【手続補正書】
【提出日】平成23年12月20日(2011.12.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
少なくとも1つのモジュラー認識ドメイン(MRD)を含む単離された完全長抗体。
【請求項２】
抗体およびMRDがリンカーペプチドを介して機能的に連結される、請求項1記載の抗体。
【請求項３】
リンカーペプチドが、2〜20個のペプチドまたは4〜15個のペプチドである、請求項2記載の抗体。
【請求項４】
リンカーペプチドが、GGGS(SEQ ID NO: 1)、SSGGGGSGGGGGGSS (SEQ ID NO: 2)、およびSSGGGGSGGGGGGSSRSS (SEQ ID NO: 19)からなる群より選択される配列を含む、請求項2または3記載の抗体。
【請求項５】
MRDが、抗体の重鎖のC末端に機能的に連結されるか、抗体の重鎖のN末端に機能的に連結されるか、抗体の軽鎖のC末端に機能的に連結されるか、または抗体の軽鎖のN末端に機能的に連結される、請求項1〜4のいずれか一項記載の抗体。
【請求項６】
2つ以上のMRDが、抗体の任意の末端に機能的に連結されるか、または2つ以上MRDが、抗体の2つ以上末端に機能的に連結される、請求項1〜5のいずれか一項記載の抗体。
【請求項７】
MRDの標的が、インテグリン、血管新生サイトカイン、血管内皮増殖因子(VEGF)、インスリン様増殖因子-I受容体(IGF-IR)、腫瘍抗原、CD20、上皮増殖因子受容体(EGFR)、ErbB2受容体、ErbB3受容体、腫瘍に関連した表面抗原上皮細胞接着分子(Ep-CAM)、血管新生因子、血管新生受容体、細胞表面抗原、血管ホーミングペプチド、および神経成長因子からなる群より選択される、請求項1〜6のいずれか一項記載の抗体。
【請求項８】
MRDがインテグリンをターゲティングし、
YCRGDCT(SEQ ID NO: 3)、
PCRGDCL(SEQ ID NO: 4)、
TCRGDCY (SEQ ID NO: 5)、および
LCRGDCF (SEQ ID NO: 6)
からなる群より選択される配列を含み；
MRDが血管新生サイトカインをターゲティングし、
MGAQTNFMPMDDLEQRLYEQFILQQGLE (SEQ ID NO:7)、
MGAQTNFMPMDNDELLLYEQFILQQGLE (SEQ ID NO:8)、
MGAQTNFMPMDATETRLYEQFILQQGLE (SEQ ID NO:9)、
AQQEECEWDPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEWDPWTCEHMLE (SEQ ID NO:10)、
AQQEECEFAPWTCEHM (SEQ ID NO:21)、
AQQEECEFAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEFAPWTCEHMLE (SEQ ID NO:23)、
AQQEECELAPWTCEHM (SEQ ID NO:24)、
AQQEECELAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECELAPWTCEHMLE (SEQ ID NO:26)、
AQQEECEFSPWTCEHM (SEQ ID NO:27)、
AQQEECEFSPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEFSPWTCEHMLE2xConFS (SEQ ID NO:29)、
AQQEECELEPWTCEHM (SEQ ID NO:30)、
AQQEECELEPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECELEPWTCEHMLE (SEQ ID NO:32)、
AQQEECEFAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECELAPWTCEHMLE (SEQ ID NO:33)、
AQQEECEFAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEFSPWTCEHMLE (SEQ ID NO:34)、
MGAQTNFMPMDNDELLNYEQFILQQGLE (SEQ ID NO:11)、および
Xが20種の天然アミノ酸の内の1つより選択される、PXDNDXLLNY (SEQ ID NO:12)、
からなる群より選択される配列を含み；
MRDがVEGFをターゲティングし、
VEPNCDIHVMWEWECFERL (SEQ ID NO:13)
の配列を含み；
MRDがインスリン様増殖因子-I受容体をターゲティングし、
SFYSCLESLVNGPAEKSRGQWDGCRKK (SEQ ID NO:14)、
NFYQCIEMLASHPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:35)、
NFYQCIEQLALRPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:36)、
NFYQCIDLLMAYPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:37)、
NFYQCIERLVTGPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:38)、
NFYQCIEYLAMKPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:39)、
NFYQCIEALQSRPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:40)、
NFYQCIEALSRSPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:41)、
NFYQCIEHLSGSPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:42)、
NFYQCIESLAGGPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:43)、
NFYQCIEALVGVPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:44)、
NFYQCIEMLSLPPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:45)、
NFYQCIEVFWGRPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:46)、
NFYQCIEQLSSGPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:47)、
NFYQCIELLSARPAEKSRGQWAECRAG (SEQ ID NO:48)、および
NFYQCIEALARTPAEKSRGQWVECRAP (SEQ ID NO:49)
からなる群より選択される配列を含み；
MRDがEGFRをターゲティングし、
VDNKFNKELEKAYNEIRNLPNLNGWQMTAFIASLVDDPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK (SEQ ID NO:16)、および
VDNKFNKEMWIAWEEIRNLPNLNGWQMTAFIASLVDDPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK (SEQ ID NO:17)
からなる群より選択される配列を含み；
MRDがErbB2受容体をターゲティングし、
VDNKFNKEMRNAYWEIALLPNLNNQQKRAFIRSLYDDPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK (SEQ ID NO:18)
の配列を含み；または
MRDが血管ホーミングペプチドをターゲティングし、
ACDCRGDCFCG (SEQ ID NO: 15)
の配列を含む、請求項7記載の抗体。
【請求項９】
キメラ抗体またはヒト化抗体である、請求項1〜8のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１０】
EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、CD20、インスリン様増殖因子-I受容体、前立腺特異的膜抗原、血管新生因子、血管新生受容体、および細胞表面抗原からなる群より選択される細胞表面抗原に結合する、請求項1〜9のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１１】
MRDの標的が血管新生因子または血管新生受容体であり、抗体がEGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、CD20、インスリン様増殖因子-I受容体、または前立腺特異的膜抗原からなる群より選択される細胞表面抗原に結合する、請求項1〜10のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１２】
MRDの標的が血管新生受容体であり、抗体が血管新生因子または血管新生受容体に結合する、請求項1〜10のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１３】
MRDの標的が細胞表面抗原であり、抗体が細胞表面抗原、血管新生因子、または血管新生受容体に結合する、請求項1〜10のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１４】
ErbB2に結合する、請求項1〜11および13のいずれか一項記載の抗体。
【請求項１５】
トラスツズマブである、請求項14記載の抗体。
【請求項１６】
MRD標的がAng2である、請求項14または15記載の抗体。
【請求項１７】
MRDがSEQ ID NO: 8の配列を含む、請求項16記載の抗体。
【請求項１８】
X1がEまたはDであり;X2が任意のアミノ酸であり;X3が任意のアミノ酸であり;X4が任意のアミノ酸であり;およびX5が任意のアミノ酸である、NFYQCIX1X2LX3X4X5PAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:58);
MGAQTNFMPMDNDELLLYEQFILQQGLEGGSGSTASSGSGSSLGAQTNFMPMDNDELLLY (SEQ ID NO:20);
NFYQCIELLSARPAEKSRGQWAECRAG (SEQ ID NO:48); 
NFYQCIEALARTPAEKSRGQWVECRAP (SEQ ID NO:49);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnEFAPWTXn(SEQ ID NO: 22);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnELAPWTXn(SEQ ID NO: 25);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnEFSPWTXn(SEQ ID NO: 28);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnELEPWTXn(SEQ ID NO: 31);
nが約0〜50個のアミノ酸残基であり、X、X1、およびX2が任意のアミノ酸である、Xn AQQEECEX1X2PWTCEHMXn(SEQ ID NO: 57);
NFYQCIEMLASHPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:35); 
NFYQCIEQLALRPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:36); 
NFYQCIDLLMAYPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:37); 
NFYQCIERLVTGPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:38); 
NFYQCIEYLAMKPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:39); 
NFYQCIEALQSRPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:40); 
NFYQCIEALSRSPAEKSRGQWQECRTGG (SEQ ID NO:41); 
NFYQCIEHLSGSPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:42); 
NFYQCIESLAGGPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:43); 
NFYQCIEALVGVPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:44); 
NFYQCIEMLSLPPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:45); 
NFYQCIEVFWGRPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:46); 
NFYQCIEQLSSGPAEKSRGQWQECRTG (SEQ ID NO:47); 
AQQEECEFAPWTCEHM (SEQ ID NO:21);
AQQEECEFAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEFAPWTCEHMLE (SEQ ID NO:23);
AQQEECELAPWTCEHM (SEQ ID NO:24);
AQQEECELAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECELAPWTCEHMLE (SEQ ID NO:26);
AQQEECEFSPWTCEHM (SEQ ID NO:27);
AQQEECEFSPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEFSPWTCEHMLE2xConFS (SEQ ID NO:29);
AQQEECELEPWTCEHM (SEQ ID NO:30);
AQQEECELEPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECELEPWTCEHMLE (SEQ ID NO:32);
AQQEECEFAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECELAPWTCEHMLE (SEQ ID NO:33);
AQQEECEFAPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEFSPWTCEHMLE (SEQ ID NO:34);および
AQQEECEWDPWTCEHMGSGSATGGSGSTASSGSGSATHQEECEWDPWTCEHMLE (SEQ ID NO:10)からなる群より選択される配列を含む、タンパク質。
【請求項１９】
請求項1〜17のいずれか一項記載の抗体または請求項18記載のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項２０】
請求項19記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
【請求項２１】
請求項20記載のベクターを含む宿主細胞または該細胞の子孫。
【請求項２２】
疾患の治療において使用するための、請求項1〜17のいずれか一項記載の抗体または請求項18記載のタンパク質。
【請求項２３】
疾患が癌である、請求項22記載の抗体またはタンパク質。
【請求項２４】
抗体またはタンパク質が、血管新生を阻害するか、血管新生を調整するか、または腫瘍増殖を阻害する、請求項22または23記載の抗体またはタンパク質。
【請求項２５】
MRD結合標的を用いてMRDを選択する段階を含み、該MRDがファージディスプレイライブラリーまたは天然リガンドに由来する、請求項1〜17のいずれか一項記載の抗体を作製するための方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４８】
本発明の1つの態様において、抗体はキメラ抗体またはヒト化抗体である。
[本発明1001]
モジュラー認識ドメイン(MRD)を含む単離された完全長抗体。
[本発明1002]
抗体およびMRDがリンカーペプチドを介して機能的に連結される、本発明1001の抗体。
[本発明1003]
リンカーペプチドが、2〜20個の間のペプチドである、本発明1002の抗体。
[本発明1004]
リンカーペプチドが、4〜15個の間のペプチドである、本発明1002の抗体。
[本発明1005]
リンカーペプチドが配列GGGS(SEQ ID NO: 1)を含む、本発明1002の抗体。
[本発明1006]
リンカーペプチドが配列
2011509084.tif 000001
を含む、本発明1002の抗体。
[本発明1007]
リンカーペプチドが配列
2011509084.tif 000002
を含む、本発明1002の抗体。
[本発明1008]
MRDが抗体の重鎖のC末端に機能的に連結される、本発明1001の抗体。
[本発明1009]
MRDが抗体の重鎖のN末端に機能的に連結される、本発明1001の抗体。
[本発明1010]
MRDが抗体の軽鎖のC末端に機能的に連結される、本発明1001の抗体。
[本発明1011]
MRDが抗体の軽鎖のN末端に機能的に連結される、本発明1001の抗体。
[本発明1012]
2つ以上のMRDが抗体の任意の末端に機能的に連結される、本発明1001の抗体。
[本発明1013]
抗体の2つ以上の末端に機能的に連結された2つ以上のMRDが存在する、本発明1001の抗体。
[本発明1014]
MRDの標的がインテグリンである、本発明1001の抗体。
[本発明1015]
インテグリンをターゲティングするMRDが配列YCRGDCT(SEQ ID NO: 3)を含む、本発明1014の抗体。
[本発明1016]
インテグリンをターゲティングするMRDが配列PCRGDCL(SEQ ID NO: 4)を含む、本発明1014の抗体。
[本発明1017]
インテグリンをターゲティングするMRDが配列TCRGDCY (SEQ ID NO: 5)を含む、本発明1014の抗体。
[本発明1018]
インテグリンをターゲティングするMRDが配列LCRGDCF (SEQ ID NO: 6)を含む、本発明1014の抗体。
[本発明1019]
MRDの標的が血管新生サイトカインである、本発明1001の抗体。
[本発明1020]
血管新生サイトカインをターゲティングするMRDが配列
2011509084.tif 000003
を含む、本発明1019の抗体。
[本発明1021]
血管新生サイトカインをターゲティングするMRDが配列
2011509084.tif 000004
を含む、本発明1019の抗体。
[本発明1022]
血管新生サイトカインをターゲティングするMRDが配列
2011509084.tif 000005
を含む、本発明1019の抗体。
[本発明1023]
血管新生サイトカインをターゲティングするMRDが
2011509084.tif 000006
からなる群より選択される、本発明1019の抗体。
[本発明1024]
血管新生サイトカインをターゲティングするMRDが配列
2011509084.tif 000007
を含む、本発明1019の抗体。
[本発明1025]
血管新生サイトカインをターゲティングするMRDが、Xが20種の天然アミノ酸の内の1つより選択される配列PXDNDXLLNY(SEQ ID NO: 12)を含む、本発明1019の抗体。
[本発明1026]
MRDの標的がErbB2である、本発明1001の抗体。
[本発明1027]
MRDの標的がVEGFである、本発明1001の抗体。
[本発明1028]
VEGFをターゲティングするMRDが配列
2011509084.tif 000008
を含む、本発明1027の抗体。
[本発明1029]
MRDの標的がインスリン様増殖因子-I受容体である、本発明1001の抗体。
[本発明1030]
インスリン様増殖因子-I受容体をターゲティングするMRDが
2011509084.tif 000009
からなる群より選択される、本発明1029の抗体。
[本発明1031]
MRDの標的が腫瘍抗原である、本発明1001の抗体。
[本発明1032]
MRDの標的がCD20である、本発明1001の抗体。
[本発明1033]
MRDの標的が上皮増殖因子受容体(EGFR)である、本発明1001の抗体。
[本発明1034]
EGFRをターゲティングするMRDが、配列
2011509084.tif 000010
を含む、本発明1033の抗体。
[本発明1035]
EGFRをターゲティングするMRDが、配列
2011509084.tif 000011
を含む、本発明1033の抗体。
[本発明1036]
MRDの標的がErbB2受容体である、本発明1001の抗体。
[本発明1037]
ErbB2受容体をターゲティングするMRDが、配列
2011509084.tif 000012
を含む、本発明1036の抗体。
[本発明1038]
MRDの標的がErbB3受容体である、本発明1001の抗体。
[本発明1039]
MRDの標的が、腫瘍に関連した表面抗原上皮細胞接着分子(Ep-CAM)である、本発明1001の抗体。
[本発明1040]
MRDの標的が血管新生因子である、本発明1001の抗体。
[本発明1041]
EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、CD20、インスリン様増殖因子-I受容体、または前立腺特異的膜抗原からなる群より選択される細胞表面抗原に結合する、本発明1040の抗体。
[本発明1042]
MRDの標的が血管新生受容体である、本発明1001の抗体。
[本発明1043]
EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、CD20、インスリン様増殖因子-I受容体、または前立腺特異的膜抗原からなる群より選択される細胞表面抗原に結合する、本発明1042の抗体。
[本発明1044]
血管新生因子に結合する、本発明1042の抗体。
[本発明1045]
血管新生受容体に結合する、本発明1042の抗体。
[本発明1046]
MRDの標的が細胞表面抗原である、本発明1001の抗体。
[本発明1047]
細胞表面抗原に結合する、本発明1046の抗体。
[本発明1048]
細胞表面抗原が、EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、CD20、インスリン様増殖因子-I受容体、または前立腺特異的膜抗原からなる群より選択される、本発明1047の抗体。
[本発明1049]
血管新生因子に結合する、本発明1046の抗体。
[本発明1050]
血管新生受容体に結合する、本発明1046の抗体。
[本発明1051]
MRDが血管ホーミングペプチドである、本発明1001の抗体。
[本発明1052]
血管ホーミングペプチドをターゲティングするMRDが配列ACDCRGDCFCG (SEQ ID NO: 15)を含む、本発明1051の抗体。
[本発明1053]
MRDが神経成長因子(NGF)である、本発明1001の抗体。
[本発明1054]
本発明1001の抗体のヌクレオチド配列を含む、単離されたポリヌクレオチド。
[本発明1055]
本発明1054のポリヌクレオチドを含むベクター。
[本発明1056]
ポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が、宿主細胞において該ポリヌクレオチドの発現を制御する調節配列に機能的に連結されている、本発明1054のポリヌクレオチドを含むベクター。
[本発明1057]
本発明1055のベクターを含む宿主細胞または該細胞の子孫。
[本発明1058]
それを必要とする対象に本発明1001の抗体を投与する段階を含む、疾患を治療する方法。
[本発明1059]
疾患が癌である、本発明1058の方法。
[本発明1060]
追加の治療物質が対象に投与される、本発明1058の方法。
[本発明1061]
それを必要とする対象に本発明1001の抗体を投与する段階を含む、血管新生を阻害する方法。
[本発明1062]
追加の治療物質が対象に投与される、本発明1061の方法。
[本発明1063]
それを必要とする対象に本発明1001の抗体を投与する段階を含む、血管新生を調整する方法。
[本発明1064]
追加の治療物質が対象に投与される、本発明1063の方法。
[本発明1065]
それを必要とする対象に本発明1001の抗体を投与する段階を含む、腫瘍増殖を阻害する方法。
[本発明1066]
追加の治療物質が対象に投与される、本発明1065の方法。
[本発明1067]
MRD結合標的を用いてMRDを選択する段階を含む、1つまたは複数のMRDを含む完全長抗体を作製するための方法であって、該MRDがファージディスプレイライブラリーに由来する方法。
[本発明1068]
MRD結合標的を用いてMRDを選択する段階を含む、1つまたは複数のMRDを含む完全長抗体を作製するための方法であって、該MRDが天然リガンドに由来する方法。
[本発明1069]
抗体がキメラ抗体またはヒト化抗体である、本発明1001の抗体。
[本発明1070]
X1がEまたはDであり;X2が任意のアミノ酸であり;X3が任意のアミノ酸であり;X4が任意のアミノ酸であり;X5が任意のアミノ酸である、配列
2011509084.tif 000013
を含む、ペプチド。
[本発明1071]
2011509084.tif 000014
からなる群より選択される、本発明1070のペプチド。
[本発明1072]
2011509084.tif 000015
より選択されるペプチド。
[本発明1073]
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnEFAPWTXn(SEQ ID NO: 22);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnELAPWTXn(SEQ ID NO: 25);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnEFSPWTXn(SEQ ID NO: 28);
nが約0〜50個のアミノ酸残基である、XnELEPWTXn(SEQ ID NO: 31);
ならびに
nが約0〜50個のアミノ酸残基であり、X、X1、およびX2が任意のアミノ酸である、
2011509084.tif 000016
(SEQ ID NO: 57)
からなる群より選択される、ペプチド。
[本発明1074]
2011509084.tif 000017
からなる群より選択される、本発明1073のペプチド。