【手続補正書】
【提出日】平成22年5月18日(2010.5.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号207〜221のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、EGFR（上皮細胞成長因子受容体型キナーゼ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項２】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号1〜9のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、CaMK II（カルシウムカルモジュリン依存性キナーゼ２型）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項３】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号10〜36のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、ERK2によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項４】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号37〜56のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、JNK1によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項５】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号57〜70のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、p38αによりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項６】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号71〜84のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、MAPKAP-K2によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項７】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号85〜122のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、PKA（サイクリックAMP依存性プロテインキナーゼ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項８】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号123〜137のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、PKC-α（プロテインキナーゼＣのαサブタイプ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項９】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号138〜160のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、PKC-ζ（プロテインキナーゼＣのゼータサブタイプ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１０】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号161〜172のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、PKC-δ（プロテインキナーゼＣのデルタサブタイプ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１１】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号173〜177のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、Aktによりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１２】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号178〜191のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、Srcによりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１３】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号192〜206のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、Abl（アベルソンチロシンキナーゼ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１４】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号222〜231のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、INSR（インスリン受容体型キナーゼ）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１５】
標識物質により標識化されていてもよい、以下の(a)または(b)のポリペプチド：
(a) 配列番号232〜246のいずれか１つにより表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド；
(b) 上記(a)に示すアミノ酸配列において、1以上のアミノ酸が欠失、付加、挿入または置換されたアミノ酸配列を含み、JAK1（ヤヌスキナーゼ１型）によりリン酸化され得るポリペプチド。
【請求項１６】
タンパク質キナーゼの活性の測定方法であって、
(a) 請求項1〜15のいずれかに記載のポリペプチドと、前記タンパク質キナーゼの活性を有する可能性のある試料とを、前記タンパク質キナーゼが基質ポリペプチドをリン酸化可能な条件で反応させる工程と、
(b) 工程(a)でリン酸化されたポリペプチドを定量する工程と
を含み、
以下の条件：
前記ポリペプチドが請求項1に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがEGFRである、
前記ポリペプチドが請求項2に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがCaMK IIである、
前記ポリペプチドが請求項3に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがERK2である、
前記ポリペプチドが請求項4に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJNK1である、
前記ポリペプチドが請求項5に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがp38αである、
前記ポリペプチドが請求項6に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがMAPKAP-K2である、
前記ポリペプチドが請求項7に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKAである、
前記ポリペプチドが請求項8に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-αである、
前記ポリペプチドが請求項9に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-ζである、
前記ポリペプチドが請求項10に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-δである、
前記ポリペプチドが請求項11に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAktである、
前記ポリペプチドが請求項12に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがSrcである、
前記ポリペプチドが請求項13に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAblである、
前記ポリペプチドが請求項14に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがINSRである、
前記ポリペプチドが請求項15に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJAK1である、
のいずれか1つを満足する、前記方法。
【請求項１７】
タンパク質キナーゼの活性に関連する疾患の診断方法であって、
(a) 請求項1〜15のいずれかに記載のポリペプチドと、哺乳動物から単離された成分を含む前記タンパク質キナーゼの活性を有する可能性のある試料とを、前記タンパク質キナーゼが基質ポリペプチドをリン酸化可能な条件で反応させる工程と、
(b) 工程(a)でリン酸化されたポリペプチドを定量する工程と
を含み、
以下の条件：
前記ポリペプチドが請求項1に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがEGFRである、
前記ポリペプチドが請求項2に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがCaMK IIである、
前記ポリペプチドが請求項3に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがERK2である、
前記ポリペプチドが請求項4に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJNK1である、
前記ポリペプチドが請求項5に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがp38αである、
前記ポリペプチドが請求項6に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがMAPKAP-K2である、
前記ポリペプチドが請求項7に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKAである、
前記ポリペプチドが請求項8に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-αである、
前記ポリペプチドが請求項9に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-ζである、
前記ポリペプチドが請求項10に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-δである、
前記ポリペプチドが請求項11に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAktである、
前記ポリペプチドが請求項12に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがSrcである、
前記ポリペプチドが請求項13に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAblである、
前記ポリペプチドが請求項14に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがINSRである、
前記ポリペプチドが請求項15に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJAK1である、
のいずれか1つを満足する、前記方法。
【請求項１８】
請求項1〜15のいずれかに記載のポリペプチドを含む、該ポリペプチドを基質とするタンパク質キナーゼの活性の測定用試薬であって、
以下の条件：
前記ポリペプチドが請求項1に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがEGFRである、
前記ポリペプチドが請求項2に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがCaMK IIである、
前記ポリペプチドが請求項3に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがERK2である、
前記ポリペプチドが請求項4に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJNK1である、
前記ポリペプチドが請求項5に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがp38αである、
前記ポリペプチドが請求項6に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがMAPKAP-K2である、
前記ポリペプチドが請求項7に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKAである、
前記ポリペプチドが請求項8に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-αである、
前記ポリペプチドが請求項9に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-ζである、
前記ポリペプチドが請求項10に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-δである、
前記ポリペプチドが請求項11に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAktである、
前記ポリペプチドが請求項12に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがSrcである、
前記ポリペプチドが請求項13に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAblである、
前記ポリペプチドが請求項14に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがINSRである、
前記ポリペプチドが請求項15に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJAK1である、
のいずれか1つを満足する、前記試薬。
【請求項１９】
請求項1〜15のいずれかに記載のポリペプチドを含む、該ポリペプチドを基質とするタンパク質キナーゼの活性に関連する疾患の診断薬であって、
以下の条件：
前記ポリペプチドが請求項1に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがEGFRである、
前記ポリペプチドが請求項2に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがCaMK IIである、
前記ポリペプチドが請求項3に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがERK2である、
前記ポリペプチドが請求項4に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJNK1である、
前記ポリペプチドが請求項5に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがp38αである、
前記ポリペプチドが請求項6に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがMAPKAP-K2である、
前記ポリペプチドが請求項7に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKAである、
前記ポリペプチドが請求項8に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-αである、
前記ポリペプチドが請求項9に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-ζである、
前記ポリペプチドが請求項10に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-δである、
前記ポリペプチドが請求項11に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAktである、
前記ポリペプチドが請求項12に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがSrcである、
前記ポリペプチドが請求項13に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAblである、
前記ポリペプチドが請求項14に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがINSRである、
前記ポリペプチドが請求項15に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJAK1である、
のいずれか1つを満足する、前記診断薬。
【請求項２０】
基板と、該基板上に固定化された請求項1〜15のいずれかに記載のポリペプチドとを含む、該ポリペプチドを基質とするタンパク質キナーゼの活性検出用ポリペプチドアレイであって、
以下の条件：
前記ポリペプチドが請求項1に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがEGFRである、
前記ポリペプチドが請求項2に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがCaMK IIである、
前記ポリペプチドが請求項3に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがERK2である、
前記ポリペプチドが請求項4に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJNK1である、
前記ポリペプチドが請求項5に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがp38αである、
前記ポリペプチドが請求項6に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがMAPKAP-K2である、
前記ポリペプチドが請求項7に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKAである、
前記ポリペプチドが請求項8に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-αである、
前記ポリペプチドが請求項9に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-ζである、
前記ポリペプチドが請求項10に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがPKC-δである、
前記ポリペプチドが請求項11に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAktである、
前記ポリペプチドが請求項12に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがSrcである、
前記ポリペプチドが請求項13に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがAblである、
前記ポリペプチドが請求項14に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがINSRである、
前記ポリペプチドが請求項15に記載のポリペプチドであり、且つ前記タンパク質キナーゼがJAK1である、
のいずれか1つを満足する、前記ポリペプチドアレイ。
【請求項２１】
請求項1〜15のいずれか1項に記載のポリペプチドをコードする核酸。