【手続補正書】
【提出日】平成25年4月11日(2013.4.11)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
将来の心血管系イベントのリスクを減らすためのアセチルサリチル酸処理に対するヒト被験体の応答性を評価するのを補助するためのインビトロでの方法であって：
ヒト被験体のアポリポタンパク質（ａ）（Ａｐｏ（ａ））遺伝子の染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０
ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）の位置で一塩基多型の正体を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項２】
染色体６：１６０８８０８７７の位置のシトシンまたはグアニンによって特徴付けられる多型の存在が、アセチルサリチル酸に対する応答性を示す、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記被験体由来の血液サンプル中のリポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））のレベルを決定する工程をさらに包含する、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記被験体が、血中でＬｐ（ａ）のレベルが上昇している、請求項３に記載の方法。
【請求項５】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約１０ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約１５ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４に記載の方法。
【請求項７】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約２０ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４に記載の方法。
【請求項８】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約２５ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４に記載の方法。
【請求項９】
染色体６：１６０８８０８７７の位置のチミンまたはアデニンによって特徴付けられる多型の存在が、アセチルサリチル酸に対する非応答性を示す、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記心血管系イベントが、心筋梗塞、発作、急性冠症候群、心筋虚血、慢性安定狭心症、不安定狭心症、心血管系死亡、冠動脈再狭窄、冠ステント再狭窄、冠ステント再血栓症、血管再生、血管形成術、一過性虚血性発作、肺塞栓症、血管閉塞または静脈血栓症である、請求項１に記載の方法。
【請求項１１】
前記多型の正体が、前記被験体から得た核酸と、核酸プローブとを接触することによって決定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
前記多型の正体が、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチド連結アッセイ、サイズ分析、または一本鎖高次構造多型によって決定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１３】
前記多型の正体が、前記被験体から得られた核酸を配列決定することによって決定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１４】
インビトロでのアッセイであって、
ある薬剤と、染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）でヌクレオチドのシトシンまたはグアニンを有する（Ａｐｏ（ａ））遺伝子によってコードされるアポリポタンパク質（ａ）（Ａｐｏ（ａ））タンパク質とを接触させる工程と、
該単離されたＡｐｏ（ａ）タンパク質に、またはリポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））に対する該薬剤の結合を評価する工程と、
コントロールに対する結合を比較する工程と、
を包含する、アッセイ。
【請求項１５】
インビトロでのアッセイであって、
ある薬剤と、染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）でヌクレオチドのチミンまたはアデニンを有するアポリポタンパク質（ａ）遺伝子によってコードされるＡｐｏ（ａ）タンパク質とを接触させる工程と、
該単離されたＡｐｏ（ａ）タンパク質に対する該薬剤の結合を評価する工程と、
コントロールに対する該結合を比較する工程と、
を包含する、アッセイ。
【請求項１６】
前記コントロールが、前記単離されたＡｐｏ（ａ）タンパク質に対する、Ｌｐ（ａ）に対するもしくは血小板に対するアセチルサリチル酸の結合の測定、または血小板とのアセチルサリチル酸の相互作用の測定を含む、請求項１４または１５のいずれか１項に記載のアッセイ。
【請求項１７】
ヒト被験体が染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）でシトシンまたはグアニンによって特徴付けられるＡｐｏ（ａ）多型を有することに基づいて、該ヒト被験体における将来の心血管系イベントのリスクを低減するための組成物であって、アセチルサリチル酸を含む、組成物。
【請求項１８】
前記ヒト被験体がまた、血中でリポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））のレベルが上昇している、請求項１７に記載の組成物。
【請求項１９】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが、前記被験体由来の血液サンプル中で約１０ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２０】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが、前記被験体由来の血液サンプル中で約１５ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項１９に記載の組成物。
【請求項２１】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが、前記被験体由来の血液サンプル中で約２０ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２２】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが、前記被験体由来の血液サンプル中で約２５ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項１８に記載の組成物。
【請求項２３】
前記心血管系イベントが、心筋梗塞、発作、急性冠症候群、心筋虚血、慢性安定狭心症、不安定狭心症、心血管系死亡、冠動脈再狭窄、冠ステント再狭窄、冠ステント再血栓症、血管再生、血管形成術、一過性虚血性発作、肺塞栓症、血管閉塞または静脈血栓症である、請求項１７に記載の組成物。
【請求項２４】
ヒト被験体が染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）でチミンまたはアデニンによって特徴付けられるＡｐｏ（ａ）多型を有することに基づいて該ヒト被験体において将来の心血管系イベントのリスクを低減するための組成物であって、該組成物は、抗血小板剤またはアセチルサリチル酸以外の抗血栓剤を含む、組成物。
【請求項２５】
前記抗血栓剤がチエノピリジンまたはチエノピリジン誘導体である、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２６】
前記チエノピリジンまたはチエノピリジン誘導体が、クロピドグレル、クロピドグレル重硫酸塩、チクロピジン、プラスグレル（ＣＳ−７４７またはＬＹ６４０３１５）、ＳＲ２５９８９、またはＰＣＲ４０９９である、請求項２５に記載の組成物。
【請求項２７】
前記抗血栓剤が、セノキサパリンナトリウム、キシメラガトラン、アブシキシマブまたはチロフィバンである、請求項２４に記載の組成物。
【請求項２８】
将来の心血管系イベントのリスクを低減するための、アセチルサリチル酸処理に対するヒト被験体の応答性を評価するのを補助するためのインビトロでの方法であって、
該ヒト被験体のアポタンパク質（ａ）（Ａｐｏ（ａ））遺伝子の染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）の位置で一塩基多型（ＳＮＰ）と連鎖するかまたは連鎖不平衡にある遺伝子マーカーの有無を検出する工程、を包含する方法。
【請求項２９】
前記遺伝子マーカーが、対立遺伝子、ＳＮＰ、制限酵素断片長多型（ＲＦＬＰ）、無作為増幅多型ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）、増幅断片長多型（ＡＦＬＰ）、または単純配列リピート（ＳＳＲ）である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記遺伝子マーカーが、染色体６：１６０８４９８９４（ＮＣＢＩビルド１２８；ｒｓ９４５７９３１  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）の位置でＳＮＰである、請求項２８に記載の方法。
【請求項３１】
前記遺伝子マーカーが、染色体６：１６０８３０２７２（ＮＣＢＩビルド１２８；ｒｓ９４５７９２７  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）の位置でＳＮＰである、請求項２８に記載の方法。
【請求項３２】
前記連鎖が、Ｋｒｉｎｇｌｅ（Ｋｒ）ＩＶ  ２型ドメインの１６、１７または１８リピートの間である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３３】
前記染色体６：１６０８８０８７７の位置のシトシンまたはグアニンによって特徴付けられる多型の存在が、アセチルサリチル酸に対する応答性を示す、請求項２８に記載の方法。
【請求項３４】
前記染色体６：１６０８８０８７７の位置のチミンまたはアデニンによって特徴付けられる多型の存在が、アセチルサリチル酸に対する非応答性を示す、請求項２８に記載の方法。
【請求項３５】
前記被験体由来の血液サンプル中のリポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））のレベルを決定する工程をさらに包含する、請求項２８に記載の方法。
【請求項３６】
前記心血管系イベントが、心筋梗塞、発作、急性冠症候群、心筋虚血、慢性安定狭心症、不安定狭心症、心血管系死亡、冠動脈再狭窄、冠ステント再狭窄、冠ステント再血栓症、血管再生、血管形成術、一過性虚血性発作、肺塞栓症、血管閉塞または静脈血栓症である、請求項２８に記載の方法。
【請求項３７】
ヒト被験体が、染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）でシトシンまたはグアニンによって特徴付けられるＡｐｏ（ａ）多型と連鎖するか、または連鎖不均衡である遺伝子マーカーを有することに基づいて、該ヒト被験体において将来の心血管系イベントのリスクを低減するための組成物であって、該組成物は、アセチルサリチル酸を含む、組成物。
【請求項３８】
ヒト被験体が、染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）でチミンまたはアデニンによって特徴付けられるＡｐｏ（ａ）多型と連鎖するかまたは連鎖不平衡にある遺伝子マーカーを有することに基づいて、該ヒト被験体において将来の心血管系イベントのリスクを低減するための組成物であって、該組成物は、アセチルサリチル酸以外の抗血栓剤を含む、組成物。
【請求項３９】
前記遺伝子マーカーが、対立遺伝子、ＳＮＰ、制限酵素断片長多型（ＲＦＬＰ）、無作為増幅多型ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）、増幅断片長多型（ＡＦＬＰ）、または単純配列リピート（ＳＳＲ）である、請求項３７または３８のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４０】
前記ヒト被験体がまた、血液中のリポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））の上昇したレベルを有する、請求項３７または３８のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４１】
前記心血管系イベントが、心筋梗塞、発作、急性冠症候群、心筋虚血、慢性安定狭心症、不安定狭心症、心血管系死亡、冠動脈再狭窄、冠ステント再狭窄、冠ステント再血栓症、血管再生、血管形成術、一過性虚血性発作、肺塞栓症、血管閉塞または静脈血栓症である、請求項３７または３８のいずれか１項に記載の組成物。
【請求項４２】
将来の心血管系イベントのヒト被験体のリスクを評価するのを補助するためのインビトロでの方法であって：
該ヒト被験体のアポリポタンパク質（ａ）遺伝子の染色体６：１６０８８０８７７（２００６年３月アセンブリ−ＮＣＢＩビルド３６．１；ｒｓ３７９８２２０  ｄｂＳＮＰ＠ＮＣＢＩ）の位置の一塩基多型の正体を決定する工程と、
該ヒト被験体由来の血液サンプル中でリポタンパク質（ａ）（Ｌｐ（ａ））のレベルを決定する工程と、
を包含する、方法。
【請求項４３】
前記染色体６：１６０８８０８７７の位置のシトシンまたはグアニンによって特徴付けられる多型の存在、および前記被験体由来の血液サンプル中のＬｐ（ａ）のレベルの上昇の存在は、該被験体が将来の心血管系イベントのリスク増大にあることを示している、請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約１０ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約１５ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４６】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約２０ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４７】
Ｌｐ（ａ）の前記レベルが前記被験体由来の前記血液サンプル中で約２５ｍｇ／ｄｌ以上である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４８】
前記心血管系イベントが、心筋梗塞、発作、心血管系死亡、冠動脈再狭窄、冠ステント再狭窄、冠ステント再血栓症、血管再生、肺塞栓症、または静脈血栓症である、請求項４２に記載の方法。
【請求項４９】
請求項１〜１３、２８〜３６、および４２〜４８のいずれか１項に記載の方法を実行するためのキットであって、該キットは、対立遺伝子特異的なヌクレオチドプローブおよび／または対立遺伝子特異的なプライマーを含む、キット。
【請求項５０】
請求項１〜１３、２８〜３６、および４２〜４８のいずれか１項に記載の方法において使用するためのパッケージおよび説明書をさらに備える、請求項４９に記載のキット。
【請求項５１】
緩衝液および酵素をさらに備える、請求項４９または５０に記載のキット。
【請求項５２】
前記酵素はポリメラーゼである、請求項５１に記載のキット。
【請求項５３】
前記ポリメラーゼは熱安定性ポリメラーゼである、請求項５２に記載のキット。
【請求項５４】
前記ポリメラーゼはｔａｑポリメラーゼである、請求項５３に記載のキット。
【請求項５５】
前記対立遺伝子特異的ヌクレオチドプローブおよび／または対立遺伝子特異的プライマーは検出可能に標識されたものである、請求項４９〜５４のいずれか１項に記載のキット。
【請求項５６】
デオキシヌクレオチドトリホスフェート（ｄＮＴＰ）をさらに含む、請求項４９〜５５のいずれか１項に記載のキット。
【請求項５７】
請求項１〜１３、２８〜３６、および４２〜４８のいずれか１項に記載の方法を実行するための対立遺伝子特異的なプローブまたは対立遺伝子特異的なプライマー。
【請求項５８】
前記対立遺伝子特異的なプローブまたは対立遺伝子特異的なプライマーは、検出可能に標識される、請求項５７に記載の対立遺伝子特異的なプローブまたは対立遺伝子特異的なプライマー。