【手続補正書】
【提出日】平成25年8月22日(2013.8.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
血清試料中のｍｉＲＮＡのレベルの低下または上昇を、肺腫瘍または肺病変を有する患者において肺がんを特徴づけるための指標とする方法であって、
ａ．血清試料中のｍｉＲＮＡのレベルを測定するステップであって、前記ｍｉＲＮＡが、ｍｉｒ−２７ｂ、ｍｉＲ−１５ｂ、ｍｉＲ−２１０、ｍｉＲ−１５５、ｍｉＲ−１２６、ｍｉＲ−１４２−３ｐ、ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｍｉＲ−１８１ｄ、ｍｉＲ−２１、ｍｉＲ−２０５、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｅ、ｍｉＲ−１０ａ、ｍｉＲ−１０ｂ、ｍｉＲ−１３０ｂ、ｍｉＲ−１３２、ｍｉＲ−１３３ｂ、ｍｉＲ−１３９、ｍｉＲ−１４３、ｍｉＲ−１５２、ｍｉＲ−１７−５ｐ、ｍｉＲ−１９３、ｍｉＲ−１９４、ｍｉＲ−１９５、ｍｉＲ−１９６ｂ、ｍｉＲ−１９９ａ＊、ｍｉＲ−１９ｂ、ｍｉＲ−２０２、ｍｉＲ−２０４、ｍｉＲ−２０６、ｍｉＲ−２０ｂ、ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−２２１、ｍｉＲ−２７ａ、ｍｉＲ−２９６、ｍｉＲ−２９ａ、ｍｉＲ−３０１、ｍｉＲ−３２４−３ｐ、ｍｉＲ−３２４−５ｐ、ｍｉＲ−３３９、ｍｉＲ−３４６、ｍｉＲ−３６５、ｍｉＲ−３７８、ｍｉＲ−４２２ａ、ｍｉＲ−４３２、ｍｉＲ−４８５−３ｐ、ｍｉＲ−４９６、ｍｉＲ−４９７、ｍｉＲ−５０５、ｍｉＲ−５１８ｂ、ｍｉＲ−５２５、ｍｉＲ−５６６、ｍｉＲ−６０５、ｍｉＲ−６３８、ｍｉＲ−６６０、およびｍｉＲ−９３から選択されるステップと、
ｂ．前記試料中の前記ｍｉＲＮＡのレベルの低下または上昇を決定し、それによって前記患者における肺がんが特徴づけられるステップと
を含む方法。
【請求項２】
前記肺がんが小細胞肺がんまたは非小細胞肺がんである、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記患者が、以前に肺疾患についてスクリーニングされたことがある、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記患者が、肺がんを有する疑いがある、または肺がんを発症する危険性がある、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記スクリーニングが、ＣＴスキャンまたは胸部Ｘ線によるものであった、請求項３に記載の方法。
【請求項６】
前記ｍｉＲＮＡを増幅するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記増幅が、定量的逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応によるものである、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
第２のｍｉＲＮＡを増幅し、測定し、そのレベルの低下または上昇を決定するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
血清試料中の第１のｍｉＲＮＡおよび第２のｍｉＲＮＡのレベルの低下または上昇を、患者における肺疾患を特徴づけるための指標とする方法であって、
ａ．血清試料中の第１のｍｉＲＮＡおよび第２のｍｉＲＮＡのレベルを測定するステップであって、前記第１のｍｉＲＮＡが、ｍｉｒ−２７ｂ、ｍｉＲ−１５ｂ、ｍｉＲ−２１０、ｍｉＲ−１５５、ｍｉＲ−１２６、ｍｉＲ−１４２−３ｐ、ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｍｉＲ−１８１ｄ、ｍｉＲ−２１、ｍｉＲ−２０５、ｌｅｔ−７ａ、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ、ｌｅｔ−７ｇ、ｌｅｔ−７ｉ、ｍｉＲ−１０１、ｍｉＲ−１０６ａ、ｍｉＲ−１０６ｂ、ｍｉＲ−１２５ａ、ｍｉＲ−１２６＊、ｍｉＲ−１３０ｂ、ｍｉＲ−１３２、ｍｉＲ−１３３ｂ、ｍｉＲ−１４０、ｍｉＲ−１４５、ｍｉＲ−１４６ａ、ｍｉＲ−１４６ｂ、ｍｉＲ−１４８ｂ、ｍｉＲ−１５０、ｍｉＲ−１５１、ｍｉＲ−１５ａ、ｍｉＲ−１８１ａ、ｍｉＲ−１８１ｂ、ｍｉＲ−１８５、ｍｉＲ−１８６、ｍｉＲ−１９０、ｍｉＲ−１９１、ｍｉＲ−１９３ａ、ｍｉＲ−１９９ａ＊、ｍｉＲ−２０２、ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−２２２、ｍｉＲ−２３ａ、ｍｉＲ−２４、ｍｉＲ−２６ａ、ｍｉＲ−２６ｂ、ｍｉＲ−２７ａ、ｍｉＲ−２９ｂ、ｍｉＲ−３０１、ｍｉＲ−３０ａ−５ｐ、ｍｉＲ−３０ｂ、ｍｉＲ−３０ｃ、ｍｉＲ−３０ｄ、ｍｉＲ−３０ｅ−５ｐ、ｍｉＲ−３２０、ｍｉＲ−３２４−３ｐ、ｍｉＲ−３２６、ｍｉＲ−３３５、ｍｉＲ−３４０、ｍｉＲ−３４２、ｍｉＲ−３４５、ｍｉＲ−３４６、ｍｉＲ−３４ａ、ｍｉＲ−３７４、ｍｉＲ−３７５、ｍｉＲ−３７８、ｍｉＲ−４２２ａ、ｍｉＲ−４２２ｂ、ｍｉＲ−４２５、ｍｉＲ−４８６、ｍｉＲ−４９６、ｍｉＲ−５１８ｂ、ｍｉＲ−６６０、ｍｉＲ−７、ｍｉＲ−９２、ｍｉＲ−９３、ｍｉＲ−９８、ｍｉＲ−９９ａ、およびｍｉＲ−９９ｂから選択されるステップと、
ｂ．前記試料中の前記第１のｍｉＲＮＡおよび前記第２のｍｉＲＮＡのレベルの低下または上昇を検出し、それによって前記患者における肺疾患が特徴づけられるステップと
を含む方法。
【請求項１０】
前記第１のｍｉＲＮＡが、ｍｉｒ−２７ｂ、ｍｉＲ−１５ｂ、ｍｉＲ−２１０、ｍｉＲ−１５５、ｍｉＲ−１２６、ｍｉＲ−１４２−３ｐ、ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｍｉＲ−１８１ｄ，ｌｅｔ−７ｇ、ｍｉＲ−１０６ｂ、ｍｉＲ−１２６＊、ｍｉＲ−１３２、ｍｉＲ−１４０、ｍｉＲ−１４６ａ、ｍｉＲ−１５０、ｍｉＲ−１５ａ、ｍｉＲ−１８１ａ、ｍｉＲ−１８１ｂ、ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−２４、ｍｉＲ−３０ａ−５ｐ、ｍｉＲ−３２０、ｍｉＲ−３４２、ｍｉＲ−３４５、ｍｉＲ−３７４、ｍｉＲ−４２２ａ、ｍｉＲ−４２２ｂ、ｍｉＲ−４８６、およびｍｉＲ−９２から選択される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記第１のｍｉＲＮＡおよび前記第２のｍｉＲＮＡが、表３から選択される対である、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
前記肺疾患ががんである、請求項９に記載の方法。
【請求項１３】
前記患者が肺腫瘍または肺病変を有する、請求項９に記載の方法。
【請求項１４】
前記患者が、以前に肺疾患についてスクリーニングされたことがある、請求項９に記載の方法。
【請求項１５】
前記がんが小細胞肺がんまたは非小細胞肺がんである、請求項１２に記載の方法。
【請求項１６】
前記第１のｍｉＲＮＡおよび前記第２のｍｉＲＮＡを増幅するステップをさらに含む、請求項９に記載の方法。
【請求項１７】
前記増幅が、定量的逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応によるものである、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
前記患者が男性である、請求項９に記載の方法。
【請求項１９】
前記患者が女性である、請求項９に記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１３
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１３】
本発明のある特定の実施形態では、診断または予後判定は、肺疾患の対象の血清中または血漿中に存在するレベルが上昇または低下しているｍｉＲＮＡの量を測定することによって実現することができる。ある場合には、肺疾患を特徴づけるために１種の血清ｍｉＲＮＡまたは血漿ｍｉＲＮＡを検出（例えば、増幅および測定）することができ、一方他の実施形態では、２種以上のｍｉＲＮＡを血清または血漿から検出する。一部の実施形態は、ｍｉＲＮＡの対を検出することを含む。ある場合には、肺疾患または肺がんの患者の血清または血漿において、対の一方のｍｉＲＮＡは上昇していて、対の他方のｍｉＲＮＡは低下している。別の状況では、対のｍｉＲＮＡの両方が上昇していてよい、または両方が低下していてよい。ある特定の実施形態では、タンパク質マーカーなどの非ｍｉＲＮＡバイオマーカーも測定することができる。本発明の一部の実施形態は、肺がんを診断または予後判定すること、または患者における肺がんの種類を決定することに関する。一部の実施形態では、患者は、以前に肺疾患についてスクリーニングされたことがある。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
肺腫瘍または肺病変を有する患者において肺がんを特徴づける方法であって、
ａ．血清試料中のｍｉＲＮＡのレベルを測定するステップであって、前記ｍｉＲＮＡが、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｃ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｅ、ｍｉＲ−１０ａ、ｍｉＲ−１０ｂ、ｍｉＲ−１３０ｂ、ｍｉＲ−１３２、ｍｉＲ−１３３ｂ、ｍｉＲ−１３９、ｍｉＲ−１４３、ｍｉＲ−１５２、ｍｉＲ−１５５、ｍｉＲ−１５ｂ、ｍｉＲ−１７−５ｐ、ｍｉＲ−１９３、ｍｉＲ−１９４、ｍｉＲ−１９５、ｍｉＲ−１９６ｂ、ｍｉＲ−１９９ａ＊、ｍｉＲ−１９ｂ、ｍｉＲ−２０２、ｍｉＲ−２０４、ｍｉＲ−２０５、ｍｉＲ−２０６、ｍｉＲ−２０ｂ、ｍｉＲ−２１、ｍｉＲ−２１０、ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−２２１、ｍｉＲ−２７ａ、ｍｉＲ−２７ｂ、ｍｉＲ−２９６、ｍｉＲ−２９ａ、ｍｉＲ−３０１、ｍｉＲ−３２４−３ｐ、ｍｉＲ−３２４−５ｐ、ｍｉＲ−３３９、ｍｉＲ−３４６、ｍｉＲ−３６５、ｍｉＲ−３７８、ｍｉＲ−４２２ａ、ｍｉＲ−４３２、ｍｉＲ−４８５−３ｐ、ｍｉＲ−４９６、ｍｉＲ−４９７、ｍｉＲ−５０５、ｍｉＲ−５１８ｂ、ｍｉＲ−５２５、ｍｉＲ−５６６、ｍｉＲ−６０５、ｍｉＲ−６３８、ｍｉＲ−６６０、およびｍｉＲ−９３から選択されるステップと、
ｂ．前記試料中の前記ｍｉＲＮＡのレベルの低下または上昇を決定し、それによって前記患者における肺がんを特徴づけるステップと
を含む方法。
（項目２）
前記肺がんが小細胞肺がんまたは非小細胞肺がんである、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記患者が、以前に肺疾患についてスクリーニングされたことがある、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記患者が、肺がんを有する疑いがある、または肺がんを発症する危険性がある、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記スクリーニングが、ＣＴスキャンまたは胸部Ｘ線によるものであった、項目３に記載の方法。
（項目６）
前記ｍｉＲＮＡを増幅するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記増幅が、定量的逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応によるものである、項目６に記載の方法。
（項目８）
第２のｍｉＲＮＡを増幅し、測定し、そのレベルの低下または上昇を決定するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目９）
患者における肺疾患を特徴づける方法であって、
ａ．血清試料中の第１のｍｉＲＮＡおよび第２のｍｉＲＮＡのレベルを測定するステップであって、前記第１のｍｉＲＮＡが、ｌｅｔ−７ａ、ｌｅｔ−７ｂ、ｌｅｔ−７ｄ、ｌｅｔ−７ｆ、ｌｅｔ−７ｇ、ｌｅｔ−７ｉ、ｍｉＲ−１０１、ｍｉＲ−１０６ａ、ｍｉＲ−１０６ｂ、ｍｉＲ−１２５ａ、ｍｉＲ−１２６、ｍｉＲ−１２６＊、ｍｉＲ−１３０ｂ、ｍｉＲ−１３２、ｍｉＲ−１３３ｂ、ｍｉＲ−１４０、ｍｉＲ−１４２−３ｐ、ｍｉＲ−１４２−５ｐ、ｍｉＲ−１４５、ｍｉＲ−１４６ａ、ｍｉＲ−１４６ｂ、ｍｉＲ−１４８ｂ、ｍｉＲ−１５０、ｍｉＲ−１５１、ｍｉＲ−１５ａ、ｍｉＲ−１５ｂ、ｍｉＲ−１８１ａ、ｍｉＲ−１８１ｂ、ｍｉＲ−１８１ｄ、ｍｉＲ−１８５、ｍｉＲ−１８６、ｍｉＲ−１９０、ｍｉＲ−１９１、ｍｉＲ−１９３ａ、ｍｉＲ−１９９ａ＊、ｍｉＲ−２０２、ｍｉＲ−２１０、ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−２２２、ｍｉＲ−２３ａ、ｍｉＲ−２４、ｍｉＲ−２６ａ、ｍｉＲ−２６ｂ、ｍｉＲ−２７ａ、ｍｉＲ−２７ｂ、ｍｉＲ−２９ｂ、ｍｉＲ−３０１、ｍｉＲ−３０ａ−５ｐ、ｍｉＲ−３０ｂ、ｍｉＲ−３０ｃ、ｍｉＲ−３０ｄ、ｍｉＲ−３０ｅ−５ｐ、ｍｉＲ−３２０、ｍｉＲ−３２４−３ｐ、ｍｉＲ−３２６、ｍｉＲ−３３５、ｍｉＲ−３４０、ｍｉＲ−３４２、ｍｉＲ−３４５、ｍｉＲ−３４６、ｍｉＲ−３４ａ、ｍｉＲ−３７４、ｍｉＲ−３７５、ｍｉＲ−３７８、ｍｉＲ−４２２ａ、ｍｉＲ−４２２ｂ、ｍｉＲ−４２５、ｍｉＲ−４８６、ｍｉＲ−４９６、ｍｉＲ−５１８ｂ、ｍｉＲ−６６０、ｍｉＲ−７、ｍｉＲ−９２、ｍｉＲ−９３、ｍｉＲ−９８、ｍｉＲ−９９ａ、およびｍｉＲ−９９ｂから選択されるステップと、
ｂ．前記試料中の前記第１のｍｉＲＮＡおよび前記第２のｍｉＲＮＡのレベルの低下または上昇を検出し、それによって前記患者における肺疾患を特徴づけるステップと
を含む方法。
（項目１０）
前記第１のｍｉＲＮＡが、ｌｅｔ−７ｇ、ｍｉＲ−１０６ｂ、ｍｉＲ−１２６、ｍｉＲ−１２６＊、ｍｉＲ−１３２、ｍｉＲ−１４０、ｍｉＲ−１４２−３ｐ、ｍｉＲ−１４６ａ、ｍｉＲ−１５０、ｍｉＲ−１５ａ、ｍｉＲ−１５ｂ、ｍｉＲ−１８１ａ、ｍｉＲ−１８１ｂ、ｍｉＲ−１８１ｄ、ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−２４、ｍｉＲ−３０ａ−５ｐ、ｍｉＲ−３２０、ｍｉＲ−３４２、ｍｉＲ−３４５、ｍｉＲ−３７４、ｍｉＲ−４２２ａ、ｍｉＲ−４２２ｂ、ｍｉＲ−４８６、およびｍｉＲ−９２から選択される、項目９に記載の方法。
（項目１１）
前記第１のｍｉＲＮＡおよび前記第２のｍｉＲＮＡが、表３から選択される対である、項目９に記載の方法。
（項目１２）
前記肺疾患ががんである、項目９に記載の方法。
（項目１３）
前記患者が肺腫瘍または肺病変を有する、項目９に記載の方法。
（項目１４）
前記患者が、以前に肺疾患についてスクリーニングされたことがある、項目９に記載の方法。
（項目１５）
前記がんが小細胞肺がんまたは非小細胞肺がんである、項目１２に記載の方法。
（項目１６）
前記第１のｍｉＲＮＡおよび前記第２のｍｉＲＮＡを増幅するステップをさらに含む、項目９に記載の方法。
（項目１７）
前記増幅が、定量的逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応によるものである、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記患者が男性である、項目９に記載の方法。
（項目１９）
前記患者が女性である、項目９に記載の方法。