(57)【要約】  本発明は、ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９単為結果遺伝子の１つ又は複数を保有するソラヌム・チコペルシクム（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｔｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）植物に関する。好ましい植物は、ｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の対又はｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の対を含み、好ましくは、植物は、対の２つの遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性であり、より好ましくは、植物は、対の両方の遺伝子についてホモ接合性である。そのような植物は無核トマトを産生できる。本発明はさらに、マーカー支援育種を使用してｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９単為結果遺伝子の１つ又は複数を保有する植物を産生するための方法に関する。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ｐａｔ−６単為結果遺伝子を含むソラヌム・リコペルシクム（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）植物。
【請求項２】
ｐａｔ−７単為結果遺伝子をさらに含む、請求項１に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項３】
ｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性である、請求項１又は２に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項４】
ＤＮＡ断片についてホモ接合性であり、オランダで４月から７月の間に管理された条件下で温室内栽培される場合に栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物に少なくとも１０％の単為結果率をもたらすＤＮＡ断片上にｐａｔ−６遺伝子が存在し、
ａ）前記ＤＮＡ断片がマーカーＴＧ１８２とＴ０６３５との間のＳ．ハブロチャイテス（Ｓ．ｈａｂｒｏｃｈａｉｔｅｓ）第４染色体のセグメントに含まれ、又は
ｂ）前記ＤＮＡ断片が中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖にハイブリダイズする、
請求項１から３までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項５】
オランダで４月から７月の間に管理された条件下で温室内栽培される場合にＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４  ｐａｔ−６遺伝子を含む栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物に少なくとも１０％の単為結果率の増大をもたらすＤＮＡ断片上にＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−７遺伝子が存在し、
ａ）前記ＤＮＡ断片がＳ．マーカーＴＧ４４１とＴＧ５３８との間のハブロチャイテス第５染色体のセグメントに含まれ、マーカーＣＤ６４と連鎖し、又は
ｂ）前記ＤＮＡ断片が中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖にハイブリダイズする、
請求項２から４までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項６】
ｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の少なくとも１つがＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在する遺伝子であり、より好ましくはｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の少なくとも１つがＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来する、請求項１から５までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項７】
Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ系−１ではない、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９単為結果遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物。
【請求項８】
ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性である、請求項７に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項９】
ＤＮＡ断片についてホモ接合性であり、Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ系−１において存在するＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−９対立遺伝子を含み、オランダで４月から７月の間に管理された条件下で温室内栽培される場合に栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物に少なくとも２９％の単為結果率をもたらすＤＮＡ断片上にｐａｔ−８遺伝子が存在し、
ａ）前記ＤＮＡ断片がマーカーＴ０６３５とＴＧ２８７との間、好ましくはマーカーＴ０９５８とＣＴ２５８との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメントに含まれ、又は
ｂ）前記ＤＮＡ断片が中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖にハイブリダイズする、
請求項７又は８に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１０】
ＤＮＡ断片についてホモ接合性であり、Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ系−１において存在するＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−８遺伝子を含み、オランダで４月から７月の間に管理された条件下で温室内栽培される場合に栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物に少なくとも６５％の単為結果率をもたらすＤＮＡ断片上にＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−９遺伝子が存在し、
ａ）前記ＤＮＡ断片がマーカーＴＧ１５１９とＡｔ３ｇ２４０１０との間のＳ．ハブロチャイテス第９染色体のセグメントに含まれ、又は
ｂ）前記ＤＮＡ断片が中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖にハイブリダイズする、
請求項７から９までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１１】
ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の少なくとも１つがＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来し、より好ましくはｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の少なくとも１つがＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在する遺伝子である、請求項７から９までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１２】
Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−８及びｐａｔ−９単為結果遺伝子をさらに含む、請求項１から６までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１３】
Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性である、請求項１２に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１４】
Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子が請求項９及び１０に記載のＤＮＡ断片上に存在する、請求項１２又は１３に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１５】
Ｓ．ハブロチャイテスｓｅ機能的不稔性遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１６】
Ｓ．ハブロチャイテスｓｅ遺伝子についてホモ接合性である、請求項１５に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１７】
ＤＮＡ断片についてホモ接合性である場合に栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物において少なくとも１．０ｍｍ突出した柱頭によってもたらされる機能的不稔を与えるＤＮＡ断片上にＳ．ハブロチャイテスｓｅ遺伝子が存在し、
ａ）前記ＤＮＡ断片がマーカーＴＧ５３８とＴ３５８との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメントに含まれ、マーカーＴＧ３１８と連鎖し、又は
ｂ）前記ＤＮＡ断片が中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖にハイブリダイズする、
請求項１５又は１６に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１８】
Ｓ．ハブロチャイテスｓｅ遺伝子がＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在する遺伝子であり、より好ましくは前記Ｓ．ハブロチャイテスｓｅ遺伝子がＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来する、請求項１５から１７までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項１９】
請求項１５から１８までに記載のｓｅ機能的不稔性遺伝子をさらに含む、請求項１から１４までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項２０】
ｓｅ遺伝子についてホモ接合性である、請求項１９に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項２１】
チェリー、カクテル、ミニプラム、プラムカクテル、プラム、ラウンド及びビーフからなる群から選択される種類の市販用トマトである、請求項１から２０までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項２２】
クラリー、コンチタ、ギセラ、ファボリタ、ジョセフィーナ、ルピータ、プロリコ、リカント、アモロッソ、ＷＳ４１７６、アランカ、カンパリ、シレン、パナレア、ティティ、サンタ、サンタリナ、サンテラ、ＷＳ４１６６、ダッシャー、ギンコ、バレリーナ、サンストリーム、ロマナ、サバンタス、ＷＳ４１７８、ＷＳ４１７９、レコンクイスタ、レコバ、ヨガ、トローロ、ヤキ、ドゥリンタ、ハバナ、プライサンセ、メカノ、トリシア、グランデラ、ビザール、ブリリアント、アキシオン、インガー、エスペロ、セドリコ、エモーション、ダニエラ、アロマタ、クロチルデ、エバー、クラランス、レチチア、イクラム、ボルドー、アストナ、ブラボナ、ベネビタ、デリカタ、アドミロ、プレゴ、グロウデナ、ビルロクエ、クエスト、マカレナ、カールソン、ラプソディ、クネロ、クマト、モモタロウ、エクソタ、ロージー、イエローゴールド、オラマ、カロビタ及びビンテージからなる群から選択される亜種又は栽培種である、請求項２１に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項２３】
ｐａｔ、ｐａｔ−１、ｐａｔ−２、ｐａｔ−３、ｐａｔ−４、ｐａｔ−５、ｐｓ−２、ｓｈａ及びｓｄｓからなる群から選択される単為結果遺伝子をさらに含む、請求項１から２２までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物。
【請求項２４】
請求項１から２３までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物由来の種子。
【請求項２５】
請求項１から２３までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物由来の果実。
【請求項２６】
ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性であるＳ．リコペルシクム植物を産生するための方法であって、
ａ）第１のＳ．リコペルシクム植物をｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の少なくとも１つを含むソラヌム・リコペルシクム複合体の第２の植物と交雑するステップと、
ｂ）Ｆ１世代及びさらなる世代を、反復親である第１のＳ．リコペルシクム植物と少なくとも２世代にわたって戻し交雑するステップと、
ｃ）ステップｂ）で得られた最も遠い戻し交雑世代を少なくとも２世代にわたって自殖するステップと
を含み、ステップｂ）及びｃ）の少なくとも１つにおいて少なくとも１つの分子マーカーを使用して、ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性であるＳ．リコペルシクム植物を選択する方法。
【請求項２７】
無核トマトを形成できるＳ．リコペルシクム植物を産生するための方法であって、
ａ）第１のＳ．リコペルシクム植物をＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の少なくとも１つを含むソラヌム・リコペルシクム複合体の第２の植物と交雑するステップと、
ｂ）Ｆ１世代及びさらなる世代を、反復親である第１のＳ．リコペルシクム植物と少なくとも２世代にわたって戻し交雑するステップと、
ｃ）ステップｂ）で得られた最も遠い戻し交雑世代を少なくとも２世代にわたって自殖するステップと
を含み、ステップｂ）及びｃ）の少なくとも１つにおいて少なくとも１つの分子マーカーを使用して、請求項１から１５までのいずれか一項に記載のＳ．リコペルシクム植物を選択する方法。
【請求項２８】
前記分子マーカーが、
ａ）マーカーＴＧ１８２とＴ０６３５との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、
ｂ）マーカーＴＧ４４１とＴＧ５３８との間のＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、
ｃ）マーカーＣＤ６４と連鎖するＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、
ｄ）マーカーＴ０６３５とＴＧ２８７との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、
ｅ）マーカーＴ０９５８とＣＴ２５８との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、
ｆ）マーカーＴＧ１５１９とＡｔ３ｇ２４０１０との間のＳ．ハブロチャイテス第９染色体のセグメント、及び
ｇ）マーカーＴＧ５３８とＴＧ３５８との間のＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、及び
ｈ）マーカーＴ３１８と連鎖するＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント
と連鎖する又はその存在が診断に用いられるマーカーからなる群から選択される、請求項２６又は２７に記載の方法。
【請求項２９】
分子マーカーが、マーカーＴＧ１８２、Ｔ０８９１、Ｔ０９５８、Ｔ０６３５、１１４Ｃ１５−Ｓ、ＴＧ６０９、ＳＳＲ４５０、ＳＳＲ９４、ＣＴ２５８、ＴＧ４４１、ＣＤ６４、ＴＧ５３８、Ａｔ３ｇ２４０１０、Ｔ０１５６、ＳＳＲ５９９、Ａｔ５ｇ０６３６０、Ｔ１０６５、ＣＴ２２０、ＴＧ３５８及びＴ３１８からなる群から選択される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
無核トマトを産生するための方法であって、請求項１から１４まで若しくは１９から２３までのいずれか一項に記載の植物又は請求項２７から２９までのいずれか一項に記載の方法において得られる植物を、無核トマトの産生を促す条件下で栽培するステップと、任意選択で前記トマトを収穫するステップとを含む方法。
【請求項３１】
無核トマトを形成できるＳ．リコペルシクム植物のマーカー支援育種のための分子マーカーの使用であって、分子マーカーが、
ａ）マーカーＴＧ１８２とＴ０６３５との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、
ｂ）マーカーＴＧ４４１とＴＧ５３８との間のＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、
ｃ）マーカーＣＤ６４と連鎖するＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、
ｄ）マーカーＴ０６３５とＴＧ２８７との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、
ｅ）マーカーＴ０９５８とＣＴ２５８との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、
ｆ）マーカーＴＧ１５１９とＡｔ３ｇ２４０１０との間のＳ．ハブロチャイテス第９染色体のセグメント、及び
ｇ）Ｓ．ハブロチャイテス第５染色体のマーカーＴＧ５３８とＴＧ３５８との間のセグメント、及び
ｃ）マーカーＴ３１８と連鎖するＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント
と連鎖する又はその存在が診断に用いられるマーカーからなる群から選択される使用。
【請求項３２】
分子マーカーが、マーカーＴＧ１８２、Ｔ０８９１、Ｔ０９５８、Ｔ０６３５、１１４Ｃ１５−Ｓ、ＴＧ６０９、ＳＳＲ４５０、ＳＳＲ９４、ＣＴ２５８、ＴＧ４４１、ＣＤ６４、ＴＧ５３８、Ａｔ３ｇ２４０１０、Ｔ０１５６、ＳＳＲ５９９、Ａｔ５ｇ０６３６０、Ｔ１０６５、ＣＴ２２０、ＴＧ３５８及びＴ３１８からなる群から選択される、請求項３１に記載の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、分子マーカーとの遺伝連鎖によって存在を評価できる単為結果遺伝子を保有するソラヌム・リコペルシクム（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）植物に関する。本発明はさらに、植物の種及び植物から得られる無核トマト、育種の支援に単為結果遺伝子と連鎖した分子マーカーを使用して植物を得るための方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
通常の果実の生長においては、果実の結実の開始は、受粉及び受精の完了の成功に依存する。しかし、これらの過程は、狭い環境的制約に依存する（Ｐｉｃｋｅｎ  １９８４）。優れた花粉産生は、夜間の温度範囲１５から２１℃で可能になり、確実に花粉を飛散させるためには空気の循環が必要である。したがって、トマトでは、果実結実の失敗は、特定の野外条件下（低温又は高温と組み合わせた高湿度又は低湿度）及び冬期又は早春の栽培期間での保温していない温室又はトンネルではありふれた現象である（Ｇｅｏｒｇｅら、１９８４）。受粉及び／又は受精をすることのない無核果への子房の成長である単為結果性の果実の生長は、厳しい条件下でのこの乏しい果実結実の問題を克服するための機会を示す。トマトでは天然の単為結果の３つの供給源が、無核果を産生するための実用的応用についてのそれらの展望から広く研究されている（Ｇｏｒｇｕｅｔら、２００５によって概説された）、ソレッシ（Ｓｏｒｅｓｓｉ）又はモントファベット（Ｍｏｎｔｆａｖｅｔ）１９１（ｐａｔ）、セベリアニン（ｐａｔ−２）及びＲＰ７５／５９（ｐａｔ−３／ｐａｔ−４）。加えてトマトにおける単為結果の他の２つの供給源、ＩＶＴ−系１及び２（Ｚｉｊｌｓｔｒａ、１９８５）は、それらについての詳細な研究はこれまでに行われていないが、ソレッシ及びセベリアニンよりもより高く、且つより安定なレベルの単為結果を生じることが見出された。ＩＶＩ−系１における単為結果は、Ｓ．ハブロチャイテス（Ｓ．ｈａｂｒｏｃｈａｉｔｅｓ）に由来し、単因子性と考えられた。ＩＶＩ−系２における単為結果は、Ｓ．ペルビアヌム（Ｓ．ｐｅｒｕｖｉａｎｕｍ）に由来し、多因子性であると考えられた。今日までに、トマトにおいて単為結果について位置付けられた唯一の遺伝子は、第３染色体の長腕に位置付けられたｐａｔ−１である（Ｂｅｒａｌｄｉら、２００４）。
【０００３】
したがって、単為結果性の果実についての新規遺伝子を提供することは、本発明の目的である。
【０００４】
定義
本記載において、他に示す場合を除いて、本明細書において使用する用語及び定義は、（メンデル）遺伝学において使用されるものであり、Ｍ．Ｗ．Ｓｔｒｉｃｋｂｅｒｇｅｒ、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、ｓｅｃｏｎｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ（１９７６）を、詳細には１１３〜１２２頁及び１６４〜１７７頁を参照する。その中で述べられる「遺伝子」は、一般的には生物（すなわち植物トマト）の生物学的特徴を決定する遺伝的因子を意味し、「対立遺伝子」は、（２倍体）植物トマトにおいて存在する遺伝子対の個々の遺伝子である。これに関連して本明細書において使用する用語ｐａｔ−遺伝子又はｓｅ−遺伝子は、それぞれ本発明の単為結果性又は機能的不稔性の表現型を産生できる又はこれに寄与できるそれぞれの遺伝子のｐａｔ−対立遺伝子又はｓｅ−対立遺伝子を指すことが理解される。
【０００５】
植物は、ある遺伝子について前記遺伝子の同一の対立遺伝子を含有する場合に「ホモ接合性」であると、ある遺伝子について前記遺伝子の２つの異なる対立遺伝子を含有する場合に「ヘテロ接合性」であると称される。大文字の使用は、優勢（形態の）遺伝子を示し、小文字の使用は劣性遺伝子を示す、したがって、「Ｘ，Ｘ」は、Ｘの遺伝子又は特質についての優性ホモ接合遺伝型を示し、「Ｘ，ｘ」及び「ｘ，Ｘ」はヘテロ接合遺伝型を示し、「ｘ，ｘ」は、劣性ホモ接合性遺伝型を示す。一般に知られているように、劣性ホモ接合遺伝型だけが対応する劣性表現型を通常与える（すなわち「ｘ」の特性又は特質を示す植物を生じる）が、ヘテロ接合及び優性ホモ接合遺伝型は、他の遺伝子及び／又は複数対立遺伝子、抑制因子、共優性などの他の因子が（も）表現型の決定において役割を演じない限り、対応する優性表現型を通常与える（すなわち「Ｘ」の特性又は特質を示す植物を生じる）。
【０００６】
原則としてハイブリッド種子は、多くの場合異なる系に属する２つの異なる親植物トマトを交雑することによって得られる。既知である栽培技術及び植物育種技術を用いて、そのようなハイブリッドは高度に特異的な所望の特性を有して提供されることができ、ハイブリッドを「設計する」こと、すなわちハイブリッド植物にあらかじめ決定した遺伝的特徴を与えることを可能にする。ハイブリッド種子をもたらすために交雑される２つの親系統（の特性）を適切に選択することによってこれは、通常達成される。通常これらは、数世代にわたる自家受精（自家受粉）によって得られた近交系であり、そのような近交系も、他の−通常は、あらかじめ決定した−近交親系統と交雑する場合に所望の特性を有するハイブリッド後代をもたらすように、通常育種家によって再び特別に「設計」されている。通例、そのような親系統は、遺伝的にホモ接合性であり、（すなわち同系交雑の結果として）同一であるので、それらは、親系統の特性を組み合わせ得る安定且つ信頼性のある形式で遺伝的に均一の−ヘテロ接合体であっても−ハイブリッド系の組合せをもたらすことができる。それを実施する際に、その目的は、１つには親系統由来の特定の特性をできるだけ純粋に種子に交雑することであり、もう１つには、特性の改善を、とりわけ植物及び果実の生長並びにその収率に関してもたらすことができる雑種優勢又は近交系生長の既知の効果に関する使用である。この雑種優勢効果は、使用される親系統が特定の遺伝的特性に関して、関連していない場合に／関連していないことによって（すなわち親系統が遺伝的に「遠く離れている」場合に）得られる。ハイブリッドの形成を含む伝統的な栽培技術を使用する、一般的に植物の、具体的にはトマトの育種技術のさらなる記載について、周知の手引き書を参照し、その内容を参照として本明細書に組み込む。
【０００７】
本明細書において使用する用語「植物」は、植物全体又は、植物細胞、植物プロトプラスト、植物トマトが再生可能である植物細胞組織培養物、植物カルス、植物細胞凝集塊及び植物内で無処理である植物細胞などの、その任意の部分若しくはその派生体、或いは胚、花粉、胚珠、果実（例えば収穫されたトマト）、花、葉、種子、根、根端などの植物の一部分を含む。
【０００８】
植物学的用語法：Ｌｉｎｎａｅｕｓは、植物分類学の父と考えられている。彼は、現在のトマトを最初はソラヌム（Ｓｏｌａｎｕｍ）に分類したが、その学名は長い間リコペルシコン・エスカレンタム（Ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｏｎ  ｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ）であった。同様に現代のトマトの野生類縁体は、Ｌ．ペンネリー（Ｌ．ｐｅｎｎｅｌｌｉｉ）、Ｌ．ヒルスツム（Ｌ．ｈｉｒｓｕｔｕｍ）、Ｌ．ペルビアヌム（Ｌ．ｐｅｒｕｖｉａｎｕｍ）、Ｌ．チレンセ（Ｌ．ｃｈｉｌｅｎｓｅ）、Ｌ．パルビフロルム（Ｌ．ｐａｒｖｉｆｌｏｒｕｍ）、Ｌ．ケミエレウスキー（Ｌ．ｃｈｍｉｅｌｅｗｓｋｉｉ）、Ｌ．チースマニー（Ｌ．ｃｈｅｅｓｍａｎｉｉ）、Ｌ．セラシフォルメ（Ｌ．ｃｅｒａｓｉｆｏｒｍｅ）及びＬ．ピンピネルリフォリウム（Ｌ．ｐｉｍｐｉｎｅｌｌｉｆｏｌｉｕｍ）などのようにリコペルシコン属に分類されていた。過去数年にわたり、トマト研究者及び栽培者においてこれらの種の名称を分類し直すかどうか議論があった。現代のトマトに新たに提案された学名は、ソラヌム・リコペルシクムである。同様に野生種の名称は、変更され得る。Ｌ．ペンネリーはソラヌム・ペンネリー（Ｓｏｌａｎｕｍ  ｐｅｎｎｅｌｌｉｉ）になり、Ｌ．ヒルスツムはＳ．ハブロチャイテスになり、Ｌ．ペルビアヌムはＳ．「ヌペルビアヌル」（Ｓ．‘Ｎｐｅｒｕｖｉａｎｕｍｒ’）とＳ．「カレジオン・デ・フアイレス」（Ｓ．‘Ｃａｌｌｅｊｏｎ  ｄｅ  Ｈｕａｙｌｅｓ’）とに分割され、Ｓ．ペルビアヌム（Ｓ．ｐｅｒｕｖｉａｎｕｍ）及びＳ．コルネリオムエルレリ（Ｓ．ｃｏｒｎｅｌｉｏｍｕｅｌｌｅｒｉ）、Ｌ．パルビフロルム（Ｌ．ｐａｒｖｉｆｌｏｒｕｍ）は、Ｓ．ネオリキー（Ｓ．ｎｅｏｒｉｃｋｉｉ）になり、Ｌ．ケミエレウスキーはＳ．ケミエレウスキー（Ｓ．ｃｈｍｉｅｌｅｗｓｋｉｉ）になり、Ｌ．チレンセはＳ．チレンセ（Ｓ．ｃｈｉｌｅｎｓｅ）になり、Ｌ．チースマニアエ（Ｌ．ｃｈｅｅｓｍａｎｉａｅ）はＳ．チースマニアエ（Ｓ．ｃｈｅｅｓｍａｎｉａｅ）又はＳ．ガラパゲンセ（Ｓ．ｇａｌａｐａｇｅｎｓｅ）になり、Ｌ．ピンピネルリフォリウムはＳ．ピンピネルリフォリウム（Ｓ．ｐｉｍｐｉｎｅｌｌｉｆｏｌｉｕｍ）になり得る（Ｓｏｌａｎａｃｅａ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｎｅｔｗｏｒｋ（２００５）Ｓｐｏｏｎｅｒ  ａｎｄ  Ｋｎａｐｐ；ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｓｇｎ．ｃｏｒｎｅｌｌ．ｅｄｕ／ｈｅｌｐ／ａｂｏｕｔ／ｓｏｌａｎｕｍ＿ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ．ｈｔｍｌ）。
【０００９】
ｐａｔ又はｓｅ遺伝子及び対立遺伝子を含む核酸配列又は断片は、本明細書において定義する任意のＳ．ハブロチャイテスのｐａｔ又はｓｅ遺伝子及び対立遺伝子と、中程度の又は好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で「ハイブリダイズする」それらの能力によっても定義され得る。ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、本明細書において、少なくとも約２５、好ましくは約５０ヌクレオチド、７５又は１００、及び最も好ましくは約２００若しくはそれを超えるヌクレオチドの核酸配列の、温度約６５℃、約１Ｍの塩を含む溶液、好ましくは６×ＳＳＣ若しくは同程度のイオン強度を有する任意の他の溶液中でのハイブリダイズを可能にする条件及び、６５℃、約０．１Ｍ若しくはそれより低い塩を含む溶液中、好ましくは０．２×ＳＳＣ若しくは同程度のイオン強度を有する任意の他の溶液での洗浄と定義される。好ましくは、ハイブリダイゼーションは、終夜で、すなわち少なくとも１０時間実施され、且つ好ましくは洗浄は少なくとも１時間、少なくとも２回の洗浄溶液の交換を伴って実施される。通常これらの条件は、約９０％又はそれを超える配列同一性を有する配列の特異的ハイブリダイゼーションを可能にする。中程度の条件は、本明細書において、少なくとも５０ヌクレオチド、好ましくは約２００若しくはそれを超えるヌクレオチドの核酸配列の、温度約４５℃、約１Ｍの塩を含む溶液、好ましくは６×ＳＳＣ若しくは同程度のイオン強度を有する任意の他の溶液中でのハイブリダイズを可能にする条件及び、室温で約１Ｍの塩を含む溶液中、好ましくは６×ＳＳＣ若しくは同程度のイオン強度を有する任意の他の溶液での洗浄と定義される。好ましくは、ハイブリダイゼーションは、終夜で、すなわち少なくとも１０時間実施され、且つ好ましくは洗浄は少なくとも１時間、少なくとも２回の洗浄溶液の交換を伴って実施される。通常これらの条件は、５０％までの配列同一性を有する配列の特異的ハイブリダイゼーションを可能にする。当業者は、５０％から９０％の間で同一性が変動する配列を明確に同定するために、これらのハイブリダイゼーション条件を変更できる。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
Ｆｉｎｋｅｒｓら（２００７ｂ）は、遺伝的バックグラウンド、Ｓ．リコペルシクム、栽培種マネーメーカー（Ｍｏｎｅｙｍａｋｅｒ）においてＳ．ハブロチャイテス  アクセションＬＹＣ４についての一連の浸透性交雑系を近年開発した。単為結果性の果実の生長及び花柱の突出が、Ｓ．ハブロチャイテスの第４染色体短腕をホモ接合状態で、Ｓ．ハブロチャイテスの全長第５染色体をホモ接合状態若しくはヘテロ接合状態で保有する浸透性交雑系の１つ（ＩＬ５−１）で観察された（未刊、私信）。
【００１１】
本発明者らは、ここでＩＬ５−１において無核果の生長に関連する２つの新規単為結果遺伝子（１つは主、もう１つは微働）を特徴付け、且つ位置付けた。加えて、花柱突出遺伝子座の位置も同定された。さらにＩＶＴ−系１から組み合わせたさらに２つの単為結果遺伝子をＦ２分離集団を使用して同定し、且つ位置付けた。
【課題を解決するための手段】
【００１２】
したがって第１の態様において、本発明は、ｐａｔ−６単為結果遺伝子を含むソラヌム・リコペルシクム植物に関する。ｐａｔ−６単為結果遺伝子は、Ｓ・リコペルシクム植物に単為結果性を与えることができる。本発明のｐａｔ−６単為結果遺伝子は、本明細書において栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物において、植物がＤＮＡ断片についてホモ接合性であり、且つ（好ましくは本明細書の以下で定義されるとおり）オランダで４月から７月の間に管理された条件下で温室内栽培される場合に、少なくとも１０％の単為結果率を与えるＤＮＡ断片上に存在する遺伝子であって、ａ）ＤＮＡ断片が、マーカーＴＧ１８２とＴ０６３５との間のＳ．ハブロチャイテスの第４染色体のセグメント内に含まれる、又はｂ）ＤＮＡ断片がａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖に中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする、遺伝子として定義される。
【００１３】
本明細書全体を通じて使用する単為結果率は、本発明のｐａｔ及び／又はｓｅ遺伝子を有する栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物がオランダで管理された条件下で温室内栽培される本明細書の実施例において記載されるとおり決定される。好ましい管理された温室条件は、夜間の最低温度１７℃、日中の最低温度１９℃、相対湿度約７５％、日長約１６時間及び、光レベルが１平方メートルあたり１５０ワットを下回ると開始し、レベルが１平方メートルあたり２５０ワットを上回ると終了する人工光（１５０μｍｏｌ／ｍ２／秒）である。春及び夏は、本明細書において４月から７月と定義され、冬は、１０月から１月と定義される。
【００１４】
本発明のＳ．リコペルシクム植物は、ｐａｔ−６単為結果遺伝子についてヘテロ接合性であってもよいが、好ましくは植物はｐａｔ−６単為結果遺伝子についてホモ接合性である。
【００１５】
本発明の好ましいＳ．リコペルシクム植物は、ソラヌム・ハブロチャイテスｐａｔ−６単為結果遺伝子を、より好ましくはＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在するｐａｔ−６遺伝子を、最も好ましくはＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来するｐａｔ−６遺伝子を含む。Ｓ．ハブロチャイテスＬＹＣ４は、Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ  ａｎｄ  Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒａｌ  Ｃｒｏｐｓ  ＩＰＫ，Ｃｏｒｒｅｓｔｒａｓｓｅ３，Ｇａｔｅｒｓｌｅｂｅｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ（ｈｔｔｐ：／／ｍａｎｓｆｅｌｄ．ｉｐｋ−ｇａｔｅｒｓｌｅｂｅｎ．ｄｅ／）のＭａｎｓｆｅｌｄ’ｓ  Ｗｏｒｌｄ  ＤａｔａｂａｓｅのＬ．ヒルスツムＬＹＣ４として利用可能である。Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ−１系の種子は、２００７年１０月１９日にブダペスト条約の下で、ＮＣＩＭＢ，Ａｂｅｒｄｅｅｎ，ＵＫ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｉｍｂ．ｃｏｍ）に寄託され、アクセション番号ＮＣＩＭＢ４１５０９に帰属された。
【００１６】
第２の態様において、本発明は、ｐａｔ−７単為結果遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物に関する。ｐａｔ−７単為結果遺伝子は、ｐａｔ−６遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物の単為結果表現型に寄与することができる。本発明のｐａｔ−７単為結果遺伝子は、本明細書において、Ｓ．ハブロチャイテスＬＹＣ４  ｐａｔ−６遺伝子を含む栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物において、植物がオランダで４月から７月の間に本明細書において上記に定義した管理された条件下で温室内栽培される場合に、少なくとも１０％の単為結果率の増大を与えるＤＮＡ断片上に存在する遺伝子であって、ａ）ＤＮＡ断片が、マーカーＴＧ４４１とＴＧ５３８との間のＳ．ハブロチャイテスの第５染色体のセグメント内に含まれ、マーカーＣＤ６４と連鎖し、又はｂ）ＤＮＡ断片がａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖に中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする遺伝子と定義される。好ましくは、ＤＮＡ断片のマーカーＣＤ６４への連結は、Ｆ１植物が、マーカーＴＧ４４１とＴＧ５３８の間より長くないＳ．ハブロチャイテスセグメントをＳ．リコペルシクムバックグラウンドに含有する１つの親と交雑した、Ｓ．ハブロチャイテスＤＮＡ又は他の野生型ＤＮＡを含有しないＳ．リコペルシクム植物とのハイブリッドであるＦ２集団において、ＤＮＡ断片がマーカーＣＤ６４の１センチモルガン上流（テロメア側）又は下流（セントロメア側）内にあると、本明細書において定義される。
【００１７】
単為結果率における少なくとも１０％の増大は、本明細書において、ｐａｔ−７遺伝子、好ましくは単一のｐａｔ−７遺伝子を含む又は含まない、すなわちヘテロ接合性（例えば本明細書における表３を参照されたい）のｐａｔ−６植物における単為結果率の４．１％から少なくとも４．５１％への増大を意味すると理解される。好ましくはｐａｔ−７遺伝子によって寄与されるｐａｔ−６単為結果率における増大は、少なくとも１５、２０、３０又は５０％、１００％の最大単為結果率までである。
【００１８】
本発明のＳ．リコペルシクム植物は、ｐａｔ−７単為結果遺伝子についてヘテロ接合性であってよいが、好ましくは植物はｐａｔ−７単為結果遺伝子についてホモ接合性である。
【００１９】
本発明の好ましいＳ．リコペルシクム植物は、Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−７単為結果遺伝子を、より好ましくはＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在するｐａｔ−７遺伝子を、最も好ましくはＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来するｐａｔ−７遺伝子を含む。
【００２０】
第３の態様において、本発明は、両者とも本明細書上記で定義されるｐａｔ−６遺伝子及びｐａｔ−７遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物に関する。植物は、ｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の一方又は両方についてヘテロ接合性であってよい。しかし、好ましくは植物は、ｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の両方についてホモ接合性である。
【００２１】
したがって、第４の態様において、本発明は、ｐａｔ−８単為結果遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物に関する。ｐａｔ−８単為結果遺伝子は、以下に定義するｐａｔ−９単為結果遺伝子も含むＳ．リコペルシクム植物に単為結果性を与えることができる。本発明のｐａｔ−８単為結果遺伝子は、本明細書において栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物において、植物がＤＮＡ断片についてホモ接合性であり、Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在するＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−９遺伝子を含み、オランダで４月から７月の間に本明細書において上記に定義した管理された条件下で温室内栽培される場合に、少なくとも２９％の単為結果率を与えるＤＮＡ断片上に存在する遺伝子であって、ａ）ＤＮＡ断片が、マーカーＴ０６３５とＴＧ２８７との間、好ましくはマーカーＴ０９５８とＣＴ２５８との間のＳ．ハブロチャイテスの第４染色体のセグメント内に含まれ、又はｂ）ＤＮＡ断片がａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖に中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする遺伝子と定義される。
【００２２】
本発明のＳ．リコペルシクム植物は、ｐａｔ−８単為結果遺伝子についてヘテロ接合性であってよいが、好ましくは植物はｐａｔ−８単為結果遺伝子についてホモ接合性である。
【００２３】
本発明の好ましいＳ．リコペルシクム植物は、Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−８単為結果遺伝子を、より好ましくはＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来するｐａｔ−８遺伝子を、最も好ましくはＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在するｐａｔ−８遺伝子を含む。
【００２４】
したがって第５の態様において、本発明は、ｐａｔ−９単為結果遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物に関する。ｐａｔ−９単為結果遺伝子は、上記に定義したｐａｔ−８単為結果遺伝子も含むＳ．リコペルシクム植物に単為結果性を与えることができる。本発明のｐａｔ−９単為結果遺伝子は、本明細書において、栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物において、植物がＤＮＡ断片についてホモ接合性であり、Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在するＳ．ハブロチャイテスｐａｔ−８遺伝子を含み、オランダで４月から７月の間に本明細書において上記に定義した管理された条件下で温室内栽培される場合に、少なくとも６５％の単為結果率を与えるＤＮＡ断片上に存在する遺伝子であって、ａ）ＤＮＡ断片が、Ｓ．ハブロチャイテスの第９染色体のマーカーＴＧ１５１９とＡｔ３ｇ２４０１０との間のセグメント内に含まれ、又はｂ）ＤＮＡ断片がａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖に中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする遺伝子と定義される。
【００２５】
本発明のＳ．リコペルシクム植物は、ｐａｔ−９単為結果遺伝子についてヘテロ接合性であってよいが、好ましくは植物はｐａｔ−９単為結果遺伝子についてホモ接合性である。
【００２６】
本発明の好ましいＳ．リコペルシクム植物は、Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−９単為結果遺伝子を、より好ましくはＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来するｐａｔ−９遺伝子を、最も好ましくはＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１に存在するｐａｔ−９遺伝子を含む。
【００２７】
第６の態様において、本発明は、両者とも本明細書上記で定義されるｐａｔ−８遺伝子及びｐａｔ−９遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物に関する。植物は、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の一方又は両方についてヘテロ接合性であってよい。しかし、好ましくは植物は、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の両方についてホモ接合性である。Ｓ．ハブロチャイテスｐａｔ−８及びｐａｔ−９単為結果遺伝子を含む好ましいＳ．リコペルシクム植物は、Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ系−１ではない植物である。
【００２８】
第７の態様において、本発明は、それぞれが本明細書の上記で定義されるｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の種々の組合せを含むＳ．リコペルシクム植物に関する。したがってそのような植物は、ｐａｔ−６遺伝子をｐａｔ−８及び／若しくはｐａｔ−９遺伝子との組合せで、又はｐａｔ−７遺伝子をｐａｔ−８及び／若しくはｐａｔ−９遺伝子との組合せで含むことができる。しかし、より好ましいのは、ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の４つ全てを含む植物である。そのような植物は、ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子のいずれかについてヘテロ接合性であってよい。しかし最も好ましいのは、ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の４つ全てについてホモ接合性である植物である。
【００２９】
第８の態様において、本発明は、ｓｅ機能的不稔性遺伝子を含むＳ．リコペルシクム植物に関する。本明細書において機能的不稔性は、生存可能な花粉によって特徴付けられる表現型として理解されるが、花の正常な形態及び機能からの逸脱によって自然な受粉が強く制限されている。ｓｅ機能的不稔性遺伝子は、突出した柱頭によってもたらされた機能的不稔性をＳ．リコペルシクム植物に与えることができる。突出した柱頭によってもたらされた機能的不稔性は、本明細書において第３房、開花前での植物１個あたり１個の花の葯及び花柱の長さを測定することによって決定される。突出した柱頭は、花柱の長さから葯の長さを減算することによって算出された。Ｓ．ハブロチャイテスの花は、突出した柱頭を有するが、Ｓ．リコペルシコン（Ｓ．ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｏｎ）の花の柱頭は、開花前には葯錐体の中にある。ｓｅ遺伝子についてホモ接合性であるＳ．リコペルシコン植物は、ヘテロ接合性又はホモ接合性の植物ＳＬよりも顕著に突出した柱頭を有する花を産生する（例えば表５を参照されたい）。ｓｅ遺伝子についてホモ接合性であるＳ．リコペルシコン植物において柱頭は、少なくとも１．０、１．２、１．５又は２．０ｍｍ突出している。
【００３０】
本発明のｓｅ機能的不稔性遺伝子は、本明細書において、栽培種マネーメーカーのＳ．リコペルシクム植物において、植物がＤＮＡ断片についてホモ接合性である場合に、少なくとも１．０、１．２、１．５又は最も好ましくは２．０ｍｍ突出している柱頭によってもたらされた機能的不稔性を与えるＤＮＡ断片上に存在する遺伝子であって、ａ）ＤＮＡ断片が、マーカーＴＧ５３８とＴ３５８との間のＳ．ハブロチャイテスの第４染色体のセグメント内に含まれ、マーカーＴＧ３１８と連鎖し、又はｂ）ＤＮＡ断片がａ）におけるＤＮＡ断片の相補鎖に中程度の若しくは好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする遺伝子と定義される。
【００３１】
本発明のＳ．リコペルシクム植物は、ｓｅ機能的不稔性遺伝子についてヘテロ接合性であってよいが、好ましくは植物はｓｅ機能的不稔性遺伝子についてホモ接合性である。
【００３２】
本発明の好ましいＳ．リコペルシクム植物は、Ｓ．ハブロチャイテスｓｅ遺伝子を、好ましくはＳ．リコペルシクムＩＶＴ系−１において存在する、より好ましくはＳ．ハブロチャイテスＬＹＣ４に由来するＳ．ハブロチャイテスｓｅ遺伝子を含む。
【００３３】
第９の態様において、本発明は、本明細書の上記で定義されるｓｅ機能的不稔性遺伝子を、本明細書の上記で定義されるｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の種々の組合せのいずれかとの組合せで含むＳ．リコペルシクム植物に関する。そのようなＳ．リコペルシクム植物は、ｓｅ機能的不稔性遺伝子についてヘテロ接合性であってよいが、好ましくは植物は、ｓｅ機能的不稔性遺伝子についてホモ接合性である。
【００３４】
他の態様において、本発明は、任意の単為結果及び／又は機能的不稔性の遺伝子を、単為結果及び／又は不稔性について、好ましくは機能的不稔性及び／又は位置的不稔性についての１つ又は複数の追加的遺伝子と組み合わせたＳ．リコペルシクム植物に関する。単為結果又は不稔性についての１つ又は複数の追加的遺伝子は、例えば、ｐａｔ、ｐａｔ−１、ｐａｔ−２、ｐａｔ−３、ｐａｔ−４、ｐａｔ−５、ｐｓ−２、ｓｈａ及びｓｄｓ（これらの遺伝子の出典の記載については米国特許第６，０６０，６４８号及びＥＰ１４２８４２５を参照されたい）からなる群から選択される遺伝子を含む、既に記載されている遺伝子であってもよい。
【００３５】
本明細書の上に記載の本発明の態様のいずれか１つによるＳ．リコペルシクム植物は、以下の商業的トマトの種類：チェリー、カクテル、ミニプラム、プラムカクテル、プラム、ラウンド、ビーフ及び本明細書において記載する多数の特殊な種類のいずれか１つの植物であってもよい。これらの種類のそれぞれについてのトマト品種又は栽培種の適切な例は、
チェリー：クラリー、コンチタ（Ｃｏｎｃｈｉｔａ）、ギセラ（Ｇｉｓｅｌａ）、ファボリタ（Ｆａｖｏｒｉｔａ）、ジョセフィーナ（Ｊｏｓｅｆｉｎａ）、ルピータ（Ｌｕｐｉｔａ）；
カクテル：プロリコ（Ｐｒｏｌｙｃｏ）、リカント、アモロッソ、ＷＳ４１７６、アランカ、カンパリ、シレン（Ｓｈｉｒｅｎ）、パナレア（Ｐａｎａｒｅａ）、ティティ（Ｔｙｔｙ）；
ミニプラム：サンタ、サンタリナ（Ｓａｎｔａｌｉｎａ）、サンテラ（Ｓａｎｔｅｌｌａ）、ＷＳ４１６６、ダッシャー（Ｄａｓｈｅｒ）；
プラムカクテル：ギンコ（Ｇｉｎｋｏ）、バレリーナ（Ｂａｌｅｒｉｎａ）、サンストリーム；
プラム：ロマナ（Ｒｏｍａｎａ）、サバンタス（Ｓａｖａｎｔａｓ）、ＷＳ４１７８、ＷＳ４１７９、レコンクイスタ（Ｒｅｃｏｎｑｕｉｓｔａ）、レコバ（Ｒｅｃｏｖａ）、ヨガ（Ｙｏｇａ）、トローロ（Ｔｏｒｒｏ）、ヤキ（Ｙａｋｉ）；
ラウンド：ドゥリンタ（Ｄｕｒｉｎｔａ）、ハバナ（Ｈａｂａｎａ）、プライサンセ（Ｐｌａｉｓａｎｃｅ）、メカノ、トリシア、グランデラ（Ｇｒａｎｄｅｌｌａ）、ビザール、ブリリアント、アキシオン（Ａｘｘｉｏｎ）、インガー（Ｉｎｇａｒ）、エスペロ（Ｅｓｐｅｒｏ）、セドリコ、エモーション、ダニエラ、アロマタ（Ａｒｏｍａｔａ）、クロチルデ（Ｃｌｏｔｉｌｄｅ）、エバー、クラランス（Ｃｌａｒａｎｃｅ）、レチチア（Ｌｅｔｉｔｉａ）、イクラム、ボルドー、アストナ（Ａｓｔｏｎａ）；
ビーフ：ブラボナ（Ｂｒａｖｏｎａ）、ベネビタ（Ｂｅｎｅｖｉｔａ）、デリカタ（Ｄｅｌｉｋａｔａ）、アドミロ（Ａｄｍｉｒｏ）、プレゴ、グロウデナ（Ｇｒｏｗｄｅｎａ）、ビルロクエ（Ｂｉｒｌｏｑｕｅ）、クエスト、マカレナ、カールソン、ラプソディ、クネロ（Ｃｕｎｅｒｏ）；
特殊：クマト、モモタロウ、エクソタ（Ｅｘｏｔａ）、ロージー、イエローゴールド、オラマ（Ｏｒａｍａ）、カロビタ（Ｃａｒｏｖｉｔａ）、ビンテージ（Ｖｉｎｔａｇｅ）
である。
【００３６】
したがって本明細書において上記で記載する本発明の態様のいずれか１つによる好ましいＳ．リコペルシクム植物は、クラリー、コンチタ、ギセラ、ファボリタ、ジョセフィーナ、ルピータ、プロリコ、リカント、アモロッソ、ＷＳ４１７６、アランカ、カンパリ、シレン、パナレア、ティティ、サンタ、サンタリナ、サンテラ、ＷＳ４１６６、ダッシャー、ギンコ、バレリーナ、サンストリーム、ロマナ、サバンタス、ＷＳ４１７８、ＷＳ４１７９、レコンクイスタ、レコバ、ヨガ、トローロ、ヤキ、ドゥリンタ、ハバナ、プライサンセ、メカノ、トリシア、グランデラ、ビザール、ブリリアント、アキシオン、インガー、エスペロ、セドリコ、エモーション、ダニエラ、アロマタ、クロチルデ、エバー、クラランス、レチチア、イクラム、ボルドー、アストナ、ブラボナ、ベネビタ、デリカタ、アドミロ、プレゴ、グロウデナ、ビルロクエ、クエスト、マカレナ、カールソン、ラプソディ、クネロ、クマト、モモタロウ、エクソタ、ロージー、イエローゴールド、オラマ、カロビタ及びビンテージからなる群から選択される栽培種の植物である。
【００３７】
本発明のＳ．リコペルシクム植物は、本明細書においてソラヌム・リコペルシクム複合体の植物であると理解される。ソラヌム・リコペルシクム複合体は、栽培されたトマト、Ｓ．リコペルシクムに加えて、Ｓ．ケミエレウスキー、Ｓ．ハブロチャイテス、Ｓ．ピンピネルリフォリウム、Ｓ．ネオリキー及びＳ．ペンネリーなどの種々の野生のトマトを含み、それら全てがＳ．リコペルシクムとのハイブリダイゼーションについて非常に優れている。ソラヌム・リコペルシクム複合体のトマト植物及びトマト果実は、互いに容易に交雑する。
【００３８】
本発明の好ましいＳ．リコペルシクム植物は、ｐａｔ−６及びｐａｔ−７遺伝子の対並びにｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の対の少なくとも１つを含む植物であって、好ましくは植物は、対の２つの遺伝子の内の少なくとも１つについてホモ接合性であり、より好ましくは植物は、対の両方の遺伝子についてホモ接合性である。そのような植物は、無核トマト、好ましくは本明細書の下記に定義する実質的に無核なトマトを産生できる。本発明の植物は、好ましくは、広範な環境条件下で少なくとも４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５、９７、９８、９９、９９．９又は１００％の単為結果率で（実質的に）無核なトマトを産生する。本明細書においてこの広範な環境条件は、植物トマトが栽培され、且つ結実すると周知である環境条件を含むと理解される。そのような条件は、日中の平均温度範囲８〜４０℃、好ましくは１２〜３５℃、夜間の温度範囲−２〜３０℃、好ましくは０〜２８℃、２４時間あたりの明期範囲４〜２０時間、好ましくは６〜１８時間、及び平均湿度範囲１０〜１００％、好ましくは２０〜９５％を含む。本発明の植物は、好ましくはオランダで４月から７月に本明細書において上記に定義した管理された条件下で温室内栽培される場合に、前述の単為結果率で無核トマトを少なくとも産生する。
【００３９】
さらに本発明の単為結果性表現型の植物は、植物トマトの育種、栽培及び／若しくは生育のため、並びに／又はそのような植物によって産生されるトマトのために望ましい多数のあらかじめ決定された特性の１つ又は複数をさらに含んでもよい。これらの特質は、具体的に限定されず、当業者に明らかであるとおり、例えば早期の果実の生長、生育の増大、生産量の増大、植物又は果実の任意の形態（ラウンド、シリンドリカル、ペア若しくはチェリーを含む）、果実の大きさ及び／又は品質、それらの均一性、ウイルス又は他の病気に対する抵抗性の増大、寒耐性の増大、長期保存などを含む。
【００４０】
他の態様において、本発明は、本明細書の上記で定義の任意のＳ．リコペルシクム植物由来で、且つ／又は本明細書に記載の方法（単数又は複数）における使用に適する種子又は苗（任意選択で容器内の）などのトマトについての栽培材料に関する。本発明の単為結果性及び／又は機能的不稔性の植物のいくつかについて、本質的に生物学的な過程によって種子を得ることは不可能又は非効率的である場合があり、ヒトの介入が受粉及び／又は受精のために必要である。このヒトの介入は、一般的に、父及び母の選択に応じて同じ又は第２の親からそれぞれ得た花粉での第１の親植物の花の前胚を受精させることを含む。機器又は好ましくは手によって、実際には花粉管を切断する又は切り取ることによって花粉管を開いて花粉を用意することが必要である場合がある。これら及び他の状況について花粉は花粉管から、好ましくは再び手によって例えば解体することによって除かれ、次にそのように得られた花粉は、母植物（の前胚）を受精させるために、母植物の花／雌しべに、再び好ましくは手によって、軽く触れる、又は散らすなどの他の適切な方法によって塗られる。手による受粉は、ハイブリッドトマトを得るために一般的に使用されている技術であり、本発明の目的のためにそれに、花粉管の切開及びかき取ることだけを加えなければならない。
【００４１】
さらなる態様において、本発明は、本明細書において上記に定義したＳ．リコペルシクム植物由来の果実に関する。好ましくは果実は無核果、すなわち無核トマトである。本明細書において使用する用語「無核トマト」は、いかなる受精し成熟した種子も含有しないトマトを指す。本発明のトマトは、いかなる受精し成熟した種子も含有しないが、トマトは、小さな白色の未受精の子房を含有してもよい。これらの未受精の子房は真の種子とはみなされない。本発明の無核トマトは、実質的に無核である。本明細書において使用する用語「実質的に無核」は、トマトが少なくとも９０％無核であることを意味する。好ましくは本発明の無核トマトは、約９５％から約９９％無核であり、最も好ましくは本発明のトマトは、約１００％無核である。
【００４２】
さらなる態様において、本発明は、本明細書において上記に定義した植物及びトマトを産生するための方法に関する。
【００４３】
したがって、第１のそのような態様において、本発明は、本明細書の上記で定義のｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性であるＳ．リコペルシクム植物を産生するための方法に関する。その方法は、好ましくは、ａ）第１のＳ．リコペルシクム植物をｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の少なくとも１つを含むソラヌム・リコペルシクム複合体の第２の植物と交雑するステップと、ｂ）Ｆ１世代及びさらなる世代を、反復親である第１のＳ．リコペルシクム植物と少なくとも２世代にわたって戻し交雑するステップと、ｃ）ｂ）で得られた最も遠い戻し交雑世代を少なくとも２世代にわたって自殖するステップとを含む。好ましくは、その方法において、ステップｂ）及びｃ）の少なくとも１つにおいて少なくとも１つの分子マーカーを使用して、ｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の少なくとも１つについてホモ接合性であるＳ．リコペルシクム植物を選択する。
【００４４】
第２のそのような態様において、本発明は、本明細書において上記に定義した無核トマトを産生するＳ．リコペルシクム植物を産生するための方法に関する。その方法は、好ましくは、ａ）第１のＳ．リコペルシクム植物をｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８及びｐａｔ−９遺伝子の少なくとも１つを含むソラヌム・リコペルシクム複合体の第２の植物と交雑するステップと、ｂ）Ｆ１世代及びさらなる世代を、反復親である第１のＳ．リコペルシクム植物と少なくとも２世代にわたって戻し交雑するステップと、ｃ）ｂ）で得られた最も遠い戻し交雑世代を少なくとも２世代にわたって自殖するステップとを含む。好ましくは、その方法において、ステップｂ）及びｃ）の少なくとも１つにおいて少なくとも１つの分子マーカーを使用して、本明細書において上記に定義したＳ．リコペルシクム植物を選択する。本明細書における無核トマトを産生するＳ．リコペルシクム植物は、無核トマトを産生でき、好ましくは本明細書において上記に定義した環境条件下で無核トマトを産生する植物を意味すると理解される。
【００４５】
本明細書における「分子マーカー」は、例えば本明細書で定義するｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の対立遺伝子である、特定の対立遺伝子の存在又は欠如について（直接又は間接的に）示唆的である核酸配列又はその一組を指すと理解される。分子マーカーの存在又は欠如は、さまざまな分子アッセイ又は検査において検出され得る。分子レベルでの植物の遺伝型の分析、比較及び特徴付けに利用できるこれらの研究室型の技術として、例えば制限断片長多型（ＲＦＬＰ）、ランダム増幅多型ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）、任意プライムポリメラーゼ連鎖反応（ＡＰ−ＰＣＲ）、ＤＮＡ増幅フィンガープリント（ＤＡＦ）、配列特徴付け増幅領域（ＳＣＡＲ）、増幅断片長多型（ＡＦＬＰ）、マイクロサテライトとも称される単純反復配列（ＳＳＲ）及び一塩基多型（ＳＮＰ）が挙げられる。
【００４６】
開発されたアッセイの正確な種類は、それが一方の本明細書で定義するｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の対立遺伝子と、他方の対応するＳ．リコペルシクムの対立遺伝子とを区別できる限りは重要ではない。種々の種類のアッセイの例は、実施例において示される。本発明の方法におけるマーカー支援選択を実施するために、対象の植物トマト又は植物の一部を、例えば最初にＤＮＡ抽出に供する、その技術は当技術分野において周知である（Ｈｎｅｔｋｏｖｓｋｙら、Ｃｒｏｐ  Ｓｃｉ．，３６（２）：３９３〜４００（１９９６）を参照されたい）。抽出が完了すると、切断増幅多型配列（ＣＡＰＳ）アッセイ（Ａｋｏｐｙａｎｚら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２０：６２２１〜６２２５（１９９２）及びＫｏｎｉｅｃｚｎｙ＆Ａｕｓｕｂｅｌ，Ｔｈｅ  Ｐｌａｎｔ  Ｊｏｕｒｎａｌ，４：４０３〜４１０（１９９３）を参照されたい）、又はＳＣＡＲアッセイを非限定的に含む分子アッセイが実施され得る。ＳＣＡＲアッセイは、ＰＣＲによる遺伝子座（例えば本発明のｐａｔ−６、ｐａｔ−７、ｐａｔ−８、ｐａｔ−９及びｓｅ遺伝子の内の１つの近くの特定の遺伝子座）でのＤＮＡの増幅に続く制限酵素での消化を含む。核酸配列間の多型は、例えば異なる大きさの制限断片が生じることによって異なる対立遺伝子間を区別する。これらのアッセイにおいて使用される核酸プライマー及び酵素の例は、本明細書の実施例において示される。
【００４７】
したがって、本発明の好ましい方法において分子マーカーは、ａ）マーカーＴＧ１８２とＴ０６３５との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、ｂ）マーカーＴＧ４４１とＴＧ５３８との間のＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、ｃ）マーカーＣＤ６４と連鎖するＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、ｄ）マーカーＴ０６３５とＴＧ２８７との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、ｅ）マーカーＴ０９５８とＣＴ２５８との間のＳ．ハブロチャイテス第４染色体のセグメント、ｆ）マーカーＴＧ１５１９とＡｔ３ｇ２４０１０との間のＳ．ハブロチャイテス第９染色体のセグメント、ｇ）マーカーＴＧ５３８とＴＧ３５８との間のＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、及びｈ）マーカーＴ３１８と連鎖するＳ．ハブロチャイテス第５染色体のセグメント、と連鎖する又はその存在が診断に用いられるマーカーからなる群から選択される。より好ましくは分子マーカーは、マーカーＴＧ１８２、Ｔ０８９１、Ｔ０９５８、Ｔ０６３５、１１４Ｃ１５−Ｓ、ＴＧ６０９、ＳＳＲ４５０、ＳＳＲ９４、ＣＴ２５８、ＴＧ４４１、ＣＤ６４、ＴＧ５３８、Ａｔ３ｇ２４０１０、Ｔ０１５６、ＳＳＲ５９９、Ａｔ５ｇ０６３６０、Ｔ１０６５、ＣＴ２２０、ＴＧ３５８及びＴ３１８からなる群から選択される。
【００４８】
さらなる態様において、本発明は、無核トマトを形成できるＳ．リコペルシクム植物のマーカー支援育種のための、上記で定義の分子マーカーの使用に関する。
【００４９】
さらなる態様において、本発明は、無核トマトを産生するための方法に関する。その方法は、好ましくは本明細書の上記で定義する植物又は本明細書において上記で定義する方法によって得られた若しくは得られる植物を無核トマトの産生を促す条件下で栽培するステップと、任意選択でトマトを収穫するステップとを含む。無核トマトの産生を促す条件も本明細書の上記で定義されている。本発明の植物で産生される無核トマトは、収穫され、市販され及び／又はそれ自体が又は任意選択で分類、洗浄若しくは梱包などの１つ又は複数のさらなる加工工程の後に消費され得る。
【００５０】
本発明による無核トマトはまた、最終的な使用のために容易である又は適する形態であってもそうでなくてもよいトマト生産物、具体的には食品のために本来周知である方法においてさらに加工され得る。これに関して、本発明によるトマトは、それらが生産工程において種子／種を除くためのさらなるステップを経ずに直接加工され得る有利点を有する。
【００５１】
したがってさらなる態様において、本発明は、本発明による無核トマトから得られた生産物、具体的には食品、及びトマトが種子を除くための分離ステップを経ずにこれらの生産物に加工される前記食品を得るための方法に関する。したがってそのような方法は、別の方法でトマトを裏ごしするステップ、又はつぶすステップをとりわけ含むことができ、任意選択でさらなる望ましい成分を混ぜるステップ又は加えるステップ及びそのように得られた種子若しくはその残渣を含まないトマト生産物を保存、輸送若しくは販売に適する容器に梱包するステップが続き、その際前記方法は、トマトをつぶすステップと生産物を梱包するステップの間に任意の種／種子を除くためのステップを含まない。
【００５２】
そのような最終的な使用について、本発明の無核トマトの他の有利点は、それらが同時期に収穫された無核果ではないトマトと比較して果肉の高含量（乾燥重量として表される）、すなわちトマトの総重量に基づいて１、２、５、１０、２５若しくは３５％又はそれより多く（すなわち、収穫時の総重量約１１０から１２０グラムで、平均で、無核果ではないトマトについての約４．５から５．５グラムの乾燥物と比較して無核トマトについての約５．５から６．５グラムの乾燥物）を有することである。乾燥物の収量に関して、これは少なくとも約２０％の増大（さらに無核果ではないトマトの乾燥物はいまだ種を含んでいる）を意味する。
【００５３】
本文書及びその請求項において、動詞「含む」及びその活用形は、非限定的意味で、その語に続く項目が含まれることを意味するために使用されるが、具体的に述べられていない項目は排除されない。加えて、不定冠詞「１つ（ａ）」又は「１つ（ａｎ）」によって参照される要素は、文脈が要素が１つ及び要素の内のただ１つがあることを明確に必要としない限り１つより多い要素が存在する可能性を排除しない。したがって不定冠詞「１つ（ａ）」又は「１つ（ａｎ）」は、通常「少なくとも１つ」を意味する。
【図面の簡単な説明】
【００５４】
【図１】ＢＣ５Ｓ１集団５−１（ｎ＝７４）において最初の５房に結実した無核果の平均百分率の度数分布を示すグラフである。
【図２（Ａ）】集団５−１（ＢＣ５Ｓ１）で開発したＩＬ５−１の第４染色体及び第５染色体ＳＨ浸透性交雑の遺伝連鎖群を示す図である。単為結果ＱＴＬ（ｐａｔ−６及びｐａｔ−７）の位置は、連鎖地図の左に赤で示される。ｐａｔ−６は、ＢＣ５Ｓ１集団に位置付けられ、ｐａｔ−７はＢＣ５Ｓ２集団に位置付けられた。花柱突出遺伝子座（ｓｅ）の位置は、黒で示される。ＱＴＬバーは、距離を示し、内側の濃いバーは１ＬＯＤ支持信頼区間を示し、外側の薄いバーは２ＬＯＤ支持信頼区間を示す。
【図２（Ｂ）】第４染色体の短腕及びセントロメア領域、第５染色体全長並びに第９染色体の長腕のテロメア領域についてのＳＧＮ参照地図を示す図である（ｈｔｔｐ：／／ｓｇｎ．ｃｏｒｎｅｌｌ．ｅｄｕ）。同定されたＱＴＬの推定位置は、それぞれの色コードによって表される。ｐａｔ−６及びｐａｔ−７の１ＬＯＤ信頼区間が重複していることから、この重複は、波線の黒線で示される。
【図２（Ｃ）】Ｆ２集団で開発されたＩＶＴ−系１の第４染色体及び第９染色体ＳＨ浸透性交雑の遺伝連鎖群を示す図である。単為結果ＱＴＬ（ｐａｔ−８及びｐａｔ−９）の位置は、茶色で示される。地図での位置は、ｃＭで示される。写真は、測定された特質の表現型外観を表す。地図及びＱＴＬ配列比較は、ＭａｐＣｈａｒｔで実施された。
【図３】左：ＢＣ５Ｓ２後代の第４染色体の短腕についての遺伝型図である。色コード：黒はホモ接合性ＳＨを、白はホモ接合性ＳＬを、灰色は最も近い２つの隣接マーカーの間での組換えの正確な位置が不明であることから不明を示す。バーの下の数字は、上で述べたマーカーの位置をｃＭで示す。各後代の参照番号は、遺伝型図の最左に示され、後代あたりの植物数は、最右に示される。右：春／夏（白）及び冬（黒）における特定の後代あたりの最初の５房についての平均単為結果率を標準誤差のバーと共に示すグラフである。
【図４】ＩＶＴ−系１のＦ２集団（ｎ＝１６０）における最初の５房に結実した無核果の平均百分率の度数分布を示すグラフである。
【図５】Ｆ２集団（ｎ＝１３７）におけるｐａｔ−８とｐａｔ−９との間の相互作用を示すグラフである。各カラムは、春（２００６）に記録された対立遺伝子の組合せあたりの平均ｐａｔ率を意味する。バーによる色の違いは、群の間の有意差（Ｐ＜０．０５）に関する。
【図６】ＢＩＬ４：５、ＢＩＬ５、ＢＣ５Ｓ１集団（４：５）及びＢＣ５Ｓ１集団（５）の開発のための、Ｓ．ハブロチャイテスＬＹＣ４（ＳＨ）とＳ．リコペルシクム栽培種マネーメーカー（ＳＬ）との間の種間の交雑から得られた戻し交雑計画を示す図である。
【実施例】
【００５５】
１．  材料と方法
１．１  植物材料
ソラヌム・ハブロチャイテスＬＹＣ４における単為結果遺伝子の位置付けのために本発明者らは、Ｆｉｎｋｅｒｓら（２００７ｂ）の浸透性交雑系（ＩＬ）開発計画の一部であるＢＣ５Ｓ１集団２個を独自に使用した（図６を参照されたい）。これらのＩＬはソラヌム・ハブロチャイテスＬＹＣ４（本明細書以下でＳＨと称する）の染色体断片（単数又は複数）をソラヌム・リコペルシクム栽培種マネーメーカーの遺伝的バックグラウンド（本明細書以下でＳＬと称する）に含有する。ＢＣ５Ｓ１集団２個は、以前ＩＬ５−１及びＩＬ５−２の選択のために使用されており（Ｆｉｎｋｅｒｓら、２００７ｂ）、本明細書以下で集団５−１及び５−２と記される。第４染色体の短腕及び第５染色体の全長について分離される集団５−１は、植物１７４個からなった。第５染色体の長腕について分離される集団５−２は、植物１８３個からなった。植物は、オランダで管理された条件下で温室内栽培された。次いで関連する一連のＢＣ５Ｓ２組換え植物が選択され、さらに研究された。
【００５６】
ＩＶＴ−系１における単為結果遺伝子の位置付けのために、本発明者らは、ＩＶＴ−系１（単為結果性）とソラヌム・リコペルシクム栽培種マネーメーカー（単為結果性ではない）との単交雑由来のＦ２集団を使用した。Ｆ２集団は、植物１６０個から構成され、オランダで管理された条件下で温室内栽培された。Ｓ．リコペルシクムＩＶＴ−系１の種子は、２００７年１０月１９日にブダペスト条約の下で、ＮＣＩＭＢ，Ａｂｅｒｄｅｅｎ，ＵＫ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｉｍｂ．ｃｏｍ）に寄託され、アクセション番号ＮＣＩＭＢ４１５０９に帰属された。
【００５７】
１．２  花の形態
新鮮な花をＢＣ５Ｓ１植物の第３房で開花前に採取し、分析した。葯長及び花柱長を接眼レンズのレチクルを使用して最も近い０．１ｍｍまで測定した。
【００５８】
１．３  単為結果の特徴付け
単為結果を促進するために受粉を最少にするために、植物は揺らさなかった。単為結果のレベルを分類するために、植物の最初の５房を果実の大きさ、房１つあたりの果実数、房１個あたりの花の数及び種子の存在について分析した。果実の大きさは、接眼レンズのレチクルを使用して最も近い１ｍｍまで測定した。果実は成熟期で採点した。単為結果特質を房１つあたりの花の総数からの無核果の百分率として定量的に算出した。次いで本発明者らは、最初の５房における植物１つあたりに結実した無核果の平均百分率を算出した。
【００５９】
１．４  ＤＮＡ抽出
２種類のＤＮＡ単離技術を使用した。ほとんどの実験については、Ｓｔｅｗａｒｄ及びＶｉａ（１９９３）によって記載された迅速ＣＴＡＢ  ＤＮＡ単離法を、１．２ｍｌ  ＣＯＳＴＡＲクラスターチューブ（Ｃｏｒｎｉｎｇ  Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄ）を使用する９６ウェル形式用に調整して使用することによって、２枚の若いトマトの葉から総ＤＮＡを単離した。葉試料は、Ｒｅｔｓｃｈを使用して粉砕した。
【００６０】
関連するＢＣ５Ｓ２後代の選択のためにＤＮＡ単離を迅速なアルカリ（ＮａＯＨ）に基づく抽出方法（Ｗａｎｇら、１９９３）によって実施した。この方法は、Ｇｏｒｇｕｅｔら（２００６）によって記載のとおり９６ウェル形式にスケールアップされた。
【００６１】
１．５  分子マーカー分析
ＰＣＲに基づくマーカーを使用して遺伝子型を決定した。ＣＡＰＳ並びにＳＣＡＲマーカー、ＴＧ４４１、ＣＤ６４、ＣＤ３１、ＴＡＣＬ２、ＴＧ５３８、ＴＧ３１８及びＴＧ３５８のプライマー及び酵素は、Ｃｏａｋｅｒ＆Ｆｒａｎｃｉｓ（２００４）及びＢｒｏｕｗｅｒ＆Ｓｔ．Ｃｌａｉｒ（２００４）によって記載されている。他のＣＡＰＳ及びＳＣＡＲマーカーは、Ｔａｎｋｓｌｅｙら（１９９２）又はＦｕｌｔｏｎら（２００２）によって以前位置付けられたＲＦＬＰ及びＣＯＳマーカー配列に基づいて作製した。ＲＦＬＰ及びＣＯＳマーカーの配列は、「ＳＯＬ  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ  Ｎｅｔｗｏｒｋ」で利用可能である（Ｍｕｅｌｌｅｒら  ２００５；ｈｔｔｐ：／／ｓｇｎ．ｃｏｒｎｅｌｌ．ｅｄｕ）。ＲＦＬＰ及びＣＯＳマーカーのＣＡＰＳ及びＳＣＡＲマーカーへの変換は、Ｇｏｒｇｕｅｔら（２００６）に記載のとおり実施した。表１を参照されたい。各ＰＣＲ反応物（２５μｌ）は、脱塩水中に１０〜２０ｎｇのゲノムＤＮＡ、１×ＰＣＲ反応緩衝液、０．４μＭの順方向及び逆方向それぞれのプライマー、０．２ｍＭ  ｄＮＴＰ並びに０．５単位Ｔａｑポリメラーゼを含有した。ＰＣＲ条件は、９４℃での５’ホットスタートに続く３９周期の９４℃で３０’’、アニーリング温度（表１）で３０’’、７２℃で３０’’及び７２℃で７’での最終伸長であった。約３μｌのＰＣＲ産物を総量１５μｌで少なくとも３時間１〜２単位の制限酵素で消化した。消化後、ＤＮＡ断片を２〜３％アガロースゲルで分離した。マイクロサテライトマーカーに対する逆方向プライマーをＩＲＤ７００又はＩＲＤ８００で標識した。ＰＣＲ反応物（１０μｌ）をＣＡＰＳマーカーについて記載したのと同じ比率で、０．１μＭだけの順方向及び標識逆方向プライマーで調製した。ＰＣＲ条件は、９４℃での３’ホットスタートに続く３０周期の９４℃で４５’’、５３℃で４５’’、７２℃で１’及び７２℃で３’での最終伸長であった。ＰＣＲ後にＬＩ−ＣＯＲローディングダイ１０μｌを加え、ＩＲＤ７００標識断片をＬＩ−ＣＯＲ  ４２００  ＤＮＡ配列決定装置で、本質的にＭｙｂｕｒｇ及びＲｅｍｉｎｇｔｏｎ（２０００）によって公表された方法に従って分析した。ＡＦＬＰマーカーはＧｏｒｇｕｅｔら（２００６）によって記載されたように決定した。
【００６２】
１．６  データ分析及び位置付け
記録した特質の分布を正規化するために、無核果の果実の百分率をロジットスケールに変換した、ｌｏｇｉｔ（ｐ）＝ｌｏｇ（ｐ／（１００−ｐ））、（ｐは、植物１本あたりでの最初の５房での無核果の百分率）。
【００６３】
遺伝連鎖地図を、Ｋｏｓａｍｂｉ位置付け機能を適用してＪｏｉｎＭａｐ３．０（Ｖａｎ  Ｏｏｉｊｅｎ及びＶｏｏｒｒｉｐｓ  ２００１）で構築した。ＱＴＬ位置付けを、ＭａｐＱＴＬ５の距離の位置付け及び多重ＱＴＬ位置付け手順（Ｖａｎ  Ｏｏｉｊｅｎ  ２００４）を使用して実施した。奇数のロガリズム（ＬＯＤ）閾値３．０を設定した（Ｖａｎ  Ｏｏｉｊｅｎ  １９９９）。２ＬＯＤ支持区間を推定ＱＴＬについての信頼区間として使用した。
【００６４】
ＱＴＬ分析についてのモデルを本明細書以下に示す。
【００６５】
ＢＣ５Ｓ２集団において、個体の表現型Ｙについて使用した線型モデルは：
Ｙｉ（ｊ）＝μ＋Ｘｉ（ｊ）αｊ＋ｅｉ  ［１］
式中、μは集団平均であり、Ｘｉ（ｊ）は個体ｉ（ｊ）についての主遺伝子座でのＳＨ対立遺伝子数であり、αｊは主遺伝子の１つの対立遺伝子の効果である。この効果は、ｊ、微働遺伝子の遺伝型状態に応じて異なる。微働遺伝子がホモ接合性ＳＬである場合ｊ＝１（ｉ＝１．．．６１）、微働遺伝子がヘテロ接合性である場合ｊ＝２（ｉ＝１．．．２１）及び微働遺伝子がホモ接合性ＳＨである場合ｊ＝３（ｉ＝１．．．２４）。ｅｉは残差である。
【００６６】
２つの単為結果遺伝子の位置付けに使用するＦ２集団において、個体の表現型Ｙについて使用したモデルは２つの遺伝子座の階乗の組合せである：
Ｙ＝μ＋Ｘ１Ｘ２＋ｅ  ［２］
式中、μは集団平均であり、Ｘ１Ｘ２は２つの単為結果遺伝子の組合せの効果であり、ｅは残差である。
【００６７】
２．  結果
２．１．１  Ｓ．ハブロチャイテスＬＹＣ４における単為結果遺伝子の位置付け
単為結果性の果実の生長を、Ｆｉｎｋｅｒｓら（２００７ｂ）によって開発された浸透性交雑系ＩＬ５−１において観察した。ＩＬ５−１は、第４染色体の短腕上にＳＨ浸透性交雑及びＳＨ由来の第５染色体の全長を保有する。加えてＩＬ５−１の花は、自家受粉の変化を部分的に抑制する、開花前からの突出した花柱を示した。本発明者らは、ＩＬ５−１での単為結果は、単為結果遺伝子（単数又は複数）と位置的不稔性との組合せによると仮定した。ＩＬは、最初に受粉を促進するために振られることから、単為結果性の果実の生長は、不稔性の特定の形態の存在でのみ明らかであった。ＳＨの第５染色体の長腕だけを保有するＩＬ５−２は、単為結果性ではないが、花柱の突出を示した。結論は、花柱突出を招く遺伝子は第５染色体に位置することであった。
【００６８】
この材料において観察された単為結果及び位置的不稔性の遺伝子の位置付け及び特徴付けのために、本発明者らは２つのＩＬの浸透性交雑領域の遺伝連鎖地図を、２つのＢＣ５Ｓ１集団（それぞれＩＬ５−１及びＩＬ５−２のＳＨ浸透性交雑について分離する集団５−１及び集団５−２）を用いることによって作成した。両集団を、ホモ接合性又はヘテロ接合性ＳＨ浸透性交雑を第５染色体に有する植物を選択するためにＳＣＡＲマーカーＴＧ３１８で幼若期に選別した。最終的な集団５−１及び集団５−２は、それぞれ７４及び６６個の植物からなった。ＴＧ３１８を第５染色体でのその中央位置により、集団を選別するために選択した。したがって第５染色体のＴＧ３１８遺伝子座でホモ接合性ＳＬである植物を除くことにより、本発明者らは、現在ある単為結果性の果実の生長を促進するために機能的不稔を有する植物についての集団を濃縮した。次いで単為結果を集団５−１において、位置的不稔性を集団５−１及び５−２において評価した。
【００６９】
２．１．２  遺伝連鎖地図の構築
ＳＨ浸透性交雑の領域での連鎖地図の開発における最初のステップは、浸透性交雑の境界のマーカーを同定することであった。本発明者らは、浸透性交雑の予測領域内に１組のＲＦＬＰ−及びＣＯＳ−由来のＰＣＲプライマーの組合せを開発し、遺伝子座がその中であるか外であるかを決定した。ＩＬ５−１の第４染色体での浸透性交雑の境界を、ＥＸＰＥＮ２０００連鎖地図上でそれぞれ５５ｃＭ及び５６ｃＭであるマーカーＴ０６３５とＴＧ６０９の間に決定した。第５染色体については、ＩＬ５−２において浸透性交雑の境界を、ＥＸＰＥＮ１９９２連鎖地図上でそれぞれ２７ｃＭ及び３９ｃＭであるマーカーＣＤ６４とＣＤ３１の間に決定した。ＩＬ５−１は、第５染色体全体に及ぶ可能性が高い（Ｆｉｎｋｅｒｓら、２００７ｂ）。
【００７０】
ＩＬ５−１のＳＨ第４染色体浸透性交雑の遺伝連鎖地図を集団５−１（ｎ＝７４）を使用して作成した。ＥＸＰＥＮ２０００地図において第４染色体の短腕に位置する１３個のＲＦＬＰ又はＣＯＳマーカーを、ＣＡＰＳ又はＳＣＡＲマーカーに転換し、集団５−１に位置付けた。２つのマイクロサテライトマーカー、ＳＳＲ４３及びＳＳＲ７２（ｈｔｔｐ：／／ｓｇｎ．ｃｏｒｎｅｌｌ．ｅｄｕ；Ｍｕｅｌｌｅｒら、２００５）を加えた。第４染色体における浸透性交雑は、テロメアからＣＡＰＳマーカーＴ０６３５までへの第４染色体の短腕のほぼ全体である、２２．４ｃＭに及んだ（図２）。
【００７１】
ＳＨ第５染色体の遺伝連鎖地図を集団５−１及び５−２を使用して構築した。合計で９個のＣＡＰＳ又はＳＣＡＲマーカーを利用可能な情報（Ｃｏａｋｅｒ及びＦｒａｎｃｉｓ  ２００４；Ｂｒｏｕｗｅｒ及びＳｔ．Ｃｌａｉｒ  ２００４）のいずれかに基づいて、又はＲＦＬＰ配列（Ｔａｎｋｓｌｅｙら、１９９２）に基づいて開発した。ＩＬ５−２のＳＨ浸透性交雑は、テロメア末端からＣＡＰＳマーカーＣＤ３１までへの第５染色体の長腕における２６．２ｃＭに及んだ。第５染色体の短腕上のＩＬ５−１のＳＨ浸透性交雑の境界（ＴＧ４１１に対して遠位）は、決定されておらず、したがって浸透性交雑は少なくとも５７．４ｃＭに及んだ（図２）。
【００７２】
第４及び第５染色体上のマーカーの順序は、「ＳＯＬ  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ  Ｎｅｔｗｏｒｋ」（ｈｔｔｐ：／／ｓｇｎ．ｃｏｒｎｅｌｌ．ｅｄｕ）のＴｏｍａｔｏ−ＥＸＰＥＮ２０００地図及びＥＸＰＥＮ１９９２地図に従った。全体として、第４及び第５染色体浸透性交雑の地図距離をＥＸＰＥＮ２０００参照地図と比較して５８％及び第５染色体浸透性交雑（ＴＧ４４１−ＣＴ１３８）において高密度ＲＦＬＰトマト地図（Ｔａｎｋｓｌｅｙら、１９９２）と比較して３１％減った。
【００７３】
２．１．３  単為結果の選別及び分離
単為結果を最初の５房における無核果のこれらの房における花の総数に対する百分率として定量的に特徴付けた。（図１）。単為結果レベルの分布は、０から９０．５％の範囲であり、単為結果性の果実の平均の大きさ（４．７３ｃｍ）は、有核果の大きさ（４．７５ｃｍ）と有意には異ならなかった（ｐ＞０．０５）。
【００７４】
２．１．４  単為結果遺伝子座の位置付け
単為結果率の正規性を改善するために、この百分率をロジットスケールに変換し、この最後のパラメーターをＱＴＬ位置付け手順に使用した。距離の位置付けを応用することによって、単為結果についての１つのＱＴＬ（ｐａｔ−６と称する）を第４染色体上（図２）、セントロメアの近傍にＣＡＰＳマーカーＴ０９５８／Ｔ０８９１／Ｔ０６３５での最高ＬＯＤ値を有して（表２）同定した。このＱＴＬは、合計変動の４８．９％を説明するものであった。ＭＱＭ位置付け手順において補助因子として３つのピークマーカーの内の１つを使用することによっても、他のＱＴＬは検出されなかった。
【００７５】
２．１．５  ＢＣ５Ｓ２における単為結果遺伝子の確認
第４染色体上のｐａｔ−６の位置を確認及び範囲を限定するため並びにｐａｔ−６と第５染色体上の遺伝子との潜在的相互作用を研究するために、本発明者らは、小さなホモ接合性ＳＨ浸透性交雑を第４染色体の短腕上に有する１組の組換え後代を開発した。この１組の後代を開発するために、第４染色体浸透性交雑についての組換え体、植物ＢＣ５Ｓ２を分子マーカーを使用して実生期で選別した。ホモ接合性組換え植物を選択し、９個のクラスに分けた（図３）。第５染色体上の潜在的な単為結果遺伝子は、ＢＣ５Ｓ１集団においては、ほとんどの植物がホモ接合性ＳＨ又は第５染色体についてヘテロ接合性であったことから同定できなかった。第５染色体について無作為に分離する組換え後代の評価は、本発明者らが第５染色体上の潜在的単為結果遺伝子を探すことを可能にした。選択した植物の遺伝子型を同定し、２００６年４月から７月（本明細書以下において春／夏と称する）に単為結果のレベルについて評価した。切断後、組換え後代を栽培し、且つ２００６／２００７冬に再評価した。各組換え後代における単為結果のレベルを図３に示す。ＳＨ染色体セグメントＴＧ１８２−Ｔ０６３５を保有する組換え後代だけが、単為結果性の果実を産生した。これは、単為結果遺伝子ｐａｔ−６の位置を集団５．１において３．７ｃＭまで限定した。単為結果性レベルは、冬においてよりも春／夏において有意に（ｐ＜０．０５）高かった。しかし、より著しくは、単為結果のレベルは、１つの後代から別の後代へと大きく変動し、これは、その染色体上に第２の単為結果遺伝子を有する可能性を排除してそのＳＨ断片の大きさに依存しなかった。したがって本発明者らは、後代１から５においてｐａｔ−６と第５染色体との潜在的相互作用を調査した。この相互作用を研究するために本発明者らは、Ｍｕｌｔｉｐｌｅ−ＱＴＬモデル（ＭＱＭ）位置付け機能を適用し、マーカーＴ０６３５（ｐａｔ−６に対するピークマーカーの１つ）を補助因子として使用した。第５染色体のマーカーＣＤ６４と連鎖したＱＴＬは単為結果特質の発現に顕著な効果を示した（図２）。このＱＴＬを本明細書以下においてｐａｔ−７と称し、それは両方の季節で検出された。
【００７６】
ｐａｔ−６とｐａｔ−７との効果及び相互作用を研究するために（表３）、本発明者らは、観察された変動を説明するための最良の線型モデルを探索した。ｐａｔ−６遺伝子は、この相互作用において明らかに主遺伝子であるが、その効果の大きさはｐａｔ−７遺伝子座の対立遺伝子に依存する。より高いレベルの単為結果が、ｐａｔ−６の２つのＳＨ対立遺伝子が少なくとも１つのｐａｔ−７のＳＨ対立遺伝子との組合せで存在する場合に観察される。春／夏にこれらの植物において観察された単為結果率は、ｐａｔ−７の１個のＳＨ対立遺伝子を有するものが平均で４１％、２個のＳＨ対立遺伝子を有するものが４６％である。ｐａｔ−６がホモ接合性ＳＬである場合、ｐａｔ−７遺伝子単独では全く単為結果を示さない。これら２つの観察に関して、モデル［１］を春／夏に６４．８％、冬に５７．９％の相関係数を有する、最も良く適合する線型モデルとして見出した。このモデルの詳細を表４に示す。
【００７７】
２．１．６  機能的不稔性の特徴付け及び位置付け
突出した柱頭によってもたらされる機能的不稔性を集団５−１及び５−２において第３房で開花前の葯及び花柱の長さを測定することによって評価した。突出した柱頭の大きさは、花柱の長さから葯の長さを減算することによって算出した。ＳＨ花は、突出した柱頭を有するが、ＳＬ花の柱頭は、開花前では葯錐体の中にある。距離の位置付けは、柱頭突出（ｓｅ）について１つの主なＱＴＬをマーカーＴＧ３１８と連鎖した第５染色体上に示した（図２）。マーカーＴＧ３１８でＳＨ浸透性交雑についてホモ接合性である植物は、そのマーカーでヘテロ接合性又はホモ接合性なＳＬ植物よりも顕著により突出した柱頭を有する花を産生した（ＬＯＤ１９．２；表５）。
【００７８】
集団５−２において種子の存在又は欠如を決定することによって不稔性も定量的に特徴付けた。特徴付けた５房について種なし果実を有する植物を少なくとも１つの有核果を産生する植物と区別した。集団５−１は、この集団が有核果の結実に影響する単為結果についても分離されていることから、この目的のためには使用しなかった。この特質を第５染色体上のＣＡＰＳマーカーＴＧ３１８で、したがって柱頭突出についてのＱＴＬで同時分離した。
【００７９】
２．２．１  ＩＶＴ−系１
ＩＶＴ−系１は、ソラヌム・ハブロチャイテス（アクセション不明）とＳＬとの間の種間交雑に続く数世代の戻し交雑後の少なくとも１回の自家受粉から１９８０年代初期に開発された（Ｚｉｊｌｓｔｒａ  １９８５）。ＩＶＴ−系１に存在する単為結果遺伝子（単数又は複数）の位置付けのための最初のステップにおいて、本発明者らは、ＳＨ浸透性交雑の位置を同定する必要があった。本発明者らは、ＩＶＴ−系１上の多数の既知のＳ．ハブロチャイテスＡＦＬＰマーカーを選別した。７個のＳＨ浸透性交雑が、第４、５、６、９及び１１染色体上に明確に同定できた。既知のＳ．ハブロチャイテスＡＦＬＰマーカーが存在した浸透性交雑体だけが回収される可能性があり、したがって本発明者らは、他の小さなＳＨ浸透性交雑体の存在の可能性を排除できない。
【００８０】
ＩＶＴ−系１とＳＬとの交雑に由来する植物１６０個から構成されるＦ２集団を栽培し、植物の単為結果レベルをオランダ、Ｗａｇｅｎｉｎｇｅｎで２００６年の春に、既に記載したものと同じ手順で評価した。Ｆ２集団における単為結果率は、４４％の植物がいかなる単為結果性の果実も有さずに０から９７％で変動した（図４）。同じ房での有核果及び無核果は、大きさにおいてそれぞれ平均４．３６ｃｍ及び４．１１ｃｍで有意に異なった（Ｐ＜０．０５）。
【００８１】
ｐａｔ−６が既に位置付けられている第４染色体のセントロメアの近くのＳＨ浸透性交雑の存在から、本発明者らは、ＩＶＴ−系１での単為結果もｐａｔ−６又は任意のその対立遺伝子バリアントの管理下にあるであろうと仮定した。マーカーＴ０６３５がＩＶＴ−系１のＳＨ浸透性交雑にあることを確認後、本発明者らは、マーカーＴ０６３５（ｐａｔ−６についてのピークマーカー）とＦ２集団において観察された単為結果の分離との関連を検査した。この関連は、高度に有意であった。
【００８２】
関連は有意であったが、Ｔ０６３５についてホモ接合性ＳＨである全ての植物が単為結果性の果実を産生するのではないことは明らかであった、これは他の遺伝子座の作用様式によるものであり得る。この、他の遺伝子座の場所を見出すために本発明者らは、Ｔ０６３５遺伝子座でホモ接合性ＳＨのＦ２植物の１組においてＡＦＬＰプライマーの組合せを選別した。ＡＦＬＰマーカーの１つ、Ｐ１８Ｍ５１−２１９は、単為結果に明確に関連しており、第９染色体浸透性交雑に位置付けられることが知られていた。したがってＩＶＴ−系１での単為結果は、１つは第４染色体のセントロメアの近くに、もう１つは第９染色体の長腕のテロメアの近くに位置付けられる少なくとも２つの遺伝子の管理下にある。
【００８３】
これらの２つの単為結果遺伝子座をより正確に位置付けるために、本発明者らは、第４及び第９染色体上の浸透性交雑についての連鎖地図を開発した（図２）。第４染色体の浸透性交雑の境界は、マーカーＴ０６３５とＴ０９５８との間及びＣＴ２５８とＴＧ２８７の間にあった。第９染色体については、浸透性交雑の上流境界はマーカーＴ１５１９とＡｔ３ｇ２４０１０の間に位置付けられ第９染色体の長碗の残り部分にわたった可能性が高い。２つの連鎖群は、８個のＣＡＰＳマーカーを使用して作成され、ＲＦＬＰ又はＣＯＳ配列及び３つのＳＳＲマーカーから変換された（ＳＧＮデータベース；Ｍｕｅｌｌｅｒら、２００５）。第４染色体でのマーカーの順序は、ＳＧＮ参照地図においてと同一であった。第９染色体の浸透性交雑において、マーカーの順序の少数の逆転が観察された。第４染色体の浸透性交雑は、１．７ｃＭに及び（ＳＧＮ参照地図では７ｃＭ）、第９染色体の浸透性交雑は３．８ｃＭ（参照地図においては１７ｃＭ）であった。これらは、組換えの約７５％の抑制を意味する。
【００８４】
単為結果遺伝子をＭａｐＱＴＬを使用して位置付けた、本発明者らは、分布の正規化を改善するために単為結果率のロジットスケールを使用した。第４及び第９染色体上の２つの浸透性交雑の遺伝子の大きさが小さいことから、両方の全領域が非常に重要であり、２つの単為結果遺伝子の位置の範囲を限定できなかった。これらの２つの単為結果遺伝子は、第４染色体及び第９染色体上に位置する遺伝子について、本明細書以下においてそれぞれｐａｔ−８及びｐａｔ−９と記す。ｐａｔ−８及びｐａｔ−９が位置付けられる遺伝領域の範囲を限定することが不可能であったことから、本発明者らは、以下の分析において計算の正確性を改善するために一方又は両方の浸透性交雑についての組換え植物、及び多義性スコアリングを有する植物を排除した。合計１６０個のＦ２植物から１３７個は２つの浸透性交雑のいずれについても組換えではなかった。ＡＮＯＶＡは、両方の遺伝子座が単為結果に非常に顕著な効果を有し、両遺伝子座の間の相互作用も非常に重要であることを示した。したがって本発明者らは、モデル［２］をＦ２集団において観察された変動を説明するための最良の適応モデルとして選択した（Ｒ２＝７３．７％）。モデル［２］に基づいて観察され、予測されたｐａｔ−８とｐａｔ−９との間の異なる対立遺伝子の組合せ効果を図５及び表６に示す。ｐａｔ−８又はｐａｔ−９遺伝子座のいずれかにおけるＳＨ対立遺伝子の欠如は、無核果性ではない果実を生じる。単為結果の最高レベルは、両遺伝子がホモ接合性ＳＨである場合に得られる（単為結果性の果実の結実７６％）。
表１  ＣＡＰＳ及びＳＣＡＲマーカーのためのプライマー配列及びＰＣＲ反応パラメーター
【表１】
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ａ未消化のＰＣＲ産物の大きさ
ｂＰＣＲアニーリング温度
ｃ染色体番号
ｄ参考文献：Ｔａｎｋｓｌｅｙら、（１９９２）、Ｆｕｌｔｏｎら、（２００２）
ｅＳ．ハブロチャイテス及びＳ．リコペルシクムそれぞれのＰＣＲ産物長
表２  集団５−１における距離の位置付けによって検出された、表現型平均、ピークＬＯＤ値、明らかになった変動の百分率、及びｐａｔ−６に対する「ロジットＰａｔ」の遺伝的作用
【表２】
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１ロジット数は平均ｐａｔ率に戻し変換される。
表３  ＢＣ５Ｓ２において春／夏及び冬にｐａｔ−６及びｐａｔ−７の各単為結果対立遺伝子の組合せについて観察された単為結果率
【表３】
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１ｓｐｒ／ｓｕｍ：春／夏
２ＳＥ：標準誤差
３ｎ：遺伝子型カテゴリーあたりの個体数
表４  モデル［１］の有意性及びパラメーターの推定値
【表４】
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表５  ＢＣ５Ｓ１集団５−１及び５−２における距離の位置付けによって検出された、表現型平均、ピークＬＯＤ値、明らかになった変動の百分率、及び「柱頭突出」の遺伝的作用
【表５】
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１ｎ：遺伝子型カテゴリーあたりの個体数
表６  Ｆ２集団（ｎ＝１３７）においてｐａｔ−８及びｐａｔ−９の各単為結果対立遺伝子の組合せについて観察された単為結果率
【表６】
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１：回帰モデルから予測された効果、百分率に戻し変換
２：対立遺伝子の各組合せについて観察された平均
【００８５】
（参考文献）
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【図２】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図１】
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【図３】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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