【手続補正書】
【提出日】平成25年5月27日(2013.5.27)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
可変重鎖及び可変軽鎖フレームワーク領域を含む合成抗体又はそれらの機能的断片のコレクションであって、
前記可変重鎖フレームワーク領域及び可変軽鎖フレームワーク領域が、生殖系タンパク質対の生殖系タンパク質配列を含み、
前記生殖系タンパク質対が、以下の特性：
ｉ）Ｆａｂ型の相対的提示率が、サンプリングしたＦａｂの上位７５％以内の値を含むこと、
ｉｉ）Ｆａｂ型の発現レベルが、Ｆａｂ  ＶＨ１−６９  ＶＬＡ＿Ｖｌ１−４０  ＡＹＡと比較して少なくとも０．４であること、
ｉｉｉ）Ｆａｂ型の熱安定性が、６０℃以上にて少なくとも４５分間であること、
ｉｖ）Ｆａｂ型のウシ又はマウス血清安定性が、３７℃にて１０日間を超えていること、
ｖ）ＩｇＧ型の発現レベルが、ＭＯＲ０３０８０と比べて少なくとも０．４であること、及び
ｖｉ）ＩｇＧ型の血清安定性が、３７℃にて１４日間であることを含み、
前記抗体又はそれらの機能的断片のコレクションが、少なくとも２個の異なる生殖系タンパク質対の生殖系タンパク質配列を含み、
前記生殖系タンパク質対が、生殖系遺伝子対によりコードされ、前記生殖系タンパク質対がＩＧＨＶ１−１８（配列番号６５）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ１−１８（配列番号６５）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ１−４６（配列番号６８）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ１−４６（配列番号６８）／ＩＧＫＶ１−３９（配列番号１２９）、ＩＧＨＶ１−４６（配列番号６８）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ１−６９＊０１（配列番号７０）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＬＶ１−４７（配列番号１６７）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＬＶ３−０１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−１６（配列番号１２４）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＬＶ１−４７（配列番号１６７）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−１６（配列番号１２４）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−３９（配列番号１２９）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＬＶ１−４０（配列番号１６５）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＬＶ１−５１（配列番号１６９）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＬＶ２−１１（配列番号１７１）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−３９（配列番号１２９）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＬＶ２−１４（配列番号１７２）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−３０（配列番号８６）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−３０（配列番号８６）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ３−３３（配列番号８９）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−３３（配列番号８９）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−４８（配列番号９３）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＬＶ１−５１（配列番号１６９）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＬＶ１−５１（配列番号１６９）、ＩＧＨＶ４−０４（配列番号１０２）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ４−０４（配列番号１０２）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ４−０４（配列番号１０２）／ＩＧＬＶ３−２１（配列番号１８２）、ＩＧＨＶ４−３９（配列番号１０９）／ＩＧＬＶ２−１４（配列番号１７２）、ＩＧＨＶ４−３９（配列番号１０９）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ５−５１（配列番号１１３）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ５−５１（配列番号１１３）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ５−５１（配列番号１１３）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ６−１（配列番号１１５）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、及びＩＧＨＶ６−１（配列番号１１５）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）から選択されるコレクション。
【請求項２】
前記生殖系遺伝子対が、前記ヒト免疫レパートリー中少なくとも０．０５％の濃度で存在する、請求項１に記載のコレクション。
【請求項３】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、ヒト配列を含む、請求項１又は２に記載のコレクション。
【請求項４】
前記抗体又はそれらの機能的断片のコレクションが、少なくとも８の異なる生殖系タンパク質対の生殖系タンパク質配列を含む、請求項１乃至３のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項５】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、生殖系タンパク質配列を含む１つ又は複数の相補性決定領域を含む、請求項１乃至４のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項６】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、生殖系タンパク質配列を含むＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、及びＦＲ３領域を含む、請求項１乃至５のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項７】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、ＪＨ４、Ｊκ１、及びＪλ２／３からなる群から選択されるＦＲ４領域を含む、請求項１乃至６のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項８】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、多様化されたＨＣＤＲ３領域を含む、請求項１乃至７のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項９】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、多様化されたＬＣＤＲ３領域を含む、請求項１乃至８のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１０】
前記コレクションが、１×１０４個の抗体又はそれらの機能的断片を含む、請求項１乃至９のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１１】
前記生殖系タンパク質対が、サンプリングしたＦａｂの上位６０％以内の値を含むＦａｂ型の相対的提示率を含む、請求項１乃至１０のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１２】
前記生殖系タンパク質対が、Ｆａｂ  ＶＨ１−６９  ＶＬＡ＿Ｖｌ１−４０  ＡＹＡと比較して、少なくとも０．６のＦａｂ型の発現レベルを含む、請求項１乃至１１のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１３】
前記生殖系タンパク質対が、７０℃以上にて少なくとも４５分間のＦａｂ型の熱安定性を含む、請求項１乃至１２のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１４】
前記生殖系タンパク質対が、ＭＯＲ０３０８０と比較して、少なくとも０．６のＩｇＧ型の発現レベルを含む、請求項１乃至１３のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１５】
前記抗体の前記機能的断片が、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、Ｆｖ、及びｓｃＦｖからなる群から選択される、請求項１乃至１４のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項１６】
請求項１乃至１５のいずれか１項に記載のコレクションをコードする核酸のコレクション。
【請求項１７】
請求項１６に記載の核酸を含むベクター。
【請求項１８】
請求項１６に記載の核酸又は請求項１７に記載のベクターを含む組換え宿主細胞。
【請求項１９】
原核生物又は真核生物である、請求項１８に記載の組換え宿主細胞。
【請求項２０】
大腸菌又は哺乳動物である、請求項１９に記載の組換え宿主細胞。
【請求項２１】
可変重鎖及び可変軽鎖のフレームワーク領域を含む合成抗体又はその機能的断片のコレクションであって、前記フレームワーク領域が、生殖系タンパク質配列を含み、前記生殖系タンパク質配列が、以下の特性：
ｉ）前記相補性決定領域における翻訳後修飾が４つ以下であること、
ｉｉ）前記相補性決定領域におけるメチオニンが２つ以下であること、
ｉｉｉ）未対形成システインが１つ以下であること、
ｉｖ）潜在的なＴ細胞エピトープが１つ以下であること、
ｖ）凝集傾向が中程度であるか又は低いこと、及び
ｖｉ）等電点が少なくとも７．５であることを含み、
前記抗体又はそれらの機能的断片のコレクションが、少なくとも２個の異なる可変重鎖生殖系タンパク質配列を含み、
前記生殖系タンパク質配列が生殖系遺伝子配列によりコードされているコレクション。
【請求項２２】
前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系遺伝子配列が、前記ヒト免疫レパートリー中少なくとも０．５％の濃度で存在する、請求項２１に記載のコレクション。
【請求項２３】
前記抗体又はそれらの機能的断片のコレクションが、少なくとも５個の異なる可変重鎖生殖系タンパク質配列を含む、請求項２１又は２２に記載のコレクション。
【請求項２４】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、ヒト配列を含む、請求項２１乃至２３のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項２５】
前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系遺伝子配列が、前記ヒト免疫レパートリー中、少なくとも５．０％の濃度で存在する、請求項２１乃至２４のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項２６】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、生殖系タンパク質配列を含む１つ又は複数の相補性決定領域を含む、請求項２１乃至２５のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項２７】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、生殖系タンパク質配列を含むＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、及びＦＲ３を含む、請求項２１乃至２６のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項２８】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、ＪＨ４、Ｊκ１、及び、Ｊλ２／３からなる群から選択されるＦＲ４領域を含む、請求項２１乃至２７のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項２９】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、多様化されたＨＣＤＲ３領域をさらに含む、請求項２１乃至２８のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項３０】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、多様化されたＬＣＤＲ３領域を更に含む、請求項２１乃至２９のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項３１】
前記コレクションが、１×１０４個の抗体又はそれらの機能的断片を含む、請求項２１乃至３０のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項３２】
前記可変重鎖生殖系タンパク質配列が、ＩＧＨＶ３−２３、ＩＧＨＶ３−３０、ＩＧＨＶ４−３９、ＩＧＨＶ４−３４、ＩＧＨＶ４−５９、ＩＧＨＶ１−６９、ＩＧＨＶ５−５１、ＩＧＨＶ３−７、ＩＧＨＶ１−１８、ＩＧＨＶ３−４８、ＩＧＨＶ３−１５、ＩＧＨＶ３−２１、ＩＧＨＶ１−２、ＩＧＨＶ３−３３、ＩＧＨＶ４−３１、ＩＧＨＶ３−５３、ＩＧＨＶ３−１１、ＩＧＨＶ３−９、ＩＧＨＶ４−４、ＩＧＨＶ１−４６、ＩＧＨＶ３−７４、ＩＧＨＶ１−２４、ＩＧＨＶ４−６１、ＩＧＨＶ１−８、ＩＧＨＶ１−３、ＩＧＨＶ３−４９、ＩＧＨＶ３−４３、ＩＧＨＶ４−２８、ＩＧＨＶ３−６４、及びＩＧＨＶ７−８１からなる群から選択される、請求項２１乃至３１のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項３３】
前記可変κ軽鎖生殖系タンパク質配列が、ＩＧＫＶ３−２０、ＩＧＫＶ１−３９／１Ｄ−３９、ＩＧＫＶ１−５、ＩＧＫＶ３−１５、ＩＧＫＶ４−１、ＩＧＫＶ３−１１、ＩＧＫＶ２−２８／２Ｄ−２８、ＩＧＫＶ１−３３／１Ｄ−３３、ＩＧＫＶ２−３０、ＩＧＫＶ１−９、ＩＧＫＶ１−１７、ＩＧＫＶ１−２７、ＩＧＫＶ１−８、ＩＧＫＶ１−１６、ＩＧＫＶ１−６、ＩＧＫＶ１−１２、ＩＧＫＶ２Ｄ−２９、ＩＧＫＶ１−１３、ＩＧＫＶ１Ｄ−８、及びｌＧＫＶ２−２４からなる群から選択される、請求項２１乃至３２のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項３４】
前記可変λ軽鎖生殖系タンパク質配列が、ＩＧＬＶ２−１４、ＩＧＬＶ１−４０、ＩＧＬＶ１−４４、ＩＧＬＶ１−５１、ＩＧＬＶ２−２３、ＩＧＬＶ３−２１、ＩＧＬＶ１−４７、ＩＧＬＶ３−１、ＩＧＬＶ２−１１、ＩＧＬＶ２−８、ＩＧＬＶ６−５７、ＩＧＬＶ３−２５、ＩＧＬＶ７−４６、ＩＧＬＶ１−３６、ＩＧＬＶ７−４３、ＩＧＬＶ９−４９、ＩＧＬＶ４−６９、ＩＧＬＶ２−１８、ＩＧＬＶ３−１０、及びＩＧＬＶ３−２７からなる群から選択される、請求項２１乃至３３のいずれか１項に記載のコレクション。
【請求項３５】
請求項１に記載の合成抗体又はそれらの機能的断片のコレクションを産生する方法。
【請求項３６】
前記産生ステップが、可変重鎖及び可変軽鎖フレームワーク領域を含む抗体又はそれらの機能的断片のコレクションを生成することを更に含み、
前記可変重鎖フレームワーク領域及び可変軽鎖フレームワーク領域が、生殖系タンパク質対の生殖系タンパク質配列を含み、
前記生殖系タンパク質対が、以下の特性：
ｉ）Ｆａｂ型の相対的提示率が、サンプリングしたＦａｂの上位７５％以内の値を含むこと、
ｉｉ）Ｆａｂ型の発現レベルが、Ｆａｂ  ＶＨ１−６９  ＶＬＡ＿Ｖｌ１−４０  ＡＹＡと比較して少なくとも０．４であること、
ｉｉｉ）Ｆａｂ型の熱安定性が、６０℃以上にて少なくとも４５分間であること、
ｉｖ）Ｆａｂ型のウシ又はマウス血清安定性が、３７℃にて１０日間を超えていること、
ｖ）ＩｇＧ型の発現レベルが、ＭＯＲ０３０８０と比べて少なくとも０．４であること、及び
ｖｉ）ＩｇＧ型のウシ血清安定性が、３７℃にて１４日間であることを含み、
前記抗体又はそれらの機能的断片のコレクションが、少なくとも２つの異なる生殖系タンパク質対を含む、請求項３５に記載の方法。
【請求項３７】
前記産生ステップが、
ａ）前記ヒト免疫レパートリーに存在する前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系遺伝子対を含むデータを取得するステップと、
ｂ）以下の特性：
ｉ）Ｆａｂ型の相対的提示率が、サンプリングしたＦａｂの上位７５％以内の値を含むこと、
ｉｉ）Ｆａｂ型の発現レベルが、Ｆａｂ  ｐＭｘ１１＿ＦＨ  ＶＨ１−６９  ＶＬＡ＿Ｖｌ１−４０  ＡＹＡと比較して少なくとも０．４であること、
ｉｉｉ）Ｆａｂ型の熱安定性が、６０℃以上にて少なくとも４５分間であること、
ｉｖ）Ｆａｂ型のウシ又はマウス血清安定性が、３７℃にて１０日間を超えていること、
ｖ）ＩｇＧ型の発現レベルが、ＭＯＲ０３０８０と比べて少なくとも０．４であること、及び
ｖｉ）ＩｇＧ型のウシ血清安定性が、３７℃にて１４日間であることを含む前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系タンパク質対を特定するステップと、
ｃ）ステップｂ）で特定された前記生殖系タンパク質対の前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系タンパク質配列を含む抗体又はそれらの機能的断片のコレクションの生成するステップとを更に含む、請求項３５又は３６に記載の方法。
【請求項３８】
ステップｂ）が、
ｂａ）前記ヒト免疫レパートリー中少なくとも０．０５％の濃度で存在する前記可変重鎖及び可変軽鎖生殖系遺伝子対を特定するステップと、
ｂｂ）ステップｂａ）で特定された前記生殖系タンパク質対を含む抗体又はそれらの機能的断片を生成するステップと、
ｂｃ）前記生殖系タンパク質対の以下の特性：
ｉ）Ｆａｂ型の相対的提示率、
ｉｉ）Ｆａｂ型の発現レベル、
ｉｉｉ）６０℃以上におけるＦａｂ型の熱安定性、
ｉｖ）３７℃にて１０日間を超えるＦａｂ型のウシ又はマウス血清安定性、
ｖ）ＩｇＧ型の発現レベル、及び
ｖｉ）３７℃にて１４日間のＩｇＧ型のウシ血清安定性を評価するステップとを更に含む、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
ステップａ）が、
ａａ）試料からヒトＢ細胞を単離するステップと、
ａｂ）前記Ｂ細胞に由来するｃＤＮＡを生成するステップと、
ａｃ）前記Ｂ細胞に由来する前記ｃＤＮＡをＰＣＲ増幅するステップと、
ａｄ）前記ＰＣＲ産物を配列決定するステップと、
ａｅ）各ＰＣＲ産物の前記生殖系遺伝子を特定するステップとを更に含む、請求項３７又は３８に記載の方法。
【請求項４０】
コレクションを生成する前記ステップが、
ｃａ）前記抗体又はそれらの機能的断片をコードする前記核酸を合成するステップと、
ｃｂ）前記核酸をベクターにクローニングするステップと、
ｃｃ）前記抗体又はそれらの機能的断片を発現させるステップとを更に含む、請求項３５乃至３８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記生殖系遺伝子対が、前記ヒト免疫レパートリー中少なくとも０．０５％の濃度で存在する、請求項３５乃至４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、ヒト配列を含む、請求項３５乃至４１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、少なくとも８の異なる生殖系タンパク質対の生殖系タンパク質配列を含む、請求項３５乃至４２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、生殖系タンパク質配列を含む１つ又は複数の相補性決定領域を含む、請求項３５乃至４３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、生殖系タンパク質配列を含むＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、及び、ＦＲ３を含む、請求項３５乃至４４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、ＪＨ４、Ｊκ１、及びＪλ２／３からなる群から選択されるＦＲ４領域を含む、請求項３５乃至４５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、多様化されたＨＣＤＲ３領域を含む、請求項３５乃至４６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４８】
前記抗体又はそれらの機能的断片が、多様化されたＬＣＤＲ３領域を含む、請求項３５乃至４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
前記コレクションが、１×１０４個の抗体又はそれらの機能的断片を含む、請求項３５乃至４８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５０】
前記生殖系タンパク質対が、サンプリングしたＦａｂの上位６０％以内の値を含むＦａｂ型の相対的提示率を含む、請求項３５乃至４９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５１】
前記生殖系タンパク質対が、Ｆａｂ  ＶＨ１−６９  ＶＬＡ＿Ｖｌ１−４０  ＡＹＡと比較して、少なくとも０．６のＦａｂ型の発現レベルを含む、請求項３５乃至５０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５２】
前記生殖系タンパク質対が、７０℃以上にて少なくとも４５分間のＦａｂ型の熱安定性を含む、請求項３５乃至５１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５３】
前記生殖系タンパク質対が、ＭＯＲ０３０８０と比較して、少なくとも０．６のＩｇＧ型の発現レベルを含む、請求項３５乃至５２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５４】
前記抗体の前記機能的断片が、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、Ｆｖ、及びｓｃＦｖからなる群から選択される、請求項３５乃至５３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５５】
生殖系タンパク質対の生殖系タンパク質配列を含むＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、及びＦＲ３を含む単離された抗体又はその機能的断片であって、前記生殖系タンパク質対がＩＧＨＶ１−１８（配列番号６５）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ１−１８（配列番号６５）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ１−４６（配列番号６８）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ１−４６（配列番号６８）／ＩＧＫＶ１−３９（配列番号１２９）、ＩＧＨＶ１−４６（配列番号６８）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ１−６９＊０１（配列番号７０）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＬＶ１−４７（配列番号１６７）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−０７（配列番号７７）／ＩＧＬＶ３−０１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ１−１６（配列番号１２４）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＬＶ１−４７（配列番号１６７）、ＩＧＨＶ３−１１（配列番号７９）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−０５（配列番号１１８）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−１６（配列番号１２４）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ１−３９（配列番号１２９）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＬＶ１−４０（配列番号１６５）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＬＶ１−５１（配列番号１６９）、ＩＧＨＶ３−１５（配列番号８１）／ＩＧＬＶ２−１１（配列番号１７１）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＫＶ１−３９（配列番号１２９）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＬＶ２−１４（配列番号１７２）、ＩＧＨＶ３−２１（配列番号８４）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−３０（配列番号８６）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−３０（配列番号８６）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ３−３３（配列番号８９）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−３３（配列番号８９）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−４８（配列番号９３）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＫＶ１−１２（配列番号１２２）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＬＶ１−５１（配列番号１６９）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ３−５３（配列番号９５）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ１−２７（配列番号１２６）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＫＶ３−１５（配列番号１５３）、ＩＧＨＶ３−７４（配列番号１００）／ＩＧＬＶ１−５１（配列番号１６９）、ＩＧＨＶ４−０４（配列番号１０２）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ４−０４（配列番号１０２）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ４−０４（配列番号１０２）／ＩＧＬＶ３−２１（配列番号１８２）、ＩＧＨＶ４−３９（配列番号１０９）／ＩＧＬＶ２−１４（配列番号１７２）、ＩＧＨＶ４−３９（配列番号１０９）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ５−５１（配列番号１１３）／ＩＧＫＶ１−０９（配列番号１２１）、ＩＧＨＶ５−５１（配列番号１１３）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）、ＩＧＨＶ５−５１（配列番号１１３）／ＩＧＬＶ３−１（配列番号１７５）、ＩＧＨＶ６−１（配列番号１１５）／ＩＧＫＶ１−０６（配列番号１１９）、及びＩＧＨＶ６−１（配列番号１１５）／ＩＧＬＶ２−２３（配列番号１７４）からなる群から選択される、単離された抗体又はその機能的断片。