(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも１つのモジュラー抗原トランスポート分子(ＭＡＴ分子)を細胞外間隙から細胞の内部へとトランスポートさせるトランスロケーションモジュール、少なくとも１つの前記ＭＡＴ分子を細胞内から、抗原のプロセシング又はＭＨＣ分子の抗原での負荷に関与する細胞小器官へとトランスポートさせるターゲティングモジュール、および少なくとも１つの個体においてＭＡＴ分子により調節される免疫応答の特異性を決定する抗原モジュールを少なくとも含んでいるモジュラー抗原トランスポート分子(ＭＡＴ分子)であって、前記モジュールは共有結合性の結合で互いに連結され、
a)前記トランスロケーションモジュールは、アミノ酸配列YGRKKRRQRRを含むHIV-tatの分子部分であり、
b)前記ターゲティングモジュールは、MHC インバリアント鎖  Ii33, Ii41, Ii35, Ii43又はその部分的な配列からなる分子部分であり、該分子部分は少なくともMHC  II分子のヒト  インバリアント鎖のアミノ酸1から110に対応するアミノ酸配列を含み、
c)前記抗原モジュールは、タンパク質またはペプチドからなるアレルゲンである、
モジュラー抗原トランスポート分子(ＭＡＴ分子)。
【請求項２】
請求項1に記載のＭＡＴ分子であって、付加的に少なくとも一つのタグモジュールが存在し、前記タグモジュールが前記ＭＡＴ分子の単離および／または検出のために提供されるＭＡＴ分子。
【請求項３】
請求項2に記載のＭＡＴ分子であって、少なくとも１つのタグモジュールが、4〜6の連続的なヒスチジン残基を有するHisタグ、Mycタグ、FLAGタグ、HAタグ、Strepタグ、Xpressタグ、Sタグ、CBDタグ、GSTタグ、HSVタグ、T7タグ、プロテインAタグ、V5タグ、キチン結合タグ、マルトース結合タグ、カルモジュリン結合タグ、またはビオチン基の群から選択されるＭＡＴ分子。
【請求項４】
請求項1〜3の何れか一項に記載のＭＡＴ分子であって、前記の個々のモジュールがスペーサーモジュールを介して共に連結されえる共有結合性の結合により互いに連結されるＭＡＴ分子。
【請求項５】
請求項1〜4の何れか一項に記載のＭＡＴ分子をコードする核酸。
【請求項６】
請求項5に記載の核酸配列を具備するベクター。
【請求項７】
請求項6に記載のベクターであって、少なくとも１つの次の要素:  請求項5に記載の核酸と機能的に連結されるプロモーター、抗生物質に対する耐性遺伝子、抗真菌剤に対する耐性遺伝子、を具備するベクター。
【請求項８】
少なくとも、請求項6または7に記載の１つのベクターまたは請求項5に記載の１つの核酸を具備する、初代細胞または細胞株。
【請求項９】
少なくとも、請求項1〜4の何れかに記載の１つのＭＡＴ分子、請求項5に記載の１つの核酸、または請求項6または7に記載の１つのベクターを具備する、エクソソームまたはリポソーム。
【請求項１０】
請求項1〜4の何れかに記載のＭＡＴ分子および／または請求項5に記載の核酸および／または請求項6または7に記載のベクターおよび／または請求項9に記載のエクソソームまたはリポソームおよび／または請求項8に記載の細胞を含む、医薬またはワクチン。
【請求項１１】
少なくとも１つの以下の成分および／または他の薬学的に許容される賦形剤および添加物を付加的に含む、請求項10に記載の医薬またはワクチン:
a)生理的な塩化ナトリウム溶液
b)薬学的に許容されるアジュバント
c)薬学的に許容される緩衝物質
d)薬学的に許容される担体タンパク質
e)薬学的に許容される保存剤
f)薬学的に許容される着色剤。
【請求項１２】
請求項10または11に記載の医薬またはワクチンであって、その製品が、皮下注射、リンパ節への注射に関して、または粘膜を介した投与に関して設計されることを特徴とする医薬またはワクチン。
【請求項１３】
請求項12に記載の医薬またはワクチンであって、前記粘膜が胃腸管の又は呼吸器系の粘膜であることを特徴とする医薬またはワクチン。
【請求項１４】
請求項10〜13の何れか１項に記載の医薬であって、
a)予防、および／または、免疫反応を減少させること又は増強させること、および／または
b)自己免疫疾患の、アレルギーの、リウマチ性の障害の、移植された器官に対する拒絶反応の、ウイルス性の、細菌性の又は真核生物性の病原体による感染症の、および／または悪性疾患の治療、
を意図することを特徴とする医薬。
【請求項１５】
請求項1〜4の何れか１項に記載のＭＡＴ分子の、請求項5〜7の何れか１項に記載の核酸またはベクターの、請求項8に記載の細胞株又は初代細胞の、または請求項9に記載のエクソソームまたはリポソームの、医薬またはワクチンを製造するための使用。
【発明の詳細な説明】
【発明の技術分野】
【０００１】
本発明は、不十分に刺激される又は過剰に刺激される免疫システムと関連した障害の予防、治療、または診断のための、免疫システムの刺激および阻害に関する。これらの障害には、特に感染性疾患、新生物疾患、アレルギー、自己免疫性疾患、移植拒絶反応などが含まれる。発明の核心は新規方法であり、この方法により免疫システムはＭＡＴ分子を供給されることにより影響される、該ＭＡＴ分子は少なくとも以下の３つの成分（constituents）からなる：
【０００２】
1.  トランスロケーションモジュール（a translocation module）、これは前記ＭＡＴ分子を外側から細胞に貫入（penetrate）させる効果を有する、  
2.  細胞内ターゲティングモジュール（an intracellular targeting module）、これによって前記ＭＡＴ分子が、前記細胞内で、変化した免疫応答が又は抗原の変化した提示が存在するような様式でプロセスされるとの効果を有する、および
3.  抗原モジュール（an antigen module）、これは調節された免疫応答の特異性を決定する。
【０００３】
ＭＡＴ分子を提供するこれら３つの要素の組み合わせによって、次の事項が可能となる。その事項とは、治療された個体の免疫システムを、標的化された（targeted）及び特異的な様式で調節させることを可能にする、または抗原提示細胞による抗原の提示を、変化させることを可能にする。
【背景技術】
【０００４】
抗原提示細胞による抗原のプロセシング  
抗原提示細胞(APC)による抗原のプロセシングは、２つの異なる経路により発生する。細胞の内側で生じる抗原は、MHC  I(主要組織適合複合体クラスI、MHCクラスI)分子により、細胞表面上で提示され、他方で細胞外抗原は、MHC  II(主要組織適合複合体クラスII、MHCクラスII)分子により、細胞表面上で提示される。双方の機構により、宿主による抗原に対する免疫応答が惹起される。MHC  II-抗原複合体の形態で細胞表面上に提示されるまでの、取り込みから細胞内への抗原の経路は、多様な細胞小器官、特に小胞体、ゴルジ体、トランス-ゴルジネットワーク、リソソーム、エンドソームを介して、およびMHCクラスIIコンパートメント(MIIC)を介して進行する。MIICsは、MHC  II媒介性の抗原提示における重要な部分に作用する。細胞のこれらの小器官において、MHC  II分子は、低分子量の抗原またはタンパク質のタンパク分解性の断片（proteolytic fragments）を負荷される。このプロセスにおいて、インバリアント鎖(MHC  IIガンマ鎖またはIiとも称される、これは最初にMHC  II分子と結合する)は、タンパク分解性の分解を受ける；そして抗原は、MHC  II分子と、MHC  IIに対して直接的に又は間接的に結合する様々なタンパク質の制御下で結合する[1]。これらの調節性の分子には、とりわけHLA-DM、HLA-DO、LAMP-1、LAMP-2、CD63、CD83、などが含まれる。これらのタンパク質の正確な機能は、いまだ部分的に未解明であるが、それらの多くはシグナル配列を有し、この配列により、例えばリソソームへの、エンドソームへの、トランス-ゴルジネットワークへの、MIICsへの彼らのトランスポートが促進される[2-4]。いくつかのプロテアーゼが、抗原をMHC  II分子上に提示させるために必要とされる、タンパク質分解性の反応に関与している。MIICsに存在するプロテアーゼには、とりわけ多様なメンバーのカテプシンファミリー、例えばカテプシンSおよびカテプシンLが含まれる[1]。
【０００５】
ターゲティングおよびターゲティング配列  
特に特定の部位で又は特定の細胞小器官において、細胞の内側または外側に蓄積する特性を有するアミノ酸配列は、ターゲティング配列として頻繁に参照される。この関連において、多様なタイプのターゲティングを区別できることを強調すべきである。特に細胞内および細胞外ターゲティング（extracellular targeting）の間の区別が存在する。細胞外ターゲティングに関して、例えば、外側から、細胞表面上の直接的に接近可能な構造に対して（例えば、膜タンパク質の細胞外部分に対して）結合する抗体が使用される。腫瘍細胞の細胞表面上のタンパク質に結合する抗体を、例えば、細胞毒と連結できる。この抗体は、次に細胞毒の腫瘍細胞に対する細胞外ターゲティングを生じせしめ、このようにして後者の標的化された殺傷を可能にする。このタイプのターゲティングは基本的に細胞内ターゲティングとは異なる。該ターゲティングでは細胞内膜を乗り越えることがしばしば必要であるか、又は該ターゲティングではターゲティング配列が細胞内レセプターにより結合され、このようにして特定の細胞小器官などに貫入するか、又はターゲティング配列が特定のチャンネル（特定のタンパク質により形成される）から、ターゲティング配列が特異的である細胞小器官へと貫入する。ターゲティング配列またはターゲティングモジュールが本特許出願において以下で記述される場合、原則的には常に細胞内ターゲティングであり、細胞外ターゲティングではない。加えて、本特許出願において、ターゲティングは全てのタイプの細胞内ターゲティングを意味しなく、MHC分子に対する抗原のプロセシング、修飾および／または結合に関与する、細胞小器官または細胞内領域へと分子をトランスポートさせるために作用する細胞内ターゲティングのみを意味する。係る細胞小器官または細胞内領域の例は、小胞体、ゴルジ体、トランス-ゴルジネットワーク、エンドソーム、リソソーム、およびMIICsである。多様なタンパク質に由来するターゲティング配列は、文献[1-5]に記載される。
【０００６】
トランスロケーションおよびトランスロケーション配列  
加えて、多数のアミノ酸配列（特にウイルス、例えば、HIV  tatまたはタンパク質VP22（単純ヘルペスウイルスに由来する）に由来するもの）は、タンパク質、ペプチド、および他のクラスの物質（例えば、核酸または薬学的に活性な物質）の細胞内部へのトランスポートを促進する；これら配列は文献により知られている。この目的に関して、これらの所謂トランスロケーション配列は、共有結合性の又は非共有結合性の結合の何れかを介して、トランスポートされる分子（カーゴ分子とも称される）に連結される。トランスロケーション配列およびカーゴ分子（cargo molecule）により結果的に生じた化合物の細胞外添加が、このようにして可能となる。トランスロケーション配列は、次にカーゴ分子の細胞内部への侵入を生じせしめる。この原理は、多数の研究、特にHIV  Tat配列に関する研究に同様に記載されている[6-8]。
抗原をカーゴ分子として使用することは既に可能であり、意図される事項であったが、既知のトランスロケーション手段の援助のみによって、特定の任務（例えば、アレルギーの脱感作）に望ましいと思われる十分に標的化され調薬された様式（dosed manner）で、個体における免疫応答を産生させることはこれまで可能ではなかった。それ故、標的化された免疫調節に関する、更なる方法が必要とされている。
【発明の課題】
【０００７】
任意の多様な抗原を、十分に標的化された様式で、そのより良い治療的および診断的な使用が可能である、それらのプロセシング部位へと供給するための手段を提供することが本発明の課題である。
【課題の解決】
【０００８】
本発明は、効率的で特異的な免疫応答を達成するために、細胞に対して高度に標的化された様式で抗原を供給せしめ得る方法を提供する。前記方法は、第一に抗原を細胞外間隙（extracellular space）から細胞の細胞内間隙へと効率的に運搬することを可能とし、第二に抗原に関して、それらが細胞の内部に到着したときに、それらが抗原提示に関して更に処理される細胞小器官に効率的に到達することを可能とする。この二段階のプロセスを、個体の免疫応答の標的化された効率的な調節に関して、極めて一般的に利用することが可能である。
【０００９】
特殊な分子がこれらの効果を達成するための道具として開発され、これらは本明細書の以下の記載において「モジュラー抗原トランスポーター（modular antigen transporter）」分子またはＭＡＴ分子と称される。これらのＭＡＴ分子、関連する核酸、ベクター、細胞、細胞株、小胞（vesicles）、免疫グロブリン、並びに本発明に属する及びこれらの構成要素に関連する又はそれらと作動する、使用および方法が、本願の特許請求の範囲に詳細に記載される。
【００１０】
ＭＡＴ分子(モジュラー抗原トランスポート分子)と称される、新規クラスの分子を提供する少なくとも３つのモジュールの以前には記載されていない組み合わせが、前記課題を達成するために提供される。これらの３つのモジュールには、少なくとも1つのトランスロケーションモジュール、少なくとも1つのターゲティングモジュール、および少なくとも1つの抗原モジュールが含まれる。前記３つの異なるモジュールは、共有結合性の又は非共有の結合を介して互いに連結される。この様式で調製されたＭＡＴ分子は、ＭＡＴ分子に存在する抗原への免疫応答が影響される個体に対して直接的に投与できる。或いは、細胞に関してインビトロにおいてＭＡＴ分子で処理すること、及びそのように処理された細胞を引き続いて個体に投与することも可能である。この方法において、トランスロケーションモジュールは、ＭＡＴ分子を細胞内に貫入させ得る効果を有する。ターゲティングモジュールは、ＭＡＴ分子が細胞内プロセシングを、免疫応答が存在し且つ抗原モジュールにおける抗原のアイデンティティーが抗原（該抗原に対して免疫応答が方向付けられる）を決定するように、受けるとの効果を有する。個体の免疫応答を調節するための本新規方法の実質的な利点は、特にその普遍的な適応性である（即ち、広範囲の抗原、多様なトランスロケーションモジュール、および多様なターゲティングモジュールを操作できる）。加えて、トランスロケーションモジュールの使用により、組織または細胞特異的ではないが、事実上全てのタイプの細胞の免疫調節に関して適切で普遍的な方法が達成される。更なる利点は、ＭＡＴ分子のモジュラー構造（modular structure）である。モジュラー構造により、ＭＡＴ分子は即座に特定の医学的な要求に適用可能となる。全ての３つのタイプのモジュールの少なくとも１つのモジュールがＭＡＴ分子に存在するかぎり、ＭＡＴ分子の３つの構成要素の正確な配置及びそれらの接合（connection）の性質を共に変化させることも可能である。前記方法の基礎において、抗原に関する制限はない。前記方法を、例えば病原体に対して（例えば、ウイルス、細菌、寄生虫などに対して、即ち、非常に一般的にはワクチンとして）、個体の免疫システムを活性化するために使用することが可能である。加えて、前記方法を使用して、変性細胞（例えば、腫瘍細胞など）に対する免疫システムを活性化できる。また一方、それを例えば、花粉、動物毛髪、ハウスダストダニ（house dust mites）、昆虫毒などのアレルゲンに対する個体の免疫システムの脱感作に関して、または免疫システムの標的化された抑制（例えば、自己免疫性応答が存在する場合）、例えば、関節炎、リウマチ、糖尿病、SLE(全身性エリテマトーデス)、などに関して、および移植拒絶反応の抑制に関して、使用することができる。明示的に記載されない、強すぎる又は弱すぎる免疫応答に関連する、更なる障害を、同様に本発明のＭＡＴ分子で治療できる。
【００１１】
現在まで従来技術において頻繁に非常に不利であると認められてきたことは、トランスロケーション配列が、特定のタイプの細胞に対して特異的ではなく、全てのタイプの細胞において等しく活性であるということである[9]。しかしながら、本発明において、トランスロケーションモジュールの普遍的な機能性は非常に有利であり、これは現在まで従来技術において実現されていない。従来技術において現在まで、「カーゴ分子」（これらの分子は細胞内にトランスロケーション配列の援助で挿入される）を、細胞内でのタンパク分解性の分解から防御することが試みられている[9]。本発明において、本発明の作用の様式に関して、明示的に要望され及び有利である事項とは正に逆である。細胞における抗原モジュールのタンパク分解性の分解は、本発明の効果に関して、即ち効率的な抗原提示に関して有利である。このようなことから本発明に使用されるターゲティングモジュールは、抗原モジュールの細胞区画（ここで彼らはタンパク分解性の分解を受ける）へのトランスポートを特異的に促進する。
【００１２】
本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして使用できる、周知のアミノ酸配列は、HIV TatおよびVP22配列である。これらの配列に関して、細胞膜を介したトランスロケーションおよび細胞核へのトランスポートの両方を生じることが記載されている[7]。この細胞核へのトランスポートは、本発明との関連において望まれない、というのも抗原プロセシングは細胞核において生じなく、それゆえに効率的な抗原提示が生じないからである。この以前には未解決であった課題は、本発明のターゲティングモジュールにより解決され、これは次の効果を有している。その効果とは、ＭＡＴ分子が細胞内を介して細胞核へとトランスポートされず、抗原プロセシング又はＭＨＣ分子の抗原での負荷が生じる、それらの細胞小器官へと特異的にトランスポートされることである。従って、本発明のＭＡＴ分子の細胞内トランスロケーションモジュールによって、現在までの従来技術において開示されたＴａｔ抗原融合タンパク質が示す実質的な不利な点が排除された。
【００１３】
現在までの従来技術において同様に既知のものは、ターゲティング配列（例えば、MHC  II分子のインバリアント鎖）、及び抗原からなる融合タンパク質である。しかしながら、これらの融合タンパク質は、抗原提示細胞へ効率的に貫入する能力を有していない。この事項に関して、それらが個体を免疫するために使用される際には、融合タンパク質の細胞への取込を促進するアジュバントが付加的に必要とされる。しかしながら、これらのアジュバント（例えば、鉱油、放線菌の抽出物、またはフロイントアジュバント）は、望まれない副作用（例えば、局所性の炎症性反応）を有している。本発明で使用されるＭＡＴ分子は従来のワクチンと比較して利点を有しており、それらが生理的に許容性の良好なトランスロケーションモジュール（このモジュールは非常に効果的に細胞への取り込みを促進する）に対して直接的に連結される。このことにより、ある種の状況において、全体的に又は部分的に付加的なアジュバントを省くことが可能である。この結果、明瞭により少ない望まれない副作用がＭＡＴ分子を用いた免疫により生じるだろう。 
【００１４】
細胞外または細胞内のMHC  I提示の抗原により、細胞障害性免疫応答が誘導されるが、強い防御性の体液性免疫応答は誘導されないことが、以前から知られている。しかしながら、ＭＡＴ分子の使用を介して、抗原モジュールに存在する抗原を細胞外から添加することが可能である。しかし、それらは細胞内抗原のように作用する、というのもトランスロケーションモジュールは、抗原を細胞内間隙へとトランスポートし、ターゲティングモジュールは、抗原の細胞内トランスポートに、体液性免疫応答が存在するような様式で影響するからである。この新規方法によって、細胞外から添加した抗原（ＭＡＴ分子）での体液性免疫応答の強い誘導を達成することが可能であり、これは長年要望されてきたことである。
【００１５】
この目的のために、現在の従来技術とは対照的に、それ自体知られた２つの機構が、抗原での免疫化が実質的に改善されるように、本発明において新規の様式で組み合わされた。これらの機構は、両方のケースにおいて、非常に効率的な免疫応答を全般的に生じる標的化された抗原トランスポート機構である。２つのトランスポート機構の各々は、ＭＡＴ分子の規定のモジュールにより生じる。関連するものは：  
【００１６】
1. 細胞外間隙から細胞内間隙への抗原のトランスポート(トランスロケーションモジュール)  
と組み合わせた  
2. 抗原プロセシングに関わる細胞小器官に特異的な、細胞内の抗原のトランスポート(ターゲティングモジュール)  
これにより次の結果に至る：  非常に効率的な免疫化、IgGのみ、IgEなし
【００１７】
２つの既知のトランスポート機構の新規組み合わせは、例えば非常に低い抗原濃度での免疫化の可能性を生じ、付加的に非常に多大で驚くべき利点を有する；その利点とはTh1タイプの免疫応答が主に生じることである（即ち、ＩｇＧ抗体の形態における免疫応答であり、ＩｇＥを生じるアレルギーの形態における免疫応答ではない）。
【発明の詳細な記載】
【００１８】
トランスロケーション配列／トランスロケーションモジュール  
トランスロケーション配列およびトランスロケーションモジュールの用語は、共に（side by side）、本明細書のテキストにおいて、均等用語として及び同じ意味を有する用語として使用される。トランスロケーションモジュールの用語は、トランスロケーションモジュールが、本発明の目的のためのＭＡＴ分子のほんの一部分であることを明確にするために導入された。加えて、トランスロケーションモジュールは、天然で生じるトランスロケーション  ペプチド配列（例えば、HIV tat）のみならず、例えば、ペプチドミメティックス（peptidomimetics）または他の構造（この構造は天然で生じるトランスロケーション  ペプチド配列と同じ機能を請け負うことが可能である）をも表す。
【００１９】
本発明は、少なくとも1つのトランスロケーションモジュール、少なくとも1つのターゲティングモジュール、および少なくとも1つの抗原モジュールからなる、ＭＡＴ分子を調製するための多様なトランスロケーションモジュールの使用を含む。一般的には、現在既知である及び将来的に既知となる、全てのトランスロケーション配列は、本発明の目的に関する使用に適切である。多数の適切なトランスロケーション配列は、前記文献に記載されている。これらのトランスロケーション配列には、ウイルス性の配列、ホメオタンパク質配列（homeoprotein sequences）、ロイシンジッパー配列、アルギニンおよびリジンリッチ配列、および分泌シグナル配列の非存在にもかかわらず分泌されるタンパク質の多様な他の配列、などが含まれる。
【００２０】
トランスロケーションモジュールとして適切なウイルス性のペプチド配列  
本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切なペプチド配列には、とりわけウイルス性タンパク質またはウイルス性タンパク質の部分配列（例えば、タンパク質HIV転写アクチベータータンパク質(HIV tat)）が含まれる。適切なTatタンパク質には、HIV-1ウイルスのTatタンパク質のほかに、他のレンチウイルスのTatタンパク質も含まれる[9]。多数の修飾されたTatペプチドが、トランスロケーションを生じさせる能力を有する配列として記載されている。これらには、Tatタンパク質の部分配列のみに相当するTatペプチド[10]、点突然変異を含むTatペプチド[10]、前記配列が逆転したTatペプチド(逆位した)[10]、又は異常なアミノ酸（例えば、アミノ酸のＤ異性体）を含むTatペプチド[10]、などが含まれる。ペプチド配列の全てのこれらのバリエーションは、それゆえトランスロケーションモジュールとして一般的に適切である。トランスロケーションモジュールとして、本発明の目的に同様に適切なペプチドは、他のウイルス、例えば、VP22(単純ヘルペスウイルス-1  VP22外被タンパク質)に由来するものである[9]。現在、トランスロケーションに適切なVP22配列を含む市販の発現ベクターも利用可能である。これらの発現ベクターは、VP22融合タンパク質が調製されることを許容するものである(VoyagerTM VP22システム、Invitrogen、Breda、the Netherlands)。しかしながら、ターゲティングモジュールは、この発現システムの使用における、融合タンパク質に存在しない。他のウイルス、例えば、Marek’s疾病ウイルス-1、家禽においてリンパ腫の原因となるウイルスも、VP22に関連し、トランスロケーションモジュールとして同様に適切なタンパク質を発現する[11]。これらのタンパク質及びこれらのタンパク質の部分的な配列は例としてのみ記載される；また、多数の更なるペプチドが現在知られており、そして将来的に知られうる；それらは本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切である。
【００２１】
トランスロケーションモジュールとして適切なホメオタンパク質  
本発明の目的に適切なトランスロケーションモジュールの更なるグループは、ショウジョウバエのホメオティックタンパク質  アンテナペディア(ANTp)に由来するペプチドである[9]。中でも、トランスロケーションモジュールとして適切なANTpペプチドは、ANTpの逆位配列（an inverted sequence）を含む[7]、アミノ酸のＤ異性体を含む[7]、又はそれらの配列において点突然変異を含む[7]、ペプチドである。多数の更なるANTp配列修飾も、可能であり、おそらくトランスロケーションを可能にせしめる[7]。ANTpペプチドバリアントも、トランスポートペプチドと称される。更なるホメオタンパク質、例えば、engrailed1(En1)、engrailed2(En2)、Hoxa-5、Hoxc-8、Hoxb-4、およびKNOTTED-1[7]などは、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして使用可能な配列を同様に具備する。KNOTTED-1は、実際は植物タンパク質であるが、動物細胞におけるトランスロケーションモジュールとして同様に適切である。これらのペプチドは例としてのみ記載される、また本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切であろうペプチド配列を具備する、多数の更なるホメオタンパク質が知られている[12]。更に、以前には開示されたことのないホメオタンパク質も、トランスロケーションモジュールとして適切な配列を具備し得る。
【００２２】
トランスロケーションモジュールとして適切なロイシンジッパータンパク質  
本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切な配列の更なるグループは、ロイシンジッパードメインを具備するペプチドである。そのロイシンジッパードメインがトランスロケーション配列として使用できるタンパク質の例は、例えば、ヒト  cFos-(139-164)、ヒト  cJun-(252-279)、または酵母転写因子  酵母GCN4-(231-252)である[8]。既に知られた又は将来において知られ得る、更なるロイシンジッパータンパク質は、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして、同様に適切である。
【００２３】
トランスロケーションモジュールとして適切な、アルギニンまたはリジンリッチなペプチド  
アルギニン  リッチなペプチド（RNAおよびDNA結合タンパク質に度々由来する）は、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして使用できる、更なるペプチド配列を代表する。係る配列の例は、HIV-1 rev-(34-50)、フロックハウスウイルスコート（flock house virus coat）タンパク質FHVコート(35-49)、BMV Gag-(7-25)、HTLV-II Rex-(4-15)、CCMV Gag-(7-25)、P22 N-(14-30)、ラムダN-(1-22)、phi 21 N-(12-29)、およびPRP6-(129-144)（酵母より）である[8]。本発明の目的に関して、4〜16を有する[8]又は16を超えるアルギニン残基を有する、ポリアルギニンペプチドを使用することも同様に可能である。ポリアルギニンペプチドに加えて、同様にトランスロケーションモジュールとして使用できるペプチドは、アルギニンの他に、更なるアミノ酸（例えば、W/Rペプチド(RRWRRWWRRWWRRWRR） [9]またはTatペプチドの全体で11アミノ酸のうち9つの中心アミノ酸残基がアルギニン残基で置換されたR9-Tatペプチド(GRRRRRRRRRQ) [8]）をも具備するペプチドである。ペプチド（例えば、９つのリジン残基からなるペプチド）が、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして作用する能力を有することを示すことは付加的に可能である[13]。これらのペプチドは例としてのみ記載される、また、多くの更なるアルギニンまたはリジンリッチなペプチドが、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとしての使用に適切である[8]。現在既に知られている又は将来的に知られうる、更なるアルギニンまたはリジンリッチなペプチドも、トランスロケーションモジュールとして適切である。グアニジノまたはアミジノ基を含む配列も、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切である[14]。
【００２４】
トランスロケーションモジュールとして適切なシグナル配列を欠くタンパク質  
いくつかの更なるタンパク質は、分泌シグナル配列が存在すること無く、細胞膜の内側から外側へと貫入する（即ち、分泌される）能力を有する。これらのタンパク質は、逆に細胞の内側へ、その外側から貫入することもしばしば可能である。これらのタンパク質またはこれらのタンパク質の部分的な配列も、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして使用され得る。係るタンパク質のいくつかの典型的な例は、線維芽細胞成長因子1(FGF-1)、線維芽細胞成長因子2(FGF-2)、カベオリン-1、ラクトフェリン、チオレドキシン、インターロイキン1βおよび毛様体神経栄養因子(CNTF；ciliary neurotrophic factor) [7]、またはインターロイキン1α、輸精管タンパク質（vas deferens protein）、血小板由来内皮細胞成長因子(PR-ECGF)、チモシン、パラ-チモシン、14.5kDa レクチン(L14)、トランスグルタミナーゼ、チオレドキシン様タンパク質(ADF)、坐骨神経成長促進活性（sciatic nerve growth-promoting activity）、XIIIa因子、乳房由来成長抑制物質（mammary-derived growth inhibitor）、ガレクチン（galectin）、ロダナーゼ（rhodanase）である[15]。これらのペプチドは例としてのみ記載される。また、多数の更なるペプチドが、既知であるか又は将来的に知られるだろう、それらは本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切である。
【００２５】
トランスロケーションモジュールとして適切な毒素  
多くの毒素または毒素の部分配列は、トランスロケーションモジュールとして作用する特性を有しており、例えば、次の毒素がある:完全なアブリン（complete abrin）、完全なリシン、完全なモデシン（modeccin）、完全なジフテリア毒素A、完全なジフテリア毒素、完全な百日咳毒素、完全なシガ毒素（complete Shiga toxin）、リシンのＡ鎖、アブリンのＡ鎖、モデシンのＡ鎖、シュードモナス外毒素（pseudomonas exotoxin）の酵素的に活性なドメイン、ジフテリア毒素AのＡ鎖、百日咳毒素の酵素的に活性なドメイン、シガ毒素の酵素的に活性なドメイン、ゲロニン（gelonin）、アメリカヤマゴボウ抗ウイルス性タンパク質（pokeweed antiviral protein）、サポリン（saporin）、トリチン（tritin）、オオムギ毒素（barley toxin）、およびヘビ毒ペプチド[16]。例として記載されるこれらの毒素、および明示的に記載されない多数の更なる他の毒素または将来的に知られるだろう毒素は、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして使用し得る。
【００２６】
トランスロケーションモジュールの効率の制御  
トランスロケーションの効率を、例えばポリ-アルギニン鎖の長さを変化させることにより又は例えばHIV Tat配列の部分配列のみの特定の選択により、制御することができる；このことは対応する（corresponding）ＭＡＴ分子の非常に効率的なトランスロケーション（又はより低度に効率的なトランスロケーション）が、特定の必要性に応じて生じように行われる[8、13]。非常に効率的なトランスロケーションは次の利点を有し得る、ＭＡＴ分子の有効性が増加する、および／または、ＭＡＴ分子の必要な用量を減少させ得る、そしてワクチンのコストが倹約される。ＭＡＴ分子の用量の減少化は、副作用が少なくなるとの利点を有する。一方で、トランスロケーションの効率の減少により、ＭＡＴ分子が処理された個体に広く分布することが可能となる（例えば、静脈内注射後に）、というのも彼らは局所的に、実質上定量的に、近傍に存在する全ての細胞に直ぐには貫入しないからである。
【００２７】
トランスロケーションモジュールとして作用する最小配列の例  
例として説明される全てのトランスロケーション配列に関して、本発明の目的に関するＭＡＴ分子のトランスロケーションモジュールとして効果的であるために、ＭＡＴ分子の成分として完全なタンパク質の形態で存在する必要はない。これに対し、トランスロケーション配列として使用できる最小配列領域は、多くの前記タンパク質に関して既知である。この配列領域には、例えばHIV Tatに関して、例えば次の配列:Tyr-Gly-Arg-Lys-Lys-Arg-Arg-Gln-Arg-Arg-Arg、VP22に関して次の配列:Asp-Ala-Ala-Thr-Ala-Thr-Arg-Gly-Arg-Ser-Ala-Ala-Ser-Arg-Pro-Thr-Glu-Arg-Pro-Arg-Ala-Pro-Ala-Arg-Ser-Ala-Ser-Arg-Pro-Arg-Arg-Pro-Val-Glu、およびアンテナペディアに関して次の配列:Arg-Gln-Iso-Lys-Iso-Trp-Phe-Gln-Asn-Arg-Arg-Met-LysTrp-Lys-Lys[17]が含まれる。前記配列に関して、現在既知の最小の機能的な配列セグメントに相当（correspond）しない断片の形態で使用することも可能である（結果的に生じる配列が、前記トランスロケーションモジュールの目的に関して、依然として機能的である限り）。
【００２８】
このように、トランスロケーションモジュールは、本発明の目的に関するＭＡＴ分子のトランスロケーションモジュールとして効果的であるために、ＭＡＴ分子の成分として、完全なタンパク質または完全な分子の形態である必要はない。これに対し、トランスロケーションモジュールとして使用できる配列領域は、例えば、説明したタンパク質に関して知られている。加えて、前記タンパク質配列は、以前に開示された機能的な配列セグメントに相当しない断片の形態で使用してもよい（結果的な配列が、トランスロケーションモジュールとして、依然として機能的である限り）。トランスロケーションモジュールの機能性の試験は、例えば、蛍光標識されたトランスロケーションモジュールを用いることにより又は酵素標識されたトランスロケーションモジュールを用いることにより又は金属粒子で標識されたトランスロケーションモジュールを用いることにより確認できる。このような様式で標識されたトランスロケーションモジュールは、実験動物またはインビトロで培養された細胞に投与される。そしてトランスロケーションモジュールの運命は、例えばFACS(蛍光活性化セルソーティング)、顕微鏡観察、共焦点蛍光顕微鏡、電子顕微鏡観察などの方法を用いることにより追跡される。トランスロケーションモジュールの機能性を点検するための、これらの技術は、文献に記載され、そのうちのいくつかはトランスロケーションに関する配列の機能性を確認するために既に使用されている[8、18]。
【００２９】
ターゲティング配列／ターゲティングモジュール  
ターゲティング配列およびターゲティングモジュールの用語は、共に（side by side）、本明細書のテキストにおいて、均等用語として及び同じ意味を有する用語として使用される。ターゲティングは、本発明において原則的に常に細胞内ターゲティングを意味する。ターゲティングモジュールの用語は、トランスロケーションモジュールが、本発明の目的に関するＭＡＴ分子のほんの一部分であることを明確にするために導入された。
【００３０】
本発明は、少なくとも1つのトランスロケーションモジュール、少なくとも1つのターゲティングモジュール、および少なくとも1つの抗原モジュールからなるＭＡＴ分子を調製するための、ターゲティングモジュールとしての多様な配列の使用を含む。一般的には、現在既知である及び将来的に既知となる、ターゲティングを媒介することが可能な、全てのアミノ酸配列および分子は、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとしての使用に適切である。多数の適切な配列は、前記文献に記載されている。ターゲティングモジュールとして適切な、これらの配列に含まれる配列は、次に示す効果を有する全てのものである。その効果とは、ＭＡＴ分子が、ＭＡＴ分子に存在する抗原モジュールの提示に関与するプロセスが発生する細胞内の部位もしくは細胞小器官へと細胞内でトランスポートされることである。前記細胞内の、これらの部位および細胞小器官には、特に、MHCクラスIIコンパートメント(MIICs)、エンドソーム、リソソーム、ゴルジ体、トランス-ゴルジネットワーク、および小胞体が含まれる。これらの細胞内の細胞小器官は、例えば、抗原のトランスポートまたはプロセシング、MHC  II分子の抗原またはプロセスされた抗原での調製および負荷（loading）、および抗原が負荷されたMHC  II分子の細胞表面へのトランスポートなどに関与する。
【００３１】
ターゲティングモジュールとして適切な配列を含むＭＨＣ分子  
いくつかの配列は、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして特に適切である。MHC  II分子のインバリアント鎖(Ii、インバリアント鎖、MHC IIガンマ鎖)は、ターゲティングを媒介し得るものとして、最も頻繁に文献に記載される配列である。ヒトにおけるインバリアント鎖の様々なバリアントが記載され、それらバリアントはIiP33、IiP41、IiP35、およびIiP43[1]とも称され、これらはターゲティングモジュールとして適切である。本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして適切な更なる配列は、MHC  II分子のベータ鎖である[19]。前記配列の断片も、ターゲティングモジュールとして適切である。
【００３２】
ターゲティングモジュールとして適切な配列を含むリソソーム膜タンパク質  
リソソームに出現する、いくつかの膜タンパク質は、主要なタンパク質成分の１つであり、リソソームへのターゲティングを生じさせる配列モチーフを有している。このグループのタンパク質には、とりわけLamp 1(リソソーム関連性の膜タンパク質-1)、Lamp 2、Lamp 3、Limp II(リソソーム統合性の膜タンパク質II)、およびLAP(リソソームの酸性ホスファターゼ)が含まれる[4]。これらの及び他のリソソームのタンパク質（該タンパク質は現在既知である又は将来的に既知となるものであり、該タンパク質はターゲティング配列モチーフを有する）は、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして使用可能であり、完全なタンパク質配列又はその部分的な配列をターゲティングモジュールとして使用することが可能である。
【００３３】
ターゲティングモジュールとして適切な配列を含むテトラスパンタンパク質（Tetraspan proteins）  
４つの膜貫通のドメインを有するタンパク質のファミリーのメンバー(テトラスパンタンパク質)は、同様に本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして適切である、というのもこれらのタンパク質はMIICsに非常に効率的に進入するからである。「テトラスパン（tetraspan）」タンパク質がMIICsに進入する機構は不明確である、というのも彼らはターゲティングを可能とせしめる、如何なる既知のアミノ酸配列をも具備していないからである。このことにもかかわらず、これらのタンパク質をMIICsへとトランスポートする機構が存在し、このことは彼らを本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして使用できることを意味している。「テトラスパン」タンパク質のファミリーには、CD37、CD53、CD63、CD81、CD82、およびCD86が含まれる[20]。CD63およびCD82に関して次のことが知られている、それは彼らがMHC II、HLA-DO、およびHLA-DM分子と会合することである[20]。「テトラスパン」タンパク質は、同様にエクソソーム（exosomes）の膜に存在する。エクソソームは、MIICsの形質膜との融合後に形成される小胞であり、抗原提示細胞により放出される。エクソソームはMHC  II分子を具備し、抗原を提示でき、それゆえT細胞を刺激できる[20]。更なるタンパク質（該タンパク質は「テトラスパン」タンパク質ファミリーに非常に類似しており、該タンパク質はそれゆえ本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして同様に適切である）は、住血吸虫（Schistosoma mansoni）膜タンパク質SM23および腫瘍関連抗原CO-029である[21]。更なるテトラスパンタンパク質、またはテトラスパンタンパク質の部分配列（明示的に説明されない又は現在いまだ未知である）は、ターゲティングモジュールとして適切な配列を同様に具備し得る。 
【００３４】
ターゲティングモジュールとして適切な配列を有している更なるタンパク質  
多数の更なるタンパク質が、様々な細胞タイプのエンドソームの/リソソームの区画に見いだされるはずであり、それゆえ現在部分的にのみ知られている特定の機構を介して達成される。これらのタンパク質又はこれらのタンパク質の部分的な配列も、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして使用することに適切である。エンドソームの/リソソームの区画に存在する、これらのタンパク質には、とりわけ、低密度リポタンパク質(低比重リポたんぱく)、インシュリン、上皮細胞成長因子(EGF)、重合体の免疫グロブリン（polymeric immunoglobulin）、トランスフェリン、陽イオン依存性のマンノース6-ホスフェート受容体、陽イオン非依存性のマンノース6-ホスフェート受容体、CD3、など[21]、およびCD1b[22]、および多くの更なるタンパク質またはタンパク質配列（これらは現在既知である又は将来的に既知となるものであり、これらはエンドソームの/リソソームの区画へのターゲティングを許容する）が含まれる。これらの配列は、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして使用され得る。様々な販売者が、ターゲティングに適切な配列をコードする核酸配列を具備している発現ベクターを供給している。例えば、BD Bioscience Clontech (Palo Alto、CA、USA)およびストラタジーン(La Jolla、CA、USA)の双方は、ターゲティングモジュールを有する発現ベクターを供給しており、これは生じた融合タンパク質をゴルジ体またはペルオキシソームへと誘導する。しかしながら、これらの発現ベクターは、融合タンパク質が、調製されるべきトランスロケーションモジュールを具備することを許容せず、そのためそれらは本発明のＭＡＴ分子とは異なる。Clontechベクターにおいて、例えば、一連のカルレティキュリン(KDEL「検索配列」（retrieval sequence）)が、融合タンパク質のゴルジ体へのターゲティングに使用される。更なるタンパク質（該タンパク質は、明示的に説明されない又は現在まで未知である）は、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして適切な配列を同様に具備し得る。
【００３５】
特定のグループのターゲティング配列に存在する配列モチーフ  
ある種の配列モチーフは、ターゲティングモジュールとして様々なタンパク質配列の機能に重要であることが確認されている。HLA-DMのベータ鎖に関して、例えば、配列モチーフ、チロシン-スレオニン-プロリン-ロイシンがターゲティングモチーフとして同定されており、チロシン残基およびロイシン残基は明らかに特定の機能的な重要性を有している[2]。細胞内ターゲティングに重要なチロシンモチーフは、様々なリソソームの膜タンパク質、例えば、LAP(リソソームの酸性ホスファターゼ)、Lamp 1(リソソーム関連性膜タンパク質1)、Lamp 2、およびLamp 3[3、4]に関して同定されている、並びにCD1b[22]に関して同定されている。更なるリソソームのタンパク質、Limp II(リソソーム統合性の膜タンパク質II)に関する細胞内ターゲティングに重要なロイシンモチーフを同定することが可能であった[4]。次の事項をIiに関して示すことが可能であった。その事項とは、２つの配列領域が、細胞内ターゲティングに関して、互いに独立して重要であることである(アミノ酸ポジション1〜11およびポジション12〜29)[23]。両方のターゲティング配列は、それら自身においてさえも機能的であり；また、配列1から11は、機能上必須のロイシン-イソロイシン  モチーフをポジション7および8に具備している[23]。MHC  II分子のベータ鎖は、１つ又は２つの機能上重要なロイシン残基を含む配列モチーフを同様に具備し；また、保存されたグリシン残基は、このロイシンモチーフのＮ末端に直接的に先行して位置している[19]。要約すると、結果的に特にロイシンおよびチロシン残基は、ターゲティング配列における重要な機能を有しており、ターゲティングモジュールとして特に適切なアミノ酸配列を設計することが可能である。これらは、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして使用され得る。
【００３６】
ターゲティングモジュールとして使用できる「非アミノ酸構造（Non-amino acid structures）」  
アミノ酸配列またはアミノ酸に相当しない分子も、本発明の目的に関するＭＡＴ分子のためのターゲティングモジュールとして使用できる。リソソームにおけるターゲティングに適切な構造として長く知られている例は、例えば、マンノース6-ホスフェートである[24]。マンノース6-ホスフェート残基を具備するタンパク質は、様々なマンノース6-ホスフェート受容体によりリソソームへとトランスポートされる。この機能を本発明の目的のために使用して、ＭＡＴ分子をリソソームへトランスポートすることができる（抗原の効率的な提示を達成するため）。この目的に関して、マンノース6-ホスフェート残基は、共有結合性に又は非共有結合性に、単独で又はより複雑な糖構造の成分として、ＭＡＴ分子へと連結することができる。本発明の目的に関するＭＡＴ分子のためのターゲティングモジュールとして、マンノース6-ホスフェート受容体の全てのリガンドを使用することが一般的に可能である。更なる現在知られている構造または将来的に知られる構造（これらは、MIICs、エンドソーム、リソソーム、ゴルジ体、トランス-ゴルジネットワーク、または小胞体を標的とすることが可能である）を、本発明の目的に関するターゲティングモジュールとして使用できる。
【００３７】
例示の様式で説明される、全てのターゲティングモジュールは、本発明の目的に関するＭＡＴ分子のターゲティングモジュールとして効果的であるために、ＭＡＴ分子の成分として、完全なタンパク質または完全な分子の形態である必要はない。これに対し、ターゲティングモジュールとして使用できる配列領域は、例えば、説明したタンパク質に関して知られている。加えて、例示の様式で説明されるタンパク質配列は、以前に開示された機能的な配列セグメントに相当しない断片の形態で使用してもよい（結果的な配列が、ターゲティングモジュールとして、依然として機能的である限り）。ターゲティングモジュールの機能性の試験は、例えば、蛍光標識されたターゲティングモジュールを用いることにより又は酵素標識されたターゲティングモジュールを用いることにより又は金属粒子で標識されたターゲティングモジュールを用いることにより確認できる。このような様式で標識されたターゲティングモジュールは、実験動物またはインビトロで培養された細胞に投与される。そしてターゲティングモジュールの運命は、例えばFACS(蛍光活性化セルソーティング)、顕微鏡観察、共焦点蛍光顕微鏡、電子顕微鏡観察などの方法を用いることにより追跡される。
【００３８】
抗原モジュール  
本発明の目的に関する抗原モジュールとして、原則的に免疫応答を調節することができる全てのタイプの抗原を使用することができる。現在既に知られている抗原及び将来的に発見される抗原の双方が、適切である。ある種の状況において、前記抗原は次のようなものであってもよい；つまりそのものにより、現時点で当該技術において既知である通常の免疫方法で免疫応答へと誘導されないが、そのものにより、本発明に記載された新規方法の適用で個体による免疫応答へと誘導される。タンパク質およびペプチドのみならず、糖構造（sugar structures）、脂質、例えば、リポ多糖、リポタイコ酸（lipoteichoic acids）、および細菌膜の他の成分(CD1bは、例えば、糖構造および脂質と結合する)、核酸、例えば、CpGモチーフを含むDNA、有機物質（organic substances）、例えば、ラテックスまたは薬学的に活性な物質を、本発明の目的に関する抗原として使用することが可能である。前記抗原は、ヒト、動物、植物、真菌、寄生生物（parasites）、単細胞の又は多細胞性の微生物、ウイルス、および他の生物形態（life forms）から由来したものであってもよい。前記抗原は、生体物質（biological material）から単離されてもよく、組換え型抗原として調製されてもよく、又は合成（例えば、ペプチド合成）により調製されてもよい。合成により調製された抗原は、天然で生じる物質であってもよい又は天然で生じないが、化学合成により取得可能な物質であってもよい。非天然の物質（これらは、ある種の状況において、抗原として実際に適切である）の例は、例えば、医薬に存在する合成により調製された物質、又は天然で生じないアミノ酸配列を有している合成ペプチド、又はペプチドミメティックスなどである。天然で生じる又は合成の又は組換え型の抗原は、分子生物学的な、酵素的な、化学的な及び他の方法により、それらに特定の適用に関してより有利な特性を与えるために、修飾することができる。これらの有利な特性は、とりわけ、抗原としてより高い又はより低い活性、抗原としてより広い又はより特異的な作用、親水性の又は疎水性の溶液中での良好な溶解性、細胞膜に対する、細胞小器官の膜に対する、血液脳関門に対する、血液-CSFバリアなどに対する抗原モジュールのより大きな透過性、インビボ又はインビトロにおけるより高い又はより低い半減期、より高い又はより低い毒性、ＭＡＴ分子の形態における抗原の適用後のインビボ又はインビトロにおける抗原のよりよい検出性などであり得る。本発明の目的のために、複数の抗原を１つの抗原モジュールに組み合わせることが付加的に可能である[25]。このために、同一の抗原に関して、１を超えるコピーで抗原モジュール中に存在させることが可能である、又は、例えば、同じ抗原の異なるバリアントに関して、１つの抗原モジュール中で組み合わせることが可能である。例えば、抗原（例えば、抗原１）および他の抗原（例えば、抗原２）を、１つの抗原モジュールにおいて組み合わせることも、可能である。例えば、更なる組み合わせ（例えば、抗原１を２コピー以上、抗原２をシングルコピー）を、１つの抗原モジュールに組み合わせてもよい。1以上の異なる、および／または、1以上の同一の抗原モジュールを、１つのＭＡＴ分子に存在させることも付加的に可能で��る。単独で又は複数で存在する、同一の又は変更したコピーの抗原（１以上の異なる抗原に由来する）の全ての可能な組み合わせを、本発明の目的のために組み合わせることは原則的に可能である。
【００３９】
抗原モジュールとして使用できる抗原およびアレルゲン  
多数の抗原（特にアレルゲン）が、これまで文献に記載されている。以下で具体的に知られるアレルゲンは、本発明の目的に関する抗原モジュールとして使用できる。更なるアレルゲンおよびアレルゲンのバリアント（本発明の目的に関する抗原モジュールとして使用できる）は、当該技術において知られている[26、27]。アレルゲンは、植物および草（grasses）からの、樹木からの、ダニ（mites）からの、真菌からの、昆虫からの、食物からの、および他のアレルゲン（例えば、ラテックスアレルゲン）からのアレルゲンなどのグループにしたがって整理される。一覧表のリストは以下の通りである:  生物体の学名、一般に使用されるアレルゲンの略語に続いて、アレルゲンのGeneBankアクセッション番号(括弧内に記載される)が記載される（知られているものに）。
【００４０】
植物および草のアレルゲン:  
Ambrosia artemisiifolia、Amb a 1およびAmb a 2；Mercurialis annua、Mer a 1(Y13271)；Parietaria judaica、Par j 1(X77414)、Par j 2(X95865; X95866)；Cynodon dactylon、Cyn d 1(S83343)；Dactylis glomerata、Dac g 3(U25343)；Holcus lanatus、Hol I 1(Z27084、Z68893)；Lolium perenne、Lol p 1(M57474)、Lol p 2(X73363) Lol p 5(M59163)；Phalaris aquatica、Pha a 1(S80654)；Phleum pratense、PhI p 1(X78813)、PhI p 2(X75925)、PhI p 3、PhI p 5(X74735)
【００４１】
樹木のアレルゲン:  
Alnus glutinosa, Aln g 1 (S50892); Betula verrucosa, Bet v 1 (X15877), Bet v 2, Bet v 1d; Carpinus betulus, Car b 1 (X66932, X66918); Corylus avellana, Cor a 1 (X70999, X71000, X70997, X70998, Z72439, Z72440, AF136945, AF323973, AF323974, AF323975); Ligustrum vulgare, Lig v 1 (X77787, X77788); Olea europea, Ole e 1 (S75766), Ole e 9 (AF249675); Syringa vulgaris, Syr v 1 (X76541); Cryptomeria japonica, Cry j 1, Cry j 2 (D29772, D37765); Cupressus arizonica, Cup a 1 (AJ278498); Cupressus sempervirens, Cup s 1 (AF257491); Juniperus ashei, Jun a 2 (AJ404653)
【００４２】
ダニのアレルゲン:  
Blomia tropicalis, Blo t 5 (U59102); Dermatophagoides farinae, Der f 1, Der f 2, Der f 11; Dermatophagoides pteronyssinus, Der p 1, Der p 2, Der p 5, Der p 7; Lepidoglyphus destructor, Lep d 2 (X81399); P. americana, Cra-A; T. putrescentiae, Tyr p 2
【００４３】
動物のアレルゲン：  
Bos domesticus, Bos d 2 (L42867); Equus caballus, Equ c 1 (U70823); Felis domesticus, Fel d 1 (M74952, M74953)
【００４４】
真菌のアレルゲン:  
Alternaria alternata, Alt a 1 (U82633), Alt a 2 (U62442); Aspergillus flavus, Asp fl 1 (AF137272); Aspergillus fumigatus, Asp f 1 (M83781, S39330), Asp fl/a, Asp f 2 (U56938), Asp f 3 (U20722, U58050), Asp f 4, Asp f 6, Asp f 8; Aspergillus niger, Asp n 18; Aspergillus oryzae, Asp o 13 (X17561); C. comatus, Cop c 1; Penicillium chrysogenum, Pen ch 13 (AF193420), Pen ch 20 (S77837); Penicillium oxalicum, Pen o 18 (AAG44478); Malassezia sympodialis, Mal s 1 (X96486)
【００４５】
昆虫のアレルゲン:  
Apis mellifera, Api m 1 (X16709), Api m 2 (L10710), Api m 4 (X02007); PLA2 (X16709); Blattella germanica, Bla g 1 (AF072219, L47595, AF072221, AF072220), Bla g 2 (U28863), Bla g 4 (U40767), Bla g 5 (U92412); Periplaneta americana, Per a 1 (AF072222), Per a 3 (L40819); Dolichovespula maculata, Dol m 1 (X66869), Dol m 2 (L34548), Dol m 5 (J03601); Dolichovespula arenaria, Dol a 5 (M98859), Polistes annularies, Pol a 5 (M98857); Vespula vulgaris, Ves v 1 (L43561), Ves v 2 (L43562), Ves v 5 (M98858); Myrmecia pilosula, Myr p 1 (X70256), Myr p 2 (581785)
【００４６】
食物のアレルゲン:  
Salmo salar, Sal s 1 (X97824); Bos domesticus, Bos d 4 (M18780), Bos d 5 (X14712); Gallus domesticus, Gal d 1 (J00902), Gal d 2 (J00992); Metapenaeus ensis, Met s 1 (U08008); Hordeum vulgare, Hor v 15 (X63517); Oryza sativa, Ory s 1 (U31771); Apium graveolens, Api g 1 (Z48967); Daucus carota, Dau c 1 (U47087, D88388); Malus domestica, Mal d 1 (X83672); Pyrus communis, Pyr c 1 (AF057030); Persea americana, Pers a 1 (Z78202); Prunus armeniaca, Pru ar 1 (U93165); Prunus avium, Pru av 1 (U66076); Arachis hypogaea, Ara h 1 (L34402), Ara h 2 (L77197); Bertholletia excelsa, Ber e 1 (M17146); Juglans regia, Jug r 1 (U66866), Jug r 2 (AF066055); Ricinus communis, Ric c 1 (X54158); Sesamum indicum, Ses i 1 (AF240005)
【００４７】
更なるアレルゲン(ラテックス):  
Hevea brasiliensis、Hev b 1 (X56535)、Hev b 2、Hev b 3、Hev b 5 (U42640)、Hev b 6 (M36986)、Hev b 7、Hev b 8
【００４８】
これらの既知のアレルゲンは例示の様式でのみ記載される。本発明の目的に関する抗原モジュールに同様に使用できる、更なるアレルゲンが、当該技術において知られている。
アレルゲンの他に、いくつかの既知の病原体（それに対する効果的または持続的な免疫が、現在利用可能ではない）が存在する。本発明の方法は新規の免疫化戦略に基づくものである。それゆえ現在のところ予防的な免疫により満足に治療することができない、これらの障害への免疫に効果を示すことは可能である。これらの障害には、特に、HIVウイルスでの、Ｃ型肝炎ウイルスでの、結核(Mycobacterium tuberculosis)、ライ病(Mycobacterium leprae)、ペスト(Yersinia pestis)での、およびマラリア病原体(Plasmodium種、例えば、falciparum)での感染症が含まれる。
【００４９】
ＭＡＴ分子に存在し得る更なるモジュール  
既に記載した３つのモジュール（トランスロケーションモジュール、ターゲティングモジュール、および抗原モジュール、これらはＭＡＴ分子に少なくとも存在しなければならない）のほかに、更に自由選択のモジュールをＭＡＴ分子に存在させることも可能である。これらの自由選択のモジュールには、例えば、ＭＡＴ分子を単離（isolate）または検出することを可能にするモジュールが含まれる。係るモジュールは、当該技術においてしばしば「タグ（tags）」と称され、そのため本発明では以下においてタグモジュールと称する。ＭＡＴ分子に自由選択的に存在する、更なるモジュールは、スペーサーモジュールであってもよい。即ち、該モジュールは他のモジュールの間に配置され、該モジュールの任務はこれらのモジュールを互いに連結することである。これらのモジュールを、本発明において以下ではスペーサーモジュール（spacer modules）と称する。ある種のモジュールに関して、２以上のモジュールの機能を同時に引き受けることも可能である。例えば、多くのタグモジュールを、ＭＡＴ分子の単離のため及び検出のために同時に使用できる；或いは、ＭＡＴ分子に存在する抗原モジュールを、ＭＡＴ分子の検出および／または単離のためにも使用し得る（例えば、抗原モジュールに対する抗体が利用可能な場合）。
【００５０】
ＭＡＴ分子に存在し得るタグモジュール  
本発明の目的に関して、1以上の異なる、および／または、1以上の同一のタグモジュールを、１つのＭＡＴ分子の成分にすることが可能である。タグモジュールは短いペプチドであってもよく、しばしば20アミノ酸残基以下からなるが、完全なタンパク質配列またはタンパク質の特定のドメインに相当するものであってもよい。タグモジュールは、アミノ酸から構成されない官能基（例えば、ビオチンまたはジゴキシゲニン）であってもよい。ほとんど全てのタグモジュールは、２つの異なる様式で使用できる。第一に、それらを使用してＭＡＴ分子を単離できる、および第二に、それらを使用してＭＡＴ分子の存在を検出できる。一般的に、現在既知の全てのタグモジュール及び将来的に既知となる全てのタグモジュールは、本発明の目的に関する使用に適切である。本発明の目的に関して使用できる、適切なタグ分子の例は：  4から12以上のヒスチジン配列、好ましくは直線的に連続的な（directly consecutive）ヒスチジン残基、Hisタグとも称される、His6タグ、HIS6タグ、ペンタHisTM、テトラHisTM、RGS HisTM、など(Qiagen、Hilden、ドイツ)、Mycまたはc-Mycタグ、PinPointTMタグ(対応するタンパク質が細菌によりインビボでビオチン基を付与されるとの効果を有する、シグナル配列)、HAタグ、6xHNタグ(Promega Biosciences Inc.，San Louis Obispo、CA、USA)、XpressTMタグ、mycタグ、V5タグ(インビトロゲン、Breda、オランダ)、Sタグ、CBDタグ、GSTタグ、HSVタグ、T7タグ(Novagen Inc.，Madison、WI、USA)、FLAGタグ、HAタグ、c-mycタグ、カルモジュリン結合ペプチドタグ(CBP)タグ(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)、Hisタグ、プロテインAタグ、グルタチオンS-トランスフェラーゼ(GST)タグ(Amersham Biosciences、Uppsala、スウェーデン)、Strep-tagII(IBA GmbH、Gottingen、ドイツ)、Hisタグ(Roche Applied Science、Rotkreuz、スイス)、FLAGタグ、GSTタグ、プロテインAタグ(シグマ、St. Louis、MO、USA)、マルトース結合タンパク質(MBP)、キチン結合タグ(New England Biolabs、Beverly、MA、USA)、Hisタグ(BD Biosciences Clontech、Palo Alto、CA、USA)である。１を超えるタグモジュールが１分子において使用される適用は、いくつかのこれらのタグモジュールに関しても記載されている。例えば、２つのタグモジュールを、１つのタンパク質のN末端に又はC末端に連結することができる、又は1つのタグモジュールを、N末端およびC末端の各々に連結することができる(Qiagen、Hilden、ドイツ、およびストラタジーン、La Jolla、CA、USA)。タグモジュールを、他のタンパク質の配列の内部に導入してもよい、例えば１つのタンパク質の２つのドメインの間(Strep-tagII、IBA、Gottingen、ドイツ)。
【００５１】
更なるタグモジュールを主に使用して、それらが連結する分子を検出する。また一方で、これらのタグ分子をタンパク質を単離するために使用してもよい（例えば、アフィニティークロマトグラフィーの使用により）。この目的のために、例えば、これらのタグモジュールに対する抗体が連結された、クロマトグラフィー物質を使用することが可能である。本発明の目的に関して、タグモジュール、例えば、緑色蛍光タンパク質(GFP)、強化緑色蛍光タンパク質(EGFP)、強化シアン蛍光タンパク質(ECFP)、強化黄色蛍光タンパク質(EYFP)、赤色蛍光タンパク質(DsRed2)(BD Bioscience Clontech、Palo Alto、CA、USA)、レニラ緑色蛍光タンパク質(hrGFP；renilla green fluorescent protein)(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)を使用することも可能である。これらのタグモジュールを、Ｎ末端及びＣ末端（例えば、１つの融合タンパク質の）の両方に配置してもよい。蛍光タグモジュールのほかに、タグモジュールとして酵素を使用することも可能である。頻繁に使用される酵素の例は、ルシフェラーゼ、β-ガラクトシダーゼ、アルカリホスファターゼ、西洋わさびペルオキシダーゼ、などである。これらの酵素は、それら酵素のそれぞれの酵素活性を介して検出できる（即ち、これらの酵素の基質の転換に基づいて）。様々なタイプの基質がこの目的に適切であり、例えば、スペクトルの可視領域で光を吸収する基質、蛍光基質、その転換が光の放出を誘導する基質、又はその酵素転換が、その基質の濃度の減少もしくは産物の増加を介して、様々な検出方法の使用により決定できる基質、などである
【００５２】
本発明の目的に関するタグモジュールの更に可能な使用は、例えば、キナーゼ基質として適切なペプチド配列の使用である。これらのペプチド配列を、次に放射性燐の添加およびキナーゼの添加により放射標識できる。本発明の目的に関して、この様式で使用できるタグモジュールの例は：  kemptideタグ(プロテインキナーゼＡによりリン酸化できるペプチド)、カルモジュリン結合ペプチドタグ(CBP)、これはプロテインキナーゼＡで同様にリン酸化することができる(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)、などである。
【００５３】
本発明の目的に関するタグモジュールの更に可能な使用は、例えば、タンパク質、タンパク質ドメイン、又はペプチド配列（特異的に他のタンパク質または他の構造に結合できる）の使用である。文献より既知である、係るタグモジュールの例は：プロテインＡ、プロテインG、プロテインA/G、プロテインL、全てのこれらのタンパク質は抗体構造と結合する(ピアス、Rockford、IL、USA)、グルタチオンS-トランスフェラーゼ（これはグルタチオンと結合する）、マルトース結合タンパク質(MBP)（これはアミロースと結合する）、ストレプトアビジンまたはアビジン（これら双方はビオチンと結合する）、カルモジュリン結合ペプチド（これはカルモジュリンと結合する）、キチン結合タグ（これはキチンと結合する）などである。本発明の目的に関するタグモジュールとして、各々のケースにおいて他の分子と特異的に結合する分子の全てのタイプを使用することが一般的に可能である（即ち、レセプター-リガンド、抗体-抗原、レクチン-糖構造、タンパク質-脂質、タンパク質-核酸、タンパク質-タンパク質、など）、また多数の更なる例が文献に記載されている[28]。
【００５４】
スペーサーモジュール  
本発明の目的に関して使用できるスペーサーモジュールは、他のモジュール（これらはＭＡＴ分子のコンポーネントである）を互いに連結するために適切な全てのタイプの分子である。連結（coupling）は、共有結合性による及び非共有結合性による結合の双方により生じ得る。スペーサーモジュールはとりわけ次の任務を有する、その任務とは、ＭＡＴ分子の様々なモジュールを空間内で互いから分離することである（それらが、それらの機能性に相互に悪影響を及ぼさないように）。本発明の目的に関するＭＡＴ分子のモジュールは、後の時間に再び切断（化学的な又は酵素的な反応により、例えば、プロテアーゼにより）できるスペーサーモジュールにより連結できる。以上のように、ＭＡＴ分子のモジュール（これらはスペーサーモジュールにより接合されている）を、所望のとおり互いに分離することが可能である。
【００５５】
この目的に関して、現在既知である又は将来的に既知となる、一般的に全てのプロテアーゼを使用することが可能である[29、30]。現在、頻繁に使用されるプロテアーゼは、トロンビン、Xa因子、エンテロキナーゼ、またはTAGZymeシステム(Qiagen、Hilden、ドイツ) などである。スペーサーモジュールを切断するために適切な様々な化学反応は、当業者に知られている、又はスペーサー分子の製造者（例えば、ピアスから）の情報から見つけることができる。
【００５６】
スペーサーモジュールは、特にペプチド配列または有機分子である。本発明の目的に関して使用できる多数のスペーサー分子が、当該技術において既知である。加えて、本発明の目的に関して、将来的に開発される又は発見されるスペーサー分子を使用することも可能である。適切なスペーサーモジュールは、とりわけ、ペプチドスペーサー、クロスリンカー、天然の又は合成のポリマー〔例えば、核酸、置換型の（substituted）又は非置換型の炭化水素〕、などである。非共有結合性の相互作用を介して互いに複合体を形成することができる（したがって2以上のモジュールを共に接合してＭＡＴ分子を提供することができる）分子の組み合わせを、スペーサーモジュールとして使用することが付加的に可能である。このような互いに結合する分子の組み合わせの既知の例は、ビオチン/ストレプトアビジンである。
【００５７】
スペーサーモジュールとしてのペプチド配列  
複数のドメインからなる多くのタンパク質は、それらのアミノ酸配列に、文献においてスペーサーとも称される短い配列領域を有している。これらのスペーサーはタンパク質の様々なドメインを空間的に互いに分離するとの任務（task）を有しており、このことは、それらが、それらの機能性に相互に悪影響を及ぼさない様式で行われる。２つのドメインが互いに空間配置的に互いを妨害しない程度に、スペーサー配列がフレキシブルであることを保証することが特にこの目的のために必要である。
【００５８】
このタイプのペプチド配列を、本発明の目的に関するスペーサーモジュールとして、使用できる。多数の異なるスペーサーペプチド配列が、文献に記載されている。これらのスペーサーは、好ましくは2および60アミノ酸の間の長さを有するが、しかし、より長い配列を有していてもよい。スペーサーは、僅か1アミノ酸からなっていてもよい。多くの商業的に利用可能な発現ベクターは、ペプチドスペーサーをコードする配列領域を既に具備している（それらスペーサーは、例えば、タグ配列を、発現ベクターに導入されるべきタンパク質配列へと接合する）。僅か２アミノ酸からなる、非常に短いペプチドスペーサー（例えば、ロイシン-グリシン、グリシン-アラニン、またはセリン-アラニン(IBA GmbH、Gottingen、ドイツ)）が、頻繁に使用される〔又はグリシンおよび／またはアラニンからなり、4〜6アミノ酸の長さの短いアミノ酸配列(Qbiogene Inc.，Carlsbad、CA、USA)〕。多数の更なるスペーサー配列は文献に記載されており、それを本発明の目的に関するスペーサーモジュールとして使用することができる。全ての現在既知のスペーサー分子および将来的に既知となるスペーサー分子を、本発明のＭＡＴ分子におけるスペーサーモジュールとして使用することは原則的に可能である。スペーサーモジュールとして適切なアミノ酸配列を同定するための方法は、アミノ酸配列をタンパク質ドメインに関してスクリーニングするデータベースの使用である。好ましくは、2〜60アミノ酸の長さを有する、短いアミノ酸配列（これらは、アミノ酸配列において、この様式で同定された２つのタンパク質ドメインの間に存在する）を、本発明の目的に関するスペーサーモジュールとして使用できる。タンパク質ドメインと、スペーサーモジュールとして適切なペプチド配列とを同定するための、現在利用可能なデータベースの１つは、「SBASEタンパク質ドメインライブラリ」である[31]。
【００５９】
スペーサーモジュールとしてのクロスリンカー  
クロスリンカーの形態でのスペーサーモジュールも、本発明の目的に関するＭＡＴ分子へと導入できる。この目的のために、ＭＡＴ分子の個々のモジュールが調製され、そしてクロスリンカーでの化学反応により互いに共有結合性に連結される。多数のクロスリンカーが、この目的のために商業的に利用可能である。例えば、ピアス(Pierce Biotechnology、Inc.，Rockford、IL、USA)は、多数の異なるクロスリンカーを提供している。例えば、ピアスからの、アミノ基、スルフヒドリル基、糖構造、カルボキシル基、ヒドロキシル基と反応するクロスリンカーのなかから選択して、又は組み合わされるモジュールとは非選択的に、ＭＡＴ分子を提供することが現在可能である。同様に、ＭＡＴ分子を調製するために現在利用可能なもの（例えば、Pierce Biotechnology Inc.から）は、特定の化学反応〔例えば、チオール、塩基、過ヨウ素酸塩（periodate）、ヒドロキシルアミンにより、光の作用により、又は非特異反応により〕により再度分離できるクロスリンカーである。クロスリンカーの標的化選択（targeted selection）により、ＭＡＴ分子の個々のモジュールの間の距離を特定的に固定することが付加的に可能である。例えば、ピアスは、使用したクロスリンカーに依存して、1.4オングストローム(N-スクシニミジル  ヨードアセテート)〜34.7オングストローム(ビス(ベータ-(4-アジドサリチルアミド)エチル)ジスルフィド)の距離を導入するクロスリンカーを現在提供している。本発明の目的に関するＭＡＴ分子を提供する様々なモジュールを連結するためのクロスリンカーの使用における、更なる可能なバリエーションは、クロスリンカー  sulfo-SBED（Pierce Biotechnology Inc.より）の使用の可能性である。sulfo-SBEDは、一方で２つのモジュールを共有結合性の反応により連結し、そして導入されたスペーサー分子にビオチン基を付加的に具備している。そして、ＭＡＴ分子の更なるモジュールを非共有結合によりこのビオチン基に付着させることが可能となる。この目的のために、導入されるモジュールを、例えば、アビジンまたはストレプトアビジンへと連結することが可能である。この様式で産生されたストレプトアビジン連結モジュールを、次にクロスリンカーに存在するビオチン基を介して、他のモジュールへと連結できる。全ての現在既知のクロスリンカーおよび将来的に既知となるクロスリンカーを、モジュールを連結するために使用して、本発明の目的に関するＭＡＴ分子を提供することが原則的に可能である。
【００６０】
更なるスペーサーモジュール  
本発明の目的に関するスペーサーモジュールは、例えば、アミノ酸のL異性体またもしくはD異性体、異常なアミノ酸（unusual amino acids）、翻訳後修飾を有するアミノ酸、核酸、PNAs(ペプチド核酸)、脂質、糖構造、又は他の天然の若しくは合成のポリマー〔例えば、置換型もしくは非置換型の炭化水素、ポリアセテート（polyacetate）、ポリエチレングリコール、シクロデキストリン、ポリメタクリレート（polymethacrylate）、ゼラチン、オリゴウレア（oligourea）など〕、又は他の物質、又は説明した物質の組み合わせ若しくは他の組み合わせ、からなるものであってもよい。モジュールを共に接合させてＭＡＴ分子を提供するために適切な、全ての現在既知の物質（および将来的に既知となり且つ対応する特性を有する分子）を、本発明の目的のためのＭＡＴ分子を提供するための、モジュールを連結するスペーサーモジュールとして使用することは原則的に可能である。
【００６１】
非共有結合性の相互作用により共に連結されるスペーサーモジュール  
文献には、このクラスのスペーサー分子の多くの例が存在する。非共有結合性の相互作用を介して共に連結され、商業的に利用可能な分子の組み合わせの例は：  ビオチン/ストレプトアビジンまたはアビジンまたはStrep-tagII(IBA GmbH、Gottingen、ドイツ)またはPinPointTMタグ(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)、グルタチオンS-トランスフェラーゼ/グルタチオンおよびプロテインＡ/抗体の定常領域(FC部分)(Pharmacia Amersham Biosciences、Uppsala、スウェーデン、シグマ、St. Louis、MO、USA)、マルトース結合タンパク質(MBP)/アミロース(New England Biolabs、Beverly、MA、USA)、ヒスチジンタグ/Niキレート(Qiagen、Hilden、ドイツ、BD Bioscience Clontech、Palo Alto、Ca、USA、インビトロゲン、Breda、オランダ、Novagen Inc.，Madison、WI、USA、Roche Applied Science、Rotkreutz、スイス)、キチン結合タグ/キチン(New England Biolabs、Beverly、MA、USA)、カルモジュリン結合タンパク質/カルモジュリン(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)である。加えて、いくつかの更なる分子の組み合わせ、例えば、レセプター/リガンドの組み合わせ、抗体/抗原の組み合わせ、レクチン/糖構造の組み合わせ、なども存在する。多数の現在既知のタンパク質-タンパク質相互作用は、データベース中に見出され、これらを本発明の目的に関するスペーサーモジュールとして使用できる[28]。現在既知である及び将来的に既知となる、互いに非共有結合に参加できる、全ての分子の組み合わせを、本発明の目的に関するスペーサーモジュールとして原則的に使用できる。スペーサーモジュールをＭＡＴ分子へと導入するための、更なる方法は、1分子において２つの異なる結合部位を組み合わせた二重特異性分子（bispecific molecules）の使用である。係る分子の例は、ビオチン標識レクチン(Pierce Biotechnology, Inc.，Rockford、IL、USA)であろう。これは例えば、ストレプトアビジン標識モジュールと、レクチンが結合する糖構造を有する更なるモジュールとを共に連結することができる。この様式での連結に関して、可能性のある更なる例は、２つの異なるエピトープを認識する二重特異性抗体（bispecific antibodies）などである。
【００６２】
スペーサーモジュールをＭＡＴ分子へと導入することに関する、更なるバリアントを次に示す：第一に、少なくとも２つのモジュールが、非共有結合的に連結させるスペーサーモジュールを介して互いに連結される。次に、その複合体は、共有結合性の結合を空間的に近接するモジュールの間に導入する、化学的なクロスリンカーで処理される。これは次の利点を有する、その利点は第一段階において、特定のモジュールが標的化された規定の様式で互いに連結され、そして次に非共有結合性の連結が、より安定な共有結合性の連結へと転換されることである。モジュールが、共有結合を生じさせるクロスリンカーで直接的に処理される場合、モジュールが互いに連結される様式は、通常はランダムであり特異的ではない。
【００６３】
ＭＡＴ分子の構造  
ＭＡＴ分子の個々のモジュールの任意の所望の配置が、一般的に可能である。各モジュールは、ＭＡＴ分子に１以上の頻度で存在してもよい。最低限要求される事項は、少なくとも1つのトランスロケーションモジュール、少なくとも1つのターゲティングモジュール、および少なくとも1つの抗原モジュールの存在の必要性である。付加的なモジュール（例えば、タグモジュール、スペーサーモジュール、など）は、自由選択で存在してもよいが、存在する必要性はない。全てのモジュールは、ＭＡＴ分子に１以上の頻度で存在してもよい。モジュールが１以上存在する場合、彼らは同一のコピーの形態で存在してもよい、又は、あるモジュールの異なるバージョンが、各ケースにおいてシングルコピーで又は２以上のコピーで存在してもよい。同じクラスのモジュールのうち、全く異なるモジュール（例えば、Hisタグモジュールおよびビオチンタグモジュール）を、ＭＡＴ分子に存在させることも可能である。両方のモジュールは、機能的に同じ任務(タグモジュール)をＭＡＴ分子内で請け負うが、彼らの分子構造に関連して共通するものを有する必要性はない。
【００６４】
ＭＡＴ分子における抗原モジュールの２以上の同一のコピーが作用することにより、例えば、増強した免疫応答を関連性のある抗原に対して発生させる。２以上の異なる抗原モジュールは、例えば、２以上の異なる抗原に対する同時の免疫反応を調節するために、1つのＭＡＴ分子中で組み合わされてもよい。ＭＡＴ分子において使用される、２以上の異なるトランスロケーションモジュール例えば、Tat配列およびVP22配列が作用することにより、トランスロケーションをより効率的にすることが可能である、というのもＭＡＴ分子のトランスロケーションが、広いスペクトラムの異なる細胞タイプまたは組織タイプで効率的に生じるからである。例えば、２以上のタグモジュール（例えば、HisタグおよびFLAGタグ）を１つのＭＡＴ分子中で使用することも可能である（このケースでは、例えばHisタグが機能してＭＡＴ分子を分離し、例えばFLAGタグが機能してＭＡＴ分子を検出する）。ＭＡＴ分子において２以上の異なるターゲティングモジュール（例えば、MHC  II分子のインバリアント鎖からの配列、および更なるターゲティングモジュールとしてマンノース6-リン酸基、そのうち例えば、インバリアント鎖はMIICsへのターゲティングモジュールとして作用し、マンノース6-リン酸基はターゲティングをリソソームへと誘導する）を使用することが可能であり、これにより抗原提示の効率を又は抗原提示細胞により提示された抗原の異なるエピトープの数を全体的に増加させることが可能である。
【００６５】
ＭＡＴ分子内の個々のモジュールのポジションは、少なくとも1つのトランスロケーションモジュール、少なくとも1つのターゲティングモジュール、および少なくとも1つの抗原モジュールが存在するかぎり、所望のとおり変化させてもよい。ＭＡＴ分子のモジュールの全て又はいくつかに関して、例えば、モジュールを直線的で連続的な配置の形態で存在させないことも可能であり、環状として又は分岐状モジュール構造又はデンドリマーの形態として、又は直鎖状および／または分枝状および／または環状および／またはデンドリマー分子部分（dendrimeric molecule portions）の組み合わせとして存在させることも可能である。ＭＡＴ分子の環状モジュール構造は、例えば、２つのシステイン残基を互いに反応させることにより産生できる、或いは、1つのシステイン残基とチオールエステル基とを反応させることにより産生できる（元は直鎖状構造を有していたモジュールの鎖内で）。特定のベクターを供給する発現ベクターの販売者が存在し、これにより環状の融合タンパク質を、例えばIMPACTTM-TWINシステム（New England Biolabs、Beverly、MA、ＵＳＡより）により調製することが可能である。分岐状モジュール（Branched module）を、例えば、ペプチド（ここで、ポリL-リジンから開始され、新しいリジン残基が引き続くリジン残基の各々の双方の遊離アミノ基に付着する）を合成することにより調製し得る。事実上、任意の程度の枝分れを有するペプチド構造を、この様式で作出することが可能である。例えば、トランスロケーションモジュールおよび／またはターゲティングモジュールを、引き続いて分枝状ペプチド基礎構造上に合成することが可能である[32]。更なるモジュールも、直鎖状、環状、又は分枝状のペプチド基礎構造上にタンパク質連結により連結できる[33、34]。例えば、ビオチン基をペプチド基礎構造へとペプチド合成の間に導入することは付加的に可能である。また、モジュールを次にペプチド基礎構造上のこれらのビオチン基に、例えばストレプトアビジン、Strepタグシステムを介して又はPinPointTMシステムを介して(それぞれIBA GmbH、Gottingen、ドイツ、およびPromega Biosciences Inc.，San Louis Obispo、CA、USA)付着させることができる。この様式で付着されるモジュールは、次に非共有結合を介して、ペプチド基礎構造へと連結される。
【００６６】
図1は、ＭＡＴ分子の可能な構造のいくつかの例を、種々のモジュールのそれらの組成に関して及びＭＡＴ分子内のモジュールの配置に関して、例示の様式で示している。
【００６７】
ＭＡＴ分子のモジュールの構造  
ペプチド、タンパク質、アミノ酸、異常なアミノ酸（unusual amino acids）、翻訳後修飾など。
ペプチドおよびタンパク質の用語は、本明細書中で共に均等なものとして使用される。ペプチドまたはタンパク質は、本発明の目的に関して、ペプチド結合を介した少なくとも２つのアミノ酸の共有結合性の接合（covalent connection）を意味する。「アミノ酸」の用語および「アミノ酸残基」の用語は、本明細書において均等なものとして使用される（即ち、２つの用語の意味は同一である）。アミノ酸/アミノ酸残基およびペプチド/タンパク質の用語は、本明細書において、最も広い可能な定義の形態で使用される。
【００６８】
アミノ酸は、本発明の目的に関して、遺伝暗号により決定される20アミノ酸のほかに、停止コドンによりコードされるアミノ酸〔例えば、セレノ-システインまたはピロ-リジン（pyrro-lysine）〕をも意味する。付加的に含まれるものは、全ての既知のアミノ酸およびペプチド誘導体（例えば、グリコシル化型の、リン酸化型の、硫酸化型のアミノ酸/ペプチド類、およびL-異性体の及びD-異性体のアミノ酸）、および将来的に知られるアミノ酸およびペプチド誘導体である。アミノ酸およびペプチド誘導体は、翻訳後修飾により、化学的な修飾により、酵素的な修飾により、または他の機能の基礎に基づいて、特異的に生じ得る又は調製し得る。生じたペプチドは、ペプチド分子の全ての領域に生じ得る修飾を含み得る。例えば、修飾は、ペプチドバックボーン（peptide backbone）に、アミノ酸側鎖に、ペプチドのＮ末端で、又はペプチドのＣ末端で生じ得る。前記修飾は、単一のアミノ酸に、複数のアミノ酸に、又は全てのアミノ酸に存在し得る；そして、修飾の、如何なるタイプにも関せず、１つのタイプに関して、または複数のタイプに関して、任意の組み合わせで１つのペプチドにおいて存在することが可能である。前記ペプチドは分枝状（branched）であってもよく、前記ペプチドは環状形態であってもよい。また、分枝状および環状のペプチドの任意の組み合わせが可能である。分枝状および／または環状のペプチドは、天然の生物学的なプロセスを通して生じてもよく又は合成によって調製されてもよい。例示の様式で説明される、異常なアミノ酸の例は、とりわけ以下のものである:アルファ-アミノ酪酸、ベータ-アミノ酪酸、ベータ-アミノイソ酪酸（beta-aminoisobutyric acid）、ベータ-アラニン、ガンマ-アミノ酪酸、アルファ-アミノアジピン酸、4-アミノ安息香酸、アミノエチルシステイン（aminoethylcysteine）、アルファ-アミノペニシラン酸（alpha-aminopenicillanic acid）、アリシン、4-カルボキシグルタミン酸、シスタチオニン、カルボキシグルタミン酸、カルボキシアミドメチルシステイン（carboxyamidomethylcysteine）、カルボキシメチルシステイン（carboxymethylcysteine）、システイン酸、シトロリン（citroline）、デヒドロアラニン、ジアミノ酪酸、デヒドロアミノ-2-酪酸、エチオニン、グリシン-プロリン  ジペプチド（glycine-proline dipeptide）、4-ヒドロキシプロリン、ヒドロキシリジン、ヒドロキシプロリン、ホモセリン、ホモシステイン、ヒスタミン、イソバリン（isovaline）、リジノアラニン（lysinoalanine）、ランチオニン、ノルバリン、ノルロイシン、オルニチン、2-ピペリジンカルボン酸（2-piperidinecarboxylic acid）、ピログルタミン酸、ピロリジン（pyrrolysine）、プロリン-ヒドロキシプロリン  ジペプチド、サルコシン、4-セレノシステイン、シンデシン（syndesines）、チオプロリン（thioproline）、など。全ての前記アミノ酸は、それらのＬ異性体の形態で又はそれらのＤ異性体の形態で存在できる（この形態が、彼らの構造上許容されるかぎり）。一般的に、天然で生じる又は形成される又は酵素的に又は化学的に又は別の様式で調製できる、全ての現在既知のアミノ酸およびアミノ酸誘導体、および将来的に既知となるアミノ酸の修飾が、「アミノ酸」の用語に含まれる；そしてそれは本発明の目的に関するＭＡＴ分子の成分であり得る。
【００６９】
本発明の目的に関するＭＡＴ分子の１以上のモジュールに存在し得る、説明された、翻訳後の又は化学的な修飾の例は、とりわけ以下の構造による、アミノ酸配列の修飾である：遊離システインとペプチド配列中のシステインとの結合、２つのシステイン残基間のジスルフィド結合、メチル化、アセチル化、アシル化、ファルネシル化、ホルミル化、ゲラニルゲラニル化、ビオチン化、ステアロイル化（stearoylations）、パルミチル化（palmitylations）、リポイル化（lipoylations）、C-マンノシル化、ミリストイル化、リン酸化、サルファチル化（sulfatylations）、N-グリコシレーション（N-glycosilations）、O-グリコシレーション、アミド化、脱アミド化（deamidations）、脱メチル化、システイニル化、カルボキシル化、ヒドロキシル化、ヨウ素化、酸化、ペジル化（pegylations）、プレニル化、ADP-リボシル化、5’-アデノシル化（5’-adenosylations）、4’-ホスホパンテノール化（4’-phosphopan-theinations）、グルタチオニル化（glutathionylations）、以下の共有結合であって:フラビンの、ヘム基(または他のポルフィリン)の、核酸の又は核酸誘導体の、脂質の又は脂質誘導体の、ホスファチジルイノシトールの、グリコシルホスファチジルイノシトール  アンカー(GPIアンカー)の、ピリドキサールリン酸の、マンノース6-ホスフェートの共有結合、システインのカルボキシアミドメチルシステインまたはカルボキシメチルシステインまたはピリジルエチルシステイン（pyridylethylcysteine）への修飾、リジンのリポ酸への修飾、グルタミンのピログルタミン酸への修飾、tRNAsによるペプチドへのアミノ酸の付加、ペプチドのユビキチン標識、ペプチドの分枝化（branchings）、例えばポリ-L-リジンの形態での、可能なペプチドの環化（例えば、ジスルフィド結合を2つのシステイン残基間で形成されることによる）、など。多数の更なるタンパク質の修飾（とりわけ、データベース中に保管されている）は、文献に記載されている[35]。一般的に、天然で生じる又は形成される又は酵素的に又は化学的に又は別の様式で調製できる、全ての現在既知のペプチドの修飾、および将来的に既知となるペプチドの修飾が、「ペプチド」の用語に含まれる；そしてそれは本発明の目的に関するＭＡＴ分子の成分であり得る。
【００７０】
ペプチドミメティックス  
本発明の目的に関して、ＭＡＴ分子の、モジュールの1以上のアミノ酸または完全なモジュール（the complete module）または全てのモジュールを、ペプチドミメティックスからなる構造で置換することが付加的に可能である。ペプチドミメティックスの用語は、本明細書において、最も広い可能な規定（the widest possible definition）の形態で使用される。ペプチドミメティックスは、非ペプチドの構造要素であり、そして模倣することが可能である又は天然の親分子（parent molecule）の生物学的効果をアンタゴナイズすることが可能である。ペプチドミメティックスを従来のペプチド構造の置換物として用いる可能性に関して詳しく取り組んでいる多数の研究が、当該技術分野において知られている。ＭＡＴ分子の1以上のモジュールが、全体的に又は部分的にペプチドミメティックスから構成される（composed）ことは一般的に可能である[36-38]。このことは様々な利点を有し得る。トランスロケーションモジュールは、おそらく細胞へとより効率的に貫入でき、それによって、ターゲティングモジュールは、ＭＡＴ分子を、より効率的に又はより低効率で、および／または、より特異的に、所望の細胞内細胞小器官へとトランスポートし得る；抗原モジュールは、増強した又は減少した免疫応答（従来の抗原に対する免疫応答と比較して）を生じ得る；またはタグモジュールは、良好な物理化学的な特性を有し得るもので、これによりＭＡＴ分子の単離および／または検出に関するそれらの適合性が改善される、等々。ある種の状況において、ペプチドミメティックスの使用を介して、ＭＡＴ分子のインビボ安定性を減少または増加させること、その毒性を減少または増加させること、その親水性または疎水性の媒体（media）における溶解度を改善すること、そのインビトロ安定性を延長させること、そしてペプチドミメティックスを合成するためのコストを多分減少させること（対応する従来のペプチドを合成するためのコストに比較して）、が付加的に可能である。ペプチドミメティックスの一例は、NOXXON Pharma（AG、Berlin、ドイツ）から供給される、スピーゲルマース（Spiegelmers）（登録商標）である。このタイプのペプチドミメティックスは、例えば次のような利点を有している。その利点とは、彼らが免疫応答を惹起しないので、価値ある様式（a worthwhile manner）で（例えば、ＭＡＴ分子のトランスロケーションモジュール、ターゲティングモジュール、タグモジュール、スペーサーモジュール、などにおいて）使用できるだろうとのことである。しかしながら、スピーゲルマース（登録商標）は、抗原モジュールとして適切ではないだろう。
【００７１】
ＭＡＴ分子の調製および単離  
本発明の更なる態様は、当業者に既知の組換え型の発現システム、クロマトグラフィー法、および化学合成プロトコールを用いた、ＭＡＴ分子の単離である。この様式で単離されたＭＡＴ分子は、とりわけ、医薬および診断補助（diagnostic aids）を生産するために並びに実験動物において及びインビトロシステムにおいて抗体を産生するために使用できる。
【００７２】
ＭＡＴ分子の調製  
ＭＡＴ分子を調製するための当業者に既知の方法は、ペプチドの組換え型の発現を含む。ペプチドの発現に関して、とりわけ細胞システム、例えば、細菌（例えば、大腸菌）、酵母細胞（例えば、Saccharomyces cerevisiae）、昆虫細胞（例えば、Spodoptera frugiperda(Sf-9)細胞）、または哺乳類細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞）を使用することが可能である。これらの細胞は、アメリカン・ティッシュ・カルチャー・コレクション(ATCC)から入手可能である。ペプチドの組換え型の発現に関して、例えば、核酸配列（該配列は、全体のＭＡＴ分子をコードするか又はＭＡＴ分子の個々の分子をコードする）が、発現ベクターに、適切な調節性の核酸配列（例えば、選択マーカー、プロモータ、など）と組み合わせて導入される（分子生物学の方法を用いて）。適切な選択マーカーは、例えば、抗生物質に対する耐性（例えば、アンピシリン、カナマイシン、ネオマイシン、ピューロマイシン）、または代謝性の欠陥〔例えば、アラニン、ロイシン、トリプトファンなどを産生できない酵母細胞、または酵素ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼを欠失しているので、ＨＡＴ培地(ヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン培地)において生存することができない哺乳類細胞〕、などである。適切なプロモーターは、例えば、サイトメガロウイルス最初期プロモーター(CMVプロモーター)、SP1最小プロモーター、またはチミジンキナーゼプロモーター(TKプロモーター)である。プロモータの選択において、特定の細胞システムに適切なプロモーターを選択することが必要である。例えば、T7またはT7/lacOプロモーターは細菌に適切であるが、例えばnmt1プロモーターは酵母細胞に適切である。ＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールが有毒である場合、特定の発現ベクターを使用することは有利または必要であろう；該特定の発現ベクターは、これらの分子の発現を外側からコントロールすることを可能にするものである〔例えば、Tet-OnTM およびTet-OffTM 発現システム(Promega Biosciences、San Louis、CA、USA)により〕。このシステムにおいて、発現ベクターのプロモーターの活性は、テトラサイクリンを細胞の成長培地へと添加することにより制御される。ＭＡＴ分子の又はＭＡＴ分子のモジュールの発現を外部から制御するために使用できる方法の更なる例は、IPTGによるT7ポリメラーゼの誘導、またはエクジソン誘導性の発現システム〔例えば、Complete Control（登録商標）誘導性哺乳類発現システム(ストラタジーン、La Jolla、MO、USA)〕の使用である。IRES(内部リボソーム侵入部位)配列を具備するベクターの使用において、複数の分子を、ただ１つの発現ベクター(例えば、pLP-IRESneoベクター、Promega Biosciences、San Louis; CA、USA)を使用することにより、同時に調製することも可能である。したがって、この様式において、例えばＭＡＴ分子の２以上のモジュール（これらのモジュールは互いに非共有結合により相互作用することが意図される）を、互いに並行して適切な化学量論的な量比で発現させることが可能である、そして多分並行して精製することも可能である。様々な会社が、様々な細胞システムに対する、商業的に利用可能な発現ベクターを供給している（例えば、Invitrogen、Qiagen、Stratagene、Clontech、Novagen、New England Biolabs、Pharmingen、Promega、Pharmacia、など）。この様式で単離された発現ベクターは、次に適切な細胞に、当業者に既知の様式で、例えば、電気穿孔法、リン酸カルシウム共沈、リポソーム媒介性の形質移入などにより導入できる。或いは、分子生物学の方法により産生された組換え型のウイルスを使用することも可能である。これらのウイルスは、次々に細胞に感染し、感染した細胞によるＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールの発現を生じせしめる。適切なウイルス性の発現システムは、例えば、バキュロウイルスシステム、例えば、BacculoGold(BD Bioscience Pharmingen、Palo Alto、CA、USA)、アデノウイルス発現システム、例えば、ViraPortTM (ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)、レトロウイルス発現システム、例えば、AdEasy(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)などである。
【００７３】
発現ベクターおよびウイルス発現システムをトランスフェクションすることの代替として、インビトロ翻訳システムを使用することも可能である；ここでは例えば、ウサギ網状赤血球ライセートまたは大腸菌S30抽出物またはコムギ胚芽抽出物が、ＭＡＴ分子の合成に又はＭＡＴ分子のモジュールのインビトロ合成に使用される（発現に必要とされる生細胞なしで）。
【００７４】
ＭＡＴ分子を調製するための細胞システム  
細胞ライセートまたは細胞培養上清を、ＭＡＴ分子を調製するための又はＭＡＴ分子の個々のモジュールを調製するための出発物質として、使用できる。細胞システムは、細菌（例えば、大腸菌、桿菌、カウロバクター、シュードモナス属、またはstreptomycete）、または酵母（例えば、Saccharomyces、pichia、またはhansenula）、または昆虫細胞（例えば、Sf-9、Sf-21、またはHigh Five）、または哺乳類細胞（例えば、CHO細胞、COS細胞、3T3細胞、BHK細胞、293細胞）、などから取得し得る。タンパク質の細胞内部から細胞外間隙へのタンパク質のトランスポートを発生させるシグナル配列の使用を介して、発現されるタンパク質を、細胞培養培地に又は細胞膜周辺間隙（例えば、細菌の）に特異的に蓄積させることは可能である。ＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールを調製するための出発物質の更なる供給源は、トランスジェニック動物、トランスジェニック植物、トランスジェニック真菌、トランスジェニック微生物であってもよい（これらのトランスジェニック中には、ＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールをコードする核酸が、安定的に又は一過性に導入されている）。対応する（corresponding）核酸は、このケースにおいて、特定の生物体のゲノムへと直接的に統合されてもよい、また例えばプラスミドの形態で又は他のDNAまたはＲＮＡ分子の形態で生物体へと導入されてもよい。対応するＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを、次にトランスジェニック動物の例えばミルク、卵、血清、尿、組織などから、トランスジェニック植物の例えば貯蔵塊茎（storage tubers）、種子、葉などから、トランスジェニック真菌の例えば、菌糸（mycelium）、子実体（fruiting body）などから、またはインビトロで培養された細胞または他の生物体から、または対応する細胞培養培地から単離できる。全てのタイプの生物体は、ＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを調製するための発現システムとしての使用に一般的に適切である。
【００７５】
ＭＡＴ分子の単離  
この様式で調製されたＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールは、当業者に既知の技術を用いて単離できる。タンパク質を単離するための、当業者に既知の多数の方法が、この目的のために使用でき、例えば、沈殿法、液体相分離法（liquid phase separation methods）、クロマトグラフィー法などがある。適切な沈殿法には、とりわけ、免疫沈降、硫酸アンモニウム沈殿、ポリエチレングリコール沈殿、エタノール沈殿、トリクロロ酢酸沈殿(TCA precipitation)、温熱沈殿（thermal precipitation）、などが含まれる。液体相分離法には、例えば、有機溶媒（例えば、アルコール、アセトン、クロロホルム、アセトニトリル）などによる抽出が含まれる、およびクロマトグラフィー法には、例えば、陽イオン交換体クロマトグラフィー、陰イオン交換体クロマトグラフィー、等電点フォーカシング（isoelectric focussing）、逆相クロマトグラフィー、ゲル濾過、固定化金属イオン親和性クロマトグラフィー(IMAC；immobilized metal ion affinity chromatography)、これには多様な金属イオン（例えば、ニッケル、亜鉛、コバルト）などを使用できる、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、多数の異なるアフィニティークロマトグラフィー法（例えば、免疫アフィニティークロマトグラフィー、固定化された核酸、または固定化されたプロテアーゼインヒビターを用いたアフィニティークロマトグラフィー法）などが含まれる。使用されるクロマトグラフィーメディアは、アガロースマトリックスに基づく、磁性ビーズに基づく構造を；様々なポリマー（例えば、ポリスチレン）に基づく、膜の形態で、中空糸の形態で、有していてもよい。クロマトグラフィー法は、一般的にクロマトグラフィーカラムに数μｌの容量から、大きなクロマトグラフィーカラムに数百リッターの容量までの、広く多様なスケールで実施できる。加えて、クロマトグラフィーは、正常な大気圧下、1から50barの範囲の中間の圧力下(例えば、FPLCシステム、Pharmacia Amersham Biosciences、Uppsala、スウェーデン)、および約400bar（おそらく更に大きな圧力）までの範囲での非常に高い圧力下(HPLCシステム)で実施できる。クロマトグラフィーは、ＭＡＴ分子に、未変性の（native）および変性の効果を有する条件下で実施できる。マトリックス物質と単離されるＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールとの間の様々な相互作用を、アフィニティークロマトグラフィーに使用できる。これらには、本明細書の他の部分で既に説明した、特定の機能的な基またはリガンドと相互作用し、そしてＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールの単離を許容する、多数のタグ分子が含まれる。しかしながら、例えば、タンパク質-タンパク質相互作用、核酸-タンパク質相互作用、核酸-核酸相互作用、糖-レクチン相互作用、糖-タンパク質相互作用、レセプター-リガンド相互作用、抗体-抗原相互作用(例えば、抗FLAG、抗HA、抗mycタグ抗体)、ハプテン-抗体相互作用、スピーゲルマー相互作用（Spiegelmer interactions）(NOXXON Pharma AG、Berlin、ドイツ)などの、全てのタイプの相互作用を使用することは原則的に可能である。
【００７６】
アフィニティークロマトグラフィー  
アフィニティークロマトグラフィーに使用できる方法は、特にタグモジュールとマトリックスとの選択的な結合に基づく方法である。ＭＡＴ分子を単離するための、タグモジュールおよび関連するマトリックスの適切な組み合わせは、とりわけ以下のものである:ヒスチジンタグとニッケルキレートマトリックス(Qiagen、Hilden、ドイツ)、GSTタグとグルタチオン-セファロース(Amersham Biosciences、Uppsala、スウェーデン)、マルトース結合タンパク質タグとアミロースマトリックス(New England Biolabs、Beverly、MA、USA)、ビオチンタグとストレプトアビジンまたはアビジンマトリックス(IBA GmbH、Gottingen、ドイツ)、キチン結合タンパク質タグとキチンマトリックス(New England Biolabs、Beverly、MA、USA)、カルモジュリン結合ペプチドタグとカルモジュリンマトリックス(ストラタジーン、La Jolla、CA、USA)、プロテインAまたはプロテインGまたはプロテインA/GまたはプロテインL、および抗体分子の各々のタンパク質（例えば、抗体のＦｃ部分）により認識される、特定の領域(Amersham Biosciences、Uppsala、スウェーデン)、FLAGタグ、HAタグ、mycタグ、ヒスチジンタグ、など、と特定のタグに対する抗体が連結したマトリックス、など(Promega Biosciences Inc.，San Louis Obispo、CA、USA、インビトロゲン、Breda、オランダ、Qiagen、Hilden、ドイツ、を含む多くの異なる会社)。
【００７７】
プロテアーゼ認識配列  
この様式で単離されるＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールは、適切な場合には、それらのタグモジュールおよび／または他のモジュールから分離できる。この目的のために、例えば、プロテアーゼ認識配列を適切なポジションで特定の発現ベクターへと導入することが可能である。多数の適切なプロテアーゼ認識配列が当業者に知られており、これにはプロテアーゼ、例えば、トロンビン、Xa因子、エンテロキナーゼ、またはTAGZymeシステム(Qiagen、Hilden、ドイツ)の認識配列が含まれる。添加されたプロテアーゼは、例えば、固定化されたプロテアーゼインヒビター、例えば、エンテロキナーゼに対するEK-AWAY(インビトロゲン、Breda、オランダ)、Xa除去樹脂(Qiagen Hilden、ドイツ)、トロンビンを除去するためのベンザミジン-セファロース（benzamidine-Sepharose）、などを介して、再び除去できる。ＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールを単離するための更なる可能性は、インテイン（即ち、プロテアーゼの）の使用である、それらはＭＡＴ分子の成分であり、適切な実験条件下で、それらはそれら自身をＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールの残りの部分からタンパク分解性に排除する(GeneaseTM、New England Biolabs、Beverly、MA、USA)。通常は、現在既知である及び将来的に既知となる、全てのプロテアーゼ認識配列[29、30]は、本発明の目的に関するＭＡＴ分子の成分を除去するために適切である。プロテアーゼ認識配列は、天然で生じているもの又は特異的に設計されているものであってもよく、また、全体的に又は部分的に天然のアミノ酸、異常なアミノ酸、ペプチドミメティックスなどから構成されていてもよい。
【００７８】
封入体（Inclusion bodies）  
本発明の更なる態様は、ＭＡＴ分子の又はＭＡＴ分子のモジュールの不正確にフォールドされたタンパク質凝集物の調製であり、これは封入体とも称される。封入体は、細胞外間隙から細胞膜を介して細胞の内部へとトランスポートすることを可能にせしめる、トランスロケーションモジュールを具備する分子として調製できる。このトランスロケーションは、元は不正確にフォールドされた分子を正確にフォールドさせて、そして当初（outset）から正確にフォールドされたＭＡＴ分子のように細胞の内側で作用させる。この手順は次の利点を有する、その利点とは、未フォールドのタンパク質が変性条件下で単離できることである（このことは技術的複雑性および財政的なコストの低減化に度々関連する）。加えて、封入体は相対的に安定な構造である。このことは、後に医学的な用途のために保存されるＭＡＴ分子の貯蔵および安定性に関して、ある種の条件下で利点を有する。この方法により、未フォールドの又はフォールドしたＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを、本発明の目的のために使用することも可能である。ある種のトランスロケーションモジュールは、細胞外間隙から細胞への及びリバーストランスポート（reverse transport）での、トランスロケーションの双方を発生させる。なおも不正確にフォールドされたＭＡＴ分子のトランスフォーメーションは、ＭＡＴ分子で処理される個体のインビボで直接的に発生し得る；又はＭＡＴ分子のフォールディングは、細胞システムにおいてインビトロで実施できる。加えて、未フォールドのＭＡＴ分子の細胞へのトランスロケーション、および正確にフォールドされたＭＡＴ分子の細胞外間隙への引き続くトランスロケーションは、ある種の状況下で同じトランスロケーションモジュールにより生じ得る。このタイプの機構は、本発明の目的に関するトランスロケーションモジュールとして適切な幾つかの配列（例えば、VP22配列）に関して記載されている[39]。
【００７９】
ＭＡＴ分子の修飾  
ＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールは、酵素的に、化学的に、または当業者に既知の多数の方法による他の方法により、修飾できる。例えば、ペプチドはキナーゼを用いることによりリン基（phosphorus groups）を付与され得る、リン基はホスファターゼを用いて除去できる、糖構造はグリコシダーゼを用いて除去できる、等々。適切なキナーゼ、ホスファターゼ、およびグリコシダーゼなど、並びに適切なプロトコールは、様々な製造者（例えば、New England Biolabs、Beverly、MA、USA）から取得可能である。ＭＡＴ分子の又はＭＡＴ分子のモジュールのリン酸化を付加的に使用することにより、ＭＡＴ分子またはＭＡＴ分子のモジュールを放射性のリンで標識することができる、このようにして、それらをインビトロおよび／またはインビボで容易に検出可能にする。ＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを化学反応により修飾することも可能である。例えば、ジスルフィド架橋は還元により破壊できる、チオエステル基は共有結合性にシステイン残基と反応できる、又は２つのシステイン残基は反応してジスルフィド架橋を形成できる、このようにして環状の又は分枝状のＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを調製することが可能である(例えば、IMPACTTM-TWIN Protein Fusion and Purification System、New England Biolabs、Beverly、MA、USA)。特定の影響を、ＭＡＴ分子の又はＭＡＴ分子のモジュールの修飾に、発現システムの選択を介して与えることも可能である。例えば、糖鎖形成は細菌において発生しない、また昆虫細胞は特定のタイプの糖鎖形成のみを合成し、他方で哺乳類細胞は完全な糖鎖形成を産生する。係る様式で修飾された又は係る様式で選択された発現細胞システムに関して、それらが特異的に産生できる、又は特異的に産生できない、特定の翻訳後修飾を使用することも可能である、これらの有利な特性は、とりわけ、次の特性であり得る。それは即ち、親水性の又は疎水性の溶媒における良好な溶解性、例えば、室温での、37°Cでの、4°Cでの、-20°Cでの、-70°Cでの又は他の温度でのＭＡＴ分子の長期安定性、ＭＡＴ分子の長期の分子安定性（molecular stability）であり；それらが単独で又は他の固形の、液体の、又はガス状の物質と混合されて、医薬または診断補助などとして調製された形態で存在する場合は、細胞膜、細胞小器官、血液脳関門、血液-CSF関門、および他の生物学的膜および関門などに対する、ＭＡＴ分子の高い貫入性（penetrability）、高い又は低いインビボまたはインビトロ半減期、低い又は高い毒性、ＭＡＴ分子の良好なインビボまたはインビトロ検出性などである。
【００８０】
タンパク質連結（Protein ligation）  
ＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを調製するための更なる可能性は、タンパク質連結である。これは、例えば、ペプチドの２つの端が、1以上の化学反応により共有結合性に共に連結される化学反応を意味している。１つの例は、チオールエステルとシステイン側鎖との反応であろう(例えば、IMPACTTM-TWIN Protein Fusion and Purification System、New England Biolabs、Beverly、MA、USA).例えば、環状ペプチドを、この様式で調製することが可能である。分岐状ＭＡＴ分子は、例えば、ポリリジンペプチドの化学合成により調製できる。該化学合成では、２つの更なるリジン残基(1つのリジンをリジンの各アミノ基に）が各リジンに付着させられて、１つの分枝状ポリリジンペプチドが形成される。引き続いて、各末端のリジン上に、ペプチド鎖を合成することができる、またはペプチドをペプチド連結により共有結合性に付着させることができる。他の分枝状ポリマーを、本発明の目的に関するＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールに対する、担体構造（carrier structure）としても使用できる。その一例は、例えば、PEGスター分子（PEG star molecules）であり、これはエチレン酸化物をクロスリンクしたジビニルベンゼンで重合させることにより調製できる。
【００８１】
ペプチドミメティックス  
ＭＡＴ分子又はＭＡＴ分子のモジュールを調製するための更なる可能性は、ペプチドまたはペプチドミメティックスの[40]又はペプチドおよびペプチドミメティックスの組み合わせの化学合成である。ＭＡＴ分子の又はＭＡＴ分子のモジュールの化学合成による調製物は、様々な製造者から入手可能な自動合成機および合成試薬（synthetic chemicals）を用いたメリフィールド固相合成プロトコールなどにより生じさせることができる。ペプチドミメティックスの合成を提供する会社の例は、The Peptide LaboratoryTM（Benicia、CA、USA）である。従来のペプチドに関する及びペプチドミメティックスに関する多数のシントン（synthons）は、例えば、会社（Sigma-Aldrich Co, St. Louis, MO, USA）から購入できる。
【００８２】
医薬および診断補助の組成物  
ＭＡＴ分子のペプチド部分（peptide portions）、アミノ酸部分、アミノ酸誘導体部分、ペプチドミメティックス部分など（医薬および診断補助に存在する）は、それらの塩の形態で存在してもよい（これらの塩が薬理学的に許容される塩である限り）。注射を意図した医薬または診断補助は、例えば、無菌の水性の又は油性の溶液であってもよく、この溶液は従来技術にしたがって適切な賦形剤（例えば、分散剤、保湿剤、および懸濁物を安定化する因子）と混合される。注射のための無菌溶液は、薬理学的に許容される希釈剤または溶媒（例えば、1,3-ブタンジオール）を用いて生産されてもよい。許容される溶媒および緩衝剤のなかで使用可能なものは、とりわけ、水、リンゲル溶液、等張性の塩化ナトリウム溶液などである。加えて、無菌の油（合成のモノ又はジグリセリドが含まれる）を使用できる。脂肪酸（例えば、オレイン酸）を使用することによって、注射のための溶液を調製することも可能である。ジメチルアセトアミド、洗剤（イオン性の及び非イオン性の洗剤を含む）、ポリエチレングリコール、などを使用することが更に可能である。上述の物質の混合物も同様に可能である。医薬に関して、前記医薬を連続的に放出する生分解性のポリマーとの混合物の形態で生産することも付加的に可能である。係るシステムの一例は、例えば、Atrigelシステム(Atrix Labs、Fort Collins、CO、USA)である。
【００８３】
直腸投与に使用できる調製物（Preparation）は、ＭＡＴ分子、および、適切な場合には適切な非刺激性の軟膏基剤または充填剤（例えば、カカオバター、合成のモノ―、ジ―、もしくはトリグリセリド、脂肪酸、またはポリエチレングリコール）を伴う更なる物質からなる混合物からなるものである。着色料、保存剤、および臭気剤（odorants）を存在させることは付加的に可能である。これらの及び更なる適切な物質は、室温で固体であり、体温で融解する（それらが含有する物質を放出するように）。
【００８４】
経口投与に関して、とりわけ、カプセル、錠剤、丸剤、粉剤、顆粒剤などを使用することが可能である。係る剤形（dosage forms）において、医薬および診断補助の活性物質は、特定の剤形に適切なアジュバントと組み合わされる。前記物質は、ラクトース、スクロース、デンプン粉末、セルロースエステル、アルカノール酸（alkanoic acids）、セルロースアルキルエステル、ステアリン酸、マグネシウムステアリン酸エステル、酸化マグネシウム、亜リン酸または亜硫酸のナトリウムまたはカルシウム塩、ゼラチン、アラビアゴム、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン、ポリビニルアルコールなどで処理されてもよい（例えば、錠剤、カプセル剤などに対して）。係るカプセル剤、錠剤などは、活性物質のコントロールされた放出を、可能とする又は促進する物質を付加的に含んでもよい（例えば、ヒドロキシプロピルメチルセルロース）。緩衝物質（例えば、クエン酸ナトリウム、マグネシウムまたはカルシウムの炭酸塩または重炭酸塩など）を存在させることが付加的に可能である。更なる成分は、着色剤、芳香剤、調味料、保存剤、および甘味剤であってもよい。錠剤、丸剤、カプセルなどは、一方において胃酸に耐性にせしめ、他方において腸のアルカリ環境下で溶解する効果を有する、コーティングを付加的に施されてもよい。
【００８５】
経口投与に関して、液剤（liquid）、薬学的に許容されるエマルジョン剤、溶剤（solutions）、シロップ剤、およびゲル様調製物を使用することも可能である。これらの調製物は、医療に使用される溶媒（例えば、水、エタノール）などを含んでいてもよい。これらの調製物は、アジュバント、保湿剤、乳化剤（emulsifiers）、および懸濁剤など、および甘味剤、調味料、着色剤、保存剤、および臭気剤をも含んでいてもよい。
【００８６】
注射目的を意図する液体調製物は、無菌の粉剤または顆粒剤から、水性の又は非水系の溶媒に溶解させることにより、生産できる。これらの溶液の基礎となる、粉剤および顆粒剤は、経口的に投与できる医薬に関して説明された１以上の物質を含んでいてもよい。適切な溶媒は、とりわけ、水、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、エタノール、コーン油、綿実油、やし油、ベンジルアルコール、塩化ナトリウム溶液、または多様な他の緩衝液である。更なる可能な構成成分（ingredients）は、着色剤、保存剤などである。
【００８７】
ＭＡＴ分子および医薬の更なる構成成分の量は、剤形、投薬頻度（dosage frequency）、選択した投与経路、年齢、性、重量、患者の健康状態、などに依存する。考慮すべき付加的な因子は、治療が診断、治療のためか又は予防のためかどうか、および治療の目的が免疫反応を増強するためか又は免疫反応を抑制するためかどうかである。医薬の処方（formulation）および用量（dosage）における多数の研究が当業者に知られている[41、42]。
【００８８】
ＭＡＴ分子を用いた抗体の取得  
本発明の更なる態様は、ＭＡＴ分子を用いた、モノクローン性の、オリゴクローン性の（oligoclonal）、またはポリクローン性の抗体の取得である。
前記抗体は、当業者が精通した通常の様式で取得される。ＭＡＴ分子を用いて取得される係る抗体により、ＭＡＴ分子の抗原モジュールに存在する抗原の特異的な免疫学的検出が可能となる。前記抗体は、抗原モジュールに存在する抗原、および／または抗原モジュールにおける抗原と類似（similar）する抗原、および／または抗原モジュールにおける抗原の１以上のエピトープ、および／または抗原モジュールにおける抗原の１以上のネオエピトープ（neo-epitopes）、および／または対応する完全な抗原などを正確に認識する（これらの抗原の一部のみが、抗原モジュールに存在していたにもかかわらず）。ポリクローン性の抗体は、適切な実験動物（例えば、マウス、ラット、モルモット、ハムスター、ウサギ、ヤギ、ヒツジ、ネコ、イヌ、サル、ウシ、ウマ、ロバ、ニワトリ、または他の実験動物）の免疫化により産生できる。モノクローナル抗体は、実験動物（例えば、マウスまたはラット）の免疫化、引き続く当業者に既知のハイブリドーマ技術の適用により産生できる。モノクローナル抗体は、組換え型の実験アプローチによっても産生し得る；ここでは、例えば、核酸（特定のモノクローナル抗体をコードする）がハイブリドーマ細胞株（実験動物のＭＡＴ分子での免疫化により産生された）から単離される。これらの核酸は、組換え発現システムに使用して又はインビトロ翻訳システムを用いることにより、対応する抗体を産生することができる。この様式で産生される抗体は、完全な抗体分子の形態で、完全な抗体または他のアミノ酸配列と融合された抗体の部分からなるタンパク質として、F(ab)断片として、F(ab)2断片として、単鎖可変性断片(ScFv；single-chain variable fragments)として、または他の抗体断片として、産生すること及び使用することが可能である。
【００８９】
本発明の医薬および診断補助のための投与経路  
本発明の医薬および診断補助は、様々な経路により免疫される患者に又は実験動物に投与できる。これらの方法は、とりわけ、例えば、錠剤、被覆錠剤（coated tablets）、カプセル、顆粒剤、液体溶剤（liquid solutions）、液体に溶解される粉剤など、例えば、被覆錠剤、錠剤、顆粒剤、および適切な場合に、胃の酸性環境に暴露されることなく、前記医薬が腸に到達し、前記医薬の構成成分がその場所でのみ放出されるようなカプセルの可能な混合物（possible compositions）の形態での経口の及び舌下の投薬を含む。前記医薬を、皮膚に又は粘膜に、例えば、軟膏、スプレー、散布剤（dusting powders）、チンキ剤（tinctures）などの形態で局所適用することにより、又はエアロゾルとして粘膜（例えば、気道の）を介して吸入させて投与することが付加的に可能である。坐剤、浣腸剤などの形態での直腸投与も可能である。医薬の経皮投与において、例えば、パッチ（patches）またはイオントポレシス（iontoporesis）適用(電流の補助による経皮投与）などの補助を使用することも可能である。前記医薬および診断補助を投与するための、本発明の目的に関して適切な他の形態は、注射、輸液、または薬用のポンプシステムを介した投与である。注射、輸液、またはポンプシステムを介した投与は、とりわけ、静脈内に、筋肉内に、皮下に、皮内に、関節内に、肋骨内に（intrasternally）、クモ膜下腔内に（intrathecally）、腹腔内に、等々で生じ得る。ＭＡＴ分子のリンパ節（例えば、鼠径部のリンパ節）への直接注射も可能である。ＭＡＴ分子の投与の更なる可能なタイプは、患者の細胞のインビトロ治療であり、該細胞は特に抗原提示に特化した細胞（例えば、樹状細胞、Bリンパ球、マクロファージ、更なるマクロファージ様細胞など）、などである。更なる例として、実験動物の細胞、または細胞株を、ＭＡＴ分子で処理できる。処理された細胞を、引き続いて前記患者または前記実験動物へと投与できる。前記細胞を、生細胞（living cells）として、もはや分裂する能力を有さない不活化細胞として、または殺傷された細胞として、前記患者または前記実験動物に投与できる。不活化細胞または殺傷された細胞は、例えば、適切な物質での処理で又は照射（放射線の又は紫外線の放射）により獲得できる。医薬（特に本発明のＭＡＴ分子）を投与するための更なる可能性は、動物、ヒト、または植物細胞の安定な又は一過性の形質移入を、ＭＡＴ分子の発現を誘導するベクターで実施することである。この様式で修飾された細胞は、適切な場合には、マトリックスに捕捉される；これにより第一に細胞は局所的に固定され、そして第二に細胞は患者の又は実験動物の免疫系から防御される、他方で、これにより前記細胞から放出されるＭＡＴ分子が患者の又は実験動物の体へと排出されることが許容される。ある種の状況において、形質移入した細胞に関して、患者または実験動物へと直接的に投与することも可能である；このケースにおいて前記細胞は、適切な場合には、彼らがもはや分裂できない（例えば、照射により又は適切な化学物質での処理により）ような様式で処理される。前記医薬は、リポソームまたは他のベシクル（例えば、エクソソーム、またはデオクソソーム（deoxosomes））にパッケージされて投与されてもよい、或いは前記医��は、生分解性のポリマー（これは前記医薬を連続的に放出する）と混合された形態で投与できる。係るシステムの一例は、例えば、Atrigelシステム(Atrix Labs、Fort Collins、CO、USA)である。更なる物質に関して、同じ又は1以上の他の投与経路により、同時に又は経時的に本発明の医薬または診断補助の用量まで投与することが付加的に可能である。これらの更なる物質は、とりわけ、それらの免疫賦活性の特性を介して、本発明の医薬または診断補助の効果を改善し得る。同時に又は連続的に与えられる係る物質は、とりわけ、アジュバント、鉱油、フロイントアジュバント、免疫賦活性のタンパク質またはメディエータ、例えば、サイトカイン、他のワクチン、などであってもよい。適切な場合には、免疫抑制物質を、例えば、望まない局所免疫反応を減少または抑制させる（一方で、全身性の免疫反応は保持される）ために同時に又は連続的に投与することは付加的に価値がある。免疫抑制物質の同時の又は連続的な投与を対照的に使用して、全身性の免疫反応を阻止してもよい（他方では同時に局所性の免疫反応が保持される）。
【００９０】
ＭＡＴ分子の有効性の検査の可能性  
様々なインビトロおよびインビボ実験を実施して、個々の免疫応答の調節に関連する、ＭＡＴ分子の有効性を検査することができる。
インビトロモデルとして適切なものは、末梢血の単核球(PBMCs)などであり、例えば、アレルギー性の障害を罹患している患者の血液から取得される。係る細胞の利点は次のことである、それは特定の患者に対してアレルギー性の応答を生じさせる抗原が、頻繁に知られていることである。この知識により、例えば、臨床試験を患者で又は実験動物で実施する前に、患者の脱感作をインビトロでシミュレートすることが可能である。この目的のために、例えば、アレルギーの人々（allergic people）からのPBMCsを、特定の抗原（これに対して、アレルギーの人間が応答する）で、または抗原モジュールに特定のアレルゲンを具備するＭＡＴ分子で処理できる。従って、多様な剤形(完全なＭＡＴ分子、トランスロケーションモジュールを有する／有さない分子、ターゲティングモジュールを有する／有さない分子など)に対する、初代の患者細胞（primary patient’s cells）の免疫反応を、調査できる。適切な測定パラメーターは、とりわけ、細胞培養上清におけるサイトカインの決定である。様々なタイプのＴ細胞が特定の抗原に対する免疫応答に関与する；この細胞は、例えばT-ヘルパー細胞のタイプ１(Th1細胞)またはタイプ２(Th2細胞)またはタイプ0(Th0細胞)である。各ケースに関与するＴ細胞のタイプは、抗原に対して誘導された免疫応答が、免疫グロブリンのクラスE(IgE)または免疫グロブリンのクラスG(IgG)から主に構成されるかどうかにおいて、大きな効果を有している。次の事項が文献から既知である；その事項とは、特に、IgE免疫応答がアレルギー性の反応および喘息の原因であり、他方ではIgG免疫応答が抗原に対する耐性（tolerance）に通常関連することである。PBMCsを抗原で処理することにより活性化される、特定のＴ細胞タイプは、例えば、細胞表面上の表面抗原の発現を決定することによっても、またはメッセンジャー（例えば、PBMCsにより放出されるサイトカインなど）を決定することによっても決定できる。決定することが可能なTh1免疫応答のマーカーは、例えば、細胞培養培地におけるインターフェロンガンマ(INF-g)またはインターロイキン-1(IL-1)であり、他方でIL-4、IL-5、IL-6、IL-10、およびIL-13はTh2免疫応答を示す。これらのサイトカインを当業者に既知の標準的な方法により検出することが可能であり、これは例えば、ELISA決定法（例えば、細胞培養上清から）、またはPBMCsの細胞の表面または内側に存在するメッセンジャーのFACS分析、または細胞培養上清または細胞ライセートのウエスタンブロットによる方法などである。これらの又は他のメッセンジャーを検出するために適切な多数の他の方法は、文献に開示されている[43、44]。PBMCsにより放出されるメッセンジャーのほかに、細胞内または膜関連のメッセンジャーまたは更なるタンパク質を、PBMCsにおけるＴ細胞の免疫学的な性質決定に関して使用することも可能である。このような調査に適切な多数の抗体は、とりわけ、Pharmingen（San Diego、CA、USA）、Beckmann Coulter Inc.（Fullerton、CA、USA）、Santa Cruz Biotechnology Inc.（Santa Cruz、CA、USA）、などから供給されている。しかしながら、対応する調査は、患者の初代細胞（primary cells）のみならず、適切に処理された実験動物（例えば、マウス、ラット、モルモット）から取得された細胞などでも実施できる。実験動物での実験は次の��うな利点を有する、その利点とは、これらの動物の細胞をインビトロで試験できるのみならず、その免疫系を、インタクトな生物体の背景（context）においてインビボでも調査できることである。ＭＡＴ分子の用量、組成、および投与の形態の効果を及び対応するコントロールの効果を調査することも可能である、このコントロールは、例えば、抗原のみからなる、またはトランスロケーションモジュールおよび抗原モジュールのみからなる、またはターゲティングモジュールおよび抗原モジュールのみからなる分子である。とりわけ、ＭＡＴ分子または対応するコントロールが従来の方法で皮下に注射される場合、または注射をリンパ節に直接的に行う場合、免疫応答の性質における差異が存在するかどうかを調査することが可能である。ＭＡＴ分子の及び対応するコントロールの非侵襲性の投与（例えば、経口または舌下の投与）の効果を調査することも可能である、実験動物において実施できる、更なる調査は、ＭＡＴ分子または対応するコントロールを、アジュバント（例えば、鉱油、放線菌の抽出物、またはフロイントアジュバント）の同時投与の有り無しで投与することである。最も効果的または最高に許容性を示す、実施すべき免疫化に関する時間スケジュール、および免疫化の用量およびメンバーを確認することも可能である。異なる抗原モジュールを、それらの有効性に関して、更に試験できる。ヒト患者での後の試験に関して、最良の免疫戦略をこの様式で確認することができる。
【００９１】
メッセンジャー、細胞内のタンパク質、および表面タンパク質のほかに、インビトロで培養された細胞の免疫反応を性質決定するために又は実験動物の免疫反応を性質決定するために又は実験動物の若しくは臨床研究でのヒト患者の免疫反応を性質決定するために特に適切なものは、免疫グロブリンである。例えば、ELISAsを用いることにより、アレルゲンまたは抗原の投与により放出された抗体がIgEタイプまたはIgGタイプであるかどうかを、調査および定量することが可能である。この情報は、関与する免疫反応のタイプを示すであろう。
【００９２】
Ｔ細胞により放出されたメッセンジャーも、とりわけPBMC調製物に存在する免疫システムの細胞の増殖にとりわけ効果を有するので、細胞（例えば、PBMCs）の増殖を決定することにより免疫応答を性質決定することも可能である。この目的のために、例えば、インビトロ調査（例えば、トリチウム標識チミジンでのDNA取り込み試験）を実施することにより、細胞成長を検出することが可能である。細胞増殖を決定するための、当業者に既知の多数の他の方法を、これらの調査に同様に使用できる。免疫システムの特定の細胞の増殖をインビボにおいて決定することも可能である（例えば、FACS調査を、実験動物または試験に参加したヒト患者の血液サンプルで実施することにより）。適切な抗体を選択することにより、例えば、血液中に存在する細胞タイプの異なる亜集団を定量することが可能である。ＭＡＴ分子または対応するコントロールでの処理の効果を、この様式で調査できる。
【例示的な態様】
【００９３】
以下の例示的な態様（exemplary embodiments）は、本発明を実施例の様式で説明することを意図するものであるが、本発明の範囲を限定することを意図するものではない。
【００９４】
実施例1：  
ＭＡＴ分子に関する発現ベクターのクローニング  
以下に記載される全ての分子生物学の方法は、当業者に既知の標準方法に基づいて実施された[43]。ベクター  pQE-30(Qiagen、Hilden、ドイツ)を、ＭＡＴ分子（モジュラー抗原トランスポート分子）を発現させるベクターをクローニングするために使用した。
【００９５】
第１工程において、トランスロケーションモジュールをコードする核酸配列を、細菌性の発現ベクターに導入した。HIV Tatのアミノ酸  GYGRKKRRQRRRをコードするDNA配列を、合成オリゴヌクレオチドを介してベクターpQE-30へと導入した。前記オリゴヌクレオチドは、HIV Tat配列に加えて、５’末端に制限酵素Bgl IIの認識配列および３’末端にBamH I、Spe I、Pst I、およびHind IIIに対する認識配列を具備するものであった。合成により調製したHIV Tat配列を、引き続いてBgl IIおよびHind IIIで切断し、そしてベクターpQE-30を制限エンドヌクレアーゼBam HIおよびHind IIIで切断した。Tat配列およびベクターpQE-30を、次にNucleoSpin extract 2 in 1(Macherey-Nagel、Oensingen、スイス)を用いて単離し、リガーゼを用いて連結し、コンピテント細菌に電気穿孔法により形質転換し、アンピシリン（ampizilin）を含有している寒天プレート上に蒔いた。生じた細菌性のコロニーを選択し、ベクターDNAをそれから分離した。この様式で取得したベクターを、標準方法を用いて配列決定して、核酸配列を確認した。正確な配列を有しているベクターを含む細菌性のクローンを、更なる研究に使用した。第2工程において、ターゲティングモジュールを前記ベクターに導入した。この目的のために、ヒト末梢単核球(PBMCs)からのmRNAを、当業者に既知の標準方法を用いて単離し、逆転写酵素PCRを介して相補ＤＮＡ(cDNA)へと転写した。MHC  II分子のヒト  インバリアント鎖の核酸配列（これはMHC  IIのインバリアント鎖のアミノ酸1から110をコードする）を、この様式で取得したcDNAを用いること及び多様なPCRプライマーを用いることにより取得した（これらプライマーはBgl II認識配列をPCR産物の５’末端に導入し、Spe I、Bam HI、Pst I、およびHind III認識配列をPCR産物の３’末端に導入した）。MHC IIのインバリアント鎖の本配列領域を、第１工程に基づいて、既にpQE-30ベクターに導入したTat配列の３’末端の後ろに導入した。生じたベクターの配列を、シークエンシングにより確認した。
当業者に既知の部位特異的突然変異誘発の標準方法を使用して、シトシンをチミジン（ポジション292）で及びグアニンをアデニン（ポジション318）で置換した。２つの点突然変異は、対応するタンパク質のアミノ酸配列に変化を生じさせず、制限エンドヌクレアーゼの望まれない認識配列を単に除去する。第3工程において、最終的に、抗原モジュールを前記ベクターに導入した。多様な抗原の核酸配列を、pQE-30ベクター（このベクター中には特定の抗原のコード配列が既に導入されている）、およびPCRプライマー（これらはSpe Iおよび／またはBamH I認識配列をPCR産物の５’末端に、終止コドンおよびPst IまたはHind III認識配列をPCR産物の３’末端に導入する）を用いることにより取得した。とりわけ、抗原Der p 1(成熟Der p 1タンパク質のアミノ酸配列に基づく)のアミノ酸1〜222をコード化する核酸配列を、抗原モジュールとして取得した。抗原Der p 1の本配列領域を、最初の２工程に基づいて、既にpQE-30ベクターに導入したMHC IIのインバリアント鎖の配列の３’末端の後ろに導入した。生じたベクターの正確な配列を、シークエンシングにより確認した。引き続く試験において、前記発現ベクターを、製造者のプロトコールに基づいて、QIAfilterプラスミドmidiキット(Qiagen、Hilden、ドイツ)を用いて単離した。
【００９６】
実施例2：  
抗原Bet v 1、Asp f 1、Asp f 6、およびDer p 1のコード配列の取得  
抗原モジュールにおける種々の抗原のコード配列を、当業者に既知の種々の方法で単離した[43]。Bet v 1配列を、合成オリゴヌクレオチドを介して取得した。Asp f1およびAsp f6配列は、以前の研究で取得されており、これらの研究に使用されたベクターより単離した[45、46]、引き続いてpQE-30ベクターに導入した。Der p 1配列を、ハウスダストのダニ(Dermatophagoides pteronyssinus)から取得したｍＲＮＡを用いた、逆転写酵素PCRにより単離した。
【００９７】
実施例3：  
細菌におけるＭＡＴ分子の発現および単離  
ＭＡＴ分子の発現および単離を、製造者の情報に基づいて実施した(Qiagen、Hilden、ドイツ)。詳細には、特定の発現ベクター(pQE-30-ＭＡＴ分子)で形質転換した大腸菌M15細菌の予備培養物を、細菌振盪機（37°C、一晩）中で、20mlの培地(2×YT培地、100μg/mlアンピシリン、25μg/mlカナマイシン)にセットアップした。前記予備培養物を、2000mlの培地(2×YT培地、100μg/mlアンピシリン、25μg/mlカナマイシン)で37°C（細菌振盪機中で）で、光学濃度0.6（波長600 nmで）に達するまで培養した。IPTGを終濃度1mMで添加し、そして4から15hの新規の増殖期の後に、細菌を培養培地から遠心分離2000g、20分間により分離した。そして細菌ペレットを-20°Cで貯蔵した。細胞ライセートを、細菌ペレットを解凍すること、8M尿素溶液(5mlの尿素溶液／グラム湿重量の細菌ペレット)中で注意して1〜2h撹拌すること、および引き続いて48000gで30分間遠心分離することにより生産した。澄んだ上清を、ＭＡＴ分子の調製用のニッケルキレートクロマトグラフィーに使用した。ＭＡＴ分子を、49または18mlカラム(Bio-Rad Laboratories Inc.，Hercules、CA、USA)に5〜10mlのNi-NTA  Superflowマトリックス(Qiagen)をパックしたものと、Bio-Radのクロマトグラフィーシステム(Econo pumpおよびUVモニター)とを用いることにより単離した。クロマトグラフィーカラムを、最初に5カラム容量のバッファーA(100mM NaH2PO4、10mM Tris/HCl、6MグアニジンHCl、pHを8.0にHClで調整)で洗浄し、そして次に細菌のライセートを流速1.4ml/minでカラムにロードする。次に５〜１０カラム容量の各々バッファーＡおよびバッファーＢ（バッファーＢ：100mM NaH2PO4、10mM Tris/HCl、8M尿素、pH8.0)をポンプで前記カラムに流速1.4ml/minで注入し、そしてフロースルーの吸光度を波長280nm(A280)で観察する。フロースルーが、約0.01未満の安定なA280に達したら、前記カラムを5〜10カラム容量のバッファーC(100mM NaH2PO4、10mM Tris/HCl、8M尿素、pHを6.3にHClで調整)で最終的に約0.01未満の安定なA280に達するまで洗浄する。ＭＡＴ分子を、次にバッファーE(100mM NaH2PO4、10mM Tris/HCl、8M尿素、pHを4.5にHClで調整)で溶出し、そして採取する。
【００９８】
実施例4：  
ＭＡＴ分子のSDSポリアクリルアミドゲル、クーマシー染色、および抗-Hisウエスタンブロット法での検出  
SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動:  
緩衝剤、NuPAGE（登録商標）ゲル、およびXcell SureLockTM電気泳動法チャンバー(Invitrogen Life Technologies、Breda、オランダ)を、製造者の情報に基づいて電気泳動に使用した。5または10μgの分離されたＭＡＴ分子／レーンの電気泳動的な分離を、12% NuPAGE（登録商標）Novex bis-Trisゲル(Invitrogen)中で定電圧200Vで、1×濃縮のNuPAGE（登録商標）SDSサンプルバッファーを用いて、還元条件下で35〜50minのコースで実施した。使用されたランニングバッファー（running buffer）は、MESまたはMOPSバッファー(MESバッファー:50mM MES(morpholinoethanesulfonic acid)、50mM Tris/HCl、3.5mM SDS、1mM EDTA、pH7.3、MOPSバッファー:50mM MOPS(3-(N-morpholino)propanesulfonic acid)、50mM Tris/HCl、3.5mM SDS、1mM EDTA、pH7.7)であった。
【００９９】
クーマシーブルー染色:  
ゲルを染色溶液(200mlのメタノール、50mlの酢酸、250mlの水、0.5gのクーマシーブルーR-250)中で1hインキュベートすることにより染色し、そして次に脱染溶液(200mlのメタノール、50mlの酢酸、250mlの水)を複数回入れ替えることにより、ゲルのバックグランドが透明になるまで脱染色した。Xcell IITMブロットモジュール(Invitrogen)を製造者の情報に基づいて使用して、タンパク質をNuPAGE（登録商標）ゲルからブロッティング膜へと電気転写する。前記ブロッティング装置を、製造者の情報に基づいて、1×NuPAGE（登録商標）転写バッファー（10または20%メタノールと共に）を用いてセットアップする。PVDF膜をブロッティング膜に使用し、そして電気転写を定電圧30V、1hで行った。
【０１００】
ＭＡＴ分子の免疫学的な検出:  
ＭＡＴ分子の免疫学的な検出を、抗His抗体を用いて、製造者の指示に基づいて実施した(抗-RGS(His)4抗体、Qiagen、Hilden、ドイツ)。全ての実験の工程を、室温で実施した。PVDF膜を、最初に乾燥させ、そして次に直接的に（以前の自由なタンパク質結合部位のブロッキングなしに）、抗His抗体(Qiagen)を1:1000から1:2000にTBS(50mM Tris/HCl、150mM塩化ナトリウム、pH7.5)で希釈したものに3%BSA(ウシ血清アルブミン)を添加したもので、1hインキュベーションする。膜を次に、TBS、0.05% Tween20、0.2%トリトンX-100で各々10分間を3×洗浄し、そして引き続いてTBS（更なる添加物なし）で１回洗浄する。使用した二次抗体は、抗マウスIg-HRP抱合体(アマシャム、Buckinghamshire、イギリス)を1:10000から1:20000にTBS（10%ミルク粉末を添加）で希釈したものであり、1hインキュベーションする。最終的に、ブロットを、TBS、0.05% Tween20、0.2%トリトンX-100で各時間10分間で４×洗浄する。抱合体を、ECLTMシステム(アマシャム)を用いて、製造者の情報に基づいて検出する。化学発光シグナルはオートラジオグラフィーフィルムを用いて検出され、これは標準プロトコールに基づいて現像される。
【０１０１】
実施例5：  
細胞株および初代ヒト細胞へのＭＡＴ分子のトランスロケーション  
PBMCs(末梢血単核球)を、ボランティア被験者からの新鮮な、ヘパリン処理したヒト血液をFicoll-Paque(ファルマシア、Uppsala、スウェーデン)を用いた当業者に既知の密度勾配遠心分離により取得した。Jurkat株化細胞を、ATCC(American Type Culture Collection, Manassas, VA, USA)から取得した。前記細胞をRPMI-1640中で培養した（これは次の添加物を含有している：10%ウシ胎児血清、200units/mlペニシリン、200μg/mlストレプトマイシン、MEMビタミン、MEM非必須アミノ酸、1mMピルビン酸ナトリウム、2mM L-グルタミン、および0.001% 2-メルカプトエタノール）。トランスロケーションを決定するため、前記細胞を1×10Exp6/ml  RPMI培地（全ての添加物を有する）の濃度に再懸濁した。前記細胞を、図面の説明における各情報に基づいて、0.01から5mMの濃度の組換え型分子またはＭＡＴ分子で5分間、4、22、または37°Cでインキュベーションした。前記細胞を次に遠心分離した。そして細胞ペレットを40μlの溶解バッファー(8M尿素、100mMリン酸ナトリウム、10mM Tris/HCl、100mM塩化アンモニウム)中で室温で5分間インキュベーションした。不溶性の細胞成分を、遠心分離(15000g、15min)で除去した。そして澄んだライセートを、実施例4に基づいたウエスタンブロット法により更に調査した。抗His抗体を使用して、タンパク質を検出した。
【０１０２】
実施例6：  
患者からの末梢血単核球(PBMC)のアレルゲンでの刺激  
PBMCsを刺激するための及び刺激されたPBMCsの増殖を決定するための以下に記載された方法は、文献に記載されている[44]。PBMCsを、ボランティア被験者からの新鮮な、ヘパリン処理した血液をFicoll-Paque(ファルマシア、Uppsala、スウェーデン)を用いた密度勾配遠心分離によって単離した。ボランティア被験者は、個々の患者に関して既知の１つのアレルゲンに対して、アレルギーを有する患者であった。患者は、彼らの血液サンプルで実施される実験に関して、スイスの法律に基づいて説明を受けてから、彼らは本試験に参加することに同意した。PBMCsが取得された後に、それらはRPMI培地（実施例5による添加物を有する）に入れられた。各ケースにおいて、0.01〜100nMの組換え型抗原（これに対して特定の患者がアレルギー反応を示す）を添加した。各ケースにおいて、無修飾の抗原とトランスロケーションモジュールおよびターゲティングモジュールに連結した抗原(ＭＡＴ分子)とを調査した。ターゲティングモジュールなしで、トランスロケーションモジュールおよび抗原モジュールのみが連結されているような実験のアプローチも、いくつかの実験で実施した(図7A)。いくつかの実験で使用されたコントロールは、トランスロケーションモジュールのみ又はトランスロケーションモジュールおよびターゲティングモジュール（しかし、抗原モジュールなし）からなる構築物であった。5日間のインキュベーション時間の後に、10μCi/mlのトリチウム標識チミジンを前記培地に添加した。PBMCsのチミジン取り込みは、抗原提示の効率及びそれに関連する処理細胞の増殖の測定値として確認された。この目的のために、放射性の細胞培養培地を8〜10h後に除去し、細胞を洗浄し、そして取り込まれた放射性チミジンの量を放射能を測定することにより決定した。1205 Betaplate液体シンチレーションカウンタ（Wallac ADL AG、Hμnenberg、スイス）を、これに使用した。コントロールとして、抗原で刺激されない細胞を同様にトリチウム標識チミジンでインキュベーションし、そして次に同じ様式で分析した。取得された結果は、増殖の測定値としての（したがって抗原提示の効率の測定値としての）、放射性のチミジンの取り込みの測定値である。より高く測定されたチミジン取り込みは、より効率的な抗原提示を意味する。0.01nM〜100nMの抗原濃度が各実験において調査されたので、最大の抗原提示が生じる抗原濃度を付加的に決定することが可能である。より低い濃度は、次の事項を意味する。その事項とは、前記抗原が免疫応答のモジュレーターとしてより効率的であることである。更なるコントロールとして、細胞を各0.5μg/mlの抗-CD3および抗-CD28抗体で処理した、この処理は非常に強い増殖刺激を提示する。従って、各実験に関して、PBMCsの増殖による、最大許容チミジン取り込み（maximum possible thymidine incorporation）を決定することが可能であった。
【０１０３】
実施例7：  
ＭＡＴ分子刺激でのサイトカイン放出  
PBMCsを、アレルギーの人々の血液から単離し（実施例5に記載のとおり）、そして希釈した（10Exp6/ml  培地）。本細胞懸濁液の100μl部分を、96-ウェルプレートに播種し、0.01〜1000nMの単離された抗原で5日間処理する。細胞培養培地は、この時間中置換されなかった。96ウェルプレートの遠心分離後、上清を除去し、-20°Cで保存した（サイトカインを分析するまで）。PBMCsを、各ケースにおいて、PBMCsを単離した患者がアレルギー反応を呈する抗原で処理した。以下のサイトカインを、この様式で取得した上清において調査した：インターフェロンガンマ(INFg)、インターロイキン-10(IL-10)、およびインターロイキン-5(IL-5)。図8Aおよび8Bは、Bet v 1に対してアレルギー反応を示している患者からのPBMCsから得られた結果を示す。INFg、IL-10、およびIL-5免疫アッセイ(ELISAs=酵素結合免疫吸着アッセイ)を、当業者に既知の方法により、DuoSet（登録商標） ELISA Development Systems（R & D Systems Inc.，Minneapolis、USA）を用いて実施した。
【０１０４】
サイトカイン決定に関する上清の取得と並行して、刺激実験を同じドナーからのPBMCsで実施した（実施例6に基づく）。これらの細胞増殖アッセイの結果は、同様に図8Aおよび8Bに示される。
【０１０５】
実施例8：  
無修飾の抗原およびＭＡＴ分子の抗原モジュールに存在する抗原のインビボ効果  
マウスの免疫化  
ＭＡＴ分子の有効性を試験するために、CBA/2マウスを各回2週間のインターバルで、組換え型ＭＡＴ分子と共にアルミニウム水酸化物をアジュバントとして用いて、当業者に既知の様式で３回免疫した。組換え型ＭＡＴ分子を、実施例3に記載のとおり産生した。３つの異なる経路を免疫化に使用した。一連の実験を、各ケースにおいて、抗原の又はコントロールの皮下、腹腔内、および節内（intranodal）の注射で実施した。節内注射のケースにおいて、組織は、直接の注射が可能なように外科的に暴露された。使用されたＭＡＴ分子は、トランスロケーションモジュールとしてのHIV Tat配列、ターゲティングモジュールとしてのヒトインバリアント鎖、および抗原モジュールとしてのPLA2(ハチ毒からのホスホリパーゼA2)ペプチドからなるタンパク質であった(名称:trans-target-PLA2)。PLA2(名称:PLA2)をコントロールとして使用した。0.9%強度の塩類溶液（名称：コントロール）を更なるコントロールとして使用した。節内免疫化（intranodal immunization）を0.1μg、皮下および腹腔内免疫化を10μgのＭＡＴ分子、又は対応する量のコントロールタンパク質またはコントロール緩衝液、と共にアルミニウム水酸化物をアジュバントとして用いて処理した。3動物を各実験群において免疫化した（各ケースにおいて9動物が実験毎に使用されるように）。3シリーズの実験を実施した。そして異なる免疫化経路(皮下、腹腔内、節内)を各シリーズの実験において試験した。血液を、各実験動物の尾静脈から、初回免疫化の前に及び引き続く2、4、および6週後に採取した。血液を室温で凝固させ、そして次に血清を遠心分離後に採取し、そして-20°Cで分析時まで保存した。この様式で産生された血清を使用して、PLA2特異的なIgGおよびIgEの力価を決定した。
【０１０６】
マウス血清におけるPLA2特異的なIgG2a力価の決定  
PLA2-特異的なIgG2a力価の決定に関して、マイクロタイタープレート(96穴)を、100μl/穴の5μg/ml  PLA2(シグマ-アルドリッチ、Buchs DG、スイス)を炭酸緩衝液中に含む溶解液で4°Cで一晩コートした。リン酸緩衝された塩化ナトリウム溶液(PBS)、0.05% Tweenで2回洗浄した後、フリーのタンパク質結合部位をブロッキング緩衝剤(PBS、2.5%スキムミルク粉末)を200μl/穴で施し、室温で1〜2hインキュベーションすることによりブロックした。洗浄を2×繰り返した。そして次に試験される血清サンプルの、ブロッキング緩衝剤による連続的な1:2希釈系列(50μl/穴)(1:2から1:64希釈)を、室温3hまたは4°C一晩インキュベーションした。無処置の動物からの血清無し又は血清有りでのインキュベーションを、ネガティブコントロールとして実施した。この後に5×洗浄し、ビオチン標識抗マウスIgG2a(PharMingen GmbH、Hamburg、ドイツ)をブロッキング緩衝剤により1:500希釈したもので室温(100μl/穴)で2hインキュベーションし、そして再び5×洗浄した。最終的に、100μl/穴の西洋わさびペルオキシダーゼ（1:1000にブロッキング緩衝剤中で希釈）を、室温で1hインキュベーションし、そして次に6×洗浄した。呈色反応を、100μl/穴のABTS(2,2’-azinodi-(3-ethylbenzothiazolinesulfonic acid)を製造者の情報に基づいてABTS緩衝剤中に溶解した溶液に、0.1% (v/v)の30%強度の過酸化水素溶液を加えた溶液で実施した。約30分間後、波長405nm(参照フィルター:595nm)での吸収を測定した。これら試験の結果を図9に示す。
【０１０７】
マウス血清におけるPLA2特異的なIgE力価の決定  
PLA2  IgE  ELISAを、PLA2  IgG2a  ELISAに関するプロトコールに基づいて実施する。上記のプロトコールとの差異は：マイクロタイタープレートを5μg/mlの抗マウスIgE抗体でコートしたことである。血清サンプルをインキュベーションし、プレートを洗浄した後に、1:333希釈のビオチン標識PLA2(Pierce Biotechnology Inc.，Rockford、USA)をインキュベーションした。ABTSでの発色は、約1hかかる。これら試験の結果を図9に示す。
【０１０８】
本特許出願における全ての例および一覧（enumerations）は、原則的に主題（the subject matter）を説明することを意図しているが、特許請求の範囲を限定することを意図しない。特に、トランスロケーションモジュール、ターゲティングモジュール、抗原モジュール、スペーサーモジュール、およびタグモジュールの例は、例示のみであると理解され、ＭＡＴ分子の全ての可能な成分の完全なリスト（exhaustive list）ではない。本発明の基礎的なアイデアは、特定のトランスロケーションモジュール、特定のターゲティングモジュール、および特定の抗原モジュールの特定の組み合わせからなるものではない。本発明の基礎的なアイデアは、少なくともこれらの３つのモジュールの組み合わせを使用することにより、免疫化のためのＭＡＴ分子を提供することである。前記モジュールの各々個別の１つにおいて、特異的に使用される例は、本発明の概念に重要ではない（immaterial）。また、本発明の目的に関するそれぞれのモジュールに関して、現在既知ではないものを含む他の例を使用することも結果的に可能である。
【０１０９】
ある用語が本特許において明確に規定されない場合、または当該技術分野における当業者に知られていない場合、またはある用語を文脈上から明確に規定できない場合、以下の標準的な研究における個々の用語に対して説明された規定が各ケースに適用される。ある用語が以下に引用される研究の２以上において、異なる規定で説明される場合、各ケースにおいて適用される規定は、以下のリストにおいて説明される最初の研究（the first work）において説明されたものである。以下の文献は、この目的のために引用される:
【０１１０】
メルク  マニュアル[49]  
モレキュラークローニング（ラボラトリー  マニュアル）[43]  
カレント  プロトコール  イン  イムノロジー[44]  
カレント  プロトコール  イン  プロテインサイエンス[50]  
カレント  プロトコール  イン  ファーマコロジー[51]  
カレント  プロトコール  イン  セルバイオロジー[52]
【参照文献】
【０１１１】
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0004718183.tif 000003
0004718183.tif 000004
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【図面の簡単な説明】
【０１１２】
【図１】図１は、ＭＡＴ分子の理論的な構造を示す。図1は、例示により、いかにして本発明のＭＡＴ分子の個々のモジュールを構築し得るかについて図式的に示している。図において「Trans」はトランスロケーションモジュールを意味する、「Target」はターゲティングモジュールを意味する、「AG」は抗原モジュールを意味する、「Tag」はタグモジュールを意味する、ダッシュ(-)はリンカーモジュール（linker module）を意味する。リンカーモジュールは、他のモジュールと共有結合性および／または非共有結合性の結合により共に連結され得る。図1Aは、種々のモジュールの直線状の配置のいくつかの例を示す。図1Bは、分岐状ＭＡＴ分子の配置の種々の例を示す（デンドロマー性の構造も含まれる）。および図1Cは、環状のＭＡＴ分子の配置のいくつかの例を示す（環状の配置に、直鎖状および／または分枝状の配置を組み合わせることが可能である）。通常は、示される全ての配置は、広範囲の配置が可能であるとの事実を説明することを意図した単なる例示である。図式的に示されたＭＡＴ分子の例は、本発明の権利の範囲を限定するように理解されない。
【図２】図２は、融合タンパク質の発現、精製、および検出を示す。タグモジュール(His6タグ)、トランスロケーションモジュール(Tat配列)、ターゲティングモジュール(ヒトMHCIIのインバリアント鎖)、および抗原モジュール(Asp f1=Aspergillus fumigatus抗原1)からなる多様なＭＡＴ分子は、大腸菌中で発現され、変性条件下で固定化された金属イオン  アフィニティークロマトグラフィーを用いて分離された。前記工程は、発現システムの製造者(Qiagen、Hilden、ドイツ)からの情報に基づいて実施された[47、48]。分離されたタンパク質の10μgまたは5μgサンプルを、SDSポリアクリルアミドゲル中での電気泳動法で分画し、そして次にクーマシーブルー(図2A)で染色するか、またはタグモジュールを認識する抗体を用いたウエスタンブロットで分析した(図2B)。発現したタンパク質のポジションは、矢印により示される。
【図３】図３は、タンパク質およびＭＡＴ分子の温度非依存性のトランスロケーションを示す。初代ヒト末梢単核球(PBMCs)を、特定のタンパク質またはＭＡＴ分子と濃度1μMで4、22、または37°Cで5分間インキュベーションし、洗浄し、尿素を含有しているサンプル緩衝剤中に回収した。ライセートを、次にSDSポリアクリルアミドゲル中での電気泳動法で分画し、PVDF膜に電気転写した。そしてタンパク質またはＭＡＴ分子を特異的な抗体(抗RGS(His)4抗体)を用いて検出した。矢印は、タンパク質またはＭＡＴ分子のポジションを示している。融合タンパク質は、全ての温度での細胞のライセートで検出され、このことは細胞の内部へのトランスロケーションが成功したことを示している。
【図４】図４は、ＭＡＴ分子の細胞株および初代ヒト細胞へのトランスロケーションを示す。図4に示される結果は、図3における実験と実質的に同じ方法で実施されたが、２点において差がある、即ち：図4Aは、ＭＡＴ分子のトランスロケーションが、初代ヒト細胞(PBMCs)及びヒト腫瘍細胞株(Jurkat cells)の双方において成功したことを示している。矢印は、タンパク質またはＭＡＴ分子が検出された、ウエスタンブロット上のポジションを示している。図4Aおよび4Bは次の事項をも示す。その事項とは、多様な抗原モジュール〔Asp f 1=Aspergillus fumigatusアレルゲン、Der p 1=ハウスダストダニ  アレルゲン、Bet v 1=カバノキ（birch）花粉アレルゲン〕が、初代ヒトPBMC細胞にトランスロケーションにより進入できることである。
【図５】図５は、ＭＡＴ分子のトランスロケーションの用量動態（Dose kinetic）を示す。図5に示される結果は、図3における実験と実質的に同じ方法で取得された。しかし、このケースにおいては、３または４つの異なる濃度のタンパク質またはＭＡＴ分子が使用された(0.01mM、0.1mM、1mM、および5mM)。トランスロケーション反応に関して、明瞭な用量依存性を示すことが可能であった。より多量の特定の分子が、添加したＭＡＴ分子の濃度が増加するにしたがって細胞の内部で検出された。個々のタンパク質のポジションは、矢印により示される。
【図６】図6は、ＭＡＴ分子の種々の機能的な構造を示す。図6に示される結果は、図3における実験と実質的に同じ方法で取得された。しかし、このケースにおいては、トランスロケーションモジュール(Tat配列)および抗原モジュール(Asp f 1=Aspergillus fumigatusアレルゲン)の３つの異なる配置が調査された。図6Aにおける矢印は、ウエスタンブロットにおいて融合タンパク質が検出されるポジションを示している。図6Bは、３つの異なる融合タンパク質の構造を示す。Ｎ末端、逆位のＣ末端、およびＣ末端のトランスロケーションモジュールを有する融合タンパク質が調査された。全て３つの融合タンパク質は、トランスロケーションにより細胞の内部へと成功裏にトランスポートした。
【図７−１】図７は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsのインビトロ細胞増殖を示す。図7は、アレルギーの人々からのPBMCs(peripheral blood mononuclear cells)における調査を示す（これらはＭＡＴ分子とインビトロで共に置かれる）。ＭＡＴ分子は、抗原モジュールとして、アレルギー患者がアレルギー反応を示す、特定のアレルゲンを具備する。アレルギー人物の抗原提示細胞の抗原提示（これはＭＡＴ分子の添加の影響で、より効率的である）により、PBMCsの成長の刺激が誘導される。それにより生じる細胞増殖は、放射標識したDNAビルディングブロック(チミジン)の取込を介して、定量化された(Y軸)。X軸は、特定の細胞刺激検査に使用されたＭＡＴ分子濃度、または抗原分子濃度をnMで示している。ＭＡＴ分子の相対的に低い濃度で使用した際に、細胞増殖(=免疫賦活=チミジン取り込みにおける増加=放射能における増加)が、調査された全ての抗原モジュール(ＭＡＴ分子の部分として)で試験された、全ての患者において存在している。コントロールとして、各ケースにおいて、同じPBMCsを水のみ（ＭＡＴ分子または抗原を含有していない）で処理した(=レジェンドにおけるコントロール）。加えて、強い成長刺激(抗CD3および抗CD28抗体、各々0.5μg/ml）で5日間処理した細胞によるチミジンの取込は、各実験に対するポジティブコントロールとして測定された。この刺激によって得られた成長は、彼らの増殖する能力に関する、調製されたPBMCsの質の基準（a check）を示す。それにより得られた値は次のとおりであった、図7Aの実験において得られた値は77864±5347cpm、図7Bの実験において得られた値は100374±11678cpm、図7CおよびDの実験において得られた値は112205±5958cpmであった。図7Aから7Gは次の事項を示す。その事項とは、全て7つの試験した抗原で、抗原をＭＡＴ分子の抗原モジュールへと取込ませることにより、アレルギーの人間のPBMCsの増殖開始が誘導されることである（相対的に低い濃度においてさえも）。試験された抗原は、Der p 1(ハウスダストダニアレルゲン;図7A)、Bet v 2(カバノキ花粉アレルゲン、図7B)、Asp f 1(Aspergillus fumigatusアレルゲン1、図7C)、Asp f 6(Aspergillus fumigatusアレルゲン6、図7D)、Asp f 3(Aspergillus fumigatusアレルゲン3、図7E)、PLA2(ハチ毒からのホスホリパーゼＡ２アレルゲン、図7F)、およびFel d 1(Felis domesticus、図7G)であった。図7Hは、抗原Bet v 1に加えて、ＭＡＴ分子（Bet v 1を抗原モジュールにおいて有する）を使用することにより、Bet v 1に対してアレルギーを有する４個体の異なる患者(I.からIV.)の結果を示す。この図において、個々の患者のPBMCsの増殖が、４ケースの全てにおいて、抗原としてBet v 1を使用した際の濃度よりも低い濃度で発生したことが示されている。
【図７−２】図７は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsのインビトロ細胞増殖を示す。図7は、アレルギーの人々からのPBMCs(peripheral blood mononuclear cells)における調査を示す（これらはＭＡＴ分子とインビトロで共に置かれる）。ＭＡＴ分子は、抗原モジュールとして、アレルギー患者がアレルギー反応を示す、特定のアレルゲンを具備する。アレルギー人物の抗原提示細胞の抗原提示（これはＭＡＴ分子の添加の影響で、より効率的である）により、PBMCsの成長の刺激が誘導される。それにより生じる細胞増殖は、放射標識したDNAビルディングブロック(チミジン)の取込を介して、定量化された(Y軸)。X軸は、特定の細胞刺激検査に使用されたＭＡＴ分子濃度、または抗原分子濃度をnMで示している。ＭＡＴ分子の相対的に低い濃度で使用した際に、細胞増殖(=免疫賦活=チミジン取り込みにおける増加=放射能における増加)が、調査された全ての抗原モジュール(ＭＡＴ分子の部分として)で試験された、全ての患者において存在している。コントロールとして、各ケースにおいて、同じPBMCsを水のみ（ＭＡＴ分子または抗原を含有していない）で処理した(=レジェンドにおけるコントロール）。加えて、強い成長刺激(抗CD3および抗CD28抗体、各々0.5μg/ml）で5日間処理した細胞によるチミジンの取込は、各実験に対するポジティブコントロールとして測定された。この刺激によって得られた成長は、彼らの増殖する能力に関する、調製されたPBMCsの質の基準（a check）を示す。それにより得られた値は次のとおりであった、図7Aの実験において得られた値は77864±5347cpm、図7Bの実験において得られた値は100374±11678cpm、図7CおよびDの実験において得られた値は112205±5958cpmであった。図7Aから7Gは次の事項を示す。その事項とは、全て7つの試験した抗原で、抗原をＭＡＴ分子の抗原モジュールへと取込ませることにより、アレルギーの人間のPBMCsの増殖開始が誘導されることである（相対的に低い濃度においてさえも）。試験された抗原は、Der p 1(ハウスダストダニアレルゲン;図7A)、Bet v 2(カバノキ花粉アレルゲン、図7B)、Asp f 1(Aspergillus fumigatusアレルゲン1、図7C)、Asp f 6(Aspergillus fumigatusアレルゲン6、図7D)、Asp f 3(Aspergillus fumigatusアレルゲン3、図7E)、PLA2(ハチ毒からのホスホリパーゼＡ２アレルゲン、図7F)、およびFel d 1(Felis domesticus、図7G)であった。図7Hは、抗原Bet v 1に加えて、ＭＡＴ分子（Bet v 1を抗原モジュールにおいて有する）を使用することにより、Bet v 1に対してアレルギーを有する４個体の異なる患者(I.からIV.)の結果を示す。この図において、個々の患者のPBMCsの増殖が、４ケースの全てにおいて、抗原としてBet v 1を使用した際の濃度よりも低い濃度で発生したことが示されている。
【図７−３】図７は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsのインビトロ細胞増殖を示す。図7は、アレルギーの人々からのPBMCs(peripheral blood mononuclear cells)における調査を示す（これらはＭＡＴ分子とインビトロで共に置かれる）。ＭＡＴ分子は、抗原モジュールとして、アレルギー患者がアレルギー反応を示す、特定のアレルゲンを具備する。アレルギー人物の抗原提示細胞の抗原提示（これはＭＡＴ分子の添加の影響で、より効率的である）により、PBMCsの成長の刺激が誘導される。それにより生じる細胞増殖は、放射標識したDNAビルディングブロック(チミジン)の取込を介して、定量化された(Y軸)。X軸は、特定の細胞刺激検査に使用されたＭＡＴ分子濃度、または抗原分子濃度をnMで示している。ＭＡＴ分子の相対的に低い濃度で使用した際に、細胞増殖(=免疫賦活=チミジン取り込みにおける増加=放射能における増加)が、調査された全ての抗原モジュール(ＭＡＴ分子の部分として)で試験された、全ての患者において存在している。コントロールとして、各ケースにおいて、同じPBMCsを水のみ（ＭＡＴ分子または抗原を含有していない）で処理した(=レジェンドにおけるコントロール）。加えて、強い成長刺激(抗CD3および抗CD28抗体、各々0.5μg/ml）で5日間処理した細胞によるチミジンの取込は、各実験に対するポジティブコントロールとして測定された。この刺激によって得られた成長は、彼らの増殖する能力に関する、調製されたPBMCsの質の基準（a check）を示す。それにより得られた値は次のとおりであった、図7Aの実験において得られた値は77864±5347cpm、図7Bの実験において得られた値は100374±11678cpm、図7CおよびDの実験において得られた値は112205±5958cpmであった。図7Aから7Gは次の事項を示す。その事項とは、全て7つの試験した抗原で、抗原をＭＡＴ分子の抗原モジュールへと取込ませることにより、アレルギーの人間のPBMCsの増殖開始が誘導されることである（相対的に低い濃度においてさえも）。試験された抗原は、Der p 1(ハウスダストダニアレルゲン;図7A)、Bet v 2(カバノキ花粉アレルゲン、図7B)、Asp f 1(Aspergillus fumigatusアレルゲン1、図7C)、Asp f 6(Aspergillus fumigatusアレルゲン6、図7D)、Asp f 3(Aspergillus fumigatusアレルゲン3、図7E)、PLA2(ハチ毒からのホスホリパーゼＡ２アレルゲン、図7F)、およびFel d 1(Felis domesticus、図7G)であった。図7Hは、抗原Bet v 1に加えて、ＭＡＴ分子（Bet v 1を抗原モジュールにおいて有する）を使用することにより、Bet v 1に対してアレルギーを有する４個体の異なる患者(I.からIV.)の結果を示す。この図において、個々の患者のPBMCsの増殖が、４ケースの全てにおいて、抗原としてBet v 1を使用した際の濃度よりも低い濃度で発生したことが示されている。
【図７−４】図７は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsのインビトロ細胞増殖を示す。図7は、アレルギーの人々からのPBMCs(peripheral blood mononuclear cells)における調査を示す（これらはＭＡＴ分子とインビトロで共に置かれる）。ＭＡＴ分子は、抗原モジュールとして、アレルギー患者がアレルギー反応を示す、特定のアレルゲンを具備する。アレルギー人物の抗原提示細胞の抗原提示（これはＭＡＴ分子の添加の影響で、より効率的である）により、PBMCsの成長の刺激が誘導される。それにより生じる細胞増殖は、放射標識したDNAビルディングブロック(チミジン)の取込を介して、定量化された(Y軸)。X軸は、特定の細胞刺激検査に使用されたＭＡＴ分子濃度、または抗原分子濃度をnMで示している。ＭＡＴ分子の相対的に低い濃度で使用した際に、細胞増殖(=免疫賦活=チミジン取り込みにおける増加=放射能における増加)が、調査された全ての抗原モジュール(ＭＡＴ分子の部分として)で試験された、全ての患者において存在している。コントロールとして、各ケースにおいて、同じPBMCsを水のみ（ＭＡＴ分子または抗原を含有していない）で処理した(=レジェンドにおけるコントロール）。加えて、強い成長刺激(抗CD3および抗CD28抗体、各々0.5μg/ml）で5日間処理した細胞によるチミジンの取込は、各実験に対するポジティブコントロールとして測定された。この刺激によって得られた成長は、彼らの増殖する能力に関する、調製されたPBMCsの質の基準（a check）を示す。それにより得られた値は次のとおりであった、図7Aの実験において得られた値は77864±5347cpm、図7Bの実験において得られた値は100374±11678cpm、図7CおよびDの実験において得られた値は112205±5958cpmであった。図7Aから7Gは次の事項を示す。その事項とは、全て7つの試験した抗原で、抗原をＭＡＴ分子の抗原モジュールへと取込ませることにより、アレルギーの人間のPBMCsの増殖開始が誘導されることである（相対的に低い濃度においてさえも）。試験された抗原は、Der p 1(ハウスダストダニアレルゲン;図7A)、Bet v 2(カバノキ花粉アレルゲン、図7B)、Asp f 1(Aspergillus fumigatusアレルゲン1、図7C)、Asp f 6(Aspergillus fumigatusアレルゲン6、図7D)、Asp f 3(Aspergillus fumigatusアレルゲン3、図7E)、PLA2(ハチ毒からのホスホリパーゼＡ２アレルゲン、図7F)、およびFel d 1(Felis domesticus、図7G)であった。図7Hは、抗原Bet v 1に加えて、ＭＡＴ分子（Bet v 1を抗原モジュールにおいて有する）を使用することにより、Bet v 1に対してアレルギーを有する４個体の異なる患者(I.からIV.)の結果を示す。この図において、個々の患者のPBMCsの増殖が、４ケースの全てにおいて、抗原としてBet v 1を使用した際の濃度よりも低い濃度で発生したことが示されている。
【図７−５】図７は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsのインビトロ細胞増殖を示す。図7は、アレルギーの人々からのPBMCs(peripheral blood mononuclear cells)における調査を示す（これらはＭＡＴ分子とインビトロで共に置かれる）。ＭＡＴ分子は、抗原モジュールとして、アレルギー患者がアレルギー反応を示す、特定のアレルゲンを具備する。アレルギー人物の抗原提示細胞の抗原提示（これはＭＡＴ分子の添加の影響で、より効率的である）により、PBMCsの成長の刺激が誘導される。それにより生じる細胞増殖は、放射標識したDNAビルディングブロック(チミジン)の取込を介して、定量化された(Y軸)。X軸は、特定の細胞刺激検査に使用されたＭＡＴ分子濃度、または抗原分子濃度をnMで示している。ＭＡＴ分子の相対的に低い濃度で使用した際に、細胞増殖(=免疫賦活=チミジン取り込みにおける増加=放射能における増加)が、調査された全ての抗原モジュール(ＭＡＴ分子の部分として)で試験された、全ての患者において存在している。コントロールとして、各ケースにおいて、同じPBMCsを水のみ（ＭＡＴ分子または抗原を含有していない）で処理した(=レジェンドにおけるコントロール）。加えて、強い成長刺激(抗CD3および抗CD28抗体、各々0.5μg/ml）で5日間処理した細胞によるチミジンの取込は、各実験に対するポジティブコントロールとして測定された。この刺激によって得られた成長は、彼らの増殖する能力に関する、調製されたPBMCsの質の基準（a check）を示す。それにより得られた値は次のとおりであった、図7Aの実験において得られた値は77864±5347cpm、図7Bの実験において得られた値は100374±11678cpm、図7CおよびDの実験において得られた値は112205±5958cpmであった。図7Aから7Gは次の事項を示す。その事項とは、全て7つの試験した抗原で、抗原をＭＡＴ分子の抗原モジュールへと取込ませることにより、アレルギーの人間のPBMCsの増殖開始が誘導されることである（相対的に低い濃度においてさえも）。試験された抗原は、Der p 1(ハウスダストダニアレルゲン;図7A)、Bet v 2(カバノキ花粉アレルゲン、図7B)、Asp f 1(Aspergillus fumigatusアレルゲン1、図7C)、Asp f 6(Aspergillus fumigatusアレルゲン6、図7D)、Asp f 3(Aspergillus fumigatusアレルゲン3、図7E)、PLA2(ハチ毒からのホスホリパーゼＡ２アレルゲン、図7F)、およびFel d 1(Felis domesticus、図7G)であった。図7Hは、抗原Bet v 1に加えて、ＭＡＴ分子（Bet v 1を抗原モジュールにおいて有する）を使用することにより、Bet v 1に対してアレルギーを有する４個体の異なる患者(I.からIV.)の結果を示す。この図において、個々の患者のPBMCsの増殖が、４ケースの全てにおいて、抗原としてBet v 1を使用した際の濃度よりも低い濃度で発生したことが示されている。
【図８Ａ】図8は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsによるインビトロでのサイトカイン分泌を示す。図8Aおよび8BはBet v 1に対してアレルギー反応を示している2個体の独立した患者に関して次の事項を示している。その事項とは、インビトロで培養され、Bet v 1抗原(Bet v 1単独またはＭＡＴ分子のモジュールとして)で刺激されたPBMCsが、限定したサイトカイン分泌パターン（a defined cytokine secretion pattern）を示すことである。I.は各ケースにおいて細胞増殖試験（図７でのように）の結果を示す、II.はインターフェロンガンマ(INFg)レベルを示す、III.はインターロイキン-10(IL-10)値を示す、およびIV.はインターロイキン-5(IL-5)レベルを示す（細胞培養物の上清における）。脱感作効果を有するPBMC刺激で、PBMC増殖およびINFg放出における増加は、より低い抗原用量でさえも発生すべきである。加えて、IL-5産生はより低くなるべきである。このサイトカイン分泌パターンは、アレルギーの人々の免疫細胞の脱感作を示している(Th2免疫応答の代わりにTh1）。IL-10濃度の増加により、なぜ細胞増殖(図I.)が高い抗原用量で降下するかが説明される。このサイトカイン分泌パターンは、両方のケースで発生する(図8Aおよび図8B)。
【図８Ｂ】図8は、抗原/ＭＡＴ分子による、アレルギーの人々のPBMCsによるインビトロでのサイトカイン分泌を示す。図8Aおよび8BはBet v 1に対してアレルギー反応を示している2個体の独立した患者に関して次の事項を示している。その事項とは、インビトロで培養され、Bet v 1抗原(Bet v 1単独またはＭＡＴ分子のモジュールとして)で刺激されたPBMCsが、限定したサイトカイン分泌パターン（a defined cytokine secretion pattern）を示すことである。I.は各ケースにおいて細胞増殖試験（図７でのように）の結果を示す、II.はインターフェロンガンマ(INFg)レベルを示す、III.はインターロイキン-10(IL-10)値を示す、およびIV.はインターロイキン-5(IL-5)レベルを示す（細胞培養物の上清における）。脱感作効果を有するPBMC刺激で、PBMC増殖およびINFg放出における増加は、より低い抗原用量でさえも発生すべきである。加えて、IL-5産生はより低くなるべきである。このサイトカイン分泌パターンは、アレルギーの人々の免疫細胞の脱感作を示している(Th2免疫応答の代わりにTh1）。IL-10濃度の増加により、なぜ細胞増殖(図I.)が高い抗原用量で降下するかが説明される。このサイトカイン分泌パターンは、両方のケースで発生する(図8Aおよび図8B)。
【図９】図9は、抗原/ＭＡＴ分子による、マウスにおけるインビボ免疫応答を示す。CBA/2マウスを、単離されたPLA2で、抗原モジュールにPLA2を有しているＭＡＴ分子で、またはコントロール緩衝剤で、3回、2週間のインターバルで免疫し、次にPLA2特異的な血清力価のIgG2aおよびIgE抗体を測定した。脱感作が存在する場合、PLA2特異的なIgG抗体のみが出現すべきである（PLA2特異的なIgEではなく）。IgE抗体はアレルギー性の反応の原因である。3つの異なる免疫化経路が調査された（抗原の皮下、腹腔内、および節内の注射）。３つ全ての免疫化経路において次の事項が見いだされた。その事項とは、PLA2での免疫化が、別のIgE免疫応答(アレルギー)へと誘導されることである(図9、左手のカラム)。しかしながら、ＭＡＴ分子（PLA2を抗原モジュールとして具備する）での免疫化に際し、IgE免疫応答(アレルギーなし)は存在しない。対照的に、両方の免疫化（PLA2での及び抗原モジュールにおいてPLA2を具備するＭＡＴ分子での免疫化）により、所望のIgG免疫応答（アレルギー性の反応を誘導しない）が誘導される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７−１】
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【図７−２】
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【図７−３】
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【図７−４】
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【図７−５】
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【図８Ａ】
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【図８Ｂ】
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【図９】
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【配列表】
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