(57)【要約】      （修正有）【課題】精巣、脾臓、腎臓、肺などの増殖・分化やその機能保全に関わる、あるいは癌や自己免疫疾患・アレルギーのような細胞の増殖・分化やその機能保全あるいは老化に関わる予防薬、治療薬、または検査薬のスクリーニング等に有用な新規ＤＮＡ及び該ＤＮＡを含む遺伝子、該ＤＮＡにコードされる新規ポリペプチド及び該ポリペプチドを含む組換え蛋白質、新規ポリペプチドに対する抗体を提供すること。【解決手段】以下の（ａ）又は（ｂ）のポリペプチドをコードする塩基配列から成るＤＮＡ：（ａ）特定配列で示されるアミノ酸配列と同一又は実質的に同一のアミノ酸配列の一部又は全部から成るポリペプチド、（ｂ）特定配列で示されるアミノ酸配列において、一部のアミノ酸が欠失、置換又は付加されたアミノ酸配列から成り、（ａ）のポリペプチドと実質的に同質の生物学的活性を有するポリペプチド。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の（ａ）又は（ｂ）のポリペプチドをコードする塩基配列から成るＤＮＡ：（ａ）配列番号：１で示されるアミノ酸配列と同一又は実質的に同一のアミノ酸配列の一部又は全部から成るポリペプチド；又は（ｂ）配列番号：１で示されるアミノ酸配列において、一部のアミノ酸が欠失、置換又は付加されたアミノ酸配列から成り、（ａ）のポリペプチドと実質的に同質の生物学的活性を有するポリペプチド。
【請求項２】
以下の（ａ）、（ｂ）又は（ｃ）のＤＮＡ：（ａ）配列番号：２で示される塩基配列において、配列番号：１で示されるアミノ酸配列の一部又は全部をコードするＤＮＡ；（ｂ）（ａ）のＤＮＡと相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ；又は（ｃ）（ａ）のＤＮＡと相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、（ａ）のＤＮＡがコードするポリペプチドと実質的に同質の生物学的活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ。
【請求項３】
請求項１又は２記載のＤＮＡを含む哺乳動物由来遺伝子。
【請求項４】
請求項３記載の哺乳動物が齧歯類である齧歯類由来遺伝子。
【請求項５】
請求項４記載の齧歯類がマウスであるマウス遺伝子。
【請求項６】
以下の（ａ）又は（ｂ）のポリペプチド：（ａ）配列番号：１で示されるアミノ酸配列と同一又は実質的に同一のアミノ酸配列の一部または全部から成るポリペプチド；又は（ｂ）配列番号：１で示されるアミノ酸配列において、一部のアミノ酸が欠失、置換又は付加されたアミノ酸配列の一部または全部から成り、（ａ）のポリペプチドと実質的に同質の生物学的活性を有するポリペプチド。
【請求項７】
請求項１若しくは２記載のＤＮＡ、又は請求項３ないし５のいずれか一項に記載の遺伝子を導入した宿主細胞で作製される組換え蛋白質である、請求項６記載のポリペプチド。
【請求項８】
請求項１若しくは２記載のＤＮＡ、又は請求項３ないし５のいずれか一項に記載の遺伝子を含む組換えベクター。
【請求項９】
請求項６又は７記載のポリペプチドに特異的に結合する抗体。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は、ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フ及びプロリンに富む配列を有し、かつ精巣、脾臓、腎臓、肺などに強発現が認められる新規ＤＮＡ及び該ＤＮＡを含む遺伝子、該ＤＮＡにコードされる新規ポリペプチド及び該ポリペプチドを含む組換え蛋白質、並びに、新規ポリペプチドに対する抗体等に関する。
【０００２】
【従来の技術】
近年のヒトゲノムプロジェクト及びヒトｃＤＮＡプロジェクトの成功により、多くのヒト疾患関連遺伝子が同定あるいは推定されるにいたった。しかしながらその一方で倫理上の問題からヒト遺伝子を用いた研究には制約があり、新たな研究の方向性が模索されている。このような観点からモデル生物における相同遺伝子を同定することは、研究を進展させる意味できわめて重要なステップと考えられる。特にマウスは最も研究が進んでいるモデル生物で、ゲノム情報や変異種の情報も比較的多く蓄積されているが、蓄積されたゲノム情報はまだ十分なものではない。一方、生体内で発現している遺伝子を解析する手段として、ｃＤＮＡの配列をランダムに解析する研究がなされ、得られたｃＤＮＡの断片配列がＥｘｐｒｅｓｓｅｄ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｔａｇ（ＥＳＴ）としてデータベースに登録、公開がなされた。しかし、多くのＥＳＴは１００塩基長から５００塩基長といった短い塩基配列情報のみであり、その機能を推定することは困難である。
【０００３】
精巣、脾臓、腎臓、肺などでは、多くのホルモン、ホルモン様物質、神経伝達物質あるいは生理活性物質による調節のもとで生理的な機能の調節が行なわれている。また、各種組織における機能の調節には、機能を受け持つ特異的な細胞の増殖あるいは同細胞の活性化が関係している。従って、精巣、脾臓、腎臓、肺などに強く発現している新規な遺伝子を取得して、その遺伝子にコードされる精巣、脾臓、腎臓、肺などにおける複雑な機能を調節する蛋白質を得ることは、医薬品開発に有用である。また、得られた蛋白質に対するアゴニスト、アンタゴニストを効率よくスクリーニングし、医薬品を開発するためには、生体内で発現している該蛋白質の遺伝子の機能をホモロジー検索から推定し、その情報を基にして該蛋白質を適当な発現系で発現させて組換え蛋白質を得、更にして該蛋白質に特異的に結合する抗体を得ることが必要であった。
【０００４】
長鎖ヒトｃＤＮＡプロジェクトにて、ヒト脳由来のヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子（０．  Ｎａｇａｓｅ，Ｔ．，  Ｉｓｈｉｋａｗａ，Ｋ．，  Ｍｉｙａｊｉｍａ，Ｎ．，  Ｔａｎａｋａ，Ａ．，  Ｋｏｔａｎｉ，Ｈ．，  Ｎｏｍｕｒａ，Ｎ．  ａｎｄ  Ｏｈａｒａ，Ｏ．  Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｃｏｄｉｎｇ  ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  ｕｎｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ  ｈｕｍａｎ  ｇｅｎｅｓ．  ＩＸ．Ｔｈｅ  ｃｏｍｐｌｅｔｅ  ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  １００  ｎｅｗ  ｃＤＮＡ  ｃｌｏｎｅｓ  ｆｒｏｍ  ｂｒａｉｎ  ｗｈｉｃｈ  ｃｏｄｅ  ｆｏｒｌａｒｇｅ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｉｎ  ｖｉｔｒｏ．，  ＤＮＡ  Ｒｅｓ．  ５：３１−３９  （１９９８））が報告されているが、その機能については不明であった。ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子は染色体１２ｑ１３．３に存在し、更に、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子のＳＮＰｓも複数箇所報告されており（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ：８０／ｅｎｔｒｅｚ／ｑｕｅｒｙ．ｆｃｇｉ？ｄｂ＝ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ＆ｃｍｄ＝Ｄｉｓｐｌａｙ＆ｄｏｐｔ＝ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ＿ｓｎｐ＆ｆｒｏｍ＿ｕｉｄ＝３０４３６１５）、ヒト疾患の大部分が単なる遺伝子の欠失によって引き起こされるのではなくて、アミノ酸置換によって蛋白質の機能や活性が一部分だけ変化することにより引き起こされることを鑑みると、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子は各種臓器の分化やその機能保全に関わる、あるいは癌、自己免疫疾患、及びアレルギーといった細胞の増殖・分化に関わる疾患に関与している可能性が考えられた考えられる。ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子が、ヒトＫＩＡＡ１７６８遺伝子にコードされる蛋白質にはＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチーフ、あるいはＴＰＲ繰り返しモチーフが認められ、ＴＰＲ遺伝子ファミリーに属していることが判明していた。しかしながら、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子が、ヒトＫＩＡＡ１７６８遺伝子にコードされる蛋白質にはＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチーフ以外特徴的なモチーフが認められず遺伝子情報としては不十分であり、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子の機能を推定することが出来なかった。
【０００５】
【非特許文献１】
１．  Ｇｏｅｂｌ，  Ｍ．  ａｎｄ  Ｙａｎａｇｉｄａ  Ｍ．  （１９９１）  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  １６：１７３−１７７，    Ｔｈｅ  ＴＰＲ  ｓｎａｐ  ｈｅｌｉｘ：  ａ  ｎｏｂｅｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｒｅｐｅａｔ  ｍｏｔｉｆ  ｆｒｏｍ  ｍｉｔｏｓｉｓ  ｔｏ  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ．
【非特許文献２】
２．  Ｌａｍｂ，  Ｊ．Ｒ  ｅｔ  ａｌ．  （１９９５）  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  ２０：２５７−２５９，  Ｔｅｔｒａｔｒｉｃｏ  ｐｅｐｔｉｄｅ  ｒｅｐｅａｔ  ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ：  ｔｏ  ＴＰＲ  ｏｒ  ｎｏｔ  ｔｏ  ＴＰＲ？
【非特許文献３】
３．  ＭｃＤｏｎａｌｄ，  Ｗ．Ｈ．  ｅｔ  ａｌ．  （１９９９）  Ｍｏｌ．  Ｃｅｌｌ．  Ｂｉｏｌ．，  １９：５，３５２−５，３６２，  Ｍｙｂ−ｒｅｌａｔｅｄ  ｆｉｓｓｉｏｎ  Ｙｅａｓｔ  ｃｄｃ５ｐ  ｉｓ  ａ  ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ  ｏｆ  ａ  ４０  Ｓ  ｓｎＲＮＰ−ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ  ｃｏｍｐｌｅｘ  ａｎｄ  ｉｓ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌ  ｆｏｒ  ｐｒｅ−ｍＲＮＡ  ｓｐｌｉｃｉｎｇ．
【非特許文献４】
４．  Ｂｅｌｌ，  Ｍ．  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  ＥＭＢＯ  Ｊ．，  ２１：２，７２４−２，７３５，  ｐ１１０，  ａ  ｎｏｖｅｌ  ｈｕｍａｎ  Ｕ６  ｓｎＲＮＰ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ａｎｄ  Ｕ４／Ｕ６  ｓｎＲＮＰ  ｒｅｃｙｃｌｉｎｇ  ｆａｃｔｏｒ．
【非特許文献５】
５．  Ｐｒｅｋｅｒ，  Ｐ．Ｊ．  ａｎｄ  Ｋｅｌｌｅｒ，  Ｗ．  （１９９８）  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  ２３：１５−１６，    Ｔｈｅ  ＨＡＴ  ｈｅｌｉｘ，  ａ  ｒｅｐｅｔｉｔｉｖｅ  ｍｏｔｉｅｆ  ｉｍｐｌｉｃａｔｅｄ  ｉｎ  ＲＮＡ  ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ．
【非特許文献６】
６．  Ｍａｃｉａｓ，  Ｍ．Ｊ．  ｅｔ  ａｌ．  （２００２）  ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，  ５１３：３０−３７，  ＷＷ  ａｎｄ  ＳＨ３  ｄｏｍａｉｎｓ，  ｔｗｏ  ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ  ｓｃａｆｆｏｌｄｓ  ｔｏ  ｒｅｃｏｇｎｉｚｅ  ｐｒａｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｌｉｇａｎｄｓ．
【非特許文献７】
７．  Ｔａｋｅｎａｗａ，  Ｔ．  ａｎｄ  Ｍｉｋｉ  Ｈ．  （２００１）  Ｊ．  Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，  １１４：１，８０１−１，８０９，    ＷＡＳＰ  ａｎｄ  ＷＡＶＥ  ｆａｍｉｌｙ  ｐｒｏｔｅｉｎｓ：  ｋｅｙ  ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ  ｆｏｒ  ｒａｐｉｄ  ｒｅａｒｒａｎｇｅｍｅｎｔ  ｏｆ  ｃｏｒｔｉｃａｌ  ａｃｔｉｏｎ  ｆｉｌａｍｅｎｔｓ  ａｎｄ  ｃｅｌｌ  ｍｏｖｅｍｅｎｔ．
【非特許文献８】
８．  Ｊｅｎｎｅ  Ｄ．Ｅ．  ｅｔ  ａｌ．  （２０００）  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，  ６６：９３−９７，    Ａ  ｃｏｍｍｏｎ  ｓｅｔ  ｏｆ  ａｔ  ｌｅａｓｔ  １１  ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  ｇｅｎｅｓ  ｉｓ  ｌｏｓｔ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｍａｊｏｒｉｔｙ  ｏｆ  ＮＦ１  ｐａｔｉｅｎｔｓ  ｗｉｔｈ  ｇｒｏｓｓｄｅｌｅｔｉｏｎｓ．
【非特許文献９】
９．  Ｚｈａｎｇ  Ｋ，  ｅｔ  ａｌ．  （１９９１）  Ｇｅｎｅｓ  Ｄｅｖ．，  ５：１，０８０−１，０９１Ｔｈｅ  ｃｒｏｏｋｅｄ  ｎｅｃｋ  ｇｅｎｅｏｆ  Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ  ｃｏｎｔａｉｎｓ  ａ  ｍｏｔｉｆ  ｆｏｕｎｄ  ｉｎ  ａ  ｆａｍｉｌｙ  ｏｆ  ｙｅａｓｔ  ｃｅｌｌ  ｃｙｃｌｅ  ｇｅｎｅｓ．
【０００６】
【本発明が解決しようとする課題】
従来、ヒト長鎖ｃＤＮＡプロジェクトでヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子が取得されていたが、遺伝子情報が完全でなくその機能が不明であった。一方、精巣、脾臓、腎臓、肺などで発現する新規遺伝子を取得し、該遺伝子、該遺伝子がコードする蛋白質あるいはその蛋白質に特異的に結合する抗体を得ることは、細胞内で該蛋白質が他の蛋白質との結合を阻害する化合物を、あるいはシグナル伝達等に影響及ぼす化合物をスクリーニングするのに重要である。
【０００７】
従って、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子に関連する新規遺伝子を取得し、新規モチ−フを取得し、同遺伝子の組織特異的発現パターンを得て、該新規遺伝子がコードする蛋白質の機能に関する情報を得ることは、該蛋白質の特異的結合蛋白質や、アゴニスト、アンタゴニストを検索する際の非常に重要な手段となる。上記の蛋白質の特異的結合蛋白質が見出されなくても、該蛋白質の不活化実験（例えばノックアウト動物の作製）から該蛋白質の生理作用を解析することにより、該蛋白質に対するアゴニストまたはアンタゴニストを作製することが可能であり、該蛋白質に対する特異的結合蛋白質、アゴニストまたはアンタゴニストなどは、脳・神経系疾患の患者の機能不全に関連する疾患の予防あるいは治療薬や診断薬として活用することが可能となる。生体での該蛋白質の機能の低下または昂進が、脳・神経系の疾患の原因となっている場合が考えられる場合がある。この場合には、該蛋白質に対するアンタゴニストやアゴニストの投与だけでなく、該蛋白質の脳・神経系への投与や、該蛋白質をコードする遺伝子に対するアンチセンス核酸の投与、あるいは該遺伝子を用いた遺伝子治療に応用することもできる。この場合には該蛋白質の塩基配列は、脳・神経系疾患の患者の遺伝子欠失や変異の有無を調べるために必要な情報であり、該蛋白質をコードする遺伝子は、該蛋白質の機能不全に関与する疾患の予防あるいは治療薬や診断薬に応用することが出来る。
【０００８】
【課題を解決するための手段】
本発明者は、鋭意研究を重ねた結果、マウス脳由来のｃＤＮＡライブラリーから、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子に高いホモロジーを示す遺伝子（ＤＮＡ）をクローニングし、その遺伝子がコードするポリペプチドのＮ−末端側にヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子になかった全く新しい配列が付加していること、また、得られた遺伝子が精巣、脾臓、腎臓、肺などで強く発現していることを発見した。更に、得られた遺伝子情報を解析することにより、そのＣ−末端側に５つのＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フを有すること、加えてＮ−末端側に付加された新規配列には、プロリンに富む特徴的な配列が存在することを発見し、更にその遺伝子情報をもとに新規ポリペプチドとそれに特異的な抗体を得て、本発明を完成するに至った。
【０００９】
即ち、本発明は第一の態様として、以下の（ａ）のポリペプチドをコードする塩基配列から成るＤＮＡ：（ａ）配列番号：１で示されるアミノ酸配列と同一又は実質的に同一のアミノ酸配列の一部（例えば、以下に示すＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フあるいはプロリンに富む配列の少なくとも一つを有するもの）又は全部から成るポリペプチド；又は（ｂ）配列番号：１で示されるアミノ酸配列において、一部のアミノ酸が欠失、置換又は付加されたアミノ酸配列から成り、（ａ）のポリペプチドの一部又は全部と実質的に同質の生物学的活性を有するポリペプチド、に係る。
本発明の第二の態様として、以下の（ａ）のＤＮＡ：（ａ）配列番号：２で示される塩基配列において、配列番号：１で示されるアミノ酸配列（配列番号：２の塩基対第２〜４，９１５番目）の一部（例えば、以下に示すＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フあるいはプロリンに富む配列の少なくとも一つを有するもの）又は全部をコードするＤＮＡ；（ｂ）（ａ）のＤＮＡと相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡ；又は（ｃ）（ａ）のＤＮＡと相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、（ａ）のポリペプチドの一部又は全部と実質的に同質の生物学的活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡに係る。以上の本発明の第一及び第二の態様であるＤＮＡをまとめて、以下、「本発明のＤＮＡ」ともいう。本発明のＤＮＡは、新規ポリペプチドをコードするものである。又、本発明はこれらＤＮＡを含む哺乳動物由来遺伝子、哺乳動物が齧歯類である齧歯類由来遺伝子、特に齧歯類がマウスであるマウス遺伝子にも係る。特に、マウス遺伝子は「マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子」ともいう。
更に、本発明は本発明のＤＮＡ又は遺伝子（ＫＩＡＡ０５４６遺伝子）にコードされるポリペプチド（以下、「本発明のポリペプチド」ともいう。）、例えば、本発明のＤＮＡ又は遺伝子を導入した宿主細胞で作製される組換え蛋白質であるポリペプチド（以下、「ＫＩＡＡ０５４６蛋白質」ともいう）に係る。
また、本発明は、本発明のＤＮＡ又は遺伝子を含む組換えベクター、及び、本発明のポリペプチド若しくはその部分ペプチド又は該ポリペプチドを含む組換え蛋白質を又はそれらの塩に特異的に結合する抗体に係る。
【００１０】
また、本発明のＤＮＡ及び該ＤＮＡを含む遺伝子、該ＤＮＡにコードされる新規ポリペプチド及び該ポリペプチドを含む組換え蛋白質、該ポリペプチドに対する抗体を用いることによって、該蛋白質の発現量を変化させる化合物、該蛋白質に結合する蛋白質との結合性を変化させる化合物（アンタゴニスト、アゴニスト）のスクリーニング方法、該スクリーニング用キット、該スクリーニング方法などを提供する。更に、本発明ポリペプチド若しくはその部分ペプチド又は該ポリペプチドを含む組換え蛋白質を又はそれらの塩を用いることを特徴とする、それら物質と特異的に結合する物質のスクリーニング方法、並びにスクリーニング用キット等も提供する。
【００１１】
更に、本発明は、本発明のＤＮＡ、本発明のＤＮＡを含有する組換えベクター又は発現ベクター、該ベクターを保持する形質転換体、該形質転換体を培養し、本発明のポリペプチドの一部あるいは全長のポリペプチドを含む組換え蛋白質を生成、蓄積せしめ、これを採取することを特徴とする、本発明のポリペプチド若しくは該ポリペプチドを含む組換え蛋白質、又はその塩の製造方法、及び、こうして得られる本発明のポリペプチドの一部あるいは全長のポリペプチドを含む組換え蛋白質またはその塩を提供する。又、本発明は、本発明のＤＮＡを含有してなる医薬、本発明のポリペプチド若しくはその部分ペプチド又は該ポリペプチドを含む組換え蛋白質をコードするＤＮＡに実質的に相補的な塩基配列を有するアンチセンスヌクレオチド又はそれらを含有してなる医薬、本発明のポリペプチド若しくはその部分ペプチド又は該ポリペプチドを含む組換え蛋白質を含有してなる医薬を提供する。
更に、本発明は、本発明ＤＮＡ、本発明ポリペプチド、その部分ポリペプチド若しくは該ポリペプチドを含む組換え蛋白質、又は、本発明のＤＮＡ又は遺伝子に対する抗体を網羅的に作成し、それらを集積させて得られる、所謂、ＤＮＡチップ（アレイ）、プロテインチップにも係る。
【００１２】
【発明の実施の形態】
本発明のＤＮＡは、かずさＤＮＡ研究所で採取されたマウス脳由来のｍＲＮＡを出発材料として、本発明者が調製したｃＤＮＡライブラリーから、ｃＤＮＡ断片として単離した後に、塩基配列を決定し同定したものである。即ち、具体的には、小原他の方法（ＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，４：５３−５９）に従って調製したマウス脳由来のｃＤＮＡライブラリーから、約４５，０００個の組換え体を選択した。次に、このクローンのうち約８，０００個の３’末端ＤＮＡ配列を決定し、その中から、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子に高い相同性を有するクローンを選択し全塩基配列の決定を行なった。次に、こうして得られた全塩基配列に基づき、ＤＮＡ解析プログラム（ＧＣＧ，  Ｆａｓｔａ＆  Ｂｌａｓｔ）を用いてホモロジー検索を行なった。その結果、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子がコードするアミノ酸配列と配列番号：１で示されるアミノ酸配列の８９４番目から１，５２５の６３２アミノ酸について比較したところ、アミノ酸レベルで約９０．２％という有意な相同性を有する、配列番号：２に示される塩基配列を有するクローンを取得した（クローン名：ｍｂｇ０１３２３）。
【００１３】
取得したｍｂｇ０１３２３にコードされるポリペプチド（本発明のポリペプチド）のアミノ酸配列は１，６３８アミノ酸であり、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子（ＮＣＢＩ−ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ  Ｎｏ．ＡＢ０１１１１８）にコードされている蛋白のアミノ酸配列の６３２アミノ酸（ＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，  １９９８  ５：３１−３９）に比較しＮ−末端側及びＣ−末端側の両方向に長く伸びていた。得られた「本発明のポリペプチド」のアミノ酸配列について、以下の実施例に記載したようにホモロジー検索を行った結果、「本発明のポリペプチド」ではヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子にコードされているポリペプチドに比較し、Ｎ−末端側１−８９３番目の８９３個のアミノ酸配列、及びＣ−末端側の１，５２６−１，６３８番目の１１３個のアミノ酸配列が新規に付加されていることが判明した。ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子にコードされているポリペプチドに対し、新規に付加されていた「本発明のポリペプチド」のＮ−末端側８９３個のアミノ酸配列及びＣ−末端側の１１３個のアミノ酸配列について公共のデーターベースを用いてホモロジー検索を行った。
その結果、国際公開番号ＷＯ  ０１／７４８３６（発明の名称：  Ｈｕｍａｎ  ｂｏｎｅ  ｍａｒｒｏｗ  ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２２、Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｈｙｓｅｑ  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：１１，Ｏｃｔ．  ２００１）のＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２２  （５２６アミノ酸長）の１４９−５２５番目の配列（３７７アミノ酸長）と、本発明ののポリペプチド（１，６３８アミノ酸長）の一部のアミノ酸配列番号１７６−５８８（４１３アミノ酸長）の配列とでやや高いホモロジーが認められた（約７２．７％）。国際公開番号  ＷＯ  ０１／７４８３６のＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２２  （５２６アミノ酸長）の出願では、単にポリペプチド断片のアミノ酸配列について各種疾病処置用蛋白質として記載しているのみで、その機能については不明である。５２６アミノ酸長のアミノ酸配列に対し、「本発明のポリペプチド」の１，６３８アミノ酸配列は長く、後に述べるようにその機能についても記載可能で有用である。
また、国際公開番号ＷＯ  ９９／５７１４４（発明の名称：  ＨＴＲＭ  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  （Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｉｎｃｙｔｅ  Ｐｈａｒｍ  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：  １１，  Ｎｏｖ．  １９９９）のＨＴＲＭ  （Ｈｕｍａｎ  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒ  ｍｏｌｅｃｕｌａｒ）  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ（８１２アミノ酸長）の１−８１１番目の８１１アミノ酸長のアミノ酸配列と、本発明のポリペプチド（１，６３８アミノ酸長）の８２７番目から１，６３７番目の８１１アミノ酸長のアミノ酸配列に、高いホモロジーが認められた（約９１．０％）。公開された  ＨＴＲＭ  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ  （８１２アミノ酸長）配列に対し，  本発明の１，６３８アミノ酸長のポリペプチドでは、Ｎ−末端側に８２６アミノ酸長の新規配列が、Ｃ−末端側に１アミノ酸長の新規配列がそれぞれ付加された構成であった。国際公開番号ＷＯ  ９９／５７１４４のＨＴＲＭ  （Ｈｕｍａｎ  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒ  ｍｏｌｅｃｕｌａｒ）  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ  （８１２アミノ酸長）  の出願では、単にポリペプチド断片のアミノ酸配列についてＨＴＲＭ蛋白質の発現量減少に対する処置薬として記載しているのみで、その機能については不明である。８１２アミノ酸長のアミノ酸配列に対し、「本発明のポリペプチド」の１，６３８アミノ酸配列は長く、後に述べるようにその機能についても記載可能で有用である。
尚、配列番号：２に示される塩基配列を有する本発明のＤＮＡを含むプラスミド（プラスミド表示名：  ｍｂｇ０１３２３）は、茨城県つくば市東１丁目１番地１中央第６の独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センターに平成１４年８月２１日付けで寄託され、受託番号ＦＥＲＭ  Ｐ−１８９８２が付されている。
【００１４】
ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子の配列は５，５３５ｂｐ（ＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，  １９９８  ５：３１−３９，ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｋａｚｕｓａ．ｏｒ．ｊｐ／ｈｕｇｅ／ｇｆｐａｇｅ／ＫＩＡＡ０５４６／）であるが、コードされているポリペプチドのアミノ酸配列の長さは６３２アミノ酸である。ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子ホモログを詳細に研究することにより、Ｎ−末端側にはさらにポリペプチドがコードされている可能性について検証される可能性がある。本発明のＤＮＡにコードされているポリペプチドのアミノ酸配列の長さは１，６３８アミノ酸であるが、本発明のＤＮＡに対するホモログについて更に詳細に研究することにより、Ｎ−末端側に更に伸張してポリペプチドがコードされていることを見つける可能性がある。
【００１５】
尚、当業者であれば、本明細書によって初めて開示された配列番号：２に示した塩基配列に基づいてクローンの５’側に適当なプライマー（例えば、配列番号：２の塩基対第６１〜８０番目５’−  ＴＧＡＧＣＴＧＣＡＧＣＴＴＣＧＣＣＴＧＴ−３に対応させて合成した配列５’−  ＡＣＡＧＧＣＧＡＡＧＣＴＧＣＡＧＣＴＣＡ−３’  ）を調製し、該プライマーと市販されている哺乳動物脳由来のｍＲＮＡとハイブリダイゼーションを行なった後に逆転写反応を行なうことにより本発明のＤＮＡの上流側（遺伝子の５’側）の領域を含む新たなｃＤＮＡ断片を特異的に合成することができる。合成した５’側の領域を含む新たなｃＤＮＡ断片をプラスミドに挿入した後、配列番号２の一部分をプローブとして、コロニーハイブリダイゼーションのような相同性クローニングによって、本発明のＤＮＡを含む哺乳動物由来ＫＩＡＡ０５４６遺伝子の全領域を調製することが可能である。あるいは他の方法で、例えば次のような方法を用いても遺伝子の５’側が更に伸張した塩基配列を得ることが出来る。すなわち、本発明のＤＮＡをプローブとして用いれば、コロニーハイブリダイゼーションのような相同性クローニングによって、ヒトを含めた各種哺乳動物由来ＫＩＡＡ０５４６遺伝子の５’末端領域を調製することができる。更に、本発明のＤＮＡ配列及び本発明のポリペプチドのアミノ酸配列が開示されている以上、当業者であれば、これらの情報に基づき、ヒトを含めた各種哺乳動物由来ＫＩＡＡ０５４６遺伝子の５’末端領域を容易に取得することが出来る。又、短い断片や得られた配列に人工的な間違いが起こらないように十分な注意を払いながら、ＲＡＣＥ等のＰＣＲ法を使用することによっても、ヒトを含めた各種哺乳動物由来ＫＩＡＡ０５４６遺伝子の全領域を調製することが可能である。
【００１６】
本発明のＤＮＡとしては、前述した本発明のポリペプチドをコードする塩基配列から成るものであればいかなるものであってもよい。また、脳、又は、それ以外の組織、例えば、心臓、肺、肝臓、脾臓、腎臓、精巣、等の細胞・組織に由来するｃＤＮＡライブラリー等から同定・単離されたｃＤＮＡ、又は、合成ＤＮＡのいずれでもよい。ライブラリー作成に使用するベクターは、バクテリオファージ、プラスミド、コスミド、ファージミドなどいずれであってもよい。また、前記した細胞・組織よりｔｏｔａｌＲＮＡ画分またはｍＲＮＡ画分を調製したものを用いて、直接ＲｅｖｅｒｓｅＴｒａｎｓｃｒｉｐｔａｓｅ  Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  Ｃｈａｉｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ（以下、「ＲＴ−ＰＣＲ法」と略称する）によって増幅することもできる。
【００１７】
配列番号：１で示されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列とは、配列番号：１で示される全アミノ酸配列との相同性の程度が、全体の平均で約６０％以上、好ましくは約８０％以上、より好ましくは約９０％以上であるアミノ酸配列を意味する。従って、本発明の配列番号：１で示されるアミノ酸配列と実質的に同一のアミノ酸配列から成るポリペプチドとしては、例えば、前記の配列番号：１で示されるアミノ酸配列に対して上記の相同性を有し、配列番号：１で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチドと実質的に同質の生物学的活性を有するポリペプチドを挙げることが出来る。ここで、実質的に同質とは、それらの活性が性質的に同質であることを示す。又、本発明のポリペプチドには、例えば、配列番号：１で示されるアミノ酸配列中の一部（好ましくは、１〜２０個程度、より好ましくは１〜１０個程度、さらに好ましくは数個）のアミノ酸が欠失、置換又は付加したアミノ酸配列、或いはそれらを組み合わせたアミノ酸配列から成り、配列番号：１で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチドと実質的に同質の生物学的活性を有するポリペプチドも含まれる。
【００１８】
更に、本発明のＤＮＡは、例えば、配列番号：２で示される塩基配列において、配列番号：１で示されるアミノ酸配列をコードするＤＮＡ、又は、該ＤＮＡと相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、好ましくは更に配列番号：１で示されるアミノ酸配列から成るポリペプチドと同質の生物学的活性を有するポリペプチド（蛋白質）をコードするＤＮＡであればいずれのものでもよい。かかる条件下で、配列番号：２で示される塩基配列において、配列番号：１で示されるアミノ酸配列をコードするＤＮＡと相補的な塩基配列からなるＤＮＡとハイブリダイズできるＤＮＡとしては、例えば、該ＤＮＡの全塩基配列との相同性の程度が、全体の平均で、約６０％以上、好ましくは約８０％以上、より好ましくは約９０％以上である塩基配列を含有するＤＮＡ等を挙げることが出来る。ハイブリダイゼーションは、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｃｌｏｎｉｎｇ  ｔｈｉｒｄ．ｅｄ．（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂ．Ｐｒｅｓｓ，２００１）に記載の方法等、当業界で公知の方法あるいはそれに準じる方法に従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。ここで、「ストリンジェントな条件」とは、例えば、ＤＩＧ  ＤＮＡ  Ｌａｂｅｌｉｎｇ  （ベーリンガー・マンハイム社製Ｃａｔ  Ｎｏ．  １１７５０３３）でプローブをラベルした場合に、３２℃のＤＩＧ  Ｅａｓｙ  Ｈｙｂ溶液（ベーリンガー・マンハイム社製Ｃａｔ  Ｎｏ．  １６０３５５８）中でハイブリダイズさせ、４０℃の０．１ｘＳＳＣ溶液（０．１％［ｗ／ｖ］ＳＤＳを含む）中でメンブレンを洗浄する条件（１ｘＳＳＣは０．１５ＭＮａＣｌ，０．０１５Ｍクエン酸ナトリウムである）でのサザンブロットハイブリダイゼーションで本発明ヒトＤＮＡプローブにハイブリダイズする程度の条件である。
【００１９】
本発明のＤＮＡのクローニングの手段としては、本発明のポリペプチドの部分等の適当な塩基配列を有する合成ＤＮＡプライマーを用いてＰＣＲ法によって増幅するか、または適当なベクターに組み込んだＤＮＡを本発明のポリペプチドの一部あるいは全領域をコードするＤＮＡ断片もしくは合成ＤＮＡを用いて標識したものとのハイブリダイゼーションによって選別することができる。ハイブリダイゼーションの方法は、例えば、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｃｌｏｎｉｎｇ  ｔｈｉｒｄ．ｅｄ．（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂ．Ｐｒｅｓｓ，２００１）に記載の方法などに従って行なうことができる。また、市販のライブラリーを使用する場合、添付の使用説明書に記載の方法に従って行なうことができる。ＤＮＡの塩基配列の変換は、公知のキット、例えば、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩ逆転写酵素キット（ギブコＢＲＬ社）等を用いて、Ｇａｐｐｅｄ  ｄｕｐｌｅｘ法やＫｕｎｋｅｌ法などの公知の方法あるいはそれらに準じる方法に従って行なうことができる。クローン化されたポリペプチドをコードするＤＮＡは目的によりそのまま、または所望により制限酵素で消化したり、リンカーを付加したりして使用することができる。該ＤＮＡはその５’末端側に翻訳開始コドンとしてのＡＴＧを有し、また３’末端側には翻訳終止コドンとしてのＴＡＡ、ＴＧＡまたはＴＡＧを有していてもよい。これらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合成ＤＮＡアダプターを用いて付加することもできる。
【００２０】
本発明のポリペプチドの発現ベクターは、当該技術分野で公知の方法に従って作成することが出来る。例えば、（１）本発明のＤＮＡ又は本発明のＤＮＡを含む哺乳動物由来遺伝子を含有するＤＮＡ断片を切り出し、（２）該ＤＮＡ断片を適当な発現ベクター中のプロモーターの下流に連結することにより製造することができる。発現ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド（例、ｐＢＲ３２２，ｐＢＲ３２５，ｐＵＣ１８，ｐＵＣ１１８）、枯草菌由来のプラスミド（例、ｐＵＢ１１０，ｐＴＰ５，ｐＣ１９４）、酵母由来プラスミド（例、ｐＳＨ１９，ｐＳＨ１５）、λファージなどのバクテリオファージ、あるいはＳＶ４０、ＣＭＶウイルス、レトロウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、ウシパピローマウイルスなどの動物ウイルス由来配列を使用した発現ベクター等を利用することが出来る。本発明で用いられるプロモーターとしては、遺伝子の発現に用いる宿主に対応した適切なプロモーターであればいかなるものでもよい。例えば、宿主が大腸菌である場合は、ｔｒｐプロモーター、ｌａｃプロモーター、ｒｅｃＡプロモーター、λＰＬプロモーター、ｌｐｐプロモーターなどが、宿主が枯草菌である場合は、ＳＰＯ１プロモーター、ＳＰＯ２プロモーター、ｐｅｎＰプロモーターなど、宿主が酵母である場合は、ＰＨＯ５プロモーター、ＰＧＫプロモーター、ＧＡＰプロモーター、ＡＤＨプロモーターなどが好ましい。動物細胞を宿主として用いる場合は、ＳＲαプロモーター、ＳＶ４０プロモーター、ＬＴＲプロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＨＳＶ−ＴＫプロモーター、ＨＳＰプロモーター、メタロチオネインプロモーターなどが挙げられる。
【００２１】
発現ベクターには、以上の他に、所望により当該技術分野で公知の、エンハンサー、スプライシングシグナル、ポリＡ付加シグナル、選択マーカー、ＳＶ４０複製オリジン（以下、ＳＶ４０ｏｒｉと略称する場合がある）等を付加することができる。また、必要に応じて、本発明のＤＮＡにコードされた蛋白質を他の蛋白質（例えば、グルタチオンＳトランスフェラーゼ、ヒスチジンタグ、カルモデュリンバインディング蛋白質、及びプロテインＡ等）との融合蛋白質として発現させることも可能である。このような融合蛋白質は、適当なプロテアーゼを使用して切断し、それぞれの蛋白質に分離することが出来る。
【００２２】
宿主細胞としては、例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、酵母、昆虫細胞、昆虫、動物細胞などが用いられる。エシェリヒア属菌の具体例としては、エシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）Ｋ１２由来のＤＨ１（Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，６０巻，１６０（１９６８）），ＪＭ１０３（Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，９巻，３０９（１９８１）），ＪＡ２２１（Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，１２０巻，５１７（１９７８）），及びＨＢ１０１（Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，４１巻，４５９（１９６９））、あるいはエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ  ｃｏｌｉ）Ｂ株等が用いられる。バチルス属菌としては、例えば、バチルス・サチルス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ  ｓｕｂｔｉｌｉｓ）ＭＩ１１４（Ｇｅｎｅ，２４巻，２５５（１９８３）），２０７−２１〔Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，９５巻，８７（１９８４）〕等が用いられる。酵母としては、例えば、サッカロマイセス  セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）ＡＨ２２，ＡＨ２２Ｒ−，ＮＡ８７−１１Ａ，ＤＫＤ−５Ｄ，２０Ｂ−１２、シゾサッカロマイセス  ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｐｏｍｂｅ）ＮＣＹＣ１９１３，ＮＣＹＣ２０３６、ピキア  パストリス（Ｐｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓ）等が用いられる。動物細胞としては、例えば、サル腎臓細胞由来ＣＯＳ−１，ＣＯＳ−７，Ｖｅｒｏ細胞，チャイニーズハムスターＣＨＯ細胞（以下、ＣＨＯ細胞と略記），ｄｈｆｒ遺伝子欠損チャイニーズハムスター細胞ＣＨＯ（以下、ＣＨＯ（ｄｈｆｒ−）細胞と略記），マウスＬ細胞，マウスＡｔＴ−２０，マウスミエローマ細胞，ラットＧＨ３細胞，ヒトＦＬ細胞、ヒトＨｅｌａ細胞あるいはヒトミエローマ細胞などが用いられる。
【００２３】
これら宿主細胞の形質転換は、当該技術分野で公知の方法に従って行うことが出来る。例えば、以下に記載の文献を参照することが出来る。Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ，６９巻，２１１０（１９７２）；  Ｇｅｎｅ，１７巻，１０７（１９８２）；Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ＆  Ｇｅｎｅｒａｌ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，１６８巻，１１１（１９７９）；Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１９４巻，１８２−１８７（１９９１）；Ｐｒｏｃ．  Ｎａｔｌ．  Ａｃａｄ．  Ｓｃｉ．  ＵＳＡ），７５巻，１９２９（１９７８）；細胞工学別冊８  新  細胞工学実験プロトコール．２６３−２６７（１９９５）（秀潤社発行）；及びＶｉｒｏｌｏｇｙ，５２巻，４５６（１９７３）。
【００２４】
このようにして得られた、本発明のＤＮＡを含む哺乳動物由来遺伝子を含有する発現ベクターで形質転換された形質転換体は、当該技術分野で公知の方法に従って培養することが出来る。例えば、宿主がエシェリヒア属菌の場合、培養は通常約１５〜４３℃で約３〜２４時間行ない、必要により、通気や撹拌を加えることもできる。宿主がバチルス属菌の場合、培養は通常、約３０〜４０℃で約６〜２４時間行ない、必要により通気や撹拌を加えることもできる。宿主が酵母である形質転換体を培養する際、培養は通常、ｐＨ約５〜８に調整された培地を用いて約２０〜３５℃で約２４〜７２時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加えることもできる。宿主が動物細胞である形質転換体を培養する際、ｐＨは約６〜８に調整された培地を用いて、通常約３０〜４０℃で約１５〜６０時間行ない、必要に応じて通気や撹拌を加えることもできる。
【００２５】
上記培養物から本発明のポリペプチドを分離精製するには、例えば、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、これを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、リゾチームおよび／または凍結融解などによって菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過により蛋白質の粗抽出液を得る。緩衝液の中に尿素や塩酸グアニジンなどの蛋白質変性剤や、トリトンＸ−１００ＴＭなどの界面活性剤が含まれていてもよい。培養液中に蛋白質が分泌される場合には、培養終了後、公知の方法で菌体あるいは細胞と上清とを分離し、上清を集める。このようにして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれる蛋白質の精製は、公知の分離・精製法を適切に組み合わせて行なうことができる。こうして得られた本発明のポリペプチド（蛋白質）は、公知の方法あるいはそれに準じる方法によって塩に変換することができ、逆に塩で得られた場合には公知の方法あるいはそれに準じる方法により、遊離体または他の塩に変換することができる。更に、組換え体が産生する蛋白質を、精製前または精製後に、メチオニンアミノペプチダーゼを用いてＮ−末端メチオニンを除去したり、ミリストイル転移酵素を用いてＮ−末端アミノ酸のミリストイル化を行ったり、アセチルトランスフェラーゼを用いてＮ−末端アミノ酸のアセチル化を行ったり、或いはその他の修飾酵素を用いることにより任意にアミノ酸の修飾を行うことが出来る。又、Ｃ−末端を修飾するプロセシングカルボキシルペプチダーゼ、Ｃ−末端アミド化酵素等を作用させてＣ−末端アミノ酸を修飾することも出来る。更に、トリプシン、キモトリプシン、ＦａｃｔｏｒＸａ、トロンビン、又は、ＫＥＸ２プロテアーゼのような適当な蛋白限定分解酵素を作用させることにより、ポリペプチドを部分的に除去することもできる。
融合蛋白質として産生させた場合には、適当な蛋白質限定分解酵素を用いて不必要なポリペプチド部分を除去することもできる。
本発明ポリペプチド（蛋白質）又はその塩の存在は、様々な結合アッセイ及び特異抗体を用いたエンザイムイムノアッセイ等により測定することができる。
【００２６】
本発明のポリペプチド（蛋白質）は、Ｃ−末端が通常カルボキシル基（−ＣＯＯＨ）またはカルボキシレート（−ＣＯＯ−）であるが、Ｃ−末端がアミド（−ＣＯＮＨ２）またはエステル（−ＣＯＯＲ）であってもよい。ここでエステルにおけるＲとしては、例えば、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピルもしくはｎ−ブチルなどのＣ１−６アルキル基、例えば、シクロペンチル、シクロヘキシルなどのＣ３−８シクロアルキル基、例えば、フェニル、α−ナフチルなどのＣ６−１２アリール基、例えば、ベンジル、フェネチルなどのフェニル−Ｃ１−２アルキル基もしくはα−ナフチルメチルなどのα−ナフチル−Ｃ１−２アルキル基などのＣ７−１４アラルキル基のほか、経口用エステルとして汎用されるピバロイルオキシメチルエステルなどが用いられる。
【００２７】
本発明のポリペプチド（その存在状態は蛋白質である）がＣ−末端以外にカルボキシル基（またはカルボキシレート）を有している場合、カルボキシル基がアミド化またはエステル化されているものも本発明の蛋白質に含まれる。この場合のエステルとしては、例えば上記したＣ−末端のエステルなどが用いられる。さらに、本発明の蛋白質には、Ｎ−末端のメチオニン残基のアミノ基が保護基（例えば、ホルミル基、アセチル基などのＣ１−６アシル基など）で保護されているもの、生体内で切断されて生成するＮ−末端のグルタミン酸残基がピログルタミン化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上にある、例えばＯＨ、ＣＯＯＨ、ＮＨ２、ＳＨなどが適当な保護基（例えば、ホルミル基、アセチル基などのＣ１−６アシル基など）で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖蛋白質などの複合蛋白質なども含まれる。
【００２８】
本発明のポリペプチドの一部からなるペプチドとしては、前記した本発明のポリペプチド（その存在状態は蛋白質である）の部分ペプチドであって、実質的に同質の活性を有するものであればいずれのものでもよい。尚、ここで、「同質の活性」とは、このような部分ペプチドが本発明の各態様において、試薬、標準物質、又は免疫原等として使用できることを意味する。例えば、本発明のポリペプチド（蛋白質）の構成アミノ酸配列のうち少なくとも２０個以上、好ましくは５０個以上、さらに好ましくは７０個以上、より好ましくは１００個以上、最も好ましくは２００個以上のアミノ酸配列を有し、例えば、本発明の組換え蛋白質と実質的に同質の生物学的活性を有するするペプチドなどが用いられる。このような部分ペプチドの具体例としては、配列番号：１で示されるアミノ酸配列の中の、ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フあるいはプロリンに富む配列の少なくとも一つを有するものを挙げることが出来る。
又、本発明の部分ペプチドはＣ−末端が通常カルボキシル基（−ＣＯＯＨ）またはカルボキシレート（−ＣＯＯ−）であるが、前記した本発明の蛋白質のごとく、Ｃ末端がアミド（−ＣＯＮＨ２  ）またはエステル（−ＣＯＯＲ）であってもよい。さらに、本発明の部分ペプチドには、前記した本発明の蛋白質と同様に、Ｎ−末端のメチオニン残基のアミノ基が保護基で保護されているもの、Ｎ−末端側が生体内で切断され生成したグルタミル基がピログルタミン酸化したもの、分子内のアミノ酸の側鎖上の置換基が適当な保護基で保護されているもの、あるいは糖鎖が結合したいわゆる糖ペプチドなどの複合ペプチドなども含まれる。
【００２９】
本発明のポリペプチド（その存在状態は蛋白質である）又はその一部からなるペプチドの塩としては、とりわけ生理学的に許容される酸付加塩が好ましい。この様な塩としては、例えば、無機酸（例えば、塩酸、リン酸、臭化水素酸、硫酸）との塩、あるいは有機酸（例えば、酢酸、ギ酸、プロピオン酸、フマル酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸、リンゴ酸、蓚酸、安息香酸、メタンスルホン酸、ベンゼンスルホン酸）との塩などが用いられる。
【００３０】
本発明のポリペプチド（その存在状態は蛋白質である）、その一部からなるペプチドもしくはそれらの塩またはそれらのアミド体は、当該技術分野で公知の化学合成方法を用いて調製することも出来る。例えば、通常市販されている蛋白質合成用樹脂を用い、α−アミノ基と側鎖官能基を適当に保護したアミノ酸を、目的とする蛋白質の配列通りに、当業界において自体公知の各種縮合方法に従い、樹脂上で縮合させる。反応の最後に樹脂から蛋白質を切り出すと同時に各種保護基を除去し、さらに高希釈溶液中で分子内ジスルフィド結合形成反応を実施し、目的の蛋白質、その部分ペプチドまたはそれらのアミド体を取得する。上記した保護アミノ酸の縮合に関しては、例えば、ＤＣＣ、Ｎ，Ｎ’−ジイソプロピルカルボジイミド、及びＮ−エチル−Ｎ’−（３−ジメチルアミノプロリル）カルボジイミドのようなカルボジイミド類に代表される蛋白質合成に使用できる各種活性化試薬を用いることができる。これらによる活性化にはラセミ化抑制添加剤（例えば、ＨＯＢｔ，  ＨＯＯＢｔ）とともに保護アミノ酸を直接樹脂に添加するかまたは、対照とする酸無水物またはＨＯＢｔエステルあるいはＨＯＯＢｔエステルとしてあらかじめ保護アミノ酸の活性化を行なった後に樹脂に添加することができる。
【００３１】
保護アミノ酸の活性化や樹脂との縮合に用いられる溶媒としては、酸アミド類、ハロゲン化炭化水素類、アルコール類、スルオキシド類、及びエーテル類等、当業界において蛋白質縮合反応に使用しうることが知られている溶媒から適宜選択されうる。反応温度は蛋白質結合形成反応に使用され得ることが知られている範囲から適宜選択され、通常約−２０〜５０℃の範囲から適宜選択される。活性化されたアミノ酸誘導体は通常１．５〜４倍過剰で用いられる。ニンヒドリン反応を用いたテストの結果、縮合が不十分な場合には保護基の脱離を行うことなく縮合反応を繰り返すことにより十分な縮合を行なうことができる。反応を繰り返しても十分な縮合が得られないときには、無水酢酸またはアセチルイミダゾールを用いて未反応アミノ酸をアセチル化して、後の反応に影響を及ぼさないようにすることができる。原料の各アミノ基、カルボキシル基、及びセリン水酸基等の保護基としても、当該技術分野において、通常使用される基を使用することができる。原料の反応に関与すべきでない官能基の保護ならびに保護基、およびその保護基の脱離、反応に関与する官能基の活性化などは公知の基または公知の手段から適宜選択しうる。
【００３２】
本発明の一部からなるペプチドまたはそれらの塩は、当該技術分野において自体公知のペプチドの合成法に従って、あるいは本発明の蛋白質を適当な蛋白質限定分解酵素で切断することによって製造することができる。ペプチドの合成法としては、例えば、固相合成法、液相合成法のいずれによっても良い。公知の縮合方法や保護基の脱離としては、例えば、以下の（１）〜（３）に記載された方法が挙げられる。
（１）泉屋信夫他、ペプチド合成の基礎と実験、  丸善（株）  （１９７５年）
（２）矢島治明  および榊原俊平、生化学実験講座１、  蛋白質の化学ＩＶ、  ２０５、（１９７７年）
（３）矢島治明監修、続医薬品の開発  第１４巻  ペプチド合成  広川書店。
又は、一部からなるペプチドは、例えば、Ｃ−末端から十数残基の配列或いは配列番号：１で示されるアミノ酸配列の任意の場所の十数残基の部分を公知のペプチド合成装置等を用いて合成することが出来る。更に、このような部分ぺプチドは例えば約５０から５００アミノ酸長までの長さの適当な部位のポリペプチド、または約５００アミノ酸長から全長までの長さの適当な場部位のポリペプチドを選択して、組換え蛋白質として前述の遺伝子組換え技術を用いて製造しても良い。
反応後の精製も自体公知の方法、例えば、溶媒抽出・蒸留・カラムクロマトグラフィー・液体クロマトグラフィー・再結晶などを組み合わせて本発明の部分ペプチドを精製単離することができる。上記方法で得られる部分ペプチドが遊離体である場合は、公知の方法によって適当な塩に変換することができるし、逆に塩で得られた場合は、公知の方法によって遊離体に変換することができる。
【００３３】
本発明のポリペプチド（その存在状態は蛋白質である）、その一部からなるペプチドまたはそれらの塩と特異的に結合する抗体は、それらを特異的に認識し得るものであれば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体の何れであってもよい。本発明のポリペプチド（蛋白質）、その部分ペプチドまたはそれらの塩に対する抗体は、本発明のポリペプチド（蛋白質）又はその部分ペプチドを抗原として用い、当業者に公知の抗体または抗血清の製造法に従って製造することができる。このように免疫原として使用できる部分ぺプチドの例として、配列番号１に示される本発明ポリペプチドのＣ末端における十数個〜１００個程度の連続したアミノ酸から成るペプチドを挙げることができる。
例えば、ポリクローナル抗体の場合には、上記抗原を単独、又は、セルロース、重合アミノ酸、アルブミン及びキーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）等の適当な担体に結合させて、アジュバントの存在又は非存在下で、例えば、ラット、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ウマなどの適当な動物に対して免疫誘導することによって容易に得ることが出来る。ポリクローナル抗体は免疫された動物の血清から公知の様々な方法によって回収及び精製することが出来る。
一方、モノクローナル抗体を製造するためには、例えば、上記の免疫された動物から抗体産生細胞（例えば、脾臓又はリンパ節由来）を回収し、公知の不死化増殖細胞（例えば、Ｐ３Ｘ６３Ａｇ８株等の骨髄腫細胞株）との細胞融合により、ハイブリドーマを作成する。これを更にクローニングし、本発明のポリペプチド等に特異的に認識する抗体を生産しているハイブリドーマのクローンを選別し、該ハイブリドーマの培養液からモノクローナル抗体を回収し精製することによって容易に得ることが出来る。
尚、合成ペプチドに対する抗体の作製と抗体の精製に関する参考文献として、例えば、新細胞工学実験プロトコル、東大医科学研究所制癌研究部編、秀潤社、１９９３年、２−２−２，合成ペプチドに対する抗体の作製、ｐ２１０−２１７を挙げることが出来る。
更に、当業者には公知である様々な遺伝子工学的手法により、こうして得られた抗体の抗原決定基等を含む、ヒト化抗体等の各種キメラ抗体も容易に製造することが出来る。
本発明の抗体は、体液や組織などの被検体中に存在する本発明のポリペプチド（蛋白質）等を検出するために使用することができる。また、これらを精製するために使用する抗体カラムの作製、精製時の各分画中の本発明のポリペプチド（蛋白質）の検出、被検細胞内における本発明のポリペプチド（蛋白質）の挙動の分析などのために使用することができる。
【００３４】
更に、本発明の抗体は、公知の方法による被検液中の本発明のポリペプチド（蛋白質）等の定量、特に、モノクローナル抗体を使用したサンドイッチ免疫測定法による定量、及び組織染色等による検出などに使用することができる。それによって、例えば、本発明のポリペプチド（蛋白質）等が関与する疾病の診断を行なうことができる。これらの目的には、抗体分子そのものを用いてもよく、また、抗体分子のＦ（ａｂ’）２  、Ｆａｂ’、あるいはＦａｂ画分を用いてもよい。本発明の抗体を用いる本発明の蛋白質等の定量法は、特に制限されるべきものではなく、被測定液中の抗原量（例えば、蛋白質量）に対応した抗体、抗原もしくは抗体−抗原複合体の量を化学的または物理的手段により検出し、これを既知量の抗原を含む標準液を用いて作製した標準曲線より算出する測定法であれば、いずれの測定法を用いてもよい。例えば、ネフロメトリー、競合法、イムノメトリック法およびサンドイッチ法が好適に用いられるが、感度、特異性の点で、後述するサンドイッチ法を用いるのが好ましい。標識物質を用いる測定法に用いられる標識剤としては、当該技術分野で公知の、例えば、放射性同位元素、酵素、蛍光物質、発光物質などを用いることが出来る。
【００３５】
これらの測定・検出方法に関する一般的な技術手段の詳細については、総説、成書などを参照することができる。例えば、入江  寛編「続ラジオイムノアッセイ」（講談社、昭和５４年発行）、石川栄治ら編「酵素免疫測定法」（第３版）（医学書院、昭和６２年発行）、「Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  ＥＮＺＹＭＯＬＯＧＹ」Ｖｏｌ．  ７０（Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（Ｐａｒｔ  Ａ））、  同書Ｖｏｌ．  ７３（Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（ＰａｒｔＢ））、同書Ｖｏｌ．  ７４（Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（Ｐａｒｔ  Ｃ））、  同書Ｖｏｌ．  ８４（Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（Ｐａｒｔ  Ｄ：Ｓｅｌｅｃｔｅｄ  Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙｓ））、  同書Ｖｏｌ．  ９２（Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（Ｐａｒｔ  Ｅ：Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ａｎｄ  Ｇｅｎｅｒａｌ  Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙ  Ｍｅｔｈｏｄｓ））、  同書Ｖｏｌ．  １２１（Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（Ｐａｒｔ  Ｉ：ＨｙｂｒｉｄｏｍａＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ））（以上、アカデミックプレス社発行）などを参照することができる。
【００３６】
本発明のポリペプチド（蛋白質）又はその一部分からなるペプチドをコードするＤＮＡに実質的に相補的な塩基配列を有するアンチセンスＤＮＡとしては、当該ＤＮＡの塩基配列に実質的に相補的な塩基配列を有し、該ＤＮＡの発現を抑制し得る作用を有するものであれば、いずれのアンチセンスＤＮＡであってもよい。実質的に相補的な塩基配列とは、例えば、本発明のＤＮＡに相補的な塩基配列の全塩基配列または部分塩基配列と約９５％以上、最も好ましくは１００％の相同性を有する塩基配列などが挙げられる。又、これらアンチセンスＤＮＡと同様の作用を有する核酸配列（ＲＮＡまたはＤＮＡの修飾体）も本発明でいうアンチセンスＤＮＡに含まれる。これらのアンチセンスＤＮＡは、公知のＤＮＡ合成装置などを用いて製造することができる。
【００３７】
更に、本発明のポリペプチド（蛋白質）等は、これら物質の活性を阻害する化合物またはその塩のスクリーニングのための試薬として有用である。すなわち、本発明は、本発明のポリペプチド（蛋白質）、その一部からなるペプチドまたはそれらの塩を用いることを特徴とする、該物質又はそれらの塩の活性を阻害する化合物（以下、「阻害剤」ともいう）のスクリーニング方法、及びその為のスクリーニング用キットを提供する。本発明のスクリーニング方法またはスクリーニング用キットを用いて得られる化合物またはその塩は、上記した試験化合物から選ばれた化合物であり、本発明のポリペプチド（蛋白質）等の生物学的活性を阻害する化合物である。該化合物またはその塩は、本発明の蛋白質等の活性を直接阻害するものであってもよいし、本発明のポリペプチド（蛋白質）等の発現を阻害することによって間接的に本発明のポリペプチド（蛋白質）等の活性を阻害するものであってもよい。該化合物の塩としては、例えば、薬学的に許容可能な塩などが用いられる。例えば、無機塩基との塩、有機塩基との塩、無機酸との塩、有機酸との塩、塩基性または酸性アミノ酸との塩などがあげられる。本発明のポリペプチド（蛋白質）等の生物学的活性を阻害する化合物も上記各種疾病に対する治療・予防剤などの医薬として使用できる可能性がある。
【００３８】
本発明のＤＮＡ及び該ＤＮＡを含む哺乳動物由来遺伝子をプローブとして使用することにより、ヒトにおける本発明のポリペプチド又はその一部分からなるペプチドをコードするＤＮＡまたはｍＲＮＡの異常（遺伝子異常）を検出することができるので、例えば、該ＤＮＡまたはｍＲＮＡの損傷、突然変異あるいは発現低下や、該ＤＮＡまたはｍＲＮＡの増加あるいは発現過多などの遺伝子診断剤として有用である。本発明のＤＮＡを用いる上記の遺伝子診断は、例えば、公知のノーザンハイブリダイゼーションやＰＣＲ−ＳＳＣＰ法（Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，第５巻，８７４〜８７９頁（１９８９年）、Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ａｃａｄｅｍｙ  ｏｆ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ＵｎｉｔｅｄＳｔａｔｅｓ  ｏｆ  Ａｍｅｒｉｃａ，第８６巻，２７６６〜２７７０頁（１９８９年））などにより実施することができる。更に、ＫＩＡＡ０５４６遺伝子に異常があったり、欠損している場合あるいは発現量が減少している場合、生体内において正常な機能を発揮できない患者に対しては、公知手段に従って（１）レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノウイルスアソシエーテッドウイルスベクターなどの適当なベクターをベヒクルとして使用する遺伝子治療によって、本発明のＤＮＡ又は哺乳動物由来遺伝子を該患者体内に導入し、発現させるか、又は（２）本発明のポリペプチド（蛋白質）等を該患者に注入すること等によって、該患者において本発明の蛋白質等の機能を発揮させることができるものと考えられる。前者の場合、本発明のＤＮＡ又は哺乳動物由来遺伝子を適当なベクターをベヒクルとして使用し、ベクターにのせた形の該ＤＮＡを単独、又は、摂取促進のための補助剤とともに、遺伝子銃やハイドロゲルカテーテルのようなカテーテルによって投与することも可能である。
【００３９】
本明細書および図面において、塩基やアミノ酸などを略号で表示する場合、ＩＵＰＡＣ−ＩＵＢＣｏｍｍｉｓｉｏｎ  ｏｎ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅによる略号あるいは当該分野における慣用略号に基づくものであり、またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特に明示しなければＬ体を示すものとする。
【００４０】
本願明細書の配列表の配列番号は、以下の配列を示す。
〔配列番号：１〕本発明のポリペプチドのアミノ酸配列（アミノ酸数：１，６３８）を示す。
〔配列番号：２〕配列番号：１で示されるアミノ酸配列を有する本発明のポリペプチドをコードするＤＮＡの塩基配列を含む、クローンｍｂｇ０１３２３の全塩基配列（５，６５６塩基対）を示す。
【００４１】
【実施例】
以下に、実施例により本発明をさらに具体的に説明するが、本発明はそれに限定されるものではない。なお、実施例における各種遺伝子操作は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｃｌｏｎｉｎｇ  ｔｈｉｒｄ．ｅｄ．（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂ．Ｐｒｅｓｓ，２００１）に記載されている方法に従った。
【００４２】
（１）マウス脳由来ｃＤＮＡライブラリーの構築
ａｔｔＢ１部位を有するオリゴヌクレオチド：５’−ＦｇｃＧＣＡＣＣＡＣＴＴＴＧＴＡＣＡＡＧＡＡＡＧＣＴＧＧＧＣＧＧＣＣＧＣ（Ｔ）１８−３’（Ｆ、ｇおよびｃは、それぞれフルオレッセイン基、フォスフォロチオエイト修飾Ｇ、フォスフォロチオエイト修飾Ｃ残基を表す）をプライマーとして、マウスの成体（８週令雄のＢＡＬＢ／ｃマウス）脳由来ｍＲＮＡを鋳型にＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔＩＩ逆転写酵素キット（インビトロジェン社製）で２本鎖ｃＤＮＡを合成した。これにａｔｔＢ１部位を有するアダプターをｃＤＮＡにライゲーションした。その後、アガロースゲルで１ｋｂ−２ｋｂ、２ｋｂ−３ｋｂ、３ｋｂ−５ｋｂ、５ｋｂ−７ｋｂ、７ｋｂ−１１ｋｂと１１ｋｂ−１３ｋｂにｃＤＮＡをサイズ分画した。これらを、サイズを小さくしたａｔｔＰ  ｐＳＰＯＲＴ−１エントリーベクター（インビトロジェン社製）にＢＰ反応により移し換えた後、大腸菌ＥｌｅｃｔｏｒｏＭａｘ  ＤＨ１０Ｂ株（インビトロジェン社製）にエレクトロポーレーション法により導入した。プレートに出現した１０６個以上の形質転換体を集め、液体培地中で、３７℃で２−３時間培養した後プラスミドを調製した。スーパーコイルドプラスミドの形でサイズ分画した後、ＬＲ反応によりａｔｔＲ  ｐＢＣデスティネーションベクター（インビトロジェン社製）にｃＤＮＡを移し換えた。このプラスミドを精製後、ＤＨ１０Ｂ株にエレクトロポーレーション法により導入し、各分画が期待されるサイズになるまで、上記の分画操作を２−３回繰り返した。最後に各分画ごとにＤＨ１０Ｂ株にプラスミドを導入した。なお、ここで用いた試験管内での相同組み換え反応を利用したクローニングシステムは小原等の方法  （Ｎｕｃｒｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，  ２９，  ｅ２２  （２００１）およびＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｖｏｌ．９，  ４７−５７（２００２））  に従った。
次に、５ｋｂ−７ｋｂ画分に含まれる約８，０００個のクローンの末端ＤＮＡ配列を決定した。この中から、ヒトＫＩＡＡ０５４６に相同性が高いクローンのｃＤＮＡに関して全塩基配列の決定を行なった。配列決定には、アプライドバイオシステム社製のＤＮＡシークエンサー（ＡＢＩ  ＰＲＩＳＭ３７００）と同社製反応キットを使用した。大部分の配列はショットガンクローンをダイターミネーター法を用いて決定した。一部の塩基配列については、決定した塩基配列を元にしてオリゴヌクレオチドを合成し、プライマーウォーキング法で決定した。
【００４３】
（２）ホモロジー検索による本発明ＤＮＡを含むクローンの決定
次に、こうして得られた全塩基配列に基づき、ＤＮＡ解析プログラム（Ｆａｓｔａ  ＆  Ｂｌａｓｔ）を用いたホモロジー検索を実施したところ、公開されているデータベースの中のヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子と高いホモロジーを示す候補クローンｍｂｇ０１３２３が見出された。更に、別のＤＮＡ解析プログラム（ＢＥＳＴＦＩＴ）を用いて、このクローンｍｂｇ０１３２３とヒトＫＩＡＡ０５４６のアミノ酸配列と塩基配列について比較したところ、アミノ酸配列のレベルでは、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子がコードするアミノ酸配列と配列番号：１で示されるアミノ酸配列のうち８９４番目から１，５２５番目までの６３２アミノ酸について、約９０．２％のホモロジーを示し、ＤＮＡ塩基配列のレベルでヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子の塩基配列と配列番号：２で示される塩基配列のうち２，６８１番目から４，５７６までの１，８９６塩基について、約８８．１％のホモロジーを示すことが判明した。
公開されたポリペプチドのアミノ酸配列に関するデーターベースを検索すると、国際公開番号ＷＯ  ０１／７４８３６（発明の名称：  Ｈｕｍａｎ  ｂｏｎｅ  ｍａｒｒｏｗ  ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２２、Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｈｙｓｅｑ  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：１１，  Ｏｃｔ．  ２００１）のＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：  １２２  （５２６アミノ酸長）の１４９−５２５番目の配列（３７７アミノ酸長）と、本発明ののポリペプチド（１，６３８アミノ酸長）の一部のアミノ酸配列番号１７６−５８８（４１３アミノ酸長）の配列とでやや高いホモロジーが認められた（約７２．７％）。また、国際公開番号ＷＯ  ９９／５７１４４（発明の名称：  ＨＴＲＭ  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  （Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｉｎｃｙｔｅ  Ｐｈａｒｍ  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：  １１，  Ｎｏｖ．  １９９９）のＨＴＲＭ  （Ｈｕｍａｎ  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒ  ｍｏｌｅｃｕｌａｒ）  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ  （８１２アミノ酸長）の１−８１１番目の８１１アミノ酸長のアミノ酸配列と、本発明のポリペプチド（１，６３８アミノ酸長）の８２７番目から１，６３７番目の８１１アミノ酸長のアミノ酸配列に、高いホモロジーが認められた（約９１．０％）。公開された  ＨＴＲＭ  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ｐｒｏｔｅｉｎ  （８１２アミノ酸長）配列に対し，  本発明の１，６３８アミノ酸長のポリペプチドでは、Ｎ−末端側に８２６アミノ酸長の新規配列が、Ｃ−末端側に１アミノ酸長の新規配列が付加された構成であった。
【００４４】
更に、公開された遺伝子の塩基酸配列に関するデーターベースを検索すると、本発明のｍｂｇ０１３２３塩基配列（５，６５６塩基）の一部の配列とホモロジーを有する部分配列についていくつかの報告があったが、配列全体をカバーする報告はなかった。詳しくには、次に示す４つの公開された塩基配列に対し、本発明の５，６５６塩基長の塩基配列には新規配列の付加が認められた。１）国際公開番号ＷＯ  ９９／５７１４４（発明の名称：  ＨＴＲＭ  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０  ＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ，Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｉｎｃｙｔｅ  Ｐｈａｒｍ  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：  Ｎｏｖ−１１−１９９９）のＨＴＲＭ  （Ｈｕｍａｎ  ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ  ｒｅｇｕｌａｔｏｒ  ｍｏｌｅｃｕｌａｒ）  ｃｌｏｎｅ  ２０７６５２０（全３，２４７塩基配列）の配列番号１２−２，７９７（２，７８６塩基長）と、本発明の塩基配列（５，６５６塩基）の一部（配列番号２，４３５−５，２２３，  ２，７８９塩基長）とで高いホモロジーが認められた（約８９．８％）。２）国際公開番号ＷＯ  ０１／２２９２０（発明の名称：  Ｈｕｍａｎｃｏｌｏｎ  ｃａｎｃｅｒ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｅｎｃｏｄｉｎｇ  ｃＤＮＡ  ＳＥＱ  ＮＯ：４５５，  Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｈｕｍａｎ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｓｃｉ．  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：０５−Ａｐｒ−２００１）  の  ＳＥＱ  ＮＯ：４５５  （全２，３６１塩基長）の配列番号１７−２，２５９（２，２４３塩基長）と、本発明の塩基配列（５，６５６塩基）の一部（配列番号２，９７８−５，２２３、  ２，２４６塩基長）とで高いホモロジーが認められた（約９０．１％）。３）国際公開番号ＷＯ  ９７／４０１５１（発明の名称：Ｈｕｍａｎ  Ｊ１４３−１  ｓｅｃｒｅｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ，  Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｉｎｓｔ．  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：１８−Ｏｃｔ−２００１）のＨｕｍａｎ  Ｊ１４３−１  ｓｅｃｒｅｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  （全１，６８６塩基長）の配列番号３７−１，２１５  （１，１７９塩基長）と、本発明の塩基配列（５，６５６塩基長）の一部（配列番号４，０４２−５，２２３，  １，１８２塩基長）とで高いホモロジーが認められた（約９２．４％）。４）国際公開番号ＷＯ  ０１／７７２８９（発明の名称：  ｃＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ＃１７７  ｅｎｃｏｄｉｎｇ  ｎｏｖｅｌ  ｈｕｍａｎ  ｓｅｃｒｅｔｅｄｐｒｏｔｅｉｎ  ，  Ａｐｐｌｉｃａｎｔ：  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｉｎｓｔ．  Ｉｎｃ．，  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ  ｄａｔｅ：１８−Ｏｃｔ−２００１）のｃＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ＃１７７  （全１，６５１塩基長）の配列番号３７−１，２１５（１，１７９塩基長）と、本発明の塩基配列（全５，６５６塩基長）の一部（配列番号４，０４２−５，２２３，    １，１８２塩基長）とで高いホモロジーが認められた（約９２．４％）。３）と４）については、４）のｃＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ＃１７７    （全１，６５１塩基長）  の配列と３）の  Ｈｕｍａｎ  Ｊ１４３−１  ｓｅｃｒｅｔｅｄ  ｐｒｏｔｅｉｎ  （全１，６８６塩基長）とは全長が若干違うが基本的に相同配列である関係であった。
【００４５】
以上のホモロジー検索の結果から、候補クローンｍｂｇ０１３２３はヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子と高いホモロジーを示し、かつヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子に対し新規配列が付加された構成となっていること、また、部分的には類似遺伝子が存在するが全長については既知配列の例がない、全く新規遺伝子であることが判明した。
【００４６】
（３）モチ−フ検索
本発明のＤＮＡに関して、ＰＲＯＳＩＴＥ  ｄａｔａｂａｓｅを検索するための蛋白質解析プログラムであるｐｆｔｏｏｌｓ  （Ｂａｉｒｏｃｈ  Ａ，  Ｂｕｃｈｅｒ  Ｐ，  Ｈｏｆｍａｎｎ  Ｋ，  Ｎｕｃｌｅｉｃ  ＡｃｉｄｓＲｅｓ．  １９９７  Ｊａｎ  １；２５（１）：２１７−２１）、及びＰｆａｍ  ｄａｔａｂａｓｅを検索するための蛋白質解析プログラムｈｍｍｅｒ  ２．１（Ｓｏｎｎｈａｍｍｅｒ，  Ｅ．  Ｌ．  Ｌ．，  Ｅｄｄｙ，  Ｓ．  Ｒ．，  Ｂｉｒｎｅｙ，  Ｅ．，  Ｂａｔｅｍａｎ，  Ａ．，  ａｎｄ  Ｄｕｒｂｉｎ，  Ｒ．，  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ  １９９８；  ２６，  ３２０−３２２）を用いてモチ−フ検索を行なった  （Ｓｕｙａｍａ  ｅｔ．  ａｌ．  １９９９  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．  ２７：  ３３８−３３９）。本発明のＤＮＡは、５，６５６塩基対あり、１，６３８個のアミノ酸からなるリペプチドをコードしている。本発明のＤＮＡがコードするポリペプチドのアミノ酸配列には、Ｎ−末端側にプロリンに富む特徴的な配列が、また、Ｃ−末端部分には５個回のＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フを有することが判明した（図１）。
詳しくは、ＰｒｏｆｉｌｅＳｃａｎ検索法によると配列番号：１に示されるアミノ酸配列のうちＮ−末端側の１９１−２６５番目にＰｒｏｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｒｅｇｉｏｎが、更にＦＰｒｉｎｔＳｃａｎ検索法によると、配列番号：１に示されるアミノ酸配列のうち１９０−２０６番目、２４４−２６５番目、及び４００−４２５番目にＰｒｏｌｉｎｅ  ｒｉｃｈ  ｅｘｔｅｎｓｈｉｏｎが見出された。
これらの結果から、Ｎ−末端領域に新規なプロリンに富む領域（Ｐｒｏｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｒｅｇｉｏｎ）が存在が確認された。
また、Ｃ−末端側にはＨＭＭＳｍａｒｔ検索法によると、配列番号：１に示されるアミノ酸配列のうち１，０３０−１，０６２番目，  １，０６４−１，０９５番目，  １，２９９−１，３３１番目，  １，４０８−１，４４３番目，  及び１，５６８−１，６００番目の５カ所にＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フが見出され、ＰｒｏｆｉｌｅＳｃａｎ検索法によると、配列番号：１に示されるアミノ酸配列のうち１，０１０−１，０８３番目，  １，２５１−１，３１８番目，  及び１，２８５−１，３１８番目にＴＰＲ繰り返しモチ−フが、また、ＨＭＭＰｆａｍ検索法によると、配列番号：１に示されるアミノ酸配列のうち１，２５１−１，２８４番目，  及び１，２８５−１，３１８番目にＴＰＲ繰り返しモチ−フが見出された。
ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フは、ＴＰＲ繰り返しモチ−フの半分（Ｈａｌｆ）の長さのモチーフであるので、上記のモチーフ検索により本発明のポリペプチドのＣ−末端側に、少なくとも５個のＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フの存在を確認することが出来た。
【００４７】
（４）ｍＲＮＡレベルでの発現頻度
ｍＲＮＡレベルでのヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子の発現については、卵巣、腎臓、精巣、胸腺で弱いが発現が認められていたが、特徴的な所見はなかった（ＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，  １９９８  ５：３１−３９）。そこで、本発明の遺伝子の一つであるマウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子について、ＲＴ−ＰＣＲ法によりマウスにおける同遺伝子の組織特異的及び発生段階特異的発現を解析した。マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子の転写産物をＰＣＲ法で増幅して検出するために必要なフォアワードプライマーとリバースプライマーを市販のＤＮＡ自動合成機を用いて合成した。フォアワードプライマーの配列を５’−ＧＡＴＣＧＣＴＣＴＡＣＡＣＣＡＡＣＴＣＣ  −３’（配列番号：３）、リバースプライマーの配列を５’−ＧＧＣＡＣＣＧＴＡＡＣＣＡＡＡＣＡＴＣＴＡ  −３’（配列番号：４）とし、それらのプライマーを用いてマウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子の転写産物をＲＴ−ＰＣＲ法で増幅すると、約６４１ｂｐＤＮＡ断片が得られる設計にした。マウス各組織から調製されたｍＲＮＡを材料とし、リバーストランスクリプターゼ（ＲＴ）により１ｓｔストランドｃＤＮＡ  まで調製が終了しているＣｌｏｎｔｅｃｈ社製のＭｕｌｔｉｐｌｅ  Ｔｉｓｓｕｅ  ｃＤＮＡ  Ｐａｎｅｌｓ  （Ｃｌｏｎｔｅｃｈ社Ｃａｔ．  Ｎｏ．  ＃Ｋ１４２３−１，  ＃Ｋ１４３０−１）を用い、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ社が示す方法により以下のようにして解析を行った。すなわち、各マウス組織１ｓｔストランドｃＤＮＡと上記プライマーをそれぞれ混合し、各々についてＰＣＲを行い、マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子の転写産物のうち６４１ｂｐＤＮＡ長のＤＮＡ断片の増幅を図った。ＰＣＲは、ＴａｑポリメラーゼとしてＴａＫａＲａ  Ｅｘ  Ｔａｑ（宝酒造，  ＃ＲＰ００１Ａ）を用い、上述のＤＮＡ混合液を９５°Ｃ（２．５分）で加熱した後、９５°Ｃ（３０秒）／６０°Ｃ（３０秒）／７２°Ｃ（３０秒）のサイクルを３０回繰り返して行った。コントロールとしてＣｌｏｎｔｅｃｈ社が提供するＧ３ＰＤＨプライマー（＃５４０６−１）を使用したＧ３ＰＤＨ転写産物由来約９３８ｂｐＤＮＡ断片の増幅も同様にして行った。増幅を終えたＰＣＲ産物を、サイズマーカーとともに２％  ａｇａｒｏｓｅ  ｇｅｌ（Ｒｏｃｋｌａｎｄ社製、＃５００７０）を用いて電気泳動で分画し、分画したＰＣＲ産物の量を半定量的に比較した（図２）。その結果、調べた組織別あるいは発生過程のｃＤＮＡパネルの内、精巣、脾臓、腎臓、肺などにおいて、マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子に由来する約６４１ｂｐＤＮＡ断片が特異的に増幅され、濃いバンドとして検出された。また、また受精１７日目の胚と平滑筋において約６４１ｂｐＤＮＡ断片が特異的に増幅され、やや濃いバンドとして検出された。その他に、心臓、脳、肝臓、骨格筋、骨髄、眼、リンパ球、前立腺、胸腺、子宮、及び受精７日目、１１日目、１５日目の胚に於いて、約６４１ｂｐＤＮＡ断片が特異的に増幅され、薄いバンドとして検出された。マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子は、精巣、脾臓、腎臓、肺などで特異的に強く発現していること、また受精１７日目の胚と平滑筋、及び弱いが心臓、脳、肝臓、骨格筋、骨髄、眼、リンパ球、前立腺、胸腺、子宮、及び受精７日目、１１日���、１５日目の胚での発現も認められたことから、この蛋白質が精巣、脾臓、腎臓、肺などのみならず平滑筋、心臓、脳、肝臓、骨格筋、骨髄、眼、リンパ球、前立腺、胸腺、子宮等の発生・分化のメカニズムに関わっている可能性が高いことが判明した。尚、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子の発現パターン（ＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，  １９９８  ５：３１−３９）と比較すると、マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子は脾臓で高い発現が認められた。更に、マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子は、発生段階において発生初期から発現し始め以降持続的に発現し、受精１７日目の胚で強い発現が認められることが判明した。。
尚、図２において、下段のＧ３ＰＤＨはコントロールとして用いたハウスキーピング遺伝子（Ｇ３ＰＤＨ）の発現パターンを示す。従って、以上の結果から、本発明の遺伝子がコードするポリペプチドは精巣、脾臓、腎臓、肺などの発生・分化や機能保全に関わっている可能性が高いといえる。
【００４８】
（５）本発明遺伝子の機能推定
ＴＰＲ（Ｔｅｔｒａｔｒｉｃｏ  ｐｅｐｔｉｄｅ  繰り返し配列）モチ−フは３４アミノ酸からなり、へリックス・ターン構造を形成すること、タンデムに存在すること、コンパクトにたたみ込まれしばしばｓｎａｐ  ｈｅｌｉｘ  ｗｉｔｈ  ｋｎｏｂ  ａｎｄ  ｈｏｌｅ構造を取ること等が知られている（Ｇｏｅｂｌ，  Ｍ．  ａｎｄ  Ｙａｎａｇｉｄａ  Ｍ．  ，１９９１，  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  １６：１７３−１７７，  Ｌａｍｂ，  Ｊ．Ｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９９５，  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  ２０：２５７−２５９）。  ＴＰＲモチ−フが存在する遺伝子には、ＣＤＣ２３、ＣＤＣ１６、ＣＤＣ２７、ＳＳＮ６、ＭＡＳ７０、  ＰＡＳ１０、ＳＫ１３、ＣＲＮ及び  Ｎｕｃ２（＋）等がある。また、これら遺伝子は、核内にあって広く有糸分裂、スプライシングあるいは遺伝子の転写に関わっている（Ｇｏｅｂｌ，  Ｍ．  ａｎｄ  Ｙａｎａｇｉｄａ  Ｍ．，  １９９１，  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  １６：１７３−１７７，    Ｌａｍｂ，  Ｊ．Ｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９９５，  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  ２０：２５７−２５９）。  一部のＴＰＲ蛋白質（例えばｃｄｃ５ｐは）ｓｎＲＮＡと蛋白複合体を形成しＰｒｅ−ＲＮＡスプライシングに必須で、その欠損により生育が阻害される（ＭｃＤｏｎａｌｄ，  Ｗ．Ｈ．  ｅｔ  ａｌ．  ，１９９９，  Ｍｏｌ．  Ｃｅｌｌ．  Ｂｉｏｌ．，  １９：５，３５２−５，３６２）。ＴＰＲモチーフに加えてＲＮＡ認識モチーフ（ＲＲＭｓ）を有するｓｎＲＮＡ結合蛋白リサイクル因子（ｐ１１０）の報告もある（Ｂｅｌｌ，  Ｍ．  ｅｔ  ａｌ．  ，２００２，  ＥＭＢＯ  Ｊ．，  ２１：２，７２４−２，７３５）。
最近、本発明のポリペプチドに認められるＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フが、ｍＲＮＡプロセシングに関与することが報告され、同モチーフがｍＲＮＡの成熟に重要であることが判明した（Ｐｒｅｋｅｒ，  Ｐ．Ｊ．  ａｎｄ  Ｋｅｌｌｅｒ，  Ｗ．  ，１９９８，  Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  ２３：１５−１６）。本発明のポリペプチドにおいてもＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）  繰り返し配列は５回繰り返し存在し、他のＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）  繰り返し配列をタンデムに有する分子との機能的相同性が推測される。またＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）  繰り返し配列は種間を越えて高度に保存されていることから（Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍ．  Ｓｃｉ．，  １９９１，１６：１７３−１７７）、その機能はＲＮＡプロセッシングなどの細胞の根源的現象において重要と考えられた。
【００４９】
プロリンに富む配列については、ある種の蛋白質に存在するＷＷドメインやＳＨ３ドメインと相互作用を引き起こし、それにより蛋白複合体の形成が進行するという報告がある。また、プロリンに富む配列を有するＷＡＳＰあるいはＷＡＶＥファミリー蛋白質では、同蛋白質がプロリンに富む配列を介し細胞骨格系の蛋白質に存在するＳＨ３ドメインと結合し、蛋白複合体を形成するという報告がある（Ｍａｃｉａｓ，  Ｍ．Ｊ．ｅｔ  ａｌ．，  ２００２，  ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，  ５１３：３０−３７）。  また、プロリンに富む配列を含む蛋白質は、Ｐｒｏｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｒｅｇｉｏｎを介して細胞骨格系の蛋白との会合が生じているという（Ｔａｋｅｎａｗａ，  Ｔ．  ａｎｄ  Ｍｉｋｉ  Ｈ．  ，２００１，  Ｊ．  Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，  １１４：１，８０１−１，８０９）。
これまでに、ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フとプロリンに富む配列の両方を有する蛋白質については報告がない。本発明のポリペプチドにおいて見出されたＲＮＡプロセッシングモチーフ蛋白質に特徴的なＨＡＴ  （Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）  繰り返し配列は、上記で示したようにＲＮＡ結合ドメインと考えられ、本発明のポリペプチドはｍＲＮＡプロセッシングに関わる分子と推定される。ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フ及びプロリンに富む配列を有する本発明の蛋白質  は、ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フのｍＲＮＡプロセシング機能と、プロリンに富む配列が他の蛋白質のＷＷドメインやＳＨ３ドメインと結合して蛋白複合体を形成する機能の両方を兼ね備えることから、転写機構及びｍＲＮＡの成熟に関わる重要役割を担う複合蛋白質の中心を担う新規蛋白質といえる。
【００５０】
ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子のｍＲＮＡレベルの発現について調べられたが、特徴的な発現臓器が認められなかった（ＤＮＡ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，  １９９８  ５：３１−３９）。本発明のｍｂｇ０１３２３遺伝子は、精巣、脾臓、腎臓、肺などで特に発現量が高いことから、精巣、脾臓、腎臓、肺などの発育、機能保全、あるいは精巣、脾臓、腎臓、肺などの癌・自己免疫疾患・アレルギーのような細胞の増殖に関わる疾患や老化あるいは先天奇形など分化異常を含めたヒト疾患の機序解明及び診断・治療薬、検査薬の開発に有用である。本発明の組換え蛋白質、あるいは組換え蛋白質を発現する組換え体を利用することにより、アゴニスト、アンタゴニストのスクリーニングあるいはドラッグデザイン研究に利用できる。
【００５１】
このように細胞の増殖や分化に極めて重要なＨＡＴ  繰り返し配列を有する蛋白質をコードする遺伝子は、それ自身も直接疾患原因遺伝子となりうる。例えば、ＨＡＴ繰り返しモチ−フを含む蛋白質をコードするヒトＨＣ６６遺伝子（ＨＡＴ：５回繰り返し）は肝細胞癌、神経線維症Ｉ型と関係するという（Ｊｅｎｎｅ  Ｄ．Ｅ．  ｅｔ  ａｌ．  ，２０００，  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，  ６６：９３−９７）  。ショウジョウバエＣＲＮ遺伝子（ＨＡＴ：１６回繰り返し）は細胞分裂に必須で、その欠損により神経芽細胞の増殖が止まり、その結果として全神経の欠損が生じる（Ｚｈａｎｇ  Ｋ，  ｅｔ  ａｌ．  ，  １９９１，    Ｇｅｎｅｓ  Ｄｅｖ．，  ５：１，０８０−１，０９１）。
これらの知見から、本発明のＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フ及びプロリンに富む配列  モチ−フを持つ蛋白質に関わるＤＮＡ及び該ＤＮＡを含む遺伝子、該ＤＮＡにコードされるポリペプチド及び該ポリペプチドを含む組換え蛋白質については、それらが精巣、脾臓、腎臓、肺などの細胞の増殖あるいは分化の調節などに、また、それら臓器の機能保全や老化に関わる病態の解明に関わることが強く示唆される。
【００５２】
（６）合成ペプチドを抗原としたウサギポリクローナル抗体の作製
マウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子がコードするポリペプチドの一部からなるアミノ酸配列をもとに、ペプチド合成して作製した合成ペプチドを免疫原（抗原）として、常法に従い、ウサギポリクローナル抗体を作製した。抗原としてはカルボキシル末端の１５個のアミノ酸から成るペプチド（ＥＬＬＮＬＮＳＮＫＴＥＳＫＮＬ）を、そのＮ末で担体とするキーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）にキャリアーカップリングさせ、担体と結合した合成ペプチドを８０％から９０％の純度にまで精製したものを抗原として用いた。日本白色種家兎（メス）に初回は抗原量０．１５ｍｇにて皮内免疫を、その後は約１週間ごとに抗原量０．３ｍｇにて４回の感作を実施して合計５回の皮内免疫を行った。３回目、４回目及び５回目の各皮内免疫の後に試験採血を行い、ＨＲＰＯ（ホースラディッシュパーオキシダーゼ）結合ヤギＩｇＧ抗ウサギ抗体（ＣＡＰＰＥＬ社製）を用いたＥＬＩＳＡ法にて抗原に対する抗体値を測定した。全部で３回の試験採血において、夫々、２，０００倍希釈、４，０００倍希釈、８，０００倍希釈にて吸光度（４９２ｎｍ）が３となり、３回目の試験採血において抗体価の十分な上昇を確認された。そこで、この３回目の試験採血の後に、抗体精製用の全採血を行った。採血した血液から血清を遠心にて分離し、ついで、得られた血清を抗原に用いた合成ペプチドをカップリングしたアフイニティビーズを用いたカラムにかけ、精製ウサギポリクローナル抗体（ａｎｔｉ−ｍＫＩＡＡ０５４６  ａｂ）を得た。
【００５３】
（７）精製ウサギポリクローナル抗体を用いたウエスタンブロット法による各種マウス臓器でのマウスＫＩＡＡ０５４６蛋白質の検出
上記で得られた精製ウサギポリクローナル抗体を用い、ウエスタンブロット法にて各種マウス臓器でのマウスＫＩＡＡ０５４６蛋白質の検出を試みた。各種マウス臓器由来の可溶性蛋白質については、ＩＣＲマウスから採取した臓器を蛋白分解阻害剤の存在下で物理的に破砕して遠心して得た上清を用いた。各種マウス臓器としては、心臓、脳、肺、肝臓、筋肉、腎臓、精巣、膵臓、前立腺、胸腺、胃を使用した。ポリアクリルアミドゲル電気泳動は、ポリアクリルアミドゲルの各レーンに約２０マイクログラムの各種マウス臓器由来可溶性蛋白質をアプライして電気泳動で分画し、次に分画した蛋白質をメンブレンにブロットし、ブロットしたメンブレンに対し５００倍希釈した抗体を用いて免疫染色反応を行った。すなわち、ポリアクリルアミドゲル電気泳動はＢｉｏ−Ｒａｄ社製のレディ−ゲルＪ（＃Ｎｏ．  １６１−Ｊ３６１）を用いて行い、ＧｅｎｅＳｙｓｔｅｍｓ社製のＭｕｌｔｉ−Ｒｅｐｌｉｃａ  Ｂｌｏｔｔｉｎｇ  Ｋｉｔ  （＃Ｎｏ．  ＧＳ１００１）を用いて転写し蛋白質をメンブレンにブロットした。二次抗体にはＡｍｅｒｓｈａｍ社製Ａｎｔｉ−Ｒａｂｂｉｔ  Ｉｇ，  ＨＲＰ−Ｌｉｎｋｅｄ  Ｗｈｏｌｅ  Ａｂ  （＃Ｎｏ．  ＮＡ９３４）を用い、検出には同社のＥＣＬ  Ｐｌｕｓ  Ｗｅｓｔｅｒｎ  ｂｌｏｔｔｉｎｇ  Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ  Ｒｅａｇｅｎｔｓ  （＃Ｎｏ．  ＲＰＮ２１３３）を用いた。分子量を知る目的でインビトロジェン社製のＭａｇｉｃＭａｒｋ  Ｗｅｓｔｅｒｎ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｔａｎｄａｒｄ  （＃Ｎｏ．ＬＣ５６００）を各種臓器サンプルとともに電気泳動した。その結果を図３に示した。ＲＴ−ＰＣＲで解析したマウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子のｍＲＮＡレベルの発現では、精巣、脾臓、腎臓、肺などで発現量が高いことを確認したが、ウエスタンブロット法では精巣と膵臓での発現量が特に高かった。精巣と膵臓で発現が認められた蛋白質については、サイズマーカーから推定される分子量は約１６０ｋＤａであり、アミノ酸の一時構造から計算される分子量とも矛盾しなかった。さらに、脳、肺、胸腺、胃においても分子量は約１６０ｋＤａ付近に弱いがバンドが認められ、ＲＴ−ＰＣＲによるｍＲＮＡレベルの発現の実験結果と一致する結果を得た。更に、前立腺、心臓においては、精巣と膵臓に比較して分子量が少し低目になっているがやや強いバンドとして認められた。この分子量の相違は、翻訳後の蛋白分解系の存在を考慮すると必ずしも矛盾する結果とは考えられない。
【００５４】
（８）精製ウサギポリクローナル抗体を用いた免疫組織化学染色法によるマウス組織特異的発現の検出
ウエスタンブロット法によりマウスＫＩＡＡ０５４６蛋白質は、精巣と膵臓で強い発現が認められる結果を得た。そこで、上記で得られた精製ウサギポリクローナル抗体を用い、免疫組織化学染色法によるマウス組織特異的発現の検出を試みた。免疫組織化学染色は定法に基づきＡＢＣ法で行ったが（Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：  ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｍａｎｕａｌｓ．  Ｅｄ  Ｈａｒｌｏｗ  ＆  Ｄａｖｉｄ  Ｌａｎｅ，  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，  １９８８，  ｐ３５９−４２０）、一次抗体としてはウエスタンブロット法と同じく精製ウサギポリクローナル抗体を５００倍に希釈して用いた。ビオチン化二次抗体及びＡＢＣ試薬はＶｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ社製Ｅｌｉｔｅ  ＡＢＣ  ｋｉｔ  （＃Ｎｏ．  ＰＫ−６１０１）を使用し、呈色反応にはＫｉｒｋｅｇａａｒｄ  Ｐｅｒｒｙ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ社製のＤＡＢ  （３，３’−ｄｉａｍｉｎｏｂｅｎｚｉｄｉｎｅ）  Ｒｅａｇｅｎｔ  Ｓｅｔ  （＃Ｎｏ．５４−１０−００）を使用した。染色された蛋白質は茶色から褐色にて検出された。その結果、対照（ｃｏｎｔｒｏｌ）に比較し精製ウサギポリクローナル抗体処理にて顕微鏡下で観察すると明らかに茶色から褐色に染色され、白黒写真ではやや濃染として認められ、予想されたように精巣及び膵臓の組織切片にて陽性所見を得た（図４）。
興味深いことに、精巣では精巣の支持組織を構築するＬｅｙｄｉｇ細胞が陽性所見を呈したが、この細胞はテストステロンという男性ホルモンを合成し分泌する。また膵臓では顕微鏡下で観察すると、ランゲルハンス島以外の実質細胞である腺房細胞の細胞質が明らかに茶色から褐色に染色され、白黒写真ではやや濃染が認められた。腺房細胞は２０種類を超える消化酵素を分泌する細胞であることから、ＫＩＡＡ０５４６蛋白質はホルモンや酵素などの分泌機構とも関与している可能性が考えられた。
【００５５】
【発明の効果】
ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子にはその機能を類推するモチ−フ構造が無く、その機能を推定すること困難で全く未知であった。今回、本発明者はマウス脳由来のｃＤＮＡライブラリーから、ヒトＫＩＡＡ０５４６遺伝子に高いホモロジーを示す遺伝子（ＤＮＡ）をクローニングし、Ｎ−末端側に新たにＤＮＡ配列が付加されている新規ＤＮＡ配列、すなわちマウスＫＩＡＡ０５４６遺伝子を取得することに成功した。
【００５６】
これまでに記載したことから、本発明のＤＮＡ、本発明のポリペプチドあるいは本発明の抗体は、癌・自己免疫疾患・アレルギーのような細胞の増殖に関わる疾患や先天奇形など分化異常を含めたヒト疾患の機序解明及び診断・治療上で必要不可欠な役割を果たすと考えられる。また、ＲＴ−ＰＣＲによる各組織及び発生段階での発現のパターン情報は、精巣、脾臓、腎臓、肺などで特に発現量が高く、及び発生後期での発現が高いことを明らかとし、本発明の遺伝子が特に精巣、脾臓、腎臓、肺などの発生・分化やその機能保全また老化において重要性であること明らかにした。
【００５７】
更に、精製ウサギポリクローナル抗体を用いたウエスタンブロット法の結果からも、精巣においてはｍＲＮＡ、蛋白レベルともに高いことから精巣において重要な機能をつかさどっている可能性が、また膵臓についてはｍＲＮＡレベルの発現量の測定はしなかったが少なくとも蛋白質レベルの発現量は高く、膵臓において重要な機能をつかさどっている可能性が示された。また脳、肺、胸腺、胃において、また前立腺、心臓についても蛋白質レベルの発現量が確認されそれらの臓器において重要な機能をつかさどっている可能性が示された。
【００５８】
従って、本発明のＤＮＡ及び該ＤＮＡを含む哺乳動物由来遺伝子、それらがコードするポリペプチドの一部又は全長、該ポリペプチドの一部又は全長に対する抗体、アンチセンスＤＮＡ等は、癌や先天奇形を含めたヒト疾患を治療する為のモデル動物であるマウスを用いた各種治療・予防方法開発において、医薬として使用することが可能である。
【００５９】
【配列表】
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【図面の簡単な説明】
【図１】本発明のポリペプチドに新規に認められたＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フ及びプロリンに富む配列（ｐｒｏｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｒｅｇｉｏｎ）  を示す（ａａ：  アミノ酸配列で数字はアミノ酸数、ボックス：上から、ＦＰｒｉｎｔＳｃａｎ検索法、ＨＭＭＰｆａｍ検索法、ＨＭＭＳｍａｒｔ検索法、またＰｒｏｆｉｌｅＳｃａｎ検索法によるそれぞれ異なった検索法で同定したｐｒｏｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｒｅｇｉｏｎ、ＨＡＴ  繰り返し配列を示す）。
これらの結果から、ＰｒｏｆｉｌｅＳｃａｎ検索法及びＦＰｒｉｎｔＳｃａｎ検索法により新規プロリンに富む配列（ｐｒｏｌｉｎｅ−ｒｉｃｈ  ｒｅｇｉｏｎ）を、また、新規を含めた５つの新規ＨＡＴ（Ｈａｌｆ−Ａ−ＴＰＲ）繰り返しモチ−フを、ＨＭＭＳｍａｒｔ検索法により、それぞれ新たに同定した。
【図２】ＲＴ−ＰＣＲ法によるｍｂｇ０１３２３（マウスＫＩＡＡ０５４６）遺伝子のマウス各組織における発現強度の比較。上段はｍｂｇ０１３２３遺伝子の発現強度、下段はコントロールとして用いたハウスキーピング遺伝子（Ｇ３ＰＤＨ）の発現強度を、アガロース電気泳動で分画した後のエチジウムブロミド染色パターンについての写真で示す。
【図３】精製ウサギポリクローナル抗体を用いたウエスタンブロット法による各種マウス臓器でのマウスＫＩＡＡ０５４６蛋白質の検出の結果を示す。
【図４】精製ウサギポリクローナル抗体を用いたマウス免疫組織化学染色法による組織特異的発現の検出の結果を示す。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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