【手続補正書】
【提出日】平成26年1月10日(2014.1.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置であって、
（ａ）ＰＣＲを行うための反応容器を収容するように適応されたチャネルを加熱又は冷却し、上部面と下部面とを有する第１熱源と、
（ｂ）前記チャネルを加熱又は冷却し、上部面と前記第１熱源の上部面と向き合う下部面とを有する第２熱源と、
（ｃ）前記チャネルを加熱又は冷却し、上部面と前記第２熱源の上部面と向き合う下部面とを有する第３熱源であって、前記チャネルは、前記第１熱源と接触する下端部と前記第３熱源の上部面と接する貫通口により定義され、また前記下端部と前記貫通口との間の中心点がチャネル軸を形成し、前記チャネル軸を基準に前記チャネルが配置される、第３熱源と、
（ｄ）前記第２又は第３熱源の少なくとも一部内で前記チャネルの周囲に配置されたチャンバーのような少なくとも一つの温度形状化要素であって、前記チャンバーは、前記第２又は第３熱源及び前記チャネルの間に、前記第２又は第３熱源と前記チャネルとの間の熱伝逹を減少させるほど十分なチャンバーギャップを有する、少なくとも一つの温度形状化要素と、
（ｅ）前記第１熱源内で前記チャネルを収容するように適応された収容口と
備えることを特徴とする熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項２】
前記装置は、前記第１熱源の上部面と前記第２熱源の下部面との間に位置した第１断熱体を備え、かつ、
前記装置は、前記第２熱源の上部面と前記第３熱源の下部面との間に位置した第２断熱体を備える
ことを特徴とする請求項１に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項３】
前記装置は、前記第２熱源内に完全に位置した第１チャンバーを備え、
前記第１チャンバーは、前記チャネル軸に沿って第１チャンバーの下端部と向き合う第１チャンバーの上端部を備え、かつ、
前記第１チャンバーは、前記チャネル軸の周囲に配置された少なくとも一個のチャンバー壁を備える
ことを特徴とする請求項１に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項４】
前記装置は、前記第２熱源に位置する第２チャンバーをさらに備えることを特徴とする請求項３に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項５】
前記第１断熱体及び第２断熱体は、固体又は気体を含むことを特徴とする請求項２に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項６】
前記第１チャンバーは、固体又は気体を含むことを特徴とする請求項３に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項７】
前記気体は、空気であることを特徴とする請求項５ないし６のうちの何れか１項に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項８】
前記第１チャンバーは、前記チャネル軸に垂直な面に沿って前記チャネルを基準に本質的に対称的に配置されることを特徴とする請求項３に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項９】
前記第１チャンバーの少なくとも一部は、前記チャネル軸に垂直な面に沿って前記チャネルを基準に非対称的に配置されることを特徴とする請求項３に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１０】
前記装置は、前記第２熱源内に位置する前記第１チャンバー及び前記第２チャンバーを備え、前記第１チャンバーは、前記第２チャンバーから前記チャネル軸の方向の長さ（ｌ）だけ離隔していることを特徴とする請求項４に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１１】
前記第１チャンバー、前記第２チャンバー、及び前記第２熱源は、前記第１熱源からの又は前記第３熱源への熱伝逹を減少させるほど十分な面積と厚さ（又は体積）で前記第１及び第２チャンバーの間で前記チャネルと接触する第１温度ブレーキを定義することを特徴とする請求項１０に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１２】
前記装置は、前記第１熱源の上部面と前記第２熱源の下部面との間に位置した第１断熱体を備え、かつ、
前記第１チャンバーは、前記第２熱源内に位置し、前記第１チャンバー及び前記第１断熱体は、前記第１熱源からの熱伝逹を減少させるほど十分な面積と厚さ（又は体積）で前記第１チャンバー及び前記第１断熱体の間で前記チャネルと接触する第１温度ブレーキを定義することを特徴とする請求項３に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１３】
前記第１温度ブレーキは、上部面と下部面とを有し、かつ、
前記第１温度ブレーキの前記下部面は、前記第２熱源の前記下部面とほぼ同じ高さに位置する
ことを特徴とする請求項１２に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１４】
前記第２熱源は、前記第２熱源から遠ざかり、前記第１又は第３熱源に向かって延びる少なくとも一つの突出部を備えることを特徴とする請求項１〜６及び８〜１３のうちの何れか１項に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１５】
前記第１熱源は、前記第１熱源から遠ざかり、前記第２熱源に向かって伸びる、又は、前記第１熱源の下部面から遠ざかって延びる少なくとも一つの突出部を備えることを特徴とする請求項１〜６及び８〜１３のうちの何れか１項に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１６】
前記第３熱源は、前記第３熱源から遠ざかり、前記第２熱源に向かって伸びる、又は、前記第３熱源の上部面から遠ざかって延びる少なくとも一つの突出部を備えることを特徴とする請求項１〜６及び８〜１３のうちの何れか１項に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１７】
前記装置は、前記チャネル軸が重力方向に対して傾斜するように適用されることを特徴とする請求項１〜６及び８〜１３のうちの何れか１項に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１８】
前記チャネル軸は、前記第１、第２、及び第３熱源のうち何れか一つの上部面又は下部面に垂直で、前記装置は、傾斜していることを特徴とする請求項１７に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項１９】
熱対流により重合酵素連鎖反応（ＰＣＲ）を行うための方法であって、
（ａ）二本鎖核酸分子を変性させて一本鎖鋳型を形成するのに適した温度範囲に、収容口を備える第１熱源を維持するステップと、
（ｂ）少なくとも一つのオリゴヌクレオチドプライマーを前記一本鎖鋳型にアニールするのに適した温度範囲に第３熱源を維持するステップと、
（ｃ）前記一本鎖鋳型に沿って前記プライマーの重合を助けるのに適した温度に第２熱源を維持するステップと、
（ｄ）プライマー伸長生成物を生成するのに十分な条件下で前記収容口と前記第３熱源との間に熱対流を生成するステップと
のうち、少なくとも一つのステップを含むことを特徴とする熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２０】
前記方法は、水溶液内にある前記二本鎖核酸及びオリゴヌクレオチドプライマー、並びに、水溶液内にあるＤＮＡ重合酵素又は固定化されたＤＮＡ重合酵素を含む反応容器を提供するステップをさらに含むことを特徴とする請求項１９に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２１】
前記方法は、前記反応容器を前記収容口、及び前記第２又は第３熱源のうち、少なくとも一つの中に配置されたチャンバーのような少なくとも一つの温度形状化要素に接触させるステップをさらに含み、前記接触は、前記反応容器内で前記熱対流を助けるほど十分であることを特徴とする請求項２０に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２２】
前記方法は、前記反応容器を前記第１及び第２熱源の間の第１断熱体及び前記第２及び第３熱源の間の第２断熱体に接触させるステップをさらに含むことを特徴とする請求項２１に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２３】
前記方法は、前記チャネル軸に対して本質的に対称的な前記反応容器内の流体流れを生成するステップをさらに含むことを特徴とする請求項２０に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２４】
前記方法は、前記チャネル軸を基準に非対称である前記反応容器内の流体流れを生成するステップをさらに含むことを特徴とする請求項２０に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２５】
少なくともステップ（ａ）ないし（ｃ）は、プライマー伸長生成物を生成するために、反応容器当たりの約１Ｗの電力より少ない電力を消費することを特徴とする請求項２０に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２６】
前記ＰＣＲ伸長生成物は、約１５分ないし約３０分内又はより短い時間内に生成されることを特徴とする請求項１９に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２７】
熱対流により重合酵素連鎖反応（ＰＣＲ）を行うための方法であって、前記方法は、プライマー伸長生成物を生成するのに十分な条件下で請求項１〜６及び８〜１３のうちの何れか１項に記載の装置により収容される反応容器に、オリゴヌクレオチドプライマー、核酸鋳型、ＤＮＡ重合酵素、及び緩衝溶液を追加するステップを含むことを特徴とする熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項２８】
少なくとも一つの光学検出装置をさらに備えることを特徴とする請求項１〜６及び８〜１３のうちの何れか１項に記載の熱対流ＰＣＲを行うように適応された装置。
【請求項２９】
少なくとも一つの光学検出装置を使用して前記プライマー伸長生成物をリアルタイムで検出するステップをさらに含むことを特徴とする請求項１９〜２６のうちの何れか１項に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。
【請求項３０】
少なくとも一つの光学検出装置を使用してプライマー伸長生成物をリアルタイムで検出するステップをさらに含む請求項２７に記載の熱対流により重合酵素連鎖反応を行うための方法。