【誤訳訂正書】
【提出日】平成24年3月29日(2012.3.29)
【誤訳訂正１】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１１
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１１】
ある実施態様おいて、本発明のペルヒドロラーゼ酵素は自然に発生するなペルヒドロラーゼ（言い換えると、細胞の遺伝子によりコードされる野生型ペルヒドロラーゼ）のアミノ酸配列に対して少なくとも８０％同一性を有する。ある実施態様おいて、該酵素は自然に発生するなマイコバクテリウム・スメグマチス（Ｍ．  ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）（配列番２）に対して少なくとも８０％の同一性を有するアミノ酸配列を有する。ある実施態様おいて、ペルヒドロラーゼ酵素は配列番号２に記載のアミノ酸配列を含むマイコバクテリウム・スメグマチス（Ｍ．  ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）ペルヒドロラーゼ中の位置と同等の位置のアミノ酸に少なくとも１つの置換を含み、前記少なくとも１つの置換基が１２、２２、５９、１５３、１５４、１９４、１９６、及び２０４の位置から選択される。特に好ましい実施態様おいて、酵素が次のアミノ酸置換のいずれか一つ又は組合せを含む。それは、１２位においてＧＩｙ、Ｐｒｏ、または、Ｇｌｎ、２２位においてＴｒｐ、５９位においてＰｒｏ、１５３位においてＰｒｏ、１５４位においてＴｈｒ、Ｓｅｒ、Ｖａｌ、またはＧｌｎ、１９４位においてＧｌｙ、１９６位においてＳｅｒ、Ｇｌｎ、Ｖａｌ、Ｇｌｙ、Ｐｒｏ、Ｉｌｅ、またはＨｉｓ、２０４位においてＴｙｒまたはＴｒｐであり、アミノ酸の位置は配列番号２のマイコバクテリウム・スメグマチス（Ｍ．  ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）ペルヒドロラーゼ中１２、２２、５９、１５３、１５４、１９４、１９６、及び２０４の位置と位置的に同等である。他の実施態様おいて、酵素は次のアミノ酸を含む。それは、１５４位においてＡｌａと１９４位においてＭｅｔ、１５４位においてＧｌｙと１９４位においてＶａｌ、又は１２位においてＧｌｙと１９４位においてＭｅｔ、１５４位においてＴｈｒと１９６位においてＩｌｅ、１２位においてＧｌｎと１５４位においてＶａｌ、１２位においてＭｅｔと１５４位においてＧｌｕ、１２位においてＧｌｙと１５４位においてＧｌｙ、１５４位においてＧｌｕと１９４位においてＳｅｒ、１２位においてＧｌｙと２２位においてＴｈｐ、又はそれらの任意の組合せであり、アミノ酸の位置は、配列番号２のマイコバクテリウム・スメグマチス（Ｍ  ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）ペルヒドロラーゼ中１２、２２、５９、１５３、１５４、１９４、１９６、及び２０４の位置と位置的に同等である。好ましい実施態様おいて、本発明のペルヒドロラーゼ酵素は、過加水分解対加水分解の比の値が少なくとも１であり、及び／又は配列番号２と比較して低い加水分解を有する。
【誤訳訂正２】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１２】
また、本発明は長鎖アシルエステル基質を加水分解する単離ペルヒドロラーゼ酵素の提供である。ある実施態様おいて、酵素は長鎖アシルエステル基質と過酸化物存在下、長鎖過酸を生成する。ある好ましい実施態様において、長鎖アシルエステル基質は少なくとも６個の炭素原子の鎖を含む。特に好ましい実施態様おいて、長鎖アシルエステル基質は少なくとも９個の炭素原子の鎖を含む。
【誤訳訂正３】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７６】
関連（及び誘導体）蛋白質は「変異蛋白質」を含む。ある実施態様において、少量のアミノ酸残基の数の違いによって変異蛋白質は親蛋白質と異なり、またお互いに異なる。異なるアミノ酸残基の数は一以上であってよく、好ましくは約１、２、３、４、５、１０、１５、２０、３０、４０、５０、又はそれ以上のアミノ酸残基であってよい。好ましい実施態様において、変異体間の異なるアミノ酸の数は１及び１０の間である。特に好ましい実施態様において、特に関連蛋白質及び変異蛋白質は少なくとも約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％、約９７％、約９８％、または約９９％のアミノ酸同一性を有する。加えて、本明細書にて用いる関連蛋白質又は変異蛋白質は、特徴的な領域のアミノ酸の数について別の関連蛋白質又は親蛋白質と異なる蛋白質をいう。例えば、ある実施態様において、変異蛋白質は約１、２、３、４、５、又は１０個の特徴的な領域が親蛋白質と異なる。
【誤訳訂正４】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１０２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１０２】
本明細書で用いる「核酸配列同一性の割合（％）」とは、配列のヌクレオチド残基と同一性のある候補配列中のヌクレオチド残基の割合として定義される。
【誤訳訂正５】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１０６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１０６】
少なくとも２つの核酸又はポリペプチドの文脈での「実質的に同様の」及び「実質的に同一の」という語句は、通常ポリヌクレオチド又はポリペプチドが引用（例えば、野生型）の配列と比較して、少なくとも約４０％の同一性、さらに好ましくは少なくとも約５０％の同一性、もっと好ましくは少なくとも約６０％の同一性、好ましくは少なくとも約７５％の同一性、より好ましく少なくとも約８０％の同一性、さらにもっと好ましくは少なくとも約９０％の同一性、好ましくは約９５％の同一性、好ましくは９７％の同一性、時には９８％と同じ程度、及び約９９％の配列同一性を有する配列を含むことを意味する。標準パラメータ(例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ，  ｅｔ  ａｌ，  Ｊ．  ＭｏＩ．  Ｂｉｏｌ．  ２１５：４０３‐４１０  ［１９９０］；  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ｅｔ  ａｌ，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ８９：１０９１５  ［１９８９］  ；  Ｋａｒｉｎ  ｅｔ  ａｌ，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ９０：５８７３  ［１９９３］；  及びＨｉｇｇｉｎｓ  ｅｔ  ａｌ，  Ｇｅｎｅ  ７３：２３７  ‐  ２４４  [１９８８］を参照)を用いるＢＬＡＳＴ、ＡＬＩＧＮ、及びＣＬＵＳＴＡＬのような周知のプログラムを用いて配列同一性を決定してよい。ＢＬＡＳＴ解析を行うためのソフトウェアは全米バイオテクノロジー情報センター（Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ）を通じて誰でも入手可能である。またデータベースはＦＡＳＴＡ（Ｐｅａｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ，  Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ  ８５：２４４４‐２４４８  ［１９８８］）を用いて検索してもよい。二つのポリペプチドが実質的に同一であるとは第一のポリペプチドが第二のポリペプチドと免疫的に交差反応を有することが１つの指標である。典型的に、同類アミノ酸置換による異なるポリペプチドは免疫的に交差反応を有する。すなわち、例えば、同類アミノ酸置換よってのみ異なる二つのペプチドの場合、第一のポリペプチドは第二のポリペプチドと実質的に同一である。二つの核酸が実質的に同一であるとはストリンジェントな条件（例えば中間から高いストリンジェンシーの範囲内）下、２分子がお互いにハイブリダイズすることが別の指標となる。
【誤訳訂正６】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１２５
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１２５】
さらに、本発明のあるペルヒドロラーゼ酵素は種々のアシル供与基質に対して活性を有し、低い基質濃度でも活性を有する。そして、過酸：酸の比が高いので効率的な過加水分解の手段を提供する。実際に、加水分解に対してより高い過加水分解の割合が高い漂白利用（例えば、すべて引用により本明細書に組み込まれるＵ．Ｓ．  Ｐａｔｅｎｔ  Ｎｏ．  ５，３５２，５９４、５，１０８，４５７、５，０３０，２４０、３９７４，０８２、及び５，２９６，６１６を参照）において好適であると認識されている。本発明のあるペルヒドロラーゼ酵素は過加水分解対加水分解の比が１より大きい比の値を有する。ある実施態様において、ペルヒドロラーゼ酵素は１より大きい過加水分解対加水分解の比の値を有し、漂白において有用である。
【誤訳訂正７】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１３４
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１３４】
ある実施態様において、本発明のペルヒドロラーゼは、親酵素（例えば、設計された酵素が親酵素として用いる場合、微生物によってコードされた野生型酵素だが、本発明を種々の野生型酵素に限定すること意図していない）のアミノ酸配列に少なくとも約３５％同一性を有するアミノ酸配列をもつ。ある実施態様において、本発明のペルヒドロラーゼは微生物の染色体によってコードされる野生型酵素に関係しているが、同じではない。特に好ましい実施態様において、本発明のペルヒドロラーゼは、親酵素（例えば、マイコバクテリウム・スメグマチス（Ｍ．  ｓｍｅｇｍａｔｉｓ）の野生型ペルヒドロラーゼ、又はＷＯ０５／０５６７８２に記載の変異体、又はＷＯ０５／０５６７８２に記載のような、細菌の染色体によってコードされる自然に発生するアシルトランスフェラーゼ関連酵素）のアミノ酸に少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、又は少なくとも約９９％、同一性を有するアミノ酸配列を有する。
【誤訳訂正８】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】０１４２
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【０１４２】
好ましい実施態様において、長鎖過酸を提供する一以上のアミノ酸の改変は高い過加水分解対加水分解の比の値（例えば、１より大きい比の値）、及び低い過酸加水分解速度（例えば、配列番号２と比較して、０．８未満の過酸加水分解速度）を有するペルヒドロラーゼを提供する改変との組合せであり、その結果長鎖過酸を効率的に生成するペルヒドロラーゼ酵素を提供することができる。
【誤訳訂正９】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００７８
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００７８】
ある実施態様において、所望の活性を有する酵素を生産するために相同蛋白質を設計する。特に好ましい実施態様において、設計された蛋白質はＳＧＮＨ−ヒドロラーゼファミリー蛋白質の範囲に入る。ある実施態様において、設計された蛋白質は次の保存残基の少なくとも１つ又は組み合わせを含む。すなわち、Ｌ６、Ｗ１４、Ｗ３４、Ｌ３８、Ｒ５６、Ｄ６２、Ｌ７４、Ｌ７８、Ｈ８１、Ｐ８３、Ｍ９０、Ｋ９７、Ｇ１１０、Ｌ１１４、Ｌ１３５、Ｆ１８０、Ｇ２０５である。別の実施態様において、これらの設計された蛋白質はＧＤＳＬ（配列番号２８）及びＧＲＴＴ  （配列番号２９）及び／又はＡＲＴＴ（配列番号３０）のモチーフを含む。さらなる実施態様において、酵素はマルチマーであり、２量体、８量体及び４量体を含むが、これらに限定されない。さらに実施態様において、設計された蛋白質は過加水分解対加水分解の比の値が１より大きいことを示す。
【誤訳訂正１０】
【訂正対象書類名】明細書
【訂正対象項目名】００１６
【訂正方法】変更
【訂正の内容】
【００１６】
さらに、本発明は本発明の少なくとも一つのペルヒドロラーゼを含む洗浄組成物の提供である。好ましい実施態様おいて、さらに洗浄組成物は長鎖アシルエステル基質と過酸化物の供給源を含み、それらとペルヒドロラーゼ酵素は長鎖過酸を生成する。ある実施態様において、洗浄組成物は、さらに少なくとも一つの界面活性剤を含む。ある実施態様おいて、洗浄組成物は洗濯洗剤である。