【手続補正書】
【提出日】平成23年12月14日(2011.12.14)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
治療に用いるための、その宿主リガンドとの結合が減少した、組換えブドウ球菌ＭＳＣＲＡＭＭタンパク質もしくはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質またはそのリガンド結合領域の少なくとも一部を含んでなるそのフラグメント。
【請求項２】
治療に用いるための、その宿主リガンドを非共有結合する能力が低下したまたはその能力に欠けている、請求項１に記載の組換えＭＳＣＲＡＭＭもしくはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質、またはそのフラグメント。
【請求項３】
ＭＳＣＲＡＭＭまたはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質のドック、ロックアンドラッチング中に起こるそのリガンドとの非共有結合が減少したまたは抑制された、請求項２に記載の組換えＭＳＣＲＡＭＭもしくはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質、またはそのフラグメント。
【請求項４】
前記リガンドがヘム、ヘモグロビン、コラーゲンまたはフィブリノーゲンである、請求項１〜３のいずれか一項に記載の組換えＭＳＣＲＡＭＭもしくはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質、またはそのフラグメント。
【請求項５】
ａ．フィブリノーゲン結合タンパク質；
ｂ．ＳｄｒＤ、ＳｄｒＥ、ＳｄｒＧ、ＳｄｒＦ；あるいは
ｃ．ＩｓｄＢおよび／またはＩｓｄＨ
である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の組換えＭＳＣＲＡＭＭタンパク質またはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質、もしくはそのフラグメント。
【請求項６】
フィブリノーゲンを非共有結合する能力が低下したまたはその能力に欠けている、請求項５に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質、またはそのフィブリノーゲン結合領域の少なくとも一部を含んでなるそのフラグメント。
【請求項７】
疎水性ポケットを形成している２つのＤｅＶ−ＩｇＧドメインを含んでなり、
前記２つのＤｅｖ−ＩｇＧドメイン間に形成された前記疎水性ポケットがフィブリノーゲン結合を減少させるまたは抑制するように改変され；または
前記フィブリノーゲン結合タンパク質が、前記疎水性溝において前記フィブリノーゲンを覆うラッチングペプチドを含んでなり、前記ラッチングペプチドがフィブリノーゲン結合を減少させるまたは抑制するように改変または除去されている、請求項６に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項８】
前記フィブリノーゲン結合タンパク質がそのフィブリノーゲン結合領域単独またはそのフラグメントを含んでなる、請求項５〜７のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項９】
黄色ブドウ球菌、表皮ブドウ球菌および／またはS. lugdunensis由来の、請求項５〜８のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１０】
前記フィブリノーゲン結合タンパク質が、以下
ａ．ＦｂＩ、ＳｄｒＦおよび／またはＳｄｒＧ；
ｂ．フィブリノーゲン結合タンパク質クランピング因子Ａ（ＣｌｆＡ）および／またはフィブリノーゲン結合タンパク質クランピング因子Ｂ（ＣｌｆＢ）；
ｃ．ＩｓｄＡ；あるいは
ｄ．ＦｎＢＰＡおよび／またはＦｎＢＰＢ
のうちの１つから選択される、請求項５〜９のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１１】
フィブリノーゲンを非共有結合する能力が低下していないまたはその能力に欠けていない組換えフィブリノーゲン結合タンパク質をもたらすために、そのフィブリノーゲン結合領域内に少なくとも１つのヌクレオチドまたはアミノ酸残基の置換、挿入、欠失もしくは付加を含んでなる、請求項５〜１０のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１２】
前記フィブリノーゲン結合タンパク質のフィブリノーゲン結合領域Ａを含んでなり、前記ヌクレオチドまたはアミノ酸の置換、挿入、欠失もしくは付加が、フィブリノーゲンとの非共有相互作用を、好ましくは、前記フィブリノーゲン結合タンパク質の領域Ａ亜領域のＮ２とＮ３を分ける疎水性ポケットとのリガンド結合を抑制することまたは減少させることにより、減少させる、請求項１１に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１３】
フィブリノーゲンを非共有結合する能力が低下したまたはその能力に欠けている組換えフィブリノーゲン結合タンパク質をもたらすために、前記ラッチングペプチドアミノ酸残基が存在しないフィブリノーゲン結合領域を含んでなる、請求項５〜１２のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１４】
前記組換えタンパク質がＣｌｆＡである、請求項５〜１３のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１５】
ＣｌｆＡ  Ａフィブリノーゲン結合領域（領域Ａ）の疎水性残基が少なくとも１以上の核酸またはアミノ酸の置換、挿入、欠失もしくは付加を受ける、請求項１４に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１６】
アミノ酸残基Ａｌａ２５４、Ｔｙｒ２５６、Ｐｒｏ３３６、Ｔｙｒ３３８、Ｉｌｅ３８７、Ｌｙｓ３８９、Ｇｌｕ５２６および／またはＶａｌ５２７がＡｌａまたはＳｅｒのいずれかと置換されている、請求項１４または請求項１５に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１７】
ｒＣｌｆＡＰ３３６Ｓ  Ｙ３３８ＡまたはｒＣｌｆＡＰ３３６  Ａ  Ｙ３３８Ｓをもたらすために、ＣｌｆＡのフィブリノーゲン結合領域（領域Ａ）の残基Ｐ３３６および／またはＹ３３８がセリンまたはアラニンのいずれかと置換されている、請求項１４〜１６のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１８】
前記組換えブドウ球菌フィブリノーゲン結合タンパク質が、残基Ｐ３３６および／またはＹ３３８がセリンおよび／またはアラニンのいずれかと置換されている配列番号１〜３のいずれかによるアミノ酸配列、またはそのフラグメントを有する、請求項１４〜１７のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項１９】
前記フィブリノーゲン結合タンパク質、そのフィブリノーゲン結合領域、最小フィブリノーゲン結合領域および／またはフラグメントを含んでなる、請求項１４〜１８のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項２０】
フィブリノーゲンを非共有結合する能力が低下したまたはその能力に欠けている前記フィブリノーゲン結合タンパク質の組換えフラグメントをもたらすために、前記フラグメントがそのフィブリノーゲン結合領域の少なくとも一部を含んでなる、請求項１４〜１９のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項２１】
ａ．亜領域Ｎ１２３、前記フィブリノーゲン結合領域（領域Ａ）のアミノ酸残基４０〜５５９にわたる；
ｂ．亜領域Ｎ２３、ＣｌｆＡのフィブリノーゲン結合領域（領域Ａ）のアミノ酸残基２２１〜５５９にわたる；および／または
ｃ．前記フィブリノーゲン結合領域（領域Ａ）のアミノ酸残基２２１〜５３１
を含んでなる、請求項１４〜２０のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項２２】
配列番号４〜１４のいずれかによるアミノ酸配列を含んでなる請求項１４〜２１のいずれか一項に記載の組換えフィブリノーゲン結合タンパク質。
【請求項２３】
好ましくは、Staphylocciによって引き起こされる、敗血症、敗血症性関節炎および／または心内膜炎を含む、微生物感染症の治療または予防に用いるための、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の組換えＭＳＣＲＡＭＭもしくはＭＳＣＲＡＭＭ様タンパク質、またはそのフラグメント。
【請求項２４】
好ましくは、Staphylocciによって引き起こされる、微生物感染症の治療または予防用の薬剤の製造における、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の組換えタンパク質、またはそのフラグメントの使用。
【請求項２５】
請求項１〜２２のいずれか一項に記載の組換えタンパク質、またはそのフラグメントを発現する核酸構築物、発現ベクターまたは宿主細胞。
【請求項２６】
請求項１〜２２のいずれか一項に記載の組換えタンパク質、またはそのフラグメントを含んでなる、ワクチン。
【請求項２７】
好ましくは、過免疫血清としての、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の組換えタンパク質、またはそのフラグメントに対して惹起された抗体。
【請求項２８】
請求項１〜２２のいずれか一項に記載の組換えタンパク質、またはそのフラグメント、および製薬上許容されるアジュバントを含んでなる、免疫原性医薬組成物。