【手続補正書】
【提出日】平成25年6月21日(2013.6.21)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織における腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
配列番号2のヌクレオチド1〜413および配列番号3のヌクレオチド1〜413中の連続した5〜30ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドの逆相補物に少なくとも50%の配列同一性を有する長さ5〜30ヌクレオチドの少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項２】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織における腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの天然アンチセンスの逆相補物に少なくとも50%の配列同一性を有する長さ5〜30ヌクレオチドの少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項３】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織における腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドに対するアンチセンスオリゴヌクレオチドに少なくとも50%の配列同一性を有する少なくとも1つの長さ5〜30ヌクレオチドのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項４】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織における腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの天然アンチセンスオリゴヌクレオチドの領域を標的にする少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項５】
腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの機能および/または発現が対照と比較してin vivoまたはin vitroで増大する、請求項4に記載の組成物。
【請求項６】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドが腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの天然アンチセンス配列を標的にする、請求項4に記載の組成物。
【請求項７】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドが腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのコードおよび/または非コード核酸配列を含む核酸配列を標的にする、請求項4に記載の組成物。
【請求項８】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドが腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのオーバーラップおよび/または非オーバーラップ配列を標的にする、請求項4に記載の組成物。
【請求項９】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾された糖部分、少なくとも1つの修飾されたヌクレオシド間結合、少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドおよびそれらの組み合わせから選択される1つまたは複数の修飾を含む、請求項4に記載の組成物。
【請求項１０】
1つまたは複数の修飾が2'-O-メトキシエチル修飾糖部分、2'-メトキシ修飾糖部分、2'-O-アルキル修飾糖部分、二環性糖部分およびそれらの組み合わせから選択される少なくとも1つの修飾された糖部分を含む、請求項9に記載の組成物。
【請求項１１】
1つまたは複数の修飾がホスホロチオエート、2'-O-メトキシエチル(MOE)、2'-フルオロ、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホラミデート、カルバミン酸、炭酸、リン酸トリエステル、アセトアミデート、カルボキシメチルエステルおよびそれらの組み合わせから選択される少なくとも1つの修飾されたヌクレオシド間結合を含む、請求項9に記載の組成物。
【請求項１２】
1つまたは複数の修飾が、ペプチド核酸(PNA)、ロックド核酸(LNA)、アラビノ核酸(FANA)、それらの類似体、誘導体および組み合わせから選択される少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドを含む、請求項9に記載の組成物。
【請求項１３】
少なくとも1つのオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの配列番号4〜10に記載のオリゴヌクレオチド配列を含む、請求項1に記載の組成物。
【請求項１４】
in vivoまたはin vitroで哺乳動物の細胞または組織における腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)の機能および/または発現を調節するための組成物であって、
腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンス核酸分子の少なくとも5個の連続する核酸の相補配列に少なくとも50%の配列同一性を有する、腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのアンチセンスポリヌクレオチドに特異的な、長さ5〜30ヌクレオチドの少なくとも1つの低分子干渉RNA(siRNA)オリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１５】
前記オリゴヌクレオチドが、腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンス核酸分子に相補的である少なくとも5個の連続する核酸の配列に少なくとも80%の配列同一性を有する、請求項14に記載の組成物。
【請求項１６】
in vivoまたはin vitroで哺乳動物の細胞または組織における腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)の機能および/または発現を調節するための組成物であって、
配列番号1〜3に記載の少なくとも1つの核酸配列に少なくとも50%の配列同一性を有する、腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのセンスおよび/または天然アンチセンス鎖の非コードおよび/またはコード配列に特異的な、長さ5〜30ヌクレオチドの少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１７】
少なくとも1つの修飾を含む合成修飾オリゴヌクレオチドであって、少なくとも1つの修飾が、少なくとも1つの修飾された糖部分、少なくとも1つの修飾されたヌクレオチド間結合、少なくとも1つの修飾されたヌクレオチド、およびそれらの組み合わせから選択され、腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)遺伝子にハイブリダイズし、かつ正常対照と比較してin vivoまたはin vitroで腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)遺伝子の機能および/または発現を調節するアンチセンス化合物であるオリゴヌクレオチド。
【請求項１８】
少なくとも1つの修飾が、ホスホロチオエート、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホラミデート、カルバミン酸、炭酸、リン酸トリエステル、アセトアミデート、カルボキシメチルエステルおよびそれらの組み合わせからなる群から選択されるヌクレオチド間結合を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１９】
少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２０】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合の骨格を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２１】
ペプチド核酸、ロックド核酸(LNA)、類似体、誘導体、およびそれらの組み合わせから選択される少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドを含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２２】
ホスホロチオエート、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホラミデート、カルバミン酸、炭酸、リン酸トリエステル、アセトアミデート、カルボキシメチルエステル、およびそれらの組み合わせから選択される修飾されたヌクレオチドを含む複数の修飾を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２３】
ペプチド核酸、ロックド核酸(LNA)、類似体、誘導体、およびそれらの組み合わせから選択される修飾されたヌクレオチドを含む複数の修飾を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２４】
2'-O-メトキシエチル修飾糖部分、2'-メトキシ修飾糖部分、2'-O-アルキル修飾糖部分、二環性糖部分、およびそれらの組み合わせから選択される少なくとも1つの修飾された糖部分を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２５】
2'-O-メトキシエチル修飾糖部分、2'-メトキシ修飾糖部分、2'-O-アルキル修飾糖部分、二環性糖部分、およびそれらの組み合わせから選択される修飾された糖部分を含む複数の修飾を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２６】
長さ少なくとも5〜30ヌクレオチドのオリゴヌクレオチドであり、腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのアンチセンス鎖および/またはセンス鎖にハイブリダイズし、腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンスのコードおよび/または非コード核酸配列の少なくとも5個の連続する核酸の相補配列に少なくとも20%の配列同一性を有する、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２７】
腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンスのコードおよび/または非コード核酸配列の少なくとも5個の連続する核酸の相補配列に少なくとも80%配列同一である、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２８】
少なくとも1つの腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドにハイブリダイズし、かつ正常対照と比較してin vivoまたはin vitroで少なくとも1つの腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの発現および/または機能を調節する、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２９】
配列番号4〜10に記載の配列を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３０】
アンチセンス配列、相補配列、対立遺伝子、相同体、アイソフォーム、変種、誘導体、変異体、断片またはそれらの組み合わせを含む、1つまたは複数の腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドに特異的な1つまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項３１】
オリゴヌクレオチドが、配列番号4〜10に記載のヌクレオチド配列のいずれか1つと比較して少なくとも40%の配列同一性を有する、請求項30に記載の組成物。
【請求項３２】
オリゴヌクレオチドが、配列番号4〜10に記載のヌクレオチド配列を含む、請求項30に記載の組成物。
【請求項３３】
配列番号4〜10に記載のオリゴヌクレオチドが、1つまたは複数の修飾または置換を含む、請求項32に記載の組成物。
【請求項３４】
1つまたは複数の修飾が、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ペプチド核酸、ロックド核酸(LNA)分子およびそれらの組み合わせから選択される、請求項33に記載の組成物。
【請求項３５】
少なくとも1つの腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドおよび/または少なくとも1つのそのコード産物に関連する疾患を予防するまたは治療するための組成物であって、
前記少なくとも1つの腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの天然アンチセンス配列に結合し、かつ前記少なくとも1つの腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドの発現を調節する少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドの治療有効量を含む組成物。
【請求項３６】
少なくとも1つの腫瘍壊死因子受容体2(TNFR2)ポリヌクレオチドに関連する疾患が、癌、細胞増殖に関連する、または細胞増殖を特徴とする疾患または状態、TNFRSF1B/TNFR2の突然変異体または異常な発現または機能に関連する疾患または障害、神経疾患または障害、自己免疫疾患または障害、免疫系に関連する疾患または障害、炎症性腸疾患、多遺伝子性の感受性を伴う慢性的な炎症性の状態(クローン病、潰瘍性大腸炎を含む)、過剰なサイトカイン活性に関連する疾患または障害、悪液質、肝疾患、腎疾患(糸球体腎炎、急性腎臓移植片拒絶、急性尿細管壊死を含む)、循環器の疾患または障害、虚血介在性の動脈形成および血管形成、酸化ストレス、炎症、脳マラリア、炎症に関連する疾患、障害または状態(関節リウマチ、乾癬および乾癬性関節炎、クローン病、潰瘍性大腸炎、慢性炎症誘導性の結腸上皮変質を含む)から選択される、請求項35に記載の組成物。
【請求項３７】
In vivo投与のために少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを同定および選択する方法であって、病態に関連する標的ポリヌクレオチドを選択するステップ;選択された標的ポリヌクレオチドまたは選択された標的ポリヌクレオチドにアンチセンスであるポリヌクレオチドに相補的である少なくとも5個の連続するヌクレオチドを含む少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを同定するステップ;ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下における、アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的ポリヌクレオチドまたは選択された標的ポリヌクレオチドにアンチセンスであるポリヌクレオチドのハイブリッドの熱的融点を測定するステップ;ならびに得られた情報に基づいてin vivo投与のための少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを選択するステップ
を含む方法。