(57)【要約】  複数のアナライトのそれぞれについてのサンプルを分析する方法が説明される。方法は、液体サンプル（例えば全血）を有する間隔の空いた試験ゾーンのアレイに接触することを含む。試験ゾーンはマイクロ流体デバイスのチャネル内に配置される。チャネルは少なくとも１つの柔軟な壁面と、柔軟であっても、または柔軟でなくてもよい第２の壁面とにより画定される。各試験ゾーンはそれぞれの標的アナライトに特有のプローブ化合物を含む。マイクロ流体デバイスは圧縮されて、チャネル内の壁面の内面間の距離であるチャネルの厚みを低減する。各アナライトの存在は、対応する位置における内面間の距離が減少している複数の試験ゾーンのそれぞれにおける相互作用を光学的に検出することにより決定される。各試験ゾーンにおける相互作用は、サンプル中の標的アナライトの存在を表す。
2010526283.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
アナライトを検出するためのデバイスであって、デバイスがカートリッジとキャップとを備え、
カートリッジが、
入口と入口と流体連通する検出領域とを含むマイクロ流体チャネルと、
少なくとも部分的に変形可能な壁面を有し、およびチャネルの検出領域と流体連通するマイクロ流体流路とを有し、
キャップが、入口を密封し、および入口とマイクロ流体チャネルとマイクロ流体流路とを含む流体回路を形成するように構成された密封部材を有する、アナライトの検出デバイス。
【請求項２】
流体回路を形成後、キャップおよびカートリッジが不可逆的に閉じるように構成されている、請求項１に記載のデバイス。
【請求項３】
キャップがカートリッジに柔軟に結合されている、請求項１に記載のデバイス。
【請求項４】
キャップおよびカートリッジが、キャップを取り外すことができるような第１の相対的位置に係合し、および流体回路を形成後、キャップを不可逆的に閉じるような第２の相対的位置に係合するように構成されている、請求項１に記載のデバイス。
【請求項５】
検出領域がカートリッジの少なくとも１つの面と少なくとも蓋の１つの面とにより範囲を限定されている、請求項１に記載のデバイス。
【請求項６】
蓋が検出領域を覆う透明フィルムを含む、請求項５に記載のデバイス。
【請求項７】
蓋がカートリッジに接着剤で固定されている、請求項６に記載のデバイス。
【請求項８】
アナライトを検出するためのシステムであって、システムがカートリッジとキャップと蛍光検出器とを備え、
カートリッジが、
入口と入口と流体連通する検出領域とを含むマイクロ流体チャネルと、
少なくとも部分的に変形可能な壁面を有し、およびチャネルの検出領域と流体連通するマイクロ流体流路とを有し、
キャップが、
入口を密封し、および入口とマイクロ流体チャネルとマイクロ流体流路とを含む流体回路を形成するように構成された密封部材を有し、
蛍光検出器が、
光源と、
１０°以上の立体角を得る集光レンズと、
１０°以上の立体角を得る対物レンズとを含む、アナライトを検出するためのシステム。
【請求項９】
蛍光検出器がカメラを含む、請求項８に記載のシステム。
【請求項１０】
蛍光検出器が１つ以上の選択可能な放射フィルタを含む、請求項８に記載のシステム。
【請求項１１】
液体サンプルをマイクロ流体チャネルに導入することにより、チャネルによって密封され、および輸送液体によって第１端において範囲を限定された連続した液体スラグを生成することと、
輸送液体が液体スラグの第１端と第２端との間の流体連通を提供するように流体回路を形成することと、
輸送液体によって液体スラグの第１端と第２端とに差圧を加えることとを含む、アナライトを検出する方法。
【請求項１２】
流体回路の一部分が弾性変形可能な壁面により形成される、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
液体スラグの第１端と第２端とに差圧を供給するステップが、弾性変形可能な壁面に圧縮を加えることを含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
第１蛍光抗体と第２蛍光抗体とでアナライトをラベリングすることをさらに含み、第１および第２の蛍光抗体が別個の放射波長を有する、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
アナライトを検出するステップが、第１蛍光抗体の放射波長におけるアナライトの第１画像を記録することと、第２蛍光抗体の放射波長におけるアナライトの第２画像を記録することと、第１および第２画像を比較することとを含む、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
複数の粒子を含む液体サンプルをマイクロ流体チャネルに導入することにより、チャネルによって密封され、および輸送液体によって第１端において範囲を限定された連続した液体スラグを生成することと、
輸送液体が液体スラグの第１端と第２端との間の流体連通を提供するように流体回路を形成することと、
輸送液体によって液体スラグの第１端と第２端とに差圧を加えることにより、液体サンプルの少なくとも一部と光ラベルとを含む混合物を生成することと、
各複合物が複数の粒子のうちの１つと光ラベルのうちの少なくとも１つとを含む、複数の複合物を生成することと、
混合物のサブセット内に存在する複合物を検出することとを含む、方法。
【請求項１７】
流体回路の一部分が弾性変形可能な壁面により形成される、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
液体スラグの第１端と第２端とに差圧を加えるステップが、弾性変形可能な壁面に圧縮を加えることを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
混合物の複数の異なるサブセットのそれぞれ内に存在する複合物を検出することをさらに含む、請求項１６から１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
複数の異なるサブセットの全容積が、マイクロ流体デバイスに導入された液体サンプルの容積の少なくとも９０％である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
液体サンプルの全容積Ｖをマイクロ流体デバイスに導入することを含み、混合物の全容積が容積Ｖの少なくとも９０％である、請求項１６から２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
混合物が液体サンプルの容積Ｖの少なくとも約９０％を含む、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
混合物の全容積の少なくとも１０％内に存在する複合物を検出することを含む、請求項２０に記載の方法。
【請求項２４】
粒子が細胞であり、光ラベルが蛍光ラベルである、請求項１６から２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
マイクロ流体チャネルが、入口と入口と流体連通する検出領域とを含み、およびマイクロ流体デバイスのマイクロ流体チャネルである、請求項１１から２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６】
液体サンプルをマイクロ流体チャネルに導入する前に、液体サンプルを毛細管の穴に導入することをさらに含む、請求項１１から２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
液体サンプルを毛細管の穴に導入するステップと、液体サンプルをマイクロ流体チャネルに導入するステップとの中間に、毛細管をマイクロ流体デバイスに接続し、液体サンプルが毛細管内に残るようにすることをさらに含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
液体サンプルのサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出することをさらに含み、サブセットがマイクロ流体デバイスの検出領域内に存在する、請求項１１から２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
液体サンプルをマイクロ流体チャネルに導入するステップが、弾性変形可能な壁面に圧縮を加えることにより実行される、請求項１１から２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
弾性変形可能な壁面に圧縮を加えるステップが、流体回路の第１部分に圧縮を加え、最初に圧縮を完全に解放することなく、導入ステップを実行するのに十分な量だけ、圧縮を加えた箇所を流体回路に沿って移動させることを含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
最初に圧縮を完全に解放した状態で、サブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出するステップを実行することを含む、請求項１１から３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
液体サンプルが血液である、請求項１１から３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３３】
毛細管の穴が凝固防止剤を含む、請求項２６から３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
液体サンプルを毛細管の穴に導入するステップと、液体サンプルの少なくとも一部をマイクロ流体チャネルに導入するステップとの中間に、液体サンプルが毛細管から流れ出るのを防止することを含む、請求項２６から３３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
マイクロ流体チャネルの検出領域が液体サンプルの毛細管流れを促進しない、請求項１１から３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
マイクロ流体チャネルの内面の少なくとも一部が疎水性である、請求項１１から３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
マイクロ流体デバイスおよび光検出器のうちの少なくとも一方を他方に対して移動し、その後、液体サンプルの異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す光信号を検出することをさらに含む、請求項２５から３６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３８】
毛細管が第１および第２開放端を備えるエンドツーエンド毛細管であり、毛細管の穴が全容積Ｖを有し、液体サンプルの少なくとも一部を導入するステップが、液体サンプルの少なくとも９０％をマイクロ流体チャネルに導入することを含む、請求項２６から３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
請求項１１から３８に記載の方法のいずれかを実行するように構成された、デバイス。
【請求項４０】
アナライトを検出するためのデバイスであって、デバイスがカートリッジとキャップとを備え、
カートリッジが、
内面上に抗凝固剤を有する毛細管入口と、試薬を含むチャンバと、入口と流体連通する検出領域とを含むマイクロ流体チャネルと、
少なくとも部分的に変形可能な壁面を有し、およびチャネルの検出領域と流体連通するマイクロ流体流路とを有し、
キャップが、
入口を密封し、および入口とマイクロ流体チャネルとマイクロ流体流路とを含む流体回路を形成するように構成された密封部材を有する、アナライトの検出デバイス。
【請求項４１】
光源と、
１０°以上の立体角を得る集光レンズと、
１０°以上の立体角を得る対物レンズであって、顕微鏡対象物を撮像するように構成された対物レンズとを含む、蛍光検出器。
【請求項４２】
液体サンプルを毛細管の穴に導入することと、
液体サンプルの液体サンプル−ガスの境界面に作用する圧力を低減することによって、液体サンプルの少なくとも一部をマイクロ流体デバイスのマイクロ流体ネットワーク内に導入することとを含む、方法。
【請求項４３】
液体サンプルを毛細管の穴に導入するステップ後に、毛細管をマイクロ流体デバイスに接続し、液体サンプルが毛細管内に残るようにすることをさらに含む、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
圧力を低減するステップが、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部分を圧縮することによりネットワークからガスを移動させ、その後にマイクロ流体ネットワークの少なくとも一部分を復元することによって実行される、請求項４２または４３に記載の方法。
【請求項４５】
マイクロ流体ネットワークが、少なくとも部分的に、第１および第２の概して平らな基板によりそれら基板間に画定されており、基板の少なくとも一方が外部圧力を加えると変形して、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部分を圧縮し、少なくとも一方の基板が、外部圧力を解放すると最初の状態に回復して、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部分を復元可能にする傾向がある、請求項４２から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４６】
マイクロ流体ネットワークが、入口および入口と流体連通する検出領域を含むマイクロ流体チャネルと、検出領域と流体連通するマイクロ流体流路とによって、少なくとも部分的に画定されており、マイクロ流体流路が、外部圧力を加えると少なくとも部分的に変形して、マイクロ流体流路の少なくとも一部分を圧縮する壁面を有し、壁面が、外部圧力を解放すると最初の状態に回復して、マイクロ流体流路の少なくとも一部分を復元可能にする傾向がある、請求項４２から４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
液体サンプルをマイクロ流体ネットワーク内に存在する１つ以上の試薬と混合して、混合物を生成することをさらに含む、請求項４２から４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
混合物が、マイクロ流体ネットワークに導入された液体サンプルの少なくとも９０％を含む、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
１つ以上の試薬が、サンプルと反応してラベルとサンプル中に存在するアナライトを含む複合物を生成する、検出可能なラベルを含む、請求項４７または４８に記載の方法。
【請求項５０】
液体サンプルのサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出することをさらに含み、サブセットが、マイクロ流体デバイスの検出ゾーン内に存在する、請求項４７から４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５１】
液体サンプルのサブセットを検出ゾーンから移動することと、液体サンプルの異なるサブセットを検出ゾーンに導入することと、異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出することとをさらに含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
サブセットを移動するステップおよび異なるサブセットを導入するステップが、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部分を圧縮することにより実行され、圧縮部分がネットワークに沿って、検出ゾーンから少なくとも部分的にずれている、請求項５１に記載の方法。
【請求項５３】
少なくとも一部分を圧縮するステップが、マイクロ流体ネットワークの第１部分を圧縮することと、最初に圧縮を完全に解放することなく、圧縮箇所を移動および導入のステップを実行するのに十分な量だけマイクロ流体ネットワークに沿って移動することとを含む、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
最初にマイクロ流体ネットワークの圧縮を完全に解放することなく、異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出するステップを実行することを含む、請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
液体サンプルが血液である、請求項４２から５４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５６】
毛細管の穴が凝固防止剤を含む、請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
液体サンプルを毛細管の穴に導入するステップと、液体サンプルの少なくとも一部をマイクロ流体ネットワークに導入するステップとの中間に、液体サンプルが毛細管から流れ出るのを防止することを含む、請求項４２から５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５８】
液体サンプルが毛細管から流れ出るのを防止するステップが、液体サンプル−ガスの境界面に作用する圧力を増加することを含む、請求項５７に記載の方法。
【請求項５９】
マイクロ流体ネットワークが液体サンプルの毛細管流れを促進しない、請求項４２から５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６０】
第１および第２基板のうちの少なくとも一方によって画定されたマイクロ流体ネットワークの内面が疎水性である、請求項５９に記載の方法。
【請求項６１】
アナライトが粒子である、請求項４２から６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６２】
粒子が細胞である、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
マイクロ流体デバイスおよび光検出器のうちの少なくとも一方を他方に対して移動し、その後、液体サンプルの異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す光信号を検出することをさらに含む、請求項４９に記載の方法。
【請求項６４】
毛細管が第１および第２開放端を備えるエンドツーエンド毛細管であり、毛細管の穴が全容積Ｖを有し、液体サンプルの少なくとも一部を導入するステップが、液体サンプルの少なくとも９０％をマイクロ流体ネットワークに導入することを含む、請求項４２から６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６５】
請求項４２から６４のいずれかを実行するように構成された、デバイス。
【請求項６６】
マイクロ流体デバイスの第１基板の内面と第２基板の内面との間に配置されたマイクロ流体ネットワークに液体サンプルを導入し、基板の少なくとも一方が柔軟であり、液体サンプルが複数の粒子を含むことと、
マイクロ流体ネットワーク内の複数の位置において、第１基板の内面と第２基板の内面との間の距離を連続的に低減することによって、液体サンプルの少なくとも一部と光ラベルとを含む混合物を生成することと、
各複合物が複数の粒子のうちの１つと光ラベルのうちの少なくとも１つとを含む、複数の複合物を生成することと、
混合物のサブセット内に存在する複合物を検出することとを含む、方法。
【請求項６７】
混合物の複数の異なるサブセットのそれぞれ内に存在する複合物を検出することをさらに含む、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
複数の異なるサブセットの全容積が、マイクロ流体デバイスに導入された液体サンプルの容積の少なくとも９０％である、請求項６６または６７に記載の方法。
【請求項６９】
液体サンプルの全容積Ｖをマイクロ流体デバイスに導入することを含み、混合物の全容積が容積Ｖの少なくとも９０％である、請求項６６から６８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７０】
混合物の全容積の少なくとも約９０％内に存在する複合物を検出することを含む、請求項６８に記載の方法。
【請求項７１】
粒子が細胞であり、光ラベルが蛍光ラベルである、請求項６６から７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７２】
マイクロ流体デバイスの第１基板の内面と第２基板の内面との間に配置されたマイクロ流体ネットワークに液体サンプルの全容積Ｖを導入し、基板の少なくとも一方が柔軟であり、液体サンプルが複数の粒子を含むことと、
マイクロ流体ネットワーク内で混合物を生成し、混合物が液体サンプルの容積Ｖの少なくとも約９５％と光ラベルを含むことと、
各複合物が複数の粒子のうちの１つと光ラベルのうちの少なくとも１つとを含む、複数の複合物を生成することと、
混合物のサブセット内に存在する複合物を検出することとを含む、方法。
【請求項７３】
混合物が液体サンプルの容積Ｖの少なくとも約９５％を含む、請求項７２に記載の方法。
【請求項７４】
混合物の複数の異なるサブセットのそれぞれ内に存在する複合物を検出することをさらに含む、請求項７２または７３に記載の方法。
【請求項７５】
複数の異なるサブセットの全容積が、マイクロ流体デバイスに導入された液体サンプルの容積の少なくとも９０％である、請求項７４に記載の方法。
【請求項７６】
請求項６６から７５の方法のいずれかを実行するように構成された、デバイス。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２００７年５月３日出願の米国特許出願第６０／９１５，８８４号および２００８年３月１４日出願の米国特許出願第６１／０３６，５３７号の優先権を主張し、それぞれの全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本出願は、２００６年９月２２日出願の米国仮特許出願第６０／８２６，６７８号と、米国を指定し、２００４年５月６日出願の独国特許出願ＤＥ１０２００４０２２２６３号、シリアル番号１１／５９３，０２１号を有し、２００６年１１月６日出願の米国継続出願の優先権を主張する、２００５年５月６日出願の国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００５／００４９２３号の米国継続出願と、米国を指定し、２００５年１１月４日出願の独国特許出願ＤＥ１０２００５０５２７５２号、２００６年１１月６日出願の国際出願の優先権を主張する、２００６年１１月６日出願の国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３号およびＥＰ０６／０６８１５５号と、２００６年１１月２２日出願の米国仮特許出願６０／８６７，０１９号とに関する。上記出願のそれぞれの全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０００３】
本発明は分析（例えば、サンプル中の１つ以上のアナライトに対する分析）に関する。
【背景技術】
【０００４】
分析はサンプル中の１つ以上のアナライトの存在を決定するために実行される。分析は、サンプルについて複数の分析（例えば複数の異なるアナライトのそれぞれに対して）を実行するために用いることができる。典型的なアレイには、それぞれがポリヌクレオチド、抗体または蛋白質などの異なるプローブ化合物を有する、複数の間隔を空けた試験ゾーンを有する基板を含む。使用中は、アレイはサンプルと接触し、次にサンプルはアレイの各位置と相互に作用する。各位置においては、相互作用は、例えば、対応するアナライトとその位置のプローブ化合物との結合および／または対応するアナライトとプローブ化合物との間の化学反応を含んでもよい。反応は結果として検出可能な生成物（例えば沈殿物）をもたらす。相互作用の存在および程度は、対応するアナライトがサンプル中に存在するかどうかに依存する。
【０００５】
一般に、相互作用は光学的に（例えば蛍光によって）検出される。例えば、光学的検出は、少なくとも一次元（例えば２次元）の相互に間隔を空けた複数の感光素子（例えばピクセル）を有する、撮像検出器（例えばＣＣＤ）を用いて実行できる。感光素子のそれぞれは、基板の異なる空間位置からの光を受光するように配置される。このようにして、複数の感光素子により同時に検出された光を合成して、基板の少なくとも一次元（例えば２次元）に画像データを生成できる。画像データを評価して、アレイの複数の位置における相互作用の存在および／または程度を決定できる。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
本発明は分析（例えばサンプル中の複数のアナライトに対する分析）に関する。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
一態様においては、１つの分析方法は：
間隔を空けた試験ゾーンのアレイを液体サンプルと接触させることを含み、試験ゾーンは、マイクロ流体デバイスの第１基板の内面と第２基板の内面との間に配置され、基板の少なくとも一方は柔軟性があり、各試験ゾーンは、標的アナライトに対する分析に関係するように構成されたプローブ化合物を含むことと、
試験ゾーンに対応する位置における第１および第２基板の内面間の距離を低減することと、
対応する位置における内面間の距離が低減された複数の試験ゾーンのそれぞれにおける相互作用の存在を連続的に光学的に決定することを含み、各試験ゾーンにおける相互作用が標的アナライトのサンプル中の存在を示すこととを含む。
【０００８】
分析方法はさらに、複数の試験ゾーンのそれぞれについて、光学的に決定された相互作用に基づいてそれぞれのアナライトの存在を決定することを含んでもよい。
【０００９】
少なくともいくつかの試験ゾーンのそれぞれについて、複数の試験ゾーンのそれぞれにおける相互作用は、試験ゾーンのアナライトとプローブ化合物との間の結合反応であってもよい。
【００１０】
光学的に決定するステップは、ゼロ次検出器を用いて試験ゾーンのそれぞれからの光を検出することを含んでもよい。
【００１１】
ゼロ次検出器を用いて試験ゾーンのそれぞれからの光を検出するステップは、基本的に、ゼロ次検出器を用いて光を検出することであってもよい。
【００１２】
分析方法はさらに、第１および第２基板の内面間の距離が低減されている、複数の位置のそれぞれについて、試験ゾーンにおいて光学的に決定するステップの後に、内面間の距離をその後増加することを含んでもよい。
【００１３】
距離を低減するステップは、試験ゾーンに対応する位置において第１および第２基板の内面間の距離を連続的に低減することを含んでもよい。この実施形態では、分析方法はさらに、第１および第２基板の内面間の距離が低減される、複数の位置のそれぞれについて、試験ゾーン領域における結合を光学的に検出するステップ後に、内面間の距離をその後増加することを含んでもよい。
【００１４】
光学的に決定するステップは、対応する配置における内面間の距離が低減される、複数の試験ゾーンのそれぞれにおける相互作用を連続的に検出することを含んでもよい。一実施形態では、光学的に検出するステップは、わずかＮ個の試験ゾーンからの光を同時に検出することを含む。ここで、Ｎ≦５またはＮ≦３またはＮ＝１である。あるいは、光学的に決定するステップは、ゼロ次検出器を用いて試験ゾーンのそれぞれからの光を検出することを含む。ゼロ次検出器を用いて試験ゾーンのそれぞれからの光を検出するステップは、基本的、ゼロ次検出器を用いて光を検出することであってもよい。
【００１５】
光学的に検出するステップは、光学的決定を実行するために用いられる光検出器の光検出ゾーンに対してマイクロ流体デバイスを移動することを含んでもよい。
【００１６】
距離を低減するステップは、マイクロ流体デバイスに圧縮力を加える部材に対して、マイクロ流体デバイスを移動することを含む。部材に対してマイクロ流体デバイスを移動するステップは、部材の少なくとも一部を回転させることを含んでもよい。
【００１７】
各試験ゾーンは細長く、主軸を画定してもよい。さらに、マイクロ流体デバイスを移動するステップは、複数の試験ゾーンのそれぞれの主軸に概して垂直の移動軸に沿ってデバイスを移動することを含んでもよい。例えば、複数の試験ゾーンの移動軸および主軸は１０°以内でまたはさらに５°以内で垂直である。
【００１８】
さらに、試験ゾーンの大多数またはさらにすべての移動軸および主軸は概して垂直であってもよい。
【００１９】
分析方法はさらに、移動のステップ中に、マイクロ流体デバイスの参照コードに含まれる情報を読み取ること、および読み取り情報に基づいて複数の試験ゾーンのそれぞれの特性を決定することを含んでもよい。
【００２０】
決定するステップは、複数の試験ゾーンのそれぞれについて、試験ゾーンが光検出を実行するのに用いられる光検出器の検出ゾーン内にあるときを表す値を決定することを含んでもよい。さらに、決定するステップは、マイクロ流体デバイスの試験ゾーンの生理化学特性を決定することを含んでもよい。例えば、生理化学特性は、複数の試験ゾーンのそれぞれにより決定できるアナライトを表す。さらに、決定するステップは、使用に先立って、マイクロ流体デバイス内に貯蔵された試薬のアイデンティティを決定することを含んでもよい。
【００２１】
試験ゾーンの垂直寸法に沿った幅に対する主軸に沿った長さの割合は、少なくとも２．５またはさらに少なくとも５であってもよい。
【００２２】
光学的に検出するステップは、接触ステップの後に、試験ゾーンを液体のないサンプルと最初に接触させることなく実行されてもよい。
【００２３】
光学的に決定するステップは、試験ゾーンからの蛍光を励起および検出することを含んでもよい。
【００２４】
別の態様では、分析方法は：
間隔を空けた試験ゾーンのアレイをサンプルと接触させることを含み、試験ゾーンは、第１の面と第２の面との間に配置され、各試験ゾーンは、それぞれのアナライトに対する分析に関係するように構成されたプローブ化合物を含むことと、
試験ゾーンに対応する位置における内面間の距離を低減することと、
対応する位置における内面間の距離が低減された複数の試験ゾーンのそれぞれにおける分析の結果を連続的に光学的に決定することとを含む。
【００２５】
分析方法はさらに、複数の試験ゾーンのそれぞれについて、分析の結果に基づいてそれぞれのアナライトの存在を決定することを含んでもよい。
【００２６】
試験ゾーンの少なくともいくつかのそれぞれについて、分析結果は、試験ゾーンのアナライトとプローブ化合物との間の結合反応を表すことができる。
【００２７】
光学的に決定するステップは、ゼロ次検出器を用いて試験ゾーンのそれぞれからの光を検出することを含んでもよい。
【００２８】
ゼロ次検出器を用いて試験ゾーンのそれぞれからの光を検出するステップは、基本的に、ゼロ次検出器を用いて光を検出することであってもよい。
【００２９】
分析方法はさらに、内面間の距離が低減された、複数の位置のそれぞれについて、試験ゾーンにおいて光学的に決定するステップの後に、その後に内面間の距離を増加することを含んでもよい。
【００３０】
距離を低減するステップは、試験ゾーンに対応する位置における内面間の距離を連続的に低減することを含んでもよい。
【００３１】
別の態様では、分析システムは：
間隔を空けた試験ゾーンのアレイを備えるマイクロ流体デバイスを受け取るように構成されたマイクロ流体デバイスリーダであって、試験ゾーンはマイクロ流体デバイスの第１基板の内面と第２基板の内面間に配置され、基板の少なくとも一方は柔軟性があり、各試験ゾーンは標的アナライトに対する分析に関係するように構成されたプローブ化合物を含む、マイクロ流体デバイスリーダと、
少なくとも１つの試験ゾーンがマイクロ流体デバイスの検出ゾーン内にあるとき、試験ゾーンの少なくとも１つからの光を検出するように構成された光検出器と、
マイクロ流体デバイスおよび光検出器の検出ゾーンのうちの少なくとも一方を他方まで移動させるように構成された移動器と、
光デバイスの検出ゾーンに対応する位置における第１基板および第２基板の内面間の距離を低減するように構成された圧縮器と、
光検出器からの信号を受け取るように構成されたプロセッサであって、信号は試験ゾーンから検出された光を表すプロセッサとを備える。
【００３２】
システムは、わずかＮ個の試験ゾーンからの光を同時に光学的に検出するように構成されてもよい。ここで、Ｎ≦５またはＮ≦３またはＮ＝１である。
【００３３】
検出器は蛍光検出器であってもよい。
【００３４】
別の態様では、分析デバイスは、両基板の間にチャネルを画定する第１および第２基板を備え、基板の少なくとも一方は柔軟性があり、チャネルは間隔を空けた試験ゾーンのアレイを備え、各試験ゾーンは標的アナライトに対する分析に関係するように構成されたプローブ化合物を含む。
【００３５】
別の態様では、製造品は：
基板と、
複数の細長い試験ゾーンとを備え、各試験ゾーンは標的アナライトに対する分析に関係するように構成されたプローブ化合物をそれぞれ備え、各試験ゾーンは主軸とこの主軸に垂直な幅とを画定し、試験ゾーンの主軸は概して平行である。
【００３６】
別の態様では、分析方法は：
毛細管の穴に液体サンプルを導入することと、
液体サンプルの液体サンプル−ガスの境界面に作用する圧力を低減することにより、液体サンプルの少なくとも一部をマイクロ流体デバイスのマイクロ流体ネットワーク内に導入することとを含む。
【００３７】
分析方法はさらに、毛細管の穴に液体サンプルを導入するステップの後に、毛細管をマイクロ流体デバイスに接続し、液体サンプルが毛細管内に残るようにすることを含んでもよい。
【００３８】
圧力を低減するステップは、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部を圧縮することによりネットワークからガスを移動させ、およびその後に、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部を減圧することにより実行されてもよい。
【００３９】
マイクロ流体ネットワークは、一般に平らな第１および第２の基板により、それら基板の間に少なくとも部分的に画定され、基板の少なくとも一方は、外部圧力を加えると変形して、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部を圧縮し、少なくとも一方の基板は、外部圧力を解放すると最初の状態に回復して、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部分の復元を可能にする傾向がある。
【００４０】
さらに、マイクロ流体ネットワークは、入口および入口と流体連通する検出領域を含むマイクロ流体チャネルと、検出領域と流体連通するマイクロ流体流路とによって少なくとも部分的に画定されることができ、マイクロ流体流路は、外部圧力を加えると少なくとも部分的に変形して、マイクロ流体流路の少なくとも一部を圧縮する壁面を有し、壁面は外部圧力を解放すると最初の状態に回復して、マイクロ流体流路の少なくとも一部分の復元を可能にする傾向がある。
【００４１】
分析方法はさらに、液体サンプルをマイクロ流体ネットワーク内に存在する１つ以上の試薬と混合して、混合物を生成することを含んでもよい。混合物は、マイクロ流体ネットワークに導入された液体サンプルの少なくとも９０％を含んでもよい。１つ以上の試薬は、サンプルと反応して、サンプル中に存在するラベルおよびアナライトを含む複合物を生成する、検出可能なラベルを含む。
【００４２】
分析方法はさらに、液体サンプルのサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出することを含んでもよく、サブセットはマイクロ流体デバイスの検出ゾーン内に存在する。
【００４３】
分析方法はさらに、検出ゾーンから液体サンプルのサブセットを移動することと、検出ゾーンに液体サンプルの異なるサブセットを導入することと、異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出することとを含んでもよい。サブセットを移動するステップおよび異なるサブセットを導入するステップは、マイクロ流体ネットワークの少なくとも一部を圧縮することにより実行され、圧縮部分はネットワークに沿って検出ゾーンから少なくとも部分的にずれている。少なくとも一部を圧縮するステップは、マイクロ流体ネットワークの第１部分を圧縮することと、最初に圧縮を完全に解放することなく、移動および導入のステップを実行するのに十分な量だけ、マイクロ流体ネットワークに沿って圧縮位置を移動することとを含んでもよい。
【００４４】
分析方法はさらに、マイクロ流体ネットワークの圧縮を最初に完全に解放することなく、異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出するステップを実行することを含んでもよい。
【００４５】
分析方法はさらに、毛細管の穴に液体サンプルを導入するステップと液体サンプルの少なくとも一部をマイクロ流体ネットワークに導入するステップとの中間に、液体サンプルが毛細管から流れ出すのを防止することを含んでもよい。液体サンプルが毛細管から流れ出るのを防止するステップは、液体サンプル−ガスの境界面に作用する圧力を増加することを含んでもよい。
【００４６】
いくつかの実施形態では、マイクロ流体ネットワークは液体サンプルの毛細管の流れを促進しない。第１および第２基板の少なくとも一方により画定される、マイクロ流体ネットワークの内面は疎水性であってもよい。
【００４７】
アナライトは粒子、例えば細胞であってもよい。
【００４８】
分析方法はさらに、マイクロ流体デバイスおよび光検出器のうちの少なくとも一方を他方に対して移動することと、その後に液体サンプルの異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す光信号を検出することとを含んでもよい。
【００４９】
毛細管は第１および第２開放端を備える、エンドツーエンド毛細管であってもよく、毛細管の穴は全容積Ｖを含み、液体サンプルの少なくとも一部を導入するステップはマイクロ流体ネットワーク内に液体サンプルの少なくとも９０％を導入することを含む。
【００５０】
別の態様では、分析方法は：
マイクロ流体デバイスの第１基板の内面と第２基板の内面との間に配置されたマイクロ流体ネットワークに液体サンプルを導入することを含み、基板の少なくとも１つは柔軟性があり、液体サンプルは複数の粒子を含むことと、
マイクロ流体ネットワーク内の複数の位置における第１および第２基板の内面間の距離を連続的に低減することにより、液体サンプルの少なくとも一部分および光ラベルを含む混合物を生成することと、
複数の複合物を生成することを含み、各複合物は複数の粒子のうちの１つおよび光ラベルの少なくとも１つを備えることと、
混合物のサブセット内に存在する複合物を検出することとを含む。
【００５１】
分析方法はさらに、混合物の複数の異なるサブセットのそれぞれの中に存在する複合物を検出することを含んでもよい。
【００５２】
複数の異なるサブセットの全容積は、マイクロ流体デバイスに導入される液体サンプルの容積の少なくとも９０％であってもよい。
【００５３】
分析方法はさらに、液体サンプルの全容積Ｖをマイクロ流体デバイスに導入することを含んでもよく、この場合、混合物の全容積は容積Ｖの少なくとも９０％である。
【００５４】
分析方法はさらに、混合物の全容積の少なくとも９０％内に存在する複合物を検出することを含んでもよい。
【００５５】
粒子は細胞であってもよい。
【００５６】
光ラベルは蛍光ラベルであってもよい。
【００５７】
別の態様では、分析方法は：
マイクロ流体デバイスの第１基板の内面と第２基板の内面との間に配置されたマイクロ流体ネットワークに液体サンプルの全容積Ｖを導入することを含み、基板の少なくとも一方は柔軟性があり、液体サンプルは複数の粒子を含むことと、
マイクロ流体ネットワーク内で混合物を生成することを含み、混合物は液体サンプルの容積Ｖの少なくとも約９０％および光ラベルを含むことと、
複数の複合物を生成することを含み、各複合物は複数の粒子のうちの１つおよび光ラベルの少なくとも１つを含むことと、
混合物のサブセット内に存在する複合物を検出することとを含む。
【００５８】
混合物は液体サンプルの容積Ｖの少なくとも約９５％を含んでもよい。
【００５９】
分析方法はさらに、混合物の複数の異なるサブセットのそれぞれの中に存在する複合物を検出することを含んでもよい。
【００６０】
複数の異なるサブセットの全容積はマイクロ流体デバイスに導入される液体サンプルの容積の少なくとも約９０％であってもよい。
【００６１】
別の態様では、アナライトを検出するデバイスは：
入口および入口と流体連通する検出領域を含む、マイクロ流体チャネルを有するカートリッジと、少なくとも部分的に変形可能な壁面を有し、チャネルの検出領域と流体連通する、マイクロ流体流路と、入口を密封し、入口、マイクロ流体チャネルおよびマイクロ流体流路を含む流体回路を形成するように構成された密閉部材を有するキャップとを備える。
【００６２】
検出デバイスのキャップおよびカートリッジは流体回路形成後に不可逆的に閉じられるように構成されてもよい。
【００６３】
あるいは、キャップはカートリッジに柔軟に結合されてもよい。
【００６４】
さらに、キャップおよびカートリッジは、キャップを取り外しできるような第１の相対的位置に係合し、および流体回路形成後にキャップを不可逆的に閉じるような第２の相対的位置に係合するように構成されてもよい。
【００６５】
検出領域はカートリッジの少なくとも１つの面と蓋の１つの面とにより範囲を限定されてもよい。蓋は、検出領域を覆う透明フィルムを含んでもよい。さらに、蓋はカートリッジに接着剤で固定されてもよい。
【００６６】
別の態様では、アナライトを検出するデバイスは内面上に抗凝固剤を有する毛細管の入口を含むマイクロ流体チャネルと、試薬を含むチャンバと、入口と流体連通する検出領域とを有するカートリッジと、少なくとも部分的に変形可能な壁面を有し、およびチャネルの検出領域と流体連通するマイクロ流体流路と、入口を密封し、入口、マイクロ流体チャネルおよびマイクロ流体流路を含む流体回路を形成するように構成された密閉部材を有するキャップとを備える。
【００６７】
別の態様では、蛍光検出器は光源と、１０°以上の立体角を得る集光レンズと、１０°以上の立体角を得て顕微鏡対象物を撮像するように構成された対物レンズとを含む。
【００６８】
集光レンズおよび／または対物レンズは、１０°から１５°の立体角、例えば１２°から１４°（例えば１３．５°）を得ることができる。
【００６９】
蛍光検出器はさらに開口を含んでもよい。開口は、１０°以上の立体角（例えば１０°から１５°または１２°から１４°または１３．５°）を得るように構成されてもよい。
【００７０】
蛍光検出器はさらに少なくとも１つのフィルタを含んでもよい。フィルタは所定の一連の放射波長に関して選択されてもよい。例えば、１つのフィルタは１つの特定の波長を有する光を通過するように選択され、別のフィルタは、例えば、カートリッジ内のラベリング試薬のために用いられる染料の放射波長に依存して、異なる特定の波長を有する光を通過するように選択されてもよい。
【００７１】
別の態様では、アナライトを検出するシステムは：
カートリッジを備え、このカートリッジは、入口および入口と流体連通する検出領域を含むマイクロ流体チャネルと、少なくとも部分的に変形可能な壁面を有し、およびチャネルの検出領域と流体連通するマイクロ流体流路と、入口を密封し、入口、マイクロ流体チャネルおよびマイクロ流体流路を含む流体回路を形成するように構成された密閉部材を有するキャップと、光源を含む蛍光検出器と、１０°以上の立体角を得る集光レンズと、１０°以上の立体角を得る対物レンズとを含む。
【００７２】
蛍光検出器はカメラを含んでもよい。
【００７３】
さらに、蛍光検出器は１つ以上の選択可能な放射フィルタを含んでもよい。
【００７４】
別の態様では、液体サンプル中のアナライトを検出する方法は：
マイクロ流体チャネルに液体サンプルを導入し、これにより、チャネルにより密封され、および輸送流体により第１端において範囲を限定された連続した液体スラグを生成することと、
輸送流体が液体スラグの第１端と第２端との間の流体連通を提供するように流体回路を形成することと、
輸送流体によって液体スラグの第１および第２端に差圧を加えることとを含む。
【００７５】
別の態様では、液体サンプル中のアナライトを検出する方法は：
マイクロ流体チャネルに液体サンプルを導入し、これにより、チャネルにより密閉されおよび輸送流体により第１端において範囲を限定された連続した液体スラグを生成することを含み、液体サンプルは複数の粒子を含むことと、
輸送流体が液体スラグの第１端と第２端との間の流体連通を提供するように流体回路を形成することと、
輸送流体によって液体スラグの第１および第２端に差圧を加えることにより、液体サンプルの少なくとも一部および光ラベルを含む混合物を生成することと、
複数の複合物を生成することを含み、各複合物は複数の粒子の１つおよび光ラベルの少なくとも１つを含むことと、
混合物のサブセット内に存在する複合物を検出することとを含む。
【００７６】
次に、デバイスおよび方法（例えば、アナライトを検出するデバイス、システムおよび方法）のさらなる例示的な実施形態が説明される。
【００７７】
流体回路の一部は弾性変形可能な壁面により形成されてもよい。
【００７８】
液体スラグの第１および第２端に差圧を加えるステップは、弾性変形可能な壁面を圧縮することを含んでもよい。
【００７９】
液体サンプルは、所望に応じて、決定されるべきアナライトに基づいて選択されてもよい。例示的なサンプルは、水、水溶液、有機溶液、無機溶液、ヒトおよび他の動物の体液、例えば尿、痰、唾液、脳脊髄液、全血、ならびに血漿および血清などの血液由来の物質を含む。
【００８０】
決定されるべきアナライトは、所望に応じて選択されてもよい。例えば、アナライトは、医薬品（例えば診断）、研究（例えば薬物発見）、産業（例えば水または食品の品質の監視）または法医学に関係してもよい。決定されるべき例示的なアナライトは、病気などの生理学的状態のマーカ（例えば診断マーカまたは予測マーカ）を含む。このようなマーカは心臓マーカ（例えばナトリウム利尿ペプチドおよびトロポニンファミリのメンバ）、がんマーカ（例えば核マトリクス蛋白質）、遺伝子マーカ（例えばポリヌクレオチド）、敗血症マーカ、神経マーカおよび病原性状態を示すマーカを含む。アナライトは、病原体（例えばバクテリア、ウイルスまたは菌類）の存在を表すものであってもよい。
【００８１】
典型的な実施形態では、アナライトの１つ以上は、ウイルス、バクテリア、細胞、菌類または胞子などの粒子を含む。例えば、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６９１５３号（この全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる）に記載された粒子はいずれも検出可能である。自然発生粒子の例には、特に原核細胞（例えば、大腸菌または枯草菌などのバクテリア細胞）、真核細胞（例えば、サッカロマイセスセレヴィシエなどのイースト菌、Ｓｆ９またはＨｉｇｈ５細胞などの昆虫細胞、ヒーラ細胞またはコス細胞などの永遠に伝えられる細胞系および哺乳動物の血液細胞などの１次細胞）またはウイルス（例えばＭＩ３またはＴ７ファージなどのファージ粒子）を含む。１つの実施形態では、粒子は細胞であってもよい。
【００８２】
ラベルまたはプローブ化合物または捕捉分子は、所望に応じて、決定されるべきアナライトに基づいて選択されてもよい。アナライトの存在を決定するための適切なラベルまたはプローブ化合物は、２００６年９月２２日出願の米国仮特許出願第６０／８２６，６７８号に記載されており、この仮出願の全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。ラベルまたは捕捉分子またはプローブまたはプローブ分子または分子プローブは、分子または複合物を示すと理解され、これらのラベルまたは分子を用いて、特定の特性結合挙動または特定の反応性によって、他の分子を検出できる。例示的なプローブ化合物は、ペプチドなどの生体高分子、蛋白質、抗原、抗体、炭水化物、核酸および／またはこれらの類似物および／または上述の生体高分子の混合高分子を含む。
【００８３】
本発明に従って使用できる検出可能なマーカまたはラベルは、化学的、物理的または酵素反応において、検出可能な化合物または信号を直接または間接的に生成する、任意の化合物を含む。好ましくは、ラベルは、特に酵素ラベル、着色ラベル、蛍光ラベル、色素ラベル、発光ラベル、放射ラベル、ハプテン、ビオチン、金属複合物、金属から選択されてもよく、および蛍光ラベルを有するコロイド金が特に好ましい。これらの種類のラベルすべては当該技術分野では十分に確立されている。このようなラベルが介在する物理的反応の例は蛍光放射である。したがって、光ラベルは蛍光ラベルであってもよい。
【００８４】
分析方法はさらに、第１光ラベルおよび第２光ラベル抗体でアナライトをラベリングすることを含んでもよく、この場合、第１および第２光ラベルは異なる。第１および第２光ラベルは、別個の放射波長を有する、第１および第２蛍光性ラベルであってもよい。ラベルは抗体であってもよい。例えば、分析方法はさらに、第１光ラベル蛍光性抗体および第２蛍光性抗体でアナライトをラベリングすることを含んでもよく、この場合、第１および第２蛍光性抗体は別個の放射波長を有する。
【００８５】
アナライトを検出するステップは、第１蛍光抗体の放射波長においてアナライトの第１画像を記録することと、第２蛍光抗体の放射波長においてアナライトの第２画像を記録することと、第１および第２画像を比較することとを含んでもよい。
【００８６】
分析方法はさらに、混合物の複数の異なるサブセットのそれぞれの中に存在する複合物を検出することを含んでもよい。例えば、マイクロ流体デバイスの各混合物内の粒子は、存在する場合、検出可能なラベルと結合して、複合物を生成できる。複合物の生成を可能にする適切な培養期間後に、複合物の存在が検出される。複合物の検出の例は、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３号に記載され、この全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【００８７】
複数の異なるサブセットの全容積は、マイクロ流体デバイスに導入される液体サンプルの容積の少なくとも９０％であってもよい。
【００８８】
分析方法はさらに、マイクロ流体デバイスに液体サンプルの全容積Ｖを導入することを含んでもよく、この場合、混合物の全容積は容積Ｖの少なくとも約９０％または少なくとも約９５％であってもよい。
【００８９】
分析方法はさらに、混合物の全容積の少なくとも１０％内、例えば、混合物の全容積の１０％から９０％、１５％から５０％または２０％から３０％内に存在する複合物を検出することを含んでもよい。
【００９０】
マイクロ流体チャネルは入口および入口と流体連通する検出領域を含んでもよい。さらに、マイクロ流体チャネルはマイクロ流体デバイスのマイクロ流体チャネルであってもよい。
【００９１】
分析方法はさらに、液体サンプルをマイクロ流体チャネルに導入する前に、毛細管の穴に液体サンプルを導入することを含んでもよい。
【００９２】
毛細管は一般に、標準的な毛細管（例えばプラスチック毛細管などのエンドツーエンド毛細管）である。エンドツーエンド毛細管は内側の穴と、第１および第２開口（１つは穴のどちらかの端部にある）とを含む。毛細管の穴は、へパリンなどの凝固防止剤を含んでもよい。例えば、毛細管はヘパリンなどでコーティングされた抗凝固剤であってよい。一般に、毛細管の穴は液体サンプルの全容積Ｖを含むように構成される。容積Ｖは一般に、約２５マイクロリットル以下（例えば約２０マイクロリットル以下、約１５マイクロリットル以下、約１０マイクロリットル以下、約５マイクロリットル以下）である。一般的に、容積Ｖは約１マイクロリットル以上（例えば約３または５または７．５マイクロリットル以上）である。
【００９３】
分析方法はさらに、毛細管の穴に液体サンプルを導入するステップとマイクロ流体チャネルに液体サンプルを導入するステップとの中間に、マイクロ流体デバイスに毛細管を接続し、液体サンプルが毛細管内に残るようにすることを含んでもよい。
【００９４】
分析方法はさらに、液体サンプルのサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出することを含んでもよく、サブセットはマイクロ流体デバイスの検出ゾーンまたは検出領域内に存在する。
【００９５】
いくつかの実施形態では、毛細管の出口は、例えば約５μＬ、１０μＬまたは２０μＬの所定の容積を有する反応チャンバに向かって開いている。いくつかの実施形態では、反応チャンバは試薬ペレットを含む。試薬ペレットは、ラベル、例えば、蛍光染料でラベルされ、サンプル内で検出されるべき抗原に親和性を有する抗体を含んでもよい。例えば、液体サンプル中のヘルパーＴ細胞の数を検出するために、試薬ペレットは、第１蛍光染料（例えばフィコエリトリン）でラベルされたアンチ−ＣＤ４＋−抗体、および第２蛍光染料（例えばフィコエリトリン−Ｃｙ５）でラベルされたアンチ−ＣＤ３＋−抗体、塩、および安定化試薬などを含んでもよい。いくつかの実施形態では、第１ゾーンの内面はサンプルを処理するのに必要な試薬で覆われる。液体サンプル中の細胞などの粒子を検出するための例示的な分析は、例えば、国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットに記載されており、この明細書の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットに記載されているように、検出はマイクロ流体チャネル内で実行されてもよい。したがって、マイクロ流体チャネルは少なくとも部分的に光学的に透明である。例えば、マイクロ流体チャネルは少なくとも部分的に光透過性の層で覆われてもよい。
【００９６】
液体サンプルを導入するステップは、弾性変形可能な壁面を圧縮することにより実行されてもよい。弾性変形可能な壁面を圧縮するステップは、流体回路の第１部分を圧縮することと、および最初に圧縮を完全に解放することなく、圧縮箇所を、移動および導入のステップを実行するのに十分な量だけ流体回路に沿って移動することとを含んでもよい。
【００９７】
分析方法は、最初に圧縮を完全に解放した状態で、異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す信号を光学的に検出するステップを実行することをさらに含む。
【００９８】
分析方法はさらに、毛細管の穴に液体サンプルを導入するステップとマイクロ流体チャネルに液体サンプルの少なくとも一部を導入するステップとの中間に、液体サンプルが毛細管から流れ出るのを防止することを含んでもよい。
【００９９】
いくつかの実施形態では、マイクロ流体チャネルの検出領域は液体サンプルの毛細管流れを促進しない。
【０１００】
さらに、マイクロ流体チャネルの内面の少なくとも一部は疎水性であってもよい。
【０１０１】
分析方法はさらに、マイクロ流体デバイスおよび光検出器の少なくとも一方を他方に対して移動し、その後に液体サンプルの異なるサブセット内に存在する複合物の量を表す光信号を検出することを含んでもよい。
【図面の簡単な説明】
【０１０２】
【図１】マイクロ流体デバイスを示している。
【図２】図１のマイクロ流体デバイスの側面図である。
【図３ａ】図１のマイクロ流体デバイスの２つの試験ゾーンの平面図である。
【図３ｂ】図３ａの試験ゾーンを形成する方法を示している。
【図３ｃ】図３ａの試験ゾーンを形成する方法を示している。
【図３ｄ】図３ａの試験ゾーンを形成する方法を示している。
【図３ｅ】図３ａの試験ゾーンを形成する方法を示している。
【図３ｆ】図３ａの試験ゾーンを形成する方法を示している。
【図３ｇ】図３ａの試験ゾーンを形成する方法を示している。
【図４】図１のマイクロ流体デバイスを作動するために構成されたシステムの側面図である。
【図５】図１のマイクロ流体デバイスを作動するために構成されたシステムの部分側面図である。
【図６】図１のマイクロ流体デバイスのチャネルに沿った位置に応じて蛍光強度データを示している。
【図７】マイクロ流体デバイスを示している。
【図８ａ】図７のマイクロ流体デバイスの２つの試験ゾーンうちの一方の平面図である。
【図８ｂ】図７のマイクロ流体デバイスの２つの試験ゾーンのうちの他方の平面図である。
【図９】マイクロ流体デバイスを示している。
【図１０ａ】図９のマイクロ流体デバイスの断面側面図であり、また液体サンプル物質を含む毛細管を示している。
【図１０ｂ】毛細管がマイクロ流体デバイスの入口に接続されている状態の、図１０ａのマイクロ流体デバイスを示しており、液体サンプルはマイクロ流体デバイスのマイクロ流体ネットワーク内に進入していない。
【図１０ｃ】液体サンプルの一部がサンプル毛細管からマイクロ流体デバイスのマイクロ流体ネットワーク内に吸入されている状態の、図１０ｃのマイクロ流体デバイスを示している。
【図１０ｄ】液体サンプルをサンプル毛細管からマイクロ流体デバイスのマイクロ流体ネットワーク内に吸引するステップが完了している状態の、図１０ｃのマイクロ流体デバイスを示している。
【図１０ｅ】液体サンプルの一部がマイクロ流体ネットワークの全長に沿って距離Δｌ移動された状態の、図１０ｄのマイクロ流体デバイスを示している。
【図１０ｆ】図１０ｅのマイクロ流体デバイスおよび液体サンプルの一部中に存在するアナライトの検出を示している。
【図１１】図１、図７および図９のいずれかのマイクロ流体デバイスを作動するための作動システムを示している。作動システムは、図４および図５の作動システムのいずれかまたはすべての機能を含む。
【図１２】流体回路の概略図を示している。
【図１３】流体回路を有するカートリッジの断面図を示している。
【図１４ａ】蛍光検出器の断面図を示している。
【図１４ｂ】蛍光検出器の断面図を示している。
【図１５】検出器の光路の概略図を示している。
【図１６ａ】蛍光検出器を用いる細胞計数分析の図を示している。
【図１６ｂ】蛍光検出器を用いる細胞計数分析の図を示している。
【図１７】蛍光検出器を用いる細胞計数分析から生じる２つの画像の重ね合わせを示している。
【発明を実施するための形態】
【０１０３】
サンプルを分析して複数のアナライトの存在を決定する方法（例えば定性的におよび／または定量的に）は、マイクロ流体デバイスのチャネル内にサンプルを導入することを含む。マイクロ流体デバイスは、分析の設計および複雑性に依存して、単一チャネルまたは複数チャネルを有してもよい。いくつかの実施形態では、チャネルは、デバイスの第１および第２基板の対向した内面の間に画定される。
【０１０４】
一般に、分析を実行するためのデバイスは、少なくとも１つの変形可能な表面により範囲を限定される、マイクロ流体流路を含んでもよい。例えば、マイクロ流体流路は、デバイスの第１および第２基板の対向した内面の間に画定され、第２基板は第１基板と比較すると相対的に柔軟であってもよい。別の例では、マイクロ流体流路の一部は圧縮可能なゾーンを含んでもよい。圧縮可能なゾーンは流体回路の全長であってもよく、全長に沿った回路の少なくとも１つの壁面は圧縮可能または変形可能である。局部的な圧縮力が変形可能な表面に加えられると、表面は変形する。十分な力が加えられると、変形可能な表面はマイクロ流体流路を中断する程度にまで圧縮される。マイクロ流体流路に対して表面の変形箇所を移動するステップは、具体的には、変形可能な表面がマイクロ流体流路を中断する程度に圧縮されるとき、マイクロ流体流路内の液体を移動できる。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、第２基板は第１基板と比較して相対的に柔軟であってもよい。複数の試験ゾーンはチャネルに沿って間隔を空けていてもよい。各試験ゾーンは、それぞれのアナライトに対する分析に関係するように構成された、固定化されたプローブ化合物を含む。一般に、各分析はプローブ化合物と、それぞれのアナライトとのまたはアナライトおよび試薬（例えば光ラベル）を含むそれぞれの複合物との相互作用を含む。
【０１０６】
各試験ゾーンについての分析結果を決定するために、第２基板の外面に局部的な圧縮力を加えてもよい。圧縮力は、第１および第２基板の内面を分離する距離の局部的な低減を引き起こす。局部的な距離の低減する位置は、チャネル内に画定される光検出ゾーンと重なる。距離が低減されると、移動物質（例えばサンプル、非結合光プローブおよび／または試薬）は、検出ゾーンにおいて基板間から移動する。マイクロ流体デバイスは、試験ゾーンが検出ゾーンを連続的に通過するように移動される。各試験ゾーンについての分析結果は、試験ゾーンが検出ゾーンを通過するときに、光学的に（例えば蛍光によって）決定される。各アナライトの存在は、分析結果に基づいて決定される（例えば、定量的におよび／または定性的に）。
【０１０７】
分析結果は一般に、サンプルと試験ゾーンとを接触させた後、最初に試験ゾーンを洗浄液に接触させることなく、決定されてもよい。
【０１０８】
決定されるべきアナライトは所望に応じて選択されてもよい。例えば、アナライトは、医薬品（例えば診断）、研究（例えば薬物発見）、産業（例えば水または食品の品質の監視）または法医学に関係してもよい。決定されるべき例示的なアナライトは、病気などの生理学的状態のマーカ（例えば診断マーカまたは予測マーカ）を含む。このようなマーカは心臓マーカ（例えばナトリウム利尿ペプチドおよびトロポニンファミリのメンバ）、がんマーカ（例えば核基質蛋白質）、遺伝子マーカ（例えばポリヌクレオチド）、敗血症マーカ、神経マーカおよび病原性状態を示すマーカを含む。アナライトは、病原体（例えばバクテリア、ウイルスまたは菌類）の存在を表すものであってもよい。
【０１０９】
試験ゾーンのプローブ化合物は決定されるべきアナライトに基づいて、所望に応じて選択されてもよい。例示的なプローブ化合物はポリヌクレオチド、抗体および蛋白質を含む。
【０１１０】
サンプル液体は決定されるべきアナライトに基づいて、所望に応じて選択されてもよい。例示的なサンプルは、水、水溶液、有機溶液、無機溶液、ヒトおよび他の動物の体液、例えば尿、痰、唾液、脳脊髄液、血液全体および血漿および血清などの血液由来の物質を含む。
【０１１１】
図１、図２および図４を参照すると、マイクロ流体デバイス１００および作動システム５００を用いてサンプルを分析し、複数のアナライトの存在を決定する（例えば定量的および／または定性的に）ことができる。マイクロ流体デバイス１００は、マイクロ流体ネットワーク１０７を画定する第１および第２基板１０２、１０４を含み、このネットワークは、入口１０６と、入口と連通するチャネル１１０およびリザーバ１０８を含む。複数の間隔を空けた試験ゾーン１１２ｉはチャネル１１０内に配置される。各試験ゾーン１１２ｉは、アナライトに対する分析に関係するように構成された、１つ以上の試薬（例えばプローブ化合物）を含む。チャネル１１０はまた参照ゾーン１１７を含む。デバイス１００はまた、複数のインデシア１１６ｊを含む参照パターン１１４を含む。参照パターン１１４は試験ゾーン１１２ｉの空間特性に関する情報を提供する。
【０１１２】
作動システム５００はハウジング５０２と、検出器５０４と、参照パターンリーダ５０６と、検出器５０４およびパターンリーダ５０８と通信するプロセッサとを含む。検出器５０４は、サンプルと試験ゾーン１１２ｉとの間の相互作用を検出する光学的な蛍光検出器である。検出器５０４は、光源５５０（例えば発光ダイオードまたはレーザダイオード）およびゼロ次光検出器５５２（例えば光電子増倍管またはアバランシェフォトダイオードなどのフォトダイオード）を含む。参照パターンリーダ５０６は、システム５００の動作中にデバイス１００の参照パターン１１４を読み取る。
【０１１３】
次に、マイクロ流体デバイス１００およびシステム５００をより詳細に説明する。
【０１１４】
第１基板１０２は一般に、蛍光ラベルからの蛍光を励起および検出するために有効な光の波長に対しては光学的に透過性（透明）である。例えば、第１基板１０２は、約３５０ｎｍから約８００ｎｍの間の少なくとも１つの波長領域において、入射光の少なくとも約７５％（例えば少なくとも約８５％、少なくとも約９０％）を透過してもよい。第１基板１０２は、例えば、高分子材料、ガラスまたはシリカから形成してもよい。第２基板１０４は一般に、曲げやすいまたは柔軟な材料（例えば弾性高分子材料）から形成される。第１基板１０２は第２基板１０４より柔軟性が劣ってもよい。例えば、第１基板１０２は実質的に硬質であってもよい（例えばデバイス１００の操作を容易にするために十分に硬質）。
【０１１５】
チャネル１１０は毛細管チャネルである。入口１０６に供給されたサンプル１１３は、毛細管力によりチャネル１１０に沿って移動する。チャネル１１０は、主軸ａｌに沿う方向に向けられる。リザーバ１０８は、サンプルの前方にガスの構成を防止するための通気孔１１１を含む。
【０１１６】
各試験ゾーン１１２ｉは一般に、アナライトが存在するときに検出可能な相互作用を提供するように構成された試薬（例えばプローブ化合物）を含む。相互作用は、例えば、対応するアナライトと試験位置のプローブ化合物との結合および／または対応するアナライトとプローブ化合物との間の化学反応を含んでもよい。反応により検出可能な生成物（例えば沈殿物）が生じる。例示的なプローブ化合物は、蛋白質、抗体およびポリヌクレオチドを含む。アナライトの存在を決定するための適切なプローブ化合物は、２００６年９月２２日出願の米国特許仮出願第６０／８２６，６７８号に記載されており、この仮出願の全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１１７】
また図３ａを参照すると、各試験ゾーン１１２ｉは、細長く、チャネル１１０の主軸ａｌと概して垂直に向けられた主軸ａ２を有する。一般に、試験ゾーン１１２の垂直寸法に沿った幅ｗに対する主軸ａ２に沿った長さの割合は、少なくとも２．５（例えば少なくとも５）である。軸ａ２に沿った長さは、一般に少なくとも２００μｍ（例えば少なくとも約３６０ミクロン）、一般に約２０００μｍ以下（例えば約１０００μｍ以下、約７５０μｍ以下）である。幅ｗは、一般に少なくとも約２５μｍ（例えば少なくとも約５０ミクロン）および一般に約５００μｍ以下（例えば約２５０μｍ以下、約１５０μｍ以下）である。例示的な実施形態では、試験ゾーン１１２は長さが約５００μｍおよび幅が約１００μｍである。
【０１１８】
図２で明らかなように、試験ゾーン１１２ｉはチャネル１１０に沿って、近接する試験ゾーンから距離ｄ７の間隔を空けている。試験ゾーン１１２ｉ間の距離ｄ７は検出器５０４の検出ゾーンに関連して以下に詳細に説明する。
【０１１９】
試験ゾーン１１２ｉは所望に応じて形成されてもよい。一般に、試薬は第１基板と接触する。次に、試薬および基板は相対的に横方向に移動され、細長い試験ゾーンを形成する。
【０１２０】
図３ｂから図３ｇを参照すると、試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、毛細管スポッタ４００からの試薬を第１基板１０２上に分配することを含む。図３ｂでは、１つ以上のプローブ化合物を含む試薬液４０２の量は（例えば約２から８ｎｌの間、約３から５ｎｌの間）、毛細管スポッタの毛細管の遠位端４０４に導入される。遠位端４０４は一般に、約８０から１２０μｍ（例えば約１００μｍ）の間の直径を有する。試薬液４０２および基板１０２は、最初は距離ｄ１だけ分離されている（例えば接触しない）。一般に、ｄ１は少なくとも約２５０μｍ（例えば約５００μｍ）である。
【０１２１】
図３ｃでは、遠位端４０４と基板１０２とは、試薬液４０２が基板１０２の位置と接触するように、より小さい分離距離ｄ２になる。より小さい分離距離ｄ２では、遠位部４０４は基板１０２の位置に近接する（例えばｄ２がゼロになるように接触する）。遠位端４０４および基板１０２は、近接する（例えば接触する）位置において、分離距離ｄ２にしばらくの間（例えば約１秒以下、約０．５秒以下、約０．２５秒以下）維持される。いくつかの実施形態では、遠位端４０２が近接する（例えば接触する）位置に維持される時間は、ほとんどゼロに近い。
【０１２２】
図３ｄでは、遠位端４０４および基板１０２は、遠位端４０４および基板が遠位端４０４の試薬液４０２により接続された状態である、中間分離距離ｄ３まで移動される。一般に、中間分離距離ｄ３は少なくとも約５μｍである（例えば少なくとも約１０μｍおよび約３０μｍ以下、約２５μｍ以下）である。例示的な実施形態では、中間分離距離ｄ３は約２０μｍである。
【０１２３】
図３ｅでは、遠位端４０４および基板１０２は、培養時間の間は中間分離距離ｄ３に維持され、これにより、遠位端における試薬液４０２の少なくとも一部（例えば少なくとも約１０％、少なくとも約２５％、少なくとも約４０％）が気化して、試薬液４０２の残存部分４０２’のみが残るようにされる。一般に、試薬液４０２の約７５％以下（例えば約５０％以下）だけが気化して、溶液４０２’を残す。培養時間は溶液４０２の特性（例えばプローブ化合物の濃度および溶剤の蒸気圧）および遠位端４０４の環境（例えば相対湿度および相対温度）に依存する。通常の培養時間は、先端部および基板が近接位置ｄ２にある時間より長い（少なくとも５倍、少なくとも１０倍、少なくとも２０倍、少なくとも約３５倍である）。例示的な培養時間は、最短で約５秒（例えば約１０秒、少なくとも約２０秒、少なくとも約２５秒）である。
【０１２４】
図３ｆでは、中間分離ｄ３における培養時間後に、遠位端４０４および基板１０２のうちの少なくとも一方が他方に対して横方向に移動され、主軸ａ２に沿って試薬液４０２’を分配する。図３ｇでは、横方向移動が完了すると、遠位端４０２と基板１０２とは分離し、試薬液によって接続されなくなる。例えば、遠位端４０４および基板１０２は、最初の分離距離ｄｌに戻ってもよい。方法を繰り返して（例えば異なる試薬液を用いて）、基板の複数の位置のそれぞれにおいて細長い試験ゾーンに分配することができる。
【０１２５】
一般に、遠位端と基板の垂直方向の分離は、基板に対して遠位端を移動することにより変更される。一般に、遠位端と基板の水平方向の分離は、遠位端に対して基板を移動することにより実行される。例示的な試薬液、プローブ化合物および分配デバイスは、２００６年９月２２日出願の米国仮特許出願第６０／８２６，６７８号に記載されており、この仮出願の全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１２６】
図３ａで明らかなように、また図８ａおよび図８ｂを参照すると、細長い試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、遠位端および基板を横方向に移動するステップを省略する分配方法に比べて、プローブ化合物のより均等な分配を実現する。試験ゾーン１１２ｉは第１部分１１９および第２部分１２１を含む。第１部分１１９におけるプローブ化合物の分布は、第２部分１２１または試験ゾーン３１２ｉにおける分布に比べてより均等であり、これは横方向移動のステップなしに実行された。
【０１２７】
図１に戻ると、参照ゾーン１１７は、サンプル中のいずれのアナライトの存在とも無関係に、検出器５０４により検出可能な応答を生成する。参照ゾーン１１７は一般に、蛍光媒体（例えば高分子または固定化蛍光分子）を含む。参照ゾーン１１７はシステム５００の動作に関連して以下に詳細に説明する。
【０１２８】
参照パターン１１４のインデシア１１６ｊは、システム５００の参照パターンリーダ５０６により読み取られるように構成される。インデシア１１６ｊは磁気材料（例えば磁気インク）から構成される。パターンリーダ５０６は、インデシア１１６ｊの存在を検出できる。参照パターン１１４はシステム５００の動作に関連して以下に詳細に説明する。
【０１２９】
図４に戻ると、作動システム５００のハウジング５０２は、デバイス１００と、圧縮ローラ５１６および支持ローラ５１８、５２０を含む圧縮システムと、制動バネ５１４を含む移動アクチュエータ５１２とを収容するための開口部５１０を含む。デバイス１００がハウジング５００内に収容されると、検出器５０４はチャネル１１０内の光学検出ゾーン５２４を画定する。使用中は、デバイス１００は検出ゾーン５２４に対して移動される。試験ゾーン１１２ｉは連続的に検出ゾーンに出入りする。検出器５０４はサンプルと連続する試験ゾーン１１２ｉとの間の相互作用を連続的に検出する。検出器５０４はまた参照ゾーン１１７を検知する。
【０１３０】
図６を参照すると、検出器５０４は、デバイス１００が移動する距離（相対または絶対距離）に応じて信号６００を出力する。信号６００は、参照ゾーン１１７を表すピーク６１７と、各ゾーン１１２ｉにおける相互作用を表すピーク６１２ｉとを含む。同時に、パターンリーダ５０６は、デバイス１００が移動する距離に応じて、インデシア１１６ｉを表す信号６０２を出力する。インデシア１１６ｉが試験ゾーン１１２ｉに空間的に関連することから、プロセッサ５０８は、試験ゾーンが信号を示さない場合（例えば、ゼロと区別できない信号６１２ａを示す試験ゾーン１１２ａの場合のような）であっても、検出ゾーン５２４が特定の試験ゾーンと一致する時を決定できる。参照ゾーン１１７および対応する信号６１７を、信号６０２の代替として、または信号６０２と組み合わせて用いることにより、信号６００のどの領域が特定の試験ゾーンに対応するかを決定できる。
【０１３１】
次に、圧縮システムを説明する。使用中は、圧縮システムはデバイス１００を圧縮して、チャネル１１０内の基板１０２、１０４間の距離を低減する。デバイス１００がハウジング５０２内に収容されると、第１基板１０２の外面１３２は支持ローラ５１８、５２０の方向に向けられ、第２基板１０４の外面１３４は圧縮ローラ５１６の方向に向けられる。支持ローラ５１８、５２９と圧縮ローラ５１６と間の距離ｄ４はデバイス１００の厚みｄ１（図５）より小さい。第２基板１０４は第１基板１０２と比較して相対的に柔軟であることから、圧縮ローラ５１６は第２基板１０４を圧縮して、第２基板１０４の内面１０３と第１基板１０２の内面１０５との間の距離ｄ６を局部的に低減する。
【０１３２】
弛緩状態（例えば非圧縮状態）では（図２）、距離ｄ６は一般に少なくとも約２５μｍ（例えば約５０μｍ、少なくとも約７５μｍ）である。非圧縮状態では、距離ｄ６は一般に約５００μｍ以下（例えば約２５０μｍ以下）である。局所的に低減された距離状態（例えば局所的に圧縮された状態）（図４の試験ゾーン１１２ｅ）では、距離ｄ６は一般に約１５μｍ以下（例えば約１０μｍ以下、約５μｍ以下例えば約２５μｍ以下）である。低減された距離状態で分離された表面間で実行される蛍光検出の例は、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００５／００４９２３号の米国継続出願に記載されており、この全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１３３】
図４および図５で明らかなように、圧縮システムは、チャネル１１０の全長の一部のみにわたってチャネル１１０内の距離ｄ８を低減する。典型的には、距離ｄ８は、試験ゾーン１１２ｉを分離する距離ｄ７に比べて、約５倍以下の長さ（例えば約３倍以下の長さ、約２倍以下の長さ、ほぼ同じの長さ）である。
【０１３４】
一般に、距離ｄ７は十分大きく、検出器５０４により画定される光学検出ゾーン５２４がチャネル１１０内の試験ゾーン１１２ｉのすべてより小さい（例えば５以下、３以下、２以下）範囲を含む。例示的な実施形態では、ｄ７は十分大きく、チャネル１１０の主軸ａｌに沿った検出ゾーン５２４の幅は同時に３つを超える試験ゾーン１１２ｉに接触しない（例えば２つ以下、１つ以下である）。チャネル１１０の主軸ａｌに垂直の検出ゾーン５２４の幅は一般に、軸ａ２に沿った試験ゾーン１１２ｉの長さとほぼ同一またはそれ以下（例えば７５％以下、５０％以下、３０％以下）である。
【０１３５】
使用中、サンプル液体は入口１０６に供給される。毛細管力はサンプルをチャネル１１０に沿ってリザーバ１０８の方向に吸引する。サンプル液体はチャネル１１０に沿って試験ゾーン１１２ｉと接触する。サンプル内のアナライトは試験ゾーンのプローブ化合物と相互に作用する。適切な培養時間後、デバイス１００がハウジング５００に挿入され、移動アクチュエータ５１２のバネ５１４を圧縮する。デバイス１００の挿入中、圧縮ローラ５１６および支持ローラ５２０は、デバイス１００が圧縮されないように間隔を空けている。デバイス１００が完全に挿入されると、検出ゾーン５２４は参照ゾーン１１７をほぼ覆うように配置される。圧縮ローラ５１６はチャネル１１０を局部的に圧縮する（図５）。
【０１３６】
サンプルのアナライトと試験ゾーン１１２ｉとの間の相互作用が決定される準備が完了すると（例えば培養期間後に）、移動アクチュエータ５１２は、検出器５０４の検出ゾーン５２４に対してデバイス１００を移動する（図４）。試験ゾーン１１２ｉは検出ゾーン５２４を連続的に通過し、光源からの光で照射される。圧縮ローラ５１６は、距離ｄ６の局部的低減が検出ゾーン５２４に空間的に一致するように配置される。したがって、光検出器は連続的に、試験ゾーン１１２ｉから光を検出し、この間、試験ゾーンのそれぞれは局部的に低減された距離状態（例えば局部的に圧縮される状態）にある（図４の試験ゾーン１１２ｅ）。各試験ゾーンから発生する蛍光はレンズにより集光され、光検出器により検出される。距離ｄ６の連続的な局部的低減および光学的決定は、各試験ゾーンが検出ゾーン５２４を通過して移動するまで、続行される。
【０１３７】
各試験ゾーンのプローブ化合物およびアナライトに加えて、第２基板１０４の内面１０３と第１基板１０２の内面１０５との間のチャネル１１０内に他の物質が存在する。このような物質の例はサンプルの付随物および試薬（例えば非結合または未反応の光プローブ）を含む。これらの物質は一般に、試験ゾーン１１２ｉとサンプルの相互作用に関連しない、背景放射（例えば、蛍光または散乱光）を生成する。背景放射の強度は一般に、検出ゾーン５２４に対応する位置における内面間に残る、このような物質の量に比例する。しかしながら、各試験ゾーンにおける相互作用を表す光信号の強度は、試験ゾーンの近辺に空間的に局所化している。光検出器は、相互作用を示す蛍光および背景放射の両方を受光し、検出する。
【０１３８】
図９、図１０ａおよび図１１を参照すると、マイクロ流体デバイス７００および作動システム５００’を用いてサンプルを分析して、１つ以上のアナライトの存在を決定する（例えば定性的および／または定量的に）ことができる。典型的な実施形態では、アナライトの１つ以上は、ウイルス、バクテリア、細胞、菌類または胞子などの粒子を含む。例えば、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３号（全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる）に記載された粒子はいずれも検出可能である。
【０１３９】
マイクロ流体デバイス７００は、マイクロ流体ネットワーク７０７を画定する第１および第２基板７０２、７０４を含み、このネットワークは、入口７０６と、入口と連通する複数のチャネル７１０ａ、７１０ｂ、７１０ｃ（各チャネルはそれぞれのリザーバ７０８ａ、７０８ｂ、７０８ｃを有する）を含む。各リザーバは、アナライトに対する分析に関係するように構成された試薬物質７０９ａ、７０９ｂ、７０９ｃ（例えばプローブ化合物）を含む。デバイス７００は、上述と同一であってもよい、複数のインデシア１１６ｊ（図９、図１０ａ、図１１には図示せず）を含む参照パターン１１４を含んでもよい。
【０１４０】
作動システム５００’はハウジング５０２’と、検出器５０４’と、参照パターンリーダ（図示せず）と、検出器５０４’およびパターンリーダと通信するプロセッサとを含む。検出器５０４は、アナライト（例えば粒子）および検出可能なラベル（例えば光ラベル）を含む複合物を検出する、光学的な蛍光検出器である。適切なラベルの例は、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３号に記載されており、この全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。検出器５０４’は、光源５５０’（例えば発光ダイオードまたはレーザダイオード）と光検出器５５２’（例えばダイオードアレイなどの１次検出器または多次元検出器（例えば電荷結合検出器などの画像検出器））とを含む。光検出器は一般に、マイクロ流体デバイスの各チャネル内に画定されたそれぞれの検出ゾーンからの光を空間的に選択して検出する。
【０１４１】
次に、マイクロ流体デバイス７００およびシステム５００’をより詳細に説明する。
【０１４２】
第１基板７０２は一般に、光学的に、蛍光ラベルからの蛍光を励起および検出するのに有効な光の波長に対しては光透過性（例えば透明）である。例えば、第１基板７０２は、約３５０ｎｍから約８００ｎｍの間の少なくとも１つの波長範囲内の入射光の少なくとも約７５％（例えば少なくとも約８５％、少なくとも約９０％）を透過してもよい。第１基板７０２は、例えば、高分子材料、ガラスまたはシリカから形成されてもよい。第２基板７０４は一般に、曲げやすいまたは柔軟な材料（例えば弾性高分子材料）から形成される。第１基板７０２は第２基板７０４より柔軟性が劣ってもよい。例えば、第１基板７０２は実質的に硬質であってもよい（例えば、デバイス７００の操作を容易にするために十分に硬質）。
【０１４３】
チャネル７１０ａから７１０ｃは一般に、チャネル内の液体サンプルの移動を促進するが、一般には毛細管チャネルではない（すなわち、液体は一般に、毛細管現象によりデバイス７００のチャネル内で移動しない）。例えば、チャネルの１つ以上の内面は、液体サンプルの毛細管運動を抑制するために疎水性であってもよい。代替的に、またはこれと組み合わせて、チャネルの内側寸法を大幅に大きくして、毛細管力がチャネル内のサンプルの実質的な移動を駆動するようにしてもよい。当然ながら、いくつかの実施形態では、チャネルは毛細管チャネルであってもよい。
【０１４４】
デバイス７００は３つのチャネルおよび対応するリザーバを備えて示されているが、一般にＮ個のチャネルおよび対応するリザーバを有し、ここではＮは少なくとも１であり、一般に２０未満である。
【０１４５】
各リザーバ７０８ｉは一般に、アナライトが存在する状態で検出可能な相互作用を提供するように構成された試薬７３５ｉ（例えば光ラベルなどの検出可能なラベル）を含む。相互作用は、例えば、対応するアナライトをラベルに結合して、アナライトおよび１つ以上のラベルを含む複合物を生成することを含んでもよい。このような複合物の例は、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３号に記載されている（この全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる）。各試薬は一般に、異なるアナライトの検出を可能にするように構成される。
【０１４６】
図１０ｂから図１０ｆを参照すると、デバイス７００は以下のように作動する。ある量の液体サンプル７３８（例えば、血液、唾液または尿などの生体液体）が毛細管７３６に導入される。毛細管７３７は一般に、標準的な毛細管（例えば、プラスチック毛細管などのエンドツーエンド毛細管）である。エンドツーエンド毛細管は内側の穴と、第１および第２開口と（一方の開口はどちらかの端部にある）を含む。毛細管は、へパリンなどで抗凝固コーティングされる。適切な毛細管の例には、Ｋａｂｅ  Ｌａｂｏｒｔｅｃｈｎｉｋ社（Ｎｕｒｎｂｒｅｃｈｔ−Ｅｌｓｅｎｒｏｔｈ、Ｄｅｕｔｓｃｈｌａｎｄ、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｋａｂｅ−ｌａｂｏｒｔｅｃｈｎｉｋ．ｄｅ／ｉｎｄｅｘ．ｐｈｐ？ｓｐｒａｃｈｅ＝ｄｅ＆ａｋｔ＿ｓｅｉｔｅ＝ｓｔａｒｔｓｅｉｔｅ＿ｐｒｏｄｕｋｔｅ．ｐｈｐ）から市販されている２０μｌへパリンでコーティングされた毛細管がある。一般に、毛細管の穴は、液体サンプルの全容積Ｖを収容するように構成される。容積Ｖは一般に約２５マイクロリットル以下（例えば約２０マイクロリットル以下、約１５マイクロリットル以下、約１０マイクロリットル以下）である。一般に、容積Ｖは約５マイクロリットル以上（例えば約７．５マイクロリットル以上）である。
【０１４７】
図１０ｂで明らかなように、デバイス７００の入口７０６は毛細管７３６を収容するように構成される。サンプル７３７は一般に、毛細管７３６内に残り、導入力を受けるまでマイクロ流体デバイスには入らない。
【０１４８】
図１０ｃで明らかなように、導入力は、基板７０２、７０４の内面間の距離を低減することによりサンプル７３７に加えられ、マイクロ流体ネットワーク内の容積を低減する。例えば、図１０ｃは、マイクロ流体ネットワークの一部に沿って移動するローラを示している。一般に、圧縮により、対向する内面は相互に接触する。チャネル内の容積が、チャネルの所定の領域の復元後に増加するに伴い、液体サンプル７３７の内面７３９に作用するガス圧が低減して、サンプルをマイクロ流体ネットワーク内に強制的に押し込む。圧縮および復元は、マイクロ流体ネットワークに沿ったローラ７１６の単一の連続移動で実行されるか、または蠕動方式のような複数ステップで連続的に実行されてもよい。
【０１４９】
図１０ｄで明らかなように、液体サンプル７３７の容積Ｖの実質的にすべて（例えば少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、基本的にすべて）は、マイクロ流体ネットワーク内に吸入される。例示的な実施形態では、容積Ｖの少なくとも９０％はネットワーク内に吸入される。
【０１５０】
マイクロ流体ネットワーク内の液体サンプルはチャネル７１０ｉおよびリザーバ７０８ｉのそれぞれに入り、各リザーバ内の試薬を移動させて混合物を生成する。一般に、混合物の生成は、マイクロ流体ネットワーク内に液体サンプルのバルク運動を引き起こすことにより促進される。このようなバルク運動は一般に、マイクロ流体デバイスの圧縮および復元により生じて、基板７０２、７０４の間の内側の距離を低減する。圧縮および復元は、他に対して、ローラ７１６およびマイクロ流体デバイス７００の少なくとも一方の繰返し運動により、蠕動方式で実行されてもよい。
【０１５１】
一般に、デバイス７００のＮ個のチャネル内の試薬７３５ｉの混合により生成される混合物の全容積は、デバイス７００に導入される液体サンプルの量の少なくとも約７０％（例えば少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、本質的にすべて）を含む。例示的な実施形態では、デバイス７００のＮ個のチャネル内の試薬７３５ｉの混合により生成される混合物の全容積は、デバイス７００に導入される液体サンプルの量の少なくとも約９０％を含む。
【０１５２】
マイクロ流体デバイスの各混合物内の粒子は、存在する場合、検出可能なラベルと結合して複合物を生成する。複合物の生成を可能にする適切な培養期間後、複合物の存在が検出される。各試薬７３５ｉは一般に、異なるアナライトの検出を可能にするように構成される。複合物の検出の例は、国際特許出願第ＰＣＴ／ＥＰ２００６／０６８１５３号に記載されており、この全開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【０１５３】
図１０ｆを参照すると、検出は一般に、デバイス内の各混合物のサブセット内で発生する。一般に、検出は各混合物の複数の異なるサブセット内で実行されてもよい。例えば、圧縮状態においてローラ７１６を移動し、混合物の新しい部分を各検出ゾーン内に移動することによって、各混合物の異なるサブセットは検出ゾーンを通過して移動できる。これを複数回実行することにより、各混合物の実質的にすべて（例えば少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、本質的にすべて）が検出を受けるようにしてもよい。この実施形態において、検出は圧縮状態においてローラ７１６を用いて実行される。すでに検出を受けた混合物は、廃棄物コンテナとして作用する毛細管７３６に入る。
【０１５４】
いくつかの実施形態では、検出の実行は、光検出器に対してデバイス７００を走査することによって、各検出が連続的に溶液の異なるサブセットを含むようにしてなされる。これを複数回実行することにより、各混合物の実質的にすべて（例えば少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、本質的にすべて）が検出を受けるようにしてもよい。この実施形態において、検出は復元状態においてローラ７１６を用いて実行される。
【０１５５】
分析を実行する方法およびデバイスを説明した。他の実施形態の例を次に説明する。
【０１５６】
入口１０６は、遮るものがない開口として説明されているが、他の構成も可能である。例えば、入口は、シリンジを受け入れる、シリンジ取り付け部（例えば気密取り付け部）を備えて構成されてもよい。代替方法として、入口は、サンプルが針により導入されるガスケットとして構成されてもよい。別の代替方法として、入口は、サンプルを導入できるが、サンプルを排出できない、一方向弁を備えて取り付けられてもよい。別の代替方法として、入口は標準的な毛細管（例えばプラスチック毛細管などのエンドツーエンド毛細管）を受け入れるように構成されてもよい。毛細管は、へパリンなどの抗凝固剤でコーティングされてもよい。適切な毛細管の例には、Ｋａｂｅ  Ｌａｂｏｒｔｅｃｈｎｉｋ社（Ｎｕｒｎｂｒｅｃｈｔ−Ｅｌｓｅｎｒｏｔｈ、Ｄｅｕｔｓｃｈｌａｎｄ、ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｋａｂｅ−ｌａｂｏｒｔｅｃｈｎｉｋ．ｄｅ／ｉｎｄｅｘ．ｐｈｐ？ｓｐｒａｃｈｅ＝ｄｅ＆ａｋｔ＿ｓｅｉｔｅ＝ｓｔａｒｔｓｅｉｔｅ＿ｐｒｏｄｕｋｔｅ．ｐｈｐ）から市販されている２０μｌへパリンコーティング毛細管がある。
【０１５７】
マイクロ流体デバイスが毛細管現象により満たされると説明してきたが、他の実施形態を用いてもよい。例えば、システム５００は、サンプルを入口に供給する前に、マイクロ流体ネットワークの内部容積を低減するように設計されてもよい。サンプルが供給されると、内部容積が増加し、それによりサンプルを吸入する。このような容積の減少は、例えば、圧縮ローラ５１６を用いて達成されてもよい。例えば、マイクロ流体デバイスは、移動アクチュエータ５１２の制動バネ５１４が圧縮状態になるように、ハウジング５００内に収容されてもよい。圧縮ローラ５１６は、リザーバ１０８に対応する位置でデバイス１００を圧縮するように配置される。この圧縮によりリザーバ１０８の内部容積が低減する。容積の低減は、デバイス１００内に受け入れられるサンプルの容積とほぼ同じ容積（例えば、容積より少なくとも約２５％大きい、例えば容積より少なくとも５０％大きい）である。リザーバ１０８が圧縮状態にあると、サンプルの容積はデバイス１００の入口１０６に供給される。圧縮ローラ５１６は入口１０６から離れて、デバイス１００の反対端１３７に向かって後退する。ローラ５１６がリザーバ１０８から離れると、リザーバが復元し、その結果マイクロ流体ネットワークの内部容積は増加する。容積の増加により、デバイスにサンプルを吸入する真空が生じる。
【０１５８】
開放毛細管チャネルを有するマイクロ流体デバイスを説明してきたが、他の実施形態を用いてもよい。例えば、チャネルは、全長の少なくとも一部に沿ってチャネルの断面の少なくとも一部（例えば大部分またはすべて）を占有する媒体を含んでもよい。一般に、媒体は、それぞれ間隔を空けた試験ゾーン（例えば捕捉容積）を画定するために、複数のプローブ化合物に固定できるものであり、各試験ゾーンは３次元に配置された捕捉位置を有する。媒体にある穴または空隙により、液体はチャネルに沿って浸透する（例えば毛細管現象によって）。チャネルに沿った液体の移動は、例えば、上述のようにチャネル内に真空を生成することにより、促進または誘発されてもよい。一般に、プローブ化合物は、チャネルに沿って間隔を空けた試験ゾーンを画定するために、多孔質の媒体に対して固定される。アナライトと試験ゾーンのプローブ化合物との相互作用は、デバイス１００の試験ゾーン１１２ｉについて説明したのと同様に、連続的に決定されてもよい。各試験ゾーンは３次元に配置されるため、チャネルの対向する内面間の距離を低減するステップは、試験ゾーンの固定化されたプローブ化合物により占有される捕捉容積を低減する。光検出は、低減された容積（すなわち低減された距離）状態において試験ゾーンにおいて実行される。
【０１５９】
試験ゾーン１１２ｉは細長いとして説明してきたが、他の構成も可能である。例えば、図７を参照すると、マイクロ流体デバイス３００は複数の試験ゾーン３１２ｉを含み、それぞれの試験ゾーンは概して円形構成を有する。形状の差以外は、試験ゾーン３１２ｉはデバイス１００の試験ゾーン１１２ｉと同一であってもよい。試験ゾーンの差以外は、デバイス１００および３００は同一であってもよい。
【０１６０】
試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、遠位端４０４および基板１０２の横方向移動を開始する前に（図３ｆ）、遠位端４０４および基板１０２を最初の分離距離ｄ１（図３ｂ）から近接分離距離ｄ２（図３ｃ）および中間分離距離ｄ３（図３ｄ）に移動する、と説明してきたが、他の実施形態が実行されてもよい。例えば、遠位端４０４および基板１０２を横方向に移動して、先端部４０４および基板１０２を近接分離距離ｄ２に置いてもよい。この実施形態では、分離距離ｄ２は一般に０より大きい。
【０１６１】
試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、試薬液４０２の残存部分４０２’のみが残るまで、培養時間の間に遠位端４０４および基板１０２を中間分離距離ｄ３に維持するステップを含む、と説明してきたが、他の実施形態が実行されてもよい。例えば、遠位端４０４および基板１０２の横方向の移動は、遠位端４０４および基板１０２が近接分離距離ｄ２（図３ｃ）から分離距離ｄ３（図３ｄ）に移動されると、即座に開始してもよい。言い換えると、培養時間はほぼゼロであってもよい。別の例として、培養中、試薬液を気化するステップは、追加の試薬液を毛細管の先端に導入するステップに置き換えてもよい。したがって、毛細管の先端の試薬の総量は培養中に増加する。
【０１６２】
試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、遠位端４０４および基板１０２を分離距離ｄ３に維持する培養時間を含む、と説明してきたが、他の実施形態が実行されてもよい。例えば、分離距離ｄ３は培養時間中に変化してもよい。例えば、先端４０４を、培養時間中に基板１０２に対して水平方向および／または垂直方向に振動させてもよい。代替的に、またはこれと組み合わせて、先端４０４を、水平方向の移動中に基板１０２に対して水平方向および／または垂直方向に振動させてもよい。このような振動は、培養または水平方向の移動中に第１基板へのプローブ分子の輸送を促進できる。
【０１６３】
試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、毛細管分配デバイスを使用する、と説明してきたが、他の分配デバイスが使用されてもよい。例えば、物質は固体分配デバイス（例えば固体棒）から分配されてもよい。
【０１６４】
試験ゾーン１１２ｉを形成する方法は、ある量の試薬液を毛細管スポッタの毛細管の遠位端に導入し（図３ｂ）、および先端および基板をより小さい分離距離ｄ２に移動して、試薬液４０２が基板１０２の位置に接触するようにする、と説明してきたが、他の実施形態が実行されてもよい。例えば、試薬液は、遠位端および基板がより小さい分離距離に移動した後（例えば遠位端が基板と接触した後）にだけ、遠位端に導入されてもよい。
【０１６５】
チャネルの内面間の距離を連続的に低減する方法およびマイクロ流体デバイスリーダを説明してきたが、他の構成も可能である。例えば、マイクロ流体デバイスリーダは、チャネルの大部分（例えば実質的にすべてまたはすべて）に沿って、内面間の距離を同時に低減するように構成されてもよい。次に、リーダは検出器の検出ゾーンをチャネルに沿って移動して、異なる試験ゾーンが連続的に読み取られるようにしてもよい。
【０１６６】
第１の相対的に硬質な基板および第２の相対的に柔軟な基板を有するマイクロ流体デバイスを説明してきたが、他の実施形態が使用されてもよい。例えば、チャネルの対向する内面の画定する両方の基板は柔軟であってもよい。このような実施形態では、光検出器の一部は圧縮システムの一部を形成してもよい。例えば、マイクロ流体デバイスは、圧縮ローラと検出器の光学系との間を移動してもよい。
【０１６７】
参照パターンは、マイクロ流体デバイスの試験ゾーンの空間的特性に関する情報を提供する、と説明してきたが、参照パターンは、追加のまたは代替の情報を提供してもよい。例えば、参照パターンは、マイクロ流体デバイスの試験ゾーンの生理化学特性に関する情報を提供してもよい。このような特性には、それに対して試験ゾーンを構成して分析する、アナライトを含む。他の特性には、デバイス上に保存された試薬のアイデンティティおよび特性ならびにデバイスのデータ情報（例えば使用期限）を含む。
【０１６８】
磁気インデシアを含む参照パターンを説明してきたが、他のインデシアが使用されてもよい。例えば、インデシアが、周囲の物質と比較して異なる光学濃度または反射率を有する領域から形成されてもよい。参照パターンリーダは一般に、透過率または反射率によりインデシアを読み取るように構成された、光学式リーダである。
【０１６９】
他の実施形態では、第１基板は、例えば、射出成形によって形成されたチャネルを含んでもよい。チャネルは、２次元および３次元（すなわち幅および深さ）より実質的に大きい１次元（長さ）を有する。チャネルは、矩形、Ｖ字形（三角形）、Ｕ字形または他の形状の断面を有してもよい。いくつかの実施形態では、チャネルの断面の形状および／または寸法はチャネルの全長に沿って変化してもよい。第２基板は、接着剤により第１基板に固定されてもよい。第２基板は、例えば透明テープから形成されてもよい。第２基板（例えばテープ）が機械的剛性を有し、これにより、第２基板（例えばテープ）の外面の機械的接触が、第２基板の内面を実質的に変形させないようにしてもよい。
【０１７０】
ある特定の実施形態では、チャネルは、チューブ、パイプ、毛細管などの内面により画定されてもよい。チャネルは、矩形、Ｖ字形（三角形）または他の形状の断面を有してもよい。いくつかの実施形態では、チャネルの断面の形状および／または寸法はチャネルの全長に沿って変化してもよい。チャネルの一部は光学的に透明であってもよい。
【０１７１】
いくつかの実施形態では、チャネルは、分析に使用される検出システムにより検出可能であるように構成された、画定された構造体または固定化された分子などの、１つ以上の参照および／またはアライメントマークを含む。アライメントマークは、例えば、固定化された蛍光ビーズ、固定化された蛍光高分子、蛋白質、核酸などを含んでもよい。アライメントマークはまた、微細構造などとのような物理構造を含んでもよい。
【０１７２】
マイクロ流体デバイスは、サンプルをチャネルに導入した後に流体回路を形成するように構成されてもよい。流体回路はエンドレスループで液体サンプルを密封する。液体サンプルが流体回路内に密封され、液体サンプルの容積が流体回路の全容積より小さくなると、流体回路の残りの容積は輸送液体によって占められる可能性がある。輸送流体はサンプル流体と実質的に不混和性流体であってもよい（例えば、親水性／疎水性、または密度差の理由で）。輸送流体は、例えば空気などの気体であってもよい。典型的には、流体サンプルは連続スラグ内の流体回路内に存在する。
【０１７３】
流体回路の一部は圧縮可能なゾーンを含む。圧縮可能なゾーンは流体回路の全長であってもよく、全長に沿った回路の少なくとも１つの壁面は圧縮可能または変形可能である。圧縮可能なゾーンに局所的な圧縮力が加えられると、壁面は変形する。十分な力が加えられると、壁面は流体回路を中断する程度にまで圧縮される。最も一般的には、流体回路は所定の位置（この位置ではチャネルが輸送流体で満たされている）で中断される。
【０１７４】
流体回路が中断されると、流体回路内の流体サンプルの位置は、中断位置を流体回路の残りの位置に対して移動することにより、操作できる。中断位置を移動することにより、中断位置の一方側の輸送流体の容積が減少し、これに対応して、中断位置の他方側の輸送流体の容積が増加する。容積の変化は結果的に、流体サンプルの端部（すなわち、その位置において流体サンプルと輸送流体とが合流する）に差圧を発生する。流体サンプルは、流体回路内で移動することにより、圧力を均等化するように反応する。
【０１７５】
１つ以上の試験ゾーンがチャネルに沿って間隔を空けていてもよい。典型的には、各分析は、それぞれのアナライトとプローブ化合物との相互作用、またはアナライトおよび試薬（例えば光ラベル）を含むそれぞれの複合物とプローブ化合物との相互作用を含む。
【０１７６】
チャネル内のサンプルの位置は、圧縮可能なゾーンの一部に局所的な圧縮力を加えるように構成されたアクチュエータまたはローラにより制御できる。マイクロ流体デバイスはアクチュエータまたはローラに対して移動し、これによりサンプルがチャネル内の所望の位置に移動するようにされる。あるいは、マイクロ流体デバイスが静止している間に、ローラが移動してもよい。
【０１７７】
図１２のａ）は閉じた状態の流体回路１０を示す。流体回路１０は第１ゾーン１と、マイクロ流体チャネル２と、第２ゾーン３と、入口４とを含む。閉じた状態では、第２ゾーン３は入口４に緊密に接続されている。図１２のｂ）は、入口４において流体サンプル５を受け入れる準備ができている、開いた状態の流体回路１０を示す。流体サンプル５が入口４に接触した後、毛管現象により液体サンプル５を第１ゾーン１内に吸入する。図１２のｃ）からｄ）は、サンプルが供給された後の閉じた状態の流体回路を示す。ローラ６は、第２ゾーンが非圧縮状態（図１２のｃ）に示すとおり）、または圧縮状態（図１２のｄ）に示すとおり）のいずれかになるように、第２ゾーン３に対して位置合わせされる。流体回路１０内の液体サンプル５の位置は、ローラ６を位置合わせすることにより第２ゾーン３が圧縮状態なるようにし、および圧縮状態を維持する間に、第２ゾーン３に対してローラ６を移動することにより（図１２のｄ）に矢印で示す）調節できる。流体回路が閉じているため、ローラ６の移動によりローラの両側に差圧が生じ、差圧が液体サンプルの移動を引き起こし、それにより、均等圧を回復する。流体回路はカートリッジ内で作用するように構成されてもよい。特定の例では、流体回路は変形によって圧縮できるマイクロ流体流路と、検出領域を含むマイクロ流体チャネルと、閉じた流体回路を可逆的または不可逆的に形成できる密封部材とを有してもよい。
【０１７８】
図１３は例示的なカートリッジ１００の切断図を示す。カートリッジ１００は基板１０１と、キャップ１０２と、第１ゾーン１０３、コンジット１０８、チャネル１０５、第２ゾーン１０４、および入口／緊密接続部１０９を含む流体回路とを含む。チャネル１０５は少なくとも部分的に光透過性の層により覆われてもよい。第１ゾーン１０３は、所望のサンプル容積（例えば、１μＬから２０μＬ、２μＬから１０μＬ、または約５μＬ）を保持するために選択された、例えば毛細管であってもよい。毛細管はその内面を抗凝固剤でコーティングされてもよい。毛細管の入口１０９はサンプル１０６を受け入れるように構成される。いくつかの実施形態では、毛細管の出口は所定の容積（例えば、約５μＬ、１０μＬまたは２０μＬ）を備える反応チャンバ１１０に向かって開いている。いくつかの実施形態では、反応チャンバ１１０は試薬ペレット１０７を含む。試薬ペレット１０７は、蛍光染料でラベルされ、およびサンプル中で検出される抗原に対する親和力を有する抗体を含んでもよい。例えば、液体サンプル中のヘルパーＴ細胞の数を検出するために、試薬ペレットは、第１蛍光染料（例えばフィコエリトリン）でラベルされたアンチ−ＣＤ４＋−抗体、および第２蛍光染料（例えばフィコエリトリン−Ｃｙ５）でラベルされたアンチ−ＣＤ３＋−抗体、塩、および安定化試薬などを含んでもよい。いくつかの実施形態では、第１ゾーンの内面はサンプルを処理するのに必要な試薬で覆われる。液体サンプル中の細胞などの粒子を検出するための例示的な分析は、例えば、国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットに記載されており、この明細書の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。反応チャンバ１１０と流体連通するコンジット１０８は、反応チャンバとチャネル１０５の第１端とを接続する。国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットに記載されているように、検出はチャネル内で実行されてもよい。したがって、チャネルは少なくとも部分的に光学的に透明である。例えば、チャネル１０５は少なくとも部分的に透過性の層で覆われてもよい。チャネル１０５の第２端は、コンジット１０８を介して第２ゾーン１０４の第１端に接続される。第２ゾーンは少なくとも部分的に柔軟であり、これにより第２ゾーンの内径がゼロまで減少できる。たとえば、第２ゾーンは弾性シリコーンチューブなどであってもよい。第２ゾーンの第２端はキャップ１０２内に組み込まれ、このキャップ１０２は基板に接触し、第２ゾーンを保持するように適合されている。キャップを開くことにより、第１ゾーンと第２ゾーンとの間の緊密な接続部１０９が開き、キャップを閉じることにより、第１ゾーンと第２ゾーンとの間の緊密な接続部１０９が閉じる。
【０１７９】
出荷状態では、マイクロ流体デバイスは閉じられていてもよい。すなわち、第２ゾーンが接続部１０９において第１ゾーンとの緊密な接続を形成する。あるいは、マイクロ流体デバイスは開いた状態で出荷されてもよい。いくつかの実施形態では、マイクロ流体デバイスは、カートリッジが最初に閉じられた後に、カートリッジが開くのを防止するように構成された機構を含む（例えば安全目的のため）。キャップ１０２内の密封部材が毛細管１０３の端部との流体密封接続を形成すると、接続部１０９は閉じられる。動作中、ユーザはキャップを開き、それによりキャップの第１端の第１ゾーンを開放する。ユーザが第１ゾーンの開放端をサンプル液（例えば、指先穿刺により生成される血液液滴）に接触させる。このようにして、毛細管１０３はサンプルで満たされる。ユーザはキャップを閉じ、それにより第１ゾーンと第２ゾーンとの間の接続部１０９を閉じる。この段階で、流体回路は、反応チャンバ、コンジット、チャネルおよび第２ゾーン内に連続した所定容積のサンプル液、試薬ペレット、および連続した容積の輸送流体（例えば空気）を含む。ユーザはマイクロ流体デバイスを作動するために設計された装置内にマイクロ流体デバイスを置く。装置は第２ゾーンを圧縮するように構成されたアクチュエータ、検出器、およびコントローラを含む。アクチュエータは第２ゾーンを圧縮し、圧縮点における第２ゾーンの直径をゼロまで減少する。圧縮された状態の間に、デバイスおよびアクチュエータが相互に移動すると、輸送流体の圧力はサンプル容積の一端で増加し、一方で、サンプル容積の他端では減少する。サンプル容積の各端の圧力が均等になるまで、サンプル容積は流体回路内で移動する。
【０１８０】
チャネル１０５は、外部力を加えない状態ではチャネル１０５内でサンプルが移動しないように疎水性であってもよい。いくつかの実施形態では、試薬ペレット１０７に近接した壁面もまた疎水性であってもよい。親水性材料を使用すると、試薬ペレットの長期間の安定性が疎水性材料に比べて低下する可能性がある。
【０１８１】
一実施形態では、アクチュエータは装置内に固定され、マイクロ流体デバイスは圧縮手段に対して移動する。国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットに記載されているように、アクチュエータは、例えばローラである。
【０１８２】
マイクロ流体デバイスが装置内で移動することにより、サンプルが移動して反応チャンバ内に入り、それによりこのチャンバ内で試薬ペレットを溶解してもよい。抗体はサンプル中に存在するそれぞれの抗原に結合する。サンプルの種類に応じて、抗原はサンプル液中に浮遊する粒子上（例えば、液体サンプル中の細胞表面上）に位置してもよい。抗体はラベルされるため（例えば蛍光染料により）、抗体がそれぞれの抗原に結合すると、抗原も同様にラベルされる。たとえば、国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットを参照のこと。さらにデバイスを装置に対して同一方向に移動することにより、サンプルはチャネル内に移動する。チャネルが満たされると、検出が開始される。
【０１８３】
望ましくは、検出器は小型、安価、および汎用性を備える。すなわち、検出器は本明細書に記載する用途だけでなく他の用途に適合可能である。検出器は蛍光顕微鏡であってもよく、好ましくは、超小型の外形寸法であり、カートリッジに比べて高さが低い。検出器は５μｍ以上のサイズの物体を画像化でき、分析に使用される蛍光染料から放射される波長の信号を検出するように構成される。光源は分析に使用される蛍光染料を励起するのに適するスペクトルの光を放射する高出力ＬＥＤであってもよい。異なる染料を使用する場合、例えば、異なる２つの波長の光を放射する少なくとも２つの異なる染料を使用する場合、検出は少なくとも２つの異なる波長のそれぞれを検出できなければならない。検出器は焦点調節機構およびカメラを含んでもよい。
【０１８４】
通常、蛍光顕微鏡に対しては極めて高出力の光源が使用される。この理由は、ほぼ平行な光ビームを有し、放射光の小部分のみ（約２°の立体角）が使用されるためである。集光レンズと、光源から放射される光の大部分を集光する検出レンズとを用いることにより、低出力光源（例えばＬＥＤ）を使用できる。従来から、蛍光顕微鏡は光学的忠実度に関しては極めて高い値を有し、従って、視野は集光レンズに対して大きい立体角から外れると言われてきた。実際に、視野は、高い光学的忠実度を達成するために、比較的重い、大型の、複雑な光学系を必要とする傾向にあった。
【０１８５】
図１４ａおよび図１４ｂを参照すると、例示的な検出器５００は、第１光路５０２および第２光路を含む本体５０１を含む。特定の例では、光路のそれぞれは、個別に、概して円筒形または他の適切な構造を有してもよい。第１光路５０２は励起光路を表し、第２光路５０３は検出光路を表す。
【０１８６】
第１光路５０２は光源５０５とカートリッジ５１６とを接続する。光源５０５は、４５５ｎｍ、４７０ｎｍおよび５２８ｎｍの放射波長と、１２０°の視角を有する（ランベルト発光体）、高出力ＬＥＤ（例えば、Ｐｌａｔｉｎｕｍ  Ｄｒａｇｏｎ（Ｒ）ＬＥＤ（Ｏｓｒａｍ））であってもよい。蛍光染料を使用する場合、光源は分析において用いられる蛍光染料の励起波長に応じて選択される。例えば、フィコエリトリンおよびフィコエリトリン−Ｃｙ５を使用する場合、光源は約５２０ｎｍの波長を有する光を放射するように選択され、一方、フィコエリトリンおよびＰｅｒＣＰを使用する場合、光源は約４８０ｎｍの波長を有する光を放射するように選択される。集光レンズ５０６（例えば、屈折率１．５３３のトパーズから作られる）はＬＥＤから放射された光を集光して第１光路５０２内に導く。開口部５０２ａは、１３．５°以下の最大立体角でダイクロイックミラー５０４を照射できるように構成される。光路５０２はまた、５０５ｎｍから５３０ｎｍの間の波長を有する光を通過させる、帯域通過フィルタ５０７（励起フィルタ）を含む。したがって、残りの励起波長は約５２８ｎｍになる。
【０１８７】
光路５０３は、ダイクロイックミラー５０４を介してＣＭＯＳカメラを物体５１６に接続し、光路５０２に対してある一定角度（図１４では９０°で示される）に構成される。光路５０３はまた、第１放射フィルタ５１０を含む。いくつかの実施形態では、フィルタ５１０はフィルタチェンジャ５１２に取り付けられる。フィルタチェンジャ５１２は追加の放射フィルタ、例えばフィルタ５１３を含んでもよい。放射フィルタ５１０および５１３は放射波長の所定のセット、例えば、カートリッジ内の試薬をラベリングするのに用いられる蛍光染料の放射波長に関連して選択されてもよい。例えば、フィルタ５１０および５１３は、フィコエリトリンおよびフィコエリトリン−Ｃｙ５の放射波長に対応して、それぞれ５９０ｎｍおよび６８５ｎｍの波長を有する光を通過させるように選択されてもよい。光路５０３は、ダイクロイックミラー５０４上に最大１３．５°の立体角を形成するように構成された開口部５０３ａを含む。
【０１８８】
ダイクロイックミラー５０４は励起光路５０から検出光路５０３を分離するように構成される。いくつかの実施形態では、ダイクロイックミラーは、波長＜＝５６８ｎｍを有する光は通過するが、波長＞５６８ｎｍを有する光は反射する、ショートパスダイクロイックミラーである。このように、ダイクロイックミラー５０４により、励起光路からの光は通過するが、物体５１６からの光は反射して検出光路に入る。この場合も、ダイクロイックミラー５０４の物理特性は、分析において使用されるラベル（例えば蛍光染料）に応じて選択される。
【０１８９】
いくつかの実施形態では、検出器はさらに、焦点調節機構５１４を備え、この機構５１４により検出レンズ５０８と物体との距離を５ｍｍ以下（例えば、１または２ｍｍ）まで連続的に変化させる。
【０１９０】
いくつかの実施形態では、検出レンズ５０８は０．４以下、例えば０．２の検出光学開口と、０．５以下、例えば０．４の励起光学開口とを有するように構成される。
【０１９１】
検出器はまた、例えば６４０×４８０ピクセルの解像度を有する８ビット濃淡値のＣＭＯＳカメラなどのデジタル撮像デバイスなどを含んでもよい。他の実施形態では、デジタル撮像デバイスはより高い解像度を有してもよく、および／またはカラーＣＭＯＳカメラであってもよい。
【０１９２】
いくつかの実施形態では、検出システムの再生倍率は１：１から１：１０の間、例えば１：３、１：４または１：５である。
【０１９３】
いくつかの実施形態では、物体５１６と検出レンズ５０８との間の距離は、２ｍｍから２０ｍｍ、たとえば、８ｍｍ、９ｍｍ、または１０ｍｍである。
【０１９４】
図１５を参照すると、動作中、光源５０５から放射された光はレンズ５０６によって集光され、励起フィルタ５０７によって濾光される。光は開口５０２ａ、ダイクロイックミラー５０４、検出レンズ５０８、開口５０９を通過し、物体６０１を励起する。いくつかの実施形態では、物体５１６はサンプル液、例えば血液で満たされたチャネルであり、サンプル液は多くの粒子、例えば検出されるべきヘルパーＴ細胞を含む。粒子は抗体に結合した１つ以上の蛍光染料でラベルされてもよい。他の実施形態では、物体は、１つ以上の蛍光染料でラベルされ、およびチャネル表面の１つに固定されたプローブ分子またはプローブ分子のアレイに結合した、標的分子を含むチャネルである。染料はＬＥＤからの励起光の影響を受けて蛍光を発する。蛍光染料から放射された光は開口５０９、検出レンズ５０８を通過し、ダイクロイックミラー５０４により反射されて検出光路５０３に入る。そこで光は、蛍光染料から放射された光の波長を有する光を通過するように適合された、検出フィルタ５１０（またはフィルタチェンジャ５１２の位置に応じて５１３）を通過する。フィルタを通過後、光は付属のＣＭＯＳカメラ５１１のＣＭＯＳチップによって集光される。
【０１９５】
図１６ａから図１６ｂは検出器を使用して、例えば血液サンプル中に存在するヘルパーＴ細胞の数を検出できる方法を示す。デバイスおよび反応チャンバの詳細は、上記および参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第２００７／０５１８６１号パンフレットで見ることができる。上述の例においては、カートリッジは２つのラベルされた抗体、すなわち、フィコエリトリンでラベルされたアンチ−ＣＤ４抗体、およびフィコエリトリン−Ｃｙ５でラベルされたアンチ−ＣＤ３抗体で調製される。ヘルパーＴ細胞はそれら細胞の表面上に両方の抗原を示すため、ヘルパーＴ細胞は両方の蛍光染料でラベルされる。他の細胞、すなわち細胞の表面上の両方の抗原のうちの１つのみを示す細胞がサンプル中に存在してもよい。これらの細胞は一致した蛍光染料でのみラベルされる。
【０１９６】
それぞれの蛍光染料でラベルされた抗体との反応後、蛍光を発する細胞７１２を含む液体サンプルは移動して検出チャネル７１１内に入る。第１位置では（図１６ａ）、検出器７１０はチャネル７１１の一部分７１３上の像を表す第１画像７１４を検出する。一部分７１３は所定の容積のサンプル、例えば１００ｎＬを表す。画像７１４は、サンプル中に存在するフィコエリトリンでラベルされたアンチ−ＣＤ４＋抗体により放射された光を通過させ、フィコエリトリン−Ｃｙ５−アンチ−ＣＤ３＋抗体により放射された光を遮断するように構成された、第１フィルタを用いて取り込まれる。同じ位置の第２画像７１５は、フィコエリトリン−Ｃｙ５−アンチ−ＣＤ３＋抗体により放射された光を通過させ、フィコエリトリンでラベルされたアンチ−ＣＤ４＋により放射された光を遮断するように構成された、第２フィルタを用いて取り込まれる。画像７１４および７１５は一部分７１３内の様々な数の信号を示してもよい。さらに、光学系の収差によって、両方の画像７１４および７１５は相互のアライメントから外れることもある。
【０１９７】
ソフトウェア（例えば、ＣｌｏｎｄｉａｇによるＩｃｏｎｏｃｌｕｓｔ）を使用して、例えば、チャネル内のアライメントマーク（図示せず）を用いることにより、または両方の画像内に存在する信号間の関係を分析することにより、両方の画像７１４および７１５をアライメントすることができる。さらに、ソフトウェアは、両方の画像内で検出された信号を識別し、記録する（７１６）。図１６ａでは、３つの信号が両方の画像内に存在すると特定された。これは、両方の抗原を有する３つの細胞が一部分７１３内に見出されたことを意味する。結果は表示されてもよく、さらなる計算または統計のために用いられてもよく、あるいはさらなる処理のために保存されてもよい。
【０１９８】
検出器７１０およびチャネル７１１は、チャネル７１１の別の部分７１７を見るために相互に移動され（図１６ｂ）、検出手順が繰り返される。画像７１８および７１９は、それぞれ第１および第２フィルタを用いて記録される。ソフトウェアは、両方の画像内で検出された信号を識別し、記録する（７２０）。
【０１９９】
検出チャネルの追加の部分において検出を繰り返して、各部分のそれぞれ内の細胞の数を表す一式の値を得てもよい。サンプル中に存在する細胞の数、ならびに対応する統計パラメータは、この一式の値から計算されてもよい。例えば、１００ｎＬ当たりの３つの細胞の平均は、５μＬのサンプル容積中の細胞の総数１５０に一致する。
【０２００】
図１７は、液体サンプルとして血液を使用するＴ細胞カウント試験の間において検出された２つの画像の重ね合わせを示す。両方の画像は、異なる２つの検出フィルタを使用して、チャネルの同一位置（例えば、図５の画像７１４および７１５と同様）において検出される。８０１および８０２は２つの異なる検出ファイルを利用して撮像される１つのアライメントマークを表す。２つの画像間のずれは明らかに検出可能であり、マークを用いることにより修正できる。８０３および８０４はアライメントマーク８０１および８０２と同様に同一距離だけ位置が変化した単一細胞を表す。この細胞は両方の画像内に存在するため、この細胞が両方の抗体でラベルされており、ヘルパーＴ細胞であると決定できる。８０５は２つの重ね合わせた画像のうちの１つ内だけで検出可能な細胞を表す。このようにして、この細胞が細胞表面上の両方の抗原を示さず、したがってヘルパーＴ細胞ではないことを導き出すことができる。画像内にはまた他の血液細胞も見ることができる。血液細胞は蛍光抗体でラベルされていないため、それら細胞は単に、影として見ることができる（８０６）。
【０２０１】
他の実施形態は特許請求の範囲内にある。
【図１】
2010526283.tif 000003
【図２】
2010526283.tif 000004
【図３ａ】
2010526283.tif 000005
【図３ｂ】
2010526283.tif 000006
【図３ｃ】
2010526283.tif 000007
【図３ｄ】
2010526283.tif 000008
【図３ｅ】
2010526283.tif 000009
【図３ｆ】
2010526283.tif 000010
【図３ｇ】
2010526283.tif 000011
【図４】
2010526283.tif 000012
【図５】
2010526283.tif 000013
【図６】
2010526283.tif 000014
【図７】
2010526283.tif 000015
【図８ａ】
2010526283.tif 000016
【図８ｂ】
2010526283.tif 000017
【図９】
2010526283.tif 000018
【図１０ａ】
2010526283.tif 000019
【図１０ｂ】
2010526283.tif 000020
【図１０ｃ】
2010526283.tif 000021
【図１０ｄ】
2010526283.tif 000022
【図１０ｅ】
2010526283.tif 000023
【図１０ｆ】
2010526283.tif 000024
【図１１】
2010526283.tif 000025
【図１２】
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【図１３】
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【図１４ａ】
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【図１４ｂ】
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【図１５】
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【図１６ａ】
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【図１６ｂ】
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【図１７】
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【国際調査報告】
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