【手続補正書】
【提出日】平成24年9月6日(2012.9.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
免疫複合体の存在を被験体における基底乳癌腫のための指標とする方法であって、
該被験体から得たサンプルをＣＳＰＧ４に特異的に結合する抗体と、該免疫複合体の形成に十分な期間接触させる工程、
を含む、方法。
【請求項２】
前記サンプルが生検サンプル、血液サンプル、血清サンプル、または尿サンプルである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記サンプルが非乳房由来の生検サンプルである、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記サンプルが乳房生検である、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記サンプルをＣＳＰＧ４に特異的に結合する抗体のパネルと接触させる工程を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記抗体がモノクローナル抗体２２５．２８、その機能的フラグメント、そのキメラ形態、またはそのヒト化形態である、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記抗体が標識されている、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記基底乳癌がエストロゲン受容体、プロゲステロン受容体、Ｈｅｒ２のいずれも発現しない、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記被験体が乳癌と診断された被験体である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
基底乳癌細胞の成長を阻害するための組成物であって、ＣＳＰＧ４に特異的に結合する有効量の抗体を含む、組成物。
【請求項１１】
前記抗体がエフェクター分子に共有結合する、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１２】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項１０に記載の組成物。
【請求項１３】
前記モノクローナル抗体が、２２５．２８、その機能的フラグメント、そのキメラ形態、またはそのヒト化形態である、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１４】
前記エフェクター分子が化学療法薬である、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１５】
前記エフェクター分子が有毒部分を含む、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１６】
前記有毒部分が、リシンＡ、アブリン、ジフテリア毒素またはそのサブユニット、シュードモナス外毒素またはその一部、およびボツリヌス毒素Ａ〜Ｆからなる群から選択される、請求項１５に記載の組成物。
【請求項１７】
前記シュードモナス外毒素がＰＥ３５、ＰＥ３７、ＰＥ３８、およびＰＥ４０からなる群から選択される、請求項１６に記載の組成物。
【請求項１８】
前記基底乳癌細胞がｉｎ  ｖｉｖｏにおけるものである、請求項１２に記載の組成物。
【請求項１９】
前記基底乳癌細胞がトリプルネガティブ乳癌細胞である、請求項１２に記載の組成物。
【請求項２０】
前記基底乳癌細胞の成長の阻害が、前記基底乳癌細胞の転移をｉｎ  ｖｉｖｏで減少させる、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２１】
被験体において基底乳癌腫に対する免疫応答をもたらすための組成物であって、治療有効量のＣＳＰＧ４ポリペプチドを含む、組成物。
【請求項２２】
前記免疫応答がＢ細胞応答である、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２３】
前記免疫応答がＴ細胞応答である、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２４】
前記免疫応答によって前記被験体における前記基底乳癌の徴候または症状が軽減される、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２５】
前記免疫応答によって転移数が減少される、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２６】
アジュバントをさらに含む、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２７】
前記基底乳癌腫がトリプルネガティブ乳癌癌腫である、請求項２０に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００６】
概要
コンドロイチン（ｃｏｎｄｒｏｉｔｉｎ）硫酸プロテオグリカン４（ＣＳＰＧ４）（高分子量黒色腫関連抗原としても公知）がトリプルネガティブ乳癌細胞（ＴＮＢＣ）としても公知の型の基底乳癌腫細胞（ＢＢＣ）上で過剰発現することを本明細書中に開示する。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
被験体における基底乳癌腫の検出方法であって、
該被験体から得たサンプルをＣＳＰＧ４に特異的に結合する抗体と、免疫複合体の形成に十分な期間接触させる工程、
該免疫複合体の存在を検出する工程であって、免疫複合体の存在が該被験体における基底乳癌腫の存在を証明する、工程
を含む、方法。
（項目２）
前記サンプルが生検サンプル、血液サンプル、血清サンプル、または尿サンプルである、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記サンプルが非乳房由来の生検サンプルである、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記サンプルが乳房生検である、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記サンプルをＣＳＰＧ４に特異的に結合する抗体のパネルと接触させる工程を含む、項目１に記載の方法。
（項目６）
前記抗体がモノクローナル抗体２２５．２８、その機能的フラグメント、そのキメラ形態、またはそのヒト化形態である、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記抗体が標識されている、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記基底乳癌がエストロゲン受容体、プロゲステロン受容体、Ｈｅｒ２のいずれも発現しない、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記被験体が乳癌と診断されている、項目１に記載の方法。
（項目１０）
基底乳癌細胞の成長を阻害する方法であって、
該基底乳癌細胞を有効量の抗体と接触させ、それにより、該癌細胞の成長を阻害する工程であって、該抗体は、ＣＳＰＧ４に特異的に結合する、工程
を含む、方法。
（項目１１）
前記抗体がエフェクター分子に共有結合する、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
前記抗体がモノクローナル抗体である、項目１０に記載の方法。
（項目１３）
前記モノクローナル抗体が、２２５．２８、その機能的フラグメント、そのキメラ形態、またはそのヒト化形態である、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記エフェクター分子が化学療法薬である、項目１１に記載の方法。
（項目１５）
前記エフェクター分子が有毒部分を含む、項目１１に記載の方法。
（項目１６）
前記有毒部分が、リシンＡ、アブリン、ジフテリア毒素またはそのサブユニット、シュードモナス外毒素またはその一部、およびボツリヌス毒素Ａ〜Ｆからなる群から選択される、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記シュードモナス外毒素がＰＥ３５、ＰＥ３７、ＰＥ３８、およびＰＥ４０からなる群から選択される、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記基底乳癌細胞がｉｎ  ｖｉｖｏにおけるものである、項目１２に記載の方法。
（項目１９）
前記基底乳癌細胞がトリプルネガティブ乳癌細胞である、項目１２に記載の方法。
（項目２０）
前記基底乳癌細胞の成長を阻害する工程が、前記基底乳癌細胞の転移をｉｎ  ｖｉｖｏで減少させる工程を含む、項目１８に記載の方法。
（項目２１）
被験体において基底乳癌腫に対する免疫応答をもたらす方法であって、
基底乳癌腫を有する被験体を選択する工程、および
該被験体に治療有効量のＣＳＰＧ４ポリペプチドを投与し、それにより、該被験体において該基底乳癌腫に対する免疫応答をもたらす、工程
を含む、方法。
（項目２２）
前記免疫応答がＢ細胞応答である、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記免疫応答がＴ細胞応答である、項目２１に記載の方法。
（項目２４）
前記免疫応答によって前記被験体における前記基底乳癌の徴候または症状が軽減される、項目２１に記載の方法。
（項目２５）
前記免疫応答によって転移数が減少される、項目２１に記載の方法。
（項目２６）
アジュバントを投与する工程をさらに含む、項目２１に記載の方法。
（項目２７）
前記基底乳癌腫がトリプルネガティブ乳癌癌腫である、項目２０に記載の方法。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
ヒト乳癌の基底管腔サブタイプは、細胞分画のみが基底サイトケラチン５に対して陽性である（＜７０％）という点で古典的な基底型腫瘍と区別される。さらに、３５％の基底管腔乳癌がＨＥＲ２の増幅または過剰発現を示す（Ｌａａｋｓｏ  ｅｔ  ａｌ，２００６，Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１２：４１８５−４１９１）。一例を挙げれば、基底管腔サブタイプ腫瘍を、ＥＲ−／ＰＲ−／ＨＥＲ２＋／ＣＫ５＋／ＥＧＦＲ＋と特徴づけることができる。
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００９８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００９８】
有用な抗体の例には、マウスモノクローナル抗体２２５．２８；７６３．７４；ＶＦ１−ＴＰ４１．２；ＶＴ８０．１１２；６５３．２５；７６３．７４；ＴＰ６１．５およびＴ８−２０３が含まれる（ＰＣＴ公開番号８９／１１２９６号；Ｄｒａｋｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．ＤＯＩ  １０：１００７，ｓ００２６２−００８−０５６７−５，２００８；Ｇｏｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１４：３４０１−３４０７，２００８（全てが本明細書中で参考として援用される）を参照のこと）。モノクローナル抗体２２５．２８および７６３．７４は、以前に他者によってＡｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）に寄託されていた。ＣＳＰＧ４に特異的に結合するいくつかのハイブリドーマ分泌抗体は、他者によってブダペスト条約に従って以前に寄託されていた）。１つの具体例では、抗体はモノクローナル抗体（ｍＡｂ）２２５．２８であるか、ｍＡｂ２２５．２８によって結合したエピトープに特異的に結合するキメラ抗体、ヒト化抗体、または完全なヒト抗体である。さらなる実施形態では、抗体は、ｍＡｂ２２５．２８によって結合したエピトープに特異的に結合するモノクローナル抗体（ｍＡｂ）２２５．２８の機能的フラグメント、キメラ抗体、ヒト化抗体、または完全なヒト抗体である。別の具体例では、抗体はｍＡｂ７６３．７４であるか、ｍＡｂ７６３．７４よって結合したエピトープに特異的に結合するキメラ抗体、ヒト化抗体、または完全なヒト抗体である。同様に、抗体は、ｍＡｂ７６３．７４によって結合したエピトープに特異的に結合するｍＡｂ７６３．７４の機能的フラグメント、またはキメラ抗体、ヒト化抗体、または完全なヒト抗体の機能的フラグメントであり得る。いくつかの実施形態では、抗体は、ＣＳＰＧ４に特異的に結合する任意の完全なヒト抗体である。
【手続補正５】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１３０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１３０】
一例を挙げれば、ＥＭをコードするｃＤＮＡを含むベクターへの可変領域をコードするｃＤＮＡの挿入によって有用な免疫毒素を調製する。１つの連続するポリペプチドが産生されるように可変領域およびＥＭがインフレームで読み取られるように挿入する。ポリペプチドは、機能的Ｆｖ領域および機能的ＥＭ領域を含む。１つの実施形態では、細胞毒素がｓｃＦｖのカルボキシル末端に存在するように細胞毒素をコードするｃＤＮＡをｓｃＦｖにライゲーションする。一例を挙げれば、毒素がｓｃＦｖのアミノ末端に存在するように非特異的結合を排除または軽減されるように変異されたシュードモナス外毒素（「ＰＥ」）をコードするｃＤＮＡをｓｃＦｖにライゲーションする。別の例では、ＰＥ３８をｓｃＦｖのアミノ末端（ｓｃＦｖ−ＦｃＣ２１など）に配置する。さらなる例では、毒素が重鎖可変領域のカルボキシル末端に存在するように、細胞毒素をコードするｃＤＮＡを目的の抗原に結合する抗体の重鎖可変領域にライゲーションする。次いで、重鎖可変領域を、ジスルフィド結合を使用して抗体の軽鎖可変領域にライゲーションすることができる。さらに別の例では、細胞毒素が軽鎖可変領域のカルボキシル末端に存在するように、細胞毒素をコードするｃＤＮＡを抗原（例えば、ＣＳＰＧ４）に結合する抗体の軽鎖可変領域にライゲーションする。次いで、軽鎖可変領域を、ジスルフィド結合を使用して抗体の重鎖可変領域にライゲーションすることができる。