(57)【要約】      （修正有）【課題】治験薬データベース等の化合物情報データベースに掲載されている情報から、化合物を製造可能な中間体に関する構造や該中間体から製造可能な化合物がどれくらいあるか等の情報を得る方法を提供すること。【解決手段】入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、親化合物以外のＣＡＳ番号を比較して同一のＣＡＳ番号を抽出し、対応する親化合物のＣＡＳ番号を前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成して表示することを特徴とする有機化合物情報の処理システム。【選択図】図２
2005157424.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
親化合物のＣＡＳ番号を入力する入力手段と、
入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、前記中間体情報ファイルを記憶手段に記憶する中間体情報作成手段と、
前記中間体情報ファイルの親化合物以外のＣＡＳ番号を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出する抽出手段と、
抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するリスト作成手段と、
前記リストを表示する表示手段とを備えてなることを特徴とする有機化合物情報の処理システム。
【請求項２】
親化合物のＣＡＳ番号を入力するステップと、
入力された親化合物にＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号を前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けた中間体情報を作成するステップと、
前記中間体情報を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出するステップと、
抽出されたＣＡＳ番号を、対応する親化合物のＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するステップとを含むことを特徴とする有機化合物情報の処理方法。
【請求項３】
コンピュータを、
親化合物のＣＡＳ番号を入力する入力手段と、
入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、前記中間体情報ファイルを記憶手段に記憶する中間体情報作成手段と、
前記中間体情報ファイルのＣＡＳ番号を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出する抽出手段と、
抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するリスト作成手段と、
前記リストを表示する表示手段として機能させるための処理プログラム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、有機化合物情報の処理システム、処理方法および処理プログラムに関する。
【背景技術】
【０００２】
近年製薬企業においては、開発医薬品の中間体の製造を外部の化学企業等へ委託するケースが増加している。かかる開発医薬品の中間体製造ビジネスにおいては、製薬企業からの委託という形態が主体ではあるが、中間体を製造可能な企業から、製薬企業に対して、前記中間体の製造を提案するという形態を取ることもあり得る。いずれの形態であっても、中間体を製造するに要するコストや対応のスピード等が重要であるのはもちろんであるが、後者の中間体の製造を提案するという形態においては、どのような中間体を提案するか、どのような中間体を標的化合物とするか、という点も重要であった。特に、中間体を製造する企業にとっては、種々の開発医薬品に誘導が可能な共通の中間体を標的化合物とすることにより、より多くのビジネスチャンスを得ることができ、また当該ビジネスの拡大へつながることが考えられた。
【０００３】
一方で、開発医薬品自体の情報は、例えばＰｈａｒｍａＳｔｒｕｃｔｕｒｅｓ等の市販の種々の治験薬データベースにほぼ網羅的に掲載されているため、前記データベースを検索することにより、開発医薬品の数自体は膨大であるものの、その構造は把握できるようになっている。しかしながら、その中間体についての情報は前記データベースに掲載されている場合が少なく、前記データベースを検索するだけでは、中間体をピックアップすることすら難しいという状況であり、これらデータベースに掲載されている多くの開発医薬品の情報を活用して、その中間体に関する情報を得ることは知られていなかった。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
このような状況のもと、本発明者らは、治験薬データベース等の化合物情報データベースに掲載されている情報から、化合物を製造可能な中間体に関する構造や該中間体から製造可能な化合物がどれくらいあるか等の情報を得る方法として、有機化合物の製造方法については、ほぼ網羅的に掲載され、その信頼性も高いケミカルアブストアクツ等の有機化合物文献情報を活用する方法を鋭意検討したところ、親化合物のＣＡＳ番号を入力する入力手段と、入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、前記中間体情報ファイルを記憶手段に記憶する中間体情報作成手段と、前記中間体情報ファイルの親化合物以外のＣＡＳ番号を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出する抽出手段と、抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するリスト作成手段と、前記リストを表示する表示手段とを備えてなることを特徴とする有機化合物情報の処理システムにより、膨大な有機化合物情報から容易にその中間体に関する情報を得ることができることを見出し、本発明に至った。
【課題を解決するための手段】
【０００５】
すなわち本発明は、親化合物のＣＡＳ番号を入力する入力手段と、入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、前記中間体情報ファイルを記憶手段に記憶する中間体情報作成手段と、前記中間体情報ファイルの親化合物以外のＣＡＳ番号を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出する抽出手段と、抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するリスト作成手段と、前記リストを表示する表示手段とを備えてなることを特徴とする有機化合物情報の処理システム、処理方法および処理プログラムを提供するものである。
【発明の効果】
【０００６】
本発明によれば、膨大な化合物情報から、その合成中間体に関する情報を容易に得ることができ、有用で、多くの開発医薬品に誘導可能な中間体を見出すことができるため、例えば開発医薬品の中間体製造ビジネスにおいて、より有利となり得る。
【発明を実施するための最良の形態】
【０００７】
本発明の有機化合物情報の処理システムは、親化合物のＣＡＳ番号を入力する入力手段と、入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、前記中間体情報ファイルを記憶手段に記憶する中間体情報作成手段と、前記中間体情報ファイルのＣＡＳ番号を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するリスト作成手段と、前記リストを表示する表示手段とを備えてなることを特徴とする有機化合物情報の処理システムであり、その一例の構成を機能的に示した図を図１に示した。
【０００８】
また、本発明の有機化合物情報の処理方法は、親化合物のＣＡＳ番号を入力するステップ（以下、ステップ（ｉ）と略記する。）と、入力された親化合物にＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号を前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けた中間体情報を作成するステップ（以下、ステップ（ｉｉ）と略記する。）と、前記中間体情報を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するステップ（以下、ステップ（ｉｉｉ）と略記する。）とを含むことを特徴とする有機化合物情報の処理方法であり、そのフロー図を図２に示した。
【０００９】
また、本発明の有機化合物情報の処理プログラムは、コンピュータを、親化合物のＣＡＳ番号を入力する入力手段と、入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報をピックアップし、該文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルを作成し、前記中間体情報ファイルを記憶手段に記憶する中間体情報作成手段と、前記中間体情報ファイルのＣＡＳ番号を比較し、同一のＣＡＳ番号を抽出し、抽出したＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号を、前記抽出したＣＡＳ番号と関連付けたリストを作成するリスト作成手段と、前記リストを表示する表示手段として機能させるための処理プログラムである。
【００１０】
以下、本発明について、図面を参照しながら説明する。まず、前記ステップ（ｉ）では、親化合物のＣＡＳ番号が入力手段１により、入力される（図２  Ｓ１）。入力された親化合物のＣＡＳ番号は、記憶手段５に記憶される。かかる入力手段１としては、親化合物のＣＡＳ番号が入力可能なものであればよく、例えばキーボード等が挙げられる。かかる親化合物のＣＡＳ番号としては、例えばＰｈａｒｍａＳｔｒｕｃｔｕｒｅｓ、ＣＩＰＳＬＩＮＥ、ＰＩＯＮＥＥＲ、明日の新薬等の市販の治験薬データベース等に掲載されている化合物のＣＡＳ番号等が挙げられる。かかるデータベースにＣＡＳ番号が掲載されている場合は、かかるデータベースからＣＡＳ番号を抽出し、入力するようにしてもよい。なお、ＣＡＳ番号だけでは、親化合物の構造が把握できないので、親化合物の構造も入力しておき、ＣＡＳ番号からその構造を参照できるようにしておいてもよい。親化合物のＣＡＳ番号の一例を、その構造とともに図３に示した。図３は、親化合物として、（Ｒ）−サルブタモールのＣＡＳ番号３４３９１−０４−３を入力した例である。
【００１１】
全ての親化合物のＣＡＳ番号の入力が終われば、次ステップ（ｉｉ）に進む。
【００１２】
ステップ（ｉｉ）では、中間体情報作成手段２により、前記ステップ（ｉ）で入力された親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースが検索され（図２  Ｓ２）、前記親化合物のＣＡＳ番号および前記親化合物の製造方法が掲載された文献情報がピックアップされ、ピックアップされた文献情報から前記親化合物以外の化合物のＣＡＳ番号が抽出され、抽出されたＣＡＳ番号が前記親化合物のＣＡＳ番号と関連付けて格納された中間体情報ファイルが作成される。作成された中間体情報ファイルは記憶手段５に記憶される（図２  Ｓ３）。これにより、前記親化合物の製造方法に関連する化合物のＣＡＳ番号がピックアップされる。
【００１３】
有機化合物文献情報データベースとしては、ＣＡＳ番号で検索が可能なものであって、有機化合物の製造方法や中間体のＣＡＳ番号等が掲載されたものであればよく、例えばケミカルアブストラクツ、バイルシュタイン等が挙げられる。かかる有機化合物文献情報データベースを、親化合物のＣＡＳ番号に基づき、検索することにより、親化合物のＣＡＳ番号が記載された文献情報がピックアップされる。ピックアップされた文献情報には、親化合物のＣＡＳ番号のほかに、親化合物の製造方法やその中間体のＣＡＳ番号等が掲載されており、かかる文献情報から、前記親化合物のＣＡＳ番号以外のＣＡＳ番号を抽出することにより、親化合物の製造方法に関連する化合物のＣＡＳ番号が抽出される。抽出された親化合物以外のＣＡＳ番号は、親化合物のＣＡＳ番号と関連付けられ、中間体情報ファイルとして格納される。なお、かかる検索において、例えば市販試薬カタログ等に記載されている市販化合物のＣＡＳ番号や中間体に該当しない親化合物に類似した医薬品化合物のＣＡＳ番号等を除外するようにしておくことにより、ノイズの少ない中間体情報ファイルが作成される。
【００１４】
このようにして、全ての親化合物のＣＡＳ番号について、化合物文献情報の検索がなされ、親化合物以外のＣＡＳ番号の抽出が終了すれば（図１  Ｓ４）、全ての親化合物のＣＡＳ番号について、中間体情報ファイルが作成されており、次ステップ（ｉｉｉ）に進む。中間体情報ファイルの一例を図４に示す。図４には、（Ｒ）−サルブタモール（ＣＡＳ番号３４３９１−０４−３）を親化合物としたときに、作成された中間体情報ファイルを示している。１行目は、親化合物のＣＡＳ番号を示しており、２行目は、抽出された親化合物以外のＣＡＳ番号の個数を示しており、３行目以降に、抽出された親化合物以外のＣＡＳ番号が示されている。また、図６に、全ての親化合物について作成された中間体情報ファイルを模式的に表わした図を示した。ここでは、親化合物のＣＡＳ番号をＴ１〜Ｔｎとし、検索により抽出された親化合物以外のＣＡＳ番号をＲ１〜Ｒｒとし、例えば親化合物のＣＡＳ番号Ｔ１については、その中間体情報ファイルには、９つの化合物のＣＡＳ番号Ｒ１〜Ｒ９が格納されており、例えば親化合物のＣＡＳ番号Ｔ２については、その中間体情報ファイルには、９つの化合物のＣＡＳ番号Ｒ２、Ｒ１０〜Ｒ１７が格納されていることを示す。
【００１５】
続いて、ステップ（ｉｉｉ）では、リスト作成手段３により、記憶手段５に記憶された全ての中間体情報ファイルのＣＡＳ番号が比較され、同一のＣＡＳ番号を有する親化合物のＣＡＳ番号が抽出され（図２  Ｓ５）、抽出された親化合物のＣＡＳ番号が、前記同一のＣＡＳ番号と関連付けられたリストが作成される（図２  Ｓ６）。
【００１６】
親化合物のＣＡＳ番号の抽出のフローを図５に示した。記憶手段５に記憶された中間体情報ファイルの中から、互いに比較していない任意の二つの中間体情報ファイルが選択され（図５  Ｓ５１）、互いに比較していない任意の二つの中間体情報ファイルに格納されている親化合物のＣＡＳ番号以外のＣＡＳ番号が比較される（図５  Ｓ５２）。同一のＣＡＳ番号が存在すれば（図５  Ｓ５３）、対応するそれぞれの親化合物のＣＡＳ番号が抽出される（図５  Ｓ５４）。そして、抽出された親化合物のＣＡＳ番号と、前記同一のＣＡＳ番号とが対応付けられたリストが作成される（図２  Ｓ６および図５  Ｓ５６）。
【００１７】
選択された二つの中間体情報ファイルの親化合物のＣＡＳ番号以外の全てのＣＡＳ番号の比較が終了すれば（図２  Ｓ７および図５  Ｓ５７）、互いに比較していない別の任意の二つの中間体情報ファイルが選択され、比較が実行される。
【００１８】
前記リストは、同一のＣＡＳ番号の化合物を用いて製造された親化合物のＣＡＳ番号のリストであり、例えば同じＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号は、同じ行に、異なるＣＡＳ番号に対応する親化合物のＣＡＳ番号は、異なる行にリスト化されるようなっている。したがって、同一のＣＡＳ番号を抽出すると、そのＣＡＳ番号が、リストに既に存在しているかどうかが判断され、リストに既に存在しているＣＡＳ番号と同一であれば、同じ行に親化合物のＣＡＳ番号が追加され、異なるＣＡＳ番号であれば、異なる行に親化合物のＣＡＳ番号がリスト化されるようなっている。作成されたリストは記憶手段５に記憶される。かかるリストの具体例を図７に示す。図７は、図６に示した模式的な中間体情報ファイルから、同一のＣＡＳ番号を抽出し、対応する親化合物のＣＡＳ番号をリスト化したものであり、例えばＣＡＳ番号がＴ１、Ｔ２およびＴ４の親化合物は、いずれもＣＡＳ番号Ｒ２の化合物を中間体としていることが分かる（リスト番号Ｃ１）。また、ＣＡＳ番号Ｔ５、Ｔ６、Ｔ８およびＴ９の親化合物は、ＣＡＳ番号Ｒ５１の化合物を中間体としていることが分かる（リスト番号Ｃ３）。
【００１９】
このようにして、全ての中間体情報ファイルの比較が終了すれば（図５  Ｓ５８）、次ステップ（ｖｉ）に進む。
【００２０】
ステップ（ｖｉ）では、表示手段により、前記ステップ（ｖ）で作成されたリストが表示される。表示手段としては、前記リストが表示可能なものであればよく、例えばディスプレイ、プリンタ等が挙げられる。
【図面の簡単な説明】
【００２１】
【図１】本発明の有機化合物情報の処理システムの構成の一例を機能的に示した図である。
【図２】本発明の有機化合物情報の処理方法のフロー図である。
【図３】親化合物のＣＡＳ番号の一例とその構造を示した図である。
【図４】図３に示した親化合物のＣＡＳ番号に基づき、有機化合物文献情報データベースを検索し、作成された中間体情報ファイルの一例である。
【図５】ステップ（ｉｉｉ）のフロー図である。
【図６】親化合物のＣＡＳ番号Ｔ１〜Ｔｎについて、作成された中間体情報ファイルを模式的に示した図である。
【図７】図６に示した中間体情報ファイルをもとに作成されたリストの一例である。
【符号の説明】
【００２２】
１    入力手段、２    中間体情報作成手段、３    リスト作成手段、
４    表示手段、５    記憶手段
【図１】
2005157424.tif 000003
【図２】
2005157424.tif 000004
【図３】
2005157424.tif 000005
【図４】
2005157424.tif 000006
【図５】
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【図６】
2005157424.tif 000008
【図７】
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