(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
特異的標的細胞抗原に応答するＴ細胞受容体を同定する方法であって、
複数の標的細胞を有する基体を提供すること；
前記基体上の前記標的細胞をＣＤ８＋Ｔ細胞と接触すること；及び、
標識のない光学イメージングを使用してＴ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少を同定することを含み、
Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少は、前記Ｔ細胞が前記標的細胞上に提示された抗原によって活性化されたＴ細胞受容体を有することを示す、前記方法。
【請求項２】
前記Ｔ細胞の質量の増大が検出され、及び前記Ｔ細胞が前記標的細胞上に提示された抗原によって活性化されたＴ細胞受容体を有することを示す、または、前記標的細胞の質量の減少が、接触しているＴ細胞が前記標的細胞上に提示された抗原によって活性化されるＴ細胞受容体を有することを示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
標的細胞の死が、光学顕微鏡法を使用して定性的にモニターされる、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
活性化されるＴ細胞を選択すること、及び／もしくは単離すること、ならびに／または、
活性化されるＴ細胞を選択すること、培養すること、もしくは、貯蔵すること、ならびに／または、
選択されるＴ細胞からＴ細胞受容体をクローニングすること、
をさらに含む、請求項１−３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記標的細胞が、マイクロチャネルに配置される、または、
前記標的細胞が、基体上のマイクロウェルに配置される、
請求項１−４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
前記標的細胞が、基体上のマイクロウェルに配置され、及び、
前記基体は、少なくとも１０のマイクロウェル、または、少なくとも１００のマイクロウェル、または、少なくとも１０００のマイクロウェルを含む、
請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記マイクロウェルは、平均でマイクロウェル当たり１つのＴ細胞を含む、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記マイクロウェルが、重合体から製造される、または、
前記マイクロウェルが、ケイ素基体にエッチングされる、
請求項６または７に記載の方法。
【請求項９】
前記基体が、反射性である、請求項１−８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記標識のない光学イメージングを使用することが、Ｔ細胞質量及び／または標的細胞質量における変化によって生じる前記Ｔ細胞及び／または標的細胞を通過する光の相変化を検出することを含む、請求項１−９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記標識のない光学イメージングが、定量的相イメージング顕微鏡法を含む、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記標識のない光学イメージングが、生細胞干渉法（ＬＣＩ）、デジタルホログラフィー及び側方シアリング干渉からなる群より選択される方法を含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記標識のない光学イメージングが：
試験光線と参照光線との間の微小な相シフトを測定するように適応された干渉顕微鏡の観察チャンバに前記基体を提供すること；
照明波長にて試験光線に細胞を曝露すること；
細胞を通って広がる試験光線と参照光線との間の微小な相シフトを測定すること；及び、
Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少の計測として、前記微小な相シフトまたはそこから由来したパラメーターを使用すること、
を含む、生細胞干渉法を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記微小な相シフトが、その質量変化が決定される細胞の全ての投影された領域間で積分される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少の前記計測が、パラメーターｍとして算出される請求項１３に記載の方法：
【数１】
0006367318.tif 000008
式中、φは、測定された微小な相シフトであり、λは、照明波長であり、及び積分は、全ての細胞領域、Ａ全体で行われる。
【請求項１６】
Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少の前記計測は、
【数２】
0006367318.tif 000009
として算出され、式中、ｍは、細胞乾燥質量であり、φλは、測定された相シフトであり、ｋは、５．５６ｐｇ／μｍ３として得られる質量変換因子であり、及びＡは、投影された領域である、請求項１３に記載の方法。
【請求項１７】
顕微鏡に機能的に接続された検出器；
複数のマイクロウェルを含む基体を含む試料チャンバ（灌流イメージングチャンバ）；及び、
ビームスプリッタ、参照ミラー及び、試料チャンバを介して光路長を補償する参照流体チャンバを含む干渉計
を含む生細胞干渉計システムを使用して行われる、請求項１３−１６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
前記試料チャンバが、チャンバ内の細胞培地を循環させるために適応された少なくとも１つの灌流導管を含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記生細胞干渉計システムが、１つまたは複数の細胞のイメージを処理する、及び格納するように適応されたプロセッサエレメント及びメモリ貯蔵エレメントを含む、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記標識のない光学イメージングが、透過白色光顕微鏡に取り付けられた四波側方シアリング干渉計を使用する側方シアリング干渉を含む、請求項１２に記載の方法。
【請求項２１】
細胞（群）の質量が、どのように細胞（群）の質量が時間にわたって変化するかを観察するために複数回観察される、請求項１−２０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２２】
複数の細胞の質量を定量化するために使用される、請求項１−２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２３】
前記標的細胞が、癌幹細胞、転移性細胞、病原体に感染した細胞、異種のタンパク質またはペプチドを発現する構築物をトランスフェクトした組換え細胞からなる群から選択される細胞を含む、請求項１−２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記標的細胞は、癌の細胞を含む、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記標的細胞は、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、副腎皮質癌腫、カポジ肉腫、肛門癌、虫垂癌、星細胞腫、非定型奇形様／横紋筋腫瘍、胆管癌、肝臓外癌、膀胱癌、骨癌、脳幹膠腫、星細胞腫、脊髄腫瘍、中枢神経系非定型奇形腫様／横紋筋腫瘍、中枢神経系胚芽腫、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣細胞腫、乳癌、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、類癌腫、心臓腫瘍、子宮頸癌、脊索腫、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、慢性骨髄増殖性障害、大腸癌、結腸直腸癌、頭蓋咽頭腫、皮膚ｔ−細胞リンパ腫、胆管癌、肝臓外癌、非浸潤性乳管癌（ＤＣＩＳ）、胚芽腫、子宮体癌、上衣細胞腫、食道癌、鼻腔神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝臓外胆管癌、眼内メラノーマ、網膜芽細胞腫、骨の線維性組織球腫、悪性及び骨肉腫、胆嚢癌、胃の（胃）癌、胃腸管系類癌腫、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、卵巣癌、精巣癌、頭蓋外癌、性腺外癌、毛様細胞性白血病、頭頚部癌、心臓癌、肝細胞性（肝臓）癌、組織球症、ランゲルハンス細胞癌、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、眼内メラノーマ、島細胞腫瘍、膵神経内分泌腫瘍、腎臓癌、ランゲルハンス細胞組織球増殖症、喉頭癌、白血病、急性リンパ芽球性（ＡＬＬ）、急性骨髄様（ＡＭＬ）、慢性リンパ性（ＣＬＬ）、慢性骨髄性（ＣＭＬ）、有毛細胞、唇及び経口腔癌、肝癌（原発性）、非浸潤性小葉癌（ＬＣＩＳ）、肺癌、リンパ腫、皮膚Ｔ−細胞癌、ホジキン、非ホジキン、原発性中枢神経系（ＣＮＳ）、マクログロブリン血症、ワルデンストレーム、雄型乳癌、メラノーマ、メルケル細胞癌腫、中皮腫、転移性頚部扁平上皮癌、正中線路癌腫、口癌、多発性内分泌腺腫、多発性骨髄腫／血漿細胞新生物、菌状息肉腫、骨髄異形成症候群、骨髄性白血病、慢性病患者（ＣＭＬ）、多発性骨髄腫、経鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽腫、口腔癌、唇、及び口咽頭癌、骨肉腫、卵巣癌、膵癌、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び経鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、クロム親和性細胞腫、下垂体腫瘍、血漿細胞新生物、胸膜肺芽細胞腫、原発性中枢神経系（ＣＮＳ）リンパ腫、前立腺癌、直腸癌、腎臓細胞（腎臓）癌、腎臓骨盤及び輸尿管、移行細胞癌、横紋筋肉腫、唾液腺癌、肉腫、皮膚癌、小腸癌、扁平上皮癌、隠れた原発性である頚部扁平上皮癌、胃の（胃）癌、精巣癌、喉頭癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、栄養膜腫瘍、輸尿管及び腎盂癌、尿道癌、子宮癌、子宮体癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ワルデンストレームマクログロブリン血症及びウィルムス腫瘍からなる群から選択される癌細胞を含む、請求項２４に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
この出願は、２０１３年５月２４日に出願されたＵＳＳＮ  ６１／８２７，３７８の利益及びそれに対する優先権を主張し、全ての目的のためにその全体が参照により本明細書に援用される。
【０００２】
政府の支援の記載
この研究は、国立衛生研究所からの認可番号Ｔ３２ＣＡ００９１２０及びＫ２５ＣＡ１５７９４０によって支援された。政府は、本発明に一定の権利を有する。
【背景技術】
【０００３】
ＣＤ８＋Ｔリンパ球媒介細胞毒性は、ウイルス及び癌に対する適応免疫応答の重要な構成要素であり、及び自己免疫（Ｋａｌｉｎｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．  （２００６）  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．，  ３６：  １３７−１４６；  Ｔｕｍａ  ａｎｄ  Ｐａｍｅｒ  （２００２）  Ｃｕｒｒ．  Ｏｐｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １４：  ３４８−３５３）にも関係する。Ｔ細胞によって媒介される細胞毒性は、標的細胞死またはエフェクター細胞の細胞毒性能の代理マーカーによって典型的には測定される。標準アッセイは、５１Ｃｒ放出アッセイ及びＥＬＩＳＰＯＴであり、その両方が全リンパ球集団または部分母集団応答の一括測定を提供する（Ｈｏｂｅｉｋａ  ｅｔ  ａｌ．  （２００５）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ２８：  ６３−７２；  Ｍａｌｙｇｕｉｎｅ  ｅｔ  ａｌ．  （２００７）  Ａｄｖ．  Ｅｘｐ．  Ｍｅｄ．  Ｂｉｏｌ．  ６０１：  ２７３−２８４）。ペプチド−ＭＨＣ四量体及び微少溶液プラットホームの導入により、Ｔ細胞抗原特異性及びサイトカイン分泌の解析を介した細胞毒性の代理計測が可能になった（Ｈｏｂｅｉｋａ  ｅｔ  ａｌ．  （２００５）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ２８：  ６３−７２；  Ｋｗｏｎｇ  ｅｔ  ａｌ．  （２００９）  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．  Ｓｏｃ．  １３１：  ９６９５−９７０３；  Ｍａ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｎａｔ．  Ｍｅｄ．  １７：  ７３８−７４３）。単一細胞レベルにてＴリンパ球媒介細胞毒性を直接追跡することは、混合集団内の細胞障害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）を解析するために有益であり、これは癌細胞に対するＴ細胞認識を評価するために特に関連する。生存可能なＣＴＬは、場合によっては培養すること、及びさらに増殖することができ、または免疫原性ペプチドに対して最適な特異性を有する対応するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）は、臨床状況における利用のために分子的にクローン化することができる（Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ  ｅｔ  ａｌ．（２００８）Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．  Ｃａｎｃｅｒ、８：２９９−３０８）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】ＵＳＳＮ  ６１／８２７，３７８
【非特許文献】
【０００５】
【非特許文献１】Ｋａｌｉｎｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．  （２００６）  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．，  ３６：  １３７−１４６
【非特許文献２】Ｔｕｍａ  ａｎｄ  Ｐａｍｅｒ  （２００２）  Ｃｕｒｒ．  Ｏｐｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １４：  ３４８−３５３
【非特許文献３】Ｈｏｂｅｉｋａ  ｅｔ  ａｌ．  （２００５）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ２８：  ６３−７２
【非特許文献４】Ｍａｌｙｇｕｉｎｅ  ｅｔ  ａｌ．  （２００７）  Ａｄｖ．  Ｅｘｐ．  Ｍｅｄ．  Ｂｉｏｌ．  ６０１：  ２７３−２８４
【非特許文献５】Ｈｏｂｅｉｋａ  ｅｔ  ａｌ．  （２００５）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ２８：  ６３−７２
【非特許文献６】Ｋｗｏｎｇ  ｅｔ  ａｌ．  （２００９）  Ｊ．  Ａｍ．  Ｃｈｅｍ．  Ｓｏｃ．  １３１：  ９６９５−９７０３
【非特許文献７】Ｍａ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｎａｔ．  Ｍｅｄ．  １７：  ７３８−７４３
【非特許文献８】Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ  ｅｔ  ａｌ．（２００８）Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．  Ｃａｎｃｅｒ、８：２９９−３０８
【非特許文献９】Ｂａｌａｇｏｐａｌａｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １１：  ２１−３３
【非特許文献１０】Ｄｅｌｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｒｅｖ．  １８９：  ５１−６３
【非特許文献１１】Ｓａｕｃｅ  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  Ｊ．  Ｈｅｍａｔｏｔｈｅｒ．  Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｓ．  １１：  ９２９−９４０
【非特許文献１２】Ｔｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００８）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ３１：  ７４２−７５１
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
光学顕微鏡により、標的細胞認識及び死滅の完全な状況の、ＣＴＬの直接の同定及びトラッキングができる。エピフルオレッセンス、共焦点顕微鏡法、総内面反射蛍光及び２光子レーザ走査顕微鏡法などの光学イメージング法がリンパ球活性化の研究のために探られてきたが、細胞を追跡し、及び定量化するために典型的には抗体または抱合されたタンパク質標識化を必要とする（Ｂａｌａｇｏｐａｌａｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １１：  ２１−３３；  Ｄｅｌｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｒｅｖ．  １８９：  ５１−６３）。これは、典型的な蛍光標識法技術のために必要とされる、多様な表現型に関連した形質導入の非効率性、並びにインビトロ培養の間の消耗または老化に向かう進行性の分化のために、Ｔリンパ球の研究への適用可能性を制限する（Ｓａｕｃｅ  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  Ｊ．  Ｈｅｍａｔｏｔｈｅｒ．  Ｓｔｅｍ  Ｃｅｌｌ  Ｒｅｓ．  １１：  ９２９−９４０；  Ｔｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００８）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ３１：  ７４２−７５１）。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
１）細胞の活性化を介してこれらの質量を増加させること；及び／または２）活性化を介してこれらの質量蓄積速度を増加させること；及び／または３）標的細胞を死滅させることを介して標的細胞質量を減少させることによって特異的標的細胞抗原に応答する有用なＴリンパ球を同定するための方法が提供される。Ｔ細胞及び／または標的細胞（標的抗原を有する）の質量における変化は、標識のない光学イメージング技術（たとえば、ＬＳＩ、側方シアリング干渉、デジタルホログラフィー顕微鏡法及び同様のもの）を使用して同定される。
【０００８】
したがって、種々の態様において、本明細書において想定される方法（類）は、以下の実施形態のいずれか１つまたは複数を含んでいてもよいが、制限される必要はない：
【０００９】
実施形態１：特異的標的細胞抗原に応答するＴ細胞受容体を同定する方法であって、前記方法は：複数の標的細胞を有する基体を提供すること；前記基体上の前記標的細胞をＣＤ８＋Ｔ細胞と接触すること；及び、標識のない光学イメージングを使用してＴ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少を同定することを含み、Ｔ細胞の質量の増大または標的細胞の質量の減少は、前記Ｔ細胞が前記標的細胞上に提示された抗原によって活性化されたＴ細胞受容体を有することを示す、前記方法。
【００１０】
実施形態２：Ｔ細胞の質量の増大が検出され、及び前記Ｔ細胞が前記標的細胞上に提示された抗原によって活性化されたＴ細胞受容体を有することを示す、実施形態１の方法。
【００１１】
実施形態３：標的細胞質量の減少は、接触しているＴ細胞が前記標的細胞上に提示された抗原によって活性化されるＴ細胞受容体を有することを示す、実施形態１−２のいずれか１つに記載の方法。
【００１２】
実施形態４：標的細胞の死は、光学顕微鏡法を使用して定性的にモニターされる、実施形態１−３のいずれか１つに記載の方法。
【００１３】
実施形態５：活性化されるＴ細胞を選択すること、及び／または単離することをさらに含む、実施形態１−４のいずれか１つに記載の方法。
【００１４】
実施形態６：活性化されるＴ細胞を選択すること、培養すること、または貯蔵することをさらに含む実施形態１−５のいずれか１つに記載の方法。
【００１５】
実施形態７：前記方法は、マイクロマニピュレーターを使用して活性化されたＴ細胞を選択することを含む、実施形態５−６のいずれか１つに記載の方法。
【００１６】
実施形態８：選択されるＴ細胞からＴ細胞受容体をクローニングすることをさらに含む、実施形態５−７のいずれか１つに記載の方法。
【００１７】
実施形態９：前記標的細胞は、静置培養である、実施形態１−８のいずれか１つに記載の方法。
【００１８】
実施形態１０：前記標的細胞は、マイクロチャネルに配置される、実施形態１−８のいずれか１つに記載の方法。
【００１９】
実施形態１１：前記標的細胞は、基体上のマイクロウェルに配置される、実施形態１−８のいずれか１つに記載の方法。
【００２０】
実施形態１２：前記基体は、少なくとも１０のマイクロウェルを含む、実施形態１１に記載の方法。
【００２１】
実施形態１３：前記基体は、少なくとも１００のマイクロウェルを含む、実施形態１１に記載の方法。
【００２２】
実施形態１４：前記基体は、少なくとも１０００のマイクロウェルを含む、実施形態１１に記載の方法。
【００２３】
実施形態１５：前記Ｔ細胞は、前記マイクロウェルに導入される、実施形態１１−１４のいずれか１つに記載の方法。
【００２４】
実施形態１６：マイクロウェルは、平均でマイクロウェル当たり約１つのＴ細胞を含む、実施形態１５に記載の方法。
【００２５】
実施形態１７：前記マイクロウェルは、重合体から製造される、実施形態１１−１６のいずれか１つに記載の方法。
【００２６】
実施形態１８：前記マイクロウェルは、水のものとほぼ等しい屈折率をもつ重合体（たとえば、ＭＹ１３３、ＭＹ重合体からのＵＶ−硬化性重合体）から製造される、実施形態１７に記載の方法。
【００２７】
実施形態１９：前記マイクロウェルは、ＰＤＭＳで製造される、実施形態１７に記載の方法。
【００２８】
実施形態２０：前記マイクロウェルは、ケイ素基体にエッチングされる、実施形態１１−１６のいずれか１つに記載の方法。
【００２９】
実施形態２１：前記基体は、反射性である、実施形態１−２０のいずれか１つに記載の方法。
【００３０】
実施形態２２：前記標識のない光学イメージングを使用することは、Ｔ細胞質量及び／または標的細胞質量における変化によって生じる前記細胞（群）を通過する光の相変化を検出することを含む、実施形態１−２１のいずれか１つに記載の方法。
【００３１】
実施形態２３：前記標識のない光学イメージングは、定量的相イメージング顕微鏡法を含む、実施形態２２に記載の方法。
【００３２】
実施形態２４：前記標識のない光学イメージングは、生細胞干渉法（ＬＣＩ）、デジタルホログラフィー及び側方シアリング干渉からなる群より選択される方法を含む、実施形態２３に記載の方法。
【００３３】
実施形態２５：生細胞干渉法を含む前記標識のない光学イメージングは：試験光線と参照光線との間の微小な相シフトを測定するように適応された干渉顕微鏡の観察チャンバに前記基体を提供すること；照明波長にて試験光線に細胞を曝露すること；細胞を通って広がる試験光線と参照光線との間の微小な相シフトを測定すること；及び、Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少の計測として、前記微小な相シフトまたはそこから由来したパラメーターを使用すること、
を含む、実施形態２４に記載の方法。
【００３４】
実施形態２６：前記微小な相シフトは、その質量変化が決定される細胞の実質的に全ての投影された領域間で積分される、実施形態２５に記載の方法。
【００３５】
実施形態２７：Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少の前記計測は、パラメーターｍとして算出される実施形態２５に記載の方法：
【数１】
0006367318.tif 000002
式中、φは、測定された微小な相シフトであり、λは、照明波長であり、及び積分は、全ての細胞領域、Ａ全体で行われる。
【００３６】
実施形態２８：Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少の前記計測は、
【数２】
0006367318.tif 000003
として算出され、式中、ｍは、細胞乾燥質量であり、φλは、測定された相シフトであり、ｋは、５．５６ｐｇ／μｍ３として得られる質量変換因子であり、及びＡは、投影された領域である、実施形態２５に記載の方法。
【００３７】
実施形態２９：生細胞干渉計システムを使用して行われる方法は：
顕微鏡に機能的に接続された検出器；
複数のマイクロウェルを含む前記基体を含む試料チャンバ（灌流イメージングチャンバ）；及び、
ビームスプリッタ、参照ミラー及び試料チャンバを介して光路長を補償する参照流体チャンバを含む干渉計
を含む、実施形態２５−２８のいずれか１つに記載の方法。
【００３８】
実施形態３０：試料チャンバは、チャンバ内の細胞培地を循環させるために適応された少なくとも１つの灌流導管を含む、実施形態２９に記載の方法。
【００３９】
実施形態３１：生細胞干渉計システムは、１つまたは複数の細胞のイメージを処理する、及び格納するように適応されたプロセッサエレメント及びメモリ貯蔵エレメントを含む、実施形態１６に記載の方法。
【００４０】
実施形態３２：前記標識のない光学イメージングは、透過白色光顕微鏡に取り付けられた四波側方シアリング干渉計を使用する側方シアリング干渉を含む、実施形態２４に記載の方法。
【００４１】
実施形態３３：細胞（群）の質量は、どのように細胞（群）の質量が時間にわたって変化するかを観察するために複数回観察される、実施形態１−３２のいずれか１つに記載の方法。
【００４２】
実施形態３４：方法は、複数の細胞の質量を定量化するために使用される、実施形態１−３３のいずれか１つに記載の方法。
【００４３】
実施形態３５：方法は、少なくとも１，０００の異なる細胞の質量を定量化するために使用される、実施形態１−３４のいずれか１つに記載の方法。
【００４４】
実施形態３６：方法は、少なくとも１０，０００の異なる細胞の質量を定量化する使用される、実施形態１−３４のいずれか１つに記載の方法。
【００４５】
実施形態３７：前記標的細胞は、癌細胞を含む、実施形態の１−３６のいずれか１つに記載の方法。
【００４６】
実施形態３８：前記標的細胞は、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性顆粒球性白血病（ＡＭＬ）、副腎皮質癌腫、ＡＩＤＳ関連癌（たとえば、カポシ肉腫、リンパ腫）、肛門癌、虫垂癌、星細胞腫、非定型奇形様／横紋筋腫瘍、胆管癌、肝臓外の癌、膀胱癌、骨癌（たとえば、ユーイング肉腫、骨肉腫、悪性線維性組織球腫）、脳幹膠腫、脳腫瘍（たとえば、星状細胞腫、脳及び脊髄腫瘍（脳幹膠腫）中枢神経系非定型奇形腫様／横紋筋腫瘍、中枢神経系胚芽腫、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣細胞腫、乳癌、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、類癌腫（たとえば、小児、胃腸管系）、心臓腫瘍、子宮頸癌、脊索腫、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、慢性骨髄増殖性障害、結腸癌、結腸直腸癌、頭蓋咽頭腫、皮膚ｔ−細胞リンパ腫、管癌、たとえば（胆管、肝臓外）、乳管上皮内癌（ＤＣＩＳ）、胚芽腫、子宮体癌、上衣細胞腫、食道癌、神経上皮腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝臓外胆管癌は、眼癌（たとえば、眼内メラノーマ、網膜芽細胞腫）、骨の線維性組織球腫、悪性及び骨肉腫、胆嚢癌、胃の（胃）癌、胃腸管系類癌腫、消化管間質腫瘍（ＧＩＳＴ）、胚細胞腫瘍（たとえば、卵巣癌、精巣癌、頭蓋外癌、性腺外癌、中枢神経系）、妊娠性栄養膜腫瘍、脳幹癌、毛様細胞性白血病、頭頚部癌、心臓癌、肝細胞性（肝臓）癌、組織球症、ランゲルハンス細胞癌、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、眼内メラノーマ、島細胞腫瘍、膵神経内分泌腫瘍、カポシ肉腫、腎臓癌（たとえば、腎細胞、ウィルムス腫瘍、及びその他の腎臓腫瘍）、ランゲルハンス細胞組織球増殖症、喉頭癌、白血病、急性リンパ芽球性（ＡＬＬ）、急性骨髄様（ＡＭＬ）、慢性リンパ性（ＣＬＬ）、慢性骨髄性（ＣＭＬ）、有毛細胞、唇及び経口腔癌、肝癌（原発性）、上皮内小葉癌（ＬＣＩＳ）、肺癌（たとえば、幼年期、非小細胞、小細胞）、リンパ腫（たとえば、ＡＩＤＳ関連バーキット（たとえば、非ホジキンリンパ腫）、皮膚Ｔ−細胞（たとえば、菌状息肉腫、セーザリー症候群）、ホジキン、非ホジキン、原発性中枢神経系（ＣＮＳ））、マクログロブリン血症、ワルデンストレーム、雄型乳癌、悪性骨及び骨肉腫の線維性組織球腫、メラノーマ（たとえば、小児、眼内（眼））、メルケル細胞癌腫、中皮腫、転移性鱗屑状の頚部癌、正中線路癌腫、口癌、多発性内分泌腺腹、多発性骨髄腫／血漿細胞新生物、菌状息肉腫、骨髄異形成症候群、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、多発性骨髄腫、経鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽腫、口腔癌、唇及び口咽頭癌、骨肉腫、卵巣癌、膵癌、膵神経内分泌腫瘍（島細胞腫瘍）、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、クロム親和性細胞腫、下垂体腫瘍、血漿細胞新生物、胸膜肺芽細胞腫、原発性中枢神経系（ＣＮＳ）リンパ腫、前立腺癌、直腸癌、腎臓の細胞（腎臓）癌、腎臓の骨盤及び輸尿管、移行細胞癌、横紋筋肉腫、唾液腺癌、肉腫（たとえば、ユーイング、カポジ、骨肉腫、ラドミオサルコーマ、軟部組織、子宮）、セーザリー症候群、皮膚癌（たとえば、メラノーマ、メルケル細胞癌腫、基底細胞癌、非メラノーマ）、小腸癌、扁平上皮癌、隠れた原発性である鱗屑状頚部癌、胃の（胃）癌、精巣癌、喉頭癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、栄養膜腫瘍、輸尿管及び腎盂癌、尿道癌、子宮癌、子宮体癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ワルデンストレームマクログロブリン血症及びウィルムス腫瘍からなる群より選択される癌の細胞を含む、実施形態３７に記載の方法。
【００４７】
実施形態３９：前記標的細胞は、乳癌、中枢神経系癌、子宮頸癌、結腸直腸癌、精巣癌、卵巣癌、白血病、リンパ腫、メラノーマ、軟部組織肉腫、精巣癌及び甲状腺癌からなる群より選択される癌細胞を含む、実施形態３７に記載の方法。
【００４８】
実施形態４０：前記標的細胞は、癌幹細胞を含む、実施形態３７に記載の方法。
【００４９】
実施形態４１：前記標的細胞は、転移性細胞を含む、実施形態３７に記載の方法。
【００５０】
実施形態４２：前記標的細胞は、病原体に感染した細胞を含む、実施形態１−３６のいずれか１つに記載の方法。
【００５１】
実施形態４３：前記標的細胞は、細菌、真菌及びウイルスからなる群より選択される病原体に感染した細胞を含む、実施形態４２に記載の方法。
【００５２】
実施形態４４：前記標的細胞は、異種のタンパク質またはペプチドを発現する構築物をトランスフェクトした組換え細胞を含む、実施形態１−３６のいずれか１つに記載の方法。
【図面の簡単な説明】
【００５３】
【図１】生細胞干渉計（ＬＣＩ）の一つの実施形態を模式的に示す。この図解では、非限定的な実施形態ではあるが、ＬＣＩは、観察チャンバに置かれた試料の光学的厚さと、比較セルの光学的厚さを比較するマイケルソン−タイプ干渉顕微鏡を含む。反映する基体を観察チャンバに懸濁させ、ＬＣＩにより透明な細胞での光学的厚さの測定を行うことができる。顕微鏡対物レンズの相対位置及び観察チャンバは、コンピュータによって制御することができ、及び３次元で変換でありえ、迅速な自動化された画像獲得ができる。生細胞干渉計は、粘着性及び非粘着細胞の両方の質量を測定することができる。
【図２Ａ】Ｔ及び標的細胞のＬＣＩ測定質量を示す。図２Ａ：Ｔ細胞質量測定実験のための作業の流れ。ドナー末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）には、ＭＡＲＴ１特異的、Ｆ５  ＴＣＲを形質導入し、及びＣＤ８＋Ｔ細胞について濃縮される。これらのＴ細胞のサブセットをフローサイトメトリーによって解析して、５０％を超える形質導入効率を確認する。残りの細胞をＬＣＩでＭＡＲＴ１を発現するＨＬＡ一致（またはミスマッチ対照）Ｍ２０２標的細胞をイメージングする。図２Ｂ：活性化されたＦ５を形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞、いくつかの非応答性Ｔ細胞及び死滅標的細胞における相シフト及び質量分布を示す試料ＬＣＩデータ。
【図２Ｂ】Ｔ及び標的細胞のＬＣＩ測定質量を示す。図２Ａ：Ｔ細胞質量測定実験のための作業の流れ。ドナー末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）には、ＭＡＲＴ１特異的、Ｆ５  ＴＣＲを形質導入し、及びＣＤ８＋Ｔ細胞について濃縮される。これらのＴ細胞のサブセットをフローサイトメトリーによって解析して、５０％を超える形質導入効率を確認する。残りの細胞をＬＣＩでＭＡＲＴ１を発現するＨＬＡ一致（またはミスマッチ対照）Ｍ２０２標的細胞をイメージングする。図２Ｂ：活性化されたＦ５を形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞、いくつかの非応答性Ｔ細胞及び死滅標的細胞における相シフト及び質量分布を示す試料ＬＣＩデータ。
【図３】（パネルＡ−Ｅ）は、ＣＤ８＋濃縮されたＰＢＭＣの形質導入を図示す。（Ａ）ドナーＰＢＭＣの典型的な形質導入効率を示す形質導入されたＴ細胞のフローサイトメトリーデータ。（パネルＢ）ＣＤ８＋Ｔ細胞濃縮効率を示すＣＤ８＋濃縮された集団のフローサイトメトリー。（パネルＣ）ＨＬＡ一致ＭＡＲＴ１を発現するＭ２０２細胞の共培養後の、Ｆ５形質導入したＣＤ８＋濃縮されたＴ細胞活性化を実証するＩＦＮｇ放出アッセイ。負の対照Ｍ２０７細胞は、ＭＡＲＴ１を発現するが、ＨＬＡミスマッチである。（パネルＤ）干渉計ステージ上の標的細胞の生存度を示す（パネルＥ）に示した健康なＭ２０２細胞の質量対時間。
【図４−１】パネルＡ−Ｍは、Ｔ細胞によって媒介される細胞毒性の間の標的細胞死のＬＣＩトラッキングを示す。パネルＡ−Ｈ：イメージングの開始の直後（ｔ＝０は、標的細胞上へＣＴＬをプレートにまいたおよそ３０分後である）に生じる単一の細胞毒性のイベントのイメージ。パネルＡ−Ｄ：ＣＴＬを媒介した標的細胞死滅の強度イメージを示すｔ＝０及び５時間のイメージング。パネルＡ及びパネルＣにおけるボックスは、イメージパネルＢ及びパネルＤにおける小領域を示す。パネルＢ及びパネルＤの矢印は、（パネルＥ−Ｉ）における質量プロファイリングによって追跡した標的細胞を示す。パネルＥ：イメージングの開始時に標的細胞との持続的接触の開始後の選択した標的細胞のＬＣＩ質量プロフィール。パネルＦ−Ｈ：死滅標的細胞のＬＣＩ質量プロフィール。。
【図４−２】パネルＩ：パネルＥ−Ｈにおいて示した標的細胞について測定した総質量対時間。パネルＪ：全時間にわたる死滅対健康な標的細胞の規準化した質量。規準化した質量は、初期質量によって割った質量である。健康な細胞は、４時間にわたって規準化された質量においておよそ１５％の増大を示す（青線は、ｎ＝３１１の健康なＭ２０２細胞の平均を示し、灰色の領域は、＋／−ＳＤを示す）。死滅した標的細胞（赤線）は、１−４時間にわたって２０〜６０％の質量の減少を示す。パネルＫ：標的細胞のほとんど完全な死滅を示すイメージングの１８時間後のパネルＡ及びパネルＣに示したステージ位置の強度イメージ。パネルＬ：非特異的Ｔ細胞をプレートにまいた標的細胞の生存度を示す、形質導入されていない（Ｆ５−）ＣＤ８＋Ｔ細胞と共にプレートにまいたＭ２０２細胞のイメージング１８時間後のステージの強度イメージ。パネルＭ：４時間にわたって質量においておよそ１５％の増大を示す、ｎ＝２０５８の形質導入されていない対照ＣＴＬで処理した健康なＭ２０２細胞についての規準化した質量対時間
【図５】パネルＡ−Ｆは、Ｔ細胞を媒介した細胞毒性間のＣＴＬ質量及び質量蓄積速度のＬＣＩ測定を示す。パネルＡ：活性化されたＣＴＬ及び対応する標的細胞の質量対時間。ｔ＝０ｈは、標的細胞が細胞死の開始時に基体から剥離する位置である。ＣＴＬ＋標的細胞は、これらを別々に測定されることができないフレームにおける両細胞の総質量をいう。パネルＢ：１０のＣＴＬによって媒介される細胞毒性イベントの規準化した質量対時間。ＣＴＬ質量は、全ての追跡についてｔ＝０ｈの位置にて使用される標的細胞形態変化時の質量に関して規準化してある。灰色線は、質量蓄積速度を決定するために使用される最良適合線を示す。パネルＣ：細胞毒性イベントの最初の１００分の間の質量蓄積においておよそ４倍の増大を示す、細胞毒性イベントの前の、細胞毒性イベントの最初の１００分の間の、及び細胞毒性イベントの最初の１００分後のＣＴＬの平均質量蓄積速度。パネルＤ：およそ３倍の質量の相違を示す、９つの非応答性及び１つの細胞障害生Ｔ細胞のＬＣＩイメージ。白い矢印は、標的細胞との持続的な接触及びその後の標的細胞死の後にこの細胞を追跡することによって決定した、活性化されたＴ細胞を示す。パネルＥ：１１６の活性化されたＣＴＬの平均質量は、非応答性対照の平均質量よりおよそ２．８倍大きい。パネルＦ：活性化されたＣＴＬの平均領域は、非活性化対照よりおよそ１．４倍大きいだけであり、及び９５％の信頼水準にて有意でなく、ＣＴＬ活性化を決定するためにＬＣＩ質量測定の有用性を示す。Ｃにおけるエラーバーは、９５％の信頼区間を示す。Ｅ及びＦにおけるエラーバーは、＋／−ＳＤを示す。＊  ｐ＜０．０５、＊＊  ｐ＜０．０１、＊＊＊  ｐ＜１０−３。ａｃｔ＝活性化／細胞毒性、１１６細胞、ｎ＝３実験。ｕｎａｃｔ＝非活性／非応答性、３５９細胞、ｎ＝３実験。Ｆ５−＝、形質導入されていない、Ｆ５-ネガティブ対照実験、５３０細胞、ｎ＝２実験。ＰＣ３＝ＰＣ３細胞、ＨＬＡミスマッチの無関係な抗原対照、３０１５細胞、ｎ＝３実験。
【図６Ａ】ＬＣＩによる５時間の観察の期間にわたる細胞障害生Ｔ細胞（ＣＤ８＋、Ｆ５  ＴＣＲ形質導入した）によって死滅される標的Ｍ２０２細胞の強度イメージ、質量分布イメージ及び質量対時間を示す４つのパネルビデオからのイメージを示す。図６Ａ：時間０；図６Ｂ：時間１時間；図６Ｃ：時間２時間；図６Ｄ：時間３時間；図６Ｅ：時間４時間；図６Ｆ：時間５時間。
【図６Ｂ】ＬＣＩによる５時間の観察の期間にわたる細胞障害生Ｔ細胞（ＣＤ８＋、Ｆ５  ＴＣＲ形質導入した）によって死滅される標的Ｍ２０２細胞の強度イメージ、質量分布イメージ及び質量対時間を示す４つのパネルビデオからのイメージを示す。図６Ａ：時間０；図６Ｂ：時間１時間；図６Ｃ：時間２時間；図６Ｄ：時間３時間；図６Ｅ：時間４時間；図６Ｆ：時間５時間
【図６Ｃ】ＬＣＩによる５時間の観察の期間にわたる細胞障害生Ｔ細胞（ＣＤ８＋、Ｆ５  ＴＣＲ形質導入した）によって死滅される標的Ｍ２０２細胞の強度イメージ、質量分布イメージ及び質量対時間を示す４つのパネルビデオからのイメージを示す。図６Ａ：時間０；図６Ｂ：時間１時間；図６Ｃ：時間２時間；図６Ｄ：時間３時間；図６Ｅ：時間４時間；図６Ｆ：時間５時間
【図６Ｄ】ＬＣＩによる５時間の観察の期間にわたる細胞障害生Ｔ細胞（ＣＤ８＋、Ｆ５  ＴＣＲ形質導入した）によって死滅される標的Ｍ２０２細胞の強度イメージ、質量分布イメージ及び質量対時間を示す４つのパネルビデオからのイメージを示す。図６Ａ：時間０；図６Ｂ：時間１時間；図６Ｃ：時間２時間；図６Ｄ：時間３時間；図６Ｅ：時間４時間；図６Ｆ：時間５時間
【図６Ｅ】ＬＣＩによる５時間の観察の期間にわたる細胞障害生Ｔ細胞（ＣＤ８＋、Ｆ５  ＴＣＲ形質導入した）によって死滅される標的Ｍ２０２細胞の強度イメージ、質量分布イメージ及び質量対時間を示す４つのパネルビデオからのイメージを示す。図６Ａ：時間０；図６Ｂ：時間１時間；図６Ｃ：時間２時間；図６Ｄ：時間３時間；図６Ｅ：時間４時間；図６Ｆ：時間５時間
【図６Ｆ】ＬＣＩによる５時間の観察の期間にわたる細胞障害生Ｔ細胞（ＣＤ８＋、Ｆ５  ＴＣＲ形質導入した）によって死滅される標的Ｍ２０２細胞の強度イメージ、質量分布イメージ及び質量対時間を示す４つのパネルビデオからのイメージを示す。図６Ａ：時間０；図６Ｂ：時間１時間；図６Ｃ：時間２時間；図６Ｄ：時間３時間；図６Ｅ：時間４時間；図６Ｆ：時間５時間
【図７】パネルＡ−Ｄは、ＬＣＩステージ上の活発な増殖及びＴ細胞の特異性を媒介した細胞毒性を示す対照標的細胞増殖状態についての、平均した、規準化された質量対時間プロットを示す。パネルＡ：Ｆ５  ＴＣＲを形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞での処理の間の無影響のＭ２０２細胞（ｎ＝６３２）。パネルＢ：Ｆ５  ＴＣＲ形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞での処理より前のＭ２０２細胞（ｎ＝１１７）。パネルＣ：Ｍ２０２細胞（ｎ＝２０５８）は、Ｆ５  ＴＣＲ陰性で処理したＣＤ８＋Ｔ細胞。パネルＤ：Ｆ５  ＴＣＲ形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞で処理した抗原無関係なＰＣ−３前立腺癌細胞（ｎ＝１００６）。線は、平均の規準化された質量対時間（最初の時点にて質量に関して規準化した）を示す。陰影のついた領域は、平均＋／−ＳＤを示す。
【図８】パネルＡ−Ｃは、ＬＣＩステージ上の恒常的増殖を示す、非応答性Ｔ細胞についての、平均した、規準化された質量対時間を示す。パネルＡ：Ｍ２０２標的細胞と共にプレートにまいた非応答性Ｆ５  ＴＣＲ形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞（ｎ＝１０１）。パネルＢ：Ｍ２０２標的細胞と共にプレートにまいた形質導入されていないＣＤ８＋Ｔ細胞（ｎ＝１４６）。パネルＣ：抗原無関係なＰＣ−３前立腺癌標的細胞と共にプレートにまいたＦ５  ＴＣＲ形質導入ＣＤ８＋Ｔ細胞（ｎ＝９５０）。
【図９】パネルＡ−Ｈは、典型的な標的細胞状態を示す１８時間のイメージング後の干渉計ステージ上の細胞の強度イメージを示す。左列は、完全なイメージフレームを示し、右列は、完全なイメージフレームのサブセットに示す。パネルＡ−（Ｄ：標的細胞のほとんど完全な死滅を示すＦ５  ＴＣＲ形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞と共にプレートにまいたＭ２０２標的細胞。比較するために、（パネルＡ−Ｆ）は、図３、パネルＡ及びＢと同じ視野を示す。パネルＣ及びＤは、単一の生細胞を示す。パネルＥ及びＦ：１８時間のイメージング及びＴ細胞媒介細胞傷害性のための同族ＴＣＲ要求の後のステージ上の生存度を示す、形質導入されていないＣＤ８＋Ｔ細胞と共にプレートにまいたＭ２０２標的細胞。パネルＧ及びＨ：Ｆ５  ＴＣＲの特異性を示す、Ｆ５  ＴＣＲを形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞と共にプレートにまいた抗原無関係なＰＣ−３前立腺癌標的細胞。
【図１０】パネルＡ−Ｊは、図５、パネルＡと同様のＣＴＬ及び対応する標的細胞についての質量対時間プロットを示す。ｔ＝０ｈは、標的細胞が細胞死の開始時に基体から剥離する位置である。ＣＴＬ＋標的細胞は、典型的にはＣＴＬと標的細胞間の重複のため、これらを別々に測定されることができないフレームにおける両細胞の総質量をいう。
【図１１Ａ】対照実験と比較した、活性化され、及び非応答性のＴ細胞についての領域ヒストグラムである。活性化＝活性化／細胞毒性Ｆ５  ＴＣＲを形質導入したＴ細胞、１１６細胞、ｎ＝３実験。非活性化＝非活性化／非応答性Ｆ５  ＴＣＲを形質導入したＴ細胞、３５９細胞、ｎ＝３実験。Ｆ５ｎｅｇ＝Ｍ２０２標的細胞と共にプレートにまいた形質導入されていないＦ５  ＴＣＲ陰性Ｔ細胞、５３０Ｔ細胞、ｎ＝２実験。ＰＣ３＝ＨＬＡミスマッチの抗原無関係なＰＣ−３前立腺癌細胞と共にプレートにまいたＦ５  ＴＣＲを形質導入したＴ細胞、３，０１５Ｔ細胞、ｎ＝３実験。
【図１１Ｂ】対照実験と比較した、活性化され、及び非応答性のＴ細胞についての領域ヒストグラムである。活性化＝活性化／細胞毒性Ｆ５  ＴＣＲを形質導入したＴ細胞、１１６細胞、ｎ＝３実験。非活性化＝非活性化／非応答性Ｆ５  ＴＣＲを形質導入したＴ細胞、３５９細胞、ｎ＝３実験。Ｆ５ｎｅｇ＝Ｍ２０２標的細胞と共にプレートにまいた形質導入されていないＦ５  ＴＣＲ陰性Ｔ細胞、５３０Ｔ細胞、ｎ＝２実験。ＰＣ３＝ＨＬＡミスマッチの抗原無関係なＰＣ−３前立腺癌細胞と共にプレートにまいたＦ５  ＴＣＲを形質導入したＴ細胞、３，０１５Ｔ細胞、ｎ＝３実験。
【図１２】Ｔ細胞を単離する際の使用のための基体上の複数のマイクロウェルの模型図を示す。
【発明を実施するための形態】
【００５４】
既知または未知の抗原に対するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）の同定は、自己抗原に対するＴＣＲの低頻度、所望のＴＣＲの低親和性及び患者当たりに利用できる組織が小量を含む理由の多様性のために癌免疫療法の開発における主要なボトルネックである。Ｔ細胞応答を測定する既存のアプローチは、大きさまたは代理のアッセイに依存し、Ｔ細胞媒介細胞傷害性の有効性を直接決定せず、及び非効率的であり、かつこれらのまれなＴ細胞の単離のためにエラーを起こしやすい。
【００５５】
所望の抗原に対して特異性をもつ望ましいＴリンパ球の同定、単離及び特性付けのための改良された方法を本明細書において記述した。種々の実施形態において、方法は、Ｔ細胞がある同族抗原を有する標的細胞が存在するときの細胞活性化の指標として細胞の質量における変化（たとえば、Ｔ細胞の質量の増大及び／または標的細胞の質量の減少）を同定するために、標識のない光学イメージングを利用する。
【００５６】
種々の実施形態において、基体は、複数の標的細胞（たとえば、癌細胞、病原体に感染した細胞、特徴マーカーを発現する細胞、構築物がトランスフェクトされて、タンパク質またはペプチド、その他を組換え発現する細胞）が配置された上に提供される。標的細胞は、細胞毒性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）と接触して、標的細胞（類）によって示された抗原を認識する／によって活性化されるＴ細胞受容体を有するこれらのＣＴＬは、これらの質量を増大する。標的細胞が死滅されると、その細胞は、質量の減少を示す。したがって、Ｔ細胞の質量の増大または標的細胞の質量の減少は、Ｔ細胞が標的細胞上に提示された抗原によって活性化されるＴ細胞受容体を有する指標である。
【００５７】
標識のない光学イメージング法を使用してＴ及び標的細胞質量変化を追跡することにより、たとえば本明細書において記述したように、方法は、Ｔ細胞を媒介した細胞毒性の間の標的及び応答するＴ細胞の直接測定を可能にし、癌に対する養子免疫処理における使用のためのＴＣＲクローニングを容易にする。これらの方法は、病原体に感染した細胞（たとえば、ウイルス、細菌、真菌その他に感染した細胞）によって活性化されたＴ細胞を同定するために、特定のペプチドまたはタンパク質及び同様のものを発現する（たとえば、組換え発現する）細胞を同定するために、同様に使用することができる。
【００５８】
より具体的には、種々の実施形態において、本明細書において記述した方法は、１）細胞の活性化を介してこれらの質量を増加させること；及び／または２）活性化を介してこれらの質量蓄積速度を増加させること；及び／または３）標的細胞を死滅させることを介して標的細胞質量を減少させることによって特異的標的細胞抗原に応答する有用なＴリンパ球を同定するために利用することができる。これは、単一細胞レベルで複合集団において細胞毒性Ｔリンパ球の応答を直接定量化する点で、既存の技術を超える改善である。
【００５９】
種々の実施形態において、細胞質量における変化は、種々の干渉観測及び／または定量的相イメージング顕微鏡技術を使用して決定される。例証であるが、非限定的なイメージング方法は、生細胞干渉法（ＬＣＩ）、デジタルホログラフィー及び側方シアリング干渉を含むが、限定されない。しかし、多くの顕微鏡システム及び方法を本明細書において記述した方法との使用のために適応することができる。したがって、一定の実施形態は、走査型光学顕微鏡、共焦点顕微鏡及び同様のものを使用することができる。本明細書において記述した方法での使用のために適応することができる光学的プロファイリング法を記述する、例証の、及び非限定的な出版目録は、Ｕ．Ｓ．  Ｐａｔｅｎｔ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ  Ｎｏ：２０１０／０２８４０１６；２００５／０２４８７７０；２００５／０２２５７６９；２００５／０２００８５６；２００５／０１９５４０５；２００５／０１２２５２７；２００５／００８８６６３；２００４／０２５２３１０；２００５／０１１７１６５；２００３／０２３４９３６；２００４／００６６５２０；２００８／００１８９６６、２００５／０１６７５７８及び同様のものを含むが、限定されない。
【００６０】
生細胞干渉法（またはデジタルホログラフィー顕微鏡法、生細胞イメージング能をもつ通常の顕微鏡に接続された側方シアリング干渉観測カメラ及び同様のものを含む別の定量的相イメージング技術）は、光学的に標的細胞及び候補ＣＴＬの共培養の質量応答のプロフィールを作るために使用することができる。一定の実施形態において、スクリーニングは、基体上に配置された標的細胞上で行われる。一定の実施形態において、スクリーニングは、基体にエッチングまたは重合体（たとえば、ＰＤＭＳ、ＭＹ１３３などの水のものとほぼ等しい屈折率をもつ重合体、ＭＹ重合体からのＵＶ−硬化性重合体及び同様のもの）における形成によって製造されたマイクロウェルのアレイ（たとえば、１００を上回るまたは１０００を上回るまたは１０，０００を上回るマイクロウェルを含むアレイ）上で行うことができる。一定の実施形態において、スクリーニングは、ＰＤＭＳまたはＭＹ１３３に微少製造されたおよそ１，０００のアレイまたは５，０００または１０，０００〜１５，０００または２０，０００または２５，０００マイクロウェル上で行われる（たとえば、図１２を参照されたい）。
【００６１】
ＬＣＩのための一定の実施形態において、標的細胞（または標的細胞を含むマイクロウェル）は、反射性である基体（たとえば、反射性であるケイ素基体）上に配置される。標的細胞は、この基体上で、及び／またはマイクロウェルにおいて増殖させることができる。次いで、Ｔ細胞（たとえば、ＣＤ８＋Ｔ細胞）を添加することができる（たとえば、ウェル当たりおよそ１つのＣＤ８＋細胞の密度にて装置上に播種される）。
【００６２】
マイクロウェル構造により、Ｔ細胞を顕微鏡視野から浮遊して出すことなく、細胞全体の培地の灌流が可能となる。一定の実施形態において、上記のように、マイクロウェルは、特に細胞が静置培養において増殖される場合に、省略することができる。
【００６３】
一定の実施形態において、標的細胞のためのスクリーンは、ＴＣＲクローニングの試みに対して不必要な負担を課すだろう偽陽性を減少させるために以下の３つの工程の１つまたは複数を含みことができる：
１．顕微鏡強度イメージを使用して定性的に標的細胞の死滅についてモニターする；及び／または
２．標的細胞の質量減少動態をチェックして、これが細胞毒性のイベントに一致していることを確認する；及び／または
３．活性化されたＴ細胞の質量増大動態をチェックして、その挙動が活性化されたＴ細胞のものと一致することを確認する。
【００６４】
一定の実施形態標的において、このスクリーニング法によって同定されたＣＴＬＳは、たとえばマイクロマニピュレーターを使用してマイクロウェルから除去すること、及びＴＣＲクローニングまたは下流の解析のために貯蔵することができ、及び／またはデータベースに記録することができる。
【００６５】
生細胞干渉法
一定の実施形態において、Ｔ細胞及び／または標的細胞（群）の質量における変化は、生細胞干渉法（ＬＣＩ）を使用して検出される。生細胞干渉法（ＬＣＩ）は、数時間以内に細胞全体質量応答を定量化し、及び既知または未知の抗原に対するＴＣＲを同定するために患者の試料で作業するために唯一適する標識のない定量的相顕微鏡法技術である。簡潔には、物質との光の相互作用は、それが細胞を通過するので光を遅らせて、相の測定可能なシフトを生じる。全ての細胞全体のこの相シフトを定量化することにより、細胞の質量を非常に正確に決定することができる。ＬＣＩは、制御された培養条件下で同時に何百または何千もの細胞の質量応答または質量蓄積速度のプロフィールを作るために使用することができることが示されている（たとえば、ＰＣＴ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  Ｎｏ：ＷＯ２０１３０１９９８４  Ａ１（ＰＣＴ／ＵＳ２０１２／０４９３８８）を参照されたい）。本明細書において、我々は、これらが候補細胞障害性Ｔ細胞（ＣＴＬ）によって作用されるので、何千もの標的細胞を調べるためのプラットホームとしてＬＣＩを使用する。図２−５に示したように、ＬＣＩの感度により、標的細胞の質量（それが死滅するときの標的細胞質量減少）及び活性化の間のＣＴＬそれ自体の質量（質量増大）に対するこれらの効果に基づいて、ＣＴＬの同定が可能である。ＬＣＩのハイスループットな性質により、ＴＣＲクローニングのための標的として個々のＣＴＬの同定が可能になる。
【００６６】
このアプローチは、Ｔ細胞応答の間のＴ細胞質量蓄積の動態及び可変性、並びにＴ細胞媒介細胞傷害性による標的細胞質量減少の動態及び可変性を含むＴ細胞によって媒介される細胞毒性の原理に光を当てる。
【００６７】
このアプローチは、また代理アッセイを使用することなく直接ＣＴＬを同定するための一般化されたプラットホームを提供する。活性化の間のリンパ球の質量応答を直接測定することにより、本システムは、活性化の間の質量増大などの重要な生物物理パラメーターに基づいて広く関心対象のリンパ球を同定し、及び選択するためのプラットホームを提供する。
【００６８】
生細胞干渉法（ＬＣＩ）は、細胞全体の応答を測定する標識のない光学顕微鏡法技術である。一定の実施形態において、ＬＣＩは、マイケルソン型干渉計を使用して試料チャンバにおける生細胞の光学的厚さを参照チャンバにおける液体の光学的厚さと比較し、及びさらに細胞とその周囲の培地との間の光学的厚さの相違を定量化する（Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ｊ．  １０１：  １０２５−１０３１；  Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２００８）  ＡＣＳ  Ｎａｎｏ，  ２：  ８４１−８４６）（たとえば、図１を参照されたい）。細胞のバイオマスとの光の干渉のための光学的厚さの相違は、細胞の材料密度と線形に比例する（Ｒｏｓｓ  （１９６７）  Ｐｈａｓｅ  ｃｏｎｔｒａｓｔ  ａｎｄ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ  ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  ｆｏｒ  ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ．  Ｌｏｎｄｏｎ，：  Ｅｄｗａｒｄ  Ａｒｎｏｌｄ，  ｘｘｉ，  ２３８  ｐｐ．）。この相互作用に基づいて、細胞質量を測定されたそれぞれの細胞を通過する光の相遅滞に、総細胞質量の２％の精度で関連させることができる（Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ｊ．  １０１：  １０２５−１０３１；  Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２００８）  ＡＣＳ  Ｎａｎｏ，  ２：  ８４１−８４６；  Ｒｏｓｓ  （１９６１）  Ｐｈａｓｅ  ｃｏｎｔｒａｓｔ  ａｎｄ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ  ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  ｆｏｒ  ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ．  Ｌｏｎｄｏｎ，：  Ｅｄｗａｒｄ  Ａｒｎｏｌｄ，  ｘｘｉ，  ２３８  ｐｐ．）。実際には、ＬＣＩでは、１−５時間のイメージング以内にイメージング位置当たり同時に１００−４００細胞の質量及び質量蓄積または喪失割合の測定を得る（Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．（２０１１）Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ｊ．  １０１：１０２５−１０３１）。２０−５０イメージング位置での細胞毒性イベントの間に正確なトラッキング及び質量決定を可能にするための２−５分毎に自動化された測定では、この技術は、２，０００〜２０，０００細胞の質量を定量化することができる。
【００６９】
実施例にて図示したように、ＬＣＩにおいて、イメージ収集後、光相シフトデータは、定量的相イメージングにおける固有の整数波長曖昧性によって生じる相を包む誤差について修正することができる（Ｇｈｉｇｌｉａ  ａｎｄ  Ｐｒｉｔｔ，  （１９９８）  Ｔｗｏ−Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ  Ｐｈａｓｅ  Ｕｎｗｒａｐｐｉｎｇ：  Ｔｈｅｏｒｙ，  Ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ，  ａｎｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ：  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ．）。結果は、それぞれの細胞全体の位相ずれのマップであり、これを局所的乾燥質量密度のマップ（図２Ｂ）に変換することができる。細胞の総乾燥質量は、局所的密度の合計として定量化することができる（Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ｊ．  １０１：  １０２５−１０３１；  Ｒｏｓｓ  （１９６７）  Ｐｈａｓｅ  ｃｏｎｔｒａｓｔ  ａｎｄ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ  ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  ｆｏｒ  ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ．  Ｌｏｎｄｏｎ，：  Ｅｄｗａｒｄ  Ａｒｎｏｌｄ，  ｘｘｉ，  ２３８  ｐｐ．；  Ｍｉｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，  １０８：  １３１２４−１３１２９）：
【数３】
0006367318.tif 000004
式中、ｍは、細胞乾燥質量であり、φλは、測定された相シフトであり、ｋは、質量変換因子であり、及びＡは、投影された領域である。一定の実施形態において、質量変換因子（Ｂａｒｅｒ  （１９５２）  Ｎａｔｕｒｅ  １６９：  ３６６−３６７；  Ｍｉｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，  １０８：  １３１２４−１３１２９）は、屈折率（
0006367318.tif 000005
）の単位変化当たりの密度における変化の尺度であり、ｋ＝５．５６ｐｇ／μｍ３として得ることができる（Ｒｏｓｓ  （１９６７）  Ｐｈａｓｅ  ｃｏｎｔｒａｓｔ  ａｎｄ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ  ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  ｆｏｒ  ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ．  Ｌｏｎｄｏｎ，：  Ｅｄｗａｒｄ  Ａｒｎｏｌｄ，  ｘｘｉ，  ２３８  ｐｐ．）。このパラメーター、ｋは、水の屈折率に相対的な屈折率の変化として測定することができ、したがって、この様式において測定される細胞質量は、細胞乾燥質量または水以外の細胞内全ての質量である。
【００７０】
しかし、細胞の質量（ｍ）は、算出する必要がないことが認識されるだろう。単に質量における変化の検出により、本明細書において記述した方法のための十分な読出しを提供することができる。一定の実施形態において、これは、相シフトの計測によって単に提供することができ、相シフトは、細胞の投影された領域（Ａ）全体に、またはこれらの測定のいずれかに由来する１つ以上のパラメーターとして組み込まれる。
【００７１】
本明細書において記述したアプローチは、個々のＣＴＬ及びこれらの同族標的細胞の質量を定量化することによって、標識化のない単一細胞レベルにてＴリンパ球媒介細胞毒性を直接追跡する。単一の細胞毒性イベントを同定し、及び個々のＴ細胞媒介細胞傷害性イベントを確認するために大量データを使用して混合種個体群内を時間と共に評価する。プルーフの概念として、我々は、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）がマッチしたＭＡＲＴ１＋標的細胞に対して応答するＴリンパ球によって認識されるメラニン細胞抗原（ＭＡＲＴ１）に対する特異性をもつ２,０００の個々のＣＴＬまでの追跡を示す（Ｊｏｈｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．（２００６）Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １７７：６５４８−６５５９）（実施例１を参照されたい）。標的細胞をＬＣＩによってイメージングして、ベースライン質量蓄積速度を確立する。次いで、ＣＴＬを標的細胞上にまいて、及び個々の細胞毒性イベントを対応するＴ細胞との接触後の標的細胞質量における特徴的減少として同定する。
【００７２】
Ｔ細胞は、活性化の間にサイズが増加することは、十分に確立されている（Ｒａｔｈｍｅｌｌ  ｅｔ  ａｌ．  （２０００）  Ｍｏｌ．  Ｃｅｌｌ，  ６：  ６８３−６９２）。この以前に観察されたサイズの増大は、バイオマスにおける増大とは対照的に、細胞内の溶質濃度または重量オスモル濃度における変化の結果として生じ得る（Ｔｚｕｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  ＰＬｏＳ  Ｏｎｅ，  ６：  ｅｌ６０５３）。これまで、この曖昧性は、解決されていなかったが、しかし、この結果は、単一のＣＴＬの活性化の機構に対する有益な洞察を提供する。本明細書において記述したアプローチを使用して、同族の標的細胞に応答するＣＴＬのサイズ増大が、バイオマスの増大のためであること、及びバイオマス測定は、活性化されたＴ細胞の強力な同定を提供することが決定された。単一のＣＴＬの質量を測定する能力は、養子免疫処理プロトコルにおける潜在的な使用のためのＣＴＬの解析に加えて、代謝性または分化状態に属するＴ細胞生物学的研究を含むいくつかの潜在的な下流の適用を開拓する。
【００７３】
典型的な実施形態において、ＬＣＩ方法は、生細胞干渉計システムを使用して行うことができ、これは、顕微鏡に機能的に接続された検出器、細胞を含むように適応された観察チャンバを含む試料アセンブリー、比較セルを含むように適応された参照チャンバを含む参照アセンブリー、並びに光源から試験光及び参照光に光ビームを分割するためのビームスプリッタを含む。一定の実施形態において、観察チャンバは、チャンバ内の細胞培地を循環させるように適応された少なくとも１つの灌流導管を含む。いくつかの実施形態において、生細胞干渉計システムは、１つまたは複数の細胞のイメージを処理し、及び記憶するように適応されたプロセッサエレメント及びメモリ記憶エレメントを含む。実施形態において、１つまたは複数の細胞の質量は、どのように集団細胞が時間にわたって変化するかを観察するために複数の時間にて決定され、及び任意にこのような変化についての動態を提供する。任意に、たとえば細胞の質量特性における変化は、時間的な質量プロフィールを観察するために時間と共に観察される（たとえば、細胞の質量が時間にわたって変化する特異的方法）。一定の実施形態は、観察された時間質量プロフィールを時間質量プロフィールのデータベースと比較する工程を含み、時間質量プロフィールのデータベースは、Ｔ細胞活性化の特徴及び／または標的細胞死滅である時間質量プロフィールを含むように選択される。
【００７４】
側方シアリング干渉法
一定の実施形態において、細胞サイズの変化（たとえば、細胞サイズの変化によって導入される光学的相シフト）は、側方シアリング干渉を使用して決定することができる。側方シアリング干渉法は、１方向の相勾配を測定するために使用される技術である。入射波面は、２つ同一に複写されるが、波面に傾けられる。伝播後、これらの相互の干渉パターンを、たとえばＣＣＤカメラで記録する。相勾配は、インタフェログラムフリンジ度に関するフーリエデコンボリューションによって二次的なゆがみから回復される。
【００７５】
複数波干渉法（Ｐｒｉｍｏｔ  ａｎｄ  Ｓｏｇｎｏ  （１９９５）  Ｊ．  Ｏｐｔ．  Ｓｏｃ．  Ａｍ．  Ａ，  １２（１２）：  ２６７９）は、この原則を一つ以上の傾斜方向に拡張する。四波側方シアリング干渉法（ＱＷＬＳＩ）では、４つの複製が具体的２Ｄ回折格子によって作製される。本例では、２つの垂直な方向に沿った２つの勾配を測定し、及び次いで積分して視野強度及び相を決定した（Ｐｒｉｍｏｔ  ａｎｄ  Ｇｕeｒｉｎｅａｕ  （２０００）  Ａｐｐｌ．  Ｏｐｔ．  ３９（３１），  ５７１５−５７２０）。インタフェログラム変形は、波動または幾何光学を使用して解釈することができる。生細胞の定量的相顕微鏡法のために四波側方シアリング干渉法を使用する方法は、Ｂｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００９）  Ｏｐｔｉｃｓ  Ｅｘｐｒｅｓｓ  １７（１５）：  １３０８０−１３０９４によって記述される。加えて、従来の顕微鏡でＱＷＬＳＩを実行する装置は、市販されている（たとえば、Ｐｈａｓｉｃｓ社、Ｍａｒｓｅｉｌｌｅ、ＦｒａｎｃｅからのＳＩＤ４ｂｉｏ（登録商標）を参照されたい）。
【００７６】
デジタルホログラフィー顕微鏡法
デジタルホログラフィー顕微鏡法は、生細胞を回折限界横分解及び副波長軸方向の精度で記述することができる光路長分布の定量的測定を提供する（Ｍａｒｑｕｅｔ  ｅｔ  ａｌ．  （２００５）  Ｏｐｔ．  Ｌｅｔｔ．  ３０（５）：  ４６８−４７０を参照されたい）。定量的相対比イメージング方法としてのデジタルホログラフィー顕微鏡法は、試験した物体を通過する光に関する位相遅延を検出する一種の光学干渉法である。相対的に透明な試料を通過するときに、光の強度は、ほとんど変化しないが、一方で、試料を通る光は、速度を上げる、または遅らせ、及び対応する位相変化をもたらす。位相遅延または進行は、試料と周囲環境との間の屈折率の関係に依存する。相情報は、光路長（光学的厚さ）に比例するので、試料の深さプロフィール及び／またはサイズ／質量を算出することができる。したがって、デジタルホログラフィーは、生細胞及びマイクロ光学エレメントなどの相物体を測定するために特に適する。
【００７７】
ＤＨＭにおいて、物体から生じる光波面情報は、ホログラムとしてデジタルで記録され、そこからコンピュータは、数値再建アルゴリズムを使用することによって物体イメージを算出する。
【００７８】
干渉パターン、すなわちホログラムを作製するために、ＤＨＭでは、干渉性（単色）光源、たとえばレーザを使用して細胞（群）を照射する。レーザ光は、物体ビーム及び参照ビームに分割される。広がった物体ビームは、試料を照射して、物体波面を生じる。物体波面が顕微鏡対物レンズによって収集された後、物体及び参照波面がビームスプリッタによって連結されて干渉し、及びホログラムを生じる。デジタルで記録されたホログラムを使用して、コンピュータは、デジタルレンズとして作用し、及びそこから由来する可視イメージまたは情報（たとえば、細胞質量）を算出する。
【００７９】
適切なＤＨＭ法は、軸外しＦｒｅｓｎｅｌ  ＤＨＭ、フーリエＤＨＭ、イメージ面ＤＨＭ、インラインのＤＨＭ、Ｇａｂｏｒ  ＤＨＭ及び移相のデジタルホログラフィーを含むが、限定されない。
【００８０】
細胞のデジタルホログラフ顕微鏡法は、たとえばＰａｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１２）  Ｏｐｔｉｃｓ  Ｅｘｐｒｅｓｓ，  ２０（１０）：  １１４９６−１１５０５，  ２０１２；  Ｚｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｃｈｉｎｅｓｅ  Ｐｈｙｓｉｃｓ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，  ２８（１１）：  １１４２０９；  Ｋｅｍｐｅｒ  ｅｌ  ａｌ．  （２００６）  Ｂｉｏｐｈｏｔｏｎｉｃｓ  ａｎｄ  Ｎｅｗ  Ｔｈｅｒａｐｙ  Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ，  ６１９１：  ６１９１０Ｔ−１−８；及びＷａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１３）  Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ  ａｎｄ  Ｍａｔｈｅｍａｔｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ  ２０１３，  Ａｒｔｉｃｌｅ  ＩＤ  ７１５８４３に記述される。
【００８１】
実施例
以下の例は、例証のために提供されるが、特許請求の範囲の発明を限定しない。
【００８２】
実施例１
抗原特異的細胞毒性の間の単一のＣＤ８＋Ｔ細胞のバイオマス変化の定量化
細胞障害性Ｔ細胞応答を定量化する既存のアプローチは、一括の、または代理の測定に依存し、これは関心対象の単一の活性化されたＴ細胞の直接の同定を妨げる。単一細胞顕微鏡法またはフローサイトメトリー法は、蛍光標識化に典型的には依存し、これがヒト由来Ｔリンパ球などの初生細胞への適用可能性を制限する。本明細書において、我々は、生細胞干渉法（ＬＣＩ）、細胞生存度を維持する標識のない顕微鏡法技術を使用して、細胞の混合種個体群内の単一のＴリンパ球媒介細胞毒性イベントを追跡するための定量法を導入する。ＬＣＩは、細胞内バイオマスと光の相互作用によって生じる相シフトを測定することによって、個々の細胞内の質量分布を定量化する。ＬＣＩを使用して、我々は、同族標的細胞を死滅させる細胞障害性Ｔ細胞をイメージした。Ｔ細胞による攻撃後の１−４時間にわたって２０−６０％の特徴標的細胞質量減少に加えて、非応答性Ｔ細胞の質量に関してＴ細胞質量の有意な２−３倍の増大があった。直接的に、ＣＤ８＋Ｔ及び標的細胞質量変化の標識のない測定は、癌免疫療法における適用のための、特異的な、活性化された患者由来Ｔ細胞を同定するための、Ｔ細胞活性化及び相対的に迅速なアプローチの動力学的、定量的評価を提供する。
【００８３】
材料及び方法
株化細胞及びＰＢＭＣ
Ｍ２０２、Ｍ２０７（Ｓｏｎｄｅｒｇａａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１０）  Ｊ．  Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ  Ｍｅｄ．  ８：  ３９）、ＰＣ−３、ＰＧ１３及び２９３Ｔ細胞（ＡＴＣＣ）は、５％のＦＢＳ、１００Ｕ／ｍＬペニシリン、１００μｇ／ｍＬストレプトマイシン及び２ｍｍｏｌ／ｌ−グルタミンを補ったＤＭＥＭまたはＲＰＭＩ１６４０培地のいずれかを使用して、８％のＣＯ２において３７℃にてルーチンで維持した。匿名の健康なドナーに由来するＨＬＡ  Ａ２．１＋  ＰＢＭＣをＵＣＬＡにてＡＩＤＳ研究ウイルス学コアラボのためのセンターから得て、及び収集の後に凍結した。解凍したＰＢＭＣは、レトロウイルス感染の前に４日間完全培地（ＣＭ）プラス抗ＣＤ３／２／２８のビーズ中で再生した。ＣＭは、２５ｍｍｏｌ／Ｌ  ＨＥＰＥＳ、５．５×１０−５ｍｏｌ／Ｌβ−メルカプトエタノール及び３００ＩＵ／ｍＬ  ＩＬ−２を補充したＡＩＭ−Ｖ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、ＵＳＡ）からなった。ＰＢＭＣは、全てのイメージング実験の前に合計７−１０日間培養した。細胞は、ＬＣＩイメージングプラットホーム上で完全培地において維持した。
【００８４】
ＭＡＲＴ１特異的なＣＤ８＋Ｔ細胞の産生
Ｆ５レトロウイルスは、ＭＡＲＴ１  ＥＬＡＧＩＧＬＴＶペプチド断片に特異性をもつＦ５  ＴＣＲからなるレトロウイルスベクターを産生するために修飾したＰＧ１３細胞から収集し、これは、細胞毒性実験において使用されるＭ２０２及びＭ２０７株化細胞によって発現される。簡潔には、２９３Ｔ細胞には、パッケージングベクターｐＣＬ−Ｅｃｏ及びＭＳＣＶに基づいたレトロウイルスベクターＲＶ−ＭＳＣＶ−Ｆ５ＭＡＲＴ１  ＴＣＲをトランスフェクトした。生じる上清を使用して、Ｇｉｂｂｏｎ類人猿白血病ウイルス（ＧａＬＶ）エンベロープ−偽型産生のためにマウスＰＧ１３レトロウイルス株をパッケージする細胞を形質導入した。ＰＢＭＣには、製造業者のプロトコルに従ってＲｅｔｒｏｎｅｃｔｉｎ（タカラ、日本）の存在下でＰＧ１３上清を含むレトロウイルスを感染した。感染の４８−７２時間後に、細胞をＭＡＲＴ１特異的四量体（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｃｏｕｌｔｅｒ、ＵＳＡ）で染色して、フローサイトメトリー（ＦＡＣＳＣａｎｔｏ、ＢＤ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、ＵＳＡ）によって解析した。ＣＤ８＋Ｔ細胞をネガティブ濃縮（幹細胞Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、ＵＳＡ）によって単離して、濃縮効率をフローサイトメトリーによって検証した。
【００８５】
フローサイトメトリーによるＩＦＮｇ測定
ＤＭＦ５形質導入したＣＤ８＋Ｔ細胞の機能的特異性を検証するために、合計１×１０５Ｔ細胞を２００μｌの完全培地と共に９６ウェル平面プレートにおいて、３７℃及び８％のＣＯ２に加湿されたインキュベーターにおいて、１８時間、１×１０５標的細胞（Ｍ２０２またはＭ２０７）と共培養した。上清におけるＩＦＮ−ガンマの濃度を製造業者のプロトコル（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ、ＵＳＡ  ｃａｔ＃  ＢＭＳ８２２８ＦＦ）にしたがってヒトＩＦＮｇ  ＦｌｏｗＣｙｔｏｍｉｘ  Ｓｉｍｐｌｅｘキットを使用してフローサイトメトリーによって決定した。
【００８６】
ＬＣＩ質量測定
標的細胞を、ポリ−ｌ−リシン（Ｓｉｇｍａ）の０．０１％溶液で処理した２０ｍｍ×２０ｍｍケイ素スライドに、およそ２．５×１０４細胞／ｃｍ２の密度にてまいて、イメージング実験の開始前に４８時間細胞培養インキュベーターにおいて増殖させた。付着した標的細胞と共にケイ素スライドをカスタムメイドの、温度及びＣＯ２制御された灌流ベースの生細胞イメージングチャンバに置き、及びＴ細胞の添加のおよそ１．５時間前にイメージングした。Ｔ細胞−標的細胞共培養を１８時間連続的にイメージングした。３０のイメージング位置をケイ素基体上の標的細胞の適切な密度に基づいて選び、及びほぼ３〜４分毎にイメージを収集した。イメージングは、改変ＧＴ−Ｘ８光学探層装置（Ｂｒｕｋｅｒ）を使用して、分解能を保存すると共に視野を増大するために０．５５×縮小レンズと共に２０×倍率（開口数０．２８）で行った。干渉じまは、ビームスプリッタ、参照ミラー及び試料チャンバを介する光路長を補償する参照流体チャンバからなるマイケルソン−タイプ干渉計を使用して生成した。イメージは、位相シフト干渉（ＰＳＩ）方法及び５３０ｎｍファイバーで接続されたＬＥＤ（Ｔｈｏｒｌａｂｓ）からの照明を使用して取得した。強度イメージは、マイケルソン相イメージングのために必要な干渉じまのないイメージの平均強度を表す。
【００８７】
位相アンラッピング
定量的相イメージングにおける固有の整数−波長相曖昧性を除去するために（Ｇｈｉｇｌｉａ  ａｎｄ  Ｐｒｉｔｔ，  （１９９８）  Ｔｗｏ−Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ  Ｐｈａｓｅ  Ｕｎｗｒａｐｐｉｎｇ：  Ｔｈｅｏｒｙ，  Ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ，  ａｎｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ：  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ．）、我々は、Ｍａｔｌａｂ（Ｍａｔｈｗｏｒｋｓ）において実行されたカスタムスクリプトを使用して相アンラッピングを行った。最初に、我々は、Ｆｌｙｎｎの最小不連続法（同上）に基づいてアンラッピングを行った。次に、トレーニングデータセットを関心対象の標的及びＴ細胞の外見で選択した相データのおよそ２００のサブイメージに単一波長修正を手動で適用することによって構築した。このトレーニングデータセットを線形判別分析（ＬＤＡ）に使用して、生画像それ自体、計算された強度イメージ及びラップした相イメージに適用した種々の端部を見いだすフィルタの結果を含むイメージ統計の１６のセットに基づいて、相がラップされた領域の境界上であるピクセルを同定した。ＬＤＡに続いて遺伝的最適化を行い、ＬＤＡ結果及び相ラップされた領域の境界を決定する際に使用される分水界アルゴリズム閾値を洗練した。最終的なＬＤＡ結果に適用される分水界アルゴリズムによって決定される境界内の領域は、１波長の相シフトまでシフトされ（修正され）、及び中央値は、３のカーネルサイズでフィルタした。
【００８８】
質量トラッキング
単一細胞質量測定は、Ｍａｔｌａｂ（Ｍａｔｈｗｏｒｋｓ）において実行されたカスタムスクリプトを使用して行った。簡潔には、相−補正画像を、Ｏｔｓｕ閾値処理に基づいたイメージ分割前にガウシアンローパスフィルタした。最後に、イメージ分割によって同定される対象を、Ｃｒｏｃｋｅｒ及びＧｒｉｅｒ（１９９６）Ｓｃｉｅｎｃｅ  １７９：１２による粒子追跡アルゴリズムに基づいて、Ｄａｎｉｅｌ  Ｂｌａｉｒ及びＥｒｉｃ  ＤｕｆｒｅｓｎｅによるＭａｔｌａｂのために適応された粒子追跡コードを使用して追跡した。細胞領域は、定量的相イメージにおいて２００ピクセルの近辺に基づいて局所的適応閾値を使用して決定した。
【００８９】
統計
統計分析は、両側ＷｅｌｃｈスチューデントＴ試験を不等分散及び試料サイズで使用して行った。
【００９０】
結果
Ｔ細胞によって媒介される細胞毒性の定量的イメージングのためのＬＣＩ
我々は、ＨＬＡマッチした標的株化細胞に対する健康なヒトドナーＣＤ８＋濃縮されたリンパ球の抗原特異性を確立することによって細胞毒性イベントを解析するためのモデルシステムを開発した。末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）には、Ｆ５抗ＭＡＲＴ１  ＴＣＲを形質導入し、これはＭＡＲＴ１に対して特異性をもつ高親和性ＴＣＲである（Ｊｏｈｎｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００６）／．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １７７：  ６５４８−６５５９）。ＭＡＲＴ１を発現する標的細胞及び抗原定義されたＣＤ８＋濃縮されたＴ細胞を、ＬＣＩステージ上の生細胞観察チャンバにおいて共培養して、１８時間の期間の間イメージングした（図２Ａ）。観察チャンバは、８％のＣＯ２にて培地の連続灌流によって温度調節し、及びｐＨを維持した。イメージ収集後、光相シフトデータは、定量的相イメージングにおける固有の整数波長曖昧性によって生じる相を包む誤差について修正することができる（Ｇｈｉｇｌｉａ  ａｎｄ  Ｐｒｉｔｔ，  （１９９８）  Ｔｗｏ−Ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ  Ｐｈａｓｅ  Ｕｎｗｒａｐｐｉｎｇ：  Ｔｈｅｏｒｙ，  Ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ，  ａｎｄ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ：  Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ．）。結果は、それぞれの細胞全体の位相ずれのマップであり、これを局所的乾燥質量密度のマップ（図２Ｂ）に変換することができる。細胞の総乾燥質量は、局所的密度の合計として定量化される（Ｒｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｂｉｏｐｈｙｓ．  Ｊ．  １０１：  １０２５−１０３１；  Ｒｏｓｓ  （１９６７）  Ｐｈａｓｅ  ｃｏｎｔｒａｓｔ  ａｎｄ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ  ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  ｆｏｒ  ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ．  Ｌｏｎｄｏｎ，：  Ｅｄｗａｒｄ  Ａｒｎｏｌｄ，  ｘｘｉ，  ２３８  ｐｐ．；  Ｍｉｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，  １０８：  １３１２４−１３１２９）：
【数４】
0006367318.tif 000006
式中、ｍは、細胞乾燥質量であり、φλは、測定された相シフトであり、ｋは、質量変換因子であり、及びＡは、投影された領域である。一定の実施形態において、質量変換因子（Ｂａｒｅｒ  （１９５２）  Ｎａｔｕｒｅ  １６９：  ３６６−３６７；  Ｍｉｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２０１１）  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，  １０８：  １３１２４−１３１２９）は、屈折率（
0006367318.tif 000007
）の単位変化当たりの密度における変化の尺度であり、ｋ＝５．５６ｐｇ／μｍ３として得ることができる（Ｒｏｓｓ  （１９６７）  Ｐｈａｓｅ  ｃｏｎｔｒａｓｔ  ａｎｄ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ  ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ  ｆｏｒ  ｃｅｌｌ  ｂｉｏｌｏｇｉｓｔｓ．  Ｌｏｎｄｏｎ，：  Ｅｄｗａｒｄ  Ａｒｎｏｌｄ，  ｘｘｉ，  ２３８  ｐｐ．）。このパラメーター、ｋは、水の屈折率に相対的な屈折率の変化として測定することができ、したがって、この様式において測定される細胞質量は、細胞乾燥質量または水以外の細胞内全ての質量である。この方程式では、（図２Ｂ）における測定された活性化されたＴ細胞の乾燥質量は、２４０ｐｇであり、標的細胞質量は、８４０ｐｇであり、及び非活性Ｔ細胞は、６５ｐｇの平均乾燥質量を有する。
【００９１】
抗原特異的Ｔ細胞及びイメージングプラットホーム上での生存度の維持
抗原定義されたＣＴＬを産生するために、我々は、レトロウイルス形質導入によりＨＬＡ  Ａ２．１＋健康なドナーＰＢＭＣにＦ５  ＴＣＲを感染し、及び磁気標識された非ＣＤ８＋細胞を除去するために磁気分離によってＣＤ８＋細胞を濃縮した（図３、パネルＡ−Ｂ）。ＣＤ８＋Ｔ細胞は、内因性ＴＣＲを有するが、Ｆ５抗ＭＡＲＴ１  ＴＣＲの異所性発現は、外来性アルファ及びベータ鎖の過剰発現を生じて、優先的な対形成及び表面発現を可能にする。単離された細胞の大多数は、イメージングの前にＭＡＲＴ１ペプチド四量体染色によって決定したときに表面上にＦ５  ＴＣＲを発現する７５％でＣＤ８＋であった。我々は、Ｆ５リダイレクトされたＣＤ８＋Ｔ細胞が同族の標的細胞について特異的であったことを検証するために、１８時間共培養期間の後、上清におけるインターフェロンγ（ＩＦＮｇ）蓄積を測定した。フローサイトメトリーによって解析したビーズに基づいた免疫アッセイの結果は、ＨＬＡミスマッチの対照株化細胞との共培養と比較して、ＨＬＡマッチＭＡＲＴ１＋  Ｍ２０２標的細胞との共培養により、優位な３．５倍高い、Ｆ５形質導入したＣＴＬからのＩＦＮｇ放出を示した（図３、パネルＣ）。
【００９２】
標的細胞をそれぞれの実験の開始前に１．５時間標準培地においてイメージングして、生細胞培養イメージングプラットホームがＣＴＬの非存在下で標的細胞の生存度を維持することを確認した。Ｍ２０２標的細胞は、陽性質量蓄積速度を示し、健康集団及び細胞生存度の維持を示した。（図３、パネルＤ−Ｅ；図７、パネルＢ）。対照実験は、長期イメージング期間の間のＴ及び標的細胞生存度の維持を示した（図７及び８）。
【００９３】
死滅した標的細胞の質量減少
標的細胞対照測定の１．５時間後、Ｆ５  ＭＡＲＴ１応答性ＣＴＬ（図３、パネルＡ−Ｂ）を生細胞イメージングチャンバに添加して、１８時間連続してイメージングした。この実験期間は、典型的にはＥＬＩＳＰＯＴによるＴ細胞活性の測定のために必要とされる期間と類似する（Ｈｏｂｅｉｋａ  ｅｔ  ａｌ．  （２００５）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．  ２８：  ６３−７２）。個々の標的細胞を死滅させる単一ＣＴＬは、ＣＴＬとの長期接触後の標的細胞の外観変化として、強度画像データの定性的解析を介して同定される（図４、パネルＡ−Ｄ）。細胞毒性イベントは、より幅広い集団内で、非特異性または非応答性Ｔ細胞の存在にもかかわらず検出可能である。ＬＣＩは、Ｔ細胞を媒介した細胞毒性のイベントの間の標的細胞内の質量分布の定量的マップを提供する（図４、パネルＥ−Ｈ）。連続画像フレームからのこれらの質量分布を統合して、全時間にわたる標的細胞質量の測定を得ることができる（式１及び図４、パネルＩ）。ＣＴＬの認識のための個々の細胞毒性イベントは、対応するＣＴＬの標的細胞質量における特徴的な減少によって確認される（図４、パネルＩ及び映像、そのイメージは、図６Ａ−６Ｆに示してある）との長期の接触後（２時間につき３０ｍ）。
【００９４】
標的細胞質量は、ＣＴＬによって死滅されないときの４時間にわたる１５％の総標的細胞質量の増大と比較して（図４、パネルＩ−Ｊ）、ＣＴＬによって首尾よく攻撃されたときに１−４時間にわたって２０〜６０％まで減少した。Ｔ細胞と標的細胞との接触にもかかわらず、ＨＬＡミスマッチの、抗原無関係な標的細胞（ＭＡＲＴ１を欠く）または非特異的Ｔ細胞（図４、パネルＫ−Ｍ；図７、パネルＣ−Ｄ及び９、パネルＣ−Ｄ）を使用する対照実験において応答がなかった。これは、標的細胞死が抗原特異的ＣＴＬの存在のためだったこと、及びＴ細胞媒介細胞傷害性による標的細胞質量減少の速度及び程度がＬＣＩを使用して直接定量化可能なことを示す。Ｔ細胞によって媒介される細胞毒性は、最初の３０分以内に明らかであり、及びＣＴＬの添加後、最初の２−４時間以内に確認され、Ｔ細胞媒介細胞傷害性を測定する際のＬＣＩアプローチの速度を示す（映像図６Ａ−６Ｆ）。標的細胞のほぼ９５％は、ＣＴＬの添加後１８時間までに死滅したが、一方で対照標的細胞の９５％より多くは、１８時間にて健康にみえた（図４、パネルＫ−Ｌ；図９）。
【００９５】
活性化されたＣＴＬの質量増大
標的細胞質量の減少と平行して、個々の活性化されたＣＴＬは、細胞毒性イベントの最後まで全体のサイズが増加した（図５）。個々のＣＴＬ及び標的細胞質量は、これらの相互作用の期間を通じて追跡することができる（図５、パネルＡ；図１０）。このような１０のイベントについてのＣＴＬ質量対時間データを、標的細胞が死イベントの開始時に形態を劇的に変えた（「丸められた」）ときの質量に関して規準化したＣＴＬ質量で、図５（パネルＢ）に要約してあり、これはｔ＝０時間として定義される。典型的な追跡では、標的細胞は、最初に健康細胞の増殖速度に合わせた質量の増大を示す（図４、パネルＭ）。この期間中に（ｔ＜０時間）、ＣＴＬは、相対的に遅い増殖速度を示す（図５、パネルＣ）。次いで、標的細胞は、最初の１−２時間にわたる質量の非常に迅速な喪失の直前に、「混乱」し、及び基体から離れる。この初期期間（およそ１００分）の間に、Ｔ細胞質量蓄積速度は、有意に増加する（図５、パネルＣ）。標的細胞は、質量が減少し、及び主細胞体は、次の２−５時間にわたって凝縮し、Ｔ細胞は、初期期間の間により遅い速度にて質量が増加し続ける（図５、パネルＣ）。
【００９６】
質量蓄積速度におけるこの変化は、周囲の非応答性Ｔ細胞より有意な２−４倍高い細胞質量を生じた（図５、パネルＤ）。それぞれの細胞毒性イベントのエンドポイントにて１１６のＣＴＬの総細胞質量を、実験の期間中に標的を死滅させなかった３，９００の対照Ｔ細胞の質量と比較した。平均で、ＣＴＬは、これらの非特異的または非応答性対応物（図５、パネルＥ；図１１、パネルＡ）と比較して２．８倍高い質量を有した。この質量増大は、観察チャンバを介して連続培地灌流のために、活性化されたＴ細胞が離れて洗浄される前に、観察の平均期間によって限定される期間である４時間まで持続した。
【００９７】
応答性対非応答性Ｔ細胞の二次元（２Ｄ）領域を算出して、全体のサイズに関して有意な相違があったかどうかを決定した。２Ｄ領域における観察された１．４倍の増大は、総細胞質量における２．８倍の相違より小さかったし、及び対照と比較してｐ＜０．０５レベルでの統計的有意性に達しなかった（図５、パネルＦ；図１１、パネルＢ）。これらの結果は、ＣＤ８＋Ｔ細胞の質量変化が細胞領域における変化より強い活性のための指標であることを示す。加えて、球状Ｔ細胞については、質量における観察された１．４倍の増大は、容積における１．７倍の増大に対応し、これは観察された質量における２．８倍の増大より実質的に低い。したがって、これらの結果は、活性化の間にまたＴ細胞密度の増大があるが、密度定量化は、ＬＣＩ測定の本配置では可能でないことを示唆する。
【００９８】
考察
ＬＣＩは、細胞毒性イベントの間に、単一のエフェクターＴ細胞及びこれらの影響を受けた標的細胞の感受性の高いバイオマス測定を介して、定量的な標識のない細胞毒性アッセイを提供する（図２）。死滅した標的細胞の質量を時間と共に追跡することができ、１〜４時間にわたって質量における２０〜６０％の減少を確認し、細胞毒性傷害と一致した（図４）。我々は、同族標的細胞の認識及び死滅後のエフェクターＴ細胞の総質量における有意な２．８倍の平均増大を見いだした（図５）。Ｔ細胞の質量の変化は、単独での領域における２Ｄ変化の測定よりも有意なＴ細胞活性化状態の指標であることを見いだした。
【００９９】
我々が活性化されたＣＴＬにおいて観察した質量増大は、代謝変化によって駆動される生合成の増大を伴う可能性が高い。Ｔ細胞は、それらの主要エネルギー源としてグルコース及びグルタミンを使用することが証明されている。活性化されたリンパ球は、細胞外環境からのグルコース、アミノ酸、及び脂肪酸取り込みを有意に増加することによってタンパク質合成需要を満たすエネルギーを産生する（Ｆｏｘ  ｅｔ  ａｌ．（２００５）Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  ５：８４４−８５２）。グルコース欠乏研究は、活性化されたＴ細胞がグルタミンの適切なレベルの存在下でさえ増殖及び生存のためにグルコースを必要とすることを示している（Ｍｉｃｈａｌｅｋ  ａｎｄ  Ｒａｔｈｍｅｌｌ（２０１０）Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｒｅｖ．  ２３６：１９０−２０２）。ＴＣＲシグナリングは、グルコース輸送体Ｇｌｕｔ１の転写を調節するのに重要な役割を果たし、活性化での増強されたグルコース取り込みを可能にする（Ｍａｃｉｖｅｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２００８）  Ｊ．  Ｌｅｕｋｏｃ．  Ｂｉｏｌ．  ８４：  ９４９−  ９５７）。研究は、抗ＣＤ３抗体などのＴＣＲアゴニストまたはＣＤ３タンパク質の架橋を生じさせる化合物がＧｌｕｔ１発現の迅速かつ最大の誘導を生じることを示した（Ｍｉｃｈａｌｅｋ  ａｎｄ  Ｒａｔｈｍｅｌｌ  （２０１０）  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  Ｒｅｖ．  ２３６：  １９０−２０２；  Ｍａｃｉｖｅｒ  ｅｔ  ａｌ．  （２００８）  Ｊ．  Ｌｅｕｋｏｃ．  Ｂｉｏｌ．  ８４：  ９４９−９５７）。
【０１００】
本明細書で示したＬＣＩ技術の潜在的な適用は、単一及び潜在的にまれなＣＴＬの同定及び単離のためである。研究の発展している本体では、自己腫瘍細胞のＴＣＲ認識を有する腫瘍浸潤Ｔリンパ球（ＴＩＬ）の同定に焦点が集まっている（Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ  ｅｔ  ａｌ．（２００８）Ｎａｔ．  Ｒｅｖ．  Ｃａｎｃｅｒ、８：２９９−  ３０８；  Ｃｈｅｅｖｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２００９）Ｃｌｉｎ．  Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．  １５：５３２３−５３３７）。最近の研究では、これらのＣＴＬが相対的に低い頻度で発生し、混合集団からのこれらの存在及び単離を確認するためにバルクまたは代理の細胞毒性アッセイを使用することを困難にすることを示している（Ｅｌｋｏｒｄ  ｅｔ  ａｌ．  （２００６）  Ｃｌｉｎ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １２０：  ９１−９８；  Ｗｈｉｔｅｓｉｄｅ  （２００４）  Ｄｅｖ．  Ｂｉｏｌ．  （Ｂａｓｅｌ）  １１６：  ２１９−２２８；  ｄｉｓｃｕｓｓｉｏｎ  ２２９−２３６）。ＬＣＩアプローチは、根底にあるペプチド−ＭＨＣ−ＴＣＲ認識イベントの天然の増幅器としてＣＴＬと標的細胞との間の細胞毒性相互作用を使用し、これが非特異的結合による偽陽性を回避する。ＬＣＩイメージングプラットホームは、セグメント化培養システムと基本的に適合性であり、これにより現在の開放灌流細胞培養系では失われ得るまれな細胞の単離が可能になるだろう。したがって、ＬＣＩは、自己主要細胞またはＨＬＡマッチ癌株化細胞を死滅させるまれなエフェクターＴ細胞の同定及び単離のための生存可能な選択肢を提供し得る。
【０１０１】
癌関連抗原に対するＴ細胞は、これらが自己抗原に対して生じ、及びおそらく胸腺選択及び寛容性誘導を逃れた場合、より低い親和性のＴＣＲを有することが一般に予想される（Ｗｏｏｌｄｒｉｄｇｅ  ｅｔ  ａｌ．（２００９）Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １２６：１４７−１６４）。ＴＣＲとペプチド−ＭＨＣとの間の親和性は、Ｔ細胞刺激の結果において重要な役割を果たすと考えられる（Ｓｔｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．  （２００９）  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １２６：  １６５−１７６）。ＴＣＲ−ペプチド−ＭＨＣの間の親和性を評価するための古典的な方法は、表面プラズモン共鳴を使用してオン及びオフの速度の測定を伴う。表層結合したペプチド−ＭＨＣ−ＴＣＲ相互作用は、ＣＴＬによって標的細胞の認識の間に生じる複数の受容体を媒介した相互作用を正確に模倣しない。証拠は、これらの測定がリンパ球エフェクター機能に関して限られた情報を提供することを示唆する（Ｓｔｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．  （２００９）  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １２６：  １６５−１７６；  Ｅｄｗａｒｄｓ  ａｎｄ  Ｅｖａｖｏｌｄ  （２０１１）  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ．Ｒｅｓ．  ５０：  ３９−４８）。トランスフェクション系において、これらの野生型対応物と比較して同族のペプチド−ＭＨＣリガンドに対してより高い親和性で操作されたＴＣＲは、増加したＣＴＬ活性を示した（Ｅｄｗａｒｄｓ、  ａｎｄ  Ｅｖａｖｏｌｄ（２０１１）Ｉｍｍｕｎｏｌ  ．Ｒｅｓ．５０：３９−４８）。親和性モデルは、Ｔ細胞の活性化が関与した受容体の数に関連があることを示唆する。より高い親和性相互作用には、より少ないＴＣＲ−ペプチド−ＭＨＣ係合を必要として、Ｔ細胞を細胞毒性状態に活性化する（Ｔｉａｎ  ｅｔ  ａｌ．  （２００７）  Ｊ．  Ｉｍｍｕｎｏｌ．  １７９：  ２９５２−２９６０）。より高い親和性ＴＣＲ−ペプチド−ＭＨＣ相互作用では、これらのより低い親和性対応物より迅速な応答を駆動すると考えられ、及びＬＣＩアプローチは、これらの相互作用をまた潜在的に区別し得る。
【０１０２】
承認
我々は、株化細胞の供給についてＤｒ．  Ｒｉｂａｓの研究室（ＵＣＬＡ）に、及びデータ解析での彼女の援助についてＤｉａｎ  Ｈｕａｎｇ（ＵＣＬＡ）に感謝する。この研究は、ＡＩＤＳ研究ウイルス学コアラボのためのＵＣＬＡセンター及び健康なＨＬＡ  Ａ２．１＋  ＰＢＭＣを供給するこれらのドナーなしでは可能でなかっただろう。
【０１０３】
本明細書において記述した実施例及び実施形態は、例証目的のみであること、及びその見地の種々の改変または変更は、当業者に示唆されるだろうし、及びこの出願の精神及び範囲、並びに添付の特許請求の範囲の範囲内に含まれることが理解される。本明細書において引用した全ての刊行物、特許及び特許出願は、全ての目的のためにこれらの参照により本明細書に援用される。
【図１】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図３】
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【図４−１】
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【図４−２】
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【図５】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図６Ｃ】
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【図６Ｄ】
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【図６Ｅ】
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【図６Ｆ】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１２】
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