(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒト対象が、１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクを有するかどうかを判定するためのデータを収集する方法であって、
（ａ）前記ヒト対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップであって、
【化１】
0006774879.tif 000058
(III)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
前記生体サンプルが、血液サンプル、血清サンプル、血漿サンプル、又はそれから取得されたリポタンパク質分画である前記ステップと、
（ｂ）前記ヒト対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【化２】
0006774879.tif 000059
(IV)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、
式中、
Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記生体サンプルが含有する前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度が増加している場合には、前記ヒト対象は、１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっていると判定するステップと、
を含む前記方法。
【請求項２】
ヒト対象において、ＣＶＤ及び／又はその合併症のうちの１つ又は複数に対する治療の有効性を評価するためのデータを収集する方法であって、
（ａ）前記ヒト対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップであって、
【化３】
0006774879.tif 000060
(III)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
前記生体サンプルが、血液サンプル、血清サンプル、血漿サンプル、又はそれから取得されたリポタンパク質分画である前記ステップと、
（ｂ）前記ヒト対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【化４】
0006774879.tif 000061
(IV)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、
式中、
Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が増加しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度が低下している場合には、治療は有効であると判定するステップと、
を含む前記方法。
【請求項３】
ヒト対象において、ＣＶＤ及び／又はその合併症の１つ又は複数について、適切な治療を選択するためのデータを収集する方法であって、
（ａ）前記ヒト対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップであって、
【化５】
0006774879.tif 000062
(III)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
前記生体サンプルが、血液サンプル、血清サンプル、血漿サンプル、又はそれから取得されたリポタンパク質分画である前記ステップと、
（ｂ）前記ヒト対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【化６】
0006774879.tif 000063
(IV)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、
式中、
Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度が増加している場合には、前記ヒト対象が、治療を必要とする、又はすでに実施されている治療の変更若しくは補充を必要とすると判定するステップと、
を含む前記方法。
【請求項４】
マススペクトロメトリーを用いて、前記少なくとも１つの式（ＩＩＩ）のセラミド及び前記少なくとも１つの式（ＩＶ）のセラミドの濃度が測定される、請求項１から３までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
直接サンプル注入法又は高性能分離法と連結したマススペクトロメトリー装置を用いて、前記少なくとも１つの式（ＩＩＩ）のセラミド及び前記少なくとも１つの式（ＩＶ）のセラミドの濃度が測定される、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
少なくとも２つ若しくは少なくとも３つの式（ＩＩＩ）のセラミドの濃度が測定される、請求項１から５までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項７】
少なくとも２つ若しくは少なくとも３つの式（ＩＶ）のセラミドの濃度が測定される、請求項１から６までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
Ｚ＝（式ＩＩＩのセラミド）a／（式ＩＶのセラミド）bの式（式中、ａ、ｂ∈Ｒである）により、前記コントロールサンプルと比較して前記生体サンプルが有するＺ値が高い場合に、前記対象は１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっている、請求項１から７までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記１つ又は複数のＣＶ合併症が、ＡＭＩ（急性心筋梗塞）、ＡＣＳ（急性冠状動脈症候群）、脳卒中、又はＣＶ死のうちの１つ又は複数である、請求項１から８までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミド及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定する前に、前記生体サンプルから脂質を抽出するステップを更に含む、請求項１から９までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項１１】
前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミド及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定する前に、少なくとも１つの同位体標識された式ＩＩＩのセラミド及び少なくとも１つの同位体標識された式ＩＶのセラミドで、前記生体サンプルをスパイクするステップを更に含む、請求項１から１０までのいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
前記少なくとも１つの同位体標識されたセラミドの同位体が、重水素である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
ＣＶ合併症を予測するための組成物又はキットであって、
（ａ）少なくとも１つの同位体標識された式ＩＩＩのセラミドと、
【化７】
0006774879.tif 000064
(III)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）少なくとも１つの同位体標識された式ＩＶのセラミドと、
【化８】
0006774879.tif 000065
(IV)
（式中、
Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、
式中、
Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、
Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
を含む前記組成物又はキット。
【請求項１４】
前記少なくとも１つの同位体標識されたセラミドの同位体が、重水素である、請求項１３に記載の組成物又はキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１４年６月１６日付け出願の米国仮特許出願第６２／０１２，５４３号、及び２０１５年４月２日付け出願の米国特許出願第１４／６７７，５９５号に対する優先権及びその利益を主張し、その全内容を本明細書において参照により組み込む。
【０００２】
本出願は、心血管系（ＣＶ）合併症、例えばＡＭＩ（急性心筋梗塞）、ＡＣＳ（急性冠状動脈症候群）、脳卒中、又はＣＶ死等を発症するリスクが高まっている対象を識別する際の、セラミドバイオマーカー及びその使用と一般的に関連する。
【背景技術】
【０００３】
現行のＣＶマーカーであるＬＤＬ−Ｃ、ＨＤＬ−Ｃ、及び総コレステロールは、ＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等に対するリスクが上昇している冠動脈疾患（ＣＡＤ）患者、又は対象を、より安定な疾患を有する患者から識別することができない。
心筋梗塞という用語は、病理学的には、潅流需要の増加又は血流の減少により引き起こされ得る、遷延性の虚血に起因した心筋細胞の死を指す。該イベントは、それが突然且つ重篤な場合には「急性」と呼ばれる。心臓バイオマーカー（クレアチニンキナーゼＭＢ［ＣＫ−ＭＢ］、トロポニン、及びミオグロビン）及び心電図（ＥＣＧ）所見の変化に加えて、病歴及び身体検査から臨床的に強く疑われると、ＡＭＩの診断が下される。２次元心エコー検査等のイメージング技術も、心筋機能不全を実証する際に有用である。しかし、現行のＣＶマーカーであるＬＤＬ−Ｃ、ＨＤＬ−Ｃ、及び総コレステロールによる識別は、心組織の損傷がすでに生じてしまったときに限定される。これらのマーカーは、ＣＶＤ合併症が生ずる可能性を予測することができない。
【０００４】
急性冠状動脈症候群（ＡＣＳ）は、心臓への血流が突然低下することによりもたらされたあらゆる状態について用いられる用語である。急性冠状動脈症候群の第１の兆候は、心停止と呼ばれる心臓の突然の停止であり得る。急性冠状動脈症候群は、救急処置室又は病院において多くの場合診断されるが、この場合、心組織の損傷又は心臓の電気活動における問題に関するエビデンスを提供する、ＡＭＩと同じ心臓バイオマーカー又は心電図（ＥＣＧ）が用いられる。
脳卒中は、脳組織から酸素及び養分を奪う、脳への血液供給障害に起因する脳機能の喪失である。数分以内に、脳細胞は死滅し始める。脳卒中は、動脈の閉塞（虚血性脳卒中）、又は血管漏出若しくは血管破裂（出血性脳卒中）が原因となり得る。人によっては、脳を通過する血流の一時的な途絶を経験する場合がある（一過性虚血発作、又はＴＩＡ）。脳卒中は、脳イメージング及び物理試験の実施により、通常診断される。
突然心臓死（ＳＣＤ）は、突発性心停止（ＳＣＡ）とも呼ばれ、心機能の喪失により引き起こされる突然の予期せぬ死である。突発性心停止は、心臓発作（心筋梗塞）ではない。心臓発作は、心臓が酸素に富んだ十分な血液を受け入れるのを阻止するような閉塞が、冠動脈の１つ又は複数において存在するときに生ずる。対照的に、突発性心停止は、心臓に向かう電気系に不具合が生じ、非常に不規則な状態に突然陥ったときに生ずる。心拍動は、危険なほどに速くなる。心室細動が生ずる場合もあり、血液が身体に送達されない。最初の数分間における最大の懸念として、脳への血流が急激に低下するため、ヒトは意識を失うことが挙げられる。緊急治療が速やかに開始されなければ死に至る。突発性心停止は前触れもなく生じ、生じている間に、メディカルテストにより診断されるのは稀である。一方、ＳＣＡは、ヒトの突発性の虚脱に関するその他の原因を除外することにより、多くの場合、それが生じた後に診断される。
【０００５】
ＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及び突然心臓死は、急性段階で診断されるが、予測マーカーは入手不能である。これらのイベントに潜むリスク因子として、例えば年齢、低脂血症、高血圧症、喫煙、糖尿病、ＣＡＤ、又は過去の心臓発作が挙げられる。イベントを予測し得る診断検査は存在しないものの、心血管系疾患は、全世界における主たる死亡原因である。更に、ＣＶＤは、その他のあらゆる疾患群よりも大きな社会的負担となっている。ＣＶＤの診断で用いられる試験と同様の試験が、イベントの予測で利用される。今日、最も革新的なアプローチは、ＬＤＬ−Ｃ、ＨＤＬ−Ｃ、Ｌｐ（ａ）、Ｌｐ−ＰＬＡ２（ＰＬＡＣ試験）、又はＣＲＰの利用である。しかし、掲載する脂質ベースのマーカー（ＬＤＬ−Ｃ、ＨＤＬ−Ｃ、Ｌｐ（ａ）、Ｌｐ−ＰＬＡ２（ＰＬＡＣ試験））のいずれも、医師にとって階層化の一助となり得るような、臨床的に有用な予兆情報を提供しない。ＣＲＰは、研究現場において有望であるが、しかし非特異的であることが証明されており（ＣＲＰは急性期の反応物質であり、多くの異なる刺激に対して反応する可能性があり、極めて変わりやすい試験結果をもたらす）、従って、臨床用途でＣＲＰ値を解釈するのは困難である。ＣＶ合併症、例えばＡＭＩ（急性心筋梗塞）、ＡＣＳ（急性冠状動脈症候群）、脳卒中、及びＣＶ死等を予測し得る診断検査に対して、未だ満たされない必要性が存在する。
【０００６】
セラミドに基づくリスク階層化により、今日のその他の脂質ベースのバイオマーカーと比較して、そのいずれにも勝るｐ値が得られる。更に、血漿セラミドのレベルは、特定の脂質低下治療（例えば、スタチン等）の影響を受ける可能性があり、従ってセラミドマーカーは、正確で実行可能なリスク階層化を実現する．
スタチン治療を受けているＣＡＤ患者、又はスタチン治療を受けていない同患者におけるＣＶの転帰を予測すること（Ｚｏｒａ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ社特許出願国際公開第２０１３０６８３７３号及び同第２０１３０６８３７４号）、又は高リスクＣＡＤ患者を識別すること、又は対象がＣＶ合併症を発症するリスクを有するかどうかを予測すること（Ｚｏｒａ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ社特許出願米国特許第１３／６９５，７６６号及び同第１３／８０５，３１９）を目的として、特定のセラミドを含む脂質分子の大きな群、及び２つの脂質分子から計算される比が識別された。
しかし、ＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症する患者のリスクを予測する方法について、その改善の必要性がなおも存在する。
【発明の概要】
【０００７】
本出願は、セラミドの構造に基づきセラミドの組み合わせを選択し、これを使用して、ＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死を含むＣＶＤ／ＣＡＤ関連合併症を予測するための独自のルールについて開示する。このようなセラミドマーカーは、従って高リスク冠動脈疾患患者を識別及び治療する手段を提供する。このような高感度で特異的なセラミドマーカーは、ＣＶＤ／ＣＡＤの転帰を予測する臨床用途の現行マーカーと比較して、診断及び予知における優れた価値を示すために、特に試験された。新たに規定されたルールに基づくセラミドバイオマーカーの組み合わせを用いれば、早期介入、症状発現及び罹患の抑制、並びにＣＶＤと関連した疾病率／死亡率の減少が促進される。従って、本明細書で記載及び主張するセラミドマーカーの組み合わせにより、重大なＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクを有する患者のために、治療、薬物介入、及びフォローアップが個別に策定できるようになる。
【０００８】
この新規に識別されたルールによれば、組み合わせたときに（濃度の増減に基づく）、ＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクが増加する特定のセラミドが、セラミドの構造及びその関連性に基づき異なる群に分類された。従って、特定の実施形態では、方法は、少なくとも１つの式（Ｉ）のセラミド（Ａ群セラミド）、及び少なくとも１つの式（ＩＩ）のセラミド（Ｂ群セラミド）の濃度を、対象から得られた生体サンプル中で測定するステップを含む。
少なくとも１つの式（Ｉ）のセラミドの濃度低下が、少なくとも１つの式（ＩＩ）のセラミドの濃度増加と組み合わさったとき、それはＣＶＤ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症する対象のリスク増加と関連する。
【０００９】
式（Ｉ）のセラミドは下記の構造を有する。
【化１】
0006774879.tif 000002
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【００１０】
式（ＩＩ）のセラミドは下記の構造を有する。
【化２】
0006774879.tif 000003
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【００１１】
１つの実施形態では、対象が１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法は、ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＡ群セラミドの濃度を測定するステップ、ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＢ群セラミドの濃度を測定するステップ、ｃ）前記少なくとも１つのＡ群セラミドの濃度、及び前記少なくとも１つのＢ群セラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップ、並びにｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つのＡ群セラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つのＢ群セラミドの濃度が増加している場合には、前記対象は１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっていると判定するステップを含む。特定の実施形態では、方法は、少なくとも１つの式Ｉ及びＩＩのセラミドの濃度を測定する前に、少なくとも１つの重水素標識された式Ｉのセラミド及び少なくとも１つの重水素標識された式ＩＩのセラミドを含む生体サンプルでスパイクするステップを更に含む。
【００１２】
１つの実施形態では、式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。別の実施形態では、式（Ｉ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）の濃度、並びに式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。
【００１３】
別の態様は、ヒト血液サンプル中に存在することがこれまで知られていなかったＡ群セラミドのサブセット、及び／又は式Ｂセラミドのサブセット、及び対象が、１つ又は複数のＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法でのそれらの使用と関連する。従って、特定の実施形態では、方法は、対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式（ＩＩＩ）のセラミド（Ｃ群セラミド）、及び少なくとも１つの式（ＩＶ）のセラミド（Ｄ群セラミド）の濃度を測定するステップを含む。
少なくとも１つの式（ＩＩＩ）のセラミドの濃度が低下し、それが少なくとも１つの式（ＩＶ）のセラミドの濃度の増加と組み合わさったとき、それは対象がＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクの増加と関係する。
【００１４】
式（ＩＩＩ）のセラミドは、下記の構造を有する。
【化３】
0006774879.tif 000004
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【００１５】
式（ＩＶ）のセラミドは、下記の構造を有する。
【化４】
0006774879.tif 000005
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【００１６】
１つの実施形態では、対象が１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法は、ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＣ群セラミドの濃度を測定するステップ、ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＤ群セラミドの濃度を測定するステップ、ｃ）前記少なくとも１つのＣ群セラミドの濃度、及び前記少なくとも１つのＤ群セラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップ、並びにｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つのＣ群セラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つのＤ群セラミドの濃度が増加している場合には、前記対象は１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっていると判定するステップを含む。特定の実施形態では、方法は、少なくとも１つの式ＩＩＩ及びＩＶのセラミドの濃度を測定する前に、少なくとも１つの重水素標識された式ＩＩＩのセラミド及び少なくとも１つの重水素標識された式ＩＶのセラミドを含む生体サンプルでスパイクするステップを更に含む。
【００１７】
特定の実施形態では、前記少なくとも１つの式（Ｉ）のセラミド及び少なくとも１つの式（ＩＩ）のセラミドの濃度、又は前記少なくとも１つの式（ＩＩＩ）のセラミド及び前記少なくとも１つの式（ＩＶ）のセラミドの濃度が、Ｚ＝（式Ｉのセラミド）a／（式ＩＩのセラミド）b、又はＺ＝（式ＩＩＩのセラミド）a／（式ＩＶのセラミド）bの式より求められ、式中、ａ、ｂ∈Ｒである。
【００１８】
別の態様は、対象において、ＣＶＤ及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ若しくは複数に対する治療の有効性を評価する方法に関し、同方法は、ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度を測定するステップ、ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度を測定するステップ、ｃ）前記少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度、及び前記少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度を、コントロールサンプルと比較するステップ、並びにｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度が等しい、又は増加しており、且つ前記少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度が等しい、又は低下している場合には、治療は有効であると判定するステップを含む。
【００１９】
特定の実施形態では、対象のアテローム性動脈硬化症、或いはＣＶＤ及び／又はその合併症のうち、１つ若しくは複数に対する治療の有効性を評価する方法は、測定するステップの後に、測定するステップで得られた少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドの濃度に基づき、対象においてすでに実施されている治療を変更、補充、又はそのまま継続するステップを更に含み得る。
本方法の１つの実施形態では、式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。別の実施形態では、式（Ｉ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）の濃度、並びに式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。
【００２０】
なおも別の態様は、対象において、ＣＶＤ及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ若しくは複数について、適切な治療を選択する方法に関し、同方法は、ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度を測定するステップ、ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度を測定するステップ、ｃ）前記少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度、及び前記少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度を、コントロールサンプルと比較するステップ、並びにｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度が低下しおり、且つ前記少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度が増加している場合には、前記対象が、治療を必要とする、又はすでに実施されている治療の変更若しくは補充を必要とすると判定するステップを含む。
【００２１】
本方法の１つの実施形態では、式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。別の実施形態では、式（Ｉ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）の濃度、並びに式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。
１つの実施形態では、治療はその有効性が評価され、又は本明細書で記載及び主張する方法に基づき、必要に応じて選択されるが、その治療は脂質調節治療（例えば、スタチン又は本出願で別途記載されているその他の脂質降下薬）である。別の実施形態では、方法は、ステップ（ｄ）で必要であると判定された対象に治療を実施するステップを更に含む。
【００２２】
なおも別の態様は、対象において、ＣＶＤ及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ若しくは複数を治療する、又は予防する方法に関し、同方法は、治療上有効用量の薬物を対象に投与するステップを含み、この場合、薬物はスタチン、スタチン以外のＨＭＧ−ＣｏＡレダクターゼ阻害剤、ナイアシン（ニコチン酸）、コレステロール吸収抑制剤、コレステリルエステル転送タンパク質（ＣＥＴＰ）、胆汁酸封鎖剤、フィブラート、植物ステロール、及びＰＣＳＫ９阻害剤より選択される別の脂質降下薬、又は小分子、抗体、アンチセンスＲＮＡ、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、及び天然の脂質若しくは修飾された脂質より選択される脂質／脂質濃度比のモジュレーターであり、またこの場合、薬物を投与する前に、コントロールサンプルと比較して、少なくとも１つのＡ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミド）の濃度の低下、及び少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度の増加に基づき、対象は、ＣＶＤ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等に罹患している、又はこれらを発症するリスクが高いものとして識別される。
【００２３】
生体サンプル中のセラミドの濃度は、任意の現在利用可能な技法又はその後に開発された技術を用いて測定することができる。特定の実施形態では、セラミドの濃度は、マススペクトロメトリーを用いて測定される。特定の実施形態では、マススペクトロメトリー装置は、直接サンプル注入法又は高性能分離法と連結している。
対象から得られた生体サンプル及びコントロールサンプルは、好ましくは血液サンプル、より好ましくは血漿サンプル、又は好ましくは血清サンプルである。特定の実施形態では、血液サンプルは、フィルター上で乾燥させた血液スポットである。また、血液、血漿、又は血清の分画、例えばその脂質分画である場合もある。従って、特定の実施形態では、方法は、Ａ、Ｂ、Ｃ、及び／又はＤ群セラミドの濃度を測定する前に、生体サンプルから脂質を抽出する更なるステップを含む。或いは、対象から得られたサンプル及びコントロールサンプルは、いずれも組織サンプル、例えば頸動脈組織等の動脈組織、又は頸動脈プラーク物質等の動脈プラーク物質であってもよい。
【００２４】
なおも別の態様は、ＣＶ合併症を予測するための、又は本明細書に開示の任意の方法を実施するための組成物又はキットである。特定の実施形態では、組成物又はキットは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式Ｉのセラミド、及び／又は少なくとも１つの式（ＩＩ）のセラミドを含む。１つの実施形態では、キットは、同位体（例えば重水素）標識された式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）を含む。別の実施形態では、キットは、同位体（例えば重水素）標識された式（Ｉ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）、並びに同位体（例えば重水素）標識された式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）を含む。
別の実施形態は、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式（ＩＩＩ）のセラミド、及び／又は少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式（ＩＶ）のセラミドを含む組成物又はキットと関連する。
添付図面は、本明細書に組み込まれ、本明細書の一部を構成するが、同図面は、特定の実施形態について説明し、また文書による説明と共に、本明細書に開示の組成物及び方法の特定の原理について説明する役割を果たす。
【図面の簡単な説明】
【００２５】
【図１】スチューデントｔ検定によるｐ値が最低である、Ａ群セラミド種１０例の相対的な変化／差異の平均（コントロール群の平均濃度で割り算した、症例群とコントロール群との差異の平均）を示す図である。
【図２】スチューデントｔ検定によるｐ値が最低である、Ｂ群セラミド種１０例の相対的な変化／差異の平均（コントロール群の平均濃度で割り算した、症例群とコントロール群との差異の平均）を示す図である。
【図３】Ａ群セラミド又はＢ群セラミドのいずれにも該当しないセラミド種６例の相対的な変化／差異の平均（コントロール群の平均濃度で割り算した、症例群とコントロール群との差異の平均）を示す図である。
【図４】本発明のいくつかの実施形態に基づくシステムの概略図である。特に、この図は、開示されるシステム及び方法に基づくコンピューターシステム１０６を導入する際に利用可能である、様々なハードウェア、ソフトウェア、及びその他のリソースについて説明する。
【発明を実施するための形態】
【００２６】
これ以降に、様々な代表的な実施形態を詳細に参照しながら、その事例を添付図面に示すと共に、それに続く「発明を実施するための形態」で議論する。下記の「発明を実施するための形態」は、読者が、本発明の特定の実施形態、特徴、及び態様の詳細について、より深く理解できるように提示されるものと理解され、本発明の範囲を制限するものと解釈してはならない。
１．略語
別途明記しない限り、本出願で用いられる略語は、下記の意味を有する：ＬＤＬ−Ｃ：低密度リポタンパク質コレステロール；ＨＤＬ−Ｃ：高密度リポタンパク質コレステロール；ＣＶＤ：心血管系疾患；ＣＶ：心血管系；ＣＡＤ：冠動脈疾患；ＩＶＵＳ：血管内超音波検査；ＮＩＲＳ：近赤外分光法；ＯＣＴ：光干渉断層撮影法；ＣＡＢＧ：冠動脈バイパス術；ＭＳ：マススペクトロメトリー；ＯＲ：オッズ比；ＳＤ：標準偏差；ＡＵＣ：曲線下面積；Ｓｅｎｓ：感度；Ｓｐｅｃ：特異性；ＭＲＣ％：相対変化の平均；ｐ−ｖａｌ：Ｐ値；ｑ−ｖａｌ：及びＱ値；Ｐｒ（＞χ）：χ二乗；ＩＣＤ−１０：疾病及び関連保健問題の国際統計分類、改訂第１０版。
【００２７】
２．定義
本発明がより容易に理解され得るように、特定の用語について最初に定義する。追加の定義は、「発明を実施するための形態」全体を通じて定める。
用語「対象」、「宿主」、「患者」、及び「個体」は、本明細書では診断又は治療するのが望ましいあらゆる哺乳動物の対象、特にヒトを指すのに交換可能に用いられる。対象は、狭心症、心筋梗塞、又は脳卒中等の心血管系疾患イベントに、これまでに罹患している可能性がある。ＣＶＤは、アテローム性動脈硬化症の結果である場合もあれば、そうでない場合もある。又は、対象は、過去にＣＶＤの兆候を有さない健常者である場合もある。
【００２８】
冠血管疾患／心血管系疾患（ＣＶＤ）は、当技術分野における一般意味を有し、ＣＡＤを含む、心臓、心臓弁、血液、及び身体の脈管構造に影響を及ぼす非常に多くの状態を分類するのに用いられる。本開示では、ＣＶＤ及びＣＡＤという用語は、交換可能に利用可能である。心血管系疾患として、内皮細胞機能不全、冠動脈疾患、狭心症、心筋梗塞、アテローム性動脈硬化症、うっ血性心不全、高血圧症、脳血管性疾患、脳卒中、一過性虚血発作、深部静脈血栓、末梢動脈疾患、心筋症、不整脈、大動脈弁狭窄症、及び動脈瘤が挙げられる。かかる疾患は、多くの場合、アテローム性動脈硬化症と関係する。本発明の好ましい実施形態では、心血管系疾患は、アテローム性動脈硬化症と関連した心血管系疾患である。
【００２９】
本明細書で用いる場合、用語「コンピューター実施型の方法」とは、その目的を実現するために機械又は装置を利用する方法を意味する。
本明細書で用いる場合、用語「プロセッサー」とは、指示を解釈及び実行する能力を有するデバイスを意味する。特に、プロセッサーは、インプットデータを受け入れ、該当するアウトプットデータを提供する論理的回路構成を採用する。プロセッサーは、ネットワークを介して相互にやり取りすることができる。
【００３０】
本出願で用いる場合、「Ａ群セラミド」、「Ａ群のセラミド」等は、式（Ｉ）のセラミドを意味する。
【化５】
0006774879.tif 000006
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【００３１】
本出願で用いる場合、「Ｂ群セラミド」、「Ｂ群のセラミド」等は、式（ＩＩ）のセラミドを意味する。
【化６】
0006774879.tif 000007
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【００３２】
本出願で用いる場合、「Ｃ群セラミド」、「Ｃ群のセラミド」等は、式（ＩＩＩ）のセラミドを意味する。
【化７】
0006774879.tif 000008
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【００３３】
本出願で用いる場合、「Ｄ群セラミド」、「Ｄ群のセラミド」等は、式（ＩＶ）のセラミドを意味する。
【化８】
0006774879.tif 000009
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【００３４】
本明細書で用いる場合、本発明による「脂質降下薬」は、好ましくはＨＭＧ−ＣｏＡレダクターゼ阻害剤、ナイアシン（ニコチン酸）、コレステロール吸収抑制剤、コレステリルエステル転送タンパク質（ＣＥＴＰ）阻害剤、胆汁酸封鎖剤、フィブラート、植物ステロール、又はＰＣＳＫ９阻害剤である。
【００３５】
本明細書で用いる場合、「コレステロール吸収抑制剤」は、好ましくはエゼチミブ又はＳＣＨ−４８４６１であり、コレステリルエステル転送タンパク質（ＣＥＴＰ）阻害剤は、好ましくはエバセトラピブ、アナセトラピブ、又はダルセトラピブであり、胆汁酸封鎖剤は、好ましくはコレセベラム、コレスチラミン、又はコレスチポールであり、フィブラートは、好ましくはフェノフィブラート、ゲムフィブロジル、クロフィブラート、又はベザフィブラートであり、またＰＣＳＫ９阻害剤は、ＰＣＳＫ９特異的抗体、ｓｉＲＮＡ、及びペプチド模倣体から選択される。
【００３６】
３．セラミドの構造及び命名法
セラミド分子は、スフィンゴイド塩基（ＳＢ）及び脂肪酸（ＦＡ）鎖から構成される。１つの代表的なセラミド分子の構造は、下記のように表される。
【化９】
0006774879.tif 000010
このＣｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）脂質は、Ｂ群セラミドであり、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１７個を有する飽和アルキル鎖である。
【００３７】
セラミドの命名法は、ＳＢに対応する第１の番号の対及びＦＡに対応する第２の番号の対として一般的に表される。例えば、上記Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）分子では、第１の番号の対（ｄ１８：１）は、ＳＢを意味し、また第２の番号の対（１８：０）はＦＡを意味する。ＳＢ及びＦＡの命名法では、各対の最初の数字はＳＢ又はＦＡ鎖内の炭素原子の数を意味し、一方２番目の数字は、ＳＢ又はＦＡ鎖の炭素−炭素二重結合の数を意味する。従って、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）では、ＳＢは、炭素原子１８個及び炭素−炭素二重結合１個を有し、一方ＦＡは、炭素原子１８個を有するが、炭素−炭素二重結合を含まない。ＦＡは、構造内に二重結合を有するかどうかに応じて飽和又は不飽和であり得る。例えば、ＦＡ１６：１は、炭素原子１６個及び炭素−炭素二重結合１個を有する不飽和ＦＡであり、一方ＦＡ１８：０は、炭素原子１８個を有し、炭素−炭素二重結合を含まない飽和ＦＡである。
【００３８】
更なる事例を挙げるならば、Ｃｅｒ（ｄ１８：２／２３：０）の構造は以下の通りである。
【化１０】
0006774879.tif 000011
この脂質はＡ群セラミドであり、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２２個を有する飽和アルキル鎖である。
【００３９】
更なる事例を挙げるならば、Ｃｅｒ（ｄ１６：１／２２：１）の構造は以下の通りである。
【化１１】
0006774879.tif 000012
この脂質はＢ群セラミドであり、式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１個を有するモノ不飽和アルキル鎖である。
新規セラミド合成では、ＳＢに対する第１の二重結合は、炭素４において形成され、ＳＢｄ１６：１及びｄ１８：１を形成する。ＳＢの第２の二重結合は、炭素１４に最も一般的に位置し、ＳＢｄ１８：２を形成する。
ＦＡ鎖内の二重結合は、ＦＡ鎖の長さ及び炭素−炭素二重結合の数に応じて様々な位置であり得る。２２：１ＦＡでは、最も一般的な二重結合の位置は、炭素１３である。２３：１ＦＡでは、最も一般的な二重結合の位置は、炭素１４である。２４：１ＦＡでは、最も一般的な二重結合の位置は、位置１５である。２４：２及び２６：２ＦＡでは、最も一般的な二重結合の位置は、炭素５及び９である。
【００４０】
４．診断方法
本明細書では、生体サンプル中のセラミドの特定の組み合わせを測定することにより、ＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及び心血管系の死亡を含むＣＶ合併症を予測する方法が開示される。セラミドは、動物実験に基づくＣＶＤの病因と関わってきたが、一方ヒトを対象としたデータは、概ね欠けている。本発明者らは、特定の異なるセラミド分子を含む、特定の脂質とＣＶ死亡率との関係を最近明らかにした（米国特許第１３／６９５，７６６号、同第１３／８０５，３１９号、国際公開第２０１３０６８３７３号、同第２０１３０６８３７４号、及びTarasov et al. 2014）。
診断用途では、マーカーは、できる限り高い感度及び特異性を有するべきである。感度は、マーカーにより症例として適正に分類される症例の割合を表す指標であり、また特異性は、マーカーによりコントロールとして適正に分類されるコントロールの割合を表す指標である。診断用途では、初期段階において標的を定めた治療を行うために、ＣＶイベントを将来有するであろう対象について、その識別される割合（％）が十分高いことが重要である。しかし、治療コストの制約上、特異性が低いマーカーよりも、特異性が高いマーカーが好ましい。
【００４１】
例えば、０．７の感度を有する試験は、ＣＶイベントに直面する患者１０００００例からなる母集団のうち、７００００例が、該イベントに対して高リスクを有するものとして試験により識別されることを示唆する。特異性が０．２の場合、安定なＣＶＤを有するが、重度のイベントを将来的に有さない患者１０００００例からなる母集団のうち、低リスクとして適正に識別されるのは２００００例に過ぎず、一方８００００例は、高リスクとして誤って識別される。これは、患者８００００例に対する標的を定めた治療のコストが、無駄に使われることを意味する。対照的に、同一のイベントについて特異性の数値が０．８である代替的試験が用いられた場合には、患者２００００例のみが、重度のイベントに対して高リスクを有すると誤って識別される。特異性が低い試験と比較して、これは患者６００００例分の治療コストを節約する。
【００４２】
本出願は、ＣＶ合併症を発症するリスクが高まっている患者を識別するための、感度及び特異性が有意に改善したセラミドの組み合わせを選択するルールを開示する。この感度及び特異性の改善は、第１の構造的なクラスに由来する少なくとも１つのセラミドの濃度の低下、及び第２の構造的なクラスに由来する少なくとも１つのセラミドの濃度の増加が、ＣＶ合併症を発症するリスクが高まっていることを示唆するように、２つの異なるクラスに該当するセラミド構造により決定づけられる。開示されたルールに基づき選択された、両クラスに由来するセラミド種の特定の組み合わせは、従来型のリスクマーカー、又は個々のセラミド分子、又はその比と比較して、ＣＶ合併症の予測に優れる。
【００４３】
セラミド種の組み合わせをランダムに選択したのでは、診断の改善は実現できない。むしろ、セラミドの組み合わせは、非常に長い飽和脂肪酸を有する少なくとも１つのセラミドと、長鎖飽和脂肪酸又は超長鎖不飽和脂肪酸を有する少なくとも１つのセラミドとを組み合わせることによる、本明細書に開示のルールに基づき選択されるべきである。特に、選択されたセラミドの組み合わせでは、個々のセラミド、又は２つの脂質分子に由来する比と比較して、診断上の感度及び特異性に改善が見られた。これらの特定のセラミドの組み合わせが有する疾患関連の特異性は、セラミド種の構造、及びセラミドクラスのメンバーを構成する様々なセラミドシンターゼの生物学的機能により決定される。
【００４４】
非常に長い飽和脂肪酸鎖（２２：０〜２６：０）を有するセラミドの濃度は、ＣＶ合併症に対するリスクが高まっている個体では低い（Ａ群セラミド）。一方、長鎖飽和脂肪酸（１６：０及び１８：０）、及び超長鎖不飽和脂肪酸（２２：１〜２６：２）を有するセラミドの濃度は、ＣＶ合併症のリスクが高まっている個体ではより高い（Ｂ群セラミド）。ＣＶ合併症の診断は、例えば２つのＡ群セラミド又はＢ群セラミドを選択するのではなく、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを測定する場合に改善する。
【００４５】
組み合わせたときに診断能力の改善を実現することが判明した２つの異なるクラスのセラミドを下記の表に示すが、この場合、Ａ群のセラミド種には、掲載したスフィンゴイド塩基（ＳＢ）のうちの１つと、掲載した脂肪酸（ＦＡ）のうちの１つが含まれ、またこの場合、Ｂ群のセラミド種には、掲載したスフィンゴイド塩基（ＳＢ）うちの１つと、掲載した脂肪酸（ＦＡ）のうちの１つが含まれる。
【００４６】
【表１】
0006774879.tif 000013
【００４７】
化学式により、セラミドについて２つの構造的なクラスを定義することも可能である。Ａ群セラミド（ＣＶ合併症のリスクの増加と関連して濃度が低下する）は、式Ｉに基づく構造を有する。
【化１２】
0006774879.tif 000014
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【００４８】
Ｂ群セラミド（ＣＶ合併症のリスクの増加と関連して濃度が増加する）は、式ＩＩに基づく構造を有する。
【化１３】
0006774879.tif 000015
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【００４９】
Ａ群及びＢ群セラミドは、その合成に関わるセラミドシンターゼの機能に基づき分類することも可能である。６つの異なるセラミドシンターゼ（ＣｅｒＳ１〜６）が、ヒトにおいて特徴づけられている。ＦＡ基質に対するセラミドシンターゼ（ＣｅｒＳ）のすでに知られている特異性に基づけば、Ｂ群セラミドは、長いＦＡ（炭素１４〜１８個）を有するセラミドを合成することが知られているＣｅｒＳ１、Ｓ４、Ｓ５、及びＳ６よりもっぱら生成されるセラミドを含む。ＣｅｒＳ２及びＳ３より合成される非常に長いＦＡ（≧２２個の炭素原子）を有する脂肪酸が、Ａ群及びＢ群の両方で見出されている。しかし、Ａ群の非常に長いセラミド分子は飽和しているが、一方、Ｂ群の非常に長いセラミドは不飽和である。従って、ＣｅｒＳ２及びＳ３の生成物は、飽和レベルに応じてＡ群又はＢ群に配置される。
【００５０】
特定のセラミドを、セラミド内に見出される構造及び／又は脂肪酸基質に対するセラミドシンターゼの特異性に基づき、異なる群に分類することにより、本出願は、ＣＶ合併症を発症するリスクが高まっている患者を識別するために、感度及び特異性が有意に改善したセラミドの組み合わせを選択するルールを開示する。
特別な実施形態では、対象が、１つ又は複数のＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法が提供され、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００５１】
【化１４】
0006774879.tif 000016
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００５２】
【化１５】
0006774879.tif 000017
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記生体サンプルが含有する、前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度が増加している場合には、前記対象は１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっていると判定するステップと、
を含む。
【００５３】
別の態様は、対象において、ＣＶＤ及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ又は複数に対する治療の有効性を評価する方法に関し、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００５４】
【化１６】
0006774879.tif 000018
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００５５】
【化１７】
0006774879.tif 000019
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度及び、前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度が、等しい又は増加しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度が、等しい又は低下している場合には、治療は有効であると判定するステップと、
を含む。
【００５６】
なおも別の態様は、対象において、ＣＶＤ、及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ又は複数について、適切な治療を選択する方法に関し、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００５７】
【化１８】
0006774879.tif 000020
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００５８】
【化１９】
0006774879.tif 000021
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、又はジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度が増加している、場合には、前記対象は、治療必要とする、又はすでに実施される治療の変更若しくは補充を必要とすると判定するステップと、
を含む。
【００５９】
上記方法の１つの実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式Ｉのセラミドの濃度が測定される。別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩのセラミドの濃度が測定される。なおも別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式Ｉのセラミドの濃度が測定され、及び少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩのセラミドの濃度が測定される。
【００６０】
上記方法の１つの実施形態では、少なくとも１つの式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度が測定される。特定の実施形態では、下記の式（ＩＩ）のセラミド又はその組み合わせが、上記の方法で測定され得る。
【００６１】
【表２】
0006774879.tif 000022
別の実施形態では、式（Ｉ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）の濃度、並びに式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）のうちの少なくとも１つの濃度が測定される。特定の実施形態では、下記の式（Ｉ）及び式（ＩＩ）のセラミドを組み合わせたときのその濃度が、上記の方法で測定され得る。
【００６２】
【表３】
0006774879.tif 000023
【００６３】
別の態様は、ヒト血液サンプル中に存在することがこれまでに知られていなかったＡ群セラミドのサブセット、及びＢ群セラミドのサブセット、並びに対象が、１つ又は複数のＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法でのその使用と関連する。新規に識別されたセラミドを下記の表１に記載する。
【００６４】
【表４】
0006774879.tif 000024
【００６５】
Ａ群セラミドのサブセットを代表する新規に識別されたセラミドは、式ＩＩＩの構造を有する。
【化２０】
0006774879.tif 000025
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）。
【００６６】
Ｂ群セラミドのサブセットを代表する新規に識別されたセラミドは、式ＩＶの構造を有する。
【化２１】
0006774879.tif 000026
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【００６７】
従って、特定の実施形態は、対象が、１つ又は複数のＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を発症するリスクを有するかどうかを判定する方法と関連し、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００６８】
【化２２】
0006774879.tif 000027
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００６９】
【化２３】
0006774879.tif 000028
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記生体サンプルが含有する、前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度が増加している場合には、前記対象は、１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっていると判定するステップと、
を含む。
【００７０】
別の態様は、対象において、ＣＶＤ、及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ又は複数に対する治療の有効性を評価する方法に関し、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００７１】
【化２４】
0006774879.tif 000029
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００７２】
【化２５】
0006774879.tif 000030
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する、前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が等しい、又は増加しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度が等しい、又は低下している場合には、治療は有効であると判定するステップと、
を含む。
【００７３】
なおも別の態様は、対象において、ＣＶＤ、及び／又はその合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等のうちの１つ又は複数に対して、適切な治療を選択する方法に関し、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００７４】
【化２６】
0006774879.tif 000031
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００７５】
【化２７】
0006774879.tif 000032
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップと、
（ｄ）前記コントロールサンプルと比較して、前記サンプルが含有する前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が低下しており、且つ前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度が増加している場合には、前記対象は、治療を必要とする、又はすでに実施されている治療の変更若しくは補充を必要とすると判定するステップと、
を含む。
【００７６】
上記方法の１つの実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が測定される。別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＶのセラミドの濃度が測定される。なおも別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が測定され、及び少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＶのセラミドの濃度が測定される。
【００７７】
上記方法の特定の実施形態では、前記少なくとも１つの式（Ｉ）のセラミド、及び前記少なくとも１つの式（ＩＩ）のセラミド、又は前記少なくとも１つの式（ＩＩＩ）のセラミド、及び前記少なくとも１つの式（ＩＶ）のセラミドの濃度が、Ｚ＝（式Ｉのセラミド）a／（式ＩＩのセラミド）b、又はＺ＝（式ＩＩＩのセラミド）a／（式ＩＶのセラミド）bの式により測定されるが、式中、ａ、ｂ∈Ｒであり、（式Ｉのセラミド）、（式ＩＩのセラミド）、（式ＩＩＩのセラミド）、及び（式ＩＶのセラミド）は、式Ｉのセラミドの濃度、式ＩＩのセラミドの濃度、式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び式ＩＶのセラミドの濃度をそれぞれ意味する。本実施形態によれば、前記コントロールサンプルと比較して、生体サンプルが有するＺ値が高い場合には、対象は、１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクが高まっている。その他の実施形態では、式は、前記コントロールサンプルと比較して、サンプルが有するＺ値が等しい、又は低下している場合には、治療は有効であると判定するのに用いられる。別の実施形態では、前記コントロールサンプルと比較して、サンプルが有するＺ値が高い場合には、対象が治療を必要とする、又は心血管系患者の治療に関する該当するガイドラインに従い、治療のレベル、及び処方された療法、及びその用量を調整する必要があると判定するために、Ｚ値が計算される。
【００７８】
前記対象から得られたサンプル中の総コレステロール、低密度リポタンパク質コレステロール（ＬＤＬ−Ｃ）、高密度リポタンパク質コレステロール（ＨＤＬ−Ｃ）、アポリポタンパク質Ａ−Ｉ、アポリポタンパク質Ａ−ＩＩ、及び／又はアポリポタンパク質Ｂ（アポＢ）、及び／又はアポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ（アポＣ−ＩＩＩ）について、その血清レベルを測定するステップを更に含むことが、本明細書に記載する方法及び使用にとって有用であり、また有利でさえあり得る。更に、開示する方法又は使用の１つの実施形態によれば、対象は、総コレステロール、低密度リポタンパク質コレステロール（ＬＤＬ−Ｃ）、アポリポタンパク質Ｃ−ＩＩＩ（アポＣ−ＩＩＩ）、又はアポリポタンパク質Ｂ（アポＢ）のうちの１つ又は複数の血清レベルが上昇していない、又はＨＤＬ−コレステロール（ＨＤＬ−Ｃ）の血清レベルが低下していない患者であるのが好ましい。
【００７９】
５．検出法
本明細書では、対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式Ｉのセラミド及び少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を検出する方法も開示され、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００８０】
【化２８】
0006774879.tif 000033
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００８１】
【化２９】
0006774879.tif 000034
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
を含み、
（ｃ）前記少なくとも１つの式Ｉのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＩのセラミドの濃度を、コントロールサンプルと比較するステップを含んでもよい。
【００８２】
上記方法の１つの実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式Ｉのセラミドの濃度が測定される。別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩのセラミドの濃度が測定される。なおも別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式Ｉのセラミドの濃度が測定され、及び少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩのセラミドの濃度が測定される。
【００８３】
上記方法の１つの実施形態では、式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）のうちの少なくとも１つの濃度が測定される。特定の実施形態では、下記式（ＩＩ）のセラミド又はその組み合わせが、上記検出法で測定され得る。
【００８４】
【表５】
0006774879.tif 000035
別の実施形態では、式（Ｉ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）の濃度、並びに式（ＩＩ）のセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）のうちの少なくとも１つの濃度が測定される。特定の実施形態では、下記式（Ｉ）のセラミド及び式（ＩＩ）のセラミドの組み合わせについて、その濃度が上記検出法で測定され得る。
【００８５】
【表６】
0006774879.tif 000036
【００８６】
上記方法の１つの実施形態では、生体サンプル及びコントロールサンプルは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式Ｉのセラミド、及び少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩのセラミドを含む。一般的に、同位体標識されたセラミドは、生体サンプル中で検出されるセラミドと同一である。例えば、式ＩＩのセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の濃度、並びに式Ｉのセラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）の濃度が測定される場合には、生体サンプル及びコントロールサンプルは、同位体標識されたＣｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、同位体標識されたＣｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、同位体標識されたＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）、及び同位体標識されたＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）を含む。
【００８７】
上記方法の１つの実施形態では、対象は、心血管系疾患イベント、例えば狭心症、心筋梗塞、又は脳卒中等にこれまでに罹患したことがある。
本明細書では、対象から得られた生体サンプル中において、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミド、及び少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を検出する方法も開示され、同方法は、
（ａ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００８８】
【化３０】
0006774879.tif 000037
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
（ｂ）対象から得られた生体サンプル中で、少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度を測定するステップと、
【００８９】
【化３１】
0006774879.tif 000038
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
を含み、また
（ｃ）前記少なくとも１つの式ＩＩＩのセラミドの濃度、及び前記少なくとも１つの式ＩＶのセラミドの濃度をコントロールサンプルと比較するステップを含んでもよい。
【００９０】
上記方法の１つの実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が測定される。別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＶのセラミドの濃度が測定される。なおも別の実施形態では、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＩＩのセラミドの濃度が測定され、及び少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、又は少なくとも６つの式ＩＶのセラミドの濃度が測定される。
上記方法の１つの実施形態では、生体サンプル及びコントロールサンプルは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩＩのセラミド、及び少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＶのセラミドを含む。一般的に、同位体標識されたセラミドは、生体サンプル中で検出されるセラミドと同一である。
上記方法の１つの実施形態では、対象は、心血管系疾患イベント、例えば狭心症、心筋梗塞、又は脳卒中等にこれまでに罹患したことがある。
【００９１】
６．セラミド濃度測定
本明細書で記載及び主張するすべての態様及び実施形態と関連して、セラミド濃度測定が、アッセイ法を用いて一般的に実施される。対象のサンプル、及び該当する場合には対応するコントロールサンプルに由来するセラミド濃度の情報収集は、様々な化学的及び高分解能分析技法により実施可能である。適する分析技法として、マススペクトロメトリーや核（磁気）共鳴分光法が挙げられるが、但しこれらに限定されない。個々のセラミド、又はセラミドクラスを分離し、またその構造情報を提供する能力を有する任意の高分解能の技術が、対象となるセラミドマーカーに関する情報、例えば生体サンプルに由来するセラミドプロファイルを収集するのに利用可能である。マススペクトロメトリー（ＭＳ）によりセラミドマーカーについて情報収集することが、開示する方法の好ましい実施形態の１つである。ＭＳ装置は、ロボット型ナノフローイオン源装置等の直接サンプル注入法、又は高性能液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）若しくは超高性能液体クロマトグラフィー（ＵＰＬＣ）等の高性能分離法と連結可能である。
【００９２】
その他の方法が、ＭＳ及び／又はＨＰＬＣ／ＵＰＬＣと共に、対象とするセラミドを検出するのに利用可能又は組み合わせ可能であり、例えば核磁気共鳴分光法、液体クロマトグラフィー、薄層クロマトグラフィー、ガスクロマトグラフィー、蛍光分光法、又は二面偏波式干渉法、及び／又はＥＬＩＳＡ等の免疫測定法が挙げられる。代替的、又は更なる実施形態によれば、サンプル中のセラミドは、セラミドに特異的に結合する能力を有する結合部分を用いて検出及び／又は定量可能である。結合部分は、例えばリガンド−受容体の対、すなわち特異的結合相互作用保有能力を有する分子の対からなるメンバーを含み得る。結合部分は、例えば特異的結合の対からなるメンバー、例えば抗体−抗原、酵素−基質、核酸ベースのリガンド、その他のタンパク質リガンド、又は当技術分野において公知のその他の特異的結合の対等も含まれ得る。
【００９３】
好ましい実施形態では、セラミドの濃度は、マススペクトロメトリー（ＭＳ）を用いて測定され、この場合、ＭＳ装置は、直接注入法、又はＨＰＬＣ若しくはＵＰＬＣ等の高性能分離法と連結可能である。
【００９４】
７．サンプルの調製及び同位体標識されたセラミド
本明細書で記載及び主張する方法によれば、対象から得られた生体サンプルとコントロールサンプルは、いずれも好ましくは血液サンプル、より好ましくは血漿サンプル又は血清サンプルである。サンプルは、乾燥血液スポットである場合もある。またサンプルは、血液、血漿、又は血清の分画、例えばサンプルから抽出される脂質分画である場合もある。血液サンプルは、例えば患者のコレステロールレベルの測定と関連して採取され得る。収集された血液サンプルは調製可能であり、また血清又は血漿は、当業者にとって周知の技法を用いて分離可能である。静脈血液サンプルが、針とＢＤ社バキュテーナー（登録商標）プラスチック管、又はバキュテーナー（登録商標）プラス・プラスチック管を用いて、患者から収集され得る（ＢＤバキュテーナー（登録商標）ＳＳＴ（商標）管は、スプレーコーティングされたシリア（ｓｉｌｉａ）及び血清分離用のポリマーゲルを含む）。血清は、例えば１３００ＲＣＦで１０分間、室温において遠心分離することにより、収集後の血液サンプルから分離され、小型のプラスチック管内で、−８０℃において保管され得る。血漿は、例えば２５００×ｇ、４℃で５分間遠心分離することにより分離可能である。乾燥した血液スポットが、血液のスポットをフィルターペーパー上に配置し、風乾させることにより調製される。
或いは、対象から得られたサンプルとコントロールサンプルは、いずれも組織サンプル、例えば頸動脈組織等の動脈組織、又は頸動脈プラーク物質等の動脈プラーク物質であってもよい。
【００９５】
１つの実施形態では、生体試料は、既知量の同位体標識されたＡ、Ｂ、Ｃ、又はＤ群セラミドでスパイクされる。対象とするセラミドを検出するのに利用可能である任意の同位体が利用可能であり、これには水素（例えば重水素）、炭素及び酸素の同位体が含まれるが、但しこれらに限定されない。好ましい実施形態では、生体サンプルは、脂質抽出前に、同位体標識されたセラミドでスパイクされる。同位体標識されたセラミドは、内部標準として機能し、天然由来の分子ではない。好ましい実施形態では、重水素標識が、重水素標識されたセラミドを生成するのに用いられ、これにはＮ−パルミトイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（ｄ１８：１／１６：０）、Ｎ−ステアロイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（ｄ１８：１／１８：０）、Ｎ−リグノセロイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（ｄ１８：１／２４：０）、及びＮ−ネルボノイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：１））が含まれるが、但しこれらに限定されない。
【００９６】
８．コントロール
対象から得られた生体サンプル中のセラミドレベルは、コントロールと比較される。コントロールは、健常者から得られた生体サンプルであり得る。コントロールは、重大なＣＶＤイベントの病歴を有さないＣＡＤ患者から得られたサンプルであってもよい。また、サンプルは、一般化された健常者母集団から得られたサンプルの組み合わせを代表するサンプル、又は重大なＣＶＤイベントの病歴を有さないＣＡＤ患者母集団から得られたサンプルの組み合わせを代表するサンプルであってもよい。生体サンプルは、全血、血清、又は血漿であり得る。また、生体サンプルは、組織サンプルであってもよい。しかし、好ましい実施形態では、生体サンプルは、血漿又は血清である。
【００９７】
或いは、コントロールは、本発明に基づくセラミドマーカーに関するデータのセット、例えば健常者から採取される場合、サンプル中、又は一般化された健常者母集団から、若しくは重大なＣＶＤイベントの病歴を有さないＣＡＤ患者から、若しくは重大なＣＶＤイベントの病歴を有さないＣＡＤ患者母集団から採取される場合、サンプルの組み合わせに含まれる本発明に基づくセラミドの濃度に関する情報であり得る。情報、従って対応するデータのセットは、これまでに測定、計算、又は推定されている場合もあれば、まだ測定、計算、又は推定されていない場合もあり、又は文献から引用される場合もある。
【００９８】
治療の有効性を評価する方法では、コントロールサンプルは、上記で議論したように健常者に由来し得るが、この場合、対象から得られた生体サンプルが含有する、少なくとも１つのＡ群（又はＣ群）セラミドの濃度、及び少なくとも１つのＢ群（又はＤ群）セラミドの濃度が、コントロールサンプルの濃度とほぼ同一又は等しい（有意に異ならない）という所見から、治療は有効であったことが示唆される。或いは、コントロールサンプルは、１つ又は複数のＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、又はＣＶ死等を発症するリスクを有する対象から取得可能である。特定の実施形態では、コントロールサンプルが採取される対象は、治療対象者と同一の個体であり、この場合、少なくとも１つのＡ群（又はＣ群）セラミドの濃度が、コントロールサンプルと比較して増加しており、且つ少なくとも１つのＢ群（又はＤ群）セラミドの濃度が、コントロールサンプルと比較して低下していれば、治療は有効であったことが示唆される。
【００９９】
９．組成物及びキット
別の態様は、ＣＶ合併症を予測するため、又は本明細書に開示の任意の方法を実施するためのキットであり、この場合、該キットは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）で標識されたＡ、Ｂ、Ｃ、又はＤ群セラミドを含み、また方法を実施するための１つ又は複数の試薬を含んでもよい。また、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識されたＡ、Ｂ、Ｃ、又はＤ群セラミドを含む組成物も含まれる。
【０１００】
１つの実施形態では、組成物又はキットは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式Ｉのセラミドを含む。
【化３２】
0006774879.tif 000039
(I)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【０１０１】
別の実施形態では、組成物又はキットは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩのセラミドを含む。
【化３３】
0006774879.tif 000040
(II)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有する飽和、モノ不飽和、若しくはジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個若しくは２５個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【０１０２】
例えば、特定の実施形態では、組成物又はキットは、以下に示す同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩのセラミドのうちの１つ、又はその組み合わせを含む。
【表７】
0006774879.tif 000041
【０１０３】
別の実施形態では、キット又は組成物は、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式Ｉのセラミド、及び少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩのセラミドを含む。その他の実施形態では、キット又は組成物は、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、若しくは少なくとも６つの同位体（例えば重水素）標識された式Ｉのセラミド、及び／又は少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、若しくは少なくとも６つの同位体（例えば重水素）で標識された式ＩＩのセラミドを含む。
【０１０４】
例えば、特定の実施形態では、組成物又はキットは、以下に示す同位体（例えば重水素）標識された式（Ｉ）及び式ＩＩのセラミドの組み合わせを含む。
【表８】
0006774879.tif 000042
【０１０５】
その他の実施形態では、組成物又はキットは、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩＩのセラミドを含む。
【化３４】
0006774879.tif 000043
(III)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子２１〜２３個又は２５個を有する飽和アルキル鎖である）
【０１０６】
別の態様は、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＶのセラミドを含む組成物又はキットと関連する。
【化３５】
0006774879.tif 000044
(IV)
（式中、Ｒ1は、炭素原子１３個を有するモノ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である、或いは、式中、Ｒ1は、炭素原子１５個を有するジ不飽和アルキル鎖であり、Ｒ2は、炭素原子１５個若しくは１７個を有する飽和アルキル鎖、炭素原子２１〜２３個を有するモノ不飽和アルキル鎖、又は炭素原子２３個を有するジ不飽和アルキル鎖である）
【０１０７】
別の実施形態では、キット又は組成物は、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩＩのセラミドと、少なくとも１つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＶのセラミドとを含む。その他の実施形態では、キット又は組成物は、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、若しくは少なくとも６つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＩＩのセラミド、及び／又は少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、若しくは少なくとも６つの同位体（例えば重水素）標識された式ＩＶのセラミドを含む。組成物は、溶液、例えば蒸留水、緩衝化溶液、又はその他の適切な溶媒等を更に含み得る。
本明細書に開示のすべてのキットには、ＣＶ合併症、例えばＡＭＩ、ＡＣＳ、脳卒中、及びＣＶ死等を予測するためのその使用について説明書が添付され得る。
【０１０８】
１０．コンピューター実施型の診断法
本明細書に開示のすべての態様及び実施形態によれば、提供される方法は、コンピューター実施型であり得る。
１つの実施形態では、本発明のコンピューター実施型の方法は、いずれも（ｉ）生体サンプル中で、少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミドと少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度を反映する情報を、少なくとも１つのプロセッサーにより取得するステップ；（ｉｉ）生体サンプル中の少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミドと少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度を、ユーザーが読み取り可能なフォーマットでアウトプットするステップを更に含み得る。
【０１０９】
別の実施形態では、コンピューター実施型の方法は、コントロール、及び生体サンプル中の少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミド（又は少なくとも１つのＣ群セラミドと少なくとも１つのＤ群セラミド）の濃度の間の差異の割合（％）を、少なくとも１つのプロセッサーにより決定するステップ、及び決定ステップ（ｉｉｉ）で得られた差異の割合（％）をユーザーが読み取り可能なフォーマットでアウトプットするステップを更に含み得る。
なおも別の実施形態では、コンピューター実施型の方法は、アウトプットするステップで得られた差異の割合（％）に基づき、対象が１つ又は複数のＣＶ合併症を発症するリスクを有するかどうかを判定するステップを更に含み得る。
【０１１０】
コンピューター実施型の方法の１つの実施形態では、前記少なくとも１つのＡ群セラミドは、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）を含み、並びに前記少なくとも１つのＢ群セラミドは、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）を含む。
図４に示す実施形態では、コンピューターシステム１０６は、オペレーティングシステムの制御下で、又はこれと連携して稼働するランダムアクセスメモリーと連結した１つ又は複数のプロセッサー１１０を含み得る。実施形態中のプロセッサー１１０は、１つ若しくは複数のサーバー、クラスター、又はその他のコンピューター、又はハードウェアリソース中に含まれ得る、或いは、クラウドベースリソースを用いて導入され得る。オペレーティングシステムは、例えば市販のＬｉｎｕｘ（商標）オペレーティングシステム、Ｕｎｉｘ（商標）オペレーティングシステム、又はその他のオープンリソース、又は独自開発のオペレーティングシステム若しくはプラットフォームであり得る。プロセッサー１１０は、その他のデータにアクセスする、又はプログラム命令を保管するために、データストア１１２、例えばハードドライブ又はドライブアレイ上に保管されるデータベース等とやり取り可能である。
【０１１１】
プロセッサー１１０は、ネットワークインターフェース１０８を介して更にやり取り可能であり、次に、ネットワークインターフェース１０８は、前記１つ若しくは複数のネットワーク１０４、例えばインターネット、又はその他のパブリック若しくはプライベートネットワーク等を介してやり取り可能であり、従って、クエリー又はその他のリクエストが、クライアント１０２、又はその他のデバイス若しくはサービスから入手可能となる。更に、プロセッサー１１０は、前記１つ又は複数のネットワーク１０４を介して、情報、指示、ワークフロークエリーパーシャルワークフロー、又はその他のデータをユーザーに送付するのに、ネットワークインターフェース１０８を利用することができる。ネットワークインターフェース１０４は、１つ若しくは複数のサーバーを含み得る、又はこれとやり取り可能に連結し得る。クライアント１０２は、例えばインターネットに連結したパーソナルコンピュータであり得る。
【０１１２】
本明細書に開示の方法を履行するために、プロセッサー１１０は、コントロールロジック及びコントロールオペレーションを実行するように、一般的にプログラムされ得る、又は構成され得る。プロセッサー１１０は、コプロセッサー１１４と、やり取り可能に更に連結する（すなわち、コミュニケーションチャンネルにより連結する）ことができる。コプロセッサー１１４は、本明細書に開示の方法を実行するように構成された専用のハードウェア及び／又はファームウェアコンポーネントであり得る。従って、本明細書に開示の方法は、プロセッサー１１０、及び／又はコプロセッサー１１４により実行され得る。
コンピューターシステム１０６のその他のコンフィギュレーション、関連するネットワーク接続、及びその他のハードウェア、ソフトウェア、及びサービスリソースも可能である。
下記の実施例は、本明細書の実施形態について、更に定義及び記載する。
【実施例】
【０１１３】
（例１）
治験患者。Ｃｏｒｏｇｅｎｅ試験は前向きコホート試験であり、フィンランド人の継続患者５０００例が、ヘルシンキ大学中央病院（Helsinki University Central Hospital）の領域内で、診断を目的とした冠血管造影法に割り振られた。本試験では、少なくとも１つの冠動脈において＞５０％の狭窄を有するＣＡＤ患者４３６例について分析した。このネスト化された症例−コントロール試験では、コントロール対象１例を各症例にマッチさせた。症例は、平均２．５年のフォローアップ期間中に、ＣＶを理由に死亡したＣＡＤ患者であった。マッチしたコントロールは、フォローアップ期間中にいかなる原因によっても死亡しなかったＣＡＤ患者であった。マッチングの基準には、年齢、性別、肥満指数、スタチンの使用、喫煙、及び２型糖尿病が含まれた。
【０１１４】
解析方法。定量する場合、セラミドの抽出は、Jung HR et al., High throughput quantitative molecular lipidomics. Biochim Biophys Acta. 2011 Nov;1811(11):925-34に記載されたHamilton Microlab Starロボット上で実施した、Ｆｏｌｃｈ脂質抽出改変法を用いて行ったが、同文献を本明細書に参照により組み込む。サンプルを既知量の非内因性合成内部標準でスパイクした。脂質抽出後、サンプルをクロロホルム：メタノール（１：２、ｖ／ｖ）中で再溶解し、合成外部標準を抽出物に抽出後スパイクした。抽出物をＭＳ解析前に−２０℃で保管した。
セラミドを、超高速液体クロマトグラフィー（ＵＨＰＬＣ）システム（Ｅｋｓｉｇｅｎｔ  ｕｌｔｒａＬＣ  １００システム）を備えた、ハイブリッドトリプル四重極／リニアイオントラップ質量分析装置（５５００  ＱＴＲＡＰ）上で分析したが、この場合、Sullards MC et al., Structure-specific, quantitative methods for analysis of sphingolipids by liquid chromatography-tandem mass spectrometry: "inside-out" sphingo-lipidomics. Methods Enzymol. 2007;432:83-115の記載に基づき、多重反応モニタリング（ＭＲＭ）に基づく方法を陰イオンモードで用いた。
【０１１５】
ヒト血漿中に存在することがまだ知られていないセラミドの新規の群（ｄ１６：１及びｄ１８：２）について、正確な測定を組み込むために、ＬＣ−ＭＲＭ分析を補充した（表１を参照）。ヒト血漿において、ＭＳ／ＭＳ連続分析及びリテンションタイムによりその存在を検証した。ＭＳ／ＭＳでは、期待される分子イオンより生成した選択的スフィンゴシンフラグメントイオン、例えばｄ１６：１に対応するｍ／ｚ、２３６．２５、ｄ１８：２に対応するｍ／ｚ、２６２．２５により、同定確認を行った。更に、これを系統的なリテンションタイムシフトにより補完した。特徴的なシフトから、新規セラミド種の帰属性が確認された。その存在及び本出願に記載する目的のためにバイオマーカーとして働く能力は、驚くべきであり、また予期されるものではなかった。
【０１１６】
マススペクトロメトリーによる検出ピークの質量及びカウントを、対応する脂質名及び濃度のリストに変換した。校正直線を作成して、モニタリングの対象となる脂質クラス毎に定量ダイナミックレンジ、例えば定量限界を決定した。内部標準を用いて内因性の脂質種を定量した。校正直線を用いて、方法の定量限界を決定した。
厳密なカットオフを適用して、実際の脂質ピークからバックグラウンドノイズを除去した。各サンプルを照査し、合否判定基準を満たすときに限り許容した。検出ピークの質量及びカウントを、対応する脂質名のリストに変換した。脂質を、その各内部標準及びサンプルボリュームに標準化して、その濃度を割り出した。
【０１１７】
Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）分子の標的を定めたセラミド定量。Ｊｕｎｇらの記載に従い、Ｈａｍｉｌｔｏｎ  Ｍｉｃｒｏｌａｂ  Ｓｔａｒロボット上で実施した、Ｆｏｌｃｈ脂質抽出改変法を用いてセラミドを抽出した。Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）の特定の組み合わせについて定量する場合、脂質抽出前に、生体サンプルを、既知量の下記の重水素標識された内部標準でスパイクした：Ｎ−パルミトイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０））、Ｎ−ステアロイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０））、Ｎ−リグノセロイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０））、及びＮ−ネルボノイル−Ｄ−エリスロスフィンゴシン−ｄ７（Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：１））。適する脂質フリーのマトリックスが入手できなかったので、校正直線標準を溶液状態で作製した。既知量の分析対象物及び安定な同位体標識された内部標準を、クロロホルム：メタノール（１：２、ｖ／ｖ）に添加して、校正直線の各点を決めた。
【０１１８】
ＬＣ−ＭＳ／ＭＳを、超高速液体クロマトグラフィー（ＵＨＰＬＣ）システム（Ｅｋｓｉｇｅｎｔ  ｕｌｔｒａＬＣ  １００システム）を備えたハイブリッドトリプル四重極／リニアイオントラップ質量分析計（ＱＴＲＡＰ  ５５００）上で実施したが、この場合、多重反応モニタリング（ＭＲＭ）に基づく方法を陽イオンモードで用いた。
サンプル抽出物（５μＬ）を、カラム温度が６０℃のＷａｔｅｒｓ  Ａｃｑｕｉｔｙ  ＢＥＨ  Ｃ１８、１．７μｍ  ＶａｎＧｕａｒｄプレカラムに連結したＷａｔｅｒｓ  Ａｃｑｕｉｔｙ  ＢＥＨ  Ｃ１８、２．１×５０ｍｍ  ｉｄ．１．７μｍに投入した。移動相Ａは、０．１％ギ酸を含むＨＰＬＣグレード水に溶解した１０ｍＭ酢酸アンモニウムと移動相Ｂとから構成された。流速は０．５μＬ／分で、０．０〜０．５分、８５％Ｂ；０．５〜１５分、８５〜１００％Ｂ；１５〜４分、１００％Ｂ；４．１０〜５分、８５％Ｂのグラジエントを用いた。ソース温度を３００℃に設定した；イオンスプレーは５０００Ｖであった；デクラスタリングポテンシャル３０Ｖ；エントランスポテンシャルは１０であった；ガス１及びガス２の設定は、５０及び３０であった。各スキャンのドウェルタイムは２５ｍ秒、及び衝突エネルギーを４０Ｖに設定した。総取得時間は４．５分であった。
【０１１９】
分析ソフトウェア（バージョン１．６）を用いてデータを取得し、ＭｕｌｔｉＱｕａｎｔ（バージョン３．０）を用いて処理した。校正曲線は、例えばＣｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）及びＣｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）について１／ｘ2、並びにＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）について１／ｙ2の重み付けを用いて、実際の濃度に対して分析対象物／内部標準のピーク面積比をプロッティングすることにより構築した。サンプルのピーク面積比を校正直線から読み取った。
標識標準のスフィンゴシン骨格内の７つの重水素は、親イオンのＭＳ／ＭＳ上で、そのスフィンゴシンフラグメントイオンにおいて７Ｄａの質量シフトを引き起こす。内因性及び内部標準のＭＲＭ分析におけるスフィンゴシンフラグメントイオンを含む、親イオンの質量の差異は、従ってそれぞれ７Ｄａであり、例えばＣｅｒｄ１８：１／１６：０及びＤ７−Ｃｅｒ１８：１／１６：０のＭＲＭ移行は、５３８．５／２６４．２及び５４５．５／２７１．２である。
【０１２０】
質量シフトを含む内部標準及び対応する内因性の種の分析的挙動、例えば抽出回収率、イオン化、及びリテンションタイム等が同じであると、正確な測定及び定量がしやすくなる。サンプル中の内因性セラミドとその内部標準とのピーク面積比は、校正直線から読み取られ、サンプル中の内因性セラミドについて正確な量が得られる。校正直線は、重水素化された標準の一定量と混合された内因性セラミドの希釈系列を、記載するようなＬＣ−ＭＲＭで分析することにより得られる。
重水素標識された内部標準を、本アッセイ用として特別に製造した。従って、これらの特別な重水素標識されたセラミドの絶対的な定量は、これまで未実施である。
【０１２１】
統計的手法。オッズ比は、記載するような心血管系転帰イベントの有無と、母集団内の安定なＣＡＤを有する個体に関するイベントの不存在の有無について、その両者間の関係を定量的に記載する。１標準偏差当たりのオッズ比（１ＳＤ当たりのＯＲ）は、ある変数において１標準偏差分の変化が生じたときに、これに対する応答として、コントロール群における良化予測のオッズで割り算した症例群における良化予測のオッズを数値化したものである。四分位オッズ比（ＯＲ２〜４）は、異なる四分位における不良転帰に対する良化転帰の比を、第１の四分位におけるかかる比と比較して数値化したものである。レシーバー動作特性曲線下面積（ＡＵＣ）は、マーカーの全体的な予測性能を記載する。その数値は０〜１の間であり、０．５は、転帰のランダムな、すなわち５０／５０（例えばコイントス）予測に対応し、より高い数値は、感度（ｓｅｎｓ）及び特異性（ｓｐｅｃ）に関して、より良好な予測正確性を示す。平均相対変化（ＭＲＣ％）は、症例群のセラミド濃度平均値とコントロール群のセラミド濃度平均値との間の差異を、コントロール群の平均値で割り算したものとして計算される。ｐ値は、対数変換後のデータについて、スチューデントのｔ検定を用いて計算される。また、偽陽性率ｑ値の見積もりも計算される。このｑ値は、ｐ値が対応するマーカーのｐ値よりも小さいすべてのマーカーにおいて、偽陽性所見の割合（％）を見積もる。
【０１２２】
脂質（単一マーカーと２マーカーの診断モデルに対応するモデル内の１つ又は２つの脂質）の濃度を用いて、症例群とコントロール群を説明するロジスティック回帰分析モデルを、Ｃｏｒｏｇｅｎｅ治験母集団内で近似させた。逸脱統計学を用いた尤度比検定を見積もった。逸脱の測定は、複数のモデルの比較に一般的に用いられる。逸脱は、モデルとデータの間の適合度不足の指標を表す、モデルの適合度統計学の品質である。一般的に、逸脱が大きくなるほど、データのモデルへの適合度は不十分となる。逸脱は、通常、そのまま解釈されず、むしろ同一のデータに近似させたその他のモデルからの逸脱と比較される。例えば、Nelder, J.A.; Wedderburn, R.W.M. (1972). “Generalized Linear Models.”  Journal of the Royal Statistical Society. Series A (General) 135 (3): 370-384を参照.
【０１２３】
尤度比検定は、ネスト化モデル、すなわち２モデルの場合、より多数の変数を有するモデルと、より大きい方のモデルの変数サブセットを有する他方のモデルに適用され得る。逸脱統計学は、ほぼχ二乗分布に従い、これより統計的有意性が見積もられ得る。ここでは、ｐ＜０．０５が、有意差の閾値として用いられた。ｐ＞０．０５である場合には、２つのモデルは、コントロールから症例を判別することに関して、互いに有意差はない。対照的に、ｐ＜０．０５の場合、より多数の変数を有するモデルの方が、より小さなモデルよりも優れる。逸脱統計学が用いられる、ネスト化モデルの尤度比検定は、変数の数が異なるモデルを比較するための確立された方法である。
【０１２４】
結果。本実施例の試験では、フォローアップ期間中にＣＶイベントを有したＣＡＤ患者のセラミド濃度を、イベントを有さないコントロール対象と比較した。図１及び２は、スチューデントのｔ検定のｐ値が最低のＡ群セラミド種１０種類及びＢ群セラミド種１０種類の平均相対変化／差異（症例群とコントロール群との差異を、コントロール群の平均濃度で割り算したものの平均）を示す。これらより、Ａ群又はＢ群のほとんどのセラミド種は、症例群とコントロール群を、ｐ＜０．０５で区別することから、高リスク患者（将来ＣＶイベントを有するおそれがある）をコントロール患者から区別する個々のセラミド種の検出力（例えば、より良好なオッズ比（ＡＵＣ）又は感度及び特異性、より低いｐ値）が実証される。
Ａ群又はＢ群に該当しないセラミドについても分析を行ったが、図３に示す通り、かかるセラミドでは、対数変換後の濃度の見積もりにおいて、症例とコントロールとが、スチューデントのｔ検定により、ｐ＜０．０５で一般的に区別されないことが判明した。
Ｃｏｒｏｇｅｎｅ試験に由来する患者、特にフォローアップ期間中にＣＶイベントを有したＣＡＤ患者を対象に、イベントを有さないコントロール対象と比較して、セラミド濃度の様々な組み合わせを分析するのに、逸脱統計学を用いた。逸脱統計学の結果を、モデル比較１〜９にまとめる。
【０１２５】
（例２）
モデル比較１。モデル比較１では、単一のセラミド種（Ａ群又はＢ群）を、一方はＡ群に、他方はＢ群に由来する２つのセラミドの組み合わせと比較した。モデル比較１では、下記の表４に示す通り、単一マーカーモデルのいずれか一方と比較して、２マーカーを組み合わせたモデルについて、Ｐｒ（＞χ）＜０．０５であるという事実より、モデルを組み合わせたときの判別力は、単一マーカーモデルの判別力よりも有意に良好であることが示唆される。
【０１２６】
【表９】
0006774879.tif 000045
（例３）
モデル比較２。判別モデルを２つのセラミドのみの組み合わせに限定する特別な理由は存在しない。しかし、実用目的から、及びコスト上の制約理由から、できる限り少ないセラミドを使用するのが好ましい。従って、感度及び特異性向上のベネフィットと、より多くの脂質分子種を分析する追加のコストとを、両天秤にかけなければならない。モデル比較２では、２つのセラミド種を用いたモデルを、３つのセラミド種を用いたモデルと比較したが、この場合、３つのセラミドマーカーには、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドが含まれた。モデル比較２では、表５に示す通り、二重マーカーモデルのいずれかと比較したときに、３マーカーを組み合わせたモデルについてＰｒ（＞Ｃｈｉ）＜０．０５であったが、これは、３マーカーモデルの判別力は、二重マーカーモデルの判別力よりも有意に良好であることを示している。
【０１２７】
【表１０】
0006774879.tif 000046
【０１２８】
（例４）
モデル比較３：モデル内のセラミド種の数を増やしても、それは、より良好なモデルがもたらされることを必ずしも意味しない。その例として、モデル比較３は、２セラミドモデルより良好ではない３セラミドモデルを示す。この場合、Ｂ群に由来する２つのセラミドの組み合わせを、Ｂ群に由来する３つのセラミドと比較した。モデル比較３では、表６に示す通り、２マーカーモデルと比較したときに、３マーカーを組み合わせたモデルについてＰｒ（＞Ｃｈｉ）＞０．０５であったが、これは、３マーカーモデルの判別力は、二重マーカーモデルの判別力より有意に良好ではないことを示している。
【０１２９】
【表１１】
0006774879.tif 000047
【０１３０】
従って、モデル比較３は、セラミドの数を単に増加させても、モデル性能の改善は実現しないことを実証する。むしろ、セラミドの組み合わせは、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを含む、本出願で提供されるガイダンスに基づき選択されるべきである。
【０１３１】
（例５）
モデル比較４。セラミド種の興味深い組み合わせを、モデル比較４に示す。この組み合わせには、３つのＢ群セラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１６：０）、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／１８：０）、及びＣｅｒ（ｄ１８：１／２４：１）、並びに１つのＡ群セラミド、Ｃｅｒ（ｄ１８：１／２４：０）が含まれる。この特別な組み合わせは、分析したすべての治験母集団に系統的に出現する。更に、モデル比較４のセラミド種は、一般的なセラミド種の存在量と比較して、ヒト血清又は血漿サンプル中に豊富に存在する。４つのセラミド種が組み合わされたモデルは、表７に示す通り、すべての症例において、その単一の成分を含むモデルよりも優れる（すべてのＰｒ（＞Ｃｈｉ）＜０．０５）。
【０１３２】
【表１２】
0006774879.tif 000048
【０１３３】
（例６）
モデル比較５〜７。バイオマーカーを組み合わせる場合、分析されるバイオマーカーの数が増加するに従い、診断能力が増大するという一般認識が存在し得る。しかし、モデル比較３に示す通り、この認識は、ＣＶ合併症を予測する文脈においては、セラミドバイオマーカーについて必ずしも通用しない。モデル比較５〜７から、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを選択するルールを適用しないで、モデル内のセラミド種の数を単に増加させても、モデル性能は改善しないことが更に実証される。従って、モデル比較５〜７より、セラミドをランダムに選択した場合、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを選択する、新規に識別されたルールに基づきセラミドを選択する場合と比較して、診断能力が不足することが実証される。
【０１３４】
モデル比較５では、Ａ群又はＢ群に該当しないセラミドの組み合わせについて分析した。表８では、１５例のモデル比較を、その逸脱統計学及びχ二乗ｐ値の見積もり（ｐ＜０．０５は、モデル間の有意差を表す）と共に示す。各モデル比較では、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを含まないセラミドのランダムな組み合わせを比較した。モデルサイズが異なる１５例すべての実施例において、逸脱統計学に関するｐ値は０．０５を上回り、これは、モデルが非Ａ／Ｂセラミドをより多く有しても、セラミドの数がより少ないモデルと比較して、症例−コントロール群の判別において、有意な良化が認められないことを意味する。
【０１３５】
【表１３】
0006774879.tif 000049
【０１３６】
モデル比較６では、Ａ群セラミドのランダムな組み合わせ（少なくとも１つのＢ群セラミドを含まない）について比較した。表９では、１５例のモデル比較を、その逸脱統計学及びχ二乗ｐ値の見積もり（ｐ＜０．０５は、モデル間の有意差を表す）と共に示す。モデルサイズが異なる１５例すべての実施例において、逸脱統計学に関するｐ値は０．０５を上回り、これは、モデルがより多くのＡ群セラミドを有しても、Ａ群セラミドの数がより少ないモデルと比較して、症例−コントロール群の判別において有意な良化が認められないことを意味する。
【０１３７】
【表１４】
0006774879.tif 000050
0006774879.tif 000051
【０１３８】
モデル比較７では、Ｂ群セラミドのランダムな組み合わせ（少なくとも１つのＡ群セラミドを含まない）について比較した。表１０では、１５例のモデル比較を、その逸脱統計学及びχ二乗ｐ値の見積もり（ｐ＜０．０５は、モデル間の有意差を表す）と共に示す。モデルサイズが異なる１５例すべての実施例において、逸脱統計学に関するｐ値は、０．０５を上回り、これは、モデルがより多くのＢ群セラミドを有しても、Ｂ群セラミドの数がより少ないモデルと比較して、症例−コントロール群の判別において有意な良化が認められないことを意味する。
【０１３９】
【表１５】
0006774879.tif 000052
0006774879.tif 000053
【０１４０】
（例７）
モデル比較８〜９。モデル比較８〜９は、モデル比較１、２、及び４を補完し、少なくとも１つのＡ群と少なくとも１つのＢ群セラミドとからなる組み合わせを、すべてＡ群セラミド（モデル比較８）又はすべてＢ群セラミド（モデル比較９）からなる組み合わせと比較する。このようなモデル比較より、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを有するという、新規に識別されたルールに基づきセラミドを選択した場合の、その診断能力が実証される。
【０１４１】
モデル比較８では、少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミドとからなる組み合わせを、Ａ群セラミドのみからなる組み合わせと比較した。表１１では、３０例のモデル比較を、その逸脱統計学及びχ二乗ｐ値の見積もり（ｐ＜０．０５は、モデル間の有意差を表す）と共に示す。モデルサイズが異なる３０例すべての実施例において、逸脱統計学に関するｐ値は、０．０５未満であり、これは、モデルが、少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミドとを有すると、Ａ群セラミドのみを有するモデルと比較して、症例−コントロール群の判別において有意な良化が認められることを意味する。
【０１４２】
【表１６】
0006774879.tif 000054
0006774879.tif 000055
【０１４３】
モデル比較９では、少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミドとからなる組み合わせを、Ｂ群セラミドのみからなる組み合わせと比較した。表１２では、３０例のモデル比較を、その逸脱統計学及びχ二乗ｐ値の見積もり（ｐ＜０．０５は、モデル間の有意差を表す）と共に示す。モデルサイズが異なる３０例すべての実施例において、逸脱統計学に関するｐ値は、０．０５未満であり、これは、少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミドを有するモデルは、Ｂ群セラミドのみを有するモデルと比較して、症例−コントロール群の判別において有意な良化が認められることを意味する。
【０１４４】
【表１７】
0006774879.tif 000056
0006774879.tif 000057
【０１４５】
従って、本試験の結果より、少なくとも次の傾向、すなわち（１）少なくとも１つのＡ群セラミドと少なくとも１つのＢ群セラミドとからなる組み合わせは、Ａ群セラミド又はＢ群セラミド単独と比較して、その判別力を有意に改善させる、（２）Ａ群及びＢ群セラミドの数が増加すると、セラミドの組み合わせが、少なくとも１つのＡ群セラミド及び少なくとも１つのＢ群セラミドを含む場合には、判別力が有意に増加する、（３）Ａ群セラミドの数（Ｂ群セラミドを含まない）が増加しても、組み合わされたセラミドの判別力は有意に改善しない、（４）Ｂ群セラミドの数（Ａ群セラミドを含まない）が増加しても、組み合わされたセラミドの判別力は有意に改善しない、及び（５）Ａ群又はＢ群に該当しないセラミドの数が増加しても、組み合わされたセラミドの判別力は有意に改善しないことが実証される。
【０１４６】
従って、これらのデータは、判別力（ＣＶ合併症を発症するリスクを有する患者をコントロール患者から判別する力）が有意に改善した、ＣＶ合併症予測用セラミドバイオマーカーを選択するための新規ルールを規定するのに役立った。新規選択ルールに従い、また少なくとも１つのＡ群セラミドを少なくとも１つのＢ群セラミドと組み合わせることにより、症例群とコントロール群との区別は、個々のマーカー、又は脂質比、又は本選択ルールに基づき選択されないセラミドのマーカーの組み合わせと比較して、それよりも有意に正確となり得る。
【０１４７】
本発明は、その好ましい実施形態を参照しながら、特に提示及び記載されてきたが、添付の特許請求の範囲に含まれる本発明の範囲から逸脱せずに、形態及び詳細事項について様々な変更を加えることができるものと、当業者は理解する。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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