(57)【要約】本開示は、単鎖抗原提示ポリペプチドおよび多量体抗原提示ポリペプチドを含む、抗原提示ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示の抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、および当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示の抗原提示ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。2021500855.tif 000310
2021500855.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）（ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、
（ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、第１のポリペプチドと、
（ｂ）（ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド
を含む、第２のポリペプチドと、
を含む、多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドであって、
前記多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドは、１つ以上の免疫調節ドメインを含み、
前記多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドは、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、
前記多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項２】
（ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｉｖ）免疫調節ドメイン
を含み、
（ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含むか、または
（ａ２）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｉｖ）免疫調節ドメイン
を含み、
（ｂ２）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
（ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、
（ｉｖ）免疫調節ドメイン、および
（ｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、
（ｂ３）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含むか、または
（ａ４）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含み、
（ｂ４）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含むか、または
（ａ５）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含み、
（ｂ５）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
（ａ６）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｉｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、
（ｂ６）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｉｖ）第２の二量体化ポリペプチド
を含むか、または
（ａ７）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含み、
（ｂ７）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、および
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含むか、または
（ａ８）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含み、
（ｂ８）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド
を含むか、または
（ａ９）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｖ）第１の二量体化ポリペプチド
を含み、
（ｂ９）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含むか、または
（ａ１０）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、
（ｉｉｉ）免疫調節ドメイン、および
（ｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド
を含み、
（ｂ１０）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含むか、または
（ａ１１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、
（ｖ）第１の二量体化ポリペプチド、および
（ｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド
を含み、
（ｂ１１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）免疫調節ドメイン、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチド
を含む、
請求項１に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項３】
（ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、
（ｉｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、
（ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、
（ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、および
（ｖｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項４】
（ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、
（ｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｖｉ）前記免疫調節ポリペプチド
を含むか、または
（ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、
（ｉｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、
（ｖｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、および
（ｖｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド
を含み、前記第１および前記第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含むか、または
（ｃ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記免疫調節ポリペプチド、
（ｉｉ）前記エピトープ、
（ｉｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｖｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含むか、または
（ｄ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、
（ｉｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、および
（ｖｉ）前記免疫調節ポリペプチド
を含むか、または
（ｅ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）前記免疫調節ポリペプチド、
（ｉｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、
（ｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｖｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含むか、または
（ｆ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記免疫調節ポリペプチド、
（ｉｉ）前記エピトープ、
（ｉｉｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、
（ｖ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｖｉ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含む、請求項３に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項５】
（ａ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ／または
（ｂ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ／または
（ｃ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ／または
（ｄ）前記ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、
請求項１もしくは２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは請求項３もしくは４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項６】
前記免疫調節ポリペプチドが、
（ａ）天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含むか、または
（ｂ）天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して１〜１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含むバリアント免疫調節ポリペプチドであり、前記バリアント免疫調節ポリペプチドは、免疫共調節ポリペプチドに対する前記天然免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、前記免疫共調節ポリペプチドに対する低下した親和性を有する、
請求項１もしくは２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは請求項３もしくは４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項７】
２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、請求項１もしくは２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは請求項３もしくは４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項８】
（ａ）前記エピトープが、がんエピトープであるか、または
（ｂ）前記エピトープが、自己エピトープである、
請求項１もしくは２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは請求項３もしくは４に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【請求項９】
（ａ）（ｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチド
を含む、第１のポリペプチドと、
（ｂ）（ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、および
（ｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、第２のポリペプチドと、
を含む、多量体抗原提示ポリペプチドであって、
前記多量体ポリペプチドは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープを含み、前記エピトープは、
（Ａ）前記第１のポリペプチドのＮ末端、または
（Ｂ）前記第２のポリペプチドのＮ末端
にある、
前記多量体抗原提示ポリペプチド。
【請求項１０】
（ａ１）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含み、
（ｂ１）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、および
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含むか、または
（ａ２）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含み、
（ｂ２）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含むか、または
（ａ３）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含み、
（ｂ３）前記第２のポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含むか、または
（ａ４）前記第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、および
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド
を含み、
（ｂ４）前記第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、
（ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、および
（ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド
を含む、
請求項９に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【請求項１１】
（ｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ  α１ポリペプチド、
（ｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α２ポリペプチド、
（ｉｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチド、
（ｉｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β２ポリペプチド、
（ｖ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、および
（ｖｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格
を含む、単鎖抗原提示ポリペプチド。
【請求項１２】
（ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  α１ポリペプチド、
（ｉｖ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  α２ポリペプチド、および
（ｖ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  β２ポリペプチド
を含むか、または
（ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、
（ｉ）前記エピトープ、
（ｉｉ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチド、
（ｉｉｉ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  β２ポリペプチド、
（ｉｖ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  α１ポリペプチド、および
（ｖ）前記クラスＩＩ  ＭＨＣ  α２ポリペプチド
を含む、
請求項１１に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【請求項１３】
（ａ１）請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、
（ｂ１）薬学的に許容される賦形剤と
を含むか、または
（ａ２）請求項９〜１２のいずれか１項に記載の抗原提示ポリペプチドと、
（ｂ２）バッファーと
を含む、
組成物。
【請求項１４】
（ａ）請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチド、または
（ｂ）請求項９〜１２のいずれか１項に記載の抗原提示ポリペプチド
をコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
【請求項１５】
請求項１４に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の組み換え発現ベクター。
【請求項１６】
請求項１４に記載の１つ以上の核酸または請求項１５に記載の１つ以上の組み換え発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
【請求項１７】
抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法であって、Ｔ細胞を請求項９〜１２のいずれか１項に記載の抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、前記Ｔ細胞に対する前記抗原提示ポリペプチドの結合が、前記Ｔ細胞が前記抗原提示ポリペプチドに存在する前記エピトープに特異的であることを示す、前記方法。
【請求項１８】
エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、前記Ｔ細胞を請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、前記接触は、前記エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、前記方法。
【請求項１９】
治療方法であって、それを必要とする個体に、有効量の、請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドを投与することを含み、前記投与は、前記個体を治療する、前記治療方法。
【請求項２０】
Ｔ細胞を標的とするように共刺激ポリペプチドを選択的に送達する方法であって、Ｔ細胞の混合集団を請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、前記Ｔ細胞の混合集団は、前記標的Ｔ細胞と非標的Ｔ細胞とを含み、
前記標的Ｔ細胞は、前記Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド内に存在する前記エピトープに特異的であり、
前記接触は、前記Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド内に存在する前記共刺激ポリペプチドを前記標的Ｔ細胞に送達する、前記方法。
【請求項２１】
個体から取得されたＴ細胞の混合集団において、目的のエピトープに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、
（ａ）前記Ｔ細胞の混合集団を請求項１〜８のいずれか１項に記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドとｉｎ  ｖｉｔｒｏで接触させることであって、前記Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドは、前記目的のエピトープを含む、ことと、
（ｂ）前記接触に応じたＴ細胞の活性化および／または増殖を検出することであって、活性化および／または増殖されたＴ細胞は、前記標的Ｔ細胞の存在を示す、ことと、
を含む、前記方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
本出願は、２０１７年９月７日に出願された米国仮特許出願第６２／５５５，５２６号、および２０１８年６月２９日に出願された米国仮特許出願第６２／６９２，３１４号の利益を主張するものであり、当該出願は、その全体が参照により本明細書に援用される。
【背景技術】
【０００２】
序論
哺乳類の免疫系の適切な機能の中核をなすのは、２つの特殊な細胞種である抗原提示細胞（「ＡＰＣ」）とＴ細胞との間における活動とコミュニケーションの連携である。ＡＰＣは、外来生物由来のタンパク質、または異常なタンパク質（例えば、がん細胞における遺伝子突然変異によるもの）を捕捉し、それを、Ｔ細胞を含むより大きな免疫系による精査のためのシグナルに適した小さな断片に分解する役割を持つ。特に、ＡＰＣは、タンパク質を小さなペプチド断片に分解し、次に、それが主要組織適合遺伝子複合体（「ＭＨＣ」）のタンパク質と対になり、細胞表面に提示される。Ｔ細胞エピトープとしても知られる、ペプチド断片を含むＭＨＣの細胞表面の提示は、Ｔ細胞による監視の基本的な足がかりを提供し、これにより、Ｔ細胞は、特異的な認識が可能になる。ペプチド断片は、病原体由来、腫瘍由来、または天然宿主タンパク質（自己タンパク質）由来であり得る。更に、ＡＰＣは、その存在が脅威レベルの激化を意味する、細菌毒素、ウイルスタンパク質、ウイルスＤＮＡ、ウイルスＲＮＡなどの他の外来成分を認識することができる。ＡＰＣは、より効果的な応答をもたらすために、更なる共刺激シグナルを介して、この情報をＴ細胞に中継する。
【０００３】
Ｔ細胞は、特殊な細胞表面受容体であるＴ細胞受容体（「ＴＣＲ」）を介して、ペプチド−主要組織適合遺伝子複合体（「ｐＭＨＣ」）複合体を認識する。ＴＣＲは、各Ｔ細胞に固有のものであり、その結果、各Ｔ細胞は、特定のｐＭＨＣ標的に極めて特異的である。潜在的脅威にあふれた世界に適切に対処するために、人体内には、明確に異なるＴＣＲを有する別個のＴ細胞が多数（約１０，０００，０００）存在する。更に、特定のＴ細胞ペプチドに特異的である任意の所与のＴ細胞は、最初は、全Ｔ細胞集団のごく小さな部分でしかない。通常は、休眠状態で、数も限られているが、特定のＴＣＲを持つＴ細胞は、ＡＰＣによって容易に活性化および増幅され、何百万ものＴ細胞が関与する極めて強力なＴ細胞応答をもたらすことができる。このように活性化されたＴ細胞応答は、以下に例示するように、ウイルス感染、細菌感染、および腫瘍を含む他の細胞脅威を攻撃し、除去することが可能である。逆に、自己抗原または共通抗原に対する、過活性のＴ細胞応答の広範な非特異的活性化は、健康な組織または細胞を不適切に攻撃および破壊するＴ細胞を発生させることがある。
【０００４】
ＭＨＣタンパク質は、ヒトの場合、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）と称される。ＨＬＡクラスＩＩ遺伝子座には、ＨＬＡ−ＤＭ（ＨＬＡ−ＤＭ  α鎖およびＨＬＡ−ＤＭ  β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ−ＤＭＡおよびＨＬＡ−ＤＭＢ）、ＨＬＡ−ＤＯ（ＨＬＡ−ＤＯ  α鎖およびＨＬＡ−ＤＯ  β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ−ＤＯＡおよびＨＬＡ−ＤＯＢ），ＨＬＡ−ＤＰ（ＨＬＡ−ＤＰ  α鎖およびＨＬＡ−ＤＰ  β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ−ＤＰＡおよびＨＬＡ−ＤＰＢ）、ＨＬＡ−ＤＱ（ＨＬＡ−ＤＱ  α鎖およびＨＬＡ−ＤＱ  β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ−ＤＱＡおよびＨＬＡ−ＤＱＢ）、およびＨＬＡ−ＤＲ（ＨＬＡ−ＤＲ  α鎖およびＨＬＡ−ＤＲ  β鎖をそれぞれコードするＨＬＡ−ＤＲＡおよびＨＬＡ−ＤＲＢ）が含まれる。
【発明の概要】
【０００５】
概要
本開示は、単鎖抗原提示ポリペプチドおよび多量体抗原提示ポリペプチドを含む、抗原提示ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示の抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、および当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示の抗原提示ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。
【図面の簡単な説明】
【０００６】
【図１】ペプチドを含む、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖およびベータ鎖の模式図を示す。
【図２Ａ】図２Ａ〜２Ｃは、抗原提示ポリペプチド（ＡＰＰ）の例の模式図を示す。
【図２Ｂ】図２Ａの説明を参照のこと。
【図２Ｃ】図２Ａの説明を参照のこと。
【図３Ａ】抗原提示ポリペプチドの例の模式図を示す。
【図３Ｂ】インフルエンザウイルスペプチドと複合体化したヒトクラスＩＩ  ＭＨＣタンパク質ＨＬＡ−ＤＲ１の結晶構造を示す。
【図４Ａ】本開示のＡＰＰのゲル解析を示す。
【図４Ｂ】本開示のＡＰＰの発現レベルを示す。
【図４Ｃ】本開示のＡＰＰの説明を示す。
【図５Ａ】免疫調節（ＭＯＤ）ポリペプチドを含まないＡＰＰの模式図を示す。図５Ａ中の表記のない長方形は、二量体化ドメイン（例えば、ｂＺＩＰポリペプチド）を表す。
【図５Ｂ】ＭＯＤポリペプチドを含むＡＰＰの模式図を示す。図５Ｂ中、破線を指し示す矢印は、ＭＯＤポリペプチド（複数可）の可能な位置を示す。
【図６】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＲＡ  α鎖のアミノ酸配列を示す。
【図７−１】図７Ａ〜７Ｊは、ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＲＢ１  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図７−２】図７−１の説明を参照のこと。
【図７−３】図７−１の説明を参照のこと。
【図８Ａ】図８Ａ〜８Ｃは、ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＲＢ３  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図８Ｂ】図８Ａの説明を参照のこと。
【図８Ｃ】図８Ａの説明を参照のこと。
【図９】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＲＢ４  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１０】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＲＢ５  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１１】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＭＡ  α鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１２】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＭＢ  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１３】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＯＡ  α鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１４】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＯＢ  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１５】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＰＡ１  α鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１６】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＰＢ１  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１７】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＱＡ１  α鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１８】ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＱＡ２  α鎖のアミノ酸配列を示す。
【図１９】図１９Ａ〜１９Ｂは、ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＱＢ１  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図２０】図２０Ａ〜２０Ｂは、ＨＬＡクラスＩＩ  ＤＱＢ２  β鎖のアミノ酸配列を示す。
【図２１−１】図２１Ａ〜２１Ｇは、免疫グロブリンＦｃポリペプチドのアミノ酸配列を示す。
【図２１−２】図２１−１の説明を参照のこと。
【図２１−３】図２１−１の説明を参照のこと。
【図２１−４】図２１−１の説明を参照のこと。
【図２２−１】図２２Ａ〜２２Ｌは、本開示の例示的な多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド（ＴＭＡＰＰ）の模式図を示す。
【図２２−２】図２２−１の説明を参照のこと。
【図２２−３】図２２−１の説明を参照のこと。
【図２３】図２３Ａ〜２３Ｉは、本開示の例示的な単鎖ＴＭＡＰＰの模式図を示す。
【図２４】本開示の例示的なＡＰＰの産生を示す。
【図２５Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列（図２５Ａ）、およびこれをコードするヌクレオチド配列（図２５Ｂ）を示す。
【図２５Ｂ】図２５Ａの説明を参照のこと。
【図２６Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図２６Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図２７Ａ】例示的な単鎖ＡＰＰのアミノ酸配列を示す。
【図２７Ｂ】例示的な単鎖ＡＰＰのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図２８Ａ】例示的な単鎖ＴＭＡＰＰのアミノ酸配列を示す。
【図２８Ｂ】例示的な単鎖ＴＭＡＰＰのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図２９Ａ】例示的な単鎖ＴＭＡＰＰのアミノ酸配列を示す。
【図２９Ｂ】例示的な単鎖ＴＭＡＰＰのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３０Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３０Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３１Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３１Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３２Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３２Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３３Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３３Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３４Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３４Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３５Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３５Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３６】本開示の例示的なＴＭＡＰＰの模式図を示し、発現のゲル解析を示す。
【図３７Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３７Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３８Ａ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列を示す。
【図３８Ｂ】多量体ＴＭＡＰＰの例示的なポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列を示す。
【図３９】本開示の例示的なＡＰＰの産生を示す。
【発明を実施するための形態】
【０００７】
定義
「ポリヌクレオチド」および「核酸」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、リボヌクレオチドまたはデオキシリボヌクレオチドのいずれかである、任意の長さのヌクレオチドの重合形態を指す。したがって、本用語は、限定するものではないが、一本鎖、二本鎖もしくは多本鎖のＤＮＡもしくはＲＮＡ、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＤＮＡ−ＲＮＡハイブリッド、またはプリンおよびピリミジン塩基もしくは他の天然、化学的もしくは生化学的修飾、非天然もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含む重合体を含む。
【０００８】
「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、任意の長さのアミノ酸の重合形態を指し、これらには、コードアミノ酸および非コードアミノ酸、化学的もしくは生化学的に修飾されたアミノ酸、または誘導体化されたアミノ酸、ならびに修飾されたペプチド骨格を有するポリペプチドが含まれ得る。
【０００９】
ポリヌクレオチドまたはポリペプチドが別のポリヌクレオチドまたはポリペプチドに対して、あるパーセントの「配列同一性」を有するということは、整列させ、２つの配列を比較したとき、当該パーセンテージの塩基またはアミノ酸が同じであり、同じ相対位置にあることを意味する。配列同一性は、多数の異なる方法で決定することができる。配列同一性を決定するには、様々な簡便な方法およびコンピュータープログラム（例えば、ＢＬＡＳＴ、Ｔ−ＣＯＦＦＥＥ、ＭＵＳＣＬＥ、ＭＡＦＦＴなど）を使用して配列を整列させることができ、こうした方法およびコンピュータープログラムは、ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｌｉ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ、ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｔｃｏｆｆｅｅ／、ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／Ｔｏｏｌｓ／ｍｓａ／ｍｕｓｃｌｅ／、ｍａｆｆｔ．ｃｂｒｃ．ｊｐ／ａｌｉｇｎｍｅｎｔ／ｓｏｆｔｗａｒｅ／を含むワールドワイドウェブ上のサイトを通じて利用可能である。例えば、Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．（１９９０），Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｉ．２１５：４０３−１０を参照されたい。
【００１０】
「保存的アミノ酸置換」という用語は、類似の側鎖を有するアミノ酸残基のタンパク質の互換性を指す。例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシンからなる脂肪族側鎖を有するアミノ酸の群；セリンおよびトレオニンからなる脂肪族ヒドロキシル側鎖を有するアミノ酸の群；アスパラギンおよびグルタミンからなるアミド含有側鎖を有するアミノ酸の群；フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファンからなる芳香族側鎖を有するアミノ酸の群；リシン、アルギニン、およびヒスチジンからなる塩基性側鎖を有するアミノ酸の群；グルタミン酸およびアスパラギン酸からなる酸性側鎖を有するアミノ酸の群；ならびにシステインおよびメチオニンからなる硫黄含有側鎖を有するアミノ酸の群。例示的な保存的アミノ酸置換基は、バリン−ロイシン−イソロイシン、フェニルアラニン−チロシン、リシン−アルギニン、アラニン−バリン−グリシン、およびアスパラギン−グルタミンである。
【００１１】
本明細書で（例えば、Ｔ細胞上のポリペプチド（例えば、Ｔ細胞受容体）に対するＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドの結合に関して）使用される「結合」という用語は、２つの分子間の非共有結合的な相互作用を指す。非共有結合は、例えば、静電的、疎水性、イオン性および／または水素結合相互作用（塩橋および水橋などの相互作用を含む）による２つの分子間の直接的会合を指す。非共有結合性相互作用は、一般に、１０−６Ｍ未満、１０−７Ｍ未満、１０−８Ｍ未満、１０−９Ｍ未満、１０−１０Ｍ未満、１０−１１Ｍ未満、１０−１２Ｍ未満、１０−１３Ｍ未満、１０−１４Ｍ未満、または１０−１５Ｍ未満の解離定数（ＫＤ）を特徴とする。「親和性」は、非共有結合の強さを指し、結合親和性の増大は、ＫＤの低下と相関する。「特異的結合」は、一般に、少なくとも約１０−７Ｍ以上、例えば、５×１０−７Ｍ、１０−８Ｍ、５×１０−８Ｍ、１０−９Ｍ以上の親和性を有する結合を指す。「非特異的結合」は、一般に、約１０−７Ｍ未満の親和性を有する結合（例えば、１０−６Ｍ、１０−５Ｍ、１０−４Ｍの親和性を有する結合）（例えば、その指定の結合部位または受容体以外の部分に対するリガンドの結合）を指す。しかしながら、いくつかの文脈において、例えば、ＴＣＲとペプチド／ＭＨＣ複合体との間の結合である「特異的結合」は、１μＭ〜１００μＭ、または１００μＭ〜１ｍＭの範囲であり得る。「共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ  ｂｉｎｄｉｎｇ）」または「共有結合（ｃｏｖａｌｅｎｔ  ｂｏｎｄ）」は、本明細書で使用されるとき、２つの異なる分子間での１つ以上の共有化学結合の形成を指す。
【００１２】
本明細書で使用される「免疫学的シナプス」または「免疫シナプス」という用語は、一般に、適応免疫応答において相互作用する２つの免疫細胞の間の天然の界面を指し、例えば、抗原提示細胞（ＡＰＣ）または標的細胞と、エフェクター細胞、例えば、リンパ球、エフェクターＴ細胞、ナチュラルキラー細胞などとの間の界面が含まれる。ＡＰＣとＴ細胞との間の免疫学的シナプスは、例えば、Ｂｒｏｍｌｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｎｕ  Ｒｅｖ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．２００１；１９：３７５−９６（当該文献の開示は、その全体が参照により本明細書に援用される）に記載されているように、一般に、Ｔ細胞抗原受容体と主要組織適合遺伝子複合体分子との相互作用によって開始される。
【００１３】
「Ｔ細胞」は、ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋細胞）、細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋細胞）、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）、およびＮＫ−Ｔ細胞を含む、ＣＤ３を発現する全てのタイプの免疫細胞を含む。
【００１４】
「免疫調節ポリペプチド」（「共刺激ポリペプチド」とも称される）という用語は、本明細書で使用されるとき、Ｔ細胞上の同種の免疫共調節ポリペプチドに特異的に結合することによって、一次シグナル（例えば、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体と、ペプチドをロードした主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）ポリペプチドとの結合によってもたらされるもの）に加えて、Ｔ細胞応答（限定するものではないが、増殖、活性化、分化などを含む）を媒介するシグナルをもたらす、抗原提示細胞（ＡＰＣ）（例えば、樹状細胞、Ｂ細胞など）上のポリペプチド、またはＡＰＣ上のポリペプチドの一部を含む。免疫調節ポリペプチドには、限定するものではないが、ＣＤ７、Ｂ７−１（ＣＤ８０）、Ｂ７−２（ＣＤ８６）、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ−Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、ＨＶＥＭ、Ｔｏｌｌリガンド受容体に結合するアゴニストまたは抗体、およびＢ７−Ｈ３と特異的に結合するリガンドが含まれ得る。また、共刺激ポリペプチドは、とりわけ、Ｔ細胞上に存在する同種の共刺激分子、限定するものではないが、ＩＬ−２、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４−１ＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＰＤ−１、ＩＣＯＳ、リンパ球機能関連抗原−１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、Ｂ７−Ｈ３、およびＣＤ８３に特異的に結合するリガンドなどと特異的に結合する抗体も包含する。
【００１５】
上記のとおり、「免疫調節ポリペプチド」（本明細書において「ＭＯＤ」とも称される）は、Ｔ細胞上の同種の免疫共調節ポリペプチドに特異的に結合する。
【００１６】
本開示のＴＭＡＰＰの「免疫調節ドメイン」（「ＭＯＤ」）は、標的Ｔ細胞上に存在し得る同種の免疫共調節ポリペプチドに結合する。
【００１７】
「異種」とは、本明細書で使用されるとき、天然の核酸またはタンパク質にはみられないヌクレオチドまたはポリペプチドをそれぞれ意味する。
【００１８】
「組み換え」とは、本明細書で使用されるとき、特定の核酸（ＤＮＡまたはＲＮＡ）が、天然系でみられる内因性核酸とは区別可能な構造的なコード配列または非コード配列を有するコンストラクトをもたらす、クローニング、制限、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）および／またはライゲーションの各工程の様々な組み合わせの産物であることを意味する。ポリペプチドをコードするＤＮＡ配列は、ｃＤＮＡ断片または一連の合成オリゴヌクレオチドからアセンブリし、細胞または無細胞転写翻訳系に含有される組み換え転写単位から発現可能な合成核酸を提供することができる。
【００１９】
「組み換え発現ベクター」または「ＤＮＡコンストラクト」という用語は、ベクターおよび１つのインサートを含むＤＮＡ分子を指すために本明細書中で区別なく使用される。組み換え発現ベクターは、通常、インサート（複数可）の発現および／または伝播のために、あるいは、他の組み換えヌクレオチド配列の構築のために作製される。インサート（複数可）は、プロモーター配列に作動可能に連結されても連結されなくてもよく、ＤＮＡ制御配列に作動可能に連結されても連結されなくてもよい。
【００２０】
本明細書で使用されるとき、「親和性」という用語は、２つの作用物質（例えば、抗体および抗原）の可逆的結合の平衡定数を指し、解離定数（ＫＤ）で表される。親和性は、無関係のアミノ酸配列に対する抗体の親和性よりも、少なくとも１倍超、少なくとも２倍超、少なくとも３倍超、少なくとも４倍超、少なくとも５倍超、少なくとも６倍超、少なくとも７倍超、少なくとも８倍超、少なくとも９倍超、少なくとも１０倍超、少なくとも２０倍超、少なくとも３０倍超、少なくとも４０倍超、少なくとも５０倍超、少なくとも６０倍超、少なくとも７０倍超、少なくとも８０倍超、少なくとも９０倍超、少なくとも１００倍超、もしくは少なくとも１，０００倍超、またはそれ以上であり得る。抗体の標的タンパク質に対する親和性は、例えば、約１００ナノモル（ｎＭ）〜約０．１ｎＭ、約１００ｎＭ〜約１ピコモル（ｐＭ）、または約１００ｎＭ〜約１フェムトモル（ｆＭ）以上であり得る。本明細書で使用されるとき、「アビディティ」という用語は、希釈後における２つ以上の作用物質の複合体の解離抵抗性を指す。
【００２１】
「結合」という用語は、例えば、共有結合性、静電性、疎水性、ならびにイオン性および／または水素結合の相互作用（塩橋および水橋などの相互作用を含む）による２つの分子間の直接的会合を指す。「特異的結合」は、少なくとも約１０−７Ｍ以上、例えば、５×１０−７Ｍ、１０−８Ｍ、５×１０−８Ｍを超える親和性を有する結合を指す。「非特異的結合」は、約１０−７Ｍ未満の親和性を有する結合、例えば、１０−６Ｍ、１０−５Ｍ、１０−４Ｍなどの親和性を有する結合を指す。
【００２２】
「治療」、「治療すること」などの用語は、一般に、所望の薬理学的作用および／または生理学的作用を得ることを意味するために本明細書で使用される。作用は、疾患もしくはその症状を完全もしくは部分的に防ぐという点で予防的であり得、および／または疾患および／または当該疾患に起因し得る有害作用を部分的もしくは完全に治すという点で治療的であり得る。本明細書で使用される「治療」は、哺乳動物における疾患または症状のあらゆる治療を包含し、（ａ）疾患もしくは症状に罹患する素因があり得るが、まだ罹患の診断を受けていない対象における疾患もしくは症状の発症予防、（ｂ）疾患もしくは症状の阻害、すなわち、その発生の阻止、または（ｃ）疾患の緩和、すなわち、疾患の退行の誘起を含む。治療薬は、疾患または損傷の発生前、発生中、または発生後に投与され得る。進行中の疾患の治療が特に対象となるが、この場合、治療は、患者の望ましくない臨床症状を安定化または軽減させるものである。そのような治療は、望ましくは、患部組織における機能が完全に失われる前に実施される。主題の治療法は、望ましくは、疾患の症候期中、いくつかの場合においては、疾患の症候期後に投与される。
【００２３】
「個体」、「対象」、「宿主」および「患者」という用語は、本明細書中で区別なく使用され、診断、治療、または治療法が望まれるあらゆる哺乳類対象を指す。哺乳類は、例えば、ヒト、非ヒト霊長類、げっ歯類（例えば、ラット、マウス）、ウサギ類（例えば、ウサギ）、有蹄類（例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ウマ、ヤギなど）などを含む。
【００２４】
本発明を更に説明する前に、本発明が、記載される特定の実施形態に限定されず、当然のことながら、それ自体多様であり得ることを理解されたい。また、本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的にしており、本発明の範囲が添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるため、限定を意図するものではないことも理解されたい。
【００２５】
値の範囲が記載される場合、その範囲の上限値と下限値との間にある、別途明確な記載がない限りはその下限値の単位の１０分の１までの各値、およびその指定範囲内の任意の他の指定値または間にある値は、本発明内に包含されることが理解される。これらのより狭い範囲の上限値および下限値は、指定範囲内の任意の特定の限界値が除外される場合には、より狭い範囲に独立して含まれ得、また本発明内に包含される。指定範囲が限界値の一方または両方を含む場合、当該含まれる限界値の一方または両方を除いた範囲もまた本明細書に含まれる。
【００２６】
別途の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されている意味と同一の意味を有する。本明細書に記載のものと同様または同等の任意の方法および材料を本発明の実施または検証に使用することができるが、好ましい方法および材料を以下に記載する。本明細書で言及される全ての公開物は、当該公開物に関連して引用される方法および／または材料を開示および記載するために、参照により本明細書に援用される。
【００２７】
本明細書および添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形（ａ，ａｎ，ｔｈｅ）は、別途明記されない限り、複数の指示物を含むことに留意すべきである。したがって、例えば、「Ｔｒｅｇ」への言及は、複数の当該Ｔｒｅｇを含み、「ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖」への言及は、１つ以上のＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖および当業者に知られているその同等物を含むなどとなる。更に、特許請求の範囲は、何らかの任意選択の要素を除外するように作成される場合があることにも留意されたい。したがって、本記述は、請求項の要素の詳述に関連した「だけ」、「のみ」などの排他的用語の使用、または「否定による」限定の使用に対する前提として働くことが意図される。
【００２８】
明確を期すために、本発明のいくつかの特徴が別個の実施形態の文脈で記載されるが、１つの実施形態で組み合わせて提供され得ることも認識される。逆に、煩雑になるのを避けるために、本発明の様々な特徴が１つの実施形態の文脈で記載されるが、これもまた別個に提供されてもよいし、任意の好適な部分的組み合わせで提供されてもよい。本発明に関する実施形態の全ての組み合わせが本発明に明確に包含され、ありとあらゆる組み合わせが個別にかつ明確に開示された場合と同様に本明細書に開示される。加えて、様々な実施形態およびその要素の全ての部分的組み合わせもまた本発明に明確に包含され、ありとあらゆるそのような部分的組み合わせが個別にかつ明確に本明細書に開示された場合と同様に本明細書に開示される。
【００２９】
本明細書で考察される公開物は、本出願の出願日以前の開示についてのみ記載される。本明細書におけるいかなる記載も、本発明が先行発明に基づいてかかる公開物に先行する権利がないという自認を構成するものではない。更に、記載される公開日は、実際の公開日とは異なる場合があり、これは個別に確認する必要がある場合がある。
【００３０】
詳細な説明
本開示は、単鎖抗原提示ポリペプチドおよび多量体抗原提示ポリペプチドを含む、抗原提示ポリペプチドを提供する。本開示は、本開示の抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸、および当該核酸で遺伝子改変された細胞を提供する。本開示の抗原提示ポリペプチドは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法を提供する。
【００３１】
本開示の抗原提示ポリペプチド（ＡＰＰ）は、単鎖ポリペプチドまたは多重鎖（多量体）ポリペプチドであり得る。本開示のＡＰＰは、いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドを含む。他の場合、本開示のＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドを含まない。これらの場合、ＡＰＰは、本明細書において、Ｔ細胞調節ＡＰＰまたは「ＴＭＡＰＰ」と称され得る。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、より高次の複合体を形成し、例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ホモ二量体を形成する。したがって、「ＡＰＰ」という用語は、多量体ＡＰＰ、単鎖ＡＰＰ、多量体ＴＭＡＰＰ、および単鎖ＴＭＡＰＰを含む。この用語は、更に、ＡＰＰの高次複合体も含む。
【００３２】
抗原提示ポリペプチド
本開示は、単鎖ＡＰＰおよび多量体ＡＰＰを含む、抗原提示ポリペプチド（ＡＰＰ）を提供する。
【００３３】
天然に生じるクラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチドは、α鎖およびβ鎖を含む。「クラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチド」は、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）のα鎖およびβ鎖を含む。ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドには、ＭＣＨクラスＩＩ  ＤＰ  αおよびβポリペプチド、ＤＭ  αおよびβポリペプチド、ＤＯＡ  αおよびβポリペプチド、ＤＯＢ  αおよびβポリペプチド、ＤＱ  αおよびβポリペプチド、ならびにＤＲ  αおよびβポリペプチドが含まれる。本明細書で使用されるとき、「クラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチド」は、クラスＩＩ  ＭＨＣ  α鎖ポリペプチド、クラスＩＩ  ＭＨＣ  β鎖ポリペプチド、またはクラスＩＩ  ＭＨＣ  αもしくはβ鎖ポリペプチドの一部のみを含み得る。例えば、「クラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチド」は、ｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α鎖ポリペプチドのα１ドメインのみ、ｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α鎖のα２ドメインのみ、ｉｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α鎖のα１ドメインおよびα２ドメインのみ、ｉｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β鎖のβ１ドメインのみ、ｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β鎖のβ２ドメインのみ、ｖｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β鎖のβ１ドメインおよびβ２ドメインのみ、ｖｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α鎖のα１ドメイン、クラスＩＩ  ＭＨＣ  β鎖のβ１ドメイン、およびクラスＩＩ  ＭＨＣのβ２ドメインなどを含む、ポリペプチドであり得る。
【００３４】
クラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチドは、アレル型を含む。ＨＬＡ遺伝子座は、本質的に、高度に多型である。Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  ｆｏｒ  Ｆａｃｔｏｒｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ＨＬＡ  Ｓｙｓｔｅｍ  ２０００（Ｈｕｍ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．；６２（４）：４１９−６８，２００１）に開示されているように、２２１のＨＬＡ−ＤＲＢ１アレル、１９のＤＲＢ３アレル、８９のＤＲＢ４アレル、１４のＤＲＢ５アレル、１９のＤＱＡ１アレルおよび３９のＤＱＢ１アレルがあり、新しいアレルが絶えず発見されている。ＷＨＯ  ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ  ｆｏｒ  Ｆａｃｔｏｒｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ＨＬＡ  Ｓｙｓｔｅｍ（ｗｗｗ．ａｎｔｈｏｎｙｎｏｌａｎ．ｃｏｍ／ＨＩＧ／）の２００７年改訂版では、３つのＤＲＡアレル、４９４のＤＲＢ１アレル、１つのＤＲＢ２アレル、４４のＤＲＢ３アレル、１３のＤＲＢ４アレル、１８のＤＲＢ５アレル、３つのＤＲＢ６アレル、２つのＤＲＢ７アレル、１０のＤＲＢ８アレル、１つのＤＲＢ９アレル、３４のＤＱＡ１アレル、８３のＤＱＢ１アレル、２３のＤＰＡ１、１２６のＤＰＢ１アレル、４つのＤＭＡアレル、７つのＤＭＢアレル、１２のＤＯＡアレルおよび９つのＤＯＢアレルがあることが示された。本明細書で使用されるとき、「クラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチド」という用語は、任意の既知のクラスＩＩ  ＭＨＣポリペプチドのアレル型を含む。
【００３５】
多量体抗原提示ポリペプチド
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、２つのポリペプチド鎖は、例えば、ジスルフィド結合を介して、互いに共有結合されている。他の場合において、２つのポリペプチド鎖は、互いに共有結合されていない。いくつかの場合において、２つのポリペプチド鎖は、互いに共有結合されておらず、これらの場合のいくつかにおいて、２つのポリペプチド鎖のそれぞれは、二量体化ペアのメンバーを含む。本開示の多量体ＡＰＰの例は、図２Ａおよび図２Ｂに模式的に示されている。
【００３６】
いくつかの場合において、本開示の抗原提示多量体ポリペプチド（多量体ＡＰＰ）は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）によって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドと免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドとの間にリンカーを含む。
【００３７】
いくつかの場合において、本開示の抗原提示多量体ポリペプチド（多量体ＡＰＰ）は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。二量体化ペアの第１のメンバーと第２のメンバーは、互いに、非共有結合的に結合する。いくつかの場合において、二量体化ペアの第１のメンバーと第２のメンバーは、二量体化剤を必要とすることなく、互いに、非共有結合的に結合する。いくつかの場合において、二量体化ペアの第１のメンバーと第２のメンバーは、二量体化剤の存在下で、互いに、非共有結合的に結合する。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー、およびｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチド、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプ��ドと二量体化ペアの第２のメンバーとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドと二量体化ペアの第１のメンバーとの間にリンカーを含む。
【００３８】
いくつかの場合において、本開示の抗原提示多量体ポリペプチド（多量体ＡＰＰ）は、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ペアの第１のメンバー、ｖｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ペアの第１のメンバー、ｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチド、ｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドと二量体化ペアの第１のメンバーとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドと二量体化ペアの第２のメンバーとの間にリンカーを含む。
【００３９】
単量体抗原提示ポリペプチド
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖である。例を図２Ｃおよび図５Ａに模式的に示す。
【００４０】
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ（例えば、単鎖ＡＰＰ）は、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドと免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格との間にリンカーを含む。
【００４１】
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドとの間にリンカーを含む。いくつかの場合において、ＡＰＰは、ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドとＩｇまたは非Ｉｇ骨格との間にリンカーを含む。
【００４２】
いくつかの場合において、本開示の単鎖ＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。１つの非限定的な例として、本開示の単鎖ＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ
2021500855.tif 000003
である。他の場合において、エピトープは、
2021500855.tif 000004
ではなく、代わりに、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２７Ａに示される１５５９アミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２７Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜７００を含む。
【００４３】
ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖
ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、α１ドメインおよびα２ドメインを含む。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するα１ドメインおよびα２ドメインは、同じＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドに由来する。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するα１ドメインおよびα２ドメインは、２つの異なるＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドに由来する。
【００４４】
本開示のＡＰＰ（例えば、多量体ＡＰＰ、単鎖ＡＰＰ、多量体ＴＭＡＰＰ、単鎖ＴＭＡＰＰ）に含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、シグナルペプチドが欠如している。本開示の多量体ポリペプチドに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、約６０アミノ酸〜約１９０アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖は、約６０アミノ酸〜約８０アミノ酸、約８０アミノ酸〜約１００アミノ酸、約１００アミノ酸〜約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸〜約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸〜約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸〜約１８０アミノ酸、または約１８０アミノ酸〜約２００アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  α１ドメインは、約３０アミノ酸〜約９５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  α１ドメインは、約３０アミノ酸〜約４０アミノ酸、約４０アミノ酸〜約５０アミノ酸、約５０アミノ酸〜約６０アミノ酸、約６０アミノ酸〜約７０アミノ酸、約７０アミノ酸〜約８０アミノ酸、約８０アミノ酸〜約９０アミノ酸、または約９０アミノ酸〜約９５アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  α２ドメインは、約３０アミノ酸〜約９５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  α２ドメインは、約３０アミノ酸〜約４０アミノ酸、約４０アミノ酸〜約５０アミノ酸、約５０アミノ酸〜約６０アミノ酸、約６０アミノ酸〜約７０アミノ酸、約７０アミノ酸〜約８０アミノ酸、約８０アミノ酸〜約９０アミノ酸、または約９０アミノ酸〜約９５アミノ酸の長さを有し得る。
【００４５】
ＤＲＡ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドは、ＤＲＡポリペプチドである。ＤＲＡポリペプチドは、図６に示されるＤＲＡアミノ酸配列のアミノ酸２６〜２０３と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＡポリペプチドは、約１７８アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、または１８０アミノ酸）の長さを有する。
【００４６】
「ＤＲＡポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＡポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000005
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００４７】
好適なＤＲＡ  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000006
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８４アミノ酸（例えば、８０、８１、８２、８３、８４、８５、または８６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＡ  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000007
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００４８】
好適なＤＲＡ  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000008
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。
【００４９】
ＤＭＡ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドは、ＤＭＡポリペプチドである。ＤＭＡポリペプチドは、図１１に示されるＤＭＡアミノ酸配列のアミノ酸２７〜２１７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＭＡポリペプチドは、約１９１アミノ酸（例えば、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、または１９３アミノ酸）の長さを有する。
【００５０】
「ＤＭＡＡポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＭＡＡポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000009
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００５１】
好適なＤＭＡ  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000010
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９８アミノ酸（例えば、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、または１０１アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＡ  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000011
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００５２】
好適なＤＭＡ  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000012
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９３アミノ酸（例えば、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＡ  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000013
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００５３】
ＤＯＡ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドは、ＤＯＡポリペプチドである。ＤＯＡポリペプチドは、図１３に示されるＤＯＡアミノ酸配列のアミノ酸２６〜２０４と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＯＡポリペプチドは、約１７９アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、または１８２アミノ酸）の長さを有する。
【００５４】
「ＤＯＡポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＯＡポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000014
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００５５】
好適なＤＯＡ  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000015
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８５アミノ酸（例えば、８３、８４、８５、８６、８７、または８８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＡ  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000016
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００５６】
好適なＤＯＡ  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000017
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＡ  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000018
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００５７】
ＤＰＡ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドは、ＤＰＡ１ポリペプチドである。ＤＰＡ１ポリペプチドは、図１５に示されるＤＰＡ１アミノ酸配列のアミノ酸２９〜２０９と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＰＡ１ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、１８３、または１８４アミノ酸）の長さを有する。
【００５８】
「ＤＰＡ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＰＡ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000019
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００５９】
好適なＤＰＡ１  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000020
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＡ１  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000021
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００６０】
好適なＤＰＡ１  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000022
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９７アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＡ１  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000023
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００６１】
ＤＱＡ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドは、ＤＱＡ１ポリペプチドである。ＤＱＡ１ポリペプチドは、図１７に示されるＤＱＡ１アミノ酸配列のアミノ酸２４〜２０４と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＡ１ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、または１８３アミノ酸）の長さを有する。
【００６２】
「ＤＱＡ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＡ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000024
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００６３】
好適なＤＱＡ１  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000025
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ１  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000026
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００６４】
好適なＤＱＡ１  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000027
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ１  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000028
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００６５】
ＤＱＡ２
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチドは、ＤＱＡ２ポリペプチドである。ＤＱＡ２ポリペプチドは、図１８に示されるＤＱＡ２アミノ酸配列のアミノ酸２４〜２０４と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＡ２ポリペプチドは、約１８１アミノ酸（例えば、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、または１８３アミノ酸）の長さを有する。
【００６６】
「ＤＱＡ２ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＡ２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000029
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００６７】
好適なＤＱＡ２  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000030
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約８７アミノ酸（例えば、８４、８５、８６、８７、８８、または８９アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ２  α１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000031
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００６８】
好適なＤＱＡ２  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000032
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９１、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＡ２  α２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000033
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００６９】
ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖
ＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、β１ドメインおよびβ２ドメインを含む。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するβ１ドメインおよびβ２ドメインは、同じＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドに由来する。いくつかの場合において、抗原提示細胞中に存在するβ１ドメインおよびβ２ドメインは、２つの異なるＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドに由来する。
【００７０】
本開示のＡＰＰ（例えば、多量体ＡＰＰ、単鎖ＡＰＰ、多量体ＴＭＡＰＰ、単鎖ＴＭＡＰＰ）に含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、シグナルペプチドが欠如している。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、約６０アミノ酸〜約２１０アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩベータ鎖は、約６０アミノ酸〜約８０アミノ酸、約８０アミノ酸〜約１００アミノ酸、約１００アミノ酸〜約１２０アミノ酸、約１２０アミノ酸〜約１４０アミノ酸、約１４０アミノ酸〜約１６０アミノ酸、約１６０アミノ酸〜約１８０アミノ酸、約１８０アミノ酸〜約２００アミノ酸、または約２００アミノ酸〜約２１０アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  β１ドメインは、約３０アミノ酸〜約１０５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  β１ドメインは、約３０アミノ酸〜約４０アミノ酸、約４０アミノ酸〜約５０アミノ酸、約５０アミノ酸〜約６０アミノ酸、約６０アミノ酸〜約７０アミノ酸、約７０アミノ酸〜約８０アミノ酸、約８０アミノ酸〜約９０アミノ酸、約９０アミノ酸〜約９５アミノ酸、約９５アミノ酸〜約１００アミノ酸、または約１００アミノ酸〜約１０５アミノ酸の長さを有し得る。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  β２ドメインは、約３０アミノ酸〜約１０５アミノ酸の長さを有し得、例えば、本開示のＡＰＰに含めるのに好適なＭＨＣクラスＩＩ  β２ドメインは、約３０アミノ酸〜約４０アミノ酸、約４０アミノ酸〜約５０アミノ酸、約５０アミノ酸〜約６０アミノ酸、約６０アミノ酸〜約７０アミノ酸、約７０アミノ酸〜約８０アミノ酸、約８０アミノ酸〜約９０アミノ酸、約９０アミノ酸〜約９５アミノ酸、約９５アミノ酸〜約１００アミノ酸、または約１００アミノ酸〜約１０５アミノ酸の長さを有し得る。
【００７１】
ＤＲＢ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ａ〜７Ｊのいずれか１つに記載のＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ａに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｂに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｃに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｄに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｅに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｆに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｇに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｈに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｉに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ１ポリペプチドである。ＤＲＢ１ポリペプチドは、図７Ｊに示されるＤＲＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ１ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
【００７２】
「ＤＲＢ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000034
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００７３】
好適なＤＲＢ１  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000035
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ１  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000036
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００７４】
好適なＤＲＢ１  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000037
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、または１０６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ１  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000038
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００７５】
ＤＲＢ３
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ３ポリペプチドである。ＤＲＢ３ポリペプチドは、図８Ａ〜８Ｃのいずれか１つに記載のＤＲＢ３アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ３ポリペプチドである。ＤＲＢ３ポリペプチドは、図８Ａに示されるＤＲＢ３アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ３ポリペプチドである。ＤＲＢ３ポリペプチドは、図８Ｂに示されるＤＲＢ３アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ３ポリペプチドである。ＤＲＢ３ポリペプチドは、図８Ｃに示されるＤＲＢ３アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ３ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
【００７６】
「ＤＲＢ３ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ３ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000039
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００７７】
好適なＤＲＢ３  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000040
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ３  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000041
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００７８】
好適なＤＲＢ３  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000042
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、または１０５アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ３  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000043
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００７９】
ＤＲＢ４
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ４ポリペプチドである。ＤＲＢ４ポリペプチドは、図９に示されるＤＲＢ４アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ４ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
【００８０】
「ＤＲＢ４ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＣＤＲ４ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000044
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００８１】
好適なＤＲＢ４  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000045
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ４  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000046
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００８２】
好適なＤＲＢ４  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000047
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、または１０５アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ４  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000048
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００８３】
ＤＲＢ５
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＲＢ５ポリペプチドである。ＤＲＢ５ポリペプチドは、図１０に示されるＤＲＢ５アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２２７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＲＢ５ポリペプチドは、約１９８アミノ酸（例えば、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、または２０２アミノ酸）の長さを有する。
【００８４】
「ＤＲＢ５ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＲＢ５ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000049
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００８５】
好適なＤＲＢ５  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000050
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ５  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000051
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００８６】
好適なＤＲＢ５  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000052
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約１０３アミノ酸（例えば、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、または１０５アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＲＢ５  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000053
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００８７】
ＤＭＢ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＭＢポリペプチドである。ＤＭＢポリペプチドは、図１２に示されるＤＭＢアミノ酸配列のアミノ酸１９〜２０７と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＭＢポリペプチドは、約１８９アミノ酸（例えば、１８７、１８８、１８９、１９０、または１９１アミノ酸）の長さを有する。
【００８８】
「ＤＭＢポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＭＢポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000054
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００８９】
好適なＤＭＢ  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000055
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＢ  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000056
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００９０】
好適なＤＭＢ  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000057
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９５アミノ酸（例えば、９３、９４、９５、９６、９７、または９８アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＭＢ  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000058
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００９１】
ＤＯＢ
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＯＢポリペプチドである。ＤＯＢポリペプチドは、図１４に示されるＤＯＢアミノ酸配列のアミノ酸２７〜２１４と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＯＢポリペプチドは、約１８８アミノ酸（例えば、１８６、１８７、１８８、１８９、または１９０アミノ酸）の長さを有する。
【００９２】
「ＤＯＢポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＯＢポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000059
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００９３】
好適なＤＯＢ  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000060
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＢ  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000061
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００９４】
好適なＤＯＢ  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000062
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＯＢ  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000063
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００９５】
ＤＰＢ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＰＢ１ポリペプチドである。ＤＰＢ１ポリペプチドは、図１６に示されるＤＰＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３０〜２１５と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＰＢ１ポリペプチドは、約１８６アミノ酸（例えば、１８４、１８５、１８６、１８７、または１８８アミノ酸）の長さを有する。
【００９６】
「ＤＰＢ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＰＢ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000064
、またはそのアレルバリアントを含む。
【００９７】
好適なＤＰＢ１  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000065
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９２アミノ酸（例えば、９０、９１、９２、９３、または９４アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＢ１  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000066
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【００９８】
好適なＤＰＢ１  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000067
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＰＢ１  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000068
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【００９９】
ＤＱＢ１
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＱＢ１ポリペプチドである。ＤＱＢ１ポリペプチドは、図１９Ａまたは図１９Ｂに示されるＤＱＢ１アミノ酸配列のアミノ酸３３〜２２０と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＢ１ポリペプチドは、約１８８アミノ酸（例えば、１８６、１８７、１８８、１９０、１９１、または１９２アミノ酸）の長さを有する。
【０１００】
「ＤＱＢ１ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＢ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000069
、またはそのアレルバリアントを含む。
【０１０１】
好適なＤＱＢ１  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000070
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、または９６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ１  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000071
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【０１０２】
好適なＤＱＢ１  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000072
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２、９３、９４、９５、または９６アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ１  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000073
、またはその天然アレルバリアントを含み得る。
【０１０３】
ＤＱＢ２
いくつかの場合において、好適なＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチドは、ＤＱＢ２ポリペプチドである。ＤＱＢ２ポリペプチドは、図２０Ａまたは図２０に示されるＤＱＢ２アミノ酸配列のアミノ酸３３〜２１５と、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有し得る。いくつかの場合において、ＤＱＢ２ポリペプチドは、約１８２アミノ酸（例えば、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、または１８２アミノ酸）の長さを有する。
【０１０４】
「ＤＱＢ２ポリペプチド」は、アレルバリアント、例えば、天然アレルバリアントを含む。したがって、いくつかの場合において、好適なＤＱＢ２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000074
、またはそのアレルバリアントを含む。
【０１０５】
好適なＤＱＢ２  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000075
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２  ９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ２  β１ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000076
、または天然アレルバリアントを含み得る。
【０１０６】
好適なＤＱＢ２  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000077
に対して、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、約９４アミノ酸（例えば、９２  ９３、９４、９５、９６、または９７アミノ酸）の長さを有し得る。好適なＤＱＢ２  β２ドメインは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000078
、その天然アレルバリアントを含み得る。
【０１０７】
骨格ポリペプチド
本開示のＡＰＰは、多量体であれ単量体であれ、免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格を含み得る。本開示のＡＰＰポリペプチドは、多量体であれ単量体であれ、Ｆｃポリペプチドを含み得るか、別の好適な骨格ポリペプチドを含み得る。
【０１０８】
好適な骨格ポリペプチドには、抗体ベースの骨格ポリペプチドおよび非抗体ベースの骨格が含まれる。非抗体ベースの骨格には、例えば、アルブミン、ＸＴＥＮ（延長組み換え）ポリペプチド、トランスフェリン、Ｆｃ受容体ポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド（例えば、Ｈａｓｓｏｕｎｅｈ  ｅｔ  ａｌ．（２０１２）Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．５０２：２１５参照；例えば、（Ｖａｌ−Ｐｒｏ−Ｇｌｙ−Ｘ−Ｇｌｙ；ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６５）（配列中、Ｘは、プロリン以外の任意のアミノ酸である）のペンタペプチド反復単位を含むポリペプチド）、アルブミン結合ポリペプチド、シルク様ポリペプチド（例えば、Ｖａｌｌｕｚｚｉ  ｅｔ  ａｌ．（２００２）Ｐｈｉｌｏｓ  Ｔｒａｎｓ  Ｒ  Ｓｏｃ  Ｌｏｎｄ  Ｂ  Ｂｉｏｌ  Ｓｃｉ．３５７：１６５参照）、シルクエラスチン様ポリペプチド（ＳＥＬＰ；例えば、Ｍｅｇｅｅｄ  ｅｔ  ａｌ．（２００２）Ａｄｖ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖ  Ｒｅｖ．５４：１０７５参照）などが含まれる。好適なＸＴＥＮポリペプチドには、例えば、ＷＯ２００９／０２３２７０、ＷＯ２０１０／０９１１２２、ＷＯ２００７／１０３５１５、ＵＳ２０１０／０１８９６８２、およびＵＳ２００９／００９２５８２に開示されているものが含まれる。Ｓｃｈｅｌｌｅｎｂｅｒｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２００９）Ｎａｔ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２７：１１８６）も参照されたい。好適なアルブミンポリペプチドには、例えば、ヒト血清アルブミンが含まれる。
【０１０９】
好適な骨格ポリペプチドは、いくつかの場合において、半減期延長ポリペプチドである。したがって、いくつかの場合において、好適な骨格ポリペプチドは、骨格ポリペプチドを持たない対照多量体ポリペプチドと比較して、多量体ポリペプチドのｉｎ  ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を増大させる。例えば、いくつかの場合において、骨格ポリペプチドは、骨格ポリペプチドを持たない対照多量体ポリペプチドと比較して、多量体ポリペプチドのｉｎ  ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍を超えて増大させる。一例として、いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、Ｆｃポリペプチドを持たない対照多量体ポリペプチドと比較して、多量体ポリペプチドのｉｎ  ｖｉｖｏ半減期（例えば、血清半減期）を、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約５０％、少なくとも約２倍、少なくとも約２．５倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、または１００倍を超えて増大させる。
【０１１０】
Ｆｃポリペプチド
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含み得る。例えば、ＡＰＰが多量体ポリペプチドである場合、いくつかの場合において、多量体ポリペプチドの第１および／または第２のポリペプチド鎖は、Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単量体ポリペプチドであり、Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。Ｆｃポリペプチドは、ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ、ヒトＩｇＧ２  Ｆｃ、ヒトＩｇＧ３  Ｆｃ、ヒトＩｇＧ４  Ｆｃなどであり得る。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａ〜２１Ｇに示されるＦｃ領域のアミノ酸配列に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃ領域は、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、Ｎ７７の置換を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、Ｎ７７Ａの置換を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ２  Ｆｃポリペプチドのアミノ酸９９〜３２５に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるヒトＩｇＧ３  Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１９〜２４６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるヒトＩｇＭ  Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１〜２７６に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＡ  Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１〜２３４に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＧ４  Ｆｃポリペプチドに対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、例えば、Ｆｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるヒトＩｇＧ４  Ｆｃポリペプチドのアミノ酸１００〜３２７に対して、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【０１１１】
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、アスパラギン以外のアミノ酸によるＮ２９７の置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｃに示されるアミノ酸配列（Ｎ２９７Ａの置換を含むヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、ロイシン以外のアミノ酸によるＬ２３４の置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、ロイシン以外のアミノ酸によるＬ２３５の置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。
【０１１２】
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｅに示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｆに示されるアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｇに示されるアミノ酸配列（Ｌ２３４Ａの置換およびＬ２３５Ａの置換を含むヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、プロリン以外のアミノ酸によるＰ３３１の置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含み、いくつかの場合において、置換は、Ｐ３３１Ｓの置換である。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、ロイシン以外のアミノ酸によるＬ２３４およびＬ２３５の置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、ロイシン以外のアミノ酸によるＬ２３４およびＬ２３５の置換、ならびにプロリン以外のアミノ酸によるＰ３３１の置換を除き、図２１Ａに示されるアミノ酸配列（ヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、図２１Ｂに示されるアミノ酸配列（Ｌ２３４Ｆ、Ｌ２３５Ｅ、およびＰ３３１Ｓの置換を含むヒトＩｇＧ１  Ｆｃ）を含む。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するＦｃポリペプチドは、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの置換を含むＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドである。
【０１１３】
リンカー
上記のとおり、本開示のＡＰＰは、例えば、エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間、第１のＭＨＣポリペプチドポリペプチドと第２のＭＨＣポリペプチドとの間などに挿入されたリンカーペプチドを含み得る。
【０１１４】
好適なリンカー（「スペーサー」とも称される）は、容易に選択することができ、１アミノ酸〜２５アミノ酸、３アミノ酸〜２０アミノ酸、２アミノ酸〜１５アミノ酸、３アミノ酸〜１２アミノ酸など、また４アミノ酸〜１０アミノ酸、５アミノ酸〜９アミノ酸、６アミノ酸〜８アミノ酸、または７アミノ酸〜８アミノ酸を含む、多くの好適な長さのいずれかであってよい。好適なリンカーは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、２５〜３５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、または３５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、３５〜４５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、または４５アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、４５〜５０アミノ酸長であり得る。好適なリンカーは、４５、４６、４７、４８、４９、または５０アミノ酸長であり得る。
【０１１５】
例示的なリンカーとしては、グリシンポリマー（Ｇ）ｎ、グリシン−セリンポリマー（例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６６）および（ＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６７）（式中、ｎは、少なくとも１つの整数である）を含む）、グリシン−アラニンポリマー、アラニン−セリンポリマー、および当該技術分野において知られている他の柔軟性のあるリンカーが挙げられる。グリシンおよびグリシン−セリンポリマーが使用され得、ＧｌｙとＳｅｒはいずれも比較的非構造的であることから、構成成分間の中間テザーとして機能することができる。グリシンポリマーは、グリシンが更にアラニンよりも極めて多くのΦ−Ψ空間を利用でき、長い側鎖を持つ残基よりも制限が少ない（Ｓｃｈｅｒａｇａ，Ｒｅｖ．Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ  Ｃｈｅｍ．１１１７３−１４２（１９９２）参照）。例示的なリンカーは、限定するものではないが、ＧＧＳＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６８）、ＧＧＳＧＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６９）、ＧＳＧＳＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７０）、ＧＳＧＧＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７１）、ＧＧＧＳＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７２）、ＧＳＳＳＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７３）などを含む、アミノ酸配列を含み得る。例示的なリンカーは、例えば、Ｇｌｙ（Ｓｅｒ４）ｎ、（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４４）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である）を含み得る。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＳＳＳＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７４）（式中、ｎは、４である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＳＳＳＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７４）（式中、ｎは、５である）を含む。例示的なリンカーは、例えば、（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である）を含み得る。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４５）（式中、ｎは、２である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４６）（式中、ｎは、３である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４７）（式中、ｎは、４である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４８）（式中、ｎは、５である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４９）（式中、ｎは、６である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５０）（式中、ｎは、７である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５１）（式中、ｎは、８である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５２）（式中、ｎは、９である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３５３）（式中、ｎは、１０である）を含む。いくつかの場合において、リンカーは、アミノ酸配列ＡＡＡＧＧ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７６）を含む。
【０１１６】
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するリンカーポリペプチドは、ＡＰＰの第２のポリペプチド中に存在するシステイン残基とジスルフィド結合を形成することができるシステイン残基を含む。いくつかの場合において、例えば、好適なリンカーは、アミノ酸配列
2021500855.tif 000079
を含む。
【０１１７】
エピトープ提示ペプチド
本開示のＡＰＰ中に存在するペプチドエピトープ（本明細書において「ペプチド抗原」または「エピトープ提示ペプチド」または「エピトープ」とも称される）は、Ｔ細胞の表面上のＴＣＲに対するエピトープを表す。エピトープ提示ペプチドは、約４アミノ酸〜約２５アミノ酸の長さを有し得、例えば、エピトープは、４アミノ酸（ａａ）〜１０ａａ、１０ａａ〜１５ａａ、１５ａａ〜２０ａａ、または２０ａａ〜２５ａａの長さを有し得る。例えば、本開示のＡＰＰ中に存在するエピトープは、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７、ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、２０ａａ、２１ａａ、２２ａａ、２３ａａ、２４ａａ、または２５ａａの長さを有し得る。いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドは、５アミノ酸〜１０アミノ酸、例えば、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａの長さを有する。
【０１１８】
本開示のＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドは、Ｔ細胞によって特異的に結合され、すなわち、エピトープは、エピトープ特異的Ｔ細胞によって特異的に結合される。エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープ提示ペプチドに結合するが、参照アミノ酸配列と異なるエピトープには実質的に結合しない。例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞は、参照アミノ酸配列を有するエピトープ提示ペプチドに結合し、参照アミノ酸配列と異なるエピトープには、結合したとしても、１０−６Ｍ未満、１０−５Ｍ未満、または１０−４Ｍ未満の親和性で結合する。エピトープ特異的Ｔ細胞は、少なくとも１０−７Ｍ、少なくとも１０−８Ｍ、少なくとも１０−９Ｍ、または少なくとも１０−１０Ｍの親和性で、特異的なエピトープ提示ペプチドに結合することができる。
【０１１９】
好適なエピトープ提示ペプチドには、がん関連抗原中に存在するエピトープ提示ペプチドが含まれるが、これらに限定されない。がん関連抗原には、葉酸受容体α、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＣＡＩＸ）、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ４４ｖ７／８、がん胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮糖タンパク質−２（ＥＧＰ−２）、上皮糖タンパク質−４０（ＥＧＰ−４０）、葉酸結合タンパク質（ＦＢＰ）、胎児型アセチルコリン受容体、ガングリオシド抗原ＧＤ２、Ｈｅｒ２／ｎｅｕ、ＩＬ−１３Ｒ−ａ２、κ軽鎖、ＬｅＹ、Ｌ１細胞接着分子、黒色腫関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＭＡＧＥ−Ａ１、メソテリン、ＭＵＣ１、ＮＫＧ２Ｄリガンド、腫瘍胎児抗原（ｈ５Ｔ４）、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）、腫瘍関連糖タンパク質−７２（ＴＡＧ−７２）、および血管内皮細胞増殖因子受容体−２（ＶＥＧＦ−Ｒ２）が含まれるが、これらに限定されない。例えば、Ｖｉｇｎｅｒｏｎ  ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｍｍｕｎｉｔｙ  １３：１５；および  Ｖｉｇｎｅｒｏｎ（２０１５）ＢｉｏＭｅｄ  Ｒｅｓ．Ｉｎｔ’ｌ  Ａｒｔｉｃｌｅ  ＩＤ  ９４８５０１を参照されたい。いくつかの場合において、エピトープは、ヒトパピローマウイルスＥ７抗原エピトープであり、例えば、Ｒａｍｏｓ  ｅｔ  ａｌ．（２０１３）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．３６：６６を参照されたい。
【０１２０】
いくつかの場合において、好適なペプチドエピトープは、ＭＵＣ１ポリペプチド、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）Ｅ６ポリペプチド、ＬＭＰ２ポリペプチド、ＨＰＶ  Ｅ７ポリペプチド、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）ｖＩＩＩポリペプチド、ＨＥＲ−２／ｎｅｕポリペプチド、黒色腫抗原ファミリーＡ３（ＭＡＧＥＡ３）ポリペプチド、ｐ５３ポリペプチド、変異型ｐ５３ポリペプチド、ＮＹ−ＥＳＯ−１ポリペプチド、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原；ＰＳＭＡ）ポリペプチド、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）ポリペプチド、Ｔ細胞によって認識される黒色腫抗原（ｍｅｌａｎＡ／ＭＡＲＴ１）ポリペプチド、Ｒａｓポリペプチド、ｇｐ１００ポリペプチド、プロテアーゼ３（ＰＲ１）ポリペプチド、ｂｃｒ−ａｂｌポリペプチド、チロシナーゼポリペプチド、サバイビンポリペプチド、前立腺特異的抗原（ＰＳＡ）ポリペプチド、ｈＴＥＲＴポリペプチド、肉腫転座切断点ポリペプチド、滑膜肉腫Ｘ（ＳＳＸ）切断点ポリペプチド、ＥｐｈＡ２ポリペプチド、前立腺性酸性フォスファターゼ（ＰＡＰ）ポリペプチド、黒色腫アポトーシス阻害（ＭＬ−ＩＡＰ）ポリペプチド、アルファ−フェトプロテイン（ＡＦＰ）ポリペプチド、上皮細胞接着分子（ＥｐＣＡＭ）ポリペプチド、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２  ＥＴＳ融合体）ポリペプチド、ＮＡ１７ポリペプチド、ペアードボックス−３（ＰＡＸ３）ポリペプチド、未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）ポリペプチド、アンドロゲン受容体ポリペプチド、サイクリンＢ１ポリペプチド、Ｎ−ｍｙｃがん原遺伝子（ＭＹＣＮ）ポリペプチド、Ｒａｓホモログ遺伝子ファミリーメンバーＣ（ＲｈｏＣ）ポリペプチド、チロシナーゼ関連タンパク質−２（ＴＲＰ−２）ポリペプチド、メソテリンポリペプチド、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）ポリペプチド、黒色腫関連抗原−１（ＭＡＧＥ  Ａ１）ポリペプチド、シトクロムＰ４５０  １Ｂ１（ＣＹＰ１Ｂ１）ポリペプチド、胎盤特異的タンパク質１（ＰＬＡＣ１）ポリペプチド、ＢＯＲＩＳポリペプチド（ＣＣＣＴＣ結合因子またはＣＴＣＦとしても知られる）、ＥＴＶ６−ＡＭＬポリペプチド、乳癌抗原ＮＹ−ＢＲ−１ポリペプチド（アンキリンリピートドメイン含有タンパク質３０Ａとも称される）、Ｇタンパク質シグナル伝達調節因子（ＲＧＳ５）ポリペプチド、Ｔ細胞によって認識される扁平上皮癌抗原（ＳＡＲＴ３）ポリペプチド、炭酸脱水酵素ＩＸポリペプチド、ペアードボックス−５（ＰＡＸ５）ポリペプチド、ＯＹ−ＴＥＳ１（精巣抗原；アクロシン結合タンパク質としても知られる）ポリペプチド、精子タンパク質１７ポリペプチド、リンパ球特異的タンパク質チロシンキナーゼ（ＬＣＫ）ポリペプチド、高分子量黒色腫関連抗原（ＨＭＷ−ＭＡＡ）、Ａキナーゼアンカータンパク質−４（ＡＫＡＰ−４）、滑膜肉腫Ｘ切断点２（ＳＳＸ２）ポリペプチド、Ｘ抗原ファミリーメンバー１（ＸＡＧＥ１）ポリペプチド、Ｂ７ホモログ３（Ｂ７Ｈ３；ＣＤ２７６としても知られる）ポリペプチド、レグマインポリペプチド（ＬＧＭＮ１；アスパラギニルエンドペプチダーゼとしても知られる）、ＩｇおよびＥＧＦ相同性ドメイン−２を含むチロシンキナーゼ（Ｔｉｅ−２；アンジオポエチン−１受容体としても知られ���）ポリペプチド、Ｐ抗原ファミリーメンバー４（ＰＡＧＥ４）ポリペプチド、血管内皮細胞増殖因子受容体２（ＶＥＧＦ２）ポリペプチド、ＭＡＤ−ＣＴ−１ポリペプチド、線維芽細胞活性化タンパク質（ＦＡＰ）ポリペプチド、血小板由来成長因子受容体ベータ（ＰＤＧＦβ）ポリペプチド、ＭＡＤ−ＣＴ−２ポリペプチド、Ｆｏｓ関連抗原−１（ＦＯＳＬ）ポリペプチド、ならびにウィルムス腫瘍−１（ＷＴ１）ポリペプチドの約４アミノ酸長〜約２０アミノ酸長（例えば、４アミノ酸（ａａ）、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、１０ａａ、１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、または２０ａａ）のペプチド断片である。
【０１２１】
がん関連抗原のアミノ酸配列は、当該技術分野において知られており、例えば、ＭＵＣ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＡＡ５６７３４）、ＬＭＰ２（ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＡＡ４７０２４）、ＨＰＶ  Ｅ６（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＤ３３２５２）、ＨＰＶ  Ｅ７（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＨＧ９９４８０）、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１３３３８７０）、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＩ６７１４７）、ＭＡＧＥ−Ａ３（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ１１７４４）、ｐ５３（ＧｅｎＢａｎｋ  ＢＡＣ１６７９９）、ＮＹ−ＥＳＯ−１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＡＡ０５９０８）、ＰＳＭＡ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ２５６７２）、ＣＥＡ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＡ５１９６７）、ｍｅｌａｎ／ＭＡＲＴ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００５５０２）、Ｒａｓ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１１２３９１４）、ｇｐ１００（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６０６３４）、ｂｃｒ−ａｂｌ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＢ６０３８８）、チロシナーゼ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＢ６０３１９）、サバイビン（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ５１６６０）、ＰＳＡ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＡＤ５４６１７）、ｈＴＥＲＴ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＢＡＣ１１０１０）、ＳＳＸ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１２６５６２０）、Ｅｐｈ２Ａ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００４４２２）、ＰＡＰ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ１６３４４）、ＭＬ−ＩＡＰ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ１４４７５）、ＡＦＰ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１１２５）、ＥｐＣＡＭ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００２３４５）、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２  ＥＴＳ融合体）（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＣＡ８１３８５）、ＰＡＸ３（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＩ０１３０１）、ＡＬＫ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００４２９５）、アンドロゲン受容体（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００００３５）、サイクリンＢ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＡＯ９９２７３）、ＭＹＣＮ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１２８０１５７）、ＲｈｏＣ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ５２８０８）、ＴＲＰ−２（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＣ６０６２７）、メソテリン（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ０９２７２）、ＰＳＣＡ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＨ６５１８３）、ＭＡＧＥ  Ａ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００４９７９）、ＣＹＰ１Ｂ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＭ５０５１２）、ＰＬＡＣ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＧ２２５９６）、ＢＯＲＩＳ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１２５５９６９）、ＥＴＶ６（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１９７８）、ＮＹ−ＢＲ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿４４３７２３）、ＳＡＲＴ３（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０５５５２１）、炭酸脱水酵素ＩＸ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＥＡＷ５８３５９）、ＰＡＸ５（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０５７９５３）、ＯＹ−ＴＥＳ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿１１５８７８）、精子タンパク質１７（ＧｅｎＢａｎｋ  ＡＡＫ２０８７８）、ＬＣＫ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１０３６２３６）、ＨＭＷ−ＭＡＡ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１８８８）、ＡＫＡＰ−４（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００３８７７）、ＳＳＸ２（ＧｅｎＢａｎｋ  ＣＡＡ６０１１１）、ＸＡＧＥ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１０９１０７３、ＸＰ＿００１１２５８３４、ＸＰ＿００１１２５８５６、およびＸＰ＿００１１２５８７２）、Ｂ７Ｈ３（Ｇｅ���Ｂａｎｋ  ＮＰ＿００１０１９９０７、ＸＰ＿９４７３６８、ＸＰ＿９５０９５８、ＸＰ＿９５０９６０、ＸＰ＿９５０９６２、ＸＰ＿９５０９６３、ＸＰ＿９５０９６５、およびＸＰ＿９５０９６７）、ＬＧＭＮ１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１００８５３０）、ＴＩＥ−２（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０００４５０）、ＰＡＧＥ４（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１３０５８０６）、ＶＥＧＦＲ２（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００２２４４）、ＭＡＤ−ＣＴ−１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００５８９３  ＮＰ＿０５６２１５）、ＦＡＰ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００４４５１）、ＰＤＧＦβ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００２６００）、ＭＡＤ−ＣＴ−２（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００１１３８５７４）、ＦＯＳＬ（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿００５４２９）、およびＷＴ−１（ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０００３６９）を参照されたい。これらのポリペプチドはまた、例えば、Ｃｈｅｅｖｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２００９）Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．１５：５３２３、および当該文献中で引用されている参考文献；Ｗａｇｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２００３）Ｊ．Ｃｅｌｌ．Ｓｃｉ．１１６：１６５３；Ｍａｔｓｕｉ  ｅｔ  ａｌ．（１９９０）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ  ５：２４９；Ｚｈａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ  ３８３：１６８でも考察されている。
【０１２２】
いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／８２−９０（ＬＬＭＧＴＬＧＩＶ；ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７８）である。いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／８６−９３（ＴＬＧＩＶＣＰＩ；ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７９）である。いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／１１−２０（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴＴ；ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８０）である。いくつかの場合において、エピトープは、ＨＰＶ１６Ｅ７／１１−１９（ＹＭＬＤＬＱＰＥＴ；ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８１）である。追加の好適なＨＰＶエピトープについては、例えば、Ｒｅｓｓｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．（（１９９５）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５４：５９３４）を参照されたい。
【０１２３】
いくつかの場合において、ペプチドエピトープは、「自身の」抗原（自己抗原）に関連するか、当該抗原中に存在するエピトープである。自己抗原としては、例えば、アグリカン、アラニル−ｔＲＮＡシンテターゼ（ＰＬ−１２）、アルファベータクリスタリン、アルファフォドリン（Ｓｐｔａｎ１）、アルファ−アクチニン、α１アンチキモトリプシン、α１アンチトリプシン、α１ミクログロブリン、アルソラーゼ、アミノアシル−ｔＲＮＡシンテターゼ、アミロイド、アネキシン、アポリポタンパク質、アクアポリン、殺菌性／透過性増強タンパク質（ＢＰＩ）、β−グロビン前駆体ＢＰ１、β−アクチン、β−ラクトグロブリンＡ、β−２−糖タンパク質Ｉ、ベータ２−ミクログロブリン、血液型抗原、Ｃ反応性タンパク質（ＣＲＰ）、カルモジュリン、カルレチクリン、カルジオリピン、カタラーゼ、カテプシンＢ、セントロメアタンパク質、コンドロイチン硫酸、クロマチン、コラーゲン、補体成分、シトクロムＣ、シトクロムＰ４５０  ２Ｄ６、サイトケラチン、デコリン、デルマタン硫酸、ＤＮＡ、ＤＮＡトポイソメラーゼＩ、エラスチン、エプスタインバー核抗原１（ＥＢＮＡ１）、エラスチン、エンタクチン、抽出可能な核抗原、第Ｉ因子、第Ｐ因子、第Ｂ因子、第Ｄ因子、第Ｈ因子、第Ｘ因子、フィブリノゲン、フィブロネクチン、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＬＣ−１）、グリアジンおよびアミド化グリアジンペプチド（ＤＧＰ）、ｇｐ２１０核エンベロープタンパク質、ＧＰ２（主要チモーゲン顆粒膜糖タンパク質）、グルテニン、糖タンパク質ｇｐＩＩｂ／ＩＩＩａ、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、グリコアルブミン、グリセルアルデヒド３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）、ハプトグロビンＡ２、熱ショックタンパク質、ヘモシアニン、ヘパリン、ヒストン、ヒスチジル−ｔＲＮＡシンテターゼ（Ｊｏ−１）、ホルデイン、ヒアルロニダーゼ、免疫グロブリン、インスリン、インスリン受容体、インテグリン、間質性レチノール結合タンパク質３、内因子、Ｋｕ（ｐ７０／ｐ８０）、乳酸脱水素酵素、ラミニン、肝臓サイトゾル抗原タイプ１（ＬＣ１）、肝臓／腎臓ミクロソーム抗原１（ＬＫＭ１）、リゾチーム、黒色腫分化関連タンパク質５（ＭＤＡＳ）、Ｍｉ−２（クロモドメインヘリカーゼＤＮＡ結合タンパク質４）、ミトコンドリアタンパク質、ムスカリン受容体、ミエリン関連糖タンパク質、ミオシン、ミエリン塩基性タンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質、ミエロペルオキシダーゼ（ＭＰＯ）、リウマチ因子（ＩｇＭ抗ＩｇＧ）、ニューロン特異的エノラーゼ、ニコチン性アセチルコリン受容体Ａ鎖、ヌクレオリン、ヌクレオポリン、ヌクレオソーム抗原、ＰＭ／Ｓｃｌ１００、ＰＭ／Ｓｃｌ７５、膵臓β細胞抗原、ペプシノーゲン、ペルオキシレドキシン１、ホスホグルコースイソメラーゼ、リン脂質、ホスホチジルイノシトール、血小板由来成長因子、ポリメラーゼベータ（ＰＯＬＢ）、カリウムチャネルＫＩＲ４．１、増殖細胞核抗原（ＰＣＮＡ）、プロテアーゼ−３、プロテオリピドタンパク質、プロテオグリカン、プロトロンビン、リカバリン、ロドプシン、リボヌクレアーゼ、リボ核タンパク質、リボソーム、リボソームリンタンパク質、ＲＮＡ、Ｓｍタンパク質、Ｓｐ１００核タンパク質、ＳＲＰ５４（シグナル認識粒子５４ｋＤａ）、セカリン、セレクチン、平滑筋タンパク質、スフィンゴミエリン、連鎖球菌抗原、スーパーオキシドジスムターゼ、滑膜性関節タンパク質、Ｔ１Ｆ１ガンマコラーゲン、スレオニル−ｔＲＮＡシンテターゼ（ＰＬ−７）、組織型トランスグルタミナーゼ、甲状腺ペルオキシダーゼ、サイログロブリン、甲状腺刺激ホルモン受容体、トランスフェリン、トリオースリン酸イソメラーゼ、チューブリン、腫瘍壊死アルファ、トポイソメラーゼ、Ｕ１−ｄｎＲＮＰ  ６８／７０ｋＤａ、Ｕ１−ｓｎＲＮＰ  Ａ、Ｕ１−ｓｎＲＮＰ  Ｃ、Ｕ−ｓｎＲＮＰ  Ｂ／Ｂ’、ユビキチン、血管内皮細胞増殖因子、ビメンチン、ならびにビトロネクチンが含まれる。
【０１２４】
１型糖尿病（Ｔ１Ｄ）に関連する抗原には、例えば、プレプロインスリン、プロインスリン、インスリン、インスリンＢ鎖、インスリンＡ鎖、グルタミン酸デカルボキシラーゼの６５ｋＤａアイソフォーム（ＧＡＤ６５）、グルタミン酸デカルボキシラーゼの６７ｋＤａアイソフォーム（ＧＡＤ６７）、チロシンホスファターゼ（ＩＡ−２）、熱ショックタンパク質ＨＳＰ６５、膵島特異的グルコース６−ホスファターゼ触媒サブユニット関連タンパク質（ＩＧＲＰ）、膵島抗原２（ＩＡ２）、および亜鉛トランスポーター（ＺｎＴ８）が含まれる。例えば、Ｍａｌｌｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．（２０１１）Ｃｌｉｎ．Ｄｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１１：５１３２１０、および米国特許出願公開第２０１７／００４５５２９号を参照されたい。特定の自己免疫障害に「関連する」抗原は、その自己免疫障害を有する個体に存在する自己抗体および／または自己反応性Ｔ細胞の標的である抗原である。この場合、そのような自己抗体および／または自己反応性Ｔ細胞は、自己免疫障害に関連する病理学的状態を媒介する。本開示の抗原提示ポリペプチドに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したＴ１Ｄ関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。１つの非限定的な例として、エピトープ提示ペプチドは、プロインスリン７３〜９０
2021500855.tif 000080
である。別の非限定的な例として、エピトープ提示ペプチドは、次のインスリン（ＩｎｓＡ（１〜１５）ペプチド：
2021500855.tif 000081
である。別の非限定的な例として、エピトープ提示ペプチドは、次のインスリン（ＩｎｓＡ（１〜１５；Ｄ４Ｅ）ペプチド：
2021500855.tif 000082
である。別の非限定的な例として、エピトープ提示ペプチドは、次のＧＡＤ６５（５５５〜５６７）ペプチド；
2021500855.tif 000083
である。別の非限定的な例として、エピトープ提示ペプチドは、次のＧＡＤ６５（５５５〜５６７；Ｆ５５７Ｉ）ペプチド；
2021500855.tif 000084
である。別の非限定的な例として、エピトープ提示ペプチドは、次の膵島抗原２（ＩＡ２）ペプチド：
2021500855.tif 000085
である。
【０１２５】
グレーヴス病に関連する抗原には、例えば、サイログロブリン、甲状腺ペルオキシダーゼ、およびサイロトロピン受容体（ＴＳＨ−Ｒ）が含まれる。本開示のＡ｛｛に含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したグレーヴス病関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
【０１２６】
自己免疫性多内分泌腺症候群に関連する抗原には、１７−アルファヒドロキシラーゼ、ヒスチジンデカルボキシラーゼ、トリプトファンヒドロキシラーゼ、およびチロシンヒドロキシラーゼが含まれる。本開示の抗原提示ポリペプチドに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した自己免疫性多内分泌腺症候群関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
【０１２７】
リウマチ様関節炎に関連する抗原には、例えば、コラーゲン、ビメンチン、アグレガン、およびフィブリノゲンが含まれる。本開示の抗原提示ポリペプチドに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したリウマチ様関節炎関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
【０１２８】
パーキンソン病に関連する抗原には、例えば、α−シヌクレインが含まれる。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したパーキンソン病関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
【０１２９】
多発性硬化症に関連する抗原には、例えば、ミエリン塩基性タンパク質、ミエリンオリゴデンドロサイト糖タンパク質、およびプロテオリピドタンパク質が含まれる。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述した多発性硬化症関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。
【０１３０】
セリアック病に関連する抗原には、例えば、組織型トランスグルタミナーゼおよびグリアジンが含まれる。本開示のＡＰＰに含めるのに好適なエピトープ提示ペプチドは、上述したセリアック関連抗原のいずれか１つの４アミノ酸長〜約２５アミノ酸長のエピトープ提示ペプチドであり得る。セリアック病に関連する他の抗原には、例えば、セカリン、ホルデイン、アベニン、およびグルテニンが含まれる。セカリンの例としては、ライムギセカリンが挙げられる。ホルデインの例としては、オオムギホルデインが挙げられる。グルテニンの例としては、コムギグルテニンが挙げられる。例えば、Ｕ．Ｓ．２０１６／０２７９２３３を参照されたい。
【０１３１】
免疫調節ドメインを含む抗原提示ポリペプチド
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド（ＴＭＡＰＰ）である。したがって、本開示は、ＴＭＡＰＰを提供する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つのポリペプチド鎖を含み、本明細書において、「多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド」と称される場合もある。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。本開示のＴＭＡＰＰは、「ｓｙｎＴａｃポリペプチド」とも称される。
【０１３２】
本開示のＴＭＡＰＰは、１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つ以上の免疫調節ポリペプチド（例えば、２、３、４、または５つの免疫調節ポリペプチド）を含む。
【０１３３】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドを含む場合、２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、第１のポリペプチド鎖中にのみ存在する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドを含む場合、２つ以上の免疫調節ポリペプチドは、第２のポリペプチド鎖中にのみ存在する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドを含む場合、２つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、第１のポリペプチド鎖中に存在し、２つ以上の免疫調節ポリペプチドのうちの少なくとも１つは、第２のポリペプチド鎖に存在する。
【０１３４】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を有する。すなわち、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を持たず、例えば、２つの免疫調節ポリペプチドのうちの１つは、第１のアミノ酸配列を含み、２つの免疫調節ポリペプチドのうちの２つ目は、第２のアミノ酸配列を含み、ここで、第１および第２のアミノ酸配列は同一でない。いくつかの場合において、第１および第２のアミノ酸配列は、アミノ酸配列が１アミノ酸〜１０アミノ酸、１０アミノ酸〜２５アミノ酸、または２５アミノ酸を超えて、互いに異なる。いくつかの場合において、第１および第２のアミノ酸配列は、９８％未満、９５％未満、９０％未満、８５％未満、８０％未満、７５％未満、または７０％未満のアミノ酸配列同一性を互いに共有する。
【０１３５】
本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性を調節する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ＣＤ８＋Ｔ細胞応答、例えば、がん細胞に対するＣＤ８＋Ｔ細胞応答を活性化する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、自己反応性Ｔ細胞および／または自己反応性Ｂ細胞の活性を低下させる。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の数および／または活性を増大させ、これにより、自己反応性Ｔ細胞および／または自己反応性Ｂ細胞の活性の低下をもたらす。
【０１３６】
本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドには、ＩＬ−２、トランスフォーミング増殖因子ベータ（ＴＧＦβ）、ＪＡＧ１、ＣＤ７、Ｂ７−１（ＣＤ８０）、Ｂ７−２（ＣＤ８６）、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ−Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、ＨＶＥＭが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドは、野生型または天然免疫調節ポリペプチドと比較して、１〜１０のアミノ酸置換を含み、かつその同種の免疫共調節ポリペプチド（例えば、Ｔ細胞の表面上に存在する免疫共調節ポリペプチド）に対して、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する野生型または天然免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、親和性の低下を呈する、バリアントである。
【０１３７】
Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ペプチドエピトープ（ＴＣＲが認識および結合するペプチド）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α鎖ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β鎖ポリペプチド、およびｉｖ）免疫調節ポリペプチド（本明細書において「ＭＯＤポリペプチド」または「ＭＯＤドメイン」とも称される）を含む。本開示のＴＭＡＰＰは、二量体化ポリペプチド、および免疫グロブリン骨格（例えば、Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド）または非免疫グロブリン骨格のうちの一方または両方を更に含み得る。本開示の多量体ＴＭＡＰＰの非限定的な例は、図２２Ａ〜２２Ｊおよび図２４に模式的に示されている。
【０１３８】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。本開示のＴＭＡＰＰが２または３コピーの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、その２または３コピーは、タンデムに並んでいる。本開示のＴＭＡＰＰが２または３コピーの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、その２または３コピーは、リンカーによって互いに分離されている。
【０１３９】
本開示のＴＭＡＰＰは、１つ以上のリンカーを含み得、ここで、当該１つ以上のリンカーは、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間（かかるリンカーは、本明細書において「Ｌ１」と称される）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとの間（かかるリンカーは、本明細書において「Ｌ２」と称される）、ｉｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチドと第２の免疫調節ポリペプチドとの間（かかるリンカーは、本明細書において「Ｌ３」と称される）、ｉｖ）ペプチド抗原（「エピトープ」）とＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとの間、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドと二量体化ポリペプチド（例えば、二量体化ペアの第１または第２のメンバー）との間、およびｖｉ）二量体化ポリペプチド（例えば、二量体化ペアの第１または第２のメンバー）とＩｇＦｃポリペプチドとの間のうちの１つ以上の間にある。いくつかの場合において、Ｌ１リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、Ｌ２リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、Ｌ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１４０】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）Ｍ��ＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１および第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ���端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１および第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１および第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、第１および第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む。本開示のＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、第１の免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３」リンカー）、例えば、約２アミノ酸長〜５０アミノ酸長のリンカーによって第２の免疫調節ポリペプチドに連結される。好適なＬ３リンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの
場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１４１】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（���えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、およびｖ）およびｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第１のメンバー（例えば、第１のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第２のメンバー（例えば、第２のロイシンジッパーポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、���、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１４２】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫調節ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ポリペプチド、およびｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コ��ーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１４３】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは��２コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１４４】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）二量体化ペアの第１のメンバーを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）二量体化ペアの第２のメンバーを含む、第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）第１のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２のロイシンジッパーポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、単一の免疫調節ポリペプチドを含み得る。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、２コピーの免��調節ポリペプチドを含み得、その２コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、３コピーの免疫調節ポリペプチドを含み得、その３コピーは、タンデムに並んでいてもよいし、リンカーによって分離されていてもよい。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１４５】
例示的な多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
以下は、次のポリペプチドペアを採用した本開示の多量体ＴＭＡＰＰの非限定的な例である：１）図２６Ａに示される１４５２ポリペプチドと図３４Ａに示される１６６１ポリペプチド、２）図３３Ａに示される１６５９ポリペプチドと図３５Ａに示される１６６４ポリペプチド、３）図に示される１６３７ポリペプチドと図２５Ａに示される１４０８ポリペプチド、図３１Ａに示される１６３９ポリペプチドと図３２Ａに示される１６４０ポリペプチド、および５）図３７Ａに示される１７１１ポリペプチドと図３８Ａに示される１７０５ポリペプチド。ＴＭＡＰＰを必要とする個体に投与されるＴＭＡＰＰは、一般に、上述の図に示されるようなリーダー配列またはヒスチジンタグを含まない。
【０１４６】
１）１４５２＋１６６１。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、ｖｉ）二量体化ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）リンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチド、およびｖｉｉ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ、例えば、
2021500855.tif 000086
である。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000087
（Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ−ＤＲＢ１  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000088
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列
2021500855.tif 000089
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列
2021500855.tif 000090
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000091
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000092
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図２６Ａに示される１４５２アミノ酸配列を、リーダー配列なし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図２６Ａに示される１４５２アミノ酸配列のアミノ酸２１〜６２８を含む。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３４Ａに示される１６６１アミノ酸配列を、リーダー配列なしで含む。例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３４Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜４９１を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドのエピトープは、
2021500855.tif 000093
ではなく、代わりに、異なるエピトープで置換される。
【０１４７】
２）１６５９＋１６６４。いくつかの場合において、本開示の本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、およびｉｉｉ）ＨＬＡ  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、およびｖ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、およびｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ、例えば、
2021500855.tif 000094
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000095
を含む。いくつかの場合において、ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000096
を含む。いくつかの場合において、ＤＲＡ  α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000097
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000098
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000099
（Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000100
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３３Ａに示される１６５９アミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３３Ａに示される１６５９アミノ酸配列のアミノ酸２１〜５９１を含む。いくつかの場合において、エピトープは、
2021500855.tif 000101
ではなく、代わりに、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３５Ａに示される１６６４アミノ酸配列を、リーダー配列なしで含む。例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３５Ａに示される１６６４アミノ酸配列のアミノ酸２１〜４２９を含む。
【０１４８】
３）１６３７−１４０８。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、ｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチド、およびｖｉ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、およびｉｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）ｐｐ６５エピトープ
2021500855.tif 000102
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000103
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000104
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000105
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000106
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000107
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000108
（Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000109
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000110
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３０Ａに示される１６３７アミノ酸配列を、リーダー配列なし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３０Ａに示される１６３７アミノ酸配列のアミノ酸２１〜６２９を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、エピトープ
2021500855.tif 000111
を含まず、代わりに、エピトープは、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図２５Ａに示されるアミノ酸配列を含むが、リーダーペプチドを含まない。したがって、例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図２５Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜４９３を含む。
【０１４９】
４）１６３９＋１６４０。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、ｖ）二量体化ポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１−４  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、ｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチド、およびｖｉ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１−４  β２ポリペプチド、およびｉｖ）ロイシンジッパー二量体化ポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、プロインスリン７３〜９０
2021500855.tif 000112
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１−４  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000113
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000114
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000115
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000116
を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000117
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000118
（Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１−４  β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000119
を含む。いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000120
を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３１Ａに示されるアミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、図３１Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜６３３を含む。いくつかの場合において、エピトープは、プロインスリン７３〜９０
2021500855.tif 000121
ではなく、代わりに、エピトープは、異なるエピトープで置換される。いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３２Ａに示されるアミノ酸配列を、リーダーペプチドなしで含む。例えば、いくつかの場合において、第２のポリペプチドは、図３２Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜４９３を含む。
【０１５０】
５）１７１１＋１７０５。いくつかの場合において、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含む。１つの非限定的な例として、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、およびｉｖ）ＩｇＧ  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。多量体ＴＭＡＰＰは、バリアントＩｇＧ  Ｆｃポリペプチドを含み得る。例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、およびｉｖ）Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの置換を含むＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。多量体ＴＭＡＰＰは、１つ以上のリンカーを含み得る。例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ペプチドリンカー、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｖ）ペプチドリンカー、ｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、およびｖｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ペプチドリンカー、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、ｖ）ペプチドリンカー、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド（例えば、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの置換を含むＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチド）を含む��第２のポリペプチドと、を含み得る。例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ペプチドリンカー（ＧＧＧＧＳ）３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４６）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｖ）ペプチドリンカーＧＧＧＧＳ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）、ｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、およびｖｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｉｉｉ）ペプチドリンカー（ＧＧＧＧＳ）４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４７）、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、ｖ）ペプチドリンカー（ＧＧＧＧＳ）６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４９）、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチド（例えば、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの置換を含むＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチド）を含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰは、ａ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ペプチドリンカー（ＧＧＧＧＳ）３（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４６）、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｖ）ペプチドリンカーＧＧＧＧＳ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）、ｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、およびｖｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含む第１のバリアントＩＬ−２ポリペプチド、ｉｉ）Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含む第２のバリアントＩＬ−２ポリペプチド（例えば、第１および第２のバリアントＩＬ−２ポリペプチドが同じアミノ酸配列を含む場合）、ｉｉｉ）ペプチドリンカー（ＧＧＧＧＳ）４（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４７）、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、ｖ）ペプチドリンカー（ＧＧＧＧＳ）６（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３４９）、およびｖｉ）Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの置換を含むＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み得る。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000122
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000123
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000124
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000125
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000126
を含む。いくつかの場合において、第１および第２の免疫調節ポリペプチドは、バリアントＩＬ−２ポリペプチドであり、いずれもアミノ酸配列：
2021500855.tif 000127
を含む。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドは、Ｌ２３４ＡおよびＬ２３５Ａの置換を含むＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドであり、アミノ酸配列：
2021500855.tif 000128
を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）図３７Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜３２８を含む第１のポリペプチドと、ｂ）図３８Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜６８８を含む第２のポリペプチドと、を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ａ）図３７Ｂに示されるヌクレオチド配列によってコードされる第１のポリペプチドと、ｂ）図３８Ｂに示されるヌクレオチド配列によってコードされる第２のポリペプチドと、を含む。
【０１５１】
単一ポリペプチド鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。非限定的な例を図２３Ａ〜２３Ｉに模式的に示す。本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、例えば、ペプチド抗原と免疫調節ポリペプチドとの間、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩポリペプチドとの間、２つのＭＨＣクラスＩＩポリペプチドの間、免疫調節ポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間などの任意の２つの隣接するポリペプチドの間に１つ以上のリンカーを含み得る。
【０１５２】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０１５３】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖ）２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０１５４】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０１５５】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０１５６】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉ）免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、１つ以上のリンカーを含み得、ここで、リンカーは、ｉ）ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドとの間、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドと免疫調節ポリペプチドとの間、およびｉｖ）免疫調節ポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間のうちの１つ以上の間にあり得る。
【０１５７】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、１つ以上のリンカーを含み得、ここで、リンカーは、ｉ）ペプチド抗原と免疫調節ポリペプチドとの間、ｉｉ）免疫調節ポリペプチドとＭＨＣクラスＩＩ  β１ポ���ペプチドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドと２コピーの免疫調節ポリペプチドとの間のうちの１つ以上の間にあり得る。
【０１５８】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）免疫グロブリンまたは非免疫グロブリン骨格ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉｉ）２コピーの免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。上記の実施形態のいずれか１つにおいて、ＴＭＡＰＰは、１つ以上のリンカーを含み得、ここで、リンカーは、ｉ）免疫調節ポリペプチドとペプチド抗原との間、ｉｉ）ペプチド抗原とＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプ���ドとの間、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドと２コピーの免疫調節ポリペプチドとの間のうちの１つ以上の間にあり得る。
【０１５９】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｖ）１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、単一のポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む、単一のポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇまたは非Ｉｇ骨格ポリペプチドを含む、単一のポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）二量体化ポリペプチドを含む、単一のポリペプチド鎖を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１６０】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）１つ以上の免疫調節ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｖｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｖｉ）第２の免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）１つ以上の免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）二量体化ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＴＣＲによって認識される（例えば、認識および結合が可能である）ペプチド抗原（「エピトープ」）、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）１���以上の免疫調節ポリペプチド、ｖｉｉ）二量体化ポリペプチド、およびｖｉｉｉ）二量体化ポリペプチドを含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、ＭＨＣポリペプチドとＩｇ  Ｆｃポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ１」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰは、免疫調節ポリペプチドとＭＨＣポリペプチドとの間にリンカー（「Ｌ２」）を含み、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。いくつかの場合において、ＴＭＡＰＰが２つの免疫調節ポリペプチドを含む場合、いくつかの場合において、当該２つの免疫調節ポリペプチドは、リンカー（「Ｌ３）によって分離され、ここで、例示的な好適なリンカーは、（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）を含む。
【０１６１】
例示的な単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド
以下は、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰの非限定的な例である。例えば、図２８Ａ（１５９９ポリペプチド）および図２９Ａ（１６０１ポリペプチド）を参照されたい。ＴＭＡＰＰを必要とする個体に投与されるＴＭＡＰＰは、一般に、上述の図に示されるようなリーダー配列またはヒスチジンタグを含まない。
【０１６２】
１）１５９９
いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。１つの非限定的な例として、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、ｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ  β２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、およびｖｉｉ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ（例えば、
2021500855.tif 000129
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000130
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000131
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ  β２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000132
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000133
（Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000134
を含む。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２８Ａに示されるアミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２８Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜９８１を含む。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、ヘマグルチニンエピトープ（例えば、
2021500855.tif 000135
を含まず、代わりに、エピトープは、異なるエピトープで置換される。
【０１６３】
２）１６０１
いくつかの場合において、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチド、ｖ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、ｖｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、その同種の免疫共調節ポリペプチドに対して親和性が低いバリアント免疫調節ポリペプチド）、およびｖｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。１つの非限定的な例として、本開示の単鎖ＴＭＡＰＰは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチド、ｖ）第１の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、ｖｉ）第２の免疫調節ポリペプチド（例えば、Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を含むバリアントＩＬ−２ポリペプチド）、およびｖｉｉ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含み得る。いくつかの場合において、エピトープは、ヘマグルチニンエピトープ（例えば、
2021500855.tif 000136
である。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000137
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000138
を含む。いくつかの場合において、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000139
を含む。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000140
（Ｈ１６ＡおよびＦ４２Ａの置換を下線で示す）を含む。いくつかの場合において、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000141
を含む。いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２９Ａに示されるアミノ酸配列を、リーダーペプチドなし、かつＣ末端リンカーおよびヒスチジンタグなしで含む。例えば、いくつかの場合において、単鎖ポリペプチドは、図２９Ａに示されるアミノ酸配列のアミノ酸２１〜８７６を含む。
【０１６４】
免疫調節ポリペプチド
本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドには、ＩＬ−２、ＣＤ７、Ｂ７−１（ＣＤ８０）、Ｂ７−２（ＣＤ８６）、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、Ｆａｓリガンド（ＦａｓＬ）、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ−Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ）、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、ＭＩＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、およびＨＶＥＭが含まれるが、これらに限定されない。
【０１６５】
いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、４−１ＢＢＬポリペプチド、Ｂ７−１ポリペプチド、Ｂ７−２ポリペプチド、ＩＣＯＳ−Ｌポリペプチド、ＯＸ−４０Ｌポリペプチド、ＣＤ８０ポリペプチド、ＣＤ８６ポリペプチド、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチド、ＦａｓＬポリペプチド、およびＰＤ−Ｌ２ポリペプチドから選択される。免疫調節ポリペプチドは、完全長の免疫調節ポリペプチドの細胞外部分のみを含み得る。したがって、例えば、免疫調節ポリペプチドは、いくつかの場合において、天然免疫調節ポリペプチドに通常みられる、シグナルペプチド、膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインのうちの１つ以上を除外することができる。
【０１６６】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドは、天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列の全てまたは一部（例えば、細胞外部分）を含む。他の場合において、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適な免疫調節ポリペプチドは、天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して少なくとも１つのアミノ酸置換を含むバリアント免疫調節ポリペプチドである。いくつかの場合において、バリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する天然免疫調節ポリペプチド（例えば、バリアントに存在するアミノ酸置換（複数可）を含まない免疫調節ポリペプチド）の免疫共調節ポリペプチドに対する親和性よりも、免疫共調節ポリペプチドに対して低い結合親和性を呈する。
【０１６７】
低親和性バリアント免疫調節ポリペプチド
免疫共調節ドメインに対して親和性の低下を呈する好適な免疫調節ドメインは、野生型免疫調節ドメインと１アミノ酸（ａａ）〜２０ａａの違いを有し得る。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１ａａ、２ａａ、３ａａ、４ａａ、５ａａ、６ａａ、７ａａ、８ａａ、９ａａ、または１０ａａ異なる。別の例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、アミノ酸配列が、対応する野生型免疫調節ポリペプチドと１１ａａ、１２ａａ、１３ａａ、１４ａａ、１５ａａ、１６ａａ、１７ａａ、１８ａａ、１９ａａ、または２０ａａ異なる。一例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０のアミノ酸置換を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、単一のアミノ酸置換を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２つのアミノ酸置換（例えば、２以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、３つのアミノ酸置換（例えば、３以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、４つのアミノ酸置換（例えば、４以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、５つのアミノ酸置換（例えば、５以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、６つのアミノ酸置換（例えば、６以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、７つのアミノ酸置換（例えば、７以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、８つのアミノ酸置換（例えば、８以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、９つのアミノ酸置換（例えば、９以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１０のアミノ酸置換（例えば、１０以下のアミノ酸置換）を含む。
【０１６８】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１１のアミノ酸置換（例えば、１１以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１２のアミノ酸置換（例えば、１２以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１３のアミノ酸置換（例えば、１３以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１４のアミノ酸置換（例えば、１４以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１５のアミノ酸置換（例えば、１５以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１６のアミノ酸置換（例えば、１６以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１７のアミノ酸置換（例えば、１７以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１８のアミノ酸置換（例えば、１８以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、１９のアミノ酸置換（例えば、１９以下のアミノ酸置換）を含む。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、対応する参照（例えば、野生型）免疫調節ポリペプチドと比較して、２０のアミノ酸置換（例えば、２０以下のアミノ酸置換）を含む。
【０１６９】
上述のとおり、本開示のＴＭＡＰＰに含めるのに好適なバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、対応する野生型免疫調節ポリペプチドの同種の免疫共調節ポリペプチドに対する親和性と比較して、親和性の低下を呈する。
【０１７０】
免疫調節ポリペプチドと同種の免疫共調節ポリペプチドの例示的なペアとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１７１】
ａ）４−１ＢＢＬ（免疫調節ポリペプチド）と４−１ＢＢ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７２】
ｂ）ＰＤ−Ｌ１（免疫調節ポリペプチド）とＰＤ１（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７３】
ｃ）ＩＬ−２（免疫調節ポリペプチド）とＩＬ−２受容体（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７４】
ｄ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２８（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７５】
ｅ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２８（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７６】
ｆ）ＯＸ４０Ｌ（ＣＤ２５２）（免疫調節ポリペプチド）とＯＸ４０（ＣＤ１３４）（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７７】
ｇ）Ｆａｓリガンド（免疫調節ポリペプチド）とＦａｓ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７８】
ｈ）ＩＣＯＳ−Ｌ（免疫調節ポリペプチド）とＩＣＯＳ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１７９】
ｉ）ＩＣＡＭ（免疫調節ポリペプチド）とＬＦＡ−１（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８０】
ｊ）ＣＤ３０Ｌ（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ３０（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８１】
ｋ）ＣＤ４０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ４０Ｌ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８２】
ｌ）ＣＤ８３（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ８３Ｌ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８３】
ｍ）ＨＶＥＭ（ＣＤ２７０）（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ１６０（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８４】
ｎ）ＪＡＧ１（ＣＤ３３９）（免疫調節ポリペプチド）とＮｏｔｃｈ（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８５】
ｏ）ＪＡＧ１（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ４６（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８６】
ｐ）ＣＤ８０（免疫調節ポリペプチド）とＣＴＬＡ４（同種の免疫共調節ポリペプチド）、
【０１８７】
ｑ）ＣＤ８６（免疫調節ポリペプチド）とＣＴＬＡ４（同種の免疫共調節ポリペプチド）、および
【０１８８】
ｒ）ＣＤ７０（免疫調節ポリペプチド）とＣＤ２７（同種の免疫共調節ポリペプチド）。
【０１８９】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。
【０１９０】
結合親和性の決定
免疫調節ポリペプチドとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性は、バイオレイヤー干渉法（ＢＬＩ）により、精製された免疫調節ポリペプチドおよび精製された同種の免疫共調節ポリペプチドを使用して決定することができる。ＴＭＡＰＰとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性もまた、ＢＬＩにより、精製されたＴＭＡＰＰおよび同種の免疫共調節ポリペプチドを使用して決定することができる。ＢＬＩ法は、当業者によく知られている。例えば、Ｌａｄ  ｅｔ  ａｌ．（２０１５）Ｊ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｓｃｒｅｅｎ．２０（４）：４９８−５０７；およびＳｈａｈ  ａｎｄ  Ｄｕｎｃａｎ（２０１４）Ｊ．Ｖｉｓ．Ｅｘｐ．１８：ｅ５１３８３を参照されたい。本開示中に記載される、免疫調節ポリペプチドとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間、またはｓｙｎＴａｃとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の特異的および相対的結合親和性は、以下の手順を使用して決定することができる。
【０１９１】
ＴＭＡＰＰとその同種の免疫共調節ポリペプチドとの間の結合親和性を決定するために、Ｏｃｔｅｔ  ＲＥＤ  ９６（Ｐａｌ  ＦｏｒｔｅＢｉｏ）機器または同様の機器を使用して、ＢＬＩアッセイを以下のように実施することができる。ＴＭＡＰＰ（例えば、本開示のＴＭＡＰＰ；対照ＴＭＡＰＰ（対照ＴＭＡＰＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む））を不溶性支持体（「バイオセンサー」）上に固定する。固定化されたＴＭＡＰＰが「標的」である。固定化は、捕捉抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、捕捉抗体は、ＴＭＡＰＰを固定化する。例えば、固定化は、抗Ｆｃ（例えば、抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ）抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、固定化された抗Ｆｃ抗体は、ＴＭＡＰＰ（ＴＭＡＰＰは、ＩｇＦｃポリペプチドを含む）に結合し、これを固定化する。固定化されたＴＭＡＰＰに免疫共調節ポリペプチドをいくつかの異なる濃度でアプライして、機器の応答を記録する。アッセイは、２５ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（ｐＨ６．８）、５％ポリ（エチレングリコール）６０００、５０ｍＭ  ＫＣｌ、０．１％ウシ血清アルブミン、および０．０２％  Ｔｗｅｅｎ  ２０非イオン性界面活性剤を含む液体媒体中で実施される。固定化されたＴＭＡＰＰに対する免疫共調節ポリペプチドへの結合は、３０℃で実施される。結合親和性の陽性対照として、抗ＭＨＣクラスＩＩモノクローナル抗体を使用することができる。例えば、１６−２３抗体（Ｓｉｇｍａ；「１６．２３」とも称される；例えば、Ｐｉｏｕｓ  ｅｔ  ａｌ．（１９８５）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６２：１１９３；Ｍｅｌｌｉｎｓ  ｅｔ  ａｌ．（１９９１）Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１７４：１６０７；ＥＣＡＣＣハイブリドーマコレクション１６−２３、ＥＣＡＣＣ９９０４３００１参照）などの抗ＨＬＤ−ＤＲ３モノクローナル抗体を、結合親和性の陽性対照として使用することができる。別の例として、ＨＫＢ１抗体（Ｉｍｍｕｎｏｔｏｏｌｓ；Ｈｏｌｔｅ  ｅｔ  ａｌ．（１９８９）Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１９：１２２１）などのｐａｎ−ＨＬＡクラスＩＩ抗体を、結合親和性の陽性対照として使用することができる。抗ＭＨＣクラスＩＩモノクローナル抗体の連続希釈物を使用して、標準曲線を作成する。免疫共調節ポリペプチドまたは抗ＭＨＣクラスＩＩ  ｍＡｂが「アナライト」である。ＢＬＩは、ｉ）固定化されたポリペプチド（「標的」）と、ｉｉ）内部リファレンスレイヤーの２つの表面から反射される白色光の干渉波を解析する。バイオセンサーチップに結合する分子（「アナライト」；例えば、免疫共調節ポリペプチド、抗ＨＬＡ抗体）の数の変化によって、干渉波にシフトが生じ、この干渉波のシフトをリアルタイムに測定することができる。標的／アナライト相互作用の親和性を記述する２つの動力学的用語は、結合定数（ｋａ）と解離定数（ｋｄ）である。これらの２つの用語の比（ｋｄ／ａ）が親和性定数ＫＤを与える。
【０１９２】
上記のとおり、免疫調節ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２またはＩＬ−２バリアント）とその同種の免疫共調節ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２Ｒ）との間の結合親和性の決定もまた、ＢＬＩによって決定することができる。アッセイは、ＴＭＡＰＰについて上に記載したものと同様である。Ｏｃｔｅｔ  ＲＥＤ  ９６（Ｐａｌ  ＦｏｒｔｅＢｉｏ）機器または同様の機器を使用して、ＢＬＩアッセイを以下のように実施することができる。本開示のＴＭＡＰＰの構成成分である免疫調節ポリペプチド（例えば、本開示のバリアントＩＬ−２ポリペプチド）および対照免疫調節ポリペプチド（対照免疫調節ポリペプチドは、野生型免疫調節ポリペプチド、例えば、野生型ＩＬ−２を含む））を不溶性支持体（「バイオセンサー」）上に固定する。免疫調節ポリペプチドが「標的」である。固定化は、捕捉抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、捕捉抗体は、免疫調節ポリペプチドを固定化する。例えば、標的が免疫親和性タグ（例えば、ＦＬＡＧ、ヒトＩｇＧ  Ｆｃ）に融合されている場合、固定化は、免疫親和性タグ（例えば、抗ヒトＩｇＧ  Ｆｃ）に対する適切な抗体を不溶性支持体上に固定化することによって行うことができ、固定化された抗体は、免疫調節ポリペプチド（免疫調節ポリペプチドは、ＩｇＦｃポリペプチドを含む）に結合し、これを固定化する。固定化された免疫調節ポリペプチドに免疫共調節ポリペプチド（または複数のポリペプチド）をいくつかの異なる濃度でアプライして、機器の応答を記録する。あるいは、免疫共調節ポリペプチド（または複数のポリペプチド）をバイオセンサーに固定化し（例えば、ＩＬ−２受容体ヘテロ三量体、例えば、単量体サブユニット、ヘテロ二量体サブ複合体、または完全なヘテロ三量体に対して）、固定化された免疫共調節ポリペプチド（複数可）に免疫調節ポリペプチドをいくつかの異なる濃度でアプライして、機器の応答を記録する。アッセイは、２５ｍＭ  ＨＥＰＥＳ（ｐＨ６．８）、５％ポリ（エチレングリコール）６０００、５０ｍＭ  ＫＣｌ、０．１％ウシ血清アルブミン、および０．０２％  Ｔｗｅｅｎ  ２０非イオン性界面活性剤を含む液体媒体中で実施される。固定化された免疫調節ポリペプチドに対する免疫共調節ポリペプチドへの結合は、３０℃で実施される。ＢＬＩは、ｉ）固定化されたポリペプチド（「標的」）と、ｉｉ）内部リファレンスレイヤーの２つの表面から反射される白色光の干渉波を解析する。バイオセンサーチップに結合する分子（「アナライト」；例えば、免疫共調節ポリペプチド）の数の変化によって、干渉波にシフトが生じ、この干渉波のシフトをリアルタイムに測定することができる。標的／アナライト相互作用の親和性を記述する２つの動力学的用語は、結合定数（ｋａ）と解離定数（ｋｄ）である。これらの２つの用語の比（ｋｄ／ａ）が親和性定数ＫＤを与える。したがって、野生型免疫調節ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２）のその受容体（例えば、ＩＬ−２Ｒ）に対する結合親和性と、バリアント免疫調節ポリペプチド（例えば、本明細書で開示されるＩＬ−２バリアント）のその同種の免疫共調節ポリペプチド（例えば、その受容体）（例えば、ＩＬ−２Ｒ）に対する結合親和性の両方を決定することにより、野生型免疫共調節ポリペプチドと比較した、同種の免疫共調節ポリペプチドに対するバリアント免疫共調節ポリペプチドの相対結合親和性を決定することが可能となる。すなわち、バリアント免疫調節ポリペプチドのその受容体（その同種の免疫共調節ポリペプチド）に対する結合親和性が、野生型免疫調節ポリペプチドの同じ同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性と比較して減少するかどうかを決定することができ、もしそうであれば、その結合親和性は、野生型免疫共調節ポリペプチドの結合親和性からパーセンテージが小さくなる。
【０１９３】
ＢＬＩアッセイは、マルチウェルプレートで実施される。アッセイを実施するには、プレートのレイアウトを決め、アッセイのステップを決め、バイオセンサーをＯｃｔｅｔＤａｔａ  Ａｃｑｕｉｓｉｔｉｏｎソフトウエアに割り当てる。バイオセンサーアセンブリを水和する。水和したバイオセンサーアセンブリおよびアッセイプレートをＯｃｔｅｔ機器で１０分間平衡化する。データを取得したら、その取得データをＯｃｔｅｔ  Ｄａｔａ  Ａｎａｌｙｓｉｓソフトウエアに読み込ませる。処理ウインドウで、リファレンスの差し引き、ｙ軸の位置合わせ、ステップ間補正、およびＳａｖｉｔｚｋｙ−Ｇｏｌａｙフィルターの方法を指定することによって、データ処理を行う。解析ウインドウで、解析するステップ（結合および解離）を指定し、カーブフィッティングモデル（１：１）、フィッティング方法（グローバル）、および目的のウインドウ（秒単位）を指定することによって、データ解析を行う。フィッティングの質を評価する。各データのトレース（アナライト濃度）のＫＤ値は、３倍の範囲内であれば、平均化することができる。ＫＤエラー値は、親和性定数値の１０倍以内でなければならず、Ｒ２値は、０．９５を超えるものとする。例えば、Ａｂｄｉｃｈｅ  ｅｔ  ａｌ．（２００８）Ｊ．Ａｎａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．３７７：２０９を参照されたい。
【０１９４】
いくつかの場合において、ｉ）対照ＴＭＡＰＰ（ここで、対照ＴＭＡＰＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性と、ｉｉ）野生型免疫調節ポリペプチドのバリアントを含む本開示のＴＭＡＰＰの、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性との比は、ＢＬＩによって（上記のとおり）測定したとき、少なくとも１．５：１、少なくとも２：１、少なくとも５：１、少なくとも１０：１、少なくとも１５：１、少なくとも２０：１、少なくとも２５：１、少なくとも５０：１、少なくとも１００：１、少なくとも５００：１、少なくとも１０２：１、少なくとも５×１０２：１、少なくとも１０３：１、少なくとも５×１０３：１、少なくとも１０４：１、少なくとも１０５：１、または少なくとも１０６：１である。いくつかの場合において、ｉ）対照ＴＭＡＰＰ（ここで、対照ＴＭＡＰＰは、野生型免疫調節ポリペプチドを含む）の、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性と、ｉｉ）野生型免疫調節ポリペプチドのバリアントを含む本開示のＴＭＡＰＰの、同種の免疫共調節ポリペプチドに対する結合親和性との比は、ＢＬＩによって測定したとき、１．５：１〜１０６：１、例えば、１．５：１〜１０：１、１０：１〜５０：１、５０：１〜１０２：１、１０２：１〜１０３：１、１０３：１〜１０４：１、１０４：１〜１０５：１、または１０５：１〜１０６：１の範囲内である。
【０１９５】
本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、少なくとも１００μＭ（例えば、少なくとも１０μＭ、少なくとも１μＭ、少なくとも１００ｎＭ、少なくとも１０ｎＭ、または少なくとも１ｎＭ）の親和性で、Ｔ細胞上のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）に結合する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、約１０−４Ｍ〜約５×１０−４Ｍ、約５×１０−４Ｍ〜約１０−５Ｍ、約１０−５Ｍ〜５×１０−５Ｍ、約５×１０−５Ｍ〜１０−６Ｍ、約１０−６Ｍ〜約５×１０−６Ｍ、約５×１０−６Ｍ〜約１０−７Ｍ、約１０−７Ｍ〜約５×１０−７Ｍ、約５×１０−７Ｍ〜約１０−８Ｍ、または約１０−８Ｍ〜約１０−９Ｍの親和性で、Ｔ細胞上のＴＣＲに結合する。別の方法で表現すると、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープは、約１ｎＭ〜約５ｎＭ、約５ｎＭ〜約１０ｎＭ、約１０ｎＭ〜約５０ｎＭ、約５０ｎＭ〜約１００ｎＭ、約０．１μＭ〜約０．５μＭ、約０．５μＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、約７５μＭ〜約１００μＭの親和性で、Ｔ細胞上のＴＣＲに結合する。
【０１９６】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、１ｎＭ〜１００ｎＭ、または１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、同種の免疫共調節ポリペプチドに対して、約１ｎＭ〜約５ｎＭ、約５ｎＭ〜約１０ｎＭ、約１０ｎＭ〜約５０ｎＭ、約５０ｎＭ〜約１００ｎＭの結合親和性を有する。
【０１９７】
ＰＤ−Ｌ１バリアント
１つの非限定的な例として、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドである。野生型ＰＤ−Ｌ１は、ＰＤ１に結合する。
【０１９８】
野生型ヒトＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列を含み得る。
2021500855.tif 000142
【０１９９】
野生型ヒトＰＤ−Ｌ１エクトドメインは、次のアミノ酸配列を含み得る。
2021500855.tif 000143
【０２００】
野生型ＰＤ−１ポリペプチドは、次のアミノ酸配列を含み得る。
2021500855.tif 000144
【０２０１】
いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ−１（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ−１ポリペプチド）に対して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ−Ｌ１ポリペプチドの結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、本開示のバリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ−Ｌ１ポリペプチドの結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＰＤ−１（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ−１ポリペプチド）に結合する。
【０２０２】
いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ−１に対して、１ｎＭ〜１ｍＭの結合親和性を有する。いくつかの場合において、本開示のバリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ−１に対して、１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ１（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：３に記載されるアミノ酸配列を含むＰＤ１ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。
【０２０３】
いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、２〜１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２に記載されるＰＤ−Ｌ１アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
【０２０４】
好適なＰＤ−Ｌ１バリアントは、以下のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０２０５】
2021500855.tif 000145
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｒｇである。
【０２０６】
好適なＰＤ−Ｌ１バリアントは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０２０７】
2021500855.tif 000146
（式中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｓｐである。
【０２０８】
好適なＰＤ−Ｌ１バリアントは、次のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０２０９】
2021500855.tif 000147
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｒｇである。
【０２１０】
ＣＤ８０バリアント
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである。野生型ＣＤ８０は、ＣＤ２８に結合する。
【０２１１】
ヒトＣＤ８０のエクトドメインの野生型アミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
【０２１２】
2021500855.tif 000148
【０２１３】
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000149
【０２１４】
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000150
【０２１５】
野生型ＣＤ２８アミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000151
【０２１６】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８０ポリペプチドのＣＤ２８に対する結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８０ポリペプチドの、ＣＤ２８（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５、６、または７のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＣＤ２８に結合する。
【０２１７】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、本開示のバリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：６、またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。
【０２１８】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、２〜１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８０ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：４に記載されるＣＤ８０アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
【０２１９】
好適なＣＤ８０バリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０２２０】
2021500855.tif 000152
（式中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２１】
2021500855.tif 000153
（式中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２２】
2021500855.tif 000154
（式中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２３】
2021500855.tif 000155
（式中、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２４】
2021500855.tif 000156
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２５】
2021500855.tif 000157
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２６】
2021500855.tif 000158
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２７】
2021500855.tif 000159
（式中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２８】
2021500855.tif 000160
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２２９】
2021500855.tif 000161
（式中、Ｘは、Ｍｅｔ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３０】
2021500855.tif 000162
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３１】
2021500855.tif 000163
（式中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３２】
2021500855.tif 000164
（式中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３３】
2021500855.tif 000165
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３４】
2021500855.tif 000166
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３５】
2021500855.tif 000167
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２３６】
2021500855.tif 000168
（式中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）。
【０２３７】
ＣＤ８６バリアント
いくつかの場合において、本開示のＴ  ＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである。野生型ＣＤ８６は、ＣＤ２８に結合する。
【０２３８】
野生型ヒトＣＤ８６の完全エクトドメインのアミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000169
【０２３９】
野生型ヒトＣＤ８６のＩｇＶドメインのアミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000170
【０２４０】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８６ポリペプチドのＣＤ２８に対する結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８またはＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ８６ポリペプチドの、ＣＤ２８（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５、６、または７のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％低い、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＣＤ２８に結合する。
【０２４１】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８に対して、１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、本開示のバリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＣＤ２８（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：５、６、または７のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含むＣＤ２８ポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。
【０２４２】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２〜１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：８に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
【０２４３】
いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２〜１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＣＤ８６ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：９に記載されるＣＤ８６アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
【０２４４】
好適なＣＤ８６バリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０２４５】
2021500855.tif 000171
（式中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２４６】
2021500855.tif 000172
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２４７】
2021500855.tif 000173
（式中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２４８】
2021500855.tif 000174
（式中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２４９】
2021500855.tif 000175
（式中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５０】
2021500855.tif 000176
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５１】
2021500855.tif 000177
（式中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５２】
2021500855.tif 000178
（式中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５３】
2021500855.tif 000179
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５４】
2021500855.tif 000180
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５５】
2021500855.tif 000181
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５６】
2021500855.tif 000182
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５７】
2021500855.tif 000183
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５８】
2021500855.tif 000184
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２５９】
2021500855.tif 000185
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２６０】
2021500855.tif 000186
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２６１】
2021500855.tif 000187
（式中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２６２】
2021500855.tif 000188
（式中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２６３】
2021500855.tif 000189
（式中、１番目のＸはＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、２番目のＸはＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、１番目および２番目のＸは、両方ともＡｌａである）、
【０２６４】
2021500855.tif 000190
（式中、１番目のＸはＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、２番目のＸはＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、１番目および２番目のＸは、両方ともＡｌａである）、
【０２６５】
2021500855.tif 000191
（式中、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである）、
【０２６６】
2021500855.tif 000192
（式中、１番目のＸはＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、２番目のＸはＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、１番目および２番目のＸは、両方ともＡｌａである）、
【０２６７】
2021500855.tif 000193
（式中、Ｘ１はＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）、および
【０２６８】
2021500855.tif 000194
（式中、Ｘ１はＡｓｎ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）。
【０２６９】
４−１ＢＢＬバリアント
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドである。野生型４−１ＢＢＬは、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）に結合する。
【０２７０】
野生型４−１ＢＢＬアミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000195
【０２７１】
いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ヒト４−１ＢＢＬの腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）相同性ドメイン（ＴＨＤ）のバリアントである。
【０２７２】
ヒト４−１ＢＢＬのＴＨＤの野生型アミノ酸配列は、例えば、以下のＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１１〜１３のうちの１つであり得る。
【０２７３】
2021500855.tif 000196
【０２７４】
2021500855.tif 000197
【０２７５】
2021500855.tif 000198
【０２７６】
野生型４−１ＢＢアミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000199
【０２７７】
いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、４−１ＢＢに対して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含む４−１ＢＢＬポリペプチドの結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、本開示のバリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、同一条件下にてアッセイしたとき、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載されるアミノ酸配列を含む４−１ＢＢＬポリペプチドの、４−１ＢＢポリペプチド（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１４に記載されるアミノ酸配列を含む４−１ＢＢポリペプチド）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、４−１ＢＢに結合する。
【０２７８】
いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、４−１ＢＢに対して、１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、４−１ＢＢ（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１４に記載されるアミノ酸配列を含む４−１ＢＢポリペプチド）に対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。
【０２７９】
いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、２〜１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１０〜１３のうちの１つに記載される４−１ＢＢＬアミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
【０２８０】
好適な４−１ＢＢＬバリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０２８１】
2021500855.tif 000200
（式中、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８２】
2021500855.tif 000201
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８３】
2021500855.tif 000202
（式中、Ｘは、Ｍｅｔ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８４】
2021500855.tif 000203
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８５】
2021500855.tif 000204
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８６】
2021500855.tif 000205
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８７】
2021500855.tif 000206
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８８】
2021500855.tif 000207
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２８９】
2021500855.tif 000208
（式中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９０】
2021500855.tif 000209
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９１】
2021500855.tif 000210
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９２】
2021500855.tif 000211
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９３】
2021500855.tif 000212
（式中、Ｘは、Ｉｌｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９４】
2021500855.tif 000213
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９５】
2021500855.tif 000214
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９６】
2021500855.tif 000215
（式中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９７】
2021500855.tif 000216
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９８】
2021500855.tif 000217
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０２９９】
2021500855.tif 000218
（式中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３００】
2021500855.tif 000219
（式中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０１】
2021500855.tif 000220
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０２】
2021500855.tif 000221
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０３】
2021500855.tif 000222
（式中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０４】
2021500855.tif 000223
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０５】
2021500855.tif 000224
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０６】
2021500855.tif 000225
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０７】
2021500855.tif 000226
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０８】
2021500855.tif 000227
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３０９】
2021500855.tif 000228
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１０】
2021500855.tif 000229
（式中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１１】
2021500855.tif 000230
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１２】
2021500855.tif 000231
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１３】
2021500855.tif 000232
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１４】
2021500855.tif 000233
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１５】
2021500855.tif 000234
（式中、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１６】
2021500855.tif 000235
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１７】
2021500855.tif 000236
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１８】
2021500855.tif 000237
（式中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３１９】
2021500855.tif 000238
（式中、Ｘは、Ｌｙｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２０】
2021500855.tif 000239
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２１】
2021500855.tif 000240
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２２】
2021500855.tif 000241
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２３】
2021500855.tif 000242
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２４】
2021500855.tif 000243
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２５】
2021500855.tif 000244
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２６】
2021500855.tif 000245
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２７】
2021500855.tif 000246
（式中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２８】
2021500855.tif 000247
（式中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３２９】
2021500855.tif 000248
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３０】
2021500855.tif 000249
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３１】
2021500855.tif 000250
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３２】
2021500855.tif 000251
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３３】
2021500855.tif 000252
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３４】
2021500855.tif 000253
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３５】
2021500855.tif 000254
（式中、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３６】
2021500855.tif 000255
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３７】
2021500855.tif 000256
（式中、Ｘは、Ｐｒｏ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３８】
2021500855.tif 000257
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３３９】
2021500855.tif 000258
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４０】
2021500855.tif 000259
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４１】
2021500855.tif 000260
（式中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４２】
2021500855.tif 000261
（式中、Ｘは、Ａｓｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４３】
2021500855.tif 000262
（式中、Ｘは、Ｓｅｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４４】
2021500855.tif 000263
（式中、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４５】
2021500855.tif 000264
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４６】
2021500855.tif 000265
（式中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４７】
2021500855.tif 000266
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４８】
2021500855.tif 000267
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３４９】
2021500855.tif 000268
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５０】
2021500855.tif 000269
（式中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５１】
2021500855.tif 000270
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５２】
2021500855.tif 000271
（式中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５３】
2021500855.tif 000272
（式中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５４】
2021500855.tif 000273
（式中、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５５】
2021500855.tif 000274
（式中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５６】
2021500855.tif 000275
（式中、Ｘは、Ａｒｇ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５７】
2021500855.tif 000276
（式中、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５８】
2021500855.tif 000277
（式中、Ｘは、Ｔｒｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３５９】
2021500855.tif 000278
（式中、Ｘは、Ｌｅｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３６０】
2021500855.tif 000279
（式中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３６１】
2021500855.tif 000280
（式中、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３６２】
2021500855.tif 000281
（式中、Ｘは、Ｇｌｙ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３６３】
2021500855.tif 000282
（式中、Ｘは、Ｔｈｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３６４】
2021500855.tif 000283
（式中、Ｘは、Ｖａｌ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）。
【０３６５】
ＩＬ−２バリアント
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するバリアント免疫調節ポリペプチドは、バリアントＩＬ−２ポリペプチドである。野生型ＩＬ−２は、ＩＬ−２受容体（ＩＬ−２Ｒ）に結合する。
【０３６６】
野生型ＩＬ−２アミノ酸配列は、次のとおりであり得る。
2021500855.tif 000284
【０３６７】
野生型ＩＬ２は、細胞の表面上のＩＬ２受容体（ＩＬ２Ｒ）に結合する。ＩＬ２受容体は、いくつかの場合において、アルファ鎖（ＩＬ−２Ｒα；ＣＤ２５とも称される）、ベータ鎖（ＩＬ−２Ｒβ；ＣＤ１２２とも称される、およびガンマ鎖（ＩＬ−２Ｒγ；ＣＤ１３２とも称される）を含む、ヘテロ三量体ポリペプチドである。ヒトＩＬ−２Ｒα、ＩＬ２Ｒβ、およびＩＬ−２Ｒγのアミノ酸配列は、以下のとおりであり得る。
【０３６８】
ヒトＩＬ−２Ｒα：
2021500855.tif 000285
【０３６９】
ヒトＩＬ−２Ｒβ：
2021500855.tif 000286
【０３７０】
ヒトＩＬ−２Ｒγ：
2021500855.tif 000287
【０３７１】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰがバリアントＩＬ−２ポリペプチドを含む場合、「同種の免疫共調節ポリペプチド」は、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１６、１７、および１８のアミノ酸配列に含まれるポリペプチドを含む、ＩＬ−２Ｒである。
【０３７２】
いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＩＬ−２Ｒに対して、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるアミノ酸配列を含むＩＬ−２ポリペプチドの結合親和性と比較して、結合親和性の低下を呈する。例えば、いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、同一条件下にてアッセイしたとき、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるアミノ酸配列を含むＩＬ−２ポリペプチドの、ＩＬ−２Ｒ（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１６〜１８に記載されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ−２Ｒ）に対する結合親和性よりも、少なくとも１０％低い、少なくとも１５％低い、少なくとも２０％低い、少なくとも２５％、少なくとも３０％低い、少なくとも３５％低い、少なくとも４０％低い、少なくとも４５％低い、少なくとも５０％低い、少なくとも５５％低い、少なくとも６０％低い、少なくとも６５％低い、少なくとも７０％低い、少なくとも７５％低い、少なくとも８０％低い、少なくとも８５％低い、少なくとも９０％低い、少なくとも９５％低い、または９５％を超えて低い結合親和性で、ＩＬ−２Ｒに結合する。
【０３７３】
いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＩＬ−２Ｒに対して、１００ｎＭ〜１００μＭの結合親和性を有する。別の例として、いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＩＬ−２Ｒ（例えば、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１６〜１８に記載されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含むＩＬ−２Ｒ）に対して、約１００ｎＭ〜１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約６００ｎＭ、約６００ｎＭ〜約７００ｎＭ、約７００ｎＭ〜約８００ｎＭ、約８００ｎＭ〜約９００ｎＭ、約９００ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約５μＭ、約５μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約１５μＭ、約１５μＭ〜約２０μＭ、約２０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、または約７５μＭ〜約１００μＭの結合親和性を有する。
【０３７４】
いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、単一のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、２〜１０のアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、２つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、３つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、４つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、５つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、６つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、７つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、８つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、９つのアミノ酸置換を有する。いくつかの場合において、バリアントＩＬ−２ポリペプチドは、ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：１５に記載されるＩＬ−２アミノ酸配列と比較して、１０のアミノ酸置換を有する。
【０３７５】
好適なＩＬ−２バリアントは、以下のアミノ酸配列のいずれか１つに対して、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、ポリペプチドを含む：
【０３７６】
2021500855.tif 000288
（ここで、Ｘは、Ｐｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３７７】
2021500855.tif 000289
（ここで、Ｘは、Ａｓｐ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３７８】
2021500855.tif 000290
（ここで、Ｘは、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３７９】
2021500855.tif 000291
（ここで、Ｘは、Ｈｉｓ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｒｇである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｓｎである。いくつかの場合において、Ｘは、Ａｓｐである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｃｙｓである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｇｌｕである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｇｌｎである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｇｌｙである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｉｌｅである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｌｙｓである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｌｅｕである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｍｅｔである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｐｈｅである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｐｒｏである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｓｅｒである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｔｈｒである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｔｙｒである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｔｒｐである。いくつかの場合において、Ｘは、Ｖａｌである）、
【０３８０】
2021500855.tif 000292
（ここで、Ｘは、Ｔｙｒ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３８１】
2021500855.tif 000293
（ここで、Ｘは、Ｇｌｎ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘは、Ａｌａである）、
【０３８２】
2021500855.tif 000294
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである）、
【０３８３】
2021500855.tif 000295
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である）（いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａである）、
【０３８４】
2021500855.tif 000296
（ここで、Ｘ１は、Ｇｌｕ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）、
【０３８５】
2021500855.tif 000297
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）、
【０３８６】
2021500855.tif 000298
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）、
【０３８７】
2021500855.tif 000299
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）、
【０３８８】
2021500855.tif 000300
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ４は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａであり、Ｘ４はＡｌａである）、
【０３８９】
2021500855.tif 000301
（ここで、Ｘ１はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ４は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａであり、Ｘ４はＡｌａである）、
【０３９０】
2021500855.tif 000302
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＡｓｐ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４はＴｙｒ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ５はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ４は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ５は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａであり、Ｘ４はＡｌａであり、Ｘ５はＡｌａである）、
【０３９１】
2021500855.tif 000303
（ここで、Ｘ１はＨｉｓ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ２はＰｈｅ以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３はＧｌｎ以外の任意のアミノ酸である。いくつかの場合において、Ｘ１は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ２は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ３は、Ａｌａである。いくつかの場合において、Ｘ１はＡｌａであり、Ｘ２はＡｌａであり、Ｘ３はＡｌａである）。
【０３９２】
二量体化ペア
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示の抗原提示ポリペプチド（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、ポリペプチドの二量体化ペアを含む。例えば、本開示の抗原提示ポリペプチド（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、少なくとも第１および第２のポリペプチドを含む多量体ポリペプチドであり、いくつかの場合において、第１のポリペプチドは、二量体化ペアの第１のメンバーを含み、第２のポリペプチドは、二量体化ペアの第２のメンバーを含む。
【０３９３】
二量体化ペプチドは、当該技術分野において知られており、任意の既知の二量体化ペプチドが使用に好適である。二量体化ペプチドは、コラーゲンリピートＧｌｙ−Ｘａａ−Ｘａａからなるコラーゲンドメインを含む、コレクチンファミリー（例えば、ＡＣＲＰ３０またはＡＣＲＰ３０様タンパク質）のポリペプチドを含む。他の二量体化ペプチドは、コイルドコイルドメインおよびロイシンジッパードメインを含む。コラーゲンドメインは、（Ｇｌｙ−Ｘａａ−Ｘａａ）ｎを含み得、式中、Ｘａａは、任意のアミノ酸であり、ｎは、１０〜４０の整数である。いくつかの場合において、コラーゲンドメインは、（Ｇｌｙ−Ｘａａ−Ｐｒｏ）ｎを含み、式中、Ｘａａは、任意のアミノ酸であり、ｎは、１０〜４０の整数である。二量体化ペプチドは、当該技術分野においてよく知られており、例えば、米国特許出願公開第２００３／０１３８４４０号を参照されたい。
【０３９４】
いくつかの場合において、二量体化ペアは、互いに結合する２つのロイシンジッパーポリペプチドを含む。ロイシンジッパーポリペプチドの非限定的な例としては、例えば、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000304
のいずれか１つのペプチドを含む。
【０３９５】
いくつかの場合において、ロイシンジッパーポリペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000305
を含む。
【０３９６】
更なるロイシンジッパーポリペプチドは、当該技術分野において知られており、そのいずれも本開示の抗原提示ポリペプチドの使用に好適である。
【０３９７】
コラーゲンオリゴマー化ペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000306
を含み得る。
【０３９８】
コイルドコイル二量体化ペプチドは、当該技術分野において知られている。例えば、コイルドコイル二量体化ペプチドは、次のアミノ酸配列：
2021500855.tif 000307
のいずれか１つのペプチドを含み得る。
【０３９９】
いくつかの場合において、二量体化ペプチドは、少なくとも１つのシステイン残基を含む。例としては、例えば、
2021500855.tif 000308
が挙げられる。
【０４００】
追加のポリペプチド
本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、上記のものに加えて、１つ以上のポリペプチドを含み得る。好適な追加のポリペプチドには、エピトープタグおよび親和性ドメインが含まれる。１つ以上の追加のポリペプチドは、本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖のＮ末端、本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖のＣ末端、または本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖の内部に含まれ得る。
【０４０１】
エピトープタグ
好適なエピトープタグには、ヘマグルチニン（ＨＡ；例えば、ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６９）、ＦＬＡＧ（例えば、ＤＹＫＤＤＤＤＫ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７０）、ｃ−ｍｙｃ（例えば、ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ；ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７１）などが含まれるが、これらに限定されない。
【０４０２】
親和性ドメイン
親和性ドメインは、同定または精製に有用な結合パートナー、例えば、固体支持体上に固定されたものなどと相互作用することができるペプチド配列を含む。発現タンパク質に融合されたヒスチジンなどの複数の連続する単一アミノ酸をコードするＤＮＡ配列を、ニッケルセファロースなどの樹脂カラムへの高親和性結合による組み換えタンパク質のワンステップ精製に使用することができる。例示的な親和性ドメインとしては、Ｈｉｓ５（ＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７２）、ＨｉｓＸ６（ＨＨＨＨＨＨ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７３）、Ｃ−ｍｙｃ（ＥＱＫＬＩＳＥＥＤＬ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７１）、Ｆｌａｇ（ＤＹＫＤＤＤＤＫ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７０）、ＳｔｒｅｐＴａｇ（ＷＳＨＰＱＦＥＫ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７４）、ヘマグルチニン、例えば、ＨＡタグ（ＹＰＹＤＶＰＤＹＡ）（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２６９）、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、チオレドキシン、セルロース結合ドメイン、ＲＹＩＲＳ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７５）、Ｐｈｅ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｔｈｒ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：２７６）、キチン結合ドメイン、Ｓ−ペプチド、Ｔ７ペプチド、ＳＨ２ドメイン、Ｃ末端ＲＮＡタグ、
2021500855.tif 000309
、金属結合ドメイン、例えば、亜鉛結合ドメインまたはカルシウム結合ドメイン、例えば、カルシウム結合タンパク質、例えば、カルモジュリン、トロポニンＣ、カルシニューリンＢ、ミオシン軽鎖、リカバリン、Ｓ−モジュリン、ビジニン、ＶＩＬＩＰ、ニューロカルシン、ヒポカルシン、フリクエニン、カルトラクチン、カルパイン大サブユニット、Ｓ１００タンパク質、パルブアルブミン、カルビンジンＤ９Ｋ、カルビンジンＤ２８Ｋおよびカルレチニンに由来するものなど、インテイン、ビオチン、ストレプトアビジン、ＭｙｏＤ、Ｉｄ、ロイシンジッパー配列、ならびにマルトース結合タンパク質が挙げられる。
【０４０３】
薬物コンジュゲート
本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に連結した（例えば、共有結合した）小分子薬物を含み得る。例えば、本開示のＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、当該Ｆｃポリペプチドは、共有結合的に連結した小分子薬物を含み得る。いくつかの場合において、小分子薬物は、がん化学療法剤、例えば、細胞傷害剤である。本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖は、ポリペプチド鎖に連結した（例えば、共有結合した）細胞傷害剤を含み得る。例えば、本開示のＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、当該Ｆｃポリペプチドは、共有結合的に連結した細胞傷害剤を含み得る。細胞傷害剤は、プロドラッグを含む。
【０４０４】
薬物（例えば、がん化学療法剤）は、本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖に直接的にまたは間接的に連結され得る。例えば、本開示のＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、薬物（例えば、がん化学療法剤）は、Ｆｃポリペプチドに直接的にまたは間接的に連結され得る。直接的な連結は、アミノ酸側鎖への直接的な連結を伴い得る。間接的な連結は、リンカーを介した連結であり得る。薬物（例えば、がん化学療法剤）は、チオエーテル結合、アミド結合、カルバメート結合、ジスルフィド結合、またはエーテル結合を介して、本開示のＡＰＰのポリペプチド鎖（例えば、Ｆｃポリペプチド）に連結され得る。
【０４０５】
リンカーには、切断可能なリンカーおよび切断不可能なリンカーが含まれる。いくつかの場合において、リンカーは、プロテアーゼで切断可能なリンカーである。好適なリンカーには、例えば、ペプチド（例えば、２〜１０アミノ酸長、例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０アミノ酸長）、アルキル鎖、ポリ（エチレングリコール）、ジスルフィド基、チオエーテル基、酸分解性基、光分解性基、ペプチダーゼ分解性基、およびエステラーゼ分解性基が含まれる。好適なリンカーの非限定的な例は、ｉ）Ｎ−スクシンイミジル−［（Ｎ−マレイミドプロピオンアミド）−テトラエチレングリコール］エステル（ＮＨＳ−ＰＥＧ４−マレイミド）、ｉｉ）Ｎ−スクシンイミジル４−（２−ピリジルジチオ）ブタノエート（ＳＰＤＢ）、Ｎ−スクシンイミジル４−（２−ピリジルジチオ）２−スルホブタノエート（スルホ−ＳＰＤＢ）、Ｎ−スクシンイミジル４−（２−ピリジルジチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）、Ｎ−スクシンイミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）−シクロヘキサン−１−カルボキシ−（６−アミドカプロエート）（ＬＣ−ＳＭＣＣ）、κ−マレイミドウンデカン酸Ｎ−スクシンイミジルエステル（ＫＭＵＡ）、γ−マレイミド酪酸Ｎ−スクシンイミジルエステル（ＧＭＢＳ）、ε−マレイミドカプロン酸Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＥＭＣＳ）、ｍ−マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）、Ｎ−（α−マレイミドアセトキシ）−スクシンイミドエステル（ＡＭＡＳ）、スクシンイミジル−６−（β−マレイミドプロピオンアミド）ヘキサノエート（ＳＭＰＨ）、Ｎ−スクシンイミジル４−（ｐ−マレイミドフェニル）ブチレート（ＳＭＰＢ）、Ｎ−（ｐ−マレイミドフェニル）イソシアネート（ＰＭＰＩ）、Ｎ−スクシンイミジル４（２−ピリジルチオ）ペンタノエート（ＳＰＰ）、Ｎ−スクシンイミジル（４−ヨード−アセチル）アミノベンゾエート（ＳＩＡＢ）、６−マレイミドカプロイル（ＭＣ）、マレイミドプロパノイル（ＭＰ）、ｐ−アミノベンジルオキシカルボニル（ＰＡＢ）、Ｎ−スクシンイミジル４−（マレイミドメチル）シクロヘキサンカルボキシレート（ＳＭＣＣ）、ＳＭＣＣの「長鎖」アナログ（ＬＣ−ＳＭＣＣ）であるＮ−スクシンイミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）−シクロヘキサン−１−カルボキシ−（６−アミドカプロエート）、３−マレイミドプロパン酸Ｎ−スクシンイミジルエステル（ＢＭＰＳ）、Ｎ−スクシンイミジルヨードアセテート（ＳＩＡ）、Ｎ−スクシンイミジルブロモアセテート（ＳＢＡ）、およびＮ−スクシンイミジル３−（ブロモアセトアミド）プロピオネート（ＳＢＡＰ）である。
【０４０６】
ポリペプチド（例えば、Ｆｃポリペプチド）は、文献に記載されるように、スクシンイミジル４−（Ｎ−マレイミドメチル）−シクロヘキサン−１−カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、スルホ−ＳＭＣＣ、マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＭＢＳ）、スルホ−ＭＢＳまたはスクシンイミジル−ヨードアセテートなどの架橋剤で修飾して、１〜１０個の反応性基を導入することができる。次いで、修飾されたＦｃポリペプチドをチオール含有細胞傷害剤と反応させることで、コンジュゲートを生成する。
【０４０７】
例えば、本開示のＡＰＰがＦｃポリペプチドを含む場合、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖は、式（Ａ）−（Ｌ）−（Ｃ）のものであってよく、ここで、（Ａ）は、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖であり、（Ｌ）は、存在する場合、リンカーであり、（Ｃ）は、細胞傷害剤である。（Ｌ）は、存在する場合、（Ａ）を（Ｃ）に連結する。いくつかの場合において、Ｆｃポリペプチドを含むポリペプチド鎖は、２つ以上の細胞傷害剤（例えば、２、３、４、もしくは５つ、または５つを超える細胞傷害剤）を含み得る。
【０４０８】
好適な薬物には、例えば、ラパマイシンが含まれる。好適な薬物には、例えば、全トランス型レチノイン酸（ＡＴＲＡ）などのレチノイド、ビタミンＤ３、ビタミンＤ３アナログなどが含まれる。上記のとおり、いくつかの場合において、薬物は、細胞傷害剤である。細胞傷害剤は、当該技術分野において知られている。好適な細胞傷害剤は、細胞死をもたらすか、細胞死を誘導するか、または何らかの方法で細胞生存率を低下させる任意の化合物であり得、例えば、メイタンシノイドおよびメイタンシノイドアナログ、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ−１０６５およびＣＣ−１０６５アナログ、デュオカルマイシンおよびデュオカルマイシンアナログ、カリケアミシンなどのエンジイン、アウリスタチンを含むドラスタチンおよびドラスタチンアナログ、トマイマイシン誘導体、レプトマイシン誘導体、メトトレキサート、シスプラチン、カルボプラチン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシルならびにモルホリノドキソルビシンが挙げられる。
【０４０９】
例えば、いくつかの場合において、細胞傷害剤は、真核細胞における微小管形成を阻害する化合物である。そのような薬剤には、例えば、メイタンシノイド、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ−１０６５、デュオカルマイシン、デュオカルマイシンアナログ、カリケアミシン、ドラスタチン、ドラスタチンアナログ、アウリスタチン、トマイマイシン、およびレプトマイシン、または前述のいずれか１つのプロドラッグが含まれる。メイタンシノイド化合物には、例えば、Ｎ（２’）−デアセチル−Ｎ（２’）−（３−メルカプト−１−オキソプロピル）−マイタンシン（ＤＭ１）、Ｎ（２’）−デアセチル−Ｎ（２’）−（４−メルカプト−１−オキソペンチル）−マイタンシン（ＤＭ３）、およびＮ（２’）−デアセチル−Ｎ２−（４−メルカプト−４−メチル−１−オキソペンチル）−マイタンシン（ＤＭ４）が含まれる。ベンゾジアゼピンには、例えば、インドリノベンゾジアゼピンおよびオキサゾリジノベンゾジアゼピンが含まれる。
【０４１０】
細胞傷害剤は、当該技術分野において知られている。好適な細胞傷害剤は、細胞死をもたらすか、細胞死を誘導するか、または何らかの方法で細胞生存率を低下させる任意の化合物であり得、例えば、メイタンシノイドおよびメイタンシノイドアナログ、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ−１０６５およびＣＣ−１０６５アナログ、デュオカルマイシンおよびデュオカルマイシンアナログ、カリケアミシンなどのエンジイン、アウリスタチンを含むドラスタチンおよびドラスタチンアナログ、トマイマイシン誘導体、レプトマイシン誘導体、メトトレキサート、シスプラチン、カルボプラチン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ビンクリスチン、ビンブラスチン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシルならびにモルホリノドキソルビシンが挙げられる。
【０４１１】
細胞傷害剤には、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、マイタンシンまたはそのアナログもしくは誘導体、アウリスタチンまたはその機能性ペプチドアナログもしくは誘導体、ドラスタチン１０または１５もしくはそれらのアナログ、イリノテカンまたはそのアナログ、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、糖質コルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、カリケアミシンまたはそのアナログもしくは誘導体、代謝拮抗剤、６メルカプトプリン、６チオグアニン、シタラビン、フルダラビン、５フルオロウラシル、デカルバジン、ヒドロキシウレア、アスパラギナーゼ、ゲムシタビン、クラドリビン、アルキル化剤、白金誘導体、デュオカルマイシンＡ、デュオカルマイシンＳＡ、ラケルマイシン（ＣＣ−１０６５）またはそのアナログもしくは誘導体、抗生物質、ピロロ［２，１−ｃ］［１，４］−ベンゾジアゼピン（ＰＤＢ）、ジフテリア毒素、リシン毒素、コレア毒素、志賀様毒素、ＬＴ毒素、Ｃ３毒素、志賀毒素、百日咳毒素、テタヌス毒素、大豆Ｂｏｗｍａｎ−Ｂｉｒｋプロテアーゼ阻害薬、緑膿菌外毒素、アロリン、サポリン、モデシン、ゲラニン、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、アルファ−サルシン、Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ  ｆｏｒｄｉｉタンパク質、ジアンチンタンパク質、Ｐｈｙｔｏｌａｃｃａ  ａｍｅｒｉｃａｎａタンパク質、ｍｏｍｏｒｄｉｃａ  ｃｈａｒａｎｔｉａ阻害剤、クルシン、クロチン、ｓａｐａｏｎａｒｉａ  ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン毒素、リボヌクレアーゼ（ＲＮａｓｅ）、ＤＮａｓｅ  Ｉ、Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃａｌ  ｅｎｔｅｒｏｔｏｘｉｎＡ、アメリカヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質、ジフテリア菌毒素、および緑膿菌内毒素が含まれる。
【０４１２】
いくつかの場合において、細胞傷害剤は、真核細胞における微小管形成を阻害する化合物である。そのような薬剤には、例えば、メイタンシノイド、ベンゾジアゼピン、タキソイド、ＣＣ−１０６５、デュオカルマイシン、デュオカルマイシンアナログ、カリケアミシン、ドラスタチン、ドラスタチンアナログ、アウリスタチン、トマイマイシン、およびレプトマイシン、または前述のいずれか１つのプロドラッグが含まれる。メイタンシノイド化合物には、例えば、Ｎ（２’）−デアセチル−Ｎ（２’）−（３−メルカプト−１−オキソプロピル）−マイタンシン（ＤＭ１）、Ｎ（２’）−デアセチル−Ｎ（２’）−（４−メルカプト−１−オキソペンチル）−マイタンシン（ＤＭ３）、およびＮ（２’）−デアセチル−Ｎ２−（４−メルカプト−４−メチル−１−オキソペンチル）−マイタンシン（ＤＭ４）が含まれる。ベンゾジアゼピンには、例えば、インドリノベンゾジアゼピンおよびオキサゾリジノベンゾジアゼピンが含まれる。
【０４１３】
核酸
本開示は、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。本開示は、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。
【０４１４】
本開示の単鎖抗原提示ポリペプチドをコードする核酸
上記のように、いくつかの場合において、本開示のＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。上記のように、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、単一のポリペプチド鎖を含む。本開示は、本開示の単鎖ＡＰＰ（本開示の単鎖ＴＭＡＰＰを含む）をコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。
【０４１５】
本開示の多量体ポリペプチドをコードする核酸（複数可）
上記のとおり、いくつかの場合において、本開示のＡＰＰ（本開示のＴＭＡＰＰを含む）は、少なくとも２つの別個のポリペプチド鎖を含む。本開示は、本開示の多量体ＡＰＰ（例えば、多量体ＴＭＡＰＰ）をコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチド（本開示の多量体ＡＰＰ、本開示の多量体ＴＭＡＰＰ）の個々のポリペプチド鎖は、別個の核酸にコードされる。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの全てのポリペプチド鎖は、単一の核酸にコードされる。いくつかの場合において、第１の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、単一の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドおよび本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。
【０４１６】
多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖をコードする別個の核酸
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。上記のとおり、いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの個々のポリペプチド鎖は、別個の核酸にコードされる。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの別個のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えば、プロモーター（真核細胞において機能するプロモーターなど）に作動可能に連結され、ここで、プロモーターは、構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターであり得る。
【０４１７】
例えば、本開示は、第１の核酸および第２の核酸を提供し、ここで、第１の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸は、当該多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、第１および第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素に作動可能に連結される。いくつかの場合において、転写制御要素は、真核細胞において機能するプロモーターである。いくつかの場合において、核酸は、別個の発現ベクター中に存在する。
【０４１８】
１つの非限定的な例として、本開示は、第１の核酸および第２の核酸を提供し、第１の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第１のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端の順に、ａ）エピトープ（例えば、Ｔ細胞エピトープ）、ｂ）第１のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、およびｃ）免疫調節ポリペプチド（例えば、上記のような低親和性バリアント）を含み、第２の核酸は、本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、第２のポリペプチドは、Ｎ末端からＣ末端への順序で、ａ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、およびｂ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む。好適なＴ細胞エピトープ、ＭＨＣポリペプチド、免疫調節ポリペプチド、およびＩｇ  Ｆｃポリペプチドについては、上記のとおりである。いくつかの場合において、第１および第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素に作動可能に連結される。いくつかの場合において、転写制御要素は、真核細胞において機能するプロモーターである。いくつかの場合において、核酸は、別個の発現ベクター中に存在する。
【０４１９】
多量体ポリペプチド中に存在する２つ以上のポリペプチドをコードする核酸
本開示は、本開示の多量体ポリペプチドの少なくとも第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、核酸を提供する。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドが第１、第２、および第３のポリペプチドを含む場合、核酸は、第１、第２、および第３のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、タンパク質分解により切断可能なリンカーを含む。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）を含む。いくつかの場合において、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドと第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間に挿入された、リボソームスキッピングシグナル（またはシス作用性加水分解酵素要素、ＣＨＹＳＥＬ）を含む。本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列と第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列との間にタンパク質分解により切断可能なリンカーが提供される核酸の例は、以下に記載され、これらの実施形態のいずれにおいても、タンパク質分解により切断可能なリンカーをコードするヌクレオチド配列の代わりに、ＩＲＥＳまたはリボソームスキッピングシグナルを使用することができる。
【０４２０】
いくつかの場合において、第１の核酸（例えば、組み換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡなど）は、本開示の多量体ポリペプチドの第１のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、第２の核酸（例えば、組み換え発現ベクター、ｍＲＮＡ、ウイルスＲＮＡなど）は、本開示の多量体ポリペプチドの第２のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの場合において、第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、および第２のポリペプチドをコードする第２のヌクレオチド配列は、それぞれ、転写制御要素、例えば、プロモーター（真核細胞において機能するプロモーターなど）に作動可能に連結され、ここで、プロモーターは、構成性プロモーターまたは誘導性プロモーターであり得る。
【０４２１】
組み換え発現ベクター
本開示は、本開示の核酸を含む、組み換え発現ベクターを提供する。いくつかの場合において、組み換え発現ベクターは、非ウイルスベクターである。いくつかの実施形態において、組み換え発現ベクターは、ウイルスコンストラクト、例えば、組み換えアデノ随伴ウイルスコンストラクト（例えば、米国特許第７，０７８，３８７号参照）、組み換えアデノウイルスコンストラクト、組み換えレンチウイルスコンストラクト、組み換えレトロウイルスコンストラクト、非組み込み型ウイルスベクターなどである。
【０４２２】
好適な発現ベクターには、ウイルスベクター（例えば、ワクシニアウイルス、ポリオウイルス、アデノウイルスをベースにするウイルスベクター（例えば、Ｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ  Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ  Ｖｉｓ  Ｓｃｉ  ３５：２５４３  ２５４９，１９９４；Ｂｏｒｒａｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ６：５１５  ５２４，１９９９；Ｌｉ  ａｎｄ  Ｄａｖｉｄｓｏｎ，ＰＮＡＳ  ９２：７７００  ７７０４，１９９５；Ｓａｋａｍｏｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｈ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ５：１０８８  １０９７，１９９９；ＷＯ９４／１２６４９、ＷＯ９３／０３７６９、ＷＯ９３／１９１９１、ＷＯ９４／２８９３８、ＷＯ９５／１１９８４およびＷＯ９５／００６５５参照）、アデノ随伴ウイルス（例えば、Ａｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ９：８１  ８６，１９９８，Ｆｌａｎｎｅｒｙ  ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ  ９４：６９１６  ６９２１，１９９７；Ｂｅｎｎｅｔｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｉｎｖｅｓｔ  Ｏｐｔｈａｌｍｏｌ  Ｖｉｓ  Ｓｃｉ  ３８：２８５７  ２８６３，１９９７；Ｊｏｍａｒｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ４：６８３  ６９０，１９９７，Ｒｏｌｌｉｎｇ  ｅｔ  ａｌ．，Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  １０：６４１  ６４８，１９９９；Ａｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｈｕｍ  Ｍｏｌ  Ｇｅｎｅｔ  ５：５９１  ５９４，１９９６；Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ  ｉｎ  ＷＯ  ９３／０９２３９，Ｓａｍｕｌｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｖｉｒ．（１９８９）６３：３８２２−３８２８；Ｍｅｎｄｅｌｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｖｉｒｏｌ．（１９８８）１６６：１５４−１６５；およびＦｌｏｔｔｅ  ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ（１９９３）９０：１０６１３−１０６１７参照）、ＳＶ４０、単純ヘルペスウイルス、ヒト免疫不全ウイルス（例えば、Ｍｉｙｏｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，ＰＮＡＳ  ９４：１０３１９  ２３，１９９７；Ｔａｋａｈａｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ  Ｖｉｒｏｌ  ７３：７８１２  ７８１６，１９９９参照）、レトロウイルスベクター（例えば、マウス白血病ウイルス、脾臓壊死ウイルス、ならびにラウス肉腫ウイルス、Ｈａｒｖｅｙ肉腫ウイルス、トリ白血病ウイルス、レンチウイルス、ヒト免疫不全ウイルス、骨髄増殖性肉腫ウイルスおよび乳腺腫瘍ウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクター）などが含まれるが、これらに限定されない。多数の好適な発現ベクターが当業者に知られており、多くが市販されている。
【０４２３】
使用される宿主／ベクター系に応じて、構成性および誘導性プロモーター、転写エンハンサー要素、転写ターミネーターなどを含む多数の好適な転写および翻訳制御要素のいずれかを発現ベクターに使用することができる（例えば、Ｂｉｔｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（１９８７）Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ，１５３：５１６−５４４参照）。
【０４２４】
いくつかの場合において、本開示のＡＰＰをコードするヌクレオチド配列は、制御要素、例えば、プロモーターなどの転写制御要素に作動可能に連結される。転写制御要素は、真核細胞（例えば、哺乳類細胞）または原核細胞（例えば、細菌または古細菌細胞）のいずれかで機能的であり得る。いくつかの場合において、ＤＮＡ標的ＲＮＡおよび／または部位特異的改変ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、ＤＮＡ標的ＲＮＡおよび／または部位特異的改変ポリペプチドをコードする当該ヌクレオチド配列を原核生物および真核細胞の両方で発現させることが可能な複数の制御要素に作動可能に連結される。
【０４２５】
好適な真核生物プロモーター（真核細胞で機能するプロモーター）の非限定的な例としては、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）前初期単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）チミジンキナーゼ、前期および後期ＳＶ４０、レトロウイルス由来の長い末端反復（ＬＴＲ）、ならびにマウスメタロチオネイン−Ｉに由来するものが挙げられる。適切なベクターおよびプロモーターの選択は、十分に当業者の技術レベルの範囲内である。発現ベクターはまた、翻訳開始のためのリボソーム結合部位および転写ターミネーターを含有する。発現ベクターはまた、発現の増幅に適切な配列を含み得る。
【０４２６】
遺伝子改変された宿主細胞
本開示は、遺伝子改変された宿主細胞を提供し、当該宿主細胞は、本開示の核酸（複数可）で遺伝子改変されている。
【０４２７】
好適な宿主細胞には、酵母細胞、昆虫細胞、および哺乳類細胞などの真核細胞が含まれる。いくつかの場合において、宿主細胞は、哺乳類細胞株の細胞である。好適な哺乳類細胞株には、ヒト細胞株、非ヒト霊長類細胞株、げっ歯類（例えば、マウス、ラット）細胞株などが含まれる。好適な哺乳類細胞株には、ＨｅＬａ細胞（例えば、米国培養細胞系統保存機関（ＡＴＣＣ）番号ＣＣＬ−２）、ＣＨＯ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ９６１８、ＣＣＬ６１、ＣＲＬ９０９６）、２９３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１５７３）、Ｖｅｒｏ細胞、ＮＩＨ  ３Ｔ３細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ−１６５８）、Ｈｕｈ−７細胞、ＢＨＫ細胞（例えば、ＡＴＣＣ番号ＣＣＬ１０）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１７２１）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ−７細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１６５１）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＣＬＩ．３）、ヒト胎児腎細胞（ＨＥＫ）細胞（ＡＴＣＣ番号ＣＲＬ１５７３）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞などが含まれるが、これらに限定されない。
【０４２８】
遺伝子改変された宿主細胞を使用して、本開示のＡＰＰを産生することができる。例えば、遺伝子改変された宿主細胞を使用して、本開示の多量体ＴＭＡＰＰ、または本開示の単鎖ＴＭＡＰＰを産生することができる。ポリペプチド（複数可）をコードするヌクレオチド配列を含む発現ベクター（複数可）を宿主細胞に導入して、遺伝子改変された宿主細胞を生成し、その遺伝子改変された宿主細胞がポリペプチド（複数可）を産生する。
【０４２９】
組成物
本開示は、本開示のＡＰＰを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。本開示は、本開示のＴＭＡＰＰを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物（医薬組成物を含む）を提供する。
【０４３０】
抗原提示ポリペプチドを含む組成物
本開示の組成物は、本開示のＡＰＰまたは本開示のＴＭＡＰＰに加えて、塩、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４など；緩衝剤、例えば、Ｔｒｉｓ緩衝液、Ｎ−（２−ヒドロキシエチル）ピペラジン−Ｎ’−（２−エタンスルホン酸）（ＨＥＰＥＳ）、２−（Ｎ−モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）、２−（Ｎ−モルホリノ）エタンスルホン酸ナトリウム塩（ＭＥＳ）、３−（Ｎ−モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、Ｎ−トリス［ヒドロキシメチル］メチル−３−アミノプロパンスルホン酸（ＴＡＰＳ）など；可溶化剤；界面活性剤、例えば、Ｔｗｅｅｎ−２０などの非イオン性界面活性剤；プロテアーゼ阻害薬；グリセロールなどのうちの１つ以上を含み得る。
【０４３１】
組成物は、薬学的に許容される賦形剤を含み得、賦形剤については、様々なものが当該技術分野において知られており、本明細書で詳細に論じる必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、例えば、“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ”，１９ｔｈ  Ｅｄ．（１９９５）または最新版、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ  Ｃｏ；Ａ．Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ；Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ  ７ｔｈ  ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ；およびＨａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ  ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な公開物中に十分記載されている。
【０４３２】
医薬組成物は、ｉ）本開示のＡＰＰまたは本開示のＴＭＡＰＰ、およびｉｉ）薬学的に許容される賦形剤を含み得る。いくつかの場合において、主題の医薬組成物は、対象への投与に好適なものであり、例えば、無菌である。例えば、いくつかの実施形態において、主題の医薬組成物は、ヒト対象への投与に好適なものであり、例えば、組成物が無菌であり、検出可能な発熱物質および／または他の毒素を含まない。
【０４３３】
タンパク質組成物は、他の成分、例えば、医薬品等級のマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、タルカム、セルロース、グルコース、スクロース、マグネシウム、カーボネートなどを含み得る。組成物は、生理学的条件に近づけるために必要とされる薬学的に許容される補助物質、例えば、ｐＨ調整剤および緩衝剤、毒性調整剤など、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウム、塩酸塩、硫酸塩、溶媒和物（例えば、混合イオン性塩、水、有機物質）、水和物（例えば、水）などを含み得る。
【０４３４】
例えば、組成物は、水溶液、粉末形態、顆粒剤、錠剤、丸剤、坐剤、カプセル剤、懸濁剤、スプレーなどを含み得る。組成物は、以下に記載される様々な投与経路に応じて製剤化され得る。
【０４３５】
本開示のＡＰＰまたは本開示のＴＭＡＰＰが注射剤として組織に直接投与される場合（例えば、皮下、腹腔内、筋肉内、リンパ管内、および／または静脈内投与）、製剤は、即時使用可能な剤形として、または非水性形態（例えば、再構成可能な貯蔵安定性粉末）もしくは薬学的に許容される担体および賦形剤で構成される液剤などの水性形態として、提供することができる。タンパク質含有製剤はまた、投与後の主題タンパク質の血清半減期を延長するように提供することもできる。例えば、タンパク質は、コロイドとして調製されたリポソーム製剤、または血清半減期を延長する他の従来技術で提供され得る。リポソームの調製には、例えば、Ｓｚｏｋａ  ｅｔ  ａｌ．１９８０  Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｂｉｏｅｎｇ．９：４６７、米国特許第４，２３５，８７１号，同第４，５０１，７２８号および同第４，８３７，０２８号に記載されるような様々な方法が利用可能である。調製物はまた、制御放出形態または徐放性形態で提供されてもよい。
【０４３６】
いくつかの場合において、本開示の組成物は、ａ）本開示のＡＰＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む。いくつかの場合において、本開示の組成物は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む。いくつかの場合において、組成物は、無菌である。いくつかの場合において、組成物は、ヒト対象への投与に好適なものであり、例えば、組成物は、無菌であり、検出可能な発熱物質および／または他の毒素を含まない。したがって、本開示は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）生理食塩水（例えば、０．９％ＮａＣｌ）と、を含む組成物を提供し、当該組成物は、無菌であり、検出可能な発熱物質および／または他の毒素を含まない。
【０４３７】
非経口投与に好適な製剤の他の例としては、等張無菌注射用液剤、抗酸化剤、静菌剤、および製剤を対象のレシピエントの血液と等張にする溶質、懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、および保存剤が挙げられる。例えば、主題の医薬組成物は、容器、例えば、無菌容器、例えば、シリンジ中に存在し得る。製剤は、アンプルおよびバイアルなどの単位用量または複数回用量の密封容器で提供することができ、使用直前に注射剤用の無菌液状賦形剤、例えば、水の添加のみを要するフリーズドライ（凍結乾燥）状態で保存することができる。即時注射用液剤および懸濁剤は、滅菌された散剤、顆粒剤および錠剤から調製することができる。
【０４３８】
製剤中における本開示のＡＰＰまたは本開示のＴＭＡＰＰの濃度は、大きく変えることができ（例えば、重量で約０．１％未満、通常、約２％または少なくとも約２％から２０％〜５０％までまたはそれ以上）、選択された特定の投与様式および患者の必要性に従って、主に、液量、粘度、および患者による因子に基づいて通常選択される。
【０４３９】
本開示は、本開示の組成物、例えば、液体組成物を含む、容器を提供する。容器は、例えば、シリンジ、アンプルなどであってよい。いくつかの場合において、容器は、無菌である。いくつかの場合において、容器も組成物も無菌である。
【０４４０】
核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物
本開示は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む組成物、例えば、医薬組成物を提供する。薬学的に許容される賦形剤は、多種多様なものが当該技術分野において知られており、本明細書で詳細に論じる必要はない。薬学的に許容される賦形剤は、例えば、Ａ．Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ”，２０ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ；Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍｓ（１９９９）Ｈ．Ｃ．Ａｎｓｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ  ７ｔｈ  ｅｄ．，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆  Ｗｉｌｋｉｎｓ；およびＨａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ（２０００）Ａ．Ｈ．Ｋｉｂｂｅ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，３ｒｄ  ｅｄ．Ａｍｅｒ．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ａｓｓｏｃ．を含む、様々な公開物中に十分記載されている。
【０４４１】
本開示の組成物は、ａ）本開示のＡＰＰまたは本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸または１つ以上の組み換え発現ベクターと、ｂ）緩衝液、界面活性剤、抗酸化剤、親水性ポリマー、デキストリン、キレート化剤、懸濁化剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、静菌剤、湿潤剤、および保存剤のうちの１つ以上と、を含み得る。好適な緩衝液には、（例えば、Ｎ，Ｎ−ビス（２−ヒドロキシエチル）−２−アミノエタンスルホン酸（ＢＥＳ）、ビス（２−ヒドロキシエチル）アミノ−トリス（ヒドロキシメチル）メタン（ＢＩＳ−Ｔｒｉｓ）、Ｎ−（２−ヒドロキシエチル）ピペラジン−Ｎ’３−プロパンスルホン酸（ＥＰＰＳまたはＨＥＰＰＳ）、グリシルグリシン、Ｎ−２−ヒドロキシエチルピペラジン−Ｎ’−２−エタンスルホン酸（ＨＥＰＥＳ）、３−（Ｎ−モルホリノ）プロパンスルホン酸（ＭＯＰＳ）、ピペラジン−Ｎ，Ｎ’−ビス（２−エタン−スルホン酸）（ＰＩＰＥＳ）、炭酸水素ナトリウム、３−（Ｎ−トリス（ヒドロキシメチル）−メチル−アミノ）−２−ヒドロキシ−プロパンスルホン酸）ＴＡＰＳＯ、（Ｎ−トリス（ヒドロキシメチル）メチル−２−アミノエタンスルホン酸（ＴＥＳ）、Ｎ−トリス（ヒドロキシメチル）メチル−グリシン（トリシン）、トリス（ヒドロキシメチル）−アミノメタン（Ｔｒｉｓ）など）が含まれるが、これらに限定されない。好適な塩には、例えば、ＮａＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＫＣｌ、ＭｇＳＯ４などが含まれる。
【０４４２】
本開示の医薬製剤は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを、約０．００１％〜約９０％（ｗ／ｗ）の量で含み得る。製剤の以下の記載において、「主題の核酸または組み換え発現ベクター」は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含むことが理解される。例えば、いくつかの実施形態において、主題の製剤は、本開示の核酸または組み換え発現ベクターを含む。
【０４４３】
主題の核酸または組み換え発現ベクターは、他の化合物または化合物の混合物との混合、カプセル化、コンジュゲート、または別の方法による会合が可能であり、かかる化合物には、例えば、リポソームまたは受容体標的分子が含まれ得る。主題の核酸または組み換え発現ベクターは、取り込み、分布および／または吸収を助ける１つ以上の成分と組み合わせて製剤にすることができる。
【０４４４】
主題の核酸または組み換え発現ベクター組成物は、限定するものではないが、錠剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、液状シロップ剤、軟質ゲル剤、坐剤、および浣腸剤などの多くの可能な剤形のうちのいずれかに製剤化することができる。主題の核酸または組み換え発現ベクター組成物はまた、水性、非水性または混合媒体中の懸濁剤として製剤化することもできる。水性懸濁剤は、例えば、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトールおよび／またはデキストランを含む、懸濁剤の粘度を高める物質を更に含有し得る。懸濁剤は、安定剤も含有し得る。
【０４４５】
主題の核酸または組み換え発現ベクターを含む製剤は、リポソーム製剤であり得る。本明細書で使用されるとき、「リポソーム」という用語は、球状の二重層（複数可）に配置された両親媒性脂質から構成される小胞を意味する。リポソームは、親油性材料から形成される膜と、送達される組成物を含有する水性内部と、を有する、単層または多層の小胞である。カチオン性リポソームは、正に荷電したリポソームであり、負に荷電したＤＮＡ分子と相互作用して安定な複合体を形成することができる。ｐＨ感受性または負に荷電したリポソームは、ＤＮＡと複合体を形成するのではなく、ＤＮＡを捕捉すると考えられる。カチオン性および非カチオン性のいずれのリポソームも、主題の核酸または組み換え発現ベクターを送達するために使用することができる。
【０４４６】
リポソームにはまた、「立体的に安定化された」リポソームも含まれ、この用語は、本明細書で使用されるとき、１つ以上の特殊な脂質を含むリポソームを指し、この特殊な脂質は、リポソームに組み込まれると、そのような特殊な脂質を欠くリポソームと比較して循環寿命を向上させる。立体的に安定化されたリポソームの例は、リポソームの小胞形成脂質部分の一部が１つ以上の糖脂質を含むもの、またはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分などの１つ以上の親水性ポリマーにより誘導体化されているものである。リポソームおよびその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されており、その全体が参照により本明細書に援用される。
【０４４７】
本開示の製剤および組成物はまた、界面活性剤を含み得る。薬物製品、製剤および乳剤における界面活性剤の使用は、当該技術分野においてよく知られている。界面活性剤およびその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されている。
【０４４８】
一実施形態において、核酸の効率的な送達をもたらすために、様々な浸透促進剤が含まれる。非脂溶性薬物が細胞膜を超えて拡散することを助けるのに加えて、浸透促進剤は、脂溶性薬物の透過性も向上させる。浸透促進剤は、５つの広い分類、すなわち、界面活性剤、脂肪酸、胆汁酸塩、キレート化剤、および非キレート化非界面活性剤のうちの１つに属するように分類され得る。浸透促進剤およびその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されており、その全体が参照により本明細書に援用される。
【０４４９】
経口投与用の組成物および製剤には、散剤または顆粒剤、微粒子、ナノ粒子、水もしくは非水性媒体中の懸濁剤もしくは液剤、カプセル剤、ゲルカプセル剤、サシェ剤、錠剤、またはミニ錠剤が含まれる。粘稠剤、矯味剤、希釈剤、乳化剤、分散助剤または結合剤が望ましい場合がある。好適な経口製剤には、主題のアンチセンス核酸が、１つ以上の浸透促進剤、界面活性剤およびキレート剤とともに投与されるものが含まれる。好適な界面活性剤には、脂肪酸および／またはそのエステルもしくは塩、胆汁酸および／またはその塩が含まれるが、これらに限定されない。好適な胆汁酸／塩および脂肪酸ならびにその使用は、米国特許第６，２８７，８６０号に更に記載されている。また、浸透促進剤の組み合わせ、例えば、胆汁酸／塩と組み合わせた脂肪酸／塩も好適である。例示的な好適な組み合わせは、ラウリン酸、カプリン酸およびＵＤＣＡのナトリウム塩である。更なる浸透促進剤には、ポリオキシエチレン−９−ラウリルエーテル、およびポリオキシエチレン−２０−セチルエーテルが含まれるが、これらに限定されない。好適な浸透促進剤にはまた、プロピレングリコール、ジメチルスルホキシド、トリエタノールアミン、Ｎ，Ｎ−ジメチルアセトアミド、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、２−ピロリドンおよびその誘導体、テトラヒドロフルフリルアルコール、ならびにＡＺＯＮＥ（商標）が含まれる。
【０４５０】
方法
本開示のＡＰＰは、様々な研究および診断目的に有用である。例えば、本開示のＡＰＰは、抗原特異的Ｔ細胞を直接的にまたは間接的に標識するために使用され得る。
【０４５１】
本開示のＴＭＡＰＰは、Ｔ細胞の活性の調節に有用である。したがって、本開示は、Ｔ細胞の活性を調節する方法であって、一般に、標的Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを伴う、方法を提供する。
【０４５２】
抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法
本開示は、抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法を提供する。方法は、Ｔ細胞を本開示のＡＰＰと接触させることと、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合を検出することと、を含む。
【０４５３】
本開示は、抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法であって、Ｔ細胞を本開示のＡＰＰと接触させることを含み、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合は、Ｔ細胞がＡＰＰに存在するエピトープに特異的であることを示す、方法を提供する。
【０４５４】
いくつかの場合において、ＡＰＰは、検出可能な標識を含む。好適な検出可能な標識には、放射性同位体、蛍光ポリペプチド、または蛍光産物を生成する酵素および有色産物を生成する酵素が含まれるが、これらに限定されない。ＡＰＰが検出可能な標識を含む場合、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合は、当該検出可能な標識を検出することによって検出される。
【０４５５】
好適な蛍光タンパク質には、緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）またはそのバリアント、ＧＦＰの青色蛍光バリアント（ＢＦＰ）、ＧＦＰのシアン蛍光バリアント（ＣＦＰ）、ＧＦＰの黄色蛍光バリアント（ＹＦＰ）、改良型ＧＦＰ（ＥＧＦＰ）、改良型ＣＦＰ（ＥＣＦＰ）、改良型ＹＦＰ（ＥＹＦＰ）、ＧＦＰＳ６５Ｔ、Ｅｍｅｒａｌｄ、Ｔｏｐａｚ（ＴＹＦＰ）、Ｖｅｎｕｓ、Ｃｉｔｒｉｎｅ、ｍＣｉｔｒｉｎｅ、ＧＦＰｕｖ、不安定化ＥＧＦＰ（ｄＥＧＦＰ）、不安定化ＥＣＦＰ（ｄＥＣＦＰ）、不安定化ＥＹＦＰ（ｄＥＹＦＰ）、ｍＣＦＰｍ、Ｃｅｒｕｌｅａｎ、Ｔ−Ｓａｐｐｈｉｒｅ、ＣｙＰｅｔ、ＹＰｅｔ、ｍＫＯ、ＨｃＲｅｄ、ｔ−ＨｃＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ、ＤｓＲｅｄ２、ＤｓＲｅｄモノマー、Ｊ−Ｒｅｄ、ダイマー２、ｔ−ダイマー２（１２）、ｍＲＦＰ１、ポシロポリン、Ｒｅｎｉｌｌａ  ＧＦＰ、Ｍｏｎｓｔｅｒ  ＧＦＰ、ｐａＧＦＰ、Ｋａｅｄｅタンパク質およびｋｉｎｄｌｉｎｇタンパク質、フィコビリタンパク質およびフィコビリタンパク質結合体（Ｂ−フィコエリトリン、Ｒ−フィコエリトリンおよびアロフィコシアニンを含む）が含まれるが、これらに限定されない。蛍光タンパク質の他の例としては、ｍＨｏｎｅｙｄｅｗ、ｍＢａｎａｎａ、ｍＯｒａｎｇｅ、ｄＴｏｍａｔｏ、ｔｄＴｏｍａｔｏ、ｍＴａｎｇｅｒｉｎｅ、ｍＳｔｒａｗｂｅｒｒｙ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ１、ｍＲａｓｐｂｅｒｒｙ、ｍＧｒａｐｅ２、ｍＰｌｕｍ（Ｓｈａｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２００５）Ｎａｔ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２：９０５−９０９）などが挙げられる。花虫類種に由来する種々の蛍光および有色タンパク質のいずれか、例えば、Ｍａｔｚ  ｅｔ  ａｌ．（１９９９）Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１７：９６９−９７３に記載されているものなども使用に適している。
【０４５６】
好適な酵素には、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）、アルカリホスファターゼ（ＡＰ）、β−ガラクトシダーゼ（ＧＡＬ）、グルコース−６−リン酸デヒドロゲナーゼ、β−Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ、β−グルクロニダーゼ、インベルターゼ、キサンチンオキシダーゼ、ホタルルシフェラーゼ、グルコースオキシダーゼ（ＧＯ）などが含まれるが、これらに限定されない。
【０４５７】
いくつかの場合において、Ｔ細胞に対するＡＰＰの結合は、検出可能に標識された、ＡＰＰに特異的な抗体を使用して検出される。ＡＰＰに特異的な抗体は、放射性同位体、蛍光ポリペプチド、または蛍光産物を生成する酵素、または有色産物を生成する酵素などの検出可能な標識を含み得る。
【０４５８】
いくつかの場合において、検出されるＴ細胞は、複数のＴ細胞を含むサンプル中に存在する。例えば、検出されるＴ細胞は、１０〜１０９個のＴ細胞、例えば、１０〜１０２、１０２〜１０４、１０４〜１０６、１０６〜１０７、１０７〜１０８、または１０８〜１０９、または１０９個を超えるＴ細胞を含むサンプル中に存在し得る。
【０４５９】
Ｔ細胞活性を調節する方法
本開示は、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを含み、Ｔ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることにより、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。いくつかの場合において、接触は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで生じる。いくつかの場合において、接触は、ｉｎ  ｖｉｖｏで生じる。いくつかの場合において、接触は、ｅｘ  ｖｉｖｏで生じる。
【０４６０】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰに接触させるＴ細胞は、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。Ｔｒｅｇは、ＣＤ４＋、ＦＯＸＰ３＋、およびＣＤ２５＋である。Ｔｒｅｇは、自己反応性Ｔ細胞を抑制することができる。いくつかの場合において、本開示の方法は、Ｔｒｅｇを活性化し、それにより、自己反応性Ｔ細胞の活性を低下させる。
【０４６１】
本開示は、Ｔｒｅｇの増殖を増加させる方法であって、Ｔｒｅｇを本開示のＴＭＡＰＰに接触させることを含み、当該接触させることにより、Ｔｒｅｇの増殖を増加させる、方法を提供する。本開示は、個体におけるＴｒｅｇの数を増加させる方法であって、個体に本開示のＴＭＡＰＰを投与することを含み、当該投与することにより、個体におけるＴｒｅｇの数の増加をもたらす、方法を提供する。例えば、Ｔｒｅｇの数は、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、少なくとも２倍、少なくとも２．５倍、少なくとも５倍、少なくとも１０倍、または１０倍を超えて増加し得る。
【０４６２】
いくつかの場合において、接触させる細胞は、ヘルパーＴ細胞であり、ヘルパーＴ細胞を本開示のＴＭＡＰＰに接触させることにより、ヘルパーＴ細胞の活性化をもたらす。いくつかの場合において、ヘルパーＴ細胞の活性化は、ＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞、例えば、がん細胞を標的とし、殺傷するＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞の活性化および／または数の増加をもたらす。
【０４６３】
治療法
本開示は、治療方法であって、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節し、個体を治療するのに有効な量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードする１つ以上の核酸を個体に投与することを含む、治療方法を提供する。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の組み換え発現ベクターを投与すること含む。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上のｍＲＮＡ分子を投与することを含む。いくつかの場合において、本開示の治療方法は、それを必要とする個体に、本開示のＴＭＡＰＰを投与することを含む。治療することができる状態には、がんおよび自己免疫障害が含まれる。
【０４６４】
本開示は、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸（例えば、発現ベクター、ｍＲＮＡなど）を投与することを含み、当該ＴＭＡＰＰは、個体におけるエピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、方法を提供する。エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節することは、個体の疾患または障害を治療することができる。したがって、本開示は、治療方法であって、それを必要とする個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ（例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰ、または本開示の単鎖ＴＭＡＰＰ）を投与すること含む、治療方法を提供する。いくつかの場合において、疾患または障害は、自己免疫疾患または障害である。いくつかの場合において、疾患または障害は、がんである。
【０４６５】
いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、活性化ポリペプチドであり、ＴＭＡＰＰは、エピトープ特異的Ｔ細胞を活性化させる。いくつかの場合において、エピトープは、がん関連エピトープであり、ＴＭＡＰＰ（例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰ、または本開示の単鎖ＴＭＡＰＰ）は、がん関連エピトープに特異的なＴ細胞の活性を増大させる。
【０４６６】
本開示は、個体のがんを治療する方法であって、個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸（例えば、発現ベクター、ｍＲＮＡなど）を投与することを含み、当該ＴＭＡＰＰは、がんエピトープであるＴ細胞エピトープを含み、多量体ポリペプチドは、刺激性免疫調節ポリペプチドを含む、方法を提供する。いくつかの場合において、「有効量」の本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体におけるがん細胞の数が減少する量である。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体におけるがん細胞の数が、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体におけるがん細胞の数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体におけるがん細胞の数が検出不可能なレベルまで減少する量である。いくつかの場合において、「有効量」の本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体における腫瘍量が減少する量である。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体における腫瘍量が、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体における腫瘍量と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体（腫瘍を有する個体）に１以上の用量で投与されたとき、当該個体における腫瘍体積が減少する量である。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体（腫瘍を有する個体）に１以上の用量で投与されたとき、当該個体における腫瘍体積が、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体における腫瘍体積と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少する量である。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体の生存期間が増大する量である。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの「有効量」は、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、ＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体において予想される生存期間と比較して、少なくとも１ヶ月、少なくとも２ヶ月、少なくとも３ヶ月、３ヶ月〜６ヶ月、６ヶ月〜１年、１年〜２年、２年〜５年、５年〜１０年、または１０年を超えて当該個体の生存期間が増大する量である。
【０４６７】
いくつかの場合において、免疫調節ポリペプチドは、阻害性ポリペプチドであり、本開示のＴ  ＴＭＡＰＰは、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を阻害する。いくつかの場合において、エピトープは、自己エピトープであり、本開示のＴＭＡＰＰは、自己エピトープに特異的なＴ細胞の活性を選択的に阻害する。
【０４６８】
本開示は、個体の自己免疫障害を治療する方法であって、個体に、有効量の本開示のＴＭＡＰＰ、または当該ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸を投与することを含み、当該ＴＭＡＰＰ（例えば、本開示の多量体ＴＭＡＰＰまたは本開示の単鎖ＴＭＡＰＰ）は、自己エピトープであるＴ細胞エピトープを含み、当該ＴＭＡＰＰは、阻害性免疫調節ポリペプチドである、方法を提供する。いくつかの場合において、「有効量」の本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、自己反応性Ｔ細胞の数が、ＴＭＡＰＰの投与前、またはＴＭＡＰＰによる投与のない状態の個体における自己反応性Ｔ細胞の数と比較して、少なくとも１０％、少なくとも１５％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％減少する量である。いくつかの場合において、「有効量」の本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体におけるＴｈ２サイトカインの産生が減少する量である。いくつかの場合において、「有効量」の本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に１以上の用量で投与されたとき、当該個体の自己免疫疾患に関連する１つ以上の症状を改善する量である。
【０４６９】
上記のとおり、いくつかの場合において、主題の治療方法の実施にあたり、本開示のＴＭＡＰＰは、それを必要とする個体に、ポリペプチドそのものとして投与される。他の場合において、主題の治療方法の実施にあたり、ＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む１つ以上の核酸が、それを必要とする個体に投与される。したがって、他の場合において、本開示の１つ以上の核酸、例えば、本開示の１つ以上の組み換え発現ベクターが、それを必要とする個体に投与される。
【０４７０】
製剤
好適な製剤は、上記のとおりであり、好適な製剤は、薬学的に許容される賦形剤を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む核酸と、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含み、いくつかの場合、核酸は、ｍＲＮＡである。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の核酸と、ｂ）本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の核酸と、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰをコードするヌクレオチド配列を含む組み換え発現ベクターと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。いくつかの場合において、好適な製剤は、ａ）本開示のＴＭＡＰＰの第１のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第１の組み換え発現ベクターと、ｂ）本開示のＴＭＡＰＰの第２のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む第２の組み換え発現ベクターと、ｃ）薬学的に許容される賦形剤と、を含む。
【０４７１】
好適な薬学的に許容される賦形剤は、上記のとおりである。
【０４７２】
用量
好適な用量は、様々な臨床学的因子に基づき、主治医または他の有資格医療関係者によって決定され得る。医療分野においてよく知られているように、任意のある患者に対する用量は、患者の体格、体表面積、年齢、投与される特定のポリペプチドまたは核酸、患者の性別、投与の時間および経路、全般的な健康状態、ならびに同時に投与される他の薬物を含む、多くの因子に依存する。本開示の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（例えば、多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）は、１用量当たり１ｎｇ／ｋｇ体重〜２０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．１ｍｇ／ｋｇ体重〜１０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、０．５ｍｇ／ｋｇ体重〜５ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得るが、前述の因子を特に考慮した上で、この例示的範囲を下回る用量または上回る用量が想定される。レジメンが連続注入である場合、１μｇ〜１０ｍｇ／ｋｇ体重／分の範囲内であってもよい。本開示のＴＭＡＰＰは、約１ｍｇ／ｋｇ体重〜５０ｍｇ／ｋｇ体重、例えば、約１ｍｇ／ｋｇ体重〜約５ｍｇ／ｋｇ体重、約５ｍｇ／ｋｇ体重〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１０ｍｇ／ｋｇ体重〜約１５ｍｇ／ｋｇ体重、約１５ｍｇ／ｋｇ体重〜約２０ｍｇ／ｋｇ体重、約２０ｍｇ／ｋｇ体重〜約２５ｍｇ／ｋｇ体重、約２５ｍｇ／ｋｇ体重〜約３０ｍｇ／ｋｇ体重、約３０ｍｇ／ｋｇ体重〜約３５ｍｇ／ｋｇ体重、約３５ｍｇ／ｋｇ体重〜約４０ｍｇ／ｋｇ体重、または約４０ｍｇ／ｋｇ体重〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重の量で投与され得る。
【０４７３】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰの好適な用量は、０．０１μｇ〜１００ｇ／ｋｇ体重、０．１μｇ〜１０ｇ／ｋｇ体重、１μｇ〜１ｇ／ｋｇ体重、１０μｇ〜１００ｍｇ／ｋｇ体重、１００μｇ〜１０ｍｇ／ｋｇ体重、または１００μｇ〜１ｍｇ／ｋｇ体重である。当業者であれば、体液または組織において測定された投与薬剤の滞留時間および濃度に基づいて、反復投与頻度を容易に推定することができる。治療が成功した後、疾患状態の再発を予防するために、患者に維持療法を受けさせることが望ましい場合もあり、この場合、本開示の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（例えば、多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）は、０．０１μｇ〜１００ｇ／ｋｇ体重、０．１μｇ〜１０ｇ／ｋｇ体重、１μｇ〜１ｇ／ｋｇ体重、１０μｇ〜１００ｍｇ／ｋｇ体重、１００μｇ〜１０ｍｇ／ｋｇ体重、または１００μｇ〜１ｍｇ／ｋｇ体重の範囲の維持用量で投与される。
【０４７４】
当業者であれば、特定の多量体ポリペプチドまたは単鎖ポリペプチド（多量体ＴＭＡＰＰまたは単鎖ＴＭＡＰＰ）、症状の重症度および副作用に対する対象の感受性に応じて、用量レベルが変わり得ることを容易に理解するであろう。所与の化合物に好ましい用量は、様々な手段により、当業者によって容易に決定される。
【０４７５】
いくつかの場合において、複数回用量の本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターが投与される。本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの投与頻度は、様々な因子のいずれか、例えば、症状の重症度などに応じて変わり得る。例えば、いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、月１回、月２回、月３回、隔週（ｑｏｗ）、週１回（ｑｗ）、週２回（ｂｉｗ）、週３回（ｔｉｗ）、週４回、週５回、週６回、隔日（ｑｏｄ）、１日１回（ｑｄ）、１日２回（ｑｉｄ）、または１日３回（ｔｉｄ）投与される。
【０４７６】
本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの投与継続期間、例えば、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターが投与される期間は、様々な因子のいずれか、例えば、患者の応答などに応じて変わり得る。例えば、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、約１日〜約１週間、約２週間〜約４週間、約１ヶ月〜約２ヶ月、約２ヶ月〜約４ヶ月、約４ヶ月〜約６ヶ月、約６ヶ月〜約８ヶ月、約８ヶ月〜約１年、約１年〜約２年、もしくは約２年〜約４年またはそれ以上に及ぶ期間にわたって投与され得る。
【０４７７】
投与経路
活性剤（本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクター）は、ｉｎ  ｖｉｖｏ法およびｅｘ  ｖｉｖｏ法、ならびに全身および局所投与経路を含む、薬物送達に好適な任意の利用可能な方法および経路を使用して個体に投与される。
【０４７８】
従来の薬学的に許容される投与経路には、腫瘍内、腫瘍近傍、筋肉内、気管内、リンパ管内、頭蓋内、皮下、皮内、局所適用、静脈内、動脈内、経直腸、経鼻、経口、ならびに他の経腸および非経口の投与経路が含まれる。投与経路は、ＴＭＡＰＰおよび／または所望の効果に応じて、組み合わされてもよいし、所望により調節されてもよい。本開示のＴＭＡＰＰ、または本開示の核酸もしくは組み換え発現ベクターは、単回投与または複数回投与で投与され得る。
【０４７９】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、静脈内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、筋肉内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、リンパ管内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、局所投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、腫瘍内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、腫瘍近傍に投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、頭蓋内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、皮下投与される。
【０４８０】
いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、静脈内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、筋肉内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、局所投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、腫瘍内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、腫瘍近傍に投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、頭蓋内投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、皮下投与される。いくつかの場合において、本開示のＴＭＡＰＰは、リンパ管内投与される。
【０４８１】
本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターは、全身または局所経路を含む、従来の薬物の送達に好適な任意の利用可能な従来の方法および経路を使用して宿主に投与することができる。一般に、本開示の方法での使用が企図される投与経路には、経腸、非経口および吸入経路が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。
【０４８２】
吸入投与以外の非経口投与経路には、局所、経皮、皮下、筋肉内、眼窩内、嚢内、脊髄内、胸骨内、腫瘍内、リンパ管内、腫瘍近傍および静脈内経路、すなわち、消化管経路以外の任意の投与経路が含まれるが、必ずしもこれらに限定されない。非経口投与は、本開示のＴＭＡＰＰ、本開示の核酸、または本開示の組み換え発現ベクターの全身送達または局所送達をもたらすために実施することができる。全身送達が所望される場合、投与は、典型的に、医薬品の浸潤性または全身吸収による局所投与または粘膜投与を伴う。
【０４８３】
治療に好適な対象
本開示の方法による治療に好適な対象には、がんを有する個体が含まれ、これには、がんであると診断された個体、がんに対する治療を受けたが、当該治療に応答しなかった個体、およびがんに対する治療を受け、当該治療に最初は応答したが、その後抵抗性となった個体が含まれる。
【０４８４】
本開示の方法による治療に好適な対象には、自己免疫疾患を有する個体が含まれ、これには、自己免疫疾患であると診断された個体、および自己免疫疾患に対する治療を受けたが、当該治療に応答しなかった個体が含まれる。本開示の方法で治療することができる自己免疫疾患には、セリアック病、多発性硬化症、リウマチ様関節炎、Ｉ型自己免疫性糖尿病（ＩＤＤＭ）、クローン病、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）、自己免疫性脳脊髄炎、重症筋無力症（ＭＧ）、橋本病、グッドパスチャー症候群、天疱瘡（例えば、尋常性天疱瘡）、グレーヴス病、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性血小板減少性紫斑病、抗コラーゲン抗体による強皮症、混合性結合組織病、多発性筋炎、悪性貧血、特発性アジソン病、自己免疫関連不妊症、糸球体腎炎（例えば、急速進行性糸球体腎炎、増殖性糸球体腎炎）、水疱性類天疱瘡、およびシェーグレン症候群が含まれるが、これらに限定されない。
【０４８５】
共刺激ポリペプチドを選択的に送達する方法
本開示は、ＩＬ−２などの共刺激ポリペプチド、または本明細書で開示されるＩＬ−２バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアントを、例えば、所与のエピトープに特異的なＴＣＲを標的とするように、選択されたＴ細胞または選択されたＴ細胞集団に送達する方法を提供する。本開示は、ＩＬ−２などの共刺激ポリペプチド、または本明細書で開示されるＩＬ−２バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアントを、本開示のＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的なＴＣＲを持つ標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法を提供する。方法は、Ｔ細胞の集団を本開示のＴＭＡＰＰと接触させることを含む。Ｔ細胞の集団は、ｉ）標的Ｔ細胞と、ｉｉ）エピトープに特異的でない非標的Ｔ細胞（例えば、エピトープ特異的Ｔ細胞が結合するエピトープ以外のエピトープ（複数可）に特異的なＴ細胞）と、を含む、混合集団であり得る。エピトープ特異的Ｔ細胞は、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープ提示ペプチドに特異的であり、ＴＭＡＰＰによって提供されるペプチドＨＬＡ複合体またはペプチドＭＨＣ複合体に結合する。Ｔ細胞の集団をＴＭＡＰＰに接触させると、ＴＭＡＰＰ中に存在する共刺激ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２または低親和性ＩＬ−２バリアント）が、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的なＴ細胞（複数可）に選択的に送達される。
【０４８６】
したがって、本開示は、ＩＬ−２などの共刺激ポリペプチド、もしくは本明細書で開示されるＩＬ−２バリアントなどの天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアント、または両方の組み合わせを、標的Ｔ細胞に選択的に送達する方法であって、Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＡＰＰと接触させることを含む、方法を提供する。Ｔ細胞の混合集団は、標的Ｔ細胞と非標的Ｔ細胞とを含む。標的Ｔ細胞は、ＴＭＡＰＰ内に存在するエピトープに特異的である。Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＡＰＰに接触させると、ＴＭＡＰＰ内に存在する共刺激ポリペプチド（複数可）が、標的Ｔ細胞に送達される。
【０４８７】
例えば、本開示のＴＭＡＰＰを、ｉ）ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープに特異的な標的Ｔ細胞（複数可）と、ｉｉ）非標的Ｔ細胞（複数可）、例えば、ＴＭＡＰＰ中に存在するエピトープではない第２のエピトープ（複数可）に特異的なＴ細胞（複数可）とを含む、Ｔ細胞の集団に接触させる。当該集団に接触させると、ＴＭＡＰＰ中に存在する共刺激ポリペプチド（複数可）（例えば、天然共刺激ポリペプチド（例えば、天然ＩＬ−２）または天然共刺激ポリペプチドの低親和性バリアント（例えば、本明細書で開示されるＩＬ−２バリアント））の選択的送達が標的Ｔ細胞にもたらされる。したがって、例えば、ＴＭＡＰＰに結合するのは、非標的Ｔ細胞の５０％未満、４０％未満、３０％未満、２５％未満、２０％未満、１５％未満、１０％未満、５％未満、または４％未満、３％未満、２％未満または１％未満であり、結果として、共刺激ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２またはＩＬ−２バリアント）は、非標的Ｔ細胞には送達されない。
【０４８８】
いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのものである。いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのものであり、本開示のＴＭＡＰＰに対する標的Ｔ細胞集団の生物学的応答（例えば、Ｔ細胞の活性化および／または増大および／または表現型分化）は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養の環境で惹起される。例えば、Ｔ細胞の混合集団は、個体から取得することができ、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＴＭＡＰＰと接触させることができる。かかる接触は、定められた用量（複数可）および／または曝露スケジュール（複数可）での単回または複数回のＴ細胞の集団の曝露を含み得る。いくつかの場合において、当該接触により、Ｔ細胞の集団内の標的Ｔ細胞の選択的な結合／活性化および／または拡大が生じ、活性化および／または拡大された標的Ｔ細胞の集団が生成される。一例として、Ｔ細胞の混合集団は、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）であり得る。例えば、患者由来のＰＢＭＣは、標準的な採血およびＰＢＭＣ濃縮技術によって取得することができ、その後、標準的なリンパ球培養条件下で０．１〜１０００ｎＭの本開示のＴＭＡＰＰに曝露される。ｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養物中の標的Ｔ細胞の存在量は、定められた用量およびスケジュールでのＴ細胞混合集団の曝露前、曝露中、および曝露後の時点で、特定のペプチド−ＭＨＣ多量体および／または表現型マーカーおよび／または機能活性（例えば、サイトカインＥＬＩＳｐｏｔアッセイ）によってモニタリングすることができる。いくつかの場合において、抗原特異的細胞の最適な存在量および／または表現型がｉｎ  ｖｉｔｒｏで達成されたら、活性化および／または拡大された標的Ｔ細胞の集団の全てまたは一部が個体（Ｔ細胞の混合集団が取得された個体）に投与される。
【０４８９】
いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのものである。例えば、Ｔ細胞の混合集団は、個体から取得され、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで本開示のＴＭＡＰＰと接触させる。かかる接触は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ細胞培養の環境における、定められた用量（複数可）および／または曝露スケジュール（複数可）での単回または複数回のＴ細胞の曝露を含み得、これを使用して、当該Ｔ細胞の混合集団が、ＴＭＡＰＰによって提示されるエピトープに特異的であるＴ細胞を含むかどうかを決定することができる。ＴＭＡＰＰのエピトープに特異的なＴ細胞の存在は、Ｔ細胞の混合集団を含むサンプルを評価することによって決定することができ、Ｔ細胞の集団は、エピトープに特異的でないＴ細胞（非標的Ｔ細胞）を含み、エピトープに特異的なＴ細胞（標的Ｔ細胞）を含み得る。既知のアッセイを使用して、標的Ｔ細胞の活性化および／または増殖を検出することができ、これにより、特定のＴＭＡＰＰが、個体内に存在するＴ細胞に結合するエピトープを保有しているかどうか、ひいては、当該ＴＭＡＰＰが、その個体にとって、治療用組成物としての利用可能性を有するかどうかを決定することができる、ｅｘ  ｖｉｖｏアッセイが提供される。標的Ｔ細胞の活性化および／または増殖を検出するのに好適な既知のアッセイには、例えば、Ｔ細胞の表現型および／または抗原特異性および／または増殖についてのフローサイトメトリーによる特性評価が含まれる。エピトープ特異的Ｔ細胞の存在を検出するそのようなアッセイ、例えば、コンパニオン診断には、ＴＭＡＰＰが標的Ｔ細胞の選択的な結合／活性化および／または拡大をもたらすかどうかを決定するための追加のアッセイ（例えば、エフェクターサイトカインＥＬＩＳｐｏｔアッセイ）および／または適切な対照（例えば、抗原特異的および抗原非特異的な多量体ペプチド−ＨＬＡ染色試薬）が更に含まれ得る。したがって、例えば、本開示は、個体から取得されたＴ細胞の混合集団において、目的のエピトープに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、ａ）Ｔ細胞の混合集団を本開示のＴＭＡＰＰとｉｎ  ｖｉｔｒｏで接触させることであって、多量体ポリペプチドは、目的のエピトープを含む、ことと、ｂ）当該接触に応じたＴ細胞の活性化および／または増殖を検出することであって、活性化および／または増殖されたＴ細胞は、標的Ｔ細胞の存在を示す、こととを含む、方法を提供する。代替的および／または付加的に、ＴＭＡＰＰを使用して所望のＴ細胞集団の活性化および／または拡大（増殖）が得られた場合、活性化／拡大されたＴ細胞を含むＴ細胞の集団の全てまたは一部が、治療として、当該個体に投与され得る。
【０４９０】
いくつかの場合において、Ｔ細胞の集団は、個体におけるｉｎ  ｖｉｖｏのものである。そのような場合、共刺激ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２または低親和性ＩＬ−２）をエピトープ特異的Ｔ細胞に選択的に送達するための本開示の方法は、ＴＭＡＰＰを個体に投与することを含む。
【０４９１】
共刺激ポリペプチド（例えば、ＩＬ−２または低親和性ＩＬ−２）が選択的に送達されるエピトープ特異的Ｔ細胞はまた、本明細書中、「標的Ｔ細胞」とも称される。いくつかの場合において、標的Ｔ細胞は、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である。いくつかの場合において、Ｔｒｅｇは、自己反応性Ｔ細胞の活性を阻害または抑制する。いくつかの場合において、標的Ｔ細胞は、細胞傷害性Ｔ細胞である。例えば、標的Ｔ細胞は、がんエピトープ（例えば、がん細胞によって提示されるエピトープ）に特異的な細胞傷害性Ｔ細胞であり得る。
【０４９２】
本開示の非限定的態様の例
上に記載される本主題の実施形態を含む態様は、単独でも、または１つ以上の他の態様もしくは実施形態との組み合わせでも有益であり得る。前述の説明を限定することなく、１〜１３５の番号を付した本開示のいくつかの非限定的な態様を以下に記載する。本開示を読めば当業者には明らかであるように、個々に番号が付された態様のそれぞれは、個々に番号が付された先行の態様または後述の態様のいずれかとともに使用または組み合わせられてもよい。これは、全てのそのような態様の組み合わせに対する裏付けを提供することを意図しており、以下に明示的に記載される態様の組み合わせに限定されるものではない。
【０４９３】
態様１．多量体抗原提示ポリペプチドであって、ａ）ｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチド、およびｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、第２のポリペプチドと、を含み、当該多量体ポリペプチドは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープを含み、エピトープは、Ａ）第１のポリペプチドのＮ末端、またはＢ）第２のポリペプチドのＮ末端にある、当該多量体抗原提示ポリペプチド。
【０４９４】
態様２．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０４９５】
態様３．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０４９６】
態様４．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０４９７】
態様５．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様１に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０４９８】
態様６．第１のポリペプチドがＣ末端にＩｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、態様１〜５のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０４９９】
態様７．第２のポリペプチドがＣ末端にＩｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、態様１〜５のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５００】
態様８．ａ）第１のポリペプチドが第１の二量体化ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが第２の二量体化ポリペプチドを含む、態様１〜７のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５０１】
態様９．第１および第２の二量体化ポリペプチドが、ロイシンジッパーポリペプチド、コラーゲン二量体化ポリペプチド、またはコイルドコイルポリペプチドである、態様８に記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５０２】
態様１０．ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２〜８のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５０３】
態様１１．ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２〜８のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５０４】
態様１２．ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２〜８のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５０５】
態様１３．ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２〜８のいずれか１つに記載の多量体抗原提示ポリペプチド。
【０５０６】
態様１４．ｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α２ポリペプチド、ｉｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチド、ｉｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β２ポリペプチド、ｖ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、およびｖｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５０７】
態様１５．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α１ポリペプチド、ｉｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α２ポリペプチド、およびｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β２ポリペプチドを含む、態様１４に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５０８】
態様１６．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  β２ポリペプチド、ｉｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α１ポリペプチド、およびｖ）クラスＩＩ  ＭＨＣ  α２ポリペプチドを含む、態様１４に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５０９】
態様１７．Ｃ末端に免疫グロブリンＦｃポリペプチドを含む、態様１５または１６に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１０】
態様１８．リンカーを含む、態様１５に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１１】
態様１９．リンカーが、エピトープとクラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチドとの間にある、態様１８に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１２】
態様２０．リンカーを含む、態様１６に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１３】
態様２１．リンカーが、エピトープとクラスＩＩ  ＭＨＣ  β１ポリペプチドとの間にある、態様２０に記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１４】
態様２２．ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１４〜２１のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１５】
態様２３．ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１４〜２１のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１６】
態様２４．ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１４〜２１のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１７】
態様２５．ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様１４〜２１のいずれか１つに記載の単鎖抗原提示ポリペプチド。
【０５１８】
態様２６．多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドであって、ａ）ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、ｉｉ）第１の主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩポリペプチドを含む、第１のポリペプチドと、ｂ）ｉ）第２のＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、第２のポリペプチドと、を含み、当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドは、１つ以上の免疫調節ドメインを含み、当該多量体ポリペプチドの一方または両方のポリペプチドは、任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、当該多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５１９】
態様２７．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫調節ドメインを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２０】
態様２８．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）免疫調節ドメインを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２１】
態様２９．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）免疫調節ドメイン、およびｖ）第１の二量体化ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２２】
態様３０．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２３】
態様３１．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２４】
態様３２．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｖ）第１の二量体化ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｉｖ）第２の二量体化ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２５】
態様３３．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、およびｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２６】
態様３４．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２７】
態様  ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖ）第１の二量体化ポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２８】
態様３６．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｉｉ）免疫調節ドメイン、およびｉｖ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５２９】
態様３７．ａ）第１のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）第１の二量体化ポリペプチド、およびｖｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含み、ｂ）第２のポリペプチドが、Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ドメイン、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）第２の二量体化ポリペプチドを含む、態様２６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３０】
態様３８．第２のポリペプチドが、２コピーの免疫調節ドメインを含む、態様３７に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３１】
態様３９．リンカーを含む、態様２６〜３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３２】
態様４０．ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２６〜３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３３】
態様４１．ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２６〜３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３４】
態様４２．ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２６〜３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３５】
態様４３．ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様２６〜３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３６】
態様４４．免疫調節ポリペプチドが、天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含む、態様２６〜３８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３７】
態様４５．免疫調節ポリペプチドが、ＩＬ−２、４−１ＢＢＬ、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８０、ＣＤ８６、Ｂ７−１、ＩＣＯＳ−Ｌ、ＯＸ−４０Ｌ、ＦａｓＬ、ＴＧＦβ、ＪＡＧ１、ＣＤ７０、ＩＣＡＭ、およびＰＤ−Ｌ２からなる群から選択される、態様４４に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３８】
態様４６．免疫調節ポリペプチドが、天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して１〜１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含むバリアント免疫調節ポリペプチドであり、バリアント免疫調節ポリペプチドは、免疫共調節ポリペプチドに対する天然免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、当該免疫共調節ポリペプチドに対する低下した親和性を有する、態様２６〜４５のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５３９】
態様４７．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドである、態様４６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４０】
態様４８．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである、態様４６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４１】
態様４９．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＩＬ−２ポリペプチドである、態様４６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４２】
態様５０．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである、態様４６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４３】
態様５１．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドである、態様４６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４４】
態様５２．多量体ポリペプチドが、２つの免疫調節ポリペプチドを含む、態様２６〜５１のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４５】
態様５３．２つの免疫調節ポリペプチドが、同じポリペプチド鎖上にある、態様５２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４６】
態様５４．２つの免疫調節ポリペプチドが、別個のポリペプチド鎖上にある、態様５２に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４７】
態様５５．２つの免疫調節ポリペプチドが、同じアミノ酸配列を含む、態様５２〜５４のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４８】
態様５６．多量体ポリペプチドが、ａ）エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ｂ）任意の２つの隣接するＭＨＣポリペプチドの間、ｃ）ＭＨＣポリペプチドとＦｃポリペプチドとの間、およびｄ）２つの隣接する免疫調節ポリペプチドの間のうちの１つ以上にペプチドリンカーを含む、態様２６〜５５のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５４９】
態様５７．リンカーが２０アミノ酸〜４０アミノ酸の長さを有する、態様５６に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５０】
態様５８．リンカーが、式（ＧＧＧＧＳ）ｎ（ＳＥＱ  ＩＤ  ＮＯ：７５）（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）のペプチドである、５６または５７に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５１】
態様５９．ｉ）Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）が結合することが可能なエピトープ、ｉｉ）主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）クラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖｉ）免疫調節ポリペプチド、およびｖｉｉ）任意選択により、免疫グロブリン（Ｉｇ）Ｆｃポリペプチドまたは非Ｉｇ骨格を含む、単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５２】
態様６０．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉ）免疫調節ポリペプチドを含む、態様５９に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５３】
態様６１．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）第１の免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、ｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、およびｖｉｉ）第２の免疫調節ポリペプチドを含み、第１および第２の免疫調節ポリペプチドは、同じアミノ酸配列を含む、態様５９に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５４】
態様６２．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）エピトープ、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドを含む、態様５９に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５５】
態様６３．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチド、およびｖｉ）免疫調節ポリペプチドを含む、態様５９に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５６】
態様６４．Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）エピトープ、ｉｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様５９に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５７】
態様６５／Ｎ末端からＣ末端の順に、ｉ）免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）エピトープ、ｉｉｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチド、ｉｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチド、ｖ）ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチド、およびｖｉ）ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドを含む、態様５９に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５８】
態様６６．ＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５９〜６５のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５５９】
態様６７．ＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドが、図６、１１、１３、１５、１７、および１８のいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  α２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５９〜６５のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６０】
態様６８．ＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β１ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５９〜６５のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６１】
態様６９．ＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドが、図７Ａ〜７Ｊ、図８Ａ〜８Ｂ、図９、図１０、図１２、図１４、図１６、図１９Ａ〜１９Ｂ、および図２０Ａ〜２０Ｂのいずれか１つに記載されるＭＨＣクラスＩＩ  β２ポリペプチドに対して、少なくとも９５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、態様５９〜６５のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６２】
態様７０．免疫調節ポリペプチドが、天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列を含む、態様５９〜６９のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６３】
態様７１．免疫調節ポリペプチドが、ＩＬ−２、４−１ＢＢＬ、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８０、ＣＤ８６、Ｂ７−１、ＩＣＯＳ−Ｌ、ＯＸ−４０Ｌ、ＦａｓＬ、ＪＡＧ１、ＴＧＦβ、ＣＤ７０、ＩＣＡＭ、およびＰＤ−Ｌ２からなる群から選択される、態様７０に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６４】
態様７２．免疫調節ポリペプチドが、天然免疫調節ポリペプチドのアミノ酸配列と比較して１〜１０のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列を含むバリアント免疫調節ポリペプチドであり、バリアント免疫調節ポリペプチドは、免疫共調節ポリペプチドに対する天然免疫調節ポリペプチドの親和性と比較して、当該免疫共調節ポリペプチドに対する低下した親和性を有する、態様５９〜６９のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６５】
態様７３．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアント４−１ＢＢＬポリペプチドである、態様７２に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６６】
態様７４．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８０ポリペプチドである、態様７２に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６７】
態様７５．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＩＬ−２ポリペプチドである、態様７２に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６８】
態様７６．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＣＤ８６ポリペプチドである、態様７２に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５６９】
態様７７．バリアント免疫調節ポリペプチドが、バリアントＰＤ−Ｌ１ポリペプチドである、態様７２に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７０】
態様７８．２つの免疫調節ポリペプチドを含む、態様５９〜７７のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７１】
態様７９．２つの免疫調節ポリペプチドが、同じアミノ酸配列を含む、態様７８に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７２】
態様８０．多量体ポリペプチドが、ａ）エピトープとＭＨＣポリペプチドとの間、ｂ）任意の２つの隣接するＭＨＣポリペプチドの間、ｃ）ＭＨＣポリペプチドとＦｃポリペプチドとの間、およびｄ）２つの隣接する免疫調節ポリペプチドの間のうちの１つ以上にペプチドリンカーを含む、態様５９〜７９のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７３】
態様８１．リンカーが２０アミノ酸〜４０アミノ酸の長さを有する、態様８０に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７４】
態様８２．リンカーが、式（ＧＧＧＧＳ）ｎ（式中、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、または８である）のペプチドである、態様８０または態様８１に記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７５】
態様８３．Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含み、Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドは、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ２  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ３  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＧ４  Ｆｃポリペプチド、ＩｇＡ  Ｆｃポリペプチド、またはＩｇＭ  Ｆｃポリペプチドである、態様２６〜５８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは態様５９〜８２のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７６】
態様８４．薬物がＩｇ  Ｆｃポリペプチドにコンジュゲートされる、態様８３に記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７７】
態様８５．エピトープが、がんエピトープである、態様２６〜５８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは態様５９〜８２のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７８】
態様８６．エピトープが、自己エピトープである、態様２６〜５８のいずれか１つに記載の多量体Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドまたは態様５９〜８２のいずれか１つに記載の単鎖Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド。
【０５７９】
態様８７．ａ）態様１〜８６のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドと、ｂ）バッファーとを含む、組成物。
【０５８０】
態様８８．ａ）態様２６〜８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、ｂ）薬学的に許容される賦形剤とを含む、組成物。
【０５８１】
態様８９．ａ）態様２６〜８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと、ｂ）生理食塩水とを含む、組成物。
【０５８２】
態様９０．生理食塩水が０．９％ＮａＣｌである、態様８９に記載の組成物。
【０５８３】
態様９１．無菌である、態様８９または態様９０に記載の組成物。
【０５８４】
態様９２．態様１〜２５のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
【０５８５】
態様９３．態様９２に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の組み換え発現ベクター。
【０５８６】
態様９４．態様９２に記載の１つ以上の核酸または態様９３に記載の１つ以上の組み換え発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
【０５８７】
態様９５．真核細胞である、態様９４に記載の宿主細胞。
【０５８８】
態様９６．態様２６〜８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む、１つ以上の核酸。
【０５８９】
態様９７．態様９６に記載の１つ以上の核酸を含む、１つ以上の組み換え発現ベクター。
【０５９０】
態様９８．態様９１に記載の１つ以上の核酸または態様９７に記載の１つ以上の組み換え発現ベクターにより遺伝子改変された、宿主細胞。
【０５９１】
態様９９．真核細胞である、態様９８に記載の宿主細胞。
【０５９２】
態様１００．抗原特異的Ｔ細胞を検出する方法であって、Ｔ細胞を態様１〜２５のいずれか１つに記載の抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、Ｔ細胞に対する抗原提示ポリペプチドの結合は、Ｔ細胞が抗原提示ポリペプチドに存在するエピトープに特異的であることを示す、当該方法。
【０５９３】
態様１０１．抗原提示ポリペプチドが、検出可能な標識を含む、態様１００に記載の方法。
【０５９４】
態様１０２．検出可能な標識が、放射性同位体、蛍光ポリペプチド、または蛍光産物を生成する酵素、有色産物を生成する酵素である、態様１０１に記載の方法。
【０５９５】
態様１０３．Ｔ細胞に対する抗原提示ポリペプチドの結合が、検出可能に標識された、抗原提示ポリペプチドに特異的な抗体を使用して検出される、態様１００に記載の方法。
【０５９６】
態様１０４．Ｔ細胞が、複数のＴ細胞を含むサンプル中に存在する、態様１００〜１０２のいずれか１つに記載の方法。
【０５９７】
態様１０５．エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する方法であって、Ｔ細胞を態様２６〜８２のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、当該接触は、エピトープ特異的Ｔ細胞の活性を選択的に調節する、当該方法。
【０５９８】
態様１０６．当該接触させることが、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで行われる、態様１０５に記載の方法。
【０５９９】
態様１０７．当該接触させることが、ｉｎ  ｖｉｖｏで行われる、態様１０５に記載の方法。
【０６００】
態様１０８．Ｔ細胞が制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）である、態様１０５〜１０７のいずれか１つに記載の方法。
【０６０１】
態様１０９．当該接触させることが、Ｔｒｅｇを活性化し、自己反応性Ｔ細胞の活性を低下させる、態様１０８に記載の方法。
【０６０２】
態様１１０．Ｔ細胞がＣＤ４＋Ｔヘルパー細胞であり、当該接触させることがＣＤ４＋Ｔ細胞を活性化する、態様１０５〜１０９のいずれか１つに記載の方法。
【０６０３】
態様１１１．当該活性化したＣＤ４＋Ｔ細胞が、ＣＤ８＋Ｔ細胞を活性化する、態様１０９に記載の方法。
【０６０４】
態様１１２．ＣＤ８＋Ｔ細胞が、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドによって提示されるがんエピトープに特異的である、態様１０６に記載の方法。
【０６０５】
態様１１３．Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドをそれを必要とする個体に投与することを含む、態様１０６および１０７〜１１２のいずれか１つに記載の方法。
【０６０６】
態様１１４．当該投与することが全身投与である、態様１１３に記載の方法。
【０６０７】
態様１１５．当該投与することが局所投与である、態様１１３に記載の方法。
【０６０８】
態様１１６．当該投与することが腫瘍近傍の投与である、態様１１３に記載の方法。
【０６０９】
態様１１７．当該投与することが静脈内投与によるものである、態様１１３に記載の方法。
【０６１０】
態様１１８．当該個体がヒトである、態様１０５〜１１７のいずれか１つに記載の方法。
【０６１１】
態様１１９．当該個体が自己免疫疾患を有する、態様１１８に記載の方法。
【０６１２】
態様１２０．当該個体ががんを有する、態様１１８に記載の方法。
【０６１３】
態様１２１．治療方法であって、それを必要とする個体に、態様２６〜８２のいずれか１つに記載の有効量のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドを投与することを含み、当該投与は、個体を治療する、当該治療方法。
【０６１４】
態様１２２．個体ががんを有し、当該投与することががんを治療する、態様１２１に記載の方法。
【０６１５】
態様１２３．個体が自己免疫障害を有し、当該投与することが自己免疫障害を治療する、態様１２１に記載の方法。
【０６１６】
態様１２４．当該投与することが静脈内投与によるものである、態様１２１〜１２３のいずれか１つに記載の方法。
【０６１７】
態様１２５．当該投与することが局所投与によるものである、態様１２１〜１２３のいずれか１つに記載の方法。
【０６１８】
態様１２６．当該投与することが全身投与によるものである、態様１２１〜１２３のいずれか１つに記載の方法。
【０６１９】
態様１２７．Ｔ細胞を標的とするように共刺激ポリペプチドを選択的に送達する方法であって、Ｔ細胞の混合集団を態様２６〜８６のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドと接触させることを含み、Ｔ細胞の混合集団は、標的Ｔ細胞と非標的Ｔ細胞とを含み、標的Ｔ細胞は、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド内に存在するエピトープに特異的であり、当該接触は、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチド内に存在する共刺激ポリペプチドを標的Ｔ細胞に送達する、当該方法。
【０６２０】
態様１２８．Ｔ細胞の集団は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏのものである、態様１２７に記載の方法。
【０６２１】
態様１２９．Ｔ細胞の集団は、個体におけるｉｎ  ｖｉｖｏのものである、態様１２７に記載の方法。
【０６２２】
態様１３０．Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドを個体に投与することを含む、態様１２９に記載の方法。
【０６２３】
態様１３１．標的Ｔ細胞が制御性Ｔ細胞である、態様１２７〜１３０のいずれか１つに記載の方法。
【０６２４】
態様１３２．標的Ｔ細胞が細胞傷害性Ｔ細胞である、態様１２７〜１３０のいずれか１つに記載の方法。
【０６２５】
態様１３３．Ｔ細胞の混合集団が、個体から取得されたｉｎ  ｖｉｔｒｏのＴ細胞の混合集団であり、当該接触させることが、標的Ｔ細胞の活性化および／または増殖をもたらし、活性化および／または増殖された標的Ｔ細胞の集団を生成する、態様１２７または１２８に記載の方法。
【０６２６】
態様１３４．活性化および／または増殖された標的Ｔ細胞の集団を個体に投与することを更に含む、態様１３３に記載の方法。
【０６２７】
態様１３５．個体から取得されたＴ細胞の混合集団において、目的のエピトープに結合する標的Ｔ細胞の存在を検出する方法であって、ａ）Ｔ細胞の混合集団を態様２６〜８６のいずれか１つに記載のＴ細胞調節抗原提示ポリペプチドとｉｎ  ｖｉｔｒｏで接触させることであって、Ｔ細胞調節抗原提示ポリペプチドは、目的のエピトープを含む、ことと、ｂ）当該接触に応じたＴ細胞の活性化および／または増殖を検出することであって、活性化および／または増殖されたＴ細胞は、標的Ｔ細胞の存在を示す、ことと、を含む、当該方法。
【実施例】
【０６２８】
以下の実施例は、本発明の実施法および使用法に関する完全な開示と説明を当業者に提供するために記載されるものであり、発明者らが発明とみなすものの範囲を限定するものでも、以下の実験が行われた実験の全てであることまたは以下の実験のみが行われたことを示すものでもない。使用される数（例えば量、温度など）に関しては、正確さを確保するように努めたが、多少の実験誤差および偏差を考慮されたい。別途指定のない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量であり、温度は摂氏度であり、圧力は大気圧または略大気圧である。標準的な略語、例えば、ｂｐ：塩基対、ｋｂ：キロベース、ｐｌ：ピコリットル、ｓまたはｓｅｃ：秒、ｍｉｎ：分、ｈまたはｈｒ：時間、ａａ：アミノ酸、ｋｂ：キロベース、ｂｐ：塩基対、ｎｔ：ヌクレオチド、ｉ．ｍ．：筋肉内、ｉ．ｐ．：腹腔内、ｓ．ｃ．：皮下などが使用され得る。
【０６２９】
実施例１：抗原提示ポリペプチドの産生
安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドの産生を最適化するために、ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む、様々な構造配置の抗原提示ポリペプチドを合成し、発現させ、プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製した。
【０６３０】
使用した発現ベクターは、ｐＤ２６１０−ｖ１０：ＣＭＶ（ｖ１０）−ＯＲＦ、Ｍａｍｍ−ＥｌｅｃＤ（ＡＴＵＭ社製）であった。抗原提示ポリペプチド（複数可）（例えば、ＭＨＣクラスＩＩ  ｓｙｎＴａｃ）をコードするヌクレオチド配列を含む核酸を発現ベクターに挿入して、抗原提示ポリペプチド（複数可）（例えば、ＭＨＣクラスＩＩ  ｓｙｎＴａｃ）をコードする組み換え発現ベクターを生成した。組み換え発現ベクターを、標準的な方法を使用して、ＥｘｐｉＣＨＯ細胞（Ｔｈｅｒｍｏ；改変チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞；例えば、Ｊａｉｎ  ｅｔ  ａｌ．（２０１７）Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｅｘｐｒ．Ｐｕｒｉｆ．１３４：３８参照）に導入し、遺伝子改変されたＥｘｐｉＣＨＯ細胞を生成した。遺伝子改変されたＥｘｐｉＣＨＯ細胞を標準的な培地中でｉｎ  ｖｉｔｒｏ培養した。遺伝子改変されたＥｘｐｉＣＨＯ細胞によって、抗原提示ポリペプチド（複数可）（例えば、ＭＨＣクラスＩＩ  ｓｙｎＴａｃ）が産生され、培地中に分泌された。プロテインＡアフィニティークロマトグラフィーを使用して、抗原提示ポリペプチド（複数可）（例えば、ＭＨＣクラスＩＩ  ｓｙｎＴａｃ）を培地から精製した。
【０６３１】
簡潔に述べれば、５ｍＬのｍＡｂ  Ｓｅｌｅｃｔ  ＳｕＲｅが予め充填されたカラム（ＧＥカタログ番号１１００３４９５）（ビーズに結合されたプロテインＡ）を使用した。使用した流量は、１．０ｍＬ／分であった。培地を１．０ｍＬ／分でカラムにロードした。カラムは、培地をロードする前に、カラム容積（ＣＶ）５倍の平衡バッファー（１×リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）、２０ｍＭ  ＥＤＴＡ）で平衡化した。カラムに培地をロードしたら、カラムをＣＶ５倍の平衡バッファーで洗浄し、次いで、ＣＶ１０倍の洗浄バッファー（１×ＰＢＳ＋８６３ｍＭ  ＮａＣｌ（合計ＮａＣｌ  １Ｍ）、５ｍＭＥＤＴＡ）で洗浄した。次に、カラムをＣＶ５倍の平衡バッファーで洗浄した。最後に、カラムに結合した抗原提示ポリペプチド（複数可）（例えば、ＭＨＣクラスＩＩ  ｓｙｎＴａｃ）を溶出バッファー（５０ｍＭグリシン、ｐＨ２．８、５００ｍＭ  ＮａＣｌ）で溶出し、２５ｍＬのフラクションを回収した。回収したフラクションに中和バッファー（Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、ｐＨ９．０）を添加した。ピークフラクションをプールし、透析バッファー（ＰＢＳ＋３６３ｍＭ  ＮａＣｌ）に対して透析し、次いで、濃縮した。次いで、濃縮した生成物をサイズ排除クロマトグラフィーに供した。
【０６３２】
ＭＨＣクラスＩＩ  ｓｙｎＴａｃｓの設計にあたり、ばらつきのあったパラメーターには、ＭＨＣクラスＩＩアルファ鎖およびベータ鎖の向き、Ｆｃの配置、ＩＬ２（ＭＯＤ）の配置、ならびに各種リンカーの長さおよび内容が含まれた。示されるバリアントは、単鎖型および二本鎖型を含み、そのそれぞれは、図２４に模式的に示されるように、α−１ドメインのＮ末端に連結されたＭＨＣクラスＩＩ  β−１ドメインと、α−２のＣ末端または別個の鎖上にあるβ−２と、を含む。β−２ドメインまたはＩＬ２融合ありおよびなしの単鎖バリアントが示されており、また、ｂＺＩＰ二量体化ドメインありおよびなしの２本鎖型も示されている。ヘマグルチニン（ＨＡ）ペプチドエピトープの代わりにＣＭＶペプチドエピトープを含む２本鎖型が示され、また、ＭＨＣクラスＩＩ  ＤＲ１アレルの代わりにＤＲ４を含み、プロインスリンペプチドを含む型も示される。
【０６３３】
免疫調節ポリペプチドありまたはなしの抗原提示ポリペプチドを生成した。抗原提示ポリペプチドのアミノ酸配列、および当該ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を図２５〜３５に記載する。ポリペプチドには、単鎖ポリペプチドおよび多量体ポリペプチドが含まれた。抗原提示ポリペプチドを以下に示す：
【０６３４】
１）１５９９−これは、バリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチドを含む単鎖ポリペプチドである。１５９９ポリペプチドは、ＨＬＡ  β２ポリペプチドも含む。１５９９ポリペプチドは、ｉ）エピトープ（ヘマグルチニンエピトープ）、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１およびα２、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２、ｖ）バリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチド、ならびにｖ）ＩｇＧ１  Ｆｃを含む。
【０６３５】
２）１５５９−これは、ＨＬＡ  β２ポリペプチドを含む単鎖ポリペプチドである。１５５９ポリペプチドは、免疫調節ポリペプチドを含まない。１５５９ポリペプチドは、ｉ）エピトープ（ヘマグルチニン（ＨＡ）エピトープ）、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１およびα２、ｉｖ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２、ならびにｖ）ＩｇＧ１  Ｆｃを含む。
【０６３６】
３）１６０１−これは、単鎖ポリペプチドのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチドである。１６０１ポリペプチドは、ＨＬＡ  β２ポリペプチドを含まない。１６０１ポリペプチドは、ｉ）エピトープ（ヘマグルチニンエピトープ）、ｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１、ｉｉｉ）ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１およびα２、ｉｖ）２コピーのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチド、ならびにｖ）ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０６３７】
４）１４５２＋１６６１−これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。エピトープは、ヘマグルチニンエピトープである。ＨＬＡ  ＤＲＢ１およびＤＲＡ  ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。両ポリペプチド鎖は、ロイシンジッパー二量体化ペプチドを含む。１４５２ポリペプチドは、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０６３８】
５）１６５９＋１６６４−これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ  ＤＲＢ１およびＤＲＡ  ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、ヘマグルチニンエピトープである。１６６４ポリペプチドは、２コピーのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチドを含む。両ポリペプチド鎖は、ロイシンジッパー二量体化ペプチドを含まない。１６５９ポリペプチドは、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０６３９】
６）１６３７＋１４０８−これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ  ＤＲＢ１およびＤＲＡ  ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、ＣＭＶエピトープである。１４０８ポリペプチドは、２コピーのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチドを含む。両鎖は、ロイシンジッパー（ｂＺＩＰ）を含む。１６３７ポリペプチドは、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０６４０】
７）１６３９＋１６４０−これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ  ＤＲＢ１−４およびＤＲＡ  ＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、プロインスリンエピトープである。両鎖は、ロイシンジッパー（ｂＺＩＰ）を含む。１６４０鎖は、２コピーのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチドを含む。１６３９ポリペプチドは、ＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む。
【０６４１】
上記のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む発現コンストラクトを哺乳類細胞株に導入した。産生されたポリペプチドを還元ポリアクリルアミドゲルにロードした。図４Ａ〜４Ｂは、図４Ｃに記載される様々な多量体ポリペプチドのゲル解析（図４Ａ）および発現レベル（図４Ｂ）を示す。図２４の左パネルに示されるように、全てのポリペプチドが検出可能な量で産生された。各種コンストラクトを図２４の右パネルに模式的に示す。
【０６４２】
β−２ドメインを含まない単鎖型（ＩＬ２を含む）は、プロテインＡ精製をすると、ロバストな発現レベルを示し、均一でインタクトな産物であった（レーン３）。解析ゲルで観察される顕著な分解産物によって示されるように、β−２ドメインの追加により、分子の発現低下および不安定化が生じた（レーン１）。ＩＬ２を除去すると（β−２は保持したまま）、更に発現が低下したが、分解産物は最小であった（レーン２）。
【０６４３】
β−２ドメインが別個の鎖上にある場合、ｂＺＩＰロイシンジッパー二量体化ドメインの組み込みにより、ロバストな組み立てが観察された（レーン５）。ｂＺＩＰドメインを含まない場合、インタクトなＦｃ含有鎖の中程度の発現と産生が観察され、β−２鎖が組み込まれた（レーン４）。二本鎖ｂＺＩＰモデルのＨＡペプチドをＣＭＶペプチドに変更すると、インタクト産物の発現は、極めてロバストであった（レーン６）。β−２アレルをＤＲ１からＤＲ４に変え、プロインスリンペプチドを加えた場合でも、インタクト産物の発現は、ロバストであった（レーン７）。
【０６４４】
１６３９＋１６４０多量体抗原提示ポリペプチドの産生を図３９に示す。プロテインＡカラムでのシングルステップ精製後の還元条件および非還元条件下におけるクマシー染色ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルを示す。ゲルは、６９．５ｋＤの１６３９鎖および５１．３ｋＤの１６４０鎖を示す。ゲルの密度スキャンは、１６３９＋１６３０多量体ポリペプチドが約７９ｍｇ／Ｌで産生されたことを示した。
【０６４５】
したがって、安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドが合成され、発現し、精製された。これらは、単鎖系または二本鎖系のいずれかを組み込んだ設計モデルを表した。二本鎖系を使用する場合、β−２ドメインおよび二量体化ドメインの両方の組み込みは、ロバストな発現をもたらした。ＭＨＣへの結合のために選択されたペプチドは、安定化を提供することができた。更に、２つの異なるＭＨＣアレルのＭＨＣクラスＩＩポリペプチドを用いると、安定したインタクトなＭＨＣクラスＩＩ抗原提示ポリペプチドが生成された。
【０６４６】
実施例２：更なる抗原提示ポリペプチド
Ｔ細胞調節抗原提示多量体ポリペプチドをコードするコンストラクトを生成し、第１のポリペプチドは、ｉ）エピトープ、ｉｉ）ＨＬＡ  β１ポリペプチド、ｉｉｉ）ＨＬＡ  α１ポリペプチド、およびｉｖ）ＨＬＡ  α２ポリペプチドを含み、第２のポリペプチドは、ｉ）２コピーのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチド、ｉｉ）ＨＬＡ  β２ポリペプチド、およびｉｉｉ）Ｉｇ  Ｆｃポリペプチドを含んだ。
【０６４７】
当該コンストラクトによってコードされる多量体ポリペプチドを実施例１に記載されているように産生し、そのようにして産生された多量体ポリペプチドを解析した。図３６は、多量体ポリペプチドを模式的に示す。
【０６４８】
１）１７１１＋１７０５−これは、多量体抗原提示ポリペプチドである。ＨＬＡ  ＤＲＢ１クラスＩＩポリペプチドを含む。エピトープは、ヘマグルチニンエピトープである。１７１１ポリペプチドは、２コピーのバリアントＩＬ−２免疫調節ポリペプチド、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチド、およびＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドを含む。１７０５ポリペプチドは、エピトープ提示ペプチド、ＨＬＡ  ＤＲＢ１  β１ポリペプチド、ＨＬＡ  ＤＲＡ  α１ポリペプチド、およびＨＬＡ  ＤＲＡ  α２ポリペプチドを含む。
【０６４９】
２）１７０９＋１７０５。この多量体ポリペプチドは、１７１１＋１７０５と同様であるが、１７０９ポリペプチドは、いかなる免疫調節ポリペプチドも含まない点で異なる。したがって、１７０９ポリペプチドは、１７１１ポリペプチド中に存在するＨＬＡ  ＤＲＢ１  β２ポリペプチドおよびＩｇＧ１  Ｆｃポリペプチドのみを含む。
【０６５０】
発現結果を図３６に記載する。ゲル解析は、インタクトなポリペプチドが生成されたことを示している。発現レベルは、１０〜１５ｍｇ／Ｌであった。３５ｋＤバンドにはＦｃ分解産物が含まれるが、ウェスタンブロット解析では、３５ｋＤバンドにペプチド−β１−α１−α２鎖も含まれることが示された。
【０６５１】
本発明について、その具体的な実地形態を参照しながら説明してきたが、当業者であれば、本発明の本来の趣旨および範囲から逸脱することなく、種々の変更を行うことができ、等価物を代わりに使用できることが理解されよう。更に、特定の状況、材料、物質の組成、プロセス、１つまたは複数のプロセスステップを本発明の目的、趣旨および範囲に適合させるように、多くの改変を行ってもよい。こうした改変は全て、本明細書に添付される特許請求の範囲に含まれるものとする。
【図１】
2021500855.tif 000311
【図２Ａ】
2021500855.tif 000312
【図２Ｂ】
2021500855.tif 000313
【図２Ｃ】
2021500855.tif 000314
【図３Ａ】
2021500855.tif 000315
【図３Ｂ】
2021500855.tif 000316
【図４Ａ】
2021500855.tif 000317
【図４Ｂ】
2021500855.tif 000318
【図４Ｃ】
2021500855.tif 000319
【図５Ａ】
2021500855.tif 000320
【図５Ｂ】
2021500855.tif 000321
【図６】
2021500855.tif 000322
【図７−１】
2021500855.tif 000323
【図７−２】
2021500855.tif 000324
【図７−３】
2021500855.tif 000325
【図８Ａ】
2021500855.tif 000326
【図８Ｂ】
2021500855.tif 000327
【図８Ｃ】
2021500855.tif 000328
【図９】
2021500855.tif 000329
【図１０】
2021500855.tif 000330
【図１１】
2021500855.tif 000331
【図１２】
2021500855.tif 000332
【図１３】
2021500855.tif 000333
【図１４】
2021500855.tif 000334
【図１５】
2021500855.tif 000335
【図１６】
2021500855.tif 000336
【図１７】
2021500855.tif 000337
【図１８】
2021500855.tif 000338
【図１９】
2021500855.tif 000339
【図２０】
2021500855.tif 000340
【図２１−１】
2021500855.tif 000341
【図２１−２】
2021500855.tif 000342
【図２１−３】
2021500855.tif 000343
【図２１−４】
2021500855.tif 000344
【図２２−１】
2021500855.tif 000345
【図２２−２】
2021500855.tif 000346
【図２２−３】
2021500855.tif 000347
【図２３】
2021500855.tif 000348
【図２４】
2021500855.tif 000349
【図２５Ａ】
2021500855.tif 000350
【図２５Ｂ】
2021500855.tif 000351
【図２６Ａ】
2021500855.tif 000352
【図２６Ｂ】
2021500855.tif 000353
【図２７Ａ】
2021500855.tif 000354
【図２７Ｂ】
2021500855.tif 000355
【図２８Ａ】
2021500855.tif 000356
【図２８Ｂ】
2021500855.tif 000357
【図２９Ａ】
2021500855.tif 000358
【図２９Ｂ】
2021500855.tif 000359
【図３０Ａ】
2021500855.tif 000360
【図３０Ｂ】
2021500855.tif 000361
【図３１Ａ】
2021500855.tif 000362
【図３１Ｂ】
2021500855.tif 000363
【図３２Ａ】
2021500855.tif 000364
【図３２Ｂ】
2021500855.tif 000365
【図３３Ａ】
2021500855.tif 000366
【図３３Ｂ】
2021500855.tif 000367
【図３４Ａ】
2021500855.tif 000368
【図３４Ｂ】
2021500855.tif 000369
【図３５Ａ】
2021500855.tif 000370
【図３５Ｂ】
2021500855.tif 000371
【図３６】
2021500855.tif 000372
【図３７Ａ】
2021500855.tif 000373
【図３７Ｂ】
2021500855.tif 000374
【図３８Ａ】
2021500855.tif 000375
【図３８Ｂ】
2021500855.tif 000376
【図３９】
2021500855.tif 000377
【配列表】
2021500855000001.app
【国際調査報告】
2021500855.tif 000378
2021500855.tif 000379
2021500855.tif 000380
2021500855.tif 000381
2021500855.tif 000382
2021500855.tif 000383