【手続補正書】
【提出日】平成25年5月30日(2013.5.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）非マイクロ流体容積中の生体サンプルから検体をキャプチャ粒子上に捕捉し、その検体−結合キャプチャ粒子を第１のマイクロ流体チャネルを介して送るように構成されたサンプル準備モジュールと；
（ｂ）前記第１のマイクロ流体チャネルと流体連通する反応チャンバを具え、前記検体−結合キャプチャ粒子を固定化し、前記検体上で化学反応又は生化学反応を行って反応生成物を生成するように構成された反応モジュールと；
（ｃ）前記反応チャンバと流体連通しており前記反応生成物の解析を実行するように構成された解析モジュールと；
を具えるシステムであって、
当該システムが、前記検体を捕捉し、当該検体上で化学反応又は生化学反応を行い、４時間未満に前記反応生成物の解析を行うように構成されていることを特徴とするシステム。
【請求項２】
請求項１に記載のシステムにおいて：
（１）前記サンプル準備モジュールが、前記生体サンプル中の細胞から前記検体を放出させる又は抽出するように構成されており；
（２）前記捕捉粒子が磁気応答性キャプチャ粒子であり、前記反応モジュールが前記検体−結合キャプチャ粒子を固定化するように構成した磁力源を具え；
（３）前記反応モジュールが熱サイクルを実行するように構成されており；
（４）前記反応生成物の解析が、電気泳動と前記反応生成物の検出を具え；または
（５）前記（１）乃至（４）の組み合わせである；
ことを特徴とするシステム。
【請求項３】
請求項１に記載のシステムにおいて：
（１）前記検体が核酸を含み；
（２）前記化学反応又は生化学反応が、核酸増幅を具え；または
（３）前記化学反応又は生化学反応が、前記検体の複数の縦列型反復配列（ＳＴＲ）マーカを増幅するステップを具える；または
（４）前記（１）乃至（３）の組み合わせである；
ことを特徴とするシステム。
【請求項４】
請求項３に記載のシステムにおいて：
（１）前記検体がＤＮＡを含み；
（２）前記化学反応又は生化学反応が、ポリメラーゼ鎖反応（ＰＣＲ）を具え；または
（３）前記化学反応又は生化学反応が、前記検体の複数の統合ＤＮＡインデックスシステム（ＣＯＤＩＳ）ＳＴＲマーカを増幅するステップを具える；または
（４） 前記（１）乃至（３）の組み合わせである；
ことを特徴とするシステム。
【請求項５】
請求項１に記載のシステムにおいて、当該システムが：
（１）前記検体を捕捉して、当該検体について化学反応又は生化学反応を実行し、２時間未満で前記反応生成物についての解析を実行する；
（２）閉システムである；
（３）持ち運び可能である；
（４）１０フィート３以下のエンクロージャに適合する；
（５）電池で稼働する；または
（６）前記（１）乃至（５）の組み合わせである；
ことを特徴とするシステム。
【請求項６】
請求項１に記載のシステムが更に、前記解析モジュールから前記解析に関するデータを受信するデータ解析モジュールと、当該データを転送して解析結果を出力するコンピュータで実行可能なコードを具えることを特徴とするシステム。
【請求項７】
請求項６に記載のシステムにおいて、前記データ解析モジュールが、前記検体の複数を増幅し、電気泳動にかけて、検出したＳＴＲマーカについてのコンピュータ解析を行った、検出した複数のＳＴＲマーカを認識するコンピュータファイルを生成するように構成されていることをと特徴とするシステム。
【請求項８】
請求項１に記載のシステムが更に、前記反応チャンバと前記解析モジュールとに流体連結した処理モジュールであって：
（１）前記反応生成物を第２のマイクロ流体チャネルを介して非マイクロ流体処理チャンバに流し；
（２）前記反応生成物を処理し；
（３）前記処理した反応生成物を前記解析モジュールに流す；
ように構成されていることを特徴とする処理モジュールを具えることを特徴とするシステム。
【請求項９】
請求項８に記載のシステムにおいて、前記反応生成物の処理が、反応生成物を希釈するまたは反応生成物の塩分濃度を下げるステップを具えることを特徴とするシステム。
【請求項１０】
請求項１に記載のシステムにおいて：
（Ｉ）前記サンプル準備モジュールと反応モジュールが使い捨てカートリッジに一体化されており：
（ｉ）サンプルチャンバと、混合チャンバと、熱サイクル用の反応チャンバを具える少なくとも一セットの流体チャンバであって、これらのチャンバが互いに流体連通している流体チャンバと；
（ｉｉ）熱サイクルを含む化学反応又は生化学反応を実行する試薬を含む試薬カード又は試薬カートリッジであって、前記試薬カード又は試薬カートリッジが、閉構造中で前記使い捨てカートリッジ上に担持されており、前記少なくとも一セットの流体チャンバと流体連通するように配置されている試薬カード又は試薬カートリッジと；
を具え、
（ＩＩ）前記システムが更に：
（ｄ）アクチュエータアッセンブリであって、前記使い捨てカートリッジが当該アクチュエータアッセンブリに係合すると前記少なくとも一セットの流体チャンバのチャンバ間で流体が移動するように構成したアクチュエータアッセンブリと；
（ｅ）前記使い捨てカートリッジが前記アクチュエータアッセンブリと係合すると、前記反応チャンバ内の温度を循環させるように構成された熱循環器と；
（ｆ）前記解析モジュール中のキャピラリ電気泳動アッセンブリであって、前記使い捨てカートリッジが前記アクチュエータアッセンブリと係合するときに前記使い捨てカートリッジから電気泳動サンプルを受け取るように構成され、当該電気泳動サンプルに電気泳動を実行するように構成された電気泳動アッセンブリと；
（ｇ）前記システムを制御するように構成されたコンピュータ制御システムと；
を具える、
ことを特徴とするシステム。
【請求項１１】
請求項１０に記載のシステムにおいて：
（１）前記少なくとも一セットの流体チャンバが更に、洗浄チャンバと排水チャンバを具え；
（２）前記少なくとも一セットの流体チャンバのチャンバが、マイクロ流体チャネルを介して互いに連結された非マイクロ流体チャンバであり；
（３）流体が、ダイヤフラムバルブを用いて前記少なくとも一セットの流体チャンバのチャンバ間を選択的に移動し；
（４）前記システムが、２又はそれ以上の生体サンプルの複数の操作を並列に実行するように構成されており；
（５）（１）乃至（４）のいずれかの組み合わせである；
ことを特徴とするシステム。
【請求項１２】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記解析モジュールが；
（ｉ）チャネルインレットとチャネルアウトレットを有する少なくとも一の電気泳動サンプルチャネルと；
（ｉｉ）キャピラリインレットとキャピラリアウトレットを有する少なくとも一の電気泳動キャピラリであって、当該少なくとも一の電気泳動キャピラリが、導電性媒体を具え、連結地点において前記少なくとも一の電気泳動サンプルチャネルに連通している電気泳動キャピラリと；
（ｉｉｉ）前記少なくとも一の電気泳動キャピラリの前記キャピラリインレットと前記キャピラリアウトレットに電圧をかけるように構成されたアノードとカソードであって、当該アノードとカソードの一方が、少なくとも二本のフォークを具える第１の電極を具え、前記第１の電極の少なくとも二本のフォークが、前期連結地点の異なる側部において前記少なくとも一の電気泳動サンプルと導通している、アノードとカソードと；
（ｉｖ）前記少なくとも一の電気泳動サンプルチャネルと導通し、前記連結地点で前記少なくとも一の電気泳動キャピラリのキャピラリインレットとほぼ反対側にある第２の電極と；
を具える電気泳動システムを具えることを特徴とするシステム。
【請求項１３】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記解析モジュールが：
（ｉ）少なくとも一の蛍光モジュールに励起光を当てるように構成された励起源であって、前記少なくとも一の蛍光モジュールが、前記励起光によって励起される励起光以外の光を発する、励起源と；
（ｉｉ）前記励起光をフィルタにかけて、前記発光を伝送するように構成した阻止フィルタと；
（ｉｉｉ）前記発光を集束させるように構成した結像レンズと；
（ｉｖ）前記励起光をほぼ透過させ、前記発光を検出器に向けて反射するように構成されたダイクロイックミラーと；
（ｖ）ダイクロイックミラーから反射された光の焦点を合わせるように構成された少なくとも一のレンズを具える合焦システムと；
（ｖｉ）前記集束した光を受け取るように構成した光検出器と；
を具える光学システムを具えることを特徴とするシステム。
【請求項１４】
請求項１に記載のシステムにおいて、前記生体サンプルが、細胞、体液、血液、口腔サンプル、唾液、鼻サンプル、粘液、肺洗浄、精液、尿、膣サンプル、羊膜サンプル、糞便サンプル、皮膚、髪、プリオン、バクテリア、マイコプラズマ、真菌、又はウィルスを含むことを特徴とするシステム。