【手続補正書】
【提出日】平成22年9月2日(2010.9.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ウイルスの出芽を阻害するのに有用なタンパク質複合体のモジュレーターの選択方法であって、該タンパク質複合体が第２のタンパク質と相互作用する第１のタンパク質を含み、
（ａ）該第１のタンパク質が、
（ｉ）  Ｔｓｇ１０１、
（ｉｉ）  ＨＩＶ  ＧＡＧ  ｐ６と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPISASYPPYQATGPPNTSYMPGMPGGISPYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGPYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY
と少なくとも７５％同一のアミノ酸配列を含むポリペプチド、
（ｉｉｉ）  ＨＩＶ  ＧＡＧ  ｐ６と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPISASYPPYQATGPPNTSYMPGMPGGISPYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGPYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY
と少なくとも８５％同一のアミノ酸配列を含むポリペプチド、
（ｉｖ）  ＨＩＶ  ＧＡＧ  ｐ６と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPISASYPPYQATGPPNTSYMPGMPGGISPYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGPYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY
と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含むポリペプチド
であり、
（ｂ）該第２のタンパク質が、
（１）  ＨＩＶ  ＧＡＧポリペプチド、
（２）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MGARASVLSGGELDKWEKIRLRPGGKKQYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELRSLYNTIAVLYCVHQRIDVKDTKEALDKIEEEQNKSKKKAQQAAADTGNNSQVSQNYPIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVLAEAMSQVTNPATIMIQKGNFRNQRKTVKCFNCGKEGHIAKNCRAPRKKGCWKCGKEGHQMKDCTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRPEPTAPPEESFRFGEETTTPSQKQEPIDKELYPLASLRSLFGSDPSSQ
と少なくとも７５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（３）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MGARASVLSGGELDKWEKIRLRPGGKKQYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELRSLYNTIAVLYCVHQRIDVKDTKEALDKIEEEQNKSKKKAQQAAADTGNNSQVSQNYPIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVLAEAMSQVTNPATIMIQKGNFRNQRKTVKCFNCGKEGHIAKNCRAPRKKGCWKCGKEGHQMKDCTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRPEPTAPPEESFRFGEETTTPSQKQEPIDKELYPLASLRSLFGSDPSSQ
と少なくとも８５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（４）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MGARASVLSGGELDKWEKIRLRPGGKKQYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELRSLYNTIAVLYCVHQRIDVKDTKEALDKIEEEQNKSKKKAQQAAADTGNNSQVSQNYPIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVLAEAMSQVTNPATIMIQKGNFRNQRKTVKCFNCGKEGHIAKNCRAPRKKGCWKCGKEGHQMKDCTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRPEPTAPPEESFRFGEETTTPSQKQEPIDKELYPLASLRSLFGSDPSSQ
と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（５）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができる（１）、（２）、（３）または（４）のフラグメントであって、Ｐ（Ｔ／Ｓ）ＡＰ後期ドメインモチーフを含むフラグメント、
（６）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるレトロウイルスＧＡＧポリペプチド
（７）  Ｐ（Ｔ／Ｓ）ＡＰ後期ドメインモチーフを含む（６）のフラグメント、または
（８）  （１）〜（７）のいずれかを含む融合タンパク質
であり、
該方法が、
（ａ）  １つまたは複数の試験化合物の存在下で前記第１のタンパク質に前記第２のタンパク質を接触させるステップと、
（ｂ）  前記第１のタンパク質と前記第２のタンパク質との間の相互作用を検出するステップと
を含む、方法。
【請求項２】
前記接触ステップをインビトロで行う、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記接触ステップを宿主細胞内において行う、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記宿主細胞が酵母細胞である、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
請求項１に記載の第２のタンパク質を発現する宿主細胞であって、請求項１に記載の第１のタンパク質をコードする第１の核酸に作動可能に連結された第１の異種プロモーターを有する第１のキメラ発現カセットを含む宿主細胞。
【請求項６】
前記第２のタンパク質が、前記宿主細胞において、前記第２のタンパク質をコードする第２の核酸に作動可能に連結された第２の異種プロモーターを有する第２のキメラ発現カセットから発現される請求項５に記載の宿主細胞。
【請求項７】
（ａ）請求項１に記載のタンパク質複合体の三次元構造を定義する原子座標を得るステップと、
（ｂ）該原子座標に基づいて、前記第１のタンパク質と前記第２のタンパク質との間の相互作用を妨害することができる化合物を設計または選択するステップと
を含む、請求項１に記載のタンパク質複合体中の第１のタンパク質と第２のタンパク質との間の相互作用を妨害することができる化合物を得る方法。
【請求項８】
請求項１に記載のタンパク質複合体のモジュレーターの選択方法であって、
（ａ）試験化合物に、請求項１に記載のタンパク質複合体を接触させるステップと、
（ｂ）前記第１のタンパク質と前記第２のタンパク質との間の相互作用を検出するステップと
を含む、方法。
【請求項９】
前記試験化合物の、ＨＩＶに感染した宿主細胞からのＨＩＶウイルスの出芽を阻害する能力を試験するステップをさらに含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
（ａ）請求項１に記載のタンパク質複合体と選択的に免疫反応性の抗体と、
（ｂ）Ｔｓｇ１０１またはＧＡＧポリペプチドと選択的に免疫反応性の抗体であって、請求項１に記載のタンパク質複合体の形成を妨害し、または既存の請求項１に記載のタンパク質複合体を不安定化、破壊、または解離する抗体と、
（ｃ）（ａ）をコードする核酸、または（ｂ）をコードする核酸と
から選択される宿主細胞からのウイルスの出芽を阻害するのに適した化合物。
【請求項１１】
（ａ）  Ｔｓｇ１０１遺伝子の複製もしくは転写調節領域、またはＴｓｇ１０１ｍＲＮＡの翻訳開始領域、エクソン／イントロン連結点もしくはコード領域と特異的にハイブリッド形成するアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｂ）  ＨＩＶ  ＧＡＧｐ６と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPISASYPPYQATGPPNTSYMPGMPGGISPYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGPYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY
と少なくとも７５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（ｃ）  ＨＩＶ  ＧＡＧｐ６と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPISASYPPYQATGPPNTSYMPGMPGGISPYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGPYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY
と少なくとも８５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（ｄ）  ＨＩＶ  ＧＡＧｐ６と相互作用することができるポリペプチドであって、以下のアミノ酸配列
MAVSESQLKKMVSKYKYRDLTVRETVNVITLYKDLKPVLDSYVFNDGSSRELMNLTGTIPVPYRGNTYNIPICLWLLDTYPYNPPICFVKPTSSMTIKTGKHVDANGKIYLPYLHEWKHPQSDLLGLIQVMIVVFGDEPPVFSRPISASYPPYQATGPPNTSYMPGMPGGISPYPSGYPPNPSGYPGCPYPPGGPYPATTSSQYPSQPPVTTVGPSRDGTISEDTIRASLISAVSDKLRWRMKEEMDRAQAELNALKRTEEDLKKGHQKLEEMVTRLDQEVAEVDKNIELLKKKDEELSSALEKMENQSENNDIDEVIIPTAPLYKQILNLYAEENAIEDTIFYLGEALRRGVIDLDVFLKHVRLLSRKQFQLRALMQKARKTAGLSDLY
と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（ｅ）  Ｐ（Ｔ／Ｓ）ＡＰ後期ドメインモチーフを含むレトロウイルスＧＡＧフラグメント、
（ｆ）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるポリペプチドであって、以下の配列
MGARASVLSGGELDKWEKIRLRPGGKKQYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELRSLYNTIAVLYCVHQRIDVKDTKEALDKIEEEQNKSKKKAQQAAADTGNNSQVSQNYPIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVLAEAMSQVTNPATIMIQKGNFRNQRKTVKCFNCGKEGHIAKNCRAPRKKGCWKCGKEGHQMKDCTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRPEPTAPPEESFRFGEETTTPSQKQEPIDKELYPLASLRSLFGSDPSSQ
と少なくとも７５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（ｇ）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるポリペプチドであって、以下の配列
MGARASVLSGGELDKWEKIRLRPGGKKQYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELRSLYNTIAVLYCVHQRIDVKDTKEALDKIEEEQNKSKKKAQQAAADTGNNSQVSQNYPIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVLAEAMSQVTNPATIMIQKGNFRNQRKTVKCFNCGKEGHIAKNCRAPRKKGCWKCGKEGHQMKDCTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRPEPTAPPEESFRFGEETTTPSQKQEPIDKELYPLASLRSLFGSDPSSQ
と少なくとも８５％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（ｈ）  Ｔｓｇ１０１と相互作用することができるポリペプチドであって、以下の配列
MGARASVLSGGELDKWEKIRLRPGGKKQYKLKHIVWASRELERFAVNPGLLETSEGCRQILGQLQPSLQTGSEELRSLYNTIAVLYCVHQRIDVKDTKEALDKIEEEQNKSKKKAQQAAADTGNNSQVSQNYPIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEWDRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSPTSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHKARVLAEAMSQVTNPATIMIQKGNFRNQRKTVKCFNCGKEGHIAKNCRAPRKKGCWKCGKEGHQMKDCTERQANFLGKIWPSHKGRPGNFLQSRPEPTAPPEESFRFGEETTTPSQKQEPIDKELYPLASLRSLFGSDPSSQ
と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、
（ｉ）  請求項１に記載のタンパク質複合体に対して選択的な免疫反応性を示す抗体であって、請求項１に記載の第１のタンパク質と第２のタンパク質とのタンパク質−タンパク質相互作用を阻害することができる抗体、
（ｊ）  Ｔｓｇ１０１またはＧＡＧポリペプチドと選択的に免疫反応性の抗体であって、請求項１に記載のタンパク質複合体の形成を妨害し、または既存の請求項１に記載のタンパク質複合体を不安定化、破壊、または解離する抗体、
（ｋ）  （ｉ）をコードする核酸、
（ｌ）  （ｊ）をコードする核酸
からなる群から選択される化合物の、ウイルス感染を治療するための組成物の製造における使用。
【請求項１２】
宿主細胞中のＴｓｇ１０１及びＨＩＶ  ＧＡＧを有するタンパク質複合体の濃度を減少させるステップを含む、インビトロで宿主細胞からのウイルス粒子の出芽を阻害する方法であって、
（ａ）請求項１に記載の方法により選択されたモジュレーター、請求項１０に記載の化合物、または請求項１１に記載の組成物を用いて、Ｔｓｇ１０１とＨＩＶ  ＧＡＧとの相互作用を妨害するステップ、または
（ｂ）Ｔｓｇ１０１遺伝子の複製もしくは転写調節領域、またはＴｓｇ１０１ｍＲＮＡの翻訳開始領域、エクソン／イントロン連結点もしくはコード領域と特異的にハイブリッド形成するアンチセンスオリゴヌクレオチドまたはＴｓｇ１０１核酸に特異的にハイブリッド形成するリボザイム化合物を該細胞に投与することにより、Ｔｓｇ１０１の発現を減少させるステップ
を含む方法。