【手続補正書】
【提出日】平成26年10月24日(2014.10.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象外来性ＲＮＡの特定の標的部位での特異的切断を指示するための１以上のポリヌクレオチドを含む組成物であって、前記切断が細胞内に内在性シグナルＲＮＡが存在する場合にのみ起こり、前記内在性シグナルＲＮＡが、シグナル配列を含むＲＮＡ分子であり、前記シグナル配列が１８〜２５ヌクレオチド長の任意の所定配列であり、
これにより、前記組成物を前記内在性シグナルＲＮＡを含む細胞に導入することで、特定の配列内に位置する特定の標的部位での前記対象外来性ＲＮＡの切断が指示され、前記特定の配列は所定シグナル配列とハイブリダイズするために十分な相補性がある、組成物。
【請求項２】
前記１以上のポリヌクレオチドが、
前記対象外来性ＲＮＡをコードする第１のポリヌクレオチド配列；
所定切断部位での内在性シグナルＲＮＡの切断を媒介し得る機能的ＲＮＡをコードする第２のポリヌクレオチド配列；および
キャリアＲＮＡをコードする第３のポリヌクレオチド配列
を含む、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のＲＮＡ分子であって、かつ、前記ＲＮＡ分子が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド下流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の下流に延びる）；
（２）前記第１の配列の下流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；
（３）前記第１の配列の上流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり；かつ
前記所定切断部位が前記所定シグナル配列の５′末端であり、好ましくは、
前記エッジ配列が２３〜２８ヌクレオチド長であって、所定切断部位から約２３〜２８ヌクレオチド下流までに位置し、前記第２の配列が２ヌクレオチド長であり、かつ、前記第３の配列が０ヌクレオチド長である；または、
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のＲＮＡ分子を含み、かつ、前記ＲＮＡ分子が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド上流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延びる）；
（２）前記第１の配列の上流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；
（３）前記第１の配列の下流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり；かつ
前記所定切断部位が前記所定シグナル配列の３′末端であり、好ましくは、
前記エッジ配列が２５〜３０ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から２ヌクレオチド上流に位置し、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延び、前記第２の配列が０ヌクレオチド長であり、かつ、前記第３の配列が０ヌクレオチド長である；または、
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のキャリア配列を含むポリヌクレオチド配列からプロセシングされ、前記キャリア配列が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド下流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の下流に延びる）；
（２）前記第１の配列の下流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の上流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり；
前記ポリヌクレオチド配列が、細胞内において、前記キャリア配列の３′末端であるキャリア切断部位で切断され；
前記キャリア切断部位での切断が、前記組成物の第４のポリヌクレオチド配列によりコードされている機能的核酸によって果たされ；かつ
前記所定切断部位が前記所定シグナル配列の５′末端であり、好ましくは、
前記エッジ配列が２３〜２８ヌクレオチド長であって、所定切断部位から約２３〜２８ヌクレオチド下流までに位置し、前記第２の配列が２ヌクレオチド長であり、かつ、前記第３の配列が０ヌクレオチド長である、または、
前記対象外来性ＲＮＡ、機能的ＲＮＡおよび機能的核酸を１以上のポリヌクレオチド分子上に位置させることができる；または、
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のキャリア配列を含むポリヌクレオチド配列からプロセシングされ、前記キャリア配列が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド上流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延びる）；
（２）前記第１の配列の上流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の下流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり；
前記ポリヌクレオチド配列が、細胞内において、前記キャリア配列の５′末端であるキャリア切断部位で切断され；
前記キャリア切断部位での切断が、前記組成物の第４のポリヌクレオチド配列によりコードされている機能的核酸によって果たされ；かつ
前記所定切断部位が前記所定シグナル配列の３′末端であり、好ましくは、
前記エッジ配列が２５〜３０ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から２ヌクレオチド上流に位置し、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延び、前記第２の配列が０ヌクレオチド長であり、かつ、前記第３の配列が０ヌクレオチド長である；または、
前記対象外来性ＲＮＡ、機能的ＲＮＡおよび機能的核酸を１以上のポリヌクレオチド分子上に位置させることができる；または、
前記機能的ＲＮＡが、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、投げ輪型ＲＮＡ、低分子ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ発現ドメイン、アンチセンスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）およびリボザイムからなる群から選択される；または、
前記対象外来性ＲＮＡと前記機能的ＲＮＡを同じまたは異なるポリヌクレオチド分子上に位置させることができる、請求項２に記載の組成物。
【請求項４】
前記内在性シグナルＲＮＡが細胞ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡまたはその双方である；または、
前記所定シグナル配列が新生細胞、ウイルス感染細胞またはその双方に独特なものである；または、
十分な相補性が少なくとも３０％の相補性である；または、
前記十分な相補性が少なくとも９０％である；または、
前記１以上のポリヌクレオチドが１以上のＤＮＡ分子、１以上のＲＮＡ分子またはその組合せを含む；または、
前記細胞がヒト細胞、動物細胞、培養細胞および植物細胞からなる群から選択される；または、
前記細胞が生物体内に存在する、請求項１に記載の組成物。
【請求項５】
前記対象外来性ＲＮＡが、
（ａ）対象外来性タンパク質をコードする配列；および
（ｂ）前記対象外来性タンパク質の発現を阻害し得る阻害配列
をさらに含み、
前記特定の標的部位が前記阻害配列と前記対象外来性タンパク質をコードする配列の間に位置し、これにより、前記組成物を内在性シグナルＲＮＡを含む細胞に導入した後に、前記対象外来性ＲＮＡが転写され、前記特定の標的部位で切断され、それにより、前記阻害配列が前記対象外来性タンパク質をコードする配列から分離され、対象外来性タンパク質が発現され得る、請求項１に記載の組成物。
【請求項６】
前記対象外来性タンパク質が、リシン、リシンＡ鎖、アブリン、アブリンＡ鎖、ジフテリア毒素Ａ鎖およびそれらの改変形態からなる群から選択される；または、
前記対象外来性タンパク質が、アルファトキシン、サポリン、トウモロコシＲＩＰ（ｍａｉｚｅ  ＲＩＰ）、オオムギＲＩＰ、コムギＲＩＰ、トウモロコシＲＩＰ（ｃｏｒｎ  ＲＩＰ）、ライムギＲＩＰ、アマＲＩＰ、志賀毒素、志賀毒素様ＲＩＰ、モモルジン、チミジンキナーゼ、ブタクサ抗ウイルスタンパク質、ゲロニン、シュードモナス外毒素、シュードモナス外毒素Ａ、大腸菌シトシンデアミナーゼおよびそれらの改変形態からなる群から選択される；または、
前記阻害配列が前記対象外来性タンパク質をコードする配列の下流に位置し、前記阻害配列が細胞内局在のためのＲＮＡ局在化シグナルまたは内在性ｍｉＲＮＡ結合部位を含む；または、
前記対象外来性ＲＮＡが前記特定の切断部位の下流であって、かつ、前記対象外来性タンパク質をコードする配列の上流に内部リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）配列を含み、前記ＩＲＥＳ配列が完全な対象外来性ＲＮＡ内よりも切断された対象外来性ＲＮＡ内でより機能的となる；または、
前記対象外来性ＲＮＡが前記対象外来性タンパク質をコードする配列からすぐ上流にヌクレオチド配列をさらに含み、前記ヌクレオチド配列が切断された対象外来性ＲＮＡにおける前記対象外来性タンパク質の翻訳効率を高め得る内部リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）配列を含む；または、
前記対象外来性ＲＮＡが前記対象外来性タンパク質をコードする配列からすぐ下流に位置する細胞質ポリアデニル化エレメントを含むヌクレオチド配列をさらに含み、前記細胞質ポリアデニル化エレメントが切断された対象外来性ＲＮＡにおける前記対象外来性タンパク質の翻訳効率を高める；または、
前記組成物が付加的ＲＮＡ分子をコードする付加的ポリヌクレオチド配列をさらに含み、前記付加的ＲＮＡ分子がその３′末端に、前記特定の標的部位の上流であって、かつ、前記対象外来性タンパク質をコードする配列の下流に位置する配列に結合し得るヌクレオチド配列を含み、前記付加的ＲＮＡ分子が、切断された対象外来性ＲＮＡにおける前記対象外来性タンパク質の翻訳効率を高める；または、
前記組成物が阻害配列の上流に位置する位置での前記対象外来性ＲＮＡの切断を果たし得る切断成分をコードする付加的ポリヌクレオチド配列をさらに含み、前記切断成分が
（ａ）前記対象外来性ＲＮＡ内に位置し、エンドヌクレアーゼ認識部位、内在性ｍｉＲＮＡ結合部位、シス作用リボザイムおよびｍｉＲＮＡ配列からなる群から選択され、前記対象外来性ＲＮＡにおける前記対象外来性タンパク質の翻訳効率を低減する、核酸配列；
（ｂ）マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、投げ輪型ＲＮＡ、低分子ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ発現ドメイン、アンチセンスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）およびリボザイムからなる群から選択され、前記対象外来性ＲＮＡにおける前記対象外来性タンパク質の翻訳効率を低減する、阻害ＲＮＡ
からなる群から選択される；または、
前記特定の配列が複数の特定の配列であり、前記特定の標的部位が複数の特定の標的部位である；または、
前記阻害配列が前記対象外来性タンパク質をコードする配列の上流に位置し、前記阻害配列が折畳み自由エネルギーが−３０ｋｃａｌ／ｍｏｌ未満である二次構造を形成することができ、これにより、前記二次構造が、読み取りリボソームが前記対象外来性タンパク質の最初のコドン（ｓｔａｒｔ  ｃｏｄｏｎ）に達しないよう遮断するために十分なものとなる；または、
前記阻害配列が前記特定の標的部位の上流に位置し、かつ、前記阻害配列が前記対象外来性タンパク質の翻訳効率を低減し；好ましくは、前記阻害配列が複数の開始コドンを含み、前記開始コドンのそれぞれと前記対象外来性タンパク質をコードする配列が同じリーディングフレームになく；より好ましくは、
前記対象外来性ＲＮＡが、前記開始コドンと前記対象外来性タンパク質をコードする配列の最初のコドン（ｓｔａｒｔ  ｃｏｄｏｎ）との間に位置する終止コドンをさらに含み、前記終止コドンと前記開始コドンが同じリーディングフレームにある；または、
前記阻害配列が開始コドンの下流にヌクレオチド配列をさらに含み、前記ヌクレオチド配列と前記開始コドンが同じリーディングフレームにあり、かつ、前記ヌクレオチド配列が細胞内局在のための選別シグナルをコードし；より好ましくは、前記細胞内局在がミトコンドリア、核、エンドソーム、リソソーム、ペルオキシソームおよび小胞体（ＥＲ）からなる群から選択され；または、
前記阻害配列が開始コドンの下流にヌクレオチド配列をさらに含み、前記ヌクレオチド配列と前記開始コドンが同じリーディングフレームにあり、かつ、前記ヌクレオチド配列がタンパク質分解シグナルをコードする；または、
前記阻害配列が開始コドンの下流にヌクレオチド配列をさらに含み、前記ヌクレオチド配列と前記開始コドンが同じリーディングフレームにあり；前記ヌクレオチド配列と前記対象外来性タンパク質をコードする配列が同じリーディングフレームにあり、前記ヌクレオチド配列があるアミノ酸配列をコードし、これにより、前記アミノ酸配列が前記対象外来性タンパク質に融合されると、前記対象外来性タンパク質の生物学的機能が阻害される；または、
前記対象外来性ＲＮＡが前記開始コドンの下流に終止コドンをさらに含み、前記終止コドンと前記開始コドンが同じリーディングフレームにあり、かつ、前記対象外来性ＲＮＡが前記終止コドンの下流にイントロンをさらに含み、これにより、前記対象外来性ＲＮＡがナンセンス依存分解（ＮＭＤ）の標的となる、請求項５に記載の組成物。
【請求項７】
細胞において対象外来性タンパク質の特異的発現を指示するための１以上のポリヌクレオチドを含む組成物であって、前記対象外来性タンパク質が細胞に内在性シグナルＲＮＡが存在する場合にのみ発現され、前記内在性シグナルＲＮＡがシグナル配列を含むＲＮＡ分子であり、前記シグナル配列が１８〜２５ヌクレオチド長の任意の所定配列であり、これにより、前記組成物を前記内在性シグナルＲＮＡを含む細胞に導入することで、特定の配列内に位置する特定の標的部位での対象外来性ＲＮＡの切断が指示され、前記特定の配列は所定シグナル配列とハイブリダイズするために十分な相補性があり、細胞において前記対象外来性ＲＮＡが切断された後にのみ、前記切断された対象外来性ＲＮＡによりコードされている対象外来性タンパク質がその細胞において発現され得る、組成物。
【請求項８】
前記１以上のポリヌクレオチドが、
前記対象外来性ＲＮＡをコードする第１のポリヌクレオチド配列；
所定切断部位での内在性シグナルＲＮＡの切断を媒介し得る機能的ＲＮＡをコードする第２のポリヌクレオチド配列；および
キャリアＲＮＡをコードする第３のポリヌクレオチド配列
を含む、請求項７に記載の組成物。
【請求項９】
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のＲＮＡ分子であって、かつ、前記ＲＮＡ分子が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド下流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の下流に延びる）
（２）前記第１の配列の下流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の上流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になる；または、
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のＲＮＡ分子を含み、かつ、前記ＲＮＡ分子が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド上流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延びる）
（２）前記第１の配列の上流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の下流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり、好ましくは、
前記細胞がヒト細胞、動物細胞、培養細胞および植物細胞からなる群から選択される、または、
前記細胞が生物体内に存在する；または、
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のキャリア配列を含むポリヌクレオチド配列からプロセシングされ、前記キャリア配列が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド下流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の下流に延びる）
（２）前記第１の配列の下流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の上流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり、
前記ポリヌクレオチド配列が、細胞内において、前記キャリア配列の３′末端であるキャリア切断部位で切断され；かつ
前記キャリア切断部位での切断が、前記組成物の第４のポリヌクレオチド配列によりコードされている機能的核酸によって果たされる；または、
前記キャリアＲＮＡが、少なくとも約１８ヌクレオチド長のキャリア配列を含むポリヌクレオチド配列からプロセシングされ、前記キャリア配列が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド上流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延びる）
（２）前記第１の配列の上流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の下流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり、
前記ポリヌクレオチド配列が、細胞内において、前記キャリア配列の５′末端であるキャリア切断部位で切断され；かつ
前記キャリア切断部位での切断が、前記組成物の第４のポリヌクレオチド配列によりコードされている機能的核酸によって果たされる、請求項８に記載の組成物。
【請求項１０】
前記対象外来性ＲＮＡが、
ａ）前記対象外来性タンパク質をコードする配列；および
ｂ）対象外来性タンパク質の発現を阻害し得る阻害配列
をさらに含み、
前記特定の標的部位が、前記阻害配列と前記対象外来性タンパク質をコードする配列の間に位置し、これにより、前記組成物を内在性シグナルＲＮＡを含む細胞に導入した後に、前記対象外来性ＲＮＡが転写され、前記特定の標的部位で切断され、それにより、前記阻害配列が前記対象外来性タンパク質をコードする配列から分離され、対象外来性タンパク質が発現され得る；または、
前記内在性シグナルＲＮＡが細胞ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡまたはその双方である；または、
前記所定シグナル配列が新生細胞、ウイルス感染細胞またはその双方である；または、
十分な相補性が少なくとも３０％の相補性である；または、
前記十分な相補性が少なくとも９０％である；または、
前記１以上のポリヌクレオチドが１以上のＤＮＡ分子、１以上のＲＮＡ分子またはその組合せを含む；または、
前記対象外来性タンパク質がリシン、リシンＡ鎖、アブリン、アブリンＡ鎖、ジフテリア毒素Ａ鎖、アルファトキシン、サポリン、トウモロコシＲＩＰ（ｍａｉｚｅ  ＲＩＰ）、オオムギＲＩＰ、コムギＲＩＰ、トウモロコシＲＩＰ（ｃｏｒｎ  ＲＩＰ）、ライムギＲＩＰ、アマＲＩＰ、志賀毒素、志賀毒素様ＲＩＰ、モモルジン、チミジンキナーゼ、ブタクサ抗ウイルスタンパク質、ゲロニン、シュードモナス外毒素、シュードモナス外毒素Ａ、大腸菌シトシンデアミナーゼおよびそれらの改変形からなる群から選択される；または、
前記機能的ＲＮＡがマイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、投げ輪型ＲＮＡ、低分子ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ発現ドメイン、アンチセンスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）およびリボザイムからなる群から選択される、請求項７に記載の組成物。
【請求項１１】
内在性シグナルＲＮＡを含む特異的細胞集団を死滅させる方法であって、前記細胞集団に、対象外来性ＲＮＡの、特定の配列内に位置する特定の標的部位での特異的切断を指示するための１以上のポリヌクレオチドを含む組成物を導入することを含み、前記特定の配列が前記内在性シグナルＲＮＡとハイブリダイズするために十分な相補性があり、前記内在性シグナルＲＮＡがシグナル配列を含むＲＮＡ分子であり、前記シグナル配列が１８〜２５ヌクレオチド長の任意の所定配列であり；
前記細胞集団において対象外来性ＲＮＡが切断されると、前記細胞集団を死滅させ得る対象外来性タンパク質の発現が可能となる、方法。
【請求項１２】
前記１以上のポリヌクレオチドが、
前記対象外来性ＲＮＡをコードする第１のポリヌクレオチド配列；
所定切断部位での内在性シグナルＲＮＡの切断を媒介し得る機能的ＲＮＡをコードする第２のポリヌクレオチド配列；および
キャリアＲＮＡをコードする第３のポリヌクレオチド配列
を含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のＲＮＡ分子であって、かつ、前記ＲＮＡ分子が
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド下流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の下流に延びる）
（２）前記第１の配列の下流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の上流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になる；または、
前記キャリアＲＮＡが少なくとも約１８ヌクレオチド長のＲＮＡ分子を含み、かつ、前記ＲＮＡ分子が
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド上流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延びる）
（２）前記第１の配列の上流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の下流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になる；または、
前記キャリアＲＮＡが、少なくとも約１８ヌクレオチド長のキャリア配列を含むポリヌクレオチド配列からプロセシングされ、前記キャリア配列が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド下流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の下流に延びる）
（２）前記第１の配列の下流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の上流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり、
前記ポリヌクレオチド配列が、細胞内において、前記キャリア配列の３′末端であるキャリア切断部位で切断され；かつ
前記キャリア切断部位での切断が、前記組成物の第４のポリヌクレオチド配列によりコードされている機能的核酸によって果たされる；または、
前記キャリアＲＮＡが、少なくとも約１８ヌクレオチド長のキャリア配列を含むポリヌクレオチド配列からプロセシングされ、前記キャリア配列が、
（１）エッジ配列とハイブリダイズするためにそれと十分な相補性がある１４〜３１ヌクレオチド長の第１の配列（前記エッジ配列は１４〜３１ヌクレオチド長であって、前記所定切断部位から０〜５ヌクレオチド上流に位置し、かつ、前記内在性シグナルＲＮＡ内の上流に延びる）
（２）前記第１の配列の上流にあり、０〜５ヌクレオチド長のランダム配列である第２の配列；および
（３）前記第１の配列の下流にあり、０〜７０００ヌクレオチド長である第３の配列
から本質的になり、
前記ポリヌクレオチド配列が、細胞内において、前記キャリア配列の５′末端であるキャリア切断部位で切断され；かつ
前記キャリア切断部位での切断が、前記組成物の第４のポリヌクレオチド配列によりコードされている機能的核酸によって果たされる、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記内在性シグナルＲＮＡが細胞ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡまたはその双方である；または、
十分な相補性が少なくとも３０％の相補性である；または、
前記十分な相補性が少なくとも９０％である；または、
前記ポリヌクレオチドが１以上のＤＮＡ分子、１以上のＲＮＡ分子またはその組合せである；または、
前記機能的ＲＮＡがマイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、投げ輪型ＲＮＡ、低分子ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ発現ドメイン、アンチセンスＲＮＡ、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）およびリボザイムからなる群から選択される；または、
前記対象外来性タンパク質がリシン、リシンＡ鎖、アブリン、アブリンＡ鎖、ジフテリア毒素Ａ鎖、アルファトキシン、サポリン、トウモロコシＲＩＰ（ｍａｉｚｅ  ＲＩＰ）、オオムギＲＩＰ、コムギＲＩＰ、トウモロコシＲＩＰ（ｃｏｒｎ  ＲＩＰ）、ライムギＲＩＰ、アマＲＩＰ、志賀毒素、志賀毒素様ＲＩＰ、モモルジン、チミジンキナーゼ、ブタクサ抗ウイルスタンパク質、ゲロニン、シュードモナス外毒素、シュードモナス外毒素Ａ、大腸菌シトシンデアミナーゼおよびそれらの改変形態からなる群から選択される；または、
前記細胞集団がヒト細胞、動物細胞、培養細胞および植物細胞からなる群から選択される；または、
前記細胞集団が新生細胞集団である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
癌を治療するための、請求項1に記載の組成物。