(57)【要約】【課題】磁性ビーズの結合されている疎水性重合体が壁面に結合されているマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを備えるマイクロ流体素子及びそれを利用する方法を提供する。【解決手段】マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に疎水性重合体が結合されており、前記疎水性重合体重合体には磁性ビーズが結合されているマイクロ流体素子である。【選択図】図１
2008011859.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に疎水性重合体が結合されており、前記疎水性重合体には磁性ビーズが結合されている、マイクロ流体素子。
【請求項２】
前記疎水性重合体は、水接触角が７０°〜９０°である、請求項１に記載のマイクロ流体素子。
【請求項３】
前記疎水性重合体は、ビニル系単量体の重合体である、請求項１に記載のマイクロ流体素子。
【請求項４】
前記ビニル系単量体は、Ｃ１−Ｃ２０のアルキルアクリレート、Ｃ１−Ｃ２０のアルキルメタクリレート、及びスチレンから構成される群から選択される少なくとも１種である、請求項３に記載のマイクロ流体素子。
【請求項５】
前記疎水性重合体は、架橋性単量体により架橋重合されている、請求項１〜４のいずれか１項に記載のマイクロ流体素子。
【請求項６】
前記架橋性単量体は、脂肪族架橋性単量体および芳香族架橋性単量体の少なくとも一方である、請求項５に記載のマイクロ流体素子。
【請求項７】
前記脂肪族架橋性単量体は、エチレングリコールジメタクリレート、エチレングリコールジアクリレート、トリメチロールプロパンジアクリレート、トリメチロールプロパントリアクリレート、トリメチロールプロパンジメタクリレート、トリメチロールプロパントリメタクリレート、ジビニルケトン、アリールアクリレート、ジアリルマレエート、ジアリルフマレート、ジアリルスクシネート、ジアリルカルボネート、ジアリルマロネート、ジアリルオキサレート、ジアリルアジペート、ジアリルセバケート、ジビニルセバケート、Ｎ，Ｎ’−メチレンジアクリルアミド、及びＮ，Ｎ’−メチレンジメタクリルアミドから構成される群から選択される少なくとも１種である、請求項６に記載のマイクロ流体素子。
【請求項８】
前記芳香族架橋性単量体は、ジビニルベンゼン、トリビニルベンゼン、ジビニルトルエン、ジビニルナフタレン、ジアリルフタレート、ジビニルキシレン、及びジビニルエチルベンゼンから構成される群から選択される少なくとも１種である、請求項６または７に記載のマイクロ流体素子。
【請求項９】
前記磁性ビーズは、前記疎水性重合体に共有結合によって結合されている、請求項１〜８のいずれか１項に記載のマイクロ流体素子。
【請求項１０】
ビニル系単量体と、ビニル結合を有する官能基を表面に有する磁性ビーズと、架橋性単量体と、光重合開始剤と、マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に存在するビニル結合を有する官能基と、を光重合することを含む、マイクロ流体素子の製造方法。
【請求項１１】
前記光重合反応は、前記ビニル系単量体１００質量部に対して、前記磁性ビーズ１５質量部ないし３３質量部、前記架橋性単量体２５質量部ないし７５質量部、及び前記光重合開始剤５質量部ないし１３質量部を前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバに注入し、紫外線を照射して行われる、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記ビニル系単量体は、Ｃ１−Ｃ２０のアルキルアクリレート、Ｃ１−Ｃ２０のアルキルメタクリレート、及びスチレンから構成される群から選択される少なくとも１種である、請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記架橋性単量体は、脂肪族架橋性単量体および芳香族架橋性単量体の少なくとも一方である、請求項１０または１１に記載の方法。
【請求項１４】
発光装置をさらに備える、請求項１〜９のいずれか１項に記載のマイクロ流体素子。
【請求項１５】
前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバと流体流通可能に連結されている反応チャンバ、前記反応チャンバに熱を提供するヒーター、および前記熱を冷却する冷却器を備えるＰＣＲ反応部が備えられている、請求項１〜９および１４のいずれか１項に記載のマイクロ流体素子。
【請求項１６】
請求項１〜９、１４および１５のいずれか１項に記載のマイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して、細胞またはウイルスを含む試料を流しながら、細胞またはウイルスを疎水性重合体に付着させる段階を含む、細胞またはウイルスをマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内で濃縮する方法。
【請求項１７】
前記細胞またはウイルス試料のｐＨは、ｐＨ２．０〜７．０である、請求項１６に記載の方法。
【請求項１８】
請求項１〜９、１４および１５のいずれか１項に記載のマイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して、細胞またはウイルスを含む試料を流しながら、細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階と、
前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内の磁性ビーズに光を照射して熱を発生させることで、細胞またはウイルスを破砕する段階と、
を含む細胞またはウイルスを破砕する方法。
【請求項１９】
請求項１〜９、１４および１５のいずれか一項に記載のマイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ流通を介して、細胞またはウイルスを含む試料を流しながら、細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階と、
前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内の磁性ビーズに光を照射して熱を発生させることで、細胞またはウイルスを破砕して細胞またはウイルス破砕物を得る段階と、
前記細胞またはウイルス破砕物を鋳型としてＰＣＲを行う段階と、
を含む細胞またはウイルスから標的核酸を増幅する方法。
【請求項２０】
請求項１５に記載のマイクロ流体素子において、ＰＣＲがマイクロ流体素子内のＰＣＲ反応部で行われる、請求項１９に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、マイクロ流体素子、ならびにそれを利用した細胞またはウイルス濃縮、核酸抽出及び増幅方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
マイクロ流体素子は、細胞濃縮、細胞分離、破砕、及び核酸の増幅のためのラボオンチップ（Ｌａｂ−ｏｎ−ａ−ｃｈｉｐ）として広く使われている。
【０００３】
一方、“磁性ビーズ”は、主に金属酸化物粒子が硬い重合体コーティング層で被覆されている。前記金属酸化物粒子は、常磁性または超常磁性特性を有する任意の金属酸化物または金属合金を意味する。“常磁性粒子”とは、外部磁場に敏感であるが、永久磁性ドメインを維持できない金属酸化物粒子をいう。“硬い”という用語は、粒子が被覆されて維持されるように、コーティング内で前記金属酸化物粒子を安定化させる程度に架橋された重合体コーティングを意味する。このような磁性ビーズは、当業界の周知の方法によって製造することができる。例えば、特許文献１、特許文献２、特許文献３に多様な磁性ビーズについて開示されている。
【０００４】
また、特許文献４には、複合磁性ビーズとして、ａ）一つ以上のビニル単量体を含む第１重合体の微多孔性マトリクス及びｂ）誘導可能な磁性特性を有する金属酸化物及び一つ以上のビニル単量体を有する第２重合体コーティングを含む複数個の一次ビーズであり、前記コーティングは、前記金属酸化物を被覆し、前記複数個の一次ビーズは、前記微多孔性マトリクスにわたって分布されている複合磁性ビーズが開示されている。
【特許文献１】米国特許第５，３９５，６８８号明細書
【特許文献２】米国特許第５，３１８，７９７号明細書
【特許文献３】米国特許第５，２８３，０７９号明細書
【特許文献４】米国特許第５，８３４，１２１号明細書
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
しかし、磁性ビーズが共有結合して疎水性重合体マトリクスとしてマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に共有結合されているマイクロ流体素子は、まだ開示されていない。
【０００６】
本発明の目的は、磁性ビーズが結合された疎水性重合体がマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に共有結合されているマイクロ流体素子を提供することである。
【０００７】
本発明の他の目的は、本発明のマイクロ流体素子を用いて細胞またはウイルスを濃縮する方法を提供することである。
【０００８】
本発明のさらに他の目的は、本発明のマイクロ流体素子を用いて細胞またはウイルスを破砕する方法を提供することである。
【０００９】
本発明のさらに他の目的は、本発明のマイクロ流体素子を用いて細胞またはウイルスから核酸を増幅する方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本発明は、マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に疎水性重合体が結合されており、前記疎水性重合体には、磁性ビーズが結合されているマイクロ流体素子を提供する。
【発明の効果】
【００１１】
本発明のマイクロ流体素子によれば、細胞またはウイルスを濃縮、破砕及び細胞またはウイルスから核酸を増幅する過程のうち、一つ以上の過程を効率的に行うことができる。
【００１２】
本発明の細胞またはウイルスをマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内で濃縮する方法によれば、細胞またはウイルスを前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ中に効率的に濃縮できる。
【００１３】
本発明の細胞またはウイルスを破砕する方法によれば、細胞またはウイルスをマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内で効率的に破砕できる。
【００１４】
本発明の細胞またはウイルスから標的核酸を増幅する方法によれば、細胞またはウイルスから標的核酸を効率的に増幅できる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１５】
本発明は、マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に疎水性重合体が結合されており、前記疎水性重合体には磁性ビーズが結合されている、マイクロ流体素子である。
【００１６】
本発明において、“マイクロ流体素子”とは、マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバなどのマイクロ流体要素を含む装置を指す。一つ以上の入口及び出口は、マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して連結されている。入口または出口がマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して連結されているものであれば、その名称に関係なくマイクロ流体素子に含まれる。例えば、マイクロチップやラボオンチップが含まれうる。このようなマイクロ流体素子は、細胞濃縮、細胞分離、破砕、及び核酸の増幅のために広く使われている。しかし、本願のマイクロ流体素子が、マイクロチップやラボオンチップに限定されるものではなく、単純に入口及び出口が備えられており、前記入口と出口との間がマイクロチャンネルによって連結されているか、マイクロチャンネルによって連結されたマイクロチャンバが備えられていればよい。
【００１７】
本発明において、疎水性重合体は、水接触角が７０°〜９０°の重合体でありうる。水接触角が７０°〜９０°である前記重合体は、細胞またはウイルスのような物質を結合して濃縮できる。本発明において、前記重合体は、接触角が前記範囲に含まれるものであれば、いずれの重合体でもよく、例えば、共重合体、及び架橋重合体などが含まれ、望ましくは、網状媒質を形成する架橋重合体である。
【００１８】
本発明において、“水接触角”とは、Ｋｒｕｓｓ  Ｄｒｏｐ  Ｓｈａｐｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｓｙｓｔｅｍ  Ｔｙｐｅ  ＤＳＡ  １０  Ｍｋ２によって測定された水接触角を意味する。具体的には、１．５μｌの蒸溜水滴を試料上に自動的に位置させ、前記水滴をＣＣＤ−カメラによって０．２秒ごとに１０秒間モニターし、Ｄｒｏｐ  Ｓｈａｐｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  ｓｏｆｔｗａｒｅ〈ＤＳＡ  ｖｅｒｓｉｏｎ  １．７、Ｋｒｕｓｓ〉によって分析した値を採用する。前記水滴の完全な形状は、タンジェント方法によって一般的円錐曲線の切片方程式〈ｇｅｎｅｒａｌ  ｃｏｎｉｃ  ｓｅｃｔｉｏｎ  ｅｑｕａｔｉｏｎ〉に適合化した（ｆｉｔｔｅｄ）。前記角は、右側及び左側のいずれも測定し、平均値を各水滴に対して決定し、試料当たり全５滴を測定した。前記５滴の平均を水接触角とした。
【００１９】
本発明において、前記重合体の平均分子量は、特に制限されるものではないが、ＧＰＣ（ゲル浸透クラマトグラフ）による測定で重量平均分子量が１００，０００〜１，０００，０００であることが好ましい。なお、ＧＰＣは、Ｊ．Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ，  ｐａｒｔ  Ｂ，  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｐｈｙｓｉｃｓ，  Ｖｏｌ．  ３８，  ｐ．  １３４８，  ２０００；Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｌｅｔｔｅｒｓ，  ｐ．  １０４９，２０００；などに記載されている方法によって行われる。
【００２０】
本発明のマイクロ流体素子において、前記疎水性重合体は、フリーラジカル重合反応によって重合されうるビニル二重結合を有するビニル系単量体の重合体でありうる。したがって、前記ビニル系単量体には、例えば、アクリル基を有する単量体も含まれうる。ここで、「ビニル系単量体の重合体」とは、ビニル系単量体の共重合体、ビニル系単量体と重合しうる他の単量体との共重合体、ビニル系単量体と後述する架橋性単量体との架橋重合体を含む概念である。前記ビニル系単量体は、特に限定されるものではないが、Ｃ１−Ｃ２０、好ましくはＣ１−Ｃ１０、より好ましくはＣ１−Ｃ４のアルキルアクリレート、Ｃ１−Ｃ２０、好ましくはＣ１−Ｃ１０、より好ましくはＣ１−Ｃ４のアルキルメタクリレート及びスチレンから構成される群から選択される少なくとも１種である。Ｃ１−Ｃ４のアルキル（メタ）アクリレートとしては、メチル（メタ）アクリレート、エチル（メタ）アクリレート、ｎ−プロピル（メタ）アクリレート、ｉｓｏ−プロピル（メタ）アクリレート、ｎ−ブチル（メタ）アクリレート、ｉｓｏ−ブチル（メタ）アクリレート、ｓｅｃ−ブチル（メタ）アクリレート、ｔ−ブチル（メタ）アクリレートが挙げられる。
【００２１】
本発明のマイクロ流体素子において、前記重合体は、ビニル系単量体と架橋性単量体の重合体とよって得られる架橋重合されたものでありうる。ビニル系単量体と架橋性単量体との混合比は、特に限定されるものではないが、ビニル系単量体１００重量部に対して、好ましくは架橋性単量体２５〜７５重量部、より好ましくは２５〜５０重量部である。
【００２２】
前記架橋性単量体は、当業界に知られた任意の架橋性単量体が使われうる。例えば、脂肪族架橋性単量体または芳香族架橋性単量体が使われうる。前記脂肪族架橋性単量体は、エチレングリコールジメタクリレート、エチレングリコールジアクリレート、トリメチロールプロパンジアクリレート、トリメチロールプロパントリアクリレート、トリメチロールプロパンジメタクリレート、トリメチロールプロパントリメタクリレート、ジビニルケトン、アリールアクリレート、ジアリルマレエート、ジアリルフマレート、ジアリルスクシネート、ジアリルカルボネート、ジアリルマロネート、ジアリルオキサレート、ジアリルアジペート、ジアリルセバケート、ジビニルセバケート、Ｎ，Ｎ’−メチレンジアクリルアミド、及びＮ，Ｎ’−メチレンジメタクリルアミドから構成された群から選択されたものでありうる。これらのうち、好ましくは、トリメチロールプロパンジアクリレート、トリメチロールプロパントリアクリレート、トリメチロールプロパンジメタクリレート、トリメチロールプロパントリメタクリレートであり、より好ましくは、トリメチロールプロパントリメタクリレートである。
【００２３】
また、前記芳香族架橋性単量体は、ジビニルベンゼン、トリビニルベンゼン、ジビニルトルエン、ジビニルナフタレン、ジアリルフタレート、ジビニルキシレン、及びジビニルエチルベンゼンから構成された群から選択されたものが含まれうる。上記脂肪族架橋性単量体または芳香族架橋性単量体は、単独で用いてもよく、２種以上併用してもよい。
【００２４】
本発明のマイクロ流体素子において、前記磁性ビーズは、前記疎水性重合体に共有結合によって結合されていてもよい。前記重合体と磁性ビーズとの共有結合は、当業界に知られた任意の方法によって製造できる。例えば、前記磁性ビーズの表面を一つ以上のビニル二重結合を有する官能基に官能化させ、このビニル官能基を含む磁性ビーズを前記ビニル系単量体及び／または架橋性単量体の存在下でイオンラジカル重合を行うことによって製造できる。
【００２５】
また、前記疎水性重合体とマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面との結合は、望ましくは共有結合である。前記壁面と前記疎水性重合体との共有結合も、当業界に知られた任意の方法によって行われうる。例えば、前記共有結合は、前記磁性ビーズが結合されている重合体を合成した後に、得られた重合体を官能化された壁面に反応させて結合されるか、前記壁面をフリーラジカル重合できるビニル官能基を有するように官能化した後に、フリーラジカル反応を前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内で行うことで行われうる。前記壁面にビニル官能基を導入する方法は、実施例に記載されているような、ビニル官能基を有する酸化ケイ素を利用する方法が含まれる。また、酸化ケイ素の表面ではない場合では、他の方法が使用されうる。例えば、ＰＭＭＡ及びＣＯＣのようなプラスチックにビニル官能基を導入しようとする場合、実施例に記載された３−（トリメトキシシリル）プロピルメタクリレートのような、シリル化合物がではないアクリレートまたはメタクリレート基を有する化合物を用いてＵＶを照射することで、ビニル基を導入する方法が使われる。
【００２６】
本発明で使われる磁性ビーズは、当業界に知られた任意の磁性ビーズであり、米国特許第５，３９５，６８８号、第５，３１８，７９７号、及び第５，２８３，０７９号公報に記載された磁性ビーズが使われうる。
【００２７】
本発明のマイクロ流体素子の製造方法の一具体例は、ビニル系単量体と、ビニル結合を有する官能基を表面に有する磁性ビーズと、架橋性単量体と、光重合開始剤と、マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの壁面に存在するビニル結合を有する官能基と、を光重合することを含む。
【００２８】
マイクロチャンネルあるいはマイクロチャンバの壁面、または磁性ビーズの表面に、ビニル結合を有する官能基を存在させる方法としては、ビニル結合を有する化合物とマイクロチャネル等とを常温で数時間反応させる方法が挙げられる。
【００２９】
上記ビニル結合を有する化合物としては、３−（トリメトキシシリル）Ｃ１−Ｃ４アルキルメタクリレート、３−（トリメトキシシリル）Ｃ１〜Ｃ４アルキルアクリレートが挙げられる。Ｃ１−Ｃ４のアルキルとしては、メチル基、エチル基、ｎ−プロピル基、ｉｓｏ−プロピル基、ｎ−ブチル基、ｉｓｏ−ブチル基、ｓｅｃ−ブチル基、ｔ−ブチル基が挙げられる。
【００３０】
本発明のマイクロ流体素子の製造方法の一具体例は、前記光重合反応は、前記ビニル系単量体１００重量部に対して、前記磁性ビーズを１５重量部ないし３３重量部、前記架橋性単量体を２５重量部ないし７５重量部、及び前記光重合開始剤を５重量部ないし１３重量部を前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバに注入し、紫外線を照射して行われるマイクロ流体素子でありうる。紫外線照射の条件は、特に限定されるものではないが、２５００〜７５００ｍＪ／ｃｍ２であることが好ましい。
【００３１】
本発明の前記具体例において、前記ビニル系単量体は、Ｃ１−Ｃ２０、好ましくはＣ１−Ｃ１０、より好ましくはＣ１−Ｃ４のアルキルアクリレート、Ｃ１−Ｃ２０、好ましくはＣ１−Ｃ１０、より好ましくはＣ１−Ｃ４のアルキルメタクリレート及びスチレンから構成される群から選択されるものでありうる。また、前記架橋性単量体は、脂肪族架橋性単量体または芳香族架橋性単量体の少なくとも一方であるが、脂肪族架橋性単量体であることが好ましい。なお、脂肪族架橋性単量体、芳香族架橋性単量体は、上記で列挙した単量体を具体的に用いうる。架橋性単量体のうち、好ましくは、トリメチロールプロパンジアクリレート、トリメチロールプロパントリアクリレート、トリメチロールプロパンジメタクリレート、トリメチロールプロパントリメタクリレートであり、より好ましくは、トリメチロールプロパントリメタクリレートである。
【００３２】
本発明の前記具体例において、前記光重合開始剤は、従来公知のものを用いることができるが、アセトフェノン誘導体であることが好ましく、２，２−ジメトキシ−２−フェニルアセトフェノンであることがより好ましい。
【００３３】
本発明のマイクロ流体素子において、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの内部に光を提供できるように発光装置をさらに備えてもよい。前記発光装置は、前記ビーズが吸収できる波長帯の光を出す発光装置であれば、いずれも使用できる。例えば、前記発光装置は、レーザーであってもよい。前記発光装置、例えば、レーザーは、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバにレーザーを印加して、その内部の重合体に結合されている磁性ビーズに適用できるものであれば、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの内部または外部に位置してもよい。前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの外部に位置する場合、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバと接触するか、離隔されうる。この場合、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの一つ以上の壁面は、透光性材質からなる。前記発光装置、例えば、レーザーは、磁性ビーズにレーザーを印加してレーザー加熱を誘発させて、試料中の細胞を破砕でき、蛋白質などの生物学的物質を変性させることができる。
【００３４】
本発明のマイクロ流体素子において、前記マイクロ流体素子は、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバと流体流通可能に連結されている反応チャンバ、前記反応チャンバに熱を提供するヒーター、及び前記熱を冷却する冷却器を有するＰＣＲ反応部が備えられていてもよい。したがって、本発明のマイクロ流体素子は、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバで細胞またはウイルスを含んでいる生物学的試料を濃縮し、破砕した後に得られる細胞破砕物を直接的に使用してＰＣＲを行うことができる。
【００３５】
本発明はまた、本発明によるマイクロ流体素子の前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して細胞またはウイルスを含む試料を流しながら、細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階を含む細胞またはウイルスを前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内で濃縮する方法を提供する。
【００３６】
本発明の濃縮方法は、本発明によるマイクロ流体素子の前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して細胞またはウイルスを含む試料を流す段階を含む。前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバには、前記疎水性重合体が付着されているため、細胞またはウイルスがこれらの重合体に結合される。前記細胞またはウイルス試料のｐＨは、ｐＨ２．０〜７．０、好ましくは、ｐＨ２．５〜４．０である。
【００３７】
本発明はまた、本発明によるマイクロ流体素子において、マイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して、細胞またはウイルスを含む試料を流しながら細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階と、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内の前記重合体に光を照射して熱を発生させることで、細胞またはウイルスを破砕する段階と、を含む細胞またはウイルスを破砕する方法を提供する。
【００３８】
本発明において、前記光は、前記磁性ビーズが吸収できる波長帯の光であり、前記発光装置は、前記磁性ビーズが吸収できる波長帯の光を出すものであれば、いずれも使用可能である。前記発光装置は、例えば、レーザー発生器でありうる。
【００３９】
本発明の細胞またはウイルスを破砕する方法は、前記のように、マイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して細胞またはウイルスを含む試料を流しながら、細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階を含む。
【００４０】
本発明の細胞またはウイルスを破砕する方法は、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内の前記重合体に光を照射して熱を発生させて細胞またはウイルスを破砕する段階を含む。光、例えばレーザー光を前記重合体に印加することによって、前記磁性ビーズと反応して熱を発生させ、これによって細胞またはウイルスが破砕される。破砕の際、用いられる緩衝液としては、Ｔｒｉｓ緩衝液であることが好ましい。
【００４１】
本発明はまた、本発明によるマイクロ流体素子において、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバの内部に光を提供できるように発光装置をさらに含んでおり、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバと流体流通可能に連結されている反応チャンバ、前記反応チャンバに熱を提供するヒーター、及び前記熱を冷却する冷却器を備えるＰＣＲ反応部がさらに備えられているマイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して、細胞またはウイルスを含む試料を流しながら細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階と、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内に前記磁性ビーズに光を照射して熱を発生させることで、細胞またはウイルスを破砕する段階と、前記細胞またはウイルス破砕物を鋳型としてＰＣＲを行う段階とを含む細胞またはウイルスから標的核酸を増幅する方法を提供する。
【００４２】
本発明において、前記光は、前記ビーズが吸収できる波長帯の光であり、前記発光装置は、前記ビーズが吸収できる波長帯の光を出すものであれば、いずれも使用可能である。前記発光装置は、例えば、レーザー発生器でありうる。
【００４３】
本発明の細胞またはウイルスから標的核酸を増幅する方法は、マイクロ流体素子のマイクロチャンネルまたはマイクロチャンバを介して細胞またはウイルスを含む試料を流しながら、細胞またはウイルスを前記疎水性重合体に付着させる段階と、前記マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内の前記磁性ビーズに光を照射して熱を発生させることで、細胞またはウイルスを破砕する段階とを含み、これらについては前記した通りである。
【００４４】
本発明の細胞またはウイルスから標的核酸を増幅する方法はまた、前記細胞またはウイルス破砕物を鋳型としてＰＣＲを行う段階を含む。“ＰＣＲ（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  ｃｈａｉｎ  ｒｅａｃｔｉｏｎ）”は当業界で周知である。例えば、米国特許第４，６８３，１９５号、第４，６８３，２０２号、及び第４，９６５，１８８号公報にＰＣＲについて詳細に記載されており、これらの方法によってＰＣＲを行うことができる。ＰＣＲは、適切な条件下でＤＮＡポリメラーゼのような重合剤及びｄＮＴＰの存在下でプライマーを標的核酸（“鋳型”ともいう）の鎖に混成化することに関連する。プライマー延長産物が変成されれば、前記鋳型の一つのコピーが製造されたことであり、アニーリング、延長及び変性の周期を所望の回数だけ行って、標的核酸と同じ配列を有する核酸の量を指数的に増加させる。
【００４５】
本発明の細胞またはウイルスから標的核酸を増幅する方法において、前記ＰＣＲは、前記マイクロ流体素子内の前記ＰＣＲ反応部で行われる。
【実施例】
【００４６】
以下、本発明を実施例を通じてさらに詳細に説明する。しかし、それら実施例は、本発明を例示的に説明するためのものであり、本発明の範囲がそれら実施例に限定されるものではない。
【００４７】
実施例１：マイクロチャンネルまたはマイクロチャンバ内で磁性ビーズと共重合された重合体の合成
本実施例では、磁性ビーズとＴＭＣ−１０００（サムスンテックウィン）用マイクロチップのマイクロチャンバ（体積６μｌ）の表面とを３−（トリメトキシシリル）プロピルメタクリレートと反応させて、ビニル官能基を有するようにした。前記マイクロチップのマイクロチャンバは、湿式エッチングされたシリコンと孔を有するガラスとを接合させて製作されたものである。次に、前記磁性ビーズ、ビニル系単量体としてブチルメタクリレート、架橋性単量体としてトリメチロールプロパントリメタクリレート、及び光重合開始剤として２，２−ジメトキシ−２−フェニルアセトフェノンを前記マイクロチャンネル内でＵＶを照射して光重合させることで、磁性ビーズが結合されている架橋されたポリブチルメタクリレートが壁面に共有結合されているマイクロチャンバを製造した。
【００４８】
（１）磁性ビーズのメタクリレート官能基化
酸化ケイ素表面を有する磁性ビーズ（ＢＩＯＣＩＮＥ社、直径１μｌ）１ｍｌ（４０ｍｇ）をマイクロチューブに添加し、０．１Ｎ  ＮａＯＨで３回、蒸溜水で１回、０．１Ｎ  ＨＣｌで３回、蒸溜水で１回洗浄した後、アセトンで３回洗浄した。磁石を用いて前記磁性ビーズを溶液から分離した後、ここに３０％  ３−（トリメトキシシリル）プロピルメタクリレート溶液（ｖ／ｖ、アセトン）を加え、１２時間よく混合しながら反応させた。反応が完了した後、アセトンで３回、メタノールで３回洗浄した後、メタノール１ｍｌに懸濁して保管した。
【００４９】
（２）マイクロチャンバの内部表面のメタクリレート官能基化
ＴＭＣ−１０００（サムスンテックウィン）用マイクロチップのマイクロチャンバ（体積６μｌ）に０．１Ｎ  ＮａＯＨを入れて２０分間放置した後、溶液を除去して水で洗浄した。さらに０．１Ｎ  ＨＣｌを入れて２０分間放置した後、溶液を除去して水とアセトンとでそれぞれ洗浄した。
【００５０】
マイクロチャンバを乾燥させた後、３０％  ３−（トリメトキシシリル）プロピルメタクリレート溶液（ｖ／ｖ、アセトン）を加え、１２時間常温で放置した後、アセトンで３回洗浄した後、オーブンで乾燥した。
【００５１】
（３）ブチルメタクリレート共重合体の合成
１５重量％のブチルメタクリレート、１０重量％のトリメチロールプロパントリメタクリレート（ＴＲＩＭ）、５０重量％のメタノール、２５重量％のヘキサンを含む溶液を製造した後、ここに２，２−ジメトキシ−２−フェニルアセトフェノン１０ｍｇ（ブチルメタクリレート１００重量部に対して６．７重量部）を溶解した。
【００５２】
得られた混合溶液１００μｌに、（１）で磁石を用いて除去して得られたメタクリレート官能化した磁性ビーズ１００μｌ（ブチルメタクリレート１００重量部に対してメタクリレート官能化した磁性ビーズ２６．７重量部）を添加し、よく混合した。この溶液を（２）でメタクリレート官能化したマイクロチャンバに注入した後、ここにＵＶ−ｃｒｏｓｓｌｉｎｋｅｒ（ＣＬ−１０００）を用いて５０００ｍＪ／ｃｍ２のエネルギーで４分間２５４ｎｍの光に露光した。次に、反応物中の溶液をチップ自体を遠心分離して除去し、反応産物をメタノールで３回洗浄した後、オーブンで乾燥した。対照群として、磁性ビーズが結合されていない重合体は、磁性ビーズを混合する過程を除いては同一に合成した。
【００５３】
図１は、マイクロチャンバ内で合成された磁性ビーズが結合されている架橋されたポリブチルメタクリレートを示す図である。図１に示すように、架橋されたポリブチルメタクリレートには、多くの気孔が存在する。合成された疎水性重合体の水接触角は、７５°であった。
【００５４】
実施例２：磁性ビーズの結合されている疎水性重合体が結合されているマイクロチャンバでの細胞濃縮
本実施例では、磁性ビーズの結合されている架橋されたポリブチルメタクリレートが結合されているマイクロチャンバで細胞を含む試料を流して細胞を濃縮した。
【００５５】
まず、１００ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ４．０）中に０．０１  ＯＤ６００となるように大腸菌を添加し、大腸菌溶液を実施例１で準備した重合体が結合されているマイクロチャンバに５０μｌ／分の速度で３分間流した。前記マイクロチャンバ通過前後の溶液を１×ＰＢＳで１０，０００倍希釈し、細胞培養に使われるフィルムである３Ｍ  ＰｅｔｒｉＦｉｌｍに塗抹し、生育された大腸菌コロニー数を測定して、前記マイクロチャンバ通過前後の細胞濃度を測定した。これに基づいて、前記マイクロチャンバ通過前後の細胞数を比較して、前記マイクロチャンバ中の重合体に大腸菌が結合した結合比率を計算し、マイクロチャンバの体積とマイクロチャンバを通過した溶液の体積とを比較して、大腸菌の濃縮率を計算した（表１参照）。
【００５６】
【表１】
2008011859.tif 000003
【００５７】
表１に示したように、大腸菌は、磁性ビーズが結合されているか否かに関係なく、約１０倍以上濃縮されたことが分かる。
【００５８】
実施例３：磁性ビーズの結合されている疎水性重合体が結合されているマイクロチャンバでの細胞濃縮及び細胞破砕、及び前記細胞破砕物を利用したＰＣＲ
本実施例では、実施例２で濃縮された大腸菌をレーザーを用いて破砕し、その破砕物を直接ＰＣＲに用いて大腸菌核酸を増幅した。
【００５９】
まず、実施例２のように大腸菌濃縮が完了した後、マイクロチャンバから溶液を除去し、ここにＴｒｉｓ（１０ｍＭ、ｐＨ９．０）または１×ＰＢＳ溶液を満たした。次に、前記マイクロチャンバの上部基板を通じて８０８ｎｍ波長のレーザー光をレーザー発生器（Ｈａｍａｍａｔｓｕ  ８４４６−７２社、１Ｗ）を用いて４０秒間前記重合体−磁性ビーズに照射した。その結果から得られる細胞破砕物をＰＣＲに直接使用した。
【００６０】
ＰＣＲマスター混合物は、１０×Ｓｏｌｇｅｎｔ緩衝液２０μｌ、ｔａｇポリメラーゼ（Ｓｏｌｇｅｎｔ）４μｌ、ｄＮＴＰ（１０ｍＭｍ、Ｓｏｌｇｅｎｔ）４μｌ、フォワードプライマー（１０μＭ）及びリバースプライマー（１０μＭ）をそれぞれ１０μｌ（それぞれ配列番号１及び２）及びＴａｑＭａｎ  ｐｒｏｂｅ（１０μＭ）（配列番号３）８μｌの混合物（総５６μｌ）であり、前記マスター混合物と前記マイクロチャンバから分離された細胞破砕物とを３：１（ｖ／ｖ）で混合した後、ＴＭＣ−１０００のＰＣＲ反応チャンバに１μｌ注入してＰＣＲを行った。
【００６１】
ＰＣＲ条件は、９５℃で１分間変性させた後、９５℃で５秒、４５℃で２０秒、７２℃で２０秒を４０回行った。リアルタイムでＰＣＲを行いつつＣｔ値を測定した。その結果は表２のようである。
【００６２】
【表２】
2008011859.tif 000004
【００６３】
表２に示したように、重合体−磁性ビーズを使用した場合のＣｔ値が、使用しない場合に比べて減少した。これは、磁性ビーズが存在する場合にレーザー光によって細胞破砕がさらに効率的に起こるためであると考えられる。
【００６４】
本実施例では、前記ＰＣＲ産物を電気泳動し、それから得られた産物をＬａｂＣｈｉｐ（Ａｇｉｌｅｎｔ社）を用いて分析した。その結果は表３のようである。
【００６５】
【表３】
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【００６６】
表３に示したように、Ｔｒｉｓ緩衝液を破砕緩衝液として使用した場合、Ｃｔ値と一致して磁性ビーズが結合された共重合体で産物がさらに多く増幅された。
【００６７】
図２は、磁性ビーズが結合されている疎水性重合体が共有結合されているマイクロチャンバで大腸菌細胞を濃縮し、レーザーを用いて細胞を破砕し、細胞破砕物を直接鋳型としてＰＣＲして得られた産物を電気泳動した結果を示す図である。各レーンについての説明は、前記表３に示した通りである。
【産業上の利用可能性】
【００６８】
本発明は、マイクロ流体素子関連の技術分野に好適に用いられる。
【図面の簡単な説明】
【００６９】
【図１】マイクロチャンバ内で合成された磁性ビーズが結合されている架橋されたポリブチルメタクリレートを示す図である。
【図２】図２は磁性ビーズが結合されている疎水性重合体が共有結合されているマイクロチャンバで大腸菌細胞を濃縮し、レーザーを用いて細胞を破砕し、細胞破砕物を直接鋳型としてＰＣＲを行って得られた産物を電気泳動した結果を示す図である。
【図１】
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【図２】
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【配列表】
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