【手続補正書】
【提出日】平成15年11月28日(2003.11.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】発明の名称
【補正方法】変更
【補正の内容】
【発明の名称】有機化合物の構造推定方法


【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）構造推定対象となる有機化合物に対する二次元ＮＭＲスペクトル測定で得られた二次元プロトンＮＭＲ情報を入力するステップと、
（ｂ）有機化合物の構造のうち、プロトンの結合した炭素原子が１原子以上つらなる部分を基幹部分、基幹部分以外の部分を非基幹部分と呼ぶとき、有機化合物に含まれる基幹部分と当該基幹部分に隣接する非基幹部分とから構成され、且つ、該非基幹部分中の原子が前記基幹部分以外の基幹部分中のプロトンの結合した炭素原子と結合している場合には当該プロトンの結合した炭素原子を疑似原子として含む部分構造と、二次元プロトンＮＭＲ情報との相関関係を蓄積した知識ベースに蓄積された部分構造のそれぞれについて、その二次元プロトンＮＭＲ情報と前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報とを照合し、前記構造推定対象となる有機化合物に含まれる可能性のある部分構造を推定するステップとを含むことを特徴とする有機化合物の構造推定方法。
【請求項２】
前記知識ベース中の二次元プロトンＮＭＲ情報および前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報は、１Ｈ−ＮＭＲスペクトルにおける各ピークの化学シフト値、各ピークのプロトン数、及び存在する場合にはクロスピーク情報を含む請求項１記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項３】
前記知識ベースは、有機化合物中の同じ芳香族環に属する基幹部分を持つ複数の部分構造は一つの部分構造として蓄積する請求項２記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項４】
前記ステップｂは、
（ｂ−１）前記知識ベース中の部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報における各ピークの化学シフト値及び各ピークのプロトン数が前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報に矛盾しないかどうかを調べるステップと、
（ｂ−２）前記知識ベース中の部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報における各クロスピークが前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報に矛盾しないかどうかを調べるステップとを含む請求項２記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項５】
前記ステップｂ−１では、前記知識ベース中の部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報におけるヘテロ原子に結合したプロトンにかかるピークについては、マッチするピークが前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報中に存在しない場合でもマッチしたものと判定する請求項４記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項６】
前記ステップｂ−２では、前記知識ベース中の部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報におけるヘテロ原子に結合したプロトンにかかるクロスピークおよびジェミナルプロトンにかかるクロスピークについては、マッチするクロスピークが前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報中に存在しない場合でもマッチしたものと判定する請求項４記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項７】
前記ステップｂ−２では、前記知識ベース中の部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報におけるクロスピークを構成するピークが、前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報における同じプロトン数のピークにマッチする場合、部分構造の当該ピークとクロスピークを成すピークとして、当該部分構造が持つピークのみが前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報に存在するか否かを検査する請求項４記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項８】
前記ステップｂ−２では、前記知識ベース中の部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報におけるクロスピークを構成するピークが、前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報におけるプロトン数のより多いピークにマッチする場合、部分構造の当該ピークとクロスピークを成すピークが前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報中に存在しない場合でも、および部分構造の当該ピークとクロスピークを成すピークとして、当該部分構造が持つピーク以外のピークが前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報に存在していても、マッチすると判断する請求項４記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項９】
前記ステップｂは更に、
（ｂ−３）前記構造推定対象となる有機化合物に含まれる可能性のある部分構造毎に、その部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報における各ピークのプロトン数と前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報におけるマッチしたピークのプロトン数とから、当該部分構造が前記構造推定対象となる有機化合物に含まれる可能性のある個数を求めるステップを含む請求項４記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１０】
（ｃ）前記ステップｂによって推定された部分構造から前記構造推定対象となる有機化合物の候補構造を組み立てるステップを更に含む請求項１または２記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１１】
前記ステップｃは、
（ｃ−１）前記ステップｂによって推定された部分構造から全体構造を組み立てる際の出発点となる部分構造を選定するステップと、
（ｃ−２）該選定された部分構造を出発点として前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報と矛盾の無い候補構造を組み立てるステップとを含む請求項１０記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１２】
前記ステップｃ−１では、前記ステップｂによって推定された部分構造の全てを、全体構造を組み立てる際の出発点となる部分構造に選定する請求項１１記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１３】
前記ステップｃ−１では、前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報中の各クロスピーク毎に、そのクロスピークにマッチするクロスピークを持つ部分構造の集合を生成し、その部分構造の集合の何れか１つを、全体構造を組み立てる際の出発点となる部分構造に選定する請求項１１記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１４】
前記ステップｃ−１では、前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報中にクロスピークが存在しない場合、前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報中の各ピーク毎に、そのピークにマッチするピークを持つ部分構造の集合を生成し、その部分構造の集合の何れか１つを、全体構造を組み立てる際の出発点となる部分構造に選定する請求項１３記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１５】
前記生成した部分構造の集合毎に、その部分構造の集合を全体構造を組み立てる際の出発点となる部分構造に選定した際の優劣をコンピューティング時間の面から評価し、最も評価の高い部分構造の集合を、全体構造を組み立てる際の出発点となる部分構造に選定する請求項１３または１４記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１６】
前記ステップｃ−２は、
（ｃ−２−１）部分構造どうしを重ね合わせてより大きな部分構造を生成することにより、前記ステップｃ−１によって選定された部分構造毎に、その部分構造をルートとし、完全構造またはそれ以上大きくできない部分構造をリーフとする組み立ての樹を探索するステップと、
（ｃ−２−２）リーフの内、完全構造であって且つ前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報と矛盾の無い構造を１つの候補構造とするステップとを含む請求項１１記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１７】
前記ステップｃ−２−１では、部分構造どうしの重ね合わせは、疑似原子を例外として、水素原子のない構造の部分でのみ行う請求項１６記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１８】
前記ステップｃ−２−１では、一方の部分構造の何れか１つの非基幹部分の全原子及びその息子原子が、他方の部分構造の何れか１つの非基幹部分の全原子およびその息子原子にマッチするとき、この２つの部分構造は重ね合わせることができると判定する請求項１７記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項１９】
前記ステップｃ−２−１では、一方の部分構造中の疑似原子と他方の部分構造中の疑似原子またはプロトンの結合した炭素原子とを重ね合わせのスタート点として重ね合わせを試行する請求項１８記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項２０】
前記ステップｃ−２−１では、組み立ての樹のノードから、より大きな部分構造を生成するために当該ノードに部分構造を重ね合わせる処理を行う前に、当該部分構造の二次元プロトンＮＭＲ情報と当該ノードの二次元プロトンＮＭＲ情報とを統合した二次元プロトンＮＭＲ情報が前記入力された二次元プロトンＮＭＲ情報に矛盾しないかどうかをチェックし、矛盾する場合には重ね合わせ処理を行わない請求項１６記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項２１】
前記ステップｃ−２−１では、深さ方向優先探索によって組み立ての樹を探索し、且つ、バックトラック時に直前に重ね合わせた部分構造を差し引くことにより直前のノードを動的に生成する請求項１６記載の有機化合物の構造推定方法。
【請求項２２】
前記ステップｃ−２−２では、各候補構造毎に当該完全構造がどの程度良い候補であるかを定量的に示すスコアを算出する請求項１６記載の有機化合物の構造推定方法。
【手続補正３】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００１】
【産業上の利用分野】
本発明は有機化合物の構造推定に関し、特に既知の有機化合物の部分構造と二次元プロトンＮＭＲ情報（ピークの化学シフトとＨ−ＨＣＯＳＹピークなどのクロスピークの情報）との相関関係を蓄積する知識ベースを使って、未知の有機化合物から測定された二次元プロトンＮＭＲ情報に基づいて未知有機化合物に含まれうる部分構造、更には完全構造を推定する方法に関する。