【手続補正書】
【提出日】平成24年2月28日(2012.2.28)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１７
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１７】
なおさらなる実施形態は、本明細書で提供される場合、上記脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる少なくとも１種の油に少なくとも一部基づいて、燃料（例えば、バイオ燃料）を提供する。
したがって、本発明は、以下の項目を提供する：
（項目１）
種子油における脂肪酸不飽和化を調節するための方法であって、該方法は、
脂肪種子をつける植物を得る工程；および
該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子において、少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を調整する工程であって、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して改変されている、工程、
を包含する、方法。
（項目２）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を調整する工程は、該発現もしくは活性を下方調節する工程であり、上記改変されている種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、低下させられている、項目１に記載の方法。
（項目３）
１種以上の膜脂質における脂肪酸不飽和化に対する、種子油における脂肪酸不飽和化の示差的調節を含む、項目１および２のいずれか１項に記載の方法。
（項目４）
上記１種以上の膜脂質における脂肪酸不飽和化に対する、種子油における脂肪酸不飽和化は、種子油において示差的に減少させられている、項目３に記載の方法。
（項目５）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、およびそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含む、項目１および２のいずれか１項に記載の方法。
（項目６）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、およびそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含む、項目５に記載の方法。
（項目７）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を調整する工程は、変異誘発法および組換えＤＮＡ法のうちの少なくとも一方の使用を含む、項目１および２のいずれか１項の方法。
（項目８）
遺伝子サイレンシング、アンチセンス法、ｓｉＲＮＡ法、形質転換法のうちの少なくとも１つの使用を含む、項目７に記載の方法。
（項目９）
脂肪種子をつける植物もしくはその一部を生成するための方法であって、該方法は、脂肪種子をつける植物の品種の生殖質に、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する変異もしくは遺伝的改変を付与する工程を包含し、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して改変されている、方法。
（項目１０）
項目９に記載の、脂肪種子をつける遺伝子型もしくは植物もしくはその一部を生成するための方法であって、
適切な方法を使用して、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する導入遺伝子を、選択された品種に導入する工程を包含し、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して改変されている、
方法。
（項目１１）
項目９に記載の、脂肪種子をつける遺伝子型もしくは植物もしくはその一部を生成するための方法であって、
脂肪種子をつける植物の品種の生殖質を提供する工程；
該生殖質を変異誘発因子で処理して、変異誘発された生殖質を生成する工程；
該変異誘発された生殖質から、該変異誘発因子によって誘発された、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する遺伝子型を含む、脂肪種子をつける植物の種子を選択する工程であって、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較すると改変されている、工程；ならびに
脂肪種子をつける植物を、該種子から生長させる工程、
を包含する、
方法。
（項目１２）
上記変異誘発された生殖質を生成する工程は、上記植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における発現もしくはその活性を改変する、少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）配列の変異を生成する工程を包含し、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して、改変されている、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
脂肪種子をつける植物もしくはその一部であって、該植物もしくはその一部は、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する変異もしくは遺伝的改変を含み、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して、改変されている、脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目１４）
上記変異は、上記植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における発現もしくはその活性を改変する少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）配列の変異を含み、ここで上記種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して、改変されている、項目１３に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目１５）
上記植物もしくはその一部は、Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ以外である、項目１３に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその植物。
（項目１６）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を調整する工程は、該発現および活性のうちの少なくとも一方を下方調節する工程を包含し、ここで上記改変されている種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、低下させられている、項目１３に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目１７）
１種以上の膜脂質における脂肪酸不飽和化と比較して、種子油における脂肪酸不飽和化の示差的調節を包含する、項目１６に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目１８）
上記種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布を改変する２つ以上の異なる変異もしくは遺伝的改変を含み、ここで該２つ以上の異なる変異もしくは遺伝的改変のうちの少なくとも一方は、上記植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現および活性のうちの少なくとも一方を改変する変異である、項目１３に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目１９）
上記２つ以上の異なる変異のうちの少なくとも１つは、上記種子もしくは発生中の種子におけるＦＡＤ２の活性もしくは量を低下させるかもしくは除去するＦＡＤ２デサチュラーゼ変異である、項目１８に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目２０）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、ならびにそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含む、項目１３〜１９のいずれか１項に記載の、脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目２１）
上記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、およびそれらのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含む、項目２０に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
（項目２２）
項目１３〜２１のいずれか１項に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる種子もしくは純粋育種種子。
（項目２３）
項目１３〜２１のいずれか１項に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる油。
（項目２４）
上記油は、食品用油である、項目２３に記載の油。
（項目２５）
上記油は、正常の（野生型）ＰＤＣＴ調整を有する植物と比較して、より高度に飽和化もしくは不飽和化されている、項目２４に記載の油。
（項目２６）
項目１３〜２１のいずれか１項に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる油に少なくとも一部基づく、可燃性燃料。
（項目２７）
配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、ならびにそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸であって、ここで該ポリペプチドは、ホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）を含む、単離された核酸。
（項目２８）
配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、ならびにそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、ホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）を含む、単離されたポリペプチド。
（項目２９）
配列番号４、配列番号４と少なくとも４６％、少なくとも４７％、少なくとも５１％、少なくとも５２％、少なくとも５３％、少なくとも５５％、少なくとも６２％、少なくとも６４％、少なくとも６６％少なくとも７１％、および少なくとも８０％の配列同一性を有する配列からなる群より選択される配列を含む、単離された核酸であって、ここで該配列は、２２８位においてアデノシンヌクレオチドを含む、単離された核酸。
（項目３０）
項目２８に記載の核酸配列によってコードされる、単離されたポリペプチド。
（項目３１）
配列番号５からなる、項目３０に記載の単離されたポリペプチド。
（項目３２）
項目２７および２９のいずれか１項に記載の、トランスフェクトされた核酸を含む、組換え植物細胞。
【手続補正２】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
種子油における脂肪酸不飽和化を調節するための方法であって、該方法は、
脂肪種子をつける植物を得る工程；および
変異誘発および組換えＤＮＡ法のうちの少なくとも１つを使用して、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子において、少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を調整する工程であって、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して改変されており、好ましくは、該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、低下される、工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
１種以上の膜脂質における脂肪酸不飽和化に対する、種子油における脂肪酸不飽和化の示差的調節を含む、請求項１に記載の方法であって、好ましくは、１種以上の膜脂質における脂肪酸不飽和化に対する、種子油における該脂肪酸不飽和化は、種子油において示差的に減少させられている、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、およびそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含み、該少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、およびそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含む、請求項１および２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４】
遺伝子サイレンシング、アンチセンス法、ｓｉＲＮＡ法、形質転換法のうちの少なくとも１つの使用を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
脂肪種子をつける植物もしくはその一部を生成する工程を包含する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法であって、該工程は、脂肪種子をつける植物の品種の生殖質に、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する変異もしくは遺伝的改変を付与することを含み、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して改変されており、好ましくは、該工程は、適切な方法を使用して、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する導入遺伝子を、選択された該品種に導入することを含み、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して改変されている、
方法。
【請求項６】
請求項５に記載の方法であって、
脂肪種子をつける植物の品種の生殖質を提供する工程；
該生殖質を変異誘発因子で処理して、変異誘発された生殖質を生成する工程；
該変異誘発された生殖質から、該変異誘発因子によって誘発された、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する遺伝子型を含む、脂肪種子をつける植物の種子を選択する工程であって、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較すると改変されている、工程；ならびに
脂肪種子をつける植物を、該種子から生長させる工程、
を包含し、好ましくは、該遺伝子型は、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における発現もしくはその活性を改変する、少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）配列の変異を含む、
方法。
【請求項７】
脂肪種子をつける植物もしくはその一部であって、該植物もしくはその一部は、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現もしくは活性を改変する変異もしくは遺伝的改変を含み、ここで該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、該ＰＤＣＴの通常の種子の発現を有する植物の種子油と比較して、改変されており、好ましくは、該変異もしくは遺伝的改変は、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における発現もしくはその活性を改変する少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）配列の変異を含み、好ましくは、該種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布は、低下させられており、好ましくは、該植物もしくはその一部は、１種以上の膜脂質における脂肪酸不飽和化と比較して、種子油における脂肪酸不飽和化の示差的調節を含み、特に、該植物もしくはその一部は、Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ以外である、脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
【請求項８】
前記種子油における脂肪酸不飽和化のレベル、量、もしくは分布を改変する２つ以上の異なる変異もしくは遺伝的改変を含む、請求項７に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部であって、ここで該２つ以上の異なる変異もしくは遺伝的改変のうちの少なくとも一方は、該植物の１つ以上の種子もしくは発生中の種子における少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）の発現および活性のうちの少なくとも一方を改変する変異であり、好ましくは、該２つ以上の異なる変異のうちの少なくとも１つは、該種子もしくは発生中の種子におけるＦＡＤ２の活性もしくは量を低下させるかもしくは除去するＦＡＤ２デサチュラーゼ変異である、脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
【請求項９】
前記少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、ならびにそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含み、好ましくは、該少なくとも１つのホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）は、配列番号７、配列番号９、配列番号１１、配列番号１３、配列番号１５、配列番号１７、配列番号２０、配列番号２２、配列番号２４、配列番号２６、およびそれらのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択される少なくとも１つの配列を含む、請求項７または８のいずれか１項に記載の、脂肪種子をつける植物もしくはその一部。
【請求項１０】
請求項７〜９のいずれか１項に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる種子もしくは純粋育種種子。
【請求項１１】
請求項７〜１０のいずれか１項に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる油であって、好ましくは、該油は、正常の（野生型）ＰＤＣＴ調整を有する植物と比較して、より高度に飽和化もしくは不飽和化されており、好ましくは、該油は、食品用油である、油。
【請求項１２】
請求項７〜１１のいずれか１項に記載の脂肪種子をつける植物もしくはその一部から得られる油に少なくとも一部基づく、可燃性燃料。
【請求項１３】
配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、ならびにそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする配列を含む、単離された核酸であって、ここで該ポリペプチドは、ホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）を含み、好ましくは、該単離された核酸は、配列番号４、配列番号４と少なくとも４６％、少なくとも４７％、少なくとも５１％、少なくとも５２％、少なくとも５３％、少なくとも５５％、少なくとも６２％、少なくとも６４％、少なくとも６６％少なくとも７１％、および少なくとも８０％の配列同一性を有する配列からなる群より選択される配列を含み、ここで該配列は、２２８位においてアデノシンヌクレオチドを含む、単離された核酸。
【請求項１４】
配列番号３、配列番号３と少なくとも４６％、少なくとも４８％、少なくとも５８％、少なくとも６４％、少なくとも７１％もしくは少なくとも８５％のアミノ酸配列同一性を有する配列、ならびにそのＰＤＣＴ活性部分からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチドであって、ここで該ポリペプチドは、ホスファチジルコリン：ジアシルグリセロールコリンホスホトランスフェラーゼ（ＰＤＣＴ）を含み、特に該単離されたポリペプチドは、配列番号５からなる場合がある、単離されたポリペプチド。
【請求項１５】
請求項１３に記載の、トランスフェクトされた核酸を含む、組換え植物細胞。