【手続補正書】
【提出日】平成25年10月18日(2013.10.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象とする抗原に結合する抗原結合物質を同定する方法であって、該方法は、
（ａ）第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞の集団を提供することを含み、
該第１の核酸配列は、抗原結合物質の第１の成分を含む第１のポリペプチドをコードしており、該第１の核酸配列は、任意には核酸配列を体細胞超変異に供することにより作製されたものであり、
該一組の第２の核酸配列は、抗原結合物質の第２の成分を含む第２のポリペプチドをコードする第２の核酸配列を含み、該第２の核酸配列は、任意には核酸配列のライブラリを体細胞超変異に供することにより作製されたものであり、かつ、
（１）該第１の成分および（２）第２の成分は一緒になって抗原結合物質を形成し、かつ該細胞集団は、任意には活性化誘導シチジンデアミナーゼ（ＡＩＤ）を発現し、
（ｂ）該第１の核酸配列および該一組の第２の核酸配列が発現されて一組の抗原結合物質を産生する条件下で該細胞集団を維持することを含み、
（ｃ）該対象とする抗原に結合する抗原結合物質を同定することを含み、かつ
（ｄ）任意には、該同定された抗原結合物質をコードする核酸配列の一方または両方を体細胞超変異に供して、該対象とする抗原に結合する所望の抗原結合物質をコードする変異体核酸配列を提供することを含み、
但し、該第１の核酸配列、該第２の核酸配列、および／または該同定された抗原結合物質をコードする核酸配列の少なくとも１つは体細胞超変異に供される、
方法。
【請求項２】
（ａ）該第１の核酸配列が、核酸配列を体細胞超変異に供することにより作製されたものではなく、かつ、該第２の核酸配列が、核酸配列のライブラリを体細胞超変異に供することにより作製されたものであるか、
（ｂ）該第１の核酸配列が、核酸配列を体細胞超変異に供することにより作製されたものであり、かつ、該第２の核酸配列が、核酸配列のライブラリを体細胞超変異に供することにより作製されたものではないか、
（ｃ）該第１の核酸配列が、核酸配列を体細胞超変異に供することにより作製されたものであり、かつ、該第２の核酸配列が、核酸配列のライブラリを体細胞超変異に供することにより作製されたものであるか、または、
（ｄ）該第１の核酸配列が、核酸配列を体細胞超変異に供することにより作製されたものではなく、かつ、該第２の核酸配列が、核酸配列のライブラリを体細胞超変異に供することにより作製されたものではない、
請求項１に記載の方法。
【請求項３】
工程（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、および任意に（ｄ）を繰り返すことを更に含み、但し、該繰り返される工程では、該第１の核酸配列は、最初の工程（ａ）、（ｂ）、（ｃ）、および（ｄ）により提供された所望の抗原結合物質をコードする変異体核酸配列の一つを含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記の抗原結合物質を同定することが、
（ｉ）該対象とする抗原が該抗原結合物質に結合できる条件下で該対象とする抗原を該細胞集団に提供すること、および
（ｉｉ）発現されて該対象とする抗原に結合する抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞の亜集団を同定すること
を含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
該細胞の亜集団を濃縮することを更に含み、該濃縮が、
（ｉｉｉ）発現されて該対象とする抗原に所望の親和性で結合する抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞の亜集団を、発現されて（１）該対象とする抗原に結合しないか、または（２）該対象とする抗原に所望の親和性で結合しない抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞から分離することによるか、
（ｉｖ）発現されて該対象とする抗原のエピトープに所望の親和性で結合する抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞の亜集団を、発現されて（１）該対象とする抗原の該エピトープに結合しないか、または（２）該対象とする抗原の該エピトープに所望の親和性で結合しない抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞から分離することによるか、
（ｖ）発現されて対象とする抗原に結合し、かつ第２の対象とする抗原と所望の親和性で交差反応する抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞の亜集団を、発現されて（１）該第２の対象とする抗原と交差反応しないか、または（２）該第２の対象とする抗原と所望の親和性で交差反応しない抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞から分離することによるか、または、
（ｖｉ）発現されて該対象とする抗原に結合する抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞の亜集団を、発現されて（１）所望の発現レベルで抗原結合物質を産生しないか、（２）所望の安定性を有する抗原結合物質を産生しないか、（３）所望の機能的活性を有する抗原結合物質を産生しないか、または（４）所望の触媒活性を有する抗原結合物質を産生しない抗原結合物質を産生する第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む細胞から分離することによる、
請求項４に記載の方法。
【請求項６】
該細胞の亜集団が、蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）、分離可能なビーズ、抗原パニング、および／またはＥＬＩＳＡを用いて同定される、請求項４または５に記載の方法。
【請求項７】
該第１の核酸配列、１以上の該第２の核酸配列、該同定された抗原結合物質をコードする核酸配列の一方または両方、および／または１以上の該変異体核酸配列を配列決定することを更に含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
該抗原結合物質が、抗体、抗体コンジュゲート、またはそれらの抗原結合断片である、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
（ａ）前記の抗原結合物質の第１の成分を含む第１のポリペプチドが抗体重鎖またはその断片であり、かつ、前記の抗原結合物質の第２の成分を含む第２のポリペプチドの各々が抗体軽鎖またはその断片であるか、または、
（ｂ）前記の抗原結合物質の第１の成分を含む第１のポリペプチドが抗体軽鎖またはその断片であり、かつ、前記の抗原結合物質の第２の成分を含む第２のポリペプチドの各々が抗体重鎖またはその断片である、
請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
該抗体軽鎖がカッパ（κ）軽鎖またはラムダ（λ）軽鎖である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記の抗原結合物質の第１の成分が、ヒト抗体、非ヒト抗体、またはキメラ抗体から得られ、かつ、前記の抗原結合物質の第２の成分が、ヒト抗体、非ヒト抗体、またはキメラ抗体から得られる、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１２】
該第１の核酸配列および少なくとも１つの該第２の核酸配列が、同一の核酸分子上に提供されている、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１３】
該第１の核酸配列および該一組の第２の核酸配列が、異なる核酸分子上に提供されている、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
該第１の核酸配列が、対応する野生型核酸配列と比較して、体細胞超変異のコールドスポットおよび／または体細胞超変異のホットスポットの密度を増加または減少させ、それにより体細胞超変異に対する該核酸配列の感受性が増加または減少されるように改変されている、請求項１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１５】
１以上の該第２の核酸配列が、対応する野生型核酸配列と比較して、体細胞超変異のコールドスポットおよび／または体細胞超変異のホットスポットの密度を増加または減少させ、それにより体細胞超変異に対する該核酸配列の感受性を増加または減少させるように改変されている、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１６】
該細胞が真核細胞である、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１７】
該第１の核酸配列および／または該一組の第２の核酸配列がベクターの形態である、請求項１〜１６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
該ベクターが、複製可能な遺伝的表示パッケージである、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
該複製可能な遺伝的表示パッケージがウイルスベクターまたはバクテリオファージである、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
該第１の核酸配列および該一組の第２の核酸配列が、同一ベクター上で該細胞集団に提供される、請求項１７〜１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２１】
該第１の核酸配列および該一組の第２の核酸配列が、別個のベクター上で該細胞集団に提供される、請求項１７〜１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２２】
該第１の核酸配列および該一組の第２の核酸配列が、細胞に対して同時にまたは順次に提供される、請求項１〜２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２３】
該所望の抗原結合物質またはその断片のアミノ酸配列を取得し、かつ取得したアミノ酸配列を利用して、該抗原結合物質またはその断片の更なるコピーを製造することを更に含む、請求項１〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
該変異体核酸配列の配列を取得し、かつ取得した配列を利用して、該所望の抗原結合物質またはその断片の更なるコピーを製造することを更に含む、請求項１〜２３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２５】
対象とする抗原に結合する抗原結合物質を同定する方法であって、該方法は、
（ａ）第１の核酸配列および一組の第２の核酸配列を含む哺乳動物細胞の集団を提供することを含み、
該第１の核酸配列は、抗原結合物質の第１の成分を含む第１のポリペプチドをコードしており、
該一組の第２の核酸配列は、抗原結合物質の第２の成分を含む第２のポリペプチドをコードする第２の核酸配列を含み、かつ、
（１）該第１の成分および（２）第２の成分は一緒になって抗原結合物質を形成し、
（ｂ）該第１の核酸配列および該一組の第２の核酸配列が発現されて一組の抗原結合物質を産生する条件下で該哺乳動物細胞の集団を維持することを含み、かつ
（ｃ）該対象とする抗原に結合する抗原結合物質を同定することを含む、
方法。
【請求項２６】
請求項１〜２５のいずれか１項に記載の方法により同定された抗原結合物質。
【請求項２７】
対象とする抗原に結合するポリペプチドを製造する方法であって、該方法は、請求項２６記載の抗原結合物質をポリペプチドに挿入することを含み、それにより対象とする抗原に結合するポリペプチドが製造される、方法。
【請求項２８】
請求項２６に記載の抗原結合物質およびその担体を含む組成物。