(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
試料に対して生物学的アッセイを実施するための、試薬を利用する分析システムであって、試薬が、機械可読ラベルを有する試薬キット箱に含まれ、
前記機械可読ラベルを読み取るためのスキャナであって、前記機械可読ラベルの読み取りに応答してスキャナ信号を生成する、スキャナと、
１つ以上の試料に対して実施される１つ以上のアッセイの自動化のための複数のプロトコルを記憶するメモリと、
前記試料に応答して検出器信号を生成する検出器と、
前記スキャナ信号を受信し、かつ少なくとも前記スキャナ信号に応答して前記複数のプロトコルから対応するプロトコルを選択するコントローラであって、前記検出器信号が、前記コントローラによって受信され、処理されてデータセットにされる、コントローラと、
アッセイプロトコルパラメータのユーザ選択のためのユーザ入力モジュールであって、前記コントローラと通信する、ユーザ入力モジュールと、
前記コントローラと通信するデータ処理モジュールであって、前記データセットを受信し、かつ前記プロトコルに従って前記データセットを処理する、データ処理モジュールと、を備える、分析システム。
【請求項２】
前記スキャナ、前記ユーザ入力モジュール、及び前記データ処理モジュールが、携帯型電子装置の構成要素である、請求項１に記載の分析システム。
【請求項３】
前記携帯型電子装置が、タブレットコンピュータである、請求項２に記載の分析システム。
【請求項４】
前記携帯型電子装置が、ラップトップコンピュータである、請求項２に記載の分析システム。
【請求項５】
前記機械可読ラベルが、バーコードを含み、前記スキャナが、バーコードを読み取るように構成される、請求項１に記載の分析システム。
【請求項６】
前記機械可読ラベルが、マトリックスコードを含み、前記スキャナが、前記マトリックスコードを読み取るように構成される、請求項１に記載の分析システム。
【請求項７】
前記機械可読ラベルが、ＲＦＩＤタグを含み、前記スキャナが、ＲＦＩＤ読取装置である、請求項１に記載の分析システム。
【請求項８】
前記データ処理モジュールが、前記スキャナ信号に応答して曲線適合計算を実施する、請求項１に記載の分析システム。
【請求項９】
前記データ処理モジュールが、前記スキャナ信号に応答して前記データセットからプロットを生成する、請求項１に記載の分析システム。
【請求項１０】
前記データ処理モジュールが、前記スキャナ信号に応答して前記データセットから決定係数値を決定する、請求項１に記載の分析システム。
【請求項１１】
前記検出器が、発光、蛍光、吸光度、ＵＶ可視光、またはマルチモード検出器を含む、請求項１に記載の分析システム。
【請求項１２】
前記ユーザ入力モジュールが、ディスプレイ部分を含み、前記ディスプレイ部分が、前記スキャナ信号に応答してユーザ選択可能プロトコルパラメータを表示する、請求項１に記載の分析システム。
【請求項１３】
試料に対して生物学的アッセイを実施する方法であって、
検出器、スキャナ、メモリモジュール、及びデータプロセッサを含む分析システムを提供することと、
プロトコルを選択するための情報を含む機械可読ラベルを含む試薬を提供することと、
前記スキャナで前記機械可読ラベルをスキャンし、前記機械可読ラベルの読み取りに応答してスキャナ信号を生成することと、
前記メモリモジュール上の生物学的アッセイのための複数のプロトコルを提供することと、
前記スキャナ信号に応答して前記複数のプロトコルのうちの１つのプロトコルを自動的に選択することであって、前記プロトコルが、前記試薬を必要とする、選択することと、
前記検出器を用いて前記試料の特徴を検出することであって、前記検出器が、検出器信号を生成する、検出することと、
前記検出器信号からデータセットを収集することと、
前記データプロセッサを用いて前記プロトコルに従って前記データセットを処理することと、を含む、方法。
【請求項１４】
前記データセットを処理する行為が、前記スキャナ信号に応答して曲線適合計算を実施することを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記プロトコルに従って前記データセットをプロットすることをさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】
前記データセットから決定係数を計算することをさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１７】
前記機械可読ラベルをスキャンする行為が、バーコードをスキャンすることを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１８】
前記機械可読ラベルをスキャンする行為が、マトリックスコードをスキャンすることを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１９】
前記機械可読ラベルをスキャンする行為が、ＲＦＩＤタグをスキャンすることを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項２０】
前記検出器を用いて前記試料の特徴を検出する行為が、前記試料の発光、蛍光、吸光度、またはＵＶ可視光のうちの少なくとも１つを検出することを含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項２１】
プロトコルパラメータのユーザ選択のためのユーザ入力モジュールを提供することをさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項２２】
前記ユーザ入力モジュール上にプロトコルパラメータを表示することをさらに含む、請求項２１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【背景技術】
【０００１】
本発明は、生物学的アッセイを実施するためのシステム及び方法に関する。
【０００２】
より具体的には、本出願は、試薬と共に使用するための自動分析器及びアッセイプロトコルに関する。
【０００３】
試薬及び自動分析器を使用する生物学的アッセイは、ユーザのためのいくつかの工程ステップを伴い得る。一部のアッセイならびにデータ取得後に実施される下流データ分析は、他のものより複雑である。既存の検出機器は、ユーザがデータ取得前に多岐にわたる変数及び設定を持つ複雑なソフトウェアを使用する。さらに、データ取得後、ユーザは、自分で従来のデータ分析ツールを使用してデータを分析しなければならない。現在、ユーザは、生データを収集して、データ自体をプロットしなければならず、これは、時折、間違って、または非効率に行われる。以前のシステムは、標準曲線を生成するために使用されるデータを収集し、今後のまたは後続の実験試料分析で使用するためにそのデータを保存する。それらは、実験試料を測定する前に予め定義される単一データ分析方法も使用する。したがって、標準品及び実験試料は、別個のアッセイ、異なるオペレータによる実行処理、さらには異なる日に分析される。
【０００４】
機器を操作するために使用されるソフトウェアは、複雑な場合が多く、選択されなければならない多数の変数をユーザに提供する。これらの他の機器は、データの分析をユーザに提供するまでには至らず、代わりにユーザにこれらの計算を自身で実施することを強いる。多くのユーザは、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ（登録商標）Ｅｘｃｅｌ（登録商標）及び他の分析ソフトウェアプログラムでこれらの計算を楽に行うことができるが、実験が成功したか、または不成功であったかを知る前に、ユーザに追加の工程ステップ、時間、及び誤差要因をもたらす。
【０００５】
さらに、既存の発明は、あまり複雑ではない方法、及び一般的に一種類の分析（例えば、用量応答曲線）を使用する分析を説明する。ユーザにとって限られたこの分析は、単一の工程またはアッセイ種類を対象とする。さらに、既存のシステムは、保存された較正データを使用する単一のアッセイ工程に特定される。
【発明の概要】
【０００６】
いくつかの実施形態では、本発明は、試料に対して生物学的アッセイを実施するための試薬を利用する分析システムを提供する。試薬は、機械可読ラベルに関連する。スキャナは機械可読ラベルを読み取り、機械可読ラベルの読み取りに応答してスキャナ信号を生成する。コントローラは、スキャナ信号を受信し、少なくともスキャナ信号に応答して複数のプロトコルから対応するプロトコルを選択する。メモリは、１つ以上の試料に対して実施される１つ以上のアッセイの自動化のための複数のプロトコルを記憶する。検出器 は、１つ以上の試料に対して実施されるアッセイに応答して検出器信号を生成する。検出器信号はコントローラによって受信され、処理されてデータセットにされる。ユーザ入力モジュールは、アッセイプロトコルパラメータのユーザ選択を容易にする。ユーザ入力モジュールは、コントローラと通信する。データ処理モジュールは、コントローラと通信する。データ処理モジュールはデータセットを受信し、プロトコルに従ってデータセットを処理する。
【０００７】
他の実施形態では、本発明は、試料に対して生物学的アッセイを実施する方法を提供する。検出器、スキャナ、メモリモジュール、及びデータプロセッサを含む分析システムは、機械可読ラベルを含む試薬と共に提供される。機械可読ラベルはスキャナでスキャンされ、機械可読ラベルの読み取りに応答してスキャナ信号を生成する。試薬に関連する生物学的アッセイのための複数のプロトコルは、メモリモジュール上に提供される。複数のプロトコルから１つのプロトコルがスキャナ信号に応答して自動的に選択され、このプロトコルは、試薬を必要とする。試料の特徴は検出器によって検出される。検出器は検出器信号を生成する。データセットは検出器信号から収集される。データセットは、データプロセッサを用いてプロトコルに従って処理される。
【０００８】
本発明の他の態様は、詳細な説明及び添付の図面を考慮することにより明らかとなるであろう。
【図面の簡単な説明】
【０００９】
【図１】分析システムのブロック図である。
【図２】発光計の斜視図である。
【図３】機械可読ラベルを伴う試薬キットの箱の例を図示する。
【図４】フローチャートであり、自動的にプロトコルを選択する、データを収集する、及びデータを分析する工程を図示する。
【図５】分析システムのユーザ入力ディスプレイの設定ウィンドウのスクリーン表示である。
【図６】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、アッセイの選択肢を列記する。
【図７】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、アッセイデータ分析ツールを列記する。
【図８】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、細胞状態アッセイデータ分析ツールを列挙する。
【図９】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、キナーゼアッセイシステムから生成されたデータに基づきＡＴＰからＡＤＰへの変換曲線を生成するための指示を列記する。
【図１０】９６ウェルプレート形式のＡＴＰからＡＤＰへの変換アッセイの例示的なプレートレイアウトである。
【図１１】ＡＴＰからＡＤＰへの変換アッセイ用の分析器システムからの処理データのスクリーン例である。
【図１２】例示的なＡＴＰからＡＤＰへの変換曲線の結果のスクリーン例である。
【図１３】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、キナーゼ酵素滴定曲線を生成するために必要な入力内容を列記する。
【図１４】３８４ウェルプレート形式のキナーゼ酵素滴定の例示的なプレートレイアウトである。
【図１５】キナーゼ酵素滴定曲線用の分析システムから生成された処理データのスクリーン例である。
【図１６】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、キナーゼ阻害剤ＩＣ５０分析を生成するために必要な入力内容を列記する。
【図１７】３８４ウェルプレート形式のキナーゼ阻害剤ＩＣ５０ 分析の例示的なプレートレイアウトである。
【図１８】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、キナーゼプロファイル分析を生成するために必要な入力内容を列記する。
【図１９】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、細胞滴定分析に必要な入力内容を列挙する。
【図２０】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、用量応答分析を生成するために必要な入力内容を列記する。
【図２１】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、キナーゼアッセイシステムプロトコルの選択を図示する。
【図２２】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、ユーザ定義されたプロトコルの選択を図示する。
【図２３】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、発光試験プロトコルの選択を図示する。
【図２４】ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示であり、プロトコルパラメータの任意の手動ユーザ選択を図示する。
【図２５】キナーゼ阻害剤ＩＣ５０分析を生成するための分析器システムから生成された処理データのスクリーン表示である。
【図２６】キナーゼプロファイル分析用の分析器システムから生成された処理データのスクリーン例である。
【図２７】細胞滴定分析用の分析器システムから算出したデータから生成されたプロットのスクリーン表示である。
【図２８】用量応答用の分析器システムからのプロットのスクリーン表示である。
【図２９】自動的に選択可能なプロトコルのリストを表示するユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示である。
【図３０】発光機能試験キットのラベルをスキャンした後の図２９のユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示である。
【図３１】自動的に選択したアッセイ完了後の図３０の ユーザ入力ディスプレイのスクリーン表示である。
【図３２】分析器から算出したデータからの可溶化物濃縮値の表のスクリーン表示である。
【図３３】分析器から算出したデータからの発光値の表のスクリーン表示である。
【図３４】分析器から算出したデータからの標準曲線のスクリーン表示である。
【図３５】分析器から算出したデータからの計算したＡＴＰ量の表のスクリーン表示である。
【発明を実施するための形態】
【００１０】
本発明の任意の実施形態を詳細に説明する前に、本発明が、その出願において、以下の説明に記載される、または以下の図面に図示される、構成の詳細及び構成要素の配置に限定されないことを理解されたい。本発明は、他の実施形態であることができ、様々な方法で実施または実行することができる。
【００１１】
図１を参照すると、分析システム１０は、発光計１４などの分析器を含む。他の実施形態では、分析器はまた、蛍光光度計、サーモサイクラー、分光計、精製システム、またはＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒなどのマルチモード装置（すなわち、発光、蛍光、吸光度、及び／または他の特徴を測定することができるもの）であってもよい。本発明はまた、Ｐｒｏｍｅｇａ（登録商標）Ｍａｘｗｅｌｌ（登録商標）デバイスなど、生物学的構成成分の精製及び分離を含む生物学的試料の処理におけるアプリケーションも有する。
【００１２】
発光計１４は、広範な動的範囲を有する、使いやすく、高感度のマイクロプレート発光計である。発光計１４は、例えば、生物発光リポーター、細胞系、及び生化学アッセイを含む、広範囲の発光アッセイを実施するために使用され得る。図２を参照すると、発光計１４は、内部空洞２２に囲まれたハウジング１８を含む。試料トレイ５０は、例えば、９６ウェルプレート、３８４ウェルプレート、または他の好適なプレートなどのマイクロタイタープレート５２を受容するように構成される。いくつかの実施形態では、マイクロタイタープレート５２のウェルは、ユーザによって試料で予め充填されてよい。他の実施形態では、試薬瓶は、試薬が発光計によってアッセイを実施するプレートに分配され得るように、発光計１４（または他の種類の機器）と流体連通にある。
【００１３】
光学ヘッド５４（図２）は、発光検出器などの検出器５８（図１）を含む。発光検出器５８は、９６ウェルプレートのウェルの輝き及び閃光発光反応の両方を読み取る。発光検出器は、試料の発光特徴を検出し、検出器信号を生成する。検出器５８は、吸光度、蛍光、化学発光、電気発光、ＵＶ可視光、または他の試料特徴も測定することができる。
【００１４】
図１を参照すると、検出器信号は、検出器５８と通信するコントローラ６２によって受信される。コントローラ６２は、例えば、マイクロプロセッサコントローラであってよい。コントローラ６２は、メモリモジュール６６と通信する。
【００１５】
複数のアッセイプロトコルは、例えば、ファームウェアとしてメモリモジュール６６内に保存される。プロトコルは、１つ以上のアッセイの自動化に必要とされるシーケンス及びタイミングを含む。コントローラは、アッセイプロトコルに従って発光計の注入器シリンジ及び他の機械的態様の操作を制御する。プロトコルは、検出器信号の収集、それを生データセットに書式設定し、処理するための指示も提供する。プロトコルは、生データを最終書式設定、分析、及びプロットするための指示も提供する。
【００１６】
コントローラ６２は、ユーザインターフェース７０、スキャナ７４、及びデータプロセッサ７８と通信する。ユーザインターフェース７０、スキャナ７４、及びデータプロセッサ７８は、本発明のいくつかの実施形態では、独立構成要素であってよい。他の実施形態では、それらは、ラップトップコンピュータ、タブレットコンピュータ（例えば、ＩＰＡＤ）、またはスマートフォンなどの携帯型電子装置８２の構成要素であってよい。コントローラ６２とインターフェースモジュール７０、スキャナモジュール７４、及びデータ処理モジュール７８との間の通信は、有線またはワイヤレス通信であってよい。ワイヤレス通信は、ワイヤレスローカルエリアネットワーク（例えば、ＷＩＦＩネットワーク）、またはテレコミュニケーションネットワークを介してであってよい。あるいは、携帯型電子装置８２、または個々のユーザ７０、スキャナ７４、及びデータプロセッサ７８は、ＥＴＨＥＲＮＥＴ（登録商標）ハブを介してコントローラ６２に配線され得る。また他の実施形態では、ユーザインターフェース７０、スキャナ７４、及びデータプロセッサ７８は、分析器システム１０が単一の一体装置であるように、発光計１４に統合され得る。
【００１７】
ユーザインターフェース７０は、自動的に選択されたアッセイ、データ分析、及びデータ出力プロトコルを見るために提供される。いくつかの実施形態では、ユーザインターフェース７０は、ユーザによるプロトコルの手動による選択も提供する。ユーザインターフェース７０は、ユーザがメモリモジュール６６を見て、それからプロトコルを選択できるスクリーンを含む。スクリーンは、例えば、ＬＣＤまたはＬＥＤディスプレイであってよく、タッチスクリーン機能を含み得る。ユーザインターフェース７０は、タブレットコンピュータのタッチスクリーンディスプレイ、もしくはラップトップコンピュータのキーボード及びディスプレイの組み合わせであるか、または例えば、スクリーンに隣接する一連のボタンを使用して実行することができる。図５〜９、１３、１６〜２４、及び２９〜３１は、ユーザインターフェース７０上に表示され得る例示的なメニュー、プロトコル指示、及びユーザ選択可能オプションのスクリーン表示を図示する。
【００１８】
スキャナ７４は、試薬プロトコルの自動選択のために提供される。いくつかの実施形態では、スキャナ７４は、光学バーコードまたはマトリックスコード読取装置を含む。スキャナ７４は、試薬箱、瓶、またはキットに取り付けられるバーコード、マトリックスコード、またはＲＦＩＤタグなどの機械可読媒体を読み取るために提供される。図３は、マトリックスコード９０（すなわち、２次元コード）などの機械可読コードを有する試薬箱ラベル８６の例を図示する。スキャナ７４は、タブレットコンピュータまたは他の携帯型電子装置のカメラなど、バーコードまたはマトリックスコードを読み取るための光学カメラも含み得る。他の実施形態では、スキャナは、ＲＦＩＤスキャナまたは他の種類の読取装置デバイスであってよい。また他の実施形態では、ユーザは、どのプロトコルを使用するかを示すためにコード（例えば、文字及び／または数字の組み合わせ）を手動で入力することができる。
【００１９】
試薬に関連する機械可読ラベルを読み取ると、スキャナ７４は、特定の試薬に対応するスキャナ信号を生成する。スキャナ信号は、コントローラ６２と通信する。スキャナ信号を受信すると、コントローラ６２は、メモリ６６から１つ以上の対応するプロトコルを選択する。次に、利用可能なプロトコル（複数可）は、ユーザインターフェース７０上に表示され、データプロセッサ７８に提供される。
【００２０】
データプロセッサ７８は、コントローラ６２から生データを受信するためにコントローラ６２と通信し、プロトコルに従ってデータを処理、分析、及びプロットする。プロット及び統計分析を含む処理データは、ユーザインターフェース７０上に表示され、かつ／または別個のディスプレイ上に表示され得る。いくつかの実施形態では、データプロセッサは、データ分析及び処理のために、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ（登録商標）Ｅｘｃｅｌ（登録商標）または他の集計表ソフトウェアを利用する。図１０〜１２、１４〜１５、１７、及び２５〜２８は、データプロセッサ７８からの処理データ及びプロットの例を提供する。
【００２１】
ユーザインターフェース７０、スキャナ７４、及びデータプロセッサ７８の組み合わせは、ａ）試薬キットの機械可読ラベルに基づく正しい機器プロトコルの自動的選択、ｂ）データ取得、次いで、ｃ）ユーザのための自動データ分析のワークフローステップの統合を可能にする。ユーザは、試薬キット箱の機械可読ラベルをスキャンする、スキャナ７４を利用することにより、またはユーザインターフェース７４上の手動選択を行うことによりプロトコルを開始することができる。次いで、プロトコルは、データ取得を開始するためにセットアップ工程を通してユーザを誘導する。ユーザが本方法を開始し、データ収集したら、コントローラ６２からの生データは、次に、自動的に分析され、データプロセッサ７８により予め定義された様式で、ユーザのために図示的にプロットされる。セットアップの簡潔化は少ないユーザ入力変数を伴うか、またはより複雑なセットアップは追加のユーザ入力変数を伴い得る。データプロセッサ７８からの予め分析されたデータは、次いで、ユーザのために最終報告書に生データと共にエクスポートされ得、この場合、ユーザは所望するようにデータをさらに操作することができる。
【００２２】
図４は、プロトコルの選択、データ収集、及びデータ分析の工程の一実施形態の概要を提供する。ユーザは、第１に、試薬と共に提供された機械可読ラベル（例えば、図３のマトリックスコード９０）をスキャンするためにスキャナを使用する。バーコードのスキャンに応答して、分析システム１０は、適切な方法を自動的に選択し、全ての必要とされる従属物を確認する。これは、ユーザが手動でプロトコルを選択する、またはユーザ自身のプロトコルを構築する必要性を回避する。
【００２３】
試薬キットをスキャンした後、プロトコルは自動的に開始される。プロトコルは、試料及び／または標準品を装填するためのユーザへの指示、ユーザが実行したい標準曲線の種類を選択する能力、ならびに標準曲線を生成するために使用される測定点の数を提供する。次に、ユーザは選択された方法を開始し、選択された方法は生データ収集を生成するために実行される。生データは、例えば、相対的光単位（ＲＬＵ）、相対的蛍光単位（ＲＦＵ）、吸光度、または試料の他の特徴において表され得る。
【００２４】
生データ収集後、データは、ユーザのために自動的にプロットされ、そのため、ユーザはデータ収集後にこれを行う必要がない。標準品は、実験試料と同時に測定される。標準曲線の種類は、様々な種類のもの（例えば、線形適合、用量応答、２次方程式等）、ならびに標準曲線を生成するために使用される標準点の数（例えば、２〜１２点）であってよい。
【００２５】
次いで、実験試料は、ユーザのアッセイが機能し、結果を解釈するのに役立ったかをユーザに知らせるために、標準曲線に基づいて計算される。データプロセッサ７８は、所望の曲線適合計算を含む予め定義されたテンプレートを自動的に選択し、データを予め定義された位置にエクスポートすることができる。データプロセッサ７８は、既知の濃度を有する標準品を含むテンプレートのセクションに関して平均生データを計算する。
【００２６】
データプロセッサ７８は、全ての標準品に関する平均測定値を組み込む予め定義された回帰モデルを使用して回帰分析も実施し、傾向線をプロットする。データプロセッサ７８は、回帰係数、決定係数値Ｒ２、標準偏差ＳＤ、及び他の必要な統計データを計算する。計算した回帰係数を使用して、データプロセッサは、マイクロプレート中の未知物質の濃度を決定し、表示する。
【００２７】
以下の非限定的な実施例は、特定の試薬を利用するワークフローを図示する。
【００２８】
実施例１：ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）ＡＴＰ滴定
【００２９】
ユーザがスキャナ７４を用いてＧｌｏＭａｘ（登録商標）ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）発光試験キットのバーコードをスキャンしたときにワーク−フローが開始される。
【００３０】
以下の指示は、ユーザインターフェース７０のユーザ入力スクリーン上に表示される：
・′′ＧｌｏＭａｘ（登録商標）ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）発光機能試験キットは、ＡＴＰ及びＣｅｌｌＴｉｔｅｒ（登録商標）−Ｇｌｏアッセイの７点系列希釈を使用して、ＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ機器の機能を試験するために使用されます。′′
・′′ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）試薬を準備し、室温と平衡にさせます。′′
・′′ウェルＡ１〜Ａ８、Ｂ１〜Ｂ８、及びＣ１〜Ｃ８は、ＡＴＰ及びブランクの系列希釈物を含みます。１００ｕｌのＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）試薬を、希釈系列及びブランクの各ウェルに添加してください。′′
・′′細胞試料にプレートの残留物を使用したい場合は、そうしてください。１００ｕｌの試料＋１００ｕｌのＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）試薬を必ず添加してください。′′
・′′「続ける」をクリックし、ドアが開いたら、プレートをＧｌｏＭａｘ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒ内に設置してください。′′
これらの工程が完了したら、ドアが開く。
【００３１】
次に、プロトコルは、ユーザインターフェース７０スクリーン上に指示を追加する：
・′′プレートを３０秒間振盪します。′′
・′′１０分間インキュベートします。′′
・′′発光を読み取ります。′′
【００３２】
生データが収集され、線形計算が適用される。プレートウェルＡ８、Ｂ８、及びＣ８の平均が取られる。これらは背景対照である。各ウェル（Ａ１〜Ａ７、Ｂ１〜Ｂ７、及びＣ１〜Ｃ７）から平均背景が減算される。次に、列７を通して背景を減算したＡ１、Ｂ１、Ｃ１；Ａ２、Ｂ２、Ｃ２等からの３つ組試料の平均が求められる。次に、プロットは平均ＲＬＵ−（マイナス）背景値対ＡＴＰ濃度から作製され、グラフラベルが追加される。Ｒ２値は、線形適合から計算される。
【００３３】
実施例２：ＱｕａｎｔｉＦｌｕｏｒ（登録商標）ｄｓＤＮＡ滴定
【００３４】
ユーザがスキャナを用いてＧｌｏＭａｘ（登録商標）蛍光試験キットのバーコードをスキャンしたときにワーク−フローが開始される。
【００３５】
次のプロンプトがユーザインターフェース７０のユーザ入力ディスプレイ上に現れる：
・′′ＧｌｏＭａｘ（登録商標）蛍光機能試験キットは、Ｌａｍｂｄａ  ＤＮＡ及びＱｕａｎｔｉＦｌｕｏｒ（登録商標）ｄｓＤＮＡシステムの６点系列希釈を使用して、ＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ機器の機能を試験するために使用されます。′′
・′′ＤＮＡ系列希釈物を含むＢＬＡＣＫ９６ウェルプレートを室温に解凍します。１０００ｘｇで１分間プレートを回転させて、ウェルの底から濃縮物を回収します。プラスチックのシールを慎重に取り除きます。′′
・′′ウェルＡ１〜Ａ６、Ｂ１〜Ｂ６、及びＣ１〜Ｃ６は、ＤＮＡ及びブランクの系列希釈物を含みます。１００ｕｌの希釈したＱｕａｎｔｉＦｌｕｏｒ（商標）ｄｓＤＮＡ色素を、希釈系列及びブランクの各ウェルに添加してください。′′
・′′細胞試料にプレートの残留物を使用したい場合は、そうしてください。１００ｕｌの試料＋１００ｕｌの希釈したＱｕａｎｔｉＦｌｕｏｒ（商標）ｄｓＤＮＡ色素を必ず添加してください。′′
・′′「続ける」をクリックし、ドアが開いたら、プレートをＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ内に設置してください。′′
これらの工程が完了したら、ドアが開く。
【００３６】
プロトコルはスクリーンを追加する：
・′′プレートを３０秒間振盪します。′′
・′′５分間インキュベートします。′′
・′′４９０ｎｍの励起及び５１０〜５７０ｎｍの放射を使用して、蛍光を読み取ります。′′
【００３７】
次に、生データが収集され、線形計算が適用される。最初に、背景対照としてウェルＡ６、Ｂ６、及びＣ６の平均が取られる。次に、各ウェル（Ａ１〜Ａ５、Ｂ１〜Ｂ５、及びＣ１〜Ｃ５）から平均背景が減算される。列５を通して背景を減算したＡ１、Ｂ１、Ｃ１；Ａ２、Ｂ２、Ｃ２等からの３つ組試料の平均が求められる。
【００３８】
次に、プロットは平均ＲＦＵ−背景値対ＤＮＡ濃度から生成され、グラフラベルが適用される。線形適合から計算されるＲ２値も適用される。
【００３９】
実施例３：ウシ血清アルブミンアッセイ。
【００４０】
ユーザがスキャナを用いてＧｌｏＭａｘ（登録商標）吸光度試験キットをスキャンしたときにワークフローが開始される。
【００４１】
ユーザへの以下の指示を伴うウィンドウは、ユーザインターフェース７０のスクリーン上に表示される：
・′′ＧｌｏＭａｘ（登録商標）吸光度機能試験キットは、ＢＳＡタンパク質及びＰｉｅｒｃｅ６６０ｎｍタンパク質アッセイの７点希釈を使用して、ＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ機器の機能を試験するために使用されます。′′
・′′ＢＳＡタンパク質希釈物を含むＣＬＥＡＲ９６ウェルプレートを室温に解凍します。１０００ｘｇで１分間プレートを回転させて、ウェルの底から濃縮物を回収します。プラスチックのシールを慎重に取り除きます。′′
・′′ウェルＡ１〜Ａ８、Ｂ１〜Ｂ８、及びＣ１〜Ｃ８は、タンパク質及びブランクの系列希釈物を含みます。１５０ｕｌのタンパク質アッセイ試薬を、希釈系列及びブランクの各ウェルに添加してください。′′
・′′細胞試料にプレートの残留物を使用したい場合は、そうしてください。２０ｕｌの試料＋１５０ｕｌのＰｉｅｒｃアッセイ試薬を必ず添加してください。′′
・′′「続ける」をクリックし、ドアが開いたら、プレートをＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ内に設置してください。′′
これらの工程が完了したら、ドアが開く。
【００４２】
プロトコルはスクリーンを後に追加する：
・′′プレートを３０秒間振盪します。′′
・′′５分間インキュベートします。′′
・′′６００ｎｍを使用して吸光度を読み取ります。′′
【００４３】
次に、生データが収集され、データの線形計算が適用される。最初に、Ａ８、Ｂ８、及びＣ８の平均が計算され、背景対照として使用される。次に、各ウェル（Ａ１〜Ａ５、Ｂ１〜Ｂ７、及びＣ１〜Ｃ７）から平均背景が減算される。列７を通して背景を減算したＡ１、Ｂ１、Ｃ１；Ａ２、Ｂ２、Ｃ２等からの３つ組試料の平均が求められる。
【００４４】
プロットは平均吸光度−（マイナス）背景値対タンパク質濃度から作製され、Ｒ２値が線形適合から計算される。
【００４５】
実施例４：Ｎａｎｏ−Ｇｌｏ（登録商標）リポーター滴定。
【００４６】
ユーザがＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｎａｎｏ−Ｇｌｏ（登録商標）発光キットのバーコードをスキャンしたときにワーク−フローが開始される。
【００４７】
ユーザへの以下の指示を伴うウィンドウは、ユーザインターフェース上に表示される：
・′′ＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｎａｎｏ−Ｇｌｏ（登録商標）発光機能試験キットは、リポーター可溶化物及びＮａｎｏ−Ｇｌｏ（登録商標）ルシフェラーゼアッセイの７点系列希釈を使用して、ＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ機器の機能を試験するために使用されます。′′
・′′Ｎａｎｏ−Ｇｌｏ（登録商標）試薬を準備し、室温と平衡にさせます。′′
・′′可溶化物系列希釈物を含むＷＨＩＴＥ９６ウェルプレートを室温に解凍します。１０００ｘｇで１分間プレートを回転させて、ウェルの底から濃縮物を回収します。プラスチックのシールを慎重に取り除きます。′′
・′′細胞試料にプレートの残留物を使用したい場合は、そうしてください。ＮａｎｏＬｕｃ（登録商標）ルシフェラーゼを発現する１００ｕｌの溶解された細胞＋１００ｕｌのＮａｎｏ−Ｇｌｏ（登録商標）試薬を必ず添加してください。′′
・′′「続ける」をクリックし、ドアが開いたら、プレートをＧｌｏＭａｘ（登録商標）Ｄｉｓｃｏｖｅｒ内に設置してください。′′
これらの工程が完了したら、ドアが開く。
【００４８】
次に、プロトコルはスクリーンを追加する：
・′′プレートを３０秒間振盪します。′′
・′′１０分間インキュベートします。′′
・′′発光を読み取ります。′′
【００４９】
次に、生データが収集され、データの線形計算が適用される。最初に、ウェルＡ８、Ｂ８、及びＣ８の平均が求められ、背景対照として使用される．次に、各ウェル（Ａ１〜Ａ５、Ｂ１〜Ｂ７、及びＣ１〜Ｃ７）から平均背景が減算される。列７を通して背景を減算したＡ１、Ｂ１、Ｃ１；Ａ２、Ｂ２、Ｃ２等からの３つ組試料の平均が求められる。
【００５０】
平均ＲＬＵ背景値対ＮａｎｏＬｕｃ（登録商標）ルシフェラーゼの濃度がプロットされる。ラベルがプロットに適用され、線形適合から計算されたＲ２値が表示される。
【００５１】
よって、本発明は、特に、自動プロトコルプロンプティングを有する分析器を提供する。本発明の様々な特徴及び利益は、以下の特許請求の範囲に記載される。
【図１】
0006324485.tif 000002
【図２】
0006324485.tif 000003
【図３】
0006324485.tif 000004
【図４】
0006324485.tif 000005
【図５】
0006324485.tif 000006
【図６】
0006324485.tif 000007
【図７】
0006324485.tif 000008
【図８】
0006324485.tif 000009
【図９】
0006324485.tif 000010
【図１０】
0006324485.tif 000011
【図１１】
0006324485.tif 000012
【図１２】
0006324485.tif 000013
【図１３】
0006324485.tif 000014
【図１４】
0006324485.tif 000015
【図１５】
0006324485.tif 000016
【図１６】
0006324485.tif 000017
【図１７】
0006324485.tif 000018
【図１８】
0006324485.tif 000019
【図１９】
0006324485.tif 000020
【図２０】
0006324485.tif 000021
【図２１】
0006324485.tif 000022
【図２２】
0006324485.tif 000023
【図２３】
0006324485.tif 000024
【図２４】
0006324485.tif 000025
【図２５】
0006324485.tif 000026
【図２６】
0006324485.tif 000027
【図２７】
0006324485.tif 000028
【図２８】
0006324485.tif 000029
【図２９】
0006324485.tif 000030
【図３０】
0006324485.tif 000031
【図３１】
0006324485.tif 000032
【図３２】
0006324485.tif 000033
【図３３】
0006324485.tif 000034
【図３４】
0006324485.tif 000035
【図３５】
0006324485.tif 000036