【手続補正書】
【提出日】平成24年10月18日(2012.10.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
抗体でも抗体フラグメントでもない機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片、切断可能リンカー、およびペプチドマスクを含む、活性化可能ポリペプチドであって、該ペプチドマスクは、（ｉ）該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片の結合パートナーへの結合を阻害し、（ｉｉ）該結合パートナーのアミノ酸配列を有さず、そして、未切断状態では、該ペプチドマスクは該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片の該結合パートナーへの結合を阻害し、切断状態では、該ペプチドマスクは該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片の該結合パートナーへの結合を阻害しない、活性化可能ポリペプチド。
【請求項２】
請求項１に記載の活性化可能ポリペプチドであって、
前記機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片は、前記結合パートナーへの結合について、１００ｎＭ以下の平衡解離定数を有し、
前記ペプチドマスクは、
（Ａ）該結合パートナーに対する該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片の平衡解離定数よりも大きい、該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片への結合についての平衡解離定数を有し、
（Ｂ）該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片の天然型結合パートナーに対して、５０％を超えない類似性を有するポリペプチド配列を含み、そして
（Ｃ）切断状態において、該結合パートナーへの結合について、該機能性タンパク質またはその機能性タンパク質断片を妨害も、それと競合もせず；
前記切断可能リンカーは、プロテアーゼに対する基質として機能し、そのようなプロテアーゼは、該結合パートナーと共に組織中に共局在化しており、そしてそのようなプロテアーゼは、該活性化可能ポリペプチド内で該切断可能リンカーを切断することができ、
ここで、該切断可能リンカーは、未切断状態において、該活性化可能ポリペプチドの該結合パートナーへの結合が、未改変機能性タンパク質または機能性タンパク質断片の該結合パートナーへの結合の平衡解離定数よりも少なくとも１００倍高い平衡解離定数で生じるように、かつ一方では、切断状態において、該機能性タンパク質または機能性タンパク質断片が、該結合パートナーの存在下で該結合パートナーに結合することができるように、該活性化可能ポリペプチド内に位置付けられ；
該活性化可能ポリペプチドは、未切断状態において、以下のＮ末端からＣ末端への構造上の配置：
（ペプチドマスク）−（切断可能リンカー）−（機能性タンパク質もしくは機能性タンパク質断片）または
（機能性タンパク質もしくは機能性タンパク質断片）−（切断可能リンカー）−（ペプチドマスク）
を有し、
ここで、該ペプチドマスクのカップリングは、該ペプチドマスクにカップリングされている場合の該結合パートナーに対する該機能性タンパク質もしくは機能性タンパク質断片の解離定数（Ｋｄ）が、該ペプチドマスクにカップリングされていない場合の該結合パートナーに対する該機能性タンパク質もしくは機能性タンパク質断片のＫｄより少なくとも１００倍高くなるように、該機能性タンパク質もしくは機能性タンパク質断片がその結合パートナーへ結合する能力を低減させる、活性化可能ポリペプチド。
【請求項３】
前記ペプチドマスクが、以下の特徴：
（ｉ）該ペプチドマスクの長さが８〜１５アミノ酸である；
（ｉｉ）該ペプチドマスクが前記機能性タンパク質にとって固有のものである；
（ｉｉｉ）該ペプチドマスクが該機能性タンパク質からいったんアンカップリングすると、治療効果を有する；
（ｉｖ）該ペプチドマスクが５０％未満の遺伝的にコードされていないアミノ酸を含有し、必要に応じて、該遺伝的にコードされていないアミノ酸が、必要に応じてＤ−アミノ酸、必要に応じてβ−アミノ酸、または必要に応じてγ−アミノ酸である；
（ｖ）該ペプチドマスクが表３に示す配列から選択された配列または少なくともその９０％の相同性を有する配列を含有する；
（ｖｉ）該ペプチドマスクがコンセンサス配列ＴＤＶＤＹＹＲＥＷＸＸＸＸＸＸＸＸを含有し、ここで、Ｘは任意のアミノ酸である；
（ｖｉｉ）該ペプチドマスクが可溶性受容体のそのリガンドへの結合を阻害する；
（ｖｉｉｉ）該ペプチドマスクが受容体のリガンド結合ドメインを阻害する；
（ｉｘ）該ペプチドマスクが表１４に示す配列から選択された配列または少なくともそれの９０％相同性を有する配列を含有する；
（ｘ）該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合をアロステリックに阻害する；および
（ｘｉ）該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を立体的に阻害する
のうちの一つ以上を有する、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項４】
前記機能性タンパク質が全長タンパク質、全長タンパク質の機能性フラグメント、球状タンパク質、繊維状タンパク質、またはマルチマータンパク質である、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項５】
前記機能性タンパク質がリガンド、可溶性膜タンパク質もしくはその機能性フラグメント、可溶性受容体もしくはそのフラグメント、受容体タンパク質の細胞外ドメインもしくはそのフラクション、またはインターフェロンタンパク質である、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項６】
前記リガンドがＤＬＬ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４、Ｊａｇｇｅｄ１およびＪａｇｇｅｄ２から成る群より選択されるか、あるいは前記インターフェロンタンパク質がＩ型インターフェロン、ＩＩ型インターフェロン、ＩＩＩ型インターフェロン、ＩＦＮ−α、ＩＦＮ−β、ＩＦＮ−ω、ＩＦＮ−γ、ＩＦＮ−α  ２ａ、ＩＦＮ−α  ２ｂ、およびＩＦＮ−α  ｃｏｎ１から成る群より選択される、請求項５に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項７】
前記結合パートナーが前記インターフェロンタンパク質の受容体であり、該受容体は、必要に応じてＩＦＮＡＲ、必要に応じてＩＦＮＡＲ１、必要に応じてＩＦＮＡＲ２、必要に応じてＩＦＮＧＲ、および必要に応じてＩＦＮＬＲ１から成る群より必要に応じて選択されるか；あるいは該結合パートナーはＮｏｔｃｈ受容体であり、該Ｎｏｔｃｈ受容体が、必要に応じてＮｏｔｃｈ１、必要に応じてＮｏｔｃｈ２、必要に応じてＮｏｔｃｈ３および必要に応じてＮｏｔｃｈ４から成る群より必要に応じて選択される、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項８】
前記切断可能リンカーが、以下の特徴：
（ｉ）該切断可能なリンカーは、表２の基質から選択された酵素の基質である；
（ｉｉ）該切断可能なリンカーは、マトリプターゼ、プラスミン、ＭＭＰ−９、ｕＰＡ、ＨＣＶ−ＮＳ３／４、ＰＳＡ、およびレグマインから成る群より選択された酵素の基質である；
（ｉｉｉ）該切断可能なリンカーは、マトリプターゼまたはＨＣＶ−ＮＳ３／４の基質である；
（ｉｖ）該切断可能なリンカーは、ＸＸＱＡＲ（Ａ／Ｖ）ＸおよびＡＧＰＲから選択されるマトリプターゼ基質のコンセンサス配列を含む；
（ｖ）該切断可能なリンカーは、ＤＥＸＸＸＣ（Ａ／Ｓ）およびＤＬＸＸＸＴ（Ａ／Ｓ）から選択されるＨＣＶ−ＮＳ３／４基質のコンセンサス配列を含む；
（ｖｉ）該切断可能なリンカーは、ＭＭＰ−９基質の配列を含み、該配列はＶＨＭＰＬＧＦＬＧＰを含む；および
（ｖｉｉ）該切断可能なリンカーは、プラスミン基質の配列を含み、該配列はＱＧＰＭＦＫＳＬＷＤを含む；
のうちの一つ以上を有する、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項９】
免疫グロブリンのＦｃ領域をさらに含む、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項１０】
前記活性化可能ポリペプチドが前記切断可能なリンカーを切断することができる酵素の存在下にないとき、該活性化可能ポリペプチドが該切断可能なリンカーを切断することができる該酵素の存在下にあり、該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を阻害しないときと比較した場合に、該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を少なくとも９０％阻害する、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチド。
【請求項１１】
治療的有効量の請求項１に記載の活性化可能ポリペプチドおよび薬学的に許容され得る賦形剤を含む、薬学的組成物。
【請求項１２】
疾患または障害を処置するための、請求項１１に記載の薬学的組成物。
【請求項１３】
前記疾患または障害が癌または肝臓病態である、請求項１２に記載の薬学的組成物。
【請求項１４】
哺乳動物被験体の新脈管形成を阻害するための、請求項１１に記載の薬学的組成物。
【請求項１５】
請求項１に記載の活性化可能ポリペプチドを製造する方法であって、該方法は：
（ａ）核酸構築物を含む細胞を培養する工程であって、該核酸構築物は該活性化可能ポリペプチドの発現をもたらす条件下で該活性化可能ポリペプチドの発現をコードし、該活性化可能ポリペプチドは、ペプチドマスク、切断可能リンカー、および抗体でも抗体フラグメントでもない機能性タンパク質を含み、ここで、
（ｉ）該活性化可能ポリペプチドは、未切断状態において、以下のＮ末端からＣ末端への構造上の配置：
（ペプチドマスク）−（切断可能リンカー）−（機能性タンパク質）または
（機能性タンパク質）−（切断可能リンカー）−（ペプチドマスク）
を有し、
（ｉｉ）該ペプチドマスクのカップリングは、該ペプチドマスクにカップリングされている場合の該結合パートナーに対する該機能性タンパク質の解離定数（Ｋｄ）が、該ペプチドマスクにカップリングされていない場合の該結合パートナーに対する該機能性タンパク質のＫｄより少なくとも１００倍高くなるように、該機能性タンパク質がその結合パートナーへ結合する能力を低減させる、工程；ならびに
（ｂ）該活性化可能ポリペプチドを回収する工程
を含む、方法。
【請求項１６】
請求項１に記載の活性化可能ポリペプチドをコードする、単離された核酸分子。
【請求項１７】
請求項１６に記載の単離された核酸分子を含む、ベクター。
【請求項１８】
前記活性化可能ポリペプチドの発現をもたらす条件下で細胞を培養することによって、請求項１に記載の活性化可能ポリペプチドを生成する方法であって、該細胞は、該活性化可能ポリペプチドをコードする単離された核酸分子を含むベクターを含む、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００３５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００３５】
別の態様において、本開示は、ペプチドマスクおよび切断可能なリンカーにカップリングされた機能性タンパク質を含む、改善された生物学的利用能を有するＣ型肝炎処置のためのタンパク質治療薬を提供し、該タンパク質治療薬のその標的に対する結合親和性は、非肝臓組織におけるタンパク質治療薬のその標的への結合と比較したときに、肝臓組織においてより高く、標的は両方の組織に存在する。１実施形態において、切断可能なリンカーは、マトリプターゼまたはＨＣＶ  ＮＳ３／４酵素に特異的な基質を含む。
参照による組み入れ
本明細書で言及するすべての刊行物、特許、および特許出願は、個々の刊行物、特許、または特許出願がそれぞれ特異的におよび個別に参照により組み入れられることが指摘されたのと同じ程度まで、参照により本明細書に組み入れられている。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
抗体でも抗体フラグメントでもない機能性タンパク質を含む組成物であって、該機能性タンパク質が、（ｉ）該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を阻害し、（ｉｉ）該結合パートナーのアミノ酸配列を有さない、ペプチドマスクにカップリングされている、組成物。
（項目２）
前記機能性タンパク質が、切断されることが可能である切断可能なリンカーにさらにカップリングされ、それにより、（ｉ）未切断状態では、前記ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を阻害し、（ｉｉ）切断状態では、該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を阻害しない、項目１に記載の組成物。
（項目３）
前記切断可能なリンカーは、酵素によって特異的に切断することが可能であり、還元剤によって還元することが可能であり、または光分解することが可能である、項目２に記載の組成物。
（項目４）
ペプチドマスクにカップリングされた前記機能性タンパク質が組換え発現されている、項目１に記載の組成物。
（項目５）
前記ペプチドマスクが前記機能性タンパク質にとって固有のものである、項目１に記載の組成物。
（項目６）
前記ペプチドマスクが前記機能性タンパク質からいったんアンカップリングすると、治療効果を有する、項目１に記載の組成物。
（項目７）
前記ペプチドマスクの長さが８〜１５アミノ酸である、項目１に記載の組成物。
（項目８）
前記ペプチドマスクがその結合パートナーに対して５０％未満のアミノ酸配列相同性を有する、項目１に記載の組成物。
（項目９）
前記ペプチドマスクが５０％未満の遺伝的にコードされていないアミノ酸を含有する、項目１に記載の組成物。
（項目１０）
前記遺伝的にコードされていないアミノ酸がＤ−アミノ酸、β−アミノ酸、またはγ−アミノ酸である、項目９に記載の組成物。
（項目１１）
前記機能性タンパク質が全長タンパク質、全長タンパク質の機能性フラグメント、球状タンパク質、繊維状タンパク質、またはマルチマータンパク質である、項目１に記載の組成物。
（項目１２）
前記機能性タンパク質がリガンドである、項目１に記載の組成物。
（項目１３）
前記リガンドがインターフェロンタンパク質である、項目１２に記載の組成物。
（項目１４）
前記インターフェロンタンパク質がＩ型インターフェロン、ＩＩ型インターフェロン、およびＩＩＩ型インターフェロンから成る群より選択される、項目１３に記載の組成物。
（項目１５）
インターフェロンタンパク質がＩＦＮ−α、ＩＦＮ−β、ＩＦＮ−ω、およびＩＦＮ−γから成る群より選択される、項目１３に記載の組成物。
（項目１６）
インターフェロンタンパク質がＩＦＮ−αである、項目１３に記載の組成物。
（項目１７）
前記ペプチドマスクが表３に示す配列から選択された配列または少なくともその９０％の相同性を有する配列を含有する、項目１６に記載の組成物。
（項目１８）
前記ペプチドマスクがコンセンサス配列ＴＤＶＤＹＹＲＥＷＸＸＸＸＸＸＸＸを含有する、項目１６に記載の組成物。
（項目１９）
ＩＦＮ−αタンパク質が２ａ、２ｂ、およびｃｏｎ１から成る群より選択される、項目１６に記載の組成物。
（項目２０）
前記結合パートナーが前記インターフェロンタンパク質の受容体である、項目１３に記載の組成物。
（項目２１）
前記インターフェロンタンパク質の前記受容体がＩＦＮＡＲ、ＩＦＮＡＲ１、ＩＦＮＡＲ２、ＩＦＮＧＲ、およびＩＦＮＬＲ１から成る群より選択される、項目２０に記載の組成物。
（項目２２）
前記機能性タンパク質が可溶性膜タンパク質またはその機能性フラグメントである、項目１に記載の組成物。
（項目２３）
前記機能性タンパク質が可溶性受容体またはそのフラグメントである、項目１に記載の組成物。
（項目２４）
前記機能性タンパク質が受容体タンパク質の細胞外ドメインまたはそのフラクションである、項目１に記載の組成物。
（項目２５）
前記ペプチドマスクが前記可溶性受容体のそのリガンドへの結合を阻害する、項目２３に記載の組成物。
（項目２６）
前記ペプチドマスクが前記受容体のリガンド結合ドメインを阻害する、項目２５に記載の組成物。
（項目２７）
前記受容体がＮｏｔｃｈである、項目２３に記載の組成物。
（項目２８）
前記Ｎｏｔｃｈ受容体がＮｏｔｃｈ１、Ｎｏｔｃｈ２、Ｎｏｔｃｈ３およびＮｏｔｃｈ４から成る群より選択される、項目２７に記載の組成物。
（項目２９）
前記リガンドがＤＬＬ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４、Ｊａｇｇｅｄ１およびＪａｇｇｅｄ２から成る群より選択される、項目２５に記載の組成物。
（項目３０）
前記ペプチドマスクが表１４に示す配列から選択された配列または少なくともそれの９０％相同性を有する配列を含有する、項目２７に記載の組成物。
（項目３１）
前記切断可能なリンカーが表２の基質から選択された酵素の基質である、項目２に記載の組成物。
（項目３２）
前記切断可能なリンカーがマトリプターゼ、プラスミン、ＭＭＰ−９、ｕＰＡ、ＨＣＶ−ＮＳ３／４、ＰＳＡ、およびレグマインから成る群より選択された酵素の基質である、項目２に記載の組成物。
（項目３３）
前記切断可能なリンカーがマトリプターゼまたはＨＣＶ−ＮＳ３／４の基質である、項目３２に記載の組成物。
（項目３４）
マトリプターゼ基質のコンセンサス配列がＸＸＱＡＲ（Ａ／Ｖ）ＸまたはＡＧＰＲを含む、項目３２に記載の組成物。
（項目３５）
ＨＣＶ−ＮＳ３／４基質のコンセンサス配列がＤＥＸＸＸＣ（Ａ／Ｓ）またはＤＬＸＸＸＴ（Ａ／Ｓ）を含む、項目３２に記載の組成物。
（項目３６）
ＭＭＰ−９基質の配列がＶＨＭＰＬＧＦＬＧＰを含む、項目３２に記載の組成物。
（項目３７）
プラスミン基質の配列がＱＧＰＭＦＫＳＬＷＤを含む、項目３２に記載の組成物。
（項目３８）
免疫グロブリンのＦｃ領域をさらに含む、項目１に記載の組成物。
（項目３９）
前記ペプチドマスクの前記機能性タンパク質への前記カップリングが非共有結合である、項目１に記載の組成物。
（項目４０）
前記ペプチドマスクが前記機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合をアロステリックに阻害する、項目１に記載の組成物。
（項目４１）
前記ペプチドマスクが前記機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を立体的に阻害する、項目１に記載の組成物。
（項目４２）
前記ペプチドマスクの前記機能性タンパク質への結合親和性が、前記結合パートナーの該機能性タンパク質への結合親和性よりも低い、項目１に記載の組成物。
（項目４３）
前記ペプチドマスクの前記機能性タンパク質に対する解離定数（Ｋｄ）が、該機能性タンパク質のその結合パートナーに対するＫｄの少なくとも１００倍高い、項目１に記載の組成物。
（項目４４）
前記ペプチドマスクの前記機能性タンパク質に対するＫｄが約５ｎＭよりも低い、項目４３に記載の組成物。
（項目４５）
前記組成物が前記切断可能なリンカーを切断することができる酵素の存在下にないとき、該組成物が該切断可能なリンカーを切断することができる該酵素の存在下にあり、該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を阻害しないときと比較した場合に、該ペプチドマスクが該機能性タンパク質のその結合パートナーへの結合を少なくとも９０％阻害する、項目３に記載の組成物。
（項目４６）
前記切断可能なリンカーが酵素により、少なくとも５×１０４Ｍ−１Ｓの速度にて特異的に切断されることができる、項目３に記載の組成物。
（項目４７）
治療的有効量の項目２に記載の組成物および薬学的に許容され得る賦形剤を含む、薬学的組成物。
（項目４８）
疾患または障害を処置する方法であって、それを必要とする被験体に治療的有効量の項目４７に記載の薬学的組成物を投与する工程を含む方法。
（項目４９）
前記疾患または障害が癌である、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
前記疾患または障害が肝臓病態である、項目４８に記載の方法。
（項目５１）
前記肝臓病態がＣ型肝炎感染または肝細胞癌である、項目５０に記載の方法。
（項目５２）
哺乳動物被験体の新脈管形成を阻害する方法であって、それを必要とする被験体に治療的有効量の項目４７に記載の薬学的組成物を投与する工程を含む方法。
（項目５３）
複製可能な生物学的実体の表面に提示された、複数の活性化可能機能性タンパク質の候補を含むライブラリ。
（項目５４）
前記機能性タンパク質がインターフェロンまたは可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質である、項目５３に記載のライブラリ。
（項目５５）
ａ．複製可能な生物学的実体のゲノム中にペプチドマスクをそれぞれコードする組換えＤＮＡ構築物のコレクションを導入して、該導入が複製可能な組換え生物学的実体を産生する工程と；
ｂ．該複製可能な組換え生物学的実体を候補ペプチドマスクの発現および提示に好適な条件下で培養する工程と；
を含む、候補ペプチドマスクのライブラリを作製する方法。
（項目５６）
候補ペプチドマスクがインターフェロンタンパク質または可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体を結合する能力についてスクリーニングされる、項目６４に記載の方法。
（項目５７）
前記インターフェロンタンパク質がプロ−ＩＦＮ−αである、項目５６に記載の方法。
（項目５８）
ペプチドマスクのスクリーニング方法であって、
ａ．複数の候補ペプチドマスクを機能性タンパク質と接触させる工程と；
ｂ．メンバのうちの第１の集団を機能性タンパク質によってスクリーニングする工程を含み；
該方法がペプチドマスクの選択を提供する、方法。
（項目５９）
候補ペプチドマスクがインターフェロンタンパク質または可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体を結合する能力についてスクリーニングされる、項目５８に記載の方法。
（項目６０）
前記インターフェロンタンパク質がプロ−ＩＦＮ−αである、項目５６に記載の方法。
（項目６１）
ペプチドマスクにカップリングされた活性化可能機能性タンパク質のスクリーニング方法であって、
ａ．候補の活性化可能タンパク質の複数を、該機能性タンパク質を結合することが可能な結合パートナーおよび該活性化可能タンパク質の切断可能なリンカーを切断することが可能な酵素と接触させる工程と；
ｂ．該酵素の存在下で該結合パートナーに結合する該複数のメンバのうちの第１の集団をスクリーニングする工程と；
ｃ．該第１の集団を該結合パートナーと該酵素の非存在下で接触させる工程と；該第１の集団を消耗させることによって、該第１の集団から、メンバのうちの第２の集団を、該酵素の非存在下で該結合パートナーを結合するメンバについてスクリーニングする工程を含み；
該方法が、該酵素の存在下で結合する結合パートナーと比較して、該酵素の非存在下でその結合パートナーへの結合の低下を呈する活性化可能機能性タンパク質の候補の選択を提供する、方法。
（項目６２）
候補ペプチドマスクがインターフェロンタンパク質または可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体を結合する能力についてスクリーニングされる、項目６４に記載の方法。
（項目６３）
前記インターフェロンタンパク質がプロ−ＩＦＮ−αである、項目５６に記載の方法。
（項目６４）
ペプチドマスクにそれぞれカップリングされた活性化可能機能性タンパク質の候補のライブラリを作製する方法であって、
ａ．複製可能な生物学的実体のゲノム中に、複数の活性化可能機能性タンパク質の候補をコードする組換えＤＮＡ構築物のコレクションを導入して、該導入が複製可能な組換え生物学的実体を産生する工程と；
ｂ．該複製可能な組換え生物学的実体を、該活性化可能機能性タンパク質の候補の発現および提示に好適な条件下で培養する工程を含む方法。
（項目６５）
活性化可能機能性タンパク質の候補が、そのカップリングされたペプチドマスクの配列において異なる、項目６４に記載の方法。
（項目６６）
前記機能性タンパク質がインターフェロンまたは可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質である、項目６４に記載の方法。
（項目６７）
ペプチドにカップリングされた活性化可能機能性タンパク質のスクリーニング方法であって、
ａ．候補の活性化可能タンパク質の複数を、該機能性タンパク質を結合することが可能な結合パートナーおよび該活性化可能タンパク質の切断可能なリンカーを切断することが可能な酵素と接触させる工程と；
ｂ．該酵素の存在下で該結合パートナーに結合する該複数のメンバのうちの第１の集団をスクリーニングする工程と；
ｃ．該第１の集団を該結合パートナーと、該酵素の非存在下で接触させる工程と；該第１の集団を消耗させることによって、該第１の集団から、メンバのうちの第２の集団を、該酵素の非存在下で該結合パートナーを結合するメンバについてスクリーニングする工程とを含み；
該方法が該酵素の存在下で結合する結合パートナーと比較して、該酵素の非存在下でその結合パートナーへの結合の低下を呈する活性化可能機能性タンパク質の候補の選択を提供する、方法。
（項目６８）
前記機能性タンパク質がインターフェロンまたは可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質である、項目６７に記載の方法。
（項目６９）
項目２に記載の組成物をコードするベクター。
（項目７０）
前記機能性タンパク質がインターフェロンタンパク質または可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質である、項目６９に記載のベクター。
（項目７１）
マトリプターゼによる切断が可能な基質を含む改変ＩＦＮ−αタンパク質。
（項目７２）
ＨＣＶ−ＮＳ３／４による切断が可能な基質を含む改変ＩＦＮ−αタンパク質。
（項目７３）
マトリクスメタロプロテイナーゼによる切断が可能な基質を含む改変可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質。
（項目７４）
プラスミンによる切断が可能な基質を含む改変可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質。
（項目７５）
レグマインによる切断が可能な基質を含む改変可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質。
（項目７６）
ｕＰＡによる切断が可能な基質を含む改変可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質。
（項目７７）
ＰＳＡによる切断が可能な基質を含む改変可溶性Ｎｏｔｃｈ受容体タンパク質。
（項目７８）
ペプチドマスクおよび切断可能なリンカーにカップリングされた機能性タンパク質を含む、改善された生物学的利用能を有するＣ型肝炎処置のためのタンパク質治療薬であって、該タンパク質治療薬のその標的に対する結合親和性が、非肝臓組織における該タンパク質治療薬のその標的への結合と比較したときに、肝臓組織においてより高く、標的が両方の組織に存在する、タンパク質治療薬。
（項目７９）
前記切断可能なリンカーがマトリプターゼまたはＨＣＶ  ＮＳ３／４酵素に特異的な基質を含む、項目７８に記載のタンパク質治療薬。