(57)【要約】本発明は一般的に低密度リポ蛋白受容体関連蛋白（ＲＡＰ）の受容体選択的変異体およびその組成物、そのような変異体を形成する方法および治療目的のためにそのような受容体選択的ＲＡＰ変異体組成物を使用する方法に関する。本発明は高い親和性でＣＲ含有蛋白に結合する環状ＲＡＰペプチド（類縁体または誘導体を包含）、そのような環状ペプチドを含むコンジュゲートおよび組成物、およびそのようなペプチドの、例えばそのようなＣＲ含有蛋白の阻害剤または増強剤としての、またはそのようなＣＲ含有蛋白を発現する組織への診断薬または治療薬のターゲティング送達のための治療上または診断上の使用を提供する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号９７に少なくとも７０％同一である５０個の連続するアミノ酸を含み、そして約１ｘ１０−８Ｍ以下の結合親和性ＫｄでＣＲ含有蛋白に結合する、約８５アミノ酸長未満である環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２】
約１ｘ１０−８Ｍ以下のＫｄでＬＲＰ１に結合する請求項１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３】
成熟ＲＡＰの２５１、２５６、２５７、２６６、２７０、２７９、２８０、２９６または３０５位の何れか１つにおける変異を含む請求項１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項４】
マトリプターゼに選択的に結合する請求項１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項５】
ＲＡＰの２５１、２５６、２５７、２６６、２７０または２８０位の何れか１つにおける変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項６】
ＲＡＰの２５１位における変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項７】
ＲＡＰの２５６位における変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項８】
ＲＡＰの２５７位における変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項９】
ＲＡＰの２６６位における変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１０】
ＲＡＰの２７０位における変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１１】
ＲＡＰの２８０位における変異を含む請求項４記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１２】
ＶＬＤＬＲ蛋白に選択的に結合する請求項１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１３】
ＲＡＰの２５１、２５６、２７０または２９６位の何れか１つにおける変異を含む請求項１２記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１４】
ＲＡＰの２５１位における変異を含む請求項１２記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１５】
ＲＡＰの２５６位における変異を含む請求項１２記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１６】
ＲＡＰの２７０位における変異を含む請求項１２記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１７】
ＲＡＰの２９６位における変異を含む請求項１２記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１８】
ＦＤＣ−８Ｄ６（ＣＤ３２０）蛋白に選択的に結合する請求項１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項１９】
ＲＡＰの２５１、２５６、２７０、２７９または３０５位の何れか１つにおける変異を含む請求項１８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２０】
ＲＡＰの２５１位における変異を含む請求項１８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２１】
ＲＡＰの２５６位における変異を含む請求項１８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２２】
ＲＡＰの２７０位における変異を含む請求項１８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２３】
ＲＡＰの２７９位における変異を含む請求項１８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２４】
ＲＡＰの３０５位における変異を含む請求項１８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２５】
配列番号９７を含む請求項１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２６】
ＲＡＰの２７１〜３１９位内に少なくとも１つの追加的変異を含有する請求項１〜２５の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２７】
ＲＡＰの２０５〜２５０位内に少なくとも１つの変異を含有する請求項１〜２６の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２８】
前記変異が塩基性アミノ酸による酸性アミノ酸の置き換えである請求項１〜２７の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項２９】
前記酸性アミノ酸がＤおよびＥよりなる群から選択される請求項２８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３０】
前記塩基性アミノ酸がＫおよびＲよりなる群から選択される請求項２８記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３１】
前記変異が酸性アミノ酸による塩基性アミノ酸の置き換えである請求項１〜２７の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３２】
前記塩基性アミノ酸がＫおよびＲよりなる群から選択される請求項３１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３３】
前記酸性アミノ酸がＤおよびＥよりなる群から選択される請求項３１記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３４】
前記変異がＦ、Ｙ、Ｗ、およびＨよりなる群から選択されるアミノ酸によるＡ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｇ、Ｉ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、Ｎ、Ｐ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、およびＶよりなる群から選択されるアミノ酸の置き換えである請求項１〜２７の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３５】
以下の位置、即ち：１７５、２０５、２１３、２１７、２２６、２３０、２３２、２３９、２４１、２４２、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５６、２５７、２６１、２６６、２６７、２６８、２７０、２７３、２７９、２８０、２８７、２９０、２９４、２９６、２９７、２９８、３０５、３０８、３１１、３１２、３１３、３１４、または３１５の３つ以上における変異を含む請求項１〜３４の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３６】
以下の位置、即ち：２０５、２１７、２４９、２５１、２５６、２５７、２６６、２７０、２９４、２９６、２９７、３０５の３つ以上における変異を含む請求項１〜３４の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３７】
以下の変異、即ち：Ｒ２０５Ｓ、Ｓ２１３Ｔ、Ｅ２１７Ｋ、Ｌ２２６Ｍ、Ｈ２４９Ｙ、Ｅ２３０Ｖ、Ｓ２３２Ｐ、Ｅ２３９Ｇ、Ｅ２４６Ｇ、Ｅ２５１Ｌ、Ｅ２５１Ｋ、Ｅ２５１Ｔ、Ｅ２５１Ｇ、Ｅ２５１Ｐ、Ｅ２５１Ｎ、Ｅ２５１Ｒ、Ｋ２５６Ｒ、Ｋ２５６Ｖ、Ｋ２５６Ａ、Ｋ２５６Ｉ、Ｋ２５６Ｐ、Ｋ２５６Ｌ、Ｉ２６６Ｆ、Ｉ２６６Ｔ、Ｋ２５７Ｙ、Ｑ２６１Ｒ、Ａ２６７Ｖ、Ｈ２６８Ｒ、Ｋ２７０Ｐ、Ｋ２７０Ｄ、Ｋ２７０Ｎ、Ｋ２７０Ｇ、Ｋ２７０Ｅ、Ｋ２７０Ｗ、Ｌ２７１Ｍ、Ｈ２７３Ｙ、Ｄ２７９Ｙ、Ｖ２８３Ｍ、Ｒ２８７Ｈ、Ｈ２９０Ｙ、Ｈ２９０Ｌ、Ｅ２９４Ｖ、Ｒ２９６Ｌ、Ｔ２９７Ｉ、Ｋ２９８Ｒ、Ｋ３０５Ｔ、Ｋ３０６Ｍ、Ｓ３１２Ｆ、Ｇ３１３Ｄ、Ｅ２４６Ｃ、Ｌ２４７Ｇ、Ｇ２８０Ａ、Ｌ３１１Ａ、Ｓ３１２Ｃ、Ｑ３０９Ｃ、Ｆ２５０Ｃ、Ｌ３０８Ｇ、Ｌ３１１Ｇ、Ｅ２４１Ｃ、およびＩ３１５Ｃの３つ以上を含む請求項１〜３４の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチド。
【請求項３８】
請求項１〜３７の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチドを投与することにより疾患を治療する方法であって、該環状ＲＡＰペプチドが該疾患の病態生理学に関与するＣＲ含有蛋白に選択的に結合する、方法。
【請求項３９】
診断薬または治療薬にコンジュゲートされた請求項１〜３７の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチドを含む化合物。
【請求項４０】
前記環状ＲＡＰペプチドおよび診断薬または治療薬がリンカーを介して連結している請求項３９記載の化合物。
【請求項４１】
前記リンカーがペプチドリンカーである請求項４０記載の化合物。
【請求項４２】
前記治療薬が神経膠細胞誘導ニューロン成長因子（ＧＤＮＦ）、脳誘導ニューロン成長因子（ＢＤＮＦ）、ニューロン成長因子（ＮＧＦ）、ディスインテグリンおよびメタロプロテイナーゼドメイン１０（ＡＤＡＭ１０）、ＬＲＰ５／６に対するシャペロン蛋白（ＭＥＳＤ）、癌化学療法剤、プロテアーゼ阻害剤、アポトーシス促進分子、自己免疫抗原、リソソーム酵素、ナノ粒子、グリココンジュゲートおよび核酸よりなる群から選択される請求項３９記載の化合物。
【請求項４３】
製薬上許容しうる担体、希釈剤または賦形剤中に請求項１〜３７または３９〜４２の何れかの化合物を含む医薬組成物。
【請求項４４】
動物の中枢神経系内に診断薬または治療薬を送達する方法であって、請求項４３記載の医薬組成物を該送達を必要とする対象に投与することを含む方法。
【請求項４５】
前記対象が神経学的な疾患に罹患しているヒト対象である請求項４４記載の方法。
【請求項４６】
前記神経学的疾患がアルツハイマー病、パーキンソン病、多発性硬化症、筋萎縮性側索硬化症、および中枢神経系の癌よりなる群から選択される請求項４５記載の方法。
【請求項４７】
対象の特定の組織または組織のセットに診断薬または治療薬を送達する方法であって、請求項４３記載の医薬組成物を該送達を必要とする対象に投与することを含む方法。
【請求項４８】
前記診断薬または治療薬が血液脳関門を通して送達される請求項４７記載の方法。
【請求項４９】
活性剤にコンジュゲートされた請求項１〜３７の何れか１項に記載の環状ＲＡＰペプチドを含むコンジュゲート。
【請求項５０】
前記環状ＲＡＰペプチドおよび活性剤がリンカーを介して連結されている請求項４９記載のコンジュゲート。
【請求項５１】
前記活性剤が化学療法剤である請求項４９記載のコンジュゲート。
【請求項５２】
前記化学療法剤が放射性同位体である請求項５１記載のコンジュゲート。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本願は、２００７年３月２１日に出願された米国仮特許出願第６０／９１９，２３８号の優先権の利益を主張し、この米国仮特許出願の全体は、本明細書中に参考として援用される。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は低密度リポ蛋白受容体関連蛋白（ＲＡＰ）の環状ペプチド、例えばその類縁体、その組成物、およびそのような環状ＲＡＰペプチドを形成する方法および使用する方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
（発明の背景）
アルファ−２−マクログロブリン／低密度リポ蛋白受容体関連蛋白関連蛋白１（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｐ３０５３３、Ｐｆａｍアクセッション番号ＰＦ０６４００およびＰＦ０６４０１）としても知られている受容体関連蛋白（ＲＡＰ）は低密度リポ蛋白受容体（ＬＤＬＲ）ファミリーの殆ど全てのメンバーに結合する独特の３９ｋＤの蛋白である。小胞体およびゴルジ体に局在化することにより（非特許文献１）、ＲＡＰはこれらのファミリーメンバーに対するシャペロンとして作用する。例えばＲＡＰはこれらのコンパートメントないでＬＲＰに堅固に結合することにより同時発現リガンドとの受容体の早期の会合を防止する（非特許文献２）。
【０００４】
自身のシグナル配列を含む完全長のヒトＲＡＰは３５７アミノ酸である。成熟ＲＡＰは３２３アミノ酸を含有し、そのうち最後の４アミノ酸（ＨＮＥＬ）が小胞体貯留シグナリングを構成している。ＲＡＰは３つの弱い相同性を有するドメイン（ｄ１、ｄ２およびｄ３）よりなることが報告されている。３つのドメイン全てがＬＲＰと結合できるが、ｄ３が最高の親和性で結合する。種々の出版物がＲＡＰの３ドメインの境界の僅かに異なる割り付け（残基１−１００、１０１−２００および２０１−３２３、または１８−１１２、１１３−２１８および２１９−３２３）を報告しており、そしてドメインは僅かに異なる結合の特性を有すると考えられている。例えばｄ１はＬＲＰへのアルファ−２−マクログロブリンの結合を阻害すると報告されているのに対し、ｄ３はＬＲＰの適切な折り畳みを促進すると報告されている。（非特許文献３参照。）別の４ドメイン割り付け（残基１〜９２、９３〜１６３、１６４〜２１６および２１７〜３２３）が非特許文献４（Ｍｅｄｖｅｄ等）により報告されている。
【０００５】
ＲＡＰのトランケーションおよび／または変異された型が研究されている。非特許文献５（Ｍｅｌｍａｎ等）は成熟ＲＡＰの残基２２１〜３２３、２２１〜２７５、２７６〜３２３、２２１〜２９０、２２１〜３００および２２１〜３１０を包含するＧＳＴ／ＲＡＰフラグメント融合物の多くの形成を報告しており、これら全てのＬＲＰへの結合親和性は観察されないか低値であった。このデータより、Ｍｅｌｍａｎ等は高親和性のＬＲＰ結合のためには残基２０１〜２１０が必要とされると結論付けている。Ｍｅｌｍａｎ等は又、２０３〜２０６（部位Ａ）、２８２〜２８９（部位Ｂ）および３１４〜３１９（部位Ｃ）位内に変異を含有するＲＡＰ変異体を形成しており；部位Ａ単独または部位Ｂ単独の内部の変異はＬＲＰ結合活性の僅かな低減をもたらしたのに対し、部位ＡとＢの両方における変異はＬＲＰ結合活性を有意に低下させた。上記Ｍｅｄｖｅｄ等は、２つのＧＳＴ／ＲＡＰのＣ末端フラグメントの融合物を作成しており、その一方は成熟ＲＡＰの残基２１６〜３２３よりなり、そしてもう一方は残基２０６〜３２３よりなる。非特許文献６は種々のフラグメントへの成熟ＲＡＰの蛋白分解性切断を報告しており、そして高度にプロテアーゼ耐性の領域として残基２２３〜３２３を発見している。上記Ｏｂｅｒｍｏｅｌｌｅｒ等は又、成熟ＲＡＰの残基１９１〜３２３よりなるＲＡＰフラグメントを形成し、そしてＬＲＰの種々のドメインとの結合相互作用を研究している。非特許文献７はＲＡＰの残基２２１〜３２３を含有するＧＳＰ／ＲＡＰフラグメント融合物を構築しており、そして小胞体シャペロンＥＲｐ５７へのその結合を評価している。非特許文献８はａｐｏＥ受容体２への結合に関してＲＡＰドメインフラグメントを試験しており、そして第３のドメイン（残基２１６〜３２３）のみ結合したことを報告している。非特許文献９はＬＲＰの種々のフラグメントへの結合に関してＲＡＰｄ３（残基２１６−３２３）を試験している。非特許文献１０は又、ユビキチン（Ｕ−ＣＲ５６）に融合したＬＲＰフラグメントに結合する能力に関して残基２１９〜３０９にＣ末端トランケーションしたＲＡＰｄ３の変異体を試験しており、そしてＵ−ＣＲ５６に対する親和性の有意な低下を観察している。非特許文献１１は各々の保存されたヒスチジンがアラニンに変異しており、ドメイン１の全ヒスチジンがアラニンに変異しており、ドメイン２の全てのヒスチジンがアラニンに変異しており、そしてドメイン３の全てのヒスチジンがアラニンに変異している完全長ＲＡＰの変異体を構築している。非特許文献１２はＲＡＰの残基２０６〜３２３内にランダムな変異を有するクローンを含有するライブラリを構築し、そして、ＲＡＰの２５６位のリジンの変異または２７０位のリジンがＲＡＰのＬＲＰへの結合を根絶したことを報告している。
【０００６】
リポ蛋白受容体関連蛋白（ＬＲＰ）受容体ファミリーは広範な種類の生理学的現象を媒介する細胞表面の、膜貫通蛋白のグループを含む。受容体は全てＬＤＬＲに相同であり、そして同様のドメイン機構を共有しており、これにはＬＤＬ受容体クラスＡドメインまたは補体型リピート（ＣＲ）が包含され、それは保存された蛋白配列の大型のファミリーの一部である。このファミリーのメンバーに対する構造的なデータは、ＣＲ配列が特徴的な折り畳み、ＬＤＬ受容体様モジュールを採用していることを示唆している（Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ  Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，ＳＣＯＰという用語）。ＣＲ配列はＬＤＬＲファミリーおよびＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼ（マトリプターゼ）ファミリーを包含する種々の異なる型の蛋白において観察されている。
【０００７】
ＬＲＰファミリーメンバーの作用の機序は結合したリガンドのエンドサイトーシスおよび細胞外空間からのシグナルトランスダクションの両方を包含する（１）。ＬＲＰは種々の細胞機能、限定しないが例えばリポ蛋白の代謝（２、３）、マトリックスメタロプロテアーゼおよび凝固因子の制御（４〜６）、細胞の消長の特定（３、７）、神経細胞の遊走のガイダンス（７、８）、腫瘍細胞の増殖の誘導、ライノウィルスの結合（１１、１２）、神経伝達物質によるシグナリング、抗原提示細胞による抗原の獲得、血液脳関門を通過するリガンドのトランスサイトーシス（１６〜１９）、糸球体濾液からの蛋白の回収（２０）、内分泌ホルモンの輸送（２１）、脳からのアミロイドβペプチドの流出（２２）、骨付着の活性化（２３）および内皮細胞増殖の調節（２４）に参加している。このように多くの役割において機能するＬＤＬＲの能力は部分的にはこれらの受容体が結合することができるリガンドの多様なセットから誘導される。この受容体ファミリーの別の特徴は、多様で、そして頻繁には独特の、各ＬＤＬＲの組織分布パターンである。
【０００８】
ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼファミリーはｃｏｒｉｎおよびマトリプターゼＳＴ１４、マトリプターゼ−２およびマトリプターゼ−３を包含する。マトリプターゼ（ＭＴ−ＳＰ１、ＳＴ１４、ＴＡＤＧ−１５）は種々の上皮腫瘍（癌腫）において過剰発現される。肝細胞活性化物質阻害剤−１（ＨＡＩ−１）により促進された相互活性化の後、マトリプターゼは直接細胞外マトリックス成分を分解することによるか、またはウロキナーゼプラスミノーゲン活性化物質（ｕＰＡ）のような別のプロテアーゼを活性化することにより、マトリックス分解事象をもたらすことにより、腫瘍の成長および転移を促進する（２６，３４，３５）。ＬＤＬＲおよびマトリプターゼファミリーに加えて、種々の他の蛋白がＣＲドメインを有している。１つのそのような蛋白であるＦＤＣ−８Ｄ６抗原（ＣＤ３２０）はそのようなドメインの対を有し、そしてリンパ小節におけるＢ細胞の分化において重要な役割を果たしている（３６，３７）。
【０００９】
ＣＲ含有蛋白がこれらのファミリーの一部のメンバーの独特の組織分布プロファイルとともに病態生理学的プロセスにおいて果たしている重要な役割は、これらの蛋白を有用な薬物標的としている。蛋白選択的薬物はターゲティングされた蛋白の機能に対して直接影響を及ぼすことができ、特定の疾患状態に対して蛋白が有している作用を裏付けている。或いは、薬物はターゲティングされた蛋白の組織分布を好都合に利用することにより、疾患を有する特定の組織に対して他の治療分子を効率的に送達することができる。哺乳類の生理学および病態生理学的特徴におけるＣＲ含有蛋白の重要性の多大な証拠にも関わらず、ＬＤＬＲまたはＣＲ含有蛋白ファミリーの特定のメンバーに対して選択的に作用する薬物の例は殆ど無い。これらのファミリーの特定のメンバーに結合する分子を創生する能力は、そのような薬物を開発する手段を提供することになる。
【００１０】
例えば特許文献１（Ｚａｎｋｅｌ等）はＧＤＮＦのＲＡＰへの融合物（これは血液脳関門を通過する）がＧＤＮＦのジスルフィド結合ホモ２量体コンホーメーションを保持しているコンジュゲートを生成したことを示すデータを報告している。ＲＡＰ−ＧＤＮＦコンジュゲートはＧＤＮＦと同じ親和性（Ｋｄ）でＧＤＮＦに対する受容体（ＧＦＲα−１）に結合して活性化し、そして、培養物中のＰＣ１２細胞におけるＲＡＰ−ＧＤＮＦ誘導ニューライト派生により明らかにされる通りインビトロの生物学的活性を保持していた。
【００１１】
哺乳類の生理学的特徴の全体に渡ってＣＲ含有蛋白の広範な関与があるとすれば、ＲＡＰの本来の結合特性を保持しているか、または特定のＣＲ含有蛋白に対して進歩した結合選択性を有し、かつ他の所望の特性、例えば進歩した安定性または生産製造の容易さを呈するＲＡＰフラグメントおよび変異体の必要性が存在する。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１２】
【特許文献１】国際公開第２００６／１３８３４３号パンフレット
【非特許文献】
【００１３】
【非特許文献１】ＢｕおよびＳｃｈｗａｒｔｚ，Ｔｒｅｎｄｓ  Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．８（７）：２７２−６，１９９８
【非特許文献２】ＨｅｒｚおよびＷｉｌｌｎｏｗ，Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ  １１８  Ｓｕｐｐｌ：Ｓ３７−４１，１９９５
【非特許文献３】Ｏｂｅｒｍｏｅｌｌｅｒ等、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２（１６）：１０７６１−１００７６８（１９９７）
【非特許文献４】Ｍｅｄｖｅｄ等、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７４（２）：７１７−７２７（１９９９）
【非特許文献５】Ｍｅｌｍａｎ等、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６（３１）：２９３３８−２９３４６（２００１）
【非特許文献６】Ｒａｌｌ等、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２７３（３７）：２４１５２−２４１５７（１９９８）
【非特許文献７】ＭｃＣｏｒｍｉｃｋ等、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，４４：５７９４−８０３（２００５）
【非特許文献８】Ａｎｄｅｒｓｅｎ等、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ４２，９３５５−６４（２００３）
【非特許文献９】Ａｎｄｅｒｓｅｎ等、Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ２７５，２１０１７−２４（２０００）
【非特許文献１０】Ａｎｄｅｒｓｅｎ等、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ４０，１５４０８−１７（２００１）
【非特許文献１１】Ｌｅｅ等、Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  ２２，４２３−３０（２００６）
【非特許文献１２】Ｍｉｇｌｉｏｒｉｎｉ等、Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ  ２７８，１７９８６−９２（２００３）
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【００１４】
補体型リピート（ＣＲ）は特徴的な折り畳み構造を採用している保存された蛋白配列の大型のファミリーである。ＣＲ含有蛋白はＬＤＬ受容体ファミリー、ＩＩ型膜貫通セリンプロテアーゼ（マトリプターゼ）ファミリー、および他の蛋白、例えばＦＤＣ−８Ｄ６抗原（ＣＤ３２０）のメンバーを包含する。受容体関連蛋白（ＲＡＰ）は高い親和性でこれらのＣＲ含有蛋白の多くに結合する。成熟ＲＡＰの３２３アミノ酸配列を配列番号９５に示す。１２３アミノ酸長の成熟ＲＡＰのドメイン３のアミノ酸配列（アミノ酸２０１〜３２３）を配列番号９６に示す。アミノ酸２４３〜３１３は配列番号９７に示す。ＲＡＰのアミノ酸２４９〜３０３は配列番号９８に示す。
【００１５】
本発明は高い親和性でＣＲ含有蛋白に結合する環状ＲＡＰペプチド（類縁体または誘導体を包含）、そのような環状ペプチドを含むコンジュゲートおよび組成物、およびそのようなペプチドの、例えばそのようなＣＲ含有蛋白の阻害剤または増強剤としての、またはそのようなＣＲ含有蛋白を発現する組織への診断薬または治療薬のターゲティング送達のための治療上または診断上の使用を提供する。環状ＲＡＰペプチドは所望の特性、例えば進歩した親和性、ＣＲ含有蛋白に対する進歩した結合選択性、進歩した安定性、および／または製造の容易さを示す場合がある。
【００１６】
本発明の環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰのアミノ酸配列、好ましくはドメイン３に基づいており、好ましくは１２３アミノ酸長未満であり、そして２つの非隣接アミノ酸の間に共有結合を含有する。一部の実施形態においては、共有結合はＲＡＰペプチドの３次元構造を安定化させる。一部の実施形態においては、共有結合は約１ｘ１０−８Ｍかそれより低いＫｄでＣＲ含有蛋白に環状ＲＡＰペプチドが結合するような結合親和性における進歩をもたらす（より低いことがより良好な親和性を意味する）。そのような結合親和性は当該分野で知られた何れかの方法、例えばラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡ、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）系の技術（例えばＢｉａｃｏｒｅ）の分析、または動的エクスクルージョン試験（例えばＫｉｎＥｘＡ）により計測できる。親和性のデータは、例えばＳｃａｔｃｈａｒｄ等、Ａｎｎ  Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．、５１：６６０（１９４９）の方法により分析してよい。例示される実施形態においては、ＣＲ蛋白に対する結合親和性は約１ｘ１０−９、１０−１０、１０−１１、１０−１２、１０−１３、１０−１４Ｍ以下である。本発明は種々の大きさ、例えば約１０３、約９９、約９５、約９０、約８５、約８２、約８０、約７８、約７６、７５、７４、７３、７２、７１、７０、６９、６８、６７、６６、６５、６４、６３、６２、６１、６０、５９、５８、５７、または５６アミノ酸長以下の環状ＲＡＰペプチドを提供する。一部の実施形態においては、共有結合は約７６、７５、７４、７３、７２、７１、７０、６９、６８、６７、６６、６５、６４、６３、６２、６１、６０、５９、５８、５７、または５６アミノ酸の分だけ分離されたアミノ酸の間で形成される。
【００１７】
本発明の環状ＲＡＰペプチドは成熟ヒトＲＡＰ配列に基づいたアミノ酸配列を含んでよい（配列番号９５）。１つの実施形態において、環状ＲＡＰペプチドのアミノ酸配列は成熟ＲＡＰのＮ末端から少なくとも２００から２４３個までのアミノ酸を消失している。即ち、環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰのアミノ酸１〜２００、１〜２２０、１〜２２５、１〜２３０、１〜２３５、１〜２４０、１〜２４１、１〜２４２、１〜２４３、または或いは１〜２４４、１〜２４５、１〜２４６、１〜２４７、または１〜２４８を消失していてよい。関連する実施形態においては、ＲＡＰペプチドアミノ酸配列はさらに、成熟ＲＡＰのＣ末端から少なくとも４から１１個までのアミノ酸を更に消失している。即ち、環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰのアミノ酸３１４〜３２３または３１３〜３２３、または或いは３０４〜３２３、３０５〜３２３、３０６〜３２３、３０７〜３２３、３０８〜３２３、３０９〜３２３、３１０〜３２３、３１１〜３２３、または３１２〜３２３を消失していてよい。別の実施形態においては、ＲＡＰペプチドアミノ酸配列は（ａ）少なくとも７１アミノ酸長であり、そして（ｂ）アミノ酸２５６〜２７０を含む成熟ＲＡＰの連続部分を含む。関連する実施形態においては、ＲＡＰペプチドアミノ酸配列は（ａ）少なくとも７１アミノ酸長であり、そして（ｂ）アミノ酸２５６〜２７０を含む成熟ＲＡＰドメインの連続部分を含む。環状ＲＡＰペプチドのための基本を形成してよいＲＡＰの例示される部分は成熟ＲＡＰ（配列番号９５）のアミノ酸２００〜３２３、２２１〜３２３、２００〜３１９、２２１〜３１９、２４３〜３１９、２４４〜３１９、２４９〜３１９、２００〜３１３、２２１〜３１３、２４３〜３１３、２４４〜３１３、２４９〜３１３、２００〜３０３、２２１〜３０３、２４３〜３０３、２４４〜３０３、２４６〜３１１、２４６〜３１３、または２４９〜３０３を包含する。
【００１８】
本明細書に記載する通り、環状ＲＡＰペプチドはネイティブのＲＡＰのものと同様（例えばネイティブのＲＡＰと比較して約５倍差以下）のＣＲ含有蛋白に対する親和性および選択性を呈するものとして製造できる。環状ＲＡＰペプチドは又ネイティブのＲＡＰと比較してＣＲ含有蛋白１つ以上に対して向上した親和性および／または改変された選択性を呈するものとして製造できる。１つの実施形態において、環状ＲＡＰペプチドは少なくとも約１．５倍、２倍、２．５倍、３倍、４倍、５倍、７倍、１０倍、または２０倍の向上した親和性（ネイティブＲＡＰと相対比較して）および／またはＬＤＬＲ（Ｐ０１１３０）、ＬＲＰ１（Ｐ９８１５７）、ＬＲＰ１Ｂ（Ｑ９ＮＺＲ２）、ＬＲＰ２（Ｐ９８１６４）、ＬＲＰ３（Ｏ７５０７４）、ＬＲＰ４（Ｏ７５０９６）、ＬＲＰ５（Ｏ７５１９７）、ＬＲＰ６（Ｏ７５５８１）、ＬＲＰ８（Ｑ１４１１４）、ソルチリン関連受容体、ＳｏｒＬＡ（Ｑ９２６７３）、ＬＲＰ１０（Ｑ７Ｚ４Ｆ１）、ＬＲＰ１１（Ｑ８６ＶＺ４）、ＬＲＰ１２（Ｑ９Ｙ５６１）、ＦＤＣ−８Ｄ６（ＣＤ３２０）、ＶＬＤＬＲ（Ｐ９８１５５）、ＴＡＤＧ−１５（ＳＴ１４、Ｑ８ＷＶＣ１）、ＴＭＰＳ３（Ｐ５７７２７）、ＴＭＰＳ４（Ｑ９ＮＲＳ４）、ＴＭＰＳ６（Ｑ８ＩＵ８０）、Ｑ６ＩＣＣ２、Ｑ６ＰＪ７２、Ｑ７６Ｂ６１、Ｑ７ＲＴＹ８、Ｑ７Ｚ７Ｋ９、Ｑ８６ＹＤ５、Ｑ８ＮＡＮ７、Ｑ８ＮＢＪ０、Ｑ８ＷＷ８８、Ｑ９６ＮＴ６、Ｑ９ＢＹＥ１、Ｑ９ＢＹＥ２、Ｑ９ＮＰＦ０およびｃｏｒｉｎ（Ｑ８ＩＺＲ７）よりなる群から選択されるＣＲ含有蛋白に対する進歩した結合選択性を呈する。同様の結合選択性は、例えば特定のＣＲ含有蛋白に対するペプチドの結合親和性の、少なくとも１つ他のＣＲ含有蛋白に対するペプチドの結合親和性と相対比較した場合の比により計算してよい。ペプチドは他のＣＲ含有蛋白１、２、３、４、５、６、７、または８つと相対比較した場合のＣＲ含有蛋白に対する結合選択性を呈してよい。
【００１９】
本発明の環状ＲＡＰペプチドはネイティブのＲＡＰ配列を含んでよく、或いはネイティブの配列に対する変異を包含してよい。例示される実施形態においては、本発明の環状ＲＡＰペプチドは配列番号９７または配列番号９８の何れかと少なくとも６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一であるアミノ酸配列を含む。一部の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドは約８５アミノ酸長未満であり、配列番号９８に少なくとも７０％同一である５０隣接アミノ酸を含み、そして約１ｘ１０−８Ｍ以下の結合親和性ＫｄでＣＲ含有蛋白に結合する。一部の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰのアミノ酸２００〜３１９、３００〜３１９、または２４７〜２５７から選択される領域の何れか１つの内部の１、２、３、４、５、または６以上の位置において変異を包含する。例示される実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰ（配列番号９５）の１７５、２０５、２１３、２１７、２２６、２３０、２３２、２３９、２４１、２４２、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５６、２５７、２６１、２６６、２６７、２６８、２７０、２７３、２７９、２８０、２８７、２９０、２９４、２９６、２９７、２９８、３０５、３０８、３１１、３１２、３１３、３１４、または３１５よりなる群から選択される１、２、３、４、５、または６以上の位置において変異を包含する。他の実施形態において、環状ＲＡＰペプチドは以下の位置、即ち：２０５、２１７、２４９、２５１、２５６、２５７、２６６、２７０、２９４、２９６、２９７、３０５の３つ以上において変異を含む。他の実施形態において、環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰの２５１、２５６および２７０位において少なくとも１つの変異を含有する。
【００２０】
１つの特徴において、環状ＲＡＰペプチドはマトリプターゼ蛋白に選択的に結合する。マトリプターゼ特異的なペプチドは成熟ＲＡＰ（配列番号９５）のアミノ酸２４３〜３１３または２４９〜３０３を含んでよく、そして更に、成熟ＲＡＰの２５１、２５６、２５７、２６６、２７０または２８０位の何れか１つにおいて変異を含有することを意図している。更に又、マトリプターゼ特異的ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰの２５１、２５６、２５７、２６６、２７０および／または２８０位において少なくとも１、２、３、４、５または６つの変異を含有することを意図している。
【００２１】
別の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドはＶＬＤＬＲ蛋白に選択的に結合する。ＶＬＤＬＲ特異的なペプチドは成熟ＲＡＰ（配列番号９５）のアミノ酸２４３〜３１３または２４９〜３０３を含んでよく、そして更に、ＲＡＰの２５１、２５６、２７０または２９６位の何れか１つにおいて変異を含有することを意図している。更に又、ＶＬＤＬＲ特異的なＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰの２５１、２５６、２７０および／または２９６位において少なくとも１、２、３、または４つの変異を含有することを意図している。
【００２２】
別の特徴において、環状ＲＡＰペプチドはＦＤＣ−８Ｄ６（ＣＤ３２０）蛋白に選択的に結合する。ＦＤＣ−８Ｄ６特異的ペプチドは成熟ＲＡＰ（配列番号９５）のアミノ酸２４３〜３１３または２４９〜３０３を含んでよく、そして更に、ＲＡＰの２５１、２５６、２７０，２７９または３０５位の何れか１つにおいて変異を含有することを意図している。更に又、ＦＤＣ−８Ｄ６特異的ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰの２５１、２５６、２７０，２７９および／または３０５位において少なくとも１、２、３、４または５つの変異を含有することを意図している。
【００２３】
上記した変異の何れも酸性群（Ｄ、Ｅ）のアミノ酸の塩基性群（Ｋ、Ｒ）のアミノ酸による置き換えまたはその逆を包含してよい。上記した変異の何れも群（Ａ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｇ、Ｉ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、Ｎ、Ｐ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、Ｔ、Ｖ）のアミノ酸の群（Ｆ、Ｙ、Ｗ、Ｈ）のアミノ酸による置き換えも包含してよい。その他の実施形態において、環状ＲＡＰペプチドは成熟ＲＡＰ（配列番号９５）と比較して、以下の変異、即ち：Ｖ１７５Ｌ、Ｒ２０５Ｓ、Ｓ２１３Ｔ、Ｅ２１７Ｋ、Ｌ２２６Ｍ、Ｈ２４９Ｙ、Ｅ２３０Ｖ、Ｓ２３２Ｐ、Ｅ２３９Ｇ、Ｅ２４６Ｇ、Ｅ２５１Ｌ、Ｅ２５１Ｋ、Ｅ２５１Ｔ、Ｅ２５１Ｇ、Ｅ２５１Ｐ、Ｅ２５１Ｎ、Ｅ２５１Ｒ、Ｋ２５６Ｒ、Ｋ２５６Ｖ、Ｋ２５６Ａ、Ｋ２５６Ｉ、Ｋ２５６Ｐ、Ｋ２５６Ｌ、Ｉ２６６Ｆ、Ｉ２６６Ｔ、Ｋ２５７Ｙ、Ｑ２６１Ｒ、Ａ２６７Ｖ、Ｈ２６８Ｒ、Ｋ２７０Ｐ、Ｋ２７０Ｄ、Ｋ２７０Ｎ、Ｋ２７０Ｇ、Ｋ２７０Ｅ、Ｋ２７０Ｗ、Ｌ２７１Ｍ、Ｈ２７３Ｙ、Ｄ２７９Ｙ、Ｖ２８３Ｍ、Ｒ２８７Ｈ、Ｈ２９０Ｙ、Ｈ２９０Ｌ、Ｅ２９４Ｖ、Ｒ２９６Ｌ、Ｔ２９７Ｉ、Ｋ２９８Ｒ、Ｋ３０５Ｔ、Ｋ３０６Ｍ、Ｓ３１２Ｆ、Ｇ３１３Ｄ、Ｅ２４６Ｃ、Ｌ２４７Ｇ、Ｇ２８０Ａ、Ｌ３１１Ａ、Ｓ３１２Ｃ、Ｑ３０９Ｃ、Ｆ２５０Ｃ、Ｌ３０８Ｇ、Ｌ３１１Ｇ、Ｅ２４１Ｃ、およびＩ３１５Ｃの３、４、５、６以上を含む。
【００２４】
上記した実施形態の何れかにおいて、ＲＡＰペプチドはペプチドのＮ末端またはその近傍におけるシステインおよびペプチドのＣ末端またはその近傍におけるシステインを含有してよく、これにより、２つのシステインの間のジスルフィド結合形成を介してペプチドの環化およびアルファヘリックスの安定化が可能となる。場合により、グリシンまたはプロリンがシステインおよびアルファヘリックスの間に介在してよい（例えばＮ末端におけるＣｙｓ−ＧｌｙおよびＣ末端におけるＧｌｙ−Ｃｙｓ）。グリシンの導入は隣接する非ネイティブのヘリックス間のジスルフィド結合に関するアルファヘリックスの切断を可能にする。
【００２５】
本発明は又、本発明の環状ＲＡＰペプチド少なくとも２、３、４、５、または６つのオリゴマーの組み合わせまたはアレイを意図している。アレイは同じ環状ＲＡＰペプチドの反復アレイまたは異なる環状ＲＡＰペプチドのアレイであってよい。種々の組み合わせは隣接しているか、またはドメインが同じＣＲ含有蛋白内の異なるＣＲ対に結合するか、または異なるＣＲ含有蛋白内のＣＲ対に結合することができるようにする３次元配置において各環状ＲＡＰペプチドをディスプレイするペプチドリンカー（例えば１、２、３、４または５アミノ酸長）により分離されていてよい。
【００２６】
別の特徴において、本発明は診断薬または治療薬にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチド（または環状ＲＡＰペプチドのアレイ）を含むコンジュゲートを提供する。１つの実施形態において、ポリペプチドおよび診断薬または治療薬はリンカーを介して連結される。その他の実施形態においては、該リンカーはペプチドリンカーである。別の実施形態においては、本発明のポリペプチドを含むコンジュゲートはインビボでトランスサイトーシスに付される。例示される実施形態においては、本発明のポリペプチドに連結された治療薬は神経膠細胞誘導ニューロン成長因子（ＧＤＮＦ）、脳誘導ニューロン成長因子（ＢＤＮＦ）、ニューロン成長因子（ＮＧＦ）、または当該分野で知られた他の神経成長因子、ディスインテグリンおよびメタロプロテイナーゼドメイン１０［ホモサピエンス］ＡＤＡＭ１０、またはＡＰＰまたはＡｂｅｔａに作用する他のプロテアーゼ、ＭＥＳＤ（細胞表面への受容体の輸送のために必要なＬＲＰ５／６に対するシャペロン蛋白）、癌化学療法剤、プロテアーゼ阻害剤、アポトーシス促進（ｐｒｏ−ａｐｏｐｔｏｔｉｃ）分子、自己免疫抗原またはリソソーム酵素よりなる群から選択される。関連の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチド（または環状ＲＡＰペプチドのアレイ）を含むコンジュゲートは活性剤にコンジュゲートされる。その他の実施形態においては、活性剤は化学療法剤である。更にその他の実施形態において、化学療法剤は放射性同位体である。
【００２７】
更に別の実施形態において、本発明は対象の特定の組織への診断薬または治療薬の送達を、該剤および本発明の環状ＲＡＰペプチド（またはそのアレイ）を含むコンジュゲートをその対象に投与することにより行う方法を意図する。１つの実施形態において、環状ＲＡＰペプチドにコンジュゲートされた診断薬または治療薬は上皮または内皮の障壁を通過するトランスサイトーシスにより特定の組織に送達される。１つの実施形態において、剤は血液脳関門を通過して送達される。関連の実施形態においては、対象は神経学的疾患、例えば限定しないが、アルツハイマー病、パーキンソン病、多発性硬化症、筋萎縮性側索硬化症、他の脱髄関連障害、中枢神経系の癌、外傷性の脳傷害、脊髄傷害、卒中または大脳の虚血、プラーク硬化症、大脳血管炎、癲癇、ハンチントン病、ツレット症候群、ギヤン−バレー症候群、ウィルソン病、ピック病、神経炎症性障害、脳炎、ウィルス、カビまたは細菌起源の脳脊髄炎または髄膜炎、または他の中枢神経系の感染症、プリオン疾患、小脳性運動失調、小脳変性、脊髄小脳性変性症候群、フリードリヒ運動失調、毛細血管拡張性運動失調、脊髄筋委縮症、進行性核上麻痺、ジストニー、筋肉痙攣、振せん、色素性網膜炎、老人性痴呆症、皮質下痴呆、動脈硬化性痴呆、エイズ関連痴呆、または他の痴呆症、線状体黒質変性、ミトコンドリア性脳ミオパシー、ニューロンセロイド脂褐素沈着症、中枢神経系の関与するリソソーム保存障害、白質萎縮症、尿素回路不全障害、肝性脳症、腎性脳症、代謝性脳症、ポルフィリン症、神経毒化合物中毒、放射線誘導脳損傷、または精神障害、例えば精神病、不安、抑鬱、注意欠陥、記憶障害、認知障害、食欲障害、肥満、嗜癖、強度欲望、または薬物依存に罹患している。本発明は更に、対象の特定の組織内の細胞のリソソームコンパートメントに治療用蛋白を送達する方法を提供し、これは本発明の環状ＲＡＰペプチドにコンジュゲートした該治療用蛋白を含むコンジュゲートの有効量に該細胞を接触させることを含む。１つの実施形態において、対象はリソソーム保存疾患（ＬＳＤ）に罹患している。
【００２８】
別の実施形態においては、本発明は癌または転移癌の治療方法、またはＣＲ含有蛋白に関連する腫瘍形成性または転移性の作用を低減する方法を意図している。そのような方法においては、腫瘍形成性のＣＲ含有蛋白に選択的に結合する環状ＲＡＰペプチド（またはそのアレイ）または該環状ＲＡＰペプチド（またはアレイ）にコンジュゲートした癌治療薬を含むコンジュゲートを対象に投与する。そのような腫瘍形成性ＣＲ含有蛋白は例えば限定しないが、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６、何れかのマトリプターゼまたはＦＤＣ−８Ｄ６抗原を包含する。本発明の環状ＲＡＰペプチドは、標的ＣＲ含有蛋白に関連する腫瘍形成性の作用を、例えば結合または活性な部位をブロックすることによりその機能を直接妨害することにより、減衰させてよい。或いは、癌治療薬にコンジュゲートされた本発明の環状ＲＡＰペプチドを含むコンジュゲートは、抗腫瘍剤を用いてこれらのＣＲ含有蛋白を過剰発現する組織をターゲティングするために使用してよい。例えばマトリプターゼを過剰発現する組織は癌腫、例えば卵巣、子宮頚部、前立腺、乳腺、肺、結腸または胃の癌腫を包含する。
【００２９】
別の実施形態においては、本発明は肝臓の障害、例えば肝炎または肝臓癌を治療するために肝臓に治療薬を送達する方法を意図している。そのような方法では、ネイティブＲＡＰの結合特性を保持しているか、またはＬＲＰ１に対してむしろ高値の親和性で選択的に結合する環状ＲＡＰペプチド（またはそのアレイ）にコンジュゲートした治療薬を含むコンジュゲートを対象に投与する。一部の実施形態においては、方法は肝細胞癌および他の肝臓疾患を治療するための肝臓に化学療法剤／細胞毒性剤の送達を包含する。
【００３０】
更に別の実施形態において、本発明は骨粗鬆症または低減した骨芽および／または増大した破骨細胞活性に関連した他の疾患を治療する方法を意図しており、これは、ＬＲＰ５に選択的に結合し、そしてこれにより骨芽細胞分化および骨付着に拮抗する、並びに破骨細胞活性を促進する因子を阻害する、環状ＲＡＰペプチドまたは環状ＲＡＰペプチドにコンジュゲートされた活性剤を含むコンジュゲートを投与することを含む。そのような治療方法は骨芽を増大および／または破骨細胞活性を低減し、そしてこれにより骨損失を低減、或いは、骨強化を促進することが期待される。
【００３１】
関連する特徴において、本発明は診断薬または治療薬にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチドを含むコンジュゲート、および製薬上許容しうる担体、希釈剤または賦形剤を含む医薬組成物を提供する。
【００３２】
異なる特徴において、本発明は検出可能な部分または標識にコンジュゲートされた環状ＲＡＰペプチドを提供する。環状ＲＡＰペプチドが特定のＣＲ含有蛋白に対して結合選択性を有する場合、環状ＲＡＰペプチドはそのようなＣＲ含有蛋白の存在を検出するために使用してよい。これは又例えば腫瘍形成性に関連する過剰発現を包含する、ＣＲ含有蛋白の発現パターンを検出するために使用してよい。本発明は更にＣＲ含有蛋白の過剰発現または過少発現に関連する状態を診断するためにそのような環状ＲＡＰペプチドを使用する方法を提供する。
【００３３】
他の特徴において、本発明は天然に環化することができるか、または共有結合を介して環化するように更に化学的に修飾することができる、合成により、または組み換え手段によりＲＡＰペプチドを製造する方法を特徴とする。本発明は上記したＲＡＰペプチドの何れかをコードする核酸、そのような核酸を含むベクター、そのような核酸またはベクターを含有する宿主細胞、および適当な培地中で宿主細胞を培養し、そして該宿主細胞または培地からペプチドを単離する工程を含むそのようなペプチドの製造方法を提供する。
【００３４】
本発明の他の特徴および利点は以下の詳細な説明から明らかになるものである。しかしながら、詳細な説明および特定の実施例は、本発明の好ましい実施形態を示してはいるが、本発明の精神および範囲に包含される種々の変更および改変は本詳細な説明から当業者には明らかになるため、単なる説明として示されている。
【図面の簡単な説明】
【００３５】
【図１】図１は補体型リピートの代表的な説明図であり、そしてＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄの符号を有する位置における残基により形成されたカルシウム結合ループの表面を示す、Ｓｉｍｏｎｏｖｉｃ等（４３）により測定された低密度リポ蛋白受容体関連蛋白１（ＬＲＰ１ＣＲ７、ＰＤＢ１Ｊ８Ｅ）の第７の補体型リピートの配列に基づいている。カルシウムは球型で示す。
【図２】図２は結合分析およびＲＡＰ変異体またはＣＲ抗体の選択のために選択されたＣＲ配列のアライメントを示す。使用した特定の対およびトリプレットは左側のカッコ内に示す。パニング基質（ＬＲＰ２ＣＲ８９）は赤色（より明色）のカッコ内に示す。アライメント内のＡｘｃＢｘＣｘＤモチーフを示し、各ＣＲ配列に関するＡおよびＣ位に下線を付した。各ＣＲ対に関するＡ、Ｃ、Ａ’、およびＣ’におけるアミノ酸の文字列連続部は右側に示す。陰影部のアミノ酸はアラインされた位置における優勢なアミノ酸に同一であり；太字のアミノ酸はアラインされた位置における優勢なアミノ酸に相同である。配列はＣｌｕｓｔａｌ  Ｗ（４４）によりアラインし、そしてＢＯＸＳＨＡＤＥによりフォーマットした。
【図３】図３はＣＲ蛋白のＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析を示す。精製され、再度折り畳まれた蛋白を、２ｍＭＤＴＴの存在下または非存在下にＳＤＳローディング緩衝液中で変性させた。処理した試料は、方法において記載する通り、１２％ＮｕＰＡＧＥＢｉｓ−Ｔｒｉｓゲル中で分割した。ゲルをクーマシーブリリアントブルーで染色した。レーンの各対を試験した会合ＣＲ蛋白で底部において標識する。分子量マーカーサイズを示す。典型的な結果を示す。略記法：Ｌ１はＬＲＰ１であり；Ｌ２はＬＲＰ２であり；Ｌ６はＬＲＰ６であり；ＭはＭＡＴ（マトリプターゼ、ＳＴ１４）であり；ＶはＶＬＤＬＲであり；ＹＶＷＲ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９であり；ＹＶＷＤ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｒ１０８８Ｄであり；ＹＤＷＲ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｖ１０４７Ｄであり；ＹＤＷＤ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｖ１０４７ＤＲ１０８８Ｄであり；ＷＶＷＲ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２Ｗであり；ＷＤＷＲ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＶ１０４７Ｄであり；ＷＶＷＤ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＲ１０８８Ｄであり；ＷＤＷＤ＝ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＶ１０４７ＤＲ１０８８Ｄである。
【図４】図４は１００〜１．２５ｎＭで製造したＲＡＰｄ３の連続希釈物を用いた選択されたＣＲ蛋白に対するＲＡＰｄ３の結合を示す。
【図５−１】図５ＡはＬＲＰ２ＣＲ８９およびＬＲＰ１ＣＲ３−５に対するＲＡＰｄ３、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３（ＲＡＰｖ２Ａｄ３）および中間配列変異体の結合を示す。図５ＡはＬＲＰ２ＣＲ８９に対するＲＡＰｄ３変異体およびＲＡＰｖ２Ａｄ３復帰変異体の結合を示す。図５ＢはＬＲＰ１ＣＲ３−５に対するＲＡＰｄ３変異体およびＲＡＰｖ２Ａｄ３復帰変異体の結合を示す。データは単一の結合部位と仮定しながらプロットし、そして非直線回帰によりフィットさせた（ＧｒａｐｈＰａｄＰｒｉｓｍ）。Ｋｄ値および標準偏差は回帰分析から誘導した。
【図５−２】図５ＢはＬＲＰ２ＣＲ８９およびＬＲＰ１ＣＲ３−５に対するＲＡＰｄ３、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３（ＲＡＰｖ２Ａｄ３）および中間配列変異体の結合を示す。図５ＡはＬＲＰ２ＣＲ８９に対するＲＡＰｄ３変異体およびＲＡＰｖ２Ａｄ３復帰変異体の結合を示す。図５ＢはＬＲＰ１ＣＲ３−５に対するＲＡＰｄ３変異体およびＲＡＰｖ２Ａｄ３復帰変異体の結合を示す。データは単一の結合部位と仮定しながらプロットし、そして非直線回帰によりフィットさせた（ＧｒａｐｈＰａｄＰｒｉｓｍ）。Ｋｄ値および標準偏差は回帰分析から誘導した。
【図５−３】表２はＬＲＰ１ＣＲ３−５およびＬＲＰ２ＣＲ８９に対するＲＡＰｄ３およびＲＡＰｖ２（ＲＡＰｖ２Ａ）変異体の結合に関するデータを示す。ＮＦは結合が計測できなかったこと、または、単一の結合部位と仮定しながら非直線回帰を用いた場合にデータを信頼性高くフィットできなかったことを示している。最大結合のパーセントは各リガンドに関して試験した最高濃度におけるＯＤとその濃度における全てのそのようなリガンドに関して計測された最高ＯＤの比である。
【図６−１】図６はＬＲＰ２ＣＲ８９変異体に対するＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３およびＲＡＰｄ３の結合を示す。図中使用される略記法は、以下の通り、即ち：ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２Ｗ（ＷＶＷＲ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｖ１０４７Ｄ（ＹＤＷＲ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｒ１０８８Ｄ（ＹＶＷＤ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｖ１０４７ＤＲ１０８８Ｄ（ＹＤＷＤ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＶ１０４７ＤＲ１０８８Ｄ（ＷＤＷＤ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＶ１０４７Ｄ（ＷＤＷＲ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＲ１０８８Ｄ（ＷＶＷＤ）である。
【図６−２】表３はＬＲＰ２ＣＲ８９変異体に対するＲＡＰｄ３およびＲＡＰｖ２Ａｄ３の結合に関するデータである。ＮＦは結合が計測できなかったこと、または、単一の結合部位と仮定しながら非直線回帰を用いた場合にデータを信頼性高くフィットできなかったことを示している。最大結合のパーセントは各リガンドに関して試験した最高濃度におけるＯＤとその濃度における全てのそのようなリガンドに関して計測された最高ＯＤの比である。
【図６−３】表４は異なるＣＲ対に対して変異体ファージライブラリをパニングすることにより単離したＲＡＰｄ３変異体配列を示す。可変の位置のみ示す。アミノ酸ナンバリングは成熟ＲＡＰに相当する。変異体の名称（ｄ３）、アフィニティー選択のために使用したＣＲ対（ＣＲ）、変異体および標的ＣＲ対（測定時）の間の複合体に関する見かけの解離定数（Ｋｄ）、および可変の位置におけるアミノ酸の実体を示す。
【図７】図７はＣＲ対に対するＲＡＰｄ３変異体の結合を示す。ＲＡＰｄ３、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３、ＶＲＡＰ２ｄ３、ＭａｔＲＡＰ１ｄ３およびＭａｔＲＡＰ２ｄ３は各々８０ｎＭ濃度においてＬＲＰ１ＣＲ３−５、ＬＲＰ６ＣＲ１２、ＬＲＰ６ＣＲ２３、ＬＲＰ６ＣＲ１−３、ＬＲＰ２ＣＲ８９、ＬＲＰ２ＣＲ２７２８、ＬＲＰ２ＣＲ３０３１、ＬＲＰ２ＣＲ３４３５、ＬＲＰ２ＣＲ３４−３６、ＶＬＤＬＲＣＲ７８、ＶＬＤＬＲＣＲ６−８、ＭＡＴＣＲ１２、ＭＡＴＣＲ２３およびＭＡＴＣＲ３４とともにインキュベートした。試料は２回、２連で試験し、そして値を組み合わせた。次に平均および標準偏差を計算した。リガンド非存在下にインキュベートしたウェルから得られたブランク値を吸光度データの補正のために使用した。変動係数（ＣＶ）は試験した何れの条件に関しても２０％を超えず（平均６％）、そして図示しなかった。
【図８】図８は本発明において単離したＲＡＰｄ３変異体の完全なアミノ酸配列を示す。
【図９】図９はＮ末端およびＣ末端の両方におけるＭａｔＲＡＰ１変異体のトランケーションが結合親和性に対して有する正の作用を示す。トランケーションされた変異体は完全長変異体に関して記載した通り作成した。
【図１０】図１０はＦＤＦ−８Ｄ６抗原に由来する標的ＣＲ対への３２０ＲＡＰ１および相当するトランケーションされた変異体の結合を示す。
【図１１Ａ】図１１Ａは、ｒｈＬＲＰ１クラスター２およびｒｍＶＬＤＬＲエクトドメインへのＲＡＰペプチドの相対的な結合を示す。
【図１１Ｂ】図１１Ｂ、ｒｈＬＲＰ１クラスター２およびｒｍＶＬＤＬＲエクトドメインへのＲＡＰペプチドの相対的な結合を示す。
【図１２】図１２はＬＲＰ発現およびＬＲＰ欠損ＣＨＯ細胞の細胞生存性に対する毒素コンジュゲートｍＲＡＰの作用を示す。
【図１３Ａ】図１３Ａは異なる細胞毒性剤にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチド、ヘプタイドの化学構造を示す。
【図１３Ｂ】図１３Ｂは異なる細胞毒性剤にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチド、ヘプタイドの化学構造を示す。
【図１３Ｃ】図１３Ｃは異なる細胞毒性剤にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチド、ヘプタイドの化学構造を示す。
【図１４Ａ】図１４ＡはｍＲＡＰペプチドおよびストレプトアビジンにコンジュゲートしたｍＲＡＰによるＬＲＰ１受容体へのＲＡＰおよびｕＰＡ−ＰＡＩ−１の結合の阻害を示す。
【図１４Ｂ】図１４ＡはｍＲＡＰペプチドおよびストレプトアビジンにコンジュゲートしたｍＲＡＰによるＬＲＰ１受容体へのＲＡＰおよびｕＰＡ−ＰＡＩ−１の結合の阻害を示す。
【図１４Ｃ】図１４ＡはｍＲＡＰペプチドおよびストレプトアビジンにコンジュゲートしたｍＲＡＰによるＬＲＰ１受容体へのＲＡＰおよびｕＰＡ−ＰＡＩ−１の結合の阻害を示す。
【図１５】図１５は動物における静脈内投与後の環状ＲＡＰペプチドの生体分布を示す。
【発明を実施するための形態】
【００３６】
（発明の詳細な説明）
ＲＡＰは機能的には２尖端性であり、第１および第３のドメイン（ｄ１およびｄ３）の両方が低ナノモル親和性においてＬＤＬＲ内の補体型リピート（ＣＲ）の縦列対に結合する。約１１０アミノ酸よりなるドメイン３は該当するＣＲ対に対して最高の親和性を有することがわかっている。免疫原性を最小限とし、生産効率を最大限とし、そして力価を向上させるためには、受容体結合に直接参加するような配列にまでＲＡＰを最小限化することが有用である。しかしながら、ｄ３の安定な折り畳みは受容体接触表面の形成に直接参加しないＲＡＰ内の配列を必要とすることがわかっている。ｄ３のＮ末端領域およびｄ２のＣ末端領域内に存在するこれらの追加的な配列は、従って、安定な折り畳みおよび高親和性受容体結合を確保するために必要である。単離されたｄ３は完全長ＲＡＰの範囲内においてはｄ３ほど堅固には受容体に結合しない。折り畳み安定化配列を欠いているｄ３のトランケーションされた型も又、受容体への結合は不良である。ＲＡＰｄ３およびＬＤＬＲＣＲ３４の間の複合体から誘導された構造的データは、ＲＡＰｄ３の受容体結合配列は可撓性のループにより連結された概ね等しい長さの２つの逆平行アルファヘリックス内に存在することを示している。対となったヘリカルアンサンブルは強力な逆時計方向の捻転を有しており、そして伸長した捻転「Ｕ」に近似している。
【００３７】
本発明は単一の分子内共有結合、例えばジスルフィド結合で安定化されたＲＡＰｄ３の実質的にトランケーションされた型を提供する。分子内共有結合を有さないトランケーションされた未環化の型は、ＬＲＰ１に対する低減した結合親和性を有する。これとは対照的に環状ＲＡＰペプチドは完全長ＲＡＰｄ３のものとは区別できない進歩した受容体結合親和性を有する。ネイティブＲＡＰ中に存在する大型のペプチド領域の代わりに単一の非ネイティブの共有結合を有するＲＡＰｄ３のフラグメント内の３次元のヘリカルな構造を安定化させる能力は、進歩した親和性を与え、そして多くの利点をもたらす。本発明は、例えば固相ペプチド合成により、組み換え生物を必要とすることなく小型ＲＡＰペプチドの迅速な製造を可能とし、潜在的に低減された免疫原性を可能とし、そして活性剤へのコンジュゲーションの多大な容易性を可能とする。
【００３８】
本発明の環状ＲＡＰペプチドは標的受容体の２つの一般的特性に基づいて潜在的な薬学上の用途を有している。第１に、多くの受容体が疾患状態の樹立および進行において役割を果たしている。従ってそのような受容体に選択的に結合する試薬は、受容体の挙動およびそれらが支援している病態生理学的作用を改変するために使用してよい。第２に、多くの受容体が独特の組織分布を有する。従ってそのような受容体に選択的に結合する試薬は、ターゲティングされた受容体が優先的に発現される組織にまで他の薬物物質を選択的に運搬するために使用してよい。本発明は又、疾患、例えば限定しないが細胞増殖性疾患、例えば新生物性疾患、自己免疫疾患、心臓血管疾患、ホルモン異常疾患、変性疾患、加齢の疾患、中枢神経系の疾患（例えばアルツハイマー病、癲癇、高脂血症）、精神の疾患および状態（例えば精神分裂病、気分障害、例えば抑鬱および不安）、感染性疾患、自己免疫疾患、酵素欠損性疾患、リソソーム貯留疾患、例えば上記したもの等の防止、管理および治療におけるそのような組成物の使用を意図している。
【００３９】
ＬＤＬＲファミリーのメンバーは又、毛細管内皮上、および、ニューロンおよび星状細胞を包含するＣＮＳ細胞型上にも発現される（例えばＬＤＬ受容体、メガリン、ＬＲＰ１）。ＬＤＬ受容体ファミリーは結合リガンドをエンドサイトーシスに付し、そして腎臓、甲状腺の分極した上皮細胞を通過して、そして脳内の毛細管内皮細胞を通過してリガンドをトランスサイトーシスに付すことが明らかにされている。従ってＬＤＬＲは異なる種々の組織において異なる種々のレベルで発現される組成的および機能的に関連した受容体のプールを含む。例としては、筋肉組織上で発現されるＶＬＤＬＲ、ニューロン組織上で発現されるＬＲＰ１Ｂ、腎臓およびニューロンの組織の両方の上で発現されるメガリンおよび肝臓および血管平滑筋組織上で発現されるＬＲＰ１が挙げられる。本発明の環状ＲＡＰペプチドはこれらの受容体の何れか、並びに本明細書に記載する他のＣＲ含有蛋白を発現する組織をターゲティングするために使用できる。
【００４０】
より一般的な実施形態においては、本発明の受容体選択的環状ＲＡＰペプチドは、単独で、アレイにおいて、または治療薬にコンジュゲートされた状態で、ＣＲ含有蛋白が特異的にモジュレート（活性化または阻害）され得る手段を構成する。モジュレーションが起こる機序には少なくとも４つ、即ち：リガンド結合部位との環状ＲＡＰペプチドの直接の会合によるリガンド結合の競合的ブロッキング；リガンド結合部位の環状ＲＡＰペプチド誘導アロステリック修飾によるリガンド結合の非競合的ブロッキング；環状ＲＡＰペプチドの結合により誘導された同じかまたは異なる受容体の間の交差結合の後の細胞表面からの受容体または他のＣＲ含有蛋白のクリアランス；または、選択的環状ＲＡＰペプチドに結合した活性剤の組織への代替的送達（例えばプロテアーゼ、プロテアーゼ阻害剤、他の酵素、放射性同位体、アポトーシス促進剤、毒素、治療用分子（薬物）、他の受容体結合部分等）が存在する。
Ａ．定義
特段の記載が無い限り、本明細書において使用される全ての技術的および専門的な用語は、本発明が属する分野の当業者が一般的に理解するものと同じ意味を有する。以下の参考文献、即ち：Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎ等、ＤＩＣＴＩＯＮＡＲＹ  ＯＦ  ＭＩＣＲＯＢＩＯＬＯＧＹ  ＡＮＤ  ＭＯＬＥＣＵＬＡＲ  ＢＩＯＬＯＧＹ（第２版、１９９４）；ＴＨＥ  ＣＡＭＢＲＩＤＧＥ  ＤＩＣＴＩＯＮＡＲＹ  ＯＦ  ＳＣＩＥＮＣＥ  ＡＮＤ  ＴＥＣＨＮＯＬＯＧＹ（Ｗａｌｋｅｒ編、１９８８）；ＴＨＥ  ＧＬＯＳＳＡＲＹ  ＯＦ  ＧＥＮＥＴＩＣＳ、第５版、Ｒ．Ｒｉｅｇｅｒ等、（編）、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ  Ｖｅｒｌａｇ（１９９１）；およびＨａｌｅおよびＭａｒｈａｍ、ＴＨＥ  ＨＡＲＰＥＲ  ＣＯＬＬＩＮＳ  ＤＩＣＴＩＯＮＡＲＹ  ＯＦ  ＢＩＯＬＯＧＹ（１９９１）は本発明において使用される用語の多くの一般的定義を当業者に示すものである。
【００４１】
本明細書において引用する各々の公開物、特許出願、特許、および他の参考文献は本開示と矛盾が生じない限り、参照により全体が本明細書に組み込まれる。
【００４２】
本明細書においては、本明細書および添付請求項において使用される限り、単数表記「ａ」「ａｎ」および「ｔｈｅ」は特段の記載が無い限り複数表記を包含する。
【００４３】
本明細書においては、以下の用語は特段の記載が無い限りそれらに割りつけられた意味を有するものとする。
【００４４】
「環状ＲＡＰペプチド」とは本明細書においては、約１００アミノ酸長未満であり、そして配列番号９８（アミノ酸２４９〜３０３）と少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９８％、９９％以上同一または同様であり、そして２つの非連続アミノ酸の間に共有結合を含有するペプチドを意味する。例示される実施形態において、共有結合は２つのシステインの間のジスルフィド結合である。
【００４５】
「ＲＡＰコンジュゲート」または「コンジュゲート」とは、活性剤に結合した本発明の環状ＲＡＰペプチドを含む化合物を指す。本明細書においては、「コンジュゲートした」という用語は治療薬および環状ＲＡＰペプチドが例えば共有化学結合、物理的な力、例えばファンデルワールス力、または疎水性相互作用、カプセル化、包埋、またはこれらの組み合わせにより物理的に連結されていることを意味する。
【００４６】
「変異」という用語は本明細書においては、ペプチド配列におけるアミノ酸の挿入、欠失または置換を意味する。ネイティブまたは野生型のアミノ酸配列と相対比較して変異１個以上を有するペプチドは「類縁体」とみなされる。
【００４７】
「誘導体」という用語は、例えば治療薬または診断薬へのコンジュゲーション、標識化（例えば放射性核種または種々の酵素）、共有結合による重合体の連結、例えばＰＥＧ化（ポリエチレングリコールによる誘導体化）および非天然アミノ酸の化学合成による挿入または置換による共有結合的な修飾を指す。本発明の誘導体は本発明の未誘導体化分子の結合特性を保持している。癌治療用の抗体の細胞毒性剤、例えば放射性同位体（例えばＩ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０およびＲｅ１８６）、化学療法剤、または毒素へのコンジュゲーションは癌細胞の破壊を増強する場合がある。
【００４８】
低密度リポ蛋白受容体クラスＡドメイン（ＬＤＬ−Ａ、Ｐｆａｍ）としても知られている「補体リピート」または「ＣＲ」とは、その特徴の一部として６つのシステインおよび酸性アミノ酸のクラスターにより定義される蛋白ドメインのファミリーのメンバーである。補体リピートの多くはＬＤＬ受容体様モジュール（蛋白の構造分類、ＳＣＯＰ）と称される定義された構造に折り畳まれることがわかっている。ＣＲドメインはＬＤＬＲに属する受容体を包含する多くの受容体のリガンド結合決定基を構成する。ｃが保存されたシステイン、ｘは何れかのアミノ酸、そしてＢおよびＤはアスパルテート、グルタメートまたはアスパラギンの何れかであるモチーフＡｘｃＢｘＣｘＤを有する各ＣＲ内のアミノ酸の線状配列は、カルシウム結合およびリガンド結合に関与することが明らかにされている。特定のＣＲドメインに直ぐ隣接する対はＲＡＰに結合することが明らかにされている。ＲＡＰ結合ＣＲ対の２つのＣＲドメインの両方におけるＡおよびＣ位におけるアミノ酸（Ａ、Ｃ、Ａ’、Ｃ’）はＲＡＰ結合に関与することが明らかにされている。
【００４９】
「ＣＲ含有蛋白」とはＣＲ１つ以上を含有する蛋白である。ＣＲ含有蛋白の非限定的な例はＬＤＬＲ（Ｐ０１１３０）、ＬＲＰ１（Ｐ９８１５７）、ＬＲＰ１Ｂ（Ｑ９ＮＺＲ２）、ＬＲＰ２（Ｐ９８１６４）、ＬＲＰ３（Ｏ７５０７４）、ＬＲＰ４（Ｏ７５０９６）、ＬＲＰ５（Ｏ７５１９７）、ＬＲＰ６（Ｏ７５５８１）、ＬＲＰ８（Ｑ１４１１４）、ソルチリン関連受容体、ＳｏｒＬＡ（Ｑ９２６７３）、ＬＲＰ１０（Ｑ７Ｚ４Ｆ１）、ＬＲＰ１１（Ｑ８６ＶＺ４）、ＬＲＰ１２（Ｑ９Ｙ５６１）、ＦＤＣ−８Ｄ６（ＣＤ３２０）、ＶＬＤＬＲ（Ｐ９８１５５）、ＴＡＤＧ−１５（ＳＴ１４／マトリプターゼ／ＭＴ−ＳＰ１、Ｑ８ＷＶＣ１）、ＴＭＰＳ３（Ｐ５７７２７）、ＴＭＰＳ４（Ｑ９ＮＲＳ４）、ＴＭＰＳ６（Ｑ８ＩＵ８０）、Ｑ６ＩＣＣ２、Ｑ６ＰＪ７２、Ｑ７６Ｂ６１、Ｑ７ＲＴＹ８、Ｑ７Ｚ７Ｋ９、Ｑ８６ＹＤ５、Ｑ８ＮＡＮ７、Ｑ８ＮＢＪ０、Ｑ８ＷＷ８８、Ｑ９６ＮＴ６、Ｑ９ＢＹＥ１、Ｑ９ＢＹＥ２、Ｑ９ＮＰＦ０およびｃｏｒｉｎ（Ｑ８ＩＺＲ７）を包含する。これらの蛋白の各を識別するユニプロットアクセッション番号レファレンスを提示する。
【００５０】
結合親和性Ｋｄは当該分野で従来より知られている方法により計測する。
【００５１】
「選択性」、「結合選択性」または「選択的に結合する」とは、種々の異なる受容体に対するあるリガンドの親和性における相違点を指す。リガンドはそれが特定の受容体に他の受容体よりも少なくとも３倍高値の親和性で結合する場合に、その受容体に対して選択的となる。例えばＲＡＰはほとんど同一の親和性でＬＲＰ１、ＬＲＰ１Ｂ、ＬＲＰ２、ＳｏｒＬＡ、ａｐｏＥＲ２およびＶＬＤＬＲに結合する。従ってＲＡＰはこれらの受容体の１つに対して他のものを超えて選択性ではない。しかしながらＲＡＰは、５ｎＭ未満の解離定数でＬＲＰ１、ＬＲＰ１Ｂ、ＬＲＰ２、ＳｏｒＬＡ、ａｐｏＥＲ２およびＶＬＤＬＲに強力に結合するものの、ＬＤＬＲ、ＬＲＰ５およびＬＲＰ６に対してはＬＲＰ１に対するよりも少なくとも１０倍低値である親和性で弱く結合するのみである。従って、ＲＡＰはＬＤＬＲ、ＬＲＰ５およびＬＲＰ６と相対比較して、ＬＲＰ１、ＬＲＰ１Ｂ、ＬＲＰ２、ＳｏｒＬＡ、ａｐｏＥＲ２およびＶＬＤＬＲに対して選択的である。ＨＲＶ２被膜蛋白はＶＬＤＬＲには強力に結合するが、他のＬＤＬＲには結合しない。従って、ＨＲＶ２被膜蛋白は他のＬＤＬＲよりも高度にＶＬＤＬＲに対する優先性を伴いながら、その結合において選択性を示す。ｒｅｅｌｉｎはａｐｏＥＲ２およびＶＬＤＬＲに結合するが、他のＬＤＬＲには結合しない。従って、ｒｅｅｌｉｎは他のＬＤＬＲを超えてａｐｏＥＲ２およびＶＬＤＬＲに対して選択的である。
【００５２】
「増大する相対的送達」とは本明細書においては、本発明の環状ＲＡＰペプチドにコンジュゲートした活性剤を含むコンジュゲートの意図される送達部位（例えばＣＲ含有蛋白を発現している脳または組織）における蓄積が未コンジュゲート活性剤の蓄積と相対比較して増大する作用を指す。
【００５３】
「コードする」とはヌクレオチド（即ちｒＲＮＡ、ｔＲＮＡおよびｍＲＮＡ）の所定の配列またはアミノ酸の所定の配列の何れかおよびそれから生じる生物学的特性を有する生物学的プロセスにおいて他の重合体および巨大分子の合成のための鋳型として機能する遺伝子、ｃＤＮＡ、またはｍＲＮＡのようなポリヌクレオチドにおけるヌクレオチドの特定の配列の固有の特性を指す。即ち、遺伝子は、その遺伝子により生産されたｍＲＮＡの転写および翻訳が細胞または他の生物学的系において蛋白を生産する場合に、その蛋白をコードしている。自身のヌクレオチド配列がｍＲＮＡ配列と同一であり通常は配列表中に提示されるコーディング鎖、および転写のための鋳型として使用される遺伝子またはｃＤＮＡの非コーディング鎖の両方を、その蛋白またはその遺伝子またはｃＤＮＡの他の産物をコードすると称することができる。特段の記載が無い限り、「あるアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」とは相互の縮重型であり、そしてその同じアミノ酸配列をコードするすべてのヌクレオチド配列を包含する。蛋白およびＲＮＡをコードするヌクレオチド配列はイントロンを包含してよい。
【００５４】
「組み換えポリヌクレオチド」とは天然には共に連結されていない配列を有するポリヌクレオチドを指す。組み換えポリヌクレオチドを含む宿主細胞は「組み換え宿主細胞」と称される。遺伝子は組み換え宿主細胞内で発現されることにより、例えば「組み換えポリペプチド」を生産する。
【００５５】
「発現制御配列」とは自身に作動可能に連結したヌクレオチド配列の発現（転写および／または翻訳）を調節するポリヌクレオチド中のヌクレオチド配列を指す。「作動可能に連結した」とは一方の部分の活性（例えば転写を調節する能力）がもう一方に対する作用（例えば配列の転写）をもたらすような２つの部分の間の機能的関連性を指す。発現制御配列は例えば限定されないが、プロモーター配列（例えば誘導できるまたは構成できる）、増強剤、転写ターミネータ、開始コドン（即ちＡＴＧ）、イントロンのためのスプライシングシグナル、および終止コドンを含むことができる。
【００５６】
「発現ベクター」は発現されるべきヌクレオチド配列に作動可能に連結した発現制御配列を含む組み換えポリヌクレオチドを含むベクターを指す。発現ベクターは発現のための十分なシス作用エレメントを含み；発現のための他のエレメントは宿主細胞により、或いは、インビトロの発現系により供給され得る。発現ベクターは当該分野で知られた全てのもの、例えばコスミド、プラスミド（例えばネイキッドまたはリポソーム中に含有）および組み換えポリヌクレオチドを取り込むウィルスを包含する。
【００５７】
「増幅」とは例えば逆転写、ポリメラーゼ連鎖反応、およびリガーゼ連鎖反応によりポリヌクレオチド配列がコピーされ、そしてこれにより、より多数のポリヌクレオチド分子に増殖する何れかの手段を指す。
【００５８】
核酸ハイブリダイゼーション実験に言及する場合の「ストリンジェントなハイブリダイゼーション」および「ストリンジェントなハイブリダイゼーション洗浄条件」とは、配列依存性であり、そして異なる環境パラメーターの下においては異なっている。核酸のハイブリダイゼーションに関する詳細な指針はＴｉｊｓｓｅｎ（１９９３）Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ｉｎ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ−−Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ｗｉｔｈ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｏｂｅｓ、第１部第２章「Ｏｖｅｒｖｉｅｗ  ｏｆ  ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ａｎｄ  ｔｈｅ  ｓｔｒａｔｅｇｙ  ｏｆ  ｎｕｃｌｅｉｃ  ａｃｉｄ  ｐｒｏｂｅ  ａｓｓａｙｓ」，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋに記載されている。一般的に、高度にストリンジェントなハイブリダイゼーションおよび洗浄の条件は所定のイオン強度およびｐＨにおける特定の配列に関する熱的融点（Ｔｍ）より約５℃低値となるように選択される。Ｔｍは標的配列の５０％が完全にマッチしたプローブにハイブリダイズする温度（所定のイオン強度およびｐＨの下）である。極めてストリンジェントな条件は特定のプローブに関するＴｍと等しくなるように選択される。
【００５９】
高度にストリンジェントな洗浄条件の例は約１５分間７２℃における０．１５ＭのＮａＣｌである。ストリンジェントな洗浄条件の例は１５分間６５℃における０．２ｘＳＳＣ洗浄である（ＳＳＣ緩衝液の説明についてはＳａｍｂｒｏｏｋ等を参照）。頻繁には、高ストリンジェンシー洗浄はバックグラウンドプローブシグナルを除去するために低ストリンジェンシー洗浄により先行される。例えば１００ヌクレオチドより多いデュプレックスに関する例示される中ストリンジェンシー洗浄は１５分間４５℃における１ｘＳＳＣである。例えば１００ヌクレオチドより多いデュプレックスに関する例示される低ストリンジェンシー洗浄は、１５分間４０℃における４〜６ｘＳＳＣである。一般的に、特定のハイブリダイゼーション試験において未関連のプローブに関して観察されるよりも２ｘ（またはそれより高値）のＳ／Ｎ比が、特定のハイブリダイゼーションの検出を示す。
【００６０】
「ポリペプチド」または「ペプチド」とはペプチド結合を介して連結したアミノ酸残基よりなる重合体、その天然に存在する構造的変異体、および天然に存在しない類縁体を指す。合成ポリペプチドは例えば自動ポリペプチド合成装置を用いて合成できる。「蛋白」という用語は典型的にはより大きいポリペプチドを指す。「ペプチド」という用語は典型的にはより短いポリペプチドを指す。
【００６１】
ポリヌクレオチドまたはポリペプチド配列の２つ以上に言及する場合の「同一」または「パーセント同一性」という用語は後述する配列比較アルゴリズムの１つを用いて、または目視による検査により測定した場合に、最大一致となるように比較してアラインした場合に、同じであるか、または同じであるヌクレオチドまたはアミノ酸残基の特定のパーセンテージを有する配列またはサブ配列の２つ以上を指す。好ましくは、パーセント同一性は少なくとも約５０残基長、少なくとも約１００残基、少なくとも約１５０残基である配列の領域に渡って、或いは、比較する生体重合体の一方または両方の全長に渡って、存在する。
【００６２】
比較のための配列の最適アライメントは、例えばＳｍｉｔｈ  ａｎｄ  Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２（１９８１）のローカルホモロジーアルゴリズムにより、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ  ａｎｄ  Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３（１９７０）のホモロジーアライメントアルゴリズムにより、Ｐｅａｒｓｏｎ  ａｎｄ  Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：２４４４（１９８８）の同様性検索方法により、これらのアルゴリズムのコンピューター実行（ＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡおよびＴＦＡＳＴＡ、Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，５７５  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｄｒ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）により、または目視による検査により、実施できる。
【００６３】
パーセント配列同一性および配列同様性を測定する場合に適しているアルゴリズムの他の例はＢＬＡＳＴアルゴリズムであり、これはＡｌｔｓｃｈｕｌ等、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０（１９９０）に記載されている。
【００６４】
「パーセント同様性」という用語はポリペプチド配列に関して使用する場合、従来の配列比較アルゴリズムを用いるか、または目視による検査により計測した場合に、最大一致となるように比較およびアラインした場合に、（１）同じであるか、または（２）保存的置換によってのみ異なる（即ち同様である）アミノ酸残基のパーセンテージを記載する。
【００６５】
「実質的に純粋」または「単離された」とは、目標物質種が存在する優勢な物質種（即ちモル基準で組成物中の何れかの他の個々の巨大分子物質種よりも豊富に存在するもの）であり、そして、実質的に精製された画分が、目標物質種が存在する全ての巨大分子物質種の少なくとも約５０％（モル基準）を含む組成物であることを意味する。一般的に、実質的に純粋な組成物は、組成物中に存在する巨大分子物質種の約８０％、９０％、９５％、９９％以上が目的の精製された物質種であることを意味する。目標物質種は、組成物が本質的に単一の巨大分子物質種よりなる場合に、本質的に均質となるまで精製される（従来の検出方法により組成物中に夾雑物質種が検出されない）。溶媒種、小分子（＜５００ダルトン）、安定化剤（例えばＢＳＡ）、および元素状のイオン種はこの定義の目的のためには巨大分子物質種とはみなさない。一部の実施形態においては、本発明のコンジュゲートは実質的に純粋であるか単離されている。一部の実施形態においては本発明の医薬組成物は実質的に精製または単離された環状ＲＡＰペプチドまたは活性剤とのそのコンジュゲートを含む。
【００６６】
目標に適用する「天然に存在する」とは目標が自然界に観察され得るという事実を指す。例えば自然界に存在する原料から単離することができる、そして実験室において人間により意図的に修飾されていない、生物中に存在するポリペプチドまたはポリヌクレオチド配列は、天然に存在するものである。
【００６７】
「検出する」とは、試料中の分析対象の存在、非存在、または量を測定することを指し、そして試料中、または試料中の細胞当たりの、分析対象の量を定量することを包含することができる。
【００６８】
「検出可能な部分」または「標識」とは、分光分析的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的な手段により検出可能である組成物を指す。有用な標識は３２Ｐ、３５Ｓ、蛍光染料、電子稠密試薬、酵素（例えばＥＬＩＳＡにおいて一般的に使用されているもの）、ビオチン−ストレプトアビジン、ジゴキシゲニン、ハプテンおよび対応する抗血清またはモノクローナル抗体が得られる蛋白、または標的に対して相補的な配列を有する核酸分子を包含する。検出可能な部分は頻繁には、試料中の結合した検出可能な部分の量を定量するために使用できる、計測可能なシグナル、例えば放射性、発色性、または蛍光性のシグナルを発生する。検出可能な部分は、共有結合的に、またはイオン性、ファンデルワールス力または水素結合を介して、例えば放射性ヌクレオチドまたはストレプトアビジンにより認識されるビオチニル化ヌクレオチドの取り込み等の何れかによりプライマーまたはプローブ内に取り込むかこれに結合することができる。検出可能な部分は直接または間接的に検出可能であってよい。間接的な検出では、検出可能な部分への第２の直接または間接的に検出可能な部分の結合を行うことができる。例えば検出可能な部分はストレプトアビジンに対する結合相手であるビオチンのような結合相手、または自身が特異的にハイブリダイズできる相補配列に対する結合相手であるヌクレオチド配列の、リガンドであることができる。結合相手はそれ自体、直接検出可能であってよく、例えば抗体自体が蛍光分子により標識されてよい。結合相手は又、間接的に検出可能であってよく、例えば相補ヌクレオチド配列を有する核酸が分枝鎖ＤＮＡ分子の一部分であることができ、そしてこれが、他の標識された核酸分子とのハイブリダイズを介して検出可能であることができる。（例えばＰＤ．ＦａｈｒｌａｎｄｅｒおよびＡ．Ｋｌａｕｓｎｅｒ、Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（１９８８）６：１１６５参照）。シグナルの定量は例えばシンチレーション係数、デンシトメトリー、またはフローサイトメトリーにより達成される。
【００６９】
「リンカー」とは、共有結合的に、またはイオン性、ファンデルワールス力または水素結合を介するかの何れかにより２つの別の分子を連結する分子、例えば５’末端において１つの相補配列に、そして３’末端において別の相補配列にハイブリダイズすることにより２つの非相補配列を連結する核酸分子を指す。
【００７０】
「腫瘍」または「新生物」または「癌」とは本明細書においては、原発腫瘍および／または転移の両方を包含する。そのような腫瘍は一般的に固形腫瘍であるか、またはそれらは局在化した蓄積を伴った瀰漫性の腫瘍である。このような腫瘍および新生物の多くの型が知られている。原発の脳腫瘍は、神経膠腫、髄膜腫、ニューリノーマ、下垂体腺腫、髄芽細胞腫、頭蓋咽頭腫、血管腫、類表皮癌、肉腫等を包含する。癌腫は例えば卵巣癌、子宮頸癌、前立腺癌、乳癌、肺癌、結腸癌または胃癌を包含する。肝細胞癌、またはヘパトーマは全世界で第５番目に多い癌であり、そして発生率は一貫して上昇している。肝細胞癌は肝細胞の疾患である。頭蓋内腫瘍の５０パーセントは頭蓋内転移である。脳腫瘍および新生物は脳および神経組織に関連している場合があるか、それらは髄膜、頭蓋、血管系または何れかの他の頭部または頚部の組織に関連している場合がある。本発明による治療に係る腫瘍または新生物は悪性または良性であってよく、そして、化学療法、放射線、および／または他の治療により予め治療されていてよい。
【００７１】
「有効量」という用語は、対象の健康状態、病理学的状態、および疾患に対して所望の結果をもたらすため、または、診断目的のために十分な用量を意味する。所望の結果は投薬のレシピエントにおける自覚的または他覚的な改善を含んでよい。「治療有効量」とは健康に対する意図された有益な作用をもたらすために有効な剤の量を指す。
【００７２】
「小型有機分子」とは医薬品中に一般的に使用される有機分子と相応した大きさの有機分子を指す。有機性の生体重合体（例えば蛋白、核酸等）は用語から除外される。好ましい小型有機分子の大きさは約５，０００Ｄａ〜約２，０００Ｄａ、または〜約１，０００Ｄａである。
【００７３】
診断または治療の「対象」とはヒトまたは非ヒトの動物、例えば哺乳類または霊長類である。
【００７４】
「治療」とは予防的治療または施療的治療または診断的治療を指す。
【００７５】
「予防的」治療とは、病理学的状態を発症する危険性を低下させる目的のために、疾患の徴候を呈していないか、または早期の徴候のみを呈している対象になされる治療である。本発明のコンジュゲート化合物は病理学的状態を発症する確率を低減するため、または発症した場合に病理学的状態の重症度を最低限とするための予防的治療として施行してよい。
【００７６】
「施療的」治療は、病理学的状態の徴候または症状を呈している対象に、そのような徴候または症状を減衰または排除する目的のためになされる治療である。徴候または症状は生化学的、細胞上、組織学的、機能的、自覚的または他覚的であってよい。本発明のコンジュゲート化合物は施療的治療として、または診断のために投与してよい。
【００７７】
「診断」とは病理学的状態の存在または性質を発見することを意味する。診断方法はそれらの特異性および選択性において異なる。特定の診断方法は状態の明確な診断を与える必要はなく、方法が診断に役立つ陽性の指示を与えれば十分である。
【００７８】
「製薬上許容しうる担体」とは標準的な製薬用の担体、緩衝液、および賦形剤の何れか、例えばリン酸塩緩衝食塩水、デキストロースの５％水溶液、およびエマルジョン、例えば油／水または水／油エマルジョン、および種々の型の水和剤および／またはアジュバントであって、ヒトへの投与のために適しているものとして当局により認可されているものを指す。適当な製薬用の担体および製剤はＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第１９版（Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，１９９５）に記載されている。好ましい製薬用の担体は活性剤の意図される投与様式により変動する。典型的な投与様式は、経腸（例えば経口）または非経腸（例えば皮下、筋肉内、静脈内、腹腔内または髄腔内の注射；または局所、経皮、または経粘膜、例えば肺内の投与）を包含する。「製薬上許容しうる塩」とは医薬品用途のための化合物に製剤できる塩、例えば金属塩（ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウム等）およびアンモニアまたは有機アミンの塩である。
【００７９】
Ａ．ＣＲ含有蛋白およびその役割
「ＬＤＬＲ」とは低密度リポ蛋白受容体関連蛋白１（ＬＲＰ１）を包含する低密度リポ蛋白受容体ファミリーのメンバーを指す。ＬＲＰ１は４５２５アミノ酸の大型蛋白（６００ｋＤａ）であり、これはフリンにより切断され、５１５−（アルファ）ｋＤおよび８５−（β）ｋＤａの２つのサブユニットを生じ、これらは非共有結合的に結合した状態で残存する。ＬＲＰ１は大部分の組織型上で発現されるが、主に肝臓に存在する。低密度リポ蛋白（ＬＤＬ）受容体ファミリーの他のメンバーはＬＤＬ−Ｒ（１３２ｋＤａ）；ＬＲＰ２（メガリン、ｇｐ３３０）；ＬＲＰ／ＬＲＰ１およびＬＲＰ１Ｂ（６００ｋＤａ）；ＶＬＤＬ−Ｒ（１３０ｋＤａ）；ＬＲＰ５；ＬＲＰ６；ａｐｏＥＲ−２（ＬＲＰ−８、１３０ｋＤａ）；ＭｏｓａｉｃＬＤＬ−Ｒ（ＬＲ１１、２５０ＫＤａ）；および他のメンバー例えばＬＲＰ３、ＬＲＰ６、およびＬＲＰ−７を包含する。ファミリーの特徴的な性質は、細胞表面発現；細胞外リガンド結合ドメインリピート（ＤｘＳＤＥ）；リガンド結合のためのＣａ＋＋の必要性；ＲＡＰとａｐｏＥの結合；ＥＧＦ前駆体相同ドメインリピート（ＹＷＴＤ）；単一の膜スパン領域；細胞質ドメイン（ＦＤＮＰＸＹ）における内在化シグナル；および種々のリガンドの受容体媒介エンドサイトーシスを包含する。ファミリーのメンバーの一部、例えばＬＲＰ１、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６、ａｐｏＥＲ２およびＶＬＤＬＲはシグナリングトランスダクション経路に関与している。
【００８０】
ＲＡＰｄ３は逆平行ヘリカルヘアピンとして折り畳まれる。第１のヘリックスである約Ｄ２３７〜Ｖ２７７は、残基Ｇ２７８〜Ｇ２８０よりなるターン部分により、第２のヘリックスである残基Ｅ２８１〜Ｒ３１７に連結される。２つのヘリックスは右足（ヘリックス２）−クロスオーバー−左足（ヘリックス１）の配置において近接している。ＬＤＬＲのＣＲ３はＫ２７０において主にＲＡＰｄ３に接触しており、そしてＣＲ４はＫ２５６において主にＲＡＰｄ３との接点を形成している、Ｋ２５６およびＫ２７０は両方ともヘリックス２の同じ面上にある。ＲＡＰＲ２８２およびＲ２８５はＣＲ３の負荷電カルシウムキレート形成ポケットを指向しているのに対し、ＲＡＰＫ２５３はＣＲ４の結合において同様の役割を果たしている。ＬＤＬＲＣＲ対はＲＡＰｄ３逆平行ヘリカルヘアピンの約Ｈ２４９〜Ｔ３０３の間の残基と会合しているのみである。この領域外に、ヘリックス１のＮ末端伸長およびヘリックス２のＣ末端伸長がある。ヘリックス１および２のこれらの部分は恐らくは、ヘリカルバンドルの安定化に寄与している。更に又、ヘリックス１は短いヘリックスであるターン部分Ｓ２３２〜Ｔ２３６、およびＲ２０６〜Ｑ２３１の間の残基を含む一部の追加的な配列に先行されている。短いヘリックスおよび追加的な配列も又、ＲＡＰｄ３の折り畳み安定性のために重要であることが示唆されている。
ｉ．ＬＲＰ１選択的ＲＡＰペプチド
ネイティブのＲＡＰは肝細胞上で高度に発現されるＬＲＰ１に強力に結合する。本発明の１つの特徴は肝臓疾患の治療のために肝臓に治療用化合物を送達するための、環状ＲＡＰペプチドへの化学療法剤または肝臓障害を治療するための他の薬物のコンジュゲーションを意図している。肝臓疾患を治療するためのＲＡＰコンジュゲートの投与は、薬物の大半がほぼ注射直後に肝細胞に直接送達されることになるため、肝臓疾患の治療に関連していた数種の問題点、例えば肝臓による剤のクリアランスを解決すると考えられる。更に又、ＲＡＰコンジュゲートはＬＲＰ１を介してエンドサイトーシスに付されるため、原形質膜における薬物耐性機序（ＭＤＲ、Ｐ−糖蛋白）が迂回される。
【００８１】
ｉｉ．ＬＲＰ２選択的ＲＡＰペプチド
ＬＲＰ２は脳の毛細管の内皮上で発現され、そして脳の実質内へのａｐｏＪの輸送を媒介することがわかっている（Ｌｕｎｄｇｒｅｎ等、（１９９７）Ｊ  Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ  Ｃｙｔｏｃｈｅｍ  ４５，３８３−３９２；Ｚｌｏｋｏｖｉｃ等、（１９９６）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ９３，４２２９−４２３４；Ｓｈａｙｏ等、（１９９７）Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉ  ６０，ＰＬ１１５−１１８）。他のＬＤＬＲよりも大きい親和性でＬＲＰ２に選択的に結合する本発明の環状ＲＡＰペプチドおよびそのコンジュゲートは脳への増強された分布を有することが期待される。例えばＧＤＮＦはパーキンソン病を有する対象における黒質線状体ニューロンの生存および成長を促進することがわかっている（Ｌｉｎ等、（１９９３）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２６０，１１３０−１１３２）。しかしながら、ＧＤＮＦは血管系から脳内に進入しない。ＧＤＮＦへのＬＲＰ２選択的ＲＡＰペプチドの融合は脳へのＧＤＮＦの分布を増大することが期待される。
ｉｉｉ．ＶＬＤＬＲ選択的ＲＡＰペプチド
同様に、ＶＬＤＬＲは脳の毛細管の内皮上に発現され、そして大動脈の内皮を通過するリポ蛋白リパーゼの輸送を媒介することがわかっている（Ｗｙｎｅ等、（１９９６）Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｖａｓｃ  Ｂｉｏｌ  １６，４０７−４１５；Ｏｂｕｎｉｋｅ等、（２００１）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ  ２７６，８９３４−８９４１）。ＶＬＤＬＲに選択的に結合する本発明の環状ＲＡＰペプチドおよびそのコンジュゲートは脳への増強された分布を有することが期待される。ＶＬＤＬＲは又、血管マクロファージ内への過剰な遊離脂肪酸（ＦＦＡ）の取り込みを媒介することにより泡沫細胞の形成に関与することが示唆されている（Ｈｉｌｔｕｎｅｎ等、（１９９８）Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ  ９７，１０７９−１０８６；Ｑｕ等、（２００４）Ｊ  Ｈｕａｚｈｏｎｇ  Ｕｎｉｖ  Ｓｃｉ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇ  Ｍｅｄ  Ｓｃｉ  ２４，１−４，８）。ＶＬＤＬＲに選択的に結合する環状ＲＡＰペプチドおよびそのコンジュゲートはマクロファージとのリポ蛋白粒子の会合をブロックし、そして泡沫細胞の形成を阻害することが期待される。そのような環状ＲＡＰペプチドおよびそのコンジュゲートは又、脂肪細胞への循環中のリポ蛋白からのＦＦＡの移行を制限し、感受性の対象において肥満への進行を緩徐化することが期待される（Ｇｏｕｄｒｉａａｎ等、（２００１）Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ  Ｔｈｒｏｍｂ  Ｖａｓｃ  Ｂｉｏｌ  ２１，１４８８−１４９３；Ｇｏｕｄｒｉａａｎ等、（２００４）Ｊ  Ｌｉｐｉｄ  Ｒｅｓ  ４５，１４７５−１４８１；Ｔａｃｋｅｎ等、（２００１）Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｌｉｐｉｄｏｌ  １２，２７５−２７９；Ｙａｇｙｕ等、（２００２）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ  ２７７，１００３７−１００４３）。肝臓中のＶＬＤＬＲの低レベル発現を伴った筋肉内皮の管腔表面上のＶＬＤＬＲの高レベル発現は、静脈内投与後の筋肉組織への環状ＲＡＰペプチドおよびそのコンジュゲートの分布を駆動することが期待される。筋肉組織に対する治療作用を有する剤をＶＬＤＬＲ選択的環状ＲＡＰペプチドに結合することによりそのような剤の筋肉への分布を向上させることができる。
【００８２】
ｉｖ．腫瘍または転移に関連するＣＲ含有蛋白
少なくとも３つのＣＲ含有蛋白、ＬＲＰ５、ＬＲＰ６およびＳＴ１４（ＴＡＤＧ−１５）の過剰発現は独立して増大した腫瘍形成性または発癌性に関連している（Ｌｉ等、（２００４）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ２３，９１２９−９１３５；Ｈｏａｎｇ等、（２００４）Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ１０９，１０６−１１１；Ｔａｎｉｍｏｔｏ等、（２００５）Ｂｒ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ９２，２７８−２８３；Ｓａｎｔｉｎ等、（２００４）Ｉｎｔ  Ｊ  Ｃａｎｃｅｒ１１２，１４−２５；Ｓａｎｔｉｎ等、（２００３）Ｃａｎｃｅｒ  ９８，１８９８−１９０４；Ｔａｎｉｍｏｔｏ等、（２００１）Ｔｕｍｏｕｒ  Ｂｉｏｌ  ２２，１０４−１１４）。これらの蛋白に選択的に結合する本発明の環状ＲＡＰペプチドまたはそのコンジュゲートはその腫瘍形成性の作用を減衰させる手段を提供することが期待される。環状ＲＡＰペプチドはＣＲ含有蛋白の機能を直接妨害する場合がある。或いは、環状ＲＡＰペプチドはＣＲ含有蛋白を過剰発現する組織に送達をターゲティングするために癌治療薬にコンジュゲートしてよい。例えばマトリプターゼ（ＭＴ−ＳＰ１、ＳＴ１４、ＴＡＤＧ−１５）は種々の上皮腫瘍（癌腫）において過剰発現される。
【００８３】
肝細胞活性化物質阻害剤−１（ＨＡＩ−１）により促進された相互活性化の後、マトリプターゼは直接細胞外マトリックス成分を分解することによるか、またはウロキナーゼプラスミノーゲン活性化物質（ｕＰＡ）のような別のプロテアーゼを活性化することにより、マトリックス分解事象をもたらすことにより、腫瘍の成長および転移を促進する（２６，３４，３５）。マトリプターゼ（ＳＴ１４）のエクトドメイン内のＣＲアレイに隣接するプロテアーゼドメインはマトリプターゼ（ＳＴ１４）を過剰発現する細胞の増強された侵襲性および腫瘍形成性に関与するとされている。マトリプターゼはＮ末端ＩＩ型膜貫通ドメインを介して上皮細胞の外側または基底外側の膜内にアンカリングしている（Ｐｆｉｓｔｅｒｍｕｅｌｌｅｒ等、（１９９６）ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ３９６，１４−２０）。膜に包埋された配列に続いて細胞外ＳＥＡドメイン、２つのＣＵＢドメイン、４つのＣＲドメインおよび蛋白のＣ末端におけるトリプシンドメインが存在する。マトリプターゼ内部のＣＲ配列の変異誘発は結果として生じるプロテアーゼ変異体が活性化されることを不可能とする（Ｑｉｕ等（２００３）Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ１２２，２９１−３０３）。同様に、マトリプターゼの第３のＣＲドメインに結合する抗体は酵素の活性化をブロックする（Ｂａｓｕ等（２００１）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ１４，３０３−１３）。第３のＣＲドメインを包含するマトリプターゼ内部の２つのＣＲ対の一方に対して親和性を有する環状ＲＡＰペプチドは、この領域に対する抗体による観察された阻害と同様の態様において蛋白分解性の活性化を妨害することが期待される。そのようなＲＡＰペプチドはり患した組織におけるマトリプターゼの過剰発現の転移性および腫瘍形成能の作用を減衰することが期待される。マトリプターゼ選択的環状ＲＡＰペプチドおよびプロテアーゼ阻害剤を含むコンジュゲートは又、その蛋白分解性の活性に関連するマトリプターゼのそのような作用を特異的にブロックすることが期待される。
【００８４】
ＬＲＰ６選択的環状ＲＡＰペプチドは、ＬＲＰ６のエンドサイトーシスを誘導することによるか、またはＬＲＰ６により媒介されるＷｎｔシグナルトランスダクション事象を妨害することによるかの何れかにより、腫瘍細胞上のＬＲＰ６をダウンレギュレートするように設計できる。同様に、治療薬（例えば癌化学療法剤）または診断薬にコンジュゲートしたＬＲＰ６選択的環状ＲＡＰペプチドはＬＲＰ６を過剰発現する組織にターゲティング送達するために使用できる。
【００８５】
ｖ．ＬＲＰ５選択的ＲＡＰペプチドおよび骨疾患
ＬＲＰ５を介した増強されたＷｎｔシグナリングは骨芽細胞の分化を増大し、破骨細胞活性を阻害し、そして骨付着を増強することが明らかにされている（Ｗｅｓｔｅｎｄｏｒｆ等、（２００４）Ｇｅｎｅ  ３４１，１９−３９；Ｚｈａｎｇ等、（２００４）Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ２４，４６７７−４６８４）。このシグナリング機序は骨芽細胞特異的ＡＰＣ（腺腫性甲状腺腫）ノックアウトマウスを用いて、そしてＤＫＫ（Ｄｉｃｋｋｏｐｈ）−１およびスクレロスチン媒介阻害に対して非感受性のＬＲＰ５変異体を用いて確認されている（Ｚｈａｎｇ等、（２００４）Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ２４，４６７７−４６８４；Ｈｏｌｍｅｎ等、（２００５）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ）。阻害剤結合を妨害するか、または他の手段（例えばＷｎｔ結合をブロッキングすることなくＬＲＰ５を安定化すること）を介してＷｎｔシグナリングを増強するＬＲＰ５特異的環状ＲＡＰペプチドは、同様の作用を有することが期待される。例えば２つのＬＲＰ５ＣＲ対の何れかに対して特異的な環状ＲＡＰペプチドとベータープロペラーシャペロン蛋白Ｍｅｓｄとの間の融合物はＬＲＰ５を介したＷｎｔシグナリングのＤＫＫ−１媒介拮抗作用を妨害することが期待される（Ｈｓｉｅｈ等、（２００３）Ｃｅｌｌ１１２，３５５−３６７；Ｈｅｒｚ等、（２００３）Ｃｅｌｌ１１２，２８９−２９２）。ＬＲＰ５の阻害を妨害する（例えばＬＲＰ５へのＤＫＫ−１結合またはその阻害を低減する）これらの環状ＲＡＰペプチドおよびそのコンジュゲートは、骨粗鬆症または低減した骨芽細胞活性および／または増大した破骨細胞活性に関連する他の疾患の治療において施療的作用を有することが期待される。同様にＬＲＰ５を介してＷｎｔシグナリングを阻害する環状ＲＡＰペプチドは骨粗鬆症のような増大した骨芽細胞活性に関連する疾患の治療において施療上の作用を有することが期待される。
【００８６】
ｖｉ．ＦＤＣ−８Ｄ６選択的ＲＡＰペプチド
ＦＤＣ−８Ｄ６抗原（ＣＤ３２０）はそのようなドメインの対を有し、そしてリンパ小節におけるＢ細胞の分化において重要な役割を果たしている（３６，３７）。
【００８７】
非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）にはＢ細胞と称されている免疫細胞のクラスの増殖および節外の遊走が関与している。ＮＨＬは２０〜３９歳男性の癌による死亡の主要原因である。研究によればＦＤＣ−８Ｄ６抗原蛋白（ＣＤ３２０）は新生物性のＢ細胞の生育を促進する（３６，３７）。８Ｄ６抗原はＣＲドメインの単一の対を含有する。８Ｄ６に結合してその機能をブロックする環状ＲＡＰペプチドのような剤は、ヒトにおける非ホジキンリンパ腫の進行を緩徐化することが期待される。
【００８８】
Ｂ．治療
本発明の環状ＲＡＰペプチドまたはそのコンジュゲートの投与により治療可能な特定の疾患状態は、ターゲティングされるＣＲ含有蛋白の型およびコンジュゲート中に存在できる薬物部分と同様に多様である。即ち、疾患状態は、細胞増殖性疾患、例えば新生物性疾患、自己免疫疾患、心臓血管疾患、ホルモン異常疾患、変性疾患、加齢の疾患、中枢神経系の疾患（例えばアルツハイマー病、癲癇、高脂血症）、精神の疾患および状態（例えば精神分裂病、気分障害、例えば抑鬱および不安）、感染性疾患、酵素欠損性疾患、リソソーム貯留疾患、例えば上記したもの等を包含する。
【００８９】
治療とは、疾患を獲得する確率の低下、疾患の防止、疾患の進行を緩徐化、停止または退行させること、または宿主が罹患している疾患状態に関連する症状の緩解を包含するコンジュゲートの投与に関連した対象にとって有益な結果の何れかを意味し、ここで緩解または利益とは、炎症およびそれに伴う疼痛のような、治療すべき病理学的状態に関連するパラメーター、例えば症状の桁数における低減を少なくとも指すように広範な意味において使用される。そのため、治療とは又、病理学的状態、または少なくともそれに伴う症状が、完全に阻害される、例えば発生が防止されるか、または停止される、例えば終決されることにより、宿主がもはや病理学的状態、またはその病理学的状態を特徴づける症状を被ることはないという状況を包含する。
【００９０】
ｉ．リソソーム貯留疾患
一部の実施形態においては、治療すべき疾患はリソソーム貯留疾患であり、そしてコンジュゲートは該哺乳類の脳組織中に存在する貯留顆粒の量を低下させるために有効な量において医薬組成物として投与される。典型的には、そのような障害の症状は病歴の定型的な評価、身体検査、心エコー検査、心電図、磁気共鳴画像化、睡眠ポリグラフ計、骨格検査、運動範囲計測、角膜撮影、および皮膚生検を介してモニタリングする。そのような障害における環状ＲＡＰペプチドまたはそのコンジュゲートの投与は該対象における発達遅延および退行の正常化、高圧水頭症の低減、該対象における脊髄圧縮の低減、および該対象の脳血管の周囲の血管周囲嚢胞の数および／または大きさの低減をもたらす。そのような続発症をモニタリングおよび評価する方法は当該分野で知られている。そのような続発症の追加的説明に関して、当業者は米国特許６，５８５，９７１；米国特許６，５６９，６６１および米国特許６，４２６，２０８および米国特許出願公開２００４０００９９０６を参照できる。
【００９１】
好ましい実施形態においては、動物はムコ多糖症Ｉに罹患しており、そして正常α−Ｌ−イズロニダーゼ活性の約５０％未満を有している。そのような実施形態においては、ヒトα−Ｌ−イズロニダーゼ約０．００１ｍｇ／ｋｇ体重および０．５ｍｇ／ｋｇ体重の有効用量を、コンジュゲートの部分として、例えば毎週、その欠損に罹患した対象に投与することが望ましい。他の実施形態においては、対象には、該ヒトα−Ｌ−イズロニダーゼの哺乳類中約０．０１ｍｇ／１５ｃｃＣＳＦ〜約５．０ｍｇ／１５ｃｃＣＳＦの用量を毎週投与する。本明細書において意図される治療は、リソソーム貯留疾患を有する対象の脳細胞中のグリコサミノグリカン（ＧＡＧ）の分解を促進する。脳細胞はニューロン、神経膠細胞、上衣細胞であってよい。典型的には顆粒蓄積が起こり、そして本発明のコンジュゲートを投与することにより緩解すべき脳細胞は、ニューロン、神経膠細胞、ミクロ神経膠細胞、星状細胞、稀突起神経膠細胞、血管周囲細胞、周皮細胞、髄膜細胞、上衣細胞、クモ膜顆粒細胞、クモ膜、硬膜、軟膜および脈絡叢細胞を包含する。好ましい実施形態における治療は髄膜細胞中の貯留顆粒を、該コンジュゲートの投与の非存在下の同様の細胞に存在するリソソーム貯留顆粒の数と比較して低減する。これは、一部の対象における高圧水頭症の症状を緩和する治療上の作用をもたらし、そして該投与は該対象の髄膜組織におけるＣＳＦ液の量を低減する。
【００９２】
本発明のコンジュゲートで治療可能なリソソーム貯留疾患の非限定的な例は、ムコ多糖症のＩ型、ムコ多糖症ＩＩ型ハンター症候群、ムコ多糖症ＩＩＩＡ型サンフィリッポ症候群、ムコ多糖症ＩＩＩＢ型サンフィリッポ症候群、ムコ多糖症ＩＩＩＣ型サンフィリッポ症候群、ムコ多糖症ＩＩＩＤ型サンフィリッポ症候群、ムコ多糖症ＩＶＡ型モルキート症候群、ムコ多糖症ＩＶＢ型モルキート症候群、ムコ多糖症ＶＩ型、ムコ多糖症ＶＩＩ型スライ症候群、ムコ多糖症ＩＸ型、アスパルチルグルコサミン尿症、コレステロールエステル貯留疾患／ウオルマン疾患、シスチン蓄積症、ダノン症、ファブリー症、ファーバー脂肪肉芽腫症／ファーバー症、フコース蓄積症、ガラクトシアリドーシスＩ／ＩＩ型、ゴシェ病Ｉ／ＩＩＩＩ型ゴシェ症、球様細胞白質萎縮症／クラッベ症、グリコーゲン貯留症ＩＩ型／ポーンプ病、ＧＭ１−ガングリオシドーシスＩ／ＩＩ／ＩＩＩ型、ＧＭ２−ガングリオシドーシスＩ型／Ｔａｙ  Ｓａｃｈｓ症、ＧＭ２−ガングリオシドーシスＩＩ型サンドホフ症、ＧＭ２−ガングリオシドーシス、α−マンノシドーシスＩ／ＩＩ型、β−マンノシドーシス、異染性白質萎縮症、異染性白質萎縮症、ムコリピドーシスＩ型／シアリドーシスＩ／ＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩ／ＩＩＩＩ−細胞症、ムコリピドーシスＩＩＩＣ型疑似フーラーポリジストロフィー、多発性スルファターゼ欠損症、ニューロンセロイドリポフスチン症、ＣＬＮ１バッテン病、ニューロンセロイドリポフスチン症、ＣＬＮ２バッテン病、ニーマン−ピック病Ａ／Ｂ型ニーマン−ピック病、ニーマン−ピック病ＣＩ型ニーマン−ピック病、ニーマン−ピック病Ｃ２型ニーマン−ピック病、ピクノジソストーシス、シンドラー病Ｉ／ＩＩ型シンドラー病、またはシアル酸貯留症を包含する。
【００９３】
ｉｉ．神経学的障害
他の実施形態においては、治療すべき疾患は神経学的疾患であり、そしてコンジュゲートはそのような神経学的疾患を防止、管理または治療するために有効な量の医薬組成物として投与される。神経学的障害は限定しないが例えばアルツハイマー病、パーキンソン病、多発性硬化症、筋萎縮性側索硬化症、他の脱髄関連障害、中枢神経系の癌、外傷性脳傷害、脊髄傷害、卒中または脳虚血、プラーク硬化症、脳血管炎、癲癇、ハンチントン病、ツレット症候群、ギヤン−バレー症候群、ウィルソン病、ピック病、神経炎症性障害、脳炎、ウィルス、カビまたは細菌起源の脳脊髄炎または髄膜炎、または他の中枢神経系の感染症、プリオン疾患、小脳性運動失調、小脳変性、脊髄小脳性変性症候群、フリードリヒ運動失調、毛細血管拡張性運動失調、脊髄筋委縮症、進行性核上麻痺、ジストニー、筋肉痙攣、振せん、色素性網膜炎、老人性痴呆症、皮質下痴呆、動脈硬化性痴呆、エイズ関連痴呆、または他の痴呆症、線状体黒質変性、ミトコンドリア性脳ミオパシー、ニューロンセロイド脂褐素沈着症、中枢神経系の関与するリソソーム保存障害、白質萎縮症、尿素回路不全障害、肝性脳症、腎性脳症、代謝性脳症、ポルフィリン症、神経毒化合物中毒、放射線誘導脳損傷、または精神障害、例えば精神病、不安、抑鬱、注意欠陥、記憶障害、認知障害、食欲障害、肥満、嗜癖、強度欲望、または薬物依存を包含する。
アルツハイマー病
好ましい実施形態においては、治療すべき障害はアルツハイマー病であり、これは罹患した患者の脳の内部における４０〜４２アミノ酸ペプチド、アミロイドベータ（Ａβ）の上昇したレベルに関連している（Ｓｅｌｋｏｅ等（１９９６）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ  ２７１，１８２９５−１８２９８）。一連の逐次的な蛋白分解事象によるその発生の後、Ａβはオリゴマー化し、そして究極的にはニューロン間質の内部の不溶性プラーク中に蓄積する。Ａβの可溶性および不溶性の形態の両方がインビトロおよびインビボで神経毒性であることが明らかにされている（Ｚｅｒｂｉｎａｔｔｉ等、（２００４）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  ＳｃｉＵＳＡ１０１，１０７５−１０８０；Ｔｓａｉ等、（２００４）Ｎａｔ  Ｎｅｕｒｏｓｃｉ；Ｓｃｈｍｉｔｚ等（２００４）Ａｍ  Ｊ  Ｐａｔｈｏｌ  １６４，１４９５−１５０２；Ｇｏｎｇ等（２００３）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  ＳｃｉＵＳＡ１００，１０４１７−１０４２２；Ｂａｒｄ等（２０００）Ｎａｔ  Ｍｅｄ  ６，９１６−９１９；Ｓｃｈｅｎｋ等（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ４００，１７３−１７７；Ｈｓｉａ等（１９９９）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  ＳｃｉＵＳＡ９６，３２２８−３２３３）。可溶性Ａβ単量体およびオリゴマーは又、長期の強化を阻害することにより記憶欠損を可逆的に誘導することが明らかにされている（Ｇｏｎｇ等（２００３）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  ＳｃｉＵＳＡ１００，１０４１７−１０４２２）。
【００９４】
Ａβは機能が解明されていない細胞表面膜蛋白であるアミロイド前駆体蛋白、即ちＡＰＰの蛋白分解性のフラグメントである。Ａβの形成は、ニューロン分泌経路内部において、または受容体のＬＤＬＲファミリーのメンバーであるＬＲＰ１によるＡＰＰのエンドサイトーシスを介して、開始される（Ｃａｍ等、（２００４）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ２７９，２９６３９−２９６４６）。エンドソーム系に到達すると、ＡＰＰは膜プロテアーゼであるベータ部位ＡＰＰ切断酵素、即ちＢＡＣＥにより切断される。ＢＡＣＥは膜貫通ドメインの直ぐＮ末端側である６７１位においてＡＰＰを切断する。次にＡＰＰの残余部分は、ガンマセクレターゼ複合体を構成する３つの蛋白、即ちプレセニリン−１、プレセニリン−２およびニカストリンの複合体により二回目の切断を受ける（Ｘｉａ等（２００３）Ｊ  Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉ１１６，２８３９−２８４４）。プレセニリンは脂質の二層の内側リーフレット内部のそれらの基質を切断する。ガンマセクレターゼ切断工程はＡＰＰの膜貫通ドメイン内部の７１１位と７１３位の間で生じる。ガンマセクレターゼ切断によりＡβが放出され、これはニューロン内部に保持されるか、または細胞外空間に分泌される。何れの位置においても、Ａβはニューロンに対して毒性である（Ｃａｓａｓ等（２００４）Ａｍ  Ｊ  Ｐａｔｈｏｌ１６５，１２８９−１３００）。
【００９５】
ベータおよびガンマセクレターゼによるＡＰＰの逐次的切断はアミロイド形成性経路と称される。代替経路は正常な脳において優勢となり：ＡＰＰの全エクトドメインはアルファセクレターゼにより触媒される蛋白分解プロセスである受容体シェディングを介して放出される。放出されたエクトドメインはｓＡＰＰαと称され、そして神経保護および記憶増強作用を有することが明らかにされている（Ｆｕｒｕｋａｗａ等（１９９６）Ｊ  Ｎｅｕｒｏｃｈｅｍ  ６７，１８８２−１８９６；Ｍｅｚｉａｎｅ等（１９９８）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  ＳｃｉＵＳＡ９５，１２６８３−１２６８８）。ＡＰＰエクトドメインの放出は非アミロイド形成性の経路における重要な事象である。この場合の蛋白分解はアミロイド形成中にＡβになるＡＰＰの領域内部の６８８位において生じる（Ａｌｌｉｎｓｏｎ等（２００３）Ｊ  Ｎｅｕｒｏｓｃｉ  Ｒｅｓ７４，３４２−３５２）。従って、アミロイド形成性および非アミロイド形成性の経路は相互に排他的である。ｓＡＰＰαの放出は膜結合プロテアーゼでもあるアルファーセクレターゼ、ＡＤＡＭ１０により触媒される（Ｆａｈｒｅｎｈｏｌｚ等（２０００）Ａｎｎ  Ｎ  Ｙ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ９２０，２１５−２２２）。ＡＤＡＭ１０はＮｏｔｃｈ切断酵素（Ｋｕｚｂａｎｉａｎ）およびＴＮＦ−アルファ前駆体切断酵素（ＴＡＣＥ、ＡＤＡＭ１７）を包含する「シェダーゼ」酵素のファミリーの部分であるディスインテグリンおよびメタロプロテイナーゼ（ａ ｄｉｓｉｎｔｅｇｒｉｎ  ａｎｄ  ｍｅｔａｌｌｏｐｒｏｔｅｉｎａｓｅ）である。ＡＤＡＭ１０はＢＡＣＥのエクトドメインのシェディングを担っていることがわかっている（Ｈｕｓｓａｉｎ等（２００３）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ  ２７８，３６２６４−３６２６８）。
【００９６】
ＡＤＡＭファミリーの他のメンバーと同様、ＡＤＡＭ１０はＮ末端プロドメイン、触媒プロテアーゼドメイン、ディスインテグリンドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞質テール部を有する。プロドメインは酵素の適切な折り畳みの要件である触媒ドメインに堅固に会合している。この会合は又、プロドメイン中のシステインを活性部位の亜鉛原子に可逆的に結合可能とし、酵素の蛋白分解活性をマスキングしつつ、分泌経路を通過する。トランスゴルジに到達すれば、構成的分泌経路のプロ蛋白コンバターゼフリンがＡＤＡＭ１０の残基２１１〜２１４（ＲＫＫＲ）を認識し、プロドメインを切断し、そして酵素を蛋白分解的に活性とする。
【００９７】
ＡＤＡＭ１０によるｓＡＰＰα放出と引き換えにベータおよびガンマセクレターゼによるＡβ放出が増大することは、アルツハイマー病の基礎であると考えられている。ＡＰＰプロセシングをアミロイド形成性の経路から離れるようにシフトさせるためにＢＡＣＥまたはガンマ−セクレターゼ複合体の薬理学的阻害剤を開発するための多くのプログラムが進行中である。補完的な手順は、脳の間質におけるアルファセクレターゼのレベルを上昇させることによりＡβと引き換えにｓＡＰＰα生産を増大させることである。ＡＰＰの蛋白分解的プロセシングにおける不均衡は特定のニューロンプロテアーゼであるＡＤＡＭ１０の内因性レベルを中程度に補充することにより動物モデルにおいて是正されている。脳における上昇したＡＤＡＭ１０レベルの利点はアルツハイマー病のマウスモデルにおいて確認されている（Ｐｏｓｔｉｎａ等（２００４）Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ  １１３，１４５６−１４６４；Ｌｉｃｈｔｅｎｔｈａｌｅｒ等（２００４）Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ  １１３，１３８４−１３８７）。脳ＡＤＡＭ１０レベルの僅かな上昇が疾患の表現型を防止することがわかっている。
【００９８】
本発明は環状ＲＡＰペプチドとＡＤＡＭ１０の間の融合物の静脈内投与に基づいてアルツハイマー病を治療することを意図している。好ましい実施形態はＡＤＡＭ１０−環状ＲＡＰペプチドコンジュゲートを投与すること、および脳アルファセクレターゼ活性を上昇させることを含むアルツハイマー病を治療する方法であり、この場合、該投与は静脈内、頸動脈内、または髄腔内の投与による。そしてそのアルファセクレターゼの上昇が、アミロイド形成性経路から離れるようにＡＰＰプロセシングを偏向させることを期待できる。ｓＡＰＰαの増強された生産、およびその必然的結果としてのＡβの減衰した生産は、アルツハイマー病に罹患した患者に対する治療効果を有することが推定される。或いは、本発明は環状ＲＡＰペプチドとＡＰＰまたはＡｂｅｔａに作用する他のプロテアーゼの間の融合物の投与を含む、またはベータセクレターゼの阻害剤を用いた、またはガンマセクレターゼの阻害剤を用いた、アルツハイマー病に対する治療を意図している。
【００９９】
関連する特徴において、本発明は結合したプロドメインを有するＡＤＡＭ１０−ＲＡＰ融合物を使用することにより静脈内注射された活性なシェダーゼ酵素の末梢作用を最小限にすることを意図している。未損傷のプロＡＤＡＭ１０−ＲＡＰはフリン阻害剤であるα１−抗トリプシンＰｏｒｔｌａｎｄとの同時発現により標準的な生産系統から単離できる（Ｓｒｏｕｒ等（２００３）ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ５５４，２７５−２８３；Ｂｅｎｊａｎｎｅｔ等（１９９７）Ｊ  Ｂｉｏｌ  Ｃｈｅｍ２７２，２６２１０−２６２１８）。次に融合物の活性化が、トランスサイトーシスの間、または脳間質への到達時の何れかに、組織中へのクリアランスの後のプロドメインの除去により起こる。トランスサイトーシスの間、融合物はＬＲＰとの会合のために膜会合型となる。次に融合物−受容体複合体がエンドソーム内部で細胞を通過する。以前のインビボおよびインビトロの試験では、トランスサイトーシスの間の通過における一部の蛋白の部分的蛋白分解が明らかにされている（Ｌｉｓｉ等（２００３）Ｊ  Ｅｎｄｏｃｒｉｎｏｌ  Ｉｎｖｅｓｔ２６，１１０５−１１１０）。内皮細胞内への初期のエンドサイトーシス時、またはニューロン内への最終エンドサイトーシス時の何れかのＡＤＡＭ１０−ＲＡＰコンジュゲートのエンドサイトーシスは早期のエンドソームにおけるフリンに融合物を曝露させることになる（Ｍａｙｅｒ等（２００４）Ｊ  Ｈｉｓｔｏｃｈｅｍ  Ｃｙｔｏｃｈｅｍ５２，５６７−５７９；Ｂｏｓｓｈａｒｔ等（１９９４）Ｊ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ１２６，１１５７−１１７２；Ｒｏｈｎ等（２０００）Ｊ  Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉ１１３（Ｐｔ  １２），２０９３−２１０１）。ＡＤＡＭ１０の遅延した活性化のための代替の手順は、ＡＤＡＭ感受性ペプチドリンカーによる、プロドメインおよび触媒ドメインを連結させるフリン感受性ペプチドリンカーの置き換えである。修飾されたプロドメインが生産系統において切断される限り、この反応は、ヒドロキサメート阻害剤の存在下の培養によるか、またはＴＩＭＰ１またはＴＩＭＰ３との同時発現により、阻害することができる（Ａｍｏｕｒ等（２０００）ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔ  ４７３，２７５−２７９）。末梢系におけるＲＡＰ融合物の半減期は短いが、ＡＤＡＭ感受性プロＡＤＡＭ１０ＲＡＰ融合物の蓄積が、間質空間内部のニューロン表面における内因性の活性なＡＤＡＭ１０への融合物の曝露をもたらすことになる。次に蛋白分解性の連鎖反応が想定され、各々の活性化されたＡＤＡＭ１０−ＲＡＰ融合物がその後更にＡＤＡＭ１０−ＲＡＰを活性化する。マンニトールとの頸動脈内同時投与、並びに髄腔内投与は、不活性ＡＤＡＭ１０を必要としない場合がある。
【０１００】
本発明の意図する追加的な神経学的障害を以下に記載する。例えばパーキンソン病は振せんおよび低減された運動ニューロン機能、硬直および運動不能を特徴とする。神経学的徴候は黒質の主要遠心性突起、即ち黒質線状体管の誤機能による。ドーパミン作用性の系におけるニューロンの細胞体がＰＤの侵攻に関与する主要な細胞である。主要なパーキンソン症候群の例はパーキンソン病（ＰＤ）、進行性核上麻痺（ＰＳＰ）およびオリーブ橋小脳変性（ＯＰＣＤ）に包含される線状体黒質変性（ＳＮＤ）、および多系委縮（ＭＳＡ）として知られる症候群におけるＳｈｙ  Ｄｒａｇｅｒ症候群（ＳＤＳ）を包含する。
【０１０１】
「ルーゲーリック病」と称される場合が多い筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）は脳および脊髄における運動ニューロンを攻撃する進行性の神経変性疾患である。ＡＬＳにおける運動ニューロンの進行性の変性は最終的にはその死滅をもたらし、筋肉の運動を開始および制御する脳の能力を低減させる。
【０１０２】
ハンチントン病（ＨＤ）は遺伝的な疾患であるが、線状体中棘ＧＡＢＡ作用性ニューロンにおけるニューロンの変性をもたらす（Ｈｉｃｋｅｙ等、Ｐｒｏｇ  Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ  Ｂｉｏｌ  Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ．２７：２５５−６５、２００３）。この変性は無制御の運動、知的機能の損失、および情動障害を誘発する。
【０１０３】
多発性硬化症（ＭＳ）は青年の頻発する廃疾性の疾患である。この疾患は恐らくは自己免疫型の炎症性反応、および、中枢神経系のミエリン形成細胞である稀突起神経膠細胞の損失に関連する場合が多い脱髄を特徴とする。現在の使用可能な治療法はＭＳの炎症因子に着目しているが、再髄鞘形成に対する作用は殆ど無い。
【０１０４】
本発明の組成物は脳の癌を治療するために有用である。最も一般的な脳腫瘍は神経膠腫であり、これは神経膠組織において開始される。星状細胞腫は星状細胞と称される小型の星の形状を有する細胞から生じ、成人の大脳において生じる場合が多い。第ＩＩＩ等級の星状細胞腫は未分化星状細胞腫と称される場合がある。第ＩＶ等級の星状細胞腫は通常は多形性神経膠芽細胞腫と称される。脳幹の神経膠腫は脳の最下部の幹様の部分において起こる。脳幹は多くの生命機能を制御している。大部分の脳幹神経膠腫は高い等級の星状細胞腫である。上衣細胞腫は通常は脳質の管壁において発生する。それらは又、脊髄においても生じる場合がある。稀突起神経膠腫は神経を保護する脂肪性の被膜であるミエリンを生産する細胞中に生じる。これらの腫瘍は通常は大脳に生じる。それらは緩徐に成長し、そして通常は周囲の脳組織には拡張されない。髄芽細胞腫は出生後の身体内には通常は残存しない原始神経細胞から発生する。この理由のため、髄芽細胞腫は原始神経外胚葉腫（ＰＮＥＴ）と称される場合がある。大部分の髄芽細胞腫は小脳において生じるが；それらは別の領域においても同様に生じる場合がある。髄膜腫は髄膜から成長する。それらは通常は良性である。これらの腫瘍は極めて緩徐に成長するため、脳はその存在に対して適応できる場合があり；髄膜腫はそれらが症状をもたらす前にかなり大型にまで成長する場合が多い。神経鞘腫は内耳神経を保護するミエリンを生産するシュバン細胞において開始される良性の腫瘍である。内耳神経腫は神経鞘腫の１種である。頭蓋咽頭腫は視床下部近傍の下垂体の領域において発生する。それらは通常は良性であるが；それらは視床下部を圧迫するか損傷を与え、生命機能に影響する場合があることから、悪性と考えられる場合もある。生殖細胞腫は原始（発生中）の性細胞、または生殖細胞から生じる。脳における生殖細胞腫の最も頻繁な型は胚細胞腫である。松果体領域の腫瘍は松果体中またはその周囲において発生する。腫瘍は緩徐成長型の飲細胞腫であるか急速成長型であることができる（松果体芽細胞腫）。松果体領域は到達が極めて困難であり、そしてこれらの腫瘍は除去できない場合が多い。
【０１０５】
脳腫瘍に対する治療は多くの要因に依存している。これらに包含されるものは腫瘍の型、位置および大きさ、並びに患者の年齢および全身状態である。通常は脳腫瘍は手術、放射線療法、および化学療法により治療される。１つの特徴において、本発明は環状ＲＡＰペプチドを含む組成物を神経芽腫または神経腫瘍を有する対象に投与することを含む神経芽腫および神経腫瘍の成長および進行を阻害する方法を提供する。追加的な特徴において、環状ＲＡＰペプチドは神経腫瘍を治療するために有用な剤にコンジュゲートしてよい。
ＧＤＮＦ
別の好ましい実施形態においては、本発明は神経膠細胞誘導神経栄養因子（ＧＤＮＦ）のようなニューロン成長因子にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチドを投与することにより神経変性疾患を治療する方法を意図している。そのような神経変性疾患はパーキンソン病を包含するがこれに限定されない。ＧＤＮＦは胚性中脳ドーパミンニューロンに対する栄養因子としてラット神経膠腫細胞系統上澄みから本来は精製されている。インビボにおいて、ＧＤＮＦホモ２量体はその受容体であるＧＦＲα−１（恐らくはやはり２量体）に結合し、次にＧＤＮＦ−ＧＦＲα−１複合体がＲｅｔ蛋白に結合し、これが２量化する。Ｒｅｔの２量化はチロシン１０６２の自己ホスホリル化を誘発する。ＧＤＮＦは他のニューロンのサブ集団に対して顕著な作用を有することが研究により示されている。ＧＤＮＦはパーキンソン病の動物モデルにおいてドーパミンニューロンを保護し、そしてインビボで運動ニューロンを救済するため、数種の神経変性疾患を治療するための治療薬としてＧＤＮＦを使用できるという期待が生じていた。しかしながらＧＤＮＦは血液脳関門を通過しない。本発明はＧＤＮＦにコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチドを投与することを含む血液脳関門を通過してＧＤＮＦを輸送する方法を提供する。
ｉｉｉ．肝障害
本発明の環状ＲＡＰペプチドまたはコンジュゲートを用いた治療のために意図される肝疾患は例えば限定しないが以下に考察する障害を包含する。肝細胞癌、即ちヘパトーマは世界で第５番目に頻発している癌であり、そして発生率は一貫して上昇している。肝細胞癌は肝細胞の疾患である。腫瘍形成性の肝細胞は高いレベルのＬＲＰ１発現を保持している。腫瘍細胞が薬物耐性を高頻度で示すため、そして全身（静脈内）投与に起因して特に心臓および腎臓において使用される化学療法が重篤な毒性を有するため、肝細胞癌は化学療法に良好に応答しない。
【０１０６】
肝炎は肝臓の炎症に対する包括的な用語である。肝炎は急性または慢性であることができ、そして、例えばウィルス（例えばＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥ型または非ＡＢＣＤＥ型の肝炎、ＣＭＶ、エプスタイン−バー）、カビ、リケッチアまたは寄生虫感染、アルコール、化学的毒素、薬物（例えばアセトアミノフェン、アミオダロン、イソニアジド、ハロタン、クロルプロマジン、エリスロマイシン）、代謝性肝臓病（例えばウィルソン病、アルファ１−抗トリプシン欠乏症）、癌、特発性自己免疫性肝疾患、肝硬変（例えば原発性胆汁性肝硬変）、胆道閉鎖に起因する急性または慢性の肝障害を包含する。Ａ、Ｂおよび／またはＣ型肝炎ウィルスの感染は肝不全をもたらす緩徐に進行する肝臓病をもたらす場合がある。急性の肝炎感染はＡ型肝炎ウィルスによりもっとも頻繁に誘発される。Ｂ型肝炎およびＣ型肝炎の感染は両方とも身体内に持続的に存在し、そして長時間継続する感染（慢性）となる場合がある。Ｃ型肝炎は肝硬変および癌を包含する重篤な状態を誘発する場合がある。
【０１０７】
環状ＲＡＰペプチドにコンジュゲートした組成物を用いて治療することができると意図されるその他の肝障害および状態は、肝臓脂肪症（米国特許６，５９６，７６２）、胆汁鬱滞（米国特許６，０６９，１６７）、肝硬変、毒性肝損傷、肝切除後の状態、胆道閉鎖を包含する。
【０１０８】
肝疾患の治療のための環状ＲＡＰペプチドへのコンジュゲーションのための候補薬物は、例えば限定しないが、５−フルオロウラシル、ドキソルビシン（アドリアマイシン）、マイトマイシンＣ、シスプラチン、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシド、および表１に示す他の化学療法剤、アデホビル、ラミブジン、エンテカビル、リバビリン、インターフェロンアルファ、ＰＥＧ化インターフェロンアルファ−２ａ、インターフェロンアルファ−２ｂおよび他の抗ウィルス剤、ビタミンＥ、ウルソデオキシコール酸、および肝臓障害を治療するために使用される他の剤を包含する。
【０１０９】
（表１）
【０１１０】
【表１−１】
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【０１１１】
【表１−２】
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【０１１２】
【表１−３】
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ｉｖ．癌
マトリプターゼは上皮癌、例えば癌腫、例えば卵巣、子宮頚部、前立腺、乳腺、肺、結腸または胃の癌腫上で過剰発現される。他の例は肺の中皮腫、黒色腫、非小細胞肺癌、神経膠腫、肝細胞（肝）癌、甲状腺腫、膀胱癌、神経膠芽腫、子宮内膜癌、腎臓癌、膵臓癌、または非黒色腫皮膚癌を包含する。環状ＲＡＰペプチドはマトリプターゼ活性を阻害するため、または細胞毒性在または他の癌治療薬の送達のためのターゲティング剤として、使用することができる。
【０１１３】
ＬＲＰ６は結腸および乳腺の癌において過剰発現されることがわかっている。環状ＲＡＰペプチドはＬＲＰ６活性を阻害するため、または細胞毒性剤または他の癌治療薬の送達のためのターゲティング剤として、使用することができる。
【０１１４】
本発明の環状ＲＡＰペプチドまたはコンジュゲートを用いて治療してよい癌の他の例は、リンパ腫、例えばバーキットリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、Ｔ細胞リンパ腫および白血病を包含する。
【０１１５】
ｖ．骨代謝障害
本発明の環状ＲＡＰペプチドまたはコンジュゲートを用いて治療してよい骨代謝障害は骨粗鬆症、大理石骨病、骨の炎症、関節炎、慢性関節リューマチ、変形性関節症、高コルチゾール症、性機能低下症、一次または二次的な副甲状腺機能亢進症、または甲状腺機能亢進症；高カルシウム血症；ビタミンＤ欠乏状態（例えばくる病／骨軟化症、壊血病、栄養不良）、吸収不良症候群、慢性腎不全（腎性骨形成異常症）、慢性肝臓病（肝性骨形成異常症）、加齢または運動不能；薬物に起因する骨粗鬆症（糖質コルチコイドまたはステロイド、ヘパリン、アルコール）または遺伝病（例えば骨形成不全、ホモシステイン尿症）、骨転移癌、骨髄腫、骨折、骨移植、線維性形成異常、および／またはパジェット病に関連する骨の障害（例えば異常な骨の付着、異常な骨の損失または骨の弱化）を包含する。
【０１１６】
Ｃ．環状ＲＡＰペプチドおよび活性剤のコンジュゲート
環状ＲＡＰペプチドおよび活性剤は当該分野で知られた何れかの手段を介して結合してよい。それらは例えば共有結合的な化学結合、物理的な力、例えばファンデルワールス力または疎水相互作用、カプセル化、包埋、またはこれらの組み合わせにより、物理的に連結してよい。好ましい実施形態においては、治療薬および環状ＲＡＰペプチドは共有結合的な化学結合により物理的に連結される。即ち、好ましい化学療法剤はＲＡＰペプチドへのコンジュゲーションにおいて使用されるべき官能基、例えばアルコール、酸、カルボニル、チオールまたはアミン基を含有する。アドリアマイシンはアミンクラスに属し、そしてカルボニルを介して連結する可能性も同様に存在する。パクリタキセルはアルコールクラスに属する。適当なコンジュゲーション基を有さない化学療法剤はそのような基を付加するために更に修飾してよい。これらの化合物は全て本発明において意図される。多数の治療薬の場合は、種々のコンジュゲーションの組み合わせを使用できる。
【０１１７】
一部の実施形態においては、直接（無介在原子）または間接（リンカー、例えば共有結合的に連結した原子を介する）の何れかであってよい共有結合的な化学結合はＲＡＰペプチドおよび活性剤を連結する。一部の実施形態においては、ＲＡＰペプチドおよびコンジュゲートの活性剤部分はＲＡＰペプチドの原子および活性剤の原子との間の共有結合により直接連結される。他の実施形態においては、ＲＡＰペプチドは、共有結合を含むリンカー、または実質的に何れかのアミノ酸配列のペプチドまたは活性剤部分にＲＡＰペプチドを連結することができる何れかの分子または原子により、活性剤部分に連結される。
【０１１８】
一部の実施形態においては、リンカーは１〜約６０または１〜３０原子以上、２〜５原子、２〜１０原子、５〜１０原子、または１０〜２０原子長の原子鎖を含む。一部の実施形態においては、鎖原子は全て炭素原子である。一部の実施形態においては、鎖原子はＣ、Ｏ、Ｎ、およびＳよりなる群から選択される。鎖原子およびリンカーはより多くの可溶性コンジュゲートが得られるようにその期待される溶解度（親水性）に応じて選択してよい。一部の実施形態においては、リンカーはリソソーム中で酵素攻撃に付される官能基を与える。一部の実施形態においては、リンカーは標的組織または臓器に存在する酵素による攻撃に付され、そして攻撃または加水分解の際には活性剤とＲＡＰペプチドとの間の連結部として機能する官能基を与える。一部の実施形態においては、リンカーは標的部位において存在する条件（例えばリソソームの低ｐＨ）下において加水分解に付される官能基を与える。リンカーはそのような官能基１つ以上を含有してよい。一部の実施形態においては、リンカーの長さはＲＡＰペプチド結合部位および活性剤活性結合部位の一方または両方の間の立体障害（活性剤が大型である場合）の可能性を低減するために十分長いものである。
【０１１９】
リンカーが共有結合またはペプチドであり、そして活性剤がポリペプチドである場合は、全コンジュゲートは融合蛋白であることができる。そのようなペプチジルリンカーは何れかの長さであってよい。例示されるリンカーは約１〜５０アミノ酸長、５〜５０、３〜５、５〜１０、５〜１５、または１０〜３０アミノ酸長である。そのような融合蛋白は当該分野で知られた組み換え遺伝子操作法により製造してよい。一部の実施形態においては、コンジュゲートのＲＡＰペプチド部分は活性化合物を放出するために急速に分解または切断されるように製剤する。他の実施形態においては、リンカーは細胞内、またはより好ましくはリソソーム環境条件下に切断に付されることによりＲＡＰペプチド部分から活性剤部分を放出または分離する。
【０１２０】
コンジュゲートは同じＲＡＰペプチドに連結された活性剤１つ以上を含むことができる。例えばコンジュゲーション反応はＲＡＰペプチドに対して活性剤の分子１〜５、約５、約１〜１０、約５〜１０、約１０〜２０、約２０〜３０、または３０以上をコンジュゲートしてよい。これらの製剤は混合物として使用することができ、或いは、それらは特定の化学量論的な製剤にまで精製してよい。如何なるフォーマットおよび如何なる化学量論的な比が好ましいかは当業者の知る通りである。更に又、標的部位またはコンパートメントへの１種より多い剤の送達が望ましい場合は、１種より多い活性剤をＲＡＰペプチドに連結してよい。複数の活性剤種を同じＲＡＰペプチドに結合してよく、例えばアドリアマイシン−シスプラチナムＲＡＰペプチドコンジュゲートが挙げられる。即ち、コンジュゲートはある範囲の化学量論的比よりなり、そして１種より多い活性剤を配合してよい。これらは又、精製された混合物に分離してよく、或いはそれらは凝集塊として使用してよい。
【０１２１】
本発明の環状ＲＡＰペプチド、またはそのコンジュゲートは又、安定性または薬物動態の特性を増強するため、所望により修飾してよい（例えばＰＥＧ化による）。
【０１２２】
本発明のＲＡＰペプチドは治療用蛋白、例えば神経膠細胞誘導ニューロン成長因子（ＧＤＮＦ）、脳誘導ニューロン成長因子（ＢＤＮＦ）、ニューロン成長因子（ＮＧＦ）、当該分野で知られた他の神経栄養因子、ＡＤＡＭ１０、ＡＰＰまたはＡｂｅｔａに作用する他のプロテアーゼ、ＭＥＳＤ、癌の化学療法剤、プロテアーゼ阻害剤、自己免疫抗原、アポトーシス促進分子、リソソーム酵素、ＤＮＡまたはｓｉＲＮＡに融合または連結してよい。ＣＲ含有蛋白に対する向上した親和性または結合選択性を有する環状ＲＡＰペプチドへのこれらの剤の融合は血液脳関門を通過する、または他の組織部位への増大した輸送を促進することになることを意図している。１つの特徴において、環状ＲＡＰペプチドへのコンジュゲーションは、コンジュゲートの静脈内、皮下、筋肉内、脳室内、髄腔内または実質内の投与の後の、改変された組織分布または進歩したコンジュゲートの送達をもたらす。
【０１２３】
更に可能となることは、環状ＲＡＰペプチドへのコンジュゲーションは以下の作用、即ち：増大した力価、意図する標的受容体または組織とは異なる受容体または組織への減衰した結合、意図する標的受容体または組織である受容体または組織への増大した結合、意図する標的受容体または組織である受容体または組織への増大した接触可能性、身体からのクリアランスの改変された速度、および、蛋白への免疫応答の改変された特性、の１つ以上により誘発される活性剤の薬理学的活性における改変をもたらすことである。
【０１２４】
更に可能となることは、本発明の環状ＲＡＰペプチドをＤＮＡまたはｓｉＲＮＡのような治療用核酸にコンジュゲートすることにより、該核酸の組織選択的分布を向上させ、そして細胞内への該核酸のエンドサイトーシスを促進することである（Ｋｉｍ等、（２００４）Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ１５、３２６−３３２）。
【０１２５】
Ｄ．活性剤
本発明の活性剤は生物学的プロセスに影響することができる剤を包含する。本発明の化合物、組成物および方法における使用のための特に好ましい活性剤は治療薬、例えば薬物および診断薬である。「薬物」または「治療薬」という用語は、治療有効量で投与した場合に薬理学的活性を有するか、または健康に利益となる活性剤を指す。特に好ましい剤は天然に存在する生物学的な剤（例えば酵素、蛋白、ポリヌクレオチド、抗体、ポリペプチド、ナノ粒子、グリココンジュゲート）である。薬物または治療薬の例は疾患または状態の防止、診断、軽減、治療または治癒において使用される物質を包含する。剤は疾患を誘発する剤ではないことを特に意図している。
【０１２６】
ｉ．蛋白活性剤
活性剤は非蛋白または蛋白であることができる。活性剤は蛋白または酵素、または蛋白または酵素の治療上または生物学的な活性の一部、実質的に全て、または全てをなお保持しているそれらの何れかのフラグメントであることができる。一部の実施形態においては、蛋白または酵素は、発現または生産されない場合、または発現または生産において実質的に低減された場合には、疾患、例えば限定しないがリソソーム貯留疾患を生じさせるものである。好ましくは蛋白または酵素はヒトまたはマウスから誘導するか入手する。
【０１２７】
本発明の好ましい実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドにコンジュゲートした活性剤が蛋白または酵素、または蛋白または酵素の生物学的活性を保有しているそのフラグメントである場合、活性剤はヒトまたは哺乳類の蛋白または酵素の相当する部分に対するアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有する。他の実施形態においては、コンジュゲートの活性剤部分は、ヒトまたは哺乳類の種にネイティブな蛋白または酵素である。他の実施形態においては、蛋白または酵素、またはそのフラグメントは、相当するヒトまたは哺乳類の蛋白または酵素のネイティブの配列に実質的に相同である（即ち、少なくとも１０、２５、５０、１００、１５０、または２００アミノ酸の長さ、または活性剤の全長に渡って、アミノ酸配列において少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、より好ましくは９８％、または最も好ましくは９９％同一である）。
【０１２８】
化合物が蛋白である場合、化合物は酵素、または酵素の活性の一部、実質的に全て、または全てをなお保持している酵素の何れかのフラグメントであることができる。好ましくは、リソソーム貯留疾患の治療においては、酵素は、発現または生産されない場合、または発現または生産において実質的に低減された場合には、リソソーム貯留疾患を生じさせる細胞中に存在する酵素である。好ましくは、酵素はヒトまたはマウスから誘導するか入手する。好ましくは、酵素はリソソーム貯留酵素、例えばα−Ｌ−イズロニダーゼ、イズロネート−２−スルファターゼ、ヘパランＮ−スルファターゼ、α−Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ、アリールスルファターゼＡ、ガラクトシルセラミダーゼ、酸アルファグルコシダーゼ、トリペプチジルペプチダーゼ、ヘキソースアミニダーゼアルファ、酸スフィンゴミエリナーゼ、β−ガラクトシダーゼ、または何れかの他のリソソーム貯留酵素である。
【０１２９】
従って、一部の実施形態においては、ヒトリソソーム貯留疾患（ＬＳＤ）の治療においては、環状ＲＡＰペプチドコンジュゲートは治療すべき対象または患者のリソソーム中において欠損している活性剤蛋白または酵素を含む。そのような酵素は、例えばアルファ−Ｌ−イズロニダーゼ、イズロネート−２−スルファターゼ、ヘパランＮ−スルファターゼ、アルファ−Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ、アリールスルファターゼＡ、ガラクトシルセラミダーゼ、酸アルファグルコシダーゼ、チオエステラーゼ、ヘキソースアミニダーゼＡ、酸スフィンゴミエリナーゼ、アルファガラクトシダーゼ、または何れかの他のリソソーム貯留酵素を包含する。リソソーム貯留疾患およびその場合に欠損している蛋白、即ち活性剤として有用なものの表を以下に示す。
【表Ａ−１】
2010524849.tif 000005
【０１３０】
【表Ａ−２】
2010524849.tif 000006
【０１３１】
即ち、本発明の方法を用いて治療または防止できるリソソーム貯留疾患は限定されないが、ムコ多糖症Ｉ（ＭＰＳＩ）、ＭＰＳＩＩ、ＭＰＳＩＩＩＡ、ＭＰＳＩＩＩＢ、異染性白質萎縮症（ＭＬＤ）、クラッベ、ポーンプ、セロイド脂褐素症、テイ−サックス症、ニーマン−ピックＡおよびＢ、および他のリソソーム症を包含する。
【０１３２】
即ち、上記表によれば、各疾患に対し、コンジュゲートした剤は好ましくは疾患において欠損している特定の活性剤酵素を含む。例えばＭＰＳＩに関わる方法については、好ましい化合物または酵素はα−Ｌ−イズロニダーゼである。ＭＰＳＩＩに関わる方法については、好ましい化合物または酵素はイズロネート−２−スルファターゼである。ＭＰＳＩＩＩＡに関わる方法については、好ましい化合物または酵素はヘパラン−Ｎ−スルファターゼである。ＭＰＳＩＩＩＢに関わる方法については、好ましい化合物または酵素はα−Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼである。異染性白質萎縮症（ＭＬＤ）に関わる方法については、好ましい化合物または酵素はアリールスルファターゼＡである。クラッベ病に関わる方法については、好ましい化合物または酵素はガラクトシルセラミダーゼである。ポーンプ病に関わる方法については、好ましい化合物または酵素は酸α−グルコシダーゼである。ＣＬＮに関わる方法については、好ましい化合物または酵素はトリペプチジルペプチダーゼである。Ｔａｙ−Ｓａｃｈｓ病に関わる方法については、好ましい化合物または酵素はヘキソースアミニダーゼアルファである。ニーマン−ピックＡおよびＢ症に関わる方法については、好ましい化合物または酵素は酸スフィンゴミエリナーゼである。
【０１３３】
環状ＲＡＰペプチドコンジュゲートは環状ＲＡＰペプチドに連結された活性剤部分１つ以上（例えば１〜１０または１〜４または２〜３部分）を含むことができる。例えばコンジュゲーション反応は単一の環状ＲＡＰペプチドにアルファ−Ｌ−イズロニダーゼ分子１〜４個をコンジュゲートしてよい。これらの製剤は混合物として使用するか、またはそれらは特定の環状ＲＡＰペプチド−剤の化学量論的な製剤となるように精製してよい。如何なるフォーマットおよび如何なる化学量論的な比が好ましいかは当業者の知る通りである。更に又、異なる活性剤１つ以上を環状ＲＡＰペプチドの何れかの所定の分子に連結することにより保存された基質のより完全な分解を促進してよい。これらの環状ＲＡＰペプチドコンジュゲート剤はある範囲の化学量論的な比よりなるものであってよい。これらは又、精製された混合物に分離してよく、或いはそれらは凝集塊として使用してよい。融合物中の環状ＲＡＰペプチドとＬＳＤの順序が重要である場合がある。従って、一部の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドはＬＳＤ酵素に対してＮ末端側であり、そして他の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドはＬＳＤ酵素に対してＣ末端側である。
【０１３４】
環状ＲＡＰペプチドコンジュゲート活性剤はＣＮＳ内部またはそれに付随しない細胞のリソソーム中に進入するか、またはその内部に輸送されるか、またはそこに最終的に残留することができる。コンジュゲートされた剤の通過速度は受容体輸送活性をモジュレートできる何れかの化合物または蛋白によりモジュレートできる。細胞はリソソーム貯留疾患に罹患した何れかの組織または臓器の系に由来するものであることができる。細胞は、例えば内皮、上皮、筋肉、心臓、骨、肺、脂肪、腎臓、または肝臓の細胞であることができる。一部の実施形態においては、細胞は好ましくはＢＢＢ内部に存在する細胞である。一部の実施形態においては、細胞はニューロンまたは脳細胞である。他の実施形態においては、細胞は末梢、または例えばＢＢＢの内皮により全身循環から単離されないものの細胞である。
【０１３５】
ｉｉ．薬物活性剤
一般的に、薬物活性剤は如何なる大きさのものであってもよい。好ましい薬物は目的の標的に結合できる小型の有機性分子である。コンジュゲートの薬物部分は、小分子の場合、一般的に少なくとも約５０Ｄ、通常は少なくとも約１００Ｄの分子量を有し、この場合、分子量は５００Ｄ以上もの高値になってよいが、通常は約２０００Ｄを超えない。
【０１３６】
薬物部分は要件方法の実施の間にコンジュゲートを投与する対象となる宿主における標的と相互作用することができる。標的は多くの異なる型の天然に存在する構造であることができ、その場合、目的の標的は細胞内および細胞外の両方の標的を包含し、そしてそのような標的は蛋白、リン脂質、核酸等であってよく、そして蛋白は特定の目的のものである。目的の特定の蛋白性標的は、限定しないが酵素、例えばキナーゼ、ホスファターゼ、レダクターゼ、シクロオキシゲナーゼ、プロテアーゼ等、ＳＨ２、ＳＨ３、ＰＴＢおよびＰＤＺドメインのような蛋白−蛋白相互作用に関与するドメインを含む標的、構造蛋白、例えばアクチン、チューブリン等、膜受容体、免疫グロブリン、例えばＩｇＥ、細胞接着受容体、例えばインテグリン等、イオンチャンネル、膜貫通ポンプ、転写因子、シグナリング蛋白等を包含する。
【０１３７】
一部の実施形態においては活性剤または薬物はイソシアネート試薬と反応するためのヒドロキシルまたはアミノ基を有し、或いは、活性剤は、イソシアネート試薬と反応するためのヒドロキシルまたはアミノ基を導入するように化学的に修飾される。
【０１３８】
一部の実施形態においては、活性剤または薬物は好ましくは活性剤の所望の生物学的活性を損失することなく修飾され、および／または、共有結合に参加してよい領域を含む。薬物部分は頻繁には、炭素環または複素環の構造および／または芳香族またはポリ芳香族の構造を含み、これらは上記官能基１つ以上で置換されている。薬物部分として更に有利なものは、生物学的分子、蛋白、酵素、多糖類およびポリ核酸中に存在する構造、例えばペプチド、糖類、脂肪酸、ステロイド、プリン、ピリミジン、それらの誘導体、構造的類縁体または組み合わせである。
【０１３９】
適当な活性剤は、限定しないが例えば精神薬理学的な剤、例えば（１）中枢神経系阻害薬、例えば全身麻酔剤（バルビツレート、ベンゾジアゼピン、ステロイド、シクロヘキサノン誘導体、およびその他の剤）、沈静催眠剤（ベンゾジアゼピン、バルビツレート、ピペリジンジオン、およびトリオン、キナゾリン誘導体、カーバメート、アルデヒドおよび誘導体、アミド、アクリルウレイド、ベンズアゼピンおよび関連の薬物、フェノチアジン等）、中枢随意筋緊張変調薬物（鎮痙剤、例えばヒダントイン、バルビツレート、オキサゾリジンジオン、スクシンイミド、アシルウレイド、グルタルイミド、ベンゾジアゼピン、第２および第３アルコール、ジベンズアゼピン誘導体、バルプロ酸および誘導体、ＧＡＢＡ類縁体等）、鎮痛剤（モルヒネおよび誘導体、オリパビン誘導体、モルフィナン誘導体、フェニルピペリジン、２，６−メタン−３−ベンズアゾカイン誘導体、ジフェニルプロピルアミンおよびアイソスター、サリシレート、ｐ−アミノフェノール誘導体、５−ピラゾロン誘導体、アリール酢酸誘導体、フェナメートおよびアイソスター等）および抗嘔吐剤（抗コリン作用剤、抗ヒスタミン、抗ドーパミン作用剤等）、（２）中枢神経系刺激剤、例えば興奮剤（呼吸刺激剤、痙攣刺激剤、精神運動刺激剤）、麻薬拮抗剤（モルヒネ誘導体、オリパビン誘導体、２，６−メタン−３−ベンズアゾカイン誘導体、モルフィナン誘導体）ｎｏｏｔｒｏｐｉｃ剤、（３）精神薬、例えば不安緩解鎮静剤（ベンゾジアゼピン、プロパンジオールカーバメート）抗精神病在（フェノチアジン誘導体、チオキサンチン誘導体、他の３環化合物、ブチロフェノン誘導体およびアイソスター、ジフェニルブチラミン誘導体、置換ベンズアミド、アリールピペラジン誘導体、インドール誘導体等）、抗欝在（３環化合物、ＭＡＯ阻害剤等）、（４）呼吸管薬、例えば中枢性鎮咳剤（麻薬アルカロイドおよびその誘導体）；薬力学的な剤、例えば（１）末梢神経系の薬物、例えば局所麻酔剤（エステル誘導体、アミド誘導体）、（２）シナプスまたは神経エフェクター接合部位において作用する薬物、例えばコリン作用剤、コリン作用性ブロッキング剤、神経筋肉ブロッキング剤、アドレナリン作用剤、抗アドレナリン作用剤、（３）平滑筋活性薬物、例えば鎮痙剤（抗コリン作用剤、向筋肉鎮痙剤）、血管拡張剤、平滑筋刺激剤、（４）ヒスタミンおよび抗ヒスタミン、例えばヒスタミンおよびその誘導体（ベタゾール）、抗ヒスタミン（Ｈ１拮抗剤、Ｈ２拮抗剤）、ヒスタミン代謝薬、（５）心臓血管薬、例えば強心剤（植物抽出物、ブテノリド、ペンタジエノリド、ｅｒｙｔｈｒｏｐｈｌｅｕｍ種由来のアルカロイド、イオノフォア、アドレナリン受容体刺激剤等）、抗不整脈薬、抗高血圧剤、抗高脂血剤（クロフィブリック酸誘導体、ニコチン酸誘導体、ホルモンおよび類縁体、抗生物質、サリチル酸および誘導体）、抗静脈瘤薬、止血剤、（６）血液および造血系の薬物、例えば抗貧血薬、血液凝固薬（止血剤、抗凝固剤、抗トロンビン剤、血栓溶解剤、血液蛋白およびその画分）、（７）胃腸管の薬物、例えば消化剤（健胃薬、胆汁分泌促進剤）、抗潰瘍薬、抗下痢剤、（８）局所作用薬物；化学療法剤、例えば（１）抗感染剤、例えば外部寄生生物殺傷剤（塩素化炭化水素、ピレスリン、硫酸化合物）、駆虫剤、抗原虫剤、抗マラリア剤、抗アメーバ剤、抗リューシュマニア薬、抗トリコモナス剤、抗トリパノソーム剤、スルホンアミド、抗マイコバクテリア薬、抗ウィルス性化学療法剤等、および（２）細胞増殖阻害剤、即ち、抗新生物剤または細胞毒性薬、例えばアルキル化剤、例えば塩酸メクロレタミン（窒素マスタード、ムスタルゲン、ＨＮ２）、シクロホスファミド（シトバン、エンドキサナ）、イフォスファミド（ＩＦＥＸ）、クロラムブシル（ロイケラン）、メルファラン（フェニルアラニンマスタード、Ｌ−サルコリシン、アルケラン、Ｌ−ＰＡＭ）、ブスルファン（ミレラン）、チオテパ（トリエチレンチオホスホロアミド）、カルムスチン（ＢｉＣＮＵ、ＢＣＮＵ）、ロムスチン（ＣｅｅＮＵ、ＣＣＮＵ）、ストレプトゾシン（ザノサール）等；植物アルカロイド、例えばビンクリスチン（オンコビン）、ビンブラスチン（ベルバン、ベルベ）、パクリタキセル（タキソール）等；代謝拮抗剤、例えばメトトレキセート（ＭＴＸ）、メルカプトプリン（プリネトール、６−ＭＰ）、チオグアニン（６−ＴＧ）、フルオロウラシル（５−ＦＵ）、シタラビン（シトザール−Ｕ、Ａｒａ−Ｃ）、アザシチジン（ミロザール、５−ＡＺＡ）等；抗生物質、例えばダクチノマイシン（アクチノマイシンＤ、コスメゲン）、ドキソルビシン（アドリアマイシン）、ダウノルビシン（ダウノマイシン、セルビジン）、イダルビシン（イダマイシン）、ブレオマイシン（ブレノキサン）、ピカマイシン（ミトラマイシン、ミトラシン）、マイトマイシン（ムタマイシン）等、および他の抗細胞増殖剤、例えばヒドロキシ尿素（ヒドレア）、プロカルバジン（ムタラン）、ダカルバジン（ＤＴＩＣ−Ｄｏｍｅ）、シスプラチン（プラチノール）カルボプラチン（パラプラチン）、アスパラギナーゼ（エルスパール）エトポシド（ベプシド、ＶＰ−１６−２１３）、アムサルクリン（ＡＭＳＡ、ｍ−ＡＭＳＡ）、ミトタン（リソドレン）、ミトキサントロン（ノバトロン）等を包含する。好ましい化学療法剤は、遊離の形態においては所望の用量において許容できない全身毒性を呈するものである。そのような剤の治療レベルに関連する一般的な全身毒性は環状ＲＡＰペプチドへのそれらの連結により低減される場合がある。特に好ましいものは有用な治療薬であるが心臓毒性のために用量制限されている心臓毒性化合物である。古典的な例はアドリアマイシン（ドキソルビシンとしても知られている）およびその類縁体、例えばダウノルビシンである。そのような薬物に環状ＲＡＰペプチドを連結させることは、心臓における活性剤の蓄積および関連する心臓毒性を防止する場合がある。
【０１４０】
適当な活性剤は、限定しないが例えば抗生物質、例えば：アミノグリコシド、例えばアミカシン、アプラマイシン、アルベカシン、バンバーマイシン、ブチロシン、ジベカシン、ジヒドロストレプトマイシン、フォルチマイシン、ゲンタマイシン、イセパマイシン、カナマイシン、ミクロノムシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、パロマイシン、リボスタマイシン、シソマイシン、スペクチノマイシン、ストレプトマイシン、トブラマイシン、トロスペクトマイシン；アンフェニコール、例えばアジダムフェニコール、クロラムフェニコール、フロルフェニコール、およびテイマフェニコール；アンサマイシン、例えばリファミド、リファンピン、リファマイシン、リファペンチン、リファキシミン；ベータラクタム、例えばカルバセフェム、カルバペネム、セファロスポリン、セファマイシン、モノバクタム、オキサフェム、ペニシリン；リンコサミド、例えばクリナマイシン、リンコマイシン；マクロライド、例えばクラリスロマイシン、ジルトロマイシン、エリスロマイシン等；ポリペプチド、例えばアンホマイシン、バシトラシン、カプレオマイシン等；テトラサイクリン、例えばアピサイクリン、クロロテトラサイクリン、クロモサイクリン等；合成抗細菌剤、例えば２，４−ジアミノピリジン、ニトロフラン、キノロンおよびその類縁体、スルホンアミド、スルホンを包含する。
【０１４１】
適当な活性剤は、限定しないが例えば抗カビ剤、例えば：ポリレン、例えばアンホテリシンＢ、カンジシジン、デルモスタチン、フィリピン、フンジクロミン、ハチマイシン、ハミシン、ルセンソマイシン、メパルトリシン、ナタマイシン、ニスタチン、ペシロシン、ペリマイシン；合成抗カビ剤、例えばアリルアミン、例えばブテナフィン、ナフチフィン、テルビナフィン；イミダゾール、例えばビフォナゾール、ブトコナゾール、クロルダントイン、クロルミダゾール等、チオカーバメート、例えばトルシクレート、トリアゾール、例えばフルコナゾール、イトラコナゾール、テルコナゾールを包含する。
【０１４２】
適当な活性剤は、限定しないが例えば、駆虫剤、例えば：アレコリン、アスピジン、アスピジノール、ジクロロフェン、エムベリン、コシン、ナフタレン、ニクロサミド、ペレチエリン、キナクリン、アラントラクトン、アモカルジン、アモスカネート、アスカリドール、ベフェニウム、ビトスカネート、４塩化炭素、カルバクロール、シクロベンダゾール、ジエチルカルバマジン等を包含する。
【０１４３】
適当な活性剤は、限定しないが例えば、抗マラリア剤、例えば：アセダプソン、アモジアキン、アルテエーテル、アルテメーテル、アルテミシニン、アルテスネート、アトバクオン、ベベエルリン、ベルベリン、キラータ、クロルグアニド、クロロキン、クロルプロガウニル、シンコーナ、シンコニジン、シンコニン、シクログアニル、ゲンチオピクリン、ハロファントリン、ヒドロキシクロロキン、塩酸メフロキン、３−メチルアルサセチン、パマキン、プラスモシド、プリマキン、ピリメタミン、キナクリン、キニジン、キニン、キノシド、キノリン、２塩基性ヒ酸ナトリウムを包含する。
【０１４４】
適当な活性剤は、限定しないが例えば、抗原虫剤、例えば：アクラニル、チニダゾール、イプロニダゾール、エチルスチバミン、ペンタミジン、アセトアルソン、アミニトロゾール、アニソマイシン、ニフラテル、チニダゾール、ベンジダゾール、スラミン等を包含する。
【０１４５】
活性剤としての使用のための適当な薬物はＧｏｏｄｍａｎおよびＧｉｌｍａｎのＴｈｅ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｂａｓｉｓ  ｏｆ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ（第９版）（Ｇｏｏｄｍａｎ等編）（ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ）（１９９６）；および１９９９  Ｐｈｙｓｉｃｉａｎ’ｓ  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ（１９９８）に記載されている。
【０１４６】
適当な活性剤は、限定しないが例えば、米国特許５，８８０，１６１、５，８７７，２０６、５，７８６，３４４、５，７６０，０４１、５，７５３，６６８、５，６９８，５２９、５，６８４，００４、５，６６５，７１５、５，６５４，４８４、５，６２４，９２４、５，６１８，８１３、５，６１０，２９２、５，５９７，８３１、５，５３０，０２６、５，５２５，６３３、５，５２５，６０６、５，５１２，６７８、５，５０８，２７７、５，４６３，１８１、５，４０９，８９３、５，３５８，９５２、５，３１８，９６５、５，２２３，５０３、５，２１４，０６８、５，１９６，４２４、５，１０９，０２４、５，１０６，９９６、５，１０１，０７２、５，０７７，４０４、５，０７１，８４８、５，０６６，４９３、５，０１９，３９０、４，９９６，２２９、４，９９６，２０６、４，９７０，３１８、４，９６８，８００、４，９６２，１１４、４，９２７，８２８、４，８９２，８８７、４，８８９，８５９、４，８８６，７９０、４，８８２，３３４、４，８８２，３３３、４，８７１，７４６、４，８６３，９５５、４，８４９，５６３、４，８４５，２１６、４，８３３，１４５、４，８２４，９５５、４，７８５，０８５、４，６８４，７４７、４，６１８，６８５、４，６１１，０６６、４，５５０，１８７、４，５５０，１８６、４，５４４，５０１、４，５４１，９５６、４，５３２，３２７、４，４９０，５４０、４，３９９，２８３、４，３９１，９８２、４，３８３，９９４、４，２９４，７６３、４，２８３，３９４、４，２４６，４１１、４，２１４，０８９、４，１５０，２３１、４，１４７，７９８、４，０５６，６７３、４，０２９，６６１、４，０１２，４４８に開示されている抗新生物剤：
米国特許５，１９２，７９９、５，０３６，０７０、４，７７８，８００、４，７５３，９５１、４，５９０，１８０、４，６９０，９３０、４，６４５，７７３、４，４２７，６９４、４，４２４，２０２、４，４４０，７８１、５，６８６，４８２、５，４７８，８２８、５，４６１，０６２、５，３８７，５９３、５，３８７，５８６、５，２５６，６６４、５，１９２，７９９、５，１２０，７３３、５，０３６，０７０、４，９７７，１６７、４，９０４，６６３、４，７８８，１８８、４，７７８，８００、４，７５３，９５１、４，６９０，９３０、４，６４５，７７３、４，６３１，２８５、４，６１７，３１４、４，６１３，６００、４，５９０，１８０、４，５６０，６８４、４，５４８，９３８、４，５２９，７２７、４，４５９，３０６、４，４４３，４５１、４，４４０，７８１、４，４２７，６９４、４，４２４，２０２、４，３９７，８５３、４，３５８，４５１、４，３２４，７８７、４，３１４，０８１、４，３１３，８９６、４，２９４，８２８、４，２７７，４７６、４，２６７，３２８、４，２６４，４９９、４，２３１，９３０、４，１９４，００９、４，１８８，３８８、４，１４８，７９６、４，１２８，７１７、４，０６２，８５８、４，０３１，２２６、４，０２０，０７２、４，０１８，８９５、４，０１８，７７９、４，０１３，６７２、３，９９４，８９８、３，９６８，１２５、３，９３９，１５２、３，９２８，３５６、３，８８０，８３４、３，６６８，２１０に開示されている精神薬理学的／向精神剤；
米国特許４，９６６，９６７、５，６６１，１２９、５，５５２，４１１、５，３３２，７３７、５，３８９，６７５、５，１９８，４４９、５，０７９，２４７、４，９６６，９６７、４，８７４，７６０、４，９５４，５２６、５，０５１，４２３、４，８８８，３３５、４，８５３，３９１、４，９０６，６３４、４，７７５，７５７、４，７２７，０７２、４，５４２，１６０、４，５２２，９４９、４，５２４，１５１、４，５２５，４７９、４，４７４，８０４、４，５２０，０２６、４，５２０，０２６、５，８６９，４７８、５，８５９，２３９、５，８３７，７０２、５，８０７，８８９、５，７３１，３２２、５，７２６，１７１、５，７２３，４５７、５，７０５，５２３、５，６９６，１１１、５，６９１，３３２、５，６７９，６７２、５，６６１，１２９、５，６５４，２９４、５，６４６，２７６、５，６３７，５８６、５，６３１，２５１、５，６１２，３７０、５，６１２，３２３、５，５７４，０３７、５，５６３，１７０、５，５５２，４１１、５，５５２，３９７、５，５４７，９６６、５，４８２，９２５、５，４５７，１１８、５，４１４，０１７、５，４１４，０１３、５，４０１，７５８、５，３９３，７７１、５，３６２，９０２、５，３３２，７３７、５，３１０，７３１、５，２６０，４４４、５，２２３，５１６、５，２１７，９５８、５，２０８，２４５、５，２０２，３３０、５，１９８，４４９、５，１８９，０３６、５，１８５，３６２、５，１４０，０３１、５，１２８，３４９、５，１１６，８６１、５，０７９，２４７、５，０７０，０９９、５，０６１，８１３、５，０５５，４６６、５，０５１，４２３、５，０３６，０６５、５，０２６，７１２、５，０１１，９３１、５，００６，５４２、４，９８１，８４３、４，９７７，１４４、４，９７１，９８４、４，９６６，９６７、４，９５９，３８３、４，９５４，５２６、４，９５２，６９２、４，９３９，１３７、４，９０６，６３４、４，８８９，８６６、４，８８８，３３５、４，８８３，８７２、４，８８３，８１１、４，８４７，３７９、４，８３５，１５７、４，８２４，８３１、４，７８０，５３８、４，７７５，７５７、４，７７４，２３９、４，７７１，０４７、４，７６９，３７１、４，７６７，７５６、４，７６２，８３７、４，７５３，９４６、４，７５２，６１６、４，７４９，７１５、４，７３８，９７８、４，７３５，９６２、４，７３４，４２６、４，７３４，４２５、４，７３４，４２４、４，７３０，０５２、４，７２７，０７２、４，７２１，７９６、４，７０７，５５０、４，７０４，３８２、４，７０３，１２０、４，６８１，９７０、４，６８１，８８２、４，６７０，５６０、４，６７０，４５３、４，６６８，７８７、４，６６３，３３７、４，６６３，３３６、４，６６１，５０６、４，６５６，２６７、４，６５６，１８５、４，６５４，３５７、４，６５４，３５６、４，６５４，３５５、４，６５４，３３５、４，６５２，５７８、４，６５２，５７６、４，６５０，８７４、４，６５０，７９７、４，６４９，１３９、４，６４７，５８５、４，６４７，５７３、４，６４７，５６５、４，６４７，５６１、４，６４５，８３６、４，６３９，４６１、４，６３８，０１２、４，６３８，０１１、４，６３２，９３１、４，６３１，２８３、４，６２８，０９５、４，６２６，５４８、４，６１４，８２５、４，６１１，００７、４，６１１，００６、４，６１１，００５、４，６０９，６７１、４，６０８，３８６、４，６０７，０４９、４，６０７，０４８、４，５９５，６９２、４，５９３，０４２、４，５９３，０２９、４，５９１，６０３、４，５８８，７４３、４，５８８，７４２、４，５８８，７４１、４，５８２，８５４、４，５７５，５１２、４，５６８，７６２、４，５６０，６９８、４，５５６，７３９、４，５５６，６７５、４，５５５，５７１、４，５５５，５７０、４，５５５，５２３、４，５５０，１２０、４，５４２，１６０、４，５４２，１５７、４，５４２，１５６、４，５４２，１５５、４，５４２，１５１、４，５３７，９８１、４，５３７，９０４、４，５３６，５１４、４，５３６，５１３、４，５３３，６７３、４，５２６，９０１、４，５２６，９００、４，５２５，４７９、４，５２４，１５１、４，５２２，９４９、４，５２１，５３９、４，５２０，０２６、４，５１７，１８８、４，４８２，５６２、４，４７４，８０４、４，４７４，８０３、４，４７２，４１１、４，４６６，９７９、４，４６３，０１５、４，４５６，６１７、４，４５６，６１６、４，４５６，６１５、４，４１８，０７６、４，４１６，８９６、４，２５２，８１５、４，２２０，５９４、４，１９０，５８７、４，１７７，２８０、４，１６４，５８６、４，１５１，２９７、４，１４５，４４３、４，１４３，０５４、４，１２３，５５０、４，０８３，９６８、４，０７６，８３４、４，０６４，２５９、４，０６４，２５８、４，０６４，２５７、４，０５８，６２０、４，００１，４２１、３，９９３，６３９、３，９９１，０５７、３，９８２，０１０、３，９８０，６５２、３，９６８，１１７、３，９５９，２９６、３，９５１，９５０、３，９３３，８３４、３，９２５，３６９、３，９２３，８１８、３，８９８，２１０、３，８９７，４４２、３，８９７，４４１、３，８８６，１５７、３，８８３，５４０、３，８７３，７１５、３，８６７，３８３、３，８７３，７１５、３，８６７，３８３、３，６９１，２１６、３，６２４，１２６に開示されている心臓血管剤；
米国特許５，９０２，５９４、５，８７４，４７６、５，８７４，４３６、５，８５９，０２７、５，８５６，３２０、５，８５４，２４２、５，８１１，０９１、５，７８６，３５０、５，７８３，１７７、５，７７３，４６９、５，７６２，９１９、５，７５３，７１５、５，７４１，５２６、５，７０９，８７０、５，７０７，９９０、５，６９６，１１７、５，６８４，０４２、５，６８３，７０９、５，６５６，５９１、５，６４３，９７１、５，６４３，９５０、５，６１０，１９６、５，６０８，０５６、５，６０４，２６２、５，５９５，７４２、５，５７６，３４１、５，５５４，３７３、５，５４１，２３３、５，５３４，５４６、５，５３４，５０８、５，５１４，７１５、５，５０８，４１７、５，４６４，８３２、５，４２８，０７３、５，４２８，０１６、５，４２４，３９６、５，３９９，５５３、５，３９１，５４４、５，３８５，９０２、５，３５９，０６６、５，３５６，８０３、５，３５４，８６２、５，３４６，９１３、５，３０２，５９２、５，２８８，６９３、５，２６６，５６７、５，２５４，６８５、５，２５２，７４５、５，２０９，９３０、５，１９６，４４１、５，１９０，９６１、５，１７５，１６０、５，１５７，０５１、５，０９６，７００、５，０９３，３４２、５，０８９，２５１、５，０７３，５７０、５，０６１，７０２、５，０３７，８０９、５，０３６，０７７、５，０１０，１０９、４，９７０，２２６、４，９１６，１５６、４，８８８，４３４、４，８７０，０９３、４，８５５，３１８、４，７８４，９９１、４，７４６，５０４、４，６８６，２２１、４，５９９，２２８、４，５５２，８８２、４，４９２，７００、４，４８９，０９８、４，４８９，０８５、４，４８７，７７６、４，４７９，９５３、４，４７７，４４８、４，４７４，８０７、４，４７０，９９４、４，３７０，４８４、４，３３７，１９９、４，３１１，７０９、４，３０８，２８３、４，３０４，９１０、４，２６０，６３４、４，２３３，３１１、４，２１５，１３１、４，１６６，１２２、４，１４１，９８１、４，１３０，６６４、４，０８９，９７７、４，０８９，９００、４，０６９，３４１、４，０５５，６５５、４，０４９，６６５、４，０４４，１３９、４，００２，７７５、３，９９１，２０１、３，９６６，９６８、３，９５４，８６８、３，９３６，３９３、３，９１７，４７６、３，９１５，８８９、３，８６７，５４８、３，８６５，７４８、３，８６７，５４８、３，８６５，７４８、３，７８３，１６０、３，７６４，６７６、３，７６４，６７７に開示されている抗微生物剤；
米国特許５，８７２，１０９、５，８３７，７３５、５，８２７，８３７、５，８２１，２５０、５，８１４，６４８、５，７８０，０２６、５，７７６，９４６、５，７６０，００２、５，７５０，５４３、５，７４１，７９８、５，７３９，２７９、５，７３３，９３９、５，７２３，４８１、５，７１６，９６７、５，６８８，９４９、５，６８６，４８８、５，６８６，４７１、５，６８６，４３４、５，６８４，２０４、５，６８４，０４１、５，６８４，０３１、５，６８４，００２、５，６７７，３１８、５，６７４，８９１、５，６７２，６２０、５，６６５，７５２、５，６５６，６６１、５，６３５，５１６、５，６３１，２８３、５，６２２，９４８、５，６１８，８３５、５，６０７，９５９、５，５９３，９８０、５，５９３，９６０、５，５８０，８８８、５，５５２，４２４、５，５５２，４２２、５，５１６，７６４、５，５１０，３６１、５，５０８，０２６、５，５００，４１７、５，４９８，４０５、５，４９４，９２７、５，４７６，８７６、５，４７２，９７３、５，４７０，８８５、５，４７０，８４２、５，４６４，８５６、５，４６４，８４９、５，４６２，９５２、５，４５９，１５１、５，４５１，６８６、５，４４４，０４３、５，４３６，２６５、５，４３２，１８１、ＲＥ０３４９１８、５，３９３，７５６、５，３８０，７３８、５，３７６，６７０、５，３６０，８１１、５，３５４，７６８、５，３４８，９５７、５，３４７，０２９、５，３４０，８１５、５，３３８，７５３、５，３２４，６４８、５，３１９，０９９、５，３１８，９７１、５，３１２，８２１、５，３０２，５９７、５，２９８，６３３、５，２９８，５２２、５，２９８，４９８、５，２９０，８００、５，２９０，７８８、５，２８４，９４９、５，２８０，０４５、５，２７０，３１９、５，２６６，５６２、５，２５６，６８０、５，２５０，７００、５，２５０，５５２、５，２４８，６８２、５，２４４，９１７、５，２４０，９２９、５，２３４，９３９、５，２３４，９３７、５，２３２，９３９、５，２２５，５７１、５，２２５，４１８、５，２２０，０２５、５，２１２，１８９、５，２１２，１７２、５，２０８，２５０、５，２０４，３６５、５，２０２，３５０、５，１９６，４３１、５，１９１，０８４、５，１８７，１７５、５，１８５，３２６、５，１８３，９０６、５，１７７，０７９、５，１７１，８６４、５，１６９，９６３、５，１５５，１２２、５，１４３，９２９、５，１４３，９２８、５，１４３，９２７、５，１２４，４５５、５，１２４，３４７、５，１１４，９５８、５，１１２，８４６、５，１０４，６５６、５，０９８，６１３、５，０９５，０３７、５，０９５，０１９、５，０８６，０６４、５，０８１，２６１、５，０８１，１４７、５，０８１，１２６、５，０７５，３３０、５，０６６，６６８、５，０５９，６０２、５，０４３，４５７、５，０３７，８３５、５，０３７，８１１、５，０３６，０８８、５，０１３，８５０、５，０１３，７５１、５，０１３，７３６、５，００６，５４２、４，９９２，４４８、４，９９２，４４７、４，９８８，７３３、４，９８８，７２８、４，９８１，８６５、４，９６２，１１９、４，９５９，３７８、４，９５４，５１９、４，９４５，０９９、４，９４２，２３６、４，９３１，４５７、４，９２７，８３５、４，９１２，２４８、４，９１０，１９２、４，９０４，７８６、４，９０４，６８５、４，９０４，６７４、４，９０４，６７１、４，８９７，３９７、４，８９５，９５３、４，８９１，３７０、４，８７０，２１０、４，８５９，６８６、４，８５７，６４４、４，８５３，３９２、４，８５１，４１２、４，８４７，３０３、４，８４７，２９０、４，８４５，２４２、４，８３５，１６６、４，８２６，９９０、４，８０３，２１６、４，８０１，５９８、４，７９１，１２９、４，７８８，２０５、４，７７８，８１８、４，７７５，６７９、４，７７２，７０３、４，７６７，７７６、４，７６４，５２５、４，７６０，０５１、４，７４８，１５３、４，７２５，６１６、４，７２１，７１２、４，７１３，３９３、４，７０８，９６６、４，６９５，５７１、４，６８６，２３５、４，６８６，２２４、４，６８０，２９８、４，６７８，８０２、４，６５２，５６４、４，６４４，００５、４，６３２，９２３、４，６２９，７９３、４，６１４，７４１、４，５９９，３６０、４，５９６，８２８、４，５９５，６９４、４，５９５，６８６、４，５９４，３５７、４，５８５，７５５、４，５７９，８６６、４，５７８，３９０、４，５６９，９４２、４，５６７，２０１、４，５６３，４７６、４，５５９，３４８、４，５５８，０６７、４，５５６，６７２、４，５５６，６６９、４，５３９，３２６、４，５３７，９０３、４，５３６，５０３、４，５１８，６０８、４，５１４，４１５、４，５１２，９９０、４，５０１，７５５、４，４９５，１９７、４，４９３，８３９、４，４６５，６８７、４，４４０，７７９、４，４４０，７６３、４，４３５，４２０、４，４１２，９９５、４，４００，５３４、４，３５５，０３４、４，３３５，１４１、４，３２２，４２０、４，２７５，０６４、４，２４４，９６３、４，２３５，９０８、４，２３４，５９３、４，２２６，８８７、４，２０１，７７８、４，１８１，７２０、４，１７３，６５０、４，１７３，６３４、４，１４５，４４４、４，１２８，６６４、４，１２５，６１２、４，１２４，７２６、４，１２４，７０７、４，１１７，１３５、４，０２７，０３１、４，０２４，２８４、４，０２１，５５３、４，０２１，５５０、４，０１８，９２３、４，０１２，５２７、４，０１１，３２６、３，９９８，９７０、３，９９８，９５４、３，９９３，７６３、３，９９１，２１２、３，９８４，４０５、３，９７８，２２７、３，９７８，２１９、３，９７８，２０２、３，９７５，５４３、３，９６８，２２４、３，９５９，３６８、３，９４９，０８２、３，９４９，０８１、３，９４７，４７５、３，９３６，４５０、３，９３４，０１８、３，９３０，００５、３，８５７，９５５、３，８５６，９６２、３，８２１，３７７、３，８２１，４０１、３，７８９，１２１、３，７８９，１２３、３，７２６，９７８、３，６９４，４７１、３，６９１，２１４、３，６７８，１６９、３，６２４，２１６に開示されている抗炎症剤；
米国特許４，４５０，１５９、４，４５０，１５９、５，９０５，０８５、５，８８３，１１９、５，８８０，２８０、５，８７７，１８４、５，８７４，５９４、５，８４３，４５２、５，８１７，６７２、５，８１７，６６１、５，８１７，６６０、５，８０１，１９３、５，７７６，９７４、５，７６３，４７８、５，７３９，１６９、５，７２３，４６６、５，７１９，１７６、５，６９６，１５６、５，６９５，７５３、５，６９３，６４８、５，６９３，６４５、５，６９１，３４６、５，６８６，４６９、５，６８６，４２４、５，６７９，７０５、５，６７９，６４０、５，６７０，５０４、５，６６５，７７４、５，６６５，７７２、５，６４８，３７６、５，６３９，４５５、５，６３３，２７７、５，６２４，９３０、５，６２２，９７０、５，６０５，９０３、５，６０４，２２９、５，５７４，０４１、５，５６５，５６０、５，５５０，２３３、５，５４５，７３４、５，５４０，９３１、５，５３２，２４８、５，５２７，８２０、５，５１６，７９７、５，５１４，６８８、５，５１２，６８７、５，５０６，２３３、５，５０６，２２８、５，４９４，８９５、５，４８４，７８８、５，４７０，８５７、５，４６４，６１５、５，４３２，１８３、５，４３１，８９６、５，３８５，９１８、５，３４９，０６１、５，３４４，９２５、５，３３０，９９３、５，３０８，８３７、５，２９０，７８３、５，２９０，７７２、５，２８４，８７７、５，２８４，８４０、５，２７３，９７９、５，２６２，５３３、５，２６０，３００、５，２５２，７３２、５，２５０，６７８、５，２４７，０７６、５，２４４，８９６、５，２３８，６８９、５，２１９，８８４、５，２０８，２４１、５，２０８，２２８、５，２０２，３３２、５，１９２，７７３、５，１８９，０４２、５，１６９，８５１、５，１６２，３３４、５，１５１，４１３、５，１４９，７０１、５，１４７，８７７、５，１４３，９１８、５，１３８，０５１、５，０９３，３３８、５，０９１，３８９、５，０６８，３２３、５，０６８，２４７、５，０６４，８３５、５，０６１，７２８、５，０５５，２９０、４，９８１，７９２、４，８１０，６９２、４，４１０，６９６、４，３４６，０９６、４，３４２，７６９、４，３１７，８２５、４，２５６，７６６、４，１８０，５８８、４，０００，２７５、３，７５９，９２１に開示されている免疫阻害剤；
米国特許４，４４６，１２８、４，５２４，１４７、４，７２０，４８４、４，７２２，８９９、４，７４８，０１８、４，８７７，６１９、４，９９８，９３１、５，０４９，３８７、５，１１８，５０９、５，１５２，９８０、５，２５６，４１６、５，４６８，７２９、５，５８３，１３９、５，６０４，２３４、５，６１２，０６０、５，６１２，３５０、５，６５８，５６４、５，６７２，６０５、５，６８１，５７１、５，７０８，００２、５，７２３，７１８、５，７３６，１４３、５，７４４，４９５、５，７５３，６８７、５，７７０，２０１、５，８６９，０５７、５，８９１，６５３、５，９３９，４５５、５，９４８，４０７、６，００６，７５２、６，０２４，９５７、６，０３０，６２４、６，０３７，３７２、６，０３７，３７３、６，０４３，２４７、６，０６０，０４９、６，０８７，０９６、６，０９６，３１５、６，０９９，８３８、６，１０３，２３５、６，１２４，４９５、６，１５３，２０３、６，１６９，０８７、６，２５５，２７８、６，２６２，０４４、６，２９０，９５０、６，３０６，６５１、６，３２２，７９６、６，３２９，１５３、６，３４４，４７６、６，３５２，６９８、６，３６５，１６３、６，３７９，６６８、６，３９１，３０３、６，３９５，７６７、６，４０３，５５５、６，４１０，５５６、６，４１２，４９２、６，４６８，５３７、６，４８９，３３０、６，５２１，２３２、６，５２５，０３５、６，５２５，２４２、６，５５８，６６３、６，５７２，８６０に開示されている免疫調節剤；
米国特許５，２９２，７３６、５，６８８，８２５、５，５５４，７８９、５，４５５，２３０、５，２９２，７３６、５，２９８，５２２、５，２１６，１６５、５，４３８，０６４、５，２０４，３６５、５，０１７，５７８、４，９０６，６５５、４，９０６，６５５、４，９９４，４５０、４，７４９，７９２、４，９８０，３６５、４，７９４，１１０、４，６７０，５４１、４，７３７，４９３、４，６２２，３２６、４，５３６，５１２、４，７１９，２３１、４，５３３，６７１、４，５５２，８６６、４，５３９，３１２、４，５６９，９４２、４，６８１，８７９、４，５１１，７２４、４，５５６，６７２、４，７２１，７１２、４，４７４，８０６、４，５９５，６８６、４，４４０，７７９、４，４３４，１７５、４，６０８，３７４、４，３９５，４０２、４，４００，５３４、４，３７４，１３９、４，３６１，５８３、４，２５２，８１６、４，２５１，５３０、５，８７４，４５９、５，６８８，８２５、５，５５４，７８９、５，４５５，２３０、５，４３８，０６４、５，２９８，５２２、５，２１６，１６５、５，２０４，３６５、５，０３０，６３９、５，０１７，５７８、５，００８，２６４、４，９９４，４５０、４，９８０，３６５、４，９０６，６５５、４，８４７，２９０、４，８４４，９０７、４，７９４，１１０、４，７９１，１２９、４，７７４，２５６、４，７４９，７９２、４，７３７，４９３、４，７２１，７１２、４，７１９，２３１、４，６８１，８７９、４，６７０，５４１、４，６６７，０３９、４，６５８，０３７、４，６３４，７０８、４，６２３，６４８、４，６２２，３２６、４，６０８，３７４、４，５９５，６８６、４，５９４，１８８、４，５６９，９４２、４，５５６，６７２、４，５５２，８６６、４，５３９，３１２、４，５３６，５１２、４，５３３，６７１、４，５１１，７２４、４，４４０，７７９、４，４３４，１７５、４，４００，５３４、４，３９５，４０２、４，３９１，８２７、４，３７４，１３９、４，３６１，５８３、４，３２２，４２０、４，３０６，０９７、４，２５２，８１６、４，２５１，５３０、４，２４４，９５５、４，２３２，０１８、４，２０９，５２０、４，１６４，５１４、４，１４７，８７２、４，１３３，８１９、４，１２４，７１３、４，１１７，０１２、４，０６４，２７２、４，０２２，８３６、３，９６６，９４４に開示されている鎮痛剤；
米国特許５，２１９，８７２、５，２１９，８７３、５，０７３，５６０、５，０７３，５６０、５，３４６，９１１、５，４２４，３０１、５，０７３，５６０、５，２１９，８７２、４，９００，７４８、４，７８６，６４８、４，７９８，８４１、４，７８２，０７１、４，７１０，５０８、５，４８２，９３８、５，４６４，８４２、５，３７８，７２３、５，３４６，９１１、５，３１８，９７８、５，２１９，８７３、５，２１９，８７２、５，０８４，２８１、５，０７３，５６０、５，００２，９５５、４，９８８，７１０、４，９００，７４８、４，７９８，８４１、４，７８６，６４８、４，７８２，０７１、４，７４５，１２３、４，７１０，５０８に開示されているコリン作用剤；
米国特許５，０９１，５２８、５，０９１，５２８、４，８３５，１５７、５，７０８，０１５、５，５９４，０２７、５，５８０，８９２、５，５７６，３３２、５，５１０，３７６、５，４８２，９６１、５，３３４，６０１、５，２０２，３４７、５，１３５，９２６、５，１１６，８６７、５，０９１，５２８、５，０１７，６１８、４，８３５，１５７、４，８２９，０８６、４，５７９，８６７、４，５６８，６７９、４，４６９，６９０、４，３９５，５５９、４，３８１，３０９、４，３６３，８０８、４，３４３，８００、４，３２９，２８９、４，３１４，９４３、４，３１１，７０８、４，３０４，７２１、４，２９６，１１７、４，２８５，８７３、４，２８１，１８９、４，２７８，６０８、４，２４７，７１０、４，１４５，５５０、４，１４５，４２５、４，１３９，５３５、４，０８２，８４３、４，０１１，３２１、４，００１，４２１、３，９８２，０１０、３，９４０，４０７、３，８５２，４６８、３，８３２，４７０に開示されているアドレナリン作用剤；
米国特許５，８７４，４７９、５，８６３，９３８、５，８５６，３６４、５，７７０，６１２、５，７０２，６８８、５，６７４，９１２、５，６６３，２０８、５，６５８，９５７、５，６５２，２７４、５，６４８，３８０、５，６４６，１９０、５，６４１，８１４、５，６３３，２８５、５，６１４，５６１、５，６０２，１８３、４，９２３，８９２、４，７８２，０５８、４，３９３，２１０、４，１８０，５８３、３，９６５，２５７、３，９４６，０２２、３，９３１，１９７に開示されている抗ヒスタミン剤；
米国特許５，８６３，５３８、５，８５５，９０７、５，８５５，８６６、５，７８０，５９２、５，７７６，４２７、５，６５１，９８７、５，３４６，８８７、５，２５６，４０８、５，２５２，３１９、５，２０９，９２６、４，９９６，３３５、４，９２７，８０７、４，９１０，１９２、４，７１０，４９５、４，０４９，８０５、４，００４，００５、３，６７０，０７９、３，６０８，０７６、５，８９２，０２８、５，８８８，９９５、５，８８３，０８７、５，８８０，１１５、５，８６９，４７５、５，８６６，５５８、５，８６１，３９０、５，８６１，３８８、５，８５４，２３５、５，８３７，６９８、５，８３４，４５２、５，８３０，８８６、５，７９２，７５８、５，７９２，７５７、５，７６３，３６１、５，７４４，４６２、５，７４１，７８７、５，７４１，７８６、５，７３３，８９９、５，７３１，３４５、５，７２３，６３８、５，７２１，２２６、５，７１２，２６４、５，７１２，２６３、５，７１０，１４４、５，７０７，９８４、５，７０５，４９４、５，７００，７９３、５，６９８，７２０、５，６９８，５４５、５，６９６，１０６、５，６７７，２９３、５，６７４，８６１、５，６６１，１４１、５，６５６，６２１、５，６４６，１３６、５，６３７，６９１、５，６１６，５７４、５，６１４，５１４、５，６０４，２１５、５，６０４，２１３、５，５９９，８０７、５，５８５，４８２、５，５６５，５８８、５，５６３，２５９、５，５６３，１３１、５，５６１，１２４、５，５５６，８４５、５，５４７，９４９、５，５３６，７１４、５，５２７，８０６、５，５０６，３５４、５，５０６，２２１、５，４９４，９０７、５，４９１，１３６、５，４７８，９５６、５，４２６，１７９、５，４２２，２６２、５，３９１，７７６、５，３８２，６６１、５，３８０，８４１、５，３８０，８４０、５，３８０，８３９、５，３７３，０９５、５，３７１，０７８、５，３５２，８０９、５，３４４，８２７、５，３４４，８２６、５，３３８，８３７、５，３３６，６８６、５，２９２，９０６、５，２９２，８７８、５，２８１，５８７、５，２７２，１４０、５，２４４，８８６、５，２３６，９１２、５，２３２，９１５、５，２１９，８７９、５，２１８，１０９、５，２１５，９７２、５，２１２，１６６、５，２０６，４１５、５，１９４，６０２、５，１６６，２０１、５，１６６，０５５、５，１２６，４８８、５，１１６，８２９、５，１０８，９９６、５，０９９，０３７、５，０９６，８９２、５，０９３，５０２、５，０８６，０４７、５，０８４，４５０、５，０８２，８３５、５，０８１，１１４、５，０５３，４０４、５，０４１，４３３、５，０４１，４３２、５，０３４，５４８、５，０３２，５８６、５，０２６，８８２、４，９９６，３３５、４，９７５，５３７、４，９７０，２０５、４，９５４，４４６、４，９５０，４２８、４，９４６，８３４、４，９３７，２３７、４，９２１，８４６、４，９２０，０９９、４，９１０，２２６、４，９００，７２５、４，８９２，８６７、４，８８８，３３６、４，８８５，２８０、４，８８２，３２２、４，８８２，３１９、４，８８２，３１５、４，８７４，８５５、４，８６８，１６７、４，８６５，７６７、４，８６１，８７５、４，８６１，７６５、４，８６１，７６３、４，８４７，０１４、４，７７４，２３６、４，７５３，９３２、４，７１１，８５６、４，７１０，４９５、４，７０１，４５０、４，７０１，４４９、４，６８９，４１０、４，６８０，２９０、４，６７０，５５１、４，６６４，８５０、４，６５９，５１６、４，６４７，４１０、４，６３４，６９５、４，６３４，６９３、４，５８８，５３０、４，５６７，０００、４，５６０，５５７、４，５５８，０４１、４，５５２，８７１、４，５５２，８６８、４，５４１，９５６、４，５１９，９４６、４，５１５，７８７、４，５１２，９８６、４，５０２，９８９、４，４９５，１０２に開示されているステロイド剤；
を包含し；上記すべての開示内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【０１４７】
コンジュゲートの薬物部分は、全薬物、または目的の標的に対するその親和性および特異性を保持しつつベクター蛋白リガンドまたはリンカーへの共有結合のための連結部位を有しているその結合フラグメントまたは部分であってよい。そのような薬物のコンジュゲートは薬物そのものと同じ障害、疾患、および適応症に対して使用してよい。
【０１４８】
ｉｉｉ．好ましい癌化学療法活性剤
本発明の環状ＲＡＰペプチドコンジュゲートにおける使用のための好ましい癌化学療法剤は、遊離の形態であるか、または遊離の形態でそのような腫瘍に対してそのように有用でない場合は環状ＲＡＰペプチドに連結された場合に有用となる、脳の内部または周囲における脳腫瘍または他の新生物を治療する場合に有用となり得る全ての薬物を包含する。そのような化学療法剤は好ましくは細胞毒性の化学療法剤、限定しないが例えばアドリアマイシン（ドキソルビシンとしても知られている）、シスプラチン、パクリタキセル、その類縁体、およびエクスビボおよびインビボで腫瘍に対して活性を示す他の化学療法剤を包含する。そのような化学療法剤は又、アルキル化剤、代謝拮抗剤、天然産物（例えばビンカアルカロイド、エピドフィロトキシン、抗生物質、酵素および生物学的応答モディファイアー）、トポイソメラーゼ阻害剤、微小管阻害剤、紡錘糸毒、ホルモンおよび拮抗剤、およびその他の剤、例えば白金配位複合体、アントラセンジオン、置換尿素等を包含する。他の化学療法剤は当業者の知る通りである。
【０１４９】
癌または新生物を治療する場合に有用な細胞毒性の放射性同位体、例えば限定しないが１３１Ｉ（ヨウ素）、１２５Ｉ、１１１Ｉｎ（インジウム）、９０Ｙ（イットリウム）、６７Ｃｕ（銅）、１２７Ｌｕ（ルテチウム）、２１２Ｂｉ（ビスマス）、２１３Ｂｉ、２５５Ｆｍ（フェルミウム）、１４９Ｔｂ（テルビウム）、２２３Ｒｄ（ラジウム）、２１３Ｐｂ（鉛）、２１２Ｐｂ、２１１Ａｔ（アスタチン）、８９Ｓｒ（ストロンチウム）、１５３Ｓｍ（サマリウム）、１６６Ｈｏ（ホルミウム）、２２５Ａｃ（アクチニウム）、１８６Ｒｅ（レニウム）、６７Ｇａ（ガリウム）、６８Ｇａおよび９９ｍＴｃ（テクネチウム）を本発明のＲＡＰ環状ペプチドにコンジュゲートしてよい。放射性同位体をポリペプチドに連結する場合は、そのような目的のために当該分野で知られた金属キレート形成剤、限定しないが例えば１，４，７，１０−テトラアザシクロ−１１ドデカン−Ｎ，Ｎ’，Ｎ’’，Ｎ’’’−４酢酸（ＤＯＴＡ）、１，４，８，１１−テトラアザシクロテトラデカンＮ，Ｎ’，Ｎ’’，Ｎ’’’−４酢酸（ＴＥＴＡ）、ジエチレントリアミンペンタアセテート（ＤＴＰＡ）、ジメルカプトコハク酸（ＤＭＳＡ）、テトラアザシクロトリデカン−Ｎ、Ｎ”、Ｎ”，Ｎ”’−４酢酸（ＴＲＩＴＡ）、および１，５，９，１３−テトラアザシクロヘキサデカン−Ｎ，Ｎ’，Ｎ”，Ｎ’”−４酢酸（ＨＥＴＡ）、ヒドロキシエチリデンジホスホネート（ＨＥＤＰ）、ＨＥＸＡ、およびエチレンジアミン４酢酸（ＥＤＴＡ）を用いてよく、これらはポリペプチド上への放射性同位体の「ローディング」を可能にする。
【０１５０】
好ましい化学療法剤は、遊離の形態においては所望の用量において許容できない全身毒性を呈するものである。そのような剤の治療レベルに関連する一般的な全身毒性は環状ＲＡＰペプチドへのそれらの連結により低減される。特に好ましいものは有用な治療薬であるが心臓毒性のために用量制限されている心臓毒性化合物である。古典的な例はアドリアマイシン（ドキソルビシンとしても知られている）およびその類縁体、例えばダウノルビシンである。そのような薬物に環状ＲＡＰペプチドを連結させることは、心臓における蓄積および関連する心臓毒性を低下させる。
【０１５１】
ｉｖ．グリココンジュゲート
グリココンジュゲートは炭水化物部分を包含する何れかの分子である。例としては、糖蛋白、オリゴ糖、糖脂質およびプロテオグリカンが包含されるが、これらに限定されない。そのような分子は治療薬の生体利用性の増強または病原性の機序をブロックする能力のような有益な機能を有する。例えば、アルファ−Ｌ−イズロニダーゼは、酵素に結合したオリゴマンノース７−ビスホスホネート決定基のために、身体全体に渡って効率的に分布するグリココンジュゲート（糖蛋白）である。ヘパリンスルフェートはヒトにおける凝固経路をブロッキングする場合に有用なプロテオグリカンの炭水化物部分である。治療活性を有するグリココンジュゲートへの適当な環状ＲＡＰペプチドの結合は、生体分布に影響することによりグリココンジュゲートの力価を増大させる手段を提供する場合がある。或いは、環状ＲＡＰペプチドグリココンジュゲート融合物は、特定の組織における受容体１つ以上の機能に直接影響する能力を有するビス特異的な受容体結合分子として機能するように操作されてよい。
【０１５２】
ｖ．ナノ粒子
ナノ粒子は生体分解性および非生体分解性の重合体から、または脂質のような他の物質から構築される巨大分子組立物である。そのような組立物は粒子内部の空洞内に治療分子を含有するように操作されてよい。この手段を介して、ナノ粒子は薬物の生体分布、薬物動態、免疫原性および力価を改変する手段を提供する。そして次に適当な環状ＲＡＰペプチドの結合が、これらの分子の組織分布の特異性を増大させる手段を提供する。
【０１５３】
Ｅ．環状ＲＡＰペプチドを製造する方法
ＲＡＰペプチドは好ましくは、当該分野で知られた何れかの方法を用いて形成できる共有結合の形成を介して環化する。一部の実施形態においては、共有結合はペプチドのＮ末端におけるアミノ酸とＣ末端におけるアミノ酸との間で形成される。一部の実施形態においては、共有結合は２つの末端アミノ酸の側鎖の間で形成される。他の実施形態においては、共有結合は１つの末端アミノ酸の側鎖と他の末端アミノ酸の末端基との間で、または各々の末端アミノ酸の末端基の間で形成される。例えばヘッドからテール、側鎖から側鎖、側鎖からヘッド、側鎖からテールの全てが可能である。
【０１５４】
天然に環化するＲＡＰペプチドは、２つのシステインを所望の位置に挿入し、そしてシステインにジスルフィド結合を自然に形成させることにより、容易に作成できる。グリシンまたはプロリンをシステインに対して内部に（例えば最もＮ末端側のシステインに対してＣ末端側に、そして最もＣ末端側のシステインに対してＮ末端側に）挿入することによりＲＡＰペプチドのネイティブの３次元構造の共有結合による構造的ひずみを最小限にすることができる。
【０１５５】
末端カルボキシル基への末端アミンのヘッドからテールへの環化カップリングは多くの方法を用いながら、例えばｐ−ニトロフェニルエスエル、アジド法、２，４，５−トリクロロフェニルおよびペンタフルオロフェニルエステル、混合無水物法、ＨＯＢｔまたはＨＯＮＳｕまたはＨｏＡｔまたはＨＡＴＵ、ＤＩＣ、ＤＣＣのような触媒の存在下のカルボジイミド、または樹脂上環化を用いながら実施できる。
【０１５６】
更に又、環状構造は、架橋形成基、ペプチドのアミノ酸残基の側鎖、またはペプチドの末端アミノ酸残基と形成することができる。架橋形成基はペプチドの２つの部分の環化を可能にする化学部分である。架橋形成基の非限定的な例は、アミド、チオエーテル、チオエステル、ジスルフィド、尿素、カーバメート、スルホンアミド等を包含する。そのような架橋形成基を有する単位の取り込みのための種々の方法が当該分野で知られている。例えば、ラクタム架橋（即ち環状アミド）は例えばリジンまたはオルニチンおよびグルタミン酸またはアスパラギン酸のアミンおよびカルボン酸を有するアミノ酸の側鎖を介して形成できる。チオエステルはＣ末端とＣｙｓ残基の側鎖との間で形成できる。或いは、チオエステルはチオールおよびカルボン酸を有するアミノ酸の側鎖の間で形成できる。
【０１５７】
或いは、交差結合はチオエーテル結合によりともに共有結合しているアラニン残基を連結するためにランチオニン（チオ−ジアラニン）残基を取り込むことにより形成できる。別の方法においては、交差結合剤、例えばジカルボン酸、例えばスベリン酸（オクタンジ酸）等が、遊離のアミノ、ヒドロキシル、チオール基およびこれらの組み合わせのようなアミノ酸側鎖の官能基２つの間に連結部を導入できる。
【０１５８】
酵素触媒環化も又使用できる。例えば、チロシジンシンターゼのチオエステラーゼドメインはチオエステル前駆体を環化するために、サブチリシン変異体はペプチドグリコレートフェニルアラニルアミドエステルを環化するために、そして抗体リガーゼ１６Ｇ３はｐ−ニトロフェニルエステルの環化を触媒するために使用できることが報告されている。ペプチド環化の考察については参照により全体が本明細書に組み込まれるＤａｖｉｅｓ，Ｊ．Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｃｉ．，９：４７１−５０１（２００３）を参照できる。
Ｆ．ＲＡＰペプチドの製造
ｉ．合成
本発明のペプチドは従来の手法に従って溶液相固相、または液相のペプチド合成手法により合成できる。種々の自動合成装置が市販されており、そして既知のプロトコルに従って使用できる。例えば、各々が参照により本明細書に組み込まれるＳｔｅｗａｒｔおよびＹｏｕｎｇ，Ｓｏｌｉｄ  Ｐｈａｓｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，第２版、Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏ．，（１９８４）；Ｔａｍ等、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．１０５：６４４２，１９８３；Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ，Ｓｃｉｅｎｃｅ２３２：３４１−３４７，１９８６；およびＢａｒａｎｙおよびＭｅｒｒｉｆｉｅｌｄ，Ｔｈｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅｓ，ＧｒｏｓｓおよびＭｅｉｅｎｈｏｆｅｒ編、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１  ２８４；Ｂａｒａｎｙ等、Ｉｎｔ．Ｊ．Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｒｅｓ．３０：７０５−７３９，１９８７；Ｂｏｄａｎｓｚｋｙ，Ｔｈｅ  Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ｏｆ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，第２版、Ｓｐｒｉｎｇｅｒ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９９３）；およびＭｏｌｉｎａ等、Ｐｅｐｔ．Ｒｅｓ．９：１５１−５，１９９６，米国特許５，４２４，３９８，およびＦｉｓｃｈｅｒ等、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ８：５２９−５４２，２００２を参照できる。
【０１５９】
例えば、溶液相手法、例えばアジド法、酸クロリド法、酸無水物法、混合無水物法、活性エステル法（例えばｐ−ニトロフェニルエステル、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル、またはシアノメチルエステル）、カルボジイミド法、酸化還元法、またはジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣＤ）／添加剤法を使用できる。
【０１６０】
固相ペプチド合成法は０．１〜１．０ｍＭｏｌアミン／ｇ重合体を含有するコポリ（スチレン−ジビニルベンゼン）を使用する。ペプチド合成のためのこれらの方法はアルファアミノ基のブチルオキシカルボニル（ｔ−ＢＯＣ）または９−フルオレニルメチルオキシカルボニル（ＦＭＯＣ）保護を使用する。両方の方法とも、ペプチドのＣ末端から開始される各工程において単一のアミノ酸が付加される段階的合成を行う（Ｃｏｌｉｇａｎ等、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ、Ｗｉｌｅｙ  Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，１９９１，Ｕｎｉｔ９参照）。化学合成の終了時に、ペプチドを脱保護することによりｔ−ＢＯＣまたはＦＭＯＣアミノ酸ブロッキング基を除去し、そして低下した温度における酸による処理（例えば０℃において約０．２５〜約１時間液体ＨＦ−１０％アニソール）により重合体から切断することができる。試薬を蒸発させた後、ペプチドを１％酢酸溶液を用いて重合体から抽出し、これを次に凍結乾燥して粗製の物質とする。粗製の物質は通常は溶媒として５％酢酸を用いたセファデックスＧ−１５上のゲル濾過のような手法により精製できる。カラムの適切な画分の凍結乾燥により得られる均質なペプチドまたはペプチド誘導体を、次に、アミノ酸分析、薄層クロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー、紫外線吸収スペクトル分析、モル旋光度、溶解度、および固相エドマン分解による定量のような標準的な手法により特性化できる。
【０１６１】
液相の手法では、伝統的な溶液と固相化学との間の複合型であるポリエチレングリコールに可逆的に連結されたポリペプチド鎖の合成による組み立てを行う。方法は固相ペプチド合成で一般的に使用されているＮ−フルオレニルメトキシカルボニル法および反復アミノ脱保護工程のための従来の有機塩基ピペリジンの代わりに使用されるフロリドイオンを使用しながら実施してよい。Ｆｉｓｃｈｅｒ等、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ８：５２９−５４２，２００２を参照できる。
【０１６２】
ｉｉ．宿主細胞
キメラ蛋白を製造するために使用する宿主細胞は、細菌、コウボ、昆虫、非哺乳類脊椎動物、または哺乳類の細胞であり；哺乳類の細胞は、限定しないが例えば、ハムスター、サル、チンパンジー、イヌ、ネコ、ウシ、ブタ、マウス、ラット、ウサギ、ヒツジおよびヒトの細胞を包含する。宿主細胞は不朽化された細胞（細胞系統）または非不朽化（霊長類または二次）細胞であることができ、そして広範な種類の細胞型、限定しないが例えば線維芽細胞、ケラチノサイト、上皮細胞（例えば乳腺上皮細胞、腸上皮細胞）、卵巣細胞（例えばチャイニーズハムスター卵巣即ちＣＨＯ細胞）、内皮細胞、神経膠細胞、ニューロン細胞、血液の形態を有する要素（例えばリンパ球、骨髄細胞）、筋肉細胞、肝細胞およびこれらの体性細胞型の前駆体の何れかであることができる。宿主細胞はＣＨＯ１３−５−１のようなＬＲＰを発現しないＣＨＯ細胞の変異体を包含できる（ＦｉｔｚＧｅｒａｌｄ等、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．，１２９（６）：１５３３−４１，１９９５）。
【０１６３】
キメラ蛋白をコードするＤＮＡまたはＲＮＡを含有し、そして発現する細胞は本明細書においては遺伝子的に修飾された細胞と称する。キメラ蛋白をコードするＤＮＡまたはＲＮＡを含有し、そして発現する哺乳類細胞は遺伝子的に修飾された哺乳類細胞と称する。細胞へのＤＮＡまたはＲＮＡの導入は知られたトランスフェクション法、例えばエレクトロポレーション、マイクロインジェクション、マイクロプロジェクタイルボンバードメント、リン酸カルシウム沈降、リン酸カルシウム沈降の変法、カチオン脂質処理、フォトポレーション、融合法、受容体媒介転移、またはポリブレン沈降による。或いは、ＤＮＡまたはＲＮＡはウィルスベクターを用いた感染により導入できる。キメラ蛋白をコードするＤＮＡまたはＲＮＡを発現する哺乳類細胞を包含する細胞を作成する方法は米国特許６，０４８，７２９、５，９９４，１２９、および６，０６３，６３０に記載されている。これらの出願の各々の教示内容は参照により全体が本明細書に明示的に組み込まれる。
【０１６４】
ｉｉｉ．核酸コンストラクト
キメラ蛋白を発現するために使用される核酸コンストラクトは、トランスフェクトされた哺乳類細胞中で染色体外（エピソーム）発現されるもの、または、レシピエント細胞のゲノム内に、ランダムに、または相同組み換えを介して予め選択されたターゲティング部位において、組み込まれるものであることができる。染色体外で発現されるコンストラクトは、キメラ蛋白コード配列に加えて、細胞内の蛋白の発現のため、そして場合によりコンストラクトの複製のためにも十分な配列を含む。これは典型的にはプロモーター、キメラ蛋白コードＤＮＡおよびポリアデニル化部位を包含する。キメラ蛋白をコードするＤＮＡは、コンストラクト内において、その発現がプロモーターの制御下となるように位置づける。或いは、コンストラクトは追加的な成分、例えば、以下のもの、即ち：スプライス部位、エンハンサー配列、適切なプロモーターの制御下の選択可能なマーカー遺伝子、および適切なプロモーターの制御下の増幅可能なマーカー遺伝子、の１つ以上を含有してよい。
【０１６５】
ＤＮＡコンストラクトが細胞のゲノム内に組み込まれるような実施形態においては、キメラ蛋白コード核酸配列のみを包含する必要がある。場合により、それはプロモーターおよびエンハンサー配列、ポリアデニル化部位、スプライス部位、選択可能なマーカーをコードする核酸配列、増幅可能なマーカーをコードする核酸配列および／またはゲノム内の選択された部位にＤＮＡの組み込みをターゲティング（ＤＮＡまたはＤＮＡ配列のターゲティング）するためのレシピエント細胞内のゲノムＤＮＡに相同なＤＮＡを包含できる。
【０１６６】
ｉｖ．細胞培養法
キメラ蛋白コードＤＮＡまたはＲＮＡを含有する哺乳類細胞は、細胞の生育およびＤＮＡまたはＲＮＡの発現のために適切である条件下に培養される。キメラ蛋白を発現する細胞は、知られた方法および本明細書に記載する方法を用いながら識別することができ、そしてキメラ蛋白は知られた方法および本明細書に記載する方法を用いながら単離および精製することができ；そしてその際、キメラ蛋白生産の増幅は行っても行わなくてもよい。識別は、例えばキメラ蛋白をコードするＤＮＡまたはＲＮＡの存在を示す表現型を示している遺伝子的に修飾された哺乳類細胞をスクリーニングすること、例えばＰＣＲスクリーニング、サザンブロット分析によるスクリーニング、またはキメラ蛋白の発現に関するスクリーニングを介して、行うことができる。取り込まれたキメラ蛋白コードＤＮＡを有する細胞の選択はＤＮＡコンストラクト中に選択可能なマーカーを包含させること、そして選択可能なマーカー遺伝子を発現する細胞のみの生存のために適切である条件下に選択可能なマーカーを含有するトランスフェクトまたは感染された細胞を培養することにより、達成してよい。導入されたＤＮＡコンストラクトのその後の増幅は増幅のために適切な条件下に遺伝子修飾された哺乳類細胞を培養することにより行うことができる（例えば増幅可能なマーカー遺伝子の多数のコピーを含有する細胞のみが生存できる薬物濃度の存在下に増幅可能なマーカー遺伝子を含有する遺伝子修飾された哺乳類細胞を培養する）。
【０１６７】
キメラ蛋白を発現する遺伝子修飾された哺乳類細胞は、発現産物の検出により本明細書に記載した通り識別できる。例えば担体が環状ＲＡＰペプチドであるキメラ蛋白を発現している哺乳類細胞はサンドイッチ酵素イムノアッセイにより識別できる。抗体はコンジュゲートのＲＡＰ部分または活性剤部分に向けて指向させることができる。
【０１６８】
ｖ．ＲＡＰペプチドの精製
ＲＡＰペプチドは当該分野で良く知られている方法を用いながら逆相高速液体クロマトグラフィー（ＲＰ−ＨＰＬＣ）により精製できる。例えば“Ｔｈｅ  Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ａｎｄ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｐｅｐｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｂｙ  Ｒｅｖｅｒｓｅｄ−Ｐｈａｓｅ  ＨＰＬＣ”、第３版、Ｇｒａｃｅ  Ｖｙｄａｃ，Ｗ．Ｒ．Ｇｒａｃｅ＆Ｃｏ．，Ｃｏｌｕｍｂｉａ，ＭＤ（２００２）を参照できる。アセトニトリルおよび水とトリフルオロ酢酸の勾配が溶離剤として頻繁に使用される。分取用ＲＰ−ＨＰＬＣはミリグラムおよびグラム量において合成ペプチドを精製するため、そして、治療用途のために組み換え製造されたポリペプチドのｍｇ〜ｋｇ量を精製するために定型的に使用されている。
【０１６９】
ＲＡＰペプチドは又、参照により全体が本明細書に組み込まれるＷＯ２００６／１３８３４３（Ｚａｎｋｅｌ等）に記載されている通り製造して精製してもよい。
【０１７０】
ＲＡＰペプチドは又適切なＣＲ対にカップリングしたアガロースビーズ上のアフィニティークロマトグラフィーにより精製できる。この手法は単独で、またはＲＰ−ＨＰＬＣ精製後の追加的工程として使用できる。ＣＲ対またはトリプレットを含むＣＲ含有蛋白のフラグメントは以下の通り製造する。各々ＣＲ対またはトリプレットをコードするＤＮＡフラグメントをＨｏｔＳｔａｒｔ  ＰｆｕＴｕｒｂｏ（登録商標）ポリメラーゼおよび試薬（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を用いながらヒトｃＤＮＡ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  Ｍａｒａｔｈｏｎ−ｒｅａｄｙ（登録商標））からＰＣＲ増幅する。各々の増幅されたフラグメントを順次、ＢａｍＨＩおよびＨｉｎｄＩＩＩで消化し、そして次に同様に消化されたｐＥＴ３０（＋）ａ（ＥＭＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）内にライゲーションする。得られたプラスミドはＣＲフラグメントに融合されたＮ末端ヘキサヒスチジンおよびＳペプチドよりなる蛋白フラグメントをコードしている。全ての発現コンストラクトを配列決定することにより挿入部分の一貫性を確認する。次に各プラスミドを用いてＢＬ２１（ＤＥ３）ＣｏｄｏｎＰｌｕｓ−ＲＩＰＬ（登録商標）細胞（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を形質転換する。ＣＲフラグメントは前述したとおり発現および再折り畳みさせ、そしてＮｉ−ＮＴＡクロマトグラフィーにより製造元のプロトコル（Ｑｉａｇｅｎ）に従って精製する。活性化アガロースビーズ（ＡｆｆｉＧｅｌ  １５、Ｂｉｏ−Ｒａｄ）を１０ｍＬのフリットプラスチックカラム（Ｐｉｅｒｃｅ）に移す。ビーズを３容量の１０ｍＭＨＥＰＥＳ、１００ｍＭＮａＣｌ＋５ｍＭＣａＣｌ２緩衝液で２回洗浄する。次にＣＲフラグメント（同じ緩衝液の５カラム容量中２．５ｍｇ／ｍｌ充填ビーズ）を添加し、混合物を室温で混合しながら一夜インキュベートする。次に、Ｂｒａｄｆｏｒｄ試験で計測した場合に溶出液中に更に蛋白が存在しなくなるまで、緩衝液で洗浄する。ビーズは使用時まで２０％エタノール中に保存する。ＴＢＳ中のＲＡＰペプチドを平衡化されたＣＲ連結ビーズ（１ｍｇ／ｍｌ充填ビーズ）に添加し、２時間室温で混合しながらインキュベートする。ビーズを同じ緩衝液で洗浄し、そして結合したペプチドをＴＢＳ＋１００ｍＭＥＤＴＡ中で溶離する。
【０１７１】
Ｇ．ＲＡＰコンジュゲートの特性化
ｉ．標識
一部の実施形態においては、環状ＲＡＰペプチドまたはそのコンジュゲートはその検出を容易にするために標識する。「標識」または「検出可能な部分」とは、スペクトル分析、光化学、生化学、免疫化学、化学、または他の物理的手段により検出可能な組成物である。例えば、本発明における使用に適する標識は、例えば、放射性標識（例えば３２Ｐ）、蛍光団（例えばフルオレセイン）、電子稠密試薬、酵素（例えばＥＬＩＳＡにおいて一般的に使用されているもの）、ビオチン、ジゴキシゲニン、または、例えばハプテンまたはペプチド内に放射標識を取り込むことにより検出可能とすることができる、またはハプテンまたはペプチドと特異的に反応する抗体を検出するために使用できる、ハプテンおよび蛋白を包含する。
【０１７２】
上記した通り、使用するスクリーニング試験に応じて、コンジュゲートの活性剤、リンカーまたは環状ＲＡＰペプチド部分を標識してよい。使用する特定の標識または検出可能な基は、それがコンジュゲートの生物学的活性を有意に妨害しない限り、本発明の重要な特徴ではない。検出可能な基は検出可能な物理的または化学的な特性を有する何れかの物質であることができる。即ち、標識はスペクトル分析、光化学、生化学、免疫化学、電気的、光学的または化学的な手段により検出可能な何れかの組成物である。
【０１７３】
本発明における使用に適する標識の例は、限定しないが例えば、蛍光染料（例えばフルオレセインイソチオシアネート、テキサスレッド、ローダミン等）、放射標識（例えば３Ｈ、１２５Ｉ、３５Ｓ、１４Ｃ、または３２Ｐ）、酵素（例えばセイヨウワサビパーオキシダーゼ、アルカリホスファターゼおよびＥＬＩＳＡにおいて一般的に使用されている他のもの）、および比色標識、例えばコロイド状金または着色ガラスまたはプラスチックビーズ（例えばポリスチレン、ポリプロピレン、ラテックス等）を包含する。
【０１７４】
標識は当該分野で良く知られている方法に従って試験の所望の成分に直接または間接的にカップリングしてよい。好ましくは１つの実施形態における標識は本発明に従って活性剤をコンジュゲートするためにイソシアネート試薬を用いながら生物重合体に共有結合される。本発明の１つの特徴においては、本発明の２官能性イソシアネート試薬を用いて標識を生物重合体にコンジュゲートすることにより、自身に結合した状態で活性剤を有さない標識生物重合体コンジュゲートを形成することができる。標識生体重合体コンジュゲートは本発明に従って標識されたコンジュゲートの合成のための中間体として使用してよく、或いは、生物重合体コンジュゲートを検出するために使用してよい。上記した通り、広範な種類の標識を使用することができ、標識の選択は、必要な感度、試験の所望の成分とのコンジュゲーションの容易さ、安定性の条件、使用可能な機材、および廃棄の条件に依存している。非放射性標識は間接的な手段により結合される場合が多い。一般的に、リガンド分子（例えばビオチン）は分子に共有結合する。本来検出可能であるか、または検出可能な酵素、蛍光化合物、またはケミルミネセント化合物のようなシグナル系に共有結合されるかの何れかの、別の分子（例えばストレプトアビジン）分子にリガンドは結合する。
【０１７５】
コンジュゲートは又、例えば酵素または蛍光団とのコンジュゲーションにより、シグナル発生化合物に直接コンジュゲートできる。標識としての使用に適する酵素は、限定しないが例えば、ヒドロラーゼ、特にホスファターゼ、エステラーゼおよびグリコシダーゼ、またはオキシダーゼ、特にパーオキシダーゼを包含する。標識としての使用に適する蛍光化合物、即ち蛍光団は、限定しないが例えば、フルオレセインおよびその誘導体、ローダミンおよびその誘導体、ダンシル、ウンベリフェロン等を包含する。適当な蛍光団の別の例は、限定しないが、エオシン、ＴＲＩＴＣ−アミン、キニン、フルオレセインＷ、アクリジンイエロー、リサミンローダミン、Ｂスルホニルクロリドエリスロセイン、ルテニウム（トリス、ビピリジニウム）、テキサスレッド、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド、フラビンアデニンジヌクレオチド等を包含する。標識としての使用に適するケミルミネセント化合物は、限定しないが例えば、ルシフェリンおよび２，３−ジヒドロフタラジンジオン、例えばルミノールを包含する。本発明の方法において使用できる種々の標識およびシグナル発生系の考察は、米国特許４，３９１，９０４を参照できる。
【０１７６】
標識を検出する手段は当該分野で良く知られている。即ち、例えば標識が放射活性標識である場合、検出のための手段はシンチレーションカウンターまたはオートラジオグラフィーの場合のような写真フィルムを包含する。標識が蛍光標識である場合、それは適切な波長の光で蛍光団を励起すること、そして生じた蛍光を検出することにより検出してよい。蛍光は電子検知器、例えば電荷結合装置（ＣＣＤ）または光電子増倍装置等を用いて目視により検出してよい。同様に、酵素標識は酵素に対して適切な基質を準備すること、および生じた反応産物を検出することにより検出してよい。比色またはケミルミネセント標識は単に標識に関連する色を観察することにより検出してよい。本発明の方法における使用に適する他の標識および検出系は当該分野で良く知られている。そのような標識されたモジュレーターおよびリガンドは疾患または健康状態の診断において使用してよい。
【０１７７】
ｉｉ．コンジュゲートおよびそれらの送達のモジュレーターのスクリーニング試験
本発明は環状ＲＡＰペプチドコンジュゲートに関するスクリーニング試験を提供し、その場合、コンジュゲートは、全細胞、細胞抽出液、半精製、精製または自身の活性を計測可能とする何れかの他のフォーマットにおいて存在することができる特定の受容体の計測可能な活性に影響するそれらの能力に関して試験される。活性は、ＣＲ含有蛋白の発現、機能または分解における何れかの活性であることができ、例えばそのような活性の量および時期を包含する。そのような活性は例えば、受容体遺伝子配列またはｍＲＮＡ転写物の転写、転写プロセシング、翻訳または転写物安定性を包含する。そのような活性は例えば新しい受容体の合成、受容体の細胞下の局在および受容体結合活性の活性化を包含する。そのような活性は例えば、物質に結合する、コンホーメーションに適合する、反応を触媒する、既知リガンドに結合する等の受容体の能力を包含する。そのような活性は例えば受容体の量または安定性、受容体のプロセシングおよび除去または分解等を包含する。好ましい実施形態においては、使用される環状ＲＡＰペプチドは修飾されているか、または本来より何れかの他の受容体に対するよりもターゲティングされた受容体に対してより高値の結合親和性を有するものである。
【０１７８】
本発明は種々の異なるスクリーニングフォーマットを意図している。一部のデザインは低スループットであり、そしてシリーズにおいて、または平行して、僅か１つのみ、または２，３の化合物を試験する。高スループットのスクリーニング試験は数万または数十万の化合物を数週間または数カ月基準でスクリーニングする場合に適している。「インシリコ」のスクリーニングフォーマットは生物学的活性の潜在的なモジュレーターを発見するためにコンピューター支援合理的設計手法を使用している。
Ｈ．医薬組成物およびその投与
コンジュゲートおよびモジュレーターは種々の経路により投与してよい。経口用調製品の場合、コンジュゲートは単独または錠剤、粉末、顆粒またはカプセルを製造するための適切な添加剤と組み合わせて、例えば従来の添加剤、例えば乳糖、マンニトール、コーンスターチまたはポテトスターチとともに；結合剤、例えば血症セルロース、セルロース誘導体、アカシア、コーンスターチまたはゼラチンとともに；錠剤崩壊剤、例えばコーンスターチ、ポテトスターチまたはカルボキシメチルセルロースナトリウムとともに；潤滑剤、例えばタルクまたはステアリン酸マグネシウムとともに；そして所望により、希釈剤、緩衝剤、水分付与剤、保存料またはフレーバー剤とともに、使用できる。
【０１７９】
コンジュゲートおよびモジュレーターは、それらを水性または非水性の溶媒、例えば植物油または他の同様の油脂、合成の脂肪酸グリセリド、高級脂肪酸のエステルまたはプロピレングリコールに溶解、懸濁または乳化することにより；そして所望により、従来の添加剤、例えば可溶化剤、等張性付与剤、懸濁剤、乳化剤、安定化剤および保存料を用いながら、注射用の調製品に製剤できる。
【０１８０】
コンジュゲート、モジュレーター、およびＬＤＬＲリガンドは吸入により投与されるべきエアロゾル製剤中で利用できる。本発明の化合物は、ジクロロジフルオロメタン、プロパン、窒素等の加圧された許容される高圧ガス中に製剤できる。
【０１８１】
更に又、コンジュゲートおよびモジュレーターは乳化基剤または水溶性基剤のような種々の基剤と混合することにより座薬とすることができる。本発明の化合物は座薬として直腸に投与できる。座薬は体温では溶融するが、室温では固化している、カカオ脂、カーボワックスおよびポリエチレングリコールのようなベヒクルを包含できる。
【０１８２】
各投与単位、例えばティースプーン一杯、テーブルスプーン一杯、錠剤または座薬が活性剤を含有する組成物所定量を含有する、シロップ、エリキシル、および懸濁液のような経口または直腸投与用のコンジュゲート、モジュレーター、およびＬＤＬＲリガンドの単位剤型を提供してよい。同様に、注射または静脈内投与用の単位剤型は滅菌水、規定食塩水または他の製薬上許容しうる担体中の溶液として組成物中にコンジュゲートを含んでよい。
【０１８３】
実際の使用に際しては、本発明のコンジュゲート、モジュレーター、およびＬＤＬＲリガンドは、従来の医薬品製造手法に従って、製薬用の担体と、緊密な混合物中の活性成分として組み合わせる。担体は、例えば経口または非経口（静脈内を包含）のような投与のために望まれる調製品の形態に応じて、種々の形態をとってよい。経口用の剤型のための組成物を調製する場合は、例えば懸濁液、エリキシルおよび溶液のような経口用液体調製品の場合は水、グリコール、油脂、アルコール、フレーバー剤、保存料、着色剤等のような何れかの通常の製薬用媒体；または例えば粉末、ハードおよびソフトカプセルおよび錠剤のような経口用固体調製品の場合は澱粉、糖類、微結晶セルロース、希釈剤、顆粒化剤、潤滑剤、結合剤、錠剤崩壊剤等のような担体を使用してよく、ここで固体の経口用調製品が液体調製品よりも好ましい。
【０１８４】
投与の経皮的経路に関しては、薬物の経皮投与のための方法はＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，第１７版（Ｇｅｎｎａｒｏ等編、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ．，１９８５）に開示されている。真皮または皮膚パッチは本発明のコンジュゲート、モジュレーター、およびＬＲＰリガンドの経皮送達のための好ましい手段である。パッチは好ましくは化合物の吸収を増大させるためにＤＭＳＯのような吸収増強剤を与える。経皮薬物送達のための他の方法は米国特許５，９６２，０１２、６，２６１，５９５、および６，２６１，５９５に開示されている。これらの各は参照により全体が本明細書に組み込まれる。
【０１８５】
特定の実施形態においては、本明細書に記載するコンジュゲートを投与する治療薬はＣＳＦ中に髄腔内投与されることになる。本発明の髄腔内投与は大脳の脳室内に医薬組成物を導入することを含んでよい。或いは髄腔内投与は腰部の領域内に医薬組成物を導入することを含んでよい。更に別の代替例においては、髄腔内投与は大槽内に医薬組成物を導入することを含む。何れのこのような投与も、好ましくは瞬時注射を介する。症状の重症度および治療に対する対象の応答性に応じて、そのような瞬時注射は、週１回、月１回、６か月に１回、または毎年、投与してよい。他の実施形態においては、髄腔内投与は輸液ポンプの使用により行う。医薬品は当然ながら少なくとも数日間の期間に渡り連続的に髄腔内投与されるか、または髄腔内投与は少なくとも４週間の期間に渡り連続的に行われる。当然ながら、投与を連続注入により行う場合は、酵素置換治療の投薬速度は瞬時注射投与と比較して大きく低減してよい。好ましい実施形態においては、コンジュゲートの活性剤はイズロニダーゼであり、そしてこれはＭＰＳに関して治療されている哺乳類の体重２０ｋｇ当たりイズロニダーゼ約１ｍｇを含む量において送達される。特定の実施形態においては、上記用量は１５ｃｃＣＳＦに送達される。そのような濃度において、酵素濃度はＣＳＦｍｌ当たり１８，０００単位となることを意図している。上記した用量は単なる例示の用量であり、そしてこの用量は変動してよいことは当業者の知る通りである。
【０１８６】
本発明の方法および組成物は酵素置換療法の前に抗原特異的耐容性を誘導する方法および組成物と組み合わせてよい。そのような方法は抗原特異的耐容性を誘導することを包含し、免疫阻害剤、例えばシクロスポリンＡの投与を含み、そして更に、抗増殖剤、限定しないが例えばヌクレオチド類縁体または代謝拮抗剤の投与を含んでよい。抗増殖剤はアザチオプリンであってよい。その他の方法は例えば各々が参照により全体が本明細書に組み込まれる米国特許出願１０／１４１，６６８、公開時の米国公開番号２００３０２１１１１３；および米国特許出願１０／４２９，３１４、公開時の米国公開番号２００４０００９９０６に記載されている。
【０１８７】
製薬上許容しうる賦形剤、例えばベヒクル、アジュバント、担体または希釈剤は市販されている。更に又、製薬上許容しうる補助的物質、例えばｐＨ調節および緩衝剤、張力調節剤、安定化剤、水和剤等も市販されている。
【０１８８】
当業者の知る通り、用量レベルは特定の化合物、症状の重症度および副作用に対する対象の感受性の関数として変動する場合がある。所定の化合物に対する好ましい用量は限定しないが例えば患者、被験動物、およびインビトロで実施される用量応答および薬物動態の評価を包含する種々の手段により当業者により容易に決定される。
【０１８９】
これらの特徴の各々において、組成物は例えば限定しないが、経口、直腸、局所、非経腸（皮下、筋肉内、および静脈内を包含）、肺内（経鼻または口内吸入）、または鼻内投与に適する組成物を包含するが、何れかの所定の例における最も適当な経路は部分的には治療すべき状態の性質および重症度に、そして活性成分の性質に応じたものとなる。例示される投与経路は経口および静脈内の経路である。組成物は薬学の当該分野で良く知られている何れかの方法により単位剤型において好都合に提示され、そして製造されてよい。
【０１９０】
実際の使用においては、本発明のモジュレーターは従来の医薬品製造手法に従って薬学的担体との緊密な混合物中の活性成分として組み合わせることができる。担体は、例えば経口または非経口（静脈内を包含）のような投与のために望まれる調製品の形態に応じて、種々の形態をとってよい。経口用の剤型のための組成物を調製する場合は、例えば懸濁液、エリキシルおよび溶液のような経口用液体調製品の場合は水、グリコール、油脂、アルコール、フレーバー剤、保存料、着色剤等のような何れかの通常の製薬用媒体；または例えば粉末、ハードおよびソフトカプセルおよび錠剤のような経口用固体調製品の場合は澱粉、糖類、微結晶セルロース、希釈剤、顆粒化剤、潤滑剤、結合剤、錠剤崩壊剤等のような担体を使用してよく、ここで固体の経口用調製品が液体調製品よりも好ましい。
【０１９１】
それらの投与の容易性のため、錠剤およびカプセルは最も好都合な経口用単位剤型となっており、その場合、固体の薬学的担体が当然ながら使用される。所望により錠剤は標準的な水性または非水性の手法によりコーティングしてよい。これらの組成物中の活性化合物のパーセンテージは当然ながら変動してよく、そして、好都合には単位重量の約２パーセント〜約６０パーセントであってよい。
【０１９２】
本発明のコンジュゲート、モジュレーター、およびリガンドは動物において、そして特にヒトにおいて、治療、予防および診断介入のために有用である。本明細書に記載した通り、コンジュゲートは使用する生物重合体に応じて何れかの標的臓器、コンパートメント、または部位において活性剤の優先的な蓄積および／または放出を示す。
【０１９３】
本発明の組成物はウィルスエンベロープまたは小胞内にカプセル化またはそれに結合した状態で、または細胞内に配合させた状態で投与してよい。小胞は通常は球形であり、そして頻繁には油性であるミセル状の粒子である。リポソームは二層膜から形成された小胞である。適当な小胞は例えば限定しないが単層の小胞および多層の脂質の小胞またはリポソームを包含する。このような小胞およびリポソームは広範な種類の脂質またはリン脂質化合物、例えばホスファチジルコリン、ホスファチジン酸、ホスファチジルセリン、ホスファチジルエタノールアミン、スフィンゴミエリン、糖脂質、ガングリオシド等から、標準的な方法、例えば米国特許４，３９４，４４８に記載されているものを用いて製造してよい。そのような小胞またはリポソームは化合物を細胞内に投与するために、そして化合物を標的臓器に送達するために使用してよい。目的のｐ９７組成物の制御された放出は又、カプセル化を用いて達成してもよい（例えば米国特許５，１８６，９４１参照）。
【０１９４】
血流中、または好ましくは少なくとも血液脳関門の外部に環状ＲＡＰペプチド活性剤コンジュゲートまたはモジュレーター組成物を送達する投与の何れかの経路を使用してよい。好ましくは組成物は末梢部に、最も好ましくは静脈内に、または心臓カテーテルにより、投与される。頸静脈内および頸動脈内の注射も有用である。組成物は局所的または限局的に、例えば腹腔内または皮下または筋肉内に投与してよい。１つの特徴において、組成物は適当な薬学的希釈剤または担体とともに投与する。
【０１９５】
投与すべき用量は個体の必要性、所望の作用、使用する活性剤、生物重合体および選択された投与経路により変動する。コンジュゲートの好ましい用量は、約０．２ｐｍｏｌ／ｋｇ〜約２５ｎｍｏｌ／ｋｇの範囲であり、そして特に好ましい用量は２〜２５０ｐｍｏｌ／ｋｇの範囲であるか；またはコンジュゲートの好ましい用量は０．０２〜２０００ｍｇ／ｋｇの範囲であってよい。これらの用量は生物重合体に会合している活性剤または薬物部分の数により影響されることになる。或いは、用量は投与する活性剤に基づいて計算してよい。
【０１９６】
好ましい実施形態においてはコンジュゲートは環状ＲＡＰペプチドを含む。例えば、アドリアマイシン０．００５〜１００ｍｇ／ｋｇを含む環状ＲＡＰペプチド−アドリアマイシンの用量もインビボで有用である。特に好ましいものはアドリアマイシン０．０５〜２０ｍｇ／ｋｇを含む環状ＲＡＰペプチド−アドリアマイシンの用量である。当業者であれば、化合物の遊離の形態に関して使用される推奨用量に部分的には基づいて、環状ＲＡＰペプチドに連結する化合物の適当な用量を決定できる。環状ＲＡＰペプチドへの活性剤のコンジュゲーションは一般的に、同じ作用を得るために必要な薬物の量を低減する。
【０１９７】
本発明のコンジュゲートおよびモジュレーターは動物において、そして特にヒトにおいて、治療、予防および診断介入のために有用である。環状ＲＡＰペプチド化合物は特定の組織において優先的な蓄積を示す場合がある。診断のための好ましい医療上の適応症は例えば目的の標的臓器（例えば肺、肝臓、腎臓、脾臓）と関連する何れかの状態を包含する。特に好ましい実施形態においては、目的の標的臓器は脳である。
【０１９８】
要件方法は種々の異なる疾患状態の治療において用途を有する。特定の実施形態においては、特に有利なものは、所望の活性を有する活性剤または薬物は予め発見されているが、活性剤または薬物が十分に満足できる治療結果をもたらすように十分には標的部位、領域またはコンパートメントに送達されないような疾患状態における要件方法の使用である。そのような活性剤または薬物を用いながら、環状ＲＡＰペプチドに活性剤をコンジュゲートする要件方法を用いることにより、活性剤または薬物の治療効果および治療指数を増強できる。
【０１９９】
種々の宿主または対象が要件方法に従って治療される。一般的にそのような宿主は「哺乳類」または「哺乳類の」ものであり、ここでこれらの用語は広範に哺乳類のクラスに属する生物、例えば肉食動物目（例えばイヌおよびネコ）、げっし目（例えばマウス、モルモット、およびラット）、および霊長類（例えばヒト、チンパンジー、およびサル）を記載するために使用される。多くの実施形態において、宿主はヒトである。
【実施例】
【０２００】
以下の実施例は本発明の好ましい実施形態を説明するために記載する。以下の実施例において開示される手法は本発明の実施において良好に機能することが本発明者等により発見された手法を示しており、そしてこのため、その実施のための好ましい様式を構成すると考えられることは当業者の知る通りである。しかしながら、本開示を鑑みれば、本発明の精神および範囲から外れることなく、多くの変更を開示された特定の実施形態において行うことができ、そしてなお類似または同様の結果を得ることができることは、当業者の知る通りである。以下の実施例は環状ＲＡＰペプチドを発生させ、単離し、そしてその好ましい受容体との相互作用を特性化するための例示されるプロトコルを示している。
【０２０１】
（実施例１）
ＲＡＰ変異体の形成および分析
材料および方法
材料−Ｍ１３ファージディスプレイベクターはＭａｘｉｍ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙより入手した。発現ベクターｐＥＴ３０（＋）ａおよびＳ−ｔａｇ精製試薬はＥＭＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓより入手した。抗ＲＡＰ抗体はＢｉｏＭａｒｉｎ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ，Ｉｎｃ．において製造された。制限酵素およびＴ４ＤＮＡリガーゼはＮｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓより入手した。ＡＢＩ３１００Ａｖａｎｔ自動ＤＮＡシーケンサーを用いて配列データの作成および分析を行った。ヘキサヒスチジンタグ精製試薬はＱｉａｇｅｎから入手した。抗ＲＡＰポリクローナル抗体は前述の通りである（４９）。
【０２０２】
ＣＲ蛋白の発現、再折り畳みおよび精製−ＣＲ蛋白はインビトロで発現、精製およびそのネイティブ形態に再折り畳みできることは明らかにされている（４５，５０〜５４）。本明細書に記載した作業のためには、このプロセスのために以下のＣＲ配列：ＬＲＰ６（ＣＲ１−３）由来のＣＲトリプレット、トリプレット内部のＬＲＰ６由来の２つのＣＲ対（ＣＲ１および２、名称ＣＲ１２、ＣＲ２および３、名称ＣＲ２３）、ヒトＶＬＤＬＲ（ＣＲ６−８）由来のＣＲトリプレット、ＶＬＤＬＲ（ＣＲ７８）由来のＣＲ対、ＬＲＰ２（ＣＲ３４−３６）由来のＣＲトリプレット、ＬＲＰ２（ＣＲ８９，ＣＲ３４３５）由来の２つのＣＲ対、マトリプターゼ／ＳＴ１４／ＴＡＤＧ−１５由来の３つのＣＲ対（ＣＲ１２、ＣＲ２３およびＣＲ３４）、ＬＲＰ１（ＣＲ３−５）由来のＣＲトリプレット、およびＦＤＣ−８Ｄ６抗原由来のＣＲ対を選択した。各々をコードするＤＮＡフラグメントをヒトｃＤＮＡ（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ  Ｍａｒａｔｈｏｎ−ｒｅａｄｙＴＭ）から、または予めクローニングされたＬＲＰ６ｃＤＮＡ（９）から、ＨｏｔＳｔａｒｔ  ＰｆｕＴｕｒｂｏＴＭ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）および以下のプライマー：
【０２０３】
【化１−１】
2010524849.tif 000007
【０２０４】
【化１−２】
2010524849.tif 000008
【０２０５】
【化１−３】
2010524849.tif 000009
を用いてＰＣＲ増幅した。
【０２０６】
各々の増幅されたフラグメントは順次、ＢａｍＨＩおよびＨｉｎｄＩＩＩで消化し、そして次に同様に消化したｐＥＴ３０（＋）ａにライゲーションした。得られたプラスミドはＮ末端ヘキサヒスチジンおよびＣＲフラグメントに融合したＳ−ペプチドよりなる蛋白をコードしていた。ライゲーション反応物はエレクトロポレーションによりＸＬ−ＢｌｕｅＭＲＦ’（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）内に形質転換し、そしてプラスミドは単一のコロニーから単離した。３つの変異、Ｙ１０４０Ｗ、Ｖ１０４７ＤおよびＲ１０８８ＤをＬＲＰ２ＣＲ８９発現プラスミド内に、単独および組み合わせの両方において、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ  ＱｕｉｋＣｈａｎｇｅＩＩＸＬ試薬および以下のプライマー：
【０２０７】
【化２】
2010524849.tif 000010
を用いて導入した。
【０２０８】
すべての発現コンストラクトを配列決定することにより挿入配列および発現ベクターとの接合部を確認した。次に各プラスミドを用いてＢＬ２１（ＤＥ３）ＣｏｄｏｎＰｌｕｓ−ＲＩＰＬＴＭ細胞（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を形質転換した。ＣＲ蛋白の発現は３４μｇ／ｍｌクロラムフェニコール、１２．５μｇ／ｍｌテトラサイクリンおよび１５μｇ／ｍｌカナマイシンを添加したＬＢ中に生育させた対数生育期の細胞において、２ｍＭＩＰＴＧの添加、そしてその後の３２℃までインキュベーター温度を低下させ、そして２５０ｘｇで攪拌しながら４時間インキュベートすることにより誘導した。細胞をペレット化し、そして１０ｍＭＴｒｉｓ−ＨＣｌｐＨ８、１００ｍＭＮａＨ２ＰＯ４、８Ｍ尿素中初期培養容量の３．５％となるように再懸濁した。次に再懸濁した細胞を液体窒素中に凍結し、急速に解凍して３７℃とし、そして３ｍｍプローブに連結したＣｏｌｅ−ＰａｒｍｅｒＣＰ−１３０超音波プロセッサを用いながら振幅設定６０において１０秒間超音波処理した。この操作法を３回反復することにより細胞を完全に溶解させた。溶解物は１５℃において２０分間ＳｏｒｖａｌｌＲＣ−５遠心分離機中で１０，０００ｘｇで２回遠心分離することにより透明化させた。Ｎｉ−ＮＴＡカラム（Ｑｉａｇｅｎ  ＳｕｐｅｒｆｌｏｗＴＭ、１．５ｍＬパックドベッド）を用いてＣＲ蛋白を精製した。慨すれば、樹脂を溶解緩衝液２カラム容量で平衡化した。次に透明化した溶解物にイミダゾールを２０ｍＭとなるまで添加し、そして４℃において一夜、平衡化Ｎｉ−ＮＴＡ樹脂と共にインキュベートした。フロースルーは廃棄した。カラムを溶解緩衝液１カラム容量で１回、次に２０ｍＭイミダゾール添加ＴＢＳｐＨ８の１カラム容量で３回、洗浄した。次にＣＲ負荷ビーズをカラムから除去し、そして２００ｍＭイミダゾールを含有する同じ緩衝液の１カラム容量と共に３０分間室温においてインキュベートすることによりＣＲ蛋白を溶離させた。この工程をもう一回反復し、溶出液を合わせた。次に溶出したＣＲ蛋白溶液に２Ｍ尿素、１０ｍＭＣａＣｌ２および５ｍＭＤＴＴとなるように添加した。精製され、変性されたＣＲ蛋白溶液を３，５００ＭＷＣＯＳｌｉｄｅ−Ａ−ｌｙｚｅｒＴＭ（Ｐｉｅｒｃｅ）カセットに移し、そして順次２００倍過剰の５０ｍＭトリスＨＣｌｐＨ８．５、１０ｍＭＣａＣｌ２、１ｍＭ還元グルタチオン、０．５ｍＭ酸化グルタチオンに対して室温で一夜、そして次に５ｍＭＣａＣｌ２添加ＴＢＳに対して４℃で一夜、透析した。蛋白濃度はＢｒａｄｆｏｒｄ試験で測定し、そして純度はクーマシーブリリアントブルー染色によりＳＤＳ−ＰＡＧＥで確認した。
【０２０９】
ＲＡＰファージディスプレイライブラリの製造−ファージディスプレイファージミドｐＨａｇｅ３．２は、ＱｕｉｃｋＣｈａｎｇｅＩＩＴＭ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を用いながらｐＩＩＩリーダー配列内部のＰｈｌＭ１およびＨｉｎｄＩＩＩ部位が除去されるように修飾した。更に又、ｐＨａｇｅ３．２のポリリンカーは、ＢａｍＨＩ、ＮｏｔＩおよびＡｇｅＩ部位を含有する２本鎖リンカーへのライゲーションにより修飾した。得られた修飾ファージミドをｐＨａｇｅ３．６と命名した。ＲＡＰとヒト□−Ｌ−イズロニダーゼの間の融合物の発現のための以前に報告されているベクターであるｐｃ３Ｂ−ＲＡＰＩＤＵ（４９）をＢａｍＨＩおよびＡｇｅＩで消化することによりヒトＲＡＰ配列をコードするＤＮＡフラグメントを得た。この配列はＲＡＰｃＤＮＡのヌクレオチド１０２で始まりヌクレオチド１０５９で終わるものである。コードされるＲＡＰ蛋白はＮ末端のＲＡＰシグナルペプチドおよびＣ末端のＨＮＥＬ小胞体保持シグナルの両方を欠失している（配列番号）。更に又、５’末端におけるインフレームのＢａｍＨＩ部位および３’末端のＡｇｅＩ部位を包含するペプチドＡＥＡＥＴＧをコードするインフレームの配列が存在する。ＲＡＰ配列を同様に消化したｐＨａｇｅ３．６内にライゲーションし、Ｍ１３ｐＩＩＩリーダーペプチド、ＲＡＰ配列およびｐＩＩＩ配列の間の融合物を作成した。このコンストラクトをｐＨａｇｅ３．６ＲＡＰと命名した。次に受容体結合に重要であることが以前に報告されているＲＡＰの第３ドメイン内の２つの位置（ＲＡＰｄ３Ｋ２５６およびＫ２７０）を変異誘発に付した（５５）。これらの２つの位置を正常および変異誘発性の以下のプライマー：
【０２１０】
【化３】
2010524849.tif 000011
を用いてＲＡＰｄ３の５’および３’側半分ずつの個別のＰＣＲ増幅により飽和させた。
【０２１１】
フラグメントをｐｃ３Ｂ−ＲＡＰＩＤＵから増幅した。各変異誘発性プライマーは、選択されたリジンコドンの１つを、４７の他のコドンの１つで、または３つの可能な終止コドンの１つで置き換える。この置換によりヌクレオチドの２３０４の可能な組み合わせおよびアミノ酸（または終止コドン）の４４１の可能な組み合わせのプールが形成される。ＲＡＰｄ３の５’およびＲＡＰｄ３の３’ＰＣＲフラグメントの両方を共通の部位においてＰｖｕＩＩで消化し、そして次にＴ４ＤＮＡリガーゼを用いたライゲーション反応において組み合わせた。ＰｖｕＩＩ部位において融合した５’および３’フラグメントよりなるヘテロ２量体ライゲーション産物をＦＭＣＮｕＳｉｅｖｅＧＴＧＴＭアガロースゲル上で分割し、そしてＡｍｅｒｓｈａｍＧＦＸＴＭ試薬を用いながら精製した。ヘテロ２量体はＵＶスペクトル分析により定量し、そしてＧｅｎｅＭｏｒｐｈ  ＩＩ  ＥＺクローンＴＭ試薬（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）およびプライマーＲＡＰＫＸＦおよびＲＡＰｍｕｔ１Ｒ（上記）を用いながらエラープローンのＰＣＲにより変異誘発の追加施行に付した。ヘテロ２量体濃度は各５０μＬ反応について４００ｐｇ未満に維持することにより最終変異頻度を最大限とした。変異誘発されたＤＮＡをＡｇｅＩで消化し、ＧＦＸで精製し、ＵＶスペクトル分析で定量し、そしてＳｔｒａｔａｇｅｎｅＥＺｃｌｏｎｅＴＭ試薬を用いながらｐＨａｇｅ３．６ＲＡＰ内への無リガーゼクローニングのために使用した。無リガーゼクローニング反応産物をＱｉａｇｅｎＭｉｎＥｌｕｔｅＴＭカラムを用いて精製した。精製された無リガーゼクローニング産物の細分量（３μＬ）を使用してＸＬ１０−ＧｏｌｄＴＭ化学薬品コンピテント細胞の５０μＬ細分量を形質転換した。形質転換された細胞の細分量を連続希釈し、そして１００μｇ／ｍｌカルベニシリンを含有するＬＢプレート上にプレーティングすることにより一次形質転換体の数を測定した。残余の形質転換細胞はＮｕｎｃｌｏｎ２５ｘ２５ｃｍディッシュ上にプレーティングした。合計１１９，５００の一次形質転換コロニーを３５０ｍＬのＱｉａｇｅｎＧｉｇａＰｒｅｐＴＭＰ１緩衝液を用いながらディッシュから回収した。プラスミドＤＮＡはＱｉａｇｅｎの試薬およびプロトコルを用いながら製造した。プラスミド調製品を定量し、ＢａｍＨＩおよびＡｇｅＩで消化することにより適切なサイズのインサートの存在を確認した。
【０２１２】
ＲＡＰｄ３変異体ライブラリの製造−ＲＡＰｄ３変異体ライブラリはＰｆｕＵｌｔｒａの酵素および試薬（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を使用しながらＰＣＲにより製造した。ｄ３コーディング配列の５’および３’側半分ずつをＨＰＬＣ精製された以下のプライマー：
【０２１３】
【化４】
2010524849.tif 000012
を用いながら別個に増幅した。
【０２１４】
プライマーは２５１、２５６および２７０位のコドンをＮＮＢで置き換え、これによりこれらの位置における全ての可能なアミノ酸が生じる。更に又、ＲＡＰｄ３コーディング配列内部のＰｖｕＩＩ部位は単一のサイレントな塩基置換により削除されている。増幅されたフラグメントをＡｍｅｒｓｈａｍＧＦＸ試薬を用いて精製し、そして次にＰｆｕＵｌｔｒａを用いながら無プライマーＰＣＲにより組み立てた。次にＲＡＰｄ３変異体配列の組み立てられたプールを定量し、ＧｅｎｅＭｏｒｐｈＩＩ試薬（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を用いながら変異誘発に付した。変異誘発されたＤＮＡを順次、ＢａｍＨＩ、ＰｖｕＩＩおよびＡｇｅＩで消化し、その際、各反応の後にＧＦＸ試薬を用いて精製した。次に消化したＲＡＰｄ３変異体フラグメントプールを同様に消化されたｐＨａｇｅ３．６内にライゲーションした（上記参照）。プラスミドライブラリはＸＬ１０−Ｇｏｌｄ細胞（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）の形質転換およびカルベニシリン添加ＬＢの２５ｘ２５ｃｍディッシュ上のプレーティングにより製造した。コロニーをディッシュから回収し、そしてプラスミドＤＮＡを上記した通り製造した。
【０２１５】
ファージの製造−プラスミドライブラリ（１０ｎｇ）を使用してエレクトロポレーションによりＸＬ−ＢｌｕｅＭＲＦ’を形質転換した。２％グルコース添加の２ｘＹＴ１ｍＬ中、３７℃で１時間インキュベートした後、形質転換細胞の培養物にカルベニシリンを１００μｇ／ｍｌとなるまで添加し、そして更に６時間生育させた。この期間の後、１ｍＬ培養物を用いて、５０ｍＬの三角フラスコ中の２％グルコース、１００μｇ／ｍｌカルベニシリンおよび１０８ｐｆｕ／ｍＬのＭ１３Ｋ０７ヘルパーファージ（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ）を添加した２ｘＹＴ１０ｍＬに接種した。この培養物を３７℃で２時間２５０ｘｇで振とうし、そして次に１０分間２，０００ｘｇでＳｏｒｖａｌｌＲＣ−５遠心分離機で遠心分離することにより細胞をペレット化した。細胞を１００μｇ／ｍｌカルベニシリンおよび１００μｇ／ｍｌカナマイシンを含有する２ｘＹＴ１０ｍｌ中に再懸濁し、そして３７℃で一夜振とうした。培養物を１０，０００ｘｇで２回遠心分離することにより清澄化し、そして上澄みを収集した。上澄みを１容量の冷ＴＢＳおよび０．２容量の２％ＰＥＧ８０００（Ｓｉｇｍａ）、２．５ＭＮａＣｌと合わせることによりファージを沈殿させ、１０，０００ｘｇで遠心分離することにより収集し、そしてＴＢＳ中に再懸濁した。ファージの力価は、ファージ試料を連続希釈し、対数期のＸＬ−ＢｌｕｅＭＲＦ’と共にインキュベートし、そして１００μｇ／ｍｌカルベニシリンを添加した２ｘＹＴ寒天上にプレーティングすることにより、測定した。
【０２１６】
ファージパニング−精製され、折り畳まれたＣＲ蛋白を用いて５ｍＭＣａＣｌ２を添加したＴＢＳ中４℃において一夜１μｇ／ウェルにおいてＮｕｎｃＭａｘｉＳｏｒｐＴＭ９６穴プレートをコーティングした。ウェルを濯ぎ、５ｍＭＣａＣｌ２を添加したＴＢＳＳｕｐｅｒｂｌｏｃｋＴＭ（Ｐｉｅｒｃｅ）でブロッキングした後、ファージを添加した。５ｍＭＣａＣｌ２および０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０を添加したＴＢＳＳｕｐｅｒｂｌｏｃｋＴＭ中１０９ｃｆｕ（１０１０ｃｆｕ／ｍＬ）の精製されたファージライブラリをコーティングされたウェルに添加し、そして室温で２時間インキュベートした。次にウェルをＴＢＳＴＣ（５ｍＭＣａＣｌ２および０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０を添加した２０ｍＭＴｒｉｓ−ＨＣｌｐＨ７．４，１５０ｍＭＮａＣｌ）で１５回洗浄した。結合したファージを１ｍｇ／ｍｌＢＳＡを含有する０．２Ｍのグリシン−ＨＣｌｐＨ２．２中で溶離させ、そして０．２容量の１ＭＴｒｉｓ−ＨＣｌｐＨ９．１を含有する試験管に移すことによりｐＨを中性とした。溶出したファージは対数期のＸＬ−ＢｌｕｅＭＲＦ’細胞に溶出物を混合することにより回収した。レスキューされたファージは一夜（１６時間）３０℃で液体培地中細胞を生育せることにより増幅した。更に又、形質転換された細胞の細分量につき、試料を連続希釈し、そして１００μｇ／ｍｌカルベニシリンを添加した２ｘＹＴ寒天上にプレーティングすることにより、力価測定した。ファージは、ＰＥＧ沈澱により培地上澄みから精製および濃縮した。
【０２１７】
ＲＡＰｄ３蛋白の発現−ＲＡＰｄ３配列をｄ３レスキューＦ：５’−ＧＣＧＡＴＡＧＧＡＴＣＣＣＴＧＧＡＣＣＧＣＣＴＧＣＧＣＡＧＧＧＴＣＡＧＣＣＡＣＣ−３’（配列番号３９）およびｄ３レスキューＲ：５’−ＧＣＧＡＴＡＡＡＧＣＴＴＴＴＡＴＣＡＡＧＡＴＣＴＡＣＣＧＧＴＴＴＣＴＧＣＣＴＣＧＧＣ−３’（配列番号４０）を用いてＰＣＲ増幅し、ＢａｍＨＩおよびＨｉｎｄＩＩＩで消化し、そして同様に消化されたｐＥＴ３０（＋）ａ内にライゲーションした。ＲＡＰｄ３蛋白をＢＬ２１（ＤＥ３）ＣｏｄｏｎＰｌｕｓ−ＲＩＰＬＴＭ中で発現させ、そして上記した通りＮｉ−ＮＴＡクロマトグラフィーで精製した。蛋白濃度はＢｒａｄｆｏｒｄ試験により計測し、そして純度はＳＤＳ−ＰＡＧＥにより試験した。
【０２１８】
変異体ＲＡＰｄ３の配列復帰および野生型ＲＡＰｄ３のフォワード変異−アフィニティー選択ＲＡＰｄ３変異体内部の各変異を、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ  ＱｕｉｃｋＣｈａｎｇｅＩＩＸＬＴＭ試薬および以下のプライマー：
【０２１９】
【化５−１】
2010524849.tif 000013
【０２２０】
【化５−２】
2010524849.tif 000014
を用いて個々に復帰させた。
【０２２１】
野生型ＲＡＰｄ３は同じ方法および以下のプライマー：
【０２２２】
【化６】
2010524849.tif 000015
を用いながら変異誘発させた。
【０２２３】
固相結合試験−精製し、再折り畳みしたＣＲ蛋白（１μｇ）を４℃で一夜５ｍＭＣａＣｌ２を添加したＴＢＳｐＨ８中ＮｕｎｃＭａｘｉｓｏｒｐＴＭ９６穴プレートに結合させた。ウェルをＴＢＳＣで洗浄し、次に２％ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）を含有するＴＢＳＣでブロッキングした。次にＲＡＰリガンドを室温において０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０を添加した上記ブロッキング緩衝液中で２時間所定濃度範囲の固定化受容体と共にインキュベートした。対照ウェルにはリガンドを添加しなかった。カルシウムの非存在が結合に影響するかどうかを調べるための別の対照として、１０ｍＭＥＧＴＡを一部試料に関してインキュベーション培地中に包含させた。ウェルをＴＢＳＴＣで洗浄し、そして結合したリガンドをポリクローナル抗ＲＡＰ（ＢＰ４１／４２、１：１，０００、ＢｉｏＭａｒｉｎ）で検出した。過剰な一次抗体を除去し、ウェルを洗浄した後、二次抗体、ＨＲＰコンジュゲートヤギ抗ウサギＩｇＧ（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）と共にインキュベートした。洗浄後、ＴＭＢ基質溶液（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）を添加してＨＲＰを検出した。１ＮＨＣｌで発色を停止した。マイクロプレート分光光度計（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）で４５０ｎｍにおける吸収を計測した。データをプロットし、単一部位結合と仮定して非直線回帰によりＫｄ値を誘導した（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ）。
【０２２４】
結果
ヒトプロテオソーム内部の縦列ＣＲ対を発見し、そしてＲＡＰへの結合に関与することが以前より示唆されている対内部の位置を分析するために、Ｐｆａｍデータベース（ｐｆａｍ．ｗｕｓｔｌ．ｅｄｕ）中に発見された１９０の非重複ヒトＣＲ配列の配列をスプレッドシートに移した。次にＣＲ配列の縦列対を発見するに際し、対として帰属させるための唯一の条件として、２つのＣＲ配列はそれらが存在する蛋白の主要配列内部において相互に直に隣接していることとした。Ｐｆａｍのデータベース中に定義される通り、各ＣＲ配列の第１のアミノ酸の間の距離に対して７５アミノ酸と制限する賦課により、この条件に関しては十分な試験が行えた。縦列配置を要件とする仮定を行った理由は、所定のＣＲ配列へのＲＡＰの結合に関する過去のデータの優越性にこのような対が含まれているためである。オーバーラップした対は、３つのＣＲ配列の線状のアレイが２つのＣＲ対を含むように包含させた。この方法において１４９の縦列ＣＲ対が発見された。カルシウム結合ループの領域における配列の保存により、分析における次の工程である以前の試験においてＲＡＰ結合に直接関連付けられていた４つのアミノ酸の抽出が容易になった（５６，５７）。これらはＣＲ対の各ＣＲ配列のＡｘｃＢｘＣｘＤモチーフに由来するＡおよびＣと等価である。次に、各対の第２のＣＲ配列に由来するＡおよびＣ位のアミノ酸（以後Ａ’およびＣ’）に並置させた場合の、各対の最初のＣＲ配列に由来するＡおよびＣ位のアミノ酸の同一性を、比較目的のために、単一の４量体の文字列（ＡＣＡ’Ｃ’）にコンカタマー化した。各ＣＲ対に関する文字列を全ての他のＣＲ対に関するものと比較し、そして各々の頻度を計数した。この分析において発見された１４９の非重複ヒト縦列ＣＲ対配列のうち、Ａ、Ｃ、Ａ’およびＣ’におけるアミノ酸の最も共通した組み合わせはＷＤＷＤであり、これは１６回観察された。更に又、合計４つのＷＥＷＤシグネチャーを有するＣＲ対、２つのＷＥＷＥを有するもの、そして６つのＷＤＷＥを有するものが存在し、カノニカルなＣＲ対の本発明者等の定義に合計２８が合致した。カノニカルなＣＲ対シグネチャーはＬＤＬＲファミリーにおいてのみ、特にＶＬＤＬＲ、ＬＲＰ１、ＬＲＰ１Ｂ、ＬＲＰ２、ＬＲＰ４、ａｐｏＥＲ２およびＳｏｒＬＡにおいて、観察された。これらの受容体の全ては高い親和性でＲＡＰに結合することが以前よりわかっている。より低頻度の重複の組み合わせに加えて、１０１のユニークな組み合わせが発見され、すべてのＣＲ対含有蛋白が少なくとも１つを有していた。次にＡ、Ｃ、Ａ’およびＣ’におけるアミノ酸の各４量体の組み合わせを、それらの側鎖の概ねの物理化学的特性に基づいて６つのグループの１つにアミノ酸を割りつけることにより、一般化した。疎水性脂肪族アミノ酸はグループ１（Ｉ、Ｌ、Ｍ、Ｖ）に、小型の親水性アミノ酸はグループ２（Ａ、Ｃ、Ｇ、Ｐ、Ｓ、Ｔ）に、塩基性アミノ酸はグループ３（Ｈ、Ｋ、Ｒ）に、酸性アミノ酸はグループ４（Ｄ、Ｅ）に、カルボキシアミドアミノ酸はグループ５（Ｎ、Ｑ）に、そして芳香族アミノ酸はグループ６（Ｆ、Ｗ、Ｙ）に割りつけた。前回の通り、次に各一般化された組み合わせを全ての他のそのような組み合わせと比較し、そしてその頻度を計数した。最も共通した一般化された組み合わせは６４６４であることがわかり、芳香族アミノ酸はＡおよびＡ’、そして酸性アミノ酸はＣおよびＣ’であった。このグループは特定のカノニカルな組み合わせの２８全てを包含しており、そして１４９のＣＲ対組み合わせの４４に対応するものであった。ＣＲ対のこのクラスの代表は１０蛋白において観察され、ＬＤＬＲファミリー外の２つ、ｃｏｒｉｎおよびｐｅｒｌｅｃａｎを包含していた。合計５７の一般化された組み合わせがユニークであり、そして前回の通り、少なくとも１つのユニークな組み合わせがＶＬＤＬＲを除く各々のＬＤＬＲ受容体エクトドメイン内に観察された。選択された位置においてアミノ酸のユニークな一般化された組み合わせを有するＣＲ対を含有する他の蛋白は、膜貫通セリンプロテアーゼマトリプターゼ１、２および３（ＭＴ−ＳＰ１、ＳＴ１４、ＴＡＤＧ−１５）、ＦＤＣ−８Ｄ６抗原、ｃｏｒｉｎ、補体因子Ｉおよびヘパリンスルフェートプロテオグリカン蛋白、ｐｅｒｌｅｃａｎを包含していた（２５，５８）。
【０２２５】
各ＣＲのカルシウム結合ループ内部のＡ、Ｃ、Ａ’およびＣ’におけるアミノ酸のユニークな組み合わせを有するＣＲ対の多数から、ＣＲ対およびトリプレットを選択してＲＡＰｄ３へのそれらの結合を試験した（図２）。ＦＤＣ−８Ｄ６蛋白から誘導された追加的な対を試験し、それは８Ｄ６ＣＲ１２と表記し、以下の配列：
【０２２６】
【化７】
2010524849.tif 000016
を有していた。選択された受容体フラグメントはＣＲ配列の単一の対または２つのオーバーラップした対（トリプレット）を含み、そして選択された位置におけるアミノ酸の組み合わせの範囲を反映する意味を有していた。オーバーラップ対は単離された対よりも低い効率で折り畳まれることになることを考慮し、各トリプレットを構成しているオーバーラップ対の一方または両方を一部の例においては同様に発現させた。配列は、ＬＲＰ６ＣＲトリプレット、即ち完全長ヒトＬＲＰ６（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｏ７５５８１）のアミノ酸１２４７〜１３６３に等価なもの、即ち名称ＬＲＰ６ＣＲ１−３；ＬＲＰ６トリプレットを含む両方のオーバーラップするＣＲ対、ＬＲＰ６ＣＲ１２およびＬＲＰ６ＣＲ２３、アミノ酸１２４７−１３２２および１３２３−１３６３；ＶＬＤＬＲのフラグメント、アミノ酸２３５−３５８（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｐ９８１５５）、即ち名称ＶＬＤＬＲＣＲ６−８；ＶＬＤＬＲトリプレット内部のＣＲ対、即ち名称ＶＬＤＬＲＣＲ７８、アミノ酸２９５−３５８含有；膜貫通セリンプロテアーゼマトリプターゼ由来の３つのＣＲ対、即ち名称ＭＡＴＣＲ１２（ＳＴ１４ＣＲ１２）、アミノ酸４５２−５２４、ＭＡＴＣＲ２３（ＳＴ１４ＣＲ２３）、アミノ酸４８７−５６６（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｑ８ＷＶＣ１）およびＭＡＴＣＲ３４（ＳＴ１４ＣＲ３４）、アミノ酸５２５−６０２；ＦＤＣ−８Ｄ６抗原由来のＣＲ対、アミノ酸５３−１６８（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｑ９ＮＰＦ０）（配列番号９４）、および、ＬＲＰ１由来のトリプレット、即ち名称ＬＲＰ１ＣＲ３−５、アミノ酸８５２−９７３を含む（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｐ９８１５７）を包含していた。ＬＲＰ１ＣＲ３−５はＷＤＷＤシグネチャーを有する２つのオーバーラップしたカノニカルなＣＲ対よりなり、その各々は高い親和性でＲＡＰｄ３に結合することが以前に明らかにされている（５６）。
【０２２７】
多くの以前の試験は、ＣＲ対およびトリプレットが細菌中で発現され、そしてインビトロで再折り畳みされてネイティブの構造となることを明らかにしている（４５、５０〜５４、５６、５７、５９〜６２）。各々の精製され、再折り畳みされたＣＲ蛋白を発現させ、そして還元および非還元条件下の両方においてＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分析した（図３）。ＣＲ運動性は還元条件下において予測された分子量と合致しており、そして各々の蛋白は＞９０％純粋であると判断された。非還元条件下においては各々のＣＲ蛋白は予測された分子量に対して期待されるよりも急速にゲル中を遊走した。この観察結果は分子内ジスルフィド結合形成に依存しているコンパクトな折り畳み構造と合致している。多くの可能なジスルフィド結合の組み合わせが考えられるが、上記した試験によれば、ネイティブのジスルフィド結合パターンが再折り畳み中、特にカルシウム存在下では好ましい。大部分の場合において、そして電気泳動分析の相対的に低い分割能を考慮すれば、ＣＲ蛋白の折り畳み形態は単一のバンドとして生じている（図３）。
【０２２８】
次に各ＣＲ対またはオーバーラップ対のセットへの野生型ＲＡＰｄ３の結合を固相分析により計測した（図４）。この試験におけるＬＲＰ１ＣＲ３−５へのＲＡＰｄ３の結合に関する見かけのＫｄは１１ｎＭであり、以前に報告されている値と同じ範囲にあった（５６、５７、６３）。ＬＲＰ６ＣＲ１２、ＬＲＰ６ＣＲ２３、ＬＲＰ６ＣＲ１−３、ＶＬＤＬＲＣＲ７８、ＬＲＰ２ＣＲ３５３６、ＬＲＰ２ＣＲ３４−３６およびＭＡＴＣＲ２３へのＲＡＰｄ３の結合は試験した最も高値のリガンド濃度においてＬＲＰ１ＣＲ３−５に対するものの５％未満であった。実験の別個のセットにおいて計測したＭＡＴＣＲ１２およびＣＲ３４へのＲＡＰｄ３の結合も又、検出不能であった。ＶＬＤＬＲＣＲ６−８およびＬＲＰ２ＣＲ８９へのＲＡＰｄ３の結合は僅かに高値であり、曲線を結合等温曲線に相対的にフィットすることができた。しかしなお、これらの受容体フラグメントへのＲＡＰｄ３の結合に関する見かけの解離定数は３００ｎＭ超であった。
【０２２９】
カルシウム結合ループ内部のアミノ酸のユニークな組み合わせを含有するＣＲ対にＲＡＰｄ３が結合しないことが明らかにされたため、そのような対に結合することができるＲＡＰｄ３の変異体に関するアフィニティー選択系を開発した。他の蛋白へのＲＡＰの融合物は哺乳類および細菌の両方の細胞において発現されており、そしてネイティブのＲＡＰの受容体結合挙動を保持していることが明らかにされている（４９、６４、６５）。従って、Ｍ１３ｐＩＩＩ構造蛋白にＮ末端側に融合した完全長ＲＡＰのライブラリを、他の蛋白で以前に行われている通り、作成した。ＲＡＰ変異体のプールを作成するために、２つの変異誘発製の操作を完全長ＲＡＰコーディング配列内部の第３ドメインに適用した。受容体結合に直接参加することが以前に明らかにされている２つの位置に関するコドン、Ｋ２５６およびＫ２７０を先ず飽和変異誘発に付した。次に追加的な変異をエラープローンＰＣＲを用いてＲＡＰｄ３中にランダムに導入した。これらの操作の後、合計３８の無作為選択したクローンを配列決定することにより変異頻度を測定した。１０クローン（２６％）がＲＡＰ配列内部の終止コドンをもたらした挿入、欠失または置換を有していた。このような配列をコードする組み換えファージは、野生型ｐＩＩＩのみがファージキャプシド内に取り込まれるため、ファージ組み立ておよび感染の過程中は好ましいものとなる。別の４クローン（１１％）は野生型ＲＡＰをコードしていることがわかった。ＲＡＰファージ−ｐＩＩＩ融合物の残余の２４クローン（６３％）はｄ３に変異を有するＲＡＰ蛋白をコードしていた。これらのクローンの何れも２５６位および２７０位にアミノ酸の同じ組み合わせを有しておらず、ある範囲の置換がこれらの部位において予測された通りに生じていたことを示していた。２５６位および２７０位に限った平均の変異頻度はＲＡＰの最後の１１０アミノ酸（ＲＡＰｄ３）内で２．４アミノ酸置換であった。３８クローンの１つは７コドンのインフレーム欠失を有しており、別のものはＲＡＰｄ３の３’末端を部分的に置き換える未同定の配列のインフレーム挿入を有していた。何れの変異もＲＡＰのｄ１またはｄ２内には観察されなかった。
【０２３０】
第２のファージディスプレイライブラリをＲＡＰｄ３のみがコードされるように製造した。このライブラリは、追加的な位置である２５１をより早期のスクリーンに由来する変異体におけるこの部位の見かけ上の重要性に基づいた飽和変異誘発に付した以外は、完全長ＲＡＰライブラリと同様の様式において作成した（後述参照）。２５１、２５６および２７０位以外は、ＲＡＰｄ３変異体ライブラリはＲＡＰの最後の１１０アミノ酸内部の２アミノ酸置換の平均変異頻度を有していた。このライブラリには野生型ＲＡＰ配列の見かけ上の過剰提示はなかった。
【０２３１】
ファージパニング系が親和性に基づいてＲＡＰ配列を単離するために使用できるかどうかを試験するために、野生型ＲＡＰを発現するファージのプリパレーションを、減衰したＣＲ対結合能力を有することが予測される（５５）変異体ＲＡＰ（Ｋ２５６Ｄ、Ｋ２７０Ｄ）を発現するファージのプリパレーション中に１０００倍希釈した。パニングは方法において記載した通り実施した。回収したファージを増幅し、そして力価測定した。１０回収コロニーに由来するＲＡＰｄ３配列を配列決定した。パニング１ラウンドの後、パニング実験由来の１０コロニーの２つは野生型ＲＡＰを含有しており、原料プールから２００倍のリッチ化があった。配列のより複雑なプールを用いた系の追加的試験として、２５６および２７０位が無作為化されたＲＡＰファージライブラリをＬＲＰ１ＣＲ３−５上でパニングした。初期ファージライブラリおいて、野生型ＲＡＰ配列は１０ファージの約１つによりコードされていた（選択前の無作為クローンの配列決定に基づく）。パニングの第１ラウンドの後、野生型ＲＡＰ配列は１０ファージ中７つにコードされていた。この結果はパニング１ラウンドの後の配列の複雑なプールに由来する選択された配列に関して７倍リッチ化を明らかにしている。
【０２３２】
ＲＡＰ配列がアフィニティー選択によりファージディスプレイライブラリから単離できると結論したことにより、本発明者等は先ず野生型ＲＡＰに結合していないＣＲ対であるＬＲＰ２ＣＲ８９を選択し、これを二重変異誘発完全長ＲＡＰファージライブラリとともにパニング基質として使用した。パニング４ラウンドの後、８無作為選択クローン中３つが同一であった。共通の配列は７変異、即ち：Ｖ１７５Ｌ、Ｓ２１３Ｔ、Ｅ２１７Ｋ、Ｈ２４９Ｙ、Ｅ２５１Ｋ、Ｋ２５６Ａ、Ｋ２７０Ｅを有していた。４クローンの第２のグループは２５６位および２７０位に同一の置換（Ｋ２５６Ａ、Ｋ２７０Ｒ）を有していたが、これらの２部位以外では多様な置換パターンを有していた。パニングの第５ラウンドの後、８無作為選択クローン中７つが以前に観察されたＶ１７５Ｌ、Ｓ２１３Ｔ、Ｅ２１７Ｋ、Ｈ２４９Ｙ、Ｅ２５１Ｋ、Ｋ２５６Ａ、Ｋ２７０Ｅの変異セットを有していた。この配列に関する全変異、即ち名称ＲＡＰｖ２ＡまたはＭｅｇａＲＡＰ１（配列番号９３）は、変異体ライブラリを作成するために特に変異誘発した領域にあった。
【０２３３】
アフィニティー選択の結果としてライブラリの分割が起こったことを確認するために、ＲＡＰおよびＭｅｇａＲＡＰ１ファージを作成し、ＬＲＰ２ＣＲ８９への結合に関して試験した。同一の出発力価から、野生型ＲＡＰファージよりも２．６倍高値のコロニー形成単位（ｃｆｕ）を、ＭｅｇａＲＡＰ１ファージを用いてパニングすることにより回収した。結合したファージを抗ｐＩＩＩ抗体を用いて検出した場合に同様の結果が得られ、２ファージの間の感染性の相違は回収されたファージの力価における相違の原因とはならなかったことが示された。５０ｍＭＥＤＴＡ存在下に結合反応を実施することにより、ＭｅｇａＲＡＰ１の結合はカルシウムに依存していることがわかり、受容体としての秩序のあるＣＲ折り畳みの必要性と合致していた。ＲＡＰおよびＭｅｇａＲＡＰ１ファージの両方が単一の保存的置換（Ｖ１７５Ｌ）により異なる同一のｄ１配列およびｄ２配列を有していたため、本発明者等はＬＲＰ２ＣＲ８９への結合における向上はｄ３における相違が担っていると仮定した。従って、ＲＡＰｄ３およびＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３をサブクローニングおよび発現させて後の結合試験に付した。更に試験するために発現したｄ３領域が成熟ＲＡＰのアミノ酸２０１〜３１９を含んでいたため、ＲＡＰｖ２Ａの結合挙動に対するＶ１７５Ｌ変異の作用は調べなかった。
【０２３４】
次に、ＲＡＰｄ３およびＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３蛋白のＬＲＰ１ＣＲ３−５およびＬＲＰ２ＣＲ８９への結合を試験した。親和性における相違への各ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３変異の相対的寄与度を理解するために、本発明者等は又、多くのＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３復帰変異株およびＲＡＰｄ３フォワード変異体を作成し、それらは全て、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３と野生型ＲＡＰｄ３の間の中間的な配列変異体を含んでいた（４アミノ酸Ｃ末端保持シグナルを欠失（配列番号９２））（図５Ａおよび５Ｂ、表２）。全ての場合において、１０ｍＭＥＧＴＡはＣＲ蛋白へのＲＡＰｄ３およびＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３の両方の結合を防止した。カルシウムが結合緩衝液中に存在する唯一の２価の金属イオンであったため、この観察結果はカルシウム負荷ＣＲ蛋白へのＲＡＰｄ３およびＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３の両方の結合と合致している。ＲＡＰｄ３は１６ｎＭの解離定数でＬＲＰ１ＣＲ３−５に結合し、ＬＲＰ２ＣＲ８９に対する有意な親和性は示さず、図４に示したデータに合致していた。逆にＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３は見かけの解離定数３８ｎＭでＬＲＰ２ＣＲ８９に結合したが、ＬＲＰ１ＣＲ３−５には有意な親和性を有していなかった。従って、野生型ＲＡＰｄ３およびＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３はこれらの２つの受容体フラグメントに対して反転した結合優先性を有している。２つのＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３復帰変異体であるＴ２１３ＳおよびＫ２１７ＥはＬＲＰ２ＣＲ８９に対して僅かに向上した親和性を有しており、そしてＬＲＰ１ＣＲ３−５に検出可能に結合することは不可能なままであった。３つのＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３復帰変異体、Ｙ２４９Ｈ、Ｋ２５１ＥおよびＡ２５６Ｋは何れの受容体フラグメントにも結合できず、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３とＬＲＰ２ＣＲ８９との間の相互作用のために変異が重要であり、そしてＬＲＰ１ＣＲ３−５への結合の途絶を個別に担っているわけではないことを示していた。興味深いことに、Ｅ２７０Ｋ復帰変異体はＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３よりも高い親和性で両方の受容体フラグメントに結合し、ＬＲＰ２ＣＲ８９に対しては８ｎＭ、そしてＬＲＰ１ＣＲ３−５に対しては１４２ｎＭの見かけの解離定数を示していた。ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３変異体はＬＲＰ２ＣＲ８９に対する親和性に基づいて選択されているため、この結果はすべての可能な配列変異体を説明するには不十分である出発ライブラリの多様性と合致している。或いは、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３とＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３Ｅ２７０Ｋとの間の親和性の相違は反復パニングにおいて後者を優勢とするには不十分である場合がある。二重復帰変異体Ｔ２１３Ｓ、Ｅ２７０Ｋは本発明者等の試験においてはＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３とは区別不可能であった結合挙動を有していた。これらの位置における２つの単一部位復帰変異体はＬＲＰ２ＣＲ８９に対して、そしてＥ２７０Ｋの場合はＬＲＰ１ＣＲ３−５に対しても向上した親和性を示すように観察されたため、この結果はこれらの復帰変異体に起因する結合作用に関する加法性の欠如、または、本発明者等の試験におけるこの親和性の範囲内における正確さの欠如を示している。Ｋ２５１Ｅ、Ｅ２７０Ｋ二重復帰変異体の結合挙動はＥ２５１Ｋ変異に対するＬＲＰ２ＣＲ８９へのＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３の親和性の強力な依存性を示唆している。この復帰変異体と単一部位Ｅ２７０Ｋ復帰変異体との間のＬＲＰ２ＣＲ８９の親和性における相違はほぼ２０倍である。Ａ２５６Ｋ、Ｅ２７０Ｋ二重復帰変異体はＬＲＰ２ＣＲ８９への親和性の２倍の損失をもたらし、このフラグメントへの親和性に対してＫ２５６ＡＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３変異が有している中等度の正の作用を示唆している。しかしながら、この二重復帰変異体とＥ２７０Ｋ単一部位復帰変異体との間の最も顕著な相違はＬＲＰ１ＣＲ３−５への親和性におけるほぼ３０倍の向上である。従って、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３におけるＫ２５６Ａの変異は２つの受容体フラグメントの間で区別するこの変異体の能力の重要な決定要因であり、ＬＲＰ２ＣＲ８９への親和性も同時に向上させつつＬＲＰ１ＣＲ３−５への親和性に負の影響を与えることによりその作用を発揮している。
【０２３５】
試験したＲＡＰｄ３フォワード変異体のうち、Ｅ２５１Ｋ、Ｋ２５６ＡおよびＫ２７０Ｅの組み合わせのみがＬＲＰ２ＣＲ８９への計測可能な親和性をもたらした。ＬＲＰ２ＣＲ８９へのこの３重変異体の結合に関する見かけの解離定数は１１４ｎＭであり、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３と比較してなお相対的に高値であった。この親和性の相違は恐らくはＨ２４９Ｙ変異の付加により更に縮小されると考えられる。２１７、２４９および２５１における単一部位のＲＡＰｄ３変異体はＬＲＰ１ＣＲ３−５の結合に対して最小限の作用を有しており、そしてＬＲＰ２ＣＲ８９への親和性を計測可能な範囲としなかった。Ｋ２７０Ｅ変異は、単独またはＥ２５１Ｋ、Ｋ２５６Ａまたは両方との組み合わせにおいて、ＬＲＰ１ＣＲ３−５に計測可能に結合できなかった。ＬＲＰ１へのＲＡＰｄ３の結合に対するＫ２５６ＡまたはＫ２７０Ｅの有意な負の作用は機能喪失ＲＡＰ変異体に対する試験において以前に報告されている（５５）。ここで報告している結果はこの研究と合致している。全体として、ＬＲＰ２ＣＲ８９の結合に対するＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３における２４９、２５１および２５６における変異の正の寄与度およびＬＲＰ１ＣＲ３−５の結合に対する２５６および２７０における変異の負の寄与度は、主に、２つの受容体フラグメントへの結合におけるＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３と野生型ＲＡＰｄ３の間の相違を説明していると考えられる。
【０２３６】
この研究の１つの前提はＣＲ対のカルシウム結合ループ内部のＡ、Ｃ、Ａ’およびＣ’におけるアミノ酸はＲＡＰへの結合親和性の重要な決定要因であり、ＲＡＰ変異体の結合のためにも同様に重要であるということである。この考えを試験するために、これらの位置におけるネイティブの非カノニカルの残基を順次非ネイティブのカノニカルな残基で置換した変異体のＬＲＰ２ＣＲ８９を作成した。上記した通り、ＬＲＰ２ＣＲ８９に関するＡ、Ｃ、Ａ’、Ｃ’列はＹＶＷＲである。変異体はＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２Ｗ（ＷＶＷＲ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｖ１０４７Ｄ（ＹＤＷＲ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｒ１０８８Ｄ（ＹＶＷＤ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｖ１０４７ＤＲ１０８８Ｄ（ＹＤＷＤ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＶ１０４７ＤＲ１０８８Ｄ（ＷＤＷＤ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＶ１０４７Ｄ（ＷＤＷＲ）、ＬＲＰ２ＣＲ８９Ｙ１０４２ＷＲ１０８８Ｄ（ＷＶＷＤ）を包含していた。ＲＡＰｄ３およびＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３の両方への結合は固相試験により各々のＬＲＰ２ＣＲ８９変異体に対して計測した。ＹＶＷＤ変異体のみがＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３への有意な結合を保持しており、ＬＲＰ２ＣＲ８９と相対比較して親和性の約２倍の損失があった（図６および表３）。ＹＤＷＲの４量体配列列を有するＣ位変異体は、全ての他の単一変異またはＡまたはＣを含む変異の組み合わせが行ったようなＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３への計測可能な結合ができなかった。興味深いことに、名目上は保存的なＹ１０４２Ｗ変異単独でＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３の結合を防止するためには充分であった。ＬＲＰ２ＣＲ８９におけるＡ位はトリプトファン、即ち野生型ＲＡＰｄ３結合のためのカノニカルな残基であり、そして本発明者等の試験においては変異していなかった。Ａ、ＣおよびＣ’におけるアミノ酸の置換はＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３の結合に対する強力な負の影響を有しているが、これらの置換は、ＬＲＰ１ＣＲ５６のような他のＣＲ対におけるＲＡＰｄ３により好まれるアミノ酸の置換にも関わらず、ＲＡＰｄ３に対する親和性を大きく向上させなかった。本発明者等はＡ、Ｃ、Ａ’およびＣ’におけるＷＶＷＤおよびＷＤＷＤの組み合わせへのＲＡＰｄ３の結合の僅かな上昇を確かに観察している。これらの結果はカルシウム結合ループにおける一部のアミノ酸はＲＡＰおよびＲＡＰｖ２Ａの結合挙動を定義するために重要であるが、それらは単独ではそれを行うために十分ではないことを示唆している。
【０２３７】
スクリーニング法の一般性の試験として、ファージライブラリパニング実験を別のＣＲ蛋白に対して実施した。単離した変異体の配列は表４および図８に示す通りである。先ず、ＲＡＰｄ３単独の変異体をコードするファージディスプレイライブラリを用いたパニングのための基質として、ヒトＶＬＤＬＲの最後の３つのＣＲドメインを構成するＶＬＤＬＲＣＲ６−８を使用した。パニング５ラウンドの後、８無作為選択クローン中５つが同じ変異セット、即ち：Ｒ２０５Ｓ、Ｅ２５１Ｒ、Ｋ２５６Ｌ、Ｋ２７０Ｅ、Ｒ２９６Ｌ、Ｇ３１３Ｄを有していた。この配列変異体、ＶＲＡＰ１）ｄ３を固相結合試験のために発現させた。ＶＲＡＰ１ｄ３、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３およびＲＡＰｄ３のＬＲＰ１ＣＲ３−５、ＬＲＰ２ＣＲ８９およびＶＬＤＬＲＣＲ６−８への結合を比較した。同様の変異体配列、Ｅ２５１Ｔ、Ｋ２５６Ｉ、Ｋ２７０Ｅ、Ｒ２９６ＬをＶＬＤＬＲＣＲ７８上で選択した。本発明者等は又、同じｄ３ライブラリを用いながらヒトマトリプターゼ由来の３つのＣＲ対、ＭＡＴＣＲ１２、ＭＡＴＣＲ２３およびＭＡＴＣＲ３４上でパニングを行った。マトリプターゼ対に対するパニングの第６ラウンドによりファージライブラリを主要な配列に分割した。ＭＡＴＣＲ２３上で選択した主要な配列はＥ２５１Ｇ、Ｋ２５６Ｒ、Ｋ２７０Ｗであった。この変異体をＭａｔＲＡＰ１（ＲＡＰｖＭＡ）と命名した。ＭＡＴＣＲ３４上で選択した主要な配列はＳ２３２Ｐ、Ｅ２３９Ｇ、Ｅ２４６Ｇ、Ｅ２５１Ｌ、Ｋ２５６Ｐ、Ｉ２６６Ｔ、Ａ２６７Ｖ、Ｈ２６８Ｒ、Ｋ２７０Ｐ、Ｈ２７３Ｙ、Ｒ２８７Ｈ、Ｈ２９０Ｙ、Ｋ２９８Ｒ、Ｓ３１２Ｆであった。この変異体をＭａｔＲＡＰ２（ＲＡＰｖＭＢ）と命名した。パニング実験は又ＦＤＣ−８Ｄ６抗原由来のＣＲ対に対しても実施した。選択した主要な変異体はＫ２５６Ｓ、Ｋ２７０Ｓ、Ｌ２７１Ｍ、Ｄ２７９Ｙ、Ｖ２８３Ｍ、Ｋ３０５Ｔ、Ｋ３０６Ｍであった。この変異体を３２０ＲＡＰ１と命名した。
【０２３８】
ＲＡＰｄ３配列変異体の長さを最小限化できる程度を試験するために、ＭａｔＲＡＰ１の逐次的にトランケーションされた切片をＰＣＲにより作成し、発現させ、精製し、そして上記した通り結合に関して試験した（図９）。１０アミノ酸の除去は親和性を僅かに減衰させたが、Ｎ末端からの３１および４２アミノ酸の除去は完全長ｄ３変異体を超えて３倍までの親和性の漸増をもたらした。別の１０アミノ酸で開始される別のＮ末端トランケーション（合計５２）は完全な結合消失をもたらした。最良のＮ末端トランケーション変異体（ＭａｔＲＡＰ１Ｎ−４２）のその後のＣ末端トランケーションにより結合親和性の更に優位な増大がもたらされ、Ｃ末端リンカーおよびアフィニティータグの除去による２倍増大（完全長から６倍）に始まり、そして次にＣ末端からの別の６アミノ酸の除去後に４倍増大（完全長を超えて１２倍）に至った。別の１９アミノ酸で開始される別のＣ末端のトランケーションにより、結合の完全な消失がもたらされた。最良のトランケーションされた変異体はアミノ酸２４３〜３１３（７１アミノ酸）よりなるものであった。親和性の向上におけるこの修飾の一般性を試験するために、本発明者等は３２０ＲＡＰ１に対して同一のトランケーションを作成した。この変異体の得られたトランケーションされた型は完全長変異体と比較してＦＤＣ−８Ｄ６抗原対に対する親和性において３．５倍の向上で結合した（図１０）。
【０２３９】
ＶＬＤＬＲＣＲ７８へのＶＲＡＰ１ｄ３の結合に関する見かけの解離定数は４４±９ｎＭであることが測定された。次に本発明者等はＬＲＰ１ＣＲ３−５、ＬＲＰ２ＣＲ８９、ＬＲＰ２ＣＲ２７２８、ＬＲＰ２ＣＲ３０３１、ＬＲＰ２ＣＲ３４−３６、ＬＲＰ２ＣＲ３５３６、ＶＬＤＬＲＣＲ７８、ＶＬＤＬＲＣＲ６−８、ＬＲＰ６ＣＲ１−３、ＬＲＰ６ＣＲ１２、ＬＲＰ６ＣＲ２３、ＭＡＴＣＲ１２、ＭＡＴＣＲ２３およびＭＡＴＣＲ３４を包含する１４のＣＲ対またはトリプレットへの、各々８０ｎＭの濃度における、ＲＡＰｄ３、ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３、ＶＲＡＰ１ｄ３、ＭａｔＲＡＰ１ｄ３およびＭａｔＲＡＰ２ｄ３の結合を比較した（図７）。前回と同様、ＲＡＰｄ３はＬＲＰ１ＣＲ３−５に結合するのみであった。ＭｅｇａＲＡＰ１ｄ３はＬＲＰ２ＣＲ８９のみに結合した。ＶＲＡＰ１ｄ３はＣＲ７８対を包含するトリプレットであるＶＬＤＬＲＣＲ７８およびＶＬＤＬＲＣＲ６−８の両方に結合した。ＭａｔＲＡＰ１およびＭａｔＲＡＰ２はＭＡＴＣＲ１２およびＭＡＴＣＲ２３の両方に結合したが、他のＣＲ対にはその傾向は小さかった。
【０２４０】
ＣＲ対およびトリプレット上のパニングに加えて、全体のＣＲ対含有ヒト蛋白をＲＡＰｄ３変異体ファージパニング操作法のための標的として使用した。これらの市販の蛋白はｃｏｒｉｎ、ＬＲＰ６、ＦＤＣ−８Ｄ６抗原および補体因子Ｉを包含していた。パニングは単離されたＣＲ対およびトリプレットに関して記載したものと全く同様に実施した。
【０２４１】
（実施例２）
インビトロおよびインビボの試験を用いたＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体の評価
ＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体は、治療薬として、または血液脳関門または他の型の組織膜を通過して治療薬または診断薬を輸送することにより種々のヒトの状態または障害を治療するために、有用である。インビトロの活性または輸送試験およびＲＡＰ変異体の活性または分布のインビボの計測は、ＲＡＰ変異体の薬効を試験するための方法の例である。そのような試験の例を以下に開示する。
【０２４２】
本明細書に記載する反復ＣＲドメインの何れかに結合したＣＲ特異的抗体の製造は、当該分野で知られた何れかの手段を用いて実施してよく、そしてそのようにして製造された抗体を、他のＣＲ対と比較した場合に所望のＣＲ対に対して相対的により高値の結合があるかにつきスクリーニングしてよい。このようにして選択された抗体を次に、ファミリー中の他のＣＲ含有蛋白１つ以上と比較した場合の所望のＣＲ含有蛋白への結合があるかにつき試験することになる。次にこれらの基準に合致する抗体を、後述する例示される試験において、所望の組織にターゲティングする能力、受容体活性の改変、および／または疾患の防止または治療に関して、単独または他の活性剤にコンジュゲートした状態で試験することができる。
【０２４３】
マトリプターゼ選択的ＲＡＰ変異体を用いたインビボの抗腫瘍試験−腫瘍の形成および進行に対してマトリプターゼ選択的ＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体が有する拮抗作用を試験するために、少なくとも２つのインビボのモデルを用いることができる。第１のモデルはヒト腫瘍細胞系統を接種したヌードマウスを利用しており、そして文献に十分説明されている。この系は腫瘍の進行を緩徐化するＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体の能力を試験するために有用である。第２のモデルはケラチンプロモーターの制御下にマウスマトリプターゼを過剰発現することにより、上皮組織への発現を制限するトランスジェニックマウスモデルを利用している。このモデルもまた以前に報告されている（Ｌｉｓｔ等、  Ｇｅｎｅｓ  ａｎｄ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，２００５，１９：１９３４−１９５０）。
【０２４４】
組み換えＭＤＣＫ細胞を用いたＬＲＰ２およびＶＬＤＬＲ選択的ＲＡＰのインビトロ輸送試験−細胞膜を通過するＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体の輸送を試験するために、インビトロの輸送試験を使用する。ヒトＬＲＰ２（ＬＢ２）のミニ受容体および完全長ヒトＶＬＤＬＲを発現する安定に感染されたＭＤＣＫ細胞をインビトロで培養する。これらの細胞を０．４μｍの均一な孔径を有するトランスウェルポリアセテートメンブレンインサート（Ｃｏｓｔａｒ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＭＡ）上にプレーティングする。細胞を２ｘ１０５／ｍｌの細胞密度で播種し、そして１０％ＦＢＳを添加したＤＭＥＭ中で培養する。培地は３日毎に交換する。細胞は３７℃において５％ＣＯ２インキュベーター中に維持する。トランスサイトーシス試験は３連で実施する。輸送試験の２０分前に、トランスウェルインサートを３７℃において輸送緩衝液（２５ｍＭＨＥＰＥＳおよび０．１％アルブミンを含有するＨａｎｋバランス塩溶液）中で平衡化させる。輸送は上下のチャンバーに１２５Ｉ−ＲＡＰ変異体（１μＣｉ／ｍｌ）および９９ｍＴｃ−アルブミン（２μＣｉ／ｍｌ）を添加することにより開始する。プレートは全操作を通して１３０ｒｐｍで穏やかに振とうしながら３７℃に維持する。標識蛋白添加の５、１０、１５、２０、３０、４０、５０および６０分後、試料１０μｌを各ウェルの上下チャンバーから収集する。６０分において、上下チャンバーの全溶液を氷上の別個の試験管に移す。１２５Ｉおよび９９ｍＴｃ由来の総放射能を二重チャンネルプログラムを有するガンマカウンターで同時に計測する。輸送後の未損傷のＲＡＰおよびアルブミンの量は、酸沈殿および試料の可溶性および不溶性画分における放射能係数の比較により計測する。
【０２４５】
マウスにおけるＲＡＰおよびＲＡＰ変異体の組織分布の計測−インビボで組織をトランスサイトーシスに付すＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体の能力を測定するために、投与動物由来の組織試料中のＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体の組織分布を計測する。
【０２４６】
体重２５〜３５グラムの雄性ＣＤ１マウス（Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）をペントバルビタール３０ｍｇ／ｋｇおよびケタミン３０ｍｇ／ｋｇの腹腔内注射により麻酔する。各マウスには瞬時注射により１２５Ｉ−ＲＡＰまたはＲＡＰ変異体またはＣＲ特異的抗体および血管スペースマーカーとしての１３１Ｉ−アルブミン（１％アルブミン含有ラクテート加リンゲル中各標識蛋白１μＣｉ）を左頸静脈から投与する。所定の時間間隔において（注射後１〜６０分）、右総頸動脈を切断することにより採血し、そしてマウスを断首した。脳および末梢試料を収集し、重量および放射能に関して試験する。分布の容量は当該分野で良く知られている手法を用いながら計算する。組織試料中の放射能の低下は、ＲＡＰ変異体が標識野生型ＲＡＰと結合において競合しており、そして野生型ＲＡＰの代わりに内在化されることを示している。
【０２４７】
細胞増殖試験におけるＬＲＰ６選択的ＲＡＰ変異体の抗増殖作用の計測−ＬＲＰ６の過剰発現は増大した腫瘍形成性と相関していた。ＲＡＰ蛋白はＬＲＰ６の強力な結合物質であり、そしてＲＡＰの変異体はＲＡＰ／ＬＲＰ６の相互作用を阻害するため、またはＬＲＰ６発現細胞に薬物を送達するために有用である場合がある。ＲＡＰ変異体がＬＲＰ６媒介細胞増殖をモジュレートする能力を調べるため、細胞増殖試験を実施する。
【０２４８】
ＬＲＰ６発現コンストラクト（Ｌｉ，（２００４）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ２３，９１２９−９１３５）でトランスフェクトしたＨＴ１０８０細胞を６ウェルプレートに播種した（５ｘ１０４個／ウェル）。ＲＡＰ変異体および他の被験化合物を５〜５０ｎＭで生育培地に包含させる。毎日培地を交換し、細胞を採取する。細胞はＶｉ−Ｃｅｌｌ分析システムを用いながら計数し、そして生存性に関して採点する。種々の試験条件下における倍加時間をＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍソフトウエアを用いて非直線回帰により求める。ＲＡＰ変異体存在下における細胞増殖の低下は、ＲＡＰ変異体がＬＲＰ６誘導細胞増殖の有効な阻害剤であることを示している。同様の試験をＣＲ特異的抗体を用いて実施することができる。
【０２４９】
軟質寒天コロニー試験におけるＬＲＰ６選択的ＲＡＰ変異体の抗増殖作用の計測−ＬＲＰ６発現コンストラクトでトランスフェクトしたＨＴ１０８０細胞を寒天層（０．５％寒天および５％ＦＢＳを含有するＤＭＥＭ培地）でコーティングした６ウェルプレート中で培養する。細胞は０．３３％寒天および５％ＦＢＳを含有するＤＭＥＭ培地中に２ｘ１０３個の細胞を含有する第２の層ないに播種する。寒天および細胞に培地を積層することにより乾燥を防止する。ＲＡＰ変異体を包含する被験化合物を培地に直接添加し、そして細胞と共にインキュベートする。培地は３日毎に交換する。３連のウェルを各細胞系統につき製造する。３週間のインキュベーションの後、直径０．１ｍｍより大きいコロニーを採点する。ＲＡＰ変異体存在下のコロニー形成の低下は、ＲＡＰ変異体がＬＲＰ６誘導細胞増殖の有効な阻害剤であることを示している。
【０２５０】
腫瘍形成性のヌードマウスモデルにおけるＬＲＰ６選択的、マトリプターゼ選択的およびＦＤＣ−８Ｄ６選択的ＲＡＰ変異体の抗腫瘍作用の計測−インビボのＬＲＰ６、マトリプターゼまたはＦＤＣ−８Ｄ６抗原阻害に対するＲＡＰ変異体の作用を調べるために、腫瘍形成性の実験動物モデルを使用する。同様の試験をＣＲ特異的抗体を用いて実施することができる。
【０２５１】
雌性無胸腺ヌードマウス（４〜５週齢）（Ｈａｒｌａｎ  Ｓｐｒａｇｕｅ−Ｄａｗｌｅｙ）（Ｉｎｄｉａｎａｐｏｌｉｓ，ＩＮ）に横腹への皮下注射（９）によりＬＲＰ６発現コンストラクトでトランスフェクトしたＨＴ１０８０細胞（５０％マトリゲルマトリックス含有無血清ＤＭＥＭ２００μＬ中６ｘ１０６個の細胞（ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ））、ＣＷＲ２２Ｒ前立腺癌細胞（マトリプターゼ）またはＬ３０５５バーキットリンパ腫細胞（ＦＤＣ−８Ｄ６抗原）を投与する（３６）。選択的ＲＡＰ変異体、またはベヒクル単独を腫瘍細胞を投与されたマウスまたは対照動物に一日置きに滅菌ＰＢＳ中で尾静脈注射により投与する。腫瘍サイズは７日毎に計測し、そして腫瘍体積は幅（ａ）および長さ（ｂ）の計測を用いて計算する（ａ２ｘｂ／２、式中ａ＜ｂ）。
培養骨芽細胞におけるＬＲＰ５依存性Ｗｎｔシグナリングに対するＲＡＰ変異体の作用の計測−ＬＲＰ５を介したＷｎｔシグナリングは骨芽細胞の分化を増大させ、破骨細胞の活性を阻害し、そして骨付着を増強することが明らかにされている（Ｗｅｓｔｅｎｄｏｒｆ（２００４）Ｇｅｎｅ３４１，１９−３９；Ｚｈａｎｇ等、（２００４）Ｍｏｌ  Ｃｅｌｌ  Ｂｉｏｌ２４，４６７７−４６８４；Ｍｉｚｕｇｕｃｈｉ等、（２００４）Ｊ  Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅｔ４９，８０−８６）。ＲＡＰはＬＲＰ５においてＣＲに結合するため、ＲＡＰ変異体は受容体を介してＷｎｔシグナリングをモジュレートする場合に有用であると考えられる。ＷｎｔシグナリングをモジュレートするＲＡＰ変異体の能力を培養骨芽細胞を用いて計測する。同様の試験をＣＲ特異的抗体を用いて実施することができる。
【０２５２】
骨芽細胞系統ＭＧ６３は大量のＬＲＰ１を発現するが、ＶＬＤＬＲは発現しない。ＳＡＯＳ−２細胞は大量のＶＬＤＬＲを発現するが、ＬＲＰ１は殆ど発現しない（Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）アクセッション番号ＨＴＢ−８５）。ＭＧ６３およびＳＡＯＳ−２細胞を１０％ＣＯ２中３７℃において１０％ＦＢＳ添加ＤＭＥＭ中で生育させる。培地にはＷｎｔシグナリング経路を誘導するためのＷｎｔ７ａを、緩衝液、ＤＫＫ−１、Ｍｅｓｄ、ＲＡＰまたはＲＡＰ変異体と共に添加する。氷冷ＰＢＳで洗浄した後、細胞を収集し、ガラス製のＤｏｕｎｃｅホモゲナイザー中、１００ｍＭＴｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ７．４、１４０ｍＭＮａＣｌ、２ｍＭＤＴＴ、２ｍＭＰＭＳＦ、および１ｘＣｏｍｐｌｅｔｅＴＭプロテアーゼ阻害剤（５００μｌ／ウェル）を用いながらホモゲナイズする。ホモジネートを５００ｘｇで１０分間遠心分離し、上澄みを更に９０分間４℃で１００，０００ｘｇで遠心分離する。β−カテニンレベルは、Ｃｅｌｌ  Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙより入手したβ−カテニン特異的抗体を用いながらウエスタンブロットにより清澄化上澄み中で計測する。免疫反応性蛋白はＥＣＬシステムを用いながら検出する。或いは、細胞を先ず０．５μｇのβ−カテニン発現ベクター、０．５μｇのＷｎｔ１発現ベクター、またはブランクのｐｃＤＮＡ３ベクターを用いながら、０．５μｇのＴＯＰ−ＦＬＡＳＨＴＣＦルシフェラーゼコンストラクト（Ｕｐｓｔａｔｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）でトランスフェクトする。β−ガラクトシダーゼ発現ベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）をトランスフェクション効率のための内部対照として包含させる。４８時間後、培地を交換し、そして何れかの緩衝液、ＤＫＫ−１、Ｍｅｓｄ、ＲＡＰまたはＲＡＰ変異体を添加する。更に６時間インキュベートした後、細胞を溶解し、ルシフェラーゼおよびβ−ガラクトシダーゼの両方の活性を酵素試験キット（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いて測定する。ルシフェラーゼ活性はＤｕａｌ  Ｌｕｃｉｆｅｒａｓｅ  Ａｓｓａｙシステム（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いながらルミノメーターで測定する。ルシフェラーゼ活性はβ−ガラクトシダーゼの活性に対して規格化する。
【０２５３】
（実施例３）
環状ＲＡＰペプチドの製造および特性化
環状ＲＡＰペプチドを以下の通り製造し、そして結合親和性に関して特性化した。ＲＡＰペプチドはＡｂｇｅｎｔ（Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ）が製造した。ペプチドをＨＰＬＣで精製し、質量スペクトルにより特性化した。ＮＳ０−発現の精製された組み換え体マウスＶＬＤＬＲエクトドメインおよび組み換え体ヒトＬＲＰ１リガンドが結合したクラスターＩＩはＲ＆ＤＳｙｓｔｅｍｓ（Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ）から購入した。タグ非含有のＲＡＰｄ３はＧｅｎｅＳｃｒｉｐｔ（ＳａｎＤｉｅｇｏ）により発現および精製された。ヒトＲＡＰはＤｒ．Ｇｕｏｊｕｎ  Ｂｕ（Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ、Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，Ｓｃｈｏｏｌ  ｏｆ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ）より入手した。ブラッドフォード試験を用いて蛋白定量を行った。
【０２５４】
固相結合試験は以下の通り実施した。組み換え体ネズミＶＬＤＬＲエクトドメイン（ａａ１〜７９８、Ｃ末端ヘキサヒスチジン、１μｇ）またはｒｈＬＲＰ１クラスターＩＩ（ａａ７８６〜１１６５、Ｃ末端Ｆｃ、１μｇ）を４℃で一夜、５ｍＭＣａＣｌ２添加ＴＢＳｐＨ８（ＴＢＳＣ）中ＮｕｎｃＭａｘｉｓｏｒｐＴＭ９６穴プレートに結合させた。ウェルをＴＢＳＣで洗浄し、次に２％ＢＳＡ含有ＴＢＳＣでブロッキングした。次にペプチドを室温で０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０添加上記ブロッキング緩衝液中で２時間ある範囲の濃度の固定化受容体と共にインキュベートした。同一の結合反応を５０ｍＭＥＤＴＡ存在下で実施することにより非特異的結合の尺度とした。対照ウェルにはペプチドを添加しなかった。別の対照により抗体と受容体との間の交差反応性の非存在を樹立した。ウェルはＴＢＳＴＣで洗浄し、結合ペプチドはストレプトアビジン−ＨＲＰ（Ｐｉｅｒｃｅ）またはポリクローナル抗ＲＡＰ（１：１，０００、Ｒａｐｔｏｒ  Ｐｈａｒａｍｃｅｕｔｉｃａｌ）で検出した。被験ペプチドへの抗ＲＡＰポリクローナル抗体の結合はウエスタンブロットにより定性的に確認した（データ示さず）。過剰なストレプトアビジン−ＨＲＰまたは一次抗体を除去し、ウェルを洗浄した後に、必要に応じて二次抗体、ＨＲＰ−コンジュゲートヤギ抗ウサギＩｇＧ（ＢｉｏＲａｄ）とのインキュベーションを行った。ＴＭＢ試薬（ＢｉｏＲａｄ）を用いて発色させた。４５０ｎｍにおける吸光度をマイクロプレートスペクトル分析器（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ）で計測した。ＥＤＴＡ存在下に得られた吸光度をカルシウム存在下に得られた吸光度から差し引いた後に分析した。データをプロットし、単一部位結合と仮定しながら非直線回帰によりＫｄ値を誘導した（ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ）。
【０２５５】
成熟ヒトＲＡＰのアミノ酸２０１〜３１９を含む細菌発現され精製されたタグ非含有のＲＡＰｄ３ペプチドをＧｅｎｅＳｃｒｉｐｔから購入した。このペプチドはＣ末端ＨＮＥＬテトラペプチドを欠失している。ユニークなシステインがＣ末端に包含させることによりアフィニティータグ付けを容易にした。ＲＡＰｄ３ペプチドはマレイミド−ＰＥＯ２−ビオチン（Ｐｉｅｒｃｅ）に連結させ、そして得られたコンジュゲートを脱塩および活性化チオールセファロースビーズ（ＧＥ  ＢＩｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を用いた未反応ペプチドの捕獲により精製した。全ての他のペプチドは固相ペプチド合成により作成した。ＲＡＰｄ３とＬＤＬＲＣＲ３および４との間の複合体に関する構造データの検討により、ＣＲ対との接触面を構成している残基を除去することなくＲＡＰｄ３の大半のトランケーションを実施できることが示唆された。接触面とフランキングしている配列の一部が折り畳み安定化に関与することが示唆されているため、本発明者等は、非ネイティブのジスルフィドはそれらの非存在下における折り畳み構造を安定化させる手段として導入されると推論した。ＲＡＰｄ３、ｍＲＡＰｃ（配列番号９９）の最小化型を作成するために、ＲＡＰｄ３ＬＤＬＲＣＲ３および４の複合体の構造におけるヘリックス１上のＨ２４９に対してＮ末端側、そしてヘリックス２上のＴ３０３に対してＣ末端側に位置する残基の緊密に相反した対を発見し、そしてグリシンで置き換えた。これらの置換はＡ２４２ＧおよびＲ３１４Ｇである。これらの部位におけるグリシンの導入は隣接する非ネイティブのヘリックス間のジスルフィド結合のためにヘリックス内に中断部をもたらすことを意図していた。次に２つのシステインをそれぞれヘリックス１および２におけるＧ２４２およびＧ３１４の前および後で置換することにより、ジスルフィド結合の形成を可能にした。これらの置換はＥ２４１ＣおよびＩ３１５Ｃであった。ヘリックス２のＣ３１５に対してＣ末端側にはそれ以外の残基は包含させなかった。配列ビオチン−ＧＧＳＧＧ（配列番号１０２）をヘリックス１のＥ２４１ＣのＮ末端側に付加させることによりストレプトアビジン−レポーターコンジュゲートによる効率的な検出を可能にした。ペプチドは固相合成中に分子内ジスルフィド結合形成により環化させた。ｍＲＡＰｃペプチドの線状化対照であるｍＲＡＰを得るために、両方のシステインをセリンで置換した。ｍＲＡＰｃの別の対照として、変異Ｋ２５６ＡおよびＫ２７０Ｅを有する以外は同一のペプチド、即ちｍＲＡＰｃｋｏを作成した。これらの変異はＬＲＰ１に対するＲＡＰｄ３の親和性を有意に低下させることが予めわかっている。
【０２５６】
ＬＲＰ１およびＬＤＬＲファミリーの別の受容体であるＶＬＤＬＲに対するペプチドの結合親和性を以下の通り計測した。ＮＳ０−発現および精製されたｈｒＬＲＰ１またはＶＬＤＬＲ（Ｒ＆ＤＳｙｓｔｅｍｓ）を用いて９６穴プレートをコーティングした。種々の希釈度の被験ペプチドを３連で５０ｍＭＥＤＴＡの存在下および非存在下に固定化された受容体と共にインキュベートした。十分洗浄した後、結合したペプチドをストレプトアビジン−ＨＲＰで検出した。ＥＤＴＡ存在下に計測した結合値をＥＤＴＡ非存在下に計測した値から差し引くことにより、カルシウム依存性の結合レベルを求めた。補正した値をプロットし、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍを用いながら単一の結合部位と仮定して非直線回帰によりフィットさせた。結果を図１２Ａおよび１２Ｂに示す。
【０２５７】
ｍＲＡＰ（配列番号１０７）およびｍＲＡＰｃｋｏはｈｒＬＲＰ１クラスターＩＩに対する計測可能な親和性を有していなかったが、ｍＲＡＰｃは１０±２ｎＭのＫｄでカルシウム依存的な態様において高親和性で結合した。この結合親和性はこの系においては完全長のＲＡＰｄ３のものとは差がなかった（８±１ｎＭ）。更に又、マウスＶＬＤＬＲの全エクトドメインへのペプチドの結合も計測した。結合親和性はやはり同等であり、解離定数はｍＲＡＰｃでは５±１ｎＭであり、そして完全長ＲＡＰｄ３では１±０．２であった。
【０２５８】
（実施例４）
別の環状ＲＡＰペプチドの特性化
別の環状ＲＡＰペプチドを上記した通り開発し、そしてＬＲＰ１受容体に結合するその能力を試験した。
【０２５９】
ｍＲＡＰ−８ｃペプチドを形成するために、アミノ酸２４６〜３１２のトランケーションされたＲＡＰペプチド配列を利用し、そして以下のアミノ酸置換、即ち：Ｅ２４６Ｃ、Ｌ２４７ＧおよびＬ３１１ＧおよびＳ３１２Ｃを作成した。ｍＲＡＰ−８ｃペプチドは配列番号１００に示す通りである。別のトランケーションされたペプチドｍＲＡＰ−１４ｃを作成するために、２５０位で始まり３０９位で終わるトランケーションされたＲＡＰを使用した。以下のアミノ酸置換、即ち：Ｆ２５０ＣおよびＬ３０８ＧおよびＱ３０９ＣをｍＲＡＰ−１４ｃに対して行った。ヘリックス１に由来するＦ２５０Ｃ側鎖は複合体の構造におけるヘリックス２において既に直接位置付けられているため、ｍＲＡＰ−１４ｃの場合にはシステインの後にグリシンを置換させなかった。ｍＲＡＰ−１４ｃの配列を配列番号１０１に示す。別のトランケーションされた環化ペプチドであるヘプタイドを開発した。ヘプタイドの配列はＲＡＰのアミノ酸２４６〜３１３から誘導した。以下のアミノ酸置換、即ち：Ｅ２４６Ｃ、Ｌ２４７Ｇ、Ｇ２８０Ａ、Ｌ３１１Ａ、およびＳ３１２Ｃを行うことによりヘプタイドを形成した。ヘプタイドの配列を配列番号１０３に示す。
【０２６０】
ＬＲＰ１およびＶＬＤＬＲ受容体へのｍＲＡＰ−８ｃおよびｍＲＡＰ−１４ｃペプチドの結合は上記した通り評価した。ｍＲＡＰ−８ｃは約４〜６ｎＭの親和性（２つの別個の試験）でＬＲＰ１（クラスターＩＩ）受容体に結合したのに対し、ｍＲＡＰ−１４ｃは約２１ｎＭの親和性で結合した。ヘプタイド環状ペプチドは約３．５ｎＭの親和性でＬＲＰ１に結合した。
【０２６１】
これらの結果は数種の異なる環状ＲＡＰペプチドが高親和性でＬＲＰ１受容体に結合できることを示している。
【０２６２】
（実施例５）
インビトロにおける細胞への環状ＲＡＰペプチドの結合
細胞表面上の受容体に結合する環状ＲＡＰペプチドの能力を測定するために、培養細胞系統の存在下に結合を評価した。環状ＲＡＰペプチドが培養物中の細胞上に発現された完全長ＬＲＰ１により結合され、エンドサイトーシスに付されるかどうかを調べるために、エンドサイトーシス依存性毒性試験を使用した。２つの細胞系統を使用し、即ち１つのみの高親和性ＲＡＰ受容体ＬＲＰ１を発現するチャイニーズハムスター卵巣ＣＨＯ−Ｋ１細胞、およびＬＲＰ１発現を欠失している変異体ＣＨＯ−Ｋ１を対照として使用した。細胞を２．５％ウシ胎児血清を添加したＢｉｏＷｈｉｔｔａｋｅｒＵｌｔｒａＣＨＯ培地（Ｌｏｎｚａ，Ｂａｓｅｌ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄ）中で培養した。細胞を１２穴組織培養プレート中に播種した。ビオチニル化ｍＲＡＰｃを、ストレプトアビジンと細菌毒サポリン（ＺＡＰ，Ａｖａｎｃｅｄ  Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）との間のコンジュゲート等モル量と組み合わせた。混合物は１００ｎＭとなるまで１０％ＦＢＳを添加したフェノールレッド（Ｍｅｄｉａｔｅｃｈ，Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ）を含有しないＭＥＭ中に希釈した。コンジュゲートしたｍＲＡＰｃ（１００ｎＭ）および対照薬剤（ｍＲＡＰｃ単独、１００ｎＭ、ストレプトアビジン−サポリン単独、１００ｎＭ、サポリン単独、１ｍＭ）をコンフルエントの細胞と共に培養し、そして細胞死を４８時間後にＭＴＴ試験（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）により試験した。
【０２６３】
結果を図１２に示す。ｍＲＡＰｃペプチド単独では使用した細胞片に関わらず細胞の生存に対して影響を有していなかった。ストレプトアビジン−サポリンコンジュゲート単独では、野生型ＣＨＯ−Ｋ１細胞に対しては約１０％生細胞数が低減されたが、ＬＲＰ欠損細胞に対する影響は観察されなかった。ｍＲＡＰｃと細胞毒性コンジュゲートの組み合わせは野生型ＣＨＯ−Ｋ１に対しては約４０％まで生細胞数を低減したが、ＬＲＰ欠損細胞に対しては僅か５％の損失のみもたらした。
【０２６４】
これらのデータはＬＲＰ１細胞内経路を介した毒素の内在化により受容体依存性の態様において細胞毒性コンジュゲートの毒性を有意に増大できることを示唆している。
【０２６５】
結合阻害試験も又、ＬＲＰ１（クラスターＩＩ）へのＲＡＰｄ３の結合並びにＬＲＰリガンドα−２−マクログロブリンおよびｕＰＡ／ＰＡ１−１の結合を妨害するｍＲＡＰｃペプチドの能力を測定するために実施した。ストレプトアビジンまたは抗ビオチン抗体との複合体形成を可能とするために、ｍＲＡＰｃペプチドをペンタペプチドリンカー（ＧＧＳＧＧ）によりＲＡＰ配列から分離されたＮ末端ビオチン残基を用いてフィットさせた。固相結合試験を組み換え体ヒトＬＲＰ１クラスターＩＩ（アミノ酸７８６〜１１６５、Ｃ末端Ｆｃタグ保持、１μｇ、Ｒ＆ＤＳｙｓｔｅｍｓ、Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）を用いて実施することにより４℃で一夜５ｍＭＣａＣｌ２添加ＴＢＳｐＨ８（ＴＢＳＣ）中ＮｕｎｃＭＡＸＩＳＯＲＰＴＭ９６穴プレートをコーティングした。データはＥＬＩＳＡ試験により求めた。ウェルをＴＢＳＣで洗浄し、２％ＢＳＡ含有ＴＢＳＣでブロッキングした。ストレプトアビジンとビオチニル化ペプチドの間の複合体を用いる試験においては、ＬＲＰ１リガンド（ＲＡＰｄ３（２ｎＭ）、トリプシン活性化α−２−マクログロブリン（１ｎＭ）またはｕＰＡ／ＰＡＩ−１（１０ｎＭ）を、室温において０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０を添加した上記ブロッキング緩衝液中で２時間、阻害剤の存在下または非存在下において、固定化された受容体と共にインキュベートした。抗ビオチン抗体およびビオチニル化ペプチドの複合体を用いる試験においては、全ての阻害剤溶液を固定化されたＬＲＰ１−Ｃ２と予備インキュベートした後に、洗浄し、そして後のリガンドとのインキュベートに付した。ＣＲ対のリガンド結合コンピテンスはカルシウムを必要とするため、５０ｍＭＥＤＴＡの存在下に同一の結合反応を行うことにより非特異的結合の尺度とした。対照ウェルには阻害剤を添加しなかった。ウェルを５ｍＭＣａＣｌ２および０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０を添加したＴＢＳで洗浄した。結合したリガンドは抗−Ｓ−ペプチド−ＨＲＰコンジュゲート（Ａｂｃａｍ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＭＡ）、抗−α−２−マクログロブリン−ＨＲＰまたは抗−ＰＡＩ−１−ＨＲＰの何れかを用いて検出した。過剰のＨＲＰコンジュゲートを除去し、そしてウェルを洗浄した。ＴＭＢ試薬（ＢｉｏＲａｄ，Ｈｅｒｃｕｌｅｓ，ＣＡ）を用いて発色させた。４５０ｎｍにおける吸光度をマイクロプレートスペクトル分析器（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ，Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ，ＣＡ）で計測した。
【０２６６】
ストレプトアビジンまたは抗ビオチン抗体の何れかの存在下および非存在下のＬＲＰ１−Ｃ２への組み換え体ＲＡＰｄ３の結合を阻害するｍＲＡＰｃの能力を計測した。単量体ペプチドに関する阻害の程度（ＥＣ５０）は３２±１２ｎＭであった（図１４Ａ）。２分の１モル等量のストレプトアビジンと組み合わせた、しかしその他の点では同一条件のｍＲＡＰｃに関するＥＣ５０は４±２ｎＭであり、ペプチド単独を超えて約８倍の向上であった（図１４）。成熟ＲＡＰは０．５±２ｎＭのＥＣ５０を有しており、単量体ｍＲＡＰｃペプチドより６４倍良好であり、そしてストレプトアビジン上に組み立てたペプチドより約８倍良好であった。ストレプトアビジン単独は阻害作用を有していなかった。ストレプトアビジンの存在下に観察された阻害の多重倍加増強は最小化されたＲＡＰドメインの多量体化によるアビディティの向上と合致している。
【０２６７】
抗ビオチン抗体のビオチンに対する相対的に弱い１価の親和性（低ナノモルＫＤ）を想定し、２つの適当に近接した受容体結合ペプチドおよび単一の抗体よりなる多価の複合体の予備組立がペプチド−抗体複合体を安定化させると仮定した。従って、抗体およびペプチドを１対３のモル比において固定化された受容体と共にインキュベートした後に洗浄し、その後ＲＡＰｄ３リガンドを添加した。同様の操作法を対照、即ち：ペプチド単独、抗体単独およびＲＡＰに対しても実施した。この方法を用いながら、ｍＲＡＰｃペプチド単独に対して１７±１ｎＭのＥＣ５０が誘導された（図１４Ｂ）。ｍＲＡＰｃと抗ビオチン抗体の組み合わせは２±１ｎＭのＥＣ５０をもたらした。完全長ＲＡＰは０．３±７ｎＭのＥＣ５０をもたらした。抗体単独は阻害作用を有していなかった。４価のストレプトアビジンの場合と同様、２価の抗体の添加はＬＲＰ１−Ｃ２に対するＲＡＰｄ３の結合を阻害するペプチドの能力を有意に向上させた。次に多量体化されたｍＲＡＰｃの作用を測定した。多量体化されたｍＲＡＰｃを、ｍＲＡＰｃの単量体および完全長ＲＡＰと、単一のリガンド濃度におけるＬＲＰ１−Ｃ２、トリプシン活性化α２−マクログロブリンおよびｕＰＡ／ＰＡＩ−１複合体への２つの他のリガンドの結合の阻害において比較した。ストレプトアビジンおよびｍＲＡＰｃの複合体は１±１ｎＭのＥＣ５０において非相同リガンドの結合を阻害し、７±１ｎＭの単量体ペプチド単独より７倍良好であった（図１４Ｃ）。両方の場合において、ストレプトアビジンとｍＲＡＰｃの複合体はＲＡＰとｍＲＡＰｃ単量体の間のほぼ中間のＥＣ５０で結合を阻害した。
【０２６８】
これらの結果は多価受容体に結合する場合にアビディティが多価ＲＡＰを利していることを示している。この結果は、ストレプトアビジンまたは免疫グロブリン上に多量化された合成ペプチド配列が３つのＬＲＰ１リガンドに対する完全長ＲＡＰの阻害能力を部分的に繰り返すことができることを示している。
【０２６９】
（実施例６）
インビボの環状ＲＡＰペプチドの投与
以前の結果によれば、トランケーションされた環状ＲＡＰペプチドはインビトロの細胞の表面上のＬＲＰ１受容体に効率的に結合することが明らかにされた。インビボの環状ＲＡＰペプチドの薬効を計測するために、生体分布試験を実施した。
【０２７０】
試験はカナダモントリオールのＣｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓにおいて実施した。ビオチニル化ｍＲＡＰｃペプチド、ビオチニル化ＲＡＰ蛋白または緩衝液を３５Ｓ−ＳＬＲ−ストレプトアビジン（０．７ｍＣｉ／ｍＬ，３００Ｃｉ／ｍｍｏｌ，ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）と合わせ、そしてＤ−ＴＵＢＥＴＭ透析カセット（１４ｋＤＭＷＣＯ，ＥＭＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ／Ｍｅｒｃｋ，Ｄａｒｍｓｔａｄｔ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を用いながらリン酸塩緩衝食塩水（ＰＢＳ）に対して透析した。雄性Ｓｐｒａｇｕｅ−Ｄａｗｌｅｙラット（６−８週齢）に尾静脈より被験物質（２μＬ／ｇ；〜２０μＣｉ／匹）を注射した。注射後３０分にペントバルビタール（２００ｍｇ／ｋｇ）で動物を屠殺した。全ての対象を実験動物の人道的取り扱いに関するＣａｎａｄｉａｎ  Ｃｏｕｎｃｉｌ  ｏｎ  Ａｎｉｍａｌ  Ｃａｒｅの定めたガイドラインに従って処理した。死骸は凍結し、カルボキシメチルセルロースに包埋し、そしてＦｕｊｉＢＡＳ−２５００ホスホイメージャーを用いながら半定量的全身オートラジオルミノグラフィー（ＱＷＢＡ）により分析するために切片化した。各動物の試験臓器内の明確な輪郭を有する領域をルミネセンス分析用に選択した（Ｆｕｊｉ  Ｉｍａｇｅ  Ｒｅａｄｅｒ  ｖ１．１およびＦｕｊｉ  Ｉｍａｇｅ  Ｇａｕｇｅ  ｖ３．１２）。値は単位面積当たりの光刺激ルミネセンス（ＰＳＬ／ｍｍ２）の単位において報告する。
【０２７１】
ＬＲＰ１−Ｃ２への結合の阻害における多量体ｍＲＡＰｃの力価を想定し、多量体ペプチドの薬効および静脈内注射後の完全長ＲＡＰのインビボの生体分布挙動を模倣するそれらの能力を測定した。この挙動は肝臓における一次的蓄積を特徴とし（Ｗａｒｓｈａｗｓｋｙ等、Ｊ  Ｃｌｉｎ  Ｉｎｖｅｓｔ  ９２：９３７−９４４，１９９３）、その場合肝細胞上のＬＲＰ１への血液の接触が高値となる（Ｂｅｉｓｉｅｇｅｌ等、Ｎａｔｕｒｅ３４１：１６２−１６４，１９８９；Ｍｏｅｓｔｒｕｐ等、Ｃｅｌｌ  Ｔｉｓｓｕｅ  Ｒｅｓ２６９：３７５−３８２，１９９２）。３５Ｓ標識ストレプトアビジンの調製品を２０対１のモル比においてビオチニル化ｍＲＡＰｃペプチドと、または５対１のモル比でインビボのビオチニル化ＲＡＰと組み合わせ、そしてラットに静脈内注射した。標識したストレプトアビジン単独を対照として使用した。ストレプトアビジンは静脈内注射後、腎臓には蓄積するが、肝臓にはそれほど蓄積しないことが報告されている（Ｗｉｌｂｕｒ等、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ  Ｃｈｅｍ９：１００−１０７，１９９８；Ｒｏｓｅｂｒｏｕｇｈ等、Ｊ  Ｎｕｃｌ  Ｍｅｄ３７：１３８０−１３８４，１９９６）。
【０２７２】
ビオチニル化ＲＡＰの調製品はストレプトアビジン単独の場合よりも２．７倍高値のレベルで、そして試験した全ての他の組織中で同等以下のレベルで、肝臓に分布した（図１５）。標識ストレプトアビジン上で予備組立されたｍＲＡＰｃペプチドはストレプトアビジン単独の場合よりも７倍超高値、そして試験した全ての他の組織中で対照と比較して同等以下のレベルで肝臓に分布した（図１５）。注目すべき点は、血液中の競合ＬＲＰ１リガンドの高いレベルは明らかにペプチド複合体の肝取り込みをブロックできなかったが、これは、静脈内投与された完全長ＲＡＰに関して、今回と同様、以前にも観察されている。（Ｉｓｂｅｌｌ等、Ｂｉｏｃｈｅｍ  Ｂｉｏｐｈｙｓ  ＲｅｓＣｏｍｍ３６４：６１４−６１９，２００７参照）。
【０２７３】
生体分布のデータの結果は肝臓をターゲティングする医薬品の開発においてＲＡＰのより小型のペプチド系の型が有用であることを示している。
【０２７４】
（実施例７）
環状ＲＡＰペプチドのコンジュゲート
ＲＡＰペプチドおよび環状ＲＡＰペプチドは、種々の細胞毒性剤または他の剤にコンジュゲートすることによりその剤のＲＡＰ受容体を発現する細胞への送達に付すことができる。ペプチドコンジュゲートは当該分野で良く知られている手法を用いて作成する。
【０２７５】
例示される環状ＲＡＰペプチドコンジュゲートは図１３に記載しており、これはジフルオロメチルオルニチンにコンジュゲートしたヘプタイド（ヘプタイド−オクタ−ジフルオロメチルオルニチン）およびチロシンキナーゼ阻害剤ＳＵ６６６８にコンジュゲートしたヘプタイド（ヘプタイド−モノ−ＳＵ６６６８）を示している。図１３Ａに示すヘプタイドペプチド（配列番号１０４）はペンタペプチドリンカーＧＧＳＧＧ（配列番号１０２）を包含する。ヘプタイド−モノ−ＳＵ６６６８はヘプタイド上のＮ末端グリシンへのＳＵ６６６８のコンジュゲーションにより形成する（図１３Ｃ、配列番号１０５）。ヘプタイド−オクタ−ジフルオロメチルオルニチン（ＤＭＦＯ）はペプタペプチドのＮ末端グリシンへのリジンの付加により形成する。このＮ末端リジンは２つのＤＭＦＯ部分に各々コンジュゲートされた２つのリジン（Ｋ２、Ｋ３）に更に連結されたリジン（Ｋ１）の付加により修飾される。第１のリジン（Ｋ１）は又２つのＤＭＦＯ部分を含むオルニチン残基に連結され、そして更に、２つのＤＭＳＯ残基にコンジュゲートされた最後のリジン残基（Ｋ４）に連結される（図１３Ｂおよび配列番号１０６）。
【０２７６】
別のコンジュゲートは、本明細書に記載したまたは当該分野で知られた剤の何れかを用いて当業者により作成されてよい。
【０２７７】
（実施例８）
コンジュゲートされた環状ＲＡＰペプチドのインビトロの投与
肝細胞系統を使用して環状ＲＡＰペプチド並びに化学物質にコンジュゲートされた環状ＲＡＰペプチドの細胞表面結合を評価する。
【０２７８】
肝細胞癌（ＨＣＣ）細胞系統、例えばＨｅｂ３Ｂ、ＨｅｐＧ２およびＨｕｈ−７、または正常ヒト肝細胞系統、例えばＴＨＬＥ−５ｂまたは一次肝細胞（例えばＳｈｉｍｉｚｕ等、Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ．５６：１４７８−８５，２００７；Ａｇｒａｗａｌ等、Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌｓ．２００８Ｆｅｂ２１参照）を当該分野で知られた手法に従って培養する。培養細胞に、ジフルオロメチルオルニチン（環状ＲＡＰペプチド−オクタ−ジフルオロメチルオルニチン）またはＳＵ６６６８（環状ＲＡＰペプチド−モノ−ＳＵ６６６８）のような細胞毒性剤にコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチド、環状ＲＡＰペプチド単独、またはジフルオロメチルオルニチンまたはＳＵ６６６８単独を投与する。細胞には以下の濃度、即ち：０．０５〜５０μＭ環状ＲＡＰペプチド−オクタ−ジフルオロメチルオルニチン、０．２〜２００μＭ環状ＲＡＰペプチド−モノ−ＳＵ６６６８、０．０５〜２００μＭ環状ＲＡＰペプチド単独、０．０５〜５０μＭジフルオロメチルオルニチンまたは０．２〜２００μＭＳＵ６６６８の範囲の試薬を投与する。コンジュゲートした環状ＲＡＰペプチドを、肝細胞培養物に対するそれらの細胞増殖阻害性および細胞毒性の作用に関して評価する。
【０２７９】
環状ＲＡＰペプチドまたはコンジュゲートした環状ＲＡＰペプチドの投与後、細胞毒性および細胞増殖阻害性の作用を当該分野で知られた手法に従って計測（例えばＥｌｍｏｒｅ等、Ｉｎ  Ｖｉｔｒ  Ｍｏｌ  Ｔｏｘｉｃｏｌ．１４：１９１−２０７，２００１；Ｍｉｒｅｔ等、Ｊ  Ｂｉｏｍｏｌ  Ｓｃｒｅｅｎ．１１：１８４−９３，２００６参照）し、そして被験剤存在下の細胞生育または細胞死滅の程度を測定する。
【０２８０】
コンジュゲートした環状ＲＡＰペプチドが培養物中の細胞の生育を低減する能力は、環状ペプチドが細胞表面上の受容体に結合し、そして細胞内に剤を送達して生物学的に計測可能な作用をもたらすための有効な手段であることを示している。
【０２８１】
（実施例９）
環状ＲＡＰペプチドのインビボの投与
インビボの環状ＲＡＰペプチドの受容体結合を評価するために、そしてインビボの細胞に細胞毒性化合物を送達する分子の能力を評価するために、ヒト肝細胞癌の同所モデルを使用する。
【０２８２】
動物における同所腫瘍を作成するために、ヒト肝細胞癌細胞系統をヌードマウス、ラット、または他の適切な動物に移植し、そして腫瘍細胞をインビボで生育させる。同所モデルに適するＨＣＣ細胞系統は、限定しないが例えば上記した細胞系統、例えばＨｅｂ３Ｂ、ＨｅｐＧ２およびＨｕｈ−７を包含する。ＨＣＣの同所腫瘍モデルは当該分野で知られており、そして例えばＯｋｕｂｏ等（Ｊ  Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ  Ｈｅｐａｔｏｌ．２００７  ２２：４２３−８）；Ａｒｍｅｎｇｏｌ等、（Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．２００４  １０：２１５０−７）；およびＹａｏ等、（Ｃｌｉｎ  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．２００３  ９：２７１９−２６）に記載されている。
【０２８３】
インビボにおけるコンジュゲート環状ＲＡＰペプチドおよび対照の投与のための用量範囲を確立するために、コンジュゲート環状ＲＡＰペプチド（例えば、環状ＲＡＰペプチド−オクタ−ジフルオロメチルオルニチン（〜２００ｍｇ／ｋｇ／日）、環状ＲＡＰペプチド−モノ−ＳＵ６６６８（〜２００ｍｇ／ｋｇ／日）の何れか）、環状ＲＡＰペプチド単独（〜２００ｍｇ／ｋｇ／日）、ジフルオロメチルオルニチンまたはＳＵ６６６８単独を投与される群当たり５匹のマウスを用いながら小用量範囲試験を実施する。被験剤は２週間毎日（ＱＤｘ１４）静脈内または腹腔内に投与し、被験動物は体重変化、臨床兆候、および臨床病理および組織病理に関し、試験終了時に試験する。
【０２８４】
薬効試験を実施するために、群当たり８〜１０匹のマウスを使用し、そして上記化合物の３被験用量（環状ＲＡＰペプチド−オクタ−ジフルオロメチルオルニチン、環状ＲＡＰペプチド−モノ−ＳＵ６６６８、環状ＲＡＰペプチド単独、ジフルオロメチルオルニチンまたはＳＵ６６６８）をヒトＨＣＣ細胞投与動物および対照動物に投与する。被験剤は静脈内または腹腔内の何れかに投与し、そして適切な頻度において、例えば４週間毎日（ＱＤｘ２８）、３週間毎日（ＱＤｘ２１）または２週間毎日（ＱＤｘ１４）投与する。次に対象動物を体重変化、臨床兆候、およびインビボ薬効計測、例えば腫瘍体積、肝組織病理、および全身臨床病理に関して、当該分野で知られた手法を用いて評価する。
【０２８５】
インビボにおける肝細胞癌の生育を低減するコンジュゲート環状ＲＡＰペプチドの能力は、環状ペプチドが腫瘍細胞表面上の細胞受容体に結合し、そして細胞内に剤を送達して生物学的に計測可能な作用をもたらすための有効な手段であることを示している。動物モデルにおける効率的な腫瘍の死滅が明らかにされたことは、コンジュゲート環状ＲＡＰペプチドが肝細胞癌またはＲＡＰ受容体が関連する他の状態にり患したヒトにおける腫瘍細胞に細胞毒性剤を送達するための効率的な方法であることを示唆している。
【０２８６】
本明細書において開示し、そして請求項に記載した全ての組成物および／または方法は本発明の開示に鑑みれば予定外の実験を行うことなく作成し、そして実施することができる。本発明の組成物および方法は好ましい実施形態に関して記載してきたが、本発明の概念、精神および範囲を外れることなく、本明細書に記載した組成物および／または方法に、そして、方法の工程または工程の順序において、変更を適用してよいことは当業者の知る通りである。より特定すれば、化学的および生理学的の両方において関連する特定の剤は同じか同様の結果を達成しつつ本明細書に記載した剤の代替としてよいことは当然である。当業者には明らかであるそのような同様の置換および修飾は全て、添付請求項により定義される本発明の精神、範囲および概念に包含されるものとする。
【０２８７】
本明細書において引用した参考文献は、それらが本明細書に記載したものの補充として例示される操作上または他の詳細を与える範囲において、全て参照により本明細書に組み込まれる。
【表Ｂ−１】
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【０２８８】
【表Ｂ−２】
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【０２８９】
【表Ｂ−３】
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【０２９０】
【表Ｂ−４】
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【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５−１】
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【図５−２】
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【図５−３】
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【図６−１】
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【図６−２】
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【図６−３】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１２】
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【図１３Ａ】
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【図１３Ｂ】
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【図１３Ｃ】
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【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１４Ｃ】
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【図１５】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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