(57)【要約】本発明は、新規ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストに関する。本アンタゴニストは抗体を含み、抗体は二重特異性であってもよい。本抗体は、腫瘍成長を低減若しくは阻害、及び／又は血管形成疾患を処置するのに使用される。本発明はまた、このような処置のためのＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストとＶＥＧＦＲアンタゴニストとの組み合わせも含む。本アンタゴニストは更に、他の抗血管形成剤又は抗新生物薬剤と組み合わせて投与できる。
2010524466.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
血小板由来成長因子レセプター−β（ＰＤＧＦＲβ）のドメイン２又はドメイン１及び２に結合する、単離抗体又はその断片。
【請求項２】
ＣＤＲＨ１で配列番号２０；ＣＤＲＨ２で配列番号２２；ＣＤＲＨ３で配列番号２４；ＣＤＲＬ１で配列番号２８；ＣＤＲＬ２で配列番号３０；及びＣＤＲＬ３で配列番号３２と少なくとも約９０％相同な相補性決定領域を含む、請求項１記載の単離抗体又はその断片。
【請求項３】
配列番号１８の重鎖可変ドメインアミノ酸配列、及び配列番号２６の軽鎖可変ドメインアミノ酸配列を含む、請求項２記載の抗体。
【請求項４】
ＣＤＲＨ１で配列番号４；ＣＤＲＨ２で配列番号６；ＣＤＲＨ３で配列番号８；ＣＤＲＬ１で配列番号１２；ＣＤＲＬ２で配列番号１４；及びＣＤＲＬ３で配列番号１６と少なくとも約９０％相同な相補性決定領域を含む、血小板由来成長因子レセプター−β（ＰＤＧＦＲβ）に特異的に結合する単離抗体又はその断片。
【請求項５】
配列番号２の重鎖可変ドメインアミノ酸配列、及び配列番号１０の軽鎖可変ドメインアミノ酸配列を含む、請求項４記載の抗体。
【請求項６】
単鎖抗体、Ｆａｂ、単鎖Ｆｖ、ダイアボディ、トリアボディ、及び単一ドメイン抗体からなる群より選択される、請求項１記載の抗体。
【請求項７】
二重特異性抗体である、請求項１記載の抗体。
【請求項８】
ＶＥＧＦＲレセプターに結合する、請求項７記載の抗体。
【請求項９】
前記ＶＥＧＦＲレセプターは、ＶＥＧＦＲ１、ＶＥＧＦＲ２、及びＶＥＧＦＲ３からなる群より選択される、請求項８記載の抗体。
【請求項１０】
配列番号２、配列番号１０、配列番号１８、及び配列番号２６からなる群より選択されるアミノ酸配列をコード化する、単離ポリヌクレオチド。
【請求項１１】
配列番号１、配列番号９、配列番号１７、及び配列番号２５からなる群より選択されるヌクレオチド配列と少なくとも７０％一致するヌクレオチド配列を含む、請求項１０記載の単離ポリヌクレオチド。
【請求項１２】
配列番号１、配列番号９、配列番号１７、及び配列番号２５からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む核酸分子の相補体とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする単離ポリヌクレオチド。
【請求項１３】
宿主細胞で前記ポリヌクレオチドの発現をもたらす調節制御配列に作動可能に連結される、請求項１０記載のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。
【請求項１４】
請求項１３記載の発現ベクターを含む組換え宿主細胞。
【請求項１５】
ＰＤＧＦＲβに結合する抗体を発現する、請求項１４記載の組換え宿主細胞。
【請求項１６】
ＰＤＧＦＲβに結合する抗体を作製する方法であって、該抗体の発現を許容する条件下に請求項１５記載の細胞を培養する工程を含む方法。
【請求項１７】
哺乳動物においてＰＤＧＦＲβの活性を調節する方法であって、有効量の請求項１記載の抗体を該哺乳動物に投与する工程を含む方法。
【請求項１８】
哺乳動物において血管新生を阻害する方法であって、有効量の請求項１記載の抗体を該哺乳動物に投与する工程を含む方法。
【請求項１９】
哺乳動物において腫瘍成長を低減する方法であって、有効量の請求項１記載の抗体を該哺乳動物に投与する工程を含む方法。
【請求項２０】
有効量の抗新生物剤又は放射線を投与する工程を更に含む、請求項１９記載の方法。
【請求項２１】
哺乳動物において血管新生を阻害する、又は腫瘍成長を低減する方法であって、血小板由来成長因子−β（ＰＤＧＦＲβ）に対する有効量の特異的アンタゴニスト、及び有効量のＶＥＧＦＲアンタゴニストを該哺乳動物に投与する工程を含む方法。
【請求項２２】
前記ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストはＰＤＧＦＲβに結合する抗体である、請求項２１記載の方法。
【請求項２３】
前記抗体はＰＤＧＦＲβの二量体化を阻止する、請求項２２記載の方法。
【請求項２４】
前記抗体はＰＤＧＦＲβのドメイン２又はドメイン１及び２に結合する、請求項２２記載の方法。
【請求項２５】
前記抗体は、ＣＤＲＨ１で配列番号２０；ＣＤＲＨ２で配列番号２２；ＣＤＲＨ３で配列番号２４；ＣＤＲＬ１で配列番号２８；ＣＤＲＬ２で配列番号３０；及びＣＤＲＬ３で配列番号３２と少なくとも約９０％相同な相補性決定領域を含む、請求項２４記載の方法。
【請求項２６】
抗体は、配列番号１８の重鎖可変ドメインアミノ酸配列、及び配列番号２６の軽鎖可変ドメインアミノ酸配列を含む、請求項２５記載の方法。
【請求項２７】
前記ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲβに結合し且つＶＥＧＦＲ１、ＶＥＧＦＲ２、及びＶＥＧＦＲ３からなる群より選択されるＶＥＧＦレセプターに結合する二重特異性抗体である、請求項２１記載の方法。
【請求項２８】
ＶＥＧＦアンタゴニストは、ＶＥＧＦＲ２に結合する抗体である、請求項２７記載の方法。
【請求項２９】
ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲβに結合し且つＶＥＧＦＲリガンドに結合する二重特異性抗体である、請求項２１記載の方法。
【請求項３０】
ＶＥＧＦＲリガンドは、ＶＥＧＦ及びＰｌＧＦからなる群より選択される、請求項２９記載の方法。
【請求項３１】
ＶＥＧＦＲアンタゴニストは、ＶＥＧＦレセプターの可溶性断片である、請求項２１記載の方法。
【請求項３２】
有効量の抗新生物剤又は放射線を投与する工程を更に含む、請求項２１記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願の相互参照）
本願は、２００７年４月１７日に出願せる米国仮特許出願第６０／９２３９７９号の出願日の優先権を主張し、引用することによりその開示を本願明細書で援用する。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、血管新生及び腫瘍成長を阻害するための方法及び組成物に関する。本発明は、血管新生における血小板由来成長因子レセプター−ベータ（ＰＤＧＦＲβ）の特異的阻害の効果を実証し、またＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを、単独、又はＶＥＧＦレセプターのインヒビターと組み合わせて用いる血管新生の処置を提供する。特異的インヒビターは、抗体、又はその抗原結合断片でありうる。更に、インヒビターは、二重特異性でありうる。
【背景技術】
【０００３】
血小板由来成長因子（ＰＤＧＦ）は、殆どすべての間葉由来細胞における強力なマイトジェンの１つのファミリーである。４種のＰＤＧＦイソフォーム、Ａ、Ｂ、Ｃ及びＤがあり、ジスルフィドで結合される５種の異なる二量体蛋白質、すなわちＰＤＧＦ−ＡＡ、−ＢＢ、−ＡＢ、−ＣＣ、及び−ＤＤを形成する。これらの成長因子は、２種の構造的に関連するチロシンキナーゼレセプターであるＰＤＧＦレセプターα（ＰＤＧＦＲα）及びＰＤＧＦレセプターβ（ＰＤＧＦＲβ）によって、それらの細胞効果を発揮する（非特許文献１；非特許文献２）。
【０００４】
ＰＤＧＦＲα及びＰＤＧＦＲβは構造的に類似しており、ヘテロ二量体やホモ二量体を形成できる。ＰＤＧＦ−ＢＢ及びＰＤＧＦ−ＤＤは、ββホモ二量体レセプターの一次活性化物質である。ＰＤＧＦ−ＡＡはααレセプター二量体のみを活性化し、一方ＰＤＧＦ−ＡＢ、ＰＤＧＦ−ＢＢ、及びＰＤＧＦ−ＣＣはαα及びαβレセプター二量体を活性化する。二量体リガンド分子は、２つのレセプター蛋白質に同時に結合して、レセプター二量体化、レセプターの細胞質ドメイン内の特定残基の自己リン酸化、及び細胞内シグナル伝達を誘導する。最終的に、ＰＤＧＦＲβシグナル伝達経路の活性化は、細胞増殖及び遊走を含む様々な細胞応答を誘導する。
【０００５】
血管新生は、腫瘍成長及び転移の双方に必須であると考えられる。脈管系、又は血管形成の進展には、２種の主な細胞型である、内皮細胞（ＥＣ）及び周皮細胞／血管平滑筋細胞（ＳＭＣ）の成熟血管内への集合が関係する。血管形成におけるＰＤＧＦ−Ｂ／ＰＤＧＦＲβシグナル伝達経路の関与は、ＰＤＧＦ−Ｂ及びＰＤＧＦＲβノックアウトマウスによって示唆されている。ＰＤＧＦ−Ｂ及びＰＤＧＦＲβのノックアウトの表現型は、血管内の周皮細胞及び平滑筋細胞で被覆の減損に起因する出血がマウスに起こるという点で、事実上同じである。これらの研究により、ＰＤＧＦＲβは毛細血管への周皮細胞の動員、血管内での平滑筋細胞の発生に関わることが示唆された。外被新生血管への周皮細胞動員は、血管網の安定化および更なる確立に必須である。適切な周皮細胞被覆を欠く血管は、良好に確立された成熟血管よりもＶＥＧＦ阻害に対して脆弱である。
【０００６】
抗腫瘍剤として開発中の数多くのチロシンキナーゼインヒビターが、ＰＤＧＦＲβを阻害することが認められている。しかし、これらの化合物は、複数のチロシンキナーゼ標的を有している。例えば、メシル酸イマチニブ（Ｇｌｅｅｖｅｃ（登録商標）／ＳＴ５７１）は、Ａｂｅｌｓｏｎ（Ａｂｌ）チロシンキナーゼインヒビターとして開発されたが、ｃ−ｋｉｔ、ＰＤＧＦＲα、及びＰＤＧＦＲβも阻害する。リンゴ酸スニチニブ（Ｓｕｔｅｎｔ（登録商標）／ＳＵ１１２４８）は、ＶＥＧＦＲ、ＰＤＧＦＲ、ｃ−キット、及びＦＬＴ−３に対する活性を有する、広域スペクトル経口投与可能な複数標的化チロシンキナーゼインヒビターである。ＣＰ−６７３，４５１は、ＰＤＧＦＲα及びＰＤＧＦＲβの両者のインヒビターである。かかる小分子アンタゴニストはこれらレセプターに特異的ではないので、血管新生（腫瘍随伴血管新生、腫瘍刺激及び成長を含む）へのＰＤＧＦＲβシグナル伝達の寄与、又は複数のレセプターの不要な標的化に起因するかもしれない、かかる化合物投与に伴う毒性、を判別することは可能ではない。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００７】
【非特許文献１】Ｓａｎｄｙ，Ｊ．Ｒ．，Ｂｒ．Ｊ．Ｏｒｔｈｏｄ．２５，１９９８年，ｐ．２６９−７４
【非特許文献２】Ｂｅｔｓｈｏｌｔｚ，Ｃ．ら，Ｂｉｏｅｓｓａｙｓ２３，２００１年，ｐ．４９４−５０７
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
従って、本発明は、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを提供し、血管新生（腫瘍成長及び生存を支える血管新生を含む）におおけるＰＤＧＦＲβの役割を実証し、また、腫瘍及び血管形成疾患を処置する方法を提供する。本発明は更に、ＰＤＧＦＲβ及びＶＥＧＦＲを介してシグナル伝達を同時に阻害する利点を実証する。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
本発明は、ＰＤＧＦＲβが媒介するシグナル伝達のＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを提供する。本発明の実施形態で、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、血小板由来成長因子レセプター−β（ＰＤＧＦＲβ）に特異的に結合する抗体である。かかる抗体の１つは、ＣＤＲＨ１で配列番号２０；ＣＤＲＨ２で配列番号２２；ＣＤＲＨ３で配列番号２４；ＣＤＲＬ１で配列番号２８；ＣＤＲＬ２で配列番号３０；及びＣＤＲＬ３で配列番号３２と少なくとも約９０％相同か、又は約９０％一致する相補性決定領域を有する。かかる抗体の別のものは、配列番号１８の重鎖可変ドメインアミノ酸配列、及び配列番号２６の軽鎖可変ドメインアミノ酸配列を含む。別の実施形態で、かかる抗体は、ＣＤＲＨ１で配列番号４；ＣＤＲＨ２で配列番号６；ＣＤＲＨ３で配列番号８；ＣＤＲＬ１で配列番号１２；ＣＤＲＬ２で配列番号１４；及びＣＤＲＬ３で配列番号１６と少なくとも約９０％相同か、又は約９０％一致する相補性決定領域を有する。かかる抗体の別のものは、配列番号２の重鎖可変ドメインアミノ酸配列、及び配列番号１０の軽鎖可変ドメインアミノ酸配列を含む。本発明は更に、前記抗体の１つと同じか又は重複するエピトープに結合するＰＤＧＦＲβ特異抗体を含む。
【００１０】
本発明の抗体は、キメラ、ヒト化、又はヒト抗体でもよい。本発明の抗体は、例えば、単鎖抗体、Ｆａｂ及びＦ（ａｂ’）２断片、単鎖Ｆｖ、及び単一ドメイン抗体などの抗原結合断片でもありうる。抗体は、二特異性抗体及び三特異性抗体も含む。更に、抗体は二重特異性であることができる。
【００１１】
本発明は更に、かかる抗体をコード化する単離されたポリヌクレオチド、発現ベクター、及び当該抗体を産生する宿主細胞を提供する。
【００１２】
本発明は、有効量のＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを哺乳動物に投与することを含む、哺乳動物において血小板由来成長因子レセプター−β（ＰＤＧＦＲβ）の活性を調節する方法を提供する。本発明の一つの実施形態では、有効量のＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを用いて、哺乳動物における血管新生を阻害する。別の実施形態では、有効量のＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを用いて、哺乳動物における腫瘍成長を低減する。ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲβに結合する抗体、又はＰＤＧＦＲβ若しくはＰＤＧＦＲβリガンドに結合してＰＤＧＦＲβが媒介するシグナル伝達を低減若しくは阻止する他の任意の作用物であることができる。処置方法は、ＶＥＧＦＲアンタゴニストの同時投与を更に含むことができる。或いは、処置方法には、二重特異性抗体など、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニスト及びＶＥＧＦＲアンタゴニストの双方である作用物を使用できる。
【００１３】
本発明によれば、腫瘍及び血管形成状態の処置は更に、化学療法剤又は放射線などの抗新生物剤の投与を含むことができる。
【図面の簡単な説明】
【００１４】
【図１】図１は、抗ＰＤＧＦＲβ抗体、１Ｂ３の定量的レセプター結合及び阻止アッセイを示す。（Ａ）精製Ｆａｂ断片又は全長１Ｂ３  ＩｇＧをｍＰＤＧＦＲβ／Ｆｃ被覆プレート（１μｇ／ｍｌ）に添加して、室温で１時間インキュベートした。プレートに結合した抗体を、ヤギ抗ヒト−κ抗体−ＨＲＰで検出した。（Ｂ）１Ｂ３抗体又はＦａｂを、先ず一定量のｍＰＤＧＦＲβ／Ｆｃ（５０ｎｇ）と混合して、室温で３０分間インキュベートした。次いでこの混合物をＰＤＧＦ−ＢＢ（０．５μｇ／ｍｌ）で予めコーティングしたプレートに移し、室温で１時間インキュベートした。プレートに結合したｍＰＤＧＦＲβ／Ｆｃを、ヤギ抗ヒトＦｃ抗体−ＨＲＰ接合体で検出した。ＩＭＣ−１１２１は、ヒトＶＥＧＦＲ２に対する指向性の抗体である。データは三重の試料の平均±ＳＤを表す。
【図２】図２は、細胞表面ＰＤＧＦＲβへの抗体１Ｂ３の結合に起因する、ＰＤＧＦ−ＢＢ誘導性レセプターリン酸化、並びに下流のシグナル伝達分子、ＭＡＰＫ及びＡｋｔの阻害を示す。（Ａ）ＮＩＨ／３Ｔ３（線維芽細胞）、Ｄ１２２（Ｌｅｗｉｓ肺癌腫）、４Ｔ１（乳癌）、Ｂ１６（黒色腫）及びＨ５Ｖ（ＰｍＴで形質転換した内皮細胞）細胞で、抗ＰＤＧＦＲβ抗体１Ｂ３及び抗ヒトＦｃ抗体−ＦＩＴＣ接合体とインキュベートしたもののＦＡＣＳ解析。（Ｂ）ＮＩＨ−３Ｔ３細胞におけるＰＤＧＦ−ＢＢ誘導性レセプターリン酸化の阻害。（Ｃ）Ｄ１２２細胞におけるＰＤＧＦ−ＢＢ誘導性レセプターリン酸化の阻害。（Ｄ）Ｄ１２２細胞におけるＡＫＴ及びｐ４４／４２  ＭＡＰキナーゼのＰＤＧＦ−ＢＢ刺激リン酸化の阻害
【図３】図３は、ヒト異種移植片腫瘍のインビボの成長に対する、抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体、１Ｂ３を用いた処置の効果を示す。６種の異種移植片モデル、ＳＫ−ＯＶ−３、ＯＶ−ＣＡＲ−８、ＢｘＰＣ−３、ＯＶ−ＣＡＲ−５、Ｃａｋｉ−１及びＮＣＩ−Ｈ４６０（それぞれＡ〜Ｆ）を用い、胸腺欠損ヌードマウスにおいて異種移植片腫瘍に対する１Ｂ３の効果を調べた。確立した腫瘍（およそ２５０〜３００ｍｍ３）を持つマウスを無作為にグループ分けし、指示量の１Ｂ３、正常ヒトＩｇＧ、又は生理食塩水で腹腔内注射により週２回（マウスを週３回処置したＢｘＰＣ−３モデルを除く）処置した。腫瘍体積を週２回測定し、平均±ＳＥＭとして示した。＊１は、重篤な疾病に起因するマウスの死亡を示す。１Ｂ３はマウスに結合するが、ヒト、ＰＤＧＦＲβには結合しない。従って、観察された処置への応答は、宿主細胞の刺激の阻害に起因するものである。
【図４】図４は、インビボのヒト異種移植片腫瘍の成長に対する、抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体、１Ｂ３と、抗ｍＶＥＧＦＲ２抗体、ＤＣ１０１とを組み合わせた処置の効果を示す。ＢｘＰＣ−３（Ａ）又は５ｘ１０６  ＮＣＩ−Ｈ４６０（Ｂ）の皮下異種移植片は、雌性胸腺欠損（ｎｕ／ｎｕ）マウスで確立した。腫瘍がおよそ３００〜３５０ｍｍ３に達したら、マウスを無作為化して４群（ｎ＝１２）に分け、米国薬局方準拠の生理食塩水、４０ｍｇ／ｋｇの１Ｂ３、４０ｍｇ／ｋｇのＤＣ１０１又は４０ｍｇ／ｋｇの１Ｂ３プラス４０ｍｇ／ｋｇのＤＣ１０１で週３回処置した。腫瘍体積を週２回測定して、平均±ＳＥＭとして示す。＊１は、重篤な疾病に起因するマウスの死亡を示す。１Ｂ３はマウスに結合するが、ヒト、ＰＤＧＦＲβには結合しない。ＤＣ１０１はマウスに結合するが、ヒト、ＶＥＧＦＲ２には結合しない。従って、観察された処置への応答は、宿主細胞の刺激の阻害に起因するものである。
【図５】図５は、１Ｂ３、ＤＣ１０１、又はＤＣ１０１プラス１Ｂ３で処置した後のヒト異種移植片の免疫組織化学的分析結果を示す。処置後第３４日（ＢｘＰＣ３モデル、パネルＡ〜Ｃ）又は５０日（ＮＣＩ−Ｈ４６０モデル、パネルＤ〜Ｆ）に、各群からの６匹のマウスを屠殺し、腫瘍をＩＨＣ分析用に処理した。腫瘍を切片にし、血管（抗ＣＤ３１）及び周皮細胞／ＳＭＣ被覆（α−ＳＭＡ、パネルＢ及びＥ）の両方を二重染色した。各切片から腫瘍周縁及び腫瘍コアの免疫蛍光画像を５枚撮って、総ＣＤ３１＋血管（パネルＡ及びＤ）、α−ＳＭＡ＋血管（パネルＢ及びＥ）、及び総ＣＤ３１＋血管に対するＣＤ３１＋／α−ＳＭＡ＋二重染色のパーセンテージ（パネルＣ及びＦ）を定量化した。２種の異なる定量化方法を用いて個々の腫瘍切片の血管分布の程度、すなわち血管密度（血管の数／ｍｍ３）、及び血管面積のパーセンテージ（総腫瘍面積に対する血管面積％）を測定した。統計的解析は、二元配置分散分析（ｔｗｏ−ｗａｙ  ＡＮＯＶＡ）の後、ＦｉｓｈｅｒのＬＳＤ法を用いて多重比較（Ｓｉｇｍａ  Ｓｔａｔ  ３．１  Ｓｙｓｔａｔ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｐｏｉｎｔ  Ｒｉｃｈｍｏｎｄ、ＣＡ）を行った。＊生理食塩水群と比較してＰ＜０．０５。白抜きのバーは腫瘍周縁で、黒塗りのバーは腫瘍コアを示す。
【図６】図６は、ヒトＰＤＧＦＲβに対するＰＤＧＦＲβ特異的ヒト抗体２Ｃ５、及びマウスＰＤＧＦＲβによる、レセプター結合及びリガンド（ＰＤＧＦ−ＢＢ）の阻止を示す。結合及びリガンドの阻止は、マウスＰＤＧＦＲβのみに結合するＰＤＧＦＲβ特異抗体１Ｂ３と比較している。
【図７】図７は、抗ＰＤＧＦＲβ抗体２Ｃ５によるヒトＣａｋｉ−１腫瘍細胞において、ＰＤＧＦＲβのリガンド（ＰＤＧＦ−ＢＢ）誘導リン酸化の阻害を実証するウエスタンブロットである。抗体は、Ａｋｔ及びＰ４４／４２のリン酸化も阻害する。
【図８】図８は、抗ＰＤＧＦＲβ抗体２Ｃ５によるマウスＮＩＨ−３Ｔ３及びＤ１２２細胞系において、ＰＤＧＦＲβのリガンド（ＰＤＧＦ−ＢＢ）誘導リン酸化の阻害を実証するウエスタンブロットを示す。
【図９】図９は、抗ＰＤＧＦＲβ抗体１Ｂ３（マウスＰＤＧＦＲβに対して特異的）及び／又は２Ｃ５（ヒト及びマウスＰＤＧＦＲβの両者に結合）で処置したヌードマウスにおける、６種の皮下ヒト異種移植片腫瘍の成長を示す。
【図１０】図１０は、抗ＰＤＧＦＲβ抗体２Ｃ５（ヒト及びマウスＰＤＧＦＲβの両者に結合）及びマウスＶＥＧＦＲ−２特異抗体（ＤＣ１０１）で処置したヌードマウスにおける、６種の皮下ヒト異種移植片腫瘍の成長を示す。
【図１１】図１１は、細胞系遊走アッセイの結果を示し、２Ｃ５がＰＤＧＦ−ＢＢで刺激される細胞遊走を阻害することを実証している。
【図１２】図１２は、腫瘍異種移植片モデルにおける、２Ｃ５／化学療法併用、及び２Ｃ５／化学療法／ＤＣ１０１治療の抗腫瘍活性を示す。
【図１３】図１３は、腫瘍異種移植片モデルにおける、２Ｃ５／３Ｇ３及び２Ｃ５／１Ｅ１０併用治療の抗腫瘍活性を示す。
【図１４】図１４は、ＰＤＧＦＲβ、ＰＤＧＦ−ＢＢ、ＶＥＧＦ及びＦＧＦ発現に対する２Ｃ５の効果を示す。
【図１５】図１５は、ＰＤＧＦＲβドメインへの２Ｃ５の結合を示す。
【図１６】図１６は、１Ｂ３の可変重鎖及び可変軽鎖のＤＮＡ及びアミノ酸配列を示し、ＣＤＲには下線を付している。
【図１７】図１７は、２Ｃ５の可変重鎖及び可変軽鎖のＤＮＡ及びアミノ酸配列を示し、ＣＤＲには下線を付している。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
本発明は、ＰＤＧＦＲβに特異的な抗体、又はその断片を提供する。本発明の抗体には、ＰＤＧＦＲβのドメイン１及び２に特異的に結合するものが含まれる。本発明の抗体には、２Ｃ５及び１Ｂ３が含まれる。
【００１６】
本発明はまた、腫瘍及び血管形成疾患の処置のための組成物及び方法であって、前記抗体を含むもの、及びＶＥＧＦＲアンタゴニストと組み合わせて抗ＰＤＧＦＲβアンタゴニストを含むものも提供する。特に、本発明は、抗腫瘍及び抗血管新生機構による、癌治療のためのＰＤＧＦ−Ｂ／ＰＤＧＦＲβシグナル伝達系路の特異的標的化を提供する。更に、本発明は、血管形成疾患の治療を提供する。
【００１７】
従って、本発明は、ＰＤＧＦＲβに特異的な血小板由来成長因子レセプター−β（ＰＤＧＦＲβ）アンタゴニストを提供する。ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲβ媒介シグナル伝達を優先的に阻害する生物学的分子である。本発明によれば、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲαの阻害よりも少なくとも３倍、若しくは少なくとも５倍、又は少なくとも１０倍高く、ＰＤＧＦＲβが媒介するシグナル伝達の阻害を媒介する。ＰＤＧＦＲβ特異的阻害を判定する方法の１つは、ＰＤＧＦＲβを発現するがＰＤＧＦＲαは発現しないように操作した細胞のＰＤＧＦ誘導性活性化の阻害を、ＰＤＧＦＲαは発現するがＰＤＧＦＲβは発現しないように操作した細胞のＰＤＧＦ誘導性活性化の阻害と比較することである。別の方法は、ＰＤＧＦＲβを優先的に活性化するＰＤＧＦ（例えば、ＰＤＧＦ−ＤＤ）、及びＰＤＧＦＲαを優先的に活性化するＰＤＧＦ（例えば、ＰＤＧＦ−ＡＡ）を用いてＰＤＧＦ誘導性活性化の阻害を比較することである。本発明の一つの実施形態では、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲβに結合する抗体である。本発明の別の実施形態では、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは小分子である。
【００１８】
ＶＥＧＦレセプターを標的化する抗血管形成アプローチは、抗腫瘍療法に有効なものとして徐々に認められてきている。例えば、抗ＶＥＧＦ抗体が、特定の腫瘍の処置に対して承認されている。更に、抗マウスＶＥＧＦＲ２抗体は、マウス異種移植片モデルにて、ＶＥＧＦ／ＶＥＧＦＲ２相互作用を阻止し、ＶＥＧＦで刺激される増殖及び血管内皮細胞の生存を阻害した。しかし、抗ＶＥＧＦＲ２抗体での処置は、マウスに移植した様々な腫瘍の成長に有意な遅延をもたらしたが、腫瘍の退行は稀であった。更に、いくつかの腫瘍は、長い処置期間にＶＥＧＦＲ２阻止に対する感受性が低下しうる（又は抵抗性を得ることさえある）ことを示唆する証拠が蓄積してきている。
【００１９】
本発明によれば、ＰＤＧＦＲβ特異的な阻害は、ＶＥＧＦＲアンタゴニストの抗血管形成及び抗腫瘍活性の双方を有意に増強する。従って、本発明は、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニスト、及び任意にＶＥＧＦＲアンタゴニストを投与することにより、血管新生を阻害し、且つ腫瘍成長を低減又は阻害する改良された方法を提供する。アンタゴニストは、レセプターチロシンキナーゼ（すなわち、ＰＤＧＦＲβ又はＶＥＧＦＲ）によって媒介されるシグナル伝達を阻止、調節又は妨害する分子であり、限定しないが、抗体、小分子、蛋白質、ポリペプチド、リガンド模倣物、アンチセンスオリゴデオキシヌクレオチド、アンチセンスＲＮＡ、小阻害ＲＮＡ、三重らせん形成核酸、顕性不活性変異体、及び可溶性レセプター発現が挙げられる。更には、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニスト及びＶＥＧＦＲアンタゴニストは、合わせて、二重特異性抗体などの単一化合物としてもよいが、これに限定されることはない。
【００２０】
ＰＤＧＦＲβ及びＶＥＧＦレセプターは、レセプターを含むキナーゼインサートドメインの同じファミリーに分類される。しかし、ＶＥＧＦレセプターは７つの免疫グロブリン様ループをそれらの細胞外ドメインに有し、これに対し、ＰＤＧＦＲα及びＰＤＧＦＲβには５つ存在する。また、ＶＥＧＦレセプターは、より長いキナーゼインサートを有する。ヒト及び他の哺乳動物由来のＰＤＧＦＲβ及びＶＥＧＦＲのアミノ酸配列、並びにそれらをコード化する核酸配列は、当該技術分野で周知である。ヒトＰＤＧＦＲβの非限定例となる配列は、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＭ＿００２６０９により提供される。そのヌクレオチド配列は、切断可能なシグナル配列を有する蛋白質をコード化する。その成熟蛋白質は、約４９９アミノ酸を含む細胞外部分、２３アミノ酸の膜貫通領域、及び約５５２アミノ酸の細胞内部分を含む。ＶＥＧＦＲ配列の非限定例として、ＮＭ＿００２０１９（ヒトＶＥＧＦＲ１／Ｆｌｔ１）、ＮＭ＿００２２５３（ヒトＶＥＧＦＲ２／ＫＤＲ／Ｆｌｋ１）、及びＮＭ＿１８２９２５（ヒトＶＥＧＦＲ３／Ｆｌｔ４）が挙げられる。これらのレセプターの各々の、チロシンキナーゼドメインを含む細胞内領域、及び膜貫通ドメインの位置、細胞外ドメインのＩｇ様ドメイン構造は、当該技術分野で周知である。
【００２１】
本発明の抗体は、ＰＤＧＦＲβに結合する。本願明細書で使用する場合、「抗体」とは、免疫グロブリン（Ｉｇ）分子及び免疫学的活性部分、又は免疫グロブリン分子の変異体をいう。抗体は、抗原と特異的に結合する１以上の抗原結合部位を含んでいる。抗体としては、限定しないが、ポリクローナル、モノクローナル、キメラ、及びヒト化抗体が挙げられる。免疫学的活性部分として、Ｆｖ、単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、単一可変ドメイン（ｓＶＤ）、Ｆａｂ、Ｆａｂ’及びＦ（ａｂ’）２断片などの一価及び二価断片が挙げられる。免疫学的に活性な部分は、二特異性抗体、三特異性抗体などの多価フォーム等に組み入れることができる。抗体としては更に、ファージにてディスプレイされる抗原結合断片、及び抗体接合体が挙げられる。
【００２２】
「単離抗体」とは、（１）成分の混合物から部分的に、実質的に、又は完全に精製されている抗体；（２）その自然環境の成分から同定並びに分離及び／又は回収されている抗体；（３）モノクローナルである抗体；（４）同じ種由来の他の蛋白質を含まない抗体；（５）異なる種由来の細胞により発現される抗体；又は（６）天然に存在しない抗体である。その自然環境の夾雑成分は、抗体の診断又は治療用途を妨害する可能性のある物質であり、酵素、ホルモン、及び他の蛋白性又は非蛋白性溶質を挙げることができる。単離抗体の例として、ＰＤＧＦＲβを用いて親和性精製されている抗ＰＤＧＦＲβ抗体、ハイブリドーマ又は他の細胞系によりインビトロで作製される抗ＰＤＧＦＲβ抗体、ファージライブラリーなどのライブラリーから単離されるヒト抗ＰＤＧＦＲβ、及び遺伝子導入マウス由来のヒト抗ＰＤＧＦＲβ抗体が挙げられる。
【００２３】
一般的には、天然由来の抗体分子は、２つの同じ重鎖及び２つの軽鎖で構成される。各々の軽鎖は通常、鎖間ジスルフィド結合により重鎖に共有結合しており、そして２つの重鎖は更に、ヒンジ領域で複数のジスルフィド結合により互いに結合している。個々の鎖は、類似サイズ（約１１０〜１２５アミノ酸）及び構造を有するが機能の異なるドメインに折り畳まれる。軽鎖は、１つの可変ドメイン（ＶＬ）と、１つの定常ドメイン（ＣＬ）とを含む。重鎖は、１つの可変ドメイン（ＶＨ）と、抗体のクラス又はイソタイプにより３つ又は４つの定常ドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３及びＣＨ４）とを含む。マウス及びヒトで、イソタイプは、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、及びＩｇＭであり、ＩｇＡ及びＩｇＧは更に、サブクラス又はサブタイプに再分類される。ＶＬ及びＶＨドメインからなる抗体の部分は、「Ｆｖ」と称され、抗原結合部位を構成している。単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）は、１つのポリペプチド鎖上にＶＬドメイン及びＶＨドメインを含む改変蛋白質であり、ここで１つのドメインのＮ末端と他のドメインのＣ末端は、可動性リンカーによって連結されている。「Ｆａｂ」とは、ＶＬ−ＣＬ（すなわち、軽鎖）及びＶＨ−ＣＨ１（「Ｆｄ」とも称する）からなる抗体の部分をいう。
【００２４】
本発明の抗体は、単一の可変ドメイン（ｓＶＤ）、及びｓＶＤを含む抗原結合蛋白質を含む。ｓＶＤ結合部位は、抗原特異的Ｆｖ領域（ＶＨ及びＶＬドメインの両者を含むもの）から取得できる。Ｆｖ領域の結合親和性及び特異性は、多くの場合、主に可変ドメインの１つの寄与により生じるものであると示すことができる。或いは、ｓｃＦｖを直接入手することができる。ｓＶＤの直接的な供給源には、ＶＨドメインのみを含む抗体を天然に発現する哺乳動物（例えば、カメリド（ｃａｍｅｌｉｄ））が含まれる。更に、単一の可変ドメインのみを発現するようにファージディスプレイライブラリーを構築することができる。例えば、ヒトドメイン抗体ファージディスプレイライブラリーが、Ｄｏｍａｎｔｉｓ（ケンブリッジ、ＵＫ）より市販されている。
【００２５】
抗体可変ドメインは、抗体ごとに、特に抗原結合部位の位置で、かなりのアミノ酸配列可変性を示す。「相補性決定領域」（ＣＤＲ）と称される３つの領域が、ＶＬ及びＶＨの各々に見出される。抗体のＣＤＲは、「超可変領域」と称されることが多い。
【００２６】
「Ｆｃ」は、対合重鎖定常ドメインを含む抗体の部分の呼称である。ＩｇＧ１抗体では、例えば、ＦｃはＣＨ２及びＣＨ３ドメインを含む。ＩｇＡ又はＩｇＭ抗体のＦｃは更に、ＣＨ４ドメインを含む。Ｆｃは、Ｆｃレセプター結合、補体が媒介する細胞毒性の活性化、及び抗体依存性細胞毒性に関連している。複数のＩｇＧ様蛋白質の複合体であるＩｇＡ及びＩｇＭなどの天然の抗体では、複合体形成にＦｃ定常ドメインが必要である。
【００２７】
最後に、「ヒンジ」領域は、抗体のＦａｂ及びＦｃ部分を離間させ、Ｆａｂ同士、またＦｃに対してＦａｂの可動性を提供し、２つの重鎖の共有結合のための複数のジスルフィド結合を含む。よって、本発明の抗体には、限定しないが、天然由来の抗体、（Ｆａｂ’）２などの二価断片、Ｆａｂなどの一価断片、単鎖抗体、単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、単一ドメイン抗体、多価単鎖抗体、二特異性抗体、三特異性抗体等で、抗原に特異的に結合するものが含まれる。抗体断片はまた、本発明の抗体の可変又は超可変領域のアミノ酸配列に実質的に類似するアミノ酸配列を備えたポリペプチドを含む。本明細書で実質的に同じアミノ酸配列とは、Ｐｅａｒｓｏｎ及びＬｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８５：２４４４−２４４８（１９８８）に従いＦＡＳＴＡ検索法によって決定した場合に、比較対象のアミノ酸配列と少なくとも７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、又は少なくとも約９９％の相同性又は同一性を有する配列として定義される。
【００２８】
本発明には、「キメラ」抗体が含まれる。かかる抗体は一般的に、１つの抗体の可変ドメインと、異なる抗体の定常ドメインとを含む。通常は、抗体に対する宿主免疫応答を最低に抑えるために、そして抗体エフェクター機能を保持することにより抗体標的に対する宿主応答を増強するために、キメラ抗体の定常ドメインは、そのキメラ抗体が投与されるのと同じ種から得られる。
【００２９】
本発明は、「ヒト化」抗体も包含する。ヒト化可変ドメインを構築して、非ヒト起源の１以上の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含むアミノ酸配列をヒトフレームワーク領域（ＦＲ）に異種移植する。例えば、Ｊｏｎｅｓ，Ｐ．Ｔ．ら、１９９６，Ｎａｔｕｒｅ，３２１，５２２−２５；Ｒｉｅｃｈｍａｎ，Ｌ．ら、１９８８，Ｎａｔｕｒｅ３３２，３２３−２７；及びＱｕｅｅｎらの米国特許５５３０１０１号明細書を参照されたい。ヒト化構築体は、例えば、非ヒト供給源由来の抗原結合ドメインをヒトの処置に使用することが望まれる場合、有害な免疫原特性を排除するのに特に価値がある。可変ドメインは、高度の構造上の相同性を有しているので、ＣＤＲ及びＦＲに対応している可変ドメイン内のアミノ酸残基を容易に同定することが可能である。例えば、Ｋａｂａｔ，Ｅ．Ａ．，ら、１９９１、免疫学的興味が持たれる蛋白質の配列（Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ．）第５版、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ，Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤを参照されたい。このように、抗原結合に直接関わりそうなアミノ酸が、容易に同定される。更に、異種移植されたＣＤＲを含むヒト化結合ドメインの抗原に対する親和性を保存又は増強する方法が開発されている。１つの方法では、レシピエントの可変ドメインに、ＣＤＲ領域のコンホメーションに影響する外来フレームワーク残基を含める。第２の方法では、外来可変領域との相同性が最も近いヒト可変ドメインに外来ＣＤＲを異種移植する。Ｑｕｅｅｎ，Ｃ．ら、１９８９，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８６，１００２９−３３。ＣＤＲは、所望のＣＤＲ配列を含む重複プライマーを用いて個々のＦＲ配列を先ず増幅し、得られる遺伝子セグメントを引き続く増幅反応にてつなぎ合わせることにより、異なるＦＲに最も容易に異種移植される。異なる可変ドメインへのＣＤＲの異種移植は、アミノ酸配列内のＣＤＲに隣接するアミノ酸残基、又はＣＤＲのコンホメーションに影響を与える折り畳み可変ドメイン構造内のＣＤＲに対してパッキングされたアミノ酸残基の置換を更に含むことができる。従って、本発明のヒト化可変ドメインは、１以上の非ヒトＣＤＲを含むヒトドメインや、結合特性を保存又は増強するように更なる置換又は交換が行われているかかるドメインを含む。
【００３０】
本発明の抗体は、抗体を免疫系にとって自己として出現させるように、表面に曝された残基を交換することにより免疫原性を低減させている可変ドメインを用いてもよい（Ｐａｄｌａｎ，Ｅ．Ａ．，１９９１，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２８，４８９−９８）。抗体は、この方法によって親和性を喪失させずに修飾される（Ｒｏｇｕｓｋａら、１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９１，９６９−９７３）。抗原結合部位近傍のアミノ酸残基の内部パッキングは変化しないままであるから、親和性は保存される。免疫原性を低減する目的である、本発明による表面に曝された残基の置換は、ＣＤＲ残基又は結合特性に影響を及ぼす隣接残基の置換を意味するものではない。
【００３１】
本質的にヒトの可変ドメインを使用するのが好ましい場合が多い。ヒト抗体は、ヒトＶＨ及びＶＬフレームワーク領域（ＦＷ）や、ヒト相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。ＶＨ及びＶＬ可変ドメインの全てが、ヒト、又はヒト配列由来のものであるのが好ましい。抗体は、ヒト細胞から直接、例えばヒトハイブリドーマを創出することにより得ることができる。
【００３２】
或いは、ヒト抗体は、再配置しないヒトＩｇ遺伝子セグメントが導入されており且つ内在のマウスＩｇ遺伝子が不活性化されている遺伝子導入動物から、得ることができる（Ｂｒｕｅｇｇｅｍａｎｎ及びＴａｕｓｓｉｇ、１９９７，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８，４５５−５８に総説）。好ましい遺伝子導入動物は、１Ｍｂを超えるサイズの非常に大きな連続したＩｇ遺伝子断片を含む（Ｍｅｎｄｅｚら、１９９７，Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔ．１５，１４６−５６）が、適度な親和性のヒトＭａｂは、より小さな遺伝子座を持つ遺伝子導入動物から作製できる（例えば、Ｗａｇｎｅｒら、１９９４，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．４２，２６７２−８１；Ｇｒｅｅｎら、１９９４，Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔ．７，１３−２１を参照されたい）。
【００３３】
ヒト抗体は、抗体ＶＨ及び／又はＶＬドメインのライブラリーからも得ることができる。例えば、可変ドメインライブラリーは、ヒトゲノム配列から、又は生産的に再配置した可変領域遺伝子を発現している末梢血リンパ球から得ることができる。更には、ヒト遺伝子ライブラリーは合成できる。一実施形態で、ランダムな配列又は部分的にランダムな配列を含むように合成された１以上のＣＤＲで、ヒトフレームワーク領域を含む可変ドメインライブラリーを創出できる。例えば、ヒトＶＨ遺伝子セグメント及びＣＤＲ３Ｈ領域の合成配列（すなわち、合成ＤＨ−ＪＨ遺伝子セグメント）によってメンバーがコード化されているヒトＶＨ可変ドメインライブラリーを創出できる。同様に、ヒトＶＬ可変ドメインは、ヒトＶＬ遺伝子セグメント及びＣＤＲ３Ｌ領域の合成配列（すなわち、合成ＪＬ遺伝子セグメント）によってコード化されてもよい。別の実施形態では、ヒトフレームワークは、既知のヒト抗体配列又はヒト配列のサブグループ由来のコンセンサス配列を有するという点で、合成的であってもよい。別の態様では、１以上のＣＤＲは、再配置した可変ドメインを発現しているヒトリンパ球から増幅し、次いで特定のヒトフレームワーク内に組換えを行うことによって得られる。
【００３４】
可変ドメインのライブラリーをスクリーニングするには、ヒト重鎖及び軽鎖可変ドメインの組み合わせが糸状ファージの表面上にディスプレイされるファージディスプレイライブラリーを用いる（例えば、ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙら、１９９０，Ｎａｔｕｒｅ  ３４８，５５２−５４；Ａｕｊａｍｅら、１９９７，Ｈｕｍａｎ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ８，１５５−６８参照）のが一般的である。可変ドメインの組み合わせは通常、Ｆａｂ又はｓｃＦｖの形態で、糸状ファージ上にディスプレイされる。所望の抗原結合特性を有する様々な組み合わせの可変ドメインを保有するファージについて、ライブラリーをスクリーニングする。好ましい単一ドメインと可変ドメインとの組み合わせが、選択抗原への高親和性と、他の関連抗原への低交差反応性をディスプレイする。抗体断片の非常に大きなレパートリー（例えば、Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓら、１９９４，ＥＭＢＯ  Ｊ．１３，３２４５−６０参照）をスクリーニングすることにより、多様性に富んだ高親和性結合ドメインが単離され、その多くが、所望の抗原に対してサブナノモルの親和性を有することが期待される。
【００３５】
生理的免疫応答において、発現抗体遺伝子の突然変異及び選択により、それらの標的抗原に対して高親和性を有する抗体の生産が導かれる。親和性及び／又は特異性を修飾するために、本発明の抗体に組み込まれるＶＨ及びＶＬドメインを、同様にしてインビトロ又はインビボ突然変異及びスクリーニング手順に付すことができる。よって、本発明の結合ドメインには、直接突然変異、親和性成熟方法、又は鎖シャッフリングによりＣＤＲ及び／又はＦＷ領域を変異させることによって結合特性を改善した結合ドメインが含まれる。単一ドメイン抗体結合の一次決定基であるアミノ酸残基は、カバットに定義されるＣＤＲに含まれていてもよいが、他の残基を含んでいてもよいことは、理解されている。ｓＶＤの場合、抗原結合にとって重要な残基には、本来ＶＨ−ＶＬヘテロ二量体の界面に位置するアミノ酸も可能性として含まれる。一般的に、このような変異体をスクリーニングするのにファージディスプレイを用い、所望の結合特性を有するものを同定する（例えば、Ｙａｎｇら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２５４：３９２−４０３（１９９５）参照）。変異は、様々な方法で行うことができる。１つの方法では、本来は同一配列の集団において、２０のアミノ酸全て又はそのサブセットが特定の位置に見出されるように、個々の残基又は残基の組み合わせを無作為化する。或いは、エラープローンＰＣＲ法（例えば、Ｈａｗｋｉｎｓら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２６：８８９−８９６（１９９２）参照）により、様々なＣＤＲ残基にわたって突然変異を誘導してもよい。例えば、重鎖及び軽鎖可変領域遺伝子を含むファージディスプレイベクターを、大腸菌の変異誘発株において増殖させてもよい（例えば、Ｌｏｗら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２５０：３５９−３６８（１９９６）参照）。これらの突然変異誘発法は、当業者に公知の多くの方法の例示である。
【００３６】
本発明はまた、非免疫グロブリン骨格から改変された抗原結合蛋白質も含む。例えば、Ｓ．ａｕｒｅｕｓプロテインＡの免疫グロブリン結合ドメイン由来のアフィボディは、ジスルフィド結合を保有せず、可逆的折り畳みをディスプレイする。別の例としてのフィブロネクチンは、抗体様構造を有しており、ＣＤＲ様ループをディスプレイする。抗体と異なり、フィブロネクチンドメイン構造はジスルフィド結合に依存せず、それでも高い熱力学的安定性をディスプレイする。結合部位は、例えば、特定の位置でのコドンの多様化と、所望の抗原への結合についてのスクリーニングによって、このような骨格に改変することができる。コドンは、ループ、平坦面、空洞、又はかかる位置の組み合わせで無作為化できる。更に、ペプチド配列は挿入できる（通常はループ内）。得られるライブラリーの標的結合変異体は、当該技術分野で周知のスクリーニング技術を選択して単離でき、これにはファージディスプレイ、リボソームディスプレイ、細菌又は酵母表面ディスプレイ等が挙げられるが、これらに限定されることはない。
【００３７】
治療用の抗原結合蛋白質について、潜在的な免疫原性を最少にするため、様々なストラテジーが利用できる。ヒト骨格が使用でき、例えばペグ化又はＴ−細胞エピトープ改変（すなわち、Ｔ−細胞反応性配列の最少化）によって免疫原性を最少にできる。
【００３８】
非免疫グロブリン骨格から得られる抗原結合蛋白質は、免疫グロブリン型蛋白質よりも経済的に作製できることが多い。例えば、ジスルフィド結合又は遊離システインがないことで、細菌の細胞質の還元的環境における機能性分子の発現が可能になり、その結果、周辺質発現よりも通常高収率が得られ、またインビトロでの再折り畳みよりも利便性が高い。Ｂｉｎｚ、Ｈ．Ｋ．ら（Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２３：１２５７−６８，２００５）は、種々のこのような抗原特異的結合蛋白質、及びそれらの開発のための技術を開示している。
【００３９】
前記のとおり、二重特異性抗体を、同時投与の選択肢として提供できる。種々の望ましい特性を組み込むように設計された様々な二重特異性抗体が存在している。例えば、二重特異性二特異性抗体は最小のサイズを有している。４つの抗原結合部位を（各々の結合特異性に対して２つずつ）備えた二重特異性抗体は、各標的に対して、対応する天然抗体に類似する結合活性を有している。特定の二重特異性抗体はＦｃ領域を組み込んでおり、このため、天然の抗体のエフェクター機能（例えば、補体依存性細胞毒性（ＣＤＣ）及び抗体依存性細胞性細胞毒性（ＡＤＣＣ））を保持している。ＷＯ０１／９０１９２号パンフレットは、ＩｇＧ様四価抗体を記載している。ＷＯ２００６／０２０２５８号パンフレットは、２つの二特異性抗体を組み込んでおり、エフェクター機能を保持する四価抗体を記載している。二重特異性抗体の抗原結合部位に、種々の抗原結合抗体断片を用いることができる。これらにはＦｖ、ｓｃＦｖ、及びｓＶＤが含まれるが、限定されることはない。
【００４０】
ＰＤＧＦＲβが媒介するシグナル伝達を阻止する別の手段は、ＰＤＧＦＲβ特異的小分子インヒビターを介するものである。小分子とは、複素環、ペプチド、糖類、ステロイド等といった有機小化合物をいう。小分子モジュレーターは、好ましくは約２０００ダルトン未満、好ましくは約１０００ダルトン未満、より好ましくは約５００ダルトン未満の分子量を有する。化合物は、有効性、安定性、医薬相溶性等を増強するように修飾してもよい。小分子インヒビターとして、レセプターチロシンキナーゼのＡＴＰ結合ドメイン、基質結合ドメイン、又はキナーゼドメインを阻止する小分子が挙げられるが、これらに限定されることはない。別の実施形態では、小分子インヒビターは、ＰＤＧＦＲβのリガンド結合ドメインに結合して、ＰＤＧＦＲβリガンドによるレセプター活性化を阻止する。小分子ライブラリーを、高処理生化学的アッセイ、酵素的アッセイ、又は細胞系アッセイを使用し、阻害活性についてスクリーニングすることができる。アッセイは、被検化合物がＰＤＧＦＲβを阻害するが、ＰＤＧＦＲαは阻害しない能力を検出するように策定できる。
【００４１】
アンチセンスオリゴデオキシヌクレオチド、アンチセンスＲＮＡ及び阻害的小ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）は、ｍＲＮＡの分解の標的化をもたらし、これにより蛋白質の翻訳を阻止する。従って、ＰＤＧＦＲβの発現を阻害することができる。アンチセンスオリゴヌクレオチドが遺伝子発現を抑制する能力は、２５年以上前に発見された（Ｚａｍｅｃｎｉｋ及びＳｔｅｐｈｅｎｓｏｎ、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．７５：２８０−２８４（１９７８））。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ｍＲＮＡ及びｐｒｅ−ｍＲＮＡと塩基対合し、スプライシング、ポリアデニル化、搬出、安定性、及び蛋白質翻訳を含め、ＲＮＡプロセッシング及びメッセージ翻訳の数工程を妨害できる潜在性がある（Ｓａｚａｎｉ及びＫｏｌｅ、Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｉｎｖｅｓｔ．１１２：４８１−４８６（２００３））。しかし、最も強力で広く使用されるアンチセンスストラテジーとして挙げられるのは、ＲＮａｓｅＨを介したｍＲＮＡ又はｐｒｅ−ｍＲＮＡの分解、及び異常スプライスジャンクションの標的化を介したスプライスシングの改変の２つである。ＲＮａｓｅＨは、ＤＮＡ／ＲＮＡヘテロ二重鎖を認識して、ＤＮＡオリゴヌクレオチドの５’と３’端の間のほぼ中間点でＲＮＡを切断する。
【００４２】
ＲＮＡが媒介する生来の機構は、ｍＲＮＡ安定性、メッセージの翻訳、及びクロマチン構築を調節できる（Ｍｅｌｌｏ及びＣｏｎｔｅ、Ｎａｔｕｒｅ．４３１：３３８−３４２、２００４）。更には、外因的に導入した長い二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）が、様々な下等生物において遺伝子サイレンシングのための有効な道具になる。しかし、哺乳動物では、長いｄｓＲＮＡは、ウイルス感染及びインターフェロン生産の影響に関連する強毒性の応答を誘発する（Ｗｉｌｌｉａｍｓ、Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．Ｔｒａｎｓ．２５：５０９−５１３，１９９７）。これを回避するために、Ｅｌｂａｓｈｉｒ及び共同研究者（Ｅｌｂａｓｈｉｒら、Ｎａｔｕｒｅ，４１１：４９４−４９８，２００１）は、各鎖に５’ホスフェート及び２つの塩基３’オーバーハングを備え、細胞内への導入に伴い標的化ｍＲＮＡを選択的に分解する、１９マーの二重鎖で構成されるｓｉＲＮＡの使用を開始した。
【００４３】
哺乳動物でｄｓＲＮＡを妨害する作用には、通常は２つの酵素的工程が関わる。先ず、Ｄｉｃｅｒ（ＲＮａｓｅＩＩＩ型酵素）で、２１〜２３マーのｓｉＲＮＡセグメントにまでｄｓＲＮＡを切断する。その後、ＲＮＡ誘導性サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）がＲＮＡ二重鎖を巻き戻し、一本の鎖を同族ｍＲＮＡの相補的領域と対合させ、そしてｓｉＲＮＡ鎖の５’端の１０ヌクレオチド上流の部位での切断を開始する（Ｈａｎｎｏｎ、Ｎａｔｕｒｅ．４１８：２４４−２５１，２００２）。１９〜２２マーの範囲の化学合成した短いｓｉＲＮＡは、Ｄｉｃｅｒ工程を必要とせずに直接ＲＩＳＣ装置に入ることができる。ＲＮＡ二重鎖のいずれの鎖でも、ＲＩＳＣ複合体に負荷できる可能性があるが、オリゴヌクレオチドの組成が鎖の選択に影響する可能性があることは理解すべきである。よって、特定のｍＲＮＡ標的の選択的な分解を成し遂げるには、二重鎖が相対的弱塩基の対合を５’端に有することによりアンチセンス鎖成分の負荷を支持すべきである（Ｋｈｖｏｒｏｖａ、Ｃｅｌｌ．１１５：２０９−２１６、２００３）。外来ｓｉＲＮＡは、合成されたオリゴヌクレオチドとして提供するか、又はプラスミド若しくはウイルスベクターから発現させることができる（Ｐａｄｄｉｓｏｎ及びＨａｎｎｏｎ、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．５：２１７−２２４，２００３）。後者の場合、前駆体分子は通常、４〜８ヌクレオチドのループと１９〜３０ヌクレオチドの基部とを含む短いヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）として発現されるべきであり、これらが次いでＤｉｃｅｒによって切断されて、機能性ｓｉＲＮＡを形成する。
【００４４】
ＰＤＧＦＲβが媒介するシグナル伝達を阻害する他の手段として、レセプターに結合するが活性化しないＰＤＧＦ模倣物、並びに三重らせんインヒビター及び顕性不活性ＰＤＧＦＲβ変異体などのＰＤＧＦＲβレベル又は活性を低減させる遺伝子又はポリヌクレオチドの発現が挙げられるが、これらに限定されることはない。
【００４５】
本発明によって使用されるＲＴＫアンタゴニスト（すなわち、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニスト、ＶＥＧＦＲアンタゴニスト）は、以下の特徴の１以上を示す。
【００４６】
１）アンタゴニストは、ＲＴＫ（すなわち、ＰＤＧＦＲβ、ＶＥＧＦＲ）の外側ドメインに結合し、リガンド結合を阻害する。阻害は、精製又は膜に結合したレセプターを用いて、例えば、直接結合アッセイにより定量できる。
【００４７】
２）アンタゴニストは、レセプターを中和する。レセプターの外側、細胞外ドメインへのリガンドの結合（例えば、ＰＤＧＦＲβへのＰＤＧＦ−ＢＢ又はＰＤＧＦ−ＤＤ；ＶＥＧＦＲへのＶＥＧＦ又はＰｌＧＦ）が、ＭＡＰＫ、Ａｋｔ、及びＩＲＳ−１を含む下流のシグナル伝達分子並びにレセプターの自己リン酸化を刺激する。レセプターの中和には、シグナル伝達に通常関わるこれらの活性の１つ以上の阻害、減少、不活性化及び／又は破壊が含まれる。中和は、例えば、組織、培養細胞、又は精製した細胞成分を用いてインビボ、エキソビボ、又はインビトロで判定できる。こうして、ＰＤＧＦＲβ及び／又はＶＥＧＦＲの中和には、成長（増殖及び分化）、血管新生（血管動員、浸潤、及び転移）、並びに細胞運動性及び転移（細胞接着及び新入生）の阻害、減少、不活性化及び／又は破壊を含む様々な効果がある。
【００４８】
レセプター中和の１つの尺度は、レセプターのチロシンキナーゼ活性の阻害である。チロシンキナーゼ阻害は、例えば、組換えキナーゼレセプターの自己リン酸化レベル、及び／又は天然又は合成基質のリン酸化を測定することによって、周知の方法を用いて判定できる。よって、リン酸化アッセイは、本発明に照らして抗体の中和を判定するのに有用である。リン酸化は、例えば、ＥＬＩＳＡアッセイ又はウエスタンブロットでホスホチロシンに特異的な抗体を用いて検出できる。チロシンキナーゼ活性のアッセイについては、Ｐａｎｅｋら、Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒａ．２８３：１４３３−４４（１９９７）及びＢａｔｌｅｙら、Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉ．６２：１４３−５０（１９９８）に記載されている。本発明の抗体は、リガンドに応答する細胞で、少なくとも約３０％、少なくとも約５０％、少なくとも約７５％、好ましくは少なくとも約８５％、更に好ましくは少なくとも約９０％、ＰＤＧＦＲβのチロシンリン酸化の低減を引き起こす。
【００４９】
別のレセプター中和の尺度は、レセプターの下流基質又は他のシグナル伝達成分のリン酸化の阻害である。従って、ＭＡＰＫ、Ａｋｔ、ＩＲＳ−１、及び他の細胞成分のリン酸化のレベルを測定できる。リン酸化の低減は、少なくとも約４０％であり、少なくとも約６０％、又は少なくとも約８０％でありうる。
【００５０】
更に、レセプターチロシンキナーゼ活性によって調節される蛋白質の発現を検出する方法が、レセプター中和を判定するのに利用できる。そのような方法としては、蛋白質の発現を検出するための免疫組織化学（ＩＨＣ）、遺伝子増幅を検出するための蛍光インサイツ・ハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、競合的放射性リガンド結合アッセイ、ノーザン及びサザンブロットなどの固形マトリックスブロッティング法、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）及びＥＬＩＳＡが挙げられる。例えば、Ｇｒａｎｄｉｓら、Ｃａｎｃｅｒ，７８：１２８４−９２（１９９６）；Ｓｈｉｍｉｚｕら、ＪａｐａｎＪ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，８５：５６７−７１（１９９４）；Ｓａｕｔｅｒら、Ａｍ．Ｊ．Ｐａｔｈ．，１４８：１０４７−５３（１９９６）；Ｃｏｌｌｉｎｓ，Ｇｌｉａ１５：２８９−９６（１９９５）；Ｒａｄｉｎｓｋｙら、Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１：１９−３１（１９９５）；Ｐｅｔｒｉｄｅｓら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５０：３９３４−３９（１９９０）；Ｈｏｆｆｍａｎｎら、Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１７：４４１９−２６（１９９７）；Ｗｉｋｓｔｒａｎｄら、Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５５：３１４０−４８（１９９５）を参照されたい。エキソビボアッセイも、レセプターの中和を判定するのに使用できる。例えば、レセプターチロシンキナーゼ阻害は、インヒビターの存在下または不在下において、レセプターリガンドで刺激される細胞系を用いた分裂促進アッセイによって観察できる。別の方法は、ＲＴＫを発現している腫瘍細胞、又はＰＤＧＦＲβを発現するようにトランスフェクトされた細胞系の成長の阻害試験に関するものである。阻害は、腫瘍モデル、例えばマウスに注射したヒト腫瘍細胞を用いても観察できる。
【００５１】
本発明のアンタゴニストは、レセプター中和の特定の機構に何ら限定されない。本発明のアンタゴニストは、細胞表面レセプターに外部から結合し、レセプターが会合したチロシンキナーゼを介して媒介されるその後のシグナル伝達とリガンドとの結合を阻止し、そしてＰＤＧＦＲβ及びシグナル伝達カスケードの他の下流蛋白質のリン酸化を防止できる。
【００５２】
３）アンタゴニストは、レセプターを下方調節する。細胞の表面上に存在するＲＴＫの量は、レセプター蛋白質生産、内部移行、及び分解に依存する。細胞の表面上に存在するレセプターの量は、レセプターの内部移行、又はレセプターに結合した分子を検出することにより間接的に測定できる。例えば、レセプター内部移行は、細胞をレセプター特異的に標識化した抗体に接触させることによって測定できる。次いで膜結合抗体を剥がし、集めて計数する。内部移行した抗体は、細胞を溶解して、溶解液中の標識を検出することによって定量する。
【００５３】
抗ＲＴＫ抗体又は他の物質で処置した後の細胞上に存在するレセプター量を直接測定する別の方法は、例えば、ＲＴＫの表面発現について染色した細胞の蛍光活性化細胞選別解析による。染色した細胞は、３７℃でインキュベートして、蛍光強度を経時的に測定する。対照として、染色した集団の一部を４℃でインキュベートできる（レセプター内部移行が休止する条件下）。
【００５４】
細胞表面ＲＴＫは、ＰＤＧＦＲβに特異的であり試験する抗体の結合を阻止したり競合したりすることのない、異なる抗体を用いて検出及び測定できる。特定の実施形態では、ＲＴＫアンタゴニストでの処置への応答において、細胞表面ＲＴＫの低減は、少なくとも約５０％、又は少なくとも約７５％、又は少なくとも約９０％である。有意な低減は、通常、４時間という短時間で観察できる。
【００５５】
下方調節の別の測定は、細胞に存在するレセプター蛋白質全体の減少であり、内部レセプターの分解を反映する。従って、本発明の抗体で細胞（特に癌細胞）を処置した結果、細胞ＲＴＫ全体の低減が起きる。特定の実施形態では、細胞表面ＲＴＫの低減は、ＲＴＫアンタゴニストでの処置への応答において、少なくとも約５０％、又は少なくとも約７５％、又は少なくとも約９０％である。
【００５６】
抗体特異性は、抗原の特定のエピトープに対する抗体の選択的認識を意味する。天然の抗体は、例えば、単一特異的である。二重特異性抗体（ＢｓＡｂ）は、２種の異なる抗原結合特異性又は部位を有する抗体である。抗原結合蛋白質が１種より多くの特異性を有する場合、認識されるエピトープは、単独の抗原と、又は１種よりも多い抗原と会合してもよい。
【００５７】
好ましくは、本発明の抗体は、少なくともそのレセプターへの天然リガンドの結合と同程度の強さでレセプターに結合する。親和性は、抗原と抗体との解離に関する平衡定数（Ｋｄ）によって表され、抗原決定基と抗体結合部位の間の結合強度の測定値である。結合力は、抗体とその抗原との間の結合の強度の測定値である。結合力は、エピトープと抗体上のその抗原結合部位との間の親和性、及び抗体の価数の両方に関連している。価数とは、ある免疫グロブリンが特定のエピトープに対して有する抗原結合部位の数を意味する。例えば、一価抗体は特定のエピトープに対して１つの結合部位を有する。抗原決定基、又はエピトープは、所定の抗体が結合する抗原の部位である。Ｋの代表的な数値は、１０５〜１０１１リットル／モルである。１０４リットル／モル未満のＫはいずれも、非特異的な結合を示唆すると考えられる。Ｋの逆数は、Ｋｄ（Ｋｄは、解離定数とも称してよい）と示す。Ｋｄの値が低い程、抗原決定基と抗体結合部位との間の結合強度は強くなる。
【００５８】
本発明の抗体には、ＰＤＧＦＲβに特異的に結合し、レセプターが媒介するシグナル伝達を低減又は阻害する任意の抗体が含まれる。特定の実施形態で、抗体はそれぞれのレセプターに、約１０−８Ｍ−１未満、又は約１０−９Ｍ−１未満、又は約３ｘ１０−１０Ｍ−１未満のＫｄで結合する。特定のＰＤＧＦＲβ特異抗体の非限定例が、本明細書に開示及び／又は例証されている。本発明の特定の２つの抗体、１Ｂ３及び２Ｃ５の核酸及びアミノ酸配列を、表１に示す。
【００５９】
好ましい実施形態では、抗体の１、２、３、４、５、又は６つ全ての相補性決定領域（ＣＤＲ）は、１Ｂ３のＣＤＲのうちのいずれか１つから選択される配列を有する。代替的に好ましい実施形態では、抗体の１、２、３、４、５、又は６つ全ての相補性決定領域（ＣＤＲ）は、２Ｃ５のＣＤＲのうちのいずれか１つから選択される配列を有する。
【００６０】
本発明の抗体は、別の好ましい実施形態では、１Ｂ３若しくは２Ｃ５の重鎖可変領域に実質的に一致する重鎖可変領域配列、及び／又は１Ｂ３若しくは２Ｃ５の軽鎖可変領域に実質的に一致する軽鎖可変領域配列を有する。「実質的に一致する」によって、アミノ酸配列が参照配列と少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、又は９９％一致していることを意味する。
【００６１】
本発明の一つ実施形態では、ＰＤＧＦＲβ特異抗体は、配列番号１８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、及び配列番号２６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含んでいる。本発明の別の実施形態で、ＰＤＧＦＲβ特異抗体は、配列番号２のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン、及び配列番号１０のアミノ酸配列を含む軽鎖を含んでいる。本発明のＰＤＧＦＲβ特異抗体は更に、前記抗体と競合する（すなわち、同じ又は重複するエピトープに結合する）ものを含んでいる。
【００６２】
本発明はまた、前記抗体の可変又は超可変領域のアミノ酸配列と実質的に同じアミノ酸配列を備えた抗体も含んでいる。本明細書で実質的に同じアミノ酸配列は、Ｐｅａｒｓｏｎ及びＬｉｐｍａｎ（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：２４４４−８（１９９８））に従うＦＡＳＴＡ検索法により決定される場合、別のアミノ酸配列と少なくとも８０％、又は少なくとも約９０％、又は少なくとも約９５％の相同性又は同一性を有する配列と定義される。特にインビボの突然変異及び選択に起因して観察されるフレームワーク領域内の高頻度変異に鑑み、フレームワーク領域内に多岐にわたる置換を施すことができると期待すべきである。しかし、特定のＣＤＲ位置での変異も可能であることも期待される。例えば、すべてのＣＤＲアミノ酸が抗原と直接接触するわけではない。アミノ酸の変化、特に非接触ＣＤＲ位置での保存的な変化は、全体の結合を抑止するのでなく、潜在的により良好なものとなるよう、結合親和性に影響することが期待される。現在の技術によれば、設計によって、又は無作為に、配列の変更と、それらの結果の試験を、当業者であれば容易に行うことができる。保存的アミノ酸置換は、ペプチド、ポリペプチド若しくは蛋白質、又はその断片の１個又は数個のアミノ酸の変化による、アミノ酸組成の変化として定義される。この置換は、一般に類似した特性（例えば、酸性、塩基性、芳香性、サイズ、正帯電又は負帯電、極性、非−極性）を持つアミノ酸のものであり、置換によって、ペプチド、ポリペプチド又は蛋白質の特徴（例えば、電荷、等電点、親和性、結合力、立体配置、溶解性）又は活性を実質的に変更しないように行なわれる。このような保存的アミノ酸置換に関して行うことができる典型的置換は、以下のアミノ酸群間であってよい。グリシン（Ｇ）、アラニン（Ａ）、バリン（Ｖ）、ロイシン（Ｌ）及びイソロイシン（Ｉ）；アスパラギン酸（Ｄ）及びグルタミン酸（Ｅ）；アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）及びスレオニン（Ｔ）；ヒスチジン（Ｈ）、リジン（Ｋ）及びアルギニン（Ｒ）：アスパラギン（Ｎ）及びグルタミン（Ｑ）；フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）及びトリプトファン（Ｗ）。
【００６３】
本発明によれば、ＰＤＧＦＲβ特異抗体は、単独で、抗ＶＥＧＦＲ抗体と共に投与でき、又はＰＤＧＦＲβ及びＶＥＧＦＲの両者に結合する二重特異性抗体であってもよい。ＶＥＧＦＲ特異抗体の例も提供される。ＰＤＧＦＲβ特異抗体に関して上記したとおり、開示したＶＥＧＦＲ抗体は非限定例である。
【００６４】
本発明はまた、ＰＤＧＦＲβの所定ドメインに結合する抗体も提供する。ＰＤＧＦＲβのドメイン１及び２に結合する抗体、ドメイン１に結合する抗体、及びドメイン２に結合する抗体が、本発明の範囲に包含される。２Ｃ５は、ＰＤＧＦＲβのドメイン２、並びにドメイン１及び２に結合する抗体の例である。
【００６５】
本発明の抗体の各可変ドメインは、完全な免疫グロブリン重鎖又は軽鎖可変ドメインであってもよいし、又は天然由来のドメインの機能性等価物若しくは変異体若しくは誘導体、又は例えば、ＷＯ９３／１１２３６（Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｃｏｕｎｃｉｌ／Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓら）に記載のものなどの技術を用いてインビトロで構築した合成ドメインであってもよい。例えば、アミノ酸置換、欠失、付加、アミノ末端欠切及びカルボキシ末端欠切を含む抗体可変ドメインに対応するドメインを組み込ませて、これらの変異で抗原結合活性を保持した蛋白質又は蛋白質断片が提供されるようにすることが可能である。重要な特徴は、各可変ドメインが相補的可変ドメインと会合して抗原結合部位を形成できることである。
【００６６】
本発明の抗体及び断片は、更なるアミノ酸残基に連結又は融合させてもよい。このようなアミノ酸残基は、ペプチドｔａｇであることができ、これによりおそらく、単離が容易になる。特異的器官又は組織への抗体のホーミングのための他のアミノ酸残基も企図される。
【００６７】
本発明の別の態様では、抗体又は抗体断片は、特に抗体を内部移行させる場合、抗腫瘍剤又は検出可能なシグナルを生じる薬剤に、化学的又は生合成的に連結させることができる。抗体に連結される抗腫瘍剤としては、抗体が結合している腫瘍、又は抗体が結合している細胞の環境で腫瘍を破壊又は損傷する任意の薬剤が挙げられる。例えば、抗腫瘍剤は、化学療法剤又はラジオアイソトープなど、毒性の薬剤である。好適な化学療法剤は、当業者に既知であり、アントラサイクリン類（例えば、ダウノマイシン及びドキソルビシン）、メトトレキセート、ビンデシン、ネオカルチノスタチン、シス−プラチナ、クロランブシル、シトシンアラビノシド、５−フルオロウリジン、メルファラン、リシン及びカリケアマイシンが挙げられる。化学療法剤は、従来法を用いて抗体に接合される（例えば、Ｈｅｒｍｅｎｔｉｎ及びＳｅｉｌｅｒ、Ｂｅｈｒｉｎｇ  Ｉｎｓｔ．Ｍｉｔｔ．８２：１９７−２１５（１９８８）を参照されたい）。
【００６８】
検出可能なシグナル生成剤は、インビボ及びインビトロで診断目的に有用である。シグナル生成剤は、外的手段、通常は電磁放射線の測定によって検出できる測定可能なシグナルを生じる。ほとんどの場合、シグナル生成剤は酵素若しくは発色団であるか、又は蛍光、リン光若しくは化学発光により光を放射する。発色団には、紫外又は可視領域において光を吸収する色素が含まれ、酵素触媒反応の基質又は分解産物であることができる。
【００６９】
本発明は更に、標的又はレポーター部分が連結する抗体が企図される。標的部分は、結合対の第一メンバーである。抗腫瘍剤は、例えば、このような対の第二メンバーに接合され、これにより抗原結合蛋白質が結合している部位に指向される。このような結合対の通常の例は、アビジン及びビオチンである。好ましい実施形態で、ビオチンが本発明の抗原結合蛋白質に接合され、これによりアビジン若しくはストレプトアビジンに接合される他の部分又は抗腫瘍剤のための標的が提供される。或いは、ビオチン又はこのような別の部分は、本発明の抗原結合蛋白質に連結され、例えば検出可能なシグナル生成剤がアビジン又はストレプトアビジンに接合された診断システムにおいて、レポーターとして使用される。
【００７０】
抗腫瘍剤としての使用に好適なラジオアイソトープも、当業者に公知である。例えば、１３１Ｉ又は２１１Ａｔが使用される。これらの同位体は、従来技術を用いて抗体に付着される（例えば、Ｐｅｄｌｅｙら、Ｂｒ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ  ６８：６９−７３（１９９３）を参照されたい）。或いは、抗体に付着される抗腫瘍剤は、プロドラッグを活性化する酵素である。この方法では、投与されたプロドラッグは腫瘍部位に到達するまで不活性型のままであり、抗体複合体が投与されれば、この腫瘍部位で細胞毒型に変換される。実際には、抗体−酵素接合体を患者に投与し、処置すべき組織の領域内に局在させる。その後、処置すべき組織の領域内で細胞毒性薬物への変換が起こるように、プロドラッグをこの患者に投与する。或いは、抗体に接合した抗腫瘍剤は、インターロイキン−２（ＩＬ−２）、インターロイキン−４（ＩＬ−４）又は腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦ−α）などのサイトカインである。抗体は、サイトカインが他の組織に影響を及ぼすことなく腫瘍の損傷又は破壊を媒介するような方法で、サイトカインで腫瘍を標的化する。サイトカインは、従来の組換えＤＮＡ技術を用いてＤＮＡレベルで抗体に融合させる。
【００７１】
本発明は、抗体、又はその断片をコード化する単離されたポリヌクレオチドも前記のとおり提供する。本発明には、表１に示すような１、２、３、４、５及び／又は６つ全てのＣＤＲを含むＰＤＧＦＲβ特異抗体及び抗原結合断片をコード化する配列を有する核酸を包含する。
【００７２】
従って、本発明は、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で配列番号１、配列番号９、配列番号１７、及び配列番号２５に特異的にハイブリダイズ（または特異的に結合）する核酸を提供する。更に企図されるのは、核酸コードの縮重がなければ前記配列に特異的に結合するはずの核酸である。核酸は、完全蛋白質（例えば、完全ＶＨ又はＶＬ）又はその断片をコード化するのに充分な長さであることができる。
【００７３】
ストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーションとは、あるプローブがその標的サブ配列に優先的にハイブリダイズし、他の配列とのハイブリダイゼーションはより少ないか又は全くない条件を指す。また、サザンハイブリダイゼーションおよびノーザンハイブリダイゼーション等の核酸ハイブリダイゼーション実験に関連して、ストリンジェントなハイブリダイゼーション及びストリンジェントなハイブリダイゼーション洗浄条件は配列依存的であり、環境パラメータにより異なることも理解されたい。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件が得られるように、ハイブリダイゼーション及び洗浄液の内容並びに温度を調整することは、当該技術分野では周知である。ストリンジェンシーは、用いられるプローブのサイズおよびヌクレオチド含有量などのパラメータに依存する。一般的な説明および例については、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ−Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版）Ｖｏｌ．１−３，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ、及び他の文献を参照されたい。核酸のハイブリダイゼーションに関する他の手引きは、Ｔｉｊｓｓｅｎ，１９９３，Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ−Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ｗｉｔｈ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｏｂｅｓ，ｐａｒｔ  Ｉ，ｃｈａｐｔｅｒ  ２，Ｏｖｅｒｖｉｅｗ  ｏｆ  ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｔｈｅ  ｓｔｒａｔｅｇｙ  ｏｆ  ｎｕｃｌｅｉｃ  ａｃｉｄ  ｐｒｏｂｅ  ａｓｓａｙｓ，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．に見られる。
【００７４】
好ましいストリンジェントな条件としては、プローブと約９０％以上相補的な配列とのハイブリダイゼーションを可能にするが、約７０％未満相補的な配列とはハイブリダイゼーションさせないものが挙げられる。一般に、高度にストリンジェントなハイブリダイゼーション及び洗浄条件は、規定のイオン強度及びｐＨで、特定の配列の熱融解点（Ｔｍ）よりも約５℃低くなるように選択される。Ｔｍは、（規定のイオン強度及びｐＨ下で）標的配列の５０％が完全にマッチしたプローブとハイブリダイズする温度である。極めてストリンジェントな条件は、特定のプローブのＴｍと等しくなるように選択される。
【００７５】
サザンまたはノーザンブロットにおいて、フィルタ上に１００を超える相補残基を有する相補核酸のハイブリダイゼーションのためのストリンジェントなハイブリダイゼーション条件の一例として、４２℃で１ｍｇのヘパリンを有する５０％ホルムアミドにてハイブリダイゼーションを一晩実施することが挙げられる。高度にストリンジェントな洗浄条件の一例として、約１５分間、７２℃で０．１５ＭのＮａＣｌが挙げられる。ストリンジェントな洗浄条件の一例として、１５分間、６５℃で０．２倍ＳＳＣ洗浄が挙げられる（Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９参照）。高度なストリンジェンシーの洗浄の前に、低度のストリンジェンシーの洗浄を行い、バックグラウンドプローブシグナルを除去することがよく行われる。例えば、１００個を超えるヌクレオチドの二本鎖のための中度のストリンジェンシーの洗浄の一例として、１５分間、４５℃で１倍ＳＳＣが挙げられる。例えば、１００個を超えるヌクレオチドの二本鎖に対する低度のストリンジェンシーの洗浄の例としては、１５分間、４０℃の４〜６倍のＳＳＣが挙げられる。一般的に、特定のハイブリダイゼーションアッセイにおいて、無関係のプローブについて観察したものよりも２倍（又はそれ以上）のシグナル対雑音比が、特異的なハイブリダイゼーションの検出を示す。
【００７６】
コード化するポリペプチドが実質的に同一であれば、ストリンジェントな条件下に相互にハイブリダイズしない核酸であっても実質的に同一である。これは、例えば、遺伝子コードで認められている最大のコドン縮重を用いて核酸を生成する場合に起こる。従って、本発明のヌクレオチド配列は、配列番号１、配列番号９、配列番号１７、又は配列番号２５と少なくとも約７０％、好ましくは少なくとも約８０％、より好ましくは少なくとも約９０％同一であるヌクレオチドの配列を含む。本発明はまた、本発明の核酸を含む組換えベクターも提供する。ベクターは発現ベクターであって、プロモーター及び任意にエンハンサー配列などの制御配列に作動可能に核酸が連結されているものでもよい。種々の発現ベクターが、原核生物及び真核生物系（酵母及び哺乳動物細胞培養系を含むが、これらに限定されない）で、抗体ポリペプチドの効率的な合成のために開発されている。
【００７７】
好適な任意の発現ベクターを使用できる。本発明において有用な発現ベクターは、発現すべきＤＮＡ配列又は断片に作動可能に連結された少なくとも１種の発現制御配列を含む。制御配列は、クローニングされたＤＮＡ配列の発現を制御及び調節するために、ベクター中に挿入される。有用な発現制御配列の例は、ｌａｃ系、ｔｒｐ系、ｔａｃ系、ｔｒｃ系、λファージの主要オペレーター及びプロモーター領域、ｆｄコートタンパク質の制御領域、酵母の解糖プロモーター、例えば、３−ホスホグリセレートキナーゼのプロモーター、酵母酸性ホスファターゼのプロモーター、例えばＰｈｏ５、酵母α接合因子のプロモーター、並びにポリオーマ、アデノウイルス、レトロウイルス及びシミアンウイルス由来のプロモーター、例えばＳＶ４０の初期及び後期プロモーター、並びに原核細胞又は真核細胞及びそれらのウイルスの遺伝子の発現を制御することが公知の他の配列、又はそれらの組み合わせである。
【００７８】
選択可能マーカーは、選択的培地で成長する形質転換した宿主細胞の生存又は成長に必要な蛋白質をコード化する遺伝子である。代表的な選択可能マーカーは、（ａ）抗生物質又はその他の毒素、例えば、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキセート、又はテトラサイクリンに対する耐性を付与する蛋白質をコード化、（ｂ）栄養要求性欠損を補う蛋白質をコード化、あるいは（ｃ）複合培地から得られない重要な栄養を供給する蛋白質をコード化（例えばバチルスのＤ−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子）する。特に有用な選択可能マーカーは、メトトレキセートに対する抵抗性を付与する。例えば、ＤＨＦＲ選択遺伝子で形質転換された細胞を、先ずＤＨＦＲの競合的アンタゴニストであるメトトレキセート（Ｍｔｘ）を含有する培地中で全ての形質転換細胞を培養することにより同定する。野生型ＤＨＦＲが用いられる場合、適切な宿主細胞は、Ｕｒｌａｕｂ及びＣｈａｓｉｎ（１９８０）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７７，４２１６に記載される方法で調製し増殖させた、ＤＨＦＲ活性欠損チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞系である。その後、更に高レベルのメトトレキセートに、この形質転換細胞を曝す。これにより、ＤＨＦＲ遺伝子の複数のコピーと、同時に、発現ベクターを含むその他のＤＮＡの複数のコピー（抗体又は抗体断片をコード化するＤＮＡなど）の合成がもたらされる。
【００７９】
遺伝子構築体を酵母で発現させることが望ましい場合、酵母での使用に好適な選択遺伝子の例は、酵母プラスミドＹＲｐ７に存在するｔｒｐ１遺伝子である。Ｓｔｉｎｃｈｃｏｍｂら、（１９７９）Ｎａｔｕｒｅ，２８２，３９；Ｋｉｎｇｓｍａｎら、（１９７９）Ｇｅｎｅ  ７、１４１。ｔｒｐ１遺伝子は、トリプトファンで成長する能力を欠く酵母の変異株に対する選択マーカーを提供する。例えば、ＡＴＣＣ番号４４０７６又はＰＥＰ４−１。Ｊｏｎｅｓ（１９７７）Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  ８５，１２。酵母宿主細胞ゲノム中にｔｒｐ１損傷が存在すると、トリプトファンの非存在下での成長により形質転換を検出するために効果的な環境が提供される。同様に、Ｌｅｕ２−欠損酵母株（ＡＴＣＣ番号２０，６２２または３８，６２６）は、Ｌｅｕ２遺伝子を保有する既知のプラスミドで補完される。酵母で有用なベクターの例は、２μプラスミドである。
【００８０】
原核性クローニングベクターの例として、ｃｏｌＥ１、ｐＣＲ１、ｐＢＲ３２２、ｐＭＢ９、ｐＵＣ、ｐＫＳＭ、及びＲＰ４など、大腸菌由来のプラスミドが挙げられる。原核性ベクターとして、Ｍ１３などのファージＤＮＡの誘導体、及び他の糸状一本鎖ＤＮＡファージも挙げられる。各ポリペプチド鎖の開始点で細菌性の分泌シグナルを含むＤＮＡ構築体を用いて、所定の抗体が大腸菌内で簡便に生産される。様々な細菌性シグナル配列が、当該技術分野で公知である。好ましいシグナル配列は、Ｅｒｗｉｎｉａ  ｃａｒｏｔｏｖｏｒａのｐｅｌＢ遺伝子由来である。
【００８１】
哺乳動物細胞での発現に好適なベクターとして、ＳＶ４０の周知の誘導体、アデノウイルス、レトロウイルス由来ＤＮＡ配列、及び上記の機能性哺乳動物ベクターと機能性プラスミドとの組み合わせに由来するシャトルベクター、及びファージＤＮＡが挙げられる。抗体をコードするＤＮＡ断片は、例えば、哺乳動物細胞での高レベル発現のために、ヒトサイトメガロウイルス（ＨＣＭＶ）プロモーター及びエンハンサーを用い、ベクターにクローニングすることができる。例えば、Ｂｅｎｄｉｇら、米国特許第５８４０２９９号；Ｍａｅｄａら、（１９９１）Ｈｕｍ．Ａｎｔｉｂｏｄ．Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ  ２，１２４−３４；Ｐ．Ｊ．Ｓｏｕｔｈｅｒｎ及びＰ．Ｂｅｒｇ、Ｊ．Ｍｏｌ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．１：３２７−４１（１９８２）；Ｓｕｂｒａｍａｎｉら、Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１：８５４−６４（１９８１）；Ｋａｕｆｍａｎｎ及びＳｈａｒｐ、“Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｏｆ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  Ｃｏｔｒａｎｓｆｅｃｔｅｄ  ｗｉｔｈ  ａ  Ｍｏｄｕｌａｒ  Ｄｉｈｙｄｒｏｆｏｌａｔｅ  Ｒｅｄｕｃｔａｓｅ  Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ  ＤＮＡ  Ｇｅｎｅ，”Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５９：６０１−２１（１９８２）；Ｋａｕｆｍａｎｎ  ａｎｄ  Ｓｈａｒｐ，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．１５９：６０１−６４（１９８２）；Ｓｃａｈｉｌｌら、“Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  Ａｎｄ  Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ  Ｏｆ  Ｔｈｅ  Ｐｒｏｄｕｃｔ  Ｏｆ  Ａ  Ｈｕｍａｎ  Ｉｍｍｕｎｅ  Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｎ  ＤＮＡ  Ｇｅｎｅ  Ｉｎ  Ｃｈｉｎｅｓｅ  Ｈａｍｓｔｅｒ  Ｏｖａｒｙ  Ｃｅｌｌｓ，”Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ  Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８０，４６５４−５９（１９８３）；Ｕｒｌａｕｂ及びＣｈａｓｉｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ  Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ７７：４２１６−２０（１９８０）を参照されたい。
【００８２】
本発明は、前記の組換え又は発現ベクターを含有する組換え宿主細胞も提供する。特定の選好性の細胞系が、宿主蛋白質からの汚染の最小化と、目的蛋白質の構成的発現、高レベルの発現に基づいて選択される。有用な原核性宿主として、例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＳＧ−９３６、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＨＢ  １０１、Ｅ．ｃｏｌｉ  Ｗ３１１０、Ｅ．ｃｏｌｉ  Ｘ１７７６、Ｅ．ｃｏｌｉ  Ｘ２２８２、Ｅ．ｃｏｌｉ  ＤＨＩ、及びＥ．ｃｏｌｉ  ＭＲＣｌなどの大腸菌、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓなどのＢａｃｉｌｌｕｓ、並びにＳｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓが挙げられる。発現用の宿主として利用可能な哺乳動物細胞系は、当該技術分野で周知であり、多くの不死化細胞系、例えば、限定しないが、ＣＯＳ−７細胞、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞、ベビーハムスター腎臓（ＢＨＫ）細胞、ＰＥＲ．Ｃ６細胞、及びその他多数、例えば、リンパ腫、骨髄腫、又はハイブリドーマ細胞などのリンパ系起源の細胞系などが挙げられる。好適な更なる真核細胞として、酵母及び他の真菌が挙げられる。
【００８３】
形質転換宿主細胞は、当技術分野で公知の方法により、炭素（例えば、グルコース又はラクトースなどの炭水化物）、窒素（例えば、アミノ酸、ペプチド、蛋白質、又はペプトン、アンモニウム塩若しくは同種類のものなどのそれらの分解生成物）、並びに無機塩（例えば、ナトリウム、カリウム、マグネシウム及びカルシウムの硫酸塩、リン酸塩及び／又は炭酸塩）の、同化可能な供給源を含む液体培地中で培養される。培地は更に、例えば、成長促進物質（微量元素、例えば鉄、亜鉛、マンガン等など）を含有する。
【００８４】
本発明はまた、抗体の発現を許容する条件下で前記宿主細胞を培養する工程を含む、抗体の製造方法も提供する。好適な培地中に維持された宿主細胞での発現の後、抗体を培地から単離し、当該技術分野で公知の方法によって精製してもよい。
【００８５】
本発明は更に、本発明の抗体、核酸、ベクター又は宿主細胞、及び薬理学的に許容できる担体を含む医薬組成物を提供する。
【００８６】
本発明はまた、腫瘍の成長を処置若しくは阻害する方法、哺乳動物における血管新生依存性の状態（例えば、腫瘍成長など）を処置若しくは制御する方法、又は血管形成疾患を処置する方法であって、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを投与する工程を含む方法にも関する。一実施形態では、アンタゴニストは、ＰＤＧＦＲβが媒介する腫瘍細胞の刺激を阻止する。別の実施形態では、アンタゴニストは、血管新生を阻害又は防止するように機能し、これによって血管新生依存性の状態が処置又は制御される。典型的には、血管内皮が、他の供給源（例えば、腫瘍細胞）からの成長因子により傍分泌様式で刺激される。従って、ＰＤＧＦＲβアンタゴニストは、血管新生化した腫瘍又は新生物のある被験者を処置するのに有効である。
【００８７】
疾患を「処置する」とは、（１）疾患の素因を有するかもしれないが、まだ疾患の症状を経験もしくは提示していない哺乳動物における疾患発生を予防すること、例えば、臨床的症状の突発を予防すること；（２）疾患を阻害すること、例えばその発症を停止若しくは遅延させること；又は、（３）疾患を緩和すること、例えば疾患の症状の退縮を引き起こすことを包含する。
【００８８】
処置されうる腫瘍としては、原発腫瘍及び転移性腫瘍、並びに難治性腫瘍が挙げられる。難治性腫瘍としては、化学療法剤単独、抗体単独、放射線単独、又はそれらの組み合わせを用いる処置に応答できないかまたは抵抗性のある腫瘍が挙げられる。また、難治性腫瘍は、そのような薬剤を用いる処置により阻害されると思われるが、処置を中断してから５年まで、時には１０年まで、またはそれよりも後に再発する腫瘍も包含する。
【００８９】
ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、標的レセプター又はそのリガンドを実質的に飽和させるのに十分な投与量及び投与頻度にて投与される。実質的な飽和とは、標的化レセプターの飽和の少なくとも約５０％、又は少なくとも約８０％、又は少なくとも約９５％の飽和である。ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、投与間の欠期に少なくとも約５０％、又は少なくとも約７０％、又は少なくとも約９０％の、実質的な飽和を維持するのに十分な頻度で投与される。本発明の一実施形態で、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは抗体である。治療には、投与計画では約５ｍｇ／ｍ２から約７００ｍｇ／ｍ２までが用いられる。別の実施形態では、投与計画では約１０ｍｇ／ｍ２から約２５０ｍｇ／ｍ２までが用いられる。適切な投与量及びスケジュールは、例えば、インビトロでレセプターの飽和又は中和を成し遂げるのに必要な濃度を用いて、又はアンタゴニストの血清濃度の分析によって、当業者により容易に決定できる。
【００９０】
本発明の一実施形態では、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、化学療法剤と共に投与される。当該技術分野で公知、又は評価中の化学療法剤は、それらの標的又は作用様式に基づいてグループ分けできる。例えば、アルキル化剤として、限定されるものではないが、シスプラチン、シクロホスファミド、メルファラン、およびダカルバジンが挙げられる。代謝拮抗薬の例としては、限定されるものではないが、ドキソルビシン、ダウノルビシン、及びパクリタキセル、ゲムシタビン、及びトポイソメラーゼインヒビターのイリノテカン（ＣＰＴ−１１）、アミノカンプトテシン、カンプトテシン、ＤＸ−８９５１ｆ、及びトポテカン（トポイソメラーゼＩ）及びエトポシド（ＶＰ−１６）及びテニポシド（ＶＭ−２６）（トポイソメラーゼＩＩ）が挙げられる。他の好適な化学療法剤が当該技術分野で公知であり、メトトレキセート、ビンデシン、ネオカルチノスタチン、クロランブシル、シトシンアラビノシド、５−フルオロウリジン、メルファラン、リシン及びカリケアマイシンが挙げられる。ＰＤＧＦＲβアンタゴニスト及び化学療法剤は、血管新生の阻害及び／又は腫瘍成長の低減に有効な量にて、患者に投与する。ＰＤＧＦＲβアンタゴニストは、他の処置計画、例えば、放射線療法などの処置と組み合わせて投与できる。放射線線源は、処置される患者に対して外部（外照射療法−ＥＢＲＴ）又は内部（近接照射療法−ＢＴ）のいずれでもよい。
【００９１】
投与される抗新生物剤の用量は、例えば、薬剤の種類、処置すべき腫瘍の種類及び重篤度、並びに薬剤の投与経路を含め、多数の因子に依存する。しかし、本発明が何れか特定の用量に限定されないことは強調されるべきである。
【００９２】
本発明の実施形態で、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストは、ＶＥＧＦＲアンタゴニストと組み合わせて投与される。ＶＥＧＦＲアンタゴニストの例として、ＩＭＣ−２Ｃ６（ＶＨのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号３３及び３４；ＶＬのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号３５及び３６）（ＷＯ  ０３／０７５８４０号パンフレット参照）、及びＩＭＣ−１１２１（ＶＨのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号３３及び３４；ＶＬのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号３７及び３８）（ＷＯ  ０３／０７５８４０号パンフレット参照）など、ＶＥＧＦＲ２／ＫＤＲに結合する抗体が挙げられる。ＶＥＧＦＲ１／Ｆｌｔ−１に結合する抗体の例として、６．１２（ＶＨのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号３９及び４０；ＶＬのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号４１及び４２）及びＩＭＣ−１８Ｆ１（ＶＨのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号４３及び４４；ＶＬのヌクレオチド及びアミノ酸配列：配列番号４５及び４６）が挙げられる。ＶＥＧＦに対して特異的な抗体の一例は、Ａｖａｓｔｉｎ（登録商標）である。
【００９３】
ＰＤＧＦＲβ特異抗体について前記した通り、ＶＥＧＦＲアンタゴニストは、ＶＥＧＦレセプターにより媒介されるシグナル伝達を低減又は阻害する。阻害の機構として、限定はしないが、リガンド阻止、レセプター二量体又は多量体形成、レセプター内部移行、酵素活性の阻害（例えば、自己リン酸化、レセプター基質の修飾）等が挙げられる．
【００９４】
特定の実施形態では、本発明の抗体は二重特異性を有し、同時に２つの異なる抗原に結合できる。異なる抗原は、異なる細胞又は同じ細胞に局在することが可能である。抗原の交差結合は、例えば、第一抗原が結合している固体支持体を用意し、その第一抗原に対して特異的な二重特異性抗体を添加し、その結合蛋白質が更に特異的な第二抗原を添加し、そして結合した第二抗原の存在を検出することによって、インビトロで確認できる。
【００９５】
好ましい本発明の抗体は、２つのレセプターと、それらの各リガンドとの間の相互作用を阻止できる。例えば、ＰＤＧＦＲβ及びＫＤＲに特異的な抗体は、ＰＤＧＦ−ＢＢ誘導性の細胞活性化のみならず、ＶＥＧＦ又はＰｌＧＦ誘導性の細胞遊走も阻害する。単一特異性の抗体に比べ、二重特異性抗体は、細胞性機能のより強力なインヒビターになりうる。
【００９６】
本発明の一態様では、ＰＤＧＦＲβアンタゴニストは、ＶＥＧＦＲアンタゴニストと同時投与される。本方法は、血管新生していないか、又はまだ実質的に血管新生していないものを含め、固形又は非固形腫瘍を処置するのに効果的である。
【００９７】
ＰＤＧＦＲβアンタゴニスト単独で、又はＶＥＧＦＲアンタゴニストと組み合わせて処置できる腫瘍及び新生物としては、例えば、芽細胞腫、癌腫又は肉腫などの悪性腫瘍及び新生物、並びに高度に血管化した腫瘍及び新生物が挙げられる。本発明の方法により処置できる癌としては、例えば、脳、泌尿生殖器、リンパ系、胃、腎臓、結腸、喉頭、並びに肺及び骨、の癌が含まれる。非限定的な例としては更に、類上皮腫、頭や頚の癌などの扁平上皮癌、結腸直腸癌、前立腺癌、乳癌、肺腺癌及び小細胞及び非小細胞肺癌などの肺癌、膵臓癌、甲状腺癌、卵巣癌、及び肝臓癌が挙げられる。組成物はまた、血管新生化皮膚癌、例えば、扁平上皮癌、基底細胞癌、及び悪性ケラチノサイトの成長の抑制により処置できる皮膚癌、例えば、ヒト悪性ケラチノサイト、などの治療にも用いられる。処置できるその他の癌としては、カポジ肉腫、ＣＮＳ腫瘍（神経芽細胞腫、毛細血管性血管腫、髄膜腫と大脳転移）、黒色腫、胃腸及び腎の癌腫と肉腫、横紋筋肉腫、多形膠芽腫を含む膠芽腫、及び平滑筋腫が挙げられる。
【００９８】
非固形腫瘍の例として、白血病、多発性骨髄腫、及びリンパ腫が挙げられる。白血病の例をいくつか挙げると、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、赤血球性白血病、又は単球白血病がある。リンパ腫の例をいくつか挙げると、ホジキン及び非ホジキン・リンパ腫が挙げられる。
【００９９】
本発明の組成物は、例えば、血管新生化及び／又は炎症に関わる過剰な血管新生を特徴とする病理的な状態、例えば、アテローム硬化症、慢性関節リウマチ（ＲＡ）、血管新生緑内障、増殖性糖尿性網膜症などの増殖性網膜症、筋萎縮、血管腫、血管繊維増殖症、及び乾癬などを処置又は予防するのにも使用できる。非新生物血管形成疾患のその他の非限定的な例としては、未熟児網膜症（水晶体後部線維増殖症）、角膜移植後拒絶反応、インスリン依存型糖尿病、多発性硬化症、重症筋無力症、Ｃｈｒｏｎ病、自己免疫腎炎、原発性胆汁性肝硬変、急性膵炎、移植片拒絶（ａｌｌｏｇｒａｐｈ  ｒｅｊｅｃｔｉｏｎ）、アレルギー性炎症、接触皮膚炎、遅延性過敏症、炎症性腸疾患、敗血症性ショック、骨粗鬆症、骨関節炎、神経炎症で誘発される認知障害、オスラー−ウエーバー症候群、再狭窄（ｒｅｓｔｉｎｏｓｉｓ）、並びに菌、寄生虫、及びウイルス感染、例えば、サイトメガロウイルス感染、などがあげられる。
【０１００】
このような疾患の同定は、十分に当業者の能力と知識の範囲内にある。例えば、臨床的に顕著な新生物又は血管形成疾患にかかっている、又は臨床的に顕著な症状を発現する危険があるヒト個体は、ＰＤＧＦＲβアンタゴニストを、任意にＶＥＧＦＲアンタゴニストと組み合わせて投与するのに適している。十分な能力を有する臨床医は、例えば臨床試験を用いて、身体検査、及び医療／家族歴によって、ある個体がこの処置の対象候補であるかどうかを容易に決定できる。
【０１０１】
本発明のアンタゴニスト組成物は、腫瘍又は病理的状態を伴う血管新生に苦しむ患者のための治療処置として、その腫瘍又は病理的状態の進行を予防、抑制、又は低減するのに十分な量を投与できる。進行とは、例えば、腫瘍又は病理的状態の発達、侵襲、転移、及び／又は再発を包含する。これを達成するのに十分な量が、治療的に効果的な用量として定義される。有効量は、疾患の重篤性、及び患者自身の免疫系の全般的状態に依存する。投与スケジュールも疾患の状態と患者の状況によって異なり、１つの丸薬の投与若しくは連続的な注入ないし１日に複数回（例えば、４〜６時間毎）の投与、又は処置を行う医師の指示及び患者の状態によって決められるものまで、多様である。しかし、本発明は特定の投与量に限定されないことに注意すべきである。
【０１０２】
哺乳動物への投与方法として、例えば、経口、静脈内、腹腔内、皮下、又は筋肉内投与が挙げられる。
【０１０３】
ＰＤＧＦＲβ特異抗体及びＶＥＧＦＲ特異抗体は、疾患の処置のために、抗新生物剤又は抗血管形成剤などの他の薬剤と化学的又は生合成的に接合することができる。抗体に連結される抗腫瘍剤としては、抗体が結合している腫瘍、又は抗体が結合している細胞の環境で腫瘍を破壊又は損傷する任意の薬剤が挙げられる。例えば、抗腫瘍剤は、化学療法剤又はラジオアイソトープなど、毒性の薬剤である。化学療法剤は、従来法を用いて抗体に接合され（例えば、Ｈｅｒｍｅｎｔｉｎ及びＳｅｉｌｅｒ（１９８８）Ｂｅｈｒｉｎｇ  Ｉｎｓｔ．Ｍｉｔｔ．８２：１９７−２１５を参照されたい）、それにはペプチド及び非ペプチドリンカーによるものが含まれる。
【０１０４】
また、本発明のＰＤＧＦＲβ特異抗体は、診断目的で、インビボ及びインビトロで有用な、検出可能なシグナル生成剤と連結することもできる。シグナル生成剤は、外的手段、通常は電磁放射線の測定によって検出できる測定可能なシグナルを生じる。ほとんどの場合、シグナル生成剤は酵素若しくは発色団であるか、又は蛍光、リン光若しくは化学発光により光を放射する。発色団には、紫外又は可視領域において光を吸収する色素が含まれ、酵素触媒反応の基質又は分解産物であってもよい。
【０１０５】
本発明は更に、第２の試薬に組み込まれた処置薬若しくは診断薬と共に、このような抗体を使用することを企図する。例えば、結合対の１つのメンバーを本発明の抗体と連結させる。抗新生物剤は、例えば、このような対の第二メンバーに接合され、これにより抗体が結合している部位に指向される。好ましい実施形態では、ビオチンが本発明の抗体に接合され、これによりアビジン若しくはストレプトアビジンに接合される他の部分又は抗新生物剤に対する標的が提供される。或いは、ビオチン又はこのような別の部分は、本発明の抗体に連結され、例えば検出可能なシグナル生成剤がアビジン又はストレプトアビジンに接合された診断システムにおいて、レポーターとして使用される。
【０１０６】
本発明のＰＤＧＦＲβアンタゴニストは、任意にＶＥＧＦＲアンタゴニストと組み合わせて、１以上の好適なアジュバント、例えば、サイトカイン（例えば、ＩＬ−１０およびＩＬ−１３）など、又はその他の免疫賦活剤、例えば、限定されるものではないが、ケモカイン、腫瘍関連抗原、及びペプチドと併用投与することができる。しかし、抗体単独の投与でも、治療上効果的な方法で腫瘍の進行を防止、阻害又は低減させるのに十分であることは理解されるべきである。
【０１０７】
特定の実施形態では、ＲＴＫと結合し且つリガンド結合を阻止する本発明の抗体を、リガンドと結合する別の抗原結合蛋白質と共に投与するのが望ましい場合がある。リガンド結合抗体は当該技術分野で周知であり、例えば、抗ＶＥＧＦ（Ａｖａｓｔｉｎ（登録商標）；ベバシズマブ）が挙げられる。
【０１０８】
本発明によれば、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストとＶＥＧＦＲアンタゴニストとの同時投与と合わせて、化学療法剤又はラジオアイソトープなどの抗新生物剤を投与することができる。有用な抗新生物剤の例には、ＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストとの同時投与について前記したものが含まれる。
【０１０９】
併用治療で、ＰＤＧＦＲβアンタゴニストとＶＥＧＦＲアンタゴニストは、別々に又は一緒に、同じスケジュール又は異なるスケジュールで、同時投与できる。任意に、アンタゴニストは、単一投薬量に配合できる。任意に、アンタゴニストは、単一の活性実体に併せることができる（例えば、二重特異性抗体）。ＰＤＧＦＲβアンタゴニスト／ＶＥＧＦＲアンタゴニスト治療薬は、治療開始の前、途中、又は後に、別の薬剤やその任意の組み合わせによって、すなわち、抗新生物剤での治療の開始の前及び途中、前及び後、途中及び前、又は前、途中及び後に投与される。例えば、腫瘍又は新生物形成性疾患の処置には、ＰＤＧＦＲβアンタゴニスト／ＶＥＧＦＲアンタゴニスト治療剤は放射線療法開始の１〜３０日前、好ましくは、３〜２０日、より好ましくは、５〜１２日前に投与することができる。本発明によれば、化学療法又は放射線療法は、ＰＤＧＦＲβアンタゴニスト／ＶＥＧＦＲアンタゴニスト治療剤と同時に、前もって、又は後に行なわれる。
【０１１０】
本発明において、任意の好適な方法又は経路を用いて本発明の抗体を投与することができ、また所望により、抗新生物剤、レセプターアンタゴニスト、又はその他の医薬組成物と同時投与することができる。例えば、本発明に従って利用される抗新生物剤投与計画には、患者の新生物状態の処置に最適であると考えられる任意の投与計画が含まれる。別の悪性疾患は、特異的抗腫瘍抗体及び特異的抗新生物剤の使用を必要とする場合があり、それは患者ごとに決定されることになる。投与の経路としては、例えば、経口投与、静脈内投与、腹腔内投与、皮下投与、又は筋肉内投与が挙げられる。投与される抗新生物剤の用量は、例えば、新生物剤の種類、処置すべき腫瘍の種類及び重篤性、並びに抗新生物剤の投与経路を含め、数多くの因子による。しかし、本発明が何れか特定の方法又は投与経路に限定されないことは強調されるべきである。
【０１１１】
本発明の抗体は、予防又は処置目的のために哺乳動物において使用される場合、薬理学的に許容できる担体を更に含む組成物の形態で投与されることは理解されている。好適な薬理学的に許容できる担体としては、例えば、水、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノール等のうちの１以上、又はそれらの組み合わせが挙げられる。薬理学的に許容できる担体は、結合蛋白質の保存期間又は有効性を増強するため、湿潤剤若しくは乳化剤、防腐剤又は緩衝剤などの補助物質を少量更に含むことができる。注射用組成物は、当該技術分野で周知のように、哺乳動物への投与の後、有効成分の即時、持続又は遅延放出をもたらすように処方できる。
【０１１２】
本発明は、治療上有効量の本発明のＰＤＧＦＲβ特異的アンタゴニストを含む、腫瘍成長及び／又は血管新生を阻害するためのキットも含む。本発明の実施形態で、キットは更に、ＶＥＧＦＲアンタゴニスト（例えば、ＶＥＧＦのアンタゴニスト、ＰｌＧＦ、ＶＥＧＦＲ−１／Ｆｌｔ−１、ＶＥＧＦＲ−２／Ｆｌｋ−１／ＫＤＲ、又はＶＥＧＦＲ３／Ｆｌｔ−４）を含む。ＶＥＧＦアンタゴニストは、例えば、小分子、リガンド−結合レセプター断片、又は抗体であってもよい。ヒトに投与するアンタゴニストが抗体である場合、ヒト、ヒト化、又はキメラ抗体が好ましい。キットは更に、例えば、腫瘍形成又は血管新生に関わる別の成長因子レセプター（例えば、前記のＥＧＦＲ、ＩＧＦＲ、ＮＧＦＲ、ＦＧＦＲ等）の、好適な任意のアンタゴニストを含むことができる。代わりに、又はそれに加えて、本発明のキットは抗新生物剤を更に含んでもよい。本発明の文脈において好適な抗新生物剤の例は、本明細書に記載されている。本発明のキットは、更にアジュバントを含んでもよく、その例も上に記載されている。
【０１１３】
また、当該技術分野で周知の研究又は診断方法のためのインビボ及びインビトロでの本抗体の使用も、本発明の範囲に含まれる。診断法には、本発明の抗体を含むキットが含まれる。
【０１１４】
従って、本レセプター結合抗体は、当該技術分野で周知の研究、診断、予防又は処置方法のために、インビボ及びインビトロでこのように使用できる。当然、本明細書に開示される本発明の原理の変形例が、当業者によりなされうることは理解及び予期されるべきであり、そのような変更形態も本発明の範囲内に含まれることが意図される。
【０１１５】
本明細書中で言及されるすべての参照文献は、その全体を参照することにより本明細書に援用する。
【実施例】
【０１１６】
以下の実施例で本発明を更に説明するが、決して本発明の範囲を限定するものと解釈されるべきではない。従来法、例えば、ベクター及びプラスミドの構築、ポリペプチドをコード化する遺伝子のかかるベクター及びプラスミドへの挿入、宿主細胞へのプラスミドの導入、並びに遺伝子及び遺伝子産物の発現及びその定量などに用いられる方法の詳細な説明は、多数の刊行物から得ることができ、それにはＳａｍｂｒｏｏｋ，Ｊら、（１９８９）Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ；及びＣｏｌｉｇａｎ，Ｊ．ら、（１９９４）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄが含まれる。
【０１１７】
（ファージディスプレイライブラリー）
固定化ｍＰＤＧＦＲβ−Ｆｃを用い、以前に報告された手法（Ｌｕ、Ｄ．ら、２００２，Ｉｎｔ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ  ９７：３９３−９；Ｚｈｕ，Ｚ．ら、１９９８，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５８：３２０９−１４）に従って、３．７ｘ１０１０クローンを含むヒトＦａｂファージディスプレイライブラリー（ｄｅ  Ｈａａｒｄ、Ｈ．Ｊ．ら、１９９９，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７４：１８２１８-３０）を使用して、抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体についてスクリーニングを行った。第２回及び第３回の選択後に回収した個々のファージクローンを、固定化ｍＰＤＧＦＲβ−Ｆｃへの結合ついてＥＬＩＳＡにより調べた。可溶性Ｆａｂを生産するために、個々のバインダーのプラスミドを用いて、非サプレッサー大腸菌宿主ＨＢ２１５１を形質転換した。プロテインＧカラム（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）を用い、製造業者のプロトコルに従って、親和性クロマトグラフィーにより可溶性Ｆａｂ蛋白質を周辺質抽出物から精製した。
【０１１８】
（定量的レセプター結合及び阻止アッセイ）
結合アッセイで、様々な量の１Ｂ３  ＩｇＧ又はＦａｂをｍＰＤＧＦＲβ被覆プレート（１μｇ／ｍｌで５０μｌ）に添加し、室温で１時間インキュベートして、その後プレートをＰＢＳＴで３回洗浄した。プレートはその後、室温で更に１時間ヤギ抗ヒト−κ抗体−セイヨウワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）接合体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，Ｗｅｓｔ  Ｇｒｏｖｅ，ＰＡ）とインキュベートした。プレートを洗浄し、以前報告された通りに現像した（Ｌｕ，Ｄ．ら、２００２；Ｚｈｕ，Ｚ．ら、１９９８）。阻止アッセイでは、様々な量の精製抗体を、先ず一定量のｍＰＤＧＦＲβ（０．５μｇ／ｍｌで５０ｎｇ）と混合して、室温で３０分間インキュベートした。その後、ＰＤＧＦ−ＢＢ（０．５μｇ／ｍｌ）を予め被覆した９６ウェルのプレートに混合物を移し、室温で１時間インキュベートした。ＰＢＳＴで３回洗浄した後、プレートをヤギ抗ヒトＦｃ抗体−ＨＲＰ接合体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ）と１時間インキュベートし、報告された通りに現像した（Ｌｕ，Ｄ．ら、２００２；Ｚｈｕ，Ｚ．ら、１９９８；Ｌｏｉｚｏｓ，Ｎ．ら、２００５）。そのリガンドへの結合からｍＰＤＧＦＲβの５０％阻止をもたらす抗体濃度である、ＩＣ５０を求めた。
【０１１９】
（抗体親和性定量）
ＢＩＡコア３０００バイオセンサー（ＢＩＡＣＯＲＥ，Ｉｎｃ．，Ｕｐｐｓａｌａ，スウェーデン）を使用して、ｍＰＤＧＦＲβへの様々なＦａｂ及びＩｇＧの結合キネティクスを測定した。手短に説明すると、ｍＰＤＧＦＲβをセンサーチップ上に固定化して、可溶性抗体を１．５ｎＭ〜１００ｎＭの範囲の濃度で注射した。センサーグラムを各濃度で得て、ＢＩＡ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  ２．０のプログラムを使用して評価した。親和性常数、Ｋｄを、解離速度（ｋｏｆｆ）／会合速度（ｋｏｎ）の比から算出した（Ｌｕ、Ｄ．ら、２００２；Ｚｈｕ、Ｚ．ら、１９９８；Ｌｏｉｚｏｓ、Ｎ．ら、２００５）。
【０１２０】
（ヒト抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体の選択）
第二回からの合計１９０クローンと、第三回からの９５クローンを無作為に選んで、ファージＥＬＩＳＡ及び可溶性Ｆａｂ  ＥＬＩＳＡの双方によりｍＰＤＧＦＲβ結合及び阻止活性を試験した。第二回からのクローンの７２％超、及び第三回からの９８％が、ｍＰＤＧＦＲβに特異的に結合することが認められ、選択プロセスの効率が高いことが示唆された。リガンド阻止アッセイにより、バインダーの約２．５％も、ｍＰＤＧＦＲβをそのリガンドＰＤＧＦ−ＢＢへの結合から阻止することが明らかになった。
【０１２１】
７つのＦａｂ断片全てが、ｍＰＤＧＦＲβに特異的に結合し、ｍＰＤＧＦＲβをそのリガンドＰＤＧＦ−ＢＢへの結合から阻止した。その作用強度は様々であった。ＩＣ５０値（すなわち、ＰＤＧＦＲβ／ＰＤＧＦ−ＢＢ相互作用の５０％を阻止するのに必要な抗体濃度）の範囲は、約４ｎＭから＞３３ｎＭ（図１Ｂ）であった。最高のレセプター結合効率及びレセプター／リガンド阻止作用強度を有するクローンである、クローン１Ｂ３（表１）を更に調べるために選択した。
【０１２２】
【表１】
2010524466.tif 000003
【０１２３】
（全長ＩｇＧ抗体のクローニング及び発現）
得られたクローン１Ｂ３の重鎖及び軽鎖遺伝子をコード化するＤＮＡ配列を、ＰＣＲによって増幅し、ヒトκ軽鎖定常領域及びヒトγ１重鎖定常領域を含む発現ベクターにクローニングした。この発現ベクターをＮＳ０骨髄腫細胞にトランスフェクトして、１Ｂ３発現細胞の安定なクローンを選択した。細胞を無血清培地にて成長させ、全長の１Ｂ３  ＩｇＧを細胞培養上清からプロテインＡ親和性クロマトグラフィー（Ｐｏｒｏｓ  Ａ、Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）によって精製した。
【０１２４】
予期した通り、１Ｂ３  ＩｇＧは、固定化ｍＰＤＧＦＲβに対して、そのＦａｂ断片よりもずっと高い結合効率を示した。ＩＣ５０値は、１Ｂ３  ＩｇＧに対して０．３４ｎＭで、１Ｂ３  Ｆａｂに対して１．３ｎＭであった（図１Ａ）。ＢＩＡコア機器での表面プラズモン共鳴による結合動態解析により、ｍＰＤＧＦＲβへ結合する１Ｂ３の親和性が、そのＦａｂ形よりも約５７倍増大した（Ｆａｂに対して５．１ｎＭ、及びＩｇＧに対して０．０９ｎＭ）ことが明らかになった。ヒトＰＤＧＦＲβへの結合について１Ｂ３抗体を試験した場合、ヒト腫瘍細胞系上の細胞表面で発現されたレセプターとしても、可溶性組換え蛋白質としても、交差反応性は観察されなかった。更に、１Ｂ３は、ヒト及びマウスＰＤＧＦＲαの両者には結合しなかった（データは示さず）。阻止アッセイで、１Ｂ３は１．２ｎＭのＩＣ５０でｍＰＤＧＦＲβをそのリガンドＰＤＧＦ−ＢＢへの結合から阻害し、一方そのＦａｂのＩＣ５０は４．１ｎＭであった（図１Ｂ）。
【０１２５】
（細胞系アッセイで、１Ｂ３はＰＤＧＦ−ＢＢで刺激されるレセプターリン酸化及び下流のシグナル伝達を阻害する）
ＮＩＨ／３Ｔ３（線維芽細胞）、Ｄ１２２（ルイス肺癌腫）、４Ｔ１（乳癌）、Ｂ１６（黒色腫）及びＨ５Ｖ（ＰｍＴで形質転換した内皮細胞）を含むいくつかのマウス細胞系を、１Ｂ３をテスト試薬として用いてＦＡＣＳ解析によりＰＤＧＦＲβ発現を試験した。細胞を、ウェル当たり約１×１０６で９６ウェルプレートのウェル内に等分し、１Ｂ３（１０μｇ／ｍｌ）とともに４℃で１時間インキュベートし、その後抗ヒトＦｃ抗体−ＦＩＴＣ接合体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ）と４℃で更に１時間インキュベートした。冷ＰＢＳで数回洗浄した後、ＦＡＣＳｙａｎｔａｇｅ  ＳＥフローサイトメーター（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｓａｎ  Ｊｏｓｅ、ＣＡ）を用いて細胞を分析した。Ｒ＆Ｄからの抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体を、陽性対照として使用した（データは示さず）。ＦＡＣＳの結果（図２Ａ）、ＮＩＨ／３Ｔ３及びＤ１２２はＰＤＧＦＲβを中レベルで発現し、４Ｔ１及びＢ１６は低レベルでそのレセプターを発現し、Ｈ５Ｖでは全く染色が生じないことが示された。
【０１２６】
レセプターリン酸化を、ＮＩＨ／３Ｔ３及びＤ１２２細胞について定量した。細胞を６ｃｍディッシュに蒔き、集密度７０〜８０％まで成長させ、その後ＰＢＳ中で細胞を２回洗浄し、無血清培地中で一晩培養した。この細胞を先ず、様々な抗体とともに室温にて３０分間インキュベートし、その後ＰＤＧＦ−ＢＢを用いて３７℃にて１５分間刺激した。細胞を溶解バッファー（５０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ  ７．４、１５０ｍＭ  ＮａＣｌ、１％  ＴｒｉｔｏｎＸ−１００、１ｍＭ  ＥＤＴＡ、１ｍＭフッ化フェニルメチルスルホニル、０．５ｍＭ  Ｎａ３ＶＯ４、１μｇ／ｍｌロイペプチン、１μｇ／ｍｌペプスタチン、及び１μｇ／ｍｌアプロチニン）中で１時間溶解させ、その後溶解物を４℃にて１０分間、１２，０００ｒｐｍで遠心分離した。細胞溶解物上清から抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ  Ｉｎｃ）によりレセプターを免疫沈降させ、その後２０μｌのＰｒｏＡ／Ｇ−セファロースビーズを添加した。沈殿したレセプター蛋白質を４〜１２％ＮｕＰＡＧＥビス−トリスゲル上で分離し、ポリ二フッ化ビニリデン膜に転写した。ホスホ−ｍＰＤＧＦＲβ蛋白質を、抗ホスホチロシン抗体−ＨＲＰコンジュゲート（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ  Ｂｉｏｔｅｃｈ、Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ、ＣＡ）を用いてブロット上で検出した。ゲルに付した全レセプター蛋白質を、ｍＰＤＧＦＲβに対する抗体を用いてアッセイした。
【０１２７】
下流のシグナル伝達を調べるために、前記処置で得られた細胞溶解液を４−１２％のＮｕＰＡＧＥビス−トリスゲルによって分離した。抗ホスホ−Ａｋｔ並びに抗ホスホ−ｐ４４／ｐ４２  ＭＡＰＫ及びｐ４４／ｐ４２  ＭＡＰＫ（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）をそれぞれ用いて、リン酸化Ａｋｔ、及びｐ４４／４２  マイトゲンで活性化したプロテインキナーゼ（ＭＡＰＫ）を検出した。
【０１２８】
ＮＩＨ／３Ｔ３及びＤ１２２両細胞において、１Ｂ３はＰＤＧＦ−ＢＢで刺激されるレセプターのリン酸化を用量依存的に阻害した（図２Ｂ及び２Ｃ）。抗体はまた、Ｄ１２２細胞においてＡｋｔ及びｐ４４／４２  ＭＡＰキナーゼ両者のＰＤＧＦ−ＢＢ刺激リン酸化を強力に阻害した（図２Ｄ）。
【０１２９】
（腫瘍異種移植片モデルにおける抗ｍＰＤＧＦＲβ抗体の抗腫瘍活性）
３種の卵巣癌腫（ＳＫ−ＯＶ−３、ＯＶ−ＣＡＲ−５及びＯＶ−ＣＡＲ−８）、１種の膵臓癌腫（ＢｘＰＣ３）、１種の肺癌腫（ＮＣＩ−Ｈ４６０）、及び１種の腎臓癌腫（Ｃａｋｉ−１）を含む６種のヒト異種移植片腫瘍モデルを用いて、インビボで１Ｂ３の抗腫瘍活性を判定した。無胸腺（ｎｕ／ｎｕ）マウス（雌性、７−８週齡）を、異種移植片の移植前に７〜１０日間収容した。各マウスに、ＳＫ−ＯＶ−３、ＯＶＣＡＲ−５、ＯＶＣＡＲ−８、Ｃａｋｉ−１、ＢｘＰＣ３又はＮＣＩ−Ｈ４６０腫瘍細胞の３〜１０×１０６細胞を皮下注射した。腫瘍が、約２５０〜３００ｍｍ３に達したら、マウスを各１０〜１２匹の群に無作為に分けて、ＤＣ１０１と組み合わせた１Ｂ３、ＤＣ１０１、又は１Ｂ３で１週間に２〜３回、腹腔内注射により処置した。ヒトＩｇＧ及び／又は米国薬局方準拠の生理食塩水を、対照群として使用した。腫瘍サイズ及びマウス体重を、週２回測定した。式：π／６×（長さ×幅２）、（長さ＝最長の直径、及び幅＝長さに対して垂直方向の直径）を用いて腫瘍体積を算出した。対照群に対する処置群の平均腫瘍体積の比（Ｔ／Ｃ％）を求めた。統計的解析をスチューデントｔ検定によって実施した。
【０１３０】
抗ＰＤＧＦＲβ抗体での単独治療の抗腫瘍効果を調べるために、マウスを１Ｂ３、正常ヒトＩｇＧ、又は生理食塩水で腹腔内注射により週２回処置した。ＳＫ−ＯＶ−３モデルで、腫瘍担持マウスに６、２０、又は６０ｍｇ／ｋｇの用量で１Ｂ３を与えた。２種の低用量の１Ｂ３で処置したマウスで、腫瘍成長阻害は観察されなかった（図３Ａ）。６０ｍｇ／ｋｇでは、１Ｂ３は処置開始後２９日までに完全に腫瘍成長を阻止し（Ｐ＝０．００２８）、その後の継続的な抗体処置に関わらず、腫瘍は速やかに、ヒトＩｇＧで処置した対照群におけるものと同様の速度で成長し始めた（図３Ａ）。１Ｂ３（６０ｍｇ／ｋｇ用量）は、ＯＶ−ＣＡＲ−８及びＮＣＩ−Ｈ４６０異種移植片モデルの双方でも有意な抗腫瘍活性が実証された。すなわち、処置期間中ほぼ完全にＯＶ−ＣＡＲ−８腫瘍の成長を阻止し（図３Ｂ）（Ｐ＝０．００２２）、ＮＣＩ−Ｈ４６０腫瘍の成長を有意に緩徐化した（図３Ｆ）（Ｐ＜０．０５）。他方、１Ｂ３（週３回４０ｍｇ／ｋｇ、又は週２回６０ｍｇ／ｋｇ）は、ＢｘＰＣ３、ＯＶ−ＣＡＲ−５及びＣａｋｉ−１異種移植片モデルで何ら抗腫瘍活性を示さなかった（図３Ｃ、３Ｄ及び３Ｅ）。１Ｂ３処置は、検査した６種のモデルすべてで、体重及び動物行動の変化を含め、顕在的な毒性を起こさなかった。
【０１３１】
（腫瘍異種移植片モデルにおける抗ＶＥＧＦＲ２抗体、ＤＣ１０１の抗腫瘍及び抗血管形成活性の、１Ｂ３による増強）
抗ＶＥＧＦＲ２抗体の抗腫瘍及び抗血管形成活性が、複数の動物モデルで実証されている（Ｐｒｅｗｅｔｔ，Ｍ．ら、１９９９，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５９：５２０９−１８）。そこで、我々は１Ｂ３が、ＤＣ１０１の抗腫瘍及び抗血管形成活性を増強できることを、２種の異種移植片モデル、ＢｘＰＣ−３（膵臓癌腫）及びＮＣＩ−Ｈ４６０（非小細胞肺癌腫）を用いて実証する。３００〜３５０ｍｍ３のサイズの異種移植された腫瘍を担持する無胸腺ヌードマウスを無作為化して、４つの処置群（ｎ＝１２／群）に分けて、生理食塩水、１Ｂ３（４０ｍｇ／ｋｇ）、ＤＣ１０１（４０ｍｇ／ｋｇ）、又は１Ｂ３（４０ｍｇ／ｋｇ）プラスＤＣ１０１（４０ｍｇ／ｋｇ）を週３回腹腔内注射することにより処置した。予期した通り、ＤＣ１０１での処置は、ＢｘＰＣ３及びＮＣＩ−Ｈ４６０異種移植片の双方の成長を有意に阻害した（それぞれ、Ｐ＝０．０００１及び＜０．０００１）（図４Ａ及び４Ｂ）。１Ｂ３での単独治療で、ＮＣＩ−Ｈ４６０モデルにおける中程度の抗腫瘍活性が実証された（処置後２２日にＴ／Ｃ％＝６６％、Ｐ＝０．００６２）が、ＢｘＰＣ３異種移植片での抗腫瘍活性は示されなかった。１Ｂ３とＤＣ１０１との組み合わせは、ＢｘＰＣ３モデルで有意に腫瘍阻害の増強をもたらした。治療の終了時にＴ／Ｃ％は、抗体の組み合わせを与えたマウスで２７．３％であったのに対し、ＤＣ１０１単独処置のマウスでは３８．７％であった（Ｐ＝０．０３４６）。更に、抗体組み合わせ群では１２匹のマウスのうち７匹で腫瘍の退行が観察され（５８．３％）、これに対しＤＣ１０１単独群では１１匹のマウス中のうち２匹（１８．２％）で観察され、１Ｂ３を単独で与えたマウスで退行は観察されなかった。ＮＣＩ−Ｈ４６０モデルで、１Ｂ３プラスＤＣ１０１はやはり、１Ｂ３又はＤＣ１０１単独のいずれよりもずっと強力な腫瘍阻害活性をもたらし、処置後２２日にＴ／Ｃ％は１Ｂ３プラスＤＣ１０１の群で２２％であり、これに対し１Ｂ３群では６６％であった（Ｐ＜０．０００１）。試験の終了時には（処置後５０日）、抗体組み合わせ群で平均腫瘍体積はＤＣ１０１単独群の半分であった（８１３．９±１２７．８ｍｍ３に対して１６６０．９±５５４．４ｍｍ３）（Ｐ＝０．０２５）。抗体組み合わせ群では死亡がなかったが、ＤＣ１０１群の１２匹のマウスのうち２匹が実験中に（１匹は第２２日に、もう１匹は第４３日に）死亡した。
【０１３２】
（腫瘍切片の免疫組織化学）
抗体で処置したマウスからの腫瘍異種移植片を、血管の血管密度及び周皮細胞被覆の双方について免疫組織化学染色によって調べた。処置後第３４日（ＢｘＰＣ３モデル）又は第５０日（ＮＣＩ−Ｈ４６０モデル）に、ＤＣ１０１単独治療及びＤＣ１０１／１Ｂ３併用治療群各々からの６匹のマウスを安楽死させた。腫瘍を取り出し、１０％中性緩衝ホルマリン中で４℃にて一晩固定して、パラフィン包埋した。固定した腫瘍をＬｅｉｃａ  ＲＭ２１３５ミクロトームを用いて６μｍの厚さの切片にし、その後血管及び周皮細胞／ＳＭＣ被覆の双方につき二重染色した。
【０１３３】
抗ＣＤ３１抗体（血管染色用）及び抗α−平滑筋アクチン（α−ＳＭＡ）抗体（周皮細胞染色用）の両者を用いて腫瘍切片を染色した。切片は先ず、ラット抗マウスＰＥＣＡＭ−１（抗ＣＤ３１抗体、Ｐｈａｒｍｉｎｇｅｎ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）とともに４℃で一晩インキュベートし、その後ビオチン−ＳＰ−標識化ロバ抗ラットＩｇＧ抗体、次いでストレプトアビジン−Ｃｙ３接合体（両方ともＪａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈより入手）とともにインキュベートした。切片は更に、抗α−ＳＭＡ抗体−ＦＩＴＣ接合体（シグマ）で染色した。最後に、切片をＴｏＰｒｏ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅ、ライデン、オランダ）で室温で５分間、対比染色した。
【０１３４】
共焦点顕微鏡に結線したデジタルカメラ（Ｎｉｋｏｎ  Ｅｃｌｉｐｓｅ  ＴＥ２０００Ｕ）を用い、ＥＺ−Ｃ１  ２．２０ソフトウェアによって免疫蛍光画像（２００×の倍率）を得た。コンピュータ支援による形態学的数量化を、Ｉｍａｇｅ  Ｐｒｏ  Ｐｌｕｓソフトウェア（ＭｅｄｉａＣｙｂｅｒｎａｔｉｃｓ、Ｓｉｌｖｅｒ  Ｓｐｒｉｎｇ、ＭＤ）を用いて実施し、各切片より分析した。
【０１３５】
各切片からの腫瘍周縁及び腫瘍コアの５枚のデジタル画像で、総ＣＤ３１＋血管、α−ＳＭＡ＋血管、成熟血管（二重ＣＤ３１＋及びα−ＳＭＡ＋）、及び総ＣＤ３１＋血管に対する二重ＣＤ３１＋／α−ＳＭＡ＋血管のパーセンテージを計数した。２種の異なる定量化法を用いて、個々の腫瘍切片の血管分布の程度、すなわち血管密度（血管数／ｍｍ３）、及び血管面積のパーセンテージ（総腫瘍面積に対する血管面積％）を測定した。コンピュータ支援形態学的数量化は、Ｉｍａｇｅ  Ｐｒｏ  Ｐｌｕｓソフトウェアを用いて実施した。統計的解析には、二元配置分散分析（ｔｗｏ−ｗａｙ  ＡＮＯＶＡ）の後ＦｉｓｈｅｒのＬＳＤ法を用いて多重比較（Ｓｉｇｍａ  Ｓｔａｔ  ３．１  Ｓｙｓｔａｔ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｐｏｉｎｔ  Ｒｉｃｈｍｏｎｄ、ＣＡ）を行った。
【０１３６】
ＤＣ１０１処置で、ＢｘＰＣ３腫瘍異種移植片でのＣＤ３１＋血管密度が主に腫瘍コア内で有意に低減したが（図５Ａ）、α−ＳＭＡ＋血管密度に対しては弱い効果しか示されなかった（図５Ｂ）。ＤＣ１０１への１Ｂ３の添加は、腫瘍コアでの血管分布を更に減少させることはなかったものの、腫瘍の周辺で血管密度の低減が有意に高められる結果となった（図５Ａ）。１Ｂ３単独では、全体的な腫瘍血管密度への有意な効果は示されなかったが（図５Ａ）、腫瘍周縁でのα−ＳＭＡ染色は低減し（図５Ｂ）、この結果ＣＤ３１／α−ＳＭＡ二重陽性（成熟）血管（図５Ｃ）のパーセンテージの低下がもたらされた。これは、腫瘍内のＰＤＧＦＲβ−陽性周皮細胞が選択的に阻害されたことを示唆する。ＤＣ１０１単独で、及びＤＣ１０１プラス１Ｂ３で処置した腫瘍の双方で、ＣＤ３１＋血管の低減の程度は、腫瘍コア及び周辺の双方におけるα−ＳＭＡ＋周皮細胞被覆の低減と直接相関している（図５Ａ及びＢ）ことは興味深い。結果的に、腫瘍周縁及びコアの双方における成熟血管のパーセンテージ、すなわち、総ＣＤ３１＋血管に対する二重ＣＤ３１＋／α−ＳＭＡ＋血管の比率は、生理食塩水、ＤＣ１０１単独、又はＤＣ１０１プラス１Ｂ３で処置したマウスからの腫瘍間で有意に異なることはなさそうであった（図５Ｃ）。同様の現象が、ＮＣＩ−Ｈ４６０腫瘍異種移植片でも観察された（図５Ｄ−Ｆ）。最後に、総腫瘍面積に対する血管面積のパーセンテージを測定する代替採点法を用いて腫瘍血管分布の程度を定量した場合に、腫瘍異種移植片の双方でほぼ同じ観察結果が得られた（示さず）。
【０１３７】
（ヒト抗ｈＰＤＧＦＲβ抗体の選択）
前記のファージディスプレイライブラリーを、ヒトＰＤＧＦＲβに結合するファージ−Ｆａｂについてスクリーニングした。１Ｂ３について前記した通り、得られたｈＰＤＧＦＲβ−結合クローン、２Ｃ５（表１）の重鎖及び軽鎖遺伝子をコード化するＤＮＡ配列を、ＰＣＲによって増幅し、ヒトκ軽鎖定常領域及びヒトγ１重鎖定常領域を含む発現ベクターにクローニングした。この発現ベクターをＮＳ０骨髄腫細胞にトランスフェクトして、２Ｃ５抗体を発現している安定なクローンを選択した。
【０１３８】
ＢＩＡコア解析によって確認すると、１Ｂ３がｍＰＤＧＦＲβに結合するのと同様の結合特性で、２Ｃ５はｈＰＤＧＦＲβに結合する。１Ｂ３と同様に、２Ｃ５はＰＤＧＦＲβに対して特異的であり、ｈＰＤＧＦＲαに結合しない。しかし、１Ｂ３はマウスＰＤＧＦＲβに結合するがヒトＰＤＧＦＲβには結合しないのに対し、２Ｃ５は両方の蛋白質に結合する（図６）。１つの実験で、表面プラズモン共鳴により定量した２Ｃ５のＩＣ５０値は、ｈＰＤＧＦＲβで１．３６×１０−１１Ｍであり、ｍＰＤＧＦＲβで６．０５×１０−１１Ｍであった。ｈＰＤＧＦＲβに結合する１Ｂ３結合のＩＣ５０は、４．１７×１０−１１Ｍであった。
【０１３９】
２Ｃ５も、図６に示すように、ヒト及びマウスＰＤＧＦＲβの両者へのＰＤＧＦ−ＢＢの結合を阻止する。ＩＣ５０値はｈＰＤＧＦＲβで０．５５ｎＭ、そしてｍＰＤＧＦＲβで０．３５ｎＭであった。
【０１４０】
（細胞系アッセイで、２Ｃ５はＰＤＧＦ−ＢＢで刺激されるレセプターリン酸化及び下流のシグナル伝達を阻害する）
２Ｃ５がＰＤＧＦＲβリン酸化を阻止する能力を、ヒトＣａｋｉ−１腫瘍細胞（図７）及びマウスＮＩＨ／３Ｔ３及びＤ１２２細胞系（図８）について調べた。２Ｃ５は、試験をした低濃度でもレセプターのリン酸化を阻止した（ＩＣ５０＜＜１．８μｇ／ｍｌ）。２Ｃ５はまた、Ａｋｔ及びｐ４４／４２ＭＡＰの両キナーゼのＰＤＧＦ−ＢＢ刺激リン酸化も、Ｃａｋｉ−１細胞（図７）及びＤ１２２細胞（図８）で強力に阻害した。
【０１４１】
（腫瘍異種移植片モデルにおける抗ＰＤＧＦＲβ抗体の抗腫瘍活性）
前記５種のヒト異種移植片腫瘍モデル（ＯＶＣＡＲ−５及びＯＶＣＡＲ−８、ＢｘＰＣ３、ＮＣＩ−Ｈ４６０、及びＣａｋｉ−１）を用いて、インビボで２Ｃ５の抗腫瘍活性を判定した。腫瘍のヒトＰＤＧＦＲβレセプター及び脈管構造のマウスレセプターに結合して阻害する２Ｃ５を、マウス脈管構造のみに結合する１Ｂ３と比較した。ＳＫＯＶ−３、ＯＶＣＡＲ−８、及びＮＣＩ−Ｈ４６０モデルでは腫瘍成長の中度の低減が観察されたが、ＯＶＣＡＲ−５、ＢｘＰＣ３及びＣａｋｉ−１モデルでは観察されなかった（図９；表２）。
【０１４２】
【表２】
2010524466.tif 000004
【０１４３】
（腫瘍異種移植片モデルにおける、抗ＰＤＧＦＲβ（２Ｃ５）／抗ｍＶＥＧＦＲ２（ＤＣ１０１）抗体の組み合わせの抗腫瘍活性）
ヒト及びマウスＰＤＧＦＲβレセプターに結合する２Ｃ５（すなわち、マウス宿主内のヒト異種移植片の腫瘍及び脈管構造両者上のＰＤＧＦＲβレセプター）も、マウスＶＥＧＦＲ２に特異的な抗体（ＤＣ１０１）と組み合わせて、腫瘍成長の阻害について試験した。異種移植片細胞系は、ＢｘＰＣ−３、ＭＩＡ−ＰａＣａ−２、Ｄｅｔｒｏｉｔ−５６２、ＨＣＴ−８、ＮＣＩ−Ｈ４６０、ＮＣＩ−Ｈ２９２、及びＨＣＴ−１１６であった。２Ｃ５及びＤＣ１０１の同時投与の結果、いずれかの抗体単独の場合よりも有意に大幅に、腫瘍成長の阻害が引き起こされた（図１０及び表３）。
【０１４４】
【表３】
2010524466.tif 000005
【０１４５】
（２Ｃ５は、ＰＤＧＦ−ＢＢで刺激される細胞遊走を細胞系遊走アッセイにおいて阻害する）
２チャンバー技術を用いて、ＮＣＩ−Ｈ４６０、ＯＶＣＡＲ８、ＷＳ−１及びＵ−１１８細胞系で細胞遊走を阻害する２Ｃ５の能力を調べた。コラーゲン（１００μｇ／ｍｌ）を上部チャンバー（１００μｌ）及び下部チャンバー（１５０μｌ）に加え、３７℃で１時間インキュベートした。チャンバーをＰＢＳで２回洗浄した後、１００μｌの飢餓細胞（無血清培地中、概算値０．５〜１×１０６／ｍｌ）を上部チャンバーに加えて、１５０μｌの無血清培地を下部チャンバーに加え、その後３７℃で４時間インキュベートした。ＰＤＧＦ−ＢＢ刺激のために、ＰＤＧＦ−ＢＢを下部チャンバーに加えて終濃度を１００ｎｇ／ｍｌとした。２Ｃ５ウェルで、２Ｃ５は上部チャンバーに加えて終濃度を３０μｇ／ｍｌとした。上部チャンバー内の非遊走細胞を、膜からこすり取った。ＰＢＳで３回洗浄した後、下部チャンバー側の膜上の遊走細胞は４％ホルマリンで固定して、ヘキスト（４μｇ／ｍｌ）で染色した。この結果得られたものを集めて、細胞を蛍光顕微鏡下で計数した。３０μｇ／ｍｌの濃度で、２Ｃ５は、アッセイに用いた４種の細胞系すべてにおいて、ＰＤＧＦ−ＢＢで刺激される細胞遊走を完全に阻害した（図１１）。
【０１４６】
（腫瘍異種移植片モデルにおける、抗ＰＤＧＦＲβ（２Ｃ５）／化学療法剤、又は抗ＰＤＧＦＲβ（２Ｃ５）／化学療法剤／抗ｍＶＥＧＦＲ２（ＤＣ１０１）抗体の組み合わせの抗腫瘍活性）
ＰＤＧＦＲβ抗体２Ｃ５も、化学療法剤（ゲムシタビン）又は化学療法剤（ゲムシタビン、パラクリタキセル又はオキサリプラチン）プラス抗ＶＥＧＦＲ２抗体（ＤＣ１０１）と組み合わせて、腫瘍成長の阻害について調べた。異種移植片細胞系は、ＮＣＩ−Ｈ２９２、ＭＩＡ−ＰａＣａ−２、ＮＣＩ−Ｈ４６０、及びＧＥＯであった。２Ｃ５とゲムシタビンの同時投与の結果、２Ｃ５又はゲムシタビン単独のいずれの場合よりも強く腫瘍成長の阻害が引き起こされた。２Ｃ５と、化学療法剤及びＤＣ１０１との同時投与の結果、化学療法剤／ＤＣ１０１の組み合わせよりも強く腫瘍成長の阻害が引き起こされた（図１２及び表４）。
【０１４７】
【表４】
2010524466.tif 000006
【０１４８】
腫瘍異種移植片モデルにおける、抗ＰＤＧＦＲβ（２Ｃ５）／抗ＰＤＧＦＲα（ｈＰＤＧＦＲαに特異的な３Ｇ３、又はｍＰＤＧＦＲαに特異的な１Ｅ１０）抗体の組み合わせの抗腫瘍活性。抗ＰＤＧＦＲβ抗体２Ｃ５も、抗ＰＤＧＦＲα抗体と組み合わせて腫瘍成長の阻害について調べた。異種移植片細胞系は、Ｃａｋｉ−１、ＨＰＡＣ及びＵ−１１８ＭＧであった。２Ｃ５及び３Ｇ３の同時投与の結果、いずれの抗体単独の場合よりも格段に強く腫瘍成長の阻害が引き起こされた（図１３及び表５）。
【０１４９】
【表５】
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【０１５０】
（ＰＤＧＦＲβ、ＰＤＧＦ−ＢＢ及びＶＥＧＦ発現に対する２Ｃ５抗体の効果）
ＮＣＩ−Ｈ４６０細胞  懸濁液（５×１０５細胞／マウス）を、雌性胸腺欠損マウスに皮下注射した。腫瘍がおよそ２５０ｍｍ３に達したら、マウスを無作為化して４つの処置群に分けた（ｎ＝３５、各々、米国薬局方準拠の生理食塩水、２Ｃ５、ＤＣ１０１及び２Ｃ５＋ＤＣ１０１）。第３日、第７日及び第１４日に、各群６匹ずつの動物を屠殺して、それらの腫瘍を収集した。腫瘍溶解液でＥＬＩＳＡ解析を実施して、ＰＤＧＦＲβ、ＰＤＧＦ−ＢＢ、ｍＶＥＧＦＲ２、ｍＶＥＧＦ、ｈＶＥＧＦ、ＦＧＦ及びＨＩＦ−１αのレベルを評価した（図１４）。
【０１５１】
（２Ｃ５は、ＰＤＧＦＲβのドメイン１（Ｄ１）及びドメイン２（Ｄ２）に結合する）
先ずＰＤＧＦＲβ及びＰＤＧＦＲαの様々なキメラ構築体を、Ｎ末端から始めてＣ末端まで、ＰＤＧＦＲαドメインをＰＤＧＦＲβドメインで交換するドメインスワッピングによって作製した。ＰＤＧＦＲβ／αキメラを、２Ｃ５結合の能力について調べた。次いで、Ｄ１Ｄ２、Ｄ２Ｄ３及びＤ１Ｄ２Ｄ３を含むＰＤＧＦＲβの短いバージョンを作製して、ＰＤＧＦＲβ上の２Ｃ５結合ドメインを確認した。その結果、２Ｃ５はレセプターのＤ１及びＤ２両者を介してＰＤＧＦＲβに結合することが示唆された（図１５及び表６）。
【０１５２】
【表６】
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【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図２Ｃ−２Ｄ】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図３Ｃ】
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【図３Ｄ】
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【図３Ｅ】
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【図３Ｆ】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図５Ａ】
2010524466.tif 000022
【図５Ｂ】
2010524466.tif 000023
【図５Ｃ】
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【図５Ｄ】
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【図５Ｅ】
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【図５Ｆ】
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【図６】
2010524466.tif 000028
【図７】
2010524466.tif 000029
【図８】
2010524466.tif 000030
【図９Ａ】
2010524466.tif 000031
【図９Ｂ】
2010524466.tif 000032
【図９Ｃ】
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【図９Ｄ】
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【図９Ｅ】
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【図９Ｆ】
2010524466.tif 000036
【図１０Ａ】
2010524466.tif 000037
【図１０Ｂ】
2010524466.tif 000038
【図１１】
2010524466.tif 000039
【図１２】
2010524466.tif 000040
【図１３】
2010524466.tif 000041
【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１５Ａ】
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【図１５Ｂ】
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【図１６】
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【図１７】
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【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成21年10月9日(2009.10.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
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【手続補正書】
【提出日】平成21年12月3日(2009.12.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】
2010524466000001.app
【手続補正２】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【図１７】
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【国際調査報告】
2010524466.tif 000070
2010524466.tif 000071
2010524466.tif 000072
2010524466.tif 000073
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