【誤訳訂正書】
【提出日】平成25年11月18日(2013.11.18)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００３３
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００３３】
本発明のさらなる態様は、任意の上述の方法に用いられる、有用な組成物である。本発明のこの態様の実施形態は、少なくとも一つの捕捉ポリペプチドを含む、生体サンプル中のＹＥＡＫ又はＹＦＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物を検出するための組成物である。特定の実施形態では、捕捉ポリペプチドは、正常ヒト血清、正常非ヒト霊長類血清、正常ウサギ血清、正常マウス血清、正常ラット血清、正常フェレット血清、正常ブタ血清、正常イヌ血清、正常ウマ血清、正常ヒツジ血清、正常ウシ血清、の成分、哺乳動物由来ＨＤＬプロテオームの成分、哺乳動物由来ＬＤＬプロテオームの成分、補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、無名のタンパク質生成物（ＢＬＡＳＴ  ｓｅａｒｃｈ  ＩＤでは、ＩｇＭ  重鎖）、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、鎖Ｃ、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、無名のタンパク質生成物（ＮＣＢＩ  Ｌｏｃｕｓ／登録番号ＣＡＡ２８６５９）、及びＩｇＪ鎖から選択される。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】特許請求の範囲
【訂正対象項目名】全文
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物を検出するための方法であって、血清タンパク質である捕捉ポリペプチドを使用すること含み、前記捕捉ポリペプチドが、補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、Ｃ鎖、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、及びＩｇＪ鎖から選択される、方法。
【請求項２】
生体サンプル中においてＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物の存在を検出するための方法であって、
ａ．生体サンプルと、以下：補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、Ｃ鎖、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、及びＩｇＪ鎖から選択される血清タンパク質である、少なくとも一つの捕捉ポリペプチドとを接触させること；及び
ｂ．捕捉ポリペプチドとＲＳＰ組成物との結合の存在又は不存在を検出すること、
ここで、結合の存在は、生体サンプル中のＲＳＰ組成物の存在を示す、
を含む、方法。
【請求項３】
ＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物の生物学的利用性を測定するための方法であって、前記ＲＳＰ組成物は、対象に投与されるＲＳＰ組成物での治療を必要とする対象から採取された生体サンプルにおいて決定され、
ａ．ＲＳＰ組成物の存在を定量的に検出する免疫学的測定において、生体サンプルと、以下：補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、Ｃ鎖、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、及びＩｇＪ鎖から選択されるペプチドを含む、少なくとも一つの捕捉ポリペプチドとを接触させること；
その結果、生体サンプル中のＲＳＰ組成物の生物学的利用性を測定し、
ここで、生体サンプル中のＲＳＰ組成物のレベルが、ＲＳＰ組成物の生物学的利用性の指標である、方法。
【請求項４】
多発性硬化症、Ｉ型糖尿病、関節リウマチ及びセリアック病から選択される自己免疫関連疾患である、望ましくない免疫反応を観察するための方法であって、捕捉ポリペプチドのレベルが、対象に投与されるＲＳＰ組成物の用量での望ましくない免疫反応の治療を必要とする対象から採取された生体サンプルにおいて決定され、
ａ．生体サンプルと、以下：補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、Ｃ鎖、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、及びＩｇＪ鎖から選択されるペプチドを含む、少なくとも一つの捕捉ポリペプチドとを接触させること；及び
ｂ．前記レベルを、生体サンプル中のＲＳＰ組成物の所定の好適なレベルと比較すること；
を含み、
ここで、好適な用量は、前記生体サンプル中のＲＳＰ組成物の所定の好適なレベルをもたらす用量であり、ＲＳＰ組成物の所定の好適なレベルは、免疫反応増強又は抑制の機能的読み出しのレベルにおいてであり、ＴＮＦａ、ＩＬ−６、ＣＸＣＬ１、ＣＸＣＬ２、及びＩＬ−１２ｐ７０の増加又は検出は望ましくない免疫刺激を示し、且つＩｌ−１ｒａ、ＣＸＣＬ１３、及びＣＣＬ２２の増加又は検出は望ましい免疫刺激を示す、方法。
【請求項５】
減少した毒性を有するＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物を製造するための方法であって、以下：
ａ．ＲＳＰ組成物と、補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、Ｃ鎖、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、及びＩｇＪ鎖から選択されるペプチドを含む少なくとも一つの捕捉ポリペプチドとを接触させること；及び
ｂ．混合物から捕捉ペプチドに結合するペプチドを分離すること；
ｃ．分離されたペプチドの特徴を決定すること；及び
ｄ．分離されたペプチドの特徴を用いてペプチドのセットを調製すること、
を含む、方法。
【請求項６】
増大した有効性を有するＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物を製造するための方法であって、以下：
ａ．ＲＳＰ組成物と、補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、Ｃ鎖、免疫グロブリンＭ、免疫グロブリンラムダ軽鎖、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、Ｉｇカッパ鎖Ｖ−ＩＩＩ（ＫＡＵ寒冷凝集素）、ＩｇＡｌ  Ｂｕｒ、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤、及びＩｇＪ鎖から選択されるペプチドを含む少なくとも一つの捕捉ポリペプチドとを接触させること；及び
ｂ．混合物から捕捉ペプチドに結合するペプチドを分離すること；
ｃ．分離されたペプチドの特徴を決定すること；及び
ｄ．分離されたペプチドの特徴を用いてペプチドのセットを調製すること、
を含む、方法。
【請求項７】
前記捕捉ポリペプチドが、補体成分Ｃ３、アポリポタンパク質Ａ−１プレプロタンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩプレプロタンパク質（アポリポタンパク質Ｄ）、補体成分Ｃ４Ａ、トリプシン阻害剤、インター−アルファ−トリプシン阻害剤ファミリー重鎖関連タンパク質（ＩＨＲＰ）、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、セルロプラスミン、アポリポタンパク質Ｅ、補体因子Ｂ、プレアルブミン、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ、アルファ２−ＨＳ糖タンパク質、アポリポタンパク質Ｊ前駆体、凝固因子ＩＩ（トロンビン）、ヒスチジンリッチ糖タンパク質前駆体、アルファ−２−ＨＳ−糖タンパク質、ゲルゾリンアイソフォーム前駆体、クニッツ型プロテイナーゼ阻害剤から選択される、請求項１〜６の何れか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記捕捉ポリペプチドが、アルファ−１−抗トリプシン、アポリポタンパク質Ａ−Ｉ、アルファ−１−Ｂ−糖タンパク質、アポリポタンパク質Ａ−ＩＶ、アポリポタンパク質Ｄ、及びプレアルブミンから選択される、請求項１〜７の何れか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記血清タンパク質が、１又は２以上の捕捉ポリペプチドの実質的に純粋な調製物である、請求項１〜８の何れか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記捕捉ポリペプチドが、ＲＳＰ組成物を定量的に検出するための手段に付着される、請求項１〜９の何れか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記捕捉ポリペプチドが、固体支持体に付着される、請求項１〜１０の何れか一項に記載の方法。
【請求項１２】
混合物から捕捉ポリペプチドと結合するペプチドを分離することにより、ＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物を含むサンプルからペプチドを単離することを含む、請求項１〜１１の何れか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記捕捉ポリペプチドにエピトープタグが付けられる、請求項１〜１２の何れか一項に記載の方法。
【請求項１４】
血清タンパク質である捕捉ポリペプチドを検出するための、ＹＦＡＫ又はＹＥＡＫペプチドを含むＲＳＰ組成物の使用。