(57)【要約】      （修正有）【課題】Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）に特異的なイムノグロブリン分子に由来する組成物などの提供。【解決手段】Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）Ｅ２抗原に対して免疫学的結合親和性を示す組換えヒトモノクローナル抗体であって、該モノクローナル抗体が、コンビナトリアル抗体ライブラリーから得られるヒト抗体Fab分子の結合部分に相同なアミノ酸配列を含む、モノクローナル抗体。１つの実施形態において、２つ以上のHCV遺伝子型由来のHCV  E2抗原に対して交叉反応性であるモノクローナル抗体。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
本願明細書に記載されるような、ヒトモノクローナル抗体。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）に特異的なイムノグロブリン分子に由来する組成物に関する。より詳細には、本発明は、HCV  E2抗原に特異的に結合し得る組換えヒトモノクローナル抗体に関する。
【背景技術】
【０００２】
発明の背景
Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）感染は、世界中で発生し、そして輸血に関連する肝炎の主要な原因である。およそ150,000のHCV感染の新たな症例が、毎年合衆国において存在する。世界中の血液ドナーにおける抗HCV抗体の血清罹患率は、0.02と1.23％との間で変化することが示されており、なかには罹患率が約19％の高さの国もある。輸血誘導型肝炎の主要な原因であることに加えて、HCVはまた、血液または血液製剤に曝露される個体における肝炎の共通の原因である。従って、血液または血液製剤のレシピエント、静脈内薬剤使用者、腎臓透析患者、および注射針で刺された犠牲者は、HCV感染の高リスク群を代表する。Alterら（1993）Infect  Agents  Dis  2:155-166。さらに、泌尿生殖器管を介するHCVの異性間伝染、および母子感染は、かなり記録されている。Ohtoら(1994)  N  Engl  J  Med  330:744-750。HCV感染に関連する他の危険因子は、HCV感染個体との家族内または家庭内接触、および血液および血液透析への職業的曝露を伴う医療事業を含む。Alterら（1990）JAMA  264:2231-2235。慢性肝炎は、感染の約62％において発症する。Alterら（1992）N  Engl  J  Med  327:1899-1905。
【０００３】
HCVに関連する重篤な肝臓疾患のほとんどが、慢性的な、持続性の感染を引き起こす因子の高い性向から生じる。肝硬変は、およそ20％の慢性の症例において起こり、そのうちの20〜25％が肝不全を生じる。HCV感染に関連する別の重篤な続発症は、原発性肝細胞ガンである。
【０００４】
HCVのウイルスゲノム配列は公知であり、その配列を得る方法も同様に公知である。例えば、国際公開第WO  89/04669号；同第WO  90/11089号；および同第WO  90/14436号を参照のこと。HCVは、9.5kbの正方向の一本鎖RNAゲノムを有し、そしてウイルスのFlaviridae科の一員である。現在、系統発生的な分析に基づいて同定されたHCVの異なるがしかし関連する６つの遺伝子型が存在する（Simmondsら、J.Gen.Virol.(1993)  74:2391-2399)。ウイルスは、3000アミノ酸残基より多くを有する単一のポリぺプチドをコードする（Chooら(1989)  Science  244:359-362;  Chooら(1991)  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  88:2451-2455;  Hanら（1991)  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  88:1711-1715)。ポリぺプチドは、翻訳中および翻訳後に構造タンパク質および非構造（NS）タンパク質の両方へとプロセッシングされる。
【０００５】
特に、Ｎ末端ヌクレオキャプシドタンパク質（「コア」と命名する）からなる３つの推定HCV構造タンパク質、ならびに２つのエンベロープ糖タンパク質「E1」（Ｅとしても知られる）および「E2」（E2/NS1としても知られる）が存在する。（HCVタンパク質（E1およびE2を含む）の議論については、Houghtonら（1991)  Hepatology  14:381-388を参照のこと）。E1は、32〜35kDa種として検出され、そして約18KDaの単一のエンドＨ感受性バンドに変換される。対照的に、E2は、複数の種の生成に一致して免疫沈降法の際に複合体パターンを示す（Grakouiら(1993)  J.Virol.67:1385-1395;  Tomeiら(1993)  J.Virol.67:4017-4026)。HCVエンベロープ糖タンパク質E1およびE2は、共免疫沈降可能である安定な複合体を形成する（Grakouiら（1993)  J.Virol.67:1385-1395;  Lanfordら（1993)  Virology  197:225-235;  Ralstonら（1993)  J.Virol.67:6753-6761)。
【０００６】
慢性Ｃ型肝炎感染のための現在利用可能な唯一の処置は、αインターフェロン（α-IFN）治療からなる。しかし、インターフェロン治療に対する長期の応答は、処置された個体のほんの10％〜30％において起こり、異なるHCV株は、インターフェロン治療に対するその応答性において非常に様々であり、Ｉ型ウイルスが最も屈折性であるという証拠が存在する。さらに、インフルエンザ様の副作用が、インターフェロン治療に対して一般に起こり（処置される個体のおよそ60％〜80％において起こる）、さらに他のより一般的でない副作用（例えば、吐き気、鬱、疲労、および血小板減少症）も起こる。インターフェロン治療はまた、免疫無防備状態の個体には望ましくない。従って、慢性HCV感染の処置における、より効果的な治療アプローチに対する必要性が存在する。この点に関して、いくつかの効果が、リビビリン、あるいはウルソジオールとα-IFNとの組合せ治療を用いて観察されている。
【０００７】
特に、HCV  E1およびE2タンパク質は、非常に興味深い。なぜなら、これらの分子に基づく組換えワクチンは、霊長類研究におけるHCVでの実験的抗原投与に対して防御的であることが示されているからである。（Chooら（1994)  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  91:1294-1298)。ドナー試料から得られる抗HCV抗体分子の過免疫グロブリン組成物は、感染された個体における、および高リスク群におけるHCV感染の防止における、HCVの処置について記載されている。1991年９月25日に出願された欧州特許出願第447,984号。これらの組成物は、ドナー血液製剤から作製されるので、例えば、ヒト免疫不全ウイルス（HIV）およびHCVのような感染性の可能な存在に起因して、内在的なリスクがそれらの使用に付随している。従って、過免疫グロブリン調製物は、注意深くスクリーニングされなければならず、そしてすべての感染性因子がヒト被験体に投与される前に不活化されていなければならない。
【０００８】
正常な個体におけるHCVに対する免疫応答には、体液性および細胞媒介性成分の両方が含まれることが知られている。Kozielら（1993)  J  Virol  67:7522-7532,  Alterら（1989)  N  Engl  J  Med  321:1494-1500。さらに、いくつかの報告は、HCVに対して誘発された抗体がウイルスの感染性を中和し得ることを示している。Shimizuら（1994)  J  Virol  68:1494-1500,  Farciら（1994)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  91:7792-7796。このような結果は、有効な抗体に基づく治療が開発され得るという希望を提供する。この点に関して、高度に反応性の中和化HCV抗体調製物を、感染の危険にあるか、または最近因子に曝露された個体に投与することにより、迅速な受動免疫がその個体に提供される。このような受動免疫は、正常および免疫無防備状態の両方の被験体において、同様に首尾良いことが予想される。好ましくは、中和化抗体は、異なるHCV株に対して広く交叉反応性であり、そしてインビボで抗体の使用の効果を制御するためにモノクローナルである。
【０００９】
多くの実用上そして経済的な理由により、マウスモノクローナル抗体が、一般に研究および医学において使用されてきた。マウス抗体は、広範な種々の分子（例えば、HCV抗原）に対して惹起され得、そしてミエローマ細胞と融合されて、HCV抗原に対するモノクローナル抗体を産生するために培養物中で増殖され得るハイブリドーマを生じ得る。Kohlerら（1975)  Nature  256:495-497。このようなモノクローナル抗体は、有意な治療的価値の抗原結合特異性を有し得るが、ヒト疾患の処置におけるこのようなマウス抗体の使用は、これらの分子がヒト免疫系に対して免疫原性であるために制限されてきた。従って、マウスモノクローナル抗体は、免疫診断において最も一般的に用いれらてきた。この点に関して、推定HCV  E2エンベロープポリぺプチドに対するマウスモノクローナル抗体は、生物学的試料中のHCVの検出における使用について記載されている。Mehtaらに対する米国特許第5,308,750号。
【００１０】
従って、当該分野で、HCV  E2抗原に対するヒトモノクローナル抗体を提供する必要性が残存する。ここで、モノクローナルは、異種のHCV単離体と広く交叉反応性である。
【発明の開示】
【課題を解決するための手段】
【００１１】
本発明によって以下が提供される：
（１）Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示す組換えヒトモノクローナル抗体であって、該モノクローナル抗体が、コンビナトリアル抗体ライブラリーから得られるヒト抗体Fab分子の結合部分に相同なアミノ酸配列を含む、モノクローナル抗体。
（２）前記モノクローナル抗体が、２つ以上のHCV遺伝子型由来のHCV  E2抗原に対して交叉反応性であることをさらに特徴とする、請求項１に記載のモノクローナル抗体。
（３）前記モノクローナル抗体が、HCV遺伝子型1aおよび1b由来のE2抗原に対して交叉反応性であることをさらに特徴とする、請求項２に記載のモノクローナル抗体。
（４）請求項１に記載のモノクローナル抗体であって、前記Fab分子が、図1A（配列番号  ）、図1B（配列番号  ）、図1C（配列番号  ）、図1D（配列番号  ）、図1E（配列番号  ）、図1F（配列番号  ）、および図1G（配列番号  ）に示される配列からなる群より選択される重鎖可変領域（VH）アミノ酸配列を含む、モノクローナル抗体。
（５）請求項１に記載のモノクローナル抗体であって、前記Fab分子が、図2A（配列番号  ）、図2B（配列番号  ）、図2C（配列番号  ）、図2D（配列番号  ）、図2E（配列番号  ）、図2F（配列番号  ）、および図2G（配列番号  ）に示される配列からなる群より選択される軽鎖可変領域（VL）アミノ酸配列を含む、モノクローナル抗体。
（６）前記モノクローナル抗体が、少なくとも約1．0×107の結合親和性を有することをさらに特徴とする、請求項１に記載のモノクローナル抗体。
（７）前記モノクローナル抗体が、ELISAアッセイによって決定されるようにＣ型肝炎ウイルス（HCV）E1/E2複合体にもまた結合することをさらに特徴とする、請求項６に記載のモノクローナル抗体。
（８）前記モノクローナル抗体が、Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に結合し得るF(ab’)2フラグメントを含む、請求項１に記載のモノクローナル抗体。
（９）前記モノクローナル抗体が、本質的に、Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に結合し得るFab分子からなる、請求項１に記載のモノクローナル抗体。
（１０）前記モノクローナル抗体が、ELISAアッセイによって決定されるように、Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E1/E2複合体に結合することをさらに特徴とする、請求項９に記載のモノクローナル抗体。
（１１）Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に対する免疫学的結合親和性を示す単鎖Fv(sFv)分子であって、該sFv分子が、コンビナトリアル抗体ライブラリーから得られるヒト抗体Fab分子に相同なアミノ酸配列から形成される結合部分を含む、分子。
（１２）Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示すヒトFab分子のγ１重鎖可変領域（VH）の結合部分に相同な第一のポリぺプチドをコードする第一のヌクレオチド配列；および
Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示すヒトFab分子のκ軽鎖可変領域（VL）の結合部分に相同な第二のポリぺプチドをコードする第二のヌクレオチド配列
を含む、単離された核酸分子。
（１３）請求項１２に記載の核酸分子であって、
第一のリーダー配列ペプチドをコードする第三のヌクレオチド配列であって、該第三のヌクレオチド配列が、前記第一のヌクレオチド配列の5’末端に作動可能に連結し、そして前記第一のポリぺプチドおよび該第一のリーダー配列ペプチドが発現される場合、該第一のポリぺプチドの分泌を引き起こす、第三のヌクレオチド配列；および
第二のリーダー配列ペプチドをコードする第四のヌクレオチド配列であって、該第四のヌクレオチド配列が、該第二のヌクレオチド配列の5’末端に作動可能に連結し、そして該第二のポリぺプチドおよび該第二のリーダー配列ペプチドが発現される場合、該第二のポリぺプチドの分泌を引き起こす、第四のヌクレオチド配列、
を含む、核酸分子。
（１４）請求項１３に記載の核酸分子であって、前記第一のヌクレオチド配列が、図4A（配列番号  ）、図4B（配列番号  ）、図4C（配列番号  ）、図4D（配列番号  ）、図4E（配列番号  ）、図4F（配列番号  ）、および図4G（配列番号  ）に示される配列からなる群より選択されるヌクレオチド配列に相同である、核酸分子。
（１５）請求項１３に記載の核酸分子であって、前記第二のヌクレオチド配列が、図3A（配列番号  ）、図3B（配列番号  ）、図3C（配列番号  ）、図3D（配列番号  ）、図3E（配列番号  ）、図3F（配列番号  ）、および図3G（配列番号  ）に示される配列からなる群より選択されるヌクレオチド配列に相同である、核酸分子。
（１６）コンビナトリアルライブラリーから得られたヒトFab分子のγ１重鎖可変領域（VH）の結合部分に相同な第一のポリぺプチドをコードする第一のヌクレオチド配列をふくむ単離された核酸分子であって、該Fab分子が、Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示す、単離された核酸分子。
（１７）請求項１６に記載の核酸分子であって、ここで前記第一のヌクレオチド配列が、図4A（配列番号  ）、図4B（配列番号  ）、図4C（配列番号  ）、図4D（配列番号  ）、図4E（配列番号  ）、図4F（配列番号  ）、および図4G（配列番号  ）に示される配列からなる群より選択されるヌクレオチド配列に相同である、核酸分子。
（１８）コンビナトリアルライブラリーから得られたヒトFab分子のκ軽鎖可変領域（VL）の結合部分に相同な第一のポリぺプチドをコードする第一のヌクレオチド配列をふくむ単離された核酸分子であって、該Fab分子が、Ｃ型肝炎ウイルス（HCV）E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示す、単離された核酸分子。
（１９）請求項１８に記載の核酸分子であって、ここで前記第一のヌクレオチド配列が、図3A（配列番号  ）、図3B（配列番号  ）、図3C（配列番号  ）、図3D（配列番号  ）、図3E（配列番号  ）、図3F（配列番号  ）、および図3G（配列番号  ）に示される配列からなる群より選択されるヌクレオチド配列に相同である、核酸分子。
（２０）前記第一および第二のヌクレオチド配列の転写を指向し、それにより該第一および第二のヌクレオチド配列が宿主細胞において転写および翻訳され得る、制御配列に作動可能に連結した、請求項１２、１６、または１８のいずれかに記載される核酸分子を含む、発現ベクター。
（２１）前記制御配列が、原核生物宿主細胞において、前記第一および第二のヌクレオチド配列の転写を指向し得る、請求項２０に記載の発現ベクター。
（２２）前記制御配列が、真核生物宿主細胞において、前記第一および第二のヌクレオチド配列の転写を指向し得る、請求項２０に記載の発現ベクター。
（２３）請求項２１に記載の発現ベクターで形質転換された原核生物宿主細胞。
（２４）請求項２２に記載の発現ベクターで形質転換された真核生物宿主細胞。
（２５）組換えFab分子を産生する方法であって、以下の工程：
（a）請求項２４に記載の形質転換された宿主細胞の集団を提供する工程；および
（b）該組換えFab分子を該発現ベクターから発現する工程、
を包含する、方法。
（２６）請求項１から１０のいずれかに記載のモノクローナル抗体および薬学的に受容可能なビヒクルを含む、ワクチン組成物。
（２７）哺乳動物被験体においてHCVに抗体力価を提供するための方法であって、請求項２６に記載のワクチンの治療有効量を該被験体に導入する工程を包含する、方法。
（２８）哺乳動物被験体においてHCV感染に対する受動的免疫を提供する方法であって、請求項２６に記載のワクチン組成物の治療有効量を該被験体に導入する工程を包含する、方法。
（２９）HCV感染を有する哺乳動物被験体を治療する方法であって、請求項２６に記載のワクチン組成物の治療有効量を該被験体に導入する工程を包含する、方法。
（３０）治療有効量のα-インターフェロンを、前記ワクチン組成物とともに、前記哺乳動物被験体に投与する工程をさらに包含する、請求項２９に記載の方法。
（３１）治療有効量のリバビリンを、前記ワクチン組成物とともに、前記哺乳動物被験体に投与する工程をさらに包含する、請求項２９に記載の方法。
（３２）治療有効量のリバビリンを、前記α-インターフェロンおよび前記ワクチン組成物とともに、前記哺乳動物被験体に投与する工程をさらに包含する、請求項３０に記載の方法。
（３３）請求項１〜１０のいずれかに記載のモノクローナル抗体およびそれに結合した検出可能な部分を含む、結合複合体。
（３４）請求項１１に記載のsFv分子およびそれに結合した検出可能な部分を含む、結合複合体。
（３５）前記検出可能な部分が、放射性同位体、蛍光剤、化学発光剤、酵素、酵素基質、酵素補因子、酵素阻害剤、および色素からなる群より選択される、請求項３３または３４に記載の結合複合体
（３６）HCVを含むと疑われる試料中にHCV粒子の存在を検出するための方法であって、以下の工程：
（a）該試料を請求項３５に記載の結合複合体とインキュベートする工程であって、該インキュベートする工程が、抗体抗原複合体の形成を可能にする条件下で行われる、工程；および
（b）該抗体抗原複合体の存在または非存在を検出する工程、
を包含する、方法。
（３７）HCVに感染した哺乳動物被験体の抗HCV治療的処置の進行をモニターするための方法であって、以下の工程：
（a）生物学的試料を該被験体から得る工程；および
（b）該試料を請求項３５に記載の結合複合体とインキュベートする工程であって、該インキュベートする工程が、抗体抗原複合体の形成を可能にする条件下で行われる、工程；および
（c）該抗体抗原複合体の存在または非存在を検出する工程、
を包含する、方法。
【００１２】
発明の要旨
本発明は、HCV  E2ポリぺプチド抗原に対する免疫学的結合親和性を示し、そして異なるHCV株に対して交叉反応性であるヒトモノクローナル抗体分子の発見に基づく。モノクローナル抗体分子は、免疫されていないHCV感染した供給源から構築されたコンビナトリアルライブラリーから得られた。本発明の分子は、一般に、HCV  E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示すヒト抗体Fab分子を含む。
【００１３】
従って、１つの実施態様において、本発明は、HCV  E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示す組換えヒトモノクローナル抗体に関する。ここで、モノクローナル抗体は、コンビナトリアル抗体ライブラリーから得られるヒト抗体Fab分子の結合部分に相同なアミノ酸配列を含む。組換えモノクローナル抗体分子は、実質的に全イムノグロブリン分子の形態であり得るか、または可溶性のFab分子、Fvフラグメント、もしくはsFv分子の形態であり得る。ここで、各分子は、少なくともヒト抗体Fab分子の結合部分に相同なアミノ酸配列を含む。
【００１４】
別の実施態様において、本発明は、HCV  E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示す、ヒトFab分子の重鎖または軽鎖可変領域（VHまたはVL）の結合部分に相同なポリぺプチドについての、ポリヌクレオチドコード配列を含む単離された核酸分子に関する。関連する実施態様において、本発明は、第一のポリぺプチドについてのポリヌクレオチドコード配列、および第二のポリぺプチドについてのポリヌクレオチドコード配列を含む単離された核酸分子に関する。ここで、第一のポリぺプチドは、HCV  E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示すヒトFab分子の重鎖可変領域（VH）の結合部分に相同であり、第二のポリぺプチドは、HCV  E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示すヒトFab分子の軽鎖可変領域（VL）の結合部分に相同である。
【００１５】
他の実施態様において、本発明は、ベクターが宿主細胞内に存在するか、またはポリヌクレオチドコード配列の転写および翻訳に適切な条件下で存在する場合、ポリヌクレオチドコード配列の転写を指向する制御配列に作動可能に連結した上記の核酸分子を含む発現ベクターに関する。本発明のなおさらなる実施態様は、本発明のベクターで形質転換された宿主細胞、および形質転換された宿主細胞を用いて組換えポリぺプチドを産生するための方法に関する。
【００１６】
別の実施態様において、本発明は、本発明の組換えモノクローナル抗体分子を含むワクチン組成物に関する。なおさらなる実施態様は、ワクチン組成物を使用する方法に関する。ここで、ワクチンは、哺乳動物被験体においてHCVに対する抗体力価を提供するために、および/またはワクチン化された被験体においてHCV感染に対する受動免疫を提供するために用いられる。関連する実施態様において、ワクチン組成物は、公知の抗HCV治療法と組み合わせて用いられる。
【００１７】
なおさらなる実施態様において、本発明の組換えモノクローナル抗体分子は、検出可能な部分で標識された結合複合体を提供するために使用される。標識された結合複合体は、本発明の関連する実施態様（例えば、HCVを含むと疑われる試料中にHCV粒子の存在を検出するための特異的結合アッセイ法、およびHCV感染被験体の抗HCV処置の進行をモニターするための特異的結合アッセイ）において用いられる。
【００１８】
本発明のこれらおよび他の実施態様は、本明細書中の開示を鑑みて当業者に容易に想到する。
【発明を実施するための最良の形態】
【００１９】
発明の詳細な説明
本発明の実施は、他で示されていない場合、当該分野における技術の範囲内のウイルス学、微生物学、分子生物学、および組換えDNA技術の従来方法を使用する。そのような技術は、文献に十分に説明される。例えば、Sambrookら,  Molecular  Cloning:  A  Laboratory  Manual(第２版,  1989);  DNA  Cloning:  A  Practical  Approach,  第I巻および第II巻(D.Glover編);  Oligonucleotide  Synthesis  (N.Gait編,  1984)  ;  Nucleic  Acid  Hybridization  (B.HamesおよびS.Higgins編,  1985);  Transcription  and  Translation  (B.HamesおよびS.Higgins編,  1984);  Animal  Cell  Culture  (R.Freshney編,  1986);  Perbal,  A  Practical  Guide  to  Molecular  Cloning  (1984);  Fundamental  Virology,  第２版,  第I巻および第II巻(B.N.FieldsおよびD.M.Knipe編）を参照のこと。
【００２０】
本明細書中および添付された請求の範囲中に使用されるように、単数形の「a」、「an」および「the」は、内容が明確に他を指示しない場合は、複数の対象物を含む。
【００２１】
Ａ．定義
本発明の記載において、以下の用語が使用され、そして下記のように定義されることを意図される。
【００２２】
本明細書中で使用されたように、用語「Ｃ型肝炎ウイルス」または「HCV」は、包括的な様式でウイルスを記述し、そして従ってこの用語は、何ら特定のHCVのウイルス配列にも単離株にも限定されない。この点について、系統学的な分析に基づいて同定された11の異なるサブタイプを有する、６つの異なるHCVの遺伝子型が存在する(Houghton,  M.(1996)「Hepatitis  C  Viruses,」Fields  Virology,  第３版,  Fieldsら編,  Lippincott-Raven  Publishers,  Philadelphia  PA.;  Simmondsら,  J.Gen.Virol.(1993)  74:2391-2399)。さらに、世界中の異なるHCV単離株由来のゲノムヌクレオチド配列の比較は、74の単離株間での配列多様性の範囲内で、HCVが非常に不均一であることを立証する。それゆえ、用語「Ｃ型肝炎ウイルス」および「HCV」は、本明細書中で使用されるように、そのような単離株の全てを包括的に含む。
【００２３】
用語「E1ポリペプチドに由来する抗原」、「E1ポリペプチド抗原」および「HCV  E1抗原」は、本明細書中で交換可能に使用され、そしてHCV  E1領域由来の分子を含む。用語「ポリペプチド」は本明細書中で使用されるように、アミノ酸のポリマーをいい、特定の長さの産物をいうものではない；それゆえ、ポリペプチド、オリゴペプチド、およびタンパク質は、ポリペプチドの定義に含まれる。この用語はまた、ポリペプチドの発現後修飾（例えば、グリコシル化、アセチル化、リン酸化など）をいうものでもなく除外もしない。E1ポリペプチド抗原は、HCV  E1領域より物理的に誘導され得るか、または公知の配列に基づいて、組換え的または合成的に産生され得る。HCV1の成熟E1領域は、ポリタンパク質のほぼアミノ酸192より開始し、ほぼアミノ酸383まで連続する。
【００２４】
指定されたHCV領域に「由来する」ポリペプチドまたはアミノ酸配列は、配列内にコードされるポリペプチドのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはその部分であって、少なくとも３〜５アミノ酸、好ましくは少なくとも４〜７アミノ酸、より好ましくは少なくとも８〜10アミノ酸、そしてなおより好ましくは少なくとも11〜15アミノ酸からなる部分、あるいは配列内にコードされるポリペプチドと免疫学的に同一視し得るポリペプチドをいう。この用語法はまた、指定されたHCV領域から発現されるポリペプチドを含む。
【００２５】
用語「E2ポリペプチドに由来する抗原」、「E2ポリペプチド抗原」、および「HCV  E2抗原」は、本明細書中で交換可能に使用され、そしてHCV  E2領域由来の分子を含む。そのような分子は、その領域より物理的に誘導され得るか、または公知の配列に基づいて、組換え的または合成的に産生され得る。HCV1の成熟E2領域は、ほぼアミノ酸384〜385より開始すると考えられる。
【００２６】
本発明の目的のために、HCV  E1およびE2ポリペプチドは、HCV1ゲノムによってコードされるポリタンパク質の、アミノ酸番号（開始メチオニンが位置１と指定される）に関して決定される。しかし、「E1ポリペプチド」または「E2ポリペプチド」由来の抗原は、正確なHCV1配列を有するポリペプチドに限定されないことに注意すべきである。実際に、HCVゲノムは、不断の不安定(flux)状態にあり、そして単離株間でが比較的高度な可変性を示すいくつかの可変ドメインを含む。これらの用語が、Simmondsら,  J  Gen  Virol  (1993)  74:  2391-2399に記載の６つの遺伝子型のHCVのいずれかを有する単離株を含む、任意の種々のHCV単離株由来のE1およびE2ポリペプチド由来の抗原を含むことは、容易に明らかである。このことについて、非相同のHCV単離株中の対応するE1またはE2領域は、その配列を最大の整列(alignment)に導く様式で、２つの単離株由来の配列を整列させることによって容易に決定し得る。これは、University  of  Virginia,  Department  of  Biochemistry(Attn:  Dr.William  R.Pearson)より入手可能な  ALIGN  1.0のような、任意の多数のコンピューターソフトウエアパッケージで遂行され得る。Pearsonら,  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  (1988)  85:2444-2448を参照のこと。
【００２７】
さらに、用語「E1ポリペプチド抗原」および「E2ポリペプチド抗原」は、内部欠失、付加および置換（天然で一般的に保存的な）のような、ネイティブな配列に対する改変を含むポリペプチドを含む。これらの改変は、部位特異的変異誘発を通じてのように計画的であり得るか、または天然に生じる変異事象を通じてのように偶発的であり得る。
【００２８】
「E1/E2複合体」は、上記E1およびE2ポリペプチドの複合体をいう。このような複合体におけるE1およびE2ポリペプチドの会合の様式は、重要でない。実際に、そのような複合体は、個別に産生されたE1およびE2ポリペプチドを単に混合することにより、自然に形成し得る。同様に、同時に発現または分泌された場合、E1およびE2ポリペプチドは、培地中で自然に複合体を形成し得る。「E1/E2複合体」の形成は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動のような標準的なタンパク質検出技法および免疫沈降法のような免疫学的技法を用いることにより容易に検出される。
【００２９】
用語「抗体」は、モノクローナル抗体調製物、ならびにハイブリッド抗体、改変(altered)抗体、F(ab’)2フラグメント、F(ab)分子、Fvフラグメント、単一ドメイン抗体、キメラ抗体、および親抗体分子の免疫学的結合特性を示すその機能フラグメントを含む調製物を含む。
【００３０】
本明細書中に使用されるように、用語「モノクローナル抗体」は、同種の抗体集団を有する抗体組成物をいう。この用語は、モノクローナル抗体が作成される様式によって限定されない。この用語は、イムノグロブリン分子全体、ならびにFab分子、F(ab’)2フラグメント、Fvフラグメント、および親モノクローナル抗体分子の免疫学的結合特性を示す他の分子を含む。用語「組換えモノクローナル抗体」は、本明細書中では、組換えポリヌクレオチドの発現により産生されるモノクローナル抗体として定義される。
【００３１】
用語「抗原結合部位」または「結合部分」は、抗原結合に関与するイムノグロブリン分子の一部分をいう。抗原結合部位は、重(「Ｈ」)鎖および軽(「Ｌ」)鎖のＮ末端可変（「Ｖ」）領域のアミノ酸残基によって形成される。重鎖および軽鎖のＶ領域内の３つの非常に相違した伸長部(stretch)は、「超可変領域」と呼ばれ、「骨格領域」または「FR」として公知のより保存された隣接伸長部の間に介在する。それゆえ、用語「FR」は、イムノグロブリンの超可変領域間にこれに近接して天然に見出されるアミノ酸配列をいう。抗体分子において、軽鎖の３つの超可変領域および重鎖の３つの超可変領域は、抗原結合表面を形成する３次元空間に互いに相対して配置される。抗原結合表面は、結合抗原の３次元表面に相補的であり、そして重鎖および軽鎖のそれぞれの３つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「CDR」といわれる。
【００３２】
本明細書中に使用されるように、用語「免疫学的結合」およ「免疫学的結合特性」は、イムノグロブリン分子とそれに対してこのイムノグロブリンが特異的である抗原との間に生じるタイプの非共有結合性相互作用をいう。免疫学的結合相互作用の強度または親和性は、その相互作用の解離定数(Kd)の面から表現され得るが、そのより小さなKdは、より強い親和性を示す。選択されたポリペプチドの免疫学的結合特性は、当該分野で周知の方法を用いて定量化され得る。そのような方法の一つは、抗原結合部位／抗原複合体の形成および解離の速度の計測を伴い、その速度は、複合体パートナーの濃度、相互作用の親和性、および両方向の速度に均等に影響する幾何学的パラメーターに依存する。それゆえ、「オン速度定数」(Kon)および「オフ速度定数」(Koff)は共に、濃度ならびに会合および解離の実際の速度を計算することにより決定され得る。Koff/Konの比率は、親和性とは関係しないすべてのパラメーターの削除を可能にし、そしてそれゆえ解離定数Kdに等しい。一般的には、Davisら,  (1990)  Annual  Rev  Biochem  59:439-473を参照のこと。
【００３３】
抗体分子の免疫学的結合特性を示し得る抗原結合部位を含む、多数の治療的に有用な分子は、当該分野で公知である。そのような分子の一つは、インタクトな抗原結合部位を含むヘテロダイマーを含むFab分子である。酵素ペプシンは、両抗原結合部位を含む「F(ab’)2」フラグメントを含むいくつかのフラグメントを提供するために、IgG分子を切断し得る。「Fv」フラグメントは、IgM、およびごくまれにIgGまたはIgAイムノグロブリン分子の選択的タンパク質分解性切断によって産生され得る。しかし、Fvフラグメントは、当該分野で公知の組換え技術を用いて、より一般的に誘導される。Fvフラグメントは、ネイティブな抗体分子の抗原認識能力および結合能力の大部分を保持する抗原結合部位を含む、非共有結合性のVH::VLヘテロダイマーを含む。Inbarら,  (1972)  Proc.Nat.Acad.Sci  USA  69:2659-2662;  Hochmanら,  (1976)  Biochem  15:2706-2710;およびEhrlichら,  (1980)  Biochem  19:4091-4096。
【００３４】
指定されたFab分子またはFab核酸配列に「由来する」ポリペプチド分子またはアミノ酸配列は、配列内にコードされるFabポリペプチドのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有するポリペプチド、またはその部分であって、少なくとも３〜５アミノ酸、好ましくは少なくとも４〜７アミノ酸、より好ましくは少なくとも８〜10アミノ酸、そしてなおより好ましくは少なくとも11〜15アミノ酸からなる部分をいう。
【００３５】
単一鎖Fv（「sFv」）ポリペプチド分子は、ペプチドをコードするリンカーによって連鎖されたVHをコードする遺伝子およびVLをコードする遺伝子を含む遺伝子融合物から発現される、共有結合性のVH::VLヘテロダイマーである。Hustonら,  (1988)  Proc  Nat  Acad  Sci  USA  85(16):5879-5883。自然に凝集されるが化学的に分離される抗体Ｖ領域由来の軽および重ポリペプチド鎖を、抗原結合部位の構造と実質的に同様な３次元構造へ畳み込むsfv分子に変換するための化学構造を識別する多数の方法が記載される。例えば、Hustonらによる、米国特許第5,091,513号、および第5,132,405号；およびLadnerらによる、第4,946,778号を参照のこと。
【００３６】
上記分子の各々は重鎖および軽鎖のCDRセットを含み、これらのセットは、CDRの支持を提供しそしてCDRの互いに対する空間的関係を規定する重鎖および軽鎖のFRセットの間にそれぞれ挿入される。本明細書中で使用される用語「CDRセット」とは、重鎖または軽鎖のV領域の３つの超可変領域をいう。重鎖または軽鎖のN末端から始めて、３つの領域をそれぞれ「CDR1」、「CDR2」、および「CDR3」という。それ故、抗原結合部位は、６つのCDR（重鎖および軽鎖のV領域の各々に由来するCDRセットを含む）を含む。
【００３７】
本明細書中に使用される用語「FRセット」とは、重鎖または軽鎖のV領域のCDRセットのCDRを構成する(frame)４つの隣接アミノ酸配列をいう。いくつかのFR残基は結合抗原と接触し得る；しかし、FrはV領域を抗原結合部位（特に、CDRに直接隣接するFR残基）に畳み込む(fold)ことを主に担う。
【００３８】
ポリペプチド配列またはヌクレオチド配列をいう場合、「精製された」および「単離された」とは、示された分子が、同タイプの他の生物学的巨大分子の実質的非存在下において存在することを意味する。本明細書中で使用される用語「精製された」および「単離された」とは、好ましくは少なくとも75重量％、より好ましくは少なくとも85重量％、よりなお好ましくは少なくとも95重量％、そして最も好ましくは少なくとも98重量％の同タイプの生物学的巨大分子が存在すること意味する。「特定のポリペプチドをコードする単離された核酸分子」とは、目的のポリペプチドをコードしない他の核酸分子を実質的に有さない核酸分子をいう；しかし、分子は、組成物の基礎的特徴に有害な影響を与えない、いくつかのさらなる塩基または部分を含み得る。従って、例えば、抗体の特定の重鎖可変領域の結合部分をコードする単離された核酸分子は、目的の結合部分についてのヌクレオチドコード配列から本質的に構成される（例えば、FRセットの間に挿入されたCDRセット）。
【００３９】
「相同性」とは、２つのポリヌクレオチドまたはポリペプチド部分間の同一性のパーセントをいう。２つ以上の配列間の一致は、当該分野で公知の技術により決定され得る。例えば、相同性は、２つのポリペプチド分子間の配列情報の直接比較により決定され得る。あるいは、相同性は、相同な領域間で安定な二本鎖を形成する条件下でのポリヌクレオチドのハイブリダイゼーション（例えば、S1消化前に使用されるもの）、続いて一本鎖特異的ヌクレアーゼ（単数または複数）での消化、続いて消化されたフラグメントのサイズ決定により決定され得る。２つのDNAまたはポリペプチド配列は、分子の規定された長さにわたり、少なくとも約60％（好ましくは少なくとも約80％、そして最も好ましくは少なくとも約90％）のヌクレオチドまたはアミノ酸が適合する場合に、「実質的に相同性」である。
【００４０】
用語「組換えDNA分子」または「組換え核酸分子」とは、その起源または操作に基づいて、(1)天然で関連するポリヌクレオチドの全部または一部と関連しないか、(2)天然で連鎖するポリヌクレオチド以外のポリヌクレオチドと連鎖するか、または(3)天然に存在しない、ゲノム、cDNA、半合成、または合成起源のポリヌクレオチドをいうために本明細書中で使用される。従って、この用語は、「合成的に由来する」核酸分子を包含する。
【００４１】
本明細書中で使用される用語「核酸分子」とは、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれかの、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態をいう。この用語は、分子の一次構造のみをいい、従って二本鎖および一本鎖DNAおよびRNAを含む。これはまた、例えば、当該分野で公知の標識、メチル化、「キャップ」、アナログとの１つ以上の天然に存在するヌクレオチドの置換、無荷電結合での修飾（例えば、メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホラミダート(phosphoamidate)、カルバメートなど）および荷電結合での修飾（例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど）ようなヌクレオチド間修飾、タンパク質のような付属物部分（例えば、ヌクレアーゼ、毒素、抗体、シグナルペプチド、ポリ-L-リジンなど）を含む修飾、インターカレーター（例えば、アクリジン、ソラーレンなど）での修飾、キレート剤（例えば、金属、放射活性金属、ホウ素、酸化金属など）を含む修飾、アルキル剤を含む修飾、修飾された結合（例えば、αアノマー核酸など）での修飾のような公知のタイプの修飾、ならびにポリヌクレオチドの未修飾の形態を含む。
【００４２】
「コード配列」は、適切な調節配列の制御下に配置された場合に、通常はmRNAを介して、ポリペプチドに翻訳される核酸分子である。コード配列の境界は、5’末端の翻訳開始コドンおよび3’末端の翻訳停止コドンにより決定され得る。コード配列には、CDNAおよび組換えヌクレオチド配列が挙げられるが、これらには限定されない。
【００４３】
「制御配列」とは、それらが連結されたコード配列の発現をもたらすのに必要である核酸配列をいう。このような制御配列の性質は、宿主生物に依存して異なる；原核生物においては、このような制御配列には、一般的に、プロモーター、リボソーム結合部位、および転写末端配列が挙げられる；真核生物においては、このような制御配列には、一般的に、プロモーターおよび転写終結配列が挙げられる。用語「制御配列」は、コード配列の発現のためにその存在が必要である全ての成分を最小限含み、そしてその存在が有利であるさらなる成分（例えば、リーダー配列および融合パートナー配列）を含み得る。
【００４４】
「作動可能に連結された」とは、そのように記載される成分がそれらが意図される様式で機能することを可能にする関係にある近位をいう。コード配列に「作動可能に連結された」制御配列は、コード配列の発現が制御配列と適合する条件下で達成されるような方法で結合される。
【００４５】
本明細書中で使用される用語「発現カセット」とは、適切な宿主細胞におけるコード配列のクローン化コピーの転写およびmRNAの翻訳のために必要な全てのヌクレオチド配列を含む制御配列に作動可能に連結された少なくとも１つのコード配列を含む分子をいう。このような発現カセットは、種々の宿主（例えば、細菌、ラン藻類、植物細胞、酵母細胞、昆虫細胞、および動物細胞）において真核生物遺伝子を発現するために使用され得る。本発明の下では、発現カセットには、クローニングベクター、特別に設計されたプラスミド、ウイルスまたはウイルス粒子が挙げられ得るが、これらには限定されない。カセットはさらに、宿主細胞における自立増殖のための複製起点、選択マーカー、種々の制限部位、高コピー数についての可能性、および強力なプロモーターを含み得る。
【００４６】
「ベクター」とは、適切な制御エレメントに結合された場合に複製を可能にし、そして細胞間で遺伝子配列を移送し得る、任意の遺伝的エレメント（例えば、プラスミド、ファージ、トランスポゾン、コスミド、染色体、ウイルスなど）を意味する。従って、この用語は、クローニングビヒクルおよび発現ビヒクル、ならびにウイルスベクターを含む。
【００４７】
「組換え宿主細胞」、「宿主細胞」、「細胞」、「細胞培養物」、および他のこのような用語は、例えば、組換えベクターまたは他の移送DNAのためのレシピエントとして使用され得る（または、使用されている）微生物、昆虫細胞、および哺乳動物細胞を示し、そして形質転換されている元の細胞の子孫を含む。単一の親細胞の子孫が、天然の、偶発的な、または意図的な変異により、形態においてまたはゲノムもしく全DNA相補体においてその元の親と必ずしも完全に同一ではないかもしれない。哺乳動物宿主細胞についての例には、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)およびサル腎臓(COS)細胞が挙げられる。
【００４８】
詳細には、本明細書中で使用される「細胞株」とは、インビトロにおいて連続的なまたは延長された増殖および分裂が可能である細胞の集団をいう。しばしば、細胞株は、単一の祖先細胞に由来するクローン集団である。自発的なまたは誘導された変化は、このようなクローン集団の保存または移送の間に核型において生じ得ることは、当該分野においてさらに公知である。それ故、言及される細胞株由来の細胞は、祖先の細胞または培養物と正確に同一でないかもしれないし、そして言及される細胞株はこのような変異株を含む。用語「細胞株」はまた、不死化細胞を含む。
【００４９】
本明細書中で使用される「形質転換」とは、挿入のために使用される方法（例えば、直接取り込み、形質導入、f接合、またはエレクトロポレーション）とは無関係に、宿主細胞への異種ポリヌクレオチドの挿入をいう。異種ポリヌクレオチドは、非組込み型(non-integrated)のベクター（例えば、プラスミド）として維持され得、あるいは宿主ゲノムへ組み込まれ得る。
【００５０】
Ｂ.  一般的方法
本発明は、HCV  E2エンベロープ糖タンパク質に特異的である、新規な交叉遺伝子型反応性ヒトモノクローナル抗体分子の生成に基づく。モノクローナル抗体は、非免疫化供給源から構築されたコンビナトリアル・抗体ライブラリーを使用して得られ、そして哺乳動物被験体におけるHCV感染の予防、治療、および診断において有用である。より詳細には、モノクローナル抗体は、糸状DNAバクテリオファージの表面上でFab分子を発現するコンビナトリアル・ライブラリーから抗原選択技術を使用して得られる。
【００５１】
コンビナトリアル・ライブラリーの調製
本発明の目的のためのコンビナトリアル・ライブラリーは、公知の技術（例えば、Chanockら、(1933)  Infect  Agents  Dis  2:118-131およびBarbas,IIIら、(1995)  Methods:  Comp.Meth  Enzymol  8:94-103により記載される技術）を使用して構築され得る。抗体産生細胞は、非免疫化HCV感染供与者から、例えば、血漿、血清、脊髄液、リンパ液、呼吸器の外部切片(external  section)、消化管および尿生殖器管、涙液、唾液、乳液、白血球、およびミエローマから得られ得る。好ましくは、抗体産生細胞供給源は、非免疫化被験体の骨髄または末梢血試料から得られたリンパ球である。
【００５２】
リンパ球は、試料から得られ、そして全RNAが、公知の方法を使用して単離および抽出され得る。例えば、Chomczynskiら、(1987)  Anal  Biochem  162:156-159を参照のこと。RNAは、オリゴ-dTプライミングを使用して第一鎖CDNAに逆転写され得る。イムノグロブリン重鎖(Fd)および軽鎖のフラグメントをコードするDNAは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用して増幅されて、Fab抗原結合分子を産生するために必要な全ての遺伝物質を提供し得る。Saikiら、(1986)  Nature  324:163、Scharfら、(1986)  Science  233:1076-1078、ならびに米国特許第4,683,195号および同第4,683,202号。PCR増幅の実施においては、多数の公知のプライマーがγ1重鎖およびκ軽鎖配列について選択するために好ましく使用され得る。Perssonら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:2432-2436、Kangら、(1991)  Methods:  Comp.Meth  Enzymol  2:111-118。PCR産物は、重鎖および軽鎖DNA調製物に別々にプールされ、次いで、例えば、ゲル電気泳動を使用して精製される。次いで、精製された重鎖および軽鎖DNA分子は、適切な制限酵素で消化され、そして消化産物は精製され、適切なファージミドベクター系に連結される。Yangら、(1995)  J  Mol  Biol  254:392-403、Barbas,IIIら、(1995)  Methods:Comp.Meth  Enzymol  8:94-103、Barbas,IIIら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:7978-7982。多数の適切なファージミドベクター系は、当該分野において公知である；しかし、本明細書中の使用に特に好ましいベクターは、以前に記載されているpComb3hベクターである。Barbas,IIIら、(1995)、前出。Pcomb3hファージミドベクターが使用される場合、重鎖DNAが、目的のファージミド中へ、ファージミドコートタンパク質III(cpIII)のC末端アンカードメインについての配列に隣接しかつその上流へクローン化される。cpiiiタンパク質は、主要膜タンパク質であり、それ故、Fabアセンブリのための膜アンカーとして役立つ。
【００５３】
ベクターは、一般的に、当該分野で公知の選択マーカーを含む。例えば、Pcomb3hファージミドベクターは、細菌アンピシリン耐性遺伝子（βラクタマーゼ）を含む。ベクターはまた、適切な第一および第二リーダー配列を含む。それらの配列は、重鎖および軽鎖をコードする配列のための挿入部位の上流にそれぞれに配置され、それによって、適切な宿主細胞において産生される場合に、重鎖および軽鎖コード領域由来の発現産物は周辺質に標的化される。Pcomb3hにおいて、これらのリーダー配列は、pelB配列、omp  A配列、またはそれらの組み合わせである。
【００５４】
次いで、ヒトイムノグロブリンDNAを含むファージミドベクター系は、（例えば、電気泳動を使用して）適切な細菌宿主細胞に導入され、ここで、ファージミドは、重鎖cpiii融合ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチド（これらの各々は、それらの関連するリーダー配列により宿主細胞の周辺質に標的化される）を発現する。ファージミドベクターを含むトランスフェクトされた細菌宿主細胞は、ファージミドベクターの選択マーカーに対応する選択薬剤（例えば、アンピシリン）を含む適切な培地における増殖により選択される。
【００５５】
ファージミドDNAのレスキューは公知の技術を使用して実施される。特に、トランスフェクトされた宿主細胞は、ファージミドDNAの組換えウイルス粒子中へのパッケージングのためにトランスに必要な多数の発現産物をコードするヘルパーファージで感染される。ファージミドDNAの一本鎖コピーはこのようにウイルス粒子中にパッケージングされ、これは宿主細胞を離れるに際してファージcpVIII分子を取り込み、そして限定された数のファージcpiii分子によりキャップされ−−そのcpviiiおよびcpiii分子のいくつかはFab分子に連結される。Fab分子を提示する組換えファージ粒子（「ファージ-Fab」と称する）は、パッケージングされるゲノム内に対応する重鎖遺伝子および軽鎖遺伝子を含む。
【００５６】
上記の技術がファージミドの最初のライブラリーを使用して実施されると、レスキュープロセスはFab分子を提示する組換えファージのライブラリー（ファージディスプレイライブラリー）を生成する。レスキュープロセスはさらに最初のライブラリーの増幅を生じ、その結果、複数のコピーの各組換えファージクローンが（イムノグロブリン重鎖および軽鎖結合部分の各セットとともに）生成される。次いで、ファージディスプレイライブラリーは、HCV  E2抗原に対して「パニング（panned）」されて、その抗原に選択的に結合し得るFab分子について選択される。より特定すると、パニング手順はファージディスプレイライブラリーを含有する懸濁液を、公知の方法に従ってプラスチック反応容器に固定化されたHCV  E2抗原に適用することにより実施され得る。Burtonら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:10134-10137。適切な結合条件下でのインキュベーション後、非特異的に結合したファージ粒子は、反復する洗浄により除去される。次いで、得られるHCV  E2抗原特異的ファージ-Fabは、低Phを使用して、または過剰の可溶性E2抗原の存在下で、不溶性抗原から溶出される。パニング手順は数回反復され、ここで、細菌宿主細胞は、パニングの各回の後に溶出されたファージにより感染されて、パニングの各々の次の回のためにファージ-Fabクローンが増殖される。Samuelssonら、(1995)  Virology  207:495-502。
【００５７】
本発明において、パニング手順は、HCV  E2抗原に特異的な、高度に強力な、交叉遺伝子型反応性Fab分子について選択するために特定して開発された。特に、そこから抗体産生細胞が得られた非免疫化、HCV感染ヒト被験体の血清HCVの遺伝子型は、公知の方法を使用して決定された。Widellら、(1994)  J  Med  Virol  44:272-279。株交叉反応性についての選択は、実験的設計により提供された。ここで、パニング手順は、感染されたヒト供与者由来のHCVの遺伝子型とは異なるHCV遺伝子型に由来するHCV  E2抗原を使用して実施された。さらに、パニング手順において使用されたE2抗原は、インビボにおいてその抗原について予想されるコンフォメーションと実質的に同一のコンフォメーションのHCV  E2抗原を提供するように選択された。
【００５８】
２つの異なる組換えHCVエンベロープタンパク質調製物が、上記のパニング手順における選択抗原を提供するために使用された（「コンフォメーショナル」CHO  E2分子、およびCHO  E1/E2複合体）。コンフォメーショナルE2分子は、Spaeteら、(1992)  Virology  188:819-830に以前に記載のように、構築され、発現され、そして組換えCHO細胞から分泌され、次いで公知の方法（Rosaら、(1996)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  93:1759-1763）を使用して精製された。組換え複合体化E1/E2調製物は、Spaeteら、(1992)（前出）に記載のように、構築され、そして組換えCHO細胞から発現され、次いで公知の方法（Chooら、(1994)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  91:1294-1298）を使用して精製された。一旦精製されると、選択抗原は、上記のように、プラスチック反応容器に固定化された。
【００５９】
選択抗原に対する優れた結合親和性を示す個々のクローンは、選択され、そして感染された宿主細胞を、選択培地中で、適切な容量の細胞に達するまで増殖させることにより発現された。細菌宿主細胞はペレット化され、次いで培地中に再懸濁された。適切なインキュベーション後、細胞はスピンダウンされ、そして周辺質内容物は凍結融解技術により遊離された。細菌破片が遠心分離により除去された後、Fab含有上清は適切な容器に移され、そして将来の使用のために貯蔵された。
【００６０】
一旦選択されたFabが発現されると、選択されたFab分子の結合特性が決定され得る。特に、HCV  E2抗原に対するFab分子の親和性は、阻害ELISA技術を使用して、本明細書において決定された。例えば、Perssonら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:2432-2436、Rathら、(1988)  J  Immun  Methods  106:245-249を参照のこと。高い効力（例えば、阻害ELISAにより決定したところ、少なくとも約１×107  M-1、および好ましくは少なくとも約1.7×107  M-1の親和性）のFab分子を発現したクローンが、配列決定のために同定された。
【００６１】
パニング選択プロセスにおいて高い効力の結合を示したクローン由来のファージ（プラスミド）DNAが単離され、そして一本鎖DNAがイムノグロブリンクローニング領域の上流および下流にハイブリダイズするプライマー（その１つは、例えば、5’末端においてビオチン化されている）を使用するPCRにより得られた。PCR後、一本鎖DNAは、DNAをアルカリ性条件下で変性し、そしてビオチン化DNA鎖を固体支持体に吸着させることにより得られた。ジデオキシ配列決定反応は、公知の方法に従って（Sangerら、(1977)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  74:5463-5467）、可変領域と定常領域との間の連結部の3’にハイブリダイズする標識プライマーを使用して実施された。Kabatら、Sequences  of  Proteins  of  Immunological  Interest,  第４版,  （U.S.Dept.of  Health  and  Human  Services,  U.S.Government  Printing  Office,  1987）。反応手順は、自動化配列決定装置（例えば、Pharmacia  Biotechから入手可能であるA.L.F.）で行われた。このように得られた核酸配列情報は、選択されたモノクローナルFab分子の重鎖および軽鎖部分のコード配列を提供するために分析された。同一のクローンの複数のコピーが、配列データの比較により同定された。さらに、推定アミノ酸配列は、公知の方法を使用して得られた。
【００６２】
上記の核酸配列情報を使用して、Fab分子のコード配列はまた、公知の方法を使用して合成的に産生され得る。ヌクレオチド配列は、所望の特定のアミノ酸配列に対する適切なコドンを用いて設計され得る。一般に、その中で配列が発現される意図される宿主について好ましいコドンを選択する。全配列は、一般に、標準的方法により調製され、そして全コード配列に組立てられる重複するオリゴヌクレオチドから組立てられる。例えば、Edge  (1981)  Nature  292:756；Nambairら、(1984)  Science  223:1299；Jayら、(1984)  J.Biol.Chem.259:6311を参照のこと。
【００６３】
発現系
一旦Fab分子の重鎖および軽鎖部分のコード配列が単離または合成されると、それらは発現のための任意の適切なベクターまたはレプリコン中にクローン化され得、例えば、細菌、哺乳動物、酵母、およびウイルス発現系が使用され得る。多数のクローニングベクターが当業者に公知であり、そして以下に記載される。適切なクローニングベクターの選択は好みの問題である。
【００６４】
ｉ．細菌細胞における発現
細菌発現系が、Fab分子を産生するために使用され得る。細菌系における使用のための制御エレメントとしては、プロモーター（必要に応じてオペレーター配列を含む）、およびリボソーム結合部位が挙げられる。有用なプロモーターとしては、糖代謝酵素（例えば、ガラクトース、ラクトース（lac）、およびマルトース）由来の配列が挙げられる。さらなる例としては、生合成酵素（例えば、トリプトファン（trp））由来のプロモーター配列、β-ラクタマーゼ（bla）プロモーター系、バクテリオファージλPL、およびT7が挙げられる。さらに、tacプロモーターのような合成プロモーターが使用され得る。β-ラクタマーゼおよびラクトースプロモーター系は、Changら、Nature  (1978)  275:615、およびGoeddelら、Nature  (1979)  281:544に記載されており；アルカリホスファターゼ、トリプトファン（trp）プロモーター系は、Goeddelら、Nucleic  Acids  Res.(1980)  8:4057およびEP  36,776に記載されており、そしてtacプロモーターのようなハイブリッドプロモーターは、米国特許第4,551,433号およびdeBoerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1983)  80:21-25に記載されている。しかし、真核生物タンパク質の発現のために有用な他の公知の細菌プロモーターもまた適切である。当業者は、例えば、Siebenlistら、Cell  (1980)  20:269に記載のように、任意の必要とされる制限部位を供給するためのリンカーまたはアダプターを使用して、このようなプロモーターをFab分子に作動可能に連結し得る。細菌系における使用のためのプロモーターはまた、一般に、Fab分子をコードするDNAに作動可能に連結されたシャイン-ダルガルノ（SD）配列を含む。天然のポリペプチドシグナル配列を認識およびプロセシングしない原核生物宿主細胞については、シグナル配列が、例えば、アルカリホスファターゼ、ペニシリナーゼ、Ippまたは熱安定エンテロトキシンIIリーダーの群から選択される原核生物シグナル配列により置換され得る。プラスミドpBR322由来の複製起点は、大部分のグラム陰性細菌に適切である。
【００６５】
上記の系は、Escherichia  coliに特に適合性である。しかし、とりわけ、Bacillus  spp.、Streptococcus  spp.、Streptomyces  spp.、Pseudomonas種（例えば、P.aeruginosa）、Salmonella  typhimurium、またはSerratia  marcescansのようなグラム陰性またはグラム陽性生物を含む細菌宿主における使用のための多数の他の系が存在する。外因性DNAをこれらの宿主に導入するための方法としては、代表的には、CaCl2またはその他の薬剤（例えば、二価カチオンおよびDMSO）の使用が挙げられる。DNAはまた、上記で引用されるSambrookら、(1989)に一般に記載されるように、エレクトロポレーション、核注入、またはプロトプラスト融合により細菌細胞中に導入され得る。これらの例は、例示であり限定ではない。好ましくは、宿主細胞は、最小量のタンパク質分解酵素を分泌するべきである。あるいは、クローニングのインビトロ方法（例えば、PCRまたはその他の核酸ポリメラーゼ反応）が適切である。
【００６６】
本発明のFab分子を産生するために使用される原核生物細胞は、上記で引用されるSambrookらに一般に記載されるように、適切な培地中で培養される。
【００６７】
ii．酵母細胞における発現
酵母発現系もまた、本発明のFab分子を産生するために使用され得る。発現および形質転換ベクター（染色体外レプリコンまたは組み込みベクターのいずれか）は、多くの酵母中への形質転換のために開発されている。例えば、発現ベクターが、とりわけ、以下の酵母のために開発されている：Saccharomyces  cerevisiae（Hinnenら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1978)  75:1929；Itoら、J.Bacteriol.(1983)  153:163に記載）；Candida  albicans（Kurtzら、Mol.Cell.Biol.(1986)  6:142に記載）；Candida  maltosa（Kunzeら、J.Basic  Microbiol.(1985)  25:141に記載）；Hansenula  polymorpha（Gleesonら、J.Gen.Microbiol.(1986)  132:3459、およびRoggenkampら、Mol.Gen.Genet.(1986)  202:302に記載）；Kluyveromyces  fragilis（Dasら、J.Bacteriol.(1984)  158:1165に記載）；Kluyveromyces  lactis（De  Louvencourtら、J.Bacteriol.(1983)  154:737、およびVan  den  Bergら、Bio/Technology  (1990)  8:135に記載）；Pichia  guillerimondii（Kunzeら、J.Basic  Microbiol.(1985)  25:141に記載）；Pichia  pastoris（Creggら、Mol.Cell.Biol.(1985)  5:3376、ならびに米国特許第4,837,148号、および同第4,929,555号に記載）；Schizosaccharomyces  pombe（BeachおよびNurse,  Nature  (1981)  300:706に記載）；ならびにYarrowia  lipolytica（Davidowら、Curr.Genet.(1985)  10:380、およびGaillardinら、Curr.Genet.(1985)  10:49に記載）、Aspergillus宿主（例えば、A.nidulans（Ballanceら、Biochem.Biophys.Res.Commun.(1983)  112:284-289；Tilburnら、Gene  (1983)  26:205-221、およびYeltonら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1984)  81:1470-1474に記載）、ならびにA.niger（KellyおよびHynes、EMBO  J.(1985)  4:475479に記載））；Trichoderma  reesia（EP  244,234に記載）、ならびに糸状菌（例えば、Neurospora、Penicillium、Tolypocladium（WO  91/00357に記載））。
【００６８】
酵母ベクターのための制御配列は公知であり、そしてアルコールデヒドロゲナーゼ（ADH）（EP  284,044に記載）、エノラーゼ、グルコキナーゼ、グルコース-6-リン酸イソメラーゼ、グリセルアルデヒド-3-リン酸-デヒドロゲナーゼ（GAPまたはGAPDH）、ヘキソキナーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、3-ホスホグリセリン酸ムターゼ、およびピルビン酸キナーゼ（Pyk）（EP  329,203に記載）のような遺伝子由来のプロモーター領域を含む。酵母PHO5遺伝子（酸性ホスファターゼをコードする）もまた、Myanoharaら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1983)  80:1に記載のように、有用なプロモーター配列を提供する。酵母宿主での使用のために適切な他のプロモーター配列としては、3-ホスホグリセリン酸キナーゼ（Hitzemanら、J.Biol.Chem.(1980)  255:2073に記載）、またはその他の解糖系酵素（例えば、ピルビン酸デカルボキシラーゼ、トリオースリン酸イソメラーゼ、およびホスホグルコースイソメラーゼ（Hessら、J.Adv.Enzyme  Reg.(1968)  7:149、およびHollandら、Biochemistry  (1978)  17:4900に記載））が挙げられる。増殖条件により制御される転写のさらなる利点を有する誘導性酵母プロモーターとしては、上記のリストからならびに、その他（アルコールデヒドロゲナーゼ２、イソシトクロムＣ、酸性ホスファターゼ、窒素代謝に関連する分解酵素、メタロチオネイン、グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ、ならびにマルトースおよびガラクトース利用を担う酵素のプロモーター領域）が挙げられる。酵母発現における使用のために適切なベクターおよびプロモーターは、Hitzeman、EP  073,657にさらに記載されている。酵母エンハンサーもまた、酵母プロモーターとともに有利に使用される。さらに、天然に存在しない合成プロモーターもまた、酵母プロモーターとして機能する。例えば、１つの酵母プロモーターの上流活性化配列（UAS）が、別の酵母プロモーターの転写活性化領域と連結され得、合成ハイブリッドプロモーターを作製し得る。そのようなハイブリッドプロモーターの例としては、米国特許第4,876,197号および同第4,880,734号に記載のような、GAP転写活性化領域に連結されたADH調節配列が挙げられる。ハイブリッドプロモーターの他の例としては、EP  164,556に記載のような、解糖系酵素遺伝子（例えば、GAPまたはPyK）の転写活性化領域と組み合わされた、ADH2、GAL4、GAL10、またはPHO5遺伝子のいずれかの調節配列からなるプロモーターが挙げられる。さらに、酵母プロモーターは、酵母RNAポリメラーゼを結合し、そして転写を開始する能力を有する非酵母起源の天然に存在するプロモーターを含み得る。
【００６９】
酵母発現ベクター中に含まれ得る他の制御エレメントは、ターミネーター（例えば、GAPDH遺伝子およびエノラーゼ遺伝子由来（Hollandら、J.Biol.Chem.(1981)  256:1385に記載)）、および分泌のためのシグナル配列をコードするリーダー配列である。適切なシグナル配列をコードするDNAは、分泌酵母タンパク質の遺伝子（例えば、酵母インベルターゼ遺伝子（EP  012,873およびJP  62,096,086に記載）およびα因子遺伝子（米国特許第4,588,684号、同第4,546,083号、および同第4,870,008号；EP  324,274；およびWO  89/02463に記載)）に由来し得る。あるいは、非酵母起源のリーダー（例えば、インターフェロンリーダー）もまた、EP  060,057に記載のように、酵母における分泌を提供する。
【００７０】
外因性DNAを酵母宿主に導入する方法は当該分野で周知であり、代表的には、アルカリカチオンで処理したスフェロプラストまたは無傷酵母細胞のいずれかの形質転換を含む。酵母への形質転換は、Van  Solingenら、J.Bact.(1977)  130:946およびHsiaoら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1979)  76:3829に記載の方法に従って実施され得る。しかし、DNAを細胞に導入するための他の方法（例えば、核注入、エレクトロポレーション、またはプロトプラスト融合）もまた、Sambrookら（上記）に一般的に記載されるようにして用いられ得る。
【００７１】
酵母分泌について、ネイティブなポリペプチドシグナル配列は、酵母インベルターゼリーダー、α因子リーダー、または酸ホスファターゼリーダーにより置換され得る。２μプラスミド開始点由来の複製開始点が酵母に適切である。酵母における使用のための適切な選択遺伝子は、Kingsmanら、Gene  (1979)  7:141またはTschemperら、Gene  (1980)  10:157に記載の酵母プラスミドに存在するtrp1遺伝子である。trp1遺伝子は、トリプトファンで生育する能力を欠損する酵母変異株に対する選択マーカーを提供する。同様に、Leu2欠損酵母株（ATCC  20,622または38,626）は、Leu2遺伝子を有する公知のプラスミドにより相補される。
【００７２】
酵母における本発明のポリペプチドの細胞内産生については、酵母タンパク質をコードする配列が、発現の際に酵母細胞により細胞内で切断され得る融合タンパク質を産生するために、Fab分子のコード配列に連結され得る。このような酵母リーダー配列の一例は、酵母ユビキチン遺伝子である。
【００７３】
iii.  昆虫細胞における発現
Fab分子はまた、昆虫発現系においても産生され得る。例えば、バキュロウイルス発現ベクター(BEV)は、発現されるべき外来性遺伝子のコード配列が、SmithおよびSummers、米国特許第4,745,051号に記載のように、ウイルス遺伝子（例えば、ポリヘドリン）の代わりに、バキュロウイルスプロモーターの後方に挿入されている組換え昆虫ウイルスである。
【００７４】
本明細書中の発現構築物は、昆虫細胞系の感染または形質転換のための中間物として有用なDNAベクターを含み、このベクターは、一般に、バキュロウイルス転写プロモーターをコードするDNAを含み、必要に応じてであるが好ましくは、下流に、所望のタンパク質の分泌を導き得る昆虫シグナルDNA配列、および外来性タンパク質をコードする外来性遺伝子の挿入部位を含み、シグナルDNA配列および外来性遺伝子は、バキュロウイルスプロモーターの転写制御下に置かれ、本明細書中での外来性遺伝子は、Fab分子のコード配列である。
【００７５】
本明細書中で用いられるプロモーターは、一般に昆虫に感染する、500を超えるバキュロウイルスのいずれかに由来するバキュロウイルス転写プロモーター領域であり得る。例えば、Lepidoptera、Diptera、Orthoptera、Coleoptera、およびHymenopteraの目が挙げられる。例えば、Autographo  californica  MNPV、Bombyx  mori  NPV、rrichoplusia  ni  MNPV、Rachlplusia  ou  MNPVまたはGalleria  mellonella  MNPV、Aedes  aegypti、Drosophila  melanogaster、Spodoptera  frugiperda、およびTrichoplusia  niのウイルスDNAを含むが、これらに限定されない。従って、バキュロウイルス転写プロモーターは、例えば、バキュロウイルス前初期遺伝子IEIまたはIENプロモーター；39Kおよび後初期遺伝子を含むHindIIIフラグメントからなる群から選択されるバキュロウイルス後初期遺伝子と組み合わせた前初期遺伝子プロモーター領域；またはバキュロウイルス後期遺伝子プロモーターであり得る。前初期プロモーターまたは後初期プロモーターは、転写エンハンサーエレメントを用いて増強され得る。
【００７６】
本明細書中における使用に特に適切なプロモーターは、バキュロウイルスの強ポリヘドリンプロモーター（高レベルのDNA挿入物の発現を導く、Friesenら、(1986)    THE  MOLECULAR  BIOLOGY  OF  BACULOVIRUSES（W.Doerfler編）の「The  Regulation  of  Baculovirus  Gene  Expression」；EP  127,839およびEP  155,476に記載）；およびp10タンパク質をコードする遺伝子由来のプロモーター（Vlakら、J.Gen.Virol.(1988)  69:765-776に記載）である。
【００７７】
本明細書中で用いられるプラスミドはまた、通常、ポリヘドリンポリアデニル化シグナル（Millerら、Ann.Rev.Microbiol.(1988)  42:177に記載）、および原核生物アンピシリン耐性(amp)遺伝子、およびE.coliにおける選択および増殖のための複製開始点を含む。適切なシグナル配列をコードするDNAもまた含まれ得、そして一般に分泌される昆虫またはバキュロウイルスタンパク質の遺伝子（例えば、バキュロウイルスポリヘドリン遺伝子）（Carbonellら、Gene  (1988)  73:409に記載）、ならびに哺乳動物シグナル配列（例えば、ヒトαインターフェロン（Maedaら、Nature  (1985)  315:592-594に記載）；ヒトガストリン放出ペプチド（Lebacq-Verheydenら、Mol.Cell.Biol.(1988)  8:3129に記載）；ヒトIL-2（Smithら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1985)  82:8404に記載；マウスIL-3（Miyajimaら、Gene  (1987)  58:273に記載）；およびヒトグルコセレブロシダーゼ（Martinら、DNA  (1988)  7:99に記載）をコードする遺伝子由来の配列に由来し得る。
【００７８】
多数のバキュロウイルス株および変異株、ならびに宿主由来の対応する許容昆虫宿主細胞（例えば、Spodoptera  frugiperda（毛虫）、Aedes  aegypti（蚊）、Aedes  albopictus（蚊）、Drosophila  melanogaster（ショウジョウバエ）、およびBombyx  mori宿主細胞が同定されており、そして本明細書中で用いられ得る。例えば、Luckowら、Bio/Technology  (1988)  6:47-55、Millerら、GENETIC  ENGINEERING（Setlow,  J.K.ら編）第8巻（Plenum  Publishing,  1986）277〜279頁、およびMaedaら、Nature  (1985)  315:592-594を参照のこと。種々のこのようなウイルス株は、公的に入手可能である。例えば、Autographa  californica  NPVのL-1変異株およびBombyx  mori  NPVのBm-5株が挙げられる。このようなウイルスが、宿主細胞（例えば、Spodoptera  frugiperda細胞）のトランスフェクションのためのウイルスとして用いられ得る。
【００７９】
ポリヘドリンプロモーターに加えて、他のバキュロウイルス遺伝子がバキュロウイルス発現系において用いられ得る。これらは、それらが発現されるウイルス感染段階に従って、前初期（α）、後初期（β）、後期（γ）、極後期（δ）を含む。これらの遺伝子の発現は、おそらく転写調節の「カスケード」機構の結果として、連続的に生じる。従って、前初期遺伝子は、他のウイルス機能の非存在下で感染直後に発現され、そして得られた遺伝子産物の１つ以上が後初期遺伝子の転写を誘導する。次いで、いくつかの後初期遺伝子産物が、後期遺伝子の転写を誘導し、そして最終的に極後期遺伝子が、１つ以上のより早いクラスから既に発現された遺伝子産物の制御下で発現される。この調節カスケードの１つの比較的十分に規定された成分はIEIであり、これは、Autographo  californica核ポリヘドロシスウイルス（AcMNPV）の好ましい前初期遺伝子である。IEIは、他のウイルス機能の非存在下では抑制され、後初期クラスのいくつかの遺伝子（好ましい39K遺伝子（GuarinoおよびSummers、J.Virol.(1986)  57:563-571およびJ.Virol.(1987)  61:2091-2099に記載）を含む）ならびに後期遺伝子（GuannoおよびSummers、Virol.(1988)  162:444-451に記載）の転写を刺激する産物をコードする。
【００８０】
上記の前初期遺伝子は、後初期カテゴリーのバキュロウイルス遺伝子プロモーター領域と組み合わせて用いられ得る。前初期遺伝子と異なり、このような後初期遺伝子は、他のウイルス遺伝子または遺伝子産物（例えば、前初期遺伝子の遺伝子産物）の存在を必要とする。前初期遺伝子は、いくつかの後初期遺伝子プロモーター領域（例えば、39KまたはバキュロウイルスゲノムのHindIIIフラグメントに見出される後初期遺伝子プロモーターの１つ）のいずれかと共に組み合わせられ得る。本発明の場合では、39Kプロモーター領域が、発現されるべき外来性遺伝子に、その発現がIEIの存在によりさらに制御され得るように連結され得る（L.A.GuarinoおよびSummers  (1986a)  上記；GuarinoおよびSummers  (1986b)  J.Virol.(1986)  60:215-223；ならびにGuarinoら、(1986c)  J.Virol.(1986)  60:224-229に記載）。
【００８１】
さらに、前初期遺伝子と後初期遺伝子プロモーター領域との組み合わせが用いられる場合、異種遺伝子の発現の増強は、後初期遺伝子プロモーター領域と直接シス連結したエンハンサー配列の存在により実現され得る。このようなエンハンサー配列は、前初期遺伝子またはその産物が限られる状況で後初期遺伝子発現を増強することにより特徴づけられる。例えば、hr5エンハンサー配列は、後初期遺伝子プロモーター領域である39Kに直接、シスで連結され得、それによりクローン化された異種DNAの発現を増強する（GuarinoおよびSummers  (1986a)、(1986b)、およびGuarinoら（1986）に記載）。
【００８２】
ポリヘドリン遺伝子は、極後期遺伝子として分類される。従って、ポリヘドリンプロモーターからの転写は、未知であるが、おそらく大多数の他のウイルスおよび細胞遺伝子産物の事前の発現を必要とする。ポリヘドリンプロモーターのこの遅延発現のために、標準的なBEV（例えば、SmithおよびSummersにより例えば米国特許第4,745,051号に記載の例示のBEV）は、残りのウイルスゲノムからの遺伝子発現の結果としてのみ、かつウイルス感染が十分に行われた後のみ、外来性遺伝子を発現する。このことは、現存のBEVの使用に対する制限を表す。宿主細胞が新規に合成されたタンパク質をプロセスする能力は、バキュロウイルス感染の進行につれて減少する。従って、ポリヘドリンプロモーターからの遺伝子発現は、新規に合成されたタンパク質をプロセスする宿主細胞の能力が特定のタンパク質（例えば、ヒト組織プラスミノーゲン活性化因子）について実質的に減少した時点で生じる。結果として、BEV系における分泌糖タンパク質の発現は、クローン化遺伝子産物の不完全な分泌により複雑化され、それにより不完全にプロセシングされた形態で細胞内のクローン化遺伝子産物を捕捉する。
【００８３】
昆虫シグナル配列が、切断されて成熟タンパク質を生じ得る外来性タンパク質を発現させるために用いられ得ることが認識されているが、本発明はまた、哺乳動物シグナル配列を用いても実施され得る。
【００８４】
本明細書中で適切な例示の昆虫シグナル配列は、Lepidopteran脂質動態ホルモン(AKH)ペプチドをコードする配列である。AKHファミリーは、昆虫においてエネルギー基質動員および代謝を調節する短いブロックされた神経ペプチドからなる。好ましい実施態様では、Lepidopteran  Manduca  sexta  AKHシグナルペプチドをコードするDNA配列が用いられ得る。他の昆虫AKHシグナルペプチド（例えば、Orthoptera  Schistocerca  gregaria遺伝子座からのAKHシグナルペプチド）もまた好都合に用いられ得る。別の例示の昆虫シグナル配列は、Dorosophila角皮タンパク質をコードする配列である（例えば、CPI、CP2、CP3またはCP4）。
【００８５】
現在、本明細書中で外来性遺伝子をAcNPVに導入するために用いられ得る、最も通常に用いられている移入ベクターは、pAc373である。当業者に公知の多くの他のベクターもまた、本明細書中で使用され得る。バキュロウイルス／昆虫細胞発現系のための材料および方法は、Invitrogen（San  Diego  CA)のような会社からキットの形態で市販されている（「MaxBac」キット）。本明細書中で利用される技術は、当業者に一般に知られ、そしてSummersおよびSmith、A  MANUAL  OF  METHODS  FOR  BACULOVIRUS  VECTORS  AND  INSECT  CELL  CULTURE  PROCEDURES、Texas  Agricultural  Experiment  Station  Bulletin  No.1555、Texas  A&M  University  (1987)；Smithら、Mol.Cell.Biol.(1983)  およびLuckowおよびSummers  (1989)に充分に記載されている。これらは、例えば、pVL985の使用を含む。これは、ポリヘドリン出発コドンをATGからATTに変え、そしてATTの下流にBamHIクローン化部位32塩基対を導入している（LuckowおよびSummers、Virology  (1989)  17:31に記載）。
【００８６】
従って、例えば、本発明のポリペプチドの昆虫細胞発現について、所望のDNA配列が、公知の技術を用いて、移入ベクター中に挿入され得る。昆虫細胞宿主は、挿入された所望のDNAを野生型バキュロウイルスのゲノムDNAを共に含む移入ベクターで、通常同時トランスフェクションにより、同時形質転換され得る。ベクターおよびウイルスゲノムは組換えられ得、容易に同定され精製され得る組換えウイルスを生じる。パッケージングされた組換えウイルスは、昆虫宿主細胞を感染し、Fab分子を発現させるために用いられ得る。
【００８７】
本明細書中で適用可能な他の方法は、昆虫細胞培養の標準的な方法であり、同時トランスフェクションおよびプラスミドの調製は、SummersおよびSmith  (1987)(上記）に記載される。この参考文献はまた、遺伝子のAcMNPV移入ベクターへのクローン化、プラスミドDNA単離、遺伝子のAcmMNPVゲノムへの移入、ウイルスDNA精製、組換えタンパク質の放射性標識、および昆虫細胞培養培地の調製の、標準的な方法にも関する。ウイルスおよび細胞の培養のための手順は、VolkmanおよびSummers、J.Virol.(1975)  19:820-832およびVolkmanら、J.Virol.(1976)  19:820-832に記載される。
【００８８】
iv.  哺乳動物細胞における発現
Fab分子を産生するために、哺乳動物発現系もまた用いられ得る。哺乳動物細胞発現のための代表的なプロモーターは、とりわけ、SV40初期プロモーター、CMVプロモーター、マウス乳ガンウイルスLTRプロモーター、アデノウイルス主要後期プロモーター(Ad  MLP)、および単純ヘルペスウイルスプロモーターを含む。他の非ウイルスプロモーター（例えば、マウスメタロチオネイン遺伝子由来のプロモーター）もまた、哺乳動物構築物において利用されている。哺乳動物発現は、プロモーターに依存して、構成的または制御（誘導的）のいずれかであり得る。代表的には、転写終結およびポリアデニル化配列もまた、翻訳停止コドンの3’に位置して存在する。好ましくは、翻訳の開始を最適化するための配列もまた、Fabコード配列の5’に位置して存在する。転写終結／ポリアデニル化シグナルの例は、Sambrookら、(1989)  MOLECULAR  CLONING:  A  LABORATORY  MANUAL,  第２版、(Cold  Spring  Harbor  Press,  Cold  Spring  Harbor,  N.Y.)に記載のように、SV40由来のシグナルを含む。スプライスドナーおよびアクセプター部位を含むイントロンもまた、本発明の構築物中に設計され得る。
【００８９】
本明細書において、エンハンサーエレメントもまた使用されて哺乳動物構築物の発現レベルを増大し得る。例としては、SV40初期遺伝子エンハンサー（Dijkemaら、EMBO  J.(1985)  4:  761に記載）、ならびにラウス肉腫ウイルス（Gormanら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1982b)  79:6777に記載）、およびヒトサイトメガロウイルス（Boshartら、Cell  (1985)  41:521に記載）の長末端反復(LTR)由来のエンハンサー／プロモーターを含む。哺乳動物細胞における外来タンパク質の分泌を提供するシグナルペプチドをコードする配列を含むリーダー配列もまた、存在し得る。好ましくは、リーダーフラグメントと目的の遺伝子との間にコードされるプロセシング部位が存在し、その結果リーダー配列はインビボまたはインビトロのいずれかで切断され得る。アデノウイルストリパータイトリーダーは、哺乳動物細胞における外来タンパク質の分泌を提供するリーダー配列の例である。
【００９０】
Fab分子をコードするDNAの、哺乳動物における一過的な発現を提供する発現ベクターが存在する。一般に、一過的な発現は発現ベクターの使用を含む。このベクターは、宿主細胞において効率的に複製し得、その結果、宿主細胞は発現ベクターの多数のコピーを蓄積し、次いで発現ベクターによってコードされる高レベルの所望のポリペプチドを合成する。適切な発現ベクターおよび宿主細胞を含む一過的な発現系は、クローン化DNAによってコードされるポリペプチドの好都合な陽性の同定、ならびに所望の生物学的または生理学的特性についてのこのようなポリペプチドの迅速なスクリーニングを可能にする。一旦完成すれば、哺乳動物発現ベクターは、任意のいくつかの哺乳動物細胞を形質転換するために使用され得る。異種ポリヌクレオチドを哺乳動物細胞へ導入するための方法は当該分野で公知であり、そしてデキストラン媒介トランスフェクション、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレン媒介トランスフェクション、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、リポソームへのポリヌクレオチド（単数または複数）のカプセル化、および核へのDNAの直接的マイクロインジェクションを含む。哺乳動物細胞宿主系形質転換の一般的な局面は、U.S.4,399,216によって記載されている。ポリヌクレオチドトランスフェクションに特に有用な合成脂質は、N-[1(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-N,N,N-トリメチル塩化アンモニウムである。これはLipofectin（登録商標）の名で市販されており（BRL,  Gaithersburg,  MDから入手可能）、そしてFelgnerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1987)  84:7413によって記載されている。
【００９１】
発現のための宿主として入手可能な哺乳動物細胞株もまた公知であり、そしてアメリカンタイプカルチャーコレクション(ATCC)から入手可能な多数の不死化細胞株を含む。これらには、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、HeLa細胞、ベビーハムスター腎臓(BHK)細胞、サル腎臓細胞(COS)、ヒト肝臓ガン細胞（例えば、Hep  G2）、ヒト胚腎臓細胞、ベビーハムスター腎臓細胞、マウスセルトリ細胞、イヌ腎臓細胞、バッファローラット肝細胞、ヒト肺細胞、ヒト肝細胞、マウス乳ガン細胞などを含むが、これらに限定されない。
【００９２】
本発明のFab分子を産生するための哺乳動物宿主細胞は、種々の培地中で培養され得る。市販の培地（例えば、Ham  F10(Sigma)、最少必須培地([MEM],  Sigma)、RPMI-1640  (Sigma)、およびダルベッコ改変イーグル培地([DMEM],  Sigma)）は宿主細胞を培養するために適切である。さらに、以下に記載される任意の培地が宿主細胞の培養培地として使用され得る：HamおよびWallace,  Meth.Enz.(1979)  58:44、BarnesおよびSato,  Anal.Biochem.(1980)  102:255、米国特許第4,767,704号、同第4,657,866号、同第4,927,762号、または同第4,560,655号、WO  90/103430、WO  87/00195、およびU.S.RE  30,985。これらの任意の培地は、必要に応じて、ホルモンおよび／または他の増殖因子（例えば、インスリン、トランスフェリン、または上皮成長因子）、塩（例えば、塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム、およびリン酸塩）、緩衝液（例えば、HEPES）、ヌクレオシド（例えば、アデノシンおよびチミジン）、抗生物質（例えば、ゲンタマイシン(tm)  M薬剤）、微量元素（マイクロモルの範囲の最終濃度で通常存在する無機化合物として定義される）、およびグルコースまたは等価のエネルギー供給源が補充され得る。適切な濃度で含まれ得る他の任意の必要な補充物は、当業者に公知である。培養条件（温度、Phなど）は、発現のために選択された宿主細胞に以前から用いられているものであり、そして当業者には明らかである。
【００９３】
特異的結合分子の調製
上記の技術を用いて、HCV  E2抗原に対して免疫学的結合親和性を示す、多数の特異的結合分子が提供され得る。詳細には、選択された発現系および宿主に依存して、上記の発現ベクターによって形質転換された増殖する宿主細胞により、重鎖および軽鎖部分が発現される条件下で、可溶性Fab特異的結合分子が容易に産生され得る。非共有結合した重鎖および軽鎖を含むヘテロダイマーは、宿主細胞から単離され、そして精製され得る。本発明は、重鎖および軽鎖ポリペプチドの必要に応じた分泌もまた提供するので、Fabヘテロダイマーは培地から直接的に精製され得る。適切な増殖条件および再生方法の選択は、当業者の範囲内である。
【００９４】
さらに、本発明のFab分子は、確認されたアミノ酸配列に基づいて、タンパク質合成の従来の方法を用いて産生され得る。一般に、これらの方法は、成長するペプチド鎖への１つ以上のアミノ酸の連続的な付加を用いる。通常、第１のアミノ酸のアミノ基またはカルボキシル基のいずれかは、適切な保護基によって保護される。次いで、保護または誘導体化アミノ酸は、不活性固形支持体に結合されるか、または溶液中で利用され、アミド結合を形成させる条件下で、適切に保護された相補性（アミノまたはカルボキシル）基を有する次のアミノ酸に順番に付加される。次いで、保護基は、新たに付加されたアミノ酸残基から除去され、そして次に、次のアミノ酸（適切に保護された）が付加され、後も同様である。所望のアミノ酸が正しい配列で結合された後、任意の残りの保護基（および固相合成技術が用いられた場合は、任意の固形支持体）は続いてまたは同時に除去され、最終的なポリペプチドを生じる。この一般的手順の簡単な改変によって、成長する鎖に、１つ以上のアミノ酸を一度に付加し得る。例えば、保護トリペプチドを適切に保護されたジペプチドに結合し（キラル中心をラセミ化しない条件下で）、脱保護化後、ペンタペプチドを形成し得る。例えば、固相ペプチド合成技術については、J.M.StewartおよびJ.D.Young,  Solid  Phase  Peptide  Synthesis,  第２版、Pierce  Chemical  Co.,  Rockford,  IL  (1984)ならびにG.BaranyおよびR.B.Merrifield,  The  Peptides:  Analysis,  Synthesis,  Biology,  E.GrossおよびJ.Meienhofer編、第２巻、Academic  Press,  New  York,  (1980),  ３〜254頁；古典的な溶液合成については、M.Bodansky,  Principles  of  Peptide  Synthesis,  Springer-Verlag,  Berlin  (1984)ならびにE.GrossおよびJ.Meienhofer編,  The  Peptides:  Analysis,  Synthesis,  Biology、前出、第１巻を参照のこと。
【００９５】
組換えヒトモノクローナル抗体特異的結合分子が、公知の技術を用いて、Fab分子から調製され得る。Benderら(1992)  Hum  Antibod  Hybridomas  4:74。詳細には、選択されたFabクローンの重鎖部分のコード配列は、ヒトIg重鎖の定常ドメインのコード配列と共に、上記の種々の組換え技術を用いて発現ベクターに挿入され得る。例えば、この目的のために、哺乳動物発現ベクターpSG5(Greenら(1998)  Nucleic  Acids  Res  16:369)が使用され得る。
【００９６】
クローニングは、細菌リーダー配列（ファージミドベクター由来）を除去し、重鎖コード配列のＮ末端をヒトコンセンサス配列に改変するための、重複PCRを含む。同様に、選択されたFabクローンの軽鎖部分のコード配列は、ヒトコンセンサス配列を含むようにＮ末端改変され、そしてPSG5のような発現ベクターにクローン化される。PSG5ベクターはSV40複製起点を含み、その結果哺乳動物細胞（例えば、COS-7細胞）への重鎖および軽鎖ベクターの同時トランスフェクトによって、機能的な抗体分子の産生が確認され得る。Burtonら(1994)  Science  266:1024-1027。
【００９７】
重鎖および軽鎖は、引き続いて別々のクローニングベクターにクローン化され得、そして重鎖または軽鎖コード配列のいずれかは他のベクターにサブクローン化され、コンビナトリアルプラスミドを提供する。例えば、重鎖および軽鎖コード配列は、ヒトサイトメガロウイルスプロモーターおよびグルタミンシンセターゼ選択マーカーを含むpEE6およびpEE12ベクターにそれぞれ挿入され得る(Bebbingtonら(1992)  Bio/Technology  10:169)。次いで、重鎖は、PEE6ベクター由来の制御エレメントと共に、PEE12ベクターにサブクローン化され、コンビナトリアルプラスミドを提供し得る。コンビナトリアルプラスミドは、CHO細胞発現系において発現され得る。十分なレベルの組換え抗体産生を提供するCHO発現系由来のこれらのクローンは、拡大のために選択され得る。CHO系において発現された組換え抗体は、公知の技術（例えば、プロテインＡを用いるアフィニティクロマトグラフィー）を用いて精製され、そして組換え特異的結合分子の結合親和性は、上記のELISA阻害アッセイを用いて評価され得る。
【００９８】
あるいは、Fabクローンのコード配列は、ベクターpcLCHCおよびpcIgG1にそれぞれ移入され、次いで前記のように、CHO細胞中で完全なIgGとして発現され得る。Samuelssonら(1996)  Eur.J.Immunol.26:3029。
【００９９】
組換えF(ab’)2および組換えFv特異的結合分子もまた、公知の技術を用いて、ファージ由来Fabクローンから調製され得る。Fv分子は、一般に、Fab分子の抗原結合部分を含み、非共有結合した重鎖：軽鎖ヘテロダイマーを有し、そして天然の抗体分子のほとんどの抗原認識および結合能力を保持する。Inbarら(1972）Proc.Nat.Acad.Sci.USA  69:2659-2662;  Hochmanら(1976)  Biochem  15:2706-2710;およびEhrlichら(1980)  Biochem  19:4091-4096。代表的には、組換えモノクローナル抗体を構築するために使用した上記の組換え技術は改変され、切断型の特異的結合分子を提供し得る。これらの分子もまた、上記のようにCHO発現系にクローン化され、精製され、そして特徴付けられ得る。
【０１００】
ファージ由来のFabクローンは、公知の技術を使用して一本鎖Fv(Sfv)分子を提供するためにさらに使用され得る。これらのSfv分子は、ファージ由来Fab分子から得られた重鎖および軽鎖コード配列を含む遺伝子融合物から発現される、共有結合した重鎖：軽鎖ヘテロダイマーを有する。ここで鎖はペプチドコードリンカーにより結合される。Hustonら(1988)  Proc.Nat.Acad.Sci.USA  85(16):5879-5883。自然に凝集するが化学的に分離される軽鎖および重鎖を、抗原結合部位の構造に実質的に類似した３次元構造に折り畳まれるSfv分子に変換するために、化学構造を識別するための多数の方法が記載されている。例えば、Hustonらの米国特許第5,091,513号および同第5,132,405号、ならびにLadnerらの同第4,946,778号を参照のこと。
【０１０１】
本発明の実施に当たって、重鎖および軽鎖をSfv結合分子へと結合するために適切な化学構造を開発するために、組換えDNA設計方法が使用される。設計基準は、１つの鎖のＣ末端と別の鎖のＮ末端との間の距離を隔てる適切な長さの決定を含む。ここで、リンカーは、一般に、コイル化または２次構造を形成しない傾向にある小さな親水性アミノ酸残基から形成される。このような方法は当該分野において記載されている。例えば、Hustonらの米国特許第5,091,513号および同第5,132,405号、ならびにLadnerらの同第4,946,778号を参照のこと。
【０１０２】
リンカー設計の最初の一般的な工程は、結合されるべき妥当な部位の同定を含む。各々の免疫グロブリン鎖上の適切な結合部位は、重鎖および軽鎖からの最少の残基の損失を生じるものを含み、そして分子安定性の必要に一致する最少の残基の数を有するリンカーを必要とする。一対の部位は、結合されるべき「ギャップ」を定義する。１つの鎖のＣ末端を次のＮ末端に結合するリンカーは、一般に、生理学的溶液中で非構造的立体配置をとり、そして好ましくは重鎖および軽鎖の正確な折り畳みを阻害し得る大きな側基を有する残基を有さない、親水性アミノ酸を含む。従って、適切なリンカーは、グリシンおよびセリン残基の交互の対のポリペプチド鎖を含み、そして可溶性を増強するために挿入されるグルタミン酸およびリジン残基を含み得る。本発明の実施に使用される１つの特別なリンカーは、アミノ酸配列[(Gly)4Ser]3を有する。別の特に好ましいリンカーは、[(Ser)4Gly]の２または３反復を含むアミノ酸配列（例えば、[(Ser)4Gly]3）を有する。
このようなリンカー部分をコードするヌクレオチド配列は、当該分野で公知の種々のオリゴヌクレオチド合成技術を用いて、容易に提供され得る。例えば、Sambrook、およびManiatis、前出を参照のこと。
【０１０３】
一旦適切なリンカー配列が決定されると、Sfv分子をコードするヌクレオチド配列は、オーバーラップPCRアプローチを用いて結合され得る。例えば、Hortonら(1990)  BioTechniques  8:528-535を参照のこと。選択されたリンカー配列を介して結合されるべき軽鎖および重鎖の末端は、最初に鎖領域の末端配列、続いて所望のリンカー配列の全てまたはほとんどを含むプライマーを用いて、各鎖のPCR増幅により伸長される。この伸長工程の後、軽鎖および重鎖は、重複する伸長部分（これは、一緒になって全リンカー配列を含み、そして重複部分でアニールされ、そしてPCRで伸長され、当該分野で公知の方法を用いて完全なSfv配列を入手し得る）を含む。次いで、発現カセット中に存在するsFv配列を含む遺伝子は、適切な発現系において発現され、そしてこれから産生されたsFv分子は、上記のように精製されそして特徴付けられ得る。
【０１０４】
ワクチン組成物
治療的および予防的ワクチン組成物が本明細書中に提供される。この組成物は、一般に、１つ以上の上記の抗HCVモノクローナル抗体（Fab分子、Fvフラグメント、sFv分子、およびそれらの組合せを含む）の混合物を含む。予防的ワクチンはHCV感染を予防するために用いられ得、そして治療的ワクチンはHCV感染後の個体を処置するために用いられ得る。予防的使用は、ワクチン接種した被験体における、HCVに対する増加した抗体力価の供給を含む。この様式で、HCV感染に罹る高い危険性のある被験体（例えば、免疫無防備の個体、臓器移植患者、血液または血液産物の輸血剤を得ている個体、およびHCV感染した個体と密接な個人的接触をした個体）は、HCV因子に対する受動免疫が提供され得る。さらに、本明細書中で産生されるモノクローナル抗体、Fab分子、およびsFv分子の交叉反応性に起因して、防御のレベルは、多数の異種HCV単離株に対して提供される。本発明の抗HCVワクチンについての他の予防的使用は、感染性因子に対する曝露の後の個体におけるHCV疾患の予防を含む。本発明のワクチンの治療的使用は、感染した個体からの感染性因子の減少および／または除去の両方、ならびに循環するHCVおよびこの疾患が伝播する可能性の減少および／または除去を含む。
【０１０５】
組成物は、付属的な免疫調節剤（例えば、IL-2、改変IL-2（cys125→ser125）、GM-CSF、IL-12、γ-インターフェロン、IP-10、MIP1β、およびRANTESを含むがこれらに限定されないサイトカイン、リンホカイン、およびケモカイン）と共に投与され得る。ワクチン組成物が治療的ワクチンとして使用される場合、組成物は、公知の抗HCV療法（例えば、１週間に３回の皮下での300万単位のα-IFNの投与を一般的に必要とする、α-インターフェロン（α-IFN）療法（Causseら  (1991)  Gastroenterology  101:497-502,  Davisら  (1989)  N  Engl  J  Med  321:1501-1506,  Marcellinら  (1991)  Hepatology  13:393-397）、インターフェロンβ（β-IFN）療法（Omataら  (1991)  Lancet  338:914-915）、リビビリン療法（Di  Bisceglieら  (1992)  Hepatology  16:649-654,  Reichardら  (1991)  Lancet  337:1058-1061）およびアンチセンス療法（Wakitaら  (1994)  J  Biol  Chem  269:14205-14210））と共に投与され得る。本発明のモノクローナル抗体を含む治療的ワクチン組成物はまた、公知の抗HCV組合せ療法（例えば、α-IFNとウルソジオール（ursodiol）との組合せ（Bottelliら  (1993)  (要約)  Gastroenterology  104:879,  O’Brienら  (1993)  (要約)  Gastroenterology  104:966）、およびβ-IFNとリビビリンとの組合せ（Kakumuら  (1993)  Gastroenterology  105:507-512））と共に用いられ得る。
【０１０６】
１つ以上の抗体、抗体フラグメント、sFv分子およびそれらの組合せを成分として含むワクチン組成物の調製物は、一般に、当該分野で公知である。代表的には、このようなワクチンは、注射可能物質（例えば、液体溶液もしくは懸濁液、または注射前に液体中に溶解もしくは懸濁するのに適切な固体形態のいずれか）として調製される。組成物はまた、一般に、１つ以上の「薬学的に受容可能な賦形剤またはビヒクル」（例えば、水、生理食塩水、デキストロース、グリセロール、エタノールなどまたはそれらの組合せ）を含む。さらに、微量の補助的な物質（例えば、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝化物質など）が、このようなビヒクル中に存在し得る。ワクチン組成物は、乳化され得るか、または活性成分（モノクローナル抗体）は、リポソーム中にカプセル化され得る。
【０１０７】
一旦処方されると、ワクチン組成物は、例えば、注射（皮下または筋肉内のいずれか）により、従来通りに非経口投与される。他の様式の投与に適切なさらなる処方物は、経口および肺の処方物、坐剤、ならびに経皮適用を含む。坐剤のためには、伝統的なバインダーおよびキャリアは、例えば、ポリアルキレングリコールまたはトリグリセリドを含み得る。このような坐剤処方物は、0.5％〜10％、好ましくは１％〜２％の範囲の活性成分（単数または複数）を含む混合物から提供され得る。経口処方物は、このような通常用いられる賦形剤（例えば、薬学的グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなど）を含む。ワクチン組成物は、投薬処方と適合性の様式でかつ予防的および／または治療的に有効である量で、処置される被験体に投与される。送達される組成物の量（一般に、１用量あたり活性薬剤１〜500マイクログラムの範囲）は、処置される被験体、それ自身の免疫応答をマウントするための被験体の免疫系能力、および所望される防御の程度に依存する。必要な正確な量は、他の要因もあるが、処置される個体の年齢および全身状態、処置される状態の重篤度、ならびに選択される特定の抗HCV剤およびその投与様式に依存して変化する。適切な有効量は、当業者により容易に決定され得る。従って、組成物の「治療有効量」は、HCV疾患の症状の処置または予防をもたらすために十分であり、そして日常的な治験を通して決定され得る比較的広範な範囲内にある。
【０１０８】
さらに、ワクチン組成物は、単回用量スケジュールで、または好ましくは多回用量スケジュールで与えられ得る。多回用量スケジュールは、最初のワクチン接種の過程が１〜10の別々の用量であり得、その後他の用量が、組成物の作用を維持または補強するために必要なその後の時間間隔で与えられるものである。従って、投薬養生法はまた、少なくとも部分的に、処置される被験体の特定の必要性に基づいて決定され、そして当業者の判断に依存する。
【０１０９】
遺伝子治療
組換えモノクローナル抗体はまた、遺伝子治療に用いられ得る。これに関して、組換え抗体をコードする遺伝子は、適切な哺乳動物宿主細胞に、発現または同時発現のために、哺乳動物細胞への遺伝子移入のために開発されたウイルスに基づく多くの系を用いて導入され得る。例えば、レトロウイルスは、遺伝子送達系の便利なプラットフォームを提供する。ＶＨおよび／またはＶＬドメインポリペプチドをコードする選択されたヌクレオチド配列は、当該分野で公知の技術を用いて、ベクターに挿入され、そしてレトロウイルス粒子中にパッケージングされ得る。次いで、組換えウイルスは単離され、そして被験体に送達され得る。多くの適切なレトロウイルス系が記載されている（米国特許第5,219,740号；MillerおよびRosman  (1989)  BioTechniques  7:980-990;  Miller,  A.D.(1990)  Human  Gene  Therapy-1:5-14;  Scarpaら  (1991)  Virology  180:849-852;  Burnsら,  (1993)  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  90:8033-8037;  およびBoris-LawrieおよびTemin  (1993)  Cur.Opin.Genet.Develop.3:102-109）。本明細書中の遺伝子治療のためのレトロウイルスベクターを産生および使用するために特に好ましい方法は、例えば、1991年３月７日に公開された国際公開第WO  91/02805号、および「Eukarotic  Layered  Vector  Initiation  Systems」について1995年３月15日に出願された米国特許出願第08/404,796号；「Recombinant  α-Viral  Vectors」について1995年３月15日に出願された同第08/405,627号；および「Packaging  Cells」について1993年11月23日に出願された同第08/156,789号に記載される。
【０１１０】
多くの適切なアデノウイルスベクターがまた記載されている。宿主ゲノム中に組み込まれるレトロウイルスとは異なり、アデノウイルスは染色体外で存続し、それゆえ挿入変異誘発に関連する危険性を最小にする（Haj-AhmadおよびGraham(1986)  J.Virol.57:267-274;  Bettら  (1993)  J.Virol.67:5911-5921;  Mitterederら  (1994)  Human  Gene  Therapy  5:717-729;  Sethら  (1994)  J.Virol.68:933-940;  Barrら  (1994)  Gene  Therapy  1:51-58;  Berkner,  K.L.(1988)  BioTechniques  6:616-629;  およびRichら  (1993)  Human  Gene  Therapy  4:461-476）。
【０１１１】
種々のアデノ随伴ウイルス（AAV）ベクター系は、最近、遺伝子送達のために、開発されている。このような系は、制御配列（例えば、プロモーターおよびポリアデニル化部位）ならびに選択マーカーまたはレポーター遺伝子、エンハンサー配列、および転写の誘導を可能にする他の制御エレメントを含み得る。AAVベクターは、当該分野で周知の技術を用いて容易に構築され得る。例えば、米国特許第5,173,414号および同第5,139,941号；国際公開第WO  92/01070号（1992年１月23日公開）および同第WO  93/03769号（1993年３月４日公開）;  Lebkowskiら  (1988)  Molec.Cell.Biol.8:3988-3996；Vincentら  (1990)  Vaccines  90  (Cold  Spring  Harbor  Laboratory  Press);  Carter,  B.J.(1992)  Current  Opinion  in  Biotechnology  3:533-539;  Muzyczka,  N.(1992)  Current  Topics  in  Microbiol.and  Immunol.158:  97-129;  Kotin,  R.M.(1994)  Human  Gene  Therapy  5:793-801;  ShellingおよびSmith  (1994)  Gene  Therapy  1:165-169;  およびZhouら  (1994)  J.Exp.Med.179:1867-1875を参照のこと。
【０１１２】
Fab分子をコードする本発明の核酸分子を送達するための使用を見出すさらなるウイルスベクターは、ポックスファミリーのウイルス（ワクシニアウイルスおよびニワトリポックスウイルスを含む）に由来するベクターを含む。例としては、遺伝子を発現するワクシニアウイルス組換え体は、以下の通りに構築され得る。特定のFab分子をコードするDNAは、まず、このDNAは、ワクシニアプロモーターおよび隣接するワクシニアDNA配列（例えば、チミジンキナーゼ（TK）をコードする配列）に隣接するように、適切なベクター中に挿入される。次いで、このベクターは、ワクシニアで同時に感染される細胞をトランスフェクトするために用いられる。相同組換えは、ワクシニアプロモーターおよびFab分子をコードする遺伝子をウイルスゲノム中に挿入するように作用する。得られるTK−組換え体は、細胞を5-ブロモデオキシウリジンの存在下で培養し、そしてそれに耐性のウイルスプラークを拾うことにより選択され得る。
【０１１３】
ワクシニアに基づく感染／トランスフェクション系は、宿主細胞におけるFabフラグメントの誘導性で一過性の発現を提供するために都合良く用いられ得る。この系において、細胞は、まず、インビトロで、バクテリオファージT7  RNAポリメラーゼをコードするワクシニアウイルス組換え体で感染される。このポリメラーゼは、これがT7プロモーターを有するテンプレートのみを転写する点で、精巧な特異的を示す。感染後、細胞は、T7プロモーターにより駆動される目的のポリヌクレオチドでトランスフェクトされる。ワクシニアウイルス組換え体から細胞質中で発現されるポリメラーゼは、トランスフェクトされたDNAをRNAへと転写し、これは次いで宿主翻訳機構によりタンパク質に翻訳される。この方法は、多量のRNAおよびその翻訳産物の、高レベルで一過性の細胞質産生を提供する。例えば、Elroy-SteinおよびMoss,  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1990)  87:6743-6747;  Fuerstら,  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1986)  83:8122-8126を参照のこと。
【０１１４】
あるいは、アビポックスウイルス（例えば、ニワトリポックスウイルスおよびカナリアポックスウイルス）はまた、Fabコードヌクレオチド配列を送達するために用いられ得る。アビポックスベクターの使用は、ヒトおよび他の哺乳動物種において特に望ましい。なぜなら、アビポックス属のメンバーは、感受性の鳥類種においてのみ生産的に複製し得、従って、哺乳動物細胞において感染性でないからである。組換えアビポックスウイルスを産生するための方法は、当該分野において公知であり、そしてワクシニアウイルスの産生に関して上記のように、遺伝的組換えを使用する。例えば、国際公開第WO  91/12882号；1989年４月20日に公開された同第WO  89/03429号；および1992年３月５日に公開された同第WO  92/03545号を参照のこと。
【０１１５】
分子結合ベクター（例えば、Michaelら  J.Biol.Chem.(1993)  268:6866-6869およびWagnerら  Proc.Natl.Acad.Sci.USA  (1992)  89:6099-6103に記載されるアデノウイルスキメラベクター）はまた、本発明の下で遺伝子送達のために用いられ得る。
【０１１６】
アッセイ試薬および診断キット
HCV粒子を含む試料と免疫学的に反応し得る上記の抗HCV結合分子（Fab分子、Fvフラグメント、およびsFv分子を含む組換えモノクローナル抗体）はまた、生物学的試料の特異的結合アッセイにおけるHCVウイルス粒子および／またはウイルス抗原の存在を検出するために本明細書中で用いられ得る。特に、本発明の新規な特異的結合分子は、HCVを有するおよび／または感染した個体をスクリーニングおよび同定するため、ならびにHCVで汚染した血液または血液産物をスクリーニングするための高感受性方法において用いられ得る。本発明の結合分子はまた、処置された個体における抗HCV治療の進行をモニターするため、およびHCV因子の研究および調査において用いられるHCV培養物の増殖速度をモニターするためのアッセイにおいて用いられ得る。
【０１１７】
特異的結合アッセイの形式は、当該分野で周知である手順に従って多数の変更が施される。例えば、特異的結合アッセイは、本発明に従って調製された組換えヒトモノクローナル抗体（Fab分子、Fvフラグメント、ならびにsFv分子を含む）の１つまたはいくつかの混合物を利用するためにフォーマットされ得る。アッセイの形式は、一般に、例えば、競合、直接的結合反応、またはサンドイッチ型アッセイ技術に基づき得る。さらに、本アッセイは、免疫沈降または他の技術を用いて実施されて、アッセイの間またはその開始後のアッセイ試薬を分離し得る。他のアッセイは、アッセイの開始前に不溶化されている特異的結合分子を用いて実施され得る。これに関しては、多くの不溶化技術（免疫吸着剤などへの吸着による不溶化、反応容器の壁との接触による吸着、不溶性マトリックスもしくは「固相」基質への共有的架橋、イオン性もしくは疎水性相互作用を用いる固相基質への非共有的結合、またはポリエチレングリコールのような沈澱剤もしくはグルタルアルデヒドのような架橋剤を用いての凝集を含むが、これらに限定されない）が当該分野で周知である。
【０１１８】
当業者により本アッセイにおける使用のために選択され得る多数の固相基体が存在する。例えば、ラテックス粒子、微粒子、磁性ビーズ、常磁性ビーズ、もしくは非磁性ビーズ、メンブレン、プラスチックチューブ、マイクロタイターウェルの壁、ガラスまたはシリコン粒子、ならびにヒツジ赤血球は、全て本明細書中での使用に適切である。
【０１１９】
一般に、本アッセイの大部分は、検出可能な標識部分を有する特異的結合分子（組換えモノクローナル抗体、Fabフラグメント、Fvフラグメント、およびsFv分子）から形成される標識化結合複合体の使用を含む。多くのこのような標識は当該分野で公知であり、そして（共有的または非共有的会合技術のいずれかを用いて）本発明の結合分子へ容易に結合されて、上記のアッセイ形式における使用のための結合複合体を提供し得る。適切な検出可能な部分は、放射性同位元素、蛍光剤、発光性化合物（例えば、フルオレセインおよびローダミン）、化学発光剤（例えば、アクリジニウム、フェナントリジニウム、およびジオキセタン化合物）、酵素（例えば、アルカリホスファターゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、およびβ-ガラクトシダーゼ）、酵素基質、酵素補因子、酵素インヒビター、染料、および金属イオンを含むがこれらに限定されない。これらの標識は、当該分野で公知の結合技術を用いて結合分子と会合され得る。
【０１２０】
例示的なアッセイ方法は一般に以下の工程を含む：（１）上記のような検出可能に標識された結合複合体を調製する工程；（２）HCV粒子および/またはHCV抗原を含む疑いのある試料を入手する工程；（３）特異的結合分子-抗原複合体（例えば、抗体-抗原複合体）の形成を許容する条件下で、試料と標識された複合体とをインキュベートする工程；および（４）標識された結合分子-抗原複合体の存在または非存在を検出する工程。本明細書を読んで当業者により理解されるように、このようなアッセイは、ヒト供与者の血液および血清産物中のHIV感染の存在についてスクリーニングするため、診断的設定および/または研究的設定におけるHCV培養物の増殖速度をモニターするため、個体におけるHCV感染を検出するため、または感染被験体における抗HCV処置プロトコルの治療的効果をモニターするために使用され得る。アッセイが臨床的設定において（例えば、HCV感染を検出するためまたは抗HCV治療をモニターするため）使用される場合、試料はヒト体液および動物体液（例えば、全血、血清、血漿、脳脊髄液、尿など）から得られ得る。さらに、アッセイは、当該分野に公知のような標準品または校正物質に対する参照を使用して、定量的情報を提供するために容易に使用され得る。
【０１２１】
本発明の１つの特定のアッセイ方法において、酵素結合免疫吸着アッセイ（ELISA）が、試料中のHCV抗原濃度を定量するために使用され得る。その方法において、本発明の特異的な結合分子は酵素に結合され、標識された結合複合体を提供する。ここで、アッセイは定量的標識として結合した酵素を使用する。抗原を測定するために、選択されたHCV抗原に特異的に結合可能な結合分子（例えば、抗体分子）は、固相基質（例えば、マイクロタイタープレートまたはプラスチックカップ）に固定化され、試験試料希釈物と共にインキュベートされ、洗浄され、そして本発明の結合分子-酵素複合体と共にインキュベートされ、次いで再度洗浄される。このことに関して、適切な酵素標識は一般に公知であり、これは例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼを含む。固相に結合した酵素活性は、特異的な酵素基質を添加し、そして生成物形成または基質利用性を比色的に測定することにより測定される。固相基質に結合した酵素活性は、試料中に存在する抗原量の直接的関数である。
【０１２２】
本発明の別の特定のアッセイ方法において、生物学的試料中のHCVの存在（例えば、HCV感染の指標として）は、従来のウェスタンブロッティングおよびドットブロッティング技術（例えば、RIBA（登録商標）（Chiron  Corp.,  Emeryville,  CA）試験）を組合せた当該分野に公知の技術のようなストリップ免疫ブロットアッセイ（SIA）技術を使用して検出され得る。これらのアッセイにおいて、１つ以上の特異的な結合分子（組換えモノクローナル抗体（Fab分子を含む））は、膜状の支持体試験ストリップ上に個々の分離したバンドとして固定化される。生物学的試料中に存在するHCV粒子との反応の可視化は、比色酵素基質と組み合わせて標識された抗体結合体を用いるサンドイッチ結合技術を使用して達成される。内部コントロールはまたストリップ上に存在し得る。このアッセイは、手動で行われ得るかまたは自動化された型式で使用され得る。
【０１２３】
さらに、本発明に従って調製された組換えヒトモノクローナル抗体（Fab分子、Fvフラグメント、およびsFv分子を含む）は、生物学的試料中のHCVの存在を検出するために、アフィニティークロマトグラフィー技術において使用され得る。このような方法は当該分野に周知である。
【０１２４】
任意の上記のアッセイおよびアフィニティークロマトグラフィー技術の実施における使用に適切な、そして適切な標識された結合分子複合体試薬を含むキットはまた、本発明の実施に従って提供され得る。アッセイキットは、アッセイ説明書の適切なセットとともに、適切な容器中の、アッセイを行うために必要な全ての試薬および物質を含む、適切な材料を包装することにより組み立てられる。
【０１２５】
以下は、本発明を行うための特定の実施態様の実施例である。実施例は例証の目的のみのために提供され、そしていかにしても本発明の範囲を限定するように意図されない。
【０１２６】
使用される数値（例えば、量、温度など）の点で正確さを保証するために努力をされているが、いくらかの実験的誤差および偏差はもちろん許容されるべきである。
【実施例】
【０１２７】
実施例１
ライブラリー供与者の特徴付け
骨髄を、献血に関連する通常のスクリーニングの間にHCVポジティブであることが見出された60才の無症候性、男性血液供与者から得た。感染の原因は不明であった。供与者は免疫化されておらず、そして約３mlの量の骨髄採取の以前に、HCV感染のための処置は受けていなかった。骨髄提供の時点の供与者の血清中のHCVの遺伝子型を、刊行された方法を使用して測定し、そしてHCV  2bであることを見出した。Widellら、(1994)  J  Med  Virol  44:  272-279。
【０１２８】
詳細には、供与者からのHCV単離物のE2遺伝子の超可変領域１（HVR1）のヌクレオチド配列を、以下のように得た。１本鎖テンプレートDNAを得、そして製造者の説明書に従って、標識されたヌクレオチドを用いるサイクル配列決定反応（PCRサイクル配列決定キット,  Perkin-Elmer）において、新たに設計したプライマー（A.Widellら、投稿準備中）を使用して、配列決定反応を行った。Allanderら、(1994)  J  Med  Virol  43:415-419。反応産物を自動化シークエンサー（Applied  Biosystems,  CA）で泳動し、そしてデータをMacMollyソフトウェア（SoftGene,  Berlin,  Germanyより入手可能）を使用して編集および解析した。供与者単離物のHVR-E2領域の推定アミノ酸配列は以下のように決定された：VAGVDASTYTTGGQSGRTTYGIVGLFSLGPSQKLSLINTNGSWHINR（配列番号  ）。
【０１２９】
実施例２
ファージ提示ライブラリーの構築
リンパ球を、Ficoll-Paque（Pharmacia  Biotech,  Uppsala,  Sweden）を使用して実施例１において得た骨髄試料から単離した。全RNAを酸性フェノール抽出方法（Chomczynskiら、(1987)  Anal  Biochem  162:156-159）により抽出し、10μgのRNAのオリゴdTプライミングを利用する、第１鎖cDNA合成を行い（cDNA合成キット、Pharmacia  Biotech）、そして重鎖（Fd）DNAおよび軽鎖DNAを、γ1重鎖およびκ軽鎖のための以前に公開された配列の5’ビオチン化プライマー（5’プライマー：VH1a、VH1f、VH2f、VH3a、VH3f、VH4f、VH6a、VH6f、Vk1a、Vk2a、Vk3a；3’プライマー：CG1zおよびCK1a）(Scandinavian  Gene  Synthesis,  Kｏping,  Swedenより入手可能)を用いてPCR増幅した。例えば、Perssonら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:  2432-2436    Kangら、(1991)  Methods：Comp.Meth  Enzymol  2:  111-118を参照のこと。
【０１３０】
PCRを、サーマルサイクラー4800（Perkin-Elmer）を使用して、94℃で５分、次いで94℃で60秒、52℃で30秒、および72℃で180秒を35サイクル行った。35サイクルの後、72℃で10分の伸長工程によりPCR手順を完了した。PCR産物を1.5％アガロースゲルにおいて各々の画分を泳動することにより分析し、重鎖DNAおよび軽鎖DNAを別々にプールし、フェノール-クロロホルム抽出し、次いでエタノール沈澱した。
【０１３１】
重鎖DNAおよび軽鎖DNAの各々12μgを2.5％アガロースゲルでゲル精製し、電気溶出し（Schleicher＆Schuell,  Germany）、そしてそれぞれ制限エンドヌクレアーゼXhoI/SpeIおよびSacI/XbaI（Life  Technologies,  Gaithersburg,  MDより入手可能）により消化した。消化したPCR産物を、続いてゲル精製し、電気溶出により回収し、そして類似したベクター系について以前に記載したように（Yangら、(1995)  J  Mol  Biol  254:  392-403,  Barbas,  IIIら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:  7978-7982）対応する制限酵素により消化し、そしてゲル精製/電気的溶出した後、ベクターpComb3H（Barbas,  IIIら、(1995)  Methods:  Comp.Meth  Enzymol  8:  94-103）に連結した。連結には、T4リガーゼ（Life  Technologies）を10μlの反応容量あたり0.5ユニットを、約16℃で一晩使用した。報告されるように、コンビナトリアルライブラリーをファージで発現させた（ファージの回収を含む）。Samuelssonら、(1995)  Virology  207:  495-502。
【０１３２】
pComb3Hへの軽鎖遺伝子の連結は、２×107メンバーのライブラリーを与えた。続く、このライブラリーへのFd遺伝子の連結は、２×106メンバーのγ1/κライブラリーを生じた。
【０１３３】
実施例３
HCV  E2選択抗原の調製
アミノ酸383ala〜715lys(Chooら、(1991)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:  2451-2455の命名法を使用)を含むHCV  E2分子の短縮分泌形態を、構築した。以下のようにE2分子をチャイニーズハムスター卵巣細胞/ジヒドロ葉酸レダクターゼ（CHO/DHFR）発現系を使用して発現させ、「コンフォメーショナルHCV  E2抗原」を提供した。HCV1のアミノ酸383〜アミノ酸715のHCV  E2のDNAフラグメントをPCRにより生成し、次いでマウスサイトメガロウイルス（MCMV）前初期プロモーター/エンハンサー（Dorsch-Haslerら、(1985)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  82:  8325-8329）および選択可能なdhfr遺伝子マーカーを有するプラスミドベクターに連結した。次いで、生じるプラスミドをdhfr-  CHO細胞に安定にトランスフェクトし、コンフォメーショナルHCV  E2抗原を分泌する安定な組換えCHO細胞株を生成した、
コンフォメーショナルE2抗原を、公知の方法（Rosaら、(1996)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  93:  1759-1763）を用いて以下のように精製した。CHO細胞からの馴化培地を限外濾過により15倍に濃縮し、続いて75％飽和の硫酸アンモニウム沈澱によりさらに10倍容量濃縮し、そして25  mM  Trisクロライド/１mM  EDTA、pH  7.5に再溶解した。モノクローナル抗体5E5/H7（HeLa  E1／E2に対して惹起した）を精製のために使用した。抗体カラムを25  mM  Trisクロライド/0.15  M  NaCl、pH  7.5で平衡化した。硫酸アンモニウム沈澱したE2を25  mM  Trisクロライド/１mM  EDTA、pH  7.5に溶解し、そしてカラムにロードした。カラムをリン酸緩衝化生理食塩水（PBS）/１M  NaClで洗浄し、次いでActisep（Sterogene,  Arcadia,  CA）の３〜４カラム容量で溶出した。黄色に着色したActisep含有画分を全てプールし、撹拌セル限外濾過機において濃縮し、そしてPBS緩衝液中にダイアフィルターした。
【０１３４】
組換えHCV  E1/E2複合体抗原を、以下のように、構築し、そしてチャイニーズハムスター卵巣細胞/ジヒドロ葉酸レダクターゼ（CHO/DHFR）発現系を使用して発現した。HCV1ゲノムのMet1〜Gly917にわたる917アミノ酸ポリペプチドとしてHCV構造領域をコードするプラスミドpMCMV-HC5p（Spaeteら、(1992)  Virology  188:  819-830）を、pGEM-4  blue-HC5p-1  8由来の2813塩基対（bp）のHCV  StuIフラグメントを哺乳動物細胞発現ベクターpMCVAdhfr（Spaeteら、(1990)  J  Virol  64:  2922-2931）の唯一のSalI部位へクローニングすることにより生成した。pMCVAdhfrベクターは、MCMV前初期プロモーター/エンハンサーにより駆動されそしてSV40ポリアデニル化配列により終結される発現遺伝子の転写を伴う、選択可能なdhfr遺伝子をコードする。Klenowフラグメント（Boehringer-Mannheim  Biochemicals,  Indianapolis,  IN）を使用し、StuIフラグメントの連結の前にSalI部位を埋めた。pMCMV-HC5pプラスミドをdhfr-  CHO細胞に安定にトランスフェクトし、組換えHCV  E1/E2複合体抗原を発現する組換えCHO細胞株（＃62）を生成した。
【０１３５】
組換えE1/E2複合体抗原を公知の方法（Chooら、(1994)  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  91:  1294-1298）を使用して以下のように精製した。CHO細胞株＃62をペレット化することにより回収しそして凍結した。低浸透圧性緩衝液中でのDounceホモジナイズ化による溶解後、ペレットを２％のTriton  X-100（登録商標）中でホモジナイズすることにより抽出し、そしてE1（33  kD）およびE2（72  kD）を、アガロース結合Gralanthus  Nivalis-レクチン（Vector  Laboratories）およびファーストフローS-Sepharoseカチオンイクスチェンジャー（Pharmacia）での連続的なクロマトグラフィーにより、選択的に同時精製した。
【０１３６】
実施例４
コンビナトリアル・ライブラリーのパニング
特異的に結合するFab分子の抗原性選択を、公知の技術の変形を使用して行った。Burtonら（1991）Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:10134-10137。詳細には、マイクロタイタープレート（Costar  3690,  Cambrige,  MA）の４つのウェルを、CHO細胞で発現させた、精製した組換えコンフォメーショナルHCV  E2抗原または精製した組換えE1/E2複合体抗原（実施例３において調製した）のいずれかの50μl（2.5μg/ml）を用いて、４℃にて一晩コートした。Spaeteら（1992）Virology  188:819-830。ブロッキングを、ウェルをPBS中の５％脱脂粉乳で22℃にて１時間完全に満たすことによって達成した。50μlのファージライブラリー（５×1010cfu）を、各ウェルに添加し、そしてプレートを37℃にて２時間インキュベートした。ファージを除去し、そして各ウェルを、PBSと0.5％  Tween  20の溶液で５分間完全に満たすことによって洗浄し、次いで洗浄溶液を完全に除去した。洗浄を下記のように１〜10回行った。１ウェル当たり50μlの溶出緩衝液（固体グリシンによってpH2.2に調整した0.1M  HCl）を添加し、そして室温にて10分間インキュベートすることによってファージを溶出した。溶出緩衝液を除去し、そして50μlの溶出緩衝液当たり３μlの２M  Trisベースで中和した。E.coli  XL-1  blue細胞（Barbas,  IIIら（1991）Methods：Comp.Meth  Enzymol  2:119-124）を、溶出させたファージによって感染させ、アリコートをプレーティングし、そしてパニングの各ラウンド後のファージの増殖を、記載されているように達成した。Samuelssonら（1995）Virology  207:495-502。
【０１３７】
パニングの第１の群（パニングシリーズＩ）において、洗浄の数を３回のラウンドについて各後続のパニングで増加させ（それぞれ１、３、および10回目の洗浄）、一方パニングの第２の群（パニングシリーズII）においては、10回の洗浄を伴う単一のパニングを行った。表Ｉに示す結果によって理解され得るように、溶出されたファージで100倍の上昇が、パニングシリーズIにおいて記録された。
【０１３８】
【表１】
2008019256.tif 000002
【０１３９】
シリーズIおよびIIの両方のパニングにおいて使用した抗原は、組換えコンフォメーショナルE2抗原であった。パニングの第３の群（パニングシリーズIII）を、シリーズIのように行った；しかし、組換えE1/E2複合体抗原を使用して、陽性クローンを選択した。
【０１４０】
実施例５
Fab分子の発現
Fab分子を、アンピシリン耐性E.coli  XL-1  blue細胞コロニー（（ａ）不溶性Fabフラグメントを提供するためにインタクトであるか、または（ｂ）可溶性Fabフラグメントを提供するためにSpeIおよびNheIでの消化（これらの酵素での消化は、適合性の粘着末端を提供する；従って、生じるDNAフラグメントを欠失しているgIIIフラグメントはゲルで精製され得、そして自己連結され得る）での消化によって欠失されたgIII遺伝子（cpIIIアンカータンパク質をコードする）を有するFabプラスミドを含有する）を、50μg/mlアンピシリンおよび１％グルコースを含有するSB培地（スーパーブロス；１リットル当たり30gトリプトン、20gのイーストエキストラクト、および10gのMOPS（pH7））（Burtonら（1991）Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:10134-10137）中で、約1.0のOD600nmに達するまで増殖させることによって発現させた。細菌宿主細胞を遠心分離によってペレット化し、そして培地を１mM  IPTGおよび20mM  MgCl2を有するSB培地に交換し、そして細胞を再懸濁した。生じた培養物を、約290rpmに設定された振盪プラットホーム上で室温にてインキュベートし、そして一晩放置した。次の日、細胞をスピンダウンし、上清を捨て、PBSを（もとの培養物容量の２〜４％の間）で添加し、そして細菌細胞のペリプラズムの内容物を３サイクルの凍結融解によって遊離させた。細菌細片を遠心分離によってペレット化し、そしてFab分子含有上清を新たなバイアルに等分した。Fab分子を使用するまで-20℃で維持した。
【０１４１】
実施例６
Fabクローンの発現レベル
Fab分子（実施例５で得た）の発現レベルを、公知のELISA技術を使用して確認した。Samuelssonら（1995）Virology  207:495-502。詳細には、ヤギ抗ヒトF(ab’)2（Pierce,  USA）またはヤギ抗ヒトFd（The  Binding  Site,  UK）を0.1M炭酸-
重炭酸緩衝液（pH9.6）で1:1000に希釈し、そして４℃にて一晩のインキュベーションすることによってマイクロタイターウェルをコートした。コーティング溶液を捨て、そしてウェルを室温にて１時間PBS中の５％の粉乳でブロックし、その後、ブロッキング溶液を除去し、そしてPBS-Tでの適切な希釈でFab試料（実施例５から）を添加した。室温での１時間のインキュベーション後、プレートを洗浄し、そして1:500の希釈でのALP-ヤギ抗ヒトF(ab’)２を添加した。１時間のインキュベーション、および続く５回の洗浄後、標識基質溶液である0.1Mジエターノルアミン（pH9.8）中のp-ニトロフェニルホスフェート（Sigma,  USA）を添加した。吸光度を405nmにてマイクロプレートリーダー（Dynaster,  MA）で測定した。ほとんどのFabクローンが、１Lの培養物当たり0.2〜2.0mgのFabを産生することが見出された。これは、ペリプラスミック調製物中の10〜100μg/mlに対応する。発現させたFabクローンを、E2反応性についてスクリーニングし、そして同一のもとのクローンの複数のコピーを同定するためにすぐに配列決定した。
【０１４２】
実施例７
重鎖および軽鎖発現についてのウェスタンブロット
両鎖の正確な発現を試験するために、いくつかのFab分子を、ヒトFdおよび軽鎖に対する抗血清を使用するウェスタンブロットで分析した。詳細には、10μlのペリプラスミックFab分子調製物（実施例５で調整した）を、予め形成させた12％Tris-グリシン  ポリアクリルアミドゲルで分離し、そしてXcell  Mini-cell装置（Novex  Experimental  Technology,  San  Diego,  CA）を使用するエレクトロブロッティングによってニトロセルロースメンブレンに移した。メンブレンを５％粉乳中で一晩ブロックし、そして５％粉乳および0.05％Tween  20（PBS-MT）で1:1000に希釈したアルカリホスファターゼ結合抗ヒトFab抗血清（Pierceから入手可能）とともに、一定の振盪で22℃にて３時間インキュベートした。被験体抗ヒトFab抗血清を選択した。なぜならば、それが主に軽鎖に対して反応性であることが公知であるからである。重鎖（Fd）発現産物を検出するために、ストリップを、まず、1:1000に希釈されたヒツジ抗ヒトFd血清（Binding  Site,  U.K.）とともにインキュベートし（上記のように）、洗浄し、次いで1:500の希釈で第２次抗体、AP-抗ヤギIgG（Sigma,  St.Louis,  MO）とともに再びインキュベートした。
【０１４３】
22℃での１時間の最後のインキュベーションに続いて、メンブレンをPBS-T中で３回洗浄し、そして発色を２mlのBCIP/NBT溶液（Sigam,  St  Louis,  MO）を用いて７分間行った。メンブレンを水でリンスし、そして乾燥させた。予め染色した分子量マーカー（Amersham,  U.K.）を各ブロットにおいて使用した。
【０１４４】
試験した全てのクローンについて、両鎖の発現はほぼ等しかった。重鎖（短縮したgIIIタンパク質との融合ポリペプチドとして発現させた）は、70kDのおおよその分子量を示した。
【０１４５】
実施例８
Fabクローンの配列決定
E.coli  XL-1  blue細胞培養物（実施例５）中で増殖させた各Fab分子クローンからのプラスミドDNAを、WizardミニプレップDNA精製試薬システム（Promega）を使用して単離した。一本鎖DNAをpComb3Hベクター（pC3H-2488S:5’-CAA  CGC  AAT  TAA  TGT  GAG  TTA  G（配列番号  ）；G-back:  5’-GCC  CCC  TTA  TTA  GCG  TTT  GCC  ATC（配列番号  ））中のクローニング領域の上流および下流にハイブリダイズさせたプライマーを使用するPCRによって得た。各反応において、２つのPCRプライマーのうち１つを5’末端でビオチン化した。PCR増幅の35サイクルの後、一本鎖DNAを、アルカリ条件下でDNAを変性させ、そしてビオチン化したDNA鎖をストレプトアビジンでコートしたビーズ（Dynal,  Oslo,  Norway）に公知の技術を使用して吸着させることによって得た。Hultmanら(1989）Nucl  Acid  Res  17:4937-4945。
【０１４６】
Sangerら（1977）Proc  Natl  Acad  Sci  USA  74:5463-5467の方法に従ってジデオキシ配列決定反応を、可変Ig領域と定常Ig領域との間の接合部の3’または重鎖遺伝子および軽鎖遺伝子の開始点の5’にハイブリダイズするFITC標識したプライマーを利用して行った。詳細には、SEQKb:5’-ATA  GAA  GTT  GTT  CAG  CAG  GCA（配列番号  ）およびomp-seq:  5’-AAG  ACA  GCT  ATC  GCG  ATT  GCA  G（配列番号  ）を、κ軽鎖について使用した。SEQGb:  5’-GTC  GTT  GAC  CAG  GCA  GCC  CAG（配列番号  ）およびpel-seq:  5’-ACC  TAT  TGC  CTA  CGG  CAG  CCG（配列番号  ）を、γ重鎖について使用した。反応産物を自動化シークエンサー（A.L.F.,  Pharmacia  Biotech）で泳動して翻訳し、そしてMacMollyソフトウェア（Softgene,  Berlin,  Germany）を使用して整列させた。
【０１４７】
実施例４で行ったパニングの第１のシリーズ（パニングシリーズＩ）由来の、発現についてアッセイした（実施例６および７に記載のように）10個のFab分子クローン（Fab分子クローンL1-L10として同定した）を上記の配列決定法を使用して配列決定した。これらの10のクローンは、それらの重鎖（H3領域）において極めて類似のCDR3配列を有することが見出された。これは、それらが全て同一のＢ細胞クローン由来であったことを示す。Litwinら（1990）J  Exp  Med  171:293-297。しかし、VDJ接合部およびH3領域の長さは、同一であったが、多くの異なる点変異がそれらの重鎖において同定され、そして各重鎖を異なる軽鎖と組み合わせた。２つのクローン（Fab分子クロンL1およびL3として同定された）をさらなる試験のために選択した。
【０１４８】
実施例４で行ったパニングの第２のシリーズ（パニングシリーズII）由来の、発現についてアッセイした（実施例６および７に記載のように）20個のFab分子クローン（Fab分子クローン1:1〜1:20として同定した）を配列決定した。このラウンドの配列決定から、６つのFabクローンが、不十分なレベルのFabを産生することが見出され、そして４つのFabクローンが、特異的結合アッセイにおいてコントロール抗原に対して交叉反応性を示すことが見出された。残りの10個のFabクローンから得られた配列決定情報から、７個のFabクローンが、パニングシリーズI（L1-10Fab分子クローン）において見出されたクローンに関連する重鎖を有することが見出された。しかし、７個のFabクローンの内３個は、パニングシリーズIのクローンとは明らかに異なるH3領域を有し、そしてまた相互に独特に相関していた。これらのクローンをさらに試験するために選択し、そして本明細書中でFab分子クローン1:5、1:7、1:11として同定した。
【０１４９】
実施例４において行ったパニングの第３のシリーズ（パニングシリーズIII）由来の、30個のFab分子クローンを発現についてアッセイし（実施例６および７に記載のように）、そして16個クローンが両E1/E2複合体抗原に対しておよびE2抗原のみに対して反応性であることが見出された。これらの16個のクローンを上記のように配列決定した。配列決定した16個のクローンの内12個がクローンL1-L10に類似のH3配列を有することが見出されたが、一方残りの４つは独特のH3配列を有することが見出された。独特のH3配列を有する４つのクローンの内２つをさらに試験するために選択し、そして本明細書中でFab分子クローンA8およびA12として同定した。
【０１５０】
以下のFab分子クローン：1:5（配列番号  ）；1:7（配列番号  ）；1:11（配列番号  ）；L3（配列番号  ）；L1（配列番号  ）；A8（配列番号  ）；およびA12（配列番号  ）のκ軽鎖核酸配列を、各々、図3A〜図3Gに示す。
【０１５１】
以下のFab分子クローン：1:5（配列番号  ）；1:7（配列番号  ）；1:11（配列番号  ）；L3（配列番号  ）；L1（配列番号  ）；A8（配列番号  ）；およびA12（配列番号  ）のγ1重鎖核酸配列を、それぞれ、図4A〜図4Gに示す。
【０１５２】
以下のFab分子クローン：1:5（配列番号  ）；1:7（配列番号  ）；1:11（配列番号  ）；L3（配列番号  ）；L1（配列番号  ）；A8（配列番号  ）；およびA12（配列番号  ）の推定のγ1重鎖アミノ酸配列を、それぞれ、図1A〜図1Gに示す。各鎖由来のCDR領域（CDR1、CDR2、およびCDR3）もまた図中に同定した。
【０１５３】
以下のFab分子クローン：（1:5（配列番号  ）；1:7（配列番号  ）；1:11（配列番号  ）；L3（配列番号  ）；L1（配列番号  ）；A8（配列番号  ）；およびA12（配列番号  ）の推定のκ軽鎖アミノ酸酸配列を、それぞれ、図2A〜図2Gに示す。各鎖由来のCDR領域（CDR1、CDR2、およびCDR3）もまた上記のように同定した。
【０１５４】
要約すれば、３つのパニングシリーズから得た50クローンの内、36クローンは、E2に特異的であることが見出され、そしてそれらの36のE2特異的クローンのうちの29は関連する重鎖を共有する。
【０１５５】
実施例９
HCV  E2抗原反応性についてのELISAアッセイ
Fab分子クローン1:5、1:7、1:11およびL3を、HCV  E2抗原反応性について以下のようにスクリーニングした。組換えコンフォメーショナルHCV  E2抗原、または組換えHCV  E1/E2複合体抗原（実施例３に記載のように調製した）のいずれかを、0.05M、pH  9.6の炭酸−重炭酸緩衝液中の0.25μg/mlに希釈し、４℃にて１晩、マイクロタイターウェル（Costar  #3690；Life  Technologies）にコーティングした。結合していない抗原を捨て、そしてウェルをPBS中の５％脱脂乾燥ミルクで60分間室温にてブロッキングした。ブロッキング溶液を捨てた後、試験されるFab分子を含む溶液を1:2、1:10、および1:100希釈（希釈物：0.1%  NP-40を有するPBS）で添加した。プレートを室温で２時間インキュベートし、0.05％  Tween  20を有するPBS（PBS-T）で５回洗浄し、そしてALP-ヤギ抗ヒトF(ab’)2（Pierce、Rocherford,  IL）を1:1000希釈で添加した。60分後、そして続く洗浄後に、基質溶液（p-ニトロフェニルホスフェート）（SIGMA,  St.Louis,  MO）を添加し、そして吸光度を405nmにてマイクロプレートリーダー（Dynastar,  MA）において測定した。
【０１５６】
ポジティブな読み取りについてのカットオフ値は、ネガティブコントロール試料について得られるOD値の４倍に設定した。この試料は、等濃度の抗HIV  Fabを含んだ。Barbas  IIIら（1991）  Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:7978-7982。コントロールの目的のために、ウシ血清アルブミン（BSA）（SIGMA）、HIV  gp120LAI（Intracell,  Cambridge,  MA）、および破傷風トキソイド（TT）（SBLワクチン、Solna,  Sweden）でそれぞれ５、１、および１μg/mlで、コートしたものを、対応するELISAにおいて、非特異的な反応性についてのコントロールとして使用した。
【０１５７】
ELISAからの結果を、以下の表IIに示す。理解され得るように、1:5、1:7、1:11、およびL3クローンから発現されるFab分子は、各々、コンフォメーショナルHCV  E2抗原およびHCV  E1/E2複合体抗原の両方と強力に反応する一方で、コントロール抗原（BSA、HIVgp120、およびTT）とは交叉反応を示さなかった。
【０１５８】
【表２】
2008019256.tif 000003
【０１５９】
1  分析に使用した周辺質調製物におけるFab濃度。
2  OD405nm、試料は1:10に希釈。
3  試料を1:100に希釈。
【０１６０】
実施例１０
HCV  E2抗原反応性についてのウェスタンブロットアッセイ
Fab分子クローン1:5、1:7、1:11、L1、L3、A8、およびA12をHCV  E2抗原反応性について、以下の技術を用いてスクリーニングした。ウェスタンブロットを、  １μgの組換えコンフォメーショナルHCV  E2糖タンパク質（実施例３において得た）を使用して実施した。このタンパク質は、Laemmli緩衝液中で98℃にて５分間加熱することにより変性させ、８〜16％ポリアクリルアミド勾配ゲル（Novex  Experimental  Technologies）上で分離し、そして上記のようにブロッキングしたニトロセルロースメンブレンに移し、そして小片に切断した。続いて、各々の小片を、PBS-MT中で1:20に希釈したFab調製物（1:5、1:7、1:11、L3、L1、A8、およびA12クローンから発現した）とともに22℃にて２時間、一定に振盪しながらインキュベートした。この小片をPBS-T中で３回洗浄し、そしてPBS-MT中で1:1000に希釈したアルカリホスファターゼ結合ヤギ抗ヒトFab血清（Pierce）を添加した。22℃での１時間のインキュベーションに続いて、小片を再び0.05％  Tween  20を有するPBS中で３回洗浄し、そして発色を、２mlのBCIP/NBT溶液（Sigma、St  Louis,  MO）で10分間で行った。ポジティブコントロールとして、  Fab調製物の代わりにヒト抗HCVポジティブ血清を、１つの小片とともにインキュベートした。
【０１６１】
試験したFab分子（クローン1:5、1:7、1:11、L3、L1、A8、およびA12由来）のいずれもウェスタンブロットにおいて変性HCV  E2抗原とは反応せず、このことは、各々のFab分子が、HCV  E2抗原のコンフォメーショナルエピトープに結合することを示している。しかし、ポジティブコントロール（ヒト抗HCVポジティブ血清）は、ウェスタンブロットにおいて変性E2抗原と反応した。
【０１６２】
上記のアッセイを、非変性条件下においてゲル分離したHCV  E2抗原の使用という単一の変化以外は同一条件下で繰り返した。このさらなるアッセイにおいて試験した両方のクローン（1:7およびA8）は非変性E2抗原と結合することが見い出された。
【０１６３】
実施例１１
親和性決定についての阻害ELISAアッセイ
HCV  E2抗原へのFab分子（クローン1:5、1:7、1:11、L3、L1、A8、およびA12由来）の親和性を、阻害ELISA法を以前に記載したように用いて評価した。Perssonら（1991）Proc  Natl  Acad  Sci  USA  88:2432-2436、Rathら（1988）J  Immun  Methods  106:245-249。試験される試料を、まず濃度を階層化するために10倍希釈で力価測定した。ここで、濃度が10倍減少すると、HCV  E2  ELISAにおいて検出された結合において実質的な減少が生じた。親和性測定のために、マイクロタイターウェルのHCV  E2抗原（HCV遺伝子型1a）でのコーティングおよび続くブロッキングを、実施例９において実施したELISAについて上記のように行った。Fab試料の適切な希釈物を、可溶性HCV  E2抗原（最終濃度５μg/ml）を添加するかまたは添加しないで、ウェルに添加し、そして室温で３時間インキュベートした。プレートを、PBS-Tで４回均一に洗浄し、そして実施例９において上記のようにAP-抗Fab、基質、および吸光光度計リーダーを用いて発色した。可溶性HCV  E2抗原の存在下でのODの減少を計算し、そして外挿法により50％減少に必要な濃度を見積もった。
【０１６４】
以下の表IIIで示すように、組換えコンフォメーショナルHCV  E2抗原（HCV遺伝子型1a）に対するFab分子（クローン1:5、1:7、1:11、L3、L1、A8、およびA12由来）のおおよその親和性は、１×107と２×108M-1の間で変化した。
【０１６５】
【表３】
2008019256.tif 000004
【０１６６】
1  ODにおける50％減少のために必要な可溶性E2のおおよその濃度。
【０１６７】
異なるHCV  E2抗原（HCV遺伝子型1b）についてのFab分子（クローン1:7、A8、およびA12由来）の親和性もまた、上記の阻害ELISAを用いて見積もった。試験した分子の各々における遺伝子型1bのE2抗原についての親和性は、遺伝子型1a  E2抗原について上記で報告したもの（表III）と同様であることが見い出された。
【０１６８】
さらに、以下のFab分子クローン（L1；L3；1:5；1:7；および1:11）から調製した全組換えIgG分子を、HCV遺伝子型1a  E2抗原を用いる上記の阻害ELISAを使用して見積もった。観察された親和性は、Fab分子クローンについて上記で報告したもの（表III）と同様であった。
【０１６９】
実施例１２
HCV  E2結合の阻害
Fab分子（クローン1:5、1:7、1:11、L3、L1、A8、およびA12由来）が標的細胞に対するHCV  E2の結合をブロッキングする能力を、Rosaら(1996）Proc  Natl  Acad  Sci  USA  93:1759-1763の結合の中和（NOB）方法を用いて決定した。より詳細には、精製コンフォメーショナルHCV  E2抗原（遺伝子型HCV  1aおよびHCV  1bの両方由来、そして実施例３に記載のように調製した）を間接的免疫蛍光実験に用いて、２つの別々のバッチの細菌で発現したFab分子クローンが、インビトロでのヒト細胞に対するHCV  E2ポリペプチドの結合を中和する能力を評価した。
【０１７０】
アッセイにおいて、20μlの精製したコンフォメーショナルHCV  E2抗原（PBS中にて0.5μg/ml）を種々の希釈のFabクローンと混合した。４℃での１時間のインキュベーション後、MOLT-4細胞（Shimizuら（1992）Proc  Natl  Acad  Sci  USA  89:5477-5481に記載のようにインビトロでの低レベルのHCV複製を可能にすると報告されているヒト細胞株）のペレットを添加し、そして生じる反応混合物を４℃にて１時間インキュベートした。結合していないHCV抗原および抗体を、PBS中４℃での５分間の200×gでの２回の遠心分離により除去した。次いで、細胞を、ヒト抗HCV  E2反応性血清と４℃にて30分間インキュベートした。次いで、細胞をPBS中で二回洗浄し、そしてフルオレセインイソチオシアネート結合ヒトFab特異的抗血清とともに30分間インキュベートした。細胞を、PBS中で４℃にて再び洗浄し、そして100μlのPBSに再懸濁した。細胞に結合した蛍光を、Lysis  IIソフトウェア（Becton  Dickinson）を用いてフローサイトメーター（FACScan、Becton  Dickinson）で分析した。種々のFab調製物とともにインキュベートした細胞集団の平均蛍光強度を計算し、そして抗体なしか、またはE2抗原なしでインキュベートした細胞の平均蛍光強度と比較した。
【０１７１】
結果を以下の表IVに示す。理解され得るように、７つの試験したFabクローンすべてが、コンフォメーショナルHCV  E2抗原（遺伝子型HCV  1aおよびHCV  1bの両方）によりMOLT-4細胞結合を効率的に阻害した。クローンA8、1:7、L1、およびL3は、アッセイにおいて非常に高い中和活性を有していた。50％減少力価を、試験したクローンすべてについて表IVに示し、そしてクローン中の４つについてのアッセイの完全な結果を図５に示す。HIV-1エンベロープ糖タンパク質gp120（クローンb12およびb14）に指向させた以外は上記と同様の様式で調製した２つのネガティブコントロールのFabクローンは、アッセイにおいて中和活性を有さなかった。真核生物細胞において発現したFabクローン、およびFabクローンから由来する組換え体の完全なIgG分子は、同様なNOBアッセイにおいてネガティブであることが見い出された。
【０１７２】
【表４】
2008019256.tif 000005
【０１７３】
*μg/mlでのFab濃度。
【０１７４】
HCVウイルスとその宿主との第一の接触が、ウイルスエンベロープの細胞表面レセプターに対する結合を介して生じるため、本発明のFab分子がこの相互作用を中和する能力は、HCVに対する受動免疫を提供するためのワクチン接種においてそれらの分子を使用する有効性を確立する。
【０１７５】
従って、HCV  E2抗原に対する新規なヒトモノクローナル抗体が開示される。本発明の好ましい実施態様を、ある程度詳細に記載しているが、添付の請求の範囲により定義される本発明の精神および範囲から逸脱することなく明らかな改変が行われ得ることが理解される。
【図面の簡単な説明】
【０１７６】
【図１−１】図1A〜1Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）の推定されたγ１重鎖アミノ酸配列を示す。各重鎖のCDR領域は、図中の「CDR1」、「CDR2」および「CDR3」として同定される。
【図１−２】図1A〜1Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）の推定されたγ１重鎖アミノ酸配列を示す。各重鎖のCDR領域は、図中の「CDR1」、「CDR2」および「CDR3」として同定される。
【図１−３】図1A〜1Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）の推定されたγ１重鎖アミノ酸配列を示す。各重鎖のCDR領域は、図中の「CDR1」、「CDR2」および「CDR3」として同定される。
【図２−１】図2A〜2Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）の推定されたκ軽鎖アミノ酸配列を示す。各軽鎖のCDR領域（CDR1、CDR2およびCDR3)もまた、上記図1A〜1Gに対して注記されたように同定される。
【図２−２】図2A〜2Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）の推定されたκ軽鎖アミノ酸配列を示す。各軽鎖のCDR領域（CDR1、CDR2およびCDR3)もまた、上記図1A〜1Gに対して注記されたように同定される。
【図２−３】図2A〜2Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）の推定されたκ軽鎖アミノ酸配列を示す。各軽鎖のCDR領域（CDR1、CDR2およびCDR3)もまた、上記図1A〜1Gに対して注記されたように同定される。
【図３−１】図3A〜3Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）のκ軽鎖の核酸配列を示す。
【図３−２】図3A〜3Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）のκ軽鎖の核酸配列を示す。
【図３−３】図3A〜3Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）のκ軽鎖の核酸配列を示す。
【図４−１】図4A〜4Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）のγ1重鎖の核酸配列を示す。
【図４−２】図4A〜4Gは、それぞれ、Fab分子クローン1:5（配列番号  ）、1:7（配列番号  ）、1:11（配列番号  ）、L3（配列番号  ）、L1（配列番号  ）、A8（配列番号  ）、およびA12（配列番号  ）のγ1重鎖の核酸配列を示す。
【図５】図５は、実施例12に記載のように行われた中和アッセイの結果を示す。本アッセイでは、Fab分子クローン  1:5、1:7、1:11およびL3より発現されたFab分子の、HCV  E2ポリペプチドの標的細胞への結合をブロックする能力が評価された。（配列表）
【数１】
2008019256.tif 000006
【数２】
2008019256.tif 000007
【数３】
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【数４】
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【数５】
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【数６】
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【数７】
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【数８】
2008019256.tif 000013
【数９】
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【数１０】
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【数１１】
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【数１２】
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【数１３】
2008019256.tif 000018
【数１４】
2008019256.tif 000019
【図１−１】
2008019256.tif 000020
【図１−２】
2008019256.tif 000021
【図１−３】
2008019256.tif 000022
【図２−１】
2008019256.tif 000023
【図２−２】
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【図２−３】
2008019256.tif 000025
【図３−１】
2008019256.tif 000026
【図３−２】
2008019256.tif 000027
【図３−３】
2008019256.tif 000028
【図４−１】
2008019256.tif 000029
【図４−２】
2008019256.tif 000030
【図５】
2008019256.tif 000031