【手続補正書】
【提出日】平成26年10月16日(2014.10.16)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
アルツハイマー病の発病し易さ、またはその存在についてスクリーニングするまたは診断するための方法であって、
（ａ）試験される個体の身体から抽出された組織試料を提供するステップであって、前記組織試料は、染色体８上のクラスタリン（ＣＬＵ、ＡＰＯＪとしても知られている）遺伝子；染色体１１上のＰＩＣＡＬＭ遺伝子；染色体１上の補体受容体１遺伝子（ＣＲ１）；染色体２上のブリッジングインテグレーター１遺伝子（ＢＩＮ１）；染色体１９上のＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー７（ＡＢＣＡ７）；および染色体１１上の膜貫通４Ａ（ＭＳ４Ａ）遺伝子クラスターを含む少なくとも１つの座を含有するステップ、
（ｂ）以下のＳＮＰ：クラスタリン座におけるｒｓ１１１３６０００；ＰＩＣＡＬＭ座におけるｒｓ３８５１１７９；ＣＲ１座におけるｒｓ１４０８０７７、ｒｓ６７０１７１３、またはｒｓ３８１８３６１；ＢＩＮ１座におけるｒｓ７５６１５２８またはｒｓ７４４３７３；ＡＢＣＡ７座におけるｒｓ３７６４６５０；およびＭＳ４Ａ遺伝子クラスター座におけるｒｓ６７０１３９、ｒｓ６１０９３２、ｒｓ６７６３０９、ｒｓ６６７８９７、ｒｓ６６２１９６、ｒｓ５８３７９１、またはｒｓ１５６２９９０の存在の有無を同定するために前記座を検査するステップ、および
（ｃ）以下のＳＮＰ：クラスタリン座におけるｒｓ１１１３６０００；ＰＩＣＡＬＭ座におけるｒｓ３８５１１７９；ＣＲ１座におけるｒｓ１４０８０７７、ｒｓ６７０１７１３、またはｒｓ３８１８３６１の一つ；ＢＩＮ１座におけるｒｓ７５６１５２８またはｒｓ７４４３７３の一つ；ＡＢＣＡ７座におけるｒｓ３７６４６５０；およびＭＳ４Ａ遺伝子クラスター座におけるｒｓ６７０１３９、ｒｓ６１０９３２、ｒｓ６７６３０９、ｒｓ６６７８９７、ｒｓ６６２１９６、ｒｓ５８３７９１、またはｒｓ１５６２９９０の一つが存在する場合に、試料を抽出した個体が、アルツハイマー病を発病する可能性が高いまたは罹患していると結論づけるステップ、を含む方法。
【請求項２】
前記ステップ（ｂ）において、前記クラスタリン座におけるｒｓ１１１３６０００についての検査に加えて、またはその代わりに、ｒｓ７９８２の存在の有無を同定するために同座を検査し、ＰＩＣＡＬＭ座におけるｒｓ３８５１１７９についての検査に加えて、またはその代わりに、ｒｓ５６１６５５、またはｒｓ５９２２９７の存在の有無を同定するために同座を検査し、
前記ステップ（ｃ）において、ｒｓ７９８２、ｒｓ５６１６５５、またはｒｓ５９２２９７が存在する場合に、試料を抽出した個体が、アルツハイマー病を発病する可能性が高いまたは罹患していると結論づけること、を含む請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記検査される遺伝子座またはクラスターに相補的な少なくとも１つの標識されたオリゴヌクレオチドが、前記ＳＮＰを検出するために使用され、前記オリゴヌクレオチドが、前記ＳＮＰに結合することにより、検出する際に、前記ＳＮＰの存在を表す検出可能なシグナルを発する、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記組織試料が、ステップ（ｂ）を実行する前にＰＣＲ増幅される、請求項１から３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記組織が、ステップ（ｂ）を実行する前に酵素により断片化される、請求項１から４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記相補的オリゴヌクレオチドが、固相または基質に付着または結合し、前記組織試料が、ステップ（ｂ）を実行する前に前記固相または基質に曝露される、請求項３から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
アルツハイマー病の発病し易さ、またはその存在についてスクリーニングするまたは診断するためのキットであって、
複数のオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドの少なくとも１つが、染色体８上のクラスタリン（ＣＬＵ、ＡＰＯＪとしても知られている）遺伝子；染色体１１上のＰＩＣＡＬＭ遺伝子；染色体１上の補体受容体１遺伝子（ＣＲ１）；染色体２上のブリッジングインテグレーター１遺伝子（ＢＩＮ１）；染色体１９上のＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー７（ＡＢＣＡ７）；または染色体１１上の膜貫通４Ａ（ＭＳ４Ａ）遺伝子クラスターの座または遺伝子クラスターに相補的であり、前記オリゴヌクレオチドが、以下のＳＮＰ：クラスタリンにおけるｒｓ１１１３６０００；ＰＩＣＡＬＭにおけるｒｓ３８５１１７９；ＣＲ１におけるｒｓ１４０８０７７、ｒｓ６７０１７１３、またはｒｓ３８１８３６１；ＢＩＮ１におけるｒｓ７５６１５２８またはｒｓ７４４３７３；ＡＢＣＡ７におけるｒｓ３７６４６５０；およびＭＳ４Ａ遺伝子クラスターにおけるｒｓ６７０１３９、ｒｓ６１０９３２、ｒｓ６７６３０９、ｒｓ６６７８９７、ｒｓ６６２１９６、ｒｓ５８３７９１、またはｒｓ１５６２９９０の１つまたは複数を検出することができ、
さらに、前記オリゴヌクレオチドが、前記ＳＮＰに結合する際に検出可能なシグナルを発する標識を備える、キット。
【請求項８】
アルツハイマー病の発病し易さ、またはその存在についてスクリーニングするまたは診断するためのキットであって、
複数のオリゴヌクレオチドを含み、当該オリゴヌクレオチドの少なくとも１つが、染色体８上のクラスタリン（ＣＬＵ、ＡＰＯＪとしても知られている）遺伝子；染色体１１上のＰＩＣＡＬＭ遺伝子；染色体１上の補体受容体１遺伝子（ＣＲ１）；染色体２上のブリッジングインテグレーター１遺伝子（ＢＩＮ１）；染色体１９上のＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー７（ＡＢＣＡ７）；または染色体１１上の膜貫通４Ａ（ＭＳ４Ａ）遺伝子クラスターの座または遺伝子クラスターに相補的であり、前記オリゴヌクレオチドが、以下のＳＮＰ：クラスタリンにおけるｒｓ１１１３６０００；ＰＩＣＡＬＭにおけるｒｓ３８５１１７９；ＣＲ１におけるｒｓ１４０８０７７、ｒｓ６７０１７１３、またはｒｓ３８１８３６１；ＢＩＮ１におけるｒｓ７５６１５２８またはｒｓ７４４３７３；ＡＢＣＡ７におけるｒｓ３７６４６５０；およびＭＳ４Ａ遺伝子クラスターにおけるｒｓ６７０１３９、ｒｓ６１０９３２、ｒｓ６７６３０９、ｒｓ６６７８９７、ｒｓ６６２１９６、ｒｓ５８３７９１、またはｒｓ１５６２９９０の１つまたは複数を検出することができ、
さらに、前記キットが、前記オリゴヌクレオチドと組み合わせて使用される標識手段を含み、それによって、前記ＳＮＰへのオリゴヌクレオチドの結合が、標識手段が前記の結合を検出することを可能にし、したがって、前記ＳＮＰの存在を表すシグナルを生成する、キット。
【請求項９】
前記オリゴヌクレオチドが、固体担体上に固定される、請求項７または８に記載のキット。
【請求項１０】
染色体８上のクラスタリン（ＣＬＵ、ＡＰＯＪとしても知られている）遺伝子、染色体１１上のＰＩＣＡＬＭ遺伝子、染色体１上の補体受容体１遺伝子（ＣＲ１）、染色体２上のブリッジングインテグレーター１遺伝子（ＢＩＮ１）、染色体１９上のＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー７（ＡＢＣＡ７）、または染色体１１上の膜貫通４Ａ（ＭＳ４Ａ）遺伝子クラスターの複数の遺伝子座又はクラスターを含み、さらに、以下の変異；ＳＮＰ  ｒｓ１１１３６０００；ＳＮＰ  ｒｓ３８５１１７９；ＳＮＰ  ｒｓ１４０８０７７；ＳＮＰ  ｒｓ６７０１７１３；ＳＮＰ  ｒｓ３８１８３６１；ＳＮＰ  ｒｓ７５６１５２８；ＳＮＰｒｓ７４４３７３；ＳＮＰ  ｒｓ７９８２；ＳＮＰ  ｒｓ５６１６５５；ＳＮＰ  ｒｓ５９２２９７；ＳＮＰ  ｒｓ３７６４６５０、ＳＮＰ  ｒｓ６７０１３９；ＳＮＰ  ｒｓ１５６２９９０、ＳＮＰ  ｒｓ６６７８９７、ＳＮＰ  ｒｓ６７６３０９、ＳＮＰ  ｒｓ５８３７９１、ＳＮＰ  ｒｓ６６２１９６、およびＳＮＰ  ｒｓ６１０９３２の１つ又は任意の組み合わせを含む複数を含む核酸分子。
【請求項１１】
染色体８上のクラスタリン（ＣＬＵ、ＡＰＯＪとしても知られている）遺伝子、染色体１１上のＰＩＣＡＬＭ遺伝子、染色体１上の補体受容体１遺伝子（ＣＲ１）、染色体２上のブリッジングインテグレーター１遺伝子（ＢＩＮ１）、染色体１９上のＡＴＰ結合カセット、サブファミリーＡ、メンバー７（ＡＢＣＡ７）、または染色体１１上の膜貫通４Ａ（ＭＳ４Ａ）遺伝子クラスターの複数の遺伝子座又はクラスターを含み、さらに、以下のＳＮＰ：ＣＬＵにおけるｒｓ１１１３６０００；ＰＩＣＡＬＭにおけるｒｓ３８５１１７９；ＣＲ１におけるｒｓ１４０８０７７、ｒｓ６７０１７１３またはｒｓ３８１８３６１；ＢＩＮ１におけるｒｓ７５６１５２８またはＳＮＰｒｓ７４４３７３；ＡＢＣＡ７におけるｒｓ３７６４６５０；およびＭＳ４Ａ遺伝子クラスターにおけるｒｓ６７０１３９；ｒｓ６１０９３２、ｒｓ６７６３０９、ｒｓ６６７８９７、ｒｓ６６２１９６、ｒｓ５８３７９１またはｒｓ１５６２９９０の１つ又は複数を含む細胞または細胞系。
【請求項１２】
ＳＮＰ  ｒｓ７９８２；ＳＮＰ  ｒｓ５６１６５５；ＳＮＰ  ｒｓ５９２２９７をさらに含む、請求項１１に記載の細胞または細胞系。
【請求項１３】
機能的エンドサイトーシス経路、アポトーシス経路、補体経路、または自然免疫応答経路を含む、請求項１１または１２に記載の細胞または細胞系。
【請求項１４】
治療薬、標識、または同定手段が、アルツハイマー病（ＡＤ）を治療する、ＡＤを標識する、または同定するために各々使用することができるかどうかを試験するための、請求項１１から１３のいずれか一項に記載の細胞または細胞系の使用。
【請求項１５】
試験物質に前記細胞または細胞系を曝露するステップ、および、前記細胞または細胞系のエンドサイトーシス経路、アポトーシス経路、補体経路、または自然免疫応答経路に対する前記物質の効果、あるいは、前記試験物質が、前記ＳＮＰを標識するもしくは同定することによって前記細胞または細胞系を標識するもしくは同定する能力を観察するステップ、を含む、請求項１４に記載の使用。