(57)【要約】本開示は、プロコアグラントポリペプチド、例えばプロコアグラントペプチドおよび／または凝血因子を含むプロコアグラントポリペプチドと、プロテアーゼ切断可能基質（例えば合成トロンビン基質）および自己犠牲スペーサーを含むリンカーとを含む、プロテアーゼ活性プロコアグラント化合物を提供する。プロテアーゼによるプロテアーゼ切断可能基質の切断において、自己犠牲スペーサーはプロコアグラントポリペプチドから自身を切断し、ポリペプチドは非誘導化および活性形態になる。薬学的組成物、開示化合物を使用する出血障害の治療方法、プロコアグラントポリペプチドのインビボ有効性を増強する方法、プロコアグラントポリペプチドを含む化合物のタンパク質分解性切断の有効性を増加させる方法、プロコアグラントポリペプチドを活性化させる方法、およびプロコアグラントポリペプチドをＰＥＧのような異種部分から放出する方法も提供される。【特許請求の範囲】
【請求項１】
式
（Ｈｅｔ２）−（Ｐｅｐ２）−（Ｈｅｔ１）−（Ｌ）−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１
（式中、
Ｈｅｔ１は不在であるかまたは存在する第１の異種分子であり、
Ｈｅｔ２は不在であるかまたは存在する第２の異種分子であり、
Ｌは不在であるかまたは存在するリンカーであり、
Ｚｙはプロテアーゼ切断可能基質であり、
Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１はポリペプチドであり、
Ｐｅｐ２は不在であるかまたは存在するポリペプチドである）を有し、
Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２が凝血因子もしくはその断片、または合成プロコアグラントペプチドを含む、プロコアグラント化合物。
【請求項２】
前記自己犠牲スペーサーが前記プロテアーゼ切断可能基質の酵素切断後に１，４排除を経る、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３】
前記自己犠牲スペーサーが前記プロテアーゼ切断可能基質の酵素切断後に１，６排除を経る、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４】
前記自己犠牲スペーサーがｐ−アミノベンジルカルバメート（ＰＡＢＣ）、ｐ−アミノベンジルエーテル（ＰＡＢＥ）、またはｐ−アミノベンジルカルボナートである、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５】
前記自己犠牲スペーサーが芳香族基を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項６】
前記芳香族基がベンジル、シンナミル、ナフチル、およびビフェニルから成る群から選択される、請求項５に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項７】
前記芳香族基が複素環式である、請求項５に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項８】
前記芳香族基が少なくとも１つの置換基を含む、請求項５から７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項９】
前記少なくとも１つの置換基が、Ｆ、Ｃｌ、Ｉ、Ｂｒ、ＯＨ、メチル、メトキシ、ＮＯ２、ＮＨ２、ＮＯ３＋、ＮＨＣＯＣＨ３、Ｎ（ＣＨ３）２、ＮＨＣＯＣＦ３、アルキル、ハロアルキル、Ｃ１−Ｃ８アルキルハライド、カルボキシレート、サルフェート、スルファメート、およびスルホネートから成る群から選択される、請求項８に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１０】
前記芳香族基における少なくとも１つのＣが、Ｎ、Ｏ、またはＣ−Ｒ１で置換され、Ｒ１がＨ、Ｆ、Ｃｌ、Ｉ、Ｂｒ、ＯＨ、メチル、メトキシ、ＮＯ２、ＮＨ２、ＮＯ３＋、ＮＨＣＯＣＨ３、Ｎ（ＣＨ３）２、ＮＨＣＯＣＦ３、アルキル、ハロアルキル、Ｃ１−Ｃ８アルキルハライド、カルボキシレート、サルフェート、スルファメート、およびスルホネートから独立的に選択される、請求項７に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１１】
前記プロテアーゼ切断可能基質が凝血カスケードプロテアーゼ基質を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１２】
前記凝血カスケードプロテアーゼが、トロンビン、トロンボプラスチン、第Ｖａ因子、第ＶＩＩａ因子、第ＶＩＩＩａ因子、第ＩＸａ因子、第Ｘａ因子、第ＸＩａ因子、および第ＸＩＩａ因子から成る群から選択される、請求項１１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１３】
前記凝血カスケードプロテアーゼ基質がトロンビン基質である、請求項１１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１４】
前記トロンビン基質が合成トロンビン基質である、請求項１３に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１５】
前記合成トロンビン基質がＤ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇの配列を含む、請求項１４に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１６】
前記トロンビン基質が、Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ、Ｄ−Ａｌａ−Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ、Ａｌａ−Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ、およびＡｌａ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ｐｒｏ−Ａｒｇから成る群から選択される、請求項１３に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１７】
前記プロテアーゼ切断可能基質が、ネプリライシン（ＣＡＬＬＡまたはＣＤｌＯ）、ｔｈｉｍｅｔオリゴペプチダーゼ（ＴＯＰ）、ロイコトリエンＡ４ヒドロラーゼ、エンドセリン変換酵素、ｓｔｅ２４プロテアーゼ、ニューロライシン、ミトコンドリア中間ペプチダーゼ、間質コラゲナーゼ、コラゲナーゼ、ストロメリシン、マクロファージエラスターゼ、マトリライシン、ゼラチナーゼ、メプリン、プロコラーゲンＣ−エンドペプチダーゼ、プロコラーゲンＮ−エンドペプチダーゼ、ＡＤＡＭおよびＡＤＡＭＴメタロプロテイナーゼ、ミエリン関連メタロプロテイナーゼ、エナメリシン、腫瘍壊死因子α−変換酵素、インスリジン、ナーディライシン、ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼ、マグノリシン、ダクチリシン様メタロプロテアーゼ、好中球コラゲナーゼ、マトリクスメタロペプチダーゼ、膜型マトリクスメタロプロテイナーゼ、ＳＰ２エンドペプチターゼ、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）、プラスミン、ウロキナーゼ、ヒト線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰα）、トリプシン、キモトリプシン、カルデクリン、膵エラスターゼ、膵エンドペプチターゼ、エンテロペプチターゼ、白血球エラスターゼ、骨髄芽球、キマーゼ、トリプターゼ、グランザイム、角質層キモトリプシン酵素、アクロシン、カリクレイン、補体成分および因子、補体第２経路ｃ３／ｃ５コンバターゼ、マンノース結合タンパク関連セリンプロテアーゼ、凝固因子、トロンビン、タンパクｃ，ｕおよびｔ−型プラスミノーゲン活性化因子、カテプシンＧ、へプシン、プロスタシン、肝細胞成長因子活性エンドペプチターゼ、スブチリシン／ケキシン型タンパクコンバターゼ、フューリン、プロタンパク質コンバターゼ、プロリルペプチダーゼ、アシルアミノアシルペプチダーゼ、ペプチジル−グリカミナーゼ（ｐｅｐｔｉｄｙｌ−ｇｌｙｃａｍｉｎａｓｅ）、シグナルペプチダーゼ、ｎ−末端求核性アミノヒドロラーゼ、２０ｓプロテアソーム、γ−グルタミルトランスペプチダーゼ、ミトコンドリアエンドペプチダーゼ、ミトコンドリアエンドペプチダーゼＩａ、ｈｔｒａ２ペプチダーゼ、マトリプターゼ、部位１プロテアーゼ、レグマイン、カテプシン、システインカテプシン、カルパイン、ユビキチンイソペプチターゼＴ、カスパーゼ、グリコシルホスファチジルイノシトールタンパクトランスアミダーゼ、癌プロコアグラント、プロホルモンチオールプロテアーゼ、γ−グルタミルヒドロラーゼ、ブレオマイシンヒドロラーゼ、セプラーゼ、カテプシンＤ、ペプシン、キモシン、ガストリクシン、レニン、ヤプシンおよび／またはメマプシン、および前立腺特異抗原（ＰＳＡ）から成る群から選択されるプロテアーゼの切断部位を含む、請求項１から１０のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１８】
Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２が異なる、請求項１から１７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項１９】
Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２が同じである、請求項１から１７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２０】
Ｐｅｐ１が凝血因子またはその断片である、請求項１から１９のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２１】
Ｐｅｐ２が凝血因子またはその断片である、請求項１から２０のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２２】
Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２の両方が凝血因子またはその断片である、請求項１から２１のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２３】
Ｐｅｐ１が凝血因子の重鎖であり、Ｐｅｐ２が凝血因子の軽鎖である、請求項１から２２のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２４】
前記凝血因子が、ＦＶＩＩ、ＦＶＩＩａ、ＦＶＩＩＩ、ＦＩＸ、ＦＸ、ＦＸａ、およびフォンウィルブランド因子から成る群から選択される、請求項２０から２３のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２５】
Ｐｅｐ１が合成プロコアグラントペプチドである、請求項１から１９のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２６】
Ｐｅｐ２が合成プロコアグラントペプチドである、請求項１から１９のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２７】
Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２の両方が合成プロコアグラントペプチドである、請求項１から１９のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２８】
前記リンカーがペプチドリンカーである、請求項１から２７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項２９】
前記ペプチドリンカーが、少なくとも２つのアミノ酸、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも１０、少なくとも２０、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも６０、少なくとも７０、少なくとも８０、少なくとも９０、または少なくとも１００個のアミノ酸を含む、請求項２８に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３０】
前記ペプチドリンカーが、少なくとも２００、少なくとも３００、少なくとも４００、少なくとも５００、少なくとも６００、少なくとも７００、少なくとも８００、少なくとも９００、または少なくとも１，０００個のアミノ酸を含む、請求項２８に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３１】
前記ペプチドリンカーが、式中でｘが１から４、ｙが０または１、およびｚが１から５０である、式［（Ｇｌｙ）ｘ−Ｓｅｒｙ］ｚを有するペプチドを含む、請求項２８に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３２】
前記リンカーが非ペプチドリンカーを含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３３】
前記リンカーが非ペプチドリンカーから成る、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３４】
前記非ペプチドリンカーが、ＭＣ、ＭＰ、ＭＰＥＧ、ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＳＭＰＴ、ＬＣ−ＳＰＤＰ、およびＳＭＰＢから成る群から選択される、請求項３０または請求項３１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３５】
前記異種部分が半減期延長部分を含む、請求項１から３４のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３６】
前記半減期延長部分が低複雑性ポリペプチドである、請求項３５に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３７】
前記半減期延長部分が、アルブミン、アルブミン結合ポリペプチドまたは脂肪酸、Ｆｃ、トランスフェリン、ＰＡＳ、ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニットのＣ末端ペプチド（ＣＴＰ）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、アルブミン結合小分子、フォンウィルブランド因子、またはそれらのあらゆる組み合わせを含む、請求項３５に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３８】
前記半減期延長部分が、クリアランス受容体、または前記プロコアグラント化合物のクリアランス受容体への結合を阻止するその断片を含む、請求項３５に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項３９】
前記クリアランス受容体がＬＲＰ１である、請求項３８に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４０】
前記異種部分が、前記プロコアグラント化合物またはその断片の可視化あるいは位置特定を可能にする、ペプチドまたはポリペプチドを含む、請求項１から３９のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４１】
前記可視化または位置特定がインビトロ、インビボ、エクスビボまたはそれらのあらゆる組み合わせにおいて可能である、請求項４０に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４２】
可視化または位置特定を可能にする前記ペプチドまたはポリペプチドが、ビオチンアクセプターペプチド、リポ酸アクセプターペプチド、蛍光タンパク、二ヒ素染料の連結のためまたは準安定テクネチウムの抱合のためのシステイン含有ペプチド、ユーロピウムクラスレートの抱合のためまたは蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）系近接アッセイ法のためのペプチド、およびそれらのあらゆる組み合わせから成る群から選択される、請求項４１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４３】
前記蛍光タンパクがＧＦＰ、ＲＦＰ、ＹＦＰ、ＥＧＦＰ、ＥＹＦＰ、およびそれらのあらゆる組み合わせから成る群から選択される、請求項４２に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４４】
前記二ヒ素染料が、４’，５’−ビス（１，３，２−ジチオアルソラン−２−イル）フルオレセイン（ＦｌＡｓＨ）である、請求項４２に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４５】
前記ビオチンアクセプターペプチドが、アビジンおよびストレプトアビジン系試薬の抱合を容易にする、請求項４２に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４６】
前記リポ酸アクセプターペプチドが、リポ酸に結合するチオール反応性プローブの抱合または蛍光リポ酸類似体の直接連結を容易にする、請求項４２に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４７】
前記異種部分が非ペプチド活性剤を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４８】
前記非ペプチド活性剤がプロコアグラント分子である、請求項４７に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項４９】
前記非ペプチド活性剤が小分子薬品である、請求項４７に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５０】
前記異種部分が標的またはリガンド結合部分を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５１】
前記異種部分がアンカーまたは足場分子を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５２】
前記アンカーまたは足場分子が脂質、炭水化物、またはスルフヒドリル基である、請求項５１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５３】
式Ｈｅｔ−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１
（式中、
Ｈｅｔがシステインであり、
Ｌがペプチドリンカーであり、
Ｚｙが合成トロンビン基質であり、
Ｂｘが前記自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１がプロコアグラントペプチドである）を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５４】
前記ペプチドリンカーがＧＧＧＧアミノ酸配列を含み、前記合成トロンビン基質が前記配列ＤＰｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含み、前記自己犠牲スペーサーがＰＡＢＣであり、前記プロコアグラントペプチドが配列
【化６】
2015521589.tif 000020
を含む、請求項５３に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５５】
式Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１
（式中、
Ｚｙが合成トロンビン基質であり、
Ｂｘが自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１が凝血因子である）を含む、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５６】
前記合成トロンビン基質が前記配列ＤＰｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含み、前記自己犠牲スペーサーがＰＡＢＣであり、前記凝血因子が第Ｘａ因子または第ＶＩＩａ因子である、請求項５５に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５７】
前記プロコアグラント活性が、活性化部分トロンボプラスチン時間（ａＰＴＴ）アッセイ、修飾活性化部分トロンボプラスチン時間（ａＰＴＴ＊）アッセイ、トロンビン生成試験（ＴＧＡ）、およびＲＯＴＥＭアッセイから選択される方法を使用して測定される、請求項１に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項５８】
請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物、および薬学的に許容される担体を含む、薬学的組成物。
【請求項５９】
請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物、または請求項５８に記載の薬学的組成物の効果的な量を被験体に投与することを含む、被験体における出血疾患または障害を治療する、改良する、または防止するための方法。
【請求項６０】
前記出血疾患または障害が血液凝固障害によってもたらされる、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
前記血液凝固障害が血友病およびフォンウィルブランド病（ｖＷＤ）から選択される、請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
前記血液凝固障害が血友病Ａまたは血友病Ｂである、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
前記出血疾患または障害が、間接血症、筋出血、口腔内出血（ｏｒａｌ  ｂｌｅｅｄ）、出血、筋肉への出血、口腔内出血（ｏｒａｌ  ｈｅｍｏｒｒｈａｇｅ）、外傷、頭部外傷、胃腸出血、頭蓋内出血、腹腔内出血、胸腔内出血、骨折、中枢神経系出血、咽頭後隙における出血、後腹膜腔における出血、および腸腰筋鞘における出血から選択される、請求項５９から６２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６４】
血液凝固因子が、ＦＶ、ＦＶＩＩ、ＦＶＩＩａ、ＦＶＩＩＩ、ＦＩＸ、ＦＸ、ＦＸＩ、およびフォンウィルブランド因子から選択され、請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物、または請求項５８に記載の薬学的組成物の効果的な量を被験体に投与することを含む、哺乳類被験体における少なくとも１つの血液凝血因子における欠乏を治療する、改良する、または防止する方法。
【請求項６５】
前記被験体がヒト被験体である、請求項５９から６４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６６】
血液凝固障害を有する被験体を治療するための、請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物または請求項５８に記載の薬学的製剤。
【請求項６７】
前記被験体がヒト被験体である、請求項６６に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項６８】
血液凝固障害の治療、防止、または改良のための薬品の製造のための、請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物または請求項５８に記載の薬学的製剤の使用。
【請求項６９】
固相ペプチド合成の使用を含む、請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物を作るための方法。
【請求項７０】
直交固相ペプチド合成の使用を含む、請求項６９に記載の方法。．
【請求項７１】
ポリペプチドを自己犠牲スペーサーに結合することを含み、前記自己犠牲スペーサーがプロテアーゼ切断可能基質部分に結合されている、プロコアグラントポリペプチドのインビボ有効性を増強する方法。
【請求項７２】
前記自己犠牲スペーサーがＰＡＢＣ群を含む、請求項７１に記載の方法。
【請求項７３】
前記プロテアーゼ切断可能基質部分が合成トロンビン基質を含む、請求項７１に記載の方法。
【請求項７４】
前記プロコアグラントポリペプチドが凝血因子またはプロコアグラントペプチドである、請求項７１に記載の方法。
【請求項７５】
前記プロコアグラントポリペプチドが合成である、請求項７１に記載の方法。
【請求項７６】
自己犠牲リンカーを前記プロコアグラントポリペプチドに抱合する工程を含み、前記自己犠牲リンカーが前記プロテアーゼ基質と前記プロコアグラントペプチドまたは凝血因子との間に挿入される、プロコアグラントペプチドまたは凝血因子に動作可能に結合されたプロテアーゼ基質の切断の有効性を増加する方法。
【請求項７７】
請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物を、前記プロコアグラント化合物における前記プロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性プロコアグラントペプチドが前記プロテアーゼ切断可能基質部分のタンパク質分解性切断の際に放出される、プロコアグラントペプチドを活性化する方法。
【請求項７８】
請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物を、前記プロコアグラント化合物における前記プロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性凝血因子が前記プロテアーゼ切断可能基質部分のタンパク質分解性切断の際に放出される、凝血因子を活性化する方法。
【請求項７９】
請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物を、前記プロコアグラント化合物における前記プロテアーゼ切断可能基質に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性プロコアグラントポリペプチドが前記プロテアーゼ切断可能基質のタンパク質分解性切断の際に放出される、異種部分からプロコアグラントペプチドを放出する方法。
【請求項８０】
請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物を、前記プロコアグラント化合物における前記プロテアーゼ切断可能基質に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性凝血因子が前記プロテアーゼ切断可能基質のタンパク質分解性切断の際に放出される、異種部分から凝血因子を放出する方法。
【請求項８１】
前記プロコアグラント化合物がプロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼによって、同配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、少なくとも６倍、少なくとも７倍、少なくとも８倍、少なくとも９倍、または少なくとも１０倍速く切断される、請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項８２】
前記プロコアグラント化合物がプロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼによって、同配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも２０倍、少なくとも３０倍、少なくとも４０倍、少なくとも５０倍、少なくとも６０倍、少なくとも７０倍、少なくとも８０倍、少なくとも９０倍、または少なくとも１００倍速く切断される、請求項１から８１のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項８３】
前記自己犠牲スペーサーが非活性部位結合ペプチドを含む、請求項１から５７のいずれか１項に記載のプロコアグラント化合物。
【請求項８４】
前記プロテアーゼ切断部位が凝血因子の切断型重鎖および凝血因子の軽鎖に結合する、凝血因子の軽鎖、凝血因子の切断型重鎖（「ｔＨＣ」）、およびプロテアーゼ切断部位を含むプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項８５】
前記プロテアーゼ切断部位と前記凝血因子の前記軽鎖との間に細胞内プロセシング部位をさらに含む、請求項８４に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項８６】
前記凝血因子の前記切断型重鎖の前記Ｃ末端に任意のリンカーによって結合された異種部分をさらに含む、請求項８４または８５に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項８７】
前記異種部分が半減期延長部分を含む、請求項８６に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項８８】
前記半減期延長部分がアルブミン、アルブミン結合ポリペプチドまたは脂肪酸、Ｆｃ、トランスフェリン、ＰＡＳ、ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニットのＣ末端ペプチド（ＣＴＰ）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、アルブミン結合小分子、クリアランス受容体または前記プロコアグラント化合物のクリアランス受容体への結合を阻害するその断片、あるいはそれらのあらゆる組み合わせを含む、請求項８７に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項８９】
前記異種部分がＦｃ領域を含む、請求項８６から８８のいずれか１項に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９０】
前記異種部分がリンカーによって融合された２つのＦｃ領域を含む、請求項８６から８９のいずれか１項に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９１】
前記凝血因子が第ＶＩＩ因子または第Ｘ因子である、請求項８４から９０のいずれか１項に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９２】
前記凝血因子の前記切断型重鎖が、前記凝血因子の野生型重鎖と比較して前記重鎖のＮ末端にて１つ以上のアミノ酸を含まない、請求項８４から９０のいずれか１項に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９３】
前記１つ以上のアミノ酸が、２つのアミノ酸、３つのアミノ酸、４つのアミノ酸、５つのアミノ酸、６つのアミノ酸、７つのアミノ酸、８つのアミノ酸、９つのアミノ酸、１０個のアミノ酸、１１個のアミノ酸、１２個のアミノ酸、１３個のアミノ酸、１４個のアミノ酸、または１５個のアミノ酸を重鎖のＮ末端にて含む、請求項９２に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９４】
前記凝血因子が第ＶＩＩ因子であり、前記１つ以上のアミノ酸がＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）またはＩＶＧＧＫＶＣＰＫＧ（配列番号８４）である、請求項９２または９３に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９５】
前記凝血因子が第Ｘ因子であり、前記１つ以上のアミノ酸がＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）またはＩＶＧＧＱＥＣＫＤＧＥ（配列番号８６）である、請求項９２または９３に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９６】
前記プロテアーゼ切断可能部位がＳＵＭＯを含む、請求項８４から９５のいずれか１項に記載のプロテアーゼ切断可能ポリペプチド。
【請求項９７】
請求項８４から９６のいずれか１項に記載の切断可能ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
【請求項９８】
請求項９７に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
【請求項９９】
請求項９８に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項１００】
宿主細胞を請求項９７に記載のポリヌクレオチドまたは請求項９８に記載のベクターと遺伝子導入する工程と、前記宿主細胞を、前記ポリペプチドを発現するために十分な条件下で培養する工程とを含む、切断可能ポリペプチドを作る方法。
【請求項１０１】
請求項８４から９６のいずれか１項のプロテアーゼ切断可能ポリペプチドとプロテアーゼを、前記プロテアーゼ切断可能部位を切断するために十分な条件下で化合する工程を含み、前記プロテアーゼ切断可能ポリペプチドが切断ポリペプチドになる、プロコアグラント化合物を作る方法。
【請求項１０２】
チオエステルペプチドを前記切断ポリペプチドに加える工程をさらに含み、前記チオエステルペプチドが前記凝血因子の前記切断型重鎖の前記Ｎ末端に融合される、請求項１０１に記載の方法。
【請求項１０３】
前記チオエステルペプチドがプロテアーゼ切断可能基質（Ｚｙ）を含む、請求項１０１または１０２に記載の方法。
【請求項１０４】
前記チオエステルペプチドが自己犠牲スペーサー（Ｂｘ）を前記プロテアーゼ切断可能基質と前記凝血因子の前記切断型重鎖との間にさらに含む、請求項１０３に記載の方法。
【請求項１０５】
前記チオエステルペプチドが１つ以上のアミノ酸を前記自己犠牲スペーサーと前記凝血因子の前記切断型重鎖との間にさらに含む、請求項１０４に記載の方法。
【請求項１０６】
前記チオエステルペプチドが式
Ｚｙ−Ｂｘ−Ｗ
（式中、
Ｚｙがプロテアーゼ切断可能基質であり、
Ｂｘが自己犠牲スペーサーであり、
Ｗが１つ以上のアミノ酸である）を含む、請求項１０４または１０５に記載の方法。
【請求項１０７】
前記１つ以上のアミノ酸（Ｗ）が野生型凝血因子の前記Ｎ末端に対応するアミノ酸配列と同一であり、前記１つ以上のアミノ酸および前記凝血因子の前記切断型重鎖が、融合すると、前記凝血因子の完全重鎖になる、請求項１０４または１０５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０８】
前記１つ以上のアミノ酸がＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）またはＩＶＧＧＫＶＣＰＫＧＥ（配列番号８４）を含み、前記凝血因子が第ＶＩＩ因子を含む、請求項１０５から１０７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０９】
前記１つ以上のアミノ酸がＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）またはＩＶＧＧＱＥＣＫＤＧＥ（配列番号８６）を含み、前記凝血因子が第Ｘ因子を含む、請求項１０４から１０７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１０】
前記プロテアーゼ切断可能基質がトロンビン切断部位を含む、請求項１０３から１０９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１１】
前記トロンビン切断部位がＤ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含む、請求項１１０に記載の方法。
【請求項１１２】
前記自己犠牲スペーサーがＰＡＢＣを含む、請求項１０４から１１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１３】
前記プロテアーゼ切断可能部位がＳＵＭＯを含む、請求項１００から１１２のいずれか１項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、出血疾患または障害の治療に有用なプロコアグラント化合物に関する。
【背景技術】
【０００２】
血液凝固経路は、部分的に、血小板の表面上での第ＶＩＩＩａ因子（ＦＶＩＩＩａ）および第ＩＸａ因子（ＦＩＸａ）（Ｘａｓｅ複合体）の酵素複合体の形成を伴う。ＦＩＸａは、補助因子ＦＶＩＩＩａなしで比較的弱い触媒活性を有するセリンプロテアーゼである。Ｘａｓｅ複合体は第Ｘ因子（ＦＸ）を第Ｘａ因子（ＦＸａ）へと切断し、それが次に第Ｖａ因子（ＦＶａ）との相互作用により、プロトロンビンを切断しトロンビンを生成する。血友病Ａは第ＶＩＩＩ因子（ＦＶＩＩＩ）遺伝子における突然変異および／または欠失に引き起こされ、ＦＶＩＩＩ活性の欠乏をもたらす出血障害である（Ｐｅｙｖａｎｄｉ  ｅｔ  ａｌ．２００６）。血友病Ｂ（クリスマス病としても知られる）は、世界中で最も一般的な遺伝性出血障害のうちの１つである。それは、減少したインビボおよびインビトロ血液凝血活性をもたらし、侵された個人の生涯全体を通じて広範な医療監視を必要とする。
血友病の治療は凝血活性の回復を標的とする交換療法により行われる。入手可能である、要求に応じて出血症状を治療するためまたは予防的に治療することにより出血症状の発症を防止するための、血漿由来製剤および組換え凝血因子製剤がある。これらの製剤の半減期に基づいて、治療レジメンは、頻繁な静脈内投与を必要とする。かかる頻繁な投与は、痛みを伴い、かつ不都合である。凝血因子の半減期を延長するための戦略は、ペグ化（Ｒｏｓｔｉｎ  Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊ．Ｃｈｅｍ．２０００；１１：３８７−９６）、糖ペグ化（Ｓｔｅｎｎｉｃｋｅ  ＨＲ，ｅｔ  ａｌ．，Ｔｈｒｏｍｂ．Ｈａｅｍｏｓｔ．２００８；１００：９２０−８）、ペグ化リポソームを伴う製剤（Ｓｐｉｒａ  Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ２００６；１０８：３６６８−３６７３，Ｐａｎ  Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ２００９；１１４：２８０２−２８１１）およびアルブミンとの抱合（Ｓｃｈｕｌｔｅ  Ｓ．，Ｔｈｒｏｍｂ．Ｒｅｓ．２００８；１２２Ｓｕｐｐｌ４：Ｓ１４−９）を含む。しかしながら、凝固因子および半減期延長部分（例えばＰＥＧ）を有するプロコアグラントペプチドの修飾ならびに半減期を延長するための他の類似する戦略は、易感染性活性をもたらす。それらの活性を救済するために、切断可能リンカーが、対象のタンパク質またはペプチドとその修飾因子との間に挿入され得る。選択される切断可能リンカーは、プロテアーゼ、例えば凝血カスケードに含まれるプロテアーゼによって、効率的および迅速に切断されなければならない。多くの凝血因子の活性剤になっているトロンビンは、最も人気のある選択肢である。しかしながら、自然アミノ酸から成る公知の基質配列（例えば、ＬＶＰＲ、ＡＬＲＰＲ（配列番号７）等）全てが、最適基質ではない。さらに、凝固因子またはプロコアグラントペプチドへの切断可能リンカーの共有結合性結合は、効率的な酵素切断反応を妨げ得る立体障害（例えば、プロリン、イソロイシンまたは切断部位に対するアルギニンＣ末端のようなアミノ酸の存在による）になり得る。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００３】
【非特許文献１】Ｒｏｓｔｉｎ  Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊ．Ｃｈｅｍ．２０００；１１：３８７−９６
【非特許文献２】Ｓｔｅｎｎｉｃｋｅ  ＨＲ，ｅｔ  ａｌ．，Ｔｈｒｏｍｂ．Ｈａｅｍｏｓｔ．２００８；１００：９２０−８
【非特許文献３】Ｓｐｉｒａ  Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ２００６；１０８：３６６８−３６７３
【非特許文献４】Ｐａｎ  Ｊ，ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ２００９；１１４：２８０２−２８１１
【非特許文献５】Ｓｃｈｕｌｔｅ  Ｓ．，Ｔｈｒｏｍｂ．Ｒｅｓ．２００８；１２２Ｓｕｐｐｌ４：Ｓ１４−９
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
本開示は、プロテアーゼ切断可能基質（例えば、合成トロンビン基質）およびプロコアグラントポリペプチド、例えば凝血因子、またはプロコアグラントポリペプチドに結合された自己犠牲スペーサー（例えばＰＡＢＣ）を含む、プロコアグラント化合物を提供する。従って、いくつかの実施形態において、本開示は式
（Ｈｅｔ２）−（Ｐｅｐ２）−（Ｈｅｔ１）−（Ｌ）−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式Ｉ）
（式中、
Ｈｅｔ１は不在であるかまたは存在する第１の異種分子であり、
Ｈｅｔ２は不在であるかまたは存在する第２の異種分子であり、
Ｌは不在であるかまたは存在するリンカーであり、
Ｚｙはプロテアーゼ切断可能基質であり、
Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１はポリペプチドであり、
Ｐｅｐ２は不在であるかまたは存在するポリペプチドである）
を有するプロコアグラント化合物を提供し、Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２は、凝血因子もしくはその断片、または合成プロコアグラントペプチドを含む。
【０００５】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物における自己犠牲スペーサーは、プロテアーゼ切断可能基質の酵素切断後に１，４排除を経る。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物における自己犠牲スペーサーは、プロテアーゼ切断可能基質の酵素切断後に１，６排除を経る。いくつかの実施形態において、自己犠牲スペーサーは、ｐ−アミノベンジルカルバメート（ＰＡＢＣ）、ｐ−アミノベンジルエーテル（ＰＡＢＥ）、またはｐ−アミノベンジルカルボナートである。ある実施形態において、自己犠牲スペーサーは芳香族基を含む。いくつかの実施形態において、芳香族基はベンジル、シンナミル、ナフチル、およびビフェニルから成る群から選択される。いくつかの実施形態において、芳香族基は複素環式である。他の実施形態において、芳香族基は少なくとも１つの置換基を含む。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの置換基が、Ｆ、Ｃｌ、Ｉ、Ｂｒ、ＯＨ、メチル、メトキシ、ＮＯ２、ＮＨ２、ＮＯ３＋、ＮＨＣＯＣＨ３、Ｎ（ＣＨ３）２、ＮＨＣＯＣＦ３、アルキル、ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルキルハライド、カルボキシレート、サルフェート、スルファメート、スルホネート、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される。他の実施形態において、芳香族基における少なくとも１つのＣがＮ、Ｏ、またはＣ−Ｒ１で置換され、Ｒ１はＨ、Ｆ、Ｃｌ、Ｉ、Ｂｒ、ＯＨ、メチル、メトキシ、ＮＯ２、ＮＨ２、ＮＯ３＋、ＮＨＣＯＣＨ３、Ｎ（ＣＨ３）２、ＮＨＣＯＣＦ３、アルキル、ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ８アルキルハライド、カルボキシレート、サルフェート、スルファメート、およびスルホネートから独立的に選択される。
【０００６】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質は、凝血カスケードプロテアーゼ基質を含む。いくつかの実施形態において、凝血カスケードプロテアーゼは、トロンビン、トロンボプラスチン、第Ｖａ因子、第ＶＩＩａ因子、第ＶＩＩＩａ因子、第ＩＸａ因子、第Ｘａ因子、第ＸＩａ因子、第ＸＩＩａ因子、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される。他の実施形態において、凝血カスケードプロテアーゼ基質は、トロンビン基質である。いくつかの実施形態において、トロンビン基質は合成トロンビン基質である。他の実施形態において、合成トロンビン基質は、Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇの配列を含む。いくつかの実施形態において、トロンビン基質は、Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ、Ｄ−Ａｌａ−Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ（配列番号１７）、Ａｌａ−Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ（配列番号１７）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ（配列番号１８）、またはＡｌａ−Ｌｅｕ−Ａｒｇ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ（配列番号９０）から選択される。
【０００７】
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は、ネプリライシン（ＣＡＬＬＡまたはＣＤｌＯ）、チメットオリゴペプチダーゼ（ＴＯＰ）、ロイコトリエンＡ４ヒドロラーゼ、エンドセリン変換酵素、ｓｔｅ２４プロテアーゼ、ニューロライシン、ミトコンドリア中間ペプチダーゼ、間質コラゲナーゼ、コラゲナーゼ、ストロメリシン、マクロファージエラスターゼ、マトリライシン、ゼラチナーゼ、メプリン、プロコラーゲンＣ−エンドペプチダーゼ、プロコラーゲンＮ−エンドペプチダーゼ、ＡＤＡＭおよびＡＤＡＭＴメタロプロテイナーゼ、ミエリン関連メタロプロテイナーゼ、エナメリシン、腫瘍壊死因子α−変換酵素、インスリジン、ナーディライシン、ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼ、マグノリシン、ダクチリシン様メタロプロテアーゼ、好中球コラゲナーゼ、マトリクスメタロペプチダーゼ、膜型マトリクスメタロプロテイナーゼ、ＳＰ２エンドペプチターゼ、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）、プラスミン、ウロキナーゼ、ヒト線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰα）、トリプシン、キモトリプシン、カルデクリン、膵エラスターゼ、膵エンドペプチターゼ、エンテロペプチターゼ、白血球エラスターゼ、骨髄芽球、キマーゼ、トリプターゼ、グランザイム、角質層キモトリプシン酵素、アクロシン、カリクレイン、補体成分および因子、補体第２経路ｃ３／ｃ５コンバターゼ、マンノース結合タンパク質関連セリンプロテアーゼ、凝固因子、トロンビン、タンパク質ｃ、ｕおよびｔ−型プラスミノーゲン活性化因子、カテプシンＧ、へプシン、プロスタシン、肝細胞成長因子活性エンドペプチターゼ、スブチリシン／ケキシン型タンパク質コンバターゼ、フューリン、プロタンパク質コンバターゼ、プロリルペプチダーゼ、アシルアミノアシルペプチダーゼ、ペプチジル−グリカミナーゼ、シグナルペプチダーゼ、ｎ−末端求核性アミノヒドロラーゼ、２０ｓプロテアソーム、γ−グルタミルトランスペプチダーゼ、ミトコンドリアエンドペプチダーゼ、ミトコンドリアエンドペプチダーゼＩａ、ｈｔｒａ２ペプチダーゼ、マトリプターゼ、部位１プロテアーゼ、レグマイン、カテプシン、システインカテプシン、カルパイン、ユビキチンイソペプチターゼＴ、カスパーゼ、グリコシルホスファチジルイノシトールタンパク質トランスアミダーゼ、癌プロコアグラント、プロホルモンチオールプロテアーゼ、γ−グルタミルヒドロラーゼ、ブレオマイシンヒドロラーゼ、セプラーゼ、カテプシンＤ、ペプシン、キモシン、ガストリクシン、レニン、ヤプシンおよび／またはメマプシン、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される、プロテアーゼの切断部位を含む。
【０００８】
いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２は異なる。他の実施形態において、Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２は同じである。いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１は凝血因子またはその断片である。Ｐｅｐ２が凝血因子またはその断片である、他の実施形態において。ある実施形態において、Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２の両方が凝血因子またはその断片である。
【０００９】
いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１は凝血因子の重鎖であり、Ｐｅｐ２は凝血因子の軽鎖である。他の実施形態において、凝血因子はＦＶＩＩ、ＦＶＩＩａ、ＦＶＩＩＩ、ＦＩＸ、ＦＸ、ＦＸａ、フォンウィルブランド因子、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される。他の実施形態において、Ｐｅｐ１は合成プロコアグラントペプチドである。他の実施形態において、Ｐｅｐ２は合成プロコアグラントペプチドである。いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２の両方が合成プロコアグラントペプチドである。
【００１０】
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）はペプチドリンカーである。いくつかの実施形態において、ペプチドリンカーは、少なくとも２つのアミノ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、少なくとも１０個、少なくとも２０個、少なくとも３０個、少なくとも４０個、少なくとも５０個、少なくとも６０個、少なくとも７０個、少なくとも８０個、少なくとも９０個、または少なくとも１００個のアミノ酸を含む。他の実施形態において、ペプチドリンカーは、少なくとも２００個、少なくとも３００個、少なくとも４００個、少なくとも５００個、少なくとも６００個、少なくとも７００個、少なくとも８００個、少なくとも９００個、または少なくとも１，０００個のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態において、ペプチドリンカーは式［（Ｇｌｙ）ｘ−Ｓｅｒｙ］ｚ（式中、ｘは１から４、ｙは０または１、およびｚは１から５０である）を有するペプチドを含む。いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は、非ペプチドリンカーを含む。
【００１１】
いくつかの実施形態において、リンカー（Ｌ）は非ペプチドリンカーから成る。他の実施形態において、非ペプチドリンカーは、ＭＣ、ＭＰ、ＭＰＥＧ、ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＳＭＰＴ、ＬＣ−ＳＰＤＰ、ＳＭＰＢ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される。
【００１２】
いくつかの実施形態において、異種部分は半減期延長部分を含む。他の実施形態において、半減期延長部分は低複雑性ポリペプチドである。他の実施形態において、半減期延長部分は、アルブミン、アルブミン結合ポリペプチドまたは脂肪酸、Ｆｃ、トランスフェリン、ＰＡＳ、ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニットのＣ末端ペプチド（ＣＴＰ）、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、アルブミン結合小分子、フォンウィルブランド因子、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、半減期延長部分は、クリアランス受容体、またはプロコアグラント化合物のクリアランス受容体への結合を阻害するその断片を含む。いくつかの実施形態において、クリアランス受容体はＬＲＰ１である。
【００１３】
いくつかの実施形態において、異種部分は、プロコアグラント化合物またはその断片の可視化または位置特定を可能にする、ペプチドまたはポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、可視化または位置特定は、インビトロ、インビボ、エクスビボ、またはそれらのあらゆる組み合わせにおいて可能にされる。いくつかの実施形態において、可視化または位置特定を可能にするペプチドまたはポリペプチドは、ビオチンアクセプターペプチド、リポ酸アクセプターペプチド、蛍光タンパク質、二ヒ素染料の連結のためまたは準安定テクネチウムの抱合のためのシステイン含有ペプチド、ユーロピウムクラスレートの抱合のためまたは蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）系近接アッセイ法のためのペプチド、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される。
【００１４】
いくつかの実施形態において、蛍光タンパク質は、ＧＦＰ、ＲＦＰ、ＹＦＰ、ＥＧＦＰ、ＥＹＦＰ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される。いくつかの実施形態において、二ヒ素染料は４’，５’−ビス（１，３，２−ジチオアルソラン−２−イル）フルオレセイン（ＦｌＡｓＨ）である。いくつかの実施形態において、ビオチンアクセプターペプチドはアビジンおよびストレプトアビジン系試薬の抱合を容易にする。いくつかの実施形態において、リポ酸アクセプターペプチドは、リポ酸に結合するためのチオール反応性プローブの抱合または蛍光リポ酸類似体の直接連結を容易にする。
【００１５】
いくつかの実施形態において、異種部分は非ペプチド活性剤を含む。いくつかの実施形態において、非ペプチド活性剤はプロコアグラント分子である。いくつかの実施形態において、非ペプチド活性剤は小分子薬品である。いくつかの実施形態において、異種部分は標的またはリガンド結合部分である。いくつかの実施形態において、異種部分はアンカーまたは足場分子を含む。いくつかの実施形態において、アンカーまたは足場分子は、脂質、炭水化物、またはスルフヒドリル基である。
【００１６】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、式Ｈｅｔ−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１
（式中、
Ｈｅｔはシステインであり、
Ｌはペプチドリンカーであり、
Ｚｙは合成トロンビン基質であり、
Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１はプロコアグラントペプチドである）を有する。
【００１７】
いくつかの実施形態において、ペプチドリンカーはＧＧＧＧアミノ酸配列を含み、合成トロンビン基質は配列ＤＰｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含み、自己犠牲スペーサーはＰＡＢＣであり、プロコアグラントペプチドが配列
【化５】
2015521589.tif 000002
を含む。
【００１８】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、式Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式中、Ｚｙは合成トロンビン基質であり、Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、Ｐｅｐ１は凝血因子である）を含む。いくつかの実施形態において、合成トロンビン基質は配列ＤＰｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含み、自己犠牲スペーサーはＰＡＢＣであり、凝血因子は第Ｘａ因子または第ＶＩＩａ因子である。
【００１９】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物のプロコアグラント活性は、活性化部分トロンボプラスチン時間（ａＰＴＴ）アッセイ、修飾活性化部分トロンボプラスチン時間（ａＰＴＴ＊）アッセイ、トロンビン生成アッセイ（ＴＧＡ）、およびＲＯＴＥＭアッセイから選択される方法を使用して測定される。
【００２０】
本開示は、本発明のプロコアグラント化合物および薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物もまた提供する。
【００２１】
本発明のプロコアグラント化合物または本発明のプロコアグラント化合物を含む薬学的組成物の効果的な量を被験体に投与することを含む、被験体における出血疾患または障害を治療する、改良する、または防止する方法もまた提供される。いくつかの実施形態において、出血疾患または障害は血液凝固障害によってもたらされる。いくつかの実施形態において、血液凝固障害は血友病およびフォンウィルブランド病（ｖＷＤ）から選択される。いくつかの実施形態において、血液凝固障害は血友病Ａまたは血友病Ｂである。いくつかの実施形態において、出血疾患または障害は、間接血症、筋出血、口腔内出血（ｏｒａｌ  ｂｌｅｅｄ）、出血、筋肉への出血、口腔内出血（ｏｒａｌ  ｈｅｍｏｒｒｈａｇｅ）、外傷、頭部外傷、胃腸出血、頭蓋内出血、腹腔内出血、胸腔内出血、骨折、中枢神経系出血、咽頭後隙における出血、後腹膜腔における出血、および腸腰筋鞘における出血から選択される。
【００２２】
本開示は、血液凝固因子が、ＦＶ、ＦＶＩＩ、ＦＶＩＩａ、ＦＶＩＩＩ、ＦＩＸ、ＦＸ、ＦＸＩおよびフォンウィルブランド因子から選択され、本発明のプロコアグラント化合物、またはそのプロコアグラント化合物を含む薬学的組成物の効果的な量を被験体に投与することを含む、哺乳類被験体における少なくとも１つの血液凝固因子における欠乏を治療する、改良する、または防止する方法もまた提供する。いくつかの実施形態において、被験体はヒト被験体である。
【００２３】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物または本発明のプロコアグラント化合物を含む薬学的製剤は血液凝固障害を有する被験体の治療に使用される。いくつかの実施形態において、被験体はヒト被験体である。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物または本発明のプロコアグラント化合物を含む薬学的製剤は、血液凝固障害の治療、防止または改良のための薬品の製造に使用される。
【００２４】
固相ペプチド合成を使用する工程を含む本発明のプロコアグラント化合物を作る方法もまた提供される。いくつかの実施形態において、方法は直交固相ペプチド合成を使用する。
【００２５】
本開示は、ポリペプチドを自己犠牲スペーサーに結合する工程を含む、プロコアグラントポリペプチドのインビボ有効性を増強する方法もまた提供し、前記自己犠牲スペーサーは、プロテアーゼ切断可能基質部分に結合されている。いくつかの実施形態において、自己犠牲スペーサーはＰＡＢＣ群を含む。いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質部分は合成トロンビン基質を含む。いくつかの実施形態において、プロコアグラントポリペプチドは凝血因子またはプロコアグラントペプチドである。いくつかの実施形態において、プロコアグラントペプチドは合成である。
【００２６】
本開示は、自己犠牲リンカーを前記プロコアグラントポリペプチドに抱合する工程を含み、前記自己犠牲リンカーがプロテアーゼ基質とプロコアグラントペプチドまたは凝血因子との間に挿入される、プロコアグラントペプチドまたは凝血因子に動作可能に結合されたプロテアーゼ基質の切断の有効性を増加する方法もまた提供する。本発明のプロコアグラント化合物を前記プロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性プロコアグラントペプチドがプロテアーゼ切断可能基質部分のタンパク質分解性切断の際に放出される、プロコアグラントペプチドを活性化する方法もまた開示される。
【００２７】
本発明のプロコアグラント化合物を前記プロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性凝血因子がプロテアーゼ切断可能基質部分のタンパク質分解性切断の際に放出される、凝血因子を活性化する方法もまた提供される。本開示は、本発明のプロコアグラント化合物を前記プロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性プロコアグラントポリペプチドがプロテアーゼ切断可能基質のタンパク質分解性切断の際に放出される、異種部分からプロコアグラントペプチドを放出する方法もまた提供する。
【００２８】
本開示は、本発明のプロコアグラント化合物を前記プロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性凝血因子がプロテアーゼ切断可能基質のタンパク質分解性切断の際に放出される、異種部分から凝血因子を放出する方法もまた提供する。いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は、プロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼによって、同配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、少なくとも５倍、少なくとも６倍、少なくとも７倍、少なくとも８倍、少なくとも９倍、または少なくとも１０倍速く切断される。いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は、プロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼによって、同配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも２０倍、少なくとも３０倍、少なくとも４０倍、少なくとも５０倍、少なくとも６０倍、少なくとも７０倍、少なくとも８０倍、少なくとも９０倍、または少なくとも１００倍速く切断される。
【００２９】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、非活性部位結合ペプチドを含む自己犠牲スペーサーを含む。
【図面の簡単な説明】
【００３０】
【図１】図１Ａは、本発明のプロテアーゼ活性プロコアグラント化合物の一般的な組織を図示する。Ｈｅｔ２、Ｐｅｐ２、Ｈｅｔ１およびＬは独立的に任意の成分である。Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２はポリペプチドであり、そのうち少なくとも１つが凝血因子またはプロコアグラントペプチドである。Ｈｅｔ１およびＨｅｔは異種部分である。Ｌはリンカーである。追加のリンカーは異なる部分に接続し得、例えばリンカーはＰｅｐ２とＨｅｔ１との間に位置し得る（図に示す通り）。追加のプロテアーゼ切断可能基質および自己犠牲スペーサー群は、ポリペプチドのような他の部分のＮ末端または異種部分にて挿入され得る。図はそのような群のＰｅｐ２のＮ末端にての任意の挿入を図示する。図１Ｂは、プロテアーゼ切断可能基質（Ａａ１Ａａ２Ａａ３Ａａ４）、自己犠牲スペーサーおよび対象のタンパク質（ＰＯＩ、例えば凝血因子またはプロコアグラントペプチド）を含む本発明の例示的プロコアグラント化合物の図示であり、化合物の断片化、および断片可能基質のタンパク質分解性切断ならびに１，６自発的断片化の後の対象のペプチドまたはタンパク質の放出を図示する。
【図２】非活性部位結合ペプチド（Ｍ）を含む、本発明の代替の例示的プロテアーゼ活性プロコアグラント化合物の図示である。図は切断可能基質（Ａａ１Ａａ２Ａａ３Ａａ４）のタンパク質分解性切断および１，６自発的断片化の後の、対象のペプチドまたはタンパク質（ＰＯＩ、例えば、凝血因子またはプロコアグラントペプチド）ならびに非活性部位結合ペプチドの放出を図示する。
【図３】図３および図４は、本発明のプロテアーゼ活性プロコアグラント化合物の一般的な合成模式図を図示する。図は化合物７の合成に対応する。図３は、プロテアーゼ切断可能基質（トロンビン基質）および自己犠牲スペーサー（ＰＡＢＣ）を含む化合物の合成をもたらす反応を図示する。図４は、基質／ＰＡＢＣ化合物の合成プロコアグラントペプチドへの抱合、および化合物７を産生するための結果として生じる生成物の脱保護を図示する。
【図４】図３および図４は、本発明のプロテアーゼ活性プロコアグラント化合物の一般的な合成模式図を図示する。図は化合物７の合成に対応する。図３は、プロテアーゼ切断可能基質（トロンビン基質）および自己犠牲スペーサー（ＰＡＢＣ）を含む化合物の合成をもたらす反応を図示する。図４は、基質／ＰＡＢＣ化合物の合成プロコアグラントペプチドへの抱合、および化合物７を産生するための結果として生じる生成物の脱保護を図示する。
【図５】化合物７のトロンビンによる切断の模式的図示を表す。
【図６】化合物７のトロンビンによる切断の動態を図示する。
【図７】ＴＧＡアッセイの過程の間の化合物７の切断を図示する。
【図８】ＦＸａ凝血因子の重鎖の６つのＮ末端アミノ酸残基に対応する、ペプチドＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）の、１４ｎＭのトロンビンでの処理後の異なるプロコアグラント化合物（化合物１、２、および３）からの放出動態を図示する。
【図９】ＦＸａ凝血因子の重鎖の６つのＮ末端アミノ酸残基に対応する、ペプチドＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）の、１．４ｎＭのトロンビンでの処理後の異なるプロコアグラント化合物（化合物１、４、５および６）からの放出動態を図示する。
【図１０】活性第Ｘ因子（ＦＸａ）を産生するための第Ｘ因子の自然プロセシングを図示する。
【図１１】ＦＸａ凝血因子を含む本発明の例示的プロコアグラント化合物の図示である。
【図１２】活性第ＶＩＩ因子（ＦＶＩＩａ）を産生するための第ＶＩＩ因子の自然プロセシングを図示する。
【図１３】ＦＶＩＩａ凝血因子を含む本発明の例示的プロコアグラント化合物の図示である。
【図１４】図１４Ａ〜図１４Ｂは、プロタンパク質コンバターゼ（例えばＰＡＣＥ）により、プロセシングされた切断可能ポリペプチド（図１４Ｂ）にプロセシングされ得る、切断可能ポリペプチド、ＦＶＩＩ−１８６（図１４Ａ）の流れ図を図示する。図１４Ａは、プロタンパク質コンバターゼ（例えば、ＰＡＣＥプロセシング部位、例えば、２Ｘ（ＲＫＲ）（配列番号８８））−リンカー１−ＳＵＭＯ−短縮ＦＶＩＩＨＣ（Ｎ末端にてＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）を有さないＦＶＩＩ重鎖）−リンカー２−Ｆｃ領域２−リンカー３−Ｆｃ領域２によるＦＶＩＩＬＣ（ＦＶＩＩ軽鎖）−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を含む切断可能ポリペプチドを図示する。図１４Ｂは、ＰＡＣＥによってプロセシングされた切断可能ポリペプチドの模式的図を図示する。プロセシングされた切断可能ポリペプチドは２つのポリペプチド鎖を含み、第１の鎖がプロタンパク質コンバターゼプロセシング部位に結合するＦＶＩＩＬＣを含み、第２の鎖がリンカー１−ＳＵＭＯ−短縮ＦＶＩＩＨＣ（Ｎ末端にてＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）を有さないＦＶＩＩ重鎖）−リンカー２−Ｆｃ領域１−リンカー３−Ｆｃ領域２を含む。図１４Ｃは、上記の構築物および鎖を示す、非還元型（レーン１）または還元型（レーン２）ＳＤＳ−ＰＡＧＥを示す。（−）はペプチド結合を示す。
【図１５】図１５Ａ〜図１５Ｃは、（ｉ）ＳＵＭＯプロテアーゼによるＦＶＩＩ−１８６切断（図１５Ｂ）、および（ｉｉ）そのチオエステルペプチドへの融合（図１４Ｃ）の流れ図を図示する。図１５Ａは図１４Ｂにおける構築物と同一である。図１５Ｂは、ＦＶＩＩ−１８６がＳＵＭＯプロテアーゼによって切断された後、結果として生じる切断ポリペプチド構築物が２つの鎖を含み、第１の鎖がＦＶＩＩＬＣおよびプロタンパク質コンバターゼ部位を含み、第２の鎖が短縮ＦＶＩＩＨＣ（Ｎ末端にてＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）を有さないＦＶＩＩ重鎖）−リンカー２−Ｆｃ領域１−リンカー３−Ｆｃ領域２を含むということを図示する。第１の鎖および第２の鎖はジスルフィド結合によって結合される。図１５Ｃは、図１５Ｂにおける切断ポリペプチド構築物がチオエステルペプチド（Ｂｉｏｔｉｎ−Ｐｒａ−ＧＧＧＧ−Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＫＶ−ＣＯＳＢｎ（配列番号７９））と連結した後、結果として生じる構築物が２つのポリペプチド鎖を含み、第１の鎖がＦＶＩＩＬＣおよびプロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を含み、第２の鎖がトロンビン切断部位−ＦＶＩＩＨＣ（ＦＶＩＩ重鎖）−リンカー２−Ｆｃ領域１−リンカー３−Ｆｃ領域２（ＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６）を含むということを図示する。図１５Ｄは、構築物および鎖を示す、還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥを図示し、レーン１はマーカーを示し、レーン２はＦＶＩＩ−１８６を示し、レーン３はＳＵＭＯプロテアーゼ反応を有するＦＶＩＩ−１８６を示し、レーン３はＳＵＭＯプロテアーゼ反応を有するＦＶＩＩ−１８６および陽性対照ペプチドとの抱合を示し、レーン５はＳＵＭＯプロテアーゼ反応を有するＦＶＩＩ−１８６およびＰＡＢＣペプチドとの抱合を示す。（−）はペプチド結合を示す。
【図１６】ＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６のトロンビン活性化の後のＦＶＩＩａ発色アッセイを図示する。Ｘ軸は時間（分）を示し、Ｙ軸はＦＶＩＩａ活性の吸光度（Ａ４０５）測定を示す。（ｘ）は、トロンビンおよびヒルジンの混合物のＦＶＩＩａ活性を示す。（□）は、ＦＶＩＩ−１８６、トロンビン、およびヒルジンの混合物のＦＶＩＩａ活性を示す。（○）は、ＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６、トロンビン、およびヒルジンの混合物のＦＶＩＩａ活性を示す。
【図１７】図１７Ａ〜図１７Ｂは、プロタンパク質コンバーテアーゼ（ｃｏｎｖｅｒｔｅａｓｅ）（例えばＰＡＣＥ）によるＦＸ−０１１発現のフロー図を図示する。図１７Ａは、ＦＸＬＣ（第Ｘ因子軽鎖）−ＡＰ（活性化ペプチド）−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位１（例えば、２Ｘ（ＲＫＲ）配列番号８８））−短縮ＦＸＨＣ（Ｎ末端にて６つのアミノ酸（すなわちＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）を有さない第Ｘ因子重鎖）−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位２（例えば、ＲＲＲＲ（配列番号８９））−リンカー−Ｆｃ領域２を含む、切断可能ポリペプチド構築物を図示する。図１６Ａの切断可能構築物が発現すると、最初の構築物はプロタンパク質コンバターゼ（例えば、ＰＡＣＥ）によって３つのポリペプチド鎖構築物にプロセシングされ得、第１の鎖はＦＸＬＣを含み、第２の鎖は短縮ＦＸＨＣ（Ｎ末端にて６つのアミノ酸（すなわちＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）を有さない第Ｘ因子重鎖）−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位２を含み、第３の鎖はＦｃ領域２を含む。図１７Ｃは、鎖および構築物を示す、還元型（レーン２）および非還元型（レーン３）ＳＤＳ−ＰＡＧＥを図示する。（−）はペプチド結合を示す。
【図１８】図１８Ａ〜図１８Ｂは、トロンビン切断可能第Ｘ因子分子合成のフロー図を図示する。図１７Ｂ構築物（ＦＸ−０１１）と同一である図１８Ａの構築物は、チオエステルペプチド（ＧＧ−Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＱＥ−ＣＯＳＢｎ（配列番号８０））とインキュベートされる。結果として生じる構築物（ＴＡ−ＦＸ−０１１）は、３つの鎖を含み、第１の鎖はＦＸＬＣを含み、第２の鎖はトロンビン切断部位（Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ）−ＦＸＨＣ−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を含み、第３の鎖はＦｃ領域２を含む。第１の鎖および第２の鎖はジスルフィド結合によって結合され、第２および第３の鎖は２つのジスルフィド結合によって結合される。図１８ＣはＳＤＳ−ＰＡＧＥにおける構築物および鎖を図示する。（−）はペプチド結合を示す。
【図１９】ＴＡ−ＦＸ−０１１のトロンビン活性化の後のＦＸａ発色アッセイを図示する。Ｘ軸は時間（分）を示し、Ｙ軸はＦＸａ活性の吸光度（Ａ４０５）測定を示す。（ｘ）はトロンビンおよびヒルジンの混合物のＦＸａ活性を示す。（□）は、ＦＸ−０１１、トロンビン、およびヒルジンの混合物のＦＸａ活性を示す。（○）は、ＴＡ−ＦＸａ−０１１、トロンビン、およびヒルジンの混合物のＦＸａ活性を示す。
【図２０】図２０Ａ〜図２０Ｃは、切断可能ＦＸポリペプチド構築物（ＦＸ−０１２）の流れ図を図示する。図２０Ａは、ＦＸＬＣ−ＳＵＭＯ−短縮ＦＸＨＣ（Ｎ末端にて６つのアミノ酸、すなわちＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）を有さない第Ｘ因子重鎖）−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位１−リンカー−プロタンパク質コンベラーゼ（Ｃｏｎｖｅｒａｓｅ）プロセシング部位２−Ｆｃ領域２を含む切断可能ポリペプチドを図示する。図２０Ａの構築物は、図２０Ｂの構築物になるように、プロタンパク質コンバターゼ（例えば、ＰＡＣＥ）によって細胞内でプロセシングされ得る。図２０Ｂは３つの鎖（ＦＸ−０１２）を含む、プロセシングされた切断可能ＦＸポリペプチドを図示し、第１の鎖はＦＸＬＣを含み、第２の鎖はＳＵＭＯ−短縮ＦＸＨＣ−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位１を含み、第３の鎖はＦｃ領域２を含む。第１の鎖および第２の鎖はジスルフィド結合によって結合する。第２の鎖および第３の鎖は２つのジスルフィド結合によって結合する。
【図２１】図２１Ａ〜図２１Ｃは、（ｉ）ＳＵＭＯプロテアーゼによるＦＸ−０１２切断（図２１Ｂ）、および（ｉｉ）そのチオエステルペプチドへの融合（図２１Ｃ）の流れ図を示す。図２１Ａは、図２０Ｂにおける構築物と同一である。図２１Ｂは、ＦＸ−０１２がＳＵＭＯプロテアーゼによって切断された後、結果として生じる切断ポリペプチド構築物は３つのポリペプチド鎖を含み、第１の鎖はＦＸＬＣを含み、第２の鎖は短縮ＦＸＨＣ（Ｎ末端にて６つのアミノ酸（すなわちＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５））を有さない第Ｘ因子重鎖）−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位２を含み、第３の鎖がＦｃ領域２を含むということを図示する。第１の鎖および第２の鎖はジスルフィド結合によって結合し、第２および第３の鎖は２つのジスルフィド結合によって結合する。図２１Ｃは、図２１Ｂにおける切断ポリペプチド構築物がチオエステルペプチド（Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＱＥ−ＣＯＳＢｎ（配列番号９０））と連結した後であることを図示する。結果として生じる構築物（ＴＡ−ＦＸ−０１２）は３つの鎖を含み、第１の鎖はＦＸＬＣを含み、第２の鎖はトロンビン切断部位（Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ）−ＦＸＨＣ−Ｆｃ領域１−プロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を含み、第３の鎖はＦｃ領域２を含む。第１の鎖および第２の鎖はジスルフィド結合によって結合し、第２および第３の鎖は２つのジスルフィド結合によって結合する。図２１Ｄは、構築物および鎖を示す、還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥを図示し、レーン１はＦＸ−０１２を示し、レーン２はＳＵＭＯプロテアーゼ反応を有するＦＸ−０１２を示し、レーン３はＳＵＭＯプロテアーゼ反応を有するＦＸ−０１２およびＰＡＢＣペプチドとの抱合を示し、レーン４はＳＵＭＯプロテアーゼ反応を有するＦＸ−０１２および陽性対照ペプチドとの抱合を示し、レーン５はマーカーを示す。（−）はペプチド結合を示す。
【図２２】ＴＡ−ＦＸ−０１２のトロンビン活性化の後のＦＸａ発色アッセイを図示する。Ｘ軸は時間（分）を示し、Ｙ軸はＦＸａ活性の吸光（Ａ４０５）測定を示す。（ｘ）は、トロンビンおよびヒルジンの混合物のＦＸａ活性を示す。（・）はトロンビンおよびヒルジンを有さないＴＡ−ＦＸ−０１２のＦＸａ活性を示す。（Δ）は、ＴＡ−ＦＸａ−０１２、トロンビン、およびヒルジンの混合物のＦＸａ活性を示す。
【発明を実施するための形態】
【００３１】
本開示は、プロテアーゼ切断可能基質（例えば合成トロンビン基質）と、プロコアグラントポリペプチド、例えば凝血因子またはプロコアグラントペプチド、に結合した自己犠牲スペーサー（例えば、ＰＡＢＣ）とを含む、プロコアグラント化合物を提供する。プロテアーゼ切断可能基質は、例えば、最も公知のトロンビン基質であるＤ−ＰｈｅＰｉｐＡｒｇを組み込み得る。トロンビンのようなプロテアーゼによるプロテアーゼ切断可能基質の切断の際に、自己犠牲スペーサーは自発的断片化によりポリペプチドの放出を可能にする。
【００３２】
Ｉ．定義
本明細書および添付の請求項において使用する場合、単数形「ａ」「ａｎ」および「ｔｈｅ」は文脈が明確に別途規定しない限り、複数の指示物を含む。用語「ａ」（または「ａｎ」）は、用語「１つ以上」および「少なくとも１つ」と同様に、本明細書において交換可能に使用され得るということに留意が必要である。
【００３３】
さらに、本明細書において使用する「および／または」は、他方を伴うまたは伴わない２つの特定の特徴または成分のそれぞれの具体的な開示と見なされる。従って、本明細書において「Ａおよび／またはＢ」のような言い回しで使用する用語「および／または」は、「ＡおよびＢ」、「ＡまたはＢ」、「Ａ」（単独）、および「Ｂ」（単独）を含むことを意図する。同様に、「Ａ、Ｂ、および／またはＣ」のような言い回しにおいて使用される用語「および／または」は、以下の具体例；Ａ、Ｂ、およびＣ；Ａ、Ｂ、またはＣ；ＡまたはＣ；ＡまたはＢ；ＢまたはＣ；ＡおよびＣ；ＡおよびＢ；ＢおよびＣ；Ａ（単独）；Ｂ（単独）；およびＣ（単独）のそれぞれを包含することを意図する。
【００３４】
実施形態が言語「含む」を伴って本明細書に記載される場合は常に、「〜から成る」および／または「本質的に〜から成る」という言葉で記載される別の類似実施形態もまた提供されるということが理解される。
【００３５】
別途定義されない限り、本明細書で使用する全ての技術および科学的用語は、本開示に関連する当業者において一般的に理解されるものと同じ意味を有する。例えば、Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｂｉｏｍｅｄｉｃｉｎｅ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｕｏ，Ｐｅｉ−Ｓｈｏｗ，２ｎｄ  ｅｄ．，２００２，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ、Ｔｈｅ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｃｅｌｌ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，３ｒｄ  ｅｄ．，１９９９，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ、およびＯｘｆｏｒｄ  Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  Ｏｆ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｒｅｖｉｓｅｄ，２０００，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓは、当業者に本開示において使用される用語の多くの概略的な辞書を提供する。
【００３６】
単位、接頭辞、および記号は国際単位系（Ｓｙｓｔ系ｍｅ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ｄｅ  Ｕｎｉｔｅｓ）（ＳＩ）によって承認された形態で表す。数値範囲は、その範囲を定義する数字を含む。別途示されない限り、アミノ酸配列は左から右に、アミノからカルボキシ方向で記載する。本明細書において提供される表題は、開示の様々な実施形態に制限されるものではなく、全体としての明細書への参照によって有され得る。従って、真下に定義する用語は、明細書全体への参照によってより完全に定義される。アミノ酸は一般的に知られる３文字記号またはＩＵＰＡＣ−ＩＵＢ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｓｓｉｏｎ推奨の１文字記号によって示す。ヌクレオチドも同様に、一般的に承認される１文字コードによって示す。
【００３７】
タンパク質配列、ペプチド配列、ポリペプチド配列、またはアミノ酸配列を指すために使用する、用語「配列」は、アミノ末端からカルボキシル末端方向でのポリペプチドにおけるアミノ酸構成成分のアミノ酸線形表現であり、表現において互いに隣り合う残基はポリペプチドの一次構造において近接している。
【００３８】
「タンパク質」または「ポリペプチド」によっては、長さ、翻訳後の修飾、または機能に関係なく、アミド結合（ペプチド結合）によって線形に結合された２つ以上のアミノ酸のあらゆる配列が意味される。本明細書で使用する場合、用語「ポリペプチド（ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）」は、単数形「ポリペプチド（ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）」を複数形「ポリペプチド（ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅｓ）」と同様に含むことを意図する。「ポリペプチド」、「ペプチド」、および「タンパク質」は、本明細書において交換可能に使用される。従って、ペプチド、ジペプチド、トリペプチド、またはオリゴペプチドは、「ポリペプチド」の定義内に含まれ、用語「ポリペプチド」はこれらの用語のうちのあらゆるものの代わりに、または交換可能に使用され得る。用語「ポリペプチド」はポリペプチドの発現後修飾の生成物を指すことも意図し、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護／ブロッキング基による誘導体化、タンパク質分解性切断、または非自然発生アミノ酸による修飾を含むがこれらに限らない。ポリペプチドは自然生物原から誘導、または組換え技術によって生成し得るが、必ずしも指定核酸配列から翻訳しなくてもよい。ポリペプチドは、化学合成を含むあらゆる方法で生成し得る。本発明のポリペプチドとしてさらに含むのは、断片、誘導体、類似体、または上述のポリペプチドの変異体、およびそれらのあらゆる組み合わせである。
【００３９】
用語「断片」は、本発明のポリペプチドおよびタンパク質を指すとき、少なくともいくらかの参照ポリペプチドまたはタンパク質の性質を保持するあらゆるポリペプチドまたはタンパク質を含む。例えば、凝血因子およびプロコアグラントペプチドのようなプロコアグラントポリペプチドの場合、用語断片は、少なくともいくらかの参照ポリペプチドまたはタンパク質のプロコアグラント活性を保持するあらゆるポリペプチドまたはタンパク質を指す。ポリペプチドの断片には、タンパク質分解断片、および欠失断片が含まれる。
【００４０】
本明細書で使用される用語「変異体」は、少なくとも１つのアミノ酸修飾による、親ポリペプチド配列のものとは異なるポリペプチド配列を指す。変異体は自然に発生し、または非自然的に発生し得る。非自然発生の変異体は、当該技術分野で既知の突然変異生成技法を使用して産生することができる。変異体ポリペプチドは、保存的または非保存的なアミノ酸置換、欠失または付加を含み得る。
【００４１】
本発明のポリペプチドまたはタンパク質の「誘導体」は、天然のポリペプチドまたはタンパク質において見られない追加の特徴を示すように変化した、ポリペプチドまたはタンパク質である。「誘導体」としてさらに含まれるのは、２０個の標準アミノ酸の１つ以上の自然発生アミノ酸誘導体を含むペプチドである。指定ポリペプチドまたはタンパク質「から誘導した」ポリペプチドまたはアミノ酸配列は、ポリペプチドの起源を指す。好適には、特定の配列から誘導するポリペプチドまたはアミノ酸配列は、その配列またはその一部に本質的に同一であるアミノ酸配列を有し、一部は少なくとも１０〜２０個のアミノ酸、好適には少なくとも２０〜３０個のアミノ酸、より好適には少なくとも３０〜５０個のアミノ酸から成り、または配列においてその起源を有するために当業者にとって別の方法で同定可能である。
【００４２】
別のペプチドから誘導されたポリペプチドは、開始ポリペプチドに対する１つ以上の突然変異、例えば、別のアミノ酸残基で置換されたまたは１つ以上のアミノ酸残基挿入もしくは欠失を有する１つ以上のアミノ酸を有し得る。好適には、ポリペプチドは自然発生ではないアミノ酸配列を含む。かかる変異体は、必然的に、開始抗体と１００％未満の配列同一性または類似性を有する。好適な実施形態において、変異体は、開始ポリペプチドのアミノ酸配列と約７５％から１００％未満のアミノ酸配列同一性または類似性を有し、より好適には約８０％から１００％未満、より好適には約８５％から１００％未満、より好適には約９０％から１００％未満（例えば９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％）、最も好適には約９５％から１００％未満、例えば変異体分子の長さにわたる、アミノ酸配列同一性または類似性を有する、アミノ酸配列を有する。一実施形態において、開始ポリペプチド配列とそこから誘導された配列との間に１つのアミノ酸差異がある。この配列に関する同一性または類似性は、最大配列同一性パーセントを達成するために、必要であれば、配列を整列しギャップを導入した後の、開始アミノ酸残基と同一（すなわち同じ残基）である候補配列におけるアミノ酸残基の百分率として定義する。
【００４３】
「単離した」ポリペプチドは、自然状態において見られない形態におけるポリペプチドである。単離ポリペプチドは、自然状態において見られる形態ではなくなるまで精製されたものを含む。いくつかの実施形態において、単離したポリペプチドは実質的に純粋である。
【００４４】
「組換え」ポリペプチドまたはタンパク質は、組換えＤＮＡ技術を介して産生されるポリペプチドまたはタンパク質を指す。宿主細胞中で発現される、組換え産生されたポリペプチドおよびタンパク質は、本発明の目的のために、単離されていると見なされ、同様に、任意の好適な技法によって分離され、分画され、または部分的にもしくは実質的に精製された、天然または組換えポリペプチドも単離されていると見なされる。本明細書において開示されるポリペプチド、例えば、凝血因子またはプロコアグラントペプチドは、当該技術分野で公知の方法を使用して組換え生成され得る。代替的に、本明細書において開示されるタンパク質およびペプチドは、化学合成されてもよい。
【００４５】
「保存的アミノ酸置換」は、アミノ酸残基が同様の側鎖を有するアミノ酸残基と置き換えられる置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは当業者において定義され、基本側鎖（例えば、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｈｉｓ）、酸性側鎖（例えば、Ａｓｐ、Ｇｌｕ）、非電荷極性側鎖（例えば、Ｇｌｙ、Ａｓｎ、Ｇｎｌ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｔｙｒ、Ｃｙｓ）、無極性側鎖（例えば、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｒｏ、Ｐｈｅ、Ｍｅｔ、Ｔｒｐ）、ベータ分枝側鎖（例えば、Ｔｈｒ、Ｖａｌ、Ｉｌｅ）および芳香族側鎖（例えば、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、Ｈｉｓ）を含む。故に、ポリペプチドにおけるアミノ酸が同じ側鎖ファミリーからの別のアミノ酸と置き換えられる場合、その置換は、保存的であると見なされる。別の実施形態において、一連のアミノ酸は、側鎖ファミリーメンバーの順序および／または組成が異なる、構造的に同様の連なりと保存的に置き換えることができる。
【００４６】
非保存的置換は、そこにおいて（ｉ）正電荷側鎖（例えば、Ａｒｇ、ＨｉｓまたはＬｙｓ）を有する残基が、負電荷残基（例えば、ＧｌｕまたはＡｓｐ）に置換される、またはそれによって置換されるもの、（ｉｉ）親水性残基（例えば、ＳｅｒまたはＴｈｒ）が疎水性残基（例えば、Ａｌａ、Ｌｅｕ、Ｈｅ、ＰｈｅまたはＶａｌ）に置換される、またはそれによって置換されるもの、（ｉｉｉ）システインまたはプロリンがあらゆる他の残基に置換される、またはそれによって置換されるもの、または（ｉｖ）嵩高い疎水性または芳香族側鎖（例えば、ＶａＩ、Ｈｅ、ＰｈｅまたはＴｒｐ）を有する残基がより小さい側鎖（例えば、Ａｌａ、Ｓｅｒ）を有するまたは無側鎖（例えば、Ｇｌｙ）のものに置換される、またはそれによって置換されるものを含む。
【００４７】
２つのポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列の間の「配列同一性パーセント」という用語は、２つの配列を最適にアライメントするために導入する必要がある付加または欠失（すなわち、ギャップ）を考慮に入れて、比較のウィンドウにわたってそれらの配列によって共有される、同一の合致した位置の数を指す。合致した位置は、同一のヌクレオチドまたはアミノ酸が標的配列および参照配列の両方において提示される、任意の位置である。ギャップはヌクレオチドまたはアミノ酸ではないので、標的配列内で提示されるギャップは計数されない。同様に、参照配列からのヌクレオチドまたはアミノ酸ではなく、標的配列ヌクレオチドまたはアミノ酸が計数されるので、参照配列内で提示されるギャップは計数されない。
【００４８】
配列同一性の百分率は、両方の配列内で同一のアミノ酸残基または核酸塩基が生じる位置の数を決定して合致した位置の数を得、合致した位置の数を、比較のウィンドウ内の位置の総数で除し、その結果に１００を掛けて配列同一性の百分率を得ることによって算出される。配列の比較および２つの配列間の配列同一性パーセントの決定は、オンライン使用およびダウンロードの両方で容易に利用可能なソフトウェアを使用して達成し得る。好適なソフトウェアプログラムは、種々の情報源から、タンパク質およびヌクレオチド配列の両方のアライメントのために入手可能である。配列同一性パーセントを決定するための１つの好適なプログラムは、米国政府の国立生物工学情報センター（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）ＢＬＡＳＴウェブサイト（ｂｌａｓｔ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ）から入手可能な、ＢＬＡＳＴプログラムの一式の一部である、ｂｌ２ｓｅｑである。Ｂｌ２ｓｅｑは、ＢＬＡＳＴＮアルゴリズムまたはＢＬＡＳＴＰアルゴリズムのいずれかを使用して、２つの配列間の比較を行う。ＢＬＡＳＴＮは、核酸配列を比較するために使用される一方で、ＢＬＡＳＴＰは、アミノ酸配列を比較するために使用される。他の好適なプログラムは、例えば、ＥＭＢＯＳＳバイオインフォマティクスプログラムの一式の一部である、Ｎｅｅｄｌｅ、Ｓｔｒｅｔｃｈｅｒ、Ｗａｔｅｒ、またはＭａｔｃｈｅｒであり、それらもまた、Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ（ＥＢＩ）から、ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｐｓａ．にて入手可能である。
【００４９】
ポリヌクレオチドまたはポリペプチド参照配列と揃う、単一のポリヌクレオチドまたはポリペプチド標的配列内の異なる領域は各々、それらの独自の配列同一性パーセントを有することができる。配列同一性パーセント値は、小数第２位で四捨五入されることに留意されたい。例えば、８０．１１、８０．１２、８０．１３、および８０．１４は、８０．１に四捨五入される一方で、８０．１５、８０．１６、８０．１７、８０．１８、および８０．１９は、８０．２に四捨五入される。また、長さの値は、常に整数となることにも留意されたい。
【００５０】
ある実施形態において、第１のアミノ酸配列の第２のアミノ酸配列に対する同一性パーセント「Ｘ」は、１００ｘ（Ｙ／Ｚ）として算出し、Ｙは第１および第２の配列のアライメント（目視検査または特定の配列アライメントプログラムによる整列）において同一合致と評価されたアミノ酸残基の数であり、Ｚは第２の配列における残基の総数である。第１の配列の長さが第２の配列より長い場合、第１の配列の第２の配列に対する同一性パーセントは、第２の配列の第１の配列に対する同一パーセントよりも高くなる。
【００５１】
当業者であれば、配列同一性パーセントの算出のための配列アライメントの生成が、一次配列データによって排他的に主導される双対の配列−配列比較に限定されないことを理解するであろう。配列アライメントは、多重配列アライメントに由来し得る。多重配列アライメントを生成するための１つの好適なプログラムは、ｗｗｗ．ｃｌｕｓｔａｌ．ｏｒｇ．から利用可能なＣｌｕｓｔａｌＷ２である。別の好適なプログラムは、ｗｗｗ．ｄｒｉｖｅ５．ｃｏｍ／ｍｕｓｃｌｅ／．から利用可能なＭＵＳＣＬＥである。ＣｌｕｓｔａｌＷ２およびＭＵＳＣＬＥは、代替的に、例えば、ＥＢＩから利用可能である。
【００５２】
配列アライメントが、配列データを、構造的データ（例えば、結晶学的タンパク質構造）、機能的データ（例えば、突然変異の箇所）、または系統発生学的データ等からの異種情報源からのデータと統合することによって、生成され得ることもまた理解されるであろう。異種情報のデータを統合して多重配列アライメントを生成する、好適なプログラムは、ｗｗｗ．ｔｃｏｆｆｅｅ．ｏｒｇにて利用可能な、および代替的に、例えば、ＥＢＩから利用可能な、Ｔ−Ｃｏｆｆｅｅである。配列同一性パーセントを算出するために使用する最終アライメントは自動的または手動的に精製し得るということもまた理解されるであろう。
【００５３】
本明細書で使用される場合、用語「半減期」は、インビボにおける、本発明の特定のポリペプチド（例えば、凝血因子もしくはプロコアグラントペプチド）またはプロコアグラント化合物の生物学的半減期を指す。半減期は、被験体に投与された量の半分が動物における循環および／または他の組織から排除されるために要求される時間によって表される。本発明の所与のポリペプチドまたはプロコアグラント化合物のクリアランス曲線が時間の関数として構築される場合、曲線は大抵急速なα相および長いβ相を有する２相性である。α相は、血管内と血管外空間との間における投与されたＦｃポリペプチドの均衡を典型的に表し、部分的に、ポリペプチドのサイズによって決定される。β相は血管内空間におけるポリペプチドの異化反応を典型的に表す。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は単相性であり、従ってアルファ相を有さず、単一β相のみを有する。故に、ある実施形態において、本明細書で使用される用語半減期はβ相におけるプロコアグラント化合物の半減期を指す。ヒトにおけるヒト抗体の典型的なβ相半減期は２１日間である。
【００５４】
用語「異種」および「異種部分」は、比較する実体と別の実体から得たポリヌクレオチド、ポリペプチド、またはあらゆる他の部分を意味する。例えば、異種ポリペプチドは合成であるか、あるいは異なる種、個体の異なる細胞型、または明確に異なる個体の同じもしくは異なる細胞の型に由来し得る。一実施形態において、異種部分は、融合ポリペプチドまたはタンパク質を生成するために別のポリペプチドに融合されたポリペプチドであり得る。別の実施形態において、異種部分はポリペプチドまたはタンパク質に抱合されたＰＥＧのような非ポリペプチドであり得る。
【００５５】
本明細書で使用される場合、用語「結合された」、「融合された」、「融合」または「接続された」は、ペプチド結合（例えば遺伝子融合）、化学抱合、または他の方法による結合を指す。例えば、分子または部分が結合され得る１つの方法は、ペプチド結合によって分子または部分を結合するポリペプチドリンカーを用いる。用語「遺伝子的に融合された」、「遺伝子的に結合された」または「遺伝子融合」は、交換可能に使用し、２つ以上のタンパク質、ポリペプチド、またはその断片の、それらの個々のペプチド骨格による、これらのタンパク質、ポリペプチド、または断片をコードする単一ポリヌクレオチド分子の遺伝子発現を通じた、ペプチド共直線、共有結合性結合または付着を指す。かかる遺伝子融合は単一の近接遺伝子配列をもたらす。好適な遺伝子融合はフレームにおいて存在し、すなわち、２つ以上のオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）が、元のＯＲＦの正しいリーディングフレームを維持する方法で、連続的なより長いＯＲＦを形成するために融合される。従って、結果として生じる組換え融合タンパク質は、元のＯＲＦによってコードされるポリペプチドに対応する２つ以上のタンパク質セグメントを含む、単一のポリペプチドである。
【００５６】
本明細書で使用される場合、用語「部分」は本発明のプロコアグラント化合物の成分部分または構成成分を指す。
【００５７】
本明細書で使用される場合、用語「標的部分」は、本発明のプロコアグラント化合物を望ましい部位または細胞に、位置特定するまたは導く異種部分を指す。一実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、例えば、それを望ましい部位に位置特定することによって、プロコアグラント化合物の活性を増強する、「標的部分」を含む。かかる部分は、例えば抗体もしくはその変異体（例えば、およびｓｃＦｖ）またはペプチドであり得る。別の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、ポリペプチド、リガンドの受容体結合部分、または受容体のリガンド結合部分であり得、望ましい標的に例えば細胞もしくは組織上で結合する、標的部分を含む。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、遺伝子融合した、化学的に抱合した、またはリンカーもしくは他の部分によって構築物に結合した標的部分を含む。例示的な標的部分は下記により詳細に記載する。一実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物における使用のための標的部分は、抗体または抗体変異体を含む。用語「抗体変異体」または「修飾抗体」は自然発生せず、自然誘導抗体のものとは本明細書に記載した少なくとも１つのアミノ酸またはアミノ酸修飾において異なる、アミノ酸配列またはアミノ酸側鎖化学を有する、抗体を含む。本明細書で使用する場合、用語「抗体変異体」は、変化して自然発生のものではない抗体の合成形態、例えば、少なくとも２つの重鎖部分を含むが２つの完全重鎖を含まない抗体（例えば、領域欠失抗体またはミニボディ）、２つ以上の異なる抗原または単一抗原上の異なるエピトープに結合するよう変化した抗体の多重特異性形態）（例えば二重特異性、三重特異性等）、ｓｃＦｖ分子に結合した重鎖分子、単鎖抗体、二重特異性抗体、三重特異性抗体、および変化したエフェクター機能を有する抗体等を含む。
【００５８】
本明細書で使用する場合、用語「ｓｃＦｖ分子」は、１つの軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）またはその一部、および重鎖可変ドメイン（ＶＨ）またはその一部から成る結合分子を含み、それぞれの可変ドメイン（またはその一部）は同一または異なる抗体から誘導される。ｓｃＦｖ分子は、ＶＨドメインとＶＬドメインとの間に挿入されるｓｃＦｖリンカーを好適に含む。ＳｃＦｖ分子は当該技術分野で公知であり、米国特許第５，８９２，０１９号、Ｈｏ  ｅｔ  ａｌ．１９８９．Ｇｅｎｅ  ７７：５１、Ｂｉｒｄ  ｅｔ  ａｌ．１９８８  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４２：４２３、Ｐａｎｔｏｌｉａｎｏ  ｅｔ  ａｌ．１９９１．Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３０：１０１１７、Ｍｉｌｅｎｉｃ  ｅｔ  ａｌ．１９９１．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ５１：６３６３、Ｔａｋｋｉｎｅｎ  ｅｔ  ａｌ．１９９１．Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  ４：８３７に記載される。
【００５９】
本明細書で使用される「ｓｃＦｖリンカー」は、ｓｃＦｖのＶＬとＶＨドメインとの間に挿入される部分を指す。ｓｃＦｖリンカーは、抗原結合配座におけるｓｃＦｖ分子を好適に維持する。一実施形態において、ｓｃＦｖリンカーは、ｓｃＦｖリンカーペプチドを含む、またはｓｃＦｖリンカーから成る。ある実施形態において、ｓｃＦｖリンカーペプチドは、ｇｌｙ−ｓｅｒポリペプチドリンカーを含むまたはｇｌｙ−ｓｅｒポリペプチドリンカーから成る。他の実施形態において、ｓｃＦｖリンカーはジスルフィド結合を含む。
【００６０】
本明細書で使用される場合、用語「プロテアーゼ切断可能基質」はプロテアーゼ酵素によって認識される部位を含むペプチド配列を指す。ある切断部位は細胞内プロセシング部位を含む。一実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、かかる部位の切断が凝血形成の部位にて起こるように、凝血カスケード間に活性化された酵素によって切断された、プロテアーゼ切断可能基質を含む。例示的なプロテアーゼ切断可能基質は、例えば、トロンビン、第ＸＩａ因子、または第Ｘａ因子によって認識されるものを含む。例示的なＦＸＩａ切断部位は、例えば、ＴＱＳＦＮＤＦＴＲ（配列番号２）およびＳＶＳＱＴＳＫＬＴＲ（配列番号３）を含む。例示的なトロンビン切断部位は、例えば、ＤＦＬＡＥＧＧＧＶＲ（配列番号４）、ＴＴＫＩＫＰＲ（配列番号５）、ＬＶＰＲＧ（配列番号６）およびＡＬＲＰＲ（配列番号７）を含む。他の酵素切断部位は当該技術分野で公知である。プロテアーゼ切断可能基質は天然または非天然アミノ酸、例えばＤ−アミノ酸を含み得る。
【００６１】
本明細書で使用される場合、用語「出血疾患または障害」は、フィブリン血栓を形成することにおける障害または無能による、自発的または外傷によってもたらされる、出血傾向を特徴とする、遺伝的または後天的な状態を意味する。かかる障害の例は、血友病を含む。３つの主な形態は、血友病Ａ（第ＶＩＩＩ因子欠乏）、血友病Ｂ（第ＩＸ因子欠乏または「クリスマス病」）および血友病Ｃ（第ＸＩ因子欠乏、軽度出血傾向）である。他の止血障害は、例えば、フォンウィルブランド病、第ＸＩ因子欠乏（ＰＴＡ欠乏）、第ＸＩＩ因子欠乏、フィブリノゲン、プロトロンビン、第Ｖ因子、第ＶＩＩ因子、第Ｘ因子または第ＸＩＩＩ因子における欠乏もしくは構造的異常、ＧＰＩｂにおける欠損または欠乏であるベルナールスリエ症候群を含む。フォンウィルブランド因子の受容体である、ＧＰＩｂは、欠陥があり、１次血栓形成（１次止血）の不足および、出血傾向）ならびにＧｌａｎｚｍａｎおよびＮａｅｇｅｌｉの血小板無力症（Ｇｌａｎｚｍａｎｎ血小板無力症）の増加をもたらす。肝不全（急性および慢性形態）において、肝臓による凝固因子の不十分な生成があり、これが出血危険性を増加させる。
【００６２】
本明細書で使用する、句「効果的な量」は、あらゆる医療治療に適応可能な妥当な損益比で望ましい効果を生成するために効果的である、本発明のプロコアグラント化合物または薬学的組成物の量を指す。例えば、「効果的な量」は、治療している疾患もしくは障害の１つ以上の症状を減少あるいは軽減する、または疾患もしくは障害に関連する少なくとも１つの臨床症状マーカーもしくは症状の発症を減少あるいは遅延させる、または疾患過程を修正あるいは逆行させるために効果的な量である。
【００６３】
本明細書で使用される場合、用語「薬学的に許容される」は、ヒトにおける使用を、米国または欧州連合または他の政府の規制機関によって承認された、もしくは、Ｕ．Ｓ．Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅｉａまたは他の一般的に認識される薬局方に記載された、ということを意味する。従って、用語「薬学的に許容される」は、毒物学的および／または安全性の観点から、患者（例えばヒト患者）に許容可能である性質および／または物質を指す。
【００６４】
本明細書で使用される場合、用語「投与すること」は、本発明のプロコアグラント化合物または本発明のプロコアグラント化合物を含有する薬学的組成物を、それを必要とする被験体（例えばヒト被験体）に、投与の薬学的に許容される経路を経由して与えることを意味する。いくつかの実施形態において、投与の経路は静脈内、例えば静脈内注射または静脈内融合、である。他の実施形態において、投与の経路は、皮下、筋肉内、経口、経鼻、および肺内投与から選択される。本発明のプロコアグラント化合物は、少なくとも１つの薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物の部分として投与され得る。
【００６５】
本明細書で使用される場合、用語「予防的治療」は、本発明のプロコアグラント化合物を被験体に一定の時間にわたり被験体の血漿における活性のレベルを増加させるために投与することを意味する。好適には、増加したレベルは、例えば不測の怪我の事象において、自発的出血の発生を減少させるまたは出血を防止するために十分である。好適には、予防的治療の間、被験体における血漿タンパク質レベルはその被験体の基線レベル未満、または重度の血友病を特徴付けるレベル未満には低下しない。
【００６６】
本明細書で使用される用語「被験体」は、ヒトまたは非ヒト哺乳類を意味する。非ヒト哺乳類は、例えば、ネズミ、イヌ、霊長類、サル、ネコ、ウマ、ウシ、ブタ、および他の家畜動物ならびに小動物を含む。
【００６７】
本明細書で使用される用語「薬用量」は、本明細書に記載される治療目標を達成する投与量を意味する。本発明の方法において使用され得る薬用量は約１０〜１００ｍｇ／ｋｇ、より具体的には、１０〜２０、２０〜３０、３０〜４０、４０〜５０、５０〜６０、６０〜７０、７０〜８０、８０〜９０、または９０〜１００ｍｇ／ｋｇ、およびさらに具体的には、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、または１００ｍｇ／ｋｇである。本発明の方法において使用され得る追加の薬用量は、約１０から約１５０ｍｇ／ｋｇ、より具体的には約１００〜１１０、１１０〜１２０、１２０〜１３０、１３０〜１４０、１４０〜１５０ｍｇ／ｋｇ、およびさらに具体的には、約１１０、１１５、１２０、１２５、１３０、１３５、１４０、１４５、または１５０ｍｇ／ｋｇである。
【００６８】
本明細書で範囲に使用される「約」は、その範囲の両端を修飾する。従って「約１０〜２０」は「約１０から約２０」を意味する。
【００６９】
タンパク質分解性切断との関連で使用される用語「選択的」は、アミノ酸のランダム配列を含むペプチド基質の切断に対する、プロテアーゼ切断可能基質の切断のより大きい比率を意味する。用語「選択的」は、プロテアーゼ切断可能基質を含むプロコアグラント化合物が、自己犠牲スペーサーのアミノ基と結合されている部位にて切断されることを示す。
【００７０】
本明細書で使用される用語「Ｄ−アミノ酸」は、Ｄ−配置（例えば、Ｄ−Ｐｈｅ）を有するアミノ酸を指す。Ｄ−アミノ酸は、自然発生アミノ酸または非自然アミノ酸であり得る。
【００７１】
本明細書で使用される用語「自己犠牲スペーサー」は、２つの間隔の空いた部分（例えば凝血因子またはプロコアグラントペプチドおよびタンパク質切断可能基質）を標準的に安定な三部構造分子へと共有結合的に結合させることが可能な二機能性化学部分を指す。自己犠牲スペーサーは、その第１の部分（例えばタンパク質切断可能基質）への結合が切断された場合、第２の部分（例えば凝血因子またはプロコアグラントペプチド）から自発的に分離する。
【００７２】
ＩＩ．プロコアグラント化合物
本開示は、凝血因子またはその断片、変異体、もしくは誘導体、あるいは、自己犠牲スペーサー（例えばＰＡＢＣ）によってプロテアーゼ切断可能基質（例えばトロンビン基質）に接続したプロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）を含む、プロコアグラント化合物を提供する。ＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーは、内在性または外来性プロテアーゼおよび１，６自発的断片化によるプロテアーゼ切断可能基質の切断の際に、少なくとも１つのアミン、フェノール、カルボキシル酸、またはチオール機能性を含有するあらゆるペプチドおよびタンパク質の放出を可能にする。切断動態は、放出するアミン、フェノール、カルボキシル酸、またはチオール分子の同一性から独立的である。さらに、ＰＡＢＣはｐ−アミノベンジル基の存在により、切断比率を増強させ得る。
【００７３】
いくつかの実施形態において、本開示は以下の一般式
（Ｈｅｔ２）−（Ｐｅｐ２）−（Ｈｅｔ１）−（Ｌ）−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式Ｉ）
（式中、
Ｈｅｔ１は不在であるかまたは存在する第１の異種分子であり、
Ｈｅｔ２は不在であるかまたは存在する第２の異種分子であり、
Ｌは不在であるかまたは存在するリンカーであり、
Ｚｙはプロテアーゼ切断可能基質であり、
Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１は第１のポリペプチドであり、
Ｐｅｐ２は不在であるかまたは存在する第２のポリペプチドであり、
Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２は凝血因子またはその断片、またはプロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）である）によって表されるプロコアグラント化合物を提供する（図１Ａ参照）。
【００７４】
様々な実施形態において、本開示は、怪我の部位にて選択的に活性化可能なプロコアグラント化合物、凝血カスケードプロテアーゼにより選択的に活性化可能なプロコアグラント化合物、本開示のプロコアグラント化合物の投与を含む出血障害の治療方法、本開示のプロコアグラント化合物の生成方法、本開示のプロコアグラント化合物を含む薬学的組成物を特に提供する。
【００７５】
いくつかの実施形態において、本明細書で開示されるプロコアグラント化合物は、プロテアーゼ切断可能基質を標的とするプロテアーゼの不在において安定で薬理学的に不活性である。しかしながら、プロテアーゼの作用または他のあらゆる適切な切断条件の際に、プロテアーゼ切断可能基質は切断され、自己犠牲スペーサーは自発的反応を経、活性プロコアグラントポリペプチド（例えば、活性凝血因子またはプロコアグラントペプチド）の放出をもたらす。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物はチモーゲンである。
【００７６】
いくつかの態様において、本発明のプロコアグラントタンパク質は
（ａ）Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｂ）Ｈｅｔ１−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｃ）Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｄ）Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｅ）Ｐｅｐ２−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｆ）Ｐｅｐ２−Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｇ）Ｐｅｐ２−Ｈｅｔ１−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｈ）Ｈｅｔ２−Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｉ）Ｈｅｔ２−Ｈｅｔ１−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｊ）Ｈｅｔ２−Ｐｅｐ２−Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｋ）Ｈｅｔ２−Ｐｅｐ２−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｌ）Ｈｅｔ２−Ｐｅｐ２−Ｈｅｔ１−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、または、
（ｍ）Ｈｅｔ２−Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１
から選択される式を含み、
Ｈｅｔ１は第１の異種分子であり、
Ｈｅｔ２は第２の異種分子であり、
Ｌはリンカーであり、
Ｚｙはプロテアーゼ切断可能基質であり、
Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１は第１のポリペプチドであり、
Ｐｅｐ２は第２のポリペプチドであり、
Ｐｅｐ１もしくはＰｅｐ２は凝血因子もしくはその断片、またはプロコアグラントペプチド（例えば、合成プロコアグラントペプチド）である。
【００７７】
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される式は２つの部分、例えばリンカー、の間に追加の配列を含み得る。例えば、リンカーはＨｅｔ２とＰｅｐ２との間、またはＰｅｐ２とＨｅｔ１との間に位置し得る。いくつかの実施形態において、追加のＺｙ−Ｂｘ基は、ペプチド（例えばＰｅｐ１またはＰｅｐ２）および／または異種分子（例えばＨｅｔ１またはＨｅｔ２）のＮ末端にて存在し、かかるペプチドおよび／または異種部分の完全な放出を容易にする。従って、いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラントタンパク質は
（ｎ）Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｏ）Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｐ）Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｈｅｔ１−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｑ）Ｈｅｔ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｒ）Ｈｅｔ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、
（ｓ）Ｈｅｔ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｈｅｔ１−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１、または
（ｔ）Ｈｅｔ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１
から選択される式を含み、
Ｈｅｔ１は第１の異種分子であり、
Ｈｅｔ２は第２の異種分子であり、
Ｌはリンカーであり、
Ｚｙはプロテアーゼ切断可能基質であり、
Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、
Ｐｅｐ１は第１のポリペプチドであり、
Ｐｅｐ２は第２のポリペプチドであり、
Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２は凝血因子またはその断片、もしくはプロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）である。
【００７８】
本明細書におけるプロコアグラント化合物式の方向は、Ｎ末端（左）からＣ末端（右）へ記載される。例えば、式Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１は式ＮＨ２−Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１−ＣＯＯＨを意味する。上記に示された式（ａ）から（ｔ）は、本発明のプロコアグラント化合物の単に非制限的な例として本明細書に含まれる。例えば、式Ｈｅｔ２−Ｐｅｐ２−Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１は、Ｈｅｔ２の自由端、Ｈｅｔ２とＰｅｐ２との間、Ｐｅｐ２とＨｅｔ１との間、Ｈｅｔ１とＳｐとの間、ＬとＺｙとの間、ＺｙとＢｘとの間、ＢｘとＰｅｐ１との間、またはＰｅｐ１のＣ末端にて配列をさらに含み得る。別の実施形態において、ハイフン（−）はペプチド結合または１つ以上のアミノ酸を示す。
【００７９】
いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子またはその断片および異種部分を含む。いくつかの実施形態において、異種部分は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片、もしくは変異体、またはＸＴＥＮから成る群から選択された半減期延長部分を含む。さらに他の実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子またはその断片、第２の凝血因子またはその断片、およびＰＥＧ異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域またはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片、もしくは変異体、またはＸＴＥＮから選択された異種部分をさらに含む。
【００８０】
他の実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子またはその断片、合成プロコアグラントポリペプチド、および異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域またはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片、もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択された第２の異種部分をさらに含む。他の実施形態において、プロコアグラント化合物は２つの合成プロコアグラントペプチドおよび異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される第２の異種部分をさらに含む。さらに別の実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子またはその断片、凝血因子補助因子（例えば、第Ｘ因子における凝血因子の場合は第Ｖａ因子、または凝血因子が第ＶＩＩ因子である場合は組織因子）、および異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域またはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択された第２の異種部分をさらに含む。
【００８１】
本発明の具体的な態様において、本発明のプロコアグラント化合物は式Ｈｅｔ１−Ｌ−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式中、Ｐｅｐ１は、配列ｒＲＡＰＧＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡを含むプロコアグラントペプチドを含み、ＢｘはＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーを含み、Ｚｙは配列Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含むトロンビン切断可能基質を含み、Ｌは配列ＧＧＧＧを含むリンカーを含み、Ｈｅｔ１はシステインアミノ酸を含む足場異種部分を含む）を含む。
【００８２】
本発明の具体的な態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、式Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式中、Ｐｅｐ１はＦＸａ凝血因子を含み、ＢｘはＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーを含み、Ｚｙは配列Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含むトロンビン切断可能基質を含む）を含む。
【００８３】
本発明の具体的な態様において、本発明のプロコアグラント化合物は式Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式中、Ｐｅｐ１はＦＶＩＩａ凝血因子を含み、ＢｘはＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーを含み、Ｚｙは配列Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含むトロンビン切断可能基質を含む）を含む。
【００８４】
本発明の別の具体的な態様において、本発明のプロコアグラント化合物は式Ｐｅｐ２−Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１（式中、Ｐｅｐ１はＦＸ凝血因子を含み、ＢｘはＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーを含み、Ｚｙは配列Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含むトロンビン切断可能基質を含み、Ｐｅｐ２は活性化ペプチドである）を含み、ここにおいてトロンビン切断可能基質の切断は活性化ペプチドの放出および凝血因子の活性化をもたらす（図１１参照）。いくつかの実施形態において、かかる式に従い、凝血因子はＦＩＸａであり、活性化ペプチドはＦＶＩＩＩａである。他の実施形態において、凝血因子はＦＶＩＩａであり、活性化ペプチドは組織因子である。いくつかの実施形態において、活性化ペプチドはプロコアグラントペプチドであり得る。
【００８５】
本発明のいくつかの具体的な態様において、本発明のプロコアグラント化合物は式Ｐｅｐ１−Ｈｅｔ３−Ｈｅｔ２−Ｂｘ−Ｈｅｔ１（式中、Ｐｅｐ１は凝血因子を含み、Ｈｅｔ３は足場異種部分であり、Ｈｅｔ２は異種部分であり、Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、Ｈｅｔ１は第２の異種部分である）を含む。いくつかの実施形態において、かかる式に従い、Ｐｅｐ１はＦＶＩＩＩ凝血因子を含み、Ｈｅｔ３はシステインであり、Ｈｅｔ２はＦｃ異種部分であり、ＢｘはＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーを含み、Ｈｅｔ１はＸＴＥＮを含む。
【００８６】
本発明のいくつかの具体的な態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、式Ｐｅｐ１−Ｈｅｔ２−Ｂｘ−Ｈｅｔ１（式中、Ｐｅｐ１は凝血因子を含み、Ｈｅｔ２は足場異種部分を含み、Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、Ｈｅｔ１は第２の異種部分である）を含む。いくつかの実施形態において、かかる式に従い、Ｐｅｐ１はＦＶＩＩＩ凝血因子を含み、Ｈｅｔ２はシステインであり、ＢｘはＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーを含み、Ｈｅｔ１はＸＴＥＮを含む。
【００８７】
本開示のプロコアグラント化合物のより良い理解のために、その成分は以下に個々に記載する。
【００８８】
Ａ．ポリペプチド（例えば、Ｐｅｐ１、Ｐｅｐ２、…、Ｐｅｐｎ）
１．凝血因子およびプロコアグラントペプチド
プロコアグラント化合物本発明は、（ｉ）凝血因子、または（ｉｉ）プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）である、少なくとも１つのポリペプチド部分（Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２）を含む。
【００８９】
本明細書で使用される用語「凝血因子」は、被験体における出血発症を防止するまたはその期間を減少させる、自然発生、組換え生成、または合成的に生成された、凝血因子（例えばフォンウィルブランド因子、ＦＶ、ＦＶａ、ＦＶＩＩ、ＦＶＩＩａ、ＦＶＩＩＩ、ＦＶＩＩＩａ、ＦＩＸ、ＦＩＸａ、ＦＸ、ＦＸａ、ＦＸＩ、ＦＸＩａ、ＦＸＩＩ、ＦＸＩＩａ、ＦＸＩＩＩ、またはＦＸＩＩＩａ）、その断片、変異体、類似体、もしくは誘導体、を包含する。換言すれば、それはプロコアグラント活性を有する分子を意味する。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、ＦＶＩＩまたは活性ＦＶＩＩ（ＦＶＩＩａ）凝血因子を含む。他の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、ＦＶＩＩＩまたは活性ＦＶＩＩＩ（ＦＶＩＩＩａ）凝血因子を含む。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、ＦＩＸまたは活性ＦＩＸ（ＦＩＸａ）凝血因子を含む。他の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、ＦＸまたは活性ＦＸ（ＦＸａ）凝血因子を含む。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、フォンウィルブランド因子を含む。本明細書で使用される用語「プロコアグラントペプチド」は、プロコアグラント活性を有するあらゆるペプチドを指す。具体的に、この用語は、可溶性循環フィブリノゲンの不溶性架橋フィブリンネットワークへの変換により血液凝固の過程を開始または加速するペプチドを指す。
【００９０】
本明細書で使用する「合成プロコアグラントペプチド」は、固相ペプチド合成を使用して生成したプロコアグラントポリペプチドを指す。
【００９１】
「プロコアグラント活性」によっては、適切な検査体系におけるトロンビン生成および／またはフィブリン沈着を促進する能力が意味される。活性化部分トロンボプラスチン時間（ａＰＴＴ）検査、発色アッセイ、ＲＯＴＥＭアッセイ、プロトロンビン時間（ＰＴ）検査（ＩＮＲを決定するためにも使用される）、フィブリノゲン検査（しばしばＣｌａｕｓｓ法による）、血小板計算法、血小板機能検査（しばしばＰＦＡ−１００による）、ＴＣＴ、出血時間、撹拌検査（被験体の血漿を標準血漿と撹拌した場合に異常が矯正するかどうか）、凝固因子アッセイ、抗リン脂質（ｐｈｏｓｈｏｌｉｐｉｄ）抗体、Ｄ−二量体、遺伝子検査（例えば第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ、プロトロンビン突然変異Ｇ２０２１０Ａ）、希釈ラッセル蛇毒時間（ｄＲＶＶＴ）、種々の血小板機能検査、トロンボエラストグラフィー（ＴＥＧまたはＳｏｎｏｃｌｏｔ）、トロンボエラストメトリー（ＴＥＭ（登録商標）、例えばＲＯＴＥＭ（登録商標））、またはユーグロブリン溶解時間（ＥＬＴ）のような多数の検査が、凝固体系の機能を評価するために使用可能である。
【００９２】
ａＰＴＴ検査は、「内因性の」（接触活性化経路も参照して）および一般的凝固経路の両方の有効性を測定する性能インジケータである。この検査は、例えばＦＶＩＩＩまたはＦＩＸのような商用的に入手可能な組換え凝血因子の凝血活性を測定するために一般的に使用される。この検査は、外因性経路を測定するトロンビン時間（ＰＴ）と抱合して使用される。
【００９３】
ＲＯＴＥＭ分析は、凝血時間、血栓形成、血餅安定性および溶解といった止血全体の動態についての情報を提供する。トロンボエラストメトリーにおける異なるパラメータは、血漿凝固体系、血小板機能、繊維素溶解、またはこれらの相互作用に影響を与える多くの因子の活性に依存する。このアッセイは二次止血の全景を提供する。
【００９４】
いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は単一の凝血因子を含む。いくつかの実施形態において、単一の凝血因子はＰｅｐ１である。他の実施形態において、単一の凝血因子はＰｅｐ２である。他の実施形態において、プロコアグラント化合物は２つの凝血因子を含む。いくつかの実施形態において、２つの凝血因子は同じである。他の実施形態において、２つの凝血因子は異なる。いくつかの実施形態において、１つの凝血因子は凝血因子の断片（例えば、ＦＶＩＩＩのような凝血因子の重鎖）であり、第２の凝血因子は同じ凝血因子の断片（例えばＦＶＩＩＩのような凝血因子の軽鎖）である。いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は３つ以上の凝血因子を含む。
【００９５】
いくつかの実施形態において、凝血因子のアミノ末端は自己犠牲スペーサーと結合し、順にプロテアーゼ切断可能基質に結合する。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、２つの凝血因子（例えば２つの異なる凝血因子または凝血因子の重鎖および軽鎖）を含み、そのうち１つのみが自己犠牲スペーサーに結合するアミノ末端を有し、順にプロテアーゼ切断可能基質に結合する。他の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、２つの凝血因子（例えば２つの異なる凝血因子または凝血因子の重鎖および軽鎖）を含み、それらの両方が自己犠牲スペーサーに結合するアミノ末端を有し、順にプロテアーゼ切断可能基質に結合する。
【００９６】
いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物はプロコアグラントペプチド（例えばプロコアグラント合成ペプチド）を含む。いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は、２つのプロコアグラントペプチドを含む。いくつかの実施形態において、２つのプロコアグラントペプチドは同じであり得る。他の実施形態において、２つのプロコアグラントペプチドは異なり得る。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのプロコアグラントペプチドは合成プロコアグラントペプチドである。いくつかの実施形態において、両方のプロコアグラントペプチドは合成である。いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は３つ以上のプロコアグラントペプチドを含み得る。
【００９７】
いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子およびプロコアグラントペプチド、例えば合成プロコアグラントペプチドを含む。いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１は凝血因子であり、Ｐｅｐ２はプロコアグラントペプチド、例えば合成プロコアグラントペプチドである。他の実施形態において、Ｐｅｐ１はプロコアグラントペプチド、例えば合成プロコアグラントペプチドであり、Ｐｅｐ２は凝血因子である。
【００９８】
いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１およびＰｅｐ２は凝血因子‐凝血補助因子のペア、例えばＦＶＩＩａおよび組織因子、ＦＶＩＩＩおよびＦＩＸ、ＦＶＩＩＩおよびフォンウィルブランド因子、ＦＩＸａおよびＦＶＩＩＩａ等である。
【００９９】
本発明のプロコアグラント化合物におけるＰｅｐ１および／またはＰｅｐ２として組み込むことに適切な凝血因子およびプロコアグラントペプチドは、例えばＷＯ２０１１／０６９１６４号、ＷＯ２０１２／００６６２４号、ＷＯ２００４／１０１７４０号、ＷＯ／２００７／１１２００５号、およびＷＯ２０１２／００６６３３号、ならびに、米国特許仮出願第６１／４９１，７６２号、同第６１／４６７，８８０号、同第６１／４４２，０２９号、同第６１／３６３，１８６号、同第６１／５９９，３０５号、同第６１／５８６，６５４号、同第６１／５８６，０９９号、同第６１／６２２，７８９号、同第６１／５８６，４４３号、同第６１／５６９，１５８号、同第６１／５４１，５６１号、同第６１／５２２，６４７号、同第６１／５０６，０１５号、同第６１／４９６，５４２号、同第６１／４９６，５４１号、同第６１／４９６，５４４号、同第６１／４９６，５４３号、または米国特許第３４８００００号明細書に開示され、これらの全ては参照により全体が本明細書に組み込まれる。
【０１００】
（ｉ）凝血因子
いくつかの実施形態において、Ｐｅｐ１および／またはＰｅｐ２は凝血因子、例えば、第ＶＩＩ因子、第ＶＩＩＩ因子、第ＩＸ因子、および第Ｘ因子である。第ＶＩＩ、ＩＸ、およびＸ因子の活性形態は二量体分子から構成され、重鎖および軽鎖がジスルフィド結合のみによって結合する。凝血因子を活性化する方法は当該技術分野で公知である。
【０１０１】
ａ．第ＶＩＩ因子
いくつかの実施形態において、凝血因子は第ＶＩＩ因子の成熟形態またはその変異体である。第ＶＩＩ因子（ＦＶＩＩ、Ｆ７、または第７因子、凝固因子ＶＩＩ、血清因子ＶＩＩ、血清プロトロンビン転換加速剤、ＳＰＣＡ、プロコンバーチンおよびエプタコグアルファとも呼ばれる）は凝血カスケードの一部であるセリンプロテアーゼである。ＦＶＩＩはＧｌａドメイン、２つのＥＧＦドメイン（ＥＧＦ−１およびＥＧＦ−２）、およびセリンプロテアーゼのペプチダーゼＳ１ファミリーの全てのメンバーの中でもとりわけ高度に、例えばキモトリプシンで保存される、プロテアーゼドメイン（またはペプチダーゼＳ１ドメイン）を含む。ＦＶＩＩは単鎖チモーゲン、活性チモーゲン様二鎖ポリペプチドおよび完全活性二鎖形態として生じ得る。
【０１０２】
本明細書で使用される場合、「チモーゲン様」タンパク質またはポリペプチドは、タンパク質分解性切断によって活性化されたが、例えば、低もしくは無活性、またはタンパク質のチモーゲン形態の配座に類似する配座のような、チモーゲンに関連する性質をなお示すタンパク質を指す。例えば、それが組織因子に結合していない場合、ＦＶＩＩの二鎖活性形態は、チモーゲン様タンパク質であり、非切断ＦＶＩＩチモーゲンと類似する配座を保持し、従って非常に低い活性を示す。組織因子への結合の際に、ＦＶＩＩの二鎖活性形態は配座的変化を経、凝固因子としての完全活性を得る。
【０１０３】
例示的なＦＶＩＩ変異体は、特異活性、例えば酵素活性を増加することによってＦＶＩＩの活性を増加する突然変異（ＫｃａｔまたはＫｍ）を伴うものを含む。かかる変異体は当該技術分野において記述されており、例えば、Ｐｅｒｓｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．２００１．ＰＮＡＳ９８：１３５８３、Ｐｅｔｒｏｖａｎ  ａｎｄ  Ｒｕｆ．２００１．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６：６６１６、Ｐｅｒｓｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．２００１  Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６：２９１９５、Ｓｏｅｊｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．２００１．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６：１７２２９、Ｓｏｅｊｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．２００２．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２４７：４９０２７における例に記載される分子の突然変異体形態を含む。
【０１０４】
一実施形態において、ＦＶＩＩの変異体形態は突然変異を含む。例示的な突然変異はＶ１５８Ｄ−Ｅ２９６Ｖ−Ｍ２９８Ｑを含む。別の実施形態において、ＦＶＩＩの変異体形態はトリプシンの１７０ループからのアミノ酸ＥＡＳＹＰＧＫを伴うＦＶＩＩ成熟配列からの、アミノ酸６０８−６１９（１７０ループに対応するＬＱＱＳＲＫＶＧＤＳＰＮ）の交換を含む。ＦＩＸの高度特異活性変異体もまた当該技術分野で公知である。例えば、Ｓｉｍｉｏｎｉ  ｅｔ  ａｌ．（２００９  Ｎ．Ｅ．Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ３６１：１６７１）は、Ｒ３３８Ｌ突然変異を記載する。Ｃｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．（１９８８  ＪＢＣ  ２７３：１２０８９）およびＰｉｅｒｒｉ  ｅｔ  ａｌ．（２００９  Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒａｐｙ  ２０：４７９）はＲ３３８Ａ突然変異を記載する。他の突然変異は当該技術分野で公知であり、例えばＺｏｇｇ  ａｎｄ  Ｂｒａｎｄｓｔｅｔｔｅｒ．２００９  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  １７：１６６９、Ｓｉｃｈｌｅｒ  ｅｔｌ  ａｌ．２００３．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７８：４１２１、およびＳｔｕｒｚｅｂｅｃｈｅｒ  ｅｔ  ａｌ．１９９７．ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ  ４１２：２９５に記載されるものを含む。これらの参照文献の内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【０１０５】
チモーゲン様形態からの配座変化の際に生じる完全活性化は、その補助因子組織因子に結合する際に生じる。組織因子の不在において配座変化をもたらす突然変異もまた導入され得る。従って、ＦＶＩＩａへの言及はその二鎖形態の両方、チモーゲン様形態、および完全活性二鎖形態を含む。
【０１０６】
ｂ．第ＶＩＩＩ因子
一実施形態において、凝血因子は第ＶＩＩＩ因子の成熟形態またはその変異体である。ＦＶＩＩＩは、負電荷リン脂質表面上でカルシウムイオンを伴って生じる反応である、第ＩＸａ因子による第Ｘ因子の活性化を加速する補助因子として、血液凝固の内因性経路において機能する。ＦＶＩＩＩは、ドメイン構造Ａ１−Ａ２−Ｂ−Ａ３−Ｃ１−Ｃ２を有する２３５１アミノ酸単鎖ポリペプチドとして合成される。Ｗｅｈａｒ，Ｇ．Ａ．ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３１２：３３７−３４２（１９８４）およびＴｏｏｌｅ，Ｊ．Ｊ．ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３１２：３４２−３４７（１９８４）。
【０１０７】
ＦＶＩＩＩのドメイン構造は同種凝固因子、第Ｖ因子（ＦＶ）のものと同一である。Ｋａｎｅ，Ｗ．Ｈ．ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ（ＵＳＡ）８３：６８００−６８０４（１９８６）およびＪｅｎｎｙ，Ｒ．Ｊ．ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ（ＵＳＡ）８４：４８４６−４８５０（１９８７）。ＦＶＩＩＩのＡドメインは３３０のアミノ酸であり、互いに、ならびにＦＶのＡドメインおよび血漿同結合タンパク質セルロプラスミンと、４０％のアミノ酸同一性を有する。Ｔａｋａｈａｓｈｉ，Ｎ．ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ（ＵＳＡ）８１：３９０−３９４（１９８４）。それぞれのＣドメインは１５０個のアミノ酸であり、ＦＶのＣドメインと、ならびに、複合糖質および負電荷リン脂質を結合するタンパク質と、４０％の同一性を示す。Ｓｔｕｂｂｓ，Ｊ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ（ＵＳＡ）８７：８４１７−８４２１（１９９０）。ＦＶＩＩＩのＢドメインは、単一のエクソンによってコードされ、ＦＶのＢドメインを含むあらゆる公知のタンパク質とほとんど相同性を示さない。Ｇｉｓｔｓｃｈｉｅｒ，Ｊ．ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３１２：３２６−３３０（１９８４）およびＣｒｉｐｅ，Ｌ．Ｄ．ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３１：３７７７−３７８５（１９９２）。
【０１０８】
ＦＶＩＩＩは、Ａ−１とＡ−３ドメインとの間の二価金属イオン連鎖と関連する、重鎖（ドメインＡ１−Ａ２−Ｂ）および軽鎖（ドメインＡ３−Ｃ１−Ｃ２）のヘテロ二量体として血漿中に分泌される。血漿において、ＦＶＩＩＩはフォンウィルブランド因子に結合することにより安定する。より具体的には、ＦＶＩＩＩ軽鎖は、非共有結合性相互作用により、フォンウィルブランド因子のアミノ末端における一次結合部位と結合する。
【０１０９】
トロンビンによるタンパク質分解性活性化の際、ＦＶＩＩＩは２つの重鎖断片（Ａ１、５０ｋＤａ断片、およびＡ２、４３ｋＤａ断片）および軽鎖（Ａ３−Ｃ１−Ｃ２、７３ｋＤａ鎖）から成るヘテロ三量体へと活性化される。従って、ＦＶＩＩＩ（ＦＶＩＩＩａ）の活性形態は、トロンビン切断Ａ３−Ｃ１−Ｃ２軽鎖への二価金属イオン結合に関連するＡ１サブユニット、および、イオン会合によってＡ１ドメインと関連する遊離Ａ２サブユニットから成る。Ｅａｔｏｎ，Ｄ．ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２５：５０５（１９８６）、Ｌｏｌｌａｒ，Ｐ．ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６６：１２４８１（１９９１）、およびＦａｙ，Ｐ．Ｊ．ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６６：８９５７（１９９１）。このＦＶＩＩＩａヘテロ三量体は不安定であり、生理的条件下でのＡ２サブユニットの分離による急速な不活性化の対象である。
【０１１０】
一実施形態において、凝血因子は第ＶＩＩＩ因子のＢドメイン欠失版を含む。本明細書で使用する場合、第ＶＩＩＩ因子の「Ｂドメイン」は、当該技術分野で公知の、内部アミノ酸配列同一性およびタンパク質分解性切断の部位、例えば全長ヒト第ＶＩＩＩ因子の残基Ｓｅｒ７４１−Ａｒｇ１６４８によって定義されるＢドメインと同一である。他のヒト第ＶＩＩＩ因子ドメインは次のアミノ酸残基により定義される：Ａ１、残基Ａｌａ１−Ａｒｇ３７２；Ａ２、残基Ｓｅｒ３７３−Ａｒｇ７４０；Ａ３、残基Ｓｅｒ１６９０−Ａｓｎ２０１９；Ｃ１、残基Ｌｙｓ２０２０−Ａｓｎ２１７２；Ｃ２、残基Ｓｅｒ２１７３−Ｔｙｒ２３３２。Ａ３−Ｃ１−Ｃ２配列は残基Ｓｅｒ１６９０−Ｔｙｒ２３３２を含む。残存配列、残基Ｇｌｕ１６４９−Ａｒｇ１６８９は大抵ａ３酸性領域と呼ばれる。
【０１１１】
ブタ、ネズミおよびウマの第ＶＩＩＩ因子の、Ｂドメインを含む、全てのドメインの境界の位置は、当該技術分野で公知である。一実施形態において、第ＶＩＩＩ因子のＢドメインは欠失される（「Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子」または「ＢＤＤ  ＦＶＩＩＩ」）。ＢＤＤ  ＦＶＩＩＩの例はＲＥＦＡＣＴＯ（登録商標）（Ｓ７４３／Ｑ１６３８融合を伴う組換えＢＤＤ  ＦＶＩＩＩ）であり、当該技術分野で公知である。
【０１１２】
「Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子」は、米国特許第６，３１６，２２６号、同第６，３４６，５１３号、同第７，０４１，６３５号、同第５，７８９，２０３号、同第６，０６０，４４７号、同第５，５９５，８８６号、同第６，２２８，６２０号、同第５，９７２，８８５号、同第６，０４８，７２０号、同第５，５４３，５０２号、同第５，６１０，２７８号、同第５，１７１，８４４号、同第５，１１２，９５０号、同第４，８６８，１１２号、および同第６，４５８，５６３号において開示される完全または部分的な欠失を有し得、これらのそれぞれは参照により本明細書にその全体が組み込まれる。いくつかの実施形態において、Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子配列は、米国特許第６，３１６，２２６号の４欄４行目から５欄２８行目および実施例１〜５（米国特許第６，３４６，５１３号にも記載）にて開示される欠失のうちのいずれか１つを含む。
【０１１３】
別の実施形態において、Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子はＳ７４３／Ｑ１６３８Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子（ＳＱ版第ＶＩＩＩ因子）（例えばアミノ酸７４４からアミノ酸１６３７の欠失を有する第ＶＩＩＩ因子、例えばアミノ酸１〜７４３およびアミノ酸１６３８〜２３３２を有する第ＶＩＩＩ因子）である。いくつかの実施形態において、本発明のＢドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子は、米国特許第５，７８９，２０３号の２欄２６〜５１行目および実施例５〜８（米国特許第６，０６０，４４７号、米国特許第５，５９５，８８６号、および米国特許第６，２２８，６２０号にも記載）にて開示される欠失を有する。
【０１１４】
いくつかの実施形態において、Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子は、米国特許第５，９７２，８８５号の１欄２５行目から２欄４０行目、米国特許第６，０４８，７２０号の６欄１〜２２行目および実施例１、米国特許第５，５４３，５０２号の２欄１７〜４６行目、米国特許第５，１７１，８４４号の４欄２２行目から５欄３６行目、米国特許第５，１１２，９５０号の２欄５５〜６８行目、図２、および実施例１、米国特許第４，８６８，１１２号の２欄２行目から１９欄２１行目および表２、米国特許第７，０４１，６３５号の、２欄１行目から３欄１９行目、３欄４０行目から４欄６７行目、７欄４３行目から８欄２６行目、および１１欄５行目から１３欄３９行目、または米国特許第６，４５８，５６３号の４欄２５〜５３行目に記載される欠失を有する。
【０１１５】
いくつかの実施形態において、Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子は、Ｂドメインのほとんどの欠失を有するが、一次翻訳産物から２つのポリペプチド鎖へのインビボでのタンパク質分解性プロセシングに不可欠であるＢドメインのアミノ末端配列をなお含有し、ＷＯ９１／０９１２２号において開示される通りであり、参照によって全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態において、Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子は、アミノ酸７４７〜１６３８の欠失、すなわち事実上Ｂドメインの完全欠失を伴い構築される。参照により全体が本明細書に組み込まれる、Ｈｏｅｂｅｎ  Ｒ．Ｃ．，ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６５（１３）：７３１８−７３２３（１９９０）。
【０１１６】
Ｂドメイン欠失第ＶＩＩＩ因子は、第ＶＩＩＩ因子のアミノ酸７７１〜１６６６またはアミノ酸８６８〜１５６２の欠失を含有する。参照により全体が本明細書に組み込まれる、Ｍｅｕｌｉｅｎ  Ｐ．，ｅｔ  ａｌ．Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｎｇ．２（４）：３０１−６（１９８８）。本発明の一部である追加のＢドメイン欠失は、アミノ酸９８２から１５６２または７６０から１６３９まで（Ｔｏｏｌｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．（１９８６）８３，５９３９−５９４２））、７９７から１５６２（Ｅａｔｏｎ，ｅｔ  ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ（１９８６）２５：８３４３−８３４７））、７４１から１６４６（Ｋａｕｆｍａｎ（ＰＣＴ出願公開ＷＯ８７／０４１８７号））、７４７−１５６０（Ｓａｒｖｅｒ，ｅｔ  ａｌ．，ＤＮＡ（１９８７）６：５５３−５６４））、７４１から１６４８（Ｐａｓｅｋ（ＰＣＴ出願第８８／００８３１号））、または８１６から１５９８もしくは７４１から１６４８（Ｌａｇｎｅｒ  （Ｂｅｈｒｉｎｇ  Ｉｎｓｔ．Ｍｉｔｔ．（１９８８）Ｎｏ  ８２：１６−２５、ＥＰ２９５５９７号））の欠失を含み、これらのそれぞれは参照により全体が本明細書に組み込まれる。前述の欠失のそれぞれはあらゆる第ＶＩＩＩ因子配列において起こり得る。
【０１１７】
ｃ．第ＩＸ因子
一実施形態において、凝血因子は第ＩＸ因子の成熟形態またはその変異体である。第ＩＸ因子は４１５アミノ酸単鎖血漿チモーゲンとして循環する（Ａ．Ｖｙｓｏｔｃｈｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８，８４３６（１９９３））。ＦＩＸのチモーゲンはＦＸＩａによってまたは組織因子／ＦＶＩＩａ複合体によって活性化される。アルギニン−アラニン１４５〜１４６およびアルギニン−バリン１８０〜１８１の間の特異的切断は、システイン１３２とシステイン２８９との間の単一ジスルフィド結合によって結合する軽鎖および重鎖をもたらす（Ｓ．Ｂａｊａｊ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２２，４０４７（１９８３））。
【０１１８】
ＦＩＸの構造組織は、ビタミンＫ依存血液凝血タンパク質ＦＶＩＩ、ＦＸおよびタンパク質Ｃ（Ｂ．Ｆｕｒｉｅ  ａｎｄ  Ｂ．Ｆｕｒｉｅ，ｓｕｐｒａ）のものに類似している。アミノ末端のおよそ４５のアミノ酸がγ−カルボキシグルタミン酸、または、Ｇｌａ、ドメインを含む。これは２つの表皮成長因子相同ドメイン（ＥＧＦ）、活性化ペプチド、および、セリンプロテアーゼファミリーのメンバーである、触媒の「重鎖」に後続される（Ａ．Ｖｙｓｏｔｃｈｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８，８４３６（１９９３）、Ｓ．Ｓｐｉｔｚｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ２６５，２１９（１９９０）、Ｈ．Ｂｒａｎｄｓｔｅｔｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ  Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９２，９７９６（１９９５））。
【０１１９】
ｄ．第Ｘ因子
一実施形態において、凝血因子は第Ｘ因子の成熟形態である。第Ｘ因子は、肝細胞からチモーゲンとして血漿中に分泌される、分子重量５８．５ｋＤａのビタミンＫ依存糖タンパク質である。最初に、第Ｘ因子は計４８８個のアミノ酸から成るシグナルペプチドを有するプレプロペプチドとして生成される。シグナルペプチドは、小胞体への輸出の間シグナルペプチダーゼによって切断され、プロペプチド配列は、成熟Ｎ末端鎖のＮ末端における最初の１１のグルタミン酸残基にて起こるγカルボキシル化の後に切断される。さらなるプロセシング段階はＡｒｇ１８２とＳｅｒ１８３との間の切断により起こる。このプロセシング段階は同時にトリペプチドＡｒｇ１８０−Ｌｙｓ１８１−Ａｒｇ１８２の欠失ももたらす。結果として生じる、分泌された第Ｘ因子チモーゲンは、Ｃｙｓ１７２とＣｙｓ３４２との間のジスルフィド架橋によって共有結合的に結合される、１３９個のアミノ酸から成るＮ末端軽鎖（Ｍ，１６，２００）および３０６個のアミノ酸から成るＣ末端重鎖（Ｍ，４２，０００）から成る。さらなる翻訳後のプロセシング段階は、Ａｓｐ１０３のβ−ヒドロキシル化を、ＮおよびＯ型グリコシル化と同様に含む。
【０１２０】
これらの凝血因子の野生型（ＷＴ）版、または生物学的に活性なそれらの一部に加え、本発明は、活性を有するそれらの前駆体短縮形態、対立遺伝子変異体および種変異体、スプライス変異体にコードされる変異体、少なくとも４０％、４５％、５０％、５５％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の凝血因子の成熟形態との配列同一性を有し、血栓形成を促進する能力を保持しているポリペプチドを含む、他の変異体もまた用い得る。例えば、ＴＦ結合、第Ｘ因子結合、リン脂質結合、および／またはＦＶＩＩの凝固活性のような少なくとも１つのＦＶＩＩの活性を保持する、修飾ＦＶＩＩポリペプチドおよびその変異体が用いられ得る。活性を保持することにより、活性は、野生型凝血因子と比較し、保持された活性のレベルが検出可能な効果を産出するために十分である限りにおいて、減少または増加されるように変更され得る。
【０１２１】
例示的な修飾ポリペプチドは、組織特異性アイソフォームおよびその対立遺伝子変異体、核酸の翻訳によって調製された合成分子、組換え方法による短い方のポリペプチドの連結を含む合成のような化学合成によって生成されたタンパク質、ヒトおよび非ヒトの組織および細胞から単離されたタンパク質、キメラポリペプチドおよびその修飾形態を含むがこれらに限られない。即時凝血因子は、全長成熟ポリペプチドの少なくとも１つの活性（必要ならば活性化の際）を保持するために十分な長さである、またはそれに適切な領域を含む、ＷＴ分子の断片または一部からも成り得る。例示的な凝血因子変異体は当該技術分野で公知である。
【０１２２】
本明細書で使用される場合、用語「Ｇｌａドメイン」は、プロトロンビン、凝固因子ＶＩＩ、ＩＸおよびＸ、タンパク質Ｃ、Ｓ、およびＺのようなビタミンＫ依存タンパク質において存在する、保存膜結合モチーフを指す。これらのタンパク質は、ｇ−カルボキシグルタミン酸、これらのタンパク質のＮ末端Ｇｌａドメインにおいてクラスター化したアミノ酸の、翻訳後の合成のためにビタミンＫを要求する。ドメインにおいて存在する全てのグルタミン酸残基は、潜在的カルボキシル化部位であり、従ってそれらのうちの多くがカルボキシル化によって修飾される。カルシウムイオンを伴い、Ｇｌａドメインはホスファチジルセリンを含むリン脂質膜と相互作用する。ＧｌａドメインはＦＶＩＩａ補助因子、組織因子（ＴＦ）への結合においても役割を果たす。ＴＦと複合し、ＦＶＩＩａのＧｌａドメインは、７つのＣａ２＋イオンで荷電され、細胞表面上でのリン脂質との相互作用のための細胞膜の方向において３つの疎水性側鎖を投射し、ＴＦのＣ末端ドメインとの有意な接触を有する。
【０１２３】
第ＶＩＩ因子のＧｌａドメインは、凝血因子の負電荷リン脂質表面への結合において重要な役割を担う、珍しいアミノ酸−カルボキシグルタミン酸（Ｇｌａ）を含む。
【０１２４】
ＧＬＡドメインは、カルシウムイオンの高親和性結合を左右する。これはタンパク質の成熟形態のＮ末端先端から始まり、保存芳香族残基で終結する。保存Ｇｌａ−ｘ（３）−Ｇｌａ−ｘ−Ｃｙｓモチーフは、カルボキシラーゼによる基質認識に重要だと考えられるドメインの中央において見られる。
【０１２５】
ストップドフロー蛍光動態測定を表面プラズモン共鳴分析と組み合わせて使用することにより、Ｇｌａドメインが、ＦＶＩＩａのプロテアーゼドメインがｓＴＦとの接触を開始する一連の事象において重要であることが判明した（Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ    ａｎｄ  Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎｓ．２００５．３３７：１２７６）。さらに、凝血因子のクリアランスは、Ｇｌａ相互作用、例えば肝細胞上、およびクリアランス受容体、例えばＥＰＣＲによって、実質的に仲介され得る。
【０１２６】
一実施形態において、標的凝血因子はＧｌａドメインを欠如するように修飾される。Ｇｌａドメインは肝細胞への結合、ＥＰＣＲのようなクリアランス受容体等のような複数の経路により、凝血因子のクリアランスを仲介することに責任がある。従って、Ｇｌａドメインを除去することは凝血因子の半減期に対して有益な効果を有する。Ｇｌａドメインもまた一般的に、凝血因子を凝固の部位に位置特定することにより、活性に要求されるが、血小板を標的とするドメイン部分の包含は、血小板に対するＧｌａ欠失凝血因子を標的とする。一実施形態において、凝血因子は標的部分を含み、Ｇｌａドメインを欠如する。例えば、第ＶＩＩ因子の場合、Ｇｌａドメインは軽鎖のアミノ末端にて存在し、アミノ酸１〜３５から成る。例示的な凝血因子のＧｌａドメインは、添付の配列一覧に示す。このドメインは標準分子生物学手法を使用し、標的ドメインと置き換えることによって、除去され得、修飾軽鎖が本発明の構築物に組み込まれる。一実施形態において、切断部位は、分子の活性化を容易にするために、Ｇｌａドメインを欠如する構築物に導入され得る。例えば、一実施形態において、かかる切断部位は、凝血因子が活性であったときに切断されたアミノ酸の間（例えば、第ＶＩＩ因子の場合アミノ酸１５２と１５３との間）に導入され得る。
【０１２７】
一実施形態において、切断部位は、分子の活性化を容易にするために、Ｇｌａドメインを欠如する構築物に導入され得る。例えば、一実施形態において、かかる切断部位は凝血因子が活性であったときに切断されたアミノ酸の間（例えば、第ＶＩＩ因子の場合アミノ酸１５２と１５３との間）に導入され得る。Ｇｌａドメインを欠如する例示的な凝血因子は添付の図に図示する。
【０１２８】
例示的凝血因子は、哺乳類、例えばヒト由来のものである。
【０１２９】
（ｉｉ）プロコアグラントペプチド
本発明のプロコアグラント化合物におけるＰｅｐ１および／またはＰｅｐ２として組み込むことに適切なプロコアグラントペプチドは、例えば、米国特許仮出願第６１／４９５，８１８号、同第６１／６００，２３７号、および同第６１／６０５，５４０号において開示され、参照により全体が本明細書に組み込まれる。
【０１３０】
例示的合成プロコアグラントペプチドは例えば以下を含む
ＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦ（配列番号８）、
ＲＲＡＰＧＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号９）、
ＲＲＡＰＧＫＬＱＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号１０）、
ＰＲＩＲＴＶＧＰＧＳＲＳＡＳＧＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号１１）、
ＳＫＱＧＲＰＩＳＰＤＲＲＡＡＧＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号１２）、
ＰＲＩＲＴＶＧＰＧＳＲＳＡＳＧＫＳＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号１３）、
ＳＲＩＲＴＶＳＰＧＳＲＳＡＳＧＫＳＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号１４）、または
ＰＲＳＲＴＶＧＰＧＳＲＳＡＳＧＫＳＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（配列番号１５）。
【０１３１】
２．他のポリペプチド
いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は凝血因子または合成プロコアグラントペプチドではない、少なくとも１つのポリペプチド（例えば、Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２）を含む。いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物は、例えば、組織因子、またはその誘導体、断片、もしくは変異体のような、凝血カスケード補助因子である、Ｐｅｐ１またはＰｅｐ２ポリペプチドを含む。
【０１３２】
他の実施形態において、プロコアグラント化合物はリガンド結合部分を含むＰｅｐ１またはＰｅｐ２ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、かかるリガンド結合部分は、抗体またはその抗原結合断片である。
【０１３３】
Ｂ．自己犠牲スペーサー（Ｂｘ）
本開示に従うプロコアグラント化合物は自己犠牲スペーサーを含む。いくつかの態様において、自己犠牲スペーサーは、アミノベンジルカルバメート基、アミノベンジルエーテル基、またはアミノベンジルカルボナート基を含む。一態様において、自己犠牲スペーサーはｐ−アミノベンジルカルバメート（ＰＡＢＣ）である。
【０１３４】
ｐ−アミノベンジルカルバメート（ＰＡＢＣ）は、自己犠牲部位特異性プロドラッグ活性化のための最も効率的で最も広範なコネクタ結合である（例えばＣａｒｌ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２４：４７９−４８０（１９８１）、ＷＯ１９８１／００１１４５号、Ｒａｕｔｉｏ  ｅｔ  ｌａ，Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ  ７：２５５−２７０（２００８）、Ｓｉｍｐｌｉｃｉｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ  １３：５１９−５４７（２００８）を参照）。ＰＡＢＣは、プロテアーゼおよび１，６自発的断片化による切断の際に、あらゆるアミン薬品、ペプチド、およびタンパク質の放出を可能にする（図１を参照）。
【０１３５】
いくつかの実施形態において、自己犠牲スペーサーは、対象のポリペプチド（例えば凝血因子もしくはその断片、または合成プロコアグラントペプチド）を、プロテアーゼ切断可能基質（例えばトロンビン基質）に結合する。具体的な態様において、ＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーのカルバメート基は、対象のポリペプチドのＮ末端に結合され、ＰＡＢＣ自己犠牲スペーサーのアミノ基はプロテアーゼ切断可能基質（例えばトロンビン基質）に結合される。
【０１３６】
アミノベンジル基の芳香環は、任意に、置換されなければ環を形成する４つの非置換炭素のうちの１つに付着している水素に置き換わる芳香環上の１つ以上（例えばＲ１および／またはＲ２）の置換基で置換され得る。本明細書で使用される場合、記号「Ｒｘ」（例えばＲ１、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ４）は本明細書で記載される置換基の一般的な略語である。
【０１３７】
置換基は、ｐ−アミノベンジル基の自己犠牲能力を改善し得る（Ｈａｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｃｈｅｍ  Ｓｏｃ．，Ｐｅｒｋｉｎ  Ｔｒａｎｓ．１：２７５９−２７７０（１９９９）、Ｓｙｋｅｓ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，Ｐｅｒｋｉｎ  Ｔｒａｎｓ．１：１６０１−１６０８（２０００）を参照）。
【０１３８】
次の式は、ｐ−アミノベンジル犠牲リンカーの一般位相数学、ならびに、プロテアーゼ切断可能基質（Ａａ１Ａａ２Ａａ３Ａａ４）および、Ｐｅｐ１、Ｐｅｐ２、ポリペプチド異種部分、またはペプチドリンカーを含むリンカーであり得る、ペプチドまたは対象のタンパク質（ＰＯＩ）の相対位置を図示する。式はＲ置換基（Ｒ１、Ｒ２、Ｒ３）の可能性位置を示す。
【化１】
2015521589.tif 000003
【０１３９】
単一原子、例えばハロゲン、または複数原子基、例えばメチルであり得る置換基は、アミノベンジルまたはその分解生成物の安定性に影響を与えるために選択される。環からの脱電子は、アミノベンジル基のアミノ基と近接ペプチド結合との間の結合の切断後の、アミノベンジル基の薬品からの自発的分解を容易にするために使用され得る。例示的芳香族基Ｒ１、Ｒ２、またはＲ３置換基は、例えば、Ｆ、Ｃｌ、Ｉ、Ｂｒ、ＯＨ、メチル、メトキシ、ＮＯ２、ＮＨ２、ＮＯ３＋、ＮＨＣＯＣＨ３、Ｎ（ＣＨ３）２、ＮＨＣＯＣＦ３、アルキル、ハロアルキル、Ｃ１−Ｃ８アルキルハライド、カルボキシレート、サルフェート、スルファメート、スルホネート等を含む（例えば米国特許第７，０９１，１８６号および同第７，６５９，２４１号を参照）。ｐ−アミノベンジルリンカーは、対象のペプチドまたはタンパク質のアミノ末端に結合したヘテロ原子Ｚを含み得る。本明細書で使用される場合、用語ヘテロ原子は、酸素（Ｏ）、窒素（Ｎ）、硫黄（Ｓ）、ケイ素（Ｓｉ）、ホウ素（Ｂ）およびリン（Ｐ）を含む。一実施形態において、Ｚにおけるヘテロ原子はＯ、ＳまたはＮである。
【０１４０】
下記に図示されるように、いくつかの態様において、自己犠牲リンカーはそれぞれの凝血因子の非活性部位に結合する非活性部位結合ペプチドを含むＭ基を含む。
【化２】
2015521589.tif 000004
【０１４１】
多数の非活性部位結合モチーフは当該技術分野で公知である。非活性部位結合モチーフの挿入は、切断比率を増加させ得る。切断の際、非活性部位結合モチーフおよび対象のペプチドまたはタンパク質（例えば、凝血因子もしくはその断片、またはプロコアグラントペプチド）の両方が放出される（図２を参照）。
【０１４２】
いくつかの実施形態において、ｐ−アミノベンジル環における４つの非置換炭素のうち１つのみが置換される。いくつかの他の実施形態において、ｐ−アミノベンジル環における４つの非置換炭素のうち２つが置換される。他の実施形態において、ｐ−アミノベンジル環における４つの非置換炭素のうち３つが置換される。いくつかの実施形態において、ｐ−アミノベンジル環における４つの非置換炭素が置換される。
【０１４３】
自己犠牲排除は、例えば、１，４排除、１，６排除（例えば、ＰＡＢＣ）、１，８排除（例えば、ｐ−アミノ−シンナミルアルコール）、β−排除、環化排除（例えば、４−アミノブタノールエステルおよびエチレンジアミン）、環化／ラクトン化、環化／ラクトール化等により、起こり得る。例えば、Ｓｉｎｇｈ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｕｒｒ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１５：１８０２−１８２６（２００８）、Ｇｒｅｅｎｗａｌｄ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．４３：４７５−４８７（２０００）を参照されたい。
【０１４４】
いくつかの態様において、自己犠牲スペーサーは、例えば、シンナミル、ナフチル、またはビフェニル基（例えばＢｌｅｎｃｏｗｅ  ｅｔ  ａｌ．Ｐｏｌｙｍ．Ｃｈｅｍ．２：７７３−７９０（２０１１）を参照）を含み得る。いくつかの態様において、自己犠牲スペーサーは複素環式環を含む（例えば米国特許第７，３７５，０７８号、同第７，７５４，６８１号を参照）。多数のホモ芳香族（例えばＣａｒｌ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２４：４７９（１９８１）、Ｓｅｎｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．５５：２９７５（１９９０）、Ｔａｙｌｏｒ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．４３：１１９７（１９７８）、Ａｎｄｒｉａｎｏｍｅｎｊａｎａｈａｒｙ  ｅｔ  ａｌ．Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．２：１９０３（１９９２）を参照）、および、クマリン（例えばＷｅｉｎｓｔｅｉｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．４６：５５３（２０１０）を参照）、フラン、チオフェン、チアゾール、オキサゾール、イソキサゾール、ピロール、ピラゾール（例えばＨａｙ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．４６：５５３３（２００３）を参照）、ピリジン（例えばＰｅｒｒｙ−Ｆｅｉｇｅｎｂａｕｍ  ｅｔ  ａｌ．Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．７：４８２５（２００９）を参照）、イミダゾーン（例えばＮａｉｌｏｒ  ｅｔ  ａｌ．Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．Ｚ：１２６７（１９９９）、Ｈａｙ  ａｎｄ  Ｄｅｎｎｙ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  Ｌｅｔｔ．３８：８４２５（１９９７）を参照）、およびトリアゾール（例えばＢｅｒｔｒａｎｄ  ａｎｄ  Ｇｅｓｓｏｎ，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．７２：３５９６（２００７）を参照）系の、水溶液および生理学条件の両方の下において自己犠牲であるヘテロ芳香族基は、当該技術分野で公知である。米国特許第７，６９１，９６２号、同第７，０９１，１８６号、米国特許出願公開第２００６／０２６９４８０号、同第２０１０／００９２４９６号、同第２０１０／０１４５０３６号、同第２００３／０１３０１８９号、同第２００５／０２５６０３０号）もまた参照されたい。
【０１４５】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、２つ以上の縦列する自己犠牲スペーサー、例えば２つ以上のＰＡＢＣユニットを含む。例えば、ｄｅ  Ｇｒｏｏｔ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．６６：８８１５−８８３０（２００１）を参照されたい。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、蛍光発光性プローブに結合する自己犠牲スペーサー（例えば、ｐ−アミノベンジルアルコールまたはｐ−カルボキシベンズアルデヒドもしくはグリオキシル酸のヘミチオアミナール誘導体）を含み得る（例えばＭｅｙｅｒ  ｅｔ  ａｌ．Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．８：１７７７−１７８０（２０１０）を参照）。
【０１４６】
自己犠牲リンカーにおける置換基が慣習的な化学式で特定される、左から右に記述される場合、それらは、その構造を右から左に記述したときに得られる化学的に同一な置換基を同時に含む。例えば、「−ＣＨ２Ｏ−」は「−ＯＣＨ２−」を列挙することもまた意図する。自己犠牲、例えば、上述のｐ−アミノベンジル自己犠牲リンカーにおけるＲ１および／またはＲ２置換基、における置換基は、例えば、アルキル基、アルキレン基、アルケニル基、アルキニル基、アルコキシ基、アルキルアミノ基、アルキルチオ基、ヘテロアルキル基、シクロアルキル基、ヘテロシクロアルキル基、アリール基、アリールアルキル基、アリールオキシ基、ヘテロアリール基等を含み得る。本開示の化合物が２つ以上の置換基を含む場合、それぞれの置換基は独立的に選択される。
【０１４７】
用語「アルキル」は、それ自身または別の置換基の一部として、別途述べられない限り、多数の指定炭素原子（例えばＣ１〜Ｃ１０は１〜１０の炭素原子を意味する）を有する直鎖または分枝鎖炭化水素ラジカルを意味する。典型的に、アルキル基は１つから２４個の炭素原子を有し、例えば、１つから１０個の炭素原子、１つから８つの炭素原子、または１つから６つの炭素原子を有する。「低級アルキル」基は１つから４つの炭素原子を有するアルキル基である。用語「アルキル」は二価および多価ラジカルを含む。例えば、用語「アルキル」は、例えば式が、アルキル基が二価であることを示す場合または置換基が環を形成するために結合される場合、適切な場合はどこでも「アルキレン」を含む。アルキルラジカルの例は、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチルを、例えばｎ−ペンチル、ｎ−ヘキシル、ｎ−ヘプチル、およびｎ−オクチルの、相同体および異性体と同様に含むが、これらに限られない。
【０１４８】
用語「アルキレン」は、それ自身または別の置換基の一部として、二価（ジラジカル）アルキル基を意味し、アルキルは本明細書で定義される。「アルキレン」は−ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ２−によって例示されるがこれに限られない。典型的に、「アルキレン」基は１つから２４個の炭素原子を有し、例えば１０個以下の炭素原子（例えば１つから８つまたは１つから６つの炭素原子）を有する。「低級アルキレン」基は１つから４つの炭素原子を有するアルキレン基である。
【０１４９】
用語「アルケニル」は、それ自身または別の置換基の一部として、２つから２４個の炭素原子および少なくとも１つの二重結合を有する直鎖または分枝鎖炭化水素ラジカルを指す。典型的なアルケニル基は２つから１０個の炭素原子および少なくとも１つの二重結合を有する。一実施形態において、アルケニル基は２つから８つの炭素原子または２つから６つの炭素原子および１つから３つの二重結合を有する。例示的なアルケニル基は、ビニル、２−プロペニル、１−ブタ−３−エニル、クロチル、２−（ブタジエニル）、２，４−ペンタジエニル、３−（１，４−ペンタジエニル）、２−イソペンテニル、１−ペンタ−３−エニル、１−ヘキサ−５−エニル等を含む。
【０１５０】
用語「アルキニル」は、それ自身または別の置換基の一部として、２つから２４個の炭素原子および少なくとも１つの三重結合を有する、直鎖または分枝鎖の不飽和または多価不飽和の炭化水素ラジカルを指す。典型的な「アルキニル」基は、２つから１０個の炭素原子および少なくとも１つの三重結合を有する。本開示の一態様において、アルキニル基は、２つから６つの炭素原子および少なくとも１つの三重結合を有する。例示的なアルキニル基は、プロプ−１−イニル、プロプ−２−イニル（すなわちプロパルギル）、エチニルおよび３−ブチニルを含む。
【０１５１】
用語「アルコキシ」、「アルキルアミノ」および「アルキルチオ」（またはチオアルコキシ）は慣習的な意味で使用され、それぞれ酸素原子、アミノ基、または硫黄原子によって、分子の残部に付着するアルキル基を指す。
【０１５２】
用語「ヘテロアルキル」は、それ自身または別の用語との組み合わせによって、定数の炭素原子（例えばＣ２〜Ｃ１０、またはＣ２〜Ｃ８）および、例えば、そこにおいて窒素、硫黄およびリン原子は任意に酸化し、窒素原子（複数可）は任意に４級化する、Ｎ、Ｏ、Ｓ、Ｓｉ、ＢおよびＰ（一実施形態においてはＮ、ＯおよびＳ）から選択された少なくとも１つのヘテロ原子から成る、安定の直鎖または分枝鎖炭化水素ラジカルを意味する。ヘテロ原子（複数可）はヘテロアルキル基のあらゆる内部位置に配置され得る。ヘテロアルキル基の例は、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ３、−ＣＨ２−Ｓ−ＣＨ２−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｓ（Ｏ）−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｓ（Ｏ）２−ＣＨ３、−ＣＨ＝ＣＨ−Ｏ−ＣＨ３、−ＣＨ２−Ｓｉ（ＣＨ３）３、−ＣＨ２−ＣＨ＝Ｎ−ＯＣＨ３、および−ＣＨ＝ＣＨ−Ｎ（ＣＨ３）−ＣＨ３を含むが、これらに限られない。例えば−ＣＨ２−ＮＨ−ＯＣＨ３および−ＣＨ２−Ｏ−Ｓｉ（ＣＨ３）３のように、最大２つのヘテロ原子が連続的であり得る。
【０１５３】
同様に、用語「ヘテロアルキレン」は、それ自身または別の置換基の一部として、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｓ−ＣＨ２−ＣＨ２−および−ＣＨ２−Ｓ−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−ＣＨ２−と例示されるがこれらに限られない、ヘテロアルキルから誘導された二価ラジカルを意味する。典型的に、ヘテロアルキル基は３から２４の原子（炭素およびヘテロ原子、水素を除く）（３から２４員ヘテロアルキル）を有する。別の例において、ヘテロアルキル基は合計３から１０の原子（３から１０員ヘテロアルキル）または３から８原子（３から８員ヘテロアルキル）を有する。用語「ヘテロアルキル」は、適切な場合、例えば、式が、ヘテロアルキル基が二価であることを示す場合または置換基が環を形成するために結合される場合においていつでも「ヘテロアルキレン」を含む。
【０１５４】
用語「シクロアルキル」は、それ自身または別の用語との組み合わせによって、３から２４の炭素原子、例えば３から１２の炭素原子（例えば、Ｃ３〜Ｃ８シクロアルキルまたはＣ３〜Ｃ６シクロアルキル）を有する、飽和または不飽和の非芳香族炭素環ラジカルを表す。シクロアルキルの例は、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、１−シクロヘキセニル、３−シクロヘキセニル、シクロヘプチル等を含むがこれらに限られない。用語「シクロアルキル」は、ノルボルニル、アダマンチルおよびビシクロ［２．２．１］ヘプチルのような、架橋多環（例えば二環）構造もまた含む。「シクロアルキル」基は、アリール（例えばフェニル）、ヘテロアリール（例えばピリジル）および非芳香族（例えば炭素環式または複素環式）環から選択される少なくとも１つ（例えば１つから３つ）の他の環と融合され得る。「シクロアルキル」基が融合アリール、ヘテロアリールまたは複素環式環を含むと、その後「シクロアルキル」基は炭素環式の環によって分子の残部に付着する。
【０１５５】
用語「ヘテロシクロアルキル」「複素環式」、「複素環」または「ヘテロシクリル」は、それ自身または他の用語との組み合わせによって、例えば、そこにおいて窒素、硫黄およびリン原子任意に酸化し、窒素原子（複数可）は任意に４級化する、Ｎ、Ｏ、Ｓ、Ｓｉ、ＢおよびＰ（例えばＮ、ＯおよびＳ）から選択される、少なくとも１つかつ最大５つのヘテロ原子（例えば、窒素、酸素および硫黄から選択される１つから４つのヘテロ原子）、または、少なくとも１つで最大１０のヘテロ原子（例えばＮ、ＯおよびＳから選択された１つから５つのヘテロ原子）を当業者に公知の安定の組み合わせにおいて含有する４から８員環の融合環系を含有する、炭素環式の非芳香族環（例えば３から８員環および例えば４、５、６または７員環）を表す。例示的なヘテロシクロアルキル基は融合フェニル環を含む。「複素環式」基が融合アリール、ヘテロアリールまたはシクロアルキル環を含むと、その後「複素環式」基は複素環により分子の残部に付着する。ヘテロ原子は、複素環が分子の残部に付着する位置を占め得る。
【０１５６】
本開示の例示的なヘテロシクロアルキル基または複素環式基は、モルホリニル基、チオモルホリニル基、チオモルホリニルＳ−オキシド基、チオモルホリニルＳ，Ｓ−ジオキシド基、ピペラジニル基、ホモピペラジニル基、ピロリジニル基、ピロリニル基、イミダゾリジニル基、テトラヒドロピラニル基、ピペリジニル基、テトラヒドロフラニル基、テトラヒドロチエニル基、ピペリジニル基、ホモピペリジニル基、ホモモルホリニル基、ホモチオモルホリニル基、ホモチオモルホリニルＳ，Ｓ−ジオキシド基、オキサゾリジノニル基、ジヒドロピラゾリル基、ジヒドロピロリル基、ジヒドロピラゾリル基、ジヒドロピリジル基、ジヒドロピリミジニル基、ジヒドロフリル基、ジヒドロピラニル基、テトラヒドロチエニルＳ−オキシド基、テトラヒドロチエニルＳ，Ｓ−ジオキシド基、ホモチオモルホリニルＳ−オキシド基、１−（１，２，５，６−テトラヒドロピリジル）基、１−ピペリジニル基、２−ピペリジニル基、３−ピペリジニル基、４−モルホリニル基、３−モルホリニル基、テトラヒドロフラン−２−イル基、テトラヒドロフラン−３−イル基、テトラヒドロチエン−２−イル基、テトラヒドロチエン−３−イル基、１−ピペラジニル基、２−ピペラジニル基等を含む。
【０１５７】
「アリール」によっては、単一環（例えばフェニル）を有する、または他の芳香族もしくは非芳香族環（例えば１つから３つの他の環）に融合された、５、６、または７員の芳香族炭素環式基が意味される。「アリール」基が非芳香族環（例えば１，２，３，４−テトラヒドロナフチル）またはヘテロアリール基を含むと、その後「アリール」基はアリール環（例えばフェニル環）によって分子の残部に結合する。アリール基は任意に置換される（例えば本明細書に記載される１つから５つの置換基と）。一実施例において、アリール基は６つから１０個の炭素原子を有する。アリール基の非制限的な例は、フェニル、１−ナフチル、２−ナフチル、キノリン、インダニル、インデニル、ジヒドロナフチル、フルオレニル、テトラリニル、ベンゾ［ｄ］［１，３］ジオキソリルまたは、６，７，８，９−テトラヒドロ−５Ｈ−ベンゾ［ａ］シクロヘプテニルを含む。一実施形態において、アリール基は、フェニル、ベンゾ［ｄ］［１，３］ジオキソリルおよびナフチルから選択される。アリール基は、さらに別の実施形態において、フェニルである。
【０１５８】
用語「アリールアルキル」または「アラルキル」は、アリール基またはヘテロアリール基が、ラジカル、−アルキル−アリール、および−アルキル−ヘテロアリールを作るためにアルキル基に付着し、アルキル、アリールおよびヘテロアリールが本明細書に定義されるラジカルを含むことを意図される。例示的な「アリールアルキル」または「アラルキル」基はベンジル基、フェネチル基、ピリジルメチル基等を含む。
【０１５９】
「アリールオキシ」によっては、アリールが本明細書で定義される、基−Ｏ−アリールが意味される。一実施例において、アリールオキシ基のアリール部分はフェニルまたはナフチルである。アリールオキシ基のアリール部分は、一実施形態において、フェニルである。
【０１６０】
用語「ヘテロアリール」または「ヘテロ芳香族」は、例えば、そこにおいて窒素、硫黄およびリン原子は任意に酸化し、窒素原子（複数可）は任意に４級化する、Ｎ、Ｏ、Ｓ、ＳｉおよびＢから選択される少なくとも１つのヘテロ原子（例えば１〜３つのヘテロ原子のような１つから５つのヘテロ原子）（例えば、Ｎ、ＯおよびＳ）を含有する、多価不飽和性５、６、７員芳香族部分を指す。「ヘテロアリール」基は、単一環であり得、または、他のアリール、ヘテロアリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル環（例えば１つから３つの他の環）に融合され得る。「ヘテロアリール」基が融合アリール、シクロアルキルまたはヘテロシクロアルキル環を含むと、その後、「ヘテロアリール」基はヘテロアリール環により分子の残部に付着する。ヘテロアリール基は炭素またはヘテロ原子によって分子の残部に付着し得る。
【０１６１】
一実施例において、ヘテロアリール基は４つから１０個の炭素原子、ならびに、Ｏ、ＳおよびＮから選択される、１つから５つのヘテロ原子を有する。ヘテロアリール基の非制限的な例は、ピリジル基、ピリミジニル基、キノリニル基、ベンゾチエニル基、インドリル基、インドリニル基、ピリダジニル基、ピラジニル基、イソインドリル基、イソキノリル基、キナゾリニル基、キノキサリニル基、フタラジニル基、イミダゾリル基、イソオキサゾリル基、ピラゾリル基、オキサゾリル基、チアゾリル基、インドリジニル基、インダゾリル基、ベンゾチアゾリル基、ベンズイミダゾリル基、ベンゾフラニル基、フラニル基、チエニル基、ピロリル基、オキサジアゾリル基、チアジアゾリル基、トリアゾリル基、テトラゾリル基、イソチアゾリル基、ナフチリジニル基、イソクロマニル基、クロマニル基、テトラヒドロイソキノリニル基、イソインドリニル基、イソベンゾテトラヒドロフラニル基、イソベンゾテトラヒドロチエニル基、イソベンゾチエニル基、ベンズオキサゾリル基、ピリドピリジル基、ベンゾテトラヒドロフラニル基、ベンゾテトラヒドロチエニル基、プリニル基、ベンゾジオキソリル基、トリアジニル基、プテリジニル基、ベンゾチアゾリル基、イミダゾピリジル基、イミダゾチアゾリル基、ジヒドロベンズイソキサジニル基、ベンズイソキサジニル基、ベンゾオキサジニル基、ジヒドロベンズイソチアジニル基、ベンゾピラニル基、ベンゾチオピラニル基、クロモニル基、クロマノニル基、ピリジル−Ｎ−オキシド基、テトラヒドロキノリニル基、ジヒドロキノリニル基、ジヒドロキノリノニル基、ジヒドロイソキノリノニル基、ジヒドロクマニリル基、ジヒドロイソクマリニル基、イソインドリノニル基、ベンゾジオキサニル基、ベンゾオキサゾリノニル基、ピロリルＮ−オキシド基、ピリミジニルＮ−オキシド基、ピリダジニルＮ−オキシド基、ピラジニルＮ−オキシド基、キノリニルＮ−オキシド基、インドリルＮ−オキシド基、インドリニルＮ−オキシド基、イソキノリルＮ−オキシド基、キナゾリニルＮ−オキシド基、キノキサリニルＮ−オキシド基、フタラジニルＮ−オキシド基、イミダゾリルＮ−オキシド基、イソオキサゾリルＮ−オキシド基、オキサゾリルＮ−オキシド基、チアゾリルＮ−オキシド基、インドリジニルＮ−オキシド基、インダゾリルＮ−オキシド基、ベンゾチアゾリルＮ−オキシド基、ベンズイミダゾリルＮ−オキシド基、ピロリルＮ−オキシド基、オキサジアゾリルＮ−オキシド基、チアジアゾリルＮ−オキシド基、トリアゾリルＮ−オキシド基、テトラゾリルＮ−オキシド基、ベンゾチオピラニルＳ−オキシド基、ベンゾチオピラニルＳ，Ｓ−ジオキシド基を含む。例示的なヘテロアリール基は、イミダゾリル基、ピラゾリル基、チアジアゾリル基、トリアゾリル基、イソオキサゾリル基、イソチアゾリル基、イミダゾリル基、チアゾリル基、オキサジアゾリル基、およびピリジル基を含む。他の例示的なヘテロアリール基は、１−ピロリル基、２−ピロリル基、３−ピロリル基、３−ピラゾリル基、２−イミダゾリル基、４−イミダゾリル基、ピラジニル基、２−オキサゾリル基、４−オキサゾリル基、２−フェニル−４−オキサゾリル基、５−オキサゾリル基、３−イソキサゾリル基、４−イソキサゾリル基、５−イソキサゾリル基、２−チアゾリル基、４−チアゾリル基、５−チアゾリル基、２−フリル基、３−フリル基、２−チエニル基、３−チエニル基、２−ピリジル基、３−ピリジル基、ピリジン−４−イル基、２−ピリミジル基、４−ピリミジル基、５−ベンゾチアゾリル基、プリニル基、２−ベンズイミダゾリル基、５−インドリル基、１−イソキノリルアジド基、５−イソキノリルアジド基、２−キノキサリニル基、５−キノキサリニル基、３−キノリル基、および６−キノリル基を含む。上述のアリールおよびヘテロアリール環系のそれぞれに対する置換基は下記の許容可能なアリール基置換基から選択される。
【０１６２】
Ｃ．プロテアーゼ切断可能基質（Ｚｙ）
本発明のプロコアグラント化合物は、自己犠牲スペーサー（Ｂｘ）に結合されたプロテアーゼ切断可能基質（Ｚｙ）を含む。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、単一プロテアーゼ切断可能基質を含む。他の実施形態、プロコアグラントポリペプチド（例えばプロコアグラントペプチドの凝血因子）またはポリペプチドを含む１つ以上の異種部分がより存在する特定の実施形態において、追加のプロテアーゼ切断基質部分（単独または自己犠牲スペーサーと縦列）は、プロコアグラントポリペプチド配列または異種部分のＮ末端に結合され得る。いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質部分（単独または自己犠牲スペーサーと縦列）は、ペプチドリンカーを含むリンカー（Ｌ）のＮ末端に結合され得る。
【０１６３】
従って、本発明のプロコアグラント化合物は、Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１モジュールを含み得、例えば次の追加のモジュールのうちの１つ以上をさらに含み、
Ｚｙ−Ｈｅｔ（ＨｅｔはＨｅｔ１またはＨｅｔ２である）
Ｚｙ−Ｂｘ−Ｈｅｔ（ＨｅｔはＨｅｔ１またはＨｅｔ２である）
Ｚｙ−Ｐｅｐ（ＰｅｐはＰｅｐ２であるか、または、プロコアグラント化合物が３つ以上のポリペプチドを含む場合、追加のポリペプチドである）
Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ（ＰｅｐはＰｅｐ２であるか、または、プロコアグラント化合物が３つ以上のポリペプチドを含む場合、追加のポリペプチドである）、ここにおいて、Ｚｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１と追加のモジュールとの間に挿入されたリンカーまたは異種部分の１つ以上を任意に伴い、追加のモジュールはＺｙ−Ｂｘ−Ｐｅｐ１モジュールのＮ末端またはＣ末端に共有結合的に結合される。
【０１６４】
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質が存在であるほど、基質は同じまたは異なるプロテアーゼによって切断され得る。プロテアーゼ切断可能基質が同じプロテアーゼによって切断される場合、プロテアーゼ切断可能基質は同じであり得るか、異なり得る。
【０１６５】
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は１つ以上のプロテアーゼ、例えば血液凝血カスケードプロテアーゼによる酵素切断のための選択的な基質である。血液凝固カスケードプロテアーゼは、トロンビン、ＦＶＩＩａ、ＦＩＸａ、ＦＸａ、ＦＸＩａ、およびＦＸＩＩａを含むが、必ずしもこれらに限られない。
【０１６６】
本明細書で使用される用語「血液凝血カスケード」は、内因性、外因性、および一般的な経路を指す。内因性の凝固経路はＦＩＸａの形成をもたらし、ＦＶＩＩＩａおよびＦＸ、リン脂質およびＣａ２＋との抱合でＦＸａを与える。外因性の経路は、組織因子およびＦＶＩＩの組み合わせの後でＦＸａおよびＦＩＸａを与える。一般的な凝固経路は、プロトロンビンをトロンビン（ＦＩＩａ）に切断するために凝固因子、ＦＶ、ＦＶＩＩＩ、ＦＩＸおよびＦＸと相互作用し、その後フィブリノゲンをフィブリンに切断することができる。
【０１６７】
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は、ネプリライシン（ＣＡＬＬＡまたはＣＤｌＯ）、チメットオリゴペプチダーゼ（ＴＯＰ）、ロイコトリエンＡ４ヒドロラーゼ、エンドセリン変換酵素、ｓｔｅ２４プロテアーゼ、ニューロライシン、ミトコンドリア中間ペプチダーゼ、間質コラゲナーゼ、コラゲナーゼ、ストロメリシン、マクロファージエラスターゼ、マトリライシン、ゼラチナーゼ、メプリン、プロコラーゲンＣ−エンドペプチダーゼ、プロコラーゲンＮ−エンドペプチダーゼ、ＡＤＡＭおよびＡＤＡＭＴメタロプロテイナーゼ、ミエリン関連メタロプロテイナーゼ、エナメリシン、腫瘍壊死因子α−変換酵素、インスリジン、ナーディライシン、ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼ、マグノリシン、ダクチリシン様メタロプロテアーゼ、好中球コラゲナーゼ、マトリクスメタロペプチダーゼ、膜型マトリクスメタロプロテイナーゼ、ＳＰ２エンドペプチターゼ、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）、プラスミン、ウロキナーゼ、ヒト線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰα）、トリプシン、キモトリプシン、カルデクリン、膵エラスターゼ、膵エンドペプチターゼ、エンテロペプチターゼ、白血球エラスターゼ、骨髄芽球、キマーゼ、トリプターゼ、グランザイム、角質層キモトリプシン酵素、アクロシン、カリクレイン、補体成分および因子、補体第２経路ｃ３／ｃ５コンバターゼ、マンノース結合タンパク質関連セリンプロテアーゼ、凝固因子、トロンビン、タンパク質ｃ、ｕおよびｔ−型プラスミノーゲン活性化因子、カテプシンＧ、へプシン、プロスタシン、肝細胞成長因子活性エンドペプチターゼ、スブチリシン／ケキシン型タンパク質コンバターゼ、フューリン、プロタンパク質コンバターゼ、プロリルペプチダーゼ、アシルアミノアシルペプチダーゼ、ペプチジル−グリカミナーゼ、シグナルペプチダーゼ、ｎ−末端求核性アミノヒドロラーゼ、２０ｓプロテアソーム、γ−グルタミルトランスペプチダーゼ、ミトコンドリアエンドペプチダーゼ、ミトコンドリアエンドペプチダーゼＩａ、ｈｔｒａ２ペプチダーゼ、マトリプターゼ、部位１プロテアーゼ、レグマイン、カテプシン、システインカテプシン、カルパイン、ユビキチンイソペプチターゼＴ、カスパーゼ、グリコシルホスファチジルイノシトールタンパク質トランスアミダーゼ、癌プロコアグラント、プロホルモンチオールプロテアーゼ、γ−グルタミルヒドロラーゼ、ブレオマイシンヒドロラーゼ、セプラーゼ、カテプシンＤ、ペプシン、キモシン、ガストリクシン、レニン、ヤプシンおよび／またはメマプシン、前立腺特異抗原（ＰＳＡ）、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択された、プロテアーゼの切断部位を含む。例えばＫｏｈｃｈｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ１７：２２４１−２２４５（２００７）、Ｂｒａｄｙ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．４５：４７０６−４７１５（２００２）を参照されたい。
【０１６８】
具体的な実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は怪我の部位にてトロンビンによって選択的に切断される。いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は、例えば、本発明のプロコアグラントペプチドが診断または可視化に使用される場合、トロンビンによって生体外で選択的に切断される。非制限的な例示的トロンビン切断可能基質は、例えばＤＦＬＡＥＧＧＧＶＲ（配列番号４）、ＴＴＫＩＫＰＲ（配列番号５）もしくはＬＶＰＲＧ（配列番号６）、またはＡＬＲＰＲ（配列番号７）（例えばＡＬＲＰＲＶＶＧＧＡ（配列番号１６））を含む、本質的にこの配列から成るもしくはこの配列から成る配列を含む。
【０１６９】
具体的な実施形態において、トロンビン切断可能基質は、配列ＡＬＲＰＲ（配列番号７）、ＡＬＶＰＲ（配列番号１７）、ＬＶＰＲ（配列番号１８）、Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ（配列番号１９）、Ｄ−Ａｌａ−Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ（配列番号２０）、またはＤ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｉｐ＝ピペコリン酸）（配列番号２１）を含む（例えばＴｕｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，ＣｈｅｍＢｉｏＣｈｅｍ  ３：２０７−２０１１（２００２）、Ｊａｆｆｅｒ  ｅｔ  ａｌ．Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ．Ｔｈｒｏｍｂ．Ｖａｓｃ．Ｂｉｏｌ．２２：１９２９−１９３５（２００２）、Ｒｉｊｋｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ７９：４９１−４９９（１９９５）を参照）。多数の合成トロンビン切断可能基質は当該技術分野で公知である（例えばＩｚｑｕｉｅｒｄｏ＆Ｂｕｒｇｕｉｌｌｏ，Ｉｎｔ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．２１：５７９−５９２（１９８９）、ＷＯ１９９２／００７８６９号を参照）。トロンビンの一致切断部位は、Ｐ３−疎水性、Ｐ２−Ｐｒｏ、Ｐｉｐ、Ｐ３−Ａｒｇとして、または、Ａｒｇ、例えばＤ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ｌｙｓ（配列番号２２）、Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｒｏ−Ｌｙｓ（配列番号２３）、Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ｏｒｎ（配列番号２４）と等配電子およびイソレクトロニックであるとして特定された。Ｇａｌｌｗｉｔｚ  ｅｔ  ａｌ．ＰＬｏＳ  ＯＮＥ  ７（２）：ｅ３１７５６．ｄｏｉ：１０．１３７１／ｊｏｕｒｎａｌ．ｐｏｎｅ．００３１７５６（２０１２）、Ｔａｎｉｈａｒａ  ｅｔ  ａｌ．Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  １９：４２１−４２５（１９９８）、Ｒｉｊｋｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ  ７９：４９１−４９９（１９９５）もまた参照されたい。
【０１７０】
いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は、ＦＸＩａ切断部位（例えばＫＬＴＲ↓ＡＥＴ（配列番号２５））、ＦＸＩａ切断部位（例えばＤＦＴＲ↓ＶＶＧ（配列番号２６））、ＦＸＩＩａ切断部位（例えばＴＭＴＲ↓ＩＶＧＧ（配列番号２７））、カリクレイン切断部位（例えばＳＰＦＲ↓ＳＴＧＧ（配列番号２８））、ＦＶＩＩａ切断部位（例えばＬＱＶＲ↓ＩＶＧＧ（配列番号２９））、ＦＩＸａ切断部位（例えばＰＬＧＲ↓ＩＶＧＧ（配列番号３０））、ＦＸａ切断部位（例えばＩＥＧＲ↓ＴＶＧＧ（配列番号３１））、ＦＩＩａ（トロンビン）切断部位（例えばＬＴＰＲ↓ＳＬＬＶ（配列番号３２））、エラスターゼ−２切断部位（例えばＬＧＰＶ↓ＳＧＶＰ（配列番号３３））、グランザイム−Ｂ切断部位（例えばＶＡＧＤ↓ＳＬＥＥ（配列番号３４））、ＭＭＰ−１２切断部位（例えばＧＰＡＧ↓ＬＧＧＡ（配列番号３５））、ＭＭＰ−１３切断部位（例えばＧＰＡＧ↓ＬＲＧＡ（配列番号３６））、ＭＭＰ−１７切断部位（例えばＡＰＬＧ↓ＬＲＬＲ（配列番号３７））、ＭＭＰ−２０切断部位（例えばＰＡＬＰ↓ＬＶＡＱ（配列番号３８））、ＴＥＶ切断部位（例えばＥＮＬＹＦＱ↓Ｇ（配列番号３９））、エンテロキナーゼ切断部位（例えばＤＤＤＫ↓ＩＶＧＧ（配列番号４０））、プロテアーゼ３Ｃ（ＰＲＥＳＣＩＳＳＩＯＮ（商標））切断部位（例えばＬＥＶＬＦＱ↓ＧＰ（配列番号４１））、およびソルターゼＡ切断部位（例えばＬＰＫＴ↓ＧＳＥＳ）（配列番号４２）を含む。ある実施形態において、ＦＸＩａ切断部位は、例えばＴＱＳＦＮＤＦＴＲ（配列番号２）およびＳＶＳＱＴＳＫＬＴＲ（配列番号３）を含むがこれらに限られない。
【０１７１】
Ｄ．リンカー（Ｌ）
上述のように、本発明のプロコアグラント化合物は、１つ以上のリンカーを含み得る。本明細書で使用する場合、用語「リンカー」（本明細書で開示される式においてはＬと表される）は、本発明のプロコアグラント化合物における２つの部分（例えばＨｅｔ１、Ｈｅｔ２、Ｐｅｐ１、Ｐｅｐ２、Ｂｘ）を結合することを主な機能とする、ペプチドまたはポリペプチド配列（例えば合成ペプチドまたはポリペプチド配列）、または非ペプチドリンカーを指す。リンカーは本発明のプロコアグラント化合物のあらゆる２つの部分または非リンカー要素の間に存在し得る。例えば、１つ以上のリンカーは、プロテアーゼ切断可能基質（例えばトロンビン切断可能基質）と異種部分との間、またはプロテアーゼ切断可能基質とポリペプチド（例えばプロコアグラントペプチド、凝血因子、もしくは非プロコアグラントポリペプチド）との間、または第１のポリペプチドと第２のポリペプチドとの間、または第１の異種部分と第２の異種部分との間に存在し得る。いくつかの実施形態において、２つ以上のリンカーは縦列で結合し得る。
【０１７２】
複数のリンカーが本発明のプロコアグラント化合物において存在する場合、それぞれのリンカーは同じまたは異なり得る。一般的に、リンカーはポリペプチド分子に柔軟性を提供する。リンカーは典型的に切断されないが、しかしながら、ある実施形態において、かかる切断は所望であり得る。従って、いくつかの実施形態において、リンカーはリンカーの配列内に位置するまたはリンカー配列の一端でリンカーに隣接する１つ以上のプロテアーゼ切断可能部位を含み得る。
【０１７３】
一実施形態において、リンカーはペプチドリンカーである。いくつかの実施形態において、ペプチドリンカーは、少なくとも２つのアミノ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、少なくとも１０個、少なくとも２０個、少なくとも３０個、少なくとも４０個、少なくとも５０個、少なくとも６０個、少なくとも７０個、少なくとも８０個、少なくとも９０個、または少なくとも１００個のアミノ酸を含み得る。他の実施形態において、ペプチドリンカーは、少なくとも２００個、少なくとも３００個、少なくとも４００個、少なくとも５００個、少なくとも６００個、少なくとも７００個、少なくとも８００個、少なくとも９００個、または少なくとも１，０００個のアミノ酸を含み得る。いくつかの実施形態において、ペプチドリンカーは、少なくとも約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１５０、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１１００、１２００、１３００、１４００、１５００、１６００、１７００、１８００、１９００、または２０００個のアミノ酸を含み得る。ペプチドリンカーは１〜５つのアミノ酸、１〜１０個のアミノ酸、１〜２０個のアミノ酸、１０〜５０個のアミノ酸、５０〜１００個のアミノ酸、１００〜２００個のアミノ酸、２００〜３００個のアミノ酸、３００〜４００個のアミノ酸、４００〜５００個のアミノ酸、５００〜６００個のアミノ酸、６００〜７００個のアミノ酸、７００〜８００個のアミノ酸、８００〜９００個のアミノ酸、または９００〜１０００個のアミノ酸を含み得る。
【０１７４】
ペプチドリンカーの例は当該技術分野で周知であり、例えば式［（Ｇｌｙ）ｘ−Ｓｅｒｙ］ｚに従うペプチドリンカーがあり、ここにおいてｘは１から４であり、ｙは０または１であり、ｚは１から５０である。一実施形態において、ペプチドリンカーは、ｎが１〜１００の整数であり得る、配列Ｇｎを含む。具体的な実施形態において、具体的な実施形態、ペプチドリンカーの配列はＧＧＧＧである。ペプチドリンカーは配列（ＧＡ）ｎを含み得る。ペプチドリンカーは配列（ＧＧＳ）ｎを含み得る。他の実施形態において、ペプチドリンカーは配列（ＧＧＧＳ）ｎ（配列番号４３）を含む。さらに他の実施形態において、ペプチドリンカーは配列（ＧＧＳ）ｎ（ＧＧＧＧＳ）ｎ（配列番号４４）を含む。これらの例において、ｎは１〜１００の整数であり得る。他の例において、ｎは１〜２０の整数、すなわち１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０であり得る。リンカーの例は、ＧＧＧ、ＳＧＧＳＧＧＳ（配列番号４５）、ＧＧＳＧＧＳＧＧＳＧＧＳＧＧＧ（配列番号４６）、ＧＧＳＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号４７）、ＧＧＳＧＧＳＧＧＳＧＧＳＧＧＳＧＧＳ（配列番号４８）、またはＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号４９）を含むがこれらに限られない。他の実施形態において、リンカーはポリ−Ｇ配列（ＧＧＧＧ）ｎ（配列番号５０）であり、ｎは１〜１００の整数であり得る。
【０１７５】
一実施形態において、ペプチドリンカーは合成、すなわち非自然発生である。一実施形態において、ペプチドリンカーは、アミノ酸の第１の直線状配列を、自然には結合しないまたは本来は遺伝融合しないアミノ酸の第２の直線状配列に融合するアミノ酸配列を含む、ペプチド（またはポリペプチド）（例えば自然または非自然発生ペプチド）を含む。例えば、一実施形態において、ペプチドリンカーは自然発生ポリペプチドの修飾形態（例えば、付加、置換または欠失のような突然変異を含むもの）である非自然発生ポリペプチドを含み得る。別の実施形態において、ペプチドリンカーは非自然発生アミノ酸を含み得る。別の実施形態において、ペプチドリンカーは、本来は発生しない直線状配列において自然発生アミノ酸を含み得る。さらに別の実施形態において、ペプチドリンカーは自然発生ポリペプチド配列を含み得る。
【０１７６】
いくつかの実施形態において、リンカーは非ペプチドリンカーを含む。他の実施形態において、リンカーは非ペプチドリンカーから成る。いくつかの実施形態において、非ペプチドリンカーは、例えばマレイミドカプロイル（ＭＣ）、マレイミドプロパノイル（ＭＰ）、メトキシポリエチレングリコール（ＭＰＥＧ）、スクシンイミジル４−（Ｎ−マレイミドメチル）−シクロヘキサン−１−カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、ｍ−マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）、スクシンイミジル４−（ｐ−マレイミドフェニル）ブチレート（ＳＭＰＢ）、Ｎ−スクシンイミジル（４−ヨードアセチル）アミノベンゾネート（ＳＩＡＢ）、スクシンイミジル６−［３−（２−ピリジルジチオ）−プロピオンアミド］ヘキサノエート（ＬＣ−ＳＰＤＰ）、４−スクシンイミジルオキシカルボニル−アルファ−メチル−アルファ−（２−ピリジルジチオ）トルエン（ＳＭＰＴ）等であり得る（例えば米国特許第７，３７５，０７８号を参照）。
【０１７７】
リンカーは当該技術分野で公知の手法（例えば化学抱合、組換え手法、またはペプチド合成）を使用してポリペプチド配列に導入され得る。修飾はＤＮＡ配列分析によって確認され得る。いくつかの実施形態において、リンカーは組換え手法を使用して導入され得る。他の実施形態において、リンカーは固相ペプチド合成を使用して導入され得る。ある実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、組換え技法を使用して導入された１つ以上のリンカーおよび当該技術分野で公知の固相ペプチド合成または化学抱合を使用して導入された１つ以上のリンカーを同時に含み得る。
【０１７８】
Ｅ．異種部分（例えばＨｅｔ１、Ｈｅｔ２、…、Ｈｅｔｎ）
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は１つの異種部分（本明細書で「Ｈｅｔ１」または「Ｈｅｔ２」として示される）を含み得る。他の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は２つの異種部分（「Ｈｅｔ１」および「Ｈｅｔ２」）を含み得る。さらに別の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は３つ以上の異種部分、例えば、３、４、５、または６つ以上の異種部分を含み得る。いくつかの実施形態において、全ての異種部分は同一である。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの異種部分が他の異種部分とは異なる。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、２、３または４つ以上の異種部分を縦列で含み得る。他の実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、少なくとも１つの追加部分（例えば、プロコアグラントポリペプチド、リンカー、プロテアーゼ切断可能基質、自己犠牲スペーサー、またはそれらの組み合わせ）が２つの異種部分の間に挿入される、２つ、３つ、またはより多い異種部分を含む。
【０１７９】
異種部分は異種ポリペプチド部分もしくは異種非ポリペプチド部分、または両方を含み得る。１つの具体的な実施形態において、Ｈｅｔ１は第１の異種部分、例えば当該技術分野で公知である半減期延長分子である。いくつかの実施形態において、Ｈｅｔ２は、これも当該技術分野で公知である半減期延長分子であり得る、第２の異種部分である。いくつかの態様において、異種部分は異種ポリペプチドおよび非ポリペプチド部分の組み合わせを含む。
【０１８０】
ある実施形態において、第１の異種部分（例えば第１のＦｃ領域）および第２の異種部分（例えば第２のＦｃ領域）は、二量体を形成するために互いと会合する。一実施形態において、第２の異種部分は第２のＦｃ領域であり、第２のＦｃ領域は第１の異種部分、例えば第１のＦｃ領域に結合または会合する。例えば、第２の異種部分（例えば第２のＦｃ領域）は、リンカーにより第１の異種部分（例えば第１のＦｃ領域）に結合し得る、または、共有結合性または非共有結合性結合により第１の異種部分と会合し得る。
【０１８１】
いくつかの実施形態において、Ｈｅｔ１およびＨｅｔ２異種部分は、本発明のプロコアグラント化合物に組み込まれる場合、インビボ半減期の延長と関連する構造化または非構造化のどちらかの特徴を有する、ペプチドおよびポリペプチドである。非制限的な例は、アルブミン、アルブミン断片、免疫グロブリンのＦｃ断片、ヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニットのＣ末端ペプチド（ＣＴＰ）のβサブユニット、ＨＡＰ配列、ＸＴＥＮ、トランスフェリンもしくはその断片、ＰＡＳポリペプチド、ポリグリシンリンカー、ポリセリンリンカー、アルブミン結合部分、またはこれらのポリペプチドのあらゆる断片、誘導体、変異体もしくは組み合わせ）を含む。他の関連する態様において、異種部分は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、ポリシアル酸、またはこれらの要素のあらゆる誘導体、変異体もしくは組み合わせのような非ポリペプチド部分のための付着部位（例えばシステインアミノ酸）を含み得る。いくつかの態様において、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）、ポリシアル酸、ＸＴＥＮ、またはこれらの要素のあらゆる誘導体、変異体もしくは組み合わせのような、非ポリペプチド部分のための付着部位として機能するシステインアミノ酸から成る異種部分。
【０１８２】
いくつかの実施形態において、異種部分は、少なくとも約１０、１００、２００、３００、４００、５００、６００、７００、８００、９００、１０００、１１００、１２００、１３００、１４００、１５００、１６００、１７００、１８００、１９００、２０００、２５００、３０００、または４０００個のアミノ酸を含む、それらから本質的に成る、またはそれらから成るポリペプチドである。他の実施形態において、異種部分は、約１００から約２００個のアミノ酸、約２００から約３００個のアミノ酸、約３００から約４００個のアミノ酸、約４００から約５００個のアミノ酸、約５００から約６００個のアミノ酸、約６００から約７００個のアミノ酸、約７００から約８００個のアミノ酸、約８００から約９００個のアミノ酸、または約９００から約１０００個のアミノ酸を含む、それらから本質的に成る、またはそれらから成るポリペプチドである。
【０１８３】
ある実施形態において、異種部分は、Ｐｅｐ１および／またはＰｅｐ２ポリペプチドの生物学的活性（例えば、凝血因子もしくはその断片、またはプロコアグラント合成ペプチドのプロコアグラント活性のプロコアグラント活性）または機能に本質的に影響を与えることなく、プロコアグラント化合物の１つ以上の薬物動態性質を改善する。
【０１８４】
ある実施形態において、異種部分は、本発明のプロコアグラント化合物のインビボおよび／またはインビトロ半減期を増加させる。他の実施形態において、異種部分は、本発明のプロコアグラント化合物またはその断片（例えばプロテアーゼ切断可能基質Ｚｙのタンパク質分解性切断後の異種部分を含む断片）の可視化または位置特定を容易にする。本発明のプロコアグラント化合物またはその断片の、可視化および／または位置特定は、インビボ、インビトロ、エクスビボ、またはそれらの組み合わせであり得る。
【０１８５】
他の実施形態において、異種部分は、本発明のプロコアグラント化合物またはその断片（例えば、プロテアーゼ切断可能基質Ｚｙのタンパク質分解性切断後の異種部分を含む断片）の安定性を増加させる。本明細書で使用される場合、用語「安定性」は、プロコアグラント化合物の、環境条件（例えば気温の上昇または低下）への反応における、１つ以上の物理的性質の維持の、当業者に認知された尺度を指す。ある態様において、物理的性質は、プロコアグラント化合物の共有結合性構造（例えば、タンパク質分解性切断、不必要な酸化もしくは脱アミドの不在）の維持であり得る。他の態様において、物理的性質は、適切な折り畳み状態における（例えば、可溶性の不在、または可溶性凝集物もしくは沈殿物における）プロコアグラント化合物の存在でもあり得る。一態様において、プロコアグラント化合物の安定性は、プロコアグラント化合物の生物物理学的性質、例えば、熱安定性、ｐＨ変性特性、グリコシル化の安定除去、溶解度、生化学的機能（例えばタンパク質、受容体またはリガンドに結合する能力）等および／またはそれらの組み合わせをアッセイすることにより測定される。別の態様において、生化学的機能は、相互作用の結合親和性によって実証される。一態様において、タンパク質安定性の尺度は、熱安定性、すなわち、熱的攻撃への抵抗性である。安定性は、ＨＰＬＣ（高速液体クロマトグラフィー）、ＳＥＣ（分子ふるいクロマトグラフィー）、ＤＬＳ（動的光散乱）等のような、当該技術分野で公知の手法を使用して測定され得る。熱安定性を測定する手法は、示差走査熱量測定法（ＤＳＣ）、示差走査蛍光定量法（ＤＳＦ）、円二色性法（ＣＤ）、および熱的攻撃アッセイを含むがこれらに限られない。
【０１８６】
１．半減期延長異種部分
ある態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、少なくとも１つの半減期延長部分、すなわち、かかる異種部分を欠如する対応するプロコアグラント化合物のインビボ半減期に対してプロコアグラント化合物のインビボ半減期を増加する異種部分を含む。プロコアグラント化合物のインビボ半減期は当該技術分野で公知のあらゆる手法、例えば活性アッセイ（発色アッセイまたは１段凝血ａＰＴＴアッセイ）、ＥＬＩＳＡ等によって決定し得る。
【０１８７】
いくつかの実施形態において、１つ以上の半減期延長部分の存在は、かかる１つ以上の半減期延長部分が欠如した対応するプロコアグラント化合物の半減期と比較した、プロコアグラント化合物の半減期の増加をもたらす。半減期延長部分を含むプロコアグラント化合物の半減期は、かかる半減期延長部分が欠如した対応するプロコアグラント化合物のインビボ半減期より、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、少なくとも約６倍、少なくとも約７倍、少なくとも約８倍、少なくとも約９倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約１１倍、または少なくとも約１２倍長い。
【０１８８】
一実施形態において、半減期延長部分を含むプロコアグラント化合物の半減期は、かかる半減期延長部分が欠如した対応するプロコアグラント化合物のインビボ半減期より、約１．５倍から約２０倍、約１．５倍から約１５倍、または約１．５倍から約１０倍長い。別の実施形態において、半減期延長部分を含むプロコアグラント化合物の半減期は、かかる半減期延長部分が欠如した対応するプロコアグラント化合物のインビボ半減期と比較して、約２倍から約１０倍、約２倍から約９倍、約２倍から約８倍、約２倍から約７倍、約２倍から約６倍、約２倍から約５倍、約２倍から約４倍、約２倍から約３倍、約２．５倍から約１０倍、約２．５倍から約９倍、約２．５倍から約８倍、約２．５倍から約７倍、約２．５倍から約６倍、約２．５倍から約５倍、約２．５倍から約４倍、約２．５倍から約３倍、約３倍から約１０倍、約３倍から約９倍、約３倍から約８倍、約３倍から約７倍、約３倍から約６倍、約３倍から約５倍、約３倍から約４倍、約４倍から約６倍、約５倍から約７倍、または約６倍から約８倍に延長される。
【０１８９】
他の実施形態において、半減期延長部分を含むプロコアグラント化合物の半減期は、少なくとも約１７時間、少なくとも約１８時間、少なくとも約１９時間、少なくとも約２０時間、少なくとも約２１時間、少なくとも約２２時間、少なくとも約２３時間、少なくとも約２４時間、少なくとも約２５時間、少なくとも約２６時間、少なくとも約２７時間、少なくとも約２８時間、少なくとも約２９時間、少なくとも約３０時間、少なくとも約３１時間、少なくとも約３２時間、少なくとも約３３時間、少なくとも約３４時間、少なくとも約３５時間、少なくとも約３６時間、少なくとも約４８時間、少なくとも約６０時間、少なくとも約７２時間、少なくとも約８４時間、少なくとも約９６時間、または少なくとも約１０８時間である。
【０１９０】
さらに他の実施形態において、半減期延長部分を含むプロコアグラント化合物の半減期は、約１５時間から約２週間、約１６時間から約１週間、約１７時間から約１週間、約１８時間から約１週間、約１９時間から約１週間、約２０時間から約１週間、約２１時間から約１週間、約２２時間から約１週間、約２３時間から約１週間、約２４時間から約１週間、約３６時間から約１週間、約４８時間から約１週間、約６０時間から約１週間、約２４時間から約６日間、約２４時間から約５日間、約２４時間から約４日間、約２４時間から約３日間、または約２４時間から約２日間である。
【０１９１】
いくつかの実施形態において、半減期延長部分を含むプロコアグラント化合物の被験体当たりの平均半減期は、約１５時間、約１６時間、約１７時間、約１８時間、約１９時間、約２０時間、約２１時間、約２２時間、約２３時間、約２４時間（１日間）、約２５時間、約２６時間、約２７時間、約２８時間、約２９時間、約３０時間、約３１時間、約３２時間、約３３時間、約３４時間、約３５時間、約３６時間、約４０時間、約４４時間、約４８時間（２日間）、約５４時間、約６０時間、約７２時間（３日間）、約８４時間、約９６時間（４日間）、約１０８時間、約１２０時間（５日間）、約６日間、約７日間（１週間）、約８日間、約９日間、約１０日間、約１１日間、約１２日間、約１３日間、または約１４日間である。
【０１９２】
（ａ）低複雑性ポリペプチド
ある態様において、本発明のプロコアグラント化合物は低い組成および／または構造的複雑性を有するポリペプチド（例えば、生理的条件下で溶液において２次または３次構造を有さない変性ポリペプチド）を含む少なくとも１つの異種部分を含む。
【０１９３】
（ｂ）ＣＴＰ
ある態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、１つのヒト絨毛性ゴナドトロピンのβサブユニットのＣ末端ペプチド（ＣＴＰ）、またはその断片、変異体、または誘導体を含む、少なくとも１つの異種部分を含む。組換えタンパク質に挿入される１つ以上のＣＴＰペプチドは、そのタンパク質のインビボ半減期を増加するとして知られている。例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第５，７１２，１２２号を参照されたい。
【０１９４】
例示的なＣＴＰペプチドはＤＰＲＦＱＤＳＳＳＳＫＡＰＰＰＳＬＰＳＰＳＲＬＰＧＰＳＤＴＰＩＬ（配列番号５１）またはＳＳＳＳＫＡＰＰＰＳＬＰＳＰＳＲＬＰＧＰＳＤＴＰＩＬＰＱ（配列番号５２）を含む。例えば、参照により組み込まれる、米国特許出願公開第２００９／００８７４１１  Ａ１号を参照されたい。
【０１９５】
（ｃ）免疫グロブリン定常領域（Ｆｃ）またはその一部
ある態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、少なくとも１つのＦｃ領域を含む。本明細書で使用される用語「Ｆｃ」または「Ｆｃ領域」は、キメラタンパク質におけるＦｃ領域の望ましい性質例えばインビボ半減期における増加を維持する、Ｆｃドメイン、その変異体または断片を含む、機能的新生児型Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）結合相手を意味する。無数の突然変異体、断片、変異体、および誘導体が、例えば、ＰＣＴ出願公開ＷＯ  ２０１１／０６９１６４  Ａ２号、同ＷＯ  ２０１２／００６６２３  Ａ２号、同ＷＯ  ２０１２／００６６３５  Ａ２号、または同ＷＯ  ２０１２／００６６３３  Ａ２号に記載され、それらの全ては、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。Ｆｃ領域は、ＣＨ（定常重）ドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２等）と表されるドメインで構成される。アイソタイプ（すなわちＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、またはＩｇＥ）に依存し、Ｆｃ領域は、３つまたは４つのＣＨドメインから構成され得る。いくつかのアイソタイプ（例えばＩｇＧ）Ｆｃ領域はヒンジ領域もまた含む。Ｊａｎｅｗａｙ  ｅｔ  ａｌ．２００１，Ｉｍｍｕｎｏｂｉｏｌｏｇｙ，Ｇａｒｌａｎｄ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，Ｎ．Ｙ．，Ｎ．Ｙを参照されたい。
【０１９６】
本発明のプロコアグラント化合物を生成するためのＦｃ領域またはその一部は、多数の異なる供給源から得ることができる。いくつかの実施形態において、Ｆｃ領域またはその一部はヒト免疫グロブリンから誘導される。しかしながら、Ｆｃ領域またはその一部は、例えば齧歯類（例えば、ネズミ、ラット、ウサギ、テンジクネズミ）または非ヒト霊長類（例えばチンバンジー、マカク）を含む、別の哺乳類種の免疫グロブリンから誘導し得るということが理解される。さらに、Ｆｃ領域またはその一部は、ＩｇＭ、ＩｇＧ、ＩｇＤ、ＩｇＡおよびＩｇＥを含むあらゆる免疫グロブリンクラス、ならびにＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４を含むあらゆる免疫グロブリンアイソタイプから誘導され得る。一実施形態において、ヒトアイソタイプＩｇＧ１が使用される。
【０１９７】
免疫グロブリンのＦｃ領域を含むプロコアグラント化合物は、安定性の増加、血清半減期の増加（Ｃａｐｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９，Ｎａｔｕｒｅ  ３３７：５２５を参照）を、新生児型Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）のようなＦｃ受容体への結合と同様に含む、いくつかの望ましい性質をキメラタンパク質に与える（米国特許第６，０８６，８７５号、同第６，４８５，７２６号、同第６，０３０，６１３号、ＷＯ０３／０７７８３４号、ＵＳ２００３−０２３５５３６Ａ１号）を参照されたく、それらの全体は参照により本明細書に組み込まれる。
【０１９８】
ある実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、Ｆｃ領域に対するＦｃ受容体（ＦｃＲ）の結合性質を与えることにそれでもなお十分である１つ以上の短縮Ｆｃ領域を含み得る。例えば、ＦｃＲｎに結合するＦｃ領域の一部（すなわちＦｃＲｎ結合部分）は、ＩｇＧ１のＥＵ番号アミノ酸約２８２〜４３８（一次接触部位がＣＨ２ドメインのアミノ酸２４８、２５０〜２５７、２７２、２８５、２８８、２９０〜２９１、３０８〜３１１、および３１４である場合）、ならびにＣＨ３ドメインのアミノ酸残基３８５〜３８７、４２８、および４３３〜４３６を含む。従って、本発明のプロコアグラント化合物におけるＦｃ領域は、ＦｃＲｎ結合部分を含み得る、または、それらから成り得る。ＦｃＲｎ結合部分は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４を含む、あらゆるアイソタイプの重鎖から誘導され得る。一実施形態において、ヒトアイソタイプＩｇＧ１の抗体由来のＦｃＲｎ結合部分が使用される。別の実施例において、ヒトアイソタイプＩｇＧ４の抗体由来のＦｃＲｎ結合部分が使用される。
【０１９９】
ある実施形態において、Ｆｃ領域は、ヒンジ（例えば、上部、中部、および／または下部ヒンジ領域）ドメイン（ＥＵ番号に従う抗体Ｆｃ領域の約アミノ酸２１６〜２３０）、ＣＨ２ドメイン（ＥＵ番号に従う抗体Ｆｃ領域の約アミノ酸２３１〜３４０）、ＣＨ３ドメイン（ＥＵ番号に従う抗体Ｆｃ領域の約アミノ酸３４１〜４３８）、ＣＨ４ドメイン、またはその変異体、一部もしくは断片のうち少なくとも１つを含む。他の実施形態において、Ｆｃ領域は完全Ｆｃドメイン（すなわち、ヒンジドメイン、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメイン）を含む。いくつかの実施形態において、Ｆｃ領域は、ＣＨ３ドメイン（またはその一部）に融合されたヒンジドメイン（またはその一部）、ＣＨ２ドメイン（またはその一部）に融合されたヒンジドメイン（またはその一部）、ＣＨ３ドメイン（またはその一部）に融合されたＣＨ２ドメイン（またはその一部）、ヒンジドメイン（またはその一部）およびＣＨ３ドメイン（またはその一部）の両方に融合されたＣＨ２ドメイン（またはその一部）を含む、それらから本質的に成る、またはそれらから成る。さらに他の実施形態において、Ｆｃ領域は、少なくともＣＨ２ドメインの一部（例えば、ＣＨ２ドメインの全てまたは部分）を欠如する。具体的な実施形態において、Ｆｃ領域はＥＵ番号２２１から４４７に対応するアミノ酸を含むまたはそれらから成る。
【０２００】
本発明のプロコアグラント化合物におけるＦｃは、例えば、ＰＣＴ出願公開ＷＯ８８／０７０８９Ａ１号、同ＷＯ９６／１４３３９Ａ１号、同ＷＯ９８／０５７８７Ａ１号、同ＷＯ９８／２３２８９Ａ１号、同ＷＯ９９／５１６４２Ａ１号、同ＷＯ９９／５８５７２Ａ１号、同ＷＯ００／０９５６０Ａ２号、同ＷＯ００／３２７６７Ａ１号、同ＷＯ００／４２０７２Ａ２号、同ＷＯ０２／４４２１５Ａ２号、同ＷＯ０２／０６０９１９Ａ２号、同ＷＯ０３／０７４５６９Ａ２号、同ＷＯ０４／０１６７５０Ａ２号、同ＷＯ０４／０２９２０７Ａ２号、同ＷＯ０４／０３５７５２Ａ２号、同ＷＯ０４／０６３３５１Ａ２号、同ＷＯ０４／０７４４５５Ａ２号、同ＷＯ０４／０９９２４９Ａ２号、同ＷＯ０５／０４０２１７Ａ２号、同ＷＯ０４／０４４８５９号、同ＷＯ０５／０７０９６３Ａ１号、同ＷＯ０５／０７７９８１Ａ２号、同ＷＯ０５／０９２９２５Ａ２号、同ＷＯ０５／１２３７８０Ａ２号、同ＷＯ０６／０１９４４７Ａ１号、同ＷＯ０６／０４７３５０Ａ２号、および同ＷＯ０６／０８５９６７Ａ２号；米国特許出願公開第２００７／０２３１３２９号、同第２００７／０２３１３２９号、同第２００７／０２３７７６５号、同第２００７／０２３７７６６号、同第２００７／０２３７７６７号、同第２００７／０２４３１８８号、同第２００７／０２４８６０３号、同第２００７／０２８６８５９号、同第２００８／００５７０５６号、または米国特許第５，６４８，２６０号、同第５，７３９，２７７号、同第５，８３４，２５０号、同第５，８６９，０４６号、同第６，０９６，８７１号、同第６，１２１，０２２号、同第６，１９４，５５１号、同第６，２４２，１９５号、同第６，２７７，３７５号、同第６，５２８，６２４号、同第６，５３８，１２４号、同第６，７３７，０５６号、同第６，８２１，５０５号、同第６，９９８，２５３号、同第７，０８３，７８４号、同第７，４０４，９５６号、および同第７，３１７，０９１号において開示される１つ以上のアミノ酸位置での変化（例えば置換）を含み得、これらのそれぞれは参照によって全体が本明細書に組み込まれる。一実施形態において、特異的な変化（例えば、当業者において開示される１つ以上のアミノ酸の特異的な置換）が開示のアミノ酸位置のうちの１つ以上で起こり得る。別の実施形態において、開示のアミノ酸位置のうちの１つ以上での異なる変化（例えば、当業者において開示される１つ以上のアミノ酸位置の異なる置換）が起こり得る。
【０２０１】
本発明において使用されるＦｃ領域は、キメラタンパク質のグリコシル化を変更する当業者に認識されるアミノ酸置換もまた含み得る。例えば、プロコアグラント化合物のＦｃ領域は、減衰グリコシル化（例えばＮ−またはＯ−結合グリコシル化）をもたらす突然変異を有するＦｃ領域を含み得、または、野生型Ｆｃ部分の変更グリコフォーム（例えば、低フコースまたは無フコースのグリカン）を含み得る。
【０２０２】
（ｄ）アルブミンまたはその断片もしくは変異体
ある実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、アルブミンまたはその機能的断片を含む、異種部分を含む。完全長型において６０９アミノ酸のタンパク質である、ヒト血清アルブミン（ＨＳＡ、またはＨＡ）は、かなりの割合の血清浸透圧に関与し、また、内因性および外因性リガンドの担体としても機能する。本明細書で使用される「アルブミン」という用語は、完全長アルブミンまたはその機能的断片、変異体、誘導体、もしくは類似体を含む。アルブミンまたはその断片もしくは変異体の例は、米国特許公開第２００８／０１９４４８１  Ａ１号、同第２００８／０００４２０６  Ａ１号、同第２００８／０１６１２４３  Ａ１号、同第２００８／０２６１８７７  Ａ１号、もしくは同第２００８／０１５３７５１  Ａ１号、またはＰＣＴ出願公開第２００８／０３３４１３  Ａ２号、同第２００９／０５８３２２  Ａ１号、もしくは同第２００７／０２１４９４  Ａ２号に開示され、それらは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
【０２０３】
一実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域またはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、ＸＴＥＮ、ＰＥＧ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分にさらに結合される、アルブミン、その断片もしくは変異体を含む。
【０２０４】
（ｅ）アルブミン結合部分
ある実施形態において、異種部分は、アルブミン結合ペプチド、細菌アルブミン結合ドメイン、アルブミン結合抗体断片、脂肪酸、またはそれらのあらゆる組み合わせを含む、アルブミン結合部分である。
【０２０５】
例えば、アルブミン結合タンパク質は、細菌アルブミン結合タンパク質、ドメイン抗体を含む抗体または抗体断片であり得る（米国特許第６，６９６，２４５号を参照）。アルブミン結合タンパク質は、例えば、レンサ球菌プロテインＧのうちの１つのような、細菌アルブミン結合ドメインであり得る（Ｋｏｎｉｇ，Ｔ．ａｎｄ  Ｓｋｅｒｒａ，Ａ．（１９９８）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ２１８，７３−８３）。抱合相手として使用され得るアルブミン結合ペプチドの他の例は、例えば、Ｃｙｓ−Ｘａａ１−Ｘａａ２−Ｘａａ３−Ｘａａ４−Ｃｙｓ一致配列を有するものであり、米国特許出願第２００３／００６９３９５号またはＤｅｎｎｉｓ  ｅｔ  ａｌ．（Ｄｅｎｎｉｓ  ｅｔ  ａｌ．（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７７，３５０３５−３５０４３）に記載されるように、Ｘａａ１は、Ａｓｐ、Ａｓｎ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、またはＴｒｐであり、Ｘａａ２は、Ａｓｎ、Ｇｌｎであり、Ｈは、Ｉｌｅ、Ｌｅｕ、またはＬｙｓであり、Ｘａａ３は、Ａｌａ、Ａｓｐ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ、またはＴｙｒであり、Ｘａａ４は、Ａｓｐ、Ｇｌｙ、Ｌｅｕ、Ｐｈｅ、Ｓｅｒ、またはＴｈｒである。
【０２０６】
Ｋｒａｕｌｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ．３７８：１９０−１９４（１９９６）およびＬｉｎｈｕｌｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｃｉ．１１：２０６−２１３（２００２）によって開示される、レンサ球菌プロテインＧからのドメイン３は、細菌アルブミン結合ドメインの例である。アルブミン結合ペプチドの例としては、コア配列ＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷ（配列番号５３）を有する一連のペプチドが挙げられる。例えば、Ｄｅｎｎｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２００２，２７７：３５０３５−３５０４３（２００２）を参照されたい。アルブミン結合ペプチドのいくつかの例は以下の通りである。
ＲＬＩＥＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＥＤＤ（配列番号５４）、
ＱＲＬＭＥＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＥＤＤＦ（配列番号５５）、
ＱＧＬＩＧＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＧＤＳＶＫ（配列番号５６）、または
ＧＥＷＷＥＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＥＥＥＤ（配列番号５７）。
【０２０７】
ルブミン結合抗体断片の例は、Ｍｕｌｌｅｒ  ａｎｄ  Ｋｏｎｔｅｒｍａｎｎ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．９：３１９−３２６（２００７）、Ｒｏｏｖｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．５６：３０３−３１７（２００７）、およびＨｏｌｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔ．Ｅｎｇ．Ｄｅｓｉｇｎ  Ｓｃｉ．，２１：２８３−２８８（２００８）に開示され、それらは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。かかるアルブミン結合部分の例は、Ｔｒｕｓｓｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍ．２０：２２８６−２２９２（２００９）によって開示されるように、２−（３−マレイミドプロパンアミド）−６−（４−（４−イオドフェニル）ブタンアミド）ヘキサノエート（「アルブ」タグ）である。
【０２０８】
脂肪酸、特に長鎖脂肪酸（ＬＣＦＡ）および長鎖脂肪酸様アルブミン結合化合物は、本明細書のプロコアグラント化合物のインビボ半減期を延長するために使用し得る。ＬＣＦＡ様アルブミン結合化合物の例は１６−（１−（３−（９−（（（２，５−ジオキソピロリジン−１−イロキシ）カルボニルオキシ）−メチル）−７−スルホ−９Ｈ−フルオレン−２−イルアミノ）−３−オキソプロピル）−２，５−ジオキソピロリジン−３−イルチオ）ヘキサデカン酸（例えばＷＯ２０１０／１４０１４８号を参照）である。
【０２０９】
（ｆ）ＰＡＳ配列
他の実施形態において、少なくとも１つの異種部分がＰＡＳ配列である。本明細書で使用する場合、ＰＡＳ配列は、主にアラニンおよびセリン残基を含む、または、主にアラニン、セリン、およびプロリン残基を含むアミノ酸配列を意味し、このアミノ酸配列は生理的条件下でランダムコイル配座を形成する。従って、ＰＡＳ配列は、アラニン、セリン、およびプロリンを含む、それらから本質的に成る、またはそれらから成る、プロコアグラント化合物における異種部分の部分として使用され得る、ビルディングブロック、アミノ酸ポリマー、または配列カセットである。さらに、当業者は、ＰＡＳ配列におけるマイナー構成成分としてアラニン、セリン、およびプロリン以外の残基が加えられた場合に、アミノ酸ポリマーもまたランダムコイル配座を形成し得るということを承知する。
【０２１０】
本明細書で使用される用語「マイナー構成成分」は、アラニン、セリン、およびプロリン以外のアミノ酸がＰＡＳ配列にある程度、例えば、最大約１２％、すなわちＰＡＳ配列の１００個のアミノ酸のうち約１２個、最大約１０％、すなわちＰＡＳ配列の１００個のアミノ酸のうち約１０個、最大約９％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約９つ、最大約８％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約８つ、約６％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約６つ、約５％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約５つ、約４％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約４つ、約３％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約３つ、約２％、すなわち１００個のアミノ酸のうち約２つ、約１％、すなわち１００個のアミノ酸のうち１つ、加えられ得るということを意味する。アラニン、セリンおよびプロリンとは異なるアミノ酸は、Ａｒｇ、Ａｓｎ、Ａｓｐ、Ｃｙｓ、Ｇｌｎ、Ｇｌｕ、Ｇｌｙ、Ｈｉｓ、Ｉｌｅ、Ｌｅｕ、Ｌｙｓ、Ｍｅｔ、Ｐｈｅ、Ｔｈｒ、Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、またはＶａｌから選択され得る。
【０２１１】
生理的条件下で、ＰＡＳ配列ストレッチはランダムコイル配座を形成し、それによってインビボおよび／またはインビトロ安定性の増加をプロコアグラント化合物に仲介し伝え得る。ランダムコイルドメインが安定構造または機能をそれ自身で所持しないため、プロコアグラント化合物におけるＰｅｐ１および／またはＰｅｐ２ポリペプチドによって仲介される生物学的活性は、本質的に保存される。他の実施形態において、ランダムコイルドメインを形成するＰＡＳ配列は、生物学的に、特に血液血漿におけるタンパク質分解、免疫原性、等電点／静電挙動、細胞表面受容体への結合または内部移行に関して不活性であり、しかしなお生物分解性であり、ＰＥＧのような合成ポリマーに勝る明確な優位性を提供する。
【０２１２】
ランダムコイル配座を形成するＰＡＳ配列の非制限的な例は、ＡＳＰＡＡＰＡＰＡＳＰＡＡＰＡＰＳＡＰＡ（配列番号５８）、ＡＡＰＡＳＰＡＰＡＡＰＳＡＰＡＰＡＡＰＳ（配列番号５９）、ＡＰＳＳＰＳＰＳＡＰＳＳＰＳＰＡＳＰＳＳ（配列番号６０）、ＡＰＳＳＰＳＰＳＡＰＳＳＰＳＰＡＳＰＳ（配列番号６１）、ＳＳＰＳＡＰＳＰＳＳＰＡＳＰＳＰＳＳＰＡ（配列番号６２）、ＡＡＳＰＡＡＰＳＡＰＰＡＡＡＳＰＡＡＰＳＡＰＰＡ（配列番号６３）、ＡＳＡＡＡＰＡＡＡＳＡＡＡＳＡＰＳＡＡＡ（配列番号６４）、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択されるアミノ酸配列を含む。ＰＡＳ配列のさらなる例は、例えば、米国特許出願公開第２０１０／０２９２１３０  Ａ１号およびＰＣＴ出願公開ＷＯ２００８／１５５１３４  Ａ１号から知られている。
【０２１３】
（ｇ）ＨＡＰ配列
ある実施形態において、少なくとも１つの異種部分がグリシンリッチホモアミノ酸ポリマー（ＨＡＰ）である。ＨＡＰ配列は、長さにおいて、少なくとも５０個のアミノ酸、少なくとも１００個のアミノ酸、１２０個のアミノ酸、１４０個のアミノ酸、１６０個のアミノ酸、１８０個のアミノ酸、２００個のアミノ酸、２５０個のアミノ酸、３００個のアミノ酸、３５０個のアミノ酸、４００個のアミノ酸、４５０個のアミノ酸、または５００個のアミノ酸を有する、グリシンの反復配列を含み得る。一実施形態において、ＨＡＰ配列はＨＡＰ配列に融合または結合された部分の半減期を延長することが可能である。ＨＡＰ配列の非限定的な例としては、（Ｇｌｙ）ｎ、（Ｇｌｙ４Ｓｅｒ）ｎまたはＳ（Ｇｌｙ４Ｓｅｒ）ｎが挙げられるが、これらに限定されず、式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０である。一実施形態において、ｎは、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２６、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０である。別の実施形態において、ｎは、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、または２００である。
【０２１４】
（ｈ）ＸＴＥＮ
ある態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、ＸＴＥＮポリペプチド、またはその断片、変異体、もしくは誘導体を含む、少なくとも１つの異種部分を含む。本明細書で使用されるとき、「ＸＴＥＮ配列」は、小さい親水性アミノ酸から主に構成される非自然発生の実質的に非反復性の配列を有する、延長された長さのポリペプチドを指し、この配列は、生理的条件下で低度の二次または三次構造を有するか、何の二次または三次構造も有しない。異種部分として、ＸＴＥＮは半減期延長部分としての役割を果たす。さらに、ＸＴＥＮは、増強薬物動態パラメータおよび溶解度特徴を含むがこれらに限られない、望ましい性質を提供し得る。
【０２１５】
ＸＴＥＮ配列を含む異種部分の本発明のプロコアグラント化合物への取り込みは、プロコアグラント化合物に、配座的柔軟性、増強水溶性、高度なプロテアーゼ抵抗性、低免疫原性、哺乳類受容体への低結合、または増加した流体力学（もしくはストークス）半径、といった１つ以上の有益な性質を与える。
【０２１６】
ある態様において、ＸＴＥＮ配列は、より長いインビボ半減期または増加した曲線下面積（ＡＵＣ）のような薬物動態性質を増加し得、本発明のプロコアグラント化合物がインビボに留まり、同じものを有するがＸＴＥＮ異種部分を有さないプロコアグラント化合物と比較して増加した期間プロコアグラント活性を有するようになる。
【０２１７】
本明細書のプロコアグラント化合物における異種部分として使用され得るＸＴＥＮ配列の例は、例えば、米国特許第７，８５５，２７９号および同第７，８４６，４４５号、米国特許出願公開第２００９／００９２５８２  Ａ１号、同第２０１０／０２３９５５４  Ａ１号、同第２０１０／０３２３９５６  Ａ１号、同第２０１１／００４６０６０  Ａ１号、同第２０１１／００４６０６１  Ａ１号、同第２０１１／００７７１９９  Ａ１号、もしくは同第２０１１／０１７２１４６  Ａ１号、同第２０１３／００１７９９７  Ａ１号、もしくは同第２０１２／０２６３７０１  Ａ１、または国際特許出願公開ＷＯ  ２０１００９１１２２  Ａ１号、同ＷＯ  ２０１０１４４５０２  Ａ２号、同ＷＯ  ２０１０１４４５０８  Ａ１号、同ＷＯ  ２０１１０２８２２８  Ａ１号、同ＷＯ  ２０１１０２８２２９  Ａ１号、もしくは同ＷＯ  ２０１１０２８３４４  Ａ２号、または２０１１年８月１９日に出願された国際出願第ＰＣＴ／ＵＳ２０１１／４８５１７号において開示され、これらのそれぞれは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０２１８】
（ｉ）トランスフェリンまたはその断片
ある実施形態において、少なくとも１つの異種部分はトランスフェリンまたはその断片である。あらゆるトランスフェリンが本明細書のプロコアグラント化合物を作るために使用され得る。例として、野生型ヒトＴｆ（Ｔｆ）は、遺伝子重複に由来するように思われる、２つの主要なドメインＮ（約３３０アミノ酸）およびＣ（約３４０アミノ酸）を有する、およそ７５ｋＤａ（グリコシル化を考慮せずに）の６７９アミノ酸のタンパク質である。ＧｅｎＢａｎｋ受入番号ＮＭ００１０６３、ＸＭ００２７９３、Ｍ１２５３０、ＸＭ０３９８４５、ＸＭ  ０３９８４７、およびＳ９５９３６（ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／）を参照されたく、それらの全ては、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。トランスフェリンは、２つのドメイン、ＮドメインおよびＣドメインを含む。Ｎドメインは２つのサブドメイン、Ｎ１ドメインおよびＮ２ドメインを含み、Ｃドメインは２つのサブドメイン、Ｃ１ドメインおよびＣ２ドメインを含む。
【０２１９】
一実施形態において、トランスフェリン異種部分は、トランスフェリンスプライス変異体を含む。一実施例において、トランスフェリンスプライス変異体はヒトトランスフェリンのスプライス変異体、例えばＧｅｎｂａｎｋ受入番号ＡＡＡ６１１４０であり得る。別の実施形態において、キメラタンパク質のトランスフェリン部分はトランスフェリン配列の１つ以上のドメイン、例えば、Ｎドメイン、Ｃドメイン、Ｎ１ドメイン、Ｎ２ドメイン、Ｃ１ドメイン、Ｃ２ドメインまたはそれらのあらゆる組み合わせを含む。
【０２２０】
（ｊ）ポリマー、例えばポリエチレングリコール（ＰＥＧ）
他の実施形態において、少なくとも１つの異種部分が当該技術分野で公知の可溶性ポリマーであり、ポリエチレングリコール、エチレングリコール／プロピレングリコールコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、またはポリビニルアルコールを含むがこれらに限られない。いくつかの実施形態において、ＰＥＧ異種部分を含むプロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分をさらに含む。さらに他の実施例において、プロコアグラント化合物は凝血因子またはその断片およびＰＥＧ異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えば、Ｆｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分をさらに含む。
【０２２１】
さらに他の実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子またはその断片、第２の凝血因子またはその断片、およびＰＥＧ異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えばＦｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分をさらに含む。他の実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子またはその断片、合成プロコアグラントポリペプチド、およびＰＥＧ異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えばＦｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分をさらに含む。
【０２２２】
他の実施形態において、プロコアグラント化合物は２つの合成プロコアグラントペプチドおよびＰＥＧ異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えばＦｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分をさらに含む。さらに別の実施形態において、プロコアグラント化合物は、凝血因子もしくはその断片、凝血因子補助因子（例えば第Ｘ因子における凝血因子の場合第Ｖａ因子、または凝血因子が第ＶＩＩ因子である場合組織因子）、およびＰＥＧ異種部分を含み、プロコアグラント化合物は、免疫グロブリン定常領域もしくはその一部（例えばＦｃ領域）、ＰＡＳ配列、ＨＥＳ、およびアルブミン、その断片もしくは変異体、ＸＴＥＮ、またはそれらのあらゆる組み合わせから選択される異種部分をさらに含む。
【０２２３】
本発明によりさらに提供されるのは、ポリペプチドの増加した溶解度、安定性および循環時間、または減少した免疫原性のような、追加の利点を提供し得る異種部分を含む、本発明のプロコアグラント化合物である（米国特許第４，１７９，３３７号を参照）。修飾のためのかかる異種部分は、ポリエチレングリコール、エチレングリコール／プロピレングリコールコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、またはそれらのあらゆる組み合わせを含むがこれらに限られない、水溶性ポリマーから選択され得る。
【０２２４】
ポリマーはあらゆる分子重量であり得、分枝または非分枝であり得る。ポリエチレングリコールに対しては、一実施形態において、操作および製造の容易性のため分子重量は約１ｋＤａと約１００ｋＤａとの間である。望ましい特性（例えば、望ましい持続放出の期間、もしあれば生物学的活性上の効果、操作の容易性、タンパク質または類似体に対するポリエチレングリコールの抗原性および他の公知の効果の程度または欠如）に依存し、他のサイズが使用され得る。例えば、ポリエチレングリコールは、約２００、５００、１０００、１５００、２０００、２５００、３０００、３５００、４０００、４５００、５０００、５５００、６０００、６５００、７０００、７５００、８０００、８５００、９０００、９５００、１０，０００、１０，５００、１１，０００、１１，５００、１２，０００、１２，５００、１３，０００、１３，５００、１４，０００、１４，５００、１５，０００、１５，５００、１６，０００、１６，５００、１７，０００、１７，５００、１８，０００、１８，５００、１９，０００、１９，５００、２０，０００、２５，０００、３０，０００、３５，０００、４０，０００、４５，０００、５０，０００、５５，０００、６０，０００、６５，０００、７０，０００、７５，０００、８０，０００、８５，０００、９０，０００、９５，０００、または１００，０００ｋＤａの平均分子重量を有し得る。
【０２２５】
いくつかの実施形態において、ポリエチレングリコールは分枝構造を有し得る。分枝ポリエチレングリコールは、例えば、米国特許第５，６４３，５７５号、Ｍｏｒｐｕｒｇｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．５６：５９−７２（１９９６）、Ｖｏｒｏｂｊｅｖ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  １８：２７４５−２７５０（１９９９）、およびＣａｌｉｃｅｔｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ．Ｃｈｅｍ．１０：６３８−６４６（１９９９）において記載され、これらのそれぞれは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０２２６】
本明細書のプロコアグラント化合物のそれぞれに付着するポリエチレングリコール部分の数（すなわち置換度）もまた多様であり得る。例えば、ＰＥＧ化プロコアグラント化合物は、平均で、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１２、１５、１７、２０、またはそれより多いポリエチレングリコール分子に結合し得る。同様に、内部での平均置換度は、タンパク質分子当たり１〜３、２〜４、３〜５、４〜６、５〜７、６〜８、７〜９、８〜１０、９〜１１、１０〜１２、１１〜１３、１２〜１４、１３〜１５、１４〜１６、１５〜１７、１６〜１８、１７〜１９、または１８〜２０個のポリエチレングリコールの範囲である。置換度を決定する方法は例えばＤｅｌｇａｄｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｔｈｅｒａ．Ｄｒｕｇ  Ｃａｒｒｉｅｒ  Ｓｙｓ．９：２４９−３０４（１９９２）において記載される。
【０２２７】
いくつかの実施形態において、プロコアグラント化合物はＰＥＧ化され得る。ＰＥＧ化プロコアグラント化合物は少なくとも１つのポリエチレングリコール（ＰＥＧ）分子を含む。他の実施形態において、ポリマーは水溶性であり得る。重合体の非限定的な例としては、ポリ（アルキレンオキシド）、ポリ（ビニルピロリドン）、ポリ（ビニルアルコール）、ポリオキサゾリン、またはポリ（アクリロイルモルホリン）が挙げられ得る。凝血因子への重合体抱合の追加の型は、米国特許第７，１９９，２２３号において開示される。Ｓｉｎｇｈ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｕｒｒ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１５：１８０２−１８２６（２００８）もまた参照されたい。
【０２２８】
（ｋ）ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）
ある実施形態において、少なくとも１つの異種部分が重合体、例えばヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）またはその誘導体である。ヒドロキシエチルデンプン（ＨＥＳ）は、自然発生アミロペクチンの誘導体であり、体内でアルファアミラーゼによって分解される。ＨＥＳは炭水化物ポリマーアミロペクチンの置換誘導体であり、重量で最大９５％の濃度のコーンスターチにおいて存在する。ＨＥＳは有益な生物学的性質を示し、血液用補液剤としておよび診療所における血液希釈治療において使用される（Ｓｏｍｍｅｒｍｅｙｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｋｒａｎｋｅｎｈａｕｓｐｈａｒｍａｚｉｅ，８（８），２７１−２７８（１９８７）、およびＷｅｉｄｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｒｚｎｅｉｍ．−Ｆｏｒｓｃｈｕｎｇ／Ｄｒｕｇ  Ｒｅｓ．，４１，４９４−４９８（１９９１））。
【０２２９】
アミロペクチンはグルコース部分を含み、主鎖アルファ−１，４−グリコシド結合が存在し、分枝部位にてアルファ−１，６−グリコシド結合が見られる。この分子の物理化学的性質は主にグリコシド結合の型により決定される。ニックアルファ−１，４−グリコシド結合により、ターン当たり約６つのグルコースモノマーを伴うらせん構造が生成される。ポリマーの物理化学的性質は生化学的性質と同様に置換によって修飾され得る。ヒドロキシエチル基の導入はアルカリ性ヒドロキシエチル化によって達成され得る。反応条件を順応させることにより、非置換グルコースモノマーにおけるそれぞれのヒドロキシ基の、ヒドロキシエチル化に関する異なる反応性を引き出すことが可能である。この事実のために、当業者は限られた範囲で置換パターンに影響することができる。
【０２３０】
ＨＥＳは、分子量分布および置換度によって主に特徴付けられる。ＤＳと表す置換度は、モル置換に関連し、当該技術分野で公知である。上述のようにＳｏｍｍｅｒｍｅｙｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｋｒａｎｋｅｎｈａｕｓｐｈａｒｍａｚｉｅ，８（８），２７１−２７８（１９８７）、特にｐ．２７３を参照されたい。
【０２３１】
一実施形態において、ヒドロキシエチルデンプンは、１から３００ｋＤ、２から２００ｋＤ、３から１００ｋＤ、４から７０ｋＤの平均分子重量（重量平均）を有する。ヒドロキシエチルデンプンは、０．１から３、好適には０．１から２、より好適には０．１から０．９、好適には０．１から０．８のモル置換度、およびヒドロキシエチル基に関して２から２０の範囲におけるＣ２：Ｃ６置換の間における比率をさらに示し得る。約１３０ｋＤの平均分子重量を有するＨＥＳの非制限的な例は、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、または０．８のように０．２から０．８の、好適には０．４、０．５、０．６、または０．７のように０．４から０．７の置換度を有するＨＥＳである。
【０２３２】
具体的な実施形態において、約１３０ｋＤの平均分子重量を有するＨＥＳはＦｒｅｓｅｎｉｕｓのＶＯＬＵＶＥＮ（登録商標）である。ＶＯＬＵＶＥＮ（登録商標）は人工コロイドであり、例えば治療のための治療指標および血液量減少の予防において使用される血量補充に用いられる。ＶＯＬＵＶＥＮ（登録商標）の特徴は、１３０，０００＋／−２０，０００Ｄの平均分子重量、０．４のモル置換、および約９：１のＣ２：Ｃ６の比率である。他の実施形態において、ヒドロキシエチルデンプンの平均分子重量の範囲は、例えば４から７０ｋＤ、または１０から７０ｋＤ、または１２から７０ｋＤ、または１８から７０ｋＤ、または５０から７０ｋＤ、または４から５０ｋＤ、または１０から５０ｋＤ、または１２から５０ｋＤ、または１８から５０ｋＤ、または４から１８ｋＤ、または１０から１８ｋＤ、または１２から１８ｋＤ、または４から１２ｋＤ、または１０から１２ｋＤ、または４から１０ｋＤである。
【０２３３】
さらに他の実施形態において、用いられるヒドロキシエチルデンプンの平均分子重量は、４ｋＤより多く７０ｋＤ未満の範囲、例えば約１０ｋＤ、または９から１０ｋＤ、もしくは１０から１１ｋＤ、もしくは９から１１ｋＤの範囲、または約１２ｋＤ、または１１から１２ｋＤ）、もしくは１２から１３ｋＤ、もしくは１１から１３ｋＤの範囲、または約１８ｋＤ、または１７から１８ｋＤ、もしくは１８から１９ｋＤ、もしくは１７から１９ｋＤの範囲、または約３０ｋＤ、または２９から３０、もしくは３０から３１ｋＤの範囲、または約５０ｋＤ、または４９から５０ｋＤ、もしくは５０から５１ｋＤ、もしくは４９から５１ｋＤの範囲である。
【０２３４】
ある実施形態において、異種部分は、異なる平均分子重量および／または異なる置換度および／または異なるＣ２：Ｃ６の置換の比率を有するヒドロキシエチルデンプンの混合物であり得る。従って、異なる平均分子重量、および異なる置換度、および異なるＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、異なる平均分子重量、および異なる置換度、および同じもしくはほぼ同じＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、異なる平均分子重量、および同じもしくはほぼ同じ置換度、および異なるＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、同じもしくはほぼ同じ平均分子重量、および異なる置換度、および異なるＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、異なる平均分子重量、および同じもしくはほぼ同じ置換度、および同じもしくはほぼ同じＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、同じもしくはほぼ同じ平均分子重量、および異なる置換度、および同じもしくはほぼ同じＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、同じもしくはほぼ同じ平均分子重量、および同じもしくはほぼ同じ置換度、および異なるＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、または、ほぼ同じ平均分子重量、およびほぼ同じ置換度、およびほぼ同じＣ２：Ｃ６の置換の比率を有する、ヒドロキシエチルデンプンの混合物が用いられ得る。
【０２３５】
（ｌ）ポリシアル酸（ＰＳＡ）
ある実施形態において少なくとも１つの異種部分が重合体、例えば、ポリシアル酸（ＰＳＡ）またはその誘導体である。ポリシアル酸（ＰＳＡ）は、特定の細菌株によっておよび特定の細胞における哺乳類において生成される自然発生のシアル酸の分子重合体であるＰｏｌｙｓｉａｌｉｃ  Ａｃｉｄ：Ｆｒｏｍ  Ｍｉｃｒｏｂｅｓ  ｔｏ  Ｍａｎ，ｅｄｓ  Ｒｏｔｈ  Ｊ．，Ｒｕｔｉｓｈａｕｓｅｒ  Ｕ．，Ｔｒｏｙ  Ｆ．Ａ．（Ｂｉｒｋｈaｕｓｅｒ  Ｖｅｒｌａｇ，Ｂａｓｅｌ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ），ｐｐ３３５−３４８におけるＲｏｔｈ  Ｊ．，ｅｔ  ａｌ．（１９９３）。これらは、ｎ＝約８０以上のシアル酸残基からｎ＝２の様々な重合の程度において、制限酸加水分解によって、またはノイラミニダーゼ消化によって、またはポリマーの自然、細菌誘導形態の分別によって、生成され得る。
【０２３６】
異なるポリシアル酸の組成物もまた多様であり、ホモポリマー形態、すなわち、神経細胞接着分子（Ｎ−ＣＡＭ）の胎児型上でも見られる、大腸菌株Ｋ１およびＢ群髄膜炎菌の莢膜多糖を含む、アルファ−２，８−結合ポリシアル酸が存在する。代替の大腸菌株Ｋ９２のアルファ−２，８アルファ−２，９ポリシアル酸および髄膜炎菌のＣ群多糖のようなヘテロポリマー形態もまた存在する。シアル酸は、髄膜炎菌のＷ１３５群またはＹ群のようなシアル酸以外のモノマーを有する大体の共重合体においても見られ得る。哺乳類においてポリシアル酸のための公知の受容体は存在しないが、ポリシアル酸は、胎児の発達の（ポリマーが抗粘着機能を有する）間、病原菌による免疫系および補体系の回避ならびに未熟神経細胞のグリア細胞接着性の制御を含む、重要な生物学的機能を有するＣｈｏ  ａｎｄ  Ｔｒｏｙ，Ｐ．Ｎ．Ａ．Ｓ．，ＵＳＡ，９１（１９９４）１１４２７−１１４３１。
【０２３７】
大腸菌株Ｋ１のアルファ−２，８−結合ポリシアル酸は「コロミン酸」としても知られ、本発明を例証するために（様々な長さで）使用される。ポリペプチドにポリシアル酸を付着または抱合する様々な手法が記載される（例えば、米国特許第５，８４６，９５１号、ＷＯ−Ａ−０１８７９２２号およびＵＳ２００７／０１９１５９７Ａ１号を参照されたく、これらは参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
【０２３８】
（ｍ）クリアランス受容体
ある態様において、本発明のプロコアグラント化合物における治療ポリペプチドのインビボ半減期は、プロコアグラント化合物がクリアランス受容体、その断片、変異体または誘導体を含む少なくとも１つの異種分子を含む場合、延長し得る。治療ペプチドが第ＶＩＩＩ因子、第ＩＸ因子または第Ｘ因子である具体的態様において、低密度リポタンパク関連タンパク質受容体ＬＲＰ１のようなクリアランス受容体の可溶性形態またはその断片は、第ＶＩＩＩ因子、第ＩＸ因子または第Ｘ因子のクリアランス受容体への結合を阻害し得、それによってそのインビボ半減期を延長する。
【０２３９】
ＬＲＰ１は、第ＶＩＩＩ因子のような様々なタンパク質の受容体仲介クリアランスに関与する６００ｋＤａの膜内在性タンパク質である。例えば、Ｌｅｎｔｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｉａ  １６：６−１６（２０１０）を参照されたい。ＬＲＰ１は第Ｘａ因子（例えばＮａｒｉｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ  ９１：５５５−５６０（１９９８）を参照）および第ＩＸ因子（例えばＳｔｒｉｃｋｌａｎｄ＆Ｍｅｄｖｅｄ．Ｊ．Ｔｈｒｏｍｂ．Ｈａｅｍｏｓｔａｔ．４：１４８４−１４８６（２００６）を参照のクリアランスもまた仲介する。
【０２４０】
他の好適なＦＶＩＩＩクリアランス受容体は、例えば、ＬＤＬＲ（低比重リポタンパク質受容体）、ＶＬＤＬＲ（超低比重リポタンパク質受容体）、およびメガリン（ＬＲＰ−２）、またはそれらの断片である。例えば、Ｂｏｖｅｎｓｃｈｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ  １０６：９０６−９１２（２００５）、Ｂｏｖｅｎｓｃｈｅｎ，Ｂｌｏｏｄ  １１６：５４３９−５４４０（２０１０）、Ｍａｒｔｉｎｅｌｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ  １１６：５６８８−５６９７（２０１０）を参照されたい。
【０２４１】
２．可視化および箇所
ある実施形態において、異種部分は本発明のプロコアグラント化合物の可視化または位置特定を容易にする。可視化または位置特定を容易にする、化合物への挿入または抱合のための、無数のペプチドまたは他の部分は、当該技術分野で公知である。かかる部分を使用して、インビトロ、インビボ、エクスビボ、またはそれらの任意の組み合わせで、可視化または位置特定を容易にすることができる。
【０２４２】
トロンビンが凝血カスケードにおいて中心的役割を果たすため、そのインビボ活性の画像撮像の検出は非常に望ましい。従って、様々な異種部分が本発明のプロコアグラント化合物の可視化または位置特定を容易にする（例えば蛍光色素）本明細書のプロコアグラント化合物に操作され得る。いくつかの実施形態において、蛍光色素はそれらのアミンがトロンビン切断の際に再生するまで非蛍光であるように操作され得る。
【０２４３】
可視化または位置特定を可能にするペプチドまたはポリペプチドの非限定的な例としては、アビジンベースおよびストレプトアビジンベースの試薬の複合体化を容易にし得るビオチンアクセプターペプチド、結合されたリポ酸へのチオール反応性プローブの複合体化またはリポ酸または蛍光リポ酸類似体の直接のライゲーションを容易にし得るリポ酸アクセプターペプチド、蛍光タンパク質、例えば、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）およびその変異体（例えば、ＥＧＦＰ、ＥＹＦＰ等のＹＦＰ、ｍＶｅｎｕｓ、ＹＰｅｔもしくはＣｉｔｒｉｎｅ、またはＣｅｒｕｌｅａｎもしくはＥＣＦＰ等のＣＦＰ）もしくは赤色蛍光タンパク質（ＲＦＰ）、４’，５’−ビス（１，３，２−ジチオアルソラン−２−イル）フルオレセイン（ＦｌＡｓＨ）等の二ヒ素色素のライゲーションのためまたは準安定テクネチウム複合体化のためのシステイン含有ペプチド、蛍光共鳴エネルギー移動（ＦＲＥＴ）ベースの近接アッセイのためのユ−ロピウムクラスレート複合体化のためのペプチド、それらの任意の変異体、ならびにそれらの任意の組み合わせが挙げられる。
【０２４４】
これらの技法によって標識される本開示のプロコアグラント化合物は、例えば、病理学的血栓形成および溶解の３Ｄ画像撮像、プロコアグラント悪性病変における腫瘍画像撮像、血液および血漿におけるプロコアグラント微小粒子の流動細胞定量および特徴付け、生体内顕微鏡による血栓形成の観察のために使用され得る。
【０２４５】
３．標的部分、アンカーおよび他の部分
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、化合物を特異的位置に、例えば、化合物の凝血因子または凝血促進ペプチドを凝固の部位（「標的部分」）に位置特定することにより化合物の有効性を増強するために血小板に、標的にする、異種部分を含み得る。いくつかの実施形態において、標的部分は血小板上に発現する標的分子に結合する。好適には標的分子は血小板以外の細胞または組織上には発現しない、すなわち標的部分は血小板に特異的に結合する。
【０２４６】
一実施形態において、休止血小板上に見られる受容体／配座が標的にされる。そうすることにより、凝固の部位は増強した有効性を獲得し得る。かかる分子を標的にすることはさらに凝血因子の半減期を延長し得、および／またはクリアランスを防止し得る。かかる対象の例は、ＧｐＩｂ／Ｖ／ＩＸ複合体のＧｐＩｂ、およびＧｐＶＩおよびＧＰＩＩｂ／ＩＩＩａの非活性形態を含む。例えば、Ｓｃｈｗａｒｚ  ｅｔ  ａｌ．Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ．９９：２５−３３（２００６）、米国特許出願公開第２００７０２１８０６７号、Ｐｅｔｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｈｅｍｏｓｔａｓｉｓ，Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ，ａｎｄ  Ｖａｓｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  １０１：９３７（２００３）、ＷＯ２０１０１１５８６６号、Ｌｉｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ  ａｎ  Ｈａｅｍｏｓｔａｓｉｓｄ  ８：１７７３（２０１０）を参照されたい。
【０２４７】
本発明のプロコアグラント化合物は、１つまたは２つ以上の標的部分を含み得る。いくつかの実施形態において、２つ以上の標的部分が互いに（例えばリンカーによって）結合し得る。２つ以上の標的部分が本発明のプロコアグラント化合物において存在する場合、標的部分は同じまたは異なり得る。
【０２４８】
一実施形態において、標的部分は、標的部分を除去するために血餅の部位にて切断され得るプロテアーゼ切断可能リンカーによって、本発明のプロコアグラント化合物に融合される。別の実施形態において、標的部分は切断可能リンカーによって付着されず、従って血餅の部位にて切断されない。
【０２４９】
一実施形態において、標的部分はプロコアグラント化合物のＮまたはＣ末端上に位置する。一実施形態において、標的部分は直接本発明のプロコアグラント化合物に遺伝融合されず、むしろ構築物にリンカーまたは化学結合によって化学的に結合する（例えば米国特許第７，３８１，４０８号を参照）。
【０２５０】
一実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は少なくとも１つの抗原結合部位（例えば、抗体、抗体変異体、または抗体断片の抗原結合部位）、ポリペプチド、リガンドの受容体結合部、または血小板、例えば休止血小板もしくは活性血小板に特異的に結合する受容体のリガンド結合部を含む。例示的な標的部分は、ｓｃＦｖ分子または標的にされる分子に結合するペプチドを含む。
【０２５１】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、アンカーまたは足場分子、例えば、脂質、炭水化物またはスルフヒドリル基を含む。例えば、Ｎ末端システインにおけるスルフヒドリル基は、本発明のプロコアグラント化合物を別の分子、細胞、または他の表面に固定するために使用され得る。例えば、脂質アンカーは本発明のプロコアグラント化合物を細胞表面または脂質２重層（例えばリポソーム）に固定するために使用され得る。
【０２５２】
いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物は、出血障害の治療に有益な非ペプチド活性剤を含む異種分子を含み得る。いくつかの実施形態において、非ペプチド活性剤はプロコアグラント分子である。いくつかの実施形態において、非ペプチド活性剤は小分子薬品である。
【０２５３】
ＩＩＩ．薬学的組成物
本発明は、少なくとも１つの本発明のプロコアグラント化合物および薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物もまた提供する。
【０２５４】
用語「薬学的に許容される担体」は、当該技術分野で公知の全ての薬学的に許容される成分を意味し、典型的に非活性成分と考えられる。用語「薬学的に許容される担体」は、例えば、溶媒、固体または液体希釈剤、添加剤、ビヒクル、補助剤、賦形剤、流動促進剤、結合剤、造粒剤、分散剤、懸濁化剤、  湿潤剤、平滑剤、崩壊剤、可溶化剤、安定化剤、防腐剤、乳化剤、増量剤、防腐剤（例えば抗酸化剤）、香味剤、甘味剤、増粘剤、緩衝剤、着色剤等をそれらのあらゆる混合物と同様に含む。例示的な担体（すなわち賦形剤）はＨａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ  Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ，Ｖｏｌｕｍｅｓ  １−６，Ｎｉａｚｉ，Ｓａｒｆａｒａｚ  Ｋ．，Ｔａｙｌｏｒ＆Ｆｒａｎｃｉｓ  Ｇｒｏｕｐ  ２００５に記載され、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０２５５】
薬学的組成物は、水、緩衝剤（例えば、中性緩衝食塩水またはリン酸緩衝食塩水）、エタノール、鉱物油、植物油、ジメチルスルホキシド、炭水化物（例えば、グルコース、マンノース、スクロースまたはデキストラン）、マンニトール、タンパク質、補助剤、ポリペプチドまたはグリシンのようなアミノ酸、抗酸化剤、ＥＤＴＡのようなキレート剤またはグルタチオンおよび／または防腐剤のうちの１つ以上を追加で含み得る。
【０２５６】
薬学的組成物は投与のあらゆる適切な様式、例えば局所（例えば、経皮または眼球）、経口、頬測、経鼻、経膣、直腸または非経口投与のために製剤され得る。
【０２５７】
本明細書で使用される非経口という用語は、皮下、皮内、血管内（例えば、静脈内）、筋肉内、脊髄、頭蓋内、鞘内、眼球内、眼周囲、眼窩内、滑液嚢内、および腹腔内注射、ならびに任意の同様の注射または注入法を含む。皮下、腹腔内、頬測、静脈内および他の非経口製剤は無菌および無内毒素であることが好適である。本開示のプロコアグラント化合物は無菌媒質において非経口的に投与され得る。
【０２５８】
プロコアグラント化合物は、使用するビヒクルおよび濃度に依存し、ビヒクル中に懸濁または溶解し得る。一実施形態において、局所麻酔剤のような補助剤、防腐剤および緩衝剤は、ビヒクル中に溶解し得る。一実施例において、本発明のプロコアグラント化合物は、非静脈内経路を使用して、例えば、皮下、経鼻、頬測、経口または肺内送達によって被験体に投与される。
【０２５９】
経口使用に適切な形態は、例えば、タブレット、トローチ、ロゼンジ、水性もしくは油性懸濁剤、分散性粉末もしくは顆粒、乳剤、硬もしくは軟カプセル、またはシロップもしくはエリキシルを含む。本明細書で提供される化合物は、凍結乾燥物として製剤され得る。
【０２６０】
薬学的組成物は、例えば、懸濁剤、乳剤、持続放出製剤、クリーム、ゲルまたは粉末でもあり得る。薬学的組成物は伝統的な結合体およびトリグリセリドのような担体を伴い坐薬としても製剤され得る。
【０２６１】
一実施例において、薬学的組成物は液体製剤、例えば、緩衝、等張性、水性溶液である。一実施例において、薬学的組成物は生理的であるまたは生理的に近いｐＨを有する。別の実施例において、水性製剤は生理的または生理的に近いモル浸透圧濃度および塩分を有する。それは、塩化ナトリウムおよび／または酢酸ナトリウムを含有し得る。
【０２６２】
経口使用を意図する薬学的組成物は薬学的組成物の製造のための公知のあらゆる方法に従って製剤し得る。かかる薬学的組成物は、薬学的に優れ、味の良い製剤を提供するために、甘味剤、香味剤、着色剤、および防腐剤から成る群から選択される、１つ以上の剤を含有し得る。タブレットはタブレットの製造に適切な、無毒性の、薬学的に許容される賦形剤との混和物において、活性成分を含有し得る。それらの賦形剤は、例えば、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、ラクトース、リン酸カルシウム、またはリン酸ナトリウムのような、不活性な希釈剤、造粒剤および崩壊剤、例えば、コーンスターチ、またはアルギン酸、結合剤、例えばデンプン、ゼラチンまたはアカシア、および平滑剤、例えばステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸もしくは滑石であり得る。タブレットは非被覆であり得、または公知の技法によって被覆し得る。いくつかの場合において、かかる被覆は、消化管における崩壊および吸収を遅延させ、それによって長期間にわたる持続作用を提供するために、公知の技法によって製剤し得る（すなわちタブレットは経腸的に被覆し得る）。例えば、グリセリルモノステレートまたはジステアリン酸グリセリルのような時間遅延物質が用いられ得る。
【０２６３】
経口使用のための薬学的組成物は、活性成分が不活性固体希釈剤、例えば炭酸カルシウム、リン酸カルシウムもしくはカオリンと撹拌される硬ゼラチンカプセルとして、または、活性成分が水もしくは油媒質、例えばピーナッツ油、液体パラフィン、もしくはオリーブ油と撹拌される軟ゼラチンカプセルとしてもまた提供され得る。別の実施例において、活性成分は任意に被覆された微小タブレットまたはマイクロペレットを含有するカプセルにおいて製剤する。経口使用のための薬学的組成物はロゼンジとしてもまた提供し得る。
【０２６４】
水性懸濁剤は水性懸濁剤の製造に適切な賦形剤との混和物において活性成分（複数可）を含有する。かかる賦形剤は、懸濁化剤（例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロプロピルメチルセルロース、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン、トラガカントガムおよびアカシアガム）、および分散または湿潤剤（例えば、レシチンのような自然発生リン脂質、ポリオキシエチレンステアレートのような脂肪酸を伴うアルキレンオキシドの縮合物、ヘプタデカエチレンオキシセタノールのような長鎖脂肪族アルコールを伴うエチレンオキシドの縮合物、ポリオキシエチレンソルビトールモノオレエートのような脂肪酸およびヘキシトールから誘導された部分エステルを伴うエチレンオキシドの縮合物、またはポリエチレンソルビタンモノオレエートのような脂肪酸およびヘキシトール無水物から誘導された部分エステルを伴うエチレンオキシドの縮合物）を含む。水性懸濁剤はさらに１つ以上の防腐剤、例えばエチル、またはｎ−プロピルｐ−ヒドロキシベンゾエート、１つ以上の着色剤、１つ以上の香味剤、および１つ以上のスクロースやサッカリンのような甘味剤を含み得る。
【０２６５】
油性懸濁剤は、活性成分を、植物油、例えば、落花生油、オリーブ油、ゴマ油もしくはココナッツ油、または液体パラフィンのような鉱物油において、懸濁することにより製剤し得る。油性懸濁液は、糊剤、例えば、蜜蝋、固形パラフィン、またはセチルアルコールを含有し得る。甘味剤および香味剤は、味の良い経口製剤を提供するために加えられ得る。これらの組成物は、アスコルビン酸等の抗酸化体の添加によって保存し得る。
【０２６６】
水の添加により水性懸濁剤の製剤に適切な分散性粉末または顆粒は、混和物における活性成分に、分散剤、または湿潤剤、懸濁化剤、および１つ以上の防腐剤を提供し得る。適切な分散剤、または湿潤剤、または懸濁化剤は、すでに上述のものにより例示する。さらなる賦形剤、例えば、甘味剤、香味剤、および着色剤がまた存在してもよい。
【０２６７】
本開示の薬学的組成物は水中油乳剤の形態でもあり得る。油相は植物油または鉱物油またはこれらの混合物であり得る。適切な乳化剤は自然発生ガム、例えばアカシアガムまたはトラガカントガム、自然発生リン脂質、例えば大豆、レシチン、ならびに、脂肪酸およびヘキシトール無水物から誘導したエステル、または部分エステル、例えばソルビタンモノオレエート、ならびに、上述のエチレンオキシドを伴う部分エステルの縮合物、例えばポリオキシエチレンソルビタンモノオレエートであり得る。乳剤は甘味剤および香味剤もまた含有し得る。
【０２６８】
シロップおよびエリキシルは甘味剤、例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ソルビトール、グルコースまたはスクロースで製剤し得る。かかる製剤は、粘滑剤、防腐剤、香味剤または着色剤をさらに含有し得る。薬学的組成物は無菌の注射可能な水性または油性の懸濁剤の形態であり得る。この懸濁剤は公知の技術に従い、上述の適切な分散剤、または湿潤剤、および懸濁化剤を使用して製剤し得る。無菌で注射可能な製剤は、無毒性で親として許容可能な希釈剤または溶媒における、無菌で注射可能な溶液、もしくは懸濁剤、例えば１，３−ブタンジオールにおける溶液としてあり得る。用いられ得る許容可能なビヒクルおよび溶剤には、水、リンガー液、および等張食塩水がある。さらに、無菌で不揮発性の油が、慣習的に溶剤または懸濁化媒質として用いられる。この目的で、合成モノまたはジグリセリドを含む、あらゆる無刺激の不揮発性油が用いられ得る。さらに、オレイン酸のような脂肪酸も注射剤の製剤において用途が見られる。
【０２６９】
本開示のプロコアグラント化合物は、例えば、薬剤の直腸内投与のために、坐薬の形態においても投与され得る。これらの薬学的組成物は、薬剤を、常温では固体であるが直腸温度では液体になり、故に薬剤を放出するために直腸内で溶ける、適切な非刺激賦形剤と撹拌することにより、製剤し得る。かかる物質はカカオバターおよびポリエチレングリコールを含む。
【０２７０】
本開示のプロコアグラント化合物は、皮膚、傷もしくは眼の内部のような粘膜への局所適用のような、局所（ｌｏｃａｌ）または局所（ｔｏｐｉｃａｌ）投与のために製剤され得る。局所投与のための製剤は典型的に、活性剤（複数可）と組み合わされた局所ビヒクルを、追加的な任意の成分を伴ってまたは伴わずに含む。適切なビヒクルおよび追加の成分は当該技術分野で公知であり、ビヒクルの選択が送達の特定の物理的形態および様態に依存するということは明らかである。局所ビヒクルは、水、アルコールのような有機溶剤（例えば、エタノールまたはイソプロピルアルコール）、またはグリセリン、グリコール（例えば、ブチレン、イソプレンまたはプロピレングリコール）、脂肪族アルコール（例えばラノリン）、水および有機溶剤の混合物、ならびにアルコール、およびグリセリンのような有機溶剤の混合物；脂肪酸、アシルグリセロール（油、例えば鉱物油、および自然または合成由来の脂肪を含む）、ホスホグリセリド、スフィンゴ脂質およびワックスのような脂質系物質、コラーゲンおよびゼラチンのようなタンパク質系物質、シリコン系物質（不揮発性および揮発性の両方）、ならびにマイクロスポンジおよびポリマーマトリクスのような炭水化物系物質を含む。
【０２７１】
組成物は、安定化剤、懸濁化剤、乳化剤、粘度調整剤、ゲル化剤、防腐剤、抗酸化剤、皮膚浸透性増進剤、湿潤剤および持続放出物質のような、適用される製剤の安定性または効果性を改善するために用いられる１つ以上の成分をさらに含み得る。かかる成分の例は、Ｍａｒｔｉｎｄａｌｅ−−Ｔｈｅ  Ｅｘｔｒａ  Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ（Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｐｒｅｓｓ，Ｌｏｎｄｏｎ  １９９３）およびＭａｒｔｉｎ（ｅｄ．），Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓにおいて記載される。製剤はヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチンマイクロカプセル、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルション、ナノ粒子、またはナノカプセルのような、マイクロカプセルを含み得る。
【０２７２】
目への局所投与に適切な薬学的組成物は、活性成分が適切な担体、特に活性成分の水性溶剤において溶解または懸濁される、点眼薬もまた含み得る。抗炎症性活性成分は、例えば、０．５から１０％のような、濃度０．５％から２０％、例えば約１．５％ｗ／ｗにおける製剤において、例えば存在し得る。治療目的で、本開示の活性化合物は、通常、示された投与経路に適切な１つ以上の補助剤と組み合わせる。本開示の化合物は、ラクトース、スクロース、デンプン散剤、アルカン酸のセルロースエステル、セルロースアルキルエステル、滑石、ステアリン酸、ステアリン酸マグネシウム、酸化マグネシウム、リン酸および硫酸のナトリウムおよびカルシウム塩、ゼラチン、アカシアガム、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン、および／またはポリビニルアルコールで混和し得、その後便利な投与のためにタブレット化またはカプセル化し得る。かかるカプセルまたはタブレットは、ヒドロキシプロピルメチルセルロースにおける活性化合物の分散において提供し得るような制御放出製剤を含有し得る。
【０２７３】
非経口投与のための製剤は、水性または非水性の、等張性無菌注射溶液または懸濁剤の形態であり得る。これらの溶液および懸濁剤は、経口投与の製剤における使用のために言及した担体、または希釈剤のうちの、１つ以上を有する、無菌粉末または顆粒から製剤し得る。本開示の化合物は、水、ポリエチレングリコール、プロピレングリコール、エタノール、トウモロコシ油、綿実油、ピーナッツ油、ゴマ油、ベンジルアルコール、塩化ナトリウム、および／または様々な緩衝剤において溶解し得る。投与の他の補助剤および様態は、薬学分野において広く公知である。
【０２７４】
あるいは、活性成分は水中油クリーム基剤を伴うクリームにおいて製剤され得る。所望であれば、クリーム基剤の水性相は、例えば、少なくとも３０％ｗ／ｗのプロピレングリコール、ブタン−１、３−ジオール、マンニトール、ソルビトール、グリセロール、ポリエチレングリコール、およびそれらの混合物のような、多価アルコールを含み得る。局所投与は、望ましくは、活性成分の、皮膚または他の患部を介する、吸収または浸透を増進する化合物を含み得る。かかる経皮浸透増進剤の例は、ジメチルスルホキシドおよび関連する類似体を含む。本開示の化合物は経皮装置によって投与し得る。一実施形態において、局所投与は、リザーバー、および多孔性膜型、または固体マトリクス変異体の、いずれかのパッチを使用して達成し得る。いずれの場合においても、活性剤は、リザーバー、またはマイクロカプセルから、膜を介して、受容者の皮膚または粘膜と接触する活性剤浸透性粘着剤へと持続的に送達される。
【０２７５】
活性剤が皮膚を介して吸収される場合、活性剤の制御された一定の流れが受容者に投与される。マイクロカプセルの場合は、カプセル化剤は膜としても機能し得る。経皮パッチは、アクリル乳剤、およびポリエステルパッチのような、接着系を伴う適切な溶剤系において本開示の化合物を含み得る。本開示の乳剤の油相は、公知の物質により、公知の様式で構成し得る。相は乳化剤のみを含み得る一方で、少なくとも１つの乳化剤と、脂肪もしくは油との、または脂肪および油の両方との混合物を含み得る。一実施形態において、疎水性乳化剤は、安定化剤の役割をする親油性乳化剤と共に含まれる。相は、例えば、油と脂肪両方を含む。一緒になり、安定化剤（複数可）を伴うまたは伴わない乳化剤（複数可）は、いわゆる乳化ろうを作り、油および脂肪を共に伴うワックスは、クリーム製剤の油性分散層を形成する、いわゆる乳化軟膏基剤を作る。
【０２７６】
本開示の製剤における使用に適切な、乳化剤および乳剤安定化剤は、Ｔｗｅｅｎ  ６０、Ｓｐａｎ  ８０、セトステアリルアルコール、ミリスチルアルコール、モノステアリン酸グリセリン、およびラウリル硫酸ナトリウムなどである。薬学的乳剤製剤に使用されると見られるほとんどの油において、活性化合物の溶解度が非常に低いため、製剤のための適切な油または脂肪の選択は、所望の表面的な性質を達成することに基づく。従って、クリームは、例えば、脂っぽくない、非染色性であって水で落ちる、チューブまたは他の容器からの漏れを防ぐための適切な濃度を有する生成物であり得る。直鎖または分枝鎖、１または２塩基アルキルエステル、例えば、ジイソアジペート、ステアリン酸イソセチル、ヤシ油脂肪酸のプロピレングリコールジエステル、ミリスチン酸イソプロピル、オレイン酸デシル、パルミチン酸イソプロピル、ステアリン酸ブチル、パルミチン酸２−エチルヘキシルまたは分枝鎖の混合物が使用され得る。これらは、要求される性質に依存し、単独または組み合わせで使用され得る。あるいは、白軟パラフィン、および／または液体パラフィン、または他の鉱物油のような、高い融点を有する脂質が使用され得る。
【０２７７】
薬学的組成物は、スプレー、ミスト、またはエアロゾルを含む、吸入製剤として製剤され得る。吸入製剤としては、本明細書で提供される化合物は、当業者に公知のあらゆる吸入方法によって送達し得る。かかる吸入方法および装置は、ＣＦＣもしくはＨＦＡのような噴霧剤、または生理的および環境的に許容可能な噴霧剤を伴う定量吸入器を含むが、これらに限られない。他の適切な装置は、呼吸作動型吸入器、多用量型ドライパウダー吸入器、およびエアロゾル噴霧器である。被験体における使用のためのエアロゾル製剤は、噴霧剤、界面活性剤、および共溶剤を典型的に含み、適切な絞り弁によって閉まる、慣習的なエアロゾル容器に入れられ得る。
【０２７８】
吸入または吹送に適切な製剤は、薬学的に許容される水性もしくは有機溶媒中の溶液および懸濁剤、またはそれらの混合物、ならびに粉末を含む。液体または固体組成物は、上述の、適切で薬学的に許容される賦形剤を含有し得る。化合物は経口または経鼻呼吸経路により、局所効果または全身効果のために投与され得る。化合物は、不活性ガスの使用によって噴霧し得、または気化して噴霧／気化装置から直接発散されるか、または、噴霧装置は覆面テントもしくは間欠的陽圧呼吸機に付着し得る。
【０２７９】
吸入組成物は、噴霧化および気管支内での使用に適切な活性成分を含有する、液体もしくは粉末組成物、または定量を分注するエアロゾル単位によって投与される、エアロゾル組成物を含み得る。適切な液体組成物は、水性で薬学的に許容される吸入用剤、例えば等張食塩水または静菌性水において活性成分を含む。溶液は、ポンプもしくは圧搾作動型噴霧スプレーディスペンサの手段によって、または液体組成物の必要な投与量を患者の肺に吸入させることを引き起こすもしくは可能にするあらゆる他の慣習的な手段によって、投与される。担体が液体である、投与のための、例えば鼻噴霧または点鼻薬としての、適切な製剤は、活性成分の水性もしくは油性の溶液を含む。
【０２８０】
担体が固体である、経鼻投与に適切な製剤もしくは組成物は、例えば２０から５００ミクロンの範囲の粒子を有し、嗅ぎタバコが投与される様式（すなわち鼻の近くで保持された粉末の容器からの鼻道を介した急速吸入）で投与される粗末を含む。適切な粉末組成物は、実例として、ラクトースまたは他の気管支内投与に許容可能な不活性粉末と完全に混合した、活性成分の粉末調製を含む。粉末組成物はエアロゾルディスペンサによって投与し得るか、または、カプセルに穴を開け吸入に適切な規則的な流れに粉末を放出する装置へと患者によって挿入される、破壊可能なカプセルに入れられ得る。
【０２８１】
薬学的組成物は、持続放出製剤（すなわち、投与後に修飾因子の遅い放出を引き起こすカプセルのような製剤）として製剤され得る。かかる製剤は一般的に公知の技術を使用して調製し得、例えば、経口、直腸内、もしくは皮下埋め込みによって、または所望の標的部位での埋め込みによって投与し得る。かかる製剤内での使用のための担体は、生体適合性であり、生分解性でもあり得、好適には、製剤は修飾因子放出の相対的に一定のレベルを提供する。持続放出製剤内に含有される修飾因子の量は、例えば、埋め込みの部位、放出の速度および予測期間、ならびに、治療または防止される容態の本質に依存する。
【０２８２】
一実施例において、本明細書において提供する薬学的製剤は、１つ以上の追加の活性剤（すなわち他の生物学的活性成分）を含み得る。一実施例において、追加の活性剤は、血友病Ａのような凝固障害の治療に承認された公知の薬剤から選択される。例えば、薬学的製剤は、血液凝固因子をさらに含み得る。
【０２８３】
薬学的組成物は、生物学的利用能を改善するために、有機溶媒のような剤を伴い製剤し得る。例えば、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ  ＥＬ．ＲＴＭ．（製品番号００６４７／１／６３、ＢＡＳＦ  Ａｋｔｉｅｎｇｅｓｅｌｌｓｃｈａｆｔ，Ｇｅｒｍａｎｙ）は、３５モルのエチレンオキシドをヒマシ油のそれぞれのモルで反応させることにより調製する、ポリエトキシ化ヒマシ油である。それは水性系における無極性物質の乳剤を安定化するために使用され得る。あるいは、ペプチド、ペプチド誘導体、または二重ペプチドが、生物学的利用能の改善のために、内部に組み込まれ得るか、またはタンパク性のミクロもしくはナノ粒子に結合し得る。
【０２８４】
適切なミクロおよびナノ粒子は、米国特許第５，４３９，６８６号（Ｄｅｓａｉ  ｅｔ  ａｌ；Ｖｉｖｏｒｘ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，ＣＡ）および米国特許第５，４９８，４２１号（Ｇｒｉｎｓｔａｆｆ  ｅｔ  ａｌ；Ｖｉｖｏｒｘ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．，ＣＡ）において記載される。適切に、タンパク性ナノ粒子は、ヒト血清アルブミン、特にヒト血清アルブミン、またはその組換え形態を含む。ＷＯ  ２００７／０７７５６１号（Ｇａｂｂａｉ；Ｄｏ−Ｃｏｏｐ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｌｔｄ．，Ｉｓｒａｅｌ）は、ナノ構造および液体を含む別の適切な担体を記載し、そこにおいてＮＥＯＷＡＴＥＲ（商標）と称される。
【０２８５】
獣医の使用には、本開示の化合物は、標準獣医実務に従う、適切に許容可能な製剤として投与され、獣医は特定の動物に最も適切であろう投与レジメンおよび投与経路を決定する。非ヒト動物への投与には、本開示の化合物は、動物のエサまたは飲み水に添加され得る。動物のエサおよび飲み水の組成物を製剤することは好都合であり得、動物が食事と共に治療的に適切な量の組成物を接種するようになる。エサまたは飲み水への添加のためのプレミックスとして組成物を提示することもまた好都合であり得る。
【０２８６】
１日当たり、体重１キログラム当たり、約０．００５ｍｇから約８０ｍｇの投与量レベルは、本明細書に記載する疾患または容態の治療において有益である（例えば、体重７０ｋｇの平均的大人に基づき、１日当たり、ヒト患者当たり、約０．３５ｍｇから約５．６ｇ）。単一の投与量形態を生成するために、担体物質と組み合わされ得る活性成分の量は、治療する宿主および投与の特定様式に依存して変化する。投与量単位形態は約１ｍｇから約５００ｍｇの間の活性成分を一般的に含有する。１日の投与量は、１日当たり１から４回の投与量で投与し得る。皮膚疾患の場合には、例えば、それは本開示の化合物の局所調製として、患部に１日当たり１から４回塗布され得る。
【０２８７】
しかしながら、あらゆる特定の罹患者の具体的な投与量レベルは、用いられる具体的な化合物の、活性、年齢、体重、一般健康状態、性別、食事、投与の時刻、投与の経路、および排泄の速度、薬剤の組み合わせ、および治療下の特定の疾患の重症度を含む、様々な因子に依存する。
【０２８８】
ＩＶ．製造方法
本開示のプロコアグラント化合物は、化学合成、組換えＤＮＡ技術、より大きい分子の生化学的または酵素的断片化、前述のものの組み合わせまたはあらゆる他の方法によって生成し得る。
【０２８９】
一実施例において、方法は、化合物のアミノ酸配列、またはそのレトロ、インベルソ、またはレトロ−インベルソ変異体を、固相ペプチド合成を使用して形成する工程を含む。本発明のプロコアグラント化合物を製造する例示的方法は、本明細書の実施例１において記載する。合成ペプチドを形成する他の方法は当業者に公知である。
【０２９０】
例えば、本開示のプロコアグラント化合物は“Ｆｍｏｃ  Ｓｏｌｉｄ  Ｐｈａｓｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ−Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ”，ｅｄｉｔｅｄ  ｂｙ  Ｗ．Ｃ．Ｃｈａｎ，Ｐ．Ｄ．Ｗｈｉｔｅ，Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  ２０００、およびその参照文献において記載されるように、固相ペプチド合成を使用して合成し得る。一時的なＮ−アミノ基保護は、例えば９−フルオレニルメチルオキシカルボニル（Ｆｍｏｃ）基によって可能にされる。この非常に基不安定性の保護基の反復的切断は、例えばＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミドにおける２０％ピペリジンを使用することで生じる。側鎖機能性は、それらのブチルエーテル（セリン、トレオニンおよびチロシンの場合）、ブチルエステル（グルタミン酸およびアスパラギン酸の場合）、ブチルオキシカルボニル誘導体（リジンおよびヒスチジンの場合）、トリチル誘導体（システイン、アスパラギンおよびグルタミンの場合）、ならびに、４−メトキシ−２，３，６−トリメチルベンゼンスルホニル誘導体（アルギニンの場合）として保護し得る。
【０２９１】
固相支持体は、３つのモノマー、ジメチルアクリルアミド（骨格モノマー）、ビスアクリロイルエチレンジアミン（架橋剤）、およびアクリロイルサルコシンメチルエステル（機能化剤）から構成される、ポリジメチルアクリルアミドポリマーに基づき得、または、リンクアミドレジン（例えばＮｏｖａＰＥＧ  Ｒｉｎｋ  Ａｍｉｄｅ）のようなポリエチレングリコール（ＰＥＧ）に基づき得る。ペプチド−レジン間の切断可能な結合剤は、酸不安定性の４−ヒドロキシメチル−フェノキシ酢酸誘導体、またはＣ末端アミドの場合はリンク−アミドリンカーであり得る。全てのアミノ酸誘導体は、逆性Ｎ，Ｎ−ジシクロヘキシル−カルボジイミド／１−ヒドロキシベンゾトリアゾール仲介の結合手順を使用して添加される、アスパラギンおよびグルタミンを除き、予備形成の対称的な無水物誘導体として添加され得る。
【０２９２】
あるいは、Ｏ−ベンゾトリアゾール−Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチル−ウロニウム−ヘキサフルオロ−ホスフェート（ＨＢＴＵ）、または２−（６−クロロ−１−Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルアミニウムヘキサフルオロホスフェート（ＨＣＴＵ）のような、他のペプチド結合試薬が使用され得る（例えば原位置において）。結合および脱保護反応は、ニンヒドリン、トリニトロベンゼンスルホン酸、またはイソチン試験法を使用して観察し得る。合成の完成の際、例えば、約５〜５０％のスカベンジャーを含有する９５％のトリフルオロ酢酸での処理により、側鎖保護基の随伴性除去を伴い、ペプチドはレジン支持体から切断される。一般的に使用されるスカベンジャーは、ＴＩＰＳ（トリイソプロピルシラン）、エタンジチオール、フェノール、アニソール水、およびそれらの混合物である。正確な選択は、合成されているペプチドの構成成分アミノ酸に依存する。メチオニン含有ペプチドには、例えばＴＩＰＳ（例えば２〜５％）およびエタンジチオール（例えば２〜５％）の混合物を使用し得る。
【０２９３】
その後、粗ペプチドを生じさせるジエチルエーテルでの後続の粉砕を伴い、トリフルオロ酢酸は真空内での気化により除去され得る。存在するあらゆるスカベンジャーは、水相の凍結乾燥の際に無スカベンジャーの粗ペプチドを生じさせる、単純な抽出手順によって除去され得る。
【０２９４】
ペプチド合成のための試薬は、例えばＣａｌｂｉｏｃｈｅｍ−Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ（英国）、またはＥＭＤ４Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ（米国）から、一般的に入手可能である。
【０２９５】
ペプチドの精製は、分子ふるいクロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、溶解度差、および逆相高速液体クロマトグラフィーのような技術の、いずれかまたは組み合わせによって生じ得る。ペプチドの分析は、薄層クロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、質量分析（例えばＬＣ−ＭＳ）、酸加水分解後のアミノ酸分析を使用して、および高速原子衝撃（ＦＡＢ）質量分析法によって実行し得る。
【０２９６】
連続的なセルロース膜上の、ペプチドの位置的なアドレス指定可能な化学合成を可能にする、ＳＰＯＴ−合成もまた使用し得る（例えば、Ｒ．Ｆｒａｎｋ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ（１９９２）４８，９２１７を参照）。
【０２９７】
プロコアグラントペプチドが特に大きい、例えば５０個のアミノ酸より大きいまたは１００個のアミノ酸より大きい場合、本開示のプロコアグラント化合物は半組換え的に作られ得る（例えば米国特許第７，３８１，４０８号、Ｄａｗｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．６９：９２３−９６００（２０００）、Ｍｅｉ，Ｂ．ｅｔ．ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ  １１６：２７０−２７９（２０１０）、および米国特許出願公開ＵＳ２００６／０１１５８７６号を参照されたく、これらのそれぞれはその全体が本明細書に組み込まれる）。一実施形態において、凝血因子またはプロコアグラントポリペプチドは組換え的に生成され、その後切断可能基質および自己犠牲スペーサーを含む中間化合物に、実施例１において本明細書に記載するように、化学連結を介して付着する。化学連結は、既定の有機化学技術、および商用的に入手可能な試薬を使用して実行し得る。
【０２９８】
本発明のプロコアグラント化合物は、当該技術分野で公知の直交抱合戦略を使用して、本明細書に開示する異なる部分（例えば、ポリペプチド、異種部分、リンカー、プロテアーゼ切断可能基質等）を抱合することにより組み立て得る。いくつかの実施形態において、かかる戦略は、例えば、アルキン、アジド、Ｎ末端Ｃｙｓ、歪みアルキン、ケトン、アルデヒド、テトラジン−トランス−シクロオクテン、およびそれらの組み合わせを含む。
【０２９９】
一態様において、本発明のプロコアグラント化合物は、プロテアーゼ切断可能部位、例えばＳＵＭＯを含む切断可能なポリペプチドを使用することによって生成し得る。小さいユビキチン様修飾因子（またはＳＵＭＯ）は、ユビキチン（Ｕｂ）、およびユビキチン様（Ｕｂｌ）ファミリーのメンバーである。翻訳後のＳＵＭＯの標的タンパク質への付着は、ユビキチン抱合カスケード（Ｅ１−Ｅ２−Ｅ３酵素）に類似する酵素カスケードを介して生じ、最終的にＵｂ／Ｕｂｌ  Ｃ末端残基と基質リジン残基との間の、イソペプチド結合の形成をもたらす。
【０３００】
高活性システイニルプロテアーゼで、Ｕｌｐとしても知られるＳＵＭＯプロテアーゼは、サッカロミセスセレビシアからの、Ｕｌｐ１（Ｕｂｌ特異性プロテアーゼ１）の組換え断片である。ＳＵＭＯプロテアーゼは、アミノ酸配列ではなく、ユビキチン様（ＵＢＬ）タンパク質の３次構造、ＳＵＭＯを認識し、高度に特異的な様式で切断する。このプロテアーゼは、組換え融合タンパク質からＳＵＭＯを切断するために使用され得る。ＳＵＭＯタンパク脂質の配列は、ＳＬＱＤＳＥＶＮＱＥＡＫＰＥＶＫＰＥＶＫＰＥＴＨＩＮＬＫＶＳＤＧＳＳＥＩＦＦＫＩＫＫＴＴＰＬＲＲＬＭＥＡＦＡＫＲＱＧＫＥＭＤＳＬＲＦＬＹＤＧＩＲＩＱＡＤＱＡＰＥＤＬＤＭＥＤＮＤＩＩＥＡＨＲＥＱＩＧＧ（配列番号９０）を含む。
【０３０１】
一実施形態において、本発明に有益な切断可能ポリペプチドは、凝血因子の軽鎖と、凝血因子の切断型重鎖と、プロテアーゼ切断可能部位とを含み、プロテアーゼ切断可能部位は、凝血因子の切断型重鎖と凝血因子の軽鎖との間に挿入される。別の実施形態において、切断可能なポリペプチドは、プロテアーゼ切断可能部位と凝血因子の軽鎖との間に、細胞内プロセシング部位（本明細書においてプロタンパク質コンバターゼプロセシング部位とも称される）をさらに含む。他の実施形態において、切断可能ポリペプチドは、凝血因子の軽鎖と、プロテアーゼ切断可能部位と、凝血因子の切断型重鎖と、異種部分とを含み、プロテアーゼ切断可能部位は、凝血因子の軽鎖と切断型重鎖との間に挿入され、異種部分は、凝血因子の切断型重鎖に任意のリンカーによって結合する。さらに他の実施形態において、プロテアーゼ切断可能部位は、ＳＵＭＯプロテアーゼによって切断され得るＳＵＭＯを含む。
【０３０２】
いくつかの実施形態において、異種部分は半減期延長部分を含む。半減期延長部分の非制限的な例は、本明細書の他の部分で開示する。ある実施形態において、切断可能ポリペプチドのための凝血因子は、ＦＶＩＩまたはＦＸを含む。いくつかの実施形態において、凝血因子の切断型重鎖は、凝血因子の野生型重鎖と比較して、切断型重鎖のＮ末端にて１つ以上のアミノ酸を含まない。ある実施形態において、凝血因子の切断型重鎖から欠失した１つ以上のアミノ酸は、凝血因子の切断型重鎖から欠損している重鎖のＮ末端に対応する、２つのアミノ酸、３つのアミノ酸、４つのアミノ酸、５つのアミノ酸、６つのアミノ酸、７つのアミノ酸、８つのアミノ酸、９つのアミノ酸、１０個のアミノ酸、１１個のアミノ酸、１２個のアミノ酸、１３個のアミノ酸、１４個のアミノ酸、または１５個のアミノ酸である。一実施例において、切断可能なポリペプチドのための凝血因子は、第ＶＩＩ因子であり、１つ以上のアミノ酸は、ＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）である。別の実施例において、切断可能なポリペプチドのための凝血因子は、第Ｘ因子であり、１つ以上のアミノ酸は、ＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）である。
【０３０３】
ある実施形態において、本発明は、宿主細胞を、ポリペプチドを発現するために十分な条件下で切断可能ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドまたはベクターと、遺伝子導入する工程を含む、切断可能ポリペプチドを作る方法を対象とする。いくつかの実施形態において、宿主細胞はあらゆる細胞内プロセシング部位、例えば２Ｘ（ＲＫＲ）（配列番号８８）またはＲＲＲＲ（配列番号８９）をプロセシングし得るプロタンパク質コンバターゼ、例えばＰＡＣＥまたはＰＣ５をさらに発現する。
【０３０４】
いくつかの態様において、凝血因子の軽鎖と、プロテアーゼ切断可能部位と、凝血因子の短縮重鎖とを含む切断可能ポリペプチドは、プロテアーゼによって切断される。故に、切断後、結果として生じる構築物は、少なくとも２つの鎖を含み、第１の鎖は凝血因子の軽鎖を含み、第２の鎖は凝血因子の切断型重鎖を含む。いくつかの実施形態において、凝血因子の切断型重鎖は、野生型凝血因子と比較して、Ｎ末端の端にて１つ以上のアミノ酸を欠損し、それによって化学連結のためにＮ末端にてシステインを曝露する。一実施形態において、切断型重鎖から欠損しているアミノ酸は６つのアミノ酸、例えば、ＦＶＩＩのためのＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）、またはＦＸのためのＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）である。別の実施形態において重鎖から欠損しているアミノ酸は１１個のアミノ酸、例えば、ＦＶＩＩのためのＩＶＧＧＫＶＣＰＫＧＥ（配列番号８４）、またはＦＸのためのＩＶＧＧＱＥＣＫＤＧＥ（配列番号８６）である。）いくつかの実施形態において、プロテアーゼ切断可能部位はＳＵＭＯを含む。
【０３０５】
一態様において、本発明は、プロテアーゼ切断可能部位を切断するために十分な条件下で切断可能ポリペプチドをプロテアーゼと組み合わせる工程を含む、プロコアグラント化合物を作る方法を含む。別の実施形態において、方法は、切断ポリペプチドにチオエステルペプチドを添加する工程をさらに含む。チオエステルペプチドは、活性化可能凝血因子を形成し、凝血因子の切断型重鎖のＮ末端に融合し得る。一実施例において、チオエステルペプチドは、プロテアーゼ切断可能基質（Ｚｙ）を含む。別の実施形態において、チオエステルペプチドは、プロテアーゼ切断可能基質と自己犠牲スペーサー（Ｂｘ）とを含み、自己犠牲スペーサーはプロテアーゼ切断可能基質と切断型重鎖との間に挿入される。他の実施形態において、チオエステルペプチドは、プロテアーゼ切断可能基質と、自己犠牲スペーサーと、１つ以上のアミノ酸（Ｗ）とを含み、自己犠牲スペーサーは、プロテアーゼ切断可能基質と１つ以上のアミノ酸（Ｗ）との間に挿入される。一態様において、１つ以上のアミノ酸は、野生型重鎖と比較して、凝血因子の切断型重鎖から欠損しているＮ末端アミノ酸配列を含む。従って、ある実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質と、自己犠牲部分と、１つ以上のアミノ酸（例えば野生型重鎖に対応する６つのアミノ酸）とを含むチオエステルペプチドは、プロテアーゼ切断可能基質と、自己犠牲部分と、全長重鎖とを含む、プロテアーゼ切断可能凝血因子を形成する。いくつかの実施形態において、１つ以上のアミノ酸はＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）を含み、凝血因子は第ＶＩＩ因子を含む。ある実施形態において、１つ以上のアミノ酸はＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）を含み、凝血因子は第Ｘ因子を含む。他の実施形態において、１つ以上のアミノ酸は、１１個のアミノ酸、例えばＦＶＩＩのためのＩＶＧＧＫＶＣＰＫＧＥ（配列番号８４）、またはＦＸのためのＩＶＧＧＱＥＣＫＤＧＥ（配列番号８６）を含む。）さらに他の実施形態において、チオエステルペプチドは式Ｚｙ−Ｂｘ−Ｗ（Ｚｙはプロテアーゼ切断可能基質であり、Ｂｘは自己犠牲スペーサーであり、Ｗは凝血因子の切断型重鎖から欠損している１つ以上のアミノ酸である）を含む。特定の実施形態において、１つ以上のアミノ酸および凝血因子の切断型重鎖は、融合すると、凝血因子の完全重鎖になる。さらに他の実施形態において、プロテアーゼ切断可能基質は、トロンビン切断部位、例えばＤ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇを含む。さらに他の実施形態において、自己犠牲スペーサーはＰＡＢＣを含む。
【０３０６】
様々な方法が、本発明のプロコアグラント化合物への事後取り込みのための、凝血因子またはプロコアグラントペプチドを組換え的に生成するために利用可能である。組換え生成には、凝血因子またはプロコアグラントペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が、適切な発現ビヒクル、すなわち、挿入されるコード配列の転写および翻訳に必要な要素、またはＲＮＡウイルスベクターの場合は複製および翻訳に必要な要素を含有するベクターへ挿入される。凝血因子またはプロコアグラントペプチドをコードする核酸は、適切なリーディングフレームにおいてベクターへ挿入される。発現ベクターはその後、プロコアグラントポリペプチドを発現する、適切な標的細胞に遺伝子導入される。当該技術分野で公知の遺伝子導入技術は、リン酸カルシウム沈殿（Ｗｉｇｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．１９７８，Ｃｅｌｌ  １４：７２５）および電気穿孔（Ｎｅｕｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．１９８２，ＥＭＢＯ，Ｊ．１：８４１）を含むがこれらに限られない。真核細胞において本明細書に記載するプロコアグラントポリペプチドを発現するために、様々な宿主発現ベクター系が利用され得る。一実施形態において、真核細胞は、哺乳類細胞（例えば２９３細胞、ＰｅｒＣ６、ＣＨＯ、ＢＨＫ、Ｃｏｓ、ＨｅＬａ細胞）を含む動物細胞である。
【０３０７】
Ｖ．治療方法
本発明は、被験体（例えばヒト被験体）における出血疾患または障害を治療し、改良し、または防止する方法をさらに提供する。例示的な方法は、本開示のプロコアグラント化合物または薬学的組成物／製剤の治療的に効果的な量を、それを必要とする被験体に投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、本発明のプロコアグラント化合物または薬学的組成物は、被験体に経口的に投与される。
【０３０８】
本発明のプロコアグラント化合物および薬学的組成物は、予防的に使用し得る。本明細書で使用する場合、用語「予防的治療」は出血症状前の分子の投与を指す。一実施形態において、一般的な止血剤を必要とする被験体は、手術を受けているまたはこれから受けるところである。本発明のプロコアグラント化合物または薬学的組成物は、手術の前または後に、予防薬として投与し得る。本発明のプロコアグラント化合物または薬学的組成物は、手術の間または後に急性出血症状を制御するために投与し得る。手術は、肝移植、肝臓切除術、歯科処置、または幹細胞移植を含み得るがこれらに限られない。
【０３０９】
本発明のプロコアグラント化合物または薬学的組成物は、応需型治療にも使用し得る。用語「応需型治療」は、出血症状の症候への反応における、または出血を引き起こし得る活動の前の、本発明のプロコアグラント化合物または薬学的組成物の投与を指す。一態様において、応需型治療は、負傷後のように出血が始まるとき、または手術前のように出血が予測されるときに被験体に与えられ得る。別の態様において、応需型治療は、接触スポーツのような出血の危険性を増加する活動の前に与えられ得る。
【０３１０】
本明細書で使用する、治療する、治療、治療することは、例えば、疾患もしくは障害の重症度の減少、疾患経過の期間における減少、疾患もしくは障害に関連する１つ以上の症候の改善、疾患もしくは障害を有する被験体への必ずしも疾患もしくは障害を治療しない有益な効果の提供、または疾患もしくは障害に関連する１つ以上の症候の予防を指す。
【０３１１】
上述の実施形態のうちのいずれかに従う一実施例において、出血疾患または障害は、血液凝固障害によって引き起こされる。血液凝固障害はまた、凝血障害とも称され得る。特定の実施例において、本開示の化合物または薬学的組成物で治療され得る血液凝固障害は、血友病またはフォンウィルブランド病（ｖＷＤ）である。特定の実施例において、本開示の化合物または薬学的組成物で治療され得る血液凝固障害は、血友病Ａである。
【０３１２】
別の実施例において、出血疾患または障害に関連する出血の型は、間接血症、筋出血、口腔内出血（ｏｒａｌ  ｂｌｅｅｄ）、出血、筋肉への出血、口腔内出血（ｏｒａｌ  ｈｅｍｏｒｒｈａｇｅ）、外傷、頭部外傷、胃腸出血、頭蓋内出血、腹腔内出血、胸腔内出血、骨折、中枢神経系出血、咽頭後隙における出血、後腹膜腔における出血、および腸腰筋鞘における出血から選択される。
【０３１３】
別の実施例において、出血疾患または障害を罹患している被験体は、例えば外科的予防または周術期管理を含む、手術のための治療を必要とする。一例において、外科手術は、小手術および大手術から選択される。例となる外科的手技には、抜歯、扁桃摘出術、鼠径部ヘルニア切開術、滑膜切除術、開頭術、骨接合術、外傷外科手術、頭蓋内手術、腹腔内手術、胸腔内手術、または関節置換手術（例えば、人工膝関節全置換術、人工股関節置換手術等）、心臓手術、および帝王切開術が含まれる。
【０３１４】
凝固障害は、少なくとも１つの血液凝固因子（例えばＦＶＩＩＩ）における欠乏により引き起こされ得る。本開示は、フォンウィルブランド因子（フォンウィルブランド因子）、ＦＶ、ＦＶＩＩ、ＦＶＩＩａ、ＦＶＩＩＩ、ＦＩＸ、ＦＩＸａ、ＦＸ、ＦＸＩ、およびＦＸａ（例えば急性出血の予防および治療の両方のため）から選択される、少なくとも１つの血液凝固因子における欠乏を有する被験体（例えばヒト被験体）を治療する方法を提供する。例示的な方法は、本開示のプロコアグラント化合物または薬学的組成物の治療的に効果的な量を被験体に投与する工程を含む。
【０３１５】
上述の実施形態のうちのいずれかに従う一実施例において、被験体はヒト被験体（すなわちヒト患者）である。上述の実施形態のうちのいずれかに従う別の実施例において、被験体（例えばヒト患者）は、少なくとも１つの追加の活性剤、例えば凝固障害の治療に承認された薬剤で治療される。一実施例において、追加の活性剤は、被験体に、本開示のプロコアグラント化合物または薬学的組成物が被験体に投与されると同時に投与される。例えば、少なくとも１つの追加の活性剤は、本開示の化合物もまた含有する薬学的組成物に含まれる。別の実施例において、追加の活性剤は、被験体に、本開示の化合物とは異なる時間に、しかし治療期間内に投与される。例えば、追加の活性剤は、本開示のプロコアグラント化合物または薬学的組成物と交互に投与される。
【０３１６】
ヒト患者を含む、患者への経口および非経口投与には、本開示のプロコアグラント化合物の１日の投与量レベルは、大抵大人当たり、２から２０００ｍｇ（すなわち約０．０３から３０ｍｇ／ｋｇ）であり、単一または分割した投与量で投与される。
【０３１７】
単位投与形態（例えばタブレットまたはカプセル）は、２ｍｇから２０００ｍｇのプロコアグラント化合物を含み得る。単位投与形態は、１日当たり１回、２回またはそれ以上の回数、適切なように投与され得る。いずれにしても、医師はあらゆる患者個体に最も適切であろう実際の投与量を決定し、それは特定の患者の年齢、体重および反応で変化する。上述の投与量は、平均的場合の例示である。もちろん、より高いまたはより低い投与量の範囲がふさわしい個別の例があり得、かかる例は本発明の範囲内である。
【０３１８】
ＶＩ．他の方法
本発明は、自己犠牲リンカー（例えばＰＡＢＣ）をプロコアグラントポリペプチドに抱合する工程を含み、自己犠牲リンカーがプロテアーゼ切断可能基質とプロコアグラントポリペプチドとの間に挿入される、プロコアグラントポリペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチドまたは凝血因子）に操作可能的に結合されるプロテアーゼ切断可能基質（例えばトロンビン切断可能基質）の切断の有効性を増加する方法をさらに提供する。
【０３１９】
いくつかの実施形態において、切断の有効性は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、または少なくとも約１００％増加する。いくつかの実施形態において、切断の有効性は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも１００％増加する。
【０３２０】
いくつかの実施形態において、切断の有効性は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、少なくとも約６倍、少なくとも約７倍、少なくとも約８倍、少なくとも約９倍、少なくとも約１０倍である。いくつかの実施形態において、切断の有効性は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも約２０倍、少なくとも約３０倍、少なくとも約４０倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約６０倍、少なくとも約７０倍、少なくとも約８０倍、少なくとも約９０倍、または少なくとも約１００倍である。
【０３２１】
プロコアグラント化合物が、プロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼによって、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも１０％早く切断される、いくつかの実施形態において。いくつかの実施形態において、切断は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも７０％、少なくとも約８０％、少なくとも９０％または少なくとも約１００％速い。いくつかの実施形態において、切断は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも１００％速い。いくつかの実施形態において、切断は、同じ配列を有するが自己犠牲リンカーを有さない参照プロコアグラント化合物と比較して、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍、少なくとも約６倍、少なくとも約７倍、少なくとも約８倍、少なくとも約９倍、少なくとも約１０倍速い。
【０３２２】
本開示においてさらに提供されるのは、本発明のプロコアグラント化合物をプロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼに接触させる工程を含み、活性プロコアグラントペプチドがプロテアーゼ切断可能基質部分のタンパク質分解性切断の際に放出される、プロコアグラントペプチドを活性化する方法である。
【０３２３】
本開示は、本発明のプロコアグラント化合物をプロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質部分に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性化凝血因子がプロテアーゼ切断可能基質部分のタンパク質分解性切断の際に放出される、凝血因子を活性化する方法もまた提供する。いくつかの実施形態において、１つ以上の凝血因子（例えば活性凝血因子）、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの組み合わせが、本発明のプロコアグラント化合物のタンパク質分解性切断の際に放出され得る。
【０３２４】
本開示は、本発明のプロコアグラント化合物をプロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性プロコアグラントポリペプチドがプロテアーゼ切断可能基質のタンパク質分解性切断の際に放出される、プロコアグラントペプチドを異種部分から放出する方法もまた提供する。
【０３２５】
本開示は、本発明のプロコアグラント化合物をプロコアグラント化合物におけるプロテアーゼ切断可能基質に特異的なプロテアーゼと接触させる工程を含み、活性凝血因子がプロテアーゼ切断可能基質のタンパク質分解性切断の際に放出される、凝血因子を異種部分から放出する方法もまた提供する。いくつかの実施形態において、１つ以上の凝血因子（例えば活性凝血因子）、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの組み合わせが、本発明のプロコアグラント化合物のタンパク質分解性切断の際に、１つ以上の異種部分（例えばＰＥＧ）から放出され得る。いくつかの実施形態において、１つまたは２つ以上の凝血因子（例えば活性凝血因子）、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの因子の組み合わせおよび異種部分の放出は同時に起こる。いくつかの実施形態において、１つまたは２つ以上の凝血因子（例えば活性凝血因子）、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの因子の組み合わせの放出および異種部分の放出は経時的に起こる。
【０３２６】
本開示においてさらに提供されるのは、１つ以上の凝血因子、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの組み合わせの放出の前または同時に、１つ以上のプロテアーゼでの処置によって、本発明のプロコアグラント化合物から少なくとも１つの異種部分を放出する方法であり、本発明のプロコアグラント化合物をこのプロコアグラント化合物における１つまたは２つ以上のプロテアーゼ切断可能基質に特異的な１つ以上のプロテアーゼと接触させる工程を含む。いくつかの実施形態において、１つ、２つ、３つまたは４つ以上の異種部分の放出は、凝血因子、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば、合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの組み合わせのタンパク質分解性放出の前に起こる。他の実施形態において、１つ、２つ、３つまたは４つ以上の異種部分の放出は、凝血因子、凝血因子断片（例えば重鎖または軽鎖）、プロコアグラントペプチド（例えば合成プロコアグラントペプチド）またはそれらの組み合わせの放出と同時に起こる。いくつかの実施形態において、２つ、３つ、または４つ以上の異種部分の放出は同時に起こる。いくつかの実施形態において、２つ、３つ、または４つ以上の異種部分の放出は経時的に起こる。
【０３２７】
本発明をこれまで詳細に説明してきたが、それは次の実施例を参照することによって、より明確に理解されることになり、これらの実施例は、例示説明の目的のみで本明細書と共に含まれるものであり、本発明を限定するようには意図されない。本明細書で参照する全ての特許、特許出願、特許出願公開、および他の公開は、参照によりそれらの全体が明示的に組み込まれる。
【実施例】
【０３２８】
物質および方法
下記に記載される、ペプチド合成、精製および特徴付けの物質および方法は、別途述べられない限り、下記の実施例において使用される。
【０３２９】
１．固相ペプチド合成
本開示の合成プロコアグラントペプチドは、９−フルオレニルメトキシカルボニル／第３級ブチル（Ｆｍｏｃ／ｔＢｕ）化学を使用して固相ペプチド合成により合成した。加熱はマイクロ波オーブンまたは他の手段を使用して達成した。ほとんどの場合において、ペプチドは、３５ｍＬの反応器において、ＮｏｖａＰＥＧリンクアミドレジン（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）、またはＮｏｖａＰＥＧ  ＴＧＴレジン（Ｎｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ）を使用し、０．１ｍｍｏｌの規模で合成した。ペプチドのトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）切断が手動で実施されたのに対し、レジン負荷、アミノ酸結合、Ｆｍｏｃ脱保護および洗浄段階の標準方法は、ＣＥＭ  Ｌｉｂｅｒｔｙペプチドシンセサイザー（ＣＥＭ  Ｃｏｒｐ．）上で実施した。
【０３３０】
簡潔に言えば、Ｎ、Ｎ−ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）に溶解したＦｍｏｃ保護アミノ酸の５つの等価物が、その後２（６−クロロ−１Ｈ−ベンゾトリアゾール−１−イル）−１，１，３，３−テトラメチルアミニウムヘキサフルオロホスフェート（ＨＣＴＵ）の５つの等価物およびジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＰＥＡ）の１０個の等価物の存在下で、レジンに結合した。結合段階に使用されたマイクロ波方法は、５０℃（０Ｗで１２０秒間、２０Ｗで２４０秒間）で結合したシステインおよびヒスチジンを除き、７５℃（２０Ｗで３００秒間）での単一結合であった。アルギニンは７５℃（０Ｗで１５００秒間、２０Ｗで３００秒間）で二重結合した。Ｆｍｏｃ脱保護は５％のピペラジン、０．１Ｍの１−ヒドロキシベンゾトリアゾール（ＨＯＢｔ）を用いて、ＤＭＦにおいて、７５℃（４５Ｗで３０秒間、４５Ｗで１８０秒間）で実施された。ほとんどのアミノ酸および結合試薬はＮｏｖａｂｉｏｃｈｅｍ（登録商標）ＥＭＤ（ＥＭＤ  Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌｓ）から購入した。
【０３３１】
自動化ペプチド合成の後、ペプチドはレジンから、９５％のＴＦＡおよび５％のトリイソプロピルシラン（ＴＩＰＳ）を用いて、２時間にわたり、またはＤＣＭにおける３０％のヘキサフルオロイソプロパノール（ＨＦＩＰ）を用いて切断された。次に、ペプチドは丸底反応フラスコ内へ濾過された。溶媒は真空中で除去され、ペプチドを含有する濃縮物は沈殿し、氷冷のジエチルエーテル（Ｅｔ２Ｏ）でさらに粉砕した。合成ペプチドの同一性は質量スペクトル分析で確認した。
【０３３２】
２．ペプチド精製
合成ペプチドは、Ｗａｔｅｒｓ  ６００コントローラならびにＷａｔｅｒｓ２４８９ＵＶ／可視検出器およびＷａｔｅｒ  Ｆｒａｃｔｉｏｎ  Ｃｏｌｌｅｃｔｏｒ  ＩＩＩ（Ｗａｔｅｒｓ  Ｃｏｒｐ．）を備えるポンプシステムを使用して分取逆相高速液体クロマトグラフィー（ＲＰ−ＨＰＬＣ）により精製した。生成は典型的にＰｈｅｎｏｍｅｎｅｘ  Ｊｕｐｉｔｅｒ  Ｃ１８  １０ミクロン２５０×２１．２０ｍｍ  ＲＰ−ＨＰＬＣカラム（Ｐｈｅｎｏｍｅｎｅｘ，Ｉｎｃ．）上で、流量２０ｍＬ／分で実施した。アセトニトリル／水（０．１％  ＴＦＡ）勾配は、それぞれの特異的なペプチドに対し、疎水性に基づいて変更した。ペプチドは２つの波長２２８ｎｍおよび２８０ｎｍにて検出し、画分は液体クロマトグラフィー質量分析（ＬＣ−ＭＳ）によってさらに分析した。十分な純度のペプチドを含有する画分は、貯留し、瞬間冷凍し、凍結乾燥した。
【０３３３】
３．ペプチド特性決定
ペプチドは、ＬＣ−ＭＳ（１２００シリーズポンプ、オートハンドラおよびＵＶ検出系を備える、Ａｇｉｌｅｎｔ  ＬＣ−ＭＳ  ＴＯＦ  ６２２０）により特性決定した。ＬＣ分離は、Ａ（水＋０．０８％ギ酸＋０．０２％トリフルオロ酢酸）およびＢ（アセトニトリル＋０．０８％ギ酸＋０．０２％トリフルオロ酢酸）の移動相を使用して、Ｐｈｅｎｏｍｅｎｅｘ  Ｊｕｐｉｔｅｒ  Ｃ１８  ５ミクロン２５０×２．００ｍｍカラム上で実施した。一般的なＬＣ方法は０〜７０％Ｂの勾配を１２分間にわたって有した。質量決定は、ポジティブモードにおいてエレクトロスプレーイオン化により達成した。ペプチドの純度は、クロマトグラムを通した、２２８ｎｍでの紫外線の吸収を測定することにより決定した。
【０３３４】
実施例１
ＰＡＢＣ自己犠牲リンカーを有するトロンビン活性化可能プロコアグラント化合物
化合物１から７と指定した、７つの異なるペプチドが、本明細書で開示の実験において使用された（表１）。化合物１から６における、配列Ｉｌｅ−Ｖａｌ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｎ−Ｇｌｕは、ＦＸａ凝血因子の重鎖の６つのＮ末端アミノ酸残基に対応する。これらの化合物は、トロンビン切断可能基質および自己犠牲スペーサーの、凝血因子のＮ末端またはその断片への、この特異的な実施例においては、ＦＸへの、結合を再生する。化合物７は、ＰＡＢＣにおよびトロンビン切断可能基質に融合した、ＰＥＧのような半減期延長部分の付着のためのリンカーおよび足場アミノ酸異種部分（Ｃｙｓ）をさらに含む、合成プロコアグラントペプチドに対応する。
【表１】
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【０３３５】
１．ＰＡＢＣペプチドの合成（化合物１、４、５、および７）
化合物７の合成過程は図５および図６において示され、以下に詳細に説明する。化合物１、４、および５の合成は、外部委託し、類似する合成手順を踏んだ。化合物２、３、６は物質および方法の節に上述のように合成された。
【０３３６】
レジンからの切断後の化合物７の合成における最初の２つの段階は図３に示す。
【０３３７】
化合物Ａ合成
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）
化学合成し、完全保護した化合物Ａペプチド（Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ））は、ＮｏｖａＰＥＧ  ＴＧＴレジンから、３０％のＨＦＩＰ／ＤＣＭにより切断され、丸底反応フラスコ内へ濾過した。溶媒は真空中で除去され、ペプチドを含有する濃縮物は沈殿し、氷冷のジエチルエーテル（Ｅｔ２Ｏ）でさらに粉砕した。この物質は、さらなる精製を伴わず直接使用した。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１３０９．５１（ＭＨ）＋。
【０３３８】
化合物Ｂ合成
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＯＨ（ｐ−アミノベンジルアルコール）
室温のＴＨＦ（２ｍＬ）におけるＦｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）（化合物Ａ）（２６８ｍｇ、０．２ｍｍｏｌ）およびｐ−アミノベンジルアルコール（２８ｍｇ、１．１等価物）の撹拌溶液は、ＥＥＤＱ（５５．６ｍｇ、１．１等価物）で処理した。１６時間後、混合物は乾燥状態に蒸発し、残留物はエーテルで粉砕した。結果として生じた、化合物Ｂ（Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＯＨ（ｐ−アミノベンジルアルコール））を含む、白色固体生成物は、遠心分離により採取し、真空中で乾燥した（２００ｍｇ、７０％）。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１４１４．６１（ＭＨ）＋。
【０３３９】
化合物Ｃ合成
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＣ−ＰＮＰ
乾燥ＴＨＦ（４ｍＬ）および室温のＤＣＭ（４ｍＬ）におけるＦｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＯＨ（化合物Ｂ）（１８０ｍｇ、０．１２７ｍｍｏｌ）の撹拌溶液は、ＰＮＰクロロホルメート（３８．５ｍｇ、１．５等価物）および乾燥ピリジン（１５ｍｇ、１．５等価物）で処理した。１６時間後、混合物は１ｍＬに濃縮され、生成物は沈殿し、冷エーテルで粉砕した。結果として生じた、化合物Ｃ（Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＣ−ＰＮＰ）を含む、白色固体生成物は、遠心分離によって採取し、真空中で採取した（１５０ｍｇ、７５％）。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１５７９．６１（ＭＨ）＋。
【０３４０】
プロテアーゼ切断可能基質／自己犠牲スペーサーの、合成プロコアグラントペプチドへの抱合を含む、化合物７の合成における残りの段階は、図４に示す。
【０３４１】
化合物Ｄ合成
ｒＲＡＰＧＫ（Ａｌｌｏｃ）ＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ−ＮＨ２（ジスルフィド）
直鎖ペプチドは、一般的な方法に記載のように、ＮｏｖａＰＥＧリンクアミドレジン（０．２ｍｍｏｌ）上で合成した。Ｃｙｓ−Ｃｙｓジスルフィド結合は、粗ペプチドを５０％のＤＭＳＯ／Ｈ２Ｏにおいて一晩中３７℃で撹拌することにより形成した。３５ｍｇのペプチドが、精製後に分取ＨＰＬＣにより得られた。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１２９８．１７（ＭＨ２）２＋、８６５．７８（ＭＨ３）３＋。
【０３４２】
化合物Ｅ合成
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫ（Ａｌｌｏｃ）ＬＴＣＬＡ  ＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ−ＮＨ２（ジスルフィド）
室温のＤＭＦ（１ｍＬ）におけるＦｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＣ−ＰＮＰ（化合物Ｃ）（１２．５ｍｇ、０．００８ｍｍｏｌ）およびｒＲＡＰＧＫ（Ａｌｌｏｃ）ＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（化合物Ｄ）（３０ｍｇ、０．０１１ｍｍｏｌ）は、ＤＩＥＡ（６．５μＬ、５等価物）で処理した。混合物は、一晩中暗闇の中で放置した。粗生成物は沈殿し、冷エーテルで粉砕した。結果として生じる粗生成物は、遠心分離により採取し、真空中で乾燥し、さらなる精製を伴わず、次の段階に使用した。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：２０１８．３２（ＭＨ２）２＋、１３４５．８６（ＭＨ３）３＋。
【０３４３】
化合物７合成
段階１
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫ（Ａｌｌｏｃ）ＬＴＣＬＡ  ＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ−ＮＨ２（ジスルフィド）
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（Ｐｂｆ）−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫ（Ａｌｌｏｃ）ＬＴＣＬＡ  ＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡの前段階からのＰｂｆ脱保護は、１ｍＬの溶媒混合物（７２％ＴＦＡ、５％ＤＭＦ、５％Ｈ２Ｏ、１８％ＤＣＭ）において７５分間にわたり実施した。ＰＡＢＣリンカーがこの条件下で不安定であるため、反応の進行を観察するために様々な時点で部分標本が採取された。７５分で、冷エーテル（５０ｍＬ）が反応を止めるために添加された。結果として生じた固体は分取ＨＰＬＣにより精製され、白色粉末となった（２段階で８ｍｇ、２５％）。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１２６１．８３（ＭＨ３）３＋。
【０３４４】
段階２
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫＬＴＣＬＡ  ＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ−ＮＨ２（ジスルフィド）
室温のＮ２下のＭｅＯＨ／ジオキサン（１：１、１８０μＬ）におけるＦｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫ（Ａｌｌｏｃ）ＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ（８ｍｇ、０．００２ｍｍｏｌ）は、Ｐｄ（ＰＰｈ３）４（０．０００２ｍｍｏｌ、０．１等価物、２０μＬのＰｄ（ＰＰｈ３）４のＴＨＦ溶液（２３ｍｇ／ｍＬ））で、その後ＰｈＳｉＨ３（０．０１ｍｍｏｌ、５等価物）で処理した。２０分後、粗混合物は沈殿し、冷エーテルで粉砕した。結果として生じた粗生成物は、精製を伴わず次の段階に使用した。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１２３３．８２（ＭＨ３）３＋。
【０３４５】
段階３
Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡ−ＮＨ２（ジスルフィド）（化合物７）
Ｆｍｏｃ−Ｃｙｓ（Ａｃｍ）−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｄｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ｒＲＡＰＧＫＬＴＣＬＡＳＹＣＷＬＦＷＴＧＩＡの前段階からのＦｍｏｃ脱保護は、Ｅｔ２ＮＨ（５０μＬ、過剰量）を伴いＤＭＳＯ（２００μＬ）において実施した。２０分後、反応は完了し、混合物は分取ＨＰＬＣにより精製され、白色粉末ＳＹＮ４０１８（２段階で０．８３ｍｇ、１２％）となった。ＥＳＩ−ＭＳｍ／ｚ：１１５９．８０（ＭＨ３）３＋、８７０．０９（ＭＨ４）４＋。
【０３４６】
２．化合物７のトロンビン切断
図５はトロンビンによる化合物７の切断を図示する。ＰＢＳにおける１．４ｎＭのトロンビンでの切断の際、トロンビン基質と、ＧＧＧＧリンカーと、Ｎ末端システインとを含む分子の一部と同様に、純潔な合成プロコアグラントペプチドが放出される。反応を指揮するために、水中の２１μＬのペプチド（０．２４ｍＭ）が、４７６．５μＬのＰＢＳに添加された。混合物は、３７℃で３０分間インキュベートし、その後２．５μＬのトロンビン（２７８ｎＭ、１０μｇ／ｍＬ）で処理し、以下のおおよその初濃度となった：トロンビン＝１．４ｎＭ、ペプチド＝１０μＭ。混合物は３７℃でインキュベートした。様々な時点での部分標本（６０μＬ）は１μＬのヒルジン（１０μＭ）で急冷し、ＨＰＬＣに注入した（Ｃ−１８カラム、ＣＨ３ＣＮ／Ｈ２Ｏ、１２分間で０から７０％、６０℃、０．５ｍＬ／分、λ＝２８０ｎｍ）。化合物７の切断の動態は図６に示す。化合物７は１．４ｎｍのトロンビンにより急速に切断された。化合物７のおおよそ９０％が３０分後に切断された。
【０３４７】
化合物７もまたＴＧＡアッセイ（図７）の過程の間に完全に切断された。化合物７のＴＧＡアッセイの最後での血漿は冷ＣＨ３ＣＮ（１ｍＬ）へ移され、１３ｋ  ｒｐｍで１０分間遠心分離した。上清（１．１ｍＬ）は、新しいバイアルに移され、ｓｐｅｅｄｖａｃで乾燥した。結果として生じた固体は、３０μＬのＨ２Ｏで再構成し、分析のためにＨＰＬＣに注入した。図７は、化合物におけるプロコアグラントペプチドに対応するピークを示し、化合物７がＴＧＡアッセイの過程において完全に切断されたことを示す。
【０３４８】
３．化合物１、２、および３のトロンビン切断
図８は、１４ｎＭのトロンビンによる、化合物１、２および３の切断を図示する。これらの化合物は、上述のように、ＦＸａ凝血因子の重鎖の６つのＮ末端アミノ酸残基を含み、本明細書で開示するプロコアグラント化合物構想の凝血因子への適用性を示すモデルとして機能する。
【０３４９】
この特異的な実施例において、水中の５０μＬのペプチド（１ｍＭ）が、その後５０μＬのトロンビン（２７８ｎＭ、１０μｇ／ｍＬ）が、９００μＬのＰＢＳに添加され、以下のおおよその初濃度となった：トロンビン＝１４ｎＭ、ペプチド＝５０μＭ。混合物は室温でインキュベートした。様々な時点での部分標本（９５μＬ）は、５μＬのヒルジン（２μＭ）で急冷し、ＨＰＬＣに注入した（Ｃ−１８カラム、ＣＨ３ＣＮ／Ｈ２Ｏ、１２分間で０から７０％、６０℃  ０．５ｍＬ／分、λ＝２８０ｎｍ）。ペプチドピーク領域の減少は、産生を計算するために使用した。
【０３５０】
化合物２および３に比較して、トロンビン切断可能合成基質Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ（配列番号２１）、および自己犠牲スペーサーＰＡＢＣ（化合物１）を組み込む構築物は、トロンビンにより良い基質である。化合物１へのＰＡＢＣの組み込みは、化合物２のそれに比較して、少なくとも１０倍の切断比率における増加をもたらす。
【０３５１】
４．化合物１、４、５および６のトロンビン切断
図９は、１．４ｎＭのトロンビンによる、化合物１、４、５、および６の切断を図示する。化合物１、４、および５は、ＰＡＢＣ、および異なるトロンビン切断可能基質を組み込む。
【０３５２】
水中の５０μＬのペプチド（１ｍＭ）は、９００μＬのＰＢＳに添加された。混合物は、３７℃で３０分間インキュベートし、その後５０μＬのトロンビン（２７．８ｎＭ、１μｇ／ｍＬ）で処理し、以下のおおよその初濃度となった：トロンビン＝１．４ｎＭ、ペプチド＝５０μＭ。混合物は３７℃でインキュベートした。様々な時点での部分標本（９５μＬ）は、５μＬのヒルジン（２μＭ）で急冷し、ＨＰＬＣに注入した（Ｃ−１８カラム、ＣＨ３ＣＮ／Ｈ２Ｏ、１２分間で０から７０％、６０℃  ０．５ｍＬ／分、λ＝２８０ｎｍ）。ペプチドピーク領域の減少は、産生を計算するために使用した。
【０３５３】
化合物１は、化合物４および５より、トロンビンに良い基質であった。１．４ｎＭで、生理的に適切な濃度のトロンビンである、化合物１の３０％が迅速に切断、放出された。対照的に、ペプチドＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）の、ＰＡＢＣリンカーを有さない化合物６からのトロンビン仲介放出は観察されなかった。
【０３５４】
実施例２
ＰＡＢＣ自己犠牲リンカーを有するトロンビン活性化可能ＦＸ
上述のものに同等なペプチド合成方法、標準組換えタンパク質生成方法、および標準化学抱合技術が、本実施例において記載するプロコアグラント化合物を生成するために使用される。
【０３５５】
第Ｘ因子は、ジスルフィド架橋（Ｃｙｓ１７２−Ｃｙｓ３４２）によって結合する２つのポリペプチド鎖から成り、１３９アミノ酸軽鎖は、Ｇｌａドメインおよび２つのＥＧＦで構成され、３０６アミノ酸重鎖は、触媒ドメインに接合する活性化ペプチドで構成される。第Ｘ因子の活性化は、活性化ペプチドと触媒ドメインとの間のタンパク質分解を要求する。テンサーゼ（ｔｅｎｓａｓｅ）複合体は、この切断をＡｒｇ２３４とＩｌｅ２３５残基との間で実施する（図１０）。全てのセリンプロテアーゼにおいてのように、活性第Ｘ因子の触媒鎖のＮ末端残基は、酵素活性に関与する。生成Ｎ末端Ｉｌｅ２３５は、特に酵素の触媒機構において基礎的な役割を果たす。
【０３５６】
ＰＣＴ出願公開ＷＯ２００４／００５３４７号は、テナーゼ複合体による活性化の天然部位の、トロンビンによる切断の部位との交換を提言した。しかしながら、切断の効率性が、切断部位を囲むアミノ酸の本質によって決定するため、これらのトロンビン活性化可能ＦＸ（ＴＡ−ＦＸ）類似体は、遅い活性化および望ましくない有効性を被った。従って、より速い切断動態を示す他のＴＡ−ＦＸ類似体を有することが望ましい。
【０３５７】
本開示は、合成トロンビン基質、およびＦＸａに結合する自己犠牲スペーサー（例えばＰＡＢＣ）を含む、ＴＡ−ＦＸ類似体を提供する（図１１）。トロンビン基質（Ｄ−ＰｈｅＰｉｐＡｒｇ）のタンパク質分解および１，６自発的断片化の後、ＦＸａの自然配列が放出される（図１０）。ＴＡ−ＦＸは天然化学連結化学を使用して半合成的に生成される。この過程は、触媒ドメイン（ＣｙｓＦＸ）上にＮ末端システイン残基２４１を含有する組換え生成したＦＸ断片と、合成生成したチオエステルペプチドとの、結合部位にて天然アミド結合を生成するための反応を含む。ＣｙｓＦＸタンパク質を生成するために、重鎖の６つのＮ末端アミノ酸残基ＩＶＧＧＱＥ（配列番号８５）を含む配列が、ＦＸから切断され、テナーゼ複合体による活性化の天然部位は、切断部位、例えばＰＣ５による切断の切断部位と交換される。
【０３５８】
実施例３
ＰＡＢＣ自己犠牲リンカーを有するトロンビン活性化可能ＦＶＩＩ
上述のものと同等な、ペプチド合成方法、標準組換えタンパク質生成方法、および標準化学抱合技術が、本実施例において記載するプロコアグラント化合物を生成するために使用される。
【０３５９】
本開示は、合成トロンビン基質、およびＦＶＩＩａに結合する自己犠牲スペーサー（例えばＰＡＢＣ）を含む、トロンビン活性化可能ＦＶＩＩ（ＴＡ−ＦＶＩＩ）類似体を提供する（図１３）。トロンビン基質（Ｄ−ＰｈｅＰｉｐＡｒｇ）のタンパク質分解および１，６自発的断片化の後、ＦＶＩＩａの自然配列が放出される（図１０）。ＴＡ−ＦＶＩＩは、天然化学連結化学を使用して半合成的に生成される。この過程は、触媒ドメイン（ＣｙｓＦＶＩＩ）上にＮ末端システイン残基１５９を含有する組換え生成したＦＶＩＩ断片と、合成的に生成したチオエステルペプチドとの、結合部位にて天然アミド結合を生成するための反応を含む。ＣｙｓＦＶＩＩタンパク質を生成するために、重鎖の６つのＮ末端アミノ酸残基ＩＶＧＧＫＶ（配列番号８３）を含む配列が、ＦＶＩＩから切断され、ＦＸａによる活性化の天然部位が、切断部位、例えばＰＣ５による切断の切断部位と交換される。
【０３６０】
実施例４
ＳＵＭＯ切断部位を有するトロンビン活性化可能ＦＶＩＩ−１８６
ＦＶＩＩ−１８６のクローン化のために、ＨｉｎｄＩＩＩ部位からＦＶＩＩ−１８６のＥｃｏＲＩ部位までのヌクレオチドを含むＤＮＡ配列の合成（表２）は外部委託した。ＤＮＡはｐｃＤＮＡのＨｉｎｄＩＩＩ／ＥｃｏＲＩ部位にサブクローニングした。
【０３６１】
一過性にＦＶＩＩ−１８６を発現するために、ＨＥＫ−２９３−Ｆ細胞は、ビタミンＫ３（Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を懸濁細胞として２μｇ／Ｌ（増殖培地）まで補充した、３７℃／１０％ＣＯ２のＦＲＥＥＳＴＹＬＥ（登録商標）培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）における懸濁液において増殖した。細胞は、３日から４日毎に細胞密度５×１０５細胞／ｍｌで播種することにより継代培養した。遺伝子導入の２４時間前に、細胞は増殖培地において７×１０５細胞／ｍｌの密度で播種した。遺伝子導入の日に、遺伝子導入溶液が、遺伝子導入される細胞培養液の総量の５％と同等な量で作られた。遺伝子導入溶液において、ＤＮＡ（最終濃度２０ｍｇ／Ｌ）が、増殖培地における新しく作られたＰＥＩの溶液（６０ｍｇ／Ｌ）に添加された。溶液は、細胞培養液に直接添加する前に、３０秒間旋回し、室温で５分間インキュベートした。４時間後、ビタミンＫ３および２００ｍＭのＬグルタミンを補充した、ＯＰＴＩＣＨＯ（商標）（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）の、細胞培養液量と同等な量が、細胞に添加された。細胞培養液は、上述に示すように成長することが許され、タンパク質発現を評価するために、毎日培地試料が採取された。収集の日に、タンパク質生成またはタンパク質Ａプルダウンによるタンパク質分析の準備として、細胞は遠心沈殿し、培地は濾過した。ＦＶＩＩ−１８６の発現のために、ＦＶＩＩ−１８６をコードするプラスミドが、プロタンパク質コンバターゼＰＡＣＥをコードするプラスミドとコントランスフェクト（ｃｏｎｔｒａｎｓｆｅｃｔ）し、細胞内プロセシングおよびＦＶＩＩ軽鎖をＳＵＭＯに結合するリンカーにおけるプロタンパク質コンバターゼ切断部位（２Ｘ（ＲＫＲ）配列番号８８）の切断を確実にした（図１４）。
【０３６２】
ＦＶＩＩ−１８６を精製するために、培養上清は、ｐＨ８．０の２．０ＭのトリスでのｐＨの７．４への調節の後、Ｑ  ＳＥＰＨＡＲＯＳＥ（登録商標）Ｆａｓｔ  Ｆｌｏｗ（ＧＥ  ＨｅａｌｔｈＣａｒｅ  Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）の２５ｍＬのカラムに充填した。カラムは１０ｍＭのＭＥＳ、５０ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ６．５の溶液で洗浄した。タンパク質は、１０ｍＭのＭＥＳ、１００ｍＭのＮａＣｌ、２０ｍＭのＣａＣｌ２の、ｐＨ６．５の溶液で溶出した。ＦＶＩＩ−１８６を含有する画分は、ｐＨ５．５の０．５ＭのＭＥＳでのｐＨの６．２への調節の後、貯留し、ｒｈＦｃＲｎ−セファロースの２５ｍＬのカラムに充填した。５０ｍＭのＭＥＳ、１００ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ６．２の溶液での洗浄後、結合物質は１０ｍＭのトリス、２５０ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ８．０の溶液で溶出し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析した。
【０３６３】
ＦＶＩＩ−１８６は、次のようにＳＵＭＯプロテアーゼにより切断された。ＦＶＩＩ−１８６（０．８３ｍｇ／ｍＬ、１０μＬ）は、１０μＬの、１００ｍＭのＨＥＰＥＳ、２０ｍＭのＣａＣｌ２、０．４ｍＭ酸化型グルタチオン（ＧＳＳＧ）を含有する０．００４％のＴｗｅｅｎ８０、２０ｍＭのグルタチオン（ＧＳＨ）、０．２Ｕ／μＬのＳＵＭＯプロテアーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃａｔ．Ｎｏ．１２５８８−０１８）で、４８時間、室温でインキュベートした。還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（図１５、レーン３）は、ＦＶＩＩ−１８６の、所望のＦＶＩＩＨＣへのほぼ完全な転換を示した。
【０３６４】
ＦＶＩＩ−１８６の、ＳＵＭＯプロテアーゼ切断およびチオエステルペプチドとの天然化学連結のために、ＦＶＩＩ−１８６（０．８３ｍｇ／ｍＬ、１０μＬ）は、１０μＬの、１００ｍＭのＨＥＰＥＳ、２０ｍＭのＣａＣｌ２、０．４ｍＭのＳＹＮ４７０を正の対照ペプチドとして含有する０．００４％のＴｗｅｅｎ８０、０．４ｍＭのＧＳＳＧ、２０ｍＭのＧＳＨ、０．２Ｕ／μＬのＳＵＭＯプロテアーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃａｔ．Ｎｏ．１２５８８−０１８）で、４８時間、室温でインキュベートした。還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（図１５、レーン４）は、ＦＶＩＩＨＣ帯の完全な消滅、ならびに、正のペプチド対照およびＦＶＩＩＨＣの抱合としての単一の新しい帯を示した。
【０３６５】
トロンビン活性化可能ＦＶＩＩ−１８６（ＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６）を合成するために、ＦＶＩＩ−１８６（０．８３ｍｇ／ｍＬ、２００μＬ）は、２００μＬの、１００ｍＭのＨＥＰＥＳ、２０ｍＭのＣａＣｌ２、０．４ｍＭのＦＶＩＩ−ＰＡＢＣペプチド（すなわちＢｉｏｔｉｎ−Ｐｒａ−ＧＧＧＧ−Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＫＶ−ＣＯＳＢｎ）（配列番号７９）を含有する０．００４％のＴｗｅｅｎ８０、０．４ｍＭのＧＳＳＧ、２０ｍＭのＧＳＨ、０．２Ｕ／μＬのＳＵＭＯプロテアーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃａｔ．Ｎｏ．１２５８８−０１８）で、４８時間、室温でインキュベートし、還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（図１５、レーン５）により分析した。反応混合物は、１０ｋのＭＷＣＯを伴う０．５ｍＬの透析カセットに入れ、０．４ｍＭのＧＳＳＧ、２ｍＭのＧＳＨを含有する、１０ｍＭのトリス、２５０ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ８．０の１Ｌの溶液に対して、２４時間、４℃で透析した。抱合物は、記述のように、ｒｈＦｃＲｎ−セファロースカラムによりさらに精製した。
【０３６６】
ＦＶＩＩａ発色アッセイは、トロンビン切断およびＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６の活性化の後に実施した（図１６）。このアッセイは、活性化ＦＸ（ＦＸａ）により切断される発色基質のレベルを測定することによって決定する、ＦＶＩＩａがＦＸを活性化する能力を測定することにより、ＦＸ活性化活性を測定する。ＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６（２００ｎＭ）は、トロンビン（１４０ｎＭ）で、２０分間、３７℃で活性化した。トロンビンを冷却するためにヒルジンを添加した。ｓＴＦ−ＰＬ混合物（Ａ  ＳＴＡＣＬＯＴ（登録商標）ＦＶＩＩ−ｒＴＦキット）、ＦＸ、およびＰＥＦＡＣＨＲＯＭＥ（登録商標）ＦＸａ基質が添加され、４０５ｎｍでの吸光度を測定することにより反応を観察した。６つのＮ末端アミノ酸を欠損するＦＶＩＩ−１８６は、トロンビンの存在下では活性でなかった。完全重鎖ＦＶＩＩ（ＦＶＩＩａ−ＰＡＢＣペプチドを含む）に結合するトロンビン切断部位を有するＴＡ−ＦＶＩＩ−１８６のみが、トロンビン切断後に活性を示した。結果として生じた活性は、ＦＶＩＩａ−ＰＡＢＣペプチドがＦＶＩＩａの切断型重鎖のＮ末端システイン残基にうまく抱合され、決定的なＮ末端イソロイシン残基がトロンビンによる切断の際に生成され、形成されたタンパク質が活性に必須の構造を有するということを実証した。
【０３６７】
実施例５
ＰＡＣＥ切断部位を有するトロンビン活性化可能ＦＸ−０１１
ＦＸ−０１１のクローン化のために、ＦＸ−０１１のＨｉｎｄＩＩＩ部位からＮｏｔＩ部位までのヌクレオチドを含むＤＮＡ配列の合成（表４）は外部委託した。ＤＮＡはｐｃＤＮＡのＨｉｎｄＩＩＩ／ＮｏｔＩ部位へとサブクローン化した。
【０３６８】
ＦＸ−０１１の一過性の発現のために、ＨＥＫ−２９３−Ｆ細胞は、ＦＸ−０１１の発現を得るために、本質的に上述のように遺伝子導入された。ＦＸ−０１１をコードするプラスミドはプロタンパク質コンバターゼＰＡＣＥ（２０％）をコードするプラスミドと同時遺伝子導入され、細胞内プロセシング、ならびに、リンカーおよびリンカーの除去におけるプロタンパク質コンバターゼ切断部位の切断を確実にした（図１７）。一過性の遺伝子導入からタンパク質を分析するために、培養上清はタンパク質Ａ免疫沈降を受けた。簡潔に言えば、細胞培養液の上清は、おおよそ５０μｌのタンパク質Ａ−セファロース５０％スラリーと撹拌し、４℃で１時間揺動を伴いインキュベートし、その後、タンパク質Ａビーズを小粒化するために遠心分離した。ビーズは１ｍｌのＰＢＳにおいて再懸濁すること、急回転すること、および吸引することにより、２度洗浄した。ビーズは、還元または非還元条件下で、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ緩衝剤で再懸濁し、５分間９５℃で加熱し、遠心沈殿し、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲル上に充填し、標準プロトコルに従って処理した。非還元条件下で、ＦＸ−０１１の期待分子重量との１つの帯が観察された（図１７、レーン３）。還元状況下で、不完全にプロセシングされた活性化ペプチド−重鎖ＦＸ−Ｆｃサブユニット、所望の重鎖ＦＸ−Ｆｃサブユニット、およびＦｃサブユニットを表す３つの主要な帯が観察された（図１７、レーン２）。タンパク質はセルロース膜上に移し、重鎖ＦＸ−Ｆｃサブユニットに対応する帯は採取、分析した。Ｎ末端配列は、ＰＡＣＥによる切断後の期待通りの既存Ｎ末端システイン（Ｃｙｓ）残基を確認した。
【０３６９】
ＦＸ−０１１の精製のために、培養上清（２００ｍＬ）は、１５ｍＬの遠心濾過器ユニット３０，０００ＭＷＣＯ（カタログ番号ＵＦＣ９０３００８）により１０ｍＬに濃縮した。ｐＨ５．５の０．５ＭのＭＥＳでのｐＨの６．２への調節の後、濃縮培地は、５０ｍＭのＭＥＳ、１００ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ６．２の緩衝剤と平衡する、０．５ｍＬのｒｈＦｃＲｎ−セファロースレジン床上に充填した。５０ｍＭのＭＥＳ、１００ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ６．２の溶液での洗浄後、結合物質は、１０ｍＭのトリス、２５０ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ８．０の溶液で溶出した。抱合の前に、ＦＸ−０１１は、２０ｍＭのＨＥＰＥＳ、５００ｍＭのＮａＣｌ、５ｍＭのＣａＣｌ２の、ｐＨ７．４の緩衝剤に、透析により移した。
【０３７０】
チオエステルペプチドとの天然化学連結による、トロンビン活性化可能ＦＸ−０１１（ＴＡ−ＦＸ−０１１）の半合成のために、ＦＸ−０１１（０．５ｍｇ／ｍＬ）は、２０ｍＭのＨＥＰＥＳ、５００ｍＭのＮａＣｌ、５ｍＭのＣａＣｌ２の、ｐＨ７．４の緩衝剤において、０．５ｍＭのＦＸ−ＰＡＢＣペプチド（すなわちＧＧ−Ｄ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＱＥ−ＣＯＳＢｎ）（配列番号＿＿）、および２０ｍＭのナトリウム２−スルファニルエタンスルホネート（ＭＥＳＮＡ）で、１６時間、室温でインキュベートした。反応は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルにより分析した（図１８、レーン３）。過剰ペプチドおよびＭＥＳＮＡは、ゲル濾過により除去した。ＴＡ−ＦＸ−０１１を含有する貯留画分は、１０ｋのＭＷＣＯを伴う０．５ｍＬの透析カセットに入れ、２０ｍＭのＨＥＰＥＳ、５００ｍＭのＮａＣｌ、５ｍＭのＣａＣｌ２の、ｐＨ７．４の１Ｌの溶液に対し、２４時間４℃で透析した。
【０３７１】
ＦＸａ発色アッセイは、ＴＡ−ＦＸ−０１１のトロンビン切断後に実施した（図１９）。ＴＡ−ＦＸ−０１１（２００ｎＭ）は、トロンビン（１４０ｎＭ）で、２０分間、３７℃で活性化した。トロンビンを急冷するためにヒルジンを添加した。ＦＸａ基質が添加され、４０５ｎｍでの吸光度を測定することにより、反応を観察した。６つのＮ末端アミノ酸を欠損するＦＸ−０１１は、トロンビンの存在下では活性でなかった。完全重鎖ＦＸ（ＦＸａ−ＰＡＢＣペプチドを含む）に結合するトロンビン切断部位を有する、ＴＡ−ＦＸ−０１１のみが、トロンビン切断後に活性を示した。結果として生じた活性は、ＦＸ  ＰＡＢＣペプチドがＦＸの切断型重鎖のＮ末端システイン残基にうまく抱合し、決定的なＮ末端イソロイシン残基がトロンビンによる切断の際に生成され、形成したタンパク質が活性に必須の構造を有するということを例証した。
【０３７２】
実施例６
ＳＵＭＯ切断部位を有するトロンビン活性化可能ＦＸ−０１２
ＦＸ−０１２のクローン化のために、ＦＸ−０１２のＨｉｎｄＩＩＩ部位からＮｏｔＩ部位までのヌクレオチドを含むＤＮＡ配列の合成（表６）は外部委託した。ＤＮＡはｐｃＤＮＡのＨｉｎｄＩＩＩ／ＮｏｔＩ部位にサブクローンした。
【０３７３】
ＦＸ−０１２の一過性の発現およびタンパク質精製は、本質的にＦＶＩＩ−１８６に対して記載された通りであった。非還元条件下で、ＦＸ−０１２の期待分子重量との主要な帯が観察された（図２０、レーン２）。還元条件下で、所望のＳＵＭＯ重鎖ＦＸ−ＦｃサブユニットおよびＦｃサブユニット（図２０、レーン３）を表す２つの主要な帯が観察された。ＬＣ帯は可視的ではなかった。
【０３７４】
ＦＸ−０１２は、次のようにＳＵＭＯプロテアーゼによって切断された。ＦＸ−０１２（０．３５ｍｇ／ｍＬ）は、０．１Ｕ／μＬのＳＵＭＯプロテアーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃａｔ．Ｎｏ．１２５８８−０１８）、５０ｍＭのＨＥＰＥＳにおける２０ｍＭのＧＳＨ、１０ｍＭのＣａＣｌ２の、ｐＨ７．４の緩衝剤で、２４時間、室温でインキュベートした。還元型ＤＳ−ＰＡＧＥ（図２１、レーン２）は、ＦＸ−０１２の、所望のＦＸＨＣ−Ｆｃへの、ほぼ完全な転換を示した。
【０３７５】
ＦＸ−０１２のＳＵＭＯプロテアーゼ切断、およびチオエステルペプチドとの天然化学連結のために、ＦＸ−０１２（０．３５ｍｇ／ｍＬ）は、正の対照ペプチドとしての０．４ｍＭのＳＹＮ４７０、０．１Ｕ／μＬのＳＵＭＯプロテアーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃａｔ．Ｎｏ．１２５８８−０１８）、５０ｍＭのＨＥＰＥＳにおける２０ｍＭのＧＳＨ、１０ｍＭのＣａＣｌ２、ｐＨ７．４の緩衝剤で、２４時間、室温でインキュベートした。還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（図２１、レーン４）は、ＦＸＨＣ−Ｆｃ帯の完全な消滅および正のペプチド対照およびＦＸＨＣ−Ｆｃの抱合としての単一の新しい帯を示した。
【０３７６】
チオエステルペプチドとの天然化学連結によるトロンビン活性化可能ＦＸ−０１２（ＴＡ−ＦＸ−０１２）の合成のために、ＦＸ−０１２（０．３５ｍｇ／ｍＬ）は０．４ｍＭのＦＸ−ＰＡＢＣペプチド（すなわちＤ−Ｐｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＱＥ−ＣＯＳＢｎ）（配列番号９０）、０．１Ｕ／μＬのＳＵＭＯプロテアーゼ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｃａｔ．Ｎｏ．１２５８８−０１８）、５０ｍＭのＨＥＰＥＳにおける２０ｍＭのＧＳＨ、１０ｍＭのＣａＣｌ２の、ｐＨ７．４の緩衝剤で、２４時間、室温でインキュベートした。還元型ＳＤＳ−ＰＡＧＥ（図２１、レーン３）は、ＦＸ−ＰＡＢＣペプチドとＦＸＨＣ−Ｆｃとの所望の抱合としての新しい帯を示した。反応混合物は、１０ｋのＭＷＣＯを伴う０．５ｍＬの透析カセットに入れ、０．４ｍＭのＧＳＳＧ、２ｍＭのＧＳＨを含有する、１０ｍＭのトリス、２５０ｍＭのＮａＣｌの、ｐＨ８．０の１Ｌの溶液に対して、２４時間、４℃で透析した。抱合物は記述のように、ｒｈＦｃＲｎ−セファロースカラムによってさらに精製した。
【０３７７】
ＦＸａ発色アッセイは、ＴＡ−ＦＸ−０１２のトロンビン切断後に実施した（図２２）。ＴＡ−ＦＸ−０１２（２００ｎＭ）は、トロンビン（１４０ｎＭ）で、２０分間、３７℃で活性化した。トロンビンを冷却するためにヒルジンを添加した。ＦＸａ基質が添加され、４０５ｎｍでの吸光度を測定することにより反応を観察した。６つのＮ末端アミノ酸を欠損するＦＸ−０１２は、トロンビンの存在下では活性でなかった。完全重鎖ＦＸ（ＦＸａ−ＰＡＢＣペプチドを含む）に結合するトロンビン切断部位を有する、ＴＡ−ＦＸ−０１２のみが、トロンビン切断後に活性を示した。結果として生じた活性は、ＦＸ  ＰＡＢＣペプチドが、ＦＸの切断型重鎖のＮ末端システイン残基にうまく抱合し、決定的なＮ末端イソロイシン残基がトロンビンによる切断の際に生成され、形成したタンパク質が活性に必須の構造を有するということを例証した。
【０３７８】
本発明は、明記される機能およびそれらの関係の実現を例示する、機能的ビルディングブロックを用いて上述された。これらの機能的ビルディングブロックの境界は、記載の便宜上、本明細書で恣意的に画定されている。明記される機能およびそれらの関係が適切に行われる限り、代替的な境界が画定され得る。
【０３７９】
具体的な実施形態の上述の説明は、他の者が当業者の技能の範囲内で知識を適用することによって、過度の実験を用いずに、本発明の一般の概念から逸脱することなく、かかる具体的な実施形態の種々の適用のために、容易に修正および／または適合させることができる本発明の一般の性質を十分に明らかにするであろう。従って、かかる適合および修正は、本明細書に提示される教示および手引きに基づいて、開示される実施形態の均等物の意味および範囲内にあることが意図される。本明細書における表現法または用語法は、本明細書の用語法または表現法が教示および手引きを考慮して当業者によって解釈されるものであるように、限定目的ではなく説明目的のためのものであることを理解されたい。
【０３８０】
本発明の幅および範囲は、上述の例となる実施形態のいずれによっても限定されるべきではなく、次の特許請求の範囲およびそれらの均等物のみにおいて規定されるべきである。
表
表２．ＦＶＩＩ−１８６のＤＮＡ配列（配列番号６５）
【表２−１】
2015521589.tif 000006
【表２−２】
2015521589.tif 000007
表３．ＦＶＩＩ−１８６アミノ酸配列。シグナル配列は点線下線で示し、プロペプチドは二重下線、ＦＶＩＩ軽鎖をＳＵＭＯに結合するプロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を有するリンカーは下線、ＳＵＭＯ配列は破線下線、ＦＶＩＩをＦｃ領域に結合するリンカー領域は斜体、２つのＦｃ断片を結合するリンカーは太字で示す。（配列番号６６）
【表３】
2015521589.tif 000008
2015521589.tif 000009
表４．ＦＸ−０１１のＤＮＡ配列（配列番号６７）
【表４−１】
2015521589.tif 000010
【表４−２】
2015521589.tif 000011
表５．ＦＸ−０１１アミノ酸配列。シグナル配列は点線下線で示し、プロペプチドは二重下線、ＦＸ活性化ペプチドをＦＸ重鎖に結合するリンカー領域は下線、２つのＦｃ断片を結合するプロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を有するリンカーは太字で示す（配列番号６８）。
【表５】
2015521589.tif 000012
2015521589.tif 000013
表６．ＦＸ−０１２のＤＮＡ配列（配列番号６９）
【表６−１】
2015521589.tif 000014
【表６−２】
2015521589.tif 000015
表７．ＦＸ−０１２アミノ酸配列。シグナル配列は点線下線で示し、プロペプチドは二重下線、ＦＸ軽鎖をＳＵＭＯに結合するリンカー領域は下線、ＳＵＭＯ配列は破線下線、２つのＦｃ断片を結合するプロタンパク質コンバターゼプロセシング部位を有するリンカーは太字で示す（配列番号７０）。
【表７】
2015521589.tif 000016
配列
配列番号５１
＞ＣＴＰペプチド１
ＤＰＲＦＱＤＳＳＳＳＫＡＰＰＰＳＬＰＳＰＳＲＬＰＧＰＳＤＴＰＩＬ
配列番号５２
＞ＣＴＰペプチド２
ＳＳＳＳＫＡＰＰＰＳＬＰＳＰＳＲＬＰＧＰＳＤＴＰＩＬＰＱ
配列番号５８
＞ＰＡＳペプチド１
ＡＳＰＡＡＰＡＰＡＳＰＡＡＰＡＰＳＡＰＡ
配列番号５９
＞ＰＡＳペプチド２
ＡＡＰＡＳＰＡＰＡＡＰＳＡＰＡＰＡＡＰＳ
配列番号６０
＞ＰＡＳペプチド３
ＡＰＳＳＰＳＰＳＡＰＳＳＰＳＰＡＳＰＳＳ
配列番号６１
＞ＰＡＳペプチド４
ＡＰＳＳＰＳＰＳＡＰＳＳＰＳＰＡＳＰＳ
配列番号６２
＞ＰＡＳペプチド５
ＳＳＰＳＡＰＳＰＳＳＰＡＳＰＳＰＳＳＰＡ
配列番号６３
＞ＰＡＳペプチド６
ＡＡＳＰＡＡＰＳＡＰＰＡＡＡＳＰＡＡＰＳＡＰＰＡ
配列番号６４
＞ＰＡＳペプチド７
ＡＳＡＡＡＰＡＡＡＳＡＡＡＳＡＰＳＡＡＡ
配列番号５３
＞アルブミン結合ペプチドコア配列
ＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷ
配列番号７１
＞ＧＦＰタンパク質配列（Ｇｅｎｂａｎｋ  ＩＤ  ＡＡＧ３４５２１．１）
ＭＳＫＧＥＥＬＦＴＧＶＶＰＩＬＶＥＬＤＧＤＶＮＧＨＫＦＳＶＳＧＥＧＥＧＤＡＴＹＧＫＬＴＬＫＦＩＣＴＴＧＫＬＰＶＰＷＰＴＬ
ＶＴＴＦＧＹＧＶＱＣＦＡＲＹＰＤＨＭＫＱＨＤＦＦＫＳＡＭＰＥＧＹＶＱＥＲＴＩＦＦＫＤＤＧＮＹＫＴＲＡＥＶＫＦＥＧＤＴＬＶ
ＮＲＩＥＬＫＧＩＤＦＫＥＤＧＮＩＬＧＨＫＬＥＹＮＹＮＳＨＮＶＹＩＭＡＤＫＱＫＮＧＩＫＶＮＦＫＩＲＨＮＩＥＤＧＳＶＱＬＡＤ
ＨＹＱＱＮＴＰＩＧＤＧＰＶＬＬＰＤＮＨＹＬＳＴＱＳＡＬＳＫＤＰＮＥＫＲＤＨＭＶＬＬＥＦＶＴＡＡＧＩＴＨＧＭＤＥＬＹＫＳＲ
ＴＳＧＳＰＧＬＱＥＦＤＩＫＬＩＤＴＶＤＬＥＳＣＮ
配列番号７２
＞実施例：単鎖ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ（下線Ｇｌｙ／Ｓｅｒリンカーを伴うＦｃ配列）。
【化３】
2015521589.tif 000017
配列番号７３
＞成熟ヒトアルブミンタンパク質配列（ＮＣＢＩ参照配列ＮＰ＿０００４６８から誘導）：
ＲＧＶＦＲＲＤＡＨＫＳＥＶＡＨＲＦＫＤＬＧＥＥＮＦＫＡＬＶＬＩＡＦＡＱＹＬＱＱＣＰＦＥＤＨＶＫＬＶＮＥＶＴＥＦＡＫＴＣＶ
ＡＤＥＳＡＥＮＣＤＫＳＬＨＴＬＦＧＤＫＬＣＴＶＡＴＬＲＥＴＹＧＥＭＡＤＣＣＡＫＱＥＰＥＲＮＥＣＦＬＱＨＫＤＤＮＰＮＬＰＲ
ＬＶＲＰＥＶＤＶＭＣＴＡＦＨＤＮＥＥＴＦＬＫＫＹＬＹＥＩＡＲＲＨＰＹＦＹＡＰＥＬＬＦＦＡＫＲＹＫＡＡＦＴＥＣＣＱＡＡＤＫ
ＡＡＣＬＬＰＫＬＤＥＬＲＤＥＧＫＡＳＳＡＫＱＲＬＫＣＡＳＬＱＫＦＧＥＲＡＦＫＡＷＡＶＡＲＬＳＱＲＦＰＫＡＥＦＡＥＶＳＫＬ
ＶＴＤＬＴＫＶＨＴＥＣＣＨＧＤＬＬＥＣＡＤＤＲＡＤＬＡＫＹＩＣＥＮＱＤＳＩＳＳＫＬＫＥＣＣＥＫＰＬＬＥＫＳＨＣＩＡＥＶＥ
ＮＤＥＭＰＡＤＬＰＳＬＡＡＤＦＶＥＳＫＤＶＣＫＮＹＡＥＡＫＤＶＦＬＧＭＦＬＹＥＹＡＲＲＨＰＤＹＳＶＶＬＬＬＲＬＡＫＴＹＥ
ＴＴＬＥＫＣＣＡＡＡＤＰＨＥＣＹＡＫＶＦＤＥＦＫＰＬＶＥＥＰＱＮＬＩＫＱＮＣＥＬＦＥＱＬＧＥＹＫＦＱＮＡＬＬＶＲＹＴＫＫ
ＶＰＱＶＳＴＰＴＬＶＥＶＳＲＮＬＧＫＶＧＳＫＣＣＫＨＰＥＡＫＲＭＰＣＡＥＤＹＬＳＶＶＬＮＱＬＣＶＬＨＥＫＴＰＶＳＤＲＶＴ
ＫＣＣＴＥＳＬＶＮＲＲＰＣＦＳＡＬＥＶＤＥＴＹＶＰＫＥＦＮＡＥＴＦＴＦＨＡＤＩＣＴＬＳＥＫＥＲＱＩＫＫＱＴＡＬＶＥＬＶＫ
ＨＫＰＫＡＴＫＥＱＬＫＡＶＭＤＤＦＡＡＦＶＥＫＣＣＫＡＤＤＫＥＴＣＦＡＥＥＧＫＫＬＶＡＡＳＱＡＡＬＧＬ
配列番号５４
＞アルブミン結合ペプチド１
ＲＬＩＥＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＥＤＤ
配列番号５５
＞アルブミン結合ペプチド２
ＱＲＬＭＥＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＥＤＤＦ
配列番号５６
＞アルブミン結合ペプチド３
ＱＧＬＩＧＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＧＤＳＶＫ
配列番号７４
＞アルブミン結合ペプチド４
ＧＥＷＷＥＤＩＣＬＰＲＷＧＣＬＷＥＥＥＤ
配列番号７５
＞システイン含有ペプチド
ＧＧＧＳＧＣＧＧＧＳ
配列番号７６
＞ヒトＬＲＰ１配列（シグナルペプチドおよび膜貫通部は下線、ＮＣＢＩ参照配列：ＣＡＡ３２１１２）
【化４−１】
2015521589.tif 000018
【化４−２】
2015521589.tif 000019
配列番号７７
＞ビオチンアクセプターペプチド（ＢＡＰ）
ＬＮＤＩＦＥＡＱＫＩＥＷＨ
配列番号７８
＞リポ酸塩アクセプターペプチド２（ＬＡＰ２）
ＧＦＥＩＤＫＶＷＹＤＬＤＡ
配列番号８２
＞ＨＡＰ化モチーフ、ｎ＝１から４００
（Ｇｌｙ４Ｓｅｒ）ｎ
配列番号８２
＞ＣＴＰ
ＤＳＳＳＳＫＡＰＰＰＳＬＰＳＰＳＲＬＰＧＰＳＤＴＰＩＬＰＱ
配列番号７９
＞ＦＶＩＩ−ＰＡＢＣペプチド
Ｂｉｏｔｉｎ−Ｐｒａ−ＧＧＧＧ−ＤＰｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＫＶ−ＣＯＳＢｎ、Ｐｒａ＝Ｌ−プロパルギルグリシン
配列番号８０
＞ＦＸ−ＰＡＢＣペプチド
ＧＧ−ＤＰｈｅ−Ｐｉｐ−Ａｒｇ−ＰＡＢＣ−ＩＶＧＧＱＥ−ＣＯＳＢｎ
配列番号８１
＞ＳＹＮ４７０
ＩＫＰＥＡＰＧＥＤＡＳＰＥＥＬＮＲＹＹＡＳＬＲＨＹＬＮＬＶＴＲＱＲＹ−ＰＥＧ４−Ｇｌｙ−ＣＯＳＢｎ
【図６】
2015521589.tif 000021
【図１６】
2015521589.tif 000022
【図１】
2015521589.tif 000023
【図２】
2015521589.tif 000024
【図３】
2015521589.tif 000025
【図４】
2015521589.tif 000026
【図５】
2015521589.tif 000027
【図７】
2015521589.tif 000028
【図８】
2015521589.tif 000029
【図９】
2015521589.tif 000030
【図１０】
2015521589.tif 000031
【図１１】
2015521589.tif 000032
【図１２】
2015521589.tif 000033
【図１３】
2015521589.tif 000034
【図１４】
2015521589.tif 000035
【図１５】
2015521589.tif 000036
【図１７】
2015521589.tif 000037
【図１８】
2015521589.tif 000038
【図１９】
2015521589.tif 000039
【図２０】
2015521589.tif 000040
【図２１】
2015521589.tif 000041
【図２２】
2015521589.tif 000042
【配列表】
2015521589000001.app
【国際調査報告】
2015521589.tif 000043
2015521589.tif 000044
2015521589.tif 000045
2015521589.tif 000046