【手続補正書】
【提出日】平成21年4月3日(2009.4.3)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
細胞増殖を阻害する活性を有する化合物の同定方法であって、下記の群より選ばれるＤＮＡによりコードされる蛋白質とある化合物（被検化合物）とを接触させ、該蛋白質の脱リン酸化活性を検出し得るシグナルおよび／またはマーカーを使用する系を用い、このシグナルおよび／またはマーカーの存在または不存在または変化を検出することにより、被検化合物が該蛋白質の脱リン酸化活性を阻害するか否かを決定する工程を含む同定方法：
（１）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
（２）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、
（３）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および
（４）上記（１）から（３）のいずれかのＤＮＡを含むＤＮＡ。
【請求項２】
蛋白質の脱リン酸化活性を検出し得るシグナルおよび／またはマーカーを使用する系が、該蛋白質による下記の群より選ばれるいずれか１の化合物の脱リン酸化を検出し得るシグナルおよび／またはマーカーを使用する系である請求項１に記載の同定方法：
（１）ｐ−ニトロフェニルリン酸
（２）ＣＳＥ１Ｌ（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ  ｇｅｎｅ  １−ｌｉｋｅ）、
（３）カゼイン
（４）リン酸化ペプチドＲＲＡ−ｐＴ−ＶＡ（配列表の配列番号２１）
（５）リン酸化ペプチドＲＲＰ−ｐＴ−ＶＡ（配列表の配列番号２２）
【請求項３】
蛋白質の脱リン酸化活性を阻害することが明らかになった被検化合物が、細胞増殖を阻害する否かを測定する工程をさらに含む、請求項１に記載の同定方法。
【請求項４】
細胞増殖を阻害する活性を有する化合物の同定方法であって、下記の群より選ばれるＤＮＡによりコードされる蛋白質とある化合物（被検化合物）とを接触させ、該蛋白質とＣＳＥ１Ｌ（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ  ｇｅｎｅ  １−ｌｉｋｅ）との結合を検出するシグナルおよび／またはマーカーを使用する系を用い、このシグナルおよび／またはマーカーの存在または不存在または変化を検出することにより、被検化合物が該蛋白質とＣＳＥ１Ｌとの結合を阻害するか否かを決定する工程を含む同定方法：
（１）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
（２）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、
（３）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および
（４）上記（１）から（３）のいずれかのＤＮＡを含むＤＮＡ。
【請求項５】
蛋白質とＣＳＥ１Ｌとの結合を阻害することが明らかになった被検化合物が、細胞増殖を阻害する否かを測定する工程をさらに含む、請求項４に記載の同定方法。
【請求項６】
下記の群より選ばれるＤＮＡによりコードされる蛋白質によるＣＳＥ１Ｌ（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ  ｇｅｎｅ  １−ｌｉｋｅ）の脱リン酸化を阻害する活性を有する化合物の同定方法であって、該蛋白質および／またはＣＳＥ１Ｌとある化合物（被検化合物）とを接触させ、該蛋白質によるＣＳＥ１Ｌの脱リン酸化を検出するシグナルおよび／またはマーカーを使用する系を用い、このシグナルおよび／またはマーカーの存在または不存在または変化を検出することにより、被検化合物が該蛋白質によるＣＳＥ１Ｌの脱リン酸化を阻害するか否かを決定する工程を含む同定方法：
（１）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
（２）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、
（３）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および
（４）上記（１）から（３）のいずれかのＤＮＡを含むＤＮＡ。
【請求項７】
下記の群より選ばれるＤＮＡによりコードされる蛋白質とＣＳＥ１Ｌ（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ  ｇｅｎｅ  １−ｌｉｋｅ）の結合を阻害する活性を有する化合物の同定方法であって、該蛋白質および／またはＣＳＥ１Ｌとある化合物（被検化合物）とを接触させ、該蛋白質とＣＳＥ１Ｌの結合を検出するシグナルおよび／またはマーカーを使用する系を用い、このシグナルおよび／またはマーカーの存在または不存在または変化を検出することにより、被検化合物が該蛋白質とＣＳＥ１Ｌの結合を阻害するか否かを決定する工程を含む同定方法：
（１）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
（２）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、
（３）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および
（４）上記（１）から（３）のいずれかのＤＮＡを含むＤＮＡ。
【請求項８】
被験組織が腫瘍組織由来であるか否かを判定する方法であって、下記の群より選ばれるＤＮＡの被験組織における発現量を測定することを特徴とする判定方法：
（１）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
（２）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、
（３）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および
（４）上記（１）から（３）のいずれかのＤＮＡを含むＤＮＡ。
【請求項９】
被験組織が大腸腫瘍由来であるか否かを判定する請求項８に記載の判定方法。
【請求項１０】
被験組織が前立腺腫瘍組織由来であるか否かを判定する請求項８に記載の判定方法。
【請求項１１】
下記工程を含む請求項８に記載の判定方法：
（１）被験組織から核酸を調製する工程、
（２）前記（１）で調製した核酸から、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）により、（ｉ）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、（ｉｉ）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および（ｉｉｉ）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡより選ばれるいずれか１のＤＮＡおよび／またはそのＤＮＡ断片を増幅する工程、および
（３）前記（２）で増幅したＤＮＡおよび／またはＤＮＡ断片の量を測定する工程。
【請求項１２】
ＰＣＲが、配列表の配列番号３に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドおよび配列表の配列番号４に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチドの組み合わせをプライマーとして用いるＰＣＲである、請求項１１に記載の判定方法。
【請求項１３】
配列表の配列番号３および配列番号４からなる群より選ばれるいずれか１に記載の塩基配列で表されるオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
請求項１３に記載のオリゴヌクレオチドを含有してなる試薬キット。
【請求項１５】
腫瘍組織判定用試薬キットである請求項１４に記載の試薬キット。
【請求項１６】
下記Ａ群より選ばれるいずれか１と、下記Ｂ群より選ばれるいずれか１とを有してなる試薬キット：
ここで、Ａ群は、
（１）次の群より選ばれるＤＮＡ：（ｉ）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡ、（ｉｉ）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡと少なくとも９０％以上の相同性を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、（ｉｉｉ）配列表の配列番号１に記載の塩基配列からなるＤＮＡの塩基配列において１ないし数個のヌクレオチドの変異または誘発変異を有し、且つ脱リン酸化活性を示す蛋白質をコードするＤＮＡ、および（ｉｖ）上記（ｉ）から（ｉｉｉ）のいずれかのＤＮＡを含むＤＮＡ、
（２）上記（１）のＤＮＡによりコードされる蛋白質、
（３）上記（１）のＤＮＡを含有する組み換えベクター、および
（４）上記組み換えベクターを含有する形質転換体、からなり、
Ｂ群は、
ＣＳＥ１Ｌ（ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ  ｓｅｇｒｅｇａｔｉｏｎ  ｇｅｎｅ  １−ｌｉｋｅ）をコードするＤＮＡ、ＣＳＥ１Ｌ、該ＤＮＡを含有する組み換えベクター、および該組み換えベクターを含有する形質転換体からなる。