【手続補正書】
【提出日】平成24年10月9日(2012.10.9)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性及び／又はターゲティング活性を有する、ファージＦ８７ｓ／０６由来の単離された溶解素タンパク質、又はその断片。
【請求項２】
黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性及び／又はターゲティング活性を有する、配列番号２のアミノ酸配列、又はその断片を含む、請求項１に記載の単離された溶解素タンパク質。
【請求項３】
同一サイズの第２タンパク質と少なくとも８５％の配列同一性を有する単離された第１タンパク質であって、前記第１タンパク質が黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性及び／又はターゲティング活性を有し、前記第２タンパク質が配列番号２のアミノ酸配列又はその断片を有する、第１タンパク質。
【請求項４】
第２タンパク質と少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項３に記載の単離された第１タンパク質。
【請求項５】
請求項１、２、３又は４に記載のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
【請求項６】
配列番号１のヌクレオチド配列又はその断片を含む、請求項５に記載の核酸。
【請求項７】
請求項５に記載の核酸を含むベクター。
【請求項８】
発現ベクターである、請求項７に記載のベクター。
【請求項９】
請求項８に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項１０】
黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性及び／又はターゲティング活性を有する、ファージＦ８７ｓ／０６由来の単離された溶解素タンパク質又はその断片と、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
【請求項１１】
単離された溶解素タンパク質が、配列番号２のアミノ酸配列、又はその断片を含む、請求項１０に記載の医薬組成物。
【請求項１２】
薬学的に許容される担体と、同一サイズの第２タンパク質と少なくとも８５％の配列同一性を有する単離された第１タンパク質とを含む医薬組成物であって、前記第１タンパク質が黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性及び／又はターゲティング活性を有し、前記第２タンパク質が配列番号２のアミノ酸配列又はその断片を有する、医薬組成物。
【請求項１３】
単離された第１タンパク質が、第２タンパク質と少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項１４】
請求項１０〜１３のいずれかに記載の医薬組成物を含む、治療を必要とする対象における細菌感染症の治療剤。
【請求項１５】
細菌感染症が、グラム陽性菌による感染症である、請求項１４に記載の治療剤。
【請求項１６】
グラム陽性菌がスタフィロコッカス属、ミクロコッカス属、バチルス属、又はエンテロコッカス属である、請求項１５に記載の治療剤。
【請求項１７】
グラム陽性菌がスタフィロコッカス属である、請求項１５に記載の治療剤。
【請求項１８】
スタフィロコッカス属が黄色ブドウ球菌である、請求項１７に記載の治療剤。
【請求項１９】
抗生物質活性についてペプチドをスクリーニングする方法であって、黄色ブドウ球菌の液体培養物に対する抗菌活性及び／又はターゲティング活性について、配列番号２由来の長さが少なくとも６残基である連続するアミノ酸の配列をスクリーニングすることを含む方法。
【請求項２０】
連続するアミノ酸の配列の長さが少なくとも１０残基である、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
請求項１〜４のいずれかに記載のタンパク質を組換えによって産生するための方法であって、（ｉ）ポリペプチドの発現に適した条件下で、前記ポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を培地中で培養すること；及び（ii）前記培地から前記ポリペプチドを回収することを含む方法。
【請求項２２】
請求項１〜４のいずれかに記載のタンパク質を含むキメラポリペプチドであって、前記タンパク質の触媒ドメインが異種溶解素タンパク質の触媒ドメインで置換されている、キメラポリペプチド。
【請求項２３】
異種溶解素タンパク質が、黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有するファージＦ１７０／０８又はファージＦ１６８／０８由来の溶解素タンパク質を含む、請求項２２に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２４】
黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有する配列番号４のアミノ酸配列又はその断片を含む、請求項２３に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２５】
黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有する配列番号６のアミノ酸配列又はその断片を含む、請求項２３に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２６】
同一サイズの第４ポリペプチドと少なくとも８５％の配列同一性を有するキメラ第３ポリペプチドであって、前記第３ポリペプチドが黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有し、前記第４ポリペプチドが配列番号４のアミノ酸配列又はその断片を有する、キメラ第３ポリペプチド。
【請求項２７】
第４ポリペプチドと少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項２６に記載のキメラポリペプチド。
【請求項２８】
同一サイズの第６ポリペプチドと少なくとも８５％の配列同一性を有するキメラ第５ポリペプチドであって、前記第５ポリペプチドが黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有し、前記第６ポリペプチドが配列番号６のアミノ酸配列又はその断片を有する、キメラ第５ポリペプチド。
【請求項２９】
第６ポリペプチドと少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項２８に記載のキメラ第５ポリペプチド。
【請求項３０】
請求項２２〜２９のいずれかに記載のキメラポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
【請求項３１】
配列番号３のヌクレオチド配列又はその断片を含む、請求項３０に記載の核酸。
【請求項３２】
配列番号５のヌクレオチド配列又はその断片を含む、請求項３０に記載の核酸。
【請求項３３】
請求項３０に記載の核酸を含むベクター。
【請求項３４】
発現ベクターである、請求項３３に記載のベクター。
【請求項３５】
請求項３４に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項３６】
薬学的に許容される担体と、請求項１〜４のいずれかに記載のタンパク質とを含む医薬組成物であって、前記タンパク質の触媒ドメインが異種溶解素タンパク質の触媒ドメインで置換されてキメラポリペプチドを生じる、医薬組成物。
【請求項３７】
異種溶解素タンパク質が、黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有するファージＦ１７０／０８又はファージＦ１６８／０８由来の溶解素タンパク質を含む、請求項３６に記載の医薬組成物。
【請求項３８】
キメラポリペプチドが、黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有する配列番号４のアミノ酸配列又はその断片を含む、請求項３７に記載の医薬組成物。
【請求項３９】
キメラポリペプチドが、黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有する配列番号６のアミノ酸配列又はその断片を含む、請求項３７に記載の医薬組成物。
【請求項４０】
薬学的に許容される担体と、同一サイズの第４ポリペプチドと少なくとも８５％の配列同一性を有するキメラ第３ポリペプチドとを含む医薬組成物であって、前記第３ポリペプチドが黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有し、前記第４ポリペプチドが配列番号４のアミノ酸配列又はその断片を有する、医薬組成物。
【請求項４１】
第３ポリペプチドが第４ポリペプチドと少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項４０に記載の医薬組成物。
【請求項４２】
薬学的に許容される担体と、同一サイズの第６ポリペプチドと少なくとも８５％の配列同一性を有するキメラ第５ポリペプチドとを含む医薬組成物であって、前記第５ポリペプチドが黄色ブドウ球菌に対する抗菌活性を有し、前記第６ポリペプチドが配列番号６のアミノ酸配列又はその断片を有する、医薬組成物。
【請求項４３】
第５ポリペプチドが第６ポリペプチドと少なくとも９５％の配列同一性を有する、請求項４２に記載の医薬組成物。
【請求項４４】
請求項３６〜４３のいずれかに記載の医薬組成物を含む、それを必要とする対象における細菌感染症の治療剤。
【請求項４５】
細菌感染症がグラム陽性菌による感染症である、請求項４４に記載の治療剤。
【請求項４６】
グラム陽性菌がスタフィロコッカス属、ミクロコッカス属、バチルス属、又はエンテロコッカス属である、請求項４５に記載の治療剤。
【請求項４７】
グラム陽性菌がスタフィロコッカス属である、請求項４６に記載の治療剤。
【請求項４８】
スタフィロコッカス属が黄色ブドウ球菌である、請求項４７に記載の治療剤。
【請求項４９】
抗生物質活性についてペプチドをスクリーニングする方法であって、黄色ブドウ球菌の液体培養物に対する抗菌活性について、配列番号４又は配列番号６由来の長さが少なくとも６残基の連続するアミノ酸である配列をスクリーニングすることを含む方法。
【請求項５０】
連続するアミノ酸の配列の長さが少なくとも１０残基である、請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
請求項２２〜２９のいずれかに記載のキメラポリペプチドを組換えによって産生するための方法であって、（ｉ）前記ポリペプチドをコードするキメラ核酸を構築すること；（ii）前記ポリペプチドの発現に適した条件下で、前記キメラ核酸を含む宿主細胞を培地中で培養すること；及び（iii）前記培地から前記ポリペプチドを回収することを含む方法。