【手続補正書】
【提出日】平成25年1月17日(2013.1.17)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
アミノ酸残基１２２の置換を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、対象からの生体試料を調査することを含み、
前記対象は、前記試料が、前記少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していることが示される、方法。
【請求項２】
アミノ酸残基２および６６のうちの少なくとも１つの置換を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記試料は、アミノ酸残基２、６６、および１２２のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していることが示される、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの１つまたはそれ以上の欠失を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１〜３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
前記試料は、アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの少なくとも１つの欠失を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していることが示される、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
低シアル酸結合を有する疑いがあるバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１〜５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
前記試料は、アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していることが示される、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
前記生体試料は、血液試料である、請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記生体試料は、ＣＳＦ試料である、請求項１〜９のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記生体試料は、尿試料である、請求項１〜１０のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記対象は、野生型ＪＣＶに以前に感染したことがあることが知られている、請求項１〜１１のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記対象からの新しい生体試料が、毎年少なくとも２回、少なくとも１つのバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について調査される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候の検出は、前記対象が免疫抑制治療に不適当であることを示す、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
【請求項１５】
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候の検出は、前記対象が免疫抑制治療の修正に適していることを示す、請求項１〜１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の兆候の不在は、前記対象が免疫抑制治療に適していることを示す、請求項１〜１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の兆候の不在は、前記対象が継続して行う免疫抑制治療に適していることを示す、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質に対して特異的な抗体の存在について調査される、請求項１〜１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の存在について調査される、請求項１〜１８のいずれかに記載の方法。
【請求項２０】
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の存在について調査される、請求項１〜１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２１】
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質をコードする核酸配列の存在について調査される、請求項１〜２０のいずれかに記載の方法。
【請求項２２】
前記生体試料は、ＥＬＩＳＡに基づく分析を用いて調査される、請求項１９または２０に記載の方法。
【請求項２３】
対象からの生体試料を調査するためのキットであって、アミノ酸残基２、６６、および１２２のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを行うための手段を含む、キット。
【請求項２４】
対象からの生体試料を調査するためのキットであって、アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの少なくとも１つの欠失を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを行うための手段を含む、キット。
【請求項２５】
対象からの生体試料を調査するためのキットであって、アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを行うための手段を含む、キット。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０１５６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０１５６】
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
アミノ酸残基１２２の置換を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、対象からの生体試料を調査することを含み、
前記対象は、前記試料が、前記少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、方法。
（項目２）
アミノ酸残基２および６６のうちの少なくとも１つの置換を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記試料は、アミノ酸残基２、６６、および１２２のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、項目２に記載の方法。
（項目４）
アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの１つまたはそれ以上の欠失を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、項目１〜３のいずれかに記載の方法。
（項目５）
前記試料は、アミノ酸断片５０〜５１、５４〜５５、および１２３〜１２５のうちの少なくとも１つの欠失を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、項目４に記載の方法。
（項目６）
低シアル酸結合を有する疑いがあるバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、項目１〜５のいずれかに記載の方法。
（項目７）
アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を含むバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について、前記生体試料を調査することをさらに含む、項目１〜６のいずれかに記載の方法。
（項目８）
前記試料は、アミノ酸残基５５、６０、２６５、２６７、および２６９のうちの少なくとも１つの置換を有するバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のそれぞれの、少なくとも１つの兆候を検出することが可能なアッセイを用いて調査され、前記対象は、前記試料が、前記バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質のうちの少なくとも１つの少なくとも１つの兆候を含む場合、ＰＭＬに対する感受性が増加していると判定される、項目７に記載の方法。
（項目９）
前記生体試料は、血液試料である、項目１〜８のいずれかに記載の方法。
（項目１０）
前記生体試料は、ＣＳＦ試料である、項目１〜９のいずれかに記載の方法。
（項目１１）
前記生体試料は、尿試料である、項目１〜１０のいずれかに記載の方法。
（項目１２）
前記対象は、野生型ＪＣＶに以前に感染したことがあることが知られている、項目１〜１１のいずれかに記載の方法。
（項目１３）
前記対象からの新しい生体試料が、毎年少なくとも２回、少なくとも１つのバリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候について調査される、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候の検出を用いて、前記対象が免疫抑制治療に不適当であることを特定する、項目１〜１３のいずれかに記載の方法。
（項目１５）
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の少なくとも１つの兆候の検出を用いて、前記対象に対する免疫抑制治療の修正を勧告する、項目１〜１４のいずれかに記載の方法。
（項目１６）
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の兆候の不在を用いて、前記対象が免疫抑制治療に適していることを特定する、項目１〜１５のいずれかに記載の方法。
（項目１７）
バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の兆候の不在を用いて、前記対象が継続して行う免疫抑制治療に適していることを特定する、項目１〜１６のいずれかに記載の方法。
（項目１８）
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質に対して特異的な抗体の存在について調査される、項目１〜１７のいずれかに記載の方法。
（項目１９）
生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の存在について調査される、項目１〜１８のいずれかに記載の方法。
（項目２０）
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質の存在について調査される、項目１〜１９のいずれかに記載の方法。
（項目２１）
前記生体試料は、バリアントＪＣＶ  ＶＰ１カプシドタンパク質をコードする核酸配列の存在について調査される、項目１〜２０のいずれかに記載の方法。
（項目２２）
前記生体試料は、ＥＬＩＳＡに基づく分析を用いて調査される、項目１９または２０に記載の方法。
本発明の限定のそれぞれは、本発明の様々な実施形態を包含することができる。したがって、いずれか１つの構成要素または構成要素の組み合わせを含む本発明の限定のそれぞれは、本発明のそれぞれの態様に含まれ得ることが見込まれる。本発明は、本発明の適用において、以下の説明に記載し、または図面に示す構成要素の構造の詳細および配置に限定されるものではない。本発明は、他の実施形態、および様々な方法で実践する、または実行することが可能である。また、本明細書において使用される表現および用語は、説明の目的のためのものであり、限定と見なされるべきではない。「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」、または「伴う（ｉｎｖｏｌｖｉｎｇ）」、および本明細書におけるそれらの変形の使用は、その後に列記された項目、ならびに追加の項目を包含することを意味する。