【手続補正書】
【提出日】平成24年8月20日(2012.8.20)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＤＥＰＤＣ１に関連したがんを治療もしくは予防するか、またはＤＥＰＤＣ１とＺＮＦ２２４との間の結合を阻害するための候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下を含む方法：
（ａ）試験化合物の存在下で、ＤＥＰＤＣ１ポリペプチドまたはその機能的等価物を、ＺＮＦ２２４ポリペプチドまたはその機能的等価物と接触させる工程；
（ｂ）ポリペプチド間の結合を検出する工程；および
（ｃ）これらのポリペプチド間の結合を阻害する試験化合物を選択する工程。
【請求項２】
ＤＥＰＤＣ１ポリペプチドの機能的等価物がＺＮＦ２２４結合ドメインのアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ＤＥＰＤＣ１ポリペプチドの機能的等価物がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８、５４、および５５のアミノ酸配列を含む、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
ＺＮＦ２２４ポリペプチドの機能的等価物がＤＥＰＤＣ１結合ドメインのアミノ酸配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
ＤＥＰＤＣ１に関連したがんを治療もしくは予防するか、またはＤＥＰＤＣ１およびＺＮＦ２２４を発現しているがん細胞の増殖を阻害するための候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下を含む方法：
（ａ）候補化合物を、ＤＥＰＤＣ１およびＺＮＦ２２４を発現している細胞と接触させる工程；ならびに
（ｂ）試験化合物の非存在下で検出される発現レベルと比較して、ＤＬＧ１またはＡ２０（ＴＮＦＡＩＰ３）の発現レベルを増加させる候補化合物を選択する工程。
【請求項６】
ＤＥＰＤＣ１に関連したがんを治療もしくは予防するか、またはＤＥＰＤＣ１を発現しているがん細胞の増殖を阻害するための候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下を含む方法：
（ａ）ＤＬＧ１またはＡ２０（ＴＮＦＡＩＰ３）の転写調節領域と、該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターが導入されている、ＤＥＰＤＣ１およびＺＮＦ２２４を発現している細胞に、候補化合物を接触させる工程；
（ｂ）レポーター遺伝子の発現または活性を測定する工程；ならびに
（ｃ）対照と比較して、前記レポーター遺伝子の発現または活性のレベルを増加させる候補化合物を選択する工程。
【請求項７】
ＤＬＧ１の転写調節領域がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：５６のヌクレオチド配列である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
Ａ２０（ＴＮＦＡＩＰ３）の転写調節領域がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：８２のヌクレオチド配列である、請求項６に記載の方法。
【請求項９】
がんが膀胱癌である、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２８のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはそれと機能的に等価なポリペプチドであって、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４５または４７からなるペプチドの生物学的機能を欠くポリペプチド。
【請求項１１】
生物学的機能が細胞増殖活性である、請求項１０に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
１８〜３０個の残基からなる、請求項１０または１１に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
細胞膜透過性物質により修飾されている、請求項１０〜１２のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
以下の一般式を有する、請求項１３に記載のポリペプチド：
［Ｒ］−［Ｄ］
式中、［Ｒ］および［Ｄ］は直接連結されていてもよいしまたはリンカーにより間接的に連結されていてもよく、［Ｒ］は細胞膜透過性物質を表し；かつ［Ｄ］は請求項１０に記載のポリペプチドのアミノ酸配列を表す。
【請求項１５】
細胞膜透過性物質が以下のものからなる群より選択される、請求項１４に記載のポリペプチド：
ポリアルギニン／ＲＲＲＲＲＲＲＲＲＲＲ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４３）；
Ｔａｔ／ＲＫＫＲＲＱＲＲＲ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：２９）；
ペネトラチン（Ｐｅｎｅｔｒａｔｉｎ）／ＲＱＩＫＩＷＦＱＮＲＲＭＫＷＫＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３０）；
ブフォリンＩＩ／ＴＲＳＳＲＡＧＬＱＦＰＶＧＲＶＨＲＬＬＲＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３１）；
トランスポータン／ＧＷＴＬＮＳＡＧＹＬＬＧＫＩＮＬＫＡＬＡＡＬＡＫＫＩＬ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３２）；
ＭＡＰ（ｍｏｄｅｌ ａｍｐｈｉｐａｔｈｉｃ ｐｅｐｔｉｄｅ）／ＫＬＡＬＫＬＡＬＫＡＬＫＡＡＬＫＬＡ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３３）；
Ｋ−ＦＧＦ／ＡＡＶＡＬＬＰＡＶＬＬＡＬＬＡＰ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３４）；
Ｋｕ７０／ＶＰＭＬＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３５）；
Ｋｕ７０／ＰＭＬＫＥ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３６）；
プリオン／ＭＡＮＬＧＹＷＬＬＡＬＦＶＴＭＷＴＤＶＧＬＣＫＫＲＰＫＰ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３７）；
ｐＶＥＣ／ＬＬＩＩＬＲＲＲＩＲＫＱＡＨＡＨＳＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３８）；
Ｐｅｐ−１／ＫＥＴＷＷＥＴＷＷＴＥＷＳＱＰＫＫＫＲＫＶ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：３９）；
ＳｙｎＢ１／ＲＧＧＲＬＳＹＳＲＲＲＦＳＴＳＴＧＲ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４０）；
Ｐｅｐ−７／ＳＤＬＷＥＭＭＭＶＳＬＡＣＱＹ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４１）；および
ＨＮ−１／ＴＳＰＬＮＩＨＮＧＱＫＬ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：４２）。
【請求項１６】
請求項１０〜１５のいずれか一項に記載のポリペプチドを活性成分として含む、がんの治療および予防のいずれかまたは両方のための剤。
【請求項１７】
がんが膀胱癌である、請求項１６に記載の剤。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
本明細書に記載された方法の１つの利点は、膀胱癌の明白な臨床症状の検出前に、疾患が同定され得るという点である。疾患を早期に検出することによって、本発明は、患者の予後を改善し、回復および／または生存期間延長の確率を増加させることができる。本発明のその他の特色および利点は、以下の詳細な説明および特許請求の範囲から明白になるであろう。
[本発明1001]
ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：28のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはそれと機能的に等価なポリペプチドであって、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：45または47からなるペプチドの生物学的機能を欠くポリペプチド。
[本発明1002]
生物学的機能が細胞増殖活性である、本発明1001のポリペプチド。
[本発明1003]
8〜30個の残基からなる、本発明1001のポリペプチド。
[本発明1004]
細胞膜透過性物質により修飾されている、本発明1001のポリペプチド。
[本発明1005]
以下の一般式を有する、本発明1004のポリペプチド：
［Ｒ］−［Ｄ］
式中、［Ｒ］および［Ｄ］は直接連結されていてもよいしまたはリンカーにより間接的に連結されていてもよく、［Ｒ］は細胞膜透過性物質を表し；かつ［Ｄ］は本発明1001のポリペプチドのアミノ酸配列を表す。
[本発明1006]
細胞膜透過性物質が以下のものからなる群より選択される、本発明1005のポリペプチド：
ポリアルギニン／ＲＲＲＲＲＲＲＲＲＲＲ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：43）；
Ｔａｔ／ＲＫＫＲＲＱＲＲＲ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：29）；
ペネトラチン（Ｐｅｎｅｔｒａｔｉｎ）／ＲＱＩＫＩＷＦＱＮＲＲＭＫＷＫＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：30）；
ブフォリンＩＩ／ＴＲＳＳＲＡＧＬＱＦＰＶＧＲＶＨＲＬＬＲＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：31）；
トランスポータン／ＧＷＴＬＮＳＡＧＹＬＬＧＫＩＮＬＫＡＬＡＡＬＡＫＫＩＬ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：32）；
ＭＡＰ（ｍｏｄｅｌ ａｍｐｈｉｐａｔｈｉｃ ｐｅｐｔｉｄｅ）／ＫＬＡＬＫＬＡＬＫＡＬＫＡＡＬＫＬＡ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：33）；
Ｋ−ＦＧＦ／ＡＡＶＡＬＬＰＡＶＬＬＡＬＬＡＰ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：34）；
Ｋｕ70／ＶＰＭＬＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：35）；
Ｋｕ70／ＰＭＬＫＥ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：36）；
プリオン／ＭＡＮＬＧＹＷＬＬＡＬＦＶＴＭＷＴＤＶＧＬＣＫＫＲＰＫＰ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：37）；
ｐＶＥＣ／ＬＬＩＩＬＲＲＲＩＲＫＱＡＨＡＨＳＫ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：38）；
Ｐｅｐ−1／ＫＥＴＷＷＥＴＷＷＴＥＷＳＱＰＫＫＫＲＫＶ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：39）；
ＳｙｎＢ1／ＲＧＧＲＬＳＹＳＲＲＲＦＳＴＳＴＧＲ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：40）；
Ｐｅｐ−7／ＳＤＬＷＥＭＭＭＶＳＬＡＣＱＹ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：41）；および
ＨＮ−1／ＴＳＰＬＮＩＨＮＧＱＫＬ  （ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：42）。
[本発明1007]
本発明1001〜1006のいずれかのポリペプチドを活性成分として含む、がんの治療および予防のいずれかまたは両方のための剤。
[本発明1008]
がんが膀胱癌である、本発明1007の剤。
[本発明1009]
本発明1001〜1006のいずれかのポリペプチドを、その必要のある対象に投与する工程を含む、対象におけるがんを治療または予防する方法。
[本発明1010]
がんが膀胱癌である、本発明1009の方法。
[本発明1011]
ＤＥＰＤＣ1に関連したがんを治療もしくは予防するか、またはＤＥＰＤＣ1とＺＮＦ224との間の結合を阻害するための候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下を含む方法：
（ａ）試験化合物の存在下で、ＤＥＰＤＣ1ポリペプチドまたはその機能的等価物を、ＺＮＦ224ポリペプチドまたはその機能的等価物と接触させる工程；
（ｂ）ポリペプチド間の結合を検出する工程；および
（ｃ）これらのポリペプチド間の結合を阻害する試験化合物を選択する工程。
[本発明1012]
ＤＥＰＤＣ1ポリペプチドの機能的等価物がＺＮＦ224結合ドメインのアミノ酸配列を含む、本発明1011の方法。
[本発明1013]
ＤＥＰＤＣ1ポリペプチドの機能的等価物がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：28、54、および55のアミノ酸配列を含む、本発明1012の方法。
[本発明1014]
ＺＮＦ224ポリペプチドの機能的等価物がＤＥＰＤＣ1結合ドメインのアミノ酸配列を含む、本発明1011の方法。
[本発明1015]
ＤＥＰＤＣ1に関連したがんを治療もしくは予防するか、またはＤＥＰＤＣ1およびＺＮＦ224を発現しているがん細胞の増殖を阻害するための候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下を含む方法：
（ａ）候補化合物を、ＤＥＰＤＣ1およびＺＮＦ224を発現している細胞と接触させる工程；ならびに
（ｂ）試験化合物の非存在下で検出される発現レベルと比較して、ＤＬＧ1またはＡ20（ＴＮＦＡＩＰ3）の発現レベルを増加させる候補化合物を選択する工程。
[本発明1016]
ＤＥＰＤＣ1に関連したがんを治療もしくは予防するか、またはＤＥＰＤＣ1を発現しているがん細胞の増殖を阻害するための候補化合物をスクリーニングする方法であって、以下を含む方法：
（ａ）ＤＬＧ1またはＡ20（ＴＮＦＡＩＰ3）の転写調節領域と、該転写調節領域の制御下で発現されるレポーター遺伝子とを含むベクターが導入されている、ＤＥＰＤＣ1およびＺＮＦ224を発現している細胞に、候補化合物を接触させる工程；
（ｂ）レポーター遺伝子の発現または活性を測定する工程；ならびに
（ｃ）対照と比較して、前記レポーター遺伝子の発現または活性のレベルを増加させる候補化合物を選択する工程。
[本発明1017]
ＤＬＧ1の転写調節領域がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：56のヌクレオチド配列である、本発明1016の方法。
[本発明1018]
Ａ20（ＴＮＦＡＩＰ3）の転写調節領域がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：82のヌクレオチド配列である、本発明1016の方法。
[本発明1019]
がんが膀胱癌である、本発明1011、1015、および1016のいずれかの方法。
[本発明1020]
センス鎖とアンチセンス鎖とを含む二本鎖分子であって、該センス鎖がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：57または58からなる標的配列に対応するヌクレオチド配列を含み、かつ該アンチセンス鎖が該センス鎖に相補的なヌクレオチド配列を含み、センス分子および前記二本鎖分子が、ＺＮＦ224遺伝子を発現している細胞に導入された場合に該遺伝子の発現を阻害する、二本鎖分子。
[本発明1021]
約19〜約25ヌクレオチド長であるオリゴヌクレオチドである、本発明1020の二本鎖分子。
[本発明1022]
センス鎖がＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：9および10の中から選択される配列に対応する配列からなる、本発明1021の二本鎖分子。
[本発明1023]
一本鎖ヌクレオチド配列を介して連結されたセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む単一のヌクレオチド転写物である、本発明1020の二本鎖分子。
[本発明1024]
ポリヌクレオチドが、下記一般式を有する、本発明1023の二本鎖分子：
5’−［Ａ］−［Ｂ］−［Ａ’］−3’
式中、［Ａ］はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：57または58を含むヌクレオチド配列であり；［Ｂ］は約3〜約23個のヌクレオチドからなるヌクレオチド配列であり；かつ［Ａ’］は［Ａ］に相補的なヌクレオチド配列である。
[本発明1025]
［Ａ］が、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ：9および10の中から選択される配列に対応する配列からなる、本発明1024の二本鎖分子。
[本発明1026]
本発明1020〜1025のいずれかの二本鎖分子をコードするベクター。
[本発明1027]
薬学的に有効な量の、ＺＮＦ224遺伝子に対する二本鎖分子、または該二本鎖分子をコードするベクターと、薬学的に許容可能な担体とを対象へ投与する工程を含む、対象におけるがんを治療または予防する方法であって、該二本鎖分子および該ベクターが、ＺＮＦ224遺伝子を発現している細胞と接触して細胞増殖を阻害する、方法。
[本発明1028]
二本鎖分子が本発明1020の二本鎖分子である、本発明1027の方法。
[本発明1029]
ベクターが本発明1026のベクターである、本発明1027の方法。
[本発明1030]
治療されるがんが膀胱癌である、本発明1027の方法。
[本発明1031]
薬学的に有効な量の、ＺＮＦ224遺伝子に対する二本鎖分子、または該二本鎖分子を含むベクターと、薬学的に許容可能な担体とを含む、がんを治療または予防するための組成物であって、該二本鎖分子および該ベクターが、ＺＮＦ224遺伝子を発現している細胞と接触して細胞増殖を阻害する、組成物。
[本発明1032]
本発明1020の二本鎖分子を含む、本発明1031の組成物。
[本発明1033]
本発明1026のベクターを含む、本発明1031の組成物。
[本発明1034]
治療されるがんが膀胱癌である、本発明1031の組成物。