【手続補正書】
【提出日】平成25年2月6日(2013.2.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）患者から組織サンプルを用意し；
（ｂ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されるかを判定し；
（ｃ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されるならば患者をＢｃｌ−２低分子阻害剤に対して耐性であると分類する
ことを含むＢｃｌ−２ファミリー阻害剤に対して耐性である癌を有する患者を分類する方法。
【請求項２】
（ａ）患者から組織サンプルを用意し；
（ｂ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の発現が増幅されるかを判定し；
（ｃ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されないならば患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤を受ける資格があると分類する
ことを含む癌患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤治療を受ける資格があると同定する方法。
【請求項３】
Ｂｃｌ−２ファミリー阻害剤がＡＢＴ−２６３である請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅はＢｃｌ−ｘＬポリペプチドの発現の増加と相関している請求項１または２に記載の方法。
【請求項５】
組織サンプルは末梢血サンプル、腫瘍組織または疑わしい腫瘍組織、薄層細胞診サンプル、微小針吸引物サンプル、骨髄サンプル、リンパ節サンプル、尿サンプル、腹水サンプル、洗浄液サンプル、食道ブラシサンプル、膀胱または肺洗浄液サンプル、脊髄液サンプル、脳液サンプル、管吸引物サンプル、乳頭分泌物サンプル、胸膜滲出液サンプル、新鮮凍結組織サンプル、パラフィン包埋組織サンプル；或いは末梢血サンプル、腫瘍組織または疑わしい腫瘍組織、薄層細胞診サンプル、微小針吸引物サンプル、骨髄サンプル、尿サンプル、腹水サンプル、洗浄液サンプル、食道ブラシサンプル、膀胱または肺洗浄液サンプル、脊髄液サンプル、脳液サンプル、管吸引物サンプル、乳頭分泌物サンプル、胸膜滲出液サンプル、新鮮凍結組織サンプルまたはパラフィン包埋組織サンプルから作成される抽出物または処理サンプルからなる請求項１または２に記載の方法。
【請求項６】
判定ステップはｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを含む請求項１または２に記載の方法。
【請求項７】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを検出可能に標識されている核酸プローブを用いて実施する請求項６に記載の方法。
【請求項８】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションをＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の少なくとも一部に対して特異的にハイブリダイズする核酸プローブまたはペプチド核酸プローブを用いて実施する請求項６に記載の方法。
【請求項９】
判定はポリメラーゼ連鎖反応を含む請求項１または２に記載の方法。
【請求項１０】
ポリメラーゼ連鎖反応をＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の核酸配列の少なくとも一部に対して特異的にハイブリダイズする少なくとも１つのプライマーを用いて実施する請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
判定ステップは核酸マイクロアレイアッセイを含む請求項１または２に記載の方法。
【請求項１２】
組織サンプルは小細胞肺癌及びリンパ腫からなる群から選択される癌を有する患者に由来する請求項１または２に記載の方法。
【請求項１３】
患者をＢｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ及びＢｃｌ−ｘＬの１つに結合するように設計されたアンチセンス剤を受ける資格があると分類する請求項２に記載の方法。
【請求項１４】
（ａ）癌患者から検査サンプルを用意し；
（ｂ）検査サンプル中の腫瘍または癌細胞を同定し、または検査サンプルから腫瘍または癌細胞を抽出し；
（ｃ）腫瘍または癌細胞中でＢｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されるかを判定し；
（ｄ）治療開始前または治療開始時に測定した増幅Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子を有する腫瘍または癌細胞の数を前記腫瘍または癌細胞の基準レベルと比較する
ことを含む抗−Ｂｃｌ−２ファミリー剤で治療されている患者をモニターする方法。
【請求項１５】
癌は小細胞肺癌及びリンパ腫からなる群から選択される請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
患者はＡＢＴ−２６３で治療されている請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅はＢｃｌ−ｘＬポリペプチドの発現の増加と相関している請求項１４に記載の方法。
【請求項１８】
患者はＢｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ及びＢｃｌ−ｘの少なくとも１つに結合するように設計されたアンチセンス剤で治療されている請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
判定ステップはｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを含む請求項１４に記載の方法。
【請求項２０】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを検出可能に標識されている核酸プローブを用いて実施する請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
腫瘍細胞は循環腫瘍細胞である請求項１４に記載の方法。
【請求項２２】
（ａ）患者から検査サンプルを用意し；
（ｂ）（ｉ）検査サンプル中でＢｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されるかを判定し、及び（ｉｉ）検査サンプル中のＢｃｌ−ｘＬの量を測定し；
（ｃ）検査サンプル中のＢｃｌ−ｘＬの量が対照中のＢｃｌ−ｘＬの量より多いか少ないかを判定し；
（ｄ）（ｉ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅及び（ｉｉ）Ｂｃｌ−ｘＬの量が対照中よりも検査サンプル中で多いことに基づいて患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤に対して耐性の癌を有すると分類する
ことを含むＢｃｌ−２ファミリー阻害剤に対して耐性の癌を有する患者を分類する方法。
【請求項２３】
（ａ）患者から検査サンプルを用意し；
（ｂ）（ｉ）検査サンプル中でＢｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されるかを判定し、（ｉｉ）検査サンプル中のＢｃｌ−ｘＬの量を測定し；
（ｃ）検査サンプル中のＢｃｌ−ｘＬの量が対照中のＢｃｌ−ｘＬの量より多いか少ないかを判定し；
（ｄ）（ｉ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅及び（ｉｉ）Ｂｃｌ−ｘＬの量が対照中よりも検査サンプル中で多いことに基づいて患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤治療を受ける資格があると分類する
ことを含む癌患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤治療を受ける資格があると同定する方法。
【請求項２４】
Ｂｃｌ−２ファミリー阻害剤がＡＢＴ−２６３である請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項２５】
組織サンプルは末梢血サンプル、腫瘍組織または疑わしい腫瘍組織、薄層細胞診サンプル、微小針吸引物サンプル、骨髄サンプル、リンパ節サンプル、尿サンプル、腹水サンプル、洗浄液サンプル、食道ブラシサンプル、膀胱または肺洗浄液サンプル、脊髄液サンプル、脳液サンプル、管吸引物サンプル、乳頭分泌物サンプル、胸膜滲出液サンプル、新鮮凍結組織サンプル、パラフィン包埋組織サンプル；或いは末梢血サンプル、腫瘍組織または疑わしい腫瘍組織、薄層細胞診サンプル、微小針吸引物サンプル、骨髄サンプル、尿サンプル、腹水サンプル、洗浄液サンプル、食道ブラシサンプル、膀胱または肺洗浄液サンプル、脊髄液サンプル、脳液サンプル、管吸引物サンプル、乳頭分泌物サンプル、胸膜滲出液サンプル、新鮮凍結組織サンプルまたはパラフィン包埋組織サンプルから作成される抽出物または処理サンプルからなる請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項２６】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅の判定はｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを含む請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項２７】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを検出可能に標識されている核酸プローブを用いて実施する請求項２６に記載の方法。
【請求項２８】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションをＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の少なくとも一部に対して特異的にハイブリダイズする核酸プローブまたはペプチド核酸プローブを用いて実施する請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅の判定はポリメラーゼ連鎖反応を含む請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項３０】
ポリメラーゼ連鎖反応をＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の核酸配列の少なくとも一部に対して特異的にハイブリダイズする少なくとも１つのプライマーを用いて実施する請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
判定ステップは核酸マイクロアレイアッセイを含む請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項３２】
組織サンプルは小細胞肺癌及びリンパ腫からなる群から選択される癌を有する患者に由来する請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項３３】
患者をＢｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ及びＢｃｌ−ｘＬの１つに結合するように設計されたアンチセンス剤を受ける資格があると分類する請求項２３に記載の方法。
【請求項３４】
測定ステップ（ｂ）（ｉｉ）をイムノアッセイにより実施する請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項３５】
イムノアッセイはサンドイッチ型イムノアッセイである請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
イムノアッセイはＥＬＩＳＡである請求項３４に記載の方法。
【請求項３７】
測定ステップ（ｂ）（ｉｉ）を自動イムノアッセイ計器を用いて実施する請求項３４に記載の方法。
【請求項３８】
測定ステップ（ｂ）（ｉｉ）をＢｃｌ−ｘＬ  ｍＲＮＡを計測することにより実施する請求項２２または２３に記載の方法。
【請求項３９】
（ａ）癌患者から検査サンプルを用意し；
（ｂ）サンプル中の腫瘍または癌細胞を同定し、またはサンプルから腫瘍または癌細胞を抽出し；
（ｃ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅の存在または不在に基づいて患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤で治療を続けるべきかを決定する
ことを含む抗−Ｂｃｌ−２ファミリー剤で治療されている患者をモニターする方法。
【請求項４０】
癌は小細胞肺癌及びリンパ腫からなる群から選択される請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
患者がＡＢＴ−２６３で治療されている請求項３９に記載の方法。
【請求項４２】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅はＢｃｌ−ｘＬポリペプチドの発現の増加と相関している請求項３９に記載の方法。
【請求項４３】
患者はＢｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ及びＢｃｌ−ｘＬの少なくとも１つに結合するように設計されたアンチセンス剤で治療されている請求項４２に記載の方法。
【請求項４４】
判定ステップはｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを含む請求項４２に記載の方法。
【請求項４５】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを検出可能に標識されている核酸プローブを用いて実施する請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを少なくとも２つの核酸プローブを用いて実施する請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
核酸プローブの１つはＢｃｌ−ｘＬ遺伝子にハイブリダイズするように設計されている請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
腫瘍細胞は循環腫瘍細胞である請求項３９に記載の方法。
【請求項４９】
（ａ）患者から検査サンプルを用意し；
（ｂ）（ｉ）検査サンプル中でＢｃｌ−ｘＬ遺伝子が増幅されるかを判定し、（ｉｉ）検査サンプル中のＢｃｌ−ｘＬの量を測定し；
（ｃ）検査サンプル中のＢｃｌ−ｘＬの量が対照中のＢｃｌ−ｘＬの量よりも多いか少ないかを判定し；
（ｄ）（ｉ）Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅及び（ｉｉ）Ｂｃｌ−ｘＬの量が対照中よりも検査サンプル中で多いことに基づいて患者をＢｃｌ−２ファミリー阻害剤で治療を続けるべきかを決定する
ことを含む抗−Ｂｃｌ−２ファミリー剤で治療されている患者をモニターする方法。
【請求項５０】
Ｂｃｌ−２ファミリー阻害剤はＡＢＴ−２６３である請求項４９に記載の方法。
【請求項５１】
組織サンプルは末梢血サンプル、腫瘍組織または疑わしい腫瘍組織、薄層細胞診サンプル、微小針吸引物サンプル、骨髄サンプル、リンパ節サンプル、尿サンプル、腹水サンプル、洗浄液サンプル、食道ブラシサンプル、膀胱または肺洗浄液サンプル、脊髄液サンプル、脳液サンプル、管吸引物サンプル、乳頭分泌物サンプル、胸膜滲出液サンプル、新鮮凍結組織サンプル、パラフィン包埋組織サンプル；或いは末梢血サンプル、腫瘍組織または疑わしい腫瘍組織、薄層細胞診サンプル、微小針吸引物サンプル、骨髄サンプル、尿サンプル、腹水サンプル、洗浄液サンプル、食道ブラシサンプル、膀胱または肺洗浄液サンプル、脊髄液サンプル、脳液サンプル、管吸引物サンプル、乳頭分泌物サンプル、胸膜滲出液サンプル、新鮮凍結組織サンプルまたはパラフィン包埋組織サンプルから作成される抽出物または処理サンプルからなる請求項４９に記載の方法。
【請求項５２】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅の判定はｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを含む請求項４９に記載の方法。
【請求項５３】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションを検出可能に標識されている核酸プローブを用いて実施する請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
ｉｎ  ｓｉｔｕハイブリダイゼーションをＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の少なくとも一部に対して特異的にハイブリダイズする核酸プローブまたはペプチド核酸プローブを用いて実施する請求項５３に記載の方法。
【請求項５５】
Ｂｃｌ−ｘＬ遺伝子の増幅の判定はポリメラーゼ連鎖反応を含む請求項４９に記載の方法。
【請求項５６】
ポリメラーゼ連鎖反応をＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の核酸配列の少なくとも一部に対して特異的にハイブリダイズする少なくとも１つのプライマーを用いて実施する請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
判定ステップは核酸マイクロアレイアッセイを含む請求項４９に記載の方法。
【請求項５８】
組織サンプルは小細胞肺癌及びリンパ腫からなる群から選択される癌を有する患者に由来する請求項４９に記載の方法。
【請求項５９】
患者をＢｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｗ及びＢｃｌ−ｘＬの１つに結合するように設計されたアンチセンス剤を受ける資格があると分類する請求項４９に記載の方法。
【請求項６０】
測定ステップ（ｂ）（ｉｉ）をイムノアッセイにより実施する請求項４９に記載の方法。
【請求項６１】
イムノアッセイはサンドイッチ型イムノアッセイである請求項６０に記載の方法。
【請求項６２】
イムノアッセイはＥＬＩＳＡである請求項６０に記載の方法。
【請求項６３】
測定ステップ（ｂ）（ｉｉ）を自動イムノアッセイ計器を用いて実施する請求項６０に記載の方法。
【請求項６４】
測定ステップ（ｂ）（ｉｉ）をＢｃｌ−ｘＬ  ｍＲＮＡを計測することにより実施する請求項４９に記載の方法。
【請求項６５】
（ａ）増幅されたＢｃｌ−ｘＬ遺伝子を検出するための試薬及び（ｂ）使用説明書を含む
キット。
【請求項６６】
増幅されたＢｃｌ−ｘＬ遺伝子を検出するための試薬はＢｃｌ−ｘＬ遺伝子の少なくとも一部にハイブリダイズする検出可能に標識されているポリヌクレオチドを含む請求項６５に記載のキット。