【手続補正書】
【提出日】平成25年3月18日(2013.3.18)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：5に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ（DH）活性、エノイル-ACPレダクターゼ(ER)活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される多価不飽和脂肪酸(PUFA)シンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：37に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：39に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（d）SEQ ID NO：41に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がER活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
【請求項２】
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：5、37、39および41に対して少なくとも90％同一である、請求項1記載の単離された核酸分子。
【請求項３】
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：5、37、39および41に対して少なくとも95％同一である、請求項1記載の単離された核酸分子。
【請求項４】
それぞれ、SEQ ID NO：5、37、39および41のポリヌクレオチド配列を含む、請求項1記載の単離された核酸分子。
【請求項５】
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：6に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：38に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：40に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子；ならびに
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：42に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがER活性を含む、核酸分子。
【請求項６】
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも90％同一である、請求項5記載の単離された核酸分子。
【請求項７】
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも95％同一である、請求項5記載の単離された核酸分子。
【請求項８】
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42のアミノ酸配列を含む、請求項5記載の単離された核酸分子。
【請求項９】
DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子であって、
該ポリヌクレオチドが、請求項1〜8のいずれか一項記載のポリヌクレオチド配列の相補物と、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、単離された核酸分子。
【請求項１０】
請求項1〜9のいずれか一項記載のポリヌクレオチド配列に対して完全に相補的なポリヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
【請求項１１】
請求項1〜9のいずれか一項記載の核酸分子またはそれらの組み合わせと、転写制御配列とを含む、組換え核酸分子。
【請求項１２】
組換えベクターである、請求項11記載の組換え核酸分子。
【請求項１３】
請求項1〜9のいずれか一項記載の核酸分子、請求項11もしくは請求項12記載の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを発現する、宿主細胞。
【請求項１４】
植物細胞、微生物細胞、および動物細胞からなる群より選択される、請求項13記載の宿主細胞。
【請求項１５】
微生物細胞である、請求項14記載の宿主細胞。
【請求項１６】
細菌である、請求項15記載の微生物細胞。
【請求項１７】
ヤブレツボカビ（thraustochytrid）である、請求項15記載の微生物細胞。
【請求項１８】
ヤブレツボカビがシゾキトリウム属（Schizochytrium）であるか、またはヤブレツボカビ属（Thraustochytrium）である、請求項17記載の微生物細胞。
【請求項１９】
以下の段階を含む、少なくとも1つのPUFAを産生するための方法：
宿主細胞において、PUFAを産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、
該PUFAシンターゼ遺伝子が、請求項1〜9のいずれか一項記載の単離された核酸分子、請求項11もしくは請求項12記載の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含み、かつ
少なくとも1種類のPUFAが産生される、段階。
【請求項２０】
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、請求項19記載の方法。
【請求項２１】
少なくとも1種類のPUFAがドコサヘキサエン酸（DHA）を含む、請求項19記載の方法。
【請求項２２】
以下の段階を含む、DHAに富む脂質を産生するための方法：
宿主細胞において、脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、該PUFAシンターゼ遺伝子が、宿主細胞において、請求項1〜9のいずれか一項記載の単離された核酸分子、請求項11もしくは請求項12記載の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含み、かつ
DHAに富む脂質が産生される、段階。
【請求項２３】
請求項1〜9のいずれか一項記載の単離された核酸分子をベクター中に挿入する段階を含む、組換えベクターを作製する方法。
【請求項２４】
請求項23記載の組換えベクターを宿主細胞に導入する段階を含む、組換え宿主細胞を作製する方法。
【請求項２５】
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、請求項24記載の方法。
【請求項２６】
請求項1〜9のいずれか一項記載のポリヌクレオチド配列によってコードされる、単離されたポリペプチド。
【請求項２７】
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：6に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：38に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：40に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド；ならびに
（d）SEQ ID NO：42に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ER活性を含むポリペプチド。
【請求項２８】
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも90％同一である、請求項27記載の単離されたポリペプチド。
【請求項２９】
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも95％同一である、請求項27記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３０】
それぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42のアミノ酸配列を含む、請求項27記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３１】
融合ポリペプチドである、請求項26〜30のいずれか一項記載の単離されたポリペプチド。
【請求項３２】
請求項26〜30のいずれか一項記載のポリペプチドと、生物学的に許容される担体とを含む、組成物。
【請求項３３】
以下の段階を含む、PUFAシンターゼ活性を有する生物におけるDHAの産生を増加させる方法：
生物において、請求項1〜9のいずれか一項記載の単離された核酸分子、請求項11もしくは請求項12記載の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを、DHAを産生させるのに有効な条件下で発現させる段階であって、
該PUFAシンターゼ活性が、該生物において、不活性な活性もしくは消失した活性に取って代わるか、新たな活性を導入するか、または既存の活性を増強し、かつ
該生物におけるDHAの産生が増加する、段階。
【請求項３４】
以下の段階を含む、宿主細胞から脂質を単離する方法：
（a）宿主細胞において、脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、PKS系が、宿主細胞において、請求項1〜9のいずれか一項記載の単離された核酸分子、請求項11もしくは請求項12記載の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含む、段階、および
（b）宿主細胞から脂質を単離する段階。
【請求項３５】
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、請求項34記載の方法。
【請求項３６】
脂質がDHAを含む、請求項34記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００４５
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００４５】
本発明は、以下の段階を含む、宿主細胞から脂質を単離する方法を対象とする：（a）宿主細胞において、脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、PUFAシンターゼ遺伝子が、宿主細胞において、上記の単離された核酸分子のいずれか、上記の組換え核酸分子のいずれか、またはそれらの組み合わせを含む、段階；および（b）宿主細胞から脂質を単離する段階。いくつかの態様において、宿主細胞は、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される。いくつかの態様において、脂質はDHA、EPA、またはそれらの組み合わせを含む。
[本発明1001]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：1に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、β-ケトアシル-ACPシンターゼ（KS）活性、マロニル-CoA：ACPアシルトランスフェラーゼ（MAT）活性、アシルキャリアータンパク質（ACP）活性、ケトレダクターゼ（KR）活性、β-ヒドロキシアシル-ACPデヒドラーゼ（DH）活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される多価不飽和脂肪酸（PUFA）シンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：7に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がKS活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：9に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がMAT活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（d）SEQ ID NO：13、15、17、19、21または23のいずれか1つに対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がACP活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（e）SEQ ID NO：11に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がACP活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（f）SEQ ID NO：25に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がKR活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（g）SEQ ID NO：27に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
[本発明1002]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：1、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25および27に対して少なくとも90％同一である、本発明1001の単離された核酸分子。
[本発明1003]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：1、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25および27に対して少なくとも95％同一である、本発明1001の単離された核酸分子。
[本発明1004]
それぞれ、SEQ ID NO：1、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25および27のポリヌクレオチド配列を含む、本発明1001の単離された核酸分子。
[本発明1005]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：2に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドが、KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：8に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがKS活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：10に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがMAT活性を含む、核酸分子；
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：14、16、18、20、22または24のいずれか1つに対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがACP活性を含む、核酸分子；
（e）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：12に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがACP活性を含む、核酸分子；
（f）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：26に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがKR活性を含む、核酸分子；ならびに
（g）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：28に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子。
[本発明1006]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：2、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26および28に対して少なくとも90％同一である、本発明1005の単離された核酸分子。
[本発明1007]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：2、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26および28に対して少なくとも95％同一である、本発明1005の単離された核酸分子。
[本発明1008]
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：2、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26および28のアミノ酸配列を含む、本発明1005の単離された核酸分子。
[本発明1009]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：3に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、KS活性、鎖長因子（chain length factor）（CLF）活性、アシルトランスフェラーゼ（AT）活性、エノイル-ACPレダクターゼ（ER）活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：29に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がKS活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：31に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がCLF活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（d）SEQ ID NO：33に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がAT活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（e）SEQ ID NO：35に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がER活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
[本発明1010]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：3、29、31、33および35に対して少なくとも90％同一である、本発明1009の単離された核酸分子。
[本発明1011]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：3、29、31、33および35に対して少なくとも95％同一である、本発明1009の単離された核酸分子。
[本発明1012]
それぞれ、SEQ ID NO：3、29、31、33および35のポリヌクレオチド配列を含む、本発明1009の単離された核酸分子。
[本発明1013]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：4に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドが、KS活性、CLF活性、AT活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：30に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがKS活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：32に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがCLF活性を含む、核酸分子；
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：34に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがAT活性を含む、核酸分子；ならびに
（e）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：36に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがER活性を含む、核酸分子。
[本発明1014]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：4、30、32、34および36に対して少なくとも90％同一である、本発明1013の単離された核酸分子。
[本発明1015]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：4、30、32、34および36に対して少なくとも95％同一である、本発明1013の単離された核酸分子。
[本発明1016]
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：4、30、32、34および36のアミノ酸配列を含む、本発明1013の単離された核酸分子。
[本発明1017]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：5に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：37に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：39に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（d）SEQ ID NO：41に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がER活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
[本発明1018]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：5、37、39および41に対して少なくとも90％同一である、本発明1017の単離された核酸分子。
[本発明1019]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：5、37、39および41に対して少なくとも95％同一である、本発明1017の単離された核酸分子。
[本発明1020]
それぞれ、SEQ ID NO：5、37、39および41のポリヌクレオチド配列を含む、本発明1017の単離された核酸分子。
[本発明1021]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：6に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：38に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：40に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子；ならびに
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：42に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがER活性を含む、核酸分子。
[本発明1022]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも90％同一である、本発明1021の単離された核酸分子。
[本発明1023]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも95％同一である、本発明1021の単離された核酸分子。
[本発明1024]
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42のアミノ酸配列を含む、本発明1021の単離された核酸分子。
[本発明1025]
KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、CLF活性、AT活性、ER活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子であって、
該ポリヌクレオチドが、本発明1001〜1024のいずれかのポリヌクレオチド配列の相補物と、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、単離された核酸分子。
[本発明1026]
本発明1001〜1024のいずれかのポリヌクレオチド配列に対して完全に相補的なポリヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
[本発明1027]
本発明1001〜1025のいずれかの核酸分子またはそれらの組み合わせと、転写制御配列とを含む、組換え核酸分子。
[本発明1028]
組換えベクターである、本発明1027の組換え核酸分子。
[本発明1029]
本発明1001〜1025のいずれかの核酸分子、本発明1027もしくは本発明1028の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを発現する、宿主細胞。
[本発明1030]
植物細胞、微生物細胞、および動物細胞からなる群より選択される、本発明1029の宿主細胞。
[本発明1031]
微生物細胞である、本発明1030の宿主細胞。
[本発明1032]
細菌である、本発明1031の微生物細胞。
[本発明1033]
ヤブレツボカビ（thraustochytrid）である、本発明1031の微生物細胞。
[本発明1034]
ヤブレツボカビがシゾキトリウム属（Schizochytrium）であるか、またはヤブレツボカビ属（Thraustochytrium）である、本発明1033の微生物細胞。
[本発明1035]
以下の段階を含む、少なくとも1つのPUFAを産生するための方法：
宿主細胞において、PUFAを産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、
該PUFAシンターゼ遺伝子が、本発明1001〜1025のいずれかの単離された核酸分子、本発明1027もしくは本発明1028の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含み、かつ
少なくとも1種類のPUFAが産生される、段階。
[本発明1036]
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、本発明1035の方法。
[本発明1037]
少なくとも1種類のPUFAがドコサヘキサエン酸（DHA）を含む、本発明1035の方法。
[本発明1038]
以下の段階を含む、DHAに富む脂質を産生するための方法：
宿主細胞において、脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、該PUFAシンターゼ遺伝子が、宿主細胞において、本発明1001〜1025のいずれかの単離された核酸分子、本発明1027もしくは本発明1028の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含み、かつ
DHAに富む脂質が産生される、段階。
[本発明1039]
本発明1001〜1025のいずれかの単離された核酸分子をベクター中に挿入する段階を含む、組換えベクターを作製する方法。
[本発明1040]
本発明1039の組換えベクターを宿主細胞に導入する段階を含む、組換え宿主細胞を作製する方法。
[本発明1041]
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、本発明1040の方法。
[本発明1042]
本発明1001〜1025のいずれかのポリヌクレオチド配列によってコードされる、単離されたポリペプチド。
[本発明1043]
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：2に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：8に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：10に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、MAT活性を含むポリペプチド；
（d）SEQ ID NO：14、16、18、20、22または24のいずれか1つに対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ACP活性を含むポリペプチド；
（e）SEQ ID NO：12に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ACP活性を含むポリペプチド；
（f）SEQ ID NO：26に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KR活性を含むポリペプチド；ならびに
（g）SEQ ID NO：28に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド。
[本発明1044]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：2、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26および28に対して少なくとも90％同一である、本発明1043の単離されたポリペプチド。
[本発明1045]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：2、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26および28に対して少なくとも95％同一である、本発明1043の単離されたポリペプチド。
[本発明1046]
それぞれ、SEQ ID NO：2、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26および28のアミノ酸配列を含む、本発明1043の単離されたポリペプチド。
[本発明1047]
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：4に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性、CLF活性、AT活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：30に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：32に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、CLF活性を含むポリペプチド；
（d）SEQ ID NO：34に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、AT活性を含むポリペプチド；ならびに
（e）SEQ ID NO：36に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ER活性を含むポリペプチド。
[本発明1048]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：4、30、32、34および36に対して少なくとも90％同一である、本発明1047の単離されたポリペプチド。
[本発明1049]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：4、30、32、34および36に対して少なくとも95％同一である、本発明1047の単離されたポリペプチド。
[本発明1050]
それぞれ、SEQ ID NO：4、30、32、34および36のアミノ酸配列を含む、本発明1047の単離されたポリペプチド。
[本発明1051]
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：6に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：38に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：40に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド；ならびに
（d）SEQ ID NO：42に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ER活性を含むポリペプチド。
[本発明1052]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも90％同一である、本発明1051の単離されたポリペプチド。
[本発明1053]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42に対して少なくとも95％同一である、本発明1051の単離されたポリペプチド。
[本発明1054]
それぞれ、SEQ ID NO：6、38、40および42のアミノ酸配列を含む、本発明1051の単離されたポリペプチド。
[本発明1055]
融合ポリペプチドである、本発明1042〜1054のいずれかの単離されたポリペプチド。
[本発明1056]
本発明1042〜1054のいずれかのポリペプチドと、生物学的に許容される担体とを含む、組成物。
[本発明1057]
以下の段階を含む、PUFAシンターゼ活性を有する生物におけるDHAの産生を増加させる方法：
生物において、本発明1001〜1025のいずれかの単離された核酸分子、本発明1027もしくは本発明1028の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを、DHAを産生させるのに有効な条件下で発現させる段階であって、
該PUFAシンターゼ活性が、該生物において、不活性な活性もしくは消失した活性に取って代わるか、新たな活性を導入するか、または既存の活性を増強し、かつ
該生物におけるDHAの産生が増加する、段階。
[本発明1058]
以下の段階を含む、宿主細胞から脂質を単離する方法：
（a）宿主細胞において、脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、PKS系が、宿主細胞において、本発明1001〜1025のいずれかの単離された核酸分子、本発明1027もしくは本発明1028の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含む、段階、および
（b）宿主細胞から脂質を単離する段階。
[本発明1059]
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、本発明1058の方法。
[本発明1060]
脂質がDHAを含む、本発明1058の方法。
[本発明1061]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：68またはSEQ ID NO：120に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：74に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がKS活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：76に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がMAT活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（d）SEQ ID NO：80、82、84、86、88、90、92、94、96または98のいずれか1つに対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がACP活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（e）SEQ ID NO：78に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がACP活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（f）SEQ ID NO：100に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がKR活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（g）SEQ ID NO：118に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
[本発明1062]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：68、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、118および120に対して少なくとも90％同一である、本発明1061の単離された核酸分子。
[本発明1063]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：68、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、118および120に対して少なくとも95％同一である、本発明1061の単離された核酸分子。
[本発明1064]
それぞれ、SEQ ID NO：68、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、118および120のポリヌクレオチド配列を含む、本発明1061の単離された核酸分子。
[本発明1065]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：69に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドが、KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：75に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがKS活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：77に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがMAT活性を含む、核酸分子；
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：81、83、85、87、89、91、93、95、97または99のいずれか1つに対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがACP活性を含む、核酸分子；
（e）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：79に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがACP活性を含む、核酸分子；
（f）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：101に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがKR活性を含む、核酸分子；ならびに
（g）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：119に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子。
[本発明1066]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101および119に対して少なくとも90％同一である、本発明1065の単離された核酸分子。
[本発明1067]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101および119に対して少なくとも95％同一である、本発明1065の単離された核酸分子。
[本発明1068]
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101および119のアミノ酸配列を含む、本発明1065の単離された核酸分子。
[本発明1069]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：70またはSEQ ID NO：121に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、KS活性、CLF活性、AT活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：102に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がKS活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：104に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がCLF活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（d）SEQ ID NO：106に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がAT活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（e）SEQ ID NO：108に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がER活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
[本発明1070]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：70、102、104、106、108および121に対して少なくとも90％同一である、本発明1069の単離された核酸分子。
[本発明1071]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：70、102、104、106、108および121に対して少なくとも95％同一である、本発明1069の単離された核酸分子。
[本発明1072]
それぞれ、SEQ ID NO：70、102、104、106、108および121のポリヌクレオチド配列を含む、本発明1069の単離された核酸分子。
[本発明1073]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：71に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドが、KS活性、CLF活性、AT活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：103に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがKS活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：105に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがCLF活性を含む、核酸分子；
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：107に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがAT活性を含む、核酸分子；ならびに
（e）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：109に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがER活性を含む、核酸分子。
[本発明1074]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：71、103、105、107および109に対して少なくとも90％同一である、本発明1073の単離された核酸分子。
[本発明1075]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：71、103、105、107および109に対して少なくとも95％同一である、本発明1073の単離された核酸分子。
[本発明1076]
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：71、103、105、107および109のアミノ酸配列を含む、本発明1073の単離された核酸分子。
[本発明1077]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）SEQ ID NO：72またはSEQ ID NO：122に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列が、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（b）SEQ ID NO：110に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；
（c）SEQ ID NO：112に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がDH活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子；ならびに
（d）SEQ ID NO：114に対して少なくとも80％同一なポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリヌクレオチド配列がER活性を含むポリペプチドをコードする、核酸分子。
[本発明1078]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：72、110、112、114および122に対して少なくとも90％同一である、本発明1077の単離された核酸分子。
[本発明1079]
ポリヌクレオチド配列がそれぞれ、SEQ ID NO：72、110、112、114および122に対して少なくとも95％同一である、本発明1077の単離された核酸分子。
[本発明1080]
それぞれ、SEQ ID NO：72、110、112、114および122のポリヌクレオチド配列を含む、本発明1077の単離された核酸分子。
[本発明1081]
以下のものからなる群より選択される、単離された核酸分子：
（a）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：73に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、該ポリペプチドが、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含む、核酸分子；
（b）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：111に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子；
（c）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：113に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがDH活性を含む、核酸分子；ならびに
（d）ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、該ポリペプチドがSEQ ID NO：115に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含み、かつ該ポリペプチドがER活性を含む、核酸分子。
[本発明1082]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：73、111、113および115に対して少なくとも90％同一である、本発明1081の単離された核酸分子。
[本発明1083]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：73、111、113および115に対して少なくとも95％同一である、本発明1081の単離された核酸分子。
[本発明1084]
ポリペプチドがそれぞれ、SEQ ID NO：73、111、113および115のアミノ酸配列を含む、本発明1081の単離された核酸分子。
[本発明1085]
KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、CLF活性、AT活性、ER活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子であって、
該ポリヌクレオチドが、本発明1061〜1084のいずれかのポリヌクレオチド配列の相補物と、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、単離された核酸分子。
[本発明1086]
本発明1061〜1084のいずれかのポリヌクレオチド配列に対して完全に相補的なポリヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
[本発明1087]
本発明1061〜1085のいずれかの核酸分子またはそれらの組み合わせと、転写制御配列とを含む、組換え核酸分子。
[本発明1088]
組換えベクターである、本発明1087の組換え核酸分子。
[本発明1089]
本発明1061〜1085のいずれかの核酸分子、本発明1087もしくは本発明1088の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを発現する、宿主細胞。
[本発明1090]
植物細胞、微生物細胞、および動物細胞からなる群より選択される、本発明1089の宿主細胞。
[本発明1091]
微生物細胞である、本発明1090の宿主細胞。
[本発明1092]
細菌である、本発明1091の微生物細胞。
[本発明1093]
ヤブレツボカビである、本発明1091の微生物細胞。
[本発明1094]
ヤブレツボカビがシゾキトリウム属であるか、またはヤブレツボカビ属である、本発明1093の微生物細胞。
[本発明1095]
以下の段階を含む、少なくとも1種類のPUFAを産生するための方法：
宿主細胞において、PUFAを産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、
該PUFAシンターゼ遺伝子が、本発明1061〜1085のいずれかの単離された核酸分子、本発明1087もしくは本発明1088の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含み、かつ
少なくとも1種類のPUFAが産生される、段階。
[本発明1096]
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、本発明1095の方法。
[本発明1097]
少なくとも1種類のPUFAがDHAまたはエイコサペンタエン酸（EPA）を含む、本発明1095の方法。
[本発明1098]
以下の段階を含む、DHA、EPA、またはそれらの組み合わせに富む脂質を産生するための方法：
宿主細胞において、脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、該PUFAシンターゼ遺伝子が、宿主細胞において、本発明1061〜1085のいずれかの単離された核酸分子、本発明1087もしくは本発明1088の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含み、かつ
DHA、EPA、またはそれらの組み合わせに富む脂質が産生される、段階。
[本発明1099]
本発明1061〜1085のいずれかの単離された核酸分子をベクター中に挿入する段階を含む、組換えベクターを作製する方法。
[本発明1100]
本発明1099の組換えベクターを宿主細胞に導入する段階を含む、組換え宿主細胞を作製する方法。
[本発明1101]
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、本発明1100の方法。
[本発明1102]
本発明1061〜1085のいずれかのポリヌクレオチド配列によってコードされる、単離されたポリペプチド。
[本発明1103]
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：69に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性、MAT活性、ACP活性、KR活性、DH活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：75に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：77に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、MAT活性を含むポリペプチド；
（d）SEQ ID NO：81、83、85、87、89、91、93、95、97または99のいずれか1つに対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ACP活性を含むポリペプチド；
（e）SEQ ID NO：79に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ACP活性を含むポリペプチド；
（f）SEQ ID NO：101に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KR活性を含むポリペプチド；ならびに
（g）SEQ ID NO：119に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド。
[本発明1104]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101および119に対して少なくとも90％同一である、本発明1103の単離されたポリペプチド。
[本発明1105]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101および119に対して少なくとも95％同一である、本発明1103の単離されたポリペプチド。
[本発明1106]
それぞれ、SEQ ID NO：69、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101および119のアミノ酸配列を含む、本発明1103の単離されたポリペプチド。
[本発明1107]
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：71に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性、CLF活性、AT活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：103に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、KS活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：105に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、CLF活性を含むポリペプチド；
（d）SEQ ID NO：107に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、AT活性を含むポリペプチド；ならびに
（e）SEQ ID NO：109に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ER活性を含むポリペプチド。
[本発明1108]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：71、103、105、107および109に対して少なくとも90％同一である、本発明1107の単離されたポリペプチド。
[本発明1109]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：71、103、105、107および109に対して少なくとも95％同一である、本発明1107の単離されたポリペプチド。
[本発明1110]
それぞれ、SEQ ID NO：71、103、105、107および109のアミノ酸配列を含む、本発明1107の単離されたポリペプチド。
[本発明1111]
以下のものからなる群より選択される、単離されたポリペプチド：
（a）SEQ ID NO：73に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性、ER活性、およびそれらの組み合わせからなる群より選択されるPUFAシンターゼ活性を含むポリペプチド；
（b）SEQ ID NO：111に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド；
（c）SEQ ID NO：113に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、DH活性を含むポリペプチド；ならびに
（d）SEQ ID NO：115に対して少なくとも80％同一なアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、ER活性を含むポリペプチド。
[本発明1112]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：73、111、113および115に対して少なくとも90％同一である、本発明1111の単離されたポリペプチド。
[本発明1113]
アミノ酸配列がそれぞれ、SEQ ID NO：73、111、113および115に対して少なくとも95％同一である、本発明1111の単離されたポリペプチド。
[本発明1114]
それぞれ、SEQ ID NO：73、111、113および115のアミノ酸配列を含む、本発明1111の単離されたポリペプチド。
[本発明1115]
融合ポリペプチドである、本発明1102〜1114のいずれかの単離されたポリペプチド。
[本発明1116]
本発明1102〜1114のいずれかのポリペプチドと、生物学的に許容される担体とを含む、組成物。
[本発明1117]
以下の段階を含む、PUFAシンターゼ活性を有する生物におけるDHA、EPA、またはそれらの組み合わせの産生を増加させる方法：
生物において、本発明1061〜1085のいずれかの単離された核酸分子、本発明1087もしくは本発明1088の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを、DHA、EPA、またはそれらの組み合わせを産生させるのに有効な条件下で発現させる段階であって、
該PUFAシンターゼ活性が、該生物において、不活性な活性もしくは消失した活性に取って代わるか、新たな活性を導入するか、または既存の活性を増強し、かつ
該生物におけるDHA、EPA、またはそれらの組み合わせの産生が増加する、段階。
[本発明1118]
以下の段階を含む、宿主細胞から脂質を単離する方法：
（a）宿主細胞において脂質を産生させるのに有効な条件下でPUFAシンターゼ遺伝子を発現させる段階であって、PKS系が、宿主細胞において、本発明1061〜1085のいずれかの単離された核酸分子、本発明1087もしくは本発明1088の組換え核酸分子、またはそれらの組み合わせを含む、段階、および
（b）宿主細胞から脂質を単離する段階。
[本発明1119]
宿主細胞が、植物細胞、単離された動物細胞、および微生物細胞からなる群より選択される、本発明1118の方法。
[本発明1120]
脂質がDHA、EPA、またはそれらの組み合わせを含む、本発明1118の方法。