 000003
式（３）中、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３は、同一又は異なって、水素又はアルコキシを表す。
各Ｒ４は、それぞれ独立して、Ｈ、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ、アルコキシアルキルオキシ又は次の一般式（４）で表される置換基を表す。
【化３】
0005187189.tif 000004
式（４）中、ＷＧ１は、電子吸引性基を表す。
【０００５】
Ｂで表される核酸塩基としては特に限定されるものではなく、例えば、シトシン、ウラシル、チミン等のピリミジン塩基、アデニン、グアニン等のプリン塩基を挙げることができる。
Ｂの「修飾体」とは、核酸塩基が任意の置換基で置換されている基であり、かかる置換基としては、例えば、ハロゲン、アシル、アルキル、アリールアルキル、アルコキシ、アルコキシアルキル、ヒドロキシ、アミノ、モノアルキルアミノ、ジアルキルアミノ、カルボキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが任意の位置に１〜３個置換されている。
Ｂの修飾体に係る「ハロゲン」としては、例えば、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素を挙げることができる。
Ｂの修飾体に係る「アシル」としては、例えば、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数１〜６のアルカノイル、炭素数７〜１３のアロイルを挙げることができる。具体的には、例えば、ホルミル、アセチル、ｎ−プロピオニル、イソプロピオニル、ｎ−ブチリル、イソブチリル、ｔｅｒｔ−ブチリル、バレリル、ヘキサノイル、ベンゾイル、ナフトイル、レブリニル等を挙げることができる。
Ｂの修飾体に係る「アルキル」としては、例えば、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数１〜５のアルキルを挙げることができる。具体的には、例えば、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ｎ−ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、ｔｅｒｔ−ペンチル等を挙げることができる。当該アルキルは置換されていてもよく、かかる置換基としては、例えば、ハロゲン、アルキル、アルコキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが任意の位置に１〜３個置換されていてもよい。
Ｂの修飾体における「アリールアルキル」、「アルコキシアルキル」、「モノアルキルアミノ」及び「ジアルキルアミノ」の「アルキル」部分は、上記の「アルキル」と同じものを挙げることができる。
Ｂの修飾体に係る「アルコキシ」としては、例えば、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数１〜４のアルコキシを挙げることができる。具体的には、例えば、メトキシ、エトキシ、ｎ−プロポキシ、イソプロポキシ、ｎ−ブトキシ、イソブトキシ、ｓｅｃ−ブトキシ、ｔｅｒｔ−ブトキシ等を挙げることができる。なかでも炭素数１〜３のものが好ましく、とりわけメトキシが好ましい。
Ｂの修飾体に係る「アルコキシアルキル」の「アルコキシ」部分は、上記の「アルコキシ」と同じものを挙げることができる。
Ｂの修飾体に係る「アリールアルキル」の「アリール」としては、例えば、炭素数６〜１２のアリールを挙げることができる。具体的には、例えば、フェニル、１−ナフチル、２−ナフチル、ビフェニル等を挙げることができる。当該アリールは置換されていてもよく、かかる置換基としては、例えば、ハロゲン、アルキル、アルコキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが任意の位置に１〜３個置換されていてもよい。
Ｂの修飾体に係る「アルキル」、「アリール」の置換基である「ハロゲン」、「アルキル」及び「アルコキシ」としては、各々上記と同じものを挙げることができる。
Ｒ及びＲ４に係る「ハロゲン」、「アルコキシ」、「アルキルアミノ」又は「ジアルキルアミノ」は、前記Ｂの修飾体に係るそれらと同じものを挙げることができる。
Ｒ及びＲ４に係る「アルコキシアルキルオキシ」、「アルキルチオ」の「アルキル」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ及びＲ４に係る「アルコキシアルキルオキシ」の「アルコキシ」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルコキシ」と同じものを挙げることができる。
Ｒ及びＲ４に係る「アルケニルオキシ」、「アルケニルチオ」、「アルケニルアミノ」、「ジアルケニルアミノ」の「アルケニル」部分としては、例えば、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数２〜６のアルケニルを挙げることができる。具体的には、例えば、ビニル、アリル、１−プロペニル、イソプロペニル、１−ブテニル、２−ブテニル、１−ペンテニル、１−ヘキセニル等を挙げることができる。
Ｒ及びＲ４に係る「アルキニルオキシ」、「アルキニルチオ」、「アルキニルアミノ」、「ジアルキニルアミノ」の「アルキニル」部分としては、例えば、直鎖状又は分枝鎖状の炭素数２〜４のアルキニルを挙げることができる。具体的には、例えば、エチニル、２−プロピニル、１−ブチニル等を挙げることができる。
Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３に係る「アルコキシ」としては、前記Ｂの「アルコキシ」と同じものを挙げることができる。
ＷＧ１に係る「電子吸引性基」としては、例えば、シアノ、ニトロ、アルキルスルホニル、アリールスルホニル、ハロゲンを挙げることができる。なかでも、シアノが好ましい。
ＷＧ１に係る「アルキルスルホニル」の「アルキル」部分としては、前記Ｂの「アルキル」と同じものを挙げることができる。
ＷＧ１に係る「アリールスルホニル」の「アリール」部分としては、前記Ｂの「アリール」と同じものを挙げることができる。
「スルホキシド系溶媒」としては、例えば、下記一般式（Ｉ）で表される化合物を挙げることができる。具体的には、ジメチルスルホキシド（以下、「ＤＭＳＯ」という。）、エチルメチルスルホキシド等を挙げることができる。この中で、ＤＭＳＯが適当である。
「アミド系溶媒」としては、例えば、下記一般式（ＩＩ）で表される化合物を挙げることができる。具体的には、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（以下、「ＤＭＦ」という。）、Ｎ，Ｎ−ジエチルホルムアミド、Ｎ，Ｎ−ジメチルアセトアミド、Ｎ，Ｎ−ジエチルアセトアミド、Ｎ−メチルピロリドン等を挙げることができる。この中で、ＤＭＦが適当である。
【化４】
0005187189.tif 000005
式（Ｉ）及び（ＩＩ）中、Ｒａ、Ｒｂは、同一又は異なって、アルキルを表す。Ｒｃ、Ｒｄは、同一若しくは異なって、アルキルを表し、Ｒｅは、水素若しくはアルキルを表すか、又は、Ｒｄは、アルキルを表し、ＲｃとＲｅが隣接する窒素原子及び炭素原子と一緒になって形成する、５若しくは６員の飽和環状アミド基を表す。
【０００６】
また、本発明として、次の一般式（１０）で表されるオリゴ核酸誘導体に、ＴＢＡＦを作用させ各リボースの２’位水酸基を保護している中性条件下において脱離可能なエーテル型保護基を脱離する工程において、ＴＨＦを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を反応溶媒として用いることを特徴とする、次の一般式（１１）で表されるオリゴ核酸誘導体を製造する工程を含む、次の一般式（Ａ）で表されるオリゴＲＮＡ（以下、「オリゴＲＮＡ（Ａ）」という。）の製造方法を挙げることができる。
【化５】
0005187189.tif 000006
式（１０）及び（１１）中、各Ｂ、各Ｑ、各Ｒ、各Ｒ４は、それぞれ独立して、前記と同義である。ｎ、Ｒ１、Ｚは、前記と同義である。
【化６】
0005187189.tif 000007
式（Ａ）中、各Ｂ、各Ｑ、各Ｒは、それぞれ独立して、前記と同義である。ｎ、Ｚは、前記と同義である。
【０００７】
以下、本発明を詳細に説明する。
【０００８】
Ｉ．ホスホロアミダイト化合物
上記オリゴＲＮＡ（Ａ）の製造に使用するリボ核酸誘導体として、次の一般式（Ｂ）で表されるホスホロアミダイト化合物（以下、「ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）」という。）を挙げることができる。
【化７】
0005187189.tif 000008
式（Ｂ）中、Ｂｚは、保護基を有していてもよい核酸塩基又はその修飾体を表す。
Ｒ１、ＷＧ１は、前記と同義である。ＷＧ２は、電子吸引性基を表す。Ｒ２ａ、Ｒ２ｂは、同一若しくは異なって、アルキルを表すか、又は、Ｒ２ａ、Ｒ２ｂが隣接する窒素原子と一緒になって形成する、５〜６員の飽和アミノ環基を表す。かかる飽和アミノ環基は、窒素原子の他に環構成原子として酸素原子又は硫黄原子を１個有していてもよい。【０００９】
Ｂｚに係る「核酸塩基」としては、核酸の合成に使用されるものであれば特に制限されず、例えば、シトシン、ウラシル等のピリミジン塩基、アデニン、グアニン等のプリン塩基が挙げることができる。
Ｂｚに係る「核酸塩基」は、保護されていてもよく、なかでもアミノ基を有する核酸塩基、例えば、アデニン、グアニン、シトシンは、アミノ基が保護されているのが好ましい。かかる「アミノ基の保護基」としては、核酸の保護基として使用されるものであれば特に制限されず、具体的には、例えば、ベンゾイル、４−メトキシベンゾイル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、フェニルアセチル、フェノキシアセチル、４−ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシアセチル、４−イソプロピルフェノキシアセチル、（ジメチルアミノ）メチレン等を挙げることができる。
Ｂｚの「修飾体」とは、核酸塩基が任意の置換基で置換されている基であり、Ｂｚの「修飾体」に係る置換基としては、例えば、ハロゲン、アシル、アルキル、アリールアルキル、アルコキシ、アルコキシアルキル、ヒドロキシ、アミノ、モノアルキルアミノ、ジアルキルアミノ、カルボキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが任意の位置に１〜３個置換されている。
Ｂｚの修飾体に係る「ハロゲン」、「アシル」、「アルキル」、「アリールアルキル」、「アルコキシ」、「アルコキシアルキル」、「モノアルキルアミノ」、「ジアルキルアミノ」としては、前記Ｂの修飾体に係るそれらと同じものを挙げることができる。
Ｒ２ａ、Ｒ２ｂに係る「アルキル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ２ａ、Ｒ２ｂに係る「５〜６員の飽和アミノ環基」としては、例えば、ピロリジン−１−イル、ピペリジン−１−イル、モルホリン−１−イル、チオモルホリン−１−イルを挙げることができる。
ＷＧ２に係る「電子吸引性基」としては、前記ＷＧ１の電子吸引基と同じものを挙げることができる。
【００１０】
ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）は、２’位の水酸基に中性条件下において脱離可能なエーテル型保護基を有するホスホロアミダイト化合物である。また、２’位の水酸基に導入された基が直鎖状の置換基であり、３’位の水酸基に結合するリン原子の周りにおける立体が混み合っていないため、従来から使用されているホスホロアミダイト化合物と比較して、オリゴＲＮＡを合成する際、非常に短時間に縮合反応が進行し、縮合収率がよいという特徴を有する。ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）を使用することにより、オリゴＤＮＡの製造と同様の手法を用いて、高純度のオリゴＲＮＡ（Ａ）の製造が可能である。
ここで、「オリゴＤＮＡ」とは、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）のみからなるオリゴ核酸をいう。また、本発明において「オリゴＲＮＡ」とは、リボ核酸（ＲＮＡ）及びデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）からなるオリゴ核酸であり、少なくとも１つはリボ核酸（ＲＮＡ）を含有するオリゴ核酸をいう。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１１】
以下に示す製法において、原料が反応に影響を及ぼす置換基（例えば、ヒドロキシ、アミノ、カルボキシ）を有する場合は、原料をあらかじめ公知の方法に従い、適当な保護基で保護した後に反応を行う。保護基は、最終的に、接触還元、アルカリ処理、酸処理などの公知の方法に従い保護基を脱離することができる。
【００１２】
ＩＩ．ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）の製法
ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）は、次のようにして製造することができる。
ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）は、公知化合物又は容易に製造可能な中間体から、例えば、次の工程ａ〜工程ｈの操作を実施することにより製造することができる。
以下、詳細に説明する。【００１３】
（１）工程ａ：
次の一般式（１２）で表されるリボ核酸誘導体にアルキル化試薬を作用させることによって、中性条件下において脱離するエーテル型保護基を２’位の水酸基に導入する、次の一般式（１３）で表されるリボ核酸誘導体を製造する工程。
【化８】
0005187189.tif 000009
式（１２）、（１３）及び（１３’）中、Ｂｚ、Ｒ１、ＷＧ１は、前記と同義である。
「アルキル化試薬」として、例えば、次の一般式（１４）で表されるエーテル化合物を挙げることができる。
【化９】
0005187189.tif 000010
式（１４）中、Ｌは、ハロゲン、アリールチオ基、アルキルスルホキシド基又はアルキルチオ基を表す。ＷＧ１は、前記と同義である。
Ｌに係る「ハロゲン」、「アリールチオ基」の「アリール」、「アルキルスルホキシド基」及び「アルキルチオ基」の「アルキル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「ハロゲン」、「アリール」、「アルキル」と同じものを挙げることができる。
エーテル化合物（１４）の具体例としては、次の１〜２の化合物を挙げることができる。
１．クロロメチル  ２−シアノエチルエーテル
２．２−シアノエチル  メチルチオメチルエーテル
エーテル化合物（１４）は、中性条件下において脱離可能なエーテル型置換基を、２’位の水酸基に塩基性条件下において導入することができる新規なアルキル化試薬であり、ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）を製造するための試薬として有用である。
【００１４】
エーテル化合物（１４）は、次に示す工程１〜工程４を実施することにより製造することができる。
工程１：
次の一般式（１５）で表されるアルコール化合物をアルキルチオメチル化し、次の一般式（１６）で表される化合物を製造する工程。
【化１０】
0005187189.tif 000011
式（１５）及び（１６）中、ＷＧ１は、前記と同義である。Ｒ３は、アルキル又はアリールを表す。
化合物（１６）は、Ｌがアルキルチオ基であるエーテル化合物（１４）である。
Ｒ３に係る「アルキル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ３がメチルである場合、アルキルチオメチル化試薬としては、例えば、ジメチルスルホキシド、無水酢酸及び酢酸の混合溶液を挙げることができる。「ジメチルスルホキシド」の使用量は、化合物（１５）のモル量に対して、１０〜２００倍モル量が適当であり、好ましくは２０〜１００倍モル量である。「酢酸」の使用量は、化合物（１５）のモル量に対して、１０〜１５０倍モル量が適当であり、好ましくは２０〜１００倍モル量である。「無水酢酸」の使用量は、化合物（１５）のモル量に対して、１０〜１５０倍モル量が適当であり、好ましくは２０〜１００倍モル量である。反応温度は、０℃〜１００℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常１〜４８時間が適当である。
工程２：
化合物（１６）をハロゲン化し、次の一般式（１７）で表される化合物を製造する工程。
【化１１】
0005187189.tif 000012
式（１６）及び（１７）中、ＷＧ１、Ｒ３は、前記と同義である。Ｘ２は、ハロゲンを表す。
化合物（１７）は、エーテル化合物（１４）におけるＬがハロゲンである化合物である。
Ｘ２に係る「ハロゲン」としては、前記Ｂの修飾体に係る「ハロゲン」と同じものを挙げることができる。
本工程は、公知の方法（例えば、Ｔ．Ｂｅｎｎｅｃｈｅら、Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  ７６２（１９８３））により実施することができる。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタンなどのハロゲン系炭化水素等を挙げることができる。ハロゲン化試薬としては、例えば、塩化スルフリル、オキシ塩化リンを挙げることができる。「ハロゲン化試薬」の使用量は、化合物（１６）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。反応温度は、０℃〜１００℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
工程３：
化合物（１７）をアリールチオ化し、次の一般式（１８）で表される化合物を製造する工程。
【化１２】
0005187189.tif 000013
式（１７）及び（１８）中、ＷＧ１、Ｘ２は、前記と同義である。Ｒ３ａは、アリールを表す。
化合物（１８）は、エーテル化合物（１４）におけるＬがアリールチオ基である化合物である。
Ｒ３ａに係る「アリール」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アリール」と同じものを挙げることができる。
本工程は、公知の方法により実施することができる。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、アセトニトリルを挙げることができる。アリールチオ化試薬としては、例えば、チオフェノール、４−メチルベンゼンチオールを挙げることができる。「アリールチオ化試薬」の使用量は、化合物（１７）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜５倍モル量である。反応温度は、０℃〜１００℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常１〜４８時間が適当である。
工程４：
化合物（１６）を酸化し、次の一般式（１９）で表される化合物を製造する工程。
【化１３】
0005187189.tif 000014
式（１６）及び（１９）中、ＷＧ１、Ｒ３は、前記と同義である。
化合物（１９）は、エーテル化合物（１４）におけるＬがアルキルスルホキシド基である化合物である。
Ｒ３に係る「アルキル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
本工程は、公知の方法により実施することができる。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、メタノールを挙げることができる。酸化剤としては、例えば、メタクロロ過安息香酸、メタ過ヨウ素酸塩、過酸化水素を挙げることができる。「酸化剤」の使用量は、化合物（１６）モル量に対して、０．８〜１０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜２倍モル量である。反応温度は、０℃〜１００℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常１〜４８時間が適当である。
【００１５】
「アルキル化試薬」として、化合物（１７）を使用する場合、以下のように実施することができる。
本工程は、公知の方法に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（１２）にアルキル化試薬と塩基とを作用させることにより実施することができる。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタンなどのハロゲン系炭化水素を挙げることができる。「アルキル化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。本工程において、必要に応じて、リボ核酸誘導体（１２）に金属試薬と塩基を作用させ製造される中間体を経由した後、アルキル化試薬を作用させることもできる。かかる「金属試薬」として、例えば、二塩化ジブチルスズを挙げることができる。「金属試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。「塩基」としては、ピリジン、２，６−ジメチルピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、Ｎ−メチルイミダゾール、トリエチルアミン、トリブチルアミン、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］−７−ウンデセンなどの有機塩基等を挙げることができる。「塩基」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。反応温度は、０℃〜１２０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
【００１６】
「アルキル化試薬」として、化合物（１６）又は化合物（１８）を使用する場合、以下のように実施することができる。
本工程は、公知の方法（例えば、Ｍ．Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，Ｖｏｌ．３１，２３８５（１９９０））に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（１２）に、アルキル化試薬と酸と硫黄原子に対するハロゲン化剤とを作用させることにより実施することができる。「アルキル化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．８〜５倍モル量が適当であり、好ましくは１〜３倍モル量である。「酸」としては、例えば、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸銀、トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネートを挙げることができる。「酸」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．０１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．０２〜１０倍モル量である。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタン、ベンゼン、トルエン、キシレン、ＴＨＦ、アセトニトリル又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。本工程において使用する「硫黄原子に対するハロゲン化剤」として、例えば、Ｎ−ブロモスクシンイミド（ＮＢＳ）、Ｎ−ヨードスクシンイミド（ＮＩＳ）を挙げることができる。「硫黄原子に対するハロゲン化剤」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．８〜１０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜５倍モル量である。反応温度は、−７８℃〜３０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常５分〜５時間が適当である。
【００１７】
「アルキル化試薬」として、化合物（１９）を使用する場合、以下のように実施することができる。
本工程は、公知の方法に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（１２）に、アルキル化試薬と酸無水物と塩基とを作用させることにより実施することができる。「アルキル化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．８〜５倍モル量が適当であり、好ましくは１〜３倍モル量である。「酸無水物」としては、例えば、トリフルオロメタンスルホン酸無水物、無水酢酸を挙げることができる。「酸無水物」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．０１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．０２〜１０倍モル量である。塩基としては、例えば、テトラメチルウレア、コリジンを挙げることができる。「塩基」の使用量は、リボ核酸誘導体（１２）のモル量に対して、０．０１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．０２〜１０倍モル量である。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタン又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。反応温度は、−７８℃〜３０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常５分〜２４時間が適当である。
【００１８】
（２）工程ｂ：
工程ａにおいて製造されるリボ核酸誘導体（１３）を単離精製する工程。
本工程は、工程ａにおいて製造される混合物から通常の分離精製手段、例えば、薄層クロマトグラフィー、シリガゲルクロマトグラフィーなどの手段を用いることにより単離精製することができる。
【００１９】
（３）工程ｃ：
工程ｂとは別に、次の一般式（２０）で表されるリボ核酸誘導体にアルキル化試薬を作用させることによって、中性条件下において脱離するエーテル型保護基を２’位の水酸基に導入した、次の一般式（２１）で表されるリボ核酸誘導体を製造する工程。
【化１４】
0005187189.tif 000015
式（２０）及び（２１）中、Ｂｚ、ＷＧ１は、前記と同義である。
Ａは、次の一般式（２２ａ）又は（２２ｂ）で表されるケイ素置換基を表す。
【化１５】
0005187189.tif 000016
式（２２ａ）及び（２２ｂ）中、Ｒ６は、アルキルを表わす。
Ｒ６に係る「アルキル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
「アルキル化試薬」としては、前記と同じものを挙げることができる。【００２０】
「アルキル化試薬」として、化合物（１７）を使用する場合、以下のように実施することができる。
本工程は、公知の方法に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（２０）にアルキル化試薬と塩基とを作用させることにより実施することができる。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタンなどのハロゲン系炭化水素等を挙げることができる。「アルキル化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。本工程において、必要に応じて、リボ核酸誘導体（２０）に金属試薬と塩基を作用させ製造される中間体を経由した後、アルキル化試薬を作用させることもできる。かかる「金属試薬」として、例えば、二塩化ジブチルスズ、ｔｅｒｔ−ブチルマグネシウムクロリドを挙げることができる。「金属試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。「塩基」としては、ピリジン、２，６−ジメチルピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、Ｎ−メチルイミダゾール、トリエチルアミン、トリブチルアミン、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］−７−ウンデセンなどの有機塩基等を挙げることができる。「塩基」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。反応温度は、０℃〜１２０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
【００２１】
「アルキル化試薬」として、化合物（１６）又は化合物（１８）を使用する場合、以下のように実施することができる。
本工程は、公知の方法（例えば、Ｍ．Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，Ｖｏｌ．３１，２３８５（１９９０））に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（２０）に、アルキル化試薬と酸と硫黄原子に対するハロゲン化剤とを作用させることにより実施することができる。「アルキル化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．８〜５倍モル量が適当であり、好ましくは１〜３倍モル量である。「酸」としては、例えば、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸銀、トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネートを挙げることができる。「酸」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．０１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．０２〜１０倍モル量である。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタン、ベンゼン、トルエン、キシレン、ＴＨＦ、アセトニトリル又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。本工程において使用する「硫黄原子に対するハロゲン化剤」として、例えば、Ｎ−ブロモスクシンイミド（ＮＢＳ）、Ｎ−ヨードスクシンイミド（ＮＩＳ）を挙げることができる。「硫黄原子に対するハロゲン化剤」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．８〜１０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜５倍モル量である。反応温度は、−７８℃〜３０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常５分〜５時間が適当である。
【００２２】
「アルキル化試薬」として、化合物（１９）を使用する場合、以下のように実施することができる。
本工程は、公知の方法に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（２０）に、アルキル化試薬と酸無水物と塩基とを作用させることにより実施することができる。「アルキル化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．８〜５倍モル量が適当であり、好ましくは１〜３倍モル量である。「酸無水物」としては、例えば、トリフルオロメタンスルホン酸無水物、無水酢酸を挙げることができる。「酸無水物」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．０１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．０２〜１０倍モル量である。塩基としては、例えば、テトラメチルウレア、コリジンを挙げることができる。「塩基」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、０．０１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．０２〜１０倍モル量である。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタン又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。反応温度は、−７８℃〜３０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常５分〜２４時間が適当である。
【００２３】
（４）工程ｄ：
工程ａ〜工程ｃとは別に、リボ核酸誘導体（２０）にジメチルスルホキシドと酢酸と無水酢酸とを作用させることによって、次の一般式（２３）で表されるリボ核酸誘導体を製造する工程。
【化１６】
0005187189.tif 000017
式（２０）及び（２３）中、Ａ、Ｂｚは、前記と同義である。
本工程は、公知の方法に従い、市販品として入手可能又は文献記載の方法に従い合成可能であるリボ核酸誘導体（２０）に、ジメチルスルホキシドと酢酸と無水酢酸とを作用させることにより実施することができる。
「ジメチルスルホキシド」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、１０〜２００倍モル量が適当であり、好ましくは２０〜１００倍モル量である。「酢酸」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、１０〜１５０倍モル量が適当であり、好ましくは２０〜１００倍モル量である。「無水酢酸」の使用量は、リボ核酸誘導体（２０）のモル量に対して、１０〜１５０倍モル量が適当であり、好ましくは２０〜１００倍モル量である。反応温度は、１０℃〜５０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
【００２４】
（５）工程ｅ：
工程ｄにおいて製造されるリボ核酸誘導体（２３）に次の一般式（２４）で表されるアルコール化合物と酸と硫黄原子に対するハロゲン化剤とを作用させることによって、中性条件下において脱離するエーテル型保護基を２’位の水酸基に導入した、次の一般式（２１）で表されるリボ核酸誘導体を製造する工程。
【化１７】
0005187189.tif 000018
式（２１）、（２３）及び（２４）中、Ａ、Ｂｚ、ＷＧ１は、前記と同義である。
本工程は、公知の方法に従い、リボ核酸誘導体（２３）に、アルコール化合物（２４）と酸と硫黄原子に対するハロゲン化剤とを作用させることにより実施することができる。
使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、四塩化炭素、１，２−ジクロロエタン、ベンゼン、トルエン、キシレン、ＴＨＦ、アセトニトリル又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。「アルコール化合物（２４）」の使用量は、リボ核酸誘導体（２３）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。「酸」としては、例えば、トリフルオロメタンスルホン酸、トリフルオロメタンスルホン酸銀、トリメチルシリルトリフルオロメタンスルホネートを挙げることができる。「硫黄原子に対するハロゲン化剤」としては、例えば、Ｎ−ブロモスクシンイミド（ＮＢＳ）、Ｎ−ヨードスクシンイミド（ＮＩＳ）を挙げることができる。「硫黄原子に対するハロゲン化剤」の使用量は、リボ核酸誘導体（２３）のモル量に対して、０．１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．２〜１０倍モル量である。反応温度は、−１００℃〜２０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常５分〜１２時間が適当である。
【００２５】
（６）工程ｆ：
工程ｃ又は工程ｅにおいて製造されるリボ核酸誘導体（２１）の３’位と５’位の水酸基の保護基を脱離する反応を行うことによって、次の一般式（２５）で表されるリボ核酸誘導体を製造する工程。
【化１８】
0005187189.tif 000019
式（２１）及び（２５）中、Ａ、Ｂｚ、ＷＧ１は、前記と同義である。
本工程は、リボ核酸誘導体（２１）を有機溶媒に溶解し、フッ素化剤単独又はフッ素化剤と酸（例えば、酢酸、塩酸、硫酸）とを任意の混合比の混合試薬として反応させることにより実施することができる。本工程に使用しうる「フッ素化剤」としては、例えば、フッ化アンモニウム、ＴＢＡＦ、トリエチルアミントリヒドロフロリド、フッ化水素ピリジンを挙げることができる。「フッ素化剤」の使用量としては、リボ核酸誘導体（２１）のモル量に対して、０．１〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは０．２〜１０倍モル量である。反応温度は、０℃〜１２０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
混合試薬におけるフッ素化剤と酸との混合比は、１：２〜１：０．１（フッ素化剤：酸）が適当であり、１：１．２〜１：１が好ましい。
【００２６】
（７）工程ｇ：
工程ｆにおいて製造されるリボ核酸誘導体（２５）の５’位の水酸基に酸性条件下において脱離する保護基（Ｒ１）を導入する、リボ核酸誘導体（１３）を製造する工程。
【化１９】
0005187189.tif 000020
式（１３）及び（２５）中、Ｂｚ、Ｒ１、ＷＧ１は、前記と同義である。Ｘ３は、ハロゲンを表す。
Ｘ３に係る「ハロゲン」としては、前記Ｂの修飾体に係る「ハロゲン」と同じものを挙げることができる。
本工程は、公知の方法に従い、リボ核酸誘導体（２５）にＲ１Ｘ３を作用させることにより実施することができる。Ｒ１Ｘ３の使用量は、リボ核酸誘導体（２５）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、アセトニトリル、ＴＨＦを挙げることができる。「塩基」としては、ピリジン、２，６−ジメチルピリジン、２，４，６−トリメチルピリジン、Ｎ−メチルイミダゾール、トリエチルアミン、トリブチルアミン、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］−７−ウンデセンなどの有機塩基を挙げることができる。「塩基」の使用量は、リボ核酸誘導体（２５）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。反応温度は、０℃〜１２０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
【００２７】
（８）工程ｈ：
工程ｂ又は工程ｆにおいて製造されるリボ核酸誘導体（１３）にホスホロアミダイト化試薬と、必要に応じて活性化剤とを作用させることによって、３’位の水酸基がホスホロアミダイト化されたホスホロアミダイト化合物（Ｂ）を製造する工程。
【化２０】
0005187189.tif 000021
式（１３）及び（Ｂ）中、Ｂｚ、Ｒ１、Ｒ２ａ、Ｒ２ｂ、ＷＧ１、ＷＧ２は、前記と同義である。
「ホスホロアミダイト化試薬」としては、例えば、次の一般式（２６ａ）、（２６ｂ）で表される化合物を挙げることができる。
【化２１】
0005187189.tif 000022
式（２６ａ）及び（２６ｂ）中、Ｒ２ａ、Ｒ２ｂ、ＷＧ２は、前記と同義である。Ｘ１は、ハロゲンを表す。
Ｘ１に係る「ハロゲン」としては、前記Ｂの修飾体に係る「ハロゲン」と同じものを挙げることができる。
本工程は、リボ核酸誘導体（１３）にホスホロアミダイト試薬を作用させて、３’位の水酸基をホスホロアミダイト化する反応であり、公知の方法に従い実施することができる。必要に応じて、活性化剤を使用することもできる。使用する溶媒は、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、アセトニトリル、ＴＨＦを挙げることができる。
「ホスホロアミダイト化試薬」の使用量は、リボ核酸誘導体（１３）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。「活性化剤」としては、例えば、１Ｈ−テトラゾール、５−エチルチオテトラゾール、５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール、４，５−ジクロロイミダゾール、４，５−ジシアノイミダゾール、ベンゾトリアゾールトリフラート、イミダゾールトリフラート、ピリジニウムトリフラート、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン、２，４，６−コリジン／Ｎ−メチルイミダゾールを挙げることができる。「活性化剤」の使用量は、リボ核酸誘導体（１３）のモル量に対して、０．８〜２０倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。反応温度は、０℃〜１２０℃が適当である。反応時間は、使用する原料の種類、反応温度等によって異なるが、通常３０分〜２４時間が適当である。
このようにして、製造されるホスホロアミダイト化合物（Ｂ）は、それ自体公知の手段、例えば、濃縮、液性変換、転溶、溶媒抽出、結晶化、再結晶、分留、クロマトグラフィー等により分離精製することができる。
【００２８】
ＩＩＩ．オリゴＲＮＡ（Ａ）の製造方法
オリゴＲＮＡ（Ａ）の製造方法について、以下に詳述する。
【化２２】
0005187189.tif 000023
式（Ａ）中、各Ｂ、各Ｑ、各Ｒは、それぞれ独立して、前記と同義である。ｎ、Ｚは、前記と同義である。
オリゴＲＮＡ（Ａ）の製法は、公知の方法に従い行うことができるが、例えば、次に示す工程Ａ〜工程Ｈの操作を実施することにより、段階的に３’から５’の方向へ核酸モノマー化合物を縮合することにより行うことができる。
下記工程に使用されている化合物及び試薬のうち、ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）以外については、オリゴＲＮＡ又はオリゴＤＮＡの合成に一般的に使用されているものであれば特に限定されない。また、既存の核酸合成試薬を用いた場合と同様、すべての工程をマニュアル又は市販のＤＮＡ自動合成機を用いて製造することができる。自動合成機で行うことにより操作法の簡便化、また合成の正確性の点から自動合成機を用いる方法が望ましい。また、下記工程Ａ〜工程Ｈに記載されている化合物及び試薬のうち、核酸モノマー化合物以外については、オリゴＤＮＡ又はオリゴＲＮＡの合成に一般的に使用されているものであれば特に限定されない。
また、オリゴＲＮＡ（Ａ）の製造方法において、核酸モノマー化合物として少なくとも１回はホスホロアミダイト化合物（Ｂ）を使用することによって、各Ｒのうち少なくとも１つが水酸基であるオリゴＲＮＡ（Ａ）を製造することができる。また、例えば、後記する工程Ｂにおいて、核酸モノマー化合物として、全てホスホロアミダイト化合物（Ｂ）を使用することにより各Ｒが全て水酸基であるオリゴＲＮＡ（Ａ）を製造することができる。
【００２９】
（１）工程Ａ：
次の一般式（１）で表される（オリゴ）核酸誘導体に酸を作用させることによって、５’位の水酸基の保護基を脱離して、次の一般式（２）で表される（オリゴ）核酸誘導体を製造する工程。
【化２３】
0005187189.tif 000024
式（１）及び（２）中、ｎ、Ｒ１は前記と同義である。各Ｑ、各Ｒ４、各ＷＧ２は、それぞれ独立して、前記と同義である。各Ｂｘは、それぞれ独立して、保護基を有していてもよい核酸塩基又はその修飾体を表す。
Ｅは、アシル又は次の一般式（５）で表される置換基を表す。
【化２４】
0005187189.tif 000025
式（５）中、Ｅ１は、単結合又は次の一般式（６）で表される置換基を表す。
【化２５】
0005187189.tif 000026
式（６）中、Ｑ、ＷＧ２は、前記と同義である。
Ｔは、Ｈ、アシルオキシ、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ、アルコキシアルキルオキシ、前記一般式（４）で表される置換基又は上記一般式（５）で表される置換基を表す。但し、Ｅ又はＴのどちらか一方は、置換基（５）を表す。
Ｂｘに係る「核酸塩基」としては、核酸の合成に使用されるものであれば特に制限されず、例えば、シトシン、ウラシル、チミン等のピリミジン塩基、アデニン、グアニン等のプリン塩基を挙げることができる。
Ｂｘに係る「核酸塩基」は、保護されていてもよく、なかでもアミノ基を有する核酸塩基、例えば、アデニン、グアニン、シトシンは、アミノ基が保護されているのが好ましい。
かかる「アミノ基の保護基」としては、核酸の保護基として使用されるものであれば特に制限されず、具体的には、例えば、ベンゾイル、４−メトキシベンゾイル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、フェニルアセチル、フェノキシアセチル、４−ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシアセチル、４−イソプロピルフェノキシアセチル、（ジメチルアミノ）メチレンを挙げることができる。
Ｂｘの「修飾体」とは、核酸塩基が任意の置換基で置換されている基であり、Ｂｘの「修飾体」に係る置換基としては、例えば、ハロゲン、アシル、アルキル、アリールアルキル、アルコキシ、アルコキシアルキル、ヒドロキシ、アミノ、モノアルキルアミノ、ジアルキルアミノ、カルボキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが任意の位置に１〜３個置換されている。
Ｂｘの修飾体に係る「ハロゲン」、「アシル」、「アルキル」、「アリールアルキル」、「アルコキシ」、「アルコキシアルキル」、「モノアルキルアミノ」、「ジアルキルアミノ」としては、前記Ｂの修飾体に係るそれらと同じものを挙げることができる。
Ｅに係る「アシル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アシル」と同じものを挙げることができる。
Ｔの「アシルオキシ」に係る「アシル」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アシル」と同じものを挙げることができる。
Ｔに係る「ハロゲン」、「アルコキシ」、「アルキルアミノ」及び「ジアルキルアミノ」としては、前記Ｂの修飾体に係るそれらと同じものを挙げることができる。
Ｔに係る「アルコキシアルキルオキシ」及び「アルキルチオ」の「アルキル」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
Ｔに係る「アルコキシアルキルオキシ」の「アルコキシ」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルコキシ」と同じものを挙げることができる。
Ｔに係る「アルケニルオキシ」、「アルケニルチオ」、「アルケニルアミノ」、「ジアルケニルアミノ」の「アルケニル」部分としては、前記Ｒに係る「アルケニル」と同じものを挙げることができる。
Ｔに係る「アルキニルオキシ」、「アルキニルチオ」、「アルキニルアミノ」、「ジアルキニルアミノ」の「アルキニル」部分としては、前記Ｒに係る「アルキニル」と同じものを挙げることができる。
Ｔに係る「アルキルアミノ」、「アルケニルアミノ」、「アルキニルアミノ」は保護されていてもよく、かかる保護基はアミノ基の保護基として使用されるものであれば特に制限されず、例えば、トリフルオロアセチル、ベンゾイル、４−メトキシベンゾイル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、フェニルアセチル、フェノキシアセチル、４−ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシアセチル、４−イソプロピルフェノキシアセチル、（ジメチルアミノ）メチレンを挙げることができる。特に、トリフルオロアセチルが好ましい。
本工程は、固相担体に担持されている次の一般式（２７ａ）、（２７ｂ）で表される核酸誘導体（ｎ＝１である核酸誘導体（１））、又は、工程Ａ〜工程Ｄの操作を行うことにより製造される固相担体に担持されているオリゴＲＮＡ若しくはオリゴＤＮＡ（ｎ＝２〜１００であるオリゴ核酸誘導体（１））（以下、「固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体」という。）に酸を作用させることにより実施することができる。
【化２６】
0005187189.tif 000027
式（２７ａ）及び（２７ｂ）中、ＢＸ、Ｒ１は、前記と同義である。Ｒ２Ｌ、Ｒ４Ｌは、置換基（５）を表す。Ｒ２は、アシルオキシを表す。Ｒ４ａは、Ｈ、アシルオキシ、ハロゲン、アルコキシ、アルキルチオ、アルキルアミノ、ジアルキルアミノ、アルケニルオキシ、アルケニルチオ、アルケニルアミノ、ジアルケニルアミノ、アルキニルオキシ、アルキニルチオ、アルキニルアミノ、ジアルキニルアミノ、アルコキシアルキルオキシ又は置換基（４）を表す。
Ｒ２、Ｒ４ａの「アシルオキシ」に係る「アシル」としては、前記Ｂの修飾体に係る「アシル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ４ａに係る「ハロゲン」、「アルコキシ」、「アルキルアミノ」及び「ジアルキルアミノ」としては、前記Ｂの修飾体に係るそれらと同じものを挙げることができる。
Ｒ４ａに係る「アルコキシアルキルオキシ」及び「アルキルチオ」の「アルキル」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルキル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ４ａに係る「アルコキシアルキルオキシ」の「アルコキシ」部分としては、前記Ｂの修飾体に係る「アルコキシ」と同じものを挙げることができる。
Ｒ４ａに係る「アルケニルオキシ」、「アルケニルチオ」、「アルケニルアミノ」、「ジアルケニルアミノ」の「アルケニル」部分としては、前記Ｒに係る「アルケニル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ４ａに係る「アルキニルオキシ」、「アルキニルチオ」、「アルキニルアミノ」、「ジアルキニルアミノ」の「アルキニル」部分としては、前記Ｒに係る「アルキニル」と同じものを挙げることができる。
Ｒ４ａに係る「アルキルアミノ」、「アルケニルアミノ」、「アルキニルアミノ」は保護されていてもよく、かかる保護基はアミノ基の保護基として使用されるものであれば特に制限されず、例えば、トリフルオロアセチル、ベンゾイル、４−メトキシベンゾイル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、フェニルアセチル、フェノキシアセチル、４−ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシアセチル、４−イソプロピルフェノキシアセチル、（ジメチルアミノ）メチレンを挙げることができる。特に、トリフルオロアセチルが好ましい。
「固相担体」としては、例えば、定孔ガラス（ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ  ｐｏｒｅ  ｇｌａｓｓ；ＣＰＧ）、オキサリル化−定孔ガラス（例えば、Ａｌｕｌら，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｖｏｌ．１９，１５２７（１９９１）を参照）、ＴｅｎｔａＧｅｌ支持体−アミノポリエチレングリコール誘導体化支持体（例えば、Ｗｒｉｇｈｔら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，Ｖｏｌ．３４，３３７３（１９９３）を参照）、Ｐｏｒｏｓ−ポリスチレン／ジビニルベンゼンのコポリマーを挙げることができる。
「リンカー」としては、例えば、３−アミノプロピル、スクシニル、２，２’−ジエタノールスルホニル、ロングチェーンアルキルアミノ（ＬＣＡＡ）を挙げることができる。
核酸誘導体（２７ａ）、核酸誘導体（２７ｂ）は、公知の方法に従い製造される又は市販品として入手できる固相担体に担持されている核酸誘導体であり、好ましい態様としては、例えば、次の一般式（２８）、（２９）で表される核酸誘導体を挙げることができる。
【化２７】
0005187189.tif 000028
式（２８）及び（２９）中、ＢＸ、Ｑ、Ｒ１、Ｒ４、ＷＧ２は、前記と同義である。
Ｒ４が置換基（４）である核酸誘導体（２８）、（２９）は、ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）から公知の方法に従い製造することができる。
本工程に使用しうる「酸」としては、例えば、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリクロロ酢酸を挙げることができる。本工程に使用しうる酸は、１〜５％の濃度になるように適当な溶媒で希釈して使用することもできる。溶媒としては、反応に関与しなければ特に限定されないが、ジクロロメタン、アセトニトリル、水又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。上記反応における反応温度は、２０℃〜５０℃が好ましい。反応時間は、オリゴ核酸誘導体（１）の種類、使用する酸の種類、反応温度等によって異なるが、通常１分〜１時間が適当である。使用する試薬の量は固相担体に担持されている（オリゴ）核酸誘導体に対して０．８〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。
【００３０】
（２）工程Ｂ：
工程Ａにおいて製造される（オリゴ）核酸誘導体（２）に、活性化剤を用いて核酸モノマー化合物を縮合させ、次の一般式（７）で表されるオリゴ核酸誘導体を製造する工程。
【化２８】
0005187189.tif 000029
式（２）及び（７）中、各ＢＸ、各Ｑ、各Ｒ４、各ＷＧ２は、それぞれ独立して、前記と同義である。Ｅ、ｎ、Ｒ１、Ｔは、前記と同義である。
本工程は、固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に核酸モノマー化合物と活性化剤とを作用させることにより実施することができる。
「核酸モノマー化合物」としては、ホスホロアミダイト化合物（Ｂ）又は次の一般式（３０）で表される核酸誘導体を挙げることができる。
【化２９】
0005187189.tif 000030
式（３０）中、Ｒ１、Ｒ２ａ、Ｒ２ｂ、Ｒ４ａ、ＷＧ２は、前記と同義である。ＢＹは、保護基を有していてもよい核酸塩基又はその修飾体を表す。
ＢＹに係る「核酸塩基」としては、核酸の合成に使用されるものであれば特に制限されず、例えば、シトシン、ウラシル、チミン等のピリミジン塩基、アデニン、グアニン等のプリン塩基を挙げることができる。
ＢＹに係る「核酸塩基」は、保護されていてもよく、なかでもアミノ基を有する核酸塩基、例えば、アデニン、グアニン、シトシンは、アミノ基が保護されているのが好ましい。
かかる「アミノ基の保護基」としては、核酸の保護基として使用されるものであれば特に制限されず、具体的には、例えば、ベンゾイル、４−メトキシベンゾイル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリル、フェニルアセチル、フェノキシアセチル、４−ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシアセチル、４−イソプロピルフェノキシアセチル、（ジメチルアミノ）メチレンを挙げることができる。
ＢＹの「修飾体」とは、核酸塩基が任意の置換基で置換されている基であり、ＢＹの「修飾体」に係る置換基としては、例えば、ハロゲン、アシル、アルキル、アリールアルキル、アルコキシ、アルコキシアルキル、ヒドロキシ、アミノ、モノアルキルアミノ、ジアルキルアミノ、カルボキシ、シアノ、ニトロを挙げることができ、これらが任意の位置に１〜３個置換されている。
ＢＹの修飾体に係る「ハロゲン」、「アシル」、「アルキル」、「アリールアルキル」、「アルコキシ」、「アルコキシアルキル」、「モノアルキルアミノ」、「ジアルキルアミノ」としては、前記Ｂの修飾体に係るそれらと同じものを挙げることができる。
「活性化剤」としては、前記と同じものを挙げることができる。
反応溶媒としては、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、アセトニトリル、ＴＨＦを挙げることができる。上記反応における反応温度は、２０℃〜５０℃が好ましい。反応時間は、オリゴ核酸誘導体（２）の種類、使用する活性化剤の種類、反応温度等によって異なるが、通常１分〜１時間が適当である。使用する試薬の量は固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に対して０．８〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。
【００３１】
（３）工程Ｃ：
工程Ｂにおいて未反応である（オリゴ）核酸誘導体（２）の５’位の水酸基をキャッピングする工程。
【化３０】
0005187189.tif 000031
式（２）及び（８）中、各ＢＸ、各Ｑ、各Ｒ４、各ＷＧ２は、それぞれ独立して、前記と同義である。Ｅ、ｎ、Ｔは、前記と同義である。Ｒ５は、メチル、フェノキシメチル、ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシメチルを表す。
本工程は、工程Ｂにおいて未反応であった５’位の水酸基を保護する反応であり、固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体にキャップ化剤を作用することにより実施することができる。
「キャップ化剤」としては、例えば、無水酢酸、フェノキシ酢酸無水物又はｔｅｒｔ−ブチルフェノキシ酢酸無水物を挙げることができる。キャップ化剤は、０．０５〜１Ｍの濃度になるように適当な溶媒で希釈して使用することもできる。溶媒としては、反応に関与しなければ特に限定されないが、ピリジン、ジクロロメタン、アセトニトリル、ＴＨＦ又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。また、本工程において必要に応じて、「反応促進剤」として、例えば、４−ジメチルアミノピリジン、Ｎ−メチルイミダゾールを使用することができる。上記反応における反応温度は、２０℃〜５０℃が好ましい。反応時間は、オリゴ核酸誘導体（２）の種類、使用するキャップ化剤の種類、反応温度等によって異なるが、通常１分〜３０分が適当である。使用する試薬の量は固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に対して０．８〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。
【００３２】
（４）工程Ｄ：
工程Ｂにおいて製造されるオリゴ核酸誘導体（７）に酸化剤を作用させることによって亜リン酸基をリン酸基又はチオリン酸基に変換する工程。
【化３１】
0005187189.tif 000032
式（７）及び（９）中、各ＢＸ、各Ｑ、各Ｒ４、各ＷＧ２は、それぞれ独立して、前記と同義である。Ｅ、ｎ、Ｒ１、Ｔは、前記と同義である。
本工程は、３価のリンから５価のリンに酸化剤を使用して変換する反応であり、固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に酸化剤を作用させることにより実施することができる。
リンを酸素で酸化する場合には、「酸化剤」として、例えば、ヨウ素、ｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシドを使用することができる。該酸化剤は、０．０５〜２Ｍの濃度になるように適当な溶媒で希釈して使用することができる。反応に使用する溶媒としては、反応に関与しなければ特に限定されないが、ピリジン、ＴＨＦ、水又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。例えば、ヨウ素／水／ピリジン―ＴＨＦあるいはヨウ素／ピリジン―酢酸や過酸化剤（ｔｅｒｔ−ブチルヒドロパーオキシド／メチレンクロリドなど）を用いることができる。
また、リンを硫黄で酸化する場合には、「酸化剤」として、例えば、硫黄、Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬（３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシド）、３−アミノ−１，２，４−ジチアゾール−５−チオン（ＡＤＴＴ）を使用することができる。該酸化剤は、０．０１〜２Ｍの濃度になるように適当な溶媒で希釈して使用することができる。反応に使用する溶媒としては、反応に関与しなければ特に限定されないが、例えば、ジクロロメタン、アセトニトリル、ピリジン又はこれらの任意の混合溶媒が挙げられる。
反応温度は、２０℃〜５０℃が好ましい。反応時間は、オリゴ核酸誘導体（７）の種類、使用する酸化剤の種類、反応温度等によって異なるが、通常１分〜３０分が適当である。使用する試薬の量は固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に対して０．８〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１０〜５０倍モル量である。
【００３３】
（５）工程Ｅ：
工程Ｄにおいて製造されるオリゴ核酸誘導体（９）を固相担体から切り出し、各核酸塩基部及び各リン酸基の保護基を脱離する工程。
【化３２】
0005187189.tif 000033
式（９）及び（１０）中、各Ｂ、各ＢＸ、各Ｑ、各Ｒ４、各ＷＧ２は、それぞれ独立して、前記と同義である。Ｅ、ｎ、Ｒ、Ｒ１、Ｔ、Ｚは、前記と同義である。
切り出し工程は、所望の鎖長のオリゴＲＮＡを切り出し剤によって、固相担体及びリンカーから外す反応であり、所望の鎖長のオリゴ核酸誘導体が担持された固体担体に切り出し剤を添加することにより実施することができる。本工程において、核酸塩基部の保護基を脱離することができる。
「切り出し剤」としては、例えば、濃アンモニア水、メチルアミンを挙げることができる。本工程に使用しうる「切り出し剤」は、例えば、水、メタノール、エタノール、イソプロピルアルコール、アセトニトリル、ＴＨＦ又はこれらの任意の混合溶媒で希釈して使用することもできる。なかでも、エタノールが好ましい。
反応温度は、１５℃〜７５℃が適当であり、好ましくは１５℃〜３０℃であり、より好ましくは１８℃〜２５℃である。脱保護反応時間は、オリゴ核酸誘導体（９）の種類、反応温度等によって異なるが、１０分〜３０時間が適当であり、好ましくは３０分〜２４時間であり、より好ましくは１〜４時間である。脱保護に使用される溶液中の水酸化アンモニウムの濃度は、２０〜３０重量％が適当であり、好ましくは２５〜３０重量％であり、より好ましくは２８〜３０重量％である。使用する試薬の量は、固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に対して１〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１０〜５０倍モル量である。
【００３４】
（６）工程Ｆ：
次の一般式（１０）で表されるオリゴ核酸誘導体に、ＴＢＡＦを作用させ、各リボースの２’位水酸基の保護基を脱離する工程において、ＴＨＦを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を反応溶媒として用いることによって、次の一般式（１１）で表されるオリゴ核酸誘導体を製造する工程。
【化３３】
0005187189.tif 000034
式（１０）及び（１１）中、各Ｂ、各Ｑ、各Ｒ、各Ｒ４は、それぞれ独立して、前記と同義である。ｎ、Ｒ１、Ｚは、前記と同義である。
本工程は、オリゴ核酸誘導体（１０）にＴＢＡＦを作用させることにより実施することができる。使用するＴＢＡＦの量は除去される保護基に対して１〜５００倍モル量が適当であり、好ましくは５〜１０倍モル量である。反応溶媒として、ＴＨＦを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を使用することができる。また、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒をＴＨＦとの混合溶媒として使用する場合、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒に対するＴＨＦの使用量は、０〜９５％が適当であり、好ましくは０〜５０％である。「ＴＨＦを含有していてもよい、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒（反応溶媒）」の使用量は、オリゴ核酸誘導体（１０）の種類や使用する反応溶媒等によって異なるが、ＴＢＡＦに対して、０．８〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。反応温度は、オリゴ核酸誘導体（１０）の種類や使用する反応溶媒等によって異なるが、２０℃〜８０℃が好ましい。反応時間は、オリゴ核酸誘導体（１０）、使用する反応溶媒や反応温度等によって異なるが、通常１時間〜１００時間が適当である。
また、必要であれば、本工程における副生成物であるアクリロニトリルを捕捉するために、アクリロニトリルの捕捉剤として、例えば、ニトロアルカン、アルキルアミン、アミジン、チオール、チオール誘導体又はこれらの任意の混合物を添加することができる。「ニトロアルカン」としては、直鎖状の炭素数１〜６のニトロアルカンを挙げることができる。具体的には、例えば、ニトロメタンを挙げることができる。例えば、「アルキルアミン」としては、例えば、直鎖状の炭素数１〜６のアルキルアミンを挙げることができる。具体的には、例えば、メチルアミン、エチルアミン、ｎ−プロピルアミン、ｎ−ブチルアミン、ｎ−ペンチルアミン、ｎ−ヘキシルアミンを挙げることができる。「アミジン」としては、例えば、ベンズアミジン、ホルムアミジンを挙げることができる。「チオール」としては、例えば、直鎖状の炭素数１〜６のチオールを挙げることができる。具体的には、例えば、メタンチオール、エタンチオール、１−プロパンチオール、１−ブタンチオール、１−ペンタンチオール、１−ヘキサンチオールを挙げることができる。「チオール誘導体」としては、例えば、同一又は異なる直鎖状の炭素数１〜６のアルキルチオール基を有するアルコール又はエーテルを挙げることができる。具体的には、例えば、２−メルカプトエタノール、４−メルカプト−１−ブタノール、６−メルカプト−１−ヘキサノール、メルカプトメチルエーテル、２−メルカプトエチルエーテル、３−メルカプトプロピルエーテル、４−メルカプトブチルエーテル、５−メルカプトペンチルエーテル、６−メルカプトヘキシルエーテルを挙げることができる。
「アクリロニトリルの捕捉剤」の使用量としては、オリゴ核酸誘導体（１０）の種類等によって異なるが、オリゴ核酸誘導体（１０）の各リボースの２’位水酸基を保護している２−シアノエトキシメチルに対して、０．１〜５００倍モル量が適当であり、好ましくは1〜１０倍モル量である。【００３５】
（７）工程Ｇ：
オリゴ核酸誘導体（１１）の５’位の水酸基を脱離する工程。
【化３４】
0005187189.tif 000035
式（１１）及び（Ａ）中、各Ｂ、各Ｑ、各Ｒは、それぞれ独立して、前記と同義である。ｎ、Ｒ１、Ｚは、前記と同義である。
本工程は、最終的にオリゴＲＮＡの５’位水酸基の保護基を脱離する反応であり、固体担体から切り出されたオリゴＲＮＡに酸を作用させることにより実施することができる。
本工程において使用しうる「酸」としては、例えば、トリクロロ酢酸、ジクロロ酢酸、酢酸を挙げることができる。本工程に使用しうる酸は、適当な溶媒で希釈して使用することもできる。溶媒としては、反応に関与しなければ特に限定されないが、ジクロロメタン、アセトニトリル、水、ｐＨが２〜５の緩衝液又はこれらの任意の混合溶媒を挙げることができる。緩衝液としては、例えば、酢酸緩衝液を挙げることができる。上記反応における反応温度は、２０℃〜５０℃が好ましい。反応時間は、オリゴ核酸誘導体（１１）の種類、使用する酸の種類、反応温度等によって異なるが、通常１分〜１時間が適当である。使用する試薬の量は固相担体に担持されているオリゴ核酸誘導体に対して０．８〜１００倍モル量が適当であり、好ましくは１〜１０倍モル量である。
【００３６】
（８）工程Ｈ：
工程Ｇにおいて製造されるオリゴＲＮＡ（Ａ）を分離精製する工程。
「分離精製工程」とは、上記反応混合物から通常の分離精製手段、例えば、抽出、濃縮、中和、濾過、遠心分離、再結晶、Ｃ８からＣ１８の逆相カラムクロマトグラフィー、Ｃ８からＣ１８逆相カートリッジカラム、陽イオン交換カラムクロマトグラフィー、陰イオン交換カラムクロマトグラフィー、ゲルろ過カラムクロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー、透析、限界ろ過などの手段を単独若しくは組み合わせて用いることにより、所望のオリゴＲＮＡを単離精製する工程である。
「溶出溶媒」としては、例えば、アセトニトリル、メタノール、エタノール、イソプロピルアルコール、水の単独溶媒もしくは任意の比率の混合溶媒を挙げることができる。この場合添加物として、例えば、リン酸ナトリウム、リン酸カリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、酢酸アンモニウム、酢酸トリエチルアンモニウム、酢酸ナトリウム、酢酸カリウム、トリス塩酸、エチレンジアミン四酢酸を１ｍＭ〜２Ｍの濃度で添加し、溶液のｐＨを１〜９の範囲で調整することもできる。
【００３７】
工程Ａ〜工程Ｄの操作を繰り返すことにより、所望の鎖長のオリゴＲＮＡ（Ａ）を製造することができる。なお、本製法においてオリゴＲＮＡ（Ａ）を製造するための出発原料として、Ｒ４ａが置換基（４）である化合物（２７ａ）、Ｒ４ａがＨ若しくはアシルオキシである核酸誘導体（２７ａ）、又はＲ２がアシルである核酸誘導体（２７ｂ）等を使用することができる。但し、出発原料として、Ｒ４ａがＨ若しくはアシルオキシである核酸誘導体（２７ａ）、又はＲ２がアシルオキシである核酸誘導体（２７ｂ）を使用した場合、核酸モノマー化合物として、少なくとも１つは本発明ホスホロアミダイト化合物を使用する必要がある。
【実施例】
【００３８】
以下に参考例、実施例を揚げて本発明を更に詳しく説明するが、本発明はこれらのみに限定されない。
【００３９】
参考例１  クロロメチル  ２−シアノエチルエーテル
工程１  メチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテルの製造
３−ヒドロキシプロピオニトリル３２ｇ（４５０ｍｍｏｌ）をジメチルスルホキシド４５０ｍｌに溶解し、無水酢酸３２４ｍＬ、酢酸２３１ｍＬを加え室温で２４時間攪拌した。炭酸水素ナトリウム９９０ｇを水４．５Ｌに溶解したものを調製し、これに反応液を一時間かけて滴下した。そのまま一時間攪拌し、反応液を酢酸エチルにて抽出し、無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し得られた油状物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、無色油状物のメチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテルを４１ｇ得た（収率７０％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ２．１８（ｓ，３Ｈ）；２．６６（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ）；３．７７（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ）；４．６９（ｓ，２Ｈ）
工程２  クロロメチル  ２−シアノエチルエーテルの製造
工程１で得られたメチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテル３．３ｇ（２５ｍｍｏｌ）を７０ｍＬの塩化メチレンに溶解させ、氷冷下２ｍＬ（２５ｍｍｏｌ）の塩化スルフリルを滴下し、さらに室温にて一時間反応させた。反応後、溶媒を留去し真空中にて蒸留し、目的化合物を無色油状物として２．５ｇ得た（収率８５％）。
沸点：８４−８５℃（０．３Ｔｏｒｒ）
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ２．７２（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ）；３．９２（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ）；５．５２（ｓ，２Ｈ）
【００４０】
参考例２  ５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）
工程１  ５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジンの製造
５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）ウリジン５４６ｍｇ（１ｍｍｏｌ）を１，２−ジクロロエタン４ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン４５２ｍｇ（３．５ｍｍｏｌ）を加え、ついで３６５ｍｇ（１．２ｍｍｏｌ）の二塩化ジブチルスズを加えた後、室温で一時間反応した。その後８０℃にしクロロメチル  ２−シアノエチルエーテル１５５．４ｍｇ（１．３ｍｍｏｌ）を滴下、そのまま３０分間攪拌した。反応終了後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液に反応液を加え塩化メチレンにて抽出を行い無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物を３０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジンを得た（１９７ｍｇ；収率３４％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ２．４７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．８Ｈｚ）；２．６９（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ）；３．５５（ｄｄ，１Ｈ，１１．３，２．２Ｈｚ）；３．６２（ｄｄ，１Ｈ，１１．３，２．２Ｈｚ）；３．８３（ｓ，６Ｈ）；３．８７（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．３Ｈｚ）；４．０７−４．０８（ｍ，１Ｈ）；４．３２（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．３，１．９Ｈｚ）；４．５４（ｑ，１Ｈ，Ｊ＝５．３Ｈｚ）；４．９４，５．１１（２ｄ，２Ｈ，Ｊ＝６．９Ｈｚ）；５．３２（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ）；６．００（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝１．９Ｈｚ）；６．８５−６．８８（ｍ，４Ｈ）；７．２９−７．４１（ｍ，９Ｈ）；８．０２（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ）；８．５３（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：６５２［Ｍ＋Ｎａ］＋
工程２  ５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）の製造
工程１で得られた５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン２０９ｍｇ（０．３３２ｍｍｏｌ）、テトラゾール２３ｍｇ（０．３３２ｍｍｏｌ）をアセトニトリル２ｍＬに溶解し１５０ｍｇの（０．４９８ｍｍｏｌ）の２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトライソプロピルホスホロジアミダイトを滴下し、４５℃で１．５時間反応させた。反応後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え酢酸エチルにて抽出し、無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し得られた混合物を２０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（２００ｍｇ；収率７３％）。
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：８５２［Ｍ＋Ｎａ］＋
【００４１】
参考例３  ２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン
工程１  ３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジンの製造
３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）ウリジン１５０ｍｇ（０．３ｍｍｏｌ）をアルゴン雰囲気下ＴＨＦ７ｍＬに溶解し、メチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテル５４ｍｇ（０．４ｍｍｏｌ）、モレキュラーシーブス４Ａ１００ｍｇを加え、１０分攪拌した。０℃にしトリフルオロメタンスルホン酸１０ｍｇ（０．０６ｍｍｏｌ）のＴＨＦ２ｍＬ溶液を加え攪拌した後、Ｎ−ヨードスクシンイミド９２ｍｇ（０．４ｍｍｏｌ）を加え、１時間攪拌した。反応液をセライトろ過し、塩化メチレンにて洗浄した後、有機相を１Ｍのチオ硫酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄し、無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去した。得られた残渣を薄層クロマトグラフィーにて精製し、３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジンを得た（１５０ｍｇ；収率８５％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ０．９７−１．１２（ｍ，２８Ｈ）；２．６８−２．７３（ｍ，２Ｈ）；３．７８−３．８６（ｍ，１Ｈ）；３．９６−４．０５（ｍ，２Ｈ）；４．１２−４．３０（ｍ，４Ｈ）；５．０−５．０４（ｍ，２Ｈ）；５．７０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ）；５．７５（ｓ，１Ｈ）；７．９０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．２Ｈｚ）；９．６２（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：５７０［Ｍ＋Ｈ］＋
工程２  ２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジンの製造
工程１で得られた３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン２００ｍｇ（０．３５ｍｍｏｌ）をメタノール２ｍＬに溶解し、フッ化アンモニウム６５ｍｇ（１．７６ｍｍｏｌ）を加え５０℃にて５時間加熱攪拌した。放冷後アセトニトリルを加え攪拌し、ろ過濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（１０８ｍｇ；収率９４％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤ３ＯＤ）：  ２．７２−２．７６（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．２Ｈｚ）；３．６８−３．９２（ｍ，４Ｈ）；４．００−４．０３（ｍ，１Ｈ）；４．２６−４．３２（ｍ，２Ｈ）；４．８１−４．９５（ｍ，２Ｈ）；５．７１（ｄ，１Ｈ，  Ｊ＝８．１Ｈｚ）；６．００（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝３．３Ｈｚ）；８．１０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．１Ｈｚ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：３５０［Ｍ＋Ｎａ］＋
【００４２】
参考例４  ５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジンの製造
２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン１４ｇ（４３ｍｍｏｌ）をピリジンで共沸し真空ポンプで３０分乾燥した。ＴＨＦ３００ｍＬに溶解し、アルゴン雰囲気下ピリジン６８ｇ（８５６ｍｍｏｌ）、モレキュラーシーブス４Ａ２０ｇを加え１０分攪拌した。これに４，４’−ジメトキシトリチルクロリド１９．６ｇ（５７．８ｍｍｏｌ）を３回に分けて１時間ごとに加え、さらに１時間攪拌した。メタノール１０ｍＬを加え２分攪拌した後、セライトろ過し酢酸エチルにて洗浄した。ろ液を濃縮後、残渣を酢酸エチルに溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と分液した。有機相を飽和塩化ナトリウム水溶液にて洗浄、無水硫酸マグネシウムにて乾燥後溶媒留去した。得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（２６．５ｇ；収率９８％）。
【００４３】
参考例５  Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）
工程１  Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジンの製造
Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）シチジン５８８ｍｇ（１ｍｍｏｌ）を１，２−ジクロロエタン４ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン４５２ｍｇ（３．５ｍｍｏｌ）を加え、ついで３６５ｍｇ（１．２ｍｍｏｌ）の二塩化ジブチルスズを加えた後、室温で一時間反応した。その後８０℃にしクロロメチル  ２−シアノエチルエーテル１５５．４ｍｇ（１．３ｍｍｏｌ）を滴下、そのまま６０分間攪拌した。反応終了後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液に反応液を加え塩化メチレンにて抽出を行い無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物を３０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジンを得た（２１９ｍｇ；収率３５％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ２．１９（ｓ，３Ｈ）；２．５６（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．８Ｈｚ）；２．６５（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．２Ｈｚ）；３．５５（ｄｄ，１Ｈ，１０．５，２．５Ｈｚ）；３．６３（ｄｄ，１Ｈ，１０．５，２．５Ｈｚ）；３．８２（ｓ，６Ｈ）；３．８６（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．２Ｈｚ）；４．０９−４．１４（ｍ，１Ｈ）；４．２８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．１Ｈｚ）；４．４４−４．４９（ｍ，１Ｈ）；４．９７，５．２４（２ｄ，２Ｈ，Ｊ＝６．９Ｈｚ）；５．９６（ｓ，１Ｈ）；６．８６−６．８８（ｍ，４Ｈ）；７．０９（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝６．９Ｈｚ）；７．２６−７．４２（ｍ，９Ｈ）；８．４８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝６．９Ｈｚ）；８．５９（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：６９３［Ｍ＋Ｎａ］＋
工程２  Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）の製造
工程１で得られたＮ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）  シチジン２０５ｍｇ（０．３０６ｍｍｏｌ）を塩化メチレン２ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン１０５ｍｇ（０．８１２ｍｍｏｌ）を加え２−シアノエチルＮ，Ｎ−ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト１１６ｍｇ（０．４９ｍｍｏｌ）を滴下し、室温で１時間反応させた。反応後、溶媒を留去し得られた混合物を２０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（２４２ｍｇ；収率９１％）。
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：８７１［Ｍ＋Ｈ］＋
【００４４】
参考例６  Ｎ４−アセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジン
工程１  Ｎ４−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジンの製造
Ｎ４−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）シチジン１．００ｇ（１．８９ｍｍｏｌ）とメチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテル５００ｍｇ（３．７９ｍｍｏｌ）を混合し、トルエン１０ｍＬとＴＨＦ１０ｍＬの混合溶媒に溶解した。ついでトリフルオロメタンスルホン酸銀９７５ｍｇ（３．７９ｍｍｏｌ）を加え、モレキュラーシーブス４Ａを加え、乾燥した。氷冷下、Ｎ−ブロモスクシンイミド３７０ｍｇ（２．０８ｍｍｏｌ）を加え、反応容器を遮光し、１０分間撹拌した。さらにＮ−ブロモスクシンイミド７０ｍｇ（０．３９ｍｍｏｌ）を追加し、２５分間撹拌した。反応終了後、塩化メチレンを加えて希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄を行い、無水硫酸ナトリウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ４−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジンを得た。（９３６ｍｇ；収率８１％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ０．９０−１．１１（ｍ，２８Ｈ）；２．２８（ｓ，３Ｈ）；２．６２−２．７９（ｍ，２Ｈ）；３．７８−３．８９（ｍ，１Ｈ）；３．９６−４．０４（ｍ，２Ｈ）；４．１９−４．２３（ｍ，３Ｈ）；４．３０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝１３．６Ｈｚ）；５．００（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝６．８Ｈｚ）；５．０９（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝６．８Ｈｚ）；５．７７（ｓ，１Ｈ）；７．４４（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．５Ｈｚ）；８．３０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．５Ｈｚ）；１０．１３（ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：６１１［Ｍ＋Ｈ］＋
工程２  Ｎ４−アセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジンの製造
工程１で得られたＮ４−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジン５００ｍｇ（０．８１９ｍｍｏｌ）をＴＨＦ２．５ｍＬとメタノール２．５ｍＬの混合溶媒に溶解し、フッ化アンモニウム１５０ｍｇ（４．１０ｍｍｏｌ）を加え、５０℃で４時間反応させた。反応終了後、アセトニトリルにて希釈、濾過し、溶媒を留去し得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（２１０ｍｇ；収率７０％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（Ｄ２Ｏ）：  ２．１３（ｓ，３Ｈ）；２．６６−２．７１（ｍ，２Ｈ）；３．７２−３．７８（ｍ，３Ｈ）；３．９０（ｄｄ，１Ｈ，１３．０，２．６Ｈｚ）；４．０６−４．１１（ｍ，１Ｈ）；４．２０（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．１，５．２Ｈｚ）；４．２９（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．１，２．９Ｈｚ）；４．８３（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．２Ｈｚ）；４．９４（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．２Ｈｚ）；５．９５（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝２．９Ｈｚ）；７．２５（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．６Ｈｚ）；８．２５（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．６Ｈｚ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：３９１［Ｍ＋Ｎａ］＋
【００４５】
参考例７  Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジンの製造
２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジン９．９ｇ（２６．８ｍｍｏｌ）をピリジンで共沸し真空ポンプで３０分乾燥した。ＴＨＦ１９０ｍＬに溶解し、アルゴン雰囲気下ピリジン４３ｇ（５３８ｍｍｏｌ）、モレキュラーシーブス４Ａ２０ｇを加え１０分攪拌した。これに４，４’−ジメトキシトリチルクロリド１１．８ｇ（３４．９ｍｍｏｌ）を３回に分けて１時間ごとに加え、さらに１時間攪拌した。メタノール２ｍＬを加え２分攪拌した後、セライトろ過し酢酸エチルにて洗浄した。ろ液をエバポレーターで濃縮後残渣を酢酸エチルに溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と分液した。有機相を飽和塩化ナトリウム水溶液にて洗浄、無水硫酸マグネシウムにて乾燥後溶媒留去した。得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（１５ｇ；収率８３％）。
【００４６】
参考例８  Ｎ２−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）
工程１  Ｎ２−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンの製造
Ｎ２−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシン６２７ｍｇ（１ｍｍｏｌ）を１，２−ジクロロエタン４ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン４５２ｍｇ（３．５ｍｍｏｌ）を加え、ついで３６５ｍｇ（１．２ｍｍｏｌ）の二塩化ジブチルスズを加えた後、室温で一時間反応した。その後８０℃にしクロロメチル  ２−シアノエチルエーテル１５５．４ｍｇ（１．３ｍｍｏｌ）を滴下、そのまま６０分間攪拌した。反応終了後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液に反応液を加え塩化メチレンにて抽出を行い無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物を３０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ２−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンを得た（４５０ｍｇ；収率６３％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  １．９２（ｓ，３Ｈ）；２．４７−２．５１（ｍ，２Ｈ）；２．６８（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）；３．３０（ｄｄ，１Ｈ，１０．７，３．８Ｈｚ）；３．４７（ｄｄ，１Ｈ，１０．７，３．８Ｈｚ）；３．５５−３．６０（ｍ，１Ｈ）；３．６５−３．７０（ｍ，１Ｈ）；３．７４，３．７５（２ｓ，６Ｈ）；４．２２−４．２３（ｍ，１Ｈ）；４．５５−４．５８（ｍ，１Ｈ）；４．７８，４．８３（２ｄ，２Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ）；５．０１（ｔ，１Ｈ，Ｊ＝５．１Ｈｚ）；５．９９（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．１Ｈｚ）；６．７６−６．７９（ｍ，４Ｈ）；７．１７−７．４４（ｍ，９Ｈ）；７．８８（ｓ，１Ｈ）；８．３６（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）；１２．０６（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）
工程２  Ｎ２−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）の製造
工程１で得られたＮ２−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン４００ｍｇ（０．５６３ｍｍｏｌ）を塩化メチレン２ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン１８１ｍｇ（１．４ｍｍｏｌ）を加え２−シアノエチルＮ，Ｎ−ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト１６１ｍｇ（０．６８ｍｍｏｌ）を滴下し、室温で１時間反応させた。反応後、溶媒を留去し得られた混合物を２０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（４７１ｍｇ；収率９２％）。
【００４７】
参考例９  Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）
工程１  Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンの製造
Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）アデノシン２２．０ｇ（３６．０ｍｍｏｌ）を１，２−ジクロロエタン１７０ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン１６．３ｇ（１２６ｍｍｏｌ）を加え、ついで１２．１ｇ（３９．７ｍｍｏｌ）の二塩化ジブチルスズを加えた後、室温で一時間反応した。その後８０℃にし１５分間撹拌後、クロロメチル  ２−シアノエチルエーテル４．３０ｇ（３６．０ｍｍｏｌ）を滴下、そのまま３０分間撹拌した。反応終了後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液に反応液を加え塩化メチレンにて抽出を行い無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンを得た。（７．４７ｇ；収率３３％）
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ２．５１（ｔ，２Ｈ，Ｊ＝６．２Ｈｚ）；２．５８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．５Ｈｚ）；２．６１（ｓ，３Ｈ）；３．４５（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝１０．７，４．０Ｈｚ）；３．５４（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝１０．７，３．２Ｈｚ）；３．６２−３．７９（ｍ，２Ｈ）；３．７９（ｓ，６Ｈ）；４．２５（ｂｒ．ｑ，１Ｈ，Ｊ〜４．６Ｈｚ）；４．５９（ｑ，１Ｈ，Ｊ＝５．２Ｈｚ）；４．８７−４．９４（ｍ，３Ｈ）；６．２３（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝４．４Ｈｚ）；６．８０−６．８３（ｍ，４Ｈ）；７．２２−７．３２（ｍ，７Ｈ）；７．４０−７．４３（ｍ，２Ｈ）；８．２０（ｓ，１Ｈ）；８．６１（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）；８．６２（ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：６９５［Ｍ＋Ｈ］＋
工程２  Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）の製造
工程１で得られたＮ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン１０．０ｇ（１４．４ｍｍｏｌ）を塩化メチレン７５ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン４．７ｇ（３６ｍｍｏｌ）を加え２−シアノエチルＮ，Ｎ−ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト４．８２ｇ（２０．３ｍｍｏｌ）を滴下し、室温で１時間反応させた。反応後、溶媒を３０ｍＬ程度残して留去し得られた反応混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（１２．０ｇ；収率９３％）。
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：８９５［Ｍ＋Ｈ］＋
【００４８】
参考例１０  Ｎ６−アセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン
工程１  Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンの製造
Ｎ−ヨードスクシンイミド２４５ｍｇ（１．０９ｍｍｏｌ）とトリフルオロメタンスルホン酸銀２８０ｍｇ（１．０９ｍｍｏｌ）を塩化メチレン８ｍＬに懸濁させ、モレキュラーシーブス４Ａを加え、乾燥した。ここに、Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）アデノシン４００ｍｇ（０．７３ｍｍｏｌ）とメチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテル１４５ｍｇ（１．１１ｍｍｏｌ）を塩化メチレン４ｍＬに溶解し、氷冷下で加えた。そのまま３時間撹拌した。反応終了後、塩化メチレンを加えて希釈し、チオ硫酸ナトリウム水溶液と飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄を行い、無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンを得た。（２０１ｍｇ；収率４５％）
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ０．９８−１．１１（ｍ，２８Ｈ）；２．６２（ｓ，３Ｈ）；２．６９（ｔｄ，２Ｈ，６．５，Ｊ＝１．５Ｈｚ）；３．８１−３．８９（ｍ，１Ｈ）；４．０２−４．０９（ｍ，２Ｈ）；４．１７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝９．４Ｈｚ）；４．２８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝１３．４Ｈｚ）；４．５０（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝４．５Ｈｚ）；４．６７（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝８．８，４．５Ｈｚ）；５．０２（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ）；５．０８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ）；６．１０（ｓ，１Ｈ）；８．３４（ｓ，１Ｈ）；８．６６（ｓ，１Ｈ）；８．６７（ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：６３６［Ｍ＋Ｈ］＋
工程２  Ｎ６−アセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンの製造
工程１で得られたＮ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン３００ｍｇ（０．４７ｍｍｏｌ）を、酢酸０．１ｍＬと０．５Ｍ  ＴＢＡＦのＴＨＦ溶液２ｍＬの混合溶液に溶解し、室温で２時間撹拌した。反応終了後、得られた反応混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た。（１６０ｍｇ；収率８６％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＤＭＳＯ−ｄ６）：  ２．２５（ｓ，３Ｈ）；２．５３−２．６８（ｍ，２Ｈ）；３．４１−３．４６（ｍ，１Ｈ）；３．５６−３．６４（ｍ，２Ｈ）；３．６９−３．７３（ｍ，１Ｈ）；４．００−４．０１（ｍ，１Ｈ）；４．３６−４．３７（ｍ，１Ｈ）；４．７２−４．７８（ｍ，３Ｈ）；５．２０（ｂｔ，２Ｈ）；５．４１（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．２Ｈｚ）；６．１７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．７Ｈｚ）；８．６６（ｓ，１Ｈ）；８．７２（ｓ，１Ｈ）；１０．７２（ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：４１５［Ｍ＋Ｎａ］＋
【００４９】
参考例１１  Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンの製造
Ｎ６−アセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン９．５０ｇ（２４．２ｍｍｏｌ）を脱水ピリジン１００ｍＬに溶解し、濃縮して乾燥した後、アルゴン雰囲気下、脱水ピリジン１００ｍＬに溶解した。氷冷下、４，４’−ジメトキシトリチルクロリド１０．７ｇ（３１．２ｍｍｏｌ）を加え、室温で１時間２０分反応した。反応終了後、塩化メチレンにて希釈し、水にて洗浄を行い無水硫酸ナトリウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た。（１３．８ｇ；収率８２％）
【００５０】
参考例１２  Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）
工程１  Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンの製造
Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）グアノシン７２０ｍｇ（１ｍｍｏｌ）を１，２−ジクロロエタン４ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン４５２ｍｇ（３．５ｍｍｏｌ）を加え、ついで３６５ｍｇ（１．２ｍｍｏｌ）の二塩化ジブチルスズを加えた後、室温で一時間反応した。その後８０℃にしクロロメチル  ２−シアノエチルエーテル１５５．４ｍｇ（１．３ｍｍｏｌ）を滴下、そのまま６０分間攪拌した。反応終了後、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液に反応液を加え塩化メチレンにて抽出を行い無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物を３０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンを得た（３８４ｍｇ；収率４８％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ２．４７−２．５１（ｍ，２Ｈ）；２．５８（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）；３．４２（ｄｄ，１Ｈ，１０．１，３．８Ｈｚ）；３．４６（ｄｄ，１Ｈ，１０．１，３．８Ｈｚ）；３．５３−３．５７（ｍ，１Ｈ）；３．６９−３．７３（ｍ，１Ｈ）；３．７７（ｓ，６Ｈ）；４．２４−４．２６（ｍ，１Ｈ）；４．４８−４．５０（ｍ，１Ｈ）；４．６１−４．６５（ｍ，２Ｈ）；４．８３，４．８７（２ｄ，２Ｈ，Ｊ＝７．０Ｈｚ）；４．８８（ｔ，１Ｈ，Ｊ＝５．７Ｈｚ）；６．０５（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝５．７Ｈｚ）；６．８０−６．８２（ｍ，４Ｈ）；６．９２−６．９６（ｍ，３Ｈ）；７．０７−７．１１（ｍ，２Ｈ）；７．２０−７．４２（ｍ，９Ｈ）；７．８４（ｓ，１Ｈ）；８．９９（ｓ，１Ｈ）；１１．８１（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：８２５［Ｍ＋Ｎａ］＋
工程２  Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイトの製造
工程１で得られたＮ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン３２０ｍｇ（０．３９９ｍｍｏｌ）を塩化メチレン４ｍＬに溶解し、ジイソプロピルエチルアミン１２８．８ｍｇ（０．９９６ｍｍｏｌ）を加え２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルクロロホスホロアミダイト１４１．５ｍｇ（０．５９８ｍｍｏｌ）を滴下し、室温で１時間反応させた。反応後、溶媒を留去し得られた混合物を３０ｇのシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（３１６ｍｇ；収率７９％）。
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：１００３［Ｍ＋Ｈ］＋
【００５１】
参考例１３  Ｎ２−フェノキシアセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン
工程１  Ｎ２−フェノキシアセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンの製造
Ｎ２−フェノキシアセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）グアノシン２．０ｇ（３．０ｍｍｏｌ）をＴＨＦ１６ｍＬに溶解し、メチルチオメチル  ２−シアノエチルエーテル０．９９ｇ（７．６ｍｍｏｌ）、モレキュラーシーブス４Ａ１．０ｇを加え、アルゴン雰囲気下−４５℃で１０分攪拌した。トリフルオロメタンスルホン酸０．６８ｇ（４．５ｍｍｏｌ）のＴＨＦ５ｍＬ溶液を加え攪拌した後、Ｎ−ヨードスクシンイミド１．０２ｇ（４．５ｍｍｏｌ）を加え、１５分攪拌した。反応液に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、ろ過後酢酸エチルにて抽出、有機相を１Ｍのチオ硫酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄、水、次いで飽和塩化ナトリウム水溶液にて洗浄し、無水硫酸マグネシウムにて乾燥、溶媒留去した。得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ２−フェノキシアセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンを得た（２．０ｇ；収率８９％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ０．９９−１．１１（ｍ，２８Ｈ）；２．５９−２．７７（ｍ，２Ｈ）；３．８２−４．０５（ｍ，３Ｈ）；４．１５（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝９．３Ｈｚ）；４．２５−４．３５（ｍ，２Ｈ）；４．５２−４．５６（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝９．３，４．３Ｈｚ）；５．００，５．０７（２ｄ，２Ｈ，Ｊ＝７．２Ｈｚ）；５．９５（ｓ，１Ｈ）６．９９−７．１２（ｍ，３Ｈ）；７．３５−７．４０（ｍ，２Ｈ）；８．０９（ｓ，１Ｈ）；９．３８（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）；１１．８５（ｂｒ．ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：７６６［Ｍ＋Ｎａ］＋
工程２  Ｎ２−フェノキシアセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンの製造
１Ｍ  ＴＢＡＦのＴＨＦ溶液２．８３ｍＬ（２．８３ｍｍｏｌ）に酢酸０．１４ｍＬ（０．１４ｍｍｏｌ）を加えた溶液を調整する。工程１で得られたＮ２−フェノキシアセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン１．０ｇ（１．３５ｍｍｏｌ）をＴＨＦ２．８３ｍＬに溶解し、上で調整した溶液を加えアルゴン雰囲気下室温で１時間攪拌した。反応液を減圧下濃縮後、塩化メチレンに溶解しシリカゲルクロマトグラフィーにのせ精製し、目的化合物を得た。（０．６７ｇ；収率９９％）。
１Ｈ−ＮＭＲ（ＤＭＳＯ−ｄ６）：  ２．５９−２．６６（ｍ，２Ｈ）；３．４１−３．６３（ｍ，４Ｈ）；３．９８（ｍ，１Ｈ）；４．３２（ｍ，１Ｈ）；４．５８−４．６２（ｔ，１Ｈ，Ｊ＝５．３Ｈｚ）；４．７１−４．７８（ｄｄ，２Ｈ，Ｊ＝１３．１，６．８Ｈｚ）；４．８７（ｓ，２Ｈ）；５．１２（ｓ，１Ｈ）５．３７（ｓ，１Ｈ）；５．９７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝６．１Ｈｚ）６．９６−６．９９（ｍ，３Ｈ）；７．２８−７．３４（ｍ，２Ｈ）；８．３０（ｓ，１Ｈ）；１１．７８（ｂｒ．ｓ，２Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：５００［Ｍ−Ｈ］−
【００５２】
参考例１４  Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシンの製造
Ｎ２−フェノキシアセチル−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン６６０ｍｇ（１．３２ｍｍｏｌ）をピリジンで共沸し真空ポンプで３０分乾燥した。ＴＨＦ９ｍＬに溶解し、アルゴン雰囲気下ピリジン２．１ｇ（２６．４ｍｍｏｌ）、モレキュラーシーブス４Ａ６００ｍｇを加え１０分攪拌した。これに４，４’−ジメトキシトリチルクロリド５４０ｍｇ（１．５８ｍｍｏｌ）を３回に分けて１時間ごとに加え、さらに１時間攪拌した。メタノール２ｍＬを加え２分攪拌した後、セライトろ過し酢酸エチルにて洗浄した。ろ液をエバポレーターで濃縮後残渣を酢酸エチルに溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液と分液した。有機相を飽和塩化ナトリウム水溶液にて洗浄、無水硫酸マグネシウムにて乾燥後溶媒留去した。得られた残渣をシリカゲルクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た（８００ｍｇ；収率７５％）。
【００５３】
参考例１５  Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン
工程１  Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−メチルチオメチルアデノシンの製造
Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）アデノシン２．００ｇ（３．６２ｍｍｏｌ）をジメチルスルホキシド２５ｍＬに溶解し、無水酢酸１７．５ｍＬ、酢酸１２．５ｍＬを加え室温で１４時間撹拌した。反応終了後、水２００ｍＬに反応液を加え、酢酸エチルにて抽出を行い、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄を行い、無水硫酸ナトリウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−メチルチオメチルアデノシンを得た。（１．３６ｇ；収率６１％）
１Ｈ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ３）：  ０．９６−１．１１（ｍ，２８Ｈ）；２．２０（ｓ，３Ｈ）；２．６１（ｓ，３Ｈ）；４．０３（ｄｄ，１Ｈ，Ｊ＝１３．４，２．４Ｈｚ）；４．１８（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝９．１Ｈｚ）；４．２７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝１３．４Ｈｚ）；４．６３−４．７１（ｍ，２Ｈ）；５．００（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝１１．５Ｈｚ）；５．０７（ｄ，１Ｈ，Ｊ＝１１．５Ｈｚ）；６．０９（ｓ，１Ｈ）；８．３１（ｓ，１Ｈ）；８．６５（ｓ，１Ｈ）；８．６９（ｓ，１Ｈ）
ＥＳＩ−Ｍａｓｓ：６３５［Ｍ＋Ｎａ］＋
工程２  Ｎ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシンの製造
工程１で得られたＮ６−アセチル−３’，５’−Ｏ−（テトライソプロピルジシロキサン−１，３−ジイル）−２’−Ｏ−メチルチオメチルアデノシン１．００ｇ（１．６３ｍｍｏｌ）を、ＴＨＦ２５ｍＬに溶解した。３−ヒドロキシプロピオニトリル５．８８ｇ（８２．７ｍｍｏｌ）を加え、モレキュラーシーブス４Ａを加えて乾燥し、−４５℃に冷却した。Ｎ−ヨードスクシンイミド４４０ｍｇ（１．９６ｍｍｏｌ）を加え、ついでトリフルオロメタンスルホン酸４９０ｍｇ（３．２６ｍｍｏｌ）を加えた後、−４５℃で１５分間撹拌した。反応終了後、冷却したままトリエチルアミンを加えて中和し、塩化メチレンにて希釈、チオ硫酸ナトリウム水溶液と飽和炭酸水素ナトリウム水溶液にて洗浄を行い、無水硫酸ナトリウムにて乾燥、溶媒留去し、得られた混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにて精製し、目的化合物を得た。（７２２ｍｇ；収率７１％）。
【００５４】
参考例１６  ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジン
市販の２’／３’−Ｏ−ベンゾイル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）ウリジンが担持されているＣＰＧ固相担体（３７ｍｇ，１μｍｏｌ）をグラスフィルター付きカラムに入れ、核酸自動合成機（ＥｘｐｅｄｉｔｅＴＭ：アプライドバイオシステムズ社）を使用して、標記化合物のオリゴＲＮＡの合成を行った。
核酸モノマー化合物として、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）を、縮合触媒としてテトラゾールを、酸化剤としてヨウ素溶液を、キャッピング溶液として無水酢酸とＮ−メチルイミダゾール溶液を使用した。核酸モノマー化合物を２０回縮合させた後、切り出し剤として１０Ｍのメチルアミンのエタノール水溶液を用いて、室温中１〜２時間かけてＣＰＧ固相担体からの切り出し及び各リン酸部位の保護基の脱離反応を行った。反応混合物を減圧下、濃縮後、逆相カラム（ＯＤＳ）にて不要ピークを除去後、溶出溶媒（アセトニトリル−５０ｍＭ  トリエチルアミン−酢酸緩衝液）を用いて精製した。残渣を減圧下濃縮後、１Ｍ  ＴＢＡＦのＴＨＦ溶液を用いて室温１時間反応し、２’位の水酸基の保護基を脱離した。溶液を脱塩処理後、８０％酢酸にて５’末端の保護基を除去した（室温下１０分）。減圧下濃縮後、水層をエーテル洗浄し、精製をすることなく、高純度の目的化合物を得た。
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳ：計算値  ６３６７．５２  ［Ｍ＋Ｈ］＋
実測値  ６３６６．５０  ［Ｍ＋Ｈ］＋
【００５５】
参考例１７  ホスホロチオエート結合を有するオリゴＲＮＡの製造
シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−チミジリル−〔３’→５’〕−チミジン
市販の５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジンが担持されているＣＰＧ固相担体（２２ｍｇ，１μｍｏｌ）をグラスフィルター付きカラムに入れ、核酸自動合成機（ＥｘｐｅｄｉｔｅＴＭ：アプライドバイオシステムズ社）を使用して、標記化合物のオリゴＲＮＡの合成を行った。
核酸モノマー化合物として、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）ウリジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）、Ｎ４−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）シチジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）、Ｎ６−アセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）アデノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）、Ｎ２−フェノキシアセチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−２’−Ｏ−（２−シアノエトキシメチル）グアノシン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）、５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）シチジン  ３’−Ｏ−（２−シアノエチル  Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト）を、縮合剤としてベンジルメルカプトテトラゾールを、酸化剤としてＢｅａｕｃａｇｅ試薬（３Ｈ−１，２−ベンゾジチオール−３−オン−１，１−ジオキシド）を、キャッピング溶液としてフェノキシ酢酸無水物とＮ−メチルイミダゾール溶液を使用した。核酸モノマー化合物を２０回縮合させた後、切り出し剤として、濃アンモニア水−エタノール混合液（３：１）を用いて、４０℃、４時間かけてＣＰＧ固相担体からの切り出し及び各リン酸部位の保護基の脱離反応及び塩基の保護基の除去を行った。反応混合物を減圧下、濃縮後、２.５μＬのニトロメタンを含む０.５Ｍ  ＴＢＡＦのＤＭＳＯ溶液５００μＬを用いて室温２時間反応し、２’位の水酸基の保護基を脱離した。２５０μＬの１Ｍ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ緩衝液（ｐＨ７．５）を加えたのち、８ｍＬのエタノールに滴下し、反応生成物を沈殿させた。終夜、冷蔵庫に保存した後、上澄みを除去し、ＯＤＳカラム（ＬｉＣｈｒｏｐｒｅｐ  ＲＰ−１８）にて精製した。８０％酢酸水溶液にて４，４’−ジメトキシトリチルを脱保護し、酢酸エチルと水にて分液操作を行い、水層を濃縮し、目的化合物を得た（８０ＯＤ２６０；収率４０％）。
ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ−ＭＳ：計算値  ６９２８．４  ［Ｍ＋Ｈ］＋
実測値  ６９３０．１  ［Ｍ＋Ｈ］＋
【００５６】
試験例１  アミド系溶媒の脱保護効果
市販の５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジンが担持されているＣＰＧ固相担体（３３３ｍｇ，１５μｍｏｌ）をフィルター付きカラムに入れ、核酸自動合成機（ＥｘｐｅｄｉｔｅＴＭ：アプライドバイオシステムズ社）を使用して、固相上でアデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−チミジンの合成を行い、固相上で、４，４’−ジメトキシトリチルを脱離した。オリゴＲＮＡ２μｍｏｌ分のレジンに対し、切り出し剤として、濃アンモニア水−エタノール混合液（３：１）６ｍＬを用いて、４０℃、４時間かけてＣＰＧ固相担体からの切り出し及び各リン酸部位の保護基の脱離反応及び塩基の保護基の除去を行った。反応混合物を１０等分し減圧下濃縮し、下記表１に記載の脱保護条件において、各リボースの２’位水酸基の保護基を脱離する反応を行った。但し、各反応において、１００μｍｏｌのＴＢＡＦにつき、１μＬのニトロメタンを添加した。反応溶液量と同量の１ＭのＴｒｉｓ−ＨＣｌ緩衝液（ｐＨ７．５）を加えたのち、各オリゴＲＮＡをＨＰＬＣにて分析した。
ＨＰＬＣにおける測定条件は、以下のとおりである。
測定条件：
ＨＰＬＣ  装置  
送液ユニット：ＬＣ−１０ＡＴ（島津製作所社製）
検出器：ＳＰＤ−１０Ａ（島津製作所社製）
逆相ＨＰＬＣカラム
ＤＮＡＰａｃ  ＰＡ１００＜４ｍｍφｘ２５０ｍｍ＞（ＤＩＯＮＥＸ社製）
カラム温度  ：５０℃
移動相
グラジエント：リニアグラジエント２０分（Ｂ液：５％−２５％）
Ａ液：１０％アセトニトリルを含む２５ｍＭＴｒｉｓ−ＨＣｌ緩衝液
Ｂ液：１０％アセトニトリルと７００ｍＭ過塩素酸ナトリウムを含む２５ｍＭＴｒｉｓ−ＨＣｌ緩衝液
移動相の流量  ：１．５ｍｌ／分
紫外線可視分光器検出波長：２６０ｎｍ
【００５７】
【表１】
0005187189.tif 000036
上記表１に示すように、ＴＢＡＦのＴＨＦ溶液に、ＤＭＦを添加することにより、反応時間の短縮又はＴＢＡＦ試薬の量を低減できることが明らかである。
【００５８】
試験例２  アミド系溶媒及びスルホキシド系溶媒の脱保護効果
市販の５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジンが担持されているＣＰＧ固相担体（３３３ｍｇ，１５μｍｏｌ）をフィルター付きカラムに入れ、核酸自動合成機（ＥｘｐｅｄｉｔｅＴＭ：アプライドバイオシステムズ社）を使用して、固相上でアデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−アデニリル−〔３’→５’〕−シチジリル−〔３’→５’〕−ウリジリル−〔３’→５’〕−グアニリル−〔３’→５’〕−チミジンの合成を行い、固相上で、４，４’−ジメトキシトリチルを脱離した。この内、オリゴＲＮＡ１μｍｏｌ分のレジンに対し、切り出し剤として、濃アンモニア水−エタノール混合液（３：１）３ｍＬを用いて、４０℃、４時間かけてＣＰＧ固相担体からの切り出し及び各リン酸部位の保護基の脱離反応及び塩基の保護基の除去を行った。上記反応混合物を減圧下濃縮した後、室温下、下記表２に記載の脱保護条件において、各リボースの２’位水酸基の保護基を脱離する反応を行った。但し、各反応において、１００μｍｏｌのＴＢＡＦにつき、１μＬのニトロメタンを添加した。また、１００μｍｏｌのＴＢＡＦにつき、１００μＬの１Ｍ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ緩衝液（ｐＨ７．５）を加えたのち、２ｍＬ（但し、エントリー３については、１．５ｍＬ）のエタノールに滴下し、反応生成物を沈殿させた。終夜、冷蔵庫に保存した後、上澄みを除去し、反応生成物をＨＰＬＣにて分析し、本反応の終点を確認した。ＨＰＬＣにおける測定条件は、試験例１と同様である。
【００５９】
【表２】
0005187189.tif 000037
上記表２に示すように、反応溶媒としてＴＨＦのかわりにＤＭＳＯ又はＤＭＦを使用した場合、格段に反応性が向上することが明らかである。
さらに、上記結果から明らかなように、反応溶媒としてＤＭＳＯを使用した場合、ＴＢＡＦの使用量、反応溶媒の使用量を低減することができた。ＴＢＡＦの使用量は、反応溶媒としてＴＨＦを使用したときよりも、約１／５に減らすることができた。このことによって、高価なＴＢＡＦの使用量を低減するとともに、最終生成物を析出させるために使用する、エタノールの使用量も低減できることが明らかである。
【産業上の利用可能性】
【００６０】
ＴＢＡＦを作用させ各リボースの２’位水酸基の保護基を脱離する工程において、スルホキシド系溶媒若しくはアミド系溶媒又はこれらの混合溶媒を反応溶媒として用いる、オリゴ核酸誘導体の各リボースの２’位水酸基の保護基が除去されたオリゴ核酸誘導体を製造する工程を経由することによって、大量にかつ高純度でのオリゴＲＮＡ（Ａ）の製造が可能となった。