【手続補正書】
【提出日】平成25年10月15日(2013.10.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象における過敏性腸症候群（ＩＢＳ）の診断を補助する方法であって：
（ａ）試料中に存在するＩＢＳマーカーが前記ＩＢＳマーカーとＩＢＳマーカー結合部分とを含む複合体に転換するのに好適な条件下で、対象からの血液又は血清試料をＩＢＳマーカー結合部分と接触させること；及び
（ｂ）前記複合体のレベルを決定し、これによって試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベル又は濃度を決定すること；
を含む前記方法であり、
ここで、前記ＩＢＳマーカーが、キヌレニン、糖鎖欠損トランスフェリン、ウロコルチン、副腎皮質刺激ホルモン放出ホルモン結合タンパク質、コルチゾール、副腎皮質刺激ホルモン、サブスタンスＰ、神経成長因子、ニューロキニンＡ、ニューロキニンＢ、血管作動性腸管ペプチド、グルカゴン様ペプチド２、モチリン、下垂体アデニル酸シクラーゼ活性化ペプチド、セロトニン、トリプトファン、セロトニン−Ｏ−サルフェート、５−ヒドロキシインドール酢酸、５−ＨＴグルクロニド、チロシン、フェニルアラニン、ＵＤＰ−グルクロノシルトランスフェラーゼ１−６、セロトニン再取り込み輸送体、トリプトファンヒドロキシラーゼ１、モノアミンオキシダーゼＡ、モノアミンオキシダーゼＢ及びヒドロキシトリプタミン（セロトニン）レセプター３Ａ、β−トリプターゼ、ヒスタミン、プロスタグランジンＥ２（ＰＧＥ２）、インターロイキン−１β（ＩＬ−１β）、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、腫瘍壊死因子−α（ＴＮＦ−α）及びこれらの組み合わせからなる群から選択されるものとする、前記方法。
【請求項２】
（ｃ）試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベル又は濃度と対照レベル又は濃度とを比較することを更に含み、ここで、対照レベル又は濃度に対する試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベル又は濃度の差は、前記対象がＩＢＳである可能性の増加を示すものであるものとする、請求項１に記載の前記方法。
【請求項３】
対照レベル又は濃度が、健常対象からの血液又は血清試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベル又は濃度であり、
対照レベル又は濃度に対する試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベル又は濃度の増加が、前記対象がＩＢＳである可能性の増加を示していてもよく、
対照レベル又は濃度に対する試料中に存在するＩＢＳマーカーの同一又は低減したレベル又は濃度が、前記対象がＩＢＳでない可能性の増加を示していてもよい、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
対照レベル又は濃度が、ＩＢＳの対象からの血液又は血清試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベル又は濃度であり、
対照レベル又は濃度に対する試料中に存在するＩＢＳマーカーの同一又は増加したレベル又は濃度が、前記対象がＩＢＳである可能性の増加を示していてもよく、
対照レベル又は濃度に対する試料中に存在するＩＢＳマーカーの低減したレベル又は濃度が、前記対象がＩＢＳでない可能性の増加を示していてもよい、請求項２に記載の方法。
【請求項５】
対象がＩＢＳの疑いがある、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
結合部分が抗体を含み、
酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）であってもよく、
ＥＬＩＳＡがサンドイッチＥＬＩＳＡであってもよい、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
対象からの生物試料中の少なくとも１種の追加のバイオマーカーのレベル又は濃度を決定することを更に含み、前記バイオマーカーが、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、ＴＮＦ関連アポトーシス弱誘導因子（ＴＷＥＡＫ）、成長関連癌遺伝子α（ＧＲＯ−α）、インターロイキン−１β（ＩＬ−１β）、組織メタロプロテアーゼ阻害因子１（ＴＩＭＰ−１）、抗Saccharomyces cerevisiae抗体（ＡＳＣＡ−ＩｇＡ）、抗ＣＢｉｒ−１抗体（ＣＢｉｒ１）、抗ヒト好中球細胞質抗体（ＡＮＣＡ）、抗ヒト組織トランスグルタミナーゼＩｇＡ（ｔＴＧ）、ヒスタミン、β−トリプターゼ、プロスタグランジンＥ２（ＰＧＥ２）及びこれらの組合せからなる群から選択されるものとする、請求項１〜６のいずれか一項に記載の前記方法。
【請求項８】
（ｄ）対象における少なくとも１種の症状の存在又は重症度を同定することによって、前記対象についての症状プロファイルを決定すること；及び
（ｅ）ＩＢＳバイオマーカーのレベル及び症状プロファイルに基づくアルゴリズムを使用して、対象がＩＢＳであること又はＩＢＳでないことを診断すること；
を更に含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１種の症状が、胸痛、胸部不快感、胸焼け、普通量の食事後の不快な膨満感、普通量の食事の完食不能、腹痛、腹部不快感、便秘、下痢、鼓脹、腹部膨満、疼痛又は不快感を有することに伴う消極的な思考又は感情及びこれらの組合せからなる群から選択され、
前記少なくとも１種の症状の存在又は重症度が、質問票を使用して同定されてもよい、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
ＩＢＳバイオマーカーのレベルに基づくアルゴリズムを使用することを含み、
アルゴリズムがシステムプロファイルに更に基づいていてもよく、
前記統計的アルゴリズムが学習統計的分類子システムを含んでいてもよく、
前記統計的アルゴリズムが、少なくとも２種の学習統計的分類子システムの組合せを含んでいてもよく、
少なくとも２種の学習統計的分類子システムの組合せが、ランダムフォレスト分類子及びニューラルネットワーク分類子を含んでいてもよい、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
対象がＩＢＳである確率を提供することを更に含むか、
ＩＢＳ便秘型（ＩＢＳ−Ｃ）、ＩＢＳ下痢型（ＩＢＳ−Ｄ）、ＩＢＳ混合型（ＩＢＳ−Ｍ）、ＩＢＳ交替型（ＩＢＳ−Ａ）又は感染後ＩＢＳ（ＩＢＳ−ＰＩ）として、ＩＢＳの診断を分類することを更に含み、
ＩＢＳでない対象をＩＢＤである、ＩＢＤでない、又は健常対象であるとして診断することを更に含んでいてもよい、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
（ｃ）試料中に存在するＩＢＳマーカーが前記ＩＢＳマーカーとＩＢＳマーカー結合部分とを含む複合体に転換するのに好適な条件下において、２回目に対象から採取された第２の血液又は血清試料を、ＩＢＳマーカー結合部分と接触させること；
（ｄ）前記複合体のレベルを決定し、これによって第２の試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベルを決定すること；及び
（ｅ）第１の試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベルと第２の試料中に存在するＩＢＳマーカーのレベルとを比較すること；
を含み、
ここで、第２の試料中のＩＢＳマーカーのレベルが第１の試料と比べて高ければ、対象におけるＩＢＳの進行を示し、第２の試料中のＩＢＳマーカーのレベルが第１の試料に比べて低ければ、対象におけるＩＢＳの後退を示すものである、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
１種以上のプロセッサを制御して対象からの血液又は血清試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）と関連するか否かを分類するコードを含むコンピュータ読取可能媒体であって、
診断マーカープロファイルを含むデータセットに統計処理を適用して、前記診断マーカープロファイルに基づき前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する統計的に導出される判定を生成するための指示を前記コードが含み、
ここで、前記診断マーカープロファイルは、キヌレニン、糖鎖欠損トランスフェリン、ウロコルチン、副腎皮質刺激ホルモン放出ホルモン結合タンパク質、コルチゾール、副腎皮質刺激ホルモン、サブスタンスＰ、神経成長因子、ニューロキニンＡ、ニューロキニンＢ、血管作動性腸管ペプチド、グルカゴン様ペプチド２、モチリン、下垂体アデニル酸シクラーゼ活性化ペプチド、セロトニン、トリプトファン、セロトニン−Ｏ−サルフェート、５−ヒドロキシインドール酢酸、５−ＨＴグルクロニド、チロシン、フェニルアラニン、ＵＤＰ−グルクロノシルトランスフェラーゼ１−６、セロトニン再取り込み輸送体、トリプトファンヒドロキシラーゼ１、モノアミンオキシダーゼＡ、モノアミンオキシダーゼＢ及びヒドロキシトリプタミン（セロトニン）レセプター３Ａ、β−トリプターゼ、ヒスタミン、プロスタグランジンＥ２（ＰＧＥ２）、インターロイキン−１β（ＩＬ−１β）、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、腫瘍壊死因子−α（ＴＮＦ−α）及びこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１種の診断ＩＢＳマーカーのレベルを示すものとする、前記コンピュータ読取可能媒体。
【請求項１４】
対象からの血清又は血液試料が過敏性腸症候群（ＩＢＳ）と関連するか否かを分類するシステムであって：
（ａ）診断マーカープロファイルを含むデータセットを生成するように構成されたデータ収集モジュールであって、ここで、前記診断マーカープロファイルは、キヌレニン、糖鎖欠損トランスフェリン、ウロコルチン、副腎皮質刺激ホルモン放出ホルモン結合タンパク質、コルチゾール、副腎皮質刺激ホルモン、サブスタンスＰ、神経成長因子、ニューロキニンＡ、ニューロキニンＢ、血管作動性腸管ペプチド、グルカゴン様ペプチド２、モチリン、下垂体アデニル酸シクラーゼ活性化ペプチド、セロトニン、トリプトファン、セロトニン−Ｏ−サルフェート、５−ヒドロキシインドール酢酸、５−ＨＴグルクロニド、チロシン、フェニルアラニン、ＵＤＰ−グルクロノシルトランスフェラーゼ１−６、セロトニン再取り込み輸送体、トリプトファンヒドロキシラーゼ１、モノアミンオキシダーゼＡ、モノアミンオキシダーゼＢ及びヒドロキシトリプタミン（セロトニン）レセプター３Ａ、β−トリプターゼ、ヒスタミン、プロスタグランジンＥ２（ＰＧＥ２）、インターロイキン−１β（ＩＬ−１β）、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン（ＮＧＡＬ）、腫瘍壊死因子−α（ＴＮＦ−α）及びこれらの組み合わせからなる群から選択される少なくとも１種の診断ＩＢＳマーカーの存在又はレベルを示すものとする、前記データ収集モジュールと；
（ｂ）統計処理をデータセットに適用することによってデータセットを処理して、前記診断マーカープロファイルに基づき前記試料をＩＢＳ試料又は非ＩＢＳ試料として分類する統計的に導出される判定を生成するように構成されたデータ処理モジュールと；
（ｃ）統計的に導出される判定を表示するように構成されたディスプレイモジュールと；
を含む、前記システム。