(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
生体物質に含まれる微生物をサンプリングするためのサンプリング方法であって、
−前記生体物質を受け入れるように構成された内部空間（７）と、本体（６）の前記内部空間（７）へのアクセス開口部（１２）を画定するネック（１０）とを備える前記本体（６）を備える容器（５）であって、前記容器（５）の前記本体（６）が軟質バッグで構成されている、前記容器（５）と、
−前記ネック（１０）の前記アクセス開口部（１２）を塞ぎ、前記本体（６）の前記内部空間（７）を閉じるように、前記容器（５）の前記ネック（１０）に取り外し可能かつ密封的に取り付けられるように構成されたカバー（３０）と、
を備えるサンプリング装置（２）であって、
前記容器（５）と前記カバー（３０）のうちの少なくとも一方に、前記内部空間（７）と外部環境との間の通路を内部に備える１つ以上の移送部材（２５、４０、４５、４８）が設けられ、前記移送部材（２５、４０、４５、４８）は、前記移送部材（２５、４０、４５、４８）が前記通路を介して前記内部空間（７）と連通する開放状態と、前記移送部材（２５、４０、４５、４８）が前記通路を介した前記内部空間（７）との全ての連通を阻止する閉鎖状態とを有し、前記少なくとも１つの移送部材（２５、４０、４５、４８）は、前記開放状態で、前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）に含まれる気体の少なくとも一部を排気するように構成された排気部材（４０）を備える、
前記サンプリング装置（２）を用い、
−前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）に前記生体物質を集め、前記容器（５）の前記ネック（１０）に前記カバー（３０）を取り付けることにより、前記内部空間（７）を閉じるステップと、
−前記排気部材（４０）を前記開放状態にすることにより、前記排気部材（４０）を前記閉鎖状態にすることにより前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）に含まれる前記気体の少なくとも一部を排気するように前記容器（５）の前記本体（６）を圧縮することにより、前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）を嫌気的にするステップと、
を含む前記サンプリング方法。
【請求項２】
前記排気部材（４０）が、対向する内面及び外面を有し、前記排気部材が、停止時に前記閉鎖状態にあり、前記内面と外面との間に圧力差が加えられたときに前記開放状態に移行し、
前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）を嫌気的にすることからなるステップ中に、前記容器（５）の前記本体（６）を圧縮することによって自動的に前記排気部材（４０）を前記開放状態にし、次いで、前記容器（５）の前記本体（６）の圧縮を停止することにより自動的に前記排気部材（４０）を前記閉鎖状態にすることを行う、
請求項１に記載のサンプリング方法。
【請求項３】
前記カバー（３０）が、全体的な剛性を有する軸受部（３１）を備え、前記排気部材（４０）が、前記カバー（３０）の前記軸受部（３１）に設けられており、
前記容器（５）の前記本体（６）を前記内部空間（７）を嫌気的にすることからなるステップ中に、前記容器（５）の前記本体（６）を前記カバー（３０）の前記軸受部（３１）に押し付けることを行う、
請求項１から２の何れか１項に記載のサンプリング方法。
【請求項４】
希釈流体を前記容器（６）の前記本体（５）の前記内部空間（７）に前記開放状態の前記１つ以上の移送部材（２５、４０、４５、４８）を介して導入することにより、及び前記容器（５）の前記本体（６）を押圧することによって、前記生体物質と前記希釈流体とを混合することにより、前記生体物質を懸濁することからなるステップをさらに含む、請求項１から３の何れか一項に記載のサンプリング方法。
【請求項５】
前記開放状態の前記１つ以上の移送部材（２５、４０、４５、４８）を介して懸濁した前記生体物質の少なくとも一部を収集することにより、前記微生物をサンプリングすることからなるステップをさらに含む、請求項４に記載のサンプリング方法。
【請求項６】
前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）に前記生体物質を収集することからなるステップ中に、前記サンプリング装置を便座（３）の上に置くことによって糞便を直接収集することを行う、請求項１から５の何れか一項に記載のサンプリング方法。
【請求項７】
生体物質に含まれる微生物をサンプリングするためのサンプリング装置（２）であって、
−前記生体物質を受け入れるように構成された内部空間（７）と、本体（６）の前記内部空間（７）へのアクセス開口部（１２）を画定するネック（１０）とを備える前記本体（６）を備える容器（５）であって、前記容器（５）の前記本体（６）が軟質バッグで構成されている、前記容器（５）と、
−前記ネック（１０）の前記アクセス開口部（１２）を塞ぎ、前記本体（６）の前記内部空間（７）を閉じるように、前記容器（５）の前記ネック（１０）に取り外し可能かつ密封的に取り付けられるように構成されたカバー（３０）と、
を備え、
前記容器（５）と前記カバー（３０）のうちの少なくとも一方に、前記内部空間（７）と外部環境との間の通路を内部に備える１つ以上の移送部材（２５、４０、４５、４８）が設けられ、前記移送部材（２５、４０、４５、４８）は、前記移送部材（２５、４０、４５、４８）が前記通路を介して前記内部空間（７）と連通する開放状態と、前記移送部材（２５、４０、４５、４８）が前記通路を介した前記内部空間（７）との全ての連通を阻止する閉鎖状態とを有し、
前記サンプリング装置（２）は、前記１つ以上の移送部材（２５、４０、４５、４８）が、対向する内面及び外面を有する排気部材（４０）を備えることを特徴とし、前記容器（５）の前記本体（６）を圧縮することにより前記排気部材（４０）を自動的に前記開放状態にして、前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）に含まれる前記気体の少なくとも一部を排気し、前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）を嫌気的にするように、前記容器（５）の前記本体（６）の圧縮を停止することにより前記排気部材（４０）を自動的に前記閉鎖状態にするように、前記排気部材は、停止時に前記閉鎖状態にあり、前記内面と外面との間に圧力差が加えられたときに前記開放状態に移行する、
前記サンプリング装置（２）。
【請求項８】
前記カバー（３０）が、全体的な剛性を有する軸受部（３１）を備え、前記容器（５）の前記本体（６）を前記カバー（３０）の前記軸受部（３１）に押し付けて、前記容器（５）の前記本体（６）の前記内部空間（７）を嫌気的にすることができるように、前記排気部材（４０）が、前記カバー（３０）の前記軸受部（３１）に設けられている、請求項７に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項９】
前記排気部材（４０）が、前記通路内に配置され、気体を通過させながら前記生体物質を保持するように構成されている微孔質保持膜を備える、請求項７及び８の何れか一項に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１０】
前記１つ以上の移送部材（２５、４０、４５、４８）が、接続ポート（２６、４１、４６、４９）であって、前記容器（５）と前記カバー（３０）のうちの一方を貫通して設けられ、前記通路の少なくとも一部を内部に備える前記接続ポート（２６、４１、４６、４９）と、閉塞部材（４７）であって、前記閉塞部材（４７）が前記通路を介した全ての連通を阻止する閉塞位置と、前記閉塞部材（４７）が前記通路を介した連通を可能にする解放位置との間で前記接続ポート（２６、４１、４６、４９）に対して移動可能である前記閉塞部材（４７）とを備える、請求項７から９の何れか一項に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１１】
前記閉塞部材（４７）が、前記接続ポート（２６、４６）の前記通路に取り付けられ、前記閉塞部材（４７）が前記閉塞部材（４７）の閉塞位置に向かって付勢され、前記解放位置に向かって移動可能である、請求項１０に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１２】
前記１つ以上の移送部材（２５、４０）が、前記接続ポート（２６、４１）から延びる１つ以上のチューブ（２７、４２）を備え、前記通路の一部を内部に備える、請求項１０及び１１の何れか一項に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１３】
前記１つ以上の移送部材（２５）が、前記チューブ（２７）に取り付けられた１つ以上のバルブ（２８）を備え、前記バルブ（２８）が、前記バルブ（２８）が前記通路を介した全ての連通を阻止する閉鎖位置と、前記バルブ（２８）が前記通路を介した連通を可能にする開放位置との間で移動可能である、請求項１２に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１４】
請求項１１に従属する場合に、前記チューブ（２７）が、解放部材が設けられた相補的接続ポートを備え、前記解放部材が前記閉塞部材を前記解放位置に向かって移動させるように、前記接続ポート（２６）に取り外し可能に接続されるように構成されている、請求項１２から１３のいずれか一項に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１５】
前記アクセス開口部（１２）が開口する上部区画、及び下部区画を前記内部空間（７）に画定するように、前記容器（５）に取り付けられたフィルタ（２０）であって、０．１ｍｍ〜１．５ｍｍの細孔を有する前記フィルタ（２０）をさらに備える、請求項７から１４の何れか一項に記載のサンプリング装置（２）。
【請求項１６】
−請求項７から１５の何れか一項に記載のサンプリング装置（２）と、
−前記内部空間（７）に流体を供給するように構成された供給装置と、前記内部空間（７）に含まれる流体を受けるように構成された受け装置とから選択される１つ以上の補助装置であって、特に、希釈流体のリザーバ、分析用チューブ、分配パイプ、及び微生物用収集バッグから選択される、前記１つ以上の補助装置と、
を含むサンプリングキット（１）。
【請求項１７】
請求項１１に従属する場合に、前記補助装置が、解放部材が設けられた相補的接続ポートを備え、前記解放部材が前記閉塞部材を前記解放位置に向かって移動させるように、前記サンプリング装置（２）の前記移送部材（２５、４５）の前記接続ポート（２６、４６）に取り外し可能に接続されるように構成されている、請求項１６に記載のサンプリングキット（１）。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、微生物サンプリング方法、微生物サンプリング装置、及び当該サンプリング装置を用いるサンプリングキットに関する。
【０００２】
本発明は、特に、腸内微生物叢の移送によるクロストリジウム・ディフィシレの感染などの腸内毒素症の検査用などのヒトの腸内微生物叢のサンプリングに適用される。
【背景技術】
【０００３】
腸内微生物叢は、ヒトの胃腸管（腸、胃、及び便）に見られる全ての微生物（細菌、酵母、及び真菌）の群によって構成される。微生物の多様性は、成人の優占腸内微生物叢を構成する約１０３種の細菌種があると現在推定されており、１０１４という多くの細菌があり、各個体で２０００００〜８０００００個の遺伝子の細菌メタゲノムを示し、これはヒトゲノムの遺伝子の数の１０〜５０倍である。
【０００４】
腸は子宮内では無菌であり、生後数日でコロニーを作って、固有の個々の微生物叢に発達する。人はそれぞれ、種については比較的大差のない細菌を有しているが、微生物叢（種、割合）の正確な組成は、大部分（種の約２／３）は宿主に特異的である。
【０００５】
したがって、ヒトの腸内微生物叢は非常に多様化した生態系であり、複雑でそれぞれの個体に特異的である。
【０００６】
個体の健康には、変化後に初期状態に戻ることと、侵襲に耐えることとの両方が可能である安定した微生物叢を維持することが不可欠である。微生物叢の幅広い多様性を維持することは、微生物叢の安定性を促進する。
【０００７】
しかしながら、特定の病理学又は治療は、微生物叢のバランスを崩し、例えば、抗生物質、及び炎症性腸疾患（ＩＢＤ）などの炎症成分を伴う疾患は、腸内の微生物叢の多様性を制限し得る。抗生物質治療（又は抗生物質療法）は、特に、クロストリジウム・ディフィシレなどの病原生物の増殖を促進し得る、微生物叢の変化をもたらす。クロストリジウム・ディフィシレの感染は、院内下痢症の原因となり、この細菌は、（バンコマイシン及びメトロニダゾールなどの広範囲に効能がある）従来の抗生物質療法に対して耐性である。
【０００８】
腸内細菌叢を再確立し、クロストリジウム・ディフィシレ型の感染症と闘い、それによって恒常性（すなわち共生）を再確立するために、糞便微生物叢の移植が想定され、試験されている。糞便微生物叢の移植は、宿主の変わった腸内細菌叢のバランスを取り戻すために、レシピエント患者の消化管に健康なドナー対象の便を導入することからなる。糞便微生物叢のこの移植は、同種異系移植（すなわち、健康なドナー個体から患者へ）又は自己移植（すなわち、個体からその個体自身へ）であり得る。クロストリジウム・ディフィシレ型の感染について得られた結果は有望であり、一部の患者は、成功裏に治療されている（Ｔａｕｘｅ  ｅｔ  ａｌ，  Ｌａｂ  Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，  Ｗｉｎｔｅｒ  ２０１５，  ｖｏｌｕｍｅ  ４６，  Ｎｕｍｂｅｒ  １）。
【０００９】
このような移植を実施する前に、一般に、
−生体物質を受け入れるように構成された内部空間と、本体の前記内部空間へのアクセス開口部を画定するネックとを備える前記本体を備える容器であって、前記容器の前記本体が軟質バッグで構成されている、前記容器と、
−前記ネックの前記アクセス開口部を塞ぎ、前記本体の前記内部空間を閉じるように、前記容器の前記ネックに取り外し可能かつ密封的に取り付けられるように構成されたカバーと、
−前記内部空間と外部環境との間の通路を内部に備える移送部材であって、前記移送部材が前記通路を介して前記内部空間と連通する開放状態と、前記移送部材が前記通路を介した前記内部空間との全ての連通を阻止する閉鎖状態とを有する、前記移送部材と、
を含むタイプのサンプリング装置の使用により、健康なドナー対象から微生物叢をサンプリングする。
【００１０】
このタイプの公知のサンプリング装置は、文献、国際公開第２０１３／０９０８２５号パンフレットに記載されている。このようなサンプリング装置では、生体物質を収集した後、収集された生体物質を希釈流体と混合することによって生体物質を懸濁状態にする前に、容器をカバーで閉じる。嫌気的条件は、吸引によって本体の内部空間で達成され得、適当な物質の添加によって補完され得る。
【００１１】
しかしながら、公知のサンプリング装置は、微生物叢の細菌、特に腸内微生物叢の多数構成要素である嫌気性細菌の満足できる保存を与える簡単な方法を可能にする条件を与えない。さらに、公知のサンプリング装置は、微生物叢をサンプリングするために必要な操作を安全な方法で行うことを可能にせず、操作者は、生体物質と接触するようになるリスクがある操作を行う。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１２】
本発明は、上記に挙げた問題を軽減することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１３】
そのために、第１の態様において、本発明は、生体物質に含まれる微生物をサンプリングするためのサンプリング方法を与え、前記サンプリング方法は、上記のタイプのサンプリング装置であって、前記１つ以上の移送部材が、前記開放状態で、前記容器の前記本体の前記内部空間に含まれる気体の少なくとも一部を排気するように構成された排気部材を備える、前記サンプリング装置を用い、前記サンプリング方法は、
−前記容器の前記本体の前記内部空間に前記生体物質を集め、前記容器の前記ネックに前記カバーを取り付けることにより、前記内部空間を閉じるステップと、
−前記排気部材を前記開放状態にすることにより、前記排気部材を前記閉鎖状態にすることにより前記容器の前記本体の前記内部空間に含まれる前記気体の少なくとも一部を排気するように前記容器の前記本体を圧縮することにより、前記容器の前記本体の前記内部空間を嫌気的にするステップと、
を含む。
【００１４】
したがって、本発明は、微生物、特に微生物叢の保存のための最適条件を簡単かつ安全に得ることを可能にする。特に、本発明は、酸素を排気し、酸素に敏感な嫌気性細菌を保存するために、容器の本体に簡単な圧縮を適用することによって嫌気下に置くことを行うことを可能にする。閉鎖系に維持された細菌は、外部の汚染物質から隔離されながら、これらの嫌気条件に保たれ得る。さらに、ミキサーに頼らずに、容器の本体を圧縮することによって実施される、このように嫌気下に置くこと、及びその後に生体物質を懸濁させることは、細菌の生存能力を高めることを可能にする。さらに、操作は、カバーによって閉じられた容器を用いて実施することができ、そのため、操作者にとって、生体物質と直接接触するリスクがない。
【００１５】
排気部材は、対向する内面及び外面を有し得、排気部材は、停止時に閉鎖状態にあり、内面と外面との間に圧力差が加えられたときに開放状態に移行する。そして、サンプリング方法は、容器の本体の内部空間を嫌気的にすることからなるステップ中に、容器の本体を圧縮することによって自動的に排気部材を開放状態にし、次いで、容器の本体の圧縮を停止することにより自動的に排気部材を閉鎖状態にすることを行い得る。
【００１６】
カバーは全体的な剛性を有する軸受部を備えていてもよく、排気部材をカバーの軸受部に設けてもよい。そして、サンプリング方法は、容器の本体の内部空間を嫌気的することからなるステップ中に、容器の本体をカバーの軸受部に押し付けることを行ってもよい。
【００１７】
サンプリング方法は、希釈流体を容器の本体の内部空間に開放状態の前記１つ以上の移送部材を介して導入することにより、及び容器の本体を押圧することによって、生体物質と希釈流体とを混合することにより、生体物質を懸濁することからなるステップをさらに含んでもよい。
【００１８】
サンプリング方法は、開放状態の１つ以上の移送部材を介して懸濁した生体物質の少なくとも一部を収集することにより、微生物をサンプリングすることからなるステップをさらに含んでもよい。
【００１９】
サンプリング方法は、容器の本体の内部空間に生体物質を収集することからなるステップ中に、サンプリング装置を便座の上に置くことによって糞便を直接収集することを行ってもよい。
【００２０】
第２の態様において、本発明は、生体物質に含まれる微生物をサンプリングするためのサンプリング装置であって、
−生体物質を受け入れるように構成された内部空間と、本体の前記内部空間へのアクセス開口部を画定するネックとを備える前記本体を備える容器であって、前記容器の前記本体が軟質バッグで構成されている、前記容器と、
−前記ネックの前記アクセス開口部を塞ぎ、前記本体の前記内部空間を閉じるように、前記容器の前記ネックに取り外し可能かつ密封的に取り付けられるように構成されたカバーと、
を備え、
前記容器と前記カバーのうちの少なくとも一方に、前記内部空間と外部環境との間の通路を内部に備える１つ以上の移送部材が設けられ、前記移送部材が、前記移送部材が前記通路を介して前記内部空間と連通する開放状態と、前記移送部材が前記通路を介した前記内部空間との全ての連通を阻止する閉鎖状態とを有し、
前記１つ以上の移送部材が、対向する内面及び外面を有する排気部材を備え、前記容器の前記本体を圧縮することにより前記排気部材を自動的に前記開放状態にして、前記容器の前記本体の前記内部空間に含まれる前記気体の少なくとも一部を排気し、前記容器の前記本体の前記内部空間を嫌気的にするように、前記容器の前記本体の圧縮を停止することにより前記排気部材を自動的に前記閉鎖状態にするように、前記排気部材が、停止時に前記閉鎖状態にあり、前記内面と外面との間に圧力差が加えられたときに前記開放状態に移行する、
前記サンプリング装置を与える。
【００２１】
病原菌が広がらないようにしてマニピュレータの安全性を確保するために、排気部材は、通路内に配置され、気体を通過させながら生体物質を保持するように構成されている微孔質保持膜を備えてもよい。
【００２２】
前記１つ以上の移送部材は、接続ポートであって、容器とカバーのうちの一方を貫通して設けられ、通路の少なくとも一部を内部に備える前記接続ポートと、閉塞部材であって、前記閉塞部材が通路を介した全ての連通を阻止する閉塞位置と、前記閉塞部材が通路を介した連通を可能にする解放位置との間で前記接続ポートに対して移動可能である前記閉塞部材とを備えてもよい。
【００２３】
閉塞部材は、接続ポートの通路に取り付けられ、閉塞部材は、閉塞部材の閉塞位置に向かって付勢され、解放位置に向かって移動可能であってもよい。これらの条件は、取り外し可能かつ液密性であり、必要であれば、閉塞部材が解放位置に向かって積極的な動作によって動かされない限り、内部空間を完全に閉じたままに維持しながら双方向連通を可能にする、単純で穴のない接続を可能にする。
【００２４】
前記１つ以上の移送部材は、接続ポートから延びる１つのチューブを備え、通路の一部を内部に備えていてもよい。
【００２５】
前記１つ以上の移送部材は、チューブに取り付けられた１つ以上のバルブを備えてもよく、前記バルブは、前記バルブが通路を介した全ての連通を阻止する閉鎖位置と、前記バルブが通路を介した連通を可能にする開放位置との間で移動可能である。
【００２６】
閉塞部材が、接続ポートの通路に取り付けられている場合、チューブは、解放部材を備えた相補的接続ポートを備え、解放部材が閉塞部材を解放位置に向かって移動させるように、接続ポートに取り外し可能に接続されるように構成されている。
【００２７】
カバーは、全体的な剛性を有する軸受部を備えてもよく、容器の本体をカバーの軸受部に押し付けて、容器の内部空間を嫌気的にすることができるように、カバーの軸受部に排気部材が設けられていてもよい。
【００２８】
サンプリング装置は、アクセス開口部が開口する上部区画、及び下部区画を内部空間に画定するように、容器に取り付けられたフィルタであって、０．１ｍｍ〜１．５ｍｍの細孔を有する前記フィルタをさらに備えてもよい。
【００２９】
生体物質に含まれる固形物による通路の閉塞、又は微生物と共にそのような固形物がサンプリングされることを回避するために、前記１つの移送部材は、アクセス開口部に対してフィルタの下流の下部区画に設けられていてもよい。
【００３０】
第３の態様において、本発明は、
−上記に定義されているサンプリング装置と、
−内部空間に流体を供給するように構成された供給装置と、内部空間に含まれる流体を受けるように構成された受け装置とから選択される１つ以上の補助装置であって、特に、希釈流体のリザーバ、分析用チューブ、分配パイプ、及び微生物用収集バッグから選択される、前記１つ以上の補助装置と、
を含むサンプリングキットに関する。
【００３１】
サンプリングキットは、使用準備ができた接種材料の形態に微生物をサンプリングして処理することを特に可能にする。
【００３２】
サンプリング装置の移送部材が、接続ポートの通路に取り付けられた閉塞部材を備える場合、補助装置は、解放部材を備えた相補的接続ポートを備え、解放部材が閉塞部材を解放位置に向かって移動させるように、接続ポートに取り外し可能に接続されるように構成されていてもよい。
【００３３】
本発明の他の目的及び利点は、非限定的な例として与えられる本発明の特定の実施形態の以下の説明を読むことにより明らかとなり、以下の添付図面を参照して説明がなされる。
【図面の簡単な説明】
【００３４】
【図１】生体物質に含まれる微生物をサンプリングするためのサンプリング装置を含むサンプリングキットの遠近法による表現であり、サンプリング装置は、容器とカバーとを備え、容器は、軟質バッグで構成された本体を備え、カバーには、容器の本体の内部空間に含まれる気体の少なくとも一部を排気するように構成された排気部材が設けられている。
【００３５】
【図２】生体物質などの糞便に含まれる腸内微生物叢のサンプリングに用いられるときの図１のサンプリング装置の遠近法による表現であり、サンプリング装置は、糞便を収集するための容器と分離したカバーで開放されている。
【００３６】
【図３】カバーが容器に取り付けられており、本体をカバーに押し付けて本体の内部空間から酸素を排気し、収集した糞便中に存在する微生物を保存する、嫌気条件に置かれた図１のサンプリング装置の遠近法による表現である。
【００３７】
【図４】生体物質に含まれる微生物叢をサンプリングする方法のステップを示すフローチャートであり、サンプリング方法は、図１のサンプリング装置を用いる。
【００３８】
図面において、同じ参照符号は、同一又は類似の部分を示す。
【発明を実施するための形態】
【００３９】
図１は、生体物質に含まれる微生物をサンプリングするためのサンプリング装置２を含むサンプリングキット１の実施形態を示す。図示された実施形態において、図示された実施形態に限定されないが、サンプリング装置２は、個体の糞便に含まれる腸内微生物叢のサンプリングに用いられる。
【００４０】
サンプリング装置２は、特に糞便を収集するように構成された容器５を備える。
【００４１】
容器５は、生体物質を受け入れるように構成され、上縁８を有する内部空間７を画定する軟質バッグによって構成された本体６を備える。本体６は、糞便と外部との間のあらゆる交換を回避するために、内部空間７に含まれる糞便及び外部流体に対する障壁を形成するように構成された変形可能な材料から形成されている。特に、本体６は、ポリエチレン（ＰＥ）、ポリプロピレン（ＰＰ）、ポリ塩化ビニル（ＰＶＣ）、ポリカーボネート（ＰＣ）、又はエチレン−酢酸ビニル（ＥＶＡ）から製造されていてもよい。
【００４２】
容器５は、本体６の上縁８が任意の適当な手段によって、特に溶接、接着、又は他の手段によって接合されている、中心軸線Ａを中心とした回転体によって画定された円筒形ネック１０も備える。ネック１０は、全体的な剛性を有し、例えば、ポリエチレン（ＰＥ）、ポリプロピレン（ＰＰ）、ポリ塩化ビニル（ＰＶＣ）、ポリカーボネート（ＰＣ）、又はエチレン−酢酸ビニル（ＥＶＡ）などのプラスチック材料から製造される。ネック１０は、アクセス開口部１２を本体６の内部空間７に画定する内面１１と、オスねじ山を形成するように配置された１つ以上のランプ１４を備えた外面１３とを有する。変形例として、等間隔に配置されていてもよい１つ以上のランプ１４の任意の他の連続又は非連続配置を、ネック１０の外面１３に設けることができる。
【００４３】
容器５は、適切な向きで、特にアクセス開口部１２が上方に向いた状態で、安定した保持を与えるように構成された支持体１５も備える。図示された実施形態では、支持体１５は、ネック１０に接合され、検討される用途に応じて、便座３の縁に伸し掛かるようになることができるように形成される。支持体１５は、ネック１０の外面１３から正反対の方向に中心軸線Ａに対して半径方向に延びる２つの翼部１６を備える。変形例として、本出願において、支持体は、任意の他の適当な形状を有することができる。
【００４４】
フィルタ２０は、内部空間７に２つの区画を画定するように、例えば溶接、接着、又は他の方法によって容器５に接合される。図１において、フィルタ２０は、そして、ネック１０のアクセス開口部１２の近傍に延びるように本体６に接合される。そして、内部空間７は、アクセス開口部１２が開口する上部区画と、底部９の領域の下部区画とを有する。変形例として、フィルタは、適当なそれぞれの容量の下部区画及び上部区画を画定するために、容器のネック又は本体の任意の他の適当な位置で接合されてもよい。フィルタは、糞便に含まれる不溶性固体を保持するように構成された０．１ｍｍ〜１．５ｍｍ、特に０．３ｍｍ〜０．５ｍｍの細孔を有する。
【００４５】
容器５の本体６は、図示された特定の実施形態では、腸内微生物叢から微生物を収集することを可能にする収集部材２５を形成する、第１の移送部材を備える。収集部材２５は、本体６の底部９の近傍に容器５の本体６を貫通して形成された下部接続ポート２６と、下部接続ポート２６から延びるチューブ２７とを備える。これにより、下部接続ポート２６及びチューブ２７は、内部空間７と外部環境との間の収集部材２５内に通路を画定する。収集部材２５は、チューブ２７に取り付けられ、
−バルブが通路を介したあらゆる連通、特に流体の流れを阻止する、収集部材２５の閉鎖状態を画定する閉鎖位置、
−バルブが通路を介した連通、特に流体の流れを可能にする、収集部材２５の開放状態を画定する開放位置、
の間で移動可能なバルブ２８を備える。
【００４６】
変形例として、収集部材２５は、いくつかのチューブ２７及びいくつかのバルブ２８を備えることができる。
【００４７】
チューブ２７は、下部接続ポート２６に取り外し可能に連結されていてもよい。逆止めバルブの形態の閉塞部材は、下部接続ポート２６の通路に取り付けられ、閉塞部材が通路を介するいかなる連通も阻止する閉塞位置に向かって付勢され、閉塞部材が通路を介した連通を可能にする解放位置に向かって移動可能であってもよい。そして、チューブ２７は、下部接続ポート２６と協働するように構成された相補的接続ポートを備える。特に、相補的接続ポートには、相補的接続ポートが下部接続ポート２６に接続されている場合に、閉塞部材を解放位置に移動させるように配置された解放部材が設けられている。そして、下部接続ポート２６及び相補的接続ポートが形成し、一方がオス部材であり、他方はメス部材であり、逆止めバルブが備え付けられたルアーロック型の接続部であり、
−下部接続ポート２６は、チューブ２７が容器５の本体６から分離されている場合に、通路を介した内部空間７と外部との間の連通を阻止する閉塞位置にあり、
−下部接続ポート２６は、チューブ２７が容器５の本体６と接続されている場合に、通路を介して内部空間７と外部との間を連通する解放位置にあってもよい。
【００４８】
このような接続ポートは、閉塞部材が解放部材によって解放位置に向かって移動されていない限り、内部空間を完全に閉鎖したまま、穿孔のない接続によって通路を介した２方向連通を形成することを可能にする。
【００４９】
別の実施形態では、収集部材２５のチューブ２７は、下部接続ポート２６と一体的に形成されてもよく、そして、バルブ２８は、バルブの閉鎖位置に対応する閉塞位置と開放位置に対応する解放位置との間で接続ポート２６に対して移動可能な閉塞部材２８を形成する。変形例として、バルブ２８の代わりに、閉塞部材は、穿孔することができるか、又はチューブ２７の自由端に取り外し可能に取り付けられているプラグであることができる。
【００５０】
収集した糞便の保存を可能にするために、サンプリング装置２は、ネック１０のアクセス開口部１２を塞ぐように、本体６の内部空間７を閉じるように、容器５のネック１０に取り外し可能かつ液密に取り付けられるように構成されたカバー３０を備える。カバー３０は、全体的な剛性を有し、例えば、ネック１０と同様のプラスチック材料から形成されている。カバー３０は、中心軸線Ｂに対して垂直に延び、容器５のネック１０の直径に対応する直径を有する円形の周縁３２を有する水平壁３１を備える。カバー３０は、水平壁３１の周縁３２から延びる、中心軸線Ｂを中心とした回転体として画定された円筒状スカート３３も備える。スカート３３は、必要に応じてメスねじ山を形成し、ネック１０の外面１３でランプ１４と協働するように構成されている、突起を備えた内面を有する。変形例として、容器５のカバー３０及びネック１０を取り外し可能かつ液密に接合することができる任意の他の装置、特にクリッピング装置を設けることができる。水平壁３１は、把持のために中央突出部３５の両側それぞれに配置された２つの凹部３４を有する上面を有する。凹部３４は、凹部３４の位置における水平壁３１の下面がスカート３３の自由縁３６と同一平面上にあるか、又はスカート３３の自由縁３６を越えて延びるようになっている。
【００５１】
凹部３４のうち１つでは、カバー３０には、開放状態で容器５の本体６の内部空間７に含まれる気体の少なくとも一部を排気するように構成された排気部材の形態で製作された第２の移送部材が設けられている。図示された特定の実施形態では、排気部材は、外部に作用しない停止時には閉鎖状態にあり、カバー３０の内面及び外面にそれぞれ位置している対向する内面と外面との間に圧力差が加えられたときに開放状態に移行する一方向バルブ４０である。
【００５２】
特に、一方向バルブ４０は、その下面と上面との間にカバー３０を貫通して形成された上部接続ポート４１と、上部接続ポート４１から延びるチューブ４２とを備える。これにより、上部接続ポート４１及びチューブ４２は、内部空間７と外部環境との間の一方向バルブ４０内に通路を画定する。中央ビード４３では、一方向バルブ４０のチューブ４２は、通路に配置され、気体の通過を可能にしながら生体物質を保持するように構成された微孔質保持膜を備える。微孔質保持膜は、具体的には、１２５μｍ〜１７５μｍの細孔を有するポリプロピレン製の商品番号ＸＳ−４９１１０の下で、ＰＯＲＥＸ（登録商標）ＦＩＬＴＲＡＴＩＯＮで市販されているタイプのものであってもよい。変形例として、微孔質保持膜は、任意の他の適当な方法で、特に、１００μｍ〜３５０μｍ、特に２００μｍ〜３００μｍ、例えば２５０μｍの細孔を有する焼結材料で製造することができる。
【００５３】
逆止めバルブの形態の閉塞部材は、一方向バルブ４０の通路に取り付けられ、通路を介したいかなる連通も阻止する閉塞位置に向かって付勢され、通路を介した連通を可能にする解放位置に向かって移動可能であってもよい。
【００５４】
図示された実施形態では、一方向バルブ４０のチューブ４２は、上部接続ポート４１と一体的に形成されている。閉塞部材は、チューブ４２に、特に自由端の近傍に設けられていてもよい。
【００５５】
別の実施形態では、一方向バルブ４０のチューブ４２は、上部接続ポート４１と取り外し可能に接続されていてもよい。チューブ４２に設けられた逆止めバルブに加えて又は代えて、逆止めバルブの形態の新たな閉塞部材が、上部接続ポート４１に設けられ、通路を介するいかなる連通も阻止する閉塞位置に向かって付勢され、通路を介した連通を可能にする解放位置に向かって移動可能であってもよい。この、他の実施形態では、チューブ４２は、上部接続ポート４１と協働するように構成された相補的接続ポートを備える。特に、相補的接続ポートには、相補的接続ポートが上部接続ポート４１に接続されている場合に、上部接続ポート４１の逆止めバルブを解放位置に移動させるように配置された解放部材が設けられている。上部接続ポート４１は、チューブ４２がカバー３０から分離されているときには閉塞位置にあり、チューブ４２がカバー３０に接続されているときには解放位置にある。
【００５６】
変形例として、排気部材は、一方向バルブ以外の任意の適当な方法で形成することができる。特に、排気部材は、例えばチューブ４２の自由端に取り外し可能に取り付けられることによって、通路内に取り外し可能に配置されたプラグの形態の閉塞部材によって閉塞可能な通路を備えることができる。プラグが通路から取り外されると、排気部材は開放状態になり、容器５の内部空間７と外部との間の連通が通路を介して確立される。プラグが通路に配置されると、プラグが通路を閉塞し、排気部材は閉鎖状態になり、容器５の内部空間７と外部との間の通路を介したあらゆる連通が阻止される。
【００５７】
他方の凹部３４において、カバー３０は、図示された特定の実施形態では、供給部材４５とサンプリング部材４８とをそれぞれ形成する第３及び第４の移送部材を備える。供給部材４５及びサンプリング部材４８は、それぞれ、開放状態で内部空間と外部とを連通し、閉鎖状態で内部空間と外部との連通を遮断するように構成されている。
【００５８】
供給部材４５及びサンプリング部材４８は、それぞれ、サンプリングキットの補助装置のための追加の上部接続ポート４６、４９を備える。
【００５９】
追加の上部接続ポート４６、４９の各々は、下面と上面との間にカバー３０を貫通して形成され、ルアーロック型の接続の部材の１つ、例えばメスの部材を構成する。上述したように、供給部材４５及びサンプリング部材４８の追加の上部接続ポート４６、４９のそれぞれには、逆止めバルブ４７、プラグ、又は他の部材の形態で製作された閉塞部材が設けられていてもよい。
【００６０】
供給部材４５の閉塞部材は、例えば、通路に取り付けられ、かつ、補助装置に設けられ、ルアーロック型の接続のもう一方の部材、例えば、オスの部材を構成する相補的接続ポートの解放部材と協働するように構成された逆止めバルブ４７の形態で製作されている。通路を介したいかなる連通も阻止する閉塞位置に向かって付勢された逆止めバルブ４７は、補助装置がカバー３０から分離されているときに、供給部材４５の追加の上部接続ポート４６を閉鎖状態にする。通路を介した連通を可能にする解放位置に移動させられた閉塞部材４７は、補助装置がカバー３０に接続されているときに、供給部材４５の追加の上部接続ポート４６を開放状態にする。
【００６１】
サンプリング部材４８の閉塞部材は、例えば、追加の上部接続ポート４９に取り外し可能に取り付けられた、図示されていない、プラグの形態で製作されている。サンプリング部材４８は、プラグが追加の上部接続ポート４９から分離されているときに、通路を介した連通を促進する開放状態にあり、プラグが追加の上部接続ポート４９上にあるときに、通路を介したいかなる連通も阻止する閉鎖状態にある。
【００６２】
補助装置は、特に、
−供給部材４５の追加の上部接続ポート４６に接続されるように構成された１つ以上の希釈流体のリザーバ、特に供給バッグであって、必要に応じて、解放部材を有する相補的接続ポートが備え付けられたパイプを備える前記リザーバと、
−サンプリング部材４８の追加の上部接続ポート４９に接続されるように構成された１つ以上の分析チューブであって、前記分析チューブのそれぞれが、分析目的のために糞便を抽出することができるように、解放部材を有する相補的接続ポートが必要に応じて設けられた開口端と閉端との間に延びている、前記１つ以上の分析チューブと、
−収集部材２５の下部接続ポート２６に分配ダクトを介して接続されるように構成された微生物を収集するための１つ以上のバッグであって、解放部材を有する相補的接続ポートと必要に応じて１つ以上のバルブが備え付けられた１つ以上のパイプとを備える、前記１つ以上のバッグと、
を備えてもよい。
【００６３】
変形例として、サンプリングキット１は、内部空間７に流体を供給するように構成された供給装置と、内部空間７に含まれる流体を受けるように構成された受け装置とから選択される任意の他のタイプの補助装置を備えることができる。
【００６４】
本発明は、収集部材をそれぞれ構成する第１、第２、第３、及び第４の移送部材と、一方向バルブの形態の排気部材と、供給部材と、サンプリング部材とを備えるサンプリング装置で説明されている。変形例として、通路を内部に備える１つ以上の移送部材であって、前記移送部材のうち１つ以上が、開放状態で容器の本体の内部空間に含まれる気体の少なくとも一部を排気するように構成された排気部材を形成する前記１つ以上の移送部材を有する、任意の他の構成、任意の他の実施形態、及び任意の他の機能を与えることが可能である。特に、サンプリング装置２は、先に説明した第１の移送部材２５及び第２の移送部材４０のみを備えることができ、又は例えば、それらのうちの１つだけを備えることができる。１つ以上の移送部材が、生体物質に含まれる固体又は微生物を含むそのような固体のサンプルによる接続ポートの閉塞を回避するために、アクセス開口部に対してフィルタの下流に、好ましくは下部区画に設けられている。
【００６５】
ここで、サンプリングシステムを用いる生体物質に含まれる微生物叢をサンプリングする方法を、図２〜４に関連して説明することにする。
【００６６】
図２では、サンプリング装置２の容器５を便座３上に置き、便座３の縁に翼部を載せて、糞便を収集する。変形例として、糞便は、容器５の内部空間７に任意の他の適当な方法で堆積させることができる。この収集ステップの間、チューブ２７は容器５から分離されていてもよい。
【００６７】
図３では、糞便が本体６の内部空間７のフィルタ２０に受け入れられると、内部空間７は、カバー３０を容器５のネック１０にねじ込むことによって閉じられる。収集部材２５、一方向バルブ４０、及び２つのサンプリング部材４５、４８は、閉鎖状態にある。次に、操作者は、容器５の本体６を圧縮し、それによって一方向バルブ４０を自動的に開放状態にすることにより、容器５の本体６の内部空間７を嫌気条件にし始めることができる。特に、凹部３４の位置におけるカバー３０の水平壁３１は、カバー３０が容器５のネック１０に取り付けられたときに、軸受部を形成し、容器５の本体６が前記軸受部に対して押圧されることができる。このとき、容器５の本体６の内部空間７に含まれる気体、特に酸素の一部は、カバー３０の軸受部に設けられた一方向バルブ４０を介して排気される。本体６の圧縮は、上縁８の離れた反対側にあるベース９上に配置された剛性プレート又はハンドルなどの把持部材上のグリップ又はレストによって改善され得る。容器５の本体６の圧縮が停止されると、一方向バルブ４０は自動的に閉鎖状態に戻り、本体６の内部空間７の嫌気状態を維持する。
【００６８】
検討される用途において、嫌気的にすることを、移送部材２５、４０、４５、４８のうちの１つを介して容器５の本体６の内部空間７に不活性ガスを注入することによって完了させてもよい。
【００６９】
決められた条件下での可能な待機時間及び可能な目視検査の後、希釈流体のリザーバ、例えば希釈流体のバッグ、又は希釈流体の瓶を、サンプリング装置２のカバー３０上の供給装置４５の追加の上部接続ポート４６に接続することにより、糞便を懸濁させる。追加の上部接続ポート４６は、希釈流体が容器５の本体６の内部空間７に導入されるように、開放状態から移行する。次いで、生体物質及び希釈流体は、容器５の本体６を押圧することによって混合される。懸濁液の均質性は、フィルタ２０を通過することによって改善される。
【００７０】
糞便を懸濁させる前に、サンプリング装置２のカバー３０上のサンプリング部材４８の追加の上部接続ポート４９に接続された分析チューブを介して収集されたサンプルに対して捕捉分析を実施することができる。変形例として、このようなサンプルのサンプリングは、懸濁させることと同時又はその後に行うことができる。
【００７１】
微生物叢を使用準備ができた接種材料の形態に処理するために、チューブ２７又は分配ダクトを収集部材２５の下部接続ポート２６に接続して、糞便に含まれる微生物叢を分配ダクトの１つ以上のパイプにそれぞれ接続された１つ以上の収集バッグに取り出してもよい。
【００７２】
次いで、微生物叢は、その保存、可能な移送、及びその移植のための任意の適当な操作を受けてもよい。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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