(57)【要約】【課題】本発明は、Ｂ７様（Ｂ７−Ｌ）ポリペプチドおよびこれをコードする核酸分子ならびにこれらを含有する組成物を提供することを、課題とする。【解決手段】ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物を提供することによって、上記課題は解決された。本発明はまた、Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生するための、選択的結合因子、ベクター、宿主細胞、および方法を提供する。本発明はさらに、Ｂ７−Ｌポリペプチドに関連する疾患、障害、および状態の、診断、処置、改善、および／または予防のための薬学的組成物を提供する。本発明はさらに、Ｂ７−Ｌポリペプチドに関連する疾患、障害、および状態の、診断、処置、改善、および／または予防のための方法を提供する。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、以下：
（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列；および、
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列に対して相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、組成物。
【請求項２】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、以下：
（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチド、に対して少なくとも７０％同一であるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列の対立遺伝子改変体をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも約２５アミノ酸残基のポリペプチドフラグメントをコードする、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列の領域であって、ここで、該ポリペプチドフラグメントは、配列番号２に示されるコードされたポリペプチドの活性を有する、領域；
（ｄ）少なくとも１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列の領域；
（ｅ）少なくとも高度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｄ）のいずれか一つのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；ならびに
（ｆ）（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含み、ここで（ａ）〜（ｄ）に記載されるポリペプチドは抗ＣＤ３媒介性Ｔ細胞増殖の阻害活性を有する、組成物。
【請求項３】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、以下；
（ａ）１つまたは数個の保存的アミノ酸置換を有する、配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）１つまたは数個の保存的アミノ酸挿入を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｃ）１つまたは数個のアミノ酸欠失を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮またはＮ末端短縮を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、および、Ｎ末端短縮からなる群より選択される、１つまたは数個の改変を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｆ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列；
（ｇ）少なくとも高度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｈ）（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含み、ここで配列番号２に記載されるポリペプチドの活性は抗ＣＤ３媒介性Ｔ細胞増殖の阻害である、組成物。
【請求項４】
Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生するためのプロセスであって、該プロセスは、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列を含むベクターを含む宿主細胞を培養する工程を包含し、該プロセスは、該ポリペプチドを発現するために適切な条件下で行われ、そして、必要に応じて、該培養物から該ポリペプチドを単離する工程を包含する、プロセス。
【請求項５】
請求項４に記載のプロセスによって産生される、ポリペプチド。
【請求項６】
請求項４に記載のプロセスであって、ここで、核酸分子が、Ｂ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡに作動可能に連結された、ネイティブなＢ７−Ｌポリペプチドに対するプロモーターＤＮＡ以外のプロモーターＤＮＡを含む、プロセス。
【請求項７】
請求項２に記載の組成物であって、ここで、同一性パーセントは、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＮ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを用いて決定される、組成物。
【請求項８】
化合物がＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するためのインビトロでのプロセスであって、請求項４に記載の細胞を該化合物に曝露する工程、および該細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を測定する工程を包含する、プロセス。
【請求項９】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、該組成物はＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドを含み、ここで、該ポリペプチドは抗ＣＤ３媒介性Ｔ細胞増殖の阻害活性を有する、組成物。
【請求項１０】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、以下：
（ａ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列であって、ここで、ポリペプチドは、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列の少なくとも約２５アミノ酸残基を含むアミノ酸配列のフラグメントであって、ここで、該フラグメントは、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるポリペプチドの活性を有する、フラグメント；および、
（ｃ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列の対立遺伝子改変体についてのアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドを含み、ここで（ａ）または（ｂ）に記載されるポリペプチドは抗ＣＤ３媒介性Ｔ細胞増殖の阻害活性を有する、組成物。
【請求項１１】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、以下；
（ａ）Ｃ末端短縮またはＮ末端短縮を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；ならびに、
（ｂ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、および、Ｎ末端短縮からなる群より選択される、少なくとも１つの改変を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有し、ここで、配列番号２に示されるポリペプチドの活性が抗ＣＤ３媒介性Ｔ細胞増殖の阻害活性である、アミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドを含む、組成物。
【請求項１２】
請求項１０に記載の組成物であって、ここで、同一性パーセントは、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＮ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを用いて決定される、組成物。
【請求項１３】
請求項９、１０、１１または１２のいずれかに記載のポリペプチドに特異的に結合する選択的結合剤またはそのフラグメントを含む、Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物。
【請求項１４】
前記選択的結合剤またはそのフラグメントが、配列番号２に示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドに特異的に結合する、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１５】
前記選択的結合剤が抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１６】
前記選択的結合剤がヒト化抗体である、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１７】
前記選択的結合剤がヒト抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１８】
前記選択的結合剤がポリクローナル抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項１９】
前記選択的結合剤がモノクローナル抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２０】
前記選択的結合剤がキメラ抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２１】
前記選択的結合剤がＣＤＲ移植抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２２】
前記選択的結合剤が抗イディオタイプ抗体またはそのフラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２３】
前記フラグメントが可変領域フラグメントである、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２４】
前記可変領域フラグメントがＦａｂフラグメントまたはＦａｂ’フラグメントである、請求項２３に記載の組成物。
【請求項２５】
配列番号２のアミノ酸配列を有するポリペプチドに特異性を有する少なくとも１つの相補性決定領域を含む、選択的結合因子またはそのフラグメントを含む、Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物。
。
【請求項２６】
前記選択的結合剤またはそのフラグメントが検出可能標識に結合されている、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２７】
前記選択的結合剤またはそのフラグメントがＢ７−Ｌポリペプチドの生物学的活性に拮抗する、請求項１３に記載の組成物。
【請求項２８】
Ｂ７−Ｌポリペプチド関連の疾患、状態、または障害を、処置、予防、または改善するための組成物であって、請求項１３に組成物の有効量を含む、組成物。
【請求項２９】
Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物であって、配列番号２のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含み、非ヒト動物を免疫するための投与に適切である、組成物。
【請求項３０】
請求項９、１０、１１または１２のいずれかに記載のポリペプチドを結合し得る選択的結合因子を産生する、ハイブリドーマ。
【請求項３１】
請求項２７に記載の抗Ｂ７−Ｌ抗体またはフラグメントを用いて、Ｂ７−Ｌポリペプチドの量を検出または定量する方法。
【請求項３２】
請求項９、１０、１１、または１２のいずれかに記載のポリペプチド、および薬学的に受容可能な処方剤を含む、Ｔ細胞増殖を阻害するための組成物。
【請求項３３】
前記薬学的に受容可能な処方剤が、キャリア、アジュバント、溶解剤、安定剤、または抗酸化剤である、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３４】
前記ポリペプチドが、配列番号２に記載のアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載の組成物。
【請求項３５】
前記ポリペプチドが水溶性ポリマーを用いて共有結合的に修飾された、請求項３２に記載のポリペプチド。
【請求項３６】
請求項３５に記載の組成物であって、ここで、前記水溶性ポリマーが、ポリエチレングリコール、モノメトキシポリエチレングリコール、デキストラン、セルロース、ポリ−（Ｎ−ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール、およびポリビニルアルコールからなる群より選択される、組成物。
【請求項３７】
医学的状態を、処置、予防、または改善するための組成物であって、以下：
（ａ）請求項９、１０、１１、または１２のいずれかに記載のポリペプチド；および、
（ｂ）請求項１、２、または３のいずれかに記載の核酸によってコードされるポリペプチド、
からなる群から選択されるポリペプチドを含み、
ここで、該ポリペプチドは、患者への投与に適切である、組成物。
【請求項３８】
デバイスであって、以下：
（ａ）移植に適した膜；および
（ｂ）該膜内にカプセル化された細胞であって、該細胞は、請求項９、１０、１１、または１２のいずれかに記載のタンパク質を分泌する、細胞；
を備え、
該膜は、該タンパク質に対して透過性であり、そして該細胞に有害な物質に対して不透過性である、デバイス。
【請求項３９】
Ｂ７−Ｌポリペプチドに結合する化合物を同定する方法であって、以下：
（ａ）請求項９、１０、１１、または１２のいずれかに記載のポリペプチドを、化合物と接触させる工程；および
（ｂ）該化合物に対する該Ｂ７−Ｌポリペプチドの結合の程度を決定する工程、
を包含する、方法。
【請求項４０】
前記化合物に結合した場合に、前記ポリペプチドの活性を決定する工程をさらに包含する、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
請求項１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
【請求項４２】
化合物がＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するためのインビトロでのプロセスであって、請求項４１に記載のトランスジェニック哺乳動物を該化合物に曝露する工程、および該哺乳動物におけるＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を測定する工程を包含する、プロセス。
【請求項４３】
固体支持体に結合した、請求項１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子。
【請求項４４】
請求項１、２、または３のいずれかに記載の少なくとも１つの核酸分子を含む、Ｔ細胞増殖を阻害するための核酸分子のアレイ。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２０００年９月２０日出願の米国仮特許出願第６０／２３３，８６７号（その開示は、本明細書において参考として明白に援用されている）からの優先権の利益を主張する。
【０００２】
（発明の分野）
本発明は、Ｂ７様（Ｂ７−Ｌ）ポリペプチドおよびこれをコードする核酸分子に関する。本発明はまた、Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生するための、選択的結合因子、ベクター、宿主細胞および方法に関する。本発明はさらに、Ｂ７−Ｌポリペプチドと関連する疾患、障害、および状態の、診断、処置、改善、および／または予防のための薬学的組成物および方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
（発明の背景）
核酸分子の同定、クローニング、発現、および操作における技術進歩ならびにヒトゲノムの解読によって、新規治療薬の発見が大いに加速された。現在、高速核酸配列決定技術は、前例のない速度で配列情報を作製し得、そしてコンピュータ分析と結合されて、ゲノムの一部および全体への重複配列の組み立てならびにポリペプチドコード領域の同定を可能にする。既知アミノ酸配列のデータベース編集物に対する推定アミノ酸配列の比較は、以前に同定された配列および／または構造の目印に対する相同性の程度を決定することを可能にする。核酸分子のポリペプチドコード領域のクローニングおよび発現は、構造分析および機能分析のためのポリペプチド産物を提供する。核酸分子およびコードされるポリペプチドの操作は、治療剤として使用される生成物に対して有利な特性を与え得る。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００４】
過去１０年間にわたるゲノム研究における有意な技術進歩にも関わらず、ヒトゲノムに基づく新規治療剤の開発に対する可能性は、未だ大部分理解されていない。潜在的に有利なポリペプチド治療剤をコードする多くの遺伝子またはこれらがコードするポリペプチド（これらは、治療分子に対して「標的」としてはたらき得る）は、未だ同定されていない。従って、診断的な利点または治療的な利点を有する、新規ポリペプチドおよびこれらをコードする核酸分子を同定することが、本発明の目的である。
【課題を解決するための手段】
【０００５】
（発明の要旨）
新規なポリペプチド（これは、Ｔ細胞同時刺激経路におけるタンパク質に関する）が、同定されている。このポリペプチド（Ｂ７−様ポリペプチド（Ｂ７−Ｌ）と呼ばれる）は、ＣＤ８０、ＣＤ８６、Ｂ７ＲＰ−１、およびＢ７−Ｈ１に類似の構造を有し、そしてこれらと相同性を共有するＢ７関連ポリペプチドを表す。ヒトＢ７−Ｌポリペプチドは、Ｂ７ファミリーの他のメンバー（Ｂ７ｒｐ−１、２０％；Ｂ７−１、１２％）とよりも、ヒトＢ７−Ｈ１とより高いアミノ酸同一性（３５％）を共有する。さらに、Ｂ７−ＬポリペプチドおよびＢ７−Ｈ１のマウスおよびヒトのオルソログは、Ｂ７−１、Ｂ７−２、またはＢ７ｒｐ−１のマウスおよびヒトのオルソログ（約４０％）よりも、より高い程度のアミノ酸相同性を共有する（約７０％）。さらに、Ｂ７−Ｈ１およびＢ７−Ｌの両方は、同じレセプター（ＰＤ−１）に結合する。
【０００６】
本発明は、新規なＢ７−Ｌの核酸分子およびコードされるポリペプチドに関する。
【０００７】
本発明は、以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子を提供する：
（ａ）配列番号１に示されるヌクレオチド配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；および
（ｅ）（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列。
【０００８】
本発明はまた、以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する：
（ａ）配列番号２に示されるポリペプチドに対して少なくとも約７０％同一であるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列であって、ここで、このコードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号１に示されるヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）のヌクレオチド配列の対立遺伝子改変体またはスプライス改変体をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも約２５アミノ酸残基のポリペプチドフラグメントをコードする、配列番号１のヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）もしくは（ｂ）のヌクレオチド配列の領域であって、ここで、このポリペプチドフラグメントは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、領域；
（ｄ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、配列番号１のヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ｃ）もしくは（ｄ）いずれかのヌクレオチド配列の領域；
（ｅ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；ならびに
（ｆ）（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列。
【０００９】
本発明はさらに、以下からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を提供する；
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、このコードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、このコードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、このコードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮および／またはＮ末端短縮を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、このコードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、およびＮ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、このコードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｆ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列；
（ｇ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｈ）（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列。
【００１０】
本発明は、以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドを提供する；
（ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列；および
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列。
【００１１】
本発明はまた、以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドを提供する：
（ａ）必要に応じてアミノ末端メチオニンをさらに含む、配列番号３に示されるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号２のオルソログについてのアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸配列に対して少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列、またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列であって、ここで、このポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）少なくとも約２５アミノ酸残基を含む、配列番号２に示されるアミノ酸配列またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列のフラグメントであって、ここで、このフラグメントは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、フラグメント；ならびに
（ｅ）配列番号２に示されるアミノ酸配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列、または（ａ）〜（ｃ）のいずれかのアミノ酸配列の対立遺伝子改変体またはスプライス改変体についてのアミノ酸配列。
【００１２】
本発明は、さらに、以下からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチドを提供する：
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、このポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、このポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、このポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮および／またはＮ末端短縮を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、このポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；ならびに
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、およびＮ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、このポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列。
【００１３】
本発明はさらに、以下：位置４におけるバリン；位置６におけるイソロイシンまたはバリン；位置７におけるロイシンまたはバリン；位置８におけるメチオニンまたはバリン；位置１０におけるイソロイシン；位置１７におけるロイシンまたはバリン；位置１９におけるグリシン；位置２２におけるセリン；位置２３におけるロイシン；位置２８におけるアスパラギン酸；位置３１におけるロイシンまたはバリン；位置３２におけるバリン；位置４０におけるイソロイシン；位置５０におけるロイシン；位置５２におけるバリン；位置５５におけるバリン、ロイシン、またはメチオニン；位置６１におけるアルギニン；位置６２におけるメチオニン；位置７０におけるリジン；位置７４におけるセリン；位置７５におけるイソロイシンまたはメチオニン；位置７６におけるバリン；位置７８におけるアスパラギン酸；位置８０におけるメチオニンまたはイソロイシン；位置８４におけるアルギニン；位置８９におけるロイシン；位置９１におけるアスパラギン；位置９２におけるイソロイシンまたはロイシン；位置９４におけるイソロイシンまたはロイシン；位置９６におけるグルタミン酸；位置９７におけるアスパラギン酸；位置１００におけるフェニルアラニン；位置１０４におけるバリン；位置１０５におけるロイシン；位置１０７におけるアルギニン；位置１１０におけるチロシン；位置１１１におけるグルタミン酸；位置１１５におけるバリンまたはイソロイシン；位置１１６におけるセリン；位置１１７におけるバリン；位置１２１におけるグリシン；位置１２６におけるバリンまたはメチオニン；位置１３１におけるバリンまたはイソロイシン；位置１３９におけるイソロイシンまたはロイシン；位置１４１におけるイソロイシン；位置１４６におけるセリン；位置１４８におけるフェニルアラニン；位置１５３におけるイソロイシン、メチオニン、またはロイシン；位置１６０におけるイソロイシン；位置１６５におけるスレオニン；位置１７１におけるアスパラギン酸；位置１７４におけるフェニルアラニン；位置１７７におけるセリン；位置１７８におけるスレオニン；位置１８０におけるバリン；位置１８２におけるメチオニン、バリン、またはイソロイシン；位置１８３におけるアルギニン；位置１８８におけるリジン；位置１９３におけるイソロイシンまたはロイシン；位置２００におけるリジン；位置２０２におけるバリン；位置２０４におけるイソロイシン；位置２０９におけるバリンまたはメチオニン；位置２１３におけるイソロイシン；位置２２２におけるイソロイシンまたはバリン；位置２２３におけるバリン；位置２２５におけるロイシン；位置２２７におけるバリンまたはロイシン；位置２３１におけるロイシンまたはバリン；位置２３２におけるロイシン；位置２３５におけるバリンまたはロイシン；位置２４０におけるメチオニンまたはイソロイシン；位置２５０におけるアルギニン；位置２５５におけるアルギニン；位置２５６におけるグルタミン酸；位置２６４におけるセリン；位置２６６におけるアルギニン；および位置２６８におけるロイシン；からなる群より選択される少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する、配列番号２に示されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド（ここでこのポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する）を提供する。
【００１４】
Ｂ７−Ｌアミノ酸配列を含む融合ポリペプチドもまた、提供される。
【００１５】
本発明はまた、本明細書中に示されるような単離された核酸分子を含む発現ベクター、本明細書中に示されるような組換え核酸分子を含む組換え宿主細胞、およびＢ７−Ｌポリペプチドを産生する方法を提供し、この方法は、この宿主細胞を培養する工程、必要に応じてそのように産生されたポリペプチドを単離する工程を包含する。
【００１６】
Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸分子を含むトランスジェニック非ヒト動物もまた、本発明に含まれる。Ｂ７−Ｌ核酸分子は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現およびＢ７−Ｌポリペプチドのレベルの増加（これは、増加した循環レベルを含み得る）を可能にする様式で、動物中に導入される。あるいは、Ｂ７−Ｌ核酸分子は、内因性Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現を妨害する様式で動物に導入される（すなわち、Ｂ７−Ｌポリペプチド遺伝子ノックアウトを保有するトランスジェニック動物を作製する）。トランスジェニック非ヒト動物は、好ましくは哺乳動物であり、より好ましくはげっ歯類（例えば、ラットまたはマウス）である。
【００１７】
本発明のＢ７−Ｌポリペプチドの誘導体もまた、提供される。
【００１８】
本発明のＢ７−Ｌポリペプチドに特異的に結合し得る選択的結合因子（例えば、抗体およびペプチド）が、さらに提供される。このような抗体およびペプチドは、アゴニスト性であってもアンタゴニスト性であってもよい。
【００１９】
本発明のヌクレオチド、ポリペプチド、もしくは選択的結合因子ならびに１つ以上の薬学的に受容可能な処方剤を含む薬学的組成物もまた、本発明によって含まれる。薬学的組成物は、治療有効量の本発明のヌクレオチドまたはポリペプチドを提供するために使用される。本発明はまた、このポリペプチド、核酸分子、および選択的結合因子を使用する方法に関する。
【００２０】
本発明のＢ７−ＬポリペプチドおよびＢ７−Ｌ核酸分子は、疾患および障害（本明細書中に列挙されるものを含む）を処置、予防、改善、および／または検出するために使用され得る。
【００２１】
本発明はまた、Ｂ７−Ｌポリペプチドに結合する試験分子を同定するために、試験分子をアッセイする方法を提供する。この方法は、Ｂ７−Ｌポリペプチドを試験分子と接触させて、この試験分子のこのポリペプチドに対する結合の程度を決定する工程を包含する。この方法はさらに、このような試験分子が、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストであるか否かを決定する工程をさらに包含する。本発明はさらに、Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現またはＢ７−Ｌポリペプチドの活性に対する分子の影響を試験する方法を提供する。
【００２２】
Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現を調節する方法およびＢ７−Ｌポリペプチドのレベルを調節する（すなわち、増加または減少させる）方法もまた、本発明によって包含される。１つの方法は、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸分子を動物に投与する工程を包含する。別の方法において、Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現を調節または調整するエレメントを含む核酸分子が、投与され得る。これらの方法の例としては、本明細書中にさらに記載されるように、遺伝子治療、細胞治療、およびアンチセンス治療が挙げられる。
【００２３】
本発明の別の局面において、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、そのレセプター（「Ｂ７−Ｌポリペプチドレセプター」）を同定するために使用され得る。種々の形態の「発現クローニング」は、タンパク質リガンドに対するレセプターをクローニングするために広範囲に使用されている。例えば、ＳｉｍｏｎｓｅｎおよびＬｏｄｉｓｈ、１９９４、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｓｃｉ．１５：４３７−４１ならびにＴａｒｔａｇｌｉａら、１９９５、Ｃｅｌｌ  ８３：１２６３−７１を参照のこと。Ｂ７−Ｌポリペプチドレセプターの単離は、Ｂ７−Ｌポリペプチドシグナル伝達経路の新規アゴニストおよびアンタゴニストの同定または開発に有用である。このようなアゴニストおよびアンタゴニストとしては、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチドレセプター、抗Ｂ７−Ｌポリペプチドレセプター−選択的結合因子（例えば、抗体またはその誘導体）、低分子、およびアンチセンスオリゴヌクレオチドが挙げられ、これらのうちのいずれもが、１つ以上の疾患または障害（本明細書中に開示されるものを含む）の処置に使用され得る。
【００２４】
本発明は、以下を提供する：
（項目１）  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号１に示されるヌクレオチド配列；
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列；
（ｃ）配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列；
（ｄ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；および
（ｅ）（ａ）〜（ｃ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
（項目２）  単離された核酸分子であって、以下：
（ａ）配列番号２に示されるポリペプチドに対して少なくとも約７０％同一であるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）配列番号１に示されるヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）のヌクレオチド配列の対立遺伝子改変体またはスプライス改変体をコードするヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも約２５アミノ酸残基のポリペプチドフラグメントをコードする、配列番号１のヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）もしくは（ｂ）のヌクレオチド配列の領域であって、ここで、該ポリペプチドフラグメントは、配列番号２に示されるコードされたポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、領域；
（ｄ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、配列番号１のヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、または（ａ）〜（ｃ）いずれかのヌクレオチド配列の領域；
（ｅ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列；ならびに
（ｆ）（ａ）〜（ｄ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
（項目３）  単離された核酸分子であって、以下；
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する、配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮および／またはＮ末端短縮を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、およびＮ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列であって、ここで、該コードされたポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、ヌクレオチド配列；
（ｆ）少なくとも約１６ヌクレオチドのフラグメントを含む、（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列；
（ｇ）少なくとも中程度にストリンジェントな条件下で、（ａ）〜（ｆ）のいずれかのヌクレオチド配列の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列；ならびに
（ｈ）（ａ）〜（ｅ）のいずれかのヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、
からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、単離された核酸分子。
（項目４）  項目１、２または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、ベクター。
（項目５）  項目４に記載のベクターを含む、宿主細胞。
（項目６）  真核生物細胞である、項目５に記載の宿主細胞。
（項目７）  原核生物細胞である、項目５に記載の宿主細胞。
（項目８）  Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生するためのプロセスであって、該ポリペプチドを発現するために適切な条件下で項目５に記載の宿主細胞を培養する工程、および必要に応じて、該培養物から該ポリペプチドを単離する工程を包含する、プロセス。
（項目９）  項目８に記載のプロセスによって産生される、ポリペプチド。
（項目１０）  項目８に記載のプロセスであって、ここで、前記核酸分子が、Ｂ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡに作動可能に連結された、ネイティブなＢ７−Ｌポリペプチドに対するプロモーターＤＮＡ以外のプロモーターＤＮＡを含む、プロセス。
（項目１１）  項目２に記載の単離された核酸分子であって、ここで、同一性パーセントは、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＮ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを用いて決定される、単離された核酸分子。
（項目１２）  化合物がＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するためのプロセスであって、項目５、６、または７のいずれかに記載の細胞を該化合物に曝露する工程、および該細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を測定する工程を包含する、プロセス。
（項目１３）  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）配列番号２に示されるアミノ酸配列；および
（ｂ）ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
（項目１４）  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）必要に応じてアミノ末端メチオニンをさらに含む、配列番号３に示されるアミノ酸配列；
（ｂ）配列番号２のオルソログのアミノ酸配列；
（ｃ）配列番号２のアミノ酸配列に対して少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列、またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）少なくとも約２５アミノ酸残基を含む、配列番号２に示されるアミノ酸配列またはＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列のフラグメントであって、ここで、該フラグメントは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有するか、または抗原性である、フラグメント；ならびに
（ｅ）配列番号２に示されるアミノ酸配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１のＤＮＡ挿入物によってコードされるアミノ酸配列、または（ａ）〜（ｃ）のいずれかのアミノ酸配列の対立遺伝子改変体またはスプライス改変体についてのアミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
（項目１５）  単離されたポリペプチドであって、以下：
（ａ）少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｂ）少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｃ）少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；
（ｄ）Ｃ末端短縮および／またはＮ末端短縮を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列；ならびに
（ｅ）アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、Ｃ末端短縮、およびＮ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を有する配列番号２に示されるアミノ酸配列であって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、アミノ酸配列、
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、単離されたポリペプチド。
（項目１６）  項目１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子によってコードされる単離されたポリペプチドであって、ここで、該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、単離されたポリペプチド。
（項目１７）  項目１４に記載の単離されたポリペプチドであって、ここで、同一性パーセントは、ＧＡＰ、ＢＬＡＳＴＰ、ＦＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＡ、ＢＬＡＳＴＸ、ＢｅｓｔＦｉｔ、およびＳｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムからなる群より選択されるコンピュータープログラムを用いて決定される、単離されたポリペプチド。
（項目１８）  項目１３、１４、１５、または５６のいずれかに記載のポリペプチドに特異的に結合する、選択的結合因子またはそのフラグメント。
（項目１９）  配列番号２に示されるアミノ酸配列を含むポリペプチドまたはそのフラグメントに特異的に結合する、項目１８に記載の選択的結合因子またはそのフラグメント。
（項目２０）  抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２１）  ヒト化抗体である、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２２）  ヒト抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２３）  ポリクローナル抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２４）  モノクローナル抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２５）  キメラ抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２６）  ＣＤＲ移植抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２７）  抗イディオタイプ抗体またはそのフラグメントである、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目２８）  可変領域フラグメントである、項目１８記載の選択的結合因子。
（項目２９）  ＦａｂフラグメントまたはＦａｂ’フラグメントである、項目２８に記載の可変領域フラグメント。
（項目３０）  配列番号２のアミノ酸配列を有するポリペプチドに特異性を有する少なくとも１つの相補性決定領域を含む、選択的結合因子またはそのフラグメント。
（項目３１）  検出可能標識に結合されている、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目３２）  Ｂ７−Ｌポリペプチドの生物学的活性に拮抗する、項目１８に記載の選択的結合因子。
（項目３３）  Ｂ７−Ｌポリペプチド関連の疾患、状態、または障害を、処置、予防、または改善するための方法であって、項目１８に記載の選択的結合因子の有効量を患者に投与する工程を包含する、方法。
（項目３４）  配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチドで動物を免疫することによって産生される、選択的結合因子。
（項目３５）  項目１３、１４、１５または５６のいずれかに記載のポリペプチドを結合し得る選択的結合因子を産生する、ハイブリドーマ。
（項目３６）  項目１８に記載の抗Ｂ７−Ｌ抗体またはフラグメントを用いて、Ｂ７−Ｌポリペプチドの量を検出または定量する方法。
（項目３７）  項目１３、１４、１５、または５６のいずれかに記載のポリペプチド、および薬学的に受容可能な処方剤を含む、組成物。
（項目３８）  前記薬学的に受容可能な処方剤が、キャリア、アジュバント、溶解剤、安定剤、または抗酸化剤である、項目３７に記載の組成物。
（項目３９）  前記ポリペプチドが、配列番号３に記載のアミノ酸配列を含む、項目３７に記載の組成物。
（項目４０）  項目１３、１４、１５、または５６のいずれかに記載のポリペプチドの誘導体を含む、ポリペプチド。
（項目４１）  水溶性ポリマーを用いて共有結合的に修飾された、項目４０に記載のポリペプチド。
（項目４２）  項目４１に記載のポリペプチドであって、ここで、前記水溶性ポリマーが、ポリエチレングリコール、モノメトキシポリエチレングリコール、デキストラン、セルロース、ポリ−（Ｎ−ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール、およびポリビニルアルコールからなる群より選択される、ポリペプチド。
（項目４３）  項目１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子および薬学的に受容可能な処方剤を含む、組成物。
（項目４４）  前記核酸分子が、ウイルスベクター中に含まれる、項目４３に記載の組成物。
（項目４５）  項目１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、ウイルスベクター。
（項目４６）  異種アミノ酸配列に融合された、項目１３、１４、１５、または５６のいずれかに記載のポリペプチドを含む、融合ポリペプチド。
（項目４７）  前記異種アミノ酸配列が、ＩｇＧ定常ドメインまたはそのフラグメントである、項目４６に記載の融合ポリペプチド。
（項目４８）  医学的状態を、処置、予防、または改善するための方法であって、項目１３、１４、１５、もしくは５６のいずれかに記載のポリペプチド、または項目１、２、もしくは３のいずれかに記載の核酸によってコードされるポリペプチドを患者に投与する工程を包含する、方法。
（項目４９）  被験体において病的状態または病的状態に対する感受性を診断する方法であって、以下：
（ａ）サンプル中の、項目１３、１４、１５、もしくは５６のいずれかに記載のポリペプチド、または項目１、２、もしくは３のいずれかに記載の核酸分子によってコードされるポリペプチドの、発現の存在または発現量を決定する工程；および
（ｂ）該ポリペプチドの発現の存在または発現量に基づいて、病的状態または病的状態に対する感受性を診断する工程、
を包含する、方法。
（項目５０）  デバイスであって、以下：
（ａ）移植に適した膜；および
（ｂ）該膜内にカプセル化された細胞であって、該細胞は、項目１３、１４、１５、もしくは５６のいずれかに記載のタンパク質を分泌する、細胞；
を備え、
該膜は、該タンパク質に対して透過性であり、そして該細胞に有害な物質に対して不透過性である、デバイス。
（項目５１）  Ｂ７−Ｌポリペプチドに結合する化合物を同定する方法であって、以下：
（ａ）項目１３、１４、１５、もしくは５６のいずれかに記載のポリペプチドを、化合物と接触させる工程；および
（ｂ）該化合物に対する該Ｂ７−Ｌポリペプチドの結合の程度を決定する工程、
を包含する、方法。
（項目５２）  前記化合物に結合した場合に、前記ポリペプチドの活性を決定する工程をさらに包含する、項目５１に記載の方法。
（項目５３）  動物においてポリペプチドのレベルを調節する方法であって、項目１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子を該動物に投与する工程を包含する、方法。
（項目５４）  項目１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子を含む、トランスジェニック非ヒト哺乳動物。
（項目５５）  化合物がＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を阻害するか否かを決定するためのプロセスであって、項目５４に記載のトランスジェニック哺乳動物を該化合物に曝露する工程、および該哺乳動物におけるＢ７−Ｌポリペプチド活性またはＢ７−Ｌポリペプチド産生を測定する工程を包含する、プロセス。
（項目５６）  単離されたポリペプチドであって、以下：位置４におけるバリン；位置６におけるイソロイシンまたはバリン；位置７におけるロイシンまたはバリン；位置８におけるメチオニンまたはバリン；位置１０におけるイソロイシン；位置１７におけるロイシンまたはバリン；位置１９におけるグリシン；位置２２におけるセリン；位置２３におけるロイシン；位置２８におけるアスパラギン酸；位置３１におけるロイシンまたはバリン；位置３２におけるバリン；位置４０におけるイソロイシン；位置５０におけるロイシン；位置５２におけるバリン；位置５５におけるバリン、ロイシン、またはメチオニン；位置６１におけるアルギニン；位置６２におけるメチオニン；位置７０におけるリジン；位置７４におけるセリン；位置７５におけるイソロイシンまたはメチオニン；位置７６におけるバリン；位置７８におけるアスパラギン酸；位置８０におけるメチオニンまたはイソロイシン；位置８４におけるアルギニン；位置８９におけるロイシン；位置９１におけるアスパラギン；位置９２におけるイソロイシンまたはロイシン；位置９４におけるイソロイシンまたはロイシン；位置９６におけるグルタミン酸；位置９７におけるアスパラギン酸；位置１００におけるフェニルアラニン；位置１０４におけるバリン；位置１０５におけるロイシン；位置１０７におけるアルギニン；位置１１０におけるチロシン；位置１１１におけるグルタミン酸；位置１１５におけるバリンまたはイソロイシン；位置１１６におけるセリン；位置１１７におけるバリン；位置１２１におけるグリシン；位置１２６におけるバリンまたはメチオニン；位置１３１におけるバリンまたはイソロイシン；位置１３９におけるイソロイシンまたはロイシン；位置１４１におけるイソロイシン；位置１４６におけるセリン；位置１４８におけるフェニルアラニン；位置１５３におけるイソロイシン、メチオニン、またはロイシン；位置１６０におけるイソロイシン；位置１６５におけるスレオニン；位置１７１におけるアスパラギン酸；位置１７４におけるフェニルアラニン；位置１７７におけるセリン；位置１７８におけるスレオニン；位置１８０におけるバリン；位置１８２におけるメチオニン、バリン、またはイソロイシン；位置１８３におけるアルギニン；位置１８８におけるリジン；位置１９３におけるイソロイシンまたはロイシン；位置２００におけるリジン；位置２０２におけるバリン；位置２０４におけるイソロイシン；位置２０９におけるバリンまたはメチオニン；位置２１３におけるイソロイシン；位置２２２におけるイソロイシンまたはバリン；位置２２３におけるバリン；位置２２５におけるロイシン；位置２２７におけるバリンまたはロイシン；位置２３１におけるロイシンまたはバリン；位置２３２におけるロイシン；位置２３５におけるバリンまたはロイシン；位置２４０におけるメチオニンまたはイソロイシン；位置２５０におけるアルギニン；位置２５５におけるアルギニン；位置２５６におけるグルタミン酸；位置２６４におけるセリン；位置２６６におけるアルギニン；および位置２６８におけるロイシン；
からなる群より選択される少なくとも１つの保存的アミノ酸置換を有する、配列番号２に示されるアミノ酸配列を含み、ここで該ポリペプチドは、配列番号２に示されるポリペプチドの活性を有する、単離されたポリペプチド。
（項目５７）  固体支持体に結合した、項目１、２、または３のいずれかに記載の核酸分子。
（項目５８）  項目１、２、または３のいずれかに記載の少なくとも１つの核酸分子を含む、核酸分子のアレイ。
【００２５】
（発明の詳細な説明）
本明細書中で使用される節の表題は、体系的な目的のみのためであり、そして、そこに記載される内容を限定するようには解釈されるべきではない。本出願において列挙される全ての参考文献は、明確に本明細書中に参考として援用される
（定義）
用語「Ｂ７−Ｌ遺伝子」または「Ｂ７−Ｌ核酸分子」あるいは「Ｂ７−Ｌポリヌクレオチド」とは、配列番号１に示されるヌクレオチド配列、配列番号２に示されるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、ＡＴＣＣ寄託番号ＰＴＡ２４８１におけるＤＮＡ挿入物のヌクレオチド配列、および本明細書中で定義される核酸分子を含むか、あるいはこれらからなる核酸分子をいう。
【００２６】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチド対立遺伝子改変体」とは、生物体または生物体の集団の染色体の所定の遺伝子座を占める遺伝子の、天然に存在する可能ないくつかの代替的形態のうちの１つをいう。
【００２７】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチドスプライス改変体」とは、配列番号２に示されるようなＢ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列のＲＮＡ転写物中のイントロン配列の選択的プロセシングによって生成される、核酸分子（通常はＲＮＡ）をいう。
【００２８】
用語「単離された核酸分子」とは、（１）総核酸が供給源細胞から単離される場合に、天然で一緒に見出されるタンパク質、脂質、炭水化物、または他の物質のうち少なくとも約５０パーセントから分離された本発明の核酸分子、（２）「単離された核酸分子」が天然で連結しているポリヌクレオチドの全てまたは一部に連結していない本発明の核酸分子、（３）天然では連結しないポリヌクレオチドに作動可能に連結した本発明の核酸分子、あるいは（４）より大きなポリヌクレオチド配列の一部として、天然には存在しない本発明の核酸分子をいう。好ましくは、本発明の単離された核酸分子は、その天然の環境において見出される任意の他の夾雑核酸分子または他の夾雑物（これらは、ポリペプチド産生における使用、または治療的使用、診断的使用、予防的使用、または研究的使用を妨げる）を実質的に含まない。
【００２９】
用語「核酸配列」または「核酸分子」は、ＤＮＡ配列またはＲＮＡ配列をいう。この用語は、ＤＮＡおよびＲＮＡの公知の塩基アナログのいずれかから形成される分子を含み、これは、例えば、以下であるがこれらに限定されない：４−アセチルシトシン、８−ヒドロキシ−Ｎ６−メチルアデノシン、アジリジニル−シトシン、プソイドイソシトシン（ｐｓｅｕｄｏｉｓｏｃｙｔｏｓｉｎｅ）、５−（カルボキシヒドロキシルメチル）ウラシル、５−フルオロウラシル、５−ブロモウラシル、５−カルボキシメチルアミノメチル−２−チオウラシル、５−カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、イノシン、Ｎ６−イソ−ペンテニルアデニン、１−メチルアデニン、１−メチルプソイドウラシル、１−メチルグアニン、１−メチルイノシン、２，２−ジメチル−グアニン、２−メチルアデニン、２−メチルグアニン、３−メチルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ６−メチルアデニン、７−メチルグアニン、５−メチルアミノメチルウラシル、５−メトキシアミノ−メチル−２−チオウラシル、β−Ｄ−マンノシルキューオシン（β−Ｄ−ｍａｎｎｏｓｙｌｑｕｅｏｓｉｎｅ）、５'−メトキシカルボニル−メチルウラシル、５−メトキシウラシル、２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン、ウラシル−５−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸、オキシブトキソシン（ｏｘｙｂｕｔｏｘｏｓｉｎｅ）、プソイドウラシル、キューオシン、２−チオシトシン、５−メチル−２−チオウラシル、２−チオウラシル、４−チオウラシル、５−メチルウラシル、Ｎ−ウラシル−５−オキシ酢酸メチルエステル、ウラシル−５−オキシ酢酸、プソイドウラシル、キューオシン、２−チオシトシン、および２，６−ジアミノプリン。
【００３０】
用語「ベクター」は、宿主細胞にコード情報を伝達するために使用される任意の分子（例えば、核酸、プラスミド、またはウイルス）をいうために使用される。  用語「発現ベクター」は、宿主細胞の形質転換使用に適切であり、そして挿入された異種核酸配列の発現を、指示および／または制御する核酸配列を含むベクターをいう。発現としては、転写、翻訳、およびＲＮＡスプライシング（イントロンが存在する場合）のようなプロセスが挙げられるがこれらに限定されない。
【００３１】
用語「作動可能に連結された」は、隣接配列の配置をいうために本明細書中で、使用され、ここで、このように記載される隣接配列は、その通常の機能を行うように構成または構築される。従って、コード配列に作動可能に連結した隣接配列は、このコード配列の複製、転写および／または翻訳に影響を及ぼし得る。例えば、コード配列は、プロモーターがコード配列の転写を指示し得る場合に、このプロモーターに作動可能に連結される。隣接配列は、これが正確に機能する限り、コード配列と隣接する必要はない。従って、例えば、介在する非翻訳性であるが転写される配列が、プロモーター配列とコード配列との間に存在し得、そしてこのプロモーター配列は、なおこのコード配列に「作動可能に連結」されているとみなされ得る。
【００３２】
用語「宿主細胞」は、核酸配列で形質転換されたか、または形質転換され得、次いで目的の選択された遺伝子を発現し得る細胞をいうために使用される。この用語は、選択された遺伝子が存在する限り、子孫が形態学または遺伝子構造において本来の親と同一であろうとなかろうと、親細胞の子孫を含む。
【００３３】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチド」とは、配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチド、および関連ポリペプチドをいう。関連ポリペプチドとしては、Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメント、Ｂ７−Ｌポリペプチドオルソログ、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体、およびＢ７−Ｌポリペプチド誘導体が挙げられ、これは、配列番号２に示されるポリペプチドの少なくとも１つの活性を有する。Ｂ７−Ｌポリペプチドは、本明細書中で定義されるような成熟ポリペプチドであり得、そしてこれらが調製される方法に依存して、アミノ末端メチオニン残基を有しても有さなくてもよい。
【００３４】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメント」とは、配列番号２に示されるようなポリペプチドの、アミノ末端（リーダー配列を有するかもしくは有さない）での短縮および／またはカルボキシル末端での短縮を含むポリペプチドをいう。用語「Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメント」はまた、Ｂ７−Ｌポリペプチドオルソログ、Ｂ７−Ｌポリペプチド誘導体、もしくはＢ７−Ｌポリペプチド改変体の、アミノ末端での短縮および／もしくはカルボキシル末端での短縮をいうか、またはＢ７−Ｌポリペプチド対立遺伝子改変体もしくはＢ７−Ｌポリペプチドスプライス改変体によってコードされるポリペプチドのアミノ末端での短縮および／またはカルボキシル末端での短縮をいう。Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメントは、選択的ＲＮＡスプライシング、またはインビボプロテアーゼ活性から生じ得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドの膜結合形態もまた、本発明によって意図される。好ましい実施形態において、短縮および／または欠失は、約１０アミノ酸、または約２０アミノ酸、または約５０アミノ酸、または約７５アミノ酸、または約１００アミノ酸、または１００より多いアミノ酸を含む。このように生成されるポリペプチドフラグメントは、約２５個連続したアミノ酸、または約５０アミノ酸、または約７５アミノ酸、または約１００アミノ酸、または約１５０アミノ酸または約２００アミノ酸を含む。このようなＢ７−Ｌポリペプチドフラグメントは、必要に応じて、アミノ末端メチオニン残基を含み得る。このようなフラグメントは、例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドに対する抗体を作製するために使用され得ることが理解される。
【００３５】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチドオルソログ」とは、配列番号２に示されるようなＢ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列に対応する、別の種由来のポリペプチドをいう。例えば、マウスおよびヒトのＢ７−Ｌポリペプチドは、互いにオルソログであるとみなされる。
【００３６】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体」とは、配列番号２（リーダー配列を有するかまたは有さない）に示されるＢ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列と比較して、１つ以上のアミノ酸配列の置換、欠失（例えば、内部欠失および／もしくはＢ７−Ｌポリペプチドフラグメント）、ならびに／または付加（例えば、内部付加および／もしくはＢ７−Ｌ融合ポリペプチド）を有するアミノ酸配列を含むＢ７−Ｌポリペプチドをいう。改変体は、天然に存在（例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチド対立遺伝子改変体、Ｂ７−Ｌポリペプチドオルソログ、およびＢ７−Ｌポリペプチドスプライス改変体）し得るか、あるいは、人工的に構築され得る。このようなＢ７−Ｌポリペプチド改変体は、配列番号１に示されるようなＤＮＡ配列からそれに応じて変化するＤＮＡ配列を有する、対応する核酸分子から調製され得る。好ましい実施形態において、この改変体は、１〜３、または１〜５、または１〜１０、または１〜１５、または１〜２０、または１〜２５、または１〜５０、または１〜７５、または１〜１００、または１００より多くのアミノ酸の置換、挿入、付加、および／あるいは欠失を有し、ここで、この置換は、保存的、または非保存的、あるいはそのいずれかの組み合わせであり得る。
【００３７】
用語「Ｂ７−Ｌポリペプチド誘導体」は、配列番号２に示されるようなポリペプチド、本明細書中で定義されるような、Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメント、Ｂ７−Ｌポリペプチドオルソログ、またはＢ７−Ｌポリペプチド改変体をいい、これらは、化学的に改変されている。用語「Ｂ７−Ｌポリペプチド誘導体」はまた、本明細書中で定義されるような、Ｂ７−Ｌポリペプチド対立遺伝子改変体またはＢ７−Ｌポリペプチドスプライス改変体によってコードされるポリペプチドをいい、これらは、化学的に改変されている。
【００３８】
用語「成熟Ｂ７−Ｌポリペプチド」は、リーダー配列を欠失したＢ７−Ｌポリペプチドをいう。成熟Ｂ７−Ｌポリペプチドはまた、他の改変（例えば、アミノ末端（リーダー配列を有するかまたは有さない）および／またはカルボキシ末端のタンパク質分解性プロセシング、より大きな前駆体からのより小さなポリペプチドの切断、Ｎ結合型および／またはＯ結合型グリコシル化など）を含み得る。例示的な成熟Ｂ７−Ｌポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列によって示される。
【００３９】
用語「Ｂ７−Ｌ融合ポリペプチド」は、配列番号２に示されるようなポリペプチド、本明細書中で定義されるような、Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメント、Ｂ７−Ｌポリペプチドオルソログ、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体、またはＢ７−Ｌ誘導体のアミノ末端またはカルボキシ末端での、１つ以上のアミノ酸の融合（例えば、異種ペプチドまたはポリペプチド）をいう。用語「Ｂ７−Ｌ融合ポリペプチド」はまた、本明細書中で定義されるような、Ｂ７−Ｌポリペプチド対立遺伝子改変体またはＢ７−Ｌポリペプチドスプライス改変体によってコードされるポリペプチドのアミノ末端またはカルボキシ末端での、１つ以上のアミノ酸の融合をいう。
【００４０】
用語「生物学的に活性なＢ７−Ｌポリペプチド」は、配列番号２のアミノ酸配列を含むＢ７−Ｌポリペプチドの少なくとも１つの活性特徴を有するＢ７−Ｌポリペプチドをいう。さらに、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、免疫原として活性であり得る；すなわち、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、それに対して抗体が惹起され得る少なくとも１つのエピトープを含む。
【００４１】
用語「単離されたポリペプチド」とは、（１）細胞供給源から単離される場合に、天然で一緒に見出されるポリヌクレオチド、脂質、炭水化物、または他の物質の少なくとも約５０％から分離されている本発明のポリペプチド、（２）「単離されたポリペプチド」が天然で連結するポリペプチドの全てまたは一部に（共有結合的または非共有結合的相互作用によって）連結しない、本発明のポリペプチド、（３）天然には連結しないポリペプチドに（共有結合的または非共有結合的相互作用によって）作動可能に連結される、本発明のポリペプチド、あるいは（４）天然には存在しない本発明のポリペプチドをいう。好ましくは、この単離されたポリペプチドは、その天然の環境において見出される任意の他の夾雑ポリペプチドまたは他の夾雑物（これは、その治療的使用、診断的使用、予防的使用、または研究的使用を妨げる）を実質的に含まない。
【００４２】
用語「同一性」とは、当該分野で公知のように、配列の比較によって決定される、２つ以上のポリペプチド分子または２つ以上の核酸分子の配列間の関係をいう。当該分野において、「同一性」はまた、場合に応じて、２つ以上のヌクレオチド配列または２つ以上のアミノ酸配列間の一致によって決定されるように、核酸分子またはポリペプチド間の配列関連性の程度を意味する。「同一性」は、２つ以上の配列のうちのより小さなものと、特定の数理的モデルまたはコンピュータプログラム（すなわち、「アルゴリズム」）によって位置づけられたギャップアラインメント（存在する場合）との間の、同一の一致のパーセントを評価する。
【００４３】
用語「類似性」は、「同一性」と同類の概念であるが、「同一性」とは対照的に「類似性」は、同一の一致および保存的置換の一致の両方を含む関係の測定をいう。２つのポリペプチド配列が、例えば１０／２０個同一のアミノ酸を有し、そして残りが全て非保存的置換である場合、同一性パーセントおよび類似性パーセントは、どちらも５０％である。同じ例において、保存的置換が存在する位置がさらに５つ存在する場合、同一性パーセントは５０％のままであるが、類似性パーセントは７５％（１５／２０）である。従って、保存的置換が存在する場合、２つのポリペプチド間の類似性の程度は、これらの２つのポリペプチド間のパーセント同一性よりも高い。
【００４４】
用語「天然に存在する」または「ネイティブの」は、核酸分子、ポリペプチド、宿主細胞などのような生物学的物質と関連して使用される場合、天然において見出され、そしてヒトによって操作されていない物質をいう。同様に、「天然に存在しない」または「ネイティブではない」は、本明細書中で使用される場合、天然で見出されないか、またはヒトによって構造的に改変もしくは合成されている物質をいう。
【００４５】
用語「有効量」および「治療有効量」は、本明細書中に示されるようなＢ７−Ｌポリペプチドの１つ以上の生物学的活性の観察可能なレベルを支持するために使用されるＢ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌ核酸分子の量をいう。
【００４６】
用語「薬学的に受容可能なキャリア」または「生理学的に受容可能なキャリア」は、本明細書中で使用される場合、薬学的組成物としてのＢ７−Ｌポリペプチド、Ｂ７−Ｌ核酸分子、またはＢ７−Ｌ選択的結合因子の送達の達成または増強に適切な１つ以上の処方材料をいう。
【００４７】
用語「抗原」とは、選択的結合因子（例えば、抗体）により結合され得、そしてさらに動物において使用されて、その抗原のエピトープに結合し得る抗体を産生し得る分子または分子の一部をいう。抗原は、１つ以上のエピトープを有し得る。
【００４８】
用語「選択的結合因子」とは、Ｂ７−Ｌポリペプチドに特異性を有する分子をいう。本明細書中で使用される場合、用語「特異的」および「特異性」とは、選択的結合因子が、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドに結合し、かつヒト非Ｂ７−Ｌポリペプチドに結合しない能力をいう。しかし、選択的結合因子がまた、配列番号２に示されるようなポリペプチドのオルソログ（すなわち、その種間のバージョン（例えば、マウスＢ７−ＬポリペプチドおよびラットＢ７−Ｌポリペプチド））に結合し得ることが、理解される。
【００４９】
用語「形質導入」とは、通常はファージによる１つの細菌から別の細菌への遺伝子の伝達をいうために使用される。「形質導入」はまた、レトロウイルスによる真核生物細胞配列の獲得および伝達をいう。
【００５０】
用語「トランスフェクション」は、細胞による外来ＤＮＡまたは外因性ＤＮＡの取り込みをいうために使用され、そして細胞は、外因性ＤＮＡが細胞膜内に導入された場合には「トランスフェクト」されている。多数のトランスフェクション技術は、当該分野で周知であり、そして本明細書中に開示される。例えば、Ｇｒａｈａｍら，１９７３  Ｖｉｒｏｌｏｇｙ  ５２：４５６；Ｓａｍｂｒｏｏｋら，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，１９８９）；Ｄａｖｉｓら，Ｂａｓｉｃ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，１９８６）；およびＣｈｕら，１９８１、Ｇｅｎｅ  １３：１９７を参照のこと。このような技術を使用して、１つ以上の外因性ＤＮＡ部分を適切な宿主細胞に導入し得る。
【００５１】
本明細書中で使用される場合、用語「形質転換」とは、細胞の遺伝的特徴における変化をいい、そして細胞は、新しいＤＮＡを含有するように改変された場合に形質転換されている。例えば、細胞は、それがそのネイティブな状態から遺伝的に改変される場合に形質転換される。トランスフェクションまたは形質導入に続いて、形質転換ＤＮＡは、物理的に細胞の染色体に組み込むことにより細胞のＤＮＡと組換わり得るか、複製されることなしにエピソームエレメントとして一過的に保持され得るか、またはプラスミドとして独立的に複製し得る。ＤＮＡが細胞分裂と共に複製される場合に、細胞は、安定に形質転換されたとみなされる。
【００５２】
（核酸分子および／またはポリペプチドの関連性）
関連した核酸分子が、配列番号１の核酸分子の対立遺伝子改変体またはスプライス改変体を含むこと、および上記のヌクレオチド配列のいずれかに相補的である配列を含むことが理解される。関連した核酸分子はまた、配列番号２に示されるポリペプチドと比較して１以上のアミノ酸残基の置換、改変、付加および／または欠失を含むかまたは本質的にこれからなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。このような関連したＢ７−Ｌポリペプチドは、例えば、１以上のＮ−連結もしくはＯ−連結グリコシル化部位の付加および／もしくは欠失、または１以上のシステイン残基の付加および／もしくは欠失を含み得る。
【００５３】
関連した核酸分子はまた、配列番号２のＢ７−Ｌポリペプチドの少なくとも約２５個連続したアミノ酸、または約５０個のアミノ酸、または約７５個のアミノ酸、または約１００個のアミノ酸、または約１５０個のアミノ酸、または約２００個のアミノ酸、または２００個より多くのアミノ酸残基のポリペプチドをコードする、Ｂ７−Ｌ核酸分子のフラグメントを包含する。
【００５４】
さらに、関連したＢ７−Ｌ核酸分子はまた、本明細書中で定義したとおりの中程度または高度にストリンジェントな条件下で、配列番号１のＢ７−Ｌ核酸分子、またはポリペプチド（このポリペプチドは、配列番号２、もしくは本明細書中に定義したとおりの核酸フラグメント、もしくは本明細書中に定義したとおりのポリペプチドをコードする核酸フラグメントに示されるアミノ酸配列を含む）をコードする分子の十分に相補的な配列とハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む分子を包含する。ハイブリダイゼーションプローブは、本明細書中に提供されるＢ７−Ｌ配列を用いてｃＤＮＡライブラリー、ゲノムＤＮＡライブラリーまたは合成ＤＮＡライブラリーを関連した配列についてスクリーニングするために調製され得る。Ｂ７−ＬポリペプチドのＤＮＡ配列および／またはアミノ酸配列のうちの、既知配列に対して顕著な同一性を示す領域は、本明細書中に記載されるとおりの配列アラインメントアルゴリズムを用いて容易に決定され、そしてこれらの領域を用いて、スクリーニングのためのプローブを設計し得る。
【００５５】
用語「高度にストリンジェントな条件」とは、配列が非常に相補的であるＤＮＡ鎖のハイブリダイゼーションを許容し、かつ顕著に不一致のＤＮＡのハイブリダイゼーションを排除するように設計された条件をいう。ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーは、温度、イオン強度および変性剤（例えば、ホルムアミド）の濃度によって主に決定される。ハイブリダイゼーションおよび洗浄についての「高度にストリンジェントな条件」の例は、６５〜６８℃での０．０１５Ｍ塩化ナトリウム、０．００１５Ｍクエン酸ナトリウムまたは４２℃での０．０１５Ｍ塩化ナトリウム、０．００１５Ｍクエン酸ナトリウムおよび５０％ホルムアミドである。Ｓａｍｂｒｏｏｋ，ＦｒｉｔｓｃｈおよびＭａｎｉａｔｉｓ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（第２版，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，１９８９）；Ａｎｄｅｒｓｏｎら，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｈｙｂｒｉｄｉｓａｔｉｏｎ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ  第４章（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ  Ｌｉｍｉｔｅｄ）を参照のこと。
【００５６】
よりストリンジェントな条件（例えば、より高い温度、より低いイオン強度、より高いホルムアミドまたは他の変性剤）もまた用いられ得るが、ハイブリダイゼーションの速度が影響される。他の薬剤は、非特異的ハイブリダイゼーションおよび／またはバックグラウンドハイブリダイゼーションを減少させる目的のために、ハイブリダイゼーションおよび洗浄の緩衝液中に含まれ得る。例は、０．１％ウシ血清アルブミン、０．１％ポリビニルピロリドン、０．１％ピロリン酸ナトリウム、０．１％ドデシル硫酸ナトリウム、ＮａＤｏｄＳＯ４、（ＳＤＳ）、ｆｉｃｏｌｌ、デンハルト溶液、超音波処理サケ精子ＤＮＡ（または別の非相補的ＤＮＡ）および硫酸デキストランであるが、他の適切な薬剤もまた用いられ得る。これらの添加剤の濃度および種類は、ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに実質的に影響を与えることなく変更され得る。ハイブリダイゼーション実験は通常、ｐＨ６．８〜７．４で実施される；しかし、代表的なイオン強度の条件では、ハイブリダイゼーションの速度は、ｐＨからほぼ独立する。Ａｎｄｅｒｓｏｎら，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｈｙｂｒｉｄｉｓａｔｉｏｎ：Ａ  Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ａｐｐｒｏａｃｈ  第４章（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ  Ｌｉｍｉｔｅｄ）を参照のこと。
【００５７】
ＤＮＡ二重鎖の安定性に影響を与える因子としては、塩基組成、長さおよび塩基対の不一致程度が挙げられる。ハイブリダイゼーション条件は、これらの変動要因を適応させ、そして異なる配列関連性のＤＮＡがハイブリッドを形成するのを可能にするために当業者によって調整され得る。完全に一致したＤＮＡ二重鎖の融解温度は、以下の方程式によって評価され得る：
Ｔｍ（℃）＝８１．５＋１６．６（ｌｏｇ［Ｎａ＋］）＋０．４１（Ｇ＋Ｃ％）−６００／Ｎ−０．７２（ホルムアミド％）
ここで、Ｎは、形成される二重鎖の長さであり、［Ｎａ＋］は、ハイブリダイゼーション溶液または洗浄溶液中のナトリウムイオンのモル濃度であり、Ｇ＋Ｃ％は、ハイブリッド中での（グアニン＋シトシン）塩基の百分率である。不完全に一致したハイブリッドについては、融解温度は、１％の不一致毎に約１℃下げられる。
【００５８】
用語「中程度にストリンジェントな条件」とは、「高度にストリンジェントな条件」下で生じ得るよりも高い程度の塩基対不一致を有するＤＮＡ二重鎖が形成され得る条件をいう。代表的な「中程度にストリンジェントな条件」の例は、５０〜６５℃での０．０１５Ｍ塩化ナトリウム、０．００１５Ｍクエン酸ナトリウムまたは３７〜５０℃での０．０１５Ｍ塩化ナトリウム、０．００１５Ｍクエン酸ナトリウムおよび２０％ホルムアミドである。例示として、０．０１５Ｍナトリウムイオン中での５０℃という「中程度にストリンジェントな条件」によって、約２１％の不一致が可能になる。
【００５９】
「高度にストリンジェントな条件」と「中程度にストリンジェントな条件」との間に絶対的な区別が存在しないことが当業者によって認識される。例えば、０．０１５Ｍナトリウムイオン（ホルムアミドなし）では、完全に一致した長さのＤＮＡの融解温度は、約７１℃である。６５℃で（同じイオン強度で）の洗浄を用いると、約６％の不一致が可能になる。より関連性の遠い配列を捕獲するために、当業者は、単純に、温度を低くし得るかまたはイオン強度を高くし得る。
【００６０】
約２０ｎｔまでのオリゴヌクレオチドプローブについての１Ｍ  ＮａＣｌ＊中での融解温度の良好な評価は、以下によって与えられる：
Ｔｍ＝Ａ−Ｔ塩基対あたり２℃  ＋  Ｇ−Ｃ塩基対あたり４℃
＊６×塩クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）中でのナトリウムイオン濃度は、１Ｍである。Ｓｕｇｇｓら，Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  Ｕｓｉｎｇ  Ｐｕｒｉｆｉｅｄ  Ｇｅｎｅｓ  ６８３（ＢｒｏｗｎおよびＦｏｘ編，１９８１）を参照のこと。
【００６１】
オリゴヌクレオチドについての高度ストリンジェンシー洗浄条件は通常、６×ＳＳＣ、０．１％  ＳＤＳ中でのそのオリゴヌクレオチドのＴｍよりも０℃〜５℃低い温度においてである。
【００６２】
別の実施形態において、関連する核酸分子は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列に対して少なくとも約７０パーセント同一であるヌクレオチド配列を含むか、またはこれからなる。好ましい実施形態において、このヌクレオチド配列は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列に対して、約７５パーセント、または約８０パーセント、または約８５パーセント、または約９０パーセント、または約９５パーセント、９６パーセント、９７パーセント、９８パーセントまたは９９パーセント同一である。関連する核酸分子は、配列番号２に示されるポリペプチドの少なくとも１つの活性を有するポリペプチドをコードする。
【００６３】
核酸配列における差異は、配列番号２のアミノ酸配列に対するアミノ酸配列の保存的改変および／または非保存的改変を生じ得る。
【００６４】
配列番号２のアミノ酸配列に対する保存的改変（およびコードヌクレオチドに対する対応する改変）は、Ｂ７−Ｌポリペプチドに類似した機能的特徴および化学的特徴を有するポリペプチドを生成する。対照的に、Ｂ７−Ｌポリペプチドの機能的特徴および／または化学的特徴における実質的な改変は、配列番号２のアミノ酸配列において置換を選択することによって達成され得、これらの置換は、（ａ）置換領域における分子骨格の構造（例えば、シートコンフォメーションまたはらせんコンフォメーション）、（ｂ）標的部位における分子の電荷または疎水性、あるいは（ｃ）側鎖の大きさを、維持することに対するその影響において有意に異なる。
【００６５】
例えば、「保存的アミノ酸置換」は、その位置におけるアミノ酸残基の極性または電荷にほとんど影響がないかまたは全く影響がないような、ネイティブなアミノ酸残基の非ネイティブな残基による置換を含み得る。さらに、ポリペプチド中の任意のネイティブな残基はまた、「アラニンスキャニング変異誘発」に関して以前に記載されたように、アラニンで置換され得る。
【００６６】
保存的アミノ酸置換はまた、天然に存在しないアミノ酸残基を含み、これらの残基は、生物系における合成によるよりむしろ化学的ペプチド合成によって代表的に組み込まれる。これらは、ペプチド模倣物、およびアミノ酸部分の他の逆転形態または反転形態を含む。
【００６７】
天然に存在する残基は、共通の側鎖の特性に基づいて以下のクラスに分けられ得る：
１）疎水性：ノルロイシン、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ；
２）中性親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ；
３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；
４）塩基性：Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ；
５）鎖の方向に影響を与える残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ；および
６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ。
【００６８】
例えば、非保存的置換は、これらのクラスのうちの１つのメンバーを、別のクラス由来のメンバーへと交換することを含み得る。このような置換された残基は、非ヒトＢ７−Ｌポリペプチドと相同性であるヒトＢ７−Ｌポリペプチドの領域、またはこの分子の非相同性領域に、導入され得る。
【００６９】
このような変更を作製する場合、アミノ酸のハイドロパシー指標（疎水性親水性指標）が、考慮され得る。各アミノ酸は、その疎水性特徴および荷電特徴に基づいてハイドロパシー指標が割り当てられている。これらのハイドロパシー指標は、イソロイシン（＋４．５）；バリン（＋４．２）；ロイシン（＋３．８）；フェニルアラニン（＋２．８）；システイン／シスチン（＋２．５）；メチオニン（＋１．９）；アラニン（＋１．８）；グリシン（−０．４）；スレオニン（−０．７）；セリン（−０．８）；トリプトファン（−０．９）；チロシン（−１．３）；プロリン（−１．６）；ヒスチジン（−３．２）；グルタミン酸（−３．５）；グルタミン（−３．５）；アスパラギン酸（−３．５）；アスパラギン（−３．５）；リジン（−３．９）およびアルギニン（−４．５）である。
【００７０】
タンパク質に対して相互作用的な生物学的機能を付与することにおけるハイドロパシーアミノ酸指標の重要性は、当該分野において一般的に理解されている（Ｋｙｔｅら、１９８２，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１５７：１０５−３１）。特定のアミノ酸が類似のハイドロパシー指標またはハイドロパシースコアを有する他のアミノ酸で置換され得、そして依然として類似の生物学的活性を維持し得ることが、公知である。ハイドロパシー指標に基づいて変化を起こす際に、ハイドロパシー指標が±２以内であるアミノ酸の置換が好ましく、±１以内であるものが特に好ましく、そして±０．５以内であるものが、なおより特に好ましい。
【００７１】
類似のアミノ酸の置換が親水性に基づいて効果的になされ得る（特に、これによって作製された生物学的機能的に等価なタンパク質またはペプチドが、この場合においてと同様に、免疫学的実施形態における使用に関して考慮される場合）こともまた、当該分野において理解されている。その隣接するアミノ酸の親水性によって支配される、タンパク質の最も大きな局所的平均親水性は、その免疫原性および抗原性に、すなわち、そのタンパク質の生物学的特性に、相関する。
【００７２】
以下の親水性の値が、これらのアミノ酸残基に割り当てられている：アルギニン（＋３．０）；リジン（＋３．０）；アスパラギン酸（＋３．０±１）；グルタミン酸（＋３．０±１）；セリン（＋０．３）；アスパラギン（＋０．２）；グルタミン（＋０．２）；グリシン（０）；スレオニン（−０．４）；プロリン（−０．５±１）；アラニン（−０．５）；ヒスチジン（−０．５）；システイン（−１．０）；メチオニン（−１．３）；バリン（−１．５）；ロイシン（−１．８）；イソロイシン（−１．８）；チロシン（−２．３）；フェニルアラニン（−２．５）；およびトリプトファン（−３．４）。類似の親水性の値に基づいて変化を行う際に、親水性値が±２以内であるアミノ酸の置換が好ましく、±ｌ以内であるものが特に好ましく、そして±０．５以内であるものが、なおより特に好ましい。一次アミノ酸配列から、エピトープを、親水性に基づいて同定もし得る。これらの領域はまた、「エピトープコア領域」とも呼ばれる。
【００７３】
所望のアミノ酸置換（保存的であれ非保存的であれ）は、当業者によって、そのような置換が所望される時点で決定され得る。例えば、アミノ酸置換を使用して、Ｂ７−Ｌポリペプチドの重要な残基を同定し得るし、または本明細書中に記載されるＢ７−Ｌポリペプチドの親和性を増加もしくは減少させ得る。例示的なアミノ酸置換は、表Ｉに記載される。
【００７４】
【表１】
2008263984.tif 000002
【００７５】
当業者は、配列番号２に記載のポリペプチドの適切な改変体を、周知の技術を使用して、決定し得る。生物学的活性を破壊することなく変化され得る分子の適切な領域を同定するために、当業者は、活性のために重要であるとは考えられない領域を標的し得る。例えば、同じ種由来かまたは他の種由来の、類似の活性を有する類似のポリペプチドが既知である場合には、当業者は、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列を、このような類似のポリペプチドと比較し得る。このような比較を用いて、類似のポリペプチド間で保存される分子の残基および部分を同定し得る。このような類似のポリペプチドに対して保存されていない、Ｂ７−Ｌ分子の領域における変化が、Ｂ７−Ｌポリペプチドの生物学的活性および／または構造に不利に影響を与える可能性はさほどないことが、理解される。当業者はまた、比較的保存された領域においてさえ、活性を維持しながら、天然に存在する残基を化学的に類似するアミノ酸に置換し得ることを知っている（保存的アミノ酸残基置換）。従って、生物学的活性または構造のために重要であり得る領域でさえ、生物学的活性を破壊することなく、またはポリペプチド構造に不利に影響を与えることなく、保存的アミノ酸置換に供され得る。
【００７６】
さらに、当業者は、活性または構造のために重要である、類似のポリペプチドにおける残基を同定する、構造−機能研究を再調査し得る。このような比較を考慮して、類似のポリペプチドにおける活性または構造のために重要なアミノ酸残基に対応するＢ７−Ｌポリペプチドにおける、アミノ酸残基の重要性を推測し得る。当業者は、Ｂ７−Ｌポリペプチドのこのような推測された重要なアミノ酸残基に代わる化学的に類似するアミノ酸への置換を、選択し得る。
【００７７】
当業者はまた、類似のポリペプチドにおける三次元構造、およびその構造に関連するアミノ酸配列を分析し得る。このような情報を考慮して、当業者は、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸残基のアライメントを、その三次元構造に関して推測し得る。当業者は、そのタンパク質の表面上に存在すると推測されるアミノ酸残基に対する急激な変化を起こさないように、選択し得る。なぜなら、このような残基は、他の分子との重要な相互作用に関与し得るからである。さらに、当業者は、単一のアミノ酸置換を各アミノ酸残基に含む、試験改変体を生成し得る。これらの改変体は、当業者に公知の活性アッセイを使用して、スクリーニングされ得る。このような改変体は、適切な改変体に関する情報を集めるために使用され得る。例えば、特定のアミノ酸残基に対する変化が、破壊された活性、望ましくなく減少した活性、または適切でない活性を生じたことを発見した場合には、このような変化を有する改変体は、回避される。換言すれば、このような慣用的な実験から集めた情報に基づいて、当業者は、さらなる置換が、単独でかまたは他の変異と組み合わせてかのいずれかで回避されるべきであるアミノ酸を、容易に決定し得る。
【００７８】
多数の科学刊行物が、二次構造の推定に充てられてきた。Ｍｏｕｌｔ，１９９６，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．７：４２２−２７；Ｃｈｏｕら、１９７４，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  １３：２２２−４５；Ｃｈｏｕら、１９７４，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  １１３：２１１−２２；Ｃｈｏｕら、１９７８，Ａｄｖ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．Ｒｅｌａｔ．Ａｒｅａｓ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４７：４５−４８；Ｃｈｏｕら、１９７８，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．４７：２５１−２７６；およびＣｈｏｕら、１９７９，Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｊ．２６：３６７−８４を参照のこと。さらに、コンピュータープログラムが、二次構造の推測を補助するために現在利用可能である。二次構造を推測する１つの方法は、相同性モデリングに基づく。例えば、３０％よりも大きい配列同一性、または４０％よりも大きい配列類似性を有する、２つのポリペプチドまたはタンパク質は、しばしば、類似した構造トポロジーを有する。タンパク質構造データベース（ＰＤＢ）の近年の成長により、二次構造の推測可能性（ポリペプチド構造またはタンパク質構造内の潜在的な折り畳みの数を含む）の促進がもたらされた。Ｈｏｌｍら、１９９９、Ｎｕｃｌｅｉｃ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．２７：２４４−４７を参照のこと。所定のポリペプチドもしくはタンパク質において限定された数の折り畳みが存在すること、および一旦臨界数の構造が決定されると、構造推測が劇的により正確になること、が示唆されている（Ｂｒｅｎｎｅｒら、１９９７、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．７：３６９−７６）。
【００７９】
二次構造を推定するさらなる方法としては、「スレッディング（ｔｈｒｅａｄｉｎｇ）」（Ｊｏｎｅｓ，１９９７，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．７：３７７−８７；Ｓｉｐｐｌら、１９９６，Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  ４：１５−１９）、「プロフィール分析」（Ｂｏｗｉｅら、１９９１，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２５３：１６４−７０；Ｇｒｉｂｓｋｏｖら、１９９０，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８３：１４６−５９；Ｇｒｉｂｓｋｏｖら、１９８７，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８４：４３５５−５８）、および「進化学的連鎖（ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ  ｌｉｎｋａｇｅ）」（Ｈｏｌｍら、前出、およびＢｒｅｎｎｅｒら、前出を参照のこと）が挙げられる。
【００８０】
好ましいＢ７−Ｌポリペプチド改変体としては、グリコシル化部位の数および／または型が配列番号２に記載のアミノ酸配列と比較して変更している、グリコシル化改変体が挙げられる。１つの実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体は、配列番号２に記載のアミノ酸配列より多いかまたはより少ない数のＮ結合グリコシル化部位を含む。Ｎ結合グリコシル化部位は、配列Ａｓｎ−Ｘ−ＳｅｒまたはＡｓｎ−Ｘ−Ｔｈｒによって特徴付けられ、ここで、Ｘと印されるアミノ酸残基は、プロリン以外の任意のアミノ酸残基であり得る。この配列を作製するためのアミノ酸残基の置換は、Ｎ結合型糖鎖の付加のための潜在的な新たな部位を提供する。あるいは、この配列を排除する置換は、存在するＮ結合型糖鎖を除去する。１つ以上のＮ結合グリコシル化部位（代表的には、天然に存在するグリコシル化部位）が排除され、そして１つ以上の新たなＮ結合部位が作製される、Ｎ結合型糖鎖の再配列もまた、提供される。さらなる好ましいＢ７−Ｌ改変体としては、１つ以上のシステイン残基が、配列番号２に記載のアミノ酸配列と比較して欠失しているか、または別のアミノ酸（例えば、セリン）で置換されている、システイン改変体が挙げられる。システイン改変体は、Ｂ７−Ｌポリペプチドが、例えば不溶性の封入体の単離の後に、生物学的に活性な立体構造へとリフォールディングされなければならない場合に、有用である。システイン改変体は、一般に、ネイティブタンパク質より少ないシステイン残基を有し、そして代表的には偶数のシステイン残基を有し、対合していないシステインから生じる相互作用を最小にする。
【００８１】
他の実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体は、少なくとも１つのアミノ酸挿入を有する配列番号２に記載のアミノ酸配列（ここで、このポリペプチドは、配列番号２に記載のポリペプチドプチＤＮＡの活性を有する）、または少なくとも１つのアミノ酸欠失を有する配列番号２に記載のアミノ酸配列（ここで、このポリペプチドは、配列番号２に記載のポリペプチドの活性を有する）を含む。Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体はまた、配列番号２に記載のアミノ酸配列を含み、そしてここで、このポリペプチドは、カルボキシル末端短縮および／またはアミノ末端短縮を有し、そしてさらにここで、このポリペプチドは、配列番号２に記載のポリペプチドの活性を有する。Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体はさらに、アミノ酸置換、アミノ酸挿入、アミノ酸欠失、カルボキシル末端短縮、およびアミノ末端短縮からなる群より選択される少なくとも１つの改変を含む配列番号２に記載のアミノ酸配列を含み、そしてここで、このポリペプチドは、配列番号２に記載のポリペプチドの活性を有する。
【００８２】
さらなる実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体は、配列番号２に示されるアミノ酸配列に対して少なくとも約７０％同一であるアミノ酸配列を含む。好ましい実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体は、配列番号２に示されるアミノ酸配列に対して約７５パーセント、または約８０パーセント、または約８５パーセント、または約９０パーセント、または約９５パーセント、９６パーセント、９７パーセント、９８パーセントまたは９９パーセント同一であるアミノ酸配列を含む。Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体は、配列番号２に示されるポリペプチドの少なくとも１つの活性を有する。
【００８３】
さらに、配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチド、または他のＢ７−Ｌポリペプチドは、同種ポリペプチドに融合されてホモダイマーを形成し得るか、あるいは異種ポリペプチドに融合されてヘテロダイマーを形成し得る。異種のペプチドおよびポリペプチドとしては、以下が挙げられるが、それらに限定されない：Ｂ７−Ｌ融合ポリペプチドの検出および／または単離を可能にするエピトープ；膜貫通レセプタータンパク質またはその部分（例えば、細胞外ドメインまたは膜貫通ドメインおよび細胞内ドメイン）；膜貫通レセプタータンパク質に結合する、リガンドまたはその部分；触媒的に活性である、酵素またはその部分；オリゴマー化を促進するポリペプチドまたはペプチド（例えば、ロイシンジッパードメイン）；安定性を増加させるポリペプチドまたはペプチド（例えば、免疫グロブリン定常領域）；ならびに配列番号２に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチドあるいは他のＢ７−Ｌポリペプチドとは異なる治療活性を有する、ポリペプチド。
【００８４】
融合は、配列番号２に記載のアミノ酸配列を含むポリペプチド、あるいは他のＢ７−Ｌポリペプチドの、アミノ末端またはカルボキシル末端のいずれかにおいて、なされ得る。融合は、リンカー分子もアダプター分子も用いずに直接であっても、リンカー分子もしくはアダプター分子を介してであってもよい。リンカー分子またはアダプター分子は、１つ以上のアミノ酸残基であり得、代表的に、約２０〜約５０アミノ酸残基であり得る。リンカー分子またはアダプター分子はまた、融合した部分の分離を可能にするために、ＤＮＡ制限エンドヌクレアーゼまたはプロテアーゼに対する切断部位を有して設計され得る。一旦構築されると、融合ポリペプチドは、本明細書中に記載の方法に従って誘導体化され得ることが、理解される。
【００８５】
本発明のさらなる実施形態において、配列番号２のアミノ酸配列を含むポリペプチド、あるいは他のＢ７−Ｌポリペプチドは、ヒトＩｇＧのＦｃ領域の１つ以上のドメインに融合される。抗体は、以下の２つの機能的に独立した部分を含む；抗原と結合する「Ｆａｂ」として公知の可変ドメイン、ならびに補体活性化および食作用細胞による攻撃のようなエフェクター機能に関与する、「Ｆｃ」として公知の定常ドメイン。Ｆｃは、長い血清半減期を有し、一方でＦａｂは、短寿命である。Ｃａｐｏｎら、１９８９，Ｎａｔｕｒｅ  ３３７：５２５−３１。治療タンパク質と一緒に構築される場合には、Ｆｃドメインは、より長い半減期を提供し得るか、またはＦｃレセプター結合、プロテインＡ結合、補体結合のような機能、および恐らく、胎盤移入のような機能さえも、組み込み得る（同書）。表ＩＩは、当該分野において公知の特定のＦｃ融合物の使用を要約する。
【００８６】
【表２】
2008263984.tif 000003
【００８７】
一例において、ヒトＩｇＧのヒンジ領域、ＣＨ２領域、およびＣＨ３領域が、当業者に公知の方法を使用して、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ末端またはカルボキシル末端のいずれかにおいて、融合され得る。別の例において、ヒトＩｇＧのヒンジ領域、ＣＨ２領域、およびＣＨ３領域は、Ｂ７−Ｌポリペプチドフラグメント（例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドの推定細胞外部分）のアミノ末端またはカルボキシル末端のいずれかにおいて、融合され得る。
【００８８】
得られるＢ７−Ｌ融合ポリペプチドは、プロテインＡアフィニティーカラムの使用によって、精製され得る。Ｆｃ領域に融合したペプチドおよびタンパク質は、融合していない対応物より実質的に長いインビボでの半減期を示すことが見出された。また、Ｆｃ領域への融合によって、融合ポリペプチドの二量体化／多量体化が可能になる。このＦｃ領域は、天然に存在するＦｃ領域であってもよいし、または治療品質、循環時間、もしくは減少した凝集のような、特定の品質を改善するよう変更されてもよい。
【００８９】
関連する核酸分子およびポリペプチドの同一性および類似性は、公知の方法によって容易に計算され得る。このような方法としては、Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａ．Ｍ．Ｌｅｓｋ編、Ｏｘｆｏｒｄ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ  １９８８）；Ｂｉｏｃｏｍｐｕｔｉｎｇ：Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ  ａｎｄ  Ｇｅｎｏｍｅ  Ｐｒｏｊｅｃｔｓ（Ｄ．Ｗ．Ｓｍｉｔｈ編、Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９９３）；Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ｏｆ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄａｔａ（Ｐａｒｔ  １，Ａ．Ｍ．ＧｒｉｆｆｉｎおよびＨ．Ｇ．Ｇｒｉｆｆｉｎ編、Ｈｕｍａｎａ  Ｐｒｅｓｓ  １９９４）；Ｇ．ｖｏｎ  Ｈｅｉｎｌｅ，Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９８７）；Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｐｒｉｍｅｒ（Ｍ．ＧｒｉｂｓｋｏｖおよびＪ．Ｄｅｖｅｒｅｕｘ編、Ｍ．Ｓｔｏｃｋｔｏｎ  Ｐｒｅｓｓ  １９９１）；ならびにＣａｒｉｌｌｏら、１９８８，ＳＩＡＭ  Ｊ．Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｍａｔｈ．，４８：１０７３に記載されるものが挙げられるが、これらに限定されない。
【００９０】
同一性および／または類似性を決定するための好ましい方法は、試験される配列間での最大の適合を生じるように、設計される。同一性および類似性を決定するための方法は、公に利用可能なコンピュータープログラムにおいて記載されている。２つの配列間の同一性および類似性を決定するための好ましいコンピュータープログラム方法としては、ＧＣＧプログラムパッケージ（ＧＡＰ（Ｄｅｖｅｒｅｕｘら、１９８４，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１２：３８７；Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）、ＢＬＡＳＴＰ、ＢＬＡＳＴＮ、およびＦＡＳＴＡ（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、１９９０，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−１０）を含む）が挙げられるが、これらに限定されない。ＢＬＡＳＴＸプログラムは、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（ＮＣＢＩ）および他の供給源（Ａｌｔｓｃｈｕｌら、ＢＬＡＳＴ  Ｍａｎｕａｌ（ＮＣＢ  ＮＬＭ  ＮＩＨ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，ＭＤ）；Ａｌｔｓｃｈｕｌら、１９９０、前出）から公に利用可能である。周知のＳｍｉｔｈ  Ｗａｔｅｒｍａｎアルゴリズムもまた、同一性を決定するために使用され得る。
【００９１】
２つのアミノ酸配列を整列させるための特定のアライメントスキームは、これら２つの配列の短い領域のみの適合を生じ得、そしてこの小さな整列領域は、その２つの全長配列間に有意な関連がない場合でさえも、非常に高い配列同一性を有し得る。従って、好ましい実施形態において、選択されたアライメント方法（ＧＡＰプログラム）は、本願ポリペプチドのうちの少なくとも５０個連続するアミノ酸にわたる整列を生じる。
【００９２】
例えば、コンピューターアルゴリズムＧＡＰ（Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）を使用して、配列同一性の百分率が決定されるべき２つのポリペプチドが、それらのそれぞれのアミノ酸の最適な適合（このアルゴリズムによって決定される「適合したスパン」）のために、整列される。ギャップオープニングペナルティー（ｇａｐ  ｏｐｅｎｉｎｇ  ｐｅｎａｌｔｙ）（これは、平均対角の３倍として計算される：「平均対角」とは、使用される比較行列（ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ  ｍａｔｒｉｘ）の対角の平均である；「対角」とは、特定の比較行列によって各完全なアミノ酸適合に対して割り当てられたスコアまたは数である）およびギャップエクステンションペナルティー（ｇａｐ  ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ  ｐｅｎａｌｔｙ）（これは通常、キャップオープニングペナルティーの０．１倍である）、ならびにＰＡＭ  ２５０またはＢＬＯＳＵＭ  ６２のような比較行列が、このアルゴリズムと組み合わせて使用される。標準的な比較行列もまた、このアルゴリズムによって使用される（Ｄａｙｈｏｆｆら、５  Ａｔｌａｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ（補遺３  １９７８）（ＰＡＭ２５０比較行列）；Ｈｅｎｉｋｏｆｆら、１９９２，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ８９：１０９１５−１９（ＢＬＯＳＵＭ  ６２比較行列）を参照のこと）。
【００９３】
ポリペプチド配列比較のための好ましいパラメータとしては、以下が挙げられる：
アルゴリズム：ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ，１９７０，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３−５３；
比較行列：ＢＬＯＳＵＭ  ６２（Ｈｅｎｉｋｏｆｆら、前出）；
ギャップペナルティー：１２
ギャップ長さペナルティー（Ｇａｐ  Ｌｅｎｇｔｈ  Ｐｅｎａｌｔｙ）：４
類似性の閾値（Ｔｈｒｅｓｈｏｌｄ  ｏｆ  Ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ）：０
このＧＡＰプログラムは、上記パラメータを用いて有用である。上記パラメータは、ＧＡＰアルゴリズムを用いるポリペプチド比較（末端ギャップに対してはペナルティーがないこととともに）のためのデフォルトパラメータである。
【００９４】
核酸分子配列比較のための好ましいパラメータとしては、以下が挙げられる：
アルゴリズム：ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈ，前出；
比較行列：適合＝＋１０，非適合＝０
ギャップペナルティー：５０
ギャップ長さペナルティー：３
このＧＡＰプログラムはまた、上記パラメータを用いて有用である。上記パラメータは、核酸分子比較のためのデフォルトパラメータである。
【００９５】
Ｐｒｏｇｒａｍ  Ｍａｎｕａｌ，Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｐａｃｋａｇｅ，Ｖｅｒｓｉｏｎ  ９，Ｓｅｐｔｅｍｂｅｒ，１９９７に記載されるものを含む、他の例示的なアルゴリズム、ギャップオープニングペナルティー、ギャップエクステンションペナルティー、比較行列、および類似性の閾値が使用され得る。なされるべき特定の選択は、当業者に明らかであり、そしてなされるべき特定の比較（例えば、ＤＮＡ対ＤＮＡ、タンパク質対タンパク質、タンパク質対ＤＮＡ）；ならびにさらに、その比較が所定の配列対の間（この場合には、ＧＡＰまたはＢｅｓｔＦｉｔが一般的に好ましい）であるか、１つの配列と大きな配列データベースとの間（この場合には、ＦＡＳＴＡまたはＢＬＡＳＴＡが好ましい）であるかに、依存する。
【００９６】
（核酸分子）
Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする核酸分子は、種々の様式（化学合成、ｃＤＮＡもしくはゲノムのライブラリーのスクリーニング、発現ライブラリースクリーニング、および／またはｃＤＮＡのＰＣＲ増幅が挙げられるが、これらに限定されない）で容易に得られ得る。
【００９７】
本明細書中において使用される組換えＤＮＡ法は、一般に、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，１９８９）および／またはＣｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ
Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ  Ｉｎｃ．ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ  １９９４）に記載されている方法である。本発明は、本明細書中に記載されているような核酸分子、およびこのような分子を得るための方法を提供する。
【００９８】
Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする遺伝子が１つの種から同定された場合には、この遺伝子の全てまたは一部を、オルソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）または同じ種由来の関連遺伝子を同定するためのプローブとして使用し得る。このプローブまたはプライマーを使用して、Ｂ７−Ｌポリペプチドを発現すると考えられる種々の組織供給源由来のｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングし得る。さらに、配列番号１に記載されるような配列を有する核酸分子の部分または全てを使用して、ゲノムライブラリーをスクリーニングし、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする遺伝子を同定および単離し得る。代表的に、中程度または高度のストリンジェンシーの条件が、スクリーニングのために使用されて、このスクリーニングから得られる偽陽性の数を最少にする。
【００９９】
Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする核酸分子はまた、発現されたタンパク質の特性に基づく陽性クローンの検出を使用する発現クローニングによって、同定され得る。代表的に、核酸ライブラリーは、抗体または他の結合パートナー（例えば、レセプターまたはリガンド）を、宿主細胞表面において発現および提示された、クローニングされたタンパク質に結合させることによって、スクリーニングされる。抗体または結合パートナーは、所望のクローンを発現する細胞を同定するために、検出可能な標識で改変される。
【０１００】
以下に記載される説明に従い実施される組換え発現技術に従って、これらのポリヌクレオチドを産生し得、そしてコードされたポリペプチドを発現させ得る。例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする核酸配列を適切なベクターに挿入することによって、当業者は、多量の所望されるヌクレオチド配列を容易に生成し得る。次いで、これらの配列を使用して、検出プローブまたは増幅プライマーを生成し得る。あるいは、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを、発現ベクターに挿入し得る。発現ベクターを適切な宿主に導入することによって、コードされたＢ７−Ｌポリペプチドが、多量に生成され得る。
【０１０１】
適切な核酸配列を得るための別の方法は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）である。この方法において、ｃＤＮＡは、酵素逆転写酵素を使用して、ポリ（Ａ）＋ＲＮＡまたは全ＲＮＡから調製される。次いで、２つのプライマー（代表的には、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードするｃＤＮＡの２つの別個の領域に対して相補的である）が、ＴａｑポリメラーゼのようなポリメラーゼとともにこのｃＤＮＡに添加され、そしてこのポリメラーゼが、これら２つのプライマー間のｃＤＮＡ領域を増幅する。
【０１０２】
Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする核酸分子を調製する別の手段は、Ｅｎｇｅｌｓら、１９８９，Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔｌ．第２８版：７１６−３４によって記載されるような、当業者に周知の方法を使用する、化学合成である。これらの方法としては、とりわけ、核酸合成のためのホスホトリエステル、ホスホルアミダイト、およびＨ−ホスホネート方法が挙げられる。このような化学合成のために好ましい方法は、標準的なホスホルアミダイト化学を使用する、ポリマーにより支持される合成である。代表的に、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードするＤＮＡは、数百ヌクレオチド長である。約１００ヌクレオチドより長い核酸は、これらの方法を使用して、いくつかのフラグメントとして合成され得る。次いで、これらのフラグメントが一緒に連結されて、Ｂ７−Ｌ遺伝子の全長ヌクレオチド配列を形成し得る。通常、このポリペプチドのアミノ末端をコードするＤＮＡフラグメントは、ＡＴＧ（これは、メチオニン残基をコードする）を有する。このメチオニンは、宿主細胞において産生されるポリペプチドがその細胞から分泌されるよう設計されているか否かに依存して、Ｂ７−Ｌポリペプチドの成熟形態で存在してもそうでなくてもよい。当業者に公知の他の方法が、同様に使用され得る。
【０１０３】
特定の実施形態において、核酸改変体は、所定の宿主細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチドの最適な発現のために変更されたコドンを含む。特定のコドン変更は、発現のために選択されるＢ７−Ｌポリペプチドおよび宿主細胞に依存する。このような「コドン最適化」は、種々の方法によって（例えば、所定の宿主細胞において高度に発現される遺伝子において使用されるのに好ましいコドンを選択することによって）実行され得る。高度に発現された細菌遺伝子のコドン優先度（ｃｏｄｏｎ  ｐｒｅｆｅｒｅｎｃｅ）についての「Ｅｃｏ＿ｈｉｇｈ．Ｃｏｄ」のようなコドン頻度表を組み込むコンピューターアルゴリズムが使用され得、そしてＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  ｏｆ  Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｐａｃｋａｇｅ  Ｖｅｒｓｉｏｎ  ９．０（Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）によって提供される。他の有用なコドン頻度表としては、「Ｃｅｌｅｇａｎｓ＿ｈｉｇｈ．ｃｏｄ」、「Ｃｅｌｅｇａｎｓ＿ｌｏｗ．ｃｏｄ」、「Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ＿ｈｉｇｈ．ｃｏｄ」、「Ｈｕｍａｎ＿ｈｉｇｈ．ｃｏｄ」、「Ｍａｉｚｅ＿ｈｉｇｈ．ｃｏｄ」、および「Ｙｅａｓｔ＿ｈｉｇｈ．ｃｏｄ．」が挙げられる。
【０１０４】
いくつかの場合において、Ｂ７−Ｌポリペプチド改変体をコードする核酸分子を調製することが所望され得る。改変体をコードする核酸分子は、プライマーが所望の点変異を有する部位特異的変異誘発、ＰＣＲ増幅、または他の適切な方法を使用して生成され得る（変異誘発技術の説明に関しては、Ｓａｍｂｒｏｏｋら、前出、およびＡｕｓｕｂｅｌら、前出を参照のこと）。Ｅｎｇｅｌｓら、前出によって記載される方法を使用する化学合成もまた、このような改変体を調製するために使用され得る。当業者に公知の他の方法が、同様に使用され得る。
【０１０５】
（ベクターおよび宿主細胞）
Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする核酸分子を、標準的な連結技術を使用して適切な発現ベクターに挿入する。ベクターは、代表的に、使用される特定の宿主細胞において機能的であるように選択される（すなわち、ベクターは、遺伝子の増幅および／または遺伝子の発現が生じ得るように、宿主細胞機構と適合性である）。Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列をコードする核酸分子は、原核生物宿主細胞、酵母宿主細胞、昆虫（バキュロウイルス系）宿主細胞および／または真核生物宿主細胞において増幅／発現され得る。宿主細胞の選択は、Ｂ７−Ｌポリペプチドが翻訳後修飾（例えば、グリコシル化および／またはリン酸化）されるか否かに一部依存する。その場合、酵母宿主細胞、昆虫宿主細胞、または哺乳動物宿主細胞が好ましい。発現ベクターの総説については、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．，第１８５巻（Ｄ．Ｖ．Ｇｏｅｄｄｅｌ編，Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ  １９９０）を参照のこと。
【０１０６】
代表的に、任意の宿主細胞に使用される発現ベクターは、プラスミド維持のための配列ならびに外来性ヌクレオチド配列のクローニングおよび発現のための配列を含む。このような配列（集合的に、「隣接配列」という）は、特定の実施形態において、代表的に、以下のヌクレオチド配列の１つ以上を含む：プロモーター、１つ以上のエンハンサー配列、複製起点、転写終結配列、ドナーおよびアクセプタースプライス部位を含む完全なイントロン配列、ポリペプチド分泌のためのリーダー配列をコードする配列、リボソーム結合部位、ポリアデニル化配列、発現されるポリペプチドをコードする核酸を挿入するためのポリリンカー領域、ならびに選択可能マーカーエレメント。これらの配列のそれぞれが、以下に議論される。
【０１０７】
必要に応じて、ベクターは、「タグ」コード配列（すなわち、Ｂ７−Ｌポリペプチドコード配列の５’末端または３’末端に配置されるオリゴヌクレオチド分子）を含み得；このオリゴヌクレオチド配列は、ポリＨｉｓ（例えば、ヘキサＨｉｓ）、または別の「タグ」（例えば、ＦＬＡＧ、ＨＡ（赤血球凝集素インフルエンザウイルス）またはｍｙｃ（これに対して、市販の抗体が存在する）をコードする。このタグは、代表的には、ポリペプチドの発現の際にポリペプチドに融合され、そして宿主細胞からの、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアフィニティー精製のための手段として役立ち得る。アフィニティー精製は、例えば、アフィニティーマトリクスとして、タグに対する抗体を使用するカラムクロマトグラフィーによって達成され得る。必要に応じて、タグは、引き続いて、切断のために特定のペプチダーゼを使用するような、種々の手段によって、精製されたＢ７−Ｌポリペプチドから除去され得る。
【０１０８】
隣接配列は、同種（すなわち、宿主細胞と同じ種および／または株由来）であり得るか、異種（すなわち、宿主細胞種または株以外の種由来）であり得るか、ハイブリッド（すなわち、１つより多くの供給源由来の隣接配列の組み合わせ）であり得るか、または合成であり得るか、あるいは隣接配列は、Ｂ７−Ｌポリペプチド発現を調節するために通常機能するネイティブな配列であり得る。従って、隣接配列の供給源は、任意の原核生物または真核生物、任意の脊椎生物または無脊椎生物、または任意の植物であり得るが、但し、これは、隣接配列が、この宿主細胞の機構において機能的であり、そしてこの宿主細胞の機構によって活性化され得る場合である。
【０１０９】
本発明のベクターに有用な隣接配列は、当該分野において周知である任意のいくつかの方法によって得られ得る。代表的には、Ｂ７−Ｌ遺伝子の隣接配列以外の、本発明で有用な隣接配列は、マッピングおよび／または制限エンドヌクレアーゼ消化によって以前に同定されており、従って、適切な制限エンドヌクレアーゼを使用して、適切な組織供給源から単離され得る。いくつかの場合において、隣接配列の全長ヌクレオチド配列は公知であり得る。ここで、隣接配列は、核酸合成またはクローニングのために本明細書中で記載される方法を使用して合成され得る。
【０１１０】
隣接配列の全てまたは一部のみが既知である場合、これは、ＰＣＲを使用して、ならびに／あるいは適切なオリゴヌクレオチドおよび／または同種もしくは別の種由来の隣接配列フラグメントを用いてゲノムライブラリーをスクリーニングすることによって得られ得る。隣接配列が公知ではない場合、隣接配列を含むＤＮＡのフラグメントは、例えば、コード配列または別の遺伝子さえも含み得る大きなＤＮＡ片から単離され得る。単離は、適切なＤＮＡフラグメントを生成するための制限エンドヌクレアーゼ消化、続くアガロースゲル精製を使用する単離、Ｑｉａｇｅｎ（登録商標）カラムクロマトグラフィー（Ｃｈａｔｓｗｏｒｔｈ、ＣＡ）、または当業者に公知の他の方法によって達成され得る。この目的を達成するための適切な酵素の選択は、当業者に容易に明らかである。
【０１１１】
複製起点は、代表的に、市販の原核生物発現ベクターの一部であり、この起点は、宿主細胞におけるベクターの増幅を補助する。特定のコピー数までのベクターの増幅は、いくつかの場合において、Ｂ７−Ｌポリペプチドの最適な発現のために重要であり得る。選択されたベクターが複製起点部位を含まない場合、複製起点は、既知の配列に基づいて化学的に合成され得、そしてベクターに連結され得る。例えば、プラスミドｐＢＲ３２２（Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）からの複製起点は、大部分のグラム陰性細菌に適切であり、そして種々の起源（例えば、ＳＶ４０、ポリオーマ、アデノウイルス、水疱性口内炎ウイルス（ＶＳＶ）、またはＨＰＶもしくはＢＰＶのようなパピローマウイルス）は、哺乳動物細胞におけるクローニングベクターに有用である。一般的に、複製起点の成分は、哺乳動物発現ベクターには必要ない（例えば、ＳＶ４０起源は、それが初期プロモーターを含むという理由のみによって、しばしば使用されている）。
【０１１２】
転写終結配列は、代表的にポリペプチドコード領域の３’ 末端に配置され、そして転写を終結させるのに役立つ。通常、原核生物細胞における転写終結配列は、Ｇ−Ｃリッチフラグメントと、それに続くポリＴ配列である。この配列はライブラリーから容易にクローン化されるか、またはさらにベクターの一部として市販されているが、これはまた、本明細書中に記載された核酸合成のための方法を使用して容易に合成され得る。
【０１１３】
選択マーカー遺伝子エレメントは、選択培養培地において増殖される宿主細胞の生存および増殖に必要なタンパク質をコードする。代表的な選択マーカー遺伝子は、（ａ）原核生物宿主細胞に対して、抗生物質または他の毒素（例えば、アンピシリン、テトラサイクリン、またはカナマイシン）に対する耐性を与えるか；（ｂ）細胞の栄養要求性の欠損を補うか；あるいは、（ｃ）複合培地から入手可能でない重要な栄養素を供給する、タンパク質をコードする。好ましい選択マーカーは、カナマイシン耐性遺伝子、アンピシリン耐性遺伝子、およびテトラサイクリン耐性遺伝子である。ネオマイシン耐性遺伝子もまた、原核生物宿主細胞および真核生物宿主細胞における選択のために使用され得る。
【０１１４】
他の選択遺伝子は、発現される遺伝子を増幅するために使用され得る。増幅は、増殖に重要なタンパク質の産生のために大いに要求されている遺伝子が、組換え細胞の継続世代の染色体内でタンデムに反復されているプロセスである。哺乳動物細胞に対する適切な選択マーカーの例としては、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）およびチミジンキナーゼが挙げられる。哺乳動物細胞の形質転換体は、選択圧下に置かれ、ここで、形質転換体のみが固有に、ベクターに存在する選択遺伝子によって生存するように適応される。培地中の選択因子の濃度を連続的に変化させ、それによって選択遺伝子とＢ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡとの両方の増幅を導く条件下で、形質転換された細胞を培養することによって、選択圧を加える。結果として、増加した量のＢ７−Ｌポリペプチドが、増幅されたＤＮＡから合成される。
【０１１５】
リボソーム結合部位は、通常、ｍＲＮＡの翻訳開始に必要であり、そしてＳｈｉｎｅ−Ｄａｌｇａｒｎｏ配列（原核性物）またはＫｏｚａｋ配列（真核生物）によって特徴付けられる。このエレメントは、代表的に、発現されるＢ７−Ｌポリペプチドのプロモーターに対して３’側およびコード配列に対して５’側に配置される。Ｓｈｉｎｅ−Ｄａｌｇａｒｎｏ配列は、可変であるが、代表的には、ポリプリン（すなわち、高いＡ−Ｇ含有量を有する）である。多くのＳｈｉｎｅ−Ｄａｌｇａｒｎｏ配列は、同定されており、これらのそれぞれが、本明細書中に記載の方法を使用して、容易に合成され得、原核生物ベクターにおいて使用され得る。
【０１１６】
リーダー配列、またはシグナル配列は、宿主細胞の外にＢ７−Ｌポリペプチドを指向させるために使用され得る。代表的には、シグナル配列をコードするヌクレオチド配列は、Ｂ７−Ｌ核酸分子のコード領域に位置するか、または直接Ｂ７−Ｌポリペプチドコード領域の５’側に位置する。多くのシグナル配列が同定されており、選択された宿主細胞において機能的である任意のシグナル配列が、Ｂ７−Ｌ核酸分子と組み合わせて使用され得る。従って、シグナル配列は、Ｂ７−Ｌ核酸分子に対して同種（天然に存在する）または異種であり得る。さらに、シグナル配列は、本明細書中に記載される方法を使用して化学的に合成され得る。大半の場合、シグナルペプチドの存在による宿主細胞からのＢ７−Ｌポリペプチドの分泌は、分泌されたＢ７−Ｌポリペプチドからのシグナルペプチドの除去を生じる。シグナル配列は、ベクターの成分であり得るか、またはベクターに挿入されたＢ７−Ｌ核酸分子の一部であり得る。
【０１１７】
Ｂ７−Ｌポリペプチドコード領域に結合されたネイティブなＢ７−Ｌポリペプチドシグナル配列をコードするヌクレオチド配列、または、Ｂ７−Ｌポリペプチドコード領域に結合された異種シグナル配列をコードするヌクレオチド配列のいずれかの使用は本発明の範囲内に含まれる。選択された異種シグナル配列は、宿主細胞によって認識され、プロセスされる（すなわち、シグナルペプチダーゼによって切断される）ものであるべきである。ネイティブなＢ７−Ｌポリペプチドシグナル配列を認識せず、そしてプロセスもしない原核生物宿主細胞について、シグナル配列は、例えば、アルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、または熱安定エンテロトキシンＩＩリーダーの群から選択される原核生物シグナル配列によって置換される。酵母分泌のために、ネイティブなＢ７−Ｌポリペプチドシグナル配列は、酵母インベルターゼ、α因子、または酸ホスファターゼリーダーによって置換され得る。哺乳動物細胞発現において、ネイティブなシグナル配列で十分であるが、他の哺乳動物シグナル配列が適切であり得る。
【０１１８】
真核生物宿主細胞発現系においてグリコシル化が所望されるような、いくつかの場合において、グリコシル化または収量を改善するために種々のプレ配列（ｐｒｅｓｅｑｕｅｎｃｅ）が操作され得る。例えば、特定のシグナルペプチドのペプチダーゼ切断部位を変更し得るかまたはプロ配列（ｐｒｏ−ｓｅｑｕｅｎｃｅ）を加え得、これはまた、グリコシル化に影響し得る。最終タンパク質産物は、（成熟タンパク質の最初のアミノ酸に対して）１位に、発現に付随する１つ以上のさらなるアミノ酸を有し得、これは、完全には除去されない可能性がある。例えば、最終のタンパク質産物は、アミノ末端に結合される、ペプチダーゼ切断部位において見出される１つまたは２つのアミノ酸残基を有し得る。あるいは、いくつかの酵素切断部位の使用は、酵素が成熟ポリペプチド内のこのような領域で切断する場合に所望のＢ７−Ｌポリペプチドのわずかに短縮された（ｔｒｕｎｃａｔｅ）形態を生じ得る。
【０１１９】
多くの場合において、核酸分子の転写は、ベクター内の１つ以上のイントロンの存在によって増加する；これは、ポリペプチドが真核生物宿主細胞（特に、哺乳動物宿主細胞）において産生される場合に特に当てはまる。使用されるイントロンは、特に使用される遺伝子が全長ゲノム配列またはそのフラグメントである場合にＢ７−Ｌ遺伝子内に天然に存在するものであり得る。イントロンが遺伝子内に天然に存在しない場合（大部分のｃＤＮＡについて）、イントロンは、別の供給源から得られ得る。隣接配列およびＢ７−Ｌ遺伝子に対してイントロンの位置は、イントロンが有効に転写されなければならないので、一般的に重要である。従って、Ｂ７−Ｌ  ｃＤＮＡ分子が転写される場合、イントロンの好ましい位置は、転写開始部位に対して３’側であり、かつポリ−Ａ転写終止配列に対して５’側である。好ましくは、イントロン（単数または複数）は、コード配列を妨害しないように、ｃＤＮＡの１方の側または他方の側（すなわち、５’側または３’側）に配置される。任意の供給源（ウイルス、原核生物および真核生物（植物または動物）を含む）由来の任意のイントロンを使用して本発明を実行し得るが、但し、これは、このイントロンが、挿入される宿主細胞に適合性である場合である。合成イントロンもまたここに含まれる。必要に応じて、１つより多くのイントロンがベクター内で使用され得る。
【０１２０】
本発明の発現ベクターおよびクローニングベクターは、代表的には、宿主生物によって認識され、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする分子に作動可能に連結されたプロモーターを含む。プロモーターは、構造遺伝子の転写を制御する、構造遺伝子（一般的に、約１００〜１０００ｂｐ）の開始コドンに対して上流（すなわち、５’側）に配置される非転写配列である。プロモーターは、従来、２つのクラス（誘導プロモーターおよび構成プロモーター）のうち１つに分類される。誘導プロモーターは、培養条件におけるいくつかの変化（例えば、栄養の存在または非存在、あるいは温度の変化）に応じてそれらの制御下で、ＤＮＡからの増加したレベルの転写を開始する。他方、構成プロモーターは、連続的な遺伝子産物の産生を開始する；すなわち、遺伝子発現は、ほとんど制御されないかまたは全く制御されない。多数のプロモーター（種々の潜在的な宿主細胞によって認識される）が周知である。適切なプロモーターは、供給源のＤＮＡからプロモーターを制限酵素消化によって除去し、そして所望のプロモーター配列をベクターに挿入することによって、Ｂ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡに作動可能に連結される。ネイティブなＢ７−Ｌプロモーター配列は、Ｂ７−Ｌ核酸分子の増幅および／または発現に指向させるために使用され得る。しかし、ネイティブなプロモーターと比較して高度に転写および発現されたタンパク質のより高い収量が可能である場合、および使用のために選択された宿主細胞系と適合性である場合、異種プロモーターが好ましい。
【０１２１】
原核生物宿主との使用に適切なプロモーターとしては、β−ラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系；アルカリホスファターゼ；トリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系；およびハイブリッドプロモーター（例えば、ｔａｃプロモーター）が挙げられる。他の公知の細菌プロモーターもまた、適切である。これらの配列は、公開されており、これにより、当業者は、任意の有用な制限部位を供給するのに必要とされる場合にリンカーまたはアダプターを使用して、所望のＤＮＡにそれらの配列を連結し得る。
【０１２２】
酵母宿主との使用に適切なプロモーターはまた、当該分野において周知である。酵母エンハンサーは、酵母プロモーターと共に有利に使用される。哺乳動物宿主細胞との使用に適切なプロモーターは周知であり、限定しないが、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス（例えば、Ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ  ２）、ウシパピローマウイルス、鳥類肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、Ｂ型肝炎ウイルスおよび最も好ましくはシミアンウイルス４０（ＳＶ４０）のようなウイルスのゲノムから得られるプロモーターが挙げられる。他の適切な哺乳動物プロモーターとしては、異種哺乳動物プロモーター（例えば、熱ショックプロモーターおよびアクチンプロモーター）が挙げられる。
【０１２３】
Ｂ７−Ｌ遺伝子発現を制御する際に重要であり得るさらなるプロモーターとしては、限定しないが、以下が挙げられる：ＳＶ４０初期プロモータ領域（Ｂｅｒｎｏｉｓｔ  ａｎｄ  Ｃｈａｍｂｏｎ，１９８１，Ｎａｔｕｒｅ  ２９０：３０４−１０）；ＣＭＶプロモーター；ラウス肉腫ウイルスの３’側の長い末端反復に含まれるプロモーター（Ｙａｍａｍｏｔｏら，１９８０，Ｃｅｌｌ  ２２  ：７８７−９７）；ヘルペスチミジンキナーゼプロモーター（Ｗａｇｎｅｒら，１９８１，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．７８：１４４４−４５）；メタロチオネイン遺伝子の調節配列（Ｂｒｉｎｓｔｅｒら，１９８２，Ｎａｔｕｒｅ  ２９６：３９−４２）；β−ラクタマーゼプロモーターのような原核生物発現ベクター（Ｖｉｌｌａ−Ｋａｍａｒｏｆｆら，１９７８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，７５：３７２７−３１）；またはｔａｃプロモーター（ＤｅＢｏｅｒら，１９８３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，８０：２１−２５）。組織特異性を示し、そしてトランスジェニック動物において利用されている、以下の動物転写制御領域もまた重要である：膵臓腺房細胞において活性なエラスターゼＩ遺伝子制御領域（Ｓｗｉｆｔら，１９８４，Ｃｅｌｌ  ３８：６３９−４６；Ｏｒｎｉｔｚら，１９８６，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｓｙｍｐ．Ｑｕａｎｔ．Ｂｉｏｌ．５０：３９９−４０９（１９８６）；ＭａｃＤｏｎａｌｄ，１９８７，Ｈｅｐａｔｏｌｏｇｙ  ７：４２５−５１５）；膵臓β細胞において活性なインシュリン遺伝子制御領域（Ｈａｎａｈａｎ，１９８５，Ｎａｔｕｒｅ  ３１５：１１５−２２）；リンパ系細胞において活性な免疫グロブリン遺伝子制御領域（Ｇｒｏｓｓｃｈｅｄｌら，１９８４，Ｃｅｌｌ  ３８：６４７−５８；Ａｄａｍｅｓら，１９８５，Ｎａｔｕｒｅ  ３１８：５３３−３８；Ａｌｅｘａｎｄｅｒら，１９８７，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．，７：１４３６−４４）；精巣、乳房、リンパ系細胞、および肥満細胞において活性なマウス乳房腫瘍ウイルス制御領域（Ｌｅｄｅｒら，１９８６，Ｃｅｌｌ  ４５：４８５−９５）；肝臓において活性なアルブミン遺伝子制御領域（Ｐｉｎｋｅｒｔら，１９８７，Ｇｅｎｅｓ
ａｎｄ  Ｄｅｖｅｌ．１：２６８−７６）；肝臓において活性なα−フェトプロテイン遺伝子制御領域（Ｋｒｕｍｌａｕｆら，１９８５，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｂｉｏｌ．，５：１６３９−４８；Ｈａｍｍｅｒら，１９８７，Ｓｃｉｅｎｃｅ
２３５：５３−５８）；肝臓において活性なα１−抗トリプシン遺伝子制御領域（Ｋｅｌｓｅｙら，１９８７，Ｇｅｎｅｓ  ａｎｄ  Ｄｅｖｅｌ．１：１６１−７１）；骨髄性細胞において活性なβ−グロビン遺伝子制御領域（Ｍｏｇｒａｍら，１９８５，Ｎａｔｕｒｅ  ３１５：３３８−４０；Ｋｏｌｌｉａｓら，１９８６，Ｃｅｌｌ  ４６：８９−９４）；脳の稀突起神経膠細胞において活性なミエリン塩基性タンパク質遺伝子制御領域（Ｒｅａｄｈｅａｄら，１９８７，Ｃｅｌｌ  ４８：７０３−１２）；骨格筋において活性なミオシン軽鎖−２遺伝子制御領域（Ｓａｎｉ，１９８５，Ｎａｔｕｒｅ  ３１４：２８３−８６）；ならびに視床下部において活性なゴナドトロピン放出ホルモン遺伝子制御領域（Ｍａｓｏｎら，１９８６，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２３４：１３７２−７８）。
【０１２４】
エンハンサー配列は、より高等な真核生物によって本発明のＢ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡの転写を増加するように、ベクターに挿入され得る。エンハンサーは、転写を増加させるようにプロモーターに作用する、通常約１０〜３００ｂｐの長さのＤＮＡのシス作用エレメントである。エンハンサーは、相対的な方向および位置に依存しない。これらは、転写ユニットに対して５’側および３’側に見出される。哺乳動物遺伝子から入手可能ないくつかのエンハンサー配列が公知である（例えば、グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテインおよびインシュリン）。しかし、代表的には、ウイルス由来のエンハンサーが、使用される。ＳＶ４０エンハンサー、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、ポリオーマエンハンサー、およびアデノウイルスエンハンサーは、真核生物プロモーターの活性化についての代表的な増強エレメントである。エンハンサーは、Ｂ７−Ｌ核酸分子に対して５’位または３’位でベクターにスプライシングされ得るが、代表的には、プロモーターから５’位側に配置される。
【０１２５】
本発明の発現ベクターは、市販のベクターのような開始ベクターから構築され得る。このようなベクターは、全ての所望な隣接配列を含んでも良いし、含まなくても良い。本明細書中に記載される隣接配列の１つ以上がまだベクター内にない場合、これらは、個々に得られ得、ベクターに連結され得る。隣接配列のそれぞれを得るために使用される方法は、当業者に周知である。
【０１２６】
本発明を実施するために好ましいベクターは、細菌宿主細胞、昆虫宿主細胞、および哺乳動物宿主細胞と適合性のベクターである。このようなベクターとしては、特に、ｐＣＲＩＩ、ｐＣＲ３、およびｐｃＤＮＡ３．１（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）、ｐＢＳＩＩ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ、Ｌａ
Ｊｏｌｌａ、ＣＡ）、ｐＥＴ１５（Ｎｏｖａｇｅｎ、Ｍａｄｉｓｏｎ、ＷＩ）、ｐＧＥＸ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）、ｐＥＧＦＰ−Ｎ２（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ、Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ、ＣＡ）、ｐＥＴＬ（ＢｌｕｅＢａｃＩＩ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ｐＤＳＲ−α（国際公開番号ＷＯ  ９０／１４３６３）ならびにｐＦａｓｔＢａｃＤｕａｌ（Ｇｉｂｃｏ−ＢＲＬ、Ｇｒａｎｄ  Ｉｓｌａｎｄ、ＮＹ）が挙げられる。
【０１２７】
さらなる適切なベクターとしては、限定しないが、コスミド、プラスミド、または改変ウイルスが挙げられるが、これらのベクター系は、選択された宿主細胞と適合性でなければならないことが理解される。このようなベクターとしては、限定しないが、Ｂｌｕｅｓｃｒｉｐｔ（登録商標）プラスミド誘導体（高コピー数ＣｏｌＥｌ−ベースのファージミド、Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ  Ｃｌｏｎｉｎｇ
Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｌａ  Ｊｏｌｌａ  ＣＡ）、Ｔａｑ増幅ＰＣＲ産物をクローニングするために設計されたＰＣＲクローニングプラスミド（例えば、ＴＯＰＯＴＭ  ＴＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ（登録商標）Ｋｉｔ、およびＰＣＲ２．１（登録商標）プラスミド誘導体；Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、ならびに哺乳動物ベクター、酵母ベクターまたはバキュロウイルス発現系のようなウイルスベクター（ｐＢａｃＰＡＫプラスミド誘導体、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）が挙げられる。
【０１２８】
ベクターが構築され、そしてＢ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸分子がベクターの適切な部位に挿入された後に、完全なベクターが増幅発現および／またはポリペプチド発現に適切な宿主細胞に挿入され得る。選択された宿主細胞への、Ｂ７−Ｌポリペプチドに対する発現ベクターの形質転換は、トランスフェクション、感染、塩化カルシウム、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、リポフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン法、または他の公知の技術のような方法を含む周知の方法によって達成され得る。選択される方法は、一部、使用される宿主細胞の種類と相関関係にある。これらの方法および他の適切な方法は、当業者に周知であり、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（前出）に記載される。
【０１２９】
宿主細胞は、原核生物宿主細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）または真核生物宿主細胞（例えば、酵母細胞、昆虫細胞、または脊椎動物細胞）であり得る。宿主細胞は、適切な条件下で培養される場合、Ｂ７−Ｌポリペプチドを合成し、このポリペプチドは、続いて、培養培地から（宿主細胞がそのポリペプチドを培地に分泌する場合）収集され得るか、直接そのポリペプチドを産生する宿主細胞から収集される（そのポリペプチドが分泌されない場合）。適切な宿主細胞の選択は、所望の発現レベル、活性に望ましいかまたは必要なポリペプチド修飾（例えば、グリコシル化またはリン酸化）、および生物学的に活性な分子に折り畳まれる容易さなどの種々の因子に依存する。
【０１３０】
多くの適切な宿主細胞が当該分野において公知であり、多くが、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ），Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡから入手可能である。例としては、限定しないが、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ）、ＣＨＯ  ＤＨＦＲ（−）細胞（Ｕｒｌａｕｂら，１９８０，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９７：４２１６−２０）、ヒト胚性腎臓（ＨＥＫ）２９３または２９３Ｔ細胞、あるいは３Ｔ３細胞のような哺乳動物細胞が挙げられる。適切な哺乳動物宿主細胞の選択および形質転換、培養、増幅、スクリーニング、産物生成、および精製のための方法が当該分野において公知である。他の適切な哺乳動物細胞株は、サルＣＯＳ−１およびＣＯＳ−７細胞株、およびＣＶ−１細胞株である。さらなる例示的な哺乳動物宿主細胞としては、霊長動物細胞株およびげっ歯類動物細胞株（形質転換細胞株を含む）が挙げられる。正常な二倍体細胞、初代組織のインビトロ培養物から誘導される細胞系統、ならびに初代外植片もまた適切である。候補細胞は、選択遺伝子を遺伝子型的に欠損し得るか、または優先的に作用する選択遺伝子を含み得る。他の適切な哺乳動物細胞株としては、限定しないが、マウス神経芽細胞腫Ｎ２Ａ細胞、ＨｅＬａ、マウスＬ−９２９細胞、Ｓｗｉｓｓから誘導された３Ｔ３株、Ｂａｌｂ−ｃまたはＮＩＨマウス、ＢＨＫまたはＨａＫハムスター細胞株が挙げられる。これらの細胞株のそれぞれは、タンパク質発現の当業者に公知であり入手可能である。
【０１３１】
同様に、細菌細胞は、本発明に適切な宿主細胞として有用である。例えば、Ｅ．ｃｏｌｉの種々の株（例えば、ＨＢ１０１、ＤＨ５α、ＤＨ１０、およびＭＣ１０６１）は、生物工学の分野において宿主細胞として周知である。Ｂ．ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ  ｓｐｐ．，他のＢａｃｉｌｌｕｓ  ｓｐｐ．、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ  ｓｐｐ．などの種々の系統もまた本方法において使用され得る。
【０１３２】
当業者に公知の酵母細胞の多くの株はまた、本発明のポリペプチドの発現のため宿主細胞として入手可能である。好ましい酵母細胞としては、例えば、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ  ｃｅｒｉｖｉｓａｅおよびＰｉｃｈｉａ  ｐａｓｔｏｒｉｓが挙げられる。
【０１３３】
さらに、望ましい場合、昆虫細胞系が、本発明の方法において利用され得る。このような系は、例えば、Ｋｉｔｔｓら，１９９３，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，１４：８１０−１７；Ｌｕｃｋｌｏｗ，１９９３，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．４：５６４−７２；およびＬｕｃｋｌｏｗら，１９９３，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．，６７：４５６６−７９に記載される。好ましい昆虫細胞は、Ｓｆ−９およびＨｉ５（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）である。
【０１３４】
グリコシル化Ｂ７−Ｌポリペプチドを発現するためにトランスジェニック動物もまた使用し得る。例えば、トランスジェニック乳産生動物（例えば、雌ウシまたはヤギ）を使用し、本発明のグルコシル化ポリペプチドを動物の乳に得ることができる。Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生するために植物もまた使用し得るが、しかし、一般的に、植物において生じるグリコシル化は、哺乳動物細胞において産生されるものとは異なり、ヒト治療用途に適切ではないグリコシル化産物を生じ得る。
【０１３５】
（ポリペプチド産生）
Ｂ７−Ｌポリペプチド発現ベクターを含む宿主細胞は、当業者に周知の標準的な培地を使用して培養され得る。この培地は、通常、細胞の増殖および生存に必要な全ての栄養分を含む。Ｅ．ｃｏｌｉ細胞を培養するための適切な培地としては、例えば、Ｌｕｒｉａ  Ｂｒｏｔｈ（ＬＢ）および／またはＴｅｒｒｉｆｉｃ
Ｂｒｏｔｈ（ＴＢ）が挙げられる。真核生物細胞を培養するための適切な培地としては、Ｒｏｓｗｅｌｌ  Ｐａｒｋ  Ｍｅｍｏｒｉａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ
ｍｅｄｉｕｍ  １６４０（ＲＰＭＩ  １６４０）、Ｍｉｎｉｍａｌ  Ｅｓｓｅｎｔｉａｌ  Ｍｅｄｉｕｍ（ＭＥＭ）および／またはＤｕｌｂｅｃｃｏ’ｓ  Ｍｏｄｉｆｉｅｄ  Ｅａｇｌｅ  Ｍｅｄｉｕｍ（ＤＭＥＭ）が挙げられ、これらの全ては、培養される特定の細胞株に必要な血清および／または増殖因子を補充され得る。昆虫細胞についての適切な培地は、必要に応じて、イーストレート（ｙｅａｓｔｏｌａｔｅ）、ラクトアルブミン加水分解産物、および／または胎仔ウシ血清を補充したグレース培地である。
【０１３６】
代表的に、トランスフェクトされた細胞または形質転換された細胞の選択的な増殖に有用な抗生物質または他の化合物が、培地に補充物質として加えられる。使用される化合物は、宿主細胞が形質転換されるプラスミドに存在する選択マーカーエレメントによって検出される。例えば、選択マーカーエレメントがカナマイシン耐性である場合、培養倍地に加えられる化合物は、カナマイシンである。選択的増殖のための他の化合物としては、アンピシリン、テトラサイクリン、およびネオマイシンが挙げられる。
【０１３７】
宿主細胞によって産生されるＢ７−Ｌポリペプチドの量は、当該分野において公知の標準的な方法を使用して評価され得る。このような方法としては、限定しないが、ウェスタンブロット分析、ＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動、非変性ゲル電気泳動、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）分離、免疫沈降、および／またはＤＮＡ結合ゲルシフトアッセイのような活性アッセイが挙げられる。
【０１３８】
Ｂ７−Ｌポリペプチドが宿主細胞から分泌されるように設計された場合、ポリペプチドの大部分は、細胞培養培地中で見出され得る。しかし、Ｂ７−Ｌポリペプチドが宿主細胞から分泌されない場合、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、細胞質および／または核（真核宿主細胞について）に存在するか、あるいは、細胞質ゾル（グラム陰性細菌宿主細胞について）に存在する。
【０１３９】
宿主細胞細胞質および／または核（真核生物宿主細胞について）に位置するかまたは細胞質ゾル（細菌宿主細胞について）に位置するＢ７−Ｌポリペプチドについて、細胞内物質（グラム陰性細菌についての封入体を含む）は、当業者に公知の任意の標準的な技術を使用して宿主細胞から抽出され得る。例えば、宿主細胞は、フレンチプレス、均質化、および／または超音波処理、続く遠心分離によって、ペリプラズム／細胞質の含有物を放出するように溶解され得る。
【０１４０】
Ｂ７−Ｌポリペプチドが細胞質ゾル内に封入体を形成した場合、この封入体は、しばしば、内部および／または外部細胞膜に結合し得、従って、主に、遠心分離後にペレット材料において見出される。次いで、ペレット材料は、ｐＨ極限値で処理され得るか、あるいはジチオトレイトールのような還元剤の存在下アルカリ性のｐＨで、またはトリスカルボキシエチルホスフィンの存在下酸性のｐＨで、界面活性剤、グアニジン、グアニジン誘導体、尿素、または尿素誘導体のようなカオトロピック剤で処理されて、封入体を放出し、分断し、そして溶解し得る。次いで、溶解されたＢ７−Ｌポリペプチドは、ゲル電気泳動、免疫沈降などを使用して分析され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドを単離することが望ましい場合、単離は、本明細書中およびＭａｒｓｔｏｎら，１９９０，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．，１８２：２６４−７５に記載される方法のような標準的な方法を使用して達成され得る。
【０１４１】
いくつかの場合、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、単離の際、生物学的に活性でなくても良い。「再折り畳みする」、つまり、ポリペプチドをその三次構造に変換し、ジスルフィド連結を生成するための種々の方法を使用して、生物学的活性を回複し得る。このような方法は、溶解されたポリペプチドをあるｐＨ（通常７より上）および特定の濃度のカオトロピック剤（ｃｈａｏｔｒｏｐｅ）の存在下に曝露する工程を包含する。カオトロピック剤の選択は、封入体溶解に使用される選択肢に非常に類似するが、通常、カオトロピック剤は低い濃度で使用され、溶解に使用されるカオトロピック剤と必ずしも同一ではない。多くの場合、再折り畳み／酸化溶液はまた、還元剤、または特定の比の還元剤およびその酸化形態を含んで、タンパク質のシステイン架橋の形成を生じるジスルフィドシャフリングを可能にする特定の酸化還元電位を生じる。通常使用される酸化還元対のいくつかとしては、システイン／シスタミン、グルタチオン（ＧＳＨ）／ジチオビスＧＳＨ、塩化銅（ＩＩ）、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）／ジチアンＤＴＴ、および２，２−メルカプトエタノール（ｂＭＥ）／ジチオ−ｂ（ＭＥ）が挙げられる。多くの場合において、共溶媒が使用され得るか、または再折り畳みの効率を増加するのに必要であり得、この目的のために使用されるより一般的な試薬としては、グリセロール、種々の分子量のポリエチレングリコール、アルギニンなどが挙げられる。
【０１４２】
封入体がＢ７−Ｌポリペプチドの発現において有意な程度まで形成されない場合、ポリペプチドは、主に、細胞ホモジネートの遠心分離後に上清中に見出される。ポリペプチドは、さらに、本明細書中に記載されるような方法を使用して上清から単離され得る。
【０１４３】
溶液からのＢ７−Ｌポリペプチドの精製は、種々の技術を使用して達成され得る。ポリペプチドが、ヘキサヒスチジン（Ｂ７−Ｌポリペプチド／ｈｅｘａＨｉｓ）のようなタグまたは他の小さなペプチド（例えば、ＦＬＡＧ（Ｅａｓｔｍａｎ  Ｋｏｄａｋ  Ｃｏ．，Ｎｅｗ  Ｈａｖｅｎ，ＣＴ）またはｍｙｃ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ））をそのカルボキシ末端またはアミノ末端のいずれかにおいて含むように合成された場合、カラムマトリクスがタグについて高い親和性を有するアフィニティーカラムに溶液を通すことによって一工程で精製され得る。
【０１４４】
例えば、ポリヒスチジンは、ニッケルに対して大きな親和性および特異性で結合する。従って、ニッケルのアフィニティーカラム（例えば、Ｑｉａｇｅｎ（登録商標）ニッケルカラム）は、Ｂ７−Ｌポリペプチド／ポリＨｉｓの精製のために使用され得る。例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  §  １０．１１．８（Ａｕｓｕｂｅｌら編，Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ  Ｉｎｃ．  ａｎｄ  Ｗｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ  １９９３）を参照のこと。
【０１４５】
さらに、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、Ｂ７−Ｌポリペプチドを特異的に認識し得、そして結合し得るモノクローナル抗体の使用によって精製され得る。
【０１４６】
精製のための他の適切な手段はとしては、限定しないが、アフィニティークロマトグラフィー、免疫親和性クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、モレキュラーシーブクロマトグラフィー、ＨＰＬＣ、電気泳動（ネイティブゲル電気泳動を含む）、続くゲル溶出、および分取用等電集束法（「Ｉｓｏｐｒｉｍｅ」ｍａｃｈｉｎｅ／ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ，Ｈｏｅｆｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｓａｎ  Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ，ＣＡ）が挙げられる。いくつかの場合において、２つ以上の精製技術が、増加した純度を達成するために組み合わせられ得る。
【０１４７】
Ｂ７−Ｌポリペプチドはまた、Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄら，１９６３，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．８５：２１４９；Ｈｏｕｇｈｔｅｎら，１９８５，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８２：５１３２；およびＳｔｅｗａｒｔ  ａｎｄ  Ｙｏｕｎｇ，Ｓｏｌｉｄ  Ｐｈａｓｅ  Ｐｅｐｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｐｉｅｒｃｅ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｃｏ．１９８４）に記載されるような当該分野で公知の技術を使用する、化学合成法（例えば、固相ペプチド合成）によって調製され得る。このようなポリペプチドは、アミノ末端にメチオニンを有するかまたは有さないで合成され得る。化学的に合成されたＢ７−Ｌポリペプチドは、これらの参考文献に記載される方法を使用して酸化され得て、ジスルフィド架橋を形成し得る。化学的に合成されたＢ７−Ｌポリペプチドは、組換え的に産生されるかまたは天然の供給源から精製される対応するＢ７−Ｌポリペプチドに匹敵する生物学的活性を有すると期待され、従って、組換えまたは天然のＢ７−Ｌポリペプチドと相互交換可能に使用され得る。
【０１４８】
Ｂ７−Ｌポリペプチドを得る別の手段は、Ｂ７−Ｌポリペプチドが天然に見出される供給源の組織および／または流体のような生物学的サンプルからの精製による。このような精製は、本明細書中に記載されるようなタンパク質精製のための方法を使用して行われ得る。精製の間、Ｂ７−Ｌポリペプチドの存在が、例えば、組換え的に産生されたＢ７−Ｌポリペプチドまたはそのペプチドフラグメントに対して調製される抗体を使用してモニターされ得る。
【０１４９】
核酸およびポリペプチドを産生するための多くのさらなる方法は、当該分野において公知であり、この方法は、Ｂ７−Ｌポリペプチドに対して特異性を有するポリペプチドを産生するために使用され得る。例えば、Ｒｏｂｅｒｔｓら，１９９７，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９４：１２２９７−３０３を参照のこと。これは、ｍＲＮＡとそのコードされるペプチドとの間の融合タンパク質の産生を記載する。Ｒｏｂｅｒｔｓ，１９９９，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ  ３：２６８−７３もまた参照のこと。さらに、米国特許第５，８２４，４６９号は、特定の生物学的機能を実行し得るオリゴヌクレオチドを得るための方法を記載する。この手順は、異種プールのオリゴヌクレオチドを生成する工程を包含し、それぞれが、５’無作為化配列、中心予備選択配列、および３’無作為化配列を有する。得られる異種プールは、所望の生物学的活性を示さない細胞の集団に導入される。次いで、細胞の亜集団を、所定の生物学的機能を示すものについてスクリーニングする。その亜集団から、所望の生物学的機能を実行し得るオリゴヌクレオチドが単離される。
【０１５０】
米国特許第５，７６３，１９２号；同第５，８１４，４７６号；同第５，７２３，３２３号；および同第５，８１７，４８３号は、ペプチドまたはポリペプチドを産生するためのプロセスを記載する。これは、確率論的遺伝子またはそのフラグメントを産生し、次いで、確率論的遺伝子によってコードされた１以上のタンパク質を産生する宿主細胞にこれらの遺伝子を導入することによって達成される。次いで、この宿主細胞は、所望の活性を有するペプチドまたはポリペプチドを産生する、これらのクローンを同定するためにスクリーニングされる。
【０１５１】
ペプチドまたはポリペプチドを産生するための別の方法は、Ａｔｈｅｒｓｙｓ，Ｉｎｃ．によって出願された国際公開番号ＷＯ９９／１５６５０に記載される。（「Ｒａｎｄｏｍ  Ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｇｅｎｅ  Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ  ｆｏｒ  Ｇｅｎｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ」（ＲＡＧＥ−ＧＤ）として知られている、このプロセスは、インサイチュ組換え方法によって、内因性遺伝子の発現の活性化または遺伝子の過剰発現を含む。例えば、内因性遺伝子の発現は、非相同性組換えまたは異常な組換えによって、遺伝子の発現を活性化し得る標的細胞中に、調節配列を組み込むことによって、活性化または増加される。この標的ＤＮＡは、まず、放射線に供せられ、そして遺伝子プロモーターに挿入される。このプロモーターは、遺伝子の前方にブレイクを配置し、遺伝子の転写を開始する。これは、所望のペプチドまたはポリペプチドの発現を生じる。
【０１５２】
これらの方法はまた、包括的なＢ７−Ｌポリペプチド発現ライブラリーを作製するために使用され得、このライブラリーは、続いて、種々のアッセイ（例えば、生化学的アッセイ、細胞アッセイおよび生物全体のアッセイ（例えば、植物、マウスなど））において、ハイスループット表現型スクリーニングのために使用され得ることが理解される。
【０１５３】
（合成）
本明細書中に記載される核酸およびポリペプチド分子は、組換えおよび他の手段によって産生され得ることは、当業者によって理解される。
【０１５４】
（選択的結合アッセイ）
用語「選択的結合因子」は、１以上のＢ７−Ｌポリペプチドに対して特異性を有する分子をいう。適切な選択的結合因子としては、抗体およびその誘導体、ポリペプチド、ならびに低分子が挙げられるが、これらに限定されない。適切な選択的結合因子は、当該分野で公知の方法を使用して調製され得る。本発明の例示的なＢ７−Ｌポリペプチド選択的結合因子は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの特定の部分を結合し得、これにより、このポリペプチドのＢ７−Ｌポリペプチドレセプターへの結合を阻害する。
【０１５５】
Ｂ７−Ｌポリペプチドと結合する抗体および抗体フラグメントのような選択的結合因子は、本発明の範囲内である。この抗体は、単一特異的なポリクローナルを含むポリクローナル；モノクローナル（ＭＡｂ）；組換え；キメラ；ヒト化（例えば、相補性決定領域（ＣＤＲ）移植化）；ヒト；単鎖；および／または二重特異的；ならびにそれらのフラグメント；改変体；または誘導体であり得る。抗体フラグメントは、Ｂ７−Ｌポリペプチド上のエピトープに結合する抗体のこれらの一部を含む。このようなフラグメントの例としては、全長抗体の酵素学的切断によって産生されたＦａｂフラグメントおよびＦ（ａｂ’）フラグメントが挙げられる。他の結合フラグメントとしては、組換えＤＮＡ技術（例えば、抗体可変領域をコードする核酸配列を含む、組換えプラスミドの発現）によって産生されたフラグメントが挙げられる。
【０１５６】
Ｂ７−Ｌポリペプチドに特異的なポリクローナル抗体は、一般に、Ｂ７−Ｌポリペプチドおよびアジュバンドの複数回の皮下注射または腹腔内注射によって動物（例えば、ウサギまたはマウス）において産生される。Ｂ７−Ｌポリペプチドをキャリアタンパク質に結合させることは、有用であり得、このタンパク質は、キーホールリンペットヘモシアニン、血清、アルブミン、ウシサイログロブリン、またはダイズトリプシンインヒビターのように、免疫化される種において免疫原性である。また、ミョウバンのような凝集剤は、免疫応答を増強させるために使用される。免疫化後、この動物は採血され、そして血清を、抗Ｂ７−Ｌポリペプチド抗体力価についてアッセイする。
【０１５７】
Ｂ７−Ｌポリペプチドに特異的なモノクローナル抗体は、培地中の連続的細胞株による抗体分子の産生を提供する、任意の方法を使用して産生される。モノクローナル抗体を調製するために適切な方法の例は、Ｋｏｈｌｅｒら、１９７５、Ｎａｔｕｒｅ  ２５６：４９５−９７のハイブリドーマ法、およびヒトＢ細胞ハイブリドーマ法（Ｋｏｚｂｏｒ、１９８４、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３３：３００１；Ｂｒｏｄｅｕｒら、Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｙ  Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ  ５１−６３（Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，１９８７））が挙げられる。Ｂ７−Ｌポリペプチドと反応性の、モノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞株がまた、本発明によって提供される。
【０１５８】
本発明のモノクローナル抗体は、治療剤として使用するために、改変され得る。１実施形態は、「キメラ」抗体であり、重鎖（Ｈ）および／または軽鎖（Ｌ）の一部が、特定の種から誘導されるか、または特定の抗体のクラスもしくはサブクラスの属する抗体中の対応する配列と同一であるか、または相同性である一方で、この鎖（単数または複数）の残りは、別の種から誘導されるか、または特定の抗体のクラスもしくはサブクラスに属する抗体中の対応する配列と同一であるか、または相同性である。抗体のフラグメントが所望の生物学的活性を示す限り、これらの抗体のフラグメントも含まれる。米国特許第４，８１６，５６７号；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら、１９８５、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．８１：６８５１−５５を参照のこと。
【０１５９】
別の実施形態において、本発明のモノクローナル抗体は、「ヒト化」抗体である。非ヒト抗体をヒト化するための方法は、当該分野で周知である。米国特許第５，５８５，０８９号および５，６９３，７６２号を参照のこと。一般に、ヒト化した抗体は、非ヒトである供給源から導入された１以上のアミノ酸残基有する。ヒト化は、例えば、当該分野で記載される方法（Ｊｏｎｅｓら、１９８６、Ｎａｔｕｒｅ  ３２１：５２２−２５；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら、１９９８、Ｎａｔｕｒｅ  ３３２：３２３−２７；Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎら、１９８８、Ｓｃｉｅｎｃｅ２３９：１５３４−３６）を使用して、げっ歯動物相補性決定領域の少なくとも一部をヒトの抗体の対応する領域と置換することによって、実施され得る。
【０１６０】
Ｂ７−Ｌポリペプチドと結合するヒト抗体がまた、本発明によって包含される。内因性の免疫グロブリンの産物の非存在下で、ヒト抗体のレパートリーを産生し得る、トランスジェニック動物（例えば、マウス）を使用して、このような抗体は、Ｂ７−Ｌポリペプチド抗原（すなわち、少なくとも６個の連続アミノ酸を有する）を用いて免疫化することによって産生され、必要に応じて、キャリアに結合される。例えば、Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓら，１９９３，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ  Ｓｃｉ．９０：２５５１−５５；Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓら，１９９３，Ｎａｔｕｒｅ  ３６２：２５５−５８；Ｂｒｕｇｇｅｒｍａｎｎら，１９９３，Ｙｅａｒ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏ．７：３３を参照のこと。１つの方法において、このようなトランスジェニック動物は、重鎖および軽鎖免疫グロブリンをコードする内因性遺伝子座を無能にし、そしてヒトの重鎖および軽鎖タンパク質をコードする遺伝子座をそのゲノムに挿入することによって産生される。次いで、部分的に改変された動物（すなわち、この動物は、完全相補性より少ない低い改変を有する）は、所望の免疫系の改変の全てを有する動物を得るために交雑される。免疫原が投与される場合、これらのトランスジェニック動物が、ヒト（例えば、マウスではない）アミノ酸配列（これらの抗原に対して免疫特異性である可変領域を含む）を有する抗体を産生する。国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９６／０５９２８およびＰＣＴ／ＵＳ９３／０６９２６を参照のこと。さらなる方法は、米国特許第５，５４５，８０７号、国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９１／２４５およびＰＣＴ／ＧＢ８９／０１２０７、ならびに欧州特許第５４６０７３Ｂ１および５４６０７３Ａ１に記載される。ヒト抗体はまた、宿主細胞中の組換えＤＮＡの発現または本明細書中に記載されるようなハイブリドーマ細胞中での発現によって産生され得る。
【０１６１】
代替の実施形態において、ヒト抗体はまた、ファージディスプレイライブラリから産生され得る（Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍら，１９９１，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２７：３８１；Ｍａｒｋｓら，１９９１，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１）。これらにより、糸状バクテリオファージの表面上の抗体レパートリーのディスプレイを介した模倣免疫選択、および選択した抗原への結合によるファージの続く選択を処理する。１つのこのような技術は、国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９８／１７３６４に記載されており、これには、このようなアプローチを使用して、ＭＰＬ−レポーターおよびｍｓｋ−レポーターについて、高い親和性および機能的なアゴニスト抗体の単離が記載される。
【０１６２】
キメラ、ＣＤＲ移植化抗体、およびヒト化抗体は、代表的に組換え方法によって産生される。抗体をコードする核酸は、宿主細胞中に導入され、そして本明細書中に記載される物質および手順を使用して発現される。好ましい実施形態において、この抗体は、哺乳動物宿主細胞（例えば、ＣＨＯ細胞）中で産生される。モノクローナル（例えば、ヒト）抗体は、本明細書中に記載されるように、宿主細胞中での組換えＤＮＡの発現またはハイブリドーマ細胞中での発現によって産生され得る。
【０１６３】
本発明の抗Ｂ７−Ｌ抗体は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの検出および定量のために、任意の公知のアッセイ方法（例えば、競合結合アッセイ、直接的および間接的サンドイッチアッセイ、および免疫沈降アッセイ）において使用され得る（Ｓｏｌａ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｍａｎｕａｌ  ｏｆ
Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ  １４７−１５８（ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．，１９８７））。この抗体は、使用されるアッセイ方法に対して、適切である親和性でＢ７−Ｌポリペプチドと結合する。
【０１６４】
診断適用のために、特定の実施形態において、抗Ｂ７−Ｌ抗体は、検出可能な部分で標識され得る。この検出可能な部分は、直接的または間接的のいずれかで、検出可能なシグナルを産生し得る任意の部分であり得る。例えば、検出可能な部分は、放射性同位体（例えば、３Ｈ、１４Ｃ、３２Ｐ、３５Ｓ、１２５Ｉ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎ、または６７Ｇａ）；蛍光化合物または化学発光化合物（フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、もしくはルシフェリン）、または酵素（例えば、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、もしくは西洋ワサビペルオキシダーゼ）であり得る（Ｂａｙｅｒら，１９９０，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚ．１８４：１３８−６３）。
【０１６５】
競合結合アッセイは、標識した標準（例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはその免疫学的に反応性な部分）の、限定された量の抗Ｂ７−Ｌ抗体との結合に関して試験サンプル検体（Ｂ７−Ｌペプチド）と競合する能力に依存する。試験サンプル中のＢ７−Ｌポリペプチドの量は、抗体と結合する標準の量と反比例する。結合する標準の量を決定するのを容易にするために、この抗体は、代表的には競合前または後に不溶化され、この抗体と結合する標準および検体は、結合しないままの標準および検体から好都合に分離され得る。
【０１６６】
サンドイッチアッセイは、２種の抗体の使用を代表的に包含し、各々の抗体は、検出および／または定量されるべきタンパク質の異なる免疫部分またはエピトープに結合し得る。サンドイッチアッセイにおいて、この試験サンプル検体は、固体支持体上に免疫化される第１抗体によって代表的に結合され、その後、第２抗体が、この検体に結合し、不溶の３部の複合体を形成する。例えば、米国特許第４，３７６，１１０を参照のこと。二次抗体自体は、検出可能な部分で標識されるか（直接的なサンドイッチアッセイ）、または検出可能な部分で標識される抗免疫グロブリン抗体を使用して測定され得る（間接的サンドイッチアッセイ）。例えば、サンドイッチアッセイの１つの型は、酵素結合イムノソルベント検定法（ＥＬＩＳＡ）（この場合、検出可能な部分は、酵素である）である。
【０１６７】
抗Ｂ７−Ｌ抗体を含む、選択的結合因子はまた、インビボ画像化のために有用である。検出可能な部分で標識した抗体は、動物に、好ましくは、血流中に投与され得、宿主中の標識した抗体の存在および位置がアッセイされる。この抗体は、核磁気共鳴、放射線学、または当該分野で公知の他の検出手段のいずれかによって、動物中で検出可能である任意の部分で標識され得る。
【０１６８】
抗体を含む、本発明の選択的結合因子は、治療剤として使用され得る。これらの治療剤は、一般に、アゴニストまたはアンタゴニストであり、これらは、Ｂ７−Ｌポリペプチドの少なくとも１つの生物学的活性を、それぞれ増強または減少させるかのいずれかである。１実施形態で、本発明のアンタゴニスト抗体は、Ｂ７−Ｌポリペプチドに特異的に結合し得、そしてインビボまたはインビトロでＢ７−Ｌポリペプチドの機能活性を阻害または排除し得る抗体またはその結合フラグメントである。好ましい実施形態において、選択的結合因子（例えば、アンタゴニスト抗体）は、少なくとも約５０％、および好ましくは、少なくとも約８０％、Ｂ７−Ｌポリペプチドの機能活性を阻害する。別の実施形態において、選択的結合因子は、Ｂ７−Ｌポリペプチド結合パートナー（リガンドまたはレセプター）と相互作用し得る抗Ｂ７−Ｌポリペプチドであり、これにより、インビトロまたはインビボにおいてＢ７−Ｌポリペプチド活性を阻害または排除する、抗Ｂ７−Ｌポリペプチド抗体であり得る。アゴニストおよびアンタゴニスト抗Ｂ７−Ｌポリペプチド抗体を含む、選択的結合因子は、当該分野で周知であるスクリーニングアッセイによって同定される。
【０１６９】
本発明はまた、Ｂ７−Ｌ選択的結合因子（例えば、抗体）を含むキットおよび生物学的サンプル中でＢ７−Ｌポリペプチドレベルを検出するために有用である他の薬剤に関する。このような薬剤は、検出可能な標識、ブロック血清、ポジティブおよびネガティブコントロールサンプル、ならびに検出薬剤を含み得る。
【０１７０】
（マイクロアレイ）
ＤＮＡマイクロアレイ技術は、本発明に従って利用され得ることが理解される。ＤＮＡマイクロアレイは、固体支持体（例えば、ガラス）上に配置された核酸の小型高密度アレイである。このアレイ内の各細胞またはエレメントは、相補的核酸配列（例えば、ｍＲＮＡ）とハイブリダイゼーションするための標識として作用する、単一の核酸種の複数のコピーを含む。ＤＮＡマイクロアレイ技術を使用する発現プロファイリングにおいて、ｍＲＮＡは、最初に細胞または組織サンプルから抽出され、次いで、酵素で蛍光標識されたｃＤＮＡに変換される。この材料は、マイクロアレイにハイブリダイズされ、そして未結合のｃＤＮＡは、洗浄により除去される。次いで、このアレイ上に示された個々の遺伝子の発現は、各々核酸分子を標的するために特異的に結合される、標識されたｃＤＮＡの量を定量することによって視覚化される。この方法において、数千の遺伝子の発現が、生物学的材料の単一サンプルから、ハイスループットの並行様式で定量され得る。
【０１７１】
このハイスループット発現プロファイリングは、本発明のＢ７−Ｌ分子に関連して広範の適用を有し、これには、以下が挙げられるが、これに限定されない：治療のための標的としてのＢ７−Ｌ疾患関連遺伝子の同定および確認；関連するＢ７−Ｌ分子およびそのインヒビターの分子毒性；臨床試験のための代替標識の集団および産生の階層化；およびハイスループットスクリーニングにおいて、選択化合物の同定を援助することによって、関連するＢ７−Ｌポリペプチド低分子薬物の発見を増強すること。
【０１７２】
（化学的誘導体）
Ｂ７−Ｌポリペプチドの化学的に改変された誘導体は、本明細書中の記載を考慮して、当業者によって調製され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチド誘導体は、このポリペプチドに天然で結合した分子の型または位置のいずれかで、異なる様式で改変される。誘導体は、１以上の天然で結合した化学基の欠失によって形成される分子を含み得る。配列番号２または他のＢ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列を含むポリペプチドは、１以上のポリマーの共有結合によって改変され得る。例えば、選択されたポリマーは、代表的に水溶性であり、その結果、結合するタンパク質は、水性環境（例えば、生理学的な環境）下で沈殿しない。ポリマーの混合物が、適切なポリマーの範囲内に含まれる。好ましくは、目的産物の調製の治療学的使用のために、このポリマーは、薬学的に受容可能である。
【０１７３】
このポリマーの各々は、任意の分子量であり得、そして分枝または非分枝であり得る。このポリマーの各々は、代表的に、約２ｋＤａと約１００ｋＤａとの間の平均分子量を有する（この用語「約（およそ）」は、水溶性ポリマーの調製の際に、上記の分子量より多い、いくらか少ない分子量を有することを示す）。各ポリマーの平均分子量は、好ましくは、約５ｋＤａと約５０ｋＤａの間、より好ましくは、約１２ｋＤａと約４０ｋＤａとの間、そして最も好ましくは、約２０ｋＤａと約３５ｋＤａとの間である。
【０１７４】
適切な水溶性ポリマーまたはその混合物としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：Ｎ−連結またはＯ−連結炭水化物、糖、リン酸、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）（これは、モノ−（Ｃ１−Ｃ１０）ポリエチレングリコール、アルコキシ−ポリエチレングリコール、またはアリールオキシ−ポリエチレングリコールを含む、タンパク質を誘導するために使用されたＰＥＧの形態を含む）、モノメトキシ−ポリエチレングリコール、デキストラン（例えば、約６ｋＤの低分子量デキストラン）、セルロース、または他の炭水化物ベースのポリマー、ポリ（Ｎ−ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、プロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール（例えば、グリセロール）、およびポリビニルアルコール。共有結合したＢ７−Ｌポリペプチドマルチマーを調製するために使用され得る、二官能性架橋分子もまた、本発明に含まれる。
【０１７５】
一般に、化学的誘導は、活性化したポリマー分子とタンパク質を反応させるために使用される任意の適切な条件下で、実施され得る。ポリペプチドの化学的誘導体を調製するための方法は、概して以下の工程を包含する：（ａ）配列番号２または他のＢ７−Ｌポリペプチドのアミノ酸配列を含むポリペプチドが、１以上のポリマー分子に結合する条件下で、活性化したポリマー分子（例えば、ポリマー分子の反応性エステル誘導体またはアルデヒド誘導体）とポリペプチドを反応させる工程、ならびに（ｂ）反応生成物を得る工程。最適の反応条件は、既知のパラメータおよび所望の結果に基づいて決定される。例えば、ポリマー分子のタンパク質に対する比が大きくなるほど、結合したポリマー分子の割合も大きくなる。１実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド誘導体は、アミノ末端の単一ポリマー分子部分を有し得る。例えば、米国特許第５，２３４，７８４号を参照のこと。
【０１７６】
ポリペプチドのペグ化は、当該分野で公知の任意のペグ化反応を使用して特異的に実施され得る。このような反応は、例えば、以下の参考文献に記載されている：Ｆｒａｎｃｉｓら，１９９２，Ｆｏｃｕｓ  ｏｎ  Ｇｒｏｗｔｈ  Ｆａｃｔｏｒｓ  ３：４−１０；欧州特許第０１５４３１６号および０４０１３８４号；ならびに米国特許第４，１７９，３３７号。例えば、ペグ化は、本明細書中に記載されるように、反応性ポリエチレングリコール分子（または、類似の反応性水溶性ポリマー）とのアシル化反応またはアルキル化反応を介して実施され得る。アシル化反応のために、選択されたポリマーは、単一の反応性エステル基を有する。還元的アルキル化について、選択されたポリマーは、単一の反応性アルデヒド基を有する。反応性アルデヒドは、例えば、ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒド（これは、水に安定である）、またはモノＣ１−Ｃ１０アルコキシもしくはそのアリールオキシ誘導体である（米国特許第５，２５２，７１４号を参照のこと）。
【０１７７】
別の実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、ビオチンに化学的に連結され得る。次いで、このビオチン／Ｂ７−Ｌポリペプチド分子は、アビジンに結合され得、その結果、４価のアビジン／ビオチン／Ｂ７−Ｌポリペプチド分子が得られる。Ｂ７−Ｌポリペプチドはまた、ジニトロフェノール（ＤＮＰ）またはトリニトロフェノール（ＴＮＰ）に共有結合され得、そして得られた結合体は、抗ＤＮＰまたは抗ＴＮＰ−ＩｇＭと共に沈殿し、１０価の十量体の結合体を形成する。
【０１７８】
一般に、本発明のＢ７−Ｌポリペプチド誘導体の投与によって、緩和または調節され得る条件は、Ｂ７−Ｌポリペプチドについて本明細書中に記載されたものを含む。しかし、本明細書中に開示されるＢ７−Ｌポリペプチド誘導体は、非誘導体化分子と比較した場合、さらなる活性、増強または減少した生物学的活性、または他の特性（例えば、増加または減少した半減期）を有し得る。
【０１７９】
（遺伝子操作した非ヒト動物）
マウス、ラット、または他のげっ歯類；ウサギ、ヤギ、ヒツジ、または他の家畜のような非ヒト動物が、さらに本発明の範囲内に含まれ、ここで、ネイティブＢ７−Ｌポリペプチドをコードする遺伝子は破壊（すなわち「ノックアウト」）され、Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現レベルは、有意に減少するか、または完全に破壊される。このような動物は、米国特許第５，５５７，０３２号に記載されるような技術および方法を使用して調製され得る。
【０１８０】
本発明は、マウス、ラット、または他のげっ歯類；ウサギ、ヤギ、ヒツジ、または他の家畜のような非ヒト動物をさらに含み、この動物のＢ７−Ｌ遺伝子のネイティブの形態または異種Ｂ７−Ｌ遺伝子のいずれかが、この動物によって過剰発現され、これによって、「トランスジェニック」動物を作製する。このようなトランスジェニック動物は、米国特許第５，４８９，７４３号および国際公開番号ＷＯ９４／２８１２２号に記載されるような周知の方法を使用して調製され得る。
【０１８１】
本発明は、非ヒト動物をさらに含み、ここで、本発明の１以上のＢ７−Ｌポリペプチドのプロモーターは、（例えば、相同的な組換え方法を使用することによって）活性化されるか、または不活化され、１以上のネイティブＢ７−Ｌポリペプチドの発現のレベルを改変する。
【０１８２】
これらの非ヒト動物は、薬物候補物スクリーニングのために使用され得る。このようなスクリーニングにおいて、動物での薬物候補物の影響が測定され得る。例えば、薬物候補物は、Ｂ７−Ｌ遺伝子の発現を減少または増加させ得る。特定の実施形態において、産生されるＢ７−Ｌポリペプチドの量は、動物を薬物候補物に曝露した後に測定され得る。さらに、特定の実施形態において、動物に対する薬物候補物の実際の影響を検出し得る。例えば、特定の遺伝子の過剰発現は、疾患状態または病理学的状態を生じるか、または関連する。このような場合において、薬物候補物が遺伝子の発現を減少させる能力または病理学的状態を防止または阻害する能力を試験し得る。別の例において、ポリペプチドのフラグメントのような、特定の代謝産物の産生は、疾患状態または病理学的状態を生じ得るか、または関連し得る。このような場合において、薬物候補物がこのような代謝産物の産生を減少させる能力、または薬物候補物が病理学的状態を防止または阻害する能力を試験し得る。
【０１８３】
（Ｂ７−Ｌポリペプチド活性の他の修飾因子についてのアッセイ）
いくつかの状態において、Ｂ７−Ｌポリペプチドの活性の修飾因子である分子（すなわち、アゴニストまたはアンタゴニスト）を同定することが所望され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドを調節する天然または合成分子は、本明細書中に記載されるような、１以上のスクリーニングアッセイを使用して同定され得る。このような分子は、エキソビボ様式またはインビボ様式のいずれかで、注射、または経口送達、移植デバイスなどによって投与され得る。
【０１８４】
「試験分子」とは、Ｂ７−Ｌポリペプチドの活性を調節する（すなわち、増加または減少させる）能力について評価される分子を言う。最も一般的に、試験分子は、Ｂ７−Ｌポリペプチドと直接的に相互作用する。しかし、試験分子はまた、例えば、Ｂ７−Ｌ遺伝子発現に影響を与えることによって、またはＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナー（例えば、レセプターまたはリガンド）に結合することによって、Ｂ７−Ｌポリペプチド活性を間接的に調節し得ることが企図される。１実施形態において、試験分子は、少なくとも約１０−６Ｍ、好ましくは、約１０−８Ｍ、より好ましくは、約１０−９Ｍ、そしてさらにより好ましくは約１０−１０Ｍの親和性定数（ａｆｆｉｎｉｔｙ  ｃｏｎｓｔａｎｔ）でＢ７−Ｌポリペプチドと結合する。
【０１８５】
Ｂ７−Ｌポリペプチドと相互作用する化合物を同定するための方法は、本発明によって包含される。特定の実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、試験分子とＢ７−Ｌポリペプチドとの相互作用が可能な条件下で、試験分子と共にインキュベートされ、そして相互作用の程度が測定される。試験分子は、実質的に精製された形態または粗製の混合物でスクリーニングされ得る。
【０１８６】
特定の実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチドアゴニストまたはアンタゴニストは、Ｂ７−Ｌポリペプチドと相互作用してその活性を調節するタンパク質、ペプチド、炭水化物、脂質、または低分子量の分子であり得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現を調節する分子として、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸と相補的であるか、またはＢ７−Ｌポリペプチドの発現を指向または制御する核酸配列に対して相補的である核酸、および発現のアンチセンスレギュレーターとして作用する核酸が挙げられる。
【０１８７】
一旦、試験分子が、Ｂ７−Ｌポリペプチドと相互作用すると同定されると、この分子は、Ｂ７−Ｌポリペプチド活性を増加または減少させる能力についてさらに評価され得る。試験分子とＢ７−Ｌポリペプチドとの相互作用の測定は、いくつかの形態（細胞ベースの結合アッセイ、膜結合アッセイ、溶液相アッセイ、および免疫アッセイが挙げられる）で実施され得る。一般的に、試験分子は、特定の期間、Ｂ７−Ｌポリペプチドと共にインキュベートされ、そしてＢ７−Ｌポリペプチド活性が、生物学的活性を測定するために１以上のアッセイによって決定される。
【０１８８】
試験分子とＢ７−Ｌポリペプチドとの相互作用はまた、免疫アッセイにおいてポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体を使用して直接的にアッセイされ得る。あるいは、本明細書中に記載されるようなエピトープタグを含むＢ７−Ｌポリペプチドの改変形態は、溶液および免疫アッセイにおいて使用され得る。
【０１８９】
Ｂ７−Ｌポリペプチドが、結合パートナー（例えば、レセプターまたはリガンド）との相互作用を介して、生物学的活性を示す場合、種々のインビトロアッセイが、対応する結合パートナー（例えば、選択的結合因子、レセプター、またはリガンド）へのＢ７−Ｌポリペプチドの結合を測定するために使用され得る。これらのアッセイは、その結合パートナーに対するＢ７−Ｌポリペプチドの結合の速度および／または程度を増加または減少させる試験分子の能力について、試験分子をスクリーニングするために使用され得る。１つのアッセイにおいて、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、マイクロタイタープレートのウェル中で固定される。次いで、放射標識したＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナー（例えば、ヨウ素化Ｂ７−Ｌポリペプチド結合パートナー）および試験分子は、このウェルに、一度に一つずつか（いずれかの順序で）または同時にかのいずれかで添加され得る。インキュベーション後、このウェルを洗浄し、そしてシンチレーションカウンターを使用して、放射活性を計数し、結合パートナーがＢ７−Ｌポリペプチドに結合する範囲を決定する。代表的に、この分子は、濃度範囲にわたって試験され、そして試験アッセイのエレメントの１つ以上を欠く一連のコントロールウェルが、結果の評価の正確性のために使用され得る。この方法の代替は、タンパク質の「位置」を逆にすることを（すなわち、マイクロタイタープレートウェルに対してＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーを固定し、試験分子および放射標識したＢ７−Ｌポリペプチドをインキュベートし、そしてＢ７−Ｌポリペプチド結合の程度を決定する）を包含する。例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ
Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ、第１８章（Ａｕｓｕｂｅｌら編、Ｇｒｅｅｎ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ  Ｉｎｃ．およびＷｉｌｅｙ  ａｎｄ  Ｓｏｎｓ１９９５）を参照のこと。
【０１９０】
放射性標識に対する代替として、Ｂ７−Ｌポリペプチドまたはその結合パートナーは、ビオチンと結合体化され得、次いで、ビオチン化タンパク質の存在が、酵素（例えば、西洋わさびペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）またはアルカリホスファターゼ（ＡＰ））（これらは、比色定量的に検出され得る）に結合したストレプトアビジンを使用して検出され得るか、またはストレプトアビジンの蛍光タグ化によって検出され得る。Ｂ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナー（これらは、ビオチンに結合されている）に対する抗体はまた、ＡＰまたはＨＲＰに連結した酵素連結ストレプトアビジンとの複合体のインキュベーションに続いて、検出の目的のために使用され得る。
【０１９１】
Ｂ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーはまた、アガロースビーズ、アクリルビーズ、または他の型のこのような不活性な固体相基材への付着によって固定され得る。基材−タンパク質複合体は、相補タンパク質および試験化合物を含む溶液内に配置され得る。インキュベーション後、これらのビーズは、遠心分離によって沈澱され得、そしてＢ７−Ｌポリペプチドとその結合パートナーとの間の結合の量が、本明細書中に記載の方法を使用して評価され得る。あるいは、基材−タンパク質複合体は、カラムを通過する、試験分子および相補タンパク質を用いてカラム内に固定化され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドトとその結合パートナーとの間の複合体の形成が、次いで、本明細書中に記載の技術（例えば、放射性標識または抗体結合）のいずれかを使用して評価され得る。
【０１９２】
Ｂ７−Ｌポリペプチド結合タンパク質とＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーとの間の複合体の形成を増加または減少させる試験分子を同定するために有用な別のインビトロアッセイは、表面プラズモン共鳴検出システム（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅアッセイシステム（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ））である。ＢＩＡｃｏｒｅシステムは、製造業者によって指定されるように利用される。このアッセイは、本質的に、Ｂ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーのいずれかの、ディテクターに位置するデキストランコーティングされたセンサーチップへの共有結合に関する。次いで、試験化合物および他の相補性タンパク質が、同時にかまたは連続的にかのいずれかで、センサーチップを含むチャンバーに注入され得る。結合する相補性タンパク質の量は、センサーチップのデキストランコーティングされた側に物理的に結合する分子の質量の変化に基づいて評価され得、この分子の質量の変化は、ディテクターシステムによって測定される。
【０１９３】
いくつかの場合において、Ｂ７−ＬポリペプチドとＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーとの間の複合体の形成を増加または減少させるそれらの能力について、２つ以上の試験化合物を一緒に評価することが所望され得る。これらの場合、本明細書中に記載のアッセイは、第一の試験化合物と同時にか、またはそれに続いてのいずれかで、このようなさらなる試験化合物を添加することによって容易に改変され得る。このアッセイにおける残りの工程は、本明細書中に記載される通りである。
【０１９４】
インビトロアッセイ（例えば、本明細書中に記載されるアッセイ）は、Ｂ７−ＬポリペプチドとＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーとの間の複合体の形成に対する効果について、多数の化合物をスクリーニングするために、有利に使用され得る。これらのアッセイは、ファージディスプレイ、合成ペプチド、および化学合成ライブラリーにおいて生成された化合物をスクリーニングするために、自動化され得る。
【０１９５】
Ｂ７−ＬポリペプチドとＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーとの間の複合体の形成を増加または減少する化合物はまた、Ｂ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌポリペプチド結合パートナーのいずれかを発現する細胞および細胞株を使用して、細胞培養物においてスクリーニングされ得る。細胞および細胞株は、任意の哺乳動物から獲得され得るが、好ましくは、ヒト、または他の霊長類、イヌまたはげっ歯類の供給源由来である。Ｂ７−Ｌポリペプチドの、Ｂ７−Ｌポリペプチド結合パートナーを発現する細胞のその表面への結合は、試験分子の存在または非存在下で評価され、そして結合の程度が、例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチド結合パートナーに対するビオチン化抗体を使用するフローサイトメトリーによって決定され得る。細胞培養アッセイは、本明細書中に記載されるタンパク質結合アッセイにおいて、陽性とスコア付けされる化合物をさらに評価するために有利に使用され得る。
【０１９６】
細胞培養物はまた、薬物候補の効果をスクリーニングするために使用され得る。例えば、薬物候補は、Ｂ７−Ｌ遺伝子の発現を減少または増加させ得る。特定の実施形態において、生成されるＢ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌポリペプチドフラグメントの量は、細胞培養物の薬物候補への曝露の後に測定され得る。特定の実施形態において、細胞培養物への薬物候補の実際の効果が検出され得る。例えば、特定の遺伝子の過剰発現は、細胞培養物に対する特定の効果を有し得る。このような場合、遺伝子の発現を増加または減少させる薬物候補の能力、または細胞培養物に対する特定の効果を予防または阻害するその能力が試験され得る。他の例において、特定の代謝産物（例えば、ポリペプチドのフラグメント）の生成が、疾患または病的状態を生じ得るか、またはそれらと関連し得る。このような場合、細胞培養物におけるこのような代謝産物の生成を減少する薬物候補の能力が試験され得る。
【０１９７】
（内部移行タンパク質）
ｔａｔタンパク質配列（ＨＩＶ由来）が、タンパク質を細胞内に内部移行させるために使用され得る。例えば、Ｆａｌｗｅｌｌら、１９９４、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９１：６６４−６８を参照のこと。例えば、ＨＩＶ  ｔａｔタンパク質の１１アミノ酸の配列（Ｙ−Ｇ−Ｒ−Ｋ−Ｋ−Ｒ−Ｒ−Ｑ−Ｒ−Ｒ−Ｒ；配列番号２４）（「タンパク質形質導入ドメイン」、またはＴＡＴ  ＰＤＴと称される）は、細胞の細胞質膜および核膜を通じた送達を媒介することが記載されている。Ｓｃｈｗａｒｚｅら，１９９９，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８５：１５６９−７２；およびＮａｇａｈａｒａら，１９９８，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．４：１４４９−５２を参照のこと。これらの手順において、腹腔内投与後に組織に浸透するＦＩＴＣ構築物（ＦＩＴＣ標識されたＧ−Ｇ−Ｇ−Ｇ−Ｙ−Ｇ−Ｒ−Ｋ−Ｋ−Ｒ−Ｒ−Ｑ−Ｒ−Ｒ−Ｒ；配列番号２５）が調製され、そしてこのような構築物の細胞への結合が、蛍光活性化細胞分離（ＦＡＣＳ）分析によって検出される。ｔａｔ−β−ｇａｌ融合タンパク質で処置された細胞は、β−ｇａｌ活性を示す。注入後、このような構築物の発現が、多くの組織（肝臓、腎臓、肺、心臓および脳組織を含む）において検出され得る。このような構築物は、細胞に侵入するためにある程度のアンフォールディングを受け、そのため、細胞への移入後にリフォールディングを必要とし得ると考えられる。
【０１９８】
従って、ｔａｔタンパク質配列は、所望のポリペプチドを細胞に内部移入させるために使用され得ることが理解される。例えば、ｔａｔタンパク質配列を使用して、Ｂ７−Ｌアンタゴニスト（例えば、抗Ｂ７−Ｌ選択的結合因子、低分子、可溶性レセプター、またはアンチセンスオリゴヌクレオチド）は、Ｂ７−Ｌ分子の活性を阻害するために、細胞内に投与され得る。本明細書中で使用される場合、用語「Ｂ７−Ｌ分子」は、本明細書中に規定されるような、Ｂ７−Ｌ核酸分子およびＢ７−Ｌポリペプチドの両方をいう。所望の場合、Ｂ７−Ｌタンパク質自体もまた、これらの手順を使用して、細胞に内部投与され得る。Ｓｔｒａｕｓ，１９９９，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８５：１４６６−６７もまた参照のこと。
【０１９９】
（Ｂ７−Ｌポリペプチドを使用する細胞供給源の同定）
本発明の特定の実施形態に従って、Ｂ７−Ｌポリペプチドと関連する特定の細胞型の供給源を決定することを可能することが有用であり得る。例えば、適切な治療を選択する際の補助として疾患または病的状態の起源を決定することが有用であり得る。特定に実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸は、プローブとして使用され、このようなプローブを用いて細胞の核酸をスクリーニングすることによって、本明細書中に記載の細胞を同定し得る。他の実施形態において、抗Ｂ７−Ｌポリペプチド抗体を使用して、細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチドの存在について試験し得、それによって、このような細胞が、本明細書中に記載される型の細胞であるか否かを決定し得る。
【０２００】
（Ｂ７−Ｌポリペプチド組成物および投与）
治療組成物は、本発明の範囲内である。このようなＢ７−Ｌポリペプチドの薬学的組成物は、投与の様式に適するように選択された薬学的または生理学的に受容可能な処方剤との混合物中に、治療有効量のＢ７−ＬポリペプチドまたはＢ７−Ｌ核酸分子を含み得る。薬学的組成物は、投与の様式に適するように選択された薬学的または生理学的に受容可能な処方剤との混合物中に、治療有効量の１つ以上のＢ７−Ｌポリペプチド選択的結合因子を含み得る。
【０２０１】
受容可能な処方物の材料は、好ましくは、使用される投薬量および濃度で、レシピエントに対して非毒性である。
【０２０２】
薬学的組成物は、例えば、組成物のｐＨ、浸透性、粘度、清澄性、色、等張性、臭い、無菌性、安定性、分解または放出の速度、吸着、または浸透を改変、維持または保存するための処方物材料を含み得る。適切な処方物材料としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、またはリジン）、抗菌剤、抗酸化剤（例えば、アスコルビン酸、亜硫酸ナトリウム、または亜硫酸水素ナトリウム）、緩衝液（例えば、ホウ酸、重炭酸塩、Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、クエン酸、リン酸、または他の有機酸）、バルキング剤（例えば、マンニトールまたはグリシン）、キレート化剤（例えば、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ））、複合体化剤（例えば、カフェイン、ポリビニルピロリドン、β−シクロデキストリン、またはヒドロキシプロピル−β−シクロデキストリン）、充填剤、単糖類、二糖類、および他の炭水化物（例えば、グルコース、マンノースまたはデキストリン）、タンパク質（例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン）、着色剤、香味剤および希釈剤、乳化剤、親水性ポリマー（例えば、ポリビニルピロリドン）、低分子量ポリペプチド、塩形成対イオン（例えば、ナトリウム）、防腐剤（例えば、塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン（ｃｈｌｏｒｈｅｘｉｄｉｎｅ）、ソルビン酸、または過酸化水素）、溶媒（例えば、グリセリン、プロピレングリコール、またはポリエチレングリコール）、糖アルコール（例えば、マンニトールまたはソルビトール）、懸濁剤、界面活性剤または湿潤剤（例えば、プルオニック（ｐｌｕｒｏｎｉｃ）；ＰＥＧ；ソルビタンエステル；ポリソルベート（例えば、ポリソルベート２０またはポリソルベート８０）；トリトン；トロメタミン（ｔｒｏｍｅｔｈａｍｉｎｅ）；レシチン；コレステロールまたはチロキサポール（ｔｙｌｏｘａｐａｌ））、安定性増強剤（例えば、スクロースまたはソルビトール）、張度増強剤（例えば、ハロゲン化アルカリ金属（好ましくは塩化ナトリウムまたは塩化カリウム）、またはマンニトール、ソルビトール）、送達ビヒクル、希釈剤、賦形剤および／または薬学的アジュバント。Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（第１８版，Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ編，Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏｍｐａｎｙ  １９９０を参照のこと。
【０２０３】
最適な薬学的組成物は、当業者によって、例えば、意図される投与経路、送達形式、および所望の投薬量に依存して決定される。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，前出を参照のこと。このような組成物は、Ｂ７−Ｌ分子の、物理的な状態、安定性、インビボ放出の速度、およびインビボクリアランスの速度に影響し得る。
【０２０４】
薬学的組成物中の主要なビヒクルまたはキャリアは、本来水性であっても非水性であってもよい。例えば、注入のための適切なビヒクルまたはキャリアは、水、生理学的な生理食塩水溶液、または人工脳脊髄液であり得、おそらく非経口投与のための組成物において一般的な他の物質が補充される。中性の緩衝化生理食塩水または血清アルブミンと混合された生理食塩水は、さらなる例示的なビヒクルである。他の例示的な薬学的組成物は、約ｐＨ７．０〜８．５のＴｒｉｓ緩衝液または約ｐＨ４．０〜５．５の酢酸塩緩衝液を含み、これらはさらに、ソルビトールまたは適切な置換物を含み得る。本発明の１つの実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド組成物は、所望の程度の純度を有する選択された組成物を、任意の処方薬剤（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，前出）と混合することによって、凍結乾燥ケークまたは水溶液の形態で、保存のために調製され得る。さらに、Ｂ７−Ｌポリペプチド産物は、スクロースのような適切な賦形剤を使用して凍結乾燥物として処方され得る。
【０２０５】
このＢ７−Ｌポリペプチドの薬学的組成物は、非経口送達のために選択され得る。あるいは、これらの組成物は、吸入または消化管を介する送達（例えば、経口送達）のために選択され得る。このような薬学的に受容可能な組成物の調製は、当該分野の技術内にある。
【０２０６】
処方成分は、投与の部位において受容可能な濃度で存在する。例えば、緩衝液は、生理学的ｐＨまたはそれよりわずかに低いｐＨ（代表的に、約５〜約８のｐＨ範囲内）でこの組成物を維持するために使用される。
【０２０７】
非経口投与が意図される場合、本発明における使用のための治療組成物は、薬学的に受容可能なビヒクルに所望のＢ７−Ｌ分子を含む、発熱物質を含まない非経口的に受容可能な水溶液の形態であり得る。非経口注射のために特に適切なビヒクルは、滅菌蒸留水であり、この中で、Ｂ７−Ｌ分子が、滅菌性の等張溶液として処方され、適切に保存される。なお別の調製物は、生成物の制御されたまたは持続された放出を提供する薬剤（例えば、注入可能なミクロスフィア、生体侵食性（ｂｉｏ−ｅｒｏｄｉｂｌｅ）粒子、ポリマー化合物（ポリ乳酸またはポリグリコール酸）、ビーズまたはリポソーム）と所望の分子との処方物を含み得、次いで、これは蓄積注射を介して送達され得る。ヒアルロン酸もまた使用され得、そしてこれは、循環中に保持される持続時間を促進する効果を有し得る。所望の分子の導入のための他の適切な手段は、移植可能な薬物送達デバイスを含む。
【０２０８】
１つの実施形態において、薬学的組成物は、吸入のために処方され得る。例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、吸入のための乾燥粉末として処方され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドまたは核酸分子の吸入溶液はまた、エアロゾル送達のための噴霧剤と共に処方され得る。なお別の実施形態において、溶液は噴霧され得る。肺投与がさらに、国際公開番号ＷＯ９４／２００６９（化学的に改変されたタンパク質の肺送達が記載されている）に記載されている。
【０２０９】
特定の処方物が、経口投与され得ることがまた意図される。本発明の１つの実施形態において、この様式で投与されるＢ７−Ｌポリペプチドは、固体投薬形態（例えば、錠剤またはカプセル）の調合において慣用的に使用されるキャリアを伴うか、または伴わず処方され得る。例えば、カプセルは、バイオアベイラビリティーが最大化され、そして全身前分解（ｐｒｅ−ｓｙｓｔｅｍｉｃ  ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ）が最小化される場合、胃腸管内でのある場所で処方物の活性部分を放出するように設計され得る。さらなる薬剤が、Ｂ７−Ｌポリペプチドの吸収を促進するために含まれ得る。希釈剤、香味剤、低融点ワックス、植物油、潤滑剤、懸濁剤、錠剤崩壊剤、および結合剤もまた、使用され得る。
【０２１０】
別の薬学的組成物は、錠剤の製造に適切な非毒性賦形剤との混合物中に、有効量のＢ７−Ｌポリペプチドを含み得る。錠剤を滅菌水または別の適切なビヒクルに溶解することによって、溶液が、単位用量形態で調製され得る。適切な賦形剤は以下を含むが、これらに限定されない：不活性な希釈剤（例えば、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウムまたは重炭酸ナトリウム、ラクトース、あるいはリン酸カルシウム）；または結合剤（例えば、デンプン、ゼラチンまたはアラビアゴム）；あるいは潤滑剤（例えば、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸またはタルク）。
【０２１１】
さらなるＢ７−Ｌポリペプチドの薬学的組成物は、当業者に明らかであり、持続送達または制御送達処方物中にＢ７−Ｌポリペプチドを含む処方物を含む。種々の他の持続送達または制御送達手段（例えば、リポソームキャリア、生体侵食性微粒子あるいは多孔性ビーズおよび蓄積注射）を処方するための技術はまた、当業者に公知である。例えば、国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９３／００８２９（これは、薬学的組成物の送達のための多孔性ポリマー性微粒子の制御放出を記載する）を参照のこと。
【０２１２】
徐放性調製物のさらなる例としては、成形品の形態（例えば、フィルム、またはマイクロカプセル）の半透過性ポリマーマトリックスを含む。徐放性マトリックスとしては、ポリエステル、ヒドロゲル、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号および欧州特許第０５８４８１号）、Ｌ−グルタミン酸とγエチル−Ｌ−グルタメートとのコポリマー（Ｓｉｄｍａｎら，１９８３，Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ  ２２：５４７−５６）、ポリ（２−ヒドロキシエチル−メタクリレート）（Ｌａｎｇｅｒら，１９８１，Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｍａｔｅｒ．Ｒｅｓ．１５：１６７−２７７およびＬａｎｇｅｒ，１９８２，Ｃｈｅｍ．Ｔｅｃｈ．１２：９８−１０５）、エチレンビニルアセテート（Ｌａｎｇｅｒら，前出）またはポリ−Ｄ（−）−３−ヒドロキシ酪酸（欧州特許第１３３９８８号）が挙げられ得る。徐放性組成物はまた、リポソームを含み得、これは、当該分野で公知のいくつかの方法のいずれかによって調製され得る。例えば、Ｅｐｐｓｔｅｉｎら，１９８５，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８２：３６８８−９２；および欧州特許第０３６６７６号、同第０８８０４６号、および同第１４３９４９号を参照のこと。
【０２１３】
インビボ投与のために使用されるＢ７−Ｌ薬学的組成物は、代表的に無菌的でなければならない。このことは、滅菌濾過膜を通じた濾過によって達成され得る。組成物が凍結乾燥される場合、この方法を使用した滅菌は、凍結乾燥および再構成の前後のいずれかで実施され得る。非経口投与のための組成物は、凍結乾燥形態または溶液中で保存され得る。さらに、非経口用組成物は、一般に、滅菌アクセスポートを有する容器（例えば、静脈内溶液バッグまたは皮下注射針によって貫通可能なストッパーを有するバイアル）内に配置される。
【０２１４】
一旦、薬学的組成物が処方されると、これは、滅菌バイアル中に、溶液、懸濁液、ゲル、エマルジョン、固体として、または脱水粉末または凍結乾燥粉末として保存され得る。このような処方物は、ｒｅａｄｙ−ｔｏ−ｕｓｅ形態または投与前に再構成を必要とする形態（凍結乾燥形態）のいずれかで保存され得る。
【０２１５】
特定の実施形態において、本発明は、単一用量投与単位を作製するためのキットに関する。このキットは、各々、乾燥タンパク質を有する第一の容器および水性処方物を有する第二の容器の両方を含み得る。単一チャンバーおよび多チャンバーの予め充填されたシリンジ（例えば、液体シリンジおよび分散シリンジ（ｌｙｏｓｙｒｉｎｇｅ））を含むキットもまた、本発明の範囲に含まれる。
【０２１６】
治療に使用されるＢ７−Ｌ薬学的組成物の有効量は、例えば、治療の内容および目的に依存する。従って当業者は、処置に対する適切な投薬レベルが、送達される分子、Ｂ７−Ｌ分子が使用される指標、投与の経路、ならびに患者の大きさ（体重、体表面、または器官の大きさ）および状態（年齢および全体的な健康）に、部分的に依存して変化することを理解する。従って、臨床医は、最適な治療効果を得るために、投薬量を力価決定し（ｔｉｔｅｒ）、そして投与経路を改変し得る。代表的な投薬量は、上記の因子に依存して、約０．１μｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ以上までの範囲またはそれ以上であり得る。他の実施形態において、投薬量は、０．１μｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇまでの範囲；または１μｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇまでの範囲；または５μｇ／ｋｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇまでの範囲であり得る。
【０２１７】
投薬の頻度は、使用される処方物におけるＢ７−Ｌ分子の薬物動態学のパラメーターに依存する。代表的に、臨床医は、所望の効果を達成する投薬量に達するまで組成物を投与する。組成物は、従って、組成物は、単一用量として、経時的な２以上の用量（これは、同一量の所望の分子を含んでも、含まなくてもよい）として、あるいは移植デバイスまたはカテーテルを通じた連続的な注入として、投与され得る。適切な投薬量のさらなる改良は、当業者によって慣用的になされ、そして彼らによって慣用的に実施される課題の範囲内である。適切な投薬量は、適切な用量−応答データの使用を通じて確認され得る。
【０２１８】
薬学的組成物の投与経路は、以下のような公知の方法と一致する：例えば、経口的方法；静脈内経路、腹腔内経路、脳内（実質内）経路、脳室内経路、筋肉内経路、眼内経路、動脈内経路、門脈内経路、または病巣内経路による注入を通じた方法；徐放性系による方法；または移植デバイスによる方法。所望される場合、これらの組成物は、ボーラス注射によって投与され得るか、または注入によって連続的に投与され得るか、あるいは移植デバイスによって投与され得る。
【０２１９】
あるいは、またはさらに、組成物は、所望の分子を吸収またはカプセル化する膜、スポンジ、または他の適切な材料の移植を通じて局所的に投与され得る。移植デバイスが使用される場合、このデバイスは、任意の適切な組織または器官に移植され得、そして所望の分子の送達は、拡散、時限的放出ボーラスまたは連続的な投与を介し得る。
【０２２０】
いくつかの場合において、エキソビボ様式でＢ７−Ｌポリペプチドの薬学的組成物を使用することが所望され得る。このような例において、患者から採集された細胞、組織、または器官は、Ｂ７−Ｌポリペプチド薬学的組成物に曝露され、その後、これらの細胞、組織、または器官は、患者に移植して戻される。
【０２２１】
他の場合において、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、本明細書中に記載されるような方法を使用して遺伝子操作された特定の細胞を移植することによって送達され、Ｂ７−Ｌポリペプチドが発現および分泌され得る。このような細胞は、動物またはヒト細胞であり得、そして自己性、非相同性、または異種性であり得る。必要に応じて、この細胞は不死化され得る。免疫学的応答の機会を減少させるために、細胞はカプセル化されて、周囲の組織の浸潤を回避され得る。カプセル化材料は、代表的に、タンパク質産物の放出を可能にするが、患者の免疫系または周囲の組織からの他の有害な因子による細胞の破壊を防止する、生体適合性の半浸透性ポリマー性包囲体または膜である。
【０２２２】
本明細書中で議論されるように、単離された細胞集団（例えば、幹細胞、リンパ球、赤血球、軟骨細胞、ニューロンなど）を１つ以上のＢ７−Ｌポリペプチドで処理することが、望ましくあり得る。このことは、細胞膜に対して透過性の形態である場合、単離された細胞をこのポリペプチドに直接曝露することによって達成され得る。
【０２２３】
本発明のさらなる実施形態は、治療ポリペプチドのインビトロ産生、および遺伝子治療または細胞治療による治療ポリペプチドの産生および送達の両方のための、細胞および方法（例えば、相同組換えおよび／または他の組換え産生方法）に関する。相同組換えおよび他の組換えの方法を使用して、通常は転写的にサイレントなＢ７−Ｌ遺伝子（すなわち、過少発現される遺伝子）を含む細胞を改変し得、これによって、治療有効量のＢ７−Ｌポリペプチドを発現する細胞を生成し得る。
【０２２４】
相同組換えは、本来は、転写的に活性な遺伝子における変異を誘導または修正するように遺伝子を標的化するために開発された技術である。Ｋｕｃｈｅｒｌａｐａｔｉ，１９８９，Ｐｒｏｇ．ｉｎ  Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．＆  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３６：３０１。基本的な技術は、特定の変異を哺乳動物ゲノムの特定の領域に導入するため（Ｔｈｏｍａｓら、１９８６，Ｃｅｌｌ  ４４：４１９−２８；ＴｈｏｍａｓおよびＣａｐｅｃｃｈｉ，１９８７，Ｃｅｌｌ  ５１：５０３−１２；Ｄｏｅｔｓｃｈｍａｎら、１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．８５：８５８３−８７）、または欠損遺伝子における特定の変異を修正するため（Ｄｏｅｔｓｃｈｍａｎら、１９８７，Ｎａｔｕｒｅ  ３３０：５７６−７８）の方法として、開発された。例示的な相同組換え技術は、米国特許第５，２７２，０７１号；欧州特許第９１９３０５１号および同第５０５５００号；国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９０／０７６４２、ならびに国際公開番号ＷＯ  ９１／０９９５５）に記載されている。
【０２２５】
相同組換えを通して、ゲノムに挿入されるＤＮＡ配列は、それを標的化ＤＮＡに取り付けられることによって、目的の遺伝子の特定の領域に指向され得る。この標的化ＤＮＡは、ゲノムＤＮＡの領域に相補的（相同）であるヌクレオチド配列である。ゲノムの特定の領域に相補的な標的ＤＮＡの小片は、ＤＮＡ複製プロセスの間に、親鎖と接触される。これは、ハイブリダイズするために細胞に挿入されたＤＮＡの一般的な特性であり、それによって、共有の相同領域を通して、内因性ＤＮＡの他の片と組み換わる。この相補鎖が、変異もしくは異なる配列またはさらなるヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドに取り付けられる場合には、これはまた、この組換えの結果として新たに合成された鎖に組み込まれる。プルーフリーディング機能の結果として、ＤＮＡの新たな配列がテンプレートとして機能することが可能である。それによって、移入されたＤＮＡは、ゲノムに組み込まれる。
【０２２６】
Ｂ７−Ｌポリペプチドと相互作用し得るかまたはその発現を制御し得るＤＮＡの領域（例えば、隣接配列）が、標的ＤＮＡのこれらの片に取り付けられる。例えば、プロモーター／エンハンサーエレメント、サプレッサー、または外因性転写調節エレメントが、意図される宿主細胞のゲノムに、所望のＢ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡの転写に影響を与えるのに十分に近位および十分な方向で、挿入される。制御エレメントは、この宿主細胞ゲノムに存在するＤＮＡの一部を制御する。従って、所望のＢ７−Ｌポリペプチドの発現は、Ｂ７−Ｌ遺伝子自体をコードするＤＮＡのトランスフェクションによってではなく、Ｂ７−Ｌ遺伝子の転写のための認識可能なシグナルを有する内因性遺伝子配列を提供するＤＮＡ調節セグメントと結合した標的化ＤＮＡ（目的の内因性遺伝子と相同な領域を含む）の使用によって、達成され得る。
【０２２７】
例示的な方法において、細胞における所望の標的遺伝子（すなわち、所望の内因性細胞遺伝子）の発現は、少なくとも調節配列、エキソン、およびスプライスドナー部位を含むＤＮＡの導入によって、予め選択された部位における細胞ゲノムへの相同組換えを介して変更される。これらの構成成分は、新たな転写ユニットが実際に生成されるような様式で、染色体（ゲノム）ＤＮＡに導入される（ここで、ＤＮＡ構築物に存在する調節配列、エキソン、およびスプライスドナー部位は、内因性遺伝子に作動可能に連結されている）。染色体ＤＮＡへのこれらの構成成分の導入の結果として、所望の内因性遺伝子の発現が変化する。
【０２２８】
本明細書中で記載されるように、変化した遺伝子発現は、獲得されたとき、細胞中で通常はサイレントな（発現されていない）遺伝子の活性化（または発現の誘発）、ならびに獲得されたとき、細胞中で生理学的に有意なレベルでは発現されない遺伝子の発現の増加を包含する。この実施形態はさらに、獲得されたときに、細胞において生じている調節または誘導のパターンと異なるように調節または誘導のパターンを変化させること、および獲得されたとき、細胞中で発現されている遺伝子の発現を減少（排除を含む）させることを包含する。
【０２２９】
細胞の内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子からのＢ７−Ｌポリペプチドの産生を増加するかまたはこれを引き起こすために相同定組換えが使用され得る方法の１つは、最初に、相同性組換えを使用して、部位特異的組換え系由来の組換え配列（例えば、Ｃｒｅ／ｌｏｘＰ、ＦＬＰ／ＦＲＴ）（Ｓａｕｅｒ，１９９４，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，５：５２１−２７；Ｓａｕｅｒ，１９９３，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．，２２５：８９０−９００）を、細胞の内因性ゲノムＢ７−Ｌポリペプチドコード領域の上流（すなわち、５’側）に配置することを包含する。ゲノムＢ７−Ｌポリペプチドコード領域のすぐ上流に配置された部位に相同な組換え部位を含むプラスミドは、適切なリコンビナーゼ酵素と共に、改変された細胞株に導入される。このリコンビナーゼによって、プラスミドは、このプラスミドの組換え部位を介して、この細胞株のゲノムＢ７−Ｌポリペプチドコード領域のすぐ上流に位置する組換え部位に組込まれ得る（ＢａｕｂｏｎｉｓおよびＳａｕｅｒ、１９９３，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２１：２０２５−２９；Ｏ’Ｇｏｒｍａｎら、１９９１，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２５１：１３５１−５５）。転写を増加させることが公知の任意の隣接配列（例えば、エンハンサー／プロモーター、イントロン、翻訳エンハンサー）は、このプラスミド中に適切に配置される場合、細胞の内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子からのデノボまたは増加したＢ７−Ｌポリペプチド産生を生じる新たなまたは改変された転写ユニットを生成するような様式で統合する。
【０２３０】
部位特異的組換え配列が細胞の内因性ゲノムＢ７−Ｌポリペプチドコード領域のすぐ上流に配置された細胞株を使用するさらなる方法は、細胞株のゲノムの他の位置に第２の組換え部位を導入するために相同性組換えを使用することである。次いで、適切なリコンビナーゼ酵素が、二組換え部位の細胞株に導入され、細胞の内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子からのデノボまたは増加したＢ７−Ｌポリペプチド産生を生じる新たなまたは改変された転写ユニットを生成する組換え現象（欠失、転化、および転移）を生じる（Ｓａｕｅｒ，１９９４，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，５：５２１−２７；Ｓａｕｅｒ，１９９３，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．，２２５：８９０−９００）。
【０２３１】
細胞の内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子からのＢ７−Ｌポリペプチドの発現を増加するため、または引き起こすためのさらなるアプローチは、細胞の内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子からのデノボまたは増加したＢ７−Ｌポリペプチドの産生を生じる様式で、遺伝子（単数または複数）の発現を増加するかもしくは引き起こす工程（例えば、転写因子）、および／または遺伝子（単数または複数）の発現を減少する工程（例えば、転写リプレッサー）を包含する。この方法は、天然に存在しないポリペプチド（例えば、転写因子ドメインに融合した部位特異的ＤＮＡ結合ドメインを含むポリペプチド）の細胞への導入を包含し、それによって、細胞の内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子からのデノボまたは増加したＢ７−Ｌポリペプチドの産生が生じる。
【０２３２】
本発明はさらに、標的遺伝子の発現を変化させる方法において有用なＤＮＡ構築物に関する。特定の実施形態において、例示的なＤＮＡ構築物は、以下を含む：（ａ）１つ以上の標的化配列、（ｂ）調節配列、（ｃ）エキソン、および（ｄ）不対スプライスドナー部位。ＤＮＡ構築物中の標的化配列は、エレメント（ａ）〜（ｄ）の細胞中の標的遺伝子への組込みを指向し、その結果、これらのエレメント（ｂ）〜（ｄ）は、内因性標的遺伝子の配列に作動可能に連結される。別の実施形態において、ＤＮＡ構築物は、以下を含む：（ａ）１つ以上の標的化配列、（ｂ）調節配列、（ｃ）エキソン、（ｄ）スプライスドナー部位、（ｅ）イントロン、および（ｆ）スプライスアクセプター部位。ここで、標的化配列は、エレメント（ａ）〜（ｆ）の組込みを指向し、その結果、これらのエレメント（ｂ）〜（ｆ）は、内因性遺伝子に作動可能に連結される。標的化配列は、相同性組換えが生じる細胞染色体ＤＮＡの予め選択された部位に対して相同である。この構築物において、エキソンは、一般的に、調節配列の３’側であり、そしてスプライスドナー部位は、このエキソンの３’側である。
【０２３３】
特定の遺伝子の配列（例えば、本明細書中で記載されるＢ７−Ｌポリペプチドの核酸配列）が既知である場合、遺伝子の選択された領域に相補的なＤＮＡの片が、合成されるかまたはそうでなければ獲得される（例えば、目的の領域に結合しているネイティブのＤＮＡの特定の認識部位における適切な制限によって）。この片は、細胞に挿入された際に、標的化配列として作用し、そしてそのゲノム内の相同領域にハイブリダイズする。このハイブリダイゼーションが、ＤＮＡ複製の間に生じる場合、このＤＮＡの片、およびそれに結合した任意のさらなる配列は、Ｏｋａｚａｋｉフラグメントとして作用し、そしてＤＮＡの新たに合成された娘鎖に組み込まれる。従って、本発明は、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードするヌクレオチドを含み、このヌクレオチドは、標的化配列として使用され得る。
【０２３４】
Ｂ７−Ｌポリペプチド細胞治療（例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生する細胞の移植）もまた企図される。この実施形態は、生物学的に活性な形態のＢ７−Ｌポリペプチドを合成および分泌し得る細胞を移植する工程を包含する。このようなＢ７−Ｌポリペプチド産生細胞は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの天然のプロデューサーである細胞であり得るか、またはＢ７−Ｌポリペプチドを産生する能力が、所望のＢ７−Ｌポリペプチドをコードする遺伝子またはＢ７−Ｌポリペプチドの発現を増大する遺伝子で形質転換することによって増大された組換え細胞であり得る。このような改変は、遺伝子の送達、ならびにその発現および分泌を促進するために適切なベクターによって達成され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドを投与された患者における潜在的な免疫学的反応（外来種のポリペプチドの投与により生じ得るような反応）を最小化するために、Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生する天然の細胞が、ヒト起源であり、そしてヒトＢ７−Ｌポリペプチドを産生することが好ましい。同様に、Ｂ７−Ｌポリペプチドを産生する組換え細胞が、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドをコードする遺伝子を含む発現ベクターで形質転換されることが好ましい。
【０２３５】
移植細胞は、周辺組織の浸潤を回避するようにカプセル化され得る。ヒトまたは非ヒト動物細胞は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの放出を可能にするが、患者の免疫系または周辺組織からの他の有害な因子による細胞の崩壊を防止する、生体適合性の半透性ポリマー封入体または膜において患者に移植され得る。あるいは、Ｂ７−Ｌポリペプチドをエキソビボで産生するように形質転換された患者自身の細胞が、このようにカプセル化することなく、患者に直接移植され得る。
【０２３６】
生存細胞をカプセル化するための技術は当該分野で公知であり、そしてカプセル化された細胞の調製およびそれらの患者への移植は、慣用的に達成され得る。例えば、Ｂａｅｔｇｅら（国際公開ＷＯ９５／０５４５２および国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９４／０９２９９）は、生物学的に活性な分子の効果的な送達のために遺伝子操作された細胞を含む膜カプセルを記載する。このカプセルは、生体適合性であり、そして容易に取り戻し可能である。このカプセルは、哺乳動物宿主に移植された際に、インビボで下方制御に供されないプロモーターに作動可能に連結された、生物学的に活性な分子をコードするＤＮＡ配列を含む組換えＤＮＡ分子でトランスフェクトされた細胞をカプセル化する。このデバイスは、生存細胞由来の分子のレシピエント内の特定の部位への送達を提供する。さらに、米国特許第４，８９２，５３８号；同第５，０１１，４７２号；および同第５，１０６，６２７号を参照のこと。生存細胞をカプセル化するためのシステムは、国際公開ＷＯ９１／１０４２５（Ａｅｂｉｓｃｈｅｒら）に記載される。国際公開番号ＷＯ９１／１０４７０（Ａｅｂｉｓｃｈｅｒら）；Ｗｉｎｎら、１９９１，Ｅｘｐｅｒ．Ｎｅｕｒｏｌ．１１３：３２２−２９；Ａｅｂｉｓｃｈｅｒら、１９９１，Ｅｘｐｅｒ．Ｎｅｕｒｏｌ．１１１：２６９−７５；およびＴｒｅｓｃｏら、１９９２，ＡＳＡＩＯ  ３８：１７−２３もまた参照のこと。
【０２３７】
Ｂ７−Ｌポリペプチドのインビボおよびインビトロの遺伝子治療送達もまた想定される。遺伝子治療技術の一例は、構成的または誘発性プロモーターに作動可能に連結され得るＢ７−ＬポリペプチドをコードするＢ７−Ｌ遺伝子（ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡおよび／または合成ＤＮＡのいずれか）を使用して、「遺伝子治療ＤＮＡ構築物」を形成することである。このプロモーターは、構築物が挿入される細胞または組織型において活性である場合、内因性Ｂ７−Ｌ遺伝子に対して同種性であっても異種性であってもよい。遺伝子治療ＤＮＡ構築物の他の成分は、必要に応じて、部位特異的組込みのために設計されたＤＮＡ分子（例えば、相同組換えのために有用な内因性配列）、組織特異的プロモーター、エンハンサーまたはサイレンサー、親細胞を越える選択的優位性を提供し得るＤＮＡ分子、形質転換された細胞を同定するための標識として有用なＤＮＡ分子、ネガティブ選択系、細胞特異的結合因子（例えば、細胞標的化のための）、細胞特異的内部移行因子、ベクターからの発現を増大する転写因子、およびベクターの産生を可能にする因子を含む。
【０２３８】
次いで、遺伝子治療ＤＮＡ構築物は、ウイルスベクターまたは非ウイルスベクターを使用して（エキソビボまたはインビボノいずれかで）細胞に導入され得る。遺伝子治療ＤＮＡ構築物を導入するための１つの手段は、本明細書中に記載されるようなウイルスベクターの使用による。特定のベクター（例えば、レトロウイルスベクター）は、ＤＮＡ構築物を細胞の染色体ＤＮＡに送達し、そしてこの遺伝子は、染色体ＤＮＡに組み込まれ得る。他のベクターは、エピソームとして機能し、そして遺伝子治療ＤＮＡ構築物は、細胞質で保持される。
【０２３９】
さらに他の実施形態において、調節エレメントが、標的細胞におけるＢ７−Ｌ遺伝子の制御された発現のために包含され得る。このようなエレメントは、適切なエフェクターに応答して刺激される。このようにして、治療的ポリペプチドは、所望される場合に発現され得る。１つの従来の制御手段は、低分子結合ドメインおよび生物学的プロセスを開始し得るドメインを含むキメラタンパク質（例えば、ＤＮＡ結合タンパク質または転写活性タンパク質）を二量化する低分子二量化剤またはラパログ（ｒａｐａｌｏｇ）の使用を包含する（国際公開番号ＷＯ９６／４１８６５、ＷＯ９７／３１８９８およびＷＯ９７／３１８９９を参照のこと）。タンパク質の二量化は、導入遺伝子の転写を開始するために使用され得る。
【０２４０】
代替の調節技術は、目的の遺伝子から発現されたタンパク質を、凝集体またはクラスターとして細胞内に貯蔵する方法を使用する。目的の遺伝子は、小胞体における凝集タンパク質の保持を生じる、条件的凝集ドメインを含む融合タンパク質として発現される。貯蔵されたタンパク質は安定であり、そして細胞内で不活性である。しかし、このタンパク質は、条件的凝集ドメインを除去する薬物（例えば、低分子リガンド）を投与することによって放出され得、それにより、凝集体またはクラスターを特異的に破壊し、その結果、このタンパク質は細胞から分泌され得る。Ａｒｉｄｏｒら、２０００，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８７：８１６−１７およびＲｉｖｅｒａら、２０００，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２８７：８２６−３０を参照のこと。
【０２４１】
他の適切な制御手段または遺伝子スイッチとしては、本明細書中で記載されるシステムが挙げられるが、これらに限定されない。Ｍｉｆｅｐｒｉｓｔｏｎｅ（ＲＵ４８６）は、プロゲステロンアンタゴニストとして使用される。改変されたプロゲステロンレセプターリガンド結合ドメインのプロゲステロンアンタゴニストへの結合は、２つの転写因子のダイマーを形成することによって、転写を活性化し、次いで、核に至り、ＤＮＡに結合する。このリガンド結合ドメインは、天然のリガンドに結合するレセプターの能力を排除するように改変される。改変されたステロイドホルモンレセプター系はさらに、米国特許第５，３６４，７９１号、ならびに国際公開番号ＷＯ９６／４０９１１およびＷＯ９７／１０３３７に記載される。
【０２４２】
さらに別の制御系は、エクジソンレセプター（細胞質レセプター）に結合し、そしてこれを活性化するエクジソン（ショウジョウバエステロイドホルモン）を使用する。次いで、このレセプターは核に転座し、特定のＤＮＡ応答エレメント（エクジソン応答性遺伝子由来のプロモーター）に結合する。エクジソンレセプターは、転写を開始するためのトランス活性化ドメイン、ＤＮＡ結合ドメイン、およびリガンド結合ドメインを含む。エクジソン系はさらに、米国特許第５，５１４，５７８号、および国際公開番号ＷＯ９７／３８１１７、ＷＯ９６／３７６０９、およびＷＯ９３／０３１６２に記載される。
【０２４３】
別の制御手段は、陽性テトラサイクリン制御可能トランスアクチベーターを使用する。この系は、転写を活性化するポリペプチドに連結された変異ｔｅｔレプレッサータンパク質ＤＮＡ結合ドメイン（逆テトラサイクリン調節トランスアクチベータータンパク質（すなわち、これは、テトラサイクリンの存在下でｔｅｔオペレーターに結合する）を生じた変異ｔｅｔ  Ｒ−４アミノ酸変化）を含む。このような系は、米国特許第５，４６４，７５８号、同第５，６５０，２９８号、および同第５，６５４，１６８号に記載される。
【０２４４】
さらなる発現制御系および核酸構築物は、Ｉｎｎｏｖｉｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  Ｉｎｃ．に対する米国特許第５，７４１，６７９号および同第５，８３４，１８６号に記載されている。
【０２４５】
インビボ遺伝子治療は、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする遺伝子を、Ｂ７−Ｌ核酸分子の局所注射によって、または他の適切なウイルスもしくは非ウイルス送達ベクターによって、細胞に導入することにより達成され得る。Ｈｅｆｔｉ，１９９４，Ｎｅｕｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ２５：１４１８−３５。例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸分子は、標的細胞への送達のためのアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターに含まれ得る（例えば、Ｊｏｈｎｓｏｎ，国際公開番号ＷＯ９５／３４６７０；国際出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９５／０７１７８を参照のこと）。組換えＡＡＶゲノムは、代表的に、機能的プロモーターに作動可能に連結したＢ７−ＬポリペプチドをコードするＤＮＡ配列およびポリアデニル化配列に隣接するＡＡＶ逆末端反復を含む。
【０２４６】
代替の適切なウイルスベクターとしては、レトロウイルス、アデノウイルス、単純ヘルペスウイルス、レンチウイルス、肝炎ウイルス、パルボウイルス、パポバウイルス、ポックスウイルス、アルファウイルス、コロナウイルス、ラブドウイルス、パラミクソウイルス、およびパピローマウイルスベクターが挙げられるがこれらに限定されない。米国特許第５，６７２，３４４号は、組換え神経栄養性ＨＳＶ−１ベクターを含むインビボウイルス媒介遺伝子転移系を記載する。米国特許第５，３９９，３４６号は、治療タンパク質をコードするＤＮＡセグメントを挿入するためにインビトロで処置されたヒト細胞の送達によって、治療タンパク質を患者に提供するためのプロセスの例を提供する。遺伝子治療技術の実施のためのさらなる方法および材料は、米国特許第５，６３１，２３６号（アデノウイルスベクターに関する）、同第５，６７２，５１０号（レトロウイルスベクターに関する）、同第５，６３５，３９９号（サイトカインを発現するレトロウイルスベクターに関する）に記載される。
【０２４７】
非ウイルス送達法としては、リポソーム媒介移入、裸のＤＮＡ送達（直接注射）、レセプター媒介移入（リガンド−ＤＮＡ複合体）、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム沈降、および微粒子ボンバードメント（例えば、遺伝子銃）が挙げられるが、これらに限定されない。遺伝子治療の材料および方法はまた、誘導性プロモーター、組織特異的エンハンサー−プロモーター、部位特異的組込みのために設計されたＤＮＡ配列、親細胞を超える選択的優性を提供し得るＤＮＡ配列、形質転換された細胞を同定するための標識、ネガティブな選択系および発現制御系（安全性の指標）、細胞特異的結合因子（細胞標的化のため）、細胞特異的インターナリゼーション因子、およびベクターによる発現を増大する転写因子ならびにベクターの製造方法を含み得る。遺伝子治療技術の実施のためのこのようなさらなる方法および材料は、米国特許第４，９７０，１５４号（エレクトロポレーション技術に関する）、同第５，６７９，５５９号（遺伝子送達のためのリポタンパク質含有系を記載する）、同第５，６７６，９５４号（リポソームキャリアに関する）、同第５，５９３，８７５号（リン酸カルシウムトランスフェクションのための方法を記載する）、および同第４，９４５，０５０号（生物学的に活性な粒子が一定の速度で細胞に噴霧され、それによりこの粒子がこの細胞の表面に浸透し、そしてこの細胞の内側に組み込まれるプロセスを記載する）、および国際公開番号ＷＯ９６／４０９５８（核リガンドに関する）に記載される。
【０２４８】
Ｂ７−Ｌ遺伝子治療または細胞治療はさらに、同一または異なる細胞における１つ以上のさらなるポリペプチドの送達を含み得ることもまた企図される。このような細胞は、患者に別々に導入され得るか、またはこの細胞は、単一の移植可能デバイス（例えば、上記のカプセル化膜）に含められ得るか、あるいはこの細胞は、ウイルスベクターによって別々に改変され得る。
【０２４９】
遺伝子治療による細胞における内因性Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現を増加する手段は、Ｂ７−Ｌポリペプチドプロモーターに１つ以上のエンハンサーエレメントを挿入することであり、ここでエンハンサーエレメントは、Ｂ７−Ｌ遺伝子の転写活性を増加させるように作用し得る。使用されるエンハンサーエレメントは、遺伝子を活性化することを所望する組織に基づいて選択される−その組織においてプロモーター活性化を与えることが知られているエンハンサーエレメントが選択される。例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチドをコードする遺伝子がＴ細胞において「オンに変わる（ｔｕｒｎ  ｏｎ）」場合、ｌｃｋプロモーターエンハンサーエレメントが使用され得る。ここで、付加される転写エレメントの機能的部分は、標準的なクローニング技術を使用して、Ｂ７−Ｌポリペプチドプロモーターを含むＤＮＡのフラグメントに挿入され得る（そして必要に応じて、ベクターならびに／または５’隣接配列および／もしくは３’隣接配列に挿入される）。「相同組換え構築物」として公知のこの構築物は、次いで、エキソビボまたはインビボのいずれかで、所望の細胞に導入され得る。
【０２５０】
遺伝子治療はまた、内因性プロモーターのヌクレオチド配列を改変することによって、Ｂ７−Ｌポリペプチド発現を減少させるために使用され得る。このような改変は、典型的に、相同組換え方法によって達成される。例えば、不活性化のために選択されたＢ７−Ｌ遺伝子のプロモーターの全てまたは一部を含むＤＮＡ分子は、転写を調節するプロモーターの断片を除去および／または置換するように操作され得る。例えば、プロモーターの転写活性化因子のＴＡＴＡボックスおよび／または結合部位は、標準的な分子生物学的技術を使用して欠失され得；このような欠失は、プロモーター活性を阻害し得、それによって、対応するＢ７−Ｌ遺伝子の転写を阻止し得る。プロモーターにおけるＴＡＴＡボックスまたは転写活性化因子結合部位の欠失は、Ｂ７−Ｌポリペプチドプロモーター（調節されるＢ７−Ｌ遺伝子と同じかまたは関連の種由来）のすべてまたは関連の部分を含むＤＮＡ構築物を生成することによって達成され得、ここで、１つ以上のＴＡＴＡボックスおよび／または転写活性化因子結合部位のヌクレオチドは、１つ以上のヌクレオチドの置換、欠失、および／または挿入によって変異される。結果として、ＴＡＴＡボックスおよび／または活性化因子結合部位は、活性を減少するか、または完全に不活化される。この構築物（これはまた、典型的に、改変されたプロモーターセグメントに隣接したネイティブの（内因性）５’および３’ＤＮＡ配列に対応する少なくとも約５００塩基のＤＮＡを含む）は、直接または本明細書中に記載されるようなウイルスベクターを介してのいずれかで、適切な細胞に（エキソビボまたはインビボのいずれかで）導入され得る。典型的に、細胞のゲノムＤＮＡへのこの構築物の組込みは、相同組換えを介し、ここで、このプロモーター構築物の５’および３’ＤＮＡ配列は、内因性染色体ＤＮＡへのハイブリダイゼーションによって、改変プロモーター領域を組み込むのを補助するように作用し得る。
【０２５１】
（治療的用途）
Ｂ７−Ｌ核酸分子、ポリペプチド、ならびにそれらのアゴニストおよびアンタゴニストは、多数の疾患、障害または状態（本明細書中で引用されるものを含む）を処置、診断、改善または予防するために使用され得る。
【０２５２】
Ｂ７−Ｌポリペプチドアゴニストおよびアンタゴニストは、Ｂ７−Ｌポリペプチド活性を調節し、Ｂ７−Ｌポリペプチドの成熟形態の少なくとも１つの活性を増加または減少する分子を含む。アゴニストまたはアンタゴニストは、Ｂ７−Ｌポリペプチドと相互作用し、それによりその活性を調節する補因子（例えば、タンパク質、ペプチド、炭水化物、脂質または低分子量分子）であり得る。潜在的なポリペプチドアゴニストまたはアンタゴニストは、Ｂ７−Ｌポリペプチドのタンパク質の細胞外ドメインの一部または全てを含むＢ７−Ｌポリペプチドの可溶性形態または膜結合形態のいずれかと反応する抗体を含む。Ｂ７−Ｌポリペプチド発現を調節する分子は、典型的に、発現のアンチセンス制御因子としてはたらき得るＢ７−Ｌポリペプチドをコードする核酸を含む。
【０２５３】
Ｂ７ファミリーの関連するメンバーを発現するトランスジェニックマウスが、精嚢過形成を示すので（同時係属中の米国特許第０９／７２９，２６４（２０００年１１月２８日出願））、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストは、生殖障害および増殖障害の処置に有用であり得る。
【０２５４】
Ｂ７−Ｌポリペプチドの過剰発現は、精嚢過形成を引き起こすことによって癌細胞の増殖および維持に役割を果たし得る。従って、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴニストは、癌の診断または処置に有用であり得る。このような癌の例としては、精嚢癌、肺癌、脳癌、乳癌、造血系の癌、前立腺癌、卵巣癌、および精巣癌が挙げられるが、これらに限定されない。他の癌が、本発明の範囲内に含まれる。
【０２５５】
Ｂ７−Ｌポリペプチドの過剰発現は、精嚢過形成を引き起こすことによって細胞の不適切な増殖に役割を果たし得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドは、精嚢過形成を引き起こすことによって過剰発現に基づく細胞の不適切な増殖に役割を果たし得る。従って、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストは、異常な細胞増殖と関連する疾患の診断または処置に有用であり得る。このような疾患の例としては、動脈硬化症および脈管再狭窄が挙げられるが、これらに限定されない。細胞の不適切な増殖によって影響を受ける他の疾患が、本発明の範囲内に含まれる。
【０２５６】
Ｂ７−Ｌポリペプチドの過剰発現は、精嚢過形成を引き起こすことによって生殖系において役割を果たし得る。従って、Ｂ７−Ｌポリペプチドのアゴニストおよびアンタゴニストは、生殖系と関連する疾患の診断または処置に有用であり得る。このような疾患の例としては、不妊、流産、早産（ｐｒｅ−ｔｅｒｍ  ｌａｂｏｒ  ａｎｄ  ｄｅｌｉｖｅｒｙ）および子宮内膜症が挙げられるが、これらに限定されない。生殖系の他の疾患が、本発明の範囲内に含まれる。
【０２５７】
好ましくは、本発明のＢ７−Ｌ核酸分子、ポリペプチド、ならびにアゴニストおよびアンタゴニストは、Ｔ細胞機能と関連する疾患を処置、診断、改善、または予防するために使用される（例えば、Ｔ細胞レセプターデコイとして機能する）。例えば、延長されたＴ細胞活性化または増強されたＴ細胞活性を引き起こすＢ７−Ｌポリペプチドの抗体、細胞外ドメインを含む可溶性タンパク質、または他の調節因子は、腫瘍に対する免疫応答を増加するために使用され得る。
【０２５８】
本発明のＢ７−Ｌ核酸分子、ポリペプチド、ならびにアゴニストおよびアンタゴニストは、自己免疫疾患、移植片生存、腫瘍細胞増殖を阻害するための免疫細胞活性化、Ｔ細胞依存性Ｂ細胞媒介疾患、および癌遺伝子免疫治療の処置において使用され得る。１つの実施形態において、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体は、慢性免疫細胞機能不全を伴う疾患における症状を緩和するのに有益であり得る。全身性エリテマトーデス、慢性関節リウマチ、変形性関節症、免疫血小板減少性紫斑病（ＩＴＰ）、および乾癬のような自己免疫疾患は、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体を用いて処置され得る。さらに、炎症性腸疾患（クローン病および潰瘍性大腸炎）、グレーヴス病、橋本甲状腺炎、および糖尿病のような慢性炎症性疾患もまた、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体を用いて処置され得る。
【０２５９】
Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体は、骨髄および器官の移植のための免疫抑制剤として使用され得、そして移植片生存を延長するために使用され得る。このようなＢ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体は、既存の処置を超える有意な利点を提供し得る。骨髄および組織移植治療は、宿主による外来細胞または外来組織のＴ細胞媒介拒絶と闘わなければならない。Ｔ細胞媒介拒絶を阻害するための現在の治療レジメンは、薬物（シクロスポリンまたはＦＫ５０６）を用いた処置を含む。薬物は有効であるが、患者は、重篤な副作用（肝毒性、腎毒性、および神経毒性を含む）を被る。シクロスポリン／ＦＫ５０６クラスの治療剤に対する標的は、カルシニューリン（遍在的に発現するホスファターゼ）である。Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体は、現在の免疫治療剤の使用で観察される重篤な副作用を欠き得る。Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体は、自己免疫障害（例えば、慢性関節リウマチ、変形性関節症、乾癬、多発性硬化症、糖尿病、および全身性エリテマトーデス）に対する免疫抑制剤として使用され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体はまた、トキシックショック症候群、炎症性腸疾患、輸血に起因する同種感作、Ｔ細胞依存性Ｂ細胞媒介疾患、および対宿主性移植片病の処置を緩和するために使用され得る。
【０２６０】
例えば、多くのワクチンは、有効かつ特異的な抗体応答を誘発することによって作用する。いくつかのワクチン（特に、腸の微生物（例えば、Ａ型肝炎ウイルスおよびＳａｌｍｏｎｅｌｌａ）に対するワクチン）は、短期の抗体応答を誘発する。このワクチンの有効性を増大するために、この応答を増強および延長することが望ましい。従って、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチドは、ワクチンアジュバントとして役立ち得る。
【０２６１】
逆に、Ｂ７−Ｌは負の免疫調節機能を有し得るので、抗体、低分子、ペプチド、または他のＢ７−Ｌ機能のアンタゴニストを使用するＢ７−Ｌ活性の阻害は、免疫増強および抗腫瘍活性を生じ得る。
【０２６２】
抗ウイルス応答もまた、Ｂ７−Ｌポリペプチド経路の活性化因子またはアゴニストによって増強され得る。Ｂ７−Ｌポリペプチドアンタゴニストによる細胞性免疫機能の増強もまた、ウイルス感染細胞を除去するのに有益であり得る。補完的な様式において、Ｂ７−Ｌポリペプチドアンタゴニストはまた、抗体媒介応答を増強し得、かつ体からウイルスを排除するのを補助するように機能し得る体液性免疫機能に対して効果を有し得る。
【０２６３】
逆に、抗体酸性の阻害によって改善する多数の臨床状態が存在する。過敏症は、通常は有益な免疫応答であり、これが悪化または不適切にされ、そして炎症反応および組織傷害を導く。抗体媒介性の過敏症反応は、Ｂ７−Ｌポリペプチド活性のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体による拮抗作用を特に受け易くあり得る。アレルギー、枯草熱、喘息および急性水腫は、Ｉ型過敏症反応を引き起こし、そしてこれらの反応は、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ7−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体によって抑制され得る。
【０２６４】
抗体媒介性過敏症反応を引き起こす疾患（全身性エリテマトーデス、関節炎（慢性関節リウマチ、反応性関節炎、および乾癬関節炎）、ネフロパシー（糸球体腎炎、膜性、膜性増殖性、病巣部分的（ｆｏｃａｌ  ｓｅｇｍｅｎｔａｌ）、病巣壊死性、半月体性、および増殖性の細尿管症）、皮膚障害（天疱瘡、類天疱瘡および結節性紅斑）、内分泌障害（甲状腺炎、グレーヴス病、橋本病、インスリン依存性糖尿病）、種々の肺障害（特に、外因性肺胞炎（ｅｘｔｒｉｎｓｉｃ  ａｌｖｅｏｌｉｔｉｓ）、種々の脈管障害、腹腔疾患（ＩｇＡの異常な産生を伴う）、多くの貧血および血小板減少症、ギラン・バレー症候群、および重症筋無力症を含む）は、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体を用いて処置され得る。
【０２６５】
さらに、リンパ増殖性障害（例えば、多発性骨髄腫、Ｗａｌｄｅｎｓｔｒｏｍマクログロブリン血症、およびクリオグロブリン血症（ｃｒｉｏｇｌｏｂｕｌｉｎｅｍｉａｓ））は、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体によって阻害され得る。最後に、対宿主性移植片病（「人工」の免疫障害）は、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニスト、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド、またはＢ７−Ｌポリペプチド誘導体による抗体産生の阻害から利益を受け得る。
【０２６６】
Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニストまたはアンタゴニストは、処置される状態に適切である１つ以上のサイトカイン、増殖因子、抗生物質、抗炎症剤、および／または化学療法剤と組み合わせて（同時にかまたは連続的に）使用され得る。
【０２６７】
所望されないレベルのＢ７−Ｌポリペプチドによって引き起こされるかまたは媒介される他の疾患は、本発明の範囲内に含まれる。所望されないレベルとしては、Ｂ７−Ｌポリペプチドの過剰レベルおよびＢ７−Ｌポリペプチドの正常下レベルが挙げられる。
【０２６８】
Ｂ７−Ｌポリペプチドは、免疫応答のネガティブな調節因子（ＰＤ−１）のためのリガンドである（Ｎｉｓｈｉｍｕｒａら、１９９９，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ  １１：１４１−５１）。従って、このＢ７−Ｌポリペプチド経路のアゴニストは、おそらく免疫応答を阻害し、そしてこの経路のアンタゴニストは、免疫応答を増強し得る。しかし、Ｂ７−Ｌポリペプチド機能のアゴニストまたはアンタゴニストは、未知の生物学的因子に起因する予想外の結果を生じ得る。
【０２６９】
（Ｂ７−Ｌ核酸およびＢ７−Ｌポリペプチドの使用）
本発明の核酸分子（それ自体は生物学的に活性なポリペプチドをコードしない核酸分子を含む）を使用して、Ｂ７−Ｌ遺伝子および関連遺伝子の染色体上の位置をマッピングし得る。マッピングは、当該分野で公知の技術（例えば、ＰＣＲ増幅およびインサイチュハイブリダイゼーション）により行われ得る。
【０２７０】
Ｂ７−Ｌ核酸分子（それ自体は生物学的に活性なポリペプチドをコードしない核酸分子を含む）は、哺乳動物組織または体液サンプル中のＢ７−Ｌ核酸分子の存在について、定性的または定量的のいずれかで試験するための、診断アッセイにおけるハイブリダイゼーションプローブとして有用であり得る。
【０２７１】
他の方法はまた、１つ以上のＢ７−Ｌポリペプチドの活性を阻害することが所望される場合に使用され得る。このような阻害は、発現制御配列（三重らせん形成）またはＢ７−Ｌ  ｍＲＮＡに相補的でありかつ発現制御配列（三重らせん形成）またはＢ７−Ｌ  ｍＲＮＡにハイブリダイズする核酸分子によりもたらされ得る。例えば、アンチセンスＤＮＡまたはＲＮＡ分子（これらは、Ｂ７−Ｌ遺伝子の少なくとも一部に相補的である配列を有する）は、細胞中に導入され得る。アンチセンスプローブは、本明細書中に開示されるＢ７−Ｌ遺伝子の配列を使用して、利用可能な技術により設計され得る。代表的には、このようなアンチセンス分子の各々は、選択された各Ｂ７−Ｌ遺伝子の開始部位（５’末端）に相補的である。このアンチセンス分子が次いで、対応するＢ７−Ｌ  ｍＲＮＡにハイブリダイズする場合、このｍＲＮＡの翻訳は、防止されるかまたは低減される。アンチセンスインヒビターは、細胞または生物におけるＢ７−Ｌポリペプチドの減少または欠如に関連する情報を提供する。
【０２７２】
あるいは、遺伝子治療を使用して、１つ以上のＢ７−Ｌポリペプチドのドミナントネガティブインヒビターを作製し得る。この状況において、各選択されたＢ７−Ｌポリペプチドの変異体ポリペプチドをコードするＤＮＡが、調製され得、そして本明細書中に記載されるウイルスまたは非ウイルスの方法のいずれかを使用して患者の細胞中に導入され得る。このような変異体の各々は、代表的にはその生物学的役割において内因性ポリペプチドと競合するように設計される。
【０２７３】
さらに、Ｂ７−Ｌポリペプチド（生物学的に活性でも活性でなくても）免疫原として使用され得、すなわち、これらのポリペプチドは、抗体が誘発され得る少なくとも１つのエピトープを含有する。Ｂ７−Ｌポリペプチドに結合する選択的結合因子（本明細書中に記載されるような）は、インビボおよびインビトロでの診断目的のために使用され得、これらの目的としては、体液サンプルまたは細胞サンプル中のＢ７−Ｌポリペプチドの存在を検出するための標識された形態での使用を含むが、これに限定されない。これらの抗体をまた使用して、本明細書中に列挙される疾患および障害を含む多数の疾患および障害を、予防、処置、または診断し得る。これらの抗体は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの少なくとも１つの活性特徴を低減するかもしくは遮断するように、Ｂ７−Ｌポリペプチドに結合し得るか、またはポリペプチドに結合してＢ７−Ｌポリペプチドの少なくとも１つの活性特徴を増加し得る（Ｂ７−Ｌポリペプチドの薬物動態を増加させることによるものを含む）。
【０２７４】
Ｂ７−Ｌポリペプチドは、「発現クローニング」ストラテジーを使用して、Ｂ７−Ｌリガンドをクローニングするために使用され得る。放射性標識（１２５ヨウ素）されたＢ７−Ｌポリペプチドまたは「アフィニティー／活性−タグ化された」Ｂ７−Ｌポリペプチド（例えば、Ｆｃ融合物またはアルカリホスファターゼ融合物）を、結合アッセイにおいて使用して、Ｂ７−Ｌリガンドを発現する細胞型、細胞株、または組織を同定し得る。次いで、このような細胞または組織から単離されたＲＮＡは、ｃＤＮＡに変換され得、哺乳動物発現ベクターにクローニングされ、そして哺乳動物細胞（例えば、ＣＯＳまたは２９３）にトランスフェクトされて発現ライブラリーを生成する。放射性標識されるかまたはタグ化されたＢ７−Ｌポリペプチドは、次いで、親和性試薬として使用されて、このライブラリーにおいてＢ７−Ｌリガンドを発現する細胞のサブセットを同定および単離し得る。次いで、ＤＮＡが、これらの細胞から単離され得、そして哺乳動物細胞にトランスフェクトされて二次発現ライブラリー（ここで、Ｂ７−Ｌリガンドを発現する細胞の画分は、元のライブラリーよりも何倍も高い）を作製し得る。この富化プロセスは、Ｂ７−Ｌリガンドを含有する単一の組換えクローンが単離されるまで繰り返し反復され得る。Ｂ７−Ｌリガンドの単離は、Ｂ７−Ｌシグナル伝達経路の新規なアゴニストおよびアンタゴニストを同定または開発するために有用である。このようなアゴニストおよびアンタゴニストとしては、Ｂ７−Ｌリガンド、抗Ｂ７−Ｌリガンド抗体、低分子またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが挙げられる。
【０２７５】
ヒトＢ７−Ｌポリペプチドをコードし、ｐＧＥＭ−Ｔ−Ｅａｓｙ（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）へとサブクローニングされ、そして登録番号ＰＴＡ２４８１を有するｃＤＮＡの寄託は、Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｔｙｐｅ  Ｃｕｌｔｕｒｅ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ，１０８０１  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｂｏｕｌｅｖａｒｄ，Ｍａｎａｓｓａｓ，ＶＡ  ２０１１０−２２０９に、２０００年９月１９日になされた。
【０２７６】
本発明のヒトＢ７−Ｌ核酸もまた、対応する染色体Ｂ７−Ｌポリペプチド遺伝子を単離するための手段として有用である。このヒトＢ７−ＬゲノムＤＮＡは、遺伝的な組織変性疾患を同定するために使用され得る。
【０２７７】
以下の実施例は、例示目的のみのためであることが意図され、そして決して本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。
【０２７８】
（実施例１：ヒトＢ７−Ｌポリペプチド遺伝子のクローニング）
概して、Ｓａｍｂｒｏｏｋら（前出）に記載されるような材料および方法を、ヒトＢ７−ＬポリペプチドおよびマウスＢ７−Ｌポリペプチドをコードする遺伝子をクローニングおよび分析するために使用した。
【０２７９】
Ｇｅｎｂａｎｋ−ＥＭＢＬデータベースの検索を、ＴＢＬＡＳＴＸプログラム（ｈｔｔｐ：／／ｂｌａｓｔ．ｗｕｓｔｌ．ｅｄｕ）および問い合わせ配列としてＢ７−Ｈ１を用いて実行した。ヒトゲノムクローン（Ｃｅｌｅｒａ  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ，Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤ，ＧＡ＿１６８１７５９６）を、Ｂ７ファミリーの推定の新規メンバーをコードする核酸配列を含むとして同定した。部分的Ｂ７−Ｌ核酸配列を含むクローン（ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＫ００１８７２）を使用して、このＢ７ファミリーのこの推定の新規メンバーについての推定ｃＤＮＡ配列を構築した。
【０２８０】
種々のｃＤＮＡライブラリーおよびＭａｒａｔｈｏｎ  ｃＤＮＡライブラリー（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ，Ｐａｌｏ  Ａｌｔｏ，ＣＡ）由来のプラスミドＤＮＡを、プライマー２５１５−２７（５’−Ｃ−Ａ−Ｔ−Ａ−Ａ−Ｔ−Ａ−Ｇ−Ａ−Ｇ−Ｃ−Ａ−Ｔ−Ｇ−Ｇ−Ｃ−Ａ−Ｇ−Ｃ−Ａ−Ａ−Ｔ−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ａ−Ｃ−３’；配列番号２６）および２５２４−６３（５’−Ｇ−Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｃ−Ｃ−Ｔ−Ｇ−Ｇ−Ａ−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ｇ−Ｃ−Ｔ−Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ｔ−Ｔ−Ｇ−３’；配列番号２７）を用いて実行するＰＣＲ増幅におけるテンプレートとして使用した。このＰＣＲプライマーを、上記で同定したｃＤＮＡ配列中の推定エキソン内の配列に対応するように設計した。ＰＣＲ増幅を標準的な技術を用いて実行した。
【０２８１】
予想した４００ｂｐのＰＣＲフラグメントを、ヒト胎児胃、胸腺、頭皮、頭蓋冠、大腿、腸間膜、脾臓、脊柱、気管、および胎盤から作製したｃＤＮＡライブラリーから獲得した。さらに、予想したフラグメントを、ヒト成人Ｔ細胞、橋／髄質、および中脳ＬＶＮから得た。さらに、予想したフラグメントを、リンパ系細胞株において、ならびに結腸、胸部、卵巣、および肺の腫瘍において得た。ヒト胎児の副腎、脳、腎臓、肝臓、肺、脾臓、および胸腺、ならびに成人の骨髄、心臓、腎臓、肝臓、肺、膵臓、胎盤、網膜、骨格筋、小腸、脾臓、精巣および胸腺についてのＭａｒａｔｈｏｎ  ｃＤＮＡライブラリーもまた、推定フラグメントを生じた。この４００ｂｐのフラグメントをまた、ヒト混合組織ｃＤＮＡのサブプール（Ｅ４）から得た（このサブプールは、約１５，０００個のクローンを含む）。このサブプールは、全長ｃＤＮＡクローンについて最適化した、特別に合成したライブラリー（ＬＴＩ−ＦＬ，Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ  Ｉｎｃ．，Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤ）に由来した。
【０２８２】
ヒト混合組織ｃＤＮＡのＰＣＲ増幅物において得られた４００ｂｐのフラグメントを、単離し、そしてｐＧＥＭ−Ｔ−Ｅａｓｙ（登録商標）ベクター（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）へとクローニングした。選択したクローンのＤＮＡ配列を決定して、このクローンの配列が元々同定されたゲノム配列の配列と同一であったことを確認した。次いで、４００ｂｐのフラグメントを、このベクターから切り出し、そして３２Ｐ−ｄＣＴＰの取り込みによって標識した。標識したフラグメントを使用して、ＰＣＲ増幅実験の前にポジティブであると試験したＬＴＩ−ＦＬ  ｃＤＮＡライブラリーの１５，０００個のクローンのサブプール由来の１５０，０００個の細菌コロニーをスクリーニングした。コロニーを、ＬＢ／アンピシリンプレートからニトロセルロースフィルターに写し、６×ＳＳＣ、０．５％  ＳＤＳ、１×デンハルト溶液および１００μｇ／ｍｌ  変性サケ精子ＤＮＡ中、６０℃で３時間プレハイブリダイズさせた。１×１０６ｃｐｍ／ｍｌの３２Ｐ標識プローブの添加後、ハイブリダイゼーションを同じ条件下で一晩実行した。フィルターを、２×ＳＳＣおよび０．１％  ＳＤＳ中、室温で３０分間、２回洗浄し、次いで、０．１×ＳＳＣおよび０．１％  ＳＤＳ中、６５℃で３０分間、２回洗浄した。次いで、フィルターを、増感スクリーンを用いて−８０℃で６時間、Ｘ線フィルムに露光させた。
【０２８３】
いくつかのポジティブコロニーを、この様式で同定し、そして、これらクローン由来のプラスミドＤＮＡを、標準的な方法によって調製した。このコロニー由来のｃＤＮＡ挿入物は、約２．２ｋｂ長であった。ＤＮＡ配列分析によって、これらのクローンが、Ｂ７ファミリーの新しいメンバー（Ｂ７−Ｌ）の推定コード領域を含むこと、およびこれらのクローンにおいて同定した核酸配列が、ゲノムクローンＧＡ＿１６８１７５９６において同定された核酸配列と同一であることを確認した。
【０２８４】
ヒトＢ７−Ｌポリペプチドの全長ｃＤＮＡの配列分析によって、この遺伝子が、２７３アミノ酸のタンパク質をコードする８１９ｂｐのオープンリーディングフレームを含むことが示された（図１）。ＨＰ  Ｇ１００  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｒを使用して、成熟Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ末端を配列決定し、そしてアミノ酸配列Ｌ−Ｆ−Ｔ−Ｖ−Ｔ−Ｖ−Ｐ−Ｋ−Ｅ−Ｌ−Ｙ−Ｉ−Ｉ−Ｅ（配列番号２８）を含むことが見出され、これにより、Ｂ７−Ｌポリペプチドが、そのアミノ末端に１９アミノ酸長の単一ペプチドを有することを確証した（図１を参照のこと；推定の単一ペプチドは、下線で示される）。
【０２８５】
このクローンにおいて同定された核酸配列は、オープンリーディングフレーム全体を含むが、Ｂ７−Ｌ転写物の完全な５’未翻訳領域は含まなかった。この配列は、プライマー２５１５−２４（５’−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ｇ−Ｃ−Ｔ−Ｃ−Ｔ−Ｔ−Ｔ−Ｃ−Ａ−Ｃ−Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ｇ−Ｇ−Ｇ−Ａ−Ｔ−Ｇ−３’；配列番号２９）および２５３８−６８（５'−Ｃ−Ｃ−Ａ−Ｇ−Ｔ−Ｇ−Ｔ−Ｃ−Ａ−Ａ−Ａ−Ｇ−Ｔ−Ｔ−Ｇ−Ｃ−Ａ−Ｔ−Ｔ−Ｃ−Ｃ−Ａ−Ｇ−Ｇ−Ｇ−Ｔ−３’；配列番号３０）、ならびに以下のテンプレートを使用する、連続回の５’ＲＡＣＥを使用して決定する：胎児の肝臓、脾臓、および胸腺、ならびに成人の骨髄、肺、および脾臓由来のＭａｒａｔｈｏｎ  ｃＤＮＡライブラリー；リンパ腫細胞株および卵巣腫瘍由来のｃＤＮＡライブラリー；ならびに胎児の脾臓、胎盤ならびに成人のＴ細胞および脊柱由来のｃＤＮＡライブラリー。標準的なＲＡＣＥプロトコルを使用した。リンパ腫細胞株、胎児の脾臓、胎盤および成人のＴ細胞のＲＡＣＥ増幅について、明瞭なバンドを得た。これらの産物を、ｐＧＥＭ−Ｔ−Ｅａｓｙ（登録商標）ベクターへと連結した。このＢ７−Ｌ転写物の５’未翻訳領域の配列を、これらの形質転換反応物から選択したクローンを配列決定することによって決定した。
【０２８６】
Ｂ７−Ｌ遺伝子の推定タンパク質産物は、タンパク質のＢ７ファミリーに関連する。これらのタンパク質は、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであり、そしてＴ細胞媒介免疫応答の調節因子として作用する。タンパク質のＢ７ファミリーのメンバーは、小細胞質ドメイン、ならびに免疫グロブリンＶ（可変）およびＣ（定常）ドメインを含む細胞外領域を有する、１型膜タンパク質である。Ｂ７ファミリーの既知メンバーとしては、ＣＤ８０（Ｂ７−１）、ＣＤ８６（Ｂ７−２）、Ｂ７−ｒｐ１、およびＢ７−Ｈ１が挙げられる。Ｂ７−１およびＢ７−２は、ＣＤ２８およびＣＴＬＡ−４と相互作用し、そしてこのＢ７−１およびＢ７−２は、Ｔ細胞同時刺激経路のメディエータである。Ｂ７−ｒｐ１は、別のレセプター（ＩＣＯＳ；誘導性同時刺激因子）に結合し、そしてまた、Ｔ細胞増殖の刺激因子である。Ｂ７−Ｈ１もまた、Ｔ細胞増殖を同時刺激するが、ＣＤ２８、ＣＴＬＡ−４、またはＩＣＯＳに結合しない。このファミリーのタンパク質配列は、ほとんど保存されておらず、そして結果的に、コンピュータによる方法を使用して他の関連分子から識別することが困難である（特に、全長コード領域配列の一部分のみを比較する場合）。このＢ７ファミリーに対して配列相同性を示す他のタンパク質としては、ブチロフィリンおよびＰＲＯ３５２が挙げられる。なおより関連性が遠いものは、ミエリン稀突起膠細胞タンパク質（ＭＯＧ）である。図２Ａ〜２Ｃは、ヒトタンパク質Ｂ７−Ｌポリペプチド（ＧＡ１６８１７５９６）、ＣＤ８０（Ｂ７−１）、ＣＤ８６（Ｂ７−２）、Ｂ７−Ｈ１、Ｂ７ｒｐ−１、ＰＲＯ３５２、ブチロフィリンＢＴＦ１、ブチロフィリンＢＴＦ２、ブチロフィリンＢＴＦ４、ブチロフィリンＢＴＦ３、およびブチロフィリンのアミノ酸配列の整列を示す。
【０２８７】
マウスＢ７−Ｌオルソログの全長配列を、１９９９年６月１日にＧｅｎＢａｎｋに寄託した（登録番号ＡＦ１４２７８０）。このマウスＢ７−Ｌオルソログは、寄託の時点で、Ｂ７／ブチロフィリンファミリーに正確に配置された。Ｂ７−ＬポリペプチドのＣ末端部分から１７３アミノ酸をコードする部分的ヒトＢ７−Ｌ  ｃＤＮＡ配列を、２０００年２月２３日にＧｅｎＢａｎｋに寄託した（登録番号ＡＫ００１８７２）。このクローンによってコードされる部分的ポリペプチドは、寄託の時点では、特定のタンパク質ファミリーに割当てられなかった。
【０２８８】
Ｂ７−Ｌ遺伝子についての部分的なイントロン−エキソン構造を、ゲノムクローンＧＡ＿４３４４０６１０、ＧＡ＿４３０６８６２８、ＧＡ＿４３０６８６２７、およびＧＡ＿４３４４０６００（Ｃｅｌｅｒａ  Ｇｅｎｏｍｉｃｓ）から誘導した。図３Ａ〜３Ｅは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列（配列番号１４）の一部分を示す。エキソン１の推定アミノ酸配列（配列番号１９）の位置を、図３Ｃに示す。図３Ａ〜３Ｅに示される配列は、未知サイズのギャップによって、図４に示されるゲノムヌクレオチド配列の部分（配列番号１５）から分離されている。図４に示される配列は、約２４００塩基のマスクされた配列によって、図５Ａ〜５Ｆに示されるゲノムヌクレオチド配列（配列番号１６）から分離されている。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置が、図５Ｄに示されている。図５Ａ〜５Ｆに示される配列は、約９６００塩基のギャップによって、図６Ａ〜６Ｂに示されるゲノムヌクレオチド配列（配列番号１７）から分離されている。エキソン３の推定アミノ酸配列（配列番号２１）の位置は、図６Ａに示されている。図６Ａ〜６Ｂに示される配列は、約７２０塩基のマスクされた配列によって、図７Ａ〜７Ｍに示されるゲノムヌクレオチド配列（配列番号１８）から分離されている。エキソン４（配列番号２２）、５（配列番号２３）、および６の推定アミノ酸配列の位置は、それぞれ図７Ｄ〜７Ｅ、７Ｈ、および７Ｌに示されている。
【０２８９】
（実施例２：Ｂ７−Ｌ  ｍＲＮＡ発現）
多重ヒト組織ノーザンブロット（Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）を、ヒトＢ７−Ｌ  ｃＤＮＡ配列のヌクレオチド３３〜９０６に対応する８７４ｂｐのプローブにハイブリダイズさせた。このプローブを、製造者の指示に従ってＰｒｉｍｅ−Ｉｔ  ＲｍＴ  Ｒａｎｄｏｍ  Ｐｒｉｍｅｒ  Ｌａｂｅｌｉｎｇキット（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）を使用して放射性標識した。ノーザンブロットを、製造者の指示に従ってハイブリダイズおよび洗浄し、次いで、オートラジオグラフィーに曝露した。図８は、このノーザンブロット分析の結果を示す。
【０２９０】
Ｂ７−Ｌ  ｍＲＮＡの発現は、インサイチュハイブリダイゼーションによって局在化する。正常な胚組織および成体マウス組織のパネルを、４％  パラホルムアルデヒド中で固定し、パラフィン中に包理し、そして５μｍに切片にする。切片化した組織を、０．２Ｍ  ＨＣｌ中で透過化処理し、プロテイナーゼＫで消化し、そしてトリエタノールアミンおよび無水酢酸でアセチル化する。切片を、ハイブリダイゼーション溶液（３００ｍＭ  ＮａＣｌ、２０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ８．０、５ｍＭ  ＥＤＴＡ、１×デンハルト溶液、０．２％  ＳＤＳ、１０ｍＭ  ＤＴＴ、０．２５ｍｇ／ｍｌ  ｔＲＮＡ、２５μｇ／ｍｌ  ポリＡ、２５μｇ／ｍｌ  ポリＣおよび５０％ホルムアミド）中で１時間６０℃でプレハイブリダイズし、次いで、１０％デキストランおよび２×１０４ｃｐｍ／μｌの３３Ｐ−標識アンチセンスリボプローブ（ヒトＢ７−Ｌ遺伝子に相補的）を含有する同じ溶液中で６０℃で一晩ハイブリダイズさせる。標準的技術を用いて、ヒトＢ７−Ｌ  ｃＤＮＡ配列を含有するクローンのインビトロ転写によって、このリボプローブを得る。
【０２９１】
ハイブリダイゼーション後、切片を、ハイブリダイゼーション溶液中でリンスし、ＲＮａｓｅＡで処理してハイブリダイズしていないプローブを消化し、次いで０．１×ＳＳＣ中で５５℃で３０分間洗浄する。次いで、切片をＮＴＢ−２エマルジョン（Ｋｏｄａｋ，Ｒｏｃｈｅｓｔｅｒ，ＮＹ）に浸し、４℃に３週間曝し、発色させ、そしてヘマトキシリンおよびエオシンで対比染色する。組織形態学およびハイブリダイゼーションシグナルを、脳（矢状切片１つおよび冠状切片２つ）、胃腸管（食道、胃、十二指腸、空腸、回腸、近位結腸、および遠位結腸）、下垂体、肝臓、肺、心臓、脾臓、胸腺、リンパ節、腎臓、副腎、膀胱、膵臓、唾液腺、雄性および雌性生殖器（雌性の卵巣、卵管、および子宮；ならびに雄性の精巣、精巣上体、前立腺、精嚢および輸精管）、ＢＡＴおよびＷＡＴ（皮下、腎臓周囲）、骨（大腿）、皮膚、乳房、および骨格筋についての暗視野照明法かつ標準照明法によって同時に分析する。
【０２９２】
（実施例３：Ｂ７−Ｌポリペプチドの産生）
（Ａ．細菌におけるＢ７−Ｌポリペプチドの発現）
ＰＣＲを用いて、Ｂ７−ＬポリペプチドをコードするテンプレートＤＮＡ配列を増幅する。このＰＣＲには、この配列の５’および３’末端に対応するプライマーを用いる。増幅したＤＮＡ産物を改変して、発現ベクター内への挿入を可能にするために制限酵素部位を含むようにし得る。ＰＣＲ産物をゲル精製し、そして標準的組み換えＤＮＡ方法論を用いて発現ベクター中に挿入する。ｌｕｘプロモーターおよびカナマイシン耐性をコードする遺伝子を含むｐＡＭＧ２１（ＡＴＣＣ番号９８１１３）のような代表的なベクターを、挿入したＤＮＡの方向性クローニングのために、ＢａｍＨＩおよびＮｄｅＩを用いて消化する。連結した混合物を、エレクトロポレーションによってＥ．ｃｏｌｉ宿主株中に形質転換し、そして形質転換体をカナマイシン耐性について選択する。選択したコロニー由来のプラスミドＤＮＡを、単離し、そしてＤＮＡ配列決定に供してインサート（挿入物）の存在を確認する。
【０２９３】
形質転換した宿主細胞を、導入前に、３０μｇ／ｍＬカナマイシンを含有する２×ＹＴ培地中で３０℃でインキュベートする。最終濃度３０ｎｇ／ｍＬへのＮ−（３−オキソヘキサノイル）−ｄｌ−ホモセリンラクトンの添加、それに続く３０℃かまたは３７℃での６時間のインキュベーションによって、遺伝子発現を誘導する。Ｂ７−Ｌポリペプチドの発現を、培養物の遠心分離、細菌ペレットの再懸濁および溶解、ならびに、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動による宿主細胞タンパク質の分析によって評価する。
【０２９４】
Ｂ７−Ｌポリペプチドを含有する封入体を、以下の通り精製する。細菌細胞を遠心分離によってペレット化し、そして水中に再懸濁する。この細胞懸濁液を超音波処理によって溶解し、そして１９５，０００×ｇでの５〜１０分間の遠心分離によってペレット化する。この上清を廃棄し、そしてペレットを洗浄してホモジナイザーに移す。このペレットを、均一に懸濁されるまで、５ｍＬのＰｅｒｃｏｌｌ溶液（７５％液体Ｐｅｒｃｏｌｌおよび０．１５Ｍ  ＮａＣｌ）中でホモジナイズし、次いで希釈して２１，６００×ｇで３０分間遠心分離する。封入体を含む勾配画分を回収してプールする。単離した封入体をＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析する。
【０２９５】
Ｅ．ｃｏｌｉが産生したＢ７−Ｌポリペプチドに相当する、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル上の単一のバンドを、ゲルから切り出し、そしてＮ末端アミノ酸配列を、本質的にＭａｔｓｕｄａｉｒａら、１９８７，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６２：１０〜３５に記載のように決定する。
【０２９６】
（Ｂ．哺乳動物細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチドの発現）
ＰＣＲを用いて、Ｂ７−ＬポリペプチドをコードするテンプレートＤＮＡ配列を増幅する。このＰＣＲには、この配列の５’および３’末端に対応するプライマーを用いる。増幅したＤＮＡ産物を改変して、発現ベクター内への挿入を可能にするために制限酵素部位を含むようにし得る。ＰＣＲ産物をゲル精製し、そして標準的組み換えＤＮＡ方法論を用いて発現ベクター中に挿入する。エプスタイン−バーウイルス複製起点を含む代表的な発現ベクターであるｐＣＥＰ４（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡ）を、２９３−ＥＢＮＡ−１細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチドの発現のために用い得る。増幅およびゲル精製したＰＣＲ産物を、ｐＣＥＰ４ベクターに連結し、そしてリポフェクチンによって２９３−ＥＢＮＡ細胞中に導入する。トランスフェクトした細胞を、１００μｇ／ｍＬのハイグロマイシン中で選択し、そして得られた薬物耐性培養物をコンフルエンスになるまで増殖する。次いで、この細胞を無血清培地中で７２時間培養する。馴化培地を取り出し、Ｂ７−Ｌポリペプチド発現をＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分析する。
【０２９７】
Ｂ７−Ｌポリペプチド発現は、銀染色によって検出できる。あるいは、Ｂ７−Ｌポリペプチドを、ペプチドタグに対する抗体を用いてウエスタンブロット分析によって検出可能であり得る、エピトープタグ（例えば、ＩｇＧ定常ドメインまたはＦＬＡＧエピトープ）を有する融合タンパク質として生成する。
【０２９８】
Ｂ７−Ｌポリペプチドを、ＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲルから切り出し得るか、またはＢ７−Ｌ融合タンパク質を、エピトープタグに対するアフィニティークロマトグラフィーによって精製し、そして本明細書に記載のようにＮ末端アミノ酸配列分析に供する。
【０２９９】
（Ｃ．哺乳動物細胞におけるＢ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質の発現）
Ｂ７−Ｌポリペプチドのアミノ末端に２２０アミノ酸をコードするＢ７−Ｌ  ｃＤＮＡの６６０ｂｐフラグメント（これは、Ｂ７−Ｌポリペプチドのシグナルペプチドおよび細胞外ドメインを含む）を、適切なプライマーおよび標準的な技術を使用して、ＰＣＲによって増幅した。実施例１に記載される特別に合成したライブラリーから単離したプラスミドＤＮＡを、ＰＣＲ増幅におけるテンプレートとして使用した。
【０３００】
次いで、この６６０ｂｐのフラグメントを、発現ベクター（ｐＣＥＰ４／Ｆｃ、これは、ヒトＦｃ（ＩｇＧ−１）のカルボキシル末端の２３５アミノ酸をコードする核酸配列を含む）へとクローニングした。コロニーを、細菌細胞の形質転換後に選択し、そしてｐＣＥＰ４−Ｂ７−Ｌ／ＦｃプラスミドＤＮＡを、標準的な技術を使用して単離した。
【０３０１】
単離したプラスミドＤＮＡを用いて、製造者の指示に従ってＦｕＧＥＮＥ  ６
Ｔｒａｎｓｆｅｃｔｉｏｎ  Ｒｅａｇｅｎｔ（Ｒｏｃｈｅ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｓ，Ｉｎｄｉａｎａｐｏｌｉｓ，ＩＮ）を使用して、２９３−ＥＢＮＡ−１細胞をトランスフェクトした。形質転換後、この細胞を、１０％ウシ胎仔血清を補充したＤＭＥＭ培地中、３７℃で２４時間培養し、次いでＤＭＥＭ無血清培地に移し、そして３７℃で５日間増殖させた。このＢ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質を、製造者の指示に従ってＨｉＴｒａｐ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ａ  Ｃｏｌｕｍｎ（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）上で順化培地から精製し、次いでこの融合タンパク質を、ＰＢＳ中で透析した。この精製したタンパク質の濃度を、標準としてＣｏｏｍａｓｓｉｅ（登録商標）Ｐｌｕｓ  Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ａｓｓａｙ  Ｒｅａｇｅｎｔ（Ｐｉｅｒｃｅ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）およびＢＳＡを使用して、製造者の指示に従って測定した。
【０３０２】
（実施例４：新規ＰＤ−１リガンドとしてのＢ７−Ｌポリペプチドの同定）
既知のＢ７媒介同時刺激経路の１つにおいてＢ７−Ｌポリペプチドが機能するか否かを決定するために、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質での処理後に、ＣＤ２８、ＣＲＰ−１／ＩＣＯＳ、またはＰＤ−１を発現するＣＨＯ  Ｄ−細胞上でＦＡＣＳ分析を行った。
【０３０３】
マウスＰＤ−１（ｍＰＤ−１；Ｉｓｈｉｄａら、１９９２，ＥＭＢＯ  Ｊ．１１：３８８７−９５）をコードし、そしてネイティブのＰＤ−１シグナルペプチドを含む全長核酸配列を、Ｈｉｎｄ  ＩＩＩおよびＳａｌ  Ｉ制限エンドヌクレアーゼ部位を組み込むプライマーを使用する、マウス活性化脾臓リンパ球ｃＤＮＡライブラリーのＰＣＲ増幅によって得た。得られたＰＣＲ産物を、Ｈｉｎｄ  ＩＩＩおよびＳａｌ  Ｉで消化し、次いでｐＤＳＲａ−１９ベクターに連結した。細菌細胞への形質転換後、クローンを選択し、そして配列決定した。全長ｍＰＤ−１  ｃＤＮＡ配列を含むクローン（クローン１．５）を、制限エンドヌクレアーゼＰｖｕ  Ｉを使用して直線化し、そしてこの直線化したプラスミドを使用して、リン酸カルシウム法によってＣＨＯ  Ｄ−細胞をトランスフェクトした。トランスフェクトしたＣＨＯ  Ｄ−細胞を培養し、そして数週間後に、個々のコロニーを、リングクローンング（ｒｉｎｇ  ｃｌｏｎｉｎｇ）を介して単離した。高発現トランスフェクト体（クローン３．３６）を、それがＢ７−Ｈ１／Ｆｃ融合タンパク質に特異的に結合する能力について同定した（Ｄｏｎｇら，１９９９，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．５：１３６５−６９）。
【０３０４】
ベクター単独、ｍＰＤ−１（クローン３．３６）、ヒトＣＤ２８、またはｍＣＲＰ１／ＩＣＯＳ（クローン１．４１；Ｙｏｓｈｉｎａｇａら，１９９９，Ｎａｔｕｒｅ  ４０２：８２７−３２）を発現するＣＨＯ  Ｄ−細胞を、５％ｄＦＢＳ、１×ＰＳＧ、および１×ＮＥＡＡを補充したＤＭＥＭ中、Ｔ１７５フラスコで培養した。細胞を、Ｃｅｌｌ  Ｄｉｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  Ｓｏｌｕｔｉｏｎ（Ｓｉｇｍａ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）を使用してこの培養フラスコから出し、洗浄緩衝液（０．５％ＢＳＡ含有ＰＢＳ）中で希釈し、次いで計測した。
【０３０５】
０．１ｍｌの培地中の約３．０×１０５個の細胞を、１μｇの精製したマウスＣＲＰ１／Ｆｃ、ヒトＢ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ、マウスＢ７ｒｐ−１／Ｆｃ、またはマウスＢ７−２／Ｆｃと氷上で１時間反応させた。ＣＨＯ  Ｄ−細胞をまた、上記のように（この細胞を、ｍＢ７−Ｈ１／Ｆｃを発現するＣＨＯ  Ｄ−細胞から収集した無血清順化培地１ｍｌ中の１０μｇの融合タンパク質に曝露したことを除いて）、マウスＢ７−Ｈ１／Ｆｃと共にインキュベートした。インキュベーション後、細胞を５ｍｌの洗浄緩衝液で希釈し、遠心分離し、次いで５ｍｌの洗浄緩衝液中で２回洗浄した。次いで、この細胞を、１０μｇ／ｍｌのヤギ抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ特異的ＦＩＴＣ結合体化検出抗体（Ｃｈｅｍｉｃｏｎ，Ｔｅｍｅｃｕｌａ  ＣＡ）を含む１００μｌの洗浄緩衝液中に再懸濁した。この細胞を、氷上で３０分間反応させ、次いで上記のように洗浄した。洗浄後、細胞を、最終容量１ｍｌの洗浄緩衝液中に再懸濁させ、次いでＦＡＣＳ  Ｓｔａｒ（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，Ｆｒａｎｋｌｉｎ  Ｌａｋｅｓ，ＮＪ）を使用して分析した。
【０３０６】
図９に示されるように、Ｂ７−Ｌポリペプチドは、ＰＤ−１レセプターに特異的に結合するが、ＣＤ２８またはＣＲＰ−１／ＩＣＯＳレセプターには結合しない。この融合タンパク質Ｂ７−２／ＦｃおよびＢ７ｒｐ−１／Ｆｃは、予期された通りに、ＣＤ２８およびＣＲＰ−１／ＩＣＯＳレセプターに結合した。Ｂ７−Ｈ１もまたＰＤ−１レセプターに特異的に結合することが示されたので（図９Ｂ）、ＦＡＣＳ分析は、Ｂ７−ＬポリペプチドおよびＢ７−Ｈ１の両方が、ＰＤ−１レセプターについてのリガンドであることを示す。ＰＤ−１は、Ｔ細胞増殖のネガティブな調節因子であるので（Ｎｉｓｈｉｍｕｒａら，１９９９，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ  １１：１４１−５１）、可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチドを介するこの経路の活性化は、免疫応答の減少を生じ得る。逆に、Ｂ７−Ｌポリペプチドに対するアンタゴニスト抗体は、免疫応答を増大し得る。
【０３０７】
（実施例５：Ｂ７−ＬポリペプチドによるＴ細胞増殖の阻害）
Ｂ７−Ｌポリペプチドが、Ｔ細胞増殖における役割を果たすか否かを決定するために、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質を使用してヒトＴ細胞増殖アッセイを行った。高度に精製されたヒトＴ細胞（＞９８％  ＣＤ３＋）を、Ｐａｎ  Ｔ細胞単離キット（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃ，Ａｕｂｕｒｎ，ＣＡ）を使用して、新鮮であるかまたは解凍した、接着性が劣化した末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）のネガティブ選択によって単離した。丸底９６ウェル細胞培養プレートを、０．５または１．５μｇ／ｍｌの抗ＣＤ３抗体（ＰｈａｒＭｉｎｇｅｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）、１０μｇ／ｍｌの抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ（Ｓｉｇｍａ）、およびＰＢＳ（容量０．１ｍｌ）で、４℃で一晩プレコーティングした。このプレコーティング溶液を除去し、このプレートをＰＢＳで１回洗浄し、そして１０％のＦＣＳ培地を補充したＲＰＭＩ  １６４０または培地単独中、２０μｇ／ｍｌまで希釈した０．１ｍｌのＢ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ、Ｂ７−２／ＦｃまたはＢ７ｒｐ−１／Ｆｃ融合タンパク質を、このウェルに加えた。次いで、このプレートを、３７℃で４時間インキュベートした。インキュベーション後、培地を除去し、そして０．２ｍｌの精製Ｔ細胞（１０×１０５個の細胞を含む）をプレコーティングした各ウェルに加えた。次いで、このプレートを、３７℃で４８時間インキュベートした。インキュベーション後、１μＣｉ／ウェルの［３Ｈ］チミジンを各ウェルに加え、そしてこの培養物を３７℃でさらに１８時間インキュベートした。次いで、この細胞を収集し、そして１分当たりのカウント（ＣＰＭ）を測定した。
【０３０８】
図１０に示されるように、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質は、抗ＣＤ３抗体のいずれの濃度でも、抗ＣＤ３媒介性Ｔ細胞増殖を阻害し得た。逆に、Ｂ７ｒｐ−１／ＦｃおよびＢ７−１／Ｆｃ融合タンパク質は、同じ条件下でＴ細胞増殖を同時刺激することが示された。これらの結果は、Ｂ７−ＬポリペプチドがＴ細胞増殖のネガティブな調節因子であることを示す。さらに、これらの結果は、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質、または他の可溶性Ｂ７−Ｌポリペプチド誘導体が、免疫機能を阻害するために使用され得、それによって好都合な治療結果を提供することを示唆する。インビトロアッセイ（例えば、本明細書中に記載されるアッセイ）もまた、Ｂ７−Ｌポリペプチド活性の抗体インヒビター、可溶性タンパク質インヒビター、または低分子インヒビターについてスクリーニングするために使用され得る。
【０３０９】
（実施例６：Ｂ７−Ｌポリペプチドレセプターは、ヒト末梢血単核細胞で発現される）
ＦＡＣＳ分析を使用して、ヒトＰＢＭＣにおけるＴ細胞およびＢ細胞に対するＢ７−Ｌポリペプチドレセプターを同定した。Ｆｉｃｏｌｌ−Ｐａｑｕｅ（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｐｈａｒｍａｃｉａ  Ｂｉｏｔｅｃｈ）勾配遠心分離を使用して、健常なヒトのボランティアから得た血液からＰＢＭＣを精製し、そしてこの細胞を、１０μｇ／ｍｌのリポ多糖（ＬＰＳ）中での３日間のインキュベーションによって刺激した。ＬＰＳ処理後、０．２ｍｌの容量中の５×１０５個の細胞を、氷上で１０分間、１００μｇ／ｍｌのヒトＩｇＧ  Ｆｃでブロックした。次いで、この細胞を、１０μｇ／ｍｌの種々のビオチン化Ｆｃ融合タンパク質（または適切なコントロール）と共に、氷上で３０分間インキュベートした。Ｆｃ融合タンパク質とのインキュベーション後、図１１において示される細胞サンプルを、抗ＣＤ３抗体（ＰｈａｒＭｉｎｇｅｎ）または抗ＣＤ１９抗体（Ｂｅｃｔｏｎ
Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）と共に氷上で３０分間インキュベートした。インキュベーション後、細胞を洗浄緩衝液（０．５％ＢＳＡ含有ＰＢＳ）中で２回洗浄し、次いで氷上で３０分間、ＦＩＴＣアビジン（１：１００希釈）で染色した。この細胞を、１ｍｌの洗浄緩衝液中に再懸濁し、そしてＦＡＣＳ  Ｓｔａｒで分析した。
【０３１０】
図１１に示されるように、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃタンパク質は、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）の有意な集団に結合した。Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質およびＴ細胞（ＣＤ３）マーカーまたはＢ細胞（ＣＤ１９）マーカーを用いる二重染色によって、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質が結合する細胞の一部分が、Ｔ細胞およびＢ細胞であったことが示された。しかし、有意な数のＢ７−Ｌポリペプチドレセプター発現細胞はまた、Ｔ細胞またはＢ細胞ではないことが示された。従って、ＰＭＢＣ中の非リンパ球、ならびにリンパ球は、Ｂ７−Ｌポリペプチドによって調節され得る。この結合パターンは、ＰＤ−１発現のパターンと一致している（Ｉｓｈｉｄａら，１９９２，ＥＭＢＯ  Ｊ．１１：３８８７−９５）。
【０３１１】
（実施例７：抗Ｂ７−Ｌポリペプチド抗体の産生）
Ｂ７−Ｌポリペプチドに対する抗体は、精製したタンパク質での免疫、または生物学的合成もしくは化学的合成によって生成したＢ７−Ｌペプチドでの免疫によって得られ得る。抗体を産生するための適切な手順としては、ＨｕｄｓｏｎおよびＢａｙ，Ｐｒａｃｔｉｃａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（２ｎｄ  ｅｄ．，Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ）に記載される手順が挙げられる。
【０３１２】
抗体の産生のための１つの手順において、動物（代表的にはマウスまたはウサギ）は、Ｂ７−Ｌ抗原（例えば、Ｂ７−Ｌポリペプチド）を注射され、そしてＥＬＩＳＡによって決定されるような有意な血清力価レベルを有する動物が、ハイブリドーマ産生のために選択される。免疫された動物の脾臓を収集し、そして単一細胞懸濁物として調製し、これから脾細胞を回収する。この脾細胞を、マウス骨髄腫細胞（例えば、Ｓｐ２／０−Ａｇ１４細胞）に融合し、２００Ｕ／ｍＬのペニシリン、２００μｇ／ｍＬの硫酸ストレプトマイシン、および４ｍＭのグルタミンを含むＭＤＥＭ中で最初にインキュベートし、次いでＨＡＴ選択培地（ヒポキサンチン、アミノプテリン、およびチミジン）中でインキュベートする。選択後、この組織培養物の上清を各融合ウェルから採取し、そして抗Ｂ７−Ｌ抗体産生についてＥＬＩＳＡで試験する。
【０３１３】
抗Ｂ７−Ｌ抗体を得るための代替的な手順もまた利用され得、例えば、ヒト抗体を産生するための、ヒトＩｇ遺伝座を有するトランスジェニックマウスの免疫化、および合成抗体ライブラリー（例えば、抗体の可変ドメインの変異誘発によって作製されたライブラリー）のスクリーニングである。
【０３１４】
（実施例８：トランスジェニックマウスにおけるＢ７−Ｌポリペプチドの発現）
Ｂ７−Ｌポリペプチドの生物学的活性を評価するために、肝臓特異的ＡｐｏＥプロモーターの制御下でＢ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ融合タンパク質をコードする構築物を調製する。この構築物の送達は、Ｂ７−Ｌポリペプチドの機能についての参考となる病理学的変化を引き起こすと予想される。同様に、βアクチンプロモーターの制御下で全長Ｂ７−Ｌポリペプチドを含む構築物を調製する。この構築物の送達は、遍在的な発現を生じると予想される。
【０３１５】
これらの構築物を作製するために、ＰＣＲを使用して、所望の配列の５’末端および３’末端に対応するプライマーを使用してＢ７−ＬポリペプチドをコードするテンプレートＤＮＡ配列（これは、発現ベクターへの増幅産物の挿入を可能にするために、制限酵素部位を組み込む）を増幅する。増幅後、ＰＣＲ産物をゲル精製し、適切な制限酵素で消化し、そして標準的な組換えＤＮＡ技術を使用して発現ベクターへと連結する。例えば、増幅したＢ７−Ｌポリペプチド配列は、Ｇｒａｈａｍら，１９９７，Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，１７：２７２−７４およびＲａｙら，１９９１，Ｇｅｎｅｓ  Ｄｅｖ．５：２２６５−７３に記載されるように、ヒトβ−アクチンプロモーターの制御下で発現ベクターへとクローニングされ得る。
【０３１６】
連結後、反応混合物を使用して、Ｅ．ｃｏｌｉ宿主菌株をエレクトロポレーションによって形質転換し、そして形質転換体を、薬物耐性について選択した。選択したコロニー由来のプラスミドＤＮＡを単離し、そして適切な挿入物の存在および変異の欠如を確認するためにＤＮＡ配列決定に供する。このＢ７−Ｌポリペプチド発現ベクターは、２回のＣｓＣＩ密度勾配遠心分離を介して精製され、適切な制限酵素で切断され、そしてＢ７−Ｌポリペプチド導入遺伝子を含む直線化されたフラグメントが、ゲル電気泳動によって精製される。この精製されたフラグメントは、５ｍＭ  Ｔｒｉｓ（ｐＨ７．４）および０．２ｍＭ  ＥＤＴＡ中に、２ｍｇ／ｍＬの濃度で再懸濁される。
【０３１７】
ＢＤＦ１×ＢＤＦ１交配マウス由来の単一細胞胚に、記載されるように（国際公開番号ＷＯ９７／２３６１４）注射する。胚を、ＣＯ２インキュベーター中で一晩培養し、そして１５〜２０の２細胞胚を、偽妊娠ＣＤ１雌マウスの卵管に移す。微量注入した胚の移植から得られた子孫を、以下のようにゲノムＤＮＡサンプル中に組み込まれた導入遺伝子のＰＣＲ増幅によってスクリーニングする。耳片を、２０ｍＬの耳緩衝液（ｅａｒ  ｂｕｆｆｅｒ）（２０ｍＭ  Ｔｒｉｓ（ｐＨ８．０）、１０ｍＭ  ＥＤＴＡ、０．５％  ＳＤＳ、および５００ｍｇ／ｍＬ
プロテイナーゼＫ）中、５５℃で一晩消化する。次いで、このサンプルを２００ｍＬのＴＥで希釈し、そして２ｍＬの耳サンプルを、適切なプライマーを使用して、ＰＣＲ反応において使用する。
【０３１８】
８週齢で、トランスジェニック創始動物およびコントロール動物を、検死および病理学的分析のために屠殺する。脾臓のタンパク質を取り出し、そして総細胞ＲＮＡを、Ｔｏｔａｌ  ＲＮＡ  Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ）を使用してこの脾臓から単離し、導入遺伝子の発現をＲＴ−ＰＣＲによって決定する。脾臓から回収したＲＮＡを、以下のようにＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔＴＭ
Ｐｒｅａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｇｉｂｃｏ−ＢＲＬ）を使用してｃＤＮＡに変換する。発現ベクター配列およびＢ７−Ｌポリペプチド導入遺伝子に対して３’側に位置する適切なプライマーを使用して、導入遺伝子転写物からのｃＤＮＡ合成をプライムする。トランスジェニック創始動物およびコントロール由来の１０ｍｇの総脾臓ＲＮＡを、１ｍＭのプライマーと共に７０℃で１０分間インキュベートし、そして氷上に置く。次いで、この反応物に、１０ｍＭ  Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ（ｐＨ８．３）、５０ｍＭ  ＫＣｌ、２．５ｍＭ  ＭｇＣｌ２、１０ｍＭの各ｄＮＴＰ、０．１ｍＭ  ＤＴＴ、および２００ＵのＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ  ＩＩ逆転写酵素を補充する。４２℃で５０分のインキュベーション後、この反応を７２℃で１５分間加熱することによって停止させ、そして３７℃で２０分間、２ＵのＲＮａｓｅ  Ｈで消化する。次いで、サンプルを、Ｂ７−Ｌポリペプチドに特異的なプライマーを使用するＰＣＲによって増幅する。
【０３１９】
（実施例９：トランスジェニックマウスにおけるＢ７−Ｌポリペプチドの生物学的活性）
安楽死の前に、トランスジェニック動物を秤量し、イソフルラン（ｉｓｏｆｌｕｏｒａｎｅ）によって麻酔し、そして心臓穿刺によって採血する。サンプルを、血液学および血清化学分析に供する。Ｘ線撮影を、最終的な放血後に行う。肉眼での解剖の際に、主な内臓器官を、重量分析に供する。
【０３２０】
肉眼での解剖後、組織（すなわち、肝臓、脾臓、膵臓、胃、胃腸管全体、腎臓、生殖器官、皮膚および乳腺、骨、脳、心臓、肺、胸腺、気管、食道、甲状腺、副腎、膀胱、リンパ節および骨格筋）を取出し、そして１０％緩衝化Ｚｎ−ホルマリン中で組織学的検査のために固定する。固定後、組織をパラフィンブロック中で処理し、そして３ｍｍの切片を得る。全ての切片を、ヘマトキシリンおよびエオシンで染色し、次いで組織学的分析に供する。
【０３２１】
トランスジェニックマウスおよびコントロールマウスの両方の脾臓、リンパ節およびパイアー斑を、以下の通りにＢ細胞特異的抗体およびＴ細胞特異的抗体についての免疫組織学的分析に供する。ホルマリンで固定したパラフィン包埋切片を脱パラフィン処理し、そして脱イオン水中で水和する。切片を３％過酸化水素でクエンチし、Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｂｌｏｃｋ（Ｌｉｐｓｈａｗ，Ｐｉｔｔｓｂｕｒｇｈ，ＰＡ）でブロックし、そしてラットモノクローナル抗マウスＢ２２０およびＣＤ３（Ｈａｒｌａｎ，Ｉｎｄｉａｎａｐｏｌｉｓ，ＩＮ）中でインキュベートする。抗体結合を、色素原（ｃｈｒｏｍａｇｅｎ）としてＤＡＢ（ＢｉｏＴｅｋ，Ｓａｎｔａ  Ｂａｒｂａｒａ，ＣＡ）を用いて、ビオチン化ウサギ抗ラット免疫グロブリンおよびペルオキシダーゼ結合体化ストレプトアビジン（ＢｉｏＧｅｎｅｘ，Ｓａｎ  Ｒａｍｏｎ，ＣＡ）によって検出する。切片を、ヘマトキシリンで対比染色する。
【０３２２】
剖検後、トランスジェニック動物およびコントロールの同腹仔由来の脾臓および胸腺のＭＬＮおよび切片を取出す。シリンジの平らな末端を用いて１００ｍｍナイロン性細胞ストレーナー（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，Ｆｒａｎｋｌｉｎ  Ｌａｋｅｓ，ＮＪ）の底に対してこの組織を穏やかに粉砕することによって単細胞懸濁物を調製する。細胞を２回洗浄し、計数し、次いで各組織由来の約１×１０６細胞を、２０μＬ容量において０．５μｇ  ＣＤ１６／３２（ＦｃγＩＩＩ／ＩＩ）Ｆｃブロックで１０分間インキュベートする。次いで、サンプルを、ＦＩＴＣまたはＰＥに結合体化した、ＣＤ９０．２（Ｔｈｙ−１．２）、ＣＤ４５Ｒ（Ｂ２２０）、ＣＤ１１ｂ（Ｍａｃ−１）、Ｇｒ−１、ＣＤ４またはＣＤ８に対するモノクローナル抗体（ＰｈａｒＭｉｎｇｅｎ，Ｓａｎ  Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）の０．５μｇ抗体を有する、１００μＬ容量のＰＢＳ（Ｃａ＋およびＭｇ＋を欠く）、０．１％ウシ血清アルブミンおよび０．０１％アジ化ナトリウム中で２〜８℃で３０分間染色する。抗体結合後、細胞を洗浄し、次いでＦＡＣＳｃａｎ（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）でのフローサイトメトリーによって分析する。
【０３２３】
本発明を好ましい実施形態に関して記載してきたが、バリエーションおよび改変が当業者に思い浮かぶことが理解される。それゆえ、添付の特許請求の範囲が、本願発明の範囲内に入る全てのこのような均等なバリエーションを包含することが意図される。
【図面の簡単な説明】
【０３２４】
【図１Ａ】図１Ａ〜１Ｂは、ヒトＢ７−Ｌ遺伝子のヌクレオチド配列（配列番号１）、およびヒトＢ７−Ｌポリペプチドの推定アミノ酸配列（配列番号２）を示す。推定のシグナルペプチド（下線部）および膜貫通ドメイン（二重下線）を示す。
【図１Ｂ】図１Ａ〜１Ｂは、ヒトＢ７−Ｌ遺伝子のヌクレオチド配列（配列番号１）、およびヒトＢ７−Ｌポリペプチドの推定アミノ酸配列（配列番号２）を示す。推定のシグナルペプチド（下線部）および膜貫通ドメイン（二重下線）を示す。
【図２Ａ】図２Ａ〜２Ｃは、以下のアミノ酸配列アラインメントを示す：ヒトＢ７−Ｌポリペプチド（ＧＡ１６８１７５９６；配列番号２）、ヒトＣＤ８０またはＢ７−１（Ｃｄ８０＿Ｈｕｍａｎ；配列番号４；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｐ３３６８１）、ヒトＣＤ８６またはＢ７−２（Ｃｄ８６＿Ｈｕｍａｎ；配列番号５；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ０４３４３）、ヒトＢ７−Ｈ１（Ｂ７−Ｈ１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号６；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＦ１７７９３７）、ヒトＢ７ｒｐ−１（Ｂ７ｒｐ−１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号７；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＦ１９９０２８）、ヒトＰＲＯ３５２（Ｐｒｏ３５２＿Ｈｕｍａｎ；配列番号８；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｙ４１７０５）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ１（Ｂｔｆ１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号９；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４３）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ２（Ｂｔｓｆ２ａ２＿Ｈｕ；配列番号１０；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５５０）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ４（Ｂｔｆ４＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１１；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４６）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ３（Ｂｔｎ３ａ３＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１２；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４８）、およびブチロフィリン（Ｂｔｎ＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１３；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ３９５７６）。
【図２Ｂ】図２Ａ〜２Ｃは、以下のアミノ酸配列アラインメントを示す：ヒトＢ７−Ｌポリペプチド（ＧＡ１６８１７５９６；配列番号２）、ヒトＣＤ８０またはＢ７−１（Ｃｄ８０＿Ｈｕｍａｎ；配列番号４；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｐ３３６８１）、ヒトＣＤ８６またはＢ７−２（Ｃｄ８６＿Ｈｕｍａｎ；配列番号５；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ０４３４３）、ヒトＢ７−Ｈ１（Ｂ７−Ｈ１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号６；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＦ１７７９３７）、ヒトＢ７ｒｐ−１（Ｂ７ｒｐ−１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号７；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＦ１９９０２８）、ヒトＰＲＯ３５２（Ｐｒｏ３５２＿Ｈｕｍａｎ；配列番号８；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｙ４１７０５）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ１（Ｂｔｆ１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号９；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４３）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ２（Ｂｔｓｆ２ａ２＿Ｈｕ；配列番号１０；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５５０）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ４（Ｂｔｆ４＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１１；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４６）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ３（Ｂｔｎ３ａ３＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１２；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４８）、およびブチロフィリン（Ｂｔｎ＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１３；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ３９５７６）。
【図２Ｃ】図２Ａ〜２Ｃは、以下のアミノ酸配列アラインメントを示す：ヒトＢ７−Ｌポリペプチド（ＧＡ１６８１７５９６；配列番号２）、ヒトＣＤ８０またはＢ７−１（Ｃｄ８０＿Ｈｕｍａｎ；配列番号４；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｐ３３６８１）、ヒトＣＤ８６またはＢ７−２（Ｃｄ８６＿Ｈｕｍａｎ；配列番号５；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ０４３４３）、ヒトＢ７−Ｈ１（Ｂ７−Ｈ１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号６；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＦ１７７９３７）、ヒトＢ７ｒｐ−１（Ｂ７ｒｐ−１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号７；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号ＡＦ１９９０２８）、ヒトＰＲＯ３５２（Ｐｒｏ３５２＿Ｈｕｍａｎ；配列番号８；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｙ４１７０５）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ１（Ｂｔｆ１＿Ｈｕｍａｎ；配列番号９；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４３）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ２（Ｂｔｓｆ２ａ２＿Ｈｕ；配列番号１０；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５５０）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ４（Ｂｔｆ４＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１１；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４６）、ヒトブチロフィリンＢＴＦ３（Ｂｔｎ３ａ３＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１２；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ９０５４８）、およびブチロフィリン（Ｂｔｎ＿Ｈｕｍａｎ；配列番号１３；ＧｅｎＢａｎｋ登録番号Ｕ３９５７６）。
【図３Ａ】図３Ａ〜３Ｅは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１４）を示す。エキソン１の推定アミノ酸配列（配列番号１９）の位置を示す。
【図３Ｂ】図３Ａ〜３Ｅは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１４）を示す。エキソン１の推定アミノ酸配列（配列番号１９）の位置を示す。
【図３Ｃ】図３Ａ〜３Ｅは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１４）を示す。エキソン１の推定アミノ酸配列（配列番号１９）の位置を示す。
【図３Ｄ】図３Ａ〜３Ｅは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１４）を示す。エキソン１の推定アミノ酸配列（配列番号１９）の位置を示す。
【図３Ｅ】図３Ａ〜３Ｅは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１４）を示す。エキソン１の推定アミノ酸配列（配列番号１９）の位置を示す。
【図４】図４は、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１５）を示す。
【図５Ａ】図５Ａ〜５Ｆは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１６）を示す。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置を示す。
【図５Ｂ】図５Ａ〜５Ｆは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１６）を示す。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置を示す。
【図５Ｃ】図５Ａ〜５Ｆは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１６）を示す。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置を示す。
【図５Ｄ】図５Ａ〜５Ｆは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１６）を示す。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置を示す。
【図５Ｅ】図５Ａ〜５Ｆは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１６）を示す。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置を示す。
【図５Ｆ】図５Ａ〜５Ｆは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１６）を示す。エキソン２の推定アミノ酸配列（配列番号２０）の位置を示す。
【図６Ａ】図６Ａ〜６Ｂは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１７）を示す。エキソン３の推定アミノ酸配列（配列番号２１）の位置を示す。
【図６Ｂ】図６Ａ〜６Ｂは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１７）を示す。エキソン３の推定アミノ酸配列（配列番号２１）の位置を示す。
【図７Ａ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｂ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｃ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｄ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｅ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｆ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｇ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｈ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｉ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｊ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｋ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｌ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図７Ｍ】図７Ａ〜７Ｍは、ヒトＢ７−Ｌポリペプチドのゲノムヌクレオチド配列の一部（配列番号１８）を示す。エキソン４（配列番号２２）、エキソン５（配列番号２３）、およびエキソン６の推定アミノ酸配列の位置を示す。
【図８】図８は、ヒトＢ７−Ｌ  ｍＲＮＡ発現のノーザンブロット分析の結果を示す。
【図９】図９は、ＦＩＴＣ単独と共に、または以下の融合タンパク質：ＣＲＰ−１／Ｆｃ、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ、Ｂ７ｒｐ−１／Ｆｃ、Ｂ７−Ｈ１／Ｆｃ、もしくはＢ７−２／Ｆｃと共にのいずれかでインキュベートした、ベクター単独で（Ａ）、またはＰＤ−１（Ｂ）、ＣＲＰ−１／ＩＣＯＳ（Ｃ）、もしくはＣＤ２８（Ｄ）をコードするベクターでトランスフェクトしたＣＨＯ  Ｄ細胞の、蛍光標示式細胞分取装置（ＦＡＣＳ）分析の結果を示す。
【図１０】図１０は、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ、Ｂ７ＲＰ−１／Ｆｃ、またはＢ７−１／Ｆｃを使用する、抗ＣＤ３媒介Ｔ細胞増殖アッセイにおいて得られた結果を示す。
【図１１】図１１は、ＦＩＴＣ単独（Ａ）、Ｆｃコントロール（Ｂ）、Ｂ７ｒｐ−１／Ｆｃ（Ｃ）、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃ（Ｄ）、Ｂ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃおよび抗ＣＤ３（Ｅ）、またはＢ７−Ｌポリペプチド／Ｆｃおよび抗ＣＤ１９（Ｆ）を使用する、ヒト末梢血細胞のＦＡＣＳ分析の結果を示す。
【０３２５】
［配列表］
【化１】
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【化２】
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【化３】
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【化４】
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【化５】
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【化６】
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【化７】
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【化８】
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【化９】
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【化１０】
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【化１１】
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【化１２】
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【化１３】
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【化１４】
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【化１５】
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【化１６】
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【化１７】
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【化１８】
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【化１９】
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【化２０】
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【化２１】
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【化２２】
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【化２３】
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【化２４】
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【化２５】
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【化２６】
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【化２７】
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【化２８】
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【化２９】
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【化３０】
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【化３１】
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【化３２】
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【化３３】
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【化３４】
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【化３５】
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【化３６】
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【化３７】
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【化３８】
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【化３９】
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【化４０】
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【化４１】
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【化４２】
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【化４３】
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【化４４】
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【化４５】
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【化４６】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
2008263984.tif 000057
【図２Ｃ】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図３Ｃ】
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【図３Ｄ】
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【図３Ｅ】
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【図４】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図５Ｃ】
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【図５Ｄ】
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【図５Ｅ】
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【図５Ｆ】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図７Ａ】
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【図７Ｂ】
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【図７Ｃ】
2008263984.tif 000075
【図７Ｄ】
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【図７Ｅ】
2008263984.tif 000077
【図７Ｆ】
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【図７Ｇ】
2008263984.tif 000079
【図７Ｈ】
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【図７Ｉ】
2008263984.tif 000081
【図７Ｊ】
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【図７Ｋ】
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【図７Ｌ】
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【図７Ｍ】
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