(57)【要約】  本明細書では、アデノウイルス核酸配列及び前記核酸配列を含むアデノウイルスベクターが提供される。提供されるアデノウイルスベクターは、対象において防御免疫応答を誘導するために使用され得る。【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するファイバーポリペプチドをコードする単離された核酸配列。
【請求項２】
前記ファイバーポリペプチドが、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２に記載の単離された核酸配列。
【請求項３】
前記単離された核酸配列がさらに、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列を含む、請求項１又は２に記載の単離された核酸配列。
【請求項４】
前記ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項３に記載の単離された核酸配列。
【請求項５】
配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする単離された核酸配列。
【請求項６】
前記ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項５に記載の単離された核酸配列。
【請求項７】
請求項１〜６のいずれかに記載の核酸分子を含むベクター。
【請求項８】
アデノウイルスベクターであり、且つ導入遺伝子をさらに含む、請求項７に記載のベクター。
【請求項９】
請求項７又は８に記載のベクターを含む組換え細胞。
【請求項１０】
（ａ）請求項９に記載の組換え細胞を、前記ベクターを産生するための条件下で増殖させること；
（ｂ）前記組換え細胞から前記ベクターを単離することを含む、
ベクターを作製する方法。
【請求項１１】
請求項８に記載のベクターを含む免疫原性組成物。
【請求項１２】
必要とする対象において免疫応答を誘導する方法であって、請求項１１に記載の免疫原性組成物を前記対象に投与することを含む、方法。
【請求項１３】
（ａ）少なくとも１つの導入遺伝子；及び
（ｂ）ファイバーポリペプチドをコードする核酸配列を含むアデノウイルスベクターであって、前記ファイバーポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、アデノウイルスベクター。
【請求項１４】
前記ファイバーポリペプチドが、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１３に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項１５】
配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列をさらに含む、請求項１３又は１４に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項１６】
前記ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１５に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項１７】
前記アデノウイルスベクターがさらにＥ１欠失を含む、請求項１３〜１６のいずれか一項に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項１８】
前記アデノウイルスベクターがさらにＥ３欠失を含む、請求項１３〜１７のいずれか一項に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項１９】
前記アデノウイルスベクターが、１種以上のヒトアデノウイルス核酸配列を含むキメラアデノウイルスベクターである、請求項１３〜１８のいずれか一項に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項２０】
前記ヒトアデノウイルス核酸配列が、ヒトアデノウイルス−４、ヒトアデノウイルス−５、ヒトアデノウイルス−２６、又はヒトアデノウイルス−３５に由来する、請求項１９に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項２１】
前記アデノウイルスベクターが、ヒトアデノウイルス−５（ｈＡｄＶ−５）Ｅ４  ｏｒｆ６を含む、請求項２０に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項２２】
前記導入遺伝子が、前記Ｅ１欠失部位、前記Ｅ３欠失部位、又は右逆位末端配列（ｒＩＴＲ）に隣接して位置する、請求項１３〜２１のいずれか一項に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項２３】
前記アデノウイルスベクターが、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、及び配列番号２９からなる群から選択される核酸配列を含む、請求項１３〜２２のいずれか一項に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項２４】
前記アデノウイルスベクターが、配列番号５１又は配列番号５５から選択される核酸配列を含む、請求項１３〜１４及び１７〜２３のいずれか一項に記載のアデノウイルスベクター。
【請求項２５】
請求項１３〜２４のいずれかに記載のアデノウイルスベクター及び薬学的に許容される担体を含むワクチン。
【請求項２６】
必要とする対象において免疫応答を誘導する方法であって、請求項２５に記載のワクチンを前記対象に投与することを含む、方法。
【請求項２７】
請求項１３〜２４のいずれかに記載のアデノウイルスベクターを薬学的に許容される担体と組み合わせることを含む、ワクチンを作製する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、バイオテクノロジーに関する。より詳細には、抗原を送達し、宿主において免疫応答を誘発するための複製欠損アデノウイルスベクターなどのアデノウイルスベクターの分野及び使用に関する。
【背景技術】
【０００２】
組換えアデノウイルスベクターは、遺伝子治療適用及びワクチンに広く応用されている。ＡｄＶ−５ベクターに基づくワクチンは、様々な動物モデルにおいて強力で保護的な免疫応答を誘発することが示されている（例えば、国際公開第２００１／０２６０７号パンフレット；国際公開第２００２／２２０８０号パンフレット；Ｓｈｉｖｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ４１５：３３１（２００２）；Ｌｅｔｖｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０：７３（２００２）；Ｓｈｉｖｅｒ  ａｎｄ  Ｅｍｉｎｉ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．５５：３５５（２００４））。しかしながら、組換えＡｄＶ−５ベクターに基づくワクチンの有用性は、ヒト集団におけるＡｄＶ−５特異的中和抗体（ＮＡｂ）の高い血清有病率によって制限される可能性が高い。抗ＡｄＶ−５免疫の存在は、マウス、アカゲザル、及びヒトにおける研究において、ＡｄＶ−５に基づくワクチンの免疫原性を大幅に抑制することが示されている。
【０００３】
最も一般的なヒトアデノウイルス、例えば、ＡｄＶ−５により以前に感染又は治療された個体における既存の免疫の存在を回避するための一つの有望な戦略は、そのような既存の免疫に遭遇しないアデノウイルス血清型からの組換えベクターの開発を含む。１つのこのような戦略は、非ヒトサルアデノウイルスの使用に基づいているが、これは非ヒトサルアデノウイルスが通常ヒトに感染せず、ヒト試料では低い血清有病率を示すためである。非ヒトサルアデノウイルスは、これらのウイルスがインビトロでヒト細胞に感染できたことが示されたため、ヒトへの適用が可能である（国際公開第２００３／０００２８３号パンフレット；国際公開第２００４／０３７１８９号パンフレット）。
【０００４】
したがって、大量に生産可能で、宿主の既存の免疫に遭遇しないが依然として免疫原性があり、ベクターに挿入された異種核酸によってコードされる抗原に対して強い免疫応答を誘導することができる代替的なアデノウイルスベクターが、この分野では必要とされている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００５】
本明細書では、単離された核酸配列が提供される。単離された核酸配列は、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するファイバーポリペプチドをコードする。特定の実施形態では、ファイバーポリペプチドは、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、単離された核酸配列はさらに、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を有するヘキソン超可変領域を含むヘキソンポリペプチドをコードするヘキソン核酸配列を含む。特定の実施形態では、ヘキソンポリペプチドは、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む。
【０００６】
また、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を有するヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする単離された核酸配列も提供される。特定の実施形態では、ヘキソンポリペプチドは、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む。
【０００７】
本発明の実施形態はまた、本発明のファイバー及びヘキソン核酸配列によってコードされる単離されたファイバー及びヘキソンポリペプチドを含む。
【０００８】
特定の実施形態において、本明細書では、本明細書で開示されるヘキソンポリペプチドのうちの少なくとも１つをコードするヘキソン核酸配列、及び本明細書で開示されるファイバーポリペプチドのうちの少なくとも１つをコードする核酸配列を含む単離された核酸が提供される。特定の実施形態において、本明細書では、本明細書に記載される単離された核酸を含むベクターが提供される。一実施形態では、ベクターはウイルスベクターである。別の実施形態では、ベクターは発現ベクターである。好ましい一実施形態では、ベクターはアデノウイルスベクターである。より好ましくは、ベクターはさらに導入遺伝子を含む。
【０００９】
本明細書に記載されるベクターを含む組換え細胞も提供される。このような細胞は、組換えタンパク質の産生、組換えタンパク質の発現、又はベクター若しくはウイルス粒子の産生のために使用することができる。また、ベクターを作製する方法も提供される。方法は、（ａ）本明細書で開示される組換え細胞を、ベクターを産生するための条件下で増殖させること；及び（ｂ）組換え細胞からベクターを単離することを含む。
【００１０】
特定の実施形態では、本明細書で開示されるベクターを含む免疫原性組成物が提供される。また、本明細書で開示される免疫原性組成物を対象に投与することを含む、必要とする対象において免疫応答を誘導する方法も提供される。
【００１１】
さらに、（ａ）少なくとも１つの導入遺伝子挿入部位；及び（ｂ）ファイバーポリペプチドをコードする核酸配列を含むアデノウイルスベクターが提供され、ファイバーポリペプチドは、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、ファイバーポリペプチドは、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、アデノウイルスベクターはさらに、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を有するヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードするヘキソン核酸配列を含む。特定の実施形態では、ヘキソンポリペプチドは、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００１２】
さらに、（ａ）少なくとも１つの導入遺伝子挿入部位；及び（ｂ）ヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列を含むアデノウイルスベクターが提供され、ヘキソンポリペプチドは、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を有するヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含む。特定の実施形態では、ヘキソンポリペプチドは、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００１３】
特定の実施形態では、本明細書で提供されるアデノウイルスベクターは、複製欠損アデノウイルスベクター（ｒＡｄ）である。一実施形態では、アデノウイルスベクターは、Ｅ１欠失を含み得る。特定の実施形態では、本明細書で提供されるアデノウイルスベクターはさらに、Ｅ３欠失を含み得る。アデノウイルスベクターは、チンパンジーアデノウイルス（例えば、ＣｈＡｄ３）；ゴリラアデノウイルス；又はアカゲザルアデノウイルス（例えば、ｒｈＡｄ５１、ｒｈＡｄ５２又はｒｈＡｄ５３）などの１種以上のサルアデノウイルス（ＳＡｄＶ）に由来するアデノウイルス核酸配列を含むサルアデノウイルスベクターであり得る。アデノウイルスベクターは、１種以上のヒトアデノウイルス（例えば、ｈＡｄＶ−４、ｈＡｄＶ−５、ｈＡｄＶ−２６、ｈＡｄＶ−３５）に由来するアデノウイルス配列を含むヒトアデノウイルスベクターであり得る。好ましくは、アデノウイルスベクターは、１種以上のヒトアデノウイルス核酸配列を含むキメラアデノウイルスベクターである。ヒトアデノウイルス核酸配列は、例えば、ヒトアデノウイルス−４（ｈＡｄＶ−４）、ヒトアデノウイルス−５（ｈＡｄＶ−５）、ヒトアデノウイルス−２６（ｈＡｄＶ−２６）、又はヒトアデノウイルス−３５（ｈＡｄＶ−３５）に由来し得る。アデノウイルスベクターは、例えば、ヒトアデノウイルス−５（ｈＡｄＶ−５）  Ｅ４  ｏｒｆ６及びｏｒｆ６／７を含み得る。
【００１４】
特定の実施形態では、導入遺伝子挿入部位は、逆位末端配列（ＩＴＲ）に隣接している。特定の実施形態では、導入遺伝子は、例えば、Ｅ４領域と右ＩＴＲ（ＲＩＴＲ）の間において、Ｅ１欠失にあるか又はＥ１欠失に隣接する導入遺伝子挿入部位、Ｅ３欠失にあるか又はＥ３欠失に隣接する導入遺伝子挿入部位、及びＩＴＲに隣接する導入遺伝子挿入部位からなる群から選択される１つ以上の導入遺伝子挿入部位で挿入される。
【００１５】
特定の実施形態では、本明細書で提供されるアデノウイルスベクターは、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号５１、及び配列番号５５からなる群から選択される核酸配列を含む。
【００１６】
また、本明細書に記載されるアデノウイルスベクター及び薬学的に許容される担体を含む免疫原性組成物又はワクチンが提供される。さらに、必要とする対象において免疫応答を誘導するための方法が提供される。方法は、対象に本明細書で開示されるワクチンを投与することを含む。さらに、ベクターを作製する方法が提供される。方法は、本明細書で開示されるアデノウイルスベクターを薬学的に許容される担体と組み合わせることを含む。
【００１７】
上述の概要、及び下記の本願の好ましい実施形態の詳細な説明は、添付した図面とともに読む場合により十分に理解されることになる。しかしながら、本願は、図面に示される明確な実施形態に限定されないことを理解すべきである。
【図面の簡単な説明】
【００１８】
【図１Ａ】ＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＢＢ２４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。図１Ａは実験構成を示し、この構成はまた、図２及び図３において示される実験についても使用された。図１Ｂはインターフェロンガンマ（ＩＦＮ−γ）ＥＬＩＳＰＯＴ分析によって決定されるとおりのベクターにコードされた抗原（すなわち、Ｆｌｕｃ、ホタルルシフェラーゼ）に対してＡｄ２６．ＦＬｕｃ、ＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＢＢ２４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答のグラフを示す。ｙ軸は１０６個の脾細胞当たりのスポット形成単位（ＳＦＵ）の数を示し、点線は中程度の刺激の９５％パーセンタイルを示す。
【図１Ｂ】（上記の通り。）
【図２】Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＡｄ４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。グラフは、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴ分析によって決定されるとおりのベクターにコードされた抗原（すなわち、Ｆｌｕｃ）に対してＡｄ２６．ＦＬｕｃ、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＡｄ４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。
【図３】Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。グラフは、ＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴ分析によって決定されるとおりのベクターにコードされた抗原（すなわち、Ｆｌｕｃ）に対してＡｄ２６．ＦＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。
【図４Ａ】ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答を示す。図４Ａは実験構成を示し、この構成はまた、図５及び図６において示される実験についても使用された。図４Ｂは３種の異なる濃度（１０８、１０９及び１０１０ｖｐ）のＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、又は１０１０ｖｐのＡｄ２６．ＦＬｕｃ及びＢＢ２１．ＦＬｕｃによる免疫化後８週目に実施された呼吸器多核体ウイルス中和アッセイ（ＶＮＡ）の結果を示す。グラフは、終点力価として計算された呼吸器多核体ウイルス株Ａ２（ＲＳＶ  Ａ２）に対するＶＮＡ力価を示す（ｌｏｇ２）。図４ＣはＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴ分析によって決定されるとおりのベクターにコードされた抗原ＲＳＶ  Ｆに対してＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。図４Ｄは免疫化後８週目の免疫化マウスの血清中のＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるＲＳＶ  Ｆ特異的ＩｇＧ結合抗体力価のグラフを示す。グラフは、終点力価として計算されたＩｇＧ  ＥＬＩＳＡ力価を示す（ｌｏｇ１０）。
【図４Ｂ】（上記の通り。）
【図４Ｃ】（上記の通り。）
【図４Ｄ】（上記の通り。）
【図５Ａ】ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答を示す。図５Ａは３種の異なる濃度（１０８、１０９及び１０１０ｖｐ）のＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４８．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、又は１０１０ｖｐのＡｄ２６．ＦＬｕｃ、ＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４８．ＦＬｕｃによる免疫化後８週目に実施された呼吸器多核体ウイルス中和アッセイ（ＶＮＡ）の結果を示す。グラフは、終点力価として計算されたＲＳＶ  Ａ２に対するＶＮＡ力価を示す（ｌｏｇ２）。図５ＢはＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴ分析によって決定されるとおりのベクターにコードされた抗原ＲＳＶ  Ｆに対してＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４８．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。図５Ｃは免疫化後８週目の免疫化マウスの血清中のＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４８．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるＲＳＶ  Ｆ特異的ＩｇＧ結合抗体力価のグラフを示す。グラフは、終点力価として計算されたＩｇＧ  ＥＬＩＳＡ力価を示す（ｌｏｇ１０）。
【図５Ｂ】（上記の通り。）
【図５Ｃ】（上記の通り。）
【図６Ａ】Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答を示す。図６Ａは３種の異なる濃度（１０８、１０９及び１０１０ｖｐ）のＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、又は１０１０ｖｐのＡｄ２６．ＦＬｕｃ、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃによる免疫化後８週目に実施された呼吸器多核体ウイルス中和アッセイ（ＶＮＡ）の結果を示す。グラフは、終点力価として計算されたＲＳＶ  Ａ２に対するＶＮＡ力価を示す（ｌｏｇ２）。図６ＢはＩＦＮ−γ  ＥＬＩＳＰＯＴ分析によって決定されるとおりのベクターにコードされた抗原ＲＳＶ  Ｆに対してＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答を示す。図６Ｃは免疫化後８週目の免疫化マウスの血清中のＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるＲＳＶ  Ｆ特異的ＩｇＧ結合抗体力価のグラフを示す。グラフは、終点力価として計算されたＩｇＧ  ＥＬＩＳＡ力価を示す（ｌｏｇ１０）。
【図６Ｂ】（上記の通り。）
【図６Ｃ】（上記の通り。）
【図７】アデノウイルスベクターＡｄ４、Ａｄ５、Ａｄ２６、Ａｄ３５、Ａｄ４９、ＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４で免疫化されたマウスにおいて誘導される同種及び異種アデノウイルス中和力価を示す。
【図８】米国（ＵＳ）及び欧州連合（ＥＵ）に居住する１８歳〜５５歳までの成人に由来する２００名のヒトコホート血清試料におけるＡｄ５、Ａｄ２６、ＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４の血清有病率を示す。各ベクターに対してこれらの血清において測定された中和力価を、示されるとおりに図表において表される４種のカテゴリー（＜１６（陰性）、１６〜３００、３００〜１，０００、１０００〜４０００及び＞４０００）に分けた。
【図９】プラスミドｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１３）の概略図を示す。
【図１０】プラスミドｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ（配列番号１４）の概略図を示す。
【図１１】プラスミドｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１５）の概略図を示す。
【図１２】プラスミドｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ（配列番号１６）の概略図を示す。
【図１３】プラスミドｐＡｄ４．５ｏｒｆ６（配列番号１８）の概略図を示す。
【図１４】プラスミドｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６（配列番号２１）の概略図を示す。
【図１５】プラスミドｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６（配列番号２２）の概略図を示す。
【図１６】ＢＢ２１ファイバー（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体（配列番号５８）、及びＢＢ２４ファイバー（配列番号２）のアラインメントを示す。
【図１７】生産細胞株ｓＰＥＲ．Ｃ６における新規のベクターＢＢ２１．Ｆｌｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃの生産性を示す。
【図１８】生産細胞株ｓＰＥＲ．Ｃ６における新規のカプシドキメラベクターＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４の生産性を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１９】
本開示は、ヒトアデノウイルス種Ｅに割り当てられた新規のチンパンジーアデノウイルス単離物の単離及び同定、並びにチンパンジーヘキソン及びファイバーポリペプチドの可変領域をコードする核酸を含むワクチンベクターの構築及び評価に少なくとも部分的に基づく。本開示はさらに、ヒトアデノウイルス骨格及びキメラヘキソン若しくはファイバーポリペプチド配列又はチンパンジーヘキソン若しくはファイバーポリペプチド配列のうちの少なくとも１つを含むキメラアデノウイルスベクターの作製に少なくとも部分的に基づく。アデノウイルスベクターは、ヒトにおいて免疫応答を誘発するとともに、低い血清有病率を有することができる。アデノウイルスベクターは、ワクチンのために製剤化され、且つ目的の特異抗原に対する防御免疫を誘導するために使用され得る。
【００２０】
背景技術の項で、また本明細書全体を通して、様々な刊行物、論文及び特許が引用又は記載されており、これらの参考文献はそれぞれ、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に含まれる文献、行為、材料、装置、物品などの議論は、本発明の文脈を提供することを目的とする。そのような議論は、これらの内容のいずれか又は全てが、開示されている、又は特許請求されているあらゆる発明に関する先行技術の一部を形成することを認めるものではない。
【００２１】
別途定義されていない限り、本明細書で使用する全ての技術用語及び科学用語は、本発明が関係する分野の当業者に一般に理解されている意味と同じ意味を有する。さもなければ、本明細書で使用される特定の用語は、本明細書で規定されている意味を有する。
【００２２】
本明細書で使用する場合、及び添付した特許請求の範囲においては、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」は、別途文脈が明白に規定していない限り、複数の言及を含むことに留意しなければならない。
【００２３】
特に明記しない限り、本明細書に記載される濃度又は濃度範囲などの任意の数値は、全ての場合において、用語「約」によって修飾されていると理解されるべきである。したがって、数値は、通常、列挙された値の±１０％を含む。例えば、濃度１ｍｇ／ｍＬは、０．９ｍｇ／ｍＬ〜１．１ｍｇ／ｍＬを含む。同様に、１％（ｗ／ｖ）〜１０％（ｗ／ｖ）の濃度範囲は、０．９％（ｗ／ｖ）〜１１％（ｗ／ｖ）を含む。本明細書で使用する場合、数値範囲の使用は、全ての可能な部分的範囲、その範囲内の全ての個々の数値を明示的に含み、文脈に明らかに別段の指示がない限り、そのような範囲内の整数及び値の分数を含む。
【００２４】
別段の指示がない限り、一連の要素に先行する「少なくとも」という用語は、一連のあらゆる要素を指すと理解すべきである。当業者は、通例の実験だけを使用して、本明細書に記載される本発明の特定の実施形態に対する多数の等価物を認識することになるか、又は確認することがきできるであろう。このような等価物は、本発明に包含されるものとする。
【００２５】
本明細書で使用する場合、用語「〜を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」、「〜を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「〜を含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」、「〜を含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「〜を有する（ｈａｓ）」、「〜を有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「〜を含有する（ｃｏｎｔａｉｎｓ）」、若しくは「〜を含有する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」、又はそれらの任意の他の変形は、記載された整数又は整数群を包含することを意味するものと理解されるが、任意の他の整数又は整数群の排除を意味するものではなく、非排他的又はオープンエンドであることが意図されている。例えば、構成要素の一覧を含む組成物、混合物、プロセス、方法、物品、又は装置は必ずしもそれらの構成要素のみに限定されるものではなく、明示的に列挙されていない、又はそのような組成物、混合物、プロセス、方法、物品、若しくは装置が本来具備している他の構成要素を含むことができる。さらに、明確に反対のことを述べない限り、「又は」は包括的「又は」を意味し、排他的「又は」を意味しない。例えば、条件Ａ又はＢは、以下のいずれか１つによって満たされる。Ａが真であり（又は、存在し）且つＢが偽である（又は、存在しない）、Ａが偽であり（又は、存在しない）且つＢが真である（又は、存在する）、並びにＡ及びＢの両方が真である（又は、存在する）。
【００２６】
本明細書で使用する場合、多数の列挙された要素間の接続語「及び／又は」は、個々の選択肢及び組み合わせた選択肢の両方を包含すると理解される。例えば、２つの要素が「及び／又は」によって結合される場合、第１選択肢は第２要素を伴わない第１要素の適用性を指す。第２選択肢は、第１要素を伴わない第２要素の適用性を指す。第３選択肢は、第１及び第２要素を合わせた適用性を指す。これらの選択肢のいずれか１つは、本明細書で使用する用語「及び／又は」の意味の範囲内に含まれ、このため用語「及び／又は」の要件を満たすと理解される。２つ以上の選択肢の同時の適用性は、さらに用語「及び／又は」の意味の範囲内に含まれ、このため用語「及び／又は」の要件を満たすと理解される。
【００２７】
本明細書で使用する場合、「〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｓ  ｏｆ）」という用語、又は「〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔ  ｏｆ）」若しくは「〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」などのその変形は、本明細書及び特許請求の範囲を通して使用されるとき、記載された整数又は整数群を全て包含するが、その特定の方法、構造、又は組成物にさらなる整数又は整数群を加えることはできないことを意味する。
【００２８】
本明細書で使用する場合、「実質的に〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｓ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ  ｏｆ）」という用語、又は「実質的に〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ  ｏｆ）」若しくは「実質的に〜からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ  ｏｆ）」などのその変形は、本明細書及び特許請求の範囲を通して使用されるとき、記載された整数又は整数群を全て包含し、且つ、その特定の方法、構造、又は組成物の基本の又は新規の特性を実質的に変化させない記載された整数又は整数群を任意選択的に包含することを意味する。Ｍ．Ｐ．Ｅ．Ｐ．２１１１．０３節を参照されたい。
【００２９】
本明細書で使用する場合、「対象」は、本発明の実施形態による方法によってワクチン接種されることになるか又はワクチン接種されたあらゆる動物、好ましくは哺乳動物、最も好ましくはヒトを意味する。用語「哺乳動物」は、本明細書で使用する場合、あらゆる哺乳動物を包含する。哺乳動物の例としては、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ネコ、イヌ、マウス、ネズミ、ウサギ、モルモット、サル、ヒトなど、より好ましくはヒトが挙げられるが、これに限定されない。
【００３０】
語「右」、「左」、「下」及び「上」は、参照される図面における方向を指定する。
【００３１】
また、本明細書で好ましい発明の構成要素の寸法又は特性に言及するときに使用される「約」、「略」、「一般に」、「実質的に」などの用語は、当業者に理解されるとおり、記載された寸法／特性が厳密な境界又はパラメータではなく、機能的に同じか又は類似している、そこからのわずかな変形を排除しないことを示すことは理解されたい。少なくとも、そのような数値パラメータを含む言及は、当該技術分野で受容されている数学的及び工業的原理（例えば、四捨五入、測定又はその他の系統誤差、製造上の公差など）を使用して、最下位数を変化させない変動を含むであろう。
【００３２】
２つ以上の核酸又はポリペプチド配列（例えば、ヘキソン及びファイバーポリペプチド並びにそれらをコードするポリヌクレオチド）の文脈における用語「同一」又はパーセント「同一性」は、以下の配列比較アルゴリズムの１つを用いて、又は目視による調査によって測定されるとおり、最大の一致について比較及び整列される場合に、同じあるか、又は特定のパーセンテージの同じであるアミノ酸残基若しくはヌクレオチドを有する２つ以上の配列又は部分配列を指す。
【００３３】
配列比較のために、通常１つの配列が参照配列として作用し、それに対して試験配列が比較される。配列比較アルゴリズムを使用するとき、試験配列及び参照配列をコンピューターに入力し、必要に応じて部分配列の座標を指定し、配列アルゴリズムプログラムパラメータを指定する。次に、配列比較アルゴリズムが、指定されたプログラムパラメータに基づいて参照配列に対する試験配列のパーセント配列同一性を計算する。
【００３４】
比較のための配列の最適なアラインメントは、例えば、Ｓｍｉｔｈ  ＆  Ｗａｔｅｒｍａｎ，Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．２：４８２（１９８１）の局所相同性アルゴリズムによって、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ  ＆  Ｗｕｎｓｃｈ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４３（１９７０）の相同性アラインメントアルゴリズムによって、Ｐｅａｒｓｏｎ  ＆  Ｌｉｐｍａｎ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：２４４４（１９８８）の類似性検索法、これらのアルゴリズムのコンピューターによる実行（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ  Ｐａｃｋａｇｅ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，５７５  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ｄｒ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩのＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡ、及びＴＦＡＳＴＡ）によって、又は目視による調査（一般に、Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，Ｇｒｅｅｎｅ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ，Ｉｎｃ．とＪｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，の合弁事業（１９９５年増補版）（Ａｕｓｕｂｅｌ）を参照のこと）によって実行され得る。
【００３５】
パーセント配列同一性及び配列類似性を判定するのに好適なアルゴリズムの例は、ＢＬＡＳＴ及びＢＬＡＳＴ２．０アルゴリズムであり、これらは、それぞれ、Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９９０）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−４１０及びＡｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２において記載される。ＢＬＡＳＴ分析を実施するためのソフトウェアは、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎを通して公的に入手可能である。このアルゴリズムは、データベース配列中の同一の長さの文字列とアラインメントさせた場合、いくつかの正の値の閾値スコアＴと一致又はそれを満たす、クエリ配列中の長さＷの短い文字列を同定することにより、高スコア配列対（ＨＳＰ）をまず同定することを含む。Ｔは隣接文字列スコア閾値と称される（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ、上記）。これらの最初の隣接文字列ヒットは、より長いＨＳＰを含む文字列を探し出すための探索を開始するためのシードとして作用する。次に、文字列ヒットは、累積アラインメントスコアが増加し得る限り、各配列に沿って両方向に伸長される。
【００３６】
累積スコアは、ヌクレオチド配列に関して、パラメータＭ（一致残基の対に関する報酬スコア；常に＞０）及びＮ（不適正残基に関するペナルティースコア；常に＜０）を用いて計算される。アミノ酸配列に関して、スコアリングマトリックスは、累積スコアを計算するために使用される。各方向における文字列ヒットの伸長は、累積アラインメントスコアが、その最大到達値から量Ｘ減少する場合；１つ以上の負のスコアの残基のアラインメントが蓄積することにより、累積スコアが０以下となる場合；又はいずれかの配列の端に到達する場合に停止される。ＢＬＡＳＴアルゴリズムのパラメータＷ、Ｔ、及びＸは、アラインメントの感度及び速度を決定する。ＢＬＡＳＴＮプログラム（ヌクレオチド配列用）は、ワード長（Ｗ）が１１、期待値（Ｅ）が１０、Ｍ＝５、Ｎ＝−４、及び両鎖の比較を初期設定として使用する。アミノ酸配列に関して、ＢＬＡＳＴＰプログラムは、ワード長（Ｗ）が３、期待値（Ｅ）が１０、及びＢＬＯＳＵＭ６２スコアリングマトリックスを初期設定として使用する（Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ＆  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：１０９１５（１９８９））。
【００３７】
パーセント配列同一性を計算することに加えて、ＢＬＡＳＴアルゴリズムはまた、２つの配列間の類似性の統計分析を行う（Ｋａｒｌｉｎ  ＆  Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９０：５８７３−５７８７（１９９３））。ＢＬＡＳＴアルゴリズムによりもたらされる類似性の１つの尺度は、２つのヌクレオチド又はアミノ酸配列間の一致が偶然に起こる確率を示す最小合計確率（Ｐ（Ｎ））である。例えば、試験核酸と参照核酸の比較における最小合計確率が約０．１未満、より好ましくは約０．０１未満、及び最も好ましくは約０．００１未満である場合、核酸は参照配列と類似していると考えられる。
【００３８】
２つの核酸配列又はポリペプチドが実質的に同一であることのさらなる指標は、以下に記載されるとおり、第１の核酸によってコードされるポリペプチドが、第２の核酸によってコードされるポリペプチドと免疫学的に交差反応性であることである。したがって、ポリペプチドは通常、例えば、２つのペプチドが保存的置換によってのみ異なる場合には第２のポリペプチドと実質的に同一である。２つの核酸配列が実質的に同一であることの別の指標は、以下に記載されるとおり、２つの分子がストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズすることである。
【００３９】
本明細書で使用する場合、用語「防御免疫」又は「防御免疫応答」は、ワクチン接種された対象が、このワクチン接種を行った対象の病原性因子による感染を防除できることを意味する。病原性因子は、例えば、抗原性遺伝子産物若しくは抗原性タンパク質、又はその断片であり得る。通常、「防御免疫応答」が発現された対象は、軽度〜中程度の臨床症状を発現するにすぎないか又は症状を全く発現しない。通常、特定の因子に対する「防御免疫応答」又は「防御免疫」を有する対象は、前記因子による感染の結果として死亡しない。
【００４０】
用語「アジュバント」は、免疫系の刺激を引き起こす１種以上の物質として定義される。この文脈において、アジュバントは、本発明のアデノウイルスベクターに対する免疫応答を増強させるために使用される。
【００４１】
本明細書で使用する場合、用語「抗原性遺伝子産物又はその断片」又は「抗原性タンパク質」は、細菌、ウイルス、寄生虫、若しくは真菌タンパク質、又はその断片を含み得る。好ましくは、抗原性タンパク質又は抗原性遺伝子産物は、宿主において防御免疫応答を高め、例えば、疾患又は感染症（例えば、細菌、ウイルス、寄生虫、若しくは真菌疾患又は感染症）に対する免疫応答を誘導し、且つ／又は疾患又は感染症に対して対象を保護する免疫を対象において疾患又は感染症に対してもたらす（すなわち、ワクチン接種する）ことができる。
【００４２】
アデノウイルスベクター
特定のアデノウイルスへの曝露は、特定のアデノウイルス血清型に対する免疫応答をもたらし、アデノウイルスベクターの有効性に影響を及ぼす可能性がある。ヒトアデノウイルスによる感染はヒトにおいて一般的であるため、ヒト集団におけるヒトアデノウイルスに対する中和抗体の有病率は高い。個体におけるこのような中和抗体の存在は、ヒトアデノウイルス骨格に基づく遺伝子導入ベクターの有効性を低減すると予想され得る。有効性の低減を回避するための１つの方法は、中和抗体の標的であるアデノウイルスカプシドタンパク質上のエピトープを置き換えることである。カプシドタンパク質上の標的配列は、低い有病率であり、したがって中和抗体がヒト集団において希少である他のアデノウイルスに由来するタンパク質配列で置き換えられ得る。
【００４３】
「カプシドタンパク質」は、特定のアデノウイルスの血清型及び／又は向性の決定に関与する、アデノウイルス（例えば、ＢＢ２１、ＢＢ２４、ＨＡｄＶ−４）又はその機能的断片若しくは誘導体のカプシド上のタンパク質を指す。カプシドタンパク質は通常、ファイバー、ペントン及び／又はヘキソンタンパク質を含む。特定の実施形態では、カプシドタンパク質は、アデノウイルスの全体又は全長カプシドタンパク質である。他の実施形態では、カプシドタンパク質は、アデノウイルスの全長カプシドタンパク質の断片又は誘導体である。特定の実施形態では、本発明のアデノウイルスベクターによってコードされるヘキソン、ペントン及びファイバーは、同じ又は異なるアデノウイルス骨格（すなわち、ＢＢ２１ヘキソン及びＢＢ２１ファイバー、ＢＢ２４ヘキソン及びＢＢ２４ファイバー、ＰｒｔｏＡｄＶ−１ヘキソン及びＢＢ２１ファイバー変異体、ＰｔｒｏＡｄＶ−１３ヘキソン及びＢＢ２４ファイバーなど）のものである。
【００４４】
「ヘキソンポリペプチド」は、アデノウイルスヘキソンコートタンパク質、その機能的断片、及び誘導体を指す。
【００４５】
「ファイバーポリペプチド」は、アデノウイルスファイバータンパク質、その機能的断片、及び誘導体を指す。
【００４６】
アデノウイルスに対する中和抗体の１つの標的は、主要なコートタンパク質であるヘキソンタンパク質である。血清型を定義し、中和抗体に結合するヘキソンタンパク質又はヘキソンタンパク質内の可変配列を、本明細書に記載されるそれらのチンパンジーアデノウイルス配列などの、ヒト集団では希少なアデノウイルスに由来するヘキソンタンパク質又はヘキソンタンパク質内の可変配列で置き換えることは、ヒトで一般的に見られる抗体による中和の影響を受けにくいアデノウイルスベクターの構築を可能にし得る。
【００４７】
アデノウイルスに対する中和抗体の第２の標的は、ファイバータンパク質である。ファイバータンパク質又はファイバータンパク質内の可変配列を、本明細書に記載されるそれらのチンパンジーアデノウイルス配列などの、ヒト集団では希少なアデノウイルスに由来するファイバータンパク質又はファイバータンパク質内の可変配列で置き換えることは、ヒトで一般的に見られる抗体による中和の影響を受けにくいアデノウイルスベクターの構築を可能にし得る。上記のファイバー置換とヘキソン置換との組合せは、ヒト集団に一般的に存在する抗体による中和に対する追加の抵抗性を付与することができる。
【００４８】
本開示は、単離されたヒト及びサルアデノウイルス血清型に由来するヘキソンポリペプチド及び／又はファイバーポリペプチドをコードする単離された核酸配列及びキメラ核酸配列並びに単離された核酸配列及び／又はキメラ核酸配列のうちの少なくとも１つを含むアデノウイルスベクターを提供する。
【００４９】
「アデノウイルスベクター」は、アデノウイルスゲノムの少なくとも一部分に由来するか又は含有する組換えベクターを指す。
【００５０】
好ましい実施形態では、単離された核酸配列は、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するファイバーポリペプチドをコードする。特定の実施形態では、単離された核酸配列は、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９９％の同一性を有するファイバーポリペプチドをコードする。特定の実施形態では、単離された核酸配列は、配列番号１対して少なくとも９８％、９９％の同一性を有するファイバーポリペプチドをコードする。ファイバードポリペプチドは、例えば、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む。特定の好ましい実施形態では、単離された核酸配列はさらに、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソンポリペプチド超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列を含む。ヘキソンポリペプチドは、例えば、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含み得る。
【００５１】
好ましい実施形態では、単離された核酸配列は、ヘキソンポリペプチド超可変領域包含ポリペプチドを含むポリペプチド配列を含むヘキソンポリペプチドをコードし、ヘキソン超可変領域包含ポリペプチドは、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、ヘキソンポリペプチドは、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む。
【００５２】
好ましい実施形態では、本明細書で開示されるヘキソンポリペプチドのうちの少なくとも１つをコードするヘキソン核酸配列、及び本明細書で開示されるファイバーポリペプチドのうちの少なくとも１つをコードする核酸配列を含む単離された核酸が提供される。
【００５３】
好ましい実施形態では、本発明の実施形態によるヘキソンポリペプチドをコードする単離された核酸配列及び／又はファイバーポリペプチドをコードする単離された核酸配列のうちの少なくとも１つを含むベクター、好ましくはアデノウイルスベクターが提供される。アデノウイルスベクターは、例えば、少なくとも１つの導入遺伝子挿入部位；並びにヘキソンポリペプチド及び／又はファイバーポリペプチドをコードする核酸配列を含み、ヘキソンポリペプチドは、本明細書で開示されるヘキソンポリペプチド超可変領域包含ポリペプチドを含むポリペプチドを含み、且つファイバーポリペプチドは、本明細書に記載されるファイバーポリペプチドを含む。
【００５４】
典型的には、本発明のアデノウイルスベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、又はバキュロウイルスベクター上に組換えアデノウイルスゲノム全体を含む。本発明の核酸分子は、クローニングにより得られるか、又は合成的に生成されるＲＮＡの形態又はＤＮＡの形態であり得る。ＤＮＡは、二本鎖又は一本鎖であり得る。
【００５５】
当業者であれば、複数の血清型に由来する要素が単一の組換えアデノウイルスベクター、例えば、ヒト又はサルアデノウイルスにおいて組み合わせ得ることを認識するであろう。したがって、異なる血清型から望ましい特性を組み合わせるキメラアデノウイルスベクターが生成され得る。したがって、いくつかの実施形態では、本発明のキメラアデノウイルスベクターは、サルヘキソン及び／又はファイバーポリペプチド配列の既存の免疫の不在を、ｒＡｄ４、ｒＡｄ５、ｒＡｄ２６又はｒＡｄ３５などの現存するアデノウイルスベクターの高いレベルの抗原送達能力及び抗原提示能力と組み合わせることができた。
【００５６】
ワクチンとして使用するためのアデノウイルスベクターの利点としては、報告されている膨大な数のアデノウイルスベクターを用いた研究、開発、製造及び臨床試験における長年の経験に基づく、操作の容易性、良好な大規模での製造可能性、及び優れた安全性の記録が挙げられる。ワクチンとして用いられるアデノウイルスベクターは一般に、導入遺伝子にコードされたタンパク質に対する良好な免疫応答、例えば細胞免疫応答をもたらす。本発明によるアデノウイルスベクターは、アデノウイルスの任意の型に基づいてもよく、特定の実施形態では、ヒトアデノウイルスであり、それは任意の群又は血清型であってもよい。好ましい実施形態では、組換えアデノウイルスは、群Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ又はＧに由来するヒトアデノウイルスに基づく。他の好ましい実施形態では、組換えアデノウイルスは、ヒトアデノウイルス血清型５、１１、２６、３４、３５、４８、４９、又は５０に基づく。他の実施形態では、それはサルアデノウイルス、例えばチンパンジーアデノウイルス又はゴリラアデノウイルスであり、それらは任意の血清型であってもよい。特定の実施形態では、組換えアデノウイルスは、チンパンジーアデノウイルス１、３、７、８、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７．１、２８．１、２９、３０、３１．１、３２、３３、３４、３５．１、３６、３７．２、３９、４０．１、４１．１、４２．１、４３、４４、４５、４６、４８、４９、５０、６７、又はＳＡ７Ｐ型に基づく。
【００５７】
より好ましい実施形態では、第２の組成物のチンパンジーアデノウイルスベクターは、ＣｈＡｄＶ３である。組換えチンパンジーアデノウイルス血清型３（ＣｈＡｄ３又はｃＡｄ３）は、ヒトアデノウイルス血清型５（Ａｄ５）のものと類似した特性を有する亜群Ｃのアデノウイルスである。ＣｈＡｄ３は、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）のための候補ワクチンを評価するヒト試験において安全であり且つ免疫原性であることが示されている（Ｂａｒｎｅｓ  Ｅ，ｅｔ  ａｌ．２０１２  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ  ｍｅｄｉｃｉｎｅ  ４：１１５ｒａ１）。ＣｈＡｄ３に基づくワクチンは、ヒトＡｄ５ベクターワクチンに匹敵する免疫応答を誘導できたことが報告された。例えば、Ｐｅｒｕｚｚｉ  Ｄ，ｅｔ  ａｌ．２００９  Ｖａｃｃｉｎｅ  ２７：１２９３−３００及びＱｕｉｎｎ  ＫＭ，ｅｔ  ａｌ．２０１３  Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １９０：２７２０−３５；国際公開第２００５／０７１０９３号パンフレット；並びに国際公開第２０１１／０１３０６２７号パンフレットを参照されたい。
【００５８】
アデノウイルスベクター、その構築方法及びその増殖方法は、当該技術分野でよく知られており、例えば、米国特許第５，５５９，０９９号明細書、同第５，８３７，５１１号明細書、同第５，８４６，７８２号明細書、同第５，８５１，８０６号明細書、同第５，９９４，１０６号明細書、同第５，９９４，１２８号明細書、同第５，９６５，５４１号明細書、同第５，９８１，２２５号明細書、同第６，０４０，１７４号明細書、同第６，０２０，１９１号明細書及び同第６，１１３，９１３号明細書、並びにそれぞれＶｉｒｏｌｏｇｙ，Ｂ．Ｎ．Ｆｉｅｌｄｓ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｄ  ｅｄ．，Ｒａｖｅｎ  Ｐｒｅｓｓ，Ｌｔｄ．，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ（１９９６）の６７及び６８章に収録のＴｈｏｍａｓ  Ｓｈｅｎｋ，「Ａｄｅｎｏｖｉｒｉｄａｅ  ａｎｄ  ｔｈｅｉｒ  Ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ」、Ｍ．Ｓ．Ｈｏｒｗｉｔｚ，「Ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓｅｓ」、並びに本明細書で言及している他の参考文献に記載されている。一般的には、アデノウイルスベクターの構築は、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，２ｄ  ｅｄ．，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．（１９８９）、Ｗａｔｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ＤＮＡ，２ｄ  ｅｄ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｂｏｏｋｓ（１９９２）、及びＡｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｗｉｌｅｙ  Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ  Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ，ＮＹ（１９９５）、並びに本明細書で言及している他の参考文献に記載されているものなど、標準的な分子生物学的手法の使用を含む。
【００５９】
特定の実施形態では、アデノウイルスベクターは、Ｅ１欠失及び／又はＥ３欠失を含む。Ｅ１又はＥ３欠失は、例えば、遺伝子の完全な欠失又は部分的な欠失を含むことができ、これによりＥ１又はＥ３遺伝子産物が機能的に欠損する。したがって、特定の実施形態では、アデノウイルスは、複製欠損であり、例えば、これは、ゲノムのＥ１領域に欠失を含むためである。当業者に知られるとおり、アデノウイルスゲノムから必須領域が欠失している場合、これらの領域でコードされる機能は、好ましくは、プロデューサー細胞によってトランスに提供される必要がある。すなわち、Ｅ１、Ｅ２及び／又はＥ４領域の一部又は全部がアデノウイルスから欠失している場合、これらは、プロデューサー細胞内、例えばそのゲノムに組み込まれるか、又はいわゆるヘルパーアデノウイルス若しくはヘルパープラスミドの形態で存在する必要がある。アデノウイルスは、Ｅ３領域内にも欠失を有し得るが、これは複製に不要であるため、そのような欠失は補完される必要はない。Ｅ１、Ｅ２、Ｅ３及びＥ４領域のうちの１つ以上はまた、目的の導入遺伝子（通常、プロモーターに連結されている）を不活性化されることになる領域に挿入するなど、他の手段によっても不活性化され得る。
【００６０】
使用可能なプロデューサー細胞（当該技術分野及び本明細書では、「パッケージング細胞」又は「補完細胞」と称される場合がある）は、所望のアデノウイルスが増殖し得る任意のプロデューサー細胞であり得る。例えば、組換えアデノウイルスベクターの増殖は、アデノウイルス内の欠損を補完するプロデューサー細胞内で行われる。そのようなプロデューサー細胞は、好ましくは、それらのゲノム内に少なくとも１つのアデノウイルスＥ１配列を有し、それによりＥ１領域内に欠失を有する組換えアデノウイルスを補完することができる。任意のＥ１を補完するプロデューサー細胞、例えばＥ１により不死化されたヒト網膜細胞、例えば９１１又はＰＥＲ．Ｃ６細胞（米国特許第５，９９４，１２８号明細書を参照）、Ｅ１形質転換羊膜細胞（欧州特許第１２３０３５４号明細書を参照）、Ｅ１形質転換Ａ５４９細胞（例えば、国際公開第９８／３９４１１号パンフレット、米国特許第５，８９１，６９０号明細書を参照）、ＧＨ３２９：ＨｅＬａ（Ｇａｏ  ｅｔ  ａｌ．，２０００，Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  １１：２１３−１９）、２９３などを用いることができる。特定の実施形態では、プロデューサー細胞は、例えば、ＨＥＫ２９３細胞、又はＰＥＲ．Ｃ６細胞、又は９１１細胞、又はＩＴ２９３ＳＦ細胞などである。プロデューサー細胞内でのアデノウイルスベクターの産生は（Ｋｏｖｅｓｄｉ  ｅｔ  ａｌ．，２０１０，Ｖｉｒｕｓｅｓ  ２：１６８１−７０３）において概説される。
【００６１】
特定の実施形態では、アデノウイルスベクターは、１種以上のヒトアデノウイルス核酸配列を含むキメラアデノウイルスベクターである。ヒトアデノウイルス核酸は、例えば、ヒトアデノウイルス−４（Ａｄ−４）、ヒトアデノウイルス−５（Ａｄ−５）、ヒトアデノウイルス−２６（Ａｄ−２６）、又はヒトアデノウイルス−３５（Ａｄ−３５）から選択され得る。特定の実施形態では、Ｅ１欠損アデノウイルスベクターは、ヒトＡｄ５のアデノウイルスのＥ４−ｏｒｆ６コード配列を含む。これは、Ａｄ５のＥ１遺伝子を発現するよく知られた補完細胞株、例えば２９３細胞又はＰＥＲ．Ｃ６細胞におけるそのようなアデノウイルスの増殖を可能にする（例えば、全体が参照により本明細書に組み込まれるＦａｌｌａｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，１９９８，Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ９：１９０９−１７，Ｈａｖｅｎｇａ  ｅｔ  ａｌ．，２００６，Ｊ  Ｇｅｎ  Ｖｉｒｏｌ  ８７：２１３５−４３；国際公開第０３／１０４４６７号パンフレットを参照のこと）。
【００６２】
特定の実施形態では、アデノウイルスベクターは導入遺伝子を含む。「導入遺伝子」は、ベクター中において天然に存在しない核酸である異種核酸を指し、本発明によれば、導入遺伝子は、対象において免疫応答を誘発する抗原性遺伝子産物又は抗原性タンパク質をコードし得る。導入遺伝子は、例えば、標準的な分子生物学的手法によってベクターに導入され得る。導入遺伝子は、例えば、アデノウイルスベクターの欠失したＥ１若しくはＥ３領域内、又はＥ４領域とｒＩＴＲとの間の領域内にクローン化され得る。導入遺伝子は、一般に、発現制御配列に作動可能に連結される。好ましい実施形態では、導入遺伝子は、導入遺伝子挿入部位で挿入される。
【００６３】
必要に応じて、本発明の実施形態によるヘキソン又はファイバーポリペプチドをコードする核酸配列、及び／又は導入遺伝子は、治療される宿主（例えば、ヒト）における適切な発現を確実にするためにコドン最適化され得る。コドン最適化は、当該技術分野において広く適用されている技術である。
【００６４】
導入遺伝子は、アデノウイルス由来のプロモーター（例えば、主要後期プロモーター）の制御下に置かれ得る（すなわち、作動可能に連結され得る）か、又は異種プロモーターの制御下に置かれ得る。好適な異種プロモーターの例としては、ＣＭＶプロモーター及びＲＳＶプロモーターが挙げられる。好ましくは、プロモーターは、発現カセット内部の目的の異種遺伝子の上流に位置する。
【００６５】
好ましい実施形態では、アデノウイルスベクターは、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、配列番号２９、配列番号５１、及び配列番号５５からなる群から選択される核酸配列を含む。
【００６６】
免疫原性組成物
免疫原性組成物は、本発明における使用のための免疫学的有効量の精製された又は部分的に精製されたヒト又はサル（例えば、チンパンジー）アデノウイルスベクターを含む組成物である。前記組成物は、当該技術分野においてよく知られる方法に従ってワクチン（「免疫原性組成物」とも称される）として製剤化され得る。このような組成物は、免疫応答を増強させるためのアジュバントを含み得る。製剤における各々の構成成分の最適な比は、本開示に鑑みて当業者によく知られる技術によって決定され得る。
【００６７】
本発明の実施形態による免疫原性組成物は、本開示に鑑みて当業者に知られる方法を用いて作製され得る。液体医薬組成物としては、一般に、水、石油、動物油若しくは植物油、鉱油、又は合成油などの液体担体が挙げられる。生理食塩水溶液、ブドウ糖若しくは他の糖類溶液、又はエチレングリコール、プロピレングリコール若しくはポリエチレングリコールなどのグリコールが含まれてもよい。
【００６８】
本発明に有用な免疫原性組成物は、アジュバントを含み得る。本発明による同時投与に好適なアジュバントは、人において潜在的に安全であり、十分に耐容性を示し且つ有効であるものであるべきであり、ＱＳ−２１、Ｄｅｔｏｘ−ＰＣ、ＭＰＬ−ＳＥ、ＭｏＧＭ−ＣＳＦ、ＴｉｔｅｒＭａｘ−Ｇ、ＣＲＬ−１００５、ＧＥＲＢＵ、ＴＥＲａｍｉｄｅ、ＰＳＣ９７Ｂ、Ａｄｊｕｍｅｒ、ＰＧ−０２６、ＧＳＫ−Ｉ，ＡＳ０１、ＡＳ０３、ＡＳ０４、ＡＳ１５、ＧｃＭＡＦ、Ｂ−ａｌｅｔｈｉｎｅ、ＭＰＣ−０２６、Ａｄｊｕｖａｘ、ＣｐＧ  ＯＤＮ、Ｂｅｔａｆｅｃｔｉｎ、Ａｌｕｍ、及びＭＦ５９を含む。
【００６９】
投与され得る他のアジュバントとしては、レクチン、増殖因子、サイトカイン及びリンホカイン、例えばアルファ−インターフェロン、ガンマインターフェロン、血小板由来増殖因子（ＰＤＧＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（ｇＣＳＦ）、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ｇＭＣＳＦ）、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）、上皮増殖因子（ＥＧＦ）、ＩＬ−Ｉ、ＩＬ−２、ＩＬ−４、ＩＬ−６、ＩＬ−８、ＩＬ−１０、及びＩＬ−１２又はこれらのコード核酸が挙げられる。
【００７０】
本発明の組成物は、薬学的に許容される賦形剤、担体、緩衝剤、安定剤又は当業者によく知られる他の物質を含み得る。このような物質は、無毒性でなければならず、活性成分の効力を阻害してはならない。担体又は他の材料の厳密な性質は、投与経路、例えば筋肉内、皮下、経口、静脈内、皮膚、粘膜内（例えば、腸）、鼻腔内又は腹腔内経路に依存し得る。
【００７１】
防御免疫を誘導するための方法
本発明の別の一般的な態様は、必要とする対象において免疫応答を誘導する方法に関する。方法は、例えば、本明細書に記載されるアデノウイルスベクター及び薬学的に許容される担体を含むワクチンを対象に投与することを含み得る。また、本明細書ではワクチンを作製する方法も提供される。方法は、本明細書に記載されるアデノウイルスベクターを薬学的に許容される担体と組み合わせることを含む。
【００７２】
本明細書に記載されるものを含むが、それらに限定されない本発明の実施形態による免疫原性組成物のいずれかは、本発明の方法においてワクチンとして使用され得る。
【００７３】
ベクターを含む免疫原性組成物／ワクチンの投与は通常、筋肉内又は皮下である。しかしながら、静脈内、皮膚、皮内、生殖器又は経鼻などの他の投与様式も同様に想定され得る。免疫原性組成物の筋肉内投与は、アデノウイルスベクターの懸濁剤を注射するためのニードルを使用することにより行われ得る。代替法は、組成物を投与する無針注射デバイスの使用（例えばＢｉｏｊｅｃｔｏｒ（商標）を使用する）、又はワクチンを含有する凍結乾燥粉末である。
【００７４】
静脈内、皮膚若しくは皮下注射、又は罹患部位での注射のために、ベクターは、パイロジェンフリーであり且つ好適なｐＨ、等張性及び安定性を有する非経口的に許容される水溶液の形態となる。当業者は、例えば、塩化ナトリウム注射液、リンゲル注射液、乳酸リンゲル注射液などの等張媒体を用いて好適な溶液を調製することが十分に可能である。必要に応じて、保存剤、安定剤、緩衝剤、抗酸化剤及び／又は他の添加剤が含まれ得る。徐放性製剤もまた利用され得る。
【００７５】
通常、投与は、感染又は症状の発症の前に目的の抗原（例えば、細菌、ウイルス、寄生虫、及び／又は真菌病原体）に対する免疫応答を発生させる予防的な目的を有することになる。本発明により治療又は予防され得る疾患及び障害は、免疫応答が防御的又は治療的な役割を果たすことができるものを含む。他の実施形態では、アデノウイルスベクターは、曝露後の予防のために投与され得る。
【００７６】
ヒト又はサル（例えば、チンパンジー）アデノウイルスベクターを含有する免疫原性組成物を対象に投与すると、対象において目的の抗原に対する免疫応答が生じる。検出可能な免疫応答を誘導するのに十分な組成物の量は、組成物の「免疫原的有効用量」又は「有効量」と定義される。本発明の免疫原性組成物は、体液性及び細胞性免疫応答を誘導することができる。典型的な実施形態において、免疫応答は、防御免疫応答である。
【００７７】
投与される実際の量、及び投与の速度及び時間経過は、投与されているものの性質及び重症度に依存することになる。治療の処方、例えば、投与量などの決定は、一般開業医や他の医師、又は獣医の場合は獣医師の責任の範囲内であり、通常、治療対象の障害、個々の患者の状態、送達部位、投与方法、及び開業医に知られるその他の要因を考慮する。上述の手法及びプロトコルの例は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１６ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．ｅｄ．，１９８０において見出され得る。
【００７８】
アデノウイルスベクターの作製及びこのような粒子の組成物への任意選択的な製剤化後、ベクターは、個体、特にヒト又は他の霊長類に投与され得る。投与は、ヒト又は別の哺乳動物、例えばマウス、ラット、ハムスター、モルモット、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、ウマ、ウシ、ロバ、サル、イヌ又はネコに対するものであり得る。非ヒト哺乳動物への送達は、治療目的である必要はないが、実験の状況、例えばアデノウイルスベクターに対する免疫応答の機構の究明に使用するためであり得る。
【００７９】
１つの例示的なレジメンにおいて、アデノウイルスベクターは、約１０４〜１０１２ウイルス粒子／ｍｌの濃度を含有する約１００μｌ〜約１０ｍｌの範囲の量で投与される（例えば、筋肉内）。好ましくは、アデノウイルスベクターは、０．１〜２．０ｍｌの範囲の量で投与される。例えば、アデノウイルスベクターは、１００μｌ、５００μｌ、１ｍｌ、２ｍｌで投与され得る。より好ましくは、アデノウイルスベクターは、０．５ｍｌの量で投与される。任意選択により、アデノウイルスベクターは、約１０７ｖｐ／ｍｌ、１０８ｖｐ／ｍｌ、１０９ｖｐ／ｍｌ、１０１０ｖｐ／ｍｌ、５×１０１０ｖｐ／ｍｌ、１０１１ｖｐ／ｍｌ、又は１０１２ｖｐ／ｍｌの濃度で投与され得る。通常、アデノウイルスベクターは、ヒト対象に１回の投与で約１０９〜約１０１２ウイルス粒子（ｖｐ）の量、より典型的には約１０１０〜約１０１２ｖｐの量で投与される。
【００８０】
初回ワクチン接種の後、目的の抗原をコードする同じアデノウイルスベクターを含むワクチン／組成物又は目的の同じ抗原をコードする異なるアデノウイルスベクターを含むワクチン／組成物からのブースト又はキックが続き得る。
【００８１】
組成物は、必要に応じて、活性成分を含有する１つ以上の単位投薬形態を含むものであり得るキット、パック又はディスペンサーで提示され得る。キットは、例えば、金属又はプラスチックのホイル、例えばブリスターパックを含み得る。キット、パック又はディスペンサーに投与のための使用説明書を付随させてもよい。
【００８２】
本発明の組成物は、単独で又は他の治療と組み合わせて、治療対象の状態に応じて同時に又は順次に投与され得る。
【００８３】
実施形態
本発明はまた、以下の非限定的な実施形態を提供する。
【００８４】
実施形態１は、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するファイバーポリペプチドをコードする単離された核酸配列である。
【００８５】
実施形態２は、ファイバーポリペプチドが、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態１の単離された核酸配列である。
【００８６】
実施形態３は、単離された核酸配列がさらに、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列を含む、実施形態１又は２の単離された核酸である。
【００８７】
実施形態４は、ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態３の単離された核酸である。
【００８８】
実施形態５は、単離された核酸配列がさらに、Ｐｔｒ０１ヘキソンポリペプチド（配列番号８）又はＰｔｒ１３ヘキソンポリペプチド（配列番号１０）から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列を含む、実施形態１又は２の単離された核酸である。
【００８９】
実施形態６は、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする単離された核酸配列である。
【００９０】
実施形態７は、ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態６の単離された核酸配列である。
【００９１】
実施形態８は、実施形態１〜７のいずれか１つの核酸を含むベクターである。
【００９２】
実施形態９は、アデノウイルスベクターであり、且つ導入遺伝子をさらに含む、実施形態８のベクターである。
【００９３】
実施形態１０は、実施形態８又は９のベクターを含む組換え細胞である。
【００９４】
実施形態１１は、（ａ）実施形態１０の組換え細胞を、ベクターを産生するための条件下で増殖させること；及び（ｂ）組換え細胞からベクターを単離することを含む、ベクターを作製する方法である。
【００９５】
実施形態１２は、実施形態８又は９のベクターを含む免疫原性組成物である。
【００９６】
実施形態１３は、実施形態１２の免疫原性組成物を対象に投与することを含む、必要とする対象において免疫応答を誘導する方法である。
【００９７】
実施形態１４は、（ａ）少なくとも１つの導入遺伝子；及び（ｂ）ファイバーポリペプチドをコードする核酸配列を含むアデノウイルスベクターであって、ファイバーポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含むアデノウイルスベクターである。
【００９８】
実施形態１５は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態１４のアデノウイルスベクターである。
【００９９】
実施形態１６は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１と少なくとも９８％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態１４又は１５のアデノウイルスベクターである。
【０１００】
実施形態１７は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１と少なくとも９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態１４〜１６のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１０１】
実施形態１８は、ファイバーポリペプチドが、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態１４〜１７のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１０２】
実施形態１９は、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列をさらに含む、実施形態１４〜１８のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１０３】
実施形態２０は、ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態１９のアデノウイルスベクターである。
【０１０４】
実施形態２１は、（ａ）少なくとも１つの導入遺伝子挿入部位；及び（ｂ）ヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列を含むアデノウイルスベクターであって、ヘキソンポリペプチドが、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含むアデノウイルスベクターである。
【０１０５】
実施形態２２は、ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態２１のアデノウイルスベクターである。
【０１０６】
実施形態２３は、アデノウイルスベクターがさらにＥ１欠失又は不活性化Ｅ１を含む、実施形態１４〜２２のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１０７】
実施形態２４は、アデノウイルスベクターがさらにＥ３欠失又は不活性化Ｅ３を含む、実施形態１４〜２３のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１０８】
実施形態２５は、アデノウイルスベクターが、１種以上のヒトアデノウイルス核酸配列を含むキメラアデノウイルスベクターである、実施形態１４〜２４のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１０９】
実施形態２６は、ヒトアデノウイルス核酸配列が、ヒトアデノウイルス−４（ｈＡｄＶ−４）、ヒトアデノウイルス−５（ｈＡｄＶ−５）、ヒトアデノウイルス−２６（ｈＡｄＶ−２６）、又はヒトアデノウイルス−３５（ｈＡｄＶ−３５）に由来する、実施形態２５のアデノウイルスベクターである。
【０１１０】
実施形態２７は、アデノウイルスベクターが、ヒトアデノウイルス−５（ｈＡｄＶ−５）Ｅ４  ｏｒｆ６を含む、実施形態２６のアデノウイルスベクターである。
【０１１１】
実施形態２８は、導入遺伝子挿入部位が、逆位末端配列（ＩＴＲ）に隣接する、実施形態１４〜２７のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１１２】
実施形態２９は、導入遺伝子が、Ｅ１欠失にある導入遺伝子挿入部位、Ｅ３欠失にある導入遺伝子挿入部位、及びＩＴＲに隣接する導入遺伝子挿入部位からなる群から選択される１つ以上の導入遺伝子挿入部位で挿入される、実施形態２８のアデノウイルスベクターである。
【０１１３】
実施形態３０は、アデノウイルスベクターが、配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、及び配列番号２９からなる群から選択される核酸配列を含む、実施形態１４〜２９のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１１４】
実施形態３１は、アデノウイルスベクターが、配列番号５１又は配列番号５５から選択される核酸配列を含む、実施形態１４〜１８及び２３〜２９のいずれか１つのアデノウイルスベクターである。
【０１１５】
実施形態３２は、（ａ）少なくとも１つの導入遺伝子；（ｂ）ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）、ＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）、Ｐｔｒ０１ヘキソンポリペプチド（配列番号８）、Ｐｔｒ１３ヘキソンポリペプチド（配列番号１０）からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソンポリペプチドをコードする核酸配列、及び（ｃ）ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含むファイバーポリペプチドをコードする核酸配列を含むアデノウイルスベクターである。
【０１１６】
実施形態３３は、ヘキソンポリペプチドが、Ｐｔｒ０１ヘキソンポリペプチド（配列番号８）又はＰｔｒ１３ヘキソンポリペプチド（配列番号１０）のアミノ酸配列を含み、且つファイバーポリペプチドが、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）のアミノ酸配列を含む、実施形態３２のアデノウイルスベクターである。
【０１１７】
実施形態３４は、ヘキソンポリペプチドがＰｔｒ０１ヘキソンポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号８）を含み、且つファイバーポリペプチドがＢＢ２４ファイバーポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号２）を含む、実施形態３３のアデノウイルスベクターである。
【０１１８】
実施形態３５は、ヘキソンポリペプチドがＰｔｒ１３ヘキソンポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号１０）を含み、且つファイバーポリペプチドがＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号５８）を含む、実施形態３３のアデノウイルスベクターである。
【０１１９】
実施形態３６は、ヘキソンポリペプチドがＢＢ２１ヘキソンポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号５）を含み、且つファイバーポリペプチドがＢＢ２１ファイバーポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号１）を含む、実施形態３２のアデノウイルスベクターである。
【０１２０】
実施形態３７は、ヘキソンポリペプチドがＢＢ２４ヘキソンポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号６）を含み、且つファイバーポリペプチドがＢＢ２４ファイバーポリペプチドのアミノ酸配列（配列番号２）を含む、実施形態３２のアデノウイルスベクターである。
【０１２１】
実施形態３８は、アデノウイルスベクターがさらに、ヒトアデノウイルス−４（ＨＡｄＶ−４）、ヒトアデノウイルス−５（ＨＡｄＶ−５）、ヒトアデノウイルス−２６（ＨＡｄＶ−２６）、又はヒトアデノウイルス−３５（ＨＡｄＶ−３５）に由来する１種以上の核酸配列を含む、実施形態３２〜３７のいずれかのアデノウイルスベクターである。
【０１２２】
実施形態３９は、アデノウイルスベクターが、ヒトアデノウイルス−４（ＨＡｄＶ−４）に由来する１種以上の核酸配列及びヒトアデノウイルス−５（ＨＡｄＶ−５）Ｅ４  ｏｒｆ６の核酸配列を含む、実施形態３８のアデノウイルスベクターである。
【０１２３】
実施形態４０は、配列番号５１及び配列番号５５からなる群から選択される核酸配列を含む実施形態３９のアデノウイルスベクターである。
【０１２４】
実施形態４１は、実施形態１４〜４０のいずれかによるアデノウイルスベクター及び薬学的に許容される担体を含むワクチンである。
【０１２５】
実施形態４２は、実施形態４１のワクチンを対象に投与することを含む、必要とする対象において免疫応答を誘導するための方法である。
【０１２６】
実施形態４３は、実施形態１４〜４０のいずれかによるアデノウイルスベクターを薬学的に許容される担体と組み合わせることを含む、ワクチンを作製する方法である。
【０１２７】
実施形態４４は、配列番号３又は配列番号４から選択されるアミノ酸配列を含むヘキソン超可変領域包含ポリペプチドを含む単離されたヘキソンポリペプチドである。
【０１２８】
実施形態４５は、ヘキソンポリペプチドが、ＢＢ２１ヘキソンポリペプチド（配列番号５）又はＢＢ２４ヘキソンポリペプチド（配列番号６）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態４４の単離されたヘキソンポリペプチドである。
【０１２９】
実施形態４６は、Ｐｔｒ０１ヘキソンポリペプチド（配列番号８）又はＰｔｒ１３ヘキソンポリペプチド（配列番号１０）から選択されるアミノ酸配列を含む単離されたヘキソンポリペプチドである。
【０１３０】
実施形態４７は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９８％の同一性を有する、単離されたファイバーポリペプチドである。
【０１３１】
実施形態４８は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１のアミノ酸６〜３７５と少なくとも９９％の同一性を有する、実施形態４７の単離されたファイバーポリペプチドである。
【０１３２】
実施形態４９は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１と少なくとも９８％の同一性を有する、単離されたファイバーポリペプチドである。
【０１３３】
実施形態５０は、ファイバーポリペプチドが、配列番号１と少なくとも９９％の同一性を有する、実施形態４９の単離されたファイバーポリペプチドである。
【０１３４】
実施形態５１は、ファイバーポリペプチドが、ＢＢ２１ファイバーポリペプチド（配列番号１）、ＢＢ２１ファイバー変異体ポリペプチド（配列番号５８）、又はＢＢ２４ファイバーポリペプチド（配列番号２）から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態４９の単離されたファイバーポリペプチドである。
【０１３５】
実施形態５２は、必要とする対象において免疫応答を誘導するための実施形態４１のワクチンである。
【０１３６】
実施形態５３は、必要とする対象において免疫応答を誘導するための薬物の製造のための実施形態４１のワクチンの使用である。
【０１３７】
実施形態５４は、アデノウイルスベクターが、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４６、配列番号４７、配列番号５２、配列番号５３、配列番号５６、及び配列番号５７からなる群から選択される核酸配列を含む、アデノウイルスベクターである。
【０１３８】
実施形態５５は、アデノウイルスベクターが、配列番号３８の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１３９】
実施形態５６は、アデノウイルスベクターが、配列番号３９の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１４０】
実施形態５７は、アデノウイルスベクターが、配列番号４６の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１４１】
実施形態５８は、アデノウイルスベクターが、配列番号４７の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１４２】
実施形態５９は、アデノウイルスベクターが、配列番号５２の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１４３】
実施形態６０は、アデノウイルスベクターが、配列番号５３の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１４４】
実施形態６１は、アデノウイルスベクターが、配列番号５６の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【０１４５】
実施形態６２は、アデノウイルスベクターが、配列番号５７の核酸配列を含む、実施形態５４のアデノウイルスベクターである。
【実施例】
【０１４６】
実施例１：新規のアデノウイルスベクター単離物ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくＥ１及びＥ３欠失ベクターの作製
２つの新規のチンパンジーアデノウイルス単離物、ＢＢ２１（ＪＡｄ２−ＷＴとも命名される）及びＢＢ２４（ＪＡｄ３−ＷＴとも命名される）が同定され、且つ配列決定された。チンパンジーアデノウイルス単離物は、系統学的にヒトアデノウイルス種Ｅ（ＨＡｄＶ−Ｅ）群に属することが見出された。ＢＢ２１及びＢＢ２４の全ゲノムヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号１１及び配列番号１２であると決定された。ＢＢ２１ヘキソン及びファイバーポリペプチド配列は、それぞれ配列番号５及び１であると決定された。ＢＢ２４ヘキソン及びファイバーポリペプチド配列は、それぞれ配列番号６及び２であると決定された。ＢＢ２１及びＢＢ２４ファイバーポリペプチド配列のアラインメントは、図１５において提供される。
【０１４７】
ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくＡｄベクターの作製のために使用される単一のプラスミド系の説明
ｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１３；図９）、ｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ（配列番号１４；図１０）、ｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１５；図１１）、及びｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ（配列番号１６；図１２）は、単離物ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づく全長のＥ１及びＥ３欠失アデノウイルスベクターゲノムを保有するプラスミドである。これらのプラスミド内に含有されるＡｄベクターゲノム配列は、それぞれ配列番号２６、配列番号２７、配列番号２８、及び配列番号２９において記載される。これらのプラスミドの各々の内部において、アデノウイルスベクターゲノムは、２つのＳｗａＩ制限酵素部位に隣接する（すなわち、１つのＳｗａＩ部位が、ベクターゲノムいずれの末端にも位置する）。これらのＳｗａＩ部位は、好適なＥ１補完細胞（ＨＥＫ２９３、９１１、及びＰＥＲ．Ｃ６細胞など）のトランスフェクションによるウイルスレスキューの前にプラスミド骨格からのＡｄベクターゲノムの切除を容易にすることを意味する。これらのプラスミドによって構成されるＡｄベクターゲノムはさらに、Ｅ１欠失、Ｅ３欠失の位置、及び右逆位末端配列（ＲＩＴＲ）に隣接して導入される特定の制限酵素部位を保有する。これらの制限酵素部位は、完全Ａｄゲノムプラスミドの文脈において固有なものとして選択された。それらは、前記のそれぞれの位置又はその任意の組合せのいずれかで挿入される１つ以上の導入遺伝子発現カセットを保有するＡｄベクターの標準的な分子クローニング手法による容易な構築を可能にする「導入遺伝子挿入部位」となる。Ａｄベクターの設計及びプラスミドの構築は、以下の節においてより詳細に記載される。
【０１４８】
ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくＡｄベクターゲノムの設計
ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくＡｄベクターゲノムはそれぞれ、Ｅ１欠失、Ｅ３欠失、異なる導入遺伝子挿入部位、並びに天然Ｅ４オープンリーディングフレーム（ｏｒｆ）６及びｏｒｆ６／７のヒトアデノウイルス−５（ＨＡｄＶ−５）のものとの置換を含むように設計された。各アデノウイルスのＥ１領域は、ＡｓｉＳＩ制限酵素部位配列を含む導入遺伝子挿入部位により欠失され、且つ置換された。各アデノウイルスのＥ３領域は、ＲｓｒＩＩ制限酵素部位配列を含む導入遺伝子挿入部位により欠失され、且つ置換された。別の導入遺伝子挿入部位は、各アデノウイルスの逆位末端配列（ＩＴＲ）に隣接するＰａｃＩ制限酵素部位配列の挿入によって作製された。Ｅ４  ｏｒｆ６及びｏｒｆ６／７コード配列を含むＢＢ２１及びＢＢ２４配列は、それぞれ配列番号３０及び配列番号４０によって置換された。これらの置換配列は、ある種のＡｓｅＩ部位（クローニング目的のため）を排除する１つのサイレント変異を保有するように改変されたヒトアデノウイルス−５（ＨＡｄＶ−５）のＥ４  ｏｒｆ６及びｏｒｆ６／７コード配列（ＧｅｎＢａｎｋ配列ＡＣ＿０００００８の塩基対３２９１４−３４０７７）を含む。
【０１４９】
２種類のＥ１領域欠失が設計され、構築された。それぞれｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３及びｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３によって構成されるＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくＡｄベクターゲノムは、それぞれ配列番号１１のヌクレオチド４５６〜３０２７及び配列番号１２のヌクレオチド４５７〜３０２５の除去に相当するＥ１領域欠失を保有する。対照的に、それぞれｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ及びｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰによって構成されるＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくＡｄベクターゲノムは、ＢＢ２１又はＢＢ２４の全てのＥ１コード配列（すなわち、それぞれ配列番号１１のヌクレオチド４５６〜３４１８又は配列番号１２のヌクレオチド４５７〜３４２０）を除去するより広いＥ１領域を含む配列欠失を保有する。これらの後者の２つのＡｄベクターゲノムは、Ｅ１Ｂ  ５５ＫとｐＩＸコード配列の間の非コード配列区間のＨＡｄＶ−５のものとの置換を保有するように追加的に設計された（すなわち、配列番号１１のヌクレオチド３４１９〜３５０２又は配列番号１２の３４２１〜３５０４に相当する配列は、ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＣ＿０００００８のヌクレオチド３５１０〜３６０８（すなわち、配列番号２５）によって置換された）。
【０１５０】
ＢＢ２１に基づくＡｄベクターゲノムを含む単一のプラスミドの構築
ｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１３）は、遺伝子合成（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔ；Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪによって実施される）及び標準的な分子クローニング手順のいくつかの工程によって構築された。第一に、所望のＡｄベクターゲノムの右末端を含有する（すなわち、前述のＥ３欠失、部分的なＥ４配列置換、及びＲＩＴＲに隣接する導入遺伝子挿入部位を内部に持つ）３５７６ｂｐ  ＤＮＡ断片（配列番号３１）が合成され、ＥｃｏＲＩ−ＡｓｅＩ制限断片として、ＥｃｏＲＩ及びＮｄｅＩ消化ｐＢＲ３２２（ＧｅｎＢａｎｋ受入番号−Ｊ０１７４９．１）に結合されて、ＢＢ２１中間体プラスミド１を得た。第二に、所望のＡｄベクターゲノムの左末端を含有する（すなわち、前述のＥ１欠失を内部に持つ）４２５６ｂｐ断片（配列番号３２）が合成され、ＳｎａＢＩ−ＥｃｏＲＩ制限断片として、ＺｒａＩ及びＥｃｏＲＩ消化ＢＢ２１中間体プラスミド１に結合されて、ＢＢ２１中間体プラスミド２を得た。第三に、中間のＡｄベクターゲノム断片を含有する４０７７ｂｐ断片（配列番号３３）が合成され、ＥｃｏＲＩ−ＨｐａＩ制限断片として、ＥｃｏＲＩ及びＨｐａＩ消化ＢＢ２１中間体プラスミド２に結合されて、ＢＢ２１中間体プラスミド３（配列番号３４）を得た。第四に、ＢＢ２１ウイルスゲノム（配列番号１１）の１８８１５ｂｐ  ＡｂｓＩ−ＥｃｏＲＩ制限断片が、ＡｂｓＩ及びＥｃｏＲＩ消化ＢＢ２１中間体プラスミド３に結合されて、最終プラスミドｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１３）を得た。
【０１５１】
ｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ（配列番号１４）は、前述のＢＢ２１中間体プラスミド３（配列番号３４）が最初に所望のＥ１欠失及びＡｄ５  ｐＩＸプロモーター挿入を含有するように改変されたことを除いてｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３と同じ方法で構築された。これは、後にＡｓｉＳＩ−ＦｓｅＩ制限断片としてＡｓｉＳＩ及びＦｓｅＩ消化ＢＢ２１中間体プラスミド３に結合された２２４ｂｐ断片（配列番号３５）の合成によって行われた。
【０１５２】
ｐＢＢ２１．ＦＬｕｃ（配列番号３６）及びｐＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（配列番号３７）は、それぞれＥ１欠失の位置で挿入された導入遺伝子発現カセットを備えるＢＢ２１に基づくＡｄベクターゲノムを内部に持つｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３由来プラスミドである。これらのプラスミド内に保有されるＡｄベクターゲノム配列は、それぞれ配列番号３８及び配列番号３９において記載される。ｐＢＢ２１．ＦＬｕｃは、ホタルルシフェラーゼ（ＦＬｕｃ）に関する導入遺伝子発現カセットを保有する。このカセットは、サイトメガロウイルス主要前初期プロモーター（すなわち、「ＣＭＶプロモーター」）によって駆動され、且つＳＶ４０由来ポリアデニル化シグナルを含有する。ｐＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃは、「ＲＳＶ−ＦＡ２−２Ａ−ＧＬｕｃ」（ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）に関する導入遺伝子発現カセットを保有し、これは、呼吸器多核体ウイルス株Ａ２融合糖タンパク質、口蹄疫ウイルス２Ａペプチド、及びガウシアルシフェラーゼ（ＧＬｕｃ）で構成されるキメラタンパク質である。ＦＬｕｃカセットのように、このカセットは、ＣＭＶプロモーターによって駆動され、ＳＶ４０ポリアデニル化シグナルを保有する。加えて、このカセットは、５’非翻訳領域内にヒトアポリポタンパク質Ａ１遺伝子のイントロン２を含む配列を含有する。Ｆｌｕｃ及びＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ発現カセットはそれぞれ、いくつかの標準的な遺伝子合成及び分子クローニング工程によって構築された後、それらは、それぞれｐＢＢ２１．ｄＥ１．ｄＥ３の固有のＡｓｉＳＩ制限酵素部位に結合されて、ｐＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びｐＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃを生成した。
【０１５３】
ＢＢ２４に基づくＡｄベクターゲノムを含む単一のプラスミドの構築
ｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３（配列番号１５）は、遺伝子合成（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔによって実施される）及び標準的な分子クローニング手順のいくつかの工程によって構築された。第一に、所望のＡｄベクターゲノムの左及び右末端を含有する（すなわち、前述のＥ１欠失、Ｅ３欠失、部分的なＥ４配列置換、及びＲＩＴＲに隣接する導入遺伝子挿入部位を内部に持つ）８１４４ｂｐ  ＤＮＡ断片（配列番号４１）が合成され、ＭｆｅＩ−ＡｓｅＩ制限断片として、ＥｃｏＲＩ及びＮｄｅＩ消化ｐＢＲ３２２（ＧｅｎＢａｎｋ受入番号−Ｊ０１７４９．１）に結合されて、ＢＢ２４中間体プラスミド１（配列番号４２）を得た。第二に、ＢＢ２４ウイルスゲノム（配列番号１２）の２２４８２ｂｐ  ＮｄｅＩ−ＥｃｏＲＩ制限断片が、ＮｄｅＩ及びＥｃｏＲＩ消化ＢＢ２４中間体プラスミド１に結合されて、最終プラスミドｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３を得た。
【０１５４】
ｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３．５ＩＸＰ（配列番号１６）は、同様の様式で構築された。第一に、前述のＢＢ２４中間体プラスミド１（配列番号４２）が、所望のＥ１欠失及びＡｄ５  ｐＩＸプロモーター挿入を保有するように改変された。これは、後にＡｓｉＳＩ−ＥｃｏＲＩ制限断片としてＡｓｉＳＩ及びＥｃｏＲＩ消化ＢＢ２４中間体プラスミド１に結合された２６７１ｂｐ断片（配列番号４３）の合成によって行われた。第二に、ＢＢ２４ウイルスゲノム（配列番号１２）の１９４７０ｂｐ  ＸｂａＩ−ＥｃｏＲＩ制限断片が、改変プラスミド（ＸｂａＩ及びＥｃｏＲＩで消化された）に結合された。
【０１５５】
ｐＢＢ２４．ＦＬｕｃ（配列番号４４）及びｐＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（配列番号４５）は、それぞれＥ１欠失の位置で挿入された導入遺伝子発現カセットを備えるＢＢ２４に基づくＡｄベクターゲノムを含有するｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３由来プラスミドである。これらのプラスミド内に保有されるＡｄベクターゲノム配列は、それぞれ配列番号４６及び配列番号４７において記載される。ｐＢＢ２１．ＦＬｕｃは、ｐＢＢ２１．ＦＬｕｃに関して本明細書に記載されるものと同じＦＬｕｃ発現カセットを保有する。ｐＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃは、ｐＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃに関して本明細書に記載されるものと同じＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ発現カセットを保有する。これらの２つのカセットはそれぞれ、いくつかの標準的な遺伝子合成及び分子クローニング工程によって構築された後、それらは、それぞれｐＢＢ２４．ｄＥ１．ｄＥ３の固有のＡｓｉＳＩ制限酵素部位に結合されて、ｐＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びｐＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃを生成した。
【０１５６】
ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくアデノウイルスベクターの作製及び生産
それぞれアデノウイルスベクターゲノム配列配列番号３８、配列番号３９、配列番号４６、及び配列番号４７を含む、アデノウイルスベクターＢＢ２１．ＦＬｕｃ（ＪＡｄ２ＮＶＴ００３とも命名される）、ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（ＪＡｄ２ＮＶＴ００１とも命名される）、ＢＢ２４．ＦＬｕｃ（ＪＡｄ３ＮＶＴ００３とも命名される）、及びＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（ＪＡｄ３ＮＶＴ００１とも命名される）は、対応するＡｄベクターゲノムプラスミド（すなわち、ｐＢＢ２１．ＦＬｕｃ、ｐＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、ｐＢＢ２４．ＦＬｌｕｃ、及びｐＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）のＥ１補完ＰＥＲ．Ｃ６細胞へのトランスフェクションによって作製された。１０％ウシ胎仔血清（ＦＢＳ）及び１０ｍＭ  ＭｇＣｌ２が補充されたダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）中の接着細胞培養物として増殖されたＰＥＲ．Ｃ６細胞へのトランスフェクションの前に、Ａｄベクターゲノムプラスミドは、ＳｗａＩで消化されて、プラスミドから対応するアデノウイルスベクターゲノムを放出した。トランスフェクションは、リポフェクタミントランスフェクション試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ；Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）を用いて標準的な手順に従って実施された。ウイルスレスキュートランスフェクションの回収後、ＰＥＲ．Ｃ６細胞培養物に対する複数回の連続的な感染ラウンドによって、ウイルスをさらに増幅した。ウイルスを、以前に記載された２工程の塩化セシウム（ＣｓＣｌ）密度勾配超遠心法を用いて粗製のウイルス回収物から精製した（Ｈａｖｅｎｇａ  ｅｔ  ａｌ．，「Ｎｏｖｅｌ  ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ−ｉｎｃｏｍｐｅｔｅｎｔ  ａｄｅｎｏｖｉｒａｌ  Ｂ−ｇｒｏｕｐ  ｖｅｃｔｏｒｓ：ｈｉｇｈ  ｖｅｃｔｏｒ  ｓｔａｂｉｌｉｔｙ  ａｎｄ  ｙｉｅｌｄ  ｉｎ  ＰＥＲ．Ｃ６  ｃｅｌｌｓ」，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８７（８）：２１３５−４３（２００６））。ウイルス粒子（ＶＰ）力価は、以前に記載された分光光度法に基づく手順によって測定された（Ｍａｉｚｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，「Ｔｈｅ  ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅｓ  ｏｆ  ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ：Ｉ．Ｅｖｉｄｅｎｃｅ  ｆｏｒ  ｍｕｌｔｉｐｌｅ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｃｏｍｐｏｎｅｎｔｓ  ｉｎ  ｔｈｅ  ｖｉｒｉｏｎ  ａｎｄ  ａ  ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ  ｏｆ  ｔｙｐｅｓ  ２，７Ａ，ａｎｄ  １２」，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ，  ３６（１）：１１５−２５（１９６８））。
【０１５７】
実施例２：類人猿アデノウイルスに由来するヘキソン及びファイバー配列を内部に持つＨＡｄＶ−４に基づくＥ１及びＥ３欠失ベクターの作製。
ヘキソン、又はヘキソン及びファイバー配列において改変されているヒトアデノウイルス４型（ＨＡｄＶ−４）に基づく複製能力がないアデノウイルスベクターを作製するために、Ｅ１及びＥ３欠失、導入遺伝子挿入、並びに下記のとおりのヘキソン及び／又はファイバー置換を内部に持つ完全ＨＡｄＶ−４ベクターゲノムを保有するプラスミドを構築した。導入遺伝子発現カセットを、ベクターのＥ１欠失に挿入した。ＨＥＫ２９３又はＰＥＲ．Ｃ６などのＥ１補完細胞株へのプラスミドのトランスフェクションは、カプシドタンパク質（ヘキソン、又はヘキソン及びファイバー）が、ある種の類人猿アデノウイルス単離物に由来する異種配列によって置換されているＨＡｄＶ−４に基づくベクターのレスキューをもたらした。Ａｄベクタープラスミドの設計及び構築は、以下の節において記載される。
【０１５８】
ＨＡｄＶ−４に基づくＡｄベクターゲノムを含む単一のプラスミドの設計及び構築
ベクター設計及び構築のために使用されるＨＡｄＶ−４単離物の完全な配列（３５９９０ｂｐ）は、以前に決定された（配列番号１７）。
【０１５９】
ＨＡｄＶ−４に基づくベクターゲノムを保有する（複製能力をなくさせ、且つ外来導入遺伝子カセットの挿入のための余地を作り出すための欠失を内部に持つ）単一のプラスミドを、標準的な分子生物学及びＤＮＡクローニング手法を用いて作製した。簡潔に述べると、所望のＨＡｄＶ−４に基づくＡｄベクターの左右末端を含むＤＮＡ断片を、ＧｅｎＳｃｒｉｐｔで合成し、ｐＢＲ３２２にクローニングした。その後、精製された野生型ＨＡｄＶ−４ゲノムＤＮＡからＨＡｄＶ−４ゲノムの欠落した中間部分であるおよそ１９ｋｂｐのＨｉｎｄＩＩＩ−ＨｉｎｄＩＩＩ制限断片を（制限酵素消化により）得て、左右末端を含有するｐＢＲ３２２に基づくプラスミドに結合した。これにより、プラスミドｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３を作製した。このプラスミドは、ＳｗａＩ部位に隣接したＥ１及びＥ３欠失ＨＡｄＶ−４に基づくＡｄベクターゲノムを保有する。これらのＳｗａＩ部位は、ＰＥＲ．Ｃ６又はＨＥＫ２９３細胞株などのＥ１補完細胞株のトランスフェクションによるアデノウイルスベクターのレスキューのためのプラスミドからのベクターゲノムの切除を可能にする。Ｅ１欠失の位置で、プラスミドは、ＡｓｉＳＩ制限酵素部位で構成される導入遺伝子挿入部位を保有する。ＰａｃＩ部位で構成される別の導入遺伝子挿入部位は、右逆位末端配列に隣接して位置する。
【０１６０】
ｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３、ｐＡｄ４．５ｏｒｆ６（配列番号１８；図１３）のＥ４領域を改変したバージョンも作製した。ｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３は天然ＨＡｄＶ−４  Ｅ４配列を含有するように作製されたが、ｐＡｄ４．５ｏｒｆ６は改変Ｅ４領域を含有するように作製され、その中で天然ＨＡｄＶ−４配列のヌクレオチド３３０１８〜３４１６５は、ＨＡｄＶ−５に由来するＥ４  ｏｒｆ６及びｏｒｆ６／７配列を含有する配列（すなわち、ＨＡｄＶ−５  ＧｅｎＢａｎｋ配列ＡＣ＿０００００８のヌクレオチド配列３２９１４〜３４０７７（配列番号４８））で置換された。ｐＡｄ４．５ｏｒｆ６内に保有されるＡｄベクターゲノム配列は、配列番号４９に記載される。ｐＡｄ４．５ｏｒｆ６は、標準的なクローニング手法を用いて、記載された改変を保有する合成された配列（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔにより作製された）によるｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３の２．９ｋｂ  ＰｓｉＩ−ＰａｃＩ断片の切除及び置換によって作製された。改変されたＥ４領域を除いて、プラスミドｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３及びｐＡｄ４．５ｏｒｆ６は同じである。ｐＡｄ４．５ｏｒｆ６のマップは図１２において示される。Ｅ１及びＥ３欠失、並びにヘキソン及びファイバーをコードする領域が示される。
【０１６１】
ＨＡｄＶ−４に基づくベクターの両方のバージョンは、（ＨＥＫ２９３及びＰＥＲ．Ｃ６のような）好適なＥ１補完細胞における対応するプラスミド（すなわち、ｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３及びｐＡｄ４．５ｏｒｆ６）のトランスフェクションによりレスキューできた。しかしながら、ＨＡｄＶ−５からのＥ４  ｏｒｆ６−含有配列の使用は、ベクターの収量及び産生効率を改善することが見出された。以前に、ＨＡｄＶ−３５に基づくベクターにおける類似の置換が同様の結果を示した（Ｈａｖｅｎｇａ  ｅｔ  ａｌ．，「Ｎｏｖｅｌ  ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ−ｉｎｃｏｍｐｅｔｅｎｔ  ａｄｅｎｏｖｉｒａｌ  Ｂ−ｇｒｏｕｐ  ｖｅｃｔｏｒｓ：ｈｉｇｈ  ｖｅｃｔｏｒ  ｓｔａｂｉｌｉｔｙ  ａｎｄ  ｙｉｅｌｄ  ｉｎ  ＰＥＲ．Ｃ６  ｃｅｌｌｓ」，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８７（８）：２１３５−４３（２００６））。
【０１６２】
ｐＡｄ４．ｄＥ１．ｄＥ３及びｐＡｄ４．５ｏｒｆ６はそれぞれ、Ｅ１欠失の位置で固有のＡｓｉＳＩ制限部位及び右逆位末端配列に隣接する固有のＰａｃＩ制限部位をＡｄベクターゲノム内に保有する。これらの部位は、標準的なクローニング手法によるＡｄベクターゲノムの対応する位置での導入遺伝子発現カセットの挿入を可能にする。例えば、このようなカセットの１つ以上は、これらの位置の１つ又は両方で挿入され得る。
【０１６３】
ｐＡｄ４．ＦＬｕｃ及びｐＡｄ４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃは、それぞれホタルルシフェラーゼ（ＦＬｕｃ）をコードする導入遺伝子カセット並びに呼吸器多核体ウイルスＡ２融合糖タンパク質、口蹄疫ウイルス由来２Ａペプチド、及びガウシアルシフェラーゼ（ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）を含む融合タンパク質を保有するｐＡｄ４．５ｏｒｆ６の導入遺伝子発現カセット含有バージョンである。それらは、標準的なクローニング手法による対応するカセットのｐＡｄ４．５ｏｒｆ６のＡｓｉＳＩ部位への挿入によって構築された。２つの導入遺伝子カセットは、ＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくアデノウイルスベクターの文脈において実施例１で利用されたものと同じである。
【０１６４】
ヘキソン及びファイバー配列置換を保有するＨＡｄＶ−４に基づくベクターを含む単一のプラスミドの設計及び構築
ヘキソン及びファイバーコード配列が、類似のＨＡｄＶ−４がヒトＡｄ種Ｅに割り当てられているある種のチンパンジーアデノウイルス単離物のもので置換されたＨＡｄＶ−４に基づくベクターゲノムプラスミドが構築された。これらの構築のためのヘキソン配列ドナーとして機能するアデノウイルス単離物は、部分的なヘキソンヌクレオチド配列が以前にＧｅｎＢａｎｋにおいて（それぞれＪＮ１６３９７１及びＪＮ１６３９８３の下で）寄託されたＰｔｒｏＡｄＶ−１及びＰｔｒｏＡｄＶ−１３である。構築のために使用されるファイバー配列は、本明細書の実施例１において記載される新規のチンパンジーアデノウイルス単離物ＢＢ２１及びＢＢ２４に由来した。ヘキソン及びファイバー配列置換の２つの異なる組合せが、（ＨＡｄＶ−４に基づくベクターゲノムプラスミドの文脈において）作製された：（１）ＰｔｒｏＡｄＶ−１ヘキソンヌクレオチド配列は、ＢＢ２４ファイバーをコードするヌクレオチド配列（配列番号２）と組み合わされ且つ（２）ＰｔｒｏＡｄＶ−１３ヘキソンヌクレオチド配列は、ＢＢ２１ファイバー変異体（配列番号５８）をコードするヌクレオチド配列と組み合わされた。ヘキソン及びファイバー配列置換の前記第１の組合せを保有する構築されたプラスミドは、それぞれ配列番号５１、配列番号５２、及び配列番号５３に記載されるとおりのＡｄベクターゲノム配列を内部に持つｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６（配列番号２１；図１３）、ｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６．Ｆｌｕｃ（配列番号１９）、及びｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃ（配列番号５０）である。ヘキソン及びファイバー配列置換の前記第２の組合せを保有する構築されたプラスミドは、それぞれ配列番号５５、配列番号５６、及び配列番号５７に記載されるとおりのＡｄベクターゲノム配列を含有するｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６（配列番号２２；図１４）、ｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６．Ｆｌｕｃ（配列番号２０）、及びｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃ（配列番号５４）である。
【０１６５】
上記のヘキソン及びファイバーが改変されたＡｄベクターゲノムプラスミドは、それぞれ標準的な遺伝子合成及び分子クローニング手順によって構築された。それぞれの改変されたヘキソン及びファイバー配列を含む配列断片が（ＧｅｎＳｃｒｉｐｔによって）合成され、続いてそれらの配列をともにｐＡｄ４．５ｏｒｆ６に挿入する（その中で対応する天然ＨＡｄＶ−４ヘキソン及びファイバーを含む配列を置換する）連続的なサブクローニング工程にかけた。続いて、得られたプラスミドｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６及びｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６は、これらのプラスミドの固有のＡｓｉＳＩ部位へのこれらのカセットのクローニングによってＦｌｕｃ及びＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃのための前述の発現カセットを備えられた（ｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６．Ｆｌｕｃ、ｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃ、ｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６．Ｆｌｕｃ、及びｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃの構築をもたらした）。
【０１６６】
本明細書で行われるヘキソン配列置換は、キメラヘキソンコード配列「Ｐｔｒ０１」（配列番号７）及び「Ｐｔｒ１３」（配列番号９）の構築をもたらした。これらの配列は、超可変領域（ＨＶＲ）コード配列がそれぞれＰｔｒｏＡｄＶ−１及びＰｔｒｏＡｄＶ−１３のものによって置換されたＨＡｄＶ−４ヘキソン遺伝子を構成する。Ｐｔｒ０１及びＰｔｒ１３によってコードされるキメラヘキソンポリペプチドはそれぞれ、配列番号８及び配列番号１０において記載される。
【０１６７】
本明細書で行われるファイバー配列置換は、本明細書の実施例１に記載されるファイバードナー単離物ＢＢ２１及びＢＢ２４に由来する配列によるＨＡｄＶ−４の完全なファイバーコード配列の置換を伴った。置換ヌクレオチド配列はそれぞれ、ＢＢ２１ファイバー変異体（配列番号５８）及びＢＢ２４ファイバー（配列番号２）をコードする。図１６は、これらの２つのファイバー及びＢＢ２１ファイバー（配列番号１）のポリペプチドアラインメントを示す。
【０１６８】
ヘキソン及びファイバー配列置換を保有するＨＡｄＶ−４に基づくベクターの作製及び生産
それぞれアデノウイルスベクターゲノム配列配列番号５２、配列番号５３、配列番号５６、及び配列番号５７を含む、アデノウイルスベクターＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．Ｆｌｕｃ（Ａｄ４Ｃ１ＮＶＴ００３とも命名される）、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（Ａｄ４Ｃ１ＮＶＴ００１とも命名される）、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．Ｆｌｕｃ（Ａｄ４Ｃ２ＮＶＴ００３とも命名される）、及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（Ａｄ４Ｃ２ＮＶＴ００１とも命名される）は、それぞれＳｗａＩ消化ＡｄベクターゲノムプラスミドであるｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６．ＦＬｕｃ、ｐＡｄ４．Ｐｔｒ０１．ＢＢ２４．５ｏｒｆ６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、ｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６．ＦＬｕｃ、及びｐＡｄ４．Ｐｔｒ１３．ＢＢ２１．５ｏｒｆ６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃのＥ１補完ＰＥＲ．Ｃ６細胞へのトランスフェクションによって作製された。同様に、対照アデノウイルスベクターのＡｄ４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃはそれぞれ、プラスミドｐＡｄ４．ＦＬｕｃ及びｐＡｄ４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃから作製された。全てのトランスフェクション並びにその後のベクター増幅、精製、及びタイトレーションは、本明細書の実施例１におけるＢＢ２１及びＢＢ２４に基づくベクターに関して記載されたものと同じ標準的な手順に従ってなされた。
【０１６９】
ＨＡｄＶ−４ヘキソン及びファイバーの置換の結果としての抗アデノウイルス中和力価における低減の評価
（記載されるとおりに構築されたカプシドタンパク質のヘキソン及びファイバー置換を有する）ホタルルシフェラーゼを発現する組換えアデノウイルスを使用して、カプシドタンパク質のヘキソン及びファイバーの類人猿アデノウイルス由来の相同タンパク質による置換が、抗ＨＡｄＶ−４中和活性を有するヒト血清試料による中和において低減をもたらしたかどうかを判定した。
【０１７０】
簡潔に述べると、試験されることになるアデノウイルスの粗製のウイルス原液の同量の感染単位アリコートを、血清試料の段階希釈物とともにインキュベートした。これらのアッセイのために使用される開始希釈度は１６倍であった。インキュベーション期間に続いて、アデノウイルスアリコートを使用して、血清とのインキュベーションの結果として中和されなかった任意のアデノウイルスが指標細胞に感染する可能性があるＡ５４９細胞などの指標細胞株に感染させた。次に、ウイルスで形質導入された細胞を、ホタルルシフェラーゼ導入遺伝子の発現が可能となるように一晩インキュベートした。抗アデノウイルス中和活性を有するいずれかの血清試料の中和力価は、血清とインキュベートしなかったアデノウイルスアリコートと比較して、レポーター細胞におけるルシフェラーゼ活性の９０％の低減を達成することができた血清の最小希釈度であった。
【０１７１】
Ａｄ４．ＦＬｕｃ中和抗体を有することが見出された（試験された７９個の試料のうちの）２２個のヒト血清試料における抗アデノウイルス中和力価が決定された（表１）。それぞれキメラアデノウイルスＡｄ４．Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃに対する同じ血清試料の中和力価と比較したとき、ヘキソン及びファイバーコード配列におけるカプシド改変の結果として抗アデノウイルス中和活性における顕著な低減があることが明らかであった。これらの結果は、アデノウイルスのヘキソン及びファイバータンパク質が、抗体媒介性のアデノウイルス中和の重要な抗原決定基を含有することを確証している。それらはまた、ヒトアデノウイルスに基づくベクターに対する（Ａｄ４．ＦＬｕｃ、ＨＡｄＶ−４に基づくベクターの場合）ヒトにおける既存の抗ベクター体液性免疫が、ヒト集団において低血清有病率を有する可能性がある類人猿アデノウイルスのものによりベクターのヘキソン及びファイバータンパク質を交換することによって回避できたことを示す。
【０１７２】
まとめると、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．Ｆｌｕｃは、それらの親ＨＡｄＶ−４に基づくベクターであるＡｄ４．Ｆｌｕｃとは血清学的に異なることが判明した。さらに、一連のＡｄ４．Ｆｌｕｃ中和ヒト血清においてこれらの２つのベクターに対して見出される中和活性はないか（Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃの場合）又は限定的（Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃの場合）であった。
【０１７３】
【表１】
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【０１７４】
新規のアデノウイルスベクターによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答
実施例３〜８は、本明細書で生成された４つの新規のベクターであるアデノウイルスベクターＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４の免疫原性を評価するために実施された実験を記載する。これらの実験では、筋肉内免疫後のマウスにおいて、ベクターにコードされる（モデル）抗原に対する体液性及び細胞性免疫応答を誘導する能力について新規のベクターが評価された。ベクターは、２つの異なる抗原：ホタルルシフェラーゼ（ＦＬｕｃ）及びＲＳＶ−ＦＡ２−２Ａ−ＧＬｕｃ（ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）を用いて試験された。ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃは、呼吸器多核体ウイルス株Ａ２融合糖タンパク質、口蹄疫ウイルス２Ａペプチド、及びガウシアルシフェラーゼ（ＧＬｕｃ）で構成されるキメラタンパク質である。各ベクターは、同じ抗原をコードする導入遺伝子カセットを保有するヒトアデノウイルス２６型（ＨＡｄＶ−２６、本明細書ではＡｄ２６とも称される）に基づくベンチマークベクターと並べて比較された。それぞれの抗原に対する免疫応答は、酵素免疫スポットアッセイ（ＥＬＩＳＰＯＴ）、酵素結合免疫吸着測定（ＥＬＩＳＡ）、及びＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ抗原の場合は呼吸器多核体ウイルス中和アッセイ（ＶＮＡ）などのよく知られる免疫学的アッセイを用いて測定された。
【０１７５】
実施例３：ＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＢＢ２４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答
新規のアデノウイルスベクターＢＢ２１及びＢＢ２４の細胞性免疫原性を評価するために、Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、Ａｄ２６．ＦＬｕｃ（陽性対照）、ホタルルシフェラーゼを発現するＢＢ２１若しくはＢＢ２４ベクター（すなわち、ＢＢ２１．ＦＬｕｃ又はＢＢ２４．ＦＬｕｃ）、又は導入遺伝子をコードしないアデノベクター（空のＡｄ２６）で筋肉内において免疫化した。投与のために２つのベクター用量が試験された：マウス毎に１０９及び１０１０ウイルス粒子（ｖｐ）。免疫化の２週間後、マウスを屠殺し、脾細胞を単離した（図１Ａ）。細胞性免疫応答を、１５量体の重複ＦＬｕｃペプチドプールによる一晩の脾細胞刺激後にＩＦＮ−γ分泌細胞の相対的な数を測定するエクスビボＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した（図１Ｂ）。結果は、高用量の免疫化（１０１０）で、ＢＢ２１．Ｆｌｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃにより誘導される細胞性免疫応答が、Ａｄ２６．Ｆｌｕｃに関して見られる応答とほとんど同程度に高かったことを示す。対照的に、低用量の免疫化（１０９）で、ＢＢ２１．Ｆｌｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃの両方が、Ａｄ２６．Ｆｌｕｃより高い応答をもたらした。全体的に見て、本発明のＦＬｕｃ発現組換えＢＢ２１及びＢＢ２４アデノウイルスベクターにより誘導される細胞性免疫応答は、明らかにマウスにおけるこれらのベクターの強力な免疫原性を示している。
【０１７６】
実施例４：Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答
新規の操作されたアデノウイルスベクターＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１の細胞性免疫原性を評価するために、Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、それぞれホタルルシフェラーゼ（Ｆｌｕｃ）を発現するＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、Ａｄ２６（陽性対照）、若しくはＡｄ４（Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１の親ベクター）、又は導入遺伝子をコードしないアデノベクターである空のＡｄ２６で筋肉内において免疫化した。投与のために２つのベクター用量が試験された：マウス毎に１０９及び１０１０ウイルス粒子（ｖｐ）。免疫化の２週間後、ＢＢ２１．Ｆｌｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃに関して使用されたものと同じ実験構成に従って（図１Ａ）、マウスを屠殺し、脾細胞を単離した。細胞性免疫応答を、１５量体の重複ＦＬｕｃペプチドプールによる一晩の脾細胞刺激後にＩＦＮ−γ分泌細胞の相対的な数を測定するエクスビボＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した（図２）。結果は、高用量の免疫化（１０１０）で、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃにより誘導される細胞性免疫応答が、ベンチマーク対照ベクターＡｄ２６．Ｆｌｕｃに関して見られるものとほとんど同程度に高かったが、低用量の免疫化（１０９）で、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃは、Ａｄ２６．Ｆｌｕｃより若干高い応答をもたらしたことを示す。
【０１７７】
全体的に見て、ＢＢ２１ファイバー変異体（配列番号５８）を含む、ＦＬｕｃを発現する新規の操作されたＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１アデノウイルスベクターにより誘導される細胞性免疫応答は、明らかにマウスにおけるこのベクターの強力な免疫原性を示している。
【０１７８】
実施例５：Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃによって誘導される細胞性免疫応答
新規の操作されたアデノウイルスベクターＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃの細胞性免疫原性を評価するために、Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、Ａｄ２６．ＦＬｕｃ（陽性対照）、ＦＬｕｃを発現するＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４、又は導入遺伝子をコードしないアデノベクターである空のＡｄ２６で筋肉内において免疫化した。投与のために２つの用量が試験された：マウス毎に１０９及び１０１０ウイルス粒子（ｖｐ）。免疫化の２週間後、ＢＢ２１．Ｆｌｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃに関して使用されたものと同じ実験構成に従って（図１Ａ）、マウスを屠殺し、脾細胞を単離した。細胞性免疫応答を、１５量体の重複ＦＬｕｃペプチドプールによる一晩の脾細胞刺激後にＩＦＮ−γ分泌細胞の相対的な数を測定するエクスビボＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した（図３）。結果は、高用量で、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃは、明らかにコードされた抗原に対する細胞性免疫応答を誘導し、陽性対照ベクターＡｄ２６．Ｆｌｕｃについて見られたものに近いがいくぶん低い読み取り値を有したことを示す。
【０１７９】
全体的に見て、ＢＢ２４ファイバー（配列番号２）を含む、ＦＬｕｃを発現する新規の操作されたＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４アデノウイルスベクターにより誘導される細胞性免疫応答は、明らかにマウスにおけるこのベクターの免疫原性を示している。
【０１８０】
実施例６：ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答
新規のアデノウイルスベクターＢＢ２１の免疫原性はさらに、ベクターにコードされた（モデル）ワクチン抗原としてＲＳＶ−ＦＡ２−２Ａ−ＧＬｕｃ（ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）を用いて評価された。Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、Ａｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（陽性対照）若しくはＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（両方ともにマウス毎に１０８、１０９及び１０１０ウイルス粒子）、又はＡｄ２６．ＦＬｕｃ若しくはＢＢ２１．ＦＬｕｃ（両方ともにマウス毎に１０１０ウイルス粒子）で筋肉内において免疫化した。８週目にマウスを屠殺し、血清試料及び脾細胞を回収した（図４Ａ）。様々な免疫パラメータを下記のとおりに評価した。
【０１８１】
ウイルス中和アッセイを、呼吸器多核体ウイルス中和抗体を誘発するＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃの能力を評価するために実施した。図４Ｂは、免疫化の８週後に回収された血清試料について測定された呼吸器多核体ウイルス株Ａ２（ＲＳＶ  Ａ２）ＶＮＡ力価を示す。各点は１頭のマウスを表し、バーは群平均を表し、点線は定量下限に相当する（ＬＬＯＱ＝６，８８；直線性試料の平均終点力価）。結果は、ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによる１０１０ｖｐ用量の免疫化により、同じ抗原をコードするベンチマークのＡｄ２６について見られたものと同じ範囲のＲＳＶ  Ａ２中和力価が生じたことを示す。
【０１８２】
ベクターにコードされた抗原に対する細胞性免疫の誘導は、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって評価された。この目的のため、免疫化の８週間後、免疫化されたマウスから脾細胞を単離し、ＲＳＶ−ＦＡ２タンパク質を架橋する１５量体の重複ペプチドで一晩刺激し、細胞性免疫応答を、ＩＦＮ−γ分泌細胞の相対的な数を測定するエクスビボＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した。データは、ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘発される抗原特異的細胞性免疫応答が、用量依存的であり、且つベンチマークベクターであるＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるものと用量毎に同様の大きさであったことを示す（図４Ｃ）。予想されるとおり、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的応答は、ホタルルシフェラーゼをコードするアデノベクターで免疫化されたマウスの血清から測定されなかった。
【０１８３】
ＲＳＶ−ＦＡ２特異的ＩｇＧ抗体を誘発するＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ発現ベクターの能力を、ＥＬＩＳＡによって評価した。ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ又はホタルルシフェラーゼを発現するＡｄ２６又はＢＢ２１ベクターで免疫化されたマウスから免疫化の８週間後に回収された血清が、抗ＲＳＶ  ＦＡ２  ＩｇＧ抗体ＥＬＩＳＡにおいて試験された。特に、このＥＬＩＳＡは、組換え安定型プレ融合ＲＳＶ−ＦＡ２タンパク質（プレ−ＲＳＶ−Ｆ）に対して結合可能なＩｇＧ抗体を検出する。結果は、ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃが、Ａｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるものと同様のプレＲＳＶ−Ｆ特異的ＩｇＧ抗体力価を用量依存的に誘発したことを示す（図４Ｄ）。対照的に、予想されるとおり、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的抗体力価は、ホタルルシフェラーゼをコードするベクターで免疫化されたマウス由来の血清において検出されなかった。
【０１８４】
まとめると、データは、ＢＢ２１ベクターが、ＨＡｄＶ−２６に基づくベンチマークベクターによって誘導されるものと同様の大きさの、コードされた抗原に対する強力な細胞性及び体液性免疫応答を誘導したことを示す。これらの免疫応答は、明らかにマウスにおけるＢＢ２１ベクターの強力な免疫原性を示す。
【０１８５】
実施例７：ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答
新規のアデノウイルスベクターＢＢ２４の免疫原性はさらに、ベクターにコードされた（モデル）ワクチン抗原としてＲＳＶ−ＦＡ２−２Ａ−ＧＬｕｃ（ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）を用いて評価された。Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、Ａｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（陽性対照）、ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、若しくはＡｄ４８．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（それぞれマウス毎に１０８、１０９及び１０１０ウイルス粒子）又はＡｄ２６．ＦＬｕｃ、ＢＢ２４．ＦＬｕｃ、若しくはＡｄ４８．ＦＬｕｃ（それぞれマウス毎に１０１０ウイルス粒子）で筋肉内において免疫化した。ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃのために使用された同じ実験構成に従って（図４Ａ）、免疫化後８週目にマウスを屠殺し、血液及び脾細胞を回収した。様々な免疫パラメータを下記のとおりに評価した。
【０１８６】
ウイルス中和アッセイを、呼吸器多核体ウイルス中和抗体を誘発するＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−Ｇｌｕｃの能力を評価するために実施した。図５Ａは、免疫化の８週後に回収された血清試料について測定された呼吸器多核体ウイルス株Ａ２（ＲＳＶ  Ａ２）ＶＮＡ力価を示す。各点は１頭のマウスを表し、バーは群平均を表し、点線は定量下限に相当する（ＬＬＯＱ＝６，８８；直線性試料の平均終点力価）。３つのベクターに関して見られた結果は類似している：中和力価は、１０９及び１０１０ｖｐ用量の免疫化のいくつか又は全てに関して見られたが、１０８ｖｐ用量では中和力価はまったく検出されなかったか、又はほとんど検出されなかった。ベクターにコードされた抗原に対する細胞性免疫の誘導は、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって評価された。この目的のため、免疫化の８週間後、免疫化されたマウスから脾細胞を単離し、ＲＳＶ−ＦＡ２タンパク質を架橋する１５量体の重複ペプチドで一晩刺激し、細胞性免疫応答を、ＩＦＮ−γ分泌細胞の相対的な数を測定するエクスビボＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した。データは、ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘発される抗原特異的細胞性免疫応答が、用量依存的であり、且つ対照ベクターであるＡｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４８．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるものと用量毎に少なくとも同様の大きさであったことを示す（図５Ｂ）。予想されるとおり、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的応答は、ホタルルシフェラーゼをコードするアデノベクターで免疫化されたマウスの脾細胞から測定されなかった。
【０１８７】
ＲＳＶ−ＦＡ２特異的ＩｇＧ抗体を誘発するＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ発現ベクターの能力を、ＥＬＩＳＡによって評価した。ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ又はホタルルシフェラーゼを発現するＡｄ２６、Ａｄ４８、又はＢＢ２４ベクターで免疫化されたマウスから免疫化の８週間後に回収された血清が、抗ＲＳＶ  ＦＡ２  ＩｇＧ抗体ＥＬＩＳＡにおいて試験された。特に、このＥＬＩＳＡは、組換え安定型プレ融合ＲＳＶ−ＦＡ２タンパク質（プレ−ＲＳＶ−Ｆ）に対して結合可能なＩｇＧ抗体を検出する。結果は、ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃが、Ａｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４８．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導されるものと同様のプレＲＳＶ−Ｆ特異的ＩｇＧ抗体力価を用量依存的に誘発したことを示す（図５Ｃ）。対照的に、予想されるとおり、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的力価は、ホタルルシフェラーゼをコードするベクターで免疫化されたマウス由来の血清において検出されなかった。
【０１８８】
まとめると、データは、ＢＢ２４ベクターが、ＨＡｄＶ−２６に基づくベンチマークベクターによって誘導されるものと同様の大きさの、コードされた抗原に対する強力な細胞性及び体液性免疫応答を誘導したことを示す。これらの免疫応答は、明らかにマウスにおけるＢＢ２４ベクターの強力な免疫原性を示す。
【０１８９】
実施例８：Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによって誘導される細胞性及び体液性免疫応答
新規の操作されたアデノウイルスベクターＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１のそれぞれの免疫原性はさらに、ベクターにコードされた（モデル）ワクチン抗原としてＲＳＶ−ＦＡ２−２Ａ−ＧＬｕｃ（ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ）を用いて評価された。Ｂａｌｂ／Ｃマウスを、Ａｄ２６．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（陽性対照）、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ、若しくはＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ（それぞれマウス毎に１０８、１０９及び１０１０ウイルス粒子）又はＡｄ２６．ＦＬｕｃ、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃ、若しくはＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃ（それぞれマウス毎に１０１０ウイルス粒子）で筋肉内において免疫化した。ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃのために使用された同じ実験構成に従って（図４Ａ）、免疫化後８週目に血液試料及び脾細胞を回収した。様々な免疫パラメータを下記のとおりに評価した。
【０１９０】
ウイルス中和アッセイを、呼吸器多核体ウイルス中和抗体を誘発するＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃの能力を評価するために実施した。図６Ａは、免疫化の８週後に回収された血清試料について測定された呼吸器多核体ウイルス株Ａ２（ＲＳＶ  Ａ２）ＶＮＡ力価を示す。各点は１頭のマウスを表し、バーは群平均を表し、点線は定量下限に相当する（ＬＬＯＱ＝６，８８；直線性試料の平均終点力価）。結果は、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃによる１０１０ｖｐ用量の免疫化は両方ともに、ＲＳＶ  Ａ２中和力価をもたらしたことを示す。
【０１９１】
ベクターにコードされた抗原に対する細胞性免疫の誘導は、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的ＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって評価された。この目的のため、免疫化の８週間後、免疫化されたマウスから脾細胞を単離し、ＲＳＶ−Ｆ２Ａタンパク質を架橋する１５量体の重複ペプチドで一晩刺激し、細胞性免疫応答を、ＩＦＮ−γ分泌細胞の相対的な数を測定するエクスビボＥＬＩＳＰＯＴアッセイによって決定した。データは、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃの両方が、用量依存的な抗原特異的細胞性免疫応答を誘発できたことを示す（図６Ｂ）。予想されるとおり、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的応答は、ホタルルシフェラーゼをコードするアデノベクターで免疫化されたマウスの脾細胞から測定されなかった。
【０１９２】
ＲＳＶ−ＦＡ２特異的ＩｇＧ抗体を誘発するＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ発現ベクターの能力を、ＥＬＩＳＡによって評価した。ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ又はホタルルシフェラーゼを発現するＡｄ２６（陽性対照）、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、又はＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４ベクターで免疫化されたマウスから免疫化の８週間後に回収された血清が、抗ＲＳＶ  ＦＡ２  ＩｇＧ抗体ＥＬＩＳＡにおいて試験された。特に、このＥＬＩＳＡは、組換え安定型プレ融合ＲＳＶ−ＦＡ２タンパク質（プレ−ＲＳＶ−Ｆ）に対して結合可能なＩｇＧ抗体を検出する。結果は、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４の両方が、用量依存的にプレＲＳＶ−Ｆ特異的ＩｇＧ抗体力価を誘発できたことを示す（図６Ｃ）。予想されるとおり、ＲＳＶ−ＦＡ２特異的力価は、ホタルルシフェラーゼのみをコードするベクターで免疫化されたマウス由来の血清において検出されなかった。
【０１９３】
まとめると、データは、それぞれＢＢ２１ファイバー変異体（配列番号５８）及びＢＢ２４ファイバー（配列番号２）を含む、ＲＳＶＦ−２Ａ−ＧＬｕｃを発現する新規の操作されたアデノウイルスベクターであるＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４が、コードされた抗原に対する著しい細胞性及び体液性免疫応答を誘導できたことを示す。これらの免疫応答は、明らかにマウスにおけるＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４の良好な免疫原性を示した。
【０１９４】
実施例９：新規及び既存のアデノウイルスベクター間の血清学的交差中和の評価
新規のアデノウイルスワクチンベクターとしてのそれらの潜在的な有用性に関して、本明細書で作製される新規アデノウイルスベクターは、好ましくは、ヒトアデノウイルス血清型ＨＡｄＶ−５及びＨＡｄＶ−３５に基づくベクターなどの、ワクチンベクターとして現在既に開発中の既存のアデノウイルスベクターとは血清学的に異なるであろう。したがって、交差中和試験を、ＨＡｄＶ−４、ＨＡｄＶ−５、ＨＡｄＶ−２６、ＨＡｄＶ−３５及びＨＡｄＶ４９に基づく新規のアデノウイルスベクターであるＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４並びにいくつかの既存のベクター間で実施した。この目的のため、これらのアデノウイルスベクターの１つに対してそれぞれ産生されるマウス抗血清は、アデノウイルス中和アッセイにおいて各種ベクターの各々に対して試験された。このアッセイのために使用されるマウス抗血清は、マウス当たり１０１０ベクター粒子によるそれらの免疫化の２週間又は８週間後にＢａｌｂ／Ｃマウスから回収された。アデノウイルス中和アッセイは、以前に記載されたとおりに行われた（Ｓｐａｎｇｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ  ２００３．Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．４１：５０４６−５０５２）。簡潔に述べると、１：１６の希釈度から始めて、血清を２倍ずつ段階希釈し、続いてホタルルシフェラーゼ（ＦＬｕｃ）を発現するアデノウイルスベクターと事前に混合した後、Ａ５４９細胞とともに（細胞当たり５００個のウイルス粒子の感染の多重度で）一晩インキュベートした。感染の２４時間後に測定された感染細胞ライセートにおけるルシフェラーゼ活性レベルは、ベクター感染効率を表した。所与のベクターに対する中和力価は、ベクター感染効率の９０％の低減をもたらすことができる最高の血清希釈度として定義された。中和力価は、以下のカテゴリーに任意に分けられた：＜１６（中和なし）、１６〜２００、２００〜２，０００、及び＞２，０００。
【０１９５】
結果は、試験されたベクターの間で交差中和を示さないか又は非常に低いレベルの交差中和を示す（図７）。観察されたほんのわずかな中和交差は、ベクターＢＢ２１とＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１の間であった。これらのベクターについて見られる相反的な交差中和力価は、これらの同じベクターについて得られたそれぞれの相同的な中和力価より著しく低かった。重要なこととして、新規のベクター（すなわち、ＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４）は、試験されたパネルに含まれるヒトアデノウイルスベクター、すなわち、Ａｄ２６、Ａｄ３５、Ａｄ４９、Ａｄ５及びＡｄ４と交差中和を示さなかった。したがって、新規のアデノウイルスベクターＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４はそれぞれ、場合によっては、例えば、異種プライム−ブーストワクチン接種レジメンの文脈において、或いは又はさらに、異なる疾患若しくは抗原に対する一連の２回以上の継続的なワクチン接種の文脈において、連続的な免疫化におけるこれらの又は他の異なるアデノウイルスベクターの１種以上と組み合わせて使用され得る。
【０１９６】
実施例１０：ヒト集団における新規のアデノウイルスベクターの血清有病率
有効なワクチンベクターとしてのそれらの潜在的な使用のために重要なことは、本明細書に記載される新規のアデノウイルスベクターが、ワクチン標的集団における高レベルの既存の抗ベクター体液性免疫によって妨げられないことである。したがって、ベクターＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４はそれぞれ、米国（ＵＳ）及び欧州連合（ＥＵ）に居住する１８歳〜５５歳までの成人に由来する２００名のヒトコホート血清試料内のそれらの血清有病率について評価された。各ベクターは、実施例９において実行され且つ以前に記載されたとおりの標準的なアデノウイルス中和アッセイを実施することによって、ヒト血清試料による中和について試験された（Ｓｐｒａｎｇｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ  ２００３．Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．４１：５０４６−５０５２）。簡潔に述べると、１：１６の希釈度から始めて、血清を２倍ずつ段階希釈し、続いてホタルルシフェラーゼ（ＦＬｕｃ）を発現するアデノウイルスベクターと事前に混合した後、Ａ５４９細胞とともに（細胞当たり５００個のウイルス粒子の感染の多重度で）一晩インキュベートした。感染の２４時間後に測定された感染細胞ライセートにおけるルシフェラーゼ活性レベルは、ベクター感染効率を表した。所与のベクターに対する中和力価は、ベクター感染効率の９０％の低減をもたらすことができる最高の血清希釈度として定義された。中和力価は、以下のカテゴリーに任意に分けられた：＜１６（中和なし）、１６〜３００、３００〜１，０００、１０００〜４０００及び＞４０００。
【０１９７】
結果は、４種全ての新規のアデノウイルスベクター（すなわち、ＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、Ａｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４）が、試験されたヒト対象において対照Ａｄ５ベクターより著しく低い血清有病率を有することを示す（図８）。さらに、ベクターＢＢ２１、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４は、ベンチマークＡｄ２６ベクターより低い血清有病率をさらに示した。さらに、新規のベクターに対して見られた陽性中和力価は一般に、非常に低く、概して３００より高くなかった。対照的に、Ａｄ２６及びＡｄ５に対して見られた陽性中和力価の大部分は、３００より高かった。
【０１９８】
まとめると、上のデータは、ベクターＢＢ２１、ＢＢ２４、Ａｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１、及びＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４に対する既存の体液性抗ベクター免疫が、評価されたワクチン標的集団において低いと考えられ得ることを示し、これらのベクターがこれらの集団において有効なワクチンベクターとしての可能性を有することを示唆している。
【０１９９】
実施例１１：懸濁ＰＥＲ．Ｃ６細胞中のアデノウイルスベクター生産性
臨床試験及びそれ以降に使用されるアデノウイルスベクターは、スケーラブルな無血清アデノウイルス生産プラットフォームで高力価まで容易に生産可能である必要がある。本明細書で懸濁ＰＥＲ．Ｃ６細胞又はｓＰＥＲ．Ｃ６とも呼ばれる懸濁適応ＰＥＲ．Ｃ６（登録商標）細胞は、バイオリアクターでのアデノウイルスベクターの大規模製造を支援し、高力価で臨床グレードのベクター製剤、例えば、ＨＡｄＶ−２６又はＨＡｄＶ−３５に基づくＥ１欠損ベクターを大量にもたらすことが示されているため、このようなプラットフォームとなる（欧州特許第２５３６８２９Ｂ１号明細書、欧州特許第２３５０２６８Ｂ１号明細書）。
【０２００】
本明細書に記載される新規のベクターが、ｓＰＥＲ．Ｃ６細胞に基づく生産プロセスに合うかどうかに関する最初の評価として、小規模のベクター生産性実験を、振盪フラスコ中で培養されたｓＰＥＲ．Ｃ６細胞に対して実施した。これらの生産性実験は、実施例１及び２において記載される新規のベクターのＦｌｕｃコード化バージョンを用いて実行された。ベンチマーク対照として、ＨＡｄＶ−２６に基づくベクターＡｄ２６．Ｆｌｕｃを使用した。４ｍＭのＬ−グルタミン（Ｌｏｎｚａ）を補充した１０ｍｌの総量のＰＥＲＭＥＸＣＩＳ（登録商標）培地（Ｌｏｎｚａから入手可能）中において１×１０６細胞／ｍｌの密度で振盪フラスコに播種された懸濁ＰＥＲ．Ｃ６細胞培養物が、様々なウイルス粒子（ＶＰ）対細胞比率で各種ベクターにより感染され、４日間インキュベートされた。感染のために使用された様々なＶＰ対細胞比率は、７０、１５０及び９００であった。感染細胞培養物の試料を毎日採取し、ＶＰ力価を、これらの試料中においてＣＭＶプロモーター（試験された全てのベクターに存在する）に特異的なプライマー及びプローブを用いる定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）に基づくプロトコルによって決定した。このプロトコルでは、遊離のベクターＤＮＡ（すなわち、ウイルス粒子にパッケージされていないベクターゲノム）を除去するために、ｑＰＣＲの前に試験試料をＤＮＡ分解酵素処理する必要がある。
【０２０１】
新規のベクターＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃについて得られた生産性の結果を図１７に示し、一方で、新規のキメラベクターＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃ、並びにそれらの親ベクターＡｄ４．Ｆｌｕｃについて見られたものを図１８に示す。ＢＢ２１．ＦＬｕｃ及びＢＢ２４．Ｆｌｕｃは、全てのＶＰ対細胞感染比率及び試験された回収時点で、ベンチマーク対照ベクターＡｄ２６．Ｆｌｕｃよりも高いＶＰ力価を示した。同様に、２種のキメラベクターＡｄ４Ｐｔｒ０１−ＢＢ２４．ＦＬｕｃ及びＡｄ４Ｐｔｒ１３−ＢＢ２１．ＦＬｕｃは良好な生産性を示し、Ａｄ２６．Ｆｌｕｃについて得られたものよりも高いか又は同等のＶＰ力価をもたらした（使用されたＶＰ対細胞感染比率に依存する）。さらに、これらの２種のキメラベクターは、親の非カプシド改変ベクターＡｄ４．Ｆｌｕｃと比較して妥協のない生産性を示した。
【０２０２】
上の結果は、ｓＰＥＲ．Ｃ６に基づく無血清懸濁細胞培養物モデルに対して新規のベクターの各々の良好な生産性を実証している。
【０２０３】
まとめると、上で示されるとおりの本発明の新規の組換えアデノウイルスベクターによって誘導される体液性及び細胞性免疫応答の試験は、明らかにマウスにおけるこれらのベクターの強力な免疫原性を示す。加えて、これらのベクターは、特定の既存のアデノウイルスワクチンベクター候補（例えば、Ａｄ２６及びＡｄ３５）に対して交差中和抗体応答を誘導しないか、又はその逆もまた同じであること、及び互いに交差中和抗体応答を誘導しないか、又は非常に低い交差中和抗体応答を誘導することを実証した。さらに、新規のベクターは、ヒトにおいて低い血清有病率を示した。最後に、新規のベクターは、高い収量で容易に生産され得る。低い血清有病率、強力な免疫原性及び生産性の組合せは、本発明の新規のアデノウイルスベクターが、様々な病原体に対する新規のワクチンベクター候補として有用である可能性があり、且つさらに遺伝子治療及び／又は診断において有用性を有し得ることを示唆する。
【０２０４】
上記の実施形態に対して、この広い発明概念から逸脱することなく変更を加えることができることが当業者に理解されるであろう。したがって、本発明は、開示される特定の実施形態に限定されるものではなく、本明細書によって規定される本発明の趣旨及び範囲に含まれる変形形態を包含することが意図されることを理解されたい。
【図１Ａ】
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【図１Ｂ】
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【図２】
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【図３】
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【図４Ａ】
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【図４Ｂ】
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【図４Ｃ】
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【図４Ｄ】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図５Ｃ】
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【図６Ａ】
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【図６Ｂ】
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【図６Ｃ】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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