(57)【要約】  本発明は、固体マトリックスから、生物サンプルを、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に分解させることなく、放出するための方法であって、前記マトリックスの環境の少なくとも一つの物理化学的性質を変化させることによって、前記マトリックスの固体状態を、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移させることによって行う方法に関する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
固体マトリックスから、前記マトリックスの上に直接収集された生物サンプルを、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に分解させることなく、放出するための方法であって、前記マトリックスの環境の少なくとも一つの物理化学的性質を変化させることによって、前記マトリックスの固体状態を、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移させることによって行う方法。
【請求項２】
固体マトリックスから、生物サンプルを、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に分解させることなく放出するための方法であって、少なくとも一つのカオトロピック物質の存在下、必要に応じて、少なくとも一つの高イオン強度物質の存在下に、前記マトリックスの環境の少なくとも一つの物理化学的性質を変化させることによって、前記マトリックスの固体状態を、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移させることによって行う方法。
【請求項３】
前記環境の物理化学的性質の前記変化が、温度上昇からなることを特徴とする、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項４】
前記環境の物理化学的性質の前記変化が、溶媒の添加、及び必要に応じて試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）から選ばれる少なくとも一つの化合物の添加からなることを特徴とする、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項５】
前記環境の物理化学的性質の前記変化が、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）から選ばれる少なくとも一つの化合物の添加、及び必要に応じて一つ以上の液体の添加からなることを特徴とする、請求項１又は２に記載の方法。
【請求項６】
一つ以上の、ワックス類、パラフィンなどの高分子量アルカン炭化水素類、モノテルペン類、スクロース、アガロース類、でん粉、キチン、ペプチド類、タンパク質、ペクチン類、寒天、酸性ポリメチルアクリレート類、セルロースアセテート、セルロースアセテートフタレート、酢酸ビニル、ポリビニルアセテートフタレート、ヒドロキシプロピルメチルセルロース−アセテートスクシネート、アルギン酸塩類、メタクリル酸とメチルメタクリレートのコポリマー類、酢酸ビニルとメタクリル酸のコポリマー類、及びポリビニルアセテートフタレートを含む固体マトリックスから、生物サンプルを、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に分解させることなく放出するための方法であって、少なくとも一つのカオトロピック物質の存在下、かつ、必要に応じて、少なくとも一つの、高イオン強度物質の存在下に、前記マトリックスに少なくとも一つの酵素及び少なくとも一つの液体を加えることによって行う方法。
【請求項７】
試薬（単数もしくは複数）、溶媒（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）から選ばれる、少なくとも一つの化合物がさらに加えられることを特徴とする、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
溶解可能な固体マトリックスと、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）から選ばれる、少なくとも一つの化合物とを含むキット。
【請求項９】
少なくとも一つのカオトロピック物質、及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質を、さらに含む請求項８に記載のキット。
【請求項１０】
ワックス、高分子量アルカン炭化水素類、パラフィン、モノテルペン類、スクロース、アガロース、でん粉、キチン、ペプチド類、タンパク質、ペクチン類、寒天、酸性ポリメチルアクリレート類、セルロースアセテート、セルロースアセテートフタレート、酢酸ビニル、ポリビニルアセテートフタレート、ヒドロキシプロピルメチルセルロース−アセテートスクシネート、アルギン酸塩類、メタクリル酸とメチルメタクリレートのコポリマー類、酢酸ビニルとメタクリル酸のコポリマー類、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、及びそれらの混合物からなる群から選ばれる、溶解可能な固体マトリックスを含む、請求項８に記載のキット。
【請求項１１】
ワックス、パラフィンなどの高分子量アルカン炭化水素類、モノテルペン、スクロース、アガロース、でん粉、キチン、ペプチド類、タンパク質、ペクチン対、寒天、酸性ポリメチルアクリレート、セルロースアセテート、セルロースアセテートフタレート類、酢酸ビニル、ポリビニルアセテートフタレート、ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセテートスクシネート、アルギン酸塩類、メタクリル酸とメチルメタクリレートのコポリマー類、酢酸ビニルとメタクリル酸のコポリマー類、及びポリビニーアセテートフタレートを含む生物サンプルの直接的収集のための固体マトリックス。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、マトリックスから生物サンプルを放出するための方法及び材料、並びにマトリックスから生物サンプルを放出するためのキットに関する。
【背景技術】
【０００２】
長い間、生物材料の分析、特に、組織学及び病理学技術を用いた分析は、病気の診断と治療、食物及び環境分析、並びに法医学調査においてこの上ない重要性を持つものであった。最近の技術的進歩は、多数のさらなる可能性への道を開く、核酸及びタンパク質の分析を促進することによって、このような調査の視野を拡大した。例えば、遺伝子活動は、細胞内のＲＮＡ、特に、メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）を直接分析することによって定量することが可能である。最近の分子生物学的方法、例えば、リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（リアルタイムＲＴ−ＰＣＲ）、又は遺伝子発現チップ分析による、細胞における転写鋳型（ｍＲＮＡ鋳型）の定量的分析から、例えば、不正に発現される遺伝子の特定が可能となり、そのため、例えば、代謝障害、感染、又は癌の存在の検出が可能となっている。分子生物学的方法、例えば、ＰＣＲ（ポリメラーゼ連鎖反応）、ＲＦＬＰ（制限断片長多型）、ＡＬＦＰ（増幅断片長多型）、又は配列決定による、細胞由来ＤＮＡの分析から、例えば、遺伝的欠陥の検出、又は、ＨＬＡ（ヒト白血球抗原）型、及び、その他の遺伝子マーカーの決定も可能となっている。ゲノムＤＮＡ及びＲＮＡの分析も、感染病原体、例えば、ウィルス、細菌などに対する直接的証拠として使用されている。
【０００３】
生物サンプルのある成分、例えば、核酸又はタンパク質が分析可能であることの利点が知られるようになり、その分析そのものがより正確に、より広く利用可能となるにつれて、このような分析は重要性を増し、医学、獣医学の専門分野にとってばかりでなく、他の、広汎な領域、例えば、法医学的試料、製薬製品及び中間産物、食品及び環境試料の分析においても、利用可能なツールとして頻繁に使用されている。これらの領域の多くにおいて、サンプルの分子構造の完全性の維持は重要である。
【０００４】
例えば、血液、唾液、又は細胞といった生物サンプルの収集及び／又は取り扱いのための、最近の手順では、例えば、セルロース系もしくはコットン系の紙又はスワブ等の固体マトリックスを用いるが、これらは、その構成及びサイズの点で著しく異なっている。
【０００５】
頬内又は膣内塗抹のために、セルロース、コットン、又はポリマー線維製の頭部を持つスワブが頻繁に使用される。コットン又は合成線維製頭部を持つスワブ、及び駆出性の紙頭部を持つスワブは、種々の販売業者から入手することが可能である。このようなスワブによって生物サンプルを収集した後、そのスワブは通常乾燥され、保存され、乾燥形状として輸送されるか、又は、保存され、栄養素、抗生物質、又は他の防腐剤を含む媒体に入れて輸送される。
【０００６】
スワブから生物サンプルを回収するには、一般に、スワブ支持材料からサンプルを洗い出すことが必要である。このサンプルの洗い出しは、多くの場合、スワブを、溶解試薬と接触させることによって実行されるが、一般に、非効率的、不完全で、面倒である。回収されるサンプルの量を最大とするには、スワブ頭部の支持材料を、先ず、そのシャフトから分離する必要がある。スワブのタイプにもよるが、これの実行は、手で、せん刀、メス、もしくは剃刀の刃で切ることによって、又は、折り曲げもしくは駆出によって行われる。切断を含む分離プロセスには、交差汚染を避けるために、切断デバイスを十分に清浄化し、滅菌するか、又は各使用後に廃棄する必要がある。交差汚染は、全ての分析法に共通の問題点であるが、特に、核酸分析が予定されるサンプルについて作業する場合、殊に、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）などの増幅プロセスを用いる場合、問題となる。最悪の場合、交差汚染は、分析結果の歪曲、場合によっては完全な誤読を招く可能性がある。切断プロセスはさらに、オペレーターに対する傷害という重大なリスクを表徴する、なぜなら、傷は、外来の、感染の可能性のある物質の取り込みをもたらす可能性があるからである。
【０００７】
駆出性スワブの場合、該スワブの頭部は、スワブシャフトを曲げるか、シャフトを加圧することによってシャフトから分離されるが、これは、費用のかかる選択肢である。
【０００８】
いずれのタイプのスワブも、生物サンプルを担持する、分離されたスワブ頭部は、スワブ軸から分離後、サンプル管の中に必ず留まるという点で共通である。次に、この分離されたスワブ頭部は、輸送及び／又は保存液を吸収し、管中の利用可能体積を減らし、最小量の液体によるサンプルの効率的回収を妨げる。多くの場合、極小量のサンプル、多くの場合、例えば、ナノグラム桁のサンプルに関わるのであるから、サンプルについては、どんな僅かな損失も、過剰な希釈もできるだけ避けることが望ましい。
【０００９】
血液などの、他の生物サンプルは、一般に、処理もしくは未処理の、紙又はカードを用いて、収集及び保存される。処理用紙は、通常、病原体を不活性化し、微生物の増殖及びＤＮＡ分解を阻止する、いくつかの異なる薬剤によって処理される。標的生体分子を分離するためには、乾燥されたサンプル試料を担持する用紙から、紙又はカードの小片をパンチして切り出すことが必要である。このプロセスは、交差汚染を避けるために、各パンチ動作後、パンチングデバイスの清浄化及び滅菌を必要とする。ディスポーザブルパンチング装置が市販されているが、大げさで、高価である。さらに、小重量のパンチ紙は、静電気及び通常の空気運動と相俟って、このパンチの操作、及びサンプル調製容器の底部への移送を困難にする。
【００１０】
さらに、標的生体分子の最適収率のためには、支持材料を、生物サンプルを回収するためのプロセスに導入するまえに、小片に切り分ける必要がある。この切断プロセスは、面倒で、自動化することが困難であり、交差汚染の他の潜在原因、及びオペレーター傷害の危険性を表徴する。支持材料を切り分けなければ、回収生物サンプルの収率の低下、及びサンプルの分析などの、下流応用における感度の損失がもたらされる。
【００１１】
固体マトリックスを回収試薬（通常は溶融試薬）中に移した後、標的生体分子が、通常、固相支持体から溶出される。固体マトリックスからの、標的生体分子の溶出は、非効率的で、厄介であり、かつ、固体マトリックス上における、ある割合の生体分子の保留による損失を被る。溶出は、化学的、物理的、又は酵素的、又はそれらの組み合わせによって実行することが可能である。標的生体分子のさらなる単離には、生体分子を含む液体から、固体マトリックスを分離することが必要である。これは、ピペットによる液体の摘出、又は固体マトリックスの摘出によって実行される。両プロセスとも非効率的で、大量の溶媒を使用しない限り、サンプル試料の損失を招く可能性がある。これらのプロセスも自動化が難しい。なぜなら、固体マトリックスは、液体処理システムに干渉する可能性があるからである。さらに、容器から血液スポット又はスワブを高い信頼度で取り出すことを可能とする、自動化システムを設計することは難しい。もう一つの問題点は、固体マトリックスの中に捕捉されたまま残る液体の量である。この液体は、標的生体分子を含んでいるのであるから、それを固体マトリックスと共に排除することは、収率及び感度の低下を招く。
【００１２】
血液カード又はスワブの形状を取る、いくつかの、異なる個体マトリックスが、例えば、セルロース、コットン、Ｄａｃｒｏｎ（登録商標）、又はその他のポリマー線維製の頭部を持つスワブが知られ、市販されている。さらに、いくつかの回収及び精製法が選択される。しかしながら、生物サンプルの収集、保存、安定化、及び精製のための標準手順が不足している。このために、ある所定の、支持材料とサンプル調製法の組み合わせについて収率及びパフォーマンスを最適なものとするには、たくさんの最適化作業を実行することが必要となる。
【００１３】
ＷＯ  ０１／６０５１７には、核酸を安定化するための溶液、及び核酸に結合することが可能な固相を含む、サンプル、好ましくは血液を受容するためのレセクプタクルを用いた、血液サンプルの採取法について記載されている。サンプルは、一旦容器に移されると、引き続き、反復洗浄により固相から取り出すことが必要になる。さらに、サンプルの収集には、液体サンプルを、その供給源から低圧に置かれるレセプタクルに移すために、カニューレの使用が必要とする。このことは、例えば、幼児の指先穿刺もしくは踵穿刺からの血液等の少量のサンプルに対して、及びカニュールを通じては簡単に移すことができないサンプルに対して、レセプタクルを使用することを妨げ、例えば、唾液、尿、又は脳脊髄液の場合はかろうじて可能であるが、サンプルドナーにとっては若干の不快を伴う。さらにこの容器は、固体又は半固体サンプルには適切ではない。なぜなら、固体又は半固体サンプルは、固相の存在下では安定液と十分に混ざらないからである。
【００１４】
ＥＰ  ８１９  ６９６  Ａ２には、生物サンプルから核酸を単離する方法が記載され、カオトロピック物質と共にサンプルと混ぜ合わせられる、核酸結合固相、好ましくはシリカの使用を提案する。本方法は、先ず、溶液から、核酸を結合させた固相を単離し、次いで、該固相から核酸を単離するために、多数回の洗浄、乾燥、及び溶出工程を必要とする。さらに、大量すぎるシリカは飽和性となる可能性があり、そのため、シリカがある一定量を超えると、サンプルからそれ以上の核酸が得られない可能性がある。
【００１５】
ＷＯ  ０２／０７２８７０  Ａ２には、遺伝子材料を保存するための方法及びデバイスが記載されている。デバイスの頭部部分は、遺伝子材料を吸着するための固体マトリックス、及び遺伝子材料を分解から保護する保存機構から構成される。しかしながら、このデバイスは、液体サンプルのためにのみ使用することが可能である。さらに、遺伝子材料の分析を実行するには、固体マトリックスはより小さな部分に分割されなければならず、これは、材料の損失及びオペレーターの危険を招く。
【００１６】
ＵＳ  ２００６／００９９５６７及びＵＳ  ２００５／０２７６７２８は、生物サンプルのための保存デバイスであって、サンプルプレートにおいてサンプルを十分にコートする、溶解可能であるか、又は解離可能なマトリックス材料を含むデバイスを提案する。このマトリックス材料コーティングは、サンプルと共に乾燥され、次いで、サンプル回収のために再水和される。提案のシステムは、特に、高処理システムでの使用が意図される。しかしながら、生物サンプルは、先ず、従来技術を用いて収集されるのであるから、それからすると、提案のシステムは、収集デバイスからのサンプルの回収に関連する前述の問題点に応えるものではない。加えて、これらの公報は、カオトロピック塩の存在下にマトリックス材料を溶解する利点については沈黙する。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１７】
本発明の一目的は、従来技術の公知の欠点を克服することである。
【００１８】
本発明の他の目的は、従来技術の公知のサンプル回収と比較して、生物サンプルを、サンプル収集に使用されるデバイスから、より簡単に、より速やかに回収することを可能とすることである。
【００１９】
また、本発明の目的は、大量の溶媒の使用を要することなく、サンプル収集に使用されるデバイスから生物サンプルを回収するに際し、生物サンプルの損失を軽減することでもある。
【００２０】
さらに、本発明の目的は、収集デバイスから生物サンプルを回収するに際し、切断及び／又はパンチングデバイスの使用を避けることでもある。
【００２１】
本発明の他の目的は、生物サンプルを収集及び操作するためのシステムであって、ある範囲の、種々のタイプの生物サンプルに適用することが可能なシステムを提供することである。
【００２２】
本発明のさらに別の目的は、統合型サンプル採取又は収集及び保存デバイス、並びにそのような統合型デバイスを使用するか、又はさらに操作する方法を提供することである。
【００２３】
本発明のさらに別の目的は、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に変性させることなく、サンプル採取デバイスを溶解又は液化するための方法を提供することである。
【００２４】
本発明のさらに別の目的は、サンプル採取デバイスを溶解又は液化するための方法であって、水分子と前記生物サンプル中に含まれる生体分子との相互作用が、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に変性させることなく、修飾される方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００２５】
現存する技術から生じる問題点の解決、及びそれらの欠点の少なくとも一部の克服への寄与は、本発明では、固体マトリックスから、生物サンプルを、前記生物サンプルに含まれる生体分子を実質的に分解させることなく放出するための方法であって、少なくとも一つのカオトロピック物質の存在下、前記マトリックスの環境の少なくとも一つの物理化学的性質を変化させることによって、前記マトリックスの固体状態を、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移させることによって行う方法によって実現される。好ましくは、固体マトリックスは、前記生物サンプルの直接収集のために使用され得る。
【発明を実施するための形態】
【００２６】
生物サンプルは、任意の生物学的供給源から収集されたサンプルであってよいが、好ましくは、任意の、ヒト、動物、及び植物材料の生物サンプルである。本発明では、生物サンプルは、一般に、ただし限定的ではないが、細胞非含有、及び細胞含有サンプル材料、血漿、体液、例えば、血液、痰、唾液、尿、脳脊髄液、精液、血清の外、細胞、白血球分画、ｃｒｕｓｔａ  ｐｈｌｏｇｉｓｔｉｃａ（バフィーコート）、大便、ぬぐい液（スワブ）、吸引物、任意の種類の組織サンプル、組織断片及び器官、ワクチン、遊離又は結合核酸、又は核酸含有細胞を含む食物又は環境サンプル、植物、植物抽出物及び植物部分、細菌、ウィルス、酵母、及び他の真菌類、又は、それらからの抽出物、他の真核細胞及び前核細胞、特に、全ての可能な組織サンプル、組織断片、器官、全体生物、及び個別細胞と考えられる。好ましい生物サンプルとしては、生物サンプル、例えば、任意の体液、例えば、血液、唾液、尿、精液、痰、又は脳脊髄液、上皮細胞、スメア、細菌、ウィルス、ワクチン、極細針吸引物、バイオプシー、法医学サンプル、単離細胞、真菌、又は真菌の部分又は抽出物、植物、又は植物の部分又は抽出物が挙げられる。直接収集とは、前記マトリックスが、生物サンプル収集の際、直接使用されるという事実を表現することと理解される。そのような使用の非限定的例は、例えば、口腔内部の粘膜などを擦ることによって、前記生物サンプルと密接に接触すると考えられる、いわゆるスワブであろう。一方、非直接的収集は、生物サンプルの収集には別の収集デバイスが用いられ、次に、該収集デバイスによって、生物サンプルが、本発明によるマトリックス上に配置される場合と考えられ、例えば、前記収集デバイスからマトリックス上に生物サンプルが洗い出されるような例である。
【００２７】
生体分子とは、生物液中に存在する有機分子、例えば、核酸、タンパク質、酵素などである。好ましい実施態様では、生物サンプルは、タンパク及び／又は核酸、又は複数の核酸を含む。「核酸」という用語は、本明細書では最も広い意味で用いられ、全ての可能な供給源から得られる、リボ核酸（ＲＮＡ）及びデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）であって、全ての長さと形態、例えば、２本鎖、１本鎖、環状、直鎖、又は分枝鎖形状のものを含む。全てのサブユニット及びサブタイプ、例えば、モノマーヌクレオチド、オリゴマー、プラスミド、ウィルス及び細菌の核酸の外、動物及び植物細胞、又は他の真核細胞又は前核細胞由来のゲノム又は非ゲノムＤＮＡ及びＲＮＡ、処理及び未処理形状のメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）、転移ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）、ヘテロ核ＲＮＡ（ｈｎ−ＲＮＡ）、リボソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）、相補的ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）、ゲノムＤＮＡ（ｇＤＮＡ）、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡの外、他の全ての、考えることが可能な核酸も含まれる。
【００２８】
本発明において、実質的に分解無しにとは、好ましくは、固体マトリックスが、固体状態から、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移されるときにも、生体分子が、実質的に損傷を受けず、構成成分に分解されないことを意味することが意図される。しかしながら、この用語はさらに、固体マトリックスが、固体状態から、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移されるときにも、生物サンプルの少なくとも一つの成分が、実質的に損傷を受けず、構成成分に分解されないことを意味する場合もある。
【００２９】
水の分子と、前記生物サンプル中に含まれる生体分子との相互作用の変化は、水と生体分子、好ましくは核酸、との相互作用、例えば、水和シェルの形成や水分子と前記生物サンプル中に含まれる生体分子との他のいかなる水素結合構造の形成、といった相互作用が、いかなるものであれ、それを低減するか、又は完全に破壊するものと理解される。驚くべきことに、水の分子と生体分子との相互作用の、前記変化は、本発明の方法において、実に、より高い収率を、すなわちよりよい性能をもたらすことが見出された。
【００３０】
少なくとも一つの固体マトリックスが、少なくとも一つの物理化学的性質が変化されるときに、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下で、少なくとも部分的に、固体状態から溶解又は液体状態へ転移可能であるのが好ましい。この「固体状態」という用語は、固体マトリックスの１つの物理状態を意味すると理解される。一方、本発明における固体マトリックスの溶解又は液体状態は、溶液、分散液、縣濁液、乳液、又は溶融物の形状を取ってもよい。本発明において、「転移可能」及び「少なくとも部分的に転移可能」という用語は、本発明の方法に含まれる固体マトリックスの少なくとも一部、好ましくは、大部分、もっとも好ましくは全てが、固体状態から溶解又は液体状態に転移可能であることを意味すると理解される。本発明によれば、少なくとも一つの物理化学的性質を変えることは、前記液相又は溶解状態への転移を少なくとも部分的に誘発することが好ましく、好ましくは少なくとも１０重量％まで、より好ましくは少なくとも５０重量％の量まで、さらに好ましくは７５重量％の量まで、もっとも好ましくは完全な転移を誘発することが好ましい。固体状態から溶解又は液体状態への転移は、分散、乳化、縣濁、溶解、又は溶融の形状を取ることが好ましく、好ましくは分散、溶解、又は溶融の形状を取り、本発明では、少なくとも一つの物理化学的性質を変えることによって起こることが好ましい。
【００３１】
変化によって、マトリックスの固体状態の少なくとも一部を、溶解された液体状態へ転移させる物理化学的性質とは、例えば、該固体マトリックスを、それを少なくとも部分的に溶解する液体と接触させること、又は、固体マトリックスを、該マトリックスの、液体又は溶解状態への転移を強化又は誘発する試薬、又は、該強化又は誘発する、少なくとも一つの成分を含む組成物と接触させること、又は、固体マトリックスを、該マトリックスが融解する温度又は圧に曝すことを含む。これらの物理化学的性質は、単独で作用を発揮してもよいし、又は、互いに、又は他の性質と組み合わさって作用を発揮してもよく、これらは、変化すると、固体マトリックスの、液体状態への転移を実行、触媒し、又は他の任意のやり方で増進する。
【００３２】
本発明によれば、固体マトリックスは、生物サンプルを収集するために採用される収集条件下では、少なくとも部分的に固体であることが好ましく、好ましくは実質的に固体であること、より好ましくは完全に固体であることが好ましい。これは、特に、サンプルが直接その供給源において収集される場合、好ましい。収集条件は、サンプルを生きている生物から収集する場合、例えば、ヒト、動物、又は植物からサンプルを収集する場合、生理的条件であってもよい。生理的条件とは、一般に、物理化学的性質の典型的条件、例えば、温度、ｐＨ、電解質濃度、酵素又は他の成分の存在であって、その生物の中に、特に、収集されるその生物の部分の中に、天然状態において存在する、酵素又は他の成分の存在、と定義される。したがって、健康なヒトにおいては、例えば、生理的温度は、変動するが、一般に、３６℃から３８℃の範囲にある。これらの温度は、病気のヒトでは、数度変動させて、例えば、４４℃の高さ、又は３０℃の低さに変わることがある。ヒトにおける生理的ｐＨは、一般に７．４と考えられているが、このｐＨは、生体における位置にしたがって変動する場合がある。したがって、例えば、胃のｐＨは、一般に、１．５から３の範囲にある。
【００３３】
本発明によれば、固体マトリックスを生物サンプルに直接接触させることによって、好ましくは、固体マトリックスを用いて、生物サンプルをその供給源から直接収集すること（直接収集を参照）によって、生物サンプルを該固体マトリックスに付加することが特に好ましい。本発明では、生物サンプルを、固体マトリックスに注入しないことが好ましい。
【００３４】
少なくとも一つの固体マトリックスの固体状態から溶解又は液体状態への転移は、好ましくは、少なくとも一つのカオトロープの存在下で、好ましくは、生物サンプルを担う固体マトリックスの、安定化、輸送、もしくは保存のうちの少なくとも一つの進行中に、又は、例えば、固体マトリックスから生体分子を精製する、生物サンプルの処理中に、起こることが好ましい。生物サンプルは、固体マトリックスの上で乾燥しないと有利である。したがって、例えば、生物サンプルを安定化するために適用される、好ましくは安定液の形状を取る安定材料は、それ自体が、固体マトリックスの少なくとも部分的な溶解を実行又は強化して、該サンプルもしくは少なくともその構成成分を放出させてもよく、又は、固体マトリックスの溶解を実行又は強化し、サンプルもしくは少なくともその構成成分を放出させる薬剤を含んでもよい。固体マトリックスの、この、少なくとも部分的な溶解は、生物サンプルを含む固体マトリックスが、サンプルの安定化、輸送、操作、又は保存の際、安定材料、好ましくは安定液と接触する間に起こってもよい。
【００３５】
もう一つの可能性は、好ましくは液状であるが、必ずしもそうでなくともよい、固体マトリックスの溶解を招くかもしくは強化する薬剤が、標的生体分子の分析、又は単離及び／もしくは精製等のために、生物サンプルもしくはその構成成分の処理中に、例えば、その単離及び／もしくは調製中にさらに適用されることである。生物サンプルと接触する固体マトリックスの、安定化、輸送、処理、及び保存の内の少なくとも一つの進行中に、温度を上げるか下げること、好ましくは上げることも可能である。これによって、融解可能な固体マトリックスを、本発明による生物サンプルを実質的に分解させることなく、少なくとも部分的に、固体状態から液体状態に転移させること、好ましくは、少なくとも部分的に、生物サンプル又はその成分を放出させることが可能と考えられる。
【００３６】
本発明の方法の好ましい一実施態様では、前記マトリックスの環境の物理化学的性質の変化は、温度上昇からなり、好ましくは、少なくとも一つのカオトロープの存在下における、温度上昇からなる。
【００３７】
固体マトリックスが、生物サンプルの収集温度においては固体であると有利である。サンプルを、生きているヒト又は動物から収集しなければならない場合、固体マトリックスは、生理的温度において固体であることが好ましく、該固体マトリックスは、生理的温度を上回る温度で、好ましくは４５℃を超える温度において、好ましくは４５℃から９５℃の範囲内の温度において、より好ましくは４５℃から８５℃の範囲の温度において、さらに好ましくは４５℃から７５℃の範囲の温度において、もっとも好ましくは４５℃から６５℃の範囲の温度において、液体状態に転移することが好ましい。生物サンプルは、損傷されず、分解されることなく放出されることが好ましい。したがって、固体マトリックスは、生物サンプル、及びその成分が破壊されず、分解されない温度において融解可能であることが好ましい。サンプルを死んだヒト又は動物から、又は植物、菌、又は環境から収集する場合、固体マトリックスは、サンプル収集温度において固体である限り、より低い温度で融解することも可能である。固体マトリックスは、シャープな融解点を有することが好ましい、すなわち、固体マトリックスは、狭い温度範囲において、好ましくは５℃未満の温度範囲において、より好ましくは４℃未満の温度範囲において、さらに好ましくは３℃未満の温度範囲において、もっとも好ましくは２℃未満の温度範囲において融解することが好ましい。
【００３８】
本発明において融解可能な固体マトリックスとして適切な材料は、例えば、生理的温度において固体である油脂、例えば、ココアバター、又はパーム油脂である。別の好ましい、本発明による融解可能固体マトリックスは、４５℃を超える融解点を持ち、通常の周囲温においてプラスチック構造を有するワックスである。適切なワックスは、動物及び／又は昆虫ワックス、例えば、蜜蝋であってもよい。カイガラムシ  ｃｏｃｃｕｓ  ｃｅｒｉｆｅｒｕｓによって生産される支那ワックス、ラックカイガラムシ  ｃｏｃｃｕｓ  ｌａｃｃａから得られるシェラックワックス、抹香鯨の頭蓋腔及び脂肪塊から得られる鯨油、及び羊の皮脂腺から得られるラノリン（ウールワックス）が例として挙げられる。適切な植物ワックスの例としては、ヤマモモ潅木のベリー表面から得られるヤマモモワックス、メキシコ産潅木Ｅｕｐｈｏｒｂｉａ  ｃｅｒｉｆｅｒａ及びＥ．  ａｎｔｉｓｙｐｈｉｌｉｔｉｃａから得られるｃａｎｄｅｌｉｓｓａワックス、Ｃａｒｎａｕｂａ  Ｐａｌｍ，  Ｃａｓｔｏｒ  ｃａｒｎａｕｂａ  ｐａｌｍの葉から得られるカルナウバワックス、ヒマシ油、触媒的に水素添加したヒマシ油、エスパルトグラスからの紙生産時の副産物としてのエスパルトワックス、日本ろう、Ｒｈｕｓ及びＴｏｘｉｃｏｄｅｎｄｒｏｎ種のベリーから得られる木蝋（真正ワックスではない）、ホホバ低木の種を搾って得たホホバ油、鯨油の置換体、ブラジル産羽毛棕櫚から得られるオーリキュリーワックス、及び米糠から得られる米糠油である。本発明では、鉱油、例えば、セレシンワックス、亜炭及び褐炭から抽出されるモンタンワックス、亜炭層に見いだされる鉱物蝋、及びピートワックスも、融解可能な固体マトリックスとして好適である。本発明において、固体マトリックスとして好適な、もう一つの材料グループは、高分子量アルカン炭化水素、例えば、パラフィン、すなわち、典型的融解点を４７℃と６５℃の間に持つ、無臭、無味の石油ワックスである。さらに好適なものとして、合成ワックス、例えば、ポリエチレンを原料とするポリエチレンワックス、フィッシャー−トロプシュワックス、又は、化学的修飾ワックス−通常、エステル化又はサポニン化、置換アミドワックス、及びα−オレフィン重合体がある。さらに別の、可能な固体マトリックスとしては、モノテルペン類、例えば、タイム油の中に見出され、好ましい芳香及び強力な消毒性を持ち、４８−５２℃の融解点を有する白色結晶物質として抽出されるチモール、又は、カンフェン、すなわち、５１−５２℃の融解点を有する二環モノテルペンがある。もう一つの、融解可能な固体マトリックスグループは、糖、すなわち水性分解緩衝液と組み合わせたスクロースを含む。さらに別の、可能な固体マトリックスとしては、融解点が６５℃未満の、低融解点アガロースがある。
【００３９】
本発明によるシステムの別の実施態様では、固体マトリックスは、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下に、収集生物サンプルを少なくとも部分的に放出するために、好ましくは可溶性、好ましくは完全な可能性である。この実施態様では、マトリックス環境の物理化学的性質の変化は、溶媒の添加、かつ、必要に応じて、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）から選ばれる少なくとも一つの化合物を添加することからなってもよい。さらに、環境の物理化学的性質の変化は、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）から選ばれる少なくとも一つの化合物を添加すること、及び必要に応じて少なくとも一つの液体の添加からなってもよい。
【００４０】
したがって、固体マトリックスは、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下に、それが溶解する液体にそれを接触させること、固体マトリックスの溶解を実行し、触媒し、又は他のやり方で強化する試薬もしくは組成物と該マトリックスを接触させること、の内の少なくとも一つによって溶解させることが可能である。さらに、例えば、固体マトリックスは、溶解しない液体に接触させ、次いで、さらに試薬又は組成物と接触させることによって少なくとも部分的に溶解可能とすることも考えられる。さらに、固体マトリックスは、先ず、試薬又は組成物に接触させ、次いで、液体に接触させることも可能である。この試薬又は組成物は、固体形状を取っても、液体形状を取ってもよい。「液体形状」という用語は、少なくとも一つの溶媒、又は、当業者によって適切と考えられるいかなる可能な溶媒もしくは混合溶媒によって溶解させた少なくとも一つの溶液、又は、所望の操作温度において液体である試薬もしくは組成物、及び同様に溶融物、を意味すると理解される。
【００４１】
本発明の一様相では、固体マトリックスは、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下に、試薬としての少なくとも一つの有機溶媒によって、少なくとも部分的に溶解することが可能である。この場合、固体マトリックスは、好ましくはポリマー、好ましくは、少なくとも一つのカルボン酸含有モノマーを含むポリマー類；少なくとも一つのカルボン酸基含有モノマー、及び少なくとも一つのエチレン不飽和モノマーを含むポリマー類；少なくとも一つの酸性基及び少なくとも一つのエチレン不飽和基を含む、少なくとも一つのモノマーを含むポリマー類；少なくとも一つの環システム、好ましくは、少なくとも一つの酸素含有環である、少なくとも一つのヘテロ原子を含む少なくとも一つの環を含む、モノマーを含むポリマー類；少なくとも一つのエステル基を含むポリマー類から選ばれるポリマー類である。好ましいポリマーの例は、イソプロパノールに可溶な、酸性ポリメタクリレート類；アセトンに可溶な、セルロースアセテートフタレート；ジクロロメタンに十分可溶で、アセトンにきわめて可溶な、酢酸ビニルなどのクロトン酸コポリマー類；９０％エタノールに十分可溶なポリビニルアセテートフタレート；又は、アセトンに十分可溶なヒドロキシプロピルメチルセルロース−アセテートである。
【００４２】
本発明では、試薬は、少なくとも一つのキレート剤、又はその塩を含んでもよい。したがって、固体マトリックスは、一つの溶媒もしくは必要に応じて上に定義した一つの以上の液体の存在下に、試薬としての、少なくとも一つのキレート剤もしくはその塩の助けを借りて、液体又は溶解状態へ少なくとも部分的に転移することが可能である。本発明による適切なキレート剤は、少なくとも、２、３、４、５、６、７、又は８個の配位部位、好ましくは２から６個、より好ましくは４から６個の結合部位を含む。
【００４３】
さらに、固体マトリックスは、試薬としての、少なくとも一つのカオトロピック物質（カオトロープ）の存在下、必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度液の存在下に、少なくとも部分的に液体又は溶解状態に転移することが特に好ましい。溶液のイオン強度Ｉは、溶液中に存在する全てのイオンの濃度の関数である。濃度をモルで表すと、
【００４４】
【数１】
2010515037.tif 000002
上式において、合計は、全てのイオンＢについて求める。ZＢは、イオンＢの電荷数である（例えば、ＩＵＰＡＣ  Ｃｏｍｐｅｎｄｉｕｍ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｒｍｉｎａｌｏｇｙ、電子版、 HYPERLINK "http://goldbook.iupac.org/I03180.html" http://goldbook.iupac.org/I03180.htmlを参照されたい）。
【００４５】
高イオン強度溶液は、当業者には公知であり、０．１から５０、好ましくは５〜３０、特に好ましくは７〜２４の範囲のイオン強度を持つ。カオトロピック物質は、ＵＳ−５，２３４，８０９及び他の関連特許から知られ、米国特許慣例にしたがって、これらの文書を引用により本明細書に含める。カオトロープとは、分子構造、特に、非共有的力、例えば、水素結合、塩架橋、及び疎水作用によって形成される分子構造の分離を招く薬剤である。カオトロープとしては、グアニジニウム塩が好ましく、その場合、クアニジニウムイソチオシアネート、又はグアニジニウム塩酸塩が特に好ましい。好ましくは、この少なくとも一つのカオトロープは、溶液中に、好ましくは水溶液中に、０．０１〜１５（ｍｏｌ／ｌ）の範囲の濃度において、好ましくは１から６Ｍ（ｍｏｌ／ｌ）、より好ましくは、２から５．９Ｍの範囲、さらに好ましくは３から５．８Ｍの範囲、もっとも好ましくは４から５．７Ｍの範囲で存在する。したがって、本発明による方法のこの様相では、固体マトリックスを、水構造の破壊を実行するか、触媒するか、もしくはその他のやり方で強化する物質もしくは組成物と接触させることによって、少なくとも部分的に液体又は溶解状態に転移させることが可能である。
【００４６】
本発明によれば、さらに別の様相では、固体マトリックスが、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下に、少なくとも一つの酵素と接触させることによって、少なくとも部分的に液体又は溶解状態に転移可能なことも想定可能である。したがって、固体マトリックスは、少なくとも一つの酵素の存在下に、固体状態から、溶解又は液体状態に少なくとも部分的に転移することが可能な、少なくとも一つの物質を含んでもよい。
【００４７】
この酵素は、プロテアーゼ、セルラーゼ、アミラーゼ、グリカナーゼ、キチナーゼ、リゾチーム、リパーゼ、エステラーゼ、ペクチナーゼ、ペクトリアーゼ、アガラーゼからなる群から選ばれる少なくとも一つの酵素であることが好ましく、これは、単独で存在してもよいし、又は、少なくとも一つの、他の酵素、試薬、酸もしくは塩基と組み合わせられて存在してもよい。
【００４８】
本発明によれば、固体マトリックスは、ペプチド、エステル、ポリサッカリド及びセルロース、及び／又はそれらの少なくとも一つの誘導体を含むことが好ましい。これらの好ましい材料は、固体マトリックスが、少なくとも一つの酵素の存在下に、溶解又は液体状態に転移する場合、特に有利である。これらの材料はさらに、少なくとももう一つの他の物理化学的性質が変化する時に、少なくとも部分的に液体もしくは溶解状態に転移可能であることが好ましい。好ましい固体マトリックスの例としては、プロテアーゼによって分解が可能な、ペプチド結合によって連結される物質；エステラーゼ及び／又はｐＨを変えることによって分解が可能なエステル結合によって連結される物質；ポリサッカリド分解酵素、例えば、アミラーゼ、キチナーゼ、セルラーゼ、又はその他の酵素もしくは試薬によって分解が可能なグリコシド結合によって連結されるポリサッカリド、がある。
【００４９】
本発明における好ましい固体マトリックスは、コットン原料材料を含むか、もしくはコットン原材料を含む表面を有する。本発明による「コットン」とは、好ましくは、セルロースからなる天然ポリマー、好ましくは１から４個のグリコシド結合を介して接続される、１００〜１０，０００個のβ−Ｄ−グルコース分子から構成されるポリサッカリドを意味する。本発明において、セルロースは、水溶液には不溶であるが、該ポリマーをβ−Ｄ−グルコースに分解することによって可溶化する。この分解は、好ましくは、酵素セルラーゼによって、例えば、Ｎｏｖｏｚｙｍｅ又はＳｉｇｍａから市販されるセルラーゼによって仲介される。
【００５０】
本発明によるさらに別の好ましい固体マトリックスは、でん粉原料材料を含むか、でん粉原料材料を含む表面を有する。本発明による「でん粉」とは、好ましくは、二つの重合炭水化物（ポリサッカリド）の組み合わせ、好ましくはアミロースとアミロペクチンの組み合わせを意味する。本発明によるでん粉は水に不溶である。でん粉は、好ましくはアミラーゼと呼ばれ、でん粉ポリサッカリドの「アルファ−グルコース」成分間のグリコシド結合を破断することが可能な酵素によって触媒される、加水分解によって消化することが可能である。次に、得られた糖類は、例えば、マルターゼなどのさらに別の酵素によって処理することが可能である。
【００５１】
本発明において、もう一つの好ましい固体マトリックスは、ポリエステル原料材料を含むか、又はポリエステル原料材料を含む表面を有する。このポリエステル原料材料は、エステラーゼ又はリパーゼとインキュベートすることによって可溶化する。
【００５２】
本発明において、さらに別の固体マトリックスは、キチンもしくはキチン誘導体を原料とする材料を含むか、又はキチンもしくはキチン誘導体を原料とする材料を含む表面を有する。本発明による「キチン」とは、好ましくは、β−１，４方式で連結される、アセチルグルコサミン、特にＮ−アセチル−Ｄ−グルコース−２−アミン単位、から構築される材料を意味する。キチンは、例えば、Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐ．  ＰＩ−７Ｓから得られるリゾチーム又はキチナーゼと共に酵素的にインキュベートすることによって消化することが可能である。
【００５３】
本発明において、固体マトリックスのもう一つの好ましい様相では、少なくとも一つの、ジ−、オリゴ−、又はポリペプチド材料を含むか、又は少なくとも一つの、ジ−、オリゴ−、又はポリペプチド材料を含む表面を有していてもよい。このペプチド原料材料は、プロテアーゼ、例えば、プロテイナーゼＫとインキュベートすることによって分解及び可溶化する。プロテイナーゼＫは、脂肪族、芳香族、又は疎水性アミノ酸のカルボキシル側においてペプチド結合を切断する、内部分解性プロテアーゼである。固体マトリックスの原料又は表面に応じて、他のプロテアーゼ、例えば、コラゲナーゼ、プラスミン、スブチリシンを使用してもよい。
【００５４】
固体マトリックスはさらに、少なくとも一つのペクチンもしくはその誘導体を含むか、又は少なくとも一つのペクチンもしくはその誘導体を含む表面を有していてもよい。ペクチンは、ランダムにアセチル化及びメチル化することが可能な、α−（１，４）−ポリガラクツロン酸バックボーンを主に含むと理解される。ペクチン原料材料は、ペクチナーゼ及び／又はペクトリアーゼとインキュベートすることによって分解し、可溶化する。ペクチナーゼは、ペクチン及び他のガラクツロナンにおける、１−４−α−Ｄ−ガラクトシズロン結合のランダムな加水分解を触媒する。ペクトリアーゼは、（１，４）−α−Ｄ−ガラクツロナンメチルエステルの排除的切断を触媒し、その非還元末端に、４−デオキシ−６−Ｏ−メチル−α−Ｄ−ガラクト−４−エヌロノシル基を有するオリゴサッカリドを生成する。
【００５５】
本発明において、さらに別の好ましい固体マトリックスは、寒天もしくはアガロース、又はその誘導体を含むか、又は寒天もしくはアガロース、又はその誘導体を含む表面を有する。寒天原料材料は、アガラーゼ（アガロース３−グリカノヒドロラーゼ）とインキュベートすることによって可溶化する。
【００５６】
本発明では、固体マトリックスが、その環境ｐＨを変えることによって、好ましくは、少なくとも一つのカオトロープの存在下に、溶解又は液体状態に転移可能であるのが好ましい。固体マトリックスは、７以外のｐＨにおいて、好ましくは１から６の範囲内のｐＨにおいて、好ましくは２から６の範囲内、より好ましくは３からの６の範囲内、さらに好ましくは４から６の範囲内、さらに好ましくは５から６の範囲内、又は、８から１４の範囲のｐＨにおいて、好ましくは８から１３の範囲内で、より好ましくは８から１２の範囲内、さらに好ましくは８から１１の範囲内、さらに好ましくは８から１０の範囲内、再びより好ましくは８から９の範囲内で少なくとも部分的に可溶であることが好ましい。したがって、７以外のｐＨにおいて可溶状態に少なくとも部分的に転移可能な固体マトリックスの材料は、固体マトリックスの液体もしくは溶解状態への転移を誘発及び／又は触媒する試薬との接触を通じ、該試薬のｐＨを介して、液体もしくは溶解状態へ少なくとも部分的に転移可能である。好ましい実施態様では、固体マトリックスは、酸性媒体には不溶であり、中性及び／又は塩基性媒体には可溶である。別の実施態様では、固体マトリックスは、塩基性媒体には不溶であり、中性及び／又は酸性媒体には可溶である。さらに別の実施態様では、固体マトリックスは、中性又は生理的ｐＨ媒体には不溶であるが、酸性及び／又は塩基性ｐＨでは可溶である。酸又は塩基の存在によって、例えば、Ｈ3Ｏ+又はＯＨ-イオンの濃度によって誘発される、数多くのｐＨ依存性反応が、当業者には公知である。
【００５７】
ｐＨ依存的に溶解もしくは液体状態に転移可能な、適切な固体マトリックスは、例えば、第１ｐＨ範囲では少なくとも３０秒安定であるか、ほぼ安定であり、異なるｐＨ範囲では溶解する、メタ安定物質である。本発明において、この種の好ましい材料は、例えば、製剤のカプセル封入及び放出、好ましくは遅延放出に関して既に公知の材料等のポリマーである。本発明において、固体マトリックスとして好適なポリマーは、好ましくは、エチレン不飽和モノマー、例えば、メタクリル酸、アクリル酸、メチルメタクリレート、エチルアクリレート、酢酸ビニル、及びそれらの誘導体もしくは塩を含むコポリマー類、及び天然ポリマー、例えば、セルロース又はその誘導体もしくは塩を含むコポリマー類である。好ましいのは、二つ以上の上記モノマーを含むコポリマー類であり、例えば、二つ以上のエチレン不飽和モノマー及び／又はその誘導体もしくは塩を含むコポリマー類；二つ以上の天然ポリマー及び／又はその誘導体又は塩を含むコポリマー類；少なくとも一つのエチレン不飽和モノマー及び／又は少なくとも一つのその誘導体もしくは塩と、少なくとも一つの天然ポリマー及び／又はその誘導体もしくは塩とを含むコポリマー類；である。特に好ましいのは、メタクリル酸及びメチルメタクリレートのモル比が１：１又は１：２のコポリマー類であり、例えば、それぞれ、放出ｐHが６．０であるＥｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）Ｌ１００又は放出ｐHが７．０であるＥｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）Ｓ１００の商品名で販売されるポリマー（Ｒoｈｍ  ＧｍｂＨ）であり、メタクリル酸及びエチルアクリレートのモル比が１：１のコポリマーであり、例えば、放出ｐＨ５．５であるＥｕｄｒａｇｉｔ（登録商標）Ｌ１００−５５の商品名で販売されるポリマー（Ｒoｈｍ  ＧｍｂＨ）であり、ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセテートスクシネートであり、例えば、放出ｐＨが鎖のサイズに応じて変動し、例えば、放出ｐH５．０（ＨＰＭＣＡＳ−ＬＦ）、放出ｐH５．５（ＨＰＭＣＡＳ−ＭＦ）又は放出ｐH７．０（ＨＰＭＣＡＳ−ＨＦ）である、商品名Ａｑｏａｔ（登録商標）で市販されるポリマー（ＳｈｉｎＥｔｓｕ  Ｓｙｎｔｈａｐｈａｒｍ）であり、セルロースアセテートフタレートなどのセルロース誘導体であり、例えば、放出ｐHが６．２から６．５の範囲内である商品名Ａｑｕａｔｅｒｉｃ（登録商標）で市販されるセルロース誘導体（ＦＭＣ  Ｃｏｒｐ）、酢酸ビニールとメタクリル酸の比が９：１であるコポリマー類であり、商品名Ｋｏｌｌｉｃｏａｔ（登録商標）ＶＡＣの下に市販される、放出ｐHが５．８−６．０の範囲であるポリマー（ＢＡＳＦ）であり、又は、ポリビニルアセテートフタレートなどのポリビニル誘導体であり、例えば、商品名Ｓｕｒｅｔｅｒｉｃ（登録商標）で市販され、放出ｐHが４．５−５．５の範囲であるポリマー（Ｃｏｌｏｒｃｏｎ  Ｌｔｄ．）である。放出ｐＨとは、上述のポリマーが溶解を開始するｐＨである。放出ｐＨにおける溶解は速やかな過程ではないから、放出ｐＨが、唾液ｐＨより低くとも（ｐＨ６からｐＨ８）、前記材料をスワブ用に使用可能であると考えられる。放出ｐＨよりも低いｐＨでは、ポリマーは実質的に不溶である。
【００５８】
本発明のさらに他の様相では、マトリックスの固体状態から溶解もしくは液体状態への少なくとも部分的な転移に対し、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下で、酸及び塩基両方によって触媒されるように反応が作用することも可能である。例えば、固体マトリックスが、アミド及び／又はエステル結合を含む場合、アミド類及びエステル類等の酸もしくは塩基触媒性加水分解を利用することが可能である。さらに、でん粉及びセルロースなどの多くのポリサッカリドは、水に不溶である。しかしながら、セルロースもでん粉も、酸性及び塩基性加水分解によって、水溶性のモノ−及びオリゴサッカリドに分解可能である。したがって、中性ｐＨから酸性もしくは塩基性ｐＨへのｐＨ変化によって、でん粉又はセルロースの溶解がもたらされる。
【００５９】
ｐＨは、好ましくは、選択されるｐＨに対して適切な緩衝系を利用して調節される。所望のｐＨ範囲に適切で、必要に応じて生物サンプルと適合する、緩衝系については、当業者には公知である。
【００６０】
前記固体マトリックスは、少なくとも一つの前記した溶媒類、試薬類、酵素類、酸類、塩基類、又は当業者が適切と考えるそれらの任意の組み合わせを用いて、溶解もしくは液体状態に転移可能であり、そのことによって、少なくとも一つのカオトロピック物質、及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質の存在下で、生体分子を分解させず（disintegrated）、損傷させずもしくは分解させず（degraded）、又はその他のやり方でその後の処理において不利となる変化をもたらすことなく、生物サンプルの放出を可能とするのが、特に好ましい。
【００６１】
さらに、本発明の方法は、本発明によるデバイスと接触した生物サンプル材料を輸送する工程をさらに含むことが可能である。本発明の好ましい様相では、生物サンプル又はその少なくとも一つの構成成分は、輸送中に、少なくとも部分的に固体マトリックスから放出され、好ましくは、物理化学的性質の一つ以上を変化させること、及び固体マトリックスを少なくとも一つの放出助剤と接触させることのいずれか少なくとも一つによって、輸送中に、少なくとも部分的に固体マトリックスから放出される。
【００６２】
本発明は、綿もしくは綿誘導体、ポリエステルもしくはポリエステル誘導体、紙、セルロース誘導体の一つ以上を含む固体マトリックスに、少なくとも一つの酵素及び少なくとも一つの液体を添加することにより、前記マトリックスから、生物サンプルを、実質的に生物サンプルを分解させることなしに、放出するための方法にも関する。前記少なくとも一つの液体は、溶媒、好ましくは上記で定義した溶媒、少なくとも一つの溶媒中に溶解された物質もしくは組成物、又はそれ自体が液体状態で存在する物質もしくは組成物であってもよい。本発明の方法の一様相では、試薬（単数もしくは複数）、溶媒（単数もしくは溶媒）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）から選択される少なくとも一つの化合物が、さらに添加されてもよい。試薬（単数もしくは複数）、溶媒（単数もしくは溶媒）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）と同様、前記マトリックス中に含有される材料に関しては、マトリックス、試薬（単数もしくは複数）、溶媒（単数もしくは溶媒）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）に関して上記されている詳細対して参照がなされる。少なくとも一つのカオトロピック物質及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質の存在下で、前記生物サンプルが放出されるのが好ましい。
【００６３】
本発明では、安定化、輸送、貯蔵、及び／又は精製の間、前記固体マトリックスは、固体、液体又は溶解状態であってもよく、好ましく液体又は溶解状態である。前記固体マトリックスが、安定化、輸送、貯蔵、及び精製の少なくとも一つの間に、固体状態から液体もしくは溶解状態に転移可能であると、有利な場合がある。
【００６４】
前記固体マトリックスが、本発明によるデバイス上に収集された生物サンプルを輸送している間に、好ましくは少なくとも一つのカオトロープの存在下で、固体状態から液体状態に転移可能であるのが好ましい。ここでは輸送は、サンプル供給源から、該サンプルを分析及び／又は保存することが可能であるか、又はその他のやり方で調製又は処理することが可能な場所への輸送であってもよい。したがって、輸送は、例えば、単純に、患者から、同じ又は近くの部屋の作業ステーションへの輸送であってもよい。さらに、輸送は、サンプル供給源から、サンプルの収集後、数時間又は数日の−ただし好ましくは２４時間未満であるが−遅延及び／又は旅行を要する、中央の分析及び／又は保存施設への輸送であってもよい。
【００６５】
安定化、輸送、貯蔵、及び精製の少なくとも一つの間に生じる、好ましくは安定化又は輸送の間に生じる、より好ましくは輸送の間に生じる、生物サンプルの少なくとも部分的な放出は、効率と時間の節約という観点から、本発明の方法の格別の有利性を示す。
【００６６】
前記生物サンプル及び／又は前記生物サンプル、例えば生体分子又は細胞等、の構成成分の少なくとも一部の放出は、本発明のデバイスの前記固体マトリックスが、固体状態から液もしくは溶解状態に少なくとも部分的に転移することによって生じるのが好ましい。少なくとも一つのカオトロピック物質及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質の存在下で、前記生物サンプルが放出されるのが好ましい。
【００６７】
前記生物サンプルからの一つ以上の生物構成成分の単離が、前記サンプルの放出中もしくは後に、好ましくは前記サンプルの放出中に、起こってもよい。当業者に知られている全ての単離及び精製技術は、前記生物サンプルの単離及び／又は精製のために本発明において考慮される。
【００６８】
固体状態及び液体もしくは溶解状態のいずれにおいても、固体マトリックスは、システムの保護、及びシステム寿命の延長のための特別包装の必要をできるだけ回避するために、温度及び湿度の環境条件において、保存安定性であるのが好ましい。任意の必然的な包装は、好ましくは、システムの滅菌性、特に、固体マトリックスの滅菌性を維持する。
【００６９】
上述の問題点の解決はまた、固体マトリックスの環境の少なくとも一つの物理化学的性質を変化させることによって、前記マトリックスの固体状態を、少なくとも部分的に溶解もしくは溶液状態に転移させて、生物サンプルを、実質的に該生物サンプルを分解することなしに、固体マトリックスから放出するために、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）並びに溶媒（単数もしくは複数）から選択される少なくとも一つの化合物を含有するキット、によって提供される。前記生物サンプルが、少なくとも一つのカオトロピック物質及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質の存在下で、放出されるのが好ましく、そのような前記キットは、少なくとも一つのカオトロピック物質及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質をさらに含んでいるのが好ましい。
【００７０】
試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）に関しては、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）に関して上記されている詳細対して参照がなされる。
【００７１】
本発明の前記キットの好ましい実施態様では、前記キットが、生物サンプルを収集するための少なくとも一つの固体マトリックスをさらに含む。前記固体マトリックスは、生物サンプルの収集に対して適する任意の形状（form）又は任意の外形（shape）を有する。本発明のデバイスの好ましい態様において、前記固体マトリックスは、円形又は楕円形の球、バルブ（球根）、メッシュ、スティック、織布バルブ、紙、カード、粒子、ビーズ、ロッド、プラグ、又はフィルターの形状を取る。前記固体マトリックスの材料に関する詳細については、本発明の方法に関する上記の記載に対して参照がなされる。
【００７２】
本発明では、前記キットは、固体マトリックス（一つ以上の、ワックス類、パラフィンなどの高分子量アルカン炭化水素類、モノテルペン類、スクロース、アガロース類、でん粉、キチン、ペプチド類、タンパク質、ペクチン類、寒天、酸性ポリメチルアクリレート類、セルロースアセテート、セルロースアセテートフタレート、酢酸ビニル、ポリビニルアセテートフタレート、ヒドロキシプロピルメチルセルロース−アセテートスクシネート、アルギン酸塩類、メタクリル酸とメチルメタクリレートのコポリマー類、酢酸ビニルとメタクリル酸のコポリマー類、及びポリビニルアセテートフタレートを含む）に、少なくとも一つの酵素及び必要に応じて試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）から選択される少なくとも一つの追加の化合物が添加されることによって、実質的に生物サンプルを分解することなし、前記マトリックスから生物サンプルが放出されるために、酵素を含んでいるのが好ましい。前記少なくとも一つの追加の化合物は、本発明の方法との関係で言及された、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）に関する上記詳細な記載を参照して、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）から選択される少なくとも一つの化合物であるのが好ましい。前記生物サンプルは、少なくとも一つのカオトロピック物質及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質の存在下で放出されるのが好ましく、そのような前記キットは、少なくとも一つのカオトロピック物質及び必要に応じて少なくとも一つの高イオン強度物質をさらに含んでいるのが好ましい。
【００７３】
特に好ましい様相では、本発明の前記キットは、試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）から選択される少なくとも一つの追加の化合物をさらに含有する。試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）に関しては、本発明の方法との関係で既に言及された試薬（単数もしくは複数）、酵素（単数もしくは複数）、酸（単数もしくは複数）、及び塩基（単数もしくは複数）、液体（単数もしくは複数）、並びに溶媒（単数もしくは複数）に関する詳細な技術に対して参照がなされる。
【００７４】
少なくとも一つの追加の化合物は、少なくとも一つの添加剤、好ましくは前記生物サンプル又はその少なくとも一つの構成成分、例えば、細胞、細胞群もしくはそれらの構成成分、核酸又はたんぱく質、の完全性を維持するのを助ける少なくとも一つの添加剤、を含有するのが好ましい。添加剤は、前記生物サンプルの安定化もしくは処理を強化する任意の添加剤であってもよいし、固体、液体もしくは溶解状態の固体マトリックスの性質、又は生物サンプルの性質に影響する任意の添加剤であってもよい。その様な添加剤の例には、核酸及び／もしくはタンパク質の分解を阻害する阻害剤、巨大分子を損傷する剤の抑制を実行可能な抑制剤、並びに、プロテアーゼ、リボヌクレアーゼ、デオキシリボヌクレアーゼ、又は生物サンプル及び／もしくはその構成成分の分解反応をもたらす他の酵素の活性に対抗するか、あるいは該活性を抑える修飾剤が含まれるが、これらに限定されるものではない。添加剤は、タンパク修飾剤、例えば、少なくとも一つのアセチル化剤、ハロゲン化剤、ヌクレオチド、核酸類縁体、アミノ酸又はアミノ酸類縁体、カルボジイミド又はイミド、ハロアセテート、ハロアセタミド、アセチルサルチル酸、又は無水酸であってもよい。
【００７５】
さらに、他の処理剤も、例えば、イオン性もしくは非イオン性洗浄剤、還元剤、例えば、２−メルカプトエタノール、ジチオスレイトール、アスコルビン酸、抗微生物剤、キレート剤、例えば、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、及び処理剤として使用されるもの以外の緩衝物質、例えば、ＨＥＰＥＳ又はＭＯＰＳも考慮の対象とされる。
【００７６】
本発明のキットは、例えば、医学又は獣医学施設の内部及び外部の両方において、又は戸外で、例えば、病院で、医師の手術室で、薬局で、仕事場で、家庭で、法執行機関で、科学捜査で、環境サンプル収集で、食品サンプル収集で、植物サンプル収集で使用されるため、携帯可能となるように工夫されてもよいが、しかし必ずしもそうである必要はない。キットはさらに、広汎な生物サンプルを安定化及び／もしくは処理するために、ならびに／又は本発明によるデバイスの固体マトリックスを、固体状態から液体もしくは溶解状態に転移させるために、好適な一つ以上の組成物を含んでもよい。さらに、キットは、特定のサンプル、又は特定種類のサンプルのための特別組成物を含むことも可能である。携帯キットはさらに、好ましくは、キットを運ぶのに好適なキャリヤー、及び必要に応じて、キットを、特にサンプルを含むキットを、加熱又は冷却することが可能な、一つ以上の携帯デバイスを含む。本発明によるキットはさらに、好ましくは、該キットを使用するための案内を含む。さらに、キットは、追加の構成を含んでいてもよく、例えば、法執行機関、遺伝関係の確立、もしくは現場試験における、法的な目的を満足するために必要な構成を含んでいてもよい。このような構成としては、テープもしくはその他の不正開封防止シーリング要素、及び／又は法的文書が挙げられる。
【００７７】
本発明によるシステム及び／又はキットは、自動化システムもしくは半自動化システム、又は、例えば、高処理システムであってもよく、少なくとも部分的自動化システムと適合的であることが考えられる。この少なくとも部分的自動化システムは、生物サンプルの保存、回収、処理、精製、及び分析の内の少なくともひとつに関していてもよい。
【００７８】
本発明の実施態様及び局面は、もちろん、当業者にとって、本発明の目的を達成するのに好適と考えられる任意のやり方で互いに組み合わせることが可能である。
【００７９】
本発明はさらに、下記の非限定的図面及び実施例によって具体的に説明される。
図面の簡単な説明
図１は、閉鎖される保持要素及び固体マトリックスを含む、種々の形状：
ａ）円形頭部；
ｂ）楕円形頭部；
ｃ）球根状頭部；
ｄ）紙片；
ｅ）乳頭状頭部；
ｆ）液体又は固体を含む中空ロッドを備える楕円形頭部；
ｇ）ロッド及び固体マトリックスを貫通する閉鎖回路つき；
のロッド様ユニットを示す。
図２は、固体マトリックスに開放する中空ロッド形状を持つ保持要素を含む、種々の形態；
ａ）基本構造；
ｂ）中空ロッドを貫流する流体を有する基本構造；
のロッド様ユニットを示す。
【００８０】
図１の実施態様は、本発明によるシステム１の好ましい形状を表す。固体マトリックス３は、ロッド形状を持つ保持要素４に対し、該ロッドの先端５において付着する。ロッドは、実質が詰まっていても、中空であってもよく、中空の場合、頭部の固体マトリックス３に対して閉鎖される。
【００８１】
図１ｆ）は、保持要素として中空ロッドを有するシステムを示す。中空ロッドは、例えば冷却又は加熱のため、かつ、必要に応じて、流体７の貯留槽として活動するため、流体７の流入を可能とするよう、頭部の反対側のロッドにおいて比較的大きな開口６を有する。
【００８２】
図１ｇ）は、他の実施態様であって、例えば、冷却剤もしくは加熱剤の流通のため、又は、頭部の固体マトリックス３を加温するための電流通電のため、固体マトリックス３に対して閉鎖される回路９が、ロッドによって、又は、ロッドを通じて設けられる実施態様を示す。
【００８３】
図２ａ）及び２ｂ）に描く、さらに別の態様は、頭部の固体マトリックス３に対して開放される、保持要素としての中空ロッドを示す。中空ロッドの中に設けられるキャビティ８は、例えば、放出助剤を提供することによって、固体マトリックス３の、固体状態から液体もしくは溶解状態への転移を実行又は補佐するために使用可能である。
【００８４】
図２ｂ）は、流体７、例えば冷却剤もしくは放出助剤が、ロッドを通過し、頭部に少なくとも流入する、好ましくは頭部を貫通する流れを示す。
【実施例】
【００８５】
（実施例１）
カオトロピック溶液を利用した、可溶性頬内スワブからのＤＮＡ抽出
綿球形状の酢酸セルロース線維を、ヒトのドナーから頬内スワブを採取するのに用いた。綿球を、二つの等しい大きさの小片（Ａ及びＢ）に切断し、異なる手順を用いてＤＮＡを抽出した。
【００８６】
手順１
酢酸セルロース綿球のＡ部分は、８００μｌのＡＶＬ緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製のグアニジニウム塩を含む高塩緩衝液）中に穏やかに攪拌しながら室温で５分間溶解させた。この縣濁液５６０μｌを、２ｍｌのマイクロ遠心管に移し、この縣濁液を含む管に５６０μｌのエタノールを加えた。混合は、渦巻き攪拌によって実行し、サンプルを、膜を備えたカラムに移した（ＱＩＡＧＥＮ製のＱＩＡａｍｐ  Ｍｉｎｉ  Ｓｐｉｎカラム）。カラムを、８，０００ｒｐｍで１分間遠心し、核酸を膜に結合させた。カラムを、第１回目、５００μｌのＡＷ１緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製のグアニジニウム塩及びエタノール含有緩衝液）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分間遠心した。次に、カラムを、第２回目、５００μｌのＡＷ２緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製のエタノール含有緩衝液）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分遠心した。乾燥工程では、カラムを、新しい収集管に移し、１４，０００ｒｐｍで３分遠心した。溶出のために、１５０μｌのＡＥ緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製の低塩溶出緩衝液）を、乾燥させた膜に投下し、次いで、１４，０００ｒｐｍで１分間遠心した。
【００８７】
溶出液におけるゲノムＤＮＡを、リアルタイムＰＣＲを用いて定量した。手順１における平均収量は、ＤＮＡ  ８．７ｎｇであった。
【００８８】
手順２
酢酸セルロース綿球のＢ部分は、８００μｌのＡＶＬ緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製のグアニジニウム塩を含む高塩緩衝液）に、穏やかに攪拌しながら室温で５分間溶解させた。この縣濁液４００μｌを、２ｍｌのマイクロ遠心管に移し、この縣濁液を含む管に、７２０μｌの脱イオン水、及び２０μｌのプロテイナーゼＫ（ＱＩＡＧＥＮ製）を加えた。混合は、渦巻き攪拌によって実行し、サンプルを、５６℃で１０分間インキュベートした。さらに別の４５６μｌのＡＶＬ緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製）、及び８００μｌのエタノールを加え、混合を渦巻き攪拌によって実行した。次に、サンプルを、カラムに移した（ＱＩＡＧＥＮ製のＱＩＡａｍｐ（登録商標）Ｍｉｎｉ  Ｓｐｉｎカラム）。カラムを８，０００ｒｐｍで１分間遠心し、核酸を膜に結合させた。カラムを、第１回目、５００μｌのＡＷ１緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分間遠心した。次に、カラムを、第２回目、５００μｌのＡＷ２緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分間遠心した。乾燥工程では、カラムを、新しい収集管に移し、１４，０００ｒｐｍで３分間遠心した。溶出のために、１５０μｌのＡＥ緩衝液（ＱＩＡＧＥＮ製の低塩溶出緩衝液）を乾燥させた膜に投下し、次いで１４，０００ｒｐｍで１分間遠心した。
【００８９】
溶出液におけるゲノムＤＮＡを、リアルタイムＰＣＲを用いて定量した。手順２における平均収量は、ＤＮＡ  ５０．９ｎｇであった。
【００９０】
（実施例２）
種々の緩衝液におけるセルロースアセテートフタレートの可溶性
種々の緩衝液におけるセルロースアセテートフタレート（ＣＡＰ）の可溶性を調べた。
【００９１】
５０ｍｇ（±１ｍｇ）のＣＡＰを、２ｍｌのマイクロ遠心管に移した。１ｍｌの緩衝液を加えた。この管を閉鎖し、内容物を混ぜ合わせるために、１０秒間パルス渦巻き攪拌した。次に、管を、室温において３０時間観察した。
【００９２】
使用した緩衝液は、ＡＴＬ（細菌用分解緩衝液）、ＡＶＬ（分解緩衝液）、ＭＴＬ（分解及び結合緩衝液）、ＭＬ（分解及び結合緩衝液）、及びＲＬＴ（分解緩衝液）であった。これらは全て、ＱＩＡＧＥＮから市販される緩衝液である。
結果は以下の表１において示されている。
【００９３】
【表１】
2010515037.tif 000003
【００９４】
（実施例３）
カオトロピック液による、融解可能なスワブからのＤＮＡ抽出
パラフィン製頭部を有するスワブ（Ｐａｒａｐｌａｓｔ−ＸＴＲＡ、融解点５２℃、ＭｃＣｏｒｍｉｃｋ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を用いて、ＨｅＬａ細胞からサンプルを採取した。スワブを、カオトロピック塩の添加又は無添加下に、種々の溶液において７０℃で融解させた。ＤＮＡは、ＱＩＡａｍｐ  ＤＮＡ（ＱＩＡＧＥＮ）技法を用いて抽出した。
【００９５】
手順
単層として増殖させたＨｅＬａ細胞を、ＰＢＳで２度洗浄した。スクレーパー形状のＰａｒａｐｌａｓｔ−ＸＴＲＡ製頭部を持つスワブを用いて細胞サンプルを採取した。このスワブの頭部を、２ｍｌのマイクロ遠心管において、カオトロピック塩添加又は無添加の、種々の試薬（表２、試薬組成）５００μｌに溶解した。スワブ頭部の融解は、穏やかな攪拌下に７２℃で１０分インキュベーションすることによって実現した。フルスピード（１４，０００ｒｐｍ）で１分間遠心後、パラプラストは、液体溶液の上に固体層を形成した。液体溶液４００μｌを回収し、新しい２ｍｌマイクロ遠心管に移した。
【００９６】
２０μｌのプロテイナーゼＫの添加、及び５６℃で１０分のインキュベーション後、２００μｌのエタノール（９９．５％）を加えた。混合は、渦巻き攪拌によって実行し、サンプルを、膜を備えたカラムに移した（ＱＩＡａｍｐ  Ｍｉｎｉ  Ｓｐｉｎカラム、ＱＩＡＧＥＮから購入）。カラムを、８，０００ｒｐｍで１分間遠心し、核酸を膜に結合させた。カラムを、第１回目、５００μｌの洗浄緩衝液ＡＷ１（ＱＩＡａｍｐ  ＤＮＡ、ＱＩＡＧＥＮ）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分間遠心した。カラムを、第２回目、５００μｌの洗浄緩衝液ＡＷ２（ＱＩＡａｍｐ  ＤＮＡ、ＱＩＡＧＥＮ）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分間遠心した。乾燥工程では、カラムを、新しい収集管に移し、１４，０００ｒｐｍで１分間遠心した。溶出のために、１００μｌの水性緩衝液ＡＥ（ＱＩＡａｍｐ  ＤＮＡ、ＱＩＡＧＥＮ）を、乾燥させた膜に投下し、次いで、１０，０００ｒｐｍで１分間遠心した。
【００９７】
ＤＮＡ全体の完全性及びサイズを、アガロースゲル電気泳動によって分析した。１０μｌの溶出液を、４μｌの負荷緩衝液（５０％グリセロール及びブロムフェノールブルーを含む）と混ぜ合わせた。サンプルを、１ｘ  ＴＢＥ緩衝液に溶解した１％アガロースゲルに加えた。電気泳動は、電気泳動チェンバーのｃｍ長当たり約２ボルト下に１５０分動作させた。ＤＮＡは、臭化エチジウム染色によって可視化した（図面実験３）。ＰＣＲの成績は、ＡＢＩ配列検出システムＡＢＩ  ＰＲＩＳＭ  ７７００において、定量的、リアルタイムＰＣＲによって分析した（表２、ＣＴ値、及び３回試行における２回の独立抽出から得られる標準偏差）。ＱｕａｎｔｉＴｅｃｔ  Ｐｒｏｂｅ  ＰＣＲキット（ＱＩＡＧＥＮ）使用による、鋳型として２μｌサンプルを有する２５μｌアッセイは、ヒトのβ−アクチン遺伝子のエキソン３内の、２９４  ｂｐ断片の増幅用プライマー及びプローブを含んでいた（forward primer:  5'-TCA CCC ACA CTG TGC CCA TCT ACG A-3’; reverse primer: 5’-CAG CGG AAC CGC TCA TTG CCA ATG G-3’、フ゜ローフ゛5’-(FAM)ATG CCC TCC CCC ATG CCA TCC TGC GT(BHQ)-3'）。
【００９８】
カオトロピック塩を含む溶液内で融解させたスワブ頭部から抽出したＤＮＡは、高分子量で、約２３ｋｂの断片長を持ち、アガロースゲルにおいて明瞭なバンドとして泳動した（図面実験３、１−５列）。これらのＤＮＡサンプルは、リアルタイムＰＣＲによって増幅することが可能であり、２７から２９の範囲のＣＴ値が得られた（表２、ＡからＣ）。
【００９９】
一方、スワブ頭部を、カオトロピック塩無添加の溶液中で融解させ、前述の方法で単離した場合、ＤＮＡは見られなかった（図面実験３、６及び７列）。この結果と一致して、リアルタイムＰＣＲにおけるＣＴ値は、試薬液Ｄの場合６から７サイクル遅く、あるいは、試薬液Ｅの場合、増幅はまったく起こらなかった（表２）
【０１００】
【表２】
2010515037.tif 000004
2010515037.tif 000005
【０１０１】
図面実験３
試薬Ａ（１）、Ｂ（２及び４）、Ｃ（３及び５）、Ｄ（６）、並びにＥ（７）中に溶融したパラプラストスワブからの溶出液に関するアガロースゲル電気泳動。Ｍ：ラムダＨｉｎｄ  ＩＩＩ分子量マーカー
【０１０２】
（実施例４）
カオトロピック液による可溶性スワブからの核酸抽出
酢酸セルロース製頭部を持つスワブを、唾液及び種々のウィルス及び細菌病原体の混合物で含浸した。スワブを、アセトンか、又はカオトロピック剤含有緩衝液（ＡＶＬ緩衝液、ＱＩＡＧＥＮ）に溶解した。ＱＩＡａｍｐウィルスＲＮＡ（ＱＩＡＧＥＮ）手順を用いて核酸を抽出した。
【０１０３】
手順
Ｃｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ、及びＡ型肝炎ウィルス（ＨＡＶ）を含む病原体混合物を調製した。５ｍｌの唾液を、５０ｍｌ管に収集した。唾液の１００μｌ分液、及び病原体混合物の４０μｌ分液を、酢酸セルローススワブに含浸させた。スワブを、３ｍｌのアセトン、又は３ｍｌのＡＶＬ緩衝液のいずれかを含む１５ｍｌ管に移した。３回転倒させた後、サンプルを室温で２４時間保存した。保存後、５６０μｌのエタノール（９９．５％）を７００μｌのサンプルに加えた。混合は、渦巻き攪拌によって実行し、６３０μｌサンプルを、膜を備えたカラムに移した（ＱＩＡＧＥＮ製のＱＩＡａｍｐ  Ｍｉｎｉ  Ｓｐｉｎカラム）。カラムを、８，０００ｒｐｍで１分間遠心し、核酸を膜に結合させた。残りのサンプルを、ＱＩＡａｍｐ  Ｍｉｎｉ  Ｓｐｉｎカラムに移し、カラムを、８，０００ｒｐｍで１分間遠心した。カラムを、第１回目、５００μｌの洗浄緩衝液ＡＷ１（ＱＩＡＧＥＮ）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分間遠心した。カラムを、第２回目、５００μｌの洗浄緩衝液ＡＷ２（ＱＩＡＧＥＮ）で洗浄し、次いで、８０００ｒｐｍで１分遠心した。乾燥工程では、カラムを、新しい収集管に移し、１４，０００ｒｐｍで３分遠心した。溶出のために、１００μｌの水性緩衝液ＡＶＥ（ＱＩＡＧＥＮ）を、乾燥させた膜に投下した。１分間のインキュベーション後、１０，０００ｒｐｍで１分間遠心した。
【０１０４】
抽出核酸のＰＣＲ上の振る舞いを、種々のリアルタイムＰＣＲにおいて分析した。
溶解スワブから抽出されたＣｈｌａｍｙｄｉａ  ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ−ＤＮＡは、メーカーの記載する通り、ＡＢＩ配列検出システムＡＢＩ  ＰＲＩＳＭ  ７９００に接続したａｒｔｕｓ  Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ  ＴＭ  ＰＣＲキット（ＱＩＡＧＥＮ）を用いて分析した。
溶解スワブから抽出したＨＡＶ−ＲＮＡは、メーカーの記載する通り、Ｒｏｃｈｅから支給されたＬｉｇｈｔ  Ｃｙｃｌｅｒ  １．０に納めたａｒｔｕｓ  ＨＡＶ  ＬＣ  ＲＴ−ＰＣＲキット（ＱＩＡＧＥＮ）を用いて分析した。
【０１０５】
サンプルは全て、アセトンにも、ＡＶＬにも１時間以内に溶解した。平均ＣＴ値、及びそれぞれ３重に抽出した４サンプルの標準偏差を表３に示す。Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ標的ＤＮＡのＣＴ値は、アセトンに溶解させたものに比べると、ＡＶＬ緩衝液に溶解させたサンプルではより低かった（デルタＣＴ＝−２．７０）。ＰＣＲ反応に加えた内部コントロールのＣＴ値は等しかった。これは、ＰＣＲの抑制が、アセトンサンプルの標的ＣＴ値がより高いことの理由ではないことを示す。
Ｃ．ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓデータと同様に、ａｒｔｕｓ  ＨＡＶ  ＬＣ  ＲＴ−ＰＣＲにおいても、ＣＴ値は、アセトンサンプルに比べ、ＡＶＬに溶解させたサンプルにおいてより低かった（デルタＣＴ＝−１．８７）。
【０１０６】
【表３】
2010515037.tif 000006
【図１ａ）】
2010515037.tif 000007
【図１ｂ）】
2010515037.tif 000008
【図１ｃ）】
2010515037.tif 000009
【図１ｄ）】
2010515037.tif 000010
【図１ｅ）】
2010515037.tif 000011
【図１ｆ）】
2010515037.tif 000012
【図１ｇ）】
2010515037.tif 000013
【図２ａ）】
2010515037.tif 000014
【図２ｂ）】
2010515037.tif 000015
【国際調査報告】
2010515037.tif 000016
2010515037.tif 000017
2010515037.tif 000018
2010515037.tif 000019