【手続補正書】
【提出日】平成26年10月24日(2014.10.24)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
それを必要とする対象においてＦＶＩＩＩに対する免疫寛容を誘導するための薬学的組成物であって、
（Ｒ１）ｘ−Ｐ−（Ｒ２）ｙ
からなるアミノ酸配列を有するペプチドの治療有効量を含み、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸に対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ１は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ２は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、０または１である、
前記薬学的組成物。
【請求項２】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項１に記載の薬学的組成物。
【請求項３】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項１に記載の薬学的組成物。
【請求項４】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項１に記載の薬学的組成物。
【請求項５】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列と同一のアミノ酸配列である、請求項１に記載の薬学的組成物。
【請求項６】
ｘおよびｙがともに０である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項７】
ｘが１であり、ｙが０である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項８】
ｘが０であり、ｙが１である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項９】
ｘおよびｙがともに１である、請求項１〜５のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１０】
前記ペプチドが９〜１００個のアミノ酸からなる、請求項１〜５のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１１】
前記ペプチドが９〜５０個のアミノ酸からなる、請求項１０に記載の薬学的組成物。
【請求項１２】
前記ペプチドが９〜２５個のアミノ酸からなる、請求項１０に記載の薬学的組成物。
【請求項１３】
（Ｒ１）ｘ−Ｐ−（Ｒ２）ｙ
からなるアミノ酸配列を有する第２のペプチドの治療有効量をさらに含み、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０、６８、１５９、２５０、３４４、４７７、５６８、６５９、および７４０から選択される配列の少なくとも９個の連続するアミノ酸に対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ１は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ２は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、０または１である、
請求項１〜１２のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１４】
前記対象における抗ＦＶＩＩＩ抗体の発生を防止するための、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１５】
前記対象中に存在する抗ＦＶＩＩＩ抗体の量を減少させるための、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の薬学的組成物。
【請求項１６】
アミノ酸配列：
（Ｒ１）ｘ−Ｐ−（Ｒ２）ｙ
からなる、ペプチドであって、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸に対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ１は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ２は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、０または１である、
ペプチド。
【請求項１７】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項１８】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも９０％の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項１９】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも９５％の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項２０】
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４の少なくとも９個の連続するアミノ酸の配列と同一のアミノ酸配列である、請求項１６に記載のペプチド。
【請求項２１】
ｘおよびｙがともに０である、請求項１６〜２０のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２２】
ｘが１であり、ｙが０である、請求項１６〜２０のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２３】
ｘが０であり、ｙが１である、請求項１６〜２０のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２４】
ｘおよびｙがともに１である、請求項１６〜２０のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２５】
９〜１００個のアミノ酸からなる、請求項１６〜２０のいずれか１項に記載のペプチド。
【請求項２６】
９〜５０個のアミノ酸からなる、請求項２５に記載のペプチド。
【請求項２７】
９〜２５個のアミノ酸からなる、請求項２５に記載のペプチド。
【請求項２８】
請求項１６〜２７のいずれか１項に記載のペプチドを含む、組成物。
【請求項２９】
薬学的投与のために製剤化される、請求項２８に記載の組成物。
【請求項３０】
アミノ酸配列：
（Ｒ１）ｘ−Ｐ−（Ｒ２）ｙ
からなる第２のポリペプチドをさらに含み、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０、６８、１５９、２５０、３４４、４７７、５６８、６５９、および７４０から選択される配列の少なくとも９個の連続するアミノ酸に対して少なくとも８５％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ１は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ２は、１〜８０個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、０または１である、
請求項２８または２９に記載の組成物。
【請求項３１】
(ａ）請求項１６〜２７のいずれか１項に記載のＦＶＩＩＩペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む細胞の培養物を供給するステップ、および
(ｂ）該細胞の培養物において該ペプチドを発現させるステップ
を含む、ＦＶＩＩＩペプチドを作製する方法。
【請求項３２】
(ａ）ＭＨＣクラスＩＩ多量体と複合体を形成したペプチドと複数のＣＤ４＋Ｔ細胞を混合するステップであって、該ペプチドが、請求項１６〜２７のいずれか１項に記載のＦＶＩＩＩペプチドである、ステップ、および
(ｂ）該ＭＨＣクラスＩＩ多量体と複合体を形成した該ペプチドに対して特異的な該複数のＣＤ４＋Ｔ細胞のメンバーのうちの少なくとも１つを特定するステップ
を含む、ＦＶＩＩＩペプチド特異的Ｔ細胞を特定する方法。
【請求項３３】
前記ＭＨＣクラスＩＩ多量体がＭＨＣクラスＩＩ四量体である、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記ペプチドまたは前記ＭＨＣクラスＩＩ多量体が検出可能部分をさらに含む、請求項３２または３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記ペプチドに対して特異的な少なくとも１つの前記ＣＤ４＋Ｔ細胞を単離するステップをさらに含む、請求項３２〜３４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３６】
フローサイトメトリーを用いて前記ＣＤ４＋Ｔ細胞を単離する、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
請求項１６〜２７のいずれか１項に記載の第ＶＩＩＩ因子ペプチドと、
第２のペプチドと
を含む、融合タンパク質。
【請求項３８】
前記第２のペプチドがレポーターペプチドである、請求項３７に記載の融合タンパク質。
【請求項３９】
核酸によってコードされる、請求項３７または３８に記載の融合タンパク質。
【請求項４０】
前記ＦＶＩＩＩペプチドが前記第２のペプチドと化学的に連結している、請求項３７または３８に記載の融合タンパク質。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００７５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００７５】
一態様において、本明細書において提供されるＦＶＩＩＩペプチドは、ＦＶＩＩＩ阻害物質を阻止するための新しい免疫調節薬の臨床開発において、ＦＶＩＩＩ特異的Ｔ細胞の免疫診断に使用される。
[本発明1001]
それを必要とする対象においてＦＶＩＩＩに対する免疫寛容を誘導する方法であって、
該対象に、
（Ｒ1）ｘ−Ｐ−（Ｒ2）ｙ
からなるアミノ酸配列を有するペプチドの治療有効量を投与するステップ
を含み、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸に対して少なくとも85％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ1は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ2は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、0または1である、
方法。
[本発明1002]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも85％の同一性を有するアミノ酸配列である、本発明1001の方法。
[本発明1003]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも90％の同一性を有するアミノ酸配列である、本発明1001の方法。
[本発明1004]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも95％の同一性を有するアミノ酸配列である、本発明1001の方法。
[本発明1005]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列と同一のアミノ酸配列である、本発明1001の方法。
[本発明1006]
ｘおよびｙがともに0である、本発明1001〜1005のいずれかの方法。
[本発明1007]
ｘが1であり、ｙが0である、本発明1001〜1005のいずれかの方法。
[本発明1008]
ｘが0であり、ｙが1である、本発明1001〜1005のいずれかの方法。
[本発明1009]
ｘおよびｙがともに1である、本発明1001〜1005のいずれかの方法。
[本発明1010]
前記ペプチドが9〜100個のアミノ酸からなる、本発明1001〜1005のいずれかの方法。
[本発明1011]
前記ペプチドが9〜50個のアミノ酸からなる、本発明1010の方法。
[本発明1012]
前記ペプチドが9〜25個のアミノ酸からなる、本発明1010の方法。
[本発明1013]
前記対象に、
（Ｒ1）ｘ−Ｐ−（Ｒ2）ｙ
からなるアミノ酸配列を有する第2のペプチドの治療有効量を投与するステップ
をさらに含み、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：10、68、159、250、344、477、568、659、および740から選択される配列の少なくとも9個の連続するアミノ酸に対して少なくとも85％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ1は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ2は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、0または1である、
本発明1001〜1012のいずれかの方法。
[本発明1014]
前記薬学的組成物の投与が、前記対象における抗ＦＶＩＩＩ抗体の発生を防止する、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1015]
前記薬学的組成物の投与が、前記対象中に存在する抗ＦＶＩＩＩ抗体の量を減少させる、本発明1001〜1013のいずれかの方法。
[本発明1016]
アミノ酸配列：
（Ｒ1）ｘ−Ｐ−（Ｒ2）ｙ
からなる、ペプチドであって、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸に対して少なくとも85％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ1は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ2は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、0または1である、
ペプチド。
[本発明1017]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも85％の同一性を有するアミノ酸配列である、本発明1016のペプチド。
[本発明1018]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも90％の同一性を有するアミノ酸配列である、本発明1016のペプチド。
[本発明1019]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列に対して少なくとも95％の同一性を有するアミノ酸配列である、本発明1016のペプチド。
[本発明1020]
Ｐが、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：344の少なくとも9個の連続するアミノ酸の配列と同一のアミノ酸配列である、本発明1016のペプチド。
[本発明1021]
ｘおよびｙがともに0である、本発明1016〜1020のいずれかのペプチド。
[本発明1022]
ｘが1であり、ｙが0である、本発明1016〜1020のいずれかのペプチド。
[本発明1023]
ｘが0であり、ｙが1である、本発明1016〜1020のいずれかのペプチド。
[本発明1024]
ｘおよびｙがともに1である、本発明1016〜1020のいずれかのペプチド。
[本発明1025]
9〜100個のアミノ酸からなる、本発明1016〜1020のいずれかのペプチド。
[本発明1026]
9〜50個のアミノ酸からなる、本発明1025のペプチド。
[本発明1027]
9〜25個のアミノ酸からなる、本発明1025のペプチド。
[本発明1028]
本発明1016〜1027のいずれかのペプチドを含む、組成物。
[本発明1029]
薬学的投与のために製剤化される、本発明1028の組成物。
[本発明1030]
アミノ酸配列：
（Ｒ1）ｘ−Ｐ−（Ｒ2）ｙ
からなる第2のポリペプチドをさらに含み、
式中、
Ｐは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：10、68、159、250、344、477、568、659、および740から選択される配列の少なくとも9個の連続するアミノ酸に対して少なくとも85％の同一性を有するアミノ酸配列であり、
Ｒ1は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
Ｒ2は、1〜80個のアミノ酸からなるアミノ酸配列であり、
ｘおよびｙはそれぞれ独立して、0または1である、
本発明1028または1029の組成物。
[本発明1031]
(ａ）本発明1016〜1027のいずれかのＦＶＩＩＩペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む細胞の培養物を供給するステップ、および
(ｂ）該細胞の培養物において該ペプチドを発現させるステップ
を含む、ＦＶＩＩＩペプチドを作製する方法。
[本発明1032]
(ａ）ＭＨＣクラスＩＩ多量体と複合体を形成したペプチドと複数のＣＤ4＋Ｔ細胞を混合するステップであって、該ペプチドが、本発明1016〜1027のいずれかのＦＶＩＩＩペプチドである、ステップ、および
(ｂ）該ＭＨＣクラスＩＩ多量体と複合体を形成した該ペプチドに対して特異的な該複数のＣＤ4＋Ｔ細胞のメンバーのうちの少なくとも1つを特定するステップ
を含む、ＦＶＩＩＩペプチド特異的Ｔ細胞を特定する方法。
[本発明1033]
前記ＭＨＣクラスＩＩ多量体がＭＨＣクラスＩＩ四量体である、本発明1032の方法。
[本発明1034]
前記ペプチドまたは前記ＭＨＣクラスＩＩ多量体が検出可能部分をさらに含む、本発明1032または1033の方法。
[本発明1035]
前記ペプチドに対して特異的な少なくとも1つの前記ＣＤ4＋Ｔ細胞を単離するステップをさらに含む、本発明1032〜1034のいずれかの方法。
[本発明1036]
フローサイトメトリーを用いて前記ＣＤ4＋Ｔ細胞を単離する、本発明1035の方法。
[本発明1037]
本発明1016〜1027のいずれかの第ＶＩＩＩ因子ペプチドと、
第2のペプチドと
を含む、融合タンパク質。
[本発明1038]
前記第2のペプチドがレポーターペプチドである、本発明1037の融合タンパク質。
[本発明1039]
核酸によってコードされる、本発明1037または1038の融合タンパク質。
[本発明1040]
前記ＦＶＩＩＩペプチドが前記第2のペプチドと化学的に連結している、本発明1037または1038の融合タンパク質。