(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
検体と試薬とを混合した反応液に熱サイクルを与えることにより、前記反応液の核酸を増幅させ、かつ前記熱サイクル中に前記反応液に励起光を照射することにより、前記反応液の前記核酸の検査をする検査装置であって、
前記反応液が収容される複数の反応容器を保持する保持部と、
前記反応容器に対して励起光を照射するように構成された照射部と、
前記反応容器に対する前記照射部の励起光の照射により生じる蛍光を検出するように構成された検出部と、
前記検査装置の動作を制御するように構成された制御部とを備え、
前記制御部は、
前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間において、前記保持部に前記複数の反応容器のそれぞれと前記検出部との相対位置を変更させ、
前記複数の反応容器のそれぞれからの蛍光を、前記複数の反応容器のそれぞれが前記相対位置を変更されながら前記検出部による蛍光値の検出可能な場所に位置する複数のタイミングのそれぞれにおいて前記検出部で検出することで得られる複数個の蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、前記各サイクルの代表蛍光値から前記核酸の検査結果を演算し、その演算結果を出力するように構成されている、検査装置。
【請求項２】
前記検査装置は、核酸の増幅に伴い蛍光値が減少するＱ−ｐｒｏｂｅ（Quenching  Probe）法により前記核酸の検査をするように構成されており、
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項１に記載の検査装置。
【請求項３】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている、請求項２に記載の検査装置。
【請求項４】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最終の値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている、請求項２に記載の検査装置。
【請求項５】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項２に記載の検査装置。
【請求項６】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項２に記載の検査装置。
【請求項７】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値および最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項２に記載の検査装置。
【請求項８】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値および最終の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項２に記載の検査装置。
【請求項９】
前記検査装置は、核酸の増幅に伴い蛍光値が増加するＴａｑＭａｎ−ｐｒｏｂｅ法またはインターカレーション法により前記核酸の検査をするように構成されており、
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項１に記載の検査装置。
【請求項１０】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最大値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている、請求項９に記載の検査装置。
【請求項１１】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最終の値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている、請求項９に記載の検査装置。
【請求項１２】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項９に記載の検査装置。
【請求項１３】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項９に記載の検査装置。
【請求項１４】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値および最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項９に記載の検査装置。
【請求項１５】
前記制御部は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間における前記複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値および最終の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている、請求項９に記載の検査装置。
【請求項１６】
前記照射部および前記検出部は、前記検査装置に固定されており、
前記保持部は、前記反応容器を移動可能な機構を有しており、
前記制御部は、前記保持部を駆動させることにより、前記複数の反応容器のそれぞれと前記検出部との相対位置を変更するように構成されている、請求項１〜請求項１５のいずれか１項に記載の検査装置。
【請求項１７】
前記保持部は、円盤形状であり、回転軸を有しており、前記制御部による駆動制御に従って前記回転軸を中心に前記反応容器が円周方向に移動可能に構成されている、請求項１６に記載の検査装置。
【請求項１８】
前記保持部は、
前記反応容器を線上に往復移動可能な機構を有しており、
前記制御部による駆動制御に従って前記複数の反応容器のそれぞれに前記線上を往復移動させるように構成されている、請求項１６に記載の検査装置。
【請求項１９】
前記照射部は、複数の励起光照射部を含み、
前記検出部は、複数の蛍光検出部を含み、
前記複数の励起光照射部は、それぞれが発光部および予め定められた波長の励起光をカットする光学フィルタを備えており、各励起光照射部が、それぞれ異なる励起波長の励起光を照射するように構成されており、
前記複数の蛍光検出部は、それぞれが検出器および光学フィルタを備えており、各蛍光検出部が、それぞれ異なる波長の蛍光を検出するように構成されており、
前記制御部は、前記複数の励起光照射部のうちいずれか１つを、前記反応容器に励起光を照射する励起光照射部として選択し、選択対象の励起光照射部を切り替えることにより、複数の励起波長の励起光を前記反応容器に照射するように構成されている、請求項１、１６、１７または１８のいずれか１項に記載の検査装置。
【請求項２０】
検体と試薬とを混合した反応液に熱サイクルを与えることにより、前記反応液の核酸を増幅させ、かつ前記熱サイクル中に前記反応液に励起光を照射することにより、前記反応液の前記核酸の検査をする検査装置が核酸の検査結果を演算し出力するための方法であって、
前記検査装置が、前記反応液が収容される複数の反応容器に対して励起光を照射するステップと、
前記検査装置が、前記反応容器に対する前記励起光の照射により生じる蛍光を検出するステップと、を含み、
前記検査装置は、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間において、前記複数の反応容器のそれぞれと前記検査装置における蛍光を検出する部分との相対位置を変更するように構成されており、
前記検査装置が、前記反応液に前記熱サイクルの一定温度を与えている間において、前記複数の反応容器のそれぞれからの蛍光を、前記複数の反応容器のそれぞれが前記相対位置を変更されながら前記検出する部分による蛍光値の検出可能な場所に位置する複数のタイミングのそれぞれにおいて検出することで得られる複数個の蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、前記各サイクルの代表蛍光値から前記核酸の検査結果を演算し、その演算結果を出力するステップとを含む、方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本開示は、核酸を再現性よく正確に検査するための検査装置および核酸の検査結果を演算し出力する方法に関するものであり、特に核酸を再現性よく正確に定量するための検査装置および方法に関するものであり、さらには核酸をマルチプレックスＰＣＲでかつ再現性よく正確に定量するための検査装置および方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
近年、遺伝子を対象とした研究開発が盛んに行なわれており、創薬などの成果物が次々と市場に投入されている。遺伝子は疾病の原因や老化のメカニズムとも関連しており、このような研究開発の成果は社会的にも強く期待されている。
【０００３】
遺伝子工学や酵素工学など様々な分野において、遺伝子検査を行うために、遺伝子である少量の核酸を増幅させる技術が開発されている。例えば、遺伝子のある特定の領域を選択的に増幅する技術として、ポリメラーゼ連鎖反応法（ＰＣＲ（polymerase  chain  reaction）法）などが知られている。ＰＣＲを用いると、特定のＤＮＡ（deoxyribonucleic  acid）領域を、短時間で増幅することができる。ＰＣＲを用いることにより、テンプレートとなるＤＮＡから数百万もの複製されたＤＮＡ断片を生成することができる。
【０００４】
ＰＣＲやリガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ（ligase  chain  reaction））などによる核酸増幅方法は、反応液に対して熱サイクルを与え、反応液の加熱と冷却とを繰り返し行うことにより、既知の遺伝子配列を増幅し、増幅された遺伝子配列を検出するものである。このようにして増幅された核酸を高精度で検出するため、例えば、特開２０１１−７２２３４号公報（特許文献１）は、反応液を収容した反応容器の一側面に対して光源から光を照射し、光源から照射される光のうち直進光および容器表面で反射した反射光を検出しない位置に検出器（光センサ）を配置する技術について記載している。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】特開２０１１−７２２３４号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
特許文献１に記載された技術によると、１つの光源からの直接光および反応容器の容器表面で反射した反射光をなるべく検出しない位置に検出器が配置されているため、蛍光の検出精度を高めることができる。本開示は、核酸をいっそう再現性よく正確に検査するための別の技術を提供することを目的としている。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
一実施形態によると、検体と試薬とを混合した反応液に熱サイクルを与えることにより、反応液の核酸を増幅させ、かつ熱サイクル中に反応液に励起光を照射することにより、反応液の核酸の検査をする検査装置が提供される。検査装置は、反応液が収容される複数の反応容器を保持する保持部と、反応容器に対して励起光を照射するように構成された照射部と、反応容器に対する照射部の励起光の照射により生じる蛍光を検出するように構成された検出部と、検査装置の動作を制御するように構成された制御部とを備える。制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間において、それぞれの反応容器からの蛍光を検出部で検出することで得られる複数個の蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、各サイクルの代表蛍光値から核酸の検査結果を演算し、その演算結果を出力するように構成されている。
【０００８】
一実施形態によると、検査装置は、核酸の増幅に伴い蛍光値が減少するＱ−ｐｒｏｂｅ（Quenching  Probe）法により核酸の検査をするように構成されている。制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【０００９】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている。
【００１０】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最終の値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている。
【００１１】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００１２】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００１３】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値および最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００１４】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値および最終の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００１５】
一実施形態によると、検査装置は、核酸の増幅に伴い蛍光値が増加するＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法またはインターカレーション法により核酸の検査をするように構成されている。制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００１６】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最大値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている。
【００１７】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最終の値を示す蛍光値を、各サイクルの代表蛍光値として選択するように構成されている。
【００１８】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００１９】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００２０】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値および最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００２１】
一実施形態によると、制御部は、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間における複数個の蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値および最終の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算するように構成されている。
【００２２】
一実施形態によると、照射部および検出部は、検査装置に固定されている。保持部は、反応容器を移動可能な機構を有している。制御部は、保持部を駆動させることにより、反応容器を移動させるように構成されている。
【００２３】
一実施形態によると、保持部は、円盤形状であり、回転軸を有しており、制御部による駆動制御に従って回転軸を中心に反応容器が円周方向に移動可能に構成されている。
【００２４】
一実施形態によると、保持部は、反応容器を線上に往復移動可能な機構を有しており、制御部による駆動制御に従って反応容器が線上を往復移動可能に構成されている。
【００２５】
一実施形態によると、照射部は、複数の励起光照射部を含む。検出部は、複数の蛍光検出部を含む。複数の励起光照射部は、それぞれが発光部および予め定められた波長の励起光をカットする光学フィルタを備えており、各励起光照射部が、それぞれ異なる励起波長の励起光を照射するように構成されている。複数の蛍光検出部は、それぞれが検出器および光学フィルタを備えており、各蛍光検出部が、それぞれ異なる波長の蛍光を検出するように構成されている。制御部は、複数の励起光照射部のうちいずれか１つを、反応容器に励起光を照射する励起光照射部として選択し、選択対象の励起光照射部を切り替えることにより、複数の励起波長の励起光を反応容器に照射するように構成されている。
【００２６】
一実施形態によると、検体と試薬とを混合した反応液に熱サイクルを与えることにより、反応液の核酸を増幅させ、かつ熱サイクル中に反応液に励起光を照射することにより、反応液の核酸の検査をする検査装置が核酸の検査結果を演算し出力するための方法が提供される。この方法は、検査装置が、反応液が収容される複数の反応容器に対して励起光を照射するステップと、検査装置が、反応容器に対する照射部の励起光の照射により生じる蛍光を検出するステップと、検査装置が、反応液に熱サイクルの一定温度を与えている間において、それぞれの反応容器からの蛍光を検出部で検出することで得られる複数個の蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、各サイクルの代表蛍光値から核酸の検査結果を演算し、その演算結果を出力するステップとを含む。
【発明の効果】
【００２７】
一実施形態によると、核酸をいっそう再現性よく正確に検査することができる。
この発明の上記および他の目的、特徴、局面および利点は、添付の図面と関連して理解されるこの発明に関する次の詳細な説明から明らかとなるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００２８】
【図１】遺伝子解析装置１の外観を示す図である。
【図２】遺伝子解析装置１の機能的な構成を示すブロック図である。
【図３】核酸増幅検査装置２００の機能的な構成を示すブロック図である。
【図４】反応促進部２９０の正面断面図を示す。
【図５】反応容器３００に対する照射部２５０と検出部２６０の位置関係を示し、反応容器３００が円周上に移動する態様を示す図である。
【図６】複数の励起光照射部を含む照射部２５０および複数の蛍光検出部を含む検出部２６０の構成を示す図である。
【図７】記憶部２１０に記憶される動作設定２１１のデータ構造を示す図である。
【図８】核酸増幅検査装置２００が熱サイクルを反応液３１０に与えることによる反応液３１０の温度変化を示す図である。
【図９】核酸増幅検査装置２００が熱サイクルを反応液３１０に与えることによる反応液３１０の温度変化を示す図である。
【図１０】複数の反応容器３００のうちの１つについて、Ｑ−ｐｒｏｂｅ（ＢＯＤＩＰＹ（登録商標））を用いた際の検出部２６０が検出した蛍光値と蛍光を検出した回数との関係を示す図である。
【図１１】反応液３１０に熱サイクルを与え始めた初期の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す図である。
【図１２】反応液３１０に一定回数の熱サイクルを与えた後の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す図である。
【図１３】複数の反応容器３００のうちの１つについて、Ｔａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ（ＦＡＭ）を用いた際の検出部２６０が検出した蛍光値と蛍光を検出した回数との関係を示し、ＰＣＲ反応全体（期間ＴＤ１〜期間ＴＤ４０）の蛍光値の推移を示す図である。
【図１４】反応液３１０に熱サイクルを与え始めた初期の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す図である。
【図１５】反応液３１０に一定回数の熱サイクルを与えた後の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す図である。
【図１６】核酸増幅検査装置２００の動作を示すフローチャートである。
【図１７】実施の形態２の反応促進部２９０の構成の概略を示す図である。
【図１８】反応容器３００に対する照射部２５０と検出部２６０の位置関係を示し、反応容器３００が線上に移動する態様を示す図である。
【図１９】核酸増幅検査装置２００の他の一例を示すブロック図である。
【図２０】複数の励起光照射部を含む照射部２５０および複数の蛍光検出部を含む検出部２６０の構成の他の一例を示す図である。
【発明を実施するための形態】
【００２９】
以下、図面を参照しつつ、本発明の実施の形態について説明する。以下の説明では、同一の部品には同一の符号を付してある。それらの名称および機能も同じである。したがって、それらについての詳細な説明は繰り返さない。
【００３０】
＜実施の形態１＞
図１は、遺伝子解析装置１の外観を示す図である。図２は、遺伝子解析装置１の機能的な構成を示すブロック図である。図３は、核酸増幅検査装置２００の機能的な構成を示すブロック図である。図４は、反応促進部２９０の正面断面図を示す。
【００３１】
図１に示すように、遺伝子解析装置１は、試料から核酸を抽出するための核酸抽出装置１００と、抽出された核酸を増幅して検出するための核酸増幅検査装置２００と、ユーザが情報の入出力を受けるためのタッチパネルディスプレイ４００とを備える。図１に示すように、遺伝子解析装置１の筐体に収容された核酸抽出装置１００および核酸増幅検査装置２００の扉をユーザが開くことにより核酸抽出装置１００と核酸増幅検査装置２００とをユーザが利用することができる。核酸抽出装置１００と核酸増幅検査装置２００は、それぞれ個別に使用することもできるし、核酸抽出装置１００と核酸増幅検査装置２００とを連動させることで、核酸抽出装置１００により試料から核酸を抽出した後、核酸抽出装置１００から核酸増幅検査装置２００へ前記核酸を移送し、核酸増幅検査装置２００により核酸を増幅して検出するまでの一連の遺伝子検査を全自動で行なうことも可能である。
【００３２】
検査対象の試料から核酸を抽出する方法は、様々なものが知られている。核酸抽出装置１００は、例えば、カオトロピック剤などの抽出液と、検査対象の試料とを混合する機構を有しており、カオトロピック剤の存在下で核酸がシリカに吸着する性質を利用して、核酸を抽出する（所謂、Ｂｏｏｍ法）。ここでカオトロピック剤とは、水溶液中でカオトロピックイオンを生成し、疎水性分子の水溶性を増加させる作用（カオトロピック効果）を有している物質のことである。具体的には、核酸抽出装置１００は、少なくとも下記工程（Ａ）〜（Ｄ）を全自動で行なうことが可能である。
工程（Ａ）：試料と抽出液（例えば、カオトロピック剤）とを混合する。
工程（Ｂ）：前記混合液とシリカとを接触させ、シリカに核酸を吸着させる。
工程（Ｃ）：洗浄液（例えば、アルコール類）とシリカとを接触させ、シリカから核酸以外の成分を洗浄する。
工程（Ｄ）：溶出液（例えば、水）とシリカとを接触させ、シリカから核酸を脱着させる。
【００３３】
核酸抽出装置１００は、試料から核酸を抽出するため、タッチパネルディスプレイ４００を介して、試料、抽出液、洗浄液、溶出液の液量などの設定を受け付ける。核酸抽出装置１００は、設定に従って、試料から核酸を抽出することができる。
【００３４】
核酸を増幅する方法は、様々なものが知られている。核酸増幅検査装置２００は、例えばＰＣＲ（polymerase chain reaction）法によって反応容器に収容された反応液に熱サイクルを与えることにより、反応液の核酸を増幅させる。ＰＣＲ法では、ＤＮＡの一部分を選択的に増幅させるために、ＤＮＡポリメラーゼによる酵素反応を利用する。具体的には、（１）試料とＤＮＡポリメラーゼを含むＰＣＲ試薬とを混合した反応液を、例えば約９４℃〜９８℃にして、所定の時間（例えば１秒から１０秒程度）温度を保ち、熱変性させることで、二本鎖ＤＮＡが一本鎖ＤＮＡに変性する。（以下、変性工程とも呼称する。）（２）一本鎖ＤＮＡにＤＮＡポリメラーゼを作用させるには、予めプライマーをＤＮＡに結合させる必要があり、このアニーリングを、例えば約５０℃〜７０℃で行う。そのため、核酸増幅検査装置２００は、反応液を６０℃程度にまで急速に冷却し、一本鎖ＤＮＡとプライマーとをアニーリングさせる。（以下、アニーリング工程とも呼称する。）（３）次に、ＤＮＡポリメラーゼの活性に適した温度帯にてＤＮＡポリメラーゼを反応させることにより、ＤＮＡを伸長させる。ＤＮＡの伸長は、（２）と同じ温度で行ってもよいし、加熱して（２）より高い温度で行ってもよく、所要時間は例えば３０秒から１分程度であればよい。（以下、伸長工程とも呼称する。）核酸増幅検査装置２００で反応液に熱サイクルを与える方法は特に限定されないが、例えば、反応液を収容した反応容器に熱風または冷風を当てる、またはペルチェ素子を使用することにより、反応液の加熱および冷却を行う。中でも、ＰＣＲの高速化の観点から、熱風または冷風を用いることが好ましい。
【００３５】
核酸増幅検査装置２００は、反応液に対し、一定の温度で一定の時間、熱サイクルを与えるため、タッチパネルディスプレイ４００を介して、熱サイクルで与える温度の設定、各温度を保つ時間の設定、および熱サイクルの回数（以下、サイクル数とも呼称する。）の設定を受け付ける。核酸増幅検査装置２００は、設定に従って、反応液に熱サイクルを与えることにより、核酸を増幅させることができる。
【００３６】
核酸を検査する方法は、様々なものが知られている。核酸増幅検査装置２００は、例えばリアルタイムＰＣＲを行なうことで、対象となるＤＮＡ配列の試料中の濃度を定量することができる。リアルタイムＰＣＲについて詳述する。蛍光物質を含む反応溶液に対して、ＰＣＲを行ないながら同時に、アニーリング工程または伸長工程時の蛍光値を測定することで得られるサイクル数と蛍光値とのデータから、サイクル数に対する蛍光値をプロットすると、増幅曲線が得られる。ＰＣＲを用いた増幅は鋳型となるＤＮＡのコピー数が多いと短時間で一定の蛍光値に達し、少ないと長い時間を要する。そのため、蛍光を用いて増幅の経時変化を測定し、一定の蛍光値まで達するサイクル数（Ｃｔ値）を濃度既知の核酸と濃度未知の核酸で比較することで、対象となるＤＮＡ配列の試料中の濃度を定量することができる。
【００３７】
リアルタイムＰＣＲに用いる蛍光物質としては、特に限定されないが、インターカレーターや、ＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ、Ｑ−ｐｒｏｂｅ（Quenching  Probe）などのオリゴヌクレオチドの末端に蛍光色素を標識したプローブなどが用いられる。
【００３８】
インターカレーション法とは、インターカレーターと呼ばれる合成された二本鎖ＤＮＡに結合し蛍光を発する色素（例えばＳＹＢＲ  ＧＲＥＥＮ  Ｉ、エチジウムブロマイド等）を取り込ませることにより、ＰＣＲ反応に応じた蛍光を検出する方法である。インターカレーション法では、核酸の増幅に伴い蛍光値が増加する。
【００３９】
ＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法とは、２つのＰＣＲプライマー（プライマーセット）に囲まれた増幅配列の一部とハイブリダイズし得るＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅと呼ばれるオリゴヌクレオチドプローブを使用する方法である。ＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅは、その５’末端および３’末端にそれぞれ別の蛍光色素を結合させたものであり、具体的には５’末端にはレポーター色素（ＦＡＭ、ＶＩＣ（登録商標）、ＨＥＸ、ＴＥＴ、フルオレセイン、ＦＩＴＣ、ＴＡＭＲＡ、Ｃｙ３、Ｃｙ５、Ｔｅｘａｓ  Ｒｅｄ、Ｙａｋｉｍａ  Ｙｅｌｌｏｗ等）、３’末端にはクエンチャー色素（ＴＡＭＲＡ、ローダミン、Ｄａｂｃｙ１、ＢＨＱ１、ＢＨＱ２等）を、適宜有効な組み合わせで結合させたものである。ＰＣＲ反応前は、ＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅのレポーター色素とクエンチャー色素とは物理的に近い距離に存在するため、そのままでは蛍光共鳴（所謂、ＦＲＥＴ）により消光している。次いで、ＰＣＲ反応の進行に伴い、テンプレートＤＮＡにハイブリダイズしたＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅは、ＤＮＡポリメラーゼ（Ｔａｑ、Ｔｔｈ等）がもつ５’→３’エキソヌクレアーゼ活性により分解される。そうすると、レポーター色素とクエンチャー色素の物理的距離が離れてＦＲＥＴの効果が無くなり、レポーター色素の蛍光が検出されることになる。つまり、ＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法では、核酸の増幅に伴い蛍光値が増加する。
【００４０】
Ｑ−ｐｒｏｂｅ（Quenching  Probe）法とは、２つのＰＣＲプライマー（プライマーセット）に囲まれた増幅配列の一部とハイブリダイズし得るＱ−ｐｒｏｂｅと呼ばれるオリゴヌクレオチドプローブを使用する方法である。Ｑ−ｐｒｏｂｅは、その５’末端および／または３’末端に蛍光色素を結合させたものであり、具体的にはフルオレセイン、ＦＩＴＣ、ＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬ、Ｃｙ３、Ｃｙ５、ＣＲ６Ｇ、ＴＡＭＲＡ、Ｔｅｘａｓ  Ｒｅｄ等が挙げられる。ＰＣＲ反応前は、Ｑ−ｐｒｏｂｅの末端に結合させた蛍光色素は、蛍光を発している。次いで、ＰＣＲ反応の進行に伴い、Ｑ−ｐｒｏｂｅとテンプレートＤＮＡとがハイブリダイズし、Ｑ−ｐｒｏｂｅの蛍光色素が結合した末端において、少なくともＧ（グアニン）とＣ（シトシン）のペアー（ＧＣ塩基対）を形成することで、蛍光色素の蛍光値が減少する（所謂、Ｇ消光）。つまり、Ｑ−ｐｒｏｂｅ法では、核酸の増幅に伴い蛍光値が減少する。
【００４１】
核酸増幅検査装置２００は、蛍光光度法により、核酸を検出する。すなわち、核酸増幅検査装置２００は、反応液に対して照射器から励起光を照射して、励起光により生じる蛍光を検出器によって核酸を検出する。
【００４２】
核酸増幅検査装置２００は、励起光照射部を備える。実施の形態１では、核酸増幅検査装置２００が、２つの励起光照射部を備える例を示している。この２つの励起光照射部は、それぞれ、異なる波長の励起光を照射するように構成されている。具体的には、励起光照射部は、それぞれが、ＬＥＤ等の発光部と、予め定められた波長の励起光をカットするための光学フィルタを備える。それぞれの励起光照射部の光学フィルタがカットする波長の範囲は、それぞれの励起光照射部のＬＥＤ等の発光部によって異なるように構成されている。これにより、励起光照射部は、それぞれが異なる波長の励起光を照射する。複数の励起光照射部を備えることは、特に同一の反応容器中で複数の配列を同時に増幅検出する際（所謂、マルチプレックスＰＣＲ）の高感度検出に効果的である。
【００４３】
また、核酸増幅検査装置２００は、蛍光検出部を備えており、励起光により生じる蛍光を検出する。実施の形態１では、核酸増幅検査装置２００が、２つの蛍光検出部を備える例を示している。この２つの蛍光検出部は、それぞれ、異なる波長の蛍光を検出するように構成されている。具体的には、蛍光検出部は、それぞれが、検出器および光学フィルタを備えている。それぞれの蛍光検出部の光学フィルタがカットする波長の範囲は、それぞれの蛍光検出部によって異なるように構成されている。これにより、蛍光検出部は、それぞれが異なる波長の蛍光を検出する。複数の蛍光検出部を備えることは、特に同一の反応容器中で複数の配列を同時に増幅検出する際（所謂、マルチプレックスＰＣＲ）に必須となる。
【００４４】
核酸増幅検査装置２００は、複数の励起光照射部のうちのいずれか１つを、反応液に対して励起光を照射するものとして選択し、選択対象となる励起光照射部を切り替えることにより、複数の励起波長の励起光を反応液に交互に照射する。複数の励起光照射部を切り替えることは、特に同一の反応容器中で複数の配列を同時に増幅検出する際（所謂、マルチプレックスＰＣＲ）の高感度検出に効果的である。
【００４５】
発光部としては、例えばＬＥＤ（Light  Emitting  Diode）を使用することができる。ＬＥＤを使用することで、励起光照射部を切り替える際に発光部からの照射光の光量が安定するまでの時間が短くなり、使用可能なデータ数が向上し、データの信頼性が向上する。
【００４６】
核酸増幅検査装置２００は、核酸の検査結果を演算し、タッチパネルディスプレイ４００などの入出力Ｉ／Ｆ（Interface）を介して出力する。例えば、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング工程または伸長工程の期間において、反応液３１０に対して照射部２５０により励起光を照射し、この励起光の照射により発生する蛍光を検出部２６０で検出する。また、アニーリング工程または伸長工程の期間において、照射部２５０は、２つの励起光照射部を１回転ごとに切り替えることで、異なる波長の励起光を、順次、反応液３１０に照射する。例えば、代表的な蛍光物質であるＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＣＲ６Ｇを用いてマルチプレックスＰＣＲを行い、かつ熱サイクルの任意の１サイクルにおいてアニーリング工程の期間（３０秒）に保持盤２８０が１２回転（０．４回転／秒）するとする。この場合、複数の反応容器３００のうち１つに着目すると、検出部２６０の前をアニーリング工程の期間に１２回程度通過する。当然ながら、複数の反応容器３００のうち他の反応容器３００も同様である。これにより、核酸増幅検査装置２００は、例えば、アニーリング工程の期間において、それぞれの反応容器３００あたりＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬの蛍光値を６個程度、ＣＲ６Ｇの蛍光値を６個程度と、異なる波長の蛍光値をサイクル毎に複数個取得することができる。核酸増幅検査装置２００は、このようにして、それぞれの反応容器３００からの蛍光を検出部２６０が検出することで得られる複数個の蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、各サイクルの代表蛍光値から核酸の検査結果を演算し、演算結果をタッチパネルディスプレイ４００等により出力する。
【００４７】
図３を参照して、核酸増幅検査装置２００の構成を詳細に説明する。図３に示すように、核酸増幅検査装置２００は、記憶部２１０と、制御部２２０と、電源部２３０と、半導体リレー２３１と、反応促進部２９０とを含む。反応促進部２９０は、照射部２５０と、検出部２６０と、保持盤２８０と、駆動部２９１と、回転速度制御装置２９２と、空調部２９９とを含む。
【００４８】
記憶部２１０は、ＲＡＭ（Random  Access  Memory）等によって構成され、核酸増幅検査装置２００が使用するプログラムを記憶し、核酸増幅検査装置２００が使用する各種のデータを蓄積する。ある局面において、記憶部２１０は、動作設定２１１を記憶する。動作設定２１１は、核酸増幅検査装置２００が、照射部２５０の複数の励起光照射部のいずれかを用いて励起光を反応液３１０に照射するために、照射に使用する励起光照射部を切り替えるタイミングの設定を示す。また、動作設定２１１は、反応促進部２９０が反応液３１０に与える熱サイクルの設定（温度の大きさの設定と、温度を反応液３１０に与える時間の設定）を示す情報である。
【００４９】
制御部２２０は、記憶部２１０に記憶される制御プログラムを読み込んで実行することにより、核酸増幅検査装置２００の動作を制御する。制御部２２０は、例えばプロセッサにより実現される。制御部２２０は、プログラムに従って動作することにより、駆動制御部２２１と、温度調節部２２２としての機能を発揮する。また、制御部２２０は、半導体リレー２３１の動作を制御する信号を出力することにより、空調部２９９のオンとオフとを制御する。制御部２２０は、空調部２９９を駆動して反応促進部２９０の内部の空気を排出等することにより、反応液３１０に与える温度を調整する。
【００５０】
駆動制御部２２１は、反応液３１０に熱サイクルを加えるための核酸増幅検査装置２００の駆動を制御する。具体的には、駆動制御部２２１は、駆動部２９１に制御信号を出力することにより回転速度制御装置２９２の回転速度（角速度）を制御することで、保持盤２８０に保持される反応容器３００の移動を制御する。これにより、駆動制御部２２１は、反応容器３００の反応液３１０に対し、照射部２５０からの励起光を照射させることができる。
【００５１】
温度調節部２２２は、反応液３１０に与える熱サイクルにおいて、動作設定２１１の設定に従って、反応液３１０に対して与える温度を調節する。温度調節部２２２は、ヒーター２８１に対し、ヒーター２８１の温度を示す制御信号を出力する。
【００５２】
半導体リレー２３１は、無接点のリレーであり、制御部２２０の制御に応じて空調部２９９への電力の供給を制御する。
【００５３】
制御部２２０は、照射部２５０を駆動することにより反応液３１０に励起光を照射して、励起光の照射による蛍光を検出部２６０が検出した蛍光値を検出部２６０から受け付けることで、核酸増幅の検査をする。
【００５４】
電源部２３０は、核酸増幅検査装置２００の外部から供給される交流電源を受けて、直流電圧に変換する。
【００５５】
照射部２５０は、反応液３１０に対して励起光を照射するための励起光照射部として、第１励起光照射部２５１と、第２励起光照射部２５２とを含む。これら複数の励起光照射部が照射する励起光は、ダイクロイックミラー２５３を介して反応液３１０に照射される。
【００５６】
検出部２６０は、励起光が反応液に照射されることにより生じる蛍光を検出する。励起光が反応液に照射されることにより生じる蛍光は、ダイクロイックミラー２６３を介して第１蛍光検出部２６１と、第２蛍光検出部２６２とに入力される。
【００５７】
駆動部２９１は、制御部２２０からの制御信号に応じて、保持盤２８０の角速度を示す信号を回転速度制御装置２９２に出力することで回転速度制御装置２９２を回転させる。
【００５８】
回転速度制御装置２９２は、駆動部２９１の駆動制御に従って回転し、歯車機構により保持盤２８０を回転させることで、反応液３１０を回転方向に移動させる。
【００５９】
実施の形態１の複数の励起光照射部は、核酸増幅検査装置２００の筐体に固定されている。また、複数の蛍光検出部は、核酸増幅検査装置２００の筐体に固定されている。保持盤２８０は、反応容器３００を移動可能な機構を有している。制御部２２０が保持盤２８０を駆動させることにより、反応容器３００を移動させるように構成されている。照射部２５０は、反応容器３００の側面に対して励起光を照射可能に配置されている。また、検出部２６０は、反応容器３００の側面に対して配置され、励起光が反応液３１０に照射されることにより生じる蛍光を検出する。
【００６０】
実施の形態１の保持盤２８０は、円盤形状であり、回転軸を有している。保持盤２８０は、制御部２２０による駆動制御に従って、回転軸を中心に反応容器３００が円周方向に移動可能に構成されている。
【００６１】
制御部２２０は、例えば、保持盤２８０を一回転させるごとに、反応容器３００に励起光を照射させる励起光照射部を切り替える。
【００６２】
図４を参照して、反応促進部２９０を詳細に説明する。図４に示すように、保持盤２８０は回転盤２７９と固定され、回転盤２７９の回転に従って保持盤２８０も回転される。保持盤２８０は、容器保持孔２８２の上部から反応容器３００の挿入を受け付ける。反応容器３００は、例えば、キャピラリー形状のものを使用することができる。キャピラリー形状の反応容器３００を使用することで、反応液３１０への熱伝導性が向上し、昇温時間および／または降温時間が短縮し、トータルの反応時間の短縮が可能となる。反応容器３００は、上部から検体と試薬とを投入可能に構成されており、上部から下部へ進むに従って径が小さくなっている。反応容器３００の下部にある反応液３１０において検体と試薬とが混合される。反応容器３００は、上部にテーパー状の構造を有しており、テーパー状の構造により反応容器３００が保持盤２８０に保持される。反応容器３００の反応液３１０はヒーター２８１と空調部２９９によって温度が与えられる。
【００６３】
＜励起光照射部と検出部との位置関係＞
図５は、反応容器３００に対する照射部２５０と検出部２６０の位置関係を示し、反応容器３００が円周上に移動する態様を示す図である。図５に示すように、照射部２５０は、反応容器３００の側面に対して励起光を照射するよう配置される。反応容器３００は、保持盤２８０の回転に伴い、円周に沿って移動する。検出部２６０は、例えば、照射部２５０が照射する励起光の直進光および反応容器３００の容器表面で励起光が反射した反射光がなるべく検出器に入射しないよう配置される。具体的には、照射部２５０が照射する励起光の進行方向に対して直角となる位置に検出部２６０が配置される。
【００６４】
＜励起光照射部および検出部の構成＞
図６は、複数の励起光照射部を含む照射部２５０および複数の蛍光検出部を含む検出部２６０の構成を示す図である。
【００６５】
図６に示すように、照射部２５０の第１励起光照射部２５１は、発光ダイオード２５１Ａと、凹レンズ２５１Ｂと、ショートパスフィルタ２５１Ｃと、バンドパスフィルタ２５１Ｄとを含む。第２励起光照射部２５２は、発光ダイオード２５２Ａと、凹レンズ２５２Ｂと、ショートパスフィルタ２５２Ｃと、バンドパスフィルタ２５２Ｄとを含む。
【００６６】
ショートパスフィルタ（ＳＰＦ（Short  Pass  Filter））は、短波長側の光を透過させ、長波長側の透過を阻止するフィルタである。バンドパスフィルタ（ＢＰＦ（Band  Pass  Filter））は、特定の波長の光を選択的に透過させる。ただし、バンドパスフィルタは、特定波長以外にも高波長側に透過帯が存在することがある。そのため、ショートパスフィルタとバンドパスフィルタとを組み合わせて、ノイズを低減させる。
【００６７】
例えば、代表的な蛍光物質であるＦＡＭ（Ｃａｒｂｏｘｙｆｌｕｏｒｅｓｃｅｉｎ）またはＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＶＩＣ（登録商標）またはＣＲ６Ｇ（Ｃａｒｂｏｘｙｒｈｏｄａｍｉｎｅ  ６Ｇ）を用いてマルチプレックスＰＣＲを行なう場合、ＶＩＣ（登録商標）またはＣＲ６Ｇの励起に対応する、第１励起光照射部２５１は、５５０ｎｍの波長の励起光源となるように発光ダイオード２５１Ａとショートパスフィルタ２５１Ｃとバンドパスフィルタ２５１Ｄとを含んで構成されている。例えば、発光ダイオード２５１Ａは、最大波長５５０ｎｍのものを用いることができ、ショートパスフィルタ２５１Ｃは、「５７０ｎｍ」以上の光を阻止するものを用いることができ、バンドパスフィルタ２５１Ｄは、特定波長「５５０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。また、発光ダイオード２５１Ａは、同種の複数の発光ダイオードを用いることで、励起光の強度を向上させることができる。
【００６８】
また、例えば、代表的な蛍光物質であるＦＡＭまたはＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＶＩＣ（登録商標）またはＣＲ６Ｇを用いてマルチプレックスＰＣＲを行なう場合、ＦＡＭまたはＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬの励起に対応する、第２励起光照射部２５２は、４７０ｎｍの波長の励起光源となるように発光ダイオード２５２Ａとショートパスフィルタ２５２Ｃとバンドパスフィルタ２５２Ｄとを含んで構成されている。例えば、発光ダイオード２５２Ａは、最大波長４７０ｎｍのものを用いることができ、ショートパスフィルタ２５１Ｄは、「４９０ｎｍ」以上の光を阻止するものを用いることができ、バンドパスフィルタ２５２Ｄは、特定波長「４７０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。また、発光ダイオード２５２Ａは、同種の複数の発光ダイオードを用いることで、励起光の強度を向上させることができる。
【００６９】
ダイクロイックミラー２５３は、特定の波長の光を反射し、その他の波長の光を透過するミラーである。ダイクロイックミラー２５３は、第１励起光照射部２５１が光源となる励起光を透過させ、第２励起光照射部２５２が光源となる励起光を反射させる。ダイクロイックミラー２５３を透過または反射した光は、凸レンズ２５４およびシリンドリカルレンズ２５５を介して反応容器３００の反応液３１０に照射される。
【００７０】
検出部２６０は、第１蛍光検出部２６１と、第２蛍光検出部２６２と、ダイクロイックミラー２６３と、ミラー２６４と、レンズ２６５とを含む。第１蛍光検出部２６１は、検出器２６１Ａと、凸レンズ２６１Ｂと、バンドパスフィルタ２６１Ｃとを含む。第２蛍光検出部２６２は、検出器２６２Ａと、凸レンズ２６２Ｂと、バンドパスフィルタ２６２Ｃとを含む。
【００７１】
検出部２６０において、反応容器３００に励起光が照射されることにより生じる蛍光は、レンズ２６５を介して検出部２６０に入射し、ミラー２６４で反射される。ダイクロイックミラー２６３は、ミラー２６４で反射される反射光のうち、特定の波長の光を反射して第２蛍光検出部２６２に入射させ、その他の波長の光を透過して第１蛍光検出部２６１へ入射させるように配置される。
【００７２】
例えば、代表的な蛍光物質であるＦＡＭまたはＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＶＩＣ（登録商標）またはＣＲ６Ｇを用いてマルチプレックスＰＣＲを行なう場合、ＦＡＭまたはＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬの検出に対応する、第１蛍光検出部２６１は、５３０ｎｍの波長の蛍光を検出するようにバンドパスフィルタ２６１Ｃと凸レンズ２６１Ｂとを含んで構成されている。例えば、バンドパスフィルタ２６１Ｃは、特定波長「５３０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。検出器２６１Ａは、例えばフォトダイオードにより構成されており、検出器２６１Ａに入射される蛍光を受光して電気信号に変換する。
【００７３】
また、例えば、代表的な蛍光物質であるＦＡＭまたはＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＶＩＣ（登録商標）またはＣＲ６Ｇを用いてマルチプレックスＰＣＲを行なう場合、ＶＩＣ（登録商標）またはＣＲ６Ｇの検出に対応する、第２蛍光検出部２６２は、５９０ｎｍの波長の蛍光を検出するようにバンドパスフィルタ２６２Ｃと凸レンズ２６２Ｂとを含んで構成されている。例えば、バンドパスフィルタ２６２Ｃは、特定波長「５９０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。検出器２６２Ａは、例えばフォトダイオードにより構成されており、検出器２６２Ａに入射される蛍光を受光して電気信号に変換する。
【００７４】
＜データ構造＞
図７は、記憶部２１０に記憶される動作設定２１１のデータ構造を示す図である。図７を参照して、動作設定２１１は、反応液３１０に与える熱サイクルの温度の設定の情報を含む。例えば、熱サイクルの温度の設定として、低温時の温度が温度「６０℃」であり、高温時の温度が温度「９５℃」であることが設定されている。また、動作設定２１１は、複数の励起光照射部（第１励起光照射部２５１および第２励起光照射部２５２）のうち反応液３１０に対して励起光を照射する励起光照射部を切り替えるタイミングの情報を含む。図７の例では、保持盤２８０が一回転するたびに（容器保持孔２８２に保持される複数の反応容器３００が一周するたびに）、励起光を照射する励起光照射部を切り替えることが動作設定２１１に設定されている。
【００７５】
＜動作＞
図８から図１６を参照して、核酸増幅検査装置２００の動作を説明する。なお、図８から図１６の例はテンプレートＤＮＡとＱ−ｐｒｏｂｅ法（蛍光色素はＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬおよびＣＲ６Ｇ）またはＴａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法（蛍光色素はＦＡＭおよびＶＩＣ（登録商標））の試薬を用い、ＰＣＲ条件は９５℃−１分でＨｏｔ  Ｓｔａｒｔを行なった後、９５℃−１秒の変性工程と６０℃−３０秒のアニール工程からなる温度サイクルをＱ−ｐｒｏｂｅ法では５０サイクル、Ｔａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法では４０サイクル加えたものであり、核酸増幅検査装置２００の回転速度は０．４回転／秒であるが、これらに何ら限定されるものではない。
【００７６】
図８および図９は、核酸増幅検査装置２００が熱サイクルを反応液３１０に与えることによる反応液３１０の温度変化を示す図である。図８はＰＣＲ反応の全体を示す。図９はＰＣＲ反応の一部を示す。
【００７７】
図８および図９において、横軸は時間を示し、縦軸は反応液３１０の温度を示す。核酸増幅検査装置２００は、反応液３１０に低温（６０℃）を与えるアニーリング工程の期間（期間ＴＤ１、期間ＴＤ２、期間ＴＤ３、・・・、期間ＴＤ５０）において、反応液３１０に対して照射部２５０により励起光を照射し、この励起光の照射により発生する蛍光を検出部２６０で検出する。
【００７８】
図１０から図１２は、複数の反応容器３００のうちの１つについて、Ｑ−ｐｒｏｂｅ（ＢＯＤＩＰＹ（登録商標））を用いた際の検出部２６０が検出した蛍光値と蛍光を検出した回数との関係を示す図である。図１０は、ＰＣＲ反応全体（期間ＴＤ１〜期間ＴＤ５０）の蛍光値の推移を示す図である。図１１は、１サイクル目（期間ＴＤ１）の蛍光値の推移を示す図である。図１２は、５０サイクル目（期間ＴＤ５０）の蛍光値の推移を示す図である。
【００７９】
例えば、熱サイクルの任意の１サイクルにおいて、各アニーリングの期間（期間ＴＤ１などの各期間、今回の例では３０秒）に、保持盤２８０が１２回転（０．４回転／秒）するため、複数の反応容器３００のうちの１つは、検出部２６０の前をアニーリング工程の期間に１２回程度通過する。ここで、照射部２５０は、２つの励起光照射部を１回転ごとに切り替えることで、異なる波長の励起光を、順次、反応液３１０に照射するため、核酸増幅検査装置２００は、各アニーリングの期間に、今回の例ではＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬの蛍光値を６個程度、ＣＲ６Ｇの蛍光値を６個程度取得することができる。したがって、熱サイクルを５０回繰り返す間に、核酸増幅検査装置２００は、複数の反応容器３００のうちの１つに関して、今回の例ではＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬの蛍光値を合計３００個程度、ＣＲ６Ｇの蛍光値を合計３００個程度、それぞれ取得することができる。なお、図１０に示すように、サイクル回数を重ねるごとに、蛍光値が低下して収束しているが、これは、前述の通りＱ−ｐｒｏｂｅ法の特徴であり、反応液３１０内に、ＤＮＡの増幅産物が増加していることを示唆する。ここで、蛍光値群５０１は、検出部２６０が検出した複数個の蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を示す。
【００８０】
図１１は、反応液３１０に熱サイクルを与え始めた初期の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す。図１１は、核酸を増幅する前の状態であるため、例えば検出回数「１」〜検出回数「６」でほとんど差は見られず、同一のアニーリングの期間に検出した複数の蛍光値は安定している。
【００８１】
図１２は、反応液３１０に一定回数の熱サイクルを与えた後の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す。アニーリング工程の期間に、反応液３１０の温度が、予め定められた温度（６０℃）に到達してから蛍光値が安定する、すなわち完全にＧ消光するまで一定の時間を要する。そのため、反応液３１０の温度が６０℃に到達した瞬間に、検出部２６０による蛍光測定位置にある反応容器３００と、後続して検出部２６０による蛍光測定位置に位置する反応容器３００とでは、蛍光を検出するまでの時間が異なり、そのため本来同じであるはずの蛍光値が見かけ上異なってしまう。図１２の例では、熱サイクルの５０サイクル目の検出部が検出した蛍光値において、検出回数「２９５」の蛍光値５０２は、反応液３１０の温度が６０℃に到達した瞬間の蛍光の測定結果を示しており、他の検出回数の際の蛍光値（検出回数「２９６」〜検出回数「３００」）の蛍光値の方が明らかに安定している。したがって、核酸増幅検査装置２００は、検出部２６０が検出した蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、各サイクルの代表蛍光値から核酸の検査結果を演算し、演算結果をタッチパネルディスプレイ４００等により出力することで、核酸をいっそう再現性よく正確に検査することができる。数値が安定していない蛍光値も含めて代表蛍光値を選択または演算すると、再現性や正確性が低下するのみならず、前述の通り、複数の反応容器３００のポジションによる差が顕著に発生し、多検体同時測定が困難となる恐れがある。
【００８２】
図１３から図１５は、複数の反応容器３００のうちの１つについて、Ｔａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ（ＦＡＭ）を用いた際の検出部２６０が検出した蛍光値と蛍光を検出した回数との関係を示す図である。図１３は、ＰＣＲ反応全体（期間ＴＤ１〜期間ＴＤ４０）の蛍光値の推移を示す図である。図１４は、１サイクル目（期間ＴＤ１）の蛍光値の推移を示す図である。図１５は、３６サイクル目（期間ＴＤ３６）の蛍光値の推移をそれぞれ示す。
【００８３】
例えば、熱サイクルの任意の１サイクルにおいては、各アニーリングの期間（期間ＴＤ１などの各期間、今回の例では３０秒）に、保持盤２８０が１２回転（０．４回転／秒）するため、複数の反応容器３００のうちの１つは、検出部２６０の前をアニーリング工程の期間に１２回程度通過する。ここで、照射部２５０は、２つの励起光照射部を１回転ごとに切り替えることで、異なる波長の励起光を、順次、反応液３１０に照射するため、核酸増幅検査装置２００は、各アニーリングの期間に、今回の例ではＦＡＭの蛍光値を６個程度、ＶＩＣ（登録商標）の蛍光値を６個程度取得することができる。したがって、熱サイクルを４０回繰り返す間に、核酸増幅検査装置２００は、複数の反応容器３００のうちの１つに関して、今回の例ではＦＡＭの蛍光値を合計２４０個程度、ＶＩＣ（登録商標）の蛍光値を合計２４０個程度、それぞれ取得することができる。なお、状態（Ａ）に示すように、サイクル回数を重ねるごとに、蛍光値が上昇して収束しているが、これは、前述の通りＴａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法の特徴であり、反応液３１０内に、ＤＮＡの増幅産物が増加していることを示唆する。なお、Ｔａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法では、Ｑ−ｐｒｏｂｅ法での蛍光値群５０１ほど顕著に数値が安定していない蛍光値は見られないが、わずかに数値が安定していない蛍光値は存在する。
【００８４】
図１４は、反応液３１０に熱サイクルを与え始めた初期の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す。図１４は、核酸を増幅する前の状態であるため、例えば検出回数「１」〜検出回数「６」でほとんど差は見られず、同一のアニーリングの期間に検出した複数の蛍光値は安定している。
【００８５】
図１５は、反応液３１０に一定回数の熱サイクルを与えた後の蛍光検出部が検出した蛍光値を示す。アニーリング工程の期間に、反応液３１０の温度が、予め定められた温度（６０℃）に到達してから蛍光値が安定する、すなわち完全に蛍光を発するまで一定の時間を要する。そのため、反応液３１０の温度が６０℃に到達した瞬間に、検出部２６０による蛍光測定位置にある反応容器３００と、後続して検出部２６０による蛍光測定位置に位置する反応容器３００とでは、蛍光を検出するまでの時間が異なり、そのため本来同じであるはずの蛍光値が見かけ上異なってしまう。図１５の例では、熱サイクルの３６サイクル目の検出部が検出した蛍光値において、検出回数「２１１」の蛍光値５０３は、反応液３１０の温度が６０℃に到達した瞬間の蛍光の測定結果を示しており、他の検出回数の際の蛍光値（検出回数「２１２」〜検出回数「２１６」）の蛍光値の方がわずかに安定している。したがって、核酸増幅検査装置２００は、検出部２６０が検出した蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、各サイクルの代表蛍光値を選択または演算し、各サイクルの代表蛍光値から核酸の検査結果を演算し、演算結果をタッチパネルディスプレイ４００等により出力することで、核酸をいっそう再現性よく正確に検査することができる。数値が安定していない蛍光値も含めて代表蛍光値を選択または演算すると、再現性や正確性が低下するのみならず、前述の通り、複数の反応容器３００のポジションによる差が顕著に発生し、多検体同時測定が困難となる恐れがある。
【００８６】
図１６は、核酸増幅検査装置２００の動作を示すフローチャートである。核酸増幅検査装置２００の制御部２２０は、検出部２６０が検出した蛍光値を受け付けて、反応容器３００のポジションと、熱サイクルのサイクル回数（または蛍光値の検出回数）と、検出される蛍光の波長と、蛍光値とを対応付けて、記憶部２１０等に記憶させている。
【００８７】
ステップＳ１０３において、制御部２２０は、記憶部２１０から、検出部２６０が検出した蛍光値を読み出す。
【００８８】
ステップＳ１０５において、制御部２２０は、検出部２６０が検出した蛍光値のうち、一定の基準に基づいて、数値が安定した蛍光値を選択または演算し、代表蛍光値とする。
【００８９】
ステップＳ１０７において、制御部２２０は、サイクル数とステップＳ１０５で得られた代表蛍光値とのデータから、サイクル数に対する代表蛍光値をプロットした増幅曲線を作成する。併せて、一定の蛍光値まで達するサイクル数（Ｃｔ値）を演算する。なお、Ｃｔ値の算出方法は、前述の閾値と増幅曲線の交点をＣｔ値とする方法（Crossing Point 法）を用いてもよいし、増幅曲線の2 次導関数を求めてそれが最大となる点をＣｔ値とする方法（2nd Derivative Maximum 法）を用いてもよい。
【００９０】
ステップＳ１０９において、制御部２２０は、ステップＳ１０７におけるＣｔ値に基づいて、核酸の検査結果を出力する。なお、Ｃｔ値から核酸の検査結果を得る方法は、絶対定量法である検量線法を用いてもよいし、相対定量法であるΔΔＣｔ法を用いてもよい。
【００９１】
ステップＳ１０５の処理について詳細を説明する。
（１）例えば、核酸増幅検査装置２００が、Ｑ−ｐｒｏｂｅ法により核酸の検査をするように構成されている場合、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値の選択または演算を行う。
【００９２】
（１−ｉ）例えば、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値を代表蛍光値として選択（図１２の例では、検出回数「２９９」の蛍光値を選択）する。
【００９３】
（１−ｉｉ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最終の値を示す蛍光値を代表蛍光値として選択（図１２の例では、検出回数「３００」の蛍光値を選択）してもよい。
【００９４】
（１−ｉｉｉ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１２の例では、検出回数「２９５」の蛍光値を除外して、検出回数「２９６」〜検出回数「３００」の蛍光値の、例えば平均値を算出する）してもよい。
【００９５】
（１−ｉｖ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１２の例では、検出回数「２９５」の蛍光値を除外して、検出回数「２９６」〜検出回数「３００」の蛍光値の、例えば平均値を算出する）してもよい。
【００９６】
（１−ｖ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値および最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１２の例では、最小値を示す蛍光値である検出回数「２９９」の蛍光値と、最大値を示す蛍光値である検出回数「２９５」の蛍光値とを除外して、検出回数「２９６」〜検出回数「２９８」、および検出回数「３００」の蛍光値の、例えば平均値を算出する）してもよい。
【００９７】
（１−ｖｉ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値および最終の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１２の例では、最初の値を示す蛍光値である検出回数「２９５」の蛍光値と、最終の値を示す蛍光値である検出回数「３００」の蛍光値とを除外して、検出回数「２９６」〜検出回数「２９９」の蛍光値の、例えば平均値を算出する）してもよい。
【００９８】
なお、最大値を示す蛍光値を除外する理由は、Ｑ−ｐｒｏｂｅ法ではＤＮＡの増幅に伴い蛍光値が減少するためである。また、最初の値を示す蛍光値を除外する理由は、Ｑ−ｐｒｏｂｅが完全にＧ消光するまで一定の時間を要するためである。
【００９９】
（２）例えば、核酸増幅検査装置２００が、ＴａｑＭａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法により核酸の検査をするように構成されている場合、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値の選択または演算を行う。
【０１００】
（２−ｉ）例えば、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最大値を示す蛍光値を代表蛍光値として選択（図１５の例では、検出回数「２１５」の蛍光値を選択）する。
【０１０１】
（２−ｉｉ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最終の値を示す蛍光値を代表蛍光値として選択（図１５の例では、検出回数「２１６」の蛍光値を選択）してもよい。
【０１０２】
（２−ｉｉｉ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１５の例では、検出回数「２１１」の蛍光値を除外して、検出回数「２１２」〜検出回数「２１６」の蛍光値の、例えば平均値を算出）してもよい。
【０１０３】
（２−ｉｖ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１５の例では、検出回数「２１１」の蛍光値を除外して、検出回数「２１２」〜検出回数「２１６」の蛍光値の、例えば平均値を算出）してもよい。
【０１０４】
（２−ｖ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最小値を示す蛍光値および最大値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１５の例では、最小値を示す蛍光値である検出回数「２１１」の蛍光値と、最大値を示す蛍光値である検出回数「２１５」の蛍光値とを除外して、検出回数「２１２」〜検出回数「２１４」、および検出回数「２１６」の蛍光値の、例えば平均値を算出）してもよい。
【０１０５】
（２−ｖｉ）また、核酸増幅検査装置２００は、アニーリング期間における各サイクルの蛍光値のうち、最初の値を示す蛍光値および最終の値を示す蛍光値を除外して、その他の蛍光値を用いて各サイクルの代表蛍光値を選択または演算（図１５の例では、最初の値を示す蛍光値である検出回数「２１１」の蛍光値と、最終の値を示す蛍光値である検出回数「２１６」の蛍光値とを除外して、検出回数「２１２」〜検出回数「２１５」の蛍光値の、例えば平均値を算出）してもよい。
【０１０６】
なお、最小値を示す蛍光値を除外する理由は、Ｔａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅ法ではＤＮＡの増幅に伴い蛍光値が増加するためである。また、最初の値を示す蛍光値を除外する理由は、Ｔａｑｍａｎ（登録商標）−ｐｒｏｂｅが完全に蛍光を発するまで一定の時間を要するためである。
【０１０７】
このように、蛍光値の検出結果に基づいて、検出部２６０が検出した蛍光値のうち、数値が安定していない蛍光値を除外して、各サイクルの代表蛍光値の選択または演算を行う方法について説明したが、これらの方法に何ら限定されるものではない。
【０１０８】
＜実施の形態１のまとめ＞
実施の形態１の遺伝子解析装置１について説明した。核酸増幅検査装置２００は、このようにして、複数の反応容器３００からの蛍光の検出部２６０が検出した蛍光値のうち、数値が安定した蛍光値に基づいて、核酸の検査結果を演算し、タッチパネルディスプレイ４００等により出力する。
【０１０９】
また、実施の形態１の核酸増幅検査装置２００において、制御部２２０は、複数の励起光照射部（第１励起光照射部２５１および第２励起光照射部２５２）のうちいずれか１つを、反応容器３００に励起光を照射する励起光照射部として選択する。制御部２２０は、選択対象の励起光照射部を、例えば保持盤２８０が１回転するごとなどの予め定められたタイミングで切り替えることにより、複数の励起波長の励起光を反応容器３００に照射するように構成されている。これにより、励起光照射部が１つで１種類の波長の励起光を反応容器３００に照射する場合と比較して、複数の励起波長の励起光を反応容器３００に選択的に照射することができ、蛍光の検出の感度を高めることができる。
【０１１０】
＜実施の形態２＞
別の実施の形態の遺伝子解析装置１について説明する。実施の形態１において、反応容器３００は、保持盤２８０によって保持されることにより円周方向に移動可能に構成される例を説明した。実施の形態２では、反応容器３００は、線上を移動する。図１７は、実施の形態２の反応促進部２９０の構成の概略を示す図である。なお、核酸増幅検査装置２００における他の構成は実施の形態１と同様であるため説明を繰り返さない。図１８は、反応容器３００に対する照射部２５０と検出部２６０の位置関係を示し、反応容器３００が線上に移動する態様を示す図である。
【０１１１】
図１７に示すように、保持部２９７は、容器保持孔２８２により反応容器３００を保持する。保持部２９７は、線上に移動する機構を有している。核酸増幅検査装置２００の制御部２２０は、保持部２９７の移動を制御することにより、容器保持孔２８２に保持される反応容器３００に照射部２５０からの励起光を照射する。制御部２２０は、例えば、保持部２９７を一往復させるごとに、反応容器３００の反応液３１０に励起光を照射させる励起光照射部を切り替える。
【０１１２】
＜実施の形態３＞
図１９は、核酸増幅検査装置２００の他の一例を示すブロック図である。図１９の例では、核酸増幅検査装置２００のうち、反応促進部２９０の構成の概略を示している。
【０１１３】
図２０は、複数の励起光照射部を含む照射部２５０および複数の蛍光検出部を含む検出部２６０の構成の他の一例を示す図である。
【０１１４】
図１９に示すように、実施の形態３の核酸増幅検査装置２００は、照射部２５０により二波長の励起光を反応容器３００に照射する。検出部２６０は、４つの蛍光検出部を含む。例えば、４つの蛍光検出部のそれぞれは、特定の波長の蛍光を検出するように構成されている。
【０１１５】
図２０に示すように、検出部２６０は、第１蛍光検出部２６１と、第２蛍光検出部２６２と、第３蛍光検出部２６６と、第４蛍光検出部２６７と、ダイクロイックミラー２６３と、ダイクロイックミラー２６８と、ダイクロイックミラー２６９とを含む。第３蛍光検出部２６６は、検出器２６６Ａと、凸レンズ２６６Ｂと、バンドパスフィルタ２６６Ｃとを含む。第４蛍光検出部２６７は、検出器２６７Ａと、凸レンズ２６７Ｂと、バンドパスフィルタ２６７Ｃとを含む。
【０１１６】
検出部２６０において、反応容器３００に励起光が照射されることにより生じる蛍光は、レンズ２６５を介して検出部２６０に入射する。検出部２６０に入射する蛍光は、ダイクロイックミラー２６８により、特定の波長の光が反射されてダイクロイックミラー２６９に向かい、その他の波長の光はダイクロイックミラー２６８を透過して第４蛍光検出部２６７に入射する。ダイクロイックミラー２６９は、特定の波長の光を反射して第３蛍光検出部２６６に入射させ、その他の波長の光を透過させてダイクロイックミラー２６３に向かわせる。ダイクロイックミラー２６３は、特定の波長の光を反射して第２蛍光検出部２６２に入射させ、その他の波長の光を第１蛍光検出部２６１に入射させる。
【０１１７】
このように、検出部２６０が４つの蛍光検出部を備えることにより、同一の反応容器中で４種のＤＮＡ配列を同時に増幅検出することが可能となる。
【０１１８】
例えば、代表的な蛍光物質であるＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＣＲ６Ｇと、ＴＡＭＲＡ（Ｃａｒｂｏｘｙｔｅｔｒａｍｅｔｈｙｌｒｈｏｄａｍｉｎｅ）と、ＡＴＴＯ６６５を用いてマルチプレックスＰＣＲを行なう場合、ＴＡＭＲＡおよびＡＴＴＯ６６５の励起に対応する第１励起光照射部２５１は、５９０ｎｍの波長の励起光源となるように発光ダイオード２５１Ａとショートパスフィルタ２５１Ｃとバンドパスフィルタ２５１Ｄとを含んで構成されている。例えば、発光ダイオード２５１Ａは、最大波長５９０ｎｍのものを用いることができ、ショートパスフィルタ２５１Ｃは、「６１０ｎｍ」以上の光を阻止するものを用いることができ、バンドパスフィルタ２５１Ｄは、特定波長「５９０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。また、ＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬおよびＣＲ６Ｇの励起に対応する第２励起光照射部２５２は、４７０ｎｍの波長の励起光源となるように発光ダイオード２５２Ａとショートパスフィルタ２５２Ｃとバンドパスフィルタ２５２Ｄとを含んで構成されている。例えば、発光ダイオード２５２Ａは、最大波長４７０ｎｍのものを用いることができ、ショートパスフィルタ２５１Ｄは、「４９０ｎｍ」以上の光を阻止するものを用いることができ、バンドパスフィルタ２５２Ｄは、特定波長「４７０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。
【０１１９】
例えば、代表的な蛍光物質であるＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬと、ＣＲ６Ｇと、ＴＡＭＲＡと、ＡＴＴＯ６６５を用いてマルチプレックスＰＣＲを行なう場合、ＢＯＤＩＰＹ（登録商標）−ＦＬの検出に対応する、第１蛍光検出部２６１は、５３０ｎｍの波長の蛍光を検出するようにバンドパスフィルタ２６１Ｃと凸レンズ２６１Ｂとを含んで構成されている。例えば、バンドパスフィルタ２６１Ｃは、特定波長「５３０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。また、ＣＲ６Ｇの検出に対応する、第２蛍光検出部２６２は、５８０ｎｍの波長の蛍光を検出するようにバンドパスフィルタ２６２Ｃと凸レンズ２６２Ｂとを含んで構成されている。例えば、バンドパスフィルタ２６２Ｃは、特定波長「５８０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。また、ＴＡＭＲＡの検出に対応する、第３蛍光検出部２６６は、６３０ｎｍの波長の蛍光を検出するようにバンドパスフィルタ２６６Ｃと凸レンズ２６６Ｂとを含んで構成されている。例えば、バンドパスフィルタ２６６Ｃは、特定波長「６３０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。また、ＡＴＴＯ６６５の検出に対応する、第４蛍光検出部２６７は、６８０ｎｍの波長の蛍光を検出するようにバンドパスフィルタ２６７Ｃと凸レンズ２６７Ｂとを含んで構成されている。例えば、バンドパスフィルタ２６７Ｃは、特定波長「６８０±１０ｎｍ」の光を選択的に透過させるものを用いることができる。
【０１２０】
実施の形態１および２では、核酸増幅検査装置２００が、２つの励起光照射部および２つの蛍光検出部を備える例を、実施の形態３では、核酸増幅検査装置２００が、２つの励起光照射部および４つの蛍光検出部を備える例をそれぞれ示したが、励起光照射部および蛍光検出部の個数は複数つまり２つ以上であれば特に限定されず、例えば（１）２つの励起光照射部および２つの蛍光検出部、（２）２つの励起光照射部および３つの蛍光検出部、（３）２つの励起光照射部および４つの蛍光検出部、（４）３つの励起光照射部および３つの蛍光検出部、（５）３つの励起光照射部および４つの蛍光検出部、（６）３つの励起光照射部および５つの蛍光検出部、（７）３つの励起光照射部および６つの蛍光検出部、（８）４つの励起光照射部および４つの蛍光検出部、（９）４つの励起光照射部および５つの蛍光検出部、（１０）４つの励起光照射部および６つの蛍光検出部、（１１）４つの励起光照射部および７つの蛍光検出部、（１２）４つの励起光照射部および８つの蛍光検出部が挙げられる。
【０１２１】
１つの励起光照射部および１つの蛍光検出部、または２つの励起光照射部および１つの蛍光検出部の場合、同一の反応容器中で複数の配列を同時に増幅検出すること（所謂、マルチプレックスＰＣＲ）が不可能である。また、１つの励起光照射部および２つの蛍光検出部の場合、前記複数の蛍光物質に対してそれぞれ最適な波長の励起光を照射することができず、どちらか一方の感度が著しく低下する恐れがある。
【０１２２】
励起光照射部の個数と蛍光検出部の個数の比は１：１〜１：２が好ましい。励起光照射部の個数と蛍光検出部の個数の比が、１：１より小さい（例えば４つの励起光照射部および２つの蛍光検出部の場合）と、反応液中に４種の蛍光物質があり、その蛍光物質に最適な４波長の励起光を当てることで、４波長の蛍光を発したとしても、検出は２波長分しかできないため、４種の蛍光物質の内、２種の蛍光物質は測定不能となってしまい好ましくない。一方、励起光照射部の個数と蛍光検出部の個数の比が、１：２より大きい（例えば２つの励起光照射部および６つの蛍光検出部の場合）と、反応液中に６種の蛍光物質があり、前記６種の蛍光色素を２波長の励起光で全て励起しなければならず、感度が著しく低下する恐れがある。
【０１２３】
＜変形例＞
複数の励起光照射部の具体的な配置、および、複数の蛍光検出部の具体的な配置は、実施の形態で説明したものに限られない。また、反応液３１０に対する加熱および冷却方法も、実施の形態で説明したものに限られない。
【０１２４】
本実施の形態に係る遺伝子解析装置、および遺伝子解析装置を構成する核酸増幅検査装置は、プロセッサと、その上で実行されるプログラムにより実現される。本実施の形態を実現するプログラムは、通信インタフェースを介してネットワークを利用した送受信等により提供されることもある。
【０１２５】
今回開示された実施の形態はすべての点で例示であって制限的なものでないと考えられるべきである。この発明の範囲は上記した説明ではなくて特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲と均等の意味および範囲内でのすべての変更が含まれることが意図される。
【符号の説明】
【０１２６】
１  遺伝子解析装置、１００  核酸抽出装置、２１０  記憶部、２１１  動作設定、２２０  制御部、２２１  駆動制御部、２２２  温度調節部、２３０  電源部、２３１  半導体リレー、２５０  照射部、２５１  第１励起光照射部、２５２  第２励起光照射部、２５３  ダイクロイックミラー、２５４  凸レンズ、２５５  シリンドリカルレンズ、２６０  検出部、２６１  第１蛍光検出部、２６２  第２蛍光検出部、２６３  ダイクロイックミラー、２６４  ミラー、２６５  レンズ、２６６  第３蛍光検出部、２６７  第４蛍光検出部、２６８  ダイクロイックミラー、２６９  ダイクロイックミラー、２７９  回転盤、２８０  保持盤、２８１  ヒーター、２８２  容器保持孔、２９０  反応促進部、２９１  駆動部、２９２  回転速度制御装置、２９７  保持部、２９９  空調部、２００  核酸増幅検査装置、３００  反応容器、３１０  反応液、４００  タッチパネルディスプレイ。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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