【手続補正書】
【提出日】平成24年3月30日(2012.3.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、被験体における転移性腫瘍を発症するリスクを評価することの指標とするための方法であって、
ａ．前記被験体から得たサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記サンプル中の前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記被験体において転移性腫瘍を発症するリスクの増加を示しているステップと
を含む方法。
【請求項２】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ２６〜４０、４２〜６０、６４、６５、６７〜７３、７５〜９５、９７、９８、１００〜１０２、１０４〜１２５、１２７〜１３４、１３６、１３９〜１７６、１７８〜１８９、１９１〜２０９、２１１、２１３〜２１６、２１９〜２２６、２２８〜２３８、２４０〜２６０、２６２〜２７０、２７２〜３６０からなる群から選択された１個または複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量を測定するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記腫瘍に関連する少なくとも１つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルが、電気泳動または免疫化学的手法によって測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記被験体が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性腫瘍を有する、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記サンプルが腫瘍生検標本である、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
５個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現レベルを測定する、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、被験体における転移性腫瘍を発症するリスクを評価することの指標とするための方法であって、
ａ．前記被験体から得たサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
【請求項１１】
前記基準値が指標値である、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、被験体における腫瘍の進行を評価することの指標とするための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記被験体から得た第１のサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記被験体から得た第２のサンプル中の２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出された量または基準値と比較するステップと
を含む方法。
【請求項１３】
前記第１のサンプルが、前記腫瘍の治療前に前記被験体から採取されるサンプルである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記第２のサンプルが、前記腫瘍の治療後に前記被験体から採取されるサンプルである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１５】
２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、転移性腫瘍の治療の有効性をモニタすることの指標とするための方法であって、
ａ．第１の期間で、被験体から得た第１のサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記被験体から得た第２のサンプル中の、２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出された量または基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記被験体から得た２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。
【請求項１６】
前記被験体が、前記転移性腫瘍の治療を事前に受けている、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記第１のサンプルが、前記転移性腫瘍の治療前に前記被験体から採取されるサンプルである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１８】
前記第２のサンプルが、前記転移性腫瘍の治療後に前記被験体から採取されるサンプルである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１９】
２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、腫瘍であると診断された被験体に関する治療レジメンを選択することの指標とするための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記被験体から得た第１のサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量のレベルを検出するステップと、
ｂ．任意選択で第２の期間で、前記被験体から得た第２のサンプル中の２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量のレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、基準値または任意選択でステップ（ｂ）で検出された量と比較するステップと
を含む方法。
【請求項２０】
前記被験体が、前記腫瘍の治療を事前に受けている、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記第１のサンプルが、前記腫瘍の治療前に前記被験体から採取されるサンプルである、請求項１９に記載の方法。
【請求項２２】
前記第２のサンプルが、前記腫瘍の治療後に前記被験体から採取されるサンプルである、請求項１９に記載の方法。
【請求項２３】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のマーカーの有効量の、マーカーレベルのパターンを含む、転移性腫瘍基準発現プロファイル。
【請求項２４】
請求項２３に記載のプロファイルを作成するのに十分な、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された対応するＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを検出する複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ検出試薬を含むキット。
【請求項２５】
前記検出試薬が、１つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、請求項２４に記載のキット。
【請求項２６】
前記検出試薬が１種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、請求項２４に記載のキット。
【請求項２７】
前記検出試薬が１種または複数のアプタマーを含む、請求項２４に記載のキット。
【請求項２８】
請求項２３に記載の１つまたは複数の転移性腫瘍基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および被験体情報とを含有する機械可読媒体。
【請求項２９】
生理学的または生化学的な経路に関連した転移の指標である１個または複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
【請求項３０】
前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、新脈管形成、細胞外マトリックス分解、またはアノイキスを含む、請求項２９に記載のパネル。
【請求項３１】
腫瘍の進行の指標である１個または複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
【請求項３２】
疾患の予後を示す生物マーカーを同定する方法であって、
ａ）対照と比較して前記疾患において示差的に発現する１つまたは複数の遺伝子を同定して、遺伝子標的リストを作成するステップと、
ｂ）前記疾患の進行の機能的局面に関連した前記標的リストの１つまたは複数の遺伝子を同定するステップと
を含み、それによって前記疾患の予後を示す生物マーカーを同定する方法。
【請求項３３】
進化的に保存された変化を含む、前記遺伝子標的リストの１つまたは複数の遺伝子を同定して、第２の遺伝子標的リストを作成するステップ
をさらに含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記疾患が癌である、請求項３２に記載の方法。
【請求項３５】
前記癌が転移性癌である、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
前記機能的局面が、細胞移動、新脈管形成、細胞外マトリックス分解、またはアノイキスである、請求項３２に記載の方法。
【請求項３７】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、（ａ）ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを発現する細胞を、候補化合物を含む組成物とエキソビボ、またはインビトロで接触させるステップと、
（ｂ）物質が前記ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、前記細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、前記ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する方法。
【請求項３８】
被験体の癌を治療するための組成物であって、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を含む組成物。
【請求項３９】
被験体の癌を治療するための組成物であって、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴにより調節される化合物の活性または発現を調節する薬剤を含む組成物。
【請求項４０】
前記化合物がＴＧＦβまたはＣＸＣＲ４である、請求項３９に記載の組成物。
【請求項４１】
前記薬剤がＴＧＦβ阻害剤またはＣＸＣＲ４阻害剤である、請求項４０に記載の組成物。
【請求項４２】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上を、患者が腫瘍を有していると特定することの指標とするための方法であって、
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上が、前記腫瘍から得たサンプルにおいて測定して臨床的に有意な様式で変化する、
方法。
【請求項４３】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上を、アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択することの指標とするための方法であって、
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上を測定するステップを含み、それにより転移のリスクが評価され、そして前記患者から得た腫瘍サンプル中の前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示す、
方法。
【請求項４４】
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上を、腫瘍患者に治療決定を知らせることの指標とするための方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上に関する情報を得るステップを含み、
前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが臨床的に有意な様式で変化する場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンが選択される、
方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
本発明のその他の特徴および利点は、以下の詳細な記述および特許請求の範囲から明らかにされ、そのような記述および範囲に包含されることになる。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
所定レベルの予測精度を用いて、被験体における転移性腫瘍を発症するリスクを評価するための方法であって、
ａ．前記被験体から得たサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記サンプル中の前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記被験体において転移性腫瘍を発症するリスクが高いことを示しているステップと
を含む方法。
（項目２）
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ２６〜４０、４２〜６０、６４、６５、６７〜７３、７５〜９５、９７、９８、１００〜１０２、１０４〜１２５、１２７〜１３４、１３６、１３９〜１７６、１７８〜１８９、１９１〜２０９、２１１、２１３〜２１６、２１９〜２２６、２２８〜２３８、２４０〜２６０、２６２〜２７０、２７２〜３６０からなる群から選択された１個または複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量を測定するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記腫瘍に関連する少なくとも１つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルが、電気泳動または免疫化学的手法によって測定される、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、項目４に記載の方法。
（項目６）
前記被験体が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性腫瘍を有する、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記サンプルが腫瘍生検標本である、項目１に記載の方法。
（項目８）
前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、項目１に記載の方法。
（項目９）
５個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現レベルを測定する、項目１に記載の方法。
（項目１０）
所定レベルの予測精度を用いて、被験体における転移性腫瘍を発症するリスクを評価するための方法であって、
ａ．前記被験体から得たサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
（項目１１）
前記基準値が指標値である、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
所定レベルの予測精度を用いて、被験体における腫瘍の進行を評価するための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記被験体から得た第１のサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記被験体から得た第２のサンプル中の２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出された量または基準値と比較するステップと
を含む方法。
（項目１３）
前記第１のサンプルが、前記腫瘍の治療前に前記被験体から採取される、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記第２のサンプルが、前記腫瘍の治療後に前記被験体から採取される、項目２に記載の方法。
（項目１５）
所定レベルの予測精度を用いて、転移性腫瘍の治療の有効性をモニタするための方法であって、
ａ．第１の期間で、被験体から得た第１のサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記被験体から得た第２のサンプル中の、２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出された量または基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記被験体から得た２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。
（項目１６）
前記被験体が、前記転移性腫瘍の治療を事前に受けている、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記第１のサンプルが、前記転移性腫瘍の治療前に前記被験体から採取される、項目１５に記載の方法。
（項目１８）
前記第２のサンプルが、前記転移性腫瘍の治療後に前記被験体から採取される、項目１５に記載の方法。
（項目１９）
所定レベルの予測精度を用いて、腫瘍であると診断された被験体に関する治療レジメンを選択するための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記被験体から得た第１のサンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量のレベルを検出するステップと、
ｂ．任意選択で第２の期間で、前記被験体から得た第２のサンプル中の２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量のレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、基準値または任意選択でステップ（ｂ）で検出された量と比較するステップと
を含む方法。
（項目２０）
前記被験体が、前記腫瘍の治療を事前に受けている、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記第１のサンプルを、前記腫瘍を治療する前に前記被験体から採取する、項目１９に記載の方法。
（項目２２）
前記第２のサンプルを、前記腫瘍を治療した後に前記被験体から採取する、項目１９に記載の方法。
（項目２３）
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された２個以上のマーカーの有効量の、マーカーレベルのパターンを含む、転移性腫瘍基準発現プロファイル。
（項目２４）
項目２０に記載のプロファイルを作成するのに十分な、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜２５、４１、６１、６２、６３、６６、７４、９６、９９、１０３、１２６、１３５、１３７、１３８、１７７、１９０、２１０、２１２、２１７、２１８、２２７、２３９、２６１、および２７１からなる群から選択された対応するＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを検出する複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ検出試薬を含むキット。
（項目２５）
前記検出試薬が、１つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、項目２４に記載のキット。
（項目２６）
前記検出試薬が１種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、項目２４に記載のキット。
（項目２７）
前記検出試薬が１種または複数のアプタマーを含む、項目２４に記載のキット。
（項目２８）
項目２３に記載の１つまたは複数の転移性腫瘍基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および被験体情報とを含有する機械可読媒体。
（項目２９）
生理学的または生化学的な経路に関連した転移を示す１個または複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
（項目３０）
前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、新脈管形成、細胞外マトリックス分解、またはアノイキスを含む、項目２６に記載のパネル。
（項目３１）
腫瘍の進行を示す１個または複数のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
（項目３２）
疾患の予後を示す生物マーカーを同定する方法であって、
ａ）対照と比較して前記疾患において示差的に発現する１つまたは複数の遺伝子を同定して、遺伝子標的リストを作成するステップと、
ｂ）前記疾患の進行の機能的局面に関連した前記標的リストの１つまたは複数の遺伝子を同定するステップと
を含み、それによって前記疾患の予後を示す生物マーカーを同定する方法。
（項目３３）
進化的に保存された変化を含む、前記遺伝子標的リストの１つまたは複数の遺伝子を同定して、第２の遺伝子標的リストを作成するステップ
をさらに含む、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記疾患が癌である、項目３２に記載の方法。
（項目３５）
前記癌が転移性癌である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記機能的局面が、細胞移動、新脈管形成、細胞外マトリックス分解、またはアノイキスである、項目３２に記載の方法。
（項目３７）
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、（ａ）前記ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを発現する細胞を提供するステップと、
（ｂ）前記細胞を、候補化合物を含む組成物と接触させるステップと、
（ｃ）物質が前記ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、前記細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、前記ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する方法。
（項目３８）
前記細胞を、インビボ、エキソビボ、またはインビトロで接触させる、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
被験体の癌を治療する方法であって、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を前記被験体に投与するステップを含む方法。
（項目４０）
被験体の癌を治療する方法であって、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴにより調節される化合物の活性または発現を調節する薬剤を前記被験体に投与するステップを含む方法。
（項目４１）
前記化合物がＴＧＦβまたはＣＸＣＲ４である、項目４０に記載の方法。
（項目４２）
前記薬剤がＴＧＦβ阻害剤またはＣＸＣＲ４阻害剤である、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
腫瘍を有する患者を治療する方法であって、
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上が、前記腫瘍から得たサンプルにおいて測定して臨床的に有意な形で変化する場合に、患者が腫瘍を有していると特定するステップと、
腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンで前記患者を治療するステップと
を含む方法。
（項目４４）
アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択する方法であって、
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上を測定することにより、前記患者における転移のリスクを評価するステップであって、前記患者から得た腫瘍サンプル中の前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示すステップ
を含む方法。
（項目４５）
腫瘍患者に治療決定を知らせる方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３６０の２個以上に関する情報を得るステップと、
前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが臨床的に有意な様式で変化する場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンを選択するステップと
を含む方法。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１０６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１０６】
【表１−１】
2011526693.tif 000001
【手続補正４】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１５３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１５３】
【化１】
2011526693.tif 000002
ＳＭＡＤ３プライマーは、Ｓｕｐｅｒａｒｒａｙ製であった。