【手続補正書】
【提出日】平成25年3月26日(2013.3.26)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、
（ａ）ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７、２、４、８、９、１４、１６、１８、２２、２５、２６、３０、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４１、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５３、６５、６６、７６、７９、８４、１０１、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、１１７、１１８、１２１、１２２、１２３、および１２４；ならびに
（ｂ）１個、２個、または数個のアミノ酸が置換、欠失、または付加されている、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７、２、４、８、９、１４、１６、１８、２２、２５、２６、３０、３３、３４、３５、３６、３８、３９、４１、４３、４４、４５、４７、４８、４９、５３、６５、６６、７６、７９、８４、１０１、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、１１７、１１８、１２１、１２２、１２３、および１２４
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたペプチド。
【請求項２】
以下の特徴の一方または両方を有する、請求項１記載の単離されたペプチド：
（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、もしくはトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、または該アミノ酸であるように改変されている、および
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、もしくはメチオニンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、または該アミノ酸であるように改変されている。
【請求項３】
ＨＬＡ−Ａ２との関連において、以下からなる群より選択される少なくとも１つの置換を有する、請求項１記載の単離されたペプチド：
（ａ）Ｎ末端から２番目のアミノ酸が、ロイシンおよびメチオニンからなる群より選択される；ならびに
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、バリンおよびロイシンからなる群より選択される。
【請求項４】
ノナペプチドまたはデカペプチドである、請求項１〜３のいずれか一項記載の単離されたペプチド。
【請求項５】
請求項１〜４のいずれか一項記載の単離されたペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
【請求項６】
ＣＴＬを誘導するための組成物であって、請求項１〜４のいずれか一項記載の１種類もしくは複数種のペプチド、または請求項５記載の１種類もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、組成物。
【請求項７】
がんの治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防のための薬学的組成物であって、請求項１〜４のいずれか一項記載の１種類もしくは複数種のペプチド、または請求項５記載の１種類もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、薬学的組成物。
【請求項８】
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ２４またはＨＬＡ−Ａ２である対象への投与のために製剤化される、請求項７記載の薬学的組成物。
【請求項９】
以下からなる群より選択される段階を含む、ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）をインビトロで誘導する方法：
（ａ）ＡＰＣを、請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドとインビトロで接触させる段階、および
（ｂ）請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
【請求項１０】
以下からなる群より選択される１つの段階を含む、ＣＴＬをインビトロで誘導する方法：
（ａ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣと共培養する段階、
（ｂ）ＣＤ８陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエキソソームと共培養する段階、および
（ｃ）請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子をＴ細胞に導入する段階。
【請求項１１】
ＨＬＡ抗原と請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する、単離されたＡＰＣ。
【請求項１２】
請求項９記載の方法によって誘導される、請求項１１記載のＡＰＣ。
【請求項１３】
請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチドを標的とする、単離されたＣＴＬ。
【請求項１４】
請求項１０記載の方法によって誘導される、請求項１３記載のＣＴＬ。
【請求項１５】
対象においてがんに対する免疫応答を誘導するための組成物であって、請求項１〜４のいずれか一項記載のペプチド、その免疫学的活性断片、または該ペプチドもしくは該断片をコードするポリヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１６】
以下の段階を含む、がん細胞を検出する方法：
（ａ）以下からなる群より選択される方法により、対象由来の生体試料中の遺伝子の発現レベルを測定する段階：
（ｉ）Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子のｍＲＮＡを検出すること、
（ｉｉ）Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子によってコードされるタンパク質を検出すること、および
（ｉｉｉ）Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子によってコードされるタンパク質の生物活性を検出すること；ならびに
（ｂ）該遺伝子の正常対照レベルと比較して、段階（ａ）で測定された発現レベルが上昇していることが、がん細胞の存在と関連づけられる段階。
【請求項１７】
段階（ａ）で測定された発現レベルが正常対照レベルよりも少なくとも１０％高い、請求項１６記載の方法。
【請求項１８】
がんが、膀胱癌、子宮頸癌、胆管細胞癌、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、食道癌、胃癌、びまん性胃癌、肺癌、リンパ腫、骨肉腫、腎癌、肺腺癌（ＡＤＣ）、肺扁平上皮癌（ＳＣＣ）、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、軟部組織腫瘍、および精巣腫瘍の群より選択される、請求項１６記載の方法。
【請求項１９】
段階（ａ）で測定される発現レベルが、Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子のｍＲＮＡに対するプローブのハイブリダイゼーションを検出することにより測定される、請求項１６記載の方法。
【請求項２０】
段階（ａ）で測定される発現レベルが、Ｃ６ｏｒｆ１６７タンパク質に対する抗体の結合を検出することにより測定される、請求項１６記載の方法。
【請求項２１】
対象由来の生体試料が生検材料、痰、血液、胸水、または尿を含む、請求項１６記載の方法。
【請求項２２】
がんの診断に使用するためのキットであって、以下からなる群より選択される試薬を含む、キット：
（ａ）Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子のｍＲＮＡを検出するための試薬、
（ｂ）Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子によってコードされるタンパク質を検出するための試薬、および
（ｃ）Ｃ６ｏｒｆ１６７遺伝子によってコードされるタンパク質の生物活性を検出するための試薬。
【請求項２３】
請求項１〜４記載のペプチドのいずれかに対する抗体またはその断片。
【請求項２４】
請求項１〜４記載のペプチドのいずれかをコードするヌクレオチド配列を含むベクター。
【請求項２５】
請求項１〜４記載のペプチドのいずれか、請求項５記載のヌクレオチド、または請求項２３記載の抗体を含む診断キット。
【請求項２６】
請求項１〜４のいずれか一項記載の１種もしくは複数種のペプチド、または請求項５記載の１種もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、抗原提示細胞誘導剤。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】００２４
【補正方法】変更
【補正の内容】
【００２４】
[本発明1001]
ＨＬＡ抗原に結合し、かつ細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）誘導能を有する単離されたペプチドであって、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：159またはその免疫学的活性断片からなる、単離されたペプチド。
[本発明1002]
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ24またはＨＬＡ−Ａ2である、本発明1001の単離されたペプチド。
[本発明1003]
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2、4、7、8、9、14、16、18、22、25、26、30、33、34、35、36、38、39、41、43、44、45、47、48、49、53、65、66、76、79、84、101、110、111、112、113、114、117、118、121、122、123、および124からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1001または1002の単離されたペプチド。
[本発明1004]
ノナペプチドまたはデカペプチドである、本発明1001〜1003のいずれかの単離されたペプチド。
[本発明1005]
ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：2、4、7、8、9、14、16、18、22、25、26、30、33、34、35、36、38、39、41、43、44、45、47、48、49、53、65、66、76、79、84、101、110、111、112、113、114、117、118、121、122、123、および124からなる群より選択されるアミノ酸配列からなる単離されたペプチドであって、1個、2個、または数個のアミノ酸が置換、欠失、または付加されている、本発明1004の単離されたペプチド。
[本発明1006]
以下の特徴の一方または両方を有する、本発明1005の単離されたペプチド：
（ａ）Ｎ末端から2番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、もしくはトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、または該アミノ酸であるように改変されている、および
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、もしくはメチオニンからなる群より選択されるアミノ酸であるか、または該アミノ酸であるように改変されている。
[本発明1007]
ＨＬＡ−Ａ2との関連において、以下からなる群より選択される少なくとも1つの置換を有する、本発明1005の単離されたペプチド：
（ａ）Ｎ末端から2番目のアミノ酸が、ロイシンおよびメチオニンからなる群より選択される；ならびに
（ｂ）Ｃ末端のアミノ酸が、バリンおよびロイシンからなる群より選択される。
[本発明1008]
本発明1001〜1007のいずれかの単離されたペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
[本発明1009]
ＣＴＬを誘導するための組成物であって、本発明1001〜1006のいずれかの1種類もしくは複数種のペプチド、または本発明1008の1種類もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、組成物。
[本発明1010]
がんの治療および／もしくは予防、ならびに／または術後のその再発の予防のための薬学的組成物であって、本発明1001〜1006のいずれかの1種類もしくは複数種のペプチド、または本発明1008の1種類もしくは複数種のポリヌクレオチドを含む、薬学的組成物。
[本発明1011]
ＨＬＡ抗原がＨＬＡ−Ａ＊2402またはＨＬＡ−Ａ＊0201である対象への投与のために製剤化される、本発明1010の薬学的組成物。
[本発明1012]
以下からなる群より選択される段階を含む、ＣＴＬ誘導能を有する抗原提示細胞（ＡＰＣ）を誘導する方法：
（ａ）ＡＰＣを、本発明1001〜1007のいずれかのペプチドとインビトロ、エクスビボ、またはインビボで接触させる段階、および
（ｂ）本発明1001〜1007のいずれかのペプチドをコードするポリヌクレオチドをＡＰＣに導入する段階。
[本発明1013]
以下からなる群より選択される1つの段階を含む、ＣＴＬを誘導する方法：
（ａ）ＣＤ8陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明1001〜1007のいずれかのペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するＡＰＣと共培養する段階、
（ｂ）ＣＤ8陽性Ｔ細胞を、ＨＬＡ抗原と本発明1001〜1007のいずれかのペプチドとの複合体を自身の表面上に提示するエキソソームと共培養する段階、および
（ｃ）本発明1001〜1007のいずれかのペプチドに結合するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）サブユニットポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子をＴ細胞に導入する段階。
[本発明1014]
ＨＬＡ抗原と本発明1001〜1007のいずれかのペプチドとの複合体を自身の表面上に提示する、単離されたＡＰＣ。
[本発明1015]
本発明1013の方法によって誘導される、本発明1014のＡＰＣ。
[本発明1016]
本発明1001〜1007のいずれかのペプチドを標的とする、単離されたＣＴＬ。
[本発明1017]
本発明1014の方法によって誘導される、本発明1016のＣＴＬ。
[本発明1018]
本発明1001〜1007のいずれかのペプチド、その免疫学的活性断片、または該ペプチドもしくは該断片をコードするポリヌクレオチドを含む組成物を対象に投与する段階を含む、対象においてがんに対する免疫応答を誘導する方法。
[本発明1019]
以下の段階を含む、がんを診断する方法：
（ａ）以下からなる群より選択される方法により、対象由来の生体試料中の遺伝子の発現レベルを測定する段階：
（ｉ）Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子のｍＲＮＡを検出すること、
（ｉｉ）Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子によってコードされるタンパク質を検出すること、および
（ｉｉｉ）Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子によってコードされるタンパク質の生物活性を検出すること；ならびに
（ｂ）該遺伝子の正常対照レベルと比較して、段階（ａ）で測定された発現レベルが上昇していることが、がんの存在と関連づけられる段階。
[本発明1020]
段階（ａ）で測定された発現レベルが正常対照レベルよりも少なくとも10％高い、本発明1019の方法。
[本発明1021]
がんが、膀胱癌、子宮頸癌、胆管細胞癌、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、食道癌、胃癌、びまん性胃癌、肺癌、リンパ腫、骨肉腫、腎癌、肺腺癌（ＡＤＣ）、肺扁平上皮癌（ＳＣＣ）、小細胞肺癌（ＳＣＬＣ）、非小細胞肺癌（ＮＳＣＬＣ）、軟部組織腫瘍、および精巣腫瘍の群より選択される、本発明1019の方法。
[本発明1022]
段階（ａ）で測定される発現レベルが、Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子のｍＲＮＡに対するプローブのハイブリダイゼーションを検出することにより測定される、本発明1019の方法。
[本発明1023]
段階（ａ）で測定される発現レベルが、Ｃ6ｏｒｆ167タンパク質に対する抗体の結合を検出することにより測定される、本発明1019の方法。
[本発明1024]
対象由来の生体試料が生検材料、痰、血液、胸水、または尿を含む、本発明1019の方法。
[本発明1025]
がんの診断に使用するためのキットであって、以下からなる群より選択される試薬を含む、キット：
（ａ）Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子のｍＲＮＡを検出するための試薬、
（ｂ）Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子によってコードされるタンパク質を検出するための試薬、および
（ｃ）Ｃ6ｏｒｆ167遺伝子によってコードされるタンパク質の生物活性を検出するための試薬。
[本発明1026]
本発明1001〜1007のいずれかのペプチド、その免疫学的活性断片、または該ペプチドもしくは該断片をコードするポリヌクレオチドを含む組成物を対象に投与する段階を含む、対象においてがんに対する免疫応答を誘導する方法。
[本発明1027]
本発明1001〜1007のペプチドのいずれかに対する抗体またはその断片。
[本発明1028]
本発明1001〜1007のペプチドのいずれかをコードするヌクレオチド配列を含むベクター。
[本発明1029]
本発明1001〜1007のペプチドのいずれか、本発明1008のヌクレオチド、または本発明1027の抗体を含む診断キット。
上記に加え、本発明のその他の目的および特徴は、添付の図面および実施例と併せて以下の詳細な説明を読むことによって、より十分に明らかになるであろう。しかしながら、前述の発明の概要および以下の詳細な説明はいずれも例示的な態様であり、本発明または本発明のその他の代替的な態様を限定するものではないことが理解されるべきである。特に、本発明をいくつかの特定の態様を参照して本明細書において説明するが、その説明は本発明を例証するものであり、本発明を限定するものとして構成されていないことが理解されよう。添付の特許請求の範囲によって記載される本発明の精神および範囲から逸脱することなく、当業者は様々な変更および適用に想到することができる。同様に、本発明のその他の目的、特徴、利益、および利点は、本概要および以下に記載する特定の態様から明らかになり、当業者には容易に明白になるであろう。そのような目的、特徴、利益、および利点は、添付の実施例、データ、図面、およびそれらから引き出されるあらゆる妥当な推論と併せて上記から、単独で、または本明細書に組み入れられる参考文献を考慮して、明らかになるであろう。