【手続補正書】
【提出日】平成25年3月26日(2013.3.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
線維症の判定または定量化の方法であって、患者の生体液試料中に天然に存在するネオエピトープ含有タンパク質断片を測定する免疫検定法を実施すること、および正常レベルを上回る、前記患者における前記測定の上昇を線維症の存在または程度と関連付けることを含み、前記免疫検定法が、
前記試料中に天然に存在するタンパク質断片を、プロテイナーゼによるタンパク質の切断によって形成されるネオエピトープと反応性の免疫学的結合パートナと接触させること、および前記ネオエピトープを含むタンパク質断片を測定するために前記免疫学的結合パートナへのペプチド断片の結合の程度を測定することを含む方法によって実施され、前記タンパク質が、ＩＩＩ型コラーゲン、Ｉ型コラーゲン、ＩＶ型コラーゲン、Ｖ型コラーゲンもしくはＶＩ型コラーゲン、エラスチン、ビグリカン、デコリン、ルミカン、バーシカン、パールカン、ニューロカン、ブレビカン、フィブロモジュリン、セルグリシン、シンデカン、βグリカン、ビメンチンまたはＣ反応性タンパク質であり、但し、該ネオエピトープがＩ型コラーゲンの切断によって形成される場合、該切断は、Ｉ型コラーゲンがカテプシンＫによって切断される部位ではないことを条件とする、線維症の判定または定量化の方法。
【請求項２】
前記免疫学的結合パートナが、Ｎ末端配列ＫＮＧＥＴＧ…を有するＩＩＩ型コラーゲン
の断片に特異的に結合する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記免疫学的結合パートナが、Ｎ末端配列ＫＡＦＶＦＰ…（配列番号１１６７）を有す
るＣＲＰの断片に特異的に結合する、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記免疫学的結合パートナが、ＩＩＩ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド
中に存在するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、
前記ペプチドが、
【表１】
2012522233.tif 000001
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記免疫学的結合パートナが、ＩＩＩ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド
中に存在するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、
前記ペプチドが、
【表２】
2012522233.tif 000002
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
前記免疫学的結合パートナが、Ｉ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中に
存在するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記
ペプチドが、
【表３】
2012522233.tif 000003
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記免疫学的結合パートナが、Ｉ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中に
存在するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記
ペプチドが、
【表４】
2012522233.tif 000004
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項８】
前記免疫学的結合パートナが、ＩＶ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中
に存在するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前
記ペプチドが、
【表５】
2012522233.tif 000005
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記免疫学的結合パートナが、ＩＶ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中
に存在するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前
記ペプチドが、
【表６】
2012522233.tif 000006
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記免疫学的結合パートナが、ビグリカン、デコリン、ルミカン、バーシカンまたはパ
ールカンの切断によって生成されるペプチド中に存在するＮ末端アミノ酸配列によって構
成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記ペプチドが、
【表７】
2012522233.tif 000007
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記免疫学的結合パートナが、ビグリカン、デコリン、ルミカン、バーシカンまたはパ
ールカンの切断によって生成されるペプチド中に存在するＣ末端アミノ酸配列によって構
成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記ペプチドが、
【表８】
2012522233.tif 000008
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記免疫学的結合パートナが、Ｃ反応性タンパク質の切断によって生成されるペプチド
中に存在するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、
前記ペプチドが、
【表９】
2012522233.tif 000009
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記免疫学的結合パートナが、Ｃ反応性タンパク質の切断によって生成されるペプチド
中に存在するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、
前記ペプチドが、
【表１０】
2012522233.tif 000010
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
前記免疫学的結合パートナが、エラスチンの切断によって生成されるペプチド中に存在
するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記ペプ
チドが、
【表１１Ａ】
2012522233.tif 000011
【表１１Ｂ】
2012522233.tif 000012
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
前記免疫学的結合パートナが、エラスチンの切断によって生成されるペプチド中に存在
するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記ペプ
チドが、
【表１２Ａ】
2012522233.tif 000013
【表１２Ｂ】
2012522233.tif 000014
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１６】
前記免疫学的結合パートナが、Ｖ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中に
存在するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記
ペプチドが、
【表１３】
2012522233.tif 000015
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１７】
前記免疫学的結合パートナが、Ｖ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中に
存在するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記
ペプチドが、
【表１４】
2012522233.tif 000016
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１８】
前記免疫学的結合パートナが、ＶＩ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中
に存在するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前
記ペプチドが、
【表１５】
2012522233.tif 000017
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項１９】
前記免疫学的結合パートナが、ＶＩ型コラーゲンの切断によって生成されるペプチド中
に存在するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前
記ペプチドが、
【表１６】
2012522233.tif 000018
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２０】
前記免疫学的結合パートナが、ビメンチンの切断によって生成されるペプチド中に存在
するＮ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記ペプ
チドが、
【表１７】
2012522233.tif 000019
から成る群より選択されるＮ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２１】
前記免疫学的結合パートナが、ビメンチンの切断によって生成されるペプチド中に存在
するＣ末端アミノ酸配列によって構成されるネオエピトープに特異的に結合し、前記ペプ
チドが、
【表１８】
2012522233.tif 000020
から成る群より選択されるＣ末端配列を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項２２】
前記ネオエピトープがＩ型コラーゲンの切断によって形成される場合、該切断は、Ｉ型
コラーゲンがトリプシンによって切断される部位ではないことをさらなる条件とする、請
求項１に記載の方法。
【請求項２３】
体液試料中に天然に存在するネオエピトープ含有タンパク質断片を測定する免疫検定の
方法であって、前記免疫検定法が、前記試料中に天然に存在するタンパク質断片を、プロ
テイナーゼによるタンパク質の切断によって形成されるネオエピトープに対して反応性で
ある免疫学的結合パートナと接触させるステップと、前記ネオエピトープを含むタンパク
質断片を測定するために前記免疫学的結合パートナへのペプチド断片の結合の程度を測定
するステップとを含む方法によって実施され、ここで、前記タンパク質が、ニューロカン
、ブレビカン、フィブロモジュリン、セルグリシン、シンデカン、βグリカン、エラスチ
ン、Ｉ型コラーゲン、ＩＶ型コラーゲン、Ｖ型コラーゲンもしくはＶＩ型コラーゲン、Ｃ
ＲＰまたはビメンチンであり、但し、該ネオエピトープがＩ型コラーゲンの切断によって
形成される場合、該切断は、Ｉ型コラーゲンがカテプシンＫによって切断される部位では
ないことを条件とする、免疫検定の方法。