(57)【要約】【課題】高精度で予知確率の高い心筋梗塞のリスクを診断する手段を提供する。【解決手段】以下の工程を含んでなる方法により心筋梗塞のリスク診断を行う。（ｉ）心筋梗塞との関連が認められた１０個の遺伝子多型、又は５個の遺伝子多型から二つ以上の多型を解析する工程、（ｉｉ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び（ｉｉｉ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。【選択図】　　図１０
2004024036.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の工程（ａ）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ａ）核酸試料における、以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型。
【請求項２】
以下の工程（ｂ）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ｂ）核酸試料における、以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型。
【請求項３】
以下の工程（ｃ）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ｃ）核酸試料における、アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析する工程。
【請求項４】
以下の工程（ｉ）〜（ｉｉｉ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ｉ）核酸試料における、以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型、
（ｉｉ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ｉｉｉ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
【請求項５】
以下の工程（ｉｖ）〜（ｖｉ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ｉｖ）核酸試料における、以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型、
（ｖ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ｖｉ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
【請求項６】
以下の工程（ｖｉｉ）〜（ｉｘ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ｖｉｉ）核酸試料における、アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析する工程、
（ｖｉｉｉ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ｉｘ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
【請求項７】
以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型を解析するための核酸、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型を解析するための核酸、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型を解析するための核酸、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型を解析するための核酸、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型を解析するための核酸、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型を解析するための核酸、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型を解析するための核酸、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型を解析するための核酸、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型を解析するための核酸、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型を解析するための核酸。
【請求項８】
以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型を解析するための核酸、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型を解析するための核酸、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型を解析するための核酸、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型を解析するための核酸、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸。
【請求項９】
アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸、を含んでなる遺伝子型検出用キット。
【請求項１０】
以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸が不溶性支持体に固定されてなる固定化核酸、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型を解析するための核酸、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型を解析するための核酸、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型を解析するための核酸、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型を解析するための核酸、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型を解析するための核酸、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型を解析するための核酸、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型を解析するための核酸、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型を解析するための核酸、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型を解析するための核酸、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型を解析するための核酸。
【請求項１１】
以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸が不溶性支持体に固定されてなる固定化核酸、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型を解析するための核酸、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型を解析するための核酸、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型を解析するための核酸、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型を解析するための核酸、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸。
【請求項１２】
アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸が不溶性支持体に固定されてなる固定化核酸。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
【産業上の利用分野】
本発明は心筋梗塞に関連する遺伝子を利用した検出方法に関する。詳しくは、心筋梗塞に関連する複数の遺伝子の多型を利用した検出方法及び該方法に用いられるキットに関する。本発明は、例えば心筋梗塞のリスク診断に利用できる。
【０００２】
【従来の技術】
心筋梗塞は多因子疾患であり、個人個人の遺伝的背景とさまざまな環境因子の相互作用により発症が規定される（Ｍａｒｅｎｂｅｒｇ　ＭＥ，　Ｒｉｓｃｈ　Ｎ，　Ｂｅｒｋｍａｎ　ＬＦ，　Ｆｌｏｄｅｒｕｓ　Ｂ，　ｄｅ　Ｆａｉｒｅ　Ｕ．　Ｇｅｎｅｔｉｃ　ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ　ｔｏ　ｄｅａｔｈ　ｆｒｏｍ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ　ｉｎ　ａ　ｓｔｕｄｙ　ｏｆ　ｔｗｉｎｓ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９４；３３０：１０４１−１０４６．、Ｎｏｒａ　ＪＪ，　Ｌｏｒｔｓｃｈｅｒ　ＲＨ，　Ｓｐａｎｇｌｅｒ　ＲＤ，　Ｎｏｒａ　ＡＨ，　Ｋｉｍｂｅｒｌｉｎｇ　ＷＪ．　Ｇｅｎｅｔｉｃ−ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｉｃ　ｓｔｕｄｙ　ｏｆ　ｅａｒｌｙ−ｏｎｓｅｔ　ｉｓｃｈｅｍｉｃ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ．　Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ　１９８０；６１：５０３−５０８．）。一般的に心筋梗塞の発症率は高血圧・糖尿病・高脂血症などの従来の危険因子の数に比例して高くなる（Ｎｏｒａ　ＪＪ，　Ｌｏｒｔｓｃｈｅｒ　ＲＨ，　Ｓｐａｎｇｌｅｒ　ＲＤ，　Ｎｏｒａ　ＡＨ，Ｋｉｍｂｅｒｌｉｎｇ　ＷＪ．　Ｇｅｎｅｔｉｃ−ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｉｃ　ｓｔｕｄｙ　ｏｆ　ｅａｒｌｙ−ｏｎｓｅｔ　ｉｓｃｈｅｍｉｃ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ．　Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ　１９８０；６１：５０３−５０８．）。これらの危険因子自体も一部は遺伝的要因により制御されているが、家族歴が独立した心筋梗塞の予知因子であることから、従来の危険因子以外にも心筋梗塞感受性因子が存在することが示唆されている（Ｍａｒｅｎｂｅｒｇ　ＭＥ，　Ｒｉｓｃｈ　Ｎ，　Ｂｅｒｋｍａｎ　ＬＦ，　Ｆｌｏｄｅｒｕｓ　Ｂ，　ｄｅ　Ｆａｉｒｅ　Ｕ．　Ｇｅｎｅｔｉｃ　ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ　ｔｏ　ｄｅａｔｈ　ｆｒｏｍ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ　ｉｎ　ａ　ｓｔｕｄｙ　ｏｆｔｗｉｎｓ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９４；３３０：１０４１−１０４６．）。さらに、従来の危険因子を全く持たなくても心筋梗塞を発症する例があることも、遺伝因子との関連を示唆する。
【０００３】
心筋梗塞は欧米諸国において最も死亡率の高い疾患であり、たとえ致死的ではないにしても、心不全や狭心症・難治性不整脈を合併し患者の生活の質を著しく低下させるため、これを予防することが重要であることは言うまでもない。心筋梗塞を予防するための一つの方法は心筋梗塞感受性遺伝子を同定することである。連鎖解析（Ｂｒｏｅｃｋｅｌ　Ｕ，　Ｈｅｎｇｓｔｅｎｂｅｒｇ　Ｃ，　Ｍａｙｅｒ　Ｂ，　ｅｔ　ａｌ．　Ａ　ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ　ｌｉｎｋａｇｅ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｆｏｒ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ　ａｎｄ　ｉｔｓ　ｒｅｌａｔｅｄ　ｒｉｓｋ　ｆａｃｔｏｒｓ．Ｎａｔｕｒｅ　ｇｅｎｅｔ　２００２；３０：２１０−２１４．）および候補遺伝子による関連解析（Ｃａｍｂｉｅｎ　Ｆ，　Ｐｏｉｒｉｅｒ　Ｏ，　Ｌｅｃｅｒｆ　Ｌ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｄｅｌｅｔｉｏｎ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｇｅｎｅ　ｆｏｒ　ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ−ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ　ｅｎｚｙｍｅ　ｉｓ　ａ　ｐｏｔｅｎｔ　ｒｉｓｋ　ｆａｃｔｏｒ　ｆｏｒ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ．　Ｎａｔｕｒｅ　１９９２；３５９：６４１−６４４．、Ｗｅｉｓｓ　ＥＪ，　Ｂｒａｙ　ＰＦ，　Ｔａｙｂａｃｋ　Ｍ，　ｅｔ　ａｌ．　Ａ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｏｆ　ａ　ｐｌａｔｅｌｅｔ　ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ　ｒｅｃｅｐｔｏｒ　ａｓ　ａｎ　ｉｎｈｅｒｉｔｅｄ　ｒｉｓｋ　ｆａｃｔｏｒ　ｆｏｒ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９６；３３４：１０９０−１０９４．、Ｉａｃｏｖｉｅｌｌｏ　Ｌ，　Ｄｉ　Ｃａｓｔｅｌｎｕｏｖｏ　Ａ，　Ｄｅ　Ｋｎｉｊｆｆ　Ｐ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｃｏａｇｕｌａｔｉｏｎ　ｆａｃｔｏｒ　ＶＩＩ　ｇｅｎｅ　ａｎｄ　ｔｈｅ　ｒｉｓｋ　ｏｆ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９８；３３８：７９−８５．、Ｋｕｉｖｅｎｈｏｖｅｎ　ＪＡ，　Ｊｕｋｅｍａ　ＪＷ，　Ｚｗｉｎｄｅｒｍａｎ　ＡＨ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｔｈｅ　ｒｏｌｅ　ｏｆ　ａ　ｃｏｍｍｏｎ　ｖａｒｉａｎｔ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ　ｅｓｔｅｒ　ｔｒａｎｓｆｅｒ　ｐｒｏｔｅｉｎ　ｇｅｎｅ　ｉｎｔｈｅ　ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ　ｏｆ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９８；３３８：８６−９３．）により、心筋梗塞と関連する染色体上の遺伝子座およびいくつかの候補遺伝子群が同定された。今までにゲノム疫学的研究によりアンギオテンシン変換酵素（Ｃａｍｂｉｅｎ　Ｆ，　Ｐｏｉｒｉｅｒ　Ｏ，　Ｌｅｃｅｒｆ　Ｌ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｄｅｌｅｔｉｏｎ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｇｅｎｅ　ｆｏｒ　ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎ−ｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇ　ｅｎｚｙｍｅ　ｉｓ　ａ　ｐｏｔｅｎｔ　ｒｉｓｋ　ｆａｃｔｏｒ　ｆｏｒ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ．　Ｎａｔｕｒｅ　１９９２；３５９：６４１−６４４．）、血小板糖タンパクＩＩＩａ（Ｗｅｉｓｓ　ＥＪ，　Ｂｒａｙ　ＰＦ，　Ｔａｙｂａｃｋ　Ｍ，　ｅｔ　ａｌ．　Ａ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｏｆ　ａ　ｐｌａｔｅｌｅｔ　ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎｒｅｃｅｐｔｏｒ　ａｓ　ａｎ　ｉｎｈｅｒｉｔｅｄ　ｒｉｓｋ　ｆａｃｔｏｒ　ｆｏｒ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９６；３３４：１０９０−１０９４．）、第７血液凝固因子、コレステロールエステル移送タンパク（Ｋｕｉｖｅｎｈｏｖｅｎ　ＪＡ，　Ｊｕｋｅｍａ　ＪＷ，　Ｚｗｉｎｄｅｒｍａｎ　ＡＨ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｔｈｅ　ｒｏｌｅ　ｏｆ　ａ　ｃｏｍｍｏｎ　ｖａｒｉａｎｔ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ　ｅｓｔｅｒ　ｔｒａｎｓｆｅｒ　ｐｒｏｔｅｉｎ　ｇｅｎｅ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ　ｏｆ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ．　Ｎ　Ｅｎｇｌ　Ｊ　Ｍｅｄ　１９９８；３３８：８６−９３．）などの遺伝子多型と心筋梗塞との関連が報告されているが、相反する報告もあり、未だ一定の結論を得るに至っていない。さらに、異なる人種では異なるゲノム多型を有するため、それぞれの人種で多型と心筋梗塞との関連についてのデータベースを構築することが重要である。
【０００４】
【発明が解決しようとする課題】
以上のように、今までに数多くの遺伝子多型と冠動脈疾患あるいは心筋梗塞との関連解析が行われてきた。しかし多くの研究についてはその意義について一定の見解は得られていない。その主な理由は多くの研究における対象集団の大きさが十分でないことと、遺伝子多型のみならず環境因子が人種間で異なっていることに起因する。さらに、たとえ心筋梗塞との関連が認められたとしても、大規模集団における解析では相対危険度（オッズ比）が低いのが一般的である。
本発明は以上の背景に鑑みなされたものであって、その目的は高精度で予知確率の高い心筋梗塞の遺伝的リスクを診断する手段を提供し、心筋梗塞の一次予防に貢献することである。
【０００５】
【課題を解決するための手段】
本発明者らは、以上の目的を達成するために数種類の公的データベースを用いて、冠動脈硬化、冠動脈攣縮、高血圧、糖尿病、高脂血症などとの関連が推定される７１遺伝子を抜粋し、遺伝子の機能変化との関連が予想されるものなどを中心に１１２多型を選択した。続いて、この７１遺伝子１１２多型に関して５０００例を越える大規模関連解析を行った。その結果、心筋梗塞と関連するＳＮＰ（ｓｉｎｇｌｅ　ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）を男性で１０個、女性で５個同定することに成功した。更に、これらの多型を組み合わせて用いることにより、多因子ロジスティック回帰分析のｓｔｅｐｗｉｓｅ　ｆｏｒｗａｒｄ　ｓｅｌｅｃｔｉｏｎにより男性では最大オッズ比１１．２６、女性では最大オッズ比８８．５１を呈することが認められた。この結果から、これらのＳＮＰの中から複数のＳＮＰを選択し、各ＳＮＰを解析した結果を組み合わせて用いれば、信頼性が高く、予知確率の高い心筋梗塞のリスク診断が行えるとの知見が得られた。一方で、女性において心筋梗塞との関連が認められた５個のＳＮＰの中の一つについては、その多型を単独で解析することによっても極めて高いオッズ比が得られるものであった。本発明は以上の知見に基づくものであって、次の構成を提供する。
［１］　以下の工程（ａ）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ａ）核酸試料における、以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型。
［２］　以下の工程（ｂ）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ｂ）核酸試料における、以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型。
［３］　以下の工程（ｃ）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ｃ）核酸試料における、アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析する工程。
［４］　以下の工程（ｉ）〜（ｉｉｉ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ｉ）核酸試料における、以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型、
（ｉｉ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ｉｉｉ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
［５］　以下の工程（ｉｖ）〜（ｖｉ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ｉｖ）核酸試料における、以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型、
（ｖ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ｖｉ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
［６］　以下の工程（ｖｉｉ）〜（ｉｘ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ｖｉｉ）核酸試料における、アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析する工程、
（ｖｉｉｉ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ｉｘ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
［７］　以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型を解析するための核酸、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型を解析するための核酸、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型を解析するための核酸、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型を解析するための核酸、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型を解析するための核酸、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型を解析するための核酸、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型を解析するための核酸、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型を解析するための核酸、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型を解析するための核酸、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型を解析するための核酸。
［８］　以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型を解析するための核酸、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型を解析するための核酸、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型を解析するための核酸、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型を解析するための核酸、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸。
［９］　アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸、を含んでなる遺伝子型検出用キット。
［１０］　以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸が不溶性支持体に固定されてなる固定化核酸、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型を解析するための核酸、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型を解析するための核酸、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型を解析するための核酸、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型を解析するための核酸、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型を解析するための核酸、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型を解析するための核酸、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型を解析するための核酸、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型を解析するための核酸、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型を解析するための核酸、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型を解析するための核酸。
［１１］　以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸が不溶性支持体に固定されてなる固定化核酸、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型を解析するための核酸、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型を解析するための核酸、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型を解析するための核酸、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型を解析するための核酸、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸。
［１２］　アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型を解析するための核酸が不溶性支持体に固定されてなる固定化核酸。
【０００６】
【発明の実施の形態】
本発明の第１の局面は核酸試料の遺伝子型を検出する方法に関し、その一態様は以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程を含むことを特徴とする。また他の態様としては、以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析する工程を含むことを特徴とする。さらに他の態様としては、以下の（１５）の多型を解析する工程を少なくとも含むことを特徴とする。尚、以上の工程の結果得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定することにより心筋梗塞の遺伝的リスクを求めることができる。
（１）コネキシン３７（Ｃｏｎｎｅｘｉｎ　３７）遺伝子の塩基番号１０１９位の多型：１０１９Ｃ→Ｔ（以下、「コネキシン３７（１０１９Ｃ→Ｔ）多型」ともいう）
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子（Ｔｕｍｏｒ　ｎｅｃｒｏｓｉｓ　ｆａｃｔｏｒ−α）の塩基番号−８６３位の多型：−８６３Ｃ→Ａ（以下、「ＴＮＦα（−８６３Ｃ→Ａ）多型」ともいう）
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス（ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨ　ｏｘｉｄａｓｅ　ｐ２２　ｐｈｏｘ）遺伝子の塩基番号２４２位の多型：２４２Ｃ→Ｔ（以下、「ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス（２４２Ｃ→Ｔ）多型」ともいう）、
（４）アンギオテンシノーゲン（Ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎｏｇｅｎ）遺伝子の塩基番号−６位の多型：−６Ｇ→Ａ（以下、「アンギオテンシノーゲン（−６Ｇ→Ａ）多型」ともいう）
（５）アポリポプロテインＥ（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ）遺伝子の塩基番号−２１９位の多型：−２１９Ｇ→Ｔ（以下、「アポＥ−２１９（−２１９Ｇ→Ｔ）多型」ともいう）
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ（Ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ　ｆａｃｔｏｒ　ａｃｅｔｙｌｈｙｄｒｏｌａｓｅ）遺伝子の塩基番号９９４位の多型：９９４Ｇ→Ｔ（以下、「ＰＡＦアセチルヒドロラーゼ（９９４Ｇ→Ｔ）多型」ともいう）
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｃ−ＩＩＩ）遺伝子の塩基番号−４８２位の多型：−４８２Ｃ→Ｔ（以下、「アポＣ−ＩＩＩ（−４８２Ｃ→Ｔ）多型」ともいう）
（８）トロンボスポンジン４（Ｔｈｒｏｍｂｏｓｐｏｎｄｉｎ　４）遺伝子の塩基番号１１８６位の多型：１１８６Ｇ→Ｃ（以下、「ＴＳＰ４（１１８６Ｇ→Ｃ）多型」ともいう）
（９）インターロイキン１０（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ−１０）遺伝子の塩基番号−８１９位の多型：−８１９Ｔ→Ｃ（以下、「ＩＬ−１０（−８１９Ｔ→Ｃ）多型」ともいう）
（１０）インターロイキン１０（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ−１０）遺伝子の塩基番号−５９２位の多型：−５９２Ａ→Ｃ（以下、「ＩＬ−１０（−５９２Ａ→Ｃ）多型」ともいう）
（１１）ストロメライシン１（Ｓｔｒｏｍｅｌｙｓｉｎ−１）遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型：−１１７１／５Ａ→６Ａ（以下、「ストロメライシン１（−１１７１／５Ａ→６Ａ）多型」ともいう）
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１（Ｐｌａｓｍｉｎｏｇｅｎ　ａｃｔｉｖａｔｏｒ　ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ−１）遺伝子の塩基番号−６６８位の多型：−６６８／４Ｇ→５Ｇ（以下、「ＰＡＩ１（−６６８／４Ｇ→５Ｇ）多型」ともいう）
（１３）グリコプロテインＩｂα（Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｉｂα）遺伝子の塩基番号１０１８位の多型：１０１８Ｃ→Ｔ（以下、「グリコプロテインＩｂα（１０１８Ｃ→Ｔ）多型」ともいう）
（１４）パラオキソナーゼ（Ｐａｒａｏｘｏｎａｓｅ）遺伝子の塩基番号５８４位の多型：５８４Ｇ→Ａ（以下、「パラオキソナーゼ（５８４Ｇ→Ａ）多型」ともいう）
（１５）アポリポプロテインＥ（Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ）遺伝子の塩基番号４０７０位の多型：４０７０Ｃ→Ｔ（以下、「アポＥ（４０７０Ｃ→Ｔ）多型」ともいう）
【０００７】
以上において１０１９Ｃ→Ｔのような表記は、当該塩基番号位置の多型が矢印の前又は後の塩基である二つの遺伝子型からなることを意味する。但し、−１１７１／５Ａ→６Ａは塩基番号−１１７１位から３’方向にＡ（アデニン）が連続して５個存在する遺伝子型と６個存在する遺伝子型からなる多型を意味する。同様に、−６６８／４Ｇ→５Ｇは塩基番号−６６８位から３’方向にＧ（グアニン）が連続して４個存在する遺伝子型と５個存在する遺伝子型からなる多型を意味する。
【０００８】
各遺伝子における塩基番号は公共のデータベースであるＧｅｎＢａｎｋ（ＮＣＢＩ）に登録されている公知の配列を基準として表される。尚、配列番号１の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｍ９６７８９：Ｈｏｍｏ　ｓａｐｉｅｎｓ　ｃｏｎｎｅｘｉｎ　３７　（ＧＪＡ４）　ｍＲＮＡ，　ｃｏｍｐｌｅｔｅ　ｃｄｓ）において１０１９番目の塩基がコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基に相当する。同様に配列番号２の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｌ１１６９８：Ｈｏｍｏ　ｓａｐｉｅｎｓ　ｔｕｍｏｒ　ｎｅｃｒｏｓｉｓ　ｆａｃｔｏｒ　ａｌｐｈａ　ｇｅｎｅ，ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｒｅｇｉｏｎ）において１９７番目の塩基が腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基に相当し、配列番号３の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｍ６１１０７：Ｈｏｍｏ　ｓａｐｉｅｎｓ　ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ　ｂ　ｌｉｇｈｔ　ｃｈａｉｎ　（ＣＹＢＡ）　ｇｅｎｅ，　ｅｘｏｎｓ　３　ａｎｄ　４）において６８４番目の塩基がＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基に相当し、配列番号４の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｘ１５３２３：Ｈ．ｓａｐｉｅｎｓ　ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎｏｇｅｎ　ｇｅｎｅ　５’ｒｅｇｉｏｎ　ａｎｄ　ｅｘｏｎ　１）において４６３番目の塩基がアンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基に相当し、配列番号５の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　ＡＦ０５５３４３：Ｈｏｍｏ　ｓａｐｉｅｎｓ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ　（ＡＰＯＥ）　ｇｅｎｅ，　５’　ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ　ｒｅｇｉｏｎ，ｐａｒｔｉａｌ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ）において８０１番目の塩基がアポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基に相当し、配列番号６の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｕ２０１５７：Ｈｕｍａｎ　ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ　ｆａｃｔｏｒ　ａｃｅｔｙｌｈｙｄｒｏｌａｓｅ　ｍＲＮＡ，　ｃｏｍｐｌｅｔｅ　ｃｄｓ）において９９６番目の塩基が血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基に相当し、配列番号７の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｘ１３３６７：Ｈｕｍａｎ　ＤＮＡ　ｆｏｒ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｃ−ＩＩＩ　５’−ｆｌａｎｋ）において９３６番目の塩基がアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基に相当し、配列番号８の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｚ１９５８５：Ｈ．ｓａｐｉｅｎｓ　ｍＲＮＡ　ｆｏｒ　ｔｈｒｏｍｂｏｓｐｏｎｄｉｎ−４）において１１８６番目の塩基がトロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基に相当し、配列番号９の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｚ３０１７５：Ｈ．ｓａｐｉｅｎｓ　ＩＬ−１０　ｇｅｎｅ　ｆｏｒ　ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ　１０　（ｐｒｏｍｏｔｅｒ））において４５５番目の塩基がインターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基に、６８２番目の塩基が−５９２位塩基にそれぞれ相当し、配列番号１０の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｕ４３５１１：Ｈｏｍｏ　ｓａｐｉｅｎｓｓｔｒｏｍｅｌｙｓｉｎ−１　ｇｅｎｅ，　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｒｅｇｉｏｎ）において６９８番目の塩基がストロメライシン１遺伝子���−１１７１位塩基に相当し、配列番号１１の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｘ１３３２３：Ｈｕｍａｎ　ｇｅｎｅ　ｆｏｒ　ｐｌａｓｍｉｎｏｇｅｎ　ａｃｔｉｖａｔｏｒ　ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ　１　（ＰＡＩ−１）　５’−ｆｌａｎｋ　ａｎｄ　ｅｘｏｎ　１）において１３１番目の塩基がプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の−６６８位塩基に相当し、配列番号１２の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．Ｊ０２９４０：Ｈｕｍａｎ　ｐｌａｔｅｌｅｔ　ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｉｂ　ａｌｐｈａ　ｃｈａｉｎ　ｍＲＮＡ，　ｃｏｍｐｌｅｔｅ　ｃｄｓ）において５２４番目の塩基がグリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基に相当し、配列番号１３の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｍ６３０１２：Ｈ．ｓａｐｉｅｎｓ　ｓｅｒｕｍ　ｐａｒａｏｘｏｎａｓｅ　（ＰＯＮ）　ｍＲＮＡ，　ｃｏｍｐｌｅｔｅ　ｃｄｓ）において５８４番目の塩基がパラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基に相当し、配列番号１４の塩基配列（Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ　Ｎｏ．　Ｍ１００６５：Ｈｕｍａｎ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ　（ｅｐｓｉｌｏｎ−４　ａｌｌｅｌｅ）　ｇｅｎｅ，　ｃｏｍｐｌｅｔｅ　ｃｄｓ）において４０７０番目の塩基がアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基に相当する。
【０００９】
本発明において「多型を解析する」とは、解析対象の遺伝子多型について核酸試料がどのような遺伝子型を有するかを調べることを意味し、多型が存在する位置の塩基（塩基配列）を調べることと同義である。典型的には、コネキシン３７（１０１９Ｃ→Ｔ）多型の解析を例に採れば、核酸試料におけるコネキシン３７の遺伝子型がＴＴ（１０１９位塩基が両アレル共にＴのホモ接合体）、ＣＴ（１０１９位塩基がＣのアレルとＴのアレルとのヘテロ接合体）、及びＣＣ（１０１９位塩基が両アレル共にＣのホモ接合体）の中のいずれであるかを調べることを意味する。
【００１０】
上記の（１）〜（１０）の多型は、後述の実施例で示されるように、日本人男性を対象とした解析において心筋梗塞の遺伝的リスクの判定に利用することが特に有効と認められた多型である。従って、これらの多型を解析対象とすることは、男性、特に日本人男性を被験者とするときにより高精度で予知確率の高い診断を可能とする。
【００１１】
同様に（１１）〜（１５）の多型は、後述の実施例で示されるように、日本人女性を対象とした解析において心筋梗塞の遺伝的リスクの判定に利用することが有効と認められた多型である。従って、これらの多型を解析対象とすることは、女性、特に日本人女性を被験者とするときにより高精度で予知確率の高い診断を可能とする。これらの多型の中でも（１５）の多型については、後述の実施例で示されるように、それを解析することにより極めて高いオッズ比で心筋梗塞の遺伝的リスクを判別できることが確認された。従って、この多型を単独で解析することによっても高精度かつ予知確率の高い心筋梗塞の遺伝的リスクを判定することが可能である。勿論、この（１５）の多型の解析に加えて、（１１）〜（１４）から選択されるいずれか又は複数の多型の解析を組み合わせて実施し、遺伝子型の検出或は心筋梗塞の遺伝的リスクの診断を行うこともできる。
【００１２】
ここで、原則的には解析する多型の数の増加に比例して核酸試料の遺伝子型がより細かく分類され、これによって一層予知確率の高い心筋梗塞の遺伝的リスクの診断を行うことができる。かかる見地から、上記の（１）〜（１０）の多型の中でより多くの多型を解析して遺伝子型を検出することが好ましい。従って、（１）〜（１０）のすべての多型を解析することが最も好ましい。九つ以下の多型を組み合わせて遺伝子型の検出を行う場合には、後述の実施例で示されるオッズ比の高い多型を優先的に選択して用いることが好ましい。例えば八つの多型を組み合わせて用いるのであれば、オッズ比の高い順から九つ、即ち（１）、（３）、（５）、（６）、（７）、（８）、（９）及び（１０）を選択することが好ましい。同様に、例えば七つの多型を組み合わせて用いるのであれば（１）、（３）、（５）、（６）、（８）、（９）及び（１０）を選択することが好ましい。同様に、例えば六つの多型を組み合わせて用いるのであれば（１）、（５）、（６）、（８）、（９）及び（１０）を選択することが好ましい。同様に、例えば五つの多型を組み合わせて用いるのであれば（１）、（５）、（６）、（８）　及び（９）を選択することが好ましい。
【００１３】
（１１）〜（１５）の多型から選択される二つ以上の多型を解析する場合も同様に、これらすべての多型、即ち五つの多型を解析することが最も好ましい。四つ以下の多型を組み合わせて遺伝子型の検出を行う場合には、後述の実施例で示されるオッズ比の高い多型を優先的に選択して用いることが好ましい。例えば四つの多型を組み合わせて用いるのであれば、オッズ比の高い順から四つ、即ち（１１）、（１２）、（１４）、及び（１５）を選択することが好ましい。同様に、例えば三つの多型を組み合わせて用いるのであれば（１１）、（１２）、及び（１５）を選択することが好ましい。同様に、例えば二つの多型を組み合わせて用いるのであれば（１１）及び（１５）を選択することが好ましい。
【００１４】
各遺伝子多型を解析する方法は特に限定されるものではなく、例えばアリル特異的プライマー（及びプローブ）を用い、ＰＣＲ法による増幅、及び増幅産物の多型を蛍光又は発光によって解析する方法や、ＰＣＲ（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ　ｃｈａｉｎ　ｒｅａｃｔｉｏｎ）法を利用したＰＣＲ−ＲＦＬＰ（ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ　ｆｒａｇｍｅｎｔ　ｌｅｎｇｔｈ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ：制限酵素断片長多型）法、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ（ｓｉｎｇｌｅ　ｓｔｒａｎｄ　ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ：単鎖高次構造多型）法（Ｏｒｉｔａ，Ｍ．　ｅｔ　ａｌ．，　Ｐｒｏｃ．　Ｎａｔｌ．　Ａｃａｄ．　Ｓｃｉ．，　Ｕ．Ｓ．Ａ．，　８６，　２７６６−２７７０（１９８９）等）、ＰＣＲ−ＳＳＯ（ｓｐｅｃｉｆｉｃ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ：特異的配列オリゴヌクレオチド）法、ＰＣＲ−ＳＳＯ法とドットハイブリダイゼーション法を組み合わせたＡＳＯ（ａｌｌｅｌｅ　ｓｐｅｃｉｆｉｃ　ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ：アレル特異的オリゴヌクレオチド）ハイブリダイゼーション法（Ｓａｉｋｉ，　Ｎａｔｕｒｅ，　３２４，　１６３−１６６（１９８６）等）、又はＴａｑＭａｎ−ＰＣＲ法（Ｌｉｖａｋ，　ＫＪ，　Ｇｅｎｅｔ　Ａｎａｌ，１４，１４３（１９９９），Ｍｏｒｒｉｓ，　Ｔ．　ｅｔ　ａｌ．，　Ｊ．　Ｃｌｉｎ．　Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．，３４，２９３３（１９９６））、Ｉｎｖａｄｅｒ法（Ｌｙａｍｉｃｈｅｖ　Ｖ　ｅｔ　ａｌ．，　Ｎａｔ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ，１７，２９２（１９９９））、プライマー伸長法を用いたＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ（ｍａｔｒｉｘ）法（Ｈａｆｆ　ＬＡ，　Ｓｍｉｒｎｏｖ　ＩＰ，　Ｇｅｎｏｍｅ　Ｒｅｓ　７，３７８（１９９７））、ＲＣＡ（ｒｏｌｌｉｎｇ　ｃｙｃｌｅ　ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）法（Ｌｉｚａｒｄｉ　ＰＭ　ｅｔ　ａｌ．，　Ｎａｔ　Ｇｅｎｅｔ　１９，２２５（１９９８））、ＤＮＡチップ又はマイクロアレイを用いた方法（Ｗａｎｇ　ＤＧ　ｅｔ　ａｌ．，　Ｓｃｉｅｎｃｅ　２８０，１０７７（１９９８）等）、プライマー伸長法、サザンブロットハイブリダイゼーション法、ドットハイブリダイゼーション法（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ，Ｅ．，　Ｊ．　Ｍｏｌ．　Ｂｉｏｌ．　９８，　５０３−５１７（１９７５））等、公知の方法を採用できる。さらに、解析対象の多型部分を直接シークエンスすることにより解析してもよい。尚、これらの方法を任意に組み合わせて多型解析を行ってもよい。
【００１５】
核酸試料が少量の場合には、検出感度ないし精度の面からＰＣＲ法を利用した方法（例えば、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ法）により解析することが好ましい。また、ＰＣＲ法又はＰＣＲ法を応用した方法などの遺伝子増幅法により核酸試料を予め増幅（核酸試料の一部領域の増幅を含む）した後、上記いずれかの解析方法を適用することもできる。
一方、多数の核酸試料を解析する場合には、特に、アリル特異的ＰＣＲ法、アリル特異的ハイブリダイゼーション法、ＴａｑＭａｎ−ＰＣＲ法、Ｉｎｖａｄｅｒ法、プライマー伸長法を用いたＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ／ＭＳ（ｍａｔｒｉｘ）法、ＲＣＡ（ｒｏｌｌｉｎｇ　ｃｙｃｌｅ　ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）法、又はＤＮＡチップ又はマイクロアレイを用いた方法等、多数の検体を比較的短時間で解析することが可能な解析方法を用いることが好ましい。
【００１６】
以上の方法では、各方法に応じたプライマーやプローブ等の核酸（本発明において、「多型解析用核酸」ともいう）が使用される。多型解析用核酸の例としては、解析対象の多型を含む遺伝子において、当該多型部位を含む一定領域（部分ＤＮＡ領域）に相補的な配列を有する核酸を挙げることができる。また、解析対象の多型を含む遺伝子において、当該多型部位を含む一定領域（部分ＤＮＡ領域）に相補的な配列を有し、当該多型部分を含むＤＮＡフラグメントを特異的に増幅できるように設計された核酸（プライマー）を挙げることができる。このような核酸としては、例えばコネキシン３７遺伝子の１０１９位の多型が解析対象の場合には、１０１９位の塩基がＣ（シトシン）であるコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は１０１９位の塩基がＴ（チミン）であるコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸が該当する。
【００１７】
多型解析用核酸の他の具体例としては、解析対象の多型部位がいずれかの遺伝子型である場合にのみ、当該多型部位を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットを挙げることができる。より具体的には、解析対象の多型部位を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、多型部位がいずれかの遺伝子型であるアンチセンス鎖の当該多型部位を含む部分ＤＮＡ領域に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーとセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーからなる核酸セットを例示することができる。このような核酸セットとしては、コネキシン３７遺伝子の１０１９位の多型が解析対象の場合には、コネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、１０１９位塩基がＣ（シトシン）であるコネキシン３７遺伝子のアンチセンス鎖において１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーとセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーからなる核酸セット、又は１０１９位塩基がＴ（チミン）であるコネキシン３７遺伝子のアンチセンス鎖において１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー、及びセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーからなる核酸セットが該当する。ここで、増幅される部分ＤＮＡ領域の長さはその検出に適した範囲で適宜設定され、例えば５０　ｂｐ〜２００　ｂｐ、好ましくは８０　ｂｐ〜１５０　ｂｐである。より具体的には、例えばコネキシン３７（１０１９Ｃ→Ｔ）多型解析用の核酸セットとして次の配列を有するものを例示できる。尚、以下の配列の下線部は多型に対応する部分を表す。また、配列中のＮはＡ、Ｔ、Ｃ、及びＧのいずれかであることを意味する。
【００１８】
センスプライマー
ＣＴＣＡＧＡＡＴＧＧＣＣＡＡＡＡＮＣＣ：配列番号１５、又は
ＣＣＴＣＡＧＡＡＴＧＧＣＣＡＡＡＡＮＴＣ：配列番号１６
アンチセンスプライマー
ＧＣＡＧＡＧＣＴＧＣＴＧＧＧＡＣＧＡ：配列番号１７
【００１９】
同様に、ＴＮＦα（−８６３Ｃ→Ａ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
アンチセンスプライマー
ＧＧＣＣＣＴＧＴＣＴＴＣＧＴＴＡＡＮＧＧ：配列番号１８、又は
ＡＴＧＧＣＣＣＴＧＴＣＴＴＣＧＴＴＡＡＮＴＧ：配列番号１９
センスプライマー
ＣＣＡＧＧＧＣＴＡＴＧＧＡＡＧＴＣＧＡＧＴＡＴＣ：配列番号２０
【００２０】
同様に、ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス（２４２Ｃ→Ｔ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
アンチセンスプライマー
ＡＣＣＡＣＧＧＣＧＧＴＣＡＴＧＮＧＣ：配列番号２１、又は
ＡＣＣＡＣＧＧＣＧＧＴＣＡＴＧＮＡＣ：配列番号２２
センスプライマー
ＧＣＡＧＣＡＡＡＧＧＡＧＴＣＣＣＧＡＧＴ：配列番号２３
【００２１】
同様に、アンギオテンシノーゲン（−６Ｇ→Ａ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
アンチセンスプライマー
ＣＧＧＣＡＧＣＴＴＣＴＴＣＣＣＮＣＧ：配列番号２４、又は
ＣＧＧＣＡＧＣＴＴＣＴＴＣＣＣＮＴＧ：配列番号２５
センスプライマー
ＣＣＡＣＣＣＣＴＣＡＧＣＴＡＴＡＡＡＴＡＧＧ：配列番号２６
【００２２】
同様に、アポＥ（−２１９Ｇ→Ｔ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＧＡＡＴＧＧＡＧＧＡＧＧＧＴＧＴＣＴＮＧＡ：配列番号２７、又は
ＡＧＡＡＴＧＧＡＧＧＡＧＧＧＴＧＴＣＴＮＴＡ：配列番号２８
アンチセンスプライマー
ＣＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＧＡＣＡＣＣＴＣ：配列番号２９
【００２３】
同様に、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼ（９９４Ｇ→Ｔ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＴＴＣＴＴＴＴＧＧＴＧＧＡＧＣＡＡＣＮＧＴ：配列番号３０、又は
ＡＴＴＣＴＴＴＴＧＧＴＧＧＡＧＣＡＡＣＮＴＴ：配列番号３１
アンチセンスプライマー
ＴＣＴＴＡＣＣＴＧＡＡＴＣＴＣＴＧＡＴＣＴＴＣＡ：配列番号３２
【００２４】
同様に、アポＣ−ＩＩＩ（−４８２Ｃ→Ｔ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＣＧＧＡＧＣＣＡＣＴＧＡＴＧＣＮＣＧ：配列番号３３、又は
ＣＧＧＡＧＣＣＡＣＴＧＡＴＧＣＮＴＧ：配列番号３４
アンチセンスプライマー
ＴＧＴＴＴＧＧＡＧＴＡＡＡＧＧＣＡＣＡＧＡＡ：配列番号３５
【００２５】
同様に、ＴＳＰ４（１１８６Ｇ→Ｃ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＣＧＡＧＴＴＧＧＧＡＡＣＧＣＡＣＮＣＴ：配列番号３６、又は
ＣＧＡＧＴＴＧＧＧＡＡＣＧＣＡＣＮＧＴ：配列番号３７
アンチセンスプライマー
ＧＧＴＣＴＧＣＡＣＴＧＡＣＡＴＴＧＡＴＧＡＧ：配列番号３８
【００２６】
同様に、ＩＬ−１０（−８１９Ｔ→Ｃ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＴＡＣＣＣＴＴＧＴＡＣＡＧＧＴＧＡＴＧＴＡＮＴＡ：配列番号３９、又は
ＴＡＣＣＣＴＴＧＴＡＣＡＧＧＴＧＡＴＧＴＡＮＣＡ：配列番号４０
アンチセンスプライマー
ＡＴＡＧＴＧＡＧＣＡＡＡＣＴＧＡＧＧＣＡＣＡ：配列番号４１
【００２７】
同様に、ＩＬ−１０（−５９２Ａ→Ｃ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
アンチセンスプライマー
ＣＡＧＡＧＡＣＴＧＧＣＴＴＣＣＴＡＣＡＮＧＡ：配列番号４２、又は
ＣＣＡＧＡＧＡＣＴＧＧＣＴＴＣＣＴＡＣＡＮＴＡ：配列番号４３
センスプライマー
ＧＣＣＴＧＧＡＡＣＡＣＡＴＣＣＴＧＴＧＡ：配列番号４４
【００２８】
同様に、ストロメライシン１（−１１７１／５Ａ→６Ａ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＴＴＴＧＡＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＡＮＡＣ：配列番号４５、又は
ＴＴＧＡＴＧＧＧＧＧＧＡＡＡＡＮＣＣ：配列番号４６
アンチセンスプライマー
ＣＣＴＣＡＴＡＴＣＡＡＴＧＴＧＧＣＣＡＡ：配列番号４７
【００２９】
同様に、ＰＡＩ１（−６６８／４Ｇ→５Ｇ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＧＧＣＡＣＡＧＡＧＡＧＡＧＴＣＴＧＧＡＣＡＣＧ：配列番号４８
アンチセンスプライマー
ＧＧＣＣＧＣＣＴＣＣＧＡＴＧＡＴＡＣＡ：配列番号４９
【００３０】
同様に、グリコプロテインＩｂα（１０１８Ｃ→Ｔ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＣＣＣＡＧＧＧＣＴＣＣＴＧＮＣＧ：配列番号５０、又は
ＣＣＣＣＡＧＧＧＣＴＣＣＴＧＮＴＧ：配列番号５１
アンチセンスプライマー
ＴＧＡＧＣＴＴＣＴＣＣＡＧＣＴＴＧＧＧＴＧ：配列番号５２
【００３１】
同様に、パラオキソナーゼ（５８４Ｇ→Ａ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＡＣＣＣＡＡＡＴＡＣＡＴＣＴＣＣＣＡＧＧＡＮＣＧ：配列番号５３、又は
ＡＡＣＣＣＡＡＡＴＡＣＡＴＣＴＣＣＣＡＧＧＮＣＴ：配列番号５４
アンチセンスプライマー
ＧＡＡＴＧＡＴＡＴＴＧＴＴＧＣＴＧＴＧＧＧＡＣ：配列番号５５
【００３２】
同様に、アポＥ（４０７０Ｃ→Ｔ）多型解析用の核酸プライマーとして次の配列を有するものを例示できる。
センスプライマー
ＣＣＧＡＴＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＡＮＣＧ：配列番号５６、又は
ＧＣＣＧＡＴＧＡＣＣＴＧＣＡＧＡＡＮＴＧ：配列番号５７
アンチセンスプライマー
ＣＧＧＣＣＴＧＧＴＡＣＡＣＴＧＣＣＡＧ：配列番号５８
【００３３】
一方、プローブの具体例として以下のものを挙げることができる。
アポＣ−ＩＩＩ（−４８２Ｃ→Ｔ）多型解析用プローブとして
ＡＧＣＣＡＣＴＧＡＴＧＣＮＣＧＧＴＣＴ：配列番号５９、又は
ＡＧＣＣＡＣＴＧＡＴＧＣＮＴＧＧＴＣＴ：配列番号６０。
【００３４】
ＩＬ−１０（−８１９Ｔ→Ｃ）多型解析用プローブとして
ＧＴＡＣＡＧＧＴＧＡＴＧＴＡＮＴＡＴＣＴＣＴＧＴＧ：配列番号６１、又は
ＧＴＡＣＡＧＧＴＧＡＴＧＴＡＮＣＡＴＣＴＣＴＧＴＧ：配列番号６２。
【００３５】
ＰＡＩ１（−６６８／４Ｇ→５Ｇ）多型解析用プローブとして
ＴＧＧＡＣＡＣＧＴＧＧＧＧＧＡＧＴＣＡＧ：配列番号６３、又は
ＴＧＧＡＣＡＣＧＴＧＧＧＧＡＧＴＣＡＧＣ：配列番号６４。
【００３６】
以上の核酸プライマー、核酸プローブは単なる一例であって、核酸プライマーであれば目的の増幅反応を支障なく行える限度において、他方核酸プローブであれば目的のハイブリダイゼーション反応を支障なく行える限度において一部の塩基配列に改変が施されたものであってもよい。ここでの「一部の改変」とは、塩基の一部が欠失、置換、挿入及び／又は付加されていることを意味する。改変にかかる塩基数は、例えば１〜７個、好ましくは１〜５個、更に好ましくは、１〜３個である。尚、このような改変は、原則として多型部位に対応する塩基以外の部分において行われる。ただし、解析対象の多型がストロメライシン１（−１１７１／５Ａ→６Ａ）多型又はＰＡＩ１（−６６８／４Ｇ→５Ｇ）多型の場合には、多型部位に対応する塩基の一部を改変して得られる核酸をプライマー又はプローブとして用いることも可能である。
【００３７】
多型解析用核酸（プローブ、プライマー）には、解析方法に応じて適宜ＤＮＡ断片又はＲＮＡ断片が用いられる。多型解析用核酸の塩基長はそれぞれの機能が発揮される長さであればよく、プライマーとして用いられる場合の塩基長の例としては１０〜５０ｂｐ程度、好ましくは１５〜４０ｂｐ程度、更に好ましくは１５〜３０ｂｐ程度である。
尚、プライマーとして用いられる場合には増幅対象に特異的にハイブリダイズし、目的のＤＮＡフラグメントを増幅することができる限り鋳型となる配列に対して多少のミスマッチがあってもよい。プローブの場合も同様に、検出対象の配列と特異的なハイブリダイズが行える限り、検出対象の配列に対して多少のミスマッチがあってもよい。ミスマッチの程度としては、１〜数個、好ましくは１〜５個、更に好ましくは１〜３個である。
多型解析用核酸（プライマー、プローブ）はホスホジエステル法など公知の方法によって合成することができる。尚、多型解析用核酸の設計、合成等に関しては成書（例えば、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｔｈｉｒｄ　Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，　Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ）を参考にすることができる。
【００３８】
本発明における多型解析用核酸を予め標識物質で標識しておくことができる。このような標識化核酸を用いることにより、例えば増幅産物の標識量を指標として多型の解析を行うことができる。また、多型を構成する各遺伝子型の遺伝子における部分ＤＮＡ領域をそれぞれ特異的に増幅するように設計された２種類のプライマーを互いに異なる標識物質で標識しておけば、増幅産物から検出される標識物質及び標識量によって核酸試料の遺伝子型を判別できる。このような標識化プライマーを用いた検出方法の具体例としては、多型を構成する各遺伝子型のセンス鎖にそれぞれ特異的にハイブリダイズする２種類の核酸プライマー（アリル特異的センスプライマー）をフルオレセインイソチオシアネートとテキサスレッドでそれぞれ標識し、これら標識化プライマーとアンチセンス鎖に特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーとを用いて多型部位を含む部分ＤＮＡ領域を増幅し、得られた増幅産物における各蛍光物質の標識量を測定して多型を検出する方法を挙げることができる。尚、ここでのアンチセンスプライマーを例えばビオチンで標識しておけば、ビオチンとアビジンとの特異的な結合を利用して増幅産物の分離を行うことができる。
【００３９】
多型解析用核酸の標識に用いられる標識物質としては３２Ｐなどの放射性同位元素、フルオレセインイソチオシアネート、テトラメチルローダミンイソチオシアネート、テキサスレッドなどの蛍光物質を例示でき、標識方法としてはアルカリフォスファターゼ及びＴ４ポリヌクレオチドキナーゼを用いた５’末端標識法、Ｔ４　ＤＮＡポリメラーゼやＫｌｅｎｏｗ断片を用いた３’末端標識法、ニックトランスレーション法、ランダムプライマー法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｔｈｉｒｄ　Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｈａｐｔｅｒ　９，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，　Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ）などを例示できる。
【００４０】
以上の多型解析用核酸を不溶性支持体に固定化した状態で用いることもできる。固定化に使用する不溶性支持体をチップ状、ビーズ状などに加工しておけば、これら固定化核酸を用いて多型の解析をより簡便に行うことができる。
【００４１】
核酸試料は、被験者の血液、皮膚細胞、粘膜細胞、毛髪等から公知の抽出方法、精製方法を用いて調製することができる。多型解析対象の遺伝子を含むものであれば、任意の長さのゲノムＤＮＡを核酸試料として用いることができる。また、必ずしも解析対象の遺伝子のすべてが一の核酸上に存在する核酸試料を用いる必要はない。即ち、本発明の核酸試料としては、解析対象の遺伝子のすべてが一の核酸上に存在しているもの、解析対象の遺伝子が二以上の核酸上に分かれて存在しているもののいずれをも用いることができる。尚、核酸試料において解析対象の遺伝子が完全な状態（即ち、遺伝子の全長が存在する状態）でなくても、少なくとも解析される多型部位が存在している限りにおいて断片的、部分的な状態であってもよい。
【００４２】
各遺伝子多型の解析は遺伝子多型ごとに、又は複数若しくは全部を同時に行う。前者の場合としては、例えば被験者から得た核酸試料を解析対象の多型の数に合わせて分注し、各多型の解析を個別に行う。後者の場合としては、例えばＤＮＡチップまたはマイクロアレイによって行うことができる。尚、ここでいう同時とは解析過程のすべての操作が同時に行われることのみを意味するのではなく、一部の操作（例えば、核酸増幅操作、プローブのハイブリダイズ、又は検出）が同時に行われる場合も含む。
【００４３】
解析対象の遺伝子の転写産物であるｍＲＮＡを利用して各遺伝子の多型を解析することもできる。例えば、被験者の血液、尿等から解析対象である遺伝子のｍＲＮＡを抽出、精製した後、ノーザンブロット法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ，　Ｔｈｉｒｄ　Ｅｄｉｔｉｏｎ，７．４２，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，　Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ）、ドットブロット法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ，　Ｔｈｉｒｄ　Ｅｄｉｔｉｏｎ，７．４６，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，　Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ）、ＲＴ−ＰＣＲ法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｃｌｏｎｉｎｇ，　Ｔｈｉｒｄ　Ｅｄｉｔｉｏｎ，８．４６，Ｃｏｌｄ　Ｓｐｒｉｎｇ　Ｈａｒｂｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　Ｐｒｅｓｓ，　Ｎｅｗ　Ｙｏｒｋ）、ＤＮＡチップ（ＤＮＡアレイ）を用いた方法などを実行することにより、ｍＲＮＡを出発材料として多型解析を行うことができる。
【００４４】
さらに、上記の多型の中でアミノ酸の変化を伴うものについては、解析対象の遺伝子の発現産物を用いて多型解析を行うこともできる。この場合、多型部位に対応するアミノ酸を含んでいる限り、部分タンパク質、部分ペプチドであっても解析用試料として用いることができる。
【００４５】
このような遺伝子の発現産物を用いて解析する方法としては、多型部位のアミノ酸を直接分析する方法、又は立体構造の変化を利用して免疫学的に分析する方法などが挙げられる。前者としては、周知のアミノ酸配列分析法（エドマン法を利用した方法）を用いることができる。後者としては、多型を構成するいずれかの遺伝子型を有する遺伝子の発現産物に特異的な結合活性を有するモノクローナル抗体又はポリクローナル抗体を用いた、ＥＬＩＳＡ法（酵素結合免疫吸着定量法）、ラジオイムノアッセイ、免疫沈降法、免疫拡散法等などを用いることができる。
【００４６】
以上説明した本発明の検出方法を実行することにより得られる多型情報は、心筋梗塞の遺伝的リスクの診断に利用することができる。即ち、本発明は以上の検出方法によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び決定された核酸試料の遺伝子型から遺伝的リスクを求める工程を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法も提供する。ここでの遺伝子型の決定は、典型的には、検出対象の多型に関して核酸試料の両アレルがいずれの遺伝子型をそれぞれ有するかを決定することである。コネキシン３７（１０１９Ｃ→Ｔ）多型が検出対象である場合を例に採れば、典型的には核酸試料におけるコネキシン３７の遺伝子型がＴＴ（１０１９位塩基が両アレル共にＴのホモ接合体）、ＣＴ（１０１９位塩基がＣのアレルとＴのアレルとのヘテロ接合体）、及びＣＣ（１０１９位塩基が両アレル共にＣのホモ接合体）の中のいずれであるかを決定することである。
【００４７】
後述の実施例で得られた結果を考慮すれば、高精度かつ予知確率の高い心筋梗塞の遺伝的リスクの診断を可能とするために、例えばコネキシン３７（１０１９Ｃ→Ｔ）多型であれば核酸試料の遺伝子型がＴＴ又はＣＴのいずれかであるか、それともＣＣであるかが決定される。同様に、ＴＮＦα（−８６３Ｃ→Ａ）多型であればＡＡ又はＣＡのいずれかであるか、それともＣＣであるか、ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス（２４２Ｃ→Ｔ）多型であればＴＴ又はＣＴのいずれかであるか、それともＣＣであるか、アンギオテンシノーゲン（−６Ｇ→Ａ）多型であればＡＡであるか、それともＧＡ又はＧＧのいずれかであるか、アポＥ−２１９（−２１９Ｇ→Ｔ）多型であればＴＴであるか、それともＧＴ又はＧＧのいずれかであるか、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼ（９９４Ｇ→Ｔ）多型であればＴＴ又はＧＴのいずれかであるか、それともＧＧであるか、アポＣ−ＩＩＩ（−４８２Ｃ→Ｔ）多型であればＴＴであるか、それともＣＴ又はＣＣのいずれかであるか、ＴＳＰ４（１１８６Ｇ→Ｃ）多型であればＣＣ又はＧＣのいずれかであるか、それともＧＧであるか、ＩＬ−１０（−８１９Ｔ→Ｃ）多型であればＣＣであるか、それともＣＴ又はＴＴのいずれかであるか、ＩＬ−１０（−５９２Ａ→Ｃ）多型であればＣＣであるか、それともＣＡ又はＡＡのいずれかであるか、ストロメライシン１（−１１７１／５Ａ→６Ａ）多型であれば６Ａ／６Ａ又は５Ａ／６Ａのいずれかであるか、それとも５Ａ／５Ａであるか、ＰＡＩ１（−６６８／４Ｇ→５Ｇ）多型であれば５Ｇ／５Ｇ又は４Ｇ／５Ｇのいずれかであるか、それとも４Ｇ／４Ｇであるか、グリコプロテインＩｂα（１０１８Ｃ→Ｔ）多型であればＴＴであるか、それともＣＴ又はＣＣのいずれかであるか、パラオキソナーゼ（５８４Ｇ→Ａ）多型であればＡＡであるか、それともＧＡ又はＧＧのいずれかであるか、アポＥ（４０７０Ｃ→Ｔ）多型であればＴＴであるか、それともＣＴ又はＣＣのいずれかであるかが決定される。
【００４８】
心筋梗塞の遺伝的リスクを診断することにより、将来的に心筋梗塞を罹患するおそれの程度（発症し易さ）、即ち発症リスク（発症脆弱性）が予測され、また遺伝子型という客観的指標に基づいて心筋梗塞の認定や病状の把握を行うことが可能となる。換言すれば、本発明の診断方法によって心筋梗塞の発症リスクの評価、心筋梗塞に罹患していることの認定、又は症状の把握を行うことができる。中でも発症リスクの評価を行えることは臨床上極めて有意義である。発症リスクを事前に知ることは心筋梗塞の一次予防に貢献し、適切な予防措置を講じることを可能とするからである。
本発明の診断方法によって得られる情報は、適切な治療法の選択や、予後の改善、患者のＱＯＬ（クオリティー・オブ・ライフ）の向上、又は発症リスクの低減などに利用することができる。
【００４９】
本発明の診断方法を定期的に実行することにより、心筋梗塞の発症リスク等をモニターすることができる。このようなモニターの結果、ある外的因子（環境因子、薬剤の投与など）と発症リスク等の増加との間に相関関係が認められれば、当該外的因子を危険因子と認定し、この情報を基に発症リスク等の低減を図ることが可能と考えられる。
【００５０】
本発明で得られる心筋梗塞の発症に関連する遺伝情報を利用して、心筋梗塞の治療（予防的処置を含む）を行うことができる。例えば、本発明の診断方法を実施した結果、解析対象の多型が心筋梗塞の発症リスクを高める遺伝子型であった場合に、発症リスクの低い遺伝子型を有する遺伝子を生体内に導入して発現させれば、当該遺伝子が発現することによって症状の軽減、発症の抑制、発症リスクの軽減などを期待できる。発症リスクの高い遺伝子型を有する遺伝子のｍＲＮＡに対するアンチセンス鎖を導入し、当該ｍＲＮＡの発現を抑制する方法によっても、同様の治療効果が期待される。
【００５１】
遺伝子又はアンチセンス鎖の導入は、例えば、遺伝子導入用プラスミド又はウイルスベクターを用いた方法、エレクトロポーレーション（Ｐｏｔｔｅｒ，Ｈ．　ｅｔ　ａｌ．，　Ｐｒｏｃ．　Ｎａｔｌ．　Ａｃａｄ．　Ｓｃｉ．　Ｕ．Ｓ．Ａ．　８１，　７１６１−７１６５（１９８４））、超音波マイクロバブル（Ｌａｗｒｉｅ，　Ａ．，　ｅｔ　ａｌ．　Ｇｅｎｅ　Ｔｈｅｒａｐｙ　７，　２０２３−２０２７　（２０００））、リポフェクション（Ｆｅｌｇｎｅｒ，　Ｐ．Ｌ．　ｅｔ　ａｌ．，　Ｐｒｏｃ．　Ｎａｔｌ．　Ａｃａｄ．　Ｓｃｉ．　Ｕ．Ｓ．Ａ．　８４，７４１３−７４１７（１９８４））、マイクロインジェクション（Ｇｒａｅｓｓｍａｎｎ，Ｍ．　＆　Ｇｒａｅｓｓｍａｎｎ，Ａ．，　Ｐｒｏｃ．　Ｎａｔｌ．　Ａｃａｄ．　Ｓｃｉ．　Ｕ．Ｓ．Ａ．　７３，３６６−３７０（１９７６））等の方法により行うことができる。これらの方法を利用して、所望の遺伝子などを生体に対して直接的に導入（ｉｎ　ｖｉｖｏ法）又は間接的に導入（ｅｘ　ｖｉｖｏ法）することができる。
【００５２】
本発明の第２の局面は、上述した本発明の検出方法又は診断方法に使用されるキット（遺伝子型検出用キット、又は心筋梗塞診断用キット）を提供する。かかるキットには、上記の（１）〜（１０）の多型からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析するための核酸（多型解析用核酸）が含まれる。又は上記の（１１）〜（１５）の多型からなるグループより選択される二つ以上の多型を解析するための核酸（多型解析用核酸）が含まれる。更に他の態様としては、上記の（１５）の多型を解析するための核酸が含まれてキットが構成される。
多型解析用核酸は、それが適用される解析方法（上述したアリル特異的核酸等を用いたＰＣＲ法を利用する方法、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ法、ＰＣＲ−ＳＳＣＰ、ＴａｑＭａｎ−ＰＣＲ法、Ｉｎｖａｄｅｒ法等）において、解析対象の多型部分を含むＤＮＡ領域又はそれに対応するｍＲＮＡを特異的に増幅できるもの（プライマー）又は特異的に検出できるもの（プローブ）として設計される。以下に、本発明において提供されるキットの具体例を示す。
【００５３】
以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１）１０１９位塩基がＣであるコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は１０１９位塩基がＴであるコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（２）−８６３位塩基がＣである腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−８６３位塩基がＡである腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（３）２４２位塩基がＣであるＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は２４２位塩基がＴである腫瘍壊死因子α遺伝子の２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（４）−６位塩基がＧであるアンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−６位塩基がＡであるアンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（５）−２１９位塩基がＧであるアポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−２１９位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（６）９９４位塩基がＧである血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は９９４位塩基がＴである血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（７）−４８２位塩基がＣであるアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−４８２位塩基がＴであるアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（８）１１８６位塩基がＧであるトロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は１１８６位塩基がＣであるトロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（９）−８１９位塩基がＴであるインターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−８１９位塩基がＣであるインターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、及び
（１０）−５９２位塩基がＡであるインターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−５９２位塩基がＣであるインターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸。
以上では、（１）〜（１０）からなるグループから二つ以上の核酸を選択してキットを構成しているが、（１）〜（１０）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸を選択してキットを構成してもよい。例えば、（１）、（５）（６）、（８）、（９）及び（１０）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸）より二つ以上の核酸を選択してキットを構成したり、（１）、（５）、（６）、（８）及び（９）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位５位までの多型を解析するための核酸）より二つ以上の核酸を選択してキットを構成することができる。
【００５４】
以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１１）−１１７１位から３’方向にＡが５個連続して存在するストロメライシン１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−１１７１位から３’方向にＡが６個連続して存在するストロメライシン１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（１２）−６６８位から３’方向に連続して４個のＧが存在するプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は−６６８位から３’方向に連続して５個のＧが存在するプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、
（１３）１０１８位塩基がＣであるグリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は１０１８位塩基がＴであるグリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、（１４）５８４位塩基がＧであるパラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は５８４位塩基がＡであるパラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、及び
（１５）４０７０位塩基がＣであるアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は４０７０位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸。
以上では、（１１）〜（１５）からなるグループから二つ以上の核酸を選択してキットを構成しているが、（１１）〜（１５）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸を選択してキットを構成してもよい。例えば、（１１）、（１２）、（１４）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１１）、（１２）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位３位までの多型を解析するための核酸）より二つ以上の核酸を選択してキットを構成することができる。
【００５５】
以下の核酸を含んでなる遺伝子型検出用キット、
４０７０位塩基がＣであるアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸、又は４０７０位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域に相補的な配列を有する核酸。
【００５６】
以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１）核酸試料中のコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基がＣである場合にのみ、該コネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基がＴである場合にのみ、該コネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（２）核酸試料中の腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基がＣである場合にのみ、該腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中の腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基がＡである場合にのみ、該腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（３）核酸試料中のＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基がＣである場合にのみ、該ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基がＴである場合にのみ、該ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（４）核酸試料中のアンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基がＧである場合にのみ、該アンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のアンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基がＡである場合にのみ、該アンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（５）核酸試料中のアポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基がＧである場合にのみ、該アポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のアポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基がＴである場合にのみ、該アポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（６）核酸試料中の血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基がＧである場合にのみ、該血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中の血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基がＴである場合にのみ、該血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（７）核酸試料中のアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基がＣである場合にのみ、該アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基がＴである場合にのみ、該アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（８）核酸試料中のトロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基がＧである場合にのみ、該トロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のトロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基がＣである場合にのみ、該トロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（９）核酸試料中のインターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基がＴである場合にのみ、該インターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のインターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基がＣである場合にのみ、該インターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、及び
（１０）核酸試料中のインターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基がＡである場合にのみ、該インターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のインターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基がＣである場合にのみ、該インターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット。
以上では、（１）〜（１０）からなるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成しているが、（１）〜（１０）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成してもよい。例えば、（１）、（５）、（６）、（８）、（９）及び（１０）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１）、（５）、（６）、（８）及び（９）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位５位までの多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成することができる。
【００５７】
以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１１）核酸試料中のストロメライシン１遺伝子において−１１７１位から３’方向にＡが５個連続して存在する場合にのみ、該ストロメライシン１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のストロメライシン１遺伝子において−１１７１位から３’方向にＡが６個連続して存在する場合にのみ、該ストロメライシン１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（１２）核酸試料中のプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子において−６６８位から３’方向にＧが４個連続して存在する場合にのみ、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子において−６６８位から３’方向にＧが５個連続して存在する場合にのみ、該プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（１３）核酸試料中のグリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基がＣである場合にのみ、該グリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のグリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基がＴである場合にのみ、該グリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、
（１４）核酸試料中のパラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基がＧである場合にのみ、該パラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のパラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基がＡである場合にのみ、該パラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、及び
（１５）核酸試料中のアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基がＣである場合にのみ、該アポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基がＴである場合にのみ、該アポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット。
以上では、（１１）〜（１５）からなるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成しているが、（１１）〜（１５）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成してもよい。例えば、（１１）、（１２）、（１４）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１１）、（１２）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位３位までの多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成することができる。
【００５８】
以下の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
核酸試料中のアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基がＣである場合にのみ、該アポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット、又は核酸試料中のアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基がＴである場合にのみ、該アポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セット。
【００５９】
以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１）コネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、１０１９位塩基がＣであるコネキシン３７遺伝子において１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は１０１９位塩基がＴであるコネキシン３７遺伝子において１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、コネキシン３７遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−８６３位塩基がＣである腫瘍壊死因子α遺伝子において−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマー及び／又は−８６３位塩基がＡである腫瘍壊死因子α遺伝子において−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、腫瘍壊死因子α遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、２４２位塩基がＣであるＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子において−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマー及び／又は２４２位塩基がＴであるＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子において２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−６位塩基がＧであるアンギオテンシノーゲン遺伝子において−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマー及び／又は−６位塩基がＡであるアンギオテンシノーゲン遺伝子において−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、アンギオテンシノーゲン遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−２１９位塩基がＧであるアポリポプロテインＥ遺伝子において−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は−２１９位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子において−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、アポリポプロテインＥ遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、９９４位塩基がＧである血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子において９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は９９４位塩基がＴである血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子において９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−４８２位塩基がＣであるアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子において−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は−４８２位塩基がＴであるアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子において−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、１１８６位塩基がＧであるトロンボスポンジン４遺伝子において１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は１１８６位塩基がＣであるトロンボスポンジン４遺伝子において１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、トロンボスポンジン４遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（９）インターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−８１９位塩基がＴであるインターロイキン１０遺伝子において−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は１１８６位塩基がＣであるインターロイキン１０遺伝子において−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、インターロイキン１０遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−５９２位塩基がＡであるインターロイキン１０遺伝子において−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマー及び／又は−５９２位塩基がＣであるインターロイキン１０遺伝子において−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、インターロイキン１０遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、からなる核酸セット。
以上では、（１）〜（１０）からなるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成しているが、（１）〜（１０）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成してもよい。例えば、（１）、（５）、（６）、（８）、（９）及び（１０）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１）、（５）、（６）、（８）及び（９）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位５位までの多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成することができる。
【００６０】
以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の−１１７１位における多型部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、−１１７１位から３’方向にＡが５個連続して存在するストロメライシン１遺伝子において当該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は−１１７１位から３’方向にＡが６個連続して存在するストロメライシン１遺伝子において当該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、ストロメライシン１遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の−６６８位における多型部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された一組のプライマーと、並びに−６６８位から３’方向にＧが４個連続して存在するプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子において該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするプローブ及び／又は−６６８位から３’方向にＧが５個連続して存在するプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子において該配列部分を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするプローブと、からなる核酸セット、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、１０１８位塩基がＣであるグリコプロテインＩｂα遺伝子において１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は１０１８位塩基がＴであるグリコプロテインＩｂα遺伝子において１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、グリコプロテインＩｂα遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、５８４位塩基がＧであるパラオキソナーゼ遺伝子において５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は５８４位塩基がＡであるパラオキソナーゼ遺伝子において５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、パラオキソナーゼ遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、４０７０位塩基がＣであるアポリポプロテインＥ遺伝子において４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は４０７０位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子において４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、アポリポプロテインＥ遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット。
以上では、（１１）〜（１５）からなるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成しているが、（１１）〜（１５）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成してもよい。例えば、（１１）、（１２）、（１４）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１１）、（１２）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位３位までの多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成することができる。
【００６１】
以下の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
アポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された核酸セットであって、４０７０位塩基がＣであるアポリポプロテインＥ遺伝子において４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマー及び／又は４０７０位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子において４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域、に対して特異的にハイブリダイズするセンスプライマーと、アポリポプロテインＥ遺伝子の一部領域に対して特異的にハイブリダイズするアンチセンスプライマーと、からなる核酸セット。
【００６２】
以下の（１）〜（１０）からなるグループより選択される二つ以上の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１）１０１９位塩基がＣであるコネキシン３７遺伝子のアンチセンス鎖において１０１９位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、１０１９位塩基がＴであるコネキシン３７遺伝子のアンチセンス鎖において１０１９位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びコネキシン３７遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてコネキシン３７遺伝子の１０１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（２）−８６３位塩基がＣである腫瘍壊死因子α遺伝子のセンス鎖において−８６３位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、−８６３位塩基がＡである腫瘍壊死因子α遺伝子のセンス鎖において−８６３位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及び腫瘍壊死因子α遺伝子のアンチセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されて腫瘍壊死因子α遺伝子の−８６３位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（３）２４２位塩基がＣであるＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子のセンス鎖において２４２位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、２４２位塩基がＴであるＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子のセンス鎖において２４２位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子のアンチセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の２４２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（４）−６位塩基がＧであるアンギオテンシノーゲン遺伝子のセンス鎖において−６位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、−６位塩基がＡであるアンギオテンシノーゲン遺伝子のセンス鎖において−６位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びアンギオテンシノーゲン遺伝子のアンチセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてアンギオテンシノーゲン遺伝子の−６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（５）−２１９位塩基がＧであるアポリポプロテインＥ遺伝子のアンチセンス鎖において−２１９位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、−２１９位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子のアンチセンス鎖において−２１９位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びアポリポプロテインＥ遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてアポリポプロテインＥ遺伝子の−２１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（６）９９４位塩基がＧである血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子のアンチセンス鎖において９９４位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、９９４位塩基がＴである血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子のアンチセンス鎖において９９４位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及び血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されて血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の９９４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（７）−４８２位塩基がＣであるアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子のアンチセンス鎖において−４８２位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズする第１核酸と、−４８２位塩基がＴであるアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子のアンチセンス鎖において−４８２位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズする第２核酸と、アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてアポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の−４８２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、前記第１核酸及び前記第３核酸を用いて増幅された核酸に対して特異的にハイブリダイズする第４核酸と、並びに前記第２核酸及び前記第３核酸を用いて増幅された核酸に対して特異的にハイブリダイズする第５核酸と、からなる核酸セット、
（８）１１８６位塩基がＧであるトロンボスポンジン４遺伝子のアンチセンス鎖において１１８６位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、１１８６位塩基がＣであるトロンボスポンジン４遺伝子のアンチセンス鎖において１１８６位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びトロンボスポンジン４遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてトロンボスポンジン４遺伝子の１１８６位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（９）−８１９位塩基がＴであるインターロイキン１０遺伝子のアンチセンス鎖において−８１９位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズする第１核酸と、−８１９位塩基がＣであるインターロイキン１０遺伝子のアンチセンス鎖において−８１９位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズする第２核酸と、及びインターロイキン１０遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてインターロイキン１０遺伝子の−８１９位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、前記第１核酸及び前記第３核酸を用いて増幅された核酸に対して特異的にハイブリダイズする第４核酸と、並びに前記第２核酸及び前記第３核酸を用いて増幅された核酸に対して特異的にハイブリダイズする第５核酸と、からなる核酸セット、及び
（１０）−５９２位塩基がＡであるインターロイキン１０遺伝子のセンス鎖において−５９２位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、−５９２位塩基がＣであるインターロイキン１０遺伝子のセンス鎖において−５９２位塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びインターロイキン１０遺伝子のアンチセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてインターロイキン１０遺伝子の−５９２位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット。
以上では、（１）〜（１０）からなるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成しているが、（１）〜（１０）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成してもよい。例えば、（１）、（５）、（６）、（８）、（９）及び（１０）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１）、（５）、（６）、（８）及び（９）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位５位までの多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成することができる。
【００６３】
以下の（１１）〜（１５）からなるグループより選択される二つ以上の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
（１１）−１１７１位から３’方向にＡが５個連続して存在するストロメライシン１遺伝子のアンチセンス鎖において該配列部分に対応する配列を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、−１１７１位から３’方向にＡが６個連続して存在するストロメライシン１遺伝子のアンチセンス鎖において該配列部分に対応する配列を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びストロメライシン１遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてストロメライシン１遺伝子の−１１７１位における多型部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の−６６８位における多型部分を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅するように設計された一組の核酸（第１核酸及び第２核酸）と、−６６８位から３’方向にＧが４個連続して存在するプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子を鋳型とし且つ前記一組の核酸を用いて増幅される核酸に対して特異的にハイブリダイズする第３核酸と、及び−６６８位から３’方向にＧが５個連続して存在するプラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子を鋳型とし且つ前記一組の核酸を用いて増幅される核酸に対して特異的にハイブリダイズする第４核酸と、からなる核酸セット、
（１３）１０１８位塩基がＣであるグリコプロテインＩｂα遺伝子のアンチセンス鎖において１０１８位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、１０１８位塩基がＴであるグリコプロテインＩｂα遺伝子のアンチセンス鎖において１０１８位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びグリコプロテインＩｂα遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてグリコプロテインＩｂα遺伝子の１０１８位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、
（１４）５８４位塩基がＧであるパラオキソナーゼ遺伝子のアンチセンス鎖において５８４位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、５８４位塩基がＡであるパラオキソナーゼ遺伝子のアンチセンス鎖において５８４位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びパラオキソナーゼ遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてパラオキソナーゼ遺伝子の５８４位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット、及び
（１５）４０７０位塩基がＣであるアポリポプロテインＥ遺伝子のアンチセンス鎖において４０７０位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、４０７０位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子のアンチセンス鎖において４０７０位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びアポリポプロテインＥ遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット。
以上では、（１１）〜（１５）からなるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成しているが、（１１）〜（１５）の二つ以上を任意に選択してグループとし、かかるグループから二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成してもよい。例えば、（１１）、（１２）、（１４）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が１以上の多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成したり、（１１）、（１２）及び（１５）からなるグループ（後述の実施例においてオッズ比が上位３位までの多型を解析するための核酸セット）より二つ以上の核酸セットを選択してキットを構成することができる。
【００６４】
以下の核酸セットを含んでなる遺伝子型検出用キット、
４０７０位塩基がＣであるアポリポプロテインＥ遺伝子のアンチセンス鎖において４０７０位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第１の標識物質で標識された第１核酸と、４０７０位塩基がＴであるアポリポプロテインＥ遺伝子のアンチセンス鎖において４０７０位塩基に対応する塩基を含む部分領域、に対して特異的にハイブリダイズし且つ第２の標識物質で標識された第２核酸と、及びアポリポプロテインＥ遺伝子のセンス鎖の一部領域に対して特異的にハイブリダイズし且つ前記第１核酸／又は前記第２核酸とともに使用されてアポリポプロテインＥ遺伝子の４０７０位塩基を含む部分ＤＮＡ領域を特異的に増幅することが可能な第３核酸と、からなる核酸セット。
【００６５】
以上のキットにおいては、キットの使用方法に応じた一又は二以上の試薬（バッファー、反応用試薬、検出用試薬など）などを組み合わせてもよい。
以下、実施例を用いて本発明をより詳細に説明する。
【００６６】
【実施例】
＜実施例１＞　遺伝子多型の選択
ＰｕｂＭｅｄ［Ｎａｔｉｏｎａｌ　Ｃｅｎｔｅｒ　ｆｏｒ　Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ　Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ　（ＮＣＢＩ）］，　Ｏｎｌｉｎｅ　Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ　ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ　ｉｎ　Ｍｅｎ　（ＮＣＢＩ），　Ｓｉｎｇｌｅ　Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　（ＮＣＢＩ）などの数種類の公的データベースを用いて、今までに報告された遺伝子の中から血管生物学、血小板・白血球生物学、凝固線溶系、脂質・糖・その他の代謝因子などの総合的側面から冠動脈硬化、冠動脈攣縮、高血圧、糖尿病、高脂血症などとの関連が推定される７１遺伝子を抜粋した。さらにこれらの遺伝子に存在する多型の中でプロモーター領域やエクソンに存在するもの、あるいはスプライスドナー部位やアクセプター部位に位置し、遺伝子産物の機能変化との関連が予想されるものを中心に１１２多型を選択した（図１及び図２）。
【００６７】
＜実施例２＞　遺伝子多型の決定
対象は日本人男女５０６１例（男性３３０９例、女性１７５２例）で、１９９４年７月から２００１年１２月の間に１５参加施設に外来受診または入院した症例である。心筋梗塞は２８１９例（男性２００３例、女性８１６例）で、全例に冠動脈造影および左室造影を行った。心筋梗塞の診断は典型的な心電図変化および血清ＣＫ、ＧＯＴ、ＬＤＨの上昇により行った。さらに左室造影による壁運動異常およびそれに対応する左主幹動脈あるいは主要な冠動脈の狭窄により心筋梗塞の確定診断を行った。
【００６８】
対照は２２４２例（男性１３０６例、女性９３６例）で、参加施設を受診し冠動脈疾患の従来の危険因子、即ち喫煙（１日１０本以上）、肥満（ｂｏｄｙ　ｍａｓｓ　ｉｎｄｅｘ≧２６　ｋｇ／ｍ２）、高血圧（収縮期血圧≧１４０　ｍｍＨｇまたは拡張期血圧≧９０　ｍｍＨｇあるいはその両方）、糖尿病（空腹時血糖≧１２６　ｍｇ／ｄＬまたはヘモグロビンＡ１ｃ≧　６．５％あるいはその両方）、高脂血症（血清総コレステロール≧２２０　ｍｇ／ｄＬ）、高尿酸血症（男性では血清尿酸≧７．７　ｍｇ／ｄＬ、女性では血清尿酸≧５．５　ｍｇ／ｄＬ）の少なくとも一つを有するが冠動脈疾患を有しない症例である。これらの対照は安静時心電図が正常であり、運動負荷試験でも心筋虚血性変化は認められなかった。
【００６９】
それぞれの対象から静脈血７　ｍＬを５０　ｍｍｏｌ／Ｌ　ＥＤＴＡ−２Ｎａを含むチューブに採血し、ゲノムＤＮＡをＤＮＡ抽出キット（Ｑｉａｇｅｎ，　Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ，　ＣＡ）を用いて抽出した。７１候補遺伝子１１２多型の決定は蛍光・発光法によるアリル特異的プライマー・プローブ測定システム（東洋紡ジーンアナリシス、敦賀、日本）により行った（図３及び図４）。多型部位を含むＤＮＡ断片は５’末端にフルオレセインイソチオシアネート（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｉｎ　ｉｓｏｔｈｉｏｃｙａｎａｔｅ：ＦＩＴＣ）またはテキサスレッド（Ｔｅｘａｓ　ｒｅｄ：ＴｘＲ）で標識した２種類のアリル特異的センスプライマー（またはアンチセンスプライマー）と５’末端をビオチンで標識したアンチセンスプライマー（またはセンスプライマー）を用いてｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ　ｃｈａｉｎ　ｒｅａｃｔｉｏｎ　（ＰＣＲ）により増幅した。また別法として、多型部位を含むＤＮＡ断片は２種類のアリル特異的センスプライマーと５’末端をビオチンで標識したアンチセンスプライマーを用いて、またはセンスプライマーと５’末端をビオチンで標識したアンチセンスプライマーを用いてＰＣＲにより増幅した。反応溶液　（２５μＬ）　には２０　ｎｇのＤＮＡ，　５　ｐｍｏｌの各プライマー，　０．２　ｍｍｏｌ／Ｌの各デオキシヌクレオシド三リン酸（ｄＡＴＰ，　ｄＧＴＰ，　ｄＣＴＰ，　ｄＴＴＰ），　１−４　ｍｍｏｌ／ＬのＭｇＣｌ２，　１　ＵのＤＮＡポリメラーゼ（ｒＴａｑ　ｏｒ　ＫＯＤｐｌｕｓ；　東洋紡、大阪、日本）　を含み、それぞれのＤＮＡポリメラーゼ緩衝液を用いた。　増幅プロトコールは初期変性が９５℃、５分；　３５−４５　ｃｙｃｌｅｓで変性が９５℃、３０分、アニーリングが５５−６７．５℃で３０秒、伸展が７２℃で３０秒、そして最終伸展を７２℃で２分とした。
【００７０】
蛍光法による遺伝子型の決定では、増幅したＤＮＡ　を９６穴プレートの各ウェルでストレプトアビジン結合磁気ビーズを含む溶液中で室温でインキュベートした。このプレートを磁気スタンド上に置き、各ウェルから上清を採取し、０．０１　Ｍ　ＮａＯＨを含む９６穴プレートの各ウェルに移した後、マイクロプレートリーダーによりＦＩＴＣは励起・蛍光波長が４８５と５３８　ｎｍ、ＴｘＲは励起・蛍光波長が５８４　と６１２　ｎｍで蛍光を測定した。また発光法による遺伝子型の決定では、増幅したＤＮＡ　を０．３　Ｍ　ＮａＯＨ　で変性させ、９６穴プレートの各ウェルの底面に固定したいずれかのアリル特異的補足プローブと３５−４０％ホルムアミドを含むハイブリダイゼーション緩衝液で３７℃、３０分間ハイブリダイゼーションを行った。ウェルを十分に洗浄した後、アルカリフォスファターゼ結合ストレプトアビジンを各ウェルに加え、プレートを３７℃で１５分間振騰した。ウェルを再度洗浄し、０．８　ｍＭ　２−（４−ｉｏｄｏｐｈｅｎｙｌ）−３−（４−ｎｉｔｒｏｐｈｅｎｙｌ）−５−（２，４−ｄｉｓｕｌｆｏｐｈｅｎｙｌ）−２Ｈ−ｔｅｔｒａｚｏｌｉｕｍ　（ｍｏｎｏｓｏｄｉｕｍ　ｓａｌｔ）と０．４　ｍＭ　５−ｂｒｏｍｏ−４−ｃｈｌｏｒｏ−３−ｉｎｄｏｌｙｌ　ｐｈｏｓｐｈａｔｅ　ｐ−ｔｏｌｕｉｄｉｎｅ　ｓａｌｔを含む溶液を加えた後、吸光度　４５０　ｎｍを測定した。
【００７１】
以上の方法による遺伝子型決定の精度を確認するために、５０人のＤＮＡサンプルを無作為に選びＰＣＲ−制限酵素断片長多型（ＰＣＲ−ＲＦＬＰ）法またはＰＣＲ産物の直接塩基配列決定法を行った。いずれのサンプルにおいてもアリル特異的プライマー・プローブ測定システムにより決定された遺伝子型はＰＣＲ−制限酵素断片長多型法またはＤＮＡ塩基配列決定法によって決定されたものと同一であった。
【００７２】
尚、以下の関連解析における統計解析は次のように行った。まず、データは平均±標準偏差で表示した。臨床データは心筋梗塞患者と対照との間でｕｎｐａｉｒｅｄ　Ｓｔｕｄｅｎｔ’ｓ　ｔ　ｔｅｓｔ　または　Ｍａｎｎ−Ｗｈｉｔｎｅｙ　Ｕ　ｔｅｓｔを用いて比較した。３群間のデータはｏｎｅ−ｗａｙ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　ｖａｒｉａｎｃｅ　またはＫｒｕｓｋａｌ−Ｗａｌｌｉｓ　ｔｅｓｔならびに　Ｓｃｈｅｆｆｅ’ｓ　ｐｏｓｔ−ｈｏｃ　ｔｅｓｔにより比較した。定性的データは　ｃｈｉ−ｓｑｕａｒｅ　ｔｅｓｔで検定した。アリル頻度は　ｇｅｎｅ　ｃｏｕｎｔｉｎｇ　ｍｅｔｈｏｄにより推定し、Ｈａｒｄｙ−Ｗｅｉｎｂｅｒｇ　ｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍから逸脱しているかどうかはｃｈｉ−ｓｑｕａｒｅ　ｔｅｓｔ　によって検定した。また、危険因子を補正した多因子ロジスティック回帰分析を行った。心筋梗塞は従属因子とし、年齢、ｂｏｄｙ　ｍａｓｓ　ｉｎｄｅｘ　（ＢＭＩ）、喫煙状況（０＝非喫煙，１＝喫煙）、代謝因子　（０＝高血圧・糖尿病・高コレステロール血症・高尿酸血症の経歴なし、１　＝　経歴あり）、それぞれの多型の遺伝子型を独立因子とした。それぞれの遺伝子型はｄｏｍｉｎａｎｔ（優性），　ｒｅｃｅｓｓｉｖｅ（劣性），　ａｄｄｉｔｉｖｅ　（付加）遺伝モデルで解析し、Ｐ値、オッズ比、９５％信頼区間（ＣＩ）を算出した。組み合わせ遺伝子型解析では、ロジスティック回帰分析のｓｔｅｐｗｉｓｅ　ｆｏｒｗａｒｄ　ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ　ｍｅｔｈｏｄ　によりそれぞれの遺伝子型についてのオッズ比を算出した。
【００７３】
＜実施例３＞　心筋梗塞関連多型の選択、及び心筋梗塞診断方法の開発
最初に７１遺伝子１１２多型に関するスクリーニング関連解析を男性４５１例（心筋梗塞２１９例、対照２３２例）、女性４５８例（心筋梗塞２２６例、対照２３２例）について行った。これらの症例は全体の５０６１例から無作為に選んだ。
以上の方法でスクリーニング関連解析を行った９０９例（男性４５１例、女性４５８例）の背景データを図５に示す。男性においては、年齢、ＢＭＩ、および従来の冠動脈疾患の危険因子である喫煙、高血圧、糖尿病、高コレステロール血症、高尿酸血症などの頻度には心筋梗塞群と対照群との間に有意差を認めなかった。　女性では、年齢、ＢＭＩ、および高血圧、高コレステロール血症、高尿酸血症などの頻度には心筋梗塞群と対照群との間に有意差を認めなかったが、喫煙および糖尿病の頻度は心筋梗塞群では対照群に比べ有意に高値であった。１１２多型と心筋梗塞とのスクリーニング関連解析において、年齢、ＢＭＩ、および喫煙、高血圧、糖尿病、高コレステロール血症、高尿酸血症の頻度を補正した多因子ロジスティック回帰分析により男性で１９個、女性で１８個の一塩基多型　（ＳＮＰ）　が心筋梗塞との関連を示した（図６）。尚、スクリーニング関連解析においてはロジスティック回帰分析においてＰ値＜０．１　の場合関連ありとするカテゴリーを用いた。これらのＳＮＰの中で、４個のＳＮＰが男女両方の心筋梗塞と関連し、他のＳＮＰは男女いずれか一方の心筋梗塞と関連した。
【００７４】
次に、これらの多型の遺伝子型を残りの４１５２例（男性心筋梗塞１７８４例、男性対照１０７４例、女性心筋梗塞５９０例、女性対照７０４　例）について決定した。次に、これらの多型と心筋梗塞との関連についての大規模関連解析を合計５０６１例（男性心筋梗塞２００３例、男性対照１３０６例、女性心筋梗塞８１６例、女性対照９３６例）において遂行した。
【００７５】
大規模関連解析における全５０６１例（男性３３０９、女性１７５２例）の背景データを図７に示す。男性では、年齢、ＢＭＩおよび喫煙の頻度には心筋梗塞群と対照群との間に有意差を認めなかったが、高血圧、高尿酸血症は心筋梗塞群が対照群に比べて有意に低く、糖尿病と高コレステロール血症の頻度は心筋梗塞群が対照群に比べ有意に高かった。女性では、年齢および高血圧の頻度には心筋梗塞群と対照群との間に有意差を認めなかったが、ＢＭＩおよび喫煙、糖尿病、高コレステロール血症、高尿酸血症の頻度は心筋梗塞群が対照群に比べ有意に高かった。男性１９　ＳＮＰ、女性１８　ＳＮＰと心筋梗塞との大規模関連解析において、年齢、ＢＭＩ、および喫煙、高血圧、糖尿病、高コレステロール血症、高尿酸血症の頻度を補正した多因子ロジスティック回帰分析により男性で１０個、女性で５個のＳＮＰが心筋梗塞と有意な関連を示した（ｄｏｍｉｎａｎｔ　または　ｒｅｃｅｓｓｉｖｅ　遺伝モデルのいずれかがＰ＜０．０５）（図８）。これらのＳＮＰについての遺伝子型の分布およびロジスティック回帰分析の結果を図８と図９にそれぞれ示す。
【００７６】
本実施例では多因子ロジスティック回帰分析のｓｔｅｐｗｉｓｅ　ｆｏｒｗａｒｄ　ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ　ｍｅｔｈｏｄ　を行った（図１０）。この方法では、図９に示したそれぞれのＳＮＰの心筋梗塞との関連におけるＰ値に基づいてｄｏｍｉｎａｎｔ又はｒｅｃｅｓｓｉｖｅ遺伝モデルを採用した。これらの遺伝子の染色体上の遺伝子座を図１０に示す。インターロイキン１０（Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ−１０）遺伝子の−８１９Ｔ→Ｃ多型と−５９２Ａ→Ｃ多型は連鎖不平衡にあった　［ｐａｉｒｗｉｓｅ　ｌｉｎｋａｇｅ　ｄｉｓｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ　ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ，　Ｄ’（Ｄ／Ｄｍａｘ），　ｏｆ　０．４０６；　ｓｔａｎｄａｒｄｉｚｅｄ　ｌｉｎｋａｇｅ　ｄｉｓｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ　ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ，　ｒ，　ｏｆ　０．３９６；　Ｐ　＜　０．０００１，　ｃｈｉ−ｓｑｕａｒｅ　ｔｅｓｔ］。腫瘍壊死因子α（Ｔｕｍｏｒ　ｎｅｃｒｏｓｉｓ　ｆａｃｔｏｒ−α）遺伝子と血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ（ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ　ｆａｃｔｏｒ　ａｃｅｔｙｌｈｙｄｒｏｌａｓｅ）遺伝子の遺伝子座は近接しているが、両者の多型における遺伝子型の分布には関連を認めなかった。同様に、プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１（ｐｌａｓｍｉｎｏｇｅｎ　ａｃｔｉｖａｔｏｒ　ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ−１　）遺伝子とｐａｒａｏｘｏｎａｓｅ　遺伝子の遺伝子座は近接しているが、両者の多型における遺伝子型の分布には関連を認めなかった。
【００７７】
Ｓｔｅｐｗｉｓｅ　ｆｏｒｗａｒｄ　ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ　ｍｅｔｈｏｄにより算出した組み合わせ遺伝子型による心筋梗塞罹患のオッズ比を、男性は図１１　と図１３（Ａ）に、女性は図１２と図１３（Ｂ）に示す。男性では、５個のＳＮＰ（ＴＳＰ４（１１８６Ｇ→Ｃ）多型、コネキシン３７（１０１９Ｃ→Ｔ）多型、ＰＡＦアセチルヒドロラーゼ（９９４Ｇ→Ｔ）多型、アンギオテンシノーゲン（−６Ｇ→Ａ）多型、腫瘍壊死因子α（−８６３Ｃ→Ａ）多型）　の組み合わせ遺伝子型により、最大のオッズ比が４．５０となった（図１１、図１３（Ａ）参照）。さらに５個のＳＮＰ（ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス（２４２Ｃ→Ｔ）多型、アポＥ（−２１９Ｇ→Ｔ）多型、アポＣ−ＩＩＩ（−４８２Ｃ→Ｔ）多型、ＩＬ−１０（−８１９Ｔ→Ｃ）多型、ＩＬ−１０（−５９２Ａ→Ｃ）多型）を加え全部で１０個のＳＮＰとした場合には最大のオッズ比が１１．２６となった（図１０と図１３（Ａ）参照）。女性では、５個のＳＮＰ（アポＥ（４０７０Ｃ→Ｔ）多型、グリコプロテインＩｂα（１０１８Ｃ→Ｔ）多型、ストロメライシン１（−１１７１／５Ａ→６Ａ）多型、ＰＡＩ１（−６６８／４Ｇ→５Ｇ）多型、パラオキソナーゼ（５８４Ｇ→Ａ）多型）の組み合わせ遺伝子型により、最大のオッズ比が８８．５１となった（図１２と図１３（Ｂ）参照）。
【００７８】
以上のように、本発明者らは７１候補遺伝子から選択した１１２多型と心筋梗塞との関連について検討し、５０６１例の大規模関連解析により心筋梗塞と関連するＳＮＰを男性で１０個、女性で５個同定した。さらに、多因子ロジスティック回帰分析のｓｔｅｐｗｉｓｅ　ｆｏｒｗａｒｄ　ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ　ｍｅｔｈｏｄにより男性では最大オッズ比１１．２６、女性では最大オッズ比８８．５１を呈する心筋梗塞リスク診断方法（心筋梗塞の遺伝的リスク診断システム）を開発した。
【００７９】
心筋梗塞の主な原因は動脈硬化性冠動脈疾患であり、これにより動脈内径の血行力学的な有意狭窄を生じ、血管の収縮拡張調節の異常を来し、動脈硬化巣の破裂や血栓形成を起こしやすくする。本発明者らは血管生物学、血小板・白血球生物学、凝固・線溶系、脂質・糖・その他の代謝因子などの包括的視点に基づいて７１個の候補遺伝子を選択した。実際、心筋梗塞と関連した遺伝子群はその発症病態において多彩な役割を有していた。すなわち、血管生物学（ｃｏｎｎｅｘｉｎ　３７，　ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨ　ｏｘｉｄａｓｅ　ｐ２２　ｐｈｏｘ，　ａｎｄ　ｔｈｒｏｍｂｏｓｐｏｎｄｉｎ　４）、血管の炎症（ｔｕｍｏｒ　ｎｅｃｒｏｓｉｓ　ｆａｃｔｏｒ−α，　ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ　ｆａｃｔｏｒ　ａｃｅｔｙｌｈｙｄｒｏｌａｓｅ，　ａｎｄ　ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ−１０）、高血圧（ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎｏｇｅｎ）、脂質代謝（ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ　ａｎｄ　Ｃ−ＩＩＩ　ａｎｄ　ｐａｒａｏｘｏｎａｓｅ）、血小板機能（ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｉｂα）、基質代謝（ｓｔｒｏｍｅｌｙｓｉｎ−１）、線溶系（ＰＡＩ−１）などである（Ｂｏｅｒｍａ　Ｍ，　Ｆｏｒｓｂｅｒｇ　Ｌ，　ｖａｎ　Ｚｅｉｊｌ　Ｌ，　ｅｔ　ａｌ．　Ａ　ｇｅｎｅｔｉｃ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｉｎ　ｃｏｎｎｅｘｉｎ　３７　ａｓ　ａ　ｐｒｏｇｎｏｓｔｉｃ　ｍａｒｋｅｒ　ｆｏｒ　ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｔｉｃ　ｐｌａｑｕｅ　ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ．　Ｊ　Ｉｎｔｅｒｎ　Ｍｅｄ　１９９９；２４６：２１１−２１８．、Ｉｎｏｕｅ　Ｎ，　ＫａｗａｓｈｉｍａＳ，　Ｋａｎａｚａｗａ　Ｋ，　Ｙａｍａｄａ　Ｓ，　Ａｋｉｔａ　Ｈ，　Ｙｏｋｏｙａｍａ　Ｍ．　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｏｆ　ｔｈｅ　ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨ　ｏｘｉｄａｓｅ　ｐ２２　ｐｈｏｘ　ｇｅｎｅ　ｉｎ　ｐａｔｉｅｎｔｓ　ｗｉｔｈ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ａｒｔｅｒｙ　ｄｉｓｅａｓｅ．　Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ　１９９８；９７：１３５−１３７．、Ｔｏｐｏｌ　ＥＪ，　ＭｃＣａｒｔｈｙ　Ｊ，　Ｇａｂｒｉｅｌ　Ｓ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｓｉｎｇｌｅ　ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ　ｉｎ　ｍｕｌｔｉｐｌｅ　ｎｏｖｅｌ　ｔｈｒｏｍｂｏｓｐｏｎｄｉｎ　ｇｅｎｅｓ　ｍａｙ　ｂｅ　ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ　ｗｉｔｈ　ｆａｍｉｌｉａｌ　ｐｒｅｍａｔｕｒｅ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ．　Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ　２００１；１０４：２６４１−２６４４．、Ｓｋｏｏｇ　Ｔ，　ｖａｎ’ｔ　Ｈｏｏｆｔ　ＦＭ，　Ｋａｌｌｉｎ　Ｂ，　ｅｔ　ａｌ．　Ａ　ｃｏｍｍｏｎｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　（Ｃ→Ａ　ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ　ａｔ　ｐｏｓｉｔｉｏｎ　−８６３）　ｉｎ　ｔｈｅ　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｒｅｇｉｏｎ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｔｕｍｏｒ　ｎｅｃｒｏｓｉｓ　ｆａｃｔｏｒ−α　（ＴＮＦ−α）　ｇｅｎｅ　ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ　ｗｉｔｈ　ｒｅｄｕｃｅｄ　ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ　ｌｅｖｅｌ　ｏｆ　ＴＮＦ−α．　Ｈｕｍ　Ｍｏｌ　Ｇｅｎｅｔ　１９９９；８：１４４３−１４４９．、Ｙａｍａｄａ　Ｙ，　Ｉｃｈｉｈａｒａ　Ｓ，　Ｆｕｊｉｍｕｒａ　Ｔ，　Ｙｏｋｏ��ａ　Ｍ．　Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ　ｏｆ　ｔｈｅ　Ｇ９９４→Ｔ　ｍｉｓｓｅｎｓｅ　ｍｕｔａｔｉｏｎ　ｉｎ　ｅｘｏｎ　９　ｏｆ　ｔｈｅ　ｐｌａｓｍａ　ｐｌａｔｅｌｅｔ−ａｃｔｉｖａｔｉｎｇ　ｆａｃｔｏｒａｃｅｔｙｌｈｙｄｒｏｌａｓｅ　ｇｅｎｅ　ａｓ　ａｎ　ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ　ｒｉｓｋ　ｆａｃｔｏｒ　ｆｏｒ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ａｒｔｅｒｙ　ｄｉｓｅａｓｅ　ｉｎ　Ｊａｐａｎｅｓｅ　ｍｅｎ．　Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ　１９９８；４７：１７７−１８１．、Ｋｏｃｈ　Ｗ，　Ｋａｓｔｒａｔｉ　Ａ，　Ｂｏｔｔｉｇｅｒ　Ｃ，　Ｍｅｈｉｌｌｉ　Ｊ，　ｖｏｎ　Ｂｅｃｋｅｒａｔｈ　Ｎ，　Ｓｃｈｏｍｉｇ　Ａ．　Ｉｎｔｅｒｌｅｕｋｉｎ−１０　ａｎｄ　ｔｕｍｏｒ　ｎｅｃｒｏｓｉｓ　ｆａｃｔｏｒ　ｇｅｎｅ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ　ａｎｄ　ｒｉｓｋ　ｏｆ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ａｒｔｅｒｙ　ｄｉｓｅａｓｅ　ａｎｄ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ．　Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ　２００１；１５９：１３７−１４４．、ＩｎｏｕｅＩ，　Ｎａｋａｊｉｍａ　Ｔ，　Ｗｉｌｌｉａｍｓ　ＣＳ，　ｅｔ　ａｌ．　Ａ　ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ　ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｏｆ　ｈｕｍａｎ　ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎｏｇｅｎ　ｉｓ　ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ　ｗｉｔｈ　ｅｓｓｅｎｔｉａｌ　ｈｙｐｅｒｔｅｎｓｉｏｎａｎｄ　ａｆｆｅｃｔｓ　ｂａｓａｌ　ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ　ｉｎ　ｖｉｔｒｏ．　Ｊ　Ｃｌｉｎ　Ｉｎｖｅｓｔ　１９９７；９９：１７８６−１７９７．、Ｌａｍｂｅｒｔ　Ｊ−Ｃ，　Ｂｒｏｕｓｓｅａｕ　Ｔ，　Ｄｅｆｏｓｓｅ　Ｖ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｔ　ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｏｆ　ａｎ　ＡＰＯＥ　ｇｅｎｅ　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｗｉｔｈ　ｉｎｃｒｅａｓｅｄ　ｒｉｓｋ　ｏｆ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ　ａｎｄ　ｄｅｃｒｅａｓｅｄ　ＡＰＯＥ　ｐｌａｓｍａ　ｃｏｎｃｅｎｔｒｅａｔｉｏｎｓ−ｔｈｅ　ＥＣＴＩＭ　ｓｔｕｄｙ．　Ｈｕｍ　Ｍｏｌ　Ｇｅｎｅｔ　２０００；９：５７−６１．、Ｅｔｏ　Ｍ，　Ｗａｔａｎａｂｅ　Ｋ，　Ｍａｋｉｎｏ　Ｉ．　Ｉｎｃｒｅａｓｅｄ　ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ　ｏｆ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　ｅｐｓｉｌｏｎ　２　ａｎｄ　ｅｐｓｉｌｏｎ　４　ａｌｌｅｌｅｓ　ｉｎ　ｐａｔｉｅｎｔｓ　ｗｉｔｈｉｓｃｈｅｍｉｃ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ．　Ｃｌｉｎ　Ｇｅｎｅｔ　１９８９；３６：１８３−１８８．、Ｒｕｉｚ　Ｊ，　Ｂｌａｎｃｈｅ　Ｈ，Ｊａｍｅｓ　ＲＷ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｇｌｎ−Ａｒｇ１９２　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ　ｏｆ　ｐａｒａｏｘｏｎａｓｅ　ａｎｄ　ｃｏｒｏｎａｒｙ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ　ｉｎ　ｔｙｐｅ　２　ｄｉａｂｅｔｅｓ．　Ｌａｎｃｅｔ　１９９５；３４６：８６９−７２．、Ｍｕｒａｔａ　Ｍ，　Ｍａｔｓｕｂａｒａ　Ｙ，　Ｋａｗａｎｏ　Ｋ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｃｏｒｏｎａｒｙ　ａｒｔｅｒｙ　ｄｉｓｅａｓｅ　ａｎｄ　ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ　ｉｎ　ａ　ｒｅｃｅｐｔｏｒ　ｍｅｄｉａｔｉｎｇ　ｓｈｅａｒ　ｓｔｒｅｓｓ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ　ｐｌａｔｅｌｅｔ　ａ��ｔｉｖａｔｉｏｎ．　Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ　１９９７；９６：３２８１−３２８６．、Ｅｒｉｋｓｓｏｎ　Ｐ，　Ｋａｌｌｉｎ　Ｂ，　ｖａｎ’ｔ　Ｈｏｏｆｔ　ＦＭ，　Ｂａｖｅｎｈｏｌｍ　Ｐ，　Ｈａｍｓｔｅｎ　Ａ．　Ａｌｌｅｌｅ−ｓｐｅｃｉｆｉｃ　ｉｎｃｒｅａｓｅ　ｉｎ　ｂａｓａｌ　ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｐｌａｓｍｉｎｏｇｅｎ−ａｃｔｉｖａｔｏｒ　ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ　１　ｇｅｎｅ　ｉｓ　ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ　ｗｉｔｈ　ｍｙｏｃａｒｄｉａｌ　ｉｎｆａｒｃｔｉｏｎ．　Ｐｒｏｃ　Ｎａｔｌ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ　１９９５；９２：１８５１−１８５５．、Ｙｅ　Ｓ，　Ｗａｔｔｓ　ＧＦ，　Ｍａｎｄａｌｉａ　Ｓ，　Ｈｕｍｐｈｒｉｅｓ　ＳＥ，　Ｈｅｎｎｅｙ　ＡＭ．　Ｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｙ　ｒｅｐｏｒｔ：　ｇｅｎｅｔｉｃ　ｖａｒｉａｔｉｏｎ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｈｕｍａｎ　ｓｔｒｏｍｅｌｙｓｉｎ　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｉｓ　ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ　ｗｉｔｈ　ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ　ｏｆ　ｃｏｒｏｎａｒｙａｔｙｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ．　Ｂｒ　Ｈｅａｒｔ　Ｊ　１９９５；７３：２０９−２１５．）。本発明者らは１１２遺伝子多型を９０９　例において検討し、さらに１９個のＳＮＰを男性２８５８例で、１８個のＳＮＰを女性１２９４例で検討した結果、合計で１７９，４０２個の遺伝子型を決定した。この遺伝子型決定数は今まで報告された遺伝子多型の関連解析の中で最大のものである。以上の実施例で示された心筋梗塞リスク診断方法は最大オッズ比が男性で１１．２６、女性で８８．５１を呈し、これも今までに報告された大規模関連解析の中で最大のオッズ比である。
【００８０】
心筋梗塞と関連した１５個のＳＮＰの中で、アポリポプロテインＥ（ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎＥ）　遺伝子の４０７０Ｔ→Ｃ　（Ａｒｇ１５８Ｃｙｓ）多型が女性の心筋梗塞リスクとして最大のオッズ比を示した。アポリポプロテインＥはカイロミクロンと超低密度リポプロテイン（ｖｅｒｙ　ｌｏｗ　ｄｅｎｓｉｔｙ　ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ：ＶＬＤＬ）レムナントの主要構成成分であり、肝臓での受容体によるこれらのリポタンパクの取り込みに際し、リガンドとして働く（Ｍａｈｌｅｙ　ＲＷ．　Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ：　ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ　ｔｒａｎｓｐｏｒｔ　ｐｒｏｔｅｉｎ　ｗｉｔｈ　ｅｘｐａｎｄｉｎｇ　ｒｏｌｅ　ｉｎ　ｃｅｌｌ　ｂｉｏｌｏｇｙ．　Ｓｃｉｅｎｃｅ　１９９８；２４０：６２２−６３０．）。アポリポプロテインＥ遺伝子の１５８Ｃｙｓ　（ε２）アリルはレムナントリポタンパクの肝臓の受容体への結合異常を来し（Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ　ＷＪ，　Ｋｏｖａｎｅｎ　ＰＴ，　Ｂｒｏｗｎ　ＭＳ，　ｅｔ　ａｌ．　Ｆａｍｉｌｉａｌ　ｄｙｓｂｅｔａｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａ．　Ａｂｎｏｒｍａｌ　ｂｉｎｄｉｎｇ　ｏｆ　ｍｕｔａｎｔ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ　ｔｏ　ｌｏｗ　ｄｅｎｓｉｔｙ　ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ　ｏｆ　ｈｕｍａｎ　ｆｉｂｒｏｂｌａｓｔｓ　ａｎｄ　ｍｅｍｂｒａｎｅｓ　ｆｒｏｍ　ｌｉｖｅｒ　ａｎｄ　ａｄｒｅｎａｌ　ｏｆ　ｒａｔｓ，　ｒａｂｂｉｔｓ，　ａｎｄ　ｃｏｗｓ．　Ｊ　Ｃｌｉｎ　Ｉｎｖｅｓｔ　１９８１；６８：１０７５−１０８５．）、血漿からの除去の遅延を生ずる（Ｇｒｅｇｇ　ＲＥ，　Ｚｅｃｈ　ＬＡ，　ＳｃｈａｅｆｅｒＥＪ，　Ｂｒｅｗｅｒ　ＨＢ　Ｊｒ．　Ｔｙｐｅ　ＩＩＩ　ｈｙｐｅｒｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａ：　ｄｅｆｅｃｔｉｖｅ　ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ　ｏｆ　ａｎ　ａｂｎｏｒｍａｌ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ．　Ｓｃｉｅｎｃｅ　１９８１；２１１：５８４−５８６．）。家族性ｄｙｓｂｅｔａｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａ　（ＦＤ，　またはＩＩＩ型高リポタンパク血症）患者の多くは、Ａｒｇ１５８Ｃｙｓ多型のホモ接合体である（Ｂｒｅｓｌｏｗ　ＪＬ，　Ｚａｎｎｉｓ　ＶＩ，　ＳａｎＧｉａｃｏｍｏ　ＴＲ，　Ｔｈｉｒｄ　ＪＬ，　Ｔｒａｃｙ　Ｔ，　Ｇｌｕｅｃｋ　ＣＪ．　Ｓｔｕｄｉｅｓ　ｏｆ　ｆａｍｉｌｉａｌ　ｔｙｐｅ　ＩＩＩ　ｈｙｐｅｒｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａ　ｕｓｉｎｇ　ａｓ　ａ　ｇｅｎｅｔｉｃ　ｍａｒｋｅｒ　ｔｈｅ　ａｐｏ　Ｅ　ｐｈｅｎｏｔｙｐｅ　Ｅ２／２．　Ｊ　Ｌｉｐｉｄ　Ｒｅｓ　１９８２；２３：１２２４−１２３５．）。しかし、１５８Ｃｙｓ／Ｃｙｓホモ接合体のうち　わずか１〜４％しか家族性ｄｙｓｂｅｔａｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａを発症しないことから、他の遺伝因子あるいは環境因子が本疾患の発症に必要であると思われる。家族性ｄｙｓｂｅｔａｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａ患者における動脈硬化性レムナントリポタンパク（β−ＶＬＤＬ）の血漿中への蓄積（Ｍａｈｌｅｙ　ＲＷ．　Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅ：　ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ　ｔｒａｎｓｐｏｒｔ　ｐｒｏｔｅｉｎ　ｗｉｔｈ　ｅｘｐａｎｄｉｎｇ　��ｏｌｅ　ｉｎ　ｃｅｌｌ　ｂｉｏｌｏｇｙ．　Ｓｃｉｅｎｃｅ　１９９８；２４０：６２２−６３０．）あるいはヒト１５８Ｃｙｓ／Ｃｙｓを過剰発現したマウス（Ｓｕｌｌｉｖａｎ　ＰＭ，　Ｍｅｚｄｏｕｒ　Ｈ，　Ｑｕａｒｆｏｒｄｔ　ＳＨ，　Ｍａｅｄａ　Ｎ．　Ｔｙｐｅ　ＩＩＩ　ｈｙｐｅｒｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｅｍｉａ　ａｎｄ　ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓ　ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ　ｉｎ　ｍｉｃｅ　ｒｅｓｕｌｔｉｎｇｆｒｏｍ　ｇｅｎｅ　ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ　ｏｆ　ｍｏｕｓｅ　Ａｐｏｅ　ｗｉｔｈ　ｈｕｍａｎ　ＡＰＯＥ＊２．　Ｊ　Ｃｌｉｎ　Ｉｎｖｅｓｔ　１９９８；１０２：１３０−１３５．）　は、動脈硬化の進展促進が認められる。Ｅｔｏらはε２　（１５８Ｃｙｓ）アリルが日本人の男性（オッズ比　２．４４，　ε２　ａｌｌｅｌｅ　対ε３／ε３型）　および女性　（オッズ比　３．０３）で冠動脈疾患と関連することを報告した（Ｅｔｏ　Ｍ，　Ｗａｔａｎａｂｅ　Ｋ，　Ｍａｋｉｎｏ　Ｉ．　Ｉｎｃｒｅａｓｅｄ　ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ　ｏｆ　ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ　ｅｐｓｉｌｏｎ　２　ａｎｄ　ｅｐｓｉｌｏｎ　４　ａｌｌｅｌｅｓ　ｉｎ　ｐａｔｉｅｎｔｓ　ｗｉｔｈ　ｉｓｃｈｅｍｉｃ　ｈｅａｒｔ　ｄｉｓｅａｓｅ．　Ｃｌｉｎ　Ｇｅｎｅｔ　１９８９；３６：１８３−１８８．）。ＴＴ　型　（１５８Ｃｙｓ／Ｃｙｓ）　が心筋梗塞罹患の危険因子となるという本発明者らの結果は、Ｅｔｏらの結果と一致する。
【００８１】
以上の実施例で検討したＳＮＰのいくつかは、その近傍に存在する心筋梗塞発症と真に関連する遺伝子のＳＮＰと連鎖不平衡にある可能性がある。しかしながら、男性で９個、女性で５個の遺伝子が日本人の心筋梗塞感受性遺伝子座であることが示された。さらに、組み合わせ遺伝子型により信頼性および予知確率の高いリスク診断が可能になった。このことから、本発明の診断方法は心筋梗塞の一次予防および中高年者の生活の質の改善ならびに医療費の削減に貢献できることが期待される。
【００８２】
この発明は、上記発明の実施の形態及び実施例の説明に何ら限定されるものではない。特許請求の範囲の記載を逸脱せず、当業者が容易に想到できる範囲で種々の変形態様もこの発明に含まれる。
【００８３】
【発明の効果】
本発明によれば心筋梗塞に関連する遺伝子多型が解析され、核酸試料の遺伝子型が検出される。この遺伝子型の検出によって得られる多型情報を用いることにより、高精度で予知確率の高い心筋梗塞のリスク診断を行うことができる。したがって、本発明は心筋梗塞の発症リスクを事前に知る有効な手段となる。また、本発明によればこれらの疾患の診断に有用な補助的情報が得られ、より適切な治療を可能とし予後の改善などを図ることができる。更に本発明は、心筋梗塞の発症メカニズムを解明する上での有効な情報を提供し、心筋梗塞の予防、治療へ貢献することが期待される。
【００８４】
以下、次の事項を開示する。
１１．以下の工程（ａ１）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ａ１）核酸試料における、以下の（１）〜（１０）の多型を解析する工程、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型。
１２．以下の工程（ｂ１）を含んでなる、核酸試料の遺伝子型を検出する方法、
（ｂ１）核酸試料における、以下の（１１）〜（１５）の多型を解析する工程、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型。
１３．以下の工程（Ｉ）〜（ＩＩＩ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（Ｉ）核酸試料における、以下の（１）〜（１０）の多型を解析する工程、
（１）コネキシン３７遺伝子の塩基番号１０１９位の多型、
（２）腫瘍壊死因子α遺伝子の塩基番号−８６３位の多型、
（３）ＮＡＤＨ／ＮＡＤＰＨオキシダーゼｐ２２フォックス遺伝子の塩基番号２４２位の多型、
（４）アンギオテンシノーゲン遺伝子の塩基番号−６位の多型、
（５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号−２１９位の多型、
（６）血小板活性化因子アセチルヒドロラーゼ遺伝子の塩基番号９９４位の多型、
（７）アポリポプロテインＣ−ＩＩＩ遺伝子の塩基番号−４８２位の多型、
（８）トロンボスポンジン４遺伝子の塩基番号１１８６位の多型、
（９）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−８１９位の多型、及び
（１０）インターロイキン１０遺伝子の塩基番号−５９２位の多型、
（ＩＩ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ＩＩＩ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
１４．以下の工程（ＩＶ）〜（ＶＩ）を含んでなる、心筋梗塞のリスク診断方法、
（ＩＶ）核酸試料における、以下の（１１）〜（１５）の多型を解析する工程、
（１１）ストロメライシン１遺伝子の塩基番号−１１７１位の多型、
（１２）プラスミノーゲン活性化因子インヒビター１遺伝子の塩基番号−６６８位の多型、
（１３）グリコプロテインＩｂα遺伝子の塩基番号１０１８位の多型、
（１４）パラオキソナーゼ遺伝子の塩基番号５８４位の多型、及び
（１５）アポリポプロテインＥ遺伝子の塩基番号４０７０位の多型、
（Ｖ）前記工程によって得られる多型情報から核酸試料の遺伝子型を決定する工程、及び
（ＶＩ）決定された遺伝子型から心筋梗塞の遺伝的リスクを求める工程。
【００８５】
【配列表】
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【図面の簡単な説明】
【図１】図１は、実施例におけるスクリーニング関連解析において検討した１１２遺伝子多型をまとめた表である。
【図２】図２は、同じく実施例におけるスクリーニング関連解析において検討した１１２遺伝子多型をまとめた表である。
【図３】図３は、実施例において遺伝子型を決定するために使用されるプライマー（上から順に配列番号３０、３１、３２、２１、２２、２３、１５、１６、１７、２４、２５、２６、１８、１９、２０、３３、３４、３５、４２、４３、４４）、プローブ（上から順に配列番号５９、６０）及びその他の条件をまとめた表である。図中、ＦＩＴＣはフルオレセインイソチオシアネートを、ＴｘＲはテキサスレッドをそれぞれ表す。
【図４】図４は、同じく実施例において遺伝子型を決定するために使用されるプライマー（上から順に配列番号２７、２８、２９、３９、４０、４１、３６、３７、３８、５３、５４、５５、５６、５７、５８、４８、４９、４５、４６、４７、５０、５１、５２）、プローブ（上から順に配列番号６１、６２、６３、６４）及びその他の条件をまとめた表である。図中、ＦＩＴＣはフルオレセインイソチオシアネートを、ＴｘＲはテキサスレッドをそれぞれ表す。
【図５】図５は、実施例のスクリーニング関連解析における対象９０９例の背景をまとめた表である。年齢とＢｏｄｙ　ｍａｓｓ　ｉｎｄｅｘのデータは平均±標準偏差で表される。表中、＊１はＰ＝０．０２７８を、＊２はＰ＜０．０００１　ｖｅｒｓｕｓ　ｃｏｎｔｒｏｌｓをそれぞれ表す。
【図６】図６は、実施例のスクリーニング関連解析において心筋梗塞との関連が認められた遺伝子多型をまとめた表である。
【図７】図７は、実施例における関連解析の全対象５０６１例の背景をまとめた表である。年齢とＢｏｄｙ　ｍａｓｓ　ｉｎｄｅｘのデータは平均±標準偏差で表される。表中、＊１はＰ＝０．０２２を、＊２はＰ＜０．００１を、＊３はＰ＝０．０１７をそれぞれ表す。
【図８】図８は、実施例における関連解析の全対象５０６１例において心筋梗塞との関連が認められた遺伝子多型の遺伝子型分布をまとめた表である。
【図９】図９は、実施例における関連解析の全対象５０６１例における遺伝子多型と心筋梗塞の多因子ロジスティック回帰分析の結果を示す表である。表中、ＯＲはオッズ比を、ＣＩは信頼区間をそれぞれ表す。
【図１０】図１０は、心筋梗塞と関連のある遺伝子多型における多因子ロジスティック回帰分析のｓｔｅｐｗｉｓｅ　ｆｏｒｗａｒｄ　ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ　ｍｅｔｈｏｄの結果を示す表である。表中、ＣＩは信頼区間を表す。
【図１１】図１１は、男性における５個の組合せ遺伝子多型を用いた心筋梗塞の遺伝的リスク（発症リスク）診断の結果を示す表である。
【図１２】図１２は、女性における５個の組合せ遺伝子多型を用いた心筋梗塞の遺伝的リスク（発症リスク）診断の結果を示す表である。
【図１３】図１３は、組み合わせる遺伝子多型の数と心筋梗塞罹患のオッズ比の関係を表すグラフである。尚、（Ａ）が男性を対象とした場合、（Ｂ）が女性を対象とした場合である。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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