(57)【要約】  本開示は改良したオリゴヌクレオチド系組成物に関し、また被験体においてＨＢＶ感染を治療する方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示はＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）発現の耐久性ノックダウンを生成する強力なオリゴヌクレオチドの開発に関する。当該オリゴヌクレオチドは、肝細胞のＨＢｓＡｇの全形態をコードするｍＲＮＡの、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を介した認識及び破壊を誘導する。本開示はＢ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドを提供し、当該オリゴヌクレオチドはアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態では、当該オリゴヌクレオチドは更にセンス鎖を含み、当該センス鎖はアンチセンス鎖と共に二重鎖領域を形成する。【選択図】図１０
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、１９〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含み、前記アンチセンス鎖が、ＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡ（配列番号１）で規定されるＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡの配列に相補的な領域を含むことを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【請求項２】
１９〜５０ヌクレオチド長のセンス鎖を更に含み、前記センス鎖が、前記アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成する、請求項１に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３】
前記センス鎖が、ＵＵＮＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮ（配列番号２）で規定される配列に相補的な領域を含む、請求項２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４】
前記センス鎖が、５’‐ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮＵＵＧＵＣ（配列番号３）で規定される配列に相補的な領域を含む、請求項２又は３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項５】
前記アンチセンス鎖が、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号４）で規定される配列を含む、請求項３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項６】
前記アンチセンス鎖が、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＣＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５）で規定される配列からなる、請求項３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項７】
前記アンチセンス鎖が、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）で規定される配列からなる、請求項３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項８】
前記センス鎖が、ＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡ（配列番号６）で規定される配列を含む、請求項２〜６のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項９】
前記センス鎖が、ＧＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号７）で規定される配列を含む、請求項２〜８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１０】
前記センス鎖が、ＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）で規定される配列からなる、請求項２〜８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１１】
前記センス鎖が、ＧＡＣＡＡＧＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８．１）で規定される配列からなる、請求項２〜８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１２】
Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、前記センス鎖が、ＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）で規定される配列を含み、前記アンチセンス鎖が、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）で規定される配列を含み、
前記アンチセンス鎖及び前記センス鎖のそれぞれが、１つ以上の２’‐フルオロ及び２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエート結合を含み、前記アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素が、リン酸類似体を含み、前記センス鎖が、１つ以上のＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分とコンジュゲートされていることを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【請求項１３】
Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
前記センス鎖が、ＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）で規定される配列を含み、３、８〜１０、１２、１３及び１７位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、２、４〜７、１１、１４〜１６、１８〜２６、及び３１〜３６位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、前記センス鎖が、１つ以上のＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分とコンジュゲートされており、
前記アンチセンス鎖が、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）で規定される配列を含み、２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６及び１９位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８及び２０〜２２位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも３つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、前記アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素が、リン酸類似体を含むことを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
前記センス鎖が、１位と２位の前記ヌクレオチド間でホスホロチオエート結合を含む、請求項１３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１５】
前記アンチセンス鎖が、１位と２位、２位と３位、３位と４位、２０位と２１位、及び２１位と２２位のヌクレオチド間に５つのホスホロチオエート結合を含む、請求項１３又は１４に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１６】
前記アンチセンス鎖の前記５’‐ヌクレオチドが、以下の構造：
【化１】
2021500025.tif 000020
を有する、請求項１３又は１４に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１７】
前記センス鎖上の前記‐ＧＡＡＡ‐配列の１つ以上のヌクレオチドが、一価のＧａｌＮａｃ部分とコンジュゲートされている、請求項１３又は１４に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１８】
前記センス鎖上の前記‐ＧＡＡＡ‐配列の前記各ヌクレオチドが、一価のＧａｌＮａｃ部分とコンジュゲートされている、請求項１７に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１９】
前記‐ＧＡＡＡ‐モチーフが、以下の構造：
【化２】
2021500025.tif 000021
を含み、式中：
Ｌが、結合、クリックケミストリーハンドル、又は長さが１〜２０の包括的かつ連続的な共有結合原子のリンカーであって、置換及び非置換アルキレン、置換及び非置換アルケニレン、置換及び非置換アルキニレン、置換及び非置換ヘテロアルキレン、置換及び非置換ヘテロアルケニレン、置換及び非置換ヘテロアルキニレン、並びにこれらの組み合わせから成る群より選択されるリンカーであり、
Ｘが、Ｏ、Ｓ又はＮである、請求項１８に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２０】
Ｌが、アセタールリンカーである、請求項１９に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２１】
Ｘが、Ｏである、請求項１９又は２０に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２２】
前記‐ＧＡＡＡ‐配列が、以下の構造：
【化３】
2021500025.tif 000022
を含む、請求項１６に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２３】
前記センス鎖が、その３’末端にＳ1‐Ｌ‐Ｓ2で規定されるステムループを含み、Ｓ1はＳ2に相補的であり、Ｌは最大６ヌクレオチド長のＳ1とＳ2間のループを形成することを特徴とする請求項２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２４】
Ｌが、テトラループである、請求項２３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２５】
Ｌが、４ヌクレオチド長の、Ｓ1とＳ2間のループを形成する、請求項２３又は２４に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２６】
Ｌが、ＧＡＡＡで規定される配列を含む、請求項２３〜２５のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２７】
前記ステムループのＬの４までのヌクレオチドが、それぞれ別のＧａｌＮＡｃとコンジュゲートされている、請求項２３〜２６のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２８】
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾されたヌクレオチドを含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項２９】
前記修飾ヌクレオチドが、２’‐修飾を含む、請求項２８に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３０】
前記２’‐修飾が、２’‐アミノエチル、２’‐フルオロ、２’‐Ｏ‐メチル、２’‐Ｏ‐メトキシエチル、及び２’‐デオキシ‐２’‐フルオロ‐β‐ｄ‐アラビノ核酸から選択される修飾である、請求項２９に記載のオリゴヌクレオチド。  
【請求項３１】
前記オリゴヌクレオチドの全ヌクレオチドが、修飾ヌクレオチドである、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３２】
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオチド間結合を含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３３】
前記少なくとも１つの修飾ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項３２に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３４】
前記アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素が、リン酸類似体を含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３５】
前記オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオチドが、標的化リガンドとコンジュゲートされている、請求項１〜１０のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３６】
前記標的化リガンドが、Ｎ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分である、請求項３５に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項３７】
請求項１〜３６のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドと、対イオンとを含むことを特徴とする組成物。
【請求項３８】
請求項１〜３７のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容可能な担体とを含むことを特徴とする組成物。
【請求項３９】
細胞内のＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）表面抗原の発現を低減する方法であって、請求項１〜３６のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドを、前記細胞に送達する工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項４０】
前記細胞が、肝細胞である、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
前記細胞が、インビボ細胞である、請求項３０〜４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
前記細胞が、インビトロ細胞である、請求項３９又は４０に記載の方法。
【請求項４３】
被験体においてＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）感染を治療する方法であって、請求項１〜３６のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド、又は請求項３７もしくは３８に記載の組成物を、前記被験体に投与する工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項４４】
被験体においてＨＢＶ感染を治療する方法であって、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを選択的に標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを前記被験体に投与する工程を含み、非表面抗原コードＨＢＶ  ｍＲＮＡ転写産物を標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドによる治療をせずに、前記ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを投与することを特徴とする方法。
【請求項４５】
被験体においてＨＢＶ感染を治療する方法であって、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを選択的に標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを前記被験体に投与する工程を含み、ＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡ転写産物を選択的に標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを前記被験体に投与しないことを特徴とする方法。
【請求項４６】
前記被験体に有効量のエンテカビルを投与する工程を更に含む、請求項３９〜４５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドであって、前記オリゴヌクレオチドが、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、
前記センス鎖が、ＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）に規定される配列を含み、かつ３、８〜１０、１２、１３及び１７位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、２、４〜７、１１、１４〜１６、１８〜２６、及び３１〜３６位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに１位と２位の前記ヌクレオチド間にある１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、前記センス鎖の前記‐ＧＡＡＡ‐配列の前記各ヌクレオチドが、一価のＧａｌＮａｃ部分とコンジュゲートされており、前記‐ＧＡＡＡ‐配列が、以下の構造：
【化４】
2021500025.tif 000023
を含み、更に、
前記アンチセンス鎖が、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）で規定される配列を含み、かつ２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６及び１９位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８及び２０〜２２位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに１位と２位、２位と３位、３位と４位、２０位と２１位、及び２１位と２２位のヌクレオチド間の５つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、前記アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素が、以下の構造：
【化５】
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を有することを特徴とするオリゴヌクレオチド。
【請求項４８】
請求項４７に記載の前記オリゴヌクレオチドを含むことを特徴とする組成物。
【請求項４９】
Ｎａ＋対イオンを更に含む、請求項４８に記載の組成物。
【請求項５０】
細胞においてＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）表面抗原の発現を低減する方法であって、請求項４７に記載の前記オリゴヌクレオチド又は請求項４８もしくは４９に記載の前記組成物を前記細胞に送達する工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項５１】
前記細胞が、肝細胞である、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
前記細胞が、インビボ細胞である、請求項５０又は５１に記載の方法。
【請求項５３】
前記細胞が、インビトロ細胞である、請求項５０又は５１に記載の方法。
【請求項５４】
被験体においてＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）感染を治療する方法であって、請求項４７に記載の前記オリゴヌクレオチド又は請求項４８もしくは４９に記載の前記組成物を、前記被験体に投与する工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項５５】
有効量のエンテカビルを前記被験体に投与する工程を更に含む、請求項５０〜５４のいずれか１項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願はオリゴヌクレオチド及びその使用、特にＢ型肝炎感染の治療に関連するオリゴヌクレオチドの使用に関する。
【背景技術】
【０００２】
慢性Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）感染は、世界中の罹患率及び死亡率の重要な原因となっている。ヌクレオシド類似体などの現在のＨＢＶ治療法では、血漿ウイルス血症を軽減するためには生涯に渡って治療が必要であり、一般に長期的には有効ではない。従来から慢性ＨＢＶにとって機能的回復が最善の治療結果であった。ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）技術は薬理学的に介入できる可能性がある。
【０００３】
外被タンパク質は、総称してＢ型肝炎表面抗原（ＨＢｓＡｇ）として公知である。ＨＢｓＡｇは、重複するオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）にコードされるＳ、Ｍ及びＬと称する３種の関連ポリペプチドから成る。最小のエンベロープタンパク質は２２６個のアミノ酸を有するＳであり、Ｓ‐ＯＲＦと称する。Ｍ及びＬは上流の翻訳開始部位から生成され、Ｓにそれぞれ５５及び１０８個のアミノ酸を付加する。ＨＢＶのＳ、Ｍ、及びＬ糖タンパク質はＤａｎｅ粒子というインタクトな感染性ＨＢＶウイルス粒子のウイルス外被に見られ、これら３種は全て非常に過剰に生成及び分泌され、慢性ＨＢＶ患者の血液中に見られる非感染性サブウイルスの球状及び繊維状粒子（両方ともデコイ粒子と称される）を形成する。デコイ粒子表面上に豊富に存在するＨＢｓＡｇは、慢性ＨＢＶ感染（ＣＨＢ）患者の体液性免疫及び自然クリアランスを阻害すると考えられている。
【発明の概要】
【０００４】
本開示の態様は、改善されたオリゴヌクレオチド系組成物に関するものであり、また被験体におけるＨＢＶ感染を治療する方法に関する。いくつかの実施形態では、本開示は、ＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）発現の耐久性ノックダウンを生成する強力なオリゴヌクレオチドの開発に関する。当該オリゴヌクレオチドは、肝細胞のＨＢｓＡｇの全形態をコードするｍＲＮＡの、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）を介した認識及び破壊を誘導する。これには、宿主ゲノムに組み込まれているｃｃｃＤＮＡとＨＢＶのＤＮＡとの両方から転写されたウイルスＲＮＡから翻訳されたタンパク質が含まれる。本明細書においてオリゴヌクレオチドは、既知の遺伝子型全てに渡ってＨＢＶゲノムにコードされるＨＢｓＡｇ転写産物の広範なセットを標的とするように設計している。いくつかの実施形態では、肝細胞においてＨＢｓＡｇ転写産物を標的とする本明細書で開示したオリゴヌクレオチドは、被験体への投与後の長期間（例えば、７週間を超えて数か月まで）持続する高い特異性でＨＢｓＡｇ発現を安定的に低下させ得ることが見出された（例えば、実施例１及び３参照）。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドを使用してＨＢｓＡｇ発現を標的にすると、プレゲノムＲＮＡ（ｐｇＲＮＡ）及び他のウイルスのライフサイクル中間体が減少することが発見されている。また本明細書で開示した特定のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、ｃｃｃＤＮＡ又は組み込まれたウイルスのいずれかに由来するＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ転写産物をノックダウンできることも分かっている。更なる態様では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドを使用してＨＢｓＡｇ発現を標的にすると、全ＨＢＶタンパク質（ＨＢｘを除く）、すなわちＨＢｃＡｇ、ＨＢｅＡｇ、及びＨＢＶポリメラーゼの発現が低下し、ＨＢＶコアタンパク質のサイトゾルが保持されることが発見されている。更に、いくつかの実施形態では、本明細書で提供する方法を使用したｍＲＮＡノックダウンに起因する循環ＨＢｓＡｇのクリアランスは、ＣＨＢ患者における高レベルの循環ＨＢｓＡｇに引き起こされるＨＢＶ免疫寛容の破壊を可能にするため、臨床的に有利である。ＨＢＶ感染に対する免疫系活動の再活性化は、ＨＢｓＡｇの永久的なセロクリアランスとして定義される機能的回復を達成するための基礎であると考えられている。
【０００５】
過去の研究では、複数の異なるＨＢＶ遺伝子（すなわちＳ、Ｃ、Ｐ、及びＸ遺伝子）を標的とするＲＮＡｉ薬剤の組み合わせを使用すると、又は場合によってはＸ遺伝子転写産物のみを標的とすると、ＨＢＶ複製及び遺伝子発現は効果的に阻害されることが示された。ただし、ここで提供される結果から明らかになっているのは、ＨＢｓＡｇ転写産物のみを標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの使用がＨＢＶ複製及び遺伝子発現を効果的に阻害し、ＨＢＶ感染の治療に新たな治療アプローチを提供するということである。ウイルスＲＮＡをサイレンシングする直接的な効果に加えて、ＨＳＢ（ｓ）‐２１９前駆体は、ＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の核局在化を防止する。ＨＢＶ‐Ｘ、又は両遺伝子を同時に標的としても、ＨＢｃＡｇの核局在化は防止されないことは重要である。前臨床データでは、Ｓを標的とするＲＮＡｉ療法に起因する核の中心局在化の抑制がＨＢｓＡｇ抑制の持続時間を有意に改善することが強く示唆されている。特に、患者におけるＨＢｃＡｇの核局在化の排除は、抗ウイルス療法に対する好ましい反応と相関することが分かっている。
【０００６】
本開示のいくつかの態様から、Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドが提供される。当該オリゴヌクレオチドは１９〜３０ヌクレオチド長のアンチセンス鎖を含み、当該アンチセンス鎖はＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡ（配列番号１）に規定されるＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡの配列に相補的な領域を含む。
【０００７】
いくつかの実施形態では、当該オリゴヌクレオチドは更に、１９〜５０ヌクレオチド長のセンス鎖を含み、当該センス鎖は、当該アンチセンス鎖と共に二重鎖領域を形成する。いくつかの実施形態では、当該センス鎖はＵＵＮＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮ（配列番号２）に規定される配列に相補的な領域を含む。いくつかの実施形態では、当該センス鎖は５’‐ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮＵＵＧＵＣ（配列番号３）に規定される配列に相補的な領域を含む。
【０００８】
いくつかの実施形態では、当該アンチセンス鎖はＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号４）に規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、当該アンチセンス鎖はＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＣＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５）に規定される配列から成る。いくつかの実施形態では、当該アンチセンス鎖はＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）に規定される配列から成る。
【０００９】
いくつかの実施形態では、当該センス鎖はＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡ（配列番号６）に規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、当該センス鎖はＧＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号７）に規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、当該センス鎖はＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）に規定される配列から成る。いくつかの実施形態では、当該センス鎖はＧＡＣＡＡＧＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８．１）に規定される配列から成る。
【００１０】
本開示の他の態様は、Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドを提供し、当該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含む。当該センス鎖はＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）に規定される配列を含み、当該アンチセンス鎖はＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）に規定される配列を含み、アンチセンス鎖及びセンス鎖はそれぞれ、１つ以上の２’‐フルオロ及び２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエート結合を含み、当該アンチセンス鎖の５’ヌクレオチドの糖の４’‐炭素はリン酸類似体を含み、当該センス鎖は１つ以上のＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分にコンジュゲートされる。
【００１１】
本明細書では、Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低下させるためのオリゴヌクレオチドが更に提供される。当該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、当該オリゴヌクレオチド中で：当該センス鎖はＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）に規定される配列を含み、３、８〜１０、１２、１３及び１７位にある２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、２、４〜７、１１、１４〜１６、１８〜２６、及び３１〜３６位にある２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、当該センス鎖は、１つ以上のＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分にコンジュゲートされる；当該アンチセンス鎖はＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）に規定される配列を含み、２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６及び１９位にある２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８及び２０〜２２位にあるＯ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも３つのホスホロチオエートヌクレオチド間での結合を含み、当該アンチセンス鎖における５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素はリン酸類似体を含み、当該センス鎖は、１位と２位のヌクレオチド間にホスホロチオエート結合を含む。
【００１２】
いくつかの実施形態では、当該アンチセンス鎖は、ヌクレオチド１位と２位、２位と３位、３位と４位、２０位と２１位、及び２１位と２２位の間に５つのホスホロチオエート結合を含む。
【００１３】
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドは以下の構造：
【化１】
2021500025.tif 000003
を有する。
【００１４】
いくつかの実施形態では、センス鎖上の‐ＧＡＡＡ‐配列の１つ以上のヌクレオチドは一価のＧａｌＮａｃ部分にコンジュゲートされる。
【００１５】
いくつかの実施形態では、センス鎖上の‐ＧＡＡＡ‐配列の各ヌクレオチドは一価のＧａｌＮａｃ部分にコンジュゲートされる。いくつかの実施形態では、‐ＧＡＡＡ‐モチーフは以下の構造：
【化２】
2021500025.tif 000004
を含み、式中：
Ｌは、結合、クリックケミストリーハンドル、又は長さが１〜２０の包括的かつ連続的な共有結合原子のリンカーを表し、置換及び非置換アルキレン、置換及び非置換アルケニレン、置換及び非置換アルキニレン、置換及び非置換ヘテロアルキレン、置換及び非置換ヘテロアルケニレン、置換及び非置換ヘテロアルキニレン、並びにこれらの組み合わせから成る群より選択され、ＸはＯ、Ｓ又はＮである。
【００１６】
いくつかの実施形態では、Ｌはアセタールリンカーである。いくつかの実施形態では、ＸはＯである。
【００１７】
いくつかの実施形態では、‐ＧＡＡＡ‐配列は以下の構造：
【化３】
2021500025.tif 000005
を含む。
【００１８】
いくつかの実施形態では、センス鎖は、その３’末端にＳ1‐Ｌ‐Ｓ2として規定されるステムループを含み、Ｓ1はＳ2に相補的であり、Ｌは最大６ヌクレオチド長のＳ1とＳ2間のループを形成する。いくつかの実施形態では、Ｌはテトラループである。いくつかの実施形態では、Ｌは４ヌクレオチド長のＳ1とＳ2間のループを形成する。いくつかの実施形態では、ＬはＧＡＡＡとして規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、ステムループのＬの最大４ヌクレオチドは、それぞれ別のＧａｌＮＡｃにコンジュゲートされる。
【００１９】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは２’‐修飾を含む。いくつかの実施形態では、２’修飾は：２’‐アミノエチル、２’‐フルオロ、２’‐Ｏ‐メチル、２’‐Ｏ‐メトキシエチル、及び２’‐デオキシ‐２’‐フルオロ‐β‐ｄ‐アラビノ核酸：から選択される修飾である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの全ヌクレオチドは修飾ヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾ヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、当該少なくとも１つの修飾ヌクレオチド間結合はホスホロチオエート結合である。アンチセンス鎖における５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素はリン酸類似体を含む。
【００２０】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオチドは、標的化リガンドにコンジュゲートされる。いくつかの実施形態では、標的化リガンドはＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分である。
【００２１】
本明細書では更に、先行する請求項のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド及び対イオンを含む組成物、並びに先行する請求項のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド及び薬学的に許容される担体を含む組成物が提供される。
【００２２】
本開示の他の態様は、細胞におけるＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）表面抗原の発現を低減する方法を提供し、当該方法は、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの細胞への送達を含む。いくつかの実施形態では、当該細胞は肝細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はインビボ細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はインビトロ細胞である。
【００２３】
本開示の他の態様は被験体におけるＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）感染を治療する方法を提供するものであり、当該方法は、本明細書に記載の組成物のオリゴヌクレオチド、又は当該組成物を被験体に投与する工程を含む。
【００２４】
被験体においてＨＢＶ感染を治療する方法も提供され、当該方法は、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを選択的に標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを被験体に投与する工程を含み、当該方法では、非表面抗原をコードするＨＢＶ  ｍＲＮＡ転写産物を標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドでの治療をせずに、ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを投与する。被験体においてＨＢＶ感染を治療する方法も提供され、当該方法はＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを選択的に標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを被験体に投与する工程を含み、当該方法では、ＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡ転写産物を選択的に標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを被験体に投与しない。いくつかの実施形態では、当該方法は更に、有効量のエンテカビルを被験体に投与する工程を含む。
【００２５】
本開示の他の態様は、Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原（ＨＢｓＡｇ）ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドを提供し、当該オリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と共に二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、当該オリゴヌクレオチド中で：
センス鎖はＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）に規定される配列を含み、３、８〜１０、１２、１３及び１７位にある２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、２、４〜７、１１、１４〜１６、１８〜２６、及び３１〜３６位にある２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに１位と２位のヌクレオチド間でホスホロチオエートヌクレオチド間結合を１つ含み、センス鎖の‐ＧＡＡＡ‐配列のヌクレオチドはそれぞれ、一価のＧａｌＮａｃ部分にコンジュゲートされ、‐ＧＡＡＡ‐配列は以下の構造：
【化４】
2021500025.tif 000006
を含み；また、
アンチセンス鎖はＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）に規定される配列を含み、２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６及び１９位にある２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド、１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８及び２０〜２２位にあるＯ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びにヌクレオチド１位と２位、２位と３位、３位と４位、２０位と２１位、及び２１位と２２位との間にホスホロチオエートのヌクレオチド間結合を５つ含み、当該アンチセンス鎖における５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素は以下の構造：
【化５】
2021500025.tif 000007
を有する。
【００２６】
オリゴヌクレオチドを含む組成物も提供される。いくつかの実施形態では、当該組成物は更に、Ｎａ＋対イオンを含む。
【００２７】
細胞におけるＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）表面抗原の発現を低減する方法も提供され、当該方法は、オリゴヌクレオチド又は組成物の送達を含む。いくつかの実施形態では、当該細胞は肝細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はインビボ細胞である。いくつかの実施形態では、細胞はインビトロ細胞である。
【００２８】
被験体においてＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）感染を治療する方法が提供され、当該方法は、オリゴヌクレオチド又は組成物を被験体に投与する工程を含む。いくつかの実施形態では、当該方法は更に、有効量のエンテカビルを被験体に投与する工程を含む。
【００２９】
本明細書に組み込まれ、本明細書の一部を構成する添付図面は、特定の実施形態を説明し、書面の説明と共に、本明細書で開示した組成物及び方法の特定の態様の非限定的な例を提供する役割を担う。
【図面の簡単な説明】
【００３０】
【図１】ＨＢＶゲノムの構成の略図上のＲＮＡｉ標的部位の例を示す。
【図２】ＨＤＩマウスにおけるＨＢｓＡｇ発現を低減するためのオリゴヌクレオチドの単回投与評価を示す。
【図３】ＨＢｓＡｇを標的とするオリゴヌクレオチドを用いた特定の投与計画中の血漿ＨＢｓＡｇレベルの経時的なグラフである。この例から分かるように、オリゴヌクレオチドは前臨床的な効力を示し、投与期間を超えて減少レベルを維持した。
【図４】レポーターアッセイを用いたＨｅＬａ細胞におけるＨＢｓＡｇマッピングの結果を示すグラフである。ＨＢＶゲノムの２５４位を標的とする未修飾ｓｉＲＮＡを、特定の濃度で陽性対照として使用した。Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ社から市販されているＳｉｌｅｎｃｅｒのｓｉＲＮＡがこれらの実験の陰性対照となった。エラーバーはＳＥＭを表す。
【図５】ＨＢｓＡｇを標的とするオリゴヌクレオチドＨＢＶ‐２１９において設計されたミスマッチがＨＢＶ遺伝子型全体で増加することを示す遺伝子型保存比較を示す。
【図６】プロトタイプ配列としてＨＢＶ  Ｇｅｎｏｔｙｐｅ  Ａを使用するｐｓｉＣＨＥＣＫ２レポーターアッセイ用に設計したベクターを示す。
【図７】ミスマッチの導入の効果を評価するために設計したオリゴヌクレオチドのいくつかの例を示す。親及びミスマッチ鎖のオリゴヌクレオチド配列を整列させ、ボックス内のミスマッチ位置と共に示している。ｐｓｉＣＨＥＣＫ２レポーターアッセイで使用する対応するレポーター配列を更に示す。
【図８】ミスマッチ研究で評価したオリゴヌクレオチドの単回用量滴定プロットを示し、ガイド鎖のミスマッチがインビボで忍容されることを実証している。
【図９】ＨＢｓＡｇを標的とするオリゴヌクレオチドへのミスマッチの取り込みがインビボでの効力に悪影響を及ぼさないことを実証するインビボ用量滴定プロットを示す。
【図１０】化学修飾を有し二重鎖形態のＨＢｓＡｇを標的とするオリゴヌクレオチド（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９）の例を示す。濃い影は２’‐Ｏ‐メチルリボヌクレオチドを示す。明るい影は２’‐フルオロ−デオキシリボヌクレオチドを示す。
【図１１Ａ】肝細胞におけるＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の細胞内分布を検出する免疫組織化学染色の結果を示す。
【図１１Ｂ】ＨＢＶｐｇＲＮＡに対する検出ＲＮＡ転写産物配列をマッピングしたＲＮＡ配列決定の結果を示す。
【図１２Ａ】ＨＢＶの流体力学的注射（ＨＤＩ）モデルにおいて、ビヒクル対照及びＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと比較した、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＨＢＶ（ｓ）‐２１９オリゴヌクレオチド前駆体ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２を用いた治療後のＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現の経時的推移を示す。
【図１２Ｂ】ＡＡＶ‐ＨＢＶモデルにおいて、ビヒクル対照及びＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと比較した、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＨＢＶ（ｓ）‐２１９オリゴヌクレオチド前駆体ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２を用いた治療後のＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現の経時的推移を示す。
【図１３】ビヒクル対照及びＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡ（ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ）を標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと比較した、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＨＢＶ（ｓ）‐２１９オリゴヌクレオチドを用いた治療後の、ＨＢＶのＡＡＶ‐ＨＢＶモデル及びＨＤＩモデルから得た幹細胞におけるＨＢｃＡｇの細胞内分布を表す免疫組織化学染色の結果を示す。
【図１４Ａ】ＰＸＢ‐ＨＢＶモデルにおけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体１（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９  Ｐ１）の抗ウイルス活性を示す。マウス９匹のコホートに、ＰＢＳ中のＨＢＶ‐２１９Ｐ１を０ｍｇ／ｋｇ又は３ｍｇ／ｋｇのいずれかで３週間毎に皮下投与した。各コホートから６匹のマウスを、血清ＨＢｓＡｇ及び血清ＨＢＶ  ＤＮＡについて示された各時点（図１４Ａ及び図１４Ｂ）で非末梢下顎頬出血により分析した。２８日目（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１の最初の投与から）に、残りの全てのマウスを安楽死させ、ＲＴ‐ｑＰＣＲにより肝ＨＢＶ  ＤＮＡ（図１４Ｃ）及び肝ｃｃｃＤＮＡ（図１４Ｄ）用に肝生検を採取した。
【図１４Ｂ】ＰＸＢ‐ＨＢＶモデルにおけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体１（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９  Ｐ１）の抗ウイルス活性を示す。マウス９匹のコホートに、ＰＢＳ中のＨＢＶ‐２１９Ｐ１を０ｍｇ／ｋｇ又は３ｍｇ／ｋｇのいずれかで３週間毎に皮下投与した。各コホートから６匹のマウスを、血清ＨＢｓＡｇ及び血清ＨＢＶ  ＤＮＡについて示された各時点（図１４Ａ及び図１４Ｂ）で非末梢下顎頬出血により分析した。２８日目（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１の最初の投与から）に、残りの全てのマウスを安楽死させ、ＲＴ‐ｑＰＣＲにより肝ＨＢＶ  ＤＮＡ（図１４Ｃ）及び肝ｃｃｃＤＮＡ（図１４Ｄ）用に肝生検を採取した。
【図１４Ｃ】ＰＸＢ‐ＨＢＶモデルにおけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体１（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９  Ｐ１）の抗ウイルス活性を示す。マウス９匹のコホートに、ＰＢＳ中のＨＢＶ‐２１９Ｐ１を０ｍｇ／ｋｇ又は３ｍｇ／ｋｇのいずれかで３週間毎に皮下投与した。各コホートから６匹のマウスを、血清ＨＢｓＡｇ及び血清ＨＢＶ  ＤＮＡについて示された各時点（図１４Ａ及び図１４Ｂ）で非末梢下顎頬出血により分析した。２８日目（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１の最初の投与から）に、残りの全てのマウスを安楽死させ、ＲＴ‐ｑＰＣＲにより肝ＨＢＶ  ＤＮＡ（図１４Ｃ）及び肝ｃｃｃＤＮＡ（図１４Ｄ）用に肝生検を採取した。
【図１４Ｄ】ＰＸＢ‐ＨＢＶモデルにおけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体１（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９  Ｐ１）の抗ウイルス活性を示す。マウス９匹のコホートに、ＰＢＳ中のＨＢＶ‐２１９Ｐ１を０ｍｇ／ｋｇ又は３ｍｇ／ｋｇのいずれかで３週間毎に皮下投与した。各コホートから６匹のマウスを、血清ＨＢｓＡｇ及び血清ＨＢＶ  ＤＮＡについて示された各時点（図１４Ａ及び図１４Ｂ）で非末梢下顎頬出血により分析した。２８日目（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１の最初の投与から）に、残りの全てのマウスを安楽死させ、ＲＴ‐ｑＰＣＲにより肝ＨＢＶ  ＤＮＡ（図１４Ｃ）及び肝ｃｃｃＤＮＡ（図１４Ｄ）用に肝生検を採取した。
【図１５Ａ】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体２（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）はエンテカビルの抗ウイルス活性を増強することを示す。ＨＢＶマウス流体力学的注射（ＨＤＩ）モデルでは、１日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２を単回、マウスに皮下投与した後、５００ｎｇ／ｋｇのエンテカビル（ＥＴＶ）を１４日間毎日経口投与した。循環ウイルス負荷（ＨＢＶ  ＤＮＡ）をｑＰＣＲにより測定した（図１５Ａ）。血漿ＨＢｓＡｇレベルをＥＬＩＳＡにより測定した（図１５Ｂ）。肝臓ＨＢＶ  ｍＲＮＡ及びｐｇＲＮＡレベルをｑＰＣＲにより測定した（図１５Ｃ）。結果から、併用療法で明らかな相加効果が示されている。ＥＴＶ療法だけでは、循環ＨＢｓＡｇや肝ウイルスＲＮＡに対する効果は示されない。ＨＢｓＡｂ又はＨＢＶ  ＲＮＡにより測定したＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の抗ウイルス活性は、ＥＴＶの共投与に影響を受けない。「ＢＬＯＤ」は「検出限界以下」を意味する。
【図１５Ｂ】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体２（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）はエンテカビルの抗ウイルス活性を増強することを示す。ＨＢＶマウス流体力学的注射（ＨＤＩ）モデルでは、１日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２を単回、マウスに皮下投与した後、５００ｎｇ／ｋｇのエンテカビル（ＥＴＶ）を１４日間毎日経口投与した。循環ウイルス負荷（ＨＢＶ  ＤＮＡ）をｑＰＣＲにより測定した（図１５Ａ）。血漿ＨＢｓＡｇレベルをＥＬＩＳＡにより測定した（図１５Ｂ）。肝臓ＨＢＶ  ｍＲＮＡ及びｐｇＲＮＡレベルをｑＰＣＲにより測定した（図１５Ｃ）。結果から、併用療法で明らかな相加効果が示されている。ＥＴＶ療法だけでは、循環ＨＢｓＡｇや肝ウイルスＲＮＡに対する効果は示されない。ＨＢｓＡｂ又はＨＢＶ  ＲＮＡにより測定したＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の抗ウイルス活性は、ＥＴＶの共投与に影響を受けない。「ＢＬＯＤ」は「検出限界以下」を意味する。
【図１５Ｃ】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体２（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）はエンテカビルの抗ウイルス活性を増強することを示す。ＨＢＶマウス流体力学的注射（ＨＤＩ）モデルでは、１日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２を単回、マウスに皮下投与した後、５００ｎｇ／ｋｇのエンテカビル（ＥＴＶ）を１４日間毎日経口投与した。循環ウイルス負荷（ＨＢＶ  ＤＮＡ）をｑＰＣＲにより測定した（図１５Ａ）。血漿ＨＢｓＡｇレベルをＥＬＩＳＡにより測定した（図１５Ｂ）。肝臓ＨＢＶ  ｍＲＮＡ及びｐｇＲＮＡレベルをｑＰＣＲにより測定した（図１５Ｃ）。結果から、併用療法で明らかな相加効果が示されている。ＥＴＶ療法だけでは、循環ＨＢｓＡｇや肝ウイルスＲＮＡに対する効果は示されない。ＨＢｓＡｂ又はＨＢＶ  ＲＮＡにより測定したＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の抗ウイルス活性は、ＥＴＶの共投与に影響を受けない。「ＢＬＯＤ」は「検出限界以下」を意味する。
【図１６Ａ】Ｓ抗原（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）又はＸ抗原（ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸとする）を標的とするＧａｌＮａｃ共役オリゴヌクレオチドのＨＢｓＡｇ抑制活性の比較を示す。結果から、ＨＢＶＳ‐２１９Ｐ２が、ＧａｌＢＣ‐ＨＢＶＸ又は両ＲＮＡｉ薬の等モル併用よりも長い期間、ＨＢｓＡｇを抑制することが分かる。図１６Ａは、ＨＢＶゲノムにおけるＲＮＡｉ標的部位の位置が、ＨＢＶ発現マウスにおけるＨＢｓＡｇ回復動態に影響を与えることを示している。図１６Ｂは、投与２週間後（左パネル）及び投与９週間後（右パネル）の血漿ＨＢｓＡｇレベルを示し、このことはＨＢＶＸコード領域単独、又はＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２との組み合わせを標的にすると、活性の持続時間が短くなることを示している。個々の動物のデータを示した。いくつかのデータポイント（最も灰色の円）が検出限界を下回った。
【図１６Ｂ】Ｓ抗原（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）又はＸ抗原（ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸとする）を標的とするＧａｌＮａｃ共役オリゴヌクレオチドのＨＢｓＡｇ抑制活性の比較を示す。結果から、ＨＢＶＳ‐２１９Ｐ２が、ＧａｌＢＣ‐ＨＢＶＸ又は両ＲＮＡｉ薬の等モル併用よりも長い期間、ＨＢｓＡｇを抑制することが分かる。図１６Ａは、ＨＢＶゲノムにおけるＲＮＡｉ標的部位の位置が、ＨＢＶ発現マウスにおけるＨＢｓＡｇ回復動態に影響を与えることを示している。図１６Ｂは、投与２週間後（左パネル）及び投与９週間後（右パネル）の血漿ＨＢｓＡｇレベルを示し、このことはＨＢＶＸコード領域単独、又はＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２との組み合わせを標的にすると、活性の持続時間が短くなることを示している。個々の動物のデータを示した。いくつかのデータポイント（最も灰色の円）が検出限界を下回った。
【図１７Ａ】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ、又はこれらの１：１併用で治療したＨＢＶ発現マウスにおけるＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の細胞内位置を示す。図１７Ａは、投与後１、２、６、９、及び１３週目に得られ、ＨＢｃＡｇに対して染色した肝臓切片における代表的な肝細胞を示す。図１７Ｂは、各動物における核染色したＨＢｃＡｇ陽性細胞の割合を示す（ｎ＝３／群、一匹当たり５０細胞、投与２週間後）。Ｘ及びＳオープンリーディングフレーム内を標的にして代替配列を設計及び試験した。図１７Ｃは、Ｓ抗原及びＸ抗原のいずれかを標的とする代替ＲＮＡｉオリゴの投与２、３及び９週後に得られた肝細胞におけるＨＢｃＡｇの細胞内分布を示す。
【図１７Ｂ】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ、又はこれらの１：１併用で治療したＨＢＶ発現マウスにおけるＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の細胞内位置を示す。図１７Ａは、投与後１、２、６、９、及び１３週目に得られ、ＨＢｃＡｇに対して染色した肝臓切片における代表的な肝細胞を示す。図１７Ｂは、各動物における核染色したＨＢｃＡｇ陽性細胞の割合を示す（ｎ＝３／群、一匹当たり５０細胞、投与２週間後）。Ｘ及びＳオープンリーディングフレーム内を標的にして代替配列を設計及び試験した。図１７Ｃは、Ｓ抗原及びＸ抗原のいずれかを標的とする代替ＲＮＡｉオリゴの投与２、３及び９週後に得られた肝細胞におけるＨＢｃＡｇの細胞内分布を示す。
【図１７Ｃ】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ、又はこれらの１：１併用で治療したＨＢＶ発現マウスにおけるＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の細胞内位置を示す。図１７Ａは、投与後１、２、６、９、及び１３週目に得られ、ＨＢｃＡｇに対して染色した肝臓切片における代表的な肝細胞を示す。図１７Ｂは、各動物における核染色したＨＢｃＡｇ陽性細胞の割合を示す（ｎ＝３／群、一匹当たり５０細胞、投与２週間後）。Ｘ及びＳオープンリーディングフレーム内を標的にして代替配列を設計及び試験した。図１７Ｃは、Ｓ抗原及びＸ抗原のいずれかを標的とする代替ＲＮＡｉオリゴの投与２、３及び９週後に得られた肝細胞におけるＨＢｃＡｇの細胞内分布を示す。
【図１８】健康な患者におけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９の安全性及び忍容性、並びにＨＢＶ患者におけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９の治療効果を評価するように設計した研究のコホート情報別の用量を示す。
【図１９Ａ−１】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ａ−２】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ａ−３】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ａ−４】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ｂ−１】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ｂ−２】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ｂ−３】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【図１９Ｂ−４】ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造を示す。（図１９Ａ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の化学構造。（図１９Ｂ）ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の化学構造。
【発明を実施するための形態】
【００３１】
いくつかの態様によれば、本開示は、ＨＢＶ感染を治療するための細胞、特に肝臓の細胞（例えば、肝細胞）においてＨＢｓＡｇ発現を低減するのに有効である強力なオリゴヌクレオチドを提供する。特定の実施形態では、本明細書で提供されるＨＢｓＡｇを標的とするオリゴヌクレオチドは、標的組織（例えば、肝細胞）の選択された細胞に送達し、これらの組織におけるＨＢＶ感染を治療するように設計する。従って、関連する態様では、本開示は、細胞（例えば、肝臓の細胞）においてＨＢＶ表面抗原遺伝子発現を選択的に低減する工程を含むＨＢＶ感染治療方法を提供する。
【００３２】
定義された用語の説明を含む本開示の更なる態様を以下に提供する。
Ｉ．定義
【００３３】
およそ：本明細書で使用しているように、対象となる１つ又は複数の値に適用される用語「およそ」又は「約」は、言及された参照値と同様の値を指す。特定の実施形態では、特に明記しない限り、又は文脈から明白でない限り（そのような数値が、可能な値の１００％を超える場合を除く）、用語「およそ」又は「約」は、２５％、２０％、１９％、１８％、１７％、１６％、１５％、１４％、１３％、１２％、１１％、１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％、又は記述した参照値のいずれかの方向（「を超える」又は「未満」）の範囲内にある値の範囲を意味する。
【００３４】
投与する：本明細書で使用しているように、用語「投与する」又は「投与」は、薬理学的に有用な（例えば、被験体の状態を治療する）様式で物質（例えば、オリゴヌクレオチド）を被験体に提供することを意味する。
【００３５】
アシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰＲ）：本明細書で使用しているように、用語「アシアロ糖タンパク質受容体」又は「ＡＳＧＰＲ」は、大きい方の４８ｋＤａ（ＡＳＧＰＲ‐１）及び小さい方の４０ｋＤａ（ＡＳＧＰＲ‐２）のサブユニットにより形成される二部から成るＣ型レクチンを指す。ＡＳＧＰＲは主に肝細胞の洞様毛細血管表面に発現し、末端ガラクトース又はＮ‐アセチルガラクトサミン残基（アシアロ糖タンパク質）を含む循環糖タンパク質の結合、内在化、及びその後のクリアランスに大きな役割を担う。
【００３６】
相補的：本明細書で使用しているように、用語「相補的」は、２つのヌクレオチド又は２つのヌクレオチド配列が互いに塩基対を形成することを可能にする、２つのヌクレオチド間（例えば、２つの対向する核酸上、又は単一の核酸鎖の対向する領域上）又は２つのヌクレオチド配列間の構造的関係を意味する。例えば、対向する核酸のピリミジンヌクレオチドに相補的である１つの核酸のプリンヌクレオチドは、互いに水素結合を形成することによって共に塩基対を形成し得る。いくつかの実施形態では、相補的ヌクレオチドはワトソン・クリック様式で、又は安定した二重鎖の形成を可能にする任意の他の様式で塩基対になり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、２つの核酸は、相補性の領域を形成するように互いに相補的である複数のヌクレオチドの領域を有してもよい。
【００３７】
デオキシリボヌクレオチド：本明細書で使用しているように、用語「デオキシリボヌクレオチド」は、リボヌクレオチドと比較して、そのペントース糖の２’位でヒドロキシルの代わりに水素を有するヌクレオチドを指す。修飾デオキシリボヌクレオチドは、糖、リン酸基もしくは塩基中での修飾もしくは置換、又は糖、リン酸基もしくは塩基の修飾もしくは置換を含む、２’位置以外の原子の１つ以上の修飾又は置換を有するデオキシリボヌクレオチドである。
【００３８】
二本鎖オリゴヌクレオチド：本明細書で使用しているように、用語「二本鎖オリゴヌクレオチド」は、実質的に二重鎖形態であるオリゴヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域（単数又は複数）の相補的塩基対は、共有結合的には分離している核酸鎖のヌクレオチドの逆平行配列間で形成される。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域（単数又は複数）の相補的塩基対は、共有結合した核酸鎖のヌクレオチドの逆平行配列間で形成される。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドの二重鎖領域（単数又は複数）の相補的塩基対は、（例えばヘアピンを介して）折り畳まれた単一核酸鎖から形成され、互いに塩基対になるヌクレオチドの相補的逆平行配列を提供する。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドは、互いに完全に二重鎖となっている２つの共有結合的には分離している核酸鎖を含む。しかし、いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドには、部分的に二重鎖になった、例えば一端又は両端にオーバーハングを有する、共有結合的には分離している２つの核酸鎖が含まれる。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドには、部分的に相補的であるヌクレオチドの逆平行配列が含まれ、従って、１つ以上のミスマッチを有してもよく、これには内部ミスマッチ又は末端ミスマッチが含まれてもよい。
【００３９】
二重鎖：本明細書で使用しているように、核酸（例えば、オリゴヌクレオチド）に関する用語「二重鎖」は、ヌクレオチドの２つの逆平行配列の相補的塩基対合を経て形成される構造を指す。
【００４０】
賦形剤：本明細書で使用しているように、用語「賦形剤」は組成物に含まれ得る非治療剤を指し、例えば所望の一貫性又は安定化効果を提供するか、又はそれらに寄与する。
【００４１】
肝細胞：本明細書で使用しているように、用語「肝細胞（単数又は複数）」は、肝臓の実質組織の細胞を指す。これらの細胞は、肝臓の質量のおよそ７０〜８５％を占め、血清アルブミン、フィブリノーゲン、及び凝固因子のプロトロンビン群（因子３及び４を除く）を産生する。肝細胞系譜細胞のマーカーには、トランスチレチン（Ｔｔｒ）、グルタミン合成酵素（Ｇｌｕｌ）、肝細胞核因子１ａ（Ｈｎｆ１ａ）、及び肝細胞核因子４ａ（Ｈｎｆ４ａ）が挙げられるが、これらに限定されるものではない。成熟肝細胞のマーカーには、チトクロームＰ４５０（Ｃｙｐ３ａ１１）、フマリルアセト酢酸ヒドラーゼ（Ｆａｈ）、グルコース６‐リン酸（Ｇ６ｐ）、アルブミン（Ａｌｂ）、及びＯＣ２‐２Ｆ８が挙げられるが、これらに限定されるものではない。例えば、Ｈｕｃｈら、（２０１３年）、Ｎａｔｕｒｅ、４９４（７４３６）：２４７〜２５０を参照されたい。肝細胞マーカーに関するその内容は、参照により本明細書に援用される。
【００４２】
Ｂ型肝炎ウイルス：本明細書で使用しているように、用語「Ｂ型肝炎ウイルス」又は「ＨＢＶ」は、ヘパドナウイルス科（Ｈｅｐａｄｎａｖｉｒｉｄａｅ）ファミリーに属し、オルソヘパドナウイルス（Ｏｒｔｈｏｈｅｐａｄｎａｖｉｒｕｓ）属のタイプ種に分類される小型ＤＮＡウイルスを指す。ＨＢＶウイルス粒子（ウイルス粒子）は、外部脂質外被、及びタンパク質で構成された正二十面体のヌクレオカプシドコアを含む。ヌクレオカプシドは一般に、ウイルスＤＮＡ、及びレトロウイルスと同様の逆転写酵素活性を有するＤＮＡポリメラーゼを封入する。ＨＢＶ外被には、感受性細胞のウイルス結合及び感受性細胞への侵入に関与するタンパク質が埋め込まれている。肝臓を攻撃するＨＢＶは、配列に基づいた少なくとも１０種の遺伝子型（Ａ〜Ｊ）に従って分類する。概して、ゲノムがコードする４つの遺伝子が存在し、これらの遺伝子はＣ、Ｐ、Ｓ、及びＸと称する。コアタンパク質は遺伝子Ｃ（ＨＢｃＡｇ）がコードし、その開始コドンの前に上流インフレームＡＵＧ開始コドンがあり、このコドンからプレコアタンパク質が生成する。ＨＢｅＡｇはプレコアタンパク質のタンパク質分解処理により生成する。ＤＮＡポリメラーゼは遺伝子Ｐがコードする。遺伝子Ｓは表面抗原（ＨＢｓＡｇ）をコードする。ＨＢｓＡｇ遺伝子は１つの長いオープンリーディングフレームであるが、遺伝子を３つの区域、ｐｒｅ‐Ｓ１、ｐｒｅ‐Ｓ２、及びＳに分割する３つのフレーム内「開始」（ＡＴＧ）コドンが含まれる。複数の開始コドンがあるため、大、中、小（ｐｒｅ‐Ｓ１＋ｐｒｅ‐Ｓ２＋Ｓ、ｐｒｅ‐Ｓ２＋Ｓ、又はＳ）と称する３つの異なるサイズのポリペプチドが生成する。これらの比率は１：１：４としてもよい（Ｈｅｅｒｍａｎｎら、１９８４年）。
【００４３】
Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）タンパク質は、いくつかのカテゴリと機能に編成できる。ポリメラーゼは逆転写酵素（ＲＴ）として機能してプレゲノムＲＮＡ（ｐｇＲＮＡ）からウイルスＤＮＡを産生し、またＤＮＡ依存性ポリメラーゼとして機能して共有結合的に閉じた環状ＤＮＡ（ｃｃｃＤＮＡ）をウイルスＤＮＡから産生する。ポリメラーゼは、マイナス鎖の５’末端に共有結合する。コアタンパク質はウイルスのカプシド及び分泌Ｅ抗原を産生する。表面抗原は肝細胞内在化リガンドであり、またアウイルス（ａｖｉｒａｌ）の球状及び繊維状粒子の主要な成分でもある。アウイルス粒子はデーン粒子（感染性ウイルス粒子）の＞１０００倍生成され、免疫デコイとして作用し得る。
【００４４】
Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原：本明細書で使用しているように、用語「Ｂ型肝炎ウイルス表面抗原」又は「ＨＢｓＡｇ」は、ＨＢＶゲノムの遺伝子Ｓ（例えば、ＯＲＦ  Ｓ）がコードするＳドメインタンパク質を指す。Ｂ型肝炎ウイルス粒子は、遺伝子Ｓがコードする３つのタンパク質により覆われたコア粒子中でウイルス核酸を運ぶ。これら３つのタンパク質は大型表面タンパク質、中程度表面タンパク質、及び主要表面タンパク質である。これらのタンパク質の中で、主要表面タンパク質は一般に約２２６アミノ酸であり、Ｓドメインのみを含む。
【００４５】
感染：本明細書で使用しているように、用語「感染」は、被験体におけるウイルスなどの微生物の病原性侵入及び／又は拡大を指す。感染は溶原性である場合もあり、例えば、ウイルスＤＮＡが細胞内で潜伏している可能性もある。あるいは、感染は溶解性である場合もあり、例えば、ウイルスは活発に増殖し、感染した細胞の破壊を引き起こす。感染は、臨床的に明らかな症状を引き起こす場合と引き起こさない場合がある。感染は局所化したままであるか、又は、例えば被験体の血液又はリンパ系を介して広がる可能性がある。例えば、ＨＢＶ感染した個体は、ウイルス負荷、表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ｅ‐抗原（ＨＢｅＡｇ）の１つ以上の検出、及び当技術分野で公知のＨＢＶ感染を検出するための他の種々のアッセイにより同定できる。ＨＢＶ感染を検出するためのアッセイには、ＨＢｓＡｇ及び／又はＨＢｅＡｇの有無について血清又は血液サンプルを試験すること、更に任意で、ＨＢＶ抗原が検出不可能なレベルにある可能性もある期間を補償するために１種以上のウイルス抗体（例えば、ＩｇＭ及び／又はＩｇＧ）の有無をスクリーニングすることが含まれる。
【００４６】
肝臓炎：本明細書で使用しているように、用語「肝臓炎」又は「肝炎」は、肝毒性物質への暴露に起因するような、特に傷害又は感染の結果としての肝臓の腫脹、機能不全、及び／又は痛みを伴う身体状態を指す。症状には、黄疸（皮膚や眼の黄変）、疲労、脱力感、吐き気、嘔吐、食欲減退、及び体重減少が挙げられる。肝臓炎は、治療せずに放置すると、線維症、肝硬変、肝不全、又は肝癌に進行する可能性がある。
【００４７】
肝線維症：本明細書で使用しているように、用語「肝線維症」又は「肝臓の線維症」は細胞外基質タンパク質の肝臓における過剰な蓄積を指し、当該細胞外基質タンパク質にはコラーゲン（Ｉ、ＩＩＩ、及びＩＶ）、フィブロネクチン、ウンジュリン、エラスチン、ラミニン、ヒアルロナン、及びプロテオグリカンが挙げられ、これらは炎症及び肝細胞死から生じるものである。肝線維症は、治療せずに放置すると、肝硬変、肝不全、肝癌に進行することがある。
【００４８】
ループ：本明細書で使用しているように、用語「ループ」は、互いに十分に相補的である核酸の２つの逆平行領域により両側が挟まれた核酸（例えば、オリゴヌクレオチド）の不対領域を指し、これにより適切なハイブリダイゼーション条件下で（例えば、リン酸緩衝液中、細胞中）、不対領域の両側を挟む２つの逆平行領域がハイブリダイズし、二重鎖（「ステム」と称する）を形成する。
【００４９】
修飾ヌクレオチド間結合：本明細書で使用しているように、用語「修飾ヌクレオチド間結合」という用語は、ホスホジエステル結合を含む参照ヌクレオチド間結合と比較して１つ以上の化学修飾を有するヌクレオチド間結合を指す。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは天然に存在しない結合である。典型的には、修飾ヌクレオチド間結合は、修飾ヌクレオチド間結合が存在する核酸に１つ以上の望ましい特性を与える。例えば、修飾ヌクレオチドは、熱安定性、分解耐性、ヌクレアーゼ耐性、溶解性、生物学的利用能、生物活性、免疫原性低下等を改善し得る。
【００５０】
修飾ヌクレオチド：本明細書で使用しているように、用語「修飾ヌクレオチド」は、アデニンリボヌクレオチド、グアニンリボヌクレオチド、シトシンリボヌクレオチド、ウラシルリボヌクレオチド、アデニンデオキシリボヌクレオチド、グアニンデオキシリボヌクレオチド、シトシンデオキシリボヌクレオチド及びチミジンデオキシリボヌクレオチドから選択される、対応の参照ヌクレオチドと比較して１つ以上の化学修飾を有するヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、天然には存在しないヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドはその糖、核酸塩基及び／又はリン酸基中の１つ以上の化学修飾を有する。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは対応する参照ヌクレオチドにコンジュゲートされた１つ以上の化学部分を有する。典型的には、修飾ヌクレオチドは、修飾ヌクレオチドが存在する核酸に１つ以上の望ましい特性を与える。例えば、修飾ヌクレオチドは、熱安定性、分解耐性、ヌクレアーゼ耐性、溶解性、生物学的利用能、生物活性、免疫原性低下等を改善し得る。
【００５１】
ニックドテトラループ構造：「ニックドテトラループ構造」は、離れたセンス（パッセンジャー）鎖及びアンチセンス（ガイド）鎖があることを特徴とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの構造である。ここではセンス鎖がアンチセンス鎖と相補的な領域を有し、鎖の少なくとも一方、一般的にはセンス鎖は、少なくとも１つの鎖内に形成された隣接するステム領域を安定させるように構成されたテトラループを有する。
【００５２】
オリゴヌクレオチド：本明細書で使用しているように、用語「オリゴヌクレオチド」は、例えば、１００ヌクレオチド長未満の短い核酸を指す。オリゴヌクレオチドは一本鎖でも二本鎖でもよい。オリゴヌクレオチドは二重鎖領域があってもなくてもよい。一連の非限定的な例として、オリゴヌクレオチドは、小型干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、ダイサー基質干渉ＲＮＡ（ｄｓｉＲＮＡ）、アンチセンスオリゴヌクレオチド、短鎖ｓｉＲＮＡ、又は一本鎖ｓｉＲＮＡであってもよいが、これらに限定されるものではない。いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドはＲＮＡｉオリゴヌクレオチドである。
【００５３】
オーバーハング：本明細書で使用しているように、用語「オーバーハング」は、一方の鎖又は領域が二重鎖を形成する相補鎖の末端を超えて延びる一方の鎖又は領域から生じる末端非塩基対ヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態では、オーバーハングは、二本鎖オリゴヌクレオチドの５’末端又は３’末端の二重鎖領域から延びる１つ以上の不対ヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、オーバーハングは、二本鎖オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖又はセンス鎖上の３’又は５’オーバーハングである。
【００５４】
リン酸類似体：本明細書で使用しているように、用語「リン酸類似体」は、リン酸基の静電特性及び／又は立体特性を模倣する化学部分を指す。いくつかの実施形態では、リン酸類似体は、酵素的除去を受けることが多い５’‐リン酸の代わりにオリゴヌクレオチドの５’末端ヌクレオチドに位置する。いくつかの実施形態では、５’リン酸類似体は、ホスファターゼ耐性結合を含む。リン酸類似体の例には、５’メチレンホスホネート（５’‐ＭＰ）及び５’‐（Ｅ）‐ビニルホスホネート（５’‐ＶＰ）などの５’ホスホン酸が挙げられる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、５’末端ヌクレオチドの糖の４’炭素位置にリン酸類似体（「４’‐リン酸類似体」と称する）を有する。４’‐リン酸類似体の例はオキシメチルホスホネートであり、ここではオキシメチル基の酸素原子は、糖部分（例えば、その４’‐炭素で）又はその類似体に結合する。例えば、２０１６年９月２日出願の米国仮出願第６２／３８３，２０７号明細書、及び２０１６年９月１２日出願の米国仮出願第６２／３９３，４０１号明細書を参照されたい。リン酸類似体に関するこれらのそれぞれの内容は参照により本明細書に援用される。オリゴヌクレオチドの５’末端用に他の修飾が開発されている（例えば、国際公開第２０１１／１３３８７１号明細書、米国特許第８，９２７，５１３号明細書、及びＰｒａｋａｓｈら、（２０１５年）、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、４３（６）：２９９３〜３０１１を参照されたい。リン酸類似体に関するこれらのそれぞれの内容は参照により本明細書に援用される）。
【００５５】
発現低下：本明細書で使用しているように、用語、遺伝子の「発現低下」は、適切な参照細胞又は被験体と比較して、遺伝子がコードするＲＮＡ転写産物もしくはタンパク質の量の減少、及び／又は細胞もしくは対象における遺伝子の活性の量の減少を指す。例えば、細胞を二本鎖オリゴヌクレオチド（例えば、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ配列に相補的であるアンチセンス鎖を有するもの）で処理すると、二本鎖オリゴヌクレオチドで処理していない細胞と比較して、（例えば、ＨＢＶゲノムのＳ遺伝子にコードされる）ＲＮＡ転写産物、タンパク質及び／又は酵素活性の量が減少する場合がある。同様に、本明細書で使用するような「発現低下」は、遺伝子（例えば、ＨＢＶゲノムのＳ遺伝子）の発現低下をもたらす作用を指す。
【００５６】
相補性の領域：本明細書で使用しているように、用語「相補性の領域」は、例えば、リン酸緩衝液中、細胞中などの適切なハイブリダイゼーション条件下でのヌクレオチドの２つの配列間でハイブリダイゼーションを可能にするヌクレオチドの逆平行配列に十分相補的である核酸（例えば、二本鎖オリゴヌクレオチド）のヌクレオチド配列を指す。
【００５７】
リボヌクレオチド：本明細書で使用しているように、用語「リボヌクレオチド」は、その２’位にヒドロキシル基を含むそのペントース糖としてリボースを有するヌクレオチドを指す。修飾リボヌクレオチドは、リボース、リン酸基又は塩基の修飾又は置換などの、２’位以外の原子の１つ以上の修飾又は置換を有するリボヌクレオチドである。
【００５８】
ＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：本明細書で使用しているように、用語「ＲＮＡｉオリゴヌクレオチド」は以下のいずれかを指す：（ａ）センス鎖（パッセンジャー）及びアンチセンス鎖（ガイド）を有する二本鎖オリゴヌクレオチドであり、この二本鎖オリゴヌクレオチドでは、アンチセンス鎖もしくはアンチセンス鎖の一部が標的ｍＲＮＡの切断でアルゴノート２（Ａｇｏ２）エンドヌクレアーゼに使用される；又は（ｂ）単一アンチセンス鎖を有する一本鎖オリゴヌクレオチドであり、この一本鎖オリゴヌクレオチドでは、アンチセンス鎖（もしくはそのアンチセンス鎖の一部）が標的ｍＲＮＡの切断でＡｇｏ２エンドヌクレアーゼに使用される。
【００５９】
鎖：本明細書で使用しているように、用語「鎖」は、ヌクレオチド間結合（例えば、ホスホジエステル結合、ホスホロチオエート結合）を介して結合された複数のヌクレオチドの単一の連続配列を指す。いくつかの実施形態では、鎖は、２つの自由末端、例えば、５’末端及び３’末端を有する。
【００６０】
被験体：本明細書で使用しているように、用語「被験体」は、マウス、ウサギ、及びヒトを含む任意の哺乳動物を指す。一実施形態では、被験体は、ヒト又は非ヒト霊長類である。用語「個体」又は「患者」は「被験体」と言い換えて使用してもよい。
【００６１】
合成：本明細書で使用しているように、用語「合成」は、人工的に合成した（例えば、機械（例えば、固体状核酸合成装置）を使用）核酸もしくは他の分子、又は、通常分子を生成する天然源（例えば、細胞又は生物）に由来しない核酸もしくは他の分子を指す。
【００６２】
標的化リガンド：本明細書で使用しているように、用語「標的化リガンド」は、対象の組織又は細胞の同族分子（例えば、受容体）に選択的に結合し、対象の組織又は細胞に他の物質を標的化する目的で別の物質とコンジュゲートする分子（例えば、炭水化物、アミノ糖、コレステロール、ポリペプチド又は脂質）を指す。例えば、いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドを対象の特定の組織又は細胞に標的化する目的で、標的化リガンドをオリゴヌクレオチドにコンジュゲートしてもよい。いくつかの実施形態では、標的化リガンドは細胞表面受容体に選択的に結合する。従って、いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドにコンジュゲートしたときの標的化リガンドは、細胞の表面に発現する受容体への選択的結合、並びにオリゴヌクレオチド、標的化リガンド及び受容体を含む複合体の細胞によるエンドソーム内在化を通じて、オリゴヌクレオチドの特定の細胞への送達を促進する。いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、細胞内在化後、又は細胞内在化の間に切断されるリンカーを介してオリゴヌクレオチドにコンジュゲートされ、それにより、オリゴヌクレオチドが細胞内の標的化リガンドから放出される。
【００６３】
テトラループ：本明細書で使用しているように、用語「テトラループ」は、ヌクレオチドの隣接配列のハイブリダイゼーションにより形成した隣接二重鎖の安定性を向上するループを指す。安定性の向上は、隣接ステム二重鎖の融解温度（Ｔm）の上昇として検出可能であり、この温度は、ランダムに選択したヌクレオチド配列から成る同等の長さを有するループのセットから平均して予想される隣接ステム二重鎖のＴmより高い。例えば、少なくとも２塩基対長の二重鎖を含むヘアピンに添加した１０ｍＭのＮａＨＰＯ4中で、テトラループは少なくとも５０℃、少なくとも５５℃、少なくとも５６℃、少なくとも５８℃、少なくとも６０℃、少なくとも６５℃、又は少なくとも７５℃の融解温度をもたらす。いくつかの実施形態では、テトラループは、相互作用を積み重ねることにより隣接するステム二重鎖の塩基対を安定化させることが可能になる。また、テトラループ内のヌクレオチド間の相互作用には、非ワトソン‐クリックの塩基対形成、積み重ね相互作用、水素結合、及び接触相互作用が含まれるが、これらに限定されるものではない（Ｃｈｅｏｎｇら、Ｎａｔｕｒｅ、１９９０年８月１６日；３４６（６２８５）：６８０〜２；Ｈｅｕｓ及びＰａｒｄｉ、Ｓｃｉｅｎｃｅ、１９９１年７月１２日；２５３（５０１６）：１９１〜４）。いくつかの実施形態では、テトラループは、４、５個のヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、テトラループは３、４、５、又は６つのヌクレオチドを含むか、又はそれらから成り、これらは修飾されてもしなくてもよい（例えば、標的化部分にコンジュゲートされてもされなくてもよい）。一実施形態では、テトラループは４つのヌクレオチドから成る。テトラループではどのようなヌクレオチドを使用してもよく、そのようなヌクレオチドの標準ＩＵＰＡＣ‐ＩＵＢ記号は、Ｃｏｒｎｉｓｈ‐Ｂｏｗｄｅｎ（１９８５年）Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１３：３０２１〜３０３０に記載の通りに使用できる。例えば、文字「Ｎ」は、その位置に任意の塩基が存在する可能性を意味し、文字「Ｒ」は、その位置にＡ（アデニン）又はＧ（グアニン）が存在することを示すために使用でき、「Ｂ」は、その位置にＣ（シトシン）、Ｇ（グアニン）、又はＴ（チミン）が存在することを示すために使用できる。テトラループの例には、テトラループのＵＮＣＧファミリー（例えばＵＵＣＧ）、テトラループのＧＮＲＡファミリー（例えばＧＡＡＡ）、及びＣＵＵＧテトラループ（Ｗｏｅｓｅら、Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ、１９９０年１１月；８７（２１）：８４６７〜７１；Ａｎｔａｏら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１９９１年１１月１１日；１９（２１）：５９０１〜５）が挙げられる。ＤＮＡテトラループの例には、テトラループのｄ（ＧＮＮＡ）ファミリー（例えばｄ（ＧＴＴＡ））、テトラループのｄ（ＧＮＲＡ）ファミリー、テトラループのｄ（ＧＮＡＢ）ファミリー、テトラループのｄ（ＣＮＮＧ）ファミリー、及びテトラループのｄ（ＴＮＣＧ）ファミリー（例えばｄ（ＴＴＣＧ））が挙げられる。例えば、Ｎａｋａｎｏら、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、４１（４８）、１４２８１〜１４２９２、２００２年、ＳＨＩＮＪＩら、Ｎｉｐ���ｏｎ  Ｋａｇａｋｋａｉ  Ｋｏｅｎ  Ｙｏｋｏｓｈｕ、第７８巻；第２号；７３１頁（２０００年）を参照されたい。これらは関連する開示として参照により本明細書に援用される。いくつかの実施形態では、テトラループはニックドテトラループ構造内に含まれる。
【００６４】
治療：本明細書で使用しているように、用語「治療する」は、例えば被験体への治療剤（例えば、オリゴヌクレオチド）の投与を経て当該薬剤を必要とする被験体をケアする行為を指す。その目的は現時点での状態（例えば、現時点でのＨＢＶ感染）に関する被験体の健康及び／もしくは福祉を改善することであり、又は状態の発生の可能性を防止もしくは低減する（例えば、肝線維症、肝炎、肝臓癌、又はＨＢＶ感染に関連する他の状態の防止）ことである。いくつかの実施形態では、治療には、被験体が経験する状態（例えば、ＨＢＶ感染又は関連状態）の少なくとも１つの徴候、症状又は寄与因子の頻度又は重症度を低減する工程が含まれる。ＨＢＶ感染中、被験体は皮膚や眼の黄変（黄疸）、暗色尿、極度の疲労、吐き気、嘔吐、腹痛などの症状を示す場合がある。従って、いくつかの実施形態では、本明細書で提供される治療は、１つ以上のそのような症状の頻度又は重症度を低減できる可能性がある。しかし、ＨＢＶ感染は、肝硬変、肝線維症、肝炎、肝癌などの１つ以上の肝症状に発展する可能性がある。従って、いくつかの実施形態では、本明細書で提供する治療は、そのような状態の１つ以上の頻度もしくは重症度を低減、又は予防もしくは軽減する可能性がある。
ＩＩ．オリゴヌクレオチド系阻害剤
ｉ．ＨＢＶ表面抗原標的化
【００６５】
いくつかの実施形態では、ＨＢＶ表面抗原発現のオリゴヌクレオチド系阻害剤が本明細書で提供され、これを使用し、治療効果が達成できる。ＨＢＶ表面抗原ｍＲＮＡの検討及び様々なオリゴヌクレオチド試験を経て、ＨＢＶ感染を治療するためのＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）の発現を低減する強力なオリゴヌクレオチドが開発された。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、全ての既知の遺伝子型に渡って既知のＨＢＶゲノムの＞９５％を網羅するＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ配列を標的とするように設計している。いくつかの実施形態では、このようなオリゴヌクレオチドでは、肝臓中のＨＢＶプレゲノムＲＮＡ（ｐｇＲＮＡ）及びＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡが９０％を超えて低減する。いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ発現の低下は、単回投与又は治療計画後に長期間に渡って持続する。
【００６６】
従って、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、細胞内の転写産物を標的とし、それらの発現を阻害する目的で、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡに相補的な領域を有するように設計している。相補性の領域は概して、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現を阻害する目的でオリゴヌクレオチド（又はその鎖）をＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡにアニーリングするのに好適な長さ及び塩基含有量を持つ領域である。いくつかの実施形態では、相補性の領域は少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、又は少なくとも２０ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは１２〜３０（例えば、１２〜３０、１２〜２２、１５〜２５、１７〜２１、１８〜２７、１９〜２７、又は１５〜３０）ヌクレオチド長の範囲の、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡに相補的な領域を有する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９又は３０ヌクレオチド長である、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡに相補的な領域を有する。
【００６７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドはＨＢｓＡｇをコードするｍＲＮＡ配列を標的とするように設計している。例えば、いくつかの実施形態では、ＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡ（配列番号１）に規定される配列に相補的な領域を持つアンチセンス鎖を有するオリゴヌクレオチドが提供される。この配列中、Ｎは任意のヌクレオチド（Ａ、Ｇ、Ｔ、又はＣ）を指す。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは更に、アンチセンス鎖と共に二本鎖領域を形成するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、ＵＵＮＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮ（配列番号２）に規定される配列に相補的な領域を有する。いくつかの実施形態では、センス鎖は、（５’→３’方向に示す）：ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮＵＵＧＵＣ（配列番号３）に規定される配列に相補的な領域を含む。
【００６８】
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＮＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号４）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＣＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、ＵＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＵＧＵＣＧＧ（配列番号５．１）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。いくつかの実施形態では、センス鎖は、ＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡ（配列番号６）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。いくつかの実施形態では、センス鎖は、ＧＡＣＡＡＮＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号７）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。いくつかの実施形態では、センス鎖は、ＧＡＣＡＡＡＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。いくつかの実施形態では、センス鎖は、ＧＡＣＡＡＧＡＡＵＣＣＵＣＡＣＡＡＵＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号８．１）に規定される配列を含むか、又はそれから成る。
【００６９】
いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドは、アンチセンス鎖と共に二重鎖領域を形成するセンス鎖を含み、センス鎖は配列番号６〜８．１のいずれか１つに規定される配列を含み、アンチセンス鎖は配列番号４〜５．１のいずれか１つに規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は２’‐フルオロ及び２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は、Ｎ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分にコンジュゲートされる。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は２’‐フルオロ及び２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素はリン酸類似体を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖及びセンス鎖のそれぞれは、２’‐フルオロ及び２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド、並びに少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含み、アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素はリン酸類似体を含み、センス鎖はＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分にコンジュゲートされる。
【００７０】
いくつかの実施形態では、配列番号７〜８．１のいずれか１つに規定される配列を含むセンス鎖は３、８〜１０、１２、１３、及び１７位に２’‐フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は１、２、４〜７、１１、１４〜１６、１８〜２６、及び３１〜３６位に２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は１つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖は１位と２位のヌクレオチド間でホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、センス鎖はＮ‐アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分にコンジュゲートされる。
【００７１】
いくつかの実施形態では、配列番号４〜５．１のいずれか１つに規定される配列を含むアンチセンス鎖は、２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６、及び１９位に２’‐フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８、及び２０〜２２位に２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は３つのホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は１位と２位のヌクレオチド間で、２位と３位のヌクレオチド間で、３位と４位のヌクレオチド間で、２０位と２１位のヌクレオチド間で、２１位と２２位のヌクレオチド間でホスホロチオエートヌクレオチド間結合を含む。いくつかの態様では、アンチセンス鎖の５’‐ヌクレオチドの糖の４’‐炭素はリン酸類似体を含む。
ｉｉ．二本鎖オリゴヌクレオチド
【００７２】
本開示の方法においてＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現を標的化するために有用なオリゴヌクレオチドには様々な構造が存在し、ＲＮＡｉ、アンチセンス、ｍｉＲＮＡ等が含まれる。本明細書又は他の文献に記載される構造のいずれかが骨格として使用され、本明細書に記載される配列を組み込むか、又は標的とする。（例えば、ＲＮＡｉ経路を介して）ＨＢＶ抗原発現を標的化するための二本鎖オリゴヌクレオチドは概して、互いに二重鎖を形成するセンス鎖及びアンチセンス鎖を有する。いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は共有結合していない。しかし、いくつかの実施形態では、センス鎖及びアンチセンス鎖は共有結合している。
【００７３】
いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡの発現を低減するための二本鎖オリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）に関与する。例えば、各鎖が１９〜２５ヌクレオチドのサイズを有し、少なくとも１つの３’オーバーハングが１〜５ヌクレオチドであるようなＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが開発されている（例えば、米国特許第８，３７２，９６８号明細書を参照）。より長いオリゴヌクレオチドも開発されており、これはダイサーで処理して活性なＲＮＡｉ産物を生成する（例えば、米国特許第８，８８３，９９６号明細書を参照）。更なる研究により、少なくとも１つの鎖の少なくとも一方の末端が二重標的領域を超えて拡張された拡張二本鎖オリゴヌクレオチドが生成され、このオリゴヌクレオチドには鎖の１つが熱力学的に安定したテトラループ構造を含む構造が含まれる（例えば、米国特許第８，５１３，２０７号明細書及び第８，９２７，７０５号明細書、並びに国際公開第２０１００３３２２５号明細書参照。これらのオリゴヌクレオチドの開示について参照により本明細書に援用される）。このような構造は、一本鎖伸長（分子の片側又は両側）並びに二本鎖伸長を含み得る。
【００７４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、ダイサー酵素で切断可能である。このようなオリゴヌクレオチドはセンス鎖の３’末端に（例えば、１、２、又は３ヌクレオチド長の）オーバーハングを有してもよい。このようなオリゴヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡ）は、標的ＲＮＡ及び相補的なパッセンジャー鎖に対するアンチセンスである２１ヌクレオチドのガイド鎖を含んでもよく、両鎖がアニーリングして、３’末端の一方又は両方において１９ｂｐの二重鎖及び２ヌクレオチドのオーバーハングを形成する。２３ヌクレオチドのガイド鎖及び２１ヌクレオチドのパッセンジャー鎖を有するオリゴヌクレオチドを含む、より長いオリゴヌクレオチドを設計することも可能であり、ここでは分子の右側（パッセンジャー鎖の３’末端／ガイド鎖の５’末端）に平滑末端が存在し、分子の左側（パッセンジャー鎖の５’末端／ガイド鎖の３’末端）に２ヌクレオチドの３’‐ガイド鎖オーバーハングが存在する。このような分子には、２１塩基対の二重鎖領域が存在する。例えば、米国特許第９０１２１３８号明細書、第９０１２６２１号明細書、及び第９１９３７５３号明細書を参照されたい。各々は関連した開示について本明細書に援用される。
【００７５】
いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドはセンス鎖及びアンチセンス鎖を含んでもよく、両方とも１７〜２６（例えば、１７〜２６、２０〜２５、１９〜２１、又は２１〜２３）ヌクレオチド長の範囲内にある。いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖は等しい長さである。いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖の両方が２１〜２３ヌクレオチド長の範囲内にあるオリゴヌクレオチドの場合、センス鎖、アンチセンス鎖、又は両鎖上の３’オーバーハングは１又は２ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、２３ヌクレオチドのガイド鎖及び２１ヌクレオチドのパッセンジャー鎖を有し、ここでは分子の右側（パッセンジャー鎖の３’末端／ガイド鎖の５’末端）に平滑末端が存在し、分子の左側（パッセンジャー鎖の５’末端／ガイド鎖の３’末端）に２ヌクレオチドの３’‐ガイド鎖オーバーハングが存在する。このような分子には、２１塩基対の二重鎖領域が存在する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、２５ヌクレオチドのセンス鎖及び２７ヌクレオチドのアンチセンス鎖を含み、ダイサー酵素により作用を受けると、アンチセンス鎖が成熟ＲＩＳＣに組み込まれる。
【００７６】
本明細書で開示する組成物及び方法で利用する他のオリゴヌクレオチド設計には、１６量体ｓｉＲＮＡｓ（例えば、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  ｉｎ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｌｏｇｙ．Ｂｌａｃｋｂｕｒｎ（編集）、Ｒｏｙａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２００６年参照）、ｓｈＲＮＡ（例えば、１９ｂｐ以下のステムを有する；例えば、Ｍｏｏｒｅら、Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２０１０年；６２９：１４１〜１５８参照）、平滑ｓｉＲＮＡ（例えば、１９ｂｐ長；例えば、Ｋｒａｙｎａｃｋ及びＢａｋｅｒ、ＲＮＡ  第１２巻、１６３〜１７６頁（２００６年）参照）、非対称ｓｉＲＮＡ（ａｉＲＮＡ；例えば、Ｓｕｎら、Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２６，１３７９〜１３８２（２００８年）参照）、非対称短二重鎖ｓｉＲＮＡ（例えば、Ｃｈａｎｇら、Ｍｏｌ  Ｔｈｅｒ．２００９年４月；１７（４）：７２５〜３２参照）、フォークｓｉＲＮＡ（例えば、Ｈｏｈｊｏｈ、ＦＥＢＳ  Ｌｅｔｔｅｒｓ、第５５７巻、１〜３号；２００４年１月、１９３〜１９８頁参照）、単鎖ｓｉＲＮＡ（Ｅｌｓｎｅｒ；Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  ３０、１０６３（２０１２年））、ダンベル型環状ｓｉＲＮＡ（例えば、Ａｂｅら、Ｊ  Ａｍ  Ｃｈｅｍ  Ｓｏｃ  １２９：１５１０８〜１５１０９（２００７年）参照）、及び小型の内部セグメント化干渉ＲＮＡ（ｓｉｓｉＲＮＡ；例えば、Ｂｒａｍｓｅｎら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２００７年９月；３５（１７）：５８８６〜５８９７参照）が含まれる。前述の各参考文献は、その中の関連する開示について、その全体が参照により援用される。ＨＢｓＡｇの発現を低減又は阻害するためにいくつかの実施形態で使用し得るオリゴヌクレオチド構造の別の非限定的な例には、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、及び短鎖ｓｉＲＮＡが挙げられる（例えば、Ｈａｍｉｌｔｏｎら、Ｅｍｂｏ  Ｊ．，２００２年、２１（１７）：４６７１〜４６７９参照；また、米国出願第２００９００９９１１５号明細書参照）。
ａ．アンチセンス鎖
【００７７】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は「ガイド鎖」と称する場合もある。例えば、アンチセンス鎖がＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）と会合してアルゴノートタンパク質に結合するか、又は１つ以上の類似因子と会合又は結合して標的遺伝子のサイレンシングを指示することが可能な場合は、ガイド鎖と称してもよい。いくつかの実施形態では、ガイド鎖と相補的なセンス鎖は「パッセンジャー鎖」と称してもよい。
【００７８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供するオリゴヌクレオチドは、最大５０ヌクレオチド長（例えば、最大３０、最大２７、最大２５、最大２１、又は最大１９ヌクレオチド長）であるアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で提供するオリゴヌクレオチドは、少なくとも１２ヌクレオチド長（例えば、少なくとも１２、少なくとも１５、少なくとも１９、少なくとも２１、少なくとも２５、又は少なくとも２７ヌクレオチド長）であるアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、１２〜５０又は１２〜３０（例えば、１２〜３０、１１〜２７、１１〜２５、１５〜２１、１５〜２７、１７〜２１、１７〜２５、１９〜２７、又は１９〜３０）ヌクレオチド長の範囲内にある。いくつかの実施形態では、本明細書に開示したオリゴヌクレオチドのいずれか１種のアンチセンス鎖は、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、又は５０ヌクレオチド長である。
【００７９】
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は（５’→３’方向に示す）ＡＡＴＣＣＴＣＡＣＡ（配列番号９）に規定される配列に相補的な領域を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は（５’→３’方向に示す）ＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵ（配列番号１０）に規定される配列を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は（５’→３’方向に示す）ＴＧＴＧＡＧＧＡＴＴ（配列番号１１）に規定される配列を含む。
【００８０】
いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドは、配列番号９に規定される配列に相補的な領域を有するアンチセンス鎖、及びその３’末端にある１つ又は２つの非相補的ヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は配列番号４〜５．１のいずれか１つに規定されるヌクレオチド配列を含む。
【００８１】
いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡの発現を低減するためのオリゴヌクレオチドは、配列番号９に規定される配列に相補的な領域を有するアンチセンス鎖を含むことが可能であり、当該アンチセンス鎖は以下の配列のいずれか１つに規定される配列を持たない：（５’→３’方向に示す）ＴＡＴＴＧＴＧＡＧＧＡＴＴＣＴＴＧＴＣＡ（配列番号１２）；ＣＧＧＴＡＴＴＧＴＧＡＧＧＡＴＴＣＴＴＧ（配列番号１３）；ＴＧＴＧＡＧＧＡＴＴＣＴＴＧＴＣＡＡＣＡ（配列番号１４）；ＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＡＡ（配列番号１５）；ＵＧＣＧＧＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＣＴＴ（配列番号１６）；ＡＣＡＧＣＡＴＴＧＴＧＡＧＧＡＴＴＣＴＴＧＴＣ（配列番号１７）；ＵＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＡＡＣＡ（配列番号１８）；ＡＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＡＡＣＡＡ（配列番号１９）；及びＵＵＧＵＧＡＧＧＡＵＵＵＵＵＧＵＣＡＡＣＡＡＧ（配列番号２０）。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、配列番号４、５、又は５．１に規定されるヌクレオチド配列とは３つ以下のヌクレオチド分異なる。
ｂ．センス鎖
【００８２】
いくつかの実施形態では、二本鎖オリゴヌクレオチドは最大４０ヌクレオチド長（例えば、最大４０、最大３５、最大３０、最大２７、最大２５、最大２１、最大１９、最大１７、又は最大１２ヌクレオチド長）のセンス鎖を有してもよい。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは少なくとも１２ヌクレオチド長（例えば、少なくとも１２、少なくとも１５、少なくとも１９、少なくとも２１、少なくとも２５、少なくとも２７、少なくとも３０、少なくとも３５、又は少なくとも３８ヌクレオチド長）のセンス鎖を有してもよい。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは１２〜５０（例えば、１２〜４０、１２〜３６、１２〜３２、１２〜２８、１５〜４０、１５〜３６、１５〜３２、１５〜２８、１７〜２１、１７〜２５、１９〜２７、１９〜３０、２０〜４０、２２〜４０、２５〜４０、又は３２〜４０）ヌクレオチド長の範囲のセンス鎖を有してもよい。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、又は４０ヌクレオチド長のセンス鎖を有してもよい。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は２７ヌクレオチドより長い（例えば、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９又は４０ヌクレオチド）。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、２５ヌクレオチドより長い（例えば、２６、２７、２８、２９又は３０ヌクレオチド）。
【００８３】
いくつかの実施形態では、センス鎖はその３’末端にステムループを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖はその５’末端にステムループを含む。いくつかの実施形態では、ステムループを含む鎖は２〜６６ヌクレオチド長（例えば、２〜６６、１０〜５２、１４〜４０、２〜３０、４〜２６、８〜２２、１２〜１８、１０〜２２、１４〜２６、又は１４〜３０ヌクレオチド長）の範囲内にある。いくつかの実施形態では、ステムループを含む鎖は８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、又は３０ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ステムは１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、又は１４ヌクレオチド長の二重鎖を含む。いくつかの実施形態では、ステムループは分子を分解（例えば、酵素分解）からより良好に保護し、標的細胞への送達のための標的化特性を促進する。例えば、いくつかの実施形態では、ループは、オリゴヌクレオチドの遺伝子発現阻害活性に大幅に影響を与えることなく修飾を行えるヌクレオチドを追加する。特定の実施形態では、以下に規定されるステムループを（例えば、その３’末端に）含むセンス鎖を有するオリゴヌクレオチドが本明細書で提供される：Ｓ1‐Ｌ‐Ｓ2、式中Ｓ1はＳ2に相補的であり、ＬはＳ1とＳ2との間に最大１０ヌクレオチド長（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、又は１０ヌクレオチド長）のループを形成する。
【００８４】
いくつかの実施形態では、ステムループのループ（Ｌ）は（例えば、ニックドテトラループ構造内の）テトラループである。テトラループはリボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、修飾ヌクレオチド、及びそれらの組み合わせを含み得る。典型的には、テトラループは４、５個のヌクレオチドを有する。
ｃ．二重鎖長
【００８５】
いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖間に形成される二重鎖は少なくとも１２（例えば、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、又は少なくとも２１）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖間に形成される二重鎖は１２〜３０ヌクレオチド長（例えば、１２〜３０、１２〜２７、１２〜２２、１５〜２５、１８〜３０、１８〜２２、１８〜２５、１８〜２７、１８〜３０、１９〜３０、又は２１〜３０ヌクレオチド長）の範囲内にある。いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖間に形成される二重鎖は１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、又は３０ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖間に形成される二重鎖はセンス鎖及び／又はアンチセンス鎖の全長に及ぶことはない。いくつかの実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖間の二重鎖は、センス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの全長に及ぶ。特定の実施形態では、センス鎖とアンチセンス鎖間の二重鎖は、センス鎖とアンチセンス鎖の両方の全長に及ぶ。
ｄ．オリゴヌクレオチド末端
【００８６】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、センス鎖及びアンチセンス鎖を含み、それによりセンス鎖もしくはアンチセンス鎖のいずれか、又はセンス鎖及びアンチセンス鎖の両方に３’‐オーバーハングが存在する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは、他の５’末端と比較して熱力学的に安定性が低い１つの５’末端を有する。いくつかの実施形態では、センス鎖の３’末端の平滑末端及びアンチセンス鎖の３’末端のオーバーハングを含む非対称オリゴヌクレオチドが提供される。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の３’オーバーハングは１〜８ヌクレオチド長（例えば、１、２、３、４、５、６、７又は８ヌクレオチド長）である。
【００８７】
典型的には、ＲＮＡｉのオリゴヌクレオチドには、アンチセンス（ガイド）鎖の３’末端に２ヌクレオチドのオーバーハングがある。ただし他のオーバーハングも考えられる。いくつかの実施形態では、オーバーハングは、１〜６ヌクレオチド、任意に１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、２〜６、２〜５、２〜４、２〜３、３〜６、３〜５、３〜４、４〜６、４〜５、５〜６ヌクレオチド、又は１、２、３、４、５、もしくは６ヌクレオチドの長さを含む３’オーバーハングである。しかし、いくつかの実施形態では、オーバーハングは、１〜６ヌクレオチド、任意に１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、２〜６、２〜５、２〜４、２〜３、３〜６、３〜５、３〜４、４〜６、４〜５、５〜６ヌクレオチド、又は１、２、３、４、５、もしくは６ヌクレオチドの長さを含む５’オーバーハングである。
【００８８】
いくつかの実施形態では、センス鎖及び／又はアンチセンス鎖の３’末端又は５’末端の１つ以上の（例えば、２、３、４）末端ヌクレオチドは修飾されている。例えば、いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端の１つ又は２つの末端ヌクレオチドは修飾されている。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端の最後尾ヌクレオチドは修飾され、例えば２’修飾、例えば２’‐Ｏ‐メトキシエチルを含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端の最後尾にある１つ又は２つの末端ヌクレオチドは標的と相補的である。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の３’末端の最後尾にある１つ又は２つのヌクレオチドは標的と相補的ではない。
【００８９】
いくつかの実施形態では、３’末端センス鎖にニックドテトラループ構造を有し、そのアンチセンス鎖の３’末端に２つの末端オーバーハングヌクレオチドを有する二本鎖オリゴヌクレオチドが提供される。いくつかの実施形態では、２つの末端オーバーハングヌクレオチドはＧＧである。典型的には、アンチセンス鎖の２つの末端ＧＧヌクレオチドの一方又は両方は標的と相補的であるか、又は相補的でない。
【００９０】
いくつかの実施形態では、センス鎖又はアンチセンス鎖の５’末端及び／又は３’末端には逆キャップヌクレオチドがある。
【００９１】
いくつかの実施形態では、センス鎖及び／又はアンチセンス鎖の３’末端又は５’末端の末端ヌクレオチド間に、１つ以上（例えば、２、３、４、５、６）の修飾ヌクレオチド間結合がある。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチド間結合は、センス鎖及び／又はアンチセンス鎖の３’末端又は５’末端のオーバーハングヌクレオチド間にある。
ｅ．ミスマッチ
【００９２】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、センス鎖とアンチセンス鎖間に１つ以上（例えば、１、２、３、４、５）のミスマッチを有してもよい。センス鎖とアンチセンス鎖間に複数のミスマッチがある場合、ミスマッチは連続して（例えば、連続して２、３個以上）配置されるか、又は相補性領域全体に点在していてもよい。いくつかの実施形態では、センス鎖の３’末端は１つ以上のミスマッチを含む。一実施形態では、２つのミスマッチがセンス鎖の３’末端に組み込まれる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのセンス鎖の３’末端での塩基ミスマッチ又はセグメントの不安定化により、おそらくダイサーによるプロセシングの容易化を経て、ＲＮＡｉにおける合成二重鎖の効力が改善された。
【００９３】
いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖は、対応する転写産物配列と比較して１つ以上のミスマッチを含むＨＢｓＡｇ転写産物と相補的な領域を有してもよい。オリゴヌクレオチド上の相補性領域は、適切なハイブリダイゼーション条件下で転写産物と相補的な塩基対を形成する能力を維持しているのであれば、最大１、最大２、最大３、最大４、最大５等のミスマッチを有してもよい。あるいは、オリゴヌクレオチドの相補性領域は、適切なハイブリダイゼーション条件下でＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡと相補的な塩基対を形成する能力を維持しているのであれば、１以下、２以下、３以下、４以下、又は５以下のミスマッチを有してもよい。いくつかの実施形態では、相補性領域に複数のミスマッチがある場合、ミスマッチは連続して（例えば、２、３、４個以上）配置されるか、又は、適切なハイブリダイゼーション条件下でＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡと相補的な塩基対を形成する能力をオリゴヌクレオチドが維持しているのであれば、相補性領域全体に点在していてもよい。
ｉｉｉ．１本鎖オリゴヌクレオチド
【００９４】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のＨＢｓＡｇ発現を低減するためのオリゴヌクレオチドはＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡとの相補性を有する一本鎖オリゴヌクレオチドである。このような構造には、一本鎖ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが含まれるが、これに限定されるものではない。最近の取り組みにより、一本鎖ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの活性が実証されている（例えば、Ｍａｔｓｕｉら（２０１６年５月）、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ、第２４（５）巻、９４６〜９５５参照）。しかし、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドはアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）である。アンチセンスオリゴヌクレオチドは核酸塩基配列を有する１本鎖オリゴヌクレオチドであり、これは５’から３’方向に書き込まれたとき、特定の核酸の標的セグメントの逆相補体を含み、そして（例えば、ギャップマーとして）細胞内のその標的ＲＮＡのＲＡａｓｅＨ媒介切断を誘導するように、又は（例えば、ミックスマーとして）細胞内の標的ｍＲＮＡの翻訳を阻害するように適切に修飾される。本開示で使用するためのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、例えば、米国特許第９，５６７，５８７号明細書に示されるような当該分野で公知の任意の好適な様式で修飾してもよい。この文献はアンチセンスオリゴヌクレオチドの修飾（例えば、核酸塩基（ピリミジン、プリン）の長さ、糖部分、及び核酸塩基の複素環部の改変など）に関する開示について参照により本明細書に援用される。また、アンチセンス分子は何十年もの間、特定の標的遺伝子の発現を低減するために使用してきた（例えば、Ｂｅｎｎｅｔｔら；Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ  ｏｆ  Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｄｒｕｇｓ、Ａｎｎｕａｌ  Ｒｅｖｉｅｗ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｔｏｘｉｃｏｌｏｇｙ、第５７巻：８１〜１０５参照）。
ｉｖ．オリゴヌクレオチド修飾
【００９５】
オリゴヌクレオチドは、特異性、安定性、送達、生物学的利用能、ヌクレアーゼ分解耐性、免疫原性、塩基対合特性、ＲＮＡ分布及び細胞取り込み、並びに治療又は研究用途に関連する他の特徴を改善又は制御するために様々な方法で修飾してもよい。例えば、Ｂｒａｍｓｅｎら、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、２００９年、３７、２８６７〜２８８１；Ｂｒａｍｓｅｎ及びＫｊｅｍｓ（Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ  ｉｎ  Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、３（２０１２年）：１〜２２）を参照されたい。従って、いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは１つ以上の好適な修飾を含んでもよい。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、その塩基（又は核酸塩基）、糖（例えば、リボース、デオキシリボース）、又はリン酸基に修飾を有する。
【００９６】
オリゴヌクレオチド上の修飾の数及びそのヌクレオチド修飾の位置はオリゴヌクレオチドの特性に影響を及ぼし得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドを脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）又は類似の担体にコンジュゲートするか、又は組み込むことによりインビボで送達してもよい。しかし、オリゴヌクレオチドがＬＮＰ又は類似の担体に保護されていない場合、そのヌクレオチドの少なくとも数個を修飾することが有利となり得る。従って、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドのいずれかの特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの全て、又はほぼ全てのヌクレオチドを修飾する。特定の実施形態では、ヌクレオチドの半分以上を修飾する。特定の実施形態では、ヌクレオチドの半分未満を修飾する。典型的には、ネイキッド送達では、全ての糖を２’位で修飾する。これらの修飾は可逆的でも不可逆的でもよい。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドは、所望の特性（例えば、酵素分解からの保護、インビボ投与後に所望の細胞を標的とする能力、及び／又は熱力学的安定性）を得るのに十分な数及び種類の修飾ヌクレオチドを有する。
ａ．糖修飾
【００９７】
いくつかの実施形態では、修飾した糖（本明細書では糖類似体とも称する）には、例えば、糖の２’、３’、４’、及び／又は５’炭素位置に１つ以上の修飾がある修飾デオキシリボース又はリボース部分が含まれる。いくつかの実施形態では、修飾糖は、ロック核酸（「ＬＮＡ」）（例えば、Ｋｏｓｈｋｉｎら（１９９８年）、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  ５４、３６０７〜３６３０参照）、アンロック核酸（「ＵＮＡ」）（例えば、Ｓｎｅａｄら、（２０１３年）、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｔｈｅｒａｐｙ‐Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ、２、ｅ１０３参照）、及びブリッジ核酸（「ＢＮＡ」）（例えば、Ｉｍａｎｉｓｈｉ及びＯｂｉｋａ（２００２年）、Ｔｈｅ  Ｒｏｙａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．、１６５３〜１６５９年）に存在するような非天然代替炭素構造も含んでよい。Ｋｏｓｈｋｉｎら、Ｓｎｅａｄら、及びＩｍａｎｉｓｈｉ及びＯｂｉｋａは、糖修飾に関するそれらの開示について参照により本明細書に援用される。
【００９８】
いくつかの実施形態では、糖中のヌクレオチド修飾は２’‐修飾を含む。２’‐修飾は、２’‐アミノエチル、２’‐フルオロ、２’‐Ｏ‐メチル、２’‐Ｏ‐メトキシエチル、及び２’‐デオキシ‐２’‐フルオロ‐β‐ｄ‐アラビノ核酸であってもよい。典型的には、修飾は２’‐フルオロ、２’‐Ｏ‐メチル、又は２’‐Ｏ‐メトキシエチルである。いくつかの実施形態では、糖における修飾は糖環の修飾を含み、これには糖環の１つ以上の炭素の修飾が含まれてもよい。例えば、ヌクレオチドの糖の修飾は糖の２’‐酸素を含んでもよく、この２’‐酸素は糖の１’‐炭素もしくは４’‐炭素に結合しているか、又は２’‐酸素はエチレンもしくはメチレン架橋を介して１’‐炭素もしくは４’‐炭素に結合している。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは２’‐炭素〜３’‐炭素結合を欠く非環式糖を有する。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、例えば糖の４’位にチオール基を有する。
【００９９】
いくつかの実施形態では、末端の３’末端基（例えば、３’‐ヒドロキシル）はリン酸基又は他の基であり、これは、例えば、リンカー、アダプターもしくは標識を結合するために、又は別の核酸へのオリゴヌクレオチドを直接結合するために使用できる。
ｂ．５’末端リン酸
【０１００】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの５’末端リン酸基はアルゴノート２との相互作用を促進する。しかし、５’リン酸基を含むオリゴヌクレオチドは、ホスファターゼ又は他の酵素により分解されやすく、インビボでの生物学的利用能が制限される可能性がある。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、このような分解に耐性がある５’リン酸の類似体を含む。いくつかの実施形態では、リン酸類似体はオキシメチルホスホネート、ビニルホスホネート、又はマロニルホスホネートであってもよい。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド鎖の５’末端は天然５’‐リン酸基の静電特性及び立体特性を模倣する化学的部分（「リン酸模倣体」）に結合している（例えば、Ｐｒａｋａｓｈら、（２０１５年）、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２０１５年３月３１日；４３（６）：２９９３〜３０１１、リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に援用される）。５’末端に結合可能な多くのリン酸模倣体が開発されている（例えば、米国特許第８，９２７，５１３号明細書参照。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に援用される）。オリゴヌクレオチドの５’末端について、他の修飾も開発されている（例えば、国際公開第２０１１／１３３８７１号参照。リン酸類似体に関するその内容は参照により本明細書に援用される）。特定の実施形態では、ヒドロキシル基はオリゴヌクレオチドの５’末端に結合する。
【０１０１】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは糖の４’‐炭素位置にリン酸類似体（「４’‐リン酸類似体」と称する）を有する。例えば、２０１６年９月２日出願の「４’‐Ｐｈｏｓｐｈａｔｅ  Ａｎａｌｏｇｓ  ａｎｄ  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  Ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｓａｍｅ」と題された米国仮出願第６２／３８３，２０７号、及び２０１６年９月１２日出願の「４’‐Ｐｈｏｓｐｈａｔｅ  Ａｎａｌｏｇｓ  ａｎｄ  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  Ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ  ｔｈｅ  Ｓａｍｅ」と題された米国仮出願第６２／３９３，４０１を参照されたい。リン酸類似体に関するその内容はそれぞれ参照により本明細書に援用される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは５’末端ヌクレオチドに４’‐リン酸類似体を含む。いくつかの実施形態では、リン酸類似体はオキシメチルホスホネートであり、ここではオキシメチル基の酸素原子が糖部分（例えば、その４’炭素で）又はその類似体に結合している。他の実施形態では、４’‐リン酸類似体は、チオメチルホスホネート又はアミノメチルホスホネートであり、ここではチオメチル基の硫黄原子又はアミノメチル基の窒素原子は糖部分又はその類似体の４’‐炭素に結合している。特定の実施形態では、４’‐リン酸類似体はオキシメチルホスホネートである。いくつかの実施形態では、オキシメチルホスホネートは、式‐Ｏ‐ＣＨ2‐ＰＯ（ＯＨ）2又は‐Ｏ‐ＣＨ2‐ＰＯ（ＯＲ）2で表され、式中、Ｒは独立して、Ｈ、ＣＨ3、アルキル基、ＣＨ2ＣＨ2ＣＮ、ＣＨ2ＯＣＯＣ（ＣＨ3）3、ＣＨ2ＯＣＨ2ＣＨ2Ｓｉ（ＣＨ3）3、又は保護基から選択される。特定の実施形態では、アルキル基はＣＨ2ＣＨ3である。より典型的には、Ｒは独立して、Ｈ、ＣＨ3、又はＣＨ2ＣＨ3から選択される。
【０１０２】
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドに結合したリン酸類似体はメトキシホスホネート（ＭＯＰ）である。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドに結合したリン酸類似体は５’モノ‐メチル保護ＭＯＰである。いくつかの実施形態では、リン酸類似体を含む以下のウリジンヌクレオチド：
【化６】
2021500025.tif 000008
を、例えば、ガイド（アンチセンス）鎖の最初の位置で使用してもよく、この修飾ヌクレオチドは［Ｍｅホスホネート‐４Ｏ‐ｍＵ］又は５’‐メトキシ，ホスホネート‐４’オキシ‐２’‐Ｏ‐メチルウリジンと称する。
ｃ．修飾ヌクレオシド間結合
【０１０３】
いくつかの実施形態では、リン酸修飾又は置換により、少なくとも１つ（例えば、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、又は少なくとも５つ）の修飾ヌクレオチド間結合を含むオリゴヌクレオチドが生じ得る。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか１種は、１〜１０個（例えば、１〜１０個、２〜８個、４〜６個、３〜１０個、５〜１０個、１〜５個、１〜３個、又は１〜２個）の修飾ヌクレオチド間結合を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか１種は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、又は１０個の修飾ヌクレオチド間結合を含む。
【０１０４】
修飾ヌクレオチド間結合はホスホロチオエート結合、ホスホロチオエート結合、ホスホトリエステル結合、チオノアルキルホスホネート結合、チオノアルキルホスホトリエステル結合、ホスホラミダイト結合、ホスホネート結合、又はボラノホスフェート結合であってもよい。いくつかの実施形態では、本明細書で開示したいずれか１種のオリゴヌクレオチドの少なくとも１つの修飾ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。
ｄ．塩基修飾
【０１０５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドは１つ以上の修飾核酸塩基を有する。いくつかの実施形態では、修飾された核酸塩基（本明細書では塩基類似体とも称する）はヌクレオチド糖部分の１’位に結合する。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は窒素塩基である。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は窒素原子を含まない。例えば、米国公開特許出願第２００８０２７４４６２号明細書を参照されたい。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドはユニバーサル塩基を含む。しかし、特定の実施形態では、修飾ヌクレオチドは核酸塩基を含まない（脱塩基性）。
【０１０６】
いくつかの実施形態では、ユニバーサル塩基は複素環部分であり、この部分は修飾ヌクレオチド内のヌクレオチド糖部分の１’位にあるか、あるいは二重鎖に存在する場合、二重鎖の構造を実質的に変えることなく複数種の塩基に対向させることが可能なヌクレオチド糖部分置換内の同等位置にある。いくつかの実施形態では、標的核酸に完全に相補的な参照一本鎖核酸（例えば、オリゴヌクレオチド）と比較して、ユニバーサル塩基を含む一本鎖核酸は、相補的核酸で形成された二重鎖のものよりＴmが低い標的核酸を有する二重鎖を形成する。しかし、いくつかの実施形態では、ユニバーサル塩基が単一ミスマッチを生成する塩基で置き換えられた参照一本鎖核酸と比較して、ユニバーサル塩基を含む一本鎖核酸は、ミスマッチ塩基を含む核酸で形成した二重鎖のものよりＴmが高い標的核酸を有する二重鎖を形成する。
【０１０７】
ユニバーサル結合ヌクレオチドの非限定的な例には、イノシン、１‐β‐Ｄ‐リボフラノシル‐５‐ニトロインドール、及び／又は１‐β‐Ｄ‐リボフラノシル‐３‐ニトロピロールが挙げられる（米国特許出願公開第２００７０２５４３６２号、Ｑｕａｙら；Ｖａｎ  Ａｅｒｓｃｈｏｔら、Ａｎ  ａｃｙｃｌｉｃ  ５‐ｎｉｔｒｏｉｎｄａｚｏｌｅ  ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ  ａｍａｌｏｇｕｅ  ａｓ  ａｍｂｉｇｕｏｕｓ  ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１９９５年１１月１１；２３（２１）：４３６３〜７０；Ｌｏａｋｅｓら、３‐Ｎｉｔｒｏｐｙｒｒｏｌｅ  ａｎｄ  ５‐ｎｉｔｒｏｉｎｄｏｌｅ  ａｓ  ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  ｂａｓｅｓ  ｉｎ  ｐｒｉｍｅｒｓ  ｆｏｒ  ＤＮＡ  ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ  ａｎｄ  ＰＣＲ．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１９９５年７月１１日；２３（１３）：２３６１〜６；Ｌｏａｋｅｓ及びＢｒｏｗｎ，５‐Ｎｉｔｒｏｉｎｄｏｌｅ  ａｓ  ａｎ  ｕｎｉｖｅｒｓａｌ  ｂａｓｅ  ａｎａｌｏｇｕｅ．Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．１９９４年１０月１１日；２２（２０）：４０３９〜４３．前記のそれぞれは、塩基修飾に関する開示について参照により本明細書に援用される）。
ｅ．可逆的修飾
【０１０８】
標的細胞に到達する前にインビボ環境からオリゴヌクレオチドを保護するための特定の修飾を行うことが可能である一方で、当該修飾は、オリゴヌクレオチドが標的細胞のサイトゾルに到達すると、オリゴヌクレオチドの効力又は活性を低下させる可能性がある。分子が細胞外の望ましい特性を保持するように可逆的修飾を行うことは可能であり、その後、細胞の細胞質環境に入ると修飾は除去される。可逆的修飾は、例えば、細胞内酵素の作用により、又は細胞内の化学的条件により（例えば、細胞内グルタチオンによる還元により）除去することが可能である。
【０１０９】
いくつかの実施形態では、可逆的に修飾されたヌクレオチドは、グルタチオン感受性部分を含む。典型的には、核酸分子は環状ジスルフィド部分で化学的に修飾されており、ヌクレオチド間二リン酸結合により生じた負電荷を遮蔽し、細胞の取り込み及びヌクレアーゼ耐性を改善する。当初Ｔｒａｖｅｒｓａ  Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ社（「Ｔｒａｖｅｒｓａ」）に認められた米国公開出願第２０１１／０２９４８６９号明細書、Ｓｏｌｓｔｉｃｅ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ社（「Ｓｏｌｓｔｉｃｅ」）のＰＣＴ公開第ＷＯ２０１５／１８８１９７号明細書、Ｍｅａｄｅら、Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、２０１４年、３２：１２５６〜１２６３（「Ｍｅａｄｅ」）、Ｍｅｒｃｋ  Ｓｈａｒｐ＆Ｄｏｈｍｅ社のＰＣＴ公開第ＷＯ２０１４／０８８９２０号明細書を参照されたい。これらはそれぞれ、このような修正の開示について参照により組み込まれる。ヌクレオチド間二リン酸結合のこの可逆的修飾は、サイトゾル（例えば、グルタチオン）の還元環境により細胞内で切断されるように設計している。初期の例には、細胞内で切断可能であると報告されているホスホトリエステル修飾の中和が挙げられる（Ｄｅｌｌｉｎｇｅｒら、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．２００３年、１２５：９４０〜９５０）。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、このような可逆的修飾により、オリゴヌクレオチドがヌクレアーゼ及び他の過酷な環境条件（例えば、ｐＨ）に曝されるインビボ投与（例えば、血液及び／又は細胞のリソソーム／エンドソーム区分を通過する）中の保護が可能になる。グルタチオンのレベルが細胞外空間より高い細胞サイトゾルに放出されると、修飾は逆転し、その結果、オリゴヌクレオチドが切断される。可逆的なグルタチオン感受性部分を使用すると、不可逆的な化学修飾を使用する利用可能なオプションと比較して、対象のオリゴヌクレオチドに立体的に大型の化学基を導入することが可能となる。これは、これらの大型の化学基がサイトゾルで除去されるため、細胞サイトゾル内のオリゴヌクレオチドの生物学的活性に干渉しないからである。結果として、これらの大型の化学基を操作して、ヌクレアーゼ耐性、親油性、電荷、熱安定性、特異性、免疫原性低下などの様々な利点をヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドに与えることが可能になる。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分の構造を操作し、その放出の動態を改変することが可能である。
【０１１１】
いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分はヌクレオチドの糖に結合する。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分は修飾ヌクレオチドの糖の２’‐炭素に結合する。いくつかの実施形態では、特に修飾ヌクレオチドがオリゴヌクレオチドの５’末端ヌクレオチドである場合、グルタチオン感受性部分は糖の５’‐炭素に位置する。いくつかの実施形態では、特に修飾ヌクレオチドがオリゴヌクレオチドの３’末端ヌクレオチドである場合、グルタチオン感受性部分は糖の３’‐炭素に位置する。いくつかの実施形態では、グルタチオン感受性部分はスルホニル基を含む。例えば、２０１６年８月２３日出願のＣｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ  Ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ  Ｒｅｖｅｒｓｉｂｌｙ  Ｍｏｄｉｆｉｅｄ  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  ａｎｄ  Ｕｓｅｓ  Ｔｈｅｒｅｏｆと題された米国仮出願第６２／３７８，６３５号明細書を参照されたい。その内容は、関連する開示について参照により本明細書に援用される。
ｖ．標的化リガンド
【０１１２】
いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドを１つ以上の細胞又は１つ以上の器官に標的化することが望ましい場合もある。このような戦略は、他の器官における望ましくない影響を回避することに役立ち、又は、オリゴヌクレオチドでは利益がもたらされない細胞、組織もしくは器官に向かってオリゴヌクレオチドが過度に損失することを回避できる。従って、いくつかの実施形態では、特定の組織、細胞又は器官の標的化を容易にするために、例えば、オリゴヌクレオチドの肝臓への送達を容易にするために、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドを修飾してもよい。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドを肝臓の肝細胞へ送達することを促進するために、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドを修飾してもよい。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１つ以上の標的化リガンドにコンジュゲートされたヌクレオチドを含む。
【０１１３】
標的化リガンドは炭水化物、アミノ糖、コレステロール、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質もしくはタンパク質の一部（例えば、抗体もしくは抗体フラグメント）又は脂質を含んでもよい。いくつかの実施形態では、標的化リガンドはアプタマーである。例えば標的化リガンドは、腫瘍脈管系もしくは神経膠腫細胞を標的にするために使用するＲＧＤペプチド、腫瘍脈管系もしくはストーマを標的にするためのＣＲＥＫＡペプチド、ＣＮＳ脈管系に発現したトランスフェリン受容体を標的にするためのトランスフェリン、ラクトフェリンもしくはアプタマー、又は神経膠腫細胞上のＥＧＦＲを標的にするための抗ＥＧＦＲ抗体であってもよい。特定の実施形態では、標的化リガンドは、１つ以上のＧａｌＮＡｃ部分である。
【０１１４】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、又は６個）のヌクレオチドは、それぞれ別個の標的化リガンドにコンジュゲートする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの２〜４個のヌクレオチドはそれぞれ別個の標的化リガンドにコンジュゲートする。いくつかの実施形態では、標的化リガンドはセンス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの末端で２〜４ヌクレオチドにコンジュゲートし（例えば、リガンドは、センス鎖又はアンチセンス鎖の５’又は３’末端の２〜４ヌクレオチドのオーバーハング又は伸長部にコンジュゲートする）、それにより標的化リガンドは歯ブラシの毛に類似し、オリゴヌクレオチドは歯ブラシに類似する。例えば、オリゴヌクレオチドはセンス鎖の５’又は３’末端のいずれかでステムループを含み、ステムのループの１、２、３又は４つのヌクレオチドは、標的化リガンドに個々にコンジュゲートしてもよい。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、ＨＢＶ抗原の発現を低減するオリゴヌクレオチドを被験体の肝臓の肝細胞に標的化することが望ましい。この目的のために、任意の適切な肝細胞標的化部分を使用してもよい。
【０１１６】
ＧａｌＮＡｃは、アシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰＲ）の高親和性リガンドであり、これは主に肝細胞の洞様毛細血管表面に発現し、末端ガラクトース又はＮ‐アセチルガラクトサミン残基（アシアロ糖タンパク質）を含む循環糖タンパク質の結合、内在化、及びその後のクリアランスにおいて主要な役割を担う。本開示のオリゴヌクレオチドへのＧａｌＮＡｃ部分の（間接的又は直接的いずれかの）コンジュゲーションは、これらの肝細胞上で発現するＡＳＧＰＲにこれらのオリゴヌクレオチドを標的化するために利用してもよい。
【０１１７】
いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは、一価のＧａｌＮＡｃに直接的又は間接的にコンジュゲートする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、直接的又は間接的に複数の一価ＧａｌＮＡｃにコンジュゲートする（すなわち、２、３、又は４つの一価ＧａｌＮＡｃ部分にコンジュゲートし、典型的には３又は４つの一価ＧａｌＮＡｃ部分にコンジュゲートする）。いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは１つ以上の二価ＧａｌＮＡｃ、三価ＧａｌＮＡｃ、又は四価ＧａｌＮＡｃ部分にコンジュゲートする。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの１つ以上の（例えば、１、２、３、４、５又は６つ）ヌクレオチドはそれぞれ、ＧａｌＮＡｃ部分にコンジュゲートする。いくつかの実施形態では、ステムループのループ（Ｌ）の２〜４ヌクレオチドはそれぞれ、別個のＧａｌＮＡｃにコンジュゲートする。いくつかの実施形態では、標的化リガンドは、センス鎖又はアンチセンス鎖のいずれかの末端で２〜４ヌクレオチドにコンジュゲートし（例えば、リガンドは、センス鎖又はアンチセンス鎖の５’又は３’末端の２〜４ヌクレオチドのオーバーハング又は伸長部にコンジュゲートする）、それによりＧａｌＮＡｃ部分は歯ブラシの毛に類似し、オリゴヌクレオチドは歯ブラシに類似する。例えば、オリゴヌクレオチドはセンス鎖の５’又は３’末端のいずれかでステムループを含み、ステムのループの１、２、３又は４つのヌクレオチドは、ＧａｌＮＡｃ部分に個々にコンジュゲートしてもよい。いくつかの実施形態では、ＧａｌＮＡｃ部分はセンス鎖のヌクレオチドにコンジュゲートする。例えば、４つのＧａｌＮＡｃ部分をセンス鎖のテトラループ内のヌクレオチドにコンジュゲートすることが可能であり、各ＧａｌＮＡｃ部分は１つのヌクレオチドにコンジュゲートする。
【０１１９】
いくつかの実施形態では、本明細書のオリゴヌクレオチドは、以下に示す、グアニジンヌクレオチドに結合した一価のＧａｌＮａｃを含む。これは［ａｄｅｍＧ‐ＧａｌＮＡｃ］又は２’‐アミノジエトキシメタノール‐グアニジン‐ＧａｌＮＡｃと称する。
【化７】
2021500025.tif 000009
【０１２０】
いくつかの実施形態では、本明細書のオリゴヌクレオチドは、以下に示す、アデニンヌクレオチドに結合した一価のＧａｌＮａｃを含む。これは［ａｄｅｍＡ‐ＧａｌＮＡｃ］又は２’‐アミノジエトキシメタノール‐アデニン‐ＧａｌＮＡｃと称する。 
【化８】
2021500025.tif 000010
【０１２１】
このようなコンジュゲーションの例として、５’から３’までのヌクレオチド配列ＧＡＡＡ（Ｌ＝リンカー、Ｘ＝ヘテロ原子）を含むループ及びステム結合点について以下に示す。このようなループは、例えば、図１Ａに示す分子の２７〜３０位に存在し得る。化学式において、
2021500025.tif 000011
はオリゴヌクレオチド鎖への結合点である。
【化９】
2021500025.tif 000012
【０１２２】
適切な方法又は化学（例えば、クリックケミストリー）を利用して、標的化リガンドをヌクレオチドに結合することが可能である。いくつかの実施形態では、ターゲティングリガンドは、クリックリンカーを使用してヌクレオチドにコンジュゲートする。いくつかの実施形態では、アセタール系リンカーを使用して、本明細書に記載したオリゴヌクレオチドのいずれか１つのヌクレオチドに標的化リガンドをコンジュゲートする。アセタール系リンカーは、例えば２０１６年６月２３日公開の国際特許出願公開第ＷＯ２０１６１００４０１  Ａ１に開示しており、このようなリンカーに関するその内容は参照により本明細書に援用される。いくつかの実施形態では、リンカーは不安定なリンカーである。しかし、他の実施形態では、リンカーはかなり安定している。
【０１２３】
５’から３’までのヌクレオチドＧＡＡＡを含むループについて例を以下に示す。ここではアセタールリンカーを用いて、ＧａｌＮａｃ部分をループのヌクレオチドに結合する。このようなループは、例えば図１０に示す分子の２７〜３０位にあってもよい。化学式において、
2021500025.tif 000013
はオリゴヌクレオチド鎖への結合点である。
【化１０】
2021500025.tif 000014
ＩＩＩ．製剤
【０１２４】
オリゴヌクレオチドの使用を容易にするために、様々な製剤が開発されている。例えば、分解を最小化し、送達及び／もしくは取り込みを容易にし、又は製剤中のオリゴヌクレオチドに別の有益な特性を提供する製剤を使用して、オリゴヌクレオチドを被験体又は細胞環境に送達することが可能となる。いくつかの実施形態では、ＨＢＶ抗原（例えば、ＨＢｓＡｇ）の発現を低減するためのオリゴヌクレオチド（例えば、一本鎖又は二本鎖オリゴヌクレオチド）を含む組成物が本明細書で提供される。このような組成物は、被験体の標的細胞の直接的環境又は全身のいずれかに投与されると、オリゴヌクレオチドの十分な量が細胞に入り、ＨＢＶ抗原発現を低減するように適切に処方できる。本明細書で開示しているように、様々な好適なオリゴヌクレオチド製剤のいずれかを使用して、ＨＢＶ抗原を低減するためのオリゴヌクレオチドを送達することが可能となる。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、リン酸緩衝生理食塩水、リポソーム、ミセル構造、及びカプシドなどの緩衝液中に処方する。
【０１２５】
カチオン性脂質を有するオリゴヌクレオチドの製剤を使用し、細胞へのオリゴヌクレオチドのトランスフェクションを促進できる。例えば、リポフェクチン、カチオン性グリセロール誘導体、及びポリカチオン性分子（例えば、ポリリジン）などのカチオン性脂質を使用できる。好適な脂質には、Ｏｌｉｇｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ社）、ＮＣ３８８（Ｒｉｂｏｚｙｍｅ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ社、Ｂｏｕｌｄｅｒ、コロラド州）、又はＦｕＧｅｎｅ６（Ｒｏｃｈｅ社）が挙げられ、これらは全てメーカー取扱説明書に従って使用できる。
【０１２６】
従って、いくつかの実施形態では、製剤は脂質ナノ粒子を含む。いくつかの実施形態では、賦形剤はリポソーム、脂質、脂質複合体、ミクロスフェア、マイクロ粒子、ナノスフェア、又はナノ粒子を含むか、又はその他の方法で、これらを必要とする被験体の細胞、組織、器官、又は身体への投与のために処方してもよい（例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ、第２２版、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｐｒｅｓｓ、２０１３年参照）。
【０１２７】
いくつかの実施形態では、本明細書で開示した製剤は賦形剤を含む。いくつかの実施形態において、賦形剤により、組成物では有効成分の安定性、吸収、溶解性が改善され、及び／又は治療が促進される。いくつかの実施形態では、賦形剤は、緩衝剤（例えば、クエン酸ナトリウム、リン酸ナトリウム、トリス塩基、又は水酸化ナトリウム）又はビヒクル（例えば、緩衝液、ワセリン、ジメチルスルホキシド、又は鉱油）である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、その保存期間を延長するために凍結乾燥し、その後、使用（例えば、被験体への投与）前に溶液にする。従って、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドのいずれか１種を含む組成物中の賦形剤は、凍結防止剤（例えば、マンニトール、ラクトース、ポリエチレングリコール、又はポリビニルピロリドン）、又は崩壊温度調節剤（例えば、デキストラン、フィコール、又はゼラチン）であってもよい。
【０１２８】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、その意図された投与経路に適合するように処方する。投与経路の例には、静脈内、皮内、皮下などの非経口、経口（例えば、吸入）、経皮（局所）、経粘膜、及び直腸投与が挙げられる。
【０１２９】
注射用途に適した医薬組成物には、滅菌水溶液（水溶性の場合）又は分散液、及び滅菌注射用液又は分散液の即時調製用の滅菌粉末が挙げられる。静脈内投与の場合、好適な担体には、生理食塩水、静菌水、Ｃｒｅｍｏｐｈｏｒ  ＥＬ．ＴＭ．（ＢＡＳＦ社、Ｐａｒｓｉｐｐａｎｙ、ニュージャージー州）、又はリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が挙げられる。担体は例えば、水、エタノール、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、及び液体ポリエチレングリコール等）、及びこれらの好適な混合物を含有する溶媒又は分散媒とすることも可能である。多くの場合、等張剤、例えば糖、マンニトールやソルビトールなどの多価アルコール、及び塩化ナトリウムを組成物に含めることが好ましい。滅菌注射用液は、選択した溶媒中に、必要量のオリゴヌクレオチドと、必要に応じて上記に列挙した成分の１種以上とを組み合わせて含有させた後、ろ過滅菌することで調製できる。
【０１３０】
いくつかの実施形態では、有効成分（単数又は複数）の割合は全組成物の重量又は体積の約１％〜約８０％の範囲、又はそれ以上であってもよいが、組成物は少なくとも約０．１％の治療薬（例えば、ＨＢＶ抗原発現を低減するためのオリゴヌクレオチド）等を含んでもよい。溶解性、生物学的利用能、生物学的半減期、投与経路、製品保存寿命、並びに他の薬理学的考慮事項などの要素は、このような医薬製剤を調製する当業者によって企図され、従って、様々な投与量及び治療計画が望ましいと言える。
【０１３１】
多くの実施形態は本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれかの肝臓標的送達を意図しているが、他の組織の標的化も企図している。
ＩＶ．使用方法
【０１３２】
いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇの発現を低減する目的で、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか１種を有効量で細胞に送達するための方法が提供される。本明細書で提供される方法は、任意の適切な細胞型で有用である。いくつかの実施形態では、細胞はＨＢＶ抗原を発現する任意の細胞（例えば、肝細胞、マクロファージ、単球由来細胞、前立腺癌細胞、脳の細胞、内分泌組織、骨髄、リンパ節、肺、胆嚢、肝臓、十二指腸、小腸、膵臓、腎臓、消化管、膀胱、脂肪及び軟部組織並びに皮膚）である。いくつかの実施形態では、細胞は、被験体から得られ、限られた数の継代を経た可能性がある初代細胞であり、それにより、細胞は、その自然の表現型特性をほぼ維持する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドが送達される細胞は、エクスビボ細胞又はインビトロ細胞である（すなわち、培養中の細胞又は細胞が存在する生物に送達できる）。特定の実施形態では、肝細胞のＨＢｓＡｇの発現のみ低減する目的で、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか１種を有効量で細胞に送達するための方法が提供される。
【０１３３】
いくつかの実施形態では、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドは適切な核酸送達方法を用いて導入することが可能である。当該方法には、オリゴヌクレオチドを含む溶液の注入、オリゴヌクレオチドで覆われた粒子によるボンバードメント、オリゴヌクレオチドを含む溶液への細胞もしくは生物の曝露、又はオリゴヌクレオチドの存在下での細胞膜の電気穿孔が含まれる。オリゴヌクレオチドを細胞に送達するための他の適切な方法も使用してよい。この方法には、脂質媒介担体輸送、化学物質媒介輸送、及びリン酸カルシウムなどのカチオン性リポソームトランスフェクション等が挙げられる。
【０１３４】
阻害の結果は、細胞もしくは被験体の１つ以上の特性を評価するための適切なアッセイにより、又はＨＢＶ抗原発現を示す分子（例えば、ＲＮＡ、タンパク質）を評価する生化学的技術により確認できる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドがＨＢＶ抗原の発現レベルを低減する程度は、ＨＢＶ抗原の発現レベル（例えば、ｍＲＮＡ又はタンパク質レベル）を適切な対照（例えば、オリゴヌクレオチドが送達されていないか、又は陰性対照が送達されている細胞又は細胞集団におけるＨＢＶ抗原発現のレベル）と比較することにより評価する。いくつかの実施形態では、ＨＢＶ抗原発現の適切な対照レベルは、常に対照レベルを測定する必要がないように所定のレベル又は値にしてもよい。所定のレベル又は値は様々な形態を取ることが可能である。いくつかの実施形態では、所定のレベル又は値は中央値又は平均などの単一のカットオフ値とすることが可能である。
【０１３５】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドを投与すると、細胞におけるＨＢＶ抗原（例えば、ＨＢｓＡｇ）発現のレベルが低下する。いくつかの実施形態では、ＨＢＶ抗原発現レベルの低下は、ＨＢＶ抗原の適切な対照レベルと比較して１％以下、５％以下、１０％以下、１５％以下、２０％以下、２５％以下、３０％以下、３５％以下、４０％以下、４５％以下、５０％以下、５５％以下、６０％以下、７０％以下、８０％以下、又は９０％以下まで低下する可能性がある。適切な対照レベルは、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドと接触していない細胞又は細胞集団におけるＨＢＶ抗原発現のレベルであってもよい。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法に従ったオリゴヌクレオチドの細胞送達の効果は限定的な期間を経て評価する。例えば、ＨＢＶ抗原のレベルは細胞において、オリゴヌクレオチドの細胞への導入から少なくとも８時間、１２時間、１８時間、２４時間後に；又は少なくとも１、２、３、４、５、６、７、１４、２１、２８、３５、４２、４９、５６、６３、７０、７７、８４、９１、９８、１０５、１１２、１１９、１２６、１３３、１４０、もしくは１４７日後に分析してもよい。
【０１３６】
いくつかの実施形態では、ＨＢＶ抗原（例えば、ＨＢｓＡｇ）発現レベルの低下は、投与後長期間にわたって持続する。いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ発現の検出可能な低下は、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの投与から７〜７０日の期間内で持続する。例えば、いくつかの実施形態では、検出可能な低下はオリゴヌクレオチドの投与から１０〜７０日、１０〜６０日、１０〜５０日、１０〜４０日、１０〜３０日、又は１０〜２０日の期間内で持続する。いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から２０〜７０日、２０〜６０日、２０〜５０日、２０〜４０日、又は２０〜３０日の期間内で持続する。いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から３０〜７０日、３０〜６０日、３０〜５０日、又は３０〜４０日の期間内で持続する。いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から４０〜７０日、４０〜６０日、４０〜５０日、５０〜７０日、５０〜６０日、又は６０〜７０日の期間内で持続する。
【０１３７】
いくつかの実施形態では、ＨＢｓＡｇ発現の検出可能な低下は、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの投与から２〜２１週間の期間内で持続する。例えば、いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から２〜２０週、４〜２０週、６〜２０週、８〜２０週、１０〜２０週、１２〜２０週、１４〜２０週、１６〜２０週、又は１８〜２０週の期間内で持続する。いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から２〜１６週、４〜１６週、６〜１６週、８〜１６週、１０〜１６週、１２〜１６週、又は１４〜１６週の期間内で持続する。いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から２〜１２週、４〜１２週、６〜１２週、８〜１２週、又は１０〜１２週の期間内で持続する。いくつかの実施形態では、検出可能な低下は、オリゴヌクレオチドの投与から２〜１０週、４〜１０週、６〜１０週、又は８〜１０週の期間内で持続する。
【０１３８】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、細胞中でオリゴヌクレオチド（例えば、そのセンス鎖及びアンチセンス鎖）を発現するように遺伝子操作した導入遺伝子の形態で送達する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、本明細書で開示した任意のオリゴヌクレオチドを発現するように遺伝子操作した導入遺伝子を使用して送達する。導入遺伝子は、ウイルスベクター（例えば、アデノウイルス、レトロウイルス、ワクシニアウイルス、ポックスウイルス、アデノ随伴ウイルス又は単純ヘルペスウイルス）、又は非ウイルスベクター（例えば、プラスミド又は合成ｍＲＮＡ）を使用して送達してもよい。いくつかの実施形態では、導入遺伝子を被験体に直接注射できる。
ｉｉ．治療方法
【０１３９】
本開示の態様は、被験体におけるＨＢＶ感染の治療のためにＨＢｓＡｇ発現を低減する（例えば、ＨＢｓＡｇ発現を低減する）方法に関する。いくつかの実施形態では、当該方法は、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドのいずれか１種を有効量で、それを必要とする被験体に投与する工程を含んでもよい。本開示は、ＨＢＶ感染及び／又はＨＢＶ感染に伴う疾患もしくは障害の危険性がある（又はこれらにかかりやすい）被験体を治療する予防的及び治療的方法の両方を提供する。
【０１４０】
特定の態様では、本開示は、被験体に治療剤（例えば、オリゴヌクレオチド又はベクター又はそれらをコードする導入遺伝子）を投与することにより本明細書に記載の疾患又は障害を被験体において予防する方法を提供する。いくつかの実施形態では、治療対象の被験体は、例えば肝臓におけるＨＢｓＡｇタンパク質の量の低下から治療的に利益を得ると思われる被験体である。疾患又は障害の危険性がある被験体は、例えば、当技術分野で公知の診断アッセイ又は予後アッセイの１種又は併用（例えば、肝硬変及び／又は肝炎の同定）により特定することが可能である。疾患又は障害が予防されるか、又はその進行が遅れるように、予防薬の投与は、疾患又は障害に特徴的な症状の検出に先立って、又はその兆候が表れる以前に行うことが可能である。
【０１４１】
本明細書に記載の方法は典型的に、有効量、すなわち、望ましい治療結果をもたらし得る量のオリゴヌクレオチドを被験体に投与する工程を含む。治療的に許容可能な量は、疾患又は障害を治療できる量と言える。任意の１被験体の適切な投与量は、被験体のサイズ、体表面積、年齢、投与する特定の組成物、組成物中の有効成分（単数又は複数）、投与の時間及び経路、健康全般、併用する他の薬物などの特定の要素に依存する。例えば、投与量は０．１〜１２ｍｇ／ｋｇの範囲とすることが可能である。投与量はまた、０．５〜１０ｍｇ／ｋｇの範囲とすることも可能である。あるいは、投与量は１．０〜６．０ｍｇ／ｋｇの範囲とすることも可能である。投与量はまた、３．０〜５．０ｍｇ／ｋｇの範囲とすることも可能である。
【０１４２】
いくつかの実施形態では、経腸的に（例えば、経口、胃栄養チューブ、経十二指腸栄養チューブ、胃瘻又は直腸経由）、非経口的に（例えば、皮下注射、静脈内注射又は注入、動脈内注射又は注入、骨内注入、筋肉内注射、脳内注射、脳室内注射、くも膜下腔内）、局所的に（例えば、皮膚上、吸入、点眼薬、又は経粘膜）、又は標的臓器（例えば、被験体の肝臓）への直接注射により、本明細書で開示した組成物のいずれか１種を被験体に投与する。典型的には、本明細書で開示したオリゴヌクレオチドは静脈内又は皮下に投与する。
【０１４３】
非限定的な一連の例のとして、本開示のオリゴヌクレオチドは典型的には、四半期毎（３か月毎に１回）、隔月（２か月毎に１回）、毎月、又は毎週投与する。例えば、オリゴヌクレオチドは、１週間毎、２週間毎、又は３週間毎に投与してもよい。オリゴヌクレオチドは毎日投与してもよい。
【０１４４】
いくつかの実施形態では、治療対象の被験体は、ヒト又は非ヒト霊長類又は他の哺乳動物被験体である。被験体の他の例としては、イヌ及びネコなどの愛玩動物；ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、及びニワトリなどの家畜；並びにマウス、ラット、モルモット、及びハムスターなどの動物が挙げられる。
【実施例】
【０１４５】
実施例１．ＨＢｓＡｇ発現の強力なオリゴヌクレオチド阻害剤の開発
【０１４６】
ＨＢＶ感染を治療するためのＲＮＡｉに基づく治療の標的としてＨＢＶ表面抗原を同定した。図１に示すＨＢＶゲノム構成に表すように、ＨＢｓＡｇは、単一のＯＲＦから転写した３つのＲＮＡ分子にコードされる。オリゴヌクレオチドは、ＨＢｓＡｇアセンブリに寄与する１つ以上のＲＮＡ転写産物をサイレンシングする目的で設計した（図１の「Ｘ」で示したＲＮＡｉ標的部位の例）。ＨＢｓＡｇを標的とするオリゴヌクレオチドＨＢＶ‐２５４を設計し、インビトロ及びインビボで評価した。ＨＢＶ‐２５４は、４つのＨＢＶ  ＲＮＡ種のｍＲＮＡ転写産物を直接標的にする能力に基づいて選択及び設計した。実験で使用したＨＢＶ‐２５４二重鎖オリゴヌクレオチドには、（５’→３’方向に示す）ＧＵＧＧＵＧＧＡＣＵＵＣＵＣＵＣＡＡＵＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣ（配列番号２１）に規定される配列のセンス鎖；及び（５’→３’方向に示す）ＵＡＵＵＧＡＧＡＧＡＡＧＵＣＣＡＣＣＣＡＣＧＧ（配列番号２２）に規定する配列のアンチセンス鎖が含まれた。
【０１４７】
ＨＤＩマウスにおいてオリゴヌクレオチドＨＢＶ‐２５４の単回投与評価を行い、ＨＢｓＡｇウイルス転写産物を皮下標的化する能力を実証した（図２）。図に示すように、ＨＢＶ‐２５４は投与量の増加に伴ってマウスのＨＢｓＡｇレベルを系統的に低減した。ＨＢＶ‐２５４を３ｍｇ／ｋｇで皮下投与するＱＷ×３の投与計画後のマウスにおいて前臨床的効力を更に評価した（図３）。投与時間は図中の矢印で示す。１４７日間に渡ってオリゴヌクレオチド処理したマウス及び未処置の対照マウスの両方でＨＢｓＡｇレベルを監視した。試験期間全体に渡って処置マウスではＨＢｓＡｇレベル低下が持続し、最初の投与から約２か月で発現レベル（対照と比較）が低下ベースラインで落ち着いたことを確認した。
【０１４８】
未修飾テトラループ形態のオリゴヌクレオチドを使用したｐｓｉＣＨＥＣＫレポーターアッセイを用いるインビトロスクリーニングにより、他の強力なＨＢｓＡｇ標的化オリゴヌクレオチドを同定した。３つの異なるプレートからの結果を図４に示す。蛍光ベースのレポーターアッセイを用い、ＨｅＬａ細胞中、３種の濃度（１、１０、及び１００ｐＭ）でＨＢＶ‐２５４を含む各オリゴヌクレオチドを評価した。各プレートについて報告された結果は、陽性対照（８、４０、及び２００ｐＭ）、陰性対照（１ｎＭ）、及びｍｏｃｋトランスフェクションと比較して更に示す。ボックスで強調表示したオリゴヌクレオチドはインビボ試験用にスケールアップした。ここではＨＢＶ‐２１９及びＨＢＶ‐２５８が、ＨＢＶ‐２５４及びスクリーニングから同定したオリゴヌクレオチドの中で最も強力なオリゴヌクレオチドであることがわかった。ＨＢＶ‐２１９はＨＢＶ‐２５４より対数倍的な効力向上を示し、追加の評価のために選択した。
実施例２．包括的な治療有用性を高めるための配列保存分析及び遺伝子工学的ミスマッチ
【０１４９】
実施例１で評価した数種の最も強力なオリゴヌクレオチドをＨＢＶ遺伝子型Ａ‐Ｉのゲノム配列と比較した。初期保存分析の結果を表１に収載する。表に示すように、ＨＢＶ‐２１９の保存性はこれらのゲノム全体で比較的低くなっている。ただし、ミスマッチ（ＭＭ）がガイド鎖の１５位に導入されると、保存率が大幅に増加する（６６％から９６％に）。参照により本明細書に援用されるＧｅｎＢａｎｋ公共データベースから得る遺伝子型別Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）配列データを、生物情報学キュレーション及び整列化に使用した。
【表１】
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【０１５０】
次の保存性分析を行った。当該分析は表１の数種のオリゴヌクレオチドに焦点を当て、より広い探索パラメーターを含めた。例えば、初期の分析には完全長ゲノム配列のみを含めたが、焦点を絞った分析では、完全長及び部分的（標的部位との同一性が＞８０％）配列を含めた。また、試験したゲノムの数は、初期の分析における５，６２８から、焦点を絞った分析では１７，０００超に増やした。焦点を絞った分析の結果は、初期分析で観察された傾向と概ね一致した（表２）。表に示すように、また更に図５に示すように、ＨＢＶ‐２１９は、ガイド鎖の１５位でのミスマッチが忍容されない限り、ＨＢＶ遺伝子型Ｂ、Ｅ、Ｆ、Ｈ、及びＩに対して不活性であると予測された。
【表２】
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【０１５１】
ｐｓｉＣＨＥＣＫ‐２デュアルルシフェラーゼレポーターシステムを利用して、ＨＢＶ‐２１７、ＨＢＶ‐２１９、ＨＢＶ‐２５４、ＨＢＶ‐２５５、及びＨＢＶ‐２５８のそれぞれの選択した位置でのミスマッチ効果を評価した。ｐｓｉＣＨＥＣＫベクターは、レポーター遺伝子に融合した標的遺伝子の発現変化を監視することを可能にする。ここでは活性ＲＮＡｉは融合構成物を分解し、それに対応するレポーターシグナルを減少させる。図６は一般的にこれらのアッセイで利用されるベクターを示す。親部分のレポーター配列には、Ｓ  ＯＲＦ中の対象標的部位の周囲にある遺伝子型Ａ（ＧｅｎＢａｎｋ：ＡＭ２８２９８６．１）から得た１２０塩基対断片が含まれていた。親オリゴヌクレオチド二重鎖配列は、図６に示される対応部位でレポータープラスミドと１００％の相同性を有する。一方、ミスマッチオリゴヌクレオチド二重鎖配列は、レポータープラスミドに対して単一のミスマッチを有する。試験したオリゴヌクレオチドの親及びミスマッチ配列は図７に示すように、親部分レポーター配列に対応するように整列させている。
【０１５２】
例示的なミスマッチアッセイでは、試験したオリゴヌクレオチドには同一の修飾パターンが含まれていた。図７の各オリゴヌクレオチドについて示したナンバリングスキームによれば、修飾は以下の通りである：１位の５’‐メトキシ，ホスホネート‐４’‐オキシ‐２’‐Ｏ‐メチルウリジン；２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６、及び１９位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド；１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８、及び２０〜２２位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド；並びに１位と２位、２位と３位、３位と４位、２０位と２１位、２１位と２２位のヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合。ミスマッチ位置は、各親及びミスマッチセットで異なり、図７のボックスに示す。
【０１５３】
各オリゴヌクレオチドを用いたｐｓｉＣＨＥＣＫ２レポーターアッセイは、ＨｅＬａ細胞にトランスフェクトして、１ｎＭから開始し６点５倍段階希釈を利用して、３日間行った。１日目に、１０，０００個のＨｅＬａ細胞／ウェル（９６ウェル）を、黒い壁及び透明底を有するプレートに播種した（８０〜９０％コンフルエント）。２日目に、ベクターＤＮＡ及びＲＮＡｉ分子を適量の無血清Ｏｐｔｉ‐ＭＥＭ（登録商標）Ｉ培地に希釈し、穏やかに混合した。Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）２０００を穏やかに混合した後、０．２μＬを２５μＬの無血清Ｏｐｔｉ‐ＭＥＭ（登録商標）Ｉ培地に希釈し、各反応を行った。希釈液を穏やかに混合し、室温で５分間インキュベートした。５分間のインキュベーション後、等量の希釈ＤＮＡ及びＲＮＡｉ分子を、希釈したＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）２０００と混合した。混合物を穏やかに混合し、室温で２０分間インキュベートして複合体を形成した。これに続いて、ＤＮＡ‐ＲＮＡｉ分子‐Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（登録商標）２０００複合体を、細胞及び培地を含む各ウェルに加え、プレートを前後に揺らして穏やかに混合した。次に、標的遺伝子の回収及びアッセイを行う準備ができるまで、細胞をＣＯ2インキュベーター内、３７℃でインキュベートした。３日目に、１００μＬのＤｕａｌ‐Ｇｌｏ試薬を各ウェルに加え、混合し、１０分間インキュベートした後、発光を読み出した。更に、１００μＬのＤｕａｌ‐Ｇｌｏ  Ｓｔｏｐ＆Ｇｌｏを各ウェルに加え、混合し、１０分間インキュベートしてから発光を読み出した。活性に対するミスマッチの効果を評価するために、親及びミスマッチオリゴヌクレオチドごとに用量反応曲線を作成した。各オリゴヌクレオチドについて測定したＥＣ50値を、仕様を添付して表３に示す。
【表３】
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【０１５４】
相対的ＥＣ50値で示されるように、ＨＢＶ‐２１９二重鎖のインビトロ用量‐反応曲線から、ガイド鎖の１５位における単一ミスマッチによる活性の損失は無いことが分かった。ＨＢＶ‐２１９親（ここではＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１とする）とミスマッチオリゴヌクレオチド（ここではＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２とする）とを比較する次のインビトロ分析から、ミスマッチの導入により活性が失われないことが確認された（図８）。図９の単回用量滴定プロットに示すように、ＨＢＶ‐２１９ミスマッチオリゴヌクレオチド二重鎖（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）は、投与後７０日間に渡ってインビボで忍容された。
【０１５５】
図１０は、ミスマッチが組み込まれたＨＢＶ‐２１９（ここではＨＢＶ（ｓ）‐２１９とする）の修飾二重鎖構造の例を示す。図７の各オリゴヌクレオチドについて示されたナンバリングスキームによれば、センス鎖はヌクレオチド１から３６に及び、アンチセンス鎖はオリゴヌクレオチド１から２２に及び、後者の鎖は右から左の向きに番号を付けて示されている。二重鎖形態は、センス鎖の３６位のヌクレオチドとアンチセンス鎖の１位のヌクレオチドとの間にニックを入れて示されている。センス鎖の修飾は以下の通りであった：３、８〜１０、１２、１３、及び１７位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド；１、２、４〜７、１１、１４〜１６、１８〜２６、及び３１〜３６位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド；１位と２位のヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合；２７位の２’‐ＯＨヌクレオチド；２７位の２’‐アミノジエトキシメタノール‐グアニジン‐ＧａｌＮＡｃ；並びに２８、２９、及び３０位それぞれの２’‐アミノジエトキシメタノール‐アデニン‐ＧａｌＮＡｃ。アンチセンス鎖の修飾は以下の通りであった：１位の５’‐メトキシ，ホスホネート‐４’‐オキシ‐２’‐Ｏ‐メチルウリジンホスホロチオエート；２、３、５、７、８、１０、１２、１４、１６、及び１９位の２’‐フルオロ修飾ヌクレオチド；１、４、６、９、１１、１３、１５、１７、１８、及び２０〜２２位の２’‐Ｏ‐メチル修飾ヌクレオチド；並びに１位と２位、２位と３位、３位と４位、２０位と２１位、及び２１位と２２位のヌクレオチド間のホスホロチオエートヌクレオチド間結合。アンチセンス鎖には、１５位に組み込まれたミスマッチが含まれていた。また、図示するように、二重鎖のアンチセンス鎖には、２１位から２２位にわたる「ＧＧ」オーバーハングが含まれていた。
【０１５６】
ＨＢＶ（ｓ）‐２１９及び上述の２つの前駆体（ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１及びＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２）についての詳細を表４に示す。
【表４】
2021500025.tif 000018
実施例３：ＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体の抗ウイルス活性
【０１５７】
ＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の細胞内局在化に対するＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体の治療効果を評価した。ＮＯＤscidマウスを、ＨＢＶゲノムの頭‐尾二量体の流体力学的注射（ＨＤＩ）に供した。オリゴヌクレオチドによる処置は、ＨＤＩから２週間後に開始した。処置後にマウスから単離した肝細胞の免疫組織化学的染色から、ＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）発現が急激に低下したことが分かった。
【０１５８】
ＨＢＶウイルス転写産物の全体的な発現に対するＨＢｓＡｇノックダウンの効果を調べるために、ＲＮＡ配列決定を行った。ＨＤＩマウスに３ｍｇ／ｋｇで週１回投与を３回行ってから４日後に幹細胞を単離した。全ＲＮＡを肝細胞から抽出し、ＨｉＳｅｑ  Ｐｌａｔｆｏｒｍを使用したＩｌｌｕｍｉｎａ配列決定に供した。図１１Ｂは、検出されたＲＮＡ転写産物配列をＨＢＶ  ＲＮＡに対してマッピングしたＲＮＡ配列決定結果を示す。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９とその前駆体の標的部位も図示しており、オリゴヌクレオチドがｐｇＲＮＡ（３．５ｋｂ）、Ｓ１（２．４ｋｂ）、及びＳ２（２．１ｋｂ）転写産物を標的にすることが示されている。結果から、ビヒクル対照と比較して、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１での処置により全ＨＢＶウイルス転写産物のうち９０％超がサイレンシングされたことが分かる。
【０１５９】
ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１オリゴヌクレオチドの持続効果は、ＨＢＶの２つの異なるマウスモデル：ｃｃｃＤＮＡ依存性ＨＤＩモデル、及びｃｃｃＤＮＡ非依存性であるＡＡＶモデルで試験した。ＨＢＶのＨＤＩモデルにおいて、ビヒクル対照、及びＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと比較して、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１オリゴヌクレオチド３ｍｇ／ｋｇを週１回投与で３回行う処置状況下で、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現の経時的（１２週間）分析を行った（図１２Ａ）。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１オリゴヌクレオチドはＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現の≧３．９ｌｏｇ減少を示し、活性持続期間は７週間超と比較的長く：一方、比較として、ＨＢＶ（ｘ）を標的とするオリゴヌクレオチドは約３．０ｌｏｇ減少を示し、持続期間は前者より短かった。
【０１６０】
ＡＡＶ‐ＨＢＶモデルにおいて、ビヒクル対照、及びＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと比較して、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１オリゴヌクレオチド３ｍｇ／ｋｇを週１回投与で３回行う処置状況下で、ＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡ発現の更なる経時的（１２週間）分析を行った（図１２Ｂ）。このモデルでは、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２オリゴヌクレオチドは、ＨＢＶ（ｘ）を標的とするオリゴヌクレオチドと同等のｌｏｇ減少と持続期間を示した。図１２Ａ及び図１２Ｂで使用するＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、ＵＧＣＡＣＵＵＣＧＣＧＵＣＡＣＣＵＣＵＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣのセンス鎖配列、及びＵＡＧＡＧＧＵＧＡＣＧＣＧＡＡＧＵＧＣＡＧＧのアンチセンス鎖配列を有する。ＨＢｘＡｇを標的とするこのＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、本明細書ではＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸと称する。
【０１６１】
免疫組織化学的染色を行い、ビヒクル対照、及び上述のＨＢｘＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＲＶＡｉオリゴヌクレオチドと比較して、上記で示したようにＨＢｓＡｇ  ｍＲＮＡを標的とするＨＢＶ（ｓ）‐２１９前駆体オリゴヌクレオチドで処置した後のＨＢＶのＡＡＶ‐ＨＢＶモデル及びのＨＤＩモデルから得られた肝細胞におけるＨｂｃＡｇの細胞内分布を試験した（図１３）。処置後の残留コアタンパク質（ＨＢｃＡｇ）から、ＨＤＩモデルでの２種のＲＮＡｉオリゴヌクレオチド間で細胞内局在に顕著な違いが示されたが、ＡＡＶモデルでは違いは見られなかった。
実施例４：ＰＸＢ‐ＨＢＶキメラヒト肝臓モデル遺伝子型ＣにおけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１の評価
【０１６２】
キメラヒト肝臓モデルとしてＨＢＶに関する文献でも知られているＰＸＢ‐ＨＢＶモデルにおいてＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１の抗ウイルス活性を評価した。この技術は、ヒト肝細胞を重篤な免疫無防備状態のマウスに移植し、遺伝的メカニズムを利用して宿主マウス肝細胞を毒害することに基づいている（Ｔａｔｅｎｏら、２０１５年）。この過程により、マウスは＞７０％がヒト組織に由来する肝臓を含み、野生型マウスとは異なり、ＨＢＶに感染することが可能になる（Ｌｉら、２０１４年）。ＰＸＢ‐ＨＢＶモデルはＨＢＶ（ｓ）‐２１９薬理学の観点からいくつかの目的を果たしている：（１）オリゴヌクレオチドがインビボでヒトＲＮＡｉ機構（ＲＩＳＣ）に関与している可能性を確認する；（２）ＧａｌＮＡｃを標的とするリガンド構造はインビボでヒトＡＳＧＲを介して肝細胞に内在化する可能性を確認する；（３）ＨＢＶ感染の真の（ＨＢＶ発現の遺伝子操作モデルに対する）モデルにおいて有効性を確認する。移植されたヒト肝細胞が不規則なキメラ肝生理学をもたらすという制限があるにもかかわらず（Ｔａｔｅｎｏら、２０１５年）、このモデルでは有意な抗ウイルス効果が観察できる。
【０１６３】
ＨＢＶ遺伝子型Ｃによるマウスの初期感染からおよそ８週間後、各マウスから血漿を採取し、ベースラインＨＢｓＡｇ測定値として使用する。次に、各９匹のマウスのコホート（ＰＫについてはｎ＝３、ＰＤについてはｎ＝６）に、０（ＰＢＳ）又は３ｍｇ／ｋｇのＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１を週３回、ＳＣ注射した。投与の初日を０日目とする。非末梢血採取を毎週行い、各マウスの血清ＨＢｓＡｇ及び循環ＨＢＶ  ＤＮＡレベルを測定した（図１４Ａ〜図１４Ｄ）。マウスは、２８日目に末梢組織エンドポイントのために安楽死させた。２８日目の肝臓試料を、肝臓内ＨＢＶ  ＤＮＡ及びｃｃｃＤＮＡレベルについて分析した。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ１で処理したマウスについて分析した全エンドポイントで、有意な抗ウイルス活性が観察され、ＨＢｓＡｇの＞８０％低下、並びに循環ＨＢＶ  ＤＮＡ、肝内ＨＢＶ  ＤＮＡ、及びｃｃｃＤＮＡの有意な減少が見られた（図１４Ａ〜図１４Ｄ）。これらのデータから、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９での処置が全身投与後に感染ヒト肝細胞で抗ウイルス活性をもたらすことが実証されている。
実施例５：エンテカビルの抗ウイルス活性を増強するＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２
【０１６４】
治療の現在の標準であるヌクレオチド（ヌクレオシド）類似体（例えば、エンテカビル）は、循環ＨＢＶゲノムＤＮＡの低減には有効であるが、循環ＨＢｓＡｇは低減しない。このことにより、このような治療中はウイルス血症が制御されるが、生涯にわたる治療が必要であり、機能的治療が達成されることはまれである。Ｓ抗原を標的とするＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、ウイルスポリメラーゼ及びＨＢｓＡｇタンパク質の両方に影響を与える。この研究では、抗ウイルス活性について、ＨＢＶ発現マウス（ＨＤＩモデル）において単剤療法としてのＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、及びエンテカビルとの併用治療の複合効果を検討した。
【０１６５】
マウスに、５００ｎｇ／ｋｇのエンテカビル（ＥＴＶ）を毎日１４日間経口投与した。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の単回皮下投与を行った。循環ウイルス負荷（ＨＢＶ  ＤＮＡ）をｑＰＣＲ（図１５Ａ）により測定し、血漿ＨＢｓＡｇレベルをＥＬＩＳＡ（図１５Ｂ）により測定し、肝臓ＨＢＶ  ｍＲＮＡ及びｐｇＲＮＡレベルをｑＰＣＲにより測定した。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２とＥＴＶの併用療法で明らかな相加効果が観察された。結果から、ＥＴＶ療法のみでは循環ＨＢｓＡｇ又は肝臓ウイルスＲＮＡに対して効果がないことが分かる。更に、ＨＢｓＡｇ又はＨＢＶ  ＲＮＡにより測定されたＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の抗ウイルス活性はＥＴＶの共投与に影響を受けることはない（図１５Ｂ及び図１５Ｃ）。
【０１６６】
図１５Ａ〜１５Ｃに示すように、１４日間毎日５００ｎｇ／ｋｇのＰＯ投与を行うエンテカビルの単剤療法の結果、ＰＢＳ処置マウスと比較して、血漿中に検出されたＨＢＶ  ＤＮＡで平均約１．６ｌｏｇ減少が示された（ｎ＝６）。循環ＨＢｓＡｇ、又は肝ウイルスＲＮＡのいずれかには有意な減少は観察されなかった。０日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の単独１ｍｇ／ｋｇ又は３ｍｇ／ｋｇのＳＣ投与を行う単剤療法の結果、ＰＢＳと比較して、血漿中に検出されたＨＢＶ  ＤＮＡでそれぞれ平均約０．８ｌｏｇ減少又は約１．８ｌｏｇ減少が示された（ｎ＝７）。０日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の単独６ｍｇ／ｋｇのＳＣ投与を行う単剤療法の結果、血漿中ＨＢＶ  ＤＮＡで平均約２．５ｌｏｇ減少が示され、２匹のマウスのレベルが検出限界を下回っていた（ｎ＝７）。０日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の単独ＳＣ投与を行う単剤療法の結果、循環ＨＢｓＡｇと肝臓ウイルスＲＮＡの両方に用量依存的な減少が示された。エンテカビル５００ｎｇ／ｋｇを１４日間毎日ＰＯ投与し、０日目にＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の単独１ｍｇ／ｋｇのＳＣ投与を行う併用療法の結果、血漿中に検出されたＨＢＶ  ＤＮＡで平均約２．３ｌｏｇ減少が追加的に示された。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２の単独１ｍｇ／ｋｇＳＣ投与の単剤療法で、血漿ＨＢｓＡｇ及び肝臓ウイルス転写産物のレベルで同様の減少が観察され、血漿ＨＢＶ  ＤＮＡの減少で相加性が示されたが、循環ＨＢｓＡｇ又は肝臓ウイルス転写産物では示されなかった。
実施例６．  ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２とＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸとの抗ウイルス活性の比較
【０１６７】
本研究では、ＨＢＶ発現マウス（ＨＤＩモデル）に、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ（図１２Ａ及び図１２Ｂで使用するＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸと同じ配列）、又は２種のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの組み合わせを投与し、投与後２週間又は９週間の血漿ＨＢｓＡｇレベルを監視した。図１６Ｂに示すように、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２もしくはＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸのいずれか、又はこれらの組み合わせの単独飽和９ｍｇ／ｋｇのＳＣ投与を行う処置から２週間後に、同様のレベルのＨＢｓＡｇ抑制が観察された。Ｓ‐標的化ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２処理で処置したマウスではＨＢｓＡｇの長期的抑制が観察され、一方、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ又はこれらの組み合わせで処置したマウスでは、処置後９週間でＨＢｓＡｇが有意に回復した（ｎ＝３）。
【０１６８】
また、ＨＢＶ発現マウスにおけるＨＢＶコア抗原（ＨＢｃＡｇ）の細胞内局在化を、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ、又はこれらの２種のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの組み合わせを投与したマウスにおいて評価した。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２、ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸ、又はこれらの１：１の組み合わせの単独飽和用量（９ｍｇ／ｋｇ、ｓ．ｃ．）でＨＢＶ発現マウス（ＨＤＩモデル）を処置した。図１７Ａに示す時点で、肝臓切片をＨＢｃＡｇについて染色した；代表的な肝細胞を図に示す。単剤療法として、又はＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＸと組み合わせて、ＨＢＶ（ｓ）‐２１９Ｐ２で処置したコホートは核ＨＢｃＡｇを特徴づけている。ＧａｌＸＣ‐ＨＢＶＳのみで処置したコホートは、治療応答の好ましい予後指標として報告されているＨＢｃＡｇの細胞質局在のみを示している（Ｈｕａｎｇら、Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｍｏｌ．Ｍｅｄ．２０１８年）。各動物において核染色されたＨＢｃＡｇ陽性細胞の割合を図１７Ｂに示す（ｎ＝３／群、１匹当たり５０細胞、投与後２週間）。ＨＢｃＡｇ細胞内局在化に対する効果はＨＢＶトランスクリプトームの領域によるものであってＲＮＡｉ配列の未知の特性によるものではないことを確認するために、Ｘ及びＳオープンリーディングフレーム内を標的にして、代替配列を設計及び試験した（図１７Ｃ参照）。図１７ＣではＨＢＶ‐２５４を使用した。ＨＢＶ‐２５４の配列は実施例１で記述している。図１７Ｃで使用したＨＢｘＡｇを標的とする代替オリゴヌクレオチドはＧＣＡＣＣＵＣＵＣＵＵＵＡＣＧＣＧＧＡＡＧＣＡＧＣＣＧＡＡＡＧＧＣＵＧＣのセンス鎖配列、及びＵＵＣＣＧＣＧＵＡＡＡＧＡＧＡＧＧＵＧＣＧＧのアンチセンス配列を有する。２種の別のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、Ｓ又はＸ抗原において、図１６Ｂで使用したＲＮＡｉオリゴヌクレオチドとは異なるＲＮＡｉ標的配列を有する。しかし、それらは血漿レベルＨＢｃＡｇに対して同じ示差的効果を示し、その効果はＳ抗原自体を標的とすることに特異的であるが、使用されるオリゴヌクレオチドには特異的ではないことが示された。
実施例７  健康なヒト被験者における安全性、忍容性、及びＨＢＶ患者におけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９の有効性の評価
【０１６９】
本試験は、健康な被験者（Ａ群）における安全性及び忍容性、並びにＨＢＶ患者（Ｂ群）におけるＨＢＶ（ｓ）‐２１９の有効性を評価するように設計している。コホート情報別の用量を図１８に示す。ＨＢＶ（ｓ）‐２１９の分子構造を図１０及び図１９Ａに示し、また以下にも示す：
2021500025.tif 000019
【０１７０】
患者選択基準を以下に示す。
Ａ群  ‐  健康な被験者
選択基準：
１．インフォームドコンセントに署名した時点で、１８歳（又は法的同意の年齢、どちらか年長の方）から６５歳まで。
２．治療歴、健康診断及び研究室検査を含む医学的評価により決定するスクリーニング時に明白に健康であること。
ａ．進行中の疾患の症状がない。
ｂ．体温、脈拍数、呼吸数、血圧に臨床的に重大な異常がない。
ｃ．臨床的に重要な心血管疾患又は肺疾患、及び薬理学的投薬を必要とする心血管疾患又は肺疾患がない。
３．スクリーニング時に、そして治験責任医師のオピニオンの１日目のときに、正常な範囲内にある、又は臨床的に有意な異常のない１２誘導心電図（ＥＣＧ）を装着していること。
４．スクリーニング来院１のときに、及び入院時（１日目）に、アルコール又は薬物乱用のスクリーニングが陰性であること。
５．スクリーニング来院１以前の少なくとも５年間、非喫煙者であり、スクリーニング来院１での尿中コチニン濃度が陰性であること。
６．ボディマス指数（ＢＭＩ）が１８．０ｋｇ／ｍ2以上３２．０ｋｇ／ｍ2以下の範囲内であること。
７．男性又は女性：
ａ．男性参加者：
男性参加者は、治療期間中、及び研究介入での投与後少なくとも２週間、避妊手段を使用し、この期間中は精子を提供しないことに同意しなければならない。
ｂ．女性参加者：
女性の参加者は、妊娠しておらず、授乳中でなく、以下の条件の少なくとも１つが当てはまる場合に参加する資格がある：出産可能性のある女性（ＷＯＣＢＰ）ではない女性か、又は地域によっては；避妊をスクリーニング後の試験登録から開始し、研究介入での投与後少なくとも１２週間、治療期間全体にわたって継続する避妊ガイダンスに従うことに同意したＷＯＣＢＰ。
８．要件及び制限の遵守を含む、署名されたインフォームドコンセント１を提出できること。
【０１７１】
除外基準、Ａ群
１．試験薬物の吸収、分布、もしくは排除、又は本試験における臨床評価及び実験評価を妨害する可能性のあるあらゆる病状の既往歴があること。これには以下が含まれる（限定されるものではない）：慢性もしくは再発性腎疾患、機能性腸障害（例えば、頻回の下痢又は便秘）、消化管疾患、膵炎、発作障害、皮膚粘膜もしくは筋骨格障害、自殺未遂（単数又は複数）もしくは自殺念慮の既往歴、又は臨床的に有意な抑鬱もしくは薬理学的介入を必要とする他の精神神経障害。
２．不十分に制御された、もしくは不安定な高血圧；又は、スクリーニング時に持続収縮期血圧が＞１５０ｍｍＨｇであるか、もしくは拡張期血圧が＞９５ｍｍＨｇであること。
３．インスリン又は血糖降下剤で治療された真性糖尿病の既往歴。
４．過去１２か月以内に入院を必要とした喘息の既往歴。
５．中央研究所でスクリーニング結果により判定されたＧ‐６‐ＰＤ欠乏症の痕跡。
６．薬理学的に治療する甲状腺状態を除外する甲状腺状態（甲状腺機能亢進症／甲状腺機能低下症等）を除いて、現在不十分に制御されている内分泌状態。
７．参加者の悪性腫瘍が化学療法で完全寛解状態にあり、過去３年間に追加の医学的又は外科的介入を受けていない場合、悪性腫瘍の既往歴が認められること。
８．多数の薬物アレルギーの既往歴、又はオリゴヌクレオチド又はＧａｌＮＡｃに対するアレルギー反応の既往歴。
９．研究介入の投与又は局所忍容性の評価を潜在的に妨げる可能性があるＳＣ注射（単数又は複数）又は重大な腹部瘢痕に対する非忍容性の既往歴。
１０．臨床的に関連する手術歴。
１１．過去３年以内の持続的なエタノール乱用（＞４０ｇエタノール／日）又は違法薬物使用の既往歴。
１２．研究介入の投与前７日以内に生じた臨床的に重大な疾患。
１３．研究介入の投与前２か月以内の５００ｍＬを超える献血、又はスクリーニング前７日以内の血漿献血。
１４．スクリーニングで進行中に生じた重大な感染又は既知の炎症過程（治験責任医師の意見による）。
１５．慢性もしくは再発性尿路感染症（ＵＴＩ）、又はスクリーニング前１か月以内のＵＴＩの既往歴。
１６．本試験の実施中に選択的外科処置の予定があること。
１７．研究介入の投与前４週間以内の処方薬の使用。
１８．治験責任医師及びスポンサーにより臨床的に関連がないと合意されていないにも関わらず、最初の投与から７日以内に、通常のビタミンを除いた店頭（ＯＴＣ）薬又はハーブサプリメントを使用すること。
１９．投与前３か月以内に治験薬を投与されたか、又は試験前に別の臨床試験の経過観察中であること。
２０．スクリーニング時のＨＢＶ、ＨＩＶ、ＨＣＶ、又はＨＤＶ抗体の血清陽性（スクリーニング前３か月以内に実施される場合、既往歴検査を利用してもよい）。
２１．アラニンアミノトランスフェラーゼ（ＡＬＴ）、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ（ＡＳＴ）、ガンマ‐グルタミルトランスフェラーゼ（ＧＧＴ）、総ビリルビン、アルカリホスファターゼ（ＡＬＰ）、又はアルブミンがスクリーニング来院時又は入院時（１日目）に基準範囲外にあること。
２２．臨床的に関連があり、治験責任医師に容認できないと判断された完全血球数検査異常；＜１２．０ｇ／ｄＬ（１２０ｇ／Ｌに相当）のヘモグロビン；正常範囲外の血小板。
２３．＞７％のヘモグロビンＡｌＣ（ＨｂＡｌＣ）。
２４．臨床的に重要であり、治験責任医師に容認できないと判断されたその他の安全性臨床試験結果。
２５．臨床研究センターに入院する４８時間前から試験終了まで、運動レベルを大幅に変更したこと、又は変更する予定があること。
２６．治験責任医師の意見において、参加者を登録に適さないようにする状態、又は試験への参加もしくは試験の完了を妨害する可能性があるあらゆる状態。
【０１７２】
Ｂ型肝炎の成人Ｂ群
選択基準、Ｂ群
１．インフォームドコンセントに署名した時点で、１８歳（又は法的同意の年齢、どちらか年長の方）から６５歳まで。
２．以下に示す慢性Ｂ型肝炎感染：
ａ．適応する臨床情報に基づいてＣＨＢに適応する臨床既往歴があり、また以前にＨＢｓＡｇに血清陽性を示し、他のＨＢＶ血清学的マーカー（ＨＢｅＡｇ、ＨＢＶ  ＤＮＡ）に血清陽性を示す可能性がある。
ｂ．ＨＢｅＡｇ陽性患者の場合、スクリーニング時に血清ＨＢｓＡｇが＞１，０００ＩＵ／ｍＬであるか、あるいはＨＢｅＡｇ陰性患者の場合、＞５００ＩＵ／ｍＬである。
ｃ．中央研究所においてＴａｑＭａｎ（商標）ＨＢＶ  ＤＮＡ  ｖ２．０アッセイで測定した治療歴のない患者のスクリーニングでの血清ＨＢＶ  ＤＮＡが＞２０，０００ＩＵ／ｍＬである。
ｄ．血清ＩｇＭ抗ＨＢｃ陰性。
３．肝硬変の痕跡がない、代償性肝疾患に適応した臨床既往歴：
ａ．食道又は胃腸静脈瘤からの出血の既往歴なし。
ｂ．腹水の既往歴なし。
ｃ．慢性肝疾患に起因する黄疸の既往歴なし。
ｄ．肝性脳症の既往歴なし。
ｅ．門脈圧亢進症‐クモ状血管腫等の物理的な徴候なし。
ｆ．肝硬変を示した過去の肝生検、肝画像検査、エラストグラフィ結果なし。
４．Ｂ型肝炎の治療経験がないこと：Ｂ型肝炎に対する過去の抗ウイルス治療がないか（過去のＨＢＶヌクレオシド（ヌクレオチド）又はインターフェロン含有治療なし）、又は十分な忍容性及びコンプライアンスのあるスクリーニング来院の少なくとも１２週間前から継続的にヌクレオシド（ヌクレオチド）療法（エンテカビル又はテノホビル）を行っていること。
５．血清ＡＬＴ＞６０Ｕ／Ｌ（男性）、又は＞３８Ｕ／Ｌ（女性）（２×ＵＬＮ。Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｓｔｕｄｙ  ｏｆ  Ｌｉｖｅｒ  Ｄｉｓｅａｓｅ（ＡＡＳＬＤ）ＨＢＶガイダンス基準。Ｔｅｒａｕｌｔら、２０１６年）
６．スクリーニング時、及び１日目に、１２誘導ＥＣＧで（治験責任医師の意見において）臨床的に有意な異常がないこと。
７．肝疾患の他の認知された原因が無いこと。
８．十分に制御された高血圧及び高コレステロール血症のスタチン管理以外に、持続的な医学的管理又は慢性的もしくは再発的な薬理学的介入を必要とする他の医学的状態がないこと。
９．ＢＭＩが１８．０ｋｇ／ｍ2以上３２．０ｋｇ／ｍ2以下の範囲内であること。
１０．男性又は女性：
ａ．男性参加者：
男性参加者は、治療期間中、及び研究介入での最後の投与後１２週間、避妊手段を使用し、この期間中は精子を提供しないことに同意しなければならない。
ｂ．女性参加者：
女性の参加者は、妊娠しておらず、授乳中でなく、以下の条件の少なくとも１つが当てはまる場合に参加する資格がある：ＷＯＣＢＰではないか、又は地域によっては、治療期間中、及び研究介入での投与後少なくとも１２週間、避妊ガイダンスに従うことに同意したＷＯＣＢＰ。
１１．要件及び制限の遵守を含む、署名されたインフォームドコンセントを提出できること。
【０１７３】
除外基準、Ｂ群
１．試験薬物の吸収、分布、もしくは排除、又は本試験における臨床評価及び実験評価を妨害する可能性のあるいずれかの病状の既往歴があり、これには以下が含まれる（限定されるものではない）：慢性もしくは再発性腎疾患、機能性腸障害（例えば、頻回の下痢又は便秘）、消化管疾患、膵炎、発作障害、皮膚粘膜もしくは筋骨格障害、自殺未遂（単数又は複数）もしくは自殺念慮の既往歴、又は臨床的に有意な抑鬱もしくは薬理学的介入を必要とする他の精神神経障害。
２．不十分に制御された、又は不安定な高血圧。
３．インスリン又は血糖降下剤で治療された真性糖尿病の既往歴。
４．過去１２か月以内に入院を必要とした喘息の既往歴。
５．中央研究所でスクリーニング結果により判定されたＧ‐６‐ＰＤ欠乏症の痕跡。
６．薬理学的に治療する甲状腺状態以外の甲状腺状態（例えば、甲状腺機能亢進症／甲状腺機能低下症等）を除く、現在不十分に制御されている内分泌状態。
７．慢性もしくは再発性ＵＴＩ、又はスクリーニング前１か月以内のＵＴＩの既往歴。
８．ＨＣＣの既往歴
９．患者の悪性腫瘍が化学療法で完全寛解状態にあり、過去３年間に医学的又は外科的介入が追加されていない場合、ＨＣＣ以外の悪性腫瘍の既往歴は許容される。
１０．過去３年以内の持続的なエタノール乱用（＞４０ｇエタノール／日）又は違法薬物使用の既往歴。
１１．研究介入の投与又は局所忍容性の評価を潜在的に妨げる可能性があるＳＣ注射（単数又は複数）又は重大な腹部瘢痕に対する非忍容性の既往歴。
１２．治療前６週間の間に輸血を受けたか、又は治験後経過観察中に輸血されることが予想される場合。
１３．スクリーニング前２か月以内の＞５００ｍＬの献血もしくは失血、又はスクリーニング前７日以内の血漿献血。
１４．過去３年間に、スクリーニング又はインターフェロン治療から３か月以内に抗ウイルス療法（エンテカビル又はテノホビル以外）を受けたこと。
１５．抗凝固剤、全身投与コルチコステロイド、全身投与免疫調節剤、又は全身投与免疫抑制剤の過去６か月以内の使用（又はそれらを使用する予定の要件）。
１６．ＰＩ又はスポンサーの意見において試験の実行に干渉すると判断された、研究介入の投与前１４日以内の処方薬の使用。全身吸収のない局所製品、スタチン（ロスバスタチンを除く）、高血圧治療薬、ＯＴＣ及び処方鎮痛薬又はホルモン避妊薬（女性）は許容される。
１７．注入型／埋め込み型受胎調節を除いて、試験介入の投与前３か月以内の薬剤の蓄積注射又は移植。
１８．ハーブ系サプリメント又は店頭販売全身薬を永続的に使用すること；参加者は、試験期間中は進んで停止する必要がある。
１９．投与前３か月以内に治験薬を投与されたか、又は試験登録前に別の臨床試験の経過観察中であること。
２０．スクリーニング時に肝エラストグラフィ（すなわちＦｉｂｒｏＳｃａｎ（登録商標））でｋＰａが＞１０．５であること。
２１．スクリーニング時、仰臥位から１０分後、収縮期血圧が＞１５０ｍｍＨｇであり、拡張期血圧が＞９５ｍｍＨｇであること。
２２．スクリーニングで肝トランスアミナーゼ（ＡＬＴ又はＡＳＴ）が＞７×ＵＬＮと確認されたこと。
２３．ジルベール病又はデュビン・ジョンソン症候群が認識できない限り、持続性又は再発性の高ビリルビン血症の既往歴。
２４．ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）又はＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）又はデルタ肝炎ウイルス（ＨＤＶ）に対する抗体の血清陽性。
２５．Ｈｇｂが＜１２ｇ／ｄＬ（男性）又は＜１１ｇ／ｄＬ（女性）。
２６．スクリーニング時、血清アルブミンが＜３．５ｇ／ｄＬ。
２７．スクリーニング時、総ＷＢＣ数が＜４，０００細胞個／μＬ、又は絶対好中球数（ＡＮＣ）が＜１８００細胞個／μＬ。
２８．スクリーニング時、血小板数がμＬ当たり≦１００，０００。
２９．スクリーニング時の国際標準比（ＩＮＲ）又はプロトロンビン時間（ＰＴ）が、通常の基準範囲（現場の研究室基準範囲として）の上限を超えていること。
３０．血清ＢＵＮ又はクレアチニンが＞ＵＬＮであること。
３１．血清アミラーゼ又はリパーゼが＞１．２５×ＵＬＮであること。
３２．血清ＨｂＡ１ｃが＞７．０％であること。
３３．血清アルファ胎児タンパク質（ＡＦＰ）値が＞１００ｎｇ／ｍＬであること。スクリーニング時のＡＦＰが＞ＵＬＮであるが＜１００ｎｇ／ｍＬである場合、肝画像検査により、ＨＣＣの疑いのある病変が明らかにならない限り患者は適格である。
３４．臨床的に重要であり、治験責任医師に容認できないと判断されたその他の安全臨床試験結果。
３５．臨床研究センターに入院する４８時間前から試験終了まで、運動レベルを大幅に変更したこと、又は変更する予定があること。
３６．治験責任医師の意見において、参加者を登録に適さないようにする状態、又は試験への参加もしくは試験の完了を妨害する可能性があるあらゆる状態。
【０１７４】
本明細書において例示的に説明した本開示は、任意の１つ又は複数の要素及び１つ又は複数の限定が本明細書に具体的に開示されていなくても適切に実施することができる。従って、例えば、本明細書の各例では、用語「含む」、「から本質的に成る」、及び「から成る」はいずれも、他の２つの用語のいずれかに言い換えることが可能である。使用した用語及び表現は限定ではなく説明の用語として使用しており、そのような用語及び表現の使用において、図示及び説明した特徴又はその一部の同等物を除外する意図はない。しかし、請求した本発明の範囲内で様々な修正が可能であることは認識している。従って、本発明は好ましい実施形態により具体的に開示されているが、本明細書で開示した概念の任意の特徴、修正、及び変形は、当業者により対処することが可能であることは理解されており、またそのような修正及び変形は、明細書及び添付の特許請求の範囲に定義される本発明の範囲内にあると考えられていることも理解されているものとする。
【０１７５】
本発明を説明する文脈において（特に以下の特許請求の範囲の文脈において）用語「ａ」及び「ａｎ」及び「ｔｈｅ」及び同様の指示対象の使用は、本明細書で別段の指示がないか、又は文脈によって明らかに矛盾しない限り、単数形及び複数形の両方をカバーすると解釈すべきである。用語「備える」、「有する」、「含む」、及び「含有する」は、特に断りのない限り、制限のない用語（すなわち、「含む」を意味するが、これに限定されるものではない）として解釈すべきである。本明細書における値の範囲の列挙は、本明細書で別段の指示がない限り、単に、範囲内に該当する個々の各値を個別に参照する簡略法として機能することを意図し、個々の各値は、個別に本明細書で列挙されているかのように本明細書に組み込まれる。本明細書に記載されている方法は全て、本明細書で別段の指示がない限り、又は文脈によって明らかに矛盾しない限り、任意の好適な順序で実行可能である。本明細書で提供されるあらゆる例又は例示的な記述（例えば、「など」）の使用は、単に本発明をより詳細に明らかにすることを意図しており、別段の請求がない限り、本発明の範囲を限定しない。明細書の記述は、本発明の実施に不可欠な請求要素が無いことを示していると解釈すべきでない。
【０１７６】
本明細書には本発明の実施形態が説明してあり、これには本発明を実施する発明者らにとって公知の最良の形態が含まれる。これらの実施形態の変形は、前述の説明を読むと当業者に明らかになると思われる。
【０１７７】
本発明者らは、当業者がそのような変形を適切に利用することを期待し、また本発明者らは、本明細書に具体的に記載された以外の方法でも本発明が実施されることを意図している。従って、適用可能な法律によって許可されているように、本発明は、本明細書に添付された特許請求の範囲に列挙された対象物の全ての修飾物及び同等物を含む。更に、その可能な変形全てにおける上述の要素の任意の組み合わせは、本明細書で別段の指示がない限り、又は文脈に明らかに矛盾しない限り、本発明に組み込まれる。当業者は、本明細書に記載された本発明の特定の実施形態に対する多くの同等物を認識し、又は慣例的な実験を利用するだけでそれを確認できる。そのような同等物は、以下の特許請求の範囲に組み込まれることが意図されている。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１Ａ】
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【図１１Ｂ】
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【図１２Ａ】
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【図１２Ｂ】
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【図１３】
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【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１４Ｃ】
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【図１４Ｄ】
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【図１５Ａ】
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【図１５Ｂ】
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【図１５Ｃ】
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【図１６Ａ】
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【図１６Ｂ】
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【図１７Ａ】
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【図１７Ｂ】
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【図１７Ｃ】
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【図１８】
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【図１９Ａ−１】
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【図１９Ａ−２】
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【図１９Ａ−３】
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【図１９Ａ−４】
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【図１９Ｂ−１】
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【図１９Ｂ−２】
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【図１９Ｂ−３】
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【図１９Ｂ−４】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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