(57)【要約】      （修正有） 【課題】長鎖遺伝子の発現を解析する為のプローブとして実用的な合成オリゴヌクレオチドを提供する。【解決手段】（ａ）１４３種の特定塩基配列から成る核酸分子、（ｂ）（ａ）に記載の塩基配列と相補的な塩基配列から成る核酸分子、（ｃ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子、（ｄ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子の塩基配列と少なくとも９８％の同一性を有する塩基配列から成る核酸分子、又は（ｅ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子を含む１００塩基長以下の長さを有する核酸分子、及び該核酸分子から成るハイブリダーゼーション用プローブ。【選択図】  図２
2005087116.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）配列番号１ないし１４３の塩基配列から成る核酸分子、
（ｂ）（ａ）に記載の塩基配列と相補的な塩基配列から成る核酸分子、
（ｃ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子、
（ｄ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子の塩基配列と少なくとも９８％の同一性を有する塩基配列から成る核酸分子、又は
（ｅ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子を含む１００塩基長以下の長さを有する核酸分子、のいずれかから選ばれる核酸分子。
【請求項２】
合成オリゴヌクレオチドであることを特徴とする、請求項１記載の核酸分子。
【請求項３】
請求項１又は２記載の核酸分子から成るハイブリダイゼーション用プローブ。
【請求項４】
請求項３記載のハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を用いる遺伝子のスクリーニング方法。
【請求項５】
請求項３記載のハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を用いるマウス脳由来の遺伝子発現解析方法。
【請求項６】
請求項３記載のハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を含む遺伝子スクリーニング用キット。
【請求項７】
マイクロアレイ又はマイクロチップである請求項６記載の遺伝子スクリーニング用キット。
【請求項８】
マウス脳由来の遺伝子発現解析用である、請求項６又は７記載の遺伝子スクリーニング用キット。
【請求項９】
請求項１記載の核酸分子の塩基配列を設計し化学的に合成する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、約４，０００塩基対以上の長さを有する長鎖cDNAをプローブとして用いる長鎖cDNAアレイによる遺伝子発現解析を再現できる核酸分子、オリゴプローブ配列、それら核酸分子やオリゴプローブ配列を得る方法、並びに、それらを用いる遺伝子のスクリーニング方法及び遺伝子スクリーニング用キット等に関する。
【背景技術】
【０００２】
脳、神経系では、多くのホルモン、ホルモン様物質、神経伝達物質あるいは生理活性物質による調節のもとで生理的な機能の調節が行なわれている。また、機能の調節には、機能を受け持つ特異的な細胞の増殖あるいは同細胞の活性化が関係している。従って、脳に強く発現している新規な遺伝子を見出して取得し、それにコードされる脳、神経系における複雑な機能を調節する蛋白質を得ることは、医薬品開発に有用である。また、本発明の配列は脳で発現しているが、脳以外の臓器においても発現しているものが含まれることから、それら臓器で強く発現している新規な遺伝子を見出して取得し、それにコードされる脳以外の臓器における機能を調節する蛋白質を得ることは、医薬品開発に有用である。
【０００３】
本発明者が属するかずさDNA研究所では、採取されたマウス脳由来のｍＲＮＡを出発材料としてｃＤＮＡライブラリーを調製し、それに基づいて、これまで数多くのマウス脳由来の約４，０００塩基対以上にも及ぶ長鎖遺伝子を同定しその機能等についても解明してきた。これらの遺伝子は「mKIAA」を頭に付した番号が付与されて、(Okazaki,N., et al., DNA Research, 9, 179-188 (2002), Okazaki,N., et al., DNA Research, 10, 35-48 (2003))に逐次公開されている。
【０００４】
さて、近年の遺伝子解析技術の発展によって、遺伝子の機能や構造が次第に明らかになってきた。中でも、DNAマイクロチップ あるいはDNAマイクロアレイ（以下、総称して「DNAチップ」という）の技術は、遺伝子解析に有効な手段であるとして注目されている。
【０００５】
DNAチップとは、ガラス、シリコン、プラスチックなどの基板の表面上に、プローブとして多数の異なった任意の配列を有するDNAが高密度に整列化したものである。基板の形状は目的により、平板上状であったりストリップ状であったり細い繊維状であったりしてよい。DNAチップ の原理は、DNAを構成する４つの塩基A（アデニン）、T（チミン）、G（グアニン）、C（シトシン）において、AとT、GとCが互いに水素結合する性質、すなわちハイブリダイゼーションに基づいている。核酸のうちRNAは、DNAを構成するT（チミン）のかわりに類似した構造を有するU（ウラシル）により構成され、AとU、GとCが互いに水素結合することにより、相補的なRNAとDNAがハイブリダイゼーションによりハイブリッド二重鎖を形成しうる。DNAチップに固定した検出用プローブDNAと、被検体中に含まれる核酸（ターゲットとするDNAあるいはRNA）を蛍光物質やラジオアイソトープ（RI）などで標識して検出を容易にしたターゲット核酸とを、ハイブリダイゼーション法を適応することによりDNAチップ上にターゲットとして捕獲する。捕獲したターゲットは各スポットからの蛍光シグナルや放射線シグナルなどとして検出され、検出したシグナル強度をコンピュータでデータ解析することにより、ターゲット中の遺伝子発現プロファイルを観測することが可能となる。
【０００６】
このようなDNAチップに用いるプローブとしては、通常cDNAフラグメントを含むプラスミドDNA、プラスミドDNA から制限酵素等で切断して精製したcDNAフラグメント、数百塩基程度のＰＣＲ産物などのcDNAフラグメント、あるいは１５〜３０塩基程度の合成オリゴヌクレオチドなどが用いられてきた。尚、オリゴＤＮＡアレイに関連した論文としては、以下の非特許文献３、４及び５として引用したものがある。
【０００７】
約４，０００塩基対以上の長さを有する長鎖cDNA全長、あるいは同長鎖cDNAの一部分の塩基配列を有する数百塩基対長程度の長さのcDNAフラグメントを作成するには、大量のプラスミドDNAを大腸菌等を宿主として増殖、複製により多大な時間と資金を費やすことにより収集し増やさなければならず、又、ＰＣＲ反応を応用して作製したＰＣＲ産物もその増幅過程は時間と資金を多大に費やす必要がある。
また、本発明でいう長鎖cDNAを含むいわゆるcDNAは、一般的には、その安定的な存在状態は２本鎖であり、２本鎖のうちセンス側（mRNA-like配列）の鎖の配列はmRNAの検出には無駄でクロスバイブリダイゼーションを起こす可能性があり、それらにより間違った結果を取得してしまう懸念があった。更に、cDNAアレイでは、所望のcDNAを適当なベクターを使用して大腸菌等を宿主として用いプラスミドDNA等の形態で複製せしめ、次に大腸菌菌体内から取り出して精製して調製するために、煩雑かつ純品を得るのに高価な試薬を必要とするという欠点があった。
一方、DNA自動合成機を使用して人工的にDNAを合成し、それを適当なガラス基盤等にスポッティングして合成DNAアレイを作製する安価かつ迅速な方法が知られているが、本発明に関わる約４，０００塩基対長以上の長さを有する長鎖cDNAから数十塩基対長程度と短い配列を選択し、それに対する合成DNAを作製して、合成DNAアレイを得るよい方法が知られていなかった。
また、２０塩基長前後の１５〜３０塩基長のオリゴヌクレオチドをデザインする方法はすでに述べられているが（向井博之、蛋白質核酸酵素、１９９６，４１：437-439、三橋将人、蛋白質核酸酵素、１９９６，４１：439-445）、約４，０００塩基長以上の長さを有する長鎖cDNAにおいては遺伝子の選択的スプライシング（alternative splice:特定の遺伝子領域のみがスプライスアウトされたmRNAが発現する現象)などが多様で、このような長鎖遺伝子の発現を解析する為のプローブとしてわずか100塩基未満のオリゴヌクレオチドをデザインするのは極めて困難な作業である。
合成DNAの化学的な合成方法と化学合成した合成DNAの精製方法は、すでに報告されている一般的な方法を用いることにより可能である（川瀬靖聡、蛋白質核酸酵素、１９９６，４１：446-452）
【０００８】
このように、プローブとして作成するに際して、数百塩基対長程度の長さのcDNAフラグメントと２０塩基長前後の合成オリゴヌクレオチドにはそれぞれ長所・短所があり、その使い分けは未だ明確にされていない部分も多い。そこで、近年その両者の長所を併せ持つ６０−８０塩基程度のロングオリゴヌクレオチドが徐々に普及しつつある。
【非特許文献１】Okazaki,N., et al., DNA Research, 9, 179-188 (2002)
【非特許文献２】Okazaki,N., et al., DNA Research, 10, 35-48 (2003)
【非特許文献３】Michael, D. et al., Nucleic Acids. Res., 28:4554-4557, 2000, Assessment of the sensitivity and specificity of oligonucleotide (50mer)  microarrays.
【非特許文献４】Drmanac R, & Drmanac S.,  Methods Enzymol., 1999, 303:165-78. cDNA screening by array hybridization.
【非特許文献５】Eisen, M.B., & Brown, P.O.,  Methods Enzymol., 1999, 303:179-204. DNA arrays or analysis of gene expression.
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】
適切なデザインさえ可能であれば、オリゴヌクレオチドはcDNAフラグメントの作製に見られるような煩雑な作業を経ず化学的に合成可能であり有利な点を有する。しかし前記したごとく、約４，０００塩基対以上の長さを有する長鎖cDNAにおいては、特にその長鎖cDNAの特徴を適切に表現することができる１００塩基長以下の短い塩基配列を注出して選択することにより、適切なオリゴヌクレオチドの配列をデザインすることは極めて困難であり、長鎖遺伝子の発現を解析する為のプローブと未だ実用的なものは開発されていない。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
発明者等は、Okazaki, N. et al., 2002, DNA Research 9:179-188, 及びOkazaki, N. et al., 2003, DNA Research, 10:35-48  の2報にて発表済みの約４９０個の全長配列から、本発明の方法により各々の長鎖cDNA全長配列から数十塩基長の３５６個の最適配列を選択することに成功し、次にハイブリダィゼーション法より長鎖cDNAを含むプラスミドDNA を用いたcDNAアレイの発現プロファイルと比較することで、cDNAアレイと同様にオリゴDNAアレイで遺伝子発現を検出可能とする１４３個の合成オリゴ配列セットを得て本発明を完成するに至った。
即ち、本発明は第一の態様として、
（ａ）配列番号１ないし１４３の塩基配列から成る核酸分子、
（ｂ）（ａ）に記載の塩基配列と相補的な塩基配列から成る核酸分子、
（ｃ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子、
（ｄ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子の塩基配列と少なくとも９８％の同一性を有する塩基配列から成る核酸分子、
（ｅ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子を含む１００塩基長以下の長さを有する核酸分子、
のいずれかから選ばれる核酸分子に係る。
【００１１】
本発明は第二の態様として、本発明の核酸分子から成るハイブリダイゼーション用プローブに係る。
【００１２】
本発明は第三の態様として、該ハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を用いる遺伝子のスクリーニング方法に係る。
【００１３】
本発明は第四の態様として、該ハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を用いるマウス脳由来の遺伝子発現解析方法に係る。
【００１４】
本発明は第五の態様として、本発明は、該ハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を含む遺伝子スクリーニング用キットに係る。
【００１５】
更に、本発明は、第六の態様として、本発明の核酸分子の塩基配列を設計し化学的に合成する方法にも係る。  
【発明の効果】
【００１６】
本発明の核酸分子を用いて、極めて再現性の高いマウス遺伝子発現解析が可能となるオリゴＤＮＡチップ又はオリゴＲＮＡチップを容易に作製することが出来る。
【００１７】
本発明の核酸分子をハイブリダイゼーション用プローブとして使用することにより、マウスＤＮＡまたはｍＲＮＡの異常（遺伝子異常）を検出することができるので、例えば、該ＤＮＡまたはｍＲＮＡの損傷、突然変異あるいは発現低下や、該ＤＮＡまたはｍＲＮＡの増加あるいは発現過多などの遺伝子スクリーニング手段として有用である。本発明の核酸分子とは、DNAあるいはRNAをいう。核酸配列中のT（チミン）は、RNAではU（ウラシル）に置き換えて読み、DNAプローブの換わりにRNAプローブとして使用してもよい。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１８】
本発明の核酸分子は、以下のいずれかから選ばれる核酸分子である。
（ａ）配列番号１ないし１４３の塩基配列から成る核酸分子、
（ｂ）（ａ）に記載の塩基配列と相補的な塩基配列から成る核酸分子、
（ｃ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸分子、
（ｄ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子の塩基配列と少なくとも９８％の配列同一性を有する塩基配列から成る核酸分子、又は
（ｅ）（ａ）又は（ｂ）の核酸分子を含む１００塩基長以下の長さを有する核酸分子。
【００１９】
以下の本明細書において、以上の（ｂ）、（ｃ）又は（ｄ）の核酸遺伝子を、夫々の配列番号の塩基配列から成る核酸分子と「実質的に同機能の核酸分子」ともいう。
【００２０】
本発明の核酸分子は、所謂、「ロングオリゴヌクレオチド」と呼ばれているものに相当するもので６５−７５塩基長を有し、本明細書の実施例で示されるように、マウス遺伝子、特にマウス脳由来の遺伝子と特異的に反応する（ハイブリダイゼーションする）。配列番号１ないし１４３の塩基配列から成る本発明の核酸分子の塩基配列を、それが特異的に反応できるマウス脳由来の遺伝子（「mKIAA」番号）と共に、以下の配列表にまとめて記載する。
【００２１】
配列表
mKIAA0005：（配列番号１）
tatgtccgtaaccagcagaccattggggcacggaaggagctccaaaaggagctgcaggagcagat
mKIAA0010：（配列番号２）
aaactggatacgaagcagcaaaccaacaccctgctgaacctggtgtggagggactcggccagtga
mKIAA0023： （配列番号３）
tgttctcctttggcccttcatccttcaagtcttctgcttctgtcaccggggagcccccactgtac
mKIAA0029： （配列番号４）
tgacctggcctctacgtacactgtcctagctacgttcccctccatttcagctgcacagagtgcac
mKIAA0032： （配列番号５）
ccttcttgacctccctaagtatagcagcaaagagatcatgaaggctcggctgacccaggccctcg
mKIAA0055：（配列番号６）
ggccggcagtgaccccgatggtcaaccgggaaaacaagccaccatgttaccctaaagctgagatt
mKIAA0071：（配列番号７）
caacgctcgctggacaacggaagagcagcttctcgccgtacaagccattaggaaatatgggcgag
mKIAA0079：（配列番号８）
ttctgacatggctaaacaggctcaggtgcctctggccgctgtcattaaaccactggcaaggctgc
mKIAA0080：（配列番号９）
aagagactatggggaagaactgaggagccccatgacaagcctgacccctggtgagagcaaagcca
mKIAA0097：（配列番号１０）
catgtccaaaccaatgggagggtcggctccagccaaaacccagcctataccagcacctgttgaag
mKIAA0122：（配列番号１１）
aagaaacagggcattgtgacacccattgaggcccaaacacgagttcgaggttctggcctgggtgc
mKIAA0144：（配列番号１２）
ctctgtgcaggccacgcagttacagaccacgcaatctgttgaaggtgctacaggctctgcagtga
mKIAA0171：（配列番号１３）
ctggggaccttctgggcagctcatgggagagattgccaaggctacctttatgtatgagcagttcccag
mKIAA0182：（配列番号１４）
ggaagccccgaggcgccagtggcaagggattgaggcaatctttgaagcttaccaggaacacatag
mKIAA0184：（配列番号１５）
caagtgccttgtgccgttccataaagcttcagtgtgagctgtacccctcacggcagatcgccatc
mKIAA0202：（配列番号１６）
tgcgcctgcggcctcagacctatgacctccaagagagtaacgttcatctcaagctgaccatcgtg
mKIAA0203：（配列番号１７）
caagtacacgtggaaacgagggctttggggatcgggctgctctacatgtccagctggagaaatgc
mKIAA0204：（配列番号１８）
ggctagaacaagagcacactaaccgcctgagagacgaagccaagcgcatcaaaggagagcaggag
mKIAA0207：（配列番号１９）
gtggacgggctgttcctccttcgtgacagccagagtaatccaaaggcgttcgtactgacactgtg
mKIAA0219：（配列番号２０）
tctgaagcaggttatggccgttaagagccgtgtggtgctgccctatctggtgcccaagctgacaa
mKIAA0228：（配列番号２１）
actggaaccggttgcgagatcgacagtattcagtgaccgatgcccttgaagacgtcagcagcagc
mKIAA0236：（配列番号２２）
ttctgccgcctctgcagctacaaggccaagcaaaagttccaggtggtcaagcatgtgcgtaggca
mKIAA0238：（配列番号２３）
ttggagttttgggaattacaaaggtcggcagccgccgggtgatccagtacggtgcagctctcatg
mKIAA0240：（配列番号２４）
cctaacggcaactctctgtttgggaactccacttccagtcctgtagcacagcctgtcaccgttcc
mKIAA0244：（配列番号２５）
caggccaaccacaacgcatgatggggcccctttcacaagcatcacggtacatgggcccacaaaat
mKIAA0254：（配列番号２６）
ggtgagtgctatcgtggacaccttgaagacagcatttcctcgctctgaaccccagagtcccacag
mKIAA0267：（配列番号２７）
cccgcttcctgcacgaaaccggccttgctatgatttatggtcttttggtaggcctcgtgcttcgg
mKIAA0304：（配列番号２８）
agtcgtgttcgcatgaaaacgcccacagtccgtggagttctggacctgaacaatcctggggagca
mKIAA0314：（配列番号２９）
ctgggcacgtcatgcgacgcttctttgagagccgctgggaggaattttatcagggaaaacaggcc
mKIAA0315：（配列番号３０）
gaagctggagtactacacggacatcatgcgcacgctcttcctggagctcatggagcagtatgtgg
mKIAA0317：（配列番号３１）
tatgaatcctctctagggggagcctacaagcagttggtccgtgcccggttcactcggtctttcct
mKIAA0323：（配列番号３２）
cagagtggcagggtcgggaaagtcgccagcagtaagaggacaaagtcatactgtggagaaggagg
mKIAA0336：（配列番号３３）
ctgcagcaccctccgggaccccgaaatccaagctagaaacgttgcccagagaagatctcatcaag
mKIAA0357：（配列番号３４）
gccccacactgtcatcaggcagcacctagactatggccactggtatgatcggaacaagctgtctc
mKIAA0359：（配列番号３５）
tcatgctcttggagttagatatgcccagccggacaaccagagactacgagggcccagccatctct
mKIAA0360：（配列番号３６）
ccagcacccctttggtggaagagctgaacttaccggaagccatgaagaaggatccaggagagagc
mKIAA0370：（配列番号３７）
tggtaaatgatctccgttactaccgactctgcaatgacagcctgccccctggcaccgtgaagctc
mKIAA0376：（配列番号３８）
ggagctaatgatgtggcactggctaaacgttcacgcagccgcactgctgcagagggtgatattcg
mKIAA0378：（配列番号３９）
ccagcaatctctggctgaaaaagaagcccacctggccaacctccggattgagaggaggaaacagc
mKIAA0382：（配列番号４０）
ggtccagcggcactggcgagctatggaggatacctgttttgagatccagagtccctcatgtacag
mKIAA0384：（配列番号４１）
gagaccacaacagaacactggaccgatctggggatctgggtgatatggaaccattgaagggagcaccc
mKIAA0385：（配列番号４２）
catgcaactctctttcactaatgtggtacggcagtctcgcaagtgtaccacgcctcggggcacca
mKIAA0428：（配列番号４３）
atacttccatcctcccgcacacctgcaagccaagatcaaggctgcccaataccaggtcaaccagg
mKIAA0431：（配列番号４４）
cctatggcttcagagcggggtcaggcttcctgggccttgagatgttcgacacacagacacaaaca
mKIAA0461：（配列番号４５）
ttgtggctagtgttctgccaggtcccgatggcaacgttaactcacccacacgcaacgctgacatg
mKIAA0471：（配列番号４６）
ggctggagaaacagcaagcagccagcaaggaggagctagaagcagtaaagggtaagatgatggcatgcaaacac
mKIAA0488：（配列番号４７）
ctgggaggcagctgtgttctaagcggtaccgggagtttgccatactgcaccaaaacctgaagagagaatttgcc
mKIAA0511：（配列番号４８）
tctttgtgaaaggcaaaggggagcttctgacctttttcttgaaggggcgggacaggccagctgcc
mKIAA0530：（配列番号４９）
ctgccgtagcagttcagaccactgaggagcatcctgcatcctttgactggagctccttcaagcct
mKIAA0554：（配列番号５０）
agagcgagcacaaggtcctggccccggatttcgacgatgaatttgatgatgaggagccgcttcca
mKIAA0558：（配列番号５１）
atctgttttgactacaatgcgacggaagatacctcagactgtggccgcggagcctccttccctcc
mKIAA0559：（配列番号５２）
cggccatagccgcagctgaagccgctgtgcagcaactccgcattcaaccaagtaaaagacgcaaa
mKIAA0567：（配列番号５３）
cccttcccagctcagaagaccttgccagtttagctcccgacttggacaagattactgagagcctcagc
mKIAA0569：（配列番号５４）
ccgaaacgatacgggatgaggaagagactggggatcactcgatggacgacagttcagaggatggg
mKIAA0577：（配列番号５５）
actggatactgcccggttttctgccttcttcgatgacgcccctgtcttcagaatccctggacgca
mKIAA0589：（配列番号５６）
ggtggcaagaacatccgcgtggtggtcatgaacaatgtgctgccccgtgtcgtcaaaatgcacct
mKIAA0592：（配列番号５７）
ggagaagggtctcaaaactgacagccgccctaagagcacaggagtcttccaggatgaagagctgc
mKIAA0595：（配列番号５８）
accgtcagcgaaggcagcaacggcaaacggaagcagaagacaggaattctcagcccccagttgtt
mKIAA0596：（配列番号５９）
aacagtttctaaaacagcactttgagactctggccaatgggactgctccagggggcccagcacgg
mKIAA0609：（配列番号６０）
gatgcacaggagtatgagttcaccgtgttgcccaatgcctacatgatccacatgccccatgcccc
mKIAA0611：（配列番号６１）
taccaagactttgaagcccgctacgtccaggctaagctgagtgtgcatgaccgctcgctgaaggt
mKIAA0622：（配列番号６２）
ttccaggtccactagtgctctctccactgctgaatctgttgggcagtcagatcggtttgggctgg
mKIAA0623：（配列番号６３）
ttcaggagagtgtagttgtggaccagatcagccagctaagcaaagattgggggcgggtggagcag
mKIAA0630：（配列番号６４）
gggttcctcaaggcatgctgcagcttataccacacaccctagcactctggtgcatcaggttcctg
mKIAA0633：（配列番号６５）
ggctgagtgcactatcaaaagggccccctccaccactatcactgccacaccagaaaaaccacagc
mKIAA0642：（配列番号６６）
tagttctgcctctcggccagttgagacagcagccgtcgaagctcctggtatgagcagtgtttcca
mKIAA0644：（配列番号６７）
gattacctggatgaccaactgctgcagaatgggtcttgcgtggatccctcaccttcccctacagc
mKIAA0651：（配列番号６８）
tagccgcctgtctccacctcacagtcctcgagacttcacccgaatgcaggacattcctgaagaga
mKIAA0652：（配列番号６９）
ggagcagcgccaaggctctgaaccacgccctagaagagtcaacatccctactcaacatgttctgg
mKIAA0656：（配列番号７０）
aaaagctgactggtggagccaactggcaaccgaaagtcactccagccacatggtcagcgggtgtt
mKIAA0664：（配列番号７１）
ttctccccaggggttcgatttcctgagtcctgccaggatgaagttcgggaccagaagcagctgtt
mKIAA0670：（配列番号７２）
gcacggggtcaagtggccccagtccaaccccaaattcctttgtgctgactatgctgagcaagatg
mKIAA0694：（配列番号７３）
gcaaactcctatgcaagtaccccggagttacggaggacctggctggaaagcatggccaagattcatgc
mKIAA0696：（配列番号７４）
ggtgcgcaccgaccctctctggaagggactctcagaaagaagaggctgggatcagtacctgttta
mKIAA0701：（配列番号７５）
aatcccacgagtgctctgcgctctcctgcttctgaaagtgggagcccattgcttcctgacttcct
mKIAA0716：（配列番号７６）
cagtgggatttcctcgcttagccggtgtagcacgtcggaaacctcgggctttgaaaaccaagcca
mKIAA0717：（配列番号７７）
gcgtgcttagcaggaagagatgtgttccctacactagaaattaccccgtcacatgtagtggtgtccc
mKIAA0718：（配列番号７８）
ctccccagaagtgatccacctcaaggatatcgtctgctacctgtctcttctcgaaagaggaagacccgagg
mKIAA0734：（配列番号７９）
ctattgctcctcagccgtgtgctgcggtttgagcatcgagtggaagagcccaattccagcagttg
mKIAA0746：（配列番号８０）
tttccagaacagagagctagaggccactcgaagccagcgcgtggactaccccatggtcaccattt
mKIAA0760：（配列番号８１）
gagtgtgatcggaaaaccagccgtgcgctggaagacaggaacagcgtgacaagtcaagaggagag
mKIAA0768：（配列番号８２）
ttcatagttcctcctaacaaagatggggcctctccggaggggacttccaaaggacccgcgcactt
mKIAA0774：（配列番号８３）
atgctgcaaaggccagtctaccaaaatccgggcttcgtcctcctggctattcacgactccctgca
mKIAA0777：（配列番号８４）
cagtgaccaagatggggttgtgtccgaccacagcgactacgttcacgtcgaagggtcgtcctttt
mKIAA0799：（配列番号８５）
cgagcgggagctgctctttgagacgagtgaggtggtggatgtggccaagctcatgaaagcgtata
mKIAA0802：（配列番号８６）
ggccaagtttgaacgcacctgctgctccccaaagtacggttctcccaaacttcagagaaagcccc
mKIAA0803：（配列番号８７）
ggagaaaaggcagcaggtgtacaagctagacctggagggaaagcgactgcaagggcttatgcagg
mKIAA0807：（配列番号８８）
aagcctttgaggaagctaccaaccccttacaagtccctagcctgagcaggtctggacccacaagc
mKIAA0813：（配列番号８９）
gctgtaccagggccatgtccgtgttagttatgacccaggcagctaccccagctctgctatctaca
mKIAA0817：（配列番号９０）
aatgtggacattcgcctgacactagacgtgaccttcggcgctgtggacctctatgtctccacctc
mKIAA0826：（配列番号９１）
ccccaatgacatccccaaggcctacggagtggacgtaggctctcccgaaatctccttcgctaaaa
mKIAA0875：（配列番号９２）
cccaagaaaacctggaatacaacgtggagcctcaggaaatctcgcacccagatgtggggcgctac
mKIAA0890：（配列番号９３）
gggggctgccctgttatcaaggtacctggcttcatgtatcccgtcaaggaacactacctggagga
mKIAA0891：（配列番号９４）
tcaagaacgactcgtatgagaagggcccggattcggtggtggtgcacgtgtacgtgaaggagatc
mKIAA0896：（配列番号９５）
ggcaggcacttggagagaggctttacccccgagtgcaagcaatgcagcccgcatttgcaagtaaa
mKIAA0913：（配列番号９６）
gggagaagggtgacctggccttagcactcatgatcacctacaaggatgaccaggccaagctcaag
mKIAA0940：（配列番号９７）
ttcttccaggggatcaccccagtcaacgggaccatgctcttccaaaacttcccgcaccacgtcaa
mKIAA0979：（配列番号９８）
aaacctaaaggcagtcagcgaggccggaaaagaggccgtacagcttcagactcagacgagcagca
mKIAA0993：（配列番号９９）
cgacccactgaaggagacggccaccatcgggttcattaacaacttcggccagatccctaagcagt
mKIAA0998：（配列番号１００）
cgtagacgacggagtggcagattgagggcaatgaggccaaaatacccagtgattgcccaaccagc
mKIAA1019：（配列番号１０１）
gctcagtgagaatgcatttgaccttgaagccatgagtatgttaaaccgagctcaagaacggattgacgcctgggc
mKIAA1025：（配列番号１０２）
ttctaaggtttgtgctggagcagtacaacgccctatcctggctcacgtgcaatccagccacccag
mKIAA1032：（配列番号１０３）
ggtgcggattgatgaatgtgttcgacaaatggctgacatcctgggccaagttcggggcacaggga
mKIAA1039：（配列番号１０４）
ccccgaggtccaacctgaaattccgctttgataaactcagccatgctagctccagtgcgggtcac
mKIAA1044：（配列番号１０５）
ataataagcatcccaacacctccagtaaccaccccagaaggcgacgacaggcccgagtctcctga
mKIAA1049：（配列番号１０６）
agaccagagaggctgagtccagtcagccacggaaacacaatcgccctcttcttccggtccttgtt
mKIAA1060：（配列番号１０７）
tagccaaccgcccatggccacggatctccctcacgatcgtcaccacagctatcatactaaccatg
mKIAA1070：（配列番号１０８）
ccacatgaggtggttcttcggaccgcctgtcccccagattatactctagctatgaggaggtcacc
mKIAA1092：（配列番号１０９）
cttgcacagcataggcaccaaggaggggctgaaggaacggaaactacagaaggcagtggagagct
mKIAA1097：（配列番号１１０）
ggaaggcctcgaccttcagccatttcttgcaaaggacagcccagctcagattgtgacatatgatctcctgtcag
mKIAA1106：（配列番号１１１）
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mKIAA1116：（配列番号１１２）
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mKIAA1132：（配列番号１１３）
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mKIAA1176：（配列番号１１４）
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mKIAA1200：（配列番号１１５）
aaagcatggccactccaagctggtctggtgcgccctggttgggaaaaccttctactactaccgga
mKIAA1211：（配列番号１１６）
gcagcgcagagagcagctaaagaagtccaacactctccccacgtctgtgacagtggagatctcag
mKIAA1225：（配列番号１１７）
cgaagtttgtttgtgcggttggtaccatgtcgctgtctacgaggagaagaggagacagtcactactc
mKIAA1244：（配列番号１１８）
ctgacatccgagtccgtcaagctgtgagagaatggctgggaagagtgggccgtgtctatgacatc
mKIAA1249：（配列番号１１９）
cctcagaggtcacacagaggtcacacaccggggatctgtctccaaatgtacagtccagagatgcc
mKIAA1265：（配列番号１２０）
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mKIAA1302：（配列番号１２１）
ggacgctggacaagcccagaccatgaactctggaaacgcctgagtagcaacagcatcgtgccttt
mKIAA1322：（配列番号１２２）
ttcaatcagtggactcgggcattcctaccctggagattggcaacccagagcctgttccctgcagt
mKIAA1329：（配列番号１２３）
gcagcaggcgctgaactctcatagaatcagcttcatccttcgaggagggcttcgtatcctggtgg
mKIAA1331：（配列番号１２４）
ggcgctccagcagcactctgttttctactgcagtggacactgatgagatcccagccaaaaggccaaga
mKIAA1358：（配列番号１２５）
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mKIAA1365：（配列番号１２６）
cggggacctcagcctggacggtgcttaattcaaacgaaagggcagaggagtatggacggttatcc
mKIAA1400：（配列番号１２７）
ccgtggccagtcagctggtatggatcttttctccaactgcaccgaggaatgtaaagcactgggcc
mKIAA1423：（配列番号１２８）
cttgtacacgctggcctttgtgtactctccgtcgaagaatgccctgtacgagtcccagctgaagg
mKIAA1463：（配列番号１２９）
ggagagatctgggtgaatagcccccataccgccagtggctactataccatctacgacagcgagac
mKIAA1479：（配列番号１３０）
gaaggtggactatattcaggggacaccggtgagtgttcatctgcagccctccctctccagacaga
mKIAA1511：（配列番号１３１）
tatgtggttcgggatctccctgccccttgtctacttgggctactatttcggcttccgcaagcagc
mKIAA1513：（配列番号１３２）
tcgagggcgagttgcccaaagaaccgccaaaagaatgtggtcctgaaagtgtggctgagggtgac
mKIAA1544：（配列番号１３３）
ggggacaatggtgtggtggaggtctggcaggcctgtgactttaagcagctgtacatttacccagg
mKIAA1576：（配列番号１３４）
gtcaagctgtggctcagctgtgctctaccgtccccaatgtgaccgtctttggaacagcctctact
mKIAA1580：（配列番号１３５）
ctccaaatggaacagtcatgacccacggggcatacaaagtgcggatagctgtgctcagcgacggt
mKIAA1582：（配列番号１３６）
gtcaccagccagtcctcccgtagctgttccccatagctggtcacgtgccaaatctgacagtgata
mKIAA1724：（配列番号１３７）
cccctggtcataagcatgtgcctgactgggtttggattgtcgtgggcatcctcaactttgctgcctac
mKIAA1743：（配列番号１３８）
tccttcgcttcctgtgccctgccatcatgtcaccctcgctcttcaacctgcttcaggagtatcct
mKIAA1824：（配列番号１３９）
ggaccctcggatgatggctttctttgactccttggtgcgtcgtgaaattgagggctggagctcag
mKIAA1834：（配列番号１４０）
gtcggcaagagaggttctggcactgccgcttggcactgaaccacaaggttttgcattacggtgac
mKIAA1850：（配列番号１４１）
cgagagctcttctggcatgctctgagggagaatcttaagcagcactttcagcagcacctagcccg
mKIAA1930：（配列番号１４２）
atgaaatatggccgtcagcgctggaagttgcgaggccggatagagagtagtggcaagcaggtgtg
mKIAA1967：（配列番号１４３）
gggaagcctgttacagcgtgcagagcagcaagacagtggccgcctatacctggagaacaagattc
【００２２】
従って、上記の「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする」とは、そのようにして選択された核酸分子が、マウス遺伝子、特にマウス脳由来の遺伝子と特異的に反応することが出来るものであるような条件である。具体的には、オリゴアレイにおいて42℃のHybridization Buffer (50% ホルムアミド , 5×SSC , 0.5% SDS)を用いて一晩ハイブリダーゼーションを行った60℃の5×SSC , 0.5%SDS溶液中でメンブレンを洗浄する条件（1xSSCは0.15ＭNaCl，0.015Mクエン酸ナトリウムである）でのオリゴアレイ解析で本発明ヒトＤＮＡプローブにハイブリダイズする程度の条件である。
尚、ハイブリダイゼーション自体は、モレキュラー・クローニング（Molecular Cloning）２nd（J. Sambrook etal., Cold Spring Harbor La塩基ress, 1989）に記載の方法等、当業界で公知の方法あるいはそれに準じる方法に従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。
【００２３】
更に、上記の各配列番号の各塩基配列と９８％以上の配列同一性（相同性）を有している塩基配列から成る核酸分子も、マウス遺伝子、特にマウス脳由来の遺伝子と特異的に反応することが出来る。９８％以上の配列同一性（相同性）とは、配列番号１ないし１４３の塩基配列で示す各々６５−７５塩基長の配列に対し、１ヶ所の塩基置換、１ヶ所の欠失、１ヶ所の付加等を許容する程度の配列同一性をいう。６５−７５塩基長の配列に対し９８％以上の配列同一性を有する配列を用いると、ストリンジェントな条件下においてハイブリダイズすると考えられる。
又、配列番号１ないし１４３の塩基配列で示す各々６５−７５塩基長の配列を含む１００塩基長以下、例えば、８０塩基長の長さを有する核酸分子は、それら６５−７５塩基長の配列を含有することから、ストリンジェントな条件下においてハイブリダイズすると考えられるので、それら核酸分子も同様に使用することが出来る。
【００２４】
本発明の核酸分子は、当業者に公知の適当なオリゴＤＮＡ設計システムを用いてその塩基配列を設計することが出来る。例えば、以下に示す条件に基づき、オリゴ設計システムを用いて約４，０００塩基対以上の長さを有する長鎖cDNA全長から、６５−７５塩基長を有するオリゴヌクレオチド配列を設計し、その配列に基づき化学的に合成することによって、合成オリゴヌクレオチドとして得ることが出来る。
【００２５】
即ち、各核酸分子のデザインは本発明者等がクローニングした文献１，２に示されるmKIAA cDNA配列に基づきダイナコム社製統合オリゴDNA設計システムProbeQuestを用いて行った。その際の条件として以下のようにパラメータを設定した。
１）Tm  [70-80℃(最小−最大)]、
２）GC含量  [45-65%(最小−最大)]、
３）プローブ長  [65-75 塩基長(最小−最大)]、
４）プローブ設計対象領域    (3'末端側からの全長対しての割合%) [100%]、
５）塩濃度(mM) [50mM]、
６）遺伝子配列特異的領域検出のためのマスキング配列[NCBI UniGene 
build #118 87543配列] (特異的領域検出のための相同性検索に使用する配列データベース)、
７）プローブ中に許容する非特異領域  ＜ 30%、
８）スプライス・バリアントが存在する場合はスプライス部位に以外にデザイン、
９）マスキングに用いた配列の中に複数の相同配列が存在しても同一の遺伝子と判定された場合は、マスキングを無視してデザイン、
１０）遺伝子のCDS (蛋白質をコードしている領域)にデザイン、
１１）クローニングした遺伝子と既知配列情報を比較した際、cDNA合成の際のリバーストランスクリプターゼ(RNA依存DNA polymerase)の性質に起因するだろう１塩基や数塩基のギャップが存在した場合、このような部位をはずしてデザイン、
１２）cDNA配列に存在するスプライスアウトされなかっただろうイントロン領域をはずしてデザイン、具体的には5'末端領域及び3'末端領域にデフォルトで200塩基長のオリゴをデザインしない領域を設ける。
長鎖遺伝子用に特に設計し良好な結果をもたらした、本発明による新たに採用したパラメータは、８）、９）、１０）、１１）、及び１２）であった
【００２６】
尚、本明細書に記載された配列番号１ないし１４３の具体的な塩基配列に基づいて、当業者であれば、当該技術分野において周知の化学合成法によっても、本発明の核酸分子を容易に合成することが出来る。
【００２７】
このように、本発明の核酸分子はマウス遺伝子、特にマウス脳由来の遺伝子と特異的に反応することが出来るので、これらの遺伝子を検出する等の目的で行われるハイブリダイゼーション用プローブとして有用である。本発明の配列は脳で発現しているが、脳以外の臓器においても発現しているものが含まれることから、それら臓器で強く発現しているこれらの遺伝子を検出する等の目的で行われるハイブリダイゼーション用プローブとして有用である。尚、必要に応じて、本発明のハイブリダイゼーション用プローブは当業者に公知の任意の方法によって放射性同位体標識、蛍光標識、ビオチン等特異的蛋白質標識又は酵素標識される場合もある。
【００２８】
従って、このハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を用いて、遺伝子、例えば、マウス遺伝子、特にマウス脳由来の遺伝子のスクリーニングを実施することが出来る。或いは、該ハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を用いて、マウス脳由来の遺伝子発現解析を実施することが出来る。また、マウスに分類学上近いラット等げっ歯類においてマウスと遺伝子配列の相同性が高いことから、ラット等げっ歯類の脳由来の遺伝子発現解析を実施することが出来る。本発明の配列を含有するマウス長鎖が、脳以外の臓器でも発現している場合は、それら臓器における遺伝子発現解析を実施することが出来る。本発明のプローブを用いて行うスクリーニングの具体的な方法は、当業者には周知である。
【００２９】
例えば、ノーザンブロット解析による方法が挙げられる。まず本発明の核酸分子を放射性同位体標識、蛍光標識、ビオチン標識、あるいは酵素標識してプローブを作製する。次に、各組織等から得られた試料より、常法により全ＲＮＡ又はポリ（Ａ）ＲＮＡを抽出・精製し、常法であるアルカリ変性によるアガロースゲル電気泳動、あるいはホルムアルデヒド変性によるアガロースゲル電気泳動及びナイロン、あるいはニトロセルロースメンブレン等へのブロッティングを行う。このメンブレンと、先のプローブとのハイブリダイゼーションを行うことにより、各遺伝子のｍＲＮＡの発現の有無を検出することができる。ハイブリダイゼーションの条件としては、例えば、上記のストリンジェントな条件下を挙げることが出来る。尚、組織のin situ hybridizationにも応用される。その場合、DNA依存RNAポリメラーゼ等を用い試験内合成により標識RNAフラグメント作製し、それをプローブとして使用することで、DNA-RNAハイブリッド二本鎖形成に比較しより強固な二本鎖RNA形成を導き、より明確なシグナルをえることができる。更に、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ法（Genomics，第５巻，８７４〜８７９頁（１９８９年）、Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，第８６巻，２７６６〜２７７０頁（１９８９年））などにより実施することができる。
【００３０】
更に、マイクロチップ あるいはマイクロアレイ（ＤＮＡチップ）を用いて遺伝子発現解析を行うことも出来る。従って、このような各種のスクリーニング法及び遺伝子発現解析に使用することができる、本発明のハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を含む遺伝子スクリーニング用キット、例えば、マイクロアレイ又はマイクロチップ等も本発明に含まれる。このような遺伝子スクリーニング用キットには、本発明の核酸分子任意に選択された適当な種類のハイブリダイゼーション用プローブを含むことが出来るが、マウウス遺伝子を包括的・網羅的にスクリーニングするには、出来るだけ多くの種類の核酸分子を含むことが好ましく、配列番号１ないし１４３に記載の塩基配列から成る核酸分子、又はそれと実質的に同機能の核酸分子の全ての種類を含むものが最適である。更に、本発明の核酸分子以外に任意のマウス遺伝子を特異的に検出できる核酸分子を含むことが好ましい。
【００３１】
本発明のハイブリダイゼーション用プローブの少なくとも一種類を含むマイクロアレイ又はマイクロチップは、例えば、以下に示す文献に記載されたような当業者公知の任意の方法で作成することが出来る。
ＤＮＡマイクロアレイ実戦マニュアル、林崎良英  監修（羊土社）；DNA Microarrays -A Practical Approach-, Edited by Mark Schene, Oxford University Press 1999；Lockhart DJ, Dong H, Byrne MC, Follettie MT, Gallo MV, Chee MS, Mittmann M, Wang C, Kobayashi M, Horton H, Brown EL. Expression monitoring by hybridization to high-density oligonucleotide arrays；Nat Biotechnol. 1996 Dec;14(13):1675-80；Wodicka L, Dong H, Mittmann M, Ho MH, Lockhart DJ. Genome-wide expression monitoring in Saccharomyces cerevisiae；Nat Biotechnol. 1997 Dec;15(13):1359-67.
【００３２】
また、本発明のハイブリダイゼーション用プローブの配列を使用することにより、ＤＮＡチップと同様な二本鎖ＲＮＡ形成原理、ハイブリッド二本鎖形成原理を応用する目的で、DNA依存RNAポリメラーゼで試験内合成等により作製したＲＮＡフラグメントなどを用いることによりＲＮＡチップを作製することもできる。従って、本発明において、核酸分子とはＤＮＡ及びＲＮＡを含み、このようなＲＮＡチップも本発明のマイクロアレイ又はマイクロチップに含まれるものである。
【実施例】
【００３３】
以下に、実施例により本発明をさらに具体的に説明するが、本発明はそれに限定されるものではない。尚、実施例における特に記載のない各種遺伝子操作は、Molecular cloning third.ed.（Cold Spring Harbor Lab. Press，2001）に記載されている方法に従った。
【００３４】
cDNAアレイ及びオリゴDNAアレイによる解析法を以下に記載する。
８週齢の雄ICRマウス（SLC社）から摘出した脳をTRIzol（Invitrogen社、♯15596-026）で処理してTotal RNA を抽出した。さらにDynabeads mRNA Purification Kit (Dynal社、♯610.06)を用いてTotal RNA よりmRNAを抽出した。cDNAアレイに対してはSuperScriptII (Invitrogen社、♯18064-014)と[α-33P]dCTP (Amersham社、♯AH9905)を用いてプローブを放射線ラベルした。一方、オリゴアレイではBD Atlas PowerScript Fluorescent Labeling Kit ( BD Clontech社、♯634712)とCy5 Mono-reactive NHS ester (Amersham社、 ♯PA15101)を用いて蛍光ラベルした。
【００３５】
cDNAアレイに載せるプラスミドDNAは、QIAprep Spin Miniprep Kit (QIAGEN社、#27104)を用いて精製し、最終DNA濃度が0.1mg/mlの濃度になるように80%ホルムアミドを希釈液として使用して調整した。これをGenomic Solutions社製アレイ作製機（RA1 Microarrayer）を用いてピン方式によりナイロン膜(日本ジェネティク社、♯ZNXG2020)上にスポットした。
一方、オリゴDNAアレイに載せる合成オリゴDNAは、前記の設計システムによりデザインした配列情報に基づき株式会社日本遺伝子研究所が開発した方法により作製した。
この際に、合成オリゴDNAにＮａ塩等が含まれていると、デルタ−エネルギーが上昇し、ハイブリダイゼーションに影響を与えるとされていることから、脱塩カラム等を使用し塩濃度を極力低減したsalt free oligo-DNAとして作製した。また、長い合成DNAを合成する過程で副産物としてアプリン酸が生じると、それが合成したDNAをプリン基に位置で切断して断片化してしまうことがあるので、アプリン酸をL-Lysinを用いて分解する行程も経てアプリン酸 free oligo-DNAとして作製した。こうして今回３５６個の最適設計配列を合成した。次に、日本ガイシ株式会社が開発したインクジェット方を使用したアレイ化方法により、これらの配列に加えて、ＤＮＡを含まない溶液、ラン藻遺伝子由来配列等ネガティブコントロール、また、ベータチューブリン、ベーターアクチン等マウスで高発現である遺伝子由来の配列をガラス基板上にスポッティングした。すなわち、合成オリゴDNAの濃度を、５０〜１００pmole/μｌに調整し、松波硝子工業株式会社が供給するアミノ修飾オリゴＤＮＡ用コートスライドガラス上に、合成オリゴＤＮＡ等を含む溶液を、マイクロセラミックポンプを高速噴射してアレイ化し、サンプルなしの部分も含めて約５２８（１１×８×６）のマトリクスからなるオリゴDNAアレイを作成した。作製されたオリゴDNAアレイは使用直前まで真空パック内-80℃で保存し、開封後はデシケーター内で室温保存した。
【００３６】
cDNAアレイはPerfectHyb Hybridization Solution (TOYOBO社、♯HYB-101)を用いて68℃一晩ハイブリダーゼーションを行った。一方オリゴDNAアレイは自作したHybridization Buffer (50% ホルムアミド , 5×SSC , 0.5% SDS)を用いて42℃一晩ハイブリダーゼーションを行った。
【００３７】
ハイブリダーゼーションの後、cDNAアレイは68℃に加温したWash Buffer1 (2×SSC , 1%SDS)及びWash Buffer2 (0.1×SSC , 1%SDS)で洗浄した。一方オリゴDNAアレイは60℃に加温したWash Buffer1 (5×SSC , 0.5%SDS)、Wash Buffer2 (2×SSC , 0.1%SDS)及びWash Buffer3 (0.2×SSC , 0.1%SDS)で洗浄した。
オリゴDNAアレイについては、得られたシグナルは蛍光としてイメージアナライザー（富士写真フィルム株式会社製：FLA8000）を使用して検出した。バックグラウンドのシグナルより、いずれも十分に洗浄されていることを確認した（図１）。
cDNAアレイについては、ハイブリダイズした放射線シグナルを富士写真フィルム株式会社製のイメージングプレートに記録し、イメージアナライザー（富士写真フィルム株式会社製：FLA8000）を使用して検出した。
検出した各々蛍光シグナルと放射線シグナルは、富士写真フィルム株式会社が供給するFLA8000（同社製）に組み込まれた画像解析ソフトを用いて相関関係を解析した。解析した結果については、シグナル強度の対数をScatter Protで表した（図２）。この結果から、少なくとも本発明の１４３個のオリゴＤＮＡに関しては両解析結果は相関係数0.8994と極めて高い相関を示していることが確認された。
【産業上の利用可能性】
【００３８】
本発明は、癌などの増殖性疾患や先天奇形など分化異常を含めたマウス疾患及びそれと相関するヒト疾患の機序解明及び診断・治療上で必要不可欠な役割を果たすと考えられる。
更に、脳・神経系の病態及びその発症機構の解明、それによる予防薬、治療薬、検査薬の開発に有用である。
また、本発明の１４３の配列を用い配列を利用することにより、該配列に係わる遺伝子発現調節に関係するアゴニスト、アンタゴニストのスクリーニングに利用できるし、また、該配列に係わる遺伝子発現レベルを測定して薬物の作用・副作用を検出することによりドラッグデザイン研究に利用できる。
【図面の簡単な説明】
【００３９】
【図１】オリゴDNAアレイを用い、マウス脳における遺伝子発現レベルを蛍光シグナルとしてイメージアナライザーを使用して検出したイメージを示す。
【図２】マウス脳遺伝子発現解析において、異なる二つのアレイ方式に基づいた再現性を示すグラフである。  縦軸(cDNAアレイ)と横軸(オリゴDNAアレイ)はそれぞれの方式に従った異なる実験によって得られた発現強度を示している。丸で示した位置は、異なる二つのアレイ方式による検出実験により、同一遺伝子について測定された各々のシグナル強度を示す。
【図１】
2005087116.tif 000003
【図２】
2005087116.tif 000004
【配列表】
2005087116000001.app