【手続補正書】
【提出日】平成25年8月21日(2013.8.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
核酸試料を支持するためのプローブと、前記プローブの操作を可能にするためなどのために前記プローブに装着可能なマニピュレータであって、前記プローブは前記マニピュレータから独立したものである、マニピュレータとを備える、核酸採取装置であって、前記プローブは、連続構成と相互に離間された構成との間において相互に移動可能な複数のプローブ要素を備え、各プローブ要素は、前記プローブ要素が連続構成をとる場合に、他のチップパーツと組み合わされることにより、核酸の試料を搬送するために前記核酸に接触することが可能な複合チップを画定するチップパーツを備える、核酸採取装置。
【請求項２】
前記複合チップは、画定された場合に、前記チップパーツにそれぞれ固定され、前記チップパーツと個数において一致する、複数の核酸接触部を備え、各前記核酸接触部は、前記複合チップが核酸に接触した際に、ほぼ同一量の核酸に係合する、請求項1に記載の装置。
【請求項３】
前記マニピュレータは、前記連続構成と前記相互に離間された構成との間における前記プローブ要素の選択的移動を生じさせるためのプローブ要素アクティベータを備える、請求項1または2に記載の装置。
【請求項４】
前記マニピュレータは、細長シャンクを備え、前記プローブ要素アクティベータは、前記連続構成と前記相互に離間された構成との間において前記プローブ要素の選択的移動を生じさせるように、前記シャンクに沿って移動可能である、請求項2に記載の装置。
【請求項５】
前記シャンクは、中空であり、前記プローブ要素アクティベータは、前記シャンクの内部内に実質的に位置し、前記シャンクの内部で移動可能である、請求項4に記載の装置。
【請求項６】
前記シャンクは、中に形成された貫通孔を備え、前記プローブ要素アクティベータは、前記シャンク内部において前記シャンクを移動させるために、前記貫通孔を経由して接触可能である、請求項5に記載の装置。
【請求項７】
前記マニピュレータは、前記プローブ要素アクティベータに作動的に連結される回転自在部材を備え、前記回転自在部材を回転させることにより、前記プローブ要素アクティベータは、前記連続構成と前記相互に離間された構成との間において前記プローブ要素を移動させる、請求項3に記載の装置。
【請求項８】
各プローブ要素は、一方の端部に前記チップパーツを有する弾性変形可能な細長部材を備え、前記細長部材同士は、前記チップパーツが同一端部に位置する状態で相互に横付けされて延在する束状部として構成され、各プローブ要素は、前記チップパーツ同士が相互に分岐する傾向となるように屈曲状であり、前記プローブ要素アクティベータは、前記束状部を包囲し、前記束状部の各要素に沿って移動可能なシース部分を備え、前記シース部分は、前記チップパーツの近傍に位置する場合には、前記チップパーツ同士を前記プローブ要素の弾性変形性に逆らって収束させて前記複合チップを画定させ、前記シース部分は、前記束状部に沿って前記チップパーツから離間されている場合には、前記プローブ要素の屈曲状形状および弾性変形性により前記チップパーツ同士を相互から分岐させ得る、請求項3または請求項7に記載の装置。
【請求項９】
前記シース部分を所定位置に保持するための1つまたは複数の解除自在戻り止めを備える、請求項8に記載の装置。
【請求項１０】
前記チップパーツを備える自由端部をそれぞれが画定する複数の前記プローブ要素を支持する弾性変形可能シートを備え、前記シートは、前記チップパーツ同士が相互に分岐する構成と、前記チップパーツ同士が前記複合チップを画定するように前記プローブ要素同士が連続状態となる変形構成との間において変形可能である、請求項3または請求4から7のいずれかに記載の装置。
【請求項１１】
1つまたは複数の試薬および核酸試料を収容するための、封止可能開口を備えるレセプタクルをさらに備え、前記マニピュレータの操作により、前記レセプタクル内に前記試料を配置するように前記プローブが前記開口を通して挿入されるまたは挿入され得る、請求項1から10のいずれかに記載の装置。
【請求項１２】
前記プローブは、前記レセプタクル内に前記試料を配置した際に、核酸含有物質の入出を防止するために前記レセプタクルを閉鎖するクロージャを備える、請求項11に記載の装置。
【請求項１３】
前記クロージャは、前記プローブに固定されるかまたは前記プローブと一体である液密封止部材であるか、または前記液密封止部材を備える、請求項12に記載の装置。
【請求項１４】
複数の前記プローブに固定されるかまたは複数の前記プローブと一体であるクロージャを備える、請求項12に記載の装置。
【請求項１５】
前記クロージャおよび前記マニピュレータは、相互に選択的に分離可能である、請求項11から14のいずれかに記載の装置。
【請求項１６】
前記マニピュレータは、周囲環境から複数の前記プローブを隔離するように複数の前記プローブを保持するソースと、核酸と係合させるためにそれぞれの少なくとも一部を露出させるように逐次的に前記プローブを差し出すためのディスペンス機構とを備える、請求項1から15のいずれかに記載の装置。
【請求項１７】
前記ソースは、1つまたは複数のプローブを収容するチャンバであるか、または前記チャンバを備え、前記チャンバは、前記ディスペンス機構の作動時に前記プローブを通して突出させ得るチャンバ開口を備える、請求項16に記載の装置。
【請求項１８】
突出するプローブが、ディスペンス時に前記チャンバ開口を閉鎖する、請求項17に記載の装置。
【請求項１９】
前記マニピュレータは、前記プローブから前記マニピュレータを分離させた際に、前記マニピュレータから少なくとも1つの前記プローブを突き出させる1つまたは複数のイジェクタを備え、前記イジェクタまたは各イジェクタは、突き出されるべき前記プローブから遠く離れた前記マニピュレータ上の位置から操作可能である、請求項1に記載の装置。
【請求項２０】
複数の前記プローブと、前記マニピュレータから2つ以上のプローブを突き出させせるための共有イジェクタとを備える、請求項19に記載の装置。
【請求項２１】
複数の前記プローブと、対応する個数の複数のイジェクタとを備え、前記イジェクタがそれぞれ、各前記プローブを突き出させるように操作可能である、請求項19に記載の装置。
【請求項２２】
前記プローブまたは各プローブは、前記マニピュレータの操作時にレセプタクル内に核酸の試料を導入するために、使用時に前記核酸に接触することが可能なチップを備えるか、または前記チップを画定するように構成可能である、請求項1から21のいずれかに記載の装置。
【請求項２３】
少なくとも前記チップは、DNAまたは高等真核生物の核酸含有物質が付着するポリマー材料から作製されるか、または前記ポリマー材料を含む、請求項22に記載の装置。
【請求項２４】
前記ポリマー材料は、ポリカーボネート、ガラス、Topasなどの環状オレフィンコポリマー、PMMAなどのアクリル樹脂、結晶ポリスチレン、ポリプロピレン、HDPE、中耐衝撃性ポリスチレン、PVC、液体結晶ポリマー30%、Trans ABS、アセタールコポリマー、ポリエステル、ポリエーテルイミド、ポリエチレン、ナイロン、ポリエーテルポリウレタン、スチレンブタジエンブロックコポリマー、ポリプロピレンランダムコポリマー、エチレンビニルアセテート、PDMSなどのシロキサン、およびサントプレーンなどの熱可塑性エラストマーを含むリストから選択される、請求項22に記載の装置。
【請求項２５】
哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸ソースからの核酸を増幅するための方法であって、
(a)哺乳動物または植物などの高等真核生物の前記ソースに採取デバイスを接触させることにより、前記接触後に、哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸含有物質が前記採取デバイスの少なくとも一部に付着するステップであって、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、ポリマー材料から作製される、ステップと、
(b)前記核酸含有物質の事前処理を伴うことなく、核酸増幅反応を生じさせるための反応混合物を収容する反応容器内に、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部を導入するステップと、
(c)核酸増幅反応を実施するステップと
を含む、方法。
【請求項２６】
高等真核生物ソースから核酸含有物質の試料を取得し、事前処理を伴うことなく核酸増幅用の反応混合物を収容する反応容器内に前記試料を導入するための、採取デバイスの使用であって、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、接触時に前記核酸含有物質が付着するポリマー材料から作製される、使用。
【請求項２７】
前記ポリマー材料は、ポリカーボネート、ガラス、Topasなどの環状オレフィンコポリマー、PMMAなどのアクリル樹脂、結晶ポリスチレン、ポリプロピレン、HDPE、中耐衝撃性ポリスチレン、PVC、液体結晶ポリマー30%、Trans ABS、アセタールコポリマー、ポリエステル、ポリエーテルイミド、ポリエチレン、ナイロン、ポリエーテルポリウレタン、スチレンブタジエンブロックコポリマー、ポリプロピレンランダムコポリマー、エチレンビニルアセテート、PDMSなどのシロキサン、およびサントプレーンなどの熱可塑性エラストマーの中のいずれかから選択される、請求項25に記載の方法または請求項26に記載の使用。
【請求項２８】
哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸ソースは、実質的に乾燥状態にある、請求項25もしくは27に記載の方法または請求項26もしくは27に記載の使用。
【請求項２９】
哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸ソースからの核酸を増幅するための方法であって、
(a)哺乳動物または植物などの高等真核生物の前記ソースに採取デバイスを接触させることにより、前記接触後に、哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸含有物質が前記採取デバイスの少なくとも一部に付着するステップであって、哺乳動物または植物などの高等真核生物の前記ソースは、実質的に乾燥状態にある、ステップと、
(b)前記核酸含有物質の事前処理を伴うことなく、核酸増幅反応を生じさせるための反応混合物を収容する反応容器内に、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部を導入するステップと、
(c)核酸増幅反応を実施するステップと
を含む、方法。
【請求項３０】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、ガラス、ポリカーボネート、Topasなどの環状オレフィンコポリマー、PMMAなどのアクリル樹脂、結晶ポリスチレン、ポリプロピレン、HDPE、中耐衝撃性ポリスチレン、PVC、液体結晶ポリマー30%、Trans ABS、アセタールコポリマー、ポリエステル、ポリエーテルイミド、ポリエチレン、ナイロン、ポリエーテルポリウレタン、スチレンブタジエンブロックコポリマー、ポリプロピレンランダムコポリマー、エチレンビニルアセテート、PDMSなどのシロキサン、およびサントプレーンなどの熱可塑性エラストマーの中のいずれかから作製される、請求項29に記載の方法。
【請求項３１】
前記反応混合物は、カオトロピック剤を実質的に含まない、請求項25から30のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項３２】
前記反応混合物は、細胞溶解剤を実質的に含まない、請求項25から31のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項３３】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、前記反応容器に対してシールを提供する、請求項25から32のいずれか一項に記載の方法または使用。
【請求項３４】
哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸ソースから核酸を取得し、次いで事前処理を伴うことなく核酸増幅反応混合物を収容する反応容器内に哺乳動物または植物などの高等真核生物の核酸ソースを導入するための、核酸採取デバイスの使用であって、哺乳動物または植物などの高等真核生物の前記ソースは、実質的に乾燥状態にある、使用。
【請求項３５】
前記核酸は、前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部に付着され、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、ポリカーボネート、ガラス、Topasなどの環状オレフィンコポリマー、PMMAなどのアクリル樹脂、結晶ポリスチレン、ポリプロピレン、HDPE、中耐衝撃性ポリスチレン、PVC、液体結晶ポリマー30%、Trans ABS、アセタールコポリマー、ポリエステル、ポリエーテルイミド、ポリエチレン、ナイロン、ポリエーテルポリウレタン、スチレンブタジエンブロックコポリマー、ポリプロピレンランダムコポリマー、エチレンビニルアセテート、PDMSなどのシロキサン、およびサントプレーンなどの熱可塑性エラストマーの中のいずれかから作製される、請求項34に記載の使用。
【請求項３６】
反応混合物および核酸含有物質を収容し、核酸増幅反応を実施することが可能な状態にある、反応容器を準備するための方法であって、
(a)核酸増幅反応を実施するための前記反応混合物を収容する単一のチャンバを有する反応容器を用意するステップであって、前記反応容器は封止される、ステップと、
(b)採取デバイスを用意するステップと、
(c)前記核酸含有物質に前記採取デバイスを接触させることにより、前記接触後に、核酸含有物質が前記採取デバイスの少なくとも一部に付着するステップと、
(d)前記反応容器を封止解除するステップと、
(e)前記核酸含有物質が前記反応混合物と接触状態になるように、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部を前記反応容器内に配置するステップと、
(f)前記反応容器内に依然として存在する、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部により、前記反応容器を気密状態に再封止するステップと
を含む、方法。
【請求項３７】
複数の反応容器が、一体的に接合され、同時に準備される、請求項36に記載の方法。
【請求項３８】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、前記核酸含有物質が前記複数の反応容器間で分配され得るように構成される、請求項36に記載の方法。
【請求項３９】
前記反応容器を封止解除する前記ステップ(d)は、前記核酸含有物質に前記採取デバイスを接触させる前記ステップ(c)の前に実施される、請求項36または37に記載の方法。
【請求項４０】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、前記ステップ(f)において前記反応容器の前記シールを提供する、請求項36から39のいずれかに記載の方法。
【請求項４１】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、ガラス、Topasなどの環状オレフィンコポリマー、PMMAなどのアクリル樹脂、結晶ポリスチレン、ポリプロピレン、HDPE、中耐衝撃性ポリスチレン、PVC、液体結晶ポリマー30%、Trans ABS、アセタールコポリマー、ポリエステル、ポリエーテルイミド、ポリエチレン、ナイロン、ポリエーテルポリウレタン、スチレンブタジエンブロックコポリマー、ポリプロピレンランダムコポリマー、エチレンビニルアセテート、PDMSなどのシロキサン、およびサントプレーンなどの熱可塑性エラストマーの中のいずれかから作製される、請求項36から40のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４２】
前記反応混合物は、カオトロピック剤を実質的に含まない、請求項36から41のいずれかに記載の方法。
【請求項４３】
前記反応混合物は、細胞溶解剤を実質的に含まない、請求項36から41のいずれかに記載の方法。
【請求項４４】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、前記採取後に追加的な処理を伴うことなく前記反応容器内に直に配置される、請求項36から43のいずれかに記載の方法。
【請求項４５】
前記反応混合物は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、リガーゼ連鎖反応(LCR)、ループ媒介性等温増幅(LAMP)、転写媒介性増幅(TMA)、RNAシグナル媒介性増幅技術(SMART)、鎖置換増幅(SDA)、ローリングサークル増幅(RCA)、等温多置換増幅(IMDA)、ヘリカーゼ依存性増幅(HDA)、単一プライマー等温増幅(SPIA)、環状ヘリカーゼ依存性増幅(CHDA)、または核酸配列ベース増幅(NASBA)の中のいずれかを実施するためのものである、請求項36から44のいずれかに記載の方法。
【請求項４６】
前記核酸含有物質は、ヒトなどの哺乳動物起源のものである、請求項36から45のいずれかに記載の方法。
【請求項４７】
前記核酸含有物質は、実質的に乾燥状態である、請求項36から46のいずれかに記載の方法。
【請求項４８】
請求項36から47のいずれかに記載の反応容器を準備するステップと、前記反応容器内において核酸増幅反応を実施するステップとを含む、核酸を増幅するための方法。
【請求項４９】
請求項36から47のいずれかに記載の方法を実施するステップと、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部を除去するステップと、さらなる反応容器内に前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部を配置するステップと、前記さらなる反応容器内において核酸増幅反応を実施するステップとを含む、核酸を増幅するための方法。
【請求項５０】
前記さらなる反応容器は、請求項25にしたがって準備される、請求項49に記載の方法。
【請求項５１】
前記核酸含有試料は、接触により表面上に付着された皮膚細胞、乾燥血液、乾燥精液、乾燥唾液、または細胞物質などの細胞のいずれかである、請求項25から50のいずれかに記載の方法または使用。
【請求項５２】
(a)核酸増幅反応を実施するための反応混合物を収容する反応容器であって、封止される、反応容器と、(b)核酸含有物質との接触後に前記核酸含有物質の少なくとも一部が付着し得る採取デバイスとを備えるキットであって、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、前記反応容器内に導入され得るものであり、核酸増幅反応は、前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部が存在する状態で前記容器内において実施され得る、キット。
【請求項５３】
一体的に接合される複数の反応容器を備える、請求項52に記載のキット。
【請求項５４】
前記核酸含有物質が付着し得る前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、前記核酸含有物質が前記複数の反応容器間で分配され得るように構成される、請求項52または53記載のキット。
【請求項５５】
前記核酸含有物質が付着し得る前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、元のシールが除去されると、前記反応容器のシールを提供する、請求項52または53に記載のキット。
【請求項５６】
前記核酸含有物質が付着し得る前記採取デバイスまたは前記採取デバイスの一部は、ポリカーボネート、ガラス、Topasなどの環状オレフィンコポリマー、PMMAなどのアクリル樹脂、結晶ポリスチレン、ポリプロピレン、HDPE、中耐衝撃性ポリスチレン、PVC、液体結晶ポリマー30%、Trans ABS、アセタールコポリマー、ポリエステル、ポリエーテルイミド、ポリエチレン、ナイロン、ポリエーテルポリウレタン、スチレンブタジエンブロックコポリマー、ポリプロピレンランダムコポリマー、エチレンビニルアセテート、PDMSなどのシロキサン、およびサントプレーンなどの熱可塑性エラストマーの中のいずれかから作製される、請求項52から55のいずれかに記載のキット。
【請求項５７】
前記反応容器内に存在する前記反応混合物は、請求項42、43、または45のいずれかに記載のものとして定義される、請求項52から55のいずれかに記載のキット。
【請求項５８】
核酸含有物質からの核酸に対応する遺伝子型を記録するデータキャリアを準備する方法であって、請求項25、29、または48のいずれかに記載の方法を実施するステップと、前記核酸含有物質中の前記核酸の前記遺伝子型を判定するステップと、前記データキャリア上に前記遺伝子型を記録するステップとを含む、方法。
【請求項５９】
前記核酸含有物質が付着する前記採取デバイスもしくは前記採取デバイスの一部は、DNA不活性となるように処理されるか、または、前記核酸試料を支持するための前記プローブは、DNA不活性となるように処理される、請求項1から58のいずれかに記載の方法または使用またはキットまたは装置。