(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを補助的に評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質、
からなる群から選択される、前記方法。
【請求項２】
前記突然変異対立遺伝子が、ゲノムＤＮＡである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ＤＮＡの存在を、シークエンシングにより決定する、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記野生型カルレチクリン遺伝子が、
（ａ）配列番号２９０に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２８９に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｂ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含む、請求項１から３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを補助的に評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質、
からなる群から選択される、前記方法。
【請求項６】
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
からなる群から選択される、請求項１から５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
からなる群から選択される核酸を含む、請求項１から６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記遺伝子産物が、ｍＲＮＡである、請求項５から７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記ｍＲＮＡの存在または量を、リアルタイムＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、全トランスクリプトームショットガンシークエンシング（ＲＮＡｓｅｑ）、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、またはマイクロアレイにより決定する、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記遺伝子産物が、タンパク質である、請求項５から７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記タンパク質の存在または量を、免疫組織化学（ＩＨＣ）、イムノアッセイ、ゲルもしくはブロットベースの方法、ＩＨＣ、質量分析、フローサイトメトリー、またはＦＡＣＳにより決定する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質、
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、請求項５から７、１０および１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、請求項５から７および１０から１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
前記試料が、骨髄試料または血液試料である、請求項１から１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記骨髄試料が、生検により得られる、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｂ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸。
【請求項１７】
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質、
からなる群から選択されるタンパク質。
【請求項１８】
前記タンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質
からなる群から選択される、請求項１７に記載のタンパク質。
【請求項１９】
前記タンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質
からなる群から選択される、請求項１７または１８に記載のタンパク質。
【請求項２０】
前記タンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質であって、当該タンパク質は前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子にコードされるものであり、ここで前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、エクソン９内にフレームシフト突然変異を有する、前記タンパク質
からなる群から選択される、請求項１７から１９のいずれか一項に記載のタンパク質。
【請求項２１】
請求項１７から２０のいずれか一項に記載のタンパク質である免疫原性作用物質。
【請求項２２】
担体タンパク質に連結された請求項２１に記載の免疫原性作用物質を含むコンジュゲート。
【請求項２３】
請求項１７から２０のいずれか一項に記載のタンパク質に特異的に結合する抗体を含む、請求項５から７および１０から１５のいずれか一項に記載の方法に使用するための組成物。
【請求項２４】
請求項１７から２０のいずれか一項に記載のタンパク質に特異的に結合する抗体を含む、請求項５から７および１０から１５のいずれか一項に記載の方法に使用するための診断キット。
【請求項２５】
前記抗体が配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０または１４４に示される突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端に特異的に結合する、請求項２３に記載の組成物、または請求項２４に記載の診断キット。
【請求項２６】
前記抗体がポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、全長抗体（免疫グロブリン）、Ｆ（ａｂ）断片、Ｆ（ａｂ）２断片、単鎖抗体、キメラ抗体、ＣＤＲグラフト抗体、二価抗体構築物、二特異性単鎖抗体、合成抗体、または交差クローニング抗体である、請求項２３または２５に記載の組成物、あるいは請求項２４または２５に記載の診断キット。
【請求項２７】
前記骨髄性悪性腫瘍が、骨髄増殖性新生物または骨髄異形成症候群である、請求項１から１５のいずれか一項に記載の方法、請求項２３、２５および２６のいずれか一項に記載の組成物、あるいは請求項２４から２６のいずれか一項に記載の診断キット。
【請求項２８】
前記骨髄増殖性新生物が、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）または本態性血小板血症（ＥＴ）である、請求項２７に記載の方法、組成物または診断キット。
【請求項２９】
前記骨髄異形成症候群が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）である、請求項２７に記載の方法、組成物または診断キット。
【請求項３０】
請求項１７から２０のいずれか一項に記載のタンパク質の製造方法であって、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｂ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸、
からなる群より選択される核酸を含む宿主細胞、または前記核酸を含むベクターを含む宿主細胞を、前記タンパク質を発現することのできる条件下で培養する工程、および、
前記培養から前記タンパク質を回収する工程、
を含む、前記方法。
【請求項３１】
請求項１から１５のいずれか一項に記載のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子を含む核酸、または前記核酸を含むベクターを含むか、あるいは発現させるトランスジェニック細胞または非ヒトトランスジェニック動物。
【請求項３２】
配列番号４４０から４７５のいずれか一つまたは表３に示す変異ジャンクション（ｍｕｔａｔｉｏｎ ｊｕｎｃｔｉｏｎ）の配列を含む、請求項１６に記載の核酸であって、好ましくはｃＤＮＡである前記核酸。
【請求項３３】
請求項１６または３２に記載のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を有するアンチセンスＤＮＡまたはＲＮＡである核酸分子。
【請求項３４】
フォワード：ＡＣＡＡＣＴＴＣＣＴＣＡＴＣＡＣＣＡＡＣＧ  （配列番号４３７）
および／もしくは
リバース：ＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧ  （配列番号４３８）
または
フォワード：ＧＧＣＡＡＧＧＣＣＣＴＧＡＧＧＴＧＴ  （配列番号４３９）
および／もしくは
リバース：ＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧ  （配列番号４３８）
であるオリゴヌクレオチドからなる、請求項１から９および１４から１５のいずれか一項に記載の方法に使用するためのプライマー対。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、骨髄性悪性腫瘍を診断するための方法であって、カルレチクリン遺伝子の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップを含む、方法に関する。また、突然変異体カルレチクリンのゲノム配列、ｃＤＮＡ配列、ｍＲＮＡ配列、およびタンパク質配列も、本発明の対象である。さらに、本発明は、突然変異体カルレチクリンの阻害剤の医学的使用に関する。
【背景技術】
【０００２】
原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）、本態性血小板血症（ＥＴ）、および真性赤血球増加症（ＰＶ）は、古典的なＢＣＲ−ＡＢＬ陰性骨髄増殖性新生物（ＭＰＮ）に属する、単クローン性血液障害（Campbell & Green, 2006）である。２００５年における、ＪＡＫ２キナーゼ遺伝子内の体細胞突然変異の発見以来、ＭＰＮの分子診断、臨床管理、処置、および分子的理解には、目覚ましい進歩がなされている。バリンからフェニルアラニンへの突然変異（Ｖ６１７Ｆ）は、Ｊａｋ２キナーゼを構成的に活性化させる結果として、その基質（Ｓｔａｔ５、Ｓｔａｔ３、Ｅｒｋなど）のリン酸化の増大をもたらし、骨髄細胞のサイトカイン応答性の増大をもたらす（Baxter et al, 2005；James et al, 2005；Kralovics et al, 2005；Levine et al, 2005）。ＰＶにおけるＪＡＫ２エクソン１２内（Scott et al, 2007）、ならびにＰＭＦおよびＥＴにおける、トロンボポエチン受容体遺伝子ＭＰＬ内（Pardanani et al, 2006；Pikman et al, 2006）など、さらなる突然変異の同定が、すぐに続いてなされた。３つのＭＰＮの疾患実体は、それらの臨床症状が異なるが、多くの分子特徴ならびに臨床特徴を共有する。ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ突然変異は、それぞれ、ＰＶ症例のうちの約９５％、ＰＭＦ症例のうちの６０％、およびＥＴ症例のうちの５０％において存在する。ＪＡＫ２エクソン１２内の突然変異が、ＰＶ症例のうちの約３％に特異的であるのに対し、ＭＰＬ突然変異は、ＰＭＦ（５％）およびＥＴ（３％）に限られる。３つのＭＰＮ実体全てが、様々な程度で、血栓症、出血、および白血病性形質転換の素因をなす（Sverdlow et al, 2008）。患者は、数年間にわたり、ＭＰＮの慢性期にとどまりうるが、ＰＶおよびＥＴでは、疾患の進行は、続発性骨髄線維症の形態で生じ、様々な程度の汎血球減少症を伴う加速期の発症に続いて、３つのＭＰＮ実体全てに影響を及ぼす白血病性形質転換が生じる（Sverdlow et al, 2008）。
【０００３】
体細胞突然変異は、ＭＰＮ性造血幹細胞のクローン進化全体の間に蓄積される。これらの後天性遺伝子変化は、点突然変異、染色体損傷、および後成的欠損である可能性があり、それら全てが、進化しつつあるクローンの適応度に寄与しうる（Klampfl et al, 2011；Kralovics, 2008）。これらの突然変異は、多様な手段で増殖を加速化する場合もあり、前駆細胞の分化能を低下させる場合もあり、それらのアポトーシスに対する感受性を低下させる場合もある。これらの機構に影響を及ぼす突然変異は、ＭＰＮを含む様々な種類の骨髄性悪性腫瘍（Milosevic & Kralovics, 2013）における、ＴＥＴ２（Delhommeau et al, 2009）、ＥＺＨ２（Ernst et al, 2010）、ＤＮＭＴ３Ａ（Stegelmann et al, 2011）、ＡＳＸＬ１（Stein et al, 2011）、およびＴＰ５３（Harutyunyan et al, 2011）などの遺伝子において記載されている。しかし、これまでのところ、ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異だけが、ＭＰＮに強く関連すると考えられており、それらはＭＰＮについての最も有用な分子マーカーを表している。
【０００４】
ＭＰＮの分子的発症機序の理解においてなされた進歩にも拘らず、ＰＭＦおよびＥＴを伴う患者のうちの約半分は、ＪＡＫ２突然変異およびＭＰＬ突然変異の両方について陰性であるので、診断のための分子マーカーを欠いている。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
したがって、本発明の根底をなす技術上の問題は、骨髄性悪性腫瘍の診断のための手段および方法の提供である。
【０００６】
したがって、本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
技術上の問題は、特許請求の範囲において特徴づけられる実施形態の提供により解決される。
【０００８】
本明細書の下記および付属の実施例で記載される通り、驚くべきことに、骨髄性悪性腫瘍、好ましくは、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）および本態性血小板血症（ＥＴ）を患っている患者は、カルレチクリン（ＣＡＬＲ）遺伝子内に体細胞突然変異を有することが見出されたので、本発明は、上記で同定された技術上の問題を解決する。別の驚くべき知見は、ＭＰＮを伴う患者のＣＡＬＲ遺伝子内の、これらの骨髄細胞に特異的な体細胞突然変異は、ＪＡＫ２突然変異およびＭＰＬ突然変異（かつて記載された、ＭＰＮにおける、疾患の原因となる突然変異）の両方について陰性の患者と強く関連することであった。本明細書で示される通り、ＣＡＬＲ突然変異は、ＪＡＫ２およびＭＰＬについて二重陰性である、ＰＭＦ症例のうちの８８％、およびＥＴ症例のうちの６８％において見出されている。したがって、本発明は、骨髄性悪性腫瘍についての信頼できる診断を提供する。本発明は、ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異について陰性の患者など、信頼できるマーカーが存在しない患者にとりわけ有用である。
【０００９】
本明細書ではさらに、本明細書で提示される、カルレチクリン（ＣＡＬＲ）遺伝子内の体細胞突然変異は、野生型カルレチクリンタンパク質と比較して、完全に異なる特徴を有する、カルレチクリンタンパク質のＣ末端を結果としてもたらすことが見出された。これらの異なる特徴は、骨髄性悪性腫瘍、好ましくは、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）および本態性血小板血症（ＥＴ）の発症を引き起こすか、またはこれに寄与すると考えられている。
【００１０】
本明細書で同定されるＣＡＬＲの突然変異は全て、タンパク質のＣ末端アミノ酸をコードする最終端のエクソン９内にあり、主に、挿入／欠失突然変異である。突然変異の大半は、ヘテロ接合性状態で存在し、代替的リーディングフレーム（図３Ａに示される、代替的なフレーム１）へのフレームシフトを引き起こす。このフレームシフトは、カルレチクリンのＣ末端の、負に帯電したアミノ酸（アスパラギン酸およびグルタミン酸に富む）の、アルギニンおよびメチオニンに富む、主に正に帯電したポリペプチドによる置き換えを結果としてもたらす。加えて、カルレチクリンの最終端の４アミノ酸（ＫＤＥＬ（配列番号１３３１））は、小胞体（ＥＲ）保持シグナルを含有する。このシグナルは、突然変異体カルレチクリン内に存在しないことから、突然変異体タンパク質は、ＥＲ内では、野生型タンパク質と比較してそれほど代表的ではないことが示唆される。カルレチクリンの負に帯電したＣ末端は、低アフィニティーで高キャパシティーのＣａ２＋結合性ドメインであるので、突然変異体タンパク質のＣａ２＋結合機能は失われていると考えられる。本明細書では、ＣＡＬＲの主要な突然変異は、本明細書で規定される、１型および２型の突然変異であることが裏付けられている（図３Ｅを参照されたい）。したがって、これらの突然変異体および本発明に従うそれらの使用は好ましい。Ｃ末端をコードする核酸配列、ならびに１型および２型のＣＡＬＲ突然変異のＣ末端のアミノ酸配列を、配列番号５〜１２に示す。本明細書では、１型および２型のＣＡＬＲ突然変異のさらなる核酸が開示される。
【００１１】
本発明は、以下の項目に関する。
【００１２】
１．患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法。
【００１３】
２．前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含む、
項目１に従う方法。
【００１４】
３．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２に従う方法。
【００１５】
４．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２または３に従う方法。
【００１６】
５．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２〜４のいずれか一項に従う方法。
【００１７】
６．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２〜５のいずれか一項に従う方法。
【００１８】
７．カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、カルレチクリン遺伝子のエクソン９を包含する領域内にある、項目１〜６のいずれか一項に従う方法。
【００１９】
８．前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、フレームシフト突然変異を有する、項目１〜７のいずれか一項に従う方法。
【００２０】
９．前記フレームシフト突然変異が、カルレチクリン遺伝子のエクソン９内にある、項目８に従う方法。
【００２１】
１０．前記フレームシフト突然変異が、１ヌクレオチドの欠失または２ヌクレオチドの付加である、項目８または９に従う方法。
【００２２】
１１．（１＋（３×ｎ０））ヌクレオチドが、カルレチクリン遺伝子から欠失している、項目８または９のいずれか一項に従う方法。
【００２３】
１２．１、４、１９、２２、３１、３４、４６、５２ヌクレオチドが欠失している、項目８、９、および１１のいずれか一項に従う方法。
【００２４】
１３．１ヌクレオチドが欠失し、６ヌクレオチドが挿入されているか；
２ヌクレオチドが欠失し、４ヌクレオチドが挿入されているか；
３ヌクレオチドが欠失し、５ヌクレオチドが挿入されているか；
１２ヌクレオチドが欠失し、５ヌクレオチドが挿入されているか；
１８ヌクレオチドが欠失し、１１ヌクレオチドが挿入されているか；
１８ヌクレオチドが欠失し、１４ヌクレオチドが挿入されているか；
２０ヌクレオチドが欠失し、１ヌクレオチドが挿入されているか；
２８ヌクレオチドが欠失し、６ヌクレオチドが挿入されているか；
３５ヌクレオチドが欠失し、１ヌクレオチドが挿入されているか；または
３６ヌクレオチドが欠失し、２ヌクレオチドが挿入されている、
項目８、９、１１、および１２のいずれか一項に従う方法。
【００２５】
１４．（２＋（３×ｎ０））ヌクレオチドが、カルレチクリン遺伝子に挿入されている、項目８または９に従う方法。
【００２６】
１５．５ヌクレオチドが挿入されている、項目１４に従う方法。
【００２７】
１６．前記カルレチクリン遺伝子が、
（ａ）配列番号２９０に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２８９に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含む、項目１〜１５のいずれか一項に従う方法。
【００２８】
１７．前記ヌクレオチドが、カルレチクリン遺伝子のエクソン９から欠失し、かつ／または、これに挿入されている、項目１０〜１６のいずれか一項に従う方法。
【００２９】
１８．カルレチクリン遺伝子の前記エクソン９が、
（ａ）配列番号４３６に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号４３５に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含む、項目９〜１７のいずれか一項に従う方法。
【００３０】
１９．前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、項目１〜１８のいずれか一項に従う方法。
【００３１】
２０．前記突然変異対立遺伝子が、ＤＮＡ、好ましくは、ゲノムＤＮＡである、項目１〜１９のいずれか一項に従う方法。
【００３２】
２１．前記ＤＮＡの存在を、シークエンシングにより決定する、項目２０に従う方法。
【００３３】
２２．患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法。
【００３４】
２３．前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含む、
項目２２に従う方法。
【００３５】
２４．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２３に従う方法。
【００３６】
２５．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２３または２４に従う方法。
【００３７】
２６．前記カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２３〜２５のいずれか一項に従う方法。
【００３８】
２７．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目２３〜２６のいずれか一項に従う方法。
【００３９】
２８．前記対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、項目２２〜２７のいずれか一項に従う方法。
【００４０】
２９．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、項目２２〜２８のいずれか一項に従う方法。
【００４１】
３０．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、項目２２〜２９のいずれか一項に従う方法。
【００４２】
３１．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、項目２２〜３０のいずれか一項に従う方法。
【００４３】
３２．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、項目２２〜３１のいずれか一項に従う方法。
【００４４】
３３．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、項目２２〜２８のいずれか一項に従う方法。
【００４５】
３４．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、項目２２〜２８および３３のいずれか一項に従う方法。
【００４６】
３５．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、項目２２〜２８、３３、および３４のいずれか一項に従う方法。
【００４７】
３６．前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、項目２２〜２８および３３〜３５のいずれか一項に従う方法。
【００４８】
３７．前記遺伝子産物が、ｍＲＮＡである、項目２２〜３６のいずれか一項に従う方法。
【００４９】
３８．前記ｍＲＮＡの存在または量を、リアルタイムＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、全トランスクリプトームショットガンシークエンシング（ＲＮＡｓｅｑ）、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、またはマイクロアレイにより決定する、項目３７に従う方法。
【００５０】
３９．リアルタイムＰＣＲまたは逆転写酵素ＰＣＲによる決定が、
（ｉ）試料中の核酸を１つまたは２つのオリゴヌクレオチドと接触させるステップと、
（ｉｉ）標的配列を含有する増幅産物を生成するステップと
をさらに含む、請求項３８に従う方法。
【００５１】
４０．前記遺伝子産物が、タンパク質である、項目２２〜２８および３３〜３６のいずれか一項に従う方法。
【００５２】
４１．前記タンパク質の存在または量を、免疫組織化学（ＩＨＣ）、イムノアッセイ、ゲルもしくはブロットベースの方法、ＩＨＣ、質量分析、フローサイトメトリー、またはＦＡＣＳにより決定する、項目４０に従う方法。
【００５３】
４２．前記患者が、ヒト患者である、項目１〜４１のいずれか一項に従う方法。
【００５４】
４３．前記試料が、骨髄試料である、項目１〜４２のいずれか一項に従う方法。
【００５５】
４４．前記試料が、血液試料である、項目１〜４２のいずれか一項に従う方法。
【００５６】
４５．前記骨髄試料が、生検により得られる、項目４３または４４に従う方法。
【００５７】
４６．突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、患者に投与するステップをさらに含む、項目１〜４５のいずれか一項に従う方法。
【００５８】
４７．（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸。
【００５９】
４８．（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２、６、１０、１４、１８、２２、２６、３０、３４、３８、４２、４６、５０、５４、５８、６２、６６、７０、７４、７８、８２、８６、９０、９４、９８、１０２、１０６、１１０、１１４、１１８、１２２、１２６、１３０、１３４、１３８、または１４２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目４７に従う核酸。
【００６０】
４９．（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９２、２９６、３００、３０４、３０８、３１２、３１６、３２０、３２４、３２８、３３２、３３６、３４０、３４４、３４８、３５２、３５６、３６０、３６４、３６８、３７２、３７６、３８０、３８４、３８８、３９２、３９６、４００、４０４、４０８、４１２、４１６、４２０、４２４、４２８、または４３２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目４７または４８に従う核酸。
【００６１】
５０．（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４６、１５０、１５４、１５８、１６２、１６６、１７０、１７４、１７８、１８２、１８６、１９０、１９４、１９８、２０２、２０６、２１０、２１４、２１８、２２２、２２６、２３０、２３４、２３８、２４２、２４６、２５０、２５４、２５８、２６２、２６６、２７０、２７４、２７８、２８２、または２８６に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目４７〜４９のいずれか一項に従う核酸。
【００６２】
５１．ｃＤＮＡである、項目４７〜５０のいずれか一項に従う核酸。
【００６３】
５２．（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸。
【００６４】
５３．（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目５２に従う核酸。
【００６５】
５４．（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目５２または５３に従う核酸。
【００６６】
５５．（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目５２または５４に従う核酸。
【００６７】
５６．ｍＲＮＡである、項目５２〜５５のいずれか一項に従う核酸。
【００６８】
５７．（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸。
【００６９】
５８．（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、または１４１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目５７に従う核酸。
【００７０】
５９．（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目５７または５８に従う核酸。
【００７１】
６０．（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、または２８５に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目５７〜５９のいずれか一項に従う核酸。
【００７２】
６１．ゲノムＤＮＡである、項目５７〜６０のいずれか一項に従う核酸。
【００７３】
６２．（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質。
【００７４】
６３．（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目６２に従うタンパク質。
【００７５】
６４．（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目６２または６３に従うタンパク質。
【００７６】
６５．（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目６２〜６４のいずれか一項に従うタンパク質。
【００７７】
６６．項目６２または６３に従うタンパク質を含むワクチン。
【００７８】
６７．項目６２〜６５のいずれか一項のタンパク質に特異的に結合する抗体。
【００７９】
６８．項目５２〜５６のいずれか一項の核酸を特異的にターゲティングするｓｉＲＮＡ。
【００８０】
６９．少なくとも１０の連続した塩基を含む核酸分子からなる、項目６８に従うｓｉＲＮＡ。
【００８１】
７０．連続した塩基のうちの最大１０％が、非相補的である、項目６８または６９に従うｓｉＲＮＡ。
【００８２】
７１．５’端における少なくとも１つの塩基および／または３’端における少なくとも１つの塩基をさらに含む、項目６８〜７０のいずれか一項に従うｓｉＲＮＡ。
【００８３】
７２．骨髄性悪性腫瘍の処置における使用のための、突然変異体カルレチクリンの阻害剤。
【００８４】
７３．骨髄性悪性腫瘍患者を処置するための方法であって、有効量の突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、患者に投与するステップを含む、方法。
【００８５】
７４．前記突然変異体カルレチクリンが、項目６２〜６５のいずれか一項で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質である、項目７２に従う阻害剤、または項目４６もしくは７３に従う方法。
【００８６】
７５．前記阻害剤が、抗体である、項目７２もしくは７４に従う阻害剤、または項目５６、７３、もしくは７４に従う方法。
【００８７】
７６．前記阻害剤が、細胞外結合性パートナー、低分子結合性分子、アプタマー、およびイントラマーからなる群から選択される、項目７２もしくは７４に従う阻害剤、または項目５６、７３、もしくは７４に従う方法。
【００８８】
７７．前記突然変異体カルレチクリンが、項目５２〜５６のいずれか一項で規定された核酸である、項目７２に従う阻害剤、または項目４６もしくは７３に従う方法。
【００８９】
７８．前記阻害剤が、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｄｓＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｔＲＮＡ、およびアンチセンス分子からなる群から選択される、項目７２もしくは７７に従う阻害剤、または項目４６、７３、および７７のいずれか一項に従う方法。
【００９０】
７９．前記骨髄性悪性腫瘍が、骨髄増殖性新生物である、項目７２および７４〜７８のいずれか一項に従う阻害剤；または項目１〜４６および７３〜７８のいずれか一項に従う方法。
【００９１】
８０．前記骨髄増殖性新生物が、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）である、項目７９に従う阻害剤；または項目７９に従う方法。
【００９２】
８１．前記骨髄増殖性新生物が、本態性血小板血症（ＥＴ）である、項目７９に従う阻害剤；または項目７９に従う方法。
【００９３】
８２．前記骨髄性悪性腫瘍が、骨髄異形成症候群である、項目７２および７４〜７８のいずれか一項に従う阻害剤；または項目１〜４６および７３〜７８のいずれか一項に従う方法。
【００９４】
８３．前記骨髄異形成症候群が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）である、項目８２に従う阻害剤；または項目８２に従う方法。
【００９５】
８４．処置される患者が、項目１〜４６のいずれか一項に従う骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または項目１〜４６のいずれか一項に従う骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価される、項目７２および７４〜８３のいずれか一項に従う阻害剤；または項目７３〜８３のいずれか一項に従う方法。
【００９６】
８５．医薬としての使用のための、項目６２もしくは６３に従うタンパク質、項目６７に従う抗体、項目６８〜７１のいずれか一項に従うｓｉＲＮＡ、または項目７２〜７８のいずれか一項で規定された突然変異体カルレチクリンの阻害剤。
【００９７】
８６．項目４７〜５１および５７〜６１のいずれか一項に従う核酸を含むベクター。
【００９８】
８７．項目４７〜５１および５７〜６１のいずれか一項に従う核酸、または項目８６に従うベクターを含む宿主細胞。
【００９９】
８８．項目６２〜６５に従うポリペプチドを作製するための工程であって、項目８７に従う宿主細胞を、ポリペプチドの発現を可能とする条件下で培養するステップと、作製されたポリペプチドを培養物から回収するステップとを含む工程。
【発明を実施するための形態】
【０１００】
本明細書で提示されるＣＡＬＲ突然変異の、ゲノムＤＮＡ、ＲＮＡ、ｃＤＮＡ、およびタンパク質のレベルにおける検出は、骨髄性悪性腫瘍の診断、例えば、患者が骨髄性悪性腫瘍を有するかどうか、どの種類の骨髄性悪性腫瘍であるのか、および疾患の具体的な特徴についての診断に有用である。
【０１０１】
本明細書で使用される「診断」とは、とりわけ、疾病の性格の同定または症状の根底をなす生理学的もしくは病理学的問題の同定を指す。したがって、「骨髄性悪性腫瘍の診断」とは、（ａ）患者が骨髄性悪性腫瘍を有するかどうか、および／または（ｂ）どの種類の骨髄性悪性腫瘍であるのか、および／または（ｃ）具体的な骨髄性悪性腫瘍の特徴を決定することを指す。診断は、例えば、症状の検討および／または補完的な検査（例えば、細胞遺伝学的または分子的検査）に基づき実施することができる。
【０１０２】
本明細書では、「患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているかどうかを評価すること」および「骨髄性悪性腫瘍を診断すること」という用語を互換的に使用することができる。診断はまた、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうか、すなわち、患者に、骨髄性悪性腫瘍を発症する危険性があるかどうかの評価も含みうるか、またはこれにも関しうる。
【０１０３】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０１０４】
本明細書で提示される方法は、試料を患者から得るステップを含みうる。「〜を得ること」は、第三者により提供される試料の受領を包含する。例えば、血液または骨髄は、患者から採取し、適切なレセプタクルに入れ、次いで、解析に供することができる。
【０１０５】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−試料を前記患者から得るステップと、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０１０６】
本発明に従い、カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子が、前記患者に由来する試料中、好ましくは、血液試料中に存在する場合に、患者を骨髄性悪性腫瘍について「陽性」と評価する。
【０１０７】
本明細書で使用される「骨髄性悪性腫瘍」という用語は、骨髄性血液系統に影響を及ぼすクローン性血液疾患であって、慢性の臨床経過を伴う疾患および急性の臨床経過を伴う疾患を含む、疾患を指す。骨髄性悪性腫瘍は、骨髄増殖性新生物、骨髄異形成症候群、および急性骨髄性白血病を含む。本明細書では、骨髄性悪性腫瘍は、骨髄増殖性新生物、特に、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）もしくは本態性血小板血症（ＥＴ）、または骨髄異形成症候群、特に、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）であることが好ましい。
【０１０８】
したがって、骨髄性悪性腫瘍の診断は、疾患の亜型をさらに診断することでありうる。さらなる実施形態では、診断では、血液化学、細胞学、および遺伝子解析など、さらなる検査を組み合わせて活用する。骨髄増殖性新生物の性格に応じて、さらなる診断検査は、赤血球量の決定（赤血球増加症のための）、骨髄吸引物および穿孔器生検、動脈血酸素飽和度および一酸化炭素ヘモグロビンレベル、好中球アルカリホスファターゼレベル、ビタミンＢ１２（またはＢ１２結合能）、ならびに血清尿酸を含みうる。遺伝子検査は、診断においてますます重要となりつつあることが分かっている。
【０１０９】
以下の疾患を診断するには、以下の検査が従来行われている。例えば、Vardiman, et al. (2009). "The 2008 revision of the World Health Organization (WHO) classification of myeloid neoplasms and acute leukemia: Rationale and important changes". Blood 114 (5): 937-51を参照されたい。
【０１１０】
慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）
３つの切断点：
・ｕ−ＢＣＲ−ＡＢＬ（ｐ２３０）：通例の好中球増加症および好塩基球増加症を伴う、ＣＭＬをもたらす
・ｍｉｎｏｒ−ＢＣＲ−ＡＢＬ（ｐ１９０）：通例Ｂ前駆細胞性ＡＬＬであり、まれにＴ前駆細胞性ＡＬＬである、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）となる傾向を有する、ＣＭＬをもたらす
・ｍａｊｏｒ−ＢＣＲ−ＡＢＬ（ｐ２１０）：正常な通例の切断点
を有するＢＣＲ−ＡＢＬ転座である、フィラデルフィア染色体における規定的な転座ｔ（９；２２）を伴う
【０１１１】
本態性血小板血症（ＥＴ）
ＥＴは、症例のうちの最大５５％において、ＪＡＫ２Ｖ６１７Ｆ突然変異、および症例のうちの最大５％において、ＭＰＬ（トロンボポエチン受容体）突然変異と関連する。
・細胞期−線維症を伴う大型の巨核球は増大させるが、他の骨髄エレメントの増大は小さい
・線維期−骨髄エレメントを欠如させた膠原線維症
【０１１２】
これらの障害は、より特異的な遺伝子突然変異と、どのくらいの頻度で患者が線維性骨髄事象に至るのかとに従い、なおも見直されつつある。
【０１１３】
真性赤血球増加症（ＰＶ）
ＰＶは、症例のうちの９５％超において、ＪＡＫ２Ｖ６１７Ｆ突然変異と関連することが最も多いが、残りの症例は、ＪＡＫ２エクソン１２突然変異を有する。
・細胞期−クラスター化する巨核球の増大、レチクリン線維症、後期トリクロム線維症、ならびに骨髄前駆細胞および赤血球前駆細胞の増大
・線維期−骨髄エレメントを欠如させた膠原線維症
【０１１４】
原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）
ＰＭＦは、症例のうちの最大５０％において、ＪＡＫ２Ｖ６１７Ｆ突然変異、症例のうちの１〜２％において、ＪＡＫ２エクソン１２突然変異、および症例のうちの最大５％において、ＭＰＬ（トロンボポエチン受容体）突然変異と関連する。
・細胞期−クラスター化する巨核球の増大、レチクリン線維症、後期トリソミー（膠原）線維症、および骨髄前駆細胞の増大
・線維期−骨髄エレメントを欠如させた膠原線維症
【０１１５】
顕著な血小板増加症と関連する環状鉄芽球を伴う不応性貧血（ＲＡＲＳ−Ｔ）は、骨髄性悪性腫瘍と考えられることが多い。ＲＡＲＳ−Ｔの診断は従来、血液学および細胞学、骨髄の解析、ならびにｄｅｌ（５ｑ）、ｔ（３；３）（ｑ２１；ｑ２６）またはｉｎｖ（３）（ｑ２１；ｑ２６）など、核型異常の欠如を伴いうる。Broseus et al. "Clinical features and course of refractory anemia with ring sideroblast associated with marked thrombocytosis" Haematologica 9 (7): 1036-1041 (2012)を参照されたい。
【０１１６】
骨髄性悪性腫瘍の種類は、診断および処置の指針となるが、個々の悪性腫瘍は、処置の予後および経過をさらに決定する、特異的な突然変異を有しうる。遺伝子マーカーは、疾患の根底的な発症機序を明らかにすることが多いため、特に有用である。
【０１１７】
本明細書で記載される、カルレチクリン遺伝子の１つ（または複数）の突然変異対立遺伝子またはそれらの遺伝子産物の存在の決定は、単独解析として実施することができる。代替的に、この解析は、ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異など、骨髄性悪性腫瘍についての他のマーカーについての解析を後続させることもでき、先行させることもできる。例えば、骨髄増殖性新生物（および、特に、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）または本態性血小板血症（ＥＴ））など、骨髄性悪性腫瘍を患っていることが疑われる患者は、まずＪＡＫ２突然変異（特に、Ｖ６１７Ｆ突然変異）について検査することができる。それらを検査して、ＪＡＫ２突然変異について陰性であれば、突然変異体カルレチクリンについて検査することができる。次いで、それらを検査して、突然変異体カルレチクリンについて陰性であれば、ＭＰＬ突然変異、例えば、ＭＰＬ遺伝子のエクソン１０内の突然変異について検査することができる。当然ながら、さらなるマーカーもまた検査することができる。本明細書ではまた、ＪＡＫ２突然変異、突然変異体カルレチクリン、および／またはＭＰＬ突然変異について検査する、異なる順序または方式、ならびに、任意選択で、さらなるマーカーも想定されている。例えば、骨髄性悪性腫瘍についてのさらなる診断または予後診断評価のために、陽性のＪＡＫ２突然変異検査の後で、突然変異体カルレチクリンについての検査を行う（および逆の順序で行う）ことができる。また、このようなマーカーについての同時的決定も、ＪＡＫ２突然変異および突然変異体カルレチクリン（および、任意選択で、さらなるマーカー）についての同時的検査、またはＪＡＫ２突然変異、突然変異体カルレチクリン、およびＭＰＬ突然変異（および、任意選択で、さらなるマーカー）についての同時的検査と同様に想定される。骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすい患者（または患者に由来する試料）は、ＪＡＫ２突然変異およびＭＰＬ突然変異の両方について陰性である、すなわち、ＪＡＫ２およびＭＰＬの突然変異は、本発明に従い、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価された患者において存在しないことが好ましい。言い換えると、本発明に従い、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価された患者（または患者に由来する試料）は、野生型ＪＡＫ２およびＭＰＬを存在させていることが好ましい。さらなる診断のためには、さらなるマーカー／検査の使用が想定される。例えば、日常的な骨髄検査を使用することができる。骨髄検査のような、このような、さらなるマーカー／検査は、例えば、陽性の突然変異体カルレチクリン検査を検証するために使用することもでき、例えば、陰性の突然変異体カルレチクリン検査を追跡することもできる。
【０１１８】
ＪＡＫ２およびＭＰＬの野生型の核酸配列およびアミノ酸配列は公知であり、ＮＣＢＩなど、それぞれのデータベースから導出することができる。野生型ＪＡＫ２の例示的な核酸配列およびアミノ酸配列は、それぞれ、ＮＭ＿００４９７２．３（ＪＡＫ２  ｃＤＮＡ）およびＮＰ＿００４９６３．１（ＪＡＫ２タンパク質）に示されている。野生型ＭＰＬの例示的な核酸配列およびアミノ酸配列は、ＮＭ＿００５３７３．２（ＭＰＬ  ｃＤＮＡ）およびＮＰ＿００５３６４．１（ＭＰＬタンパク質）に示されている。
【０１１９】
骨髄性悪性腫瘍内のＪＡＫ２およびＭＰＬの突然変異については、本明細書の上記で記載した。このような突然変異は、例えば、ＪＡＫ２のＶ６１７Ｆ突然変異（ＪＡＫ２のアミノ酸配列の６１７位における、バリンからフェニルアラニンへの突然変異）、ＪＡＫ２をコードする核酸配列のエクソン１２内の突然変異、および／またはＭＰＬのエクソン１０内の突然変異である。
【０１２０】
バリンからフェニルアラニンへの（Ｖ６１７Ｆ）突然変異は、Baxter et al, 2005；James et al, 2005；Kralovics et al, 2005；Levine et al, 2005において開示されている。ＰＶにおける、ＪＡＫ２エクソン１２内の突然変異、ならびにＰＭＦおよびＥＴにおける、トロンボポエチン受容体遺伝子ＭＰＬ内の突然変異は、それぞれ、Scott et al, 2007およびPardanani et al, 2006；Pikman et al, 2006において開示されている。これらの参考文献の全ては、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
【０１２１】
ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異の存在は、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ（ｒｅｆ）についての対立遺伝子特異的ＰＣＲ、ならびにＪＡＫ２のエクソン１２およびＭＰＬのエクソン１０についてのサンガーシークエンシングにより除外することができる。この文脈で使用しうる、例示的なプロトコールは、参照により本明細書に組み込まれる、Kralovics R, Teo SS, Li S, Theocharides A, Buser AS, Tichelli A, Skoda RC. Acquisition of the V617F mutation of JAK2 is a late genetic event in a subset of patients with myeloproliferative disorders. Blood. 2006 Aug 15;108 (4):1377-80. Epub 2006 May 4において開示されている。
【０１２２】
したがって、本発明は、突然変異体カルレチクリンについて陽性であり、突然変異体ＪＡＫ２および突然変異体ＭＰＬについて陰性であると評価される、新規の骨髄性悪性腫瘍患者群（または、言い換えれば、新規の骨髄性悪性腫瘍患者群を、突然変異体カルレチクリンについて陽性であり、野生型ＪＡＫ２および野生型ＭＰＬについて陽性であると評価する）を提供する。
【０１２３】
好ましい実施形態では、本発明の方法は、
−患者に由来する試料中の野生型ＪＡＫ２タンパク質または野生型ＪＡＫ２核酸の存在を決定するステップおよび／または、
−患者に由来する試料中の、野生型ＭＰＬタンパク質または野生型ＭＰＬ核酸の存在を決定するステップ
を含む。
【０１２４】
特に好ましい実施形態では、本発明の方法は、
−患者に由来する試料中の野生型ＪＡＫ２タンパク質または野生型ＪＡＫ２核酸の存在を決定するステップと、
−患者に由来する試料中の、野生型ＭＰＬタンパク質または野生型ＭＰＬ核酸の存在を決定するステップと
を含む。
【０１２５】
上記の、患者に由来する試料中の野生型ＪＡＫ２タンパク質または野生型ＪＡＫ２核酸の存在を決定するステップ；および／または患者に由来する試料中の、野生型ＭＰＬタンパク質または野生型ＭＰＬ核酸の存在を決定するステップは、本明細書で提示および規定される通り、前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップの前に実施することもでき、この後で実施することもできる。
【０１２６】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−患者に由来する試料中の野生型ＪＡＫ２タンパク質または野生型ＪＡＫ２核酸の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０１２７】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−前記患者に由来する試料中の野生型ＭＰＬタンパク質または野生型ＭＰＬ核酸の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０１２８】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−前記患者に由来する試料中の野生型ＪＡＫ２タンパク質または野生型ＪＡＫ２核酸の存在を決定するステップと、
−前記患者に由来する試料中の野生型ＭＰＬタンパク質または野生型ＭＰＬ核酸の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０１２９】
本発明の方法は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているかどうかの評価だけに関することが好ましい。
【０１３０】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っていると評価するステップと
を含む方法に関する。
【０１３１】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含む方法に関する。
【０１３２】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含む方法に関する。
【０１３３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含む方法に関する。
【０１３４】
本明細書で提示される方法は、患者に由来する試料中の、カルレチクリン遺伝子の、好ましくは、ただ１つの突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップを含む。方法は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ法であることが好ましい。本明細書で提示および開示される、カルレチクリン遺伝子の突然変異は、体細胞突然変異である。これらの突然変異は、ホモ接合性の状態で存在する場合もあり、ヘテロ接合性の状態で存在する場合もあるが、ヘテロ接合性の状態で存在することが好ましい。
【０１３５】
カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子は、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含みうる。本明細書で開示および提示される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、共通のＣ末端アミノ酸配列を特徴とする。例えば、実施例の表２から明らかな通り、突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端は、共通の最小配列を有する。前記共通の最小配列は、配列番号４に表示されるアミノ酸配列に示され、配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされる。
【０１３６】
したがって、本発明に従い使用される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される。
【０１３７】
一実施形態では、本発明に従い使用される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１、２、もしくは３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；または
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質である。
【０１３８】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１３９】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、もしくは３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；または
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
である、方法に関する。
【０１４０】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１４１】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、もしくは３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；または
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
である、方法に関する。
【０１４２】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１４３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、もしくは３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；または
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
である、方法に関する。
【０１４４】
本明細書で提示および使用される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、および１４４に示される、特徴的なＣ末端を有する。これらのＣ末端は、配列番号４に示されるアミノ酸配列を含む。
【０１４５】
突然変異体カルレチクリンタンパク質は、上記に従い、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択することができる。
【０１４６】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１４７】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１４８】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１４９】
一実施形態では、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質からなる群から選択される。
【０１５０】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１５１】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質からなる群から選択される、方法に関する。
【０１５２】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１５３】
本明細書では、３６種類の突然変異体カルレチクリンタンパク質が同定されている（全長突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端を示す表２を参照されたい）。これらの突然変異体タンパク質は、配列番号４に示される、それらの共通の特徴的なＣ末端により１つにまとめられる。突然変異体カルレチクリンタンパク質の全長配列は、配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、および２８８に示されている。
【０１５４】
したがって、本明細書で提示および使用される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択することができる。
【０１５５】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１５６】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１５７】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１５８】
一実施形態では、本明細書で提示および使用される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質からなる群から選択することができる。
【０１５９】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１６０】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１６１】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１６２】
本明細書では、同定された突然変異が、カルレチクリン遺伝子のエクソン９内で生じることが示されている。したがって、以下は、野生型カルレチクリン遺伝子内およびそのエクソン９内の突然変異に関する。
【０１６３】
野生型カルレチクリン遺伝子は、周知である。その核酸配列およびアミノ酸配列は、受託番号ＮＧ＿０２９６６２．１（遺伝子）およびＮＰ＿００４３３４．１（タンパク質）の下に、ＮＣＢＩのようなデータベースから得ることができる。
【０１６４】
野生型カルレチクリン遺伝子の例示的な核酸配列を、配列番号２８９に示す。対応するアミノ酸配列を、配列番号２９０に示す。
【０１６５】
したがって、野生型カルレチクリン遺伝子は、
（ａ）配列番号２９０に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２８９に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含みうる。
【０１６６】
カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子は、上記で記載されたカルレチクリン遺伝子のエクソン９を包含する領域内に存在しうる。カルレチクリン遺伝子のエクソン９の野生型核酸配列を、配列番号４３５に示す。対応する野生型アミノ酸配列を、配列番号４３６に示す。
【０１６７】
上記に従い、野生型カルレチクリン遺伝子のエクソン９は、
（ａ）配列番号４３６に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号４３５に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含みうる。
【０１６８】
本明細書で示される通り（例えば、表２を参照されたい）、本明細書で提示されるカルレチクリン遺伝子の突然変異対立遺伝子は、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、フレームシフト突然変異を有する。フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のエクソン９内に存在しうる。フレームシフト突然変異に起因して、野生型カルレチクリン遺伝子のオープンリーディングフレームは、もはや使用されず、突然変異体カルレチクリンタンパク質の特徴的なＣ末端の生成をもたらす、代替的なフレーム１が使用される（突然変異体タンパク質の共通の最小のアミノ酸配列を、配列番号４に示す）。
【０１６９】
フレームシフト突然変異は、突然変異体タンパク質が、特徴的なＣ末端（配列番号４に示される）またはその断片を含むことを条件として、１または複数のヌクレオチドの欠失により引き起こすこともでき、２つ以上のヌクレオチドの挿入により引き起こすこともでき、１または複数のヌクレオチドの挿入および欠失の組合せにより引き起こすこともできる。
【０１７０】
例えば、フレームシフト突然変異とは、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、１ヌクレオチドの欠失、または野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、２ヌクレオチドの挿入である（またはこれらにより引き起こされる）。
【０１７１】
例えば、（１＋（３×ｎ０））ヌクレオチドは、カルレチクリン遺伝子から（またはそのエクソン９から）欠失させることができる［式中、ｎ０は、ゼロを含む任意の自然数でありうる］。本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を生成するのに、カルレチクリン遺伝子から（またはそのエクソン９から）欠失させうる、ヌクレオチドの数の非限定的な例は、１、４、１９、２２、３１、３４、４６、５２ヌクレオチドである。
【０１７２】
同様に、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、２ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれにより引き起こされうる）。したがって、（２＋（３×ｎ０））ヌクレオチドを、カルレチクリン遺伝子に（またはそのエクソン９に）挿入することができる［式中、ｎ０は、ゼロを含む任意の自然数でありうる］。例えば、５ヌクレオチドを、カルレチクリン遺伝子に（またはそのエクソン９に）挿入して、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を生成することができる。
【０１７３】
フレームシフト突然変異はまた、結果として得られる突然変異体タンパク質が、特徴的なＣ末端（配列番号４に示される）またはその断片を含むことを条件として、野生型カルレチクリン遺伝子への１または複数のヌクレオチドの挿入と、野生型カルレチクリン遺伝子からの１または複数のヌクレオチドの欠失と（またはそのエクソン９への挿入とこれから欠失と）の組合せによっても引き起こすことができる。
【０１７４】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、１ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、６ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１７５】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、２ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、４ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１７６】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、３ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、５ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１７７】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、１２ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、５ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１７８】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、１８ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、１１ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１７９】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、１８ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、１４ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１８０】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、２０ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、１ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１８１】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、２８ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、６ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１８２】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、３５ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、１ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１８３】
例えば、フレームシフト突然変異は、野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９からの、３６ヌクレオチドの欠失、および野生型カルレチクリン遺伝子のコード配列、特に、そのエクソン９への、２ヌクレオチドの挿入でありうる（またはこれらにより引き起こされうる）。
【０１８４】
突然変異体カルレチクリンタンパク質の特徴的なＣ末端（突然変異体タンパク質の共通の最小のアミノ酸配列を、配列番号４に示す）またはその断片の生成を結果としてもたらす、挿入／欠失発明のさらなる組合せは、たやすく察知される。
【０１８５】
上記で記載された挿入、欠失、および挿入／欠失の組合せに起因して、フレームシフトが、野生型カルレチクリン遺伝子、および、特に、そのエクソン９（のコード配列）に導入される。したがって、本明細書で開示され、本発明に従い使用される、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、これらの突然変異体のエクソン９配列によりコードされる、突然変異体のアミノ酸の連なりを含む。
【０１８６】
したがって、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択することができる。
【０１８７】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１８８】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１８９】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１９０】
一実施形態では、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質からなる群から選択される。
【０１９１】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１９２】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１９３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０１９４】
カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在は、ゲノムレベル、ｍＲＮＡレベル、またはタンパク質レベルで評価することができる。
【０１９５】
カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を、ゲノムレベルで評価する場合、突然変異対立遺伝子は、ＤＮＡ、好ましくは、ゲノムＤＮＡを含むかまたはこれからなりうる。
【０１９６】
例えば、突然変異対立遺伝子は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含みうる。
【０１９７】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、方法に関する。
【０１９８】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、方法に関する。
【０１９９】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、方法に関する。
【０２００】
一実施形態では、前記突然変異対立遺伝子は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む。
【０２０１】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、方法に関する。
【０２０２】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリン対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、方法に関する。
【０２０３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、方法に関する。
【０２０４】
突然変異解析のために日常的に援用される任意の方法を、本発明に従い使用することができる。ゲノムレベルにおける突然変異対立遺伝子の存在は、例えば、シークエンシング（サンガーシークエンシング、例えば、二方向サンガーシークエンシングなど）および／またはＰＣＲサイズ決定アッセイ（すなわち、ＰＣＲに続いて、例えば、（高密度アガロースゲル電気泳動のような）アガロースゲル電気泳動を介する断片解析を行う）など、ＰＣＲベースの検出戦略により決定することができる。
【０２０５】
核酸内の突然変異の検出は、直接シークエンシング、ゲノムＤＮＡの制限断片長多型同定（ＲＦＬＰＩ）、ランダム増幅多型検出（ＲＡＰＤ）、増幅断片長多型検出（ＡＦＬＰＤ）、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ＤＮＡシークエンシング、対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）プローブ、ＤＮＡマイクロアレイまたはビーズとのハイブリダイゼーション、高解像度溶融（ＨＲＭ）、およびＴａｑＭａｎプローブ原理を含む、当技術分野で公知の方法により実施することができる。核酸は、ゲノムＤＮＡ、増幅されたゲノムＤＮＡ、ｍＲＮＡ、ｃＤＮＡ、または増幅されたｃＤＮＡでありうる。
【０２０６】
シークエンシングは、特異的に増幅された核酸に対して実施することが典型的である。断片サイズ解析では、ＰＣＲ後における単位複製配列のサイズの差異を使用することが典型的である。高解像度溶融（ＨＲＭ）は、二本鎖ＤＮＡの溶融点を正確に測定することにより、ＤＮＡ内の突然変異を検出する（Gundry et al., “Amplicon Melting Analysis with Labeled Primers: A Closed-Tube Method for Differentiating Homozygotes and Heterozygotes” Clinical Chemistry 49: 396-406 (2003)）。使用者は、彼らの目的の突然変異が存在するＤＮＡ領域を増幅するのに、ＰＣＲを使用することが典型的である。次いで、増幅されたＤＮＡを、鎖が分離されるまで、約５０℃から約９５℃まで正確に加熱する。この工程は、蛍光色素でモニタリングすることが典型的である。
【０２０７】
本明細書で援用されうる１つの手法では、断片サイズ解析を使用した後で、シークエンシングを行うかまたは行わずにおく。上述の通り、例えば、突然変異体カルレチクリンのゲノムＤＮＡを鋳型として使用するＰＣＲアッセイを、ＤＮＡの増幅に使用することができる。その後、増幅されたＤＮＡを、例えば、アガロースゲル電気泳動を介する断片解析にかけることができる。
【０２０８】
突然変異対立遺伝子の存在を、ｍＲＮＡレベルまたはタンパク質レベルで決定するための方法は、下記にさらに記載する。
【０２０９】
ｍＲＮＡには、ＤＮＡのために使用された方法と同じ方法のうちの多くを、ｃＤＮＡを生成する逆転写の後で実施することができる。他の方法は、リアルタイムＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、全トランスクリプトームショットガンシークエンシング（ＲＮＡｓｅｑ）、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、またはマイクロアレイを含む。リアルタイムＰＣＲは、目的の配列を同時に増幅および検出する。特異的なプライマーおよび蛍光標識の使用により、野生型と突然変異とを識別することができる。
【０２１０】
タンパク質は、免疫組織化学（ＩＨＣ）、イムノアッセイ、ゲルもしくはブロットベースの方法、質量分析、フローサイトメトリー、または蛍光活性化細胞分取（ＦＡＣＳ）を含む方法により解析することができる。多くの方法は、抗体または抗体のセットの、野生型形態と突然変異体形態の差異を検出する目的のタンパク質への結合をモニタリングする。質量分析は、根底をなす配列についての情報を明らかにする、タンパク質およびその断片のサイズの差異を検出する。例えば、実施例２で示される通り、突然変異体カルレチクリンタンパク質に特異的に結合するポリクローナル抗体を使用することができる。
【０２１１】
本発明はまた、骨髄性悪性腫瘍を診断するために、カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在の決定も利用する。
【０２１２】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０２１３】
本明細書で提示される方法は、試料を患者から得るステップを含みうる。
【０２１４】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−試料を前記患者から得るステップと、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０２１５】
本明細書で提示される方法は、患者に由来する試料中の、カルレチクリン遺伝子の、好ましくは、ただ１つの突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップを含む。方法は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ法であることが好ましい。
【０２１６】
本発明の方法は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているかどうかの評価だけに関することが好ましい。
【０２１７】
本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っていると評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０２１８】
骨髄性悪性腫瘍は、骨髄増殖性新生物および骨髄異形成症候群を含む。本明細書では、骨髄性悪性腫瘍は、骨髄増殖性新生物、特に、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）もしくは本態性血小板血症（ＥＴ）、または骨髄異形成症候群、特に、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）であることが好ましい。
【０２１９】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０２２０】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０２２１】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法に関する。
【０２２２】
１または複数の突然変異対立遺伝子は、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含みうる。
【０２２３】
突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択することができる。
【０２２４】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２２５】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２２６】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２２７】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２２８】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２２９】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３０】
突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択することができる。
【０２３１】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３２】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３３】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３４】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３５】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３６】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３７】
突然変異体カルレチクリンタンパク質は、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択することができる。
【０２３８】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２３９】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４０】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４１】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４２】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４４】
突然変異対立遺伝子は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含みうる。
【０２４５】
遺伝子産物は、ｍＲＮＡでありうる。例えば、遺伝子産物は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端アミノ酸配列をコードするｍＲＮＡでありうる。
【０２４６】
したがって、遺伝子産物は、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含みうる。
【０２４７】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４８】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２４９】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５０】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５１】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５２】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５３】
前記遺伝子産物は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含みうる。
【０２５４】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５５】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５６】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５７】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５８】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２５９】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６０】
遺伝子産物は、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含みうる。
【０２６１】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６２】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６３】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６４】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６５】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６６】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６７】
遺伝子産物は、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含みうる。
【０２６８】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２６９】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２７０】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２７１】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２７２】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２７３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；および
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２７４】
遺伝子産物がｍＲＮＡである場合、前記ｍＲＮＡの存在または量は、リアルタイムＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、全トランスクリプトームショットガンシークエンシング（ＲＮＡｓｅｑ）、サンガーシークエンシング、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、またはマイクロアレイなど、日常的な技法により決定することができる。
【０２７５】
したがって、リアルタイムＰＣＲまたは逆転写酵素ＰＣＲなどのＰＣＲ法による決定は、
（ｉ）試料中の核酸を１つまたは２つのオリゴヌクレオチドと接触させるステップと、
（ｉｉ）標的配列を含有する増幅産物を生成するステップと
をさらに含みうる。
【０２７６】
本明細書では、例示的な突然変異特異的プローブおよびプライマーが提示および使用される。
【０２７７】
本発明に従い使用される、例示的なオリゴヌクレオチド（プライマー）は、
フォワード：ＡＣＡＡＣＴＴＣＣＴＣＡＴＣＡＣＣＡＡＣＧ（配列番号４３７）
および／または
リバース：ＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧ（配列番号４３８）
フォワード：ＧＧＣＡＡＧＧＣＣＣＴＧＡＧＧＴＧＴ（配列番号４３９）
および／または
リバース：ＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧ（配列番号４３８）
である。
【０２７８】
本発明における使用のための、さらに適する突然変異特異的プローブおよびプライマーは、例えば、突然変異させたカルレチクリン遺伝子のｃＤＮＡ配列から導出することができる。下記では、このようなｃＤＮＡ配列について提示および記載する。この文脈で使用しうる、例示的なｃＤＮＡ配列は、配列番号２、６、１０、１４、１８、２２、２６、３０、３４、３８、４２、４６、５０、５４、５８、６２、６６、７０、７４、７８、８２、８６、９０、９４、９８、１０２、１０６、１１０、１１４、１１８、１２２、１２６、１３０、１３４、１３８、１４２、１４６、１５０、１５４、１５８、１６２、１６６、１７０、１７４、１７８、１８２、１８６、１９０、１９４、１９８、２０２、２０６、２１０、２１４、２１８、２２２、２２６、２３０、２３４、２３８、２４２、２４６、２５０、２５４、２５８、２６２、２６６、２７０、２７４、２７８、２８２、または２８６；２９２、２９６、３００、３０４、３０８、３１２、３１６、３２０、３２４、３２８、３３２、３３６、３４０、３４４、３４８、３５２、３５６、３６０、３６４、３６８、３７２、３７６、３８０、３８４、３８８、３９２、３９６、４００、４０４、４０８、４１２、４１６、４２０、４２４、４２８、または４３２に示されている。
【０２７９】
突然変異特異的プローブおよびプライマーをデザインするために使用しうる、さらに例示的なｃＤＮＡ配列を、以下の表に表示する。
【０２８０】
【表１−１】
0006745220.tif 000002
【０２８１】
【表１−２】
0006745220.tif 000003
【０２８２】
以下は、遺伝子産物が、タンパク質／ポリペプチドである、実施形態に関する。
【０２８３】
遺伝子産物は、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含みうる。
【０２８４】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２８５】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２８６】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２８７】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２８８】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２８９】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２９０】
遺伝子産物は、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含みうる。
【０２９１】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドである、方法に関する。
【０２９２】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドである、方法に関する。
【０２９３】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドである、方法に関する。
【０２９４】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
からなる群から選択されるポリペプチドである、方法に関する。
【０２９５】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２９６】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２９７】
遺伝子産物は、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含みうる。
【０２９８】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０２９９】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３００】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０１】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０２】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０３】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０４】
遺伝子産物は、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含みうる。
【０３０５】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０６】
本発明は、患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、原発性骨髄線維症を患っているか、または原発性骨髄線維症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０７】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０８】
本発明は、患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、本態性血小板血症を患っているか、または本態性血小板血症を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３０９】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３１０】
本発明は、患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患っているか、または環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）を患いやすいと評価するステップと
を含み、
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；および
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、方法に関する。
【０３１１】
遺伝子産物が、タンパク質である場合、前記タンパク質の存在または量は、免疫組織化学（ＩＨＣ）、イムノアッセイ、ゲルもしくはブロットベースの方法、ＩＨＣ、質量分析、フローサイトメトリー、またはＦＡＣＳなど、日常的な技法により決定することができる。
【０３１２】
ＣＡＬＲ突然変異により、翻訳されるポリペプチドのフレームシフトが引き起こされるので、本明細書で記載および提示される、突然変異させたカルレチクリンタンパク質内には、特徴的なＣ末端アミノ酸配列が存在する。この特徴的なアミノ酸配列は、タンパク質の全体的な電荷を変化させる。この特徴的なアミノ酸配列はまた、タンパク質の電気泳動中に、突然変異させたカルレチクリンの泳動も変化させる。電荷および／または泳動挙動のこの差異を、突然変異させたカルレチクリンタンパク質の存在を決定するために利用することができる。例えば、突然変異体カルレチクリンタンパク質に特異的な抗体を使用して、例えば、ウェスタン免疫ブロット法により、前記突然変異体タンパク質を同定することができる。任意選択でまた、野生型カルレチクリンタンパク質に特異的な抗体も、（加えて）対照として使用することができる。このような抗体は、日常的な技法により調製されうる、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体を含みうる。
【０３１３】
患者は、ヒト患者であることが好ましい。患者は、骨髄性悪性腫瘍を患っていることが疑われる場合もあり、骨髄性悪性腫瘍を患いやすいことが疑われる場合もある。
【０３１４】
以下は、本発明に従い使用される試料に関する。試料は、骨髄試料、血液試料、または唾液試料でありうる。試料は、血液試料であることが好ましい。血液試料は、末梢顆粒球を含むことが好ましい。試料は、日常的な技法、例えば、生検により、患者から得ることができる。
【０３１５】
本明細書の上記で提示された方法は、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、患者に投与するステップをさらに含みうる。
【０３１６】
以下は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードするｃＤＮＡに関する。
【０３１７】
本発明は、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３１８】
本発明は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２、６、１０、１４、１８、２２、２６、３０、３４、３８、４２、４６、５０、５４、５８、６２、６６、７０、７４、７８、８２、８６、９０、９４、９８、１０２、１０６、１１０、１１４、１１８、１２２、１２６、１３０、１３４、１３８、または１４２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３１９】
本発明は、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４６、１５０、１５４、１５８、１６２、１６６、１７０、１７４、１７８、１８２、１８６、１９０、１９４、１９８、２０２、２０６、２１０、２１４、２１８、２２２、２２６、２３０、２３４、２３８、２４２、２４６、２５０、２５４、２５８、２６２、２６６、２７０、２７４、２７８、２８２、または２８６に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３２０】
本発明は、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９２、２９６、３００、３０４、３０８、３１２、３１６、３２０、３２４、３２８、３３２、３３６、３４０、３４４、３４８、３５２、３５６、３６０、３６４、３６８、３７２、３７６、３８０、３８４、３８８、３９２、３９６、４００、４０４、４０８、４１２、４１６、４２０、４２４、４２８、または４３２に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３２１】
上記で規定された核酸は、ｃＤＮＡであることが好ましい。
【０３２２】
以下は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードするｍＲＮＡに関する。
【０３２３】
本発明は、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３２４】
本発明は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３２５】
本発明は、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３２６】
本発明は、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３２７】
上記で規定された核酸は、ｍＲＮＡであることが好ましい。
【０３２８】
以下は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードするゲノムＤＮＡに関する。
【０３２９】
本発明は、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３３０】
本発明は、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、または１４１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３３１】
本発明は、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、または２８５に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３３２】
本発明は、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸に関する。
【０３３３】
上記で規定された核酸は、ゲノムＤＮＡであることが好ましい。
【０３３４】
以下は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質に関する。
【０３３５】
本発明は、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質に関する。
【０３３６】
本発明は、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質に関する。
【０３３７】
本発明は、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質に関する。
【０３３８】
本発明は、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質に関する。
【０３３９】
当技術分野では、「ポリペプチド」、「タンパク質」、および「核酸配列／分子」という用語の意味が周知であり、本発明の文脈に応じて使用される。例えば、本明細書で使用される「核酸配列／分子」とは、核酸および／または核酸配列／分子の、自然発生の種類または組換えにより生成された種類の全ての形態、ならびに化学合成された核酸配列／分子を指す。この用語はまた、核酸類似体および核酸誘導体も包含する。「核酸配列／分子」という用語は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）およびリボ核酸（ＲＮＡ）を指す場合がある。「核酸配列／分子」は、当業者に公知の合成化学的方法により作製することもでき、組換え技術の使用により作製することもでき、天然の供給源から単離することもでき、これらの組合せを介する場合もある。ＤＮＡおよびＲＮＡは、任意選択で、非天然のヌクレオチドを含むことが可能であり、一本鎖の場合もあり、二本鎖の場合もある。「核酸配列／分子」はまた、センスおよびアンチセンスＤＮＡならびにセンスおよびアンチセンスＲＮＡ、すなわち、ＤＮＡおよび／またはＲＮＡ内のヌクレオチドの特異的な配列と相補的なヌクレオチド配列も指す。さらに、「核酸配列／分子」という用語は、ＤＮＡもしくはＲＮＡまたはこれらのハイブリッド体あるいは現況技術で公知のこれらの任意の修飾（修飾の例については、例えば、ＵＳ５５２５７１１、ＵＳ４７１１９５５、ＵＳ５７９２６０８、またはＥＰ３０２１７５を参照されたい）を指す場合がある。核酸分子は、一本鎖の場合もあり、二本鎖の場合もあり、直鎖状の場合もあり、環状の場合もあり、天然の場合もあり、合成の場合もあり、いかなるサイズの限定も伴わない。例えば、核酸分子は、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ｍＲＮＡ、アンチセンスＲＮＡ、またはこのようなＲＮＡもしくはキメロプラストをコードするＤＮＡ（Colestrauss, Science (1996), 1386-1389）でありうる。前記核酸分子は、プラスミド、またはウイルスＤＮＡもしくはＲＮＡの形態でありうる。「核酸配列／分子」はまた、ホスホロチオエートまたはペプチド核酸（ＰＮＡ）など、現況技術の修飾のうちのいずれかを含むオリゴヌクレオチドも指す場合がある。
【０３４０】
当業者は、本明細書で提示されるヒト配列に対してある特定のレベルの同一性を伴う核酸配列を、当技術分野で公知の方法を使用して、例えば、ハイブリダイゼーションアッセイを使用することにより同定することもでき、アライメントを使用することにより同定することもでき、手作業で同定することもでき、「ハイブリダイゼーション」という用語の定義および相同性の程度との関連で、本明細書の下記で言及されるコンピュータプログラムなどのコンピュータプログラムを使用することにより同定することもできる。
【０３４１】
核酸配列は、配列番号１に示される核酸配列と、少なくとも７０％同一でありうる。より好ましくは、核酸配列は、配列番号１に示される核酸配列と、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％同一であり、高値が好ましい。最も好ましくは、核酸配列は、配列番号１に示される核酸配列と、少なくとも９９％同一である。
【０３４２】
核酸配列は、配列番号２に示される核酸配列と、少なくとも７０％同一でありうる。より好ましくは、核酸配列は、配列番号２に示される核酸配列と、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％同一であり、高値が好ましい。最も好ましくは、核酸配列は、配列番号２に示される核酸配列と、少なくとも９９％同一である。
【０３４３】
核酸配列は、配列番号３に示される核酸配列と、少なくとも７０％同一でありうる。より好ましくは、核酸配列は、配列番号３に示される核酸配列と、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％同一であり、高値が好ましい。最も好ましくは、核酸配列は、配列番号３に示される核酸配列と、少なくとも９９％同一である。
【０３４４】
核酸配列は、配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に示される核酸配列と、少なくとも７０％同一でありうる。
【０３４５】
より好ましくは、核酸配列は、配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に示される核酸配列と、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％同一であり、高値が好ましい。
【０３４６】
最も好ましくは、核酸配列は、配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に示される核酸配列と、少なくとも９９％同一である。
【０３４７】
当技術分野では、本明細書で提示される核酸配列に対してある特定のレベルの同一性を伴う核酸の特徴づけのためのハイブリダイゼーションアッセイが周知である（例えば、Sambrook, Russell "Molecular Cloning, A Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (2001)；Ausubel, "Current Protocols in Molecular Biology", Green Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y. (1989)を参照されたい）。本明細書で使用される「ハイブリダイゼーション」または「ハイブリダイズする」という用語は、厳密な条件下におけるハイブリダイゼーションに関する場合もあり、厳密でない条件下におけるハイブリダイゼーションに関する場合もある。さらに指定されない場合、条件は厳密でないことが好ましい。前記ハイブリダイゼーション条件は、例えば、Sambrook (2001) loc. cit.；Ausubel (1989) loc. cit.またはHiggins and Hames (Eds.) "Nucleic acid hybridization, a practical approach" IRL Press Oxford, Washington DC, (1985)において記載されている、従来のプロトコールに従い、確立することができる。条件の設定は、十分に当業者の技術の範囲内にあり、当技術分野で記載されているプロトコールに従い決定することができる。したがって、特異的にハイブリダイズする配列のみの検出は、通例、例えば、６５℃で０．１倍濃度のＳＳＣ、０．１％のＳＤＳ、または２倍濃度のＳＳＣ、６０℃、０．１％のＳＤＳの高度に厳密なハイブリダイゼーション条件など、厳密なハイブリダイゼーションおよび洗浄条件を要求する。相同な配列または正確には相補的でない配列の検出のための、低度に厳密なハイブリダイゼーション条件は、例えば、６５℃で、６倍濃度のＳＳＣ、１％のＳＤＳに設定することができる。周知の通り、プローブの長さおよび決定される核酸の組成は、ハイブリダイゼーション条件のさらなるパラメータを構成する。本明細書では、核酸は、プライマーまたはプローブ、例えば、本明細書の上記で規定および提示された、突然変異体カルレチクリン（または本明細書で規定されるその断片）の核酸、または突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする（またはそのＣ末端をコードする）核酸、または突然変異体カルレチクリンのエクソン９などの相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸でありうることが想定される。プライマーおよびプローブは、１０〜３０ヌクレオチドの範囲であることが多い。したがって、本発明は、本明細書の上記で規定および提示された、核酸突然変異体カルレチクリンの相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする（プライマーまたはプローブのような）核酸であって、５０、４９、４８、４７、４６、４５、４４、４３、４２、４１、４０、３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、または２０ヌクレオチドより短く、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５ヌクレオチドより長い、ハイブリダイズ核酸に関する。核酸は、１０〜３５ヌクレオチドの長さを有することが好ましく、より好ましくは１５〜２５ヌクレオチド、特に好ましくは１８〜２１、例えば、１８、１９、２０、または２１ヌクレオチドの長さである。
【０３４８】
本発明に従い、２つ以上の核酸配列の文脈における「相同性」もしくは「相同性パーセント」または「同一な」もしくは「同一性パーセント」または「同一性百分率」もしくは「配列同一性」という用語は、最大の対応について、比較域にわたり（好ましくは、全長にわたり）、または当技術分野で公知の配列比較アルゴリズムを使用して、もしくは手作業によるアライメントおよび目視により測定される指定領域にわたり、比較および整列した場合に、同じであるか、または指定された百分率の、同じである（少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、最も好ましくは、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％の同一性、最も好ましくは、少なくとも９９％の同一性）ヌクレオチドを有する２つ以上の配列または部分配列を指す。例えば、７５％〜９０％以上の配列同一性を有する配列は、実質的に同一であると考えることができる。このような定義はまた、被験配列の相補体にも適用される。好ましくは、記載された同一性は、少なくとも約１５〜２５ヌクレオチドの長さの領域にわたり、より好ましくは少なくとも約５０〜１００ヌクレオチドの長さの領域にわたり、最も好ましくは全長にわたり存在する。当業者は、例えば、当技術分野で公知の、ＣＬＵＳＴＡＬＷコンピュータプログラム（Thompson Nucl. Acids Res. 2 (1994), 4673-4680）またはＦＡＳＴＤＢ（Brutlag Comp. App. Biosci. 6 (1990), 237-245）に基づくアルゴリズムなどのアルゴリズムを使用して、配列間の同一性パーセントをどのようにして決定するのかに通じているであろう。
【０３４９】
ＦＡＳＴＤＢアルゴリズムでは、配列内部のマッチしない欠失または付加、すなわち、ギャップを、その計算において考慮しないことが典型的であるが、これは、手作業で補正して、同一性％の過大評価を回避することができる。しかし、ＣＬＵＳＴＡＬＷでは、配列のギャップを、その同一性の計算において考慮する。当業者にはまた、ＢＬＡＳＴおよびＢＬＡＳＴ  ２．０アルゴリズム（Altschul, (1997) Nucl. Acids Res. 25:3389-3402；Altschul (1993) J. Mol. Evol. 36:290-300；Altschul (1990) J. Mol. Biol. 215:403-410）も利用可能である。核酸配列のためのＢＬＡＳＴＮプログラムでは、ワード長（Ｗ）の１１、期待値（Ｅ）の１０、Ｍ＝５、Ｎ＝４、および両方の鎖の比較を、デフォルトとして使用する。ＢＬＯＳＵＭ６２スコアリング行列（Henikoff (1989) PNAS 89:10915）では、アライメント（Ｂ）の５０、期待値（Ｅ）の１０、Ｍ＝５、Ｎ＝４、および両方の鎖の比較を使用する。
【０３５０】
核酸配列内のヌクレオチド残基が、例えば、配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、および４３３のそれぞれのヌクレオチド配列内のある特定の位置に対応するかどうかを決定するために、当業者は、手作業で、または本明細書で言及されるコンピュータプログラムなどのコンピュータプログラムを使用することにより、当技術分野で周知の手段および方法、例えば、アライメントを使用することができる。例えば、基本局所的アライメント検索ツールＢＬＡＳＴを表すＢＬＡＳＴ  ２．０（Altschul (1997), loc. cit.；Altschul (1993), loc. cit.；Altschul (1990), loc. cit.）を使用して、局所的な配列アライメントを検索することができる。上記で論じたＢＬＡＳＴでは、ヌクレオチド配列のアライメントを作成して、配列類似性を決定する。アライメントの局所的な性格のために、ＢＬＡＳＴは、正確なマッチの決定または類似する配列の同定においてとりわけ有用である。ＢＬＡＳＴアルゴリズム出力の基礎単位は、高スコアセグメント対（ＨＳＰ）である。ＨＳＰは、任意ではあるが等しい長さの２つの配列断片であって、そのアライメントが、局所的に最大となり、そのアライメントスコアが、使用者により設定される閾値またはカットオフスコアを満たすかまたは超える、配列断片からなる。ＢＬＡＳＴ法は、クエリー配列とデータベース配列との間のＨＳＰを探索し、見出された任意のマッチの統計学的有意性を査定し、使用者により選択された有意性の閾値を満たすマッチだけを報告する。パラメータＥは、データベース配列とのマッチを報告するための、統計学的に有意な閾値を確立する。Ｅは、全データベース検索の文脈では、ＨＳＰ（またはＨＳＰのセット）の発生する可能性について期待される頻度の上界と解釈される。プログラム出力では、そのマッチがＥを満たす任意のデータベース配列が報告される。
【０３５１】
ＢＬＡＳＴを使用する類似のコンピュータ技法（Altschul (1997), loc. cit.；Altschul (1993), loc. cit.；Altschul (1990), loc. cit.）を使用して、ＧｅｎＢａｎｋまたはＥＭＢＬなどのヌクレオチドデータベース内の同一または類縁の分子を検索する。この解析は、複数回にわたる膜ベースのハイブリダイゼーションよりはるかに速い。加えて、コンピュータによる検索の感度を改変して、任意の特定のマッチが、正確なマッチとして類別されるのか、類似のマッチとして類別されるのかを決定することができる。検索の基盤は、
【０３５２】
【数１】
0006745220.tif 000004
として規定される積スコアであり、これにより、２つの配列の間の類似性の程度および配列マッチの長さの両方を考慮に入れる。例えば、積スコアを４０とすると、マッチは、１〜２％の誤差の範囲内で正確となり、７０とすると、マッチは、正確となろう。通例、１５〜４０の間の積スコアを示す分子を選択することにより、類似の分子が同定されるが、より低値のスコアでは、類縁の分子が同定されうる。配列アライメントを生成することが可能なプログラムの別の例は、当技術分野で公知の、ＣＬＵＳＴＡＬＷコンピュータプログラム（Thompson (1994) Nucl. Acids Res. 2:4673-4680）またはＦＡＳＴＤＢ（Brutlag (1990) Comp. App. Biosci. 6:237-245）である。
【０３５３】
下記で説明される通り、「核酸配列の相同性／同一性」について、本明細書の上記で与えられた説明および定義は、変更すべき点は変更して、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に表示される、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質の「アミノ酸配列」に適用される。
【０３５４】
本発明に従い使用されるポリペプチドは、例えば、配列番号４に表示されるアミノ酸配列を有するタンパク質に対して、少なくとも７０％の同一性／類似性を有しうる。より好ましくは、ポリペプチドは、配列番号４に表示されるタンパク質に対して、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％の同一性／類似性を有し、高値が好ましい。最も好ましくは、ポリペプチドは、配列番号４に表示されるタンパク質に対して、少なくとも９９％の相同性を有する。
【０３５５】
本発明に従い使用されるポリペプチドは、例えば、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に表示されるアミノ酸配列を有するタンパク質に対して、少なくとも７０％の同一性／類似性を有しうる。より好ましくは、ポリペプチドは、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に表示されるタンパク質に対して、少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、または９８％の同一性／類似性を有し、高値が好ましい。最も好ましくは、ポリペプチドは、それぞれ、４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に表示されるタンパク質に対して、少なくとも９９％の相同性を有する。
【０３５６】
本発明の要点から逸脱せずに述べると、本明細書で提示されるポリペプチドまたはタンパク質の（機能的な）断片または（機能的な）誘導体、例えば、配列番号４に示される突然変異体カルレチクリンの最小のＣ末端の（機能的な）断片または（機能的な）誘導体もまた使用することができる。さらに本明細書で提示される、突然変異体カルレチクリンのポリペプチドまたはタンパク質の（機能的な）断片または（機能的な）誘導体、例えば、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に示されるポリペプチドの（機能的な）断片または（機能的な）誘導体もまた使用することができる。
【０３５７】
したがって、本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上記のポリペプチド／タンパク質の（機能的な）断片は、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４のうちのいずれか１つに示される、上記の特異的なポリペプチドのうちのいずれかであって、１または複数のアミノ酸が欠失しているポリペプチドでありうる。
【０３５８】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上記のポリペプチド／タンパク質の（機能的な）誘導体は、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に示される、上記の特異的なポリペプチドのうちのいずれかであって、１または複数のアミノ酸が挿入され、付加され、または置換されているポリペプチドでありうる。
【０３５９】
好ましくは、１または複数のアミノ酸の欠失、挿入、付加、および／または置換は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンのＣ末端内、すなわち、配列番号４に示されるポリペプチドのアミノ酸配列内にある。
【０３６０】
好ましくは、１または複数のアミノ酸の欠失、挿入、付加、および／または置換は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンのＣ末端内、すなわち、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４に示されるポリペプチドのアミノ酸配列内にある。
【０３６１】
１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０アミノ酸を、好ましくは、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンのＣ末端内、すなわち、配列番号４に示されるポリペプチドのアミノ酸配列内で、欠失させるか、挿入するか、付加するか、または置換することができる。
【０３６２】
１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０アミノ酸を、好ましくは、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンのＣ末端から、すなわち、配列番号４に示されるポリペプチドのアミノ酸配列から、欠失させることができる。
【０３６３】
１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０アミノ酸を、好ましくは、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンのＣ末端内、すなわち、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４に示されるポリペプチドのアミノ酸配列内で、欠失させるか、挿入するか、付加するか、かつ／または置換することができる。
【０３６４】
「１または複数のアミノ酸が欠失した」という用語は、本明細書で提示される、特異的な突然変異体カルレチクリンタンパク質の（機能的な）断片に関する。
【０３６５】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの、好ましい（機能的な）断片は、１５〜２５の連続したアミノ酸からなる。したがって、本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。
【０３６６】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列のうちの１５〜２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。
【０３６７】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列のうちの１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。
【０３６８】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４に示されるポリペプチドのうちの１５〜２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。
【０３６９】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４に示されるポリペプチドのうちの１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。
【０３７０】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、および最大４２の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７１】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号３２または１１２に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、および最大４３の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７２】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号８、１２８、１３２、または１４４に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、および最大４４の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７３】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号１２、４４、１３６または１４０に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、および最大４５の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７４】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号１６または１２４に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、および最大４６の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７５】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号２４、４０、７６、１００または１２０に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、および最大４７の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７６】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号２８、３６、７２、８４、９６または１１６に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、および最大４８の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７７】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号２０、４８、６０、６４、６８または８０に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、および最大４９の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７８】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号５２または５６に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、および最大５０の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３７９】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号９２に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、および最大５２の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３８０】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号８８または１０４に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、および最大５３の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３８１】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの（機能的な）断片は、配列番号１０８に示されるアミノ酸配列のうちの少なくとも４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、および最大５４の連続したアミノ酸からなりうる。
【０３８２】
断片または誘導体は、それが由来する全長ポリペプチドと同じ（または本質的に同じ）生物学的活性を有することが好ましく、全長ポリペプチドは、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に示されるアミノ酸配列を有する。この意味で、断片または誘導体は、本明細書で使用される「機能的な」断片または誘導体である。
【０３８３】
本明細書で提示されるポリペプチド（例えば、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に示される）は、それが由来するポリペプチドに特徴的な生物学的活性を本質的に維持するという条件で、１または複数のアミノ酸を欠失させている場合もあり、挿入されている場合もあり、付加されている場合もあり、かつ／または置換されている場合もある。
【０３８４】
好ましくは、任意のこのような欠失、挿入、付加、および／または置換（この文脈では、特に、置換）は、保存的である、すなわち、アミノ酸は、同じまたは類似の特徴を有するアミノ酸で置換されている。例えば、疎水性のアミノ酸は、別の疎水性のアミノ酸などで置換することが好ましい。
【０３８５】
本明細書で提示されるポリペプチドに特徴的な「生物学的活性」は、骨髄増殖性新生物（特に、原発性骨髄線維症および本態性血小板血症）など、本明細書で規定される骨髄性悪性腫瘍（の発症）を引き起こす活性と考えることができる。
【０３８６】
本発明はまた、突然変異体カルレチクリンの阻害剤も提供する。これらの阻害剤は、医薬として使用することができる。
【０３８７】
「突然変異体カルレチクリンのアンタゴニスト」または「突然変異体カルレチクリンの阻害剤」という用語は、本発明の文脈では、突然変異体カルレチクリンの生理学的活性および／または発現レベルを、完全に、または部分的に、防止または低減することが可能な化合物を意味する。本明細書では、「アンタゴニスト」または「阻害剤」という用語を互換的に使用する。
【０３８８】
したがって、本発明の文脈では、前記アンタゴニストは、前記化合物／物質（すなわち、アンタゴニスト／阻害剤）が、前記突然変異体カルレチクリンに結合すると、突然変異体カルレチクリンの生理学的活性を防止、低減、阻害、または不活化しうる。本明細書で使用される「アンタゴニスト」という用語はまた、とりわけ、Mutschler, “Arzneimittelwirkungen”(1986), Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft mbH, Stuttgart, Germanyにおいて記載されている、競合的アンタゴニスト、（可逆的）非競合的アンタゴニスト、または非可逆的アンタゴニストも包含する。このような阻害は、基質回転を決定することにより測定することができる。
【０３８９】
突然変異体カルレチクリンの「アンタゴニスト」または「阻害剤」はまた、前記突然変異体カルレチクリンをコードする核酸分子の発現を防止／低減することにより、突然変異体カルレチクリンの機能を防止することが可能でもありうる。したがって、突然変異体カルレチクリンのアンタゴニスト／阻害剤は、突然変異体カルレチクリンの発現レベルの低下（例えば、突然変異体カルレチクリンｍＲＮＡおよび／または突然変異体カルレチクリンタンパク質のレベルの低下）をもたらすことが可能であり、これは、突然変異体カルレチクリン活性の低下に反映されうる。活性および／または発現レベルの低下は、本明細書でもまた記載される公知の方法により測定／検出することができる。
【０３９０】
「突然変異体カルレチクリンのアンタゴニスト／阻害剤」は、例えば、突然変異体カルレチクリン遺伝子の転写、遺伝子産物（例えば、スプライシングされていないか、または部分的にスプライシングされたｍＲＮＡ）のプロセシング（例えば、スプライシング、核からの移出など）、および／または遺伝子産物（例えば、成熟ｍＲＮＡ）の翻訳に干渉しうる。「突然変異体カルレチクリンのアンタゴニスト／阻害剤」はまた、突然変異体カルレチクリン遺伝子によりコードされるポリペプチド／タンパク質のさらなる修飾（グリコシル化またはリン酸化など）に干渉し、これにより、本明細書の上記で記載された突然変異体カルレチクリンタンパク質の活性を、完全に、または部分的に阻害することも可能である。さらに、「突然変異体カルレチクリンのアンタゴニスト／阻害剤」は、突然変異体カルレチクリンタンパク質の、他のタンパク質との相互作用に干渉する（したがって、例えば、突然変異体カルレチクリンタンパク質を伴う複合体の活性に干渉する）か、または、一般に、例えば、突然変異体カルレチクリン発現の上流のステップに干渉するか、もしくは突然変異体カルレチクリンが関与するシグナル伝達経路に干渉することにより、その合成に干渉することも可能である。作用方式に応じて、このようなアンタゴニストは、例えば、「隔離型アンタゴニスト」または「シグナル伝達型アンタゴニスト」と称することができる。
【０３９１】
まとめると、したがって、本明細書で記載される、突然変異体カルレチクリンアンタゴニスト／阻害剤は、突然変異体カルレチクリンの発現レベルおよび／または活性の低下または低減をもたらし、これにより、本明細書で規定される骨髄性悪性腫瘍の発症または増殖へのその寄与を低減するであろう。
【０３９２】
アンタゴニストは、ｓｈＲＮＡ（低分子ヘアピンＲＮＡ）、ｓｉＲＮＡ（低分子干渉ＲＮＡ）、ｍｉＲＮＡ（マイクロＲＮＡ）、ｄｓＲＮＡ（二本鎖ＲＮＡ）、ｓｔＲＮＡ（低分子一時的ＲＮＡ）、アンチセンス分子、細胞外結合パートナー、低分子（結合性）分子、アプタマー、イントラマー、または全長抗体（免疫グロブリン）、Ｆ（ａｂ）断片、Ｆ（ａｂ）２断片、単鎖抗体、キメラ抗体、ＣＤＲグラフト抗体、二価抗体構築物、合成抗体、二特異性単鎖抗体、または交差クローニング抗体などの抗体分子でありうる。
【０３９３】
本発明は、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸であって、とりわけ、本明細書で規定されるｍＲＮＡである核酸を特異的にターゲティングするｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡに関する。
【０３９４】
本明細書で提示されるｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡの連続した塩基のうちの最大１０％は、非相補的でありうる。ｓｉＲＮＡは、５’端における少なくとも１つの塩基および／または３’端における少なくとも１つの塩基をさらに含みうる。
【０３９５】
ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、アンチセンス分子などの核酸である、アンタゴニスト／阻害剤は、公知の技法により、例えば、以下の標的配列を使用して、たやすく調製することができる。例えば、本明細書で援用されるｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡなどは、下記の標的配列のうちの１つに対応するＲＮＡ配列を含むかまたはこれからなりうる。この文脈では、「〜に対応するＲＮＡ配列」という用語は、標的配列のチミジン（Ｔ）残基を、ウラシル（Ｕ）残基で置き換えることを除き、ＲＮＡ配列が、下記の標的配列のうちの１つと同一であることを意味する。ｓｉＲＮＡは、少なくとも１０の連続した塩基を含む核酸分子からなりうる。例えば、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡなどは、上記で規定された下記の標的配列のうちの１つに対応するＲＮＡ配列のうちの少なくとも１０の連続した塩基を含みうる。ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡなどは、上記で規定された下記の標的配列のうちの１つに対応するＲＮＡ配列のうちの１０の連続した塩基からなりうる。
【０３９６】
ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡなどは、下記の標的配列のうちの１つをターゲティングしうる。これらの配列は、配列番号４７６〜配列番号１３０９に関する。
【０３９７】
【表２−１】
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【０３９８】
【表２−２】
0006745220.tif 000006
【０３９９】
【表２−３】
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【０４００】
【表２−４】
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【０４０１】
【表２−５】
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【０４０２】
【表２−６】
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【０４０３】
【表２−７】
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【０４０４】
【表２−８】
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【０４０５】
【表２−９】
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【０４０６】
【表２−１０】
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【０４０７】
【表２−１１】
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【０４０８】
【表２−１２】
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【０４０９】
【表２−１３】
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【０４１０】
【表２−１４】
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【０４１１】
【表２−１５】
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【０４１２】
【表２−１６】
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【０４１３】
【表２−１７】
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【０４１４】
【表２−１８】
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【０４１５】
【表２−１９】
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【０４１６】
【表２−２０】
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【０４１７】
【表２−２１】
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【０４１８】
【表２−２２】
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【０４１９】
【表２−２３】
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【０４２０】
【表２−２４】
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【０４２１】
【表２−２５】
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【０４２２】
【表２−２６】
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【０４２３】
【表２−２７】
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【０４２４】
【表２−２８】
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【０４２５】
【表２−２９】
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【０４２６】
【表２−３０】
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【０４２７】
本明細書では、上記で提示された突然変異体カルレチクリンタンパク質に特異的に結合する抗体が想定される。このような抗体を、本発明に従い、診断および治療目的で使用することができる。例えば、突然変異させたカルレチクリンのＣ末端に固有のポリペプチドに対して作製された抗体は、骨髄性悪性腫瘍についての診断検査をもたらす。また、この固有のＣ末端に由来するペプチドの、質量分析による検出も、骨髄性悪性腫瘍についての診断検査をもたらす。好ましくは、このような抗体は、突然変異体カルレチクリンの阻害剤である。
【０４２８】
例えば、本明細書で使用される抗体は、以下の突然変異体カルレチクリンタンパク質であって、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に示されるタンパク質に特異的に結合しうる。特に、このような抗体は、突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端、例えば、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４に示されるタンパク質に特異的に結合しうる。
【０４２９】
本明細書では、抗体は、本明細書で規定される、突然変異体カルレチクリンタンパク質の（機能的な）断片または（機能的な）誘導体に特異的に結合することが可能であり、例えば、また、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質に対して、少なくとも７０％以上の同一性を有するポリペプチドにも結合しうることが想定される。
【０４３０】
したがって、本発明は、本発明の方法におけるこれらの抗体の使用に関する。したがって、本発明は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための、本明細書で記載され、提示される、突然変異体カルレチクリンタンパク質ポリペプチドのうちの１または複数に特異的に結合する、またはこれらを特異的に認識する、本明細書の上記で記載された１つ／複数の抗体の使用に関する。
【０４３１】
本発明はまた、本発明の方法における使用のための診断用キットを調製するための、上記で規定された１つ／複数の抗体、または前記１つ／複数の抗体を含む上記の組成物にも関する。
【０４３２】
抗体は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、全長抗体（免疫グロブリン）、Ｆ（ａｂ）断片、Ｆ（ａｂ）２断片、単鎖抗体、キメラ抗体、ＣＤＲグラフト抗体、二価抗体構築物、二特異性単鎖抗体、合成抗体、または交差クローニング抗体などでありうる。
【０４３３】
ポリクローナルもしくはモノクローナル抗体、または他の抗体（これらに由来する）は、とりわけ、標準的な免疫化プロトコールを使用して、日常的に調製することができる（Ed Harlow, David Lane, (December 1988), Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory；またはEd Harlow, David Lane, (December 1998), Portable Protocols (Using Antibodies): A Laboratory Manual 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratoryを参照されたい）。
【０４３４】
例えば、免疫化は、本明細書で規定される、突然変異体カルレチクリンタンパク質／ポリペプチド（および／または断片、アイソフォーム、相同体など）の、哺乳動物（例えば、マウス、ラット、ハムスターなどの齧歯動物）への腹腔内または皮下投与を伴いうる。好ましくは、突然変異体タンパク質／ポリペプチドの断片であって、好ましくは、本明細書で規定されるＣ末端（またはその断片）を保有する断片を使用する。
【０４３５】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチド（すなわち、突然変異体カルレチクリンタンパク質／ポリペプチド）の好ましい断片は、１５〜２５の連続したアミノ酸からなる。したがって、本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの断片は、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列のうちの１５〜２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。本明細書で提示され、本発明に従い使用される、上述のポリペプチドの断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列のうちの１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５の連続したアミノ酸からなることが好ましい。
【０４３６】
原理の実証として、断片（ＲＲＫＭＳＰＡＲＰＲＴＳＣＲＥＡＣＬＱＧＷＴＥＡ）を使用して、突然変異体カルレチクリン抗体に特異的に結合するポリクローナル抗体を生成した（実施例２を参照されたい）。この断片は、配列番号４に示されるアミノ酸配列のうちの２４の連続したアミノ酸からなる。これらのポリクローナル抗体は、研究用ツールとして使用することもでき、かつ／または本明細書で提示される診断法で使用することもできる。突然変異体カルレチクリンタンパク質のこの断片（または本明細書で提示および規定される他の断片）はまた、本明細書の下記でさらに記載される通り、ワクチンとしても使用することができる。
【０４３７】
当技術分野では、突然変異体ポリペプチドに特異的に結合するか、またはこれを特異的に認識する抗体の調製およびスクリーニングのための方法が公知である。例えば、突然変異体タンパク質を認識する抗体は、アフィニティー精製することができる。ＥＬＩＳＡは一般に、血清をスクリーニングし、かつ／またはアフィニティーカラム画分をアッセイするために使用される。ウェスタンブロットを使用して、抗体が、実際の目的のタンパク質を検出しうることを裏付け、抗体が、目的のタンパク質だけを認識するのか、他のタンパク質と交差反応するのかを査定することができる。
【０４３８】
当業者は、これらの文献の教示を、本発明の文脈で、本明細書で規定されるポリペプチドに特異的に結合するか、またはこれを特異的に認識する抗体の作製および検証に適用し、適応させることができる。
【０４３９】
以下は、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質の、ワクチンとしての使用に関する。したがって、突然変異体カルレチクリンタンパク質は、抗原として作用する。したがって、本明細書の以下では、「突然変異体カルレチクリンタンパク質」および「突然変異体カルレチクリンタンパク質抗原」などの用語を、互換的に使用することができる。
【０４４０】
上記に従い、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質を、ワクチンとして使用することができる。言い換えると、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質を、能動免疫化で使用することができる。したがって、本発明は、ワクチンとしての使用のための、本明細書で規定および提示される、突然変異体カルレチクリンタンパク質（または本明細書で規定および提示される、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸（またはこれらを含むベクター））に関する。突然変異体カルレチクリンタンパク質、それらの断片および誘導体については、本明細書の上記で極めて詳細に記載した。これらの説明および定義は、変更すべき点は変更して、この文脈に適用される。ワクチンとしては特に、それぞれ、配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４に示される本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質、ならびにそれらの断片のＣ末端を含むかまたはこれからなる、タンパク質が有用である。この文脈では、配列番号４に示される最小のＣ末端またはその断片を含むかまたはこれからなる、突然変異体カルレチクリンタンパク質が特に有用である。
【０４４１】
本発明は、ワクチンとしての使用のためのタンパク質であって、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、タンパク質に関する。
【０４４２】
本発明は、ワクチンとしての使用のためのタンパク質であって、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、タンパク質に関する。
【０４４３】
本発明は、本明細書の上記で規定された、ワクチンとしての使用のためのタンパク質であって、配列番号４に示されるタンパク質のうちの１５〜２５の連続したアミノ酸からなるタンパク質に関する。
【０４４４】
配列番号４に示されるタンパク質のうちの、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０アミノ酸を含むかまたはこれからなる配列番号４に示されるタンパク質の断片を、ワクチンとして使用することが好ましい。配列番号４に示されるタンパク質のうちの１５〜２５の連続したアミノ酸を含むかまたはこれからなる配列番号４に示されるタンパク質の断片が、ワクチンとしての使用のために特に好ましい。したがって、配列番号４に示されるタンパク質のうちの、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５の連続したアミノ酸を含むかまたはこれからなる配列番号４に示されるタンパク質の断片を、ワクチンとして使用する。
【０４４５】
配列番号４に示されるタンパク質のこのような断片または誘導体は、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）、ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ：bovine serum albumin）、または細菌トキソイド（例えば、破傷風トキソイド、ジフテリアトキソイド）などのタンパク質へとカップリングし、免疫化のために使用することができる。
【０４４６】
ワクチンは、本明細書で規定される骨髄性悪性腫瘍の処置において使用することができる。
【０４４７】
したがって、本発明は、本明細書で規定される、骨髄性悪性腫瘍の予防的または治療的処置のための方法であって、有効量の、本明細書の上記で規定されたワクチンを、患者に投与するステップを含む、方法に関する。言い換えると、本発明は、本明細書で規定される、骨髄性悪性腫瘍の予防的または治療的処置のための方法であって、有効量の、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質を、患者に投与するステップを含む、方法に関する。
【０４４８】
例えば、患者は通常、自己寛容のために、ＣＡＬＲには反応しないが、ＣＡＬＲのエクソン９突然変異の多くは、突然変異体ＣＡＬＲのＣ末端部分が、野生型と異なるようにフレームシフトを引き起こし、したがって、自己寛容下に置かれない。突然変異体ポリペプチドによる免疫化は、突然変異体ＣＡＬＲに対する免疫応答を発生させるであろう。したがって、ワクチンを治療的に使用して、既存のがんをターゲティングすることができる。
【０４４９】
ワクチンはまた、予防的に使用することもできるであろう。例えば、がんは、突然変異し、進化して、宿主の免疫応答および抗がん処置を回避しうることが公知である。したがって、ＣＡＬＲ突然変異を有さないか、または単一のＣＡＬＲ突然変異を有する、骨髄性悪性腫瘍を伴う患者は、後にさらなるＣＡＬＲ突然変異を発現させる可能性がある。したがって、他のＣＡＬＲ突然変異体形態に対する免疫化により、このようなＣＡＬＲ突然変異体を選択することができる。
【０４５０】
ＣＡＬＲ突然変異体はまた、患者の治療における使用のために、抗体を、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで、または別の動物において生成するのにも使用することができる。このような手法は、抗体を、患者において忍容されるエピトープに対して産生させうるため、特に有用である。このような抗体はまた、力価を正確に制御することができ、また、抗体を、ターゲティング療法のための毒素または放射性核種へとコンジュゲートさせることもできるため、治療にも有用である。
【０４５１】
能動免疫化の実施（または本明細書の上記で提示されたワクチンの使用）のための例示的なプロトコールを以下に記載する。
【０４５２】
例えば、突然変異体または野生型カルレチクリンを発現させる骨髄細胞を移植する前に、マウスを、ワクチン（例えば、配列番号４に示されるタンパク質に由来するペプチドまたは配列番号４に示されるタンパク質の断片であるペプチドであって、ＫＬＨまたはＢＳＡとカップリングさせたペプチド）で免疫化することができる。免疫化されたレシピエントマウスを、致死量未満でまたは致死量で照射して、生着を促進することもでき、全く照射しないでおくこともできる。移植された細胞は、突然変異させたカルレチクリンを発現させる細胞または野生型カルレチクリンを発現させる細胞の混合物でありうる。免疫化されたマウスを、移植後において追跡する。免疫応答が、突然変異体カルレチクリンを発現させる細胞に対して誘発されれば、生着は、好ましくは、野生型カルレチクリンを発現させる細胞について生じているであろう。免疫化を伴わない対照マウスを使用する。代替的に、免疫化は、マウスへの、野生型／突然変異させたカルレチクリンを発現させる細胞の５０：５０（または他の比による）混合物の生着後に実施することができる。免疫応答が、突然変異体カルレチクリンを発現させる細胞に対して誘発されれば、５０：５０の（または他の）比は、野生型カルレチクリンを発現させる細胞の側に変化するであろう。免疫化を伴わない対照マウスを、比較のために使用する。
【０４５３】
本発明は、本明細書で規定される骨髄性悪性腫瘍を処置または防止するためのワクチン組成物の製造のための、本明細書で提示され、本明細書の上記で規定された、抗原および任意選択でアジュバントとしての、突然変異体カルレチクリンタンパク質の使用に関する。
【０４５４】
突然変異体カルレチクリンタンパク質は、組換えにより作製する（すなわち、適切な宿主細胞内で産生させる）こともでき、合成する（すなわち、化学合成する）こともできる。本明細書では、突然変異体カルレチクリンタンパク質の組換えによる作製について記載する。例えば、組換えによる作製は、当技術分野で公知の、分子クローニングおよび組換え発現法のうちのいずれか１つを使用して達成することができる。例えば、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸分子を、細菌、酵母細胞（例えば、ピキア（Pichia）属細胞）、昆虫細胞、または哺乳動物細胞（例えば、ＣＨＯ細胞）など、適切な宿主細胞に導入することができる。コード核酸分子は、宿主細胞内の突然変異体カルレチクリンタンパク質抗原の発現を実行することが可能なプロモーターとの作動可能な連結下に置くことができる。宿主細胞により発現される突然変異体カルレチクリンタンパク質は、日常的なタンパク質精製法を使用してたやすく精製することができる。
【０４５５】
例えば、配列番号１、２、もしくは３に示されるヌクレオチド配列、または配列番号４に示される突然変異体カルレチクリンタンパク質抗原をコードする核酸配列、もしくは配列番号４に示されるタンパク質のうちの１５〜２５の連続したアミノ酸からなるタンパク質など、その断片をコードする核酸配列を、発現ベクター内でクローニングし、温度感受性のプロモーターとの作動可能な連結下に置くことができる。発現ベクターを、大腸菌（Escherichia coli）に導入し、熱を誘導して、抗原を発現させることができる。細胞を溶解させることができ、抗原が蓄積された封入体を、遠心分離により分離する。封入体内の組換えタンパク質を、ＳＤＳ、または尿素、グアニジン塩酸塩、コール酸ナトリウム、タウロコール酸ナトリウム、およびデオキシコール酸ナトリウムなど、当技術分野で公知の他の可溶化剤を使用して可溶化させる。本発明に従い、精製された組換え突然変異体カルレチクリンタンパク質を、薬学的に許容される担体と組み合わせて、ワクチン組成物を形成する。
【０４５６】
本発明は、患者における、骨髄性悪性腫瘍に対する防御を付与するための免疫原性組成物、突然変異体カルレチクリンタンパク質を含む組成物を提供する。組成物は、患者へのｉｎ  ｖｉｖｏ投与のためのワクチンとして調合することができる。組成物は、水酸化アルミニウムまたはリン酸アルミニウムなどのアジュバントを含みうる。
【０４５７】
さらに、本発明は、医薬としての使用のための、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質を含む免疫原性組成物を提供する。本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質を含む組成物は、宿主または患者を疾患骨髄性悪性腫瘍に対して免疫化するための医薬の製造のために使用することができる。
【０４５８】
本発明は、本明細書で規定される突然変異体カルレチクリンタンパク質抗原を含有するワクチン組成物（または「突然変異体カルレチクリンタンパク質ワクチン」）であって、患者への投与に適し、患者を骨髄性悪性腫瘍に対して防御することが可能な、ワクチン組成物を対象とする。
【０４５９】
「薬学的に許容される担体」という用語は、任意および全ての溶媒、分散媒、コーティング、アジュバント、安定化剤、希釈剤、保存剤、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤、吸収遅延剤などを含む。希釈剤は、水、生理食塩液、デキストロース、エタノール、グリセロールなどを含みうる。等張剤は、とりわけ、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトール、およびラクトースを含みうる。安定化剤は、とりわけ、アルブミンを含む。
【０４６０】
本発明に従うワクチン組成物中の使用に適するアジュバントは、無機塩、例えば、アラム、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、およびリン酸カルシウム；界面活性剤および微粒子、例えば、非イオン性ブロックポリマーによる界面活性剤（例えば、コレステロール）、ウィロソーム、サポニン（例えば、Ｑｕｉｌ  Ａ、ＱＳ−２１、およびＧＰＩ−０１００）、プロテオソーム、免疫刺激性複合体、コクリエート、第四級アミン（ジメチルジオクタデシルアンモニウムブロミド（ＤＤＡ））、アブリジン、ビタミンＡ、ビタミンＥ；ＲＩＢＩアジュバント系（Ｒｉｂｉ  Ｉｎｃ．）、マイコバクテリウム・フレイ（Mycobacterum phlei）の細胞壁骨格（Ｄｅｔｏｘ（登録商標））、ムラミルジペプチド（ＭＤＰ）およびムラミルトリペプチド（ＭＴＰ）、モノホスホリルリピドＡ、カルメット−ゲラン桿菌、易熱性大腸菌（E. coli）エンテロトキシン、コレラ毒素、トレハロースジミコレート、ＣｐＧオリゴデオキシヌクレオチドなどの細菌生成物；サイトカインおよびホルモン、例えば、インターロイキン（ＩＬ−１、ＩＬ−２、ＩＬ−６、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＩＬ−１８）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、デヒドロエピアンドロステロン、１，２５−ジヒドロキシビタミンＤ３；ポリアニオン、例えば、デキストラン；ポリアクリル（例えば、ポリメチルメタクリレート、Ｃａｒｂｏｐｏｌ  ９３４Ｐ）；担体、例えば、破傷風トキソイド、ジフテリアトキソイド、コレラ毒素Ｂサブユニット、腸管毒素原性大腸菌（E. coli）の突然変異体易熱性エンテロトキシン（ｒｍＬＴ）、熱ショックタンパク質；水中油エマルジョン、例えば、ＡＭＰＨＩＧＥＮ（登録商標）（Ｈｙｄｒｏｎｉｃｓ、ＵＳＡ）；ならびに、例えば、フロイント完全アジュバントおよびフロイント不完全アジュバントなどの油中水エマルジョンなど、複数のアジュバントクラスを含むがこれらに限定されない。
【０４６１】
本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質抗原と、薬学的に許容される担体とを、例えば、混合、溶解、懸濁、乳化、封入、吸着などにより、任意の好都合で実際的な様式で組み合わせて、ワクチン組成物を形成し、注射、植込み、吸入、服用などに適する錠剤、カプセル、粉末、シロップ、懸濁液などの処方物に作製することができる。ワクチンは、患者に、注射により、約０．１〜５ｍｌの用量で、または、好ましくは約０．５〜２．５ｍｌ、または、さらにより好ましくは約１ｍｌの用量で投与されうるように調合することが好ましい。適切な場合、本発明の医薬組成物は、周知の手順により無菌とすべきである。
【０４６２】
ワクチン中の本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質抗原の量は、免疫化に有効であるべきであり、一般に、投与１回当たり０．５〜１０００ｐｇの範囲にある。
【０４６３】
ワクチンにおける使用に適するアジュバントの量は、使用されるアジュバントの性格に依存する。例えば、Ｑｕｉｌ  Ａおよびコレステロールをアジュバントとして使用する場合、Ｑｕｉｌ  Ａは、一般に、投与１回当たり約１〜１０００ｐｇの量であり；コレステロールは、一般に、投与１回当たり約１〜１０００ｐｇの量である。
【０４６４】
本開示に従い、ワクチンは、経口、鼻腔内、経粘膜、局所、経皮、および非経口（例えば、静脈内、腹腔内、皮内、皮下または筋内）を含む、任意の公知の経路により投与することができる。投与はまた、無針送達デバイスを使用して達成することもできる。投与は、経路の組合せ、例えば、非経口経路を使用する初回投与と、経粘膜経路を使用する後続の投与とを使用して達成することができる。好ましい投与経路は、皮下および筋内投与を含む。
【０４６５】
本発明は、組合せワクチンおよびこのような組合せワクチンを投与することにより患者を防御するための方法を提供する。
【０４６６】
本発明は、本明細書の上記で規定および提示された、突然変異体カルレチクリンタンパク質である免疫原性作用物質を提供する。前記作用物質は、患者において、突然変異体カルレチクリンタンパク質に対する免疫原性応答を誘導するのに有効である。したがって、免疫原性作用物質は、本明細書で規定される骨髄性悪性腫瘍の処置または防止において使用することができる。
【０４６７】
さらに、本発明は、担体タンパク質に連結された免疫原性作用物質を含むコンジュゲートを提供する。免疫原性作用物質は、本明細書の上記で規定および提示された、突然変異体カルレチクリンタンパク質である。担体タンパク質（とりわけ、血清アルブミンなど）は、免疫応答を増強しうる。コンジュゲートは、担体タンパク質に融合させた免疫原性作用物質（すなわち、本明細書の上記で規定および提示された、突然変異体カルレチクリンタンパク質）を含む融合タンパク質でありうる。作用物質はまた、化学架橋により、担体タンパク質に連結することもできる。作用物質は、担体タンパク質のアミノ末端に連結するかまたは融合させることができる。作用物質は、担体タンパク質のカルボキシルに連結するかまたは融合させることができる。作用物質は、担体タンパク質の内部に連結するかまたは融合させることができる。融合タンパク質などのコンジュゲート内には、作用物質の複数のリピートまたは多量体が存在しうる。作用物質は、他のアミノ酸を伴う作用物質を含む長鎖のポリペプチドの一部でありうる。作用物質は、粒子の成分でありうる。粒子は、リポソームまたは微粒子でありうる。作用物質は、乳化させることもでき、リポソームまたは微粒子などの粒子内に封入することもできる。
【０４６８】
本明細書で提示される、突然変異させたカルレチクリンタンパク質内の固有のＣ末端ポリペプチドの存在は、野生型タンパク質を無傷のまま放置しながら、突然変異体タンパク質をターゲティングする可能性をもたらす。カルレチクリンエクソン９の−１リーディングフレームに由来するアミノ酸配列は、他のいかなる脊椎動物タンパク質との相同性も示さないペプチドをコードするので、治療効果を有する（抗体（好ましくは、阻害性抗体）、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、または低分子薬物のような）上記で規定された阻害剤を、これに対して生成することができる。例えば、突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端アミノ酸配列（エクソン９の代替的リーディングフレームに由来する突然変異体タンパク質など）を、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体（好ましくは、阻害性抗体）の作製のために使用することができる。したがって、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンは、骨髄性悪性腫瘍の免疫療法のための有益な標的である。代替的に、突然変異体ペプチドまたは組換え突然変異体タンパク質による患者の免疫化は、骨髄性悪性腫瘍の治療的介入で使用することができる。
【０４６９】
カルレチクリンは、細胞から分泌され、血清中で検出されうることが示されている。カルレチクリンはまた、細胞表面へとトラフィッキングされ、ここで、アポトーシス細胞の食作用のための「イートミーシグナル」を提示する。
【０４７０】
したがって、本発明は、医薬としての使用のための、突然変異体カルレチクリンの阻害剤を提供する。さらに、本発明は、医薬としての使用のための、本明細書で提示される突然変異体カルレチクリンタンパク質、これに特異的に結合する抗体（好ましくは、阻害性抗体）、本明細書で提示される核酸（特に、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸）、本明細書で提示されるｓｉＲＮＡに関する。本明細書では、「医薬」および「医薬組成物」という用語を互換的に使用する。したがって、「医薬組成物」に関して本明細書で提示される定義および説明は、変更すべき点は変更して、「医薬」という用語に適用される。
【０４７１】
本発明は、骨髄性悪性腫瘍の処置における使用のための、突然変異体カルレチクリンの阻害剤に関する。
【０４７２】
本発明は、骨髄性悪性腫瘍患者を処置するための方法であって、有効量の突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、患者に投与するステップを含む、方法を提供する。
【０４７３】
処置される患者は、本発明に従い「陽性」と評価された患者、すなわち、その試料が、カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子を存在させると決定されている患者でありうる。
【０４７４】
したがって、本発明は、骨髄性悪性腫瘍の処置における使用のための、突然変異体カルレチクリンの阻害剤であって、これにより、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすい患者を処置し、これにより、カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子（またはそれらの遺伝子産物）が、前記患者に由来する試料中に存在すると決定する阻害剤に関する。
【０４７５】
カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の（またはそれらの遺伝子産物の）、前記患者に由来する試料中の存在の決定に関して本明細書の上記で与えられた、全ての定義および説明は、変更すべき点は変更して、この文脈に適用される。
【０４７６】
本発明は、骨髄性悪性腫瘍患者を処置するための方法であって、有効量の突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、患者に投与するステップを含む、方法を提供し、その方法は、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップであって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の（またはそれらの遺伝子産物の）存在を決定することと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子（またはそれらの遺伝子産物）が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価することと
を含むステップをさらに含む。
【０４７７】
前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の（またはそれらの遺伝子産物の）存在の決定に関して本明細書の上記で与えられた、全ての定義および説明は、変更すべき点は変更して、この文脈に適用される。
【０４７８】
突然変異体カルレチクリンは、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質でありうる。突然変異体カルレチクリンが、突然変異体カルレチクリンタンパク質である場合、阻害剤は、抗体（好ましくは、阻害性抗体）、細胞外結合性パートナー、低分子結合性分子、アプタマー、またはイントラマーでありうる。
【０４７９】
突然変異体カルレチクリンは、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸でありうる。突然変異体カルレチクリンが、このような核酸（好ましくは、上記で提示および規定されたｍＲＮＡ）である場合、阻害剤は、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｄｓＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｔＲＮＡ、およびアンチセンス分子でありうる。
【０４８０】
上述の通り、骨髄性悪性腫瘍は、骨髄増殖性新生物または骨髄異形成症候群を含む。例示的な骨髄増殖性新生物は、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）である。本明細書では、骨髄増殖性新生物の治療、特に、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）の治療、または本態性血小板血症（ＥＴ）の治療が好ましい。本発明に従う治療的介入下に置かれる例示的な骨髄異形成症候群は、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）である。
【０４８１】
本明細書では、「処置」、「〜を処置すること」などの用語は一般に、所望の薬理学的および／または生理学的効果を得ることを意味するように使用される。効果は、疾患もしくはその症状を、完全に、もしくは部分的に、防止する点で予防的な場合もあり、かつ／または疾患および／もしくは疾患に帰せられる有害作用を、部分的に、もしくは完全に、治癒させる点で治療的な場合もある。本明細書で使用される「処置」という用語は、対象における疾患の任意の処置をカバーし、（ａ）疾患に対して素因がある可能性のある対象に関連する疾患を防止すること；（ｂ）疾患を阻害すること、すなわち、その発症を停止させること；または（ｃ）疾患を軽減すること、すなわち、疾患の退縮を引き起こすことを含む。
【０４８２】
本発明の目的での「個体」、「患者」、または「対象」は、ヒトおよび他の動物、特に、哺乳動物および他の生物の両方を含む。したがって、方法は、ヒトの治療および獣医学的適用の両方に適用可能である。好ましくは、「個体」、「患者」、または「対象」は、哺乳動物であり、最も好ましくは、「個体」、「患者」、または「対象」は、ヒトである。
【０４８３】
突然変異体カルレチクリンの阻害剤は、単一の薬剤として（すなわち、単剤療法の形態で）投与することもでき、例えば、ヒドロキシ尿素またはインターフェロンアルファ療法のような、従来の療法との組合せ療法の形態で投与することもできる。
【０４８４】
医薬組成物は、個々の患者の臨床状態、医薬組成物の送達部位、投与法、投与スケジュールの設定、および医療従事者に公知の他の因子を考慮に入れ、良質の医療のための原則（good medical practice）に合致する様式で、調合および投与されるものとする。したがって、本明細書の目的での医薬組成物の「有効量」は、このような検討事項により決定される。
【０４８５】
当業者には、個体に投与される医薬組成物の有効量は、とりわけ、化合物の性格に依存することが公知である。
【０４８６】
例えば、前記阻害剤が低分子である場合、経口投与される医薬組成物中の阻害剤の、投与１回当たりの全（薬学的）有効量は、患者１日当たり約５０ｍｇの阻害剤〜１日当たり１０００ｍｇの阻害剤の範囲となろうが、上記で言及した通り、これは、治療的判断の下に置かれる。より好ましくは、この用量は、１日当たり少なくとも５０ｍｇの阻害剤であり、最も好ましくは、ヒトでは、１日当たり約５０ｍｇ〜６００ｍｇの間の阻害剤である。例えば、阻害剤は、１日当たり体重１ｋｇ当たり１５ｍｇの用量で投与することができる。持続的に施される場合、阻害剤は、１日当たり約５０ｍｇ〜１日当たり約６００ｍｇの投与速度で投与することが典型的である。また、静脈内溶液バッグも援用することができる。変化を観察するのに必要とされる処置の長さ、および応答が生じるための処置後の間隔は、所望の効果に応じて変化すると考えられる。特定の量は、当業者に周知の従来の検査により決定することができる。
【０４８７】
本明細書で提示される組成物の投与は、とりわけ、毎日２回、毎日１回、隔日、３日ごと、４日ごと、５日ごと、毎週１回、２週間ごとに１回、３週間ごとに１回、１カ月ごとに１回の投与などを含みうる。
【０４８８】
例えば、前記化合物が、（ポリ）ペプチドまたはタンパク質である場合、非経口投与される医薬組成物の、投与１回当たりの全（薬学的）有効量は、患者の体重１ｋｇ当たり１日当たり約１μｇのタンパク質〜１ｋｇ当たり１日当たり１５ｍｇのタンパク質の範囲となろうが、上記で言及した通り、これは、治療的判断の下に置かれる。より好ましくは、この用量は、１ｋｇ当たり１日当たり少なくとも０．０１ｍｇのタンパク質であり、最も好ましくは、ヒトでは、１ｋｇ当たり１日当たり約０．０１〜１ｍｇの間のタンパク質である。持続的に施される場合、医薬組成物は、１日当たり１〜４回の注射により、または、例えば、ミニポンプを使用する持続皮下注入により、１ｋｇ当たり１時間当たり約１μｇ〜１ｋｇ当たり１時間当たり約５０μｇの投与速度で投与することが典型的である。また、静脈内溶液バッグも援用することができる。変化を観察するのに必要とされる処置の長さ、および応答が生じるための処置後の間隔は、所望の効果に応じて変化すると考えられる。特定の量は、当業者に周知の従来の検査により決定することができる。
【０４８９】
本発明の医薬組成物は、経口、直腸内、非経口、大槽内、膣内、腹腔内、局所（粉末、軟膏、点滴剤または経皮パッチによる）、口腔内投与することもでき、経口または経鼻スプレーとして投与することもできる。
【０４９０】
本発明の医薬組成物は、薬学的に許容される担体を含むことが好ましい。「薬学的に許容される担体」とは、非毒性の固体、半固体、または液体の、充填剤、希釈剤、封入材料、または任意の種類の処方物補助剤を意味する。本明細書で使用される「非経口」という用語は、静脈内、筋内、腹腔内、胸骨内、皮下、ならびに関節内注射および注入を含む投与方式を指す。
【０４９１】
医薬組成物はまた、持続放出系により、適切に投与される。持続放出型組成物の適切な例は、成型品、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルの形態の、半透性のポリマーマトリックスを含む。持続放出型マトリックスは、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号、ＥＰ５８，４８１）、Ｌ−グルタミン酸とガンマ−エチル−Ｌ−グルタメートとのコポリマー（Sidman, U. et al., Biopolymers 22:547-556 (1983)）、ポリ（２−ヒドロキシエチルメタクリレート）（R. Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277 (1981)、およびR. Langer, Chem. Tech. 12:98-105 (1982)）、エチレンビニルアセテート（R. Langer et al., Id.）またはポリ−Ｄ−（−）−３−ヒドロキシ酪酸（ＥＰ１３３，９８８）を含む。持続放出型医薬組成物はまた、リポソーム封入型化合物も含む。医薬組成物を含有するリポソームは、それ自体が公知の方法により調製される（ＤＥ３，２１８，１２１；Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 82:3688-3692 (1985)；Hwang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 77:4030-4034 (1980)；ＥＰ５２，３２２；ＥＰ３６，６７６；ＥＰ８８，０４６；ＥＰ１４３，９４９；ＥＰ１４２，６４１；日本特許出願第８３−１１８００８号；米国特許第４，４８５，０４５号および同第４，５４４，５４５号；ならびにＥＰ１０２，３２４）。通常、リポソームは、脂質含量が、約３０モルパーセントを超えるコレステロールである、小型（約２００〜８００オングストローム）の単層型であり、選択される比率は、最適の治療のために調整される。
【０４９２】
非経口投与では、医薬組成物は、一般に、それを、注射用単位剤形（溶液、懸濁液、またはエマルジョン）中に、所望の程度の純度で、薬学的に許容される担体、すなわち、レシピエントに対して、援用される投与量および濃度で非毒性であり、処方物の他の成分と適合性である担体と混合することにより調合される。
【０４９３】
一般に、処方物は、医薬組成物の成分を、液体担体もしくは微粒化された固体担体またはこれらの両方と、均一、かつ、緊密に接触させることにより調製される。次いで、必要な場合、生成物を、所望の処方物に成型する。好ましくは、担体は、非経口担体、より好ましくは、レシピエントの血液と等張性の溶液である。このような担体媒体の例は、水、生理食塩液、リンゲル液、およびデキストロース溶液を含む。本明細書ではまた、固定油およびオレイン酸エチルなどの非水性媒体も、リポソームと同様に有用である。担体は、等張性および化学的安定性を増強する物質など、少量の添加剤を含有すると適切である。このような材料は、レシピエントに対して、援用される投与量および濃度で非毒性であり、リン酸、クエン酸、コハク酸、酢酸、および他の有機酸、もしくはこれらの塩などの緩衝剤；アスコルビン酸などの抗酸化剤；低分子量（約１０残基未満）の（ポリ）ペプチド、例えば、ポリアルギニンもしくはトリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなどのタンパク質；ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー；グリシン、グルタミン酸、アスパラギン酸、もしくはアルギニンなどのアミノ酸；セルロースもしくはその誘導体、グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む、単糖、二糖、および他の炭水化物；ＥＤＴＡなどのキレート化剤；マンニトールもしくはソルビトールなどの糖アルコール；ナトリウムなどの対イオン；ならびに／またはポリソルベート、ポロキサマー、もしくはＰＥＧなどの非イオン性界面活性剤を含む。
【０４９４】
治療的投与のために使用される医薬組成物の成分は、無菌でなければならない。無菌性は、滅菌濾過膜（例えば、０．２ミクロンの膜）を通す濾過により、たやすく達成される。医薬組成物の治療用成分は、一般に、無菌のアクセスポートを有する容器、例えば、皮下注射針により穿刺可能な止栓を有する、静脈内溶液バッグまたはバイアルに入れられる。
【０４９５】
医薬組成物の成分は、通常、単位用量容器または複数回用量容器内、例えば、密封されたアンプル内またはバイアル内に、水溶液または再構成のための凍結乾燥処方物として保存される。凍結乾燥処方物の例として述べると、１０ｍｌのバイアルを、滅菌濾過された１％（ｗ／ｖ）の水溶液５ｍｌで満たし、結果として得られる混合物を凍結乾燥させる。注入溶液は、注射用静菌水を使用して、凍結乾燥化合物を再構成することにより調製される。
【０４９６】
真性赤血球増加症のための処置の目的は、過剰な血液細胞の数を低減することである。真性赤血球増加症の処置は、静脈切開術、静脈切開術を伴うかまたは伴わない化学療法、インターフェロンアルファまたはＰＥＧ化インターフェロンアルファおよび低用量のアスピリンを使用する生物学的療法を含みうる。
【０４９７】
徴候も症状も伴わない患者における原発性骨髄線維症の処置は通例、注意深い待機である。原発性骨髄線維症を伴う患者は、貧血の徴候または症状を有しうる。貧血は通例、症状を軽減し、生活の質を改善するように、赤血球の注入で処置する。加えて、貧血は、赤血球形成性増殖因子、プレドニゾン、ダナゾール、サリドマイド、レナリドミド、またはポマリドミドで処置することができる。他の徴候または症状を伴う患者における、原発性骨髄線維症の処置は、ルキソリチニブ（ＪＡＫ１およびＪＡＫ２の阻害剤）によるターゲティング療法、化学療法、ドナー幹細胞移植、サリドマイド、レナリドミド、またはポマリドミド、脾臓摘出、脾臓、リンパ節、もしくは骨髄外の他の領域であって、血液細胞が形成されつつある領域に対する放射線療法、インターフェロンアルファもしくは赤血球形成性増殖因子を使用する生物学的療法、または他のターゲティング療法薬の臨床試験への組入れを含みうる。
【０４９８】
徴候も症状も有さず、許容可能な血小板カウントを有する、６０歳より若齢の患者における、本態性血小板血症の処置は通例、注意深い待機である。場合によって、患者は、アスピリンを服用して、血栓を防止する一助とすることができる。他の患者の処置は、化学療法、ヒドロキシ尿素、アナグレリド療法、インターフェロンアルファまたはＰＥＧ化インターフェロンアルファを使用する生物学的療法、血小板アフェレーシスを含みうる。
【０４９９】
ＪＡＫ結合阻害剤であるルキソリチニブは、治癒処置および支持処置への有望性を示す。ルキソリチニブは、米国食品医薬品局により、高度および中等度の危険性の骨髄線維症の処置における使用について、２０１１年に承認されている（Tefferi March 22, 2012; Blood: 119 (12)を参照されたい）。また、Ostojicは、ルキソリチニブが、骨髄線維症の治療において使用されることについて報告している（Ostojic Therapeutics and Clinical Risk Management 2012:8 95-103を参照されたい）。
【０５００】
骨髄増殖性新生物についての臨床試験で現在使用されているＪＡＫ阻害剤は、ルキソリチニブのほかに、ＳＡＲ３０２５０３、ＣＹＴ３８７、レスタウルチニブ、ＳＢ１５１８、ＡＺＤ１４８０、ＢＭＳ９１１５４３、ＬＹ２７８４５４４、ＮＳ−０１８、およびＸＬ０１９を含む（Tefferi March 22, 2012; Blood: 119 (12)を参照されたい）。
【０５０１】
ルキソリチニブ（（３Ｒ）−３−シクロペンチル−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）ピラゾール−１−イル］プロパンニトリル；商品名：Ｊａｋａｆｉ、Ｊａｋａｖｉ）の例示的な式を、以下に示す：
【０５０２】
【化１】
0006745220.tif 000035
【０５０３】
環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症は、輸血および貧血を改善する他の支持療法であって、高用量のピロドキシン（ビタミンＢ６）を含む支持療法を要求する場合がある。また、骨髄移植も、選択肢である。ＲＡＲＳ−Ｔはまた、白血病に進行する場合がある。
【０５０４】
上記の療法の使用は、本発明に従う突然変異体カルレチクリンの存在について陽性または陰性と診断された患者のために、単独で、または突然変異体カルレチクリンを特異的にターゲティングする療法（例えば、抗体）との組合せで想定される。したがって、突然変異体ＣＡＬＲをターゲティングする療法（例えば、抗体）も同様に、単剤療法として、または他の療法と組み合わせて使用する場合、処置において有用でありうる。例えば、インターフェロンアルファ療法を使用して、本発明に従う突然変異体カルレチクリンの存在について陽性と診断された、（本態性血小板血症患者のような）ＭＰＮを伴う患者を処置することができる。
【０５０５】
例えば、患者が、検査で、突然変異体カルレチクリンおよびＪＡＫ２突然変異の存在について陽性とされた場合、本明細書では、（ルキソリチニブのような）ＪＡＫ阻害剤の使用が想定される。臨床パラメータ（例えば、患者の年齢、予後）に応じて、例えば、検査で突然変異体カルレチクリンの存在について陽性とされた患者を処置するのに、幹細胞移植のような、さらなる療法もまた使用することができる。
【０５０６】
本明細書では、本発明に従う使用のための阻害剤が記載および提示される。本発明の文脈ではまた、まだ生成されていない阻害剤、またはそれらの阻害活性について検査される公知の化合物の使用も想定される。
【０５０７】
したがって、本発明は、本明細書で規定および提示される、突然変異体カルレチクリンの阻害剤であることが疑われる候補分子の活性を評価するための方法であって、
（ａ）突然変異体カルレチクリンを含む細胞、組織、または非ヒト動物を前記候補分子と接触させるステップと、
（ｂ）前記突然変異体カルレチクリンの活性の低下を検出するステップと、
（ｃ）前記突然変異体カルレチクリンの活性を低下させる候補分子を選択するステップと
を含み、
活性の低下により、選択された分子が、本明細書で規定される、骨髄性悪性腫瘍の処置において有用となる能力が示される、方法を提供する。
【０５０８】
また、（発現）レベルの低下も、有用な阻害剤を指し示しうる。
【０５０９】
本発明は、本明細書で規定および提示される、突然変異体カルレチクリンの阻害剤であることが疑われる候補分子の活性を評価するための方法であって、
（ａ）突然変異体カルレチクリンを含む細胞、組織、または非ヒト動物を前記候補分子と接触させるステップと、
（ｂ）前記突然変異体カルレチクリンの（発現）レベルの低下を検出するステップと、
（ｃ）前記突然変異体カルレチクリンの（発現）レベルを低下させる候補分子を選択するステップと
を含み、
（発現）レベルの低下により、選択された分子が、本明細書で規定される、骨髄性悪性腫瘍の処置において有用となる能力が示される、方法に関する。
【０５１０】
突然変異体カルレチクリンは、本明細書の上記で規定された突然変異体カルレチクリンタンパク質／ポリペプチドのうちのいずれか、または本明細書で規定される核酸（特に、ｍＲＮＡ）であって、突然変異体カルレチクリンタンパク質／ポリペプチドをコードする核酸のうちのいずれかでありうる。
【０５１１】
突然変異体カルレチクリンタンパク質は、それぞれ、４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、および４３４に示されるポリペプチドのアミノ酸配列を含むかまたはこれからなりうる。この文脈ではまた、上記で規定されたこれらのタンパク質の断片または誘導体の使用も想定される。
【０５１２】
突然変異体カルレチクリン核酸は、それぞれ、１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、および４３３に示される核酸を含むかまたはこれからなりうる。
【０５１３】
さらに、本発明は、本発明の方法のために、すなわち、患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するために、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を検出することが可能な、核酸（例えば、下記で記載される、プライマー／プライマー対またはプローブのようなオリゴヌクレオチド）または抗体の使用を提供する。
【０５１４】
オリゴヌクレオチドは、約１５〜１００ヌクレオチドの長さでありうる。当業者は、自らの一般的な知見および本明細書で提示される教示に基づき、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を検出することが可能な、オリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを同定および／または調製することが容易である。これらのオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチドは、本明細書で提示される方法における、プローブまたはプライマーとして使用することができる。プライマーおよび／またはプローブは、１０〜３０ヌクレオチドの長さを有することが多い。したがって、本発明は、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を検出することが可能な核酸（特に、プライマーまたはプローブ）であって、５０、４９、４８、４７、４６、４５、４４、４３、４２、４１、４０、３９、３８、３７、３６、３５、３４、３３、３２、３１、３０、２９、２８、２７、２６、２５、２４、２３、２２、２１、または２０ヌクレオチドより短く、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５ヌクレオチドより長い、核酸に関する。核酸は、１０〜３５ヌクレオチドの長さを有することが好ましく、より好ましくは１５〜２５ヌクレオチド、特に好ましくは１８〜２１、例えば、１８、１９、２０、または２１ヌクレオチドの長さである。これらの核酸は、厳密な条件下で、本明細書の上記で規定および提示された、核酸突然変異体カルレチクリンの相補鎖とハイブリダイズしうる。
【０５１５】
当業者は、例えば、対応するプローブ／プライマーの同定に有用でありうるコンピュータプログラムが、本明細書で使用されることを知るであろう。例えば、本明細書で開示される、例示的なコード配列の核酸配列（それぞれ、配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、および４３３）は、この文脈で使用することができる。
【０５１６】
また、以下の表で開示される配列も、この文脈で使用することができる。
【０５１７】
【表３】
0006745220.tif 000036
【０５１８】
本明細書で提示され、本発明に従い使用される、例示的なオリゴヌクレオチド（プライマー）は、
フォワード：ＡＣＡＡＣＴＴＣＣＴＣＡＴＣＡＣＣＡＡＣＧ（配列番号４３７）
および／または
リバース：ＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧ（配列番号４３８）
フォワード：ＧＧＣＡＡＧＧＣＣＣＴＧＡＧＧＴＧＴ（配列番号４３９）
および／または
リバース：ＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧ（配列番号４３８）
である。
【０５１９】
一実施形態では、本発明は、本明細書で記載および説明される核酸を有する、トランスジェニック細胞または非ヒトトランスジェニック動物（またはこれを含むベクター）、例えば、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の少なくとも１つまたは複数の突然変異対立遺伝子を含む核酸に関する。このようなトランスジェニック細胞または非ヒトトランスジェニック動物を、骨髄性悪性腫瘍の処置のための医薬のスクリーニングおよび／または検証に使用することができる。
【０５２０】
この文脈で使用される「細胞」という用語はまた、複数の細胞のほか、組織内に含まれる細胞も含みうる。スクリーニングまたは検証法で使用される細胞は、骨髄性悪性腫瘍を患っている非ヒト（トランスジェニック）動物またはヒトに由来する試料から得ることができる。腫瘍細胞または細胞はまた、患者試料（例えば、生検）、特に、骨髄性悪性腫瘍を患っている患者／対象に由来する１つ／複数の生検からも得ることができる。したがって、細胞は、ヒト細胞でありうる。ここでもまた、本スクリーニングまたは検証法で使用されるこのような細胞は、組織内、または試料生検のような組織試料中に含まれうる。
【０５２１】
使用される非ヒト動物または細胞は、トランスジェニックの場合もあり、非トランスジェニックの場合もある。この文脈における「トランスジェニック」とは、特に、本明細書で記載または規定される突然変異体カルレチクリンのうちの少なくとも１つを（過剰）発現させていること、および／または突然変異体カルレチクリンのうちの少なくとも１つの活性が存在する（またはこれを増大させている）ことを意味する。
【０５２２】
本発明の文脈における、好ましい非ヒト（トランスジェニック）動物または（トランスジェニック）細胞は、骨髄性悪性腫瘍を患っている。
【０５２３】
本明細書で使用される「非ヒトトランスジェニック動物」または「トランスジェニック細胞」という用語は、ヒト以外の非ヒト動物または細胞であって、対応する野生型動物／細胞の遺伝子材料とは異なる遺伝子材料を含む、動物または細胞を指す。この文脈における「遺伝子材料」は、任意の種類の核酸分子またはその類似体、例えば、本明細書で規定される核酸分子またはその類似体でありうる。この文脈における「異なる」とは、野生型動物／細胞のゲノムに照らして、付加的であるかもしくは僅少な遺伝子材料、および／または再配列された遺伝子材料、すなわち、野生型動物／細胞のゲノムに照らして、ゲノムの異なる遺伝子座に存在する遺伝子材料を意味する。トランスジェニック細胞／動物を生成するために使用される、異なる発現系の例についての概観は、例えば、Methods in Enzymology 153 (1987), 385-516、Bitter et al. (Methods in Enzymology 153 (1987), 516-544)、およびSawers et al. (Applied Microbiology and Biotechnology 46 (1996), 1-9)、Billman-Jacobe (Current Opinion in Biotechnology 7 (1996), 500-4)、Hockney (Trends in Biotechnology 12 (1994), 456-463)、Griffiths et al., (Methods in Molecular Biology 75 (1997), 427-440)に収載されている。
【０５２４】
好ましい実施形態では、非ヒト（トランスジェニック）動物または（トランスジェニック）細胞は、哺乳動物であるか、または哺乳動物から導出される。非ヒト（トランスジェニック）動物または導出された（トランスジェニック）細胞の非限定的な例は、マウス、ラット、ウサギ、およびモルモットからなる群から選択される。
【０５２５】
本発明はまた、本発明の核酸分子を含むベクターにも関する。
【０５２６】
分子生物学の当業者には、多くの適切なベクターであって、その選択が、所望の機能に依存し、プラスミド、コスミド、ウイルス、バクテリオファージおよび遺伝子操作で従来使用されている他のベクターを含む、ベクターが公知である。当業者に周知の方法を使用して、多様なプラスミドおよびベクターを構築することができる。例えば、Sambrook et al. (loc cit.)およびAusubel, Current Protocols in Molecular Biology, Green Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y. (1989), (1994)において記載されている技法を参照されたい。代替的に、本発明のポリヌクレオチドおよびベクターは、標的細胞への送達のために、リポソームに再構成することができる。下記でさらに詳細に論じられる通り、クローニングベクターを使用して、ＤＮＡの個々の配列を単離した。関与性の配列は、特定のポリペプチドの発現が要求される発現ベクターに導入することができる。典型的なクローニングベクターは、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ  ＳＫ、ｐＧＥＭ、ｐＵＣ９、ｐＢＲ３２２、およびｐＧＢＴ９を含む。典型的な発現ベクターは、ｐＴＲＥ、ｐＣＡＬ−ｎ−ＥＫ、ｐＥＳＰ−１、ｐＯＰ１３ＣＡＴを含む。
【０５２７】
好ましくは、前記ベクターは、本明細書で規定される前記核酸配列に作動可能に連結された調節配列である、核酸配列を含む。
【０５２８】
「調節配列」という用語は、それらがライゲーションされたコード配列の発現を実行するのに必要な、ＤＮＡ配列を指す。このような制御配列の性格は、宿主生物に応じて異なる。原核生物では、制御配列は一般に、プロモーター、リボソーム結合性部位、およびターミネーターを含む。真核生物では一般に、制御配列は、プロモーター、ターミネーター、および、場合によって、エンハンサー、トランス活性化因子、または転写因子を含む。「制御配列」という用語は、最小限でも、それらの存在が発現に必要な全ての成分を含むことを意図し、また、さらなる有利な成分も含みうる。
【０５２９】
「作動可能に連結された」という用語は、そのように記載された成分が、それらの意図される様式で機能することを可能とする関係にある並置を指す。コード配列に「作動可能に連結された」制御配列は、コード配列の発現が、制御配列に適合する条件下で達成されるような様式でライゲーションされている。制御配列がプロモーターである場合、当業者には、二本鎖核酸を使用すると好ましいことが明らかである。
【０５３０】
したがって、言及されたベクターは、発現ベクターであることが好ましい。「発現ベクター」とは、選択された宿主を形質転換し、選択された宿主内のコード配列の発現をもたらすのに使用しうる構築物である。発現ベクターは、例えば、クローニングベクター、バイナリーベクター、または組込みベクターでありうる。発現は、核酸分子の、好ましくは、翻訳可能なｍＲＮＡへの転写を含む。当業者には、原核細胞および／または真核細胞内の発現を確保する調節エレメントが周知である。真核細胞の場合、それらは通常、転写の開始を確保するプロモーターと、任意選択で、転写の終結および転写物の安定化を確保するポリＡシグナルとを含む。原核宿主細胞内の発現を可能とする、可能な調節エレメントは、例えば、大腸菌（E. coli）内のＰＬ、ｌａｃ、ｔｒｐ、またはｔａｃプロモーターを含み、真核宿主細胞内の発現を可能とする調節エレメントの例は、酵母内のＡＯＸ１もしくはＧＡＬ１プロモーター、または哺乳動物および他の動物細胞内の、ＣＭＶ、ＳＶ４０、ＲＳＶプロモーター（ラウス肉腫ウイルス）、ＣＭＶエンハンサー、ＳＶ４０エンハンサー、もしくはグロビンイントロンである。
【０５３１】
転写の開始の一因となるエレメントのほか、このような調節エレメントはまた、ポリヌクレオチドの下流の、ＳＶ４０−ポリＡ部位またはｔｋ−ポリＡ部位などの転写終結シグナルも含みうる。さらに、使用される発現系に応じて、ポリペプチドを細胞内区画へと方向付ける、またはそれを培地に分泌することが可能なリーダー配列を、言及された核酸配列のコード配列に付加することができ、当技術分野では、これらが周知であるが、付属の実施例もまた、参照されたい。リーダー配列は、翻訳、開始、および終結配列と適当な相でアセンブルされ、翻訳されたタンパク質またはその部分の、ペリプラズム腔または細胞外培地への分泌を方向付けることが可能であることが好ましいリーダー配列である。任意選択で、異種配列は、所望の特徴、例えば、発現させた組換え産物の安定化またはその精製の簡略化を付与するＮ末端同定ペプチドを含む融合タンパク質をコードすることが可能である（前出を参照されたい）。当技術分野では、岡山−バーグｃＤＮＡ発現ベクターであるｐｃＤＶ１（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）、ｐＣＤＭ８、ｐＲｃ／ＣＭＶ、ｐｃＤＮＡ１、ｐｃＤＮＡ３（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ｐＥＦ−ＤＨＦＲ、ｐＥＦ−ＡＤＡまたはｐＥＦ−ｎｅｏ（Mack et al. PNAS (1995) 92, 7021-7025；およびRaum et al. Cancer Immunol Immunother (2001) 50 (3), 141-150）またはｐＳＰＯＲＴ１（ＧＩＢＣＯ  ＢＲＬ）など、この文脈で適切な発現ベクターが公知である。
【０５３２】
発現制御配列は、真核宿主細胞を形質転換するか、またはこれらにトランスフェクトすることが可能なベクター内の真核プロモーター系であることが好ましかろうが、原核生物宿主のための制御配列も使用することができる。ベクターを適切な宿主へと組み込んだら、宿主を、ヌクレオチド配列の高レベルの発現に適する条件下で維持し、所望の場合、本発明のポリペプチドの回収および精製を後続させることができる（例えば、付属の実施例を参照されたい）。
【０５３３】
細胞周期相互作用性タンパク質を発現させるのに使用しうる、代替的な発現系は、昆虫系である。１つのこのような系では、アウトグラファ・カリフォルニカ（Autographa californica）核多角体病ウイルス（ＡｃＮＰＶ）を、ツマジロクサヨトウ（Spodoptera frugiperda）細胞内またはトリコプルシア・ラルバエ（Trichoplusia larvae）内で外来遺伝子を発現させるベクターとして使用する。言及された核酸分子のコード配列は、ポリヘドリン遺伝子など、ウイルスの可欠領域にクローニングし、ポリヘドリンプロモーターの制御下に置くことができる。前記コード配列の挿入が成功すれば、ポリヘドリン遺伝子は不活性とされ、コートタンパク質を欠く組換えウイルスが産生される。次いで、組換えウイルスを使用して、ツマジロクサヨトウ（S. frugiperda）細胞またはトリコプルシア・ラルバエ（Trichoplusia larvae）に感染させ、ここで、本発明のタンパク質を発現させる（Smith, J. Virol. 46 (1983), 584；Engelhard, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 91 (1994), 3224-3227）。
【０５３４】
さらなる調節エレメントは、転写ならびに翻訳エンハンサーを含みうる。上記で記載された本発明のベクターは、選択および／または評定マーカーを含むと有利である。
【０５３５】
形質転換された細胞の選択に有用な選択マーカー遺伝子は、当業者に周知であり、例えば、ｄｈｆｒについての選択の基盤としての代謝拮抗剤耐性であって、メトトレキサートに対する耐性を付与する代謝拮抗剤耐性（Reiss, Plant Physiol. (Life Sci. Adv.) 13 (1994), 143-149）；アミノグリコシドであるネオマイシン、カナマイシン、およびパロマイシンに対する耐性を付与するｎｐｔ（Herrera-Estrella, EMBO J. 2 (1983), 987-995）；ならびにハイグロマイシンに対する耐性を付与するｈｙｇｒｏ（Marsh, Gene 32 (1984), 481-485）を含む。さらなる選択遺伝子、すなわち、細胞がトリプトファンの代わりにインドールを使用することを可能にするｔｒｐＢ；細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノールを使用することを可能にするｈｉｓＤ（Hartman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 (1988), 8047）；細胞がマンノースを使用することを可能にするマンノース−６−リン酸イソメラーゼ（ＷＯ９４／２０６２７）；およびオルニチンデカルボキシラーゼ阻害剤である、２−（ジフルオロメチル）−ＤＬ−オルニチン（ＤＦＭＯ）に対する耐性を付与するＯＤＣ（オルニチンデカルボキシラーゼ）（McConlogue, 1987, In: Current Communications in Molecular Biology, Cold Spring Harbor Laboratory ed.）、またはブラストサイジンＳに対する耐性を付与する、アスペルギルス・テレウス（Aspergillus terreus）に由来するデアミナーゼ（Tamura, Biosci. Biotechnol. Biochem. 59 (1995), 2336-2338）が記載されている。
【０５３６】
有用な評定マーカーも当業者に公知であり、市販されている。前記マーカーは、ルシフェラーゼ（Giacomin, Pl. Sci. 116 (1996), 59-72；Scikantha, J. Bact. 178 (1996), 121）、緑色蛍光タンパク質（Gerdes, FEBS Lett. 389 (1996), 44-47）、またはβ−グルクロニダーゼ（Jefferson, EMBO J. 6 (1987), 3901-3907）をコードする遺伝子であると有利である。この実施形態は、言及されたベクターを含有する細胞、組織、および生物の簡単で迅速なスクリーニングに特に有用である。
【０５３７】
上記で記載した通り、言及された核酸分子は、例えば、精製のためであるが、また、遺伝子治療の目的でも、本発明のポリペプチドを細胞内で発現させるように、単独で使用することもでき、ベクターの一部として使用することもできる。上記で記載された本発明のポリペプチドのうちのいずれか１つをコードするＤＮＡ配列を含有する核酸分子またはベクターを細胞に導入すると、細胞は、目的のポリペプチドを産生する。ｅｘ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏ法により治療用遺伝子を細胞に導入することに基づく遺伝子治療は、遺伝子導入の最も重要な適用のうちの１つである。ｉｎ  ｖｉｔｒｏまたはｉｎ  ｖｉｖｏにおける遺伝子治療に適する、ベクター、方法、または遺伝子送達系は、文献において記載されており、当業者に公知である（例えば、Giordano, Nature Medicine 2 (1996), 534-539；Schaper, Circ. Res. 79 (1996), 911-919；Anderson, Science 256 (1992), 808-813；Verma, Nature 389 (1994), 239；Isner, Lancet 348 (1996), 370-374；Muhlhauser, Circ. Res. 77 (1995), 1077-1086；Onodera, Blood 91 (1998), 30-36；Verma, Gene Ther. 5 (1998), 692-699；Nabel, Ann. N.Y. Acad. Sci. 811 (1997), 289-292；Verzeletti, Hum. Gene Ther. 9 (1998), 2243-51；Wang, Nature Medicine 2 (1996), 714-716；ＷＯ９４／２９４６９；ＷＯ９７／００９５７、ＵＳ５，５８０，８５９；ＵＳ５，５８９，４６６；またはSchaper, Current Opinion in Biotechnology 7 (1996), 635-640を参照されたい）。言及された核酸分子およびベクターは、直接的な導入のためにデザインすることもでき、リポソームまたはウイルスベクター（例えば、アデノウイルス、レトロウイルス）を介する細胞への導入のためにデザインすることもできる。好ましくは、前記細胞は、生殖系列細胞、胚細胞、もしくは卵細胞であるか、またはこれらから導出され、最も好ましくは、前記細胞は、幹細胞である。胚性幹細胞の例は、とりわけ、Nagy, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993), 8424-8428において記載されている幹細胞でありうる。
【０５３８】
本発明はまた、本発明のベクターで形質転換されるか、または本発明のベクターをトランスフェクトされた宿主も提供する。前記宿主は、上記で記載された本発明のベクターまたは上記で記載された本発明の核酸分子を宿主に導入することにより作製することができる。宿主内の少なくとも１つのベクターまたは少なくとも１つの核酸分子の存在は、上記で記載された単鎖抗体構築物をコードする遺伝子の発現を媒介することができる。
【０５３９】
宿主内に導入される、記載された本発明の核酸分子またはベクターは、宿主のゲノム内に組み込むこともでき、染色体外に維持することもできる。
【０５４０】
宿主は、任意の原核細胞または真核細胞でありうる。
【０５４１】
「原核生物」という用語は、本発明のタンパク質を発現させるためのＤＮＡまたはＲＮＡ分子で形質転換されうるか、またはこれらをトランスフェクトされうる、全ての細菌を含むことを意味する。原核生物宿主は、例えば、大腸菌（E. coli）、ネズミチフス菌（S. typhimurium）、霊菌（Serratia marcescens）、および枯草菌（Bacillus subtilis）などの、グラム陰性菌ならびにグラム陽性菌を含みうる。「真核」という用語は、酵母、高等植物、昆虫、および好ましくは、哺乳動物細胞を含むことを意味する。組換えによる作製手順で援用される宿主に応じて、本発明のポリヌクレオチドによりコードされるタンパク質は、グリコシル化することもでき、グリコシル化せずにおくこともできる。本発明のポリペプチドのコード配列を含有し、これにＮ末端のＦＬＡＧタグおよび／またはＣ末端のＨｉｓタグを遺伝子融合させた、プラスミドまたはウイルスの使用が、とりわけ好ましい。好ましくは、前記ＦＬＡＧタグの長さは、約４〜８アミノ酸であり、最も好ましくは、８アミノ酸である。当業者に一般に公知の技法のうちのいずれかを使用して、宿主を形質転換するか、またはこれにトランスフェクトするのに、上記で記載したポリヌクレオチドを使用することができる。当技術分野ではさらに、融合させ、作動可能に連結された遺伝子を調製し、それらを、例えば、哺乳動物細胞および細菌内で発現させるための方法が周知である（Sambrook, loc cit.）。
【０５４２】
好ましくは、前記宿主は、細菌または昆虫、真菌、植物、もしくは動物細胞である。
【０５４３】
言及された宿主は、哺乳動物細胞でありうることが特に想定される。特に好ましい宿主細胞は、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞、ＳＰ２／０またはＮＳ／０のような骨髄腫細胞系を含む。付属の実施例で例示される通り、ＣＨＯ細胞は、宿主として特に好ましい。
【０５４４】
より好ましくは、前記宿主細胞は、ヒト細胞またはヒト細胞系、例えば、ｐｅｒ．ｃ６（Kroos, Biotechnol. Prog., 2003, 19:163-168）である。
【０５４５】
したがって、さらなる実施形態では、本発明は、本発明のポリペプチドを作製するための工程であって、本発明の宿主を、本発明のポリペプチドの発現を可能とする条件下で培養するステップと、作製されたポリペプチドを培養物から回収するステップとを含む工程に関する。
【０５４６】
形質転換された宿主は、最適の細胞増殖を達成するように、発酵槽内で増殖させ、当技術分野で公知の技法に従い培養することができる。次いで、本発明のポリペプチドを、増殖培地、細胞溶解物、または細胞膜画分から単離することができる。例えば、微生物により発現させた、本発明のポリペプチドの単離および精製は、例えば、調製的クロマトグラフィーによる分離、および、例えば、本発明のポリペプチドまたは付属の実施例において記載されているポリペプチドのタグを指向する、モノクローナルまたはポリクローナル抗体の使用を伴う分離などの、免疫学的分離など、任意の従来の手段を介することが可能である。
【０５４７】
当技術分野では、発現を可能とする宿主を培養するための条件は、このような工程で使用される宿主系および発現系／ベクターに依存することが公知である。当技術分野では、組換えポリペプチドの発現を可能とする条件を達成するために改変されるパラメータが公知である。したがって、当業者は、適切な条件を、さらなる発明の投入なしに決定することができる。
【０５４８】
発現させたら、本発明のポリペプチドを、硫酸アンモニウム沈殿、アフィニティーカラム、カラムクロマトグラフィー、ゲル電気泳動などを含む、当技術分野の標準的な手順に従い精製することができる（Scopes, "Protein Purification", Springer-Verlag, N.Y. (1982)を参照されたい）。薬学的使用のためには、少なくとも約９０〜９５％の均一性の実質的に純粋なポリペプチドが好ましく、９８〜９９％以上の均一性が最も好ましい。部分的に、または所望の均一性まで精製したら、次いで、本発明のポリペプチドを、治療的に（体外を含む）、またはアッセイ手順の開発および実施において使用することができる。さらに、本発明のポリペプチドを培養物から回収するための方法の例については、付属の実施例で詳細に記載される。
【０５４９】
さらに、本発明は、本発明の方法を実行するのに有用なキットであって、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を検出することが可能な核酸または抗体を含むキットを提供する。本明細書ではまた、本明細書で提示される方法を実行するための、本明細書で記載されるキットの使用も想定される。
【０５５０】
例えば、前記キットは、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を特異的に決定するために要求される化合物を含みうる。さらに、本発明はまた、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を特異的に決定するために要求される化合物の、本発明の方法を実行するためのキットを調製するための使用にも関する。本発明の教示に基づいて、当業者は、どの化合物が、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を特異的に決定するために要求されるのかを知る。例えば、このような化合物は、例えば、抗体のような「結合性分子」でありうる。特に、このような化合物は、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の少なくとも１つの突然変異対立遺伝子、またはカルレチクリン遺伝子の少なくとも１つの突然変異対立遺伝子の遺伝子産物に特異的な、（ヌクレオチド）プローブ、プライマー（対）、抗体、および／またはアプタマーでありうる。本発明の（文脈で調製される）キットは、診断用キットでありうる。上述の通り、本明細書で記載される、カルレチクリン遺伝子の１つの（または複数の）突然変異対立遺伝子またはそれらの遺伝子産物の存在の決定は、単独解析として実施することができる。代替的に、この解析は、ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異など、骨髄性悪性腫瘍についての他のマーカーについての解析を後続させることもでき、先行させることもできる。また、このようなマーカーについての同時的決定も、ＪＡＫ２突然変異および突然変異体カルレチクリン（および、任意選択で、さらなるマーカー）についての同時的検査、またはＪＡＫ２突然変異、突然変異体カルレチクリン、およびＭＰＬ突然変異（および、任意選択で、さらなるマーカー）についての同時的検査と同様に想定される。キット（またはこのようなキットの使用）に従い、本明細書では、このような後続のまたは同時的な検査のための手段を提供するキットが想定される。例えば、前記キットは、カルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の（またはそれらの遺伝子産物の）存在（または量）を特異的に決定するために要求される化合物に加えて、ＪＡＫ２および／またはＭＰＬ突然変異（および、任意選択で、さらなるマーカー）の存在を特異的に決定するために要求される化合物、例えば、ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異（および、任意選択で、さらなるマーカー）の特異的な検出を可能とする、（ヌクレオチド）プローブ、プライマー（対）、抗体、および／またはアプタマーを含みうる。
【０５５１】
本発明の（文脈で調製される）キットは、指示マニュアルをさらに含むか、またはこれを備える場合がある。例えば、前記指示マニュアルは、当業者に、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を（どのようにして）決定するのか、および／あるいは骨髄性悪性腫瘍を（どのようにして）診断するのかについての指針を与えることができる。前記指示マニュアルは、本明細書で提示される方法または使用を使用または適用するための指針を含みうる。本発明の（文脈で調製される）キットは、本発明の方法および使用を実行するのに適する／要求される、物質／化学物質および／または器具をさらに含みうる。例えば、このような物質／化学物質および／または器具は、本明細書で規定される、カルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の存在、またはカルレチクリン遺伝子の１もしくは複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在もしくは量を特異的に決定するために要求される化合物を安定化させ、かつ／または保存するための、溶媒、希釈剤、および／または緩衝液である。
【０５５２】
本明細書で使用される「〜を含むこと（comprising）」および「〜を含むこと（including）」という用語、またはこれらの文法的変化形は、言明された特徴、整数、ステップ、または構成要素を指定するものであると理解すべきであるが、１もしくは複数のさらなる特徴、整数、ステップ、構成要素、またはこれらの群の付加を除外するものではない。この用語は、「〜からなること」および「〜から本質的になること」という用語を包含する。したがって、「〜を含むこと」／「〜を含むこと」／「〜を有すること」という用語は、任意のさらなる構成要素（または同様に、特徴、整数、ステップなど）が存在しうることを意味する。
【０５５３】
「〜からなること」という用語は、さらなる構成要素（または同様に、特徴、整数、ステップなど）が存在しえないことを意味する。
【０５５４】
本明細書で使用される場合の「〜から本質的になること」という用語、またはその文法的変化形は、言明された特徴、整数、ステップ、または構成要素を指定するものであると理解すべきであるが、さらなる特徴、整数、ステップ、構成要素、またはこれらの群が、特許請求される組成物、デバイス、または方法の基本的な特徴および新規の特徴を、物質的に変化させない場合に限り、１もしくは複数のさらなる特徴、整数、ステップ、構成要素、またはこれらの群の付加を除外しない。
【０５５５】
したがって、「〜から本質的になること」という用語は、具体的なさらなる構成要素（または同様に、特徴、整数、ステップなど）が存在しうる、すなわち、これらが、組成物、デバイス、または方法の本質的特徴に、物質的な影響を及ぼさないことを意味する。言い換えると、「〜から本質的になること」という用語（本明細書では「〜を実質的に含むこと」という用語と互換的に使用されうる）は、デバイスまたは方法の本質的特徴に他の構成要素の存在の物質的な影響が及ばないことを条件として、組成物、デバイス、または方法における、必須の構成要素（または同様に、特徴、整数、ステップなど）に加えた、他の構成要素の存在を許容する。
【０５５６】
「方法」という用語は、所与の課題を達成するための、様式、手段、技法、および手順であって、化学的、生物学的、および生物物理的技術分野の当業者に公知であるか、または化学的、生物学的、および生物物理的技術分野の当業者により、公知の様式、手段、技法、および手順からたやすく開発される、様式、手段、技法、および手順を含むがこれらに限定されない、様式、手段、技法、および手順を指す。
【０５５７】
本明細書で使用される「単離」という用語は、そのｉｎ  ｖｉｖｏの位置から除去された組成物を指す。好ましくは、本発明の単離組成物または化合物は、それらのｉｎ  ｖｉｖｏの位置に存在する他の物質（例えば、他のタンパク質または他の化合物）を実質的に含まない（すなわち、精製組成物もしくは精製化合物または半精製組成物もしくは半精製化合物である）。
【０５５８】
本明細書で使用される「約」という用語は、±１０％を指す。
【０５５９】
本発明は、以下の項目に関する。
【０５６０】
１．患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法。
【０５６１】
２．前記骨髄性悪性腫瘍が、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）、本態性血小板血症（ＥＴ）、ならびに環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）からなる群から選択される、項目１に従う方法。
【０５６２】
３．前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、
項目１または２に従う方法。
【０５６３】
４．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目３に従う方法。
【０５６４】
５．前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、カルレチクリン遺伝子のエクソン９内に、フレームシフト突然変異を有し、前記フレームシフト突然変異が、１ヌクレオチドの欠失または２ヌクレオチドの付加である、項目１〜４のいずれか一項に従う方法。
【０５６５】
６．前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含み、
前記突然変異対立遺伝子が、ＤＮＡ、好ましくは、ゲノムＤＮＡである、
項目１〜５のいずれか一項に従う方法。
【０５６６】
７．患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法。
【０５６７】
８．前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含み、前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目７に従う方法。
【０５６８】
９．前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目７または８に従う方法。
【０５６９】
１０．前記遺伝子産物が、ｍＲＮＡまたはタンパク質である、項目７〜９のいずれか一項に従う方法。
【０５７０】
１１．（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、２、または３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸。
【０５７１】
１２．（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、１４３、１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される、項目１１に従う核酸。
【０５７２】
１３．（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質。
【０５７３】
１４．（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目１３に従うタンパク質。
【０５７４】
１５．前記タンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、２８７、２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８、２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｄ）（ａ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つのタンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｃ）、または（ｄ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、項目１３または１４に従うタンパク質。
【０５７５】
１６．ワクチンとしての使用のための、配列番号４に示されるタンパク質のうちの１５〜２５の連続したアミノ酸からなるタンパク質など、項目１３または１４に従うタンパク質。
【０５７６】
１７．項目１３または１４のタンパク質に特異的に結合する抗体。
【０５７７】
１８．原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）、本態性血小板血症（ＥＴ）、もしくは環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）の処置における使用のための、突然変異体カルレチクリンの阻害剤；または
原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）、本態性血小板血症（ＥＴ）、もしくは環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）の処置における、項目１６に従うワクチンとしての使用のためのタンパク質であって、
前記突然変異体カルレチクリンが、項目１２〜１４のいずれか一項で規定される、突然変異体カルレチクリンタンパク質である、
阻害剤またはタンパク質。
【０５７８】
１９．前記阻害剤が、阻害性抗体である、項目１８に従う阻害剤。
【０５７９】
以下の非限定的な図および実施例を参照することにより、本発明をさらに記載する。
【０５８０】
図は、以下を示す。
【図面の簡単な説明】
【０５８１】
【図１】患者１９１および２９６における、サンガーシークエンシングによる、ＣＡＬＲ遺伝子突然変異の検証を示す図である。サンガーシークエンシングの出力波形が表示される。配列文字を囲むボックスは、欠失事象に起因して失われた塩基をマークする。図１は、配列番号１３２４〜１３２７を示す。
【図２Ａ−Ｃ】骨髄性悪性腫瘍における、ＣＡＬＲ突然変異の頻度を示す図である。Ａ：３つの古典的なＭＰＮの疾患実体内の、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、およびＣＡＬＲ突然変異の分布を示す図である。Ｂ：異なる骨髄性悪性腫瘍における、突然変異体ＣＡＬＲを伴う患者の頻度を、暗色のバーで指し示す図である。Ｎ：特異的な疾患実体について解析された患者の総数である。Ｃ：顕著な血小板増加症と関連する環状鉄芽球を伴う不応性貧血を伴う、２４例の患者における、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、ＣＡＬＲ、およびＳＦ３Ｂ１突然変異の分布を示す図である。ＰＶ：真性赤血球増加症；ＥＴ：本態性血小板血症；ＰＭＦ：原発性骨髄線維症；ｄｎＡＭＬ：急性骨髄性白血病（ｄｅ  ｎｏｖｏ  ＡＭＬ）；ＣＭＬ：慢性骨髄性白血病；ＭＤＳ：骨髄異形成症候群；ＣＭＭＬ：慢性骨髄単球性白血病；ＲＡＲＳ−Ｔ：顕著な血小板増加症と関連する環状鉄芽球を伴う不応性貧血。
【図３Ａ−Ｅ】ＭＰＮ患者におけるＣＡＬＲ突然変異の突然変異パターンを示す図である。幅の広い黒色バーは、ＣＡＬＲのエクソン９を表し、幅の狭いバーは、遺伝子の３’ＵＴＲを表し、細線は、イントロンおよび遺伝子間領域を表す。Ａ：エクソン９の起始部および末端部におけるｃＤＮＡ配列を指し示す図である。ｃＤＮＡ配列の下方に、３つの代替的リーディングフレームに由来するアミノ酸配列がある。Ｂ：３つのリーディングフレームが、とりわけ、アミノ酸の電荷に関して、異なるペプチド組成を結果としてもたらすことを示す図である。Ｃ：ＭＰＮ患者において検出された全ての突然変異、およびＣＡＬＲエクソン９内のそれらの位置についての概要を示す図である。バーは、欠失事象を指し示し、文字は、挿入された配列を指し示す。独立の挿入および欠失を、エクソン９スキームの上方に表示し、組み合わされた挿入／欠失事象を下方に表示する。Ｄ：野生型ＣＡＬＲおよび２つの最も高頻度で検出される突然変異型の特異的なペプチド組成を示す図である。Ｂ、Ｄ：各ボックスは、アミノ酸を表す。「−」記号を伴う黒色ボックスは、負に帯電したアミノ酸であり、「＋」記号を伴うボックスは、正に帯電したアミノ酸である。×を付されたボックスは、終止コドンを表す。Ｅ：ＣＡＬＲ内で観察される、３６の突然変異型全ての相対頻度を示す図である。図３は、配列番号１３２８〜１３３９を示す。
【図４Ａ−Ｂ】複数の体細胞突然変異を伴う患者における、ＣＡＬＲ突然変異の、片親性ダイソミーおよびクローン階層との関連を示す図である。パネルＡ：Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ  ＳＮＰ  ６．０によるアレイデータを、ＣＡＬＲ突然変異の負荷が５０％を超えた３例の試料について示す図である。各ドットは、単一のＳＮＰを表す。ｘ軸は、ゲノム位置を示し、ｙ軸は、ＳＮＰの対立遺伝子状態（ヘテロ接合性状態＝対立遺伝子の差異が０である）を表示する。アレイデータは、３例の試料中の１９ｐにおける、異なるサイズの片親性ダイソミーを示す。ボックスは、片親性ダイソミーのゲノム領域を指し示す。各対立遺伝子の差異プロットの右側に、同じ試料についての、ＣＡＬＲエクソン９断片解析の結果を示す。各場合において、突然変異対立遺伝子の負荷は、野生型対立遺伝子の負荷より大きい。パネルＢ：造血系前駆細胞コロニーについての解析に由来するクローン階層を示す図である。患者Ｈ＿０１９１（上）は、合計４つの遺伝子内に、体細胞突然変異を保有した。バーチャートに示される通り、コロニーのうちの５１％が、ＣＡＬＲ、ＧＡＢ２、およびＭＥＴＴＬ１１Ｂ内に、突然変異を有した。コロニーのうちの他の半分（４８％）は、４つの遺伝子全てにおいて突然変異を有したことから、ＰＨＦ１６内の突然変異は、後で獲得されたものであり、サブクローンをもたらしたことが示される。加えて、１つのコロニーは、ＣＡＬＲ内に１塩基対の欠失を保有し、この患者の顆粒球試料中および他の全てのコロニー内で観察される、５２塩基対の欠失と異なっていた。このコロニーは、患者において観察される他の突然変異のうちのいずれも有さなかったので、これは、独立のクローンを表すが、この結論は、単一のコロニーだけに基づくものである。患者Ｈ＿０２９６（下）は、ＣＡＬＲ、ＰＩＫ３Ｒ１、およびＣ１０ＯＲＦ７１内に体細胞突然変異を有した。この患者について解析された全てのコロニーは、３つの突然変異全てを有した。１つのコロニーは、この患者において観察される１塩基対の欠失に加えて、ＣＡＬＲ内に１８塩基対の欠失を示した。突然変異は両方とも、同じ対立遺伝子上に存在した。
【図５Ａ−Ｃ】ＣＡＬＲ突然変異の臨床的重要性を示す図である。それらの体細胞突然変異に従い層別化された、本態性血小板血症または原発性骨髄線維症を伴う患者における転帰の推定値である。パネルＡ：原発性骨髄線維症を伴う患者における全生存についてのカプラン−マイヤー解析を示す図である。亜群は、ログランク検定を使用して比較した。ＣＡＬＲの体細胞突然変異を保有する、骨髄線維症を伴う患者の全生存が、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ［中央値：それぞれ、２１．４年間（９５％ＣＩ：１７．１〜２２．９）対１１．０年間（９５％ＣＩ：７．８〜１４．４）；Ｐ＜０．００１］またはＭＰＬ突然変異［中央値：８．２年間（９５％ＣＩ：２．０〜未到達）；Ｐ＜０．００１］を伴う患者より良好であるのに対し、後者の２つの亜群の間では、差異が観察されなかった。パネルＢ：本態性血小板血症を伴う患者における全生存についてのカプラン−マイヤー解析を示す図である。亜群は、ログランク検定を使用して比較した。いずれの亜群においても、全生存についての中央値には到達しなかった。ＣＡＬＲ突然変異を伴う患者の全生存は、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆを保有する患者と比較して良好であった。１０年間の全生存は、後者における９１．１％（９５％ＣＩ：８７．１〜９３．９％）と対比して、前者における９６．９％（９５％ＣＩ：９１．７〜９８．８％）（Ｐ＝０．０４３）であった。パネルＣ：本態性血小板血症を伴う患者における血栓症の累積発生率を示す図である。目的の事象の非存在下における死亡は、競合事象と考え、亜群を、ペペ−森検定で比較した。ＣＡＬＲエクソン９突然変異を保有する患者の、血栓症の累積発生率は、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆを保有する患者と比較して小さかった：１０年間の累積発生率は、後者における２１．０％（９５％ＣＩ：１６．６〜２５．７％）と対比して、前者における１１．０％（９５％ＣＩ：６．３〜１７．１％）（Ｐ＝０．００３）であった。
【図６Ａ−Ｄ】ＣＡＬＲ１型突然変異についての機能解析を示す図である。パネルＡ：空ベクター（ＧＦＰ）、野生型ＣＡＬＲ（ＣＡＬＲ  ｗｔ−ＧＦＰ）、または突然変異体ＣＡＬＲ（ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２−ＧＦＰ）を発現させるＢａ／Ｆ３細胞の細胞生存率を、濃度を増大させるインターロイキン３の存在下において、７２時間後に評価したことを示す図である。ＲＬＵ：相対発光単位。誤差バーは、平均の標準誤差を表す。パネルＢ：インターロイキン３の非存在下における、空ベクター（ＧＦＰ）、野生型ＣＡＬＲ（ＣＡＬＲ  ｗｔ−ＧＦＰ）、または突然変異体ＣＡＬＲ（ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２−ＧＦＰ）を発現させるＢａ／Ｆ３細胞の細胞増殖を、７日間にわたり決定したことを示す図である。誤差バーは、平均の標準誤差を表す。パネルＣ：インターロイキン３に応答するＳＴＡＴ５の活性化を示す図である。空ベクター（ＧＦＰ）、野生型ＣＡＬＲ（ｗｔ）、またはＣＡＬＲ突然変異体（ｄｅｌ５２）を発現させるＢａ／Ｆ３細胞を、インターロイキン３を伴わずに、無血清培地中で４時間にわたり飢餓させ、次いで、表示の通り、１００ｐｇ／ｍｌおよび１ｎｇ／ｍｌのインターロイキン３で２０分間にわたり刺激した。ウェスタンブロットは、細胞溶解物に対して、ｐＹＳＴＡＴ５、ＳＴＡＴ５、およびＣＡＬＲに対する抗体により実施した。ＧＡＰＤＨに対する抗体を、ローディング対照として使用した。パネルＤ：免疫蛍光を、それぞれの構築物をトランスフェクトされたＨＥＫ２９３Ｔ内の、ＣＡＬＲ（３つ目のパネル）および小胞体特異的マーカー（カルネキシン、２つ目のパネル）に対して実施したことを示す図である。野生型ＣＡＬＲは、小胞体内で、カルネキシンと共に共局在化する（最後のパネル）。しかし、突然変異体ＣＡＬＲは、小胞体内に拘束されない。核を、色素であるＤＡＰＩで染色する（１つ目のパネル）。
【図７】Ｂａ／Ｆ３細胞の、ＳＡＲ３０２５０３に対する感受性を示す図である。空ベクター（ＧＦＰ）、ＣＡＬＲ野生型（ＣＡＬＲ  ｗｔ−ＧＦＰ）またはＣＡＬＲ突然変異体（ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２−ＧＦＰ）を発現させるＢａ／Ｆ３細胞について、減少させるＳＡＲ３０２５０３の存在下において、４８時間後に細胞生存率を規定することにより解析した。相対生存率のために、相対発光単位を、ＤＭＳＯ対照に照らして正規化した。誤差バーは、平均の標準誤差を表す。
【図８】ウェスタンブロット解析は、４匹の免疫化されたマウスの血清を、ＣＡＬＲ突然変異体ｄｅｌ５２を発現させるＨＥＫ２９３Ｔ細胞に由来する溶解物に対してプローブして実施したことを示す図である。図は、４匹の免疫化されたマウスの全てに由来する血清が、免疫化の前：ｐ（前免疫化レーン）において、突然変異体カルレチクリンペプチドに対して、いかなる抗体も有さなかったことを示す。血清は、２回にわたる追加投与の後において、特異的な抗体を生成した。
【図９】ウェスタンブロット解析は、４匹の免疫化されたマウスの血清を、ＣＡＬＲ  Δエクソン９を発現させるＨＥＫ２９３Ｔ細胞に由来する溶解物に対してプローブして実施したことを示す図である。図は、４匹の免疫化されたマウスの全てに由来する血清が、前免疫化血清（ｐ）または追加投与後のいずれにおいても、ＣＡＬＲ  Δエクソン９に対して、いかなる抗体も有さなかったことを示す。
【図１０】ウェスタンブロット解析は、４匹の免疫化されたマウスの血清を、ＣＡＬＲ突然変異体ｄｅｌ５２を発現させるＨＥＫ２９３Ｔ細胞に由来する溶解物に対してプローブして実施したことを示す図である。図は、４匹の免疫化されたマウスの全ての血清が、３回目の追加投与後において、カルレチクリン突然変異体に対して、より特異的な抗体を有したことを示す。
【実施例】
【０５８２】
実施例では、本発明について例示する。
【実施例１】
【０５８３】
原発性骨髄線維症および本態性血小板血症におけるカルレチクリンの体細胞突然変異
材料および方法
患者のサンプリング
本発明者らは、フィラデルフィア染色体陰性骨髄増殖性新生物を伴う患者であって、Ｔｈｅ  Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｖｉｅｎｎａ、Ａｕｓｔｒｉａ、およびＴｈｅ  Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ  ｏｆ  Ｈｅｍａｔｏｌｏｇｙ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ、Ｆｏｎｄａｚｉｏｎｅ  ＩＲＣＣＳ  Ｐｏｌｉｃｌｉｎｉｃｏ  Ｓａｎ  Ｍａｔｔｅｏ、Ｐａｖｉａ、Ｉｔａｌｙにおいて追跡された、患者について研究した。研究は、両方の施設の倫理委員会により承認され、全ての患者は、説明同意文書を提出した。真性赤血球増加症、本態性血小板血症、および原発性骨髄線維症の診断は、世界保健機関による２００８年の基準（Sverdlow et al, 2008）に従い施した。
【０５８４】
診断基準
真性赤血球増加症、本態性血小板血症、および原発性骨髄線維症の診断は、既に報告されている（Passamonti et al. 2004）通り、初回の観察時において使用されていた基準に従って行った。２００２年に、世界保健機関（ＷＨＯ：World Health Organization）の基準が採択され（Vardiman et al, 2002）、２００８年に、それらの改訂版が実装された（Swerdlow et al, 2008）。ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異についての解析は、パビアでは、既に記載された（Passamonti et al, 2010a；Rumi et al, 2013；Passamonti et al, 2011）通りに、ウィーンでは、下記で概括される通りに実施した。骨髄線維症は、欧州コンセンサスガイドライン（Thiele et al, 2005）に従って、半定量的に評価した。血栓性事象は、既に詳細に記載されている（Marchioli et al, 2013）通りに規定した。患者は、欧州白血病ネットにより、２０１１年に正式なものとされた推奨（Barbui et al, 2011）に従い処置した。
【０５８５】
ウィーンにおける、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ、ＪＡＫ２−エクソン１２、およびＭＰＬ−Ｗ５１５Ｌ突然変異の評価
対立遺伝子特異的ＰＣＲアッセイを使用して、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ突然変異を検出した。４μＭの共通フォワードプライマー（ｇｔｔｔｃｔｔＡＧＴＧＣＡＴＣＴＴＴＡＴＴＡＴＧＧＣＡＧＡ（配列番号１３４０））、２μＭの野生型対立遺伝子に特異的なリバースプライマー（ＴＴＡＣＴＣＴＣＧＴＣＴＣＣＡＣＡＧＡＣ（配列番号１３４１））、および２μＭの突然変異対立遺伝子に特異的なリバースプライマー（ａａａＴＴＡＣＴＣＴＣＧＴＣＴＣＣＡＣＡＧＡＡ（配列番号１３４２））からなるプライマーミックスを調製した。２つのリバースプライマーを、５’端において、６−カルボキシフルオレセイン（６−ＦＡＭ）で蛍光標識した。ＰＣＲ反応は、１．１μｌの１０倍濃度ＰＣＲ  ＧＯＬＤ緩衝液、０．６６μｌの２５ｍＭ  ＭｇＣｌ２、０．４４μｌの２．５ｍＭ  ｄＮＴＰ、１．４μｌのプライマーミックス、０．０５μｌのＡｍｐｌｉＴａｑ  Ｇｏｌｄ  ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ（５Ｕ／μｌ）、６．３６μｌのＨ２Ｏ、および１μｌのゲノムＤＮＡ（１０ｎｇ／μｌ）を含有する、ＡｍｐｌｉＴａｑ  Ｇｏｌｄ  ＤＮＡ  Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  ｗｉｔｈ  Ｇｏｌｄ  Ｂｕｆｆｅｒ  ａｎｄ  ＭｇＣｌ２（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して準備した。ＰＣＲは、以下：９５℃で５分間〜（９４℃で３０秒間、６２．２℃で３０秒間、７２℃で３０秒間）を３６回〜７２℃で１５分間〜８℃で保持、の通りに実施した。ＰＣＲ産物は、３１３０ｘｌ  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）上でサイズ決定し、およびデータは、Ｇｅｎｅ  Ｍａｐｐｅｒソフトウェア（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して解析した。
【０５８６】
ＪＡＫ２エクソン１２内の突然変異を検出するのに使用されるアッセイについては、以前に報告された（Li et al, 2008）。ＭＰＬ−Ｗ５１５Ｌについて調べるために、以下の対立遺伝子特異的ＰＣＲアッセイを使用した。８μＭの共通フォワードプライマー（ＧＴＴＴＣＴＴＣＣＧＡＡＧＴＣＴＧＡＣＣＣＴＴＴＴＴＧ（配列番号１３４３））、４μＭの野生型対立遺伝子に特異的なリバースプライマー（ＧＴＡＧＴＧＴＧＣＡＧＧＡＡＡＣＴＧＣＣ（配列番号１３４４））、および４μＭの突然変異対立遺伝子に特異的なリバースプライマー（ＡＡＡＧＴＡＧＴＧＴＧＣＡＧＧＡＡＡＣＴＧＣＡ（配列番号１３４５））からなるプライマーミックスを調製した。２つのリバースプライマーを、５’端において、６−カルボキシフルオレセイン（６−ＦＡＭ）で蛍光標識した。ＰＣＲ反応は、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ突然変異について上記で記載した通りに準備した。ＰＣＲは、以下：９４℃で１０分間〜（９４℃で３０秒間、６２．２℃で３０秒間、７２℃で３０秒間）を３０回〜７２℃で１５分間〜８℃で保持、の通りに実施した。ＰＣＲ産物は、３１３０ｘｌ  Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）上でサイズ決定し、データは、Ｇｅｎｅ  Ｍａｐｐｅｒソフトウェア（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して解析した。
【０５８７】
全エクソームシークエンシング
ゲノムＤＮＡを、標準的な手順に従い、末梢血顆粒球（腫瘍組織）およびＣＤ３＋Ｔリンパ球（対照組織）から単離した。ＤＮＡライブラリーは、ＮＥＢ  Ｎｅｘｔ  ＤＮＡ  Ｓａｍｐｌｅ調製キット（試薬セット）（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ、Ｉｐｓｗｉｃｈ、ＭＡ）を使用して生成し、全エクソームの濃縮は、製造元の指示書に従い、Ｓｕｒｅ  Ｓｅｌｅｃｔ  Ｈｕｍａｎ  Ａｌｌ  Ｅｘｏｎキット（Ａｇｉｌｅｎｔ、Ｓａｎｔａ  Ｃｌａｒａ、ＣＡ）を使用して実施した。ライブラリーは、製造元の推奨に従い、Ｉｌｌｕｍｉｎａ  ＨｉＳｅｑ２０００システム（Ｉｌｌｕｍｉｎａ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）上でシークエンシングした。全エクソームシークエンシングパラメータの詳細については、付表１を参照されたい。
【０５８８】
【表４】
0006745220.tif 000037
【０５８９】
【表５】
0006745220.tif 000038
【０５９０】
全エクソームシークエンシング解析
シークエンシングリードは、ＢＷＡ  ｖ０．５．９（Li & Durbin, 2009）を使用して、ヒト基準ゲノム（ｈｇ１８）に照らして整列させた。ＧＡＴＫのベストプラクティスガイドラインｖ３に従い、ゲノム解析ツールキット（ＧＡＴＫ）ｖ１．５（McKenna et al, 2010）を使用して、アライメントを後処理した。付表１に提示されるカバレッジデータは、Ｐｉｃａｒｄ（http://picard.sourceforge.net）製のＣａｌｃｕｌａｔｅＨｓＭｅｔｒｉｃｓ．ｊａｒスクリプトを使用して後処理されたアライメントファイルから計算した。後処理されたアライメントファイルを、２つの変異体のコーラーによりさらに解析した。
１．ＧＡＴＫ’ｓ  Ｕｎｉｆｉｅｄ  Ｇｅｎｏｔｙｐｅｒ（DePristo et al, 2011）を使用して、顆粒球ＤＮＡ試料に由来する、一塩基変異体および小規模の挿入／欠失を判定した。Ｖａｒｉａｎｔ  Ｑｕａｌｉｔｙ  Ｓｃｏｒｅ  Ｒｅｃａｌｉｂｒａｔｏｒ（ＧＡＴＫ）を使用して予備的な変異体リストを、さらに処理して、再調整された変異体リストを作成した。変異体には、ＡＮＮＯＶＡＲ  ｖｅｒｓｉｏｎ  ２０１２−０５−２５（Wang et al, 2010）を使用して注釈を施した。本発明者らは、コードエクソンにおいて見出され、タンパク質のアミノ酸組成に影響を及ぼす変異体についてのほか、スプライス部位における変異体についてもフィルタリングした。
２．Ｖａｒｓｃａｎ  ２．３．２ツール（Koboldt et al, 2012）を、顆粒球ＤＮＡ試料に由来する、後処理されたアライメントを、同じ患者のＴリンパ球試料に由来するアライメントと比較して、体細胞変異体を判定するのに使用した。Ｖａｒｓｃａｎは、プログラマーの指示書に従い使用した。Ｓａｍｔｏｏｌｓ  ０．１．１８（Li et al, 2009）により、Ｖａｒｓｃａｎのための入力として必要とされるｍｐｉｌｅｕｐファイルを作成した。Ｖａｒｓｃａｎによるヒットリストには、ＡＮＮＯＶＡＲにより注釈を施し、上記で記載した通りにフィルタリングした。２つの変異体判定パイプラインから検索された変異体リストを以下の通りに交差させることにより、最終的な変異体リストを作成した。ＧＡＴＫは、変異体が真の変異体である可能性についてのスコアであって、ＶＱＳＬＯＤスコアである、スコアを提示する。Ｖａｒｓｃａｎは、変異体が、体細胞変異体であることについてのｐ値を提示する。最終的な一塩基変異体（ＳＮＶ）の判定のための基本的な要件は、変異体は、両方の変異体判定パイプラインにより判定しなければならないこと、および顆粒球試料中の変異体は、ＧＡＴＫにより「低品質」と分類されないことであった。この範疇に収まる全てのＳＮＶから、ＶＱＳＬＯＤスコア＞０であり、かつ、体細胞ｐ値＜０．０５である、全てのＳＮＶを判定した。本発明者らはまた、ＶＱＳＬＯＤが［−２；０］である変異体も判定したが、これらには、体細胞ｐ値＜０．０１を要求した。挿入／欠失変異体判定は、ＳＮＶ判定より複雑である。真の変異体を逸しないために、本発明者らは、挿入／欠失が、両方のパイプラインにより見出されることだけを要求した。これらの変異体を判定するのに、さらなる品質尺度もｐ値も要求されなかった。
【０５９１】
サンガーシークエンシング
サンガーシークエンシングのためのプライマーは、ＰｒｉｍｅｒＺツール（http://ncbi36.genepipe.ncgm.sinica.edu.tw/primerz/beginDesign.do）またはＰｒｉｍｅｒ３ツール（http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi/）を使用してデザインした。プライマー配列を、付表２に列挙する。
【０５９２】
ＰＣＲは、ＡｍｐｌｉＴａｑ  Ｇｏｌｄ  ３６０  Ｍａｓｔｅｒｍｉｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｐａｉｓｌｅｙ、ＵＫ）を使用して実施した。
【０５９３】
ＰＣＲのためには、タッチダウンプログラム：９５℃で５分間〜（９４℃で３０秒間〜６７℃で３０秒間［１サイクル当たり−１℃］〜７２℃で３０秒間）を１０回〜（９４℃で３０秒間〜５７℃で３０秒間〜７２℃で３０秒間）を２９回〜７２℃で１０分間〜１０℃で保持、を使用した。サンガーシークエンシングのためには、ＢｉｇＤｙｅ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ  ｖ３．１  Ｃｙｃｌｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇキット（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を、以下のプログラム：９６℃で１分間〜（９６℃で１０秒間〜５０℃で５秒間〜６０℃で４分間）を２５回〜１０℃で保持、と共に使用した。シークエンシングの出力波形は、３１３０ｘｌ  Ｇｅｎｏｍｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ）（（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）上で読み取った。配列解析は、Ｓｅｑｕｅｎｃｈｅｒ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  ４．９（Ｇｅｎｅ  Ｃｏｄｅｓ、Ａｎｎ  Ａｒｂｏｒ、ＭＩ）を使用して行った。
【０５９４】
ＣＡＬＲ−エクソン９突然変異の検出のためのＰＣＲ断片解析
プライマーは、ＣＡＬＲエクソン９のためにデザインし、フォワードプライマーを、６−ＦＡＭで標識した（付表２）。ＰＣＲは、以下：９５℃で１０分間〜（９４℃で１５秒間〜５５℃で１５秒間〜７２℃で３０秒間）を１０回〜（８９℃で１５秒間〜５５℃で１５秒間〜７２℃で３０秒間）を２０回〜７２℃で２０分間〜１０℃で保持、の通りに実施した。ＰＣＲ産物は、水中で１：２５に希釈し、３１３０ｘｌ  Ｇｅｎｏｍｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ（Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ａｎａｌｙｚｅｒ）（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）上でサイズ決定した。結果について、Ｇｅｎｅ  Ｍａｐｐｅｒソフトウェアｖｅｒｓｉｏｎ  ４．０（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を使用して解析した。
【０５９５】
ＰＣＲ産物のサブクローニング
ＰＣＲ産物は、製造元の指示書に従い、ＴＯＰ−１０菌を使用して、ＴＯＰＯ  ＴＡクローニングキット（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ／Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｐａｉｓｌｅｙ、ＵＫ）によりサブクローニングした。翌日、単一の細菌コロニーを採取し、一晩にわたる培養により増殖させた。プラスミドは、ＱＩＡｐｒｅｐ  Ｓｐｉｎ  Ｍｉｎｉ  Ｐｒｅｐキット（Ｑｉａｇｅｎ、Ｈｉｌｄｅｎ、Ｇｅｒｍａｎｙ）により抽出した。シークエンシング反応は、ＢｉｇＤｙｅ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ  ｖ３．１  Ｃｙｃｌｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇキット（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）：５０〜２００ｕｇのプラスミド、４ｕｌのプライマー、１ｕｌのＢｉｇＤｙｅ  Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒミックス、１ｕｌのシークエンシング緩衝液、および最大１０ｕｌのＨＰＬＣ水を使用して準備した。シークエンシングプログラムは、９６℃で５分間〜（９６℃で１分間〜５０℃で５秒間〜６０℃で４分間）を２５回〜１０℃で保持、であった。
【０５９６】
ＳＮＰマイクロアレイ解析
ＤＮＡ試料を処理し、製造元により供給されるプロトコールに従い、Ｇｅｎｏｍｅ−Ｗｉｄｅ  Ｈｕｍａｎ  ＳＮＰ  ６．０アレイ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）とハイブリダイズさせた。生データを、Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ  Ｃｏｎｓｏｌｅ  ｖｅｒｓｉｏｎ  ３．０．２ソフトウェア（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）により解析した。Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ  Ｃｏｎｓｏｌｅソフトウェアで実装される通り、試料を、染色体異常（欠失、獲得、および後天性片親性ダイソミー）について評価した。
【０５９７】
ＣＡＬＲエクソン９突然変異のクローニング
野生型および突然変異体ＣＡＬＲを、Ｓｏｕｒｃｅ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓから購入されたクローンから増幅し、レトロウイルス構築物であるｐＭＳＣＶ−ＩＲＥＳ−ＧＦＰ内のＸｈｏＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローニングした。野生型ＣＡＬＲは、以下のプライマー−
（ＦＰ−ＡＴＧＣＣＴＣＧＡＧＣＣＧＣＣＡＣＣＡＴＧＣＴＧＣＴＡＴＣＣＧＴＧＣＣＧＣＴＧＣＴＧＣＴＣ（配列番号１３４６）、およびＲＰ−ＡＴＧＣＧＡＡＴＴＣＣＴＡＣＡＧＣＴＣＧＴＣＣＴＴＧＧＣＣＴＧＧＣＣ（配列番号１３４７））
を使用して増幅した。
突然変異体ＣＡＬＲを２つの断片内で増幅した後で、ネステッドＰＣＲ−（ＦＰ１−ＡＴＧＣＣＴＣＧＡＧＣＣＧＣＣＡＣＣＡＴＧＣＴＧＣＴＡＴＣＣＧＴＧＣＣＧＣＴＧＣＴＧＣＴＣ（配列番号１３４６）、ＲＰ１−ＣＣＴＣＡＴＣＡＴＣＣＴＣＣＴＴＧＴＣＣＴＣＴＧＣＴＣＣＴＣＧＴＣＣＴＧ（配列番号１３４８）、
ＦＰ２−ＣＡＧＧＡＣＧＡＧＧＡＧＣＡＧＡＧＧＡＣＡＡＧＧＡＧＧＡＴＧＡＴＧＡＧＧ（配列番号１３４９）、ＲＰ２−ＡＴＧＣＣＣＧＣＧＧＣＴＡＧＧＣＣＴＣＡＧＴＣＣＡＧＣＣＣＴＧＧＡＧＧ（配列番号１３５０））
にかけた。
【０５９８】
ウイルスの作製および形質導入
以前記載された通りに、レトロウイルスを生成し、細胞に形質導入した（Zuber et al, 2013）。略述すると、Ｃａｌｃｉｕｍ  Ｐｈｏｓｐｈａｔｅ  Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ｓｉｇｍａ；型番ＣＡＰＨＯＳ）を使用して、ＰｌａｔＥ細胞（１０ｃｍのディッシュ内で７５％のコンフルエンシー）に、それぞれのウイルスベクター２０μｇずつをトランスフェクトした。培地を２４時間後に交換し、トランスフェクションの３６、４０、４４、および６０時間後にウイルス上清を回収した。Ｂａ／Ｆ３細胞１００万個に、６ウェルプレート内に回収したばかりのウイルス上清を、全てのウイルス回収時点において、スピノキュレーション（４μｇ／ｍｌのポリブレン、３２℃で、１３５０ｇ、３０分）により形質導入した。最後の形質導入ステップの４８時間後において、細胞を、フローサイトメトリーにより、形質導入効率について解析した。ＧＦＰ陽性細胞を、ＦＡＣＳにより分取し、分取効率を、フローサイトメトリーにより解析した。
【０５９９】
増殖および生存率アッセイ
形質導入されたＢａ／Ｆ３細胞の生存率を、インターロイキン３の存在下において評価するため、細胞を、９６ウェルプレート内に、インターロイキン３の希釈系列上、ウェル１つ当たりの細胞５０００個、三連で（最高用量２５ｎｇ／ｍｌ）播種した。７２時間後に、細胞生存率を、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ  Ａｓｓａｙ（Ｐｒｏｍｅｇａ）により決定した。
【０６００】
インターロイキン３の非存在下における細胞増殖を決定するため、Ｂａ／Ｆ３細胞を、１２ウェルプレート内に、ウェル１つ当たりの細胞１００００００個、三連で播種し、インターロイキン３を伴わない完全ＲＰＭＩ（１０％のＦＣＳ、ペニシリン／ストレプトマイシン、およびＬ−グルタミンを伴う）中で、７日間にわたり培養した。ＣＡＳＹ（登録商標）Ｃｅｌｌ  Ｃｏｕｎｔｅｒ（Ｒｏｃｈｅ  Ｉｎｎｏｖａｔｉｓ）を使用して、２４時間ごとに、細胞数を評価した。
【０６０１】
阻害剤であるＳＡＲ３０２５０３（Ｓａｎｏｆｉ）に対する感受性を規定するため、Ｂａ／Ｆ３細胞を、９６ウェルプレート内に、ＳＡＲ３０２５０３の希釈系列上、１０ｎｇ／ｍｌのインターロイキン３の存在下において、ウェル１つ当たりの細胞２５０００個、三連で（最高濃度４０μＭ）播種した。４８時間後に、細胞生存率を、ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｍｉｎｅｓｃｅｎｔ  Ｃｅｌｌ  Ｖｉａｂｉｌｉｔｙ  Ａｓｓａｙ（Ｐｒｏｍｅｇａ）により決定した。
【０６０２】
インターロイキン３による刺激およびウェスタンブロット法
Ｂａ／Ｆ３細胞を、１ｎｇ／ｍｌのインターロイキン３の存在下、完全ＲＰＭＩ（１０％のＦＣＳ、ペニシリン／ストレプトマイシン、Ｌ−グルタミン）中で培養した。細胞を、インターロイキン３を伴わない無血清培地中で、４時間にわたり飢餓させた。刺激は、それぞれの濃度のインターロイキン３により、２０分間にわたり実施した。細胞をペレット化し、タンパク質の抽出は、以前記載された（Corvinus et al, 2005）通りに行った。略述すると、完全全細胞抽出物緩衝液（プロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤を含有する）を細胞に添加し、溶解を、液体窒素を伴う３回連続の凍結融解サイクルにより行った。溶解物は、２０，０００ｇで２０分間にわたる遠心分離の後で回収した。タンパク質濃度は、Ｂｒａｄｆｏｒｄ試薬を使用して測定した。ウェスタンブロットは、標準的な技法により実施し、ウェル１つ当たり５０μｇのタンパク質をロードした。以下の抗体−ｐＹＳｔａｔ５（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；型番７１−６９００）、Ｓｔａｔ５（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ；ｓｃ−８３６）、カルレチクリン（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ；ＭＡＢＴ１４５）、ＧＡＰＤＨ（Ｓａｎｔａ  Ｃｒｕｚ；ｓｃ−３２２３３）、抗ウサギＨＲＰ（ＧＥ；ＮＡ９３４）、および抗マウスＨＲＰ（ＧＥ；ＮＡ９３１）を使用した。
【０６０３】
免疫蛍光
製造元の指示書に従い、リポフェクション（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）により、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、ＣＭＶ−ＣＡＬＲ  ｗｔおよびＣＭＶ−ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２プラスミドをトランスフェクトされた０．１％のゼラチンでコーティングされたガラス製のカバースリップ上に、２４時間にわたり播種した。ＥＲ染色は、抗カルネキシン（ａｂ３１２９０；ａｂｃａｍ）；二次抗マウスＡｌｅｘａＦｌｕｏｒ  ５４６（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用して可視化した。抗カルレチクリン抗体（ＭＡＢＴ１４５；Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）を使用して、ＣＡＬＲ；二次抗ウサギＡｌｅｘａＦｌｏｕｒ  ５９４（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を染色した。スライドは、ＧａＡｓＰマルチ検出器ユニットおよび２つのＰＭＴを伴う、ＬＳＭ７８０（Ｃａｒｌ  Ｚｅｉｓｓ、Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用して可視化した。ピンホールは、各チャネルにおいて、１ＡＵに設定した。画像は、逐次的に撮影し、チャネルは、重複を低減するように選択した。画像は、１００倍で撮影し、ＩｍａｇｅＪ（ＮＩＨ；オープンソース）で解析した。
【０６０４】
統計学的解析
統計学的解析は、標準的な方法の使用により実施した。仮説の検定は、ノンパラメトリック法により実行した。全ての検定は、両側であり、Ｐ値は、０．０５未満の場合に有意と考えた。Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  Ｏｆｆｉｃｅ  Ｅｘｃｅｌ（Ｃｏｐｙｒｉｇｈｔ  Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  Ｃｏｒｐ）、Ｓｔａｔａ  １１．２（Ｃｏｐｙｒｉｇｈｔ  ＳｔａｔａＣｏｒｐ  ＬＰ）、およびＲ  ２．１５．２（R Core Team, 2012）を、データの管理および解析のために使用した。血栓性合併症の累積発生率は、カルプフライシュ−プレンティス法（Kalbfleisch & Prentice, 1980）に従う競合リスク法により推定した。目的の事象の非存在下における死亡は、競合事象と考えた。
【０６０５】
結果
全エクソームシークエンシングは、ＰＭＦ（原発性骨髄線維症）におけるＣＡＬＲの反復突然変異を明らかにする
全エクソームシークエンシングを使用して、ＰＭＦを伴う６例の患者に由来する末梢血顆粒球（腫瘍組織）、およびＣＤ３＋Ｔリンパ球（対照組織）に由来するゲノムＤＮＡを解析した。古典的なサンガーシークエンシングを使用する検出された変異体についての独立の検証により、患者１例当たり２〜１２の間の遺伝子内で、体細胞突然変異が確認された。反復的に影響を受けた唯一の遺伝子は、カルレチクリンをコードするＣＡＬＲであった。２例の患者は、体細胞内のＣＡＬＲのエクソン９内の欠失を保有した。ＰＣＲ産物のサブクローニングおよびシークエンシングにより、患者１９１は、５２塩基対の欠失を有し、患者２９６は、１塩基対の欠失を保有することが明らかになった（図１）。患者１９１における５２塩基対の欠失には、本発明者らの変異体判定解析パイプラインにより、一塩基変異体を伴う１塩基対の欠失とする、不正確な注釈が施されたので、患者１９１の配列アライメントは、手作業で再検討した。突然変異部位をカバーするシークエンシングリードのミスアライメントが観察された。不正確なアライメントは、影響を受けたゲノム領域内のリピートエレメントに起因した。この知見について追跡する中で、残りの４例の患者についての配列アライメントについて探索したところ、４例の患者全てにおいて、５ｂｐの反復挿入が検出された。全エクソームシークエンシングにより、患者において見出されたＣＡＬＲの突然変異は、マッチするＴリンパ球ＤＮＡ試料についてのサンガーシークエンシングにより、体細胞突然変異であることが確認された。まとめると、全エクソームシークエンシングにより解析された６例のＰＭＦ患者は全て、体細胞内のＣＡＬＲのエクソン９内の挿入または欠失突然変異を保有した。
【０６０６】
骨髄増殖性新生物（ＭＰＮ）患者におけるＣＡＬＲエクソン９突然変異の頻度
ＭＰＮにおけるＣＡＬＲ突然変異の保有率を推定するために、蛍光色素標識されたＰＣＲ産物についての高分解度のサイズ決定を使用して、８９６例のＭＰＮ患者のコホートを、ＣＡＬＲエクソン９内の挿入および欠失突然変異についてスクリーニングした。このコホートは、真性赤血球増加症（ＰＶ）を伴う３８２例の患者、本態性血小板血症（ＥＴ）を伴う３１１例の患者、および原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）を伴う２０３例の患者を含んだ（表１）。ＣＡＬＲ内に挿入または欠失を保有する１５０例の試料（１７％）が同定された。突然変異は、サンガーシークエンシングにより独立に検証した。ＰＶでは、ＣＡＬＲ突然変異は観察されなかった。ＥＴおよびＰＭＦでは、それぞれ、７８（２５％）および７２（３５％）の患者が、ＣＡＬＲ内に突然変異を有した（表１）。全ての患者を、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆ突然変異について遺伝子型解析した。この突然変異について陰性のＰＶ患者は、ＪＡＫ２エクソン１２内の突然変異について調べた。野生型ＪＡＫ２を伴うＥＴ患者およびＰＭＦ患者は、ＭＰＬエクソン１０内の突然変異について調べた。
【０６０７】
３つのＭＰＮの疾患実体における、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、およびＣＡＬＲ突然変異の分布を、図２Ａに表示する。突然変異体ＣＡＬＲを伴う全ての患者は、野生型ＪＡＫ２およびＭＰＬを有した。したがって、ＣＡＬＲ内の突然変異は、ＪＡＫ２およびＭＰＬ突然変異について野生型である、ＥＴ（Ｐ＝９．３３×１０−４５）およびＰＭＦ（Ｐ＝１．７１×１０−４４）と著明に関連する。全６７例のＭＰＮ患者について調べたところ、ＪＡＫ２およびＭＰＬのほか、ＣＡＬＲエクソン９についても野生型であった。これらの「三重陰性」症例のうち、１９例の患者を、ＣＡＬＲの９つ全てのエクソン内の突然変異についてサンガーシークエンシングにかけたが、突然変異は、検出されなかった。
【０６０８】
ＣＡＬＲ突然変異は、ＪＡＫ２およびＭＰＬが野生型のＥＴまたはＰＭＦと高度に関連したので、この疾患範疇内に収まる別の２１１例の患者について解析した。合計で、ＪＡＫ２／ＭＰＬ野生型のＥＴ患者２８９例のうち、１９５例が突然変異体ＣＡＬＲ（６７％）を有した。ＪＡＫ２／ＭＰＬが野生型のＰＭＦ患者を組み合わせた１２０例のうち、１０５例がＣＡＬＲ内に突然変異を有した（８８％）。突然変異体ＣＡＬＲを伴う患者であって、マッチするＴリンパ球ＤＮＡが入手可能な患者１５０例では、突然変異は、体細胞突然変異であった。
【０６０９】
【表６】
0006745220.tif 000039
【０６１０】
他の骨髄性悪性腫瘍におけるＣＡＬＲ突然変異の頻度
ＣＡＬＲ突然変異が、他の骨髄性悪性腫瘍において存在するかどうかについて探索するため、本発明者らは、急性骨髄性白血病（ｄｅ  ｎｏｖｏ  ＡＭＬ）を伴う２５４例の患者、慢性骨髄性白血病を伴う４５例の患者、骨髄異形成症候群を伴う７３例の患者、慢性骨髄単球性白血病を伴う６４例の患者、および顕著な血小板増加症と関連する環状鉄芽球を伴う不応性貧血を伴う２４例の患者を、ＣＡＬＲエクソン９内の突然変異についてスクリーニングした。これらの患者のうちの大多数は、野生型ＣＡＬＲエクソン９を有したが、顕著な血小板増加症と関連する環状鉄芽球を伴う不応性貧血を伴う、３例の患者は、ＣＡＬＲ内の突然変異を保有し（図２Ｂ）、それらの全ては、野生型ＪＡＫ２およびＭＰＬを有した（図２Ｃ）。スプライシング因子３Ｂサブユニット１（ＳＦ３Ｂ１：splicing factor 3B, subunit 1）をコードする遺伝子内の突然変異は、３つの遺伝子全てにおける突然変異と共に同時発生した。５２４例の健常対象のうち、１例が、ＣＡＬＲ内の３ｂｐのインフレームの欠失を有した。
【０６１１】
ＣＡＬＲフレームシフト突然変異は、Ｃ末端アミノ酸配列を、代替的リーディングフレームに由来する新規のペプチドで置換する
挿入、欠失、欠失と挿入との組合せのほか、挿入／欠失の一塩基変異体との組合せを含む、ＣＡＬＲ内の全３６種類の異なる突然変異を検出した。観察された突然変異の全ては、ＣＡＬＲの代替的リーディングフレーム１へのフレームシフト（図３Ａ）を結果としてもたらす。これは、突然変異体ＣＡＬＲタンパク質のＣ末端のアミノ酸組成の顕著な変化をもたらす（図３Ｂ）。野生型ＣＡＬＲ内のエクソン９に由来するＣ末端が、高度に負に帯電しているのに対し、代替的リーディングフレーム１に由来する突然変異体のペプチドは、正に帯電している。代替的リーディングフレーム２は、いくつかの終止コドンを有するので、このフレームへのフレームシフト突然変異は、翻訳の早期終結およびタンパク質の切断を結果としてもたらすであろう（図３Ｂ）。研究されたＭＰＮ患者では、代替的リーディングフレーム２へのフレームシフト突然変異は観察されなかった。３６種類の突然変異を、図３Ｃに表示する。突然変異のサイズおよび位置は異なるため、タンパク質のＣ末端領域では、可変数のアミノ酸の獲得および喪失が見出される（表２）。全てのフレームシフト突然変異は、新規のＣ末端アミノ酸配列を生成する（表２）。全ての突然変異体の全長タンパク質配列は、配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８に示されている。突然変異接合部近傍のｃＤＮＡ配列を、表３に提示する。
【０６１２】
【表７】
0006745220.tif 000040
【０６１３】
【表８】
0006745220.tif 000041
【０６１４】
ＣＡＬＲ遺伝子内の骨髄細胞に特異的な体細胞突然変異を、ＭＰＮを伴う患者において同定した。突然変異は、ＪＡＫ２突然変異およびＭＰＬ突然変異（かつて記載された、ＭＰＮにおける、疾患の原因となる突然変異）の両方について陰性の患者と強く関連する。ＣＡＬＲ突然変異は、ＪＡＫ２およびＭＰＬについて二重陰性である、ＰＭＦ症例のうちの８８％、およびＥＴ症例のうちの６７％において見出されているので、ＣＡＬＲ突然変異は、ＪＡＫ２／ＭＰＬ陰性のＥＴおよびＰＭＦについての診断における大きな欠落を埋めると考えられる。したがって、ゲノムＤＮＡ、ＲＮＡ、またはｃＤＮＡのレベルにおけるＣＡＬＲ突然変異の検出は、ＭＰＮについての重要な診断検査をもたらす。
【０６１５】
同定された全てのＣＡＬＲの突然変異は、タンパク質のＣ末端アミノ酸をコードする、最終端のエクソン９内にあり、主に、挿入／欠失突然変異である。突然変異のうちの大多数は、ヘテロ接合性状態で存在し、それらは、同じ代替的リーディングフレームへのフレームシフトを引き起こす。このフレームシフトは、カルレチクリンのＣ末端の、負に帯電したアミノ酸（アスパラギン酸およびグルタミン酸に富む）の、アルギニンおよびメチオニンに富む、主に正に帯電したポリペプチドによる置き換えを結果としてもたらす。加えて、カルレチクリンの最終端の４アミノ酸（ＫＤＥＬ（配列番号１３３１））は、小胞体保持シグナルを含有する。このシグナルは、突然変異体カルレチクリン内に存在しないことから、突然変異体タンパク質は、ＥＲ内では、野生型タンパク質と比較してそれほど代表的ではないことが示唆される。カルレチクリンの負に帯電したＣ末端は、低アフィニティーで高キャパシティーのＣａ２＋結合性ドメインであるので、突然変異体タンパク質のＣａ２＋結合機能は失われていると考えられる。
【０６１６】
全てのＣＡＬＲ突然変異症例のうち、１型の突然変異（５２塩基対の欠失）および２型の突然変異（５塩基対の挿入）が、それぞれ、５３％および３２％を占めていた（図３Ｄ、Ｅ）。他の突然変異型は、はるかに低頻度で観察され、多くは、単一の患者だけにおいて検出された（図３Ｅ）。３６の突然変異型は全て、代替的リーディングフレーム１へとフレームシフトするので、結果として得られる突然変異体ＣＡＬＲタンパク質は、共通の新規のアミノ酸配列を、Ｃ末端において共有する（表２）。代替的リーディングフレーム１に由来するＣ末端ペプチドが、いくつかの正に帯電したアミノ酸を含有するのに対し、野生型ＣＡＬＲのＣ末端は、大部分が負に帯電している（図３Ｂ）。加えて、野生型カルレチクリンは、Ｃ末端において小胞体保持モチーフ（アミノ酸配列ＫＤＥＬ（配列番号１３３１））を含有する。Ｃ末端のＫＤＥＬ（配列番号１３３１）は、全ての突然変異体で失われる（表２）。突然変異の種類に応じて、突然変異体タンパク質は、野生型カルレチクリンのうちの、可変量の負に帯電したアミノ酸を保持する。１型の５２塩基対の欠失が、ほぼ全ての負に帯電したアミノ酸を消失させるのに対し、２型の５塩基対の挿入は、負に帯電したアミノ酸のうちの約半分を保持する（図３Ｄ）。これらの差異を踏まえ、本発明者らは、１型および２型の突然変異が、定性的に異なる表現型と関連しうることを仮定した。したがって、本発明者らは、１型の欠失が、原発性骨髄線維症において、本態性血小板血症と比較して有意により高頻度である（Ｐ＝０．０００７）ことを見出した。加えて、本発明者らは、染色体１９ｐの片親性ダイソミーと関連するＣＡＬＲ突然変異についてホモ接合性の患者は３例だけであり、３例全てが、２型の５塩基対の挿入を有することを検出した（図４Ａ）。
【０６１７】
ＣＡＬＲ突然変異は、クローン進化の早期に獲得されるものであり、突然変異体クローンは安定である
ＣＡＬＲ内の突然変異が、患者のクローン履歴の早期に獲得されたのか、後期に獲得されたのかについて探索するために、本発明者らは、２例の患者に由来する造血系前駆細胞コロニーであって、本発明者らが、全エクソームシークエンシングに由来する突然変異プロファイルを有する、コロニーについて解析した。患者Ｈ＿０１９１およびＨ＿０２９６のクローン階層を、図４Ｂに示す。本発明者らは、ＣＡＬＲ内の突然変異が、解析された２例の患者の主要なクローン内で早期に獲得されたと結論付ける。
【０６１８】
突然変異体ＣＡＬＲを伴う２４例の患者について、本発明者らには、調べた全てが突然変異について陽性であった追跡試料が入手可能であった。
【０６１９】
ＣＡＬＲ突然変異の臨床的重要性
本発明者らは、本態性血小板血症または原発性骨髄線維症を伴う、合計で１２１５例の患者について研究した（表４）。これらのうちで、６３．４％が、ＪＡＫ２−Ｖ６１７Ｆを保有し、４．４％が、ＭＰＬエクソン１０の活性化突然変異を保有し、２３．５％が、ＣＡＬＲエクソン９の突然変異を保有し、前出のクローンマーカーのうちのいずれも有さないのは８．８％だけであった。これらの後者の患者のうちの大半が、本態性血小板血症亜群内にクラスター化されたことは注目に値する。本発明者らは、ウィルコクソンランクサム検定を使用して、異なる突然変異体遺伝子を保有する患者における血液学値を比較した。本態性血小板血症を伴う患者のうち、ＣＡＬＲ突然変異を保有する患者のヘモグロビンレベルは、診断時において、突然変異体ＪＡＫ２を保有する患者と比較して低く、白血球カウントは小さく、血小板カウントは大きかった（全ての場合においてＰ＜０．００１）。原発性骨髄線維症を伴う患者のうち、ＣＡＬＲ突然変異を保有する患者の白血球カウントは、突然変異体ＪＡＫ２を伴う患者より小さく（Ｐ＝０．０２７）、血小板カウントは大きかった（Ｐ＜０．００１）。全生存および血栓症の危険性については、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、またはＣＡＬＲ内に突然変異を保有する患者、すなわち、クローンマーカーを有する患者だけにおいて解析した。本発明者らは、初回の診断以来、突然変異状態が時間と共に変化しないことを仮定して、全ての解析を行った。追跡が不十分なために、６例の患者を除外したので、合計１１０２例の患者について検討した。３つの遺伝子のうちのいずれかが突然変異した患者の全コホートについての追跡の中央値は、５．７年間（範囲：０〜３１年間）であった。図５Ａに示される通り、原発性骨髄線維症を伴う患者の３つの亜群の間では、全生存に有意差が見られた（Ｐ＜０．００１）。ＣＡＬＲの体細胞突然変異を保有する患者の全生存は、ＪＡＫ２を伴う患者（Ｐ＜０．００１）またはＭＰＬ突然変異を伴う患者（Ｐ＜０．００１）より良好であったが、後者の２つの亜群の間では、差異が観察されなかった。全生存がはるかに長い本態性血小板血症を伴う患者では、ＣＡＬＲを突然変異させた患者と、ＪＡＫ２を突然変異させた患者との間に限り、有意差が見られた（Ｐ＝０．０４３、図５Ｂ）。全生存についてのコックス回帰による多変量解析であって、骨髄新生物の種類（本態性血小板血症対原発性骨髄線維症）、突然変異体遺伝子の種類、および患者コホート（パビア対ウィーン）を共変量として含む、多変量解析では、最初の２つの因子は、独立の予後診断因子であることが見出された。予測される通り、原発性骨髄線維症は、全生存が本態性血小板血症と比較して短いことと関連した（死亡のハザード比：７．１、Ｐ＜０．００１、ＣＩ：４．９〜１０．２）。加えて、突然変異体遺伝子の種類は、生存に対して独立の影響を及ぼした。実際、ＣＡＬＲ突然変異を保有する患者と比較して、ＪＡＫ２突然変異を伴う患者（ハザード比：３．１、Ｐ＜０．００１、ＣＩ：２．０〜４．７）およびＭＰＬ突然変異を保有する患者（ハザード比：３．５、Ｐ＜０．００１、ＣＩ：１．８〜６．７）の両方とも、死亡の危険性が高かった。本態性血小板血症における血栓症の累積発生率を、全ての原因に由来する死亡を競合事象とする競合リスク法により計算し、表５に報告する一方、実際の曲線を、図５Ｃに示す。ＣＡＬＲ突然変異を保有する、本態性血小板血症を伴う患者は、血栓症の危険性が、ＪＡＫ２突然変異を保有する患者より低かった（Ｐ＝０．００３）が、他の亜群間では、有意差が見出されなかった。ＭＰＬ突然変異を保有する患者の亜群は、小さかったことに注目すべきである。
【０６２０】
【表９】
0006745220.tif 000042
【０６２１】
【表１０】
0006745220.tif 000043
【０６２２】
１型ＣＡＬＲ突然変異についての機能解析
突然変異体ＣＡＬＲの機能的効果について研究するために、本発明者らは、野生型ＣＡＬＲおよび１型突然変異（５２塩基対の欠失）のｃＤＮＡを、レトロウイルス発現ベクターであるｐＭＳＣＶ−ＩＲＥＳ−ＧＦＰへとクローニングした。レトロウイルスの作製およびＣＡＬＲ  ｃＤＮＡの、インターロイキン３依存性マウス細胞系であるＢａ／Ｆ３へのトランスフェクションの後、本発明者らは、トランス遺伝子陽性細胞を、ＧＦＰについてのフローサイトメトリーにより分取した。次に、本発明者らは、細胞のインターロイキン３依存性増殖を測定した。１型ＣＡＬＲ突然変異を発現させる細胞は、インターロイキン３非依存性の増殖およびインターロイキン３に対する過敏性を呈示した（図６Ａ）。本発明者らが、インターロイキン３の非存在下における細胞の増殖を測定したところ、ＣＡＬＲの５２塩基対の欠失突然変異だけが、細胞の有意な蓄積を呈示した（図６Ｂ）。ＣＡＬＲの５２塩基対の欠失突然変異体細胞内のインターロイキン３非依存性が、ＪＡＫ−ＳＴＡＴシグナル伝達の活性化により引き起こされるかどうかについて探索するために、本発明者らは、細胞の、ＪＡＫ２キナーゼ阻害剤であるＳＡＲ３０２５０３に対する感受性を決定した。図７に示される通り、ＣＡＬＲの野生型および５２塩基対の欠失突然変異体の両方とも、ＳＡＲ３０２５０３に対して同様の感受性を示したことから、突然変異体ＣＡＬＲ細胞のインターロイキン３非依存性の増殖が、ＳＡＲ３０２５０３によりターゲティングされる、ＪＡＫ２またはＪＡＫファミリーキナーゼに依存することが示唆される。この仮説を確認するために、本発明者らは、対照細胞系およびＣＡＬＲをトランスフェクトされた細胞系内の、インターロイキン３の存在下および非存在下における、ＳＴＡＴ５のリン酸化について検討した。本発明者らは、ＣＡＬＲの５２塩基対の欠失突然変異体内の、インターロイキン３の非存在下、および０．１ｎｇ／ｍｌのインターロイキン３濃度において、ＳＴＡＴ５のリン酸化の増大を検出した（図６Ｃ）。したがって、ＪＡＫ−ＳＴＡＴシグナル伝達活性化の増大は、ＣＡＬＲの５２塩基対の欠失突然変異体を発現させる細胞のサイトカイン非依存性の増殖の一因となる可能性が高い。
【０６２３】
免疫蛍光顕微鏡法を使用して、野生型および１型突然変異体ＣＡＬＲの局在化を決定した。ＨＥＫ細胞内で過剰発現させたところ、野生型ＣＡＬＲは、小胞体（カルネキシンで染色された）と共局在化した。１型突然変異体ＣＡＬＲの場合、この共局在化は、おそらく、突然変異体ＣＡＬＲのＣ末端に由来するＫＤＥＬ配列（配列番号１３３１）の非存在に起因して、それほど顕著ではなかった（図６Ｄ）。
【０６２４】
本発明者らは、原発性骨髄線維症および本態性血小板血症を伴う患者における、ＣＡＬＲ遺伝子内の体細胞突然変異を同定した。ＣＡＬＲ突然変異は、ＪＡＫ２およびＭＰＬの両方における突然変異と相互に排他的である。ＪＡＫ２突然変異と特異的に関連する骨髄増殖性新生物である、真性赤血球増加症では、ＣＡＬＲ突然変異は見出されなかった。ＣＡＬＲ突然変異は、骨髄増殖性新生物のうちで、ＪＡＫ２に次いで、２番目に高頻度の突然変異である。本発明者らはまた、他の骨髄新生物を伴う患者についても研究したが、ＣＡＬＲ突然変異を見出したのは、典型的な骨髄異形成性／骨髄増殖性新生物である、顕著な血小板増加症と関連する環状鉄芽球を伴う不応性貧血伴う症例のうちの１２．５％だけであった（Malcovati et al, 2009）。このことは、ＣＡＬＲ突然変異と過剰な血小板産生との因果関係を強く裏付ける。
【０６２５】
ＣＡＬＲ突然変異は、ＪＡＫ２およびＭＰＬの変化を保有しない患者のうちの約７３％において見出されているので、本発明者らは、これらが、骨髄増殖性新生物の現行の分子診断における欠落を埋めるものと考える。まとめると、本態性血小板血症または原発性骨髄線維症を伴う、本発明者らの患者で、ＪＡＫ２、ＭＰＬ、またはＣＡＬＲの体細胞突然変異を保有しない患者は、１０％未満に過ぎない。これらの対象のうちの一部では、突然変異したクローンは、現行の手法で検出されるには、あまりに少量でありうるだろう。希少な突然変異体ドライバー遺伝子は、他の患者では役割を果たしうるが、一部の患者は、クローン疾患を全く有さない可能性もあろう。クローン性血小板増加症と反応性血小板増加症との鑑別診断は、クローンマーカーなしには困難でありうるので、これは、本態性血小板血症の臨床診断を伴う患者について特に当てはまる（Schafer, 2004）。総じて、ＣＡＬＲ突然変異の評価は、本態性血小板血症または原発性骨髄線維症についての現行の診断法を目覚ましく改善するものであり、これらの障害についてのＷＨＯ基準に組入れるべきものである（Sverdlow et al, 2008）。
【０６２６】
本発明者らが同定したＣＡＬＲの全ての突然変異は、タンパク質のＣ末端アミノ酸をコードする最終端のエクソン内の挿入／欠失突然変異である。大半の突然変異は、ヘテロ接合性状態で存在し、特異的な代替的リーディングフレームへのフレームシフトを引き起こす。このフレームシフトは、カルレチクリンのＣ末端の、負に帯電したアミノ酸の、アルギニンおよびメチオニンに富む、正に帯電したポリペプチドによる置き換えを結果としてもたらす。カルレチクリンの最終端の４アミノ酸（ＫＤＥＬ（配列番号１３３１））は、小胞体保持シグナルを含有する。このシグナルは、突然変異体カルレチクリン内には存在しない。結果として、突然変異体カルレチクリンは細胞内の局在化を変化させる。カルレチクリンの負に帯電したＣ末端は、低アフィニティーで高キャパシティーのＣａ２＋結合性ドメインであるので、突然変異体タンパク質のＣａ２＋結合機能が損なわれうる。突然変異したＣＡＬＲのＣ末端における代替的リーディングフレームに由来するペプチド配列の存在は、がん特異的なエピトープを表すので、免疫学的ターゲティングの可能性をもたらす。
【０６２７】
突然変異体カルレチクリンの発がん能についてさらに解析するため、本発明者らは、野生型および１型突然変異体ＣＡＬＲ（５２塩基対の欠失−ｄｅｌ５２）の過剰発現を伴うＢａ／Ｆ３細胞を生成した。興味深いことに、ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２  Ｂａ／Ｆ３細胞は、サイトカイン非依存性の増殖を示した。しかし、野生型カルレチクリンを発現させるＢａ／Ｆ３細胞および突然変異体カルレチクリンを発現させるＢａ／Ｆ３細胞の増殖は、ＪＡＫ２キナーゼ阻害剤で処置すると、同等に抑制されたことから、突然変異体カルレチクリンに誘導されるサイトカイン非依存性には、ＪＡＫ−ＳＴＡＴ経路が要求されることが示唆される。したがって、本発明者らは、インターロイキン３による刺激の非存在下および存在下の両方において、ｄｅｌ５２  Ｂａ／Ｆ３細胞内のＳＴＡＴ５のリン酸化の増大を検出することができた。カルレチクリン／Ｃａ２＋／カルモジュリンは、Ｓｔａｔの活性をモジュレートすることが既に示されている。カルレチクリンのＥＲｐ５７との複合体は、小胞体内で、マウス胚性線維芽細胞内のＳｔａｔ３のリン酸化および転写活性を抑制する（Coe et al, 2010）。さらに、Ｃａ２＋／カルモジュリン依存性キナーゼＩＩガンマの阻害は、リン酸化Ｓｔａｔ１、Ｓｔａｔ３、およびＳｔａｔ５のレベルの低減を結果としてもたらす（Si & Collins 2008）。興味深いことに、カルレチクリンの過剰発現は、インターフェロンアルファに誘導されるＳｔａｔ１のリン酸化を弱める結果として、インターフェロン耐性をもたらす（Yue et al, 2012）。骨髄細胞内の突然変異体カルレチクリンによるＪＡＫ−ＳＴＡＴ経路の活性化機構を解明するには、さらなる研究が要求される。ＣＡＬＲ陽性患者における、ＪＡＫ−ＳＴＡＴシグナル伝達経路の関与はまた、原発性骨髄線維症におけるＪＡＫ２阻害剤療法の有効性も説明しうる。しかし、本発明者らの結果は、ＪＡＫ２阻害剤は、突然変異したＣＡＬＲを発現させる細胞に対して、ＣＡＬＲ野生型細胞と比較して、選択性ではない可能性があることを示す。
【０６２８】
臨床転帰についての本発明者らの解析は、遡及的であるが、それらは、ＣＡＬＲ陽性骨髄増殖性新生物は、ＪＡＫ２またはＭＰＬ突然変異と関連する、対応する障害より、良性の臨床経過を有することを強く示唆する。ＭＰＬを突然変異させた患者の数が少ないため、より信頼できる比較は、ＪＡＫ２を突然変異させた患者と、ＣＡＬＲを突然変異させた患者との比較である。本発明者らの観察は、ＣＡＬＲを突然変異させた患者は、ＪＡＫ２を突然変異させた患者より血栓症の危険性が小さく、全生存も良好であることを明確に示す。血栓塞栓性合併症の発生率が小さいことは、ＣＡＬＲを突然変異させた患者は、ヘモグロビンレベルが低く、白血球カウントも小さいという事実と関連しうるであろう。良好な全生存は、原発性骨髄線維症を伴う患者および本態性血小板血症を伴う患者の両方において観察されたが、前者においてより関与性であったことから、ＪＡＫ２突然変異を伴う患者およびＪＡＫ２突然変異を伴わない患者についてのかつての知見（Campbell et al, 2006b；Rumi et al, 2013）が確認される。実際的な観点から述べると、原発性骨髄線維症および本態性血小板血症のための既存の予後診断スコアリングシステムには、突然変異体遺伝子の異なる影響が組み込まれる可能性があり（Passamonti 2010b、Passamonti 2012）、これもまた、治療上の意思決定の指針となりうる。より具体的に、ＣＡＬＲの分子的特徴づけは、本態性血小板血症および原発性骨髄線維症の将来の臨床管理の本質的構成要素となるべきである。
【実施例２】
【０６２９】
マウスにおけるＣＡＬＲ突然変異体特異的抗体の生成
ＭＰＮと関連するＣＡＬＲ突然変異は、遺伝子の最終端のエクソン（エクソン９）内で生じる。これらの突然変異は、まさに特異的な代替的リーディングフレームへの「フレームシフト」突然変異を結果としてもたらす挿入および／または欠失であり、突然変異体内の新規のＣ末端ペプチドの合成をもたらす。全ての突然変異は、同じ代替的リーディングフレームの生成を結果としてもたらすので、Ｃ末端ペプチドは、全てのＣＡＬＲ突然変異体内で同じ配列を有する。
【０６３０】
突然変異体カルレチクリンタンパク質のＣ末端配列を伴う合成ペプチド（配列−ＲＲＫＭＳＰＡＲＰＲＴＳＣＲＥＡＣＬＱＧＷＴＥＡ−）であって、キーホールリンペットヘモシアニン（ＫＬＨ）へとコンジュゲートさせた、合成ペプチドを使用して、４匹の野生型Ｃ５７Ｂｌ／６マウスを免疫化した。
【０６３１】
マウスに、初期免疫化の後、３回にわたる追加投与を施した。ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２およびエクソン９を欠く人工的に生成したＣＡＬＲ突然変異体（突然変異体ペプチドを欠くΔエクソン９）を過剰発現させるＨＥＫ細胞からの溶解物についてのウェスタンブロット解析により、マウスの血清を、突然変異体カルレチクリンに特異的な抗体の存在について調べた（免疫前および追加投与後）。溶解物を、８％のポリアクリルアミドゲル上に泳動させ、マウス血清でプローブした。ＨＲＰへとコンジュゲートさせた抗マウス抗体（ＧＥ  ＮＡ９３１）を、二次抗体として使用した。２回目の追加投与後、４匹のマウスのいずれに由来する血清も、ＣＡＬＲ突然変異体に特異的な抗体であって、ＣＡＬＲ  ｄｅｌ５２突然変異体を検出する、抗体は有した（図８）が、対照のエクソン９を欠失させたＣＡＬＲを検出する、抗体は有さなかった（図９）。カルレチクリンの３つの形態（野生型、突然変異体ｄｅｌ５２、およびエクソン９を欠失させた形態）の全てを認識する、抗カルレチクリン抗体（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ  ＭＡＢＴ１４５）を、陽性対照（Ｐｏｓ）として使用した。４匹のマウス全ての血清に由来するシグナルは、３回目の追加投与を施した後に強くなった（図１０）。
【０６３２】
突然変異体カルレチクリンのＣ末端ペプチド（上述）は、免疫原性であり、突然変異体カルレチクリンに対する特異的な抗体、特に、ポリクローナル抗体を生成するのに使用することに成功しうる。これらの抗体は、研究試薬としてのほか、本明細書で開示される診断目的でも使用することができる。
【配列表フリーテキスト】
【０６３３】
本発明は、以下のヌクレオチドおよびアミノ酸配列を参照する。
【０６３４】
本明細書で提示される配列は、ＮＣＢＩデータベースで部分的に入手可能であり、www at ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=geneから検索されうる。配列はまた、注釈が施された配列および修飾配列にも関する。本発明はまた、本明細書で提示される簡便な配列の相同配列および変異体を使用する技法および方法も提供する。このような「変異体」は、遺伝子変異体であることが好ましい。
【０６３５】
配列番号１：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号５：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号９：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０：ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号２１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号２５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号２９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号３３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号３７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号４１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号４５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号４８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号４９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号５３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号５７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号５９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号６１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号６５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号６８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号６９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号７３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号７７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号７９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号８１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号８５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号８８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号８９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号９３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号９７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号９９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１００  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１０１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１０５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１０８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１０９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１１３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１１７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１１９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１２１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１２５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１２８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１２９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１３３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１３７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１３９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１４１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型のＣ末端をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型のＣ末端のアミノ酸配列
配列番号１４５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１４８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１型のアミノ酸配列
配列番号１４９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２型のアミノ酸配列
配列番号１５３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３型のアミノ酸配列
配列番号１５７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１５９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体４型のアミノ酸配列
配列番号１６１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体５型のアミノ酸配列
配列番号１６５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１６８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体６型のアミノ酸配列
配列番号１６９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体７型のアミノ酸配列
配列番号１７３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体８型のアミノ酸配列
配列番号１７７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１７９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体９型のアミノ酸配列
配列番号１８１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１０型のアミノ酸配列
配列番号１８５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１８８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１１型のアミノ酸配列
配列番号１８９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１２型のアミノ酸配列
配列番号１９３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１３型のアミノ酸配列
配列番号１９７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号１９９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２００  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１４型のアミノ酸配列
配列番号２０１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１５型のアミノ酸配列
配列番号２０５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２０８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１６型のアミノ酸配列
配列番号２０９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１７型のアミノ酸配列
配列番号２１３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１８型のアミノ酸配列
配列番号２１７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２１９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体１９型のアミノ酸配列
配列番号２２１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２０型のアミノ酸配列
配列番号２２５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２２８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２１型のアミノ酸配列
配列番号２２９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２２型のアミノ酸配列
配列番号２３３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２３型のアミノ酸配列
配列番号２３７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２３９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２４型のアミノ酸配列
配列番号２４１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２５型のアミノ酸配列
配列番号２４５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２４８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２６型のアミノ酸配列
配列番号２４９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２７型のアミノ酸配列
配列番号２５３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２８型のアミノ酸配列
配列番号２５７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２５９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体２９型のアミノ酸配列
配列番号２６１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３０型のアミノ酸配列
配列番号２６５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２６８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３１型のアミノ酸配列
配列番号２６９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３２型のアミノ酸配列
配列番号２７３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３３型のアミノ酸配列
配列番号２７７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２７９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３４型のアミノ酸配列
配列番号２８１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３５型のアミノ酸配列
配列番号２８５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２８８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン突然変異体３６型のアミノ酸配列
配列番号２８９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン野生型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリン野生型のアミノ酸配列
配列番号２９１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１型のアミノ酸配列
配列番号２９５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号２９８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２型のアミノ酸配列
配列番号２９９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３００  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３型のアミノ酸配列
配列番号３０３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体４型のアミノ酸配列
配列番号３０７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３０９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体５型のアミノ酸配列
配列番号３１１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体６型のアミノ酸配列
配列番号３１５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３１８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体７型のアミノ酸配列
配列番号３１９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体８型のアミノ酸配列
配列番号３２３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体９型のアミノ酸配列
配列番号３２７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３２９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１０型のアミノ酸配列
配列番号３３１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１１型のアミノ酸配列
配列番号３３５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３３８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１２型のアミノ酸配列
配列番号３３９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１３型のアミノ酸配列
配列番号３４３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１４型のアミノ酸配列
配列番号３４７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３４９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１５型のアミノ酸配列
配列番号３５１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１６型のアミノ酸配列
配列番号３５５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３５８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１７型のアミノ酸配列
配列番号３５９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１８型のアミノ酸配列
配列番号３６３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体１９型のアミノ酸配列
配列番号３６７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３６９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２０型のアミノ酸配列
配列番号３７１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２１型のアミノ酸配列
配列番号３７５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３７８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２２型のアミノ酸配列
配列番号３７９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２３型のアミノ酸配列
配列番号３８３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２４型のアミノ酸配列
配列番号３８７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３８９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２５型のアミノ酸配列
配列番号３９１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２６型のアミノ酸配列
配列番号３９５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２７型をコードするヌクレオチド配列
配列番号３９８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２７型のアミノ酸配列
配列番号３９９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４００  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２８型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２８型のアミノ酸配列
配列番号４０３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２９型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体２９型のアミノ酸配列
配列番号４０７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４０９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３０型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３０型のアミノ酸配列
配列番号４１１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３１型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３１型のアミノ酸配列
配列番号４１５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３２型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４１８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３２型のアミノ酸配列
配列番号４１９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３３型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３３型のアミノ酸配列
配列番号４２３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３４型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３４型のアミノ酸配列
配列番号４２７  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２８  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４２９  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３５型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４３０  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３５型のアミノ酸配列
配列番号４３１  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４３２  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４３３  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３６型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４３４  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９突然変異体３６型のアミノ酸配列
配列番号４３５  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９野生型をコードするヌクレオチド配列
配列番号４３６  ヒト（homo sapiens）カルレチクリンのエクソン９野生型のアミノ酸配列
【０６３６】
以下の表は、本明細書で提示され、使用される配列番号についての概観を提示する。
【０６３７】
【表１１−１】
0006745220.tif 000044
【０６３８】
【表１１−２】
0006745220.tif 000045
【０６３９】
【表１１−３】
0006745220.tif 000046
【０６４０】
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【０６４１】
本明細書で引用される全ての参考文献は、参照により完全に組み込まれる。今や、本発明について完全に記載したが、当業者は、本発明を、本発明の精神もしくは範囲、またはその任意の実施形態に影響を及ぼすことなく、条件、パラメータなどの広範かつ同等な範囲内で実施しうることを理解するであろう。
本発明は以下を提供する。
［１］
患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の存在を決定するステップと、
−前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法。
［２］
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含む、
請求項１に記載の方法。
［３］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２に記載の方法。
［４］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２または３に記載の方法。
［５］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２から４のいずれか一項に記載の方法。
［６］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２から５のいずれか一項に記載の方法。
［７］
前記カルレチクリン遺伝子の前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、前記カルレチクリン遺伝子のエクソン９を包含する領域内にある、請求項１から６のいずれか一項に記載の方法。
［８］
前記突然変異対立遺伝子が、野生型カルレチクリン遺伝子と比較して、フレームシフト突然変異を有する、請求項１から７のいずれか一項に記載の方法。
［９］
前記フレームシフト突然変異が、前記カルレチクリン遺伝子のエクソン９内にある、請求項８に記載の方法。
［１０］
前記フレームシフト突然変異が、１ヌクレオチドの欠失または２ヌクレオチドの付加である、請求項８または９に記載の方法。
［１１］
（１＋（３×ｎ０））ヌクレオチドが、前記カルレチクリン遺伝子から欠失している、請求項８または９のいずれか一項に記載の方法。
［１２］
１、４、１９、２２、３１、３４、４６、５２ヌクレオチドが欠失している、請求項８、９、および１１のいずれか一項に記載の方法。
［１３］
１ヌクレオチドが欠失し、６ヌクレオチドが挿入されているか；
２ヌクレオチドが欠失し、４ヌクレオチドが挿入されているか；
３ヌクレオチドが欠失し、５ヌクレオチドが挿入されているか；
１２ヌクレオチドが欠失し、５ヌクレオチドが挿入されているか；
１８ヌクレオチドが欠失し、１１ヌクレオチドが挿入されているか；
１８ヌクレオチドが欠失し、１４ヌクレオチドが挿入されているか；
２０ヌクレオチドが欠失し、１ヌクレオチドが挿入されているか；
２８ヌクレオチドが欠失し、６ヌクレオチドが挿入されているか；
３５ヌクレオチドが欠失し、１ヌクレオチドが挿入されているか；または
３６ヌクレオチドが欠失し、２ヌクレオチドが挿入されている、
請求項８、９、１１、および１２のいずれか一項に記載の方法。
［１４］
（２＋（３×ｎ０））ヌクレオチドが、前記カルレチクリン遺伝子に挿入されている、請求項８または９に記載の方法。
［１５］
５ヌクレオチドが挿入されている、請求項１４に記載の方法。
［１６］
前記カルレチクリン遺伝子が、
（ａ）配列番号２９０に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２８９に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含む、請求項１から１５のいずれか一項に記載の方法。
［１７］
前記ヌクレオチドが、前記カルレチクリン遺伝子のエクソン９から欠失し、かつ／または、これに挿入されている、請求項１０から１６のいずれか一項に記載の方法。
［１８］
前記カルレチクリン遺伝子の前記エクソン９が、
（ａ）配列番号４３６に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号４３５に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される配列を含む、請求項９から１７のいずれか一項に記載の方法。
［１９］
前記突然変異対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、請求項１から１８のいずれか一項に記載の方法。
［２０］
前記突然変異対立遺伝子が、ＤＮＡ、好ましくは、ゲノムＤＮＡである、請求項１から１９のいずれか一項に記載の方法。
［２１］
前記ＤＮＡの存在を、シークエンシングにより決定する、請求項２０に記載の方法。
［２２］
患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいかどうかを評価するための方法であって、
−前記患者に由来する試料中のカルレチクリン遺伝子の１または複数の突然変異対立遺伝子の遺伝子産物の存在を決定するステップと、
−前記遺伝子産物が存在する場合に、前記患者が、骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価するステップと
を含む、方法。
［２３］
前記１または複数の突然変異対立遺伝子が、突然変異体カルレチクリンタンパク質をコードする核酸を含む、
請求項２２に記載の方法。
［２４］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２３に記載の方法。
［２５］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２３または２４に記載の方法。
［２６］
前記カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２３から２５のいずれか一項に記載の方法。
［２７］
前記突然変異体カルレチクリンタンパク質が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択される、請求項２３から２６のいずれか一項に記載の方法。
［２８］
前記対立遺伝子が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、１４４、１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、２８８；２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、１４１、１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、２８５、２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、請求項２２から２７のいずれか一項に記載の方法。
［２９］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、請求項２２から２８のいずれか一項に記載の方法。
［３０］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、請求項２２から２９のいずれか一項に記載の方法。
［３１］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、請求項２２から３０のいずれか一項に記載の方法。
［３２］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列を含む核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列を含む核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列を含む核酸
からなる群から選択される核酸を含む、請求項２２から３１のいずれか一項に記載の方法。
［３３］
前記遺伝子産物が、
ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、請求項２２から２８のいずれか一項に記載の方法。
［３４］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、請求項２２から２８、および３３のいずれか一項に記載の方法。
［３５］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、請求項２２から２８、３３、および３４のいずれか一項に記載の方法。
［３６］
前記遺伝子産物が、
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質
からなる群から選択されるポリペプチドを含む、請求項２２から２８、および３３から３５のいずれか一項に記載の方法。
［３７］
前記遺伝子産物が、ｍＲＮＡである、請求項２２から３６のいずれか一項に記載の方法。
［３８］
前記ｍＲＮＡの存在または量を、リアルタイムＰＣＲ、逆転写酵素ＰＣＲ、全トランスクリプトームショットガンシークエンシング（ＲＮＡｓｅｑ）、ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、またはマイクロアレイにより決定する、請求項３７に記載の方法。
［３９］
リアルタイムＰＣＲまたは逆転写酵素ＰＣＲによる前記決定が、
（ｉ）前記試料中の前記核酸を１つまたは２つのオリゴヌクレオチドと接触させるステップと、
（ｉｉ）標的配列を含有する増幅産物を生成するステップと
をさらに含む、請求項３８に記載の方法。
［４０］
前記遺伝子産物が、タンパク質である、請求項２２から２８および３３から３６のいずれか一項に記載の方法。
［４１］
前記タンパク質の存在または量を、免疫組織化学（ＩＨＣ）、イムノアッセイ、ゲルもしくはブロットベースの方法、ＩＨＣ、質量分析、フローサイトメトリー、またはＦＡＣＳにより決定する、請求項４０に記載の方法。
［４２］
前記患者が、ヒト患者である、請求項１から４１のいずれか一項に記載の方法。
［４３］
前記試料が、骨髄試料である、請求項１から４２のいずれか一項に記載の方法。
［４４］
前記試料が、血液試料である、請求項１から４２のいずれか一項に記載の方法。
［４５］
前記骨髄試料が、生検により得られる、請求項４３または４４に記載の方法。
［４６］
突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、前記患者に投与するステップをさらに含む、請求項１から４５のいずれか一項に記載の方法。
［４７］
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される核酸。
［４８］
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２、６、１０、１４、１８、２２、２６、３０、３４、３８、４２、４６、５０、５４、５８、６２、６６、７０、７４、７８、８２、８６、９０、９４、９８、１０２、１０６、１１０、１１４、１１８、１２２、１２６、１３０、１３４、１３８、または１４２に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項４７に記載の核酸。
［４９］
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９２、２９６、３００、３０４、３０８、３１２、３１６、３２０、３２４、３２８、３３２、３３６、３４０、３４４、３４８、３５２、３５６、３６０、３６４、３６８、３７２、３７６、３８０、３８４、３８８、３９２、３９６、４００、４０４、４０８、４１２、４１６、４２０、４２４、４２８、または４３２に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項４７または４８に記載の核酸。
［５０］
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４６、１５０、１５４、１５８、１６２、１６６、１７０、１７４、１７８、１８２、１８６、１９０、１９４、１９８、２０２、２０６、２１０、２１４、２１８、２２２、２２６、２３０、２３４、２３８、２４２、２４６、２５０、２５４、２５８、２６２、２６６、２７０、２７４、２７８、２８２、または２８６に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項４７から４９のいずれか一項に記載の核酸。
［５１］
ｃＤＮＡである、請求項４７から５０のいずれか一項に記載の核酸。
［５２］
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される核酸。
［５３］
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号３、７、１１、１５、１９、２３、２７、３１、３５、３９、４３、４７、５１、５５、５９、６３、６７、７１、７５、７９、８３、８７、９１、９５、９９、１０３、１０７、１１１、１１５、１１９、１２３、１２７、１３１、１３５、１３９、または１４３に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項５２に記載の核酸。
［５４］
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９３、２９７、３０１、３０５、３０９、３１３、３１７、３２１、３２５、３２９、３３３、３３７、３４１、３４５、３４９、３５３、３５７、３６１、３６５、３６９、３７３、３７７、３８１、３８５、３８９、３９３、３９７、４０１、４０５、４０９、４１３、４１７、４２１、４２５、４２９、または４３３に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項５２または５３に記載の核酸。
［５５］
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４７、１５１、１５５、１５９、１６３、１６７、１７１、１７５、１７９、１８３、１８７、１９１、１９５、１９９、２０３、２０７、２１１、２１５、２１９、２２３、２２７、２３１、２３５、２３９、２４３、２４７、２５１、２５５、２５９、２６３、２６７、２７１、２７５、２７９、２８３、または２８７に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項５２または５４に記載の核酸。
［５６］
ｍＲＮＡである、請求項５２から５５のいずれか一項に記載の核酸。
［５７］
（ａ）配列番号４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される核酸。
［５８］
（ａ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１、５、９、１３、１７、２１、２５、２９、３３、３７、４１、４５、４９、５３、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、８５、８９、９３、９７、１０１、１０５、１０９、１１３、１１７、１２１、１２５、１２９、１３３、１３７、または１４１に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項５７に記載の核酸。
［５９］
（ａ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号２９１、２９５、２９９、３０３、３０７、３１１、３１５、３１９、３２３、３２７、３３１、３３５、３３９、３４３、３４７、３５１、３５５、３５９、３６３、３６７、３７１、３７５、３７９、３８３、３８７、３９１、３９５、３９９、４０３、４０７、４１１、４１５、４１９、４２３、４２７、または４３１に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項５７または５８に記載の核酸。
［６０］
（ａ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に表示されるアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする核酸；
（ｂ）配列番号１４５、１４９、１５３、１５７、１６１、１６５、１６９、１７３、１７７、１８１、１８５、１８９、１９３、１９７、２０１、２０５、２０９、２１３、２１７、２２１、２２５、２２９、２３３、２３７、２４１、２４５、２４９、２５３、２５７、２６１、２６５、２６９、２７３、２７７、２８１、または２８５に表示されるヌクレオチド配列からなる核酸；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定された前記核酸の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸；
（ｄ）（ａ）〜（ｃ）のうちのいずれか１つの前記核酸のヌクレオチド配列に対して少なくとも７０％の同一性を伴うヌクレオチド配列からなる核酸；および
（ｅ）（ａ）〜（ｄ）のうちのいずれか１つの核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重であるヌクレオチド配列からなる核酸
からなる群から選択される、請求項５７から５９のいずれか一項に記載の核酸。
［６１］
ゲノムＤＮＡである、請求項５７から６０のいずれか一項に記載の核酸。
［６２］
（ａ）配列番号１、２、または３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質
からなる群から選択されるタンパク質。
［６３］
（ａ）配列番号１、２、３、５、６、７、９、１０、１１、１３、１４、１５、１７、１８、１９、２１、２２、２３、２５、２６、２７、２９、３０、３１、３３、３４、３５、３７、３８、３９、４１、４２、４３、４５、４６、４７、４９、５０、５１、５３、５４、５５、５７、５８、５９、６１、６２、６３、６５、６６、６７、６９、７０、７１、７３、７４、７５、７７、７８、７９、８１、８２、８３、８５、８６、８７、８９、９０、９１、９３、９４、９５、９７、９８、９９、１０１、１０２、１０３、１０５、１０６、１０７、１０９、１１０、１１１、１１３、１１４、１１５、１１７、１１８、１１９、１２１、１２２、１２３、１２５、１２６、１２７、１２９、１３０、１３１、１３３、１３４、１３５、１３７、１３８、１３９、１４１、１４２、または１４３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号４、８、１２、１６、２０、２４、２８、３２、３６、４０、４４、４８、５２、５６、６０、６４、６８、７２、７６、８０、８４、８８、９２、９６、１００、１０４、１０８、１１２、１１６、１２０、１２４、１２８、１３２、１３６、１４０、または１４４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質
からなる群から選択される、請求項６２に記載のタンパク質。
［６４］
（ａ）配列番号２９１、２９２、２９３、２９５、２９６、２９７、２９９、３００、３０１、３０３、３０４、３０５、３０７、３０８、３０９、３１１、３１２、３１３、３１５、３１６、３１７、３１９、３２０、３２１、３２３、３２４、３２５、３２７、３２８、３２９、３３１、３３２、３３３、３３５、３３６、３３７、３３９、３４０、３４１、３４３、３４４、３４５、３４７、３４８、３４９、３５１、３５２、３５３、３５５、３５６、３５７、３５９、３６０、３６１、３６３、３６４、３６５、３６７、３６８、３６９、３７１、３７２、３７３、３７５、３７６、３７７、３７９、３８０、３８１、３８３、３８４、３８５、３８７、３８８、３８９、３９１、３９２、３９３、３９５、３９６、３９７、３９９、４００、４０１、４０３、４０４、４０５、４０７、４０８、４０９、４１１、４１２、４１３、４１５、４１６、４１７、４１９、４２０、４２１、４２３、４２４、４２５、４２７、４２８、４２９、４３１、４３２、または４３３に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号２９４、２９８、３０２、３０６、３１０、３１４、３１８、３２２、３２６、３３０、３３４、３３８、３４２、３４６、３５０、３５４、３５８、３６２、３６６、３７０、３７４、３７８、３８２、３８６、３９０、３９４、３９８、４０２、４０６、４１０、４１４、４１８、４２２、４２６、４３０、または４３４に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質
からなる群から選択される、請求項６２または６３に記載のタンパク質。
［６５］
（ａ）配列番号１４５、１４６、１４７、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５７、１５８、１５９、１６１、１６２、１６３、１６５、１６６、１６７、１６９、１７０、１７１、１７３、１７４、１７５、１７７、１７８、１７９、１８１、１８２、１８３、１８５、１８６、１８７、１８９、１９０、１９１、１９３、１９４、１９５、１９７、１９８、１９９、２０１、２０２、２０３、２０５、２０６、２０７、２０９、２１０、２１１、２１３、２１４、２１５、２１７、２１８、２１９、２２１、２２２、２２３、２２５、２２６、２２７、２２９、２３０、２３１、２３３、２３４、２３５、２３７、２３８、２３９、２４１、２４２、２４３、２４５、２４６、２４７、２４９、２５０、２５１、２５３、２５４、２５５、２５７、２５８、２５９、２６１、２６２、２６３、２６５、２６６、２６７、２６９、２７０、２７１、２７３、２７４、２７５、２７７、２７８、２７９、２８１、２８２、２８３、２８５、２８６、または２８７に表示される核酸配列を有する核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｂ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｃ）（ａ）または（ｂ）で規定されたタンパク質であって、１または複数のアミノ酸が欠失し、挿入され、付加され、または置換されているタンパク質；
（ｄ）配列番号１４８、１５２、１５６、１６０、１６４、１６８、１７２、１７６、１８０、１８４、１８８、１９２、１９６、２００、２０４、２０８、２１２、２１６、２２０、２２４、２２８、２３２、２３６、２４０、２４４、２４８、２５２、２５６、２６０、２６４、２６８、２７２、２７６、２８０、２８４、または２８８に示されるアミノ酸配列を含むタンパク質をコードする核酸分子によりコードされるタンパク質；
（ｅ）（ａ）または（ｃ）で規定された核酸分子の相補鎖と厳密な条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質；
（ｆ）（ａ）〜（ｅ）のうちのいずれか１つの前記タンパク質に対して少なくとも７０％の同一性を有するタンパク質；および
（ｇ）（ａ）、（ｄ）、または（ｅ）で規定された核酸のヌクレオチド配列に対する遺伝子コードの結果として縮重である核酸によりコードされるアミノ酸配列からなるタンパク質
からなる群から選択される、請求項６２から６４のいずれか一項に記載のタンパク質。
［６６］
請求項６２または６３に記載のタンパク質を含むワクチン。
［６７］
請求項６２から６５のいずれか一項に記載のタンパク質に特異的に結合する抗体。
［６８］
請求項５２から５６のいずれか一項に記載の核酸を特異的にターゲティングするｓｉＲＮＡ。
［６９］
少なくとも１０の連続した塩基を含む核酸分子からなる、請求項６８に記載のｓｉＲＮＡ。
［７０］
前記連続した塩基のうちの最大１０％が、非相補的である、請求項６８または６９に記載のｓｉＲＮＡ。
［７１］
５’端における少なくとも１つの塩基および／または３’端における少なくとも１つの塩基をさらに含む、請求項６８から７０のいずれか一項に記載のｓｉＲＮＡ。
［７２］
骨髄性悪性腫瘍の処置における使用のための、突然変異体カルレチクリンの阻害剤。
［７３］
骨髄性悪性腫瘍患者を処置するための方法であって、有効量の突然変異体カルレチクリンの阻害剤を、前記患者に投与するステップを含む、方法。
［７４］
前記突然変異体カルレチクリンが、請求項６２から６５のいずれか一項に記載の突然変異体カルレチクリンタンパク質である、請求項７２に記載の阻害剤、または請求項４６もしくは７３に記載の方法。
［７５］
前記阻害剤が、抗体である、請求項７２もしくは７４に記載の阻害剤、または請求項５６、７３、もしくは７４に記載の方法。
［７６］
前記阻害剤が、細胞外結合性パートナー、低分子結合性分子、アプタマー、およびイントラマーからなる群から選択される、請求項７２もしくは７４に記載の阻害剤、または請求項５６、７３、もしくは７４に記載の方法。
［７７］
前記突然変異体カルレチクリンが、請求項５２から５６のいずれか一項に記載の核酸である、請求項７２に記載の阻害剤、または請求項４６もしくは７３に記載の方法。
［７８］
前記阻害剤が、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｄｓＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｔＲＮＡ、およびアンチセンス分子からなる群から選択される、請求項７２もしくは７７に記載の阻害剤、または請求項４６、７３、および７７のいずれか一項に記載の方法。
［７９］
前記骨髄性悪性腫瘍が、骨髄増殖性新生物である、請求項７２および７４から７８のいずれか一項に記載の阻害剤；または請求項１から４６および７３から７８のいずれか一項に記載の方法。
［８０］
前記骨髄増殖性新生物が、原発性骨髄線維症（ＰＭＦ）である、請求項７９に記載の阻害剤；または請求項７９に記載の方法。
［８１］
前記骨髄増殖性新生物が、本態性血小板血症（ＥＴ）である、請求項７９に記載の阻害剤；または請求項７９に記載の方法。
［８２］
前記骨髄性悪性腫瘍が、骨髄異形成症候群である、請求項７２および７４から７８のいずれか一項に記載の阻害剤；または請求項１から４６および７３から７８のいずれか一項に記載の方法。
［８３］
前記骨髄異形成症候群が、環状鉄芽球を伴う不応性貧血および血小板血症（ＲＡＲＳ−Ｔ）である、請求項８２に記載の阻害剤；または請求項８２に記載の方法。
［８４］
処置される前記患者が、請求項１から４６のいずれか一項に記載の骨髄性悪性腫瘍を患っているか、または請求項１から４６のいずれか一項に記載の骨髄性悪性腫瘍を患いやすいと評価される、請求項７２および７４から８３のいずれか一項に記載の阻害剤；または請求項７３から８３のいずれか一項に記載の方法。
［８５］
医薬としての使用のための、請求項６２もしくは６３に記載のタンパク質、請求項６７に記載の抗体、請求項６８から７１のいずれか一項に記載のｓｉＲＮＡ、または請求項７２から７８のいずれか一項に記載の突然変異体カルレチクリンの阻害剤。
［８６］
請求項４７から５１および５７から６１のいずれか一項に記載の核酸を含むベクター。
［８７］
請求項４７から５１および５７から６１のいずれか一項に記載の核酸、または請求項８６に記載のベクターを含む宿主細胞。
［８８］
請求項６２から６５に記載のポリペプチドを作製するための工程であって、請求項８７に記載の宿主細胞を、前記ポリペプチドの発現を可能とする条件下で培養するステップと、作製された前記ポリペプチドを培養物から回収するステップとを含む工程。
【図１】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図２Ｃ】
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【図３Ａ−Ｂ】
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【図３Ｃ】
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【図３Ｄ】
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【図３Ｅ】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図５Ｃ】
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【図６Ａ−Ｂ】
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【図６Ｃ】
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【図６Ｄ】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【配列表】
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