(57)【要約】【課題】  マススペクトルを的確に分析することができるマススペクトル解析装置、マススペクトル解析方法、マススペクトル解析プログラムを提供すること。【解決手段】  本発明にかかるマススペクトル解析装置は、複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析装置であって、マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出するピーク位置検出手段１４と、複数のマススペクトルにおいてピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出する一致度算出手段１５とを備えるものである。【選択図】  図１
2005351669.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析装置であって、
前記マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出するピーク位置検出手段と、
複数の前記マススペクトルにおいて検出された前記ピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出する一致度算出手段とを備えるマススペクトル解析装置。
【請求項２】
前記窓の位置に応じてピークの数が重み付けされていることを特徴とする請求項１記載のマススペクトル解析装置。
【請求項３】
異なる２群のサンプルに対して前記複数のマススペクトルがそれぞれ計測され、
前記異なる２群の前記一致度の差を算出する一致度の差算出手段をさらに備える請求項１又は２記載のマススペクトル解析装置。
【請求項４】
複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析方法であって、
前記マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出するピーク位置検出ステップと、
複数の前記マススペクトルにおいて検出された前記ピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出する一致度算出ステップとを備えるマススペクトル解析方法。
【請求項５】
前記窓の位置に応じてピークの数が重み付けされていることを特徴とする請求項４記載のマススペクトル解析方法。
【請求項６】
異なる２群のサンプルに対して前記複数のマススペクトルがそれぞれ計測され、
前記異なる２群の前記一致度の差を算出する一致度の差算出ステップをさらに備える請求項４又は５記載のマススペクトル解析方法。
【請求項７】
複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析プログラムであって、
コンピュータに対して、
前記マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出させるピーク位置検出ステップと、
複数の前記マススペクトルにおいて検出された前記ピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出させる一致度算出ステップとを備えるマススペクトル解析プログラム。
【請求項８】
前記窓の位置に応じてピークの数が重み付けされていることを特徴とする請求項７記載のマススペクトル解析プログラム。
【請求項９】
異なる２群のサンプルに対して前記複数のマススペクトルがそれぞれ計測され、
前記異なる２群の前記一致度の差を算出させる一致度の差算出ステップをさらに備える請求項７又は８記載のマススペクトル解析プログラム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、サンプルに対して測定されたマススペクトルの解析装置、解析方法及び解析プログラムに関する。
【背景技術】
【０００２】
近年、MALDI−TOF−MS（Matrix  Assisted  Laser  Desorption／Ionization−Time  Of  Flight−Mass  Spectrometry：マトリクス支援レーザ脱離イオン化飛行時間質量分析計）が利用されるようになって来ている。MALDI−TOF−MSでは、例えば、血液中のたんぱく質の質量分析を行い、疾患の診断や発症機序の生化学的な解明などを行うことができる。具体的な一例としては、癌の増殖に伴って血中に増加する蛋白質の質量スペクトルを測定、解析することで、癌と非癌の切り分けができるパターンを見出し、そのパターンを基準として判定する。
【０００３】
MALDI−TOF−MSではマススペクトルのピークの解析が重要となる。従来、マススペクトルの解析は、オペレーターが手作業で行っていた。すなわち、健常者と患者のそれぞれに対して複数のサンプルを抽出し、マススペクトルを測定する。この複数のマススペクトルを視覚的に重ね合わせて、健常者と患者との間で差が見られる特徴的なピークを抽出している。しかしながら、人間の知覚的な判断では、ばらつきがあり、再現性の高い解析を行うことが困難である。さらに、解析に要する時間が長くなってしまう。特にサンプル数が多数になった場合、解析時間が長くなり、解析を行う効率が悪くなるだけでなく、再現性の高い解析を行うことが困難になる。
【０００４】
また、２つのクロマトグラムのデータに対して、ピークの面積値又はピークの高さをピーク毎に計算して、算出された面積値又は高さ値の差をピーク毎にヒストグラム化するデータ処理装置が開示されている（特許文献１）。しかし、このデータ処理装置は、２つのクロマトグラムを比較する処理装置であり、様々な生体サンプルのマススペクトルの解析には不適当であった。
【０００５】
【特許文献１】特開平９−２１０９８３号公報
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
生体から抽出された血液等の生体サンプルでは一般的にマススペクトルの変動が大きい。このため、患者のデータと健常者のデータを比較した場合であっても、確定的な違いが常に観測できるとは限らない。すなわち、生体サンプルであるがゆえ、生体自体の個体差、健康状態の変化によって、同一の患者から得られたマススペクトルのピークであっても位置、高さ、面積等がばらついてしまう。また、原子の同位体の存在、複数の生化学物質の共存によって、解析が複雑となってしまう。さらに、マススペクトルを異なる質量分析装置で測定する場合、装置の設定によってもマススペクトルに差が生じてしまう。
【０００７】
一方、このような変動要因がある場合であっても、マススペクトルのピークの特徴を完全に無秩序にするほど重大なものではない。結果的に熟練した人間の知覚的な判断によれば、患者と健常者の傾向が判断できる程度にはピークの特徴が表れる。
【０００８】
本発明は上述の課題に鑑みてなされたもので、サンプルに対して、的確にマススペクトルを解析することができるマススペクトルの解析装置、解析方法及び解析プログラムを提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明の第一の態様にかかるマススペクトルの解析装置は、複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析装置であって、前記マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出するピーク位置検出手段（例えば、本発明の実施の形態にかかるピーク位置検出部１４）と、複数の前記マススペクトルにおいて前記ピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出する一致度算出手段（例えば、本発明の実施の形態にかかるピーク位置検出部１５）とを備えるものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１０】
本発明の第二の態様にかかるマススペクトルの解析装置は、上述のマススペクトル解析装置において、前記窓の位置に応じてピークの数が重み付けされていることを特徴とするものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１１】
本発明の第三の態様にかかるマススペクトルの解析装置は、上述のマススペクトル解析装置において、異なる２群のサンプルに対して前記複数のマススペクトルがそれぞれ計測され、前記異なる２群の前記一致度の差を算出する一致度の差算出手段（例えば、本発明の実施の形態にかかる一致度の差算出部１６）をさらに備えるものである。これにより、的確なマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１２】
本発明の第四の態様にかかるマススペクトルの解析方法は、複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析方法であって、前記マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出するピーク位置検出ステップ（例えば、本発明の実施の形態にかかるピーク位置検出ステップＳ１０２）と、複数の前記マススペクトルにおいて前記ピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出する一致度算出ステップ（例えば、本発明の実施の形態にかかる一致度算出ステップＳ１０３）とを備えるものである。これにより、的確なマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１３】
本発明の第五の態様にかかるマススペクトルの解析方法は、上述のマススペクトル解析方法において、前記窓の位置に応じてピークの数が重み付けされていることを特徴とするものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１４】
本発明の第六の態様にかかるマススペクトルの解析装置は、上述のマススペクトル解析方法において、異なる２群のサンプルに対して前記複数のマススペクトルがそれぞれ計測され、前記異なる２群の前記一致度の差を算出する一致度の差算出ステップ（例えば、本発明の実施の形態にかかる一致度の差算出ステップＳ１０５）をさらに備えるものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１５】
本発明の第七の態様にかかるマススペクトルの解析プログラムは、複数のサンプルに対して計測されたマススペクトルを解析するマススペクトル解析プログラムであって、コンピュータに対して、前記マススペクトルがピークとなるピーク位置を検出させるピーク位置検出ステップと、複数の前記マススペクトルにおいて前記ピーク位置が質量数に対して幅を持つ窓に含まれる数に基づいてピークの一致度を算出させる一致度算出ステップとを備えるものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１６】
本発明の第八の態様にかかるマススペクトルの解析プログラムは、上述のマススペクトル解析プログラムにおいて、前記窓の位置に応じてピークの数が重み付けされていることを特徴とするものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【００１７】
本発明の第九の態様にかかるマススペクトルの解析プログラムは、上述のマススペクトル解析プログラムにおいて、異なる２群のサンプルに対して前記複数のマススペクトルがそれぞれ計測され、前記異なる２群の前記一致度の差を算出させる一致度の差算出ステップをさらに備えるものである。これにより、的確にマススペクトルの解析を行うことができる。
【発明の効果】
【００１８】
本発明によれば、サンプルに対して、的確なマススペクトルの解析を行うことができるマススペクトル解析装置、マススペクトル解析方法及びマススペクトル解析プログラムを提供することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１９】
以下に、本発明を適用可能な実施の形態が説明される。以下の説明は、本発明の実施形態を説明するものであり、本発明が以下の実施形態に限定されるものではない。説明の明確化のため、以下の記載は、適宜、省略及び簡略化がなされている。又、当業者であれば、以下の実施形態の各要素を、本発明の範囲において容易に変更、追加、変換することが可能であろう。尚、各図において同一の符号を付されたものは同様の要素を示しており、適宜、説明が省略される。
【００２０】
本発明では、特定の疾患にかかっている患者のサンプルと健常者のサンプルとでマススペクトルを比較するため、複数の患者及び複数の健常者について生体サンプルを抽出し、それぞれのサンプルについてマススペクトルを計測している。そして、患者と健常者とで測定されたマススペクトルを比較することにより、マススペクトルに生じる特徴あるピークを求めている。さらに本実施の形態では、本発明による解析結果と比較するため、熟練した人間が手動で解析を行った結果を示している。
【００２１】
本発明にかかるマススペクトルの解析装置について図１を用いて説明する。図１は本発明にかかるマススペクトルの解析装置の構成を示すブロック図である。１０は解析装置、１１はデータＩ／Ｆ部、１２は入力部、１３は解析部、１４はピーク検出部、１５は一致度算出部、１６は一致度の差算出部、１７は表示部、２０は計測装置である。
【００２２】
本発明にかかる解析装置１０は例えば、パーソナルコンピュータ等の演算処理装置であり、計測装置２０により計測されたマススペクトルの解析を行う。計測装置２０は例えば、MALDI−TOF−MS（Matrix  Assisted  Laser  Desorption／Ionization−Time  Of  Flight−Mass  Spectrometry：マトリクス支援レーザ脱離イオン化飛行時間質量分析計）に用いられる飛行時間型質量分析装置を備えている。そして、計測装置２０は血液、尿、体液又は髄液等の生体サンプルに含まれるたんぱく質のマススペクトルを計測する。
【００２３】
計測装置２０は、たんぱく質にレーザを照射して、試料を気化し、遊離のイオンに変える。そして、真空の電界中でたんぱく質のイオンを飛ばしてイオンが検出器まで到達する時間によってその質量数を求める。なお、ここでの質量数とは実際には質量数／電荷のことを示す。飛行時間型質量分析装置は一定の電界によって同じエネルギーを与えられた粒子がその質量によって互いに異なる速度を持つことを利用したものである。質量数の高い粒子の場合、飛行速度が低いため、飛行時間が長くなり、質量数の低い粒子の場合、飛行速度が高いため飛行時間が短くなる。従って、質量数に応じて飛行時間が変化する。
【００２４】
計測装置２０は飛行時間に応じて検出された電流に基づいて、マススペクトルを測定する。ここで、飛行時間が質量数に対応し、検出された電流が強度に対応する。これにより、生体サンプル中に存在するたんぱく質のマススペクトルが測定される。
【００２５】
計測装置２０からの出力は、データＩ／Ｆ部１１を介して解析装置１０に入力される。データＩ／Ｆ部は例えば、計測装置２０のアナログデータをデジタルデータに変換する。これにより、解析装置２０で解析可能なマススペクトルデータが入力される。解析装置１０はハードディスクなどの記憶装置(図示せず)を備えており、入力されたマススペクトルデータを記憶する。記憶されたマススペクトルデータは解析部１３で解析処理される。解析部１３はＣＰＵやメモリなどを備えた演算処理回路を備えており、入力されたマススペクトルに基づいて所定の解析処理を実行し、解析結果を出力する。
【００２６】
解析部１３はピーク位置検出部１４と一致度算出部１５と一致度の差算出部１６とを備えている。ピーク位置検出部１４は入力されたマススペクトルデータに対して、ピークの位置を検出する。すなわち、ピーク位置検出部１４はピークの頂点における質量数を検出する。ピーク位置検出部１４は入力されたマススペクトルのそれぞれに対してピーク位置を検出する。ピーク位置は通常１つのマススペクトルに対して複数検出される。
【００２７】
一致度算出部１５は複数のマススペクトルから検出されたピーク位置の一致度を算出する。一致度とは、複数のマススペクトルのピーク位置がどの程度一致するかを示す値である。例えば、５つのマススペクトルのうち、４つのピーク位置が一致していた場合、一致度は４／５＝０．８となる。すなわち、一致度は各質量数のとき、全体のサンプルのうち、何例でピークが認められたかを示す値となる。さらに、本発明では、一致度を算出するために、質量数に対して一定の幅を持つ窓を設定している。そして、マススペクトルのピーク位置がこの窓に含まれるとき、ピークが一致するものとして一致度をカウントする。これにより、マススペクトルに変動要因があったとしても、特徴的なピークの抜けがなくなる。よって、変動の大きい生体サンプルの解析に好適である。この窓の幅は使用者によって変更可能であり、キーボードやマウスなどの入力装置を有する入力部１２によって入力される。これにより、対象となる生体サンプルにおいて頻繁に表れるピーク位置を求めることができる。
【００２８】
一致度算出部１５で算出された２つの一致度は一致度の差算出部１６でその差が算出される。例えば、患者と健常者のそれぞれで複数のサンプルのマススペクトルを測定する。そして、患者のグループと健常者のグループでそれぞれ、一致度を算出する。この２つのグループの一致度に基づいて一致度の差算出部１６は差を算出する。すなわち、患者のグループの一致度と健常者のグループの一致度との差を求める。これにより、患者と健常者とで特徴的な差のあるピークを求めることができる。表示部１７は液晶表示装置等のモニターを備えており、解析結果を表示する。使用者はこの表示された解析結果に基づいて、例えば、特定の疾患で生じる特徴あるピークを知ることができる。
【００２９】
次に、解析方法の手順について図２を用いて説明する。図２は解析方法の手順を示すフローチャートである。計測装置２０によって計測されたマススペクトルが解析装置１０に入力される（ステップＳ１０１）。このマススペクトルは患者と健常者に対してそれぞれ複数測定される。すなわち、複数の患者のマススペクトルと複数の健常者のマススペクトルが計測され、解析装置１０に入力される。ここで健常者のグループをＡ群、患者のグループをＢ群とする。使用者はそれぞれのマススペクトルがＡ群であるかＢ群であるかを入力部１２により入力する。マススペクトルデータのそれぞれは入力された群と対応付けられて解析装置１０に記憶される。すなわち、健常者のマススペクトルがＡ群として記憶され、患者のマススペクトルはＢ群として記憶される。さらに、測定対象である人の名前、性別、年齢、病状あるいは測定日時などの測定条件を入力部１２によって入力して、マススペクトルと対応付けて記憶するようにしてもよい
【００３０】
それぞれのマススペクトルに対してピーク位置が検出される（ステップＳ１０２）。ここでは、患者及び健常者に対して同じ処理がなされ、それぞれにサンプルに対してピーク位置が検出される。このピーク位置は入力された群と対応付けて記憶される。入力された全てのマススペクトルに対してピーク位置が検出されると、それぞれの群で一致度を算出する。まず、Ａ群のデータに対して、ピークの一致度を計算する（ステップＳ１０３）。これにより、健常者のマススペクトルで頻繁に表れるピーク位置を求めることができる。次にＢ群に対してピークの一致度を計算する（ステップＳ１０４）。これにより、患者のマススペクトルで頻繁に表れるピーク位置を求めることができる。
【００３１】
次にＡ群とＢ群との一致度に基づいて一致度の差を算出する（ステップＳ１０５）。すなわち、Ａ群の一致度とＢ群の一致度の差を求める。この一致度の差が一定の値以上となったピーク位置が差のあるピークとなる（ステップＳ１０６）。ここで、使用者は任意に値を入力部１２により入力し、差のあるピークを表として表示部１７に表示させるようにする。すなわち、使用者に入力された値がしきい値となり、一致度の差がしきい値以上のピーク位置が表示される。使用者はこのピーク位置に基づいて、新たに測定されたマススペクトルから、患者か健常者であるかを判別することが可能になる。例えば、患者で頻繁に表れるピーク位置であって、健常者にはあまり表れないピーク位置の場合、一致度の差が大きくなる。使用者は新しいマススペクトルがこのピーク位置にピークがあるかないかを観測し、患者か健常者かを判別することができる。
【００３２】
次に、実際のマススペクトルデータ及び解析データを用いて解析処理について説明する。図３は計測装置２０により測定されたデータを示す図である。図３において、横軸は質量数、縦軸は相対的な強度を示している。図３は計測されたマススペクトルの一例を示している。なお、横軸の質量数は実際には質量数／電荷（ｍｐｚ）のことを示している。計測装置２０における飛行時間が質量数に対応し、計測装置における検出電流が強度に対応する。なお、図３に示すマススペクトルは一つのサンプルから計測された１つのマススペクトルであり、健常者のデータである。なお、図３では質量数は３０００〜１００００（ｍｐｚ）におけるマススペクトルを示しており、この範囲に多数のピークが表れている。
【００３３】
４人の被験者について疾患中、回復後でそれぞれ２回ずつ計測し、述べ１６名のマススペクトルを測定した。ここでは、疾患中のマススペクトルを患者のデータとし、疾患から回復した時のマススペクトルを健常者のデータとしている。従って、患者及び健常者とも８例のマススペクトルが測定されている。
【００３４】
図３に示されるデータはデジタルデータであり、それぞれの質量数に対して強度が１対１で対応している。すなわち、質量数が３０００〜１００００の間で、質量数１毎に対応する強度がデジタルデータとして存在する。よって、質量数が３０００〜１００００の間で、それぞれの質量数に対応する７０００個の強度の値が存在する。
【００３５】
次に複数のサンプルで計測されたマススペクトルを図４に示す。図４（ａ）は健常者のグループのマススペクトルデータであり、図４（ｂ）は患者のグループのマススペクトルデータである。なお、ここでは図４（ｂ）の患者が回復して健常者となったときのマススペクトルデータを図４（ａ）に示している。図４では、患者及び健常者についてそれぞれ８つのマススペクトルを重ね合わせて表示している。これらのマススペクトルデータから検出されたピーク位置が図４（ｃ）に示されている。
【００３６】
本実施の形態ではノイズの多いマススペクトルから正確にピーク位置を検出するため、以下の処理を行っている。まず、マススペクトルに対して平滑化微分で傾きを求める。ここでは平滑化点数を７０点として移動平均を求め、平滑化微分を行っている。すなわち、質量数７０点分の強度の平均値を平滑化した値とする。この平滑化した値を微分して傾きを求めている。例えば、質量数４０００の時の、平滑化した強度は質量数３９６６〜４０３５の強度の平均値となる。これによりノイズの多いマススペクトルが平滑化される。
【００３７】
そして、平滑化した強度の傾きの変化から極大値となる質量数を求める。すなわち、傾きの変化が正から負に切り替わる地点が極大値となるため、その質量数が求められる。さらに極大値の近傍で平均化する前のデータが最大値となる質量数を求める。ここで、近傍点数を平滑化点数と同じ値としている。すなわち、平滑化した値が極大値となる質量数に対して質量数の幅が７０の間で、最大値となる質量数を算出する。例えば、平滑化した強度の極大値が質量数４０００であるとすると、質量数３９６６〜４０３５の間で、平滑化前の強度が最大値を取る時の質量数が算出される。さらにこの強度の最大値がしきい値を超えるものをピークとし、ピーク位置が算出される。すなわち、しきい値を超える強度の最大値が存在する質量数がピーク位置となる。これにより、ノイズが多い場合であっても正確にピーク位置を検出することができる。
【００３８】
上述の処理によって検出されたピーク位置が図４（ｃ）に示されている。図３は横軸が質量数（ｍｐｚ）を示しており、縦軸はそれぞれのサンプルに対応している。すなわち、疾患の８個のサンプルは縦軸１〜８に対応し、健常者の８個のサンプルは縦軸９〜１６に対応する。それぞれのサンプルに対応する横線で、ピークが検出された質量数に縦のマーカーが記されている。すなわち、マーカーの位置がそれぞれのサンプルにおけるピーク位置となる。例えば、サンプル１、２において、質量数３２００近傍にピークが検出されている。一方、サンプル３〜８において質量数３２００近傍にピークが検出されていない。本実施の形態における１６個のサンプルから、図４（ｃ）に示すピーク位置が検出されている。
【００３９】
図４（ｃ）に示すように同じ疾患の患者であってもそれぞれピーク位置が異なる。また回復して健常者となっていてもそれぞれピーク位置が異なる。さらにはピークの高さ及びピーク面積値がそれぞれのサンプルで異なる。本実施の形態では、ピークの高さや面積値には着目せず、ピークの位置のみに着目して解析を行うようにする。これにより、変動要因の多い生体サンプルであっても抜けがない解析を再現性よく行うことができる。
【００４０】
図４（ａ）と図４（ｂ）において、横軸の下に記載されている矢印は、熟練した人間の手動検出により検出された特徴的な差のあるマススペクトルのピークである。手動検出では、回復後のマススペクトルには１つの特徴的な差のあるピークが検出され、疾患中のマススペクトルには４つの特徴的な差のあるピークで検出されている。すなわち、回復後のマススペクトルにおいて図４（ａ）の矢印で示されている質量数には、疾患中ではピークがほとんど表れないと判断されるが、回復後ではピークが頻繁に表れると人間によって判断される。一方、疾患中のマススペクトルにおいて図４（ｂ）の矢印で示されている質量数には、回復中ではピークがほとんど表れないと判断されるが、疾患中ではピークが頻繁に表れると人間によって判断される。
【００４１】
上述の人間による判断はマススペクトルを縦一列に並べて行われている。例えば、図５に示すように８例の回復後のマススペクトルを縦一列に並べて配置する。また、図６に示すように８例の疾患中のマススペクトルを並べて縦一列に配置する。さらに、回復後と疾患中とのマススペクトルを縦一列に並べて配置する。そして、縦一列に配置された１６例のマススペクトルを人間が知覚的に判断し、回復後と疾患中とで、差のあるピークを検出している。回復後ではピークが頻繁に表れるが疾患中ではほとんどピークが表れない質量数と回復後ではピークがほとんど表れないが疾患中ではピークが頻繁に表れる質量数とが特徴的で差のあるピーク位置として検出される。これらのピーク位置に基づいて、疾患者か健常者が判断されることになる。
【００４２】
図５及び図６に示すマススペクトルを縦一列に並べて配置して、人間が知覚的に判断する場合、それぞれのマススペクトルに多数のピークがあり、解析が複雑になる。よって、特徴的で差のあるピーク位置に抜けが出てしまうことがある。また、生体サンプルであるが故、個人差、健康状態の変化によってマススペクトルが変動してしまう。さらに、原子の同位体の存在、複数の生化学物質の共存、分析装置の性能、分解能などが解析を複雑にしてしまう。統計的な精度を向上するため、サンプル数を増やしていくと、人間による知覚的な判断では解析を行う効率が悪くなるだけでなく、再現性の高い解析を行うことが困難になる。
【００４３】
本発明では、所定の演算処理によりピークの自動検出を行っているため、変動要因の多い生体サンプルであっても抜けがない解析を再現性よく行うことができる。また、本発明は、ピークの高さや面積値には着目せず、ピークの位置のみに着目して解析を行うようにしているため、健康状態の変化や個人差など変動の大きい生体サンプルに対して好適である。さらに統計精度を上げるため、サンプル数を増やした場合であっても、解析時間を短縮することができる。
【００４４】
次にピークの一致度を算出するステップについて図７を用いて説明する。図７は疾患中のサンプルに対するマススペクトルのピーク位置を示す図である。図７では図４（ｃ）と同様に、横軸が質量数（ｍｐｚ）を示しており、縦軸はそれぞれのサンプルに対応している。すなわち、疾患の８個のサンプルは縦軸１〜８に対応している。それぞれのサンプルに対応する横線で、ピークが検出された質量数に縦のマーカーが記されている。すなわち、マーカーの位置がそれぞれのサンプルにおけるピーク位置となる。
【００４５】
ピークの一致度とは、複数のマススペクトルのピーク位置がどの程度一致するかを示す値である。疾患中のサンプル数は８であるため、８つのマススペクトルの全てにおいて、同じ質量数にピークが表れた場合、その質量数における一致度は８／８＝１となる。一方、８つのマススペクトルの全てにおいて、同じ質量数でピークが全く表れなかった場合、その質量数における一致度は０となる。また、８つのマススペクトルの１つのみに、ピークが表れた質量数では、その質量数における一致度は１／８＝０．１２５となる。このピークの一致度をそれぞれの質量数に対して算出する。
【００４６】
さらに、本発明では、マススペクトルの変動要因を考慮して、質量数に対してある一定の幅を持つ窓５１を設けて一致度を算出している。すなわち、対象となるマススペクトルにおいて、この窓の幅に含まれたピークの数に基づいて一致度が算出される。例えば、図７に示す窓５１ａに着目すると、全く同じ質量数ではないが、サンプル３〜８に対応する６個のピークが窓に含まれる。この窓に含まれるピークの数に基づいて一致度が算出される。これらの、６個のピーク位置の質量数は全く同じでもよく、それぞれ異なっていてもよい。また、図７に示す窓５１ｂに着目すると、サンプル４と６で質量数の異なるピークが検出されているが、これらは窓５１ｂに含まれる。このため、２つのピークに基づいて一致度がカウントされる。今回の解析では窓幅を１０ｍｐｚとし、１０ｍｐｚの幅を持つ窓を質量数に対して走査させて、窓に含まれるピークの数をカウントする。すなわち、１０ｍｐｚの幅を持つ窓を１ｍｐｚづつずらしていき、ピーク位置がこの窓に含まれる数をカウントする。そして、窓に含まれたピークの数に基づいて、それぞれの質量数における一致度を算出する。このように窓に含まれるピークの数に基づいて一致度を算出することにより、変動要因の多い生体サンプルでも抜けのない解析を行うことができる。
【００４７】
上述のように窓幅内に含まれるピークの数に基づいて一致度が算出される。さらに本発明では、窓の形状をコサインカーブとして、窓内の位置に応じて、窓に含まれるピーク数を変更している。すなわち、窓幅に含まれるピーク位置に対して、その位置に応じた重み付けを行っている。この重み付けのための関数がコサイン関数となる。この窓の形状について図８を用いて説明する。図８は窓の形状とピーク位置の関係を示す図である。図８では説明のためサンプル数を２として図示している。
【００４８】
図８に示すように窓の形状５２はコサインカーブとなっている。従って、窓５１の中心では最大値の１となり、窓５１の外側に行くほど値が小さくなる。そして、窓５１の両端では０となる。窓の形状５２に対応する値を全てにサンプルに対して積算して、サンプル数で割った値に基づいてピークの一致度が算出される。例えば、図８に示す２つのサンプルでは、互いのピークの位置が窓に含まれる程度にずれているとする。従って、一方のピーク位置に窓の中心が走査されたとき、他方のピーク位置は中心よりずれる。この値が０．５となる。図８では一方のピーク位置に窓の中心が一致するよう走査されたときの構成を示している。この時、他方のピーク位置に対応する窓の形状５２の値は０．５となるものとする。
【００４９】
図８に示す構成では、窓の形状５２は一方が１で、他方が０．５となる。全てのサンプル数に対する窓の形状５２の値の和をサンプル数で割った値に基づいて一致度となる。図８に示す構成では窓に含まれるピークの数は１＋０．５＝１．５となる。一方、窓を走査していきもう一方のピーク位置と窓の中心とが一致したときも、窓に含まれるピークの数は０．５＋１＝１．５となる。このように窓の形状５２を考慮して、窓に含まれるピークの数を算出する。そして、窓の位置を走査して、マススペクトル全体に対して窓に含まれるピーク数を算出する。これにより、窓に含まれるピーク数は質量数の関数となる。この窓に含まれるピーク数の傾きの変化から極大値となる質量数を求める。すなわち、傾きの変化が正から負に切り替わる地点が極大値となるため、その質量数が求められる。この極大値となる質量数におけるピーク数をピークの一致度とする。窓は質量数に対して一定の幅を持っているため、極大値近傍では窓に含まれるピーク数がある程度大きくなり、極大値における値と近くなる。検出されたピーク位置が窓に含まれる数に対して極大値を求め、この極大値に対してピークの一致度を求めることにより、的確にピークの一致度を算出することができる。これにより、それぞれの群に対して頻繁に表れるピーク位置を求めることができる。
【００５０】
このようにして求められたピーク位置とピークの一致度を図９及び図１０に示す。図９は疾患中のサンプルに対する解析結果を示すグラフ図である。図１０は回復後のサンプルに対する解析結果を示すグラフ図である。図９及ぶ図１０では上がピーク位置を示すグラフであり、下がピークの一致度を示すグラフである。ピークの一致度を示すグラフでは横軸が質量数であり、縦軸がピークの一致度である。このように２群の生体サンプルに対してそれぞれピーク位置の一致度が算出される。
【００５１】
次に回復後の一致度と疾患中の一致度の差を算出するステップについて図１１を用いて説明する。図１１は算出された一致度の差を示す図である。図１１では回復後の一致度から疾患中の一致度を引いた値の絶対値を示している。従って、この一致度の差が大きいほど、回復後又は疾患中のいずれか一方で頻出し、他方でほとんど表れないピークとなる。
【００５２】
ピークの一致度の差を算出することにより、特徴的で差のあるピーク位置を求めることができる。回復後でピークが頻出し、疾患中ではピークがほとんど表れない質量数では、一致度の差が大きくなる。また、疾患中でピークが頻出し、回復後ではピークがほとんど表れない質量数では一致度の差が大きくなる。これらの質量数に表れるピークは特徴的で差のあるピークと言える。一方、疾患中と回復後ともピークが頻出する質量数では、一致度の差が小さくなる。この質量数では、ほとんどのサンプルに対してピークが表れるため、この質量数近傍にピークが表れても、差のないピークと言える。疾患中と回復後ともピークがほとんど表れない質量数では一致度の差が大きくなる。この質量数では、ほとんどのサンプルに対してピークが表れないため、この質量数近傍にピークが表れても変動要因によるものと考えられる。そして、ピークの一致度の差が大きいほど、患者と健常者でピークが表れる頻度の差が大きくなる。従って、ピークの一致度の差が大きいほど、この質量数に特徴的で差のあるピークが存在すると言える。
【００５３】
図１１には、比較のための手動検出結果６０が示されている。すなわち、手動検出結果６０に囲まれているピークは人間によって、特徴的で差のあるピークとして判断されたものである。このように、本発明によって人間によって特徴的で差のあるピークとして判断されたもの以外にも、複数の特徴的で差のあるピークを検出することができる。さらに、手動検出結果６０では検出されなかったピーク位置でも、手動検出結果６０で検出されたものより一致度の差が大きいものがあることが分かる。このように、ピーク一致度の差を算出することにより、特徴的で差のあるピークが抜けることなく解析することができる。
【００５４】
さらに、本発明により解析されたピーク位置の解析結果を表１に示す。
【表１】
2005351669.tif 000003
【００５５】
表１には本発明による解析方法で検出された特徴的で差のあるピーク位置が自動検出結果として示されている。この解析結果を表示部１７に表として表示するようにしてもよい。例えば、入力部１２によって任意の値を入力し、その値以上の一致度の差を持つピーク位置が表示部１７に表示されるようにする。表１では一致度の差の順に上からピーク位置が表示されている。さらに表１では比較のため、人間による手動検出結果で検出された特徴的で差のあるピーク位置を示している。
【００５６】
表１に示すように一致度の差が大きい質量数であっても、手動では検出できない場合がある。本発明では上述のように特徴的で差のあるピーク位置を求めることにより、抜けがなく的確な解析を行うことができる。さらに、統計誤差を低減するために、サンプル数を増やした場合であっても、従来の手動検出よりも格段に短時間で解析を行うことができる。このように抜けがなく的確な解析を行うことによって、特定の疾患で頻出するピーク位置を正確に特定することができる。よって、このピーク位置を基に、別の対象者が特定の疾患にかかっているか否かを正確に判別することができる。
【００５７】
本発明では、さらに入力部１２によって、様々な設定を使用者によって入力可能としている。例えば、解析対象となるサンプルや疾患によって、窓の幅を調整することができるようにする。また、ピーク位置検出ステップにおける平滑化点数やしきい値も変更可能としてもよい。さらに窓の形状を設定可能にして、コサイン以外の関数で重み付けを行ってもよい。これらの設定値を使用者が入力可能とすることによって、様々な疾患に応じて的確な解析を行うことができる。さらに、窓の走査ピッチは１ｍｐｚに限られたものではない。より正確な解析を行う場合は、走査ピッチを小さくすることが好ましく、解析時間を短縮する場合は、走査ピッチを大きくすることが好ましい。走査ピッチや窓の幅は整数に限らず、小数でもよい。
【００５８】
上述の解析手順や設定値は一例であり、上述の実施例に限られるものではない。なお、上述の説明ではマススペクトルにおいて強度のデータが質量数１毎に存在するとしたが、実際には強度のデータは計測装置２０の分解能に応じた質量数毎に存在する。すなわち、計測装置の分解能が０．１であるときは、質量数０．１毎に強度のデータが存在する。このとき、ピーク位置も０．１の分解能で検出されることになる。本発明にかかる解析は、例えば、生体サンプル中のたんぱく質をＳＥＬＤＩ法やＭＡＬＤＩ法でイオン化して得られたマススペクトル対して好適である。
【００５９】
本発明では、マススペクトルからピーク位置に関する情報のみを抽出し、ピーク位置に基づいて解析処理を実行している。これにより、様々な変動要因によりピークの高さや面積が変動した場合でも、的確で抜けのない解析を再現性よく行うことができる。さらに、複数の生体サンプルのピーク位置が質量に対して一定の幅を持つ窓に含まれる数を算出することにより、同位体の存在などの変動要因により、ピーク位置がずれている場合であっても、的確で抜けのない解析を行うことができる。
【００６０】
本発明にかかるマススペクトル解析装置、マススペクトル解析方法は通常のパーソナルコンピュータ（ＰＣ）以外にもワークステーション、汎用機、ＦＡコンピュータや、これらの組合せによって実施可能であることを容易に理解できるであろう。ただし、これらの構成要素は例示であり、その全ての構成要素が本発明の必須の構成要素となるわけではない。さらに、解析装置は物理的に単一である必要はなく、複数の端末により並列処理を行っても良い。
【図面の簡単な説明】
【００６１】
【図１】本発明の実施の形態１にかかるマススペクトルの解析装置の構成を模式的に示すブロック図である。
【図２】本発明の実施の形態１にかかる解析方法の手順を示すフローチャートである。
【図３】本発明の計測装置で計測されるマススペクトルの一例を示す図である。
【図４】本発明の計測装置で計測されるマススペクトル及びそのピーク位置を示すグラフ図である。
【図５】本発明の計測装置で計測される患者のマススペクトルを示すグラフ図である。
【図６】本発明の計測装置で計測される患者のマススペクトルを示すグラフ図である。
【図７】本発明の解析方法におけるピーク位置と窓の走査を示すグラフ図である。
【図８】本発明の解析方法における窓の形状とピーク位置を示すグラフ図である
【図９】本発明の患者のサンプルにおける一致度とピーク位置を示すグラフ図である
【図１０】本発明の健常者のサンプルにおける一致度とピーク位置を示すグラフ図である
【図１１】本発明の解析方法における一致度の差を示すグラフ図である
【符号の説明】
【００６２】
１０  解析装置、１１  データＩ／Ｆ部、１２  入力部、１３  解析部
１４  ピーク位置検出部、１５  一致度算出部、１６  一致度の差算出部、
１７  表示部、２０  計測装置、
５１  窓、５２  窓の形状
【図１】
2005351669.tif 000004
【図２】
2005351669.tif 000005
【図３】
2005351669.tif 000006
【図４】
2005351669.tif 000007
【図５】
2005351669.tif 000008
【図６】
2005351669.tif 000009
【図７】
2005351669.tif 000010
【図８】
2005351669.tif 000011
【図９】
2005351669.tif 000012
【図１０】
2005351669.tif 000013
【図１１】
2005351669.tif 000014