【手続補正書】
【提出日】平成25年1月25日(2013.1.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（a）生物学的試料を約1mL以上の捕集媒体中に懸濁する工程、
（b）懸濁した該生物学的試料に変性剤および溶解バッファーを加えることによって該生物学的試料を変性および溶解させる工程、
（c）標的核酸分子を少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる工程、
（d）ハイブリダイズした該標的核酸分子を支持体上に捕捉する工程
を含む大量試料調製方法であって、
変性および溶解工程（b）が約10分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約25分未満で完了し、標的核酸分子の10コピー以上が約1時間未満で単離される、
方法。
【請求項２】
標的核酸分子の10コピー以上が約30分未満で単離される、請求項1記載の方法。
【請求項３】
標的核酸分子の10コピー以上が約15分未満で単離される、請求項2記載の方法。
【請求項４】
変性および溶解工程（b）が約7.5分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約22.5分未満で完了する、請求項1記載の方法。
【請求項５】
変性および溶解工程（b）が約5分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約15分未満で完了する、請求項4記載の方法。
【請求項６】
捕集媒体が、0.5％〜約2.0％のNP-40、約0.10％〜約0.40％のデオキシコール酸ナトリウム、約25mM〜約75mMのTris-HCl、約10mM〜約50mMのEDTA、約50mM〜約200mMのNaCl、および約0.01％〜約0.10％のアジ化ナトリウムを含む、請求項1記載の方法。
【請求項７】
捕集媒体が、PRESERVCYT、STM、およびSUREPATHからなる群より選択される、請求項1記載の方法。
【請求項８】
（e）捕捉されたハイブリッド−支持体を洗浄バッファーで洗浄する工程
をさらに含む、請求項1記載の方法。
【請求項９】
方法工程（a）〜（e）が約20分〜約40分で完了する、請求項8記載の方法。
【請求項１０】
遠心分離工程を含まない、請求項1記載の方法。
【請求項１１】
洗浄工程（e）まで、標的核酸分子が細胞生物学的材料の残りから分離されない、請求項8記載の方法。
【請求項１２】
生物学的試料が子宮頸部細胞である、請求項1記載の方法。
【請求項１３】
（a）生物学的試料を約1.0mL以上の捕集媒体中に懸濁するか、または尿、血液、もしくは血清中の生物学的試料を得る工程、
（b）該生物学的試料中の標的核酸分子を変性させる工程、
（c）少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブと該標的核酸分子とを接触させることによって二本鎖核酸ハイブリッドを形成する工程、
（d）該二本鎖核酸ハイブリッドを支持体上に捕捉することによって二本鎖核酸ハイブリッド−支持体複合体を形成する工程
を含む、試料大容量中の標的核酸分子の存在を検出するための方法であって、
標的核酸分子の10コピー以上が約30分〜約3時間で同定可能である、
方法。
【請求項１４】
（e）捕捉されたハイブリッド−支持体複合体によるペレットの形成を許容し、かつ捕捉された該ハイブリッド−支持体を洗浄バッファーで洗浄する工程
をさらに含む、請求項13記載の方法。
【請求項１５】
捕集媒体が、0.5％〜約2.0％のNP-40、約0.10％〜約0.40％のデオキシコール酸ナトリウム、約25mM〜約75mMのTris-HCl、約10mM〜約50mMのEDTA、約50mM〜約200mMのNaCl、および約0.01％〜約0.10％のアジ化ナトリウムを含む、請求項13記載の方法。
【請求項１６】
捕集媒体が、PRESERVCYT、STM、およびSUREPATHからなる群より選択される、請求項13記載の方法。
【請求項１７】
変性工程が約30分未満で完了する、請求項13記載の方法。
【請求項１８】
ハイブリッド−捕捉工程が約30分未満で完了する、請求項13記載の方法。
【請求項１９】
変性工程が約10分未満で完了する、請求項17記載の方法。
【請求項２０】
ハイブリッド−捕捉工程が約25分未満で完了する、請求項18記載の方法。
【請求項２１】
遠心分離工程を含まない、請求項13記載の方法。
【請求項２２】
標的核酸分子がクラミジア・トラコマチス（C. trachomatis）由来である、請求項13記載の方法。
【請求項２３】
標的核酸分子が淋菌（N. gonorrhoeae）由来である、請求項13記載の方法。
【請求項２４】
（a）生物学的試料を約100μl以上の捕集媒体中に懸濁する工程、
（b）懸濁した該生物学的試料に変性剤および溶解バッファーを加えることによって該生物学的試料を変性および溶解させる工程、
（c）標的核酸分子を少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる工程、
（d）ハイブリダイズした該標的核酸分子を支持体上に捕捉する工程
を含む試料調製方法であって、
変性および溶解工程（b）が約10分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約25分未満で完了し、標的核酸分子の10コピー以上が約1時間未満で単離される、
方法。
【請求項２５】
標的核酸分子が、捕集媒体中に約1pg/mL未満、約0.75pg/mL未満、約0.5pg/mL未満、約0.25pg/mL未満、または約0.2pg/mL未満の濃度で存在する、請求項1記載の方法。
【請求項２６】
標的核酸が、捕集媒体中に10,000コピー/mL以下、1,000コピー/mL以下、100コピー/mL以下、または10コピー/mL以下の濃度で存在する、請求項1記載の方法。
【請求項２７】
（a）標的核酸を10,000コピー/mL以下の濃度で含む生物学的試料を提供する工程、
（b）該生物学的試料中の標的核酸分子を変性させる工程、
（c）少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブと該標的核酸分子とを接触させることによって二本鎖核酸ハイブリッドを形成する工程、
（d）該二本鎖核酸ハイブリッドを支持体上に捕捉することによって二本鎖核酸ハイブリッド−支持体複合体を形成する工程、および
（e）該二本鎖核酸ハイブリッド−支持体複合体を単離する工程
を含む試料調製方法。
【請求項２８】
（f）支持体上に捕捉されたハイブリダイズした標的核酸分子を生物学的試料から分離する工程であって、それにより標的核酸を単離する、工程
をさらに含む、請求項1、13、および24のいずれか一項記載の方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２８
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２８】
[本発明1001]
（a）生物学的試料を約1mL以上の捕集媒体中に懸濁する工程、
（b）懸濁した該生物学的試料に変性剤および溶解バッファーを加えることによって該生物学的試料を変性および溶解させる工程、
（c）標的核酸分子を少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる工程、
（d）ハイブリダイズした該標的核酸分子を支持体上に捕捉する工程
を含む大量試料調製方法であって、
変性および溶解工程（b）が約10分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約25分未満で完了し、標的核酸分子の10コピー以上が約1時間未満で単離される、
方法。
[本発明1002]
標的核酸分子の10コピー以上が約30分未満で単離される、本発明1001の方法。
[本発明1003]
標的核酸分子の10コピー以上が約15分未満で単離される、本発明1002の方法。
[本発明1004]
変性および溶解工程（b）が約7.5分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約22.5分未満で完了する、本発明1001の方法。
[本発明1005]
変性および溶解工程（b）が約5分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約15分未満で完了する、本発明1004の方法。
[本発明1006]
捕集媒体が、0.5％〜約2.0％のNP-40、約0.10％〜約0.40％のデオキシコール酸ナトリウム、約25mM〜約75mMのTris-HCl、約10mM〜約50mMのEDTA、約50mM〜約200mMのNaCl、および約0.01％〜約0.10％のアジ化ナトリウムを含む、本発明1001の方法。
[本発明1007]
捕集媒体が、PRESERVCYT、STM、およびSUREPATHからなる群より選択される、本発明1001の方法。
[本発明1008]
（e）捕捉されたハイブリッド−支持体を洗浄バッファーで洗浄する工程
をさらに含む、本発明1001の方法。
[本発明1009]
方法工程（a）〜（e）が約20分〜約40分で完了する、本発明1008の方法。
[本発明1010]
遠心分離工程を含まない、本発明1001の方法。
[本発明1011]
洗浄工程（e）まで、標的核酸分子が細胞生物学的材料の残りから分離されない、本発明1008の方法。
[本発明1012]
生物学的試料が子宮頸部細胞である、本発明1001の方法。
[本発明1013]
（a）生物学的試料を約1.0mL以上の捕集媒体中に懸濁するか、または尿、血液、もしくは血清中の生物学的試料を得る工程、
（b）該生物学的試料中の標的核酸分子を変性させる工程、
（c）少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブと該標的核酸分子とを接触させることによって二本鎖核酸ハイブリッドを形成する工程、
（d）該二本鎖核酸ハイブリッドを支持体上に捕捉することによって二本鎖核酸ハイブリッド−支持体複合体を形成する工程
を含む、試料大容量中の標的核酸分子の存在を検出するための方法であって、
標的核酸分子の10コピー以上が約30分〜約3時間で同定可能である、
方法。
[本発明1014]
（e）捕捉されたハイブリッド−支持体複合体によるペレットの形成を許容し、かつ捕捉された該ハイブリッド−支持体を洗浄バッファーで洗浄する工程
をさらに含む、本発明1013の方法。
[本発明1015]
捕集媒体が、0.5％〜約2.0％のNP-40、約0.10％〜約0.40％のデオキシコール酸ナトリウム、約25mM〜約75mMのTris-HCl、約10mM〜約50mMのEDTA、約50mM〜約200mMのNaCl、および約0.01％〜約0.10％のアジ化ナトリウムを含む、本発明1013の方法。
[本発明1016]
捕集媒体が、PRESERVCYT、STM、およびSUREPATHからなる群より選択される、本発明1013の方法。
[本発明1017]
変性工程が約30分未満で完了する、本発明1013の方法。
[本発明1018]
ハイブリッド−捕捉工程が約30分未満で完了する、本発明1013の方法。
[本発明1019]
変性工程が約10分未満で完了する、本発明1017の方法。
[本発明1020]
ハイブリッド−捕捉工程が約25分未満で完了する、本発明1018の方法。
[本発明1021]
遠心分離工程を含まない、本発明1013の方法。
[本発明1022]
標的核酸分子がクラミジア・トラコマチス（C. trachomatis）由来である、本発明1013の方法。
[本発明1023]
標的核酸分子が淋菌（N. gonorrhoeae）由来である、本発明1013の方法。
[本発明1024]
（a）生物学的試料を約100μl以上の捕集媒体中に懸濁する工程、
（b）懸濁した該生物学的試料に変性剤および溶解バッファーを加えることによって該生物学的試料を変性および溶解させる工程、
（c）標的核酸分子を少なくとも一つのポリヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる工程、
（d）ハイブリダイズした該標的核酸分子を支持体上に捕捉する工程
を含む試料調製方法であって、
変性および溶解工程（b）が約10分未満で完了し、ハイブリダイズ工程（c）と捕捉工程（d）との組み合わせが約25分未満で完了し、標的核酸分子の10コピー以上が約1時間未満で単離される、
方法。
これらの局面およびさらなる局面を以下の開示の詳細な説明において説明する。