(57)【要約】【課題】  被験者の血液を採取するといった簡便な方法でありながら、散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測できる方法、装置およびシステムを実現する。【解決手段】  ａ）被験対象から採取した細胞からゲノムを抽出する段階、ｂ）ＡＰＯＡ２遺伝子を増幅して核酸断片を得る段階、およびｃ）ｂ）で得られた核酸断片中のＡＰＯＡ２遺伝子のＴＧ反復回数を計測する段階、の各段階により被験対象のＡＰＯＡ２の遺伝子型を判定する。ＴＧ反復回数をもとにしたスコアが高いほど、散発性高齢発症型アルツハイマー症の発症年齢が低いと予測される。【選択図】  なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験対象から採取した細胞のゲノム中のＡＰＯＡ２の遺伝子型を判定することを特徴とする散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢の予測方法。
【請求項２】
両対立遺伝子におけるＡＰＯＡ２の遺伝子におけるＧＴ反復回数の合計が多いほど散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢が低いと予測する、請求項１に記載の予測方法。
【請求項３】
対立遺伝子におけるＡＰＯＡ２の遺伝子におけるＧＴ反復回数の範囲によってスコアを規定することを特徴とする請求項１または請求項２に記載の予測方法。
【請求項４】
両対立遺伝子におけるそれぞれの上記スコアの合計が高いほど散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢が低いと予測することを特徴とする請求項１ないし請求項３記載の予測方法。
【請求項５】
被験対象がＡＰＯＥ−ε４遺伝子保有者であることを特徴とする請求項１ないし請求項４記載の予測方法。
【請求項６】
ＰＣＲ法により遺伝子を増幅させることを含む、請求項１ないし請求項５に記載の予測方法。
【請求項７】
遺伝子型の判定が電気泳動度の比較により実行される、請求項１ないし請求項６のいずれかに記載の予測方法。
【請求項８】
散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症リスクの予測と組合せられる、請求項１ないし請求項７のいずれかに記載の予測方法。
【請求項９】
散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢を予測するためのデータを収集する方法であって、被験対象から採取した細胞のゲノム中のＡＰＯＡ２の遺伝子型を判定することを特徴とする方法。
【請求項１０】
細胞が血液から採取されることを特徴とする請求項９記載の方法。
【請求項１１】
ＰＣＲ法により遺伝子を増幅させることを含む、請求項９または請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
遺伝子型の判定が電気泳動度の比較により実行される、請求項９ないし請求項１１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】  本発明は、散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢を予測する方法に関連する。本発明はまた、散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢を予測する方法において使用する配列を含む核酸にも関連する。
【背景技術】
【０００２】  アルツハイマー病（ＡＤ）は、記憶、知能、身体全体の機能が衰えていき、ついには死に至る神経変性疾患である。中でも、高齢発症型アルツハイマー病（ＬＯＡＤ）は、高齢者の痴呆の主原因である。ＡＤは、特に病状が進行すると、現在のところ確実な治療法がない難病であり、患者の苦痛のみならず、患者を介護する家族や社会の負担が大きな社会問題となっている。現在、アルツハイマー病の原因解明や治療方法の開発のために、精力的に研究が進められている。【０００３】  ＡＤには家族性と散発性があり、後者が約９０％を占める。組織病理学的には、ＡＤは、神経細胞の脱落による脳の萎縮、老人班の蓄積および神経原線維変化で特徴付けられ、家族性ＡＤの研究において、これらの病変と関連すると考えられるいくつかの原因遺伝子が発見されている。家族性ＬＯＡＤの患者に頻繁に見られるアポリポタンパク質Ｅ−ε４対立遺伝子（ＡＰＯＥ−ε４）は、散発性ＬＯＡＤにおいても発症のリスク因子であることが、様々な遺伝的背景の患者で証明された（非特許文献１参照）。この事実は、家族性と散発性とは発症リスクを共有していことを意味している。【０００４】  散発性ＬＯＡＤの発症年齢と遺伝的素因の関連について、ＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子の保有数が注目されたが、これは発症年齢に対して１０％しか影響を与えておらず（非特許文献２）、さらにＡＰＯＥ−ε４遺伝子を保有する被験者が必ずしもＬＯＡＤを発症するわけではないことが明らかにされたことから（非特許文献３）、他の遺伝的素因の影響があると考えられた。一方で、ＬＯＡＤ発症者においては血漿ＡｐｏＡ２濃度の低下が明らかにされている（非特許文献４）。しかし、カロリー制限、アルコール摂取及び食事中の脂肪過多といった栄養状態を左右する状況によって、ＡＰＯＡ２の血漿中濃度は減少することが明らかにされていることから（非特許文献５）、前記血漿ＡｐｏＡ２濃度の低下によって、ＬＯＡＤが発症するかどうかは未だ不確定である。【０００５】
【非特許文献１】  Ｆａｒｒｅｒ  ＬＡ，  Ｃｕｐｐｌｅｓ  ＬＡ，  Ｈｙｍａｎ  Ｂ，  Ｋｕｋｕｌｌ  ＷＡ，  Ｍａｙｅｕｘ  Ｒ，  Ｍｙｅｒｓ  ＧＨ，  Ｐｅｒｉｃａｋ−Ｖａｎｃｅ  ＭＡ，  Ｒｉｓｃｈ  Ｎ，  Ｖａ  Ｄｕｉｊｎ  ＣＭ．  共著「ｆｏｒ  ｔｈｅ  ＡＰＯＥ  ａｎｄ  Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ  Ｄｉｓｅａｓｅ  Ｍｅｔａ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ  （１９９７）  Ｅｆｆｅｃｔｓ  ｏｆ  ａｇｅ，  ｓｅｘ，  ａｎｄ  ｅｔｈｎｉｃｉｔｙ  ｏｎ  ｔｈｅ  ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｂｅｔｗｅｅｎ  ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅ  ｇｅｎｏｔｙｐｅ  ａｎｄ  Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ  ｄｉｓｅａｓｅ．  Ａ  ｍｅｔａ−ａｎａｌｙｓｉｓ．」  ＪＡＭＡ    ２７８  Ｐ１３４９−１３５６
【非特許文献２】  Ｓｌｏｏｔｅｒ  ＡＪ，  Ｃｒｕｔｓ  Ｍ，  Ｋａｌｍｉｊｎ  Ｓ，  Ｈｏｆｍａｎ  Ａ，  Ｂｒｅｔｅｌｅｒ  ＭＭ，    Ｖａｎ  Ｂｒｏｅｃｋｈｏｖｅｎ  Ｃ，  ｖａｎ  Ｄｕｉｊｎ  ＣＭ．  共著  （１９９８）  「Ｒｉｓｋ  ｅｓｔｉｍａｔｅｓ  ｏｆ  ｄｅｍｅｎｔｉａ  ｂｙ  ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅ  ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ  ｆｒｏｍ  ａ  ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ−ｂａｓｅｄ  ｉｎｃｉｄｅｎｃｅ  Ｓｔｕｄｙ：ｔｈｅ  Ｒｏｔｔｅｒｄａｍ  Ｓｔｕｄｙ．」  Ａｒｃｈ  Ｎｅｕｒｏｌ．  ５５  Ｐ９６４−９６８
【非特許文献３】  Ｍｅｙｅｒ  ＭＲ，  Ｔｓｃｈａｎｚ  ＪＴ，  Ｎｏｒｔｏｎ  ＭＣ，  Ｗｅｌｓｈ−Ｂｏｈｍｅｒ  ＫＡ，  Ｓｔｅｆｆｅｎｓ  ＤＣ，  Ｗｙｓｅ  ＢＷ，  Ｂｒｅｉｔｎｅｒ  ＪＣ．  共著  （１９９８）  「ＡＰＯＥ  ｇｅｎｏｔｙｐｅ  ｐｒｅｄｉｃｔｓ  ｗｈｅｎ−ｎｏｔ  Ｗｈｅｔｈｅｒ−ｏｎｅ  ｉｓ  ｐｒｅｄｉｓｐｏｓｅｄ  ｔｏ  ｄｅｖｅｌｏｐ  Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ  ｄｉｓｅａｓｅ．  Ｎａｔ  Ｇｅｎｅｔ  １９：Ｐ３２１−３２２
【非特許文献４】  Ｋａｍｉｎｏ  Ｋ，  Ｋｉｄａ  Ｔ，  Ｔａｎａｋａ  Ｔ，  Ｔａｎｉｉ  Ｈ，  Ｏｋｏｃｈｉ  Ｍ，  Ｋｕｄｏ    Ｔ，  Ｋｏｂａｙａｓｈｉ  Ｔ，  Ｔａｋｅｄａ  Ｍ．  共著（２００２）  「Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｓ  ａｎｄ  β  ａｍｙｌｏｉｄｏ  ｔｒａｎｓｐｏｒｔ  ｐａｔｈｗａｙ．」Ｐｓｙｃｈｏｇｅｒｉａｔｒｉｃｓ  ２：Ｐ１４９−１５５
【非特許文献５】  Ｅｈｎｈｏｌｍ  Ｃ，  Ｈｕｔｔｕｎｅｎ  ＪＫ，Ｐｉｅｔｉｎｅｎ  Ｐ，  Ｌｅｉｎｏ  Ｕ，Ｍｕｔａｎｅｎ  Ｍ，  Ｋｏｓｔｉａｉｎｅｎ  Ｅ，  Ｐｉｋｋａｒａｉｎｅｎ  Ｊ，  Ｄｏｕｇｈｅｒｔｙ  Ｒ，  Ｉａｃｏｎｏ  Ｊ，  Ｐｕｓｋａ  Ｐ．共著  （１９８２）  「Ｅｆｆｅｃｔ  ｏｆ  ｄｉｅｔ  ｏｎ  ｓｅｔｕｍ  ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｓ  ａ  ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ  ｗｉｔｈ  ａ  ｈｉｇｈ  ｒｉｓｋ  ｏｆ  ｃｏｒｏｎａｒｙ  ｈｅａｒｔ  ｄｉｓｅａｓｅ．」Ｎ  Ｅｎｇ  Ｊ  Ｍｅｄ  ３０７：Ｐ８５０−８５５
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】  ＡＤは、進行すると治療が非常に困難であるが、理論上、器質的な中枢神経障害が軽微な段階であれば治療できる可能性がある。ＡＤの早期発見のためには、定期的に検診を受けることが望ましい。しかし、すべての人が頻繁に検診を受けるのは、被験者の時間的・経済的負担が大きく、また社会全体の医療費を圧迫するという観点からも難しい。そこで、ＡＤ発症リスクとＡＤ発症年齢の予測を行い、発症を予測された年齢の被験者に対して重点的にＡＤ検診を行うのが効率的であると考えられる。【０００７】  しかしながら、上記従来の構成では、ＡＤ発症リスクとＡＤ発症年齢の予測はできない。上記非特許文献３では、ＡＰＯＥ−ε４対立遺伝子によるＬＯＡＤ発症年齢の予測は困難であることが示唆される。さらに、上記非特許文献４では、血漿ＡｐｏＡ２濃度と散発性ＬＯＡＤ発症との関連が示唆されているが、血漿ＡｐｏＡ２濃度により散発性ＬＯＡＤ発症年齢が予測できるわけではないという問題点がある。
また、脂質代謝と散発性ＬＯＡＤ発症年齢との関連性についての知見はあるものの、脂質代謝は被験者の栄養状態に左右されることから、上記散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測することは困難である。このため、簡便でかつ、単純な解析で、上記散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測する方法の開発が強く求められていた。【０００８】  本発明は、上記の問題点に鑑みてなされたものであり、その目的は、被験者の血液を採取するといった簡便な方法でありながら、散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測できる方法、装置およびシステムを提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００９】  本発明者は、上記の課題に鑑み鋭意検討した結果、被験者の血液を採取し、ＡＰＯＡ２の遺伝子型を判定するだけで、散発性ＬＯＡＤを発症する年齢が何歳頃かどうか予測可能であることを独自に見出し、簡便でかつ単純な解析で散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測することができる本発明を完成させるに至った。【００１０】  すなわち、本発明にかかる散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測方法は、上記の課題を解決するために、被験者対象から採取した細胞のゲノム中のＡＰＯＡ２遺伝子型を判定することを特徴としている。上記方法において、両対立遺伝子におけるＡＰＯＡ２の遺伝子型のＧＴ反復回数の合計が多いほど散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢が低いと予測する工程を含むものであってもよい。また、上記方法において、対立遺伝子におけるＡＰＯＡ２の遺伝子におけるＧＴ反復回数の範囲によってスコアを規定することにより、上記発症年齢を予測する工程を含むものであってものよい。また、上記方法において、両対立遺伝子におけるそれぞれの上記スコアの合計が高いほど散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢が低いと予測する工程が含まれることが好ましい。さらに、上記被験者対象がＡＰＯＥ−ε４遺伝子保有者であることが好ましい。さらに、上記予測方法において、ＰＣＲ法により遺伝子を増幅させる工程を含む方法であってもよい。また、上記遺伝子型の判定が電気泳動度の比較により実行される方法であってもよく、散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症リスクの予測と組み合わされる工程を含むものであってもよい。【００１１】  また、本発明にかかる散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢を予測するためのデータを収集する方法は、被験対象から採取した細胞のゲノム中のＡＰＯＡ２の遺伝子型を判定する工程を含むものであってもよく、ＰＣＲ法により遺伝子を増幅させる工程を含むものであってもよい。さらに、遺伝子型の判定が電気泳動度の比較により実行される工程を含むものであってもよい。
【発明の効果】
【００１２】  本発明に係る散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢の予測方法は、以上のように被験対象から採取したゲノム中のＡＰＯＡ２の遺伝子型を判定するだけで、散発性ＬＯＡＤ発症年齢を簡単かつ迅速に予測することが可能になる。このことは、散発性ＬＯＡＤの処置や予防に有用である。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１３】  本発明は、散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢を簡便かつ単純な解析により予測するための方法及び装置を提供するものである。このため、本発明によれば、例えばＡＤ発症リスクとＡＤ発症年齢の予測を行い、発症を予測された年齢の被験者に対して重点的にＡＤ検診を行い、効率的にＡＤ発症の予防や処置が行うことができる。これらのＡＤ発症の予防や処置を行うことにより、社会問題となっている医療費の高騰を押さえ、予防医学に貢献できるものであり、この点において、本発明は非常に有用かつ社会的インパクトの強い発明であるといえる。【００１４】  以下、本発明に係る散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢を予測する方法について説明し、次いで、装置について説明することとする。なお、本発明はこれに限定されるものではない。【００１５】    （１）散発性高齢発症型アルツハイマー病の発症年齢の予測方法
散発性高齢発症型アルツハイマー病（散発性ＬＯＡＤ）とは、主に６０歳以降に発症するアルツハイマー病で、１ないし２親等内にアルツハイマー病発症者が認められない場合を指す。本発明における「散発性高齢発症型アルツハイマー病」または「散発性ＬＯＡＤ」は、ＮＩＮＣＤＳ−ＡＤＲＤＡによるアルツハイマー病の診断基凖に該当する疾患の中で、家族性発症がなく、６０歳以上で発症する疾患と定義される。【００１６】  アポリポタンパク質Ａ−ＩＩ（ＡＰＯＡ２）遺伝子は、アポリポ蛋白Ａ２（ＡｐｏＡ２）をコードしている。ＡｐｏＡ２は、高密度リポタンパク質（ＨＤＬ）の主要タンパク質であり、抹消組織から肝臓へのいわゆる逆コレステロール輸送や脂質代謝において、重要な役割を果たしている。【００１７】  本発明者らは、散発性ＬＯＡＤに罹患した人の発症年齢とＡＰＯＡ２遺伝子におけるＧＴ反復回数との関連を統計学的に調査した。その結果、散発性ＬＯＡＤ患者の中でもＡＰＯＥ−ε４遺伝子保有者では、ＡＰＯＡ２のＧＴ反復回数が多いほど発症年齢が低いことを見出した（実施例参照）。【００１８】  本発明は、上記の研究結果を利用して散発性高齢発症型アルツハイマー病発症年齢の予測を可能にしたことを特徴としている。以下に、本発明の各態様について具体的に説明する。【００１９】  本発明における「散発性高齢発症型アルツハイマー病発症年齢」とは、Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｓｔａｇｉｎｇ  （ＦＡＳＴ）の  Ｓｔａｇｅ  ３  に適合する症状および／またはそれに類似する症状を有するに至る年齢を意味する。【００２０】  本発明の散発性高齢発症型アルツハイマー病（散発性ＬＯＡＤ）の発症年齢の予測方法は、被験対象から採取した細胞のゲノムＤＮＡ中のＡＰＯＡ２遺伝子のＧＴ反復回数を計測することを含む。本発明の「被験対象」とは、散発性ＬＯＡＤに罹患する可能性のある哺乳動物、特にヒト、マウス、ウマ、愛玩動物を意味するが、散発性ＬＯＡＤに罹患している対象に対しても本発明の方法を使用できる。細胞は被験対象のいかなる組織から採取してもよく、血液から採取するのが容易である。【００２１】  ＡＰＯＡ２遺伝子のＧＴ反復回数の計測には、ａ）被験対象から採取した細胞からゲノムＤＮＡを抽出する段階、ｂ）ＡＰＯＡ２遺伝子を増幅して核酸断片を得る段階、およびｃ）ｂ）で得られた核酸断片中のＡＰＯＡ２遺伝子のＧＴ反復回数を計測する段階、が含まれる。段階ａ）では、市販の核酸抽出キットなどを使用して細胞中のゲノ厶ＤＮＡを単離する。場合によっては、段階ｂ）で使用する核酸増幅用成分がゲノムＤＮＡに接近し得る程度に細胞を溶解するだけでよく、他の細胞成分からゲノムＤＮＡを単離しなくてもよい。【００２２】  段階ｂ）では、ＰＣＲ法、ＤＮＡポリメラーゼを利用する核酸増幅法、鎖置換増幅法などでＡＰＯＡ２のＤＮＡを増幅する。最も一般的なＰＣＲ法による増幅では、ＡＰＯＡ２遺伝子領域の上流および下流に位置する配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーとして使用して、ＡＰＯＡ２遺伝子領域の核酸を増幅させる。増幅させる核酸は、ＡＰＯＡ２遺伝子領域を含んでいれば、どのような長さであってもよい。当業者は、ＡＰＯＡ２遺伝子領域を含む核酸の増幅に使用するプライマーを適宜設計し、合成することができる。プライマーとして使用するオリゴヌクレオチドは、約１５個から約５０個、好ましくは約１５個から３５個のヌクレオチドからなる。例えば、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号Ｘ０２９０５の塩基配列を参照して、ＡＰＯＡ２遺伝子領域の上流に位置するヌクレオチド配列からなるプライマーと、下流に位置するヌクレオチド配列に相補的な配列からなるプライマーを使用して増幅させる。ＡＰＯＡ２マイクロサテライト領域の増幅に使用するプライマーのオリゴヌクレオチドは、段階ｃ）で反復回数を計測するために、ＦＡＭ（カルボキシフルオロセイン）などの蛍光物質や放射性同位元素などで標識化されていてもよい。【００２３】  段階ｃ）では、ｂ）で得られた核酸断片中のＡＰＯＡ２遺伝子のＧＴ反復回数を計測する。本発明の方法では、公知のＤＮＡシークエンス法やＤＮＡチップを使用する方法などいかなる手段で反復回数を計測してもよい。また、反復回数の範囲によってスコアを規定し、両対立遺伝子におけるそれぞれの上記スコアの合計を算出してもよい。ＡＰＯＡ２遺伝子領域の多型は配列長の差異を特徴とするので、特に、最も簡便な反復回数の計測方法は、当分野で日常的に実施されている電気泳動法である。本発明の方法では、数個のヌクレオチド長の差異でも検出できるように、ポリアクリルアミドゲル電気泳動や、キャピラリーシークエンサーを利用する電気泳動が好ましい。電気泳動後、各々の電気泳動方法およびｂ）で使用したプライマーの標識に適する方法で核酸断片の長さを確認する。ポリアクリルアミド電気泳動の場合、段階ｂ）で使用するプライマーは放射性標識を有するのが好ましく、キャピラリーシークエンサーを利用する電気泳動の場合、該プライマーは蛍光標識を有するのが好ましい。【００２４】  本発明では、ＡＰＯＥ遺伝子ε４型遺伝子の保有者であって、ＡＰＯＡ２遺伝子のＧＴ反復回数が多い被験対象は、散発性ＬＯＡＤ発症年齢が低いと予測する。反復回数とは、対立遺伝子にコードされているＡＰＯＡ２遺伝子のイントロン２にあるマイクロサテライト多型の繰り返し回数をいう。【００２５】  本発明の方法は、発症リスクの予測と組合せてもよい。発症リスクは、ＡＰＯＥ遺伝子ε４型の保有数から予測できる。その方法は、Ｗｅｎｈａｍ，Ｐ．Ｒ，，Ｐｒｉｃｅ，Ｗ．Ｈ．，Ｂｌａｎｄｅｌｌ，Ｇ．Ｌａｎｃｅｔ  ３３７，１１５８−１１５９（１９９１）に記載されているＷｅｎｈａｍらのプロトコールに従って、あるいはＳＮＰ検出法により、当業者により適宜実施される。【００２６】  本発明の第２の態様は、被験対象から採取した細胞のゲノムＤＮＡ中のＡＰＯＡ２遺伝子のＧＴ反復回数を計測することを含む、散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測するためのデータを収集する方法である。その具体的方法は、上記の第１の態様と同様である。【００２７】  また、上記本発明の第２の態様は、上記散発性ＬＯＡＤ発症年齢を予測するためのデータを解析するシステムであってもよい。【００２８】  本発明にかかる散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測解析するシステムは、コンピューターなどの従来公知の演算装置を用いてなるシステムとなっていればよい。図２に本実施の形態にかかる散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測解析するシステム１００の構成の一例を表すブロック図を示す。同図に示すように、散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測解析するシステム１００は、遺伝子配列計測装置１０と、散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０と出力装置３０とを備えている。【００２９】  遺伝子配列計測装置１０は、シークエンサー５１Ａを備えている。なお、シークエンサー５１Ａとしては、従来公知のシークエンサーを利用することができ、特に限定されるものではない。【００３０】  次に、本発明の特徴的な部分である散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０について説明する。散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０は、ＧＴ反復回数計測部２１と、スコアＳＡ２計測部２２と、散発性ＬＯＡＤ発症年齢算出部２５とを備えている。【００３１】  ＧＴ反復回数計測部２１は、遺伝子配列計測装置１０から取得したデータに基づき、ＡＰＯＡ２遺伝子領域におけるＧＴ反復回数を計測するものである。【００３２】  スコアＳＡ２計測部２２は、対立遺伝子スコアＡ２算出部２３と、両対立遺伝子スコアＳＡ２算出部２４を備えている。対立遺伝子スコアＡ２算出部２３は、ＧＴ反復回数計測部２１から取得したデータに基づき、ＧＴ反復回数の範囲によって規定されたスコアＡ２を算出する。次に、両対立遺伝子スコアＳＡ２算出部２４は、対立遺伝子スコアＡ２算出部２３から取得したデータに基づき、対立遺伝子のそれぞれのＡ２スコアを足し合わせ、上記Ａ２スコアの合計である両対立遺伝子スコアＳＡ２を算出する。【００３３】  散発性ＬＯＡＤ発症年齢算出部２５は、スコアＳＡ２計測部から取得したデータに基づき、発症年齢算出式にあてはめ、散発性ＬＯＡＤ発症年齢を算出する。【００３４】  続いて、散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０が有する各種部材の具体的な機能を、図３におけるフローチャートに従って説明し、本実施の形態における散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０が行う具体的なデータ処理の一例について説明する。【００３５】  まず、ステップＳ１では、シークエンサー５１Ａを備える遺伝子配列計測装置１０によって、被験対象のＡＰＯＡ２遺伝子配列が計測され、遺伝子配列のデータとして、ＧＴ反復回数計測部２１に送られる。【００３６】  次に、ステップＳ２では、ＧＴ反復回数計測部２１が、ステップＳ１において得られた遺伝塩配列のデータに基づいて、ＧＴ反復回数を計測する。【００３７】  続いてステップＳ３では、対立遺伝子スコアＡ２計測部２３が、ステップＳ２において得られたＧＴ反復回数に基づいて、対立遺伝子スコアＡ２を算出する。【００３８】  次いでステップＳ４では、両対立遺伝子スコアＳＡ２算出部２４が、ステップＳ３において得られた対立遺伝子スコアＡ２に基づいて、両対立遺伝子スコアＳＡ２を算出する。【００３９】  最後に、ステップＳ５では、散発性ＬＯＡＤ発症年齢算出部２５が、両対立遺伝子スコアＳＡ２算出部２４において得られた両対立遺伝子スコアＳＡ２に基づき、散発性ＬＯＡＤ発症年齢を算出・予測する。次に、予測した結果を出力装置３０へと出力する。【００４０】  出力装置３０は、散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０が上述の処理を行うことによって得られる、散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測結果を外部に出力するためのものである。さらに、出力装置３０は、上記散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０の動作にかかわる情報や測定途中結果等の各種情報を表示することもできる。具体的には、公知のＣＲＴディスプレイや、液晶ディスプレイ等といった各種表示装置が好適に用いられるが特に限定されるものではない。【００４１】  散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０は、各機能を実現する制御プログラムの命令を実行するＣＰＵ（ｃｅｎｔｒａｌ  ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ  ｕｎｉｔ）、上記プログラムを格納したＲＯＭ（ｒｅａｄ  ｏｎｌｙ  ｍｅｍｏｒｙ）、上記プログラムを展開するＲＡＭ（ｒａｎｄｏｍ  ａｃｃｅｓｓ  ｍｅｍｏｒｙ）、上記プログラムおよび各種データを格納するメモリ等の記憶装置（記録媒体）などを備えている。そして、本発明の目的は、上述した機能を実現するソフトウェアである散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０の制御プログラムのプログラムコード（実行形式プログラム、中間コードプログラム、ソースプログラム）をコンピューターで読み取り可能に記録した記録媒体を、散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置２０に供給し、そのコンピューター（またはＣＰＵやＭＰＵ）が記録媒体に記録されているプログラムコードを読み出し実行することによっても、達成可能である。【００４２】  上記記録媒体としては、例えば、磁気テープやカセットテープ等のテープ系、フロッピー（登録商標）ディスク／ハードディスク等の磁気ディスクやＣＤ−ＲＯＭ／ＭＯ／ＭＤ／ＤＶＤ／ＣＤ−Ｒ等の光ディスクを含むディスク系、ＩＣカード（メモリカードを含む）／光カード等のカード系、あるいはマスクＲＯＭ／ＥＰＲＯＭ／ＥＥＰＲＯＭ／フラッシュＲＯＭ等の半導体メモリ系などを用いることができる。【００４３】  また、出力装置３０には、印刷手段が設けられていてもよい。上記印刷手段は、出力装置３０で表示可能な画像情報をＰＰＣ用紙などの記録材に記録（印刷・画像形成）する。具体的には、公知のインクジェットプリンタやレーザープリンタ等の画像形成装置が好適に用いられるが特に限定されるものではない。なお、出力装置３０としては、上記印刷手段等に限定されるものではなく、その他の出力手段を備えていてもよい。【００４４】    本発明の第３の態様は、散発性ＬＯＡＤ発症年齢の予測に使用するための配列であって、ａ）配列番号１のＡＰＯＡ２配列、ｂ）配列番号１のＡＰＯＡ２配列にＧＴリピートが付加または欠失された配列、ｃ）ａ）またはｂ）の配列において、１個または数個のヌクレオチドが欠失、置換および／または付加された配列、のいずれかの配列、またはそれらの相補的配列の全長または一部を含む核酸である。ＡＰＯＡ２遺伝子の塩基配列は、ＧｅｎＢａｎｋ  受託番号Ｘ０２９０５に公開されてぃる。核酸は、デオキシリポヌクレオチドからなるＤＮＡ、リポヌクレオチドからなるＲＮＡ、またはデオキシリポヌクレオチドとリボヌクレオチドの両者からなる核酸であってよく、ヌクレオチド類似体を含有してもよい。これらの核酸は１本鎖または２本鎖であり得る。「全長または一部を含む核酸」とは、ａ）ないしｃ）のいずれかの配列の全長または一部に加えて、例えばＡＰＯＡ２マイクロサテライト領域に隣接する領域の配列、リンカー配列、ベクターの配列などの、ＡＰＯＡ２マイクロサテライト配列の反復回数を計測するために必要とされる配列も含み得ることを意味する。
【実施例１】
【００４５】  以下、本発明を実施例によりさらに詳細に説明するが、本発明はこれらによって限定されるものではない。【００４６】  ＡＤの疑いのある患者を、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  ｏｆ  Ｎｅｕｒｏｌｏｇｉｃａｌ  ａｎｄ  Ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｖｅ  Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ  ａｎｄ    Ｓｔｒｏｋｅ  −  Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ  ‘ｓ  Ｄｉｓｅａｓｅ  ａｎｄ  Ｒｅｌａｔｅｄ  Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  （ＮＩＮＣＤＳ−ＡＤＲＤＡ）（ＭｃＫｈａｎｎ，  Ｇ．  ｅｔ  ａｌ．  Ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ  ３４，  ９３９−９４４  （１９８４））の基準に従って診断した。Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ  ｏｆ  ｓｔａｇｉｎｇ  （ＦＡＳＴ）（Ｒｅｉｓｂｅｒｇ，  Ｂ．  Ｇｅｒｉａｔｒｉｃｓ  ４１，  ３０−４６  （１９８６））の  ｓｔａｇｅ  ３に適合する発症年齢は、知力のある被験者との面談および医療記録から判定した。大阪大学ゲノム倫理委員会および愛媛医科大学によりに認証されたプロトコールに従って、ゲノムＤＮＡを収集した。【００４７】  ＡＰＯＥの遺伝子型は、Ｗｅｎｈａｍ  らのプロトコールに従って判定した（Ｗｅｎｈａｍ，  Ｐ．Ｒ．，Ｐｒｉｃｅ，Ｗ．Ｈ．，Ｂｌａｎｄｅｌｌ，  Ｇ．  Ｌａｎｃｅｔ  ３３７，１１５８−１１５９  （１９９１））。【００４８】  ＧＴ反復領域を含むＡＰＯＡ２遺伝子領域をＨＥＸ標識プライマーＡＴＣＡＴＴＴＡＣＡＣＴＴＧＣＣＣＴＣＴＴＡＣＣＣＧＡＣＣＣ（配列番号２：３７５位から４０４位）および非標識のプライマーＣＣＴＴＴＴＣＣＴＴＣＣＴＣＴＴＣＴＣＣＴＣＣＣＴＴＡＣＴＣ（配列番号３：２２８４位から２３１３位）を用いて、ＰＣＲ法で増幅した。ＰＣＲ産物の長さをＡＢＩ  ３７３  オートマティックシークエンサー（Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して判定した。ＧＴ反復回数はマーカーとの比較で計測した。反復回数の計測は、全て匿名で実施した。
表１に示すように、ＧＴ反復回数の範囲により対立遺伝子スコアＡ２を規定した。【００４９】
【表１】
2005118026.tif 000002
【００５０】
【表２】
2005118026.tif 000003
【００５１】  表２に示すように、すべての散発性ＬＯＡＤ患者において、発症年齢の重回帰により、ＳＡ２スコアは発症年齢に対して有意な影響を示さなかった。一方、ＡＰＯＥ−ε４陽性散発性ＬＯＡＤ患者では、発症年齢への回帰により、ＳＡ２スコアは、発症年齢に対し有意な影響を示し（Ｐ＜０．００１）、さらに重回帰によっても有意な影響を示した（Ｐ＝０．００１）。ＡＰＯＥ−ε４陰性散発性ＬＯＡＤ患者では、ＳＡ２スコアは、発症年齢に対し、有意な影響は示さなかった。なお、ＳＡ２スコアは、ＧＴ反復回数を反映している。従って、我々は、ＡＰＯＥ−ε４陽性散発性ＬＯＡＤ患者では、マイクロサテライト領域のＧＴ反復回数が散発性ＬＯＡＤ発症年齢変化因子であると結論付けた。
【産業上の利用可能性】
【００５２】  被験者の血液などを採取するだけで、簡便に散発性高齢発症型アルツハイマー症の発症年齢が予測できることから、健康診断や人間ドックの際に利用できる。さらに、散発性ＬＯＡＤの予防や処置を迅速に行えるため、予防医学に貢献でき、さらにＡＰＯＥ４キャリヤーにおけるＬＯＡＤの発症関連遺伝子のリスク効果の判定に際して、利用できる。
【図面の簡単な説明】
【００５３】
【図１】  本発明における実施の形態にかかる散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測解析システムの構成の一例を示す機能ブロック図である。
【図２】  本発明における実施の形態にかかる散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測解析システムの構成のその他の一例を示す機能ブロック図である。
【図３】  本発明における実施の形態にかかる散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置が行う処理手順の一例を示すフローチャートである。
【符号の説明】
【００５４】  １０      遺伝子配列計測装置
２０      散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測装置
２１      ＧＴ反復回数計測部
２２      ＳＡ２スコア計測部
２３      対立遺伝子スコアＡ２
２４      両対立遺伝子スコアＳＡ２算出部
２５      散発性ＬＯＡＤ発症年齢算出部
３０      出力装置
５１Ａ    シークエンサー
１００    散発性ＬＯＡＤ発症年齢予測解析システム
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【配列表】
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