【手続補正書】
【提出日】平成25年5月23日(2013.5.23)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体の関節リウマチを診断するためのデータを提供するためのインビトロにおける方法であって、前記方法は、
被験体から得られた生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも１つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも１つのバイオマーカーは、
配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチド、  配列番号２、配列番号３、配列番号４、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチド、
並びに
その組合せ
からなる群より選択される；および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、前記方法。
【請求項２】
前記方法は、
被験体から得られた生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも２つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも２つのバイオマーカーは、
配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチド、
配列番号２、配列番号３、配列番号４、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチド、
配列番号１１、配列番号１２、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチド、並びに
その組合せ
からなる群より選択される；および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、請求項１のインビトロにおける方法。
【請求項３】
少なくとも２つのバイオマーカーが、３つのＰＡＤ４−ペプチド、３つのＢＲＡＦ−ペプチドおよび２つのカルパスタチン−ペプチドを含み、そして３つのＰＡＤ４−ペプチドが、配列番号２、配列番号３および配列番号４を含むまたはからなり、３つのＢＲＡＦ−ペプチドが配列番号７、配列番号８および配列番号９を含むまたはからなり、そして２つのカルパスタチン−ペプチドが配列番号１１および配列番号１２を含むまたはからなる、請求項２のインビトロにおける方法。
【請求項４】
生物学的試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在をインビトロにおいて検出するための方法であって、前記方法は、
生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも１つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも１つのバイオマーカーは、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、その類似体、そのフラグメント、およびその組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤペプチドである；および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、生物学的試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在を示す、
を含む、前記方法。
【請求項５】
生物学的試料中の抗ＢＲＡＦ自己抗体の存在をインビトロにおいて検出するための方法であって、前記方法は、
生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも１つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも１つのバイオマーカーは、配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、そのフラグメント、およびその組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチドである；および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、生物学的試料中の抗ＢＲＡＦ自己抗体の存在を示す、
を含む、前記方法。
【請求項６】
少なくとも１つのバイオマーカーが、５０未満のアミノ酸のペプチドである、請求項１〜５のいずれか１項記載のインビトロにおける方法。
【請求項７】
被験体がＣＣＰ陰性であるか、または生物学的試料が、ＣＣＰ陰性被験体から得られる、請求項１〜６のいずれか１項のインビトロにおける方法。
【請求項８】
前記被験体から得られた生物学的試料中において、Ｃ反応性タンパク質、血清アミロイドＡ、インターロイキン６、Ｓ１００タンパク質、オステオポンチン、リウマチ因子、マトリックスメタロプロテアーゼ１、マトリックスメタロプロテアーゼ３、ヒアルロン酸、ｓＣＤ１４、血管新生マーカー、および骨、軟骨または滑膜の代謝産物からなる群より選択される少なくとも１つのマーカーの濃度を測定することをさらに含む、請求項１〜７のいずれか１項のインビトロにおける方法。
【請求項９】
被験体の関節リウマチのインビトロにおける診断のためのキットであって、前記キットは、
配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチド、
配列番号２、配列番号３、配列番号４、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチド、
配列番号１１、配列番号１２、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチド、並びに
その組合せ
からなる群より選択される少なくとも２つのバイオマーカー；および
バイオマーカーと、被験体から得られた生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも１つの試薬、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、前記キット。
【請求項１０】
ＣＣＰ陰性被験体の関節リウマチのインビトロにおける診断のためのキットであって、前記キットは、
配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチドからなる群より選択される３つのＢＲＡＦ−ペプチド、
配列番号２、配列番号３、配列番号４、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチドからなる群より選択される３つのＰＡＤ４−ペプチド、並びに
配列番号１１、配列番号１２、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチドからなる群より選択される２つのカルパスタチン−ペプチド
を含む、少なくとも８つのバイオマーカー；および
バイオマーカーと、被験体から得られた生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも１つの試薬、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、前記キット。
【請求項１１】
生物学的試料中の抗ＰＡＤ４自己抗体の存在を検出するためのキットであって、前記キットは、
少なくとも１つのバイオマーカー、ここで、少なくとも１つのバイオマーカーは、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、その類似体、そのフラグメント、およびその組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチドである；および
バイオマーカーと、生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも１つの試薬、ここで、前記自己抗体は、関節リウマチを示す抗ＰＡＤ４自己抗体である、
を含む、前記キット。
【請求項１２】
生物学的試料中の抗ＢＲＡＦ自己抗体の存在を検出するためのキットであって、前記キットは、
少なくとも１つのバイオマーカー、ここで、少なくとも１つのバイオマーカーは、配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、そのフラグメント、およびその任意の組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチドである；および
バイオマーカーと、生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも１つの試薬、ここで、前記自己抗体は、関節リウマチを示す抗ＢＲＡＦ自己抗体である、
を含む、前記キット。
【請求項１３】
バイオマーカーが、５０未満のアミノ酸のペプチドである、請求項９〜１２のいずれか１項記載のキット。
【請求項１４】
被験体における関節リウマチを診断するためのアレイであって、前記アレイは、その表面に付着した少なくとも２つのバイオマーカーを含み、ここで、少なくとも２つのバイオマーカーは、
配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチド、
配列番号２、配列番号３、配列番号４、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチド、
配列番号１１、配列番号１２、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチド、並びに
その任意の組合せ
からなる群より選択される、前記アレイ。
【請求項１５】
ＣＣＰ陰性被験体の関節リウマチを診断するためのアレイであって、前記アレイは、その表面に付着した少なくとも８つのバイオマーカーを含み、ここで、少なくとも８つのバイオマーカーは、
配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチドからなる群より選択される３つのＢＲＡＦ−ペプチド、
配列番号２、配列番号３、配列番号４、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチドからなる群より選択される３つのＰＡＤ４−ペプチド、並びに
配列番号１１、配列番号１２、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチドからなる群より選択される２つのカルパスタチン−ペプチド
を含む、前記アレイ。
【請求項１６】
バイオマーカーが、５０未満のアミノ酸のペプチドである、請求項１４または請求項１５記載のアレイ。
【請求項１７】
表面に付着した、生物学的試料中のＲＡ特異的自己抗体の存在を検出するための少なくとも１つの追加のバイオマーカーをさらに含む、請求項１４〜１６のいずれか１項記載のアレイ。
【請求項１８】
前記ＲＡ特異的自己抗体が抗核抗体および抗ＣＣＰ抗体である、請求項１７記載のアレイ。
【請求項１９】
前記バイオマーカーが、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＰＡＤ４−ペプチドであり、そして前記バイオマーカーが抗ＰＡＤ４自己抗体によって認識される、関節リウマチのバイオマーカー。
【請求項２０】
前記バイオマーカーが、配列番号７、配列番号８、配列番号９、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するＢＲＡＦ−ペプチドであり、そして前記バイオマーカーが抗ＢＲＡＦ自己抗体によって認識される、関節リウマチのバイオマーカー。
【請求項２１】
前記バイオマーカーが、配列番号１１、配列番号１２、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチドであり、そして前記バイオマーカーが抗カルパスタチン自己抗体によって認識される、関節リウマチのバイオマーカー。
【請求項２２】
前記バイオマーカーが、５０未満のアミノ酸のペプチドである、請求項１９〜２１のいずれか１項記載のバイオマーカー。