【手続補正書】
【提出日】平成23年11月24日(2011.11.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下：
（ａ）配列番号１、配列番号３のヌクレオチド位置４６〜ヌクレオチド位置６３３、配列番号３、配列番号５、又は配列番号７と少なくとも９０%の配列同一性を含む核酸分子；
（ｂ）配列番号２、配列番号４のアミノ酸位置１６〜アミノ酸位置２１０、又は配列番号４と少なくとも９０%の配列同一性を含むアミノ酸配列をコードする核酸分子
からなる群より選択される突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を少なくとも１つそのゲノム中に含む、ブラシカ植物、又はその細胞、部分、種子、もしくは後代。 
【請求項２】
突然変異ＩＮＤ対立遺伝子が、ｉｎｄ−ａ１−ＥＭＳ０１、ｉｎｄ−ａ１−ＥＭＳ０５、ｉｎｄ−ｃ１−ＥＭＳ０１、及びｉｎｄ−ｃ１−ＥＭＳ０３からなる群より選択される、請求項１記載の植物。
【請求項３】
２つの突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を含むことを特徴とする、請求項１又は２記載の植物。
【請求項４】
３つの突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を含むことを特徴とする、請求項１又は２記載の植物。
【請求項５】
植物の種子脱粒が、突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を含まない対応する植物の種子脱粒と比較して有意に低下又は遅延した、請求項４記載の植物。
【請求項６】
農学的に関連する鞘の脱穀性を維持した、請求項５記載の植物。
【請求項７】
植物の種子収率を、突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を含まない対応する植物の種子収率と比較し、増加させる、好ましくは有意に増加させる、請求項３〜６のいずれか一項記載の植物。
【請求項８】
種子鞘の種子が、請求項１又は２に記載する突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を少なくとも１つ含む、請求項１〜７のいずれか一項記載の植物から入手可能な種子鞘。
【請求項９】
機能的ＩＮＤタンパク質をコードする遺伝子の突然変異対立遺伝子であって、機能的ＩＮＤ遺伝子が、以下：
（ａ）配列番号１、配列番号３のヌクレオチド位置４６〜ヌクレオチド位置６３３、配列番号３、配列番号５、又は配列番号７と少なくとも９０%の配列同一性を含む核酸分子；
（ｂ）配列番号２、配列番号４のアミノ酸位置１６〜アミノ酸位置２１０、又は配列番号４と少なくとも９０%の配列同一性を含むアミノ酸配列をコードする核酸分子
からなる群より選択される核酸分子を含み、ここで前記突然変異ＩＮＤ対立遺伝子が、機能的ＩＮＤ遺伝子における対応する野生型ＤＮＡ領域と比較して１つ又は複数の欠失、挿入、又は置換されたヌクレオチドからなる突然変異ＤＮＡ領域を含み、そしてここで前記突然変異ＩＮＤ対立遺伝子が、機能的ＩＮＤタンパク質をコードしていない、
機能的ＩＮＤタンパク質をコードする遺伝子の突然変異対立遺伝子。
【請求項１０】
ｉｎｄ−ａ１−ＥＭＳ０１、ｉｎｄ−ａ１−ＥＭＳ０５、ｉｎｄ−ｃ１−ＥＭＳ０１、及びｉｎｄ−ｃ１−ＥＭＳ０３からなる群より選択される、請求項９記載の突然変異対立遺伝子。
【請求項１１】
請求項９又は１０記載の突然変異対立遺伝子によりコードされる突然変異ＩＮＤタンパク質。
【請求項１２】
プライマー又はプローブのセットを含む、生物学的サンプルにおいて請求項９又は１０記載の突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を同定するためのキットであって、セットが以下：
−  プライマー又はプローブの１つが突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の突然変異ＤＮＡ領域の５’隣接ＤＮＡ領域を特異的に認識し、プライマー又はプローブの他が突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の突然変異ＤＮＡ領域の３’隣接ＤＮＡ領域を特異的に認識するプライマー又はプローブのセット、
−  プライマー又はプローブの１つが突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の突然変異ＤＮＡ領域の５’又は３’隣接ＤＮＡ領域を特異的に認識し、プライマー又はプローブの他が突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の突然変異ＤＮＡ領域を特異的に認識するプライマー又はプローブのセット、
−  それぞれに、プライマー又はプローブの１つが突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の突然変異ＤＮＡ領域の５’又は３’隣接ＤＮＡ領域を特異的に認識し、プライマー又はプローブの他が突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の３’又は５’隣接領域と突然変異ＤＮＡ領域との間の連結領域を特異的に認識するプライマー又はプローブのセット、
−  突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の５’又は３’隣接ＤＮＡ領域と突然変異ＤＮＡ領域との間の連結領域を特異的に認識するプローブ、
からなる群より選択される、
キット。
【請求項１３】
請求項１２記載のキットであって、
−  ５’又は３’隣接領域が、配列番号５のヌクレオチド１〜９２３又は９２５〜１６２２又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む；突然変異領域が配列番号５のヌクレオチド９２４又はその相補体のヌクレオチド配列を有する；及び連結領域が配列番号５のヌクレオチド１〜９２４又は９２４〜１６２２又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む、又は
−  ５’又は３’隣接領域が、配列番号５のヌクレオチド１〜８６６又は８６８〜１６２２又はその相補体の、あるいは、配列番号５のヌクレオチド１〜９３９又は９４１〜１６２２又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む；突然変異領域が配列番号５のヌクレオチド８６７又はその相補体、あるいは配列番号５のヌクレオチド９４０又はその相補体のヌクレオチド配列を有する；及び連結領域が配列番号５のヌクレオチド１〜８６７又は８６７〜１６２２又はその相補体の、あるいは、配列番号５のヌクレオチド１〜９４０又は９４０〜１６２２又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む、又は
−  ５’又は３’隣接領域が、配列番号７のヌクレオチド１〜６４３又は６４５〜１５９３又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む；突然変異領域が配列番号７のヌクレオチド６４４又はその相補体のヌクレオチド配列を有する；及び連結領域が配列番号７のヌクレオチド１〜６４４又は６４４〜１５９３又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む、又は
−  ５’又は３’隣接領域が、配列番号７のヌクレオチド１〜８９８又は９００〜１５９３又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む；突然変異領域が配列番号７のヌクレオチド８９９又はその相補体のヌクレオチド配列を有する；及び連結領域が配列番号７のヌクレオチド１〜８９９又は８９９〜１５９３又はその相補体のヌクレオチド配列をそれぞれ含む、
キット。
【請求項１４】
請求項１２又は１３記載のキットであって、プライマー又はプローブのセットが、以下：
−  配列番号１３の配列を含む１つのプライマー及び／又は配列番号１５の配列を含む１つのプライマーを含むプライマーのセット、
−  配列番号１６の配列を含む１つのプライマー及び／又は配列番号１８の配列を含む１つのプライマーを含むプライマーのセット、
−  配列番号１９の配列を含む１つのプライマー及び／又は配列番号２１の配列を含む１つのプライマーを含むプライマーのセット、
−  配列番号２２の配列を含む１つのプライマー及び／又は配列番号２４の配列を含む１つのプライマーを含むプライマーのセット、
−  配列番号２５の配列を含む１つのプローブ及び／又は配列番号２６の配列を含む１つのプローブを含むプローブのセット、
−  配列番号２８の配列を含む１つのプローブ及び／又は配列番号２９の配列を含む１つのプローブを含むプローブのセット、
−  配列番号３１の配列を含む１つのプローブ及び／又は配列番号３２の配列を含む１つのプローブを含むプローブのセット、
−  配列番号３４の配列を含む１つのプローブ及び／又は配列番号３５の配列を含む１つのプローブを含むプローブのセット
からなる群より選択される、キット。
【請求項１５】
生物学的サンプル中に存在する核酸において突然変異ＩＮＤ対立遺伝子の突然変異ＤＮＡ領域の存在を決定することを含む、生物学的サンプルにおいて請求項９または１０記載の突然変異ＩＮＤ対立遺伝子を同定するための方法。
【請求項１６】
生物学的サンプルを請求項１２〜１４のいずれか一項に記載するプライマーまたはプローブのセットを含むキットを使用したＤＮＡ増幅反応またはハイブリダイゼーションアッセイに供することをさらに含む、請求項１５記載の方法。