【手続補正書】
【提出日】平成26年3月27日(2014.3.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の結合を阻害すること、該結合と競合すること、または該結合の力価を決定すること；
（ｂ）微生物バイオフィルムを阻害、予防または破壊すること；
（ｃ）被験体においてバイオフィルムを処置すること；あるいは
（ｄ）被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防または処置すること；
のうちの１つまたは複数において使用するための、干渉作用剤を含む組成物。
【請求項２】
前記干渉作用剤が、
（ａ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチドもしくはＩＨＦポリペプチドの断片、ＩＨＦポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物、
（ｂ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｃ）表８、表９Ａ、９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質もしくはポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｄ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｅ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｆ）微生物ＤＮＡへの結合について、組込み宿主因子と競合するポリペプチドまたはポリヌクレオチド、
（ｇ）単離されたかもしくは組換え型のＤＮＡＢＩＩポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｈ）ＨＵポリペプチドもしくはその断片、ＨＵポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物、
（ｉ）ホリデイジャンクションと似ている４方向ジャンクションポリヌクレオチド、複製フォークと似ている３方向ジャンクションポリヌクレオチド、固有の柔軟性を有するポリヌクレオチド、または屈曲したポリヌクレオチド、
（ｊ）（ａ）〜（ｈ）のうちの任意の１つをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または配列番号３６の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、またはそのそれぞれの等価物、またはストリンジェントな条件下で該ポリヌクレオチド、その等価物もしくはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド、
（ｋ）（ａ）〜（ｈ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、または各抗体もしくはその抗原結合性断片の等価物もしくは断片、
（ｌ）（ｋ）の抗体もしくは抗原結合性断片をコードする単離されたかもしくは組換え
型のポリヌクレオチド、またはその相補物、あるいは
（ｍ）ＤＮＡＢＩＩタンパク質もしくはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合と競合する小分子
のうちの１つまたは複数である、請求項１に記載の組成物。
【請求項３】
免疫応答を必要とする被験体において免疫応答を誘導すること、または受動免疫を必要とする被験体に受動免疫を付与することにおいて使用するための、干渉作用剤を含む組成物であって、該干渉作用剤が、
（ａ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｂ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｃ）表８、表９Ａ、表９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質ポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｄ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはその断片もしくは等価物、
（ｅ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または配列番号３６の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、またはそのそれぞれの等価物、またはストリンジェントな条件下で該ポリヌクレ
オチド、その等価物もしくはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド、
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、またはそのそれぞれの等価物もしくは断片、
（ｈ）（ｇ）の抗体または抗原結合性断片をコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｉ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つでパルスした抗原提示細胞、および
（ｊ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つをコードする１種または複数種のポリヌクレオチドがトランスフェクトされた抗原提示細胞、
の群のうちの１つまたは複数であるか、あるいは該干渉作用剤が
（ｋ）単離されたかもしくは組換え型のＤＮＡＢＩＩポリペプチド、またはその断片もしくは等価物、
（ｌ）ＩＨＦポリペプチドもしくはその断片、ＩＨＦポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物である、単離されたかもしくは組換え型のＤＮＡＢＩＩポリペプチド、
（ｍ）ＨＵポリペプチドもしくはその断片、ＨＵポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物である、単離されたかもしくは組換え型のＤＮＡＢＩＩポリペプチド、あるいは
（ｎ）表８において同定される微生物に由来する、単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド
のうちの１つまたは複数である、組成物。
【請求項４】
抗菌薬、ＤＮアーゼ、抗体、抗原性ペプチドまたはアジュバントのうちの１つまたは複数をさらに含む、請求項１から３までのいずれか一項に記載の組成物。
【請求項５】
単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、
（ａ）配列番号１〜５もしくは１２〜２７、３０〜３５、１０１〜３４０を含むポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｂ）配列番号１または２を含むポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド、
（ｃ）配列番号３、４、または５を含むポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド、
（ｄ）配列番号１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、３０、または３２を含むポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド、
（ｅ）配列番号１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、３１、または３３を含むポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド、
（ｆ）配列番号１２および１３を含むポリペプチド、
（ｇ）配列番号１４および１５を含むポリペプチド、
（ｈ）配列番号１６および１７を含むポリペプチド、
（ｉ）配列番号１８および１９を含むポリペプチド、
（ｊ）配列番号２０および２１を含むポリペプチド、
（ｋ）配列番号２３および２４を含むポリペプチド、
（ｌ）配列番号２５および２６を含むポリペプチド、
（ｍ）配列番号３０および３１を含むポリペプチド、
（ｎ）配列番号３２および３３を含むポリペプチド、
（ｏ）配列番号３４および３５を含むポリペプチド、
（ｐ）配列番号３３７および３３８を含むポリペプチド、
（ｑ）配列番号３３９および３４０を含むポリペプチド、
（ｒ）配列番号１２および１３から本質的になるポリペプチド、
（ｓ）配列番号１４および１５から本質的になるポリペプチド、
（ｔ）配列番号１６および１７から本質的になるポリペプチド、
（ｕ）配列番号１８および１９から本質的になるポリペプチド、
（ｖ）配列番号２０および２１から本質的になるポリペプチド、
（ｗ）配列番号２３および２４から本質的になるポリペプチド、
（ｘ）配列番号２５および２６から本質的になるポリペプチド、
（ｙ）配列番号３０および３１から本質的になるポリペプチド、
（ｚ）配列番号３２および３３から本質的になるポリペプチド、
（ａａ）配列番号３４および３５から本質的になるポリペプチド、
（ｂｂ）配列番号３３７および３３８から本質的になるポリペプチド、または
（ｃｃ）配列番号３３９および３４０から本質的になるポリペプチド、
（ｄｄ）上記の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドの断片または等価物、
（ｅｅ）上記の任意の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドの２つ以上を含む、単離されたかまたは組換え型のポリペプチド、
の群から選択され、
（ａ）から（ｅｅ）のすべてについて、該ポリペプチドは、ＩＨＦアルファ、ＩＨＦベータのうちの任意の１つの野生型、または配列番号６〜１１、２８、２９、もしくは４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
【請求項６】
請求項５に記載のポリペプチドをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または該単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチドを含むベクターもしくは宿主細胞。
【請求項７】
請求項５に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチドを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、または該抗体もしくは該抗原結合性断片をコードする、単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチドであって、ここで、該抗体が、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、抗体誘導体、ベニア化抗体、二機能性抗体、抗体誘導体、組換えヒト抗体、キメラ抗体、または抗体断片の群より必要に応じて選択される、抗体もしくは抗原結合性断片、またはポリヌクレオチド。
【請求項８】
キャリアと、
（ａ）請求項５に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、
（ｂ）請求項６に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｃ）請求項６に記載のベクター、
（ｄ）請求項６に記載の宿主細胞、
（ｅ）請求項７に記載の抗体、または
（ｆ）請求項６に記載の組換え型ポリヌクレオチド
の群のうちの１つまたは複数と
必要に応じてアジュバントまたは抗菌薬を含む、組成物であって、
ここで、該キャリアが、液体キャリア、薬学的に許容されるキャリア、固相キャリア、薬学的に許容されるポリマー、リポソーム、ミセル、インプラント、ステント、ペースト、ゲル、歯科インプラントまたは医療用インプラントの群より選択され、
必要に応じて、該組成物が、ヒト患者、小児患者、または非ヒト動物に投与するために処方されたものであり、
そして必要に応じて、ここで、該組成物が、局部的投与、局所的投与、経真皮的投与、経皮的投与、舌下投与、直腸投与、膣投与、眼投与、皮下投与、筋肉内投与、腹腔内投与、尿道投与、鼻腔内投与、吸入投与または経口的投与を含む１種または複数種の方法によって投与するために処方されたものである、組成物。
【請求項９】
（ａ）請求項５に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチド、
（ｂ）請求項６に記載の単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｃ）請求項６に記載のベクター、
（ｄ）請求項７に記載の抗体、
（ｅ）請求項８に記載の組成物、
（ｆ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｇ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｈ）表８、表９Ａ、表９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質ポリペプチド、図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｉ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｊ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｋ）微生物ＤＮＡへの結合について組込み宿主因子と競合するポリペプチド、
（ｌ）ホリデイジャンクションと似ている４方向ジャンクションポリヌクレオチド、複製フォークと似ている３方向ジャンクションポリヌクレオチド、固有の柔軟性を有するポリヌクレオチド、または屈曲したポリヌクレオチド、
（ｍ）（ｇ）〜（ｋ）のうちの任意の１つをコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｎ）（ｇ）〜（ｋ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしく特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、またはその等価物もしくは断片、あるいは
（ｏ）（ｎ）の抗体または抗原結合性断片をコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、および
（ｐ）ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合と競合する小分子
の群のうちの１つまたは複数の作用剤の使用。
【請求項１０】
（ａ）前記抗体がモノクローナル抗体またはその断片である、
（ｂ）前記モノクローナル抗体またはその断片が、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ベニア化抗体、修飾抗体または抗体誘導体である、
（ｃ）前記抗体が、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域および／またはＣＤＲ３領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、
（ｄ）前記抗体が、システイン残基の数を変更することによって、またはＦｃヒンジ領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、あるいは
（ｅ）前記モノクローナル抗体またはその断片が化学修飾されているか、ペグ化されているか、または血清タンパク質とコンジュゲートしている、
（ｆ）前記抗体がヒト抗体、ヒト化抗体であるモノクローナル抗体またはその断片である、
（ｇ）前記モノクローナル抗体またはその断片が、少なくとも１つの追加的な機能分子とコンジュゲートしているかまたは融合している、
（ｈ）前記モノクローナル抗体またはその断片が、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ベニア化抗体、修飾抗体または抗体誘導体である、
（ｉ）前記追加的な機能分子が第２の抗体である、
（ｊ）前記抗体が、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域および／またはＣＤＲ３領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、
（ｋ）前記抗体が、システイン残基の数を変更することによって、またはＦｃヒンジ領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、
（ｌ）前記モノクローナル抗体またはその断片が化学修飾されているか、ペグ化されているか、または血清タンパク質とコンジュゲートしており、該血清タンパク質が、必要に応じてヒト血清アルブミンである、あるいは
（ｍ）前記モノクローナル抗体またはその断片が、診断薬とコンジュゲートしている、請求項２、３または４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１１】
組換え型のポリヌクレオチドの等価物が、ストリンジェントな条件下で該ポリヌクレオチドまたはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチドを含み、該ストリンジェントな条件が、約２５℃から約３７℃までのインキュベーション温度；約６×ＳＳＣから約１０×ＳＳＣまでのハイブリダイゼーション緩衝液の濃度；約０％から約２５％までのホルムアミド濃度；および約４×ＳＳＣから８×ＳＳＣまでの洗浄溶液を含む、請求項３、４または８に記載の組成物、請求項５に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチド、請求項６に記載のベクター、請求項７または１０に記載の抗体、あるいは請求項９に記載の使用。
【請求項１２】
ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害するか、該結合と競合するか、もしくは該結合の力価を決定する作用剤、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、被験体におけるバイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、または被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置する作用剤を同定するための、干渉作用剤のコンピュータ実装使用であって、候補作用剤の三次元構造を、組込み宿主因子（ＩＨＦ）タンパク質の三次元構造と対照して位置決定する工程を含み、ここで、該ＩＨＦタンパク質の該三次元構造は、ＩＨＦおよびＤＮＡの複合体の結晶形から決定された原子構造座標Ｘ、ＹおよびＺに基づき、配列番号４２に示されるＴ４、Ｋ５、Ａ６、Ｅ２８、Ｑ４３、Ｋ４５、Ｓ４７、Ｇ４８、Ｎ５１、Ｒ５５、Ｋ５７、Ｒ６０、Ｒ６３、Ｎ６４、Ｐ６５、Ｋ６６、Ｒ７６、Ｔ８０、Ｒ８２またはＱ８５から選択される２つ以上のＩＨＦアミノ酸、またはそのそれぞれの等価物における該作用剤と該ＩＨＦとの相互作用により、該作用剤が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合と競合すること、もしくは該結合の力価を決定すること、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、またはバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置することが同定され、好ましくは、配列番号４２に示されるＴ４、Ｋ５、Ａ６、Ｅ２８、Ｑ４３、Ｋ４５、Ｓ４７、Ｇ４８、Ｎ５１、Ｒ５５、Ｋ５７、Ｒ６０、Ｒ６３、Ｎ６４、Ｐ６５、Ｋ６６、Ｒ７６、Ｔ８０、Ｒ８２またはＱ８５から選択されるＩＨＦアミノ酸の３つ以上、またはそのそれぞれの等価物における該作用剤と該ＩＨＦとの相互作用により、該作用剤が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合と競合すること、もしくは該結合の力価を決定すること、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、またはバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置することが同定され、より好ましくは、該原子構造座標Ｘ、ＹおよびＺが、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｄａｔａ  Ｂａｎｋ（ＰＤＢ）受託番号：１ＩＨＦに記載の座標を含む、使用。
【請求項１３】
少なくとも１つのプロセッサ、
該少なくとも１つのプロセッサに接続されたメモリ、
該メモリおよび該少なくとも１つのプロセッサと通信している記憶媒体
を含むカスタムコンピュータ装置であって、
該記憶媒体は、プロセッサ実行可能命令のセットを含み、該セットは、該プロセッサによって実行されると、該カスタムコンピュータ装置が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害するか、該結合と競合するか、もしくは該結合の力価を決定する作用剤、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、被験体におけるバイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、または被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置する作用剤を同定するように設定され、該設定は、
候補作用剤の三次元構造を、組込み宿主因子（ＩＨＦ）タンパク質の三次元構造と対照して位置決定することを含み、ここで、該ＩＨＦタンパク質の該三次元構造は、ＩＨＦおよびＤＮＡの複合体の結晶形から決定された原子構造座標Ｘ、ＹおよびＺに基づき、配列番号４２に示されるＴ４、Ｋ５、Ａ６、Ｅ２８、Ｑ４３、Ｋ４５、Ｓ４７、Ｇ４８、Ｎ５１、Ｒ５５、Ｋ５７、Ｒ６０、Ｒ６３、Ｎ６４、Ｐ６５、Ｋ６６、Ｒ７６、Ｔ８０、Ｒ８２またはＱ８５から選択される２つ以上のＩＨＦアミノ酸、またはそのそれぞれの等価物における該作用剤と該ＩＨＦとの相互作用により、該作用剤が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合と競合すること、もしくは該結合の力価を決定すること、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、またはバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置することが同定される、カスタムコンピュータ装置。
【請求項１４】
ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドおよび微生物ＤＮＡを含有する単離された試料において、ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合を調節する作用剤を同定するためのインビトロの方法であって、候補作用剤を該試料と接触させる工程、および該タンパク質または該ポリペプチドの該ＤＮＡへの結合についてアッセイする工程を含み、ここで、該作用剤は、該ＤＮＡＢＩＩタンパク質または該ＤＮＡＢＩＩポリペプチドの該微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合を予防すること、または該結合の力価を決定することによって該結合を調節する、方法。
【請求項１５】
ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の存在または非存在を、微生物感染症を有する患者が干渉作用剤を投与することによって処置される可能性があるかまたは該可能性がないことの指標とするインビトロの方法であって、該患者から単離され、かつ感染物質を含有する試料におけるＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の存在または非存在を検出する工程を含み、ここで、該ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたは該ＤＮＡＢＩＩタンパク質の存在により、該患者は、該干渉作用剤を投与することによって処置される可能性があると同定され、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の非存在により、該患者は、該干渉作用剤を投与することによって処置される可能性がないと同定される、方法。
【請求項１６】
抗菌剤、ＤＮアーゼ、抗体、抗原性ペプチド、アジュバントのうちの１つ以上と、請求項５に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチド、請求項６に記載の単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、または請求項７に記載の抗体または抗原結合性断片のうちの１つ以上とを含む、組成物。
【請求項１７】
請求項５に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、請求項６に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または請求項７に記載の抗体もしくは抗原結合性断片のうちの１つまたは複数、および必要に応じて、使用説明書、を含む、キット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２８】
表１０は、示された生物体由来のＤＮＡＢＩＩタンパク質のα部分、β部分、およびＣ末端部分の一覧表である。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害するための、該結合と競合するための、または該結合の力価を決定するための方法であって、該ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくは該ＤＮＡＢＩＩタンパク質または該微生物ＤＮＡを干渉作用剤と接触させて、該ＤＮＡＢＩＩタンパク質または該ＤＮＡＢＩＩポリペプチドの該微生物ＤＮＡへの結合を阻害する工程、該結合と競合する工程、または該結合の力価を決定する工程を含む、方法。
（項目２）
微生物バイオフィルムを阻害、予防または破壊するための方法であって、該バイオフィルムを干渉作用剤と接触させて、該微生物バイオフィルムを阻害、予防または破壊する工程を含む、方法。
（項目３）
前記接触がｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏでの接触である、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
被験体におけるバイオフィルムを阻害、予防または破壊する方法であって、該被験体に有効量の干渉作用剤を投与して、該微生物バイオフィルムを阻害、予防または破壊する工程を含む、方法。
（項目５）
被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防または処置するための方法であって、該被験体に有効量の干渉作用剤を投与して、該被験体において該バイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防または処置する工程を含む、方法。
（項目６）
前記干渉作用剤が、
（ａ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｂ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｃ）表８、表９Ａ、９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質もしくはポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｄ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｅ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｆ）微生物ＤＮＡへの結合について、組込み宿主因子と競合するポリペプチドまたはポリヌクレオチド、
（ｇ）ホリデイジャンクションと似ている４方向ジャンクションポリヌクレオチド、複製フォークと似ている３方向ジャンクションポリヌクレオチド、固有の柔軟性を有するポリヌクレオチド、または屈曲したポリヌクレオチド、
（ｈ）（ａ）〜（ｆ）のうちの任意の１つをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または配列番号３６の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、またはそのそれぞれの等価物、またはストリンジェントな条件下で該ポリヌクレオチド、その等価物もしくはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド、
（ｉ）（ａ）〜（ｆ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、または各抗体もしくはその抗原結合性断片の等価物もしくは断片、
（ｊ）（ｉ）の抗体もしくは抗原結合性断片をコードする単離されたかもしくは組換え
型のポリヌクレオチド、またはその相補物、あるいは
（ｋ）ＤＮＡＢＩＩタンパク質もしくはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合と競合する小分子
の群の干渉作用剤である、項目１から５までのいずれか一項に記載の方法。
（項目７）
前記干渉作用剤が、単離されたかもしくは組換え型のＤＮＡＢＩＩポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物である、項目１から６までのいずれか一項に記載の方法。
（項目８）
前記ＤＮＡＢＩＩポリペプチドが、ＩＨＦポリペプチドもしくはその断片、ＩＨＦポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物である、項目７に記載の方法。
（項目９）
前記ＤＮＡＢＩＩポリペプチドが、ＨＵポリペプチドもしくはその断片、ＨＵポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物である、項目７に記載の方法。
（項目１０）
前記被験体に、抗菌薬、ＤＮアーゼ、抗体、抗原性ペプチドまたはアジュバントのうちの１つまたは複数を有効量で投与する工程をさらに含む、項目４から９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
前記被験体が非ヒト動物またはヒト患者である、項目４から１０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
前記微生物ＤＮＡが、表８において同定される微生物由来である、項目１から１１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１３）
前記作用剤が、局所的投与、経真皮的投与、経皮的投与、舌下投与、直腸投与、膣投与、眼投与、皮下投与、筋肉内投与、腹腔内投与、尿道投与、鼻腔内投与、吸入投与または経口的投与を含む方法によって投与される、項目４から１２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４）
前記被験体が小児患者であり、前記作用剤が該小児患者のための処方物において投与される、項目４から１２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
免疫応答を必要とする被験体において免疫応答を誘導するか、または受動免疫を必要とする被験体に受動免疫を付与するための方法であって、該被験体に、
（ａ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｂ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｃ）表８、表９Ａ、表９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質ポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｄ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはその断片もしくは等価物、
（ｅ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または配列番号３６の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、またはそのそれぞれの等価物、またはストリンジェントな条件下で該ポリヌクレ
オチド、その等価物もしくはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド、
（ｇ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、またはそのそれぞれの等価物もしくは断片、
（ｈ）（ｇ）の抗体または抗原結合性断片をコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド
（ｉ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つでパルスした抗原提示細胞、および
（ｉ）（ａ）〜（ｅ）のうちの任意の１つをコードする１種または複数種のポリヌクレオチドがトランスフェクトされた抗原提示細胞
の群のうちの１つまたは複数の作用剤を有効量で投与する工程を含む、方法。
（項目１６）
前記作用剤が、単離されたかもしくは組換え型のＤＮＡＢＩＩポリペプチド、またはその断片もしくは等価物を含む、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記ＤＮＡＢＩＩポリペプチドが、ＩＨＦポリペプチドもしくはその断片、ＩＨＦポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物である、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記ＤＮＡＢＩＩポリペプチドが、ＨＵポリペプチドもしくはその断片、ＨＵポリペプチドのＣ末端断片、またはそのそれぞれの等価物である、項目１６に記載の方法。
（項目１９）
前記被験体に、抗菌薬、ＤＮアーゼ、抗体、抗原性ペプチドまたはアジュバントのうちの１つまたは複数を有効量で投与する工程をさらに含む、項目１５から１８までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２０）
前記被験体が非ヒト動物またはヒト患者である、項目１５から１９までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１）
前記単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチドが、表８において同定される微生物に由来する、項目１５から２０までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２２）
前記作用剤が、局所的投与、経真皮的投与、経皮的投与、舌下投与、直腸投与、膣投与、眼投与、皮下投与、筋肉内投与、腹腔内投与、尿道投与、鼻腔内投与、吸入投与または経口的投与を含む方法によって投与される、項目１５から２１までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２３）
前記被験体が小児患者であり、前記作用剤が該小児患者のための処方物において投与される、項目１５から２２までのいずれか一項に記載の方法。
（項目２４）
配列番号１〜５もしくは１２〜２７、３０〜３５、１０１〜３４０から選択されるアミノ酸配列から本質的になる単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物。
（項目２５）
配列番号１または２を含む単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
（項目２６）
配列番号３、４、または５を含む単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
（項目２７）
配列番号１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、３０、または３２を含む単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、
または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
（項目２８）
配列番号１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、３１、または３３を含む単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、配列番号６〜１１、２８、２９、または４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
（項目２９）
配列番号１２および１３を含むポリペプチド、
配列番号１４および１５を含むポリペプチド、
配列番号１６および１７を含むポリペプチド、
配列番号１８および１９を含むポリペプチド、
配列番号２０および２１を含むポリペプチド、
配列番号２３および２４を含むポリペプチド、
配列番号２５および２６を含むポリペプチド、
配列番号３０および３１を含むポリペプチド、
配列番号３２および３３を含むポリペプチド、
配列番号３４および３５を含むポリペプチド、
配列番号３３７および３３８を含むポリペプチド、または
配列番号３３９および３４０を含むポリペプチド
の群の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、
ＩＨＦアルファ、ＩＨＦベータのうちの任意の１つの野生型、または配列番号６〜１１、２８、２９、もしくは４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
（項目３０）
配列番号１２および１３から本質的になるポリペプチド、
配列番号１４および１５から本質的になるポリペプチド、
配列番号１６および１７から本質的になるポリペプチド、
配列番号１８および１９から本質的になるポリペプチド、
配列番号２０および２１から本質的になるポリペプチド、
配列番号２３および２４から本質的になるポリペプチド、
配列番号２５および２６から本質的になるポリペプチド、
配列番号３０および３１から本質的になるポリペプチド、
配列番号３２および３３から本質的になるポリペプチド、
配列番号３４および３５から本質的になるポリペプチド、
配列番号３３７および３３８から本質的になるポリペプチド、または
配列番号３３９および３４０から本質的になるポリペプチド
の群の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドであって、
ＩＨＦアルファ、ＩＨＦベータのうちの任意の１つの野生型、または配列番号６〜１１、２８、２９、もしくは４２〜１００のいずれでもない、ポリペプチド。
（項目３１）
項目２４から３０までのいずれか一項に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドの断片または等価物。
（項目３２）
項目２２から３１までのいずれか一項に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドの２つ以上を含む、単離されたかまたは組換え型のポリペプチド。
（項目３３）
項目２４から３２までのいずれかに記載のポリペプチドをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、またはその相補物。
（項目３４）
項目３３に記載の単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチドを含むベクター。
（項目３５）
項目２４から３２までのいずれか一項に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリ
ペプチド、項目３３に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または項目３４に記載のベクターを含む、単離された宿主細胞。
（項目３６）
項目２４から３２までのいずれか一項に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチドを含む、単離された抗原提示細胞であって、該ポリペプチドが該細胞の表面上に存在する、抗原提示細胞。
（項目３７）
樹状細胞である、項目３６に記載の単離された抗原提示細胞。
（項目３８）
項目２４から３２までのいずれか一項に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチドを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、または該抗体もしくは該抗原結合性断片をコードする、単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド。
（項目３９）
ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、抗体誘導体、ベニア化抗体、二機能性抗体、抗体誘導体、組換えヒト抗体、キメラ抗体、または抗体断片の群より選択される、項目３４に記載の抗体。
（項目４０）
モノクローナル抗体である、項目３９に記載の抗体。
（項目４１）
項目４０に記載の抗体を産生するハイブリドーマ細胞株。
（項目４２）
キャリアと、
（ａ）項目２４から３２までのいずれか一項に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、
（ｂ）項目３３に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｃ）項目３４に記載のベクター、
（ｄ）項目３５から３７までのいずれか一項に記載の単離された宿主細胞、または
（ｅ）項目３８から４０までのいずれか一項に記載の抗体
のうちの１つまたは複数と
を含む、組成物。
（項目４３）
アジュバント、抗原性ペプチドまたは抗菌薬のうちの１つまたは複数をさらに含む、項目４２に記載の組成物。
（項目４４）
前記キャリアが、液体キャリア、薬学的に許容されるキャリア、固相キャリア、薬学的に許容されるポリマー、リポソーム、ミセル、インプラント、ステント、ペースト、ゲル、歯科インプラントまたは医療用インプラントの群より選択される、項目４２または４３に記載の組成物。
（項目４５）
ヒト患者または非ヒト動物に投与するために処方されたものである、項目４２から４４までのいずれか一項に記載の組成物。
（項目４６）
局所的投与、経真皮的投与、経皮的投与、舌下投与、直腸投与、膣投与、眼投与、皮下投与、筋肉内投与、腹腔内投与、尿道投与、鼻腔内投与、吸入投与または経口的投与を含む１種または複数種の方法によって投与するために処方されたものである、項目４２から４４までのいずれか一項に記載の組成物。
（項目４７）
小児患者のために処方されたものである、項目４２から４６までのいずれか一項に記載の組成物。
（項目４８）
（ａ）項目２４から３２までのいずれか一項に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、
（ｂ）項目３３に記載の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｃ）項目３４に記載のベクター、
（ｄ）項目３５から３７までのいずれか一項に記載の単離された宿主細胞、
（ｅ）項目３８から４０までのいずれか一項に記載の抗体、
（ｆ）項目４２に記載の組成物、
（ｇ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｈ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｉ）表８、表９Ａ、表９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質ポリペプチド、図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｊ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｋ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｌ）微生物ＤＮＡへの結合について組込み宿主因子と競合するポリペプチド、
（ｍ）ホリデイジャンクションと似ている４方向ジャンクションポリヌクレオチド、複製フォークと似ている３方向ジャンクションポリヌクレオチド、固有の柔軟性を有するポリヌクレオチド、または屈曲したポリヌクレオチド、
（ｎ）（ｇ）〜（ｌ）のうちの任意の１つをコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｏ）（ｇ）〜（ｌ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、またはその等価物もしくは断片、
（ｐ）（ｏ）の抗体または抗原結合性断片をコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、および
（ｑ）ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合と競合する小分子
の群のうちの任意の１つまたは複数の作用剤と、
使用説明書と
を含む、キット。
（項目４９）
アジュバント、抗原性ペプチド、ＤＮアーゼ、抗体、または抗菌薬のうちの１つまたは複数をさらに含む、項目４８に記載のキット。
（項目５０）
液体キャリア、薬学的に許容されるキャリア、固相キャリア、薬学的に許容されるポリマー、リポソーム、ミセル、インプラント、ステント、ペースト、ゲル、歯科インプラント、または医療用インプラントの群より選択されるキャリアをさらに含む、項目４８または４９に記載のキット。
（項目５１）
ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドおよび微生物ＤＮＡを含有する試料において、ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合を調節する作用剤を同定する方法であって、候補作用剤を該試料と接触させる工程、および該タンパク質または該ポリペプチドの該ＤＮＡへの結合についてアッセイする工程を含む、方法。
（項目５２）
前記作用剤が、前記ＤＮＡＢＩＩタンパク質または前記ＤＮＡＢＩＩポリペプチドの前記微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合を予防すること、または該結合の力価を決定することによって該結合を調節する、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
（ａ）項目２４から３２までのいずれか一項に記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチド、
（ｂ）項目３３に記載の単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｃ）項目３４に記載のベクター、
（ｄ）項目３５から３７までのいずれか一項に記載の単離された宿主細胞、
（ｅ）項目３８から４０までのいずれか一項に記載の抗体、
（ｆ）項目４２に記載の組成物、
（ｇ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｈ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｉ）表８、表９Ａ、表９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質ポリペプチド、図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｊ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｋ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｌ）微生物ＤＮＡへの結合について組込み宿主因子と競合するポリペプチド、
（ｍ）ホリデイジャンクションと似ている４方向ジャンクションポリヌクレオチド、複製フォークと似ている３方向ジャンクションポリヌクレオチド、固有の柔軟性を有するポリヌクレオチド、または屈曲したポリヌクレオチド、
（ｎ）（ｇ）〜（ｌ）のうちの任意の１つをコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、
（ｏ）（ｇ）〜（ｌ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしく特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、またはその等価物もしくは断片、あるいは
（ｐ）（ｏ）の抗体または抗原結合性断片をコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、および
（ｑ）ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合と競合する小分子
の群のうちの作用剤の使用。
（項目５４）
前記抗体がモノクローナル抗体またはその断片である、項目６または１５に記載の方法。
（項目５５）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ベニア化抗体、修飾抗体または抗体誘導体である、項目５４に記載の方法。
（項目５６）
前記抗体が、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域および／またはＣＤＲ３領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目５５に記載の方法。
（項目５７）
前記抗体が、システイン残基の数を変更することによって、またはＦｃヒンジ領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目５５に記載の方法。
（項目５８）
前記モノクローナル抗体またはその断片が化学修飾されている、項目５５に記載の方法。
（項目５９）
前記モノクローナル抗体またはその断片がペグ化されている、項目５８に記載の方法。
（項目６０）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、血清タンパク質とコンジュゲートしている、項目５８に記載の方法。
（項目６１）
前記血清タンパク質がヒト血清アルブミンである、項目６０に記載の方法。
（項目６２）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、診断薬とコンジュゲートしている、項目５５に記載の方法。
（項目６３）
前記診断薬が、酵素、補欠分子族複合体、蛍光材料、発光材料、生物発光材料、放射性材料、陽電子放出性金属および非放射性常磁性金属イオンからなる群より選択される、項目６２に記載の方法。
（項目６４）
前記酵素が、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼおよびアセチルコリンエステラーゼからなる群より選択される、項目６３に記載の方法。
（項目６５）
前記補欠分子族複合体が、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンからなる群より選択される、項目６３に記載の方法。
（項目６６）
前記蛍光材料が、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドおよびフィコエリトリンからなる群より選択される、項目６３に記載の方法。
（項目６７）
前記発光材料がルミノールである、項目６３に記載の方法。
（項目６８）
前記生物発光材料が、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンからなる群より選択される、項目６３に記載の方法。
（項目６９）
前記放射性材料が、１２５Ｉ、１３１Ｉ、インジウム１１１、ルテチウム１７１、ビスマス２１２、ビスマス２１３、アスタチン２１１、銅６２、銅６４、銅６７、イットリウム９０、ヨウ素１２５、ヨウ素１３１、リン３２、リン３３、スカンジウム４７、銀１１１、ガリウム６７、プラセオジム１４２、サマリウム１５３、テルビウム１６１、ジスプロシウム１６６、ホルミウム１６６、レニウム１８６、レニウム１８８、レニウム１８９、鉛２１２、ラジウム２２３、アクチニウム２２５、鉄５９、セレン７５、ヒ素７７、ストロンチウム８９、モリブデン９９、ロジウム１０５、パラジウム１０９、プラセオジム１４３、プロメチウム１４９、エルビウム１６９、イリジウム１９４、金１９８、金１９９および鉛２１１からなる群より選択される、項目６３に記載の方法。
（項目７０）
前記モノクローナル抗体またはその断片が治療剤とコンジュゲートしている、項目５５に記載の方法。
（項目７１）
前記治療剤が抗菌薬である、項目７０に記載の方法。
（項目７２）
前記治療剤が、リボヌクレアーゼ（ＲＮアーゼ）、ＤＮアーゼＩ、アンチセンス核酸、
阻害性ＲＮＡ分子、免疫賦活性核酸、アプタマー、リボザイム、三重鎖形成分子および外部ガイド配列からなる群より選択される、項目７０に記載の方法。
（項目７３）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、少なくとも１つの追加的な機能分子とコンジュゲートしているかまたは融合している、項目５５に記載の方法。
（項目７４）
前記追加的な機能分子が第２の抗体である、項目７３に記載の方法。
（項目７５）
前記抗体がモノクローナル抗体またはその断片である、項目３８から４０までのいずれか一項に記載の抗体。
（項目７６）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ベニア化抗体、修飾抗体または抗体誘導体である、項目７５に記載の抗体。
（項目７７）
ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域および／またはＣＤＲ３領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目７６に記載の抗体。
（項目７８）
システイン残基の数を変更することによって、またはＦｃヒンジ領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目７６に記載の抗体。
（項目７９）
前記モノクローナル抗体またはその断片が化学修飾されている、項目７６に記載の抗体。
（項目８０）
前記モノクローナル抗体またはその断片がペグ化されている、項目７９に記載の抗体。
（項目８１）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、血清タンパク質とコンジュゲートしている、項目７９に記載の抗体。
（項目８２）
前記血清タンパク質がヒト血清アルブミンである、項目８１に記載の抗体。
（項目８３）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、診断薬とコンジュゲートしている、項目７６に記載の抗体。
（項目８４）
前記診断薬が、酵素、補欠分子族複合体、蛍光材料、発光材料、生物発光材料、放射性材料、陽電子放出性金属および非放射性常磁性金属イオンからなる群より選択される、項目８３に記載の抗体。
（項目８５）
前記酵素が、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼおよびアセチルコリンエステラーゼからなる群より選択される、項目８４に記載の抗体。
（項目８６）
前記補欠分子族複合体が、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンからなる群より選択される、項目８４に記載の抗体。
（項目８７）
前記蛍光材料が、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドおよびフィコエリトリンからなる群より選択される、項目８４に記載の抗体。
（項目８８）
前記発光材料がルミノールである、項目８４に記載の抗体。
（項目８９）
前記生物発光材料が、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンからなる群より選択される、項目８４に記載の抗体。
（項目９０）
前記放射性材料が、１２５Ｉ、１３１Ｉ、インジウム１１１、ルテチウム１７１、ビスマス２１２、ビスマス２１３、アスタチン２１１、銅６２、銅６４、銅６７、イットリウム９０、ヨウ素１２５、ヨウ素１３１、リン３２、リン３３、スカンジウム４７、銀１１１、ガリウム６７、プラセオジム１４２、サマリウム１５３、テルビウム１６１、ジスプロシウム１６６、ホルミウム１６６、レニウム１８６、レニウム１８８、レニウム１８９、鉛２１２、ラジウム２２３、アクチニウム２２５、鉄５９、セレン７５、ヒ素７７、ストロンチウム８９、モリブデン９９、ロジウム１０５、パラジウム１０９、プラセオジム１４３、プロメチウム１４９、エルビウム１６９、イリジウム１９４、金１９８、金１９９および鉛２１１からなる群より選択される、項目８４に記載の抗体。
（項目９１）
前記モノクローナル抗体またはその断片が治療剤とコンジュゲートしている、項目７６に記載の抗体。
（項目９２）
前記治療剤が抗菌薬である、項目９１に記載の抗体。
（項目９３）
前記治療剤が、リボヌクレアーゼ（ＲＮアーゼ）、ＤＮアーゼＩ、アンチセンス核酸、阻害性ＲＮＡ分子、免疫賦活性核酸、アプタマー、リボザイム、三重鎖形成分子および外部ガイド配列からなる群より選択される、項目９１に記載の抗体。
（項目９４）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、少なくとも１つの追加的な機能分子とコンジュゲートしているかまたは融合している、項目７６に記載の抗体。
（項目９５）
前記追加的な機能分子が第２の抗体である、項目９４に記載の抗体。
（項目９６）
前記抗体がモノクローナル抗体またはその断片である、項目４８に記載のキット。
（項目９７）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ベニア化抗体、修飾抗体または抗体誘導体である、項目９６に記載のキット。
（項目９８）
前記抗体が、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域および／またはＣＤＲ３領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目９７に記載のキット。
（項目９９）
前記抗体が、システイン残基の数を変更することによって、またはＦｃヒンジ領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目９７に記載のキット。
（項目１００）
前記モノクローナル抗体またはその断片が化学修飾されている、項目９７に記載のキット。
（項目１０１）
前記モノクローナル抗体またはその断片がペグ化されている、項目１００に記載のキット。
（項目１０２）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、血清タンパク質とコンジュゲートしている、項目１００に記載のキット。
（項目１０３）
前記血清タンパク質がヒト血清アルブミンである、項目１０２に記載のキット。
（項目１０４）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、診断薬とコンジュゲートしている、項目９７に記載のキット。
（項目１０５）
前記診断薬が、酵素、補欠分子族複合体、蛍光材料、発光材料、生物発光材料、放射性材料、陽電子放出性金属および非放射性常磁性金属イオンからなる群より選択される、項目１０４に記載のキット。
（項目１０６）
前記酵素が、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼおよびアセチルコリンエステラーゼからなる群より選択される、項目１０５に記載のキット。
（項目１０７）
前記補欠分子族複合体が、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンからなる群より選択される、項目１０５に記載のキット。
（項目１０８）
前記蛍光材料が、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドおよびフィコエリトリンからなる群より選択される、項目１０５に記載のキット。
（項目１０９）
前記発光材料がルミノールである、項目１０５に記載のキット。
（項目１１０）
前記生物発光材料が、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンからなる群より選択される、項目１０５に記載のキット。
（項目１１１）
前記放射性材料が、１２５Ｉ、１３１Ｉ、インジウム１１１、ルテチウム１７１、ビスマス２１２、ビスマス２１３、アスタチン２１１、銅６２、銅６４、銅６７、イットリウム９０、ヨウ素１２５、ヨウ素１３１、リン３２、リン３３、スカンジウム４７、銀１１１、ガリウム６７、プラセオジム１４２、サマリウム１５３、テルビウム１６１、ジスプロシウム１６６、ホルミウム１６６、レニウム１８６、レニウム１８８、レニウム１８９、鉛２１２、ラジウム２２３、アクチニウム２２５、鉄５９、セレン７５、ヒ素７７、ストロンチウム８９、モリブデン９９、ロジウム１０５、パラジウム１０９、プラセオジム１４３、プロメチウム１４９、エルビウム１６９、イリジウム１９４、金１９８、金１９９および鉛２１１からなる群より選択される、項目１０５に記載のキット。
（項目１１２）
前記モノクローナル抗体またはその断片が治療剤とコンジュゲートしている、項目９７に記載のキット。
（項目１１３）
前記治療剤が抗菌薬である、項目１１２に記載のキット。
（項目１１４）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、少なくとも１つの追加的な機能分子とコンジュゲートしているかまたは融合している、項目９７に記載のキット。
（項目１１５）
前記追加的な機能分子が第２の抗体である、項目１１４に記載のキット。
（項目１１６）
前記抗体がモノクローナル抗体またはその断片である、ワクチンを必要とする被験体にワクチン接種するための、項目５３に記載の使用。
（項目１１７）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、ヒト抗体、ヒト化抗体、組換え抗体、キメラ抗体、ベニア化抗体、修飾抗体または抗体誘導体である、項目１１６に記載の使用。
（項目１１８）
前記抗体が、ＶＨおよび／またはＶＬのＣＤＲ１領域、ＣＤＲ２領域および／またはＣＤＲ３領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目１１７に記載の使用。
（項目１１９）
前記抗体が、システイン残基の数を変更することによって、またはＦｃヒンジ領域内の保存的アミノ酸変異によって修飾されている、項目１１７に記載の使用。
（項目１２０）
前記モノクローナル抗体またはその断片が化学修飾されている、項目１１７に記載の使用。
（項目１２１）
前記モノクローナル抗体またはその断片がペグ化されている、項目１２０に記載の使用。
（項目１２２）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、血清タンパク質とコンジュゲートしている、項目１２０に記載の使用。
（項目１２３）
前記血清タンパク質がヒト血清アルブミンである、項目１２２に記載の使用。
（項目１２４）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、診断薬とコンジュゲートしている、項目１１７に記載の使用。
（項目１２５）
前記診断薬が、酵素、補欠分子族複合体、蛍光材料、発光材料、生物発光材料、放射性材料、陽電子放出性金属および非放射性常磁性金属イオンからなる群より選択される、項目１２４に記載の使用。
（項目１２６）
前記酵素が、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータガラクトシダーゼおよびアセチルコリンエステラーゼからなる群より選択される、項目１２５に記載の使用。
（項目１２７）
前記補欠分子族複合体が、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンからなる群より選択される、項目１２５に記載の使用。
（項目１２８）
前記蛍光材料が、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドおよびフィコエリトリンからなる群より選択される、項目１２５に記載の使用。
（項目１２９）
前記発光材料がルミノールである、項目１２５に記載の使用。
（項目１３０）
前記生物発光材料が、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンからなる群より選択される、項目１２５に記載の使用。
（項目１３１）
前記放射性材料が、１２５Ｉ、１３１Ｉ、インジウム１１１、ルテチウム１７１、ビスマス２１２、ビスマス２１３、アスタチン２１１、銅６２、銅６４、銅６７、イットリウム９０、ヨウ素１２５、ヨウ素１３１、リン３２、リン３３、スカンジウム４７、銀１１１、ガリウム６７、プラセオジム１４２、サマリウム１５３、テルビウム１６１、ジスプロシウム１６６、ホルミウム１６６、レニウム１８６、レニウム１８８、レニウム１８９、鉛２１２、ラジウム２２３、アクチニウム２２５、鉄５９、セレン７５、ヒ素７７、ストロンチウム８９、モリブデン９９、ロジウム１０５、パラジウム１０９、プラセオジム１４３、プロメチウム１４９、エルビウム１６９、イリジウム１９４、金１９８、金１９９および鉛２１１からなる群より選択される、項目１２５に記載の使用。
（項目１３２）
前記モノクローナル抗体またはその断片が治療剤とコンジュゲートしている、項目１１７に記載の使用。
（項目１３３）
前記治療剤が抗菌薬である、項目１３２に記載の使用。
（項目１３４）
前記治療剤が、リボヌクレアーゼ（ＲＮアーゼ）、ＤＮアーゼＩ、アンチセンス核酸、阻害性ＲＮＡ分子、免疫賦活性核酸、アプタマー、リボザイム、三重鎖形成分子および外部ガイド配列からなる群より選択される、項目１３２に記載の使用。
（項目１３５）
前記モノクローナル抗体またはその断片が、少なくとも１つの追加的な機能分子とコンジュゲートしているかまたは融合している、項目１１７に記載の使用。
（項目１３６）
前記追加的な機能分子が第２の抗体である、項目１３５に記載の使用。
（項目１３７）
組換え型のポリヌクレオチドの等価物が、ストリンジェントな条件下で該ポリヌクレオチドまたはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチドを含み、該ストリンジェントな条件が、約２５℃から約３７℃までのインキュベーション温度；約６×ＳＳＣから約１０×ＳＳＣまでのハイブリダイゼーション緩衝液の濃度；約０％から約２５％までのホルムアミド濃度；および約４×ＳＳＣから８×ＳＳＣまでの洗浄溶液を含む、項目１から２３まで、項目５１から５２まで、または項目５４から７４までに記載の方法、項目２４から３３までに記載の単離されたかまたは組換え型のポリペプチド、項目３４に記載のベクター、項目３５から３７までに記載の単離された細胞、項目３８から４０まで、または項目７５から９５までに記載の抗体、項目４１に記載のハイブリドーマ細胞株、項目４２から４７までに記載の組成物、項目４８から５０まで、または項目９６から１１５までに記載のキット、項目５３または項目１１６から１３６までに記載の使用。
（項目１３８）
ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害するか、該結合と競合するか、もしくは該結合の力価を決定する作用剤、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、被験体におけるバイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、または被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置する作用剤を同定するためのコンピュータ実装方法であって、候補作用剤の三次元構造を、組込み宿主因子（ＩＨＦ）タンパク質の三次元構造と対照して位置決定する工程を含み、ここで、該ＩＨＦタンパク質の該三次元構造は、ＩＨＦおよびＤＮＡの複合体の結晶形から決定された原子構造座標Ｘ、ＹおよびＺに基づき、配列番号４２に示されるＴ４、Ｋ５、Ａ６、Ｅ２８、Ｑ４３、Ｋ４５、Ｓ４７、Ｇ４８、Ｎ５１、Ｒ５５、Ｋ５７、Ｒ６０、Ｒ６３、Ｎ６４、Ｐ６５、Ｋ６６、Ｒ７６、Ｔ８０、Ｒ８２またはＱ８５から選択される２つ以上のＩＨＦアミノ酸、またはそのそれぞれの等価物における該作用剤と該ＩＨＦとの相互作用により、該作用剤が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合と競合すること、もしくは該結合の力価を決定すること、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、またはバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置することが同定される、コンピュータ実装方法。
（項目１３９）
配列番号４２に示されるＴ４、Ｋ５、Ａ６、Ｅ２８、Ｑ４３、Ｋ４５、Ｓ４７、Ｇ４８、Ｎ５１、Ｒ５５、Ｋ５７、Ｒ６０、Ｒ６３、Ｎ６４、Ｐ６５、Ｋ６６、Ｒ７６、Ｔ８０、Ｒ８２またはＱ８５から選択されるＩＨＦアミノ酸の３つ以上、またはそのそれぞれの等価物における前記作用剤と前記ＩＨＦとの相互作用により、該作用剤が、ＤＮＡＢＩＩ
ポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合と競合すること、もしくは該結合の力価を決定すること、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、またはバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置することが同定される、項目１３８に記載の方法。
（項目１４０）
前記原子構造座標Ｘ、ＹおよびＺが、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｄａｔａ  Ｂａｎｋ（ＰＤＢ）受託番号：１ＩＨＦに記載の座標を含む、項目１３８または１３９に記載の方法。
（項目１４１）
少なくとも１つのプロセッサ、
該少なくとも１つのプロセッサに接続されたメモリ、
該メモリおよび該少なくとも１つのプロセッサと通信している記憶媒体
を含むカスタムコンピュータ装置であって、
該記憶媒体は、プロセッサ実行可能命令のセットを含み、該セットは、該プロセッサによって実行されると、該カスタムコンピュータ装置が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害するか、該結合と競合するか、もしくは該結合の力価を決定する作用剤、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、被験体におけるバイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊する作用剤、または被験体においてバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置する作用剤を同定するように設定され、該設定は、
候補作用剤の三次元構造を、組込み宿主因子（ＩＨＦ）タンパク質の三次元構造と対照して位置決定することを含み、ここで、該ＩＨＦタンパク質の該三次元構造は、ＩＨＦおよびＤＮＡの複合体の結晶形から決定された原子構造座標Ｘ、ＹおよびＺに基づき、配列番号４２に示されるＴ４、Ｋ５、Ａ６、Ｅ２８、Ｑ４３、Ｋ４５、Ｓ４７、Ｇ４８、Ｎ５１、Ｒ５５、Ｋ５７、Ｒ６０、Ｒ６３、Ｎ６４、Ｐ６５、Ｋ６６、Ｒ７６、Ｔ８０、Ｒ８２またはＱ８５から選択される２つ以上のＩＨＦアミノ酸、またはそのそれぞれの等価物における該作用剤と該ＩＨＦとの相互作用により、該作用剤が、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドもしくはＤＮＡＢＩＩタンパク質の微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合と競合すること、もしくは該結合の力価を決定すること、微生物バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、バイオフィルムを阻害、予防もしくは破壊すること、またはバイオフィルムを生じる微生物感染症を阻害、予防もしくは処置することが同定される、カスタムコンピュータ装置。
（項目１４２）
ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドおよび微生物ＤＮＡを含有する試料において、ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合を調節する作用剤を同定する方法であって、候補作用剤を該試料と接触させる工程、および該タンパク質または該ポリペプチドの該ＤＮＡへの結合についてアッセイする工程を含み、ここで、該作用剤は、該ＤＮＡＢＩＩタンパク質または該ＤＮＡＢＩＩポリペプチドの該微生物ＤＮＡへの結合を阻害すること、該結合を予防すること、または該結合の力価を決定することによって該結合を調節する、方法。
（項目１４３）
干渉作用剤を投与することによって処置される可能性があるかまたは該可能性がない微生物感染症を有する患者を同定するための方法であって、該患者から単離され、かつ感染物質を含有する試料におけるＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の存在または非存在を検出する工程を含み、ここで、該ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたは該ＤＮＡＢＩＩタンパク質の存在により、該患者は、該干渉作用剤を投与することによって処置される可能性があると同定され、ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたはＤＮＡＢＩＩタンパク質の非存在により、該患者は、該干渉作用剤を投与することによって処置される可能性がないと同定される、方法。
（項目１４４）
前記ＤＮＡＢＩＩポリペプチドまたは前記ＤＮＡＢＩＩタンパク質の存在により、前記患者は、前記干渉作用剤を投与することによって処置される可能性があると同定される、項目１４３に記載の方法。
（項目１４５）
前記患者に有効量の前記干渉作用剤を投与する工程をさらに含む、項目１４４に記載の方法。
（項目１４６）
前記干渉作用剤が、
（ａ）単離されたかもしくは組換え型の組込み宿主因子（ＩＨＦ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｂ）Ｅ．ｃｏｌｉのＵ９３株由来の単離されたかもしくは組換え型のヒストン様タンパク質（ＨＵ）ポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｃ）表８、表９Ａ、表９Ｂ、表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のタンパク質もしくはポリペプチド、または図６において同定されるＤＮＡ結合性ペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｄ）配列番号１〜３４０の単離されたかもしくは組換え型のポリペプチド、またはそのそれぞれの等価物、またはその断片もしくはそれぞれの断片の等価物
（ｅ）配列番号６〜１１、２８、２９、４２〜１００、表８の単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、または表１０において同定される単離されたかもしくは組換え型のＣ末端のポリペプチド、またはそのそれぞれの断片もしくは等価物、
（ｆ）微生物ＤＮＡへの結合について組込み宿主因子と競合するポリペプチドまたはポリヌクレオチド、
（ｇ）ホリデイジャンクションと似ている４方向ジャンクションポリヌクレオチド、複製フォークと似ている３方向ジャンクションポリヌクレオチド、固有の柔軟性を有するポリヌクレオチド、または屈曲したポリヌクレオチド、
（ｈ）（ａ）〜（ｆ）のうちの任意の１つをコードする単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、または配列番号３６の単離されたかもしくは組換え型のポリヌクレオチド、またはそのそれぞれの等価物、またはストリンジェントな条件下で該ポリヌクレオチドもしくはその相補物とハイブリダイズするポリヌクレオチド、
（ｉ）（ａ）〜（ｆ）のうちの任意の１つを特異的に認識するかもしくは特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片、または各抗体もしくはその抗原結合性断片の等価物もしくは断片、
（ｊ）（ｉ）の抗体または抗原結合性断片をコードする、単離されたかまたは組換え型のポリヌクレオチド、あるいは
（ｋ）ＤＮＡＢＩＩタンパク質またはＤＮＡＢＩＩポリペプチドの微生物ＤＮＡへの結合と競合する小分子
のうちの１つまたは複数である、項目１４５に記載の方法。