【手続補正書】
【提出日】平成26年1月27日(2014.1.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質であって、該タンパク質は、
（a）配列番号１６４、１７９もしくは１８０のアミノ酸配列；または
（b）第１ポリペプチドおよび第２ポリペプチドを含んでなり、該第１ポリペプチドは、該第２ポリペプチドに対してＮ末端側に位置しており、ここで、
（ｉ）該第１ポリペプチドは、配列番号１の残基１〜１３４に対して少なくとも９８％の同一性を有する配列であり、かつ
（ｉｉ）該第２ポリペプチドは、配列番号１の残基１５５〜３９２に対して少なくとも９８％の同一性を有する配列であり、
ここで、該第１および第２ポリペプチドは、直接連結されているか、または第３ポリペプチドを介して間接的に連結されており、該第３ポリペプチドは、少なくとも３個のアミノ酸の連続した部分が欠失している、配列番号１における残基１３５〜１５４に対応する配列に対して少なくとも８０％の同一性を有する、改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２】
請求項１に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質であって、該タンパク質は、第１ポリペプチドおよび第２ポリペプチドを含んでなり、該第１ポリペプチドは、該第２ポリペプチドに対してＮ末端側に位置しており、ここで、
（ｉ）該第１ポリペプチドは、配列番号１の残基１〜１３４に対して少なくとも９８％の同一性を有する配列であり、かつ
（ｉｉ）該第２ポリペプチドは、配列番号１の残基１５５〜３９２に対して少なくとも９８％の同一性を有する配列であり、
ここで、該第１および第２ポリペプチドは、直接連結されているか、または第３ポリペプチドを介して間接的に連結されており、該第３ポリペプチドは、少なくとも３個のアミノ酸の連続した部分が欠失している、配列番号１における残基１３５〜１５４に対応する配列に対して少なくとも８０％の同一性を有する、改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項３】
前記第１ポリペプチドが、配列番号１の残基１〜１３４に対して少なくとも９９％の同一性を有する、請求項２に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項４】
前記第１ポリペプチドが、配列番号１の残基１〜１３４に対して１００％の同一性を有する、請求項３に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項５】
前記第２ポリペプチドが、配列番号１の残基１５５〜３９２に対して少なくとも９９％の同一性を有する、請求項２〜４のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項６】
前記第２ポリペプチドが、配列番号１の残基１５５〜３９２に対して１００％の同一性を有する、請求項５に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項７】
ペプチド結合が直接的である、請求項２〜６のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項８】
ペプチド結合が間接的である、請求項２〜６のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項９】
前記第３ポリペプチドが、少なくとも３個のアミノ酸の連続した部分が欠失している、配列番号１における残基１３５〜１５４に対応する配列に対して少なくとも９０％の同一性を有する配列である、請求項８に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１０】
前記第３ポリペプチドが、少なくとも３個のアミノ酸の連続した部分が欠失している、配列番号１における残基１３５〜１５４に対応する配列に対して少なくとも９５％の同一性を有する配列である、請求項９に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１１】
配列番号１における１３４〜１８３に対応する残基から欠失される連続した部分が、少なくとも４個のアミノ酸である、請求項２〜１０のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１２】
配列番号１における１３４〜１８３に対応する残基から欠失される連続した部分が、少なくとも５個のアミノ酸である、請求項１１に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１３】
前記第３ポリペプチドが、２０アミノ酸長またはそれ以下である、請求項８〜１２のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１４】
前記タンパク質が、５００アミノ酸残基長より短い、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１５】
前記タンパク質が、４００アミノ酸残基長より短い、請求項１４に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１６】
配列番号１６３のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１７】
配列番号１６４のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１８】
配列番号１６５のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項１９】
配列番号１６６のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２０】
配列番号１６７のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２１】
配列番号１６８のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２２】
配列番号１６９のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２３】
配列番号１７９のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２４】
配列番号１８０のアミノ酸配列を含んでなる、請求項２、１４または１５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２５】
請求項１〜２４のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質であって、該タンパク質は、
（a）配列番号１６４、１７９もしくは１８０のアミノ酸配列；または
（b）第１ポリペプチドおよび第２ポリペプチドからなり、該第１ポリペプチドは、該第２ポリペプチドに対してＮ末端側に位置しており、ここで、
（ｉ）該第１ポリペプチドは、配列番号１の残基１〜１３４に対して少なくとも９８％の同一性を有する配列であり、かつ
（ｉｉ）該第２ポリペプチドは、配列番号１の残基１５５〜３９２に対して少なくとも９８％の同一性を有する配列であり、
ここで、該第１および第２ポリペプチドは、直接連結されているか、または第３ポリペプチドを介して間接的に連結されており、該第３ポリペプチドは、少なくとも３個のアミノ酸の連続した部分が欠失している、配列番号１における残基１３５〜１５４に対応する配列に対して少なくとも８０％の同一性を有する、改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質。
【請求項２６】
ＴＢの治療、予防または改善のための薬剤の製造における請求項１〜２６のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質の使用。
【請求項２７】
請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質をコードする核酸配列を含んでなる、ポリヌクレオチド。
【請求項２８】
請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質をコードする核酸配列からなる、請求項２７に記載のポリヌクレオチド。
【請求項２９】
配列番号１６３〜１６９のいずれか１つに記載のポリペプチドをコードする配列を含んでなる、請求項２７または２８のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項３０】
配列番号１７９または１８０のいずれかに記載のポリペプチドをコードする配列を含んでなる、請求項２７または２８のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
【請求項３１】
ＴＢの治療、改善または予防のための薬剤の製造における請求項２７〜３０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドの使用。
【請求項３２】
（ａ）請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質と、
（ｂ）薬学上許容される担体または賦形剤と
を含んでなる、医薬組成物。
【請求項３３】
（ａ）請求項２７〜３０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドと、
（ｂ）薬学上許容される担体または賦形剤と
を含んでなる、医薬組成物。
【請求項３４】
（ａ）請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質と、
（ｂ）非特異的な免疫応答増強剤と
を含んでなる、免疫原性組成物。
【請求項３５】
（ａ）請求項２７〜３０のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドと、
（ｂ）非特異的な免疫応答増強剤と
を含んでなる、免疫原性組成物。
【請求項３６】
請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質をコードする核酸配列を含んでなる、発現ベクター。
【請求項３７】
請求項３６の発現ベクターで形質転換された宿主細胞。
【請求項３８】
請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質を組換え的に発現する宿主細胞。
【請求項３９】
請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質を生成するための方法であって、宿主細胞内で前記ポリペプチドを組換え的に発現させることを含んでなる、方法。
【請求項４０】
前記宿主細胞が、Ｅ．ｃｏｌｉである、請求項３９に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質を生成するための方法。
【請求項４１】
（ａ）請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質と、
（ｂ）該改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質と、個体由来のサンプル（例えば、全血またはより好適にはＰＢＭＣ）とを接触させるのに足りる装置と、
（ｃ）該サンプルのＴ細胞応答を定量する手段と
を含んでなる、診断キット。
【請求項４２】
請求項１〜２５のいずれか一項に記載の改変されたＲｖ３６１６ｃタンパク質と、追加の異種ポリペプチドとを含んでなる、融合タンパク質。
【請求項４３】
請求項４２に記載の融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド。
【請求項４４】
ポリペプチドの形態である追加の異種抗原成分を含んでなる、請求項３２または３３のいずれかに記載の医薬組成物。
【請求項４５】
ポリヌクレオチドの形態である追加の異種抗原成分を含んでなる、請求項３２または３３のいずれかに記載の医薬組成物。