【手続補正書】
【提出日】平成24年11月1日(2012.11.1)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
核酸標的分子を含む複合体の製造方法であって、
基質表面に結合した少なくとも一つの標的固定化プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
連結分子、
とを反応混合物に混合することを含み、
このとき、前記連結分子が、
存在する核酸標的分子に特異的に結合する標的特異的結合部分であって、該連結分子が標的特異的結合部分を複数含むとき、その標的特異的結合部分のそれぞれが、存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する、一又は複数の標的特異的結合部分と、
複数の捕捉プローブの少なくとも一つに特異的に結合する一又は複数の捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記連結分子が単一の標的特異的結合部分を含むとき、その連結分子は複数の捕捉プローブ特異的結合部分を含み、そして、前記連結分子が単一の捕捉プローブ特異的結合部分を含むとき、その連結分子は複数の標的特異的結合部分を含んでおり、
このとき、前記の混合が、存在する前記核酸標的分子が前記標的固定化プローブに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
このとき、前記の混合が、前記連結分子が存在する核酸標的分子と複数の捕捉プローブの少なくとも一つとに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
場合によって、反応混合物に架橋剤を添加し、存在する特異的に結合した核酸分子間に共有結合を形成させ、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記標的固定化プローブが前記核酸標的分子に特異的に結合し、前記核酸標的分子が前記連結分子に特異的に結合し、かつ、前記連結分子が、検出可能な標識に結合した一又は複数の捕捉プローブに特異的に結合し、それによって基質表面、標的固定化プローブ、核酸標的分子、連結分子および検出可能な標識を含む複合体が形成される、方法。
【請求項２】
核酸標的分子を含む複合体の製造方法であって、
基質表面に結合した少なくとも一つの標的固定化プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
複数の連結分子
とを、反応混合物に混合させることを含み、
このとき前記複数の連結分子のそれぞれのメンバーが一又は複数のコピーで各々存在し、それぞれのメンバーが、
存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する標的特異的結合部分と、
複数の捕捉プローブのうちの一つの捕捉プローブに特異的に結合する捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記の混合が、存在する前記核酸標的分子が前記標的固定化プローブに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
このとき前記の混合が、複数の連結分子が、存在する核酸標的分子と、検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブとに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
場合によって、反応混合物に架橋剤を添加し、存在する特異的に結合した核酸分子間に共有結合を形成させることを含み、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記標的固定化プローブが前記核酸標的分子に特異的に結合し、かつ、前記の複数の連結分子が、核酸標的分子の複数の異なる領域と、検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブとに特異的に結合し、それによって基質表面、標的固定化プローブ、核酸標的分子、複数の連結分子および検出可能な標識を含む複合体が形成される、方法。
【請求項３】
基質表面に結合した少なくとも一つの標的固定化プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
連結分子
とを含む反応混合物であって、
このとき、前記連結分子が、
存在する核酸標的分子に特異的に結合する一又は複数の標的特異的結合部分であって、前記連結分子が複数の標的特異的結合部分を含むとき、この標的特異的結合部分のそれぞれが、存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する、一又は複数の標的特異的結合部分と、
複数の捕捉プローブの少なくとも一つに特異的に結合する一又は複数の捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記連結分子が単一の標的特異的結合部分を含むとき、この連結分子が複数の捕捉プローブ特異的結合部分を含み、そして、前記連結分子が単一の捕捉プローブ特異的結合部分を含むとき、この連結分子が複数の標的特異的結合部分を含んでおり、そして、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記標的固定化プローブが前記核酸標的分子に特異的に結合し、前記核酸標的分子が前記連結分子に特異的に結合し、かつ、前記連結分子が、検出可能な標識に結合した一又は複数の捕捉プローブに特異的に結合し、それによって基質表面、標的固定化プローブ、核酸標的分子、連結分子および検出可能な標識を含む複合体が形成される、反応混合物。
【請求項４】
前記検出可能な標識が磁性粒子である、請求項３に記載の反応混合物。
【請求項５】
前記連結分子が、
複数の前記標的特異的結合部分と、
１つの前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項３に記載の反応混合物。
【請求項６】
前記連結分子が、
１つの前記標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項３に記載の反応混合物。
【請求項７】
前記連結分子が、
複数の前記標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項３に記載の反応混合物。
【請求項８】
基質表面に結合した少なくとも一つの標的固定化プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
複数の連結分子
とを含む反応混合物であって、
このとき、前記の複数の連結分子のそれぞれのメンバーが一又は複数のコピーで各々存在し、このそれぞれのメンバーが、
存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブのうちの一つの捕捉プローブに特異的に結合する捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記標的固定化プローブが前記核酸標的分子に特異的に結合し、かつ、前記複数の連結分子が、この核酸標的分子の複数の異なる領域と、検出可能な標識に結合した複数の捕捉プローブとに特異的に結合し、それによって基質表面、標的固定化プローブ、核酸標的分子、複数の連結分子および検出可能な標識を含む複合体が形成される、反応混合物。
【請求項９】
前記検出可能な標識が磁性粒子である、請求項８に記載の反応混合物。
【請求項１０】
核酸標的分子を含む複合体の製造方法であって、
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
第一の連結分子と、
第二の連結分子と、
とを反応混合物に混合することを含み、
このとき、前記第一の連結分子が、
存在する核酸標的分子に特異的に結合する標的特異的結合部分であって、第一の連結分子が標的特異的結合部分を複数含むとき、その標的特異的結合部分のそれぞれが、存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する、一又は複数の標的特異的結合部分と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブの少なくとも一つに特異的に結合する一又は複数の捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記第一の連結分子が単一の標的特異的結合部分を含むとき、その第一の連結分子は複数の捕捉プローブ特異的結合部分を含み、そして、前記第一の連結分子が単一の捕捉プローブ特異的結合部分を含むとき、その第一の連結分子は複数の標的特異的結合部分を含んでおり、
このとき、前記第二の連結分子が、
存在する核酸標的分子に特異的に結合する標的特異的結合部分であって、第二の連結分子が標的特異的結合部分を複数含むとき、その標的特異的結合部分のそれぞれが、存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する、一又は複数の標的特異的結合部分と、
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブの少なくとも一つに特異的に結合する一又は複数の捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記第二の連結分子が単一の標的特異的結合部分を含むとき、その第二の連結分子は複数の捕捉プローブ特異的結合部分を含み、そして、前記第二の連結分子が単一の捕捉プローブ特異的結合部分を含むとき、その第二の連結分子は複数の標的特異的結合部分を含んでおり、
このとき、前記の混合が、第一の連結分子が存在する前記核酸標的分子と前記検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブの少なくとも一つとに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
このとき、前記の混合が、第二の連結分子が存在する前記核酸標的分子と基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブの少なくとも一つとに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
場合によって、反応混合物に架橋剤を添加し、存在する特異的に結合した核酸分子間に共有結合を形成させ、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記第一の連結分子が前記核酸標的分子と検出可能な標識に結合した一又は複数の第二の捕捉プローブとに特異的に結合し、前記第二の連結分子が前記核酸標的分子と基質表面に結合した一又は複数の第一の捕捉プローブとに特異的に結合し、それによって検出可能な標識、第一の連結分子、核酸標的分子、第二の連結分子および基質表面を含む複合体が形成される、方法。
【請求項１１】
核酸標的分子を含む複合体の製造方法であって、
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
第一の複数の連結分子と、
第二の複数の連結分子と、
とを反応混合物に混合することを含み、
このとき、前記第一の複数の連結分子のそれぞれのメンバーが一又は複数のコピーで各々存在し、それぞれのメンバーが、
存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する標的特異的結合部分と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブのうちの一つの捕捉プローブに特異的に結合する捕捉プローブ特異的結合部分と
を含んでおり、
このとき、前記第二の複数の連結分子のそれぞれのメンバーが一又は複数のコピーで各々存在し、それぞれのメンバーが、
存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する標的特異的結合部分と、
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブのうちの一つの捕捉プローブに特異的に結合する捕捉プローブ特異的結合部分と
を含んでおり、
このとき、前記の混合が、第一の複数の連結分子が存在する前記核酸標的分子と前記検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブとに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
このとき、前記の混合が、第二の複数の連結分子が存在する前記核酸標的分子と基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブとに特異的に結合するために十分な反応条件下にあり、
場合によって、反応混合物に架橋剤を添加し、存在する特異的に結合した核酸分子間に共有結合を形成させ、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記第一の複数の連結分子が前記核酸標的分子の複数の異なる領域と検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブとに特異的に結合し、前記第二の複数の連結分子が前記核酸標的分子の複数の異なる領域と基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブとに特異的に結合し、それによって検出可能な標識、第一の複数の連結分子、核酸標的分子、第二の複数の連結分子および基質表面を含む複合体が形成される、方法。
【請求項１２】
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
第一の連結分子と、
第二の連結分子と、
とを含み、
このとき、前記第一の連結分子が、
存在する核酸標的分子に特異的に結合する標的特異的結合部分であって、第一の連結分子が標的特異的結合部分を複数含むとき、その標的特異的結合部分のそれぞれが、存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する、一又は複数の標的特異的結合部分と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブの少なくとも一つに特異的に結合する一又は複数の捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記第一の連結分子が単一の標的特異的結合部分を含むとき、その第一の連結分子は複数の捕捉プローブ特異的結合部分を含み、そして、前記第一の連結分子が単一の捕捉プローブ特異的結合部分を含むとき、その第一の連結分子は複数の標的特異的結合部分を含んでおり、
このとき、前記第二の連結分子が、
存在する核酸標的分子に特異的に結合する標的特異的結合部分であって、第二の連結分子が標的特異的結合部分を複数含むとき、その標的特異的結合部分のそれぞれが、存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する、一又は複数の標的特異的結合部分と、
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブの少なくとも一つに特異的に結合する一又は複数の捕捉プローブ特異的結合部分
とを含むものであり、
このとき、前記第二の連結分子が単一の標的特異的結合部分を含むとき、その第二の連結分子は複数の捕捉プローブ特異的結合部分を含み、そして、前記第二の連結分子が単一の捕捉プローブ特異的結合部分を含むとき、その第二の連結分子は複数の標的特異的結合部分を含んでおり、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記第一の連結分子が前記核酸標的分子と検出可能な標識に結合した一又は複数の第二の捕捉プローブとに特異的に結合し、前記第二の連結分子が前記核酸標的分子と基質表面に結合した一又は複数の第一の捕捉プローブとに特異的に結合し、それによって検出可能な標識、第一の連結分子、核酸標的分子、第二の連結分子および基質表面を含む複合体が形成される、反応混合物。
【請求項１３】
前記第一の連結分子が、
複数の前記標的特異的結合部分と、
１つの前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項１４】
前記第一の連結分子が、
１つの前記標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項１５】
前記第一の連結分子が、
複数の前記標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項１６】
前記検出可能な標識が磁性粒子である、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項１７】
前記第二の連結分子が、
複数の前記標的特異的結合部分と、
１つの前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項１８】
前記第二の連結分子が、
１つの前記標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項１９】
前記第二の連結分子が、
複数の前記標的特異的結合部分と、
複数の前記捕捉プローブ特異的結合部分
とを含む、請求項１２に記載の反応混合物。
【請求項２０】
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブを含む基質表面と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブを含む検出可能な標識と、
核酸標的分子を含有すると思われる試料と、
第一の複数の連結分子と、
第二の複数の連結分子と、
と含み、
このとき、前記第一の複数の連結分子のそれぞれのメンバーが一又は複数のコピーで各々存在し、それぞれのメンバーが、
存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する標的特異的結合部分と、
検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブのうちの一つの捕捉プローブに特異的に結合する捕捉プローブ特異的結合部分と
を含んでおり、
このとき、前記第二の複数の連結分子のそれぞれのメンバーが一又は複数のコピーで各々存在し、それぞれのメンバーが、
存在する核酸標的分子の異なる領域に特異的に結合する標的特異的結合部分と、
基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブのうちの一つの捕捉プローブに特異的に結合する捕捉プローブ特異的結合部分と
を含んでおり、
このとき、核酸標的分子が前記試料中に存在するとき、前記第一の複数の連結分子が前記核酸標的分子の複数の異なる領域と検出可能な標識に結合した複数の第二の捕捉プローブとに特異的に結合し、前記第二の複数の連結分子が前記核酸標的分子の複数の異なる領域と基質表面に結合した複数の第一の捕捉プローブとに特異的に結合し、それによって検出可能な標識、第一の複数の連結分子、核酸標的分子、第二の複数の連結分子および基質表面を含む複合体が形成される、反応混合物。
【請求項２１】
前記検出可能な標識が磁性粒子である、請求項２０に記載の反応混合物。