【手続補正書】
【提出日】平成24年9月3日(2012.9.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
移植片または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて輸血関連急性肺障害（ＴＲＡＬＩ）または移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）を誘発する（ここで、前記ヒトレシピエントはＨＮＡ−３ａ抗原またはＨＮＡ−３ｂ抗原を発現する）か否かを判定する方法であって、以下の：
ａ）ヒト被験者に移植または輸血することを意図した前記組織の試料を獲得すること、
ｂ）前記試料を、配列番号１のアミノ酸配列を含むポリペプチドもしくはその抗原性断片または配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチドもしくはその抗原性断片と接触させて、試料中のＨＮＡ−３特異的抗体と複合体を形成させること、そして
ｃ）前記ドナー組織がＨＮＡ−３抗原を発現するヒトレシピエントにおいてＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを誘発しやすい、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。
【請求項２】
移植または輸血組織を拒絶することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性（ここで、前記ドナー組織はＨＮＡ−３ａポリペプチドもしくはその抗原性断片またはＨＮＡ−３ｂポリペプチドもしくはその抗原性断片を含有する）を判定する方法であって、以下の：
ａ）移植または輸血前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
ｂ）前記生物学的試料を、配列番号１のアミノ酸配列を含むポリペプチドもしくはその抗原性断片または配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチドもしくはその抗原性断片と接触させて、前記生物学的試料中のＨＮＡ−３特異的抗体と複合体を形成させること、そして
ｃ）前記ヒト移植片または輸血レシピエントが移植または輸血組織を拒絶することに対して感受性である、ということを前記生物学的試料中の複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。
【請求項３】
以下の：
ｄ）前記試料を、Ｆｃ−γ受容体ＩＩＩｂポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−１特異的抗体と複合体を形成させること、
ｅ）前記試料を、ＣＤ１７７ポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−２特異的抗体と複合体を形成させること、
ｆ）前記試料を、ＣＤ１１ｂポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−４特異的抗体と複合体を形成させること、
ｇ）前記試料を、ＣＤ１１ａポリペプチドまたはその抗原性断片と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−５特異的抗体と複合体を形成させること、または
ｈ）前記試料をＨＬＡ抗原と接触させて、前記試料中のＨＬＡ特異的抗体と複合体を形成させること、そして
ｉ）前記試料がヒトレシピエントにおいてＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを誘発しやすい、ということを前記複合体のいずれかの存在が示す前記複合体を検出すること
というステップのうちの１つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
輸血関連急性肺障害（ＴＲＡＬＩ）または移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性（ここで、前記ドナー組織は抗ＨＮＡ−３ａ特異的抗体または抗ＨＮＡ−３ｂ特異的抗体を含有する）を判定する方法であって、以下の：
ａ）移植または輸血前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
ｂ）前記生物学的試料を、配列番号１のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその断片と特異的に結合する抗体と接触させて、前記生物学的試料中のＨＮＡ−３ａと複合体を形成させること、または、配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはその断片と特異的に結合する抗体と接触させて、前記生物学的試料中のＨＮＡ−３ｂと複合体を形成させること、そして
ｃ）前記ヒトの移植片または輸血のレシピエントがＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを発症することに対して感受性である、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること
を包含する方法。
【請求項５】
以下の：
ｄ）前記試料を、ＨＮＡ−１と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−１と複合体を形成させること、
ｅ）前記試料を、ＨＮＡ−２と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−２と複合体を形成させること、
ｆ）前記試料を、ＨＮＡ−４と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−４と複合体を形成させること、
ｇ）前記試料を、ＨＮＡ−５と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のＨＮＡ−５と複合体を形成させること、または
ｈ）前記試料をＨＬＡ抗原と特異的に結合する抗体と接触させて、前記試料中のＨＬＡと複合体を形成させること、そして
ｉ）前記試料がヒトレシピエントにおいてＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを誘発しやすい、ということを前記複合体のいずれかの存在が示す前記複合体を検出すること
というステップのうちの１つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項４記載の方法。
【請求項６】
前記抗体が、放射性標識、蛍光標識、酵素標識、アビジン標識またはビオチン標識からなる群から選択される標識を含む請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
移植または輸血のために意図されたドナー組織がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい（ここで、前記ヒトレシピエントはＨＮＡ−３ａ特異的抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的抗体を発現する）か否かを判定する方法であって、以下の：
ａ）移植または輸血のために意図された組織の試料を獲得すること、
ｂ）前記試料から核酸を抽出すること、
ｃ）前記核酸を、配列番号３の核酸配列の断片もしくは配列番号４の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、または、ＨＮＡ−３核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、前記抽出核酸から配列番号３のＨＮＡ−３ａ核酸の断片もしくは配列番号４のＨＮＡ−３ｂ核酸の断片を増幅すること、そして
ｄ）前記試料中のＨＮＡ−３ａ核酸の存在もしくはＨＮＡ−３ｂ核酸の存在を検出すること、または、前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションを検出すること（ここで、前記プローブのハイブリダイゼーションは前記試料中のＨＮＡ−３ａ核酸またはＨＮＡ−３ｂ核酸の存在を示し、前記試料中のＨＮＡ−３ａ核酸またはＨＮＡ−３ｂ核酸の存在は、ＨＮＡ−３ａ特異的抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的抗体を発現するヒトレシピエントにおいて前記試料が拒絶されやすい、ということを示す）
を包含する方法。
【請求項８】
輸血関連急性肺障害（ＴＲＡＬＩ）または移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）を発症することに対するヒト移植片または輸血レシピエントの感受性（ここで、前記ドナー組織は抗ＨＮＡ−３ａ特異的抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的抗体を含有する）を判定する方法であって、以下の：
ａ）移植または輸血の前に、ヒトの移植片または輸血のレシピエントから生物学的試料を獲得すること、
ｂ）前記生物学的試料から核酸を抽出すること、
ｃ）前記核酸を、配列番号３の核酸配列の断片もしくは配列番号４の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、または、前記生物学的試料中のＨＮＡ−３核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、前記抽出核酸から配列番号３のＨＮＡ−３ａ核酸の断片もしくは配列番号４のＨＮＡ−３ｂ核酸の断片を増幅すること、そして
ｄ）前記生物学的試料中のＨＮＡ−３ａ核酸の断片もしくはＨＮＡ−３ｂ核酸の断片の存在を検出すること、または、前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションを検出すること（ここで、前記核酸との前記プローブのハイブリダイゼーションは前記生物学的試料中のＨＮＡ−３核酸の存在を示し、前記生物学的試料中のＨＮＡ−３ａ核酸またはＨＮＡ−３ｂ核酸の存在は、ヒト輸血または移植片レシピエントがＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを発症することに対して感受性である、ということを示す）、
とを包含する方法。
【請求項９】
１）核酸を配列番号３の断片または配列番号４の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させる場合、
以下の：
ｄ）前記試料を、配列番号５の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
ｅ）前記試料を、配列番号７の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
ｆ）前記試料を、配列番号９の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、
ｇ）前記試料を、配列番号１１の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、または
ｈ）前記試料を、ＨＬＡ抗原をコードするヌクレオチド配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブと接触させること、そして
ｉ）前記核酸との前記プローブのハイブリダイズを検出すること（ここで、前記プローブのいずれかのハイブリダイゼーションは、前記試料中のＨＮＡ−１、ＨＮＡ−２、ＨＮＡ−３ｂ、ＨＮＡ−４、ＨＮＡ−５またはＨＬＡ核酸のいずれかの存在を示し、そして前記試料中のＨＮＡ−１、ＨＮＡ−２、ＨＮＡ−３ｂ、ＨＮＡ−４、ＨＮＡ−５またはＨＬＡ核酸のいずれか１つの存在は、前記試料がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい、または、前記試料がヒトレシピエントにおいてＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを誘発しやすい、ということを示す）、または
２）配列番号３のＨＮＡ−３ａ核酸の断片もしくは配列番号４のＨＮＡ−３ｂ核酸の断片を増幅する場合、
以下の：
ｄ）ＨＮＡ−１核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、配列番号５のＨＮＡ−１核酸の断片を増幅すること、
ｅ）ＨＮＡ−２核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、配列番号７のＨＮＡ−２核酸の断片を増幅すること、
ｆ）ＨＮＡ−４核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、配列番号９のＨＮＡ−４核酸の断片を増幅すること、
ｇ）ＨＮＡ−５核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、配列番号１１のＨＮＡ−５核酸の断片を増幅すること、または
ｈ）ＨＬＡ核酸に特異的な少なくとも１つのオリゴヌクレオチドプライマーを用いて、ＨＬＡ核酸の断片を増幅すること、そして
ｉ）前記試料中の任意のＨＮＡ−１、ＨＮＡ−２、ＨＮＡ−４、ＨＮＡ−５またはＨＬＡ核酸の前記断片を検出すること（ここで、前記試料中のＨＮＡ−１、ＨＮＡ−２、ＨＮＡ−３ｂ、ＨＮＡ−４、ＨＮＡ−５またはＨＬＡ核酸のいずれか１つの存在は、前記試料がヒトレシピエントにおいて拒絶されやすい、または、前記試料がヒトレシピエントにおいてＴＲＡＬＩまたはＧＶＨＤを誘発しやすい、ということを示す）
というステップのうちの１つもしくは複数のステップをさらに包含する請求項７または８に記載の方法。
【請求項１０】
前記オリゴヌクレオチドプローブが、膜、フィルター、ビーズおよびチップからなる群から選択される支持体に固定される請求項７〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記組織試料または生物学的試料が、血液、血液誘導体、血漿、血清、細胞および組織からなる群から選択される請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
以下の：
ａ）配列番号１のアミノ酸配列を含むポリペプチドもしくはその抗原性断片、または、配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチドもしくはその抗原性断片、ならびに
ｂ）Ｆｃ−γ受容体ＩＩＩｂポリペプチド（ＨＮＡ−１）、ＣＤ１７７ポリペプチド（ＨＮＡ−２）、ＣＤ１１ｂポリペプチド（ＨＮＡ−４）、ＣＤ１１ａポリペプチド（ＨＮＡ−５）およびＨＬＡ抗原からなる群から選択される１つもしくは複数のポリペプチドまたはその抗原性断片
を包含するキット。
【請求項１３】
ＨＮＡ−３ａ、ＨＮＡ−３ｂ、ＨＮＡ−１、ＨＮＡ−２、ＨＮＡ−４、ＨＮＡ−５およびＨＬＡからなる群から選択される抗原を含むペプチドと特異的に結合する１つもしくは複数の抗体をさらに包含する請求項１２に記載のキット。
【請求項１４】
以下の：
ａ）ＨＮＡ−３ａに特異的な抗体、または、ＨＮＡ−３ｂに特異的な抗体、ならびに
ｂ）ＨＮＡ−１、ＨＮＡ−２、ＨＮＡ−４、ＨＮＡ−５またはＨＬＡからなる群から選択される抗原を含むペプチドと特異的に結合する１つもしくは複数の抗体
を包含するキット。
【請求項１５】
配列番号１のアミノ酸配列、配列番号２のアミノ酸配列、Ｆｃ−γ受容体ＩＩＩｂポリペプチド、ＣＤ１７７ポリペプチド、ＣＤ１１ｂポリペプチド、ＣＤ１１ａポリペプチドおよびＨＬＡ抗原からなる群から選択される１つもしくは複数のポリペプチドまたはその抗原性断片をさらに包含する請求項１４に記載のキット。
【請求項１６】
以下の：
ａ）配列番号３の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブ、または、配列番号４の核酸配列の断片とハイブリダイズするオリゴヌクレオチドプローブ（ここで、前記核酸の断片は、ＨＮＡ−３ａ特異的同種異系抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的同種異系抗体と特異的に結合するポリペプチドをコードする）、ならびに
ｂ）配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１およびＨＬＡヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列の断片とハイブリダイズする１つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプローブ
を包含するキット。
【請求項１７】
以下の：
ａ）配列番号３のＨＮＡ−３ａ核酸の断片または配列番号４のＨＮＡ−３ｂ核酸の断片を増幅するための１つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプライマー、ならびに
ｂ）配列番号５、配列番号７、配列番号９、配列番号１１およびＨＬＡヌクレオチド配列からなる群から選択される核酸配列の断片を増幅するための１つもしくは複数のオリゴヌクレオチドプライマー
を包含するキット。
【請求項１８】
単離ポリペプチドであって、
ａ）配列番号２のアミノ酸配列、
ｂ）配列番号２のアミノ酸配列の断片（ここで、前記断片は、配列番号２のアミノ酸残基１５４を含む）、
ｃ）配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、配列番号２２、配列番号２３、配列番号２４および配列番号２６からなる群から選択されるアミノ酸配列（ここで、前記ポリペプチドは、ＨＮＡ−３ｂ特異的同種異系抗体と反応する）、
ｄ）配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号２５、配列番号２７、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１および配列番号４２からなる群から選択されるアミノ酸配列（ここで、前記ポリペプチドは、ＨＮＡ−３ａ特異的同種異系抗体と反応する）
を含む単離ポリペプチド。
【請求項１９】
請求項１８に記載のポリペプチド配列をコードするヌクレオチド配列を含む単離ポリヌクレオチド。
【請求項２０】
ＨＮＡ−３ａ特異的同種異系抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的同種異系抗体の同定のための請求項１８に記載のポリペプチドまたはその断片の使用。
【請求項２１】
ＨＮＡ−３ａ遺伝子型の確定のための、ＨＮＡ−３ａ特異的同種異系抗体と反応するタンパク質をコードする配列番号３のポリヌクレオチドまたはその断片の使用。
【請求項２２】
ＨＮＡ−３ｂ遺伝子型の確定のための請求項１８記載のポリヌクレオチドまたはその断片の使用。
【請求項２３】
ヒト被験者におけるＨＮＡ−３ｂ遺伝子型に関するスクリーニング方法であって、以下の：
ａ）前記ヒト被験者から生物学的試料を獲得すること、
ｂ）前記生物学的試料から核酸を抽出すること、そして
ｃ）前記生物学的試料中の配列番号４の核酸配列の断片を検出すること（ここで、前記断片は配列番号４のコドン１５４を含み、前記配列番号４のコドン１５４の検出は、前記ヒト被験者がＨＮＡ−３ｂ遺伝子型を有するということを示す）、
とを包含する方法。
【請求項２４】
生物学的試料中のＨＮＡ−３ａ特異的抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的抗体の検出方法であって、以下の：
ａ）生物学的試料を獲得すること、
ｂ）前記生物学的試料を、配列番号１のＨＮＡ−３ａポリペプチドまたはその断片を発現するよう形質転換されたかまたはトランスフェクトされた細胞もしくは配列番号１のＨＮＡ−３ａポリペプチドの抗原性断片を模倣するアプタマーと接触させて、前記試料中のＨＮＡ−３ａ特異的抗体と複合体を形成させること、または、前記生物学的試料を、配列番号２のＨＮＡ−３ｂポリペプチドまたはその断片を発現するよう形質転換されたかまたはトランスフェクトされた細胞もしくは配列番号２のＨＮＡ−３ｂポリペプチドの抗原性断片を模倣するアプタマーと接触させて、前記試料中のＨＮＡ−３ｂ特異的抗体と複合体を形成させること、そして
ｃ）前記生物学的試料がＨＮＡ−３ａ特異的抗体またはＨＮＡ−３ｂ特異的抗体を含有する、ということを前記複合体の存在が示す前記複合体を検出すること、
とを包含する方法。