【手続補正書】
【提出日】平成25年3月6日(2013.3.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（a）イヌから核酸を含有する試料を入手する段階；および
（b）前記試料中のSOD1遺伝子または転写物の構造を評価する段階
を含む、変性性脊髄症の遺伝マーカーに関してイヌをスクリーニングする方法であって、
参照野生型SOD1遺伝子または転写物と比較した場合の該SOD1遺伝子または転写物の構造における変化により、前記イヌが前記遺伝マーカーを保有することが指し示される、方法。
【請求項２】
イヌが、ボクサー（boxer）、ウェルシュ・コーギー（Welsh corgi）、チェサピーク・ベイ・レトリーバー（Chesapeake Bay retriever）、ローデシアン・リッジバック（Rhodesian ridgeback）、ジャーマン・シェパード（German shepherd）、ケリー・ブルー・テリア（Kerry blue terrier）、アイリッシュ・セッター（Irish setter）、オールド・イングリッシュ・シープドッグ（old English sheepdog）、コリー（collie）、スタンダード・プードル（standard poodle）、ワイヤー・フォックス・テリア（wire Fox terrier）もしくは別の品種、またはそれらの交雑種である、請求項1記載の方法。
【請求項３】
段階（a）が、パイロシークエンシング、連鎖停止シークエンシング（chain-terminating sequencing）、制限消化、アレル特異的ポリメラーゼ反応、一本鎖高次構造多型分析、遺伝子ビット（genetic bit）分析、温度勾配ゲル電気泳動、リガーゼ連鎖反応、融解曲線プロファイル、TaqMan（登録商標）アレル識別アッセイ、またはマイクロアレイハイブリダイゼーションを含む、請求項1記載の方法。
【請求項４】
SOD1の機能を評価するアッセイを実施する段階をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項５】
段階（a）が、前記遺伝マーカーと連鎖不平衡にある遺伝子座の構造を評価することを含む、請求項1記載の方法。
【請求項６】
前記遺伝マーカーが、SOD1ポリペプチドの残基40でのE→K置換に対応するSOD1コード領域内の多型である、請求項1記載の方法。
【請求項７】
前記試料を入手する段階をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項８】
前記試料が血液、頬組織、皮膚、精液または毛包を含む、請求項6記載の方法。
【請求項９】
イヌが遺伝マーカーに関してヘテロ接合性であるかホモ接合性であるかを判定する段階をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項１０】
参照野生型SOD1遺伝子がSEQ ID NO：1を含む、および／または、変化したSOD1遺伝子がSEQ ID NO：2を含む、請求項1記載の方法。
【請求項１１】
スクリーニング方法の結果に基づいて繁殖または治療法の決断を下す段階をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項１２】
イヌ変性性脊髄症または筋萎縮性側索硬化症に対する処置を評価する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）参照野生型SOD1遺伝子または転写物と比較した場合にSOD1遺伝子に突然変異を有するイヌを同定する段階；
（b）前記イヌに対して候補治療法を施す段階；および
（c）前記候補治療法を前記変性性脊髄症に対する効能に関して評価する段階。
【請求項１３】
イヌが、ボクサー、ウェルシュ・コーギー、チェサピーク・ベイ・レトリーバー、ローデシアン・リッジバック、ジャーマン・シェパード、ケリー・ブルー・テリア、アイリッシュ・セッター、オールド・イングリッシュ・シープドッグ、コリー、スタンダード・プードル、ワイヤー・フォックス・テリア、もしくは別の品種、またはそれらの交雑種である、請求項12記載の方法。
【請求項１４】
突然変異が、SOD1ポリペプチドの残基40でのE→K置換に対応するSOD1コード領域内の多型である、請求項12記載の方法。
【請求項１５】
評価が、神経学的診察、電気診断検査、CT／脊髄造影法、MRIまたは機能イメージングを含む、請求項12記載の方法。
【請求項１６】
評価が、脊髄の免疫病理組織学（immunohistopathology）を含む、請求項12記載の方法。
【請求項１７】
（a）イヌから核酸を含有する試料を入手する段階；
（b）前記イヌからの核酸を含有する試料中の残基40に対応するSOD1遺伝子または転写物の構造を評価する段階；および
（c）前記イヌを（i）参照野生型SOD1遺伝子もしくは転写物と比較して、対応するSOD1ポリペプチドの残基40でホモ接合性E→K置換が観察された場合に、変性性脊髄症を有するかもしくは発症するリスクを有するものとして同定するか、または（ii）参照野生型SOD1遺伝子もしくは転写物と比較して、対応するSOD1ポリペプチドの残基40でホモ接合性E→K置換が観察された場合に、変性性脊髄症を有するかもしくは発症するリスクを有する子孫を生むものとして同定する段階
を含む、イヌを変性性脊髄症を有するかもしくは発症するリスクを有するものとして同定するか、または変性性脊髄症を有するかもしくは発症するリスクを有する子孫を生むものとして同定する方法。
【請求項１８】
前記SOD1遺伝子が残基40でE→K置換をコードする場合に、前記イヌを繁殖させないことをさらに含む、請求項17記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００１２
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００１２】
[本発明1001]
（a）イヌから核酸を含有する試料を入手する段階；および
（b）前記試料中のSOD1遺伝子または転写物の構造を評価する段階
を含む、変性性脊髄症の遺伝マーカーに関してイヌをスクリーニングする方法であって、
参照野生型SOD1遺伝子または転写物と比較した場合の該SOD1遺伝子または転写物の構造における変化により、前記イヌが前記遺伝マーカーを保有することが指し示される、方法。
[本発明1002]
イヌが、ボクサー（boxer）、ウェルシュ・コーギー（Welsh corgi）、チェサピーク・ベイ・レトリーバー（Chesapeake Bay retriever）、ローデシアン・リッジバック（Rhodesian ridgeback）、ジャーマン・シェパード（German shepherd）、ケリー・ブルー・テリア（Kerry blue terrier）、アイリッシュ・セッター（Irish setter）、オールド・イングリッシュ・シープドッグ（old English sheepdog）、コリー（collie）、スタンダード・プードル（standard poodle）、ワイヤー・フォックス・テリア（wire Fox terrier）もしくは別の品種、またはそれらの交雑種である、本発明1001の方法。
[本発明1003]
段階（a）が、パイロシークエンシング、連鎖停止シークエンシング（chain-terminating sequencing）、制限消化、アレル特異的ポリメラーゼ反応、一本鎖高次構造多型分析、遺伝子ビット（genetic bit）分析、温度勾配ゲル電気泳動、リガーゼ連鎖反応、融解曲線プロファイル、TaqMan（登録商標）アレル識別アッセイ、またはマイクロアレイハイブリダイゼーションを含む、本発明1001の方法。
[本発明1004]
SOD1の機能を評価するアッセイを実施する段階をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1005]
段階（a）が、前記遺伝マーカーと連鎖不平衡にある遺伝子座の構造を評価することを含む、本発明1001の方法。
[本発明1006]
前記遺伝マーカーが、SOD1ポリペプチドの残基40でのE→K置換に対応するSOD1コード領域内の多型である、本発明1001の方法。
[本発明1007]
前記試料を入手する段階をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1008]
前記試料が血液、頬組織、皮膚、精液または毛包を含む、本発明1006の方法。
[本発明1009]
イヌが遺伝マーカーに関してヘテロ接合性であるかホモ接合性であるかを判定する段階をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1010]
参照野生型SOD1遺伝子がSEQ ID NO：1を含む、および／または、変化したSOD1遺伝子がSEQ ID NO：2を含む、本発明1001の方法。
[本発明1011]
スクリーニング方法の結果に基づいて繁殖または治療法の決断を下す段階をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1012]
イヌ変性性脊髄症または筋萎縮性側索硬化症に対する処置を評価する方法であって、以下の段階を含む方法：
（a）参照野生型SOD1遺伝子または転写物と比較した場合にSOD1遺伝子に突然変異を有するイヌを同定する段階；
（b）前記イヌに対して候補治療法を施す段階；および
（c）前記候補治療法を前記変性性脊髄症に対する効能に関して評価する段階。
[本発明1013]
イヌが、ボクサー、ウェルシュ・コーギー、チェサピーク・ベイ・レトリーバー、ローデシアン・リッジバック、ジャーマン・シェパード、ケリー・ブルー・テリア、アイリッシュ・セッター、オールド・イングリッシュ・シープドッグ、コリー、スタンダード・プードル、ワイヤー・フォックス・テリア、もしくは別の品種、またはそれらの交雑種である、本発明1012の方法。
[本発明1014]
突然変異が、SOD1ポリペプチドの残基40でのE→K置換に対応するSOD1コード領域内の多型である、本発明1012の方法。
[本発明1015]
評価が、神経学的診察、電気診断検査、CT／脊髄造影法、MRIまたは機能イメージングを含む、本発明1012の方法。
[本発明1016]
評価が、脊髄の免疫病理組織学（immunohistopathology）を含む、本発明1012の方法。
本発明のこれらおよび他の態様は、以下の説明および添付の図面と併せて検討することによって、より良く認識および理解されるであろう。しかし、以下の説明は、本発明のさまざまな態様およびそれらの多くの具体的な詳細を示しているものの、これらは例証の目的で提供されるものであり、限定を目的とするものではないことが理解されるべきである。本発明の範囲内で、その精神から逸脱することなしに多くの置換、変更、追加および／または再構成を施すことができ、本発明はこのような置換、変更、追加および／または再構成のすべてを含む。