(57)【要約】  本発明は、遺伝子多型の分析を用いて喫煙者及び非喫煙者における急性冠不全症候群（ＡＣＳ）の発症リスクを評価するための方法を提供する。本発明は同様に、患者がＡＣＳを発症するリスクを評価する上での遺伝子多型の使用にも関する。かかる評価に適したヌクレオチドプローブ及びプライマー、キット及びマイクロアレイも同様に提供されている。
2010525788.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象のＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
から成る群から選択された１又は複数の多型；
あるいは前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
の有無について前記対象由来の試料を分析する段階を含む方法であって、
ここで、１又は複数の前記多型の有無が該対象のＡＣＳ発症リスクの指標となる、方法。
【請求項２】
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＣＣ又はＣＴ遺伝子型；
−  ＩＦＮＧをコードする遺伝子内の８７４Ａ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ−４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ−１０をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＳＯＤ３をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／ＧＣＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＧ又はＧＧ遺伝子型；又は
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＴＴ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在が、ＡＣＳ発症リスクの減少の指標となる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
−  ＣＭＡ１をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１２をコードする遺伝子内の−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＭＩＰ１Ａをコードする遺伝子内の＋４５９Ｃ／Ｔイントロン１ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＡ遺伝子型；
−  ＣＸ３ＣＲ１をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＴＴ遺伝子型；
−  ＮＯＤ２をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／ＣＣＣ又はＣＧ遺伝子型；又は、
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在が、ＡＣＳ発症リスクの増大の指標となる、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；又は
−  前記１又は複数の多型と連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型、
から成る群から選択された１又は複数のさらなる多型の有無について前記試料を分析する段階を含んで成る、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＬＴＡをコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／ＣＣＣ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＣＣ又はＣＴ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＡＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＦＮＧをコードする遺伝子内の８７４Ａ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＮＦＫＢＩＬ１をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／ＡＡＡ遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＲＡをコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）Ｉｎｓ／Ｄｅｌ又はＤｅｌ／Ｄｅｌ遺伝子型；
−  ＩＬ−４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＧＣＬＭをコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ−１０をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＩＣＡＭＩをコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＢＡＴ１をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＮＯＳ３をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／ＴＧＧ遺伝子型；
−  ＳＯＤ３をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／ＧＣＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  ＰＡＩ−１をコードする遺伝子内の−６６８  ４Ｇ／５Ｇ５Ｇ５Ｇ遺伝子型；
−  ＭＭＰ７をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＧ又はＧＧ遺伝子型；又は
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＴＴ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在がＡＣＳ発症リスクの減少の指標となる、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
−  ＣＭＡ１をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＴＧＦＢ１をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１２をコードする遺伝子内の−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＴＴ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＲＡをコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）ＩｎｓＩｎｓ（ＡＡＣＴＴＡＡＣＴＴ）遺伝子型；
−  ＩＬ４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）ＤｅｌＤｅｌ（１Ｇ１Ｇ）遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＡをコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＧＣＬＭをコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＯＲ１３Ｇ１をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  α１−ＡＴをコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）ＡＴ又はＴＴ（ＭＳ又はＳＳ）遺伝子型；
−  ＭＩＰ１Ａをコードする遺伝子内の＋４５９Ｃ／Ｔイントロン１ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＡ遺伝子型；
−  ＣＸ３ＣＲ１をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＴＴ遺伝子型；
−  ＮＯＤ２をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／ＣＣＣ又はＣＧ遺伝子型；又は、
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在が、ＡＣＳ発症リスクの増大の指標となる、請求項４又は５に記載の方法。
【請求項７】
（ｉ）  ＡＣＳ発症リスクの減少に関連する少なくとも１つの保護性多型の有無を判定する段階；及び
（ｉｉ）  少なくとも１つの保護性多型の不在下で、ＡＣＳ発症リスクの増加に関連する少なくとも１つの感受性多型の有無を判定する段階、
を含んで成る、対象のＡＣＳ発症リスクを評価する方法において、
前記保護性１又は複数の多型の存在が、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示し、少なくとも１つの感受性多型の存在と組合わされた少なくとも１つの保護性多型の不在がＡＣＳ発症リスクの増加を標示している、方法。
【請求項８】
前記少なくとも１つの保護性多型が、
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＬＴＡをコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／ＣＣＣ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＣＣ又はＣＴ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＡＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＦＮＧをコードする遺伝子内の８７４Ａ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＮＦＫＢＩＬ１をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／ＡＡＡ遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＲＡをコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）Ｉｎｓ／Ｄｅｌ又はＤｅｌ／Ｄｅｌ遺伝子型；
−  ＩＬ−４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＧＣＬＭをコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ−１０をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＩＣＡＭＩをコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＢＡＴ１をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＮＯＳ３をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／ＴＧＧ遺伝子型；
−  ＳＯＤ３をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／ＧＣＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  ＰＡＩ−１をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ５Ｇ５Ｇ遺伝子型；
−  ＭＭＰ７をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＧ又はＧＧ遺伝子型；又は
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＴＴ遺伝子型；
から成る群から選択されている、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも1つの感受性多型が、
−  ＣＭＡ１をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＴＧＦＢ１をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１２をコードする遺伝子内の−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＴＴ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＲＡをコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）ＩｎｓＩｎｓ（ＡＡＣＴＴＡＡＣＴＴ）遺伝子型；
−  ＩＬ４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）ＤｅｌＤｅｌ（１Ｇ１Ｇ）遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＡをコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＧＣＬＭをコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＯＲ１３Ｇ１をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  α１−ＡＴをコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）ＡＴ又はＴＴ（ＭＳ又はＳＳ）遺伝子型；
−  ＭＩＰ１Ａをコードする遺伝子内の＋４５９Ｃ／Ｔイントロン１ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＡ遺伝子型；
−  ＣＸ３ＣＲ１をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＴＴ遺伝子型；
−  ＮＯＤ２をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／ＣＣＣ又はＣＧ遺伝子型；又は、
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型；
から成る群から選択された遺伝子型である、請求項７又は８に記載の方法。
【請求項１０】
１又は複数の感受性多型の存在に関係なく、２つ以上の保護性多型の存在がＡＣＳ発症リスクの減少の指標となる、請求項７〜９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
保護性多型の不在下で、１又は複数の感受性多型の存在がＡＣＳ発症リスクの増加を標示している、請求項７〜９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
２つ以上の感受性多型の存在が、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示している請求項７〜９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
対象のＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；又は
−  前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型、
から成る群から選択された2つ以上の多型の存在について前記対象由来の試料を分析する段階を含んで成る方法。
【請求項１４】
前記方法が１又は複数の疫学的リスク因子の分析を含んで成る、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
対象のＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、
（ｉ）  前記対象由来の試料の１又は複数の遺伝子検査の結果を得る段階；及び（ｉｉ）
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
から成る群から選択された１又は複数の多型；
あるいは前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
の有無について該結果を分析する段階を含む方法であって、
前記１又は複数の多型の有無を表す結果が該対象のＡＣＳ発症リスクの指標となる、方法。
【請求項１６】
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＣＣ又はＣＴ遺伝子型；
−  ＩＦＮＧをコードする遺伝子内の８７４Ａ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ−４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ−１０をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＳＯＤ３をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／ＧＣＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＧ又はＧＧ遺伝子型；又は
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＴＴ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在を標示する結果が、ＡＣＳ発症リスクの減少の指標となる、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
−  ＣＭＡ１をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１２をコードする遺伝子内の−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＭＩＰ１Ａをコードする遺伝子内の＋４５９Ｃ／Ｔイントロン１ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＡ遺伝子型；
−  ＣＸ３ＣＲ１をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＴＴ遺伝子型；
−  ＮＯＤ２をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／ＣＣＣ又はＣＧ遺伝子型；又は、
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在を標示する結果が、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示している、請求項１５に記載の方法。
【請求項１８】
分析すべき多型が存在する遺伝子の多型性領域をスパンするか又はスパンするのに使用され得る、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の方法において使用するための１又は複数のヌクレオチドプローブ及び／又はプライマー。
【請求項１９】
配列番号１〜配列番号１２４のうちのいずれか１つの配列を含む、請求項１８に記載の１又は複数のヌクレオチドプローブ及び／又はプライマー。
【請求項２０】
請求項１で定義された群から選択された１又は複数の多型をコードする核酸配列に対しハイブリッド形成する能力をもつ核酸配列又はそれに対し相補的な配列を提示する基質を含む核酸マイクロアレイ。
【請求項２１】
対象のＡＣＳを発症するリスクの評価における少なくとも1つの多型の使用において、前記少なくとも１つの多型が、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
あるいは前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
から成る群から選択されている、使用。
【請求項２２】
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；又は
−  前記多型の任意の１又は複数のものと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型、
から成る群から選択された少なくとも1つのさらなる多型の使用と併用される、請求項２１に記載の使用。
【請求項２３】
対象の体内での請求項８に定義された群から選択された保護性多型の存在及び／又は機能的効果を遺伝子型又は表現型的に複製する段階を含んで成る、ＡＣＳ発症リスクが増大した対象の治療方法。
【請求項２４】
発現された遺伝子産物の生理学的に活性な濃度が対象の年令及び性別にとって正常である範囲の外にあるような形で遺伝子の発現をアップレギュレート又はダウンレギュレートする請求項９に定義された群から選択された検出可能な感受性多型を有するＡＣＳ発症リスクが増加した対象を治療する方法において、前記遺伝子発現産物の生理学的に活性な濃度を該対象の年令及び性別にとって正常である範囲内になるよう回復させる段階を含んで成る方法。
【請求項２５】
対象のＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；又は
−  前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型、
から成る群から選択された２つ以上の多型の分析を含んで成る方法。
【請求項２６】
請求項２又は請求項３に定義されている感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現産物に対して結合する能力をもつ抗体を提示する基質を含んで成る、請求項１〜１７又は２５のいずれか１項に記載の方法において使用するための抗体マイクロアレイ。
【請求項２７】
請求項２又は請求項３に定義された群から選択された感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる化合物についてスリーニングするための方法において、
−  遺伝子発現のアップレギュレーション又はダウンレギュレーションと結びつけられているものと判定された感受性多型又は保護性多型を含む細胞と候補化合物を接触させる段階；及び
−  前記候補化合物との接触の後、前記遺伝子の発現を測定する段階、
を含んで成る方法であって、接触段階前に比べた接触段階後の発現レベルの変化が、前記遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる該化合物の能力を標示している、方法。
【請求項２８】
前記細胞が、前記多型の存在を確認するために予めスクリーニングされたヒト血管細胞である、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
前記細胞が、前記多型の存在を確認するために予めスクリーニングされたヒト血管上皮細胞である、請求項２７に記載の方法。
【請求項３０】
前記細胞が、前記遺伝子の発現のアップレギュレーションと結びつけられた感受性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をダウンレギュレートする候補化合物についてのものである、請求項２７〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記細胞が前記遺伝子の発現のダウンレギュレーションと結びつけられた感受性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をアップレギュレートする候補化合物についてのものである、請求項２７〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
前記細胞が前記遺伝子の発現のアップレギュレーションと結びつけられた保護性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をさらにアップレギュレートする候補化合物についてのものである、請求項２７〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３３】
前記細胞が前記遺伝子の発現のダウンレギュレーションと結びつけられた保護性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をさらにダウンレギュレートする候補化合物についてのものである、請求項２７〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３４】
請求項２又は請求項３に定義された群から選択された感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる化合物についてスクリーニングするための方法において、
−  感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされるものの、その細胞内ではその発現がアップレギュレートもダウンレギュレートもされない遺伝子を含む細胞と候補化合物を接触させる段階；及び
−  前記候補化合物との接触の後、前記遺伝子の発現を測定する段階、
を含んで成る方法であって、接触段階前に比べた接触段階後の発現レベルの変化が、前記遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる該化合物の能力を標示している、方法。
【請求項３５】
前記細胞が、前記遺伝子の存在及び発現ベースライン値を確認するために予めスクリーニングされたヒト血管細胞である、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
前記細胞が、前記遺伝子の存在及び発現ベースライン値を確認するために予めスクリーニングされたヒト血管上皮細胞である、請求項３４に記載の方法。
【請求項３７】
感受性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現がダウンレギュレートされ、前記スクリーニングが、前記細胞内で前記遺伝子の発現をアップレギュレートする候補化合物についてのものである、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３８】
感受性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現がアップレギュレートされ、前記スクリーニングが、前記細胞内で前記遺伝子の発現をダウンレギュレートする候補化合物についてのものである、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
保護性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現がアップレギュレートされ、前記スクリーニングが、前記細胞内で前記遺伝子の発現をアップレギュレートする化合物についてのものである、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４０】
保護性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現がダウンレギュレートされ、前記スクリーニングが、前記細胞内で前記遺伝子の発現をダウンレギュレートする化合物についてのものである、請求項３４〜３６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
ＡＳＣに対する素因があるか又はＡＳＣの診断を受けた対象の、予防用又は治療用処置に対する予想される応答性を評価するための方法において、該処理には、遺伝子発現産物の生理学的に活性な濃度を、対象の年令及び性別にとって正常である範囲内となるまで回復させることが関与している方法であって、存在する場合に、発現された遺伝子産物の生理学的に活性な濃度が前記正常な範囲の外になるような形で前記遺伝子の発現をアップレギュレート又はダウンレギュレートする請求項３で定義された群から選択される感受性多型の有無を前記対象の体内で検出する段階を含み、前記多型の存在の検出は、対象が前記処理に応答する確率が高いことを標示している、方法。
【請求項４２】
対象のＡＣＳを発症するリスクを評価するためのキットにおいて、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
から成る群から選択された１又は複数の多型；
あるいは前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
の有無について前記対象由来の試料を分析する手段を含むキット。
【請求項４３】
ＡＣＳ発症リスクが増大し、ＭＭＰ１２をコードする遺伝子のプロモータ内の−８２Ａ／Ｇ多型におけるＧＧ遺伝子型の存在が判定された対象を治療する方法において、前記対象の体内のＭＭＰ１２活性を変調する能力をもつ作用物質を前記対象に投与する段階を含んで成る方法。
【請求項４４】
前記作用物質が、１又は複数のメタロプロテイナーゼ組織阻害因子（ＴＩＭＰ）の発現又は活性を増大させる能力をもつ作用物質である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
メタロプロテイナーゼ組織阻害因子がＴＩＭＰ１、ＴＩＭＰ２、ＴＩＭＰ３又はＴＩＭＰ４から成る群から選択されている、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記作用物質が、１又は複数の膜結合型ＭＭＰの発現又は活性を低減させる能力をもつ作用物質である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
前記作用物質がＭＭＰ阻害物質である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
前記ＭＭＰ阻害物質が、４，５−ジヒドロキシアンタキノン−２−カルボン酸（ＡＱＣＡ）、アントラキニルメルカプトエチアミン、アントラキニル−アラニンヒドロキサマート、又はその誘導体から成る群から選択されている、請求項４７に記載の方法。
【請求項４９】
ＡＣＳ発症リスクが増大し、ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ多型におけるＧＧ遺伝子型の存在が判定された対象を治療する方法において、前記対象の体内のＴＩＭＰ１活性を変調する能力をもつ作用物質を前記対象に投与する段階を含んで成る方法。
【請求項５０】
前記作用物質が、ＴＩＭＰの発現又は活性を増大させる能力をもつ作用物質である、請求項４９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、遺伝子多型及び改変した遺伝子発現の分析を用いた血管機能及び／又は障害の評価のため、特に冠動脈疾患特に急性冠不全症候群（ＡＣＳ）に対する素因及び／又はその重症度を診断するための方法に関する。本発明は同様にＡＣＳ関連型血管機能不全に対する素因及び／又はその重症度を診断するための方法にも関する。
【背景技術】
【０００２】
冠状動脈性心臓病又は動脈硬化性心臓疾患としても知られている冠動脈疾患（ＣＡＤ）は、米国における主な死亡原因である。米国心臓協会によると、米国では２９秒に一人の割合でＣＡＤ関連の事象を患う人がおり、およそ１分に一人の割合でかかる事象で死亡する人がいる。４０才以降に冠状動脈性心臓病を患う生涯リスクは、男性が４９％、女性が３２％である。女性は加齢するにつれて、このリスクはほぼ男性の値にまで増大する。その上、米国におけるＣＡＤの合計年間コストはおよそ１３００億米ドルである。
【０００３】
ＣＡＤの根底にある心臓血管障害は、実際にはかかる障害に罹患する人と同様、２つのグループに分けることができる。これは、該障害の異なる病因を反映するものと考えられている。ここでは「安定型ＣＡＤ」と呼ぶ第１のグループの障害は、本来変性しており、後期発症労作性狭心症を含む。安定型ＣＡＤは標準的に高齢者が罹患し、年令（６５才以上）、高血圧、糖尿病、高コレステロールレベル（特定的には高ＬＤＬコレステロール及び低ＨＤＬコレステロール）、身体的活動又は運動の不足及び肥満と結びつけられる。
【０００４】
ここでは急性冠不全症候群（ＡＣＳ）と呼んでいる第２のグループの障害は、炎症、プラーク不安定化及び／又は喫煙に結びつけられると考えられている。出願人らは、いかなる理論による束縛も望まないが、安定型ＣＡＤに比べ、ＡＣＳに対する感受性及び／又はその重症度においては遺伝的リスク因子がより有意である、と考えている。
【０００５】
その上、出願人らは、同じくいかなる理論による束縛も望まないが、安定型ＣＡＤと結びつけられたバイオマーカーがＡＣＳのリスクに結びつけられるか又はその予測となる確率は低く、逆も同じであると考えている。
【０００６】
特に対象が喫煙者である場合に、対象が急性冠不全症候群（ＡＣＳ）を発症するリスク又はＡＣＳ関連血管機能不全の発症リスクを評価するために使用可能なバイオマーカーがあることが望ましく有利であると思われる。
【０００７】
本発明は主として、かかるバイオマーカー及びかかる障害の発症リスクを評価するための方法におけるそれらの使用に向けられている。
【発明の開示】
【０００８】
本発明は主として、患者が急性冠不全症候群（ＡＣＳ）を発症するリスクと遺伝子型の間の関連性を判定することに向けられている。ここで使用するＡＣＳには、心筋硬塞、不安定型狭心症及び関連急性冠不全症候群が含まれるが、これらに制限されるわけではない。
【０００９】
かくして、１つの態様に従うと、対象のＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
から成る群から選択された１又は複数の多型；
の有無について前記対象由来の試料を分析する段階を含む方法であって、
前記１又は複数の多型の有無が該対象のＡＣＳ発症リスクの指標となる方法が提供されている。
【００１０】
１又は複数の多型は、直接検出することもできるし、或いは又前記１又は複数の多型と連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型の検出によって検出することもできる。
【００１１】
連鎖不平衡状態（ＬＤ）というのは、２つ以上の突然変異又は多型が非常に密な遺伝的近接性をもつため同時継承されることになる遺伝学における１つの現象である。このことはすなわち遺伝子型決定にあたり、存在する通りの１つの多型がもう１つの多型の存在を暗示することを意味している（ＲｅｉｃｈＤＥｅｔａｌ；ヒトゲノム内の連鎖不平衡状態、Ｎａｔｕｒｅ２００１、４１１：１９９−２０４）。
【００１２】
該方法はさらに、
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；又は
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；
から成る群から選択された１又は複数のさらなる多型の存在について前記対象由来の試料を分析する段階を含んで成ることができる。
【００１３】
ここでもまた、１又は複数のさらなる多型の検出は、直接、又は１又は複数のさらなる多型と連鎖不平衡状態にある多型の検出によって実施可能である。
【００１４】
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＬＴＡをコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／ＣＣＣ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＣＣ又はＣＴ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＡＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＦＮＧをコードする遺伝子内の８７４Ａ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＮＦＫＢＩＬ１をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／ＡＡＡ遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＲＡをコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）Ｉｎｓ／Ｄｅｌ又はＤｅｌ／Ｄｅｌ遺伝子型；
−  ＩＬ−４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＧＣＬＭをコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＩＬ−１０をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＩＣＡＭＩをコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＢＡＴ１をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＮＯＳ３をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／ＴＧＧ遺伝子型；
−  ＳＯＤ３をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／ＧＣＧ又はＧＧ遺伝子型；
−  ＰＡＩ−１をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ５Ｇ５Ｇ遺伝子型；
−  ＭＭＰ７をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＧ又はＧＧ遺伝子型；又は
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＴＴ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示し得る。
【００１５】
−  ＣＭＡ１をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＴＧＦＢ１をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１２をコードする遺伝子内の−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＦＧＦ２をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／ＧＧＧ遺伝子型；
−  ＨＳＰ７０をコードする遺伝子内のＨｏｍＴ２４３７ＣＴＴ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＲＡをコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）ＩｎｓＩｎｓ（ＡＡＣＴＴＡＡＣＴＴ）遺伝子型；
−  ＩＬ４をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／ＴＣＣ遺伝子型；
−  ＭＭＰ１をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）ＤｅｌＤｅｌ（１Ｇ１Ｇ）遺伝子型；
−  ＰＤＧＦＡをコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／ＴＴＴ遺伝子型；
−  ＧＣＬＭをコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／ＴＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  ＯＲ１３Ｇ１をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／ＧＡＡ遺伝子型；
−  α１−ＡＴをコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）ＡＴ又はＴＴ（ＭＳ又はＳＳ）遺伝子型；
−  ＭＩＰ１Ａをコードする遺伝子内の＋４５９Ｃ／Ｔイントロン１ＣＴ又はＴＴ遺伝子型；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡＡ遺伝子型；
−  ＣＸ３ＣＲ１をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＴＴ遺伝子型；
−  ＮＯＤ２をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／ＣＣＣ又はＣＧ遺伝子型；又は、
−  ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型；
から成る群から選択された１又は複数の多型の存在は、ＡＣＳ発症リスクの増大を標示し得る。
【００１６】
本発明の方法は、喫煙者（現在の喫煙者と喫煙経験者の両方）において特に有用である。
【００１７】
本発明の方法は、２つのカテゴリーの多型、すなわち（「保護性多型」と呼ぶことのできる）ＡＣＳ発症リスクの減少と結びつけられる多型及び（「感受性多型」と呼ぶことのできる）ＡＣＳ発症リスクの増大と結びつけられる多型を識別するということが認識されるであろう。
【００１８】
従って本発明はさらに、
ＡＣＳ発症リスクの減少に関連する少なくとも１つの保護性多型の有無を判定する段階；及び
少なくとも１つの保護性多型の不在下で、ＡＣＳ発症リスクの増加に関連する少なくとも１つの感受性多型の有無を判定する段階、
を含んで成る、対象のＡＣＳ発症リスクを評価する方法において、
前記保護性１又は複数の多型の存在が、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示し、少なくとも１つの感受性多型の存在と組合わされた少なくとも１つの保護性多型の不在がＡＣＳ発症リスクの増加を標示している方法を提供する。
【００１９】
好ましくは、前記少なくとも１つの保護性多型は、．．．．から成る群から選択される。
【００２０】
該少なくとも１つの感受性多型は、．．．．から成る群から選択される。
【００２１】
本発明の好ましい形態においては、２つ以上の保護性多型の存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少の指標となる。
【００２２】
本発明のさらなる好ましい形態においては、２つ以上の感受性多型の存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示している。
【００２３】
さらに本発明のさらなる好ましい形態においては、１又は複数の感受性多型の存在に関係なく、２つ以上の保護性多型の存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少の指標となる。
【００２４】
も１つの形態において、本発明は、対象がＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、前記対象由来の試料の１又は複数の遺伝子検査の結果を得る段階；及び
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
から成る群から選択された１又は複数の多型；
あるいは前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
の有無について該結果を分析する段階を含む方法であって、
前記１又は複数の多型の有無を表す結果が該対象のＡＣＳ発症リスクの指標となる方法を提供している。
【００２５】
さらなる態様においては、対象のＡＣＳを発症するリスクを判定する方法において、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；又は
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
−  これらの１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型、
から成る群から選択された２つ以上の多型の分析を含んで成る方法が提供されている。
【００２６】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちのいずれか１又は複数のものは、ＩＬ４ＲＡをコードする遺伝子のコドン５７６に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００２７】
前記位置におけるグルタミンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００２８】
前記位置におけるアルギニンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増大を標示する。
【００２９】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちの任意の１又は複数のものは、ＬＴＡをコードする遺伝子のコドン２６に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００３０】
前記位置におけるトレオニンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００３１】
前記位置におけるアスパラギンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増大を標示する。
【００３２】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちのいずれか１又は複数のものは、ＴＬＲ４をコードする遺伝子のコドン２９９に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００３３】
前記位置におけるグリシンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００３４】
前記位置におけるアスパラギン酸の存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示する。
【００３５】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちの任意の１又は複数のものは、ＴＬＲ４をコードする遺伝子のコドン３９９に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００３６】
前記位置におけるイソロイシンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００３７】
前記位置におけるトレオニンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増大を標示する。
【００３８】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちのいずれか１又は複数のものは、ＯＲ１３Ｇ１をコードする遺伝子のコドン１３２に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００３９】
前記位置におけるイソロイシンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示する。
【００４０】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちの任意の１又は複数のものは、α１−ＡＴをコードする遺伝子のコドン２８８に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００４１】
前記位置におけるグルタミン酸塩の存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示する。
【００４２】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちのいずれか１又は複数のものは、ＩＣＡＭ１をコードする遺伝子のコドン４９６に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００４３】
前記位置におけるリジンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００４４】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちの任意の１又は複数のものは、ＮＯＳ３をコードする遺伝子のコドン２９８に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００４５】
前記位置におけるグルタミン酸塩の存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００４６】
前記位置におけるアスパラギン酸塩の存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示する。
【００４７】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちのいずれか１又は複数のものは、ＳＯＤ３をコードする遺伝子のコドン２１３に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００４８】
前記位置におけるグリシンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００４９】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちの任意の１又は複数のものは、カテスピンＧをコードする遺伝子のコドン１２５に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００５０】
前記位置におけるセリンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する。
【００５１】
前記位置におけるアスパラギンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示する。
【００５２】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちのいずれか１又は複数のものは、ＣＸ３ＣＲ１をコードする遺伝子のコドン２４９に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００５３】
前記位置におけるイソロイシンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増大を標示する。
【００５４】
さまざまな実施形態において、上述の方法のうちの任意の１又は複数のものは、ＮＯＤ２をコードする遺伝子のコドン８８１に対しマッピングする位置に存在するアミノ酸を分析する段階を含む。
【００５５】
前記位置におけるアルギニンの存在は、ＡＣＳ発症リスクの増加を標示する。
【００５６】
本発明の好ましい形態においては、本明細書で記述される方法は、ＡＣＳ発症リスクと結びつけられた１又は複数の疫学的リスク因子を含めた１又は複数のリスク因子の分析と併せて実施される。かかる疫学的リスク因子としては、喫煙又はタバコの煙に対する曝露、年令、性別、及びＡＣＳの家族履歴があるが、これらに制限されるわけではない。
【００５７】
さらなる１態様において、本発明は、対象のＡＣＳを発症するリスクの評価における少なくとも1つの多型の使用において、前記少なくとも１つの多型が、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
あるいは前記１又は複数の多型のいずれかと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
から成る群から選択されている使用を提供している。
【００５８】
任意には、前記使用は、
−  形質転換成長因子β１（ＴＧＦＢ１）をコードする遺伝子内の−５０９Ｃ／Ｔ；
−  リンホトキシンα（ＬＴＡ）をコードする遺伝子内のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ；
−  Ｔｏｌｌ様受容体４（ＴＬＲ４）をコードする遺伝子内のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ；
−  ＴＬＲ４をコードする遺伝子内のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ；
−  β細胞阻害物質様１内のカッパーライトポリペプチド遺伝子エンハンサーの核因子（ＮＦＫＢＩＬ−１）をコードする遺伝子内の−６３Ｔ／Ａ；
−  血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）をコードする遺伝子内の−１６３０Ｉｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）をコードする遺伝子内の−１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）；
−  血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）をコードする遺伝子内の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ；
−  グルタマート−システインリガーゼ修飾因子サブユニット（ＧＣＬＭ）をコードする遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ；
−  嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１（ＯＲ１３Ｇ１）をコードする遺伝子内のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ；
−  アルファ１−抗トリプシン（α１−ＡＴ）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）；
−  細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）をコードする遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ；
−  ＨＬＡ−Ｂ関連写し（ＢＡＴ１）をコードする遺伝子内の−２３Ｃ／Ｇ；
−  酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）をコードする遺伝子内のＧｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ；
−  プラスミノーゲン活性化因子阻害剤（ＰＡＩ−１）をコードする遺伝子内の−６６８４Ｇ／５Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ（ＭＭＰ７）をコードする遺伝子内の−１８１Ａ／Ｇ；又は
−  これらの多型の任意の１又は複数のものと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型、
から成る群から選択された少なくとも１つのさらなる多型の使用と併用され得る。
【００５９】
もう１つの態様においては、本発明は、本明細書で記述されている本発明の好ましい方法において使用するためのヌクレオチドプローブ及び／又はプライマーのセットを提供する。好ましくは、該ヌクレオチドプローブ及び／又はプライマーは、遺伝子の多型性領域をスパンするか又はスパンするのに使用され得るものである。同じく提供されているのは、配列番１〜１２４のうちのいずれか１つの配列番号の配列を含む任意のものを内含する。本明細書で記述されているいずれか１つのプローブ及び／又はプライマーの配列を含んで成る１又は複数のヌクレオチドプローブ及び／又はプライマーである。
【００６０】
さらにもう１つの態様においては、本発明は、本発明の方法において使用するための核酸マイクロアレイにおいて、本明細書で記述されている感受性多型又は保護性１又は複数の多型をコードする核酸配列に対しハイブリッド形成する能力をもつ核酸配列又はそれに対し相補的な配列を提供する基質を含むマイクロアレイを提供する。
【００６１】
もう１つの態様では、本発明は、本発明の方法において使用するための抗体マイクロアレイにおいて、本明細書に記述されている通りの感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現産物に対して結合する能力をもつ抗体を提示する基質を含んで成る、マイクロアレイを提供している。
【００６２】
さらなる態様では、本発明は、対象の体内での保護性多型の存在及び／又は機能的効果を遺伝子型又は表現型的に複製する段階を含んで成る、ＡＣＳ発症リスクが増大した対象の治療方法。
【００６３】
さらにもう１つの態様においては、本発明は、発現された遺伝子産物の生理学的に活性な濃度が対象の年令及び性別にとって正常である範囲の外にあるような形で遺伝子の発現をアップレギュレート又はダウンレギュレートする検出可能な感受性多型を有するＡＣＳ発症リスクが増加した対象を治療する方法において、前記遺伝子発現産物の生理学的に活性な濃度を該対象の年令及び性別にとって正常である範囲内になるよう回復させる段階を含んで成る方法を提供している。
【００６４】
さらなる態様においては、本発明は、対象の体内でのその保護性多型の機能的効果を遺伝子型又は表現型的に逆転させる段階を含んで成る、ＡＣＳに対する感受性を予測する多型の存在に起因してＡＣＳ発症リスクが増大した対象を治療する方法。
【００６５】
さらにもう１つの態様において、本発明は、ＡＣＳ発症リスクが増大し、ＭＭＰ１２をコードする遺伝子のプロモータ内の−８２Ａ／Ｇ多型におけるＧＧ遺伝子型の存在が判定された対象を治療する方法において、前記対象の体内のＭＭＰ１２活性を変調する能力をもつ作用物質を前記対象に投与する段階を含んで成る方法を提供する。
【００６６】
１実施形態において、前記作用物質は、１又は複数のメタロプロテイナーゼ組織阻害因子（ＴＩＭＰ）の発現又は活性、好ましくはＴＩＭＰ１、ＴＩＭＰ２、ＴＩＭＰ３又はＴＩＭＰ４のうちの１又は複数の発現又は活性を増大させる能力をもつ作用物質である。さらなる実施形態においては、前記作用物質は、１又は複数の膜結合型ＭＭＰの発現又は活性を低減させる能力をもつ作用物質である。さらにもう１つの実施形態においては、前記作用物質は、ＭＭＰ阻害物質であり、好ましくは前記ＭＭＰ阻害物質は、４，５−ジヒドロキシアンタキノン−２−カルボン酸（ＡＱＣＡ）、アントラキニル−メルカプトエチアミン、アントラキニル−アラニンヒドロキサマート及びそれらの誘導体を含む群から選択される。
【００６７】
さらに、もう１つの態様において、本発明は、ＡＣＳ発症リスクが増大し、ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ多型におけるＣＣ遺伝子型の存在が判定された対象を治療する方法において、前記対象の体内のＴＩＭＰ１活性を変調する能力をもつ作用物質を前記対象に投与する段階を含んで成る方法を提供する。
【００６８】
１実施形態においては、前記作用物質は、ＴＩＭＰの発現又は活性を増大させる能力をもつ作用物質である。
【００６９】
さらに、もう１つの態様では、本発明は、感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点で（この多型と結び付けられていない場合のその遺伝子の発現レベルに比べて）その発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる化合物についてスリーニングするための方法において、
−  遺伝子発現のアップレギュレーション又はダウンレギュレーションと結びつけられているものと判定された感受性多型又は保護性多型を含む細胞と候補化合物を接触させる段階；及び
−  前記候補化合物との接触の後、前記遺伝子の発現を測定する段階、
を含んで成る方法であって、接触段階前に比べた接触段階後の発現レベルの変化が、前記遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる該化合物の能力を標示している方法を提供している。
【００７０】
好ましくは、前記細胞は、前記多型の存在を確認するために予めスクリーニングされヒト血管細胞、より好ましくはヒト血管上皮細胞である。
【００７１】
好ましくは、前記細胞は、前記遺伝子の発現のアップレギュレーションと結びつけられた感受性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をダウンレギュレートする候補化合物についてのものである。
【００７２】
代替的には、前記細胞は、前記遺伝子の発現のダウンレギュレーションと結びつけられた感受性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をアップレギュレートする候補化合物についてのものである。
【００７３】
もう１つの実施形態においては、前記細胞は、前記遺伝子の発現のアップレギュレーションと結びつけられた保護性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をさらにアップレギュレートする候補化合物についてのものである。
【００７４】
代替的には、前記細胞は、前記遺伝子の発現のダウンレギュレーションと結びつけられた保護性多型を含み、前記スクリーニングが前記遺伝子の発現をさらにダウンレギュレートする候補化合物についてのものである。
【００７５】
もう１つの態様では、本発明は、感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる化合物についてスクリーニングするための方法において、
−  感受性多型又は保護性多型と結びつけられた時点でその発現がアップレギュレート又はダウンレギュレートされるものの、その細胞内ではその発現がアップレギュレートもダウンレギュレートもされない遺伝子を含む細胞と候補化合物を接触させる段階；及び
−  前記候補化合物との接触の後、前記遺伝子の発現を測定する段階、
を含んで成る方法であって、接触段階前に比べた接触段階後の発現レベルの変化が、前記遺伝子の発現及び／又は活性を変調させる該化合物の能力を標示している方法を提供している。
【００７６】
好ましくは、遺伝子の発現は、ひとたび前記スクリーニングが、前記細胞内では前記遺伝子の発現をアップレギュレートする候補化合物についてのものとなったならば、感受性多型と結び付けられた時点でダウンレギュレートされる。
【００７７】
好ましくは前記細胞は、前記遺伝子の存在及び発現ベースライン値を確認するために予めスクリーニングされたヒト血管細胞、より好ましくはヒト血管上皮細胞である。
【００７８】
代替的には、感受性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現がアップレギュレートされ、前記スクリーニングは、前記細胞内で前記遺伝子の発現をダウンレギュレートする候補化合物についてのものである。
【００７９】
もう１つの実施形態においては、保護性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現はアップレギュレートされ、前記スクリーニングは、前記細胞内で前記遺伝子の発現をアップレギュレートする化合物についてのものである。
【００８０】
代替的には、保護性多型と結びつけられた時点で遺伝子の発現はダウンレギュレートされ、前記スクリーニングは、前記細胞内で前記遺伝子の発現をダウンレギュレートする化合物についてのものである。
【００８１】
さらにもう１つの態様においては、本発明は、ＡＳＣを発生させるリスクがあるか又はＡＣＳを患う対象の、予防用又は治療用処置に対する予想される応答性を評価するための方法において、該処理には、遺伝子発現産物の生理学的に活性な濃度を、対象の年令及び性別にとって正常である範囲内となるまで回復させることが関与している方法であって、存在する場合に、発現された遺伝子産物の生理学的に活性な濃度が前記正常な範囲の外になるような形で前記遺伝子の発現をアップレギュレート又はダウンレギュレートする感受性多型の有無を前記対象の体内で検出する段階を含み、前記多型の存在の検出は、対象が前記処理に応答する確率が高いことを標示している、方法を提供している。
【００８２】
さらなる１態様においては、本発明は、本明細書で開示されている１又は複数の多型の有無について前記対象由来の試料を分析する手段を含む、対象のＡＣＳを発症するリスクを評価するためのキットを提供する。
【発明を実施するための最良の形態】
【００８３】
患者対照研究を用いて、ＡＣＳを発生させた喫煙者及び供血者対照における候補遺伝子の複数の遺伝子変異体（多型）の頻度が比較された。これらの候補遺伝子の大部分は、遺伝子発現又はタンパク質機能に対する立証済みの（又は確率の高い）機能的効果を有する。特定的には、供血者対照、耐性ある喫煙者及びＡＣＳを患う喫煙者の間の多型の頻度が比較された。
【００８４】
本明細書で記述されている１実施形態においては、２０の感受性遺伝子多型及び２０の保護性遺伝子多型が同定されている。これらは以下の通りである：
【００８５】
【表１】
2010525788.tif 000003
【００８６】
感受性遺伝子多型は、存在する場合にＡＣＳ発症リスクの増加を標示する多型である。これとは対照的に、保護性遺伝子多型は、存在する場合ＡＣＳ発症リスクの減少を標示する多型である。
【００８７】
本明細書で使用されている「ＡＣＳ発症リスク」は、リスクが当てはまる対象が将来ＡＣＳを発症する尤度を意味し、該疾病に対する素因及びその潜在的開始を内含する。従って「ＡＣＳ発症リスクの増加」という語句は、かかるリスク増加を有する対象がＡＣＳを発症する遺伝的性向又は傾向を有することを意味している。これは、かかる人物が現在いつでもＡＣＳを発症することになるということを意味せず、単に、ＡＣＳの増加に結びつけられた多型を有していないか又はＡＣＳリスクの減少と結びつけられる多型を正に有している個体の一般的集団と比べてその人物がより大きなＡＣＳ発症尤度を有することを意味している。ＡＣＳ発症リスクが増大した対象としては、評価時点でその血管機能に関わらない傾向又は好適性といったようなＡＣＳに対する素因をもつ対象、例えば、ＡＣＳに対する遺伝的傾向をもつものの正常な血管機能を有する対象、喫煙を続けた場合にＡＣＳを患うまで進行する確率の高い血管機能の穏やかな低下の傾向をもつ対象を含めた潜在的リスクのある対象、及び評価の時点でＡＣＳと一貫性ある低い血管機能の傾向をもつＡＣＳの開始の潜在性を伴う対象が含まれる。
【００８８】
同様にして、「ＡＣＳ発症リスクの減少」という語句は、かかるリスク減少をもつ対象が、ＡＣＳ発症に対する遺伝的媒性又は傾向減少を有することを意味する。これは、かかる人物がいかなる場合でもＡＣＳを発生することはないということを意味せず、単に、ＡＣＳの増加に結びつけられた１又は複数の多型を有していないか又はＡＣＳの減少と結びつけられる多型を正に有していない個体の一般的集団と比べてその人物がＡＣＳ発症尤度の減少を有することを意味している。
【００８９】
本発明に関しては、「多型」という用語は、ヌクレオチド配列の異なっている又は可変的数の反復ヌクレオチド単位をもつ１染色体座の２つ以上の代替形態（例えば対立遺伝子又は遺伝子マーカー）のランダム突然変異（通常は１％超）に起因するものより高い速度での同じ集団内での同時発生を意味する。
www.ornl.gov/sci/techresources/Human Genome/publicat/97pr/09gloss.html#pを参照のこと。従って、本明細書で使用される「多型」という用語は、ヌクレオチドの単一ヌクレオチド置換、挿入及び欠失、反復的配列（例えばマイクロサテライト）及び遺伝子の完全な又は部分的な欠如（例えばヌル変異）を含めた遺伝的変異を意図している。本明細書で使用する「多型」という用語は同様に、遺伝子型及びハプロタイプも含んでいる。遺伝子型というのは、特定の遺伝子座又は１組の遺伝子座における遺伝的組成のことである。ハプロタイプというのは、組換えにより容易に分離できず、同時に継承される傾向をもち、連鎖不平衡状態にあり得る１つの染色体上に存在する１組の密に連鎖した遺伝子マーカーである。ハプロタイプは、ＳＮＰといったような多型パターンによって同定可能である。同様にして、本発明に関連する「単一ヌクレオチド多型」又は「ＳＮＰ」という用語は、単一塩基ヌクレオチド置換及び短かい欠失及び挿入多型を含んでいる。
【００９０】
対象がＡＣＳを発症するリスクの減少及び増加は、
−  キマーゼ１（ＣＭＡ１）をコードする遺伝子内の−１９０３Ａ／Ｇ；
−  マトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ１２）をコードする遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ；
−  線維芽細胞成長因子（ＦＧＦ２）をコードする遺伝子内のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）；
−  インターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）をコードする遺伝子内のＱ５７６ＲＡ／Ｇ；
−  熱ショックタンパク質７０（ＨＳＰ７０）をコードする遺伝子内のＨＯＭＴ２４３７Ｃ；
−  インターフェロンγ（ＩＦＮＧ）をコードする遺伝子内の８７４Ａ／Ｔ；
−  インターロイキン４（ＩＬ−４）をコードする遺伝子内の−５８９Ｃ／Ｔ；
−  インターロイキン１０（ＩＬ−１０）をコードする遺伝子内の−１０８４Ａ／Ｇ（−１０８２）；
−  スーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ；
−  マクロファージ炎症性タンパク質１アルファ（ＭＩＰ１Ａ）をコードする遺伝子内の４５９Ｃ／ＴイントロンＩ；
−  カテプシンＧをコードする遺伝子内のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ；
−  ケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）をコードする遺伝子内のＩ２４９ＶＣ／Ｔ；
−  カスパーゼ（ＮＯＤ２）をコードする遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ；又は
−  メタロプロテイナーゼ１の組織阻害因子（ＴＩＭＰ１）をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／Ｃ；
から成る群から選択された１又は複数の多型；
又は以上の群のいずれか１又は複数のものと連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型；
の存在について前記対象由来の試料を分析することによって診断可能である。
【００９１】
これらの多型は、２つ以上の組合せの形でか、又は以上で列挙した残りの多型を含めた、対象のＡＣＳ発症リスクを標示するその他の多型との組合せの形で、分析することもできる。
【００９２】
高い処理量に適したもの例えばマイクロアレイを利用するものを含む多型の組合せが関与する検定が好ましい。
【００９３】
特にこれらの多型の組合せ効果の統計的分析は、本発明の遺伝子検定を用いて任意の対象（喫煙者を含む）のリスク比率を決定すること、そして特にＡＣＳ発症リスクがさらに大きい対象を識別することが可能であるということを示している。このような組合せ型分析は、感受性多型のみ、保護性多型のみの組合せ又はそれら両方の組合せの組合せであり得る。分析は、同じく段階的であり得、保護性多型の有無の分析がまず行なわれ、次に、保護性多型が存在する場合にのみ、感受性多型分析が進行する。
【００９４】
かくして、喫煙者及び非喫煙者を含む明確な対象グループ内のこれらの多型の頻度を系統的に分析することにより、ＡＣＳの発生に或る種の遺伝子及びタンパク質を関与させ、ＡＣＳ関連の血管機能不全及びＡＣＳの発症リスクが増加した対象を識別する能力を改善することが可能である。
【００９５】
当該結果は、ＡＣＳを発症する少数の対象が１又は複数の感受性多型を有し、本明細書で定義されている保護性多型をほとんど又は全く有していないために、ＡＣＳを発生させているということを示している。１又は複数の感受性多型の存在は、喫煙がもつ損傷をひき起こす刺激性及び酸化性効果を合わせて、組合さってこの対象グループをきわめてＡＣＳ発症に対し感受性の高いものにすると考えられている。家族履歴、年令、体重、喫煙歴などといった付加的なリスク因子も又、対象のリスクプロファイルに対し影響を及ぼし、本明細書で記述されている遺伝分析と組合せてこれらを評価することができる。
【００９６】
該１又は複数の多型は、直接的に、或いはこれらの１又は複数の多型と連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型の検出によって検出可能である。前述した通り、連鎖不平衡は、２つ以上の突然変異又は多型が非常に密な遺伝的近接性にあるために同時継承されるような遺伝学における１つの現象である。このことはすなわち、遺伝子型決定において、１つの多型が存在するものとして検出された場合、それはもう一方の多型の存在を暗示するということを意味している。（ＲｅｉｃｈＤＥら；ヒトゲノムにおける連鎖不平衡、Ｎａｔｕｒｅ２００１、４１１：１９９〜２０４）。
【００９７】
連鎖不平衡状態にあるものとして報告された本明細書に記述された多型の例が本明細書で提示されており、これには、実施例２及び表３３にて本明細書で示されている通り、ＭＭＰ１２−８２Ａ／Ｇ及びＭＭＰ１〜１６０７１Ｇ／２Ｇ（Ｄｅｌ／Ｇ）多型、ＬＴＡＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ及びＮＦＫＢＩＬ１−６３Ｔ／Ａ多型及びＴＬＲ４Ａｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ及びＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ多型が含まれている。
【００９８】
ＡＣＳ発症リスクの増加又は減少と結びつけられた１又は複数のその他の多型と連鎖不平衡状態にある多型が同様にＡＣＳ発症リスクについてのバイオマーカーとしての有用性を提供するということが明白になるだろう。本明細書に提示されたデータは、連鎖不平衡状態にあるＳＮＰについての頻度がきわめて類似していることを示している。従って、組合せ型多型分析において、もとのＳＮＰから計算されたものに匹敵するリスクレベルを導出するために、これらの遺伝的に連鎖されたＳＮＰを利用することができる。ＬＤ状態のＳＮＰが互いに置換されているこのような分析の一例が、ここで実施例２の中で提示されている。
【００９９】
従って、本明細書で規定されている多型と連鎖不平衡状態にある１又は複数の多型を、例えば公開データベースを用いて同定できるということが明らかになるだろう。本明細書で規定されている多型と連鎖不平衡状態にあるものとして報告されたかかる多型の例は、ここで表３５中に提示されている。
【０１００】
同様に、任意の所与の多型についてさまざまな学名が存在し得ることが多いということも明らかであろう。例えば本明細書でＳＯＤ３をコードする遺伝子内のＡｒｇ２１３Ｇｌｙとして言及している多型は、Ａｒｇ３１２Ｇｌｎ、＋７６０Ｇ／Ｃ及びＡｒｇ２３１Ｇｌｙ（ｒｓ１７９９８９５）などさまざまな形で呼ばれていたと考えられている。本明細書で記述するように、感受性多型又は保護性多型について言及する場合、かかる代替的学名も同じく本発明により意図されている。
【０１０１】
本発明の方法は、主として、ＡＣＳに結びつけられた上述の多型の検出及び同定に向けられている。これらの多型は、標準的には単一ヌクレオチド多型である。一般的用語では、単一ヌクレオチド多型（ＳＮＰ）というのは、個体間の遺伝的変異を結果としてもたらす単一塩基変化又は点突然変異である。ＳＮＰは、ほぼ１００塩基〜３００塩基に一回、ヒトゲノム内で発生し、コーディング又は非コーディング領域内で発生し得る。遺伝コードの冗長性に起因して、コーディング領域内のＳＮＰは、タンパク質産物のアミノ酸配列を変化させるか又はさせない可能性がある。例えば、非コーディング領域内のＳＮＰは、例えばプロモータ、転写因子結合部位、プロセシング部位、リポソーム結合部位といった制御領域を修飾することによって遺伝子発現を改変させ、遺伝子転写、プロセシング及び翻訳に影響を及ぼすことができる。
【０１０２】
ＳＮＰは、大規模関連遺伝子研究を容易にすることができ、最近ＳＮＰの発見及び検出に多大な関心が寄せられてきている。ＳＮＰは、例えば不利な薬物反応に対する感受性を含めた薬物応答性、健康性向、疾病の性向及び重症度といったような一定数の表現型形質（潜在形質を含む）についてのマーカーとして多大な将来性を示している。特定のＳＮＰと１表現型形質の関連性についての知識は、個体が前記特定のＳＮＰを有するか否かの知識と併用されて、診断的、予防的及び治療適応用のターゲッティンを可能にしてより良い疾病管理を可能にし、疾病状態の理解を高め、究極的には個別の治療計画といったようなさらに有効な治療の発見を促がすことができる。
【０１０３】
実際、既知のＳＮＰの、そしてかかるＳＮＰの一部については１ＳＮＰと結びつけられた生物学的効果の数多くのデータベースが構築されてきた。例えば、ＮＣＢＩＳＮＰデータベース「ｄｂＳＮＰ」は、ＮＣＢＩのＥｎｔｒｅｇシステム内に内蔵されており、ＰｕｂＭｅｄ及びＧｅｎＢａｎｋといったような他のＥｎｔｒｅｚデータベースと同じアプローチを用いてその問い合わせを行なうことができる。このデータベースは、ヒトゲノム配列上にマッピングされた１５０万超のＳＮＰについての記録を有する。各ｄｂＳＮＰエントリは、多型の配列関係（すなわち周辺配列）、多型の発生頻度（集団毎又は個体毎）、及び変異を検定するのに用いられる実験方法（単複）、プロトコル及び条件を含み、特定の表現型形質とＳＮＰを結びつける情報を内含し得る。
【０１０４】
少なくとも一部には保健及び健康に対する潜在的影響を理由として、ＳＮＰを高い信頼性で急速に同定する方法を開発するために多大な努力がこれまでに払われてきており、かつ払われ続けている。少なくとも一部には３×１０9個の塩基対の一倍体ゲノムをもつヒトゲノムＤＮＡの複雑性、及び付随する感度及び弁別必要条件を理由として、これは決してささいな仕事ではない。
【０１０５】
当該技術分野において周知のＳＮＰを検出するための遺伝子型決定アプローチには、ＤＮＡ配列決定、プライマー又はプロープの対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーションを必要とする方法、多型の近くで又は多型に隣接して結合されたプライマーに対するヌクレオチドの対立遺伝子特異性取込み（「単一塩基拡張」又は「ミニ配列決定」と呼ばれることが多い）、オリゴヌクレオチドの対立遺伝子特異性ライゲーション（接合）（ライゲーション連鎖反応又はライゲーションパドロックプローブ）、制限酵素（制限フラグメント長多型分析又はＲＦＬＰ又は化学的又はその他の作用物質）によるＰＣＲ産物又はオリゴヌクレオチドの対立遺伝子特異性分割、侵襲的構造特異的酵素を含めた構造特異的酵素による電気泳動又はクロマトグラフィ移動度の対立遺伝子依存性差異の分解又は質量分析法が含まれる。ＳＮＰがコーディング領域内にあり、アミノ酸変化を結果としてもたらす場合、アミノ酸変異の分析も同様に可能である。
【０１０６】
ＤＮＡ配列決定は、ＳＮＰの直接的決定及び同定を可能にする。特異性及び精度における利点よりも、全ゲノムさらには又ターゲティングされたサブゲノムの配列決定における固有のむずかしさの方が、スクリーニングの目的では一般に重要視される。
【０１０７】
ミニ配列決定には、調査中の試験試料上でＳＮＰ部位に隣接するＤＮＡ配列に対しプライマーがハイブリッド形成できるようにすることが関与している。プライマーは、４つの示差的にラグ付けされた螢光ジデオキシヌクレオチド（Ａ、Ｃ、Ｇ、又はＴ）の全て及びＤＮＡポリメラーゼを用いて１ヌクレオチドだけ拡張される。４つのヌクレオチドのうちの１つだけ（ホモ接合性の場合）又はそのうちの１つ（ヘテロ接合性の場合）が取込まれる。取込まれる塩基は、ＳＮＰ位置でヌクレオチドと相補的である。
【０１０８】
ＳＮＰ検出に現在使用されている多くの方法には、部位特異的及び／又は対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーションが関与する。これらの方法は、問題のＳＮＰを含有する標的配列に対するオリゴヌクレオチドの差別的結合に大幅に依存している。Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ（ＳａｎｔａＣｌａｒａ、Ｃａｌｉｆ）及びＮａｇｏｇｅｎＩｎｃ（ＳａｎＤｉｅｇｏ、Ｃａｌｉｆ）の技術が特に周知であり、単一塩基不整合を含むＤＮＡ２重鎖が、完全に塩基対合された２重鎖に比べはるかに安定性が低いという事実を利用している。整合した２重鎖の存在は、螢光により検出される。
【０１０９】
部位特異的ハイブリダイゼーションによりＳＮＰを検出するか又は同定するための方法の大部分は、感度及び特異性を増大させるためにＰＣＲといったような方法による標的増幅を必要とする（例えば米国特許第５，６７９，５２４号、ＰＣＴ国際公開第９８／５９０６６号（ＷＯ９８／５９０６６）、ＰＣＴ国際公開第９５／１２６０７号（ＷＯ９５／１２６０７）を参照のこと）。（本明細書にその全体が内含されている）米国特許出願第２００５００５９０３０号は、標的配列について選択的に富化するための予備増幅又は複雑性低減無く、かつ何らかの酵素反応の補助無く、全ヒトＤＮＡ内の単一ヌクレオチド多型を検出するための方法について記述している。該方法は、２つのハイブリダイゼーション事象すなわち捕捉プローブに対する標的配列の第１の部分のハイブリダイゼーション及び検出プローブに対する前記標的配列の第２の部分のハイブリダイゼーションが関与する単一段階ハイブリダイゼーションを利用している。両方のハイブリダイゼーション事象共、同じ反応内で起こり、ハイブリダイゼーションが起こる順序は重要ではない。
【０１１０】
米国特許出願第２００５００４２６０８号（本明細書にその全体が内含されている）は、Ｔｈｏｒｐら（米国特許第５，８７１，９７８号）の核酸ハイブリダイゼーションの電気化学的検出方法の修正について記述している。簡単に言うと、その各々が異なるＳＮＰ塩基及び該ＳＮＰ塩基の各々の側にあるプローブ塩基配列を有している捕捉プローブが設計されている。プローブ塩基は、ＳＮＰ部位に隣接する対応する標的配列に対し相補的である。各々の捕捉プローブは、基材の導電性作業面上に非導電性外部層を有する異なる電極上に固定化されている。各々の捕捉プローブと核酸標的の間のハイブリダイゼーションの範囲は、遷移金属錯体を用いて各電極における酸化−還元反応を検出することにより検出される。異なる電極におけるこれらの酸化速度差が、選択された核酸標的が選択されたＳＮＰ部位に単一ヌクレオチド多型を有するか否かを決定するために使用される。
【０１１１】
ＭＥＧＡＴＹＰＥTM技術を用いたＬｙｎｘＴｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ（Ｈａｙｗａｒｄ、Ｃａｌｉｆ）の技術は、小さい又は大きいゲノミック材料プールから同時に非常に大きな数のＳＮＰを遺伝子型決定することができる。この技術は、螢光標識されたプローブを使用して、２つの集団の収集ゲノムを比較して、予めＳＮＰのマッピング又は知識を必要とすることなく、２つの集団を区別するＳＮＰをスパンするＤＮＡフラグメントの検出及び回収を可能にする。
【０１１２】
ＳＮＰを検出し同定するためのその他の方法が数多く存在する。これらには、例えばＳＮＰに対しハイブリッド形成するプローブを測定するための質量分析法の使用が含まれる。この技術は、その実施可能速度において、質量コードタグを用いて一日あたり数個の試料から一日あたり４００００個のＳＮＰという高処理量まで変動する。好ましい例は、例えばＣＯＸ２遺伝子又は相補的配列のプロモータを内含する本発明の多型を含む核酸配列の質量分析法による決定を使用することにある。このような質量分析法は、当業者にとって既知であり、本発明の遺伝子型決定方法は、例えば本発明のＣＯＸ２プロモータ多型といった本発明の多型の質量分析法による検出のための適合に適している。
【０１１３】
ＳＮＰは、同様に、ライゲーション−ビット分析によっても分析可能である。この分析には、プライマー間の１ヌクレオチド空隙で標的にハイブリッド形成する２つのプライマーが必要である。４つのヌクレオチドの各々は、ＤＮＡポリメラーゼ、リガーゼ、標的ＤＮＡ及びプライマーを含有する別の反応混合物に付加される。ポリメラーゼは、ＳＮＰに相補的である第１のプライマーの３’末端に１つのヌクレオチドを添加し、次にリガーゼは２つの隣接するプライマーを合わせてライゲートする。試料の加熱時点で、ライゲーションが起こった場合、その時さらに大きいプライマーがハイブリッド形成された状態にとどまることになり、例えば螢光といったシグナルが検出され得る。これらの方法についてのさらなる論述を、米国特許第５，９１９，６２６号；５，９４５，２８３号；５，２４２，７９４号及び５，９５２，１７４号の中に見出すことができる。
【０１１４】
（本明細書にその全体が内含されている）米国特許第６，８２１，７３３号は、４方向錯体の形成及び分岐移動を可能にする条件下で２つの核酸を接触させる段階；検出分子がトレーサ分子又は４方向錯体を結合させる能力をもつ条件の下でトレーサ分子と検出分子を４方向錯体を接触させる段階；そして４方向錯体に対する曝露の前後に検出分子に対するトレーサ分子の結合を決定する段階を内含する、２つの核酸分子の配列の差異を検出するための方法を記述している。検出分子に結合するためのトレーサ分子と４方向錯体の競合が、２つの核酸間の差異を標示する。
【０１１５】
タンパク質及びプロテオミクスベースのアプローチが多型の検出及び分析についても適している。発現されたタンパク質の変異を結果としてもたらすか又はかかる変異と結びつけられる多型を、前記タンパク質を分析することで直接検出することができる。これには、標準的に、例えばゲル電気泳動又はＨＰＬＣなどによるＩ試料内部のさまざまなタンパク質の分離、そして化学的配列決定といったようなタンパク質配列決定又はＮＭＲ、又さらに一般的には質量分析法による前記タンパク質又はそこから誘導されたペプチドの同定、が必要とされる。プロテオーム方法は、当該技術分野において周知であり、大きな自動化潜在能力を有している。例えば、ProteomeSystems社製のProteomIQTMシステムといったような統合システムが、試料調製、タンパク質分離、画像獲得及び解析、タンパク質プロセシング、質量分析法及びバイオインフォマティクス技術を組合わせるプロテオーム分析のための高処理能力のプラットフォームを提供する。
【０１１６】
タンパク質同定のプロテオーム方法の大部分が、イオントラップ質量分析法、液体クロマトグラフィ（ＬＣ）及びＬＣ／ＭＳｎ質量分析法、ガスクロマトグラフィ（ＧＣ）質量分光分析、フーリエ変換−イオンサイクロトロン共鳴−質量分析計（ＦＴ−ＭＳ）、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ質量分析法及びＥＳＩ質量分析法及びその誘導体を含めた質量分析法を利用する。質量分析方法は同様に、リン酸化反応又はグリコシル化といったようなタンパク質の翻訳後修飾の決定においても有用であり、かくしてタンパク質の翻訳後修飾の変異を結果としてもたらすか又はかかる変異と結びつけられる多型を決定する上での有用性をもつ。
【０１１７】
関連技術も同様に周知であり、これには例えば、選択されたタンパク質スポット上に直接酵素又は化学物質を噴射することにより膜に対して２ＤＰＡＧＥゲルからエレクトロブロットされたタンパク質試料のインサイチュ酵素又は化学的消化を可能にする圧電プリント技術を含む、「化学インクジェットプリンター」といったタンパク質プロセシング装置が含まれる。タンパク質のインサイチュ消化及びインキュベーションの後、ペプチド分析のため質量分析計の中に直接膜を置くことができる。
【０１１８】
ＳＮＰを検出するために、核酸の立体配座可変性に依存する多数の方法が開発されてきた。
【０１１９】
例えば、１本鎖立体配座多型（ＳＳＣＰ、Orita et al.,ＰＮＡＳ１９８９８６：２７６６−２７７０）は或る種の条件下で溶液中の２次構造を形成するという１本鎖核酸の能力に依存した方法である。該２次構造は、塩基組成によって左右され、単一ヌクレオチド置換により改変され、非変性条件下で電気泳動移動度の差をひき起こす。さまざまな多型は、標準的には、放射能標識づけされる場合オートラジオグラフィにより、バンドの銀染色により、検出可能な形で標識されたプローブフラグメントのハイブリダイゼーションにより又は自動化ＤＮＡシーケンサなどでその後検出される螢光ＰＣＲプライマーの使用により検出される。
【０１２０】
ＳＳＣＰの修飾は、当該技術分野において周知であり、例えば異なる温度又は添加物の添加、及び異なるゲルマトリックスといったような異なるゲル走行条件の使用を含む。ＳＳＣＰのその他の変形形態は当業者にとっては周知であり、これにはＲＮＡ−ＳＳＣＰ、制限エンドヌクレアーゼフィンガプリント−ＳＳＣＰ、ジデオキシフィンガプリント（ジデオキシ配列決定とＳＳＣＰの間のハイブリット）、２方向ジデオキシフィンガプリント（ここではジデオキシ終結反応は２つの相対するプライマーと同時に実施される）、螢光ＰＣＲ−ＳＳＣＰ（ここでＰＣＲ産物は多数の螢光染料で内部標識され、制限酵素で消化され得、ＳＳＣＰが後続し、螢光染料を検出できる自動ＤＮＡシーケンサ上で分析される）が含まれる。
【０１２１】
異なる核酸構造の変動する移動度を利用するその他の方法としては、変性勾配ゲル電気泳動法（ＤＧＧＥ）、温度勾配ゲル電気泳動法（ＴＧＧＥ）及びヘテロデュプレックス分析（ＨＥＴ）が含まれる。ここで、２本鎖ＤＮＡの解離の変動（例えば塩基対不整合に起因するもの）は、電気泳動移動度の変化を結果としてもたらす。これらの移動度シフトはヌクレオチド変動を検出するために使用される。
【０１２２】
変性高圧液体クロマトグラフィ（ＨＰＬＣ）が、例えば、異なる速度でＨＰＬＣカラムから溶出するホモ２重鎖及びヘテロ２重鎖を検出して整合ヌクレオチドひいてはＳＮＰの検出を可能にするべく、上述の分離方法（例えばゲル電気泳動）に対する１つの代替案として当該技術分野において周知のＨＰＬＣを用いてＳＮＰを検出するために利用されるさらにもう１つの方法である。
【０１２３】
ＳＮＰを検出するためのさらにもう１つの方法は、化学的分割剤及び核分解酵素を含めたさまざまな作用物質による分割に対する１本鎖及び２本鎖核酸の異なる感受性に依存している。例えば、ＲＮアーゼＡによるＲＮＡ：ＤＮＡへテロ２重鎖内部での不整合の分割、例えばバクテリオファージＴ４エンドヌクレアーゼＹＩＩ又はＴ７エンドヌクレアーゼＩによるヘテロ２重鎖の分割、クリバーゼＩによる１本鎖と２本鎖ＤＮＡの間の接合部におけるヘヤピンループの５’末端の分割、及びMaxam−Gilbert配列決定化学の中で一般に使用される化学的作用物質によるヘテロ２重鎖内部の不整合ヌクレオチドの修飾が全て当該技術分野において周知のものである。
【０１２４】
さらなる例としては、翻訳の早期終結及び縮小サイズのタンパク質産物を導く変異により生成された停止コドンを分解するために用いられるタンパク質翻訳試験（ＰＴＴ）及び不整合結合タンパク質の使用がある。変異は、例えばEscherichia coliＤＮＡ不整合修復系の成分であるＭｕｔＳタンパク質又はヒトｈＭＳＨ２及びＧＴＢＰタンパク質の、不整合塩基を含む２本鎖ＤＮＡ２重鎖に対する結合によって検出される。ＤＮＡ２重鎖はこのとき、不整合結合タンパク質と共にインキュベートされ、変異は移動度シフト検定により検出される。例えば、簡易検定は、ヘテロ２重鎖に対する不整合結合タンパク質の結合がヘテロ２重鎖をエキソヌクレアーゼ分解から保護するという事実に基づいている。
【０１２５】
当業者であれば、特に１つの特定のＳＮＰがプロモータといったような遺伝子の調節領域内で発生した場合に、１遺伝子の発現の改変とこのＳＮＰを結びつけることができる、ということがわかるだろう。例えばＳＮＰが可変的用途のコドンひいては異なる存在度のｔＲＮＡと結びつけられている場合といったような、タンパク質コーティング遺伝子のコーディング領域内にＳＮＰがある場合にも、遺伝子の発現改変が結果としてもたらされ得る。かかる発現改変は、当該技術分野において周知の方法によって判定され得、かくしてかかるＳＮＰの検出のために利用され得る。同様にして、遺伝子のコーディング領域内でＳＮＰが発生し、非同義的アミノ酸置換を結果としてもたらす場合、かかる置換は、遺伝子産物の機能に変化をもたらす。同様にして、遺伝子産物がＲＮＡである場合には、かかるＳＮＰはＲＮＡ遺伝子産物の機能変化を結果としてもたらし得る。例えば活性又は機能性検定において評価されるようなこのようなあらゆる機能変化を用いて、かかるＳＮＰを検出することができる。
【０１２６】
ＳＮＰを検出及び同定する上述の方法は、本発明の方法における使用に適している。
【０１２７】
当然のことながら、本発明に従ったＳＮＰを検出し同定するためには、テストすべき材料を含有する試料を対象から入手する。該試料は、標的ＳＮＰ（又は場合によって標的ポリペプチド）を潜在的に含有するあらゆる試料であり得、あらゆる体液（血液、尿、唾液など）生検材料又はその他の組織調製物から得ることができる。
【０１２８】
ＤＮＡ又はＲＮＡは、当該技術分野において周知の数多くの方法のいずれかに従って、ＳＮから単離可能である。例えば、核酸の精製方法は、Tijssen：生化学及び分子生物学：核酸プローブでのハイブリダイゼーション第１部：理論及び核酸調製物、Elsevier, New York,N.Y.１９９３年、ならびにManiatis,T.,Fritsch,E.F及びSambrook,J.,分子クローンニグマニュアル１９８９年の中で記述されている。
【０１２９】
多型／ＳＮＰの有無の検出を補助するために、核酸プローブ及び／又はプライマーを提供することができる。かかるプローブは、多型の有無を証明する。染色体変化に特異的な核酸配列を有し、好ましくは、標的多型と組合わされた時点で検出可能なシグナルを発出する物質で標識される。
【０１３０】
核酸プローブは、ゲノミックＤＮＡ又はｃＤＮＡ又はｍＲＮＡ又は任意のＲＮＡ様又はＤＮＡ様材料、例えばペプチド核酸、分枝ＤＮＡなどであり得る。プローブは、センス又はアンチセンスポリヌクレオチドプローブであり得る。標的ポリヌクレオチドが２本鎖である場合、プローブは、センス又はアンチセンスストランドのいずれであっても良い。標的ポリヌクレオチドが１本鎖である場合、プローブは相補的１本鎖である。
【０１３１】
プローブは、当該技術分野において周知であるさまざまな合成又は酵素スキームにより調製可能である。プローブは、当該技術分野において周知の化学的方法を用いて全体的に又は一部分合成可能である（Caruthers et al.,Nucleic Acids Ros.,Symp.Ser.,２１５〜２３３（１９８０年））。代替的にはプローブを全体的に又は一部分、酵素により生成することもできる。
【０１３２】
ヌクレオチド類似体は、当該技術分野において周知の方法によってプローブ内に取込むことができる。唯一の必要条件は、取込まれたヌクレオチド類似体が、標的ポリヌクレオチド配列と塩基対合するのに役立たなければならないということである。例えば、一部のグアニンヌクレオチドを、シトシン残基と塩基対合するヒポキサンチンで置換することができる。しかしながら、これらの塩基対は、グアニンとシトシンの間のものに比べ安定性が低い。代替的には、アデニンヌクレオチドを２，６−ジアミンプリンと置換することができ、これは、アデニンとチミジンの間のものに比べて強い塩基対を形成することができる。
【０１３３】
さらに、プローブは、化学的又は酵素的に誘導体化されたヌクレオチドを内含することができる。標準的な化学的修飾としては、アシル、アルキル、アリール又はアミノ基での誘導体化が含まれる。
【０１３４】
プローブは、基材上に固定化可能である。好ましい基材は、膜、フィルタ、チップ、スライド、ウェーハ、繊維、磁気又は非磁気ビーズ、ゲル、チューブ類、プレート、重合体、微小粒子及び毛細管を含めた任意の適切な剛性又は半剛性支持体である。基材は、ポリヌクレオチドプローブが結合されるウェル、トレンチ、ピン、溝路及び細孔といったようなさまざまな表面形状を有し得る。好ましくは、基材は光学的に透明である。
【０１３５】
さらに、プローブは、基材に対し直接結合される必要はなく、むしろリンカー基を通して基材に結合され得る。リンカー基は標準的には、付着されたプローブに対する曝露を提供するべく約６〜５０原子の長さを有する。好ましいリンカー基には、エチレングリコールオリゴマ、ジアミン、二塩基酸などが含まれる。基材にリンカーを結合するべく、基材表面上の反応基がリンカーの末端部分の１つと反応する。リンカーのもう一方の末端部分はその後プローブを結合するように機能化される。
【０１３６】
プローブは、基材表面上にプローブ合成のための試薬を送り出すことによってか又は基材表面上に予め形成されたＤＮＡフラグメント又はクローンを送り出すことによって、基材に付着され得る。標準的なディスペンサとしては、基材との関係においてマイクロピペットの位置を制御するためのロボットシステムを伴い基材に対し溶液を送達するマイクロピペットがある。反応領域に同時に試薬を送達できるような形で、多数のディスペンサが存在し得る。
【０１３７】
核酸マイクロアレイが好ましい。（核酸チップを内含する）このようなマイクロアレイは、当該技術分野において周知である（例えば、各々参考として内含されている米国特許第５，５７８，８３２号；５，８６１，２４２号；６，１８３，６９８号；６，２８７，８５０号；６，２９１，１８３号；６，２９７、０１８号；６，３０６、６４３号；及び６，３０８，１７０号を参照のこと）。
【０１３８】
代替的には、抗体マイクロアレイを生成することができる。かかるマイクロアレイの生産は基本的にSchweitzer & Kingsmore,「マイクロアレイ上でのタンパク質の測定」、Curr Opin Biotechnol 2002;13(1):14-9;Avseekno et al.,「電気スプレー被着によって製造された免疫化学マイクロアレイ内のタンパク質の固定化」、Anal Chem 2001 15;73(24):6047-52;Huang.「抗体ベースのタンパク質マイクロシステム内の多数のタンパク質の検出」、Immunol Methods 2001 1;255(1-2):1-13中で記述されている通りである。
【０１３９】
本発明は同様に、本発明に従って使用するためのキットの調製をも意図している。適切なキットには、適切な容器内に入った本発明に従って使用するためのさまざまな試薬ならびに、管、バイアル及び収縮包装及びブロー成形型パッケージを含む包装材料が含まれる。
【０１４０】
本発明に従った典型的なキット内に含み入れるのに適した材料には、問題の遺伝子多型にフランキングするＤＮＡ又はｃＤＮＡ配列ドメインに対しアニールする遺伝子特異的ＰＣＲプライマー対（オリゴヌクレオチド）、ＰＣＲを実施する必要のないゲノミックＤＮＡ又はｃＤＮＡのいずれかの中で特異的配列ドメインを増幅する能力をもつ試薬；ＰＣＲ又は非ＰＣＲ増幅により増幅された配列ドメイン内のさまざまな考えられる対立遺伝子間で弁別を行なうのに必要とされる試薬（例えばオリゴヌクレオチドからのシグナルを増幅し対立遺伝子の弁別をよりローバストなものにする酵素又は螢光化学基を含有するように修飾されたものを含めた、多型の１対立遺伝子に優先的にアニールするオリゴヌクレオチドである制限エンドヌクレアーゼ）；さまざまな対立遺伝子から誘導された産物を物理的に分離するのに必要とされる試薬（例えば、電気泳動法、ＨＰＬＣカラム、ＳＳＣＰゲル、ホルムアミドゲル又はＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ用のマトリックス支持体の中で使用されるべきアガロース又はポリアクリルアミド及び緩衝液）のうちの１又は複数のものが含まれる。
【０１４１】
本発明の方法は、ＡＣＳと結びつけられるものとして知られているその他のリスク因子の分析と併用して実施できる。かかるリスク因子には、ＡＣＳ発症リスクの増加と結びつけられる疫学的リスク因子が含まれる。かかるリスク因子には、喫煙及び／又はタバコの煙に対する曝露、年令、性別及び家族履歴が含まれるが、これらに制限されるわけではない。これらのリスク因子は、対象のＡＣＳ発症リスクを評価する時点で本明細書に記述されている通りの１又は複数の多型の分析を増強するために使用可能である。
【０１４２】
本発明の予測方法は、一定数の治療的介入及び／又は治療計画を適切性について評価し所与の対象のために実施することを可能にする。これらのうち最も単純なものは、ライフスタイルを変化させる動機づけを対象に提供することにあり、例えば、対象が現在喫煙している場合には、本発明の方法は禁煙の動機づけを提供することができる。
【０１４３】
治療的介入又は処置の要領は、多型（単複）の性質及び前記多型（単複）の生物学的効果に基づくことになる。例えば、感受性多型がＩ遺伝子の発現の変化と結びつけられる場合、介入又は処置は好ましくは、例えば前記遺伝子の発現を変調させる能力をもつ作用物質の投与による前記遺伝子の正常な発現の回復に向けられる。多型が、遺伝子の発現の減少と結びつけられる場合、療法には、前記遺伝子の発現を増大させる能力をもつ作用物質の投与が関与し、換言すると、多型が遺伝子の発現の増大と結びつけられる場合、療法には前記遺伝子の発現を減少させる能力をもつ作用物質の投与が関与し得る。遺伝子発現の変調に有用な方法は、当該技術分野において周知である。例えば、多型が遺伝子のアップレギュレートされた発現と結びつけられている状況においては、例えば、ＲＮＡｉ又はアンチセンス方法論を利用する療法を実施してｍＲＮＡの存在量を減少させかくして前記遺伝子の発現を減少させることができる。代替的には、療法には、例えば前記遺伝子の産物の活性を変調させかくして前記遺伝子の異常発現を補償することに向けられた方法が関与し得る。
【０１４４】
感受性多型が遺伝子産物機能の減少及び遺伝子産物の発現レベルの減少と結びつけられる場合、治療的介入又は処置には、前記遺伝子産物又はその機能的類似体の投与などによる対象の体内の遺伝子産物の量の補足あるいは前記機能の増強又は置換えが関与し得る。例えば、多型が酵素機能の減少と結びつけられる場合、療法には、活性酵素又は酵素類似体の該対象への投与が関与し得る。同様にして、多型が遺伝子産物機能の増大と結びつけられる場合、治療的介入又は処置には、例えば対象の体内の前記遺伝子産物のレベルを減少させる能力をもつ作用物質あるいは前記遺伝子産物の阻害物質を投与することによって、前記機能を低減させることが関与し得る。例えば、ＳＮＰ対立遺伝子又は遺伝子型が酵素機能と結びつけられる場合、療法には、対象に対する酵素阻害物質の投与が関与し得る。
【０１４５】
同様にして、保護性多型が特定の遺伝子のアップレギュレーション又は酵素又はその他のタンパク質の発現に結びつけられる場合、療法は、耐性遺伝子型が欠如している個体内のこのようなアップレギュレーション又は発現及び／又はかかる個体に対するかかる酵素又はその他のタンパク質の送達を模倣することに向けられる可能性がある。さらに、保護性多型が特定の遺伝子のダウンレギュレーション又は１つの酵素又はその他のタンパク質の発現の減少又は削除と結びつけられる場合、望ましい療法は、保護性遺伝子型が欠如した個体におけるかかる条件を模倣することに向けられる可能性がある。
【０１４６】
以上で同定したさまざまな多型とＡＣＳに対する対象の感受性（又はその他のもの）の間の関係は同様に、候補療法の設計及び／又はスクリーニングにおいても利用される。これは特に感受性を予測する多型間の結びつきが遺伝子の発現のアップレギュレーション又はダウンレギュレーションのいずれかによって明らかになる場合にあてはまる。このようなケースでは、かかるアップレギュレーション又はダウンレギュレーションに対する候補療法の効果は容易に検出可能である。
【０１４７】
例えば、１つの実施形態においては、既存のヒトの血管に富む器官及び細胞培養が、上述の通りのＳＮＰ遺伝子型についてスクリーニングされる（ヒトの血管に富む器官及び細胞培養についての情報に関しては、例えば、各々本明細書にその全体が参考として内含されているClare Wise ED.,’上皮細胞培養プロトコル、2002,ISBN 0896038939,Humana Press Inc.NJ;内皮細胞培養、Roy Bicknell,ED.,1996,ISBN 0521550246,Cambridge University Press,UK;生物学的バリアの細胞培養モデル、Claus-Michael Lehr,ED.,2002,ISBN 0415277248,Taylor及びFrancis,UKを参照のこと）。多型が存在する場合にアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子の発現に関して推定上「正常」である培養と合わせて、関連する遺伝子型グループを代表する培養が選択される。
【０１４８】
かかる培養の試料は、治療用化合物候補ライブラリに曝露され、ａ）感受性ある遺伝子型内で通常アップレギュレートされる遺伝子のダウンレギュレーション又は（ｂ）感受性ある遺伝子型内で通常ダウンレギュレートされる遺伝子のアップレギュレーションについてスクリーニングされる。化合物は、感受性ある遺伝子型をもつ培養内の遺伝子の調節及び／又は作用を改変するその能力について選択される。
【０１４９】
同様にして、多型が、存在する場合に（年令及び性別について調整された）対象についての正常な範囲の外にある発現された遺伝子産物の生理学的に活性な濃度を結果としてもたらすものである場合、及びこの発現された遺伝子産物のレベルを正常な範囲内に回復させるための利用可能な予防的又は治療的アプローチが存在する場合、個々の対象をスクリーニングして、この回復的アプローチの恩恵を享受する尤度を判定することができる。かかるスクリーニングには、多型が体内に存在する対象が治療の恩恵を受ける確率の高い個体として同定されている状態で、本明細書に記述した方法のいずれかによって対象の体内の多型の有無を検出することが関与する。
【０１５０】
ここで、本発明について、以下の制限的意味のない例を参考にして、さらに詳述する。
【実施例】
【０１５１】
例１
患者関連研究
序
患者対照研究は、重要なリスク因子についての整合がきわめて重要である場合の対照グループの入念な選択を可能にする。この研究においては、ＡＣＳを患うと診断された喫煙者及びＡＣＳを患わない喫煙者が比較された。このユニークな対照グループは、ＡＣＳリスクゼロの喫煙者すなわち喫煙者でありながらＡＣＳを将来ＡＣＳを患うことが全くない喫煙者を予備選択することは不可能であるため、きわめて関連性の高いものである。出願人らは現在の知識では低リスク喫煙者グループを同定することは不可能であると考えていることから、長い喫煙歴及び正常な心臓血管機能をもつ喫煙者が「低リスク」の喫煙者として使用された。いかなる理論による束縛も望まないが、出願人らは、このアプローチにより、ＡＣＳ発症リスクの増加を付与しうる低浸透、高頻度多型のより厳密な比較が可能になる、と考えている。出願人らは同様に、ここでもいかなる理論による束縛も望まずに、正常な心臓血管機能をもつ喫煙コホートが比較子グループとして利用される場合にのみ明らかであり得るＡＣＳからの保護度を付与する多型が存在し得るとも考えている。かくして、ＡＣＳを患う喫煙者は、正常な心臓血管機能をもちＡＣＳであるという診断が全くなされていない喫煙者に比べ低いこれらの多型頻度を有すると予想されることになる。
【０１５２】
最低１５年の喫煙歴を有し急性冠不全症候群（急性心筋梗塞及び不安定狭心症を含めたＡＣＳ）の診断を受けたヨーロッパ人の子孫である対象が募集された。対象は、専門治療病院への臨床所見（履歴、ＥＣＧ、心臓バイオマーカー検定）に基づきＡＣＳと診断されたという基準を満たしていた。ＡＣＳを患う対象は、冠動脈のアテローム性疾患の存在を確認する冠動脈造影図を有していた。ＡＣＳを患う対象は、年令が４０〜６０才でヨーロッパ人の子孫であった。１４８人の対象が募集され、そのうち８５％が男性であり、平均ＦＥＶ１／ＦＶＣ（±ＩＳＤ）は７４％（±８）であり、予測されたものの百分率としての平均ＦＥＶ１は９４（±１５）であった。平均年令、一日あたりのタバコ本数、及び喫煙歴はそれぞれ、５０歳（±３）、２２本／日（±８）及び喫煙歴３１年（±１１）であった。最低１５年間喫煙し、狭心症、胸痛を患ったことがないか、心臓発作を患ったことのある、又は過去に虚血性心血管の診断を受けたことのある４６０人のヨーロッパ人対象も研究された。この対照グループは、前喫煙者又は現喫煙者であり、５５％が男性から成り、平均ＦＥＶ１／ＦＶＣ（±ＩＳＤ）が７５％（±９）で、予測中の百分率としての平均ＦＥＶ１が９８（±１２）であった地域ベースのボランティアを通して募集された。平均年令、一日あたりのタバコ本数および喫煙歴はそれぞれ６０才（±１０）、２３本／日（±１１）及び４０年（±２１）であった。
【０１５３】
この研究は、耐性喫煙者に比べ急性冠不全症候群患者においてより高い頻度で発見される多型が、生命に関わる冠不全症候群の発生に対する感受性の増加を反映し得るということを示している。同様にして、急性冠不全症候群患者に比べた耐性喫煙者においてより高い頻度で発見された多型が、保護的役割を反映する可能性もある。
【０１５４】
ＡＣＳコホートと耐性対照喫煙者についての特徴の概要
【表２】
2010525788.tif 000004
【０１５５】
遺伝子型決定方法
Seqvenom Autoflex質量分析計を用いた多型遺伝子型決定
ゲノミックＤＮＡを全血試料から抽出した（Maniatis,T.,Fritsch,E.F.及びSambrook,J.,Molecular Cloning Manual.1989）。精製されたゲノミックＤＮＡを９６ウェル平板内にアリコートし（１０ｎｇ／μｌ濃度）、以下のシーケンス、増幅条件及び方法を用いてSequenomTMシステム（SequenomTMAutoflex 質量分析計）及びSamsung24ピンナノディスペンサ）上で遺伝子型決定した。
【０１５６】
ＰＣＲ多重反応のためには以下の条件を用いた：最終濃度は、１０倍緩衝液について１５ｍＭのＭｇＣｌ2１．２５ｘ、２５ｍＭのＭｇＣｌ2１．６２５ｍＭ、ｄＮＴＰミックス２５ｍＭの５００μＭ、プライマー４μＭの１００ｎＭ、Ｔａｑポリメラーゼ（Quiagenホットスタート）０．１５Ｕ／反応、ゲノミックＤＮＡ１０ｎｇ／ｎｌであった。サイクル時間は、９５℃１５分間、５℃１５分間、５６℃３０秒、７２℃３０秒で４５サイクルと、長い延長時間３分間で終了した。３０分間３５℃でインキュベートしたエピアルカリ性ホスファターゼ（ＳＡＰ）処理（ＰＣＲ反応一回あたり２μｌ〜５μｌ）及び一回の反応につき水０．７６μｌ；ｋＭＥ１０倍終結緩衝液、０．２μｌ；ｈＭＥプライマー（１０μＭ）、１μｌ；ＭａｓｓＥＸＴＥＮＤ酵素、０．０４μｌという体積での伸長反応（ＳＡＰ処理の後２μｌ〜７μｌを添加）を用いた。ＳＮＰ及び候補遺伝子の全名称については表１〜２６を参照のこと。
【０１５７】
【表３】
2010525788.tif 000005
【０１５８】
【表４】
2010525788.tif 000006
【０１５９】
【表５】
2010525788.tif 000007
【０１６０】
【表６】
2010525788.tif 000008
【０１６１】
【表７】
2010525788.tif 000009
【０１６２】
結果
表１．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるキマーゼ（ＣＭＡ）−１９０３Ａ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表８】
2010525788.tif 000010
【０１６３】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧＧ対ＡＧ／ＡＡ、オッズ比（ＯＲ）＝１．９，９５％信頼限界１．２〜３．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝８．２３、Ｐ＝０．００４、
ＧＧ遺伝子型＝感受性
対立遺伝子Ｇ対Ａ、ＡＣＳ対耐性喫煙者対照、オッズ比（ＯＲ）＝１．４，９５％信頼限界１．１〜１．９、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝６．５２、Ｐ＝０．０１、
Ｇ対立遺伝子＝感受性
【０１６４】
表２．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における、形質転換成長因子ベータ１（ＴＧＦＢ１）−５０９Ｃ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度、
【表９】
2010525788.tif 000011
【０１６５】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＣ対ＣＴ／ＴＴ、オッズ比（ＯＲ）＝１．５，９５％信頼限界１．０〜２．２、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．９６、Ｐ＝０．０５、
ＣＣ遺伝子型＝感受性
対立遺伝子、ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣ対Ｔ、オッズ比（ＯＲ）＝１．４，９５％信頼限界１．０〜１．８、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．７９、Ｐ＝０．０５、
Ｃ対立遺伝子＝感受性
【０１６６】
表３．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるマトリックスメタロプロテイナーゼ１２（ＭＭＰ−８２Ａ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１０】
2010525788.tif 000012
【０１６７】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照について
ＧＧ対ＡＧ／ＡＡ、オッズ比（ＯＲ）＝３．２、９５％信頼限界０．８〜１３、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．７６、Ｐ＝０．０５、
ＧＧ遺伝子型＝感受性
【０１６８】
表４．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における線維芽細胞成長因子２（ＦＧＦ２）
Ｓｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１１】
2010525788.tif 000013
【０１６９】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性対照について
ＣＴ／ＴＴ対ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝１．５、９５％信頼限界０．９〜２．５、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．１、Ｐ＝０．０８、
ＣＴ／ＴＴ遺伝子型＝感受性（ＣＣ保護性）
対立遺伝子。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＴ対Ｃ、オッズ比（ＯＲ）＝１．５、９５％信頼限界０．９〜２．３、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．２４、Ｐ＝０．０２、
Ｔ対立遺伝子＝感受性
【０１７０】
表５．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるインターロイキン４受容体アルファ（ＩＬ４ＲＡ）Ｑ５７６ＲＡ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１２】
2010525788.tif 000014
【０１７１】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧＧ対ＡＡ／ＡＧ、オッズ比（ＯＲ）＝２．７１、９５％信頼限界１．１〜６．９、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝５．５２、Ｐ＝０．０２、
ＧＧ遺伝子型＝感受性
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＡ対ＡＧ／ＧＧ、オッズ比（ＯＲ）＝０．４７、９５％信頼限界０．０７〜１．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．４５、Ｐ＝０．０５、
ＡＡ遺伝子型＝保護性
対立遺伝子。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧ対Ａ、オッズ比（ＯＲ）＝１．５、９５％信頼限界１．１〜２．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝５．５６、Ｐ＝０．０２、
Ｇ対立遺伝子＝感受性
【０１７２】
表６．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるリンホトキシンアルファ（ＬＴＡ）Ｔｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１３】
2010525788.tif 000015
【０１７３】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＣ対ＡＡ／ＡＣ、オッズ比（ＯＲ）＝０．６６、９５％信頼限界０．４〜１．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝４．２８、Ｐ＝０．０４
ＣＣ遺伝子型＝保護性
ＬＴＡＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃは、ＮＦＫＢＩＬ１−６３Ｔ／Ａと連鎖不平衡状態にある。
【０１７４】
表７．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における熱ショックタンパク質（ＨＳＰ）７０ＨｏｍＴ２４３７ＣＣ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１４】
2010525788.tif 000016
【０１７５】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＣ／ＣＴ対ＴＴ、オッズ比（ＯＲ）＝０．６６、９５％信頼限界０．４３〜１．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝４．３３、Ｐ＝０．０４；
ＣＣ／ＣＴ遺伝子型＝保護性（ＴＴ＝感受性）
対立遺伝子ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣ対Ｔ、オッズ比（ＯＲ）＝０．６５、９５％信頼限界０．５〜０．９、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝５．７２、Ｐ＝０．０２、
Ｃ対立遺伝子＝保護性
【０１７６】
表８ａ．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるトール様受容体４（ＴＬＲ４）Ａｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１５】
2010525788.tif 000017
【０１７７】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＧ／ＧＧ対ＡＡ、オッズ比（ＯＲ）＝０．５４、９５％信頼限界０．３〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．２７、Ｐ＝０．０７
ＡＧ／ＧＧ遺伝子型＝保護性（ＡＡ＝感受性）
ＴＬＲ４Ａｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧはＴＬＲ４Ｔｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔと連鎖不平衡状態にある。
【０１７８】
表８ｂ．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるトール様受容体４（ＴＬＲ４）Ｔｈｒ３９９ＩｌｅＣ/Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１６】
2010525788.tif 000018
【０１７９】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＴ／ＴＴ対ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝０．５４、９５％信頼限界０．３〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．６７、Ｐ＝０．０６
ＣＴ／ＴＴ遺伝子型＝保護性（ＣＣ＝感受性）
ＴＬＲ４Ｔｈｒ３９９ＩｌｅＣ/Ｔは、ＴＬＲＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇと連鎖不平衡状態にある。
【０１８０】
表９．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるインターフェロンγ（ＩＦＮＧ）８７４Ａ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１７】
2010525788.tif 000019
【０１８１】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＴＴ対ＡＡ／ＡＴ、オッズ比（ＯＲ）＝０．５７、９５％信頼限界０．３〜０．９６、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝４．９８、Ｐ＝０．０３
ＴＴ遺伝子型＝保護性
【０１８２】
表１０．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるＢ細胞中のＫ軽鎖ポリペプチド
遺伝子エンハンサーの核因子−６３Ｔ／Ａ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１８】
2010525788.tif 000020
【０１８３】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＡ対ＡＴ／ＴＴ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７３、９５％信頼限界０．５〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．６６、Ｐ＝０．１０、
ＡＡ遺伝子型＝保護性
ＮＦＫＢＩＬ１−６３Ｔ／Ａは、ＬＴＡｔｈｒ２６Ａｓｎと連鎖不平衡状態にある。
【０１８４】
表１１．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における血小板由来成長因子受容体アルファ（ＰＤＧＦＲＡ）−１６３０挿入／欠失）ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表１９】
2010525788.tif 000021
【０１８５】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＩＤ／ＤＤ対ＩＩ、オッズ比（ＯＲ）＝０．６８、９５％信頼限界０．５〜１．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．６９、Ｐ＝０．０５
ＩＤ／ＤＤ遺伝子型＝保護性（ＩＩ感受性）
【０１８６】
表１２．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるインターロイキン４（ＩＬ−４）−５８９Ｃ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２０】
2010525788.tif 000022
【０１８７】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＴ／ＴＴ対ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝０．６８、９５％信頼限界０．４２〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．５７、Ｐ＝０．１１、
ＣＴ／ＴＴ遺伝子型＝保護性（ＣＣ＝感受性）
【０１８８】
表１３．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるマトリックスメタロプロテイナーゼ１（ＭＭＰ１）−１６０７１Ｇ／２Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２１】
2010525788.tif 000023
【０１８９】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照について１Ｇ１Ｇ対１Ｇ２Ｇ／２Ｇ２Ｇ、オッズ比（ＯＲ）＝１．４、９５％信頼限界０．９〜２．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．４４、Ｐ＝０．１２、
１Ｇ１Ｇ遺伝子型＝感受性
【０１９０】
表１４．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における血小板由来成長因子アルファ（ＰＤＧＦＡ）１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２２】
2010525788.tif 000024
【０１９１】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＴＴ対ＣＴ／ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝１．４、９５％信頼限界０．９〜２．２、＝２．２１、Ｐ＝０．１４、
ＴＴ遺伝子型−感受性
【０１９２】
表１５．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるグルタミン酸塩−システインリガーゼ修飾物質サブユニット（ＧＣＬＭ）−５８８Ｃ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度、
【表２３】
2010525788.tif 000025
【０１９３】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＴ／ＴＴ対ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝１．４、９５％信頼限界０．９〜２．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．３４、Ｐ＝０．１３
ＣＴ／ＴＴ遺伝子型＝感受性（ＣＣ保護性）
【０１９４】
表１６．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における嗅覚受容体類似体ＯＲ１３Ｇ１
Ｉｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２４】
2010525788.tif 000026
【０１９５】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＡ対ＡＧ／ＧＧ、オッズ比（ＯＲ）＝１．４、９５％信頼限界０．９〜２．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．２０、Ｐ＝０．１４、
ＡＡ遺伝子型＝感受性
【０１９６】
表１７．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるインターロイキン１０（ＩＬ−１０）−１０８４Ａ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２５】
2010525788.tif 000027
【０１９７】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧＧ対ＡＡ／ＡＧ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７４、９５％信頼限界０．５〜１．２、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１．７４、Ｐ＝０．１９、
ＧＧ遺伝子型＝保護性
【０１９８】
表１８．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるアルファ１−抗トリプシンＳ対立遺伝子Ｇｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２６】
2010525788.tif 000028
【０１９９】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＴ／ＴＴ対ＡＡ、オッズ比（ＯＲ）＝１．５、９５％信頼限界０．８〜２．７、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１．９５、Ｐ＝０．１６、
ＡＴ／ＴＴ遺伝子型＝感受性。
【０２００】
表１９．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における細胞内接着分子１（ＩＣＡＭ１）Ｋ４６９ＥＡ／ＧＡ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２７】
2010525788.tif 000029
【０２０１】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＡ対ＡＧ／ＧＧ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７０、９５％信頼限界０．５〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．９１、Ｐ＝０．０９、
ＡＡ遺伝子型＝保護性
【０２０２】
表２０．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるＨＬＡ−Ｂ関連写し１（ＢＡＴ１）−２３Ｃ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２８】
2010525788.tif 000030
【０２０３】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧＧ対ＣＣ／ＣＧ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７５、９５％信頼限界０．５〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．８８、Ｐ＝０．０９
ＧＧ遺伝子型＝保護性。
【０２０４】
表２１．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者における酸化窒素シンターゼ３（ＮＯＳ３）Ｇｌｕ２９８ＡｓｐＧ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表２９】
2010525788.tif 000031
【０２０５】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧＧ対ＧＴ／ＴＴ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７２、９５％信頼限界０．５〜１．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．７９、Ｐ＝０．０９、
ＧＧ遺伝子型＝保護性。
【０２０６】
表２２．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるスーパーオキシドジスムターゼ３（ＳＯＤ３）Ａｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３０】
2010525788.tif 000032
【０２０７】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＧ対ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝０．２３、９５％信頼限界０．０１〜１．７、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．３１、Ｐ＝０．１３、
ＣＧ／ＧＧ遺伝子型＝保護性。
【０２０８】
表２３．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるプラスミノゲン活性化因子阻害剤１（ＰＡＩ−１）−６６８#Ｄｅｌ／Ｇ（４Ｇ／５Ｇ）多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３１】
2010525788.tif 000033
【０２０９】
＃ＰＡＩ−１−６７５４Ｇ／５Ｇ多型と同じ。
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照について５Ｇ５Ｇ対４Ｇ５Ｇ／４Ｇ４Ｇ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７２、９５％信頼限界０．４〜１．２、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１．７、Ｐ＝０．１９、
５Ｇ５Ｇ遺伝子型＝保護性。
【０２１０】
表２４．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるマクロファージ炎症性タンパク質１−アルファ（ＭＩＰ１Ａ）４５９Ｃ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３２】
2010525788.tif 000034
【０２１１】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＴ／ＴＴ対ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝１．３１、９５％信頼限界０．９〜２．０、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１．８１、Ｐ＝０．１８、
ＣＴ／ＴＴ遺伝子型＝感受性。
【０２１２】
表２５．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるマトリックスメタロプロテイナーゼ７（ＭＭＰ）−１８１Ａ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３３】
2010525788.tif 000035
【０２１３】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＧＧ対ＡＡ／ＡＧ、オッズ比（ＯＲ）＝０．７０、９５％信頼限界０．４〜１．２、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１．７３、Ｐ＝０．１９、
ＧＧ遺伝子型＝保護性
【０２１４】
表２６．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるカテプシンＧＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３４】
2010525788.tif 000036
【０２１５】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＡＧ／ＧＧ対ＡＡ、オッズ比（ＯＲ）＝０．５８、９５％信頼限界０．２７〜１．２２、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．３６、Ｐ＝０．１２、
ＡＧ／ＧＧ遺伝子型＝保護性（ＡＡ感受性）
【０２１６】
表２７．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるケモカイン（ＣＸ３Ｃモチーフ）受容体１（ＣＸ３ＣＲ１）Ｉ２４９ＶＣ／Ｔ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３５】
2010525788.tif 000037
【０２１７】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＴＴ対ＣＣ／ＣＴ、オッズ比（ＯＲ）＝１．５、９５％信頼限界０．８２〜２．８１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．０４、Ｐ＝０．１５、
ＡＡ遺伝子型＝感受性
【０２１８】
表２８．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるカスパーゼ（ＮＯＤ２）Ｇｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３６】
2010525788.tif 000038
【０２１９】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＣ／ＣＧ対ＧＧ、オッズ比（ＯＲ）＝２．１、９５％信頼限界０．６６２〜６．６、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝２．０５、Ｐ＝０．１５、
ＣＣ／ＣＧ遺伝子型＝感受性
【０２２０】
表２９．ＡＣＳ患者及び耐性喫煙者におけるメタロプロテイナーゼ組織阻害因子１（ＴＩＭＰ１）３７２Ｔ／Ｃ多型対立遺伝子及び遺伝子型頻度
【表３７】
2010525788.tif 000039
【０２２１】
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＴＴ対ＣＴ／ＣＣ、オッズ比（ＯＲ）＝０．２７、９５％信頼限界０．１３〜０．５４、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１６．４２、Ｐ＝０．００００５
ＴＴ遺伝子型＝保護性
遺伝子型。ＡＣＳ対耐性喫煙者対照についてＣＣ対ＣＴ／ＴＴ、オッズ比（ＯＲ）＝１．４、９５％信頼限界１．０〜２．１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝３．６１、Ｐ＝０．０６；
ＣＣ遺伝子型＝感受性
対立遺伝子Ｔ対Ｃ、ＡＣＳ対耐性喫煙者対照、オッズ比（ＯＲ）＝０．６１、９５％信頼限界０．４５〜０．８１、Ｘ2（マンテル−ヘンツェル）＝１２．６４、Ｐ＝０．０００４、
Ｔ遺伝子型＝保護性
【０２２２】
下表３０は、本明細書中で同定されている保護性及び感受性ＳＮＰの要約を提示する。選択された感受性ＳＮＰはＳ１〜Ｓ１３として同定され、一方選択された保護性ＳＮＰはＰ１〜Ｐ１６として同定されている。ボールド体で示されたものは、以下で論述する通りＳＮＰ評点を生成するのに使用されるＳＮＰのパネル内に内含された。
【０２２３】
表３０．急性冠不全症候群についての保護性及び感受性ＳＮＰの要約
【表３８】
2010525788.tif 000040
【０２２４】
本明細書で論述されている通り、Ｓ３はＳ６とＬＤ状態にあり、Ｐ１はＰ１１とＬＤ状態にあり、Ｐ３はＰ３．１とＬＤ状態にある。従って、これらのＳＮＰは、ＳＮＰ評点を導出する場合にパネル内に共に使用されなかった。
【０２２５】
下表３１は、ＳＮＰ評点を基準としたＡＣＳ患者と喫煙対照の分布を示す。各個体についてのＳＮＰ評点は、表３０に示されているようにＳＮＰＳ１〜Ｓ５及びＰ１〜Ｐ６から成る１１のＳＮＰパネルの組合せ分析の中で決定された。各感受性ＳＮＰには、＋１の値が割当てられ、各保護性ＳＮＰには、−１の値が割当てられた。図１はこのデータをグラフで提示している。
【０２２６】
表３１．ＳＮＰ評点−１１ＳＮＰパネルに従ったＡＣＳを有する人の分布
【表３９】
2010525788.tif 000041
【０２２７】
下表３２は、より大きな１５ＳＮＰパネルを基準として決定されたＳＮＰ評点に従ったＡＣＳ患者と喫煙対照の分布を示す。この１５ＳＮＰパネルは、表３０に示されているように、ＳＮＰＳ１〜Ｓ５及びＰ１−Ｐ１０で構成されていた。ここでも又は各感受性ＳＮＰには＋１の値が割当てられ、各保護性ＳＮＰには−１の値が割当てられた。図２は表３２中に示したデータをグラフで提示している。
【０２２８】
表３２．ＳＮＰ評点−１５ＳＮＰパネルに従ったＡＣＳを有する人の分布
【表４０】
2010525788.tif 000042
【０２２９】
論述
上述の結果は、複数の多型がＡＣＳ発症リスクの増加又は減少と結びつけられたということを示している。個々の多型それ自体の結びつけは、弁別的価値はあるものの、疾患の受容可能な予測を提供する確率は低い。しかしながら、これらの多型は組合さった形で、感受性対象を耐性対象と区別する（例えばＡＣＳを発生している喫煙者と匹敵する喫煙露呈を有する最小リスクの人の間）。多型は、遺伝子発現ひいてはタンパク質合成を修飾すると思われているプロモータ多型及び炎症、マトリックス改造及びサイトカイン活性を含むプロセスの中核を成すタンパク質をコードする一定数の遺伝子の中でアミノ酸配列（そして起こりそうな発現及び／又は機能）を改変させるものとして知られるエキソン多型の両方を表わす。
【０２３０】
ＡＣＳを有する喫煙者及びＡＣＳを有していない整合された喫煙者（喫煙にも関わらずＡＣＳリスクが最低である）の比較において複数の多型が、比較グループ内よりも著しく多いか又は少ない頻度で発見されるものとして同定された。ＡＣＳ患者のコホートが小さいことから、組合せ分析においては最も有意な差異をもつ多型のみが利用されたにも関わらず、差異（Ｐ＝０．０６−０．２５）に向かう傾向のみが存在する多型が分析内に含まれた。
【０２３１】
・  キマーゼＩ遺伝子の−１９０３Ａ／Ｇ多型の分析においては、ＧＧ遺伝子型は、感受性の役割と一貫してＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．９、Ｐ＝０．００４）（表１参照）。Ｇ対立遺伝子も同様に、感受性の役割と一貫して耐性喫煙コホートに比べてＡＣＳコホートにおいて著しく大きいことがわかった。（ＯＲ＝１．４、Ｐ＝０．０１）（表１）。
【０２３２】
・  ＴＧＦＢ１遺伝子の−５０９Ｃ／Ｔ多型の分析においては、ＣＣ遺伝子型は、感受性の役割と一貫して、耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．５、Ｐ＝０．０５）（表２参照）。Ｃ対立遺伝子も同様に、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べＡＣＳコホートにおいて著しく大きいことがわかった（表２）。
【０２３３】
・  ＭＭＰ１２遺伝子内の−８２Ａ／Ｇ多型の分析においては、ＧＧ遺伝子型は、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝３．２、Ｐ＝０．０５）（表３参照）。
【０２３４】
・  ＦＧＦ２遺伝子のＳｅｒ５２Ｓｅｒ（２２３Ｃ／Ｔ）多型の分析においては、ＣＴ及びＴＴ遺伝子型は、各々感受性の役割を有していることと一貫して、耐性喫煙者コホートに比べＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．５、Ｐ＝０．０８）。Ｔ対立遺伝子は、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．５、Ｐ＝０．０７）。これとは対照的に、ＣＣ遺伝子型は、保護性の役割と一貫していることがわかった（表４）。
【０２３５】
・  ＩＬ４ＲＡ遺伝子のＱ５７６ＲＡ／Ｇ多型の分析においては、ＧＧ遺伝子型は感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝２．７１、Ｐ＝０．０２）（表５参照）。Ｇ対立遺伝子も同様に感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べＡＣＳコホートにおいて著しく大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．５、Ｐ＝０．０２）（表５）。これとは対照的に、ＡＡ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べ耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることがわかった（ＯＲ＝０．９７、Ｐ＝０．０５）（表５参照）。
【０２３６】
・  ＬＴＡ遺伝子のＴｈｒ２６ＡｓｎＡ／Ｃ多型の分析においては、ＣＣ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べ耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．６６、Ｐ＝０．０４）（表６参照）。
【０２３７】
・  ＨＳＰ７０遺伝子のＨＯＭＴ２４３７ＣＣ／Ｔ多型の分析においては、ＣＣ及びＣＴ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．６６、Ｐ＝０．０４）（表７参照）。Ｃ遺伝子型も同様に、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べ耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．６５、Ｐ＝０．０２）。これとは対照的に、ＴＴ遺伝子型は、感受性の役割と一貫していることがわかった（表７参照）。
【０２３８】
・  ＴＬＲ４遺伝子のＡｓｐ２９９ＧｌｙＡ／Ｇ多型の分析においては、ＡＧ及びＧＧ遺伝子型は、各々保護性の役割をもつことと一貫して、ＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．５４、Ｐ＝０．０７）（表８ａ参照）。これとは対照的に、ＡＡ遺伝子型は、感受性の役割と一貫していることがわかった（表８ａ参照）。
【０２３９】
・  ＴＬＲ４遺伝子のＴｈｒ３９９ＩｌｅＣ／Ｔ多型の分析においては、ＣＴ及びＴＴ遺伝子型は、各々保護性の役割をもつことと一貫して、ＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．５４、Ｐ＝０．０６）（表８ｂ参照）。これとは対照的に、ＣＣ遺伝子型は、感受性の役割と一貫していることがわかった（表８ｂ参照）。
【０２４０】
・  ＩＦＮＧ遺伝子の８７４Ａ／Ｔ多型の分析においては、ＴＴ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．５７、Ｐ＝０．０３）（表９参照）。
【０２４１】
・  ＮＦＫＢＩＬ１遺伝子の−６３Ｔ／Ａ多型の分析においては、ＡＡ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７３、Ｐ＝０．１０）（表１０参照）。
【０２４２】
・ＰＤＧＦＲＡ遺伝子の−１６３０Ｔｎｓ／Ｄｅｌ（ＡＡＣＴＴ／Ｄｅｌ）多型の分析においては、ＩｎｓＤｅｌ及びＤｅｌＤｅｌ遺伝子型は、各々保護性の役割をもつことと一貫して、ＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．６８、Ｐ＝０．０５）（表１１）。これとは対照的に、ＩｎｓＩｎｓは、感受性の役割と一貫していることがわかった（表１１参照）。
【０２４３】
・  ＩＬ−４遺伝子の−５８９Ｃ／Ｔ多型の分析においては、ＣＴ及びＴＴ遺伝子型は、各々保護性の役割を有していることと一貫して、ＡＣＳコホートに比べ耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．６８、Ｐ＝０．１１）（表１２参照）。これとは対照的に、ＣＣ遺伝子型は、感受性の役割と一貫していることがわかった（表１２）。
【０２４４】
・  ＭＭＰ１遺伝子の−１６０７１Ｇ／２Ｇ多型の分析においては、１Ｇ１Ｇ遺伝子型は、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．４、Ｐ＝０．１２）（表１３参照）。
【０２４５】
・  ＰＤＧＦＡ遺伝子の１２ＩＮ５Ｃ／Ｔ多型においては、ＴＴ遺伝子型は感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートと比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．４、Ｐ＝０．１４）（表１４参照）。
【０２４６】
・  ＧＣＬＭ遺伝子内の−５８８Ｃ／Ｔ多型においては、ＣＴ及びＴＴ遺伝子型は、各々が感受性の役割をもつことと一貫して、耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．４、Ｐ＝０．１３）（表１５参照）。これとは対照的に、ＣＣ遺伝子型は保護性の役割と一貫していることがわかった（表１５参照）。
【０２４７】
・  ＯＲ１３Ｇ１遺伝子のＩｌｅ１３２ＶａｌＡ／Ｇ多型においては、ＡＡ遺伝子型は、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．４、Ｐ＝０．１４）（表１６）。
【０２４８】
・  Ｉｌ−１０遺伝子の−１０８４Ａ／Ｇ多型の分析においては、ＧＧ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７４、Ｐ＝０．１９）（表１７参照）。
【０２４９】
・  α１−ＡＴ遺伝子におけるＧｌｕ２８８ＶａｌＡ／Ｔ（Ｍ／Ｓ）多型の分析においては、ＡＴ及びＴＴ遺伝子型は、各々が感受性の役割をもつことと一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．５、Ｐ＝０．１６）（表１８参照）。
【０２５０】
・  ＩＣＡＭ１遺伝子内のＫ４６９ＥＡ／Ｇ多型においては、ＡＡ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７０、Ｐ＝０．０９）（表１９参照）。
【０２５１】
・  ＢＡＴ１遺伝子の−２３Ｃ／Ｇ多型の分析においては、ＧＧ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７１、Ｐ＝０．０９）（表２０参照）。
【０２５２】
・  酸化窒素シンターゼ３遺伝子のＧｌｕ２９８Ａｓｐ（Ｇ／Ｔ）多型において、ＧＧ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７２、Ｐ＝０．０９）（表２１参照）。
【０２５３】
・  ＳＯＤ３遺伝子のＡｒｇ２１３ＧｌｙＣ／Ｇ多型の分析においては、ＣＧ及びＧＧ遺伝子型は、各々が保護性の役割をもつことと一貫して、ＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．２３、Ｐ＝０．１３）（表２２参照）。
【０２５４】
・  ＰＡＩ−１遺伝子の−６６８Ｄｅｌ／Ｇ（４Ｇ／５Ｇ）多型の分析においては、５Ｇ５Ｇ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７２、Ｐ＝０．１９）（表２３参照）。
【０２５５】
・  ＭＩＰ１Ａ遺伝子内の４５９Ｃ／Ｔ多型の分析においては、ＣＴ及びＴＴ遺伝子型は、各々が感受性の役割をもつことと一貫して、耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．３１、Ｐ＝０．１８）（表２４参照）。Ｔ対立遺伝子も同様に、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．３３、Ｐ＝０．０９）（表２４参照）。
【０２５６】
・  ＭＭＰ７遺伝子の−１８１Ａ／Ｇ多型の分析において、ＧＧ遺伝子型は、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．７０、Ｐ＝０．１９）（表２５参照）。
【０２５７】
・  カテスピンＧ遺伝子のＡｓｎ１２５ＳｅｒＡ／Ｇ多型の分析においては、ＡＧ及びＧＧ遺伝子型は、各々が保護性の役割をもつことと一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．５８、Ｐ＝０．１２）（表２６参照）。これとは対照的に、ＡＡ遺伝子型は、感受性の役割と一貫していることがわかった（表２６）。
【０２５８】
・  ＣＸ３ＣＲ１遺伝子のＩ２４９ＶＣ／Ｔ多型においては、ＴＴ遺伝子型は感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝１．５、Ｐ＝０．１５）（表２７）。
【０２５９】
・  ＮＯＤ２遺伝子内のＧｌｙ８８１ＡｒｇＧ／Ｃ多型の分析においては、ＣＣ及びＣＧ遺伝子型は、各々が感受性の役割をもつことと一貫して耐性喫煙者コホートに比べてＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝２．１、Ｐ＝０．１５）（表２８参照）。
【０２６０】
・  ＴＩＭＰ１遺伝子の３７２Ｔ／Ｃ多型の分析においては、ＴＴ遺伝子型は保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいてより大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．２７、Ｐ＝０．００００５）（表２９参照）。Ｔ対立遺伝子も同様に、保護性の役割と一貫してＡＣＳコホートに比べて耐性喫煙者コホートにおいて著しく大きいものであることが発見された（ＯＲ＝０．６１、Ｐ＝０．０００４）（表２９）。これとは対照的に、ＣＣ遺伝子型は、感受性の役割と一貫して耐性喫煙者コホートに比べＡＣＳコホートにおいてより大きいものであることがわかった（ＯＲ＝１．４、Ｐ＝０．０６）（表２９参照）。
【０２６１】
ＡＣＳを患いやすい体質が、個体の遺伝子構造及びタバコの煙を含めたさまざまな空気汚染物質に対するその一生涯被ばく量を含めたその他の因子の組合せ効果の結果であるということが一般に認められている。同様にして、ＡＣＳがいくつかの血管疾患を包含することが一般に認められている。本明細書のデータは、複数の遺伝子がＡＣＳ発症に寄与し得ることを示唆している。組合せた形で働き脈管構造を進展させるか又は損傷から保護する一定数の遺伝子突然変異が、ＡＣＳに対する高い耐性又は感受性に関与している確率が高い。
【０２６２】
個々の多型の分析から、２０の感受性遺伝子型及び２０の保護性遺伝子型を同定し、耐性喫煙者及びＡＣＳを有する喫煙者から成る喫煙者コホートにおけるそれらの頻度について分析した。感受性遺伝子型の存在が＋１と評定され、保護性遺伝子型の存在は−１と評定される所定のアルゴリズムの中で、各対象についてＡＣＳＳＮＰ評点が生成された。１１ＳＮＰパネルを基準にして生成されたＡＣＳＳＮＰ評点は、ＡＣＳを有する頻度に線形的に関連している。例えば、ＡＣＳを有する可能性は、＋２のＳＮＰ評点をもつ喫煙者における５８％から、−４以下のＳＮＰ評点をもつ喫煙者における５％まで減少した（表３１及び図１を参照のこと）。表３０に示されているようなＳＮＰＳ１〜Ｓ５及びＰ１〜Ｐ１０から成る１５ＳＮＰパネルでのさらなる分析においては、ＡＣＳを有する可能性は、２以上のＳＮＰ評点をもつ喫煙者における８４％から−６以下のＳＮＰ評点をもつ喫煙者における０％まで減少した（表３２及び図２を参照のこと）。
【０２６３】
さらに、ＡＣＳを有する対数オッズは、ＡＣＳＳＮＰ評点に線形的に関連しており、ＳＮＰ評点が大きくなればなるほど、急性冠不全症候群を有する確率は大きくなる（図３を参照のこと）。（テストの感受性及び特異性を最適化する受信者動作特性曲線の曲線下面積と等価である）Ｃ統計量の予備的分析から、Ｃ統計量値は以下の通りである。ＳＮＰ評点単独＝０．６５、ＳＮＰ評点／年令＝０．７４、ＳＮＰ評点／ＢＭＩ／性別＝０．７８そしてＳＮＰ評点／ＢＭＩ／性別／年令＝０．９３。
【０２６４】
かくして、ＡＣＳＳＮＰ評点は、独立してＡＣＳを有することと結びつけられ、ＡＣＳリスク及び急性冠動脈事象を有するリスクを評価するため単独で又は非遺伝的リスク因子と併せて使用可能である。
【０２６５】
これらの発見事実は、本発明の方法が、症候が現われるよりもはるかに前に個体の体内のＡＣＳを予測し得るということを示している。
【０２６６】
従って、これらの発見事実は同様に、本明細書で論述されているような治療的介入及び／又は治療計画の好機をも提示している。簡単に言うと、かかる介入又は計画には、ライフスタイルの変化を実施するための動機づけ又は異常な遺伝子発現又は遺伝子産物機能を正常化させることを目指した治療方法を対象に対し提供することが含まれ得る。例えば、本明細書で示されている通り、ＰＡＩ−１遺伝子のプロモータ内の−６７５５Ｇ５Ｇ遺伝子型は、ＡＣＳ発症リスクの減少と結びつけられる。５Ｇ対立遺伝子は、リプレッサタンパク質の結合の増加及び遺伝子の転写の減少と結びつけられると報告されている。−６７５４Ｇ４Ｇ遺伝子型を有する個体のために適した療法は、リプレッサのレベルを増大させかつ／又はリプレッサの結合を増強させ、かくして転写に対するそのダウンレギュレーション効果を増強させる能力をもつ作用物質の投与であり得る。代替的療法には、遺伝子療法例えば、−６７５４Ｇ４Ｇ遺伝子型を有するＰＡＩ−１遺伝子を結合させるための親和力が増大したリプレッサをコードする遺伝子の少なくとも１つの付加的コピーの導入が含まれる。さらなる例では、本明細書で示される通り、ＭＭＰ１２をコードする遺伝子のプロモータ内の−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型は、ＡＣＳに対する感受性と結びつけられる。例えば（本明細書にその全体が内含されている）米国特許第６，６００，０５７号（US6,600,057）の中で論述されているもの、例えばＭＭＰと不活性錯体を形成するＴＩＭＰ１、ＴＩＭＰ２、ＴＩＭＰ３及びＴＩＭＰ４を含めたメタロプロテイナーゼ組織阻害因子（ＴＩＭＰ）、ＭＭＰ作用を防ぐより一般的なプロテイナーゼ調節剤、ＭＭＰの排出されたプロ酵素形態を活性化する膜結合されたＭＭＰ（ＭＴ−ＭＭＰ）を含めたＭＭＰ遺伝子発現調節剤、及び４，５−ジヒドロキサンタキノン−２−カルボン酸（ＡＱＣＡ）及びその誘導体などの数多くのコトリクスメタロプロテイナーゼ阻害剤が知られている。−８２Ａ／ＧＧＧ遺伝子型を有することがわかっている対象における適切な療法は、ＭＭＰ１２をコードする遺伝子の発現を低減させる能力をもつ作用物質の投与、又は例えば１又は複数のＴＩＭＰの発現又は活性を増大させる能力をもつ作用物質の投与による、ＭＭＰ１２の活性を減少させる能力をもつ作用物質の投与、或いは１又は複数の膜結合ＭＭＰの発現又は活性を減少させる能力をもつ作用物質又はＭＭＰ１２のその他の活性化因子の投与であり得る。例えば、適切な療法は、４，５−ジヒドロキサンタキノン−２−カルボン酸（ＡＱＣＡ）、アントラキニル−メルカプトエチアミン、アントラキニル−アラニンヒドロキサマート、又はその誘導体といったようなＭＭＰ１阻害剤を、かかる対象に対して投与することであり得る。同様にして、ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子内の３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型は、ＡＣＳに対する感受性と結びつけられる。３７２Ｔ／ＣＣＣ遺伝子型を有することがわかっている対象における適切な療法は、ＴＩＭＰ１をコードする遺伝子の発現を変調、好ましくは増大させる能力をもつ作用物質の投与であり得る。
【０２６７】
もう１つの例においては、所与の感受性遺伝子型が、保護性遺伝子型で観察されるものと比べた遺伝子発現の増大と結びつけられる。感受性遺伝子型を有することがわかっている対象における適切な療法は、例えばアンチセンス又はＲＮＡｉ方法を用いて遺伝子の発現を低減させる能力をもつ作用物質の投与である。代替的な適切な療法は、遺伝子産物の阻害物質をかかる対象に対して投与することであり得る。さらにもう１つの例では、遺伝子のプロモータの中に存在する感受性遺伝子型が、リプレッサタンパク質の結合の増大及び該遺伝子の転写の減少に結びつけられる。適切な療法は、リプレッサレベルを減少させ、かつ／又はリプレッサの結合を防止し、かくして転写に対するそのダウンレギュレーション効果を軽減させる能力をもつ作用物質の投与である。代替的療法は、例えばリプレッサ結合に対する親和力が低減した遺伝子の少なくとも１つの付加的なコピー（例えば、保護性遺伝子型を有する遺伝子コピー）を導入することといった遺伝子療法を含み得る。
【０２６８】
かかる療法において使用するための適切な方法及び作用物質は、当該技術分野において周知であり、本明細書で論述されている。
【０２６９】
本明細書で記述されているような感受性多型及び保護性多型の両方の同定は同様に、予防的及び／又は治療的処置の方法におけるその効能を評価するべく候補化合物をスクリーニングする好機をも提供する。かかるスクリーニング方法には、感受性多型の遺伝子型又は表現型効果を逆転させるか又はこれに対抗する能力又は保護性多型の遺伝子型又は表現型効果を模倣又は複製する能力を有するのがどの一範囲の候補化合物であるかを同定することが関与している。
【０２７０】
さらに又、利用可能な予防的又は治療的アプローチに対する対象の予想される応答性を評価するための方法が提供されている。かかる方法は、利用可能な治療アプローチに、発現された遺伝子の産物の生理学的に活性な濃度を、余剰又は不足から、対象の年令及び性別にとって正常である範囲内となるように回復させることが関与している場合に、特に利用される。このような場合、該方法には、存在する場合、多型が体内に存在している対象が治療に対し応答することが予想されている状態で、かかる余剰及び不足の状態が成果としてもたらされるような形で遺伝子の発現をアップレギュレート又はダウンレギュレートする感受性多型の有無を検知する段階が含まれる。
【０２７１】
例２
この例は、ＡＣＳのリスクと結びつけられているものとして本明細書で同定されたＳＮＰと連鎖不平衡状態にあるＳＮＰとの置換について記述しており、かかるＳＮＰが、ＳＮＰ評点を導出する際に匹敵する有用性を有し得ることを示している。ここでは、ＬＤ状態のＳＮＰが本明細書で列挙された特異的ＳＮＰに置換される場合に、ＳＮＰ評点を導出するために、代替的ＳＮＰを使用することができる。これを例示する目的で、１１ＳＮＰパネル内でＴＬＲ４Ｔｈｒ３９９ＩｌｅＣ／ＴＳＮＰでＴＬＲ４Ａｓｐ２９９ＧｌｙＡ／ＧＳＮＰを置換した。これら２つのＳＮＰは、連鎖不平衡状態にあるものとして報告されている（Ａｓｐ２９９Ｇｌｙ多型のＧ対立遺伝子は、ほぼつねにＴｈｒ３９９Ｉｌｅ多型のＴ対立遺伝子と一緒に分離するものと報告されている）。この同時分離は、下表３３に示されており、ここでＡｓｐ２９９Ｇｌｙ多型とＴｈｒ３９９Ｉｌｅ多型の遺伝子型の間には９９％の一致がある（遺伝子型決定の「不首尾」は除外される）。
【０２７２】
表３３．ＴＬＲ４２９９と３９９多型間の一致
【表４１】
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【０２７３】
表３４は、１１ＳＮＰパネルについてＴＬＲ４Ａｓｐ２９９ＧｌｙＳＮＰがＴＬＲ４Ｔｈｒ３９９ＩｌｅＳＮＰで置き換えられた場合のＡＣＳ及び対照グループ内のＳＮＰ評点の分布を示している。ＳＮＰ評点を導出する上で、これはすなわち、ＡＧ／ＧＧ遺伝子型についての評点（保護性＝＋１）をＣＴ／ＴＴ遺伝子型（保護性＝＋１）についての評点と置換すること及び、後者を用いて該評点を計算することを意味している。表３４中の陰影のついたます目は、表３１に示された匹敵するグループと比べた差異を識別している。図４に描かれているグラフは、該評点をグラフ表示しており、図１のものと類似している。
【０２７４】
表３４．ＳＮＰ評点置換された１１ＳＮＰパネルに従ったＡＣＳを有する人の分布
【表４２】
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【０２７５】
従って、本明細書でＳＮＰ評点を導出するために使用されたＳＮＰとＬＤ状態にあるＳＮＰを、臨床的に意味ある評点を導出するためにＬＤ状態にあるＳＮＰと置換することが可能である。
【０２７６】
下表３６は、本明細書で表３０に特定されている多型と連鎖不平衡状態にある多型の代表例を提示している。かかる多型の例は、www.hapmap.orgで入手可能であるもののような公開データベースを用いて位置づけできる。特定された多型は、カッコ内に標示されている。当業者であれば、認識する通り、提供されたｒｓ番号は各々の多型に一意的な識別子である。
【０２７７】
これらの結果は、表３５からのものといった本明細書で列挙されているＳＮＰとＬＤ状態にあるＳＮＰが、類似の臨床的有用性でＳＮＰ評点において利用可能である、ということを示している。
【０２７８】
表３５．感受性又は保護性表現型のいずれかと結びつけられたＳＮＰと連鎖不平衡状態にあるＳＮＰ
【０２７９】
【表４３】
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【０２８０】
【表４４】
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【０２８１】
【表４５】
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【０２８２】
【表４６】
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【０２８３】
【表４７】
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【０２８４】
【表４８】
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【０２８５】
【表４９】
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【０２８６】
【表５０】
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【０２８７】
【表５１】
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【産業上の利用可能性】
【０２８８】
本発明は、対象のＡＣＳを発症するリスクを評価するための方法に向けられている。該方法は、ＡＣＳ発症リスクの増加又は減少と結びつけられるものとして本明細書に示されている多型の分析、又はかかる分析から得られた結果の分析を含んで成る。対象のリスクの評価における、ＡＣＳ発症リスクの増加又は減少と結びつけられるものとして本明細書に示されている多型の使用も、かかる評価に適したヌクレオチドプローブ及びプライマー、キット及びマイクロアレイと同様、提供されている。本明細書で記述されている多型を有する対象の治療方法も同じく提供されている。本明細書で記述されている多型と結びつけられた遺伝子の発現を変調させることのできる化合物についてスクリーニングするための方法も同様に提供されている。
【０２８９】
本明細書に参照指示又は言及されている全ての特許、刊行物、科学的論文及びその他の文書及び材料は、本発明が関係する当業者の技能レベルを標示するものであり、各々のこのような参照指示された文書及び材料はここに、その全体が個別に参考として内含されたか又はその全体が本明細書に説明された場合と同程度で、参考として本明細書に内含される。出願人は、いずれかのこのような特許、刊行物、科学的論文、ウェブサイト、電子的に入手可能な情報そしてその他の参照指示された資料又は文書からの任意の及び全ての材料及び情報を本明細書の中に物理的に内含させる権利を留保する。
【０２９０】
本明細書で記述されている特定の方法はさまざまな実施形態又は好ましい実施形態を代表しており、一例にすぎず、本発明の範囲に対する制限として意図されてはいない。その他の目的、態様、例及び実施形態は、本明細書を考慮した時点で当業者にとって明らかとなり、クレームの範囲により定義される通りの本発明の精神の中に包含される。当業者にとっては、本発明の範囲及び精神から逸脱することなく、本明細書で開示されている本発明に対しさまざまな置換及び修正を加えることができるということが直ちに明らかとなるだろう。本明細書に例示的に記述された本発明は、本明細書では不可欠なものとして特定的に開示されていないあらゆる要素（単複）又は制限（単複）が無い場合でも、適切に実施可能である。かくして、例えば、本明細書の各ケースにおいて、本発明の実施形態又は実施例の中で、「〜を含む（comprising）」、「〜基本的に〜から成る（consisting essentially of）」及び「〜から成る（consisting of）」という用語はいずれも、明細書中で他の２つの用語のいずれででも置き換えることができ、かくして、本発明のさまざまな変形実施形態の異なる範囲をもつ付加的な例を標示している。同様に、「〜を含む（comprising）」、「〜を内含する（including）」、「〜を含有する（containing）」などの用語は、制限的意味なく発展的に解決されるべきものである。本明細書に適切に例示的に記述されている方法及びプロセスは、異なる順序の段階で実践可能であり、これらは本明細書中又はクレーム中で示されている順序の段階に必ずしも制約されるわけではない。同様に、本明細書及び添付のクレーム中で使用されている単数形態「ａ」、「ａｎ、及び「ｔｈｅ」は、前後関係から相反する明確な指示のないかぎり、複数の参照指示をも含む。かくして、例えば、「a host cell（宿主細胞）」には複数のこのような宿主細胞も含まれる（例えばその培養又は集団）。いかなる状況下であれ、該特許を、本明細書で特定的に開示されている特定の例又は実施形態又は方法に制限されるべきものとして解釈してはならない。かかる供述が特定的にかつ資格又は留保条件無く出願人による書面による回答内で明示的に採用されているのでないかぎりいかなる状況下であれ、該特許をいずれかの審査官又は特許庁のその他のいずれかの職員又は従業員による何らかの供述によって制限されるべきものとして解釈してはならない。
【０２９１】
使用されている用語及び表現は記述的用語として用いられており、制限的用語として用いられるものでなく、かかる用語及び表現の使用には、図示され記述された特長又はその一部分の任意の等価物を排除する意図は全くなく、請求されている通りの本発明の範囲内でさまざまな修正が可能であることが認識されている。かくして、本発明は好ましい実施形態及び任意の特長によって特定的に開示されてきたが、当業者であれば、本明細書に開示されている概念の修正及び変形という手段を使用することができ、かかる修正及び変形は本発明の範囲内に入るものとみなされる、ということを理解すべきである。
【図面の簡単な説明】
【０２９２】
【図１】１１ＳＮＰパネルから誘導されたＳＮＰ評点に対してプロットされたＡＣＳの頻度を示すグラフを描いている。
【図２】１５ＳＮＰパネルから誘導されたＳＮＰ評点に対してプロットされたＡＣＳの頻度を示すグラフを描いている。
【図３】１１ＳＮＰパネルから誘導されたＳＮＰ評点に従ったＡＣＳを有する対数オッズを示すグラフを描いている。
【図４】置換された１１ＳＮＰパネルから誘導されたＳＮＰ評点に対するＡＣＳの頻度を示すグラフである。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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2010525788.tif 000060
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