【手続補正書】
【提出日】平成23年11月16日(2011.11.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
質量分析基体であって、
スポットのアレイを含む支持体を含み、
該スポットの一部または全ては、質量分析条件下で形成される付加物の量を低減させる量のアスコルビン酸またはその塩、互変異体もしくは類似体を含む、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化（ＭＡＬＤＩ）質量分析法のためのマトリックスを含む、基体。
【請求項２】
各スポットは直径が約２００マイクロメーターから約１ミリメーターである、請求項１に記載の基体。
【請求項３】
スポットの中心間距離が約２．２５ミリメートルである、請求項１または２に記載の基体。
【請求項４】
スポットの中心間距離が約１．１２５ミリメートルである、請求項１または２に記載の基体。
【請求項５】
各スポットの厚さが約１０マイクロメートルから約１００マイクロメートルである、請求項１〜４のいずれか１項に記載の基体。
【請求項６】
前記マトリックスがアスコルビン酸またはその塩、互変異体もしくは類似体からなる、請求項１〜５のいずれか１項に記載の基体。
【請求項７】
前記スポットの一部または全てが核酸分析物を含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の基体。
【請求項８】
前記核酸がデオキシリボ核酸である、請求項７に記載の基体。
【請求項９】
前記核酸がリボ核酸である、請求項７に記載の基体。
【請求項１０】
前記マトリックスが約５ｍＭから約５０ｍＭのアスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む、請求項１〜９のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１１】
前記マトリックスが約５ｍＭから約５０ｍＭのアスコルビン酸を含む、請求項１０に記載の基体。
【請求項１２】
前記マトリックスが３−ヒドロキシピコリン酸（３−ＨＰＡ）を含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１３】
前記マトリックスがクエン酸ジアンモニウム（ＤＡＣ）を含む、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１４】
前記支持体がビーズ、チップ、毛細管、プレート、膜、ウエハ、コーム、ピン、ピットを有するウエハ、ピットもしくはナノリットルウェルのアレイおよび実質的に平坦な表面からなる群より選択される、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１５】
前記支持体がシリコンウエハである、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１６】
前記支持体が、親水性位置を囲む疎水性領域を有する実質的に平坦な表面であり、該位置の一部または全てがスポットを含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１７】
前記アスコルビン酸の類似体が以下の式：
【化２】
2011510272.tif 000001
に従うものであり、ここで：
Ｒ１およびＲ２は独立にＯＨ、ハロゲン、Ｒ３、ＯＲ３、アジド、シアノ、ＣＨ２Ｒ３、ＣＨＲ３Ｒ４、ＳＲ３、ＮＲ３Ｒ４であり；そして
Ｒ３およびＲ４は独立にＨ、アルキル、アセチレンもしくはシアノ、または任意に置換されたアリール炭素環式環、アリール複素環、非アリール炭素環式環もしくは非アリール複素環である、請求項１〜１０および１２〜１６のいずれか１項に記載の基体。
【請求項１８】
質量分析計および請求項１〜１７のいずれか１項に記載の質量分析基体を備える、質量分析システム。
【請求項１９】
方法であって、
（ａ）核酸と、アスコルビン酸またはその塩、互変異体もしくは類似体を含む添加剤とを含む組成物を提供するステップと
（ｂ）質量分析法によって該核酸を分析するステップと
を包含し、ここで、質量分析条件下で形成される付加物が低減される、方法。
【請求項２０】
前記添加剤がアスコルビン酸またはその塩、互変異体もしくは類似体からなる、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記添加剤がアスコルビン酸からなる、請求項２０に記載の方法。
【請求項２２】
前記添加剤がシュウ酸アンモニウムをさらに含む、請求項１９または２０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２３】
前記核酸がデオキシリボ核酸である、請求項１９〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
前記核酸がリボ核酸である、請求項１９〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２５】
前記質量分析法が、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析法、レーザー脱離質量分析法（ＬＤＭＳ）、エレクトロスプレー（ＥＳ）質量分析法、イオンサイクロトロン共鳴（ＩＣＲ）質量分析法、およびフーリエ変換質量分析法からなる群より選択される、請求項１９〜２４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
前記組成物がマトリックス支援レーザー脱離／イオン化（ＭＡＬＤＩ）質量分析法用のマトリックスを含む、請求項１９〜２５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２７】
前記マトリックスが３−ヒドロキシピコリン酸（３−ＨＰＡ）を含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
前記マトリックスがクエン酸ジアンモニウム（ＤＡＣ）を含む、請求項２６に記載の方法。
【請求項２９】
前記組成物が約５ｍＭから約５０ｍＭのアスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む、請求項１９〜２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
前記組成物が約５ｍＭから約５０ｍＭのアスコルビン酸を含む、請求項１９〜２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記アスコルビン酸の類似体が以下の式：
【化３】
2011510272.tif 000002
に従うものであり、ここで：
Ｒ１およびＲ２は独立にＯＨ、ハロゲン、Ｒ３、ＯＲ３、アジド、シアノ、ＣＨ２Ｒ３、ＣＨＲ３Ｒ４、ＳＲ３、ＮＲ３Ｒ４であり；そして
Ｒ３およびＲ４は独立にＨ、アルキル、アセチレンもしくはシアノ、または任意に置換されたアリール炭素環式環、アリール複素環、非アリール炭素環式環もしくは非アリール複素環である、請求項１９、２０および２２〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１８】
本発明の方法および組成物によって改善され得る質量分析法分析の例は、核酸シーケンシング、遺伝子型同定またはメチル化分析を含むがこれに限定されない。分析は、質量分析法によって行なわれる定性分析または定量分析であってもよい。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
質量分析法によって分析される分析物を含むサンプルにおける付加物形成を低減させるための方法であって、質量分析法による該分析物の分析の前に、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む付加物低減添加剤を該サンプルに加えるステップを含む、方法。
（項目２）
前記付加物低減添加剤はシュウ酸アンモニウムをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記分析物は核酸である、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記核酸はデオキシリボ核酸である、項目３に記載の方法。
（項目５）
前記核酸はリボ核酸である、項目３に記載の方法。
（項目６）
質量分析法による前記分析は、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析法、レーザー脱離質量分析法（ＬＤＭＳ）、エレクトロスプレー（ＥＳ）質量分析法、イオンサイクロトロン共鳴（ＩＣＲ）質量分析法、およびフーリエ変換質量分析法からなる群より選択される、項目１に記載の方法。
（項目７）
質量分析法によって分析される分析物を含むサンプルにおける付加物形成を低減させるための方法であって、質量分析法による該分析物の分析の前に、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む付加物低減添加剤をマトリックスに加えるステップを含む、方法。
（項目８）
質量分析法による前記分析物の分析の前に、前記付加物低減添加剤を該分析物にも加えるステップをさらに含む、項目７に記載の方法。
（項目９）
前記付加物低減添加剤はシュウ酸アンモニウムをさらに含む、項目７または８に記載の方法。
（項目１０）
前記マトリックス組成物は３-ヒドロキシピコリン酸（３-ＨＰＡ）を含む、項目７または８に記載の方法。
（項目１１）
前記マトリックス組成物はクエン酸ジアンモニウム（ＤＡＣ）を含む、項目７または８に記載の方法。
（項目１２）
前記分析物は核酸である、項目７または８に記載の方法。
（項目１３）
質量分析法において用いるために好適な基体を調製するための方法であって、付加物低減添加剤を含むマトリックス材料を該基体上に堆積させるステップを含み、該付加物低減添加剤はアスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む、方法。
（項目１４）
前記基体を密封するステップをさらに含む、項目１３に記載の方法。
（項目１５）
酸化を最小限にするために薬剤またはガスによって前記基体を処理するステップをさらに含む、項目１３に記載の方法。
（項目１６）
前記基体はシリカを含む、項目１３に記載の方法。
（項目１７）
前記付加物低減添加剤はシュウ酸アンモニウムをさらに含む、項目１３に記載の方法。
（項目１８）
質量分析法によって分析される組成物であって、分析物と付加物低減添加剤とを含む、組成物。
（項目１９）
前記付加物低減剤は、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む、項目１８に記載の組成物。
（項目２０）
シュウ酸アンモニウムをさらに含む、項目１９に記載の組成物。
（項目２１）
マトリックス組成物と、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体とを含む、組成物。
（項目２２）
マトリックス組成物と、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体と、シュウ酸アンモニウムとを含む、組成物。
（項目２３）
質量分析法による分析に好適な組成物であって、分析物と付加物低減添加剤とを含み、該添加剤はアスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体と、シュウ酸アンモニウムとを含む、組成物。
（項目２４）
質量分析法のための標的部位であって、基体と、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体およびシュウ酸アンモニウムを含む付加物低減添加剤とを含む、標的部位。
（項目２５）
マトリックス材料をさらに含む、項目２４に記載の標的部位。
（項目２６）
質量分析法分析のための分析物を調製するための方法であって、
分析物を含む溶液を、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体を含む組成物と接触させることによって、質量分析法分析のためのサンプルを調製するステップと；
該サンプルを質量分析計に導入するステップと
を含む、方法。
（項目２７）
前記組成物はシュウ酸アンモニウムを含む、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記分析物は核酸である、項目２６に記載の方法。
（項目２９）
前記核酸はデオキシリボ核酸である、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記核酸はリボ核酸である、項目２８に記載の方法。
（項目３１）
前記質量分析法分析は、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析法、レーザー脱離質量分析法（ＬＤＭＳ）、エレクトロスプレー（ＥＳ）質量分析法、イオンサイクロトロン共鳴（ＩＣＲ）質量分析法、およびフーリエ変換質量分析法からなる群より選択される、項目２６に記載の方法。
（項目３２）
質量分析法によって分析物を分析するための方法であって、
サンプルを質量分析計に導入するステップであって、該サンプルは分析物と、アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体とを含む、ステップ、ならびに
質量分析法によって該サンプルを分析するステップ
を含む、方法。
（項目３３）
前記サンプルはシュウ酸アンモニウムをさらに含む、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記分析物は核酸である、項目３２に記載の方法。
（項目３５）
前記核酸はデオキシリボ核酸である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記核酸はリボ核酸である、項目３４に記載の方法。
（項目３７）
前記質量分析法分析は、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析法、レーザー脱離質量分析法（ＬＤＭＳ）、エレクトロスプレー（ＥＳ）質量分析法、イオンサイクロトロン共鳴（ＩＣＲ）質量分析法、およびフーリエ変換質量分析法からなる群より選択される、項目３２に記載の方法。
（項目３８）
スポットのアレイを含む基体であって、各スポットは（ｉ）マトリックス支援レーザー脱離／イオン化（ＭＡＬＤＩ）質量分析法のためのマトリックスと、（ｉｉ）アスコルビン酸またはその塩、互変異性体もしくは類似体とを含む、基体。
（項目３９）
各スポットはシュウ酸アンモニウムをさらに含む、項目３８に記載の基体。
（項目４０）
前記スポットの１つまたはそれ以上は分析物をさらに含む、項目３８に記載の基体。
（項目４１）
前記分析物は核酸である、項目４０に記載の基体。
（項目４２）
前記核酸はデオキシリボ核酸である、項目４１に記載の基体。
（項目４３）
前記核酸はリボ核酸である、項目４１に記載の基体。
（項目４４）
前記マトリックスは３-ヒドロキシピコリン酸を含む、項目３８に記載の基体。
（項目４５）
前記基体はチップである、項目３８に記載の基体。
（項目４６）
前記チップはシリコンチップである、項目４５に記載の基体。