【手続補正書】
【提出日】平成24年3月30日(2012.3.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価することの指標とするための方法であって、
ａ．前記対象由来のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記サンプル中の前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記対象において癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクの増加を示しているステップと
を含む方法。
【請求項２】
前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが、
ａ）表２、
ｂ）表３、
ｃ）表４、
ｄ）表５、
ｅ）表６、
ｆ）表７、および
ｇ）表２〜７から選択された２つ以上の表
から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが、ＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、ｃｙｃｌｉｎ  Ｄ１およびＳＰＰ１を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記癌に関連する少なくとも１つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
前記癌が前立腺癌であり、前記標準パラメータがグリーソンスコアである、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの前記レベルが、電気泳動、免疫化学的手法または非浸潤性イメージングによって測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記対象が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性前立腺癌を有する、請求項１に記載の方法。
【請求項９】
前記サンプルが、腫瘍生検標本、血液または生物学的液体中の循環腫瘍細胞である、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
４個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現レベルが測定される、請求項１に記載の方法。
【請求項１２】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価することの指標とするための方法であって、
ａ．前記対象由来のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
【請求項１３】
前記基準値が指標値である、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、対象における腫瘍の進行を評価することの指標とするための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記対象由来の第１のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記対象由来の第２のサンプル中の２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップと
を含む方法。
【請求項１５】
前記第１のサンプルは、前記腫瘍の治療前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
前記第２のサンプルは、前記腫瘍の治療後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１７】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、再発性癌または転移性癌の治療の有効性をモニタすることの指標とするための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記対象由来の第１のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記対象由来の第２のサンプル中の、２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量のレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記対象由来の２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。
【請求項１８】
前記対象が、前記癌の治療を事前に受けている、請求項１７に記載の方法。
【請求項１９】
前記第１のサンプルは、前記癌の治療前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２０】
前記第２のサンプルは、前記癌の治療後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２１】
前記第２のサンプルは、前記癌の再発後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２２】
前記第２のサンプルは、前記癌の再発前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項１７に記載の方法。
【請求項２３】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、腫瘍を有すると診断された対象に対する治療レジメンを選択することの指標とするための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記対象由来の第１のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．任意選択で、第２の期間で、前記対象由来の第２のサンプル中の２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、基準値または任意選択でステップ（ｂ）で検出された量と比較するステップと
を含む方法。
【請求項２４】
前記対象が、腫瘍の治療を事前に受けている、請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
前記第１のサンプルは、前記腫瘍を治療する前に前記対象から採取されたサンプルである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２６】
前記第２のサンプルは、前記腫瘍を治療した後に前記対象から採取されたサンプルである、請求項２３に記載の方法。
【請求項２７】
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のマーカーの、マーカーレベルのパターンを含む、転移性前立腺癌基準発現プロファイル。
【請求項２８】
請求項２７に記載のプロファイルを作成するのに十分な、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された対応するＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを検出する複数のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ検出試薬を含むキット。
【請求項２９】
前記検出試薬が、１つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、請求項２８に記載のキット。
【請求項３０】
前記検出試薬が１種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、請求項２８に記載のキット。
【請求項３１】
前記検出試薬が１種または複数のアプタマーを含む、請求項２８に記載のキット。
【請求項３２】
請求項２７に記載の１つまたは複数の転移性前立腺癌基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および対象情報とを含有する機械可読媒体。
【請求項３３】
生理学的または生化学的な経路に関連した転移を示す１個または複数のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
【請求項３４】
前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、血管新生、細胞外マトリックス分解、溢出、コロニー形成またはアノイキスを含む、請求項３３に記載のパネル。
【請求項３５】
腫瘍の進行を示す１個または複数のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
【請求項３６】
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、
（ａ）前記ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを発現する前記細胞を、候補化合物を含む組成物とエキソビボ、またはインビトロで接触させるステップと、
（ｂ）物質が前記ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、前記細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する方法。
【請求項３７】
対象の癌を治療するための組成物であって、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を含む組成物。
【請求項３８】
対象の前立腺癌を治療しまたは予防するための組成物であって、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する薬剤を含む組成物。
【請求項３９】
ゲノムが内在性のＰｔｅｎ遺伝子およびＳｍａｄ４遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有するダブルノックアウトのトランスジェニックマウスであって、野生型マウスと比較して、前立腺腫瘍の形成に対する感受性の増加を示すトランスジェニックマウス。
【請求項４０】
請求項３９に記載のトランスジェニックマウス由来の細胞。
【請求項４１】
上皮細胞である、請求項４０に記載の細胞。
【請求項４２】
前記上皮細胞が、前立腺細胞、乳房細胞、結腸細胞または肺細胞である、請求項４０に記載の細胞。
【請求項４３】
前立腺癌の進行を阻害する治療剤についてスクリーニングする方法であって、候補治療剤を請求項３９に記載のトランスジェニックマウスに投与するステップと、前記マウスにおいて前記治療剤の前立腺癌の進行に対する効果を評価するステップとを含む方法。
【請求項４４】
生物マーカーを同定する方法であって、試験化合物の非存在下において請求項３９に記載のトランスジェニックマウスから得た第１のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、試験化合物の存在下において請求項３９に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中の前記プロファイルと比較するステップを含む方法。
【請求項４５】
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
生物マーカーを同定する方法であって、第１の期間において請求項３９に記載のトランスジェニックマウスから得た第１のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、第２の期間において請求項３９に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中のプロファイルと比較するステップを含む方法。
【請求項４７】
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、請求項４６に記載の方法。
【請求項４８】
キットであって、ＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、ｃｙｃｌｉｎ  Ｄ１およびＳＰＰ１の検出または定量化のための試薬ならびに前記キットを使用するための指示を含むキット。
【請求項４９】
ゲノムが内在性のＰｔｅｎ遺伝子およびＳｍａｄ４遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有する細胞を前立腺組織が含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、前記Ｐｔｅｎ遺伝子または前記Ｓｍａｄ４遺伝子のいずれかにそのような破壊がない対照哺乳動物と比較して、前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示し、Ｓｍａｄ４遺伝子ではなく、Ｐｔｅｎ遺伝子のみにおけるホモ接合型破壊を有する対照哺乳動物と比較して、転移性であって、緩徐進行型ではない前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示す、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
【請求項５０】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のレベルを、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も必要とする対象を選択することの指標とするための方法であって、
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のうちの２個以上を測定するステップを含み、
前記対象において、癌の再発または転移性癌の発症のリスクが評価され、
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のうちの２個以上のレベルにおける臨床的に有意な変化が、前記対象における癌の再発または転移性癌の発症のリスクの増加を示し、そして、前記対象が、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も必要とすることを示す、方法。
【請求項５１】
前記看護療法の標準が、手術、放射線照射またはアンドロゲン除去である、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
ＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、ＣＹＣＬＩＮ  Ｄ１およびＳＰＰ１の発現レベルを、ＳＰＰ１阻害剤またはＣＤ４４阻害剤での治療を必要とする対象を決定することの指標とするための方法であって、
対象の前立腺癌組織由来のサンプル中のＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、ＣＹＣＬＩＮ  Ｄ１およびＳＰＰ１の発現レベルに関する情報を得るステップを含み、
対象において、前立腺癌を再発または転移性癌を発症するリスクがあることが、前記対象が、ＳＰＰ１阻害剤またはＣＤ４４阻害剤での治療を必要とすることを示す、方法。
【請求項５３】
前記阻害剤が、抗ＳＰＰ１抗体、ＳＰＰ１ｓｉＲＮＡ、ＣＤ４４抗体またはＣＤ４４ｓｉＲＮＡである、請求項５２に記載の方法。
【請求項５４】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のレベルを、対象の癌に治療レジメンが有益であるかどうかを決定することの指標とするための方法であって、
ａ）２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のレベルを検出するステップと、ｂ）ステップ（ａ）で検出された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
【請求項５５】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２を、アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択することの指標とするための方法であって、
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２の２個以上を測定するステップを含み、
前記患者における転移のリスクが評価され、前記患者由来の腫瘍サンプル中の前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示す、方法。
【請求項５６】
２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２を、腫瘍患者に治療決定を知らせることの指標とするための方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２の２個以上に関する情報を得るステップを含み、
前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが臨床的に有意に変化した場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンが選択される、方法。
【手続補正２】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】０００６
【補正方法】変更
【補正の内容】
【０００６】
したがって、本発明の１つの態様では、所定レベルの予測可能性を用いて、対象で転移性癌を発症するリスクを評価するための方法を提供する。転移性前立腺癌を発症するリスクは、対象由来のサンプル中のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定することによって決定する。対象が転移性癌を発症するリスクが高いことは、サンプル中のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの臨床的に有意な変化を測定することによって決定される。あるいは、対象が転移性癌を発症するリスクが高いことは、有効量のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較することによって決定される。いくつかの態様では、この基準値が指標である。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価するための方法であって、
ａ．前記対象由来のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記サンプル中の前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの臨床的に有意な変化を測定するステップであって、前記変化が、前記対象において癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクが高いことを示しているステップと
を含む方法。
（項目２）
前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが、
ａ）表２、
ｂ）表３、
ｃ）表４、
ｄ）表５、
ｅ）表６、
ｆ）表７、および
ｇ）表２〜７から選択された２つ以上の表
から選択される、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが、ＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、サイクリンＤ１およびＳＰＰ１を含む、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記癌に関連する少なくとも１つの標準的なパラメータを測定するステップをさらに含む、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記癌が前立腺癌であり、前記標準パラメータがグリーソンスコアである、項目４に記載の方法。
（項目６）
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの前記レベルが、電気泳動、免疫化学的手法または非浸潤性イメージングによって測定される、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記免疫化学的検出が、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光アッセイ、または酵素結合免疫吸着アッセイによって行われる、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記対象が、原発性腫瘍、再発性腫瘍、または転移性前立腺癌を有する、項目１に記載の方法。
（項目９）
前記サンプルが、腫瘍生検標本、血液または生物学的液体中の循環腫瘍細胞である、項目１に記載の方法。
（項目１０）
前記生検標本が、コア生検標本、切除組織生検標本、または切開組織生検標本である、項目１に記載の方法。
（項目１１）
４個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現レベルを測定する、項目１に記載の方法。
（項目１２）
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における癌再発のリスクまたは転移性癌を発症するリスクを評価するための方法であって、
ａ．前記対象由来のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを測定するステップと、
ｂ．前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
（項目１３）
前記基準値が指標値である、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
所定レベルの予測可能性を用いて、対象における腫瘍の進行を評価するための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記対象由来の第１のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記対象由来の第２のサンプル中の２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップと
を含む方法。
（項目１５）
前記第１のサンプルが、前記腫瘍の治療前に前記対象から採取される、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記第２のサンプルが、前記腫瘍の治療後に前記対象から採取される、項目１４に記載の方法。
（項目１７）
所定レベルの予測可能性を用いて、再発性癌または転移性癌の治療の有効性をモニタするための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記対象由来の第１のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．第２の期間で、前記対象由来の第２のサンプル中の、２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの有効量のレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、ステップ（ｂ）で検出されたレベルまたは基準値と比較するステップであって、治療の有効性が、前記対象由来の２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルの変化によってモニタされるステップと
を含む方法。
（項目１８）
前記対象が、前記癌の治療を事前に受けている、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記第１のサンプルが、前記癌の治療前に前記対象から採取される、項目１７に記載の方法。
（項目２０）
前記第２のサンプルが、前記癌の治療後に前記対象から採取される、項目１７に記載の方法。
（項目２１）
前記第２のサンプルを、前記癌の再発後に前記対象から採取する、項目１７に記載の方法。
（項目２２）
前記第２のサンプルを、前記癌の再発前に前記対象から採取する、項目１７に記載の方法。
（項目２３）
所定レベルの予測可能性を用いて、腫瘍を有すると診断された対象に関する治療レジメンを選択するための方法であって、
ａ．第１の期間で、前記対象由来の第１のサンプル中の、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｂ．任意選択で第２の期間で、前記対象由来の第２のサンプル中の２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを検出するステップと、
ｃ．ステップ（ａ）で検出された前記２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを、基準値または任意選択でステップ（ｂ）で検出された量と比較するステップと
を含む方法。
（項目２４）
前記対象が、腫瘍の治療を事前に受けている、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記第１のサンプルを、前記腫瘍を治療する前に前記対象から採取する、項目２３に記載の方法。
（項目２６）
前記第２のサンプルを、前記腫瘍を治療した後に前記対象から採取する、項目２３に記載の方法。
（項目２７）
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された２個以上のマーカーの、マーカーレベルのパターンを含む、転移性前立腺癌基準発現プロファイル。
（項目２８）
項目２７に記載のプロファイルを作成するのに十分な、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２からなる群から選択された対応するＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを検出する複数のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ検出試薬を含むキット。
（項目２９）
前記検出試薬が、１つもしくは複数の抗体またはその断片を含む、項目２８に記載のキット。
（項目３０）
前記検出試薬が１種または複数のオリゴヌクレオチドを含む、項目２８に記載のキット。
（項目３１）
前記検出試薬が１種または複数のアプタマーを含む、項目２８に記載のキット。
（項目３２）
項目２７に記載の１つまたは複数の転移性前立腺癌基準発現プロファイルと、任意選択で追加の試験結果および対象情報とを含有する機械可読媒体。
（項目３３）
生理学的または生化学的な経路に関連した転移を示す１個または複数のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
（項目３４）
前記生理学的または生化学的な経路が、細胞移動、血管新生、細胞外マトリックス分解、溢出、コロニー形成またはアノイキスを含む、項目３３に記載のパネル。
（項目３５）
腫瘍の進行を示す１個または複数のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを含む、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴパネル。
（項目３６）
ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を同定する方法であって、
（ａ）前記ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴを発現する細胞を提供するステップと、
（ｂ）前記細胞を、候補化合物を含む組成物と接触させるステップと、
（ｃ）物質が前記ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの発現または活性を変化させるか否かを決定するステップと
を含み、それにより、前記化合物の存在下で観察された前記変化が、細胞を、前記化合物を含まない組成物と接触させたときに観察されない場合、前記同定された化合物は、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する方法。
（項目３７）
前記細胞を、インビボ、エキソビボ、またはインビトロで接触させる、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
対象の癌を治療する方法であって、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する化合物を前記対象に投与するステップを含む方法。
（項目３９）
対象の前立腺癌を治療しまたは予防する方法であって、ＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの活性または発現を調節する薬剤を前記対象に投与するステップを含む方法。
（項目４０）
ゲノムが内在性のＰｔｅｎ遺伝子およびＳｍａｄ４遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有するダブルノックアウトのトランスジェニックマウスであって、野生型マウスと比較して、前立腺腫瘍の形成に対する感受性の増加を示すトランスジェニックマウス。
（項目４１）
項目４０に記載のトランスジェニックマウス由来の細胞。
（項目４２）
上皮細胞である、項目４１に記載の細胞。
（項目４３）
前記上皮細胞が、前立腺細胞、乳房細胞、結腸細胞または肺細胞である、項目４１に記載の細胞。
（項目４４）
前立腺癌の進行を阻害する治療剤についてスクリーニングする方法であって、候補治療剤を項目４０に記載のトランスジェニックマウスに投与するステップと、前記マウスにおいて前記治療剤の前立腺癌（ｐｒｏｓｔａｔｅ  ｃａｎｅｒ）の進行に対する効果を評価するステップとを含む方法。
（項目４５）
生物マーカーを同定する方法であって、試験化合物の非存在下において項目４０に記載のトランスジェニックマウスから得た第１のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、試験化合物の存在下において項目４０に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中の前記プロファイルと比較するステップを含む方法。
（項目４６）
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
生物マーカーを同定する方法であって、第１の期間において項目４０に記載のトランスジェニックマウスから得た第１のサンプル中の遺伝子発現プロファイル、ゲノムプロファイルまたはプロテオミクスプロファイルを、第２の期間において項目４０に記載のトランスジェニックマウスから得たサンプル中のプロファイルと比較するステップを含む方法。
（項目４８）
前記サンプルが、細胞サンプル、血液サンプルまたは循環腫瘍細胞である、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
キットであって、ＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、サイクリンＤ１およびＳＰＰ１の検出または定量化のための試薬ならびに前記キットを使用するための指示を含むキット。
（項目５０）
ゲノムが内在性のＰｔｅｎ遺伝子およびＳｍａｄ４遺伝子の両方のホモ接合型破壊を含有する細胞を前立腺組織が含むトランスジェニック非ヒト哺乳動物であって、前記Ｐｔｅｎ遺伝子または前記Ｓｍａｄ４遺伝子のいずれかにそのような破壊がない対照哺乳動物と比較して、前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示し、Ｓｍａｄ４遺伝子ではなく、Ｐｔｅｎ遺伝子のみにおけるホモ接合型破壊を有する対照哺乳動物と比較して、転移性であって、緩徐進行型ではない前立腺癌の発症に対する感受性の増加を示す、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
（項目５１）
癌を治療するための方法であって、
ａ）癌細胞がＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のうちの２個以上のレベルにおいて臨床的に有意な変化を示す対象を提供するステップであって、前記変化が、前記対象において癌が再発するかまたは転移性癌を発症するリスクの増加を示すステップと、
ｂ）前記対象を、看護療法の標準に加えて、アジュバント療法も用いて治療するステップと
を含む方法。
（項目５２）
前記看護療法の標準が、手術、放射線照射またはアンドロゲン除去である、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
前立腺癌を、前立腺癌の治療を必要とする対象において治療するための方法であって、ａ）対象の前立腺癌組織由来のサンプル中のＰＴＥＮ、ＳＭＡＤ４、ＣＹＣＬＩＮ  Ｄ１およびＳＰＰ１の発現レベルに関する情報を得るステップと、
ｂ）ＳＰＰ１阻害剤またはＣＤ４４阻害剤を、前記発現レベルに基づいて前立腺癌が再発するかまたは転移性癌を発症するリスクがあると同定される対象に投与するステップと
を含む方法。
（項目５４）
前記阻害剤が、抗ＳＰＰ１抗体、ＳＰＰ！ｓｉＲＮＡ、ＣＤ４４抗体またはＣＤ４４ｓｉＲＮＡである、項目５３に記載の方法。
（項目５５）
対象の癌に治療レジメンが有益であるかどうかを決定する方法であって、
ａ）２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２のレベルを検出するステップと、ｂ）ステップ（ａ）で検出された２個以上のＰＣＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴのレベルを基準値と比較するステップと
を含む方法。
（項目５６）
アジュバント治療を必要とする腫瘍患者を選択する方法であって、
ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２の２個以上を測定することにより、前記患者における転移のリスクを評価するステップであって、前記患者由来の腫瘍サンプル中の前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴの臨床的に有意な変化は、前記患者がアジュバント治療を必要としていることを示すステップ
を含む方法。
（項目５７）
腫瘍患者に治療決定を知らせる方法であって、
前記患者から得た腫瘍サンプル中の、ＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴ１〜３７２の２個以上に関する情報を得るステップと、
前記２個以上のＤＥＴＥＲＭＩＮＡＮＴが臨床的に有意に変化した場合に、前記患者における腫瘍転移を予防または低減する治療レジメンを選択するステップと
を含む方法。