【手続補正書】
【提出日】平成24年6月11日(2012.6.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
非正準的な生物学的活性を有する単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド、またはその活性な改変体。
【請求項２】
前記非正準的な生物学的活性が、細胞増殖の調節、アポトーシスの調節、細胞シグナル伝達の調節、細胞遊走の調節、細胞活性化ならびにサイトカインの産生および／または放出の調節からなる群より選択される、請求項１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項３】
前記非正準的な生物学的活性が、Ａｋｔ媒介性細胞シグナル伝達の調節、Ｅｒｋ１／２媒介性の細胞シグナル伝達の調節およびＧＰＣＲ媒介性の細胞シグナル伝達の調節、ＣＤ７１の調節およびＣＤ８０の調節からなる群より選択される、請求項１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項４】
前記非正準的な生物学的活性が、サイトカインの産生および／または放出の調節からなる群より選択され、ここで該サイトカインが、ＴＮＦ−α、ＩＬ１−β、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２ｐ４０、ＭＩＰ１−α、ＭＩＰ−１β、ＧＲＯ−α、ＭＣＰ−１およびＩＬ−１ｒａからなる群より選択される、請求項１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、配列番号１に示される全長ヒトグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素配列のフラグメントである、請求項１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項６】
請求項１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチドであって、その活性改変体が、配列番号１に示されるヒトグリシルｔＲＮＡ合成酵素配列に対してその長さに沿って少なくとも９０％の同一性を有するポリペプチドである、グリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項７】
前記ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸残基５７〜６８５、２１４〜６８５、２３９〜６８５、３１１〜６８５、４３９〜６８５、５１１〜６５８、２１４〜４３８、３６７〜４３８、２１４〜４２０、２１４〜３３８、８５〜１２７  １〜２１３、１〜６１、８５〜２１４、３３３〜６８５、１２８〜６８５、２６５〜６８５、４８３〜６８５もしくは２５〜５６、またはその活性なフラグメントを含む、請求項１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項８】
前記ポリペプチドが、全長ヒトグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素のフラグメントであり、かつ配列番号１のアミノ酸残基３６７〜４３８、またはその活性なフラグメントを含む、請求項３に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
【請求項９】
請求項１〜８のいずれか１項に記載のポリペプチドと、異種融合パートナーとを含む融合タンパク質。
【請求項１０】
請求項１〜８のいずれか１項に記載のポリペプチドまたは請求項９に記載の融合タンパク質をコードする単離されたポリヌクレオチド。
【請求項１１】
請求項１０に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
【請求項１２】
請求項１１に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１３】
請求項１に記載の少なくとも１つの単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチドを含む二量体または多量体の複合体。
【請求項１４】
生理学的に受容可能なキャリアと、以下：
（ｉ）請求項１に記載の単離されたポリペプチド；
（ｉｉ）請求項９に記載の融合タンパク質；
（ｉｉｉ）請求項１０に記載の単離されたポリヌクレオチド；
（ｉｖ）請求項１１に記載の発現ベクター；
（ｖ）請求項１３に記載の二量体または多量体の複合体；および
（ｖｉ）請求項１に記載のポリペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントからなる群より選択される少なくとも１つの成分と、
を含む、組成物。
【請求項１５】
細胞活性を調節するための請求項１４に記載の組成物であって、該組成物は、細胞または組織と接触させられるものであることを特徴とする、組成物。
【請求項１６】
前記細胞活性が細胞増殖の調節、アポトーシスの調節、細胞シグナル伝達の調節、細胞遊走の調節、細胞活性化ならびにサイトカインの産生および／または放出の調節からなる群より選択される、請求項１５に記載の組成物。
【請求項１７】
前記細胞活性が、Ａｋｔ媒介性細胞シグナル伝達の調節、Ｅｒｋ１／２媒介性の細胞シグナル伝達の調節およびＧＰＣＲ媒介性の細胞シグナル伝達の調節、ＣＤ７１の調節およびＣＤ８０の調節からなる群より選択される、請求項１５に記載の組成物。
【請求項１８】
前記細胞活性が、サイトカインの産生および／または放出の調節であり、ここで該サイトカインが、ＴＮＦ−α、ＩＬ１−β、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２ｐ４０、ＭＩＰ１−α、ＭＩＰ−１β、ＧＲＯ−α、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−１ｒａからなる群より選択される、請求項１５に記載の組成物。
【請求項１９】
ＧｌｙＲＳポリペプチドの１つ以上の非正準的な活性を調節するための組成物であって、該組成物は、調節剤を含み、ここで、該調節剤が、抗体またはその抗原結合フラグメント、干渉性ＲＮＡ分子、ドミナント・ネガティブポリペプチドおよび低分子からなる群より選択される、組成物。
【請求項２０】
状態を処置するための請求項１４に記載の組成物であって、ここで該状態は、炎症性疾患、自己免疫疾患、腫瘍性疾患、代謝病、神経性疾患、感染、心臓血管疾患および異常な脈管形成に関連する疾患からなる群より選択される、組成物。
【請求項２１】
活性な試験化合物を同定するためのスクリーニング方法であって、以下の工程：
（ａ）反応混合物を形成する工程であって、該反応混合物は：
（ｉ）請求項１〜８のいずれか１項に記載のポリペプチド；請求項９に記載の融合タンパク質、請求項１０に記載のポリヌクレオチド；および／または請求項１〜８のいずれか１項に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントからなる群より選択される成分と；
（ｉｉ）該成分によって結合されるか、および／または調節されることが公知の結合パートナー、細胞エフェクターおよび／または細胞タイプと；
（ｉｉｉ）試験化合物と
を含む、工程と；
（ｂ）該試験化合物の存在下で、該成分による結合および／または調節の増大または減
少を検出する工程であって、該試験化合物の非存在下における結合および／または調節と比較しての、該試験化合物の存在下における結合および／または調節における変化が、それによって活性な試験化合物を同定する、工程と；
を包含する、スクリーニング方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２０】
さらに他の局面では、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチド、抗体および／または他の組成物は、当該分野で公知でありかつ利用可能な本質的に任意のタイプのスクリーニングアッセイで用いられ得る。例えば、本発明の組成物（例えば、ポリペプチド、ポリヌクレオチドおよび／または抗体）は、本発明による処置を受け入れ可能な適切な細胞タイプおよび／または疾患状態を特定するために公知のスクリーニング方法論と組み合わせて用いられ得る。他の例では、本発明の組成物（例えば、ポリペプチド、ポリヌクレオチドおよび／または抗体）は、本明細書の組成物の非正準的な活性を直接または間接的に媒介または調節する、アゴニスト、アンタゴニスト、結合パートナー、競合的インヒビター、細胞エフェクターなどを特定するために公知のスクリーニング方法論と組み合わせて用いられ得る。例えば、特定の実施形態では、試験化合物を、本発明の組成物と、調節されるその結合パートナー、細胞エフェクターおよび／または細胞タイプの１つ以上との間の非正準的な活性または相互作用のインヒビターあるいは増強因子として特定するためのスクリーニング方法が提供される。この方法は、例えば、反応混合物であって：（ｉ）本発明の組成物、（ｉｉ）このような組成物によって結合および／または調節されることが公知の結合パートナー、細胞エフェクター、および／または細胞タイプ、ならびに（ｉｉｉ）試験化合物を含む反応混合物を形成する工程と；この試験化合物の存在下で、結合および／または調節が増大されるかまたは減少されるかを検出する工程とを包含し得る。試験化合物の存在下での活性または調節における、試験化合物の非存在下での効果に対する、統計学的に有意な変化（増強または阻害）は、結合および／または活性の強力なアゴニスト（模倣物または増強因子）またはアンタゴニスト（インヒビター）を示す。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
非正準的な生物学的活性を有する単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド、またはその活性な改変体。
（項目２）
前記非正準的な生物学的活性が、細胞増殖の調節、アポトーシスの調節、細胞シグナル伝達の調節、細胞遊走の調節、細胞活性化ならびにサイトカインの産生および／または放出の調節からなる群より選択される、項目１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目３）
前記非正準的な生物学的活性が、Ａｋｔ媒介性細胞シグナル伝達の調節、Ｅｒｋ１／２媒介性の細胞シグナル伝達の調節およびＧＰＣＲ媒介性の細胞シグナル伝達の調節、ＣＤ７１の調節およびＣＤ８０の調節からなる群より選択される、項目１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目４）
前記非正準的な生物学的活性が、サイトカインの産生および／または放出の調節からなる群より選択され、ここで該サイトカインが、ＴＮＦ−α、ＩＬ１−β、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２ｐ４０、ＭＩＰ１−α、ＭＩＰ−１β、ＧＲＯ−α、ＭＣＰ−１およびＩＬ−１ｒａからなる群より選択される、項目１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目５）
前記ポリペプチドが、配列番号１に示される全長ヒトグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素配列のフラグメントである、項目１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目６）
項目１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチドであって、その活性改変体が、配列番号１に示されるヒトグリシルｔＲＮＡ合成酵素配列に対してその長さに沿って少なくとも９０％の同一性を有するポリペプチドである、グリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目７）
前記ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸残基５７〜６８５、２１４〜６８５、２３９〜６８５、３１１〜６８５、４３９〜６８５、５１１〜６５８、２１４〜４３８、３６７〜４３８、２１４〜４２０、２１４〜３３８、８５〜１２７  １〜２１３、１〜６１、８５〜２１４、３３３〜６８５、１２８〜６８５、２６５〜６８５、４８３〜６８５もしくは２５〜５６、またはその活性なフラグメントを含む、項目１に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目８）
前記ポリペプチドが、全長ヒトグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素のフラグメントであり、かつ配列番号１のアミノ酸残基３６７〜４３８、またはその活性なフラグメントを含む、項目３に記載の単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目９）
項目１〜８のいずれか１項に記載のポリペプチドと、異種融合パートナーとを含む融合タンパク質。
（項目１０）
項目１〜９のいずれか１項に記載のポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチド。
（項目１１）
項目１０に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
（項目１２）
項目１１に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
（項目１３）
項目１に記載の少なくとも１つの単離されたグリシル−ｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチドを含む二量体または多量体の複合体。
（項目１４）
生理学的に受容可能なキャリアと、以下：
（ｉ）項目１に記載の単離されたポリペプチド；
（ｉｉ）項目９に記載の融合タンパク質；
（ｉｉｉ）項目１０に記載の単離されたポリヌクレオチド；
（ｉｖ）項目１１に記載の発現ベクター；
（ｖ）項目１３に記載の二量体または多量体の複合体；および
（ｖｉ）項目１に記載のポリペプチドに結合する抗体またはその抗原結合フラグメントからなる群より選択される少なくとも１つの成分と、
を含む、組成物。
（項目１５）
細胞活性を調節するための方法であって、細胞または組織を項目１４に記載の組成物と接触させる工程を包含する、方法。
（項目１６）
前記細胞活性が細胞増殖の調節、アポトーシスの調節、細胞シグナル伝達の調節、細胞遊走の調節、細胞活性化ならびにサイトカインの産生および／または放出の調節からなる群より選択される、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
前記細胞活性が、Ａｋｔ媒介性細胞シグナル伝達の調節、Ｅｒｋ１／２媒介性の細胞シグナル伝達の調節およびＧＰＣＲ媒介性の細胞シグナル伝達の調節、ＣＤ７１の調節およびＣＤ８０の調節からなる群より選択される、項目１５に記載の方法。
（項目１８）
前記細胞活性が、サイトカインの産生および／または放出の調節であり、ここで該サイトカインが、ＴＮＦ−α、ＩＬ１−β、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２ｐ４０、ＭＩＰ１−α、ＭＩＰ−１β、ＧＲＯ−α、ＭＣＰ−１、およびＩＬ−１ｒａからなる群より選択される、項目１５に記載の方法。
（項目１９）
ＧｌｙＲＳポリペプチドの１つ以上の非正準的な活性を調節するための方法であって、該ＧｌｙＲＳポリペプチドを発現する細胞を、調節剤と接触させる工程を包含し、ここで、該調節剤が、抗体またはその抗原結合フラグメント、干渉性ＲＮＡ分子、ドミナント・ネガティブポリペプチドおよび低分子からなる群より選択される、方法。
（項目２０）
状態を処置するための方法であって、項目１４に記載の組成物を、それを必要とする被験体に対して投与する工程を包含し、ここで該状態は、炎症性疾患、自己免疫疾患、腫瘍性疾患、代謝病、神経性疾患、感染、心臓血管疾患および異常な脈管形成に関連する疾患からなる群より選択される、方法。
（項目２１）
活性な試験化合物を同定するためのスクリーニング方法であって、以下の工程：
（ａ）．反応混合物を形成する工程であって、該反応混合物は：
（ｉ）項目１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチド；項目７に記載のポリヌクレオチド；および／または項目１〜６のいずれか１項に記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体またはその抗原結合フラグメントからなる群より選択される成分と；
（ｉｉ）該成分によって結合されるか、および／または調節されることが公知の結合パートナー、細胞エフェクターおよび／または細胞タイプと；
（ｉｉｉ）試験化合物と
を含む、工程と；
（ｂ）．該試験化合物の存在下で、該成分による結合および／または調節の増大または減
少を検出する工程であって、該試験化合物の非存在下における結合および／または調節と比較しての、該試験化合物の存在下における結合および／または調節における変化が、それによって活性な試験化合物を同定する、工程と；
を包含する、スクリーニング方法。