【手続補正書】
【提出日】平成25年5月2日(2013.5.2)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織におけるトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
配列番号3のヌクレオチド1〜970、配列番号4のヌクレオチド1〜1117、配列番号5のヌクレオチド1〜297(図3)中の連続した5〜30ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドの逆相補物に少なくとも50%の配列同一性を有する少なくとも1つの長さ5〜30ヌクレオチドのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項２】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織におけるトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの天然アンチセンスの逆相補物に少なくとも50%の配列同一性を有する少なくとも1つの長さ5〜30ヌクレオチドのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項３】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織におけるトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンスオリゴヌクレオチドに少なくとも50%の配列同一性を有する少なくとも1つの長さ5〜30ヌクレオチドのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項４】
in vivoまたはin vitroで患者の細胞または組織におけるトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの機能および/または発現を調節するための組成物であって、
トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの天然アンチセンスオリゴヌクレオチドの領域を標的にする少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項５】
トリステトラプロリン(TTP)の機能および/または発現が対照と比較してin vivoまたはin vitroで増大する、請求項4に記載の組成物。
【請求項６】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドがトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの天然アンチセンス配列を標的にする、請求項4に記載の組成物。
【請求項７】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドがトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのコードおよび/または非コード核酸配列を含む核酸配列を標的にする、請求項4に記載の組成物。
【請求項８】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドがトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのオーバーラップおよび/または非オーバーラップ配列を標的にする、請求項4に記載の組成物。
【請求項９】
少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの修飾された糖部分、少なくとも1つの修飾されたヌクレオシド間結合、少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドおよびそれらの組合せから選択される1つまたは複数の修飾を含む、請求項4に記載の組成物。
【請求項１０】
前記1つまたは複数の修飾が2'-O-メトキシエチル修飾糖部分、2'-メトキシ修飾糖部分、2'-O-アルキル修飾糖部分、二環性糖部分およびそれらの組合せから選択される少なくとも1つの修飾された糖部分を含む、請求項9に記載の組成物。
【請求項１１】
前記1つまたは複数の修飾がホスホロチオエート、2'-O-メトキシエチル(MOE)、2'-フルオロ、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホラミデート、カルバミン酸、炭酸、リン酸トリエステル、アセトアミデート、カルボキシメチルエステルおよびそれらの組合せから選択される少なくとも1つの修飾されたヌクレオシド間結合を含む、請求項9に記載の組成物。
【請求項１２】
前記1つまたは複数の修飾が、ペプチド核酸(PNA)、ロックド核酸(LNA)、アラビノ-核酸(FANA)、それらの類似体、誘導体およびそれらの組合せから選択される少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドを含む、請求項9に記載の組成物。
【請求項１３】
前記少なくとも1つのオリゴヌクレオチドが配列番号6〜10に記載の少なくとも1つのオリゴヌクレオチド配列を含む、請求項1に記載の組成物。
【請求項１４】
in vivoまたはin vitroで哺乳動物の細胞または組織におけるトリステトラプロリン(TTP)遺伝子の機能および/または発現を調節するための組成物であって、
トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンス核酸分子の少なくとも5個の連続する核酸の相補配列に少なくとも50%の配列同一性を有する、トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンスポリヌクレオチドに特異的な少なくとも1つの長さ5〜30ヌクレオチドの低分子干渉RNA(siRNA)オリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１５】
前記オリゴヌクレオチドが、トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンス核酸分子に相補的な少なくとも5個の連続する核酸の配列に少なくとも80%の配列同一性を有する、請求項14に記載の組成物。
【請求項１６】
in vivoまたはin vitroで哺乳動物の細胞または組織におけるトリステトラプロリン(TTP)の機能および/または発現を調節するための組成物であって、
配列番号1、3、4および5に記載の少なくとも1つの核酸配列に少なくとも50%の配列同一性を有する、トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのセンスおよび/または天然アンチセンス鎖の非コードおよび/またはコード配列に特異的な少なくとも1つの長さ5〜30ヌクレオチドのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項１７】
少なくとも1つの修飾を含む合成修飾オリゴヌクレオチドであって、少なくとも1つの修飾が少なくとも1つの修飾糖部分;少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合;少なくとも1つの修飾ヌクレオチド;およびこれらの組合せから選択され;前記オリゴヌクレオチドが、正常対照と比較してin vivoまたはin vitroでトリステトラプロリン(TTP)遺伝子にハイブリダイズし、かつ正常対照と比較してin vivoまたはin vitroでトリステトラプロリン(TTP)遺伝子の機能および/または発現を調節するアンチセンス化合物であるオリゴヌクレオチド。
【請求項１８】
前記少なくとも1つの修飾がホスホロチオエート、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホラミデート、カルバミン酸、炭酸、リン酸トリエステル、アセトアミデート、カルボキシメチルエステルおよびそれらの組合せからなる群から選択されるヌクレオチド間結合を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１９】
少なくとも1つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２０】
ホスホロチオエートヌクレオチド間結合の骨格を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２１】
ペプチド核酸、ロックド核酸(LNA)、それらの類似体、誘導体およびそれらの組合せから選択される少なくとも1つの修飾されたヌクレオチドを含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２２】
複数の修飾を含み、前記修飾がホスホロチオエート、アルキルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホラミデート、カルバミン酸、炭酸、リン酸トリエステル、アセトアミデート、カルボキシメチルエステル、およびそれらの組合せから選択される修飾されたヌクレオチドを含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２３】
複数の修飾を含み、前記修飾がペプチド核酸、ロックド核酸(LNA)、それらの類似体、誘導体、およびそれらの組合せから選択される修飾されたヌクレオチドを含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２４】
2'-O-メトキシエチル修飾糖部分、2'-メトキシ修飾糖部分、2'-O-アルキル修飾糖部分、二環性糖部分、およびそれらの組合せから選択される少なくとも1つの修飾された糖部分を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２５】
複数の修飾を含み、前記修飾が2'-O-メトキシエチル修飾糖部分、2'-メトキシ修飾糖部分、2'-O-アルキル修飾糖部分、二環性糖部分、およびそれらの組合せから選択される修飾された糖部分を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２６】
少なくとも長さ5〜30ヌクレオチドのオリゴヌクレオチドであり、トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンス鎖および/またはセンス鎖にハイブリダイズし、トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンスのコードおよび/または非コード核酸配列の少なくとも5個の連続する核酸の相補配列に少なくとも20%の配列同一性を有する、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２７】
トリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドのアンチセンスおよび/またはセンスのコードおよび/または非コード核酸配列の少なくとも5個の連続する核酸の相補配列に少なくとも80%配列同一性を有する、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２８】
正常対照と比較してin vivoまたはin vitroで少なくとも1つのトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドにハイブリダイズし、かつ正常対照と比較してin vivoまたはin vitroで少なくとも1つのトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの発現および/または機能を調節する、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２９】
配列番号6〜10に記載の配列を含む、請求項17に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３０】
アンチセンス配列、相補配列、対立遺伝子、相同体、アイソフォーム、変種、誘導体、変異体、断片またはそれらの組合せを含む１つまたは複数のトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドに特異的な1つまたは複数のオリゴヌクレオチドを含む組成物。
【請求項３１】
オリゴヌクレオチドが配列番号6〜10に記載のヌクレオチド配列のいずれか1つと比較して少なくとも40%の配列同一性を有する、請求項30に記載の組成物。
【請求項３２】
オリゴヌクレオチドが配列番号6〜10に記載のヌクレオチド配列を含む、請求項30に記載の組成物。
【請求項３３】
配列番号6〜10に記載のオリゴヌクレオチドが1つまたは複数の修飾または置換を含む、請求項32に記載の組成物。
【請求項３４】
1または複数の修飾が、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ペプチド核酸、ロックド核酸(LNA)分子、およびそれらの組合せから選択される、請求項33に記載の組成物。
【請求項３５】
少なくとも1つのトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドおよび/または少なくとも1つのそれにコードされる産物に関連する疾患を予防または治療するための組成物であって、
少なくとも１つのトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの天然アンチセンス配列に結合し、かつ前記少なくとも1つのトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドの発現を調節する少なくとも1つのアンチセンスオリゴヌクレオチドの治療有効量を含む組成物。
【請求項３６】
少なくとも1つのトリステトラプロリン(TTP)ポリヌクレオチドと関連する疾患が、トリステトラプロリン欠損症候群、心血管疾患または心血管障害、心臓傷害(例えば、血行力学的過負荷、心筋再灌流傷害、肥大型心筋症、末期うっ血性心不全、ならびに虚血状態または心筋梗塞および不安定狭心症などのその帰結の群から選択される心臓傷害)、関節炎、炎症、関節および皮膚の炎症、AIDS、炎症性腸疾患、クローン病、潰瘍性大腸炎、癌、肥満、メタボリック症候群、肥満に随伴する代謝性合併症、自己免疫疾患または自己免疫障害、悪液質、骨髄過形成、骨格筋傷害から選択される、請求項35に記載の組成物。
【請求項３７】
in vivo投与のために少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを同定および選択する方法であって、
病態に関連する標的ポリヌクレオチドを選択するステップ;
選択された標的ポリヌクレオチドまたは選択された標的ポリヌクレオチドに対してアンチセンスであるポリヌクレオチドに相補的である少なくとも5個の連続するヌクレオチドを含む少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを同定するステップ;
ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でアンチセンスオリゴヌクレオチドおよび標的ポリヌクレオチドまたは選択された標的ポリヌクレオチドに対してアンチセンスであるポリヌクレオチドとのハイブリッドの熱的融点を測定するステップ;ならびに
得られた情報に基づきin vivo投与のための少なくとも1つのオリゴヌクレオチドを選択するステップ
を含む方法。