【手続補正書】
【提出日】平成26年2月17日(2014.2.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の式のいずれかを含む、単離されたコアポリペプチド:
(a)式I:
X1-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-D-X11-X12-X13-X14-X15-W-X16-Y-X17-A-E-L-L-V-X18-X19-E-N-X20-X21-T-X22-D-X23-X24-D-S-X25-X26-X27-X28-L-X29-X30-X31-X32-X33-X34-Q-L-X35-X36-N-X37(配列番号:3)
（式中、
X1は、親水性アミノ酸であり;
X2は、疎水性アミノ酸であり;
X3は、親水性アミノ酸であり;
X4は、親水性アミノ酸であり;
X5は、疎水性アミノ酸であり;
X6は、N、E又はIであり;
X7は、親水性アミノ酸であり;
X8は、K、Y又はWであり;
X9は、M、V又はTであり;
X10は、親水性残基であり;
X11は、A、G、T又はSであり;
X12は、F、K、又はMであり;
X13は、L、I又はTであり;
X14は、親水性の酸性アミノ酸であり;
X15は、疎水性アミノ酸であり;
X16は、親水性アミノ酸であり;
X18は、疎水性アミノ酸であり;
X19は、疎水性アミノ酸であり;
X20は、親水性アミノ酸であり;
X21は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X22は、疎水性アミノ酸であり;
X23は、疎水性アミノ酸であり;
X24は、H、T又はAであり;
X25は、親水性アミノ酸であり;
X26は、疎水性アミノ酸であり;
X27は、親水性アミノ酸であり;
X28は、親水性アミノ酸であり;
X29は、疎水性アミノ酸であり;
X30は、親水性の酸性アミノ酸であり;
X31は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X32は、T又はVであり;
X33は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X34は、K、L、M、S又はRであり;
X35は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X36は、親水性アミノ酸であり;かつ
X37は、疎水性アミノ酸であり、
かつここで、該単離されたコアポリペプチドは、全長インフルエンザウイルス血球凝集素ではない。）;
(b)式II:
RX1ENLNKKVDDGFX2DIWTYNAELLVLLENERTLDX3HDSNVX4NLYEKVX5SQLKNNA(配列番号:7)
（式中、
X1は、疎水性アミノ酸であり;
X2は、疎水性アミノ酸であり;
X3は、疎水性アミノ酸であり;
X4は、親水性の塩基性アミノ酸であり;かつ
X5は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(c)式III:
RIENLNKKX1EDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDX2HDSNVKNLYEKVRX3QLRX4NA(配列番号:4)
（式中、
X1は、M、V、Tであり;
X2は、疎水性アミノ酸であり;
X3は、L、M、S、K、Rであり;かつ
X4は、親水性アミノ酸である。）;
(d)式IV:
RX1ENLNKKX2X3DGFLDX4WTYNAELLVLX5ENERTLDX6HDSNVKNLYX7KVRX8QLX9X10NX11(配列番号:5)
（式中、
X1は、疎水性アミノ酸であり;
X2は、疎水性アミノ酸であり;
X3は、親水性アミノ酸であり;
X4は、疎水性アミノ酸であり;
X5は、疎水性アミノ酸であり;
X6は、疎水性の酸性アミノ酸であり;
X7は、親水性の酸性アミノ酸であり;
X8は、L、M、又はSであり;
X9は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X10は、親水性アミノ酸であり;かつ
X11は、疎水性アミノ酸である）;
(e)式V:
X1IX2X3X4X5X6X7X8X9DX10X11X12X13X14WSYNAELLVAX15ENQHTIDLX16DSEMNKLX17EX18X19X20RQLRENA(配列番号:6)
（式中、
X1は、親水性アミノ酸であり;
X2は、親水性アミノ酸であり;
X3は、親水性アミノ酸であり;
X4は、疎水性アミノ酸であり;
X5は、E又はIであり;
X6は、親水性アミノ酸であり;
X7は、疎水性アミノ酸であり;
X8は、V又はTであり;
X9は、親水性アミノ酸であり;
X10は、親水性アミノ酸であり;
X11は、K又はMであり;
X12は、I又はTであり;
X13は、親水性の酸性アミノ酸であり;
X14は、疎水性アミノ酸であり;
X15は、疎水性アミノ酸であり;
X16は、T又はAであり;
X17は、疎水性アミノ酸であり;
X18は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X19は、T又はVであり;かつ
X20は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(f)式VI:
RLENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVKNLYXKVRMQLRDNV(配列番号:12)
（式中、Xは、親水性の酸性アミノ酸である。）;
(g)式VII:
RIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFEX1TX2X3QLRENA(配列番号:15)
（式中、X1、X2、及びX3は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(h)式VIII:
RIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDVTDSEMNKLFERVRX1QLRENA(配列番号:19)
（式中、X1は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(i)式IX:
RIENLNKKMEDGFLDVWTYNAELLVLMENERTLDFHDSNVKNLYDKVRLQLRDNA(配列番号:22);
(j)式X:
RIX1NX2NKRMEDGFLDVWTYNAELLVLLENX3RTLDX4HDANVKX5LX6EKVKSX7LX8DNA(配列番号:23)
（式中、
X1は、G又はDであり;
X2は、疎水性アミノ酸であり;
X3は、親水性アミノ酸であり;
X4は、疎水性アミノ酸であり;
X5は、親水性アミノ酸であり;
X6は、H又はYであり;
X7は、Q又はLであり;かつ
X8は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(k)式XI:
QIGNVINWTRDX1MTEX2WSYNAELLVAMENQHTIDLADSEMX3KLYERVX4KQLRENA(配列番号:30)
（式中、
X1は、疎水性アミノ酸又は親水性アミノ酸であり;
X2は、疎水性アミノ酸であり;
X3は、親水性アミノ酸であり;かつ
X4は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(l)式XII:
RINMINDKIDDQIEX1LWAYNAELLVLLENQKTLDEHDSNVKNLFDEVKRRLSANA(配列番号:36)
（式中、X1は、親水性アミノ酸である。）;
(m)式XIII:
RLNMINNKIDDQIQDX1WAYNAELLVLLENQKTLDEHDANVNNLYNKVKRALGSNA(配列番号:39)
（式中、X1は、疎水性アミノ酸である。）;
(n)式XIV:
QIGNVINWTKDSITDIWTYX1AELLVAMENQHTIDMADSEMLNLYERVRKQLRQNA(配列番号:42)
（式中、X1は、親水性アミノ酸である。）;
(o)式XV:
RINQLSKHVDDSVX1DIWSYNAQLLVLLENEKTLDLHDSNVRNLHEKVRRMLKDNA(配列番号:45)
（式中、X1は、疎水性アミノ酸である。）;
(p)式XVI:
RINMINSKIDDQITDIWAYNAELLVLLENQKTLDEHDANVRNLHDRVRRX1LX2ENA(配列番号:48)
（式中、X1は、疎水性アミノ酸であり、かつX2は、親水性の塩基性アミノ酸である。）;
(q)式XVII:
RINMLADRIDDAVTDX1WSYNAKLLVLLENDKTLDMHDANVRNLHX2QVRRX3LKX4NA(配列番号:51)
（式中、
X1は、疎水性アミノ酸であり;
X2は、親水性の酸性アミノ酸であり;
X3は、A、S又はEであり;かつ
X4は、親水性アミノ酸である。）;
(r)式XVIII:
RIQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDVTDSEMNKLFERVRRQLRENA(配列番号:55);
(s)式XIX:
QIGNVINWTRDSLTEIWSYNAELLVAMENQHTIDLADSEMNKLYERVRRQLRENA(配列番号:56);又は
(t)式XX:
RINMLADRVDDAVTDIWSYNAKLLVLX1ENDRTLDLHDANVX2NLHX3QVKRALKX4NA(配列番号:57)
（式中、
X1は、疎水性アミノ酸であり;
X2は、親水性の塩基性アミノ酸であり;
X3は、親水性の酸性アミノ酸であり;かつ
X4は、親水性アミノ酸である。）。
【請求項２】
(a)前記ポリペプチドが式Iを有し、かつ
X1が、R又はQであり;
X2が、L、M又はIであり;
X3が、E、D、Q又はGであり;
X4が、D又はNであり;
X5が、L、M又はVであり;
X6が、N、E又はIであり;
X7が、K又はNであり;
X8が、K、R、Y又はWであり;
X9が、M、V又はTであり;
X10が、E、D、K又はRであり;
X11が、A、G、T又はSであり;
X12が、F、K、I、L又はMであり;
X13が、L、I又はTであり;
X14が、D又はEであり;
X15が、V、I又はLであり;
X16が、S又はTであり;
X17が、Q又はNであり;
X18が、A又はLであり;
X19が、L又はMであり;
X20が、E又はQであり;
X21が、R又はHであり;
X22が、L又はIであり;
X23が、F、V、M、Y又はLであり;
X24が、H、T又はAであり;
X25が、N又はEであり;
X26が、V又はMであり;
X27が、K、N、S又はRであり;
X28が、K、S、又はNであり;
X29が、Y又はFであり;
X30が、D又はEであり;
X31が、K又はRであり;
X32が、T又はVであり;
X33が、K又はRであり;
X34が、K、L、M、S又はRであり;
X35が、K又はRであり;
X36が、D、N、Q又はEであり;かつ
X37が、A又はVであり、
かつここで、前記単離されたコアポリペプチドが、全長インフルエンザウイルス血球凝集素ではないか;
(b)前記ポリペプチドが式IIIを有し、かつ
X1が、M、V、Tであり;
X2が、F、Y又はLであり;
X3が、L、M、S、K、Rであり;かつ
X4が、D、N又はEであるか;
(c)前記ポリペプチドが式IVを有し、かつ
X1が、L又はIであり;X2が、M又はVであり;X3が、E又はDであり;X4が、V又はIであり;X5が、M又はLであり;X6が、F又はYであり;X7が、D又はEであり;X8が、L、M又はSであり;X9が、R又はKであり;X10が、D又はNであり、かつX11が、A又はVであるか;
(d)前記ポリペプチドが式IVを有し、かつ
X1が、R又はQであり;X2が、Q又はGであり;X3が、D又はNであり;X4が、L又はVであり;X5が、E又はIであり;X6が、K又はNであり;X7が、Y又はWであり;X8が、V又はTであり;X9が、E又はRであり;X10が、T又はSであり;X11が、K又はMであり;X12が、I又はTであり;X13が、D又はEであり;X14が、L又はVであり;X15が、L又はMであり;X16が、T又はAであり;X17が、F又はYであり;X18が、K又はRであり;X19が、T又はVであり、かつX20が、K又はRであるか;
(e)前記ポリペプチドが式IIを有し、かつ
X1が、M又はIであり;X2が、L又はIであり;X3が、F又はYであり;X4が、K又はRであり;かつX5が、K又はRであるか;
(f)前記ポリペプチドが式VIを有し、かつXが、D又はEであるか;
(g)前記ポリペプチドが式VIIを有し、かつX1が、K又はRであり;X2が、K又はRであり、かつX3が、K又はRであるか;
(h)前記ポリペプチドが式VIIIを有し、かつX1が、R又はHであるか;
(i)前記ポリペプチドが式Xを有し、かつX1が、G又はDであり;X2が、L又はMであり;X3が、E又はGであり;X4が、L又はMであり;X5が、N又はSであり;X6が、H又はYであり;X7が、Q又はLであり、かつX8が、R又はKであるか;
(j)前記ポリペプチドが式XIを有し、かつX1が、A又はSであり;X2が、V又はIであり;X3が、N又はSであり;かつX4が、K又はRであるか;
(k)前記ポリペプチドが式XIIを有し、かつX1が、D又はNであるか;
(l)前記ポリペプチドが式XIIIを有し、かつX1が、V又はIであるか;
(m)前記ポリペプチドが式XIVを有し、かつX1が、Q又はNであるか;
(n)前記ポリペプチドが式XVを有し、かつX1が、V又はIであるか;
(o)前記ポリペプチドが式XVIを有し、かつX1が、V又はIであり、かつX2が、R又はKであるか;
(p)前記ポリペプチドが式XVIIを有し、かつX1が、V又はIであり;X2が、D又はEであり;X3が、A、S又はEであり、かつX4が、T又はDであるか;又は
(q)前記ポリペプチドが式XXを有し、かつX1が、L又はIであり;X2が、K又はRであり;X3が、D又はEであり、かつX4が、S又はNである、
請求項1記載の単離されたコアポリペプチド。
【請求項３】
配列番号:8、配列番号:9、配列番号:10又は配列番号:11のアミノ酸配列を有する、請求項1記載の単離されたコアポリペプチド。
【請求項４】
配列番号:1、配列番号:2、配列番号:13、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:17、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:21、配列番号:25、配列番号:26、配列番号:27、配列番号:28、配列番号:29、配列番号:30、配列番号:31、配列番号:32、配列番号:33、配列番号:34、配列番号:35、配列番号:37、配列番号:38、配列番号:40、配列番号:41、配列番号:43、配列番号:44、配列番号:46、配列番号:47、配列番号:49、配列番号:50、配列番号:52、配列番号:53、配列番号:54、配列番号:58、配列番号:59、又は配列番号:60のアミノ酸配列を有する、請求項1記載の単離されたコアポリペプチド。
【請求項５】
式:X-L-X-L-Xを含むfluポリペプチドであって、Xは、請求項1〜4のいずれか一項記載のコアポリペプチドのいずれか1つ又はその断片であり;かつ、Lはリンカーであるか又は存在せず;かつ、任意に、(a)前記コアポリペプチドが同じであるか;(b)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端又はC末端でHis-タグに連結され、かつそのC末端でT4フォルドンドメイン又はその断片に連結されているか;又は、(c)前記fluポリペプチドが、そのC末端で、配列DYKDDDDKC（配列番号:64）を有するポリペプチドに連結されている、前記fluポリペプチド。
【請求項６】
請求項1〜4のいずれか一項記載のコアポリペプチドのいずれか1つを含む、fluポリペプチドであって、(a)前記fluポリペプチドが、そのN末端でアセチル化されているか;(b)前記fluポリペプチドが、そのN末端及び/又はC末端でポリエチレングリコールに連結されているか;(c)前記コアポリペプチドが、そのN末端及び/又はC末端で1以上のタンパク質タグに直接的又は間接的に連結されている（好ましくは、該タンパク質タグは、His-タグ又はFLAG-タグである。）か;(d)前記コアポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端及び/又はC末端でT細胞エピトープ、好ましくは、CD8T細胞エピトープに連結されている（好ましくは、該CD8T細胞エピトープは、A型インフルエンザ核タンパク質(NP)もしくはマトリックス1(M1)タンパク質、又はそれらの断片である。）か;(e)前記コアポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端及び/又はC末端でToll様受容体リガンドに連結されている（好ましくは、該Toll様受容体リガンドは、サルモネラ菌のフラジェリンである。）か;又は、(f)前記単離されたコアポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端及び/又はC末端でT4フォルドンドメイン又はその断片に連結されている、前記fluポリペプチド。
【請求項７】
(a)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端又はC末端で1以上のタンパク質タグに連結されているか;(b)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端又はC末端でCD8T細胞エピトープに連結されている（好ましくは、該CD8T細胞エピトープは、A型インフルエンザ核タンパク質(NP)もしくはマトリックス1(M1)タンパク質、又はそれらの断片である。）か;(c)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端又はC末端でToll様受容体リガンドに連結されているか;(d)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端でHis-タグに連結され、そのC末端でFLAG-タグに連結されており、かつLがグリシン残基であるか;(e)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端でHis-タグに連結され、かつそのC末端でサルモネラ菌のフラジェリンに連結されているか;又は、(f)前記fluポリペプチドが、直接的又は間接的に、そのN末端でHis-タグに連結され、かつそのC末端でA型インフルエンザ核タンパク質(NP)又はその断片に連結されている、請求項4(a)記載のfluポリペプチド。
【請求項８】
インフルエンザ血球凝集素に結合することができる中和抗血清に選択的に結合する、請求項1〜4のいずれか一項記載の単離されたコアポリペプチド。
【請求項９】
キャリアタンパク質に連結された請求項1〜4のいずれか一項記載のポリペプチドを含む、組成物。
【請求項１０】
請求項1〜8のいずれか一項記載のポリペプチドをコードする、単離された核酸。
【請求項１１】
請求項10記載の核酸を発現する、単離された細胞。
【請求項１２】
請求項11記載の核酸を含む単離されたウイルスであって、任意に、請求項11記載の核酸を含む、A型インフルエンザウイルス、B型インフルエンザウイルス、ニューカッスル病ウイルス(NDV)、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス(AAV)、又はレトロウイルスである、前記単離されたウイルス。
【請求項１３】
請求項1〜4のいずれか一項記載のポリペプチドを含む、ウイルス様粒子。
【請求項１４】
請求項1〜8のいずれか一項記載のポリペプチド、請求項12記載のウイルス、又は、請求項13記載のウイルス様粒子を含む、免疫原性組成物。
【請求項１５】
対象を免疫するための、対象のインフルエンザウイルス疾患を予防するための、又は、対象のインフルエンザウイルス感染又はインフルエンザウイルス疾患を治療するための、請求項14記載の免疫原性組成物。
【請求項１６】
対象を免疫するための、対象のインフルエンザ疾患を予防するための、又は、対象のインフルエンザウイルス感染又はインフルエンザウイルス疾患を治療するための免疫原性組成物であって、請求項12記載のウイルスを含む、前記免疫原性組成物。
【請求項１７】
前記対象がヒトである、請求項15又は16記載の免疫原性組成物。