(57)【要約】  本発明は、融合ポリペプチドを含む組成物並びにＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び目的の異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチドを作製するための方法を提供する。
2021501570.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
式（Ｉ）の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ（セレブロン）結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド、例えば異種哺乳動物、細菌又はウイルスポリペプチドを含む融合ポリペプチドであって、式（Ｉ）の前記化合物は、
【化１】
2021501570.tif 000250
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体である、融合ポリペプチド。
【請求項２】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、前記異種ポリペプチドに融合される、請求項１に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドは、ペプチド結合によって連結される、請求項１又は２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドは、ペプチド結合以外の結合によって連結される、請求項１又は２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５】
前記異種ポリペプチドは、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに直接的に連結される、請求項１〜４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６】
前記異種ポリペプチドは、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに間接的に連結される、請求項１〜４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドは、リンカー、例えばグリシン−セリンリンカー、例えば配列番号２８のアミノ酸配列を含むリンカーを介して作動可能に連結される、請求項１〜６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、前記異種ポリペプチドのＣ末端又はＮ末端に連結される、請求項１〜７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９】
ＣＯＦ１の非存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとセレブロン（ＣＲＢＮ）との会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である、請求項１〜８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１の非存在下でＣＲＢＮに結合しない、請求項１〜９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１】
ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２】
ＣＯＦ１の非存在下でＣＲＢＮに結合しない、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３】
ＣＯＦ１の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４】
ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５】
前記異種ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドは、ＣＯＦ１の存在下おいて１つ以上のリジン又はメチオニン残基でユビキチン化される、請求項１３又は１４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６】
ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７】
前記融合ポリペプチドの分解は、ＣＯＦ１の存在下でユビキチン化によって媒介される、請求項１６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項９〜１７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１０〜９５のアミノ酸残基長、１５〜９０のアミノ酸残基長、２０〜８５のアミノ酸残基長、２５〜８０のアミノ酸残基長、３０〜７５のアミノ酸残基長、３５〜７０のアミノ酸残基長、４０〜６５のアミノ酸残基長、４５〜６０のアミノ酸残基長、５０〜６５のアミノ酸残基長又は５５〜６５のアミノ酸残基長である、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターンを含む、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２１】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βヘアピンを含む、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２２】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βストランドを含む、請求項１〜２１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２３】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、αヘリックスを含む、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２４】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む、請求項１〜２３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２５】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む、請求項１〜２４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２６】
前記βヘアピン及び前記第２のαヘリックスは、６０、５０、４０又は３０個以下のアミノ酸残基によって隔てられている、請求項２５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２７】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド又はそのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド又はそのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体、例えば天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４、ＩＫＺＦ５又はそのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合配列を含む、請求項１〜２６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２８】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合配列は、前記天然に存在するポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４又はＩＫＺＦ５に由来する２つ以上の非連続的な配列を含む、請求項２７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２９】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦポリペプチド又はその構造モチーフを含む、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０】
前記ＩＫＺＦポリペプチドは、ＩＫＺＦ１ポリペプチド、ＩＫＺＦ３ポリペプチド、Ｈ１４１Ｑ置換（配列番号２１に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ２ポリペプチド、又はＨ１８８Ｑ置換（配列番号２２に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ４ポリペプチドである、請求項２９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ（例えば、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフを含む、請求項１〜３０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３２】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項３１に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３３】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む、請求項１〜３２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３４】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３５】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項３４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３６】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）は１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項１〜３５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３７】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項１〜３３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３８】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項３７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３９】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項１〜３３、３７又は３８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４０】
以下のアミノ酸残基：配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミン、１４８位のシステイン、１５０位のグルタミン、１５２位のグリシン、１６１位のロイシン又は１６２位のロイシンの１つ、２つ、３つ又は全ては、不変のままである、請求項３６〜３９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４１】
配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミンは、不変のままである、請求項４０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４２】
配列番号１９に従って番号付けされる１４８位のシステインは、不変のままである、請求項４０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４３】
配列番号１９に従って番号付けされる１５２位のグリシンは、不変のままである、請求項４０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４４】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１３９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４０のアミノ酸配列を含む、請求項１〜４３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４５】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５又は７７のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜４４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４６】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６又は７８のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜４４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４７】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項１〜４６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４８】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項４７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項４９】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９から１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項１〜４８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５０】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む、請求項１〜４９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５１】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む、請求項１〜４９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５２】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項１〜５１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５３】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項５２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５４】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列（例えば、配列番号５のアミノ酸配列を含む第１の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる第１の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる第１の配列）；及びＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第２の配列（例えば、配列番号１１のアミノ酸配列を含む第２の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる第２の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる第２の配列）を含む、請求項１〜５３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５５】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１又は３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜５４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５６】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１又は３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜５５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５７】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１４又は８５のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜５６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５８】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含み、例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１５又は８６のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜５６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項５９】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、対応する天然配列よりも少なくとも１つ少ないリジンを含む、請求項１〜５８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６０】
前記対応する天然配列中の１つ以上のリジン残基は、異なるアミノ酸、例えばアルギニンによって置き換えられる、請求項５９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６１】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１、２、３、４又は５個未満のリジン残基を含む、請求項５９又は６０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６２】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、リジン残基を含まない、請求項６１に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６３】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、ＣＯＦ１の存在下において、例えば本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ユビキチン化されず、任意選択により、ユビキチン化は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１〜６２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６４】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４、４１、４２及び４３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６５】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２又は４のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項１〜６３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６６】
前記ＣＯＦ１は、免疫調節性イミド薬剤（ＩＭｉＤ）又はその薬学的に許容される塩である、請求項１〜６５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６７】
前記ＣＯＦ１は、式（Ｉ−ａ）：
【化２】
2021501570.tif 000251
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体の構造を有する、請求項１〜６５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６８】
Ｘは、Ｏである、請求項６７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項６９】
Ｍは、存在しない、請求項６７又は６８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７０】
環Ａは、ヘテロシクリル（例えば、窒素含有ヘテロシクリル、例えば２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）イソインドリン−１，３−ジオン）である、請求項６７〜６９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７１】
Ｒ４は、オキソ又はＯＲＢ（例えば、−ＯＣＨ３又は−ＯＣＨ２ＣＨ３）であり、且つｏは、０、１又は２である、請求項６７〜７０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７２】
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素であるか、又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基を形成する、請求項６７〜７１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７３】
Ｒ３ａは、ヘテロアルキル（例えば、−ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２）、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ（例えば、−ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ３）である、請求項６７〜７２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７４】
ｎは、０である、請求項６７〜７３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７５】
前記ＣＯＦ１は、サリドマイド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である、請求項１〜７４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７６】
前記ＣＯＦ１は、レナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド及び２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される、請求項１〜７４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７７】
前記ＣＯＦ１は、
【化３】
2021501570.tif 000252
又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される、請求項１〜７４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７８】
前記ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩である、請求項１〜７４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項７９】
前記ＣＯＦ１は、レナリドミド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である、請求項１〜７４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８０】
分解ドメインをさらに含み、前記分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位によって前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドから隔てられている、請求項１〜７９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８１】
Ｎ末端からＣ末端までに、
ｉ）前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド；
ｉｉ）前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチド；
ｉｉｉ）前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、前記異種ポリペプチド、前記異種プロテアーゼ切断部位及び前記分解ドメイン；又は
ｉｖ）前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、前記異種プロテアーゼ切断部位及び前記分解ドメイン
を含む、請求項８０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８２】
Ｎ末端からＣ末端までに、前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む、請求項８０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８３】
異種プロテアーゼ切断部位によって隔てられた第１のドメイン及び第２のドメインを含む融合ポリペプチドであって、前記第１のドメインは、分解ドメインを含み、及び前記第２のドメインは、式（ＩＩ）の化合物（ＣＯＦ２）／ＣＲＢＮ（セレブロン）結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド、例えば異種哺乳動物、細菌又はウイルスポリペプチドを含み、式（ＩＩ）の前記化合物は、
【化４】
2021501570.tif 000253
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ１０の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）若しくは−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ又はＬ−タグであり；各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１１で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｌは、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ１、−ＯＲＢ１、−Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｎ（ＲＣ１）Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ１）（ＲＤ１）又は−Ｎ（ＲＣ１）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１であり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１２で置換され；
各タグは、標的タンパク質に結合可能な標的化部分であり；
ＲＡ１、ＲＢ１、ＲＣ１、ＲＤ１及びＲＥ１の各々は、独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１２で置換され；
各Ｒ１２は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、シアノ、カルボシクリル又はヘテロシクリルであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、互変異性体若しくはプロドラッグである、融合ポリペプチド。
【請求項８４】
前記分解ドメインは、前記融合ポリペプチドの発現の第１のレベルと関連する第１の状態及び前記融合ポリペプチドの発現の第２のレベルと関連する第２の状態を有し、前記第２のレベルは、例えば、安定化化合物の存在下で前記第１のレベルの少なくとも２、３、４、５、１０、２０又は３０倍増大される、請求項８０〜８３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８５】
前記安定化化合物の非存在下において、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、前記融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される、請求項８４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８６】
前記発現のレベル及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項８４又は８５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８７】
前記安定化化合物の存在下において、
ｉ）前記分解ドメインは、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；又は
ｉｉ）前記融合ポリペプチドの前記立体構造は、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、前記異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的である、請求項８４〜８６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８８】
前記分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン又はジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインから選択される、請求項８０〜８７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項８９】
前記分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインである、請求項８８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９０】
前記分解ドメインは、配列番号４６又は４８と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項８９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９１】
前記分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む、請求項９０に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９２】
前記安定化化合物は、バゼドキシフェン若しくは４−ヒドロキシタモキシフェン（４−ＯＨＴ）又はその薬学的に許容される塩である、請求項８９〜９１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９３】
前記分解ドメインは、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインである、請求項８８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９４】
前記分解ドメインは、配列番号５０と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項９３に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９５】
前記安定化化合物は、Ｓｈｉｅｌｄ−１又はその薬学的に許容される塩である、請求項９３又は９４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９６】
前記分解ドメインは、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインである、請求項８８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９７】
前記分解ドメインは、配列番号５１と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項９６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９８】
前記安定化化合物は、トリメトプリム又はその薬学的に許容される塩である、請求項９６又は９７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項９９】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞内プロテアーゼによって切断される、請求項８０〜９８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１００】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、フューリン、ＰＣＳＫ１、ＰＣＳＫ５、ＰＣＳＫ６、ＰＣＳＫ７、カテプシンＢ、グランザイムＢ、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択されるプロテアーゼによって切断される、請求項９９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０１】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＸ（Ｋ／Ｒ）Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５２）、ＲＸＸＸ［ＫＲ］Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５３）、ＲＲＸコンセンサスモチーフ（配列番号５４）、Ｉ−Ｅ−Ｐ−Ｄ−Ｘコンセンサスモチーフ（配列番号５５）、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択される切断モチーフを有する配列を含む、請求項９９又は１００に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０２】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、フューリンによって切断される、請求項９９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０３】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＴＫＲ（配列番号１２３）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲ（配列番号１２７）；ＬＱＷＬＥＱＱＶＡＫＲＲＴＫＲ（配列番号１２９）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＧ（配列番号１３１）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧ（配列番号１３３）；ＳＬＮＬＴＥＳＨＮＳＲＫＫＲ（配列番号１３５）；ＣＫＩＮＧＹＰＫＲＧＲＫＲＲ（配列番号１３７）；及びＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）からなる群から選択されるフューリン切断部位を含む、請求項１０２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０４】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）のフューリン切断部位を含む、請求項１０２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０５】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞外プロテアーゼによって切断される、請求項８０〜９８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０６】
前記哺乳動物の細胞外プロテアーゼは、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択される、請求項１０５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０７】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１０６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０８】
前記分解ドメインは、前記異種プロテアーゼ切断部位に融合され、前記異種プロテアーゼ切断部位は、前記第２のドメインにさらに融合される、請求項８３〜１０７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１０９】
Ｎ末端からＣ末端までに、
ｉ）前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド；
ｉｉ）前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチド；
ｉｉｉ）前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、前記異種ポリペプチド、前記異種プロテアーゼ切断部位及び前記分解ドメイン；又は
ｉｖ）前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、前記異種プロテアーゼ切断部位及び前記分解ドメイン
を含む、請求項８３〜１０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１０】
Ｎ末端からＣ末端までに、前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む、請求項８３〜１０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１１】
ＣＯＦ２の非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとセレブロン（ＣＲＢＮ）との会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である、請求項８３〜１１０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１２】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ２の非存在下でＣＲＢＮに結合しない、請求項８３〜１１１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１３】
ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である、請求項８３〜１１２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１４】
ＣＯＦ２の非存在下でＣＲＢＮに結合しない、請求項８３〜１１３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１５】
ＣＯＦ２の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項８３〜１１４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１６】
ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項８３〜１１５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１７】
前記異種ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドは、ＣＯＦ２の存在下おいて１つ以上のリジン又はメチオニン残基でユビキチン化される、請求項１１５又は１１６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１８】
ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項８３〜１１７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１１９】
前記融合ポリペプチドの分解は、ＣＯＦ２の存在下でユビキチン化によって媒介される、請求項１１８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２０】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１１１〜１１９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２１】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１０〜９５のアミノ酸残基長、１５〜９０のアミノ酸残基長、２０〜８５のアミノ酸残基長、２５〜８０のアミノ酸残基長、３０〜７５のアミノ酸残基長、３５〜７０のアミノ酸残基長、４０〜６５のアミノ酸残基長、４５〜６０のアミノ酸残基長、５０〜６５のアミノ酸残基長又は５５〜６５のアミノ酸残基長である、請求項８３〜１２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２２】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターンを含む、請求項８３〜１２１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２３】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βヘアピンを含む、請求項８３〜１２２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２４】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βストランドを含む、請求項８３〜１２３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２５】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、αヘリックスを含む、請求項８３〜１２４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２６】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む、請求項８３〜１２５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２７】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む、請求項８３〜１２６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２８】
前記βヘアピン及び前記第２のαヘリックスは、６０、５０、４０又は３０個以下のアミノ酸残基によって隔てられている、請求項１２７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１２９】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド又はそのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド又はそのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体、例えば天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４又はＩＫＺＦ５、そのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合配列を含む、請求項８３〜１２８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３０】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合配列は、前記天然に存在するポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４又はＩＫＺＦ５に由来する２つ以上の非連続的な配列を含む、請求項１２９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３１】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦポリペプチド又はその構造モチーフを含む、請求項８３〜１３０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３２】
前記ＩＫＺＦポリペプチドは、ＩＫＺＦ１ポリペプチド、ＩＫＺＦ３ポリペプチド、Ｈ１４１Ｑ置換（配列番号２１に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ２ポリペプチド、又はＨ１８８Ｑ置換（配列番号２２に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ４ポリペプチドである、請求項１３１に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３３】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ（例えば、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフを含む、請求項８３〜１３２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３４】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１３３に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３５】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む、請求項８３〜１３４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３６】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項８３〜１３５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３７】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１３６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３８】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項８３〜１３７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１３９】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項８３〜１３７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４０】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１３９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４１】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項８３〜１３７、１３９又は１４０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４２】
以下のアミノ酸残基：配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミン、１４８位のシステイン、１５０位のグルタミン、１５２位のグリシン、１６１位のロイシン又は１６２位のロイシンの１つ、２つ、３つ又は全ては、不変のままである、請求項１３８〜１４１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４３】
配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミンは、不変のままである、請求項１４２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４４】
配列番号１９に従って番号付けされる１４８位のシステインは、不変のままである、請求項１４２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４５】
配列番号１９に従って番号付けされる１５２位のグリシンは、不変のままである、請求項１４２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４６】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１３９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４０のアミノ酸配列を含む、請求項８３〜１４５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４７】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５又は７７のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１４６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４８】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６又は７８のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１４６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１４９】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項８３〜１４８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５０】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１４９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５１】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９から１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項８３〜１５０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５２】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む、請求項８３〜１５１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５３】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む、請求項８３〜１５２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５４】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む、請求項８３〜１５３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５５】
前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項１５４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５６】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列（例えば、配列番号５のアミノ酸配列を含む第１の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる第１の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる第１の配列）；及びＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第２の配列（例えば、配列番号１１のアミノ酸配列を含む第２の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる第２の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる第２の配列）を含む、請求項８３〜１５５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５７】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１又は３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１５６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５８】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１又は３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１５７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１５９】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１４又は８５のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１５８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６０】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含み、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１５又は８６のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１５９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６１】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、対応する天然配列よりも少なくとも１つ少ないリジンを含む、請求項８３〜１６０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６２】
前記対応する天然配列中の１つ以上のリジン残基は、異なるアミノ酸、例えばアルギニンによって置き換えられる、請求項１６１に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６３】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１、２、３、４又は５個未満のリジン残基を含む、請求項１６１又は１６２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６４】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、リジン残基を含まない、請求項１６３に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６５】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、ＣＯＦ２の存在下において、例えば本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ユビキチン化されず、任意選択により、ユビキチン化は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項８３〜１６４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６６】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４、４１、４２及び４３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項８３〜１６５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６７】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２又は４のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項８３〜１６５のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６８】
前記ＣＯＦ２は、免疫調節性イミド薬剤（ＩＭｉＤ）又はその薬学的に許容される塩である、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１６９】
前記ＣＯＦ２は、式（Ｉ）：
【化５】
2021501570.tif 000254
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体の構造を有する、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７０】
前記ＣＯＦ２は、式（Ｉ−ａ）：
【化６】
2021501570.tif 000255
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体の構造を有する、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７１】
前記ＣＯＦ２は、サリドマイド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７２】
前記ＣＯＦ２は、レナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド及び２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７３】
前記ＣＯＦ２は、
【化７】
2021501570.tif 000256
又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７４】
前記ＣＯＦ２は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩である、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７５】
前記ＣＯＦ２は、レナリドミド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７６】
前記ＣＯＦ２は、式（Ｉ）：
【化８】
2021501570.tif 000257
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体の構造を有する、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７７】
前記ＣＯＦ２は、式（Ｉ−ａ）：
【化９】
2021501570.tif 000258
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体の構造を有する、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７８】
前記ＣＯＦ２は、免疫調節性イミド薬剤（ＩＭｉＤ）又はその薬学的に許容される塩を含む、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１７９】
前記ＣＯＦ２は、サリドマイド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩を含む、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８０】
前記ＣＯＦ２は、レナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド及び２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩を含む、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８１】
前記ＣＯＦ２は、
【化１０】
2021501570.tif 000259
又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される化合物を含む、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８２】
前記ＣＯＦ２は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩を含む、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８３】
前記ＣＯＦ２は、レナリドミド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩を含む、請求項８３〜１６７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８４】
前記ＣＯＦ２は、リガンド（例えば、式（ＩＩ）のＲ１０は、Ｌ−タグである）をさらに含む、請求項１７６〜１８３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８５】
式（ＩＩ）のＲ１０は、Ｌ−タグであり、Ｌは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、図２８〜３１）において開示されるリンカーから選択されるリンカーであり、且つタグは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、表Ｔ、１１９〜１２９頁）において開示されるｄＴＡＧ標的化リガンドから選択される、請求項１７６〜１８４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８６】
前記ＣＯＦ２は、ＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及びリガンドを含み、前記ＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）は、例えば、リンカーを介してリガンドに連結される、請求項８３〜１８４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８７】
前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、リガンドに結合し、前記リガンドの非存在下での前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）との間の結合は、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドと前記リガンドとの間の結合の０．０００１、０．００１、０．０１、０．１、１又は１０％以下であり、例えば、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）に結合せず、任意選択により、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、３６〜６５頁）において開示されるｄＴＡＧから選択される、請求項１８４〜１８６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８８】
前記異種ポリペプチドは、細胞質内及び／若しくは核ポリペプチド又は膜貫通ポリペプチド、例えば表２における異種ポリペプチドから選択される、請求項１〜１８７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１８９】
前記細胞質内及び／又は核ポリペプチドは、アポトーシス経路の構成要素（例えば、カスパーゼ９）、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素（例えば、Ｃａｓ９）、転写因子（例えば、ＭＩＴＦ、ｃ−Ｍｙｃ、ＳＴＡＴ３、ＳＴＡＴ５、ＮＦ−カッパＢ、ベータ−カテニン、ノッチ、ＧＬＩ又はｃ−ＪＵＮ）、Ｔｅｔメチルシトシンジオキシゲナーゼ２（ＴＥＴ２）、ＦＫＢＰ及びタウからなる群から選択される、請求項１８８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９０】
前記膜貫通ポリペプチドは、ＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ１、ＣＣＲ２、ＣＣＲ５、ＣＣＲ７、ＣＣＲ１０、ＣＸＣＲ２、ＣＸＣＲ３、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ６、ＣＴＬＡ４、ＰＤ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、ＣＤ１３７Ｌ、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ３、ＣＤ８、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２０、ＢＣＭＡ，及びキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）からなる群から選択される、請求項１８８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９１】
前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素（例えば、Ｃａｓ９）、ＣＤ８、ＣＤ１９及びＣＤ２２からなる群から選択される、請求項１８８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９２】
前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である、請求項１９１に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９３】
前記ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項１９２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９４】
前記細胞内シグナル伝達ドメインは、１つ以上の一次シグナル伝達ドメインを含む、請求項１９３に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９５】
前記細胞内シグナル伝達ドメインは、１つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインを含む、請求項１９３又は１９４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９６】
前記１つ以上の一次シグナル伝達ドメインの１つは、ＣＤ３−ゼータ刺激ドメインを含む、請求項１９４に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９７】
前記共刺激シグナル伝達ドメインの１つ以上は、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＩＣＡＭ−１、リンパ球機能関連抗原−１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＣＤＳ、ＣＤ７、ＣＤ２８７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＮＫＧ２Ｄ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ４６、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３及びＣＤ８３に特異的に結合するリガンドからなる群から選択される共刺激タンパク質に由来する細胞内ドメインである、請求項１９５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９８】
前記共刺激シグナル伝達ドメインの前記１つ以上は、４−１ＢＢ共刺激ドメインを含む、請求項１９７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項１９９】
前記共刺激シグナル伝達ドメインの前記１つ以上は、ＣＤ２８共刺激ドメインを含む、請求項１９７又は１９８に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２００】
前記抗原結合ドメインは、ｓｃＦｖである、請求項１９３〜１９９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０１】
前記抗原結合ドメインは、ＣＤ１９；ＣＤ１２３；ＣＤ２２；ＣＤ３０；ＣＤ１７１；ＣＳ−１；Ｃ型レクチン様分子−１、ＣＤ３３；上皮増殖因子受容体バリアントＩＩＩ（ＥＧＦＲｖＩＩＩ）；ガングリオシドＧ２（ＧＤ２）；ガングリオシドＧＤ３；ＴＮＦ受容体ファミリーメンバー；Ｂ細胞成熟抗原；Ｔｎ抗原（（Ｔｎ  Ａｇ）又は（ＧａｌＮＡｃα−Ｓｅｒ／Ｔｈｒ））；前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）；受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体１（ＲＯＲ１）；Ｆｍｓ様チロシンキナーゼ３（ＦＬＴ３）；腫瘍関連糖タンパク質７２（ＴＡＧ７２）；ＣＤ３８；ＣＤ４４ｖ６；癌胎児抗原（ＣＥＡ）；上皮細胞接着分子（ＥＰＣＡＭ）；Ｂ７Ｈ３（ＣＤ２７６）；ＫＩＴ（ＣＤ１１７）；インターロイキン−１３受容体サブユニットアルファ−２；メソセリン；インターロイキン１１受容体アルファ（ＩＬ−１１Ｒａ）；前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）；プロテアーゼセリン２１；血管内皮増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）；ルイス（Ｙ）抗原；ＣＤ２４；血小板由来増殖因子受容体ベータ（ＰＤＧＦＲ−ベータ）；ステージ特異的胎児抗原−４（ＳＳＥＡ−４）；ＣＤ２０；葉酸受容体アルファ；受容体チロシン−タンパク質キナーゼＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ２／ｎｅｕ）；ムチン１、細胞表面関連（ＭＵＣ１）；上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）；神経細胞接着分子（ＮＣＡＭ）；プロスターゼ；前立腺酸性ホスファターゼ（ＰＡＰ）；変異した伸張因子２（ＥＬＦ２Ｍ）；エフリンＢ２；線維芽細胞活性化タンパク質アルファ（ＦＡＰ）；インスリン様増殖因子１受容体（ＩＧＦ−Ｉ受容体）、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）；プロテアソーム（プロソーム、マクロペイン）サブユニット、ベータ型、９（ＬＭＰ２）；糖タンパク質１００（ｇｐ１００）；切断点クラスター領域（ＢＣＲ）及びエーベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ１（Ａｂｌ）（ｂｃｒ−ａｂｌ）からなる癌遺伝子融合タンパク質；チロシナーゼ；エフリンＡ型受容体２（ＥｐｈＡ２）；フコシルＧＭ１；シアリルルイス接着分子（ｓＬｅ）；ガングリオシドＧＭ３；トランスグルタミナーゼ５（ＴＧＳ５）；高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷＭＡＡ）；ｏ−アセチル−ＧＤ２ガングリオシド（ＯＡｃＧＤ２）；葉酸受容体ベータ；腫瘍内皮細胞マーカー１（ＴＥＭ１／ＣＤ２４８）；腫瘍内皮細胞マーカー７−関連（ＴＥＭ７Ｒ）；クローディン６（ＣＬＤＮ６）；甲状腺刺激ホルモン受容体（ＴＳＨＲ）；Ｇタンパク質共役受容体クラスＣグループ５、メンバーＤ（ＧＰＲＣ５Ｄ）；染色体Ｘオープンリーティングフレーム６１（ＣＸＯＲＦ６１）；ＣＤ９７；ＣＤ１７９ａ；未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）；ポリシアル酸；胎盤特異的１（ＰＬＡＣ１）；ｇｌｏｂｏＨグリコセラミド（ＧｌｏｂｏＨ）のヘキササッカリド部分；哺乳動物腺分化抗原（ＮＹ−ＢＲ−１）；ウロプラキン２（ＵＰＫ２）；Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体１（ＨＡＶＣＲ１）；アドレナリン受容体ベータ３（ＡＤＲＢ３）；パネキシン３（ＰＡＮＸ３）；Ｇタンパク質共役型受容体２０（ＧＰＲ２０）；リンパ球抗原６複合体、座位Ｋ９（ＬＹ６Ｋ）；嗅覚受容体５１Ｅ２（ＯＲ５１Ｅ２）；ＴＣＲガンマ代替リーディングフレームタンパ��質（ＴＡＲＰ）；ウィルムス腫瘍タンパク質（ＷＴ１）；癌／精巣抗原１（ＮＹ−ＥＳＯ−１）；癌／精巣抗原２（ＬＡＧＥ−１ａ）；黒色腫関連抗原１（ＭＡＧＥ−Ａ１）；染色体１２ｐに位置するＥＴＳ転座バリアント遺伝子６（ＥＴＶ６−ＡＭＬ）；精子タンパク質１７（ＳＰＡ１７）；Ｘ抗原ファミリー、メンバー１Ａ（ＸＡＧＥ１）；アンジオポエチン結合細胞表面受容体２（Ｔｉｅ  ２）；黒色腫癌精巣抗原−１（ＭＡＤ−ＣＴ−１）；黒色腫癌精巣抗原−２（ＭＡＤ−ＣＴ−２）；Ｆｏｓ関連抗原１；腫瘍タンパク質ｐ５３（ｐ５３）；ｐ５３変異体；プロステイン；生存；テロメラーゼ；前立腺癌腫瘍抗原−１、Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原１；ラット肉腫（Ｒａｓ）変異体；ヒトテロメラーゼ逆転写酵素（ｈＴＥＲＴ）；肉腫転移ブレークポイント；アポトーシスの黒色腫抑制分子（ＭＬ−ＩＡＰ）；ＥＲＧ（膜貫通プロテアーゼ、セリン２（ＴＭＰＲＳＳ２）ＥＴＳ融合遺伝子）；Ｎ−アセチルグルコサミニル−トランスフェラーゼＶ（ＮＡ１７）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ−３（ＰＡＸ３）；アンドロゲン受容体；サイクリンＢ１；ｖ−ｍｙｃトリ骨髄細胞腫症ウイルス癌遺伝子神経芽細胞腫由来ホモログ（ＭＹＣＮ）；ＲａｓホモログファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）；チロシナーゼ関連タンパク質２（ＴＲＰ−２）；チトクロムＰ４５０  １Ｂ１（ＣＹＰ１Ｂ１）；ＣＣＣＴＣ結合因子（ジンクフィンガータンパク質）様、Ｔ細胞によって認識される扁平上皮癌抗原３（ＳＡＲＴ３）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ−５（ＰＡＸ５）；プロアクロシン結合タンパク質ｓｐ３２（ＯＹ−ＴＥＳ１）；リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）；Ａキナーゼアンカータンパク質４（ＡＫＡＰ−４）；滑膜肉腫、Ｘブレークポイント２（ＳＳＸ２）；終末糖化産物のための受容体（ＲＡＧＥ−１）；腎臓遍在性１（ＲＵ１）；腎臓遍在性２（ＲＵ２）；レグマイン；ヒトパピローマウイルスＥ６（ＨＰＶ  Ｅ６）；ヒトパピローマウイルスＥ７（ＨＰＶ  Ｅ７）；腸管カルボキシルエステラーゼ；変異熱ショックタンパク質７０−２（ｍｕｔ  ｈｓｐ７０−２）；ＣＤ７９ａ；ＣＤ７９ｂ；ＣＤ７２；白血球関連免疫グロブリン様受容体１（ＬＡＩＲ１）；ＩｇＡ受容体のＦｃ断片（ＦＣＡＲ又はＣＤ８９）；白血病免疫グロブリン様受容体サブファミリーＡメンバー２（ＬＩＬＲＡ２）；ＣＤ３００分子様ファミリーメンバーｆ（ＣＤ３００ＬＦ）；Ｃ型レクチンドメインファミリー１２メンバーＡ（ＣＬＥＣ１２Ａ）；骨髄間質細胞抗原２（ＢＳＴ２）；ＥＧＦ様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様２（ＥＭＲ２）；リンパ球抗原７５（ＬＹ７５）；グリピカン−３（ＧＰＣ３）；Ｆｃ受容体様５（ＦＣＲＬ５）；及び免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド１（ＩＧＬＬ１）からなる群から選択される抗原に結合する、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０２】
前記抗原は、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＢＣＭＡ、ＣＤ２０、ＣＤ１２３、ＥＧＦＲｖＩＩＩ又はメソセリンから選択される、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０３】
前記抗原は、ＣＤ１９である、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０４】
前記抗原は、ＣＤ２２である、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０５】
前記抗原は、ＢＣＭＡである、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０６】
前記抗原は、ＣＤ２０である、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０７】
前記抗原は、ＣＤ１２３である、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０８】
前記抗原は、ＥＧＦＲｖＩＩＩである、請求項１９３〜２００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２０９】
請求項１〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドをコードする核酸分子。
【請求項２１０】
請求項２０９に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項２１１】
ウイルスベクターである、請求項２１０に記載のベクター。
【請求項２１２】
レンチウイルスベクターである、請求項２１０に記載のベクター。
【請求項２１３】
請求項２１０〜２１２のいずれか一項に記載のベクターを含むウイルス粒子。
【請求項２１４】
請求項１〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド、請求項２０９に記載の核酸分子又は請求項２１０〜２１２のいずれか一項に記載のベクターを含む細胞、例えば宿主細胞。
【請求項２１５】
前記細胞、例えば宿主細胞は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞、例えばヒトエフェクター細胞、例えばヒトＴ細胞又はヒトＮＫ細胞である、請求項２１４に記載の細胞。
【請求項２１６】
前記細胞、例えば宿主細胞は、ＣＡＲ発現細胞、例えばＣＡＲ−Ｔ細胞である、請求項２１４又は２１５に記載の細胞。
【請求項２１７】
前記細胞、例えば宿主細胞は、ＣＲＩＳＰＲ／ＣＡＳシステムの構成要素を含む、請求項２１４又は２１５に記載の細胞。
【請求項２１８】
前記細胞、例えば宿主細胞は、ヒト癌細胞、例えばヒト腫瘍細胞である、請求項２１４〜２１７のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２１９】
前記細胞、例えば宿主細胞は、ユビキチンリガーゼ複合体、例えばＥ３ユビキチンリガーゼ複合体を含み、前記ユビキチンリガーゼ複合体は、ＣＲＢＮを含む、請求項２１４〜２１８のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２０】
請求項１〜７９若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含むか、又は請求項１〜７９若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含み、前記細胞がＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１と接触されるとき、
ｉ）前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉ）前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉｉ）前記異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の前記異種ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｉｖ）前記融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の前記融合ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｖ）前記融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の前記融合ポリペプチドの分解と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；又は
ｖｉ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項２１４〜２１９のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２１】
ＣＯＦ１、例えばレナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩をさらに含む、請求項２１４〜２２０のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２２】
請求項８０〜８２、８４〜１０７若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含むか、又は請求項８０〜８２、８４〜１０７若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含み、安定化化合物の非存在下において、前記融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、前記融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される、請求項２１４〜２１９のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２３】
請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含むか、又は請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含み、安定化化合物の非存在下において、前記融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、前記融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される、請求項２１４〜２１９のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２４】
前記異種プロテアーゼ切断部位を切断できるプロテアーゼをさらに含む、請求項２２２又は２２３に記載の細胞。
【請求項２２５】
前記細胞が安定化化合物、例えば過剰量の安定化化合物と接触されるとき、
ｉ）前記分解ドメインは、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｉｉ）前記融合ポリペプチドの前記立体構造は、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、前記異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｉｉｉ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞が前記安定化化合物と接触されていない場合の前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される、請求項２２２〜２２４のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２６】
安定化化合物をさらに含む、請求項２２２〜２２５のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２７】
前記安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む、請求項２２２〜２２６のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２８】
前記細胞が安定化化合物、例えば過剰量の安定化化合物及びＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１と接触されるとき、
ｉ）前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１ではなく前記安定化化合物とのみ接触される場合の前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉ）前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉｉ）前記異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記異種ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｉｖ）前記融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｖ）前記融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドの分解と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；又は
ｖｉ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ１ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項２２２又は２２４〜２２７のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２２９】
ＣＯＦ１、例えばレナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩をさらに含む、請求項２２２又は２２４〜２２８のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２３０】
前記細胞が安定化化合物、例えば過剰量の安定化化合物及びＣＯＦ２、例えば、過剰量のＣＯＦ２と接触されるとき、
ｉ）前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ２ではなく前記安定化化合物とのみ接触される場合の前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉ）前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ２ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉｉ）前記異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ２ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記異種ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｉｖ）前記融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ２ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｖ）前記融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ２ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドの分解と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；又は
ｖｉ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記細胞がＣＯＦ２ではなく前記安定化化合物のみと接触される場合の前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、請求項２２３〜２２９のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２３１】
ＣＯＦ２、例えばレナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩をさらに含む、請求項２２３〜２３０のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２３２】
前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であり、任意選択により、前記ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項２１４〜２３１のいずれか一項に記載の細胞。
【請求項２３３】
請求項１〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は請求項２１４〜２３２のいずれか一項に記載の細胞及び薬学的に許容される担体、賦形剤又は安定剤を含む医薬組成物。
【請求項２３４】
請求項２１４〜２３２のいずれか一項に記載の細胞を作製する方法であって、細胞、例えば免疫エフェクター細胞を、請求項２０９に記載の核酸分子、請求項２１０〜２１２のいずれか一項に記載のベクター又は請求項２１３に記載のウイルスベクターによってもたらすことを含む、方法。
【請求項２３５】
請求項１〜７９若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触させることを含む、融合ポリペプチドを分解する方法であって、任意選択により、ＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、方法。
【請求項２３６】
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、エクスビボでＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触される、請求項２３５に記載の方法。
【請求項２３７】
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、インビボでＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触される、請求項２３５に記載の方法。
【請求項２３８】
融合ポリペプチドの発現を制御する方法であって、
ｉ）請求項８０〜８２、８４〜１０７若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により前記安定化化合物の存在下において、
ａ）前記分解ドメインは、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｂ）前記融合ポリペプチドの前記立体構造は、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、前記異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｃ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される、工程
を含む、方法。
【請求項２３９】
工程ｉ）後、
ｉｉ）請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
をさらに含む、請求項２３８に記載の方法。
【請求項２４０】
前記安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む、請求項２３８又は２３９に記載の方法。
【請求項２４１】
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、エクスビボでＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及び／又は前記安定化化合物と接触される、請求項２３８〜２４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４２】
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、インビボでＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及び／又は前記安定化化合物と接触される、請求項２３８〜２４０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４３】
融合ポリペプチドの発現を制御する方法であって、
ｉ）請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により前記安定化化合物の存在下において、
ａ）前記分解ドメインは、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｂ）前記融合ポリペプチドの前記立体構造は、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、前記異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｃ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される、工程
を含む、方法。
【請求項２４４】
工程ｉ）後、
ｉｉ）請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
をさらに含む、請求項２４３に記載の方法。
【請求項２４５】
前記安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む、請求項２４３又は２４４に記載の方法。
【請求項２４６】
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、エクスビボでＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及び／又は前記安定化化合物と接触される、請求項２４３〜２４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４７】
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、インビボでＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及び／又は前記安定化化合物と接触される、請求項２４３〜２４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４８】
前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であり、任意選択により、前記ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項２３４〜２４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４９】
細胞を作製する方法であって、
ｉ）式１の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及びキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含む融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含む細胞をもたらす工程であって、任意選択により、前記ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、工程；及び
ｉｉ）前記細胞をエクスビボでＣＯＦ１と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
を含み、式（Ｉ）の前記化合物は、
【化１１】
2021501570.tif 000260
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体である、方法。
【請求項２５０】
前記細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触された後、前記細胞の増殖は、ＣＯＦ１との前記接触前の前記細胞の増殖に対して少なくとも例えば１．２、１．５、２、５又は１０倍増大される、請求項２４９に記載の方法。
【請求項２５１】
ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩である、請求項２５０に記載の方法。
【請求項２５２】
前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）、請求項２４９又は２５０に記載の方法。
【請求項２５３】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）エクスビボで、請求項１〜７９又は１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ１と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触される前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少される、工程、及び
ｉｉ）有効量の前記細胞を前記対象に投与する工程
を含み、任意選択により、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前に、
前記細胞に例えば前記細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ１の量を減少させ、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、方法。
【請求項２５４】
工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）有効量のＣＯＦ１を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２５３に記載の方法。
【請求項２５５】
工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）ＣＯＦ１の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉｉｉ）後及び工程ｉｖ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の発現レベルに前記融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与の中断は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２５４に記載の方法。
【請求項２５６】
工程ｉｖ）後、
ｖ）工程ｉｉｉ）及び／又はｉｖ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項２５５に記載の方法。
【請求項２５７】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量の、請求項１〜７９又は１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、前記細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ１と接触され、任意選択により、ＣＯＦ１の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触される前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少され、任意選択により、前記細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触された後及び前記細胞が前記対象に投与される前に、前記細胞に例えば前記細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ１の量は、減少され、それによって前記疾患を治療する、工程
を含む、方法。
【請求項２５８】
前記細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ１と接触されない、請求項２５７に記載の方法。
【請求項２５９】
工程ｉ）後、
ｉｉ）有効量のＣＯＦ１を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２５７又は２５８に記載の方法。
【請求項２６０】
工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の発現レベルに前記融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与の中断は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２５９に記載の方法。
【請求項２６１】
工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）工程ｉｉ）及び／又はｉｉｉ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項２６０に記載の方法。
【請求項２６２】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量のＣＯＦ１を前記対象に投与する工程であって、前記対象は、請求項１〜７９又は１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞を含み、任意選択により、ＣＯＦ１の投与は、ＣＯＦ１の投与前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
を含む、方法。
【請求項２６３】
工程ｉ）後、
ｉｉ）ＣＯＦ１の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ１の投与の中断は、ＣＯＦ１の投与前の発現レベルに前記融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与の中断は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２６２に記載の方法。
【請求項２６４】
工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）工程ｉ）及び／又はｉｉ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項２６３に記載の方法。
【請求項２６５】
ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）、請求項２５３〜２６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６６】
ＣＯＦ１は、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩は、例えば、１日当たり２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ又は２５ｍｇで投与される、請求項２５９〜２６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２６７】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）前記対象に、
（１）安定化化合物、及び
（２）有効量の、請求項８０〜８２、８４〜１０７又は１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞又は有効量の、請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞
を投与する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高く、それによって前記疾患を治療する、工程
を含む、方法。
【請求項２６８】
工程ｉ）後、
ｉｉ）前記安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現に対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、工程ｉ）の治療に応答し（例えば、前記対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、前記対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、前記対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、前記対象において有効である）、且つ／又は
ｂ）前記安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）の治療に対する前記対象の応答に対して応答する（例えば、前記対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、前記対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、前記対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、前記対象において有効である）、工程
をさらに含む、請求項２６７に記載の方法。
【請求項２６９】
工程ｉ）後、
ｉｉｉ）前記安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現に対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）前記安定化化合物の投与の中断は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）前記安定化化合物の投与の中断は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２６７に記載の方法。
【請求項２７０】
工程ｉ）後、
ｉｖ）前記安定化化合物の投与を中断し、且つ有効量のＣＯＦ１又はＣＯＦ２を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、工程ｉｖ）は、工程ｉ）後及び工程ｉｖ）前の前記融合ポリペプチドの発現に対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）工程ｉｖ）は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）工程ｉｖ）は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２６７に記載の方法。
【請求項２７１】
前記有害作用は、急性毒性である、請求項２７０に記載の方法。
【請求項２７２】
工程ｉｖ）後、
ｖ）例えば、表面に前記融合ポリペプチドを発現する細胞の量が既定値より小さくなった後、例えば１日、５日、１０日又は１５日間にわたり、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２の投与を中断する工程
をさらに含む、請求項２７０又は２７１に記載の方法。
【請求項２７３】
工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後、
ｖｉ）有効量の安定化化合物を投与する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の投与は、工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後及び工程ｖｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）前記安定化化合物の投与は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）前記安定化化合物の投与は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項２６８〜２７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７４】
工程ｖｉ）後、
ｖｉｉ）工程ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）又はｖｉ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項２７３に記載の方法。
【請求項２７５】
工程ｉ）前に、
ｖｉｉｉ）エクスビボで前記細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高い、工程
をさらに含む、請求項２６７〜２７４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７６】
前記細胞は、投与前にエクスビボで前記安定化化合物と接触されない、請求項２６７〜２７４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７７】
前記細胞は、投与前にエクスビボで前記安定化化合物、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２のいずれとも接触されない、請求項２７６に記載の方法。
【請求項２７８】
前記安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む、請求項２６７〜２７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７９】
ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）、請求項２７０〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８０】
ＣＯＦ２は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、前記ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、前記ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）、請求項２７０〜２７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８１】
ＣＯＦ１又はＣＯＦ２は、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩は、例えば、１日当たり２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ又は２５ｍｇで投与される、請求項２７０〜２８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８２】
前記融合ポリペプチドの前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であり、任意選択により、前記ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項２５３〜２８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８３】
医薬としての使用のための、請求項１〜２３３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド、核酸分子、ベクター、ウイルス粒子、細胞又は医薬組成物。
【請求項２８４】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象の治療における使用のための、例えば請求項２５３〜２８２のいずれか一項に記載の方法における使用のための、請求項１〜２３３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド、核酸分子、ベクター、ウイルス粒子、細胞又は医薬組成物。
【請求項２８５】
腫瘍抗原の発現を伴う前記疾患は、癌である、請求項２５３〜２８４のいずれか一項に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２８６】
前記癌は、例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療に対して進行してきた対象における中皮腫（例えば、悪性胸膜中皮腫）；肺癌（例えば、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、扁平細胞肺癌又は肺大細胞癌）；膵臓癌（例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療に対して進行してきた対象における例えば膵管腺癌又は転移性膵管腺癌（ＰＤＡ））；食道腺癌、卵巣癌（例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療のレジメン後に進行してきた対象における例えば漿液性卵巣上皮癌）、乳癌、結腸直腸癌、膀胱癌又はその任意の組合せである、請求項２８５に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２８７】
腫瘍抗原の発現を伴う前記疾患は、血液癌、例えば白血病又はリンパ腫から選択される血液癌である、請求項２５３〜２８４のいずれか一項に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２８８】
前記癌は、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫（ＭＣＬ）、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞急性リンパ性白血病（ＢＡＬＬ）、Ｔ細胞急性リンパ性白血病（ＴＡＬＬ）、小リンパ球性白血病（ＳＬＬ）、Ｂ細胞前リンパ性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞性リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、慢性炎症に関連するＤＬＢＣＬ、慢性骨髄性白血病、骨髄増殖性腫瘍、濾胞性リンパ腫、小児濾胞性リンパ腫、ヘアリーセル白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性状態、ＭＡＬＴリンパ腫（粘膜関連リンパ組織型節外性辺縁帯リンパ腫）、辺縁帯リンパ腫、脊髄形成異常、骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンストレーム型マクログロブリン血症、脾辺縁帯リンパ腫、脾リンパ腫／脾性白血病、びまん性赤脾髄小細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ヘアリーセル白血病−バリアント、リンパ形質細胞性リンパ腫、重鎖病、形質細胞性骨髄腫、骨の孤立性形質細胞腫、骨外形質細胞腫、節性辺縁帯リンパ腫、小児節性辺縁帯リンパ腫、原発性皮膚濾胞中心リンパ腫、リンパ腫様肉芽腫症、原発性縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ＡＬＫ＋大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ＨＨＶ８関連多中心性キャッスルマン病の際に生じる大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）又は分類不能リンパ腫から選択される、請求項２８７に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２８９】
前記癌は、ＭＣＬ、ＣＬＬ、ＡＬＬ、ホジキンリンパ腫、ＡＭＬ又は多発性骨髄腫から選択される、請求項２８７に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２９０】
前記細胞は、前記対象に対して自己由来である、請求項２５３〜２８９のいずれか一項に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２９１】
前記細胞は、前記対象に対して同種異系である、請求項２５３〜２８９のいずれか一項に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２９２】
前記細胞は、ＣＡＲ発現細胞、例えばＣＡＲＴ細胞である、請求項２５３〜２９１のいずれか一項に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２９３】
前記対象は、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２の投与前に、請求項１〜２０８のいずれか一項に記載の少なくとも１つの融合ポリペプチドを発現する細胞を投与されている、請求項２５３〜２９２のいずれか一項に記載の使用のための方法又は組成物。
【請求項２９４】
特定の生物学的表現型と関連する遺伝因子、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する遺伝因子を同定する方法であって、
ｉ）前記細胞をＣＯＦ１、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に暴露することにより、細胞において、請求項１〜７９又は１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドの発現を調節する工程、
（ｉｉ）目的の表現型、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する表現型を有する細胞を選択する工程、及び
（ｉｉｉ）目的の前記表現型を誘導する前記融合ポリペプチドを同定する工程
を含み、
ＣＯＦ１、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する前記細胞の暴露は、ＣＯＦ１、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する暴露前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させる、方法。
【請求項２９５】
特定の生物学的表現型と関連する遺伝因子、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する遺伝因子を同定する方法であって、
ｉ）前記細胞を安定化化合物、例えばバゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩及び続いてＣＯＦ１又はＣＯＦ２、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に暴露することにより、細胞において、請求項８０〜８２、８４〜１０７若しくは１８８〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドの発現又は請求項８３〜２０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドの発現を調節する工程、
（ｉｉ）目的の表現型、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する表現型を有する細胞を選択する工程、及び
（ｉｉｉ）目的の前記表現型を誘導する前記融合ポリペプチドを同定する工程
を含み、
前記安定化化合物、例えばバゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩に対する前記細胞の暴露は、前記安定化化合物、例えばバゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩に対する暴露前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する前記細胞の暴露は、前記安定化化合物に対する暴露後及びＣＯＦ１又はＣＯＦ２、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する暴露前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させる、方法。
【請求項２９６】
式（ＩＩＩ）の化合物（ＣＯＦ３）／ＣＲＢＮ（セレブロン）結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド、例えば異種哺乳動物、細菌又はウイルスポリペプチドを含む融合ポリペプチドであって、式（ＩＩＩ）の前記化合物は、
【化１２】
2021501570.tif 000261
（式中、
Ｘ１は、ＣＲ３であり；
【化１３】
2021501570.tif 000262
は、Ｘ１がＣＲ３であり且つＲ３が存在しない場合、任意選択により二重結合であり；
各Ｒ１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル又はハロであるか、又は
２つのＲ１は、それらが結合される炭素原子とともに５員又は６員ヘテロシクリル環を形成するか、又は
２つのＲ１は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール環を形成し；
Ｒ２は、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、−Ｃ（Ｏ）Ｃ１〜Ｃ６アルキル、−Ｃ（Ｏ）（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、−Ｃ（Ｏ）Ｏ（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７−ヘテロシクリルであり、前記アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；及び前記アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ５で置換されるか、又は
Ｒ１及びＲ２は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともに５員又は６員ヘテロシクリル環を形成し；
Ｒ３は、水素であるか、又は
【化１４】
2021501570.tif 000263
が二重結合であるとき、Ｒ３は、存在せず；
各Ｒ４は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ６Ｒ６’、−ＮＲ６Ｃ（Ｏ）Ｒ６’、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル環から独立して選択され、前記アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
各Ｒ５は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールから独立して選択されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ６及びＲ６’は、それぞれ独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル又はＣ６〜Ｃ１０アリールであり；
各Ｒ７は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ８、−（ＣＨ２）０〜３Ｃ（Ｏ）ＯＲ８、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ８Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）ＯＲ９、−Ｓ（Ｏ）ｐＮＲ８Ｒ９、−Ｓ（Ｏ）ｐＲ１２、（Ｃ１〜Ｃ６）ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−Ｏ（ＣＨ２）１〜３ＣＮ、−ＮＨ２、シアノ、−Ｏ（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、アダマンチル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む−Ｏ（ＣＨ２）０〜３−５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む単環式又は二環式５〜１０員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択され、前記アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ１１で置換され、且つ前記アリール、ヘテロアリール及びヘテロシクリルは、任意選択により、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル及びＣ１〜Ｃ６アルコキシからそれぞれ独立して選択される１つ以上の置換基で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される炭素原子とともにａ＝（Ｏ）を形成するか、又は
２つのＲ７は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ８及びＲ９は、それぞれ独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノから独立して選択されるか、又は
２つのＲ１０は、それらが結合される炭素原子とともにａ＝（Ｏ）を形成し；
各Ｒ１１は、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択され、各アリール及びヘテロシクリルは、任意選択により、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノからそれぞれ独立して選択される１つ以上の置換基で置換され；
Ｒ１２は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり；
Ｒｘは、水素又は重水素であり；
ｐは、０、１又は２であり；
ｎは、０、１又は２であり；
ｙは、１又は２であり、ここで、ｎ＋ｙ≦３であり；及び
ｑは、０、１、２、３又は４である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体である、融合ポリペプチド。
【請求項２９７】
式（ＩＩＩ）の前記化合物は、式（ＩＩＩ−ｂ）：
【化１５】
2021501570.tif 000264
（式中、Ｘ１、Ｒ１、Ｒ２、ｎ、ｑ及びその下位の変数は、請求項２９６に記載の式（ＩＩＩ）について記載されるとおりに定義される）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体である、請求項２９６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２９８】
式（ＩＩＩ）の前記化合物は、式（ＩＩＩ−ｄ）：
【化１６】
2021501570.tif 000265
（式中、Ｒ１、Ｒ２、ｑ及びその下位の変数は、請求項２９６に記載の式（ＩＩＩ）について記載されるとおりに定義される）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体である、請求項２９６又は２９７に記載の融合ポリペプチド。
【請求項２９９】
（ｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、前記異種ポリペプチドに融合されるか、
（ｉｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドは、ペプチド結合によって連結されるか、
（ｉｉｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドは、ペプチド結合以外の結合によって連結されるか、
（ｉｖ）前記異種ポリペプチドは、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに直接的に連結されるか、
（ｖ）前記異種ポリペプチドは、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに間接的に連結されるか、
（ｖｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドは、リンカー、例えばグリシン−セリンリンカー、例えば配列番号２８のアミノ酸配列を含むリンカーを介して作動可能に連結されるか、又は
（ｖｉｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、前記異種ポリペプチドのＣ末端又はＮ末端に連結される、請求項２９６〜２９８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３００】
（ｉ）ＣＯＦ３の非存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ３、例えば過剰量のＣＯＦ３の存在下での前記融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であり、任意選択により、前記融合ポリペプチドは、ＣＯＦ３の非存在下でＣＲＢＮに結合しないか；
（ｉｉ）ＣＯＦ３の非存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ３、例えば過剰量のＣＯＦ３の存在下での前記融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であり、任意選択により、前記融合ポリペプチドは、ＣＯＦ３の存在下で１つ以上のリジン又はメチオニン残基でユビキチン化されるか；又は
（ｉｉｉ）ＣＯＦ３の非存在下での前記融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ３、例えば過剰量のＣＯＦ３の存在下での前記融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であり、任意選択により、前記融合ポリペプチドの分解は、ＣＯＦ３の存在下でユビキチン化によって媒介され；
任意選択により、前記会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである、請求項２９６〜２９９のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０１】
前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１０〜９５のアミノ酸残基長、１５〜９０のアミノ酸残基長、２０〜８５のアミノ酸残基長、２５〜８０のアミノ酸残基長、３０〜７５のアミノ酸残基長、３５〜７０のアミノ酸残基長、４０〜６５のアミノ酸残基長、４５〜６０のアミノ酸残基長、５０〜６５のアミノ酸残基長又は５５〜６５のアミノ酸残基長である、請求項２９６〜３００のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０２】
前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン、βヘアピン、βストランド又はαヘリックスを含み、任意選択により、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含み、任意選択により、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含み、任意選択により、前記βヘアピン及び前記第２のαヘリックスは、６０、５０、４０又は３０個以下のアミノ酸残基によって隔てられている、請求項２９６〜３０１のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０３】
前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド又はそのＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド又はそのＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体、例えば天然に存在するＩＫＺＦ２又はそのＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合配列を含み、任意選択により、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦ２に由来する２つ以上の非連続的な配列を含む、請求項２９６〜３０２のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０４】
前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４（配列番号２１に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１３のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４（配列番号２１に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号２１のアミノ酸残基１３０〜１７４と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号２１のアミノ酸残基１３０〜１７４から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項２９６〜３０３のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０５】
前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）（例えば、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１４のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ２のアミノ酸残基２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５又は１０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号２１のアミノ酸残基２３０〜２４３と１、２、３、４、５又は１０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号２１のアミノ酸残基２３０〜２４３から１、２、３、４、５又は１０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む、請求項２９６〜３０４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０６】
配列番号２１に従って番号付けされる１４１位のヒスチジンは、不変のままである、請求項３０４又は３０５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０７】
（ｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４（配列番号２１に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１３のアミノ酸配列を含み；及び／又は
（ｉｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）を含み、例えば、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１４のアミノ酸配列を含む、請求項２９６〜３０６のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０８】
前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる、請求項２９６〜３０７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３０９】
前記異種ポリペプチドは、細胞質内及び／若しくは核ポリペプチド又は膜貫通ポリペプチド、例えば表２における異種ポリペプチドから選択される、請求項２９６〜３０８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１０】
前記細胞質内及び／又は核ポリペプチドは、アポトーシス経路の構成要素（例えば、カスパーゼ９）、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素（例えば、Ｃａｓ９）、転写因子（例えば、ＭＩＴＦ、ｃ−Ｍｙｃ、ＳＴＡＴ３、ＳＴＡＴ５、ＮＦ−カッパＢ、ベータ−カテニン、ノッチ、ＧＬＩ又はｃ−ＪＵＮ）、Ｔｅｔメチルシトシンジオキシゲナーゼ２（ＴＥＴ２）、ＦＫＢＰ及びタウからなる群から選択される、請求項３０９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１１】
前記膜貫通ポリペプチドは、ＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ１、ＣＣＲ２、ＣＣＲ５、ＣＣＲ７、ＣＣＲ１０、ＣＸＣＲ２、ＣＸＣＲ３、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ６、ＣＴＬＡ４、ＰＤ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、ＣＤ１３７Ｌ、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ３、ＣＤ８、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２０、ＢＣＭＡ，及びキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）からなる群から選択される、請求項３０９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１２】
前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素（例えば、Ｃａｓ９）、ＣＤ８、ＣＤ１９及びＣＤ２２からなる群から選択され、任意選択により、前記異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である、請求項３０９に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１３】
前記ＣＡＲは、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメイン（例えば、一次シグナル伝達ドメイン又は共刺激シグナル伝達ドメイン）を含み、任意選択により、前記一次シグナル伝達ドメインは、ＣＤ３−ゼータ刺激ドメインを含み、且つ／又は前記共刺激シグナル伝達ドメインは、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＩＣＡＭ−１、リンパ球機能関連抗原−１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＣＤＳ、ＣＤ７、ＣＤ２８７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＮＫＧ２Ｄ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ４６、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３及びＣＤ８３に特異的に結合するリガンドからなる群から選択される共刺激タンパク質に由来する細胞内ドメインを含む、請求項３１２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１４】
前記抗原結合ドメインは、ＣＤ１９；ＣＤ１２３；ＣＤ２２；ＣＤ３０；ＣＤ１７１；ＣＳ−１；Ｃ型レクチン様分子−１、ＣＤ３３；上皮増殖因子受容体バリアントＩＩＩ（ＥＧＦＲｖＩＩＩ）；ガングリオシドＧ２（ＧＤ２）；ガングリオシドＧＤ３；ＴＮＦ受容体ファミリーメンバー；Ｂ細胞成熟抗原；Ｔｎ抗原（（Ｔｎ  Ａｇ）又は（ＧａｌＮＡｃα−Ｓｅｒ／Ｔｈｒ））；前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）；受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体１（ＲＯＲ１）；Ｆｍｓ様チロシンキナーゼ３（ＦＬＴ３）；腫瘍関連糖タンパク質７２（ＴＡＧ７２）；ＣＤ３８；ＣＤ４４ｖ６；癌胎児抗原（ＣＥＡ）；上皮細胞接着分子（ＥＰＣＡＭ）；Ｂ７Ｈ３（ＣＤ２７６）；ＫＩＴ（ＣＤ１１７）；インターロイキン−１３受容体サブユニットアルファ−２；メソセリン；インターロイキン１１受容体アルファ（ＩＬ−１１Ｒａ）；前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）；プロテアーゼセリン２１；血管内皮増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）；ルイス（Ｙ）抗原；ＣＤ２４；血小板由来増殖因子受容体ベータ（ＰＤＧＦＲ−ベータ）；ステージ特異的胎児抗原−４（ＳＳＥＡ−４）；ＣＤ２０；葉酸受容体アルファ；受容体チロシン−タンパク質キナーゼＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ２／ｎｅｕ）；ムチン１、細胞表面関連（ＭＵＣ１）；上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）；神経細胞接着分子（ＮＣＡＭ）；プロスターゼ；前立腺酸性ホスファターゼ（ＰＡＰ）；変異した伸張因子２（ＥＬＦ２Ｍ）；エフリンＢ２；線維芽細胞活性化タンパク質アルファ（ＦＡＰ）；インスリン様増殖因子１受容体（ＩＧＦ−Ｉ受容体）、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）；プロテアソーム（プロソーム、マクロペイン）サブユニット、ベータ型、９（ＬＭＰ２）；糖タンパク質１００（ｇｐ１００）；切断点クラスター領域（ＢＣＲ）及びエーベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ１（Ａｂｌ）（ｂｃｒ−ａｂｌ）からなる癌遺伝子融合タンパク質；チロシナーゼ；エフリンＡ型受容体２（ＥｐｈＡ２）；フコシルＧＭ１；シアリルルイス接着分子（ｓＬｅ）；ガングリオシドＧＭ３；トランスグルタミナーゼ５（ＴＧＳ５）；高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷＭＡＡ）；ｏ−アセチル−ＧＤ２ガングリオシド（ＯＡｃＧＤ２）；葉酸受容体ベータ；腫瘍内皮細胞マーカー１（ＴＥＭ１／ＣＤ２４８）；腫瘍内皮細胞マーカー７−関連（ＴＥＭ７Ｒ）；クローディン６（ＣＬＤＮ６）；甲状腺刺激ホルモン受容体（ＴＳＨＲ）；Ｇタンパク質共役受容体クラスＣグループ５、メンバーＤ（ＧＰＲＣ５Ｄ）；染色体Ｘオープンリーティングフレーム６１（ＣＸＯＲＦ６１）；ＣＤ９７；ＣＤ１７９ａ；未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）；ポリシアル酸；胎盤特異的１（ＰＬＡＣ１）；ｇｌｏｂｏＨグリコセラミド（ＧｌｏｂｏＨ）のヘキササッカリド部分；哺乳動物腺分化抗原（ＮＹ−ＢＲ−１）；ウロプラキン２（ＵＰＫ２）；Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体１（ＨＡＶＣＲ１）；アドレナリン受容体ベータ３（ＡＤＲＢ３）；パネキシン３（ＰＡＮＸ３）；Ｇタンパク質共役型受容体２０（ＧＰＲ２０）；リンパ球抗原６複合体、座位Ｋ９（ＬＹ６Ｋ）；嗅覚受容体５１Ｅ２（ＯＲ５１Ｅ２）；ＴＣＲガンマ代替リーディングフレームタンパ��質（ＴＡＲＰ）；ウィルムス腫瘍タンパク質（ＷＴ１）；癌／精巣抗原１（ＮＹ−ＥＳＯ−１）；癌／精巣抗原２（ＬＡＧＥ−１ａ）；黒色腫関連抗原１（ＭＡＧＥ−Ａ１）；染色体１２ｐに位置するＥＴＳ転座バリアント遺伝子６（ＥＴＶ６−ＡＭＬ）；精子タンパク質１７（ＳＰＡ１７）；Ｘ抗原ファミリー、メンバー１Ａ（ＸＡＧＥ１）；アンジオポエチン結合細胞表面受容体２（Ｔｉｅ  ２）；黒色腫癌精巣抗原−１（ＭＡＤ−ＣＴ−１）；黒色腫癌精巣抗原−２（ＭＡＤ−ＣＴ−２）；Ｆｏｓ関連抗原１；腫瘍タンパク質ｐ５３（ｐ５３）；ｐ５３変異体；プロステイン；生存；テロメラーゼ；前立腺癌腫瘍抗原−１、Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原１；ラット肉腫（Ｒａｓ）変異体；ヒトテロメラーゼ逆転写酵素（ｈＴＥＲＴ）；肉腫転移ブレークポイント；アポトーシスの黒色腫抑制分子（ＭＬ−ＩＡＰ）；ＥＲＧ（膜貫通プロテアーゼ、セリン２（ＴＭＰＲＳＳ２）ＥＴＳ融合遺伝子）；Ｎ−アセチルグルコサミニル−トランスフェラーゼＶ（ＮＡ１７）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ−３（ＰＡＸ３）；アンドロゲン受容体；サイクリンＢ１；ｖ−ｍｙｃトリ骨髄細胞腫症ウイルス癌遺伝子神経芽細胞腫由来ホモログ（ＭＹＣＮ）；ＲａｓホモログファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）；チロシナーゼ関連タンパク質２（ＴＲＰ−２）；チトクロムＰ４５０  １Ｂ１（ＣＹＰ１Ｂ１）；ＣＣＣＴＣ結合因子（ジンクフィンガータンパク質）様、Ｔ細胞によって認識される扁平上皮癌抗原３（ＳＡＲＴ３）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ−５（ＰＡＸ５）；プロアクロシン結合タンパク質ｓｐ３２（ＯＹ−ＴＥＳ１）；リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）；Ａキナーゼアンカータンパク質４（ＡＫＡＰ−４）；滑膜肉腫、Ｘブレークポイント２（ＳＳＸ２）；終末糖化産物のための受容体（ＲＡＧＥ−１）；腎臓遍在性１（ＲＵ１）；腎臓遍在性２（ＲＵ２）；レグマイン；ヒトパピローマウイルスＥ６（ＨＰＶ  Ｅ６）；ヒトパピローマウイルスＥ７（ＨＰＶ  Ｅ７）；腸管カルボキシルエステラーゼ；変異熱ショックタンパク質７０−２（ｍｕｔ  ｈｓｐ７０−２）；ＣＤ７９ａ；ＣＤ７９ｂ；ＣＤ７２；白血球関連免疫グロブリン様受容体１（ＬＡＩＲ１）；ＩｇＡ受容体のＦｃ断片（ＦＣＡＲ又はＣＤ８９）；白血病免疫グロブリン様受容体サブファミリーＡメンバー２（ＬＩＬＲＡ２）；ＣＤ３００分子様ファミリーメンバーｆ（ＣＤ３００ＬＦ）；Ｃ型レクチンドメインファミリー１２メンバーＡ（ＣＬＥＣ１２Ａ）；骨髄間質細胞抗原２（ＢＳＴ２）；ＥＧＦ様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様２（ＥＭＲ２）；リンパ球抗原７５（ＬＹ７５）；グリピカン−３（ＧＰＣ３）；Ｆｃ受容体様５（ＦＣＲＬ５）；及び免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド１（ＩＧＬＬ１）からなる群から選択される抗原に結合し、任意選択により、前記抗原結合ドメインは、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＢＣＭＡ、ＣＤ２０、ＣＤ１２３、ＥＧＦＲｖＩＩＩ又はメソセリンから選択される抗原に結合する、請求項３１２に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１５】
分解ドメインをさらに含み、前記分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位によって前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチドから隔てられている、請求項２９６〜３１４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１６】
Ｎ末端からＣ末端までに、
ｉ）前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド；
ｉｉ）前記分解ドメイン、前記異種プロテアーゼ切断部位、前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び前記異種ポリペプチド；
ｉｉｉ）前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、前記異種ポリペプチド、前記異種プロテアーゼ切断部位及び前記分解ドメイン；又は
ｉｖ）前記異種ポリペプチド及び前記ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、前記異種プロテアーゼ切断部位及び前記分解ドメイン
を含む、請求項３１５に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１７】
前記分解ドメインは、前記融合ポリペプチドの発現の第１のレベルと関連する第１の状態及び前記融合ポリペプチドの発現の第２のレベルと関連する第２の状態を有し、前記第２のレベルは、例えば、安定化化合物の存在下で前記第１のレベルの少なくとも２、３、４、５、１０、２０又は３０倍増大され、任意選択により、前記安定化化合物の非存在下において、前記融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、前記融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解されるか；又は
前記安定化化合物の存在下において、
ｉ）前記分解ドメインは、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；又は
ｉｉ）前記融合ポリペプチドの前記立体構造は、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、前記異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的である、請求項３１５又は３１６に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１８】
前記分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン又はジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインから選択される、請求項３１５〜３１７のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３１９】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、フューリン、ＰＣＳＫ１、ＰＣＳＫ５、ＰＣＳＫ６、ＰＣＳＫ７、カテプシンＢ、グランザイムＢ、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択される哺乳動物の細胞内プロテアーゼによって切断される、請求項３１５〜３１８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３２０】
前記異種プロテアーゼ切断部位は、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択される哺乳動物の細胞外プロテアーゼによって切断される、請求項３１５〜３１８のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド。
【請求項３２１】
請求項２９６〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドをコードする核酸分子。
【請求項３２２】
任意選択により、ウイルスベクター、例えばレンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター又はアデノウイルスベクターである、請求項３２１に記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項３２３】
請求項２９６〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド、請求項３２１に記載の核酸分子又は請求項３２２に記載のベクターを含む細胞、例えば宿主細胞であって、任意選択により、Ｔ細胞、ＮＫ細胞又は腫瘍細胞である、細胞、例えば宿主細胞。
【請求項３２４】
請求項２９６〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は請求項３２３に記載の細胞及び薬学的に許容される担体、賦形剤又は安定剤を含む医薬組成物。
【請求項３２５】
請求項３２３に記載の細胞を作製する方法であって、細胞、例えば免疫エフェクター細胞を、請求項３２１に記載の核酸分子又は請求項３２２に記載のベクターによってもたらすことを含む、方法。
【請求項３２６】
請求項２９６〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ３と接触させることを含む、融合ポリペプチドを分解する方法であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ３の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少され、任意選択により、
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、エクスビボでＣＯＦ３と接触されるか、又は
前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、インビボでＣＯＦと接触される、方法。
【請求項３２７】
融合ポリペプチドの発現を制御する方法であって、
ｉ）請求項３１５〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により前記安定化化合物の存在下において、
ａ）前記分解ドメインは、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｂ）前記融合ポリペプチドの前記立体構造は、前記安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、前記異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｃ）前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される、工程であって、任意選択により、前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、エクスビボ又はインビボで前記安定化化合物と接触される、工程
を含む、方法。
【請求項３２８】
工程ｉ）後、
ｉｉ）請求項３１５〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ３と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程であって、任意選択により、前記融合ポリペプチド又は前記細胞は、エクスビボ又はインビボでＣＯＦ３と接触される、工程
をさらに含む、請求項３２７に記載の方法。
【請求項３２９】
細胞を作製する方法であって、
ｉ）細胞、例えば免疫エフェクター細胞を、請求項２９６〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドをコードする核酸分子によってもたらす工程；及び
ｉｉ）前記細胞をエクスビボでＣＯＦ３と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ３の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
を含む、方法。
【請求項３３０】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）エクスビボで、請求項２９６〜３１４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ３と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記細胞がエクスビボでＣＯＦ３と接触される前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少される、工程、及び
ｉｉ）有効量の前記細胞を前記対象に投与する工程
を含み、任意選択により、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前に、
前記細胞に例えば前記細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ３の量を減少させ、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、方法。
【請求項３３１】
工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）有効量のＣＯＦ３を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３３０に記載の方法。
【請求項３３２】
工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）ＣＯＦ３の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉｉｉ）後及び工程ｉｖ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の発現レベルに前記融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与の中断は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３３１に記載の方法。
【請求項３３３】
工程ｉｖ）後、
ｖ）工程ｉｉｉ）及び／又はｉｖ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項３３２に記載の方法。
【請求項３３４】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量の、請求項２９６〜３１４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、前記細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ３と接触され、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記細胞がエクスビボでＣＯＦ３と接触される前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少され、任意選択により、前記細胞がエクスビボでＣＯＦ３と接触された後及び前記細胞が前記対象に投与される前に、前記細胞に例えば前記細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ３の量は、減少され、それによって前記疾患を治療する、工程
を含む、方法。
【請求項３３５】
前記細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ３と接触されない、請求項３３４に記載の方法。
【請求項３３６】
工程ｉ）後、
ｉｉ）有効量のＣＯＦ３を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３３４又は３３５に記載の方法。
【請求項３３７】
工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）ＣＯＦ３の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の発現レベルに前記融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与の中断は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３３６に記載の方法。
【請求項３３８】
工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）工程ｉｉ）及び／又はｉｉｉ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項３３７に記載の方法。
【請求項３３９】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量のＣＯＦ３を前記対象に投与する工程であって、前記対象は、請求項２９６〜３１４のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞を含み、任意選択により、ＣＯＦ３の投与は、ＣＯＦ３の投与前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
を含む、方法。
【請求項３４０】
工程ｉ）後、
ｉｉ）ＣＯＦ３の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ３の投与の中断は、ＣＯＦ３の投与前の発現レベルに前記融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与の中断は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３３９に記載の方法。
【請求項３４１】
工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）工程ｉ）及び／又はｉｉ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項３４０に記載の方法。
【請求項３４２】
腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）前記対象に、
（１）安定化化合物、及び
（２）有効量の、請求項３１５〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞又は有効量の、請求項３１５〜３２０のいずれか一項に記載の融合ポリペプチドを含む細胞
を投与する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高く、それによって前記疾患を治療する、工程
を含む、方法。
【請求項３４３】
工程ｉ）後、
ｉｉ）前記安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現に対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、工程ｉ）の治療に応答し（例えば、前記対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、前記対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、前記対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、前記対象において有効である）、且つ／又は
ｂ）前記安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）の治療に対する前記対象の応答に対して応答する（例えば、前記対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、前記対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、前記対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、前記対象において有効である）、工程
をさらに含む、請求項３４２に記載の方法。
【請求項３４４】
工程ｉ）後、
ｉｉｉ）前記安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現に対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）前記安定化化合物の投与の中断は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）前記安定化化合物の投与の中断は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３４２に記載の方法。
【請求項３４５】
工程ｉ）後、
ｉｖ）前記安定化化合物の投与を中断し、且つ有効量のＣＯＦ３を前記対象に投与する工程であって、任意選択により、工程ｉｖ）は、工程ｉ）後及び工程ｉｖ）前の前記融合ポリペプチドの発現に対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）工程ｉｖ）は、前記対象における有害反応の発生に応答するか、又は前記対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）工程ｉｖ）は、有害作用を低減又は予防する、工程であって、
任意選択により、前記有害作用は、急性毒性である、工程
をさらに含む、請求項３４２に記載の方法。
【請求項３４６】
工程ｉｖ）後、
ｖ）例えば、表面に前記融合ポリペプチドを発現する細胞の量が既定値より小さくなった後、例えば１日、５日、１０日又は１５日間にわたり、ＣＯＦ３の投与を中断する工程
をさらに含む、請求項３４５に記載の方法。
【請求項３４７】
工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後、
ｖｉ）有効量の安定化化合物を投与する工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の投与は、工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後及び工程ｖｉ）前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ、任意選択により、
ａ）前記対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）前記安定化化合物の投与は、前記対象における腫瘍再発に応答するか、又は前記対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）前記安定化化合物の投与は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む、請求項３４３〜３４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４８】
工程ｖｉ）後、
ｖｉｉ）工程ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）又はｖｉ）を繰り返し、それによって前記疾患を治療する工程
をさらに含む、請求項３４７に記載の方法。
【請求項３４９】
工程ｉ）前に、
ｖｉｉｉ）エクスビボで前記細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により、前記安定化化合物の存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルは、前記安定化化合物の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高い、工程
をさらに含む、請求項３４２〜３４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５０】
前記細胞は、投与前にエクスビボで前記安定化化合物と接触されない、請求項３４２〜３４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５１】
腫瘍抗原の発現を伴う前記疾患は、癌である、請求項３３０〜３５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５２】
前記癌は、例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療に対して進行してきた対象における中皮腫（例えば、悪性胸膜中皮腫）；肺癌（例えば、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、扁平細胞肺癌又は肺大細胞癌）；膵臓癌（例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療に対して進行してきた対象における例えば膵管腺癌又は転移性膵管腺癌（ＰＤＡ））；食道腺癌、卵巣癌（例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療のレジメン後に進行してきた対象における例えば漿液性卵巣上皮癌）、乳癌、結腸直腸癌、膀胱癌又はその任意の組合せである、請求項３５１に記載の方法。
【請求項３５３】
前記癌は、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫（ＭＣＬ）、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞急性リンパ性白血病（ＢＡＬＬ）、Ｔ細胞急性リンパ性白血病（ＴＡＬＬ）、小リンパ球性白血病（ＳＬＬ）、Ｂ細胞前リンパ性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞性リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、慢性炎症に関連するＤＬＢＣＬ、慢性骨髄性白血病、骨髄増殖性腫瘍、濾胞性リンパ腫、小児濾胞性リンパ腫、ヘアリーセル白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性状態、ＭＡＬＴリンパ腫（粘膜関連リンパ組織型節外性辺縁帯リンパ腫）、辺縁帯リンパ腫、脊髄形成異常、骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンストレーム型マクログロブリン血症、脾辺縁帯リンパ腫、脾リンパ腫／脾性白血病、びまん性赤脾髄小細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ヘアリーセル白血病−バリアント、リンパ形質細胞性リンパ腫、重鎖病、形質細胞性骨髄腫、骨の孤立性形質細胞腫、骨外形質細胞腫、節性辺縁帯リンパ腫、小児節性辺縁帯リンパ腫、原発性皮膚濾胞中心リンパ腫、リンパ腫様肉芽腫症、原発性縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ＡＬＫ＋大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ＨＨＶ８関連多中心性キャッスルマン病の際に生じる大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）又は分類不能リンパ腫から選択される血液癌である、請求項３５１に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本出願は、内容が全体として参照により本明細書に組み込まれる、２０１７年１０月１８日に出願された米国仮特許出願第６２／５７４，１８８号明細書に対する優先権を主張するものである。
【０００２】
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩ形式で電子的手段により提出された配列表を含み、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。２０１８年１０月１７日に作成された前記ＡＳＣＩＩの複製は、Ｎ２０６７−７１３６ＷＯ＿ＳＬ．ｔｘｔと命名され、サイズが２，０５２，５５４バイトである。
【背景技術】
【０００３】
多くの治療用タンパク質は、疾患を予防又は治療するための重要な薬物として開発されてきた。副作用は、治療中又は治療後に発生する可能性があり、薬効の消失から深刻な毒性まで様々である。治療用タンパク質の発現レベルを調節する、例えば有効性を増大させ且つ／又は副作用を減少させるための治療用タンパク質のレベルを調節する戦略を開発することが望ましい。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００４】
本開示は、少なくとも部分的に、標的化されたタンパク質不活性化のための式（Ｉ）の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、式（ＩＩ）の化合物（ＣＯＦ２）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド又は式（ＩＩＩ）の化合物（ＣＯＦ３）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、１つ以上のＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び１つ以上の異種ポリペプチド、例えば目的のポリペプチドを含む。ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、リンカーを介して異種ポリペプチドに作動可能に連結され得る。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）など）の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下において、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドのレベル及び／又は活性を変化させ；例えば、分解、例えば融合ポリペプチドのプロテアソーム分解を増大させる。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの分解は、ユビキチン依存的である。
【０００５】
理論に束縛されるものではないが、いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）など）の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下において、融合ポリペプチドの翻訳後修飾（例えば、ユビキチン化）をもたらして、修飾された、例えばユビキチン化された融合ポリペプチドをもたらすアミノ酸配列及び／又は構造モチーフを提供する。例えば、融合ポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸、例えばリジン又はメチオニンは、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の存在下でユビキチン化され得る。いくつかの実施形態では、ユビキチン化された融合ポリペプチドは、選択的に分解される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの翻訳後修飾は、融合ポリペプチドの分解を増大させる（例えば、分解のレベル及び／又は速度の増大）。いくつかの実施形態では、分解のレベル及び／又は速度は、参照ポリペプチド、例えば、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２若しくはＣＯＦ３の非存在下の融合ポリペプチド、異種ポリペプチド又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴わないか、又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド以外の部分を伴う異種ポリペプチドの融合物の分解のレベル及び／又は速度に対して少なくとも１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される。
【０００６】
一態様では、本明細書では、式（Ｉ）の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチドが提供され、式（Ｉ）の化合物は、
【化１】
2021501570.tif 000003
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体である。
【０００７】
いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、異種哺乳動物ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、異種細菌ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、異種ウイルスポリペプチドである。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、哺乳動物ポリペプチド、細菌ポリペプチド、ウイルスポリペプチド、植物ポリペプチド、酵母ポリペプチド、真菌ポリペプチド、古細菌ポリペプチド、魚類、例えばゼブラフィッシュポリペプチドからの又はそれらに由来するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、表２におけるポリペプチド、例えば表２に記載されるとおりの細胞質内及び／若しくは核ポリペプチド又は膜貫通ポリペプチドを含む。
【０００８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドに融合される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、ペプチド結合によって連結される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、ペプチド結合以外の結合によって連結される。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに直接的に連結される。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに間接的に連結される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、リンカー、例えばグリシン−セリンリンカー、例えば配列番号２８のアミノ酸配列を含むリンカーを介して作動可能に連結される。いくつかの実施形態では、リンカーは、配列番号２８、３７、３８、３９及び９９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【０００９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドのＣ末端に連結される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドのＮ末端に連結される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドの中間にある。
【００１０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１の非存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとセレブロン（ＣＲＢＮ）との会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１の非存在下でＣＲＢＮに結合しない。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、ＣＯＦ１の非存在下でＣＲＢＮに結合しない。いくつかの実施形態では、会合又は結合は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００１１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチド又は融合ポリペプチドは、ＣＯＦ１の存在下おいて１つ以上のリジン又はメチオニン残基でユビキチン化される。いくつかの実施形態では、ユビキチン化は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００１２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの分解は、ＣＯＦ１の存在下でユビキチン化によって媒介される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの分解は、リソソームによって媒介される。いくつかの実施形態では、分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００１３】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、細胞表面ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１の非存在下での細胞表面から細胞内区画への融合ポリペプチドの再利用速度は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での細胞表面から細胞内区画への融合ポリペプチドの再利用の例えば１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％又は９０％以下である。いくつかの実施形態では、再利用は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００１４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１０〜９５のアミノ酸残基長、１５〜９０のアミノ酸残基長、２０〜８５のアミノ酸残基長、２５〜８０のアミノ酸残基長、３０〜７５のアミノ酸残基長、３５〜７０のアミノ酸残基長、４０〜６５のアミノ酸残基長、４５〜６０のアミノ酸残基長、５０〜６５のアミノ酸残基長又は５５〜６５のアミノ酸残基長である。
【００１５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のβターンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βヘアピンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のβヘアピンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βストランドを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のβストランドを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、αヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）の第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）の第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、βヘアピン及び第２のαヘリックスは、６０、５０、４０又は３０個以下のアミノ酸残基によって隔てられている。
【００１６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド又はそのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド又はそのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４若しくはＩＫＺＦ５又はそのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合配列は、天然に存在するポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４又はＩＫＺＦ５に由来する２つ以上の非連続的な配列を含む。
【００１７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦポリペプチド又はその構造モチーフを含む。
【００１８】
いくつかの実施形態では、ＩＫＺＦポリペプチドは、ＩＫＺＦ１ポリペプチド、ＩＫＺＦ３ポリペプチド、Ｈ１４１Ｑ置換（配列番号２１に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ２ポリペプチド又はＨ１８８Ｑ置換（配列番号２２に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ４ポリペプチドである。
【００１９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ（例えば、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフを含む。
【００２０】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００２１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む。
【００２２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【００２３】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００２４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む。
【００２５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【００２６】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００２７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む。
【００２８】
いくつかの実施形態では、以下のアミノ酸残基：配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミン、１４８位のシステイン、１５０位のグルタミン、１５２位のグリシン、１６１位のロイシン又は１６２位のロイシンの１つ、２つ、３つ又は全ては，不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１４８位のシステインは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１５０位のグルタミンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１５２位のグリシンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１６１位のロイシンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１６２位のロイシンは、不変のままである。
【００２９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１３９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含ｍｉ、例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４０のアミノ酸配列を含む。
【００３０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号７７のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列からなる。
【００３１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号７８のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号７８のアミノ酸配列からなる。
【００３２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【００３３】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００３４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９から１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む。
【００３５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む。
【００３６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号９１のアミノ酸配列を含む。
【００３７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ１の非存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下でのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【００３８】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００３９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列（例えば、配列番号５のアミノ酸配列を含む第１の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基が異なる第１の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基が異なる第１の配列）；及びＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第２の配列（例えば、配列番号１１のアミノ酸配列を含む第２の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基が異なる第２の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基が異なる第２の配列）を含む。
【００４０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列からなる。
【００４１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８５のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８５のアミノ酸配列からなる。
【００４２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８６のアミノ酸配列からなる。
【００４３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、対応する天然配列よりも少なくとも１つ少ないリジンを含む。いくつかの実施形態では、対応する天然配列中の１つ以上のリジン残基は、異なるアミノ酸、例えばアルギニンによって置き換えられる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１、２、３、４又は５個未満のリジン残基を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、リジン残基を含まない。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、ＣＯＦ１の存在下において、例えば本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ユビキチン化されず、任意選択により、ユビキチン化は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００４４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４、４１、４２及び４３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４３のアミノ酸配列を含む。
【００４５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列からなる。
【００４６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、免疫調節性イミド薬剤（ＩＭｉＤ）又はその薬学的に許容される塩である。
【００４７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、式（Ｉ−ａ）：
【化２】
2021501570.tif 000004
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体の構造を有する。
【００４８】
式（Ｉ−ａ）のいくつかの実施形態では、Ｘは、Ｏである。いくつかの実施形態では、Ｍは、存在しない。いくつかの実施形態では、環Ａは、ヘテロシクリル（例えば、窒素含有ヘテロシクリル、例えば２−（２．６−ジオキソピペリジン−３−イル）イソインドリン−１，３−ジオン）である。いくつかの実施形態では、Ｒ４は、オキソ又はＯＲＢ（例えば、−ＯＣＨ３又は−ＯＣＨ２ＣＨ３）であり、且つｏは、０、１又は２である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素であるか、又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基を形成する。いくつかの実施形態では、Ｒ３ａは、ヘテロアルキル（例えば、−ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２）、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ（例えば、−ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ３）である。一実施形態では、ｎは、０である。
【００４９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、サリドマイド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である。
【００５０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド及び２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される。
【００５１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、
【化３】
2021501570.tif 000005
又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される。
【００５２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド又は薬学的に許容される塩である。
【００５３】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、分解ドメインをさらに含み、分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位によってＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドから隔てられている。
【００５４】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、
ｉ）分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、異種ポリペプチド及びＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド；
ｉｉ）分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド；
ｉｉｉ）ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメイン；又は
ｉｖ）異種ポリペプチド及びＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメイン
を含む。
【００５５】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、異種ポリペプチド及びＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む。
【００５６】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、融合ポリペプチドの発現の第１のレベルと関連する第１の状態及び融合ポリペプチドの発現の第２のレベルと関連する第２の状態を有し、第２のレベルは、例えば、安定化化合物の存在下で第１のレベルの少なくとも２、３、４、５、１０、２０又は３０倍増大される。
【００５７】
いくつかの実施形態では、安定化化合物の非存在下において、融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される。
【００５８】
いくつかの実施形態では、発現のレベル及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００５９】
いくつかの実施形態では、安定化化合物の存在下において、
ｉ）分解ドメインは、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；又は
ｉｉ）融合ポリペプチドの立体構造は、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的である。
【００６０】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン又はジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインから選択される。
【００６１】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６又は４８と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４８のアミノ酸配列を含む。
【００６２】
いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン若しくは４−ヒドロキシタモキシフェン（４−ＯＨＴ）又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインであり、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。
【００６３】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５０と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５０のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、Ｓｈｉｅｌｄ−１又はその薬学的に許容される塩である。
【００６４】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５１と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、トリメトプリム又はその薬学的に許容される塩である。
【００６５】
いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞内プロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、フューリン、ＰＣＳＫ１、ＰＣＳＫ５、ＰＣＳＫ６、ＰＣＳＫ７、カテプシンＢ、グランザイムＢ、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択されるプロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＸ（Ｋ／Ｒ）Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５２）、ＲＸＸＸ［ＫＲ］Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５３）、ＲＲＸコンセンサスモチーフ（配列番号５４）、Ｉ−Ｅ−Ｐ−Ｄ−Ｘコンセンサスモチーフ（配列番号５５）、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択される切断モチーフを有する配列を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、フューリンによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＴＫＲ（配列番号１２３）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲ（配列番号１２７）；ＬＱＷＬＥＱＱＶＡＫＲＲＴＫＲ（配列番号１２９）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＧ（配列番号１３１）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧ（配列番号１３３）；ＳＬＮＬＴＥＳＨＮＳＲＫＫＲ（配列番号１３５）；ＣＫＩＮＧＹＰＫＲＧＲＫＲＲ（配列番号１３７）；及びＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）からなる群から選択されるフューリン切断部位を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）のアミノ酸配列を含まない。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）のフューリン切断部位を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞外プロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、哺乳動物の細胞外プロテアーゼは、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００６６】
一態様では、本明細書では、異種プロテアーゼ切断部位によって隔てられた第１のドメイン及び第２のドメインを含む融合ポリペプチドが提供され、第１のドメインは分解ドメインを含み、第２のドメインは、式（ＩＩ）の化合物（ＣＯＦ２）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド、例えば異種哺乳動物、細菌又はウイルスポリペプチドを含み、式（ＩＩ）の化合物は、
【化４】
2021501570.tif 000006
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ１０の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）若しくは−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ又はＬ−タグであり；各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１１で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｌは、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ１、−ＯＲＢ１、−Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｎ（ＲＣ１）Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ１）（ＲＤ１）又は−Ｎ（ＲＣ１）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１であり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１２で置換され；
各タグは、標的タンパク質に結合可能な標的化部分であり；
ＲＡ１、ＲＢ１、ＲＣ１、ＲＤ１及びＲＥ１の各々は、独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１２で置換され；
各Ｒ１２は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、シアノ、カルボシクリル又はヘテロシクリルであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、互変異性体若しくはプロドラッグである。
【００６７】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、融合ポリペプチドの発現の第１のレベルと関連する第１の状態及び融合ポリペプチドの発現の第２のレベルと関連する第２の状態を有し、第２のレベルは、例えば、安定化化合物の存在下で第１のレベルの少なくとも２、３、４、５、１０、２０又は３０倍増大される。
【００６８】
いくつかの実施形態では、安定化化合物の非存在下において、融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される。
【００６９】
いくつかの実施形態では、発現のレベル及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００７０】
いくつかの実施形態では、安定化化合物の存在下において、
ｉ）分解ドメインは、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；又は
ｉｉ）融合ポリペプチドの立体構造は、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的である。
【００７１】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン又はジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインから選択される。
【００７２】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６又は４８と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４８のアミノ酸配列を含む。
【００７３】
いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン若しくは４−ヒドロキシタモキシフェン（４−ＯＨＴ）又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインであり、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。
【００７４】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５０と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５０のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、Ｓｈｉｅｌｄ−１又はその薬学的に許容される塩である。
【００７５】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５１と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、トリメトプリム又はその薬学的に許容される塩である。
【００７６】
いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞内プロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、フューリン、ＰＣＳＫ１、ＰＣＳＫ５、ＰＣＳＫ６、ＰＣＳＫ７、カテプシンＢ、グランザイムＢ、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択されるプロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＸ（Ｋ／Ｒ）Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５２）、ＲＸＸＸ［ＫＲ］Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５３）、ＲＲＸコンセンサスモチーフ（配列番号５４）、Ｉ−Ｅ−Ｐ−Ｄ−Ｘコンセンサスモチーフ（配列番号５５）、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択される切断モチーフを有する配列を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、フューリンによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＴＫＲ（配列番号１２３）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲ（配列番号１２７）；ＬＱＷＬＥＱＱＶＡＫＲＲＴＫＲ（配列番号１２９）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＧ（配列番号１３１）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧ（配列番号１３３）；ＳＬＮＬＴＥＳＨＮＳＲＫＫＲ（配列番号１３５）；ＣＫＩＮＧＹＰＫＲＧＲＫＲＲ（配列番号１３７）；及びＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）からなる群から選択されるフューリン切断部位を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）のアミノ酸配列を含まない。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）のフューリン切断部位を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞外プロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、哺乳動物の細胞外プロテアーゼは、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００７７】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位に融合され、異種プロテアーゼ切断部位は、第２のドメインにさらに融合される。
【００７８】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、
ｉ）分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、異種ポリペプチド及びＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド；
ｉｉ）分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメイン；又は
ｉｖ）異種ポリペプチド及びＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメイン
を含む。
【００７９】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、異種ポリペプチド及びＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメインを含む。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、異種ポリペプチド及びＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメインを含む。
【００８０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２の非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとセレブロン（ＣＲＢＮ）との会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ２の非存在下でＣＲＢＮに結合しない。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、ＣＯＦ２の非存在下でＣＲＢＮに結合しない。いくつかの実施形態では、会合及び／又は結合は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００８１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチド又は融合ポリペプチドは、ＣＯＦ２の存在下おいて１つ以上のリジン又はメチオニン残基でユビキチン化される。いくつかの実施形態では、ユビキチン化は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００８２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの分解は、ＣＯＦ２の存在下でユビキチン化によって媒介される。いくつかの実施形態では、分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００８３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１０〜９５のアミノ酸残基長、１５〜９０のアミノ酸残基長、２０〜８５のアミノ酸残基長、２５〜８０のアミノ酸残基長、３０〜７５のアミノ酸残基長、３５〜７０のアミノ酸残基長、４０〜６５のアミノ酸残基長、４５〜６０のアミノ酸残基長、５０〜６５のアミノ酸残基長又は５５〜６５のアミノ酸残基長である。
【００８４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のβターンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βヘアピンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のβヘアピンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βストランドを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のβストランドを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、αヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）の第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３（例えば、ヒトＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）の第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む。いくつかの実施形態では、βヘアピン及び第２のαヘリックスは、６０、５０、４０又は３０個以下のアミノ酸残基によって隔てられている。
【００８５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド又はそのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド又はそのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４若しくはＩＫＺＦ５又はそのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合配列は、天然に存在するポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４又はＩＫＺＦ５に由来する２つ以上の非連続的な配列を含む。
【００８６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦポリペプチド又はその構造モチーフを含む。
【００８７】
いくつかの実施形態では、ＩＫＺＦポリペプチドは、ＩＫＺＦ１ポリペプチド、ＩＫＺＦ３ポリペプチド、Ｈ１４１Ｑ置換（配列番号２１に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ２ポリペプチド又はＨ１８８Ｑ置換（配列番号２２に従って番号付けされる）を有するＩＫＺＦ４ポリペプチドである。
【００８８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ（例えば、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフを含む。
【００８９】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００９０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む。
【００９１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【００９２】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００９３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む。
【００９４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【００９５】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【００９６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１７０から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５又は３０個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む。
【００９７】
いくつかの実施形態では、以下のアミノ酸残基：配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミン、１４８位のシステイン、１５０位のグルタミン、１５２位のグリシン、１６１位のロイシン又は１６２位のロイシンの１つ、２つ、３つ又は全ては、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１４７位のグルタミンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１４８位のシステインは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１５０位のグルタミンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１５２位のグリシンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１６１位のロイシンは、不変のままである。いくつかの実施形態では、配列番号１９に従って番号付けされる１６２位のロイシンは、不変のままである。
【００９８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１３９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含み、例えば、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４０のアミノ酸配列を含む。
【００９９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号７７のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号５のアミノ酸配列からなる。
【０１００】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号７８のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号７８のアミノ酸配列からなる。
【０１０１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【０１０２】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【０１０３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）（例えば、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列）（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９から１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸置換を有する配列）を含む。
【０１０４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１のアミノ酸配列を含む。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号９１のアミノ酸配列を含む。
【０１０６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、
ｉ）ＣＯＦ２の非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下であるか；
ｉｉｉ）ＣＯＦ２の非存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での異種ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；
ｉｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化が、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下であるか；又は
ｖ）ＣＯＦ２の非存在下での融合ポリペプチドの分解が、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ２、例えば過剰量のＣＯＦ２の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である、
ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９に由来する十分なアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ）を含む。
【０１０７】
いくつかの実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列（例えば、配列番号５のアミノ酸配列を含む第１の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基が異なる第１の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基１３６〜１８０と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基が異なる第１の配列）；及びＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第２の配列（例えば、配列番号１１のアミノ酸配列を含む第２の配列）又はＩＫＺＦ３のアミノ酸残基２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基が異なる第２の配列（例えば、配列番号１９のアミノ酸残基２３６〜２４９と１、２、３、４、５、６又は７個以下のアミノ酸残基が異なる第２の配列）を含む。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０及び２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列からなる。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１８０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８５のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８５のアミノ酸配列からなる。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０（配列番号１９に従って番号付けされる）を含む第１の配列及びＭＡＬＥＫＭＡＬＥＫＭＡＬＥのアミノ酸配列（配列番号９１）を含む第２の配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号８６のアミノ酸配列からなる。
【０１１２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、対応する天然配列よりも少なくとも１つ少ないリジンを含む。いくつかの実施形態では、対応する天然配列中の１つ以上のリジン残基は、異なるアミノ酸、例えばアルギニンによって置き換えられる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１、２、３、４又は５個未満のリジン残基を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、リジン残基を含まない。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、ＣＯＦ２の存在下において、例えば本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ユビキチン化されず、任意選択により、ユビキチン化は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【０１１３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４、４１、４２及び４３からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４３のアミノ酸配列を含む。
【０１１４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号４のアミノ酸配列からなる。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、免疫調節性イミド薬剤（ＩＭｉＤ）又はその薬学的に許容される塩である。
【０１１６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、式（Ｉ）：
【化５】
2021501570.tif 000007
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体の構造を有する。
【０１１７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、式（Ｉ−ａ）：
【化６】
2021501570.tif 000008
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体の構造を有する。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、サリドマイド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド及び２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、
【化７】
2021501570.tif 000009
又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される。
【０１２０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド又は薬学的に許容される塩である。
【０１２１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、式（Ｉ）：
【化８】
2021501570.tif 000010
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体の構造を含む。
【０１２２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、式（Ｉ−ａ）：
【化９】
2021501570.tif 000011
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体の構造を含む。
【０１２３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、免疫調節性イミド薬剤（ＩＭｉＤ）又はその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、サリドマイド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド及び２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩を含む。
【０１２４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、
【化１０】
2021501570.tif 000012
又はその薬学的に許容される塩からなる群から選択される化合物を含む。
【０１２５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド又はその類似体若しくは薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド又は薬学的に許容される塩を含む。
【０１２６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、リガンド（例えば、式（ＩＩ）のＲ１０は、Ｌ−タグである）をさらに含む。いくつかの実施形態では、式（ＩＩ）のＲ１０は、Ｌ−タグであり、Ｌは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、図２８〜３１）において開示されるリンカーから選択されるリンカーであり、且つタグは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、表Ｔ、１１９〜１２９頁）において開示されるｄＴＡＧ標的化リガンドから選択される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、ＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及びリガンドを含み、ＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）は、例えば、リンカーを介してリガンドに連結される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドはリガンドに結合し、リガンドの非存在下でのＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）との間の結合は、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとリガンドとの間の結合の０．０００１、０．００１、０．０１、０．１、１又は１０％以下であり、例えば、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＭｉＤ（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）に結合せず、任意選択により、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、３６〜６５頁）において開示されるｄＴＡＧから選択される。
【０１２７】
一態様では、本明細書では、式（ＩＩＩ）の化合物（ＣＯＦ３）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチドが提供され、式（ＩＩＩ）の化合物は、
【化１１】
2021501570.tif 000013
（式中、
Ｘ１は、ＣＲ３であり；
【化１２】
2021501570.tif 000014
は、Ｘ１がＣＲ３であり且つＲ３が存在しない場合、任意選択により二重結合であり；
各Ｒ１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル又はハロであるか、又は
２つのＲ１は、それらが結合される炭素原子とともに５員又は６員ヘテロシクリル環を形成するか、又は
２つのＲ１は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール環を形成し；
Ｒ２は、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、−Ｃ（Ｏ）Ｃ１〜Ｃ６アルキル、−Ｃ（Ｏ）（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、−Ｃ（Ｏ）Ｏ（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７−ヘテロシクリルであり、アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；及びアリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ５で置換されるか、又は
Ｒ１及びＲ２は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともに５員又は６員ヘテロシクリル環を形成し；
Ｒ３は水素であるか、又は
【化１３】
2021501570.tif 000015
が二重結合であるとき、Ｒ３は、存在せず；
各Ｒ４は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ６Ｒ６’、−ＮＲ６Ｃ（Ｏ）Ｒ６’、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル環から独立して選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
各Ｒ５は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールから独立して選択されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ６及びＲ６’は、それぞれ独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル又はＣ６〜Ｃ１０アリールであり；
各Ｒ７は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ８、−（ＣＨ２）０〜３Ｃ（Ｏ）ＯＲ８、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ８Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）ＯＲ９、−Ｓ（Ｏ）ｐＮＲ８Ｒ９、−Ｓ（Ｏ）ｐＲ１２、（Ｃ１〜Ｃ６）ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−Ｏ（ＣＨ２）１〜３ＣＮ、−ＮＨ２、シアノ、−Ｏ（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、アダマンチル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む−Ｏ（ＣＨ２）０〜３−５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む単環式又は二環式５〜１０員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択され、アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ１１で置換され、アリール、ヘテロアリール及びヘテロシクリルは、任意選択により、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル及びＣ１〜Ｃ６アルコキシからそれぞれ独立して選択される１つ以上の置換基で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される炭素原子とともにａ＝（Ｏ）を形成するか、又は
２つのＲ７は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ８及びＲ９は、それぞれ独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノから独立して選択されるか、又は
２つのＲ１０は、それらが結合される炭素原子とともにａ＝（Ｏ）を形成し；
各Ｒ１１は、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択され、各アリール及びヘテロシクリルは、任意選択により、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノからそれぞれ独立して選択される１つ以上の置換基で置換され；
Ｒ１２は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり；
Ｒｘは、水素又は重水素であり；
ｐは、０、１又は２であり；
ｎは、０、１又は２であり；
ｙは、１又は２であり、ここで、ｎ＋ｙ≦３であり；及び
ｑは、０、１、２、３又は４である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体である。
【０１２８】
一実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩ−ｂ）：
【化１４】
2021501570.tif 000016
（式中、Ｘ１、Ｒ１、Ｒ２、ｎ、ｑ及びその下位の変数は、式（ＩＩＩ）について上に記載されるとおりに定義される）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体である。
【０１２９】
一実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩ−ｄ）：
【化１５】
2021501570.tif 000017
（式中、Ｒ１、Ｒ２、ｑ及びその下位の変数は、式（ＩＩＩ）について上に記載されるとおりに定義される）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体である。
【０１３０】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドに融合される。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、ペプチド結合によって連結される。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、ペプチド結合以外の結合によって連結される。一実施形態では、異種ポリペプチドは、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに直接的に連結される。一実施形態では、異種ポリペプチドは、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドに間接的に連結される。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、リンカー、例えばグリシン−セリンリンカー、例えば配列番号２８のアミノ酸配列を含むリンカーを介して作動可能に連結される。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドのＣ末端に連結される。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドのＮ末端に連結される。
【０１３１】
一実施形態では、ＣＯＦ３の非存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、ＣＯＦ３、例えば過剰量のＣＯＦ３の存在下での融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合の例えば０．０１％、０．１％、１％、５％、１０％、１５％又は２０％以下である。一実施形態では、融合ポリペプチドは、ＣＯＦ３の非存在下でＣＲＢＮに結合しない。一実施形態では、ＣＯＦ３の非存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、ＣＯＦ３、例えば過剰量のＣＯＦ３の存在下での融合ポリペプチドのユビキチン化の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。一実施形態では、融合ポリペプチドは、ＣＯＦ３の存在下おいて１つ以上のリジン又はメチオニン残基でユビキチン化される。一実施形態では、ＣＯＦ３の非存在下での融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ３、例えば過剰量のＣＯＦ３の存在下での融合ポリペプチドの分解の例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。一実施形態では、融合ポリペプチドの分解は、ＣＯＦ３の存在下でユビキチン化によって媒介される。一実施形態では、会合、ユビキチン化及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【０１３２】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、１０〜９５のアミノ酸残基長、１５〜９０のアミノ酸残基長、２０〜８５のアミノ酸残基長、２５〜８０のアミノ酸残基長、３０〜７５のアミノ酸残基長、３５〜７０のアミノ酸残基長、４０〜６５のアミノ酸残基長、４５〜６０のアミノ酸残基長、５０〜６５のアミノ酸残基長又は５５〜６５のアミノ酸残基長である。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、５９のアミノ酸残基長である。
【０１３３】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターンを含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βヘアピンを含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βストランドを含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、αヘリックスを含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド及び第１のαヘリックスを含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、第１のβストランド、βヘアピン、第２のβストランド、第１のαヘリックス及び第２のαヘリックスを含む。一実施形態では、βヘアピン及び第２のαヘリックスは、６０、５０、４０又は３０個以下のアミノ酸残基によって隔てられている。
【０１３４】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド又はそのＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド又はそのＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、天然に存在するＩＫＺＦ２又はそのＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体に由来するＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合配列は、天然に存在するＩＫＺＦポリペプチド、例えば天然に存在するＩＫＺＦ２に由来する２つ以上の非連続的な配列を含む。
【０１３５】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４（配列番号２１に従って番号付けされる）を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１３のアミノ酸配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４（配列番号２１に従って番号付けされる）と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２１のアミノ酸残基１３０〜１７４と１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２１のアミノ酸残基１３０〜１７４から１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５又は４０個以下のアミノ酸置換を有する配列を含む。
【０１３６】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１４のアミノ酸配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）と１、２、３、４又は１０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２１のアミノ酸残基２３０〜２４３と１、２、３、４又は１０個以下のアミノ酸残基だけ異なる配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号２１のアミノ酸残基２３０〜２４３から、１、２、３、４又は１０個以下のアミノ酸置換を有する配列を含む。
【０１３７】
一実施形態では、配列番号２１に従って番号付けされる１４１位のヒスチジンは、不変のままである。
【０１３８】
一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４（配列番号２１に従って番号付けされる）を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１３のアミノ酸配列を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）を含む。一実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１１４のアミノ酸配列を含む。一実施形態において、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる。
【０１３９】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、分解ドメインをさらに含み、分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位によってＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドから隔てられている。
【０１４０】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、
ｉ）分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、異種ポリペプチド及びＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド；
ｉｉ）分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド；
ｉｉｉ）ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメイン；又は
ｉｖ）異種ポリペプチド及びＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種プロテアーゼ切断部位及び分解ドメイン
を含む。
【０１４１】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端までに、分解ドメイン、異種プロテアーゼ切断部位、異種ポリペプチド及びＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む。
【０１４２】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、融合ポリペプチドの発現の第１のレベルと関連する第１の状態及び融合ポリペプチドの発現の第２のレベルと関連する第２の状態を有し、第２のレベルは、例えば、安定化化合物の存在下で第１のレベルの少なくとも２、３、４、５、１０、２０又は３０倍増大される。
【０１４３】
いくつかの実施形態では、安定化化合物の非存在下において、融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される。
【０１４４】
いくつかの実施形態では、発現のレベル及び／又は分解は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞において測定されるとおりである。
【０１４５】
いくつかの実施形態では、安定化化合物の存在下において、
ｉ）分解ドメインは、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；又は
ｉｉ）融合ポリペプチドの立体構造は、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的である。
【０１４６】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン又はジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインから選択される。
【０１４７】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６又は４８と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４８のアミノ酸配列を含む。
【０１４８】
いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン若しくは４−ヒドロキシタモキシフェン（４−ＯＨＴ）又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインであり、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含み、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。
【０１４９】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５０と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５０のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、Ｓｈｉｅｌｄ−１又はその薬学的に許容される塩である。
【０１５０】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインである。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５１と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号５１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、トリメトプリム又はその薬学的に許容される塩である。
【０１５１】
いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞内プロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、フューリン、ＰＣＳＫ１、ＰＣＳＫ５、ＰＣＳＫ６、ＰＣＳＫ７、カテプシンＢ、グランザイムＢ、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択されるプロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＸ（Ｋ／Ｒ）Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５２）、ＲＸＸＸ［ＫＲ］Ｒコンセンサスモチーフ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号５３）、ＲＲＸコンセンサスモチーフ（配列番号５４）、Ｉ−Ｅ−Ｐ−Ｄ−Ｘコンセンサスモチーフ（配列番号５５）、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択される切断モチーフを有する配列を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、フューリンによって切断される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＲＴＫＲ（配列番号１２３）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲ（配列番号１２７）；ＬＱＷＬＥＱＱＶＡＫＲＲＴＫＲ（配列番号１２９）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＧ（配列番号１３１）；ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧ（配列番号１３３）；ＳＬＮＬＴＥＳＨＮＳＲＫＫＲ（配列番号１３５）；ＣＫＩＮＧＹＰＫＲＧＲＫＲＲ（配列番号１３７）；及びＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）からなる群から選択されるフューリン切断部位を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＳＡＲＮＲＱＫＲ（配列番号３４）のアミノ酸配列を含まない。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、ＧＴＧＡＥＤＰＲＰＳＲＫＲＲＳＬＧＤＶＧ（配列番号１２５）のフューリン切断部位を含む。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、哺乳動物の細胞外プロテアーゼによって切断される。いくつかの実施形態では、哺乳動物の細胞外プロテアーゼは、因子ＸＡ、エンテロキナーゼ、ｇｅｎｅｎａｓｅ、ソルターゼ、ｐｒｅｃｉｓｓｉｏｎプロテアーゼ、トロンビン、ＴＥＶプロテアーゼ，及びエラスターゼ１からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、Ｉｌｅ−Ｇｌｕ／Ａｓｐ−Ｇｌｙ−Ａｒｇ（配列番号５６）、Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ａｓｐ−Ｌｙｓ（配列番号５７）、Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ａｌａ−Ａｌａ−Ｈｉｓ−Ｔｙｒ（配列番号５８）、ＬＰＸＴＧ／Ａコンセンサスモチーフ（配列番号５９）、Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｖａｌ−Ｐｈｅ−Ｇｌｎ−Ｇｌｙ−Ｐｒｏ（配列番号６０）、Ｌｅｕ−Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ａｒｇ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ（配列番号６１）、Ｅ−Ｎ−Ｌ−Ｙ−Ｆ−Ｑ−Ｇ（配列番号６２）及び［ＡＧＳＶ］−Ｘ（Ｘは、いずれのアミノ酸でもあり得る；配列番号６３）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【０１５２】
前述の態様の特定の実施形態では、異種ポリペプチドは、細胞質内及び／若しくは核ポリペプチド又は膜貫通ポリペプチド、例えば表２における異種ポリペプチドから選択される。いくつかの実施形態では、細胞質内及び／又は核ポリペプチドは、アポトーシス経路の構成要素（例えば、カスパーゼ９）、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素（例えば、Ｃａｓ９）、転写因子（例えば、ＭＩＴＦ、ｃ−Ｍｙｃ、ＳＴＡＴ３、ＳＴＡＴ５、ＮＦ−カッパＢ、ベータ−カテニン、ノッチ、ＧＬＩ又はｃ−ＪＵＮ）、Ｔｅｔメチルシトシンジオキシゲナーゼ２（ＴＥＴ２）、ＦＫＢＰ及びタウからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、膜貫通ポリペプチドは、ＣＤ６２Ｌ、ＣＣＲ１、ＣＣＲ２、ＣＣＲ５、ＣＣＲ７、ＣＣＲ１０、ＣＸＣＲ２、ＣＸＣＲ３、ＣＸＣＲ４、ＣＸＣＲ６、ＣＴＬＡ４、ＰＤ１、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、ＣＤ１３７Ｌ、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＴＩＧＩＴ、ＣＤ３、ＣＤ８、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２０、ＢＣＭＡ，及びキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素（例えば、Ｃａｓ９）、ＣＤ８、ＣＤ１９及びＣＤ２２からなる群から選択される。
【０１５３】
いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、１つ以上の一次シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、１つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、１つ以上の一次シグナル伝達ドメインの１つは、ＣＤ３−ゼータ刺激ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインの１つ以上は、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＩＣＯＳ、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＩＣＡＭ−１、リンパ球機能関連抗原−１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＣＤＳ、ＣＤ７、ＣＤ２８７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＮＫＧ２Ｄ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ４６、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３及びＣＤ８３に特異的に結合するリガンドからなる群から選択される共刺激タンパク質に由来する細胞内ドメインである。いくつかの実施形態では、前記共刺激シグナル伝達ドメインの１つ以上は、４−１ＢＢ共刺激ドメインを含む。いくつかの実施形態では、前記共刺激シグナル伝達ドメインの１つ以上は、ＣＤ２８共刺激ドメインを含む。いくつかの実施形態では、抗原結合ドメインは、ｓｃＦｖである。
【０１５４】
いくつかの実施形態では、抗原結合ドメインは、ＣＤ１９；ＣＤ１２３；ＣＤ２２；ＣＤ３０；ＣＤ１７１；ＣＳ−１；Ｃ型レクチン様分子−１、ＣＤ３３；上皮増殖因子受容体バリアントＩＩＩ（ＥＧＦＲｖＩＩＩ）；ガングリオシドＧ２（ＧＤ２）；ガングリオシドＧＤ３；ＴＮＦ受容体ファミリーメンバー；Ｂ細胞成熟抗原；Ｔｎ抗原（（Ｔｎ  Ａｇ）又は（ＧａｌＮＡｃα−Ｓｅｒ／Ｔｈｒ））；前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）；受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体１（ＲＯＲ１）；Ｆｍｓ様チロシンキナーゼ３（ＦＬＴ３）；腫瘍関連糖タンパク質７２（ＴＡＧ７２）；ＣＤ３８；ＣＤ４４ｖ６；癌胎児抗原（ＣＥＡ）；上皮細胞接着分子（ＥＰＣＡＭ）；Ｂ７Ｈ３（ＣＤ２７６）；ＫＩＴ（ＣＤ１１７）；インターロイキン−１３受容体サブユニットアルファ−２；メソセリン；インターロイキン１１受容体アルファ（ＩＬ−１１Ｒａ）；前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）；プロテアーゼセリン２１；血管内皮増殖因子受容体２（ＶＥＧＦＲ２）；ルイス（Ｙ）抗原；ＣＤ２４；血小板由来増殖因子受容体ベータ（ＰＤＧＦＲ−ベータ）；ステージ特異的胎児抗原−４（ＳＳＥＡ−４）；ＣＤ２０；葉酸受容体アルファ；受容体チロシン−タンパク質キナーゼＥＲＢＢ２（Ｈｅｒ２／ｎｅｕ）；ムチン１、細胞表面関連（ＭＵＣ１）；上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）；神経細胞接着分子（ＮＣＡＭ）；プロスターゼ；前立腺酸性ホスファターゼ（ＰＡＰ）；変異した伸張因子２（ＥＬＦ２Ｍ）；エフリンＢ２；線維芽細胞活性化タンパク質アルファ（ＦＡＰ）；インスリン様増殖因子１受容体（ＩＧＦ−Ｉ受容体）、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）；プロテアソーム（プロソーム、マクロペイン）サブユニット、ベータ型、９（ＬＭＰ２）；糖タンパク質１００（ｇｐ１００）；切断点クラスター領域（ＢＣＲ）及びエーベルソンマウス白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ１（Ａｂｌ）（ｂｃｒ−ａｂｌ）からなる癌遺伝子ポリペプチド；チロシナーゼ；エフリンＡ型受容体２（ＥｐｈＡ２）；フコシルＧＭ１；シアリルルイス接着分子（ｓＬｅ）；ガングリオシドＧＭ３；トランスグルタミナーゼ５（ＴＧＳ５）；高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷＭＡＡ）；ｏ−アセチル−ＧＤ２ガングリオシド（ＯＡｃＧＤ２）；葉酸受容体ベータ；腫瘍内皮細胞マーカー１（ＴＥＭ１／ＣＤ２４８）；腫瘍内皮細胞マーカー７−関連（ＴＥＭ７Ｒ）；クローディン６（ＣＬＤＮ６）；甲状腺刺激ホルモン受容体（ＴＳＨＲ）；Ｇタンパク質共役受容体クラスＣグループ５、メンバーＤ（ＧＰＲＣ５Ｄ）；染色体Ｘオープンリーティングフレーム６１（ＣＸＯＲＦ６１）；ＣＤ９７；ＣＤ１７９ａ；未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）；ポリシアル酸；胎盤特異的１（ＰＬＡＣ１）；ｇｌｏｂｏＨグリコセラミド（ＧｌｏｂｏＨ）のヘキササッカリド部分；哺乳動物腺分化抗原（ＮＹ−ＢＲ−１）；ウロプラキン２（ＵＰＫ２）；Ａ型肝炎ウイルス細胞受容体１（ＨＡＶＣＲ１）；アドレナリン受容体ベータ３（ＡＤＲＢ３）；パネキシン３（ＰＡＮＸ３）；Ｇタンパク質共役型受容体２０（ＧＰＲ２０）；リンパ球抗原６複合体、座位Ｋ９（ＬＹ６Ｋ）；嗅覚受容体５１Ｅ２（ＯＲ５１Ｅ２）；ＴＣＲガンマ代替リーディ��グフレームタンパク質（ＴＡＲＰ）；ウィルムス腫瘍タンパク質（ＷＴ１）；癌／精巣抗原１（ＮＹ−ＥＳＯ−１）；癌／精巣抗原２（ＬＡＧＥ−１ａ）；黒色腫関連抗原１（ＭＡＧＥ−Ａ１）；染色体１２ｐに位置するＥＴＳ転座バリアント遺伝子６（ＥＴＶ６−ＡＭＬ）；精子タンパク質１７（ＳＰＡ１７）；Ｘ抗原ファミリー、メンバー１Ａ（ＸＡＧＥ１）；アンジオポエチン結合細胞表面受容体２（Ｔｉｅ  ２）；黒色腫癌精巣抗原−１（ＭＡＤ−ＣＴ−１）；黒色腫癌精巣抗原−２（ＭＡＤ−ＣＴ−２）；Ｆｏｓ関連抗原１；腫瘍タンパク質ｐ５３（ｐ５３）；ｐ５３変異体；プロステイン；生存；テロメラーゼ；前立腺癌腫瘍抗原−１、Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原１；ラット肉腫（Ｒａｓ）変異体；ヒトテロメラーゼ逆転写酵素（ｈＴＥＲＴ）；肉腫転移ブレークポイント；アポトーシスの黒色腫抑制分子（ＭＬ−ＩＡＰ）；ＥＲＧ（膜貫通プロテアーゼ、セリン２（ＴＭＰＲＳＳ２）ＥＴＳ融合遺伝子）；Ｎ−アセチルグルコサミニル−トランスフェラーゼＶ（ＮＡ１７）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ−３（ＰＡＸ３）；アンドロゲン受容体；サイクリンＢ１；ｖ−ｍｙｃトリ骨髄細胞腫症ウイルス癌遺伝子神経芽細胞腫由来ホモログ（ＭＹＣＮ）；ＲａｓホモログファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）；チロシナーゼ関連タンパク質２（ＴＲＰ−２）；チトクロムＰ４５０  １Ｂ１（ＣＹＰ１Ｂ１）；ＣＣＣＴＣ結合因子（ジンクフィンガータンパク質）様、Ｔ細胞によって認識される扁平上皮癌抗原３（ＳＡＲＴ３）；ペアードボックスタンパク質Ｐａｘ−５（ＰＡＸ５）；プロアクロシン結合タンパク質ｓｐ３２（ＯＹ−ＴＥＳ１）；リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）；Ａキナーゼアンカータンパク質４（ＡＫＡＰ−４）；滑膜肉腫、Ｘブレークポイント２（ＳＳＸ２）；終末糖化産物のための受容体（ＲＡＧＥ−１）；腎臓遍在性１（ＲＵ１）；腎臓遍在性２（ＲＵ２）；レグマイン；ヒトパピローマウイルスＥ６（ＨＰＶ  Ｅ６）；ヒトパピローマウイルスＥ７（ＨＰＶ  Ｅ７）；腸管カルボキシルエステラーゼ；変異熱ショックタンパク質７０−２（ｍｕｔ  ｈｓｐ７０−２）；ＣＤ７９ａ；ＣＤ７９ｂ；ＣＤ７２；白血球関連免疫グロブリン様受容体１（ＬＡＩＲ１）；ＩｇＡ受容体のＦｃ断片（ＦＣＡＲ又はＣＤ８９）；白血病免疫グロブリン様受容体サブファミリーＡメンバー２（ＬＩＬＲＡ２）；ＣＤ３００分子様ファミリーメンバーｆ（ＣＤ３００ＬＦ）；Ｃ型レクチンドメインファミリー１２メンバーＡ（ＣＬＥＣ１２Ａ）；骨髄間質細胞抗原２（ＢＳＴ２）；ＥＧＦ様モジュール含有ムチン様ホルモン受容体様２（ＥＭＲ２）；リンパ球抗原７５（ＬＹ７５）；グリピカン−３（ＧＰＣ３）；Ｆｃ受容体様５（ＦＣＲＬ５）；及び免疫グロブリンラムダ様ポリペプチド１（ＩＧＬＬ１）からなる群から選択される抗原に結合する。いくつかの実施形態では、抗原は、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＢＣＭＡ、ＣＤ２０、ＣＤ１２３、ＥＧＦＲｖＩＩＩ又はメソセリンから選択される。いくつかの実施形態では、抗原は、ＣＤ１９である。いくつかの実施形態では、抗原は、ＣＤ２２である。いくつかの実施形態では、抗原は、ＢＣＭＡである。いくつかの実施形���では、抗原は、ＣＤ２０である。いくつかの実施形態では、抗原は、ＣＤ１２３である。いくつかの実施形態では、抗原は、ＥＧＦＲｖＩＩＩである。
【０１５５】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される融合ポリペプチドをコードする核酸分子が提供される。別の態様において、本明細書では、その核酸分子を含むベクターが提供される。いくつかの実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、レンチウイルスベクターである。別の態様において、本明細書では、ベクターを含むウイルス粒子が提供される。
【０１５６】
別の態様において、本明細書では、細胞、例えば本明細書で開示される融合ポリペプチド、本明細書で開示される核酸分子又は本明細書で開示されるベクターを含む宿主細胞が提供される。いくつかの実施形態では、細胞、例えば宿主細胞は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞、例えばヒトエフェクター細胞、例えばヒトＴ細胞又はヒトＮＫ細胞である。
【０１５７】
いくつかの実施形態では、細胞、例えば宿主細胞は、ＣＡＲ発現細胞、例えばＣＡＲ−Ｔ細胞である。いくつかの実施形態では、細胞、例えば宿主細胞は、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓシステムの構成要素を含む。いくつかの実施形態では、細胞、例えば宿主細胞は、ヒト癌細胞、例えばヒト腫瘍細胞である。
【０１５８】
いくつかの実施形態では、細胞、例えば宿主細胞は、ユビキチンリガーゼ複合体、例えばＥ３ユビキチンリガーゼ複合体を含み、ユビキチンリガーゼ複合体は、ＣＲＢＮを含む。
【０１５９】
いくつかの実施形態では、細胞は、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチド）を含み、細胞がＣＯＦ１、例えば過剰量のＣＯＦ１と接触するとき、
ｉ）ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合のＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉ）融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉｉ）異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の異種ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｉｖ）融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の融合ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｖ）融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の融合ポリペプチドの分解と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；又は
ｖｉ）融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ１と接触されていない場合の融合ポリペプチドの発現レベルと比較して例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。
【０１６０】
いくつかの実施形態では、細胞は、ＣＯＦ１、例えばレナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩をさらに含む。
【０１６１】
いくつかの実施形態では、細胞は、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチド）を含み、細胞がＣＯＦ３、例えば、過剰量のＣＯＦ３と接触するとき、
ｉ）ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ３と接触していない場合のＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉ）融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ３と接触していない場合の融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉｉ）異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ３と接触していない場合の異種ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｉｖ）融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ３と接触していない場合の融合ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｖ）融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ３と接触していない場合の融合ポリペプチドの分解と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；又は
ｖｉ）融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞がＣＯＦ３と接触していない場合の融合ポリペプチドの発現レベルと比較して例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。
【０１６２】
いくつかの実施形態では、細胞は、ＣＯＦ３、例えば表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容されるさらに塩を含む。
【０１６３】
いくつかの実施形態では、細胞は、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド及び分解ドメインを含む融合ポリペプチド）を含み、安定化化合物の非存在下において、融合ポリペプチドは、細胞の分解経路によって分解され、例えば本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、例えば、融合ポリペプチドの少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上は、分解される。
【０１６４】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、異種プロテアーゼ切断部位をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞は、異種プロテアーゼ切断部位を切断できるプロテアーゼをさらに含む。
【０１６５】
いくつかの実施形態では、細胞は、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド及び分解ドメインを含む融合ポリペプチド）を含み、細胞が安定化化合物、例えば過剰量の安定化化合物と接触するとき、
ｉ）分解ドメインは、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｉｉ）融合ポリペプチドの立体構造は、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｉｉｉ）融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞が安定化化合物と接触されていない場合の融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される。
【０１６６】
いくつかの実施形態では、細胞は、安定化化合物をさらに含む。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。
【０１６７】
いくつかの実施形態では、細胞は、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド及び分解ドメインを含む融合ポリペプチド）を含み、細胞が安定化化合物、例えば過剰量の安定化化合物及びＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３、例えば、過剰量のＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の両方と接触するとき、
ｉ）ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、細胞が安定化化合物のみと接触し、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３と接触しない場合のＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉ）融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えば免疫沈降によって測定されるとおり、細胞が安定化化合物のみと接触し、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３と接触しない場合の融合ポリペプチドとＣＲＢＮとの会合と比較して少なくとも例えば１０、５０、１００、１０００又は１００００倍増大されるか；
ｉｉｉ）異種ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、細胞が安定化化合物のみと接触し、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３と接触しない場合の異種ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｉｖ）融合ポリペプチドのユビキチン化は、例えば、本明細書に記載されるアッセイによって測定されるとおり、細胞が安定化化合物のみと接触し、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３と接触しない場合の融合ポリペプチドのユビキチン化と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；
ｖ）融合ポリペプチドの分解は、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞が安定化化合物のみと接触し、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３と接触しない場合の融合ポリペプチドの分解と比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大されるか；又は
ｖｉ）融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、細胞が安定化化合物のみと接触し、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３と接触しない場合の融合ポリペプチドの発現レベルと比較して例えば０．０１％、０．１％、１％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％又は７０％以下である。
【０１６８】
いくつかの実施形態では、細胞は、ＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）、ＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩）をさらに含む。
【０１６９】
いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であり、任意選択により、ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
【０１７０】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される融合ポリペプチド又は本明細書で開示される細胞及び薬学的に許容される担体、賦形剤又は安定剤を含む医薬組成物が開示される。
【０１７１】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される細胞を作製する方法が開示される。
【０１７２】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチド）を分解する方法であって、融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触させることを含む方法が開示される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、エクスビボでＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、インビボでＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触される。
【０１７３】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）及び分解ドメインを含む融合ポリペプチド）の発現を制御する方法であって、
ｉ）融合ポリペプチド又は融合ポリペプチドを含む細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により安定化化合物の存在下において、
ａ）分解ドメインは、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｂ）融合ポリペプチドの立体構造は、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｃ）融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、安定化化合物の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される、工程
を含む方法が開示される。
【０１７４】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）融合ポリペプチド又は融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ１（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）又はＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
をさらに含む。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。
【０１７６】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、エクスビボでＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及び／又は安定化化合物と接触される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、インビボでＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（例えば、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩）及び／又は安定化合物と接触される。
【０１７７】
いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
【０１７８】
一態様において、本明細書では、細胞を作製する方法であって、
ｉ）式１の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及びキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含む融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含む細胞をもたらす工程であって、任意選択により、ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、工程；及び
ｉｉ）細胞をエクスビボでＣＯＦ１と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ１の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
を含み、式（Ｉ）の化合物は、
【化１６】
2021501570.tif 000018
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体である、方法が開示される。
【０１７９】
いくつかの実施形態では、細胞をエクスビボでＣＯＦ１と接触させた後、細胞の増殖は、ＣＯＦ１と接触される前の細胞の増殖に対して少なくとも例えば１．２、１．５、２、５又は１０倍増大される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）。
【０１８０】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチドを含む細胞）をエクスビボでＣＯＦ１と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触される前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少される、工程、及び
ｉｉ）有効量の細胞を対象に投与する工程
を含み、任意選択により、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前に、
細胞に例えば細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ１の量を減少させ、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む方法が提供される。
【０１８１】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）有効量のＣＯＦ１を対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）ＣＯＦ１の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉｉｉ）後及び工程ｉｖ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の発現レベルに融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与の中断は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０１８３】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｖ）後、
ｖ）工程ｉｉｉ）及び／又はｉｖ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０１８４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩は、例えば、１日当たり２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ又は２５ｍｇで投与される。
【０１８５】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量の本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチドを含む細胞）を対象に投与する工程であって、任意選択により、細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ１と接触され、任意選択により、ＣＯＦ１の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触される前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少され、任意選択により、細胞がエクスビボでＣＯＦ１と接触された後及び細胞が対象に投与される前に、細胞に例えば細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ１の量は、減少され、それによって疾患を治療する、工程
を含む方法が提供される。
【０１８６】
いくつかの実施形態では、細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ１と接触されない。
【０１８７】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）有効量のＣＯＦ１を対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。
【０１８８】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）ＣＯＦ１の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の発現レベルに融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与の中断は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０１８９】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）工程ｉｉ）及び／又はｉｉｉ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０１９０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩は、例えば、１日当たり２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ又は２５ｍｇで投与される。
【０１９１】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量のＣＯＦ１を対象に投与する工程であって、対象は、本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチドを含む細胞）を含み、任意選択により、ＣＯＦ１の投与は、ＣＯＦ１の投与前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
を含む方法が提供される。
【０１９２】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）ＣＯＦ１の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ１の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ１の投与の中断は、ＣＯＦ１の投与前の発現レベルに融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ１の投与の中断は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ１の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０１９３】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）工程ｉ）及び／又はｉｉ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０１９４】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩は、例えば、１日当たり２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ又は２５ｍｇで投与される。
【０１９５】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）対象に、
（１）安定化化合物、及び
（２）有効量の本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）及び分解ドメインを含む融合ポリペプチドを含む細胞）
を投与する工程であって、任意選択により、安定化化合物の存在下での融合ポリペプチドの発現レベルは、安定化化合物の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高く、それによって疾患を治療する、工程
を含む方法が提供される。
【０１９６】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現に対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、工程ｉ）の治療に応答し（例えば、対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、対象において有効である）、且つ／又は
ｂ）安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）の治療に対する対象の応答に対して応答する（例えば、対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、対象において有効である）、工程
をさらに含む。
【０１９７】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉｉ）安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現に対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）安定化化合物の投与の中断は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）安定化化合物の投与の中断は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。
【０１９８】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｖ）安定化化合物の投与を中断し、且つ有効量のＣＯＦ１又はＣＯＦ２を対象に投与する工程であって、任意選択により、工程ｉｖ）は、工程ｉ）後及び工程ｉｖ）前の融合ポリペプチドの発現に対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）工程ｉｖ）は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）工程ｉｖ）は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。いくつかの実施形態では、有害作用は、急性毒性である。
【０１９９】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｖ）後、
ｖ）例えば、表面に融合ポリペプチドを発現する細胞の量が既定値より小さくなった後、例えば１日、５日、１０日又は１５日間にわたり、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２の投与を中断する工程
をさらに含む。
【０２００】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後、
ｖｉ）有効量の安定化化合物を投与する工程であって、任意選択により、安定化化合物の投与は、工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後及び工程ｖｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）安定化化合物の投与は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）安定化化合物の投与は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２０１】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｖｉ）後、
ｖｉｉ）工程ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）又はｖｉ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０２０２】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）前に、
ｖｉｉｉ）エクスビボで細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により、安定化化合物の存在下での融合ポリペプチドの発現レベルは、安定化化合物の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高い、工程
をさらに含む。
【０２０３】
いくつかの実施形態では、細胞は、投与前にエクスビボで安定化化合物と接触されない。いくつかの実施形態では、細胞は、投与前にエクスビボで安定化化合物、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２のいずれとも接触されない。
【０２０４】
いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。
【０２０５】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）。
【０２０６】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２は、レナリドミド若しくはポマリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれからなる（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号３のアミノ酸配列を含むか又はそれからなる）。
【０２０７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２は、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、レナリドミド又はその薬学的に許容される塩は、例えば、１日当たり２．５ｍｇ、５ｍｇ、１０ｍｇ、１５ｍｇ又は２５ｍｇで投与される。
【０２０８】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチド）を分解する方法であって、融合ポリペプチド又は前記融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩）と接触させることを含む方法が開示される。一実施形態では、ＣＯＦ３の存在下において、前記融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ３の非存在下での前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される。一実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、エクスビボでＣＯＦ３と接触される。一実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、インビボでＣＯＦ３と接触される。
【０２０９】
一態様において、本明細書では、本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）及び分解ドメインを含む融合ポリペプチド）の発現を制御する方法であって、
ｉ）融合ポリペプチド又は融合ポリペプチドを含む細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により安定化化合物の存在下において、
ａ）分解ドメインは、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、細胞性分解に対してより耐性のある立体構造をとるか；
ｂ）融合ポリペプチドの立体構造は、安定化化合物が存在しない場合の立体構造に対して、異種プロテアーゼ切断部位での切断により許容的であるか；又は
ｃ）融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、安定化化合物の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルと比較して少なくとも例えば１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大される、工程
を含む方法が開示される。
【０２１０】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）融合ポリペプチド又は融合ポリペプチドを含む細胞をＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩）と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
をさらに含む。
【０２１１】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、エクスビボでＣＯＦ３と接触される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド又は細胞は、インビボでＣＯＦ３と接触される。いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。
【０２１２】
一態様において、本明細書では、細胞を作製する方法であって、
ｉ）ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及びキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含む融合ポリペプチドをコードする核酸分子を含む細胞をもたらす工程であって、任意選択により、ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む、工程；及び
ｉｉ）細胞をエクスビボでＣＯＦ３と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、例えば、本明細書に記載されるアッセイ、例えばウエスタンブロット分析又はフローサイトメトリー分析によって測定されるとおり、ＣＯＦ３の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント実質的に減少される、工程
を含む方法が開示される。
【０２１３】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチドを含む細胞）をエクスビボでＣＯＦ３と接触させる工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、細胞がエクスビボでＣＯＦ３と接触される前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少される、工程、及び
ｉｉ）有効量の細胞を対象に投与する工程
を含み、任意選択により、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前に、
細胞に例えば細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ３の量を減少させ、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む方法が提供される。
【０２１４】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）有効量のＣＯＦ３を対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２１５】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）ＣＯＦ３の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉｉｉ）後及び工程ｉｖ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の発現レベルに融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与の中断は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２１６】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｖ）後、
ｖ）工程ｉｉｉ）及び／又はｉｖ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０２１７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３は、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９のアミノ酸配列又はそれと少なくとも８０、８５、９０又は９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか又はそれからなる。
【０２１８】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量の本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチドを含む細胞）を対象に投与する工程であって、任意選択により、細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ３と接触され、任意選択により、ＣＯＦ３の存在下において、融合ポリペプチドの発現レベルは、細胞がエクスビボでＣＯＦ３と接触される前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少され、任意選択により、細胞がエクスビボでＣＯＦ３と接触された後及び細胞が対象に投与される前に、細胞に例えば細胞の内部及び／又は周囲で接触するＣＯＦ３の量は、減少され、それによって疾患を治療する、工程
を含む方法が提供される。
【０２１９】
いくつかの実施形態では、細胞は、投与前にエクスビボでＣＯＦ３と接触されない。
【０２２０】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）有効量のＣＯＦ３を対象に投与する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２２１】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）ＣＯＦ３の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉｉ）後及び工程ｉｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の発現レベルに融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与の中断は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２２２】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉｉ）後、
ｉｖ）工程ｉｉ）及び／又はｉｉｉ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０２２３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３は、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９のアミノ酸配列又はそれと少なくとも８０、８５、９０又は９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか又はそれからなる。
【０２２４】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）有効量のＣＯＦ３を対象に投与する工程であって、対象は、本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）を含む融合ポリペプチドを含む細胞）を含み、任意選択により、ＣＯＦ３の投与は、ＣＯＦ３の投与前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与は、有害作用を低減又は予防する、工程
を含む方法が提供される。
【０２２５】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）ＣＯＦ３の投与を中断する工程であって、任意選択により、ＣＯＦ３の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ（例えば、ＣＯＦ３の投与の中断は、ＣＯＦ３の投与前の発現レベルに融合ポリペプチドの発現レベルを回復させる）、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）ＣＯＦ３の投与の中断は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）ＣＯＦ３の投与の中断は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２２６】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）後、
ｉｉｉ）工程ｉ）及び／又はｉｉ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０２２７】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３は、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９のアミノ酸配列又はそれと少なくとも８０、８５、９０又は９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか又はそれからなる。
【０２２８】
一態様において、本明細書では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象を治療する方法であって、
ｉ）対象に、
（１）安定化化合物、及び
（２）有効量の本明細書で開示される細胞（例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド（例えば、ＣＡＲポリペプチド）及び分解ドメインを含む融合ポリペプチドを含む細胞）
を投与する工程であって、任意選択により、安定化化合物の存在下での融合ポリペプチドの発現レベルは、安定化化合物の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高く、それによって疾患を治療する、工程
を含む方法が提供される。
【０２２９】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉ）安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現に対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、工程ｉ）の治療に応答し（例えば、対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、対象において有効である）、且つ／又は
ｂ）安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）の治療に対する対象の応答に対して応答する（例えば、対象は、工程ｉ）の治療に対して完全奏功を有するか、対象は、腫瘍塊における縮小を示すか、対象は、腫瘍細胞の減少を示すか、又は工程ｉ）の治療は、対象において有効である）、工程
をさらに含む。
【０２３０】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｉｉ）安定化化合物の投与を中断する工程であって、任意選択により、安定化化合物の投与の中断は、工程ｉ）後及び工程ｉｉ）前の融合ポリペプチドの発現に対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）安定化化合物の投与の中断は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）安定化化合物の投与の中断は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２３１】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）後、
ｉｖ）安定化化合物の投与を中断し、且つ有効量のＣＯＦ３を対象に投与する工程であって、任意選択により、工程ｉｖ）は、工程ｉ）後及び工程ｉｖ）前の融合ポリペプチドの発現に対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍減少させ、任意選択により、
ａ）対象は、有害反応を発症したか、発症しているか又は発症することが予測され、
ｂ）工程ｉｖ）は、対象における有害反応の発生に応答するか、又は対象における有害反応の発生の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）工程ｉｖ）は、有害作用を低減又は予防する、工程
をさらに含む。いくつかの実施形態では、有害作用は、急性毒性である。
【０２３２】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｖ）後、
ｖ）例えば、表面に融合ポリペプチドを発現する細胞の量が既定値より小さくなった後、例えば１日、５日、１０日又は１５日間にわたり、ＣＯＦ３の投与を中断する工程
をさらに含む。
【０２３３】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後、
ｖｉ）有効量の安定化化合物を投与する工程であって、任意選択により、安定化化合物の投与は、工程ｉｉ）、ｉｉｉ）、ｉｖ）又はｖ）後及び工程ｖｉ）前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ、任意選択により、
ａ）対象は、再発したか、再発しているか又は再発することが予測され、
ｂ）安定化化合物の投与は、対象における腫瘍再発に応答するか、又は対象における再発の予測に応答し、且つ／又は
ｃ）安定化化合物の投与は、腫瘍再発を治療又は予防する、工程
をさらに含む。
【０２３４】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｖｉ）後、
ｖｉｉ）工程ｉｉｉ）、ｉｖ）、ｖ）又はｖｉ）を繰り返し、それによって疾患を治療する工程
をさらに含む。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、方法は、工程ｉ）前に、
ｖｉｉｉ）エクスビボで細胞を安定化化合物と接触させる工程であって、任意選択により、安定化化合物の存在下での融合ポリペプチドの発現レベルは、安定化化合物の非存在下での融合ポリペプチドの発現レベルより例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍高い、工程
をさらに含む。
【０２３６】
いくつかの実施形態では、細胞は、投与前にエクスビボで安定化化合物と接触されない。
【０２３７】
いくつかの実施形態では、安定化化合物は、バゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩であり、任意選択により、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。
【０２３８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３は、表２９において開示される化合物又はその薬学的に許容される塩である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９のアミノ酸配列又はそれと少なくとも８０、８５、９０又は９５％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか又はそれからなる。
【０２３９】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であり、任意選択により、ＣＡＲは、Ｎ末端からＣ末端方向において、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
【０２４０】
一態様では、本発明は、医薬としての使用のための本明細書で開示される融合ポリペプチド、核酸分子、ベクター、ウイルス粒子、細胞又は医薬組成物も提供する。一態様では、本発明は、腫瘍抗原の発現を伴う疾患を有する対象の治療における使用のための、本明細書で開示される融合ポリペプチド、核酸分子、ベクター、ウイルス粒子、細胞又は医薬組成物も提供する。
【０２４１】
前述の方法の特定の実施形態では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患は、癌である。
【０２４２】
いくつかの実施形態では、癌は、例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療に対して進行してきた対象における中皮腫（例えば、悪性胸膜中皮腫）；肺癌（例えば、非小細胞肺癌、小細胞肺癌、扁平細胞肺癌又は肺大細胞癌）；膵臓癌（例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療に対して進行してきた対象における例えば膵管腺癌又は転移性膵管腺癌（ＰＤＡ））；食道腺癌、卵巣癌（例えば、少なくとも１つの事前の標準的治療のレジメン後に進行してきた対象における例えば漿液性卵巣上皮癌）、乳癌、結腸直腸癌、膀胱癌又はその任意の組合せである。
【０２４３】
いくつかの実施形態では、腫瘍抗原の発現を伴う疾患は、血液癌、例えば白血病又はリンパ腫から選択される血液癌である。いくつかの実施形態において、癌は、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、マントル細胞リンパ腫（ＭＣＬ）、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）、ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞急性リンパ性白血病（ＢＡＬＬ）、Ｔ細胞急性リンパ性白血病（ＴＡＬＬ）、小リンパ球性白血病（ＳＬＬ）、Ｂ細胞前リンパ性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞性リンパ腫（ＤＬＢＣＬ）、慢性炎症に関連するＤＬＢＣＬ、慢性骨髄性白血病、骨髄増殖性腫瘍、濾胞性リンパ腫、小児濾胞性リンパ腫、ヘアリーセル白血病、小細胞型若しくは大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性状態、ＭＡＬＴリンパ腫（粘膜関連リンパ組織型節外性辺縁帯リンパ腫）、辺縁帯リンパ腫、脊髄形成異常、骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンストレーム型マクログロブリン血症、脾辺縁帯リンパ腫、脾リンパ腫／脾性白血病、びまん性赤脾髄小細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ヘアリーセル白血病−バリアント、リンパ形質細胞性リンパ腫、重鎖病、形質細胞性骨髄腫、骨の孤立性形質細胞腫、骨外形質細胞腫、節性辺縁帯リンパ腫、小児節性辺縁帯リンパ腫、原発性皮膚濾胞中心リンパ腫、リンパ腫様肉芽腫症、原発性縦隔（胸腺）大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、血管内大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ＡＬＫ＋大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、ＨＨＶ８関連多中心性キャッスルマン病の際に生じる大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）又は分類不能リンパ腫から選択される。
【０２４４】
いくつかの実施形態では、癌は、ＭＣＬ、ＣＬＬ、ＡＬＬ、ホジキンリンパ腫、ＡＭＬ又は多発性骨髄腫から選択される
【０２４５】
前述の方法の特定の実施形態では、細胞は、前記対象に対して自己由来である。前述の方法の特定の実施形態では、細胞は、前記対象に対して同種異系である。いくつかの実施形態では、細胞は、ＣＡＲ発現細胞、例えばＣＡＲＴ細胞である。
【０２４６】
いくつかの実施形態では、対象は、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の投与前に、本明細書で開示される少なくとも１つの融合ポリペプチドを発現する細胞を投与される。
【０２４７】
一態様において、本明細書では、特定の生物学的表現型と関連する遺伝因子、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する遺伝因子を同定する方法であって、
ｉ）細胞における本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチド）の発現を、前記細胞をＣＯＦ１又はＣＯＦ３、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に暴露することによって調節する工程、
（ｉｉ）目的の表現型、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する表現型を有する細胞を選択する工程、及び
（ｉｉｉ）目的の前記表現型を誘導する前記融合ポリペプチドを同定する工程
を含み、
ＣＯＦ１又はＣＯＦ３、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する前記細胞の暴露は、ＣＯＦ１又はＣＯＦ３、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する暴露前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させる、方法が開示される。
【０２４８】
一態様において、本明細書では、特定の生物学的表現型と関連する遺伝因子、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する遺伝因子を同定する方法であって、
ｉ）細胞における本明細書で開示される融合ポリペプチド（例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、異種ポリペプチド及び分解ドメインを含む融合ポリペプチド）の発現を、前記細胞を安定化化合物、例えばバゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩及び続いてＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に暴露することによって調節する工程、
（ｉｉ）目的の表現型、例えば癌の発症及び／又は進行と関連する表現型を有する細胞を選択する工程、及び
（ｉｉｉ）目的の前記表現型を誘導する前記融合ポリペプチドを同定する工程
を含み、
安定化化合物、例えばバゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩に対する前記細胞の暴露は、安定化化合物、例えばバゼドキシフェン又はその薬学的に許容される塩に対する暴露前の融合ポリペプチドの発現レベルに対して融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１．５、２、３、４、５、１０、２０、３０、４０又は５０倍増大させ、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３、例えばレナリドミド又はその薬学的に許容される塩に対する前記細胞の暴露は、安定化化合物に対する暴露後及びＣＯＦ１又はＣＯＦ２（サリドマイド及びその誘導体など（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド））又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）に対する暴露前の前記融合ポリペプチドの発現レベルに対して前記融合ポリペプチドの発現レベルを例えば少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００パーセント減少させる、方法が開示される。
【０２４９】
前述の態様の特定の実施形態では、異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表３において開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗ＣＤ１９  ＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表５、表６、表７及び表３０のいずれかにおいて開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗ＣＤ１２３  ＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表８、表９、表１０、表１１、表１２、表１３及び表１４のいずれかにおいて開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗ＢＣＭＡ  ＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表１５、表１６、表１７、表１８及び表３１のいずれかにおいて開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗ＣＤ２２  ＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表１９及び表２０のいずれかにおいて開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗ＣＤ２０  ＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表３２において開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗ＥＧＦＲｖＩＩＩ  ＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表３３において開示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲポリペプチドは、抗メソセリンＣＡＲポリペプチドであり、且つ本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表３４において開示されるアミノ酸配列を含む。
【０２５０】
前述の態様の特定の実施形態では、融合ポリペプチドは、本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表４又は表２８において開示されるアミノ酸配列を含む。
【０２５１】
前述の態様の特定の実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表１において開示されるアミノ酸配列を含む。
【０２５２】
前述の態様の特定の実施形態では、分解ドメインは、本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表２２において開示されるアミノ酸配列を含む。
【０２５３】
前述の態様の特定の実施形態では、異種プロテアーゼ切断部位は、本明細書で開示されるアミノ酸配列、例えば表２３において開示されるアミノ酸配列を含む。
【図面の簡単な説明】
【０２５４】
【図１Ａ】１６個のグリシン−セリンリンカーを介してナノルシフェラーゼに融合されたＨｉｌＤ−タグ１３６〜１８０及び２３６〜２４９デグロンの概略図である。
【図１Ｂ】ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９に連結されたナノルシフェラーゼをコードする５０ｎｇのｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラトでリバーストランスフェクトされたＨＥＫ２９３Ｔ細胞から測定された発光のレベルを示すグラフである。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９は、ＤＭＳＯのみで処理された細胞と比較して、１μＭ、１０μＭ又は１００μＭのレナリドミドで６時間処理された細胞において発光の低減を促進した。ＭＧ１３２処理は、ナノルシフェラーゼのレナリドミド依存的分解を遮断した。
【図２】ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９が、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きナノルシフェラーゼをコードするｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラトでトランスフェクトされたＨＥＫ２９３ＧＴ細胞におけるナノルシフェラーゼのレナリドミド依存的分解を促進した（ＩＣ５０＝１０ｎＭ）ことを示すウエスタンブロットである。レナリドミド依存的分解は、同様にトランスフェクトされたＨＥＫ２９３ＧＴセレブロン（ＣＲＢＮ）ＫＯ細胞において観察されなかった。プロテアソーム阻害剤ＭＧ１３２による処理は、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９のレナリドミド依存的分解を促進する能力を遮断した。
【図３Ａ】ヘアピン及びα−ヘリックスに隣接する２つのβ−シート並びに追加のα−ヘリックスとして予測されるＩＫＺＦ３の２３６〜２４９を含有するＩＫＺＦ３の１３６〜１８０を示す概略図である。下の概略図は、Ｎ及びＣ末端のアミノ酸を除去しているＩＫＺＦ３の１３６〜１８０デグロンの短縮バージョンの図である（それぞれ掲載順に配列番号３、５及び７〜１０）。
【図３Ｂ】種々のＩＫＺＦ３に基づく分解タグに融合されたナノルシフェラーゼのレナリドミド依存的分解を試験する試験からの結果を示すウエスタンブロットである。ＩＫＺＦ３に基づく分解タグは、ナノルシフェラーゼのＮ末端に融合され、ｐＮＬ１．１ＣＭＶベクターにクローン化され、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞にトランスフェクトされた。トランスフェクト細胞をＤＭＳＯ又は１０μＭのレナリドミドのいずれかで４時間処理した後、ウエスタンブロットにより分析した。２種類の暴露（長時間及び短時間の暴露）は、ナノルシフェラーゼ（「Ｎａｎｏｌｕｃ」）に関して示された。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９  Ｋ２４５Ｒ、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９  Ｋ２４５Ｓ、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０  ＭＡＬＥＫ並びにＩＫＺＦ３の１３６〜１７０  ＭＡＬＥＫは全て、レナリドミド依存的分解を促進したが、ＩＫＺＦ３の１４０〜１７０  ＭＡＬＥＫ、ＩＫＺＦ３の１４１〜１６３  ＭＡＬＥＫ及びＩＫＺＦ３の１４５〜１５５のＭＡＬＥＫは、レナリドミド誘導性分解を媒介しなかった。
【図４Ａ−４Ｂ】ＨＥＫ２９３Ｔ細胞におけるＩＫＺＦ３の１３６〜１８０タグ付きナノルシフェラーゼ（図４Ａ）又はＩＫＺＦ３の１３６〜１７０ＭＡＬＥＫタグ付きナノルシフェラーゼ（図４Ｂ）の、両方の場合において２時間のレナリドミド処理によりおよそ１００ｎＭのＩＣ５０を伴うレナリミド依存的分解を示すウエスタンブロットのグラフである。タグ付きナノルシフェラーゼ融合物は、ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを用いて発現された。
【図４Ｃ】ＨＥＫ２９３Ｔ細胞におけるＩＫＺＦ３の１３６〜１８０タグ付きナノルシフェラーゼのレナリドミド依存的分解の時間経過を示すウエスタンブロットであり、１時間で直ちに分解し、４時間でほぼ完全に分解することを示す。タグ付きナノルシフェラーゼ融合物は、ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを用いて発現された。
【図５Ａ】ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きメラニン形成関連転写因子（ＭＩＴＦ）（左パネル）並びにＩＫＺＦ３の１３６〜１８０タグ付きＭＩＴＦ（右パネル）のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットである。タグ付きＭＩＴＦ融合物は、ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを用いてＨＥＫ２９３Ｔにトランスフェクトされた。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦの分解は、約１００ｎＭのＩＣ５０を示す。この分解は、分解がＭＧ１３２処理によって遮断されたため、プロテアソームの活性に依存した。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０は、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９より少ない程度であるが、レナリドミド依存的分解も媒介した。
【図５Ｂ】これらの融合タンパク質を発現する細胞を種々の時間の間１０μＭのレナリドミドで処理した後の、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦ（左パネル）並びにＩＫＺＦ３の１３６〜１８０タグ付きＭＩＴＦ（右パネル）のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットである。試験された時点の中では、４時間の処理が最大量の分解を示す。
【図６Ａ−６Ｂ】ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９（図６Ａ）又はタグ中の全てのリジン残基がアルギニンに変異されたＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９（「リジンを含まないＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９」）（図６Ｂ）でタグ付けされたＭＩＴＦのレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットのグラフである。ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを使用してタグ付きＭＩＴＦ融合物を発現するＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、種々の濃度のレナリドミドで２４時間処理した。ＩＣ５０は、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦ（図６Ａ）に関してはおよそ１０ｎＭであり、リジンを含まないＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦ（図６Ｂ）に関しては１００ｎＭ未満である。両方の場合において、分解がプロテアソーム阻害剤ＭＧ１３２によって遮断され得たため、レナリドミド依存的分解はプロテアソームに依存した。このデータは、ＩＫＺＦ３デグロンタグではなくＭＩＴＦがユビキチン化されていたことを示唆する。
【図６Ｃ】リジンを含まないＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦのレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットである。ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを使用してタグ付きＭＩＴＦ融合物を発現するＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、２時間、４時間、８時間又は２４時間１０μＭレナリドミドで処理した。
【図６Ｄ】ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦ（左パネル）並びにリジンを含まないＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＭＩＴＦ（右パネル）のウエスタンブロットである。ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを使用してタグ付きＭＩＴＦ融合物を発現するＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、細胞をウエスタンブロット分析にかける前に２４時間１０μＭのレナリドミド、ポマリドミド、サリドマイド、ＣＲＢＮに結合できるが、ＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３に結合できない陰性対照ＩＭｉＤ又はＤＭＳＯで処理した。ポマリドミドは、タグ付きＭＩＴＦの分解をレナリドミドより若干高い程度まで媒介したが、サリドマイドは、そのような分解を媒介するのに非常に低い効果のみがあった。
【図７】ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０  Ｑ１４７Ｈタグ付きＭＩＴＦのレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットである。タグ付きＭＩＴＦ融合物をコードするｐＮＬ１．１ＣＭＶでトランスフェクトされたＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、種々のレナリドミド用量で２４時間処理した。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０  Ｑ１４７Ｈタグ付きＭＩＴＦは、レナリドミドの存在下で分解を示さなかった。
【図８】およそ１０ｎＭのＩＣ５０を有するＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きトリ骨髄細胞腫症ウイルス癌遺伝子（ＭＹＣ）ホモログのレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットである。ｐＮＬ１．１ＣＭＶコンストラクトを使用してタグ付きＭＩＴＦ融合物を発現するＨＥＫ２９３Ｔ細胞を、種々の濃度のレナリドミドで４時間処理した。
【図９Ａ】Ｃ末端のデグロンタグ付き一回膜貫通型タンパク質、ＣＤ３ゼータ、ＣＤ８／ＣＤ３ゼータキメラ、ＣＤ８、ＣＤ１９及びＣＤ２２の４時間のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットである。ジャーカット細胞を、ｐＮＧＸ＿ＬＶ＿Ｖ００２−ＣＤｘ−ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９コンストラクトウイルスで感染させ、Ｇ４１８で選択し、１０μＭのレナリドミド又はＤＭＳＯで処理した。図９Ａでは、抗Ｖ５抗体（長い１分の暴露及び短い１秒の暴露の両方が示される）及び抗ベータ−アクチン抗体を使用する染色が示される。全てのコンストラクトが発現され、１０μＭのレナリノミド処理で分解された。図９Ａにおける表は、各タンパク質に関するタンパク質分子量（ＭＷ）、細胞質ゾルのアミノ酸残基（「細胞質ゾルＡＡ」）の数及び細胞質ゾルのリジンの数を示す。興味深いことに、分解は、細胞質ゾルのリジン残基の数よりも細胞質内のアミノ酸（「ＡＡ」）の総数とより相関する。
【図９Ｂ−９Ｄ】Ｃ末端タグ付きＣＤ１９（図９Ｂ）、Ｃ末端タグ付きＣＤ３ゼータ（図９Ｃ）及びＣ末端タグ付きＣＤ８／ＣＤ３ゼータ（図９Ｄ）のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットのグラフである。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ１９、ＣＤ３ゼータ又はＣＤ８／ＣＤ３ゼータを発現する細胞を、１０μＭのレナリドミドで６時間又は種々のレナリドミド用量で２４時間処理した。図９Ｂにおいて、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ１９の分解は、およそ１００ｎＭのＩＣ５０を示し、強力な分解が６時間で検出された。図９Ｃにおいて示されるＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ３ゼータの分解は、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ１９のものより弱い。タグ付きＣＤ３ゼータの分解は、細胞を１０μＭのレナリドミドで２４時間処理した後に顕在化した。図９Ｄにおいて示されるＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ８／ＣＤ３ゼータの分解は、ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ３ゼータのものより強い。
【図１０Ａ−１０Ｄ】１μＭ又は１０μＭのレナリドミドで１時間（図１０Ａ）、６時間（図１０Ｂ）、１６時間（図１０Ｃ）又は２４時間（図１０Ｄ）処理したジャーカット細胞上のＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９タグ付きＣＤ１９の細胞表面発現を比較する一連のフローサイトメトリーのヒストグラムである。一部の細胞を、１０μＭのレナリドミドによる処理の前に１０μＭのＭＧ１３２で前処理した。ＤＭＳＯは、溶媒対照の役割を果たした。ＩＫＺＦ３の１３６〜１８０及び２３６〜２４９は、ＣＤ１９のＣ末端に融合された。
【図１０Ｅ−１０Ｆ】試験された全てのレナリドミド用量及び時点にわたる％ＣＤ１９陽性細胞（図１０Ｅ）又はＣＤ１９陽性細胞の平均蛍光強度（ＭＦＩ）（図１０Ｆ）を示す棒グラフである。１時間で最小限の分解及び６時間で微量の分解があった。分解は、１μＭ及び１０μＭの処理群の両方において１６時間及び２４時間でより一層顕在化し、この分解は、プロテアソーム阻害剤ＭＧ１３２によって部分的に遮断され得た。１μＭ及び１０μＭの処理群の両方において１６時間でＣＤ１９陽性細胞のおよそ５０％の減少があり（図１０Ｅ）、この減少はＭＦＩにおける減少と一致した（図１０Ｆ）。
【図１１】分解ドメイン（デグロン）、プロテアーゼ切断部位及び第２のタンパク質ドメイン（ＣＡＲ）を含む例示的な融合タンパク質並びに薬物、例えば安定化化合物の存在下での融合タンパク質の分解の変化を示す概略図である。
【図１２Ａ−１２Ｃ】ＦｕｒＯＮ（図１２Ａ）、ＨｉｌＤ（図１２Ｂ）又はＦｕｒＯＮ及びＨｉｌＤの両方（図１２Ｃ）に融合されたＣＡＲ分子の制御を示す概略図である。図１２Ａに示されるとおり、ＦｕｒＯＮに融合されたＣＡＲを、安定化化合物（例えば、分解ドメインに結合し、安定化する小分子リガンド、例えば、バゼドキシフェン（ＢＺＡ））を投与することによって活性化できるか、又は安定化化合物を中止することによって不活性化できる。図１２Ｂに示されるとおり、ＨｉｌＤタグに融合されたＣＡＲを、ＩＭｉＤ化合物（例えば、レナリドミド又はポマリドミド）を投与することによって不活性でき、且つＩＭｉＤ化合物の投与を停止することによって再び活性化できる。図１２Ｃに示されるとおり、ＦｕｒＯＮ及びＨｉｌＤタグの両方に融合されたＣＡＲを、安定化化合物を投与することによって活性化でき、安定化化合物を中断すること及びＩＭｉＤ化合物を投与することによって不活性化でき、ＩＭｉＤ化合物を中断すること及び安定化化合物を投与することによって再び活性化できる。ＦｕｒＯＮスイッチ及びＨｉｌＤスイッチを組み合わせることが、ＣＡＲ分子の発現及び活性に対してさらなるレイヤーの制御を加える。
【図１３Ａ−１３Ｃ】ＣＡＲ分子のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットのグラフである。コンストラクト７６５（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９）（図１３Ａ）、コンストラクト７６６（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１３Ｂ）又はコンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図１３Ｃ）を発現するＪＮＬ細胞を、１０μＭのレナリドミド（「＋」）又はＤＭＳＯ（「−」）の存在下でウエスタンブロット分析前の２４時間インキュベートした。全ての試料は、１μＭのバゼドキシフェンを受容した。「Ａ」は、２７５μＬのウイルス上清で形質導入された細胞を表す。「Ｂ」は、７００μＬのウイルス上清で形質導入された細胞を表す。
【図１４Ａ−１４Ｄ】ＣＡＲ分子のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットのグラフである。コンストラクト７７１（ＣＡＲ１９＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１４Ａ）、コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図１４Ｂ）、コンストラクト７６８（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１４Ｃ）又はコンストラクト７７０（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿ＮｏＫ）を発現するＪＮＬ細胞を、１０μＭのレナリドミド（「＋」）又はＤＭＳＯ（「−」）の存在下でウエスタンブロット分析前の２４時間インキュベートした。「Ａ」は、２７５μＬのウイルス上清で形質導入された細胞を表す。「Ｂ」は、７００μＬのウイルス上清で形質導入された細胞を表す。
【図１５Ａ−１５Ｂ】ＣＡＲ分子のレナリドミド依存的分解を示すウエスタンブロットのグラフである。ウエスタンブロット分析の前にコンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）を発現するＪＮＬ細胞を、１０μＭのレナリドミド又はＤＭＳＯで２、４、８、１６又は２４時間インキュベートしたか（図１５Ａ）又は種々の用量のレナリドミド又はＤＭＳＯで２４時間インキュベートした（図１５Ｂ）。図１５Ａは、１０μＭのレナリドミド処理の時間経過を示す。図１５Ｂは、２４時間でのレナリドミドの用量反応を示す。
【図１６Ａ−１６Ｇ】レナリドミドの存在下又は非存在下での表面ＣＡＲ発現を示すフローサイトメトリーヒストグラムのセットである。試験されたコンストラクトとしては、コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図１６Ａ）、コンストラクト７７１（ＣＡＲ１９＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１６Ｂ）、コンストラクト６７６１（ＣＡＲ１９＿１６ＫＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１６Ｃ）、コンストラクト７６８（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１６Ｄ）、コンストラクト７７０（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿ＮｏＫ）（図１６Ｅ）、コンストラクト７７３（ＨｉｌＤタグ＿ＣＡＲ１９＿ｍｏｄＳｉｇＰｅｐ）（図１６Ｆ）及びコンストラクト７７４（ＨｉｌＤタグ＿ＣＡＲ１９）（図１６Ｇ）が挙げられる。指定のコンストラクトを発現するＪＮＬ細胞を、１０μＭのレナリドミドとともに又は伴わずに２４時間インキュベートし、続いてフローサイトメトリー分析にかけた。
【図１７Ａ−１７Ｃ】レナリドミド及び／又はバゼドキシフェン（ＢＺＡ）によって制御される表面ＣＡＲ発現を示すフローサイトメトリーヒストグラムのセットである。試験されたコンストラクトとしては、コンストラクト７６５（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９）（図１７Ａ）、コンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図１７Ｂ）及びコンストラクト７６６（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿Ｖ５）（図１７Ｃ）が挙げられる。指定のコンストラクトを発現するＪＮＬ細胞を、レナリドミド及び／又はバゼドキシフェン（ＢＺＡ）の存在下又は非存在下でフローサイトメトリー分析の前に２４時間インキュベートした。
【図１８Ａ−１８Ｄ】種々の濃度のレナリドミドの存在下又は非存在下での表面ＣＡＲ発現を示すフローサイトメトリーヒストグラムのセットである。試験されたコンストラクトとしては、コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図１８Ａ及び１８Ｃ）及びコンストラクト７７０（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿ＮｏＫ）（図１８Ｂ及び１８Ｄ）が挙げられる。指定のコンストラクトを発現するＪＮＬ細胞を、レナリドミドの存在下又は非存在下でフローサイトメトリー分析の前に４時間（図１８Ａ及び１８Ｂ）又は２０時間（図１８Ｃ及び１８Ｄ）インキュベートした。    図
【０２５５】
試験された各細胞株及び各レナリドミド濃度に関する％ＣＡＲ発現（図１８Ｅ）又は平均蛍光強度（図１８Ｆ）を示す棒グラフである。
【図１９Ａ−１９Ｂ】ＪＮＬ標的細胞株処理条件、標的細胞株処理の時間の長さ、レナリドミド処理の時間及び細胞の数の間のレナリドミド反応の比較を示す一連の棒グラフである。図１９Ａは、試験からの発光シグナルを示すグラフのセットであり、コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）を発現するＪＮＬ細胞（９０００又は１２０００細胞／ウェル）を、１０μＭのレナリドミドで４時間又は２４時間処理し、続いてＮａｌｍ６細胞、ＣＤ１９発現Ｋ５６２細胞（「Ｋ５６２＋ＣＤ１９」）、Ｋ５６２細胞又は培地（細胞なし）とともに４時間、８時間又は２０時間インキュベートした。図１９Ｂは、図１９Ａにおいて記載された試験からのデータのサブセットを示すグラフのセットである：コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）を発現するＪＮＬ細胞（９０００細胞／ウェル）を、１０μＭのレナリドミドで４時間処理し、続いてＮａｌｍ６細胞、ＣＤ１９発現Ｋ５６２細胞（「Ｋ５６２＋ＣＤ１９」）、Ｋ５６２細胞又は培地（細胞なし）とともに２０時間インキュベートした。図１９Ｂにおけるｙ軸は、バックグラウンドシグナル（培地試料からのシグナル）を減じた後の発光シグナルを示す。図１９Ａ及び１９Ｂの両方において、各グラフにおける２つの棒は、それぞれＤＭＳＯで処理された試料（「ＤＭＳＯ」）及びレナリドミドで処理された試料（「レナリドミド（１０μＭ）」）を表す。
【図２０Ａ−２０Ｂ】ＪＮＬ標的細胞処理条件、標的細胞処理の時間の長さ、レナリドミド処理の時間及び細胞の数の間のレナリドミド反応の比較を示す一連の棒グラフである。図２０Ａは、試験からの発光シグナルを示すグラフのセットであり、コンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）を発現するＪＮＬ細胞（９０００又は１２０００細胞／ウェル）を、１０μＭのレナリドミドで４時間又は２４時間処理し、続いてＮａｌｍ６細胞、ＣＤ１９発現Ｋ５６２細胞（「Ｋ５６２＋ＣＤ１９」）、Ｋ５６２細胞又は培地（細胞なし）とともに４時間、８時間又は２０時間インキュベートした。図２０Ｂは、図２０Ａにおいて記載された試験からのデータのサブセットを示すグラフのセットである：コンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）を発現するＪＮＬ細胞（９０００細胞／ウェル）を、１０μＭのレナリドミドで４時間処理し、続いてＮａｌｍ６細胞、ＣＤ１９発現Ｋ５６２細胞（「Ｋ５６２＋ＣＤ１９」）、Ｋ５６２細胞又は培地（細胞なし）とともに２０時間インキュベートした。図２０Ｂにおけるｙ軸は、バックグラウンドシグナル（培地試料からのシグナル）を減じた後の発光シグナルを示す。図２０Ａ及び２０Ｂの両方において、各グラフにおける４つの棒は、それぞれレナリドミドでもバゼドキシフェンでも処理されていない試料（「ＤＭＳＯ＞＞ＤＭＳＯ」）、レナリドミドではなくバゼドキシフェンで処理された試料（「ＤＭＳＯ＞＞ＢＺＡ（１μＭ）」）、バゼドキシフェンではなくレナリドミドで処理された試料（「レナリドミド（１０μＭ）＞＞ＤＭＳＯ」）及びレナリドミド及びバゼドキシフェンの両方で処理された試料（「レナリドミド（１０μＭ）＞＞ＢＺＡ（１μＭ）」）を表す。
【図２１Ａ−２１Ｄ】３つの処理時点にわたるＮＦＡＴルシフェラーゼレポーターに対するレナリドミドの用量反応効果を示すグラフである。コンストラクト７６５（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９）（図２１Ａ）、コンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図２１Ｂ）、コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図２１Ｃ）又はコンストラクト７７０（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿ＮｏＫ）（図２１Ｄ）を発現するＪＮＬ細胞を、Ｋ５６２標的細胞（「Ｋ５６２」）又はＣＤ１９を発現するＫ５６２標的細胞（「Ｋ５６２＋ＣＤ１９」）とともにインキュベートした。レナリドミドを、標的細胞を加える２０時間前（４４時間レナリドミド処理、「２０時間前標的細胞」）、標的細胞を加える４時間前（２８時間レナリドミド処理、「４時間前標的細胞」）又は標的細胞を加えた１６時間後（８時間レナリドミド処理、「１６時間後標的細胞」）に加えた。コンストラクト７６５（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９）（図２１Ａ）又はコンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図２１Ｂ）を発現するＪＮＬ細胞は、バゼドキシフェンでも処理した。各グラフにおいて、未加工の発光を、指定のレナリドミド濃度に対してプロットした。
【図２２Ａ−２２Ｄ】図２１Ａ、２１Ｂ、２１Ｃ及び２１Ｄにおいて記載された試験からのデータを示すグラフであり、ＪＮＬ細胞を、Ｋ５６２＋ＣＤ１９標的細胞処理の５時間前にＭＧ１３２で処理し、Ｋ５６２＋ＣＤ１９標的細胞処理の４時間前にレナリドミドで処理した。試験された細胞としては、コンストラクト７６５（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９）（図２２Ａ）、コンストラクト７６７（ＦｕｒＯＮ＿ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図２２Ｂ）、コンストラクト７６９（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ）（図２２Ｃ）又はコンストラクト７７０（ＣＡＲ１９＿１６ＧＳ＿ＨｉｌＤタグ＿ＮｏＫ）（図２２Ｄ）を発現するＪＮＬ細胞が挙げられる。各グラフにおける４つの棒は、それぞれバゼドキシフェン（ＢＺＡ）、ＭＧ１３２及びレナリドミドで処理された試料（「ＢＺＡ、ＭＧ１３２、レナリドミド」）、バゼドキシフェン（ＢＺＡ）及びレナリドミドで処理された試料（「ＢＺＡ、レナリドミド」）、バゼドキシフェン（ＢＺＡ）で処理された試料（「ＢＺＡ」）及びＤＭＳＯのみで処理された試料（「ＤＭＳＯ」）を表す。各グラフにおけるｙ軸は、未加工の発光を示す。
【図２３】ＨｉｌＤ−タウ融合コンストラクトを示す概略図のセットである。０Ｎ４Ｒタウアイソフォームを使用し、これは、Ｃ末端反復ドメインエクソンを含むが、Ｎ末端エクソンを含まない。レンチウイルスコンストラクトを使用したが、全てのコンストラクトは、リポフェクタミントランスフェクション又はヌクレオフェクションにより導入された。融合産物は、ＣＡＧ又はＣＭＶプロモーターの下流で発現された。
【図２４Ａ−２４Ｂ】Ｅ３リガーゼＣＲＢＮのＨｉｌＤ−タウ融合タンパク質への動員を試験する試験の設計及び結果を示すグラフである。図２４Ａ：実験の図。レナリドミドは、Ｅ３リガーゼセレブロン（ＣＲＢＮ）をＩＫＺＦ３  βヘアピンに動員して、関連タンパク質のユビキチン化及び分解をもたらす。この動員がＨｉｌＤ−タウ融合物において生じたことを試験するために、ＨｉｌＤ−タウ−ビオチンリガーゼ融合物が作製された。ビオチンの存在下において、ビオチンリガーゼは、近傍のタンパク質に共有結合する反応性ビオチン種を生成する。レナリドミドが加えられる場合、ＣＲＢＮは、ＨｉｌＤ−タウ融合物に動員されるはずであり、ビオチンリガーゼ媒介性ビオチン化の範囲内にあるはずである。図２４Ｂ：ＨＥＫ２９３Ｔ細胞は、ＦＬＡＧタグ付きＣＲＢＮ及びＨｉｌＤ−タウ−ビオチンリガーゼ又はタウ−ビオチンリガーゼ融合物でトランスフェクトされた。トランスフェクションの４８時間後、細胞を、５０μＭのビオチン及びＤＭＳＯ又は１μＭのレナリドミドのいずれかで２１時間処理した。次に、細胞をＰＢＳ中で洗浄し、続いて氷冷Ｍ−ＰＥＲ緩衝液及びプロテアーゼ阻害剤中で溶解させた。およそ１００万個の細胞が、３００μＬの量において溶解されると推定された。細胞ライセートのウエスタン分析は、抗タウ（ＨＴ７）又は抗ＧＡＰＤＨ抗体で探索された下段のブロットにおいて示される。ビオチン化タンパク質は、２０％の細胞ライセートと５０μＬのストレプトアビジン磁性ビーズ（Ｄｙｎａｂｅａｄｓ  Ｍ−２８０）を室温で３０分間インキュベートすることによって免疫沈降された。ビオチン化タンパク質を、煮沸することによってビーズから溶出し、続いてウエスタンにより分析した。ＦＬＡＧ−ＣＲＢＮ上のＦＬＡＧシグナルに関して探索すると、強力なバンドは、レナリドミドで処理され、ＨｉｌＤタグを含有するＨＥＫ２９３Ｔ細胞に由来する免疫沈降材料においてのみ観察されたが、ＤＭＳＯで処理された細胞又はレナリドミドで処理されたがＨｉｌＤタグを含有しないタウコンストラクトでトランスフェクトされた細胞において観察されなかった。
【図２５Ａ−２５Ｃ】Ｅ３リガーゼＣＲＢＮの誘導性の動員による毒性タウタンパク質の減少を示すグラフである。ＨＥＫ２９３Ｔ細胞は、ＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ融合コンストラクトでトランスフェクトされた。タウ（Ｐ３０１Ｓ）は、家族性神経変性疾患を有する患者において同定されたタウの凝集傾向のある形態である。レナリドミドで一晩処理すると、ＹＦＰ蛍光は、ＹＦＰ蛍光の画像処理において見られるとおり、レナリドミドによって用量依存的様式で減少された（図２５Ａ）。条件毎に９つの視野が示される。図２５Ｂ：ＹＦＰ蛍光強度は、種々の用量でのレナリドミド処理の後に定量化された。図２５Ｃ：凝集傾向のあるタウの過剰発現に起因する毒性が認められ、Ｈｏｅｃｈｔ色素蛍光の分割によって同定された細胞の数によって定量化された。細胞死は、レナリドミド処理及びタウレベルの減少によって抑制されたが、これは、レナリドミド誘導性分解が毒性タンパク質の標的化タンパク質分解の細胞保護的作用を明らかにすることができることを示している。
【図２６Ａ−２６Ｄ】ＣＲＢＮの誘導的動員によるＨＥＫ２９３Ｔ細胞におけるタウタンパク質の減少及びタウの特定の形態の減少の定量化を示すグラフである。図２６Ａ：ＨＥＫ２９３Ｔ細胞は、ＨｉｌＤ−タウ（野生型）融合コンストラクトでトランスフェクトされ、種々の用量のレナリドミド又はＤＭＳＯのいずれかで処理された。上段及び下段のウエスタンブロットは、三つ組で反復された実験の代表例である。ポリクローナル抗タウ抗体（Ｄａｋｏ）又はタウのリン酸化形態に対する抗体（ＡＴ８）のいずれかに由来するタウバンドの強度は、抗アクチンバンド強度への正規化によって定量化された。この実験において減少した量のＤＮＡをトランスフェクションすると、タウのリン酸化された形態がより大きく減少した（１Ｘ  ＤＮＡ：１．５μＬのリポフェクタミン２０００を含む５０μＬのＯｐｔｉｍｅｍ培地中でトランスフェクトされた０．６２５マイクログラムのＤＮＡ；０．１Ｘ  ＤＮＡ＝０．０６２５マイクログラム；２４ウェルプレートのＨＥＫ細胞に対して）。これは、この系がＥ３リガーゼ媒介性のタウの分解の能力を測定できることを示唆する。示された実験において、レナリドミドは、トランスフェクションの４時間後（より高いＤＮＡ濃度のトランスフェクションに関する）又はトランスフェクションの２４時間後（より低いＤＮＡ濃度のトランスフェクションに関する）に投与された。図２６Ｂ：左パネル、ＨｉｌＤタグを有しないタウは、レナリドミド処理によって減少されなかった。右パネル、セレブロン（ＣＲＢＮ）についてノックアウトされたＨＥＫ２９３Ｔ細胞におけるレナリドミド処理によるタウレベルの減少はなかった。図２６Ｃ：野生型（ＷＴ）細胞に対するセレブロン（ＣＲＢＮ）ノックアウト（ＫＯ）細胞におけるＹＦＰ強度に対するレナリドミド処理の用量反応の定量化（野生型細胞に関しては図２６Ｂにおいて示されたものと同じデータ）。図２６Ｄ：ＭＬＮ４９２４による１時間の前処理を含むＮＥＤＤ付加阻害剤ＭＬＮ４９２４（１μＭ）との同時処理は、タウの分解も妨げた。まとめると、このデータは、ＣＲＢＮのＥ３リガーゼ機能がレナリドミド誘導性ＨｉｌＤ−タウ融合物分解に必要であることを示す。
【図２７】齧歯類皮質神経細胞において発現されたＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ融合物の凝集傾向の評価を示すグラフのセットである。齧歯類皮質神経細胞は、ＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ融合物でヌクレオフェクトされ、続いて内製のタウトランスジェニックマウスから単離された不溶性タウ画分とインキュベートされた。実際のＹＦＰ蛍光を、ＩｎＣｅｌｌ  ６０００分析計を用いて画像化した。中段及び下段のパネルは、上段パネルにおいて同定された神経細胞の拡大を示す。強い点状のＹＦＰ蛍光によって示されるとおり、タウ凝集体は明瞭に見える。
【図２８】ラット神経細胞において発現されたＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰのレナリドミド媒介性分解を示すグラフのセットである。齧歯類皮質神経細胞は、ＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ融合物又はタウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ融合物でヌクレオフェクトされた。ＦＬＡＧタグ付きＣＲＢＮによるコトランスフェクションも試験された（最上段）。インビトロで９日目から、神経細胞を指定の用量のレナリドミドで処理した。神経細胞を、指定の間隔でＹＦＰ蛍光についてライブイメージングした。レナリドミド処理により、ＤＭＳＯで処理されたＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ発現神経細胞又はレナリドミドで処理されたタウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰ発現神経細胞に対して経時的にＹＦＰ蛍光が減少した。分解は、ヒトＣＲＢＮのコトランスフェクションの有無にかかわらず発生し、このことは、ＨｉｌＤ−タウ融合物が、齧歯類又はヒトＣＲＢＮのいずれかによってレナリドミドにより分解され得ることを示している。
【図２９】ラット神経細胞において発現されたＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰのレナリドミド媒介性分解を示すグラフのセットである。胚性幹細胞由来のインビトロで６３日目の解離した古いヒト神経球の単一細胞懸濁液を、ＨｉｌＤ−タウ（Ｐ３０１Ｓ）−ＹＦＰでヌクレオフェクトした。神経球は、神経細胞及び神経前駆細胞の両方を含有する。１０日間の培養後、神経細胞をレナリドミドで処理した（インビトロで合計７３日齢）。画像は、指定の用量で２０時間のレナリドミド処理後のＹＦＰ蛍光を示す。レナリドミドは、用量依存的な様式でＹＦＰ蛍光強度を大幅に減少させた。
【図３０Ａ−３０Ｂ】ＣＡＲ１９−１６ＧＳ−ＨｉｌＤタグのレナリドミド媒介性分解を示すグラフのセットである。図３０Ａは、経時的に単一用量のレナリドミドで処理されたＣＡＲ１９−ＨｉｌＤタグ形質導入ジャーカット細胞のウエスタンブロットのグラフのセットである。化合物処理後又は洗い出し期間後の試料が試験された。図３０Ｂは、ウエスタンブロット分析において使用された同じ試料を分析するフローサイトメトリーヒストグラムのセットである。抗ＣＤ３ゼータ抗体がウエスタンブロット分析において使用され、ＣＤ１９−ＰＥコンジュゲートがフローサイトメトリー分析において使用された。
【図３１Ａ−３１Ｃ】異なる条件下でのＣＡＲ発現を分析するフローサイトメトリーヒストグラムのセットである。図３１Ａは、初代Ｔ細胞におけるＣＡＲ発現を示すフローサイトメトリーヒストグラムのセットである。２４時間目のＣＡＲ１９発現に対するレナリドミドの効果は図３１Ｂにおいて示される。２４又は４８時間目のＣＡＲ１９−ＨｉｌＤ発現に対するレナリドミドの効果は図３１Ｃにおいて示される。
【図３２Ａ−３２Ｃ】ＣＡＲＴ細胞によって媒介される％死滅を示すグラフのセットである。図３２Ａは、ＣＤ１９陰性細胞に対する死滅のパーセントを示すグラフである。図３２Ｂ及び３２Ｃは、１μＭのレナリドミドの存在下又は非存在下でのＣＤ１９陽性細胞に対するＣＡＲ１９  Ｔ細胞（図３２Ｂ）又はＣＡＲ１９−ＨｉｌＤ  Ｔ細胞（図３２Ｃ）の死滅のパーセントを示すグラフである。
【図３３Ａ−３３Ｂ】それぞれ１μＭのレナリドミドの存在下又は非存在下でＣＡＲ１９又はＣＡＲ１９−ＨｉｌＤを発現するＴ細胞から分泌されたＩＦＮガンマ及びＩＬ２のレベルを示すグラフである。ｘ軸上にレナリドミドの濃度がμＭで示される。
【図３４】レナリドミドがインビボでＣＡＲＴ１９．ＨｉｌＤの腫瘍増殖を制御する能力を消失させることを示すグラフである。ＲＯＩの全光束は、Ｎａｌｍ６移植後の日数に対してプロットされる。
【図３５】レナリドミド処理後のＣＡＲ１９−ＨｉｌＤ発現の減少を示すフローサイトメトリープロットのセットである。
【図３６】種々の処理群における腫瘍制御のレベルを示すグラフである。ＲＯＩの全光束は、Ｎａｌｍ６移植後の日数に対してプロットされる。レナリドミドの早期の注入は、ＣＡＲＴ−ＨｉｌＤで処理されたマウスにおいてＣＡＲＴ発現を効率的に消失させ、この群では腫瘍制御の欠如をもたらした。レナリドミドの後処理（ＣＡＲＴ注入後５日目）も、マウスのこの群での腫瘍制御の喪失によって示されるとおり、ＣＡＲＴの機能を低下させた。
【図３７Ａ−３７Ｅ】脾細胞由来のＣＤ３＋細胞におけるＣＡＲ発現を分析するグラフである。図３７Ａは、ＣＡＲＴ−ＨｉｌＤで処理されたマウスの脾細胞由来のＣＤ３＋細胞におけるＣＡＲ発現を示すグラフである（群１）。図３７Ｂ、３７Ｃ及び３７Ｄは、ＣＡＲＴ−ＨｉｌＤ及びレナリドミドで処理されたマウスの脾細胞由来のＣＤ３＋細胞におけるＣＡＲ発現を示すグラフである（それぞれ、群２、群３及び群４）。図３７Ａ〜３７Ｄにおけるピークは、個々のマウスのＣＤ３発現レベルを表す。群１．ＣＡＲ１９．ＨｉｌＤ（５ｘ１０６）。群２．ＣＡＲＴ１９−ＨｉｌＤ（５ｘ１０６）＋Ｌｅｎａ  ｑｄ。群３．ＣＡＲＴ１９−ＨｉｌＤ（５ｘ１０６）＋Ｌｅｎａ  ｂｉｄ。群４．ＣＡＲ１９．ＨｉｌＤ（５ｘ１０６）＋Ｌｅｎａ＋５日。図３７Ｅは、データを要約するグラフである。
【図３８Ａ−３８Ｃ】ＣＡＲ１９−ＣＡＲＢタグの発現及び活性に対する化合物Ｉ−１１２の影響を示すグラフである。図３８Ａは、種々の用量の化合物Ｉ−１１２又はＤＭＳＯで２４時間処理されたＣＡＲ１９−ＣＡＲＢタグを発現するジャーカットＮＦＡＴルシフェラーゼ（ＪＮＬ）細胞のウエスタンブロットであり、ＣＡＲ１９−ＣＡＲＢタグの用量反応分解を示す。図３８Ｂは、１０μＭの化合物Ｉ−１１２による処理後のタグなしＣＡＲ１９細胞と比較したＪＮＬ  ＣＡＲ１９−ＣＡＲＢタグ細胞におけるＣＡＲ１９の表面発現のフローサイトメトリー分析を示すヒストグラムのセットである。図３８Ｃは、ＣＡＲ１９−ＣＡＲＢタグを発現するＪＮＬルシフェラーゼ細胞を、１５時間の化合物Ｉ−１１２の用量反応で処理した後、Ｋ５６２（ＣＤ１９−）細胞又はＮａｌｍ６（ＣＤ１９＋）細胞のいずれかと同時処理し、ルシフェラーゼ活性の読み出しを行ったＪＮＬアッセイ結果を示すグラフである。
【図３９】ＣＡＲＢタグ−ＭＩＴＦ−ＦＬＡＧで一過的にトランスフェクトし、１０μＭ、１μＭ、０．１μＭ又は０．０１μＭの化合物Ｉ−１１２若しくはレナリドミド又はＤＭＳＯで処理したＨＥＫ２９３Ｔ細胞のウエスタンブロットであり、ＣＡＲＢタグ付きＭＩＴＦのＩ−１１２特異的な分解を示している。
【図４０Ａ−４０Ｂ】ＢＣＭＡＣＡＲ１９−ＨｉｌＤタグの発現及び活性に対するレナリドミドの影響を分析するグラフである。図４０Ａは、２４時間のレナリドミドの用量反応で処理されたＢＣＭＡＣＡＲ  ＨｉｌＤ−タグで感染させたＪＮＬ細胞のフローサイトメトリー分析結果を示すヒストグラムのセットであり、ＢＣＭＡＣＡＲのレナリドミド用量依存的な分解を示す。図４０Ｂは、ＢＣＭＡ−ＨｉｌＤタグを発現するジャーカットＮＦＡＴルシフェラーゼ細胞を、１５時間のレナリドミドの用量反応で処理した後、ＫＭＳ１１細胞と同時処理し、ルシフェラーゼ活性の読み出しを行ったＪＮＬアッセイ結果を示すグラフである。
【発明を実施するための形態】
【０２５６】
本開示は、少なくとも部分的に、標的化されたタンパク質不活性化のための式（Ｉ）の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、式（ＩＩ）の化合物（ＣＯＦ２）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド又は式（ＩＩＩ）の化合物（ＣＯＦ３）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは、１つ以上のＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び１つ以上の異種ポリペプチド、例えば異種哺乳動物、細菌又はウイルスポリペプチド、例えば、１つ以上の目的のポリペプチドを含む。ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、リンカーを介して異種ポリペプチドに作動可能に連結され得る。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）など）の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、分解、例えば、融合ポリペプチドのユビキチン化媒介性分解を増大させ；且つ／又は融合ポリペプチドのレベル及び／又は活性を変化させる。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの分解は、ユビキチン依存的である。
【０２５７】
理論に束縛されるものではないが、いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）など）の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下、融合ポリペプチドの翻訳後修飾（例えば、ユビキチン化）をもたらして、修飾された、例えば、ユビキチン化された融合ポリペプチドをもたらすアミノ酸配列及び／又は構造モチーフを提供する。例えば、融合ポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸、例えば、リジン又はメチオニンは、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の存在下でユビキチン化され得る。いくつかの実施形態では、ユビキチン化された融合ポリペプチドは、選択的に分解される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの翻訳後修飾は、融合ポリペプチド（例えば、異種ポリペプチドの全て又は一部）の分解を増大させる（例えば、分解のレベル及び／又は速度の増大）。いくつかの実施形態では、分解のレベル及び／又は速度の増大は、参照タンパク質、例えば、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２若しくはＣＯＦ３の非存在下の融合ポリペプチド、異種ポリペプチド、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴わない異種ポリペプチドの融合物又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド以外の部分を伴う異種ポリペプチドの融合物の分解のレベル及び／又は速度より、少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、５００％、１０倍、１００倍、１，０００倍又はそれ以上である。
【０２５８】
理論に束縛されるものではないが、融合ポリペプチドの分解は、以下のステップ：（１）ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（例えば、サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド））又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の、ユビキチンリガーゼ複合体（例えば、Ｅ３ユビキチンリガーゼ複合体）の１つ以上のサブユニットに対する結合、例えば、ＣＵＬ４、ＲＢＸ１、ＤＤＢＩ及び／又はＣＲＢＮ（ＣＲＬ４（ＣＲＢＮ）としても知られる）、典型的には、ＤＤＢ１−ＣＲＢＮ複合体に対する結合により、ＣＯＦ１−リガーゼ又はＣＯＦ２−リガーゼ複合体を形成するステップ；
（２）ＣＯＦ１−リガーゼ、ＣＯＦ２−リガーゼ又はＣＯＦ３−リガーゼ複合体が、融合ポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸、例えば、リジン又はメチオニンのユビキチン化に結合し、且つそれを増大させることにより、ユビキチン化された融合ポリペプチド、例えば、モノ又はポリユビキチン化融合ポリペプチドを形成するステップ；及び
（３）ユビキチン化融合ポリペプチドが、分解のために標的化され、例えば、融合ポリペプチドが、分解のために、例えば、プロテアソームに選択的に標的化されるステップ
の１つ、２つ又は全てを含み得る。
【０２５９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１（例えば、配列番号２０）又はＩＫＺＦ３（例えば、配列番号１９）の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む。
【０２６０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２（例えば、配列番号２１）の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む。
【０２６１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン（例えば、ＩＫＺＦ３のβターン）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン（例えば、ＩＫＺＦ３のβターン）及びαヘリックス（例えば、ＩＫＺＦ３のαヘリックス）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ３のアミノ酸残基１３６〜１７０若しくは１３６〜１８０及び／若しくは２３６〜２４９（配列番号１９に従って番号付けされる）又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）アミノ酸配列を含む。
【０２６２】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン（例えば、ＩＫＺＦ２のβターン）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン（例えば、ＩＫＺＦ２のβターン）及びαヘリックス（例えば、ＩＫＺＦ２のαヘリックス）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のアミノ酸残基１３０〜１７４及び／又は２３０〜２４３（配列番号２１に従って番号付けされる）又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）アミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９、１１３及び１１４からなる群から選択されるアミノ酸配列、又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）アミノ酸配列を含む。
【０２６３】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン（例えば、ＩＫＺＦ１のβターン）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターン（例えば、ＩＫＺＦ１のβターン）及びαヘリックス（例えば、ＩＫＺＦ１のαヘリックス）を含む。
【０２６４】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドの異種ポリペプチドは、翻訳後修飾（例えば、１つ以上の残基でのユビキチン化）及びＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（例えば、サリドマイド及びその誘導体、例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下で分解を受けやすい。
【０２６５】
任意選択により、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、例えば、リンカー、例えばグリシン−セリンリンカー（例えば、配列番号２８、３７、３８、３９又は９９）を介して作動可能に連結され得る。例えば、融合ポリペプチドは、３つの要素：ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、例えば、分解アミノ酸配列（例えば、デグロン）の一部、分解される目的の異種ポリペプチド及び２つを隔てるリンカーを含み得る。異種ポリペプチドは、細胞質ゾルタンパク質、核タンパク質、膜貫通タンパク質（例えば、１つ以上の膜貫通ドメインを含む）又は分泌タンパク質であり得る。例えば、目的の異種ポリペプチドは、例えば、本明細書に記載されるとおりの、例えば、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）、ＣＲＩＳＰＲ関連タンパク質、ＣＤ８、ＣＤ１９、ＣＤ２２、転写因子（例えば、ＳＴＡＴ３、ＳＴＡＴ５、ＮＦ−カッパＢ、ベータ−カテニン、ノッチ、ＧＬＩ又はｃ−ＪＵＮ）を含み得る。
【０２６６】
いくつかの実施形態では、本発明の融合ポリペプチドはさらに、分解ドメインを含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、融合ポリペプチドの発現の第１のレベルと関連する第１の状態及び融合ポリペプチドの発現の第２のレベルと関連する第２の状態を有し、第２のレベルは、例えば、安定化化合物の存在下で第１のレベルの少なくとも２、３、４、５、１０、２０又は３０倍増大される。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、異種切断部位によってＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドから隔てられている。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、異種切断部位によってＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドから隔てられている。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、異種切断部位によってＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドから隔てられている。
【０２６７】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドは第１のドメイン及び第２のドメインを含み、第１のドメインは分解ドメインを含み、第２のドメインはＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、第１のドメイン及び第２のドメインは、異種切断部位によって隔てられている。理論に束縛されるものではないが、融合ポリペプチドの発現レベルは、安定化化合物及びＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３によって制御され得る。いくつかの実施形態では、安定化化合物の非存在下では、分解ドメインは、適切な立体構造をとることができず、融合ポリペプチドの残部とともに細胞内分解経路による分解に関して標的化される。いくつかの実施形態では、安定化化合物の存在下では、分解ドメインは、適切な立体構造をとり、細胞内分解経路による分解をより受けにくい。いくつかの実施形態では、安定化化合物の存在下では、分解ドメインの適切なフォールディングは異種切断部位を露出させ、異種切断部位の切断及び融合ポリペプチドの残部からの分解ドメインの除去に委ねる。融合ポリペプチドのレベルはさらに、上記のとおりＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３によって制御され得る。
【０２６８】
いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン又はジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインから選択される。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインであり、配列番号４６又は４８と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含み、例えば、分解ドメインは、配列番号４６のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインであり、安定化化合物は、バゼドキシフェン又は４−ヒドロキシタモキシフェン（４−ＯＨＴ）である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインであり、例えば、分解ドメインは、配列番号５０と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含み、例えば、分解ドメインは、配列番号５０のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインであり、安定化化合物は、Ｓｈｉｅｌｄ−１である。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインであり、例えば、分解ドメインは、配列番号５１と少なくとも９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一であるアミノ酸配列を含み、例えば、分解ドメインは、配列番号５１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインであり、安定化化合物は、トリメトプリムである。
【０２６９】
したがって、本明細書では、異種ポリペプチド、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び／又は分解ドメインを含む融合ポリペプチド、例えば、選択的なタンパク質分解のための目的のポリペプチド並びに融合ポリペプチドをコードする核酸分子、ベクター及び細胞、例えば、前述の融合ポリペプチドを含む宿主細胞が開示される。本明細書で開示される融合ポリペプチド及び関連組成物は、治療法、例えば、分泌療法、細胞療法又は膜貫通療法（例えば、ＣＡＲ療法）の制御、遺伝子発現の制御（例えば、ＣＲＩＳＰＲ／ＣＡＳシステムの構成要素の発現及び／又は活性の制御を介して）、標的の検証並びにライブラリーのスクリーニングのために、様々な標的タンパク質を活性化又は不活性化、例えば、分解するために使用され得る。例えば、対象を治療するための前記融合ポリペプチドを選択的に制御する（例えば、分解する）ための方法がさらに開示される。
【０２７０】
本明細書に開示される組成物及び方法は、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドが、タンパク質レベル（ｍＲＮＡとは対照的に）で作用し、細胞内の既存及び新規に作られたタンパク質の活性分解を引き起こする（新生タンパク質の産生を遮断するのとは対照的に）という事実を含む、当技術分野で知られる制御システムを超える新規且つ進歩的な特徴を提供す。加えて、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、短い長さを有する場合があり、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２及びＣＯＦ３は通常、低分子量である。
【０２７１】
理論に束縛されるものではないが、実施例１６に記載されるとおり、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２（例えば、サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド））は、本明細書に記載されるＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるＣＡＲＢタグを含む融合ポリペプチド、例えば、配列番号１０９、１１３及び１１４からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＣＡＲＢタグを含む融合ポリペプチド）の分解を引き起こさないか又は実質的に引き起こさない。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２の存在下での本明細書に記載されるＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチドの分解は、同じ条件下でのＣＯＦ３の存在下の前記融合ポリペプチドの分解の１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５又は２０％以下である。
【０２７２】
同様に、ＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）は、本明細書に記載されるＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるＨｉｌＤタグを含む融合ポリペプチド、例えば、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＨｉｌＤタグを含む融合ポリペプチド）の分解を引き起こさないか又は実質的に引き起こさない。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３の存在下での本明細書に記載されるＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチドの分解は、同じ条件下でのＣＯＦ１又はＣＯＦ２の存在下の前記融合ポリペプチドの分解の１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５又は２０％以下である。
【０２７３】
したがって、一方はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドでタグ付けされ（例えば、本明細書に記載されるＨｉｌＤタグ）、他方はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドでタグ付けされた（例えば、本明細書に記載されるＣＡＲＢタグ）２つの標的ポリペプチドは、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２及びＣＯＦ３を用いて独立して制御され得る。例えば、ＨｉｌＤタグ付きタンパク質及びＣＡＲＢタグ付きタンパク質を発現する細胞は、ＨｉｌＤタグ付きタンパク質のみを発現するか（例えば、細胞をＣＯＦ３と接触させることによって）、ＣＡＲＢタグ付きタンパク質のみを発現するか（例えば、細胞をＣＯＦ１又はＣＯＦ２と接触させることによって）、又はどちらのタンパク質も発現しない（例えば、細胞をＣＯＦ１又はＣＯＦ２及びＣＯＦ３と接触させることによって）ように操作され得る。
【０２７４】
定義
別途定義されていない限り、本明細書で使用する全ての技術用語及び科学用語は、本発明が関係する分野の当業者に一般に理解されている意味と同じ意味を有する。
【０２７５】
本明細書で使用する場合、用語「式（Ｉ）の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド」は、ＣＯＦ１に結合するポリペプチド、ＣＯＦ１とＣＲＢＮの複合体に結合するポリペプチド又はＣＯＦ１の存在下でＣＲＢＮに結合するポリペプチドを指す。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ１に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ１とＣＲＢＮの複合体に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ１の存在下でＣＲＢＮに結合する。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドのユビキチン化の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドの分解の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドの不活性化の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、ユビキチン化、分解及び／又は不活性化の増大は、ＣＯＦ１及びユビキチン化リガーゼ複合体の１つ以上の構成要素（例えば、ＣＲＢＮ）の存在下で生じる。いくつかの実施形態では、ユビキチン化、分解及び／又は不活性化の増大は、参照ポリペプチド、例えば、ＣＯＦ１の非存在下でＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴う参照融合ポリペプチド又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴わない参照ポリペプチドのユビキチン化、分解及び／又は不活性化より少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、５００％、１０倍、１００倍、１，０００倍又はそれ以上高い。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含有する融合ポリペプチドの分解は、ユビキチン依存的である。例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴う融合ポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸、例えば、リジン又はメチオニンは、ＣＯＦ１の存在下でユビキチン化される。
【０２７６】
本明細書で使用する場合、用語「式（ＩＩ）の化合物（ＣＯＦ２）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド」は、ＣＯＦ２に結合するポリペプチド、ＣＯＦ２とＣＲＢＮの複合体に結合するポリペプチド又はＣＯＦ２の存在下でＣＲＢＮに結合するポリペプチドを指す。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ２に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ２とＣＲＢＮの複合体に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ２の存在下でＣＲＢＮに結合する。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドのユビキチン化の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドの分解の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドの不活性化の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、ユビキチン化、分解及び／又は不活性化の増大は、ＣＯＦ２及びユビキチン化リガーゼ複合体の１つ以上の構成要素（例えば、ＣＲＢＮ）の存在下で生じる。いくつかの実施形態では、ユビキチン化、分解及び／又は不活性化の増大は、参照ポリペプチド、例えば、ＣＯＦ２の非存在下でＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴う参照融合ポリペプチド又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴わない参照ポリペプチドのユビキチン化、分解及び／又は不活性化より少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、５００％、１０倍、１００倍、１，０００倍又はそれ以上高い。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含有する融合ポリペプチドの分解は、ユビキチン依存的である。例えば、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴う融合ポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸、例えば、リジン又はメチオニンは、ＣＯＦ２の存在下でユビキチン化される。
【０２７７】
本明細書で使用する場合、用語「式（ＩＩＩ）の化合物（ＣＯＦ３）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド」は、ＣＯＦ３に結合するポリペプチド、ＣＯＦ３とＣＲＢＮの複合体に結合するポリペプチド又はＣＯＦ３の存在下でＣＲＢＮに結合するポリペプチドを指す。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ３に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ３とＣＲＢＮの複合体に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、例えば、当技術分野で認められる方法、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅによって測定されるとおり、１０−３、１０−４、１０−５、１０−６、１０−７又は１０−８Ｍ未満の親和性（ＫＤ）を有してＣＯＦ３の存在下でＣＲＢＮに結合する。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドのユビキチン化の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドの分解の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド中に存在する場合（例えば、異種ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりの融合ポリペプチド）に作動可能に連結される）、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、融合ポリペプチドの不活性化の増大をもたらし得る。いくつかの実施形態では、ユビキチン化、分解及び／又は不活性化の増大は、ＣＯＦ３及びユビキチン化リガーゼ複合体の１つ以上の構成要素（例えば、ＣＲＢＮ）の存在下で生じる。いくつかの実施形態では、ユビキチン化、分解及び／又は不活性化の増大は、参照ポリペプチド、例えば、ＣＯＦ３の非存在下でＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴う参照融合ポリペプチド又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴わない参照ポリペプチドのユビキチン化、分解及び／又は不活性化より少なくとも５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、２００％、５００％、１０倍、１００倍、１，０００倍又はそれ以上高い。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含有する融合ポリペプチドの分解は、ユビキチン依存的である。例えば、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを伴う融合ポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸、例えば、リジン又はメチオニンは、ＣＯＦ３の存在下でユビキチン化される。
【０２７８】
本明細書で使用する場合、「ユビキチン化」は、ユビキチン分子、例えば、単一のユビキチン（モノ−ユビキチン化）又は２つ以上のユビキチン（例えば、ユビキチン分子の鎖又はポリ−ユビキチン化）の付加を指す。ユビキチン化は、ユビキチン活性化酵素（Ｅ１）、ユビキチン結合酵素（Ｅ２）及びユビキチンリガーゼ（Ｅ３）の１つ以上を含む酵素機構によって行われ得る。
【０２７９】
本明細書で使用する場合、用語「ＣＲＢＮ」は、ヒトにおいてＣＲＢＮ遺伝子によってコードされるタンパク質又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｑ９６ＳＷ２は、例示的なヒトＣＲＢＮアミノ酸配列を提供する。
【０２８０】
本明細書で使用する場合、「ＩＫＺＦポリペプチド」は、ＩＫＺＦ又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。
【０２８１】
本明細書で使用する場合、用語「ＩＫＺＦ３」は、ヒトにおいてＩＫＺＦ３遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｑ９ＵＫＴ９は、例示的なヒトＩＫＺＦ３アミノ酸配列を提供する。例示的なヒトＩＫＺＦ３アミノ酸配列は、配列番号１９によって提供される。用語「ＩＫＺＦ３ポリペプチド」は、ＩＫＺＦ３又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。
【０２８２】
本明細書で使用する場合、用語「ＩＫＺＦ１」は、ヒトにおいてＩＫＺＦ１遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｑ１３４２２は、例示的なヒトＩＫＺＦ１アミノ酸配列を提供する。例示的なヒトＩＫＺＦ１アミノ酸配列は、配列番号２０によって提供される。用語「ＩＫＺＦ１ポリペプチド」は、ＩＫＺＦ１又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。
【０２８３】
本明細書で使用する場合、用語「ＩＫＺＦ２」は、ヒトにおいてＩＫＺＦ２遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｑ９ＵＫＳ７は、例示的なヒトＩＫＺＦ２アミノ酸配列を提供する。例示的なヒトＩＫＺＦ２アミノ酸配列は、配列番号２１によって提供される。用語「ＩＫＺＦ２ポリペプチド」は、ＩＫＺＦ２又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。
【０２８４】
本明細書で使用する場合、用語「ＩＫＺＦ４」は、ヒトにおいてＩＫＺＦ４遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｑ９Ｈ２Ｓ９は、例示的なヒトＩＫＺＦ４アミノ酸配列を提供する。例示的なヒトＩＫＺＦ４アミノ酸配列は、配列番号２２によって提供される。用語「ＩＫＺＦ４ポリペプチド」は、ＩＫＺＦ４又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。
【０２８５】
本明細書で使用する場合、用語「ＩＫＺＦ５」は、ヒトにおいてＩＫＺＦ５遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｑ９Ｈ５Ｖ７は、例示的なヒトＩＫＺＦ５アミノ酸配列を提供する。例示的なヒトＩＫＺＦ５アミノ酸配列は、配列番号２３によって提供される。用語「ＩＫＺＦ５ポリペプチド」は、ＩＫＺＦ５又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。
【０２８６】
本明細書で使用する場合、「融合ポリペプチド」又は「キメラポリペプチド」は、単一の連続的なポリペプチドにおいて２つ以上の異種アミノ酸配列及び／又はタンパク質ドメインを含むポリペプチドを指す。いくつかの実施形態では、２つ以上の異種タンパク質ドメインは、例えば、リンカーを介して直接的に又は間接的に共有結合される。
【０２８７】
本明細書で使用する場合、用語「エストロゲン受容体（ＥＲ）」は、ヒトにおいてＥＳＲ１遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｐ０３３７２は、例示的なヒトエストロゲン受容体（ＥＲ）アミノ酸配列を提供する。「エストロゲン受容体（ＥＲ）ドメイン」は、エストロゲン受容体又はその断片若しくは変異体（例えば、それと実質的に同一な、例えば、それと少なくとも８５、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一なアミノ酸配列）を指す。例示的なエストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインアミノ酸配列は、配列番号４４、４６及び４８において提供される。例示的なエストロゲン受容体（ＥＲ）ドメインヌクレオチド配列は、配列番号４５、４７及び４９において提供される。
【０２８８】
本明細書で使用する場合、「ＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメイン」は、ＦＫＢＰ又はその断片若しくは変異体を指す。例示的なＦＫＢタンパク質（ＦＫＢＰ）ドメインアミノ酸配列は、配列番号５０によって提供される。
【０２８９】
本明細書で使用する場合、用語「ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）」は、ヒトにおいてＤＨＦＲ遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｐ００３７４は、例示的なジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）アミノ酸配列を提供する。「ジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメイン」は、ＤＨＦＲ又はその断片若しくは変異体を指す。例示的なジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）ドメインアミノ酸配列は、配列番号５１によって提供される。
【０２９０】
本明細書で使用する場合、用語「分解ドメイン」は、安定化化合物の存在下で発現されるときに安定な立体構造をとる融合ポリペプチドのドメインを指す。目的の細胞で発現されるときに安定な立体構造をとらない大部分の分解ドメイン（及び典型的には、それらが融合される任意のタンパク質）は、内因性の細胞機構によって分解されることになる。注目すべきことに、分解ドメインは、天然に存在するタンパク質のドメインではなく、安定化化合物との接触がないと不安定になるように設計されている。したがって、分解ドメインは、以下の特徴によって同定可能である：（１）それが天然に存在していない；（２）その発現が、分解速度の増大又は低下によって翻訳と同時に又は翻訳後に制御される；（３）分解の速度が、安定化化合物の存在下で実質的に低下する。いくつかの実施形態では、安定化化合物がない場合、融合ポリペプチドの分解ドメイン又は他のドメインは、細胞内又は細胞上で実質的に検出されない。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、安定化化合物の非存在下で不安定化された状態にある。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、安定化化合物の非存在下で自己会合しない、例えば、ホモ二量体化しない。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位に融合され、安定化化合物の存在下において、異種プロテアーゼ切断部位の切断が、安定化化合物の非存在下より効率的である。
【０２９１】
分解ドメインは、ＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／米国特許出願公開第２０１７／０２７７７８号明細書において定義されるとおりの凝集ドメインではない。
【０２９２】
「安定化化合物」又は「安定化させる化合物」は、分解ドメインを発現する細胞に添加した場合、分解ドメイン及びそれに融合された任意のタンパク質を安定化し、その後分解される速度を低下させる化合物を意味する。安定化化合物又は安定化させる化合物は、天然に存在するか又は合成的であり得る。
【０２９３】
用語「異種ポリペプチド」は、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドと（例えば、少なくとも１つのアミノ酸が）異なり、且つ活性ルシフェラーゼドメインではないか又はルシフェラーゼ配列を有するアミノ酸配列（例えば、タンパク質ドメイン）を意味する。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、レポーターポリペプチド、例えば、ルシフェラーゼ、緑色蛍光タンパク質又はｂ−ガラクトシダーゼではない。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、哺乳動物ポリペプチド、細菌ポリペプチド、ウイルスポリペプチド、植物ポリペプチド、酵母ポリペプチド、真菌ポリペプチド、古細菌ポリペプチド又は魚類、例えば、ゼブラフィッシュポリペプチドからの又はそれらに由来するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、表２におけるポリペプチド、例えば表２に記載されるとおりの細胞質内及び／若しくは核ポリペプチド、分泌ポリペプチド又は膜貫通ポリペプチドを含む。
【０２９４】
さらに、「異種プロテアーゼ切断部位」は、それが融合される１つ以上のタンパク質ドメインと異なる起源を有する（例えば、他の参照されるドメインの少なくとも１つに自然に融合されていない）プロテアーゼ切断部位を意味する。
【０２９５】
「プロテアーゼ」は、切断されることになるタンパク質における切断部位の存在に基づいて別のタンパク質を切断するタンパク質を意味する。
【０２９６】
「細胞内プロテアーゼ」は、目的の細胞内部で自然に発現されるプロテアーゼを意味する。
【０２９７】
「細胞外プロテアーゼ」は、生物体（例えば、哺乳動物）中で自然に発現され、細胞の外部（例えば、血液中又は皮膚の表面）に分泌されるか又は露出されるプロテアーゼを意味する。
【０２９８】
本明細書で使用する場合、用語「切断」は、核酸分子の骨格中などの共有結合の切断又はペプチド結合の加水分解を指す。切断は、リン酸ジエステル結合の酵素的又は化学的加水分解を含むがこれに限定されない、様々な方法によって開始され得る。一本鎖切断及び二本鎖切断の両方が可能である。二本鎖切断は、２つの異なる一本鎖切断現象の結果として生じる場合がある。
【０２９９】
追加の用語を以下に記載する。
【０３００】
用語「１つの（ａ）」及び「１つの（ａｎ）」は、冠詞の文法的目的語の１つ又は２つ以上（すなわち、少なくとも１つ）を指す。一例として、「要素」は、１つの要素又は２つ以上の要素を意味する。
【０３０１】
用語「約」は、量、経時的な持続時間などの測定可能な値を指す場合、指定された値から、±２０％の変動、又はいくつかの場合において±１０％の変動、又はいくつかの場合において±５％の変動、又はいくつかの場合において±１％の変動、又はいくつかの場合において±０．１％の変動を包含することを意味しており、それは、このような変動が開示される方法を実施するのに適切であるためである。
【０３０２】
本明細書で使用する場合、用語「抗体」は、抗原と特異的に結合する免疫グロブリン分子由来のタンパク質又はポリペプチド配列を指す。抗体は、ポリクローナル若しくはモノクローナル、複数鎖若しくは一本鎖又はインタクト免疫グロブリンであり得、且つ天然源由来又は組換え源由来であり得る。抗体は、免疫グロブリン分子の四量体であり得る。
【０３０３】
用語「抗体断片」は、抗原のエピトープと（例えば、結合、立体障害、安定化／不安定化、空間分布によって）特異的に相互作用する能力を保持する抗体の少なくとも一部分を指す。抗体断片の例としては、限定はされないが、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ断片、ｓｃＦｖ抗体断片、ジスルフィド結合Ｆｖ（ｓｄＦｖ）、ＶＨ及びＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片、直鎖抗体、ｓｄＡｂなどの単一ドメイン抗体（ＶＬ又はＶＨのいずれか）、ラクダ科ＶＨＨドメイン、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって結合された２つのＦａｂ断片を含む二価断片などの抗体断片から形成される多重特異性抗体並びに単離されたＣＤＲ又は抗体の他のエピトープ結合断片が挙げられる。抗原結合断片は、単一ドメイン抗体、マキシボディ、ミニボディ、ナノボディ、細胞内抗体、二重特異性抗体、三重特異性抗体、四重特異性抗体、ｖ−ＮＡＲ及びビス−ｓｃＦｖにも組み込まれ得る（例えば、Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ  ａｎｄ  Ｈｕｄｓｏｎ，Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ２３：１１２６−１１３６，２００５を参照）。抗原結合断片は、フィブロネクチンＩＩＩ型（Ｆｎ３）などのポリペプチドに基づく足場にも移植され得る（フィブロネクチンポリペプチドミニボディを記載する米国特許第６，７０３，１９９号明細書を参照）。
【０３０４】
用語「抗体重鎖」は、それらの天然に存在する立体構造の抗体分子中に存在する２つのタイプのポリペプチド鎖のうち大きい方を指し、これは通常、抗体が属するクラスを決定する。
【０３０５】
用語「抗体軽鎖」は、それらの天然に存在する立体構造の抗体分子中に存在する２つのタイプのポリペプチド鎖のうち小さい方を指す。カッパ（κ）及びラムダ（λ）軽鎖は、２つの主要な抗体軽鎖アイソタイプを指す。
【０３０６】
用語「抗原」、「Ａｇ」又は「抗原分子」は、免疫応答を惹起する分子を指す。免疫応答は、抗体産生若しくは特定の免疫適格細胞の活性化のいずれか又は両方を必要とする。いくつかの実施形態では、抗原は、全てのタンパク質又はペプチドを含む任意の巨大分子である。他の実施形態では、抗原は、組換え又はゲノムＤＮＡに由来する。したがって、免疫応答を誘発するタンパク質をコードするヌクレオチド配列又は部分的なヌクレオチド配列を含む任意のＤＮＡが、本明細書で使用される用語である「抗原」をコードする。
【０３０７】
抗原は、遺伝子の全長ヌクレオチド配列によってのみコードされる必要はない。実施形態において、抗原は、２つ以上の遺伝子の部分的なヌクレオチド配列の使用及び所望の免疫応答を誘発するポリペプチドをコードするように、これらのヌクレオチド配列が様々な組合せで配置されることを含むが、これらに限定されない。ある実施形態では、抗原は、「遺伝子」によってコードされる必要はない。一実施形態では、抗原は、合成的に作製され得るか又は生体試料に由来し得るか、又はポリペプチド以外の巨大分子である可能性がある。このような生体試料としては、組織試料、腫瘍試料、細胞又は他の生物学的構成成分を伴う液体が挙げられ得るが、これらに限定されない。実施形態において、抗原としては、例えば、炭水化物（例えば、単糖、二糖、オリゴ糖及び多糖）が挙げられる。
【０３０８】
用語「抗原提示細胞」又は「ＡＰＣ」は、その表面上で主要組織適合抗原複合体（ＭＨＣ）と複合体を形成した外来抗原を提示するアクセサリー細胞（例えば、Ｂ細胞、樹状細胞など）などの免疫系細胞を指す。Ｔ細胞は、それらのＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を用いてこれらの複合体を認識し得る。ＡＰＣは抗原をプロセシングし、それらをＴ細胞に提示する。
【０３０９】
用語「キメラ抗原受容体」又は代わりに「ＣＡＲ」は、免疫エフェクター細胞中にあるとき、標的細胞、典型的には癌細胞への特異性及び細胞内シグナルの生成をその細胞にもたらすポリペプチドのセット、最も簡単な実施形態では典型的には２つのポリペプチドのセットを指す。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン並びに下記で定義されるとおりの刺激分子及び／又は共刺激分子由来の機能的なシグナル伝達ドメインを含む細胞質内シグナル伝達ドメイン（本明細書では「細胞内シグナル伝達ドメイン」とも称される）を少なくとも含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは、同じポリペプチド鎖中にある（例えば、キメラ融合タンパク質を含む）。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは、互いに連続していない、例えば、異なるポリペプチド鎖中にある。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは、互いに連続していない、例えば、異なるポリペプチド鎖中にある。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのセットは、二量体化分子の存在時に融合ポリペプチドを互いに結合することができ、例えば、抗原結合ドメインを細胞内シグナル伝達ドメインに結合することができる二量体化スイッチを含む。一態様では、刺激分子は、Ｔ細胞受容体複合体と会合されるゼータ鎖である。一態様では、細胞質内シグナル伝達ドメインは、一次シグナル伝達ドメイン（例えば、ＣＤ３−ゼータの一次シグナル伝達ドメイン）を含む。一態様では、細胞質内シグナル伝達ドメインは、下記で定義されるとおりの少なくとも１つの共刺激分子由来の１つ以上の機能的なシグナル伝達ドメインをさらに含む。一態様では、ＣＡＲの共刺激分子は、本明細書に記載される共刺激分子、例えば４−１ＢＢ（すなわちＣＤ１３７）、ＣＤ２７、ＩＣＯＳ及び／又はＣＤ２８から選択される。一態様では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン並びに刺激分子由来の機能的なシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ融合タンパク質を含む。一態様では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン並びに共刺激分子由来の機能的なシグナル伝達ドメイン及び刺激分子由来の機能的なシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ融合タンパク質を含む。一態様では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン並びに１つ以上の共刺激分子由来の２つの機能的なシグナル伝達ドメイン及び刺激分子由来の機能的なシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ融合タンパク質を含む。一態様では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン並びに１つ以上の共刺激分子由来の少なくとも２つの機能的なシグナル伝達ドメイン及び刺激分子由来の機能的なシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ融合タンパク質を含む。一態様では、ＣＡＲは、ＣＡＲ融合タンパク質のアミノ末端（Ｎ−ｔｅｒ）に任意選択のリーダー配列を含む。一態様では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメインのＮ末端でリーダー配列をさらに含み、ここで、リーダー配列は、細胞内プロセシング及び細胞膜へのＣＡＲの局在化中、抗原結合ドメイン（例えば、ｓｃＦｖ）から任意選択的に切断される。
【０３１０】
用語「癌」は、制御されていない異常な細胞の増殖によって特徴づられる疾患を指す。癌細胞は、局所的に又は血流及びリンパ系を介して体の他の部分に広がることができる。様々な癌の例は、本明細書に記載され、乳癌、前立腺癌、卵巣癌、子宮頸癌、皮膚癌、膵臓癌、結腸直腸癌、腎臓癌、肝臓癌、脳癌、リンパ腫、白血病、肺癌などが挙げられるが、これらに限定されない。用語「腫瘍」及び「癌」は、本明細書において互換的に使用され、例えば、両方の用語が、固形及び液性の、例えば、散在性又は循環性腫瘍を包含する。本明細書で使用する場合、用語「癌」又は「腫瘍」は、前癌性並びに悪性の癌及び腫瘍を含む。
【０３１１】
「ＣＡＲ分子」は、文脈に依存して、ＣＡＲ（例えば、ＣＡＲポリペプチド）、ＣＡＲをコードする核酸又は両方を指す。
【０３１２】
本明細書に記載されるものなどの特定の腫瘍抗原Ｘを標的化する抗原結合ドメイン（例えば、ｓｃＦｖ又はＴＣＲ）を含むＣＡＲは、ＸＣＡＲとも称される。例えば、ＣＤ１９又はＢＣＭＡを標的化する抗原結合ドメインを含むＣＡＲは、それぞれＣＤ１９ＣＡＲ又はＢＣＭＡＣＡＲと称される。
【０３１３】
本明細書で使用する場合、用語「ＢＣＭＡ」は、Ｂ細胞成熟抗原を指す。ＢＣＭＡ（ＴＮＦＲＳＦ１７、ＢＣＭ又はＣＤ２６９としても知られる）は、腫瘍壊死受容体（ＴＮＦＲ）ファミリーのメンバーであり、最終分化Ｂ細胞、例えば、メモリーＢ細胞及び形質細胞上で主に発現される。そのリガンドは、ＴＮＦファミリーのＢ細胞活性化因子（ＢＡＦＦ）及び増殖誘導リガンド（ＡＰＲＩＬ）と呼ばれる。ＢＣＭＡは、長期間の体液性免疫を維持するための形質細胞の生存の媒介に関与する。ＢＣＭＡに関する遺伝子は第１６染色体上にコードされ、１８４個のアミノ酸のタンパク質（ＮＰ＿００１１８３．２）をコードする９９４ヌクレオチド長の一次ｍＲＮＡ転写物（ＮＣＢＩ目録ＮＭ＿００１１９２．２）を生成する。ＢＣＭＡ座位に由来する第２のアンチセンス転写物が記載されており、これはＢＣＭＡ発現の制御において役割を果たし得る。（Ｌａａｂｉ  Ｙ．ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，１９９４，２２：１１４７−１１５４）。重要性が不明なさらなる転写物バリアントが記載されている（Ｓｍｉｒｎｏｖａ  ＡＳ  ｅｔ  ａｌ．Ｍｏｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．，２００８，４５（４）：１１７９−１１８３。ＴＶ４としても知られる第２のアイソフォームが同定されている（Ｕｎｉｐｒｏｔ識別子Ｑ０２２２３−２）。本明細書で使用する場合、「ＢＣＭＡ」は、全長野生型ＢＣＭＡの変異、例えば、点変異、断片、挿入、欠失及びスプライスバリアントを含むタンパク質を含む。
【０３１４】
本明細書で使用する場合、用語「ＣＤ１９」は、白血病前駆細胞上で検出可能な抗原決定基である表面抗原分類１９タンパク質を指す。ヒト及びマウスのアミノ酸及び核酸配列は、ＧｅｎＢａｎｋ、Ｕｎｉｐｒｏｔ及びＳｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔなどの公的データベースにおいて見出すことができる。例えば、ヒトＣＤ１９のアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ／Ｓｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔ受入番号Ｐ１５３９１として見出すことができ、ヒトＣＤ１９のヌクレオチド配列のコード化は、受入番号ＮＭ＿００１１７８０９８で見出すことができる。本明細書で使用する場合、「ＣＤ１９」は、全長野生型ＣＤ１９の変異、例えば、点変異、断片、挿入、欠失及びスプライスバリアントを含むタンパク質を含む。
【０３１５】
ＣＤ１９は、例えば、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ球白血病及び非ホジキンリンパ腫を含む大部分のＢ細胞系列癌上で発現される。ＣＤ１９を発現する他の細胞は、「ＣＤ１９の発現を伴う疾患」の定義において下に提供される。それは、Ｂ細胞前駆体の早期のマーカーでもある。例えば、Ｎｉｃｈｏｌｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎ．３４（１６−１７）：１１５７−１１６５（１９９７）を参照されたい。一態様では、ＣＡＲＴの抗原結合部分は、ＣＤ１９タンパク質の細胞外ドメイン内の抗原を認識し、それに結合する。一態様では、ＣＤ１９タンパク質は、癌細胞上に発現される。
【０３１６】
本明細書で使用する場合、用語「ＣＤ２０」は、Ｂ細胞上で検出可能であると知られる抗原決定基を指す。ヒトＣＤ２０は、膜貫通４ドメイン、サブファミリーＡ、メンバー１（ＭＳ４Ａ１）とも呼ばれる。ヒト及びマウスのアミノ酸及び核酸配列は、ＧｅｎＢａｎｋ、Ｕｎｉｐｒｏｔ及びＳｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔなどの公的データベースにおいて見出すことができる。例えば、ヒトＣＤ２０のアミノ酸配列は、受入番号ＮＰ＿６９０６０５．１及びＮＰ＿０６８７６９．２で見出すことができ、ヒトＣＤ２０の転写物バリアント１及び３をコードするヌクレオチド配列は、それぞれ受入番号ＮＭ＿１５２８６６．２及びＮＭ＿０２１９５０．３で見出すことができる。一態様では、ＣＡＲの抗原結合部分は、ＣＤ２０タンパク質の細胞外ドメイン内の抗原を認識し、それに結合する。一態様では、ＣＤ２０タンパク質は、癌細胞上に発現される。本明細書で使用する場合、「ＣＤ２０」は、全長野生型ＣＤ２０の変異、例えば、点変異、断片、挿入、欠失及びスプライスバリアントを含むタンパク質を含む。
【０３１７】
本明細書で使用する場合、用語「ＣＤ２２」は、白血病前駆細胞上で検出可能であると知られる抗原決定基を指す。ヒト及びマウスのアミノ酸及び核酸配列は、ＧｅｎＢａｎｋ、Ｕｎｉｐｒｏｔ及びＳｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔなどの公的データベースにおいて見出すことができる。例えば、アイソフォーム１〜５のヒトＣＤ２２のアミノ酸配列は、それぞれ受入番号ＮＰ  ００１７６２．２、ＮＰ  ００１１７２０２８．１、ＮＰ  ００１１７２０２９．１、ＮＰ  ００１１７２０３０．１及びＮＰ  ００１２６５３４６で見出され、ヒトＣＤ２２のバリアント１〜５をコードするヌクレオチド配列は、それぞれ受入番号ＮＭ  ００１７７１．３、ＮＭ  ００１１８５０９９．１、ＮＭ  ００１１８５１００．１、ＮＭ  ００１１８５１０１．１及びＮＭ  ００１２７８４１７．１で見出すことができる。一態様では、ＣＡＲの抗原結合部分は、ＣＤ２２タンパク質の細胞外ドメイン内の抗原を認識し、それに結合する。一態様では、ＣＤ２２タンパク質は、癌細胞上に発現される。本明細書で使用する場合、「ＣＤ２２」は、全長野生型ＣＤ２２の変異、例えば、点変異、断片、挿入、欠失及びスプライスバリアントを含むタンパク質を含む。
【０３１８】
本明細書で使用する場合、用語「ＣＤ１２３」は、一部の悪性血液癌、例えば、白血病細胞上で検出可能であると知られる抗原決定基を指す。ヒト及びマウスのアミノ酸及び核酸配列は、ＧｅｎＢａｎｋ、Ｕｎｉｐｒｏｔ及びＳｗｉｓｓ−Ｐｒｏｔなどの公的データベースにおいて見出すことができる。例えば、ヒトＣＤ１２３のアミノ酸配列は、受入番号ＮＰ＿００２１７４．１（アイソフォーム１前駆体）；ＮＰ＿００１２５４６４２．１（アイソフォーム２前駆体）で見出すことができ、それらをコードするｍＲＮＡ配列は、受入番号ＮＭ＿００２１８３．３（バリアント１）；ＮＭ＿００１２６７７１３．１（バリアント２）で見出すことができる。一態様では、ＣＡＲの抗原結合部分は、ＣＤ１２３タンパク質の細胞外ドメイン内の抗原を認識し、それに結合する。一態様では、ＣＤ１２３タンパク質は、癌細胞上に発現される。本明細書で使用する場合、「ＣＤ１２３」は、全長野生型ＣＤ１２３の変異、例えば、点変異、断片、挿入、欠失及びスプライスバリアントを含むタンパク質を含む。
【０３１９】
抗体又はその抗体断片を含むＣＡＲの部分は、様々な形態において存在し得、抗原結合ドメインは、例えば、単一ドメイン抗体断片（ｓｄＡｂ）、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）、ヒト化抗体又は二重特異性抗体を含む連続的なポリペプチド鎖の一部として発現される（Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，１９９９，Ｉｎ：Ｕｓｉｎｇ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ；Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９，Ｉｎ：Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ；  Ｈｏｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：５８７９−５８８３；Ｂｉｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４２：４２３−４２６）。一態様では、本発明のＣＡＲ組成物の抗原結合ドメインは、抗体断片を含む。さらなる態様では、ＣＡＲは、ｓｃＦｖを含む抗体断片を含む。
【０３２０】
用語「同族抗原分子」は、本明細書に記載される任意の抗原を指す。一実施形態では、それは、ＣＡＲ分子、例えば、本明細書に記載される任意のＣＡＲによって認識される、例えば、標的化される抗原を指す。別の実施形態では、それは、本明細書に記載される癌関連抗原を指す。一実施形態では、同族抗原分子は組換え分子である。
【０３２１】
用語「保存的配列改変」は、アミノ酸配列を含有する抗体若しくは抗体断片の結合特性に実質的に影響しないか又はそれを変化させないアミノ酸改変を指す。このような保存的改変としては、アミノ酸の置換、付加及び欠失が挙げられる。改変は、当技術分野で知られる標準技術、例えば部位特異的変異誘発及びＰＣＲによる変異誘発により本発明の抗体又は抗体断片に導入され得る。保存的アミノ酸置換は、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基と置換される置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは当技術分野で定義されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン、トリプトファン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン）、β分岐側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）及び芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が挙げられる。したがって、本明細書に記載される目的のポリペプチド（例えば、ＣＡＲ）内の１つ以上のアミノ酸残基は、同一の側鎖ファミリー由来の他のアミノ酸残基と置換することができ、且つ改変された目的のポリペプチド（例えば、ＣＡＲ）は、本明細書に記載される機能性アッセイを使用して試験することができる。
【０３２２】
用語「共刺激分子」は、共刺激リガンドと特異的に結合し、それにより、限定されないが、増殖などのＴ細胞による共刺激応答を媒介するＴ細胞上の同族の結合パートナーを指す。共刺激分子は、抗原受容体以外の細胞表面分子又は効率的な免疫応答に必要とされるそれらのリガンドである。共刺激分子としては、ＭＨＣクラスＩ分子、ＴＮＦ受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ性活性化分子（ＳＬＡＭタンパク質）、活性化ＮＫ細胞受容体、ＢＬＴＡ、トールリガンド受容体、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ７、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１（ＣＤ１１ａ／ＣＤ１８）、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、Ｂ７−Ｈ３、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）、ＧＩＴＲ、ＢＡＦＦＲ、ＬＩＧＨＴ、ＨＶＥＭ（ＬＩＧＨＴＲ）、ＫＩＲＤＳ２、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０（ＫＬＲＦ１）、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４６、ＣＤ１９、ＣＤ４、ＣＤ８アルファ、ＣＤ８ベータ、ＩＬ２Ｒベータ、ＩＬ２Ｒガンマ、ＩＬ７Ｒアルファ、ＩＴＧＡ４、ＶＬＡ１、ＣＤ４９ａ、ＩＴＧＡ４、ＩＡ４、ＣＤ４９Ｄ、ＩＴＧＡ６、ＶＬＡ−６、ＣＤ４９ｆ、ＩＴＧＡＤ、ＣＤ１１ｄ、ＩＴＧＡＥ、ＣＤ１０３、ＩＴＧＡＬ、ＣＤ１１ａ、ＬＦＡ−１、ＩＴＧＡＭ、ＣＤ１１ｂ、ＩＴＧＡＸ、ＣＤ１１ｃ、ＩＴＧＢ１、ＣＤ２９、ＩＴＧＢ２、ＣＤ１８、ＬＦＡ−１、ＩＴＧＢ７、ＮＫＧ２Ｄ、ＮＫＧ２Ｃ、ＴＮＦＲ２、ＴＲＡＮＣＥ／ＲＡＮＫＬ、ＤＮＡＭ１（ＣＤ２２６）、ＳＬＡＭＦ４（ＣＤ２４４、２Ｂ４）、ＣＤ８４、ＣＤ９６（Ｔａｃｔｉｌｅ）、ＣＥＡＣＡＭ１、ＣＲＴＡＭ、Ｌｙ９（ＣＤ２２９）、ＣＤ１６０（ＢＹ５５）、ＰＳＧＬ１、ＣＤ１００（ＳＥＭＡ４Ｄ）、ＣＤ６９、ＳＬＡＭＦ６（ＮＴＢ−Ａ、Ｌｙ１０８）、ＳＬＡＭ（ＳＬＡＭＦ１、ＣＤ１５０、ＩＰＯ−３）、ＢＬＡＭＥ（ＳＬＡＭＦ８）、ＳＥＬＰＬＧ（ＣＤ１６２）、ＬＴＢＲ、ＬＡＴ、ＧＡＤＳ、ＳＬＰ−７６、ＰＡＧ／Ｃｂｐ、ＣＤ１９ａ及びＣＤ８３と特異的に結合するリガンドが挙げられるが、これらに限定されない。共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激分子の細胞内部分を指す。細胞内シグナル伝達ドメインは、それが由来する分子の全体の細胞内部分若しくは全体の天然の細胞内シグナル伝達ドメイン又はその機能性断片を含み得る。細胞内シグナル伝達ドメインは、それが由来する分子の全体の細胞内部分若しくは全体の天然の細胞内シグナル伝達ドメイン又はその機能性断片を含み得る。
【０３２３】
「に由来する」は、その用語が本明細書で使用される場合、第１の分子と第２の分子の間の関係性を示す。それは一般に、第１の分子と第２の分子の間の構造的類似性を指し、第２の分子に由来する第１の分子におけるプロセス又は源の限定を暗示又は包含しない。例えば、ＣＤ３ゼータ分子に由来する細胞内シグナル伝達ドメインの場合において、細胞内シグナル伝達ドメインは、必要な機能、すなわち、適切な条件下でシグナルを生成する能力を有するように十分なＣＤ３ゼータ構造を保持する。それは、細胞内シグナル伝達ドメインを生成する特定のプロセスの限定を暗示又は包含せず、例えば、それは、細胞内シグナル伝達ドメインを提供するために、ＣＤ３ゼータ配列から出発し、細胞内シグナル伝達ドメインに到達するために不必要な配列を除去するか又は変異を課さなければならないことを意味しない。
【０３２４】
本明細書に記載されるとおりの語句「腫瘍抗原の発現を伴う疾患」としては、本明細書に記載されるとおりの腫瘍抗原の発現を伴う疾患又は本明細書に記載されるとおりの腫瘍抗原を発現する細胞を伴う状態、例えば、癌若しくは悪性腫瘍又は骨髄形成異常、骨髄異形成症候群若しくは前白血病などの前癌性状態などの増殖性疾患；又は本明細書に記載される腫瘍抗原を発現する細胞を伴う非癌性の関連徴候が挙げられるが、これらに限定されない。一実施形態では、本明細書に記載されるとおりの腫瘍抗原の発現を伴う癌は、血液癌である。一実施形態では、本明細書に記載されるとおりの腫瘍抗原の発現を伴う癌は、固形癌である。本明細書に記載されるとおりの腫瘍抗原の発現を伴うさらなる疾患としては、例えば、本明細書に記載されるとおりの非定型及び／又は非古典的癌、悪性腫瘍、前癌状態又は腫瘍抗原の発現を伴う増殖性疾患が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書に記載されるとおりの腫瘍抗原の発現を伴う非癌関連徴候としては、例えば、自己免疫疾患（例えば、ループス）、炎症性障害（アレルギー及び喘息）及び移植が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原発現細胞は、腫瘍抗原をコードするｍＲＮＡを発現するか又は随時発現した。ある実施形態では、腫瘍抗原発現細胞は、腫瘍抗原タンパク質（例えば、野生型又は変異体）を産生し、腫瘍抗原タンパク質は、通常のレベル又は低下したレベルで存在し得る。ある実施形態では、腫瘍抗原発現細胞は、ある時点で検出可能なレベルの腫瘍抗原タンパク質を産生し、その後、実質的に検出可能な腫瘍抗原タンパク質を産生しなかった。
【０３２５】
語句「ＣＤ１９の発現を伴う疾患」としては、ＣＤ１９（例えば、野生型又は変異体ＣＤ１９）を発現する細胞を伴う疾患又はＣＤ１９（例えば、野生型又は変異体ＣＤ１９）を発現するか又は随時発現した細胞を伴う状態、例えば、癌若しくは悪性腫瘍又は骨髄形成異常、骨髄異形成症候群若しくは前白血病などの前癌性状態などの増殖性疾患；又はＣＤ１９を発現する細胞を伴う非癌性の関連徴候が挙げられるが、これらに限定されない。疑義を回避するために述べると、ＣＤ１９の発現を伴う疾患は、例えば、ＣＤ１９を標的化する分子、例えば、ＣＤ１９  ＣＡＲによる治療のために、ＣＤ１９の発現が下方制御されたために、目下ＣＤ１９を発現しないが、一度はＣＤ１９を発現した細胞を伴う状態を含み得る。一態様では、ＣＤ１９の発現を伴う癌は、血液癌である。一態様では、血液癌は、白血病又はリンパ腫である。一態様では、ＣＤ１９の発現を伴う癌としては、例えば、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、Ｂ細胞急性リンパ性白血病（ＢＡＬＬ）、Ｔ細胞急性リンパ性白血病（ＴＡＬＬ）、急性リンパ性白血病（ＡＬＬ）を含むが、これらに限定されない１つ以上の急性白血病；例えば、慢性骨髄性白血病（ＣＭＬ）、慢性リンパ性白血病（ＣＬＬ）を含むが、これらに限定されない１つ以上の慢性白血病を含むが、これらに限定されない癌及び悪性腫瘍が挙げられる。ＣＤ１９の発現を伴うさらなる癌又は血液学的状態は、例えば、Ｂ細胞前リンパ性白血病、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍、バーキットリンパ腫、びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリーセル白血病、小細胞型又は大細胞型濾胞性リンパ腫、悪性のリンパ球増殖性状態、ＭＡＬＴリンパ腫、マントル細胞リンパ腫（ＭＣＬ）、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄形成異常及び骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、形質芽球性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞腫瘍、ワルデンストレーム高ガンマグロブリン血症、骨髄増殖性腫瘍；組織球性障害（例えば、マスト細胞障害又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍）；マスト細胞障害、例えば、全身性マスト細胞症又はマスト細胞白血病；Ｂ細胞前リンパ性白血病、形質細胞性骨髄腫及び骨髄血液細胞の無効な産生（形成異常）によってまとめられる血液学的状態の多様な集合である「前白血病」などを含むが、これらに限定されない。
【０３２６】
ＣＤ１９発現の発現を伴うさらなる疾患としては、例えば、非定型及び／又は非古典的癌、悪性腫瘍、前癌状態又はＣＤ１９の発現を伴う増殖性疾患が挙げられるが、これらに限定されない。ＣＤ１９の発現を伴う非癌関連徴候としては、例えば、自己免疫疾患（例えば、ループス）、炎症性障害（アレルギー及び喘息）及び移植が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ＣＤ１９発現細胞は、ＣＤ１９  ｍＲＮＡを発現するか又は随時発現した。ある実施形態では、ＣＤ１９発現細胞は、ＣＤ１９タンパク質（例えば、野生型又は変異体）を産生し、ＣＤ１９タンパク質は、通常のレベル又は低下したレベルで存在し得る。ある実施形態では、ＣＤ１９発現細胞は、ある時点で検出可能なレベルのＣＤ１９タンパク質を産生し、その後、実質的に検出可能なＣＤ１９タンパク質を産生しなかった。
【０３２７】
いくつかの実施形態では、腫瘍抗原発現細胞は、腫瘍抗原をコードするｍＲＮＡを発現するか又は随時発現した。ある実施形態では、腫瘍抗原発現細胞は、腫瘍抗原タンパク質（例えば、野生型又は変異体）を産生し、腫瘍抗原タンパク質は、通常のレベル又は低下したレベルで存在し得る。ある実施形態では、腫瘍抗原発現細胞は、ある時点で検出可能なレベルの腫瘍抗原タンパク質を産生し、その後、実質的に検出可能な腫瘍抗原タンパク質を産生しなかった。他の実施形態では、疾患は、ＣＤ１９陰性癌、例えば、ＣＤ１９陰性再発性癌である。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原（例えば、ＣＤ１９）発現細胞は、腫瘍抗原をコードするｍＲＮＡを発現するか又は随時発現した。ある実施形態では、腫瘍抗原（例えば、ＣＤ１９）発現細胞は、腫瘍抗原タンパク質（例えば、野生型又は変異体）を産生し、腫瘍抗原タンパク質は、通常のレベル又は低下したレベルで存在し得る。ある実施形態では、腫瘍抗原（例えば、ＣＤ１９）発現細胞は、ある時点で検出可能なレベルの腫瘍抗原タンパク質を産生し、その後、実質的に検出可能な腫瘍抗原タンパク質を産生しなかった。
【０３２８】
用語「エフェクター機能」は、特殊化された細胞の機能を指す。Ｔ細胞のエフェクター機能は、例えば、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性又はヘルパー活性であり得る。用語「コードする」は、ヌクレオチド（例えば、ｒＲＮＡ、ｔＲＮＡ及びｍＲＮＡ）の規定の配列又はアミノ酸の規定の配列のいずれかを有する、生物学的プロセスにおける他のポリマー及び巨大分子の合成のための鋳型として機能する、遺伝子、ｃＤＮＡ又はｍＲＮＡなどのポリヌクレオチド中のヌクレオチドの特定の配列の固有の特性及びそれにより生じる生物学的特性を指す。したがって、遺伝子、ｃＤＮＡ又はＲＮＡは、細胞又は他の生物系中で、その遺伝子に対応するｍＲＮＡの転写及び翻訳によりタンパク質が産生される場合、タンパク質をコードする。ヌクレオチド配列がｍＲＮＡ配列と同一であり、通常、配列表において提供されるコード鎖及び遺伝子又はｃＤＮＡの転写のための鋳型として使用される非コード鎖は両方ともに、その遺伝子又はｃＤＮＡのタンパク質又は他の生成物をコードするものとして参照され得る。
【０３２９】
用語「内因性」は、生物体、細胞、組織又は系の内部に由来するか又はその内部で産生される任意の物質を指す。
【０３３０】
用語「外因性」は、生物体、細胞、組織又は系の外部から導入されるか又はその外部で産生される任意の物質を指す。
【０３３１】
用語「発現」は、プロモーターによって駆動される特定のヌクレオチド配列の転写及び／又は翻訳を指す。
【０３３２】
用語「４−１ＢＢ」は、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．ＡＡＡ６２４７８．２又は例えばマウス、齧歯類、サル、類人猿などの非ヒト種に由来する同等の残基として提供されるアミノ酸配列を有するＴＮＦＲスーパーファミリーのメンバーを指し；及び「４−１ＢＢ共刺激ドメイン」は、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．ＡＡＡ６２４７８．２のアミノ酸残基２１４〜２５５又は例えばマウス、齧歯類、サル、類人猿などの非ヒト種に由来する同等の残基として定義される。一態様では、「４−１ＢＢ共刺激ドメイン」は、配列番号１５８として提供される配列又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、類人猿などに由来する同等の残基である。
【０３３３】
用語「発現ベクター」は、発現されることになるヌクレオチド配列に作動可能に連結された発現制御配列を含む組換えポリヌクレオチドを含むベクターを指す。発現ベクターは、発現のための十分なシスエレメントを含み；発現のための他のエレメントは、宿主細胞によって又はインビトロ発現系において供給され得る。発現ベクターは、組換えポリヌクレオチドを組み込むコスミド、プラスミド（例えば、ネイキッド又はリポソーム中に含有される）及びウイルス（例えば、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルス）を含む、当技術分野で知られる全てのものを含む。
【０３３４】
用語「相同」又は「同一性」は、２つのポリマー分子間、例えば、２つの核酸分子間、例えば、２つのＤＮＡ分子又は２つのＲＮＡ分子間又は２つのポリペプチド分子間のサブユニット配列の同一性を指す。２つの分子の両方におけるサブユニットの位置が同じモノマーのサブユニットで占められている場合、例えば、２つのＤＮＡ分子それぞれにおける位置がアデニンで占められている場合、それらは、その位置において相同又は同一である。２つの配列間の相同性は、マッチした位置又は相同な位置の数の一次関数であり、例えば、２つの配列中の位置の半分（例えば、ポリマーの長さが１０個のサブユニット中の５個の位置）が相同である場合、２つの配列は５０％相同であり、位置の９０％（例えば、１０個のうち９個）がマッチしているか又は相同である場合、２つの配列は９０％相同である。
【０３３５】
本発明の組成物及び方法は、指定された配列又はそれに対して実質的に同一若しくは類似した配列、例えば、指定された配列と少なくとも８５％、９０％、９５％以上同一な配列を有するポリペプチド及び核酸を包含する。アミノ酸配列に関連して、用語「実質的に同一」は、第１及び第２のアミノ酸配列が共通の構造ドメイン及び／又は共通の機能的活性を有し得るように、第２のアミノ酸配列とｉ）同一又はｉｉ）整列されたアミノ酸残基の保存的置換である十分又は最小数のアミノ酸残基を含有する、第１のアミノ酸を指すために本明細書で使用される。例えば、参照配列、例えば本明細書で提供される配列と少なくとも約８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有する共通の構造ドメインを含有するアミノ酸配列である。
【０３３６】
ヌクレオチド配列に関連して、用語「実質的に同一」は、第１及び第２のヌクレオチド配列が共通の機能活性を有するポリペプチドをコードするか、又は共通の構造的ポリペプチドドメイン若しくは共通の機能的ポリペプチド活性をコードするように、第２のヌクレオチド配列において整列されたヌクレオチドと同一である十分又は最小数のヌクレオチドを含有する第１の核酸配列を指すために本明細書で使用される。例えば、参照配列、例えば本明細書で提供される配列と少なくとも約８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％の同一性を有するヌクレオチド配列である。
【０３３７】
用語「変異体」は、天然に存在する配列と実質的に同一なアミノ酸配列を有するか、又は実質的に同一なヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドを指す。いくつかの実施形態では、変異体は、機能的変異体である。
【０３３８】
用語「機能的変異体」は、天然に存在する配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、又は実質的に同一のヌクレオチド配列によってコードされ、且つ天然に存在する配列の１つ以上の活性を有することができるポリペプチドを指す。
【０３３９】
配列Ｘの用語「ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合変異体」は、（１）配列Ｘと実質的に同一なアミノ酸配列を有し、且つ（２）ＣＯＦ１に結合し、ＣＯＦ１とＣＲＢＮの複合体に結合するか、又はＣＯＦ１の存在下でＣＲＢＮに結合するポリペプチドを指す。
【０３４０】
配列Ｘの用語「ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合変異体」は、（１）配列Ｘと実質的に同一なアミノ酸配列を有し、且つ（２）ＣＯＦ２に結合し、ＣＯＦ２とＣＲＢＮの複合体に結合するか、又はＣＯＦ２の存在下でＣＲＢＮに結合するポリペプチドを指す。
【０３４１】
配列Ｘの用語「ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合変異体」は、（１）配列Ｘと実質的に同一なアミノ酸配列を有し、且つ（２）ＣＯＦ３に結合し、ＣＯＦ３とＣＲＢＮの複合体に結合するか、又はＣＯＦ３の存在下でＣＲＢＮに結合するポリペプチドを指す。
【０３４２】
「免疫エフェクター細胞」は、その用語が本明細書で使用される場合、免疫応答、例えば免疫エフェクター応答の促進に関与する細胞を指す。免疫エフェクター細胞の例としては、Ｔ細胞、例えばアルファ／ベータＴ細胞及びガンマ／デルタＴ細胞、Ｂ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、マスト細胞及び骨髄由来貪食細胞が挙げられる。
【０３４３】
「免疫エフェクター機能又は免疫エフェクター応答」は、その用語が本明細書で使用される場合、例えば、標的細胞の免疫攻撃を増強又は促進する免疫エフェクター細胞の機能又は応答を指す。例えば、免疫エフェクター機能又は応答は、標的細胞の殺傷又は標的細胞の成長若しくは増殖の阻害を促進するＴ又はＮＫ細胞の特性を指す。Ｔ細胞の場合、一次刺激及び共刺激が免疫エフェクター機能又は応答の例である。
【０３４４】
用語「阻害」又は「阻害剤」は、特定のパラメーター、例えば、所与の分子、例えば、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ１０、ＣＤ２２、ＣＤ３４、ＣＤ１２３、ＦＬＴ−３、ＲＯＲ１、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ１７９ｂ、メソセリン又はＣＤ７９ａの活性の低下を含む。例えば、活性、例えば、ＣＤ２０、ＣＤ１０、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ３４、ＣＤ１２３、ＦＬＴ−３、ＲＯＲ１、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ１７９ｂ、メソセリン又はＣＤ７９ａの活性の少なくとも５％、１０％、２０％、３０％、４０％以上の阻害が、この用語によって含まれる。このように、阻害は１００％である必要はない。阻害剤に関する活性は、本明細書に記載されるとおり又は当技術分野において知られるアッセイによって決定され得る。
【０３４５】
「細胞内シグナル伝達ドメイン」は、この用語が本明細書で使用される場合、分子の細胞内部分を指す。細胞内シグナル伝達ドメインは、ＣＡＲ含有細胞、例えばＣＡＲＴ細胞の免疫エフェクター機能を促進するシグナルを生成することができる。例えば、ＣＡＲＴ細胞における免疫エフェクター機能の例としては、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性及びヘルパー活性が挙げられる。実施形態において、細胞内シグナル伝達ドメインは、エフェクター機能シグナルを伝達し、且つ細胞を特殊化された機能を発揮するように方向づけるタンパク質の部分である。細胞内シグナル伝達ドメインの全体が利用され得るが、多くの場合、全体の鎖を使用する必要はない。細胞内シグナル伝達ドメインのトランケートされた部分が使用される範囲で、そのようなトランケートされた部分は、エフェクター機能シグナルを伝達する限り、無傷の鎖の代わりに使用され得る。したがって、細胞内シグナル伝達ドメインという用語は、エフェクター機能シグナルを伝達するのに十分な細胞内シグナル伝達ドメインのいずれかのトランケートされた部分を含むものとする。
【０３４６】
ある実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、一次細胞内シグナル伝達ドメインを含み得る。例示的な一次細胞内シグナル伝達ドメインとしては、一次刺激又は抗原依存的刺激に関与する分子に由来するものが挙げられる。ある実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激細胞内ドメインを含み得る。例示的な共刺激細胞内シグナル伝達ドメインとしては、共刺激シグナル又は抗原依存的刺激に関与する分子に由来するものが挙げられる。例えば、ＣＡＲＴの場合、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、Ｔ細胞受容体の細胞質内配列を含み得、且つ共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共受容体又は共刺激分子由来の細胞質内配列を含み得る。
【０３４７】
一次細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシン系活性化モチーフ又はＩＴＡＭとしても知られるシグナル伝達モチーフを含み得る。一次細胞質内シグナル伝達配列を含有するＩＴＡＭの例としては、ＣＤ３ゼータ、ＦｃＲガンマ、ＦｃＲベータ、ＣＤ３ガンマ、ＣＤ３デルタ、ＣＤ３イプシロン、ＣＤ５、ＣＤ２２、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＣＤ２７８（「ＩＣＯＳ」）、ＦｃεＲＩ、ＣＤ６６ｄ、ＣＤ３２、ＤＡＰ１０及びＤＡＰ１２に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３４８】
用語「単離された」は、天然の状態から改変されたか又は取り出された状態を意味する。例えば、生存している動物内に天然に存在する核酸又はペプチドは、「単離されて」いないが、その天然の状態の共存物質から部分的に又は完全に分離された同じ核酸又はペプチドは、「単離されている」。単離された核酸又はタンパク質は、実質的に精製された形態で存在することができるか、又は例えば宿主細胞などの非天然環境において存在することができる。
【０３４９】
本明細書で使用する場合、用語「メソセリン」は、４０ｋＤａのタンパク質であるメソセリンを指し、これは、グリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）結合及び巨核球（ｍｅｇｋａｒｙｏｃｙｔｅ）増強因子（ＭＰＦ）と呼ばれるアミノ末端の３１ｋＤａの取り除かれる断片によって細胞膜で固定される。両方の断片が、Ｎ−グリコシル化部位を含有する。本用語は、「可溶性メソセリン／ＭＰＦ関連」とも呼ばれる４０ｋＤａのカルボキシ末端断片の可溶性スプライスバリアントも指す。好ましくは、本用語は、例えば、細胞膜、例えば癌細胞膜上で発現されるＧｅｎＢａｎｋ受入番号ＡＡＨ０３５１２．１のヒトメソセリン及び自然に切断されるその部分を指す。本明細書で使用する場合、「メソセリン」は、全長野生型メソセリンの変異、例えば、点変異、断片、挿入、欠失及びスプライスバリアントを含むタンパク質を含む。
【０３５０】
別段の指定がない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」は、互いの縮重バージョンであり、且つ同じアミノ酸配列をコードする全てのヌクレオチド配列を含む。タンパク質又はＲＮＡをコードするヌクレオチド配列という語句は、タンパク質をコードするヌクレオチド配列が、いくつかのバージョンにおいて、イントロンを含有し得る範囲までイントロンも含み得る。
【０３５１】
本発明に関連して、一般に存在する核酸塩基に関する以下の略語が使用される。「Ａ」はアデノシンを指し、「Ｃ」はシトシンを指し、「Ｇ」はグアノシンを指し、「Ｔ」はチミジンを指し、「Ｕ」はウリジンを指す。
【０３５２】
用語「核酸」又は「ポリヌクレオチド」は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）若しくはリボ核酸（ＲＮＡ）又はそのＤＮＡ若しくはＲＮＡの組合せ及び一本鎖又は二本鎖形態のいずれかのそのポリマーを指す。用語「核酸」は、遺伝子、ｃＤＮＡ又はｍＲＮＡを含む。一実施形態では、核酸分子は、合成的（例えば、化学的に合成される）又は組換え体である。特に限定しない限り、本用語は、参照核酸と同様の結合特性を有し、天然に存在するヌクレオチドと同様の様式で代謝される、天然ヌクレオチドの類似体又は誘導体を含有する核酸を包含する。別段の指示がない限り、特定の核酸配列は、明示的に示される配列だけでなく、保存的に改変されたその変異体（例えば、縮重コドン置換）、アレル、オルソログ、ＳＮＰ及び相補的配列も暗示的に包含する。とりわけ、縮重コドン置換は、１つ以上の選択された（又は全ての）コドンの第３位が、混合塩基及び／又はデオキシイノシン残基で置換された配列を作製することによって実現し得る（Ｂａｔｚｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．１９：５０８１（１９９１）；Ｏｈｔｓｕｋａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６０：２６０５−２６０８（１９８５）；及びＲｏｓｓｏｌｉｎｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ．Ｐｒｏｂｅｓ  ８：９１−９８（１９９４））。
【０３５３】
用語「ペプチド」、「ポリペプチド」及び「タンパク質」は、互換的に使用され、ペプチド結合によって共有結合されたアミノ酸残基で構成される化合物を指す。タンパク質又はペプチドは少なくとも２つのアミノ酸を含有しなければならず、タンパク質又はペプチドの配列を含み得るアミノ酸数の最大数に制限はない。ポリペプチドは、互いにペプチド結合により連結した２つ以上のアミノ酸を含むあらゆるペプチド又はタンパク質を含む。本明細書で使用する場合、本用語は、例えば、当技術分野で一般にペプチド、オリゴペプチド及びオリゴマーと呼ばれる短鎖並びに当技術分野で一般にタンパク質と呼ばれ、多くの種類が存在する長鎖の両方を指す。「ポリペプチド」は、とりわけ、例えば、生物学的に活性な断片、実質的に相同のポリペプチド、オリゴペプチド、ホモ二量体、ヘテロ二量体、ポリペプチドの変異体、修飾ポリペプチド、誘導体、類似体、融合タンパク質を含む。ポリペプチドは天然ペプチド、組換えペプチド又はこれらの組合せを含む。
【０３５４】
用語「作動可能に連結された」又は「転写制御」は、制御配列と異種核酸配列との間の後者の発現をもたらす機能的連結を指す。例えば、第１の核酸配列は、第１の核酸配列が第２の核酸配列と機能的な関係に置かれるとき、第２の核酸配列と作動可能に連結されている。例えば、プロモーターは、プロモーターがコード配列の転写又は発現に影響を及ぼす場合にコード配列と作動可能に連結されている。作動可能に連結されたＤＮＡ配列は、互いに連続し得、例えば２つのタンパク質のコード領域を結合するために必要な場合、同じ読み枠内にある。
【０３５５】
免疫原性組成物の用語「非経口」投与としては、例えば、皮下（ｓ．ｃ．）、静脈内（ｉ．ｖ．）、筋肉内（ｉ．ｍ．）若しくは胸骨内注射、腫瘍内又は注入技術が挙げられる。
【０３５６】
用語「プロモーター」は、ポリヌクレオチド配列の特定の転写を開始するために必要な、細胞の合成装置又は導入された合成装置によって認識されるＤＮＡ配列を指す。
【０３５７】
用語「プロモーター／制御配列」は、プロモーター／制御配列に作動可能に連結された遺伝子産物の発現に必要とされる核酸配列を指す。いくつかの場合、この配列は、コアプロモーター配列である場合があり、他の場合、この配列は、遺伝子産物の発現に必要とされるエンハンサー配列及び他の調節エレメントも含む場合がある。プロモーター／制御配列は、例えば、組織特異的様式において遺伝子産物を発現するものであり得る。
【０３５８】
用語「シグナル伝達ドメイン」は、二次メッセンジャーの生成により又はこのようなメッセンジャーに応答することによってエフェクターとして機能することにより、規定されたシグナル伝達経路を経て細胞活性を制御するために、細胞内で情報を伝達することにより作用するタンパク質の機能性部分を指す。
【０３５９】
用語「ｓｃＦｖ」は、軽鎖の可変領域を含む少なくとも１つの抗体断片と重鎖の可変領域を含む少なくとも１つの抗体断片とを含む融合タンパク質を指し、軽鎖可変領域と重鎖可変領域は、例えば合成リンカー、例えば短いフレキシブルポリペプチドリンカーを介し隣接して結合され、且つ一本鎖ポリペプチドとして発現することが可能であり、ｓｃＦｖは、それが由来するインタクト抗体の特異性を保持する。指定がない限り、本明細書で使用する場合、ｓｃＦｖは、ＶＬ及びＶＨ可変領域を次のいずれかの順序で有し得、例えば、融合ポリペプチドのＮ末端及びＣ末端に対して、ｓｃＦｖはＶＬ−リンカー−ＶＨを含み得るか、又はＶＨ−リンカー−ＶＬを含み得る。
【０３６０】
抗体又はその抗体断片を含むＣＡＲの部分は、様々な形態において存在し得、抗原結合ドメインは、例えば、単一ドメイン抗体断片（ｓｄＡｂ）、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）及びヒト化抗体を含む連続的なポリペプチド鎖の一部として発現される（Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，１９９９，Ｉｎ：Ｕｓｉｎｇ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ；Ｈａｒｌｏｗ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９，Ｉｎ：Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ；  Ｈｏｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：５８７９−５８８３；Ｂｉｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ  ２４２：４２３−４２６）。一実施形態では、ＣＡＲの抗原結合ドメインは、抗体断片を含む。さらなる実施形態では、ＣＡＲは、ｓｃＦｖを含む抗体断片を含む。本明細書で使用する場合、用語「結合ドメイン」又は「抗体分子」は、タンパク質、例えば少なくとも１つの免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む免疫グロブリン鎖又はその断片を指す。用語「結合ドメイン」又は「抗体分子」は、抗体及び抗体断片を包含する。ある実施形態では、抗体分子は、多重特異性抗体分子であり、例えば、それは、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、その複数のうちの第１の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第１のエピトープに対する結合特異性を有し、その複数のうちの第２の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第２のエピトープに対する結合特異性を有する。ある実施形態では、多重特異性抗体分子は、二重特異性抗体分子である。二重特異性抗体は、２つ以下の抗原に対する特異性を有する。二重特異性抗体分子は、第１のエピトープに対する結合特異性を有する第１の免疫グロブリン可変ドメイン配列及び第２のエピトープに対する結合特異性を有する第２の免疫グロブリン可変ドメイン配列によって特徴付けられる。
【０３６１】
用語「刺激」は、刺激分子（例えば、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体又はＣＡＲ）とその同族リガンド（例えば、抗原分子）の結合により、限定はされないが、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体を介するシグナル伝達又は適切なＮＫ受容体若しくはＣＡＲのシグナル伝達ドメインを介するシグナル伝達などのシグナル伝達現象を媒介することによって誘導される一次応答を指す。刺激は、特定の分子の改変された発現を媒介することができる。
【０３６２】
用語「刺激分子」は、免疫細胞（例えば、Ｔ細胞、ＮＫ細胞、Ｂ細胞）によって発現される分子を指し、この分子は、免疫細胞シグナル伝達経路の少なくとも一部の態様に対して刺激性の様式で免疫細胞の活性化を制御する細胞質内シグナル伝達配列を提供する。一態様では、シグナルは、例えば、ペプチドを担持したＭＨＣ分子とＴＣＲ／ＣＤ３複合体との結合によって開始され、増殖、活性化、分化などを含むがこれらに限定されないＴ細胞応答の媒介をもたらす一次シグナルである。刺激性の様式において作用する一次細胞内シグナル伝達配列（「一次シグナル伝達ドメイン」とも称される）は、免疫受容体チロシン系活性化モチーフ又はＩＴＡＭとして知られるシグナル伝達モチーフを含有し得る。本発明において特に有用な細胞質内シグナル伝達配列を含有するＩＴＡＭの例としては、ＣＤ３ゼータ、共通のＦｃＲガンマ（ＦＣＥＲ１Ｇ）、ＦｃガンマＲＩＩａ、ＦｃＲベータ（ＦｃイプシロンＲ１ｂ）、ＣＤ３ガンマ、ＣＤ３デルタ、ＣＤ３イプシロン、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂ、ＤＡＰ１０及びＤＡＰ１２に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない。本発明の特定のＣＡＲにおいて、本発明の任意の１つ以上のＣＡＲＳ中の細胞内シグナル伝達ドメインは、細胞内シグナル伝達配列、例えば、ＣＤ３−ゼータの一次シグナル伝達配列を含む。本発明の特定のＣＡＲにおいて、ＣＤ３−ゼータの一次シグナル伝達配列は、配列番号１６３として提供される配列、又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、類人猿などに由来する同等の残基である。本発明の特定のＣＡＲにおいて、ＣＤ３−ゼータの一次シグナル伝達配列は、配列番号１６６として提供される配列、又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、類人猿などに由来する同等の残基である。
【０３６３】
用語「トランファーベクター」は、単離された核酸を含み且つ細胞の内部に単離された核酸を送達するために使用され得る物質の組成物を指す。線状ポリヌクレオチド、イオン性又は両親媒性化合物と結合したポリヌクレオチド、プラスミド及びウイルスを含むが、これらに限定されない多数のベクターが当技術分野で知られている。したがって、用語「トランスファーベクター」は、自律的に複製するプラスミド又はウイルスを含む。本用語は、細胞への核酸の移送を容易にする非プラスミド及び非ウイルス化合物、例えば、ポリリジン化合物、リポソームなどをさらに含むようにも解釈されるべきである。ウイルストランスファーベクターの例としては、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクターなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３６４】
用語「ゼータ」又は代わりに「ゼータ鎖」、「ＣＤ３−ゼータ」若しくは「ＴＣＲ−ゼータ」は、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．ＢＡＧ３６６６４．１又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、類人猿などに由来する同等の残基として提供されるタンパク質として定義され、また「ゼータ刺激ドメイン」又は代わりに「ＣＤ３−ゼータ刺激ドメイン」若しくは「ＴＣＲ−ゼータ刺激ドメイン」は、Ｔ細胞活性化に必要な最初のシグナルを機能的に伝達するのに十分なゼータ鎖の細胞質内ドメインに由来するアミノ酸残基として定義される。一態様では、ゼータの細胞質内ドメインは、ＧｅｎＢａｎｋ  Ａｃｃ．Ｎｏ．ＢＡＧ３６６６４．１の残基５２〜１６４又はその機能的オルソログである、例えばマウス、齧歯類、サル、類人猿などの非ヒト種に由来する同等の残基を含む。一態様では、「ゼータ刺激ドメイン」又は「ＣＤ３−ゼータ刺激ドメイン」は、配列番号１６３（変異体ＣＤ３ゼータ）として提供される配列である。一態様では、「ゼータ刺激ドメイン」又は「ＣＤ３−ゼータ刺激ドメイン」は、配列番号１６６（野生型ヒトＣＤ３ゼータ）として提供される配列である。
【０３６５】
用語「構成的」プロモーターは、遺伝子産物をコードするか又は指定するポリヌクレオチドと作動可能に連結されるとき、細胞の大部分又は全ての生理的条件下の細胞において産生されることになる遺伝子産物をもたらすヌクレオチド配列を指す。
【０３６６】
用語「誘導性」プロモーターは、遺伝子産物をコードするか又は指定するポリヌクレオチドと作動可能に連結されるとき、実質的にプロモーターに対応する誘導因子が細胞中に存在するときのみ細胞において産生されることになる遺伝子産物をもたらすヌクレオチド配列を指す。
【０３６７】
用語「組織特異的」プロモーターは、遺伝子をコードするか又は遺伝子によって指定されるポリヌクレオチドと作動可能に連結されるとき、実質的に細胞がプロモーターに対応する組織型の細胞である場合にのみ細胞において産生されることになる遺伝子産物をもたらすヌクレオチド配列を指す。
【０３６８】
用語「癌関連抗原」、「腫瘍抗原」、「過剰増殖障害抗原」及び「過剰増殖障害と関連する抗原」は、特定の過剰増殖障害に共通する抗原を互換的に指す。いくつかの実施形態では、これらの用語は、全体的に又は断片（例えば、ＭＨＣ／ペプチド）のいずれかとして癌細胞の表面上で発現される分子（通常、タンパク質、炭水化物又は脂質）を指し、これは、癌細胞に対する薬理学的薬剤の優先的な標的化に有用である。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、正常細胞及び癌細胞、例えば系統マーカー、例えばＢ細胞上のＣＤ１９の両方によって発現されるマーカーである。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、正常細胞と比較して癌細胞において過剰発現される細胞表面分子であり、例えば正常細胞と比較して１倍の過剰発現、２倍の過剰発現、３倍以上の過剰発現である。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、癌細胞において不適切に合成される細胞表面分子、例えば正常細胞上で発現される分子と比較して欠失、付加又は変異を含有する分子である。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、癌細胞の細胞表面上で全体的に又は断片（例えば、ＭＨＣ／ペプチド）として排他的に発現されることになり、正常細胞の表面上で合成又は発現されない。特定の態様では、本発明の過剰増殖障害抗原は、原発性又は転移性黒色腫、胸腺腫、リンパ腫、肉腫、肺癌、肝臓癌、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、白血病、子宮癌、子宮頸癌、膀胱癌、腎臓癌及び乳癌などの腺癌、前立腺癌（例えば、去勢抵抗性若しくは治療抵抗性前立腺癌又は転移性前立腺癌）、卵巣癌、膵臓癌など、又は形質細胞増殖性障害、例えば、無症候性骨髄腫（くすぶり型多発性骨髄腫又は緩徐進行型骨髄腫）、意義不明の単クローン性ガンマグロブリン血症（ＭＧＵＳ）、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、形質細胞腫（例えば、形質細胞異常増殖症、孤立性骨髄腫、孤立性形質細胞腫、髄外性形質細胞腫及び多発性形質細胞腫）、全身性アミロイド軽鎖アミロイド症及びＰＯＥＭＳ症候群（クロウ・深瀬症候群、高月病及びＰＥＰ症候群としても知られる）を含むが、これらに限定されない癌に由来する。いくつかの実施形態では、本発明のＣＡＲとしては、ＭＨＣ提示ペプチドに結合する抗原結合ドメイン（例えば、抗体又は抗体断片）を含むＣＡＲが挙げられる。通常、内因性タンパク質に由来するペプチドは、主要組織適合抗原複合体（ＭＨＣ）クラスＩ分子のポケットをふさぎ、且つＣＤ８＋Ｔリンパ球上のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される。ＭＨＣクラスＩ複合体は、全ての有核細胞によって構成的に発現される。癌において、ウイルス特異的及び／又は腫瘍特異的ペプチド／ＭＨＣ複合体は、免疫療法に関する細胞表面標的の特有のクラスを表す。ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）−Ａ１又はＨＬＡ−Ａ２との関係においてウイルス又は腫瘍抗原に由来するペプチドを標的化するＴＣＲ様抗体が記載されている（例えば、Ｓａｓｔｒｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｖｉｒｏｌ．２０１１  ８５（５）：１９３５−１９４２；Ｓｅｒｇｅｅｖａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ，２０１１  １１７（１６）：４２６２−４２７２；Ｖｅｒｍａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ２０１０  １８４（４）：２１５６−２１６５；Ｗｉｌｌｅｍｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ２００１  ８（２１）：１６０１−１６０８；Ｄａｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉ  Ｔｒａｎｓｌ  Ｍｅｄ  ２０１３  ５（１７６）：１７６ｒａ３３；Ｔａｓｓｅｖ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ２０１２  １９（２）：８４−１００を参照されたい）。例えば、ＴＣＲ様抗体は、ヒトｓｃＦｖファージディスプレイライブラリーなどのライブラリーをスクリーニングすることから同定され得る。
【０３６９】
使用される用語「フレキシブルポリペプチドリンカー」又は「リンカー」は、２つのポリペプチド、例えば、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドと異種ポリペプチド又は可変重鎖領域と可変軽鎖領域を合わせてに連結するために、単独で又は組み合わせて使用されるグリシン及び／又はセリン残基などのアミノ酸を含むか又はそれらからなるペプチドリンカーを指す。一実施形態では、フレキシブルポリペプチドリンカーはＧｌｙ／Ｓｅｒリンカーであり、アミノ酸配列（Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｇｌｙ−Ｓｅｒ）ｎ（配列番号１７３）を含み、ｎは、１以上の正の整数である。例えば、ｎ＝１、ｎ＝２、ｎ＝３、ｎ＝４、ｎ＝５，ｎ＝６、ｎ＝７、ｎ＝８、ｎ＝９及びｎ＝１０である。一実施形態では、フレキシブルポリペプチドリンカーとしては、（Ｇｌｙ４  Ｓｅｒ）４（配列番号１４１）又は（Ｇｌｙ４  Ｓｅｒ）３（配列番号１４２）が挙げられるが、これらに限定されない。別の実施形態では、リンカーは、（Ｇｌｙ２Ｓｅｒ）、（ＧｌｙＳｅｒ）又は（Ｇｌｙ３Ｓｅｒ）（配列番号１４３）の複数の反復を含む。参照により本明細書に組み込まれる国際公開第２０１２／１３８４７５号パンフレットにおいて記載されるリンカーも本発明の範囲に含まれる。
【０３７０】
本明細書で使用する場合、「一過的な」は、数時間、数日又は数週間の期間の組み込まれていない導入遺伝子の発現を指し、その発現の期間は、ゲノムに組み込まれるか又は細胞中の安定なプラスミドレプリコン内に含有される場合の遺伝子の発現のための期間よりも短い。実施形態において、ＣＡＲ分子は、細胞、例えば宿主細胞中で、限られた時間又は細胞複製数、例えば、５０日未満（例えば、４０日未満、３０日、２５日、２０日、１５日、１０日、５日、４日、３日、２日又はそれ以下）、一過的に発現される。一実施形態では、一過的な発現は、インビトロで転写されたＲＮＡを用いてもたらされる。
【０３７１】
本明細書で使用する場合、「安定な」は、一過的な発現より長い時間の導入遺伝子の発現を指す。実施形態において、導入遺伝子は、細胞、例えば宿主細胞のゲノムに組み込まれるか又は細胞中の安定なプラスミドレプリコン内に含有される。一実施形態において、導入遺伝子は、遺伝子送達ベクター、例えばレンチウイルスベクターなどのレトロウイルスベクターを使用して、細胞ゲノムに組み込まれる。
【０３７２】
本明細書で使用する場合、用語「治療する」、「治療」及び「治療すること」は、１つ以上の治療剤（例えば、本発明のＣＡＲなどの１以上の治療剤）の投与に起因する、増殖性障害の進行、重症度及び／又は持続の低減又は改善、又は増殖性障害の１つ以上の症状（例えば、１つ以上の識別可能な症状）の改善を指す。特定の実施形態では、用語「治療する」、「治療」及び「治療すること」は、患者によって必ずしも識別可能ではない腫瘍の増殖などの増殖性障害の少なくとも１つの測定可能な身体的パラメーターの改善を指す。他の実施形態では、用語「治療する」、「治療」又は「治療すること」は、身体的に、例えば、識別可能な症状の安定化、生理学的に、例えば、身体的パラメーターの安定化のいずれか又は両方による増殖性障害の進行の阻害を指す。他の実施形態では、用語「治療する」、「治療」又は「治療すること」は、腫瘍サイズ又は癌性細胞の数の低減又は安定化を指す。治療は１００％である必要はなく、いくつかの実施形態において、疾患又は障害の少なくとも１つの症状の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％又は９９％の低減又は遅延が、これらの用語の範囲内と見なされるのに十分である。
【０３７３】
用語「対象」は、免疫応答が誘発され得る生存している生物（例えば、哺乳動物、例えば、ヒト）を含むことが意図される。対象の例としては、ヒト、サル、チンパンジー、イヌ、ネコ、マウス、ラット及びそのトランスジェニック種が挙げられる。Ｔ細胞は、末梢血単核球、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位由来の組織、腹水、胸水、脾臓組織及び腫瘍を含む、いくつかの供給源から得ることができる。
【０３７４】
用語「トランスフェクトされた」又は「形質転換された」又は「形質導入された」は、外因性核酸が宿主細胞に移行又は導入される方法を指す。「トランスフェクトされた」又は「形質転換された」又は「形質導入された」細胞は、外因性核酸でトランスフェクトされたか、形質転換されたか又は形質導入されたものである。細胞は初代対象細胞及びその子孫を含む。
【０３７５】
用語「特異的に結合する」は、試料に存在する同族結合パートナータンパク質を認識し、且つそれに結合する抗体又はリガンドを指すが、その抗体又はリガンドは試料における他の分子を実質的に認識しないか又はそれに結合しない。
【０３７６】
範囲：この開示全体にわたって、本発明の種々の態様が範囲の形で提供され得る。範囲の形での記載は単に利便性及び簡潔さのためであり、本発明の範囲の確固たる限定として解釈されるべきではないことが理解されるべきである。したがって、範囲の記載は、全ての可能な部分範囲並びにその範囲内の個々の数値が具体的に開示されていると解釈されるべきである。例えば、１〜６などの範囲の記載は、１〜３、１〜４、１〜５、２〜４、２〜６、３〜６などの部分範囲並びにその範囲内の個々の数値、例えば、１、２、２．７、３、４、５、５．３及び６が具体的に開示されていると解釈されるべきである。別の例として、９５〜９９％同一性などの範囲は、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％同一性を有するものを含み、９６〜９９％、９６〜９８％、９６〜９７％、９７〜９９％、９７〜９８％及び９８〜９９％同一性などの部分範囲を含む。これは範囲の幅に関わらず適用される。
【０３７７】
特定の官能基及び化学用語の定義は、以下でより詳細に記載される。化学元素は、Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｐｈｙｓｉｃｓ，７５ｔｈ  Ｅｄ．の内表紙にあるＣＡＳ方式の元素周期表に従って特定され、且つ特定の官能基は一般的に、そこに記載のとおり定義される。さらに、有機化学の一般原則並びに特定の官能部分及び反応性は、Ｔｈｏｍａｓ  Ｓｏｒｒｅｌｌ，Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｂｏｏｋｓ，Ｓａｕｓａｌｉｔｏ，１９９９；  Ｓｍｉｔｈ  ａｎｄ  Ｍａｒｃｈ，Ｍａｒｃｈ’ｓ  Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，５ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，２００１；Ｌａｒｏｃｋ，Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎｓ，ＶＣＨ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８９；及びＣａｒｒｕｔｈｅｒｓ，Ｓｏｍｅ  Ｍｏｄｅｒｎ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｏｆ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，３ｒｄ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，１９８７に記載されている。
【０３７８】
本明細書で使用する場合、用語「アルキル」は、１〜１２個、１〜１０個又は１〜６個の炭素原子の直鎖状又は分岐状の基などの一価飽和、直鎖状又は分岐状鎖の炭化水素を指し、本明細書ではそれぞれ、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ１〜Ｃ１０アルキル及びＣ１〜Ｃ６アルキルと呼ばれる。アルキル基の例としては、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、イソ−ブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｓｅｃ−ペンチル、イソ−ペンチル、ｔｅｒｔ−ブチル、ｎ−ペンチル、ネオペンチル、ｎ−ヘキシル、ｓｅｃ−ヘキシルなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３７９】
本明細書で使用する場合、用語「アルケニル」及び「アルキニル」は、上記のアルキルに対して長さ及び可能な置換が類似するが、それぞれ少なくとも１つの二重結合又は三重結合を含有する不飽和脂肪族基を指す。例示的なアルケニル基としては、ＣＨ＝ＣＨ２及びＣＨ２ＣＨ＝ＣＨ２が挙げられるが、これらに限定されない。
【０３８０】
本明細書で使用する場合、用語「アルコキシ」は、鎖中に末端「Ｏ」を含有する１〜１２個の炭素原子を含有する直鎖又は分岐鎖の鎖飽和炭化水素、例えば、−Ｏ（アルキル）を指す。アルコキシ基の例としては、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、ブトキシ、ｔ−ブトキシ又はペントキシ基が挙げられるが、これらに限定されない。
【０３８１】
本明細書で使用する場合、用語「アリール」は、少なくとも１つの環が芳香族である、単環式、二環式又は多環式炭化水素環系を指す。代表的なアリール基としては、フェニル（例えば、（Ｃ６）アリール）、ナフチル（例えば、（Ｃ１０）アリール）及びアントラセニル（例えば、（Ｃ１４）アリール）などの完全な芳香族環系並びに芳香族炭素環が、インダニル、フタルイミジル、ナフチミジル又はテトラヒドロナフチルなどの１つ以上の非芳香族炭素環に縮合される環系が挙げられる。
【０３８２】
本明細書で使用する場合、用語「カルボシクリル」は、３〜１８個の炭素原子を含有する単環式又は縮合、スピロ縮合及び／若しくは架橋二環式又は多環式炭化水素環系を指し、各環は、完全に飽和されているか又は１つ以上の不飽和の単位を含有するが、環は芳香族ではない。代表的なカルボシクリル基としては、シクロアルキル基（例えば、シクロペンチル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルなど）及びシクロアルケニル基（例えば、シクロペンテニル、シクロヘキセニル、シクロペンタジエニルなど）が挙げられる。
【０３８３】
本明細書で使用する場合、用語「カルボニル」は、−Ｃ＝Ｏを指す。
【０３８４】
本明細書で使用する場合、用語「シアノ」は、−ＣＮを指す。
【０３８５】
本明細書で使用する場合、用語「ハロ」又は「ハロゲン」は、フッ素（フルオロ、−Ｆ）、塩素（クロロ、−Ｃｌ）、臭素（ブロモ、−Ｂｒ）又はヨウ素（ヨード、−Ｉ）を指す。
【０３８６】
本明細書で使用する場合、用語「ハロアルキル」は、鎖中の少なくとも１つの炭素原子が１つ以上のハロゲン原子で置換されている、一価飽和直鎖状又は分岐状アルキル鎖を指す。いくつかの実施形態では、ハロアルキル基は、例えば、１〜１２、１〜１０又は１〜６個の炭素原子を含み得、本明細書でＣ１〜Ｃ１２ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ１０ハロアルキル及びＣ１〜Ｃ６ハロアルキルとして参照される。ハロアルキル基の例としては、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、ペンタフルオロエチル、トリクロロメチルなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３８７】
用語「ハロアルコキシ」は、鎖中に末端「Ｏ」を含有する１〜１２個の炭素原子を含有する直鎖又は分岐鎖の飽和炭化水素を指し、鎖中の少なくとも１つの炭素原子が１つ以上のハロゲンで置換されている。ハロアルコキシ基の例としては、トリフルオロメトキシ、ジフルオロメトキシ、ペンタフルオロエトキシ、トリクロロメトキシなどが挙げられるが、これらに限定されない。
【０３８８】
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロアルキル」は、一価飽和直鎖状又は分岐状アルキル鎖を指し、鎖中の少なくとも１つの炭素原子は、Ｏ、Ｓ又はＮなどのヘテロ原子で置換されるが、但し、置換される際、鎖は少なくとも１つの炭素原子を含む。いくつかの実施形態では、ヘテロアルキル基は、例えば、１〜１２、１〜１０又は１〜６個の炭素原子を含み得、本明細書でＣ１〜Ｃ１２ヘテロアルキル、Ｃ１〜Ｃ１０ヘテロアルキル及びＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルとして参照される。特定の場合において、ヘテロアルキル基は、アルキル鎖中の１、２、３又は４個の個々の炭素原子の代わりに、１、２、３又は４個の独立して選択されるヘテロ原子を含む。代表的なヘテロアルキル基としては、−ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２ＮＨＣＨ３、−ＣＨ２ＣＨ２Ｎ（ＣＨ３）ＣＨ３などが挙げられる。
【０３８９】
本明細書で使用する場合、用語「アルケン」、「アルケニレン」、「アルキニレン」及び「ヘテロアルキレン」は、それぞれアルキル、アルケニル、アルキニル又はヘテロアルキル基の二価の基を指す。一価のアルキル、アルケニル、アルキニル又はヘテロアルキル基のいずれかは、アルキル、アルケニル、アルキニル又はヘテロアルキル基からの２つ目の水素の除去によるアルキレン、アルケニレン、アルキニレン又はヘテロアルキレンであり得る。
【０３９０】
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロアリール」は、少なくとも１つの環が両方とも芳香族であり、且つヘテロ原子を含み；且つ他の環がヘテロシクリルではない（下に定義されるとおり）、単環式、二環式又は多環式環系を指す。代表的なヘテロアリール基としては、（ｉ）各環がヘテロ原子を含み、且つ芳香族、例えば、イミダゾリル、オキサゾリル、チアゾリル、トリアゾリル、ピロリル、フラニル、チオフェニル、ピラゾリル、ピリジニル、ピラジニル、ピリダジニル、ピリミジニル、インドリジニル、プリニル、ナフチリジニル及びプテリジニルである；（ｉｉ）各環が、芳香族又はカルボシクリルであり、少なくとも１つの芳香環がヘテロ原子を含み、且つ少なくとも１つの他の環が、炭化水素環又は例えば、インドリル、イソインドリル、ベンゾチエニル、ベンゾフラニル、ジベンゾフラニル、インダゾリル、ベンズイミダゾリル、ベンズチアゾリル、キノリル、イソキノリル、シンノリニル、フタラジニル、キナゾリニル、キノキサリニル、カルバゾリル、アクリジニル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニル、ピリド［２，３−ｂ］−１，４−オキサジン−３−（４Ｈ）−オン、チアゾロ−［４，５−ｃ］−ピリジニル、４，５，６，７−テトラヒドロチエノ［２，３−ｃ］ピリジニル、５，６−ジヒドロ−４Ｈ−チエノ［２，３−ｃ］ピロリル、４，５，６，７，８−テトラヒドロキノリニル及び５，６，７，８−テトラヒドロイソキノリニルであり；且つ（ｉｉｉ）各環が、芳香族又はカルボシクリルであり、且つ少なくとも１つの芳香族環が、橋頭ヘテロ原子を別の芳香族環と共有する（例えば、４Ｈ−キノリジニル）、環系が挙げられる。特定の実施形態では、ヘテロアリールは、単環式又は二環式環であり、前記環の各々は、５又は６個の環原子を含有し、１、２、３又は４個の前記環原子は、Ｎ、Ｏ及びＳから独立して選択されるヘテロ原子である。
【０３９１】
本明細書で使用する場合、用語「ヘテロシクリル」は、少なくとも１つの環が飽和又は部分的に不飽和（しかし、芳香族ではない）であり、且つヘテロ原子を含む、単環式又は縮合、スピロ縮合及び／若しくは架橋二環式及び多環式炭化水素環系を指す。ヘテロシクリルは、安定な構造をもたらす任意のヘテロ原子又は炭素原子でそのペンダント基に結合することができ、環原子のいずれかは任意選択により置換され得る。代表的なヘテロシクリルとしては、（ｉ）全ての環が非芳香族であり、且つ少なくとも１つの環がヘテロ原子を含み、例えば、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロピラニル、テトラヒドロチエニル、ピロリジニル、ピロリドニル、ピペリジニル、ピロリニル、デカヒドロキノリニル、オキサゾリジニル、ピペラジニル、ジオキサニル、ジオキソラニル、ジアゼピニル、オキサゼピニル、チアゼピニル、モルホリニル及びキヌクリジニル；（ｉｉ）少なくとも１つの環が、非芳香族であり、且つヘテロ原子を含み、且つ少なくとも１つの他の環が、芳香族炭素環、例えば、１，２，３，４−テトラヒドロキノリニルであり；且つ（ｉｉｉ）少なくとも１つの環が、非芳香族であり、且つヘテロ原子を含み、且つ少なくとも１つの他の環が、芳香族であり、且つヘテロ原子を含む（例えば、３，４−ジヒドロ−１Ｈ−ピラノ［４，３−ｃ］ピリジン及び１，２，３，４−テトラヒドロ−２，６−ナフチリジン）、環系が挙げられる。特定の実施形態では、ヘテロシクリルは、単環式又は二環式環であり、前記環の各々は、３〜７個の環原子を含有し、１、２、３又は４個の前記環原子は、Ｎ、Ｏ及びＳから独立して選択されるヘテロ原子である。
【０３９２】
本明細書で記載されるとおり、本発明の化合物は、「任意選択により置換された」部分を含有し得る。一般に、用語「置換された」は、用語「任意選択により」が先行するかどうかに関わらず、指定された部位の１つ以上の水素が好適な置換基で置き換えられていることを意味する。別段の指示がない限り、「任意選択により置換された」基は、基の各々の置換可能な位置に好適な置換基を有し得、任意の所与の構造における２つ以上の位置が、指定の基から選択される２つ以上の置換基で置換され得る場合、置換基は、各々の位置で同じであるか又は異なり得る。本発明の下で想定される置換基の組み合わせは、好ましくは、安定な又は化学的に実現可能な化合物の形成をもたらすものである。本明細書で使用する場合、用語「安定な」は、それらの生成、検出並びに特定の実施形態では、それらの回収、精製及び本明細書で開示される目的の１つ以上のための使用を可能にする条件に供されたときに、実質的に変化しない化合物を指す。
【０３９３】
本明細書で使用する場合、用語「オキソ」は、＝Ｏを指す。
【０３９４】
本明細書で使用する場合、用語「チオカルボニル」は、Ｃ＝Ｓを指す。
【０３９５】
本明細書で使用する場合、用語「薬学的に許容される塩」は、適切な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー応答などを伴わずに、ヒト及び下等動物の組織と接触して使用するのに適し、妥当な利益／リスク比に相応する塩を指す。薬学的に許容される塩は、当技術分野でよく知られている。例えば、Ｂｅｒｇｅらは、参照によって本明細書に組み込まれるＪ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１９７７，６６、１−１９において詳細に薬学的に許容される塩を記載している。本発明の化合物の薬学的に許容される塩は、好適な無機及び有機酸並びに塩基から誘導されるものを含む。薬学的に許容される、非毒性の酸付加塩の例は、塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸及び過塩素酸などの無機酸又は酢酸、シュウ酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸若しくはマロン酸などの有機酸により形成されるか、或いはイオン交換などの当技術分野において知られる他の方法を使用することによって形成されるアミノ基の塩である。他の薬学的に許容される塩としては、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、ショウノウ酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、２−ヒドロキシ−エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、３−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、ｐ−トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが挙げられる。適切な塩基から誘導される塩としては、アルカリ金属、アルカリ土類金属、アンモニウム及びＮ＋（Ｃ１〜４アルキル）４塩が挙げられる。代表的なアルカリ金属又はアルカリ土類金属としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどが挙げられる。さらなる薬学的に許容される塩としては、適切な場合、ハロゲン化物、水酸化物、カルボン酸塩、硫酸塩、リン酸塩、硝酸塩、低級アルキルスルホン酸塩及びアリールスルホン酸塩などの対イオンを使用して形成される非毒性アンモニウム、第四級アンモニウム及びアミンカチオンが挙げられる。
【０３９６】
用語「溶媒和物」は、通常、加溶媒分解反応によって溶媒と会合されている化合物の形態を指す。この物理的会合は、水素結合を含み得る。通常の溶媒としては、水、メタノール、エタノール、酢酸、ＤＭＳＯ、ＴＨＦ、ジエチルエーテルなどが挙げられる。式（Ｉ）、式（Ｉ−ａ）及び／又は式（ＩＩ）の化合物は、例えば、結晶形態で作製及び溶媒和され得る。好適な溶媒和物としては、薬学的に許容される溶媒和物を含み、化学量論的な溶媒和物及び非化学量論的な溶媒和物の両方をさらに含む。特定の場合において、溶媒和物は、例えば、１つ以上の溶媒分子が結晶性固体の結晶格子に組み込まれている場合、単離が可能になる。「溶媒和物」は、溶液相及び単離可能な溶媒和物の両方を包含する。代表的な溶媒和物としては、水和物、エタノール付加物及びメタノール付加物が挙げられる。
【０３９７】
用語「水和物」は、水と会合されている化合物を指す。通常、化合物の水和物中に含有される水分子の数は、水和物中の化合物分子の数に対して一定の比にある。したがって、化合物の水和物は、例えば、一般式Ｒ・ｘ  Ｈ２Ｏによって表され得、式中、Ｒは化合物であり、ｘは０よりも大きい数である。所与の化合物は、例えば、一水和物（ｘは１である）、低水和物（ｘは０よりも大きく、１よりも小さい数である、例えば、半水和物（Ｒ・０．５Ｈ２Ｏ））及び多水和物（ｘは１よりも大きい数である、例えば、二水和物（Ｒ・２Ｈ２Ｏ）及び六水和物（Ｒ・６Ｈ２Ｏ））を含む、２つ以上の型の水和物を形成し得る。
【０３９８】
同じ分子式を有するが、それらの原子の結合の性質若しくは順序又は空間中のそれらの原子の配置が異なる化合物は、「異性体」と呼ばれることを理解されたい。空間中の原子の配置が異なる異性体を「立体異性体」と呼ぶ。
【０３９９】
互いに鏡像でない立体異性体は「ジアステレオマー」と呼ばれ、互いに重ねることができない鏡像であるものは「エナンチオマー」と呼ばれる。化合物が不斉中心を有する場合、例えば、４つの異なる基に結合され、一対のエナンチオマーが可能である。エナンチオマーは、その不斉中心の絶対配置によって特徴付けられ得、カーン・プレログのＲ−及びＳ−順位則によって記載されるか、又は分子が偏光面を回転させる様式により、右旋性若しくは左旋性（すなわち、それぞれ、（＋）異性体又は（−）異性体）として指定される。キラル化合物は、個々のエナンチオマー又はその混合物として存在し得る。等比率のエナンチオマーを含有する混合物は、「ラセミ混合物」と呼ばれる。
【０４００】
用語「互変異性体」は、特定の化合物構造の互換的な形態であり、水素原子及び電子の置換において変動する化合物を指す。したがって、２つの構造は、π電子及び原子（通常、Ｈ）の移動を通して、等価であり得る。例えば、エノール及びケトンは、酸又は塩基のいずれかによる処理によって迅速に相互変換されるため、互変異性体である。互変異性の別の例は、フェニルニトロメタンのａｃｉ形態及びニトロ形態であって、これらは、酸又は塩基による処理によって同様に形成される。
【０４０１】
互変異性形態は、目的の化合物の最適な化学的反応性及び生物学的活性の達成に関連し得る。
【０４０２】
別段の指定のない限り、本明細書に示される構造は、その構造の全ての異性（例えば、鏡像異性、ジアステレオ異性及び幾何的（又は立体構造的））形態；例えば、各不斉中心に対するＲ及びＳ立体配置、Ｚ及びＥ二重結合異性体並びにＺ及びＥ立体構造的異性体も含むものとする。したがって、本化合物の単一の立体化学的異性体並びに鏡像異性、ジアステレオ異性及び幾何的（又は立体構造的）混合物は、本発明の範囲内である。別段の指定のない限り、本発明の化合物の全ての互変異性形態は、本発明の範囲内である。さらに、別段の指定のない限り、本明細書に示される構造は、１つ以上の同位体的に富化された原子が存在することのみが異なる化合物も含むものとする。例えば、水素の重水素若しくはトリチウムによる置き換え又は炭素の１３Ｃ富化炭素若しくは１４Ｃ富化炭素による置き換えを含む本構造を有する化合物は、本発明の範囲内である。実施形態において、本明細書で開示される化合物（例えば、式（Ｉ）の化合物）のいずれか１つの中に存在する水素原子は、重水素に同位体濃縮される。そのような化合物は、例えば、分析ツールとして、生物学的アッセイにおけるプローブとして又は本発明による治療剤として、有用である。
【０４０３】
特定のエナンチオマーが好ましい場合、いくつかの実施形態では、それは対応するエナンチオマーを実質的に含まずに付与され得、「光学的に富化された」と称され得る。本明細書で使用する場合、「光学的に富化された」とは、化合物が、有意に高い割合の一方のエナンチオマーから構成されていることを意味する。特定の実施形態では、化合物は、少なくとも約９０重量％の好ましいエナンチオマーから構成される。他の実施形態では、化合物は、少なくとも約９５重量％、９８重量％又は９９重量％の好ましいエナンチオマーから構成される。好ましいエナンチオマーは、キラル高圧液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）並びにキラル塩の形成及び結晶化を含む、当業者に知られる任意の方法によってラセミ混合物から単離されても、不斉合成によって調製され得る。例えば、Ｊａｃｑｕｅｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｅｎａｎｔｉｏｍｅｒｓ，Ｒａｃｅｍａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎｓ（Ｗｉｌｅｙ  Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８１）；Ｗｉｌｅｎ，ｅｔ  ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  ３３：２７２５（１９７７）；Ｅｌｉｅｌ，Ｅ．Ｌ．Ｓｔｅｒｅｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ｃａｒｂｏｎ  Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ（ＭｃＧｒａｗＨｉｌｌ，ＮＹ，１９６２）；Ｗｉｌｅｎ，Ｓ．Ｈ．Ｔａｂｌｅｓ  ｏｆ  Ｒｅｓｏｌｖｉｎｇ  Ａｇｅｎｔｓ  ａｎｄ  Ｏｐｔｉｃａｌ  Ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎｓ  ｐ．２６８（Ｅ．Ｌ．Ｅｌｉｅｌ，Ｅｄ．，Ｕｎｉｖ．ｏｆ  Ｎｏｔｒｅ  Ｄａｍｅ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｏｔｒｅ  Ｄａｍｅ，ＩＮ  １９７２）を参照されたい。
【０４０４】
これらの及び他の例示的置換基は、発明を実施するための形態、図面、実施例及び特許請求の範囲においてより詳細に記載される。本発明は、上記の例示的な置換基のリストによって何ら限定されることを意図するものではない。
【０４０５】
ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド
本明細書では、とりわけ、式（Ｉ）の化合物（ＣＯＦ１）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド、式（ＩＩ）の化合物（ＣＯＦ２）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド又は式（ＩＩＩ）の化合物（ＣＯＦ３）／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチドが開示される。実施形態において、ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（サリドマイド及びその誘導体、例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下、融合ポリペプチド中のＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、翻訳後修飾及び／又は融合ポリペプチドの分解を増大させる。いくつかの実施形態では、翻訳後修飾は、融合ポリペプチド（例えば、異種ポリペプチド及び／又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドの全て又は一部の１つ又は全て）中の１つ以上のアミノ酸残基、例えば、１つ以上のリジン又はメチオニンのユビキチン化（例えば、モノ又はポリユビキチン化）を含み得る。
【０４０６】
特定の実施形態では、融合ポリペプチド（例えば、異種ポリペプチド及び／又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドの全て又は一部）の１つ以上のリジン残基がユビキチン化される。いくつかの実施形態では、融合ポリペプチド（例えば、異種ポリペプチド及び／又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドの全て又は一部）の１つ以上のメチオニン残基がユビキチン化（例えば、モノ又はポリユビキチン化）される。
【０４０７】
理論に束縛されるものではないが、いくつかの実施形態では、本明細書に記載される融合ポリペプチドの不活性化、例えば、分解は、例えば、細胞又は反応混合物における以下のステップの１つ、２つ、３つ又は全てを含み得る：
（１）ＣＯＦ１若しくはＣＯＦ２（例えば、サリドマイド及びその誘導体（例えば、レナリドミド））の存在下又はＣＯＦ３（例えば、表２９において開示される化合物）の存在下、ユビキチンリガーゼ複合体（例えば、Ｅ３ユビキチンリガーゼ複合体）の１つ以上のサブユニット（例えば、ＣＲＢＮ）に対する、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドを含む融合ポリペプチドの会合；
（２）融合ポリペプチドのユビキチン化（例えば、異種ポリペプチド及び／又はＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドでのユビキチン化）により、ユビキチン化融合ポリペプチドをもたらすこと；及び
（３）ユビキチン化融合ポリペプチドの分解。
【０４０８】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるいずれかのＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の存在下において、例えば、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の非存在下での修飾及び／又は分解と比較して、融合ポリペプチドの翻訳後修飾及び／又は分解を増大させる。一実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の存在下において、例えば、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の非存在下でのユビキチン化と比較して、融合ポリペプチドの選択的なビキチン化を増大させる。
【０４０９】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＣＯＦ１、ＣＯＦ２又はＣＯＦ３の存在下でユビキチンリガーゼ複合体（例えば、Ｅ３ユビキチンリガーゼ複合体）の１つ以上の構成要素に結合するアミノ酸配列及び／又は構造モチーフ（例えば、ドメイン）に由来する。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１又はＣＯＦ２は、例えば、本明細書に記載されるとおり、化合物のサリドマイドクラス（例えば、レナリドミド、ポマリドミド及びサリドマイド）である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３は、表２９において開示される化合物である。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ジンクフィンガードメイン（例えば、ジンクフィンガー２ドメイン）又はその部分を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、βターンを含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、転写因子のイカロスファミリー、例えば、ＩＫＺＦ１若しくはＩＫＺＦ３のβターン又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、転写因子のイカロスファミリー、例えば、ＩＫＺＦ１若しくはＩＫＺＦ３のβヘアピン又はそれと実質的に同一な（例えば、Ｋｒｏｎｋｅ，Ｊ．ｅｔ  ａｌ．（２０１４）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３４３（６１６８）：３０１−５）において記載されるとおりのＩＫＺＦ１又はＩＫＺＦ３のβヘアピンと例えば少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のβターン又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２のβヘアピン又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列を含む。
【０４１０】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１（例えば、配列番号２０）若しくはＩＫＺＦ３（例えば、配列番号１９）又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ１（例えば、配列番号２０）若しくはＩＫＺＦ３（例えば、配列番号１９）又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列の少なくとも１０個のアミノ酸、少なくとも１５個のアミノ酸、少なくとも２０個のアミノ酸、少なくとも２５個のアミノ酸、少なくとも３０個のアミノ酸、少なくとも３５個のアミノ酸、少なくとも４０個のアミノ酸、少なくとも４５個のアミノ酸、少なくとも５０個のアミノ酸、少なくとも５５個のアミノ酸、少なくとも６０個のアミノ酸、少なくとも６５個のアミノ酸、少なくとも７０個のアミノ酸、少なくとも７５個のアミノ酸、少なくとも８０個のアミノ酸、少なくとも８５個のアミノ酸、少なくとも９０個のアミノ酸、少なくとも９０個のアミノ酸又は少なくとも９５個のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ２／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１〜６、１１〜１５、４０、４１〜４３、７７、７８、８４〜８６及び１００からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれらからなる。
【０４１１】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２（例えば、配列番号２１）又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列の約１０〜約９５個のアミノ酸残基、約１５〜約９０個のアミノ酸残基、約２０〜約８５個のアミノ酸残基、約２５〜約８０個のアミノ酸残基、約３０〜約７５個のアミノ酸残基、約３５〜約７０個のアミノ酸残基、約４０〜約６５個のアミノ酸残基、約４５〜約６５個のアミノ酸残基、約５０〜約６５個のアミノ酸残基又は約５５〜約６５個のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、ＩＫＺＦ２（例えば、配列番号２１）又はそれと実質的に同一な（例えば、それと少なくとも８５％、８７、９０、９５、９７、９８、９９又は１００％同一な）配列の少なくとも１０個のアミノ酸、少なくとも１５個のアミノ酸、少なくとも２０個のアミノ酸、少なくとも２５個のアミノ酸、少なくとも３０個のアミノ酸、少なくとも３５個のアミノ酸、少なくとも４０個のアミノ酸、少なくとも４５個のアミノ酸、少なくとも５０個のアミノ酸、少なくとも５５個のアミノ酸、少なくとも６０個のアミノ酸、少なくとも６５個のアミノ酸、少なくとも７０個のアミノ酸、少なくとも７５個のアミノ酸、少なくとも８０個のアミノ酸、少なくとも８５個のアミノ酸、少なくとも９０個のアミノ酸、少なくとも９０個のアミノ酸又は少なくとも９５個のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、配列番号１０９、１１３及び１１４からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むか又はそれらからなる。
【０４１２】
いくつかの実施形態では、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ２、ＩＫＺＦ３、ＩＫＺＦ４及びＩＫＺＦ５又はその断片の例示的な全長配列は、表１において提供される。
【０４１３】
【表１】
2021501570.tif 000019
【０４１４】
【表２】
2021501570.tif 000020
【０４１５】
【表３】
2021501570.tif 000021
【０４１６】
【表４】
2021501570.tif 000022
【０４１７】
【表５】
2021501570.tif 000023
【０４１８】
分解化合物
本明細書では、とりわけ、例えば、分解タグを含む融合タンパク質のユビキチン化及び／又は分解を増大させることができる分解化合物が開示される。
【０４１９】
いくつかの実施形態では、分解化合物は、化合物のサリドマイドクラスのメンバーを含む。いくつかの実施形態では、化合物のサリドマイドクラスのメンバーとしては、レナリドミド（ＣＣ−５０１３）、ポマリドミド（ＣＣ−４０４７又はＡＣＴＩＭＩＤ）、サリドマイド又はその塩若しくは誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、分解化合物は、化合物のサリドマイドクラスの１つ、２つ、３つ又はそれ以上のメンバーの混合物であり得る。サリドマイド類似体及びサリドマイド類似体の免疫調節性特性は、参照により全体として本明細書に組み込まれるＢｏｄｅｒａ  ａｎｄ  Ｓｔａｎｋｉｅｗｉｃｚ，Ｒｅｃｅｎｔ  Ｐａｔ  Ｅｎｄｏｃｒ  Ｍｅｔａｂ  Ｉｍｍｕｎｅ  Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖ．２０１１  Ｓｅｐ；５（３）：１９２−６において記載される。サリドマイド類似体及びＥ３ユビキチンの構造複合体は、参照により全体として本明細書に組み込まれるＧａｎｄｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｒ  Ｊ  Ｈａｅｍａｔｏｌ．２０１４  Ｍａｒ；１６４（６）：８１１−２１において記載される。サリドマイド類似体によるＥ３ユビキチンリガーゼの調節は、参照により全体として本明細書に組み込まれるＦｉｓｃｈｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ．２０１４  Ａｕｇ  ７；５１２（７５１２）：４９−５３において記載される。
【０４２０】
いくつかの実施形態では、分解化合物は、式（Ｉ）：
【化１７】
2021501570.tif 000024
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、溶媒和物若しくは互変異性体を含む。
【０４２１】
いくつかの実施形態では、Ｘは、Ｏである。
【０４２２】
いくつかの実施形態では、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ４（例えば、１個のＲ４、２個のＲ４、３個のＲ４、４個のＲ４、５個のＲ４、６個のＲ４、７個のＲ４、８個のＲ４、９個のＲ４、１０個のＲ４、１１個のＲ４又は１２個のＲ４）により置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、６員ヘテロシクリル又は５員ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、６員ヘテロシクリル又は５員ヘテロシクリルであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１〜６個のＲ４（例えば、１個のＲ４、２個のＲ４、３個のＲ４、４個のＲ４、５個のＲ４又は６個のＲ４）により置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、窒素含有ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、ピペリジニル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。
【０４２３】
いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。
【０４２４】
いくつかの実施形態では、Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ６（例えば、１個のＲ６、２個のＲ６、３個のＲ６、４個のＲ６、５個のＲ６、６個のＲ６、７個のＲ６、８個のＲ６、９個のＲ６、１０個のＲ６、１１個のＲ６又は１２個のＲ６）で置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡである。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル（例えば、ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２−フェニル−ｔ−ブチル）、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、ＮＨ２）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ（例えば、ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ３）である。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、１〜６個のＲ６（例えば、１個のＲ６、２個のＲ６、３個のＲ６、４個のＲ６、５個のＲ６又は６個のＲ６）で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルである。
【０４２５】
いくつかの実施形態では、各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ７（例えば、１個のＲ７、２個のＲ７、３個のＲ７、４個のＲ７、５個のＲ７、６個のＲ７、７個のＲ７、８個のＲ７、９個のＲ７、１０個のＲ７、１１個のＲ７又は１２個のＲ７）で置換される。
【０４２６】
いくつかの実施形態では、各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜６個のＲ８（例えば、１個のＲ８、２個のＲ８、３個のＲ８、４個のＲ８、５個のＲ８又は６個のＲ８）で置換される。
【０４２７】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。ある実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。ある実施形態では、ｎは１である。ある実施形態では、Ｒ３は、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）である。ある実施形態では、分解化合物は、レナリドミド、例えば、３−（４−アミノ−１−オキソイソインドリン−２−イル）ピペリジン−２，６−ジオン又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解化合物は、例えば、以下の式：
【化１８】
2021501570.tif 000025
によるレナリドミドである。
【０４２８】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジニル−２，６−ジオニル）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。ある実施形態では、ｎは１である。ある実施形態では、Ｒ３は、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）である。ある実施形態では、分解化合物は、ポマリドミド、例えば、４−アミノ−２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）イソインドリン−１，３−ジオン又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解化合物は、例えば、以下の式：
【化１９】
2021501570.tif 000026
によるポマリドミドである。
【０４２９】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジニル−２，６−ジオニル）である。ある実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。ある実施形態では、ｎは０である。ある実施形態では、分解化合物は、サリドマイド、例えば、２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）イソインドリン−１，３−ジオン又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解産物は、例えば、以下の式：
【化２０】
2021501570.tif 000027
によるサリドマイドである。
【０４３０】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。ある実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。ある実施形態では、ｎは１である。ある実施形態では、Ｒ３は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル（例えば、ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２−フェニル−ｔ−ブチル）である。ある実施形態では、Ｒ３は、１個のＲ６で置換されたＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキル（例えば、ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２−フェニル−ｔ−ブチル）である。ある実施形態では、分解化合物は、２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解化合物は、以下の式：
【化２１】
2021501570.tif 000028
において示されるとおりの構造を有する。
【０４３１】
いくつかの実施形態では、分解化合物は、式（Ｉ−ａ）：
【化２２】
2021501570.tif 000029
（式中、
環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｍは、存在しないか、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
Ｒ３の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ６で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
ｎは、０、１、２又は３であり；
ｏは、０、１、２、３、４又は５であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体である。
【０４３２】
いくつかの実施形態では、Ｘは、Ｏである。
【０４３３】
いくつかの実施形態では、Ｍは、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル又はＣ１〜Ｃ６ヘテロアルキルであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１〜６個のＲ４（例えば、１個のＲ４、２個のＲ４、３個のＲ４、４個のＲ４、５個のＲ４又は６個のＲ４）で置換される。いくつかの実施形態では、Ｍは存在しない。
【０４３４】
いくつかの実施形態では、環Ａは、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１〜６個のＲ４（例えば、１個のＲ４、２個のＲ４、３個のＲ４、４個のＲ４、５個のＲ４又は６個のＲ４）で置換される。いくつかの実施形態では、環Ａは、ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、環Ａは、ヘテロシクリル、例えば、６員ヘテロシクリル又は５員ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、環Ａは、窒素含有ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、環Ａは、ピペリジニル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。
【０４３５】
いくつかの実施形態では、Ｍは存在せず、且つ環Ａはヘテロシクリル（例えば、ピペリジニル、例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。
【０４３６】
いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。
【０４３７】
いくつかの実施形態では、Ｒ３ａは、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ６（例えば、１個のＲ６、２個のＲ６、３個のＲ６、４個のＲ６、５個のＲ６、６個のＲ６、７個のＲ６、８個のＲ６、９個のＲ６、１０個のＲ６、１１個のＲ６又は１２個のＲ６）で置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ３ａは、水素、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡである。いくつかの実施形態では、Ｒ３ａは、水素である。いくつかの実施形態では、Ｒ３ａは、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）である。いくつかの実施形態では、Ｒ３ａは、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ（例えば、ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ３）である。
【０４３８】
いくつかの実施形態では、各Ｒ３は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ６（例えば、１個のＲ６、２個のＲ６、３個のＲ６、４個のＲ６、５個のＲ６、６個のＲ６、７個のＲ６、８個のＲ６、９個のＲ６、１０個のＲ６、１１個のＲ６又は１２個のＲ６）で置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ３は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル（例えば、ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２−フェニル−ｔ−ブチル）である。
【０４３９】
いくつかの実施形態では、各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ７（例えば、１個のＲ７、２個のＲ７、３個のＲ７、４個のＲ７、５個のＲ７、６個のＲ７、７個のＲ７、８個のＲ７、９個のＲ７、１０個のＲ７、１１個のＲ７又は１２個のＲ７）で置換される。
【０４４０】
いくつかの実施形態では、各Ｒ６は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜６個のＲ８（例えば、１個のＲ８、２個のＲ８、３個のＲ８、４個のＲ８、５個のＲ８又は６個のＲ８）で置換される。
【０４４１】
いくつかの実施形態では、ｎは、０又は１である。一実施形態では、ｎは０である。一実施形態では、ｎは１である。
【０４４２】
いくつかの実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ）：
【化２３】
2021501570.tif 000030
（式中、
Ｘ１は、ＣＲ３であり；
【化２４】
2021501570.tif 000031
は、Ｘ１がＣＲ３であり且つＲ３が存在しない場合、任意選択により二重結合であり；
各Ｒ１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル若しくはハロであるか、又は
２つのＲ１は、それらが結合される炭素原子とともに５員又は６員ヘテロシクリル環を形成するか、又は
２つのＲ１は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール環を形成し；
Ｒ２は、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、−Ｃ（Ｏ）Ｃ１〜Ｃ６アルキル、−Ｃ（Ｏ）（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、−Ｃ（Ｏ）Ｏ（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７−ヘテロシクリルであり、アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；及びアリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ５で置換されるか、又は
Ｒ１及びＲ２は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともに５員又は６員ヘテロシクリル環を形成し；
Ｒ３は、水素であるか、又は
【化２５】
2021501570.tif 000032
が二重結合であるとき、Ｒ３は、存在せず；
各Ｒ４は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ６Ｒ６’、−ＮＲ６Ｃ（Ｏ）Ｒ６’、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル環から独立して選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
各Ｒ５は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールから独立して選択されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ６及びＲ６’は、それぞれ独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル又はＣ６〜Ｃ１０アリールであり；
各Ｒ７は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ８、−（ＣＨ２）０〜３Ｃ（Ｏ）ＯＲ８、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ８Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）ＯＲ９、−Ｓ（Ｏ）ｐＮＲ８Ｒ９、−Ｓ（Ｏ）ｐＲ１２、（Ｃ１〜Ｃ６）ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−Ｏ（ＣＨ２）１〜３ＣＮ、−ＮＨ２、シアノ、−Ｏ（ＣＨ２）０〜３−Ｃ６〜Ｃ１０アリール、アダマンチル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む−Ｏ（ＣＨ２）０〜３−５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む単環式又は二環式５〜１０員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択され、アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ１１で置換され、且つアリール、ヘテロアリール及びヘテロシクリルは、任意選択により、ハロゲン、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル及びＣ１〜Ｃ６アルコキシからそれぞれ独立して選択される１つ以上の置換基で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される炭素原子とともにａ＝（Ｏ）を形成するか、又は
２つのＲ７は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ８及びＲ９は、それぞれ独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノから独立して選択されるか、又は
２つのＲ１０は、それらが結合される炭素原子とともにａ＝（Ｏ）を形成し；
各Ｒ１１は、シアノ、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択され、各アリール及びヘテロシクリルは、任意選択により、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノからそれぞれ独立して選択される１つ以上の置換基で置換され；
Ｒ１２は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり；
Ｒｘは、水素又は重水素であり；
ｐは、０、１又は２であり；
ｎは、０、１又は２であり；
ｙは、１又は２であり、ここで、ｎ＋ｙ≦３であり；及び
ｑは、０、１、２、３又は４である）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体である。
【０４４３】
いくつかの実施形態では、式（ＩＩＩ）の分解化合物は、式（ＩＩＩ−ａ）：
【化２６】
2021501570.tif 000033
（式中、
Ｘ１は、ＣＲ３であり；
【化２７】
2021501570.tif 000034
は、Ｘ１がＣＲ３であり且つＲ３が存在しない場合、任意選択により二重結合であり；
各Ｒ１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル若しくはハロであり；
Ｒ２は、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員若しくは６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５−ヘテロシクリル〜７−ヘテロシクリルであり、アルキルは、任意選択により１つ以上のＲ４で置換され；及びアリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ５で置換され；
Ｒ３は水素であるか、又は
【化２８】
2021501570.tif 000035
が二重結合であるとき、Ｒ３は、存在せず；
各Ｒ４は、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ６Ｒ６’、−ＮＲ６Ｃ（Ｏ）Ｒ６’、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜４個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル環から独立して選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
各Ｒ５は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリル、Ｃ６〜Ｃ１０アリール並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールから独立して選択されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ５は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ６及びＲ６’は、それぞれ独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ７は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、−Ｃ（Ｏ）Ｒ８、−Ｃ（Ｏ）ＮＲ８Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）Ｒ９、−ＮＲ８Ｃ（Ｏ）ＯＲ９、（Ｃ１〜Ｃ６）ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２、シアノ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ７カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから独立して選択されるか、又は
２つのＲ７は、隣接する原子上にある場合、それらが結合される原子とともにＣ６〜Ｃ１０アリール又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換されるか、又は
２つのＲ７は、それらが結合される原子とともにＣ５〜Ｃ７カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルを形成し、任意選択により１つ以上のＲ１０で置換され；
Ｒ８及びＲ９は、それぞれ独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ１〜Ｃ６アルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルキル、Ｃ１〜Ｃ６ハロアルコキシ、Ｃ１〜Ｃ６ヒドロキシアルキル、ハロ、−ＯＨ、−ＮＨ２及びシアノから独立して選択され；
Ｒｘは、水素又は重水素であり；
ｎは、１又は２であり；及び
ｑは、０、１、２、３又は４である）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物若しくは互変異性体である。
【０４４４】
ある実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩ−ｂ）：
【化２９】
2021501570.tif 000036
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体であり、式中、Ｘ１、Ｒ１、Ｒ２、ｎ、ｑ及びその下位の変数は、式（ＩＩＩ）について上に記載されるとおりに定義される。
【０４４５】
ある実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩ−ｃ）：
【化３０】
2021501570.tif 000037
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体であり、式中、Ｒ１、Ｒ２、ｎ、ｑ及びその下位の変数は、式（ＩＩＩ）について記載されるとおりに定義される。
【０４４６】
ある実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩ−ｄ）：
【化３１】
2021501570.tif 000038
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体であり、Ｒ１、Ｒ２、ｑ及びその下位の変数は、式（ＩＩＩ）について記載されるとおりに定義される。
【０４４７】
ある実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩ−ｅ）
【化３２】
2021501570.tif 000039
の化合物又はその薬学的に許容される塩、水和物、溶媒和物、プロドラッグ、立体異性体及び互変異性体であり、式中、Ｒ１、Ｒ２、ｑ及びその下位の変数は、式（ＩＩＩ）について記載されるとおりに定義される。
【０４４８】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり且つｎは１である。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、且つｑは０である。
【０４４９】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、且つｑは０又は１である。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、且つＲ１はＣ１〜Ｃ６アルキルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０４５０】
別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０４５１】
上記の式のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４５２】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４５３】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４５４】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４５５】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり、アリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、１〜３個のＲ５で任意選択により置換される。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４５６】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ６〜Ｃ１０アリールである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５員又は６員ヘテロアリールである。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ３〜Ｃ８カルボシクリルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４５７】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり、アリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、１〜３個のＲ５で任意選択により置換される。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４５８】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ６〜Ｃ１０アリールである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５員又は６員ヘテロアリールである。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ３〜Ｃ８カルボシクリルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４５９】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０４６０】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６１】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６２】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６３】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６４】
上の式のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６５】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６６】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６７】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６８】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４６９】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７０】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７１】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、ハロ、−ＯＨ、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７２】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７３】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７４】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７５】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７６】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールから選択され、フェニル及びヘテロアリール基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７７】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル及びヘテロアリール基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７８】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリールから選択され、フェニル及びヘテロアリール基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４７９】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、フェニル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、フェニル及びヘテロアリール基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４８０】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換されたフェニルである。
【０４８１】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換されたフェニルである。
【０４８２】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換されたフェニルである。
【０４８３】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは１であり、ｎ１は１であり、ｑは０であり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換されたフェニルである。
【０４８４】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、且つｎは２である。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、且つｑは０である。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、且つｑは０又は１である。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、且つＲ１はＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０４８５】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０４８６】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルである。
【０４８７】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４８８】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、−Ｃ（Ｏ）ＯＲ６、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４８９】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で任意選択により置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４９０】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、Ｒ２は、１〜３個のＲ４で置換されたＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つ各Ｒ４は、独立して、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５員又は６員ヘテロアリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル並びにＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルから選択され、アリール、ヘテロアリール、カルボシクリル及びヘテロシクリル基は、１〜３個のＲ７で任意選択により置換される。
【０４９１】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり、アリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、１〜３個のＲ５で任意選択により置換される。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４９２】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ６〜Ｃ１０アリールである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５員又は６員ヘテロアリールである。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ３〜Ｃ８カルボシクリルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４９３】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルであり、アリール、カルボシクリル及びヘテロシクリルは、１〜３個のＲ５で任意選択により置換される。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、Ｃ６〜Ｃ１０アリール、Ｃ３〜Ｃ８カルボシクリル又はＯ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含む５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４９４】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ６〜Ｃ１０アリールである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０であり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５員又は６員ヘテロアリールである。さらに別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、１〜３個のＲ５で任意選択により置換されたＣ３〜Ｃ８カルボシクリルである。別の実施形態では、Ｘ１はＣＨであり、ｎは２であり、ｑは０又は１であり、Ｒ１はＣ１〜Ｃ６アルキルであり、且つＲ２は、Ｏ、Ｎ及びＳから選択される１〜３個のヘテロ原子を含み、１〜３個のＲ５で任意選択により置換された５〜７員ヘテロシクリルである。
【０４９５】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、
【化３３】
2021501570.tif 000040
は、
【化３４】
2021501570.tif 000041
【化３５】
2021501570.tif 000042
である。
【０４９６】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、
【化３６】
2021501570.tif 000043
は、
【化３７】
2021501570.tif 000044
である。
【０４９７】
式（ＩＩＩ）のいくつかの実施形態では、
【化３８】
2021501570.tif 000045
は、
【化３９】
2021501570.tif 000046
である。
【０４９８】
分解化合物は、１つ以上のキラル中心を含み得るし、１つ以上の立体異性体として存在し得る。いくつかの実施形態では、分解化合物は、１つのキラル中心を含み、立体異性体、例えば、Ｒ立体異性体及びＳ立体異性体の混合物である。いくつかの実施形態では、混合物は、Ｒ立体異性体とＳ立体異性体の比、例えば、約１：１比のＲ立体異性体とＳ立体異性体（すなわち、ラセミ混合物）を含む。いくつかの実施形態では、混合物は、約５１：４９、約５２：４８、約５３：４７、約５４：４６、約５５：４５、約６０：４０、約６５：３５、約７０：３０、約７５：２５、約８０：２０、約８５：１５、約９０：１０、約９５：５又は約９９：１のＲ立体異性体とＳ立体異性体の比を含む。いくつかの実施形態では、混合物は、約５１：４９、約５２：４８、約５３：４７、約５４：４６、約５５：４５、約６０：４０、約６５：３５、約７０：３０、約７５：２５、約８０：２０、約８５：１５、約９０：１０、約９５：５又は約９９：１のＳ立体異性体とＲ立体異性体の比を含む。いくつかの実施形態では、分解化合物は、式（Ｉ）又は式（Ｉ−ａ）の単一の立体異性体、例えば、単一のＲ立体異性体又は単一のＳ立体異性体である。
【０４９９】
いくつかの実施形態では、分解化合物（例えば、式（Ｉ）、式（Ｉ−ａ）、（ＩＩＩ）、（ＩＩＩ−ａ）、（ＩＩＩ−ｂ）、（ＩＩＩ−ｃ）、（ＩＩＩ−ｄ）又は（ＩＩＩ−ｅ）の化合物）は、リンカー又は結合基に結合されない。いくつかの実施形態では、分解化合物（例えば、式（Ｉ）、式（Ｉ−ａ）、（ＩＩＩ）、（ＩＩＩ−ａ）、（ＩＩＩ−ｂ）、（ＩＩＩ−ｃ）、（ＩＩＩ−ｄ）又は（ＩＩＩ−ｅ）の化合物）は、別の部分、例えば、リガンド、標的化剤又は二量体化できる部分を含まない。
【０５００】
ある実施形態では、分解化合物は、式（Ｉ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（Ｉ−ａ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ−ａ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ−ｂ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ−ｃ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ−ｄ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。ある実施形態では、分解化合物は、式（ＩＩＩ−ｅ）の化合物又はその薬学的に許容される塩である。
【０５０１】
本開示の例示的な分解化合物（例えば、式（ＩＩＩ）、式（ＩＩＩ−ａ）、式（ＩＩＩ−ｂ）、式（ＩＩＩ−ｃ）、式（ＩＩＩ−ｄ）若しくは式（ＩＩＩ−ｅ）の化合物又はその薬学的に許容される塩）としては、表２９におけるものが挙げられる。
【０５０２】
【表６】
2021501570.tif 000047
【０５０３】
【表７】
2021501570.tif 000048
【０５０４】
【表８】
2021501570.tif 000049
【０５０５】
【表９】
2021501570.tif 000050
【０５０６】
【表１０】
2021501570.tif 000051
【０５０７】
【表１１】
2021501570.tif 000052
【０５０８】
【表１２】
2021501570.tif 000053
【０５０９】
【表１３】
2021501570.tif 000054
【０５１０】
【表１４】
2021501570.tif 000055
【０５１１】
【表１５】
2021501570.tif 000056
【０５１２】
【表１６】
2021501570.tif 000057
【０５１３】
【表１７】
2021501570.tif 000058
【０５１４】
【表１８】
2021501570.tif 000059
【０５１５】
【表１９】
2021501570.tif 000060
【０５１６】
【表２０】
2021501570.tif 000061
【０５１７】
【表２１】
2021501570.tif 000062
【０５１８】
【表２２】
2021501570.tif 000063
【０５１９】
【表２３】
2021501570.tif 000064
【０５２０】
【表２４】
2021501570.tif 000065
【０５２１】
【表２５】
2021501570.tif 000066
【０５２２】
【表２６】
2021501570.tif 000067
【０５２３】
【表２７】
2021501570.tif 000068
【０５２４】
【表２８】
2021501570.tif 000069
【０５２５】
【表２９】
2021501570.tif 000070
【０５２６】
【表３０】
2021501570.tif 000071
【０５２７】
【表３１】
2021501570.tif 000072
【０５２８】
【表３２】
2021501570.tif 000073
【０５２９】
【表３３】
2021501570.tif 000074
【０５３０】
【表３４】
2021501570.tif 000075
【０５３１】
【表３５】
2021501570.tif 000076
【０５３２】
【表３６】
2021501570.tif 000077
【０５３３】
【表３７】
2021501570.tif 000078
【０５３４】
【表３８】
2021501570.tif 000079
【０５３５】
【表３９】
2021501570.tif 000080
【０５３６】
【表４０】
2021501570.tif 000081
【０５３７】
【表４１】
2021501570.tif 000082
【０５３８】
【表４２】
2021501570.tif 000083
【０５３９】
【表４３】
2021501570.tif 000084
【０５４０】
【表４４】
2021501570.tif 000085
【０５４１】
【表４５】
2021501570.tif 000086
【０５４２】
【表４６】
2021501570.tif 000087
【０５４３】
【表４７】
2021501570.tif 000088
【０５４４】
【表４８】
2021501570.tif 000089
【０５４５】
【表４９】
2021501570.tif 000090
【０５４６】
【表５０】
2021501570.tif 000091
【０５４７】
【表５１】
2021501570.tif 000092
【０５４８】
【表５２】
2021501570.tif 000093
【０５４９】
【表５３】
2021501570.tif 000094
【０５５０】
【表５４】
2021501570.tif 000095
【０５５１】
【表５５】
2021501570.tif 000096
【０５５２】
【表５６】
2021501570.tif 000097
【０５５３】
【表５７】
2021501570.tif 000098
【０５５４】
【表５８】
2021501570.tif 000099
【０５５５】
【表５９】
2021501570.tif 000100
【０５５６】
【表６０】
2021501570.tif 000101
【０５５７】
【表６１】
2021501570.tif 000102
【０５５８】
【表６２】
2021501570.tif 000103
【０５５９】
【表６３】
2021501570.tif 000104
【０５６０】
【表６４】
2021501570.tif 000105
【０５６１】
【表６５】
2021501570.tif 000106
【０５６２】
【表６６】
2021501570.tif 000107
【０５６３】
【表６７】
2021501570.tif 000108
【０５６４】
【表６８】
2021501570.tif 000109
【０５６５】
【表６９】
2021501570.tif 000110
【０５６６】
【表７０】
2021501570.tif 000111
【０５６７】
【表７１】
2021501570.tif 000112
【０５６８】
【表７２】
2021501570.tif 000113
【０５６９】
【表７３】
2021501570.tif 000114
【０５７０】
【表７４】
2021501570.tif 000115
【０５７１】
【表７５】
2021501570.tif 000116
【０５７２】
別の態様では、分解化合物は、式（ＩＩ）：
【化４０】
2021501570.tif 000117
（式中、
Ｘは、Ｏ又はＳであり；
Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、１つ以上のＲ４によって独立して且つ任意選択により置換され；
Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであるか；又はＲ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合される炭素原子と合わせて、カルボニル基又はチオカルボニル基を形成し；
Ｒ１０の各々は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）若しくは−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ又はＬ−タグであり；各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１１で置換され；
各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ７で置換され；
ＲＡ、ＲＢ、ＲＣ、ＲＤ及びＲＥの各々は、独立して、水素又はＣ１〜Ｃ６アルキルであり；
各Ｒ１１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ８で置換され；
各Ｒ７は、独立して、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｒ８は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡであり；
各Ｌは、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ１、−ＯＲＢ１、−Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｎ（ＲＣ１）Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ１）（ＲＤ１）又は−Ｎ（ＲＣ１）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１であり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１２で置換され；
各タグは、標的タンパク質に結合可能な標的化部分であり；
ＲＡ１、ＲＢ１、ＲＣ１、ＲＤ１及びＲＥ１の各々は、独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１つ以上のＲ１２で置換され；
各Ｒ１２は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、シアノ、カルボシクリル又はヘテロシクリルであり；
ｎは、０、１、２、３又は４であり；及び
ｘは、０、１又は２である）
の化合物又はその薬学的に許容される塩、エステル、水和物、互変異性体若しくはプロドラッグである。
【０５７３】
いくつかの実施形態では、Ｘは、Ｏである。
【０５７４】
いくつかの実施形態では、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、それらの各々は、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ４（例えば、１個のＲ４、２個のＲ４、３個のＲ４、４個のＲ４、５個のＲ４、６個のＲ４、７個のＲ４、８個のＲ４、９個のＲ４、１０個のＲ４、１１個のＲ４又は１２個のＲ４）により置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、Ｃ１〜Ｃ６アルキル又はヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、Ｒ４によって置換されたＣ１〜Ｃ６アルキル（例えば、メチル又はエチル）である。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、１〜６個のＲ４によって置換されたＣ１〜Ｃ６アルキル（例えば、メチル又はエチル）である。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、６員ヘテロシクリル又は５員ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、任意選択により１〜６個のＲ４（例えば、１個のＲ４、２個のＲ４、３個のＲ４、４個のＲ４、５個のＲ４又は６個のＲ４）により置換された６員ヘテロシクリル又は５員ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、窒素含有ヘテロシクリルである。いくつかの実施形態では、Ｒ１は、ピペリジニル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。
【０５７５】
いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。
【０５７６】
いくつかの実施形態では、各Ｒ１０は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）若しくは−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ又はＬ−タグであり；各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ１１（例えば、１個のＲ１１、２個のＲ１１、３個のＲ１１、４個のＲ１１、５個のＲ１１、６個のＲ１１、７個のＲ１１、８個のＲ１１、９個のＲ１１、１０個のＲ１１、１１個のＲ１１又は１２個のＲ１１）で置換される。いくつかの実施形態では、Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡである。いくつかの実施形態では、Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル（例えば、ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２）、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、ＮＨ２）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ（例えば、ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ３）である。
【０５７７】
いくつかの実施形態では、各Ｒ４は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、ハロ、シアノ、オキソ、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ）（ＲＤ）又は−Ｎ（ＲＣ）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ７（例えば、１個のＲ７、２個のＲ７、３個のＲ７、４個のＲ７、５個のＲ７、６個のＲ７、７個のＲ７、８個のＲ７、９個のＲ７、１０個のＲ７、１１個のＲ７又は１２個のＲ７）で置換される。
【０５７８】
いくつかの実施形態では、各Ｒ１１は、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、ハロ、オキソ、シアノ、−ＯＲＢ、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）、−Ｎ（ＲＣ）Ｃ（Ｏ）ＲＡ、アリール又はヘテロアリールであり、各アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜６個のＲ８（例えば、１個のＲ８、２個のＲ８、３個のＲ８、４個のＲ８、５個のＲ８又は６個のＲ８）で置換される。
【０５７９】
いくつかの実施形態では、各Ｌは、独立して、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、−Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｃ（Ｏ）ＯＲＢ１、−ＯＲＢ１、−Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｃ（Ｏ）Ｎ（ＲＣ１）（ＲＤ１）、−Ｎ（ＲＣ１）Ｃ（Ｏ）ＲＡ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１、−Ｓ（Ｏ）ｘＮ（ＲＣ１）（ＲＤ１）又は−Ｎ（ＲＣ１）Ｓ（Ｏ）ｘＲＥ１であり、各アルキル、アルケニル、アルキニル及びヘテロアルキルは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ１２（例えば、１個のＲ１２、２個のＲ１２、３個のＲ１２、４個のＲ１２、５個のＲ１２、６個のＲ１２、７個のＲ１２、８個のＲ１２、９個のＲ１２、１０個のＲ１２、１１個のＲ１２又は１２個のＲ１２）で置換される。
【０５８０】
いくつかの実施形態では、ＲＡ１、ＲＢ１、ＲＣ１、ＲＤ１及びＲＥ１の各々は、独立して、水素、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール又はヘテロアリールであり、各アルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール及びヘテロアリールは、独立して且つ任意選択により１〜１２個のＲ１２（例えば、１個のＲ１２、２個のＲ１２、３個のＲ１２、４個のＲ１２、５個のＲ１２、６個のＲ１２、７個のＲ１２、８個のＲ１２、９個のＲ１２、１０個のＲ１２、１１個のＲ１２又は１２個のＲ１２）で置換される。
【０５８１】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。ある実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。ある実施形態では、ｎは１である。ある実施形態では、Ｒ１０は、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）である。ある実施形態では、分解化合物は、レナリドミド、例えば、３−（４−アミノ−１−オキソイソインドリン−２−イル）ピペリジン−２，６−ジオン又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解化合物は、例えば、以下の式：
【化４１】
2021501570.tif 000118
によるレナリドミドである。
【０５８２】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジニル−２，６−ジオニル）である。いくつかの実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。ある実施形態では、ｎは１である。ある実施形態では、Ｒ１０は、−Ｎ（ＲＣ）（ＲＤ）（例えば、−ＮＨ２）である。ある実施形態では、分解化合物は、ポマリドミド、例えば、４−アミノ−２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）イソインドリン−１，３−ジオン又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解化合物は、例えば、以下の式：
【化４２】
2021501570.tif 000119
によるポマリドミドである。
【０５８３】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジニル−２，６−ジオニル）である。ある実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂは、それらが結合する炭素と合わせてカルボニル基を形成する。ある実施形態では、ｎは０である。ある実施形態では、分解化合物は、サリドマイド、例えば、２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）イソインドリン−１，３−ジオン又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解産物は、例えば、以下の式：
【化４３】
2021501570.tif 000120
によるサリドマイドである。
【０５８４】
ある実施形態では、Ｘは、Ｏである。ある実施形態では、Ｒ１は、ヘテロシクリル（例えば、ピペリジン−２，６−ジオニル）である。ある実施形態では、Ｒ２ａ及びＲ２ｂの各々は、独立して水素である。ある実施形態では、ｎは１である。ある実施形態では、Ｒ１０は、Ｃ１〜Ｃ６ヘテロアルキル（例えば、ＣＨ２ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ２−フェニル−ｔ−ブチル）である。ある実施形態では、分解化合物は、２−（４−（ｔｅｒｔ−ブチル）フェニル）−Ｎ−（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−５−イル）メチル）アセトアミド又はその薬学的に許容される塩を含む。ある実施形態では、分解化合物は、以下の式：
【化４４】
2021501570.tif 000121
において示されるとおりの構造を有する。
【０５８５】
いくつかの実施形態では、分解化合物（例えば、式（ＩＩ）の化合物）は、リンカー又は結合基に結合されない。いくつかの実施形態では、分解化合物（例えば、式（ＩＩ）の化合物）は、別の部分、例えば、リガンド、標的化剤又は二量体化できる部分を含まない。いくつかの実施形態では、Ｒ１０は、Ｌ−タグではない。
【０５８６】
いくつかの実施形態では、分解化合物（例えば、式（ＩＩ）の化合物）は、リンカー又は結合基に結合される（例えば、少なくとも１つのＲ１０は、Ｌ−タグである）。いくつかの実施形態では、分解化合物（例えば、式（ＩＩ）の化合物）は、別の部分、例えば、リガンド、標的化剤又は二量体化できる部分を含む。いくつかの実施形態では、Ｒ１０はＬ−タグであり、且つＬはアルキル又はヘテロアルキル（例えば、ＰＥＧ鎖）である。いくつかの実施形態では、Ｌは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、図２８〜３１）において開示されるリンカーから選択されるリンカーである。
【０５８７】
いくつかの実施形態では、Ｒ１０はＬ−タグであり、且つタグは、標的タンパク質に結合できるか又は結合される標的化部分である。タグは、小分子化合物又はアミノ酸配列（例えば、ペプチド又はポリペプチド）を含み得る。いくつかの実施形態では、タグは、キナーゼ阻害剤、ＢＥＴブロモドメイン含有タンパク質阻害剤、細胞質ゾルシグナル伝達タンパク質ＦＫＢＰ１２リガンド、ＨＤＡＣ阻害剤、リジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管新生阻害剤、免疫抑制性化合物又はアリール炭化水素受容体（ＡＨＲ）阻害剤である。
【０５８８】
特定の実施形態では、タグはＳＥＲＭ（選択的エストロゲン受容体修飾薬）又はＳＥＲＤ（選択的エストロゲン受容体分解薬）である。ＳＥＲＭ及びＳＥＲＤの非限定的な例は、国際公開第２０１４／１９１７２６号パンフレット、国際公開第２０１３／０９０９２１号パンフレット、国際公開第２０１４／２０３１２９号パンフレット、国際公開第２０１４／２０５１３６号パンフレット、国際公開第２０１４／２０５１３８号パンフレット及び国際公開第２０１４／２０３１３２号パンフレット；米国特許出願公開第２０１３／０１７８４４５号明細書及び米国特許出願公開第２０１５／０００５２８６号明細書；並びに米国特許第９，０７８，８７１号明細書、米国特許第８，８５３，４２３号明細書及び米国特許第８，７０３，８１０号明細書において提供される。
【０５８９】
さらなるタグとしては、例えば、内因性タンパク質に結合する（標的タンパク質に結合する）任意の部分が挙げられる。例示的なタグとしては、多数の他のものの中で、Ｈｓｐ９０阻害剤、キナーゼ阻害剤、ＨＤＭ２及びＭＤＭ２阻害剤、ヒトＢＥＴブロモドメイン含有タンパク質を標的化する化合物、ＨＤＡＣ阻害剤、ヒトリジンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、血管新生阻害剤、核ホルモン受容体化合物、免疫抑制性化合物及びアリール炭化水素受容体（ＡＨＲ）を標的化する化合物が挙げられる。このような小分子タグとしては、薬学的に許容される塩、エナンチオマー、溶媒和物及びこれらの組成物の多形並びに目的の標的タンパク質に結合し得る他の小分子も挙げられる。
【０５９０】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｈｅｗｉｔｔ，Ｗ．Ｍ．，ｅｔ．ａｌ．（２０１６）Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．５５：５７０３−５７０７において記載されるとおりのＵｂｃ９  ＳＵＭＯ  Ｅ２リガーゼ５Ｆ６Ｄ標的化リガンドである。
【０５９１】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｋｉｒｂｙ，Ｃ．Ａ．ｅｔ  ａｌ，（２０１２）Ａｃｔａ  Ｃｒｙｓｔａｌｌｏｇｒ．Ｓｅｃｔ．Ｆ  ６８：１１５−１１８；及びＳｈｕｌｔｚ，Ｍ．Ｄ．，ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．５６：７０４９−７０５９において記載されるとおりのＴａｎｋ１標的化リガンドである。
【０５９２】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｇｕｄｒｕｎ  Ｌａｎｇｅ，ｅｔ  ａｌ．，（２００３）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．４６，５１８４−５１９５において記載されるとおりのｐｐ６０  Ｓｒｃ標的化リガンドのＳＨ２ドメインである。
【０５９３】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｈｕｔａ，Ｂ．Ｐ．，ｅｔ  ａｌ．，（２０１６）Ｃｈｅｍｍｅｄｃｈｅｍ  １１：２７７において記載されるとおりのＳｅｃ７ドメイン標的化リガンドである。
【０５９４】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｉ．Ｎｅｍｃｏｖｉｃｏｖａ  ａｎｄ  Ｄ．Ｍ．Ｚａｊｏｎｃ  Ａｃｔａ  Ｃｒｙｓｔ．（２０１４）．Ｄ７０，８５１−８６２において記載されるとおりのサポシン−Ｂ標的化リガンドである。
【０５９５】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｌｅｏｎ，Ｒ．，Ｍｕｒｒａｙ，ｅｔ  ａｌ．，（２００９）Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ４８：１０５９１−１０６００において記載されるとおりのタンパク質Ｓ１００−Ａ７  ２ＯＷＳ標的化リガンドである。
【０５９６】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｓｃｈｅｖｉｔｚ，Ｒ．Ｗ．，ｅｔ  ａｌ．，（１９９５）Ｎａｔ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．２，４５８−４６５において記載されるとおりのホスホリパーゼＡ２標的化リガンドである。
【０５９７】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｋｒｏｊｅｒ，Ｔ．；ｅｔ  ａｌ．Ｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．２０１６，７，２３２２−２３３０において記載されるとおりのＰＨＩＰ標的化リガンドである。
【０５９８】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｍａｎｇｅｓｈ  Ｊｏｓｈｉ，ｅｔ  ａｌ．Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．（２００６）４５，３７９０−３７９５において記載されるとおりのＰＤＺ標的化リガンドである。
【０５９９】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｋａｒｌｂｅｒｇ，Ｔ．，ｅｔ  ａｌ．，（２０１５）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２９０：７３３６−７３４４において記載されるとおりのＰＡＲＰ１５標的化リガンドである。
【０６００】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ａｎｄｅｒｓｓｏｎ，Ｃ．Ｄ．，ｅｔ  ａｌ．，（２０１２）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．５５：７７０６−７７１８．；Ｗａｈｌｂｅｒｇ，Ｅ．，ｅｔ  ａｌ．（２０１２）Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３０：２８３−２８８．；Ａｎｄｅｒｓｓｏｎ，Ｃ．Ｄ．，ｅｔ  ａｌ．（２０１２）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．５５：７７０６−７７１８において記載されるとおりのＰＡＲＰ１４標的化リガンドである。
【０６０１】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｈｅｌｇｅ  Ｇａｄ，ｅｔ．ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ，（２０１４）５０８，２１５−２２１において記載されるとおりのＭＴＨ１標的化リガンドである。
【０６０２】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｌｕｚ，Ｊ．Ｇ．，ｅｔ  ａｌ．，（２０１５）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．５８：４７２７−４７３７において記載されるとおりのｍＰＧＥＳ−１標的化リガンドである。
【０６０３】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ａ．Ｄ．，ｅｔ  ａｌ（２００７）Ｓｃｉｅｎｃｅ  ３１７：５１０−５１２において記載されるとおりのＦＬＡＰ−５−リポキシゲナーゼ活性化タンパク質標的化リガンドである。
【０６０４】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｋｕｈｎ，Ｂ．；ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（２０１６）５９，４０８７−４１０２において記載されるとおりのＦＡ結合タンパク質標的化リガンドである。
【０６０５】
ある実施形態では、タグは、例えば、Ｓｏｕｅｒｓ，Ａ．Ｊ．，ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｎａｔ  Ｍｅｄ  １９：２０２−２０８において記載されるとおりのＢＣＬ２標的化リガンドである。
【０６０６】
ある実施形態では、タグは、標的タンパク質に結合することができる任意の小分子又はタンパク質であり、ユビキチンリガーゼによって作用又は分解されたものが標的タンパク質である。いくつかの実施形態では、タグは、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、表Ｔ、１１９〜１２９頁）において開示されるｄＴＡＧ標的化リガンドである。
【０６０７】
Ｒ１０がＬ−タグであるとき、タグは、標的タンパク質に結合できるか又は結合される。例示的な標的タンパク質としては、ＦＫ５０６結合タンパク質−１２（ＦＫＢＰ１２）、ブロモドメイン含有タンパク質４（ＢＲＤ４）、ＣＲＥＢ結合タンパク質（ＣＲＥＢＢＰ）又は転写活性化因子ＢＲＧ１（ＳＭＡＲＣＡ４）が挙げられる。いくつかの実施形態では、標的タンパク質は、ホルモン受容体、例えば、エストロゲン受容体タンパク質、アンドロゲン受容体タンパク質、レチノイドｘ受容体（ＲＸＲ）タンパク質又は細菌ＤＨＦＲを含むジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）を含む。いくつかの実施形態では、標的タンパク質は、細菌デヒドロゲナーゼに由来するアミノ酸配列を含む。他の実施形態では、標的タンパク質は、７，８−ジヒドロ−８−オキソグアニントリホスファターゼ、ＡＦＡＤ、アラキドン酸塩５−リポキシゲナーゼ活性化タンパク質、アポリポタンパク質、ＡＳＨ１Ｌ、ＡＴＡＤ２、バキュロウイルスＩＡＰリピート含有タンパク質２、ＢＡＺ１Ａ、ＢＡＺ１Ｂ、ＢＡＺ２Ａ、ＢＡＺ２Ｂ、Ｂｃｌ−２、Ｂｃｌ−ｘＬ、ＢＲＤ１、ＢＲＤ２、ＢＲＤ３、ＢＲＤ４、ＢＲＤ５、ＢＲＤ６、ＢＲＤ７、ＢＲＤ８、ＢＲＤ９、ＢＲＤ１０、ＢＲＤＴ、ＢＲＰＦ１、ＢＲＰＦ３、ＢＲＷＤ３、ＣＤ２０９、ＣＥＣＲ２、ＣＲＥＢＢＰ、Ｅ３リガーゼＸＩＡＰ、ＥＰ３００、ＦＡＬＺ、脂肪細胞に由来する脂肪酸結合タンパク質４（ＦＡＢＰ４）、ＧＣＮ５Ｌ２、ＧＴＰアーゼ、ｋ−ＲＡＳ、ＨＤＡＣ６、造血性プロスタグランジンＤシンターゼ、ＫＩＡＡ１２４０、乳酸グルタチオンリアーゼ、ＬＯＣ９３３４９、Ｍｃｌ−１、ＭＬＬ、ＰＡ２ＧＡ、ＰＢ１、ＰＣＡＦ、ペプチジル−プロリルｃｉｓ−ｔｒａｎｓイソメラーゼＮＩＭＡ相互作用１、ＰＨＩＰ、ポリ−ＡＤＰ−リボースポリメラーゼ１４、ポリ−ＡＤＰ−リボースポリメラーゼ１５、ＰＲＫＣＢＰ１、プロサポシン、プロスタグランジンＥシンターゼ、網膜桿体ロドプシン感受性ｃＧＭＰ  ３’，’５−環状ホスホジエステラーゼサブユニットデルタ、Ｓ１００−Ａ７、ＳＭＡＲＣＡ２、ＳＭＡＲＣＡ４、ＳＰ１００、ＳＰ１１０、ＳＰ１４０、Ｓｒｃ、Ｓｕｍｏ−結合酵素ＵＢＣ９、スーパーオキシドジスムターゼ、ＴＡＦ１、ＴＡＦ１Ｌ、タンキラーゼ１、タンキラーゼ２、ＴＩＦ１ａ、ＴＲＩＭ２８、ＴＲＩＭ３３、ＴＲＩＭ６６、ＷＤＲ９、ＺＭＹＮＤ１１又はＭＬＬ４に由来するアミノ酸配列を含む。他の実施形態では、標的タンパク質は、ＭＤＭ２に由来するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、標的タンパク質は、国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレット（例えば、１１２〜１１４頁）において開示されるｄＴＡＧである。
【０６０８】
一実施形態では、標的タンパク質は、ＢＲＤ２、ＢＲＤ３、ＢＲＤ４又はＢＲＤＴに由来する。一実施形態では、標的タンパク質は、改変されたか又は変異体のＢＲＤ２、ＢＲＤ３、ＢＲＤ４又はＢＲＤＴタンパク質である。特定の実施形態では、ＢＲＤ２の１つ以上の変異は、アミノ酸位置９７でのトリプトファン（Ｗ）の変異、アミノ酸位置１０３でのバリン（Ｖ）の変異、アミノ酸位置１１０でのロイシン（Ｌ）の変異、アミノ酸位置３７０でのＷの変異、アミノ酸位置３７６でのＶの変異又はアミノ酸位置３８１でのＬの変異を含む。
【０６０９】
一実施形態では、標的タンパク質は、細胞質ゾルシグナル伝達タンパク質ＦＫＢＰ１２に由来する。特定の実施形態では、標的タンパク質は、改変されたか又は変異体の細胞質ゾルシグナル伝達タンパク質ＦＫＢＰ１２である。特定の実施形態では、改変されたか又は変異体の細胞質ゾルシグナル伝達タンパク質ＦＫＢＰ１２は、ＦＫＢＰ１２リガンドのための増大された結合ポケットを作り出す１つ以上の変異を含有する。特定の実施形態では、１つ以上の変異は、アミノ酸位置３６でのフェニルアラニン（Ｆ）のバリン（Ｖ）への変異（Ｆ３６Ｖ）（ＦＫＢＰ１２＊又はＦＫＢＰ＊として本明細書で互換的に呼ばれる）を含む。
【０６１０】
いくつかの実施形態では、分解化合物は、各々が全体として参照により本明細書によって組み込まれる、米国特許第７，９７３，０５７号明細書；米国特許第８，５４６，４３０号明細書；米国特許第８，７１６，３１５号明細書；国際公開第２０１７／０５９０６２号パンフレット；又は国際公開第２０１７／０２４３１８号パンフレットにおいて開示される化合物である。
【０６１１】
異種ポリペプチド
本明細書では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び目的の異種ポリペプチドを含む融合ポリペプチドが提供される。いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドは、リンカー（例えば、グリシン−セリンリンカー）によって隔てられている。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される融合ポリペプチドは３つの要素：ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりのデグロンのアミノ酸配列の一部）、異種ポリペプチド及びＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドと異種ポリペプチドを隔てるリンカーを含む。他の実施形態では、本明細書に記載される融合ポリペプチドは、２つの要素：異種ポリペプチドに直接的に連結されたＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりのデグロンのアミノ酸配列の一部）を含む。これらの要素は、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド（例えば、本明細書に記載されるとおりのデグロンのアミノ酸配列の一部）が、目的の異種ポリペプチドのＮ末端、目的の異種ポリペプチドのＣ末端又は目的の異種ポリペプチドの中間に位置するように配置され得る。一実施形態では、異種ポリペプチドは、細胞質ゾル及び／又は核タンパク質であり、且つＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドに対してＮ末端に位置する。一実施形態では、異種ポリペプチドは、膜貫通タンパク質であり、且つＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチドは、異種ポリペプチドに対してＣ末端に位置する。
【０６１２】
いくつかの実施形態では、融合ポリペプチドはさらに、分解ドメインを含む。いくつかの実施形態では、分解ドメインは、異種プロテアーゼ切断部位によってＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ又はＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び異種ポリペプチドから隔てられている。
【０６１３】
本明細書で開示される融合ポリペプチドは、任意の目的の異種ポリペプチドを含み得る。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、膜貫通タンパク質（例えば、膜貫通受容体）であり得る。特定の実施形態では、目的の異種ポリペプチドは、例えば、イオンチャネル結合型受容体、酵素結合型受容体（例えば、受容体チロシンキナーゼ、チロシンキナーゼ関連受容体、受容体様チロシンホスファターゼ、受容体セリン／スレオニンキナーゼ；受容体グアニリルシクラーゼ及びヒスチジンキナーゼ関連受容体）又はＧタンパク質共役型受容体であり得る。いくつかの実施形態では、膜貫通タンパク質は、例えば、本明細書に記載されるとおりのキメラ抗原受容体である。
【０６１４】
別の実施形態では、異種ポリペプチドは、分泌タンパク質（例えば、小さい分泌タンパク質）である。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、例えば、抗体、ナノボディ又は細胞製造におけるタンパク質結合分子であり得る。いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、治療用又は臨床用タンパク質（例えば、インスリン、成長ホルモン、エリスロポエチン又は治療用抗体）であり得る。特定の実施形態では、タンパク質は、製造のための細胞に対して毒性であり得る（例えば、細菌毒素及びプロテアーゼ）。
【０６１５】
表２は、本明細書で開示される融合ポリペプチドにおける使用のための例示的異種ポリペプチドのリストを含む。さらなる目的の異種ポリペプチドは、下の節において記載されるとおりのキメラ抗原Ｔ細胞受容体を含む。
【０６１６】
【表７６】
2021501570.tif 000122
【０６１７】
ＣＡＲ抗原結合ドメイン
一態様では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び／又は分解ドメインに連結された本開示のＣＡＲは、抗原結合ドメインとも呼ばれる標的特異的結合要素を含む。一実施形態では、抗原結合ドメインを含むＣＡＲの部分は、抗原、例えば、本明細書に記載される抗原、例えば、ＣＤ１９を標的化する、例えば、それに特異的に結合する抗原結合ドメインを含む。一実施形態では、抗原結合ドメインは、ヒトＣＤ１９を標的化する、例えば、それに特異的に結合する。
【０６１８】
いくつかの実施形態では、ＣＯＦ１／ＣＲＢＮ、ＣＯＦ２／ＣＲＢＮ若しくはＣＯＦ３／ＣＲＢＮ結合ポリペプチド及び／又は分解ドメインに連結された異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲは、腫瘍抗原に結合する抗原結合ドメイン（例えば、抗体若しくは抗体断片、ＴＣＲ又はＴＣＲ断片）、膜貫通ドメイン並びに細胞内シグナル伝達ドメイン（例えば、共刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン）及び／又は一次シグナル伝達ドメインを含む。本開示に関連するＣＡＲ核酸コンストラクト、コードされたタンパク質、含有するベクター、宿主細胞、医薬組成物並びに投与及び治療の方法は、全体として参照により組み込まれる国際公開第２０１５１４２６７５号パンフレットにおいて詳細に開示される。
【０６１９】
いくつかの実施形態では、異種ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）であり、ＣＡＲは、腫瘍支持抗原（例えば、本明細書に記載されるとおりの腫瘍支持抗原）に結合する抗原結合ドメイン（例えば、抗体若しくは抗体断片、ＴＣＲ若しくはＴＣＲ断片）、膜貫通ドメイン（例えば、本明細書に記載される膜貫通ドメイン）並びに細胞内シグナル伝達ドメイン（例えば、本明細書に記載される細胞内シグナル伝達ドメイン）（例えば、共刺激ドメイン（例えば、本明細書に記載される共刺激ドメイン）及び／又は一次シグナル伝達ドメイン（例えば、本明細書に記載される一次シグナル伝達ドメイン）を含む細胞内シグナル伝達ドメイン）を含む。いくつかの実施形態では、腫瘍支持抗原は、間質細胞又は骨髄系由来サプレッサー細胞（ＭＤＳＣ）上に存在する抗原である。他の態様では、本発明は、そのような核酸によってコードされるポリペプチド並びにそのような核酸及び／又はポリペプチドを含有する宿主細胞を特徴とする。
【０６２０】
いくつかの実施形態では、ＣＡＲ分子は、ＣＤ１３７（４−１ＢＢ）シグナル伝達ドメイン、ＣＤ２８シグナル伝達ドメイン、ＣＤ２７シグナル伝達ドメイン、ＩＣＯＳシグナル伝達ドメイン、ＣＤ３ゼータシグナルドメイン又はその任意の組合せから選択される少なくとも１つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＣＡＲ分子は、ＣＤ１３７（４−１ＢＢ）、ＣＤ２８、ＣＤ２７又はＩＣＯＳから選択される１つ以上の共刺激分子から選択される少なくとも１つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
【０６２１】
いくつかの実施形態では、複数の免疫エフェクター細胞、例えば、Ｔ細胞制御性枯渇細胞の集団は、抗原結合ドメインとも呼ばれる標的特異的結合要素を含むＣＡＲをコードする核酸を含む。結合要素の選択は、標的細胞の表面を定義するリガンドの種類及び数に依存する。例えば、抗原結合ドメインは、細胞表面マーカーとして作用するリガンド又は特定の疾患状態と関連する標的細胞を認識するように選択され得る。したがって、本明細書に記載されるＣＡＲにおいて抗原結合ドメインのためのリガンドとして作用し得る細胞表面マーカーの例としては、ウイルス、細菌及び寄生虫感染症、自己免疫疾患並びに癌細胞と関連するものが挙げられる。
【０６２２】
ＣＡＲ分子、例えば、本明細書に記載されるＴＡ  ＣＡＲ又はＢＣＡ  ＣＡＲの一部であり得る様々な構成要素の非限定的な例の配列は、表３において列挙され、ここで、「ａａ」はアミノ酸を意味し、「ｎａ」は対応するペプチドをコードする核酸を意味する。
【０６２３】
【表７７】
2021501570.tif 000123
【０６２４】
【表７８】
2021501570.tif 000124
【０６２５】
【表７９】
2021501570.tif 000125
【０６２６】
【表８０】
2021501570.tif 000126
【０６２７】
【表８１】
2021501570.tif 000127
【０６２８】
【表８２】
2021501570.tif 000128
【０６２９】
【表８３】
2021501570.tif 000129
【０６３０】
【表８４】