【手続補正書】
【提出日】平成25年2月8日(2013.2.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
抗炎症活性を有し、かつ配列番号１のアミノ酸残基１〜１５４、１〜１７１もしくは１〜１７４を含む、長さが約２００アミノ酸までの単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素（ＡｓｐＲＳ）ポリペプチド、または長さが５０アミノ酸以上であるその活性断片、または配列番号１の残基１〜１５４、１〜１７１もしくは１〜１７４に対して少なくとも９０％の同一性を有するその活性変異体。
【請求項２】
前記活性断片の長さが１００アミノ酸以上である、請求項１に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項３】
前記活性断片の長さが１３０アミノ酸以上である、請求項１に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項４】
前記活性変異体が配列番号１の残基１〜１５４、１〜１７１または１〜１７４に対して少なくとも９５％の同一性を有する、請求項１に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項５】
前記ポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸残基１〜１５４、１〜１７１、もしくは１〜１７４または配列番号１の残基１〜１５４、１〜１７１もしくは１〜１７４に対して少なくとも９０％の同一性を有する活性変異体から本質的に成る、請求項１に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項６】
活性変異体が配列番号１の残基１〜１５４、１〜１７１もしくは１〜１７４に対して少なくとも９５％の同一性を有する、請求項５に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項７】
前記ポリペプチドの長さが約１５０〜１６０アミノ酸である、請求項１から６のいずれか一項に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項８】
配列番号１の残基１〜１５４から本質的に成る、請求項７に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項９】
配列番号１の残基１〜１５４、１〜１７１または１〜１７４から成る、請求項１に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１０】
異種の融合パートナーをさらに含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１１】
前記異種の融合パートナーがＦｃ断片である、請求項１０に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１２】
前記ポリペプチドがペグ化によって修飾されている、請求項１から９のいずれか一項に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１３】
前記ポリペプチドが、１つまたは複数の構成アミノ酸の化学的なおよび／または酵素による誘導体化を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１４】
前記抗炎症活性が、抗炎症性サイトカインの産生の誘導、ｔｏｌｌ様受容体への結合またはその両方である、請求項１から１３のいずれか一項に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１５】
前記抗炎症性サイトカインがＩＬ−１０である、請求項１４に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１６】
前記ｔｏｌｌ様受容体がＴＬＲ２およびＴＬＲ４である、請求項１４に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド。
【請求項１７】
ａ）請求項１から１６のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドもしくはその相補体、
ｂ）ａ）の単離されたポリヌクレオチドを含む発現ベクター、または
ｃ）ｂ）の発現ベクターを含む宿主細胞。
【請求項１８】
薬学的に許容できる担体と、
請求項１から１６のいずれか一項に記載のＡｓｐＲＳポリペプチドまたは請求項１７に記載のポリヌクレオチドと
を含む、組成物。
【請求項１９】
前記組成物のＬＰＳ含有細菌内毒素レベルが約１２ＥＵ／ｍｇ未満である、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
経口投与、非経口投与、静脈内投与、鼻腔内投与、吸入、頭蓋内投与、または筋肉内投与のために処方されている、請求項１８または１９に記載の組成物。
【請求項２１】
炎症性疾患、自己免疫疾患、新生物性疾患、代謝病、神経学的な疾患、感染症、心血管疾患、および異常な血管新生と関連する疾患からなる群から選択される状態を治療する際に使用するための、請求項１８から２０のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２２】
炎症性疾患または自己免疫疾患を治療する際に使用するための請求項２１に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２２】
他の態様では、本発明は、本発明による組成物を投与することによって、治療を必要とする被験体において、疾患、障害、または他の状態を治療するための方法を提供する。例示として、そのような疾患、障害、または状態は、炎症性疾患、自己免疫疾患、新生物性疾患（例えば癌）、代謝病、神経学的な疾患、感染症、心血管疾患、および異常な血管新生と関連する疾患を含み得るが、これらに限定されない。
本発明の好ましい実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
非標準的な生物活性を有する、単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素（ＡｓｐＲＳ）ポリペプチドまたはその活性変異体。
（項目２）
前記非標準的な生物活性は、細胞増殖の調整、アポトーシスの調整、炎症の調整、細胞分化の調整、血管新生の調整、細胞結合の調整、Ａｋｔを介した細胞シグナル伝達の調整、細胞の代謝の調整、サイトカイン産生または活性の調整、およびｔｏｌｌ様受容体シグナル伝達の調整からなる群から選択される、項目１に記載の単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目３）
配列番号１に記載の完全長ヒトアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素配列の断片である、項目１に記載の単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目４）
前記その活性変異体は、配列番号１に記載のヒトアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素配列に対してその長さにわたり少なくとも８０％または９０％の同一性を有するポリペプチドである、項目１に記載の単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目５）
配列番号１のアミノ酸残基１〜３１、１〜１５４、１〜１７１、もしくは１〜１７４またはその活性断片もしくは変異体から本質的に成る、項目１に記載の単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチド。
（項目６）
項目１から５のいずれか一項に記載のポリペプチドおよび異種の融合パートナーを含む融合ポリペプチド。
（項目７）
項目１に記載の少なくとも１つの単離されたアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素ポリペプチドを含む二量体または多量体複合体。
（項目８）
項目１から６のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする単離されたポリヌクレオチドまたはその相補体。
（項目９）
項目８に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
（項目１０）
項目９に記載の発現ベクターを含む宿主細胞。
（項目１１）
項目８に記載のポリヌクレオチドと特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチド。
（項目１２）
プライマー、プローブ、およびアンチセンスオリゴヌクレオチドから選択される、項目１１に記載オリゴヌクレオチド。
（項目１３）
項目１に記載の単離されたＡｓｐＲＳポリペプチド、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドの細胞性結合パートナー、またはその両方に対して結合特異性を示す結合剤。
（項目１４）
抗体、その抗原結合断片、ペプチド、ペプチドミメティック、小分子、およびアプタマーから選択される、項目１３に記載の結合剤。
（項目１５）
前記ＡｓｐＲＳポリペプチドの非標準的な活性に拮抗する、項目１３に記載の結合剤。
（項目１６）
前記ＡｓｐＲＳポリペプチドの非標準的な活性を刺激する、項目１３に記載の結合剤。
（項目１７）
試料中のアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素（ＡｓｐＲＳ）ポリペプチドの存在またはレベルを決定する方法であって、項目１から６のいずれか一項に記載のＡｓｐＲＳポリペプチドに特異的に結合するものまたは結合剤と前記試料を接触させるステップ、前記結合剤の存在または非存在を検出するステップ、およびそれによって、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドの存在またはレベルを決定するステップを含む方法。
（項目１８）
試料中のアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素（ＡｓｐＲＳ）ポリペプチドの存在またはレベルを決定する方法であって、項目１から６のいずれか一項に記載のＡｓｐＲＳポリペプチドを特異的に同定することができる分子検出器の中に前記試料を導入するステップ、およびそれによって、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドの存在またはレベルを決定するステップを含む方法。
（項目１９）
前記分子検出器は質量分析計（ＭＳ）である、項目１８に記載の方法。
（項目２０）
前記ＡｓｐＲＳタンパク質断片の存在またはレベルをコントロール試料または所定の値と比較するステップを含む、項目１７または１８に記載の方法。
（項目２１）
前記試料とコントロールを区別するために前記試料の状態を特徴付けるステップを含む、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記試料およびコントロールは細胞または組織を含み、前記方法は、異なる種の細胞もしくは組織、異なる組織または器官の細胞、異なる細胞発生段階の細胞、異なる細胞分化状態の細胞、または健常な細胞および罹患した細胞を区別するステップを含む、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
項目１から６のいずれか一項に記載のアスパルチルｔＲＮＡ合成酵素（ＡｓｐＲＳ）ポリペプチドまたはその細胞性結合パートナーの１つもしくは複数に特異的に結合する化合物を同定する方法であって、ａ）適した条件下で、少なくとも１つの試験化合物と、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドまたはその細胞性結合パートナーまたはその両方を組み合わせるステップ、およびｂ）前記試験化合物に対する前記ＡｓｐＲＳポリペプチドまたはその細胞性結合パートナーまたはその両方の結合を検出し、それによって、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドまたはその細胞性結合パートナーまたはその両方に特異的に結合する化合物を同定するステップを含む方法。
（項目２４）
前記試験化合物は、ポリペプチドもしくはペプチド、抗体もしくはその抗原結合断片、ペプチドミメティック、または小分子である、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記試験化合物は、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドまたはその細胞性結合パートナーの非標準的な生物活性を刺激する、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
前記試験化合物は、前記ＡｓｐＲＳポリペプチドまたはその細胞性結合パートナーの非標準的な生物活性に拮抗する、項目２３に記載の方法。
（項目２７）
項目２３から２６のいずれか一項に記載の方法によって同定される化合物。
（項目２８）
生理学的に許容できる担体と、（ｉ）項目１に記載の単離されたポリペプチド；（ｉｉ）項目６に記載の融合タンパク質；（ｉｉｉ）項目７に記載の二量体または多量体
複合体；（ｉｖ）項目８に記載の単離されたポリヌクレオチド；（ｖ）項目９に記載の発現ベクター；（ｖｉ）項目１１に記載のオリゴヌクレオチド；（ｖｉｉ）項目１３に記載の結合剤；および（ｖｉｉｉ）項目２７に記載の化合物からなる群から選択される少なくとも１つの成分とを含む組成物。
（項目２９）
細胞または組織を項目２８の組成物と接触させるステップを含む、細胞の活性を調整するための方法。
（項目３０）
前記細胞の活性は、細胞移動、細胞増殖、アポトーシス、炎症、細胞分化、血管新生、細胞結合、Ａｋｔを介した細胞シグナル伝達、細胞の代謝、サイトカイン産生、およびｔｏｌｌ様受容体シグナル伝達の調整からなる群から選択される、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
前記細胞の活性はサイトカイン産生である、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
前記サイトカインは、ＩＬ１−β、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２ｐ４０、ＭＩＰ１−α、ＭＩＰ−１β、ＧＲＯ−α、ＭＣＰ−１、またはＩＬ−１ｒａのうちのいずれか１つまたは複数である、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記細胞の活性はｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）シグナル伝達である、項目３１に記載の方法。
（項目３４）
前記ＴＬＲは、ＴＬＲ２、ＴＬＲ４、またはその両方である、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
先天免疫応答を刺激する方法である、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記細胞は被験体中に存在する、項目２９に記載の方法。
（項目３７）
炎症性疾患、自己免疫疾患、新生物性疾患、代謝病、神経学的な疾患、感染症、心血管疾患、および異常な血管新生と関連する疾患からなる群から選択される状態を治療するための方法であって、治療を必要とする被験体に、項目２９に記載の組成物を投与するステップを含む方法。