(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
a) 複数の化合物のそれぞれについて、該化合物から生成されるイオンの質量電荷比に関する情報を含む化合物情報が保存された記憶部と、
b) 前記複数の化合物の中から、定量及び／又は定性の対象である複数の分析対象化合物を指定する入力を受け付ける化合物指定入力受付部と、
c) 前記記憶部から、前記指定された分析対象化合物に関する化合物情報を抽出する化合物情報抽出部と、
d) 前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、他の分析対象化合物から生成されるイオンと質量電荷比が異なるイオンを１乃至複数個、基準イオン候補として分析者に提示する基準イオン候補提示部と、
を備えることを特徴とする質量分析装置。
【請求項２】
前記化合物情報に、前記複数の化合物のそれぞれから生成されるイオンが検出される強度に関する情報が含まれており、
前記基準イオン候補提示部が、前記強度に関する情報に基づいて基準イオン候補を提示する
ことを特徴とする請求項１に記載の質量分析装置。
【請求項３】
前記基準イオン候補提示部が、前記複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補を、質量電荷比が大きい順に提示する
ことを特徴とする請求項１に記載の質量分析装置。
【請求項４】
前記基準イオン候補提示部が、他の基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオンを、前記複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補として提示する
ことを特徴とする請求項１〜３のいずれかに記載の質量分析装置。
【請求項５】
a) 複数の化合物のそれぞれについて、該化合物から生成されるイオンの質量電荷比に関する情報を含む化合物情報が保存された記憶部と、
b) 前記複数の化合物の中から、定量及び／又は定性の対象である複数の分析対象化合物と該複数の分析対象化合物の基準イオンの質量電荷比を指定する入力を受け付ける化合物指定入力受付部と、
c) 前記記憶部から、前記指定された分析対象化合物に関する化合物情報を抽出する化合物情報抽出部と、
d) 前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、該分析対象化合物について指定された基準イオンと質量電荷比が合致するイオンが他の分析対象化合物から生成されるか否かを確認する基準イオン確認部と、
を備えることを特徴とする質量分析装置。
【請求項６】
e) 前記基準イオン確認部によって、分析対象化合物について指定された基準イオンの質量電荷比に合致するイオンが他の分析対象化合物から生成されることが確認された場合に、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、他の分析対象化合物から生成されるイオンと質量電荷比が異なるイオンを代替基準イオン候補として分析者に提示する代替基準イオン候補提示部
を備えることを特徴とする請求項５に記載の質量分析装置。
【請求項７】
前記化合物情報に、前記複数の化合物のそれぞれから生成されるイオンが検出される強度に関する情報が含まれており、
前記代替基準イオン候補提示部が、前記強度に関する情報に基づいて前記代替基準イオン候補を提示する
ことを特徴とする請求項６に記載の質量分析装置。
【請求項８】
前記代替基準イオン候補提示部が、質量電荷比が大きい順に代替基準イオン候補を提示する
ことを特徴とする請求項６に記載の質量分析装置。
【請求項９】
前記代替基準イオン候補提示部が、他の基準イオンや代替基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオンを代替基準イオン候補として提示する
ことを特徴とする請求項６から８のいずれかに記載の質量分析装置。
【請求項１０】
請求項１から４のいずれかに記載の質量分析装置と、試料に含まれる複数の分析対象化合物を時間的に分離するクロマトグラフを有し、
前記化合物情報に、前記クロマトグラフにおける前記複数の化合物のそれぞれの保持時間に関する情報が含まれており、
前記基準イオン候補提示部が、前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、他の分析対象化合物から生成されるイオンと、保持時間又は質量電荷比が異なるイオンを基準イオン候補として分析者に提示する
ことを特徴とするクロマトグラフ質量分析装置。
【請求項１１】
請求項５に記載の質量分析装置と、試料に含まれる複数の分析対象化合物を時間的に分離するクロマトグラフを有し、
前記化合物情報に、前記クロマトグラフにおける前記複数の化合物のそれぞれの保持時間に関する情報が含まれており、
前記基準イオン確認部が、前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、保持時間の差が予め決められた時間よりも短い他の分析対象化合物から該分析対象化合物について指定された基準イオンと質量電荷比が合致するイオンが生成されるか否かを確認する
ことを特徴とするクロマトグラフ質量分析装置。
【請求項１２】
請求項６から９のいずれかに記載の質量分析装置と、試料に含まれる複数の分析対象化合物を時間的に分離するクロマトグラフを有し、
前記化合物情報に、前記クロマトグラフにおける前記複数の化合物のそれぞれの保持時間に関する情報が含まれており、
前記基準イオン確認部が、前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、保持時間の差が予め決められた時間よりも短い他の分析対象化合物から該分析対象化合物について指定された基準イオンと質量電荷比が合致するイオンが生成されるか否かを確認し、
前記代替基準イオン候補提示部が、前記基準イオン確認部によって、前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、保持時間の差が予め決められた時間よりも短い他の分析対象化合物から該分析対象化合物について指定された基準イオンと質量電荷比が合致するイオンが生成されることが確認された場合に、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、保持時間の差が予め決められた時間よりも短い他の分析対象化合物から生成されるイオンと質量電荷比が異なるイオンを代替基準イオンとして分析者に提示する
ことを特徴とするクロマトグラフ質量分析装置。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、質量分析装置に関する。また、ガスクロマトグラフや液体クロマトグラフと質量分析装置を組み合わせて構成したクロマトグラフ質量分析装置に関する。
【背景技術】
【０００２】
試料に含まれる成分の定性分析や定量分析を行うために、ガスクロマトグラフ（ＧＣ）や液体クロマトグラフ（ＬＣ）等のクロマトグラフと、四重極型質量分析計等の質量分析装置とを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置が広く用いられている。
クロマトグラフ質量分析装置では、クロマトグラフによって時間的に分離された試料中の複数の成分を順に質量分析装置に導入し、それらの定性分析や定量分析を行う。
【０００３】
クロマトグラフ質量分析装置を用いて試料の定性分析や定量分析を行う際には、分析対象化合物を特徴づけるイオンを、定量イオン及び確認イオンとして用いる。種々の化合物にそれぞれ対応する定量イオンと確認イオンは、予め該化合物の標品等を質量分析した結果に基づいて１乃至複数組設定され、データベースに保存される。分析者は該データベースを参照して定量イオン及び確認イオンを設定する。そして、試料をクロマトグラフ質量分析して得られる定量イオンのマスクロマトグラムのピークと確認イオンのマスクロマトグラムのピークの強度比（あるいは面積比）を用いて化合物を同定（定性）し、定量イオンのマスクロマトグラムのピークの強度（面積）から化合物を定量する（例えば特許文献１、２）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】特開２０１１−２４２２５５号公報
【特許文献２】特開２０１２−１３２７９９号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
近年、クロマトグラフ質量分析装置を用いて、血液や尿といった代謝物中の化合物の含有量からがんや糖尿病等の病気を発見する試みがなされている。こうした分析では、対象化合物が１００種類以上、多い場合には約４００種類にもなり、これらの中には類似の分子構造を有する糖質やアミノ酸などが含まれる。類似の分子構造を持つ化合物群はカラムからほぼ同じ保持時間で溶出する。また、化合物群からは同一の質量電荷比を有するイオンが生成される場合が多い。そのため、化合物群に含まれる化合物Ａの定量イオンや確認イオンに設定された質量電荷比のイオンが、化合物Ａとほぼ同時にカラムから溶出する別の化合物Ｂからも生成される可能性がある。すると、マスクロマトグラムにおいて化合物Ａの定量イオンのピークに化合物Ｂ由来のイオンのピークが重なり、化合物Ｂの含有量を含む、誤った値を化合物Ａの定量値としてしまうことになる。確認イオンの場合も同様であり、この場合には化合物Ａを誤って定性してしまう。
【０００６】
こうした問題は、上記以外に、ＭＳ／ＭＳ装置を用いた多重反応モニタリング（ＭＲＭ：Multiple Reaction Monitoring）分析において、上記定量イオンに対応するプリカーサイオンとプロダクトイオンの組である定量ＭＲＭトランジションや、上記確認イオンに対応する確認ＭＲＭトランジションを設定する場合にも生じる。また、クロマトグラフを併用しない質量分析においても同様の問題が生じる。
なお、以降の説明において、定量イオン、確認イオン、定量ＭＲＭトランジション、及び確認ＭＲＭトランジションを適宜、「基準イオン」と呼ぶ。
【０００７】
本発明が解決しようとする課題は、試料に含まれる複数の分析対象化合物の定性及び／又は定量を行う際に、別の分析対象化合物の影響を受けない基準イオンを確実に決定することができる質量分析装置、及び該質量分析装置にクロマトグラフを組み合わせて構成したクロマトグラフ質量分析装置を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
上記課題を解決するために成された本発明に係る質量分析装置の第１の態様は、
a) 複数の化合物のそれぞれについて、該化合物から生成されるイオンの質量電荷比に関する情報を含む化合物情報が保存された記憶部と、
b) 前記複数の化合物の中から、定量及び／又は定性の対象である複数の分析対象化合物を指定する入力を受け付ける化合物指定入力受付部と、
c) 前記記憶部から、前記指定された分析対象化合物に関する化合物情報を抽出する化合物情報抽出部と、
d) 前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、他の分析対象化合物から生成されるイオンと質量電荷比が異なるイオンを１乃至複数個、基準イオン候補として分析者に提示する基準イオン候補提示部と、
を備えることを特徴とする。
【０００９】
上記分析対象化合物を指定する入力は、化合物名を入力したり、画面上に化合物リストを表示させて分析対象化合物をチェックして選択したりすること等により行うことができる。
上記の、他の分析対象化合物から生成されるイオンと質量電荷比とが異なる、とは、同一の質量フィルタ条件で分析対象化合物の基準イオンを検出したときに、他の分析対象化合物から生成されるイオンが同時に検出されない程度に質量電荷比が異なっていることを意味する。即ち、基準イオンの質量電荷比と、他の分析対象化合物から生成されるイオンの質量電荷比が、装置の質量分解能程度以上に異なることを意味する。
また、上記の基準イオンは、例えば、定量イオンや確認イオン、プリカーサイオンとプロダクトイオンの組である定量ＭＲＭトランジションや、確認ＭＲＭトランジションである。
【００１０】
本発明に係る質量分析装置の第１の態様では、分析者が化合物指定入力受付部を通じて複数の分析対象化合物を指定すると、基準イオン候補提示部は記憶部に保存された化合物情報を参照して、他の化合物から生成されない質量電荷比のイオンを各分析対象化合物の基準イオン候補として分析者に提示する。分析者は提示された基準イオン候補の中から定量イオンや確認イオンを選択するだけでよい。従って、本発明に係る第１の態様の質量分析装置を用いることによって、複数の分析対象化合物について、別の分析対象化合物の影響を受けない基準イオンを確実に決定することができる。
【００１１】
従来、分析者は、分析に先立ち、各分析対象化合物の定量イオン及び確認イオンと同一の質量電荷比のイオンが他の分析対象化合物から生成されないことを確認し、生成される場合には別の定量イオンや確認イオンを設定するという作業を行っていた。しかし、上述のとおり、１００種類以上もの分析対象化合物についてこうした作業を行おうとすると、時間がかかり、また、人為的なミスによって同一の質量電荷比を有するイオンを設定してしまう可能性もあったが、本発明に係る質量分析装置を用いることで確実かつ容易に適切な基準イオンを決定することができる。
【００１２】
上記第１の態様の質量分析装置では、さらに、
前記化合物情報に、前記複数の化合物のそれぞれから生成されるイオンが検出される強度に関する情報が含まれており、
前記基準イオン候補提示部が、前記強度に関する情報に基づいて基準イオン候補を提示する
ことが望ましい。
【００１３】
イオンの強度に関する情報に基づいて基準イオン候補を提示する、とは、例えばイオンの検出強度が高い順に基準イオン候補を順位付けして提示することや、あるいは検出される強度が予め決められた閾値以上であるイオンのみを基準イオン候補として提示することを意味する。また、強度に関する情報としては、強度の絶対値のほか、１つの化合物のマスピークの中で最も強度が大きいマスピークであるベースピークとの強度比の値などを用いることができる。この態様の質量分析装置を用いると、分析者は高強度で検出される基準イオンを選択しやすくなり、分析対象化合物をより高精度で定性及び／又は定量することができる。
【００１４】
また、上記第１の態様の質量分析装置では、
前記基準イオン候補提示部が、前記複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補を、質量電荷比が大きい順に提示する
ように構成することもできる。
【００１５】
一般に、化合物から生成される各種イオンのうち、質量電荷比が大きいイオンほど、その化合物を特徴付けるイオンであることが多い。従って、複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補を、質量電荷比が大きい順に提示するように構成しておけば、分析者は、各分析対象化合物について、それらをより特徴づけるイオンを基準イオン候補として選択しやすくなる。
【００１６】
さらに、上記第１の態様の質量分析装置では、
前記基準イオン候補提示部が、他の基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオンを、前記複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補として提示する
ように構成することもできる。
【００１７】
異なる分析対象化合物の基準イオン候補の質量電荷比の差が小さいと、分解能が低い質量分析装置では、それら基準イオン候補を十分に分離して検出することが難しい場合がある。基準イオン候補提示部が、他の基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオン（例えば質量電荷比が２以上異なるイオン）を、前記複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補として提示するように構成しておくことにより、分析者が、質量分析装置において、より確実に分離可能な複数の基準イオン候補を容易に選択することができる。
【００１８】
上記課題を解決するために成された本発明に係る質量分析装置の第２の態様は、
a) 複数の化合物のそれぞれについて、該化合物から生成されるイオンの質量電荷比に関する情報を含む化合物情報が保存された記憶部と、
b) 前記複数の化合物の中から、定量及び／又は定性の対象である複数の分析対象化合物と該複数の分析対象化合物の基準イオンの質量電荷比を指定する入力を受け付ける化合物指定入力受付部と、
c) 前記記憶部から、前記指定された分析対象化合物に関する化合物情報を抽出する化合物情報抽出部と、
d) 前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、該分析対象化合物について指定された基準イオンと質量電荷比が合致するイオンが他の分析対象化合物から生成されるか否かを確認する基準イオン確認部と、
を備えることを特徴とする。
【００１９】
質量分析装置を用いた定性や定量が頻繁に行われる分析対象化合物では、予め基準イオンが設定されていることが多い。こうした場合に第２の態様の質量分析装置を好適に用いることができる。この態様の質量分析装置では、分析者が化合物指定入力受付部を通じて複数の分析対象化合物を指定する情報（例えば化合物名）と基準イオンの質量電荷比を入力すると、基準イオン確認部によって該基準イオンが適切なものであるかが確認される。分析者はその結果を確認して適切な基準イオンを選択することができる。従って、上記第２の態様の質量分析装置を用いることによっても、複数の分析対象化合物について、別の分析対象化合物の影響を受けない基準イオンを確実に決定することができる。
【００２０】
上記第２の態様の質量分析装置では、さらに、
e) 前記基準イオン確認部によって、分析対象化合物について指定された基準イオンの質量電荷比に合致するイオンが他の分析対象化合物から生成されることが確認された場合に、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、他の分析対象化合物から生成されるイオンと質量電荷比が異なるイオンを代替基準イオン候補として分析者に提示する代替基準イオン候補提示部
を備えることが望ましい。
【００２１】
また、代替基準イオン候補提示部を備える態様の質量分析装置では、
前記化合物情報に、前記複数の化合物のそれぞれから生成されるイオンが検出される強度に関する情報が含まれており、
前記代替基準イオン候補提示部が、前記強度に関する情報に基づいて代替基準イオン候補を提示する
ことが望ましい。
【００２２】
あるいは、代替基準イオン候補提示部を備える態様の質量分析装置では、
前記代替基準イオン候補提示部が、質量電荷比が大きい順に代替基準イオン候補を提示する
ように構成することもできる。
【００２３】
さらに、代替基準イオン候補提示部を備える態様の質量分析装置では、
前記代替基準イオン候補提示部が、他の基準イオンや代替基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオンを代替基準イオン候補として提示する
ように構成することもできる。
【００２４】
本発明の第３の態様は、上記のいずれかの質量分析装置と試料に含まれる複数の分析対象化合物を時間的に分離するクロマトグラフを組み合わせたクロマトグラフ質量分析装置である。クロマトグラフは、ガスクロマトグラフ、液体クロマトグラフのいずれであってもよい。
【００２５】
第３の態様のクロマトグラフ質量分析装置では、さらに、
前記化合物情報に、前記クロマトグラフにおける前記複数の化合物のそれぞれの保持時間に関する情報が含まれており、
前記基準イオン候補提示部が、前記化合物情報抽出部により抽出された化合物情報に基づき、前記複数の分析対象化合物のそれぞれについて、該分析対象化合物から生成されるイオンであって、他の分析対象化合物から生成されるイオンと、保持時間又は質量電荷比が異なるイオンを基準イオン候補として分析者に提示する
ことが望ましい。
【００２６】
クロマトグラフ質量分析装置では、ある分析対象化合物の基準イオンと同一の質量電荷比のイオンが別の分析対象化合物から生成される場合でも、両化合物の保持時間が違えばこれらのイオンが同時に検出されることはない。この態様のクロマトグラフ質量分析装置では、こうしたイオンを基準イオン候補に加えることができるため、より高強度のイオンを基準イオンとして高精度の定性や定量を行うことが可能になる。なお、上記保持時間として保持指標を用いてもよい。
【発明の効果】
【００２７】
本発明に係る質量分析装置あるいはクロマトグラフ質量分析装置を用いることにより、定性や定量を行う複数の分析対象化合物のそれぞれについて、別の分析対象化合物の影響を受けない基準イオンを確実に決定することができる。
【図面の簡単な説明】
【００２８】
【図１】本発明に係るクロマトグラフ質量分析装置の一実施例であるガスクロマトグラフ質量分析装置の要部構成図。
【図２】実施例１において基準イオン候補を提示するまでの手順を説明するフローチャート。
【図３】実施例１における化合物情報の一例。
【図４】実施例１において基準イオン候補を抽出する手順を説明する図。
【図５】実施例２において基準イオン候補を提示するまでの手順を説明するフローチャート。
【発明を実施するための形態】
【００２９】
本発明に係る質量分析装置及びクロマトグラフ質量分析装置の一実施例について、以下、図面を参照して説明する。
【００３０】
図１は本実施例のガスクロマトグラフ質量分析装置（ＧＣ／ＭＳ／ＭＳ）の要部構成図である。このガスクロマトグラフ質量分析装置は、ガスクロマトグラフ（ＧＣ）部１、質量分析（ＭＳ）部３、及びそれらの間に位置するインターフェイス部２で構成される。
【００３１】
ガスクロマトグラフ（ＧＣ）部１では、マイクロシリンジ１１によって試料液が試料気化室１０に注入される。試料液は試料気化室１０内で気化し、キャリアガス流路１２から供給されるキャリアガス（Ｈｅ）の流れに乗ってカラム１４に送られる。カラム１４はカラムオーブン１３により所定の温度に加熱されており、その中で試料中の成分が時間的に分離される。分離された各成分は順にカラム１４の出口に到達し、加熱ヒータ等を含むインターフェイス部２を経て、質量分析（ＭＳ）部３のイオン化室３１に導入される。
【００３２】
イオン化室３１に導入された化合物分子は電子イオン化（ＥＩ）法や化学イオン化（ＣＩ）法などによりイオン化される。生成されたイオンはイオン化室３１の外側に引き出され、イオンレンズ３２により収束されて４本のロッド電極から構成される前段四重極マスフィルタ（Ｑ１）３３の長軸方向の空間に導入される。前段四重極マスフィルタ（Ｑ１）３３には、図示しない電源から直流電圧と高周波電圧とを重畳した電圧が印加され、その印加電圧に応じた質量電荷比を有するイオンのみがその長軸方向の空間を通過し、コリジョンセル３４に導入される。
【００３３】
コリジョンセル３４の内部には、高周波電場の作用によりイオンを収束させる多重極型イオンガイド（ｑ２）３５が配置されている。また、コリジョンセル３４内には連続的に又は間欠的に外部よりＡｒガス等のＣＩＤガスが導入される。コリジョンセル３４に導入されたイオンはＣＩＤガスに接触して開裂し、その開裂によって生成されたプロダクトイオンは収束されつつ後段四重極マスフィルタ（Ｑ３）３６の長軸方向の空間に導入される。後段四重極マスフィルタ（Ｑ３）３６は前段四重極マスフィルタ（Ｑ１）３３と同様に４本のロッド電極で構成され、図示しない電源から直流電圧と高周波電圧とを重畳した電圧がそれらロッド電極に印加され、その印加電圧に応じた質量電荷比を有するプロダクトイオンのみがその長軸方向の空間を通過してイオン検出器３７に到達する。イオン検出器３７による検出信号はＡ／Ｄ変換器３８によりデジタルデータに変換されてデータ処理部４に送られる。
【００３４】
データ処理部４は、本発明に特徴的な処理を行うために、化合物情報記憶部４１、化合物指定入力受付部４２、化合物情報抽出部４３、基準イオン候補提示部４４、基準イオン確認部４５、及び代替基準イオン候補提示部４６を機能ブロックとして備えている。ＧＣ部１、インターフェイス部２、及びＭＳ部３に含まれる各部の動作は、分析制御部５によりそれぞれ制御される。また、中央制御部６にはキーボードやマウス等のポインティングデバイスを含む入力部７や表示部８が接続され、中央制御部６は入出力制御や分析制御部５よりも上位のシステム制御を担う。なお、データ処理部４、分析制御部５、及び中央制御部６は、パーソナルコンピュータをハードウエア資源とし、該パーソナルコンピュータにインストールされた専用の制御／処理ソフトウエアをパーソナルコンピュータ上で実行することにより具現化される。
【００３５】
本実施例のＧＣ／ＭＳ／ＭＳのＭＳ部３では、コリジョンセル３４内でのＣＩＤ操作を伴うＭＳ／ＭＳ分析のモードとして、ＭＲＭ測定モード、プリカーサイオンスキャン測定モード、プロダクトイオンスキャン測定モード、ニュートラルロススキャン測定モード、を実行することができる。また、コリジョンセル３４内でのＣＩＤ操作を行わないＭＳ分析のモードとして、Ｑ１ＳＩＭ測定モード、Ｑ３ＳＩＭ測定モード、Ｑ１スキャン測定モード、Ｑ３スキャン測定モードを実行することもできる。これらのうち、ＭＲＭ測定モード、Ｑ１ＳＩＭ測定モード、及びＱ３ＳＩＭ測定モードが、本実施例の特徴的な動作に関連する。
【００３６】
化合物情報記憶部４１には、複数の化合物の化合物情報が保存されている。化合物情報には、化合物の保持時間情報と、該化合物をＭＳ分析して得たＭＳスペクトル及びＭＳ／ＭＳ分析して得たＭＳ２スペクトルにおけるマスピークの位置（質量電荷比）と強度が含まれる。図３に化合物Ａ、Ｂ、及びＣの化合物情報の一例を示す。図３ではＭＳスペクトルのマスピークの位置と強度を表形式で示したが、その他マススペクトルのデータそのものなど、適宜の形式のものを用いることができる。また、図３に示す強度はベースピーク（マススペクトル上で最も強度が大きいピーク）に対する強度比としたが、強度の実測値（絶対値）とすることもできる。さらに、保持時間（分）に代えて、保持指標を用いてもよい。なお、保持指標とは、成分の保持時間を基準化合物（n-アルカン）、ＦＡＭＥ（脂肪酸メチルエステル）等の基準化合物の保持時間により指標化したものである。
【実施例１】
【００３７】
次に、本実施例のガスクロマトグラフ質量分析装置を用いて、試料に含まれる複数の分析対象成分の基準イオン（定量イオンや確認イオン）を決定する方法について、図２のフローチャートを参照して説明する。
【００３８】
分析者が所定の入力操作によって分析条件設定画面を呼び出すと、表示部８の画面上に記憶部４１に保存された化合物（化合物Ａ〜Ｃ）のリストが表示される。分析者が表示された化合物の中から入力部７により分析対象化合物を選択すると（ステップＳ１）、化合物指定入力受付部４２により分析対象化合物が特定される（ステップＳ２）。また、それらに関する化合物情報が化合物情報抽出部４３により記憶部４１から抽出される（ステップＳ３）。本実施例では、分析者が２つの化合物Ａ、Ｂを分析対象化合物として選択する場合を例に説明する。
【００３９】
続いて、基準イオン候補提示部４４は、抽出された化合物Ａ、Ｂの化合物情報を用いて化合物Ａ、Ｂのそれぞれについて基準イオン候補を提示する。具体的には、図４(a)に示すように、化合物Ａ、化合物Ｂからそれぞれ生成されるイオンを質量電荷比順に並べて比較し、質量電荷比が相互に異なるイオンを抽出する（ステップＳ４、図４(b)）。そして、それら基準イオン候補を、マスピークの強度が大きい順に並べ替えて（ステップＳ５）、その上位の所定個（本実施例では3個）を表示部８の画面に表示する（ステップＳ６、図４(c)）。分析者は、画面に表示された基準イオン候補を確認し、必要な数のイオンを基準イオンとして決定する。本実施例において、例えば化合物Ａ、Ｂのそれぞれの定量イオン及び確認イオンを決定する場合には、化合物Ａのm/z=341のイオンを定量イオン、m/z=56のイオンを確認イオンとし、化合物Ｂのm/z=202のイオンを定量イオン、m/z=100のイオンを確認イオンとして選択する。以上のとおり、本実施例のクロマトグラフ質量分析装置を用いることによって、分析者は容易かつ確実に、別の分析対象化合物の影響を受けない基準イオンを確実に決定することができる。
【００４０】
上記の実施例では、基準イオン候補提示部４４が、化合物Ａ、化合物Ｂの基準イオン候補をマスピークの強度が大きい順に表示部８の画面に表示するように構成したが（図４(c)）、基準イオン候補提示部４４が、化合物Ａ、化合物Ｂの基準イオン候補を質量電荷比が大きい順に所定個（本実施例では3個）を表示部８の画面に表示するように構成することもできる。この構成では、化合物Ａ、化合物Ｂの基準イオン候補は図４(d)に示すように表示される（即ち、化合物Ａの基準イオン候補にm/z=56のイオンが含まれなくなる）。
【００４１】
一般に、化合物から生成される各種イオンのうち、質量電荷比が大きいイオンほど、その化合物を特徴付けるイオンであることが多い。従って、図４(d)に示すように基準イオン候補を表示するように構成しておけば、分析者は、化合物Ａ、化合物Ｂのそれぞれについて、当該化合物により特徴的なイオンを基準イオンとして容易に選択することができる。
【００４２】
ところが、使用する質量分析装置の質量分解能が低い場合、異なる分析対象化合物の基準イオン候補の質量電荷比の差が小さい（例えば質量電荷比の差が１以下である）と、それらを十分に分離して検出することが難しい。例えば、図４(c)に基づいて化合物Ａのm/z=341のイオンを定量イオン、m/z=56のイオンを確認イオンとした場合、化合物Ａの確認イオン（m/z=56のイオン）と化合物Ｂから生成されるm/z=55のイオンの質量電荷比の差が１しかない。
【００４３】
そこで、基準イオン候補４４が、まず他の基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値（例えば２）以上であるイオンを抽出し、さらにそれらのマスピークの強度が大きい順に並べ替えて表示部８の画面に表示するように構成することも有効である。この構成では、化合物Ａ、化合物Ｂの基準イオン候補は図４(e)となる。このような構成を採ることによって、分析者が、より確実に分離可能な複数の基準イオン候補）を容易に選択する（化合物Ａのm/z=341のイオンを定量イオン、m/z=500のイオンを確認イオンとして選択し、化合物Ｂのm/z=202のイオンを定量イオン、m/z=100のイオンを確認イオンとして選択することができる。
【実施例２】
【００４４】
質量分析装置を用いた定性や定量が頻繁に行われる分析対象化合物では、予め基準イオンが設定されていることが多い。そこで、こうした場合に本実施例のガスクロマトグラフ質量分析装置を用いて、試料に含まれる複数の分析対象成分の基準イオン（定量イオンや確認イオン）を決定する方法について、図５のフローチャートを参照して説明する。ここでは、化合物Ａの定量イオンとしてm/z=322のイオン、確認イオンとしてm/z=341のイオンが、化合物Ｂの定量イオンとしてm/z=50のイオン、確認イオンとしてm/z=202のイオンが、それぞれ設定されている場合を例に説明する。
【００４５】
分析者が所定の入力操作によって分析条件設定画面を呼び出すと、表示部８の画面上に記憶部４１に保存された化合物のリストが表示される。続いて、分析者が、表示された化合物の中から、入力部７により化合物Ａ、Ｂを選択すると（ステップＳ１１）、化合物指定入力受付部４２により分析対象化合物として化合物Ａ、Ｂが特定される（ステップＳ１２）。そして、それらに関する化合物情報が化合物情報抽出部４３により記憶部４１から抽出される（ステップＳ１３）。
【００４６】
本実施例では、さらに、分析者が化合物Ａ、Ｂについて予め設定された上記の定量イオン及び確認イオンの質量電荷比を入力する（ステップＳ１４）。すると、基準イオン確認部４５はそれらの値を、化合物情報抽出部４３により抽出された化合物Ａ、Ｂの化合物情報と比較する。具体的には、化合物Ａについて分析者が入力した定量イオン（m/z=322）と確認イオン（m/z=341）の質量電荷比と同一のイオンが他の分析対象化合物（化合物Ｂ）から生成されるか否かを確認する（ステップＳ１５）。化合物Ｂの化合物情報にはm/z=322のイオンが含まれている。従って、基準イオン確認部４５は、化合物Ａの定量イオン（m/z=322）が化合物Ｂからも生成される（即ち、定量イオンとして適切ではない）ことを表示部８の画面上に表示する。
【００４７】
上記のように、基準イオン確認部４５により、分析者により入力された分析対象化合物のイオンと同一の質量電荷比のイオンが別の分析対象化合物から生成されると判断される（ステップＳ１５でＹＥＳ）と、代替基準イオン候補提示部４６は、別のイオンを代替基準イオン候補として提示する。具体的には、化合物Ａの定量イオン候補として、化合物Ａから生成されるイオンのうち、他の分析対象化合物（化合物Ｂ）から生成されるイオンと質量電荷比が異なるイオンを抽出し（ステップＳ１６）、その中から最もマスピークの強度が大きいイオンの質量電荷比を表示部８に表示する（ステップＳ１７）。あるいは、抽出したイオンをマスピークの強度が大きい順に並べ替えて表示部８に表示する。本実施例では、m/z=341のイオンが既に分析者によって化合物Ａの確認イオンとして既に入力されているため、化合物Ａの定量イオンに関する代替基準イオン候補としてm/z=500のイオンを提示する。好ましくは、代替基準イオン候補提示部４６は、化合物Ａの定量イオン候補を分析者により入力された確認イオンとともに、それらのマスピーク強度を付して表示する。これにより、分析者は定量イオンと確認イオンの強度を視認し、それらを入れ替えて使用することができる。化合物Ｂについても同様の処理が行われ、代替基準イオン候補提示部４６は、化合物Ｂの定量イオンに関する代替基準イオン候補としてm/z=100のイオンを抽出し、分析者が入力した確認イオン（m/z=202）とともにマスピークの強度を付して表示部８に表示する。ここでは、説明を容易にするために、分析対象化合物を２種類としたが、３種類以上の場合も同様である。
【００４８】
実施例２の質量分析装置においても、実施例１の質量分析装置と同様に、代替基準イオン候補提示部４６が、質量電荷比が大きい順に代替基準イオン候補を提示するように構成することができる。また、代替基準イオン候補提示部４６が、他の基準イオンや代替基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオンを代替基準イオン候補として提示するように構成することもできる。
【実施例３】
【００４９】
上記実施例では、基準イオン候補提示部４４、基準イオン確認部４５、及び代替基準イオン候補提示部４６が、化合物情報に含まれるイオンの質量電荷比と強度に関する情報のみを参照する場合について説明したが、これらに加え、保持時間も参照するように構成することができる。以下、そのような例を説明する。ここでは、分析者が化合物Ａ〜Ｃを分析対象化合物に選択した場合を例に挙げる。
【００５０】
分析者が、入力部７により化合物Ａ〜Ｃを選択すると、化合物指定入力受付部４２により分析対象化合物として特定される。また、それらに関する化合物情報が化合物情報抽出部４３により記憶部４１から抽出される。ここまでの動作は上述した例と同じである。
【００５１】
基準イオン候補提示部４４は、抽出された化合物Ａ〜Ｃの化合物情報を用いて各化合物の基準イオン候補を提示する。このとき、基準イオン候補提示部４４は、まず、化合物Ａ〜Ｃの保持時間の差を算出し、その差が、予め決められた時間よりも短い化合物をグループ化する。予め決められた時間とは、典型的にはマスクロマトグラムを取得する際にクロマトグラムのピークが分離できる最小の時間を意味する。
【００５２】
この実施例では化合物ＡとＢがグループ化される。そして、同一のグループに属する化合物Ａ、Ｂについて、それぞれから生成されるイオンを質量電荷比順に並べて比較し、別の分析対象化合物から生成されることがないイオンを抽出して基準イオン候補とする（図４(b)）。そして、それら基準イオン候補を、マスピークの強度が大きい順に並べ替えて表示部８の画面に表示する。化合物Ｃには同じグループに属する別の分析対象化合物が存在しないため、化合物Ｃから生成される全イオンをマスピークの強度が大きい順に並べ替えて表示する。ここでは基準イオン候補をマスピークの強度が大きい順に並べる場合を例に挙げたが、上述したように、質量電荷比が大きい順に並べて表示するようにしてもよい。また、１つのグループ内に複数の化合物が存在する場合に、他の基準イオン候補との質量電荷比の差が所定値以上であるイオンを、前記複数の分析対象化合物のそれぞれに関する基準イオン候補として提示するようにしてもよい。
【００５３】
先に説明した方法では、分析対象化合物の基準イオン候補を提示する際に、他の全ての分析対象化合物から生成されないイオンを抽出した。そのため、分析対象化合物として化合物Ａ〜Ｃが選択された場合、化合物Ａの基準イオン候補に、化合物Ｃから生成されるm/z=500のイオンは含まれない。実際には、化合物Ａと化合物Ｃがガスクロマトグラフから質量分析装置に導入される時間に大きな開きがあるため、これらの化合物が同時に検出されることはなく、化合物Ａの基準イオン候補としてm/z=500のイオンを使用しても定量や定性を行ううえで問題は生じない。このように、イオンの質量電荷比と強度に加え、保持時間も参照して基準イオン候補を提示するように構成することで、より高強度のイオンを基準イオンとして高精度の定性や定量を行うことが可能になる。
【００５４】
上記の実施例はいずれも一例であって、本発明の趣旨に沿って適宜に変更することができる。
上記実施例ではガスクロマトグラフ質量分析装置について説明したが、液体クロマトグラフ質量分析装置でも同様に構成することができる。液体クロマトグラフ質量分析装置で多く用いられるエレクトロスプレーイオン化法では、主に分子イオンが生成されるため、これを開裂させてプロダクトイオンを検出する、ＭＲＭ測定によって分析対象成分を定量及び定性することが多い。こうした場合には、化合物情報に含まれるイオンの質量電荷比として、特定のプリカーサイオンから生成されるプロダクトイオンの質量電荷比を保存しておき、基準イオン候補提示部４４や代替基準イオン候補提示部４６が、これを用いて定量ＭＲＭトランジションや定性ＭＲＭトランジションを提示するように構成することもできる。
また、本発明はクロマトグラフを有しない質量分析装置を用いて、試料に含まれる全ての分析対象成分を同時に測定することによってそれらを定量及び定性するために用いることもできる。この場合には保持時間に関する情報を使用せず、基準イオン候補提示部４４や代替基準イオン候補提示部４６は、イオンの質量電荷比と強度に関する情報に基づいて基準イオン候補を提示する。
【符号の説明】
【００５５】
１…ＧＣ部
１０…試料気化室
１１…マイクロシリンジ
１２…キャリアガス流路
１３…カラムオーブン
１４…カラム
２…インターフェイス部
３…ＭＳ部
３１…イオン化室
３２…イオンレンズ
３３…前段四重極マスフィルタ
３４…コリジョンセル
３５…多重極型イオンガイド
３６…後段四重極マスフィルタ
３７…イオン検出器
３８…Ａ／Ｄ変換器
４…データ処理部
４１…化合物情報記憶部
４２…化合物指定入力受付部
４３…化合物情報抽出部
４４…基準イオン候補提示部
４５…基準イオン確認部
４６…代替基準イオン候補提示部
５…分析制御部
６…中央制御部
７…入力部
８…表示部
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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