(57)【要約】【課題】実験仮説の検証に用いる文献の信頼性評価する手段を提供する。【解決手段】本発明による文献の信頼性評価システムは、文献情報を保持する文献データベースと、文献の投稿先雑誌の有用度を保持する雑誌有用度リストと、実験仮説の検証のために必要となるキーワードの入力を促すための入力画面を提供し、この入力画面にて入力されたキーワードを受付ける条件入力処理部と、上記条件入力部によって受付けた条件に基づいて、上記文献データベースをテキストマイニング検索し、文献リストと該文献の信頼度と文献投稿先の雑誌名を検索するテキストマイニング処理部と、上記テキストマイニング検索によって抽出された文献の信頼性を計測する信頼性計測処理部と、上記テキストマイニング検索の結果である文献名とその信頼性を表示する結果出力処理部と、を有する。【選択図】図５
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
文献情報を保持する文献データベースと、文献の投稿先雑誌の有用度を保持する雑誌有用度リストと、実験仮説の検証のために必要となるキーワードの入力を促すための入力画面を提供し、この入力画面にて入力されたキーワードを受付ける条件入力処理部と、上記条件入力部によって受付けた条件に基づいて、上記文献データベースをテキストマイニング検索し、文献リストと該文献の信頼度と文献投稿先の雑誌名を検索するテキストマイニング処理部と、上記テキストマイニング検索によって抽出された文献の信頼性を計測する信頼性計測処理部と、上記テキストマイニング検索の結果である文献名とその信頼性を表示する結果出力処理部と、を有する文献の信頼性評価システム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ライフサイエンス分野における文献を評価する方法に関し、特に、実験仮説の検証に用いて好適な文献の信頼性評価システムに関する。
【背景技術】
【０００２】
ライフサイエンス分野における実験の成果は、バイオデータベースという名のもとに、塩基配列データ、蛋白質アミノ酸配列データ、蛋白質立体構造データ、生体分子間の相互作用データなど、様々な情報がテキスト形式の文書で保存され、公開されている。
【０００３】
これらのデータには、通常、アノテーション（注釈）情報や文献情報が付随している。近年、テキストマイニング技術を使用して、公開されている大量のデータの中から必要な情報を抽出することが可能となっている。
【０００４】
しかしながら、世の中で公開されているデータは膨大であり、その特性も性質も様々である。従って、１回の検索だけでは満足する情報を収集することはできない。そのため、スクリーニングを複数回繰り返して必要なデータを必要な量だけ入手する。
【０００５】
ところで、収集したデータから、新たな実験仮説を立ててそれを検証しようとする場合、収集されたデータの信頼性が重要となる。
【０００６】
公開されている多種多様なデータベースから収集したデータには、信頼性を評価する共通の基準となるものは記載されていない。そのため、必要とする分野の文献を網羅的に収集すると同時に信頼性を検証しなければならない。従って、データ収集と検証に膨大な時間と労力を費やす必要があるのが現状である。本発明に関連する公知技術としては下記の特許文献がある。
【０００７】
【特許文献１】特開２００６−９９４２３号公報
【発明の開示】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
従来の技術では、実験仮説の検証を行うとき、テキストマイニング検索によって文献を収集することができる。テキストマイニング検索では、収集対象のデータに記載されているテキスト情報から直接的に特徴を抽出する。このような方法では、対象としているデータに信頼性を評価するための基準となる情報が含まれていない場合には、別のデータベースから信頼性に関わる特徴を２次的に抽出しなければならない。
【０００９】
本発明の目的は、実験仮説の検証に用いる文献の信頼性を評価する手段を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【００１０】
本発明による文献の信頼性評価システムは、文献情報を保持する文献データベースと、文献の投稿先雑誌の有用度を保持する雑誌有用度リストと、実験仮説の検証のために必要となるキーワードの入力を促すための入力画面を提供し、この入力画面にて入力されたキーワードを受付ける条件入力処理部と、上記条件入力部によって受付けた条件に基づいて、上記文献データベースをテキストマイニング検索し、文献リストと該文献の信頼度と文献投稿先の雑誌名を検索するテキストマイニング処理部と、上記テキストマイニング検索によって抽出された文献の信頼性を計測する信頼性計測処理部と、上記テキストマイニング検索の結果である文献名とその信頼性を表示する結果出力処理部と、を有する。
【００１１】
本発明による文献の信頼性評価システムは、文献データベースを最新の状態で保持する文献データベース更新処理部と、雑誌有用度リストを最新の状態で保持する雑誌有用度リスト更新処理部を有する。
【発明の効果】
【００１２】
本発明によれば、実験仮説の検証に用いる文献の信頼性評価する手段を提供することができる。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１３】
以下、本発明を実施する場合の一形態を図面を参照して具体的に説明する。
【００１４】
図１は、本発明による文献の信頼性を評価するためのシステムの概念図である。本例のシステムは、テキストマイニングを行うサーバコンピュータ（以下、単にサーバ１という）と、利用者がサーバ１を利用するためにキーワードの入力や、評価結果の参照を行うクライアントコンピュータ（以下、単にクライアント２という）とを有し、両者は、互いに、ネットワーク３によって接続されている。サーバ１は、文献情報を保持する文献データベース１７、及び、文献の投稿先雑誌の有用度を保持する雑誌有用度リスト１８を有する。尚、有用度とは、利用度、知名度等を数値化したものである。
【００１５】
サーバ１は、条件入力処理部１１、テキストマイニング処理部１２、信頼性計測処理部１３、結果出力処理部１６、文献データベース更新処理部１４、及び、雑誌有用度リスト更新処理部１５を有し、本発明による文献の信頼性評価システムを構成する。条件入力処理部１１は、クライアント２の利用者に対して実験仮説の検証のために必要となるキーワードの入力を促すための入力画面を提供し、この入力画面にて入力されたキーワードを受付ける。テキストマイニング処理部１２は、受付けた条件に基づいて、文献データベース１７をテキストマイニング検索する。信頼性計測処理部１３は、テキストマイニング検索によって抽出された文献の信頼性を計測する。結果出力処理部１６は、テキストマイニング検索の結果である文献名とその信頼性を表示する。文献データベース更新処理部１４は、文献データベースを最新の状態で保持する。雑誌有用度リスト更新処理部１５は、雑誌有用度リストを最新の状態で保持する。
【００１６】
図２は、文献データベース１７の例を示す図である。本例の文献データベース１７は、文献ＩＤ２１、各文献ＩＤに対する題名２２、本文２３、及び、投稿先雑誌名２４の組が格納されている。本例では、文献情報として、題名（タイトル）、本文、投稿先雑誌名を格納するが、この他に、アブストラクト、作者、出版年なども付加的に格納してもよい。
【００１７】
図３は、実験仮説の検証のために必要となるキーワードの入力を促すための入力画面の例を示す。本例の入力画面３１は、実験仮説の検証に必要なキーワードの入力フィールド群３２と、入力されたキーワードをサーバに送信するためのボタン３３を有する。キーワードの入力フィールド群３２には、分野、実験手法、及び、事象の３つのカテゴリが示されている。利用者は、分野、実験手法、及び、事象の欄に、キーワードを入力し、ボタン３３をクリックする。尚、図示のカテゴリ以外に、実験実施機関なども加えてもよい。更に、これらカテゴリ毎に入力されたキーワードに対して重み付けを加えることができるインタフェースを用意しても良い。
【００１８】
図４は、テキストマイニング結果と信頼性を複合的に評価して表示する結果表示画面の例を示した図である。本例の結果表示画面４１は、入力されたキーワードに基づいてテキストマイニング検索を行った結果である文献リスト４２と、各文献の投稿先雑誌名４３と、各文献の信頼度４４と、各文献に含まれるキーワードの頻度４５とを有する。なお、文献リスト４２の文献は、信頼度４４の値の順にソーティングされて表示されている。更に、キーワードの頻度４５には、入力されたキーワードの頻度ばかりでなく、入力キーワードに関連性のあるキーワードの頻度が表示されている。即ち、図４の結果表示画面において、最初のキーワードは、入力されたキーワードであるが、次のキーワードは、入力キーワードに関連性のあるキーワードである。
【００１９】
図５を参照して、本発明による実験仮説における文献の評価方法を説明する。利用者は、クライアント２にて、実験仮説検証に必要なキーワードを入力する。上述のように、キーワードは、分野、実験手法、及び、事象の３つのカテゴリについて選択又は指定する。キーワードはサーバに送られる。ステップＳ５０１にて、サーバ１の条件入力処理部１１は、クライアント２から送信されたキーワードを受信する。ステップＳ５０２にて、サーバ１のテキストマイニング処理部１２は、テキストマイニング検索によって、受信したキーワードを特徴とする文献を文献データベース１７から検索し、図４に示したように、文献リストを作成する。ステップＳ５０３にて、サーバ１のテキストマイニング処理部１２は、各文献に対する文献投稿先の雑誌名を検出する。ステップＳ５０４にて、サーバ１の信頼性計測処理部１３は、文献リストの各文献の信頼度を計算する。
【００２０】
ここで、信頼度の計算方法を説明する。先ず、雑誌有用度リスト１８を検索し、文献投稿先の雑誌名の有用度を検出する。次に、文献リストの各文献における、キーワードの出現頻度を計測する。ここでは、入力されたキーワードの頻度ばかりでなく、入力キーワードに関連性のあるキーワードの頻度を計測する。こうして、各文献に対して、文献投稿先の雑誌の有用度とキーワードの出現頻度より、所定の式を用いて信頼度を計算する。例えば、有用度と頻度を単純に加算してもよく、有用度と出現頻度を乗算してもよい。
【００２１】
ステップＳ５０５にて、結果出力処理部１６は、図４に示した結果表示画面を表示する。この結果表示画面は、クライアント２にて表示される。ステップＳ５０６にて、サーバ１の文献データベース更新処理部１４は、文献データベース１７の内容を更新する。即ち、テキストマイニング処理部１２によって検索された結果より、図２の文献データベース１７の内容を更新する。ステップＳ５０７にて、サーバ１の雑誌有用度リスト更新処理部１５は、雑誌有用度リスト１８の内容を更新する。即ち、テキストマイニング処理部１２によって検索された結果より、雑誌有用度リスト１８の内容を更新する。
【００２２】
本発明によれば、利用者は、想定される実験仮説の評価を行うときに必要な、特定テーマに関する文献の収集、収集された文献集合に対する網羅的な分析、分析結果に対する判断といったプロセスに費やす時間と労力の省力化を図ることが可能となる。
【００２３】
以上、本発明の例を説明したが本発明は上述の例に限定されるものではなく、特許請求の範囲に記載された発明の範囲にて様々な変更が可能であることは当業者に容易に理解されよう。
【図面の簡単な説明】
【００２４】
【図１】本発明による実験仮説評価システムの概念を示す図である。
【図２】本発明による文献データベースの例を示す図である。
【図３】本発明による実験仮説評価システムにおいて、利用者にキーワードの入力を促すためのインタフェースの例を示す図である。
【図４】本発明による実験仮説評価システムにおいて、テキストマイニング結果と信頼性を複合的に評価して表示する画面の例を示す図である。
【図５】本発明による実験仮説評価システムによる処理の例を示す図である。
【符号の説明】
【００２５】
１…サーバ、２…クライアント、３…ネットワーク、１１…条件入力処理部、１２…テキストマイニング処理部、１３…信頼性計測処理部、１４…文献データベース更新処理部、１５…雑誌有用度リスト更新処理部、１６…結果出力処理部、１７…文献データベース、１８…雑誌有用度リスト
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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