【手続補正書】
【提出日】平成25年12月27日(2013.12.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
多特異的融合タンパク質であって、前記多特異的融合タンパク質は、（ｉ）ＲＯＮ結合ドメイン、（ｉｉ）ＣＤ３結合ドメイン、および（ｉｉｉ）前記ＲＯＮ結合ドメインと前記ＣＤ３結合ドメインとの間の免疫グロブリン定常領域またはそのサブ領域を含む、多特異的融合タンパク質。
【請求項２】
前記免疫グロブリン定常領域またはそのサブ領域が、免疫グロブリンＦｃ領域または免疫グロブリンＣＨ２ＣＨ３ドメインを含む、請求項１に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項３】
前記免疫グロブリンＣＨ２ＣＨ３ドメインが、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２またはＩｇＤ由来である、請求項２に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項４】
前記多特異的融合タンパク質が、免疫グロブリンＣＨ１ドメインを含まない、請求項１〜３のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項５】
前記免疫グロブリンＦｃ領域またはＣＨ２ＣＨ３ドメインが、
（ｉ）位置２９７のアスパラギンにおけるアミノ酸置換および位置２３４、位置２３５、位置２３６または位置２３７における１つのアミノ酸置換；
（ｉｉ）位置２９７のアスパラギンにおけるアミノ酸置換および位置２３４〜位置２３７のうちの２つにおけるアミノ酸置換；
（ｉｉｉ）位置２９７のアスパラギンにおけるアミノ酸置換および位置２３４〜位置２３７のうちの３つにおけるアミノ酸置換；
（ｉｖ）位置２９７のアスパラギンにおけるアミノ酸置換、位置２３４、位置２３５および位置２３７におけるアミノ酸置換、ならびに２３６におけるアミノ酸欠失；
（ｖ）位置２３４〜位置２３７のうちの３つにおけるアミノ酸置換、ならびに位置３１８、位置３２０および位置３２２におけるアミノ酸置換；または
（ｖｉ）位置２３４〜位置２３７のうちの３つにおけるアミノ酸置換、位置２３６におけるアミノ酸置換、ならびに位置３１８、位置３２０および位置３２２におけるアミノ酸置換；
を含む、請求項２に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項６】
前記多特異的融合タンパク質が、ヒンジドメインを含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項７】
前記多特異的融合タンパク質が、Ｎ末端からＣ末端へ、（ａ）ＲＯＮ結合ドメイン、（ｂ）ヒンジドメイン、（ｃ）免疫グロブリン定常領域またはそのサブ領域、および（ｄ）ＣＤ３結合ドメインを含むか、あるいはＮ末端からＣ末端へ、（ａ）ＣＤ３結合ドメイン、（ｂ）ヒンジドメイン、（ｃ）免疫グロブリン定常領域またはそのサブ領域、および（ｄ）ＲＯＮ結合ドメイン、を含む、請求項１〜６のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項８】
前記多特異的融合タンパク質が、二量体化ドメインを含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項９】
前記ＲＯＮ結合ドメインは、
ｉ．  配列番号６７のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号６８のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号６９のＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬドメイン、ならびに配列番号７０のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号７１のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号７２のＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨドメイン；または
ｉｉ．  配列番号１４１のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４２のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号１４３のＣＤＲ３アミノ酸配列、を含む、ＶＬドメイン、ならびに配列番号１４４のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４５のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号１４６のＣＤＲ３アミノ酸配列、を含む、ＶＨドメイン
を含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１０】
前記ＶＬドメインおよび前記ＶＨドメインはヒト化されている、請求項９に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１１】
前記ＶＬドメインは、配列番号８０および１５２のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含み、前記ＶＨドメインは、配列番号８１、１５３、および１７６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含む、請求項９に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１２】
前記ＶＬドメインは、配列番号８２、８３、および１５４のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含み、かつ前記ＶＨドメインは、配列番号８４〜８６、１５５、および１５６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含む、請求項９に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１３】
前記ＲＯＮ結合ドメインは、抗体、抗体の抗原結合断片、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、ｓｃＦｖ、ｄＡｂ、またはＦｖ断片である、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１４】
前記抗体または前記抗体の抗原結合断片は、非ヒトのもの、キメラのもの、ヒト化されたもの、またはヒトのものである、請求項１３に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１５】
前記抗体または前記抗体の抗原結合断片は、配列番号８０、８２、８３、１５２、および１５４のアミノ酸配列のうちのいずれか１つと少なくとも約９０％同一のＶＬドメインを含み、かつ配列番号８１、８４〜８６、１５３、１５５、１５６、および１７６のアミノ酸配列のうちのいずれか１つと少なくとも約９０％同一のＶＨドメインを含む、請求項１３に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１６】
前記免疫グロブリン定常領域またはそのサブ領域は、第１のリンカーペプチドと第２のリンカーペプチドとの間に配置される、請求項１〜６および８〜１５のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１７】
前記第１のリンカーペプチドおよび前記第２のリンカーペプチドは独立して、配列番号６１０〜７７７に提供されるリンカーから選択される、請求項１６に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１８】
前記第１のリンカーペプチドは、免疫グロブリンヒンジ領域を含み、前記第２のリンカーペプチドは、ＩＩ型Ｃレクチンストーク領域を含む、請求項１６に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項１９】
以下の構造：
Ｎ−ＢＤ１−Ｘ−Ｌ２−ＢＤ２−Ｃ
を含み、式中、
−Ｘ−は、−Ｌ１−ＣＨ２ＣＨ３−であり、式中、Ｌ１は、配列番号３４９〜３６６および４２０〜４７５のうちのいずれか１つを含むアミノ酸配列を有する免疫グロブリンＩｇＧ１ヒンジであり、−ＣＨ２ＣＨ３−は、ヒトＩｇＧ１  ＣＨ２ＣＨ３領域または１つ以上のエフェクター機能を欠くその変異体であり、
Ｌ２は、配列番号６１０〜７７７のうちのいずれか１つを含むアミノ酸配列を有するリンカーペプチドであり、そして
ＢＤ１は、ＲＯＮ結合ドメインであり、かつＢＤ２は、ＣＤ３結合ドメインであるか、または
ＢＤ１は、ＣＤ３結合ドメインであり、かつＢＤ２はＲＯＮ結合ドメインであるかのいずれかである、
請求項１に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項２０】
前記融合タンパク質が配列番号７８８または８２１を含む、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質。
【請求項２１】
請求項１〜２０のうちのいずれか一項に記載の多特異的融合タンパク質と、薬学的に許容される担体、希釈剤または賦形剤と、を含む、組成物。
【請求項２２】
請求項１に記載の多特異的融合タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
【請求項２３】
発現制御配列に動作可能に連結された請求項２２に記載のポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
【請求項２４】
請求項２３に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
【請求項２５】
癌または炎症性障害を治療するための、請求項２１に記載の組成物。
【請求項２６】
前記癌は、膵臓癌、肺癌、結腸癌、および乳癌からなる群から選択される、請求項２５に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２５】
本開示の別の態様は、治療を必要とする対象に、本明細書に記載の１つ以上の免疫グロブリン結合ポリペプチドおよび薬学的に許容される賦形剤を含む治療的に有効な量の組成物を投与することを含む、炎症性障害を治療するための方法を提供する。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
ヒトＲＯＮに特異的に結合する免疫グロブリン結合ポリペプチドであって、前記免疫グロブリン結合ポリペプチドは、
（ａ）  ＶＬドメインであって、
ｉ．  配列番号６７のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号６８のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号６９のＣＤＲ３アミノ酸配列、もしくは
ｉｉ．  配列番号１４１のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４２のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号１４３のＣＤＲ３アミノ酸配列、を含む、ＶＬドメイン、または
（ｂ）  ＶＨドメインであって、
ｉ．  配列番号７０のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号７１のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号７２のＣＤＲ３アミノ酸配列、もしくは
ｉｉ．  配列番号１４４のＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４５のＣＤＲ２アミノ酸配列、および配列番号１４６のＣＤＲ３アミノ酸配列、を含む、ＶＨドメイン、または
（ｃ）  （ａ）のＶＬおよび（ｂ）のＶＨ
を含む、免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２）
前記ＶＬドメインは、配列番号８０または１５２のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含み、前記ＶＨドメインは、配列番号８１、１５３、および１７６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含む、項目１に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目３）
前記ＶＬドメインおよび前記ＶＨドメインはヒト化される、項目１に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目４）
ヒト化された前記ＶＬは、配列番号８２、８３、および１５４のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含み、ヒト化された前記ＶＨドメインは、配列番号８４〜８６、１５５、および１５６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含む、項目３に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目５）
前記免疫グロブリン結合ポリペプチドは、抗体または抗体の抗原結合断片である、項目１に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目６）
前記抗体または前記抗体の抗原結合断片は、非ヒトのもの、キメラのもの、ヒト化されたもの、またはヒトのものである、項目５に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目７）
非ヒトの前記抗体もしくはキメラの前記抗体または非ヒトの前記抗体もしくはキメラの前記抗体の抗原結合断片は、配列番号８０および１５２のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＬドメインと、配列番号８１、１５３、および１７６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＨドメインと、を有する、項目６に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目８）
ヒト化された前記抗体またはヒト化された前記抗体の抗原結合断片は、配列番号８２、８３、および１５４のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＬドメインと、配列番号８４〜８６、１５５、および１５６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＨドメインと、を有する、項目６に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目９）
前記抗体または前記抗体の抗原結合断片は、配列番号８０、８２、８３、１５２、および１５４のアミノ酸配列のうちのいずれか１つと少なくとも約９０％同一のＶＬドメイン
を含み、かつ配列番号８１、８４〜８６、１５３、１５５、１５６、および１７６のアミノ酸配列のうちのいずれか１つと少なくとも約９０％同一のＶＨドメインを含む、項目６に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１０）
前記結合ポリペプチドは、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２断片、ｓｃＦｖ、ｄＡｂ、およびＦｖ断片からなる群から選択される、項目１に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１１）
前記ｓｃＦｖは、配列番号８０および１５２のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＬドメインを有し、かつ配列番号８１、１５３、および１７６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＨドメインを有する、項目１０に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１２）
前記ｓｃＦｖは、ヒト化されており、かつ配列番号８２、８３、および１５４のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＬドメインを有し、かつ配列番号８４〜８６、１５５、および１５６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＨドメインを有する、項目１０に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１３）
前記免疫グロブリン結合ポリペプチドは、小モジュラー式免疫製薬（ＳＭＩＰ）タンパク質である、項目１に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１４）
前記ＳＭＩＰタンパク質は、非ヒトのタンパク質、キメラのタンパク質、ヒト化されたタンパク質、またはヒトのタンパク質である、項目１３に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１５）
非ヒトの前記ＳＭＩＰタンパク質またはキメラの前記ＳＭＩＰタンパク質は、配列番号８０および１５２のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＬドメインと、配列番号８１、１５３、および１７６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＨドメインと、を有する、項目１４に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１６）
ヒト化された前記ＳＭＩＰタンパク質は、配列番号８２、８３、および１５４のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＬドメインと、配列番号８４〜８６、１５５、および１５６のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を含むＶＨドメインと、を有する、項目１４に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１７）
配列番号３４９〜３６６および４２０〜４７５のうちのいずれか１つのアミノ酸配列を有するヒンジドメインを含む、項目１３〜１６のいずれか一項に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１８）
ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、またはＩｇＤの免疫グロブリンＣＨ２ＣＨ３ドメインを含む免疫グロブリン定常サブ領域ドメインを含む、項目１７に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目１９）
ヒトＩｇＧ１  ＣＨ２ＣＨ３を含む免疫グロブリン定常サブ領域ドメインを含む、項目１８に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２０）
前記ヒトＩｇＧ１  ＣＨ２は、配列番号２４１のアミノ酸配列を含み、前記ヒトＩｇＧ１  ＣＨ３は、配列番号３１９のアミノ酸配列を含む、項目１９に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２１）
前記ＳＭＩＰタンパク質は、配列番号９４〜１１４および１６０〜１６８から選択されるアミノ酸配列のうちのいずれか１つのアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む、項目１４に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２２）
前記免疫グロブリン結合ポリペプチドは、第１のヘテロ二量化ドメインを含む第１の一本鎖ポリペプチド中に含有され、前記第１のヘテロ二量化ドメインは、前記第１のヘテロ二量化ドメインと同一ではない第２のヘテロ二量化ドメインを含む第２の一本鎖ポリペプチドと会合することができ、会合した前記第１の一本鎖ポリペプチドおよび前記第２の一本鎖ポリペプチドは、ポリペプチドヘテロ二量体を形成する、項目１〜２１のいずれか一項に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２３）
前記ポリペプチドヘテロ二量体は、
配列番号１７０のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号３５のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、
配列番号１７２のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号２７のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、
配列番号１７４のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号２９のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、
配列番号１７４のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号３２のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、
配列番号１１６のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号３５のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、
配列番号１１８のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号２７のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、
配列番号１２０のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号２９のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド、または
配列番号１２０のアミノ酸配列を含む第１の一本鎖ポリペプチド、および配列番号３２のアミノ酸配列を含む第２の一本鎖ポリペプチド
を含む、項目２２に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２４）
前記免疫グロブリン結合ポリペプチドは、第１の結合ドメインと第２の結合ドメインとの間に配置される免疫グロブリン定常サブ領域ドメインを含む一本鎖多特異的結合タンパク質中に含有され、前記第１の結合ドメインは、項目１〜２１に記載のヒトＲＯＮ結合ドメインであり、前記第２の結合ドメインは、項目１〜２１に記載のヒトＲＯＮ結合ドメインであるか、あるいはヒトＲＯＮ以外の標的分子に対して特異的である、項目１〜２１のいずれか一項に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２５）
前記免疫グロブリン定常サブ領域は、ＩｇＧ１  ＣＨ２ＣＨ３である、項目２４に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２６）
前記免疫グロブリン定常サブ領域は、第１のリンカーペプチドと第２のリンカーペプチドとの間に配置される、項目２４に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２７）
前記第１のリンカーペプチドおよび前記第２のリンカーペプチドは独立して、配列番号６１０〜７７７に提供されるリンカーから選択される、項目２６に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２８）
前記第１のリンカーペプチドは、免疫グロブリンヒンジ領域を含み、前記第２のリンカーペプチドは、ＩＩ型Ｃレクチンストーク領域を含む、項目２６または２７に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目２９）
以下の構造：
Ｎ−ＢＤ１−Ｘ−Ｌ２−ＢＤ２−Ｃ
を含み、式中、ＢＤ１は、ヒトＲＯＮに対して特異的なｓｃＦｖを含み、
−Ｘ−は、−Ｌ１−ＣＨ２ＣＨ３−であり、式中、Ｌ１は、配列番号３４９〜３６６、４２０〜４７５のうちのいずれか１つを含むアミノ酸配列を有する免疫グロブリンＩｇＧ１ヒンジであり、−ＣＨ２ＣＨ３−は、ヒトＩｇＧ１  ＣＨ２ＣＨ３領域または１つ以上のエフェクター機能を欠くその変異体であり、
Ｌ２は、配列番号６１０〜７７７のうちのいずれか１つを含むアミノ酸配列を有するリンカーペプチドであり、
ＢＤ２は、ヒトＲＯＮまたはヒトＲＯＮ以外の標的分子に対して特異的な結合ドメインである、
項目２４に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチド。
（項目３０）
項目１〜２９のうちのいずれか一項に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチドと、薬学的に許容される賦形剤と、を含む、組成物。
（項目３１）
項目１〜３０のいずれか一項に記載の免疫グロブリン結合ポリペプチドを発現することができる、発現ベクター。
（項目３２）
項目３１に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
（項目３３）
治療を必要とする対象に、治療的に有効な量の項目３０に記載の組成物を投与することを含む、癌を治療するための方法。
（項目３４）
前記癌は、膵臓癌、肺癌、結腸癌、および乳癌からなる群から選択される、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
治療を必要とする対象に、治療的に有効な量の項目３０に記載の組成物を投与することを含む、炎症性障害を治療するための方法。