(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記（１）〜（３）のいずれかを検出することを特徴とする、膵臓癌を判定するためのデータを収集する方法、
（１）ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より184番目のアスパラギン又は／及び211番目のアスパラギンに結合しているフコシル化糖鎖の総和、
（２）ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より184番目のアスパラギン又は／及び211番目のアスパラギンに結合している、下記構造式［II］で示される糖鎖構造（配列）を含む糖鎖がフコシル化されたフコシル化糖鎖、
0005358952.tif 000022
（３）ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より211番目のアスパラギンに結合している、下記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含む糖鎖がフコシル化されたフコシル化糖鎖、
0005358952.tif 000023
【請求項２】
請求項１の（１）におけるフコシル化糖鎖の糖鎖が、下記構造式［I］〜［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むものである、請求項１に記載の方法。
0005358952.tif 000024
0005358952.tif 000025
0005358952.tif 000026
【請求項３】
請求項１の（２）におけるアスパラギンが、ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より184番目のアスパラギンである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
請求項１の（２）におけるアスパラギンが、ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より211番目のアスパラギンである、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
ヒトハプトグロビンに存在する、ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より211番目のアスパラギンに結合している糖鎖由来であって、下記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含み、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中の少なくとも１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されている膵臓癌マーカー。
0005358952.tif 000027
【請求項６】
糖鎖構造（配列）が、下記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含み、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中の少なくとも１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）と非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中の少なくとも１つのガラクトース（Ｇａｌ）がフコシル化されている請求項５に記載の膵臓癌マーカー。
0005358952.tif 000028
【請求項７】
生体由来試料中に存在する、請求項５に記載の膵臓癌マーカーを検出することを特徴とする膵臓癌を判定するためのデータを収集する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、膵臓癌マーカーおよび膵臓癌の判定（診断・検査）法に関する。
【背景技術】
【０００２】
膵臓癌は代表的な難治癌であり、その最大の理由は早期診断が困難なことにある。
現在、膵臓癌の腫瘍マーカー（診断マーカー）として、CEA、CA19-9、CA-50、エラスターゼ1、Span-1、DUPAN-2等が開発され、臨床診断で利用されている。しかしながら、これら腫瘍マーカーは、膵臓癌以外に、慢性膵炎のみならず、慢性肝炎や肝硬変などの肝良性疾患や膵臓癌以外の癌（例えば、胃癌、大腸癌等）でも陽性を示してしまうという問題や、或いは特定の膵臓癌に対して陰性を示してしまうという問題等があり、膵臓癌を特異的に且つ確実に検出・診断する腫瘍マーカーとしては満足できるものではなかった。
【０００３】
一方、ハプトグロビンは、ヘモグロビンと特異的親和性を持つ糖タンパク質である。ヒトのハプトグロビンは、２つのサブユニット（αおよびβ）から構成される分子量約90KDの四量体であり、ハプトグロビン1-1（Hp1-1）、ハプトグロビン2-1（Hp2-1）及びハプトグロビン2-2（Hp2-2）の３つの型に分けられる。
近年、フコシル化されたハプトグロビンと各種癌との関連性が研究されており、フコシル化ハプトグロビンが膵臓癌の検出に有用ではないかとの指摘がなされている（非特許文献１）。
【０００４】
【非特許文献１】Okuyama N, et al., Int J Cancer. 2006 Jun 1;118(11):2803-8.
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
本発明は、膵臓癌の検出に有用な新規腫瘍マーカー（膵臓癌マーカー）及びこれを用いた特異性の高い膵臓癌の判定方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明は、上記課題を解決する目的でなされたものであり、以下の構成よりなる。
（１）ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のN末端より184番目のアスパラギン又は／及び211番目のアスパラギンに結合しているフコシル化糖鎖を検出することを特徴とする膵臓癌判定方法。
（２）ヒトハプトグロビンに存在する、下記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含み、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中の少なくとも１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されている膵臓癌マーカー。
0005358952.tif 000002
（３）生体由来試料中に存在する上記（２）に記載の膵臓癌マーカーを検出することを特徴とする膵臓癌判定方法。
【０００７】
即ち、本発明者らは上記目的を達成すべく鋭意研究を重ねた結果、膵臓癌とヒトハプトグロビンに存在するフコシル化糖鎖との関係を詳細に分析した結果、膵臓癌患者検体において、ヒトハプトグロビンの特定部位に存在するフコシル化糖鎖（Ｎ−グリカン）が健常人及び慢性膵炎患者に比べて著しく増加しており、その増加の程度が当該特定部位以外の部位に存在するフコシル化糖鎖の増加に比べて著しく高いことを見出し、膵臓癌マーカーとして当該特定部位に存在するフコシル化糖鎖を指標とすれば、確度の高い膵臓癌の判定（検査、診断）が可能となることを見出し、本発明を完成させるに至った。
【発明の効果】
【０００８】
本発明の膵臓癌マーカーを利用した判定方法はより確度の高い膵臓癌の判定（診断、検査）を可能とする。また、本発明の膵臓癌マーカーは、例えば血清中に見出されるため、非浸襲的且つ簡便に膵臓癌を判定（診断、検査）することが可能である。
【発明を実施するための最良の形態】
【０００９】
１．本発明に係る膵臓癌マーカー
本発明の膵臓癌マーカーは、ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のＮ末端（メチオニン末端）より１８４番目（Ｓｉｔｅ  １）のアスパラギンに結合しているフコシル化された糖鎖（Ｎ−グリカン）又は／及び２１１番目（Ｓｉｔｅ  ３）のアスパラギンに結合しているフコシル化された糖鎖（Ｎ−グリカン）である。
ヒトハプトグロビンは、そのβサブユニットにＳｉｔｅ  １〜Ｓｉｔｅ  ４の４つの糖鎖結合部位を有している。
(a) Ｓｉｔｅ  １：Ｎ末端（メチオニン末端）より１８４番目のアスパラギン
(b) Ｓｉｔｅ  ２：Ｎ末端（メチオニン末端）より２０７番目のアスパラギン
(c) Ｓｉｔｅ  ３：Ｎ末端（メチオニン末端）より２１１番目のアスパラギン
(d) Ｓｉｔｅ  ４：Ｎ末端（メチオニン末端）より２４１番目のアスパラギン
尚、図１にヒトハプトグロビンのアミノ酸配列におけるＳｉｔｅ  １〜４の位置を示す。
後述の実施例に示すように、膵臓癌患者検体、慢性膵炎患者検体及び健常者検体とを比較したところ、これら４つの糖鎖結合部位のうちＳｉｔｅ  １及びＳｉｔｅ  ３に結合しているフコシル化糖鎖は、Ｓｉｔｅ  ２及びＳｉｔｅ  ４に結合しているフコシル化糖鎖よりも膵臓癌に対して高い有意差を示し、膵臓癌マーカーとして有用であることが判った。
【００１０】
本発明の膵臓癌マーカーは、具体的には下記構造式［I］〜［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、当該糖鎖の何れかの糖残基がフコシル化（Fuc）されているものである（以下、本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］又は［III］と略記する場合がある。）。
0005358952.tif 000003
0005358952.tif 000004
0005358952.tif 000005
より具体的には、本発明の膵臓癌マーカーとしては、(1)上記構造式［I］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、還元末端側（糖鎖根部）に存在するＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化（Ｆｕｃ）されているもの、(2)上記構造式［II］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側（糖鎖頭部）に存在する３本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されているもの、(3)上記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されているもの、及び(4)上記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）と非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのガラクトース（Ｇａｌ）の少なくとも２ヶ所がフコシル化されているもの等が挙げられる。中でも、(3)上記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されているもの、及び(4)上記構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）と非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのガラクトース（Ｇａｌ）の少なくとも２ヶ所がフコシル化されているものが好ましい。
【００１１】
尚、構造式［I］〜［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖としては、何れかの部位がフコシル化された当該糖鎖構造を含むものであればよく、例えば上記糖鎖構造の非還元末端のガラクトース（Gal）にシアル酸（N-acetyl-neuraminic acid：NeuAc）が結合していないもの（アシアロ体）（これら糖鎖構造のみからなるもの）、及び非還元末端の複数のガラクトース（Gal）の１つ以上にシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（シアロ体）が挙げられる。
即ち、本発明に係る膵臓癌マーカー［I］には、上記構造式［I］で示される構造のみからなるもの（アシアロ体）、上記糖鎖構造式［I］の非還元末端の２つのガラクトース（Gal）の何れか１つにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（モノシアロ体）、及び２つのガラクトース（Gal）の全てにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（ジシアロ体）が包含される。また、本発明に係る膵臓癌マーカー［II］には、上記構造式［II］で示される構造のみからなるもの（アシアロ体）、上記糖鎖構造式［II］の非還元末端の３つのガラクトース（Gal）の何れか１つにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（モノシアロ体）、３つのガラクトース（Gal）の何れか２つにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（ジシアロ体）及び３つのガラクトース（Gal）の全てにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（トリシアロ体）が包含される。また、本発明に係る膵臓癌マーカーである［III］には、上記構造式［III］で示される構造のみからなるもの（アシアロ体）、上記糖鎖構造式［III］の非還元末端の４つのガラクトース（Gal）の何れか１つにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（モノシアロ体）、４つのガラクトース（Gal）の何れか２つにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（ジシアロ体）、４つのガラクトース（Gal）の何れか３つにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（トリシアロ体）及び４つのガラクトース（Gal）の全てにシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（テトラシアロ体）が包含される。
【００１２】
より具体的には、下記構造式［１］〜［４］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖が好ましい（以下、本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］又は［４］と略記する場合がある。）。尚、下記構造式［１］〜［４］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖としては、当該糖鎖構造を含むものであればよく、例えば下記糖鎖構造の非還元末端のガラクトース（Gal）にシアル酸（N-acetyl-neuraminic acid：NeuAc）が結合していないもの（アシアロ体）（これら糖鎖構造のみからなるもの）、及び非還元末端の複数のガラクトース（Gal）の１つ以上にシアル酸（NeuAc）が結合しているもの（シアル体）が挙げられる。（尚、非還元末端の複数のガラクトース（Gal）とシアル酸（NeuAc）との結合関係は、上記した本発明に係る膵臓癌マーカー［I］〜［III］の場合と同様である。）
0005358952.tif 000006
0005358952.tif 000007
0005358952.tif 000008
0005358952.tif 000009
なかでも、後述の実施例に示すように、本発明に係る膵臓癌マーカー［３］及び［４］は、Ｓｉｔｅ  ３には存在するが、他のＳｉｔｅには殆ど存在していない。特に、本発明に係る膵臓癌マーカー［４］は、膵臓癌患者検体には存在するが、慢性膵炎患者検体及び健常者検体には殆ど存在していないので、膵臓癌マーカーとして極めて有用である。
【００１３】
２．本発明に係る膵臓癌の判定方法
本発明の膵臓癌判定方法は、生体由来試料中に存在する、上記した如きＳｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３に結合しているフコシル化糖鎖（Ｎ−グリカン）を検出することを特徴とする。
即ち、本発明の膵臓癌判定方法においては、上記した如きＳｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３に結合しているフコシル化糖鎖（Ｎ−グリカン）の量が判定（診断、検査）の指標として用いられる。
本発明においては、Ｓｉｔｅ  １のみにおけるフコシル化糖鎖の量を指標としても、また、Ｓｉｔｅ  ３のみにおけるフコシル化糖鎖の量を指標としてもよく、更にはＳｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ３の両者におけるフコシル化糖鎖の総量を指標としてもよい。
また、指標とするフコシル化糖鎖としては、本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］の総量でも、［I］、［II］及び［III］の何れか１種又は２種の量でもよい。
具体的には、本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の総量、または本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の何れか１種乃至３種の量である。
特に、Ｓｉｔｅ  １におけるフコシル化糖鎖の量を指標とする場合には、本発明に係る膵臓癌マーカー［II］の量を指標とするのが好ましく、より具体的には、本発明に係る膵臓癌マーカー［２］の量を指標とするのが好ましい。
また、Ｓｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖の量を指標とする場合には、本発明に係る膵臓癌マーカー［II］及び［III］の総量、または本発明に係る膵臓癌マーカー［II］又は［III］の量がより好ましく、本発明に係る膵臓癌マーカー［III］の量が特に好ましい。より具体的には、本発明に係る膵臓癌マーカー［２］、［３］及び［４］の総量、または本発明に係る膵臓癌マーカー［２］、［３］及び［４］の何れか１種又は２種の量を指標とするのが好ましく、なかでも本発明に係る膵臓癌マーカー［３］の量又は／及び［４］の量がより好ましく、本発明に係る膵臓癌マーカー［４］の量が特に好ましい。
【００１４】
（１）生体由来試料
本発明において用いられる生体由来試料としては、膵臓組織、血漿、血清、膵液、唾液、リンパ液、髄液等の組織又は体液自体、或いはこれらから調製されたもの等が挙げられる。なかでも、本発明の方法は血液及び血漿等の体液を試料としても有用である点に特徴を有する。
【００１５】
（２）測定・判定手順
（２−１）生体由来試料からのハプトグロビンの抽出・精製
本発明の方法を実施するにあたっては、通常、上記した如き生体由来試料から目的のハプトグロビンを抽出する。
このような抽出・精製方法としては自体公知の方法が挙げられ、例えば抗ハプトグロビン抗体が結合したアフィニティーカラムを用いる方法、抗ハプトグロビン抗体で免疫沈降する方法等が挙げられる。
【００１６】
（２−２）ハプトグロビンのグリコペプチドへの分解（各Ｓｉｔｅへの分解）
次いで、上記のようにして抽出されたハプトグロビンから、Ｓｉｔｅ  １〔ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のＮ末端（メチオニン末端）より１８４番目のアスパラギン〕を含むペプチド断片（グリコペプチド）と、Ｓｉｔｅ  ３〔ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列のＮ末端（メチオニン末端）より２１１番目のアスパラギン〕を含むペプチド断片（グリコペプチド）を分離する。
分離方法としては、例えばトリプシン及びリシルエンドペプチダーゼを用いる自体公知の方法により、以下に示す３つのペプチド断片（グリコペプチド）に分離することができる。
(a) Ｓｉｔｅ  １を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より１７９番目のメチオニンから２０２番目のリシンまでのペプチド断片（グリコペプチド）
(b) Ｓｉｔｅ  ２とＳｉｔｅ  ３を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より２０３番目のアスパラギンから２１５番目のリシンまでのペプチド断片（グリコペプチド）
(c) Ｓｉｔｅ  ４を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より２３６番目のバリンから２５１番目のリシンまでのペプチド断片（グリコペプチド）
即ち、抽出したハプトグロビンに上記方法を適用することにより上記(a)〜(c)の３つのペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物を得ることができ、得られた混合物はＳｉｔｅ  １におけるフコシル化糖鎖の検出に利用できる。
尚、図２にヒトハプトグロビンのアミノ酸配列におけるトリプシン及びリシルエンドペプチダーゼによる消化部位（消化断片）を示す。
【００１７】
また、例えばトリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃを用いる自体公知の方法、即ち、上記方法により得られた３つのペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物に、更にエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃを作用させることにより、以下に示す４つのペプチド断片（グリコペプチド）に分離することができる。
(a') Ｓｉｔｅ  １を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より１７９番目のメチオニンから１９４番目のグルタミン酸までのペプチド断片（グリコペプチド）
(b') Ｓｉｔｅ  ２を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より２０３番目のアスパラギンから２１０番目のグルタミン酸までのペプチド断片（グリコペプチド）
(c') Ｓｉｔｅ  ３を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より２１１番目のアスパラギンから２１５番目のリシンまでのペプチド断片（グリコペプチド）
(d') Ｓｉｔｅ  ４を含むペプチド断片：Ｎ末端（メチオニン末端）より２３６番目のバリンから２５１番目のリシンまでのペプチド断片（グリコペプチド）
即ち、抽出したハプトグロビンに上記方法を適用することにより上記(a')〜(d')の４つのペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物を得ることができ、得られた混合物はＳｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖の検出に利用できる。
尚、図２にヒトハプトグロビンのアミノ酸配列におけるトリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化部位（消化断片）を示す。図中、黒枠はトリプシン及びリシルエンドペプチダーゼ処理により得られるペプチド断片を、また、白枠はトリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃ処理により得られるペプチド断片をそれぞれ示す。
【００１８】
尚、必要により、得られたペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物を例えばセファロースＣＬ４Ｂカラム等によるアフィニティー分離方法に供して、ペプチド断片（グリコペプチド）の濃縮を行ってもよい。特に、上記の方法のうち、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃを用いる場合には、ペプチド断片（グリコペプチド）の濃縮を行うのが好ましい。
【００１９】
また、得られたペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物又は抽出されたハプトグロビンを酸（例えば酢酸等）により処理して、当該ペプチド断片に存在する糖鎖の非還元末端ガラクトース（Gal）に結合しているシアル酸（NeuAc）を除去（脱シアル化）してもよい。この処理により、前述した如き、シアル酸（NeuAc）以外の構造は同一であるが結合するシアル酸（NeuAc）の数（様式）が異なる複数のシアロ体からシアル酸（NeuAc）を除去して、同一構造のアシアロ体に変換することができる。これにより、不均一性（結合様式の相違）をもつシアル酸を除去することができ、後述するフコシル化糖鎖の測定においてより簡便で迅速に解析を行うことができる。特に、上記の方法のうち、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃを用いる場合には、得られるペプチド断片数が増加し、後述するフコシル化糖鎖の測定において、フコシル化糖鎖が結合しているペプチド断片と糖鎖が結合していないペプチド断片の溶出位置が重なる場合がある。従って、この場合には、この重なりを防ぐため酸処理を行うのが好ましい。
尚、上記したように、本発明に係る膵臓癌マーカー［３］及び［４］は、Ｓｉｔｅ  ３には存在するが、他のＳｉｔｅには殆ど存在していない。特に、本発明に係る膵臓癌マーカー［４］は、膵臓癌患者検体には存在するが、慢性膵炎患者検体及び健常者検体には殆ど存在していない。従って、本発明の方法において、本発明に係る膵臓癌マーカー［３］又は／及び［４］、特に本発明に係る膵臓癌マーカー［４］を指標として用いる場合には、抽出したハプトグロビンから、Ｓｉｔｅ  ３を含むペプチド断片（グリコペプチド）を分離（単離）する必要はなく、抽出したハプトグロビンをそのまま次のフコシル化糖鎖の測定に供することができる。
【００２０】
（２−３）フコシル化糖鎖（本発明に係る膵臓癌マーカー）の測定
上記のようにして得られたペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物又は酸処理して得られたペプチド断片（アシアロ−グリコペプチド）を含む混合物を、例えばＬＣ−ＥＳＩ  ＭＳやＬＣ−ＡＰＣＩ  ＭＳ等の自体公知の液体クロマトグラフィー質量分析法（ＬＣ−ＭＳ）等に供することにより、Ｓｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖（フコシル化糖鎖が結合したペプチド断片）の検出・特定並びにその量の測定を行うことができる。
即ち、例えば液体クロマトグラフィー質量分析の液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）により、混合物中のペプチド断片を各Ｓｉｔｅ毎に分離する。次いで、分離された各Ｓｉｔｅのペプチド断片について、液体クロマトグラフィー質量分析の質量分析（ＭＳ）を行うことにより、目的のＳｉｔｅ（１又は／及び３）のペプチド断片を特定し、更に、特定した目的のＳｉｔｅ（１又は／及び３）のペプチド断片中の目的のフコシル化糖鎖（目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片）を特定し、その量を測定（算出）する。
より具体的には、例えば、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼ処理した混合物を用いる場合は、ＨＰＬＣ分析により、Ｓｉｔｅ  １のペプチド断片（上記(a)）、Ｓｉｔｅ  ２及び３のペプチド断片（上記(b)）及びＳｉｔｅ  ４のペプチド断片（上記(c)）の３つに分離する。次いで、分離した各Ｓｉｔｅのペプチド断片を質量分析により、それぞれ分析して、Ｓｉｔｅ  １のペプチド断片を特定し、更に、特定したＳｉｔｅ  １の各ペプチド断片中の目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片を特定し、当該ペプチド断片の量を算出する。また、例えば、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃ処理をした混合物を用いる場合は、ＨＰＬＣ分析により、Ｓｉｔｅ  １のペプチド断片（上記(a')）、Ｓｉｔｅ  ２のペプチド断片（上記(b')）、Ｓｉｔｅ  ３のペプチド断片（上記(c')）及びＳｉｔｅ  ４のペプチド断片（上記(d')）の４つに分離する。次いで、質量分析により、分離した各Ｓｉｔｅのペプチド断片をそれぞれ分析して、Ｓｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３（好ましくはＳｉｔｅ  ３）のペプチド断片を特定し、更に、特定したＳｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３（好ましくはＳｉｔｅ  ３）の各ペプチド断片中の目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片を特定し、当該ペプチド断片の量を算出する。
【００２１】
上記において、質量分析による目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のペプチド断片の特定は、例えば以下のように行えばよい。
即ち、例えばスタンダード糖鎖と上記のＳｉｔｅ  １又は／及び３を含むペプチド断片（上記(a)、(a')、(c')）の総質量数を指標とし、この総質量数を解析することにより、上記混合物における質量分析の溶出パターンからＳｉｔｅ  １の溶出時間（溶出位置）又は／及びＳｉｔｅ  ３の溶出時間（溶出位置）を特定することができる。即ち、質量分析において、スタンダード糖鎖とＳｉｔｅ  １を含むペプチド断片（上記(a)、(a')）の総質量数に対応するピークを解析することにより、高い強度を示すピークが出現する溶出時間（溶出位置）付近のピークはＳｉｔｅ  １のペプチド断片（グリコペプチド）に起因したピークであることが特定できる。また、質量分析において、スタンダード糖鎖とＳｉｔｅ  ３を含むペプチド断片（上記(c')）の総質量数に対応するピークを解析することにより、高い強度を示すピークが出現する溶出時間（溶出位置）付近のピークはＳｉｔｅ  ３のペプチド断片（グリコペプチド）に起因したピークであることが特定できる。
尚、ここで、スタンダード糖鎖とは、例えばハプトグロビン中に多く存在していることが知られている糖鎖であり、具体的には、上記構造式［I］で示される糖鎖又はそのシアロ体（特にジシアロ体）等である。
また、上記において、指標とする総質量数としては、例えば以下に示すスタンダード糖鎖とペプチド断片の組合せが挙げられる。
(1)トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼを用いてハプトグロビンを消化した場合
・Ｓｉｔｅ  １特定用指標（酸処理を行わない場合）：Ｎ末端（メチオニン末端）より１７９番目のメチオニンから２０２番目のリシンまでのペプチド断片と上記構造式［I］で示される糖鎖
・Ｓｉｔｅ  １特定用指標（酸処理を行った場合）：Ｎ末端（メチオニン末端）より１７９番目のメチオニンから２０２番目のリシンまでのペプチド断片と上記構造式［I］で示される糖鎖のシアロ体（特にジシアロ体）
(2) トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃを用いてハプトグロビンを消化した場合
・Ｓｉｔｅ  １特定用指標（酸処理を行わない場合）：Ｎ末端（メチオニン末端）より１７９番目のメチオニンから１９４番目のグルタミン酸までのペプチド断片と上記構造式［I］で示される糖鎖
・Ｓｉｔｅ  １特定用指標（酸処理を行った場合）：Ｎ末端（メチオニン末端）より１７９番目のメチオニンから１９４番目のグルタミン酸までのペプチド断片と上記構造式［I］で示される糖鎖のシアロ体（特にジシアロ体）
・Ｓｉｔｅ  ３特定用指標（酸処理を行わない場合）：Ｎ末端（メチオニン末端）より２１１番目のアスパラギンから２１５番目のリシンまでのペプチド断片と上記構造式［I］で示される糖鎖
・Ｓｉｔｅ  ３特定用指標（酸処理を行った場合）：Ｎ末端（メチオニン末端）より２１１番目のアスパラギンから２１５番目のリシンまでのペプチド断片と上記構造式［I］で示される糖鎖のシアロ体（特にジシアロ体）
【００２２】
また、質量分析により分析された各ペプチド断片からの目的のフコシル化糖鎖（目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片）の特定およびその量の測定（算出）は、以下のように行えばよい。
即ち、後述する実施例で示すように、例えば質量分析で得られた目的Ｓｉｔｅの各ピークの質量数から、目的Ｓｉｔｅの特定に使用した指標となるスタンダード糖鎖の構造を基に、各ピーク（質量数）に対応する糖鎖構造を決定する。言い換えれば、各ピークの質量数から目的Ｓｉｔｅのペプチド断片の質量数を差し引いて糖鎖に起因する質量数を算出し、算出した糖鎖に起因する質量数から対応する糖鎖構造を決定する。次いで、決定した各糖鎖構造のうち、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片を特定し、特定した目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片のピーク強度から当該ペプチド断片の（グリコペプチド）の量を算出する。
また、例えば上記と同様にして、予め目的Ｓｉｔｅ毎に、糖鎖を有するペプチド断片（グリコペプチド）の構造とその質量数を計算、決定しておき、これと実際に測定された各糖鎖を有するペプチド断片に対応するピークの質量数とを比較して、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片の特定すると共に、特定した当該ペプチド断片（グリコペプチド）のピークの（イオン）強度から、当該ペプチド断片（グリコペプチド）の量を直接算出しても良い。
【００２３】
目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片の量の算出は、具体的には以下のように行えばよい。
(a) Ｓｉｔｅ  １におけるフコシル化糖鎖の量：
特定したＳｉｔｅ  １のマススペクトラムから、フコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、フコシル化された糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれとフコシル化された糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(b) Ｓｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖の量：
特定したＳｉｔｅ  ３のマススペクトラムから、フコシル化された糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、フコシル化された糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれとフコシル化された糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(c) Ｓｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ３の両者におけるフコシル化糖鎖の総量：
上記(a)と(b)を合計する。
(d) 本発明に係る膵臓癌マーカー［I］：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化され且つ構造式［I］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［I］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、フコシル化され且つ構造式［I］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれとフコシル化され且つ構造式［I］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(e) 本発明に係る膵臓癌マーカー［II］：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化され且つ構造式［II］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［II］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、フコシル化され且つ構造式［II］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれとフコシル化され且つ構造式［II］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(f) 本発明に係る膵臓癌マーカー［III］：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化され且つ構造式［III］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［III］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、フコシル化され且つ構造式［III］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれとフコシル化され且つ構造式［III］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(g) 本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］の総量：
上記(d)、(e)及び(f)を合計する。
(h) 本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］の２種の量：
上記(d)〜(f)から、目的とする２種を合計する。
(i) 本発明に係る膵臓癌マーカー［１］の量：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、構造式［１］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［１］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、構造式［１］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれと構造式［１］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(j) 本発明に係る膵臓癌マーカー［２］の量：
目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、構造式［２］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［２］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、構造式［２］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれと構造式［２］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(k) 本発明に係る膵臓癌マーカー［３］の量：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、構造式［３］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［３］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、構造式［３］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれと構造式［３］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(l) 本発明に係る膵臓癌マーカー［４］の量：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、構造式［４］の構造を有する糖鎖が結合したペプチド断片（本発明に係る膵臓癌マーカー［４］を有するペプチド断片：グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、構造式［４］の構造を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピーク、又はこれと構造式［４］の構造を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、それらを合計して量を求める。
(m) 本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の総量：
上記(i)、(j)、(k)及び(l)を合計する。
(n) 本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の何れか２種又は３種の量：
上記(i)〜(l)から、目的とする２種又は３種を合計する。
尚、上記方法において、酸処理を行わないペプチド断片（グリコペプチド）を含む混合物を用いた場合には、混合物中に、シアル酸（NeuAc）以外の構造は同一であるが結合するシアル酸（NeuAc）の数が異なる糖鎖（シアロ体）を有する複数のペプチド断片（シアロ−グリコペプチド）が存在する場合があり、質量分析において、これら複数のペプチド断片（シアロ−グリコペプチド）は、結合するシアル酸（NeuAc）の数が異なるため、それぞれ異なる質量として分離・測定される。従って、この場合には、上記(a)〜(n)に示したように、分離・測定されたそれぞれ異なる質量のピークから、目的のフコシル化された糖鎖を有するシアロ−グリコペプチドに対応するピークと目的のフコシル化された糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応するピークを全て特定し、それらのピークのイオン強度を合計すればよい。
【００２４】
本発明の膵臓癌の判定方法においては、上記した如き目的のフコシル化糖鎖（目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片）の量自体（上記(a)〜(n)）を、膵臓癌判定（診断、検査）の指標として用いてもよいが、例えば目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における糖鎖（糖鎖が結合したペプチド断片）の総量を１００％とした場合の同Ｓｉｔｅにおける目的のフコシル化糖鎖（目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片）の量の相対値〔相対存在度(%)〕を算出し、これを膵臓癌判定（診断、検査）の指標として用いてもよい。
尚、相対存在度（％）は、上記した質量分析において検出・決定された全ての糖鎖（糖鎖が結合した全てのペプチド断片）に対応するピーク（シグナル）強度を１００％とした場合の目的のフコシル化糖鎖（目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片）のピーク（シグナル）強度として算出することができ、具体的には以下のように算出することができる。
(a') Ｓｉｔｅ  １におけるフコシル化糖鎖の相対存在度（％）：
特定したＳｉｔｅ  １のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(a)で算出したＳｉｔｅ  １におけるフコシル化糖鎖量の相対値を算出する。
(b') Ｓｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖の相対存在度（％）：
特定したＳｉｔｅ  ３のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(b)で算出したＳｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖量の相対値を算出する。
(c') Ｓｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ３の両者におけるフコシル化糖鎖の相対存在度（％）：
特定したＳｉｔｅ  １及び３のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(c)で算出したＳｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ３の両者におけるフコシル化糖鎖の総量の相対値を算出する。
(d') 本発明に係る膵臓癌マーカー［I］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(d)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［I］の量の相対値を算出する。
(e') 本発明に係る膵臓癌マーカー［II］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(e)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［II］の量の相対値を算出する。
(f') 本発明に係る膵臓癌マーカー［III］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(f)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［III］の量の相対値を算出する。
(g') 本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(g)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］の総量の相対値を算出する。
(h') 本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］から選ばれる２種の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(h)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［I］、［II］及び［III］から選ばれる２種の量の相対値を算出する。
(i') 本発明に係る膵臓癌マーカー［１］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(f)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［１］の量の相対値を算出する。
(j') 本発明に係る膵臓癌マーカー［２］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(j)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［２］の量の相対値を算出する。
(k') 本発明に係る膵臓癌マーカー［３］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(k)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［３］の量の相対値を算出する。
(l') 本発明に係る膵臓癌マーカー［４］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(l)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［４］の量の相対値を算出する。
(m') 本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(m)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の総量の相対値を算出する。
(n') 本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の何れか２種又は３種の相対存在度（％）：
特定した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）のマススペクトラムから、フコシル化されているか否かに拘わらず、糖鎖が結合したペプチド断片（グリコペプチド）に対応する全てのピーク（即ち、糖鎖を有するアシアロ−グリコペプチドに対応する全てのピーク、又はこれと糖鎖を有する複数のシアロ−グリコペプチドのそれぞれに対応するピーク）を特定し、それらのピークのイオン強度を算出し、合計する。これを１００％として、上記(n)で算出した目的Ｓｉｔｅ（１又は／及び３）における本発明に係る膵臓癌マーカー［１］、［２］、［３］及び［４］の何れか２種又は３種の量の相対値を算出する。
【００２５】
（２−４）膵臓癌の判定方法
以上の方法により得られた目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量に関する情報（例えば量自体、相対存在度等）は、膵臓癌の判定（診断、検査）に有用である。
即ち、例えば、被験者から得られた生体由来試料中の目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）と、健常者から得られた生体由来試料中の目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）とを比較し、両者の差又は比を得る。健常者の場合に比較して被験者では目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）が多い（顕著な差が認められる）との検査結果から、被験者に膵臓癌のおそれがある、又は膵臓癌のおそれが高い等の判定が、また、健常者と被験者との間で目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）に顕著な差が認められないという検査結果から、被験者に膵臓癌のおそれはない、又は膵臓癌のおそれが低い等の判定が可能である。
また、予め基準値を設定しておき、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）が基準値より多いという検査結果から、被験者に膵臓癌のおそれがある又は被験者に膵臓癌のおそれが高い等の判定が可能である。また、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）の量的範囲又は相対値的範囲に対応させて複数の判定区分を設定し〔例えば(1)膵臓癌のおそれはない、(2)膵臓癌のおそれは低い、(3)膵臓癌の兆候がある、及び(4)膵臓癌のおそれが高い、等〕、検査結果がどの判定区分に入るかを判定することも可能である。
更には、同一被験者において、ある時点で測定された生体由来試料中の目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）と、異なる時点での目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）とを比較し、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）の増減の有無及び／又は増減の程度を評価することによって、膵臓癌の進行度や悪性度の診断、或いは術後の予後診断が可能である。即ち、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）の増加が認められたという検査結果から、膵臓癌へ病態が進行した（或いは膵臓癌の悪性度が増した）、又は膵臓癌への病態の進行の徴候が認められる（或いは膵臓癌の悪性度が増す兆候が認められる）との判定ができ、被験者から得られた生体由来試料中の目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）の減少が認められたという検査結果から、膵臓癌の病態が改善した、又は膵臓癌の病態の改善の徴候が認められるとの判定ができる。また、目的のフコシル化糖鎖が結合したペプチド断片（フコシル化糖鎖：本発明に係る膵臓癌マーカー）の量又は相対存在度（％）の変動が認められないという検査結果から、病態に変化はないとの判定が可能である。
【実施例】
【００２６】
以下、実施例及び比較例に基づいて本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらの例によって何ら限定されるものではない。
【００２７】
実施例．１
〔検体〕
膵癌患者（ＰＣ）5名（PC1〜5：男性2名、女性3名、平均年齢65歳）、慢性膵炎患者（ＣＰ）5名（CP1〜5：男性3名、女性2名、平均年齢66歳）、健常人（ＮＶ）8名（NV1〜8：男性5名、女性3名、平均年齢46歳）の血清サンプルを用いて実験を行った。尚、健常人8名のうち5名は年齢26〜38歳〔NV(<40)：NV1〜5〕、3名は63〜75歳〔NV(>60)：NV6〜8〕であった。血清サンプルは、採血後、速やかに-80度で測定まで凍結保存した。
【００２８】
〔ハプトグロビンの抽出・精製〕
膵癌患者及び慢性膵炎患者の血清100μL、及び健常人の血清300μLを0.45μmのフィルター（Minisart RC 15, Sartorius, Goettingen, Germany）でそれぞれ濾過した後、緩衝液A（50mM Sodium phosphate buffer, 0.5 M NaCl, 0.02% NaN3, pH7.4）で、7mLになるようにそれぞれ希釈した。希釈した血清を、抗ハプトグロビン抗体アフィニティーカラムにアプライした。尚、抗ハプトグロビンアフィニティーカラムは、300μLの抗ハプトグロビン抗体（DakoCytomation, Glostrup, Denmark）を1mLのHiTrap NHS-activated HP（GE Healthcare, Uppsala, Sweden）に結合させ、常法に従って作製した。
希釈した血清サンプルを、ぺリスタポンプにより室温でカラムを5回循環させた後、緩衝液A  15mLでカラムを洗浄した。洗浄後、5mLの溶離液（100mM Glycine, 0.5M NaCl, pH 3.0）でハプトグロビンを溶出した。溶出したハプトグロビン溶液を、100μLの2M Tris-HCl (pH 8.0)で中性付近に戻した後、PD-10カラム（GE Healthcare, Uppsala, Sweden）を用いて緩衝液を精製水に置換した。この溶液を減圧乾固させた後、100μLの精製水で溶解した（サンプル溶液A）。
【００２９】
〔LC-ESI MSを用いたＳｉｔｅ  １及びＳｉｔｅ  ４の糖鎖構造解析〕
（１）トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼによるハプトグロビンの消化
サンプル溶液A  80μLを減圧乾固させた後、500μLの緩衝液B（250mM Tris-HCl, 6M guanidine hydrochloride, 2mM EDTA, 10 mg dithiothreitol, pH8.5）を加え再溶解した。この溶液を50℃、1時間インキュベーションした後、20mgのヨードアセトアミドを加え、更に、室温、暗所で30分間インキュベーションした。次に、この溶液をNap-5カラム（GE Healthcare, Uppsala, Sweden）を用いて、0.05N塩酸溶液に置換した。置換後の溶液1mLを100μLの1M Tris-HCl (pH 9.0)で中性付近に戻した後、20μLの50mM Tris-HCl（pH8.5）に 2μg リシルエンドペプチターゼ及び2μg  トリプシンを溶解した酵素溶液を加え、37℃で16時間インキュベーションした。その溶液を煮沸した後、減圧乾固させた。残渣を、100μLの精製水で溶解した（サンプル溶液B）。
【００３０】
（２）LC-ESI MS解析
得られたサンプル溶液B  10μLを、ODSカラム（Develosil 300ODS-HG-5, 150 x 1.0 mm i.d., Nomura Chemical Co., Japan）を用いて、以下の条件で分離分析した。移動層として、（A）0.1% TFAと(B) 0.1% TFA/80% acetonitrileを用いた。分析には、Agilent 1100 series HPLCシステムを用い、流速50μL/mLで、80分間に渡って10%から60%の(B)液のグラジエント溶出を行った。溶出液を、連続的にエレクトロスプレーイオン化質量分析装置（Esquire HCT, Bruker Daltonics GmbsH, Bremen, Germany）へ導入した。
解析結果を以下に示す。
【００３１】
ａ）サンプル中に存在するペプチドの溶出位置の確認
上記で得られたサンプル中に存在するペプチドやグリコペプチド等がどの位置に溶出されるか確認するために、BPC（Base Peak Chromatogram）の解析を行った。
尚、BPCとは、各時刻におけるMS/MSMSスキャンで、最も強度が大きかったイオンピークのイオン強度のみを表示したクロマトグラムである。
結果を、図３ＡのBPCに示す。尚、図３ＡのBPCは、1.5秒間隔で繰り返されるMSスキャン、MSMSスキャンの両方における最強強度ピークを表示したものである。
【００３２】
ｂ）Ｓｉｔｅ  １を含むグリコペプチドの溶出位置とＳｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドの溶出位置の予備的同定
Ｓｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドの溶出位置を予備的に同定するために、以下のEIC（Extracted Ion Chromotogram）の解析を行った。
Asn型の複合型糖鎖（非常に複雑な構造を有する糖鎖化合物）の場合、MSMS測定を行うとNeuAc-Gal-GlcNAc（質量数：[M+H]+ = 657.3 m/z）がフラグメント化されやすいため、この質量数を解析することで糖鎖をもったペプチドの溶出位置を確認することができる。
図３ＡのEIC of MSMS (at m/z 657.3)は、健常人（NV5）検体における、MSMS測定で生成した質量数657.3 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
この結果、クロマトグラム中で高いピーク強度を示したのは、40、61および68分であった。
【００３３】
ｃ）Ｓｉｔｅ  １を含むグリコペプチドの溶出位置の同定
Ｓｉｔｅ  １を含むグリコペプチドのピーク位置を同定するために、ハプトグロビンの主要な糖鎖構造として知られているシアル酸結合2本分岐N-グリカン（disialo-biantennary N-glycan）糖鎖（後述する図４中、2-N2で示される糖鎖）が結合しているグリコペプチドの質量数（[M+4H] 4+ = 1221.8 m/z）をもったイオンピークの強度を解析した。
図３ＡのEIC of MS（at 1221.8-1222.8 m/z）Site 1は、健常人（NV5）検体における、MS測定で生成した質量数1221.8-1222.8 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
この結果、クロマトグラム中で高いピーク強度を示したのは68分付近の溶出位置であった。これは上記ｂ）で得られたAsn型の複合糖鎖に由来するMSMS測定時のNeuAc-Gal-GlcNAc（質量数：[M+H]+ = 657.3 m/z）の溶出位置68分と良く一致していた。
以上のことから、68分付近のピークはＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドに起因するピークであると同定した。
尚、図には示さないが、膵癌患者検体（ＰＣ）を用いた場合および慢性膵炎患者検体（ＣＰ）を用いた場合もそれぞれ上記と同様に解析し、68分付近のピークがＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドに起因するピークであることを同定した。
【００３４】
ｄ）Ｓｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドの溶出位置の同定
上記ｃ）と同様に、Ｓｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドのピーク位置を同定するために、ハプトグロビンの主要な糖鎖構造として知られているシアル酸結合2本分岐N-グリカン（disialo-biantennary N-glycan）糖鎖（後述する図４中、2-N2で示される糖鎖）が結合しているグリコペプチドの質量数（[M+3H] 3+ = 1333.9 m/z）をもったイオンピークの強度を解析した。
図３ＡのEIC of MS（at 1333.9-1334.9 m/z）Site 4は、健常人（NV5）検体における、MS測定で生成した質量数1333.9-1334.9 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
この結果、クロマトグラム中で高いピーク強度を示したのは61分付近の溶出位置であった。これは上記ｂ）で得られたAsn型の複合糖鎖に由来するMSMS測定時のNeuAc-Gal-GlcNAc（質量数：[M+H]+ = 657.3 m/z）の溶出位置61分と良く一致していた。
以上のことから、61分付近のピークはＳｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドに起因するピークであると同定した。
尚、図には示さないが、膵癌患者検体（ＰＣ）を用いた場合および慢性膵炎患者検体（ＣＰ）を用いた場合もそれぞれ上記と同様に解析し、61分付近のピークがＳｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドに起因するピークであることを同定した。
【００３５】
尚、同様にＳｉｔｅ  ２とＳｉｔｅ  ３の両方を含むグリコペプチドのピーク位置を同定した結果を、図３ＡのEIC of MS（at 1467.8-1468.8 m/z）Site 2-3に示す。
図３ＡのEIC of MS（at 1467.8-1468.8 m/z）Site 2-3は、健常人（NV5）検体における、MS測定で生成した質量数1467.8-1468.8 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
【００３６】
ｅ）ハプトグロビンのＳｉｔｅ  １における糖鎖構造の決定
健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて、上記ｃ）で特定したＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドの溶出位置付近（６７分〜７２分）のマススペクトラムのアベレージングを行った。
図３Ｂにその結果を示す。
また、図４に示すように、推定される各種糖鎖構造を有するＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドとその質量数を計算した。
図４で示される計算した質量数と推定される各種糖鎖構造との関係と、図３Ｂで示される各検体において得られたピークの質量数とから、各ピークの糖鎖構造を決定した。
尚、図３Ｂおよび図４中の糖鎖構造の略称（Abbreviation）の最初の数字は糖鎖の分岐数を、Nとその数字はNeuAcの数を、またFとその数字はフコシル化の数をそれぞれ示す。
表１に、健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて決定したＳｉｔｅ  １における糖鎖構造を示す。
【００３７】
【表１】
0005358952.tif 000010
【００３８】
ｆ）ハプトグロビンのＳｉｔｅ  ４における糖鎖構造の決定
健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて、上記ｄ）で特定したＳｉｔｅ  ４を含むグリコペプチドの溶出位置付近（５９分〜６４分）のマススペクトラムのアベレージングを行い（尚、特にそのマススペクトラムの結果は示さない。）、上記ｅ）と同様にして、各ピークの糖鎖構造を決定した。
表２に、健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて決定したＳｉｔｅ  ４における糖鎖構造を示す。
【００３９】
【表２】
0005358952.tif 000011
【００４０】
〔LC-ESI MSを用いたＳｉｔｅ  ２及びＳｉｔｅ  ３の糖鎖構造解析〕
（１）トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによるハプトグロビンの消化
50μLのサンプル溶液B（トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼ処理を行ったもの）に150μLの精製水を加えた後、さらに、1-ブタノール/エタノール溶液（4:1, v/v）1 mLを加え良く混合した。1-ブタノール/エタノール/精製水（4:1:1, v/v）で平衡化させたSepharose CL4Bが100μL入った1.5 mL用のポリプロピレンチューブに、この溶液を加えた。穏やかに混合液を30分間振とうさせた後、ゲルを、3回1-ブタノール/エタノール/精製水（4:1:1, v/v）1mLで洗浄した。さらに、ゲルをエタノール/精製水（1:1, v/v）で10分間インキュベーションした後、液相を取り出し減圧乾固させた。
【００４１】
（２）酸処理によるグリコペプチドの脱シアル化
上記（１）で得られた減圧乾固させた残渣に2Mの酢酸100μLを加え、80℃で2時間インキュベーションしシアル酸を除去し、溶液を減圧乾固した。残渣を40μLの精製水で溶解させた後、その溶液10μLに30μLのエンドプロテアーゼGlu-C溶液（1μg Glu-Cを30μLの50 mM NH4HCO3で溶解したもの）を加え、37℃で16時間インキュベーションした後、煮沸を行った（サンプル溶液C）。
【００４２】
（３）LC-ESI MS解析
得られたサンプル溶液C  10μLを、ODSカラム（Develosil 300ODS-HG-5, 150 x 1.0 mm i.d., Nomura Chemical Co., Japan）を用いて、以下の条件で分離分析した。移動層として、（A）0.08% ギ酸と (B) 0.15% ギ酸/80% アセトニトリルを用いた。分析には、Agilent 1100 series HPLCシステムを用い、流速50μL/mLで5分間（A）液を流した後、75分間に渡って0%から50%の(B)液のグラジエント溶出を行った。溶出液を、連続的にエレクトロスプレーイオン化質量分析装置（Esquire HCT, Bruker Daltonics GmbsH, Bremen, Germany）へ導入した。
【００４３】
ａ）サンプル中に存在するペプチドの溶出位置の確認
上記で得られたサンプル中に存在するペプチドやグリコペプチド等がどの位置に溶出されるか確認するてめに、BPC（Base Peak Chromatogram）の解析を行った。
結果を、図５ＡのBPCに示す。尚、図５ＡのBPCは、1.5秒間隔で繰り返されるMSスキャン、MSMSスキャンの両方における最強強度ピークを表示したものである。
【００４４】
ｂ）Ｓｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドの溶出位置とＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置の予備的同定
Ｓｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドの溶出位置とＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置を予備的に同定するために、以下のEIC（Extracted Ion Chromotogram）の解析を行った。
Asn型の複合型アシアロ糖鎖（非常に複雑な構造を有する糖鎖化合物）の場合、MSMS測定を行うとGal-GlcNAc（質量数：[M+H]+ = 366.3 m/z）がフラグメント化されやすいため、この質量数を解析することで糖鎖をもったペプチドの溶出位置を確認することができる。
図５ＡのEIC of MSMS (at m/z 366.3)は、健常人（NV5）検体における、MSMS測定で生成した質量数366.3 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
この結果、クロマトグラム中で高いピーク強度を示したのは、5および52分であった。
【００４５】
ｃ）Ｓｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドの溶出位置の同定
Ｓｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドのピーク位置を同定するために、ハプトグロビンの主要な糖鎖構造として知られている2本分岐N-グリカン（asialo-biantennary N-glycan、シアル酸を除去しているため）糖鎖（前述の図４中、2-0で示される糖鎖）が結合しているグリコペプチドの質量数（[M+2H]2+ = 1298.5 m/z）をもったイオンピークの強度を解析した。
図５ＡのEIC of MS（at 1298.4-1299.4 m/z）Site 2は、健常人（NV5）検体における、MS測定で生成した質量数1298.4-1299.4 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
この結果、クロマトグラム中で高いピーク強度を示したのは52分付近の溶出位置であった。これは上記ｂ）で得られたAsn型の複合型アシアロ糖鎖に由来するMSMS測定時のGal-GlcNAc（質量数：[M+H]+ = 366.3 m/z）の溶出位置52分と良く一致していた。
以上のことから、52分付近のピークはＳｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドに起因するピークであると同定した。
尚、図には示さないが、膵癌患者検体（ＰＣ）を用いた場合および慢性膵炎患者検体（ＣＰ）を用いた場合もそれぞれ上記と同様に解析し、52分付近のピークがＳｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドに起因するピークであることを同定した。
【００４６】
ｄ）Ｓｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置の同定
上記ｃ）と同様に、Ｓｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドのピーク位置を同定するために、ハプトグロビンの主要な糖鎖構造として知られている2本分岐N-グリカン（asialo-biantennary N-glycan、シアル酸を除去しているため）糖鎖（前述の図４中、2-0で示される糖鎖）が結合しているグリコペプチドの質量数（[M+3H] 3+ = 1063.9 m/z）をもったイオンピークの強度を解析した。
図５ＡのEIC of MS（at 1063.8-1064.8 m/z）Site 3は、健常人（NV5）検体における、MS測定で生成した質量数1063.8-1064.8 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。
この結果、クロマトグラム中で高いピーク強度を示したのは5分付近の溶出位置であった。これは上記ｂ）で得られたAsn型の複合型アシアロ糖鎖に由来するMSMS測定時のGal-GlcNAc（質量数：[M+H]+ = 366.3 m/z）の溶出位置5分と良く一致していた。
以上のことから、5分付近のピークはＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドに起因するピークであると同定した。
尚、図には示さないが、膵癌患者検体（ＰＣ）を用いた場合および慢性膵炎患者検体（ＣＰ）を用いた場合もそれぞれ上記と同様に解析し、5分付近のピークがＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドに起因するピークであることを同定した。
【００４７】
ｅ）ハプトグロビンのＳｉｔｅ  ３における糖鎖構造の決定
健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて、上記ｄ）で特定したＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置付近（３分〜８分）のマススペクトラムのアベレージングを行った。
図５Ｂにその結果を示す。
前述した図４で示される計算した質量数と推定される各種糖鎖構造との関係と、図５Ｂで示される各検体において得られたピークの質量数とから、各ピークの糖鎖構造を決定した。
尚、図５Ｂ中の糖鎖構造の略称（Abbreviation）の最初の数字は糖鎖の分岐数を、Nとその数字はNeuAcの数を、またFとその数字はフコシル化の数をそれぞれ示す。
表３に、健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて決定したＳｉｔｅ  ３における糖鎖構造を示す。
【００４８】
【表３】
0005358952.tif 000012
【００４９】
ｆ）ハプトグロビンのＳｉｔｅ  ２における糖鎖構造の決定
健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて、上記ｃ）で特定したＳｉｔｅ  ２を含むグリコペプチドの溶出位置付近（５０分〜５５分）のマススペクトラムのアベレージングを行い（尚、特にそのマススペクトラムの結果は示さない。）、上記ｅ）と同様にして、各ピークの糖鎖構造を決定した。
表４に、健常人検体（ＮＶ５）、慢性膵炎患者検体（ＣＰ４）および膵癌患者検体（ＰＣ５）のそれぞれについて決定したＳｉｔｅ  ２における糖鎖構造を示す。
【００５０】
【表４】
0005358952.tif 000013
【００５１】
（３）ハプトグロビンの各サイトにおける各種糖鎖の相対存在度の算出
ハプトグロビンのＳｉｔｅ  １からＳｉｔｅ  ４におけるN-グリカン（糖鎖）構造の相対存在度は、前記LC-ESI MS解析で得られた対応するグリコペプチドのシグナル強度を元に計算した。
Ｓｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ４においては、各グリコペプチド断片はシアル酸の有無及びその数の違いにより前記LC-ESI MSにより分離されている。従って、後述するＳｉｔｅ  ２とＳｉｔｅ  ３の結果と整合させるために、前記LC-ESI MSにおいて決定された全糖鎖構造（シアロ−グリコペプチド）を、シアル酸以外の糖鎖構造が同じグリコペプチド（シアロ−グリコペプチド）になるように、各検体毎に(1)フコシル化されていない２本鎖糖鎖（2-0）を有するもの（2-N1, 2-N2）、(2)フコシル化されている２本鎖糖鎖（2-F1）を有するもの（2-N1-F1, 2-N2-F1）、(3)フコシル化されていない３本鎖糖鎖（3-0）を有するもの（3-N2, 3-N3）、(4)フコシル化されている３本鎖糖鎖（3-F1）を有するもの（3-N2-F1, 3-N3-F1）、(5)フコシル化されていない４本鎖糖鎖（4-0）を有するもの（4-N1, 4-N2, 4-N3, 4-N4）、及び(6)フコシル化されている４本鎖糖鎖（4-F1）を有するもの（4-N1-F1, 4-N2-F1, 4-N3-F1, 4-N4-F1）にそれぞれグロープ化した。そして、前記LC-ESI MS解析で得られた各グリコペプチド（シアロ−グリコペプチド）に対応するシグナル強度（イオン強度）をグループ毎に合計（合計値）した。
検体ごとに検出・決定されたグリコペプチド（シアロ−グリコペプチド）の全シグナル強度（イオン強度）の合計を100%として、各々のグループの合計値（シグナル強度（イオン強度））の相対値（相対存在度（％））を算出し、健常人（NV）の40歳以下、健常人の60歳以上、慢性膵炎患者（CP）、膵癌患者（PC）の4群のそれぞれの平均値を算出し、各アシアロ構造の糖鎖（2-0、2-F1, 3-0, 3-F1, 4-0, 4-F1）に関する相対存在度（％）として換算した。
また、Ｓｉｔｅ  ２とＳｉｔｅ  ３に関しては、脱シアル化サンプル（脱シアル化グリコペプチド）を用いて前記LC-ESI MS解析が行われているため、得られたシグナル強度はアシアロ構造の糖鎖（アシアロ−グリコペプチド）に対応するものである。従って、前記LC-ESI MS解析で得られた値をそのまま用いて、検体ごとに検出・決定されたグリコペプチド（アシアロ−グリコペプチド）の全シグナル強度（イオン強度）の合計を100%として、各々の糖鎖構造（アシアロ−グリコペプチド）のシグナル強度（イオン強度）の相対値（相対存在度（％））を算出し、健常人（NV）の40歳以下、健常人の60歳以上、慢性膵炎患者（CP）、膵癌患者（PC）の4群のそれぞれの平均値を算出し、各アシアロ構造の糖鎖（2-0、2-F1, 3-0, 3-F1, 4-0, 4-F1, 4-F2）に関する相対存在度（％）とした。
表５〜表８に、各Ｓｉｔｅにおけるアシアロ構造糖鎖の相対存在度を示す。
【００５２】
【表５】
0005358952.tif 000014
【００５３】
【表６】
0005358952.tif 000015
【００５４】
【表７】
0005358952.tif 000016
【００５５】
【表８】
0005358952.tif 000017
【００５６】
また、図６に、各Ｓｉｔｅにおけるアシアロ構造糖鎖の相対存在度と各検体との関係を示す。
尚、相対存在度の有意差検定は、初めにnon-repeated measured ANOVAで各サイトの糖鎖構造における４群間の多重比較を行い、有意差のあった糖鎖構造のみ、４群間の２群ずつをそれぞれボンフェローニ補正を用いて比較した。
【００５７】
（４）ハプトグロビンの各サイトにおけるフコシル化糖鎖の相対存在度および非フコシル化糖鎖の相対存在度の算出
各Ｓｉｔｅにおいて、フコシル化糖鎖に関する相対存在度（％）および非フコシル化糖鎖に関する相対存在度（％）を算出した。
即ち、上記（３）と同様に、Ｓｉｔｅ  １とＳｉｔｅ  ４においては、前記LC-ESI MSにおいて決定された全糖鎖構造（シアロ−グリコペプチド）を、各検体毎に(1)フコシル化糖鎖を有さない〔非フコシル化糖鎖（without Fuc）〕もの（2-N1, 2-N2, 3-N2, 3-N3, 4-N1, 4-N2, 4-N3, 4-N4）と(2) フコシル化糖鎖（with Fuc）を有するもの（2-N1-F1, 2-N2-F1, 3-N2-F1, 3-N3-F1, 4-N1-F1, 4-N2-F1, 4-N3-F1, 4-N4-F1）にそれぞれグロープ化した。そして、前記LC-ESI MS解析で得られた各グリコペプチド（シアロ−グリコペプチド）に対応するシグナル強度（イオン強度）をグループ毎に合計（合計値）した。
検体ごとに検出・決定されたグリコペプチド（シアロ−グリコペプチド）の全シグナル強度（イオン強度）の合計を100%として、各々のグループの合計値（シグナル強度（イオン強度））の相対値（相対存在度（％））を算出し、健常人（NV）の40歳以下、健常人の60歳以上、慢性膵炎患者（CP）、膵癌患者（PC）の4群のそれぞれの平均値を算出し、フコシル化糖鎖に関する相対存在度（％）および非フコシル化糖鎖に関する相対存在度（％）を算出した。
また、Ｓｉｔｅ  ２とＳｉｔｅ  ３についても同様に、前記LC-ESI MSにおいて決定された全糖鎖構造（アシアロ−グリコペプチド）を、各検体毎に(1)フコシル化糖鎖を有さない〔非フコシル化糖鎖（without Fuc）〕もの（2-0, 3-0, 3-N2, 4-0）と(2) フコシル化糖鎖（with Fuc）を有するもの（2-F1, 3-F1, 4-F1, 4-F2）にそれぞれグロープ化した。そして、前記LC-ESI MS解析で得られた各グリコペプチド（アシアロ−グリコペプチド）に対応するシグナル強度（イオン強度）をグループ毎に合計（合計値）した。
検体ごとに検出・決定されたグリコペプチド（アシアロ−グリコペプチド）の全シグナル強度（イオン強度）の合計を100%として、各々のグループの合計値（シグナル強度（イオン強度））の相対値（相対存在度（％））を算出し、健常人（NV）の40歳以下、健常人の60歳以上、慢性膵炎患者（CP）、膵癌患者（PC）の4群のそれぞれの平均値を算出し、フコシル化糖鎖に関する相対存在度（％）および非フコシル化糖鎖に関する相対存在度（％）を算出した。
表９〜表１２に、各Ｓｉｔｅにおけるフコシル化糖鎖の相対存在度および非フコシル化糖鎖の相対存在度を示す。
【００５８】
【表９】
0005358952.tif 000018
【００５９】
【表１０】
0005358952.tif 000019
【００６０】
【表１１】
0005358952.tif 000020
【００６１】
【表１２】
0005358952.tif 000021
【００６２】
また、図７に、各Ｓｉｔｅにおけるフコシル化糖鎖の相対存在度および非フコシル化糖鎖の相対存在度と各検体との関係を示す。
尚、相対存在度の有意差検定は、初めにnon-repeated measured ANOVAで各サイトの糖鎖構造における４群間の多重比較を行い、有意差のあった糖鎖構造のみ、４群間の２群ずつをそれぞれボンフェローニ補正を用いて比較した。
【００６３】
（５）結果
表５〜８および図６の結果から、Ｓｉｔｅ  １においては3-F1（本発明の膵臓癌マーカー［II］および［２］に相当）の糖鎖構造が膵癌患者において他群（健常人および慢性膵炎患者）と比較して有意に増加していること、また、Ｓｉｔｅ  ３においては3-F1（本発明の膵臓癌マーカー［II］および［２］に相当）と4-F1〔前述の構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）がフコシル化されている本発明の膵臓癌マーカー［III］および本発明の膵臓癌マーカー［３］に相当〕の糖鎖構造が、膵癌患者において他群（健常人および慢性膵炎患者）と比較して有意に増加していることが判る。さらに、Ｓｉｔｅ  ３における4-F1の糖鎖構造はＳｉｔｅ  ４に若干認められる以外は他のＳｉｔｅには認められないこと、また、Ｓｉｔｅ  ３における4-F2〔前述の構造式［III］で示される糖鎖構造（配列）を含むフコシル化糖鎖であって、非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのＮ−アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）と非還元末端側に存在する４本に分岐した糖鎖中のいずれか１つのガラクトース（Ｇａｌ）の少なくとも２ヶ所がフコシル化されている本発明の膵臓癌マーカー［III］および本発明の膵臓癌マーカー［４］に相当）の糖鎖構造は、膵臓癌患者のみに認められることが判る。
以上のことから、Ｓｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３における上記した如き本発明に係る膵臓癌マーカーの量は、膵臓癌判定（診断、検査）の指標として有用であることが示唆される。
また、表９〜１２及び図７の結果から、いずれのＳｉｔｅにおいても、膵臓癌患者におけるフコシル化糖鎖の相対存在度の増加は認められものの、特に、Ｓｉｔｅ  １及びＳｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖の増加は、他のＳｉｔｅよりも著しく多いことが判る。また、Ｓｉｔｅ  １及びＳｉｔｅ  ３においては、膵癌患者に由来するフコシル化糖鎖が、他群（健常人および慢性膵炎患者）と比較して有意に増加していることが判る。
以上のことから、ヒトハプトグロビンのＳｉｔｅ  １又は／及びＳｉｔｅ  ３におけるフコシル化糖鎖の量は、膵臓癌判定（診断、検査）の指標として有用であることが示唆される。
【産業上の利用可能性】
【００６４】
本発明の膵臓癌マーカーは、膵臓癌の検出に有用な新規腫瘍マーカーであり、また、本発明の判定方法は、確度の高い膵臓癌の判定（診断、検査）を可能にする。
【図面の簡単な説明】
【００６５】
【図１】ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列におけるＳｉｔｅ  １〜４の位置を示す図である。
【図２】ヒトハプトグロビンのアミノ酸配列における、(1)トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼによる消化部位（消化断片）と(2)トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化部位（消化断片）を示す図である。
【図３】図３ＡのBPCは、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおけるBPCである。  図３ＡのEIC of MSMS (at m/z 657.3)は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MSMS測定で生成した質量数657.3 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図３ＡのEIC of MS（at 1221.8-1222.8 m/z）Site 1は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MS測定で生成した質量数1221.8-1222.8 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図３ＡのEIC of MS（at 1467.8-1468.8 m/z）Site 2-3は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MS測定で生成した質量数1467.8-1468.8 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図３ＡのEIC of MS（at 1333.9-1334.9 m/z）Site 4は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MS測定で生成した質量数1333.9-1334.9 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図３ＢのNV5 Site 1は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおいて同定したＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドの溶出位置付近（６７分〜７２分）のマススペクトラムをアベレージングした結果である。  図３ＢのCP4 Site 1は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した慢性膵炎患者(CP4)血清由来のヒトハプトグロビンにおいて同定したＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドの溶出位置付近（６７分〜７２分）のマススペクトラムをアベレージングした結果である。  図３ＢのPC5 Site 1は、実施例．１で得られた、トリプシン及びリシルエンドペプチダーゼにより消化した膵癌患者(PC5)血清由来のヒトハプトグロビンにおいて同定したＳｉｔｅ  １を含むグリコペプチドの溶出位置付近（６７分〜７２分）のマススペクトラムをアベレージングした結果である。
【図４】各Ｓｉｔｅにおける、各種糖鎖構造を有するペプチド断片（グリコペプチド）とその質量数の関係を示す図である。
【図５】図５ＡのBPCは、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおけるBPCである。  図５ＡのEIC of MSMS (at m/z 366.3)は、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MSMS測定で生成した質量数366.3 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図５ＡのEIC of MS（at 1298.4-1299.4 m/z）Site 2は、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MS測定で生成した質量数1298.4-1299.4 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図５ＡのEIC of MS（at 1063.8-1064.8 m/z）Site 3は、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおける、MS測定で生成した質量数1063.8-1064.8 m/zをもったフラグメントイオンのピーク強度を示したクロマトグラムである。  図５ＢのNV5 Site 3は、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った健常人(NV5)血清由来のヒトハプトグロビンにおいて同定したＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置付近（３分〜８分）のマススペクトラムをアベレージングした結果である。  図５ＢのCP4 Site 3は、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った慢性膵炎患者検体(CP4)血清由来のヒトハプトグロビンにおいて同定したＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置付近（３分〜８分）のマススペクトラムをアベレージングした結果である。  図５ＢのPC5 Site 3は、実施例．１で得られた、トリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃによる消化と酸処理（脱アシル化）を行った膵癌患者検体(PC5)血清由来のヒトハプトグロビンにおいて同定したＳｉｔｅ  ３を含むグリコペプチドの溶出位置付近（３分〜８分）のマススペクトラムをアベレージングした結果である。
【図６】実施例．１で得られた、各Ｓｉｔｅにおけるアシアロ構造糖鎖の相対存在度と各検体との関係を示す図である。
【図７】実施例．１で得られた、各Ｓｉｔｅにおけるフコシル化糖鎖の相対存在度および非フコシル化糖鎖の相対存在度と各検体との関係を示す図である。
【符号の説明】
【００６６】
図２中、黒枠はトリプシン及びリシルエンドペプチダーゼ処理により得られるペプチド断片を、また、白枠はトリプシン、リシルエンドペプチダーゼ及びエンドペプチダーゼＧｌｕ−Ｃ処理により得られるペプチド断片をそれぞれ示す。
【００６７】
図３Ｂ、図４、図５、図６及び図７において、糖鎖構造の略称（Abbreviation）の最初の数字は糖鎖の分岐数を、Nとその数字はNeuAcの数を、またFとその数字はフコシル化の数をそれぞれ示す。
【図１】
0005358952.tif 000029
【図２】
0005358952.tif 000030
【図３】
0005358952.tif 000031
【図４】
0005358952.tif 000032
【図５】
0005358952.tif 000033
【図６】
0005358952.tif 000034
【図７】
0005358952.tif 000035