【手続補正書】
【提出日】平成25年7月8日(2013.7.8)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記構造のオリゴヌクレオチドを複数含むオリゴヌクレオチド組成物であって:
【化１】
2012532199.tif 000001
式中、
Ｒ１は−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲｄＲｄ、−Ｎ３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ１−、アルケニル−Ｙ１−、アルキニル−Ｙ１−、アリール−Ｙ１−、ヘテロアリール−Ｙ１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒｅ）２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒｅ）、−ＯＲａまたは−ＳＲｃであり；
Ｙ１はＯ、ＮＲｄ、Ｓ、またはＳｅであり；
Ｒａはブロッキング基であり；
Ｒｃはブロッキング基であり；
各場合のＲｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒｅ）２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒｅ）であり；
各場合のＲｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ２−、アルケニル−Ｙ２−、アルキニル−Ｙ２−、アリール−Ｙ２−、またはヘテロアリール−Ｙ２−、あるいは、Ｎａ＋１、Ｌｉ＋１、またはＫ＋１である、カチオンであり；
Ｙ２はＯ、ＮＲｄ、またはＳであり；
各場合のＲ２は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲｄＲｄ、−Ｎ３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ１−、アルケニル−Ｙ１−、アルキニル−Ｙ１−、アリール−Ｙ１−、ヘテロアリール−Ｙ１−、−ＯＲｂ、または−ＳＲｃであり、ここで、Ｒｂはブロッキング基であり；
各場合のＢａは独立してブロックまたは非ブロックアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシルまたは修飾核酸塩基であり；
ここで、前記オリゴヌクレオチドのＸ部分の少なくとも２５％は、独立して−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−Ｓ（Ｏ）２Ｒ１０、−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−ＳＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＯ２Ｈ、
【化２】
2012532199.tif 000002
から選択される放出可能プロモエティであり;ここで、Ｒ１０は１〜４個の炭素原子を有するアルキル基であり；Ｒ１１はアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、またはシクロアルキルであり；ならびにＲ１２は水素またはアルキルであり；
Ｒ３は水素、ブロッキング基、固体支持体に結合された連結部分または核酸に結合された連結部分であり；ならびに
ｎは１〜約２００の整数である；
組成物。
【請求項２】
前記式１の化合物の各Ｘ−ホスホネート部分が、３１Ｐ  ＮＭＲ分光法または逆相ＨＰＬＣにより決定して、９８％超のジアステレオマー純度である、請求項１記載の組成物。
【請求項３】
各Ｘ−ホスホネート部分がＲＰ立体配置を有する、請求項１記載の組成物。
【請求項４】
各Ｘ−ホスホネート部分がＳＰ立体配置を有する、請求項１記載の組成物。
【請求項５】
各Ｘ−ホスホネートが独立してＲＰ立体配置またはＳＰ立体配置を有する、請求項１記載の組成物。
【請求項６】
前記オリゴヌクレオチドのＸ部分の少なくとも５０％が、独立して−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−Ｓ（Ｏ）２Ｒ１０、−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−ＳＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＯ２Ｈ、
【化３】
2012532199.tif 000003
から選択され；ここで、Ｒ１０は１〜４個の炭素原子を有するアルキル基であり；Ｒ１１はアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、またはシクロアルキルであり；ならびにＲ１２は水素またはアルキルである、請求項１記載の組成物。
【請求項７】
前記オリゴヌクレオチドのＸ部分の少なくとも９０％が、独立して−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−Ｓ（Ｏ）２Ｒ１０、−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−ＳＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＯ２Ｈ、
【化４】
2012532199.tif 000004
から選択され；ここで、Ｒ１０は１〜４個の炭素原子を有するアルキル基であり；Ｒ１１はアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、またはシクロアルキルであり；ならびにＲ１２は水素またはアルキルである、請求項１記載の組成物。
【請求項８】
各場合のＸが、独立して−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−Ｓ（Ｏ）２Ｒ１０、−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−ＳＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＯ２Ｈ、
【化５】
2012532199.tif 000005
から選択され；ここで、Ｒ１０は１〜４個の炭素原子を有するアルキル基であり；Ｒ１１はアルキル、アリール、ヘテロアリール、ヘテロシクリル、またはシクロアルキルであり；ならびにＲ１２は水素またはアルキルである、請求項１記載の組成物。
【請求項９】
Ｒ１０がメチルである、請求項１記載の組成物。
【請求項１０】
Ｒ１１がメチルである、請求項１記載の組成物。
【請求項１１】
Ｒ１２がメチルである、請求項１記載の組成物。
【請求項１２】
請求項１記載の組成物であって、
（１）アキラルＨ−ホスホネート部分を含む第１分子と５’−ＯＨ部分を含むヌクレオシドを反応させて、縮合中間体を形成させる工程；及び
（２）縮合中間体を、キラルＸ−ホスホネート部分を含む式Ｉのオリゴヌクレオチドに変換する工程；
を含む方法により調製される、
組成物。
【請求項１３】
請求項１記載の組成物であって、
（１）アキラルＨ−ホスホネート部分を含む第１分子と５’−ＯＨ部分を含むヌクレオシドを反応させて、縮合中間体を形成させる工程；
（２）工程（１）の縮合中間体をアキラルＨ−ホスホネート部分を含む第２分子と反応させて、さらなる縮合中間体を形成させる工程；及び
（３）さらなる縮合中間体を、キラルＸ−ホスホネート部分を含む式Ｉのオリゴヌクレオチドに変換する工程；
を含む方法により調製される、
組成物。
【請求項１４】
請求項１記載の組成物であって、
（１）アキラルＨ−ホスホネート部分を含む第１分子と５’−ＯＨ部分を含むヌクレオシドを反応させて、縮合中間体を形成させる工程；
（２）工程（１）の縮合中間体をアキラルＨ−ホスホネート部分を含む第２分子と反応させて、さらなる縮合中間体を形成させる工程；
（３）アキラルＨ−ホスホネート部分を含むさらなる分子を用いて工程（２）の反応を少なくとも１回繰り返して、最終縮合中間体を形成させる工程；及び
（４）最終縮合中間体を、キラルＸ−ホスホネート部分を含む式Ｉのオリゴヌクレオチドに変換する工程；
を含む方法により調製される、
組成物。
【請求項１５】
アキラルＨ−ホスホネート部分を含む第１及び第２分子が同じである、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１６】
アキラルＨ−ホスホネート部分を含む第１及び第２分子が異なっている、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１７】
アキラルＨ−ホスホネート部分を含むさらなる分子の少なくとも１つがアキラルＨ−ホスホネート部分を含む第１及び／又は第２分子と同じである、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１８】
アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子の１つ以上が修飾核酸塩基を含んでいる、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項１９】
５’−ＯＨ部分を含むヌクレオシドがさらに修飾核酸塩基を含んでいる、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項２０】
組成物のオリゴヌクレオチドがスキーム１０に記載された方法により調製されている、請求項１２〜１４のいずれか一項に記載の組成物。
【化６】
2012532199.tif 000006
【請求項２１】
スキーム１０に記載された方法が繰り返しサイクルを含む、請求項２０記載の組成物。
【請求項２２】
オリゴヌクレオチドが、アンチセンスオリゴヌクレオチド、標的配列と三重らせんを形成し、望まれていない遺伝子の転写を阻止し、タンパク質発現および／または活性を調節するアンチジーンオリゴヌクレオチド、デコイオリゴヌクレオチド、ＤＮＡワクチン、アプタマー、リボザイム、デオキシリボザイム（ＤＮＡザイムまたはＤＮＡ酵素）、ｓｉＲＮＡ、ｍｉｃｒｏＲＮＡ、ｎｃＲＮＡ（非コードＲＮＡ）、又はＰ−修飾プロドラッグとして機能するように、活性を当該オリゴヌクレオチドに付与するヌクレオチド配列を有している、請求項１記載の組成物。
【請求項２３】
治療的有効量の請求項１記載の組成物及び薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項２４】
スキーム１０に記載の方法により生じるものに対応する構造のオリゴヌクレオチドを複数含む、オリゴヌクレオチド組成物であって、
【化７】
2012532199.tif 000007
当該方法は繰り返しサイクルを含み、それにより、オリゴヌクレオチドのＸ部分の少なくとも２５％は、独立して−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−Ｓ（Ｏ）２Ｒ１０、−ＯＣＨ２ＣＨ２Ｓ−ＳＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＣＯ２Ｈ、
【化８】
2012532199.tif 000008
から選択され;並びにオリゴヌクレオチドに存在するＸ部分の少なくとも２５％はＨではない、構造を各オリゴヌクレオチドが有する、
組成物。
【請求項２５】
スキーム１０の方法の繰り返しサイクルにより調製される、請求項２４記載の組成物。