(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
一定時間継続して水中に設置された付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、
前記水中微生物を付着させる材料により構成される前記付着シートと、前記付着シートを保持する枠と、を有する１又は複数の、板状の付着板と、
前記付着板を水中に設置する部材と、
を備えることを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項２】
付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、
前記水中微生物を付着させる材料により構成される前記付着シートと、前記付着シートを保持する枠と、を有する１又は複数の付着板と、
前記付着板を水中に設置する部材と、を備え、
前記部材は、該部材を軸として前記付着板を回動可能に保持することを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項３】
請求項１又は２に記載の水中微生物採集器であって、
前記部材は、複数の前記付着板を水中の異なる深さに設置することを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項４】
請求項３に記載の水中微生物採集器であって、
前記部材は、複数の前記付着板を所定の間隔で保持することを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項５】
請求項１から４のいずれか一項に記載の水中微生物採集器であって、
１８０度未満の角度をなす２枚の前記付着板により構成される採集具を備えることを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項６】
付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、
水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートと、前記付着シートを保持する本体部分と、を有する採集具と、
前記採集具を水中に設置する部材と、を備え、
前記本体部分は、前記採集具が設置された前記水中における潮流の上流方向に前記付着シートが向くよう導く方向調整板を有することを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項７】
請求項１から６のいずれか一項に記載の水中微生物採集器であって、
前記付着シートは、略鉛直に延伸する前記部材により支持された状態で前記水中微生物を付着させて採集することを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項８】
付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、
一端が水中で下方向を向くよう設置された複数の給水管と、
前記給水管の各々の他端に複数設置され、水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートを有する採集具と、
前記給水管の一端から他端まで水を導く給水器と、
前記複数の給水管から一定時間継続して水を導くよう前記給水器を制御するポンプコントローラと、
前記複数の給水管の一端が水中の異なる深さになるよう該給水管を保持すると共に、前記採集具及び前記給水器を保持するブイとを備え、
前記採集具は、前記給水器により前記他端まで継続して導かれた水から水中微生物を採集することを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項９】
請求項１から８のいずれか一項に記載の水中微生物採集器であって、
前記付着シートは、水をろ過することにより前記水中微生物を付着させることを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項１０】
請求項１から９のいずれか一項に記載の水中微生物採集器であって、
前記付着シートは、シート形状であって、撓んで保持されることを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項１１】
請求項１から１０のいずれか一項に記載の水中微生物採集器であって、
前記付着シートは、目の大きさの異なる複数の網を、目の大きさの順に重ねて構成されることを特徴とする水中微生物採集器。
【請求項１２】
水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートと、前記付着シートを保持する枠と、を有する１又は複数の板状の付着板を水中に一定時間継続して設置する設置手順と、
前記付着シートに付着した前記水中微生物を採集する採集手順と、
を実行することを特徴とする水中微生物採集方法。
【請求項１３】
請求項１２に記載の水中微生物採集方法であって、
前記設置手順では、複数の前記付着シートを水中の異なる深さに各々設置することを特徴とする水中微生物採集方法。
【請求項１４】
複数の給水管から一定時間継続して水を導くよう給水器を制御するポンプコントローラの制御により、水中で下方向を向くようブイに保持された複数の前記給水管の一端から他端まで、前記ブイに保持された前記給水器を用いて所定時間水を吸い上げ、前記他端に設置され、水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートに前記水を供給する供給手順と、
前記ブイに保持された前記付着シートに付着した前記水中微生物を採集する採集手順と、を実行し、
前記ブイは、前記複数の給水管の一端が水中の異なる深さになるよう該給水管を保持することを特徴とする水中微生物採集方法。
【請求項１５】
請求項１２から１４のいずれか一項に記載の水中微生物採集方法であって、
前記一定時間は、干潮及び満潮の周期に基づいて定められることを特徴とする水中微生物採集方法
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、水中微生物採集器、および水中微生物採集方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
海洋環境の調査を行うために、水中微生物のモニタリングが行われている。現在、海中に採水器を沈めて海水を回収し、回収した海水から微生物を採集している。
【０００３】
特許文献１には、海、湖、川などの海洋調査、又は水質検査のために使用される採水器であって、「水を収納する採水筒の上下に、ロート状の上蓋および下蓋を取付け、各蓋のロートの筒口の上方には柔軟で弾性のある弁を、下方には重錘兼ストッパーを配置し、両者を筒口に挿通した連結具により上下に移動可能に連結した」採水器が開示されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】特開平８−２２００８４号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
水中微生物は、潮の流れに沿って移動する。例えば、海底泥に含まれる水中微生物が潮流により浮き上がり、引き潮や上げ潮に乗って海中を移動すると考えられる。潮の流れの速さや規模は日によって異なる。
【０００６】
水中微生物のモニタリングは、複数の採集データを比較することにより行われる。採水器を水に沈めて水中微生物を採集する場合、採水器に水が流入する瞬間における水中微生物を採集しているため、採水タイミングによって採集データにばらつきが生じる。そのため、好適なモニタリング結果を得ることができない。
【０００７】
特許文献１に記載された採水器は、瞬間的にある１地点の水中微生物を採取するものであるため、異なる条件下において移動する水中微生物のモニタリングに適さない。
【０００８】
そこで、本発明は、移動する水中微生物のモニタリングに有用な水中微生物採集器の提供を目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
上記課題を解決するため、本発明に係る水中微生物採集器は、一定時間継続して水中に設置された付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、前記水中微生物を付着させる材料により構成される前記付着シートと、前記付着シートを保持する枠と、を有する１又は複数の、板状の付着板と、前記付着板を水中に設置する部材と、を備えることを特徴とする。
【００１０】
また、上記課題を解決するため、本発明の他の態様に係る水中微生物採集器は、付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、前記水中微生物を付着させる材料により構成される前記付着シートと、前記付着シートを保持する枠と、を有する１又は複数の付着板と、前記付着板を水中に設置する部材と、を備え、前記部材は、該部材を軸として前記付着板を回動可能に保持することを特徴としてもよい。
【００１１】
また、上記課題を解決するため、前記部材は、複数の前記付着板を水中の異なる深さに設置することを特徴としてもよい。
【００１２】
また、上記課題を解決するため、前記部材は、複数の前記付着板を所定の間隔で保持することを特徴としてもよい。
【００１３】
また、上記課題を解決するため、前記採集具は、１８０度未満の角度をなす２枚の前記付着板により構成される採集具を備えることを特徴としてもよい。
【００１４】
また、上記課題を解決するため、本発明の他の態様に係る水中微生物採集器は、付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートと、前記付着シートを保持する本体部分と、を有する採集具と、前記採集具を水中に設置する部材と、を備え、前記本体部分は、前記採集具が設置された前記水中における潮流の上流方向に前記付着シートが向くよう導く方向調整板を有することを特徴とする。
【００１５】
また、上記課題を解決するため、前記付着シートは、略鉛直に延伸する前記部材により支持された状態で前記水中微生物を付着させて採集することを特徴としてもよい。
【００１６】
また、上記課題を解決するため、本発明の他の態様に係る水中微生物採集器は、付着シートに付着した水中微生物を採集するために用いられる水中微生物採集器であって、一端が水中で下方向を向くよう設置された複数の給水管と、前記給水管の各々の他端に複数設置され、水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートを有する採集具と、前記給水管の一端から他端まで水を導く給水器と、前記複数の給水管から一定時間継続して水を導くよう前記給水器を制御するポンプコントローラと、前記複数の給水管の一端が水中の異なる深さになるよう該給水管を保持すると共に、前記採集具及び前記給水器を保持するブイとを備え、前記採集具は、前記給水器により前記他端まで継続して導かれた水から水中微生物を採集することを特徴とする。
【００１７】
また、上記課題を解決するため、前記付着シートは、水をろ過することにより前記水中微生物を付着させることを特徴としてもよい。
【００１８】
また、上記課題を解決するため、前記付着シートは、シート形状であって、前記枠に対して撓んで保持されることを特徴としてもよい。
【００１９】
また、上記課題を解決するため、前記付着シートは、目の大きさの異なる複数の網を、目の大きさの順に重ねて構成されることを特徴としてもよい。
【００２０】
また、上記課題を解決するため、本発明の他の態様に係る水中微生物採集方法は、水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートと、前記付着シートを保持する枠と、を有する１又は複数の板状の付着板を水中に一定時間継続して設置する設置手順と、前記付着シートに付着した前記水中微生物を採集する採集手順と、を実行することを特徴とする。
【００２１】
また、上記課題を解決するため、前記設置手順では、複数の前記付着シートを水中の異なる深さに各々設置することを特徴としてもよい。
【００２２】
また、上記課題を解決するため、本発明の他の態様に係る水中微生物採集方法は、複数の給水管から一定時間継続して水を導くよう給水器を制御するポンプコントローラの制御により、水中で下方向を向くようブイに保持された複数の前記給水管の一端から他端まで、前記ブイに保持された前記給水器を用いて所定時間水を吸い上げ、前記他端に設置され、水中微生物を付着させる材料により構成される付着シートに前記水を供給する供給手順と、前記ブイに保持された前記付着シートに付着した前記水中微生物を採集する採集手順と、を実行し、前記ブイは、前記複数の給水管の一端が水中の異なる深さになるよう該給水管を保持することを特徴とする。
【００２４】
また、上記課題を解決するため、前記所定時間は、干潮及び満潮の周期に基づいて定められることを特徴としてもよい。
【発明の効果】
【００２５】
本発明によれば、移動する水中微生物のモニタリングをより適切に行うことができる。
【図面の簡単な説明】
【００２６】
【図１】第１の実施形態における水中微生物採集器の一例を示す図である。
【図２】第１の実施形態における採集具の構成の一例を示す図である。
【図３】ブイ方向から見た第１の実施形態における採集具の一例を示す図である。
【図４】第１の実施形態における水中微生物採集器を用いた採集の概要を説明するための図である。
【図５】水中微生物の採集後の処理の一例を示す図である。
【図６】第１の実施形態における採集具により採集したＤＮＡの抽出量を示す表である。
【図７】第１の実施形態における水中微生物採集器１の変形例を示す図である。
【図８】第２の実施形態における水中微生物採集器の一例を示す図である。
【図９】従来の水中微生物の採集方法の一例を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２７】
以下、本発明の一実施形態について説明する。
【００２８】
海洋や湖沼には様々な微生物が存在している。そのため、水中微生物の採集及び分析が、海洋及び湖沼の環境の調査に役立てられている。例えば、赤潮など所定の環境変化の発生前後での水中微生物の分布を調査することにより、環境変化の予測を行うことが研究されている。
【００２９】
図９は、従来の水中微生物の採集方法の一例を示す図である。図９（Ａ）は、採水器４０を用いて海水を回収する様子を示す。従来は、海中の所定ポイントに採水器４０を沈めて海水を回収し、図９（Ｂ）に示すように、回収した海水をフィルタ４１を用いてろ過する。その後、フィルタ４１に残存する水中微生物を採集する。
【００３０】
ところで、水中微生物は、潮の流れに沿って移動する。例えば、海底泥に含まれる水中微生物のシスト（包嚢）β１が潮の流れに乗って上昇し、他の海域まで移動する。潮流の上下方向の幅（深さ）、及び速さは日によって異なる。
【００３１】
例えば、引き潮及び上げ潮から生じる干満を１サイクルと考えると、潮流の深さや方向、速さは各サイクルによって異なる。複数回にわたり水中微生物の採集を行い、各々の採集結果を比較することにより分布状況を調査するモニタリングにあっては、所定の海域において一定時間（例えば、干満の１サイクル）継続して水中微生物の採集を行い、採集結果を平滑化することにより、潮流の深さや方向、速さ等の採集条件のばらつきを緩和することが望ましい。しかしながら、採水器４０を用いた水中微生物の採集では、採水器４０に即時的に流入した水から水中微生物を採集するため、採水タイミングの都度採集条件が異なることとなり、モニタリングに適さない。
【００３２】
＜第１の実施形態＞
【００３３】
図１は、第１の実施形態における水中微生物採集器１の一例を示す図である。水中微生物採集器１は、採集具１１と、ブイ１２と、ロープ１３と、アンカー１４とを有する。
【００３４】
採集具１１は、水中微生物を採集する部材である。採集具１１は、水中微生物を付着させる付着材を有する。なお、図１に示す水中微生物採集器１は、３つの採集具１１を備えているが、採集具の数はこれに限られない。水中微生物採集器１は、１または複数の採集具１１を備える。
【００３５】
付着材は、水中微生物を付着させる材料により構成される。一例において、付着材は多孔質の材料、又は微細な繊維が絡まってなる材料から成る。付着材は、例えばポリプロピレン、ポリウレタン、ポリエチレン、ポリアミド、ポリカーボネート、アクリル、セルロース混合エステル、又はセルロースアセテートである。付着材は、多孔質である表面に水中微生物を付着させたり、水をろ過することにより水中微生物を付着させる。また、付着材は、例えばカーボンであって、水中微生物を吸着することにより付着させる。他の例において、付着材は金属材料である。付着材は、例えば鉄である。また、付着材はその形状を問わない。付着材は、立方体や直方体等の形状であってもよいし、シート形状であってもよい。
【００３６】
ブイ１２は、水面に浮かぶ浮き具であって、アンカー１４に接続されたロープ１３が水面から下方向に延びるよう、ロープ１３を保持している。ロープ１３は、採集具１１を水中に設置する部材である。水中微生物採集器１が複数の採集具１１を備える場合、ロープ１３は、複数の採集具１１を水中の異なる深さに設置する。なお、図１に示す水中微生物採集器１は、１つのロープ１３に対して複数の採集具１１が保持されているが、水中微生物採集器１が複数の採集具１１を備える場合、各々の採集具１１を異なる複数のロープ１３が保持してもよい。
【００３７】
ロープ１３には、例えば所定間隔（例えば５ｍ間隔）で採集具１１が保持されている。ロープ１３は、例えば屈曲可能なワイヤ等であるが、屈曲しないポール等であってもよい。
【００３８】
アンカー１４は、水中微生物採集器１を水中の所定ポイントに留めておくための重りであって、アンカー１４によってロープ１３が水面に対して略垂直に保持される。なお、ロープ１３が屈曲しない場合には、アンカー１４は必ずしも必要でない。
【００３９】
なお、水中微生物採集器１が複数の採集具１１を備える場合、水中微生物採集器１は水平面と平行する同一平面上の異なる位置に採集具１１を保持してもよい。その場合、ロープ１３はブイ１２に対して略水平に保持される。これにより、所定の深さにおける異なる位置の水中微生物の分布状況を調査可能である。
【００４０】
図２は、第１の実施形態における採集具１１の構成の一例を示す図である。図２（Ａ）は、採集具１１の構成例を示す線図である。採集具１１は、所定の角度を成す２枚の付着板１１０により構成される。２枚の付着板１１０は接続部１１３により接続されており、２枚の付着板１１０の成す角は１８０度未満である。採集具１１はロープ１３に保持され、ロープ１３を軸として回動可能である。そのため、採集具１１に対して潮流αが当たると、採集具１１は接続部１１３が潮流αの上流の方向を向くよう回動する。
【００４１】
なお、ロープ１３が略水平に保持される場合、ロープ１３は水平面に対して略垂直の方向に延伸する軸を有し、採集具１１は軸の周方向に沿って回動可能となるよう保持される。
【００４２】
付着板１１０は、枠１１１と、付着シート１１２とを有する。枠１１１は、付着シート１１２を保持する部材である。付着シート１１２は、上述の付着材として取り扱われる。本実施形態において、付着シート１１２は、水中微生物を含む海水をろ過するシート形状のフィルタである。付着シート１１２が有するフィルタのポアサイズ（目の大きさ）は、採集を目的とする水中微生物の大きさに応じて適宜変更が可能である。なお、本実施形態における付着シート１１２は、ポアサイズの異なる複数のフィルタを重ねて構成される。２枚の付着板１１０が成す１８０度未満の部分を採集具の１１の内側とすると、採集具１１の外側から、ポアサイズの大きい順にフィルタが重ねられている。
【００４３】
図２（Ｂ）は、採集具１１の一例を示す写真である。本図に示す通り、採集具１１は１８０度未満の角度を成す２枚の付着板１１０により構成される。
【００４４】
図３は、ブイ１２方向から見た第１の実施形態における採集具１１の一例を示す図である。本実施形態では、付着シート１１２は枠１１１（及び付着板１１０）に対して撓んで保持される。付着シート１１２の撓みに水中微生物が入り込むため、より多くの水中微生物を採集することができる。なお、枠１１１と付着シート１１２とが同平面を成すよう、枠１１１が弛みなく付着シート１１２を保持するものであってもよい。
【００４５】
２枚の付着板１１０は１８０度未満の角θを成す。各θは、例えば９０度である。海域等により適宜角θを調整することで、目的とする水中微生物の付着量を調整したり、付着シート１１２にゴミが付着することを防いだりすることができる。
【００４６】
図４は、第１の実施形態における水中微生物採集器１を用いた採集の概要を説明するための図である。図４（Ａ）に示す左から右へと引き潮α１が流れる。採集具１１に引き潮αが当たることにより、採集具１１は接続部１１３が引き潮α１の上流方向（図４（Ａ）中の左方向）を向くよう、ロープ１３の周方向に沿って回動する。
【００４７】
従来の採水器４０を用いた水中微生物の採集では、採水器４０を沈めて海水を採水器４０に入れ、海上に引き上げることにより採水を行うため、短時間のうちに採水器４０に流入する海水に含まれる水中微生物を採集していた。そのため、引き潮α１の上流に存在する微生物群β２を採集することができなかった。本実施形態では、潮流の深さや方向、速さ等の採集条件のばらつきを緩和するため、水中微生物採集器１を所定時間継続して水中に設置する。そのため、潮の移動域γに沿って流される水中微生物を採集可能である。従って、引き潮α１の上流に存在する微生物群β２は、一定時間継続して設置される採集具１１によって採集される。
【００４８】
水中微生物採集器１を設置する時間は、例えば１〜２４時間である。また例えば、水中微生物採集器１を設置する時間は、採集地点における引き潮及び上げ潮から生じる周期に基づいて設定されてもよい。この場合、該所定時間は、例えば引き潮及び上げ潮を１度ずつ含む周期の継続時間である。なお、長期の採集として、例えば１週間設置してもよい。
【００４９】
図４（Ｂ）中の右から左へと流れる上げ潮α２についても同様である。上げ潮α２が採集具１１に当たると、採集具１１は接続部１１３が上げ潮α２の上流方向（図４（Ｂ）中の右方向）を向くようロープ１３の周方向に沿って回動する。上げ潮α２の上流に存在する微生物群β２についても、水中微生物採集器１を一定時間継続して設置することで、採集が可能となる。
【００５０】
本実施形態における水中微生物採集器１では、水中微生物採集器１を一定時間継続して水中に設置することにより、一時的な状況の変化の影響が軽減され、より平滑化された採集結果を得ることができる。また、水中の異なる深さに採集具１１を設置しているため、潮の流れに沿って海底泥δから湧き出る水中微生物群の深さ方向の移動状況を認識することができる。従って、移動する水中微生物のモニタリングにおいて、より有用な情報を取得することができる。
【００５１】
図５は、水中微生物の採集後の処理の一例を示す図である。まず、採集具１１から付着シート１１２を取り外す（第１の工程）。
【００５２】
次に、付着シート１１２から微生物３１を分離する（第２の工程）。
【００５３】
次に、微生物３１からＤＮＡβ３を抽出する（第３の工程）。
【００５４】
次に、ＤＮＡシーケンサ３３を用いて、抽出したＤＮＡβ３の塩基配列を読み取る（第４の工程）。その後、読み取った塩基配列を解析し、データとして蓄積する。
【００５５】
＜実験例＞
【００５６】
図６は、第１の実施形態における採集具１１により採集したＤＮＡの抽出量を示す表である。本実験例では、ロープ１３に１つの採集具１１（図２（Ｂ）写真に示す採集具１１）を保持させ、図６に示す各地において、採集具１１を水深２ｍの位置に沈めた。なお、付着シート１１２を構成するフィルタは直径４７ｍｍであって、フィルタのポアサイズは直径０．２μｍ、０.４μｍ、又は０.４５μｍのいずれかであり、図５に示す手順でＤＮＡを抽出した。図６に示す通り、ＤＮＡが抽出されており、第１の実施形態における採集具１１を用いて水中微生物が採集できることが分かった。
【００５７】
＜変形例＞
【００５８】
図７は、第１の実施形態における水中微生物採集器１の変形例を示す図である。図７（Ａ）は、採集具１１の変形例を示す写真である。本変形例における採集具１１は、内部に付着材としての付着シート１１２を有する本体部分と、該本体部分が上流方向に向くよう導く方向調整板とを備える。本図では、方向調整板は略三角形をしており、本体部分と接続する接続部から該接続部と対向する他端に向かうにつれて漸次幅が広くなるよう構成される。なお、方向調整板の形状はこれに限られない。水中に採集具１１を設置した場合、方向調整板の側面に水流が当たることにより、本体部分が水流の上流方向を向く。
【００５９】
図７（Ｂ）は、水中微生物採集器１の構成例を示している。水中微生物採集器１は、本変形例における採集具１１を１つ備えるものであっても、複数備えるものであってもよい。  
【００６０】
＜第２の実施形態＞
【００６１】
次に、第２の実施形態における水中微生物採集器２について説明する。図８は、第２の実施形態における水中微生物採集器２の一例を示す図である。以下、上述の実施形態と異なる点について説明し、重複する点については説明を省略する。
【００６２】
水中微生物採集器２は、採集具２１と、ブイ２２と、給水管２３と、給水ポンプ２４と、ポンプコントローラ２５とを有する。
【００６３】
採集具２１は、水中微生物を付着させる付着材を有する。上述の実施形態と同様に、付着材は、水中微生物を付着させる機能を有するものであれば、素材や形状を問わない。
【００６４】
図８に示す水中微生物採集器２は、水中微生物を含む海水をろ過するフィルタである付着シート１１２と、付着シート１１２を保持する部材である枠１１１とを有する。付着シート１１２は付着材として機能し、上述の実施形態と同様に海水をろ過することにより、水中微生物を採集する。
【００６５】
なお、上述の実施形態と同様に、付着シート１１２は枠１１１に対して撓むように保持されていてもよい。また、付着シート１１２はポアサイズの異なる複数のフィルタを重ねてなるものであってもよい。この場合、給水管２３の端に近い側から順に目の大きいフィルタが重ねられたものであってもよい。
【００６６】
ブイ２２は、水面に浮かぶ浮き具であって、採集具２１と、給水管２３と、給水ポンプ２４と、ポンプコントローラ２５とを保持している。
【００６７】
給水管２３は、給水ポンプ２４により汲み上げられる海水を通す管である。給水管２３の一端は水中に到達しており、他端には採集具２１が設置される。図８に示す水中微生物採集器２は、３つの給水管２３を備えているが、水中微生物採集器２が備える給水管２３の数はこれに限定されず、単数であってもよい。
【００６８】
水中微生物採集器２が複数の給水管２３を備える場合、各々の給水管２３は先端が水中の異なる深さに到達するようブイ２２に保持される。各々の給水管２３には、該給水管２３を通ってくみ上げられた海水がろ過可能な位置に、採集具２１が設置される。
【００６９】
給水ポンプ２４は、ポンプコントローラ２５の制御により、海水をくみ上げる。給水ポンプ２４は、例えばモータの駆動により海水を吸い上げる。給水ポンプ２４により、海水は給水管２３の一端から他端まで導かれる。ポンプコントローラ２５は、複数の給水管２３から継続的に海水をくみ上げるよう給水ポンプ２４を制御する。
【００７０】
前述したように、潮流の深さや方向等の採集条件は、採集時点によって異なる。そのため、水中微生物採集器２を用いて水中微生物の採集を行う際には、採集条件のばらつきを緩和するために、所定時間継続して採集を行う。つまり、ポンプコントローラー２５は給水ポンプ２４を用いて所定時間継続して給水管２３から水をくみ上げる。採集具２１には、所定時間継続して水が供給され、ろ過されずに付着シート１１２に残った水中微生物が採集される。採集具２１に対して水を供給する継続時間は、上述の実施形態と同様に、例えば給水管２３の一端において発生している引き潮及び上げ潮から生じる周期に基づいて設定される。設定時間は、例えば引き潮及び上げ潮を１度ずつ含む周期の継続時間である。
【００７１】
本実施形態では、給水管２３から継続的に採水された水から水中微生物を採集するため、採水器４０を用いた従来の採集方法に比べて水中微生物の移動状況を考慮した採集を行うことができる。また、水中の異なる深さに到達するよう設置された複数の給水管２３、及び複数の採集具２１を用いることにより、異なる深さに存在する水中微生物を共通のタイミングで採集することができる。従って、移動する水中微生物のモニタリングを適切に行うことができる。
【００７２】
以上、各実施形態に基づき本発明の説明を行ってきたが、上記実施形態に示した要件に本発明が限定されるものではない。これらの点に関しては、本発明の主旨をそこなわない範囲で変更することができ、その応用形態に応じて適切に定めることができる。また、各実施形態は、それぞれの特徴を組み合わせることができる。上述のいずれかの水中微生物採集器が、他の実施形態の特徴を併せ持つものであってもよい。
【００７３】
なお、上述の実施形態では、海中の水中微生物の採集について説明したが、水中微生物採集器１又は水中微生物採集器２により採集される水中微生物は、海中の微生物に限られない。また、水中微生物採集器１又は水中微生物採集器２により採集される生物は、微生物に限られない。
【符号の説明】
【００７４】
１・・・水中微生物採集器、２・・・水中微生物採集器、１１・・・採集具、１２・・・ブイ、１３・・・ロープ、１４・・・アンカー、２１・・・採集具、２２・・・ブイ、２３・・・給水管、２４・・・給水ポンプ、２５・・・ポンプコントローラ、３１・・・微生物、３２・・・ビーズ、３３・・・ＤＮＡシーケンサ、４０・・・採水器、４１・・・フィルタ、１１０・・・付着板、１１１・・・枠、１１２・・・付着シート、１１３・・・接続部、α・・・潮流、α１・・・引き潮、α２・・・上げ潮、β１・・・シスト、β２・・・微生物群、β３・・・ＤＮＡ、γ・・・潮の移動域、δ・・・海底泥
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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