(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）およびセリアック病の双方からの過敏性腸症候群（ＩＢＳ）の識別を補助する方法であって、
ＩＢＤおよびセリアック病の双方からのＩＢＳの識別を所望している対象由来の生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、もしくは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示されかつＩＢＤおよびセリアック病が示されない段階
を含む、前記識別を補助する方法。
【請求項２】
前記生体試料が、全血、血清、または血漿である、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記生体試料にて検出する段階が、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を使用することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記生体試料にて検出する段階が、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイ、または親和性精製を使用することを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記抗ビンキュリン抗体が、ビンキュリンまたは配列番号７のエピトープに特異的に結合することができる、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記抗ＣｄｔＢ抗体が、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）のＣｄｔＢまたは配列番号５のエピトープに特異的に結合することができる、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示される、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示される、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示される、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方の前記確立された対照レベルが、光学密度の測定値である、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
過敏性腸症候群（ＩＢＳ）のための治療の選択を補助する方法であって、
ＩＢＤおよびセリアック病の双方からのＩＢＳの識別を所望している対象由来の生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、もしくは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示されかつＩＢＤおよびセリアック病が示されない段階と；
ＩＢＳが示されればＩＢＳの治療を選択する段階と
を含む、前記選択を補助する方法。
【請求項１２】
前記生体試料が、全血、血清、または血漿である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記生体試料にて検出する段階が、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を使用することを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１４】
前記生体試料にて検出する段階が、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイ、または親和性精製を使用することを含む、請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
前記抗ビンキュリン抗体が、ビンキュリンまたは配列番号７のエピトープに特異的に結合することができる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１６】
前記抗ＣｄｔＢ抗体が、カンピロバクター・ジェジュニのＣｄｔＢまたは配列番号５のエピトープに特異的に結合することができる、請求項１１に記載の方法。
【請求項１７】
抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方の前記確立された対照レベルが、光学密度の測定値である、請求項１１に記載の方法。
【請求項１８】
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示される請求項１１に記載の方法。
【請求項１９】
抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示される、請求項１１に記載の方法。
【請求項２０】
抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳが示される、請求項１１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、その全体が参照によって本明細書に組み入れられる、２０１４年１０月９日に出願され、現在係属中の米国仮特許出願番号６２／０６１，８７７及び２０１４年１２月１日に出願され、現在係属中の米国仮特許出願番号６２／０８５，８２５に対する米国特許法１１９条（ｅ）のもとでの優先権の主張を含む。
【０００２】
発明の分野
本発明は過敏性腸症候群、その診断及び治療に関する。
【背景技術】
【０００３】
背景
本明細書での出版物はすべて、個々の出版物または特許出願のそれぞれが具体的に且つ個々に参照によって組み入れられるように指示されたかのような同じ程度に参照によって組み入れられる。以下の記載は本発明を理解することにおいて有用であってもよい情報を含む。それは、本明細書で提供される情報のいずれかが従来技術であるまたは現在請求されている発明に関連すると認めることではなく、または具体的にもしくは暗に参照される任意の出版物が従来技術であると認めることではない。
【０００４】
過敏性腸症候群（ＩＢＳ）は、集団のおよそ１５％である報告された罹病率を伴う、消化器にて最も一般的に診断される状態である。最近３０年にわたって、ＩＢＳの診断は臨床的な基準に基づいていた。これは、この状態の病態生理の理解が乏しいためである。
【０００５】
ＩＢＳの病態形成において２つの微生物的概念が出現している。第１は、ＩＢＳの症状が小腸微生物叢における変化に関連すると思われることを示唆している。これについての証拠は、呼気検査、小腸培養、小腸微生物叢のディープシークエンシング、及び消化管特異的な抗生剤であるリファキシミンに対する臨床的な応答に基づく。第２の微生物的概念は、対象のサブセットが急性胃腸炎（ＡＧＥ）の症状の発現に続いてＩＢＳを発症するということである。従来の大流行のメタ解析はＡＧＥの後にＩＢＳを発症する比率はおよそ１０％であることを示唆している。
【０００６】
ＩＢＳは、下痢、便秘及び交互に現れるパターンを含む腸機能における慢性的な変化、と同様に疼痛及び膨満感を含む腹部症状を生じる状態である。ＩＢＳの症状はＩＢＤ及びセリアック病のような器質性疾患と重複し得るので、ＩＢＳの診断は器質性疾患を除外した後に行われることが多い。最近の多国間での取り組みにおいて、ＩＢＳの専門家らは、これらの対象が主症状としての用便習慣の有意な変化及び膨満感に苦しんでいることを認めた。ＩＢＳの明瞭な病態生理の非存在下では、対象の特定は「除外診断」のアプローチに基づく。このアプローチには、それらの症状についての別の器質性の説明を除外するための頻繁な身体の画像撮影、内視鏡検査及び血液検査を含む、ＩＢＳの患者、特にＤ−ＩＢＳの患者に対するかなりの経費及び罹患率が関与する。
【０００７】
ローマ基準は臨床試験のためのＩＢＳの動員の標準化にて有益であった一方で、これらの基準はそれらが非特異的であるとき依然として「除外診断」のアプローチを当てにする。たとえば、クローン病または潰瘍性大腸炎の対象の大半はローマ基準を満たす。ローマＩＩ基準はさらに、下痢及び便秘が優勢な形態であるような優勢な腸のパターンに基づいてＩＢＳを定義することにおいて役立った。このアプローチはＩＢＳにおける症状を制御することに基づくＩＢＳの治療のための薬剤パイプラインをもたらした。Ｃ−ＩＢＳに対して運動促進剤及び分泌促進剤が開発されており、Ｄ−ＩＢＳに対して運動抑制剤が開発されている。しかしながら、これらの治療剤はＩＢＳの原因となるメカニズムには基づかず、代わりに症状の制御に基づいている。その結果、それらは反対の症状を結果的に作り出し得る。
【０００８】
セリアック病の診断が血清の組織トランスグルタミナーゼの測定によって大きく向上している一方で、慢性下痢の精密検査にてＩＢＤからＩＢＳを識別する生体マーカーのニーズが残っている。ＩＢＳを診断し、たとえば、ＩＢＤ及びセリアック病のような他のＧＩの病気からＩＢＳを識別する方法、アッセイ、及びシステムに対する当該技術におけるニーズが残っている。
【発明の概要】
【０００９】
例となる且つ説明に役立つが、範囲の限定ではないことにする組成物及び方法と併せて以下の実施形態及びその態様が記載され、説明される。
【００１０】
本発明の種々の実施形態は、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、セリアック病、またはその双方から過敏性腸症候群（ＩＢＳ）を識別する診断を所望している対象から生体試料を得る段階と；生体試料にて抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、もしくは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下す段階、または、抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高くなく、且つ抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高くなければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含む、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、セリアック病、またはその双方から過敏性腸症候群（ＩＢＳ）を識別する方法を提供する。
【００１１】
種々の実施形態では、生体試料は、全血、血清、または血漿である。
【００１２】
種々の実施形態では、生体試料にて検出する段階は、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を使用することを含むことができる。種々の実施形態では、生体試料にて検出する段階は、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイまたは親和性精製を使用することを含むことができる。
【００１３】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、ビンキュリンまたは配列番号７におけるエピトープに結合することが可能である。
【００１４】
種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）のＣｄｔＢまたは配列番号５におけるエピトープに結合することが可能である。
【００１５】
特定の実施形態では、抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下すことができる。特定の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下すことができる。種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下すことができる。
【００１６】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、または双方の確立された対照レベルは、光学密度の測定値であることができる。
【００１７】
本発明の種々の実施形態は、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、セリアック病、またはその双方から過敏性腸症候群（ＩＢＳ）を識別する診断を所望している対象から生体試料を得る段階と；生体試料にて抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、もしくは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高くなく、且つ抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高くなければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と；ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階と；ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階と、を含む、過敏性腸症候群（ＩＢＳ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、またはセリアック病の治療を選択する方法を提供する。
【００１８】
種々の実施形態では、生体試料は、全血、血清、または血漿であることができる。
【００１９】
種々の実施形態では、生体試料にて検出する段階は、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を使用することを含むことができる。種々の実施形態では、生体試料にて検出する段階は、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイ、または親和性精製を使用することを含むことができる。
【００２０】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、ビンキュリンまたは配列番号７におけるエピトープに結合することが可能である。
【００２１】
種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、カンピロバクター・ジェジュニのＣｄｔＢまたは配列番号５におけるエピトープに結合することが可能である。
【００２２】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方の確立された対照レベルは、光学密度の測定値であることができる。
【００２３】
特定の実施形態では、抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下すことができる。特定の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下すことができる。特定の実施形態では、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下すことができる。
【００２４】
[本発明1001]
炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、セリアック病、またはその双方からの過敏性腸症候群（ＩＢＳ）の識別方法であって、
ＩＢＤ、セリアック病、またはその双方からＩＢＳを識別する診断を所望している対象から生体試料を得る段階と；
前記生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、もしくは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下す段階、または
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の前記確立された対照レベルよりも高くなければ、且つ抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高くなければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と
を含む、前記識別方法。
[本発明1002]
前記生体試料が、全血、血清、または血漿である、本発明1001の方法。
[本発明1003]
前記生体試料にて検出する段階が、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を使用することを含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
前記生体試料にて検出する段階が、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイ、または親和性精製を使用することを含む、本発明1001の方法。
[本発明1005]
前記抗ビンキュリン抗体が、ビンキュリンまたは配列番号7のエピトープに特異的に結合することができる、本発明1001の方法。
[本発明1006]
前記抗ＣｄｔＢ抗体が、カンピロバクター・ジェジュニ（Ｃａｍｐｙｌｏｂａｃｔｅｒ  ｊｅｊｕｎｉ）のＣｄｔＢまたは配列番号5のエピトープに特異的に結合することができる、本発明1001の方法。
[本発明1007]
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断が行われる、本発明1001の方法。
[本発明1008]
抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断が行われる、本発明1001の方法。
[本発明1009]
抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断が行われる、本発明1001の方法。
[本発明1010]
抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方の前記確立された対照レベルが、光学密度の測定値である、本発明1001の方法。
[本発明1011]
過敏性腸症候群（ＩＢＳ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）、またはセリアック病のための治療の選択方法であって、
ＩＢＤ、セリアック病、またはその双方からＩＢＳを識別する診断を所望している対象から生体試料を得る段階と；
前記生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の確立された対照レベルよりも高ければ、抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、もしくは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断を下す段階、または
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の前記確立された対照レベルよりも高くなければ、且つ抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高くなければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と；
ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階と
を含む、前記選択方法。
[本発明1012]
前記生体試料が、全血、血清、または血漿である、本発明1011の方法。
[本発明1013]
前記生体試料にて検出する段階が、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）を使用することを含む、本発明1011の方法。
[本発明1014]
前記生体試料にて検出する段階が、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイ、または親和性精製を使用することを含む、本発明1011の方法。
[本発明1015]
前記抗ビンキュリン抗体が、ビンキュリンまたは配列番号7のエピトープに特異的に結合することができる、本発明1011の方法。
[本発明1016]
前記抗ＣｄｔＢ抗体が、カンピロバクター・ジェジュニのＣｄｔＢまたは配列番号5のエピトープに特異的に結合することができる、本発明1011の方法。
[本発明1017]
抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方の前記確立された対照レベルが、光学密度の測定値である、本発明1011の方法。
[本発明1018]
抗ビンキュリン抗体の前記レベルが抗ビンキュリン抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断が行われる本発明1011の方法。
[本発明1019]
抗ＣｄｔＢ抗体の前記レベルが抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断が行われる、本発明1011の方法。
[本発明1020]
抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の双方のレベルが抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の前記確立された対照レベルよりも高ければ、ＩＢＳの診断が行われる、本発明1011の方法。
本発明の他の特徴及び利点は、例として本発明の実施形態の種々の特徴を説明している添付の図面と併せて以下の詳細な説明から明らかになるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００２５】
例となる実施形態が参照される図面にて説明される。本明細書で開示されている実施形態及び図面は制約ではなく説明に役立つと見なされるべきであることが意図される。
【００２６】
【図１】（Ａ）本発明の種々の実施形態に従って群間で抗ＣｄｔＢ抗体のＯＤを比較する図である。（Ｂ）抗ＣｄｔＢ抗体についての光学密度（ＯＤ）を群間で比較する図である。点はボックスプロットを越えた外れ値対象を表す。力価は他の群に比べてＩＢＳ対象で高かった（ｐ＜０．００１）。力価は健常対照及びＩＢＤ対象に比べてセリアック病の対象で高かった（ｐ＜０．００１）。
【図２】（Ａ）本発明の種々の実施形態に従って群間で抗ビンキュリン抗体のＯＤを比較する図である。（Ｂ）抗ビンキュリン抗体についての光学密度（ＯＤ）を群間で比較する図である。点はボックスプロットを越えた外れ値対象を表す。力価は他の群に比べてＩＢＳ対象で高かった（ｐ＜０．００１）。
【図３Ａ】（Ａ）本発明の種々の実施形態に係る試験にてＩＢＳ対象とすべての非ＩＢＳ対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【図３Ｂ】（Ｂ）試験にてＩＢＳ対象とＩＢＤ対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である。ＡＵＣ：曲線下面積、ＣＩ：信頼区間（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【図３Ｃ】（Ｃ）試験にてＩＢＳ対象と健常対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【図４】本発明の種々の実施形態に係る試験にてＩＢＳ対象とすべてのＩＢＤ対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【図５】ＩＢＳ対象とセリアック病対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：開始時上の線、抗ビンキュリン：開始時下の線）。
【図６】ＩＢＳ対象と慢性下痢がある非ＩＢＳ対象（すなわち、ＣＤ、ＵＣ及びセリアック病）との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【図７】ＩＢＳ対象とＣＤ対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【図８】ＩＢＳ対象とＵＣ対象との間で抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを比較する受信者動作曲線（ＲＯＣ）を示す図である（抗ＣｄｔＢ：上の線、抗ビンキュリン：下の線）。
【発明を実施するための形態】
【００２７】
発明の説明
本明細書にて引用されている参考文献はすべて完全に言及されるかのようにその全体が参照によって組み入れられる。特に定義されない限り、本明細書で使用される専門用語及び科学用語は本発明が属する当該技術の当業者によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎら，Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，第３版，Ｊ．Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ（Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，ＮＹ  ２００６）；ならびにＳａｍｂｒｏｏｋ及びＲｕｓｓｅｌ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第４版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ，２０１２）は本出願で使用される用語の多数に対する一般的な指針を当業者に提供する。抗体の調製の仕方に関する参考文献については、Ｄ．Ｌａｎｅ，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，第２版．（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  ＮＹ，２０１３）；Ｋｏｈｌｅｒ及びＭｉｌｓｔｅｉｎ，（１９７６），Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．６：５１１；Ｑｕｅｅｎら．米国特許第５，５８５，０８９号；ならびにＲｉｅｃｈｍａｎｎら，Ｎａｔｕｒｅ，３３２：３２３（１９８８）；米国特許第４，９４６，７７８号；Ｂｉｒｄ，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４２：４２３−４２（１９８８）；Ｈｕｓｔｏｎら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８５：５８７９−５８８３（１９８８）；Ｗａｒｄら，Ｎａｔｕｒｅ，３３４：５４４−５４（１９８９）；Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ，Ｉ．及びＨｏｌｌｉｇｅｒ，Ｐ．（２０００），Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ，３２６，４６１−４７９；Ｈｏｌｌｉｇｅｒ，Ｐ．（２００５），Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｓｅｐ；２３（９）：１１２６−３６）を参照のこと。
【００２８】
当業者は、本発明の実践で使用されてもよい、本明細書に記載されているものに類似するまたはそれと同等の多数の方法及び材料を認識するであろう。実際、本発明は記載されている方法及び材料に決して限定されない。本発明の目的で以下の用語が以下で定義される。
【００２９】
「哺乳類」は本明細書で使用されるとき、限定しないで、ヒト及びチンパンジーや他の類人猿やサル種のような非ヒト霊長類；たとえば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ及びウマのような家畜；イヌ及びネコのような愛玩動物；マウス、ラット及びモルモットのような齧歯類を含む実験動物等を含む哺乳動物綱のメンバーを指す。該用語は特定の年齢または性別を意味しない。従って、成獣（人）及び新生児の対象は、胎児と同様にオスであれメスであれ、この用語の範囲内に含まれているように意図される。
【００３０】
「治療」または「治療すること」は本明細書で使用されるとき、治療上の処置及び予防上または予防的な対策（たとえば、状態または病状を有する可能性を軽減するための）の双方を指し、その際、目的は、治療が最終的に上手く行かなくても標的とされる病態または疾病を防ぐまたは鈍化する（軽減する）ことである。治療を必要とするものには、すでに病態もしくは疾病を伴ったものと同様に病態もしくは疾病を有する傾向があるもの、または病態もしくは疾病が予防されるべきであるもの（たとえば、病態もしくは疾病を有する可能性を減らすこと）が挙げられる。
【００３１】
「抗体」（単数）または「抗体」（複数）には本明細書で使用されるとき、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、たとえば、単鎖（組換え）Ｆｖのような抗体変異体、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、及び抗体の免疫的に活性のある断片が挙げられる。
【００３２】
「特異的に結合する」は本明細書で使用されるとき、その抗原に結合する抗体の作用を指し、無作為なタンパク質間で起きてもよい低レベルの非特異的な結合を排除するように意図される。「特異的に結合する」は本明細書で使用されるとき、抗体は関連するエピトープを含むタンパク質と交差反応することができるので抗体は本明細書で開示されているようなタンパク質またはポリペプチド以外の任意のタンパク質に結合しないことを意図されず、且つそれを暗示しない。
【００３３】
「有意に高い」は参照または対照の量に関連して本明細書で使用されるとき、参照または対照の量よりも統計的に有意に高い量を指す。
【００３４】
カンピロバクター・ジェジュニの感染に基づく感染後ＩＢＳ（ＰＩ−ＩＢＳ）の新しく検証された動物モデルは、ＡＧＥがＰＩ−ＩＢＳを引き起こし、小腸の微生物定着における有意な変化をもたらすことを示唆している。このモデルを用いて、これらの動物におけるＩＢＳ様の表現型の発症が特定の毒素である細胞致死性膨張性毒素Ｂ（ＣｄｔＢ）に依存することが断定された。重大なことに、この動物モデルにおけるＩＢＳ様の表現型の発症はＣｄｔＢの非存在下にて緩和された。実験のその後のシリーズにて、我々は、分子擬態を介してＣｄｔＢに対する宿主抗体が消化管の神経筋装置における宿主タンパク質であるビンキュリンと反応することを見いだした。動物モデルにおけるＣｄｔＢ及びビンキュリンに対する循環抗体の存在は、深部筋叢におけるカハール介在細胞（ＩＣＣ）の数における有意な低下を含む、消化管微生物集団の変化及び消化管神経筋装置における変化の発生に関連する。
【００３５】
ＩＢＳの根底にあるこれらの新しい病態生理学的なメカニズムに基づいて、我々は、ＩＢＳ患者及び非ＩＢＳ対照の大きなコホートにて抗ＣｄｔＢ抗体及び抗ビンキュリン抗体及びＣｄｔＢの保有率を評価し、ヒトにおけるビンキュリン及びＣｄｔＢに対する循環抗体の検出に基づいたＩＢＳのための生体マーカーを検証した。
【００３６】
本明細書に記載されているように、我々は、特定の理論に束縛されることを望まないで、感染後ＩＢＳの病態生理学的なメカニズム及び宿主におけるビンキュリンに対する自己抗体のその後の発生に基づいてＤ−ＩＢＳ用の生体マーカーを記載する。検査はＤ−ＩＢＳを診断することだけでなく慢性下痢の精密検査でも特異的であると思われ、ＩＢＤであるものからＤ−ＩＢＳ対象を区別することができる。
【００３７】
単独の急性胃腸炎の後でＩＢＳを発症する比率はおよそ１０％である一方で、軍隊配備のデータ及び数学的なモデル化は、ＰＩ−ＩＢＳが米国におけるＩＢＳの大きな部分を占めることを示唆している。ＰＩ−ＩＢＳは、専らではないが、たとえば、カンピロバクター・ジェジュニ、サルモネラ（Salmonella）、大腸菌（E.coli）及び赤痢菌(Shigella)のような細菌感染の後に主として起きる。これらの生物４つすべてによって共通して産生される１つの毒素が、３つのサブユニットＣｄｔＡ、ＣｄｔＢ、及びＣｄｔＣのヘテロ三量体複合体である細胞致死性膨張性毒素であり、その中でＣｄｔＢが活性のあるサブユニットである。
【００３８】
Ｃ.ジェジュニ８１〜１７６を用いて発達させた検証済動物モデルはＩＢＳ様の表現型を呈することが示されている。重大なことに、これらのラットは、ＩＢＳのヒトに特徴的な便形状の変化、小腸細菌の過剰増殖（ＳＩＢＯ）及び直腸上皮内リンパ球の増加を示す。このモデルでは、効果はカハール介在細胞の顕著な減少を伴う消化管の神経構造における変化によると思われた。さらに、ＣｄｔＢを欠いている変異体Ｃ.ジェジュニ株を感染させたラットが、野生型Ｃ.ジェジュニを感染させたものに比べて、有意に緩和されたＩＢＳ様の表現型を示したということは、このモデルにおけるＩＢＳの発症にＣｄｔＢが重要であったことを示唆している。このモデルにおける一連の免疫実験を介して、ＣｄｔＢは単に直接的な毒性を介して作用するのではなく、むしろ、ＣｄｔＢに対する抗体の宿主タンパク質であるビンキュリンとの交差反応を介して作用すると思われると断定された。ＣｄｔＢ及びビンキュリンに対する循環抗体のレベルはこれらの動物におけるＳＩＢＯの発生及びレベルに相関した。
【００３９】
ビンキュリンは、接着斑及び接着接合双方の重要な成分である１１７ｋＤａの細胞質アクチン結合タンパク質であり、インテグリンまたはカドヘリンそれぞれとアクチン細胞骨格との間で結合を形成する。さらに、ビンキュリンは、ビンキュリンのノックアウトマウスにおける神経管、心筋及び心内膜の欠損、と同様にヘテロ接合体変異体におけるストレス誘導性の心筋症によって証拠付けられたように神経細胞の運動性及び収縮性及び心臓形成で重要であると思われる。最近公表された研究では、ヘリコバクター・プロルム（Ｈｅｌｉｃｏｂａｃｔｅｒ  ｐｕｌｌｏｒｕｍ）に由来するＣｄｔが、腸管上皮細胞におけるビンキュリンを標的とし、細胞接着の低下と一緒に接着斑からのビンキュリンの非定型の脱局在化を誘発することが示されている。別の研究はビンキュリンが赤痢菌のＩｐＡ毒素によって使用されて細胞へ侵入を達成することを明らかにした。
【００４０】
この動物モデルにおける病態生理学的な観察に基づいて、我々は、ＣｄｔＢへの曝露がＣｄｔＢに対する検出可能な免疫と分子擬態に基づくビンキュリンに対する自己免疫とをもたらすという仮説を立てた。この研究では、我々は、多数のＩＢＳ及び非ＩＢＳの患者を用いて、初めて、これらの抗体のレベルがヒトにおいてＤ−ＩＢＳの生体マーカーとして役立つかどうかを評価する。我々は、生体マーカーが非ＩＢＳすべてからＤ−ＩＢＳを識別できると思われるように健常対照、セリアック病の対象、及びＩＢＤの対象と比べて、Ｄ−ＩＢＳにおいてビンキュリン及びＣｄｔＢに対する血漿抗体が上昇したことを観察する。理想的なカットオフ力価に基づいて、検査はＩＢＤに比べてＤ−ＩＢＳを特定するのに高い特異性を有する。ｔＴＧは慢性下痢の精密検査においてセリアック病の揺るぎない検査なので、実際の満たされていないニーズはＩＢＤからＩＢＳを確実に識別し得る生体マーカーである。興味深いことに、抗ビンキュリンではなく抗ＣｄｔＢは同様にセリアック病で高かった。セリアック病について別の重大な満たされていないニーズは進行中のグルテン曝露から機能的な症状を容易に識別する検査である。研究は、グルテン曝露の後、ＩＢＳは非応答性セリアック病の２番目に最も一般的な原因なので、症状のこれらの原因間を識別し得る検査は臨床的に有用であることになる。
【００４１】
これらの結果に基づいて、抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンの循環抗体はＤ−ＩＢＳの生体マーカーであり、ＰＩ−ＩＢＳの病態生理における独特の視点を提供する。特定の理論に束縛されることを望まない一方で、第１に、これらは、腸管神経系及び消化管の運動性に対する変化が関与してもよいＩＢＳの発症のメカニズムに基づく生体マーカーである。第２に、それらは、ＩＢＳを「除外診断」ではなく包含診断にする最初の機会を表す。Ｄ−ＩＢＳの対象すべてがこれらの生体マーカーについて陽性という結果を出すわけではないので、これらの抗体はメカニズム及び治療法が開発され得るＩＢＳの亜群を特定することも可能である。最後に、それはＩＢＳが器質的基盤を有してもよいことを示唆している。生体マーカーとして、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の測定値は過剰な探求をしないでＤ−ＩＢＳを特定するのに役立ち得るし、検査が陰性であるものにおける探求を対象とするのに役立ってもよい。
【００４２】
検査はセリアック病に比べてＤ−ＩＢＳを特定することに低い特異性を有する一方で、抗ｔＴＧによって付随して検査することが、これを補うはずである。
【００４３】
結論として、この研究は、大規模な前向き多施設試験を用いてＩＢＤ及び健常対照からＤ−ＩＢＳを分離する血液系の生体マーカーとしての抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢの存在を検証している。抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体は、感染後ＩＢＳの病態生理の一部であるとも思われ、所望の治療法についてＤ−ＩＢＳの亜群を特定してもよい。最も重要なことに、これはＩＢＳの器質的基盤を決定することにおける重要な段階であると思われる。
【００４４】
ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別すること
本発明の種々の実施形態はＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する方法、アッセイ、及びシステムを提供する。
【００４５】
方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体の存在を検出する段階と；抗ビンキュリン抗体の存在が検出されるならば、ＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体が存在しないならば、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００４６】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病、またはそれらの組み合わせがない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００４７】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病、またはそれらの組み合わせがない対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階と、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００４８】
方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの診断を下す段階、または抗ＣｄｔＢ抗体が非存在であれば、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００４９】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病またはそれらの組み合わせがない健常対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００５０】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病、またはそれらの組み合わせがない対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００５１】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体が非存在であれば、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００５２】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければ、ＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病、またはそれらの組み合わせがない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００５３】
種々の実施形態では、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤ、ＩＢＤの疑い、セリアック病もしくはセリアック病の疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病またはそれらの組み合わせがない対象に由来する抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、ＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階、またはセリアック病と診断されればもしくは疑われればセリアック病の治療を選択する段階を含む。
【００５４】
種々の実施形態では、システムは、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別することを所望している対象から単離された生体試料と、ＩＢＤ及びセリアック病からＩＢＳを識別するために抗ビンキュリン抗体の存在または抗ビンキュリン抗体のレベルを生体試料にて検出するためのアッセイと、を含むことができる。
【００５５】
種々の実施形態では、ＩＢＳは、Ｃ−ＩＢＳ、Ｄ−ＩＢＳ、Ａ−ＩＢＳ（Ｍ−ＩＢＳとしても知られる）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）であることができる。特定の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【００５６】
種々の実施形態では、ＩＢＤと診断されると、または疑われると、それはさらに、ＩＢＤの症状と相互に関連付けられ、ＩＢＤをさらに裏付けることができる。他の実施形態では、追加のＩＢＤの検査を行ってＩＢＤをさらに裏付けることができる。
【００５７】
種々の実施形態では、セリアック病と診断されると、または疑われると、それはさらに、セリアック病の症状と相互に関連付けられ、セリアック病をさらに裏付けることができる。他の実施形態では、追加のセリアック病の検査、たとえば、血清の組織トランスグルタミナーゼの測定を行ってセリアック病をさらに裏付けることができる。
【００５８】
種々の実施形態では、アッセイは、間接酵素結合免疫吸着アッセイ（間接ＥＬＩＳＡ）、サンドイッチＥＬＩＳＡ、競合ＥＬＩＳＡ、多重携帯用ＥＬＩＳＡを含むが、これらに限定されない酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）である。
【００５９】
種々の実施形態では、アッセイは、生体試料が抗ビンキュリン抗体を含むのであれば生体試料と反応する第１の試薬（抗ビンキュリン抗体が存在しなければ、第１の試薬は生体試料と反応しないが、第１の試薬は依然としてアッセイに存在する）と、抗ビンキュリン抗体と反応する第２の試薬（たとえば、二次抗体）または第１の試薬と反応する第２の試薬と、基質と、を含む。種々の実施形態では、第１の試薬はビンキュリンまたはその断片である。種々の実施形態では、第２の試薬は抗ビンキュリン抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、標識は基質と反応する酵素である。種々の実施形態では、第１の試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【００６０】
種々の実施形態では、アッセイは抗ビンキュリン抗体と反応する第１の試薬を含む。種々の実施形態では、第１の試薬は抗ビンキュリン抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【００６１】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体もしくはその双方の存在が検出されればＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体もしくはその双方が非存在であるならば、ＩＢＤもしくはセリアック病の存在もしくは推定存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、機械はコンピュータである。種々の実施形態では、コンピュータは患者がＩＢＳ、ＩＢＤ、またはセリアック病を有する可能性があるかどうかを表示するための表示要素を含む。
【００６２】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体もしくはその双方のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体もしくはその双方のレベルが確立された対照レベルと同等またはそれより低ければＩＢＤの存在もしくは推定存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病、またはそれらの組み合わせがない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析することを含む。
【００６３】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体もしくはその双方のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければ、ＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体もしくはその双方のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤの存在もしくは推定存在を判定するための、機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病またはそれらの組み合わせがない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルについて生体試料を分析することを含む。
【００６４】
種々の実施形態では、機械はコンピュータである。種々の実施形態では、コンピュータは患者がＩＢＳ、ＩＢＤまたはセリアック病を有する可能性があるかどうかを表示するための表示要素を含む。
【００６５】
種々の実施形態は、ＩＢＳ、ＩＢＤまたはセリアック病を有してもよい対象にてＩＢＳを治療することを提供する。方法は、ＩＢＳの治療を提供することと、本発明の方法を用いてＩＢＳであると診断された対象にＩＢＳの治療を投与することと、を含む。すなわち、対象は、本明細書にて議論されているように本発明の方法に従って抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在の検出を介してＩＢＳであると診断されている。
【００６６】
種々の実施形態では、ＩＢＳの治療は本明細書に記載されているような治療である。種々の実施形態では、ＩＢＳの治療は抗生剤療法の治療単位を投与してＩＢＳを治療することを含む。種々の実施形態では、ＩＢＳの治療は従来技術で利用可能な治療である。種々の実施形態では、ＩＢＳの治療は本明細書に記載されているような抗生剤療法の治療単位である。
【００６７】
種々の実施形態では、治療されるＩＢＳはＣ−ＩＢＳ、Ｄ−ＩＢＳ、Ａ−ＩＢＳ（Ｍ−ＩＢＳとしても知られる）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）であることができる。特定の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【００６８】
ＩＢＳとＩＢＤを識別すること
本発明の種々の実施形態は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する方法、アッセイ、及びシステムを提供する。
【００６９】
方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体の存在を検出する段階と；抗ビンキュリン抗体の存在が検出されればＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体が非存在であればＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７０】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれよりも低ければＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、セリアック病またはそれらの組み合わせがない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００７１】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７２】
方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの診断を下す段階、または抗ＣｄｔＢ抗体が非存在であればＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７３】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれよりも低ければＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない健常対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７４】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルはＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７５】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体が非存在であればＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７６】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれよりも低ければＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７７】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳとＩＢＤを識別する診断を所望している対象から生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの診断を下す段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＤもしくはＩＢＤの疑いの診断を下す段階と、を含むことができる。種々の実施形態では、確立された対照レベルはＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない対象に由来する抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、ＩＢＳと診断されればＩＢＳの治療を選択する段階、またはＩＢＤと診断されればもしくは疑われればＩＢＤの治療を選択する段階を含む。
【００７８】
種々の実施形態では、システムは、ＩＢＳとＩＢＤを識別することを所望している対象から単離された生体試料と、ＩＢＳとＩＢＤを識別するために抗ビンキュリン抗体の存在または抗ビンキュリン抗体のレベルを生体試料で検出するためのアッセイと、を含むことができる。
【００７９】
種々の実施形態では、ＩＢＳは、Ｃ−ＩＢＳ、Ｄ−ＩＢＳ、Ａ−ＩＢＳ（Ｍ−ＩＢＳとしても知られる）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）であることができる。特定の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【００８０】
種々の実施形態では、ＩＢＤと診断されると、または疑われると、それはさらに、ＩＢＤの症状と相互に関連付けられ、ＩＢＤをさらに裏付けることができる。他の実施形態では、追加のＩＢＤの検査を行ってＩＢＤをさらに裏付けることができる。
【００８１】
種々の実施形態では、アッセイは、間接酵素結合免疫吸着アッセイ（間接ＥＬＩＳＡ）、サンドイッチＥＬＩＳＡ、競合ＥＬＩＳＡ、多重携帯用ＥＬＩＳＡを含むが、これらに限定されない酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）である。
【００８２】
種々の実施形態では、アッセイは、生体試料が抗ビンキュリン抗体を含むのであれば生体試料と反応する第１の試薬（抗ビンキュリン抗体が存在しなければ、そのとき第１の試薬は生体試料と反応しないが、第１の試薬は依然としてアッセイに存在する）と、抗ビンキュリン抗体と反応する第２の試薬（たとえば、二次抗体）または第１の試薬と反応する第２の試薬と、基質と、を含む。種々の実施形態では、第１の試薬はビンキュリンまたはその断片である。種々の実施形態では、第２の試薬は抗ビンキュリン抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、標識は基質と反応する酵素である。種々の実施形態では、第１の試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【００８３】
種々の実施形態では、アッセイは抗ビンキュリン抗体と反応する第１の試薬を含む。種々の実施形態では、第１の試薬は抗ビンキュリン抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【００８４】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方の存在が検出されるのであればＩＢＳの存在または推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方が非存在であればＩＢＤの存在または推定存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、機械はコンピュータである。種々の実施形態では、コンピュータは患者がＩＢＳまたはＩＢＤを有する可能性があるかどうかを表示するための表示要素を含む。
【００８５】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方のレベルが確立された対照レベルより高いのであればＩＢＳの存在または推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低いのであればＩＢＤの存在または推定存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００８６】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方のレベルが確立された対照レベルより有意に高いのであればＩＢＳの存在または推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方のレベルが確立された対照レベルより有意に高くなければＩＢＤの存在または推定存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳ、ＩＢＤ、またはその双方がない健常対象に由来する抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体、またはその双方のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００８７】
種々の実施形態では、機械はコンピュータである。種々の実施形態では、コンピュータは患者がＩＢＳまたはＩＢＤを有する可能性があるかどうかを表示するための表示要素を含む。
【００８８】
ＩＢＳの診断
種々の実施形態は、対象にてＩＢＳを診断するまたは特定する方法、アッセイ、及びシステムを提供する。
【００８９】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の非存在が検出されればＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。
【００９０】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００９１】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００９２】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体の存在を検出する段階と；抗ビンキュリン抗体の存在が検出されればＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ビンキュリン抗体が非存在であればＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。
【００９３】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００９４】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ビンキュリン抗体のレベルを検出する段階と；抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００９５】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ＣｄｔＢ抗体が非存在であればＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体の存在または非存在について生体試料を分析する段階を含む。
【００９６】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００９７】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＳの診断を所望している対象からの生体試料を提供する段階と；生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出する段階と；抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定する段階、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定する段階と、を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【００９８】
抗ビンキュリン抗体及び／または抗ＣｄｔＢ抗体の存在を伴う対象がすべてＩＢＳを有するまたは発症するとは限らない；しかしながら、これらの方法は対象がＩＢＳを有するかどうかまたはＩＢＳを発症するかどうかの可能性に関する指標を提供する。ＩＢＳの推定存在の判定は、ＩＢＳの他の診断法または当該技術で既知のＩＢＳの症状によってさらに関係付けられてもよいし、及び／または裏付けられてもよい。さらに、ＩＢＳの推定非存在の判定もＩＢＳの他の診断法または当該技術で既知のＩＢＳの症状によってさらに関係付けられ、及び／または裏付けられてＩＢＳを除外してもよい。
【００９９】
種々の実施形態では、ＩＢＳは、Ｃ−ＩＢＳ、Ｄ−ＩＢＳ、Ａ−ＩＢＳ（Ｍ−ＩＢＳとしても知られる）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）であることができる。特定の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【０１００】
種々の実施形態では、システムは、ＩＢＳの診断を所望している対象から単離された生体試料と、生体試料にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルを検出するためのアッセイと、を含む。
【０１０１】
種々の実施形態では、システムは、ＩＢＳの診断を所望している対象から単離された生体試料と、生体試料にて抗ビンキュリン抗体の存在またはレベルを検出するためのアッセイと、を含む。
【０１０２】
種々の実施形態では、システムは、ＩＢＳの診断を所望している対象から単離された生体試料と、生体試料にて抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルを検出するためのアッセイと、を含む。
【０１０３】
種々の実施形態では、アッセイは、間接酵素結合免疫吸着アッセイ（間接ＥＬＩＳＡ）、サンドイッチＥＬＩＳＡ、競合ＥＬＩＳＡ、多重携帯用ＥＬＩＳＡを含むが、これらに限定されない酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）である。
【０１０４】
種々の実施形態では、アッセイは生体試料と反応する第１の試薬と、抗ビンキュリン抗体と反応する第２の試薬（たとえば、二次抗体）と、基質と、を含む。種々の実施形態では、第１の試薬はビンキュリンまたはその断片であり、それは、生体試料に存在すれば抗ビンキュリン抗体と反応する。種々の実施形態では、第２の試薬は抗ビンキュリン抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、標識は基質と反応する酵素である。種々の実施形態では、第１の試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【０１０５】
種々の実施形態では、アッセイは抗ビンキュリン抗体と反応する第１の試薬を含む。種々の実施形態では、第１の試薬は抗ビンキュリン抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【０１０６】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体の存在が検出されればＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体の非存在が検出されれば、ＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、機械はコンピュータである。種々の実施形態では、コンピュータはＩＢＳの存在または非存在があるかどうかを表示するための表示要素を含む。
【０１０７】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければ、ＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【０１０８】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ビンキュリン抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければ、ＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ビンキュリン抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ビンキュリン抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【０１０９】
種々の実施形態では、アッセイは生体試料と反応する第１の試薬と、抗ＣｄｔＢ抗体と反応する第２の試薬（たとえば、二次抗体）と、基質と、を含む。種々の実施形態では、第１の試薬はＣｄｔＢまたはその断片であり、それは、生体試料に存在すれば抗ＣｄｔＢ抗体と反応する。種々の実施形態では、第２の試薬は抗ＣｄｔＢ抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、標識は基質と反応する酵素である。種々の実施形態では、第１の試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【０１１０】
種々の実施形態では、アッセイは抗ＣｄｔＢ抗体と反応する第１の試薬を含む。種々の実施形態では、第１の試薬は抗ＣｄｔＢ抗体の存在を示すシグナルを生成する標識を含む。種々の実施形態では、標識は放射性標識、発色団、蛍光色素分子、量子ドット、酵素、西洋ワサビのペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、ビオチンまたはそれらの組み合わせである。種々の実施形態では、試薬は固相上（たとえば、プレート、多穴プレート）にある。
【０１１１】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ＣｄｔＢ抗体の存在が検出されればＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ＣｄｔＢ抗体の非存在が検出されれば、ＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、機械はコンピュータである。種々の実施形態では、コンピュータはＩＢＳの存在または非存在があるかどうかを表示するための表示要素を含む。
【０１１２】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルと同等もしくはそれより低ければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルの２標準偏差の範囲内の抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【０１１３】
種々の実施形態では、システムはさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高ければＩＢＳの存在もしくは推定存在を判定するための、または抗ＣｄｔＢ抗体のレベルが確立された対照レベルよりも有意に高くなければＩＢＳの非存在もしくは推定非存在を判定するための機械を含む。種々の実施形態では、確立された対照レベルは、ＩＢＳではない対象に由来する抗ＣｄｔＢ抗体のレベルである。特定の実施形態では、方法はさらに、抗ＣｄｔＢ抗体のレベルについて生体試料を分析する段階を含む。
【０１１４】
種々の実施形態では、アッセイは抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを検出するためのアッセイ（たとえば、上記で記載されているような）を含む。
【０１１５】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体及び／または抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルを決定することは、ＩＢＳに関して判定を所望している対象に由来する生体試料に本明細書で議論されているようなビンキュリンまたはその断片及び／または本明細書で議論されているようなＣｄｔＢまたはその断片を加えること、その際、抗ビンキュリン抗体及び／または抗ＣｄｔＢ抗体は（生体試料に存在するのであれば）、生体試料におけるビンキュリンまたはその断片及び／またはＣｄｔＢまたはその断片に特異的に結合することと；生体試料における抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを測定することと；抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体のレベルよりも高ければ対象がＩＢＳを有することを特定することと、を含む。
【０１１６】
種々の実施形態では、アッセイは、ＩＢＳに関して判定を所望している対象に由来する生体試料に本明細書で議論されているようなビンキュリンまたはその断片及び／または本明細書で議論されているようなＣｄｔＢまたはその断片を加えること、その際、抗ビンキュリン抗体及び／または抗ＣｄｔＢ抗体は（生体試料に存在するのであれば）、生体試料におけるビンキュリンまたはその断片及び／またはＣｄｔＢまたはその断片に特異的に結合することと；生体試料における抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体のレベルを測定することと；抗ビンキュリン抗体のレベルが抗ＣｄｔＢ抗体のレベルよりも高ければ対象がＩＢＳを有することを特定することと、を含む。
【０１１７】
治療を選択すること及び治療
種々の実施形態はそれを必要とする対象のためにＩＢＳの治療法を選択する方法を提供する。
【０１１８】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ、セリアック病またはその双方からＩＢＳを識別する診断を所望している対象にて抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と、ＩＢＳを治療する治療法を選択する段階と、を含む。
【０１１９】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ、セリアック病またはその双方からＩＢＳを識別する診断を所望している対象にて抗ビンキュリン抗体の存在を検出する段階と、ＩＢＳを治療する治療法を選択する段階と、を含む。
【０１２０】
種々の実施形態では、方法は、ＩＢＤ、セリアック病またはその双方からＩＢＳを識別する診断を所望している対象にて抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と、ＩＢＳを治療する治療法を選択する段階と、を含む。
【０１２１】
本明細書で使用されるとき治療法を選択することには、治療に関して対象を選択すること、選ぶこと、対象に処方すること、アドバイスすること、推奨すること、指導することまたは助言することが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１２２】
種々の実施形態では、方法はさらにＩＢＳを治療する治療法を投与する段階を含む。種々の実施形態では、治療法は本明細書に記載されているような治療法である。種々の実施形態では、利用できる治療法は抗生剤治療の治療単位を投与してＩＢＳを治療することを含む。種々の実施形態では、治療法は従来技術で利用できる治療法である。
【０１２３】
種々の実施形態では、方法は、抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と、抗生剤治療の治療単位を選択してＩＢＳを治療する段階と、を含む。種々の実施形態では、方法はさらに、抗生剤治療の治療単位を投与してＩＢＳを治療する段階を含む。
【０１２４】
種々の実施形態では、方法は、抗ビンキュリン抗体の存在を検出する段階と、ＩＢＳを治療するための抗生剤治療の治療単位を選択する段階と、を含む。種々の実施形態では、方法はさらに、抗生剤治療の治療単位を投与してＩＢＳを治療する段階を含む。
【０１２５】
種々の実施形態では、方法は、抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出する段階と、ＩＢＳを治療するための抗生剤治療の治療単位を選択する段階と、を含む。種々の実施形態では、方法はさらに、抗生剤治療の治療単位を投与してＩＢＳを治療する段階を含む。
【０１２６】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体、抗ＣｄｔＢ抗体またはその双方の存在を検出することは、本発明の方法またはシステムによって記載されているように実施することができる。
【０１２７】
種々の実施形態では、対象は、たとえば、本明細書で議論されているようなＩＢＳの１以上の症状を提示している対象であることができる。
【０１２８】
抗生剤の例には、アミノグリコシド（たとえば、アミカシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、ネオマイシン、ネチルミシン、ストレプトマイシン、トブラマイシン、パロモマイシン）、アンサマイシン（たとえば、ゲルダナマイシン、ハービマイシン）、カルバセフェム（たとえば、ロラカルベフ）、カルバペネム（たとえば、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム、シラスタチン、メロペネム）、セファロスポリン（たとえば、第１世代：セファドロキシル、セファゾリン、セファロチンまたはセファロシン、セファレキシン；第２世代：セファクロル、セファマンドール、セファキシチン、セフプロジル、セフロキシム；第３世代：セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン；第４世代：セフェピム；第５世代：セフトビプロール）、糖ペプチド（たとえば、テイコプラニン、バンコマイシン）、マクロライド（たとえば、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、エリスロマイシン、ロキシスロマイシン、トロレアンドマイシン、テリスロマイシン、スペクチノマイシン）、モノバクタム（たとえば、アズトレオナム）、ペニシリン（たとえば、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリン、ピペラシリン、チカルシリン）、抗生剤ポリペプチド（たとえば、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンｂ）、キノロン（たとえば、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン）、リファマイシン（たとえば、リファムピシンまたはリファムピン、リファブチン、リファペンチン、リファキシミン）、スルホナミド（たとえば、メフェニド、プロントシル、スルフアセトアミド、スルファメチゾール、スルファニルアミド、スルファサラジン、スルフィソキサゾール、トリメトプリム、トリメトプリム−スルファメトキサゾール（ｃｏ−トリモキサゾール、“ｔｍｐ−ｓｍｘ”）、及びテトラサイクリン（たとえば、デメクロサイクリン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、テトラサイクリン）、と同様にアルスフェナミン、クロラムフェニコール、クリンダマイシン、リンコマイシン、エタムブトール、ホスフォマイシン、フジシン酸、フラゾリドン、イソニアジド、リネゾリド、メトロニダゾール、ムピロシン、ニトロフラントイン、プラテンシマイシン、ピラジナミド、キヌプリスチン／ダルホプリスチンの組み合わせ、及びチニダゾール、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。種々の実施形態では、抗生剤はリファキシミンとネオマイシンの併用である。種々の実施形態では、抗生剤はリファキシミンとドキシサイクリンの併用である。種々の実施形態では、抗生剤はリファキシミンとメトロニダゾールの併用である。
【０１２９】
種々の実施形態では、抗生剤は非吸収性抗生剤である。非吸収性抗生剤の例には、リファキシミン、ネオマイシン、バシトラシン、バンコマイシン、テイコプラニン、ラモプラニン及びパラモマイシンが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１３０】
種々の実施形態では、治療されるＩＢＳは、Ｃ−ＩＢＳ、Ｄ−ＩＢＳ、Ａ−ＩＢＳ（Ｍ−ＩＢＳとしても知られる）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）であることができる。特定の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【０１３１】
種々の実施形態は対象にてＩＢＳを治療することを提供する。方法は、ＩＢＳ治療を提供する段階と、本発明の方法を用いてＩＢＳであると診断された対象にＩＢＳ治療を投与する段階と、を含む。すなわち、対象は、本明細書で議論されているような本発明の方法に従って抗ビンキュリン抗体及び抗ＣｄｔＢ抗体の存在を検出することを介してＩＢＳであると診断されている。
【０１３２】
種々の実施形態では、ＩＢＳ治療は本明細書に記載されているような治療である。種々の実施形態では、ＩＢＳ治療は、抗生剤治療の治療単位を投与してＩＢＳを治療することを含む。種々の実施形態では、ＩＢＳ治療は従来技術で利用できる治療である。種々の実施形態では、ＩＢＳ治療は本明細書に記載されているような抗生剤治療の治療単位である。
【０１３３】
種々の実施形態では、治療されるＩＢＳは、Ｃ−ＩＢＳ、Ｄ−ＩＢＳ、Ａ−ＩＢＳ（Ｍ−ＩＢＳとしても知られる）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）であることができる。特定の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【０１３４】
抗体レベルの測定値としての光学密度
特定の実施形態では、光学密度（ＯＤ）を用いて抗ビンキュリン抗体及び／または抗ＣＤＴ抗体のレベルを測定する。たとえば、光学密度は種々の実施形態において確立された対照レベルとして役立つ。特定の実施形態では、抗ビンキュリン抗体のＯＤ（ＯＤＶ）が１．６２、１．８６、または２．２３より高い場合、対象はＩＢＳを有すると判定される。種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体のＯＤ（ＯＤＶ）が１．００、１．２５、１．５０、１．７５、２．００、２．２５、２．５０、２．７５より高い場合、対象はＩＢＳを有すると判定される。特定の実施形態では、これらのＯＤ数は、１：３２の生体試料の希釈及び１．２ｕｇ／ｍｌの抗原濃度に基づく。
【０１３５】
特定の実施形態では、抗ＣＤＴ抗体のＯＤ（ＯＤＣＤＴ）が２．４８または２．７９より高い場合、対象はＩＢＳを有すると判定される。種々の実施形態では、抗ＣＤＴ抗体のＯＤ（ＯＤＣＤＴ）が２．００、２．２５、２．５０、２．７５、３．００より高い場合、対象はＩＢＳを有すると判定される。特定の実施形態では、これらのＯＤ数は、１：５１２の生体試料の希釈及び１．２ｕｇ／ｍｌの抗原濃度に基づく。
【０１３６】
他の実施形態では、ＯＤＶ及びＯＤＣＤＴのカットオフ点は、生体試料及び抗原の異なる希釈に基づいて決定することができ、本発明の実施形態の範囲内に含まれる。
【０１３７】
さらなる実施形態では、上記決定を用いて治療を対象に向けてもよい。一実施形態では、ＩＢＳが推定で存在するまたはＩＢＳを有する可能性がある対象はＩＢＳの１以上の治療法で治療されてもよい。
【０１３８】
当業者は、ＩＢＳの診断に基づいてＩＢＳのための利用できる治療を選択することができるであろう。たとえば、リファキシミン及びネオマイシンのような抗生剤を用いてＩＢＳを治療することができる。特に、リファキシミンを用いて下痢が優勢なＩＢＳを治療することができ、且つリファキシミン／ネオマイシンの併用を用いて便秘が優勢なＩＢＳを治療することができる。
【０１３９】
抗ビンキュリン抗体
種々の実施形態では、これらの方法またはシステムで検出される抗ビンキュリン抗体はビンキュリンに特異的に結合する抗体である。
【０１４０】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、ビンキュリンの５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基との少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。
【０１４１】
別の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、ビンキュリンの５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基との少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する。
【０１４２】
別の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、ビンキュリンの５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基を含むまたはそれらから成るポリペプチドに特異的に結合する。
【０１４３】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は配列番号７に特異的に結合する抗体である。
【０１４４】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、配列番号７の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基との少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。
【０１４５】
別の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、配列番号７の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基との少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する。
【０１４６】
別の実施形態では、抗ビンキュリン抗体は、配列番号７の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基を含むまたはそれらから成るポリペプチドに特異的に結合する。
【０１４７】
ビンキュリンまたは配列番号７の隣接する残基にはビンキュリンまたは配列番号７の任意のアミノ酸で開始し、任意のアミノ酸で終了するものが含まれる。
【０１４８】
ビンキュリンのタンパク質配列（配列番号７）
0006784669.tif 000002
【０１４９】
種々の実施形態では、抗体の存在または非存在を検出することは対象から得られる生体試料にて実施される。別の実施形態では、抗体の存在または非存在を検出することは対象から得られる血液、血清、または糞便の試料にて実施される。当業者は、ビンキュリン、配列番号７またはその断片に特異的に結合する抗体の存在または非存在を検出するのに使用することができる方法及びシステムを容易に十分に理解するであろう。これらの方法及びシステムには、ＥＬＩＳＡ、免疫組織化学法、フローサイトメトリー、蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、放射性免疫アッセイまたは親和性精製が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１５０】
種々の実施形態では、ビンキュリン、配列番号７またはその断片（上述のような）は、抗ビンキュリン抗体（存在するならば）を結合する基質または試薬（たとえば、捕集装置、捕捉器）として使用される。
【０１５１】
特定の実施形態では、ビンキュリン、配列番号７またはその断片に特異的に結合する抗体の存在または非存在を検出することは、対象から得られた生体試料にビンキュリン、配列番号７またはその断片を接触させてビンキュリン、配列番号７またはその断片に特異的に結合する抗体を単離することによって実施されてもよく、その際、ビンキュリン、配列番号７またはその断片に特異的に結合する抗体の単離は抗体の存在を示し、ビンキュリン、配列番号７またはその断片に特異的に結合する抗体の単離の欠如は抗体の欠如を示す。種々の実施形態では、ビンキュリンまたは配列番号７の断片は本明細書に記載されているような断片であってもよい。一例として、ビンキュリン、配列番号７またはその断片を含む親和性マトリクスを固相支持体に結合することができ；生体試料を親和性マトリクスに接触させて親和性マトリクス／抗体の複合体（抗体が存在するならば）を生じることができ；親和性マトリクス／抗体の複合体を生体試料の残りから分離することができ；抗体を親和性マトリクスから解放することができる。別の例では、標識（たとえば、蛍光標識）をビンキュリン、配列番号７またはその断片に取り付けることができ；標識されたビンキュリン、配列番号７またはその断片を生体試料と接触させて抗体が（存在すれば）標識されたビンキュリン、配列番号７またはその断片に特異的に結合できるようにすることができる。種々の実施形態では、標識されたビンキュリン、配列番号７またはその断片を分離し、抗体へのその結合について分析することができる。
【０１５２】
抗ＣｄｔＢ抗体
種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体はＣＤＴのＣｄｔＢサブユニットに特異的に結合する抗体である。ＣｄｔＢのアミノ酸配列の例は、カンピロバクター・ジェジュニの細胞致死性膨張性毒素Ｂであり、それはアミノ酸配列（配列番号５）を有する。ＣｄｔＢのアミノ酸配列の別の例は、カンピロバクター・コリの細胞致死性膨張性毒素Ｂであり、それはアミノ酸配列（配列番号１）及び核酸配列（配列番号２）を有する。
0006784669.tif 000003
【０１５３】
従って、種々の実施形態では、抗体は配列番号５（Ｃ.ジェジュニのＣｄｔＢ）に特異的に結合する。種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は配列番号５に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるアミノ酸配列に特異的に結合する抗体である。
【０１５４】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は配列番号１（Ｃ.コリのＣｄｔＢ）に特異的に結合する抗体である。種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は配列番号１に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一であるアミノ酸配列に特異的に結合する抗体である。
【０１５５】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体はＣｄｔＢの１７残基のペプチド（たとえば、配列番号１または５の１７残基）に特異的に結合する抗体である。一実施形態では、１７残基のペプチドは以下の配列：
0006784669.tif 000004
を有する。
【０１５６】
他の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、ＣｄｔＢの１７の隣接する残基（たとえば、配列番号１または５の１７の隣接する残基）との少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する１７残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。一実施形態では、ＣｄｔＢの１７残基は以下の配列：
0006784669.tif 000005
を有する。
【０１５７】
他の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、ＣｄｔＢの１７の隣接する残基（たとえば、配列番号１または５の１７の隣接する残基）との少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する１７の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する抗体である。一実施形態では、ＣｄｔＢの１７の隣接する残基は以下の配列：
0006784669.tif 000006
を有する。
【０１５８】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、抗体が以下の配列：
0006784669.tif 000007
を有する１８残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。結合の目的でＮ末端でのシステインを配列番号３に付加した。
【０１５９】
他の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、以下：
0006784669.tif 000008
に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する１８の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する抗体である。
【０１６０】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、ＣＤｔＢの５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基（たとえば、配列番号１または５の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基）との少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、ＣＤｔＢの５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基（たとえば、配列番号１または５の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基）との少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する抗体である。配列番号１の隣接する残基には配列番号１の任意のアミノ酸で開始するもの及び任意のアミノ酸で終了するものが含まれる。配列番号５の隣接する残基には配列番号５の任意のアミノ酸で開始するもの及び任意のアミノ酸で終了するものが含まれる。
【０１６１】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、抗体が以下：
0006784669.tif 000009
の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６または１７の隣接する残基（たとえば、配列番号３の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６または１７の隣接する残基）との少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６または１７残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。別の実施形態では、精製抗体は、配列番号３の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６または１７の隣接する残基（たとえば、配列番号３の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６または１７の隣接する残基）との少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６または１７の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する。配列番号３の隣接する残基には配列番号３の任意のアミノ酸で開始するもの及び任意のアミノ酸で終了するものが含まれる。
【０１６２】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、ＣｄｔＢの遺伝子配列によってコードされる１７残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。特定の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、配列番号２によってコードされる１７残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、配列番号２によってコードされる１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２残基のペプチドに特異的に結合する抗体である。種々の実施形態では、精製抗体は、配列番号２によってコードされる１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２残基のペプチドに特異的に結合する。種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、配列番号２によってコードされる１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の隣接する残基に対して少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％の相同性を有する１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、または２２の残基を含むポリペプチドに特異的に結合する抗体である。
【０１６３】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、配列番号３の１７のアミノ酸ペプチドをコードする以下の配列：
0006784669.tif 000010
を有する核酸配列によってコードされるペプチドに特異的に結合する抗体である。別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、配列番号６によってコードされるペプチドを含むポリペプチドに特異的に結合する抗体である。
【０１６４】
別の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体は、ほぼ完全長のＣｄｔＢのＯＲＦを過剰発現する大腸菌から精製されたＣｄｔＢに特異的に結合する抗体である（完全に言及されるかのようにその全体が参照によって本明細書に組み入れられるＩｎｆｅｃｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｉｍｍｕｎｉｔｙ，２０００年１２月号、６５３５〜６５４１ページ、６８巻１２号を参照のこと）。
【０１６５】
種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体の存在またはレベルを決定する場合、本明細書に記載されているようなビンキュリンタンパク質またはその断片を約１．２μｇ／ｍｌの濃度で抗原として使用される。他の実施形態では、濃度は約０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．１、１．３、１．４、１．５、１．６、１．７、１．８、１．９または２．０μｇ／ｍｌの濃度であることができる。種々の実施形態では、抗ビンキュリン抗体の存在またはレベルの決定において約１：３２希釈の生体試料（たとえば、血漿）を使用する。他の実施形態では、抗ビンキュリン抗体の存在またはレベルの決定において約１：８、１：１０、１：１２；１：１６、１：２０、１：２４、１：３０、１：３６、１：４８、または１：６４の生体試料（たとえば、血漿）の希釈が使用される。他の実施形態では、抗ビンキュリン抗体の存在またはレベルの決定では、約１：８〜１：６４の生体試料（たとえば、血漿）の希釈が使用される。
【０１６６】
種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルを決定する場合、本明細書に記載されているようなＣｄｔＢタンパク質またはその断片は約１．２μｇ／ｍｌの濃度で抗原として使用される。別の実施形態では、濃度は約０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、０．６、０．７、０．８、０．９、１．０、１．１、１．３、１．４、１．５、１．６、１．７、１．８、１．９または２．０μｇ／ｍｌの濃度であることができる。種々の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルの決定では１：５１２希釈の生体試料（たとえば、血漿）が使用される。他の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルの決定にて１：１２８、１：２５６、１：７６８または１：１０２４希釈の生体試料（たとえば、血漿）が使用される。他の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルの決定にて約１：１００、１：１５０、１：２００、１：２５０、１：３００、１：３５０、１：４００、１：５００、１：５５０；１：６００、１：６５０、１：７００、１：７５０、１：８００、１：８５０、１：９００、１：９５０、または１：１０００希釈の生体試料（たとえば、血漿）が使用される。他の実施形態では、抗ＣｄｔＢ抗体の存在またはレベルの決定にて約１：１００〜１：１０００希釈の生体試料（たとえば、血漿）が使用される。
【０１６７】
ｐＨ８．２のホウ酸緩衝化生理食塩水（ＢＢＳ）にて高結合プレート（たとえば、９６穴プレート）上に約４℃で約８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０時間（たとえば、一晩、１６時間を超える）抗原を固定化する。ウェルを交互に、抗原で被覆、またはＢＢＳにて被覆なしのままにして、血漿の非特異的結合の測定を可能にする。ほぼ室温にて約１時間、１×ＰＢＳ中の約３％ウシ血清アルブミンによってウェルをブロックする。次いで、室温にて約１時間、ＣｄｔＢについての１：５１２希釈の血漿、及びビンキュリンについての１：３２希釈の血漿と共に、被覆した及び被覆なしのウェルをインキュベートする。ＣｄｔＢ及びビンキュリンに対する抗体を陽性対照として使用する。これにＨＲＰを結合した二次抗体との約１時間のインキュベートが続く。各工程には０．０５％ＰＢＳ−ツイーン２０を用いた一連の洗浄が続く。最終的に３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）基質溶液を視覚化に用い、プレートリーダー（たとえば、ＢｉｏＴｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  ＨＴ；Ｗｉｎｏｏｓｋｉ，ＶＴ）で直ちに読み取る。光学密度（ＯＤ）を３７０ｎｍにて約９０分間読み取り、それを用いて抗ＣｄｔＢまたは抗ビンキュリンのレベルを比較する。生のＯＤ値をデータ解析に使用した。
【０１６８】
ＩＢＳの型
種々の実施形態では、方法、アッセイまたはシステムによって検出されるＩＢＳは、便秘が優勢のＩＢＳ（Ｃ−ＩＢＳ）、下痢が優勢のＩＢＳ（Ｄ−ＩＢＳ）、交互のＩＢＳ（Ａ−ＩＢＳ）（さらに最近、混合型（Ｍ−ＩＢＳ）と改名された）、または感染後過敏性腸症候群（ＰＩ−ＩＢＳ）である。種々の実施形態では、ＩＢＳはＤ−ＩＢＳである。
【０１６９】
特定の実施形態では、本発明の方法、アッセイまたはシステムに従ってＩＢＳの診断を所望している対象はＩＢＳを示す１以上の症状を有してもよい。ＩＢＳの症状の例には、下痢、便秘、膨満感及び腹痛が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１７０】
生体試料
生体試料の例には、体液、全血、血漿、糞便、腸液または腸吸引物、及び胃液または胃吸引物、血清、脳脊髄液（ＣＳＦ）、尿、汗、唾液、涙液、肺分泌物、乳腺吸引物、前立腺液、精液、子宮頸部剥離物、羊水、眼内液、粘液及び呼気水分が挙げられるが、これらに限定されない。方法の特定の実施形態では、生体試料は全血、血液血漿、血液血清、糞便、腸液または腸吸引物、または胃液または胃吸引物であってもよい。種々の実施形態では、生体試料は全血であってもよい。種々の実施形態では、生体試料は血清であってもよい。種々の実施形態では、生体試料は血漿であってもよい。
【実施例】
【０１７１】
以下の実施例は請求される本発明をさらに良好に説明するために提供されるのであって、本発明の範囲を限定すると解釈されるべきではない。特定の物質が言及される程度に、それは単に説明目的であって、本発明の限定を意図するものではない。当業者は、発明の能力を発揮することなく、且つ本発明の範囲から逸脱することなく、同等の手段または反応物質を開発してもよい。
【０１７２】
実施例１：材料及び方法
対象群
この血清マーカーの検証のために、下痢が優勢のＩＢＳ（Ｄ−ＩＢＳ）における１８０施設の大規模無作為化比較治療試験からの対象が動員された（標的３）。Ｄ−ＩＢＳの対象をローマＩＩＩ基準の存在に基づいて選択した。Ｃｅｄａｒｓ−Ｓｉｎａｉメディカルセンター及びＢｅｔｈ  Ｉｓｒａｅｌ  Ｄｅａｃｏｎｅｓｓメディカルセンターから６人の健常対照を動員した。消化器疾患の既往と腸症状の既往及びそのアンケートの完了とについて健常対照すべてをスクリーニングした。腸症状の訴えの存在と、クローン病、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）またはセリアック病に一致する結腸または小腸における慢性の炎症性変化の組織学的確認とに基づいて炎症性腸疾患（ＩＢＤ）及びセリアック病の対象を動員した。
【０１７３】
対象は、糖尿病、ＨＩＶ、不安定性甲状腺疾患及び慢性的な睡眠剤の使用があれば、試験から除外された。ＩＢＳ対象及び健常対照については腸の外科手術（胆嚢摘出または虫垂切除を除外する）も除外基準だった。
【０１７４】
患者のデータ
すべての対象について年齢及び性別を含む患者デモグラフィクスを得た。ＩＢＤの症例では、疾患の種類（ＵＣまたはクローン病）。
【０１７５】
血漿の採取
すべての対象から血漿を採取した。これは紫色のフタの遠沈管にて静脈穿刺によって採取し、３５００ｒｐｍで１５分間遠心分離し、検査時まで−８０℃で凍結保存した。標的３からのＤ−ＩＢＳの対象の症例では、試験における治療に先立って血漿を採取した。
【０１７６】
ＥＬＩＳＡ検査
完全な組換えカンピロバクターＣｄｔＢタンパク質（Ｃｒｅａｔｉｖｅ  Ｂｉｏｍａｒｔ，Ｓｈｉｒｌｅｙ，ＮＹ）または完全長ビンキュリンタンパク質（Ｎｏｖｏｐｒｏｔｅｉｎ，Ｓｈｏｒｔ  Ｈｉｌｌｓ，ＮＪ）のいずれかを１．２μｇ／ｍｌ濃度での抗原として用いてＥＬＩＳＡを行った。ｐＨ８．２でのホウ酸緩衝化生理食塩水（ＢＢＳ）（Ｍｅｄｉｃａｇｏ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）にて高結合９６穴プレート（Ｇｒｅｎｉｅｒ  Ｂｉｏ−Ｏｎｅ，Ｍｏｎｒｏｅ，ＮＣ）に対して４℃で一晩抗原を固定化した。ウェルを交互に、抗原で被覆、またはＢＢＳにて被覆なしのままにして、血漿の非特異的結合の測定を可能にした。室温にて約１時間、１×ＰＢＳ中の約３％ウシ血清アルブミンによってウェルをブロックした。次いで、室温にて約１時間、ＣｄｔＢについての１：５１２希釈の血漿、及びビンキュリンについての１：３２希釈の血漿と共に、被覆した及び被覆なしのウェルをインキュベートした。ＣｄｔＢ及びビンキュリンに対する抗体を陽性対照として使用した。これにＨＲＰを結合した二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ，Ｗｅｓｔ  Ｇｒｏｖｅ，ＰＡ）との約１時間のインキュベートが続いた。各工程には０．０５％ＰＢＳ−ツイーン２０を用いた一連の洗浄が続いた。最終的に３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）基質溶液（Ｐｉｅｒｃｅ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）を視覚化に用い、ＢｉｏＴｅｋ  Ｓｙｎｅｒｇｙ  ＨＴプレートリーダー（Ｗｉｎｏｏｓｋｉ，ＶＴ）で直ちに読み取った。光学密度（ＯＤ）を３７０ｎｍにて約９０分間読み取り、それを用いて抗ＣｄｔＢまたは抗ビンキュリンのレベルを比較した。生のＯＤ値をデータ解析に使用した。
【０１７７】
統計的解析（セリアック病患者を含まないデータ）
データは平均値±標準誤差（ＳＥ）及び正確な９５％の信頼区間（ＣＩ）として表した。複数の群の比較は、Ｂｅｒｔｌｅｔｔの検定によって分散の同等性を確認した後、一方向性の分散分析（ＡＮＯＶＡ）を用いて行った。データ分布の正規性は、重複するＫｅｒｎｅｌ密度を伴ったヒストグラムと正規分布曲線を用いて評価した。値をそれぞれ平方根及び平方に変換したのち正規化された抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢの分布。２群間の正規分布した変数の比較にはスチューデントのｔ検定を使用した。カテゴリーデータの比較にはＰｅａｒｓｏｎのカイ二乗検定を使用した。ノンパラメータ法を用いて受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線を構築した。ＤｅＬｏｎｇ法を用いて曲線下面積（ＡＵＣ）についての信頼区間を計算した。抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢの各独立した値の０．０１ＯＤの精度に対する感度、特異性及び尤度比を算出し、評価して最適なカットオフを捕捉した。０．０５未満のＰ値を有意であると見なした。解析はＳＴＡＴＡバージョン１１．２（ＳＴＡＴＡ  Ｃｏｒｐ．，Ｔｅｘａｓ，ＵＳＡ）を用いて実施した。
【０１７８】
統計的解析（セリアック患者を伴ったデータ）
数値変数は平均値±標準偏差によって要約した。データ分布の正規性は重複するＫｅｒｎｅｌ密度を伴ったヒストグラムと正規分布曲線を用いて評価した。抗ビンキュリンの分布は平方根変換によって正規化した。分散の均質性はＢａｒｔｌｅｔｔの検定によって評価した。
【０１７９】
２群間の正規分布する変数の比較にはスチューデントのｔ検定を使用した。２を超える群の間では、一元配置ＡＮＯＶＡと参照群としてのＩＢＳを伴ったＤｕｎｎｅｔｔの事後検定とによって正規分布する変数を比較した。カテゴリー変数は頻度と百分率によって要約した。カテゴリーデータの比較にはＰｅａｒｓｏｎのカイ二乗検定を使用した。標準の方法で受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線を構築した。ＤｅＬｏｎｇら２１の方法を用いて曲線下面積（ＡＵＣ）についての信頼区間を計算した。抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢの０．０１ＯＤの精度に対する感度、特異性及び尤度比を算出し、評価して役に立つカットオフを得た。全体を通して０．０５の有意水準を使用した。統計的解析はＳＴＡＴＡバージョン１１．２（ＳＴＡＴＡ  Ｃｏｒｐ．，Ｔｅｘａｓ，ＵＳＡ）及びＳＡＳバージョン９．３（ＳＡＳ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｃａｒｙ，Ｎｏｒｔｈ  Ｃａｒｏｌｉｎａ，ＵＳＡ）を用いて実施した。
【０１８０】
実施例１：結果
患者のデモグラフィクス（セリアック病に関する解析を含まない）
合計で２７６７人の対象を動員した（表１Ａ）。これには、２５６４人のＤ−ＩＢＳの対象と、４３人の健常対象と、１０人のセリアック病の対象と、１５０人のＩＢＤの対象（ｎ＝７８のクローン病、７２人の潰瘍性大腸炎（ＵＣ））と、が含まれた。ＩＢＤのコホートと比べて健常志願者、ＩＢＳ、及びセリアック病のコホートでは有意に女性が多かった（Ｐ＝０．０１）。ＩＢＳの対象は非ＩＢＳの対象よりも平均６．７歳年上だった（Ｐ＜０．０１）。他の群間では年齢に有意差はなかった。
【０１８１】
（表１Ａ）患者のデモグラフィクス
0006784669.tif 000011
値は平均値±ＳＤとして与えられる；ＯＤ−光学密度；ＣＤ−クローン病；ＵＣ−潰瘍性大腸炎
【０１８２】
患者のデモグラフィクス（セリアック病に関する解析を含む）
合計で２６８１人の対象を動員した（表１Ｂ）。これには、２３７５人のＤ−ＩＢＳの対象と、４３人の健常対象と、１２１人のセリアック病の対象と、１４２人のＩＢＤの対象（ｎ＝７３のクローン病、ｎ＝６９の潰瘍性大腸炎）と、が含まれた。ＩＢＳの対象は非ＩＢＳの群よりも平均３．９歳年上だった（Ｐ＜０．００１）。ＩＢＳの対象及び非ＩＢＳの対象の性別分布に差異はなかったが、女性の比率は、ＩＢＤ群に比べて健常対照群、ＩＢＳ群及びセリアック病群で高かった（Ｐ＜０．００１）。
【０１８３】
（表１Ｂ）患者のデモグラフィクス
0006784669.tif 000012
値は平均値±ＳＤとして与えられる；ＣＤ−クローン病；ＵＣ−潰瘍性大腸炎
【０１８４】
群間でのＥＬＩＳＡの比較（セリアック病患者を含まない）
非ＩＢＳ対象すべてにおいてよりもＩＢＳ対象において抗ＣｄｔＢのレベルは有意に高かった（１．６８±０．０５（９５％ＣＩ：１．５８〜１．７９）に比べて（２．５４±０．０１（９５％ＣＩ：２．５２〜２．５７））（Ｐ＜０．００１）（図１Ａ）。非ＩＢＳ対象の間では抗ＣｄｔＢのレベルに有意差はなかった（Ｆ検定、Ｐ＝０．２５）。
【０１８５】
非ＩＢＳ対象すべてに比べると抗ビンキュリンのレベルはＩＢＳ対象において有意に高かった（１．０１±０．０６（９５％ＣＩ：０．８９〜１．１２）に比べて（１．３３３４±０．０２（９５％ＣＩ：１．３０〜１．３７））（Ｐ＜０．００１）（図２Ａ）。非ＩＢＳ対象の間での抗ビンキュリンのレベルの差異は統計的に有意ではなかった（Ｆ検定、Ｐ＝０．０８）。
【０１８６】
群間におけるＥＬＩＳＡの比較（セリアック病患者を含む）
光学密度のレベルを用いて、Ｄ−ＩＢＳ対象における抗ＣｄｔＢ抗体のレベル（２．５３±０．６９）は、健常対象（１．８１±０．７３）、クローン病（１．７２±０．８１）、潰瘍性大腸炎（１．５４±０．６８）、及びセリアック病（２．２３±０．７０）よりも有意に高かった（Ｐ＜０．００１）（図１Ｂ）。健常対象とＩＢＤ対象との間で抗ＣｄｔＢのレベルに差異はなかったが（ｐ＝０．２３）、セリアック病の対象は他の非ＩＢＳ群すべてよりも高い抗ＣｄｔＢのレベルを有した（ｐ＜０．００１）。
【０１８７】
抗ビンキュリンのレベルも、健常対象（０．８１±０．５９）、クローン病（１．０５±０．９１）、潰瘍性大腸炎（０．９６±０．７７）、及びセリアック病（１．０７±０．９８）と比べると、Ｄ−ＩＢＳ対象（１．３４±０．８５）において有意に高かった（Ｐ＜０．０００１）（図１Ｂ）。非ＩＢＳ対象の間での抗ビンキュリンのレベルにおける差異は統計的に有意ではなかった。
【０１８８】
感度及び特異性の分析（セリアック病患者を含まない）
受信者動作特性（ＲＯＣ）を用いて非ＩＢＳ、ＩＢＤ、及び健常の個人からＩＢＳの対象を識別することにおける抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢのレベルの有用性を評価した。図３Ａ及び図４はそれぞれ、非ＩＢＳの対象すべてと及びＩＢＤの対象とＩＢＳの対象を比較した場合のこれら２つの検査についてのＲＯＣ曲線を示す。抗ＣｄｔＢの検査の方が抗ビンキュリンよりも良好に機能し、非ＩＢＳ対象のすべてから、且つＩＢＤ群のみからＩＢＳを同等に識別すると思われた。亜型解析では、ＩＢＤの型に基づく差異はないと思われた（データは示さず）。抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンの双方についてのＲＯＣ曲線はＤ−ＩＢＳがこの検査に基づいて健常対象から識別できることを示している。
【０１８９】
次いで各検査についての光学密度（ＯＤ）のレベルを用いてＤ−ＩＢＳの特定についての理想的な閾値を決定した。表２Ａ及び表３Ａは感度、特異性及び尤度比に基づくＩＢＳの特定についての可能性のある光学密度閾値を明らかにしている。Ｄ−ＩＢＳについては、低い感度に関連するとしても高い特異性の方が望ましい。Ｄ−ＩＢＳでは、理想的な検査はＩＢＳを明確に診断するので、侵襲性の検査に対するニーズを減らすことになる。それで特異性及び尤度比はさらに重要であると思われた。ＲＯＣ曲線に基づいて、抗ＣｄｔＢについての理想的なレベルは≧２．４８のレベルであると思われ、抗ビンキュリンについては最適なレベルは≧１．６２であったが、それらは感度に対する相対的に限定された効果と共に特異性を最適化すると思われる。
【０１９０】
（表２Ａ）他の原因と比較したＩＢＳの診断についての抗ＣｄｔＢの有利なカットオフ
0006784669.tif 000013
ＯＤ光学密度；＋ＬＲ正の尤度比；−ＬＲ負の尤度比
【０１９１】
（表３Ａ）他の原因と比較したＩＢＳの診断についての抗ビンキュリンの有利なカットオフ
0006784669.tif 000014
ＯＤ光学密度；＋ＬＲ正の尤度比；−ＬＲ負の尤度比
【０１９２】
感度及び特異性の解析（セリアック病患者を含む）
受信者動作特性（ＲＯＣ）を用いてＩＢＤの対象からＤ−ＩＢＳの対象を識別することにおける抗ビンキュリン及び抗ＣｄｔＢのレベルの有用性を評価した。図３ＢはＩＢＤの対象とＤ−ＩＢＳの対象を比較した場合のこれら２回の検査についてのＲＯＣ曲線を示す。双方の検査はＩＢＤ群からＤ−ＩＢＳの対象を識別するのに有効であった一方で、Ｄ−ＩＢＳ対ＩＢＤの診断についての曲線下面積（ＡＵＣ）は抗ＣｄｔＢの方が抗ビンキュリンよりも大きかった（それぞれ０．８１及び０．６２）。亜群解析では、ＩＢＤの型に基づく差異はないと思われた（データは示さず）。非ＩＢＳ、セリアック病の対象及び健常対照と比べたＤ−ＩＢＳについてのＲＯＣ曲線も識別力があった。
【０１９３】
次いで各検査についての光学密度（ＯＤ）のレベルを用いてＩＢＤと比べたときのＤ−ＩＢＳの特定のための理想的な閾値を決定した。表２Ｂ及び表３Ｂは感度、特異性及び尤度比に基づいたＤ−ＩＢＳの特定についての可能性のある光学密度閾値を明らかにしている。理想的な検査はＩＢＳを明確に診断するので、侵襲性の検査に対するニーズを減らすことになる。従って、我々は、特異性及び正の尤度比に焦点を当てた。これに基づいて、Ｄ−ＩＢＳを特定するための抗ＣｄｔＢの理想的な閾値は≧２．８０であると思われた一方で、抗ビンキュリンについては最適な閾値は≧１．６８であると思われた。
【０１９４】
（表２Ｂ）ＩＢＤと比べたＤ−ＩＢＳの診断についての抗ＣｄｔＢの有利なカットオフ
0006784669.tif 000015
ＯＤ光学密度；＋ＬＲ正の尤度比；−ＬＲ負の尤度比
【０１９５】
（表３Ｂ）ＩＢＤと比べたＤ−ＩＢＳの診断についての抗ビンキュリンの有利なカットオフ
0006784669.tif 000016
ＯＤ光学密度；＋ＬＲ正の尤度比；−ＬＲ負の尤度比
【０１９６】
生体マーカーに対する性別の影響（セリアック病患者を含まない）
抗ＣｄｔＢ及び抗ビンキュリンのレベルを、女性のみ及び男性のみにおいても比較した。Ｄ−ＩＢＳ群と対照群の対象間での性差にもかかわらず、双方の生体マーカーを使用して男性及び女性の双方にてＤ−ＩＢＳを上手く特定することができた。
【０１９７】
本明細書で使用されている見出しは単に組織化のためのものであって、いかなる方法によっても本開示を限定することを意図するものではない。個々の区分の内容はすべての区分に平等に適用可能であってもよい。
【０１９８】
本発明の種々の実施形態が詳細な説明にて上述されている。これらの記載が上記実施形態を直接記載する一方で、当業者は本明細書に示され、記載されている特定の実施形態に対する改変及び／または変化を思いついてもよいことが理解される。この記載の範囲内に入るそのような改変または変化は同様にそれらに含まれることが意図される。具体的に言及されない限り、明細書及びクレームにおける単語及び語句には当業者にとって普通の且つ慣れた意味が与えられることは本発明者らの意図することである。
【０１９９】
本出願の出願時点で出願者にとって既知である本発明の種々の実施形態の前述の記載は説明及び記載の目的で提示されており、そのように意図される。本記載は、本発明を開示されている正確な形態に対して網羅することも限定することも意図されない。記載されている実施形態は本発明の原理及びその実践的な適用を説明するのに役立ち、他の当業者が熟考された特定の用途に合うように種々の実施形態にて及び種々の改変と共に本発明を利用するのを可能にするのに役立つ。従って、本発明は本発明を実施するために開示されている特定の実施形態に限定されないことが意図される。
【０２００】
本発明の特定の実施形態が示され、記載されてきたが、本明細書の教示に基づいて、本発明及びその境界の態様から逸脱することなく、変更及び改変を行ってもよく、従って、添付のクレームはそのような変更及び改変すべてを本発明の真の趣旨及び範囲の範囲内にあるようにその範囲内に包含すべきであることが当業者に明白であるであろう。一般に、本明細書で使用される用語は一般に「オープン」用語（たとえば、用語「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」は「含んでいるが、これらに限定されない」と解釈されるべきであり、用語「有する（ｈａｖｉｎｇ）」は「少なくとも有する」と解釈されるべきであり、用語「挙げられる（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」は「挙げられるが、これらに限定されない」と解釈されるべきである、等）として意図されることが当業者によって理解されるであろう。
【図１】
0006784669.tif 000017
【図２】
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【図３Ａ】
0006784669.tif 000019
【図３Ｂ】
0006784669.tif 000020
【図３Ｃ】
0006784669.tif 000021
【図４】
0006784669.tif 000022
【図５】
0006784669.tif 000023
【図６】
0006784669.tif 000024
【図７】
0006784669.tif 000025
【図８】
0006784669.tif 000026
【配列表】
0006784669000001.app