(57)【要約】      （修正有）【課題】  従来の方法では検出できなかった、ビールを混濁させ得る偏性嫌気性グラム陰性菌を検出する方法、当該菌を含めた様々なビール混濁菌を同時に検出・識別する方法を提供する。【解決手段】  マレフィラス・シェルビシェ由来の特定な塩基配列からなるポリヌクレオチドを明らかにし、オリゴヌクレオチドからなるマレフィラス・シェルビシェ検出用プライマーセットを用いて増幅・検出を行うことで、マレフィラス・シェルビシェの検出を行う。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１に示す塩基配列の全部又は一部からなるポリヌクレオチド。
【請求項２】
配列番号２に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなる、マレフィラス・シェルビシエ（Malephilus cerevisiae）検出用プライマーセット。
【請求項３】
配列番号８に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号６に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなるビール混濁菌の検出・識別用プライマーセット。
【請求項４】
配列番号４に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号７に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号５に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなるビール混濁菌の検出・識別用プローブセット。
【請求項５】
請求項３記載のプライマーセット及び請求項４記載のプローブセットを含むことを特徴とするビール混濁菌の検出・識別用キット。
【請求項６】
請求項２記載のプライマーセットを用いて核酸断片を増幅する工程、及び、得られた核酸断片を検出する工程を含むことを特徴とする遺伝子増幅法によるマレフィラス・シェルビシエ（Malephilus cerevisiae）の検出方法。
【請求項７】
請求項３記載のプライマーセットを用いて核酸断片を増幅する工程、及び、得られた核酸断片と請求項４記載のプローブセットとのハイブリッドの融解温度を測定する工程を含むことを特徴とするビール混濁菌の検出・識別方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、偏性嫌気性グラム陰性菌の検出・識別方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
近年のビールの生ビール化への流れは、ビール鮮度という新たな価値観をもたらした。こうした背景から、ビール製造会社にとっては、ビールの製造から出荷までの時間を劇的に短縮するために、ビールを混濁させる菌（ビール混濁菌）の汚染を迅速かつ正確に判定する必要が高まっている。
【０００３】
偏性嫌気性菌であるペクチネータス属菌（Pectinatus）及びメガスフェラ属菌（Megasphera）は、製品ビールの嫌気度が高まるにしたがって汚染事故の原因菌としての危険度が増すため、これらの菌群を迅速かつ正確に検出することが望まれている。これらの菌群の検出方法として、従来より、抗原抗体反応を利用した検出法（例えば、非特許文献１参照）、ＰＣＲ法（ポリメラーゼ連鎖反応法）による検出法（例えば、特許文献１参照）、ＦＩＳＨ法（蛍光ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリッド形成法）による検出法（例えば、特許文献２参照）などが知られている。
【特許文献１】特再平０９−８２００７１号公報
【特許文献２】特開２００１−１４５４９２号公報
【非特許文献１】J. Am. Soc. Brew. Chem.: 51(4), 158-163,1993
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
しかしながら、本発明者らは、ビールを混濁させる新規な偏性嫌気性グラム陰性菌を発見し、上記従来技術の方法では当該菌を検出できない可能性があることを見出した。
【０００５】
したがって、本発明の目的は、従来の方法では検出できなかった、ビールを混濁させ得る偏性嫌気性グラム陰性菌を検出する方法を提供することにある。本発明の目的は、さらに、当該菌を含めた様々なビール混濁菌を同時に検出・識別する方法を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
上記目的を達成するために、本発明は、配列番号１に示す塩基配列の全部又は一部からなるポリヌクレオチドを提供する。
【０００７】
また、本発明は、配列番号２に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなる、マレフィラス・シェルビシエ（Malephilus cerevisiae）検出用プライマーセット、並びに、当該プライマーセットを用いて核酸断片を増幅する工程、及び、得られた核酸断片を検出する工程を含むことを特徴とする遺伝子増幅法によるマレフィラス・シェルビシエ（Malephilus cerevisiae）の検出方法を提供する。
【０００８】
さらに、本発明は、配列番号８に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号６に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなるビール混濁菌の検出・識別用プライマーセット、配列番号４に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号７に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号５に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなるビール混濁菌の検出・識別用プローブセット、当該プライマーセット及び当該プローブセットを含むことを特徴とするビール混濁菌の検出・識別用キット、並びに、当該プライマーセットを用いて核酸断片を増幅する工程、及び、得られた核酸断片と請求項４記載のプローブセットとのハイブリッドの融解温度を測定する工程を含むことを特徴とするビール混濁菌の検出・識別方法を提供する。
【０００９】
本発明者らは、既知の方法では検出できないビールを混濁させ得る偏性嫌気性グラム陰性菌であるマレフィラス・シェルビシエ（Malephilus cerevisiae）を分離することに成功し、Malephilus cerevisiae SBC8034株（未承認名）の１６Ｓ  リボソーマルＲＮＡ遺伝子（１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子）の塩基配列が配列番号１に示す塩基配列であることを明らかにした。本菌株は、独立行政法人  産業技術総合研究所  特許生物寄託センターに寄託されており、その寄託番号はＦＥＲＭ  ＢＰ−０８５２８である。
【００１０】
Malephilus cerevisiae検出用プライマーセットを用いることにより、Malephilus cerevisiaeの１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子を特異的に増幅することができるため、Malephilus cerevisiaeを検出することが可能となる。
【００１１】
また、ビール混濁菌の検出・識別用プライマーセットを用いることにより、様々なビール混濁菌の１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子を増幅することができる。そして、得られた核酸断片とビール混濁菌の検出・識別用プローブセットとのハイブリッドを形成させ、当該ハイブリッドの融解温度を測定することにより、核酸断片の由来している混濁菌の種類の違いによって融解温度が異なるため、融解温度の違いによりビール混濁菌の検出及び識別することが可能となる。
【発明の効果】
【００１２】
従来の方法では検出できなかった、ビールを混濁させ得る偏性嫌気性グラム陰性菌を検出する方法、当該菌を含めた様々なビール混濁菌を同時に検出・識別する方法を提供することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１３】
以下、本発明の好適な実施形態について詳細に説明する。
【００１４】
＜ポリヌクレオチド＞
まず、本発明のポリヌクレオチドについて説明する。本発明のポリヌクレオチドは、配列番号１に示す塩基配列の全部又は一部からなることを特徴とするが、配列番号１に示す塩基配列の相補配列の全部又は一部からなるポリヌクレオチドをも含む。ここで、配列番号１は、ビールを混濁させ得る偏性嫌気性グラム陰性菌であるMalephilus cerevisiaeの１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列を表わす。本発明のポリヌクレオチドは、以下に述べるように、Malephilus cerevisiaeを検出する上で有用であり、Malephilus cerevisiae検出用プライマー、プライマーにより増幅された核酸断片、検出用プローブ等として使用可能である。また、本発明のポリヌクレオチドは蛍光物質等により化学修飾されていてもよい。
【００１５】
本発明のポリヌクレオチドがMalephilus cerevisiae検出用プライマー又は検出用プローブとして使用される場合には、ヌクレオチドの長さが１５〜２５であるオリゴヌクレオチドであることが望ましい。プライマーの設計は、当業者であれば容易に行うことができ、必要があれば、プライマー設計支援ソフトウェアを利用して設計することも可能である。
【００１６】
なお、本発明において「ポリヌクレオチド」及び「オリゴヌクレオチド」とは、ＤＮＡ、ＲＮＡ及びＰＮＡ（ペプチド核酸）を含む意味で用いられる。また、本発明のポリヌクレオチド及びオリゴヌクレオチドは、例えば、ホスホロアミダイト法等の公知の方法により合成することが可能である。
【００１７】
＜Malephilus cerevisiaeの検出＞
次に、本発明のMalephilus cerevisiae検出用プライマーセット及びそれを用いたMalephilus cerevisiaeの検出方法について説明する。本発明のMalephilus cerevisiae検出用プライマーセットは、配列番号２に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドと配列番号３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドとからなることを特徴とし、両オリゴヌクレオチドはMalephilus cerevisiaeの１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子に特異的な塩基配列を有していることから、Malephilus cerevisiaeの１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子を特異的に増幅することができるため、Malephilus cerevisiaeを特異的に検出することが可能である。
【００１８】
本発明の検出方法によりMalephilus cerevisiaeの検出を行うには、まず、試料（例えば、ビールや発泡酒などの麦芽飲料）から核酸を抽出する。核酸の抽出は、当技術分野で公知の方法を使用することによりでき、具体的には例えば、フェノール抽出及びエタノール沈殿を行う方法、ガラスビーズを用いる方法などによりＤＮＡを抽出することができ、ＡＧＰＣ法やグアニジン・塩化セシウム超遠心法などによりＲＮＡを抽出することができる。
【００１９】
次に、得られた核酸を鋳型とし、前記プライマーセットを用いて核酸断片を増幅する。増幅方法として、当技術分野で公知の増幅方法を用いることができるが、特に、ＰＣＲ法又はＲＴ−ＰＣＲ法が好ましい。ＰＣＲ法では、抽出されたＤＮＡを鋳型として、ＤＮＡポリメラーゼにより、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子のうちプライマーセットに挟まれた部分の塩基配列からなる核酸断片が増幅される。ＰＣＲ法では、変性、アニーリング、相補鎖合成からなるサイクルを繰り返すことにより核酸断片（二本鎖ＤＮＡ）が、各工程の温度や時間、サイクル数等のＰＣＲの最適条件は、当業者であれば用意に決定することができる。ＲＴ−ＰＣＲ法では、抽出されたＲＮＡを鋳型として、逆転写酵素によりｃＤＮＡを合成し、得られたｃＤＮＡを鋳型としてＰＣＲ法を行うものである。
【００２０】
次に、増幅された核酸断片を検出する。すなわち、増幅された核酸断片がMalephilus cerevisiaeに特異的なものか否かを判定する。検出は、当技術分野で公知の方法により行うことができ、例えば、Malephilus cerevisiaeに特異的にハイブリダイズするプローブを用いたハイブリダイゼーションにより行うことが可能である。また、増幅された核酸断片の融解温度を測定することにより、核酸断片を検出することも可能である。
【００２１】
融解温度の測定は、当技術分野で公知の方法により行うことができるが、例えば、増幅された核酸断片を含む溶液にＳＹＢＲ  Ｇｒｅｅｎ  Ｉなどの核酸染色試薬を添加し、溶液の温度を上昇させながら蛍光強度を連続的に測定し、得られた融解温度曲線を分析することにより融解温度を測定することが可能である。核酸染色試薬は核酸断片を増幅する反応溶液に混ぜておくことができるため、核酸断片の増幅反応が終了後ただちに核酸断片を検出することができる。したがって、１つのチューブやキャピラリー内で、核酸断片を増幅する工程と得られた核酸断片を検出する工程とを連続して行えるため、核酸染色試薬を用いて増幅された核酸断片の融解温度を測定する方法が特に好ましい。また、本方法は、検出感度が高いという利点もある。
【００２２】
本発明のMalephilus cerevisiae検出用プライマーセットにより増幅されるMalephilus cerevisiae由来の核酸断片の融解温度は約８８℃であり、試料の融解温度と比較することにより、試料中にMalephilus cerevisiaeが含まれているか否かの判定を行うことができ、Malephilus cerevisiaeの検出が可能である。
【００２３】
＜ビール混濁菌の検出・識別＞
最後に、本発明のビール混濁菌の検出・識別用プライマーセット、プローブセット及びキット並びにそれらを用いたビール混濁菌の検出・識別方法について説明する。
【００２４】
本発明のビール混濁菌の検出・識別用プライマーセットは、それぞれ配列番号８、３及び６に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドからなることを特徴とする。配列番号８に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドは、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子のユニバーサルプライマーである。本発明のプライマーセットを用いることにより、様々なビール混濁菌の核酸断片を増幅することが可能である。
【００２５】
本発明のビール混濁菌の検出・識別用プローブセットは、それぞれ配列番号４、７、５に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドからなることを特徴とする。本プローブセットは、以下に述べるように、様々なビール混濁菌の核酸断片を検出するのに用いることができ、ビール混濁菌を検出・識別することが可能である。
【００２６】
本発明のビール混濁菌の検出・識別用キットは、前記プライマーセットと前記プローブセットを含むことを特徴とする。本キットは、さらに、反応バッファー、ｄＮＴＰ混合物、酵素などを含んでいてもよく、ＤＮＡ抽出試薬などを含んでいてもよい。
【００２７】
本発明の検出・識別方法によりビール混濁菌を検出・識別するには、まず、試料（例えば、ビールや発泡酒などの麦芽飲料）から核酸を抽出する。核酸の抽出は、前述と同様の方法により行うことができる。
【００２８】
次に、得られた核酸を鋳型とし、前記プライマーセットを用いて核酸断片を増幅する。増幅は、前述と同様の方法により行うことができ、ＰＣＲ法又はＲＴ−ＰＣＲ法が好ましい。
【００２９】
次に、得られた核酸断片と前記プローブセットとのハイブリッドを形成させ、ハイブリッドの融解温度を測定する。融解温度の測定原理の概要は次のとおりである。配列番号４及び７に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドは、それぞれ５’末端が蛍光物質であるＬＣ  Ｒｅｄ６４０及びＬＣ  Ｒｅｄ７０５で標識されている（以下、それぞれ「Ｒｅｄ６４０プローブ」及び「Ｒｅｄ７０５プローブ」という。）。一方、配列番号５に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドは、３’末端がＦＩＴＣで標識されている（以下、「ＦＩＴＣプローブ」という。）。そして、各プローブは、ＦＩＴＣプローブの３’末端とＲｅｄ６４０プローブ及びＲｅｄ７０５プローブの５’末端とが近接してビール混濁菌の核酸断片とハイブリダイズするように設計されている。核酸断片にＦＩＴＣプローブとＲｅｄ６４０プローブ（又はＲｅｄ７０５プローブ）とがともにハイブリダイズしている状態で、ハイブリッドにＦＩＴＣの励起波長の光を照射すると、ＦＲＥＴ（蛍光共鳴エネルギー移動）が生じ、Ｒｅｄ６４０（又はＲｅｄ７０５）の蛍光波長の光が観察される。この状態から温度を上昇させていくと、ＦＩＴＣプローブ及び／又はＲｅｄ６４０プローブ（又はＲｅｄ７０５プローブ）が融解して核酸断片から剥がれていき、それに従ってＦＲＥＴが生じなくなりＲｅｄ６４０（又はＲｅｄ７０５）の蛍光強度が減少していく。そして、各温度における蛍光強度を測定し、横軸に温度をとり、縦軸に蛍光強度（変化率も含む）をとれば、融解曲線が得られる。このようにして得られた融解曲線を解析することにより、ハイブリッドの融解温度を求めることができる。
【００３０】
ＦＩＴＣプローブ及び／又はＲｅｄ６４０プローブ（又はＲｅｄ７０５プローブ）は、核酸断片とのミスマッチの程度がビール混濁菌の種類によって差が生じるように設定してある。したがって、ビール混濁菌の種類によって、ハイブリッドの示す融解曲線及び融解温度が異なるため、その違いに基づいてビール混濁菌の種類を判別することが可能である。具体的には、Malephilus cerevisiaeは約６５℃、Megasphaera cerevisiaeは約４８℃及び約５６℃、Pectinatus frisingensisはで約６３℃、Pectinatus cerevisiiphilusは約５４℃の融解温度を示す。試料の融解温度とこれらの融解温度を比較することにより、試料中に含まれているビール混濁菌の検出・識別を行うことができる。
【００３１】
なお、本発明のプローブセットは、核酸断片を増幅する反応溶液に混ぜておくことができるため、核酸断片の増幅反応が終了後ただちに融解温度を測定することができる。したがって、本発明のビール混濁菌の検出・識別方法は、１つのチューブやキャピラリー内で核酸断片を増幅する工程と融解温度を測定する工程を連続して行えるという利点がある。
【実施例】
【００３２】
以下、実施例を挙げて本発明について更に詳しく説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
【００３３】
（実施例１）  M. cerevisiaeの植菌によるビールの混濁
M. cerevisiae SBC8034株を、０．２％のリンゴ酸を添加したＧＡＭ寒天培地（日水製薬社）で増殖させた。M. cerevisiae SBC8034株の１白金耳量を瓶入りの全麦芽ビール（ｐＨ４．５、苦味価３０、アルコール５％、容量３５０ｍＬ）に植菌し、ビール瓶に打栓をし、３０℃にて約１ヶ月間培養を行ったところ、ビールが混濁した。
【００３４】
表１は培養１ヶ月後の混濁ビール中の有機酸の濃度（ｐｐｍ）を示したものである。M. cerevisiae SBC8034株を植菌した混濁ビールは、正常ビールに比べ、リンゴ酸やコハク酸の濃度が約２倍になっていた。
【００３５】
【表１】
2005229838.tif 000002
【００３６】
（実施例２）  １６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子のシークエンス
（ゲノムＤＮＡの調製）
M. cerevisiae SBC8034株を、０．２％のリンゴ酸を添加したＧＡＭ寒天培地に植菌し、３０℃にて、７〜１４日間、嫌気培養を行った。なお、嫌気培養は、タバイエスペック社製の嫌気培養装置を用い、Ｎ２：Ｈ２：ＣＯ２＝９０：５：５という条件で行った。嫌気培養したM. cerevisiae SBC8034株の菌体から、ＤＮＡ抽出液PrepMan Ultra（アプライド・バイオシステムズジャパン社）を用いて、ＤＮＡの抽出を行った。
【００３７】
（１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子の増幅・解析）
上記方法により調製したＤＮＡ抽出液について、MicroSeq Full Gene 16S rDNAキット（アプライド・バイオシステムズジャパン社）を用いて、M. cerevisiae SBC8034株の１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子のシークエンスを行った。シークエンスの結果得られたM. cerevisiae SBC8034株の１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を配列番号１に示す。本遺伝子配列は、ビールを混濁させる偏性嫌気性グラム陰性菌であるペクチネータス属菌及びメガスフェラ属菌の遺伝子配列とは、明らかに異なっていた。さらに、ＧｅｎＢａｎｋ等のデータベース検索を行ったが、登録されている何れの遺伝子配列とも一致しなかった。従って、M. cerevisiaeはビールを混濁させる新規な偏性嫌気性グラム陰性菌であることが明らかとなった。
【００３８】
（実施例３）リアルタイムＰＣＲを用いたM. cerevisiaeの検出および識別
実施例２と同様の方法により、ビールを混濁させ得る様々な菌株からＤＮＡを抽出し、得られたＤＮＡ抽出液について、配列番号２及び３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドをプライマーとして用いて、表２に示した反応試薬の組成でＰＣＲを行った。
【００３９】
【表２】
2005229838.tif 000003
【００４０】
反応装置にLightCyclerクイックシステム330(ロッシュ・ダイアグノスティックス社製)を用い、９５℃で１０分間処理した後、１サイクルを９５℃で１５秒間、５０℃で５秒間、７２℃で２０秒間とし、それを４０サイクル繰り返すことによりＰＣＲを行った。
【００４１】
ＰＣＲ終了後引き続いて９５℃まで温度を上昇させた後、直ちに６５℃まで冷却し、同温度を１５秒間保持した後、２０℃／秒の割合で９５℃まで温度を上昇させた。この加熱の間、５３０ｎｍの蛍光強度を０．２℃毎に測定し、その値の一次微分の負の値（−ｄＦ／ｄＴ）をプロットして生じるピークにより融解温度を決定した。
【００４２】
表３に様々な菌株のＰＣＲ産物に対して融解温度約８８℃のピークが出現したか否かを示す。表３から明らかなように、M. cerevisiaeのみに約８８℃の融解温度を示すピークが観察された。このことから、配列番号２及び３に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドからなるプライマーセットを用いることにより、M. cerevisiaeを特異的に検出できることが明らかとなった。
【００４３】
なお、使用した一部の菌株（サッポロビール分離株）については、実施例２と同様の方法により、１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列からの菌種決定を行った。
【００４４】
【表３】
2005229838.tif 000004
【００４５】
（実施例４）リアルタイムＰＣＲを用いた偏性嫌気性グラム陰性菌の検出および識別
実施例２と同様の方法により調製した様々な菌株のＤＮＡ抽出液について、プライマーとして配列番号８に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチド（１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子のユニバーサルプライマー、5’-TGGAGAGTTTGATCCTGGCTC-3’）並びに配列番号３及び６に示す塩基配列からなるオリゴヌクレオチドを使用し、プローブとして配列番号４の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド（３’末端をリン酸化し、５’末端をＬＣ  Ｒｅｄ６４０でラベルしてある）、配列番号７の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド（３’末端をリン酸化し、５’末端をＬＣ  Ｒｅｄ７０５でラベルしてある）及び配列番号５の塩基配列からなるオリゴヌクレオチド（３’末端をＦＩＴＣでラベルしてある）を使用し、表４に示した反応試薬の組成でＰＣＲを行った。
【００４６】
【表４】
2005229838.tif 000005
【００４７】
反応装置に、LightCyclerクイックシステム330（ロッシュ・ダイアグノスティックス社製）を用い、９５℃で１０分間処理した後、１サイクルを９５℃で１５秒間、５０℃で５秒間、７２℃で２０秒間とし、それを４０サイクル繰り返すことによりＰＣＲを行った。
【００４８】
ＰＣＲ終了後引き続いて９５℃まで温度を上昇させた後、直ちに４０℃まで冷却し、同温度を１５秒間保持した後、２０℃／秒の割合で９５℃まで温度を上昇させた。この加熱の間、６４０ｎｍ及び７１０ｎｍの蛍光強度を０．２℃毎に測定し、その値の一次微分の負の値（−ｄＦ／ｄＴ）をプロットして生じるピークにより融解温度を決定した。
【００４９】
その結果、M. cerevisiae SBC8034株は６４０ｎｍで約６５℃、Megasphaera cerevisiae JCM6129株は６４０ｎｍで約４８℃及び約５６℃、Pectinatus frisingensis VTT-E-79100株は７１０ｎｍで約６３℃、P. cerevisiiphilus VTT-E-79105株は７１０ｎｍで約５４℃の融解温度を示すピークが観察された。図１及び図２は、蛍光強度の変化率（−ｄＦ／ｄＴ）と温度（℃）との関係を表わす融解曲線である。図１は６４０ｎｍにおける（ａ）Megasphaera cerevisiae JCM6129株及び（ｂ）M. cerevisiae SBC8034株の融解曲線を、図２は７１０ｎｍにおける（ｃ）P. cerevisiiphilus VTT-E-79105株及び（ｄ）Pectinatus frisingensis VTT-E-79100株の融解曲線を示す。上記の４つの菌株以外の菌株は、融解曲線においてピークを示さなかった。なお、本実施例において用いた菌株は表３に示した菌株と同一である。
【００５０】
以上より、上記プライマーおよびプローブを用いることにより、同時に複数の偏性嫌気性グラム陰性菌の検出・識別をすることが可能であることが確認された。
【図面の簡単な説明】
【００５１】
【図１】６４０ｎｍにおける（ａ）Megasphaera cerevisiae JCM6129株及び（ｂ）M. cerevisiaeSBC8034株の融解曲線である。
【図２】７１０ｎｍにおける（ｃ）P. cerevisiiphilus VTT-E-79105株及び（ｄ）Pectinatus frisingensis VTT-E-79100株の融解曲線である。
【図１】
2005229838.tif 000006
【図２】
2005229838.tif 000007
【配列表】
2005229838000001.app