(57)【要約】  本発明は、レトロウイルスパッケージングベクターの産生における使用を目的としたウイルス遺伝子またはその誘導体を含む核酸分子、およびレトロウイルスパッケージングおよびプロデューサー細胞株に関する。１つの実施形態において核酸分子は、ｅｎｖとｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子のコード配列が反対方向にあるｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む。【選択図】図３
2021502799.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
二重鎖核酸分子であって：
（ａ）ｅｎｖ遺伝子を含む第１の核酸；および
（ｂ）ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む第２の核酸を含み；
前記の第１および第２の核酸のコード配列が前記二重鎖核酸分子の対向鎖上にあり、前記のｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子が第１および第２の誘導可能プロモーターとそれぞれ独立して機能的に関連し、前記の第１および第２のプロモーターが９５％未満のヌクレオチド配列同一性をその間に有し、且つ前記二重鎖核酸分子がアポトーシス阻害物質をコードするヌクレオチド配列を１つ以上含む前記二重鎖核酸分子。
【請求項２】
請求項１に記載の二重鎖核酸分子であって、前記第１および第２のプロモーターの間の前記ヌクレオチド配列同一性が９０％、８５％、８０％、７０％または６０％未満である前記二重鎖核酸分子。
【請求項３】
請求項１または請求項２に記載の二重鎖核酸分子であって、前記ｅｎｖ遺伝子がＶＳＶ−Ｇ遺伝子である前記二重鎖核酸分子。
【請求項４】
前述の請求項のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子であって、前記ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子がＨＩＶ−１に由来するか、またはその誘導体である前記二重鎖核酸分子。
【請求項５】
前述の請求項のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子であって、前記核酸分子がｒｅｖ遺伝子を追加的に含む前記二重鎖核酸分子。
【請求項６】
前述の請求項のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子であって、前記核酸分子が導入遺伝子を追加的に含む前記二重鎖核酸分子。
【請求項７】
前述の請求項のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子であって、前記核酸分子がアポトーシス阻害物質をコードする１つまたは２つのヌクレオチド配列を含む前記二重鎖核酸分子。
【請求項８】
前述の請求項のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子であって、前記アポトーシス阻害物質がセロウイルスＧＡＭ１、アデノウイルスＥ４  Ｏｒｆ６、アデノウイルスＥ１Ｂ  ５５Ｋ、アデノウイルスＥ１Ｂ  １９Ｋ、粘液腫ウイルスＭ１１Ｌ、サイトメガロウイルスＩＥ１、サイトメガロウイルスＩＥ２、バキュロウイルスｐ３５、バキュロウイルスＩＡＰ−１、ヘルペスウイルスＵＳ３、サルヘルペスウイルスＯＲＦ１６、単純ヘルペス２  ＬＡＴ  ＯＲＦ１、ヒトＸＩＡＰ、アフリカブタ熱ＡＳＦＶ−５−ＨＬ（ＬＭＷ−５−ＨＬ／Ａ１７９Ｌ）、カポジ肉腫ウイルスＫＳｂｃｌ２、ワクシニアウイルスＳＰＩ−２、牛痘ウイルスＣｒｍＡ、エプスタインバーウイルスＢＨＲＦ１、エプスタインバーウイルスＥＢＮＡ−５、エプスタインバーウイルスＢＺＬＦ−１、パピローマウイルスＥ６、ヒトＡｖｅｎ、ヒトＢＣＬ２およびヒトＢＣＬ−ＸＬからなる群から選択される前記二重鎖核酸分子。
【請求項９】
請求項７に記載の二重鎖核酸分子であって、前記核酸分子がアポトーシス阻害物質ＩＡＰ１およびＥＢＮＡ５；ＩＡＰ１およびＢＣＬ−ＸＬ；またはＥＢＮＡ５およびＢＣＬ−ＸＬをコードするヌクレオチド配列を含む前記二重核酸分子。
【請求項１０】
前述の請求項のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子を含む、レトロウイルスベクター、より好ましくはレンチウイルスベクター。
【請求項１１】
請求項１から９のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸を含む哺乳類細胞であって、好ましくは前記二重鎖核酸が前記哺乳類細胞の核ゲノムに安定的に組込まれる前記哺乳類細胞。
【請求項１２】
請求項１から９のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子を含むレトロウイルスパッケージング細胞。
【請求項１３】
キットであって：
（ｉ）請求項１から９のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸を含むレトロウイルスパッケージングベクターを、
以下のうち１つ以上と共に含むキット：
（ｉｉ）導入遺伝子およびレトロウイルスｒｅｖ遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクター；
（ｉｉｉ）ウイルス粒子の産生に適した細胞株の細胞。
【請求項１４】
キットであって：
（ｉ）ｒｅｖ遺伝子を追加的に含む請求項１から９のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸を含むレトロウイルスパッケージングベクターを、
以下のうち１つ以上と共に含むキット：
（ｉｉ）導入遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクター；
（ｉｉｉ）ウイルス粒子の産生に適した細胞株の細胞。
【請求項１５】
レトロウイルスパッケージング細胞を生成するためのプロセスであって、前記プロセスが：
（ｉ）哺乳類細胞に請求項１から９のうちいずれか１つに記載の二重鎖核酸分子を安定的に組込み、
それによりレトロウイルスｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子、および任意にｒｅｖ遺伝子を発現する哺乳類細胞を生成する段階を含む前記プロセス。
【請求項１６】
レトロウイルス粒子の産生における請求項１２に記載のレトロウイルスパッケージング細胞の使用。
【請求項１７】
レトロウイルスを産生するためのプロセスであって、前記プロセスが：
（ａ）５’および３’レトロウイルスＬＴＲおよびレトロウイルスパッケージングシグナルおよびレトロウイルスｒｅｖ遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクターを請求項１２に記載のレトロウイルスパッケージング細胞に導入する段階であって、前記レトロウイルスパッケージング細胞がそのゲノムに安定的に組込まれたレトロウイルスｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む段階；
（ｂ）レトロウイルスが構成されて前記細胞から分泌される条件下で前記細胞を培養する段階；および
（ｃ）上清からパッケージングされたレトロウイルスを回収する段階を含む前記プロセス。
【請求項１８】
レトロウイルスを産生するためのプロセスであって、前記プロセスが：
（ａ）導入遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクターを請求項１２に記載のレトロウイルスパッケージング細胞に導入する段階であって、前記レトロウイルスパッケージング細胞がそのゲノムに安定的に組込まれたレトロウイルスｅｎｖ、ｇａｇ−ｐｏｌおよびｅｎｖ遺伝子を含む段階；
（ｂ）レトロウイルスが構成されて前記細胞から分泌される条件下で前記細胞を培養する段階；および
（ｃ）上清からパッケージングされたレトロウイルスを回収する段階を含む前記プロセス。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、レトロウイルスパッケージングベクターの産生における使用を目的としたウイルス遺伝子またはその誘導体を含む核酸分子、およびレトロウイルスパッケージングおよびプロデューサー細胞株に関する。１つの実施形態において、核酸分子は、ｅｎｖとｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子のコード配列が反対方向にあるｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む。
【０００２】
レトロウイルス（レンチウイルスを含む）は、ウイルス感染後、そのゲノムがデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）に逆転写された後、宿主細胞ゲノムに組み込まれることを包含する、複雑なライフサイクルを経るプラス鎖ＲＮＡウイルスである。そのゲノムを、標的細胞のゲノムのほぼ任意の座位にＤＮＡとして挿入し、ウイルス遺伝子の長期的発現を媒介することが可能であり、感染細胞が分裂するときには各娘細胞にＤＮＡがコピーされる。転写に細胞のＲＮＡポリメラーゼを用いることにより、そのゲノムを非スプライシングｍＲＮＡ分子として産生する。その後、ウイルスゲノムはＲｅｖと呼ばれるウイルスタンパク質を用いて細胞質に輸送される。次に、ウイルスにコードされた構造タンパク質Ｅｎｖｅｌｏｐｅ（Ｅｎｖ）、ＧａｇおよびＰｏｌｙｍｅｒａｓｅ（Ｐｏｌ）を用いて、サイトゾル内でゲノムがウイルス粒子にパッケージングされる。レトロウイルスゲノムは、典型的には長さ７〜１０ｋｂであり、一般的に研究されるＨＩＶウイルスの場合、ゲノムは長さ９．７ｋｂである。各ウイルス粒子に２コピー／ビリオンで存在する。
【０００３】
レトロウイルスのライフサイクル、およびその構造的柔軟性は、哺乳類細胞のゲノムへのＤＮＡ送達といった、数多くのバイオテクノロジー用途に対応可能である。さらに、レトロウイルスは、その表面に非レトロウイルス糖タンパク質を含むよう修飾して、そこから糖タンパク質が発生するウイルスの細胞指向性を、レトロウイルス粒子に賦与することができる。これは、天然レトロウイルス糖タンパク質が限定的な細胞指向性を有する場合に時に重要である。この一例は、ＣＤ４受容体と結合するように、そしてこのタンパク質を細胞表面に担持する細胞にのみ感染するように進化したＨＩＶ−１のＧＰ１６０糖タンパク質である。ＨＩＶ−１の場合、シュードタイピングと呼ばれるプロセスにおいて、ウイルス粒子は頻繁に修飾されて天然糖タンパク質と異なる糖タンパク質を含有する。最も一般的には、これは水疱性口内炎ウイルス（ＶＳＶ−Ｇ）に由来する糖タンパク質によって達成されて、より幅広い細胞指向性を提供する。
【０００４】
実験室においてレトロウイルスをツールとして用いる場合、典型的には、１つ以上の導入遺伝子またはｓｈＲＮＡ分子のいずれかを発現することのできる複製不全ベクターを形成するよう修飾され、これらの修飾ウイルスは、細胞の導入遺伝子発現および遺伝子操作を目的とした多能性ベクターを提供する。またレトロウイルスパッケージングプロセスの柔軟性は、多様なゲノムサイズを収容することも可能とし：３ｋｂの小型ゲノムおよび１８ｋｂの大型ゲノムをパッケージングすることが可能であるが、これらの極端な場合はウイルス力価が損なわれる可能性がある。
【０００５】
遺伝性単遺伝子病の治療において、レトロウイルス（および後にレンチウイルス）を用いて幹細胞をエクスビボで感染させ、補充しようとする導入遺伝子を発現させる治験が、現在数件実施されている。これは、通常は自己由来で実施されるが、一部の幹細胞は異種移植片として適用されることもある。
【０００６】
レトロ／レンチウイルスは、養子細胞導入の分野でも重要な用途、最も著しくは、Ｔ細胞にハイブリッド「キメラ抗原受容体」（ＣＡＲ）を発現させた後、細胞増殖して患者に再注入する用途を見出している。一般的に、ＣＡＲは、Ｔ細胞受容体に基づくが、外部がその抗原と結合した後の細胞刺激の質を改善するよう（第２および第３世代ＣＡＲにおいて）修飾された、細胞外抗体構造および細胞内構造を有する。この「ＣＡＲ  Ｔ細胞」手法は、Ｂ細胞性リンパ腫の臨床治療において、ＣＤ１９を認識するＣＡＲをコードするレンチウイルスを用いて印象的な成功を示しており、近い将来、ノバルティス社に対し、ＣＴＬ０１９として知られるＣＤ１９特異性ＣＡＲ  Ｔ細胞に対する初の米国製品認可が交付される見込みである。応用分野は、他の分子標的および他の悪性疾患に対応するよう、現在拡張されつつある。したがって、既存のウイルス産生系を用いて達成することが困難である、大スケールレンチウイルス製造に対するニーズが拡大しつつある。
【０００７】
臨床使用と共に、多くの実験室で研究および開発を目的としてレンチウイルスベクターを頻繁に用いており、この場合は外因性ＤＮＡを細胞ゲノムに挿入する必要がある。レンチウイルスの多能性により、それらを用いてＤＮＡをヒトおよびマウス幹細胞、癌細胞、初代組織細胞（肝臓、神経および線維芽細胞など）を含むがこれに限定されない多様な種類の細胞に導入することが可能である。
【０００８】
これらの細胞の感染は、幅広い指向性の糖タンパク質、最も多くはＶＳＶ−Ｇ表面糖タンパク質でウイルスを被覆またはシュードタイピングすることによってのみ可能となる。このタンパク質は、ほぼ全ての臓器に由来し、且つヒト、マウス、ラット、ハムスター、サル、ウサギ、ロバおよびウマ、ヒツジ、ウシおよび旧世界サルを含むがこれに限定されない多くの種に渡る細胞の感染を可能とする。
【０００９】
野生型レトロ／レンチウイルスは宿主細胞内で複製することが可能であるが、導入遺伝子およびｓｈＲＮＡ発現を目的として用いられるレトロ／レンチウイルスベクターは、典型的には多様な様態で無効化され、その複製して疾患を引き起こす能力を除去される。このことは、単回感染が可能な感染性ウイルス粒子の１バッチを、実験または臨床使用を目的として培養するためには、遺伝子操作でウイルスゲノムから除去され、同時にウイルスパッケージングに用いる細胞内に挿入される数種類のウイルス遺伝子（またこれによりウイルスタンパク質）を提供する必要があることを意味する。これらの遺伝子は、一般的に３つまたは４つのプラスミドに分けて提供され、細胞に共トランスフェクトされる。中心的コンポーネントは、集合するウイルス粒子が対応するＲＮＡを新たなウイルス粒子に取り込むよう方向付けるパッケージングシグナルを含んだ、ウイルスベクターゲノム（任意の導入遺伝子および標的細胞における転写を調節する関連プロモーターを含む）をコードするプラスミドである。Ｇａｇ−Ｐｏｌ、ＴａｔおよびＲｅｖなどの他のウイルスタンパク質の遺伝子は、一般的に共トランスフェクトされる他のプラスミドから提供される；さらなる他のプラスミドは、新たに形成されるウイルス粒子のエンベロープに取り込まれ、その感染指向性を方向付ける糖タンパク質を提供する。ｇａｇ−ｐｏｌ発現カセットはウイルスカプシドおよび内部構造タンパク質およびポリメラーゼおよびプロテアーゼ活性をコードする。ｒｅｖ遺伝子は、Ｒｅｖ反応エレメント（ＲＲＥ）と呼ばれるウイルスゲノムの特定領域と結合することにより、核からのレトロ／レンチウイルスゲノムの排出を促進するよう作用する。
【００１０】
レトロウイルスおよびレンチウイルスパッケージング系は複雑であるため多くの「世代」が存在し、それぞれが前の世代よりも安全性が向上している。「第１世代」パッケージング系では３つのプラスミド：ｅｎｖｅｌｏｐｅ遺伝子を除く全てのＨＩＶ遺伝子をコードする１つのプラスミド；表面糖タンパク質（最も多くはＶＳＶ−Ｇ）を提供する第２のプラスミド；およびパッケージングしようとするウイルスゲノムを含むプラスミドを用いた。この系は、ウイルス遺伝子を含むプラスミドが、ウイルスゲノムプラスミドとの同一性を有する大きなＤＮＡ領域を含み、これによりプラスミド間で組換えが発生する可能性があったという欠点を有する。これによって、疾患を引き起こすことができる感染性ウイルスが生成される可能性があった。その他の問題には、ＶＰＵ、ＶＩＦ、ＶＰＲおよびＮｅｆを含む、ウイルス産生に必要とされない多くのウイルス遺伝子の存在が含まれた。
【００１１】
「第２世代」系では、ＨＩＶ−１遺伝子コード９領域のうち５領域が系から除去された。この方法も３プラスミド系となり、１つのプラスミドはｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子およびＴａｔおよびＲｅｖタンパク質の補助的遺伝子を含み、第２のプラスミドは糖タンパク質（最も多くはＶＳＶ−Ｇ）をコードし、第３のプラスミドはパッケージングしようとするウイルスゲノムをコードした。この系のウイルスゲノムは、典型的には野生型の５’長い末端反復（ＬＴＲ）を含むので、転写活性化およびゲノム産生にはｔａｔ遺伝子を必要とする。この系は、ウイルスゲノムとパッケージングプラスミドの間の相同性が低減されているために、潜在的に有害な複製可能レトロウイルスが形成される可能性が低減されるという長所を有する。
【００１２】
最も新しい「第３世代」レンチウイルスベクター系では、３プラスミドではなく４プラスミドを用いる。「第３世代」系は、系を４プラスミド（３ヘルパープラスミドおよびベクターゲノム＋導入遺伝子を含む１プラスミド）に分割することにより、（主として複製可能ウイルスを形成するのに必要な組換え事象の数を増加させることによって）数多くの長所を提供する。しかし、「第３世代」系はプロモーターを含む修飾５−ＬＴＲを有するためにもう１つの著しい長所も有し、これによりゲノムの転写はＴａｔタンパク質による転写活性化に依存せず、それゆえＴａｔが系内にコードされる必要がなくなる。使用するプラスミドのいずれもＴａｔタンパク質を含まない。１つのプラスミドにはｒｅｖ遺伝子も配置される。したがって、第三世代系においては、４つのプラスミドは１：ｇａｇ−ｐｏｌ、２：糖タンパク質（最も多くはＶＳＶ−Ｇ）、３：ｒｅｖ、および４：導入遺伝子または目的のＲＮＡを含む自己不活化レンチウイルスゲノムをコードするプラスミドを含む。特に糖タンパク質プラスミドに関しては、数種類のエンベロープ糖タンパク質が提供され利用されているが、最も幅広く利用されているのはＶＳＶ−Ｇとして知られる水疱性口内炎ウイルスに由来する糖タンパク質である。
【００１３】
これらのレンチウイルスパッケージング遺伝子の一部、特にＶＳＶ−Ｇおよびｇａｇ−ｐｏｌコンポーネントは、哺乳類細胞に対して毒性であることが広く報告されている（Ｂｕｒｎｓ他、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９０，８０３３−８０３７（１９９３）；Ｙｅｅ他、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，９０，９５６４−９５６８（１９９４）；Ｈｏｆｆｍａｎ他、Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ，９１，２７８２−２７９３（２０１０）。これは、必要とされる多くのパッケージングタンパク質を発現する安定なパッケージング細胞の開発にとって、相当な障壁をもたらす。したがって、細胞内で一過性トランスフェクションによる全てのプラスミドの同時発現を要する非効率的なプロセスによって、複数バッチのレンチウイルスが調製されてきた。このようなトランスフェクション法は高価であり、大スケールで再現することが困難であり、またプラスミドおよび細胞デブリによるウイルス製剤の汚染を引き起こすことが多い。
【００１４】
新たなウイルス粒子を産生するのに必要な細胞ゲノム内のコンポーネントの一部、または全てをコードするレトロウイルスまたはレンチウイルスのために、「パッケージング」細胞株を作成することが非常に望ましい。これは、ウイルスパッケージングに必要とされるプラスミドトランスフェクションの複雑度が低下する可能性があり、且つ全ての細胞がウイルス産生に必要な遺伝子を発現するという重要な長所を有する。互いに対する特定の化学量関係でウイルスタンパク質を発現する細胞株を作成する能力は、もう１つの重要な長所となるであろう。安定的に、あるいは条件付きまたは誘導可能プロモーターの下でのいずれかでウイルスタンパク質の発現がいくつか試みられており、たとえばＩｋｅｄａら（Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２１，５６０−５７２（２００３））が生成したＳＴＡＲ細胞は、コドン最適化ＨＩＶ  Ｇａｇ、ＰｏｌおよびＲｅｖのレトロウイルス形質導入を用いて、パッケージング細胞の持続的発現を達成している。しかし、これらの細胞を用いて産生されるウイルスの力価は、典型的には業界標準である１×１０７〜１×１０８／ｍＬを下回る。一部の遺伝子が誘導可能でもあるか、または独立した抗生物質選択剤を必要とするという要件は系を著しく複雑にし、且つ製造のためのスケールアップの難度を著しく高める。現在まで、最も多く利用されているレトロウイルスおよびレンチウイルス糖タンパク質ＶＳＶ−Ｇを安定的且つ構成的に発現する細胞株は、その毒性が報告されていることから、生成されていない。
【００１５】
単一のプラスミド／ベクター上にＥｎｖタンパク質およびＧａｇ／Ｐｏｌタンパク質をコードする配列があることは、ウイルス粒子を産生するのに必要なプラスミドの数を減らし、これによりウイルス産生系の効率を高めるという長所を有する。しかしこの配置は、潜在的に有害な複製可能レトロウイルスの形成の可能性を高めるという著しい欠点を被る。ＥｎｖおよびＧａｇ−Ｐｏｌコード配列の双方を同じ５’から３’方向で含む単一のｍＲＮＡを細胞内で産生すると、両タンパク質が同じｍＲＮＡ分子から産生される可能性があり、これが発生する確率が相当高くなる。
【００１６】
現在、発明者らは、Ｅｎｖタンパク質のコード配列を一方の鎖に、Ｇａｇ／Ｐｏｌタンパク質を同じプラスミド／ベクターの対向鎖に配置することで、ＥｎｖおよびＧａｇ−Ｐｏｌ配列をコードする単一のｍＲＮＡを生成するプロモーターからのリードスルーの可能性が無いことを担保し、これにより複製可能レトロウイルスが形成されるリスクが低減されることを発見している。
【００１７】
したがって、本発明の目的の１つは、特に、現在ウイルス粒子の産生に必要とされているプラスミドの数を減らすことにより、ウイルス産生系の全般的効率を高めるために用いることのできる、核酸分子およびレトロウイルスパッケージングベクターを提供することである。
【００１８】
１つの実施形態において本発明は、二重鎖核酸分子であって：
（ａ）ｅｎｖ遺伝子を含む第１の核酸；および
（ｂ）ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む第２の核酸を含み；
第１および第２の核酸のコード配列が二重鎖核酸分子の対向鎖上にあり、ｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子が、その間のヌクレオチド配列同一性が９５％未満である第１および第２の誘導可能プロモーターと独立して機能的に関連し、且つ二重鎖核酸分子がアポトーシス阻害物質をコードするヌクレオチド配列を１つ以上含む二重鎖核酸分子を提供する。
【００１９】
一部の実施形態においては、二重鎖核酸分子はｒｅｖ遺伝子を含む核酸を追加的に含む。一部の実施形態においては、二重鎖核酸分子は導入遺伝子を含む核酸を追加的に含む。好ましくは、二重鎖核酸分子はレトロウイルスベクター、より好ましくはレンチウイルスベクターである。
【００２０】
二重鎖核酸分子中の核酸はＤＮＡまたはＲＮＡ、好ましくはＤＮＡでありうる。
【００２１】
好ましくは、二重鎖核酸分子はレトロウイルスベクターである。本願で用いる用語「レトロウイルスベクター」は、レトロウイルスの産生に有用であるベクターまたはプラスミドを指す。レトロウイルスベクターの例はγ−レトロウイルスベクター（マウス白血病ウイルスに由来するベクターなど）およびレンチウイルスベクターを含む。
【００２２】
好ましくは、レトロウイルスベクターはレンチウイルスベクターである。本願で用いる用語「レンチウイルスベクター」は、レンチウイルスの産生に有用であるベクターまたはプラスミドを指す。たとえば、レンチウイルスベクターはパッケージングベクター、エンベロープベクターまたはパッケージング／エンベロープベクターでありうる。
【００２３】
ｅｎｖ、ｇａｇ、ｐｏｌおよびｒｅｖ遺伝子は、好ましくはウイルス遺伝子であるかまたはウイルス遺伝子に由来する。より好ましくは、レトロウイルス遺伝子であるかまたはレトロウイルス遺伝子に由来する。レトロウイルスの例はレンチウイルス、αーレトロウイルス、γ−レトロウイルス（マウス白血病ウイルスなど）およびフォーミーレトロウイルスを含む。好ましくは、レトロウイルスはレンチウイルスである。
【００２４】
レンチウイルスは、特に造血幹細胞およびＴ細胞などの前駆細胞集団において、導入遺伝子送達およびタンパク質発現に使用されることが増えているレトロウイルス科の亜群である。大半のレトロウイルスとは異なり、レンチウイルスはそのゲノム、またはその修飾形態を、細胞周期に依存せずに送達することが可能であり、且つより短い時間枠においてより高い細胞感染効率を達成することが多い。これにより、研究および臨床使用のいずれにとってもさらにより有効なウイルスベクターとなる。
【００２５】
現在、レンチウイルス科は１０種類のウイルスからなる。これらの種は：ウシレンチウイルス群（ウシ免疫不全ウイルスおよびジェンブラナ病ウイルス）、ウマレンチウイルス群（ウマ感染性貧血ウイルス、ネコレンチウイルス群、ネコ免疫不全ウイルス、ピューマレンチウイルス）、ヒツジ／ヤギレンチウイルス群（ヤギ関節炎脳炎ウイルス、ビスナ・マエディウイルス）、霊長類レンチウイルス群（ヒト免疫不全ウイルス１，ヒト免疫不全ウイルス２，サル免疫不全ウイルス）を含む５群に分類される。
【００２６】
好ましい実施形態においては、レンチウイルスはヒト免疫不全ウイルス１、サル免疫不全ウイルスまたはウマ感染性貧血ウイルスである。より好ましい実施形態においては、レンチウイルスはヒト免疫不全ウイルス１またはウマ感染性貧血ウイルスである。
【００２７】
ｅｎｖ、ｇａｇ、ｐｏｌおよびｒｅｖ遺伝子は、１つ以上の異なるウイルス（２、３または４種類の異なるウイルスなど）に由来しうる。たとえば、ｅｎｖ遺伝子がラブドウイルス科（ＶＳＶ−Ｇなど）に由来する一方で、他のｇａｌ、ｐｏｌおよびｒｅｖ遺伝子がＨＩＶ−１に由来してもよい。
【００２８】
レトロウイルスのｅｎｖ、ｇａｇ、ｐｏｌおよびｒｅｖ遺伝子はクレードおよび分離株によって異なることが、当業者により認識されている。このような全てのクレードおよび分離株に由来するこれらの遺伝子の配列は、その誘導体と共に本願に包含される。
【００２９】
第１の核酸はｅｎｖ遺伝子を含む。ｅｎｖはウイルスエンベロープを形成するタンパク質をコードする遺伝子である。ｅｎｖ遺伝子の発現により、レトロウイルスが特定の種類の細胞を標的として接着し、さらに標的細胞膜に浸潤することが可能となる。ｅｎｖ遺伝子の例はＨＩＶ−１  ｅｎｖ遺伝子およびその誘導体を含む。
【００３０】
ＨＩＶにおいて、ｅｎｖ遺伝子は、ホモ三量体を形成し、且つ宿主細胞のプロテアーゼであるフューリンによって開裂されてｇｐ１２０およびｇｐ４１となる、ｇｐ１６０タンパク質をコードする。ＨＩＶ−１  ｅｎｖのヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、配列番号１および２にそれぞれ示す。
【００３１】
本願で用いる用語「ＨＩＶ−１  ｅｎｖ遺伝子」は、好ましくは配列番号１に示す配列を有するヌクレオチド配列または配列番号２をコードするヌクレオチド配列、またはこれと少なくとも８０％、８５％９０％、９５％または９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、且つホモ三量体を形成することが可能で、且つＨＩＶ−１プロテアーゼによって開裂されてｇｐ１２０およびｇｐ４１となることが可能なｇｐ１６０タンパク質をコードするヌクレオチド配列を指す。
【００３２】
ウイルスエンベロープは、たとえばＶＧＶ−Ｇ遺伝子などの、水疱性口内炎ウイルス（ＶＳＶ）といったウイルスに由来するｅｎｖ遺伝子またはその誘導体を用いて、シュードタイピングしうる。
【００３３】
ＶＳＶ−Ｇタンパク質はシングルパス膜糖タンパク質である。幅広い感染指向性を媒介する。遺伝子は１５３６塩基対オープンリーディングフレームによってコードされ、５１１アミノ酸からなるタンパク質を産生する。タンパク質は、Ｎ末端に１６アミノシグナルペプチドを含み（アミノ酸配列：ＭＬＳＹＬＩＦＡＬＡＶＳＰＩＬＧ、配列番号１４）、細胞表面への分泌経路から排出される際にこれが成熟タンパク質から開裂する。糖タンパク質は４５８アミノ酸の細胞外領域および２１アミノ酸の膜貫通領域（膜横断領域）、これに続く２２アミノ酸の細胞内（サイトゾル）Ｃ−末端領域を含む。小胞体からのＶＳＶ−Ｇタンパク質のシャトリングは迅速であり、またこれはＤｘＥモチーフを含むより幅広い輸送シグナルＴｙｒ−Ｔｈｒ−Ａｓｐ−Ｉｌｅ−Ｇｌｕ−Ｍｅｔ内にＤｘＥモチーフ（ただしｘは任意のアミノ酸）を含む、Ｃ末端テール内の特異的輸送シグナルによって達成される（Ｓｅｖｉｅｒ他、Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．Ｃｅｌｌ．２０００Ｊａｎ；１１（１）：１３-２２）。ＶＳＶ−Ｇタンパク質の排出の効率は、レトロウイルスおよびレンチウイルス産生に対するその有効性に対して部分的に寄与しうる。ＶＳＶ−Ｇ受容体は非特異的膜融合タンパク質と記載されることが多いが；しかし最近は、ＶＳＶ−Ｇが低密度脂質受容体（ＬＤＬ−Ｒ）と結合すると判定され（Ｆｉｎｋｅｌｓｔｅｉｎ他、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ２０１３；１１０（１８）：７３０６−７３１１）、これはその幅広い細胞指向性およびレトロウイルスおよびレンチウイルスのシュードタイピングにおける幅広い用途を説明する。
【００３４】
本願で用いる用語「ＶＧＶ−Ｇ遺伝子」は、好ましくは配列番号３に示す配列を有するヌクレオチド配列または配列番号４をコードするヌクレオチド配列、またはこれと少なくとも８０％、８５％９０％、９５％または９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、且つＬＤＬ受容体に結合することのできるポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を指す。
【００３５】
第２の核酸はｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む。本願で用いる用語「ｇａｇ−ｐｏｌ」は、近接する／オーバーラップするｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子および独立したｇａｇおよびｐｏｌ遺伝子を指す。
【００３６】
レンチウイルスのＧａｇ−Ｐｏｌタンパク質は、Ｇａｇ−Ｐｏｌタンパク質をタンパク分解的に開裂して、数多くのウイルス機能を果たす数多くのより低分子のタンパク質となることを可能とするプロテアーゼをコードする、単一のポリタンパク質として産生される。ＨＩＶ−１  Ｇａｇタンパク質は、ウイルスゲノムの５’末端から最初に翻訳されるオープンリーディングから産生され、フレームシフト配列として知られる配列を含む。このシグナルは、約２０回の翻訳のうち１回の間に、ｍＲＮＡ分子上の翻訳リボソームを１塩基後退させる。このプロセスによりＧａｇ−Ｐｏｌタンパク質が産生される。結果、レンチウイルスはＧａｇとＧａｇ−Ｐｏｌを約１：２０の比率で産生する。Ｇａｇタンパク質は３つの主要な構造タンパク質：ｐ１８、ｐ２４およびｐ１５をコードする。Ｐｏｌタンパク質セグメントも、ｐ１０（プロテアーゼ）、ｐ６６／５５（逆転写酵素）およびｐ３２（インテグラーゼ）と呼ばれる主要な３タンパク質をコードする。プロテアーゼは、タンパク分解的開裂によるこれらの各タンパク質の産生に必要とされる全ての開裂事象を担う。しかし、これらの開裂事象を確定するプロテアーゼ認識配列は十分に確定されず、プロテアーゼが幅広い特異性を有することを示唆している。したがって、このためウイルスと無関係なタンパク質の開裂が発生する可能性がある。実際、このことによりＧａｌ−Ｐｏｌタンパク質の発現は細胞にとって非常に毒性が高いと報告されている（Ｂｌａｎｃｏ他、Ｔｈｅ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２７８，２，１０８６−１０９３，２００３）。
【００３７】
一部のウイルスにおいては、ｇａｇ遺伝子とｐｏｌ遺伝子のコード配列は重複する。本発明のｇａｇ遺伝子およびｐｏｌ遺伝子のコード配列は近接、非近接、重複または非オーバーラップであり得る。
【００３８】
好ましくは、ｇａｇ−ｐｏｌ配列はレンチウイルスを形成する。ｇａｇ、ｐｏｌおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子の例はＨＩＶ−１  ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子およびその誘導体を含む。
【００３９】
ＨＩＶ−１においては、ｇａｇ遺伝子およびｐｏｌ遺伝子のリーディングフレームは、すなわちｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子においてオーバーラップする。ＨＩＶ−１  ｇａｇ−ｐｏｌヌクレオチド配列は配列番号５に示す。
【００４０】
本願で用いる用語「ＨＩＶ−１  ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子」は、好ましくは配列番号５に示す配列を有するヌクレオチド配列、またはこれと少なくとも８０％、８５％９０％、９５％または９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、且つマトリクス、カプシドおよびヌクレオカプシドタンパク質、および逆転写酵素、インテグラーゼ、およびプロテアーゼをコードするヌクレオチド配列を指す。
【００４１】
本発明の二重鎖核酸分子においては、第１および第２の核酸のポリペプチドコード配列は二重鎖核酸分子の対向鎖上にある。二重鎖核酸分子の２本の鎖は、しばしばセンス／アンチセンス鎖またはプラス／マイナス鎖と呼ばれる。したがって、ｅｎｖ遺伝子のコード配列を含む核酸鎖をセンス鎖またはプラス鎖と定義するのであれば、ｇａｇおよびｐｏｌ遺伝子のコード配列はアンチセンス鎖またはマイナス鎖上にあることになる。
【００４２】
一部の実施形態においては、二重鎖核酸分子はｒｅｖ遺伝子を含む核酸を追加的に含む。Ｒｅｖは、ＨＩＶ−１タンパク質発現の調節に不可欠であるトランス活性化タンパク質である。ｒｅｖ遺伝子中には核局在化シグナルがコードされ、これによりＲｅｖタンパク質が核内に局在化し、そこで非スプライシングおよび不完全スプライシングｍＲＮＡの排出に関与する。Ｒｅｖは、レンチウイルス産生にとって不可欠である、非スプライシング全長ゲノムの核からの排出を可能とする、Ｒｅｖ反応エレメントと呼ばれるレンチウイルスゲノム領域と結合する。ｒｅｖ遺伝子の例はＨＩＶ−１  ｒｅｖ遺伝子およびその誘導体を含む。ＨＩＶ−１  ｒｅｖヌクレオチド配列およびＲｅｖアミノ酸配列は、配列番号６および７にそれぞれ示す。
【００４３】
本願で用いる用語「ＨＩＶ−１  ｒｅｖ遺伝子」は、好ましくは配列番号６に示す配列を有するヌクレオチド配列または配列番号７をコードするヌクレオチド配列、またはこれと少なくとも８０％、８５％９０％、９５％または９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列であって、且つＲｅｖ反応エレメント（ＲＲＥ）と結合することのできるタンパク質をコードするヌクレオチド配列を指す。
【００４４】
他の一部の実施形態においては、二重鎖核酸分子はｒｅｖ遺伝子を含む核酸を含まない。
【００４５】
ＶＳＶ−Ｇは一般に細胞に対して細胞毒性である。細胞融合を誘導し、且つ合胞体を形成することが可能である。ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子産物の一部も細胞毒性である。特に、ｐｏｌ遺伝子は細胞内でタンパク質を開裂して細胞死をもたらすプロテアーゼをコードする。
【００４６】
１つ以上のアポトーシス阻害物質の発現は、これが発現しなければ細胞毒性ポリペプチドの細胞毒性によって開始されていたであろう細胞のアポトーシスを緩和または防止する。したがって、本発明の二重鎖核酸は、アポトーシス阻害物質をコードする１つ以上のヌクレオチド配列を追加的に含む。１つ以上のアポトーシス阻害物質は、独立にポリペプチドまたはＲＮＡなどであり得る。
【００４７】
好ましくは、本発明の二重鎖核酸は、アポトーシス阻害物質をコードするヌクレオチド配列を追加的に１つ、２つ、３つ，４つまたは５つ、より好ましくは１つまたは２つ含む。一部の実施形態においては、アポトーシス阻害物質はＡＰＡＦ−１（ＡＶＥＮなど）、カスパーゼ９（ＩＡＰまたはＸＩＡＰなど）、ＢＡＫ、ＢＡＸ、ＢＯＫまたはＢＡＤ（ＢＣＬ２、Ｅ１Ｂ−１９ＫまたはＢＣＬ−ＸＬなど）経路の阻害物質である。好ましくは、１つ以上のアポトーシス経路または段階を阻害する遺伝子を１つ以上用いて（Ｅ１Ｂ−１９Ｋと組み合わせたＡＶＥＮなど）、アポトーシスに対する耐性の向上を提供する。
【００４８】
一部の実施形態においては、１つ以上のアポトーシス阻害物質は、細胞膜の完全性の喪失、細胞−細胞融合または合胞体形成によってその産生が刺激されるか、または細胞内のタンパク質を開裂するプロテアーゼによって刺激されるアポトーシスタンパク質を阻害するものである。
【００４９】
アポトーシス阻害ポリペプチドの例はセロウイルスＧＡＭ１、アデノウイルスＥ４  Ｏｒｆ６、アデノウイルスＥ１Ｂ  ５５Ｋ、アデノウイルスＥ１Ｂ  １９Ｋ、粘液腫ウイルスＭ１１Ｌ、サイトメガロウイルスＩＥ１、サイトメガロウイルスＩＥ２、バキュロウイルスｐ３５、バキュロウイルスＩＡＰ−１、ヘルペスウイルスＵＳ３、サルヘルペスウイルスＯＲＦ１６、単純ヘルペス２  ＬＡＴ  ＯＲＦ  １、ヒトＸＩＡＰ、アフリカブタ熱ＡＳＦＶ−５−ＨＬ（ＬＭＷ−５−ＨＬ／Ａ１７９Ｌ）、カポジ肉腫ウイルスＫＳｂｃｌ２、ワクシニアウイルスＳＰＩ−２、牛痘ウイルスＣｒｍＡ、エプスタインバーウイルスＢＨＲＦ１、エプスタインバーウイルスＥＢＮＡ−５、エプスタインバーウイルスＢＺＬＦ−１、パピローマウイルスＥ６、ヒトＡｖｅｎ、ヒトＢＣＬ２およびヒトＢＣＬ−ＸＬを含む。
【００５０】
一部の実施形態においては、１つ以上のアポトーシス阻害物質はＲＮＡ、好ましくはアンチセンスまたはｓｈＲＮＡである。その他のＲＮＡアポトーシス阻害物質の例は、ヘルペスウイルスＬＡＴおよびアデノウイルスＶＡ１を含む。
【００５１】
好ましくは、アポトーシス阻害物質はＩＡＰ１、ＥＢＮＡ５およびＢＣＬ−ＸＬからなる群から選択される。アポトーシス阻害物質の特に好ましい組み合わせは：ＩＡＰ１＋ＥＢＮＡ５；ＩＡＰ１＋ＢＣＬ−ＸＬ；およびＥＢＮＡ５＋ＢＣＬ−ＸＬを含む。アポトーシス阻害物質ＩＡＰ１、ＥＢＮＡ５およびＢＣＬ−ＸＬのヌクレオチド配列は、本願にそれぞれ配列番号１１、１２および１３として示す。
【００５２】
特に好ましいのは：配列番号１１、１２または１３を含むアポトーシス阻害物質をコードするヌクレオチド配列、またはこれと少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％または９９％の配列同一性を有するヌクレオチド配列を追加的に含む本発明の二重鎖核酸である。
【００５３】
哺乳類培養における安定細胞株の生成には、典型的には、任意の外因的に添加されるＤＮＡを含有する細胞の培養を促進するための選択法が必要である。好ましくは、本発明の二重鎖核酸分子は選択遺伝子または抗生物質耐性遺伝子を追加的に含む。この目的を達成するために、それをコードするＤＮＡが哺乳類細胞ゲノムに挿入されるとき特定の化合物に対する耐性を提供する、多様な遺伝子が知られている。
【００５４】
好ましくは、選択遺伝子はピューロマイシンＮ−アセチルトランスフェラーゼ（Ｐｕｒｏ）、ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ（Ｈｙｇｒｏ）、ブラストサイジンのデアミナーゼ（Ｂｌａｓｔ）、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ（Ｎｅｏ）、グルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳ）、ゼオシン耐性遺伝子（Ｓｈ  ｂｌｅ）、またはジヒドロ葉酸レダクターゼ（ＤＨＦＲ）である。これらの遺伝子は、それぞれ哺乳類細胞に対して毒性であることがわかっている低分子に対する耐性を提供し、あるいはＧＳの場合は、増殖培地にグルタチオンが存在しない場合に、グルタチオンを産生する方法を細胞に提供する。
【００５５】
本発明の好ましい実施形態においては、耐性遺伝子はＰｕｒｏである。この遺伝子は、一般的な組織培養に用いられる細胞株の多くが耐性でないので、特に有効であり；Ｎｅｏの場合は多くの細胞株、特にＨＥＫ２９３誘導株が研究者らによる過去の遺伝子操作によってすでにＮｅｏ耐性となっているので（ＨＥＫ２９３  Ｔ細胞など）、これが当てはまらない。Ｐｕｒｏ選択は、毒性である時間が短い（＜７２時間）という長所もあるので、変数を迅速に試験し、ゲノムに挿入しようとする外因性ＤＮＡが入っていない細胞は、培養系から迅速に除去することができる。このことは、毒性の発現がより遅いＨｙｇｒｏなどの他の一部の選択方法には当てはまらない。
【００５６】
選択遺伝子（Ｐｕｒｏなど）を用いた安定細胞株の発生は、耐性遺伝子が必ず細胞で発現されることが要件である。これは、配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）、２Ａ開裂系、オルタナティブスプライシング、および専用プロモーターを含むがこれに限定されない多様な方法によって達成することができる。
【００５７】
本発明の好ましい実施形態においては、選択遺伝子は専用プロモーターから発現される。このプロモーターは、ヒト細胞において、好ましくはＶＳＶ−Ｇまたはｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を駆動する専用プロモーターよりも低いレベルで転写する。
【００５８】
ポリペプチドまたはＲＮＡをコードする二重鎖核酸分子内の各遺伝子は、好ましくは１つ以上の調節エレメントと機能的に関連する。これにより、ポリペプチドまたはＲＮＡが所望のレベル且つ所望の時期に発現されることが担保される。
【００５９】
この文脈において、用語「調節エレメント」はエンハンサー、プロモーター、イントロン、ｐｏｌｙＡ、インシュレーターまたはターミネーターのうち１つまたはそれ以上を含む。
【００６０】
本願のベクターに用いられるウイルスは、好ましくは他の遺伝子への転写リードスルーを最小限に維持し、かつ抑制することが所望される遺伝子（ＶＳＶ−Ｇおよびｇａｇ−ｐｏｌ）を、通常の環境で、発現されることが所望される遺伝子（ＴｅｔＲおよびアポトーシス阻害物質など）から遮蔽する取組みにおいて、ｐｏｌｙＡシグナルおよび／またはインシュレーターによって分離される。
【００６１】
同じ調節エレメント（プロモーター配列など）の複数のコピーを、２つ以上のポリペプチドまたはＲＮＡコードヌクレオチド配列と共に用いることにより（その協調発現という点で）いくつかの利点が得られるが、本発明のこの状況においては、各ポリペプチドまたはＲＮＡコードヌクレオチド配列に異なる調節エレメントを用いることが非常に望ましい。
【００６２】
したがって好ましくは、ｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子は、異なるプロモーター、異なるイントロン、異なるｐｏｌｙＡ、異なるインシュレーターおよび／または異なる転写終結配列などの、異なる調節エレメントと機能的に関連する。
【００６３】
より好ましくは、ｅｎｖプロモーターとｇａｇ−ｐｏｌプロモーターの間のヌクレオチド配列同一性の度合いは９５％未満または９０％未満、より好ましくは８５％、８０％、７０％または６０％未満である。より好ましくは、ｅｎｖターミネーターとｇａｇ−ｐｏｌターミネーターの間のヌクレオチド配列同一性の度合いは９５％未満またはまたは９０％未満、より好ましくは８５％、８０％、７０％または６０％未満である。こうして、これらの調節エレメント間の相同組み換えのリスクが低減される。
【００６４】
ｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子は、独立に誘導可能プロモーター配列と機能的に関連する。アポトーシス阻害物質遺伝子が存在する場合、これも１つ以上のプロモーターと機能的に関連し；これらは誘導可能であるか、抑制可能であるか、あるいは構成的である。
【００６５】
誘導可能プロモーターはドキシサイクリン、テトラサイクリン、ＩＰＴＧまたはラクトースによって誘導可能なものであり得る。好ましくは、誘導可能プロモーターエレメントは、Ｔｅｔリプレッサータンパク質（ＴｅｔＲ）がそこに結合することのできる複数のＴｅｔオペレーター配列を含む。結合状態においては、厳格な転写の抑制が得られる。しかし、ドキシサイクリン（より好ましくなくはテトラサイクリン）の存在下では抑制が緩和されるので、プロモーターは完全な転写活性を得る。そのような誘導可能プロモーターエレメントは、好ましくはＣＭＶプロモーターなどのもう１つのプロモーターの下流に配置される。
【００６６】
ＴｅｔＲ結合部位は、その多くが技術上既知である野生型配列を有することがある。好ましくは、ＴｅｔＲ結合部位はわずかな配列変更を取り入れることによって１つ以上の改善を受けている。本発明の実施形態において用いることのできる好ましい変種は配列：ｔｃｃｃｔａｔｃａｇｔｇａｔａｇａｇａ（配列番号８）を有する。ＴｅｔＲリプレッサータンパク質が、使用されるＴｅｔＲ結合配列変種と結合するのであれば、ＴｅｔＲタンパク質またはＴｅｔＲタンパク質の誘導体と結合するリプレッサーエレメントの代替的な変種も、本発明の実施形態において用いうる。一部のリプレッサー／結合部位変種は、互いに対する親和性が野生型よりも高くなり；これらは本発明の実施形態の１つにおいて好ましい。
【００６７】
ＴｅｔＲ遺伝子はヒト（宿主）細胞の染色体に組込まれることになる。遺伝子は、ｅｎｖまたはｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子に隣接して、またはこれと連携して組込まれることもあれば、そうでないこともある。
【００６８】
好ましい実施形態においては、ＴｅｔＲ遺伝子のコード鎖は、ｅｎｖまたはｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子に隣接して配置される場合、対向ＤＮＡ鎖上でＧａｇ−Ｐｏｌタンパク質のコード配列と逆向きの５’から３’方向にある。一部の実施形態においては、ＴｅｔＲ遺伝子はｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子と共発現する。
【００６９】
本発明の１つの実施形態においては、ＴｅｔＲタンパク質のヌクレオチド配列は配列番号９に示すものであるか、またはこれと少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも８５％、９０％または９５％の配列同一性を有し、かつＴｅｔＲタンパク質をコードするヌクレオチド配列である。
【００７０】
本発明の他の実施形態においては、ＴｅｔＲタンパク質のアミノ酸配列は配列番号１０に示すものであるか、またはこれと少なくとも８０％、より好ましくは少なくとも８５％、９０％または９５％の配列同一性を有し、かつＴｅｔＲタンパク質をコードするアミノ酸配列である。
【００７１】
一部の好ましい実施形態においては、ｅｎｖ遺伝子（好ましくはＶＳＶ−Ｇ遺伝子）およびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子と機能的に関連するプロモーターは、共通して誘導可能な（すなわち同時に誘導可能な）誘導可能プロモーターである。
【００７２】
より好ましくは、ｅｎｖ遺伝子（好ましくはＶＳＶ−Ｇ遺伝子）およびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子と機能的に関連するプロモーターは、いずれもｅｎｖ遺伝子（好ましくはＶＳＶ−Ｇ遺伝子）およびｇａｌ−ｐｏｌ遺伝子の同時抑制および共発現を可能とするＴｅｔＲ結合部位を含む。
【００７３】
好ましくは、アポトーシス阻害物質プロモーターはＲＳＶ、ＣＭＶ、ＳＶ４０、ＰＧＫおよびユビキチンプロモーターからなる群から選択される。
【００７４】
２つ以上のアポトーシス阻害物質を用いる実施形態においては、各アポトーシス阻害物質が好ましくは異なるプロモーターにより独立に駆動され；また好ましくは各プロモーターが異なる種類のもの（ＣＶＭ、ＳＶ４０など）である。
【００７５】
１つのアポトーシス阻害物質をコードする各核酸が、細胞に至適なアポトーシス阻害を提供するプロモーターの制御下で発現されることが好ましい。
【００７６】
一部の好ましい実施形態においては、本発明の二重鎖核酸分子は以下のプロモーター−アポトーシス阻害物質の組み合わせの使用を含む：
ＲＳＶ−ヒトアポトーシス阻害物質（ＩＡＰ）１
ＲＳＶ−エプスタインバーＥＢＮＡ５
ＲＳＶ−ＢＣＬ−ＸＬ
ＳＶ４０−ヒトアポトーシス阻害物質（ＩＡＰ）１
ＳＶ４０−エプスタインバーＥＢＮＡ５
ＳＶ４０−ＢＣＬ−ＸＬ
ＰＧＫ−ヒトアポトーシス阻害物質（ＩＡＰ）１
ＰＧＫ−エプスタインバーＥＢＮＡ５
ＰＧＫ−ＢＣＬ−ＸＬ
ユビキチン−ヒトアポトーシス阻害物質（ＩＡＰ）１
ユビキチン−エプスタインバーＥＢＮＡ５
ユビキチン−ＢＣＬ−ＸＬ
【００７７】
好ましくは、二重鎖核酸分子はＩＡＰ１、ＥＢＮＡ５およびＢＣＬ−ＸＬのうち少なくとも２つの組み合わせを含み、ＩＡＰ１、ＥＢＮＡ５およびＢＣＬ−ＸＬの発現が、好ましくはＲＳＶ、ＣＭＶ、ＳＶ４０、ＰＧＫ、ＧＲＰ７８、ＥＦ１−α、ＳＦＦＶ、ＣＨＥＦ−１、アデノウイルスＥ１Ａ、ニワトリβアクチン、ＣＡＧ、ＣＭＶ−β−グロビン、およびユビキチンプロモーターから選択されるプロモーターのいずれかにより駆動される。
【００７８】
本発明の二重鎖核酸分子は、少なくとも１つの選択遺伝子を追加的に含みうる。他の実施形態においては、本発明の二重鎖核酸分子および導入遺伝子を含むベクターまたはプラスミドを含むキットが提供される。
【００７９】
一部の実施形態においては、ｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子は部位特異的組換え部位、好ましくはＬｏｘＰまたはＦＲＴ部位、より好ましくはＬｏｘＰ部位と隣接する。
【００８０】
本発明は、具体的には本発明の二重鎖核酸を含むレトロウイルスパッケージングプラスミドを提供する。
【００８１】
本発明の好ましい実施形態の例は、以下のエレメントをこの順で含む二重鎖核酸分子を含む：
【００８２】
ＴｅｔＲ遺伝子（逆方向）−（誘導可能、Ｔｅｔ抑制可能プロモーターなど）ＶＳＶ−Ｇ遺伝子−（構成的、ＥＦ１ａなど、プロモーター）ピューロマイシン耐性−ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子（逆方向；誘導可能、Ｔｅｔ抑制可能など、プロモーター）−アポトーシス阻害物質１−アポトーシス阻害物質２。
【００８３】
ＴｅｔＲ遺伝子（逆方向）−（誘導可能、Ｔｅｔ抑制可能プロモーターなど）ＶＳＶ−Ｇ遺伝子−（ＩＲＥＳ、プロモーター）ピューロマイシン耐性−ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子（逆方向；誘導可能、Ｔｅｔ抑制可能など、プロモーター）−アポトーシス阻害物質１−アポトーシス阻害物質２。
【００８４】
（構成的プロモーター）ＶＳＶ−Ｇ遺伝子−（構成的プロモーター）ピューロマイシン耐性−ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子（逆方向；構成的プロモーター）−アポトーシス阻害物質１−アポトーシス阻害物質２。
【００８５】
（構成的プロモーター）ＶＳＶ−Ｇ遺伝子−ＩＲＥＳ−ピューロマイシン耐性−ｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子（逆方向；構成的プロモーター）−アポトーシス阻害物質１−アポトーシス阻害物質２。
【００８６】
２つのアミノ酸または核酸配列を整合するために利用可能な数多くのアルゴリズムが確立されている。典型的には、一方の配列が試験配列と比較することのできる参照配列の機能を果たす。配列比較アルゴリズムは、指定されたプログラムパラメーターに基づき、参照配列と比較した試験配列の配列同一性百分率を算出する。比較を目的としたアミノ酸または核酸配列の整合は、たとえばコンピューター実装アルゴリズム（ＧＡＰ、ＢＥＳＴＦＩＴ、ＦＡＳＴＡまたはＴＦＡＳＴＡ）、またはＢＬＡＳＴおよびＢＬＡＳＴ２．０アルゴリズムによって実施することができる。
【００８７】
アミノ酸配列同一性および核酸配列同一性の百分率は、ＢＬＡＳＴ整合法を用いて得ることができる（Ａｌｔｓｃｈｕｌ他  （１９９７）、「ギャップＢＬＡＳＴおよびＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ：タンパク質データベース検索プログラムの新世代」Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９−３４０２；およびｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ＢＬＡＳＴ）。好ましくは、標準またはデフォルト整合パラメーターを用いる。
【００８８】
標準タンパク質−タンパク質ＢＬＡＳＴ（ｂｌａｓｔｐ）を用いて、タンパク質データベース内の類似した配列を発見することができる。他のＢＬＡＳＴプログラムと同様に、ｂｌａｓｔｐは類似した局所領域を発見することができるよう設計されている。配列の類似性が全配列に及ぶ場合、ｂｌａｓｔｐは全般的整合も報告し、これはタンパク質同定の目的にとって好ましい結果である。好ましくは、標準またはデフォルト整合パラメーターを用いる。一部の場合では、「低複雑度フィルター」を外すこともある。
【００８９】
ＢＬＡＳＴタンパク質検索は、ＢＬＡＳＴＸプログラム、スコア＝５０、ワード長＝３で実施することもある。比較を目的としたギャップ整合を得るために、Ａｌｔｓｃｈｕｌ他（１９９７）Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２５：３３８９の記載に従ってギャップＢＬＡＳＴ（ＢＬＡＳＴ２．０に含まれる）を利用することができる。またその代わりに、ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ（ＢＬＡＳＴ２．０に含まれる）を用いて、分子間の遠隔関係を検出する累次検索を実施することができる。（Ａｌｔｓｃｈｕｌ他（１９９７）ｓｕｐｒａを参照）。ＢＬＡＳＴ、ギャップＢＬＡＳＴ、ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴを利用する場合、それぞれのプログラムのデフォルトパラメーターを用いることができる。
【００９０】
ヌクレオチド配列の比較については、ＭＥＧＡＢＬＡＳＴ、不連続ｍｅｇａｂｌａｓｔおよびｂｌａｓｔｎを用いてこの目標を達成してもよい。好ましくは、標準またはデフォルト整合パラメーターを用いる。ＭＥＧＡＢＬＡＳＴは、非常に類似した配列間で長い整合を効率よく発見するよう特に設計されている。不連続ＭＥＧＡＢＬＡＳＴを用いて、本発明の核酸と類似しているが、同一ではないヌクレオチド配列を発見することができる。
【００９１】
ＢＬＡＳＴヌクレオチドアルゴリズムは、クエリをワードと呼ばれる短いサブ配列に分解することによって類似した配列を発見する。プログラムは、始めにクエリワードとの完全一致を特定する（ワードヒット）。次に、ＢＬＡＳＴプログラムはこれらのワードヒットを多段階で拡張し、最終ギャップ整合を生成する。一部の実施形態においては、ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索はＢＬＡＳＴＮプログラム、スコア＝１００、ワード長＝１２で実施することができる。
【００９２】
ＢＬＡＳＴ検索の精度を支配する重要なパラメーターの１つはワードサイズである。ｂｌａｓｔｎがＭＥＧＡＢＬＡＳＴよりも感度が高い最も重要な理由は、より短いデフォルトワードサイズ（１１）を用いることである。このためｂｌａｓｔｎは、他の生物に由来する関連ヌクレオチド配列に対する整合発見において、ＭＥＧＡＢＬＡＳＴよりも優れている。ｂｌａｓｔｎではワードサイズを調節することが可能であり、デフォルト値より短縮して最小で７とし、検索感度を高めることができる。
【００９３】
新たに導入された不連続ｍｅｇａｂｌａｓｔページを用いることにより、より感度の高い検索を遂行することができる（ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｗｅｂ／Ｎｅｗｓｌｔｒ／ＦａｌｌＷｉｎｔｅｒ０２／ｂｌａｓｔｌａｂ．ｈｔｍｌ）。このページでは、Ｍａ他（Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．２００２  Ｍａｒ；１８（３）：４４０−５）によって報告されたものと同様のアルゴリズムを用いる。不連続ｍｅｇａｂｌａｓｔは、整合拡張のシードとして完全ワードマッチを必要とするのではなく、テンプレートのより長いウインドウ内で非連続ワードを用いる。コーディングモードでは、第１および第２コドン位置での一致の発見に注目する一方で、第３位の不一致を無視することにより、第３塩基のゆれを考慮に入れる。同じワードサイズを用いた不連続ＭＥＧＡＢＬＡＳＴにおける検索は、同じワードサイズを用いた標準的ｂｌａｓｔｎよりも感度および効率が高い。不連続ｍｅｇａｂｌａｓｔに固有のパラメーターは：
ワードサイズ：１１または１２；テンプレート：１６、１８、または２１；テンプレートタイプ：コーディング（０）、非コーディング（１）、または両方（２）である。
【００９４】
一部の実施形態においては、デフォルトパラメーターを用いてＢＬＡＳＴＰ２．５．０＋アルゴリズム（ＮＣＢＩから入手できるものなど）を用いうる。
【００９５】
他の実施形態においては、ギャップコスト：Ｅｘｉｓｔｅｎｃｅ  １１およびＥｘｔｅｎｓｉｏｎ  １による２タンパク質配列のＮｅｅｄｌｅｍａｎ−Ｗｕｎｓｃｈ整合を用いたＢＬＡＳＴ  Ｇｌｏｂａｌ  Ａｌｉｇｎｍｅｎｔプログラムを用いうる（ＮＣＢＩから入手できるものなど）。
【００９６】
また本発明は：
（ｉ）本発明の二重鎖核酸を含むレトロウイルスパッケージングベクターを、
以下のうち１つ以上と共に含むキットも提供する：
（ｉｉ）導入遺伝子およびレトロウイルスｒｅｖ遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクター；
（ｉｉｉ）ウイルス粒子の産生に適した細胞株の細胞。
【００９７】
また本発明は：
（ｉ）ｒｅｖ遺伝子を追加的に含む本発明の二重鎖核酸を含むレトロウイルスパッケージングベクターを、
以下のうち１つ以上と共に含むキットも提供する：
（ｉｉ）導入遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクター；
（ｉｉｉ）ウイルス粒子の産生に適した細胞株の細胞。
【００９８】
レトロウイルス導入ベクターは、導入遺伝子を細胞ゲノムに挿入するための部位（ＬＴＲなど）を含む。好ましくは、導入ベクター内の５’−ＬＴＲがプロモーターを含むことで、Ｔａｔタンパク質の必要性を取り除く。
【００９９】
またキットは、１本以上の遠心管、イオジキサノール、透析バッファーおよび透析カセットなどのウイルス粒子の密度バンディングおよび精製に関与するものなどの、ウイルス粒子の精製のための材料も含む。
【０１００】
また本発明は、本発明の二重鎖核酸を含む哺乳類細胞も提供する。本発明の二重鎖核酸は、哺乳類細胞の核ゲノムに安定的に組込まれるか、または細胞内のベクターまたはプラスミド内に存在しうる。好ましくは、本発明の二重鎖核酸は、哺乳類細胞の核ゲノムに安定的に組込まれる。
【０１０１】
細胞は、たとえば生存動物内に位置しない分離細胞でありうる。哺乳類細胞の例は、ヒト、マウス、ラット、ハムスター、サル、ウサギ、ロバ、ウマ、ヒツジ、ウシおよびサルに由来する任意の臓器または組織に由来するものを含む。好ましくは、細胞はヒト細胞である。細胞は初代細胞であっても不死化細胞であってもよい。好ましい細胞はＨＥＫ−２９３、ＨＥＫ２９３Ｔ、ＨＥＫ−２９３Ｅ、ＨＥＫ−２９３ＦＴ、ＨＥＫ−２９３Ｓ、ＨＥＫ−２９３ＳＧ、ＨＥＫ−２９３ＦＴＭ、ＨＥＫ−２９３ＳＧＧＤ、ＨＥＫ−２９３Ａ、ＭＤＣＫ、Ｃ１２７、Ａ５４９、ＨｅＬａ、ＣＨＯ、マウス骨髄腫、ＰｅｒＣ６、９１１およびＶｅｒｏ細胞株を含む。ＨＥＫ−２９３細胞はＥ１ＡおよびＥ１Ｂタンパク質を含有するよう修飾されており、またこれにより、この細胞株で増殖させるＥ１ＡおよびＥ１Ｂ領域の欠失したウイルスの、トランス補完による作製を可能とする。同様に、ＰｅｒＣ６および９１１細胞は同様の修飾を含み、これも使用することができる。最も好ましくは、ヒト細胞はＨＥＫ２９３、ＨＥＫ２９３Ｔ、ＨＥＫ２９３Ａ、ＰｅｒＣ６または９１１である。他の好ましい細胞は、ＣＨＯおよびＶＥＲＯ細胞を含む。好ましくは、本発明の細胞はｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を導入可能に発現することができる。
【０１０２】
また本発明は、本発明の二重鎖核酸分子を含むレトロウイルスパッケージング細胞、好ましくは哺乳類細胞、より好ましくはヒト細胞）、も提供する。
【０１０３】
したがって、さらなる実施形態においては、レトロウイルスパッケージング細胞を生成するためのプロセスであって、プロセスが：
（ｉ）本発明の二重鎖核酸分子を哺乳類細胞に安定的に組込み、
それによりレトウイルスｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子、および任意にｒｅｖ遺伝子を発現する哺乳類細胞を生成する段階を含むプロセスが提供される。
【０１０４】
また本発明は、レトロウイルス粒子産生における本発明のレトロウイルスパッケージング細胞の使用も提供する。
【０１０５】
また本発明は、レトロウイルスを産生するためのプロセスであって、プロセスが：
（ａ）５’および３’レトロウイルスＬＴＲおよびレトロウイルスパッケージングシグナルおよびレトロウイルスｒｅｖ遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクターを本発明のレトロウイルスパッケージング細胞に導入する段階であって、レトロウイルスパッケージング細胞がそのゲノムに安定的に組込まれたレトロウイルスｅｎｖおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を含む段階；
（ｂ）レトロウイルスが構成されて細胞から分泌される条件下で細胞を培養する段階；および
（ｃ）上清からパッケージングされたレトロウイルスを回収する段階を含むプロセスも提供する。
【０１０６】
また本発明は、レトロウイルスを産生するためのプロセスであって、プロセスが：
（ａ）導入遺伝子を含むレトロウイルス導入ベクターを本発明のレトロウイルスパッケージング細胞に導入する段階であって、レトロウイルスパッケージング細胞がそのゲノムに安定的に組込まれたレトロウイルスｅｎｖ、ｇａｇ−ｐｏｌおよびｒｅｖ遺伝子を含む段階；
（ｂ）レトロウイルスが構成されて細胞から分泌される条件下で細胞を培養する段階；および
（ｃ）上清からパッケージングされたレトロウイルスを回収する段階を含むプロセスも提供する。
好ましくは、ウイルスベクターは複製欠損または複製不全である。
【０１０７】
本願で用いる用語である１つ以上のベクターを細胞に「導入すること」は、形質転換、およびとりわけ任意の形態のエレクトロポレーション、コンジュゲーション、感染、形質導入、またはトランスフェクションを含む。このような導入のプロセスは技術上周知である（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．１９９５  Ａｕｇ１；９２（１６）：７２９７−３０１など）。好ましくは、回収されたレトロウイルスは続いて精製される。
【０１０８】
本願に記載された各参照文献の開示は、参照文献としてその全文を本願に個別に援用する。
【図面の簡単な説明】
【０１０９】
【図１】ＶＳＶ−Ｇ＋アポトーシス阻害物質を発現する安定細胞株の生成。
【図２】ＶＳＶ−Ｇ安定細胞株からのレンチウイルス粒子の発現。
【図３】ＶＳＶ−Ｇおよびｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を発現するベクターにおける主要な発現カセットの配置の模式図。誘導可能プロモーター：ｉ、構成的プロモーター：ｃと示される。Ａ．Ｉ．はアポトーシス阻害物質を示す。
【図４】主要な発現カセットの配置を図解する模式図。ＬＴＲは長い末端反復を示し、ＲＳＶはラウス肉腫ウイルスプロモーターを示し、ＰＧＫはヒトホスホグリセリン酸キナーゼプロモーターを示し、Ｇ４１８はＧ４１８（ジェネテシン）耐性遺伝子を示し、Ｂｌａｓｔはブラストサイジン耐性遺伝子を示する。
【図５】レンチウイルスベクターのパッケージングおよびプロデューサー細胞株生成の一時的評価。
【図６】ピューロマイシン選択時の各パッケージング細胞株の生存度。
【図７】％ＦＩＴＣ陽性集団として評価した、同定した目的のクローンにおける導入後の表面ＶＳＶ−Ｇ発現。
【図８】転写リードスルー評価を目的としたＶＳＶ−Ｇ発現構築物。
【図９】ＡＭＢＲバイオリアクター系において相異なるプロセス条件を用いた好ましいパッケージング株（ＣＶ１７０）の分析。
【図１０】非誘導プロデューサー細胞株から誘導プロデューサー細胞株へのウイルス力価の倍数変化。
【実施例】
【０１１０】
本発明は以下の実施例によってさらに例示され、別段の言及がない限りその部および割合は重量によるものであり、温度は摂氏である。これらの実施例は、本発明の好ましい実施形態を示す一方で、例示を目的としてのみ提示されることを理解すべきである。上記の考察およびこれらの実施例により、当業者は本発明の本質的特性を確認し、その主旨および範囲を逸脱することなく、本発明に多様な変更および変法を行って多様な用途および条件に適合させることができる。したがって、本願に提示および記載するものに加えて、本発明の多様な変法が、先行する記述により当業者に明らかになるであろう。そのような変法もまたは付属の請求項の範囲内となることを意図している。
【実施例１】
【０１１１】
（ウイルスタンパク質発現を支持する因子の同定）
水疱性口内炎ウイルスに由来するウイルス糖タンパク質ＶＳＶ−Ｇを、アポトーシス阻害物質パネルと共発現させた。我々は、ＶＳＶ−Ｇの構成的発現を支持した数種類の分子を同定し、さらに抗生物質選択により安定細胞株を確立することができた。続いて、このデータを用いて、後述の実施例に記載する、最終レンチウイルスパッケージングおよびプロデューサー細胞株に含める好ましいアポトーシス阻害物質を選択した。
【０１１２】
ＨＥＫ２９３懸濁細胞を、ピューロマイシン選択マーカーとＩＲＥＳを介して機能的に連結したＶＳＶ−Ｇ、さらには数多くのアポトーシス阻害物質遺伝子をコードする多様な発現ベクターにより、ＰＥＩ試薬を用いてトランスフェクトした。３〜４日毎の選択培地の培地交換により、安定したプールを確立した。構成的に発現されたＶＳＶ−Ｇ遺伝子の毒性により、安定したプールを確立するための期間が長くなった。結果を図１に示す。図に示す選択されたアポトーシス阻害物質は、ＶＳＶ−Ｇのみの構築物と比較して、安定なプールの回復率を高めた。
【０１１３】
安定的に組込んだコピーから発現させたＶＳＶ−Ｇ以外の、レンチウイルスの発現に必要な全ての因子（ＧａｇＰｏｌ、Ｒｅｖ、ゲノム）をコードする３ベクターにより、ＰＥＩ試薬を用いて安定なプールをトランスフェクトした。対照を目的として、同じプラスミドセットにＶＳＶ−Ｇベクターも含めて、親ＨＥＫ２９３株をトランスフェクトした。ゲノムはｅＧＦＰ遺伝子を含み、これを用いて接着ＨＥＫ２９３細胞における力価を測定した（ウイルス感染力価を概算するため）。結果を図２に示す。この実験より、構成的細胞株は、アポトーシス阻害物質の共発現によって支持されるとき、機能的ＶＳＶ−Ｇ発現を提供することができることが立証された。そのような発現は、高レベルウイルス粒子産生を支持するための、安定的パッケージング細胞株の安定的プロ−デューサーの状況において、十分であると考えられる。
【実施例２】
【０１１４】
（レンチウイルスパッケージングおよびプロデューサー細胞株の構築を目的とした構築物の産生）
図３に示すように、４つの構築物が産生される。構築物では、ピューロマイシン選択マーカーを用いてＶＳＶ−Ｇ遺伝子とｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子を合わせて対とし、Ｇ４１８またはブラストサイジン選択マーカーを用いてｒｅｖとゲノムを合わせて対とした。
【０１１５】
各カセットは以下の機能的コンポーネントに分解することができる：
【０１１６】
（ＶＳＶ−Ｇカセット）
・誘導可能プロモーター（２つのＴｅｔＯ部位を戦略的位置に付加することにより誘導可能プロモーターに変換されたＰＧＫ  ＣＭＶ融合プロモーター）または構成的プロモーター（ＰＧＫ  ＣＭＶ融合プロモーター）
・５’ＵＴＲ  ＝  ヒトトリオースリン酸イソメラーゼ（ＴＰＩ）イントロン
・ＣＤＳ（ＨＥＫ２９３細胞における発現に最適化されたＶＳＶ−Ｇコドン）
・ウサギβ−グロビンｐｏｌｙＡシグナル
【０１１７】
（ＧａｇＰｏｌカセット）
・誘導可能プロモーター（２つのＴｅｔＯ部位を戦略的位置に付加することにより誘導可能プロモーターに変換されたＣＭＶ）または構成的プロモーター（ＣＭＶ）
・５’ＵＴＲ（ヒトβ−グロビンイントロン）
・ＣＤＳ（野生型ＨＩＶ１  ＧａｇＰｏｌ）
・ＨＩＶ−１由来ＲＲＥ
・ヒトβ−グロビンｐｏｌｙＡシグナル
【０１１８】
（ＴｅｔＲタンパク質発現カセット（誘導可能ベクターにのみ存在）
・プロモーター（ＣＭＶ）
・ＴｅｔＲ配列（ＨＥＫ２９３細胞における発現に最適化されたコドン）
・ＰｏｌｙＡ
【０１１９】
（抗生物質耐性マーカー）
・Ｐｕｒｏ（ＩＲＥＳ−ＰｕｒｏまたはＥＦ１−α−ｐｕｒｏのいずれか）
【０１２０】
（アポトーシス阻害物質カセット）
・ＩＡＰ１およびＥＢＮＡ５
【０１２１】
（Ｒｅｖ／ゲノムベクター）
Ｒｅｖ／ゲノムベクターは、レンチウイルス粒子産生に必要な全ての因子を含むプロデューサー細胞株を生成するために、ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ安定細胞株に安定的に組込まれるよう設計された。Ｒｅｖ／ゲノム構築物を示す模式図を図４に示す。
【０１２２】
各Ｒｅｖ／ゲノムベクターカセットは以下の機能的コンポーネントに分解することができる：
【０１２３】
（ゲノム）
・第３世代レンチウイルスゲノム
・レンチウイルスゲノムの転写を駆動する異種ＣＭＶプロモーターと融合したキメラ５’−ＬＴＲ
【０１２４】
（導入遺伝子カセット）
・導入遺伝子は緑色蛍光タンパク質（ＧＦＰ）または抗ＣＤ１９キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。
・導入遺伝子は脾フォーカス形成ウイルス（ＳＦＦＶ）プロモーターから発現される。
【０１２５】
（Ｒｅｖカセット）
・構成的ＲＳＶプロモーター
・Ｒｅｖ  ＣＤＳ
【０１２６】
（抗生物質耐性マーカー）
・ＰＧＫ−Ｇ４１８またはＰＧＫ−Ｂｌａｓｔ
【実施例３】
【０１２７】
（一過的な状況におけるレンチウイルスパッケージングおよびプロデューサー細胞株の構築を目的とした構築物の分析）
安定細胞株において用いようとするベクターの機能性を評価するために、始めに接着細胞を対象とした一過性の実験においてレンチウイルス粒子を産生するために用いた。これにより、標準的４ベクター一過性発現ベクターに対するベンチマーキングが可能となった。
【０１２８】
安定レンチウイルスプロデューサー細胞株の構築を目的として生成した構築物（構成的または誘導可能）を含む２、３または４プラスミドレンチウイルスパッケージング系により、接着２９３Ｔ細胞をトランスフェクトした。このときゲノムベクターにおいて導入遺伝子としてｅＧＦＰを一貫して用いた。
【０１２９】
７２時間後に上清を含むレンチウイルスを回収し、ＤＭＥＭで連続希釈し、これを用いて接着２９３細胞に感染させた。７２時間後、細胞をトリプシン処理し、フローサイトメーターでｅＧＦＰシグナルを分析した。
【０１３０】
その後、１０〜２０％ｅＧＦＰ陽性（すなわち形質導入された）細胞が達成された連続希釈からのデータを用いて、感染性粒子濃度を算出した。これを用いて、評価対象の各パッケージング／プロデューサー構築物の性能を計測した。
【０１３１】
第０日：１０％ウシ胎児血清を添加したＤＭＥＭ中の２９３細胞を、事前に規定した密度で６ウェルプレートに播種し、翌日のトランスフェクションに備えた。細胞を３７℃、５％ＣＯ２の加湿インキュベーター内で一晩インキュベートした。
【０１３２】
第１日：表１に詳述するプラスミドの組み合わせで、評価対象の構築物が構成的であるか誘導可能であるかに関わらず、ドキシサイクリンを用いて、またはこれを用いずに、分枝ＰＥＩを用いて細胞をトランスフェクトした。
【０１３３】
第３日：ＤＭＥＭ＋１０％ＦＢＳ中の２９３Ｔ細胞を、事前に規定した密度で４８ウェルプレートに播種し、翌日の感染に備えた。細胞を３７℃、５％ＣＯ２の加湿インキュベーター内で一晩インキュベートした。
【０１３４】
第４日：レンチウイルス上清の回収後、遠心分離して細胞デブリを除去。レンチウイルスを連続希釈して２９３細胞の感染に用いた。  
【０１３５】
第７日：形質導入した細胞の回収およびフローサイトメトリーによる分析。その後、１０〜２０％ｅＧＦＰ陽性（すなわち形質導入された）細胞が達成された連続希釈を用いて、感染性粒子濃度を算出した。
【０１３６】
４、３および２プラスミド系構築物の組み合わせを、接着２９３Ｔ細胞における一過性レンチウイルスの産生について試験した。組み合わせを以下の表１に示す。
【０１３７】
【表１】
2021502799.tif 000003
2021502799.tif 000004
【０１３８】
このデータより数多くの結論が導かれた：
・レンチウイルスベクター内の全てのコンポーネントは完全に機能的である。
・２プラスミド系は高いレンチウイルス力価をもたらすことが可能であり、また多くの場合３または４プラスミド系よりも優れているか、または同等である。
・２プラスミド系でアポトーシス阻害物質もコードする構成的ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ構築物は、これらのカセットを欠いた同一の構築物と比較したとき、レンチウイルス産生の増強を示した（図５，ＢｏｘＡとＢｏｘＢ）。
・誘導可能ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ構築物は、アポトーシス阻害物質の有無に関わらず、構成的構築物をわずかにのみ下回る高レベルウイルス粒子発現を示した（図５，ボックスＣおよびボックスＢ）。
・誘導可能構築物（ボックスＣ）は、Ｄｏｘ不在下における発現レベルによって示されるように、非常に厳格な遺伝子調節を示す。
・全般的に、ドキシサイクリン処理は誘導系に関わらずウイルス粒子発現を上昇させた。
【実施例４】
【０１３９】
（ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｌＰｏｌパッケージング細胞株の生成および分析）
懸濁ＨＥＫ２９３細胞を、アポトーシス阻害物質を用いるか、またはこれを用いずに、ＶＳＶ−ＧまたはＶＳＶ−ＧおよびＧａｌＰｏｌのいずれかをコードする直鎖状誘導可能パッケージング構築物で、直鎖ＰＥＩを用いてトランスフェクトした（表２に詳述）。続いて、遺伝子が安定的に組込まれた細胞を、宿主細胞株と同様の増殖特性で生存度≧９０％が得られるまでピューロマイシン処理により選択した（図１）。ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ細胞プールを単一細胞クローニングに進め、モノクローナル高度発現細胞株を得た。これは、ソニーＳＨ８００セルソーターを用いて、９６ウェルプレート内の調製済みクローニング培地に細胞をソーティングして実施した。次に、コロニーを形成する単一細胞を、ＶＳＶ−Ｇタンパク質発現の評価に十分な数の細胞を得るまで、数回のスケールアップステージを経て選択した。この目的のために、細胞クローンを媒体対照（ＤＭＳＯ）またはドキシサイクリンで２４時間インキュベートし、ＶＳＶ−Ｇ／Ｇａｌ−Ｐｏｌ発現を誘導した。細胞を抗ＶＳＶ−Ｇおよび対応する二次ＦＩＴＣコンジュゲート抗体で染色し、フローサイトメトリーでＦＩＴＣ陽性細胞を分析した。結果を図６に示す。
【０１４０】
（安定パッケージング細胞株の生成に用いた構築物）
【０１４１】
【表２】
2021502799.tif 000005
【０１４２】
クローニング実験後に多数のクローン細胞株が生成された。２つのクローンからの代表的データを図７に示す。クローンＣＶ０２およびＣＶ３５はいずれもドキシサイクリン処理後にＶＳＶ−Ｇの高レベル発現を示した。しかし、ＣＶ３５はＶＳＶ−Ｇの基礎発現も高く、Ｔｅｔ−調節系の漏出性機能性を示す。このことは、誘導可能な状況において、生成されたパッケージング構築物を用い、安定した高度のＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ遺伝子発現が達成できることを示す。
【実施例５】
【０１４３】
（プロデューサー細胞株の生成および分析）
モノクローナルＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ懸濁ＨＥＫ２９３細胞株（実施例４に詳述）を、Ｒｅｖ単独またはＲｅｖとウイルスゲノム（ｅＧＦＰまたはＣＤ１９）の組み合わせをコードする直線化構成的構築物により、直鎖ＰＥＩを用いてトランスフェクトする（構築物の詳細は表３を参照）。続いて、遺伝子が安定的に組込まれた細胞を、宿主細胞株と同様の増殖特性で生存度≧９０％が得られるまでブラストサイジン選択により選択する。生成したプロデューサー細胞をドキシサイクリンで誘導し、設定した産生期間後に培養上清を回収し、細胞デブリを除去して清澄化する。続いて、このウイルス上清を連続希釈し、これを用いてＪｕｒｋａｔ細胞（ｅＧＦＰおよびＣＤ１９）または接着２９３細胞（ｅＧＦＰのみ）に７２時間感染させる。ｅＧＦＰレンチウイルスに感染したＪｕｒｋａｔおよび２９３細胞をフローサイトメトリーで直接分析し、これにより１０〜２０％ｅＧＦＰ陽性（すなわち形質導入された）細胞を得る希釈を用いて、感染性粒子濃度を算出する。
【０１４４】
ＣＤ１９の場合、感染Ｊｕｒｋａｔ細胞をプロテインＬで染色して表面ＣＤ１９発現を検出し、ｅＧＦＰと同様に、感染性粒子濃度を概算する。パッケージング細胞株（ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ＋Ｒｅｖ）を、ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｇＰｏｌ発現の同時的ドキシサイクリン誘導およびｅ−ＧＦＰウイルスゲノムの一過性トランスフェクションを用いて評価する。その後、産生されたウイルス上清を連続希釈し、これを用いてＪｕｒｋａｔおよび２９３細胞を感染させ、感染性粒子濃度を確立する。好ましいプロデューサープールを、ソニーＳＨ８００セルソーターを用いて、９６ウェルプレート内の調製済みクローニング培地への単一細胞ソーティングに進める。その後、コロニーを形成する単一細胞を、ドキシサイクリン誘導後のレンチウイルス産生を上記に概説した方法で評価するのに十分な数の細胞を得るまで、数回のスケールアップステージを経て選択する。
【０１４５】
（安定プロデューサー細胞株の生成を目的としたモノクローナルパッケージング細胞株のトランスフェクションに用いる構築物）
【０１４６】
【表３】
2021502799.tif 000006
【実施例６】
【０１４７】
（ウイルス遺伝子間の転写リードスルーの分析および複製可能レンチウイルス（ＲＣＬ）が生成する可能性）
レトロウイルスベクターの使用により推測される主な安全上の問題は、複製可能レトロウイルスを生成するリスクである。これは、パッケージング因子に対して個別のベクターを組み入れると共に、ＬＴＲ領域内部で削除してプロモーター活性を切除し、導入遺伝子の転写を内部プロモーターに依存させる、第３世代系による一過性レンチウイルス発現の状況で言及されている。
【０１４８】
安定バイオ産生細胞株の生成に用いた構造物におけるＶＳＶ−Ｇ遺伝子とｇａｇ−ｐｏｌ遺伝子の立体配置と、ＲＣＬ生成のリスクを低減するその可能性を評価するために、ＶＳＶ−Ｇがルシフェラーゼレポーターと直列に順方向と逆方向の両方向に発現した、２つの追加的構築物を生成した。これは図８に図示した。
【０１４９】
続いて、２つの構築物を、転写を誘導するためにドキシサイクリンで処理した接着ＨＥＫ２９３細胞に一時的にトランスフェクトし、２４時間後にルシフェラーゼ活性を測定した。順方向構築物にルシフェラーゼ活性が存在することは、安定細胞株の状況において、本発明で用いられる遺伝子立体配置によって回避される安全上の懸念に直接関係する、リードスルー転写を示す。
【実施例７】
【０１５０】
（ＶＳＶ−Ｇ／ＧａｌＰｏｌパッケージング細胞株の分析）
実施例４に記載のものと同一の方法により、追加的なパッケージング細胞株を産生した。パッケージング細胞株は、産生パラメーターを分析および最適化するために、振盪フラスコ系およびミニチュアバイオリアクター系（ＡＭＢＲ１５）の双方で増殖させた。本願に例示するものは、直線化Ｑ１８５０プラスミドの安定的な組込みによって産生された。
【０１５１】
産生パラメーターを検討するため、ＰＥＩによるＲＥＶ／ゲノムプラスミド（Ｑ１８４７）のトランスフェクション、およびドキシサイクリンを用いて誘導した後にパッケージング細胞株を７２時間培養した。上清を回収してフローサイトメトリーによる感染力価測定法で分析した。データは図９に提示し、ＡＭＢＲバイオリアクター系における各プロセス条件を用いた好ましいパッケージング株（ＣＶ１７０）の分析を示す。
【実施例８】
【０１５２】
（プロデューサー細胞株の分析）
好ましいパッケージング細胞株（ＣＶ１７０）を、完全に安定なプロデューサー細胞株の生成の出発点として用いた。安定プールは、直線化Ｑ３９２８プラスミドの安定的な組込みによって作製し、その後ＦＡＣＳソーティングによってクローニングした。その後、クローン株を拡張し、ディープウェル振盪プレートで分析した。このデータに基づき、選択したクローン細胞株を振盪フラスコ培養にスケールアップした。
【０１５３】
プロデューサー細胞株は一旦振盪フラスコに移行し、その後細胞培地にドキシサイクリンを添加して誘導した。誘導の７２時間後、上清を回収してフローサイトメトリーによる感染力価測定法で分析した。データは、図１０に非誘導株から誘導株へのウイルス力価の倍数変化として示す。
【０１５４】
（配列番号１：ＨＩＶ−１  ｅｎｖヌクレオチド）
ATGAGAGTGAAGGAGAAATATCAGCACTTGTGGAGATGGGGGTGGAGATGGGGCACCATG
CTCCTTGGGATGTTGATGATCTGTAGTGCTACAGAAAAATTGTGGGTCACAGTCTATTAT
GGGGTACCTGTGTGGAAGGAAGCAACCACCACTCTATTTTGTGCATCAGATGCTAAAGCA
TATGATACAGAGGTACATAATGTTTGGGCCACACATGCCTGTGTACCCACAGACCCCAAC
CCACAAGAAGTAGTATTGGTAAATGTGACAGAAAATTTTAACATGTGGAAAAATGACATG
GTAGAACAGATGCATGAGGATATAATCAGTTTATGGGATCAAAGCCTAAAGCCATGTGTA
AAATTAACCCCACTCTGTGTTAGTTTAAAGTGCACTGATTTGAAGAATGATACTAATACC
AATAGTAGTAGCGGGAGAATGATAATGGAGAAAGGAGAGATAAAAAACTGCTCTTTCAAT
ATCAGCACAAGCATAAGAGGTAAGGTGCAGAAAGAATATGCATTTTTTTATAAACTTGAT
ATAATACCAATAGATAATGATACTACCAGCTATAAGTTGACAAGTTGTAACACCTCAGTC
ATTACACAGGCCTGTCCAAAGGTATCCTTTGAGCCAATTCCCATACATTATTGTGCCCCG
GCTGGTTTTGCGATTCTAAAATGTAATAATAAGACGTTCAATGGAACAGGACCATGTACA
AATGTCAGCACAGTACAATGTACACATGGAATTAGGCCAGTAGTATCAACTCAACTGCTG
TTAAATGGCAGTCTAGCAGAAGAAGAGGTAGTAATTAGATCTGTCAATTTCACGGACAAT
GCTAAAACCATAATAGTACAGCTGAACACATCTGTAGAAATTAATTGTACAAGACCCAAC
AACAATACAAGAAAAAGAATCCGTATCCAGAGAGGACCAGGGAGAGCATTTGTTACAATA
GGAAAAATAGGAAATATGAGACAAGCACATTGTAACATTAGTAGAGCAAAATGGAATAAC
ACTTTAAAACAGATAGCTAGCAAATTAAGAGAACAATTTGGAAATAATAAAACAATAATC
TTTAAGCAATCCTCAGGAGGGGACCCAGAAATTGTAACGCACAGTTTTAATTGTGGAGGG
GAATTTTTCTACTGTAATTCAACACAACTGTTTAATAGTACTTGGTTTAATAGTACTTGG
AGTACTGAAGGGTCAAATAACACTGAAGGAAGTGACACAATCACCCTCCCATGCAGAATA
AAACAAATTATAAACATGTGGCAGAAAGTAGGAAAAGCAATGTATGCCCCTCCCATCAGT
GGACAAATTAGATGTTCATCAAATATTACAGGGCTGCTATTAACAAGAGATGGTGGTAAT
AGCAACAATGAGTCCGAGATCTTCAGACCTGGAGGAGGAGATATGAGGGACAATTGGAGA
AGTGAATTATATAAATATAAAGTAGTAAAAATTGAACCATTAGGAGTAGCACCCACCAAG
GCAAAGAGAAGAGTGGTGCAGAGAGAAAAAAGAGCAGTGGGAATAGGAGCTTTGTTCCTT
GGGTTCTTGGGAGCAGCAGGAAGCACTATGGGCGCAGCCTCAATGACGCTGACGGTACAG
GCCAGACAATTATTGTCTGGTATAGTGCAGCAGCAGAACAATTTGCTGAGGGCTATTGAG
GCGCAACAGCATCTGTTGCAACTCACAGTCTGGGGCATCAAGCAGCTCCAGGCAAGAATC
CTGGCTGTGGAAAGATACCTAAAGGATCAACAGCTCCTGGGGATTTGGGGTTGCTCTGGA
AAACTCATTTGCACCACTGCTGTGCCTTGGAATGCTAGTTGGAGTAATAAATCTCTGGAA
CAGATTTGGAATCACACGACCTGGATGGAGTGGGACAGAGAAATTAACAATTACACAAGC
TTAATACACTCCTTAATTGAAGAATCGCAAAACCAGCAAGAAAAGAATGAACAAGAATTA
TTGGAATTAGATAAATGGGCAAGTTTGTGGAATTGGTTTAACATAACAAATTGGCTGTGG
TATATAAAATTATTCATAATGATAGTAGGAGGCTTGGTAGGTTTAAGAATAGTTTTTGCT
GTACTTTCTATAGTGAATAGAGTTAGGCAGGGATATTCACCATTATCGTTTCAGACCCAC
CTCCCAACCCCGAGGGGACCCGACAGGCCCGAAGGAATAGAAGAAGAAGGTGGAGAGAGA
GACAGAGACAGATCCATTCGATTAGTGAACGGATCCTTGGCACTTATCTGGGACGATCTG
CGGAGCCTGTGCCTCTTCAGCTACCACCGCTTGAGAGACTTACTCTTGATTGTAACGAGG
ATTGTGGAACTTCTGGGACGCAGGGGGTGGGAAGCCCTCAAATATTGGTGGAATCTCCTA
CAGTATTGGAGTCAGGAACTAAAGAATAGTGCTGTTAGCTTGCTCAATGCCACAGCCATA
GCAGTAGCTGAGGGGACAGATAGGGTTATAGAAGTAGTACAAGGAGCTTGTAGAGCTATT
CGCCACATACCTAGAAGAATAAGACAGGGCTTGGAAAGGATTTTGCTATAA
【０１５５】
（配列番号２：ＨＩＶ−１  Ｅｎｖアミノ酸）
MRVKEKYQHLWRWGWRWGTMLLGMLMICSATEKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKA
YDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEVVLVNVTENFNMWKNDMVEQMHEDIISLWDQSLKPCV
KLTPLCVSLKCTDLKNDTNTNSSSGRMIMEKGEIKNCSFNISTSIRGKVQKEYAFFYKLD
IIPIDNDTTSYKLTSCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNNKTFNGTGPCT
NVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEVVIRSVNFTDNAKTIIVQLNTSVEINCTRPN
NNTRKRIRIQRGPGRAFVTIGKIGNMRQAHCNISRAKWNNTLKQIASKLREQFGNNKTII
FKQSSGGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNSTQLFNSTWFNSTWSTEGSNNTEGSDTITLPCRI
KQIINMWQKVGKAMYAPPISGQIRCSSNITGLLLTRDGGNSNNESEIFRPGGGDMRDNWR
SELYKYKVVKIEPLGVAPTKAKRRVVQREKRAVGIGALFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQ
ARQLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARILAVERYLKDQQLLGIWGCSG
KLICTTAVPWNASWSNKSLEQIWNHTTWMEWDREINNYTSLIHSLIEESQNQQEKNEQEL
LELDKWASLWNWFNITNWLWYIKLFIMIVGGLVGLRIVFAVLSIVNRVRQGYSPLSFQTH
LPTPRGPDRPEGIEEEGGERDRDRSIRLVNGSLALIWDDLRSLCLFSYHRLRDLLLIVTR
IVELLGRRGWEALKYWWNLLQYWSQELKNSAVSLLNATAIAVAEGTDRVIEVVQGACRAI
RHIPRRIRQGLERILL
【０１５６】
（配列番号３：ＶＳＶ−Ｇヌクレオチド）
atgaagtgtctgctgtacctggcgttcctgtttatcggggtgaactgcaagttcactatcgtgtttccgcacaaccaaaagggcaactggaaaaacgtgccttcaaattaccattattgccccagcagctcggacctgaactggcacaatgacctcattggaaccgcgctgcaggtgaagatgccaaagagccacaaggctatccaggctgacggatggatgtgccacgcgtcaaaatgggtgactacctgcgatttccgctggtacggaccaaaatacatcacgcacagcatcagatcattcaccccgtcagtggaacaatgcaaagaatccatcgaacagactaagcagggaacctggctgaaccctggatttccgccgcagtcgtgtgggtacgcaaccgtgaccgatgcagaggccgtgatcgtgcaagtcacgccgcatcacgtgcttgtggacgagtacaccggagaatgggtcgattcccagttcatcaacggcaagtgctccaactacatttgcccaaccgtgcacaacagcactacttggcacagcgactacaaagtgaagggtctgtgtgattccaacctgatctccatggatatcactttcttctcggaagacggcgaactgtcctcactgggcaaagaaggaactgggtttcgctcaaattacttcgcctacgaaactggaggaaaagcctgcaagatgcagtactgcaagcactggggcgtgagactacccagcggtgtctggttcgagatggccgataaggacctgtttgcagcagcgagattcccggaatgccctgagggatcgagcatctccgctccaagccaaacttcagtggacgtgagcctgatccaggacgtggaacggattctcgactactcgctgtgccaggagacctggtcgaagatcagagcgggactgcccatctcaccggtggacctgtcctacctggcgccaaagaatccgggcactggaccggcgttcaccatcatcaacggcaccctcaaatacttcgagacgcggtacatccgggtggacatcgcagctccgatcctctcccggatggtgggaatgatctcggggactactaccgaacgcgagctctgggacgactgggcaccttacgaggatgtcgagatcggacctaacggagtgctccggacctcctccgggtacaagttccctctgtacatgatcggccatggcatgctggactcggatctgcatctgtcgtccaaagcacaggtgtttgaacacccacacattcaagacgccgccagccagctgccggacgatgagtcgctgttcttcggagacacgggcttgtcaaagaatcccatcgagctggtggaaggatggttttcatcctggaaaagcagcatcgcttcattcttcttcatcattggcctgatcatcggcctatttctagtcctgcgggtgggaattcatctgtgcatcaagctcaagcacactaagaagcggcaaatctacactgatatcgagatgaatcgcctgggcaag
【０１５７】
（配列番号４：ＶＳＶ−Ｇアミノ酸）
MKCLLYLAFLFIGVNCKFTIVFPHNQKGNWKNVPSNYHYCPSSSDLNWHNDLIGTALQVKMPKSHKAIQADGWMCHASKWVTTCDFRWYGPKYITHSIRSFTPSVEQCKESIEQTKQGTWLNPGFPPQSCGYATVTDAEAVIVQVTPHHVLVDEYTGEWVDSQFINGKCSNYICPTVHNSTTWHSDYKVKGLCDSNLISMDITFFSEDGELSSLGKEGTGFRSNYFAYETGGKACKMQYCKHWGVRLPSGVWFEMADKDLFAAARFPECPEGSSISAPSQTSVDVSLIQDVERILDYSLCQETWSKIRAGLPISPVDLSYLAPKNPGTGPAFTIINGTLKYFETRYIRVDIAAPILSRMVGMISGTTTERELWDDWAPYEDVEIGPNGVLRTSSGYKFPLYMIGHGMLDSDLHLSSKAQVFEHPHIQDAASQLPDDESLFFGDTGLSKNPIELVEGWFSSWKSSIASFFFIIGLIIGLFLVLRVGIHLCIKLKHTKKRQIYTDIEMNRLGK
【０１５８】
（配列番号５：ＨＩＶ−１  ｇａｇ−ｐｏｌヌクレオチド）
atgggtgcgagagcgtcagtattaagcgggggagaattagatcgatgggaaaaaattcggttaaggccagggggaaagaaaaaatataaattaaaacatatagtatgggcaagcagggagctagaacgattcgcagttaatcctggcctgttagaaacatcagaaggctgtagacaaatactgggacagctacaaccatcccttcagacaggatcagaagaacttagatcattatataatacagtagcaaccctctattgtgtgcatcaaaggatagagataaaagacaccaaggaagctttagacaagatagaggaagagcaaaacaaaagtaagaaaaaagcacagcaagcagcagctgacacaggacacagcaatcaggtcagccaaaattaccctatagtgcagaacatccaggggcaaatggtacatcaggccatatcacctagaactttaaatgcatgggtaaaagtagtagaagagaaggctttcagcccagaagtgatacccatgttttcagcattatcagaaggagccaccccacaagatttaaacaccatgctaaacacagtggggggacatcaagcagccatgcaaatgttaaaagagaccatcaatgaggaagctgcagaatgggatagagtgcatccagtgcatgcagggcctattgcaccaggccagatgagagaaccaaggggaagtgacatagcaggaactactagtacccttcaggaacaaataggatggatgacacataatccacctatcccagtaggagaaatctataaaagatggataatcctgggattaaataaaatagtaagaatgtatagccctaccagcattctggacataagacaaggaccaaaggaaccctttagagactatgtagaccgattctataaaactctaagagccgagcaagcttcacaagaggtaaaaaattggatgacagaaaccttgttggtccaaaatgcgaacccagattgtaagactattttaaaagcattgggaccaggagcgacactagaagaaatgatgacagcatgtcagggagtggggggacccggccataaagcaagagttttggctgaagcaatgagccaagtaacaaatccagctaccataatgatacagaaaggcaattttaggaaccaaagaaagactgttaagtgtttcaattgtggcaaagaagggcacatagccaaaaattgcagggcccctaggaaaaagggctgttggaaatgtggaaaggaaggacaccaaatgaaagattgtactgagagacaggctaattttttagggaagatctggccttcccacaagggaaggccagggaattttcttcagagcagaccagagccaacagccccaccagaagagagcttcaggtttggggaagagacaacaactccctctcagaagcaggagccgatagacaaggaactgtatcctttagcttccctcagatcactctttggcagcgacccctcgtcacaataaagataggggggcaattaaaggaagctctattagatacaggagcagatgatacagtattagaagaaatgaatttgccaggaagatggaaaccaaaaatgatagggggaattggaggttttatcaaagtaagacagtatgatcagatactcatagaaatctgcggacataaagctataggtacagtattagtaggacctacacctgtcaacataattggaagaaatctgttgactcagattggctgcactttaaattttcccattagtcctattgagactgtaccagtaaaattaaagccaggaatggatggcccaaaagttaaacaatggccattgacagaagaaaaaataaaagcattagtagaaatttgtacagaaatggaaaaggaaggaaaaatttcaaaaattgggcctgaaaatccatacaatactccagtatttgccataaagaaaaaagacagtactaaatggagaaaattagtagatttcagagaacttaataagagaactcaagatttctgggaagttcaattaggaataccacatcctgcagggttaaaacagaaaaaatcagtaacagtactggatgtgggcgatgcatatttttcagttcccttagataaagacttcaggaagtatactgcatttaccatacctagtataaacaatgagacaccagggattagatatcagtacaatgtgcttccacagggatggaaaggatcaccagcaatattccagtgtagcatgacaaaaatcttagagccttttagaaaacaaaatccagacatagtcatctatcaatacatggatgatttgtatgtaggatctgacttagaaatagggcagcatagaacaaaaatagaggaactgagacaacatctgttgaggtggggatttaccacaccagacaaaaaacatcagaaagaacctccattcctttggatgggttatgaactccatcctgataaatggacagtacagcctatagtgctgccagaaaaggacagctggactgtcaatgacatacagaaattagtgggaaaattgaattgggcaagtcagatttatgcagggattaaagtaaggcaattatgtaaacttcttaggggaaccaaagcactaacagaagtagtaccactaacagaagaagcagagctagaactggcagaaaacagggagattctaaaagaaccggtacatggagtgtattatgacccatcaaaagacttaatagcagaaatacagaagcaggggcaaggccaatggacatatcaaatttatcaagagccatttaaaaatctgaaaacaggaaagtatgcaagaatgaagggtgcccacactaatgatgtgaaacaattaacagaggcagtacaaaaaatagccacagaaagcatagtaatatggggaaagactcctaaatttaaattacccatacaaaaggaaacatgggaagcatggtggacagagtattggcaagccacctggattcctgagtgggagtttgtcaatacccctcccttagtgaagttatggtaccagttagagaaagaacccataataggagcagaaactttctatgtagatggggcagccaatagggaaactaaattaggaaaagcaggatatgtaactgacagaggaagacaaaaagttgtccccctaacggacacaacaaatcagaagactgagttacaagcaattcatctagctttgcaggattcgggattagaagtaaacatagtgacagactcacaatatgcattgggaatcattcaagcacaaccagataagagtgaatcagagttagtcagtcaaataatagagcagttaataaaaaaggaaaaagtctacctggcatgggtaccagcacacaaaggaattggaggaaatgaacaagtagataaattggtcagtgctggaatcaggaaagtactatttttagatggaatagataaggcccaagaagaacatgagaaatatcacagtaattggagagcaatggctagtgattttaacctaccacctgtagtagcaaaagaaatagtagccagctgtgataaatgtcagctaaaaggggaagccatgcatggacaagtagactgtagcccaggaatatggcagctagattgtacacatttagaaggaaaagttatcttggtagcagttcatgtagccagtggatatatagaagcagaagtaattccagcagagacagggcaagaaacagcatacttcctcttaaaattagcaggaagatggccagtaaaaacagtacatacagacaatggcagcaatttcaccagtactacagttaaggccgcctgttggtgggcggggatcaagcaggaatttggcattccctacaatccccaaagtcaaggagtaatagaatctatgaataaagaattaaagaaaattataggacaggtaagagatcaggctgaacatcttaagacagcagtacaaatggcagtattcatccacaattttaaaagaaaaggggggattggggggtacagtgcaggggaaagaatagtagacataatagcaacagacatacaaactaaagaattacaaaaacaaattacaaaaattcaaaattttcgggtttattacagggacagcagagatccagtttggaaaggaccagcaaagctcctctggaaaggtgaaggggcagtagtaatacaagataatagtgacataaaagtagtgccaagaagaaaagcaaagatcatcagggattatggaaaacagatggcaggtgatgattgtgtggcaagtagacaggatgaggattaa
【０１５９】
（配列番号６：ＨＩＶ−１  ｒｅｖヌクレオチド）
ATGGCAGGCCGCTCAGGGGACTCGGATGAGGATCTGCTGAAGGCGGTGCGGCTCATCAAATTCCTGTACCAGAGCAACCCGCCACCGAACCCCGAAGGAACTCGCCAGGCTCGCAGGAACCGCCGCAGACGCTGGCGCGAACGGCAGCGCCAGATCCACAGCATCAGCGAACGCATCCTGTCAACTTACTTGGGACGGTCAGCGGAACCTGTCCCGCTGCAGCTGCCGCCGCTGGAGCGCCTGACTCTGGATTGCAACGAAGACTGCGGAACCAGCGGAACCCAGGGCGTGGGAAGCCCACAGATCCTGGTGGAATCGCCTACCATCTTGGAAAGCGGCGCGAAAGAA
【０１６０】
（配列番号７：ＨＩＶ−１  Ｒｅｖアミノ酸）
MAGRSGDSDEDLLKAVRLIKFLYQSNPPPNPEGTRQARRNRRRRWRERQRQIHSISERILSTYLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCNEDCGTSGTQGVGSPQILVESPTILESGAKE
【０１６１】
（配列番号８：ＴｅｔＲ結合部位）
tccctatcagtgatagaga 
【０１６２】
（配列番号９：ＴｅｔＲタンパク質のヌクレオチド配列）
Atgtcgcgcctggacaaaagcaaagtgattaactcagcgctggaactgttgaatgaggtgggaattgaaggactcactactcgcaagctggcacagaagctgggcgtcgagcagccaacgctgtactggcatgtgaagaataaacgggcgctcctagacgcgcttgccatcgaaatgctggaccgccatcacacccacttttgccccctggagggcgaatcctggcaagattttctgcggaacaatgcaaagtcgttccggtgcgctctgctgtcccaccgcgatggcgcaaaagtgcacctgggcactcggcccaccgagaaacaatacgaaaccctggaaaaccaactggctttcctttgccaacagggattttcactggagaatgccctgtacgcactatccgcggtcggccactttaccctgggatgcgtcctcgaagatcaggagcaccaagtcgccaaggaggaaagagaaactcctaccactgactcaatgcctccgctcctgagacaagccatcgagctgttcgaccaccagggtgctgaacctgcatttctgttcgggcttgaactgattatctgcggcctggagaaacagttgaagtgcgagtcgggatcctag
【０１６３】
（配列番号１０：ＴｅｔＲタンパク質のアミノ酸配列）
MSRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAIEMLDRHHTHFCPLEGESWQDFLRNNAKSFRCALLSHRDGAKVHLGTRPTEKQYETLENQLAFLCQQGFSLENALYALSAVGHFTLGCVLEDQEHQVAKEERETPTTDSMPPLLRQAIELFDHQGAEPAFLFGLELIICGLEKQLKCESGS
【０１６４】
（配列番号１１：アポトーシス阻害物質ＩＡＰ１）
ATGAACGAGGACACTCCGCCGTTTTATTTTATCAATACGCGCGACAACTTTCGCGATAACATCGCCGAACACGTATTCGATATGTTACTAGAAAGACATGGCTCGTTTGAAAATTATCCCATTGTAAACACGGCATTCATCAACAGCTTGATCGTTAACGGGTTTAAATACAATCAAGTCGATGACCACGTTGTGTGCGAGTATTGTGAAGCAGAAATAAAAAATTGGTCCGAAGACGAGTGTATTGAATATGCACACGTAACCTTGTCGCCGTATTGCGCCTACGCCAATAAGATTGCTGAGCATGAATCGTTTGGCGACAACATTACCATCAACGCTGTACTGGTAAAAGAAGGCAGACCCAAGTGTGTGTACAGATGCATGTCCAATTTACAGTCGCGTATGGATACGTTTGTTACTTTTTGGCCTGCCGCATTGCGTGACATGATTATAAACATCGCGGAAGCGGGACTTTTTTACACGGGTCGCGGAGACGAAACTGTATGTTTCTTTTGCGATTGTTGCGTACGTGATTGGCATACTAACGAAGACGCCTGGCAGCGACACGCCACCGAAAACCCGCAATGCTACTTTGTGCTGTCGGTGAAAGGTAAAGAATTTTGTCAAAACGCAATTACTGCCACTCACGTTGATAAACGTGACGATGACGACGACGACGATGATAATTTAAACGAGAGCGTCGATGACATTGAGGAAAAATACGAATGCAAAGTCTGTCTTGAACGCCAACGCGACGCAGTGCTTATGCCTTGTCGGCATTTTTGTGTTTGCGTTCAGTGTTATTTTGGTTTAGATCAAAAGTGTCCGACCTGTCGTCAAGACGTCACCGATTTCATAAAAATATTTGTGGTGTAG
【０１６５】
（配列番号１２：アポトーシス阻害物質ＥＢＮＡ５）
ATGGGAGATCGTAGCGAAGTCCCCGGTCCGGCACGCCCCGGACCTCCGGGAATTGGCCCCGAAGGCCCTCTAGGACAGCTCCTGCGTCGGCACCGCAGTCCCTCCCCGACCCGTGGAGGCCAAGAGCCCCGGCGGGTCAGACGCCGCGTATTAGTCCAGCAGGAAGAGGAAGTAGTAAGTGGCTCACCATCAGGGCCCCGGGGAGACAGGTCAGAGGTCCCAGGCCCAGCCCGCCCTGGCCCGCCGGGTATCGGACCCGAAGGGCCCCTGGGCCAGCTGTTGCGCCGGCACAGATCACCCAGCCCCACCCGCGGCGGTCAGGAACCTCGCCGGGTCAGACGGCGGGTGCTCGTACAACAGGAAGAGGAAGTTGTTTCTGGATCGCCCTCGGGCCCGCGCGGCGACCGCTCAGAGGTGCCTGGACCAGCCCGGCCTGGGCCCCCCGGAATCGGACCTGAAGGACCGCTGGGTCAGTTACTACGCCGGCACCGGTCCCCTTCGCCGACTCGGGGCGGGCAGGAACCCCGGCGCGTGAGGCGTCGCGTCCTGGTCCAGCAGGAGGAAGAGGTTGTCAGCGGCAGCCCATCCGGGCCGAGGGGGGATCGTTCGGAAGTGCCCGGCCCAGCACGCCCGGGCCCGCCAGGTATTGGGCCCGAAGGTCCGTTAGGTCAGCTGCTCCGGCGGCATAGGTCACCATCCCCGACTCGGGGCGGCCAGGAACCGCGGAGAGTGCGCCGGAGAGTGCTGGTGCAACAGGAGGAAGAAGTCGTGTCCGGGTCGCCGTCAGGTCCTCGGGGCGACCGGTCAGAAGTACCTGGACCGGCCCGCCCCGGACCGCCGGGCATCGGGCCGGAAGGCCCCCTGGGACAGCTGCTGCGGAGACATAGATCGCCATCCCCCACCAGAGGCGGACAGGAACCGCGCCGCGTGCGCCGCCGGGTGCTGGTTCAGCAAGAAGAAGAGGTTGTGTCGGGTTCACCTAGCGGCCCGAGAGGCGACCGGAGCGAAGTGCCAGGACCAGCACGTCCGGGCCCTCCAGGTATCGGCCCAGAAGGACCACTGGGACAACTGCTGAGACGCCATCGCTCGCCGAGCCCTACGCGCGGAGGTCAAGAACCGAGACGGGTCCGCAGACGAGTCCTCGTTCAACAAGAAGAAGAGGTCGTGTCTGGAAGCCCGTCTGGCCCAAGAGGGGACAGAAGCGAGGTGCCGGGACCGGCGCGGCCGGGGCCGCCGGGGATCGGGCCTGAAGGTCCGCTGGGGCAGCTCTTGCGCAGACACCGCTCGCCCAGCCCAACCCGCGGTGGACAAGAACCCCGACGGGTGCGGCGGCGCGTGCTCGTGCAACAAGAAGAAGAGGTTGTCTCGGGCTCGCCATCTGGCCCGCTCAGACCAAGACCGCGACCGCCGGCCCGGTCCCTCCGCGAATGGCTGCTGCGCATCAGAGACAGATTCGAGCCGCCAACTGAAACCACCCAGCGGCAGTCCATCTACATTGAGGAAGAGGAAGATGAGGATTAG
【０１６６】
（配列番号１３：アポトーシス阻害物質ＢＣＬ−ＸＬ）
ATGAGCCAGTCAAATCGGGAACTGGTGGTGGATTTTCTGAGCTACAAGCTCTCGCAAAAGGGCTACTCATGGAGCCAGTTTTCGGATGTCGAAGAAAACCGGACCGAGGCTCCAGAGGGCACCGAATCGGAGATGGAAACTCCGTCAGCAATCAACGGAAATCCATCATGGCACCTGGCAGATAGCCCGGCGGTGAACGGAGCAACCGGACATTCAAGCTCCCTGGACGCCAGAGAAGTGATTCCGATGGCGGCAGTGAAGCAGGCGCTACGCGAAGCGGGAGACGAGTTCGAGCTGCGGTACAGGAGAGCTTTTAGCGACCTGACTAGCCAGCTCCACATCACTCCGGGGACCGCCTACCAGTCGTTTGAACAGGTGGTGAACGAGCTGTTTCGGGATGGAGTCAACTGGGGCAGAATCGTGGCCTTCTTTTCCTTCGGCGGTGCGCTGTGCGTCGAATCCGTGGACAAGGAGATGCAGGTCCTGGTCAGCCGGATCGCAGCGTGGATGGCCACTTATCTCAACGATCACCTGGAGCCGTGGATTCAAGAGAATGGGGGCTGGGACACCTTCGTGGAACTGTATGGAAACAACGCGGCAGCAGAGTCGAGGAAGGGCCAAGAACGCTTTAATCGGTGGTTCCTGACTGGAATGACGGTGGCAGGAGTGGTGCTACTGGGCTCGCTTTTCAGCCGCAAATAA
【０１６７】
（配列番号１４：ＶＳＶ−Ｇに由来するＮ末端シグナルペプチド）
MLSYLIFALAVSPILG
【図１】
2021502799.tif 000007
【図２】
2021502799.tif 000008
【図３】
2021502799.tif 000009
【図４】
2021502799.tif 000010
【図５】
2021502799.tif 000011
【図６】
2021502799.tif 000012
【図７】
2021502799.tif 000013
【図８】
2021502799.tif 000014
【図９】
2021502799.tif 000015
【図１０】
2021502799.tif 000016
【配列表】
2021502799000001.app
【国際調査報告】
2021502799.tif 000017
2021502799.tif 000018
2021502799.tif 000019