(57)【要約】【課題】  食細胞の貪食機能をin vitroで評価できる実験的モデルを提供する。【解決手段】  食細胞と外来微生物とをin vitroで接触させて得た貪食済み食細胞を単離および固定する。  固定した食細胞の細胞膜について、その透過性を亢進させた後に、溶菌酵素、それに、フェニルメチルスルフォニルフルオライドのジメチルスルフォキシド溶液を食細胞に作用させて、食細胞内に取り込まれた外来微生物のＤＮＡを露出させる。  界面活性剤の存在下で、露出したＤＮＡと検出用ＤＮＡプローブとを用いて、in situハイブリダイゼーションを行い、得られたハイブリダイゼーションシグナルに基づいて、外来微生物に対する食細胞の食作用および／または殺傷能を同定する。【選択図】  図１３
2008194057.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の工程、すなわち；
(ａ) 食細胞と外来微生物とをin vitroで接触させ、
(ｂ) 外来微生物による貪食作用を受けた貪食済み食細胞を単離し、
(ｃ) 単離した食細胞を支持担体上に固定し、
(ｄ) 固定した食細胞の細胞膜の透過性を亢進させ、
(ｅ) 亢進処理した食細胞に対して溶菌酵素を作用させ、次いで、フェニルメチルスルフォニルフルオライドのジメチルスルフォキシド溶液を作用させて、当該貪食済み食細胞に含まれる外来微生物のＤＮＡを露出させ、
(ｆ) 露出したＤＮＡに対して、ストリンジェントな条件下で、ハイブリダイゼーションすることができる検出用ＤＮＡプローブを用いて、界面活性剤の存在下で、当該露出したＤＮＡに対してin situハイブリダイゼーションを行い、および
(ｇ) 得られたハイブリダイゼーションシグナルに基づいて、外来微生物に対する当該食細胞の食作用および／または殺傷能を同定する、
工程を含む、ことを特徴とする外来微生物に対する食細胞の機能を評価する方法。
【請求項２】
前記食細胞が、動物の血液に含まれる成分である請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記工程(ａ)に供する外来微生物の菌液濁度(Ｏ.Ｄ.=６００nm)が、０.０１〜０.０３である請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記外来微生物が、グラム陰性菌である請求項１乃至３のいずれかに記載の方法。
【請求項５】
前記外来微生物が、スタフィロコッカス・アウレウス、スタフィロコッカス・エピデルミデス、エンテロコッカス・ファエカリス、シュードモナス・アエルギノーサ、エシェリヒア・コリ、カンジダ・アルビカンス、および、これらの組み合わせからなるグループから選択される請求項１乃至３のいずれかに記載の方法。
【請求項６】
前記工程(ｃ)で固定される食細胞の密度(ｘ個/ml)が、５×１０6個/ml＜ｘ個/ml＜１×１０8個/mlである請求項１乃至５のいずれかに記載の方法。
【請求項７】
前記溶菌酵素が、１単位/ml〜１,０００単位/mlの力価のリゾスタフィンである請求項１乃至６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
前記溶菌酵素が、１,０００単位/ml〜１,０００,０００単位/mlの力価のリゾチームである請求項１乃至６のいずれかに記載の方法。
【請求項９】
前記溶菌酵素が、１０単位/ml〜１０,０００単位/mlの力価のＮ-アセチルムラミダーゼである請求項１乃至６のいずれかに記載の方法。
【請求項１０】
前記溶菌酵素が、５０単位/ml〜５００単位/mlの力価のザイモラーゼである請求項１乃至６のいずれかに記載の方法。
【請求項１１】
前記溶菌酵素が、１０単位/ml〜１００単位/mlの力価のリゾスタフィン、１０,０００単位/ml〜１００,０００単位/mlの力価のリゾチーム、１００単位/ml〜１,０００単位/mlの力価のＮ-アセチルムラミダーゼ、１００単位/ml〜５００単位/mlの力価のザイモラーゼ、および、これらの組み合わせからなるグループから選択される請求項１乃至６のいずれかに記載の方法。
【請求項１２】
前記溶菌酵素の反応が、１５分〜１２０分間、２６℃〜５９℃の条件下で進行する請求項１乃至１１のいずれかに記載の方法。
【請求項１３】
前記ジメチルスルフォキシド溶液に含まれるフェニルメチルスルフォニルフルオライドの濃度が、１０μmol/l〜１０mmol/lである請求項１乃至１２のいずれかに記載の方法。
【請求項１４】
前記ジメチルスルフォキシド溶液が、５％未満の濃度である請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記支持担体が、３-アミノプロピルトリエトキシシランをコートしたスライドグラスである請求項１乃至１４のいずれかに記載の方法。
【請求項１６】
前記ＤＮＡプローブの鎖長が、３５０〜６００塩基長である請求項１乃至１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１７】
前記ＤＮＡプローブの濃度が、０.１ng/μl〜２.２ng/μlである請求項１乃至１５のいずれかに記載の方法。
【請求項１８】
前記界面活性剤が、ドデシル硫酸ナトリウムを含む請求項１乃至１７のいずれかに記載の方法。
【請求項１９】
前記工程(ｆ)でのハイブリダイゼーションが、３０分〜９００分間、２５℃〜５０℃の条件下で進行する請求項１乃至１８のいずれかに記載の方法。
【請求項２０】
前記ハイブリダイゼーションシグナルが、色素の存在下で検出される請求項１乃至１９のいずれかに記載の方法。
【請求項２１】
以下の工程、すなわち；
食細胞と外来微生物とをin vitroで接触させ、
外来微生物による貪食作用を受けた貪食済み食細胞を単離し、
単離した食細胞を支持担体上に固定し、
固定した食細胞を色素で染色し、および
貪食中または貪食後の細胞に特徴的な細胞形態を鏡検して検出することによって、外来微生物に対する食細胞の食作用および／または殺傷能を同定する、
工程を含む、ことを特徴とする外来微生物に対する食細胞の機能を評価する方法。
【請求項２２】
以下の工程、すなわち；
ヒト以外の動物から食細胞を単離し、
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を用いて食細胞の機能を評価し、および
得られた評価結果を、正常な食細胞機能の評価結果と比較することにより、当該動物の免疫機能を評価する、
工程を含む、ことを特徴とする免疫機能を評価する方法。
【請求項２３】
前記免疫機能が、微生物に対する白血球の貪食能である請求項２２に記載の方法。
【請求項２４】
前記白血球が、放射線照射または制癌剤投与をした後のヒト以外の動物から得た血液に含まれる成分である請求項２３に記載の方法。
【請求項２５】
以下の工程、すなわち；
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を用いて食細胞の機能を評価し、および
経時的に当該機能を評価して、その経時的変化を同定する
工程を含む、ことを特徴とする食細胞の分化効率を評価する方法。
【請求項２６】
以下の工程、すなわち；
食細胞機能モジュレーターの存在下および非存在下で、外来微生物を食細胞と共にインキュベートし、および
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を用いて、当該モジュレーターの存在下および非存在下での食細胞機能を比較する、
工程を含む、ことを特徴とする食細胞機能に関するモジュレーターによる効果を判定する方法。
【請求項２７】
以下の工程、すなわち；
食細胞機能に対してモジュレーター作用を奏することが推定される薬剤の存在下および非存在下で、外来微生物を食細胞と共にインキュベートし、および
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を用いて、当該薬剤の存在下および非存在下での食細胞機能を比較する、
工程を含む、ことを特徴とする食細胞機能に関するモジュレーターをスクリーニングする方法。
【請求項２８】
以下の工程、すなわち；
薬剤の投与前および投与後にヒト以外の動物から食細胞を取得し、
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法を用いて、当該食細胞が奏する食細胞機能を評価し、および
その評価結果から判定される薬剤の効果に基づいて薬剤投与計画を検討する、
工程を含む、ことを特徴とする臨床検査方法。
【請求項２９】
請求項１乃至２１のいずれかに記載の方法に従って食細胞の機能を評価するために使用されるキットであって、(１)外来微生物、(２)リゾスタフィン、リゾチーム、Ｎ-アセチルムラミダーゼ、ザイモラーゼ、および、これらの組み合わせからなるグループより選択される一つ以上の溶菌酵素、(３)フェニルメチルスルフォニルフルオライド、(４)界面活性剤、および、(５)一つ以上のＤＮＡプローブを具備する、ことを特徴とするキット。
【請求項３０】
前記外来微生物が、グラム陰性菌である請求項２９に記載のキット。
【請求項３１】
前記外来微生物が、スタフィロコッカス・アウレウス、スタフィロコッカス・エピデルミデス、エンテロコッカス・ファエカリス、シュードモナス・アエルギノーサ、エシェリヒア・コリ、カンジダ・アルビカンス、および、これらの組み合わせからなるグループから選択される請求項２９に記載のキット。
【請求項３２】
前記界面活性剤が、ドデシル硫酸ナトリウムを含む請求項２９乃至３１のいずれかに記載のキット。
【請求項３３】
請求項２９乃至３２のいずれかに記載のキットの性能を試験する方法であって、食細胞と外来微生物とのin vitroでの接触によって外来微生物による貪食作用を受けた貪食済み食細胞を使用する、ことを特徴とするキットの性能を試験する方法。
【請求項３４】
前記性能が、キットの感度、特異性または再現性のいずれかである請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記貪食済み食細胞が、陽性コントロールとして利用される請求項３３または３４に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、食細胞機能の評価方法に関し、さらに詳細には、例えば、敗血症等の細菌や真菌等の外来微生物による感染状態の診断や、感染症治療薬の開発の上で有用な、感染の実験的モデルを提供する。  また、本発明は、食細胞による貪食能および／または殺菌能を検出、同定および評価するための方法、食細胞機能のモジュレーターによる効果を判定するための方法、食細胞機能モジュレーターのスクリーニング方法、かかる方法を実施するためのキットにも関する。
【背景技術】
【０００２】
感染症および敗血症は、予め基礎疾患があり、それが原因となって弱毒菌が感染して引き起こされることが多い。  この様な状態は、臨床現場では頻繁に起こり得るが、その臨床症状を全て網羅する理想的な動物モデルは未だ確立されていない。  この要因としては、細菌感染が基礎疾患の違いにより複雑な感染状況を呈し、また、動物種の菌種に対する感受性等に大きな隔たりがあるため、感染モデルの系が、その研究目的によって個々に確立されてきたからである。  現在よく知られている感染モデルの系は、(i) マウスやラットの腹腔に種々の菌種を感染させて腹腔内膿瘍を形成させ、敗血症の病態を追跡する方法(２相性感染理論）、(ii) 特に、低免疫下での感染の動態をみる場合、シクロホスフファミドを予め投与して白血球を減少させ、Pseudomonas aeruginosa等の弱毒菌株を感染させる方法および感染を容易にするために電気ゴテで皮膚を広範囲に火傷させ、Pseudomonas aeruginosaを付着させる方法、(iii) マクロフアージや好中球等によって遊離されるサイトカインなどの生体液性因子の動態を検討する場合、Escherichia coli等の大腸菌類縁菌及びこれらのLPSを投与して惹起される敗血症の病態を観察する方法、(vi) ラットの盲腸を結窄穿刺（CLP：Cecal Ligation and Puncture）することにより、腸内細菌を侵入させて、ICU及び消化器系外科でみられる腹膜炎によるMOFを引き起こし、その組織像の動態を確認する（亜急性重感染症腹膜炎モデル）などが挙げられる。
【０００３】
好ましい動物モデルの条件として、(I) 細菌が感染原発巣から血液中に移行すること（血液中に細菌を直接投与することは、多くの場合、細菌性ショックを引き起こし、病態としてコントロールできない）、(II) 経時的に両検査法で比較検討する際、十分な血液量が確保でき、採血部位での２次感染及びコンタミネーションが生じない血液採取が実施できること、(III) 動物種または週齢によっては好中球等の貪食細胞が少ないため、ヒトと同程度の量の貪食細胞が確保できること、(IV) 頻回な血液採取による採血時のショック及びストレス等による免疫系の変化が各個体及び検出感度に大きく影響を与えないこと、(V) 個体差を無くすため、ある程度の例数が確保できること、等が挙げられる。
【０００４】
モデル動物を作製する系として最も一般均な方法である２相性感染理論は、歴史的にも古く、1931年のMe1eneyらに始まり、Hite (1949）、Mergehagen (1958）、McDonald (1963)らによって検討、確立された系である。  このモデルは嫌気性菌、好気性菌に関わらず、原発巣の細菌が血液を介して２次的感染巣を形成するという、感染経路の理論的根拠として確立されており、一般的に敗血症感染モデルとして用いられている。  しかしながら、本系は、細菌感染症の病態解析に使用する系として確立されたため、腹腔から血液中へ移行する細菌量に重点をおいていない。  よって、各ラットの個体差の影響により、腹腔内投与した細菌量が血液中の菌量に反映されないため、投与菌量による違いをin vivo試験で考察することは困難である。
【０００５】
また、Bacterial Translocation法にも問題がある。  Escherichia coli、Enterobactor cloacae、Klebsiella pneumoniae、Enteroccocus faecalisおよびStaphylococcus epidermidis等の弱毒性感染細菌の検出感度を安易に比較できない要因として、これら菌種が腸内及び他の粘膜の常在細菌であることが挙げられる。  このin vivo試験の系では、投与された菌の動態ではなく、敗血症の病態の解析が目的であるので、投与した菌以外の菌種の侵入は考慮していない。  最近、臨床現場及び動物実験においても、腹膜炎により腸管透過性が亢進され、腸内細菌が血液中に移行して敗血症を引き起こすことが論じられている。  また、臨床現場では腹膜炎に起因するMOFにおいて感染巣が特定できない場合もあり、Bacterial Translocationとの関連が注目されている。
【０００６】
さらに、動物実験では、このin vivo試験モデルでEnterococcus faecalisを腹腔内投与した場合、腹膜炎による炎症ストレス等が誘因となり、腸管からのBacterial Translocationを引き起こし、33％(９/27)の割合で腸管のEntaerococcus faecalisが分離されたとの報告がある。  また、Steffenらも、このin vivo試験モデルで、多くの腸内細菌が血液中に移行することを認めている。
【０００７】
また、Bacterial Translocationではないが、ラット敗血症モデルに用いられる盲腸結紮穿刺法による腹膜炎では、12時間後に血液中からEscherichia coli、Enterobactor cloacae、Klebsiella pneumoniae、Enteroccocus faecalisおよびStaphylococcus epidermidisが分離されたとの報告もある。
【０００８】
感染症原因微生物と宿主との間の関係は極めて複雑であるので、様々なヒト感染症、例えば、敗血症・菌血症を模した理想的な動物モデルを確立するのはさらに困難なことである。  このように、菌血症・敗血症を含む感染症診断や、感染症治療薬開発のための薬効の判定の一助として、食細胞の形態を維持したまま、外来微生物の種に関わらず安定で適用範囲の広い食細胞の貪食能および／または殺菌能をin vitroで評価できる、感染症の実験的モデルが希求されているにもかかわらず、要求を充分に満たすものは提供されていないという現状にある。
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】
本発明は、このような現状に鑑み、in vitroにおいて食細胞の貪食機能を評価できる実験的モデルを提供することを目的とするものである。  さらに、当該実験モデルを使用することによる、生体の免疫機能および食細胞への分化効率を評価できる方法を提供することを目的とする。  また、当該実験モデルを使用することによる、免疫機能賦活剤、抗ガン剤、白血球分化因子、抗生物質などの各種薬剤をスクリーニングする方法、各種薬剤の投与計画を検討する臨床検査方法などを提供することを目的とする。  さらには、生体由来の食細胞を含む臨床検体より食細胞を得、得られた食細胞を固定し、該細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、該食細胞中に存在すると予想される外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、該ＤＮＡにストリンジェントな条件下ハイブリダイゼーションすることのできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行い、得られたシグナルにより、外来微生物を検出および／または検出するキットにおいて、感度試験、特異性試験および再現性試験などの性能試験、また、当該実験モデルを陽性コントロールなどとして使用する方法を提供する。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本発明は、以上詳説した現状に鑑みて成し遂げられたものであり、その要旨とするところは、以下の項目１〜40に記載の通りである。
【００１１】
１．食細胞と外来微生物をin vitroにおいて接触させた後、当該細胞を単離することによって調製された、外来微生物貪食済み食細胞。
【００１２】
２．前記食細胞と外来微生物とをin vitroにおいて接触させる際に使用される外来微生物の菌液濁度（O.D.=600nm）が、約0.01〜約0.03である項目１に記載の外来微生物貪食済み食細胞。
【００１３】
３．前記外来微生物貪食済み食細胞の密度が、約１×104個/μl〜約５×104個/μlである項目１または２に記載の外来微生物貪食済み食細胞。
【００１４】
４．前記外来微生物が、グラム陰性菌である項目１乃至３のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞。
【００１５】
５．前記外来微生物が、スタフィロコッカス・アウレウス、スタフィロコッカス・エピデルミデス、エンテロコッカス・ファエカリス、シュードモナス・アエルギノーサ、エシェリヒア・コリおよびカンジダ・アルビカンスならびにそれらの混合物よりなるグループから選択される１以上の微生物である項目１乃至３のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞。
【００１６】
６．外来微生物貪食済み食細胞の製造方法であって、食細胞をin vitroにおいて外来微生物と接触させ、および当該食細胞を単離する、工程を含む、外来微生物貪食済み食細胞の製造方法。
【００１７】
７．前記食細胞と外来微生物とをin vitroにおいて接触させる際に使用される前記外来微生物の菌液濁度（O.D.=600nm）が、約0.01〜約0.03である項目６に記載の外来微生物貪食済み食細胞の製造方法。
【００１８】
８．前記外来微生物貪食済み食細胞の密度が、約１×104個/μl〜約５×104個/μlである項目６または７に記載の外来微生物貪食済み食細胞の製造方法。
【００１９】
９．前記外来微生物が、グラム陰性菌である項目６乃至８のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞の製造方法。
【００２０】
10．前記外来微生物が、スタフィロコッカス・アウレウス、スタフィロコッカス・エピデルミデス、エンテロコッカス・ファエカリス、シュードモナス・アエルギノーサ、エシェリヒア・コリおよびカンジダ・アルビカンスならびにそれらの混合物よりなるグループから選択される１以上の微生物である項目６乃至８のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞の製造方法。
【００２１】
11．貪食済み外来微生物を検出および／または同定する方法であって、項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞を固定し、当該食細胞の細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、当該食細胞中に存在する外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、当該ＤＮＡにストリンジェントな条件下ハイブリダイゼーションできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行い、および得られたシグナルによって貪食済み外来微生物を検出および／または同定する、工程を含む、貪食済み外来微生物を検出および／または同定する方法。
【００２２】
12．外来微生物に対する食細胞機能の評価方法であって、項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞を固定し、当該食細胞の細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、当該食細胞中に存在する外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、当該ＤＮＡにストリンジェントな条件下ハイブリダイゼーションすることのできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行い、および得られたシグナルによって外来微生物に対する食細胞の食作用および／または殺傷能を同定する、工程を含む、外来微生物に対する食細胞機能の評価方法。
【００２３】
13．前記方法が、
(１) 固定化する食細胞の密度(ｘ個/ml)が、約５×106個/ml＜ｘ個/ml＜約１×108個/mlであること、
(２) 前記ＤＮＡ露出工程において、約１単位/ml〜約1,000単位/mlの力価のリゾスタフィンを使用すること、
(３) 前記ＤＮＡ露出工程において、約1,000単位/ml〜約1,000,000単位/mlの力価のリゾチームを使用すること、
(４) 前記ＤＮＡ露出工程において、約10単位/ml〜約10,000単位/mlの力価のＮ-アセチルムラミダーゼを使用すること、
(５) 前記ＤＮＡ露出工程において、約50単位/ml〜約500単位/mlの力価のザイモラーゼを使用すること、
(６) 前記in situハイブリダイゼーションの工程において、界面活性剤を使用すること、
(７) 前記検出用ＤＮＡプローブが、約350〜約600塩基長の鎖長を有する１種以上のＤＮＡプローブであること、および
(８) 前記検出用ＤＮＡプローブの濃度が、約0.1ng/μl〜約2.2ng/μlであること、の少なくとも１つの特徴を有する項目11または12に記載の方法。
【００２４】
14．前記ＤＮＡ露出工程において、リゾスタフィン、リゾチーム、Ｎ-アセチルムラミダーゼおよびザイモラーゼより選択される１以上の酵素が使用され、かつリゾスタフィンの力価が約10単位/ml〜約100単位/ml、リゾチームの力価が約10,000単位/ml〜約100,000単位/ml、およびＮ-アセチルムラミダーゼの力価が約100単位/ml〜約1,000単位/ml、ザイモラーゼの力価が約100単位/ml〜約500単位/mlである項目13に記載の方法。
【００２５】
15．前記ＤＮＡ露出工程において酵素が使用され、かつ、該酵素を反応させる温度が約26℃〜約59℃であり、該酵素を反応させる時間が約15分〜約120分である項目11乃至14のいずれかに記載の方法。
【００２６】
16．前記ＤＮＡ露出工程において、食細胞の形態を保持させる物質をさらに使用する項目11乃至15のいずれかに記載の方法。
【００２７】
17．前記物質が、フェニルメチルスルフォニルフルオライドである項目16に記載の方法。
【００２８】
18．前記フェニルメチルスルフォニルフルオライドの濃度が、約10μmol/l〜約10mmol/lである項目17に記載の方法。
【００２９】
19．前記物質が、ジメチルスルフォキシドにて溶解された物質である項目16乃至18のいずれかに記載の方法。
【００３０】
20．前記ジメチルスルフォキシドの濃度が、５％未満である項目19に記載の方法。
【００３１】
21．前記in situハイブリダイゼーションの工程において、ＤＮＡとＤＮＡプローブとが、界面活性剤の存在下でハイブリダイズされる項目11乃至20のいずれかに記載の方法。
【００３２】
22．前記界面活性剤が、アニオン界面活性剤である項目21に記載の方法。
【００３３】
23．前記アニオン界面活性剤が、ドデシル硫酸ナトリウムである項目22に記載の方法。
【００３４】
24．前記in situハイブリダイゼーション工程において、ハイブリダイズ反応させる温度が約25℃〜約50℃であり、ハイブリダイズ反応させる時間が約30分〜約900分である項目11乃至23のいずれかに記載の方法。
【００３５】
25．外来微生物に対する食細胞機能の評価方法であって、項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞を固定し、色素を用いて当該食細胞を染色し、貪食中または貪食後の細胞に特徴的な細胞形態を鏡検での観察によって検出することで、外来微生物に対する食細胞の食作用および／または殺傷能を同定する、工程を含む、外来微生物に対する食細胞機能の評価方法。
【００３６】
26．免疫機能の評価方法であって、被検者から食細胞を単離し、項目12乃至25のいずれかに記載の食細胞機能の評価方法を用いて該食細胞の機能を評価し、および、その評価結果を正常食細胞機能のものと比較することにより、被験者の免疫機能を評価する、工程を含む、免疫機能の評価方法。
【００３７】
27．前記免疫機能が、白血球による微生物貪食能である項目26に記載の方法。
【００３８】
28．前記免疫機能が、放射線照射または制癌剤投与後の患者の白血球による微生物貪食能である項目27に記載の方法。
【００３９】
29．食細胞への分化効率の評価方法であって、項目12乃至25のいずれかに記載の外来微生物に対する食細胞機能を評価し、および経時的に該食細胞機能を評価してその変化を同定する工程を含む、食細胞への分化効率の評価方法。
【００４０】
30．食細胞機能のモジュレーターによる効果を判定するための評価方法であって、食細胞機能モジュレーターの存在下および非存在下に外来微生物の懸濁液と食細胞とをインキュベートして食作用を許容し、および項目12乃至25のいずれかに記載の外来微生物に対する食細胞機能の評価方法を用いて、前記食細胞機能モジュレーターの存在下および非存在下における食細胞機能を比較する、工程を含む、食細胞機能のモジュレーターによる効果を判定するための評価方法。
【００４１】
31．食細胞機能のモジュレーターのスクリーニング方法であって、食細胞機能に対してモジュレーター作用を有することが推定される薬剤の存在下および非存在下に、外来微生物の懸濁液と食細胞とをインキュベートして食作用を許容し、および項目12乃至25のいずれかに記載の外来微生物に対する食細胞機能の評価方法を用いて、前記薬剤の存在下および非存在下における食細胞機能を比較する、工程を含む、食細胞機能のモジュレーターのスクリーニング方法。
【００４２】
32．臨床検査方法であって、被検者への薬剤投与前および投与後に該被検者より食細胞を取得し、項目12乃至25のいずれかに記載の食細胞機能の評価方法を用いて該食細胞の機能を評価し、およびその評価結果に基づいて判定される薬剤の効果から、薬剤投与計画を検討する、工程を含む、臨床検査方法。
【００４３】
33．食細胞を固定し、当該食細胞の細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、該食細胞中に存在する外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、該ＤＮＡにストリンジェントな条件下にてハイブリダイゼーションすることのできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行い、得られたシグナルにより食細胞機能を評価するための、(１) 外来微生物、(２) 前記ＤＮＡを露出させる工程において使用される、リゾスタフィン、リゾチーム、Ｎ-アセチルムラミダーゼおよびザイモラーゼからなるグループより選択される少なくとも１種以上の酵素、ならびに(３) １種以上の検出用ＤＮＡプローブを具備した食細胞機能を評価するためのキットの性能試験方法において、項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞を使用することを特徴とする食細胞機能の評価用キットの性能試験方法。
【００４４】
34．生体由来の食細胞を含む臨床検体より食細胞を得、得られた食細胞を固定し、該食細胞の細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、該食細胞中に存在すると予想される外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、該ＤＮＡにストリンジェントな条件下ハイブリダイゼーションすることのできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行い、得られたシグナルにより外来微生物を検出および／または同定するためのキットの性能試験方法において、項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞を使用することを特徴とする外来微生物の検出および／または同定用キットの性能試験方法。
【００４５】
35．前記性能試験が、感度試験、特異性試験または再現性試験である項目33または34に記載の性能試験方法。
【００４６】
36．項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞が、陽性コントロールとして使用される項目33または34に記載の性能試験方法。
【００４７】
37．前記固定工程の前に、外来微生物貪食済み食細胞を支持担体上に支持させる工程を含み、かつ当該支持担体が、３-アミノプロピルトリエトキシシランをコートしたスライドグラスである項目11乃至36のいずれかに記載の方法。
【００４８】
38．前記シグナルの検出の際に、シグナルと細胞のコントラストを明確にさせるための色素が使用される項目11乃至37のいずれかに記載の方法。
【００４９】
39．前記食細胞が、血液由来である項目11乃至38のいずれかに記載の方法。
【００５０】
40．項目１乃至５のいずれかに記載の外来微生物貪食済み食細胞を固定し、当該食細胞の細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、該食細胞中に存在する外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、該ＤＮＡにストリンジェントな条件下にてハイブリダイゼーションすることのできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行い、得られたシグナルにより食細胞機能を評価するためのキットであって、(１) 外来微生物、(２) 前記ＤＮＡ露出工程において使用される、リゾスタフィン、リゾチーム、Ｎ-アセチルムラミダーゼおよびザイモラーゼからなるグループより選択される少なくとも１種以上の酵素、ならびに(３) １種以上の検出用ＤＮＡプローブを具備する、食細胞機能を評価するためのキット。
【発明の効果】
【００５１】
上記した本発明の構成によって、所期の目的であった、in vitroにおいて食細胞の貪食機能を評価できる実験的モデルを実現した。  さらに、このモデルを利用することで、生体の免疫機能および食細胞への分化効率を評価する方法も確立された。
【発明を実施するための最良の形態】
【００５２】
本発明の一実施態様において、菌液濁度(O.D.=600nm)が、好ましくは、約0.01〜約0.03に調製された外来微生物と食細胞とをin vitroにおいて接触させ、該細胞を単離することにより外来微生物貪食済み食細胞を調製し、得られたこれら外来微生物貪食済み食細胞を、約１×104個/μl〜約５×104個/μlに調製することを特徴とする実験的モデル（以下、「貪食サンプル」と称す）を提供する。
【００５３】
ところで、本明細書で使用する「外来微生物貪食済み食細胞」の語は、既に外来微生物の貪食が完了した細胞のみならず、貪食中の細胞や細胞表面に外来微生物が付着して貪食を開始しようとしている細胞を含め、外来微生物に付着または外来微生物を包含しているものを指す。
【００５４】
本明細書で言う食細胞は、外来微生物をはじめとする異物を自身の細胞内に取り込むことのできる細胞であれば特に限定されるものではなく、例えば、マクロファージ、単球、好中球、好酸球などが挙げられる。  また、Ｕ937細胞、HL60細胞などの食細胞系も使用できる。
【００５５】
食細胞としては、例えば、血液、組織液、リンパ液、脳脊髄液、膿、粘液、鼻水、痰、尿、腹水などの体液等、または、透析排液もしくは、その他鼻腔、気管支、皮膚、各種臓器、骨などを洗浄した後の洗浄液にも生体由来の食細胞が含有されるため、これらからも調製することができる。  加えて、皮膚、肺、腎、粘膜などの組織からも、食細胞を調製することができる。  食細胞の一つであるマクロファージには、単球、肺胞マクロファージ、腹腔マクロファージ、固定マクロファージ、遊離マクロファージ、ハンゼマンマクロファージ、炎症性マクロファージ、肝クッパー細胞、脳ミクログリア細胞などの様々な形態に変化するため、血液のみならず、これらを含む組織も食細胞の供給源として用いることができる。  組織から食細胞を調製するためには、例えば、組織採取後に、トリプシン等の酵素を用いることにより細胞を剥離して該組織中に存在する食細胞を単離する。
【００５６】
体液等より食細胞(白血球)画分を取得するために、公知の方法を使用することができる。  例えば、ヘパリン加静脈血約５ml(白血球数の少ない場合には10ml)を採取し、この血液と血液分離試薬(塩化ナトリウム225mg、デキストラン(分子量：200,000〜300,000)1.5ｇ、滅菌精製水にて全量25mlに調製したもの)を、４：１程度の割合で混和した後、約10℃〜約40℃で、約15分〜約120分間、好ましくは37℃で約30分間静置することにより、白血球画分(上層)を取得することができる。
【００５７】
白血球は、上記得られた白血球画分を、０℃〜約20℃にて、約100〜約500×ｇで、約３分〜約60分間、好ましくは、４℃にて約140〜約180×ｇで10分間遠心分離することで得られる。  この時、赤血球が混入した場合には、溶血操作を行うのが好ましい。  例えば、白血球のペレットに滅菌精製水１mlを加えて懸濁し、直ちに過剰量のPBS（塩化ナトリウム18.24ｇ、リン酸一水素ナトリウム12水和物6.012ｇ、リン酸二水素ナトリウム２水和物1.123ｇ、滅菌精製水にて全量120mlにしたもの（PBS原液；以下、単に「PBS原液」と称する）を、滅菌精製水で20倍に希釈したもの；以下、単に「PBS」と称する）を加えて等張化した後、再度４℃下で、約140〜約180×ｇで10分間遠心分離すればよい。
【００５８】
感染症の原因ともなる外来微生物は、食細胞によって貪食される微生物であれば特に限定されなく、細菌、真菌、ウィルス、原虫、寄生虫等が含まれる。  細菌としては、例えば、ブドウ球菌、緑膿菌、腸球菌、大腸菌、連鎖球菌、肺炎球菌、結核菌、ヘリコバクター・ピロリ菌、リステリア、エルシニア、ブルセラ等が挙げられる。  真菌としては、例えば、カンジダ、アスペルギルス、アクチノミセス、コクシジオイデス、ブラスミセス等が挙げられる。  ウィルスとしては、例えば、インフルエンザウイルス、ポリオウイルス、ヘルペスウイルス、肝炎ウイルス、エイズウイルス等が挙げられる。  原虫としては、例えば、アメーバ赤痢、膣トリコモナス、マラリア、トキソプラズマ等が挙げられる。  寄生虫としては、トリパノゾーマ等が挙げられる。  特に、敗血症または菌血症の原因菌としては、例えば、グラム陽性菌であるスタフィロコッカス属（Staphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis）、エンテロコッカス属（Enterococcus faecalis、Enterococcus faecium、Streptococcus pneumoniae、Streptococcus pyogenes、Streptociccus agalactiae）、グラム陰性菌である大腸菌（Escherichia coli）、エンテロバクター（Enterobacter cloacae）、クレブシエラ（Klebsiella pneumoniae）等の大腸菌類縁腸内細菌群（Klebsiella oxytoca、Serratia marcesens、Proteus vulgaris、Citrobacter freundii）、好気性桿菌であるシュードモナス属（Pseudomonas aeruginosa）、嫌気性菌であるクロストリジウム菌（Clostridium perfringens）、バクテロイデス菌（Bacteroides fragilis）等が挙げられる。  まれに、Acinetobacter calcoaceticus、Aeromonas hydrophilia、Flavobacterium meningosepticum、Bacillus cereus等が原因となることもある。      
【００５９】
これらの内、特に、グラム陰性菌、あるいはスタフィロコッカス・アウレウス（Staphylococcus aureus）、スタフィロコッカス・エピデルミデス（Staphylococcus epidermidis）、エンテロコッカス・ファエカリス（Enterococcus faecalis）、シュードモナス・アエルギノーサ（Pseudomonas aeruginosa）、エシェリヒア・コリ（Escherichia coli）およびカンジダ・アルビカンス（Candida albicans）ならびにそれらの混合物よりなるグループから選択される１以上の微生物が、好適に用いられる。
【００６０】
食細胞に外来微生物を貪食させるためには、予め外来微生物を所定量にまで前培養し、増殖後に集めた微生物をPBSで懸濁した後に、PBSにて希釈して吸光度計により菌液の濁度(O.D.=600nm)を、約0.001〜約0.1、好ましくは、約0.01〜約0.03に調整し、作製した菌液は、別々の培養用フラスコに移し、約30分間室温で静置しておく。  ヘパリン加健常ヒト血液を採取し、前記血球分離試薬を４：１程度の割合で加え、約20〜約40℃、好ましくは、約37℃で、約30分間静置し、白血球画分を分取する。  分取した白血球画分をPBSにて懸濁する。  外来微生物を入れておいた培養用フラスコの上清を静かに捨て、PBSで希釈した白血球画分をフラスコに加え、室温で、約10分間静置する。  培養用フラスコ内の上清を捨て、フラスコの底に付着した白血球を、0.02％EDTA含有PBSを用いて遠沈管に回収し、例えば、４℃で、約140〜約180×ｇで10分間遠心分離し、白血球を収集する。  収集した白血球中に赤血球の混入が認められる場合には、滅菌精製水にて白血球の沈渣を穏やかに懸濁して溶血させた後、PBSを加えて等張化を行い、再度４℃で、約140〜約180×ｇで10分間遠心分離を行い、白血球を収集すればよい。  収集した白血球をPBSで懸濁し、血球計算盤にて細胞数を計測し、約１×104個/μl〜約５×104個/μlに調製する。
【００６１】
白血球を固定する方法として、例えば、カルノア固定を行うことができる。  具体的には、白血球を支持できる担体(支持担体)に白血球を支持せしめ、カルノア固定液(エタノール：クロロホルム：酢酸=６：３：１の容量比で混合した液）に約20分間程度浸した後、約50％〜約90％、好ましくは、約75％エタノール液に約５分間浸し、完全に風乾する。
【００６２】
前記支持担体は、不溶性素材のものが好ましく、例えば、ガラス、金属、合成樹脂（ポリスチレン、ポリエチレン、ポリプロピレン、ポリ塩化ビニル、ポリエステル、ポリアクリル酸エステル、ナイロン、ポリアセタール、フッ素樹脂など）、多糖類（セルロース、アガロースなど）が好ましい。
【００６３】
不溶性支持担体の形状としては、例えば、板状、トレイ状、球状、繊維状、棒状、盤状、容器状、セル、試験管等の種々の形状を用いることができる。  特に、本発明の実施態様として好ましい支持担体は、スライドグラスを使用するのが好ましい。  このようなスライドグラスとして、例えば、日本エアーブラウン社製のスライドグラス(商品番号MS311BL)が挙げられる。  このスライドグラス(商品番号MS311BL)には、直径５mmの円形ウェルが、14個設けられている。  また、実際に使用する際には、細胞の接着性を上げるため、３-アミノプロピルトリエトキシシラン(APS、SIGMA社)をスライドグラスにコートしたAPSコートスライドグラスを使用するのが好ましい。  その他、ポリ-Ｌ-リジンやゼラチンをコートしたスライドグラスも使用することができる。
【００６４】
APSコートスライドグラスを作製するには、まず、スライドホルダーにスライドグラス（商品番号MS311BL）を固定した後、希釈した中性洗剤で30分以上浸して洗浄し、水道水で洗剤を十分に取り除き、次に、スライドグラスを精製水にて洗浄し、高温（100℃以上）で十分に乾燥させた後、室温で放置冷却する。  その後、スライドグラスを２％APS含有アセトンに１分間浸し、直ちにアセトンおよび滅菌精製水で順次軽く洗浄した後に、風乾する。  さらに再度、スライドグラスを、約１〜約10％APS含有アセトンに１分間浸し、直ちにアセトンおよび滅菌精製水で順次軽く洗浄した後に、風乾する操作を行った後、約20℃〜約60℃、好ましくは約42℃で乾燥させることにより作製することができる。
【００６５】
白血球をAPSコートスライドグラスに支持させる際には、各ウェルに白血球が単層に広がるように塗抹し風乾するのが好ましい。  固定化する食細胞の密度（ｘ個/ml）が、約５×106個/ml＜ｘ個/ml＜約１×108個/ml、好ましくは、約１×107個/ml≦ｘ個/ml≦約５×107個/mlに調製されたものを使用することが好ましい。
【００６６】
また、このような１ml当たりの食細胞の密度の変化に対応して、APSコートスライドグラスに固定される１ウェル当たりの白血球の細胞数(ｙ個/ウェル(直径５mm))は、約2.5×104個/ウェル＜ｙ個/ウェル＜約５×105個/ウェル、好ましくは、約５×104個/ウェル≦ｙ個/ウェル≦約2.5×105個/ウェルとなるように調製するのが好ましい。  具体的には、白血球画分を、４℃にて、約140×ｇ〜約180×ｇで、約10分間遠心分離することによって得た白血球ペレットに、少量のPBSを加えて懸濁し、血球計算盤を用いて白血球数を計測する。  細胞数が、約５×104個/ウェル〜約2.5×105個/ウェルとなるようにPBSで調製した白血球懸濁液５μlを、APSコートスライドグラスの各ウェルに白血球が単層に広がるように塗抹し、完全に風乾することにより調製することができる。
【００６７】
食細胞膜の透過性を亢進させる処理として、約３〜約30分間PBSに浸し、その後、酵素前処理試薬（サポニン1.25g、ｔ-オクチルフェノキシポリエトキシエタノール（比重1.068〜1.075(20/４℃)、pH(５w/v%)5.5〜7.5）1.25ml、PBS原液25mlを混合し、滅菌精製水にて全量50mlに調製したもの)を、滅菌精製水で約２〜約50倍に希釈した溶液に浸し、振とう機で約３〜約30分間浸透する方法を用いることができる。
【００６８】
食細胞中に存在する感染症原因菌のＤＮＡを露出させる処理として、スライドグラス１枚につき酵素試薬(Ｎ-アセチルムラミダーゼ、リゾチームおよび／またはリゾスタフィン)に酵素試薬溶解液(フェニルメチルスルフォニルフルオライド(PMSF)含有ジメチルスルフォキシド(DMSO)をPBSで約100倍希釈して調製したもの)を１ml加えて酵素試液を調製した後、約20℃〜約60℃、好ましくは、約37℃〜約42℃の湿潤箱内で、この酵素試液１mlを白血球塗抹部位に滴下し、約10〜約60分間静置する。  その後、0.2mol/l塩酸含有PBS(PBS原液に塩酸を加え、滅菌精製水にて20倍希釈し、塩酸の終濃度を0.2mol/lに調製したもの)に浸し、そのまま振とう機上で、３〜30分間浸透することによって目的を達成できる。      
【００６９】
DMSOは５％以上の濃度でリゾチームおよびリゾスタフィンの活性を低下させる可能性があるため、５％未満の濃度で使用するのが好ましい。  食細胞の形態を保持させる物質としてのPMSF以外に他の公知のプロテアーゼ阻害剤、例えば、トシルリジンクロロメチルケトン(TLCK)およびそれらの混合物などを用いることもできる。  その際には、適宜DMSOなどの溶解剤を変更すれば良い。
【００７０】
酵素試薬として用いる各酵素の好ましい力価範囲は、Staphylococcus aureusの溶菌においては、リゾスタフィンの力価は１単位/mlで十分効果を示すが、Staphylococcus epidermidisの溶菌においては、10単位/ml以上のリゾスタフィン力価が必要であった。  ゆえに、リゾスタフィンの至適力価は、１単位/ml〜約1,000単位/ml、好ましくは、約10単位/ml〜約100単位/mlに設定するのが良い。  また、Enterococcus faecalisの溶菌においては、リゾチームの力価を約10,000単位/mlで固定したとき、Ｎ-アセチルムラミダーゼ力価が約10単位/ml以下では溶菌されなかった。  リゾチームについては、Ｎ-アセチルムラミダーゼ力価を100単位/mlに固定したとき、リゾチーム力価が1,000単位/ml以下では溶菌されなかった。  ゆえに、Ｎ-アセチルムラミダーゼの至適力価は、約10単位/ml〜約10,000単位/ml、好ましくは、約100単位/ml〜約1,000単位/ml、リゾチームの至適力価は、約1,000単位/ml〜約1,000,000単位/ml、好ましくは、約10,000単位/ml〜約100,000単位/mlに設定すると良い。  また、原因菌がCandida albicans等の真菌である場合には、ザイモラーゼ約50単位/ml〜約500単位/ml、好ましくは、約100単位/ml〜約500単位/mlの力価範囲にすると良い。  また、ザイモラーゼを使用する際には、特に、PMSFまたは公知のプロテアーゼ阻害剤を使用するのが好ましい。
【００７１】
また、グラム陽性菌とグラム陰性菌の成分の違い、すなわち、ペプチドグリカンまたはリポポリサッカライドの違いにより、適宜使用酵素を選択することができる。  特に、グラム陽性菌、グラム陰性菌にかかわらず、より効果的に溶菌させるには、２種類以上の酵素を併用すればよい。  本発明においては、リゾチーム、リゾスタフィンおよびＮ-アセチルムラミダーゼの３種を混合したものを使用することにより、単独の酵素によった場合と比較して溶菌活性が高まることが明らかとなった。
【００７２】
酵素処理温度は、Staphylococcus aureusは、好ましくは約４℃〜約60℃、Staphylococcus epidermidisは、約25℃より高く、好ましくは約37℃以上、また、Enterococcus faecalisでは、約25℃より高く約60℃未満、好ましくは約37℃〜約42℃とすれば良い。  ゆえに、至適酵素処理温度を、約37℃〜約42℃に設定するのが最も好ましい。  また、３種類の菌に対する共通の範囲の内、限界とされる温度は約26℃〜約59℃と予想できる。
【００７３】
また、酵素処理時間は、Staphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalisのいずれの貪食サンプルでも酵素処理時間20分以上(０分および10分においては不適であった)であり、また、白血球中に菌体は確認されなかったことから、少なくとも約15分以上、好ましくは約20分以上、さらに至適酵素処理時間を約30分〜約60分とするのが好ましい。  また、酵素処理時間を約15分〜約120分としてもよい。
【００７４】
また、Ｎ-アセチルムラミダーゼとは、Enterococcus faecalisの熱処理乾燥粉末とＮ-アセチルムラミダーゼを、２mmol/l 塩化マグネシウムを含む５mmol/l トリス塩酸緩衝液(pH 6.0)中で、37℃で、５分間反応させた場合、600nmの吸光度を下げる酵素である。  また、Streptococcus salivarius (IFO 3350)の熱処理細胞を、37℃、pH 7.0で１分間に１ug溶菌する酵素活性を１単位とした場合、2,000単位/mg以上のものを使用するのが好ましい。
【００７５】
リゾチームは、Micrococcus luteusとリゾチームをPBS内で、37℃で、５分間反応させた場合、600nmの吸光度を下げる酵素である。  また、Micrococcus luteusを、35℃、pH 6.2で１分間に540nmの吸収を0.001下げるときの酵素活性を１単位とした場合、50,000単位/mg以上のものを使用するのが好ましい。
【００７６】
リゾスタフィンは、Staphylococcus epidermidisとリゾスタフィンをPBS内にて37℃で５分間反応させた場合、600nmの吸光度を下げる酵素である。  また、Staphylococcus aureusを、37℃、pH 7.5で、10分間に620nmの吸収を0.240から0.125に下げるときの酵素活性を１単位とした場合、500単位/mg以上のものを使用するのが好ましい。
【００７７】
ザイモラーゼ（商品名：ザイモリエイス、生化学工業）とは、Arthrobacter lutesu1の培養液から調製された酵素であり、酵母生細胞の細胞壁に対して強い溶解活性を有している。  ザイモラーゼに含まれる細胞壁溶解に関わる必須酵素はβ-1,3-グルカン・ラミナリペンタオヒドロラーゼ(lanimaripentaohydrolase)であり、β-1,3-結合のグルコースポリマーに作用して、主生産物としてラミナリペンタオースを生成する。  ザイモリエイス-100Ｔは硫安分画により精製され、さらにアフィニティークロマトグラフィーにより精製され（Kitamura, K. et al. ; J. Ferment. Technol., 60, 257, 1982）、100,000単位/ｇの活性を有している。  しかしながら、この酵素の活性は、基質となる酵母の種類、培養条件および生育時期により変化することが知られている（Kitamura, K. et al. ; J. Gen. Appl. Microbiol., 20, 323, 1974、Kitamura, K. et al. ; Agric. Biol. Chem., 45, 1761, 1981、Kitamura, K. et al. ; Agric. Biol. Chem., 46, 553, 1982）。  ザイモリエイス-100Tには、β-１,３-グルカナーゼを約1.0×107単位/ｇ、プロテアーゼを約1.7×104単位/ｇ、マンナーゼを約6.0×104単位/ｇ含み、DNaseおよびRNaseは認められない（Kitamura, K. et al. ; J. Gen. Appl. Microbiol., 18, 57, 1972）。  また、ザイモリエイスの至適pHは、約5.5〜約8.5、好ましくは、約6.5〜約7.5であり、至適温度は、約25℃〜約55℃、好ましくは約35℃〜約45℃である。  さらに、酵母（対数増殖期細胞）に対する溶菌スペクトラム（属名）は、Ashbya、Candida、Debaryomyces、Eremothecium、Endomyces、Hansenula、Hanseniaspora、Kloekera、Kluyveromyces、Lipomyces、Helschkowia、Pichia、Pullularia、Torulopsis、Saccharomyces、Saccharomycopsis、Saccharomycodes、Schwanniomycesなどが挙げられる。  特に、カンジダ属として、カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ・トロピカリス(Candida tropicalis)、カンジダ・パラシロシス(Candida parasilosis)、カンジダ・ガラクタ(Candida galacta)、カンジダ・ギリエルモンジ(Candida guilliermondii)、カンジダ・クルセイ(Candida krusei)、クリプトコッカス・ネオフォーマンス(Cryptococcus neoformans)等が挙げられる。  本酵素の賦活剤として、SH化合物、例えば、システイン、２-メルカプトエタノール、ジチオスレイトールなどを用いることができる。  これらの属に属する菌も、本発明に使用できる。  この酵素は、ビール酵母懸濁液を基質として、約25℃で、２時間の内に、反応液（酵素：0.05〜0.1mg/ml溶液 １ml、基質：ビール酵母懸濁液(２mg乾燥重量／ml)３ml、緩衝液：Ｍ/15リン酸緩衝液（pH 7.5）５ml、滅菌精製水１mlで全量10mlに調製したもの）のA800が約30％減少するために必要な酵素活性を１単位とする。  ザイモリエイス-100Tは、100,000単位/ｇの活性を有している。
【００７８】
酵素試薬溶解液として用いるPMSF(プロテアーゼから白血球を保護してその形態を保持させるために添加)の濃度として、10μmol/l 以上の濃度で効果が認められ、0.1mmol/l 以上のPMSF濃度では、白血球の形態の劣化が完全に抑制されていたことから、10μmol/l〜10mmol/l、好ましくは0.1mmol/l〜１mmol/lの範囲であることが好ましい。  また、DMSOの濃度として、５％未満、好ましくは２％以下、さらには１％程度の濃度であることが好ましい。  ゆえに、酵素試薬溶解液は、0.1mol/l フェニルメチルスルフォニルフルオライド(PMSF)含有ジメチルスルフォキシド(DMSO)をPBSで100〜1,000倍希釈して調製したものであることが好ましい。
【００７９】
感染症原因菌のＤＮＡを露出させる工程の後に、細胞膜タンパク質のアセチル化の工程を挿入しても良い。  具体的には、アセチル化試薬(トリエタノールアミン7.46ｇ、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量50mlとしたもの)に無水酢酸を加え、滅菌精製水で約２倍〜約50倍希釈、好ましくは約10倍希釈し、無水酢酸の終濃度を0.1〜3.0％、好ましくは0.8％に調製したアセチレーション試薬にスライドグラスを浸し、振とう機上で５〜30分間振とうすることにより行うことができる。  その後、75％、85％、98％エタノールに、順次、２〜５分間ずつ浸し、完全に風乾させる。
【００８０】
また、細胞膜タンパク質のアセチル化工程の後に、感染症原因菌のＤＮＡをアルカリ処理することにより一本鎖ＤＮＡとする工程を挿入することもできる。  具体的には、スライドグラスを、約10mmol/l〜約300mmol/l、好ましくは、約70mmol/l水酸化ナトリウム含有PBS（PBS原液に水酸化ナトリウムを加え、滅菌精製水で20倍希釈し、水酸化ナトリウムの終濃度を70mmol/lに調製したもの）に約２〜約５分間浸すことにより行うことができる。  その後、75％、85％、98％エタノールに、順次、２〜５分間ずつ浸し、完全に風乾させる。
【００８１】
露出された感染症原因菌のＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイゼーションできる検出用ＤＮＡプローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行うには、例えば、プローブ希釈液にて調製した検出用ＤＮＡプローブを含有する液(プローブ液)を塗抹部位に塗布し、約25℃〜約50℃、好ましくは、約37℃〜約42℃の湿潤箱内で約１〜約３時間、好ましくは、約２時間静置させる。
【００８２】
その後、ハイブリダイゼーション洗浄液(ハイブリダイゼーション原液(塩化ナトリウム13.15ｇ、クエン酸三ナトリウム２水和物6.615ｇ、滅菌精製水にて全量75mlに調製したもの：以下、単に「ハイブリダイゼーション原液」と称する)を、ハイブリダイゼーション原液：滅菌精製水：ホルムアミド=５：45：50の割合で混合して調製したもの)を３つの染色ビンに用意し、順次、約35〜約45℃、好ましくは、約42℃で10分間ずつ浸す。  その後、PBSに浸し、そのまま振とう機上で約５〜約30分間振とうさせる。  詳細には、プローブ希釈液には、サケ精子DNA 600μl、100×デンハート溶液50μl、ハイブリダイゼーション原液500μl、ホルムアミド2250μl、50％硫酸デキストラン1000μlが含まれる。  プローブ液は各検出用ＤＮＡプローブ15ngを含むのが好ましく、プローブ希釈液にて全量50μlとするのが良い。
【００８３】
SA、SE、PA、EF、EKのプローブ濃度は、約0.6ng/μl〜約1.8ng/μl、好ましくは約0.6ng/μl〜約1.2ng/μlとするのが良い。  また、0.06ng/μlにおいては不適であり、0.6ng/μlにおいては適であったことから、少なくとも0.1ng/μl以上とするのが好ましい。  さらに、2.4ng/μlにおいては不適であり、1.8ng/μlにおいては適であったことから、2.2ng/μl以下とするのが好ましい。  また、陽性コントロールおよび陰性コントロールの至適濃度を、それぞれ0.4〜2.0ng/μlおよび0.6〜2.0ng/μl、好ましくは共通して0.6〜1.0ng/μlとするのが良い。
【００８４】
また、ハイブリダイゼーションを行う時間は、少なくとも30分以上、好ましくは60分以上、より好ましくは90分以上とするのが好ましい。  さらに好ましい至適ハイブリダイゼーション時間は、約120分〜約900分に設定すると良い。
【００８５】
また、in situハイブリダイゼーションの工程においてドデシル硫酸ナトリウム(SDS)などの界面活性剤を使用するのが、検出感度を高めることができる点から好ましい。  SDSの濃度は、１％以下が好ましく、より好ましくは約0.1％〜約0.5％、さらに好ましくは約0.25％とする。  SDSは、ハイブリダイゼーションの際に用いる溶液に添加されていればよく、プローブ希釈液またはプローブ液に事前に混合したものを用いてもよい。
【００８６】
さらに、検出用ＤＮＡプローブを、約350〜約600塩基長、好ましくは、約350〜約550塩基長の鎖長を有する１種以上のＤＮＡプローブとすることで、食細胞内にプローブを円滑に導入し、取り込まれている外来微生物の遺伝子への確実な接触が許容されるので好ましい。  対象となるプローブの塩基長(塩基対の数)が、必ず上記塩基長範囲に収まらなければならないことを意味するものではなく、プローブの塩基長の分布に、上記範囲の塩基長が含まれていればよいこととする。  これらプローブは、１種で用いても数種(１種以上)で用いても良い。  １種以上のプローブとは、一菌種に対しハイブリダイズできる複数種のプローブであっても良く、また、一菌種に対してプローブは１つであるが、菌種が複数種存在するためにプローブの種類が複数種となっていても良く、プローブの種類が１種以上であれば特に限定されない。
【００８７】
これらプローブは、食細胞自体といかようにもハイブリダイズしない配列を有するDNA断片を含むものとすることが好ましく、また他の種の菌に由来する遺伝子と交差ハイブリダイズするものであってはならない。  例えば、サブトラクション法を用いれば、短時間で特異プローブを作成することができる。  これらプローブは、フルオレセインイソチオシアネート(FITC）、ビオチン、ジゴキシゲニン(ジゴキシゲニン(DIG)-11-dUTP)等の非放射性同位体標識用物質を用い、定法のニックトランスレーションに従って、調製およびラベルするとよい。  プローブの鎖長は、ニックトランスレーション反応において添加するDNaseＩとＤＮＡポリメラーゼＩの量比を変化させることにより、最も効率よくラベルできるように制御することができる。  例えば、ＤＮＡプローブ(SA-24)２μgを効率よくラベル化し、また、外来微生物ＤＮＡと効率よくin situハイブリダイゼーションできるプローブ鎖長(約350〜約600の塩基長)に調節するには、全量100μlの反応液中に、10Ｕ/μlのＤＮＡポリメラーゼＩの２μlに対し、全量100μl中に約10〜約350mU、好ましくは、約25〜約200mU、より好ましくは約50〜約150mUとなるように調製されたDNaseＩの６μlが存在するようにすればよい。  このとき、各酵素の容量および反応液全量などは、上記必須至適反応条件の比率が一定である限り、適宜変更しても良い。  また、換言すれば、全量100μl中にＤＮＡポリメラーゼＩを20Ｕに対し、DNaseＩを約10〜約350mU、好ましくは、約25〜約200mU、より好ましくは、約50〜約150mUに調製すればよい。  さらに換言すれば、１単位のＤＮＡポリメラーゼＩに対し、約0.5/1,000〜約17.5/1,000、好ましくは、約1.25/1,000〜約10/1,000、より好ましくは、約2.5/1,000〜約7.5/1,000単位のDNaseＩを用いてニックトランスレーション反応を行うと良い。  また、ＤＮＡ１μgに対してみれば、ＤＮＡポリメラーゼＩを約10Ｕ、DNaseＩを約５〜約175mU、好ましくは、約12.5〜約100mU、より好ましくは、約25〜約75mUに調製すれば良い。  他のプローブについては、上記至適反応条件を参考にしてＤＮＡ量、ＤＮＡポリメラーゼＩおよびDNaseＩの至適反応条件を決定することができ、また、効率よくラベル化し、外来微生物ＤＮＡと効率よくin situハイブリダイゼーションできるプローブ鎖長(約350〜約600の塩基長)に調節することができる。
【００８８】
In situハイブリダイゼーションを行う際のストリンジェントな条件とは、例えば、ホルムアミドが約30％〜約60％、好ましくは、約50％の存在下、約30〜約50℃、好ましくは、約38〜約42℃でインキュベートし、その後、洗浄する条件である。
【００８９】
In situハイブリダイゼーションを行った後、ブロッキングの操作を行っても良い。  具体的には、湿潤箱内でスライドグラス１枚につきブロッキング試薬(ウサギ正常血清２ml、PBS原液0.5ml、滅菌精製水にて全量10mlに調製したもの)１mlを塗抹部位に滴下し、15〜60分間静置する。  その後、ブロッキング試薬を除去する。
【００９０】
菌由来の遺伝子(ゲノムDNAまたはRNA)とハイブリダイズした結果に生じるシグナルの検出のためには、定法の抗原−抗体反応等を利用した呈色反応を行うとよい。  すなわち、ハイブリダイゼーションを終えた試料を充分に洗浄した後に、ブロッキング操作を行い、次いで、抗FITC抗体、抗ジゴキシゲニン抗体などの接合物、例えば、アルカリホスファターゼ接合物を用いて処理し、次いで、接合物の発色系にてシグナルを発色し、ハイブリダイゼーションの状況を確認する。  例えば、プローブとして前記のジゴキシゲニン-11-dUTPでラベルしたものを用いた場合、抗ジゴキシゲニン−アルカリホスファターゼ接合物を用い、一般に使用されるアルカリホスファターゼに対する基質(ニトロブルーテトラゾリウムおよび５-ブロモ-４-クロロ-３-インドリルホスフェート等）を利用して検出すればよい。  次いで、呈色反応を行った後に洗浄した塗沫標本は、ナフトールブラック、Fast Green (20mg/50ml、Wako Chemicals社製)等で対比染色を行い、光学顕微鏡によって細胞内シグナルが観察される。
【００９１】
詳細には、ハイブリダイゼーションによるシグナルを得るには、例えば、検出用ＤＮＡプローブとしてジゴキシゲニン標識ＤＮＡプローブを用いる場合には、標識抗体(アルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体溶液1.05単位、バッファーＡ(トリエタノールアミン746mg、塩化ナトリウム17.5mg、塩化マグネシウム６水和物20.3mg、塩化亜鉛1.36mg、ウシ血清アルブミン1000mg、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量100mlに調製したもの)12.6μlにて全量を14μlに調製したもの)を標識抗体希釈液(トリス-(ヒドロキシメチル)-アミノメタン8.48mg、塩化ナトリウム6.14mg、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量0.7mlに調製したもの)で10〜200倍希釈、好ましくは50倍希釈した標識抗体液を調製し、この標識抗体液を塗抹部位に10μlずつ滴下し、15〜60分間静置すると良い。  その後、標識抗体洗浄液(ポリソルベート20 １ml、PBS原液50ml、滅菌精製水にて全量100mlに調製したもの)を２〜50倍、好ましくは、10倍に希釈した溶液に浸し、そのまま振とう機上で５〜30分間浸透する。  この操作を２回繰り返した後、発色前処理液１(トリス-(ヒドロキシメチル)-アミノメタン6.06ｇ、塩化ナトリウム2.92ｇ、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量50mlに調製したもの)と発色前処理液２(塩化マグネシウム６水和物5.08ｇ、滅菌精製水にて全量50mlに調製したもの)を等量混合し、滅菌精製水で５倍程度に希釈した発色前処理液に浸し、そのまま振とう機上で５〜30分間振とうすれば良い。  その後、スライドグラス１枚につき発色試薬(ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)/５-ブロモ-４-クロロ-３-インドリルフォスフェイト(BCIP))１mlを0.2μmシリンジトップフィルターを装着したディスポーザブルシリンジを用いてろ過しながら、スライドグラスの塗抹部位に滴下し、湿潤箱内で約10℃〜約45℃、好ましくは、約37℃で、約15〜約60分間遮光静置する。  その後、発色試薬洗浄液(トリス-(ヒドロキシメチル)-アミノメタン606mg、エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム２水和物186mg、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量50mlに調製したもの)を約２〜約50倍、好ましくは、約10倍に希釈した溶液に約２〜約10分間浸し、風乾した後、対比染色液(ファストグリーンFCF(食用緑色３号)50mg、滅菌精製水適量にて全量50mlに調製したもの)を２〜50倍、好ましくは10倍に希釈した溶液および、約0.1〜約５％、好ましくは約１％の酢酸溶液に浸す。  その後、前記発色試薬洗浄液を約２〜約50倍、好ましくは約10倍に希釈した溶液に再度浸して余分の前記対比染色液を洗い流し、完全に風乾すると良い。  また、上記発色試薬は、別々に調製したものであっても良い。
【００９２】
アルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体溶液は、ブロッティング用メンブレンにジゴキシゲニンラベルしたＤＮＡの１ngをブロットし、ブロッキング後、10,000倍に希釈したアルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体溶液で処理し、発色基質(NBT/BCIP)を反応させるとＤＮＡのブロッティング部位が発色し、ジゴキシゲニンラベルしていないＤＮＡで同様の操作をしても発色は認められないものを使用するのが好ましい。  また、抗ジゴキシゲニン抗体は、ヒツジ由来のものが好ましい。  詳細には、免疫したヒツジ血清より、イオン交換クロマトグラフィーと抗体カラムクロマトグラフィーで精製すると良い。
【００９３】
発色試薬（NBT/BCIP溶液、pH 9.0〜10.0）は、ニトロテトラゾリウムブルー(NBT)3.3mg、５-ブロモ-４-クロロ-３-インドリルフォスフェイト(BCIP)1.65mg、Ｎ,Ｎ-ジメチルホルムアミド99μg、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン121mg、塩酸適量、塩化ナトリウム58.4mg、塩化マグネシウム６水和物101.6mg、滅菌精製水適量にて全量10mlに調製したものであるのが好ましい。  この発色試薬としては、アルカリフォスファターゼをラベルしたタンパク質をブロッティング用メンブレンにブロットし、当該発色試薬でメンブレンを遮光室温で処理すると、ブロット部位に暗紫色のシグナルが現れるものを使用するのが好ましい。
【００９４】
上記した対比染色を行う場合に、シグナルと細胞のコントラストをさらに明確にさせるため、食用色素、例えば、黄色４号(タートラジン)を使用することができる。  その理由は、基質によって紫色が呈色し、ナフトールブラックによって青色に呈色することから、類似色のために対比染色しづらいことが挙げられる。  この方法を本発明に応用したところ、対比染色を行う際に有用であることが判明した。  食用色素を用いるという手法は、これまでに無かった方法である。
【００９５】
ジゴキシゲニンを標識化する方法として、ニックトランスレーション法を用いることができる。  その他に、PCR法、ランダムプライマーラベリング法、in vitroトランスクリプションラベリング法、ターミナルトランスフェラーゼラベリング法などを使用することができる。
【００９６】
判定は、光学顕微鏡で鏡検(×1,000)するときに、上述した対比染色液により染まった単一ウェル内の細胞に於いて、青紫色の発色が１つでも認められた場合に陽性と判定するのがよい。
【００９７】
また、検出用プローブの作成方法として、日本国特許第2558420号、特許第2798499号、特許第2965543号、特許第2965544号および特許第3026789号などを参照することができる。
【００９８】
例えば、ワーキングセルバンクから釣菌して培養するには、ワーキングセルバンク(SA-24)を滅菌シャーレに作製した50μg/mlアンピシリン含有のL-ブロス固形培地に、白金耳または使い捨てプラスチックループ等で画線塗抹する(釣菌)。
【００９９】
一晩培養した後に、シングルコロニーを採取し、50μg/mlアンピシリン含有のL-ブロス培地５mlに植菌して、37℃で終夜振とう培養する(前培養)。  前記培地400ml入り培養用フラスコに、前培養液を2.5mlずつ植菌して、約37℃で終夜振とう培養する(本培養)。
【０１００】
次に、SA-24プラスミドDNAを抽出するには、本培養した培養液を、４℃、4,000×ｇで10分間遠心分離して集菌する。  培養上清を取り除き、STE（10mmol/l トリス塩酸(pH 8.0)、１mmol/l エチレンジアミン-四酢酸２ナトリウム塩(EDTA)、0.1mmol/l 塩化ナトリウム）を20ml加えて菌体を再懸濁し、４℃、4,000×ｇで10分間遠心分離して集菌する。  10mg/mlリゾチームを含む溶液-１(50mmol/l グルコース、25mmol/l トリス塩酸(pH 8.0)、10mmol/l EDTA)５mlを加え、菌体を懸濁して室温で５分間放置する。  溶液-２(0.2mmol/l 水酸化ナトリウム、１％ドデシル硫酸ナトリウム(SDS))10mlを加え、転倒混和して氷上で10分間放置する。  氷冷した溶液-３(３mol/l 酢酸カリウム(pH 4.8)) 7.5mlを加え、転倒混和して氷上で10分間放置する。  高速冷却遠心機により、４℃、45,000×ｇで30分間遠心分離した後、上清を回収し、室温になるまで放置する。  放置した後、0.6容量(約24ml)のイソプロパノールを加え、転倒混和して室温で15分以上放置する。  高速冷却遠心機により、25℃、28,000×ｇで30分間遠心分離した後、上清を捨て、70％エタノールでペレットを洗浄して風乾する。  風乾後、TE(10mmol/l トリス塩酸(pH 8.0)、1mmol/l EDTA)を８ml加えて溶解する(プラスミドDNAの抽出）。
【０１０１】
次に、SA-24含有プラスミドＤＮＡの精製は、得られたプラスミドＤＮＡに、10mg/mlエチジウムブロマイド800μlおよび塩化セシウム8.6ｇを加え、転倒混和して溶解させる。      
【０１０２】
その溶解液を超遠心用チューブに入れ、キャップまたはシールをする。  垂直型ローターにより、20℃、500,000×ｇで５時間超遠心した後、紫外線ライト照射下で注射筒または注射針を使用してプラスミドＤＮＡのバンドを分取する。  分取したプラスミドＤＮＡ溶液に、等量のTE飽和 l-ブタノールを加えて転倒混和し、微量高速遠心機により、15,000×ｇで５分間遠心分離し、上清を取り除く。  この操作を繰り返し、プラスミドＤＮＡ溶液中のエチジウムブロマイドを取り除く。  次に、TEを加えて1.5mlとし、脱塩カラム(NAP-10)で脱塩する。  脱塩したプラスミドＤＮＡ溶液に３mol/l酢酸ナトリウム溶液を30μl加えて混和した後、３倍量の99.5％エタノールを加えて転倒混和し、−20℃で30分以上放置する。  放置後、微量冷却高速遠心機により、４℃、15,000×ｇで20分間遠心分離して上清を除いた後、冷70％エタノールを加えて懸濁し、再度、微量冷却高速遠心機により、４℃、15,000×ｇで20分間遠心分離して上清を除き、プラスミドＤＮＡの沈渣を減圧下乾固させる。  プラスミドＤＮＡに100μlのTEを加えて完全に溶解させ、260nmの吸光度で濃度を測定する(SA-24含有プラスミドＤＮＡの精製）。  その後、SA-24含有プラスミドＤＮＡの制限酵素処理およびアガロース電気泳動によるSA-24のサイズチェックを行う。
【０１０３】
SA-24含有プラスミドDNAの制限酵素処理およびアガロース電気泳動によるSA-24の精製を行うには、分子量チェックの終了したSA-24含有プラスミドDNA １mgを、制限酵素HindIII単独もしくは他の制限酵素と組み合わせ、37℃で1.5時間以上の反応により消化する。      
【０１０４】
プラスミドDNAを消化した後、反応液の一部を0.8％アガロースで電気泳動して、消化が完全に終了したことを確認する。  消化を確認した後、分取用の0.8％アガロースゲルで電気泳動し、SA-24のバンドを採取する。  採取したSA-24をアガロースゲルから抽出、精製して、吸光度計にて濃度を測定する。  精製したSA-24の一部を0.8％アガロースゲルで電気泳動し、シングルバンドであることを確認する。
【０１０５】
SA-24のラベル化を行うには、精製したSA-24の２μｇを用い、以下の表１に記載の組成を有する反応液において、ジゴキシゲニンラベルを施すとよい。
【０１０６】
【表１】
2008194057.tif 000003
【０１０７】
表１中、Ｘは、プローブ原液の濃度に応じて上記好ましいプローブ濃度となるように添加することができる容量であり、この容量に伴い精製水量Ｙを決定して最終容量を調整する。
【０１０８】
ラベル化後、反応液にTEを100μl加えて反応を停止させる。  反応停止液をスピンカラムに注入し、４℃、380×ｇで10分間遠心分離して、遊離のヌクレオチドを除く。  次に、溶出液の濃度を吸光度計により測定し、TEで10ng/μlに調製する。
【０１０９】
ラベル化を確認するには、ラベルしたSA-24の0.5μlをメンブレンに滴下し、風乾する。  ブロッキング試薬にメンブレンを浸し、室温で30分間ブロッキングする。  0.1mol/l トリス塩酸(pH 7.5）、0.15mol/l塩化ナトリウムで5,000倍に希釈したアルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体溶液に、メンブレンを室温で30分間浸す。  0.1mol/lトリス塩酸(pH 7.5）、0.15mol/l 塩化ナトリウムにメンブレンを浸し、室温で10分間振とうして２回洗浄する。  0.5mol/lトリス塩酸(pH 9.5）、0.15mol/l塩化ナトリウム、50mmol/l塩化マグネシウムに、メンブレンを室温で10分間浸す。  発色試薬にメンブレンを室温で遮光下、10分間浸す。  メンブレンをTEに浸し、発色を停止させる。  スポット下部分の青紫色の発色で、ラベル化の確認を行う。
【０１１０】
スピンカラムを作製するには、１mlのディスポーザブルシリンジに、少量の滅菌済みグラスウールを充填する。  １mmol/l トリス塩酸(pH 7.5）、１mmol/lのEDTA、0.1％SDSで膨潤させたセファデックスＧ-50をシリンジにつめる。  15mlのディスポーザブルコニカルチューブにシリンジを入れ、４℃、320×ｇで10分間遠心分離し、余分の緩衝液を落とす。  ディスポーザブルコニカルチューブからシリンジを抜き、排出された緩衝液を捨てた後、1.5mlのエッペンドルフ型チューブをディスポーザブルコニカルチューブの底に入れ、その上にシリンジを入れて作製する。
【０１１１】
プローブの特異性を確認するため、以下の手順に従って、ドットブロットハイブリダイゼーションを行うとよい。
【０１１２】
まず、スポットした各ゲノムDNAを変性するために、定法に従い0.5mol/l 水酸化ナトリウム、1.5mol/l 塩化ナトリウム溶液で飽和した濾紙(ワットマン社製３MM)上に、調製した各種細菌ゲノム100ngをナイロンメンブレン(ポールバイオダインタイプＢ、日本ポール社製)にスポットし、風乾したメンブレンを10分間静置する。  次に、0.5mol/l トリス塩酸(pH 7.5）、1.5mol/l 塩化ナトリウム溶液で飽和した前出の濾紙上に10分間静置して変性ＤＮＡを中和する。  さらに、２×SSC(Standard Saline Citrate)溶液で飽和した前記濾紙上に５分間静置し、リンスする。  その後、メンブレンを風乾し、２×SSC溶液にメンブレンを浸し、５分間浸透する。  定法に従い、プラスチックバッグ内でプレハイブリタイゼーション溶液にメンブレンを浸し、42℃、60分間親和させる。  プラスチックバッグ内で、プローブ400ngを含むハイブリタイゼーション溶液15ml内にメンブレンを浸し、42℃で、一晩反応させる。  次に、２×SSC、0.1％SDS(ドデシル硫酸ナトリウム)溶液にメンブレンを浸し、５分間洗浄する(２回繰り返す）。  その後、0.1×SSC、0.1％SDS溶液にメンブレンを浸し、60℃、10分間洗浄する(３回繰り返す）。  ２×SSC溶液にメンブレンを浸し、５分間洗浄する。  メンブレンを３％ウシ血清アルブミン、１％ブロッキングバッファー(ベーリンガー社製）、0.1mol/l トリス塩酸(pH 7.5）、0.15mol/l塩化ナトリウム溶液にメンブレンを浸し、30分間おだやかに振とうする。  その後、アルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体（ベーリンガー社製）を、0.1mol/l トリス塩酸(pH 7.5）、0.15mol/l 塩化ナトリウム溶液で5,000倍希釈した溶液にメンブレンを浸し、30分間おだやかに振とうする。  次に、0.1mol/lトリス塩酸(pH 7.5）、0.15mol/l 塩化ナトリウム溶液にメンブレンを浸し、15分間振とうする(２回）。  0.1mol/l トリス塩酸(pH 9.5）、0.1mol/l 塩化ナトリウム、５mmol/l 塩化マグネシウム溶液にメンブレンを浸し、５分間振とうする。  NBT-BCIP溶液(GIBCO BRL社製)にメンブレンを浸し、遮光下で発色反応させる。  TE(10mmol/l トリス塩酸（pH 8.0）、１mmol/l EDTA)にメンブレンを浸し、発色反応を止め、風乾する。  プレハイブリダイゼーション溶液およびハイブリダイゼーション溶液を、以下の表２に示す。
【０１１３】
【表２】
2008194057.tif 000004
【０１１４】
In situハイブリダイゼーションの工程において使用される界面活性剤としては、公知の界面活性剤が使用できる。  界面活性剤は、アニオン界面活性剤、非イオン性界面活性剤、カチオン界面活性剤および両性界面活性剤に大別される。
【０１１５】
アニオン界面活性剤は、陰イオン界面活性剤とも呼ばれ、水中で電離して有機陰イオンとなるものである。  界面活性剤の分子中の親油基をＲとして表現すると、RCOONa、RSO3Na、RSO4Naなどがある。  RCOONaのように弱酸性基を含有する界面活性剤の水溶液は加水分解しやすく弱アルカリ性であるが、RSO3Na、RSO4Naなどの強酸性基を有する界面活性剤の水溶液は加水分解を受けにくく、中性となる。  陰イオン性であるから、多量の陽イオン性物質の存在で界面活性を失うことがあり、また強酸性にした時にも失活する。
【０１１６】
非イオン性界面活性剤は、親水基が非イオン性のものをいう。  親水基として酸化エチレン基(-CH2CH2O-)が多用され、この基の数が多くなる程親水性が増す。  反対に、親油基の炭素数が増加すると、親油性が増加する。  従って、親水性・親油性を様々に変化させた界面活性剤が得られるのが特徴である。  非イオン性界面活性剤は、水中で電離せず、無機塩の影響も受けにくいため、生体に及ぼす作用も少ない。  しかも、洗浄作用は、強力で、泡立ちは比較的少ない為、洗剤のみならず、医薬品、化粧品、食品などに広く使用される。  水溶性の非イオン性界面活性剤は温度が上昇すると、ある温度で水に溶解しにくくなり、水溶液が濁り出すが、これは親水基と水との水素結合が切断されるために生じる。
【０１１７】
カチオン界面活性剤は、陽イオン界面活性剤ともいう。  水中で、電離して有機陽イオンとなるものである。  カチオン界面活性剤は、一般に洗浄作用は大きくはないが、細菌などのアニオン性のものと強く結合するため、殺菌作用が大きい。  また、繊維やプラスチックの帯電防止能もある。  カチオン界面活性剤の代表的なもので、ドデシルトリメチルクロリド［C12H25(CH3)3N］Clは水溶性であるが、ジドデシルジメチルアンモニウムクロリド［(C12H25)2(CH3)2N］Clは水に溶解しにくく、水中では２分子膜状のベシクルを形成し、ベンゼンには溶解する。
【０１１８】
両性界面活性剤は、分子内にアニオン基とカチオン基の両者を併せ持っている界面活性剤である。  水溶液中での電離状態はアミノ酸に類似しており、両性界面活性剤には、アミノ酸誘導体が多く存在する。  従って、アミノ酸と同様に等電点を有し、等電点よりアルカリ性側ではアニオン界面活性剤として、酸性側ではカチオン界面活性剤として作用する。  等電点で水溶性は最低となり、表面張力も最も低下する。  両性界面活性剤は、殺菌剤、帯電防止剤などに用いられる。
【０１１９】
また、アニオン界面活性剤は、カルボン酸型、スルホン酸型、硫酸エステル型およびリン酸エステル型に分けられ、非イオン性界面活性剤は、エステル型、エーテル型、エステルエーテル型およびアルカノールアミド型に分けられる。  カチオン界面活性剤は、アルキルアミン塩型および第四級アンモニウム塩型に分けられ、両性界面活性剤は、カルボキシベタイン型、２-アルキルイミダゾリンの誘導型およびグリシン型に分けられる。
【０１２０】
さらに、アニオン界面活性剤のカルボン酸型は、脂肪酸モノカルボン酸塩、Ｎ-アシルサルコシン塩およびＮ-アシルグルタミン酸塩に細分される。  それぞれの代表例として、脂肪酸モノカルボン酸塩には、ラウリン酸ナトリウムおよび薬用せっけんがあり、Ｎ-アシルサルコシン塩は、Ｎ-ラウロイルサルコシンナトリウム、Ｎ-アシルグルタミン酸塩にＮ-ラウロイルグルタミン酸二ナトリウムがある。  また、スルホン酸型は、ジアルキルスルホコハク酸塩、アルカンスルホン酸塩、アルファオレフィンスルホン酸塩、直鎖アルキルベンゼンスルホン酸塩、アルキル(分岐鎖) ベンゼンスルホン酸塩、アルキルナフタレンスルホン酸塩、ナフタレンスルホン酸塩-ホルムアルデヒド縮合物およびＮ-メチル-Ｎ-アシルタウリン塩に細分される。  代表例として、ジアルキルスルホコハク酸塩は、ジオクチルスルホコハク酸ナトリウム、アルカンスルホン酸塩は、ドデカンスルホン酸ナトリウム、直鎖アルキルベンゼンスルホン酸塩には直鎖ドデシルベンゼンスルホン酸ナトリウム、アルキル(分岐鎖) ベンゼンスルホン酸塩はドデシルベンゼンスルホン酸ナトリウム、アルキルナフタレンスルホン酸塩はブチルナフタレンスルホン酸ナトリウム、Ｎ-メチル-Ｎ-アシルタウリン塩にはＮ-メチル-Ｎ-ステアロイルタウリンナトリウムがある。  また、硫酸エステル型は、アルキル硫酸塩、ポリオキシエチレンアルキルエーテル硫酸塩および油脂硫酸エステル塩に細分される。  代表例として、アルキル硫酸塩は、ドデシル硫酸ナトリウム、ラウリル硫酸ナトリウムおよびセチル硫酸ナトリウム、ポリオキシエチレンアルキルエーテル硫酸塩はポリオキシエチレンラウリルエーテル硫酸トリエタノールアミンがある。  また、リン酸エステル型は、アルキルリン酸塩、ポリオキシエチレンアルキルエーテルリン酸塩およびポリオキシエチレンアルキルフェニルエーテルリン酸塩に細分される。  代表例を挙げると、アルキルリン酸塩には、モノラウリルリン酸二ナトリウムがある。  ポリオキシエチレンアルキルエーテルリン酸塩には、リン酸ナトリウムポリオキシエチレンラウリルエーテルおよびリン酸ポリオキシエチレンオレイルエーテル(8MOL)がある。
【０１２１】
非イオン性界面活性剤のエステル型は、脂肪酸グリセリン、脂肪酸ソルビタンおよび脂肪酸ショ糖エステルに細分される。  それぞれの代表例として、脂肪酸グリセリンは、モノステアリン酸グリセリン、脂肪酸ソルビタンは、モノステアリン酸ソルビタン、トリオレイン酸ソルビタン、セスキオレイン酸ソルビタン、モノラウリン酸ソルビタン、ポリソルベート20(ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル）、ポリソルベート60およびポリソルベート80、脂肪酸ショ糖エステルはステアリン酸ショ糖エステルがある。  また、エーテル型は、ポリオキシエチレンアルキルエーテル、ポリオキシエチレンアルキルフェニルエーテルおよびポリオキシエチレンポリオキシプロピレングリコールに細分される。  代表例を挙げると、ポリオキシエチレンアルキルエーテルとして、ポリオキシエチレンラウリルエーテル、ポリオキシエチレンステアリルエーテルおよびポリオキシエチレンセチルエーテルがあり、また、ポリオキシエチレンアルキルフェニルエーテルとして、ポリオキシエチレンノニルフェニルエーテルおよびポリオキシエチレンオクチルフェニルエーテルがある。  また、エステルエーテル型は、脂肪酸ポリエチレングリコールおよび脂肪酸ポリオキシエチレンソルビタンに細分される。  それそれの代表例は、脂肪酸ポリエチレングリコールは、オレイン酸ポリエチレングリコール、脂肪酸ポリオキシエチレンソルビタンには、パルミチン酸ポリオキシエチレンソルビタンおよびポリオキシエチレンソルビタンモノラウレートがある。  また、アルカノールアミド型は、脂肪酸アルカノールアミドの１つのみである。  代表例は、ラウリン酸ジエタノールアミドである。
【０１２２】
カチオン界面活性剤のアルキルアミン塩型には、モノアルキルアミン塩、ジアルキルアミン塩およびトリアルキルアミン塩があり、代表例は、モノステアリルアミン塩酸塩である。  また、第四級アンモニウム塩型は、塩化(または臭化、沃化)アルキルトリメチルアンモニウム、塩化(または臭化、沃化)ジアルキルジメチルアンモニウムおよび塩化アルキルベンザルコニウムに細分される。  それぞれの代表例は、塩化(または臭化、沃化)アルキルトリメチルアンモニウムとして、塩化ステアリルトリメチルアンモニウム、塩化(または臭化、沃化)ジアルキルジメチルアンモニウムとして、塩化ジステアリルジメチルアンモニウム、塩化アルキルベンザルコニウムは塩化ラウリルベンザルコニウムがある。
【０１２３】
両性界面活性剤のカルボキシベタイン型は、アルキルベタインの１つのみである。  代表例は、ラウリルベタインである。  また、２-アルキルイミダゾリンの誘導型は、２-アルキル-Ｎ-カルボキシメチル-Ｎ-ヒドロキシエチルイミダゾリニウムベタインの１つのみである。  代表例として、２-ウンデシル-Ｎ-カルボキシメチル-Ｎ-ヒドロキシエチルイミダゾリニウムベタインが挙げられる。  また、グリシン型は、アルキル(又はジアルキル)ジエチレントリアミノ酢酸があり、代表例として、ジオクチルジエチレントリアミノ酢酸が挙げられる。
【０１２４】
さらに、上記代表例に加えて、Triton X-100、ラウリルサルコシン、サポニン、BRIJ35、アルキルアリルポリエーテルアルコール、高級アルコール硫酸化物、Ｎ-ココイル-Ｌ-アルギニンエチルエステルDL-ピロリドンカルボン酸塩、Ｎ-ココイル-Ｎ-メチルアミノエチルスルホン酸ナトリウム、コレステロール、自己乳化型モノステアリン酸グリセリン、スクワラン、ステアリルアルコール、ステアリン酸ポリオキシル40、セタノール、セトマクロゴール1000、セバシン酸ジエチル、ノニルフェノキシポリオキシエチレンエタン硫酸エステルアンモニウム、ポリオキシエチレンオレイルアミン、ポリオキシエチレンソルビットミツロウ、ポリオキシル35ヒマシ油、マクロゴール400、Ｎ-ヤシ油脂肪酸アシルＬ-アルギニンエチル・DL-ピロリドンカルボン酸塩、ラウリルジメチルアミンオキシド液、ラウロマクロゴール、メチルセルロース、CMC(カルボキシメチルセルロース）、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油20およびポリオキシエチレン硬化ヒマシ油60、CHAPS、デオキシコール酸、ジギトニン、ｎ-ドデシルマルトシド、ノニデットP40、ｎ-オクチルグルコシド、オクチルチオグルコシド、ラウリル酸シュクロース、ドデシルポリ(エチレングリコールエーテル)ｎ,ｎ-ドデシル-Ｎ,Ｎ-ジメチル-３-アンモニオ-１-プロパンスルフォネート等も挙げることができる。
【０１２５】
上掲の各種界面活性剤は、in situハイブリダイゼーションの工程で使用されることが重要であり、その使用方法は特に限定されない。  例えば、プローブ液またはプローブ希釈液中に混合されていても良いし、プローブ液とは別に調製した界面活性剤を含有する溶液を、プローブ液を塗抹部位に塗布する前、同時または後に添加しても良いし、当業者は適宜変更することができる。
【０１２６】
なお、本発明において、陽性コントロールプローブが必要であれば、次のように作製することができる。  例えば、まず、Ｕ937細胞(ATCC CRL-1593.2)のゲノムDNAの抽出と精製を行うには、37℃、５％炭酸ガスインキュベーター内で、細胞培養フラスコ(175cm2)内のRPMI1640培地(25ml)を用い、Ｕ937細胞を培養する。  Ｕ937培養液を50mlの遠沈管に入れ、４℃、220×ｇで10分間遠心分離し、Ｕ937細胞を回収する。  細胞を10mlのPBSで懸濁洗浄し、再度４℃、180×ｇで10分間遠心分離し、細胞を回収する。  その後、上清を捨て、細胞を１mlの200μg/mlプロテネースＫ含有１％SDS含有TE溶液で懸濁し、37℃で30分間放置する。  フェノール抽出を３〜４回線り返し、除蛋白を行う。  エタノール沈殿により析出したゲノムを回収し、500μlの2.5μgリボヌクレアーゼ含有滅菌精製水に溶解し、42℃で30分間放置する。  フェノール抽出を２〜３回繰り返し、除蛋白を行う。  エタノール沈殿により析出したゲノムを回収し、500μlのTEに溶解する。  その後、吸光度計により濃度を測定し、ジゴキシゲニンラベルに供することにより、陽性コントロールプローブを作製することができる。  また、陽性コントロールプローブは、Ｕ937ゲノムを100ngスポットしたメンブレンに、陽性コントロールプローブをドットハイブリダイゼーションするとき、ハイブリッド形成が確認できるものを用いるのがよい。  陰性コントロールプローブが必要であれば、公知の方法で作製することができる。
【０１２７】
貪食サンプルの調製
以下に、本発明の貪食済み食細胞（以下、「貪食サンプル」と称する）を作製する具体的な方法を例示する。
【０１２８】
使用材料としては、Ｕ937細胞(ヒト単球株化細胞：ATCC CRL-1593.2）、Staphylococcus aureus (ATCC 126000)、Staphylococcus epidermidis (ATCC 14990)、Pseudomonas aeruginosa (ATCC 10145)、Enterococcus faecalis (ATCC 19433)、Escherichia coli (ATCC 11775)、ヘパリン加健常人血液、ブレインハートインフュージョン(BHI)(DIFCO社製）、Fetal Bovine Serum(終濃度10％、GIBCO社製)およびAntibiotic-Antimycitic(終濃度１％、GIBCO社製)を含有するRPMI 1640（RPMI培地1640(GIBCO社製))などが必要である。
【０１２９】
使用機器としては、炭酸ガスインキュベーター(タパイエスベツク製：BNA-121D型）、冷却低速遠心機(ベツクマン製：CS-6KR型）、血球計算盤(エルマ製：ブライトーライン型)、振とう培養器(タイテック製：BR-300L型）、吸光度計(ベツクマン製：DU68型）、恒温器(ヤマト科学製：IC-62型)、落射型倒立顕微鏡(ニコン製：DIAPHOT型）、蛍光顕微鏡(ニコン製：OPTIPHOT型）、CCDカメラ(浜松フォトニクス製：C5810-01型)などが必要である。
【０１３０】
まず、Ｕ937細胞の調製は、約20〜約40℃、好ましくは、約37℃の５％炭酸ガスインキュベーター内で、細胞培養フラスコ(例えば、175cm2)中のRPMI 1640培地でＵ937細胞(ヒト単球株化細胞、ATCC CRL-1593.2)を培養する。  細胞培養フラスコは、細胞が接着しやすい成分からなる物質を含むものが好ましい。  次に、Ｕ937細胞培養液を遠沈管に入れ、０℃〜約10℃、好ましくは、約４℃、約150〜約350×ｇ、好ましくは、約220×ｇで約10分間遠心分離し、Ｕ937細胞を回収した。  その後、回収したＵ937細胞をPBSで懸濁し、血球計算盤で細胞数を計算し、細胞数を約１×104個/μl〜２×104個/μlに調製するとよい。
【０１３１】
細菌貪食サンプルを調製するには、Staphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Pseudomonas aeruginosa、Enterococcus faecalisおよびEscherichia coliをBHI培養液(前出)に植菌し、約20〜約40℃、好ましくは、約37℃で、６時間以上培養する。  培養した菌液を、０〜約10℃、好ましくは、４℃、例えば、2,000×ｇで約10分間遠心分離して集菌する。  上清を捨てた後、菌のペレットをPBSを用いて懸濁し、再度４℃で、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌するのが好ましい。  集菌した菌をPBSで懸濁した後、PBSにて希釈して吸光度計により菌液の濁度(O.D.=600nm)を、約0.001〜約0.1、好ましくは、約0.01〜約0.03、特に、Staphylococcus aureusは、約0.01〜約0.03、Staphylococcus epidermidisは、約0.01〜約0.03、Pseudomonas aeruginosaは、約0.02〜約0.03、Enterococcus faecalisは、約0.01〜約0.03、Escherichia coliは、約0.02〜約0.03にそれぞれ調製したものを作製するとよい。  作製した菌液は、別々の培養用フラスコに移し、約30分間室温で静置した。  ヘパリン加健常ヒト血液を採取し、前記血球分離試薬を４：１程度の割合で加え、約20〜約40℃、好ましくは、約37℃で30分間静置し、白血球画分を分取する。  分取した白血球画分をPBSにて懸濁する。  培養用フラスコの上清を静かに捨て、PBSで希釈した白血球画分をフラスコに加え、室温で約10分間静置する。  培養用フラスコ内の上清を捨て、フラスコの底に付着した白血球を、0.02％EDTA含有PBSを用いて遠沈管に回収し、例えば、４℃、約140〜約180×ｇで10分間遠心分離し、白血球を収集する。  収集した白血球中に赤血球の混入が認められる場合には、滅菌精製水にて白血球の沈渣を穏やかに懸濁して溶血させた後、PBSを加えて等張化を行い、再度４℃で、約140〜約180×ｇで10分間遠心分離を行い、白血球を収集すればよい。  収集した白血球をPBSにて懸濁し、血球計算盤にて細胞数を計測し、約１×104個/μl〜約５×104個/μlに調製する。      
【０１３２】
これら貪食サンプルを、それぞれSA貪食サンプル、SE貪食サンプル、PA貪食サンプル、EF貪食サンプル、EK貪食サンプルとする。
【０１３３】
塗抹固定を行うには、調製したＵ937細胞と、上記のようにして作製した各細菌貪食サンプルをAPSコートスライドグラスの各ウェルに塗抹し、風乾させる。  各細菌貪食サンプルのスライドグラスに塗抹固定する細胞数は、約5.0×104〜約2.5×105個/ウェル、Ｕ937細胞の細胞数は、約5.0×104〜約1.0×105個/ウェルとするのが好ましい。  固定は、カルノア固定液（前出）に20分間浸した後、75％エタノールに５分間浸し、カルノア固定液を洗浄して風乾させた後、試験に使用するまで４℃で保存すると良い。
【０１３４】
貪食率の測定は、スライドグラスに塗抹固定した細菌貪食サンプルをアクリジンオレンジ染色液で染色し、蛍光顕微鏡(×1,000)で無作為に細胞約200個を計測する。  計測した細胞の中で、細胞内に細菌を貪食している細胞を陽性細胞とし、以下の数式に従って貪食率(％)を算出する。
【０１３５】
【数１】
2008194057.tif 000005
【０１３６】
図６に、調製および鏡検にて観察した貪食細胞の様子を示している。  なお、カルノア固定、白血球細胞膜の透過性亢進処理、溶菌処理、細胞膜タンパク質のアセチル化、菌体ＤＮＡのアルカリ処理、in situハイブリダイゼーション、ブロッキング、標識抗体との反応、検出、判定に至る具体的操作方法は、本明細書に記載した方法を用いると良い。
【０１３７】
また、本発明には、外来微生物貪食済み食細胞を固定し、該食細胞膜の透過性を亢進させる処理を施し、該食細胞中に存在する外来微生物のＤＮＡを露出させる処理を施し、該ＤＮＡにストリンジェントな条件下にてハイブリダイゼーションできる検出用ＤＮＡプローブを用いて界面活性剤の存在下にin situハイブリダイゼーションを行い、得られたシグナルにより食細胞機能を評価するためのキットであって、(１) 外来微生物、(２) ＤＮＡ露出工程において使用される、リゾスタフィン、リゾチーム、Ｎ-アセチルムラミダーゼおよびザイモラーゼからなる群より選択される少なくとも１種以上の酵素、ならびに(３) １種以上の検出用ＤＮＡプローブを具備する、食細胞機能を評価するためのキットも含まれる。
【０１３８】
このキットには、下記実施例にも示したように、血液分離試薬、酵素前処理試薬、酵素試薬、アセチル化試薬、プローブ液、ブロッキング試薬、標識抗体、標識抗体希釈液、発色前処理液-１、発色前処理液-２、発色試薬、対比染色液、PBS原液、ハイブリダイゼーション原液、標識抗体洗浄液、発色試薬洗浄液、APSコートスライドグラス、プローブ希釈液、バッファーＡ等が含まれる。  これらのうち、少なくとも酵素試薬、プローブ液を含むことが好ましい。  また、本発明に使用する各種試薬、例えば、クロロホルム、エタノール、無水酢酸、DMSO、PMSF、ホルムアミド、酢酸、塩酸、水酸化ナトリウム等を含んでいてもよい。  さらに、低速遠心機、恒温機、血球計算盤、振とう機、湿潤箱、恒温槽、光学顕微鏡、可変式ピペット、採血管、チップ、ピペット、染色ビン、メスシリンダー、注射筒、0.2μmシリンジトップフィルターの器具機械を含んでいても良い。
【０１３９】
また、本発明は、生体由来の食細胞を含む臨床検体中に含まれる、食細胞によって貪食された外来微生物の遺伝子をモニターする方法を提供する。  さらに、本発明は、原因菌の候補となる微生物の遺伝子を同定する工程を含み、同定された結果に基づいて敗血症原因菌または菌血症原因菌が特定されることを特徴とする方法を提供する。
【０１４０】
ここで使用することができる臨床検体としては、生体由来の食細胞が含まれる臨床検体であれば良く、例えば、血液、組織液、リンパ液、脳脊髄液、膿、粘液、鼻水、痰などの体液が挙げられる。  また、糖尿病、腎障害、肝障害などの病態によっては、尿、腹水、透析排液など、その他鼻腔、気管支、皮膚、各種臓器、骨などを洗浄した後の洗浄液にも生体由来の食細胞が含有されるため、これらも本発明の臨床検体として用いることができる。加えて、皮膚、肺、腎、粘膜などの組織も本発明の臨床検体として用いることができる。  これは、食細胞の一つであるマクロファージには、単球、肺胞マクロファージ、腹腔マクロファージ、固定マクロファージ、遊離マクロファージ、ハンゼマンマクロファージ、炎症性マクロファージ、肝クッパー細胞、脳ミクログリア細胞などの様々な形態に変化するため、血液のみならず、これらを含む組織も本発明の臨床検体として用いることができる。  例えば、腎炎が疑われる患者より腎生検により腎組織を採取し、トリプシン等の酵素を用いることにより細胞を剥離して該組織中に存在する食細胞を得、得られた食細胞を用いることによって、腎炎の原因微生物を検出および同定することができる。
【０１４１】
この方法を様々なセプシスが疑われた患者血液の診断に実際に応用したところ、投与された抗菌薬の影響を受けることなく、血液培養法に比べて約４倍の感度で起因菌を検出することができ、検出菌株の一致率は良好であることが明らかになっている。  そして、血液培養では検査に３日以上14日程度を要するのに比較して、本発明の方法では全操作完了までに約８時間と極めて短時間の内に、簡便な操作によって正確な結果を得ることができるので、特に、敗血症または菌血症など、速やかな善処が必要とされる感染症の診断や予後診断のモニター等において有用マーカーとなり得る。
【０１４２】
本発明の一実施態様によれば、外来微生物貪食済み食細胞を使用することを特徴とする性能試験が提供されるが、その試験としては、食細胞機能の評価用キットの感度試験、特異性試験または再現性試験などが挙げられる。  これらの試験で、外来微生物貪食済み食細胞を陽性コントロールとして使用することができる。  Staphylococcus aureusに対する性能試験に貪食サンプルを用いる場合には、特に、感度試験においては、Staphylococcus aureus貪食サンプルを用いて本明細書に記載したin situハイブリダイゼーションの方法に従って試験を行うときに、シグナルを検出できると規定すればよい。  また、特異性試験を行う場合には、各種細菌貪食サンプルを用い、本明細書に記載したin situハイブリダイゼーションの方法に従って試験を行うとき、Staphylcoccus aureusにのみシグナルを検出できると規定すればよい。  また、再現性試験を行う場合には、特異性試験を同時に３回繰り返し試験するとき、得られる結果は同一であると規定すればよい。  他の細菌、例えば、Staphylococcus epidermidis、Pseudomonas aeruginosa、Enterococcus faecalis、Escherichia coli、Enterobactor cloacae、Klebsiella pneumoniaeについても、上記性能試験を参考にして規定すればよい。
【０１４３】
また、上記した感度試験、特異性試験および再現性試験などの性能試験において陽性コントロールとして貪食サンプルを用いる場合には、貪食サンプルの規格及び試験方法、すなわち、各細菌貪食サンプルのスライドグラスに塗抹固定する細胞数は、約5.0×104〜約2.5×105個/ウェル、Ｕ937細胞の細胞数を、約5.0×104〜約1.0×105個/ウェルとするのが好ましい。
【０１４４】
さらにまた、貪食率の測定は、スライドグラスに塗抹固定した細菌貪食サンプルをアクリジンオレンジ染色液で染色し、蛍光顕微鏡(×1,000)で無作為に細胞約200個を計測すると、図６に示すような、貪食細胞に特異的な形態を観察することができる。  従って、計測した細胞の中で、細胞内に細菌を貪食している細胞を陽性細胞とし、貪食率(％)を算出する。
【０１４５】
【数２】
2008194057.tif 000006
【０１４６】
外来微生物に対する貪食機能の評価方法は、in situハイブリダーゼーションを行うことにより得られるシグナルのみならず、例えば、上記貪食率を用いて算出することによって評価しても良い。  ゆえに、これらin situハイブリダーゼーション法および染色による形態観察に基づいて食細胞機能の評価方法を実施することができ、かかる評価方法は、生体の免疫機能の評価方法、食細胞への分化効率の評価方法、食細胞機能に対するモジュレーターの評価方法、スクリーニング方法、薬剤投与計画を検討する臨床検査方法にも利用できる。
【０１４７】
免疫機能として好適なものに、白血球の生菌貪食能、特に、放射線照射または制癌剤投与後の患者の白血球の生菌貪食能が挙げられ、例えば、癌治療における化学療法剤等の投与に伴って低下する免疫力の増強や、臓器移植の際の拒絶反応抑制など、食細胞の機能を亢進あるいは拮抗させることを意図して特定の薬剤を投与した場合に、実際に体内でその薬剤が有効に作用しているかどうかをこの方法によって確認でき、従って、薬剤選択や投与量に対する有用な指針を提供することが可能となる。
【０１４８】
さらに本発明の方法は、菌血症の分野における菌と食細胞との相互作用についての、基礎および臨床研究に寄与するという効果を奏するものであり、食細胞機能のモジュレーターの有効性確認や食細胞機能に対しモジュレーター作用を有する新規物質のスクリーニングにも使用することができる。  この方法においてもやはり、如上の食細胞機能の評価方法を利用するので、従来法よりも高い信頼性をもって、アゴニストまたはアンタゴニスト等のモジュレーターによる、被験者に対する実質的な効果を見極めることができる。  そして、有効性、副作用等の点で大幅な個体差を生じることのあるモジュレーターによる特定の個体への効果が同定できるので、各患者に適合したオーダーメード的な治療指針を決定する助けとなり得る。  すなわち、被検者への薬剤投与前および投与後に被検者より食細胞を得、上記方法により当該食細胞の機能を評価し、その評価結果に基づいて判定される薬剤の効果から、薬剤投与計画を検討することを特徴とする臨床検査方法が提供される。
【０１４９】
モジュレーターとしては、食細胞の分化を促進または抑制させる物質、食機能を促進または抑制させる物質など、直接的または間接的に食細胞に関与する物質であれば特に限定されない。  例えば、G-CSG、抗ガン剤、抗生物質、免疫機能賦活剤、白血球分化因子等が挙げられる。
【実施例】
【０１５０】
以下に、本発明を実施例に沿って具体的に説明するが、これら実施例の開示によって本発明が限定的に解釈されるべきでないことは勿論である。
【０１５１】
実施例１：採血・血液検体の処理
臨床検体として、敗血症が疑われた患者より採取した血液12検体(検体Ａ〜Ｌ)を用いた。  各患者からヘパリン加静脈血10mlを採取し、これら血液と血液分離試薬(塩化ナトリウム225mg、デキストラン(分子量：200,000〜300,000)1.5ｇ、滅菌精製水にて全量25mlに調製したもの)を４：１の割合で混和した後、37℃で、30分間静置することにより、白血球画分(上層)を取得した。  この白血球画分を、４℃にて160×ｇで10分間遠心分離することで、白血球を得た。  次に、得られた白血球のペレットに滅菌精製水１mlを加えて懸濁し、直ちに過剰量のPBS(塩化ナトリウム18.24ｇ、リン酸一水素ナトリウム12水和物6.012ｇ、リン酸二水素ナトリウム２水和物1.123ｇ、滅菌精製水にて全量120mlにしたもの(PBS原液)を、滅菌精製水にて20倍に希釈したもの)を加えて等張化した後、再度４℃で、160×ｇで10分間遠心分離した。
【０１５２】
実施例２：白血球の固定
３-アミノプロピルトリエトキシシラン(APS、SIGMA社)がスライドグラス(日本エアーブラウン社製、商品番号MS311BL)にコートされたAPSコートスライドグラスを使用した。  APSコートスライドグラスの作製は、まず、スライドホルダーにスライドグラス(商品番号MS311BL)を固定した後、希釈した中性洗剤で30分以上浸すことにより洗浄し、水道水で洗剤を十分に取り除き、次に、スライドグラスを精製水にて洗浄し、高温(100℃以上)で十分に乾燥させた後、室温で放置冷却した。  その後、このスライドグラスを２％APS含有アセトンに１分間浸し、直ちにアセトン及び滅菌精製水で順次軽く洗浄した後、風乾した。  さらに、再度、スライドグラスを２％APS含有アセトンに１分間浸し、直ちにアセトン及び滅菌精製水で、順次軽く洗浄した後、風乾する操作を行った後、42℃で乾燥させることにより作製した。  白血球画分を、４℃にて、160×ｇで10分間遠心分離して得た白血球ペレットに、少量のPBSを加えて懸濁し、血球計算盤を用いて白血球数を計測する。      
【０１５３】
細胞数が１×105個/ウェルとなるようにPBSで調製した白血球懸濁液５μlを、APSコートスライドグラスの各ウェルに白血球が単層に広がるように塗抹し、完全に風乾することにより、白血球をAPSコートスライドグラスに支持させた。  その後、カルノア固定液（エタノール：クロロホルム：酢酸＝６：３：１の容量比で混合した液）に20分間浸した後、75％エタノール液に５分間浸し、完全に風乾させた。
【０１５４】
実施例３：白血球細胞膜の透過性亢進処理
PBSに10分間浸し、その後、酵素前処理試薬(サポニン1.25ｇ、ｔ-オクチルフェノキシポリエトキシエタノール(比重1.068〜1.075(20/４℃)、pH(５w/v%)5.5〜7.5）1.25ml、PBS原液25mlを混合し、滅菌精製水にて全量50mlに調製したもの)を滅菌精製水で10倍に希釈した溶液に浸し、振とう機で10分間浸透させた。
【０１５５】
実施例４：菌体壁の溶菌酵素処理
感染症原因菌のＤＮＡを露出させるため、スライドグラス１枚につき酵素試薬(Ｎ-アセチルムラミダーゼ1,000単位/ml、リゾチーム100,000単位/mlおよび／またはリゾスタフィン100単位/ml)に酵素試薬溶解液(PBSで0.1mol/lフェニルメチルスルフォニルフルオライド(PMSF)含有ジメチルスルフォキシド(DMSO)を100倍希釈して製したもの)を１ml加えて酵素試液を調製した後、37℃〜42℃の湿潤箱内で、酵素試液１mlを白血球塗抹部位に滴下し、30分間静置した。  その後、0.2mol/l 塩酸含有PBS(PBS原液に塩酸を加え、滅菌精製水にて20倍希釈し、塩酸の終濃度を0.2mol/lに調製したもの)に浸し、そのまま振とう機上で、10分間浸透させた。
【０１５６】
実施例５：細胞膜タンパク質のアセチル化
アセチル化試薬(トリエタノールアミン7.46ｇ、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量50mlとしたもの)に無水酢酸を加え、滅菌精製水で10倍希釈し、無水酢酸の終濃度を0.8％に調製したアセチレーション試薬にスライドグラスを浸し、振とう機上で10分間振とうすることにより行った。  その後、75％、85％、98％エタノールに、順次、３分間ずつ浸し、完全に風乾させた。
【０１５７】
実施例６：菌体ＤＮＡのアルカリ処理（二本鎖ＤＮＡを一本鎖に変性）
スライドグラスを、70mmol/l 水酸化ナトリウム含有PBS（PBS原液に水酸化ナトリウムを加え、滅菌精製水で20倍希釈し、水酸化ナトリウムの終濃度を70mmol/lに調製したもの）に３分間浸すことにより行った。  その後、75％、85％、98％エタノールに、順次、３分間ずつ浸し、完全に風乾させた。
【０１５８】
実施例７：ハイブリダイゼーション
プローブ希釈液(0.25％SDS、サケ精子DNA 600μl、100×デンハート溶液50μl、ハイブリダイゼーション原液500μl、ホルムアミド2250μl、50％硫酸デキストラン1000μlが含まれる)で調製したジゴキシゲニン標識ＤＮＡプローブ15ngを含有する液（プローブ液；1.0ng/μl)を塗抹部位に塗布し、37℃〜42℃の湿潤箱中で２時間静置させた。  SDS無添加のプローブ液を対照とした。  ジゴキシゲニン標識ＤＮＡプローブは、ニックトランスレーション法にて作製した。  その後、ハイブリダイゼーション洗浄液(ハイブリダイゼーション原液(塩化ナトリウム13.15ｇ、クエン酸三ナトリウム２水和物6.615ｇ、滅菌精製水にて全量75mlに調製したもの)を、ハイブリダイゼーション原液：滅菌精製水：ホルムアミド=５：45：50の割合で混合して調製したもの)を３つの染色ビンに用意し、順次、42℃で10分間ずつ浸した。  その後、PBSに浸して、そのまま振とう機上で10分間振とうさせた。  ジゴキシゲニン標識ＤＮＡプローブとして、Staphylococcus aureusおよびStaphylococcus epidermidisに対するプローブとして、SA-24(配列番号：１)、SA-36(配列番号：２)およびSA-77(配列番号：３)ならびにSE-22(配列番号：４)、SE-3(配列番号：５)およびSE-32(配列番号：６)(特許第2798499号参照)の各プローブを利用した。  また、Pseudomonas aeruginosaに対するプローブとして、P2-2(配列番号：７)(特許第2965544号参照)のプローブを利用した。  また、Enterococcus faecalisに対するプローブとして、EF-1(配列番号：８)、EF-27(配列番号：９)およびEF-7(配列番号：10)(特許第2965543号参照)を利用した。  そして、Escherichia coli、Enterobacter cloacaeおよびKlebsiella pneumoniaeに対するプローブとして、EC-24(配列番号：11）、EC-34(配列番号：12)およびEC-39(配列番号：13)ならびにET-49(配列番号：14)およびKI-50(配列番号：15)(特許第3026789号参照)を利用した。  さらに、Candida albicansに対するプローブとして、CA-26(配列番号：16）、CA-26-1(配列番号：17）、CA-26-2(配列番号：18)およびCA-26-3(配列番号：19)(特許第2558420号参照)を利用した。  これらプローブの配列を用いて、ニックトランスレーション法によりプローブの作製を行った。
【０１５９】
実施例８：ブロッキング
In situハイブリダイゼーションを行った後、ブロッキングの操作を行った。  湿潤箱内でスライドグラス１枚につきブロッキング試薬(ウサギ正常血清２ml、PBS原液0.5ml、滅菌精製水にて全量10mlに調製したもの)１mlを塗抹部位に滴下し、30分間静置した。  その後、ブロッキング試薬を除去した。
【０１６０】
実施例９：標識抗体との反応
標識抗体(アルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体溶液1.05単位、バッファーＡ(トリエタノールアミン746mg、塩化ナトリウム17.5mg、塩化マグネシウム６水和物20.3mg、塩化亜鉛1.36mg、ウシ血清アルブミン1000mg、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量100mlに調製したもの)12.6μlにて全量を14μlに調製したもの)を標識抗体希釈液(トリス-(ヒドロキシメチル)-アミノメタン8.48mg、塩化ナトリウム6.14mg、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量0.7mlに調製したもの)で50倍希釈した標識抗体液を調製し、この標識抗体液を塗抹部位に10μlずつ滴下し、30分間静置させた。  その後、標識抗体洗浄液(ポリソルベート20 １ml、PBS原液50ml、滅菌精製水にて全量100mlに調製したもの)を10倍に希釈した溶液に浸して、そのまま振とう機上で10分間浸透させた。  この操作を２回繰り返した後、発色前処理液１(トリス-(ヒドロキシメチル)-アミノメタン6.06ｇ、塩化ナトリウム2.92ｇ、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量50mlに調製したもの)と発色前処理液２(塩化マグネシウム６水和物5.08ｇ、滅菌精製水にて全量50mlに調製したもの)とを等量混合し、滅菌精製水で５倍に希釈した発色前処理液に浸し、そのまま振とう機上で10分間振とうさせた。
【０１６１】
実施例10：検  出
スライドグラス１枚につき発色試薬(ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)/５-ブロモ-４-クロロ-３-インドリルフォスフェイト(BCIP)溶液、pH 9.0〜10.0：NBT 3.3mg、BCIP 1.65mg、Ｎ,Ｎ-ジメチルホルムアミド99μg、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン121mg、塩酸適量、塩化ナトリウム58.4mg、塩化マグネシウム６水和物101.6mg、滅菌精製水適量にて全量10mlに調製したもの)１mlを、0.2μmシリンジトップフィルターを装着したディスポーザブルシリンジを用いてろ過しながら、スライドグラスの塗抹部位に滴下し、湿潤箱内で、37℃、30分間遮光静置した。  その後、発色試薬洗浄液(トリス-(ヒドロキシメチル)-アミノメタン606mg、エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム２水和物186mg、塩酸適量、滅菌精製水適量にて全量50mlに調製したもの)を10倍に希釈した溶液に５分間浸し、風乾した後、対比染色液(ファストグリーンFCF(食用緑色３号)50mg、滅菌精製水適量にて全量50mlに調製したもの)を10倍に希釈した溶液および１％酢酸溶液に浸した。  その後、前記発色試薬洗浄液を10倍に希釈した溶液に再度浸して余分の前記対比染色液を洗い流し、完全に風乾させた。
【０１６２】
実施例11：判  定
判定は、光学顕微鏡で鏡検(×1,000)するとき、単一ウェル内で対比染色液によって染まった細胞に於いて、青紫色の発色シグナルが１つでも認められた場合に陽性と判定した。  その結果、本発明の方法により、12検体中５検体で菌を検出した。  ５検体の内訳は、検体Ａ-SA(Staphylococcus aureus）、検体ＦおよびＧ-SE(Staphylococcus epidermidis）、検体Ｊ-SEおよびEF(Enterococcus faecalis）、検体Ｌ-SAおよびCA(Candida albicans)であった。  なお、同じ検体を用いて、公知の方法に従い血液培養を行ったところ、検体ＡはSAを検出し同一の結果を示したが、検体Ｆ、Ｇ、ＪおよびＬは菌を検出することができなかった。  従って、本発明の方法が、血液培養と比較して、迅速に感度よく検出できることが判明した。
【０１６３】
検体Ａ-SAにおける結果に関し、プローブ希釈液へのSDSの添加の効果を、図１に示した。  図１から、SDSを0.25％添加することで、シグナルの検出感度が格段に高められることが明らかである。  その他の検体についても同様に、SDSを添加することで良好なシグナル検出が可能となった。  なお、本実施例において使用したプローブは、SA-24(配列番号：１)、SA-36(配列番号：２)およびSA-77(配列番号：３)の塩基配列を組み合わせて用い、ニックトランスレーションによって作製したプローブである。
【０１６４】
実施例12：塗抹固定する至適白血球数の検討
APSコートスライドグラスのウェル(直径５mmの円形ウェル)に塗抹する至適白血球数を検討した。  ヘパリン加健常ヒト血液10mlを採取し、実施例１に記載の手順に従って白血球を採取した。  次に、得られた白血球を適量のPBSで懸濁した後、血球計算盤を用いて１ml当たりの白血球数を測定し、(ａ)１×108個/mlを始点として、(ｂ)５×107個/ml、(ｃ)１×107個/ml、(ｄ)５×106個/ml、(ｅ)１×106個/ml、(ｆ)５×105個/mlおよび(ｇ)１×105個/mlの希釈系列を作成した後、各々５μlをスライドグラスに塗抹した。  風乾後、カルノア固定（実施例２参照）を行い、直ちに前記対比染色液で染色し、実施例11に記載した方法を用いて判定した。  その結果、細胞数が１×108個/mlでは細胞数が過剰であり、検出不適であった。  また、５×106個/ml以下では、ウェルに観察される細胞数が少なく、検出不適であった。  よって、固定化する食細胞の密度（ｘ個/ml）としては、約５×106個/ml＜ｘ個/ml＜約１×108個/ml、とりわけ、約１×107個/ml≦ｘ個/ml≦約５×107個/mlが好ましい。  また、それに対応して、APSコートスライドグラスに固定される１ウェル当たりの白血球の細胞数（ｙ個/ウェル(直径５mm)）は、約2.5×104個/ウェル＜ｙ個/ウェル(直径５mm)＜約５×105個/ウェル、好ましくは、約５×104個/ウェル≦ｙ個/ウェル(直径５mm)≦約2.5×105個/ウェルとなるように調製するのが良いことが判明した。  試料(ａ)〜(ｆ)に関する実験結果を、図２(ａ)〜(ｆ)にそれぞれ示した。
【０１６５】
実施例13：使用溶菌酵素の選択
Staphylococcus aureus（ATCC 12600）、Staphylococcus epidermidis（ATCC 14990）、Pseudomonas aeruginosa（ATCC 10145）、Enterococcus faecalis（ATCC 19433）、Escherichia coli（ATCC 11775）を溶菌する酵素条件を検討した。  Staphylococcus  aureusおよびStaphylococcus epidermidisでは、溶菌酵素としてリゾスタフィン（Bur. J. Biochem., 38, 293-300, 1973）を使用した。  Enterococcus  faecalisには、Ｎ-アセチルムラミダーゼ（Archs. Oral Biol., 23, 543-549, 1978）、リゾチーム(生化学工業)を使用した。  また、Pseudomonas  aeruginosaおよびEscherichia coliについては、70mmol/lの水酸化ナトリウム含有PBSを使用した。  これら各種細菌を５mlのBHI(ブレインハートインフュージョン)液体培地(DIFCO社製)に植菌し、37℃で８時間以上培養した。  培養した菌液を、４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌した。  集めた菌をPBSで懸濁して試料とした。  溶菌はマイクロプレートリーダーを用い、吸光度600nmにおける菌液の濁度の減少により評価した。  その結果、Staphylococcus aureusおよびStaphylococcus epidermidisは、リゾスタフィンにより溶菌した。  Pseudomonas aeruginosaおよびEscherichia coliについては、70mmol/lの水酸化ナトリウム含有PBSで溶菌したため、酵素処理は必要としなかった。  また、Enterococcus faecalisについては、Ｎ-アセチルムラミダーゼ単独よりもリゾチームと併用した方が優れた溶菌活性が得られることが判明した。  また、貪食作用を受けて取り込まれた菌が、例えば、Pseudomonas aeruginosaおよびEscherichia coliなどである場合には、アルカリ処理に際して菌の細胞壁が溶解され、遺伝子が露出した状態となるので、必ずしもこの酵素処理を行う必要はない。  本発明において外来微生物を溶解するために使用される前処理用の各酵素は、前述した細菌株に対して有効であるのみならず、他のスタフィロコッカス(Staphylococcus)属、ストレプトコッカス(Streptococcus)属、バシルス(Bacillus)属およびミクロコッカス(Micrococcus)属を初めとする他の菌種等でも有効である。  また、かような酵素は、各々単独で用いることもできるが、混合した場合の方が有効である。  それら結果を、図３、具体的には、(ａ) Staphylococcus aureusおよびStaphylococcus epidermidis、(ｂ) Pseudomonas aeruginosaおよびEscherichia coli、ならびに(ｃ) Enterococcus faecalisについて示した。
【０１６６】
実施例14：酵素溶解液に関する検討（DMSOの至適濃度の検討）
酵素試薬に含有されるプロテアーゼは、白血球の形態を劣化させることから、白血球の形態を保持させるために添加するPMSFの溶解剤であるDMSOの酵素活性に及ぼす影響を検討した。  Enterococcus faecalisを、50mlの前記BHI液体培地に植菌し、37℃で、８時間以上培養した。  この培養液を、４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌し、PBSで懸濁した後、オートクレーブ(120℃、10分)により熱処理を行った。  次に、４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離し、上清を捨て、１mlのPBSで沈渣を懸濁させた後、凍結乾燥させた。      
【０１６７】
この凍結乾燥試料を０〜10％DMSO含有５mmol/lトリス-塩酸(pH 6.0）、２mmol/l塩化マグネシウムで懸濁し、Ｎ-アセチルムラミダーゼに対する試料とした。  また、Micrococcus luteus (JCM1464)を、５mlのBHI液体培地(前出)に植菌し、37℃で８時間以上培養した。  培養した菌液を、４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌した。
【０１６８】
上清を捨て、菌のペレットをPBS ５mlで懸濁洗浄し、再度４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌した。  このようにして集めた菌を、０〜10％DMSO含有PBSで懸濁し、リゾチームに対する試料とした。  一方、Staphylococcus epidermidisをリゾチームの場合と同様に培養、集菌し、０〜10％DMSO含有PBSで懸濁し、リゾスタフィンに対する試料とした。  酵素活性は、マイクロプレートリーダーを用い、吸光度600nmにおける試料の濁度の減少により評価した。  ただし、本試験中それぞれの酵素力価は、(ａ) Ｎ-アセチルムラミダーゼ 300単位/ml、(ｂ) リゾチーム 10,000単位/ml、(ｃ) リゾスタフィン 50単位/mlとし、酵素活性に対するDMSOの影響を検討した。  それぞれの酵素活性を単位時間当たりにおける菌濁度（O.D.＝600nm）の減少で評価した結果、DMSOは、Ｎ-アセチルムラミダーゼ活性に対しては殆ど影響を与えなかったが、リゾチームおよびリゾスタフィンに対しては、共に５％以上のDMSOで活性の低下が認められた。  また、２％以下のDMSOの濃度では、酵素活性の低下は認められなかった。  ゆえに、PMSFを溶解させるDMSO濃度は少なくとも５％未満、好ましくは２％以下、さらには１％程度とするのが好ましい。  その結果を、図４(ａ)〜(ｃ)および下記表３に示した。
【０１６９】
【表３】
2008194057.tif 000007
【０１７０】
実施例15：酵素溶解液に関する検討（PMSFの至適濃度の検討）
酵素試薬に含有されるプロテアーゼは白血球の形態を劣化させることから、白血球の形態を保持させるために添加するPMSF（PIERCE社製）の効果を検討した。100μlのDMSO(和光純薬社製)にPMSFを溶解し、PMSFの終濃度が無添加(０mmol/l)〜１mmol/lとなるようにPBSで10mlに希釈した。  この溶液に、プロテアーゼの力価が0.2単位/mlとなるよう、プロテイネースＫ(ベーリンガーマンハイム社製)を添加した。  ヘパリン加健常ヒト血液５mlを採取し、実施例１に記載の方法に従って白血球を採取した。  次に、白血球を適当量のPBSで懸濁して、血球計算盤で細胞数を計測し、細胞数を、約５×104個/ウェル〜約2.5×105個/ウェルに調製し、その５μlをAPSコートスライドグラスのウェルに塗抹し、風乾後、実施例２に記載のカルノア固定の方法に従って固定した。  このサンプルを用いて、実施例３〜11に記載の方法に従って試験を行った。  １μmol/l〜１mmol/lのPMSFの濃度で試験を実施した結果、10μmol/l以上の濃度で効果が認められ、0.1mmol/l以上のPMSF濃度では、白血球の形態の劣化が完全に抑制されていた。  その結果を、図５の(ａ) プロテアーゼ0.2単位/mlのみ、(ｂ) PMSF １μmol/ml添加、(ｃ)PMSF 10μmol/ml添加、(ｄ) PMSF 0.1mmol/ml添加、および(ｅ) PMSF １mmol/ml添加についてそれぞれ示した。
【０１７１】
実施例16：溶菌酵素ザイモラーゼの至適力価の検討
カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)を溶菌してＤＮＡを露出させるためのザイモラーゼの至適力価を検討した。  カンジダ・アルビカンスをYPD培地に植菌し、30℃で一昼夜培養した。  その後、基質としてカンジダ・アルビカンスをPBSで懸濁した溶液(基質１)、およびカルノア固定後、70％エタノールに浸し、風乾し、PBSにて懸濁した溶液(基質２)の２種類を調製した。  反応は、ザイモラーゼ/PBS：0.5ml、基質：1.5ml、M/15リン酸緩衝液：2.5ml、滅菌精製水：0.5mlにて全量5.0mlに調製したものを用いた。  その後、37℃で、２時間反応させ、そのOD800を測定した。  また、ザイモラーゼ(ザイモリエイス-100Ｔ)濃度は、０mg/ml、0.01mg/ml、0.025mg/ml、0.05mg/ml、0.1mg/ml、0.25mg/ml、0.5mg/ml、１mg/ml、2.5mg/ml、５mg/mlを用いた。  その結果、基質１を用いた場合のそれぞれのOD800値は、0.533、0.521、0.553、0.554、0.548、0.417、0.394、0.288、0.163、0.113であり、また、基質２を用いた場合のそれぞれのOD800値は、0.445、0.411、0.359、0.282、0.232、0.146、0.115、0.096、0.08、0.057であった。  基質１および基質２がともに、0.5mg/ml〜５mg/ml、特に、１mg/ml〜５mg/mlの範囲で有効であることが判明した。  すなわち、ザイモラーゼの使用量は、50単位/ml〜500単位/ml、特に100単位/ml〜500単位/mlであることが好ましい。
【０１７２】
実施例17：至適酵素処理条件（力価）の検討
(1) 貪食サンプルの作製
[1] Ｕ937細胞の調製
37℃、５％炭酸ガスインキュベーター内で、細胞培養フラスコ(175cm2)中のRPMI1640培地(25ml)でＵ937細胞(ヒト単球株化細胞、ATCC CRL-1593.2)を培養した。  次に、Ｕ937細胞培養液を50mlの遠沈管に入れ、４℃、220×ｇで10分間遠心分離し、Ｕ937細胞を回収した。  その後、回収したＵ937細胞をPBS200μlで懸濁し、血球計算盤で細胞数を計算し、細胞数を１×104個／μl〜２×104個／μlに調製した。
【０１７３】
[2] 細菌貪食サンプルの調製
Staphylococcus aureus (ATCC 12600)、Staphylococcus epidermidis (ATCC 14990)、Pseudomonas aeruginosa(ATCC 10145)、Enterococcus faecalis (ATCC 19433)およびEscherichia coli (ATCC 11775) を、各々５mlのBHI培養液に植菌し、37℃で８時間以上培養した。  培養した菌液を、４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌した。  上清を捨てた後、菌のペレットをPBS ５mlで懸濁し、再度、４℃、2,000×ｇで10分間遠心分離して集菌した。  集菌した菌をPBS５mlで懸濁した後、PBSにて希釈して吸光度計により菌液の濁度（O.D.＝600nm）を、Staphylococcus aureus（0.01〜0.03）、Staphylococcus epidermidis（0.01〜0.03）、Pseudomonas aeruginosa（0.02〜0.03）、Enterococcus faecalis（0.01〜0.03）、Escherichia coli（0.02〜0.03）にそれぞれ調製したものを15ml作製した。  作製した菌液は、個別の175cm2の培養用フラスコに移し、30分間室温で静置した。  ヘパリン加健常ヒト血液50mlを採取し、血球分離試薬を４：１の割合で加え、37℃で30分間静置し、白血球画分を分取した。  分取した白血球画分をPBSで50mlにした。  培養用フラスコ(前出)の上清を静かに捨て、PBSで希釈した白血球画分を10mlずつフラスコに加え、室温で10分間静置した。  培養用フラスコ内の上清を捨て、フラスコの底に付着した白血球を0.02％EDTA含有PBS 10mlで15mlの遠沈管に回収し、４℃、140×ｇ〜180×ｇで10分間遠心分離し、白血球を収集した。  収集した白血球中に赤血球の混入が認められたので、滅菌精製水１mlにて白血球の沈渣を穏やかに懸濁して溶血させた後、PBSを14ml加えて等張化を行い、再度４℃、140×ｇ〜180×ｇで10分間遠心分離を行い、白血球を収集した。  収集した白血球をPBSで懸濁し、血球計算盤にて細胞数を計測し、１×104個/μl〜５×104個/μlに調製した。  この貪食サンプルを、それぞれSA貪食サンプル、SE貪食サンプル、PA貪食サンプル、EF貪食サンプル、EK貪食サンプルとした。
【０１７４】
[3] 塗抹固定
実施例17(1)[1]で調製したＵ937細胞と、実施例17(1)[2]で作製した各細菌貪食サンプルとをAPSコートスライドグラスの各ウェルに５μlずつ塗抹し、風乾させた。  次に、実施例２に記載のカルノア固定液に20分間浸した後、75％エタノールに５分間浸し、カルノア固定液を洗浄して風乾させた後、試験に使用するまで４℃で保存した(実施例２参照)。      
【０１７５】
次いで、固定サンプルの前処理を、実施例３に従って行った。
【０１７６】
(2) 貪食サンプルの規格及び試験方法
[1] 細  胞  数
各細菌貪食サンプルのスライドグラスに塗抹固定する細胞の数を、5.0×104〜2.5×105個/ウェルとし、また、Ｕ937細胞の細胞の数を5.0×104〜1.0×105個/ウェルとした。
【０１７７】
[2] 貪  食  率
スライドグラスに塗抹固定した細菌貪食サンプルを、アクリジンオレンジ染色液で染色し、蛍光顕微鏡(×1,000)で無作為に約200個の細胞を計測した。  計測した細胞の中で、細胞内に細菌を貪食している細胞(図６で矢印にて示す、貪食に特徴的な形態変化が認められた細胞)を陽性細胞とし、以下の数式に従ってその貪食率(％)を算出した。
【０１７８】
【数３】
2008194057.tif 000008
【０１７９】
この時に算出した各細菌貪食サンプルの貪食率(％)は、10％以上であった。
【０１８０】
[3] 試験方法
実施例17(2)[1]および[2]で作成した貪食サンプルを検体とした。  使用したSA貪食サンプルの貪食率は23％であり、1.98×105個/ウェルであった。  SE貪食サンプルの貪食率は27％であり、1.74×105個/ウェルであった。  また、EF貪食サンプルの貪食率は34％であり、6.40×104個/ウェルであった。  各貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用いて、実施例３に記載の方法に従って、酵素前処理を行った。  次に、酵素前処理済みのスライドグラスを湿潤箱に置き、各種力価に調製した各酵素溶液１mlを検体塗抹部位に滴下して反応させた。  その後、0.2mol/l塩酸含有PBS、70％エタノールにそれぞれ10分間浸し、風乾させた。  このスライドグラスを、70mmol/l水酸化ナトリウム含有PBSに３分間、70％エタノールに10分間浸した後に風乾し、１％アクリジンオレンジ染色液で染色した。  その後、蛍光顕微鏡(×1,000)により評価した。  Staphylococcus aureusおよびStaphylococcus epidermidisは、リゾスタフィンで至適力価の検討を行った。  Enterococcus faecalisは、Ｎ-アセチルムラミダーゼとリゾチームの併用で至適力価を検討するため、Ｎ-アセチルムラミダーゼを100単位/mlに固定した場合のリゾチーム至適力価の検討と、リゾチームを10,000単位/mlに固定した場合のＮ-アセチルムラミダーゼ至適力価の検討を行った。  判定は、酵素処理により菌体が白血球中に確認されなくなるとき「適」とした。
【０１８１】
[4] 結  果
Staphylococcus aureusの溶菌においては、表４に記載のように、リゾスタフィンの力価は１単位/mlで十分効果を示すが、Staphylococcus epidermidisの溶菌においては、10単位/ml以上のリゾスタフィン力価が必要であった。  ゆえに、リゾスタフィンの至適力価を、10単位/ml〜100単位/mlに設定した。  また、Enterococcus faecalisの溶菌においては、リゾチームの力価を10,000単位/mlで固定したとき、Ｎ-アセチルムラミダーゼ力価が10単位/ml以下では溶菌されなかった。  リゾチームについては、表５に記載の通り、Ｎ-アセチルムラミダーゼ力価を100単位/mlに固定したとき、リゾチーム力価が1,000単位/ml以下では溶菌されなかった。  ゆえに、Ｎ-アセチルムラミダーゼの至適力価は、100単位/ml〜1,000単位/ml、また、リゾチームの至適力価は、10,000単位/ml〜100,000単位/mlに設定した。  その結果を、図７に示すが、図中、(ａ)は酵素処理前のStaphylococcus aureusの貪食サンプル、(ｂ)は処理前のEnterococcus faecalisの貪食サンプル、(ｃ)はサンプル(ａ)を酵素処理した後、および(ｄ)はサンプル(ｂ)を酵素処理した後の様子を示している。
【０１８２】
【表４】
2008194057.tif 000009
【０１８３】
【表５】
2008194057.tif 000010
【０１８４】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を、WO 2002/099133号公報に記載の方法（以下、「臨床検体の感染症原因微生物の同定方法」と称する）に応用したところ、同一の結果を得ることができたので、この方法での上記各酵素の至適力価も同一と考えた。
【０１８５】
実施例18：至適酵素処理条件（温度）の検討
各貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用いて、実施例17(2)[3]に記載の方法に準じて検討した。  ただし、本試験の酵素処理時間は30分、検討温度は４℃、25℃、37℃、42℃、60℃とし、また、各酵素力価は、Ｎ-アセチルムラミダーゼ(100単位/ml、生化学工業社製）、リゾチーム(10,000単位/ml、生化学工業社製）、リゾスタフィン(10単位/ml、SIGMA社製)とした。  判定は、実施例17(2)[3]に記載の方法に準じて行った。  その結果、Staphylococcus aureusは、４℃〜60℃の温度範囲で白血球の菌体は確認されなかった。  Staphylococcus epidermidisは、処理温度４℃および25℃では白血球中の菌体が残存していたが、37℃以上では菌体が確認されなかった。  また、Enterococcus faecalisでは、処理温度４℃、25℃および60℃で菌体が残存していたが、37℃および42℃では確認されなかった。  ゆえに、至適酵素処理温度を37℃〜42℃に設定した。  その結果を、表６に示した。
【０１８６】
【表６】
2008194057.tif 000011
【０１８７】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を、臨床検体の感染症原因微生物の同定方法に応用したところ、同一の結果を得ることができたので、この方法での酵素処理の至適温度も同一と考えた。
【０１８８】
実施例19：至適酵素処理条件（時間）の検討
実施例17(1)[1]および[2]に記載の方法で作成した貪食サンプルを検体とした。
【０１８９】
検討した時間は、０分、10分、20分、30分、60分、120分とした。  使用したSA貪食サンプルの貪食率は18％であり、7.80×104個/ウェルであった。  SE貪食サンプルの貪食率は34％であり、1.10×105個/ウェルであった。  また、EF貪食サンプルの貪食率は28％であり、1.30×105個/ウェルであった。  各貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用いて、実施例17(2)[3]に記載の方法に準じて検討した。  但し、本試験の酵素処理温度は37℃、各酵素力価はＮ-アセチルムラミダーゼ(100単位/ml）、リゾチーム(10,000単位/ml）、リゾスタフィン(10単位/ml)とした。  判定は、実施例17(2)[3]に記載の方法に準じて行った。  その結果、Staphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis貪食サンプルともに酵素処理時間20分以上(０分および10分においては不適であった)で、白血球中に菌体は確認されなかったことから、少なくとも15分以上、好ましくは20分以上、さらに至適酵素処理時間を30分〜60分とするのが好ましい。  その結果を、表７に示した。
【０１９０】
【表７】
2008194057.tif 000012
【０１９１】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を、臨床検体の感染症原因微生物の同定方法に応用したところ、同一の結果を得ることができたので、この方法での酵素処理の至適時間も同一と考えた。
【０１９２】
実施例20：プローブ濃度の検討
本発明のin situハイブリダイゼーション反応において、プローブ濃度はハイブリッド形成速度に影響を与える主要な因子である。  プローブ濃度が低すぎると反応速度の低下を招き、シグナルが明確でなくなる可能性がある。  また、過剰量のプローブの使用は、非特異的反応の原因に繋がる。
【０１９３】
ゆえに、各種プローブ液について、至適濃度を検討した。  まず、実施例17(1)[1]および[2]に記載の方法で作成した貪食サンプルを検体とした。  使用したSA貪食サンプルの貪食率は24％であり、1.48×105個/ウェルであった。  SE貪食サンプルの貪食率は28％であり、2.07×105個/ウェルであった。  PA貪食サンプルの貪食率は11％であり、1.59×105個/ウェルであった。  また、EF貪食サンプルの貪食率は24％であり、1.72×105個/ウェルであった。  EK貪食サンプルの貪食率は12％であり、1.63×105個/ウェルであった。  各貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用いて、実施例17(2)[3]に記載の方法に準じて検討した。  プローブは、ジゴキシゲニン標識したものを使用し、Staphylococcus aureus、Staphylococcus epidermidis、Enterococcus faecalis、Pseudomonas aeruginosa、Escherichia coliに対する各プローブ濃度を、それぞれ、0.06ng/μl、0.6ng/μl、1.2ng/μl、1.8ng/μl、2.4ng/μl、３ng/μlに調製した。  貪食サンプルを塗抹したスライドグラス(図８参照)に、上記各種濃度に調製したプローブ液を使用し、実施例３〜11に記載の方法に従い検討した。
【０１９４】
その結果、低濃度(0.06ng/μl)ではシグナルが明確でなくなり、一方で、高濃度(2.4ng/μlおよび３ng/μl)ではバックグラウンドの増大が認められた。  ゆえに、SA、SE、PA、EF、EKのプローブ濃度を0.6〜1.8ng/μl、好ましくは0.6〜1.2ng/μlとした。  また、0.06ng/μlにおいては不適であり、0.6ng/μlにおいては適であったことから、少なくとも0.1ng/μl以上とするのが好ましい。
【０１９５】
さらに、2.4ng/μlにおいては不適であり、1.8ng/μlにおいては適であったことから、2.2ng/μl以下とするのが好ましい。  その結果を、以下の表８〜表12に示した。
【０１９６】
【表８】
2008194057.tif 000013
【０１９７】
【表９】
2008194057.tif 000014
【０１９８】
【表１０】
2008194057.tif 000015
【０１９９】
【表１１】
2008194057.tif 000016
【０２００】
【表１２】
2008194057.tif 000017
【０２０１】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を、臨床検体の感染症原因微生物の同定方法に応用したところ、同一の結果を得ることができたので、この方法での上記プローブの至適濃度も同一と考えた。
【０２０２】
実施例21：ハイブリダイゼーション温度の検討
ハイブリダイゼーション反応における反応温度は、ハイブリッド形成速度とハイブリッドの安定性に影響を与えるパラメーターである。  ハイブリダイゼーション反応を高温にすると細胞の形態が劣化することが知られていることから、至適温度の検討(４℃、25℃、37℃、42℃、50℃、60℃)を行った。
【０２０３】
まず、実施例17(1)[1]および[2]に記載の方法で作成した貪食サンプルを検体とした。      
【０２０４】
使用したSA貪食サンプルの貪食率は31％であり、1.38×105個/ウェルであった。  SE貪食サンプルの貪食率は42％であり、1.95×105個/ウェルであった。  PA貪食サンプルの貪食率は14％であり、1.27×105個/ウェルであった。  また、EF貪食サンプルの貪食率は48％であり、1.05×105個/ウェルであった。  EK貪食サンプルの貪食率は17％であり、1.85×105個/ウェルであった。
【０２０５】
貪食サンプルおよびＵ937細胞を塗抹固定したスライドグラス(図９参照)を使用して、実施例３〜11に記載の方法に従い検討した。  その結果、ハイブリダイゼーション温度が４℃以下ではハイブリッド形成速度が低下し、各種プローブで安定なシグナルが観察されなかった。  また、60℃においては細胞形態の変化が認められ、安定なシグナルが観察されなかった。  また、25℃および50℃では37℃および42℃に比べ、シグナルが明確でなかったが検出することは可能であった。  ゆえに、至適ハイブリダイゼーションの温度は、25℃〜50℃、より好ましくは37〜42℃に設定すると良い。  それら結果を、以下の表13〜表17に示した。
【０２０６】
【表１３】
2008194057.tif 000018
【０２０７】
【表１４】
2008194057.tif 000019
【０２０８】
【表１５】
2008194057.tif 000020
【０２０９】
【表１６】
2008194057.tif 000021
【０２１０】
【表１７】
2008194057.tif 000022
【０２１１】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を、臨床検体の感染症原因微生物の同定方法に応用したところ、同一の結果を得ることができたので、この方法でのハイブリダイゼーションの至適温度も同一と考えた。
【０２１２】
実施例22：ハイブリダイゼーション時間の検討
実施例17(1)[1]および[2]に記載の方法で作成した貪食サンプルを検体とし、10分、60分、90分、120分、180分、900分間のハイブリダイゼーション時間について検討した。  使用したSA貪食サンプルの貪食率は47％であり、1.45×105個/ウェルであった。  SE貪食サンプルの貪食率は47％であり、1.33×105個/ウェルであった。  PA貪食サンプルの貪食率は15％である、1.91×105個/ウェルであった。  また、EF貪食サンプルの貪食率は41％であり、1.45×105個/ウェルであった。  EK貪食サンプルの貪食率は20％であり、1.23×105個/ウェルであった。
【０２１３】
貪食サンプルおよびＵ937細胞を塗抹固定したスライドグラス(図９に示すものに同じ)を使用して、実施例３〜11に記載の方法に従い検討した。  その結果、ハイブリダイゼーション時間が10分ではシグナルが観察されなかったが、60分以上でシグナルが観察され、90分以上で安定したシグナルが観察された。  また、ハイブリダイゼーション時間が900分においてもシグナルの検出には変化は認められなかった。  ゆえに、少なくとも30分以上、好ましくは60分以上、より好ましくは90分以上とするのが好ましい。  さらに好ましい至適ハイブリダイゼーション時間は、120分〜900分に設定すると良い。  それら結果を、以下の表18〜表22に示した。
【０２１４】
【表１８】
2008194057.tif 000023
【０２１５】
【表１９】
2008194057.tif 000024
【０２１６】
【表２０】
2008194057.tif 000025
【０２１７】
【表２１】
2008194057.tif 000026
【０２１８】
【表２２】
2008194057.tif 000027
【０２１９】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を、臨床検体の感染症原因微生物の同定方法に応用したところ、同一の結果を得ることができたので、この方法でのハイブリダイゼーションの至適時間も同一と考えた。
【０２２０】
実施例23：ハイブリダイゼーション溶液に添加する界面活性剤の影響
実施例17(1)[1]および[2]に記載の方法で作成した貪食サンプルを検体とした。  プローブ希釈液に各種界面活性剤(SDS、ラウリスサルコシン、サポニン、BRIJ35、Tween 20、Triton X-100)を添加し、実施例７に従ってハイブリダイゼーションを行ったところ、0.25％のSDSを添加することにより検出感度が飛躍的に増強した。  また、ラウリルサルコシン、BRIJ 35、ツイーン20（Tween 20）によって検出感度を高めることができた。  その結果を、以下の表23に示した。
【０２２１】
【表２３】
2008194057.tif 000028
【０２２２】
さらに、SDSを種々の濃度で用いた結果、好ましい濃度は、１％以下、より好ましくは0.1％〜0.5％、さらに好ましくは0.25％であることが明らかになった。
【０２２３】
貪食サンプルを用いて得られたこれら結果を臨床検体の感染症原因微生物の同定方法に応用したところ、同一の結果を得ることができた。  ゆえに、臨床検体の感染症原因微生物の同定方法においてもin situハイブリダイゼーションの工程に界面活性剤、特に、SDSを添加するのが好ましい。
【０２２４】
実施例24：ハイブリダイゼーションの際に使用するプローブ鎖長の検討
Staphylococcus aureusプローブ(SA-24(配列番号：１))およびPseudomonas aeruginosaプローブ(P２-２(配列番号：７))を、ジゴキシゲニンでラベル化した。
【０２２５】
まず、精製した各種ＤＮＡプローブ１μgを、10×L.B.(0.5mol/l トリス塩酸(pH 7.5)５μl、50mmol/l 塩化マグネシウム、0.5mgウシ血清アルブミン)５μl、100mmol/l ジチオスレイトール５μl、dNTPs(Ａ、Ｇ、Ｃ)各１nmol、ジゴキシゲニン-dUTP（Dig-dUTP）0.5nmol、dTTP各0.5nmol、DNase ３μl(25mU、75mUおよび200mU相当量）、10Ｕ/μl ＤＮＡポリメラーゼ１μlおよび滅菌精製水適量にて全量50μlとなるように調製した。  15℃、２時間でジゴキシゲニンラベル化を行った。  ラベル化後、５分間煮沸し反応を停止させた。  反応停止液をスピンカラム(CENTRI-SEP COLUMUNS CS901、PRINCETON SEPARATIONS, INC.)に注入し、25℃で２分間遠心分離(3,000×ｇ)を行い、遊離のヌクレオチドを除去した。  その後、溶出液の濃度を吸光度計により測定し、３％アガロースゲルにて電気泳動しサイズを確認した。  次に、サザンブロッティング法によりアガロースゲル内のＤＮＡをニトロセルロース膜に転写させた。  その後、２％ブロッキング試薬(ロシュ社製)に30分間浸した後、１/5,000量のアルカリフォスファターゼ標識抗ジゴキシゲニン抗体を加え、30分間浸した。  次に、100mmol/lのトリス塩酸(pH 7.5)、150mmol/l 塩化ナトリウムにて10分間振とうし、２回洗浄した。  その後、100mmol/lのトリス塩酸(pH9.5）、150mmol/l 塩化ナトリウムにて10分間振とうして洗浄した。  その後、NBT/BCIP溶液に浸して発色させた。
【０２２６】
最後に、精製水に浸し発色を止めて乾燥させた。  その結果、図１０の(ａ)SAプローブ使用時および(ｂ)PAプローブ使用時についてそれぞれ示すように、25mUのDNase（図中、レーン１）を用いて、その鎖長が、主として約350〜約600塩基長に分布するように切断した場合に、ラベル効率が高いことが示された。
【０２２７】
こうして得られた検出用プローブを、貪食サンプルや感染症患者からの臨床検体を用いた感染症原因微生物の検出方法において使用し、ハイブリダイゼーションを行ったところ、優れた感度でシグナルが検出された。  従って、ハイブリダイゼーションに使用するプローブの鎖長は、約350〜約600の塩基長、好ましくは、約350〜約550の塩基長とすることが良いものと判明した。
【０２２８】
実施例25：ハイブリダイゼーションの際に使用するプローブの検討
実施例17(1)[1]および[2]に記載の方法で作成した、Escherichia coliの貪食サンプルを検体として、検出用プローブについての検討を行った。
【０２２９】
検出用プローブは、EC-24(配列番号：11）、EC-34(配列番号：12）およびEC-39(配列番号：13)から、実施例24に記載したようにジゴキシゲニンラベル化し、約350〜約600の塩基長を有するように調製したものを、それぞれ単独または３種を組み合わせて使用した。      
【０２３０】
得られた結果から、図１１に示すとおり、(ａ)EC-24、(ｂ)EC-34または(ｃ)EC-39のそれぞれを単独で検出用プローブとして用いるよりも、(ｄ)これらを混合してなる混合プローブ「MIX」の方がシグナルが明瞭に検出され、感度が高められることが明らかであった。
【０２３１】
実施例26：種々の細菌量における本発明の貪食サンプルを用いた外来微生物の検出法と血液培養法との検出力の比較
実施例13に記載のS.aureus、 S.epidermidisまたはEnterococcus faecalisを、105、104、103、102、101、100 CFU/mlの濃度で健常人血液に混和し、インキュベーション後、臨床検体の感染症原因微生物の同定キット(ハイブリゼップ［商品名；扶桑薬品工業株式会社］)及び公知の方法に従う血液培養法により試験を実施した。  また、広域スペクトルを持つピペラシリン(PIPC)を10MICの濃度で各細菌を接触させた後、104、103、102、101、100 CFU/mlの濃度で健常人血液に混和し、同様に試験を実施した。  その結果を、以下の表24〜表26に示す。
【０２３２】
【表２４】
2008194057.tif 000029
【０２３３】
【表２５】
2008194057.tif 000030
【０２３４】
【表２６】
2008194057.tif 000031
【０２３５】
上記結果から明らかな通り、抗生剤処理を施した細菌を用いた試験では、血液培養法は抗生剤未処理の場合に検出できた細菌量においても細菌を検出されなかったが、ハイブリゼップを用いることにより抗生剤の影響を受けずに細菌を検出できた。
【０２３６】
実施例27：感度試験の確認
本発明の性能試験のうち、感度試験に貪食サンプルが使用できるか否か検討した。
【０２３７】
なお、各種操作方法は、実施例２〜11に記載の手順に従った。
【０２３８】
貪食サンプルとして、SA貪食サンプル、SE貪食サンプル、PA貪食サンプル、EF貪食サンプル、EK貪食サンプルを用いた。  各貪食サンプルは、実施例17に記載した方法により作製した。  SA貪食サンプルは、貪食率29％、細胞数が1.05×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  SE貪食サンプルは、貪食率が47％、細胞数が1.51×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  PA貪食サンプルは、貪食率が19％、細胞数が1.99×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  EF貪食サンプルは、貪食率が33％、細胞数が1.25×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  EK貪食サンプルは、貪食率が19％、細胞数は1.13×105個/ウェルであり、「適」と判定した。
【０２３９】
図１２に示すように、貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用い、実施例２〜３に記載の手順に従って試験を行った。
【０２４０】
SA、SE、PA、EFおよびEKの各貪食サンプルを１キットにつき３度試験を行い、また当該試験を３キット行ったところ、表27および図１３(ａ)〜(ｅ)に示すように、すべての貪食サンプルにおいて菌を検出することができた。  ゆえに、貪食サンプルを実施例１〜11に示す方法の感度試験に有用であることを証明した。  ゆえに、実施例１〜11に示す方法の感度試験の規格を、既知細菌の貪食サンプルを用い、実施例２〜11に記載の手順に従って試験するとき、シグナルを検出できるものと規定した。
【０２４１】
【表２７】
2008194057.tif 000032
【０２４２】
実施例28：特異性試験の確認
性能試験のうち、特異性試験に貪食サンプルが使用できるか否か検討した。
【０２４３】
また、各種操作方法は実施例２〜11に記載の手順に従った。
【０２４４】
貪食サンプルとして、SA貪食サンプル、SE貪食サンプル、PA貪食サンプル、EF貪食サンプル、EK貪食サンプルを用いた。  各貪食サンプルは、実施例17に記載の方法によって作製した。  SA貪食サンプルは、貪食率29％、細胞数が1.05×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  SE貪食サンプルは、貪食率が47％、細胞数が1.51×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  PA貪食サンプルは、貪食率が19％、細胞数が1.99×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  EF貪食サンプルは貪食率が33％、細胞数が1.25×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  EK貪食サンプルは、貪食率が19％、細胞数が1.13×105個/ウェルであり、「適」と判定した。
【０２４５】
図１２に示すように、貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用い、実施例２〜３に記載の手順に従って試験を実施した。
【０２４６】
SA、SE、PA、EFおよびEKの各貪食サンプルを１キットに含まれる１プローブにつき３度試験を行い、また当該試験を３キット行ったところ、表28〜表31に示すように、すべての既知細菌貪食サンプルにおいて正しいシグナルを検出することができた。  図１４(ａ)〜(ｅ)に、SA貪食サンプルに対しては、SA検出用プローブ(ａ)によってのみ特異的に検出することができることを示す。  ゆえに、貪食サンプルを実施例１〜11に示す方法の特異性試験に有用であることを証明した。  ゆえに、実施例１〜11に示す方法の特異性試験の規格を、既知細菌の貪食サンプルを用い、実施例２〜11に記載の手順に従って試験するとき、該当する細菌の貪食サンプルにのみシグナルを検出できると規定した。
【０２４７】
【表２８】
2008194057.tif 000033
【０２４８】
【表２９】
2008194057.tif 000034
【０２４９】
【表３０】
2008194057.tif 000035
【０２５０】
【表３１】
2008194057.tif 000036
【０２５１】
実施例29：再現性試験の確認
貪食サンプルが再現性試験に使用できるか否か検討した。
【０２５２】
また、各種操作方法は、実施例２〜11に記載の手順に従った。
【０２５３】
貪食サンプルとして、SA貪食サンプル、SE貪食サンプル、PA貪食サンプル、EF貪食サンプル、EK貪食サンプルを用いた。  各貪食サンプルは、実施例17に記載の方法に従って作製した。  SA貪食サンプルは、貪食率29％、細胞数が1.05×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  SE貪食サンプルは、貪食率が47％、細胞数が1.51×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  PA貪食サンプルは、貪食率が19％、細胞数が1.99×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  EF貪食サンプルは貪食率が33％、細胞数は1.25×105個/ウェルであり、「適」と判定した。  EK貪食サンプルは、貪食率が19％、細胞数が1.13×105個/ウェルであり、適と判定した。
【０２５４】
図１２に示すように、貪食サンプルを塗抹したスライドグラスを用い、実施例２〜３に記載の手順に従って試験を実施した。
【０２５５】
SA、SE、PA、EFおよびEKの各貪食サンプルを１キットに含まれる１プローブにつき３度試験を行い、また当該試験を３キット行ったところ、表32〜表35に示す通り、すべての貪食サンプルにおいて正しいシグナルを検出することができた。  ゆえに、貪食サンプルは、実施例１〜11に示す方法の再現性試験に適用する上で有用であることを証明した。  ゆえに、実施例１〜11に示す方法の再現性試験の規格を、既知細菌の貪食サンプルを用いて実施例２〜11に従うものとし、特異性試験を同時に３回繰り返し試験するとき、得られる結果は同一であると規定した。
【０２５６】
【表３２】
2008194057.tif 000037
【０２５７】
【表３３】
2008194057.tif 000038
【０２５８】
【表３４】
2008194057.tif 000039
【０２５９】
【表３５】
2008194057.tif 000040
【産業上の利用可能性】
【０２６０】
本発明によって、in vitroにおいて食細胞の貪食機能を評価でき、免疫機能の評価、食細胞の分化効率の評価、食細胞機能モジュレーターのスクリーニング、効果の判定、臨床検査における投与計画の指針、感染症診断の指標、キット等の性能試験など、種々の目的に利用することができる実験的モデルが安定的に提供される。
【図面の簡単な説明】
【０２６１】
【図１】(ａ)界面活性剤(SDS)不使用下および(ｂ)界面活性剤(SDS)使用下で、in situハイブリダイゼーションを実施した結果を示す図である。
【図２】種々の白血球細胞密度で固定した際の様子を示す図である。
【図３】(ａ) Staphylococcus aureusおよびStaphylococcus epidermidis、(ｂ) Pseudomonas aeruginosaおよびEscherichia coli、ならびに(ｃ) Enterococcus faecalisに対する 溶菌酵素の活性を経時的に示す図である。
【図４】(ａ) Ｎ-アセチルムラミダーゼ 300単位/ml、(ｂ) リゾチーム10,000単位/ml、および(ｃ) リゾスタフィン 50単位/mlの溶菌活性に対するDMSOの添加による濃度依存的効果を示す図である。
【図５】白血球に形態劣化をもたらすプロテアーゼの作用を抑制するために用いるPMSFの添加効果を、(ａ) プロテアーゼ 0.2単位/mlのみ、(ｂ) PMSF １μmol/ml添加、(ｃ) PMSF 10μmol/ml添加、(ｄ) PMSF 0.1mmol/ml添加、および(ｅ) PMSF １mmol/ml添加について示す図である。
【図６】本発明に従って調製した貪食サンプルにおいて、食細胞が細菌を貪食して形態変化を起こしていることを示す図である。
【図７】貪食サンプルに対する酵素処理の効果を示す図であって、(ａ) 酵素処理前のS. aureusの貪食サンプル、(ｂ) 酵素処理前のE. faecalisの貪食サンプル、(ｃ) サンプル(a)を酵素処理した後の様子、および(ｄ) サンプル(ｂ)を酵素処理した後の様子を示す図である。
【図８】in situハイブリダイゼーションでの至適プローブ濃度の検討のために用いた貪食サンプル塗抹用のスライドグラスを示す概略図である。
【図９】in situハイブリダイゼーションでの至適温度の検討のために用いた貪食サンプル塗抹用のスライドグラスを示す概略図である。
【図１０】(ａ) SAプローブおよび(ｂ) PAプローブのジゴキシゲニンラベル化で得られる検出用プローブの鎖長とラベルによるシグナル強度を示すサザンブロット(上段)および電気泳動(下段)の図である。
【図１１】E. coli貪食サンプルに関するin situハイブリダイゼーションにおいて、検出用プローブとして、(ａ) EC-24、(ｂ) EC-34、(ｃ) EC-39、および(ｄ)プローブ(ａ)〜(ｃ)の混合プローブを用いた場合に認められたシグナル検出の結果を示す図である。
【図１２】貪食サンプルの塗抹用スライドグラスを示す概略図である。
【図１３】(ａ)SA、(ｂ)SE、(ｃ)PA、(ｄ)EFおよび(ｅ)EKの各貪食サンプルを、対応する検出用プローブを用いてin situハイブリダイゼーションを行ったときのシグナル検出の結果を示す図である。
【図１４】SA貪食サンプルに対してSA検出用プローブが特異的にシグナルを呈している様子を示す図である。
【図３】
2008194057.tif 000041
【図４】
2008194057.tif 000042
【図８】
2008194057.tif 000043
【図９】
2008194057.tif 000044
【図１２】
2008194057.tif 000045
【図１】
2008194057.tif 000046
【図２】
2008194057.tif 000047
【図５】
2008194057.tif 000048
【図６】
2008194057.tif 000049
【図７】
2008194057.tif 000050
【図１０】
2008194057.tif 000051
【図１１】
2008194057.tif 000052
【図１３】
2008194057.tif 000053
【図１４】
2008194057.tif 000054
【配列表】
2008194057000001.app