(57)【要約】【課題】特定のタンパク質に特異的に結合するタンパク質を作製する。【解決手段】まず、ステップＳｔ１において、標的タンパク質Ｔのアミノ酸配列を用意する。次に、このアミノ酸配列から標的タンパク質Ｔの立体構造を予測する。標的タンパク質のアミノ酸配列からその立体構造を予測するために、ＰＳＩＢＬＡＳＴ等の公知のデータベースを用いる。このことによって、標的タンパク質の立体構造情報が得られる。次に、ステップＳｔ２において、標的タンパク質Ｔの立体構造情報からその立体構造の分類を決定する。標的タンパク質Ｔの立体構造情報からその構造分類を決定するために、ＳＣＯＰ、ＣＡＴＨまたはＦＳＳＰ等のデータベースを利用する。次に、ステップＳｔ３において、標的タンパク質Ｔと同じ構造分類に属する類似タンパク質に結合する結合タンパク質を検索する。次に、ステップＳｔ４において、上記ステップＳｔ３で得られた結合タンパク質Ｃ’が、標的タンパク質Ｔとの間で結合を形成する人工タンパク質となるように、結合タンパク質Ｃ’のアミノ酸配列を改変することによって、人工タンパク質を設計する。【選択図】　図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
標的タンパク質に結合する人工タンパク質の製造方法であって、
上記標的タンパク質の立体構造情報に基づいて、上記標的タンパク質に類似する立体構造情報を有する類似タンパク質と、上記類似タンパク質に結合する結合タンパク質とを検索する工程（ａ）と、
上記結合タンパク質のうちの上記類似タンパク質に結合する結合領域のアミノ酸配列を改変することによって得られる人工タンパク質が、上記標的タンパク質に結合するように、上記人工タンパク質のアミノ酸配列を設計する工程（ｂ）と、
を含む人工タンパク質の製造方法。
【請求項２】
請求項１に記載の人工タンパク質の製造方法において、
上記工程（ａ）の前に、上記標的タンパク質のアミノ酸配列に基づいて上記標的タンパク質の立体構造情報を算出する工程（ｄ）をさらに含むことを特徴とする人工タンパク質の製造方法。
【請求項３】
請求項１に記載の人工タンパク質の製造方法において、
上記工程（ａ）の前に、上記標的タンパク質の分光学的手法によって立体構造情報を算出する工程（ｅ）をさらに含むことを特徴とする人工タンパク質の製造方法。
【請求項４】
請求項１から３のいずれか１つに記載の人工タンパク質の製造方法において、
上記工程（ｂ）では、上記人工タンパク質のうちの、アミノ酸配列が上記結合タンパク質から改変された改変領域と、上記標的タンパク質のうちの、上記改変領域に結合される被結合領域との間の平均力場ポテンシャルが最小値となるように、上記結合タンパク質のうちの上記結合領域のアミノ酸配列を改変することによって、人工タンパク質のアミノ酸配列を設計することを特徴とする人工タンパク質の製造方法。
【請求項５】
請求項１から４のいずれか１つに記載の人工タンパク質の製造方法において、
上記工程（ｂ）の後に、上記改変領域のアミノ酸配列を改変することによって、上記人工タンパク質の上記標的タンパク質に対する結合の強さを調節する工程（ｃ）をさらに含むことを特徴とする人工タンパク質の製造方法。
【請求項６】
標的タンパク質の立体構造情報に基づいて、上記標的タンパク質に類似する立体構造情報を有する類似タンパク質と、上記類似タンパク質に結合する結合タンパク質とを検索する工程（ａ）と、
上記結合タンパク質のうちの上記類似タンパク質に結合する結合領域のアミノ酸配列を改変することによって得られる人工タンパク質が、上記標的タンパク質に結合するように、上記人工タンパク質のアミノ酸配列を設計する工程（ｂ）と、
上記人工タンパク質のアミノ酸配列に基づいて作製された上記人工タンパク質を上記標的タンパク質に結合させる工程（ｃ）と、
を含む標的タンパク質の検出方法。
【発明の詳細な説明】
【０００１】
【発明の属する技術分野】
本発明は、人工タンパク質の製造方法およびタンパク質の検出方法に関し、特に、特定のタンパク質に特異的に結合する人工タンパク質に関する。
【０００２】
【従来の技術】
近年の臨床検査では、血液や患部細胞内で発現している特定のタンパク質を検出することによって、疾病の種類および状態を検査することが一般的に行なわれている。タンパク質の検出には様々な方法があり、特に、標的となるタンパク質と特異的に結合する抗体を作製し、この抗体をプローブとして用いて標的タンパク質を検出する方法が一般的である。
【０００３】
【発明が解決しようとする課題】
抗体を検出プローブとして用いる場合、標的タンパク質を抗原として、実験動物に注射し、実験動物にこの標的タンパク質に対する抗体を産生させる。
【０００４】
しかしながら、抗体を作製する場合には、抗原を実験動物に注射する段階から、抗体を産生する細胞をスクリーニングによって得るまでに多数の工程を要する。このため、標的タンパク質と特異的に結合する抗体の作製には、非常に長い期間を要する。また、抗体を産生する細胞は非常にデリケートであり、抗体を産生する細胞に抗体を大量に産生させる工程でも、その産生環境を維持するためのコストが大きい。このため、製造コストが膨大になる。
【０００５】
また、抗体を産生する実験動物は、高等動物であり、ヒトと比較的近縁であるため、ヒト由来のタンパク質を認識する抗体を実験動物に産生させようとしても、実験動物の細胞では、ヒト由来のタンパク質を抗原として認識しない可能性がある。このため、一般的には、タンパク質の一部を切断するなど、実験動物の細胞でヒト由来のタンパク質が抗原として認識されやすいようにタンパク質を加工する必要がある。
【０００６】
従って、抗体を特定のタンパク質を検出するためのプローブとして利用するのは、コスト的にも、時間的にも非常に負担が大きい。
【０００７】
本発明は、上記不具合を解決するためになされたものであり、特定のタンパク質を特異的に結合するタンパク質を作製することを目的とする。
【０００８】
【課題を解決するための手段】
本発明の人工タンパク質の製造方法は、標的タンパク質に結合する人工タンパク質の製造方法であって、上記標的タンパク質の立体構造情報に基づいて、上記標的タンパク質に類似する立体構造情報を有する類似タンパク質と、上記類似タンパク質に結合する結合タンパク質とを検索する工程（ａ）と、上記結合タンパク質のうちの上記類似タンパク質に結合する結合領域のアミノ酸配列を改変することによって得られる人工タンパク質が、上記標的タンパク質に結合するように、上記人工タンパク質のアミノ酸配列を設計する工程（ｂ）とを含む。
【０００９】
本発明の人工タンパク質の製造方法によれば、実験動物を用いずに、標的タンパク質と特異的に結合する人工タンパク質を作製することができる。また、本発明の人工タンパク質の製造方法によって得られた人工タンパク質のアミノ酸配列に対応する塩基配列を有するＤＮＡ断片を組み込んだベクターを、遺伝子工学的手法を用いて大腸菌等の細菌に導入し、人工タンパク質を大量に発現させることによって、人工タンパク質を安価で大量に得ることができる。
【００１０】
上記工程（ａ）の前に、上記標的タンパク質のアミノ酸配列に基づいて上記標的タンパク質の立体構造情報を算出する工程（ｄ）をさらに含む構成としてもよい。
【００１１】
上記工程（ａ）の前に、上記標的タンパク質の分光学的手法によって立体構造情報を算出する工程（ｅ）をさらに含む構成としてもよい。
【００１２】
上記工程（ｂ）では、上記人工タンパク質のうちの、アミノ酸配列が上記結合タンパク質から改変された改変領域と、上記標的タンパク質のうちの、上記改変領域に結合される被結合領域との間の平均力場ポテンシャルが最小値となるように、上記結合タンパク質のうちの上記結合領域のアミノ酸配列を改変することによって、人工タンパク質のアミノ酸配列を設計してもよい。
【００１３】
上記工程（ｂ）の後に、上記改変領域のアミノ酸配列を改変することによって、上記人工タンパク質の上記標的タンパク質に対する結合の強さを調節する工程（ｃ）をさらに含むことが好ましい。
【００１４】
このことによって、標的タンパク質と、標的タンパク質に類似するタンパク質との発現量を観察するために、標的タンパク質と、標的タンパク質に類似するタンパク質とを区別をせず、どちらのタンパク質にも結合することが可能な人工タンパク質を作製することができる。
【００１５】
本発明の標的タンパク質の検出方法は、標的タンパク質の立体構造情報に基づいて、上記標的タンパク質に類似する立体構造情報を有する類似タンパク質と、上記類似タンパク質に結合する結合タンパク質とを検索する工程（ａ）と、上記結合タンパク質のうちの上記類似タンパク質に結合する結合領域のアミノ酸配列を改変することによって得られる人工タンパク質が、上記標的タンパク質に結合するように、上記人工タンパク質のアミノ酸配列を設計する工程（ｂ）と、上記人工タンパク質のアミノ酸配列に基づいて作製された上記人工タンパク質を上記標的タンパク質に結合させる工程（ｃ）とを含む。
【００１６】
本発明によれば、人工タンパク質は標的タンパク質と特異的に結合するので、人工タンパク質を標的タンパク質を検出するためのプローブとして用いることができる。特に、本発明では、人工タンパク質のアミノ酸配列に対応する塩基配列を有するＤＮＡ断片を組み込んだベクターを、遺伝子工学的手法を用いて大腸菌等の細菌に導入し、人工タンパク質を大量に発現させることによって、人工タンパク質を安価で大量に得ることができる。従って、本発明によれば、標的タンパク質を検出する際に、コスト的、時間的負担が非常に小さい。
【００１７】
【発明の実施の形態】
以下、本発明の各実施形態の人工タンパク質の製造方法を図面を参照しながら説明する。
【００１８】
（実施形態１）
図１は、本実施形態のタンパク質の製造方法の各ステップを表すフローチャートである。図２（ａ）は、標的タンパク質を表す模式図であり、図２（ｂ）は、標的タンパク質に類似した立体構造を有するタンパク質群を表す模式図である。図３（ａ）は、標的タンパク質の構造を表す模式図であり、図３（ｂ）は、標的タンパク質に類似した立体構造を有するタンパク質と、それに結合するタンパク質とを表す模式図であり、図３（ｃ）は、図３（ｂ）に示すそれぞれのタンパク質の構造を表す模式図である。
【００１９】
図１に示すように、まず、ステップＳｔ１において、検出対象となるタンパク質Ｔ（以下、標的タンパク質Ｔと称する）のアミノ酸配列を用意する。次に、図２（ａ）に示すように、このアミノ酸配列から標的タンパク質Ｔの立体構造を予測する。本実施形態では、標的タンパク質のアミノ酸配列からその立体構造を予測するために、ＰＳＩＢＬＡＳＴ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ／）等の公知のデータベースを用いる。このことによって、標的タンパク質の立体構造情報が得られる。
【００２０】
次に、ステップＳｔ２において、標的タンパク質Ｔの立体構造情報からその立体構造の分類を決定する。本実施形態では、標的タンパク質Ｔの立体構造情報からその構造分類を決定するために、ＳＣＯＰ（ｈｔｔｐ：／／ｓｃｏｐ．ｍｒｃ−ｌｍｂ．ｃａｍ．ａｃ．ｕｋ／ｓｃｏｐ／）、ＣＡＴＨ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｂｉｏｃｈｅｍ．ｕｃｌ．ａｃ．ｕｋ／ｂｓｍ／ｃａｔｈ＿ｎｅｗ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌ）またはＦＳＳＰ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ２．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／ｄａｌｉ／ｆｓｓｐ／ｆｓｓｐ．ｈｔｍｌ）等のデータベースを利用する。特に、ＰＳＩＢＬＡＳＴによって標的タンパク質の立体構造情報が得られる場合、同時にＳＣＯＰの分類コードも得られる。従って、本実施形態では標的タンパク質Ｔの立体構造の分類のために、ＳＣＯＰの分類コードを利用する。なお、標的タンパク質Ｔの立体構造情報が公知である場合、標的タンパク質の構造分類を表すＳＣＯＰの分類コードが必ず与えられているので、それを用いてもよい。
【００２１】
次に、ステップＳｔ３において、標的タンパク質Ｔと同じ構造分類に属する類似タンパク質に結合する結合タンパク質を検索する。例えば、図２（ｂ）に示すように、標的タンパク質Ｔと同じ構造分類に属し、立体構造が類似する類似タンパク質Ａ〜Ｄが検索された場合、類似タンパク質Ｃと互いに結合し、多量体を形成することができる結合タンパク質Ｃ’を選択し、結合タンパク質Ｃ’のアミノ酸配列および立体構造情報を取得する。
【００２２】
次に、ステップＳｔ４において、標的タンパク質Ｔの結合領域ｔと、上記ステップＳｔ３で得られた結合タンパク質Ｃ’との間で結合を形成するように、結合タンパク質Ｃ’のアミノ酸配列を改変する。このことによって、標的タンパク質Ｔに結合する人工タンパク質のアミノ酸配列が得られる。
【００２３】
アミノ酸配列の改変には、図３（ａ）〜（ｃ）に示すように、まず、類似タンパク質Ｃと標的タンパク質とのアミノ酸配列を比較し、結合タンパク質Ｃ’と互いに結合するタンパク質Ｃの結合領域ｒのアミノ酸配列に相同性のある標的タンパク質Ｔのアミノ酸配列を特定する。次に、特定された標的タンパク質Ｔのアミノ酸配列を標的タンパク質Ｔの結合領域ｔであると仮定し、標的タンパク質Ｔの結合領域ｔと結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒとで互いにタンパク質が結合すると仮定する。続いて、標的タンパク質Ｔと結合タンパク質Ｃ’との間の平均力場ポテンシャルの総和を算出する。次に、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに位置するアミノ酸配列を様々な配列に改変し、上記の平均力場ポテンシャルの総和が最も良好な値（具体的には最小の負の値）となるまで繰り返し行なうことによって、標的タンパク質Ｔに結合する人工タンパク質のアミノ酸配列を決定する。
【００２４】
以上のようにして、標的タンパク質Ｔに結合する人工タンパク質のアミノ酸配列が得られる。標的タンパク質Ｔに結合する人工タンパク質は、得られた人工タンパク質のアミノ酸配列に対応する塩基配列を有するＤＮＡ断片を組み込んだベクターを、遺伝子工学的手法を用いて大腸菌等の細菌に導入し、発現させることによって得られる。
【００２５】
本実施形態では、ステップＳｔ４において、結合タンパク質Ｃ’と、標的タンパク質Ｔとの間の平均力場ポテンシャルの総和を算出することによって、結合タンパク質Ｃ’のアミノ酸配列を改変し、結合タンパク質Ｃ’に基づいて人工タンパク質のアミノ酸配列を設計する。
【００２６】
１つのタンパク質内における、各アミノ酸間の平均力場ポテンシャルについては、（Ｕｓｉｎｇ　Ｄａｔａ　Ｃｏｍｐｒｅｓｓｉｏｎ　ｆｏｒ　Ｍｕｌｔｉｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ　Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ　Ａｎａｌｙｓｉｓ、Ｏｎｉｄｕｋａら、ＩＥＥＥ　ｉｎｔｅｌｌｉｇｅｎｔ　ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｍａｙ／Ｊｕｎｅ２００２、４８〜５４ページ）に詳しく記載されている。この文献に記載されている１つのタンパク質内における、各アミノ酸間の平均力場ポテンシャルを、本実施形態ではここでは２つのタンパク質のそれぞれの各アミノ酸間に適用する。以下、２つのタンパク質の各アミノ酸間の平均力場ポテンシャルを図４を参照しながら簡単に説明する。
【００２７】
図４（ａ）に示すように、２つのタンパク質ＸおよびＹは結合している。このとき、互い距離が一定の値（例えば、１ｎｍ）以内にあるタンパク質Ｘに含まれるアミノ酸と、タンパク質Ｙに含まれるアミノ酸との対を全て選び出す。次に、選ばれたアミノ酸の各対の間の互いの相対位置関係について、アミノ酸の対の組み合わせ毎に分布をとる。相対位置関係とは、図４（ｂ）に示すように、アミノ酸の対の間の距離、一方のアミノ酸から見た他方のアミノ酸の方位、および一方のアミノ酸から見た他方のアミノ酸の姿勢のことである。
【００２８】
相対位置関係をＳ、対を構成するアミノ酸の種類をａ、ｂとした場合の相対位置関係の分布をｆａｂ（Ｓ）とすると、平均力場ポテンシャルＥａｂ（Ｓ）は以下に示す式（１）で与えられる。なお、式（１）において、ｋはボルツマン定数、Ｔは絶対温度である。
【００２９】
Ｅａｂ（Ｓ）＝−ｋＴｌｏｇｆａｂ（Ｓ）　　　　（１）
通常、平均力場ポテンシャルの総和を算出する場合、タンパク質Ｘに含まれるアミノ酸と、タンパク質Ｙに含まれるアミノ酸との対を全て選び出し、アミノ酸の対の組み合わせ毎に相対位置関係の分布をとることによって求めた平均力場ポテンシャルを合計するが、本実施形態では、標的タンパク質Ｔの結合領域ｔに含まれるアミノ酸と、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに含まれるアミノ酸との間に限定して、平均力場ポテンシャルの総和を算出する。特に、本実施形態のステップＳｔ４では、平均力場ポテンシャルの総和が最も小さい負の値となるように、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに含まれるアミノ酸を改変する。本実施形態のステップＳｔ４での平均力場ポテンシャルの総和の算出する例を図５および図６を参照しながら説明する。
【００３０】
図５は、標的タンパク質Ｔの結合領域ｔに含まれるアミノ酸のうちのアミノ酸ｑ１、ｑ２、およびｑ３が、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに含まれるアミノ酸ｐに対して一定の距離以内に存在する場合を表している。
【００３１】
アミノ酸ｐと、アミノ酸ｑ１、ｑ２、およびｑ３のそれぞれとの間の相対位置関係をＳ１、Ｓ２およびＳ３とすると、結合タンパク質Ｃ’に含まれるアミノ酸ｐに関する平均力場ポテンシャルの総和Ｅｔは、次式（２）で表される。
【００３２】
Ｅｔ＝Ｅｐｑ１（Ｓ１）＋Ｅｐｑ２（Ｓ２）＋Ｅｐｑ３（Ｓ３）
＝−ｋＴ［ｌｏｇｆｐｑ１（Ｓ１）＋ｌｏｇｆｐｑ２（Ｓ２）＋ｌｏｇｆｐｑ３（Ｓ３）］　　（２）
以上に述べた算出方法に基づいて、標的タンパク質Ｔの結合領域ｔおよび結合タンパク質Ｃ’　の結合領域Ｒの各アミノ酸の対の組み合わせ毎に平均力場ポテンシャルを算出し、これらの平均力場ポテンシャルの総和が最も低い値となるように、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに含まれるアミノ酸を改変する。例えば、図５に示す結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに位置しているアミノ酸ｐを、図６に示すアミノ酸ｐ’に改変する。このような改変を、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒ全体に亘って行なうことによって、図６に示すように、結合タンパク質Ｃ’に基づいて標的タンパク質Ｔに結合する人工タンパク質が設計される。
【００３３】
なお、このようにして得られたアミノ酸配列に基づいて、実際に人工タンパク質を遺伝子工学的手法を用いて発現させて作製したときに、人工タンパク質自体の立体構造が変化してしまい、標的タンパク質Ｔに結合しないこともあり得る。この場合、人工タンパク質の各アミノ酸について、人工タンパク質自体に含まれる全アミノ酸との平均力場ポテンシャルを算出し、結合タンパク質Ｃ’と近似した平均力場ポテンシャルの総和が得られるように人工タンパク質のアミノ酸配列を修正すればよい。
【００３４】
また、得られた人工タンパク質のアミノ酸配列のうちの、図６に示す標的タンパク質Ｔの結合領域ｔに結合する結合領域Ｒ’（すなわち、結合タンパク質Ｃ’の結合領域Ｒに相当する領域）に含まれるアミノ酸配列を改変し、平均力場ポテンシャルの総和を調節することによって、標的タンパク質Ｔの結合領域ｔと人工タンパク質の結合領域Ｒ’との間の結合の強さを調節することができる。
【００３５】
このことによって、標的タンパク質Ｔと、標的タンパク質Ｔに類似するタンパク質との発現量を観察するために、標的タンパク質Ｔと、標的タンパク質Ｔに類似するタンパク質とを区別をせず、どちらのタンパク質にも結合することが可能な人工タンパク質を作製することができる。
【００３６】
以上に述べたように、本実施形態によれば、標的タンパク質Ｔに特異的に結合することが可能な人工タンパク質が得られる。
【００３７】
特に、本実施形態では、実験動物を用いないので、標的タンパク質と特異的に結合する人工タンパク質を作製するために、標的タンパク質を加工する必要がない。また、本実施形態によって得られた人工タンパク質のアミノ酸配列に対応する塩基配列を有するＤＮＡ断片を、遺伝子工学的手法を用いて大腸菌等の細菌に導入し、大量に発現させることによって、人工タンパク質を安価で大量に得ることができる。
【００３８】
つまり、本実施形態によれば、標的タンパク質Ｔに特異的に結合することが可能な人工タンパク質を、大腸菌などを用いて安価で且つ大量に得ることができる。
【００３９】
また、本実施形態では、抗体を作製する際に要する多数の工程を必要としないため、標的タンパク質と特異的に結合する人工タンパク質の作製は、非常に短い期間で達成できる。このため、製造コストを非常に低く抑えることが可能である。
【００４０】
本実施形態で得られた人工タンパク質は、標的タンパク質と特異的に結合するので、標的タンパク質を検出するためのプローブとして用いることができる。つまり、本実施形態で得られた人工タンパク質を標的タンパク質Ｔに結合させることによって、標的タンパク質を検出することができる。
【００４１】
本実施形態によって得られる人工タンパク質は、上述のように非常に低コストで得られるので、標的タンパク質を検出するためのプローブとして利用する際にも、コスト的、時間的負担が非常に小さい。
【００４２】
（実施形態２）
上記実施形態１では、標的タンパク質Ｔのアミノ酸配列が既知であり、標的タンパク質Ｔの立体構造が未知である場合を説明したが、本発明はこれに限定されない。例えば、標的タンパク質Ｔの立体構造が分光学的手法で解析可能である、または標的タンパク質Ｔの立体構造が既知である場合も、本発明を適用することが可能である。
【００４３】
図７は、本実施形態のタンパク質の製造方法の各ステップを表すフローチャートである。
【００４４】
図７に示すように、ステップＳｔ１’において、標的タンパク質Ｔの立体構造を決定する。具体的には、標的タンパク質Ｔを分光学的手法（Ｘ線構造解析、ＮＭＲ等）で解析することによって、標的タンパク質Ｔの立体構造情報を取得する。また、標的タンパク質Ｔの立体構造が既知である場合、その立体構造情報をＰＳＩＢＬＡＳＴ（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ／）等の公知のデータベースから検索することも可能である。
【００４５】
図７に示すように、本実施形態のタンパク質の製造方法は、上記実施形態１とほぼ同じである。但し、上記実施形態１のステップＳｔ１が、本実施形態ではＳｔ１’となっている点でのみ異なっている。従って、ステップＳｔ２〜Ｓｔ４の説明は省略する。
【００４６】
本実施形態によれば、上記実施形態１と全く同様に、安価で、且つ大量に標的タンパク質Ｔに特異的に結合することが可能な人工タンパク質が得られる。
【００４７】
【発明の効果】
本発明によれば、特定のタンパク質に特異的に結合するタンパク質を作製することができる。
【図面の簡単な説明】
【図１】図１は、実施形態１のタンパク質の製造方法の各ステップを表すフローチャートである。
【図２】図２（ａ）は、標的タンパク質を表す模式図であり、図２（ｂ）は、標的タンパク質に類似した立体構造を有するタンパク質群を表す模式図である。
【図３】図３（ａ）は、標的タンパク質の構造を表す模式図であり、図３（ｂ）は、標的タンパク質に類似した立体構造を有するタンパク質と、それに結合するタンパク質とを表す模式図であり、図３（ｃ）は、図３（ｂ）に示すそれぞれのタンパク質の構造を表す模式図である。
【図４】図４（ａ）および（ｂ）は、２つのタンパク質の各アミノ酸間の平均力場ポテンシャルを説明する図である。
【図５】図５は、２つのタンパク質の間の平均力場ポテンシャルの総和の算出する例を表す図である。
【図６】図６は、２つのタンパク質の間の平均力場ポテンシャルの総和の算出する例を表す図である。
【図７】図７は、実施形態２のタンパク質の製造方法の各ステップを表すフローチャートである。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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