【手続補正書】
【提出日】平成25年10月25日(2013.10.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
表１のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約６０％同一であるアミノ酸配列を含むペプチド模倣大環状分子。
【請求項２】
前記ペプチド模倣大環状分子の前記アミノ酸配列が、表１のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％同一である、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項３】
前記ペプチド模倣大環状分子の前記アミノ酸配列が、表１のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約９０％同一である、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項４】
前記ペプチド模倣大環状分子の前記アミノ酸配列が、表１のアミノ酸配列からなる群より選択される、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項５】
へリックスを含む、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項６】
α―へリックスを含む、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項７】
α，α−二置換アミノ酸を含む、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項８】
少なくとも２つのアミノ酸のα位を連結する架橋剤を含む、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項９】
前記２つのアミノ酸の少なくとも１つがα，α−二置換アミノ酸である、請求項８に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項１０】
式：
【化３７】
2013505300.tif 000001
を有する、請求項８に記載のペプチド模倣大環状分子であって、式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【化３８】
2013505300.tif 000002
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換されている、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌは、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールであるか、またはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールであるか、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗは独立して、１〜１０００の整数であり；
ｕ、ｘ、ｙおよびｚは独立して、０〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である、ペプチド模倣大環状分子。
【請求項１１】
前記ペプチド模倣大環状分子内の第１のアミノ酸の骨格アミノ基を第２のアミノ酸に連結させる架橋剤を含む、請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項１２】
式（ＩＶ）または（ＩＶａ）：
【化３９】
2013505300.tif 000003
を有する、請求項１１に記載のペプチド模倣大環状分子であって、式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【化４０】
2013505300.tif 000004
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、もしくはヘテロシクロアルキルであるか、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換されている、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
ｖおよびｗは独立して、１〜１０００の整数であり；
ｕ、ｘ、ｙおよびｚは独立して、０〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である、ペプチド模倣大環状分子。
【請求項１３】
請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子を含む、被験体の癌を処置するための組成物。
【請求項１４】
請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子を含む、被験体におけるβ−カテニンの活性を調節するための組成物。
【請求項１５】
請求項１に記載のペプチド模倣大環状分子を含む、被験体においてβ−カテニンとＴＣＦ／ＬＥＦタンパク質との間の相互作用をアンタゴナイズするための組成物。
【請求項１６】
Ｌ１およびＬ２が、独立してアルキレン、アルケニレンまたはアルキニレンである、請求項１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項１７】
Ｌ１およびＬ２が、独立してＣ３〜Ｃ１０アルキレンまたはＣ３〜Ｃ１０アルケニレンである、請求項１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項１８】
Ｌ１およびＬ２が、独立してＣ３〜Ｃ６アルキレンまたはＣ３〜Ｃ６アルケニレンである、請求項１６に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項１９】
Ｒ１およびＲ２がＨである、請求項１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項２０】
Ｒ１およびＲ２が、独立してアルキルである、請求項１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項２１】
Ｒ１およびＲ２がメチルである、請求項１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
【請求項２２】
被験体においてβカテニンの活性を調節するための組成物であって、式（Ｉ）：
【化３７】
2013505300.tif 000005
（式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【化３８】
2013505300.tif 000006
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換されている、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌは、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールであるか、またはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールであるか、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗは独立して、１〜１０００の整数であり；
ｕ、ｘ、ｙおよびｚは独立して、０〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である）
のペプチド模倣大環状分子を含む、組成物。
【請求項２３】
Ｒ１およびＲ２のうちの少なくとも一つが、非置換であるかもしくはハロ−で置換されている、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルである、請求項２２に記載の組成物。
【請求項２４】
Ｒ１およびＲ２のうちの少なくとも一つが、アルキルである、請求項２２に記載の組成物。
【請求項２５】
Ｒ１およびＲ２はメチルである、請求項２２に記載の組成物。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１１
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１１】
さらに、本発明は、被験体に本発明のペプチド模倣大環状分子を投与することを含む、上記被験体の癌を処置する方法を提供する。また、被験体に本発明のペプチド模倣大環状分子を投与することを含む、上記被験体においてβ−カテニンの活性を調節する方法、または被験体にこのようなペプチド模倣大環状分子を投与することを含む、上記被験体においてβ−カテニンとＴＣＦ／ＬＥＦタンパク質との間の相互作用をアンタゴナイズする方法を提供する。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
表１のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約６０％同一であるアミノ酸配列を含むペプチド模倣大環状分子。
（項目２）
前記ペプチド模倣大環状分子の前記アミノ酸配列が、表１のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％同一である、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目３）
前記ペプチド模倣大環状分子の前記アミノ酸配列が、表１のアミノ酸配列からなる群より選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約９０％同一である、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目４）
前記ペプチド模倣大環状分子の前記アミノ酸配列が、表１のアミノ酸配列からなる群より選択される、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目５）
へリックスを含む、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目６）
α―へリックスを含む、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目７）
α，α−二置換アミノ酸を含む、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目８）
少なくとも２つのアミノ酸のα位を連結する架橋剤を含む、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目９）
前記２つのアミノ酸の少なくとも１つがα，α−二置換アミノ酸である、項目８に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目１０）
式：
【化３７】
2013505300.tif 000007
を有する、項目８に記載のペプチド模倣大環状分子であって、式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【化３８】
2013505300.tif 000008
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換されている、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌは、式−Ｌ１−Ｌ２−の大環状分子形成リンカーであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールであるか、またはＤ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ８は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、もしくはヘテロシクロアリールであるか、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
ｖおよびｗは独立して、１〜１０００の整数であり；
ｕ、ｘ、ｙおよびｚは独立して、０〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である、ペプチド模倣大環状分子。
（項目１１）
前記ペプチド模倣大環状分子内の第１のアミノ酸の骨格アミノ基を第２のアミノ酸に連結させる架橋剤を含む、項目１に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目１２）
式（ＩＶ）または（ＩＶａ）：
【化３９】
2013505300.tif 000009
を有する、項目１１に記載のペプチド模倣大環状分子であって、式中：
Ａ、Ｃ、Ｄ、およびＥはそれぞれ独立して、天然アミノ酸または非天然アミノ酸であり；
Ｂは、天然アミノ酸もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
【化４０】
2013505300.tif 000010
、［−ＮＨ−Ｌ３−ＣＯ−］、［−ＮＨ−Ｌ３−ＳＯ２−］、または［−ＮＨ−Ｌ３−］であり；
Ｒ１およびＲ２は独立して、非置換であるかもしくはハロ−で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、もしくはヘテロシクロアルキルであるか、またはＥ残基を有する環状構造の一部であり；
Ｒ３は、必要に応じてＲ５で置換されている、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
Ｌ１およびＬ２は独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または［−Ｒ４−Ｋ−Ｒ４−］ｎであり、それぞれ、必要に応じてＲ５で置換され；
Ｒ４はそれぞれ、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり；
Ｋはそれぞれ、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ２、ＣＯ、ＣＯ２、またはＣＯＮＲ３であり；
Ｒ５はそれぞれ独立して、ハロゲン、アルキル、−ＯＲ６、−Ｎ（Ｒ６）２、−ＳＲ６、−ＳＯＲ６、−ＳＯ２Ｒ６、−ＣＯ２Ｒ６、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ６はそれぞれ独立して、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、蛍光性部分、放射性同位体または治療剤であり；
Ｒ７は、必要に応じてＲ５で置換されている、−Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリール、またはヘテロシクロアリールであり；
ｖおよびｗは独立して、１〜１０００の整数であり；
ｕ、ｘ、ｙおよびｚは独立して、０〜１０の整数であり；かつ
ｎは１〜５の整数である、ペプチド模倣大環状分子。
（項目１３）
項目１に記載のペプチド模倣大環状分子を被験体に投与することを含む、前記被験体の癌を処置する方法。
（項目１４）
項目１に記載のペプチド模倣大環状分子を被験体に投与することを含む、前記被験体におけるβ−カテニンの活性を調節する方法。
（項目１５）
項目１に記載のペプチド模倣大環状分子を被験体に投与することを含む、前記被験体においてβ−カテニンとＴＣＦ／ＬＥＦタンパク質との間の相互作用をアンタゴナイズする方法。
（項目１６）
Ｌ１およびＬ２が、独立してアルキレン、アルケニレンまたはアルキニレンである、項目１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目１７）
Ｌ１およびＬ２が、独立してＣ３〜Ｃ１０アルキレンまたはＣ３〜Ｃ１０アルケニレンである、項目１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目１８）
Ｌ１およびＬ２が、独立してＣ３〜Ｃ６アルキレンまたはＣ３〜Ｃ６アルケニレンである、項目１６に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目１９）
Ｒ１およびＲ２がＨである、項目１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目２０）
Ｒ１およびＲ２が、独立してアルキルである、項目１０に記載のペプチド模倣大環状分子。
（項目２１）
Ｒ１およびＲ２がメチルである、項目１０に記載のペプチド模倣大環状分子。