【手続補正書】
【提出日】平成26年9月11日(2014.9.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
標的分子を、被験体の生理学的状況の指標とするための方法であって、
前記被験体からの胃腸洗浄液および／または糞便試料中の胃腸系の外側に由来する前記標的分子を検出することを含む、方法。
【請求項２】
前記胃腸洗浄液が、前記被験体の胃腸系を部分的に浄化することによって前記被験体から得られる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ａ）前記標的分子が、ポリペプチド、抗体、胆汁酸、代謝産物またはグリカンを含む；
ｂ）前記標的分子が、バイオマーカーを含み、必要に応じて前記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答、治療に対する部分的応答、治療に対する負の応答または治療に対する応答がないことと関連している；
ｃ）前記標的分子が、癌または癌の素因の存在と関連し、必要に応じて前記癌が、膵臓癌、結腸直腸癌、肝臓癌または胃癌である；ならびに／あるいは
ｄ）前記標的分子が、付属消化腺に由来し、必要に応じて前記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、
請求項１から２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４】
洗浄液が前記被験体に投与され、必要に応じて、
ａ）前記洗浄液が、経口投与される；
ｂ）前記洗浄液が、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む；ならびに／あるいは
ｃ）前記洗浄液が、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される；
ことを特徴とする、請求項１から３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
大腸内視鏡検査が前記被験体に対して実施されることを特徴とする、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記被験体が、哺乳類であり、必要に応じてヒトである、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
バイオマーカーを同定するための方法であって、
試験胃腸洗浄液および／または試験糞便試料および対照胃腸洗浄液および／または対照糞便試料中の少なくとも５種の標的分子のレベルを決定することであって、前記試験胃腸洗浄液および／または前記試験糞便試料は、目的の状態または生理学的状況を有する複数の試験被験体から得られたものであり、前記対照胃腸洗浄液および／または前記対照糞便試料は、前記状態も前記生理学的状況も有さない複数の対照被験体から得られたものである、標的分子のレベルを決定すること、ならびに
前記対照胃腸洗浄液および／または前記対照糞便試料中のレベルに対して前記試験胃腸洗浄液および／または前記試験糞便試料中で有意に異なるレベルで存在する標的分子を同定し、それによってバイオマーカーを同定することと
を含む方法。
【請求項８】
ａ）前記標的分子が、ポリペプチド、胆汁酸、抗体、代謝産物、グリカンおよびそれらの組合せからなる群より選択される；
ｂ）前記標的分子が、バイオマーカーを含み、必要に応じて前記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答、治療に対する部分的応答、治療に対する負の応答または治療に対する応答がないことと関連している；
ｃ）前記標的分子が、癌または癌の素因の存在と関連し、必要に応じて前記癌が、膵臓癌、結腸直腸癌、肝臓癌または胃癌である；
ｄ）前記標的分子が、付属消化腺に由来し、必要に応じて前記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、
請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記試験胃腸洗浄液および／または前記試験糞便試料および前記対照胃腸洗浄液および／または前記対照糞便試料中の少なくとも１０種、少なくとも２０種、少なくとも３０種、少なくとも５０種または少なくとも１００種の標的分子のレベルを決定することを含む、請求項７に記載の方法。
【請求項１０】
洗浄液が前記試験被験体および前記対照被験体に投与され、必要に応じて
ａ）前記洗浄液が、経口投与される；
ｂ）前記洗浄液が、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む；ならびに／あるいは
ｃ）前記洗浄液が、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される；
ことを特徴とする、請求項７に記載の方法。
【請求項１１】
大腸内視鏡検査が前記試験被験体および前記対照被験体に対して実施されることを特徴とする、請求項７に記載の方法。
【請求項１２】
前記試験被験体および前記対照被験体が、哺乳類であり、必要に応じてヒトである、請求項７に記載の方法。
【請求項１３】
胃腸洗浄液および／または糞便試料中の標的分子を検出するためのキットであって、
被験体へ経口投与するための洗浄液と、
前記被験体から前記胃腸洗浄液および／または前記糞便試料を収集するための容器と、
胃腸系の外側に由来する標的分子を検出するための薬剤と
を含むキット。
【請求項１４】
プロテアーゼ阻害剤をさらに含む、請求項１３に記載のキット。
【請求項１５】
ａ）前記標的分子が、ポリペプチド、抗体、胆汁酸、代謝産物またはグリカンを含む；
ｂ）前記標的分子が、バイオマーカーを含み、必要に応じて前記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答、治療に対する部分的応答、治療に対する負の応答または治療に対する応答がないことと関連している；
ｃ）前記標的分子が、癌または癌の素因の存在と関連し、必要に応じて前記癌が、膵臓癌、結腸直腸癌、肝臓癌または胃癌である；ならびに／あるいは
ｄ）前記標的分子が、付属消化腺に由来し、必要に応じて前記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、
請求項１３に記載のキット。
【請求項１６】
ａ）前記洗浄液が、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む；ならびに／あるいは
ｂ）前記洗浄液が、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される、
請求項１３に記載のキット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４０】
いくつかの実施形態では、洗浄液は、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む。いくつかの実施形態では、洗浄液は、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される。
例えば、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
被験体の生理学的状況を評価するための方法であって、
上記被験体から胃腸洗浄液を得ることと、
上記胃腸洗浄液中の胃腸系の外側に由来する標的分子を検出することと
を含む方法。
（項目２）
被験体の生理学的状況を評価するための方法であって、
上記被験体から糞便試料を得ることと、
上記糞便試料中の胃腸系の外側に由来する標的分子を検出することと
を含む方法。
（項目３）
上記胃腸洗浄液が、上記被験体の胃腸系を部分的に浄化することによって上記被験体から得られる、項目１に記載の方法。
（項目４）
上記胃腸洗浄液が、糞便物質を含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
上記糞便試料が、胃腸洗浄液を含む、項目２に記載の方法。
（項目６）
上記標的分子が、ポリペプチド、抗体、胆汁酸、代謝産物またはグリカンを含む、項目１から５のいずれか一項に記載の方法。
（項目７）
上記標的分子が、バイオマーカーを含む、項目１から６のいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
上記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答、治療に対する部分的応答、治療に対する負の応答または治療に対する応答がないことと関連している、項目７に記載の方法。
（項目９）
上記標的分子が、癌または癌の素因の存在と関連している、項目１から８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０）
上記癌が、膵臓癌、結腸直腸癌、肝臓癌または胃癌である、項目８に記載の方法。
（項目１１）
上記標的分子が、付属消化腺に由来する、項目１から１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
上記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
上記被験体に洗浄液を投与することをさらに含む、項目１から１２のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４）
上記洗浄液が、経口投与される、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
上記洗浄液が、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む、項目１３に記載の方法。
（項目１６）
上記洗浄液が、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される、項目１３に記載の方法。
（項目１７）
上記被験体に対して大腸内視鏡検査を実施することをさらに含む、項目１から１６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
上記被験体が、哺乳類である、項目１から１７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
上記被験体が、ヒトである、項目１から１８のいずれか一項に記載の方法。
（項目２０）
バイオマーカーを同定するための方法であって、
目的の状態または生理学的状況を有する複数の試験被験体から試験胃腸洗浄液、および上記状態も上記生理学的状況も有さない複数の対照被験体から対照胃腸洗浄液を得ることと、
上記試験胃腸洗浄液および上記対照胃腸洗浄液中の少なくとも５種の標的分子のレベルを決定することと、
上記対照胃腸洗浄液中のレベルに対して上記試験胃腸洗浄液中で有意に異なるレベルで存在する標的分子を同定し、それによってバイオマーカーを同定することと
を含む方法。
（項目２１）
上記胃腸洗浄液が、糞便物質を含む、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
上記標的分子が、ポリペプチド、胆汁酸、抗体、代謝産物、グリカンおよびそれらの組合せからなる群より選択される、項目２０から２１のいずれか一項に記載の方法。
（項目２３）
上記試験胃腸洗浄液および上記対照胃腸洗浄液中の少なくとも１０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４）
上記試験胃腸洗浄液および上記対照胃腸洗浄液中の少なくとも２０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
上記試験胃腸洗浄液および上記対照胃腸洗浄液中の少なくとも３０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
上記試験胃腸洗浄液および上記対照胃腸洗浄液中の少なくとも５０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７）
上記試験胃腸洗浄液および上記対照胃腸洗浄液中の少なくとも１００種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２８）
上記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答、治療に対する部分的応答、治療に対する負の応答または治療に対する応答がないことと関連している、項目２０から２７のいずれか一項に記載の方法。
（項目２９）
上記バイオマーカーが、癌または癌の素因の存在と関連している、項目２０から２７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０）
上記癌が、膵臓癌、肝臓癌または胃癌である、項目２８に記載の方法。
（項目３１）
少なくとも１種の標的分子が、付属消化腺に由来する、項目２０から３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
上記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
上記試験被験体および上記対照被験体に洗浄液を投与することをさらに含む、項目２０から３２のいずれか一項に記載の方法。
（項目３４）
上記洗浄液が、経口投与される、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
上記洗浄液が、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む、項目３３に記載の方法。
（項目３６）
上記洗浄液が、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される、項目３３に記載の方法。
（項目３７）
上記試験被験体および上記対照被験体に対して大腸内視鏡検査を実施することをさらに含む、項目２０から３６のいずれか一項に記載の方法。
（項目３８）
上記試験被験体および上記対照被験体が、哺乳類である、項目２０から３７のいずれか一項に記載の方法。
（項目３９）
上記試験被験体および上記対照被験体が、ヒトである、項目２０から３８のいずれか一項に記載の方法。
（項目４０）
バイオマーカーを同定するための方法であって、
目的の状態を有する複数の試験被験体から試験糞便試料および複数の対照被験体から対照糞便試料を得ることと、
上記試験糞便試料および上記対照糞便試料中の少なくとも５種の標的分子のレベルを決定することと、上記対照糞便試料中のレベルに対して上記試験糞便試料中で有意に異なるレベルで存在する標的分子を同定し、それによってバイオマーカーを同定することと
を含む方法。
（項目４１）
上記糞便試料が、胃腸洗浄液を含む、項目４０に記載の方法。
（項目４２）
上記標的分子が、ポリペプチド、核酸、胆汁酸、抗体、代謝産物、グリカンおよびそれらの組合せからなる群より選択される、項目４０から４１のいずれか一項に記載の方法。
（項目４３）
上記試験糞便試料および上記対照糞便試料中の少なくとも１０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目４０から４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
上記糞便試料および上記対照糞便試料中の少なくとも２０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目４０から４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
上記糞便試料および上記対照糞便試料中の少なくとも３０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目４０から４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
上記糞便試料および上記対照糞便試料中の少なくとも５０種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目４０から４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４７）
上記糞便試料および上記対照糞便試料中の少なくとも１００種の標的分子のレベルを決定することを含む、項目４０から４２のいずれか一項に記載の方法。
（項目４８）
上記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答または治療に対する負の応答と関連している、項目４０から４７のいずれか一項に記載の方法。
（項目４９）
上記バイオマーカーが、癌または癌の素因の存在と関連している、項目４０から４８のいずれか一項に記載の方法。
（項目５０）
上記癌が、膵臓癌、結腸直腸癌、肝臓癌または胃癌である、項目４９に記載の方法。
（項目５１）
少なくとも１種の標的分子が、付属消化腺に由来する、項目４０から５０のいずれか一項に記載の方法。
（項目５２）
上記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
上記試験被験体および上記対照被験体が、哺乳類である、項目４０から５２のいずれか一項に記載の方法。
（項目５４）
上記試験被験体および上記対照被験体が、ヒトである、項目４０から５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５５）
胃腸洗浄液中の標的分子を検出するためのキットであって、
被験体へ経口投与するための洗浄液と、
上記被験体から上記胃腸洗浄液を収集するための容器と、
胃腸系の外側に由来する標的分子を検出するための薬剤と
を含むキット。
（項目５６）
糞便試料中の標的分子を検出するためのキットであって、
被験体へ経口投与するための洗浄液と、
上記被験体から上記糞便試料を収集するための容器と、
胃腸系の外側に由来する標的分子を検出するための薬剤と
を含むキット。
（項目５７）
プロテアーゼ阻害剤をさらに含む、項目５５から５６のいずれか一項に記載のキット。
（項目５８）
上記標的分子が、ポリペプチド、抗体、胆汁酸、代謝産物またはグリカンを含む、項目５５から５７のいずれか一項に記載のキット。
（項目５９）
上記標的分子が、バイオマーカーを含む、項目５５から５８のいずれか一項に記載のキット。
（項目６０）
上記バイオマーカーが、疾患、治療に対する正の応答または治療に対する負の応答と関連している、項目５９に記載のキット。
（項目６１）
上記標的分子が、癌または癌の素因の存在と関連している、項目５５から６０のいずれか一項に記載のキット。
（項目６２）
上記癌が、膵臓癌、肝臓癌、結腸直腸癌または胃癌である、項目６１に記載のキット。
（項目６３）
上記標的分子が、付属消化腺に由来する、項目５５から６２のいずれか一項に記載のキット。
（項目６４）
上記付属消化腺が、唾液腺、膵臓、胆嚢または肝臓である、項目６３に記載のキット。
（項目６５）
上記洗浄液が、ポリエチレングリコール、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、アスコルビン酸、ピコスルファートナトリウムおよびビサコジルからなる群より選択される成分を含む、項目５５から６４のいずれか一項に記載のキット。
（項目６６）
上記洗浄液が、ＧＯＬＹＴＥＬＹ、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ、ＮＵＬＹＴＥＬＹ、ＳＵＰＲＥＰ、ＦＬＥＥＴのＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、クエン酸マグネシウムおよびそれらの一般的な同等物からなる群より選択される、項目５５から６４のいずれか一項に記載のキット。