【手続補正書】
【提出日】平成24年2月2日(2012.2.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０３３８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０３３８】
種々の腫瘍組織サンプルにおいて、相関関係がＰＡＲＰとＩＲＡＫ１発現との間にあるかどうかを決定するために、実験を実施した。表ＸＸＶＩＩＩは、種々の組織中の発現レベルを表す。見られるように、ＰＡＲＰ１がアップレギュレートされているのと同じサブサイプの腫瘍（例えば、乳房、子宮内膜、卵巣および肺の腫瘍ならびに肉腫）において、ＩＲＡＫ１がアップレギュレートされており、そして共調節されている。従って、１つの実施形態は、ＰＡＲＰとＩＲＡＫ１モジュレータとの組み合わせで影響を受けやすい疾患の治療である。さらに、ＩＲＡＫ１関連遺伝子（ＩＲＡＫ１経路において共調節される遺伝子を含む）はまた、本明細書中で意図される。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＰＡＲＰ１の発現レベルが正常組織と比較して腫瘍組織でアップレギュレートされているがんの治療のための組み合わせ治療を同定する方法であって、該方法は、
該腫瘍組織のサンプル中で少なくとも１つの共調節遺伝子を同定し、該共調節遺伝子は、ＡＵＲＫＡ、ＵＢＥ２Ｓ、ＭＭＰ９、ＥＧＦＲ、ＥＲＢＢ３、ＴＹＭＳ、ＩＲＡＫ１、ＩＧＦ１Ｒ、ＩＧＦ２、ＤＨＦＲ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＲ、ＶＥＧＦＲ２およびＢｃｌ−２からなる群から選択され、ここで少なくとも１つの共調節遺伝子の発現は正常組織と比較して腫瘍組織でアップレギュレートされており、
ここで、該組み合わせ治療は、ＰＡＲＰ１阻害剤またはその代謝物もしくは薬学的に受容可能な塩、および該少なくとも１つの共調節遺伝子の阻害剤を含む、
ことを含む、上記方法。
【請求項２】
ＰＡＲＰ１阻害剤またはその代謝物もしくは薬学的に受容可能な塩と、共調節遺伝子の阻害剤との組み合わせにより治療可能ながんを同定する方法であって、
対象から採取された腫瘍組織サンプルにおいて、ＰＡＲＰ１の発現レベルと、ＡＵＲＫＡ、ＵＢＥ２Ｓ、ＭＭＰ９、ＥＧＦＲ、ＥＲＢＢ３、ＴＹＭＳ、ＩＲＡＫ１、ＩＧＦ１Ｒ、ＩＧＦ２、ＤＨＦＲ、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦＲ、ＶＥＧＦＲ２およびＢｃｌ−２からなる群から選択された少なくとも１つの他の遺伝子の発現レベルとを測定し、
該腫瘍組織サンプル中のＰＡＲＰ１の発現レベルおよび該少なくとも１つの他の遺伝子の発現レベルを、正常組織中のＰＡＲＰ１の発現レベルおよび該少なくとも１つの他の遺伝子の発現レベルと比較をし、ここで該組み合わせにより治療可能ながんは、ＰＡＲＰ１の発現レベルおよび少なくとも１つの他の遺伝子の発現レベルが正常組織と比較してアップレギュレートされている腫瘍組織を含む、
ことを含む、上記方法。
【請求項３】
組織のタイプが、乳房、肺、副腎、骨、結腸、子宮内膜、食道、腎臓、喉頭、肝臓、卵巣、膵臓、直腸、皮膚、小腸、胃、甲状腺、膀胱、子宮頸部および外陰部からなる群から選択される、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
組織のタイプが、乳房、肺、卵巣、膀胱、結腸、直腸、胃および子宮頸部からなる群から選択される、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
がんが、下記の表のＡ欄に記載された組織のものであって、各場合に共調節遺伝子がＢ欄に記載されたものの１つである、請求項１または２に記載の方法：
【表１】
2011521618.tif 000001
【表２】
2011521618.tif 000002
【請求項６】
組織が乳房であり、がんが腺管および小葉混合型の浸潤性癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＩＲＡＫ１またはＥＲＢＢ３またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
組織が乳房であり、がんが浸潤性腺管癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＭＭＰ９またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項８】
組織が乳房であり、がんが浸潤性小葉癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＡＵＲＫＡである、請求項５に記載の方法。
【請求項９】
組織が乳房であり、がんが腺管内癌であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ１ＲまたはＥＲＢＢ３またはＡＵＲＫＡである、請求項５に記載の方法。
【請求項１０】
組織が乳房であり、がんが粘液性癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＭＭＰ９ま
たはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１１】
組織が乳房であり、がんが葉状腫瘍（葉状嚢肉腫）、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１２】
組織が結腸であり、がんが腺癌（粘液性型を除く）、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＶＥＧＦまたはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１３】
組織が結腸であり、がんが腺癌、粘液性型、原発性であり、そして共調節遺伝子がＭＭＰ９またはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１４】
組織が肺であり、がんが腺癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１５】
組織が肺であり、がんが腺扁平上皮癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳである、請求項５に記載の方法。
【請求項１６】
組織が肺であり、がんが大細胞癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＴＹＭＳまたはＭＭＰ９またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１７】
組織が肺であり、がんが神経内分泌癌（非小細胞型）、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１８】
組織が肺であり、がんが小細胞癌であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＴＹＭＳまたはＤＨＦＲまたはＡＵＲＫＡまたはＢｃｌ−２またはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項１９】
組織が肺であり、がんが扁平上皮癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＭＭＰ９またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２０】
組織が卵巣であり、がんが腺癌、明細胞型、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＩＲＡＫ１またはＥＲＢＢ３である、請求項５に記載の方法。
【請求項２１】
組織が卵巣であり、がんが腺癌、類内膜型、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＤＨＦＲまたはＶＥＧＦまたはＭＭＰ９またはＩＲＡＫ１またはＥＲＢＢ３またはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２２】
組織が卵巣であり、がんが腺癌、乳頭漿液型、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＴＹＭＳまたはＤＨＦＲまたはＶＥＧＦまたはＭＭＰ９またはＩＲＡＫ１またはＥＲＢＢ３またはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２３】
組織が卵巣であり、がんが顆粒膜細胞腫、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＤＨＦＲまたはＶＥＧＦである、請求項５に記載の方法。
【請求項２４】
組織が卵巣であり、がんがムチン性嚢胞腺癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＤＨＦＲまたはＶＥＧＦまたはＩＲＡＫ１またはＥＲＢＢ３である、請求項５に記載の方法。
【請求項２５】
組織が卵巣であり、がんがミュラー管混合型腫瘍、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＴＹＭＳまたはＶＥＧＦまたはＭＭＰ９またはＩＲＡＫ１またはＥＲＢＢ３またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２６】
組織が直腸であり、がんが腺癌（粘液性型を除く）、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＶＥＧＦまたはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２７】
組織が胃であり、がんが腺癌（印環細胞型を除く）、原発性であり、そして共調節遺伝子がＩＧＦ２またはＴＹＭＳまたはＭＭＰ９またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２８】
組織が甲状腺であり、がんが濾胞腺癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＥＲＢＢ３またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項２９】
組織が甲状腺であり、がんが乳頭癌、原発性；全ての変異体であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＭＭＰ９またはＥＲＢＢ３である、請求項５に記載の方法。
【請求項３０】
組織が膀胱であり、がんが移行上皮癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＤＨＦＲまたはＶＥＧＦまたはＭＭＰ９またはＥＲＢＢ３またはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。
【請求項３１】
組織が子宮頸部であり、がんが腺癌、原発性であり、そして共調節遺伝子がＴＹＭＳまたはＡＵＲＫＡまたはＵＢＥ２Ｓである、請求項５に記載の方法。