(57)【要約】      （修正有）【課題】少量の検体でより多くの塩基配列の情報を獲得することができ、かつ、複数種の核酸プローブの中から適切なプローブへ標的核酸を付与することで反応検出を効率的に行いうる反応性物質の反応方法、その反応装置等を提供する。【解決手段】検出用基板１０８上に第１の溶液（核酸プローブ）による検出用プローブパターンを形成し、第１の溶液における揮発物質の揮発後に、検出用プローブパターン上に第２の溶液（標的核酸）によるスポット状パターンの形成を行い、第１の溶液及び第２の溶液のハイブリダイゼーション反応を起こす。この際、該反応に寄与しない液滴噴射を行い、例えば両液によるパターンを所望の位置に形成させるための基準位置パターン１１３を設けることからなる。【選択図】図１４
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
反応性物質を含有する溶液を、基板保持手段に保持された基板にインクジェット原理による噴射する溶液噴射工程と、
溶液噴射位置を決定するための基準位置を検出する基準位置検出工程と、
前記基準位置検出工程により検出された基準位置及びコンピュータからの情報に基づいて、前記基板保持手段の保持位置及び前記溶液噴射工程による噴射位置とを相対的に移動させる移動工程とを有し、前記溶液噴射工程により前記基板上に非接触に前記溶液を付与する反応性物質の反応方法であって、
前記溶液噴射工程は、第１の溶液を噴射する第１の溶液噴射工程と、第２の溶液を噴射する第２の溶液噴射工程とを有し、
該反応方法は、前記第１の溶液噴射工程により噴射された第１の溶液の揮発物質が揮発した後、前記第２の噴射工程が第２の溶液を噴射して第１の溶液と第２の溶液とを反応させるとともに、該反応が行われる領域とは別の領域において前記反応に関与しない溶液噴射を行うことを特徴とする反応性物質の反応方法。
【請求項２】
前記第１の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第２の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする請求項１に記載の反応性物質の反応方法。
【請求項３】
前記第１の溶液噴射工程は、前記第１の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ≧√２・Ｄ1ｐとなるように溶液噴射を行い、
前記第２の溶液噴射工程は、前記第２の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ＜Ｄ2ｐとなるように溶液噴射を行うことを特徴とする請求項１又は２に記載の反応性物質の反応方法。
【請求項４】
前記第１の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第２の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする請求項１に記載の反応性物質の反応方法。
【請求項５】
前記第１の溶液噴射工程は、前記第１の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ＜Ｄ1ｐとなるように溶液噴射を行い、
前記第２の溶液噴射工程は、前記第２の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ≧√２・Ｄ2ｐとなるように溶液噴射を行うことを特徴とする請求項１又は４に記載の反応性物質の反応方法。
【請求項６】
前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液のいずれか又は前記第１の溶液及び前記第２の溶液の両方を噴射付与することを特徴とする請求項１から５のいずれか１項に記載の反応性物質の反応方法。
【請求項７】
前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液とは別の溶液を噴射付与することを特徴とする請求項１から５のいずれか１項に記載の反応性物質の反応方法。
【請求項８】
反応性物質を含有する複数種類の溶液が付与される基板を保持する基板保持手段と、
前記基板と相対する位置に配置されインクジェット原理による溶液噴射を行う溶液噴射手段と、
溶液噴射位置を決定するための基準位置を検出する基準位置検出手段と、
前記基準位置検出手段により検出された基準位置及びコンピュータからの情報に基づいて、前記基板保持手段と前記溶液噴射手段とを相対的に移動させる移動手段とを備え、前記溶液噴射手段により前記基板上に非接触に前記溶液を付与する反応性物質の反応装置であって、
前記溶液噴射手段は、第１の溶液を噴射する第１の溶液噴射手段と、第２の溶液を噴射する第２の溶液噴射手段とを有し、
該反応装置は、前記第１の溶液噴射手段により噴射された第１の溶液の揮発物質が揮発した後、前記第２の噴射手段が第２の溶液を噴射して第１の溶液と第２の溶液とを反応させるとともに、該反応が行われる領域とは別の領域において前記反応に関与しない溶液噴射を行うことを特徴とする反応性物質の反応装置。
【請求項９】
前記基準位置は、複数の前記基板それぞれに、前記反応に関与しない溶液噴射により書き込まれたパターンで決められた位置であり、前記検出手段により光学的に検出されるとともに、
前記溶液噴射手段は、該検出情報に基づいて求められた付与位置に対して、前記第１の溶液及び第２の溶液を付与することを特徴とする請求項８に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１０】
前記パターンは、複数の前記基板の識別情報を含むことを特徴とする請求項９に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１１】
前記基板の被溶液付与面は、前記基板保持手段と前記溶液噴射手段との相対的な移動により形成されるとともに、前記溶液噴射手段の溶液噴射口面を含む仮想平面の位置から離間し、
前記基板保持手段は、前記仮想平面の位置を基準として、基板保持部分を前記基板の被溶液付与面より遠い位置としたことを特徴とする請求項８から１０のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１２】
前記溶液噴射手段は、複数が一体化した構造をなし、各噴射口面が同じ平面状である仮想同一平面を構成するとともに、前記仮想同一平面に位置する前記噴射口面における各噴射口領域は互いに独立していることを特徴とする請求項８から１１のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１３】
前記第１の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第２の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする請求項８から１２のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１４】
前記第１の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第２の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする請求項８から１２のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１５】
前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液のいずれか又は前記第１の溶液及び前記第２の溶液の両方を噴射付与することを特徴とする請求項８から１４のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１６】
前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液とは別の溶液を噴射付与することを特徴とする請求項８から１４のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置。
【請求項１７】
請求項８から１６のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置に使用される基板において、
前記基板は、前記溶液が噴射付与される面と、該噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面とを有し、前記溶液が噴射付与される面の表面粗さが前記端面の表面粗さより滑らかであることを特徴とする基板。
【請求項１８】
前記溶液が噴射付与される面と、該噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面が形作るコーナー部を面取りした面取り面とを有し、前記面取り面の表面粗さが前記溶液が噴射付与される面の表面粗さより粗いことを特徴とする請求項１７に記載の基板。
【請求項１９】
請求項８から１６のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置によって反応が行われたことを特徴とする請求項１７又は１８に記載の基板。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、反応性物質の反応方法、その反応装置、及び基板に関し、特に、ＤＮＡチップ、プロテイン（蛋白質）チップ等のバイオチップ（マイクロアレイ）を液体噴射原理によって製作する技術に関するものである。
【背景技術】
【０００２】
近年、ゲノムプロジェクトの進展により、各生物の遺伝子構造が次々に明らかになってきており、この成果を生命現象の解析に結び付けるためにも、ＤＮＡの塩基配列の解読、及び遺伝子情報の機能解析が課題となっている。そこで、細胞内における全ての遺伝子の発現量を一度にモニタリングするためのシステムとして、ＤＮＡマイクロアレイが利用されている。
【０００３】
このＤＮＡマイクロアレイを利用したモニタリングシステムでは、細胞や組織から抽出したｍＲＮＡやｔｏｔａｌＲＮＡから逆転写反応を行ってプローブＤＮＡ（核酸プローブ）を調製し、スライドガラス等の基板上に高密度にスポッティングした後、蛍光色素で標識されたターゲットＤＮＡ（標的核酸）をハイブリダイズ（相補核酸鎖の相互作用）させ、蛍光パターンを観察することにより、遺伝子発現量を評価している。
【０００４】
当該アレイのサイズは、通常１ｃｍ２〜１０ｃｍ２で、この領域に数千〜数万種のプローブＤＮＡを高密度にスポッティングする必要があり、その製造手法として、固相上にプローブＤＮＡを合成していく手法と、予め合成されたプローブＤＮＡを固相上に固定する手法がある。プローブ精製の容易性等の観点から、後者の手法を用いるのが主流となっており、従来では、接触ピンやフォトマスクを用いる方式が用いられていた。
【０００５】
しかし、接触ピンによる方式では、ペン先をＤＮＡ溶液中に浸し、表面張力で溶液を掬い上げ、ペン先を固相上に打ち付けてその衝撃力でスポットするため、固相上へ供給される液滴の供給量が不安定なうえに、固相上のスポット形状が不規則になり、さらに接触ピンの洗浄が不十分な場合にはクロスコンタミネーションが生じうるという不都合がある。さらに、作業に長時間を要するため、効率的ではない。
【０００６】
また、フォトマスクによる方式では、一度に大量のプローブを固定することができるが、露光・現像工程に長時間を要し、さらにフォトマスクの作製に手間がかかるという欠点がある。
【０００７】
このため、最近では、インクジェットヘッド（微小液滴吐出ヘッド）を用いたプローブＤＮＡの固相上へのスポッティング技術が開示されている。インクジェットヘッドを用いることにより、溶液吐出の高速性及び吐出制御の正確性に加えて、インクジェットヘッドの駆動信号を制御するだけで固相上へのプローブの配列パターンを容易に変更できるため、使用目的に応じた検査チップ等の作製が可能となり、利便性の点において格段に優れている。
【０００８】
例えば特許文献１では、マトリクス状に配置した各区画に検出用プローブを結合させた検出用基板を用いて、対象成分の核酸分子を含む検体試料の溶液複数種を各区画上に僅かな液量のアレイ状にスポットし、この微小液滴内でハイブリダイゼーション反応を行うことで、検体試料中の対象成分を検出する方法が開示されている。
【０００９】
また、例えば特許文献２では、固相表面上に形成されるたんぱく質を含むプローブからなるスポットの形状を、記号、文字、数字等の非円形にし、また位置情報を持たせることで、目的のスポットが容易に認識できるようにする技術が提案されている。
【特許文献１】特開２００２−６５２７４号公報
【特許文献２】特開２００５−７７１８２号公報
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【００１０】
プローブアレイを用いて核酸の塩基配列決定を行う場合には、できる限り多種の核酸プローブを固相上に配置しておくことが好ましい。また、遺伝子の変異の検出を効率的に行う場合、それぞれの変異に対応した配列を有する核酸プローブを固相上に配置させるとともに、各変異が得られるように標的核酸を適切な核酸プローブへ付与できることが好ましい。ただし、噴射後の溶液のパターンを他の用途で有効活用する観点から、標的拡散の付与は反応に関与しない溶液噴射であることが望ましい。さらに、サンプル中の標的核酸の検出や、遺伝子の変異、欠損の検出に当たっては、被験者からのサンプルの採取、具体的には血液等の採取はできる限り少量にとめておくことが好ましく、よって少量の検体でできる限り多くの塩基配列の情報を獲得できることが求められる。
【００１１】
そこで、本発明は、上述のごとき実情に鑑み、少量の検体でより多くの塩基配列の情報を獲得することができ、かつ、複数種の核酸プローブの中から適切なプローブへ標的核酸を付与することで反応検出を効率的に行いうる反応性物質の反応方法、その反応装置等を提供することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【００１２】
かかる目的を達成するために、請求項１記載の発明は、反応性物質を含有する溶液を、基板保持手段に保持された基板にインクジェット原理による噴射する溶液噴射工程と、溶液噴射位置を決定するための基準位置を検出する基準位置検出工程と、前記基準位置検出工程により検出された基準位置及びコンピュータからの情報に基づいて、前記基板保持手段の保持位置及び前記溶液噴射工程による噴射位置とを相対的に移動させる移動工程とを有し、前記溶液噴射工程により前記基板上に非接触に前記溶液を付与する反応性物質の反応方法であって、前記溶液噴射工程は、第１の溶液を噴射する第１の溶液噴射工程と、第２の溶液を噴射する第２の溶液噴射工程とを有し、該反応方法は、前記第１の溶液噴射工程により噴射された第１の溶液の揮発物質が揮発した後、前記第２の噴射工程が第２の溶液を噴射して第１の溶液と第２の溶液とを反応させるとともに、該反応が行われる領域とは別の領域において前記反応に関与しない溶液噴射を行うことを特徴とする。
【００１３】
また、請求項２記載の発明は、請求項１記載の反応性物質の反応方法において、前記第１の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第２の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする。
【００１４】
また、請求項３記載の発明は、請求項１又は２に記載の反応性物質の反応方法において、前記第１の溶液噴射工程は、前記第１の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ≧√２・Ｄ1ｐとなるように溶液噴射を行い、前記第２の溶液噴射工程は、前記第２の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ＜Ｄ2ｐとなるように溶液噴射を行うことを特徴とする。
【００１５】
また、請求項４記載の発明は、請求項１記載の反応性物質の反応方法において、前記第１の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第２の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする。
【００１６】
また、請求項５記載の発明は、請求項１又は４に記載の反応性物質の反応方法において、前記第１の溶液噴射工程は、前記第１の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ＜Ｄ1ｐとなるように溶液噴射を行い、前記第２の溶液噴射工程は、前記第２の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ≧√２・Ｄ2ｐとなるように溶液噴射を行うことを特徴とする。
【００１７】
また、請求項６記載の発明は、請求項１から５のいずれか１項に記載の反応性物質の反応方法において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液のいずれか又は前記第１の溶液及び前記第２の溶液の両方を噴射付与することを特徴とする。
【００１８】
また、請求項７記載の発明は、請求項１から５のいずれか１項に記載の反応性物質の反応方法において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液とは別の溶液を噴射付与することを特徴とする。
【００１９】
また、請求項８記載の発明は、反応性物質を含有する複数種類の溶液が付与される基板を保持する基板保持手段と、前記基板と相対する位置に配置されインクジェット原理による溶液噴射を行う溶液噴射手段と、溶液噴射位置を決定するための基準位置を検出する基準位置検出手段と、前記基準位置検出手段により検出された基準位置及びコンピュータからの情報に基づいて、前記基板保持手段と前記溶液噴射手段とを相対的に移動させる移動手段とを備え、前記溶液噴射手段により前記基板上に非接触に前記溶液を付与する反応性物質の反応装置であって、前記溶液噴射手段は、第１の溶液を噴射する第１の溶液噴射手段と、第２の溶液を噴射する第２の溶液噴射手段とを有し、該反応装置は、前記第１の溶液噴射手段により噴射された第１の溶液の揮発物質が揮発した後、前記第２の噴射手段が第２の溶液を噴射して第１の溶液と第２の溶液とを反応させるとともに、該反応が行われる領域とは別の領域において前記反応に関与しない溶液噴射を行うことを特徴とする。
【００２０】
また、請求項９記載の発明は、請求項８記載の反応性物質の反応装置において、前記基準位置は、複数の前記基板それぞれに、前記反応に関与しない溶液噴射により書き込まれたパターンで決められた位置であり、前記検出手段により光学的に検出されるとともに、前記溶液噴射手段は、該検出情報に基づいて求められた付与位置に対して、前記第１の溶液及び第２の溶液を付与することを特徴とする。
【００２１】
また、請求項１０記載の発明は、請求項９記載の反応性物質の反応装置において、前記パターンは、複数の前記基板の識別情報を含むことを特徴とする。
【００２２】
また、請求項１１記載の発明は、請求項８から１０のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置において、前記基板の被溶液付与面は、前記基板保持手段と前記溶液噴射手段との相対的な移動により形成されるとともに、前記溶液噴射手段の溶液噴射口面を含む仮想平面の位置から離間し、前記基板保持手段は、前記仮想平面の位置を基準として、基板保持部分を前記基板の被溶液付与面より遠い位置としたことを特徴とする。
【００２３】
また、請求項１２記載の発明は、請求項８から１１のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置において、前記溶液噴射手段は、複数が一体化した構造をなし、各噴射口面が同じ平面状である仮想同一平面を構成するとともに、前記仮想同一平面に位置する前記噴射口面における各噴射口領域は互いに独立していることを特徴とする。
【００２４】
また、請求項１３記載の発明は、請求項８から１２のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置において、前記第１の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第２の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする。
【００２５】
また、請求項１４記載の発明は、請求項８から１２のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置において、前記第１の溶液は、核酸分子を含む溶液であり、前記第２の溶液は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液であり、前記第１の溶液と前記第２の溶液とを用いてハイブリダイゼーション反応を起こすことを特徴とする。
【００２６】
また、請求項１５記載の発明は、請求項８から１４のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液のいずれか又は前記第１の溶液及び前記第２の溶液の両方を噴射付与することを特徴とする。
【００２７】
また、請求項１６記載の発明は、請求項８から１４のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１の溶液若しくは前記第２の溶液とは別の溶液を噴射付与することを特徴とする。
【００２８】
また、請求項１７記載の発明は、請求項８から１６のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置に使用される基板において、前記基板は、前記溶液が噴射付与される面と、該噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面とを有し、前記溶液が噴射付与される面の表面粗さが前記端面の表面粗さより滑らかであることを特徴とする。
【００２９】
また、請求項１８記載の発明は、請求項１７に記載の基板において、前記溶液が噴射付与される面と、該噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面が形作るコーナー部を面取りした面取り面とを有し、前記面取り面の表面粗さが前記溶液が噴射付与される面の表面粗さより粗いことを特徴とする。
【００３０】
また、請求項１９記載の発明は、請求項１７又は１８に記載の基板において、請求項８から１６のいずれか１項に記載の反応性物質の反応装置によって反応が行われたことを特徴とする。
【発明の効果】
【００３１】
本発明によれば、少量の検体でより多くの塩基配列の情報を獲得することができ、かつ、複数種の核酸プローブの中から適切なプローブへ標的核酸を付与することで反応検出を効率的に行いうる反応性物質の反応方法、その反応装置等が実現される。
【発明を実施するための最良の形態】
【００３２】
ＤＮＡ（Deoxyribo Nucleic Acids ：デオキシリボ核酸）チップ（ＤＮＡマイクロアレイともいう）とは、ＤＮＡの塩基の相補性を利用し、検査を行うためのものである。ＤＮＡとは、塩基、糖（デオキシリボース）及びリン酸が結合したもの（ヌクレオチド）がさらに結合し、最終的には２重らせん形となったものである。ここで、塩基はアデニン（Ａ）、グアニン（Ｇ）、シトシン（Ｃ）、チミン（Ｔ）の４種類がある。なお、ここでいうＤＮＡとは、逆転写酵素を用いてＲＮＡ（リボ核酸）に基づいて相補的に生成されたｃＤＮＡ（complementary DNA）も含むものとする。
【００３３】
本発明は、これらＤＮＡを基板上に付与しアレイ化してなる各種チップを製作するためのものである。その際、ＤＮＡを含む溶液を付与する場合に、インクジェット原理の溶液噴射手段を利用するものである。
【００３４】
＜実施形態１＞
まず、本発明の第１の実施形態である反応性物質の反応装置について説明する。図１及び図２を用いて、本実施形態の反応装置における液体噴射ヘッド１００について説明する。なお、この例では噴射ノズル（噴射口、出口）１を７個示しているが、必ずしもこの数に限定されるものではない。
【００３５】
この液体噴射ヘッド１００は、溶液５６が導入される流路４５内にエネルギー作用部としてピエゾ素子４６を設けたもの（ピエゾ方式）である。ここで溶液はＤＮＡを含む溶液であるが、それについて後に詳述する。
【００３６】
ピエゾ素子４６にパルス状の信号電圧を印加して図１（ａ）に示すようにピエゾ素子４６を歪ませると、流路４５の容積が減少するとともに圧力波が発生し、その圧力波によって噴射ノズル１から液滴４３が吐出する。図１（ｂ）は、ピエゾ素子４６の歪みがなくなって流路４５の容積が増大した状態である。
【００３７】
ここで噴射ノズル１直前の流路４５に導入される溶液５６は、フィルター５７を通過してきたものである。本実施形態ではこのように、フィルター５７を噴射ヘッド内に設け、ノズル目詰まりの原因となる異物を除去する機能を噴射ノズル１の最近傍に持たせている。このようにすることにより、本実施形態の溶液中の異物粒子をトラップし、基板上にＤＮＡアレイを良好に形成できるようにしている。
【００３８】
このようなフィルター５７は、小型の簡易フィルターとすることによって、図２に示したように液体噴射ヘッド１００内に組み込むことが可能となっている。そして、液体噴射ヘッド１００そのものもコンパクト化を実現できている。このようなフィルター５７は、例えばステンレスメッシュフィルターが好適に用いられ、その孔径（フィルターメッシュサイズ）は０．８μｍ〜２μｍとされる。
【００３９】
次に、液体噴射ヘッド１００の他の例について、図３を用いて説明する。この例は、サーマル方式（バブルジェット（登録商標）方式）の液体噴射ヘッド１００の例であり、液滴噴射の原動力は、ＤＮＡ溶液中で瞬時に発生する膜沸騰気泡の成長作用力である。また、ここで示した液体噴射ヘッドは、溶液が流れる流路端部から液滴が噴射するタイプのものであり、エッジシューター型と呼ばれるものである。
【００４０】
ここでは、液体噴射ヘッド１００のノズル数を４個とした例を示している。この液体噴射ヘッド１００は、発熱体基板６６と蓋基板６７とを接合させることにより形成されており、発熱体基板６６は、シリコン基板６８上にウエハプロセスによって、個別電極６９と共通電極７０とエネルギー作用部である発熱体７１とを形成することによって構成されている。
【００４１】
一方、蓋基板６７には、機能性材料を含有する溶液が導入される流路を形成するための溝７４と、流路に導入される該溶液を収容する共通液室を形成するための凹部領域７５とが形成されており、これらの発熱体基板６６と蓋基板６７とを図３に示すように接合させることにより、流路及び共通液室が形成される。
【００４２】
なお、発熱体基板６６と蓋基板６７とを接合させた状態においては、流路の底面部に発熱体７１が位置し、流路の端部にはこれらの流路に導入された溶液の一部を液滴として吐出させるためのノズル６５が形成されている。ここではノズル形状は矩形であるが、これは丸形状あるいは半円形状であってもよい。
【００４３】
さらに、より高い噴射安定性を考慮して、端面（ノズル６５の領域）に別途ノズルプレートを設け、所望のノズル径、ノズル形状（例えば丸形状）としてもよい。その場合のノズルプレートとしては、例えばＮｉ等が用いられ、エレクトロフォーミング等の手法によって高精度なものが形成できる。あるいは、樹脂フィルム（基板）にエキシマレーザー加工によってノズル孔を穿孔したものを用いてもよい。
【００４４】
なお、蓋基板６７には、供給手段（不図示）によって供給液室内に溶液を供給するための溶液流入口７６が形成されている。
【００４５】
後述するが、本実施形態ではＤＮＡ溶液を非接触噴射し、ＤＮＡプローブを「ベタ塗り」形成（ある一定領域を全被覆）するプロセスもある。その際、このようなマルチノズル型の液体噴射ヘッド１００を用いると大変効率的にＤＮＡプローブを形成することができる。
【００４６】
なお、この例では４ノズルの液体噴射ヘッド１００を示しているが、必ずしも４ノズルに限定されるものではなく、ノズル数が多ければ多いほどＤＮＡプローブの形成が効率的になることは言うまでもない。ただし、単純に多くすればよいということではなく、多くすれば液体噴射ヘッド１００も高価になり、また噴射ノズルの目詰まりによる確率も高くなるので、それらも考慮し装置全体のバランス（装置コストとＤＮＡチップの製作効率のバランス）を考えて決められる。
【００４７】
また後述するが、本実施形態では、１種類のＤＮＡ溶液を多数のノズルによって噴射するよりも、複数種類のＤＮＡ溶液をその溶液にあわせて用意し噴射するという方法が主たる使用法である。よって、複数個の噴射ヘッド１００をＤＮＡ溶液にあわせて用意する場合も、装置全体のバランスを考えて噴射ヘッドの数が決められる。
【００４８】
図４は、このようにして製作されたマルチノズル型の液体噴射ヘッド１００をノズル側から見た図を示している。本実施形態では、このようなマルチノズル型の液体噴射ヘッド１００を図５に示すように、噴射するＤＮＡ溶液ごとに設け、キャリッジ搭載される。図６はその斜視図である。
【００４９】
図５、図６には、それぞれのマルチノズル型の液体噴射ヘッド１００をＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄと符号をつけているが、それぞれ各液体噴射ヘッドＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄは、ノズル部分が液体噴射ヘッドごとに離間して構成されるとともに、液体噴射ヘッドごとに異なる種類のＤＮＡ溶液を噴射することができる。
【００５０】
これらの各液体噴射ヘッドＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄは一体化されているので、そのノズル部分（噴射口領域）はほぼ同じ平面状にある。いうなれば、これらのノズル部分（噴射口領域）は仮想同一平面を構成している。今これが仮想ではなく、例えば共通の１枚のノズルプレートに複数個吐出口を形成したような噴射ヘッドユニットであったとすると、このノズルプレートを伝わって、隣接する噴射口から吐出する溶液で、異なる溶液同士が互いに混じり合うということが起こる。
【００５１】
本実施形態ではこれを避けるために、異なるＤＮＡ溶液を噴射する噴射口領域は、前記の仮想同一平面内に位置していても、互いに独立した構造となるように構成している。そして、その各ＤＮＡ溶液は、例えばノズルの外側面を伝わって互いが混じらないようにしている。すなわち、各液体噴射ヘッドＡ、Ｂ、Ｃ、Ｄは、それぞれ別々に形成された噴射ヘッドを積層し，そのノズル面が隣接噴射ヘッドで微小段差ができるようになっている（図６では微小段差は単に線で示している）。つまり、ディスクリート構造になっている。
【００５２】
あるいは、図示しないが、このように積層する際に、各噴射ヘッドの間に離間部材を設けたり、物理的な空隙を設けたりして積層するように構成してもよい。
【００５３】
このような構成をとることにより、本実施形態においては、隣接する噴射口間において異なる溶液が噴射口の外側を伝って混じり合い、反応精度を低下させるということがなくなる。
【００５４】
なお、上記説明では液体噴射ヘッド１００としてピエゾ方式とサーマル方式（バブルジェット（登録商標）方式）の例を挙げたが、任意の液滴を定量吐出できるものであれば他の方式でもよい。つまり、０．１ｐｌ〜数１００ｐｌ程度の液滴を形成できるインクジェット原理のものであれば、これらの方式に限らず他の方式でもよい。
【００５５】
次に、このような液体噴射ヘッド１００をＤＮＡ溶液噴射手段として用いた反応性物質の反応装置について、図７を参照しながら説明する。ここで、液体噴射ヘッド１００は上記説明（図６）のような積層構造のものであるが、図３のようなものを積層せずに複数つなぎ合わせた構成（例えばラインヘッド構成）としてもよい。
【００５６】
Ｙ方向駆動軸１０２には、Ｙ方向駆動モータ１０３が接続されている。Ｙ方向駆動モータ１０３は、例えばステッピングモータ等である。制御手段１０７からＹ軸方向の駆動信号が供給されると、Ｙ方向駆動軸１０２を回転させる。Ｙ方向駆動軸１０２が回転させられると、液体噴射ヘッド１００は、Ｙ方向駆動軸１０２の方向に沿って移動する。Ｘ方向ガイド軸１０４は、基台１０６に対して動かないように固定されている。
【００５７】
作業台１０１は、製造すべき検出用基板１０８を複数枚設置させることができ、図７の例では、検出用基板１０８は、作業台１０１上に４８枚（８×６）並べられている。また、作業台１０１には作業台駆動モータ１０５が備えられている。作業台駆動モータ１０５も、例えばステッピングモータ等である。制御手段１０７からＸ軸方向の駆動信号が供給されると、作業台１０１をＸ軸方向に移動させる。
【００５８】
すなわち、作業台１０１をＸ軸方向に駆動し、液体噴射ヘッド１００をＹ軸方向に駆動させることで、液体噴射ヘッド１００を複数個配置された検出用基板１０８上のいずれの場所にも自在に移動させることができる。また、検出用基板１０８に対する液体噴射ヘッド１００の相対速度も、各軸方向の駆動機構によって駆動する作業台１０１と液体噴射ヘッド１００の速度によって定まる。
【００５９】
制御手段１０７は、液体噴射ヘッド１００の液滴吐出用の電圧を印加し、液滴吐出の制御を行う。また、Ｙ方向駆動モータ１０３には、液体噴射ヘッド１００のＹ軸方向の移動を制御する駆動信号を送信する。作業台駆動モータ１０５には、作業台１０１のＸ軸方向の移動を制御する駆動信号を送信する。
【００６０】
なお、本実施形態では、液体噴射ヘッド１００はＹ軸方向にしか移動せず、Ｘ軸方向については作業台１０１が移動するようにした。これを逆にしてもよいし、また、液体噴射ヘッド１００若しくは作業台１０１のどちらか一方、又は双方がＸ軸方向及びＹ軸方向の双方に移動できるようにしてもよい。
【００６１】
また、液体噴射ヘッド１００をカートリッジ化し、駆動制御部分から着脱自在にすることで容易にヘッドを交換でき、ＤＮＡ溶液を換えて噴射する場合に洗浄を行う必要がないので、時間等を節約することができる。さらに、他のＤＮＡ溶液と混じり合うこともなく、クロスコンタミネーションを防止することができる。
【００６２】
このような液体噴射ヘッド１００は、前述のように、噴射付与する溶液に応じて（検出用プローブ溶液と検体溶液に応じて、あるいはプローブ用、検体用溶液の種類に応じて）、それぞれ別々の液体噴射ヘッド（Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ・・・等）となっており、液体噴射ヘッドごとに異なる種類の溶液を噴射することができる。そしてそれは、本発明の主たる目的である反応を行うために溶液噴射付与を行うという用途の他に使用することも可能であるが、それについては後述する。
【００６３】
＜実施形態２＞
次に、本発明の第２の実施形態である反応性物質の反応方法について説明する。本実施形態の反応方法は、塩基配列が既知であり、相対的に入手が容易なオリゴヌクレオチドを検出用プローブとして用い、限られた試料量の検体について、検出用プローブの前記オリゴヌクレオチドに対する結合性の有無、あるいは、その結合能の強弱を、そして、両者間での複合体形成の有無、あるいは、その効率を評価する際に、検出用プローブである各オリゴヌクレオチド一種当たりの評価に要する検体の消費量をより僅かな量とすることが可能な、新規な検出方法である。
【００６４】
より具体的には、検出用プローブのオリゴヌクレオチド複数種がマトリクス状に配置されてなるＤＮＡプローブ・マトリクスを検出用基板に利用し、マトリクスの各区画に固着されている既知の塩基配列を有するＤＮＡプローブに対して、ハイブリダイゼーションするか否かを検出して、多数の検体サンプルについて、その中に特定の塩基配列を有する核酸分子が含有されるか否かの検定を同時に行う場合、各ＤＮＡプローブ当たりに要する検体の消費量を低減した際にも、十分に高い検出感度を達成することが可能な核酸分子の検出方法の形態として好適に利用可能な、新規な検出方法である。
【００６５】
本実施形態では、検出用プローブとして、その塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを用いる。より具体的には、後述するが、このオリゴヌクレオチドを、グリセリン、尿素、チオジグリコール等を含む溶液に８％ほど含む溶液（第１の溶液）とするとともに、このオリゴヌクレオチドと結合能を有する対象成分（例えば核酸分子）を検出する際、表面に検出用プローブとなるオリゴヌクレオチドを固定した検出用基板を対象成分（例えば核酸分子）に含む溶液（第２の溶液）に浸し、ハイブリダイゼーション反応を行う。
【００６６】
なお、プローブのオリゴヌクレオチドと対象成分（例えば核酸分子）との複合体を形成し、然るべき標識を利用して該複合体を検出する手法が利用されるが、本実施形態では、対象成分（例えば核酸分子）を含む溶液（第２の溶液）に検出用基板を浸す代わりに、所定の区画にプローブのオリゴヌクレオチドを固定しておき、この区画上に対象成分（例えば核酸分子）を含む溶液（第２の溶液）をインクジェット原理の溶液噴射ヘッドにより、一定の液量を非接触でスポット状に付与し、かかる微小液滴内でハイブリダイゼーション反応を行うようにしている。
【００６７】
その結果得られる複合体を、顕微検出系等を利用してスポット位置を選択しつつ検出することにより、高い検出精度、また感度を得ているのである。本実施形態の手法を用いると、プローブのオリゴヌクレオチドに作用させる試料溶液（第２の溶液）は、各プローブのオリゴヌクレオチド当たり、スポットの微小液滴に用いる液量を要するのみであり、プローブのオリゴヌクレオチドが複数種あったとしても、その合計液量は、検出用基板全体を浸すに要する液量よりはるかに少量とすることができる。
【００６８】
加えて、検体試料ごとにそれぞれ一定の液量をスポット状に載せるため、隣接するスポット間で互いの液滴が混合を生じないように、スポット径とスポット間隔を選択することにより、一度に複数の検体試料に関して、本質的に同じ条件の下で各プローブのオリゴヌクレオチドに対して結合能を示す対象成分（例えば核酸分子）の有無を、同じ感度、精度で検出・評価できる。
【００６９】
したがって、各プローブのオリゴヌクレオチドを検出用基板上の所定の区画内に均一に固定し、その区画相互間で、プローブのオリゴヌクレオチド間の混合・汚染を生じないようにし、さらに、この区画複数を整然とマトリクス状に配置し、また、各区画内にスポットする検体試料複数に関して、そのスポットをも整然と並んだアレイ・マトリクス状に行うと、結果として、検出用プローブ多種に対し、検体試料多数に関して、一度にその検出操作を実施することも可能となる。
【００７０】
すなわち、本実施形態の検体試料中の対象成分の検出方法は、塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを検出用プローブとして用い、前記オリゴヌクレオチドに対する結合能を有する対象成分が液状の検体試料中に含有されるか否か、あるいは、その結合能の強弱を評価するため、オリゴヌクレオチドと対象成分との間で形成される複合体を検出する方法であって、検出用プローブとして用いる、前記塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドが、少なくとも一種以上あるものである。また、評価の対象となる検体試料が少なくとも二種以上であるものである。
【００７１】
このような１種以上の検出用プローブ用オリゴヌクレオチドが、所定の固相基板上、それぞれ所定の区画に予め結合してなる検出用基板を用い、検出用プローブ用オリゴヌクレオチドが予め結合されている各区画内に、２種以上の検体試料それぞれについて、スポット位置が規定のアレイ形状をなすように、スポットごとに所定の試料液量を複数個スポットする工程と、各検体試料に対する複数個のスポットについて、それぞれオリゴヌクレオチドと対象成分との間で形成される複合体の有無を検出する工程と、検出結果に基づき、オリゴヌクレオチドに対する結合能を有する対象成分が含有されるか否か、あるいは、その結合能の強弱を判定する工程とを含む検体試料中の対象成分の検出方法である。
【００７２】
その際、検出用基板上の所定区画に結合しているオリゴヌクレオチドの有する、既知の塩基配列の長さが２〜１００塩基長であるとき、本実施形態の方法はより好適な検出方法となる。
【００７３】
なお、本実施形態の検出方法は、評価の対象となる液状の検体試料が、それぞれ塩基配列未知の核酸を少なくとも一種含む溶液であり、各検体試料について、オリゴヌクレオチドそれぞれとの間で複合体形成の有無を検出することにより、検体試料に含有される塩基配列未知の核酸中に、それぞれのオリゴヌクレオチドに対する結合能を有する対象成分として、オリゴヌクレオチドそれぞれの既知塩基配列に対し、相補性を有する塩基配列を有する核酸分子が含まれるか否かを、その評価の目的とする検出方法として実施すると好ましいものとなる。
【００７４】
具体的には、評価の対象となる液状の検体試料がそれぞれ含む核酸中に、生体組織から抽出したｍＲＮＡのセットが含有されている際に、好適な検出方法である。同様に、評価の対象となる液状の検体試料がそれぞれ含む核酸中に、生体組織から抽出したｍＲＮＡのセットをもとに調製されたｃＤＮＡライブラリーが含有されている際にも、好適な検出方法である。その際、評価の対象となる液状の検体試料がそれぞれ含む核酸が、１００〜５０００塩基長の核酸であることが望ましい。
【００７５】
加えて、検出の対象成分として、核酸分子以外にも、例えば、評価の対象となる液状の検体試料が、それぞれ互いに異なる蛋白質少なくとも一種を含む溶液である際にも、本実施形態の検出方法は好適に利用できる。また、評価の対象となる液状の検体試料が、それぞれ互いに異なる化学物質少なくとも一種を含む溶液である際にも、本実施形態の検出方法は好適に利用できる。本実施形態の検出方法は、特には、評価の対象となる液状の検体試料が、それぞれ異なる生物種、組織、細胞からの抽出物である際に、その実用上の利点・効果が一層発揮される。
【００７６】
本実施形態の検出方法において、複数の対象成分の検出を実施する際には、検出用プローブに用いるオリゴヌクレオチドとして、それぞれ互いに異なる既知の塩基配列を有する複数種を用い、それぞれが結合される区画が基板上に複数個マトリクス状に配置されてなる検出用基板を用いることができる。
【実施例】
【００７７】
以下、本実施形態の実施例として、実際にＤＮＡプローブアレイを形成するとともに、ｃＤＮＡを付与し、ハイブリダイゼーション反応を行い、塩基配列の変異を検出する具体的な例を説明する。
【００７８】
１．基板洗浄
２５．４ｍｍ×７６．２ｍｍ（厚さ１．１ｍｍ）のガラス基板をラックに入れ、界面活性剤溶液中で２０分間超音波洗浄を行い、その後、純水により界面活性剤を除去する。さらに、純水中で超音波処理を１５分間行う。
【００７９】
次に、このガラス基板を１Ｎ水酸化ナトリウム溶液に３０分間浸し、取り出し後、表面に付着する１Ｎ水酸化ナトリウム溶液を純水により洗い流す。
【００８０】
２．表面処理
前記した洗浄済みのガラス基板を、２％シランカップリング剤水溶液（信越化学工業社製  商品名ＫＢＭ６０３）に室温で３０分浸し、その後、窒素ガスを吹き付けて、水分を飛ばして乾燥させる。さらに、１１５℃のオーブンで１時間ベークし、ガラス基板表面に対するシランカップリング剤処理を完結させる。
【００８１】
次に、ＥＭＣＳ（Ｎ−（６−Ｍａｌｅｉｍｉｄｏｃａｐｒｏｙｌｏｘｙ）ｓｕｃｃｉｎｉｍｉｄｅ：Ｄｏｊｉｎ社製）を３ｍｇ秤量し、ジメチルスルホキシド／エタノールの１：１溶液に溶解し（最終濃度０．３ｍｇ／ｍｌ）、前記シランカップリング剤処理を行ったガラス基板を、このＥＭＣＳ溶液に２時間浸し、基板表面を被覆しているシランカップリング剤のアミノ基とＥＭＣＳ溶液のカルボキシル基を反応させる。この反応に伴い、シランカップリング剤を介して、ＥＭＣＳによる被覆がなされ、ガラス表面にはＥＭＣＳ由来のマレイミド基が表面に存在する。ＥＭＣＳ溶液との反応を終えたガラス基板は、純水洗浄後、窒素ガスで乾燥させる。このマレイミド基を導入する表面処理を施したガラス基板を、後述するＤＮＡとの結合反応に用いる。
【００８２】
３．ガラス基板固定用ＤＮＡの合成
ガラス基板上に固定するために、表１に示した塩基配列を有する６４種のオリゴヌクレオチドを化学合成する。
【００８３】
表１に示した６４種のＤＮＡは、癌抑制遺伝子であるｐ５３遺伝子の遺伝子産物（ｐ５３蛋白質）のアミノ酸配列２４８及び２４９番目に注目し、この２アミノ酸をコードする塩基配列をもとに、種々の塩基変異が加わった配列となるように選ばれる。具体的には、もととなる塩基配列ＣＧＧＡＧＧの中で変異頻度が高いのは、２４８番目のアミノ酸をコードするＣＧＧの１番目のＣがＴに、２番目のＡがＧに、そして２４８番目のアミノ酸をコードするＡＧＧの３番目のＧがＴに、それぞれ変異している場合であることが知られている。そこで、この３カ所の塩基が種々に変異した塩基配列と結合可能な配列を有するように６４種のプローブを設計すればよい。
【００８４】
実際にはプローブ全長を１８ｍｅｒとし、その中央にこの変異を含む６塩基を位置させ、その前後に各塩基長６の共通な塩基配列を置く構造とする。より具体的には、５’末端からＡＴＧＡＡＣの共通塩基配列、続く変異を含む部分として塩基配列ＮＮＧＡＧＮ、さらに、３’末端側にＣＣＣＡＴＣの共通塩基配列を有する配列５’ＡＴＧＡＡＣＮＮＧＡＧＮＣＣＣＡＴＣ３’に対する相補的な塩基配列とする。つまり、配列５’ＧＡＴＧＧＧＮＣＴＣＮＮＧＴＴＣＡＴ３’で示されるプローブとする。なお、ＤＮＡプローブとするため、前記塩基配列中、Ｎと表記した部位は、４種のＤＮＡ核酸塩基であるＡ、Ｇ、Ｃ、Ｔの何れかを意味する。
【００８５】
【表１】
2008003004.tif 000003
【００８６】
４．６４種プローブ・マトリクスの作製
次に、グリセリン、尿素、およびチオジグリコールをそれぞれ最終濃度８％、アセチレノールＥＨを最終濃度１．２％含む８μＭの溶液（第１の溶液）に、上記６４種のＤＮＡのそれぞれを調製する。そして。液体噴射ヘッドとして図１〜図６に示したようなインクジェット原理のものを利用し、液体噴射ヘッドに溶液を補給する溶液容器に異なるＤＮＡプローブ溶液を充填し、溶液を噴射できるようにする。上記のようにＤＮＡプローブ溶液は６４種あるので、この液体噴射ヘッドも６４個用意する。
【００８７】
このような６４個の液体噴射ヘッドを用いて、計６４種類のＤＮＡプローブを各２ｍｍ角の区画に非接触で「べた塗り」形成し、図８に示すように、等間隔でマトリクス（８×８）状に配置した検出用基板とする。また、図９は、検出用基板上にマトリクス（８×８）状に配置した、６４種ＤＮＡプローブの配置図を示す。
【００８８】
なお、ここで「べた塗り」状態とするには以下のようにすればよい。すなわち、今、オリゴヌクレオチドを含む検出用プローブ溶液（第１の溶液）による基板上における１滴のドット１１１の径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、図１０に示すように、Ｄ1ｄ≧√２・Ｄ1ｐとなるようにすれば、上下、左右、斜めの隣接ドットが重なり合ってこの溶液による非被覆部がなくなり、いわゆる「べた塗り」状態を得ることができる。具体的な数字を挙げると、仮に８００ｄｐｉの印写密度で「べた塗り」を行うとした場合、Ｄ1ｐ＝３１．７５μｍであるから、Ｄ1ｄ≧４４．９μｍとすれば非被覆部がなくなり、いわゆる「べた塗り」が実現する。
【００８９】
なお、上記「べた塗り」条件の不等式は、その技術思想を示すものであり、実際に溶液を噴射付与した場合には、噴射溶液の質量のばらつき（５％以内）があり、基板上における１滴のドット１１１の径Ｄ1ｄも厳密にはばらつく。よって、単純に幾何学的に見た場合、そのばらつきによって、「べた塗り」が得られない場所も存在する可能性もあるが、実際には、隣接ドット間で溶液が多少相互に流れるので、上記不等式の条件で打ち込めば、噴射溶液の質量のばらつきが多少あっても「べた塗り」は実現する。
【００９０】
そして、このオリゴヌクレオチドを含む検出用プローブ溶液（第１の溶液）による「べた塗り」パターンが作成された後、該パターン中の揮発物質が揮発された（パターン乾燥後）基板上（パターン上）には、次のプローブのオリゴヌクレオチドに作用させる試料溶液（検体）、例えば核酸分子を含む溶液、ｃＤＮＡ溶液（第２の溶液）がドット状に付与される。
【００９１】
なお、ここでいう揮発、あるいは乾燥の意味であるが、常識の範囲で考えられる揮発や乾燥の意味である。例えば厳密にいえば、不揮発といわれる物質であっても、微視的（分子オーダー）にみれば揮発する。しかしながらここでは、通常の室温環境において、水のような液体が例えばガラス基板上に液滴の状態（ドーム状のドット）であったものが蒸発、乾燥して、ガラス基板面がぬれた状態ではなく、乾いた状態になるという常識的な乾燥の意味である。
【００９２】
５．６４種のオリゴヌクレオチド結合基板表面（プローブ・マトリクス）へのｃＤＮＡ溶液の供給
癌の組織から得られた６４種のｃＤＮＡライブラリーから、ＰＣＲ反応によりｐ５３遺伝子断片を取得する。
【００９３】
具体的には、まず、バイオプシーで採取した各組織からＣａｔｒｉｍｏｘ−１４（Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社）を用いて、全ＲＮＡサンプルを分離・採取する。この全ＲＮＡサンプル溶液をもとに、Ｆｉｒｓｔ−Ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  Ｋｉｔ（Ｌｉｆｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ社製）を用いて、ｃＤＮＡライブラリーを調製する。このｃＤＮＡライブラリーに、ｐ５３遺伝子増幅用プライマーを加え、ｐ５３遺伝子断片をＰＣＲ増幅する。そして、このＰＣＲ増幅産物をテンプレートとして、標識された５’側のプライマーを用いて、片鎖のみを増幅するようなＰＣＲ反応（ＤＮＡ合成反応）を行う。この再増幅により、標識されたｐ５３遺伝子由来の一本鎖ＤＮＡを調製することができる。
【００９４】
次に、前記の標識されたプライマーとして、Ｔ３プロモーターを利用するオートシーケンサー用のプライマー（タカラバイオ株式会社製）を利用するため、まず末端にＴ３サイトを持ち、その下流にｐ５３遺伝子部分が増幅可能であるような塩基配列を連結したプライマーを合成する。そして、このプライマーを用いてＰＣＲ反応を行い、ｐ５３遺伝子部分に、Ｔ３プロモーター部位が連結されたＰＣＲ増幅産物を得る。
【００９５】
この例は、ｐ５３遺伝子増幅用の５’末端プライマーに対して、その５’側にＴ３プロモーター部位を連結した、塩基配列のプライマー（Ｔ３−Ｐ５３）を作製するものである。その塩基配列を下に示す。
５’ＡＡＴＴＡＡＣＣＣＴＣＡＣＴＡＡＡＧＧＧＡＡＣＣＴＧＡＧＧＴＴＧＧＣＴＣＴＧＡＣＴＧＴＡＣＣＡＣＣＡＴＣＣ３’
【００９６】
配列中、５’末端側の下線部がＴ３ポリメラーゼ結合サイトである。一方、増幅用の３’末端プライマーには、市販の増幅キット、ＣＬＯＮＴＥＣＨ社の「Ｈｕｍａｎ  ｐ５３Ａｍｐｌｉｍｅｒ  Ｓｅｔ」中に添付される３’末端プライマーを用いる。ＰＣＲ反応溶液には、「ｏｎｅ  ｓｈｏｔ  ＬＡ  ＰＣＲ  Ｍｉｘ」（タカラバイオ株式会社製）を用いる。
【００９７】
ＰＣＲ反応における溶液組成は、例えば下記の比率である。
ｏｎｅ  ｓｈｏｔ  ＬＡ  ＰＣＲ  Ｍｉｘ      ２５μｌ
Ｔ３−Ｐ５３ｐｒｉｍｅｒ（２０μＭ）          １μｌ
３’ｐｒｉｍｅｒ（２０μＭ）                  １μｌ
ｃＤＮＡライブラリー溶液                      ｌμｌ
ＤＷ                            ２２μｌ  ／５０μ１
【００９８】
ＰＣＲサイクルは、例えば９７℃で５分間熱変性後、９７℃２８秒、５５℃２８秒、７２℃５５秒のサイクルを２９回行い、最後に７０℃で５分間保持しする条件を用って、反応物を冷却後に５℃で一時保存すればよい。
【００９９】
反応後、ゲル電気泳動を行うことにより、３００ｍｅｒ程度の分子量域にＰＣＲ産物が形成できる。このＰＣＲ産物をＭｉｃｒｏ  Ｓｐｉｎ  Ｃｏｌｕｍｎ  Ｓ２００（Ｐｈａｒｍａｃｉａ社製）で精製して、Ｔ３プライマーが結合可能なｐ５３遺伝子断片（Ｔ３−ｌｉｎｋｅｄ  ｐ５３  ＤＮＡ）を得ることができる。
【０１００】
このようにして得られるｐ５３遺伝子断片を鋳型に、Ｒｈｏ−Ｔ３プライマー（タカラバイオ株式会社製）を用いてＰＣＲ反応により、一本鎖標識ＤＮＡを得ることができる。反応溶液の組成は、例えば下記の比率である。
ｏｎｅ  ｓｈｏｔ  ＬＡ  ＰＣＲ  Ｍｉｘ      ２５μｌ
Ｒｈｏ−Ｔ３ｐｒｉｍｅｒ（１０μＭ）          １μｌ
Ｔ３−ｌｉｎｋｅｄ  ｐ５３  ＤＮＡ            １μｌ
ＤＷ                             ２３μｌ ／５０μｌ
【０１０１】
反応サイクルは、例えば９７℃で３０秒、５０℃で２０秒、６０℃で５分を２５回繰り返す条件を用い、反応物を冷却後、５℃で一時保存すればよい。Ｍｉｃｒｏ  Ｓｐｉｎ  Ｃｏｌｕｍｎ  Ｓ２００で精製後、ゲル電気泳動で、ＰＣＲ反応により目的のローダミン標識一本鎖ＤＮＡが合成される。
【０１０２】
このようにして得られる検体試料、すなわちｐ５３遺伝子由来のローダミン標識一本鎖ＤＮＡの溶液に食塩を最終濃度１Ｍになるように加え、各ｃＤＮＡライブラリー６４種から調製される、ｐ５３遺伝子由来のローダミン標識一本鎖ＤＮＡの溶液は、例えば液体噴射ヘッドで、図８に示すような、各２ｍｍ角のプローブ固定領域に、８×８の二次元アレイ状に非接触でスポット付与される。液体噴射ヘッドとしては、前述のようなピエゾ方式のもの、あるいはサーマル方式のものが利用できる。なお、ピエゾ方式のものは熱を使わないため、サーマル方式のものよりも使用できる溶液の自由度が高い。
【０１０３】
このような液体噴射ヘッド及びそれに溶液を補給するための溶液容器をそれぞれ６４個用意し、異なるｐ５３遺伝子由来のローダミン標識一本鎖ＤＮＡ溶液を充填し、噴射、付与する。８×８の二次元アレイ状のスポットを，マトリクス（８×８）状に配置されている各ＤＮＡプローブを固定する区画上に形成する例を図１１に模式的に示す．
【０１０４】
ここで後述のハイブリダイゼーション反応を精度よく行うために、このような第２の溶液、すなわち各検体試料溶液が検体試料溶液に、それぞれ独立したドット状であって、隣接するドット間で、互いの液滴が混合を生じないようにするための条件を簡単に説明する。すなわち、今、この検体試料溶液（第２の溶液）による基板上（第１の溶液によるパターン上）における１滴のドット１１２の径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、図１２に示すように、Ｄ2ｄ＜Ｄ2ｐとなるようにすれば、上下、左右、斜めの隣接ドットが互いに重なり合うことなく、完全に独立した状態でドット形成できる。
【０１０５】
なお、上記説明では、先にオリゴヌクレオチドを含む検出用プローブ溶液（第１の溶液）による「べた塗り」パターンを作成し、乾燥させる。その後、オリゴヌクレオチドに作用させる検体試料溶液、例えば核酸分子を含む溶液（第２の溶液）をドット状に形成するが、第１の溶液と第２の溶液のパターン形成の順序を逆にしてもよい。すなわち、先に検体試料溶液、例えば核酸分子を含む溶液（第１の溶液と記す）による独立したドット状のパターンを形成し乾燥させた後、オリゴヌクレオチドを含む検出用プローブ溶液（第２の溶液と記す）による「べた塗り」パターンを作成し、その後、ハイブリダイゼーション反応を行うという方法である。
【０１０６】
この場合は、先に説明した「べた塗り」パターン作成条件、あるいは独立したドット状パターン形成条件は次のようになる。すなわち、第１の溶液（この場合、検体試料溶液、例えば核酸分子を含む溶液）による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ＜Ｄ1ｐとして、溶液噴射によって独立したドット状パターン形成する。その後、パターン中の揮発物質の揮発後（乾燥後）、第２の溶液（この場合、オリゴヌクレオチドを含む検出用プローブ溶液）の基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ≧√２・Ｄ2ｐとなるように、溶液噴射により非被覆領域がないようにすることができる。
【０１０７】
６．ハイブリダイゼーション反応
次に、検体試料であるローダミン標識一本鎖ＤＮＡ溶液計６４種をスポットしたこの検出用基板を、４０℃に設定した加湿チャンバー内に放置し、ハイブリダイゼーション反応を３時間行う。その後、検出用基板を１００ｍＭＮａＣｌを含む１０ｍＭリン酸緩衝液にて洗浄し、ハイブリッド体形成に関与しなかった検体試料を除去する。
【０１０８】
ハイブリダイゼーション反応後、８×８の二次元アレイ状にスポットした検体試料を、蛍光標識ローダミンに適する、励起光、蛍光用のフィルター・セットを装着した蛍光顕微鏡を用いて観察する。
【０１０９】
図１３は、その結果を模式的に示したものである。図９に示す配置において、４２番の正常な遺伝子の塩基配列に対応するプローブ上へのスポットに関しては、５カ所のスポットで蛍光強度が弱く（図では灰色ドットで示す）、１カ所のスポットで蛍光が観察されない（図ではブランクで示す）。また、１０番目のプローブ領域において３カ所、４１番目のプローブ領域において２カ所、４６番のプローブ領域において１カ所、それぞれスポットが蛍光を発することが観察される（図では黒ドットで示す）。
【０１１０】
これら変異のある塩基配列を有するプローブ領域において、ハイブリッド体形成に伴う蛍光が観測されるスポット位置は、上記４２番目の本来の塩基配列を有するプローブ領域において、蛍光強度が弱いスポット位置と対応している。したがって、両者間でそのプローブの塩基配列を比較すると、４２番目のプローブが有する本来の塩基配列ＣＣＴＣＣＧに対して、１０番目のプローブの塩基配列はＡＣＴＣＣＧ、４１番目のプローブの塩基配列はＣＣＴＣＣＡ、４６番目のプローブの塩基配列はＣＣＴＣＴＧである。その相補的配列は、４２番目のＣＧＧＡＧＧに対して、１０番目ではＣＧＧＡＧＴとＧがＴに、４１番目ではＴＧＧＡＧＧとＣがＴに、４６番目ではＣＡＧＡＧＧとＧがＡに、それぞれ変異したものであることがわかる。すなわち、これら１０番目、４１番目、４６番目のプローブとハイブリッド体形成する検体試料においては、それに含まれるｐ５３遺伝子由来のｃＤＮＡ断片は、前記の変異によって、４２番目のプローブに対しては１塩基ミスマッチを起こしていることが確認できる。このような方法により、６４種の検体試料全てについて、変異の有無、その種類を同時に検出することができる。
【０１１１】
なお、上記説明はＤＮＡチップの例をあげて詳述したが、本発明のシステムはこれに限定されるものではない。例えば、プロテイン（蛋白質）チップ、他の核酸（例えば、Ｒｉｂｏ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ：リボ核酸、Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ：ペプチド核酸等）チップ等、他のバイオ、ウィルス等の生体化学に関する分子（生体分子）のマイクロアレイ、物質検査のチップ等に利用することもできる。
【０１１２】
＜実施形態３＞
次に、本発明の第３の実施形態について説明する。実施形態１において、液体噴射ヘッドごとに異なる種類の溶液を噴射し、反応を行うため以外の用途にも使用することが可能であると前述した。また、例えば実施形態２では、図８に示したように、検出用基板１０８に第１の溶液による検出用プローブパターン形成を行い、その後、該溶液の揮発物質の揮発後に第２の溶液によるスポット状（ドット状）のパターン形成を行って反応を行うものである。その際、両液によるそれぞれのパターンが所望の位置に形成されるためには、両者に共通な何らかの位置決め基準となるものが必要である。
【０１１３】
本実施形態はこの点に鑑み、例えば図１４に示したように、この位置決めのための基準位置パターン１１３を設けたものである。この例では、直交する十字架形状のストライプ状のパターンとしているが、形状は必ずしもこのようなものに限定されるものではない。また、この例ではこのようなパターンを２個設けているが、必ずしも２個、あるいはそれ以上必要であるというわけではない。
【０１１４】
要するに図に示したように、Ｘ方向とそれに直交するＹ方向によって定まる（Ｘ，Ｙ）座標が２点決まれば検出用基板１０８の位置決めができ，前記（Ｘ，Ｙ）座標のうちの１つを基準位置として液体噴射ヘッドによる噴射位置を決めてやればよい。この図の場合、基準位置パターン１１３はストライプ状となった面積を有するパターンであるため、各ストライプの左右の辺部分を位置決め座標として採用すれば、２つ以上の（Ｘ，Ｙ）座標を読み取ることができるので、基準位置パターン１１３は１個でその機能を果たすことができる。もし、この基準位置パターン１１３を細い線状とした場合は、直交する２本の細い線の交点の（Ｘ，Ｙ）座標を位置決め座標として採用するので、図１４のように２つ設ければその機能を果たすことができる。
【０１１５】
なお、このような基準位置パターン１１３は、本発明においては、前述のようなオリゴヌクレオチドを含む検出用プローブ溶液（第１の溶液）、あるいは核酸分子を含む溶液（第２の溶液）を噴射付与する噴射ヘッドを、この基準位置パターン１１３形成のために兼用することができる。このように、噴射ヘッドあるいは溶液をこの基準位置パターン１１３形成のために兼用するが、その基準位置パターン１１３形成の場所は、前述の第１及び第２の溶液のパターンによる反応が行われる領域とは離れ、反応領域に接触しない場所とされる。例えば、図１４に示したような検出用基板１０８の隅の方に設ければよい。当然ではあるがこの場合は、同じ溶液を使用するものの、前述の反応には関与しない。単に基準位置パターン１１３を形成するという用途に使用するだけである。
【０１１６】
なお、このような基準位置パターン１１３形成のための溶液は、前記第１あるいは第２の溶液をそれぞれ適宜選んで使用するが、両方の溶液を使用してもよい。両方の溶液を使用した場合、前述の反応に使用する溶液と同じ溶液を使用するわけであるから反応には関与しないとはいっても同様に反応は起こる。しかしながら、その反応結果を前述のように、蛍光顕微鏡を用いて観察するというこの反応の本来の目的には使用しない。単に基準位置パターン１１３を形成し、その後そのパターンを基準位置決めに使用するという、前述の反応とは全く関係のない用途に使用するだけである。
【０１１７】
上記説明は、このような基準位置パターン１１３を形成するのに、実施形態１又は２で使用する第１あるいは第２の溶液、並びにそれらを噴射付与する液体噴射ヘッドを兼用する例であるが、これらの液体噴射ヘッドとは別に、このような基準位置パターン１１３を形成するのに専用の液体噴射ヘッドや後述する検出光学系によって検出しやすいように着色した溶液（インク）を準備してもよい。この場合、専用の液体噴射ヘッドを用意しなければならないが、パターン検出がしやすいというメリットがある。
【０１１８】
このような基準位置パターン１１３の検出手段は、例えばＣＣＤカメラとレンズを用いた検出光学系とされ、基板上の画像情報を光学的に検出し、取り込むことができる。また、図７に示した液体噴射ヘッド１００の近傍に併設され、液体噴射ヘッド１００と同様に、作業台１０１に搭載された検出用基板１０８と相対的な移動が可能となっている。
【０１１９】
ここで、使用する着色した溶液であるが、通常はＣＣＤカメラあるいは他の電子的な検出手段によってパターン検出するため、それらの検出手段で検出できれば、特に人間の可視領域で見える（検出できる）必要はないが、好ましくは、人間の目視によるパターンの有無の検出もできるように、人間の可視領域で見える（検出できる）色にするのがよい。
【０１２０】
この検出光学系によって読み取られた座標情報は、コンピュータに送られる。そして、その基準位置から、上記のような第１の溶液による検出用プローブパターン形成のための噴射位置、あるいは第２の溶液によるスポット状（ドット状）のパターン形成を行うための噴射位置が計算され、その情報に基づいて、液滴噴射付与によるパターン形成が行われる。
【０１２１】
ところで、本発明の基準位置パターン形成手段は、他に図１５に示したように、複数の基板（検出用基板１０８）ごとの識別パターンである識別符号（番号）１１４の形成手段としても利用できる。図１５に１２７ＢＤ．．．という識別符号（番号）１１４を示したが、このような符号、パターン等も、上記反応領域とは別のところに液体噴射原理で簡単に形成でき、大量に扱う基板の識別に有効である。
【０１２２】
例えば、コンピュータからの指示によって基準位置パターン形成手段（液体噴射ヘッド）を稼動させ、製造番号や製造年月日等を簡単に付与できる。通常このような識別符号等は、あとからこの基板に専用の刻印機で刻印したり、シール等を貼ったりすることによって行われるが、本発明では、上記のような反応を行う手段と同様の手段によってコンピュータ指示によって簡単に行うことができる。
【０１２３】
＜実施形態４＞
次に、本発明の第４の実施形態について説明する。実施形態１においては、図７に示したように、作業台１０１に設置された検出用基板１０８と液体噴射ヘッド１００とが相対的な移動を行いながら溶液を噴射し、反応後の検出基板を製作する。その際、液体噴射ヘッド１００が、作業台１０１や検出用基板１０８に接触したりすると装置の故障、破損を招くことがある。本実施形態では、このような故障や破損を防止しようとするものである。
【０１２４】
図１６を参照しながら詳細に説明する。図１６は、図７の液体噴射ヘッド１００や作業台１０１の上下（ここではＺ方向）の位置関係を示すため、それらを水平方向から見た図を示している。ここで、液体噴射ヘッド１００は、検出用基板１０８を保持、搭載した作業台１０１と相対的な移動を行う。ここでいう相対的な移動とは、作業台１０１に設置された検出用基板１０８を固定しておき、液体噴射ヘッド１００が、図７に示したようなＸ、Ｙ方向に移動したり、あるいは逆に液体噴射ヘッド１００を固定しておき、作業台１０１に設置された検出用基板１０８をＸ，Ｙ方向に移動してもよい。さらには、両者とも移動してもよい。いずれにしろそれらは相対的な移動であり、そしてその移動は水平方向（図７のＸ，Ｙ方向）に対して平行移動である。
【０１２５】
よって、その相対的な平行移動に伴い、例えば、液体噴射ヘッド１００の溶液噴射口（ノズル）面を含む仮想平面が存在する。ここで、この溶液噴射口面を含む仮想平面は、図に向かって垂直方向に広がった平面であり、図１６にその仮想平面の位置１１５を示す（この場合、高さ方向、すなわちＺ方向での位置を示す）。
【０１２６】
この溶液噴射口面を含む仮想平面の位置１１５は、液体噴射ヘッド１００の溶液噴射口（ノズル）面が移動する位置である。よって、その位置にはどのような障害物も存在してはならない。すなわち、検出用基板１０８の被溶液付与面１１６は、この溶液噴射口面を含む仮想平面の位置１１５から少なくとも０．５ｍｍ以上、最大５ｍｍ程度まで離すようにして、液体噴射ヘッド１００が平行移動しながら溶液噴射を行う。あるいは、基板保持手段に保持された基板側が平行移動しながら、液体噴射ヘッド１００による溶液噴射を行う。
【０１２７】
また、基板保持手段である作業台１０１の基板保持部分１１７は、この溶液噴射口面を含む仮想平面の位置１１５を基準として、基板の被溶液付与面１１６より遠い位置とする。なお、この基板保持部分１１７を基板の被溶液付与面１１６より遠くする距離は、わずかでよく、例えば０．１ｍｍ〜1ｍｍとすればよい。
【０１２８】
このような配置、構造とすることにより、本発明においては、液体噴射ヘッド１００と基板保持手段に保持された検出用基板１０８とが相対的な平行移動をしながら溶液噴射を行う際に、液体噴射ヘッド１００あるいはその基板保持手段等にぶつかって、装置や液体噴射ヘッド１００等を破損するという事故が回避される。
【０１２９】
＜実施形態５＞
次に、本発明の第５の実施形態について説明する。本発明の実施形態において、検出用基板１０８は、例えば図８に示したようなパイレックス（登録商標）ガラス、青板ガラス等のガラス基板が好適に使用される。そして、検出用プローブ溶液、あるいは核酸分子を含む溶液、さらには基準パターン形成用溶液等のドット状パターン、あるいはライン状パターン、符号等のパターンを良好に形成するために、その溶液が噴射付与される面はなめらかな面とされる。
【０１３０】
具体的には、その面は、ガラス基板製作時に研摩工程を取り入れ、０．１μｍ以下の表面性状に仕上がられるか、あるいはフロートガラス等のようにガラス基板製造時に得られる滑らかな表面性状とすべきである。表面がいわゆる擦りガラス状になっていてガラス基板が不透明になったようなもの（表面粗さ０．３μｍ以上）であっては決してならない。それは、そのような擦りガラス状になっていると、この面に前述のような溶液を噴射付与してドットパターンを形成する場合に、毛管現象により、その表面の粗さに起因する微小クラック部分に溶液が浸透していき、良好な丸いパターンが得られず、輪郭がギザギザになったパターンになってしまうからである。同様に、基準位置決めパターンを形成する場合も良好な輪郭のパターンが得られず、その結果、基準位置決め精度も低下する。
【０１３１】
しかしながら、前述のような滑らか表面性状にしておけばそのような不具合はなく、良好なドットパターンが得られ、反応後の蛍光顕微鏡等による検出精度も向上し、また基準位置決め精度も向上する。
【０１３２】
一方で、本発明の検出用基板１０８は、不必要な領域においては、その表面性状を必要以上になめらかにする必要はない。
【０１３３】
図１７は、図８の断面Ａ−Ａを示したものである。検出用基板１０８について、溶液が噴射付与される面１１８の表面性状は前述のように滑らかである必要があるが、この溶液が噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面１１９は、そこに溶液付与を行うわけではないので、溶液が噴射付与される面１１８のように何らかの加工を行ってその表面性状を確保するといったことは不要である。
【０１３４】
よって、本発明においては、このような端面１１９は特別な加工をすることなく、例えば単に切り出し加工を行ったらそのままの状態とするか、あるいは後加工を行うにしても、溶液が噴射付与される面１１８のような滑らかな状態になるまでのコストアップとなるような加工は行わず、簡単に表面に研削加工を施す程度にとどめておくようにしている。
【０１３５】
このように本実施形態では、溶液が噴射付与される面１１８は、その必要性から積極的に端面１１９より滑らかにして良好なパターン形成を行うようにし、一方で端面１１９は、基板製作コストを下げるためにその加工は行わない、若しくはたとえ行ったとしても、溶液が噴射付与される面１１８のような滑らかさを追求するコストアップとなる加工ではなく、簡単な加工にとどめておくようにしている。
【０１３６】
図１８も同様に図８の断面Ａ−Ａを示したものである。この例では、検出用基板１０８は、溶液が噴射付与される面１１８と、この溶液が噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面１１９が形作るコーナー部を面取りした面取り面１２０とを有した構成としている。そして、このような面取り面１２０の領域の加工方法としては、＃１００番〜＃２０００番のカーボランダム、エメリー等の研摩材を使用したり、あるいはそれらをバインダーで固めた砥石（グラインダー）により簡単に面を落としたり（面取りする）することができる。
【０１３７】
また、面取りされた加工部分の表面粗さについては、溶液が噴射付与される面１１８のそれより粗いようにしている。これは、溶液が噴射付与される面１１８は前述のように良好なパターン形成を行う必要があるのに対して、この面取りする部分はそのような精密パターンを形成する領域ではないので、必要以上に表面の加工精度を高くする必要がないからである。むしろ、溶液が噴射付与される面１１８よりも表面粗さを粗くし、加工コストを下げることが望ましい。
【０１３８】
本実施形態では、この面取り部の表面粗さは０.３μｍ〜５μｍとし、加工コスト低減を実現している。さらに、このように面取り面１２０を設けることにより、作業者が鋭利なコーナー部分で手を切ったりするという不慮の事故を回避するようにしている。
【０１３９】
前記した説明は、溶液が噴射付与される面１１８と、この溶液が噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面１１９が形作るコーナー部を面取りするという説明であるが、図１８に示すように、検出用基板１０８の裏面とそれに対してほぼ垂直の端面１１９が形作るコーナー部においても面取り面１２０を設けることが望ましい。
【０１４０】
なお、上述してきた実施形態は、本発明の好適な実施形態であり、上記実施形態のみに本発明の範囲を限定するものではなく、本発明の要旨を逸脱しない範囲において種々の変更を施した形態での実施が可能である。
【０１４１】
上記の実施形態によれば、反応性物質を含有する溶液を、基板保持手段に保持された基板にインクジェット原理による噴射する溶液噴射工程と、溶液噴射位置を決定するための基準位置を検出する基準位置検出工程と、前記基準位置検出工程により検出された基準位置及びコンピュータからの情報に基づいて、前記基板保持手段の保持位置及び前記溶液噴射工程による噴射位置とを相対的に移動させる移動工程とを有し、前記溶液噴射工程により前記基板上に非接触に前記溶液を付与する反応性物質の反応方法であって、前記溶液噴射工程は、第１の溶液を噴射する第１の溶液噴射工程と、第２の溶液を噴射する第２の溶液噴射工程とを有し、該反応方法は、前記第１の溶液噴射工程により噴射された第１の溶液の揮発物質が揮発した後、前記第２の噴射工程が第２の溶液を噴射して第１の溶液と第２の溶液とを反応させるとともに、該反応が行われる領域とは別の領域において前記反応に関与しない溶液噴射を行うように構成したので、少量の検体を高密度に配列させてなる新規な反応方法が実現できた。また、この反応に関与しない溶液噴射を行うようにしたので、その噴射後の溶液によるパターンをいろいろな用途に使うことができるようになった。
【０１４２】
また、上記の実施形態によれば、このような反応方法において、前記第１の溶液は塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液とし、第２の溶液は核酸分子を含む溶液とし、ハイブリダイゼーション反応を起こすようにしたので、上記効果に加え、第２の溶液（検体）中に、第１の溶液（検出用プローブ）との結合能を有する成分が含有されるか否かが簡単に検出できるようになった。
【０１４３】
また、上記の実施形態によれば、このような反応方法において、前記第１の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ≧√２・Ｄ1ｐとし、前記第２の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ＜Ｄ2ｐとなるように溶液噴射を行うようにしたので、上記効果に加え、第２の溶液（検体）によるドットを互いに接触することなく、確実に分離独立した形で形成でき、精度の高い反応、検出が得られるようになった。
【０１４４】
また、上記の実施形態によれば、このような反応方法において、前記第１の溶液は核酸分子を含む溶液とし、第２の溶液は塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液とし、ハイブリダイゼーション反応を起こすようにしたので、上記効果に加え、第１の溶液（検体）中に、第２の溶液（検出用プローブ）との結合能を有する成分が含有されるか否かが簡単に検出できるようになった。
【０１４５】
また、上記の実施形態によれば、このような反応方法において、前記第１の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ1ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ1ｐとするとき、Ｄ1ｄ＜Ｄ1ｐとし、前記第２の溶液による基板上における１滴のドット径をＤ2ｄ、隣接するドットの中心間距離をＤ2ｐとするとき、Ｄ2ｄ≧√２・Ｄ2ｐとなるように溶液噴射を行うようにしたので、上記効果に加え、第１の溶液（検体）によるドットを互いに接触することなく、確実に分離独立した形で形成でき、精度の高い反応、検出が得られるようになった。
【０１４６】
また、上記の実施形態によれば、このような反応方法において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１若しくは第２の溶液のいずれか又は両方を噴射付与するようにしたので、上記効果に加え、基板上に識別のための記号やパターン等特別な手段を新たに用いることなく、容易に形成することができるようになった。
【０１４７】
また、上記の実施形態によれば、このような反応方法において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１若しくは第２の溶液とは別の溶液を噴射付与するようにしたので、上記効果に加え、基板上に識別のための記号やパターン等を専用の見やすい溶液を用いて行うことができ、基板の識別等が見やすく簡単にできるようになった。
【０１４８】
また、上記の実施形態によれば、反応性物質を含有する複数種類の溶液が付与される基板を保持する基板保持手段と、前記基板と相対する位置に配置されインクジェット原理による溶液噴射を行う溶液噴射手段と、溶液噴射位置を決定するための基準位置を検出する基準位置検出手段と、前記基準位置検出手段により検出された基準位置及びコンピュータからの情報に基づいて、前記基板保持手段と前記溶液噴射手段とを相対的に移動させる移動手段とを備え、前記溶液噴射手段により前記基板上に非接触に前記溶液を付与する反応性物質の反応装置であって、前記溶液噴射手段は、第１の溶液を噴射する第１の溶液噴射手段と、第２の溶液を噴射する第２の溶液噴射手段とを有し、該反応装置は、前記第１の溶液噴射手段により噴射された第１の溶液の揮発物質が揮発した後、前記第２の噴射手段が第２の溶液を噴射して第１の溶液と第２の溶液とを反応させるとともに、該反応が行われる領域とは別の領域において前記反応に関与しない溶液噴射を行うように構成したので、少量の検体を高密度に配列させてなる新規な反応装置が実現できた。また、これらの反応に関与しない溶液噴射を、前記反応を行う領域とは別のところに行うようにしたので、その噴射後の溶液によるパターンをいろいろな用途に使うことができるようになった。
【０１４９】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記基準位置は、前記複数の基板それぞれに前記溶液噴射によって書き込まれたパターンで決められた位置であり、前記検出手段によって光学的に検出されるとともに、その検出情報に基づいて決められた付与位置に、前記第１及び第２の溶液を付与するようにしたので、上記効果に加え、第１及び第２の溶液を噴射付与する位置を高精度に決めることができ、反応をより確実に行うことができるようになった。また、その基準位置を決めるパターンは、本発明の反応装置によって形成されるので、予めそのようなパターンが形成された高価な基板を用いる必要がない。
【０１５０】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記反応に関与しない溶液噴射によって形成されるパターンは、前記複数の基板の識別情報を含むようにしたので、上記効果に加え、複数個の基板を使用してもそれらの区別を容易にすることができるようになった。
【０１５１】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記基板の被溶液付与面は、前記基板保持手段と噴射手段との相対的な移動によって形成されるとともに前記噴射手段の溶液噴射口面を含む仮想平面の位置から離し、かつ、前記複数の基板を保持する基板保持手段は、前記仮想平面の位置を基準として、その保持部分を前記基板の被溶液付与面より遠い位置とするようにしたので、上記効果に加え、両者の相対的な移動中に噴射ヘッドの先端部が、基板あるいは基板保持手段にぶつかって高価なノズル部分を破損したり、基板そのものを破損したりするという事故が回避される。
【０１５２】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記第１の溶液は塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液とし、第２の溶液は核酸分子を含む溶液とし、ハイブリダイゼーション反応を起こすようにしたので、上記効果に加え、第２の溶液（検体）中に、第１の溶液（検出用プローブ）との結合能を有する成分が含有されるか否かが簡単に検出できるようになった。
【０１５３】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記第１の溶液は核酸分子を含む溶液とし、第２の溶液は塩基配列が既知のオリゴヌクレオチドを含む溶液とし、ハイブリダイゼーション反応を起こすようにしたので、上記効果に加え、第１の溶液（検体）中に、第２の溶液（検出用プローブ）との結合能を有する成分が含有されるか否かが簡単に検出できるようになった。
【０１５４】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１若しくは第２の溶液のいずれか又は両方を噴射付与するようにしたので、上記効果に加え、特別な溶液を準備することなく所望のパターン形成ができるとともに、その噴射後の溶液によるパターンをいろいろな用途に使うことができるようになった。
【０１５５】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記反応に関与しない溶液噴射は、前記第１若しくは第２の溶液とは別の溶液を噴射付与するようにしたので、上記効果に加え、目的に応じた溶液を用いて所望のパターン形成ができるとともに、その噴射後の溶液によるパターンをいろいろな用途に使うことができるようになった。
【０１５６】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置において、前記溶液を噴射するインクジェット原理による複数の噴射手段は一体化され、各複数個の噴射口面は仮想同一平面を構成するとともに、異なる溶液を噴射する噴射口領域は、前記仮想同一平面内に位置していても互いに独立した構造であるようにしたので、隣接する噴射口間において異なる溶液が噴射口の外側を伝って混じり合い、反応精度を低下させるということが回避される。
【０１５７】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置に使用される基板において、該基板は前記溶液が噴射付与される面と、その面に対してほぼ垂直の端面を有し、前記溶液が噴射付与される面の表面粗さが前記端面のそれより滑らかであるようにしたので、上記効果に加え、反応領域における溶液のドット形状が均一性の優れた丸い形状となり、その後の蛍光顕微鏡等による検出精度が向上した。また、このような滑らかな面であるので、基準位置決めパターンもそのパターン形状が滑らかかつ高精度に形成でき、より高精度な基準位置決めを行うことができるようになった。さらに、溶液が噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面部分は、溶液が噴射付与される面の表面粗さほど滑らかにしないので、基板製作コストの低減を図ることができるようになった。
【０１５８】
また、上記の実施形態によれば、このような反応装置に使用される基板において、前記溶液が噴射付与される面と、その面に対してほぼ垂直の端面が形作るコーナー部を面取りした面取り面を有し、該面取り面の表面粗さが前記溶液が噴射付与される面のそれより粗いようにしたので、上記効果に加え、作業者が鋭利なコーナー部分で手を切ったりするという不慮の事故を回避できるようになった。また、溶液が噴射付与される面に対して面取り面は、溶液が噴射付与される面の表面粗さほど滑らかにしないので、基板製作コストの低減を図ることができるようになった。
【０１５９】
また、上記の実施形態によれば、本発明の液体噴射原理による反応装置によって検体中に検出用プローブとの結合能を有する成分が含有されるか否かを検出できるので、他のフォトマスクを何十枚も使用して同様な検出を行うものに比べて、非常に安価に反応検査を行うことができるようになった。
【図面の簡単な説明】
【０１６０】
【図１】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴噴射ヘッドの液滴噴射原理を説明するための図である。
【図２】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴噴射ヘッドの構成を示した断面図である。
【図３】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴噴射ヘッドの構成を示した斜視図である。
【図４】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴噴射ヘッドの構成を示した側面図である。
【図５】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴噴射ヘッドユニットの構成を示した側面図である。
【図６】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴噴射ヘッドユニットの構成を示した斜視図である。
【図７】本発明の実施形態に係る反応装置の構成を示した斜視図である。
【図８】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板の構成を示した図である。
【図９】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板のＤＮＡプローブの配置を模式的に示した図である。
【図１０】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板の作製条件を説明するための図である。
【図１１】本発明の実施形態に係る反応方法におけるスポット状アレイのパターンを模式的に示した図である。
【図１２】本発明の実施形態に係る反応方法におけるスポット状アレイの作製条件を説明するための図である。
【図１３】本発明の実施形態に係る反応方法におけるスポット状アレイのパターンのハイブリダイゼーション反応後を模式的に示した図である。
【図１４】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板の構成を示した図である。
【図１５】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板の構成を示した図である。
【図１６】本発明の実施形態に係る反応装置における液滴ヘッドユニット及び基板保持部分を側面から見た図である。
【図１７】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板の断面図である。
【図１８】本発明の実施形態に係る反応方法における検出用基板の断面図である。
【符号の説明】
【０１６１】
１    噴射ノズル（噴射口、吐出口）
４３    液滴
４５    流路
４６    ピエゾ素子
５６    溶液
５７    フィルタ
６５    ノズル
６６    発熱体基板
６７    蓋基板
６８    シリコン基板
６９    個別電極
７０    共通電極
７１    発熱体
７４    溝
７５    凹部領域
７６    溶液流入口
１００    液体噴射ヘッド
１０１    作業台
１０２    Ｙ方向駆動軸
１０３    Ｙ方向駆動モータ
１０４    Ｘ方向ガイド軸
１０５    作業台駆動モータ
１０６    基台
１０７    制御手段
１０８    検出用基板
１０９    方向検出部
１１０    第１の溶液によるパターン
１１１    検出用プローブ溶液（第１の溶液）による基板上における１滴のドット
１１２    検体試料溶液（第２の溶液）による基板上における１滴のドット
１１３    基準位置パターン
１１４    識別パターン（識別符号or番号）
１１５    溶液噴射口面を含む仮想平面の位置
１１６    被溶液付与面
１１７    基板保持部分
１１８    溶液が噴射付与される面
１１９    溶液が噴射付与される面に対してほぼ垂直の端面
１２０    面取り面
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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