【手続補正書】
【提出日】平成26年5月2日(2014.5.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
グラム陽性菌由来の少なくとも1種のグリコシル転移酵素をコードしているヌクレオチド配列；
グラム陰性菌由来の少なくとも1種のグリコシル転移酵素をコードしているヌクレオチド配列；
タンパク質をコードしているヌクレオチド配列；及び
オリゴ糖転移酵素をコードしているヌクレオチド配列：を含む、グラム陰性宿主原核生物。
【請求項２】
前記グラム陽性菌が、黄色ブドウ球菌である、請求項1記載の宿主原核生物。
【請求項３】
前記グラム陰性菌が、緑膿菌である、請求項1又は2記載の宿主原核生物。
【請求項４】
前記黄色ブドウ球菌が、莢膜多糖5型株である、請求項1〜3のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項５】
前記黄色ブドウ球菌が、莢膜多糖8型株である、請求項1〜3のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項６】
前記黄色ブドウ球菌が、メチシリン-耐性株である、請求項1〜5のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項７】
異なるグラム陽性菌株由来の少なくとも2種のグリコシル転移酵素を含む、請求項1〜6のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項８】
前記タンパク質が、緑膿菌外毒素である、請求項1〜7のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項９】
前記タンパク質が、黄色ブドウ球菌α溶血素である、請求項1〜7のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項１０】
前記タンパク質が、黄色ブドウ球菌クランピング因子Aである、請求項1〜7のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項１１】
前記宿主生物が、大腸菌である、請求項1〜10のいずれか一項記載の宿主原核生物。
【請求項１２】
第一のグラム陰性種の細菌を改変する方法であって：
標的としてグラム陽性菌を選択する工程；
少なくとも3つのモノマーを含む、該グラム陽性菌により生成された多糖の第一の反復単位を同定する工程；
該第一の反復単位と同じモノマーを少なくとも2つ含む第二の反復単位を含む第二のグラム陰性種の細菌により生成された多糖を同定する工程；
該第一のグラム陰性種の細菌へ、
a)該第二の反復単位；及び
b)該第二の反復単位には存在しない該第一の反復単位のモノマー：を含む三糖を集成するグリコシル転移酵素をコードしている1種以上のヌクレオチド配列を挿入する工程：
タンパク質をコードしているヌクレオチド配列を挿入する工程；並びに
オリゴ糖転移酵素をコードしているヌクレオチド配列を挿入する工程：を含む、前記方法。
【請求項１３】
前記タンパク質が、少なくとも1種の挿入されたコンセンサス配列D/E-X-N-Z-S/T（配列番号：24）を含み、ここでX及びZがプロリン以外の任意の天然のアミノ酸であってよい、請求項12記載の方法。
【請求項１４】
前記グラム陽性菌が、黄色ブドウ球菌である、請求項12又は13記載の方法。
【請求項１５】
黄色ブドウ球菌ワクチンであって：
挿入されたコンセンサス配列D/E-X-N-Z-S/T（配列番号：24）を含むタンパク質であって、ここでX及びZがプロリン以外の任意の天然のアミノ酸であってよい前記タンパク質；
該コンセンサス配列に結合された少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖；及び
任意に医薬として許容し得る担体又はアジュバント：を含有する、前記黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項１６】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、莢膜多糖5型を含む、請求項15記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項１７】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、莢膜多糖8型を含む、請求項15記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項１８】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、メチシリン-耐性耐性黄色ブドウ球菌株を標的化する、請求項15〜17のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項１９】
前記タンパク質が、緑膿菌外毒素である、請求項15〜18のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項２０】
前記タンパク質が、黄色ブドウ球菌α溶血素である、請求項15〜18のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項２１】
前記タンパク質が、黄色ブドウ球菌クランピング因子Aである、請求項15〜18のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項２２】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、下記構造を含む、請求項19〜21のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン:
【化１】
2013524844.tif 000001
。
【請求項２３】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、下記構造を含む、請求項19〜21のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン：
【化２】
2013524844.tif 000002
。
【請求項２４】
前記挿入されたコンセンサス配列を2種以上及び前記黄色ブドウ球菌多糖を2種以上含む、請求項15〜21のいずれか一項記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項２５】
前記黄色ブドウ球菌多糖が、異なる黄色ブドウ球菌株を標的化する多糖を含む、請求項24記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項２６】
前記黄色ブドウ球菌多糖が、莢膜多糖5型及び莢膜多糖8型を含む、請求項25記載の黄色ブドウ球菌ワクチン。
【請求項２７】
組換えN-グリコシル化タンパク質であって：
少なくとも1つの挿入されたコンセンサス配列D/E-X-N-Z-S/T（配列番号：24）を含むタンパク質であって、ここでX及びZがプロリン以外の任意の天然のアミノ酸であってよい前記タンパク質；及び
該コンセンサス配列に結合された少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖；を含む、前記組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項２８】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、莢膜多糖5型を含む、請求項27記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項２９】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、莢膜多糖8型を含む、請求項27記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３０】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、メチシリン-耐性耐性黄色ブドウ球菌株を標的化する、請求項27〜29のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３１】
前記タンパク質が、緑膿菌外毒素である、請求項27〜30のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３２】
前記タンパク質が、黄色ブドウ球菌α溶血素である、請求項27〜30のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３３】
前記タンパク質が、黄色ブドウ球菌クランピング因子Aである、請求項27〜30のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３４】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、下記構造を含む、請求項31〜33のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質：
【化３】
2013524844.tif 000003
。
【請求項３５】
前記少なくとも1種の黄色ブドウ球菌多糖が、下記構造を含む、請求項31〜33のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質：
【化４】
2013524844.tif 000004
。
【請求項３６】
前記挿入されたコンセンサス配列を2種以上及び前記黄色ブドウ球菌多糖を2種以上含む、請求項27〜33のいずれか一項記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３７】
前記黄色ブドウ球菌多糖が、異なる黄色ブドウ球菌株を標的化する多糖を含む、請求項36記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。
【請求項３８】
前記黄色ブドウ球菌多糖が、莢膜多糖5型及び莢膜多糖8型を含む、請求項37記載の組換えN-グリコシル化タンパク質。