【手続補正書】
【提出日】平成26年4月10日(2014.4.10)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
微生物バイオフィルムから、バイオフィルムが増殖した培地から、または患者から採取され、次いでバイオフィルムとして増殖させた生物学的サンプルから単離された抽出物を含む、単離された生物学的に活性な組成物であって、該抽出物が、プランクトン様の非バイオフィルム状態で増殖した前記微生物から同一または実質的に同一の抽出工程により得られた抽出物と比べて、微生物活性を調節する能力および／または免疫応答を調節する能力が向上している、組成物。
【請求項２】
前記組成物が、該組成物が投与される微生物叢を調節する能力を有する、請求項1記載の組成物。
【請求項３】
抽出物が、バイオフィルム状態の微生物によって発現されるがプランクトン様の非バイオフィルム状態の微生物によっては発現されない遺伝子の遺伝子産物を含む、請求項1記載の組成物。
【請求項４】
抽出物が物理的または化学的処理によって獲得され得る、請求項1記載の組成物。
【請求項５】
抽出物が泡を用いた処理によって獲得され得る、請求項4記載の組成物。
【請求項６】
抽出物が無細胞である、請求項1記載の組成物。
【請求項７】
生物系界面活性剤を含む、請求項1記載の組成物。
【請求項８】
微生物活性を調節する能力の向上が抗バイオフィルム効果である、請求項1記載の組成物。
【請求項９】
前記能力の向上が、付着阻害；増殖阻害；バイオフィルムマトリックス破壊；細胞外因子の分泌および／または放出を予防、阻害、および／または破壊すること；ならびに、クオラムセンシング機構を予防、阻害、および／または破壊することからなる群より選択される1つまたは複数の活性を含む、請求項8記載の組成物。
【請求項１０】
微生物活性を調節する能力の向上が、バイオフィルム促進活性であり、かつ付着促進；増殖促進；バイオフィルムマトリックスの安定化または凝集；細胞外因子の分泌および／または放出を促進、上方制御、または安定化すること；ならびに、クオラムセンシング機構を促進、上方制御、または安定化することからなる群より選択される1つまたは複数の活性を含む、請求項1記載の組成物。
【請求項１１】
バイオフィルムがプロバイオティクス生物に由来する、請求項1記載の組成物。
【請求項１２】
動物に投与された場合に、免疫システム応答を調節する、請求項1記載の組成物。
【請求項１３】
請求項1記載の単離された生物学的に活性な組成物および任意の許容可能な担体を含む、動物への投与のために調製された化粧用または薬学的組成物。
【請求項１４】
プロバイオティクス、抗生物質、生物系界面活性剤、植物抽出物、ビタミン、プレバイオティクス、および蜜蜂製品からなる群より選択される1種類または複数種類の成分をさらに含む、請求項13記載の組成物。
【請求項１５】
化粧用組成物であって、担体が化粧用途に適している、請求項13記載の組成物。
【請求項１６】
薬学的組成物であって、担体が薬学的用途に適している、請求項13記載の組成物。
【請求項１７】
局所投与のために調製された、請求項13記載の組成物。
【請求項１８】
眼球、眼球周囲、副鼻腔、鼻、歯周、口腔咽頭、耳、角質化したおよび角質化していない皮膚表面、下気道、胃腸、ならびに泌尿生殖器からなる群より選択される1つまたは複数の位置への投与のために調製された、請求項17記載の組成物。
【請求項１９】
内視鏡、舌下点滴器、針もしくはシリンジ技術、直接的もしくは間接的送達、洗浄、罹患部位への直接的もしくは間接的適用、カテーテル向けの適用、または血管内注入によって投与されるために調製された、請求項13記載の組成物。
【請求項２０】
請求項1記載の単離された生物学的に活性な組成物および任意の許容可能な担体を含む、無生物表面への適用のために調製された組成物。
【請求項２１】
微生物叢、バイオフィルム、ならびに／または微生物叢および／もしくはバイオフィルムの周辺を、請求項1記載の組成物に曝露することを含む、微生物叢を操作するための方法。
【請求項２２】
ヒト微生物叢を操作するために用いられる、請求項21記載の方法。
【請求項２３】
生物学的に活性な組成物が、操作されるのと同じ微生物叢から得られたバイオフィルムから単離される、請求項21記載の方法。
【請求項２４】
動物における病的状態を治療するために用いられる、請求項21記載の方法。
【請求項２５】
前記動物がヒトである、請求項24記載の方法。
【請求項２６】
前記状態が急性または慢性の炎症である、請求項24記載の方法。
【請求項２７】
前記状態が、ドライアイおよび他の慢性もしくは急性の眼球の状態；慢性もしくは急性の鼻副鼻腔炎；慢性もしくは急性の鼻炎；慢性もしくは急性の歯周炎；慢性もしくは急性の気管支炎、嚢胞性線維症、および呼吸器炎症の他の状態；急性および慢性の耳炎および外耳炎を含む炎症性の耳の状態；炎症性の皮膚の状態；胃炎および胃食道逆流を含む炎症性の腸の状態；炎症性の泌尿生殖器の状態；ならびに、炎症性の心血管系の状態からなる群より選択される、請求項24記載の方法。
【請求項２８】
前記病的状態が、内視鏡、舌下点滴器、針もしくはシリンジ技術、直接的もしくは間接的送達、洗浄、罹患部位への直接的もしくは間接的適用、カテーテル向けの適用、または血管内注入を介した投与によって治療される、請求項24記載の方法。
【請求項２９】
無生物表面上における、バイオフィルムの付着阻害；増殖阻害；バイオフィルムマトリックス破壊；細胞外因子の分泌および／または放出を予防、阻害、および／または破壊すること；ならびに、クオラムセンシング機構を予防、阻害、および／または破壊することに影響を及ぼすために用いられる、請求項21記載の方法。
【請求項３０】
そのような調節を必要としている動物に、有効量の請求項1記載の組成物を投与することを含む、動物における免疫応答を調節するための方法。
【請求項３１】
前記動物がヒトである、請求項30記載の方法。
【請求項３２】
1つまたは複数の抽出物画分を作製するために、バイオフィルムまたはバイオフィルムが増殖している培地を物理的または化学的に処理する工程；
生物学的活性を同定するために、該画分を試験する工程；ならびに、
該画分が生物学的活性を有することが見出された場合にそれを選択する工程
を含む、生物学的に活性な組成物を同定するための方法。
【請求項３３】
バイオフィルムがプロバイオティクスバイオフィルムである、請求項32記載の方法。
【請求項３４】
バイオフィルムまたは培地が患者から獲得される、請求項32記載の方法。
【請求項３５】
バイオフィルムまたはそれが増殖している培地が、泡、溶解剤、および／またはpH調整剤を用いて処理される、請求項32記載の方法。
【請求項３６】
請求項32記載の方法によって選択される、画分。
【請求項３７】
選択された前記画分において1種類または複数種類の単離された化合物を同定することをさらに含み、該化合物が生物学的に活性である、請求項32記載の方法。
【請求項３８】
請求項37記載の方法によって同定される、化合物。
【請求項３９】
請求項38記載の化合物、ならびに任意の化粧用および／または薬学的担体を含む、組成物。
【請求項４０】
請求項1記載の組成物を含む、吸入デバイス。
【請求項４１】
前記組成物が、生物系界面活性剤を含むように調製されている、請求項40記載の吸引デバイス。
【請求項４２】
活性が、プランクトン様状態の微生物からの抽出物よりも毒性の少ないバイオフィルムからの抽出物によって向上する、請求項1記載の組成物。
【請求項４３】
免疫応答活性の向上が抗炎症活性である、請求項1記載の組成物。
【請求項４４】
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（methicillin resistant Staphylococcus aureus）（（MRSA）、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）、表皮ブドウ球菌（S. epidermidis）、緑膿菌（Pseudomonas aeruginosa）、シュードモナス菌（Pseudomonas）、インフルエンザ菌（Haemophilus influenza）、コリネバクテリウム属（Corynebacterium）、カンジダ菌（Candida）、およびアスペルギルス菌（Aspergillus）からなる群より選択される微生物に対する抗微生物活性を有する、請求項1記載の組成物。
【請求項４５】
バイオフィルムを形成する微生物が、アエロコッカス属（Aerococcus）、大腸菌（E.coli）、バシラス属（Bacillus）、エンテロコッカス属（Enterococcus）、フソバクテリウム属（Fusobacterium）、ラクトコッカス属（Lactococcus）、リューコノストック属（Leuconostoc）、メリソコッカス属（Melissacoccus）、ミクロコッカス属（Micrococcus）、オエノコッカス属（Oenococcus）、スポロラクトバチルス属（Sporolactobacillus）、レンサ球菌（Streptococcus）、ブドウ球菌（Staphylococcus）、サッカロミセス属（Saccharomyces）、ペディオコッカス属（Pediococcus）、ペプトストレプトコッカス属（Peptostreptococcus）、プロピオニバクテリウム属（Proprionebacterium）、およびワイセラ属（Weissella）からなる群より選択される、請求項1記載の組成物。
【請求項４６】
微生物叢の調節および／または免疫応答の調節における使用のための、微生物バイオフィルムから、バイオフィルムが増殖した培地から、または患者から採取され、次いでバイオフィルムとして増殖させた生物学的サンプルから単離された生物学的に活性な組成物。
【請求項４７】
微生物叢の調節が、付着阻害；増殖阻害；バイオフィルムマトリックス破壊；細胞外因子の分泌および／または放出を予防、阻害、および／または破壊すること；ならびに、クオラムセンシング機構を予防、阻害、および／または破壊することからなる群より選択される1つまたは複数の活性を含む、請求項46記載の使用のための組成物。
【請求項４８】
微生物叢の調節が、バイオフィルム促進活性の調節を含み、かつ付着促進；増殖促進；バイオフィルムマトリックスの安定化または凝集；細胞外因子の分泌および／または放出を促進、上方制御、または安定化すること；ならびに、クオラムセンシング機構を促進、上方制御、または安定化することからなる群より選択される1つまたは複数の活性を含む、請求項46記載の使用のための組成物。
【請求項４９】
バイオフィルムがプロバイオティクス生物に由来する、請求項46記載の使用のための組成物。
【請求項５０】
動物に投与された場合に、免疫システム応答を調節する、請求項46記載の使用のための組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００５０
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００５０】
ドライアイの治療にとどまらず、本発明の組成物は、病原性バイオフィルムの予防および／もしくは破壊のために、ならびに／または慢性鼻副鼻腔炎；慢性歯周炎；慢性気管支炎、ならびにアスペルギルス症、嚢胞性線維症、および喘息を含む呼吸器炎症の他の状態；「スイマー耳」、外耳炎、および慢性耳炎などの炎症性の耳の状態；ならびにアトピー性皮膚炎および湿疹などの炎症性の皮膚の状態などの様々な他の慢性炎症状態に存在する、それらと関連している、またはそれらにつながる慢性感染症のために用いることができる。これらの状態の病態生理は、病原性種および病原性バイオフィルム形成による正常な片利共生的細菌集団の破壊を伴う可能性がある。本発明は、これらの状態および根底にある炎症状態と関連した症状を改善する。
[本発明1001]
バイオフィルムからの、バイオフィルムが増殖した培地からの、または患者から抽出し、次いでバイオフィルムとして増殖させた生物学的サンプルからの、単離された生物学的に活性な組成物。
[本発明1002]
バイオフィルムからの、バイオフィルムが増殖した培地からの、または患者から抽出し、次いでバイオフィルムとして増殖させた生物学的サンプルからの、単離された生物学的に活性な組成物であって、生物学的活性とは該組成物が投与される微生物叢を調節する能力である、組成物。
[本発明1003]
抽出によって単離される、本発明1001または1002の組成物。
[本発明1004]
抽出物が物理的または化学的処理によって獲得され得る、本発明1003の組成物。
[本発明1005]
抽出物が泡を用いた処理によって獲得され得る、本発明1004の組成物。
[本発明1006]
無細胞である、本発明1001または1002の組成物。
[本発明1007]
生物系界面活性剤を含む、本発明1001または1002の組成物。
[本発明1008]
生物学的活性とはバイオフィルムに影響を及ぼす活性である、本発明1001または1002の組成物。
[本発明1009]
前記活性が、付着阻害；増殖阻害；バイオフィルムマトリックス破壊；細胞外因子の分泌および／または放出を予防、阻害、および／または破壊すること；ならびに、クオラムセンシング機構を予防、阻害、および／または破壊することからなる群より選択される1つまたは複数の活性を含む、本発明1008の組成物。
[本発明1010]
前記活性が、付着促進；増殖促進；バイオフィルムマトリックスの安定化または凝集；細胞外因子の分泌および／または放出を促進、上方制御、または安定化すること；ならびに、クオラムセンシング機構を促進、上方制御、または安定化することからなる群より選択される1つまたは複数の活性を含む、本発明1008の組成物。
[本発明1011]
バイオフィルムがプロバイオティクス生物に由来する、本発明1001または1002の組成物。
[本発明1012]
動物に投与された場合に、免疫システムおよび／または炎症応答を調節する、本発明1001または1002の組成物。
[本発明1013]
本発明1001または1002の単離された生物学的に活性な組成物および任意の許容可能な担体を含む、動物への投与のために調製された化粧用または薬学的組成物。
[本発明1014]
プロバイオティクス、抗生物質、生物系界面活性剤、植物抽出物、ビタミン、プレバイオティクス、および蜜蜂製品からなる群より選択される1種類または複数種類の成分をさらに含む、本発明1013の組成物。
[本発明1015]
化粧用組成物であって、担体が化粧用途に適している、本発明1013の組成物。
[本発明1016]
薬学的組成物であって、担体が薬学的用途に適している、本発明1013の組成物。
[本発明1017]
局所投与のために調製された、本発明1013の組成物。
[本発明1018]
眼球、眼球周囲、副鼻腔、鼻、歯周、口腔咽頭、耳、角質化したおよび角質化していない皮膚表面、下気道、胃腸、ならびに泌尿生殖器からなる群より選択される位置への投与のために調製された、本発明1017の組成物。
[本発明1019]
内視鏡、舌下点滴器、針もしくはシリンジ技術、直接的もしくは間接的送達、洗浄、罹患部位への直接的もしくは間接的適用、カテーテル向けの適用、または血管内注入によって投与されるために調製された、本発明1013の組成物。
[本発明1020]
本発明1001または1002の単離された生物学的に活性な組成物および任意の許容可能な担体を含む、無生物表面への適用のために調製された組成物。
[本発明1021]
微生物叢、バイオフィルム、ならびに／または微生物叢および／もしくはバイオフィルムの周辺を、本発明1001または1002の組成物に曝露することを含む、微生物叢を操作するための方法。
[本発明1022]
ヒト微生物叢を操作するために用いられる、本発明1021の方法。
[本発明1023]
生物学的に活性な組成物が、操作されるのと同じ微生物叢から得られたバイオフィルムから単離される、本発明1021の方法。
[本発明1024]
動物における病的状態を治療するために用いられる、本発明1021の方法。
[本発明1025]
前記動物がヒトである、本発明1024の方法。
[本発明1026]
前記状態が急性または慢性の炎症である、本発明1024の方法。
[本発明1027]
前記状態が、ドライアイおよび他の慢性もしくは急性の眼球の状態；慢性もしくは急性の鼻副鼻腔炎；慢性もしくは急性の鼻炎；慢性もしくは急性の歯周炎；慢性もしくは急性の気管支炎、嚢胞性線維症、および呼吸器炎症の他の状態；急性および慢性の耳炎および外耳炎を含む炎症性の耳の状態；炎症性の皮膚の状態；胃炎および胃食道逆流を含む炎症性の腸の状態；炎症性の泌尿生殖器の状態；ならびに、炎症性の心血管系の状態からなる群より選択される、本発明1024の方法。
[本発明1028]
前記病的状態が、内視鏡、舌下点滴器、針もしくはシリンジ技術、直接的もしくは間接的送達、洗浄、罹患部位への直接的もしくは間接的適用、カテーテル向けの適用、または血管内注入を介した投与によって治療される、本発明1024の方法。
[本発明1029]
無生物表面上における、バイオフィルムの付着阻害；増殖阻害；バイオフィルムマトリックス破壊；細胞外因子の分泌および／または放出を予防、阻害、および／または破壊すること；ならびに、クオラムセンシング機構を予防、阻害、および／または破壊することに影響を及ぼすために用いられる、本発明1021の方法。
[本発明1030]
そのような調節を必要としている動物に、有効量の本発明1001または1002の組成物を投与することを含む、動物における免疫システムおよび／または炎症応答を調節するための方法。
[本発明1031]
前記動物がヒトである、本発明1030の方法。
[本発明1032]
バイオフィルムを増殖させる工程；
1つまたは複数の抽出物画分を作製するために、バイオフィルムまたはバイオフィルムが増殖している培地を物理的または化学的に処理する工程；
生物学的活性を同定するために、該画分を試験する工程；ならびに、
該画分が生物学的活性を有することが見出された場合にそれを選択する工程
を含む、生物学的に活性な組成物を同定するための方法。
[本発明1033]
バイオフィルムがプロバイオティクスバイオフィルムである、本発明1032の方法。
[本発明1034]
バイオフィルムまたは培地が患者から獲得される、本発明1032の方法。
[本発明1035]
バイオフィルムまたはそれが増殖している培地が、泡、溶解剤、および／またはpH調整剤を用いて処理される、本発明1032の方法。
[本発明1036]
本発明1032の方法によって選択される、画分。
[本発明1037]
選択された前記画分において1種類または複数種類の単離された化合物を同定することをさらに含み、該化合物が生物学的に活性である、本発明1032の方法。
[本発明1038]
本発明1037の方法によって同定される、化合物。
[本発明1039]
本発明1038の化合物、ならびに任意の化粧用および／または薬学的担体を含む、組成物。
[本発明1040]
本発明1001または1002の組成物を含む、吸入デバイス。
[本発明1041]
前記組成物が、生物系界面活性剤を含むように調製されている、本発明1040の吸引デバイス。