(57)【要約】  胃腸（ＧＩ）管がん及び膵がんを検出するために試料を収集及び評価する非侵襲的又は最小侵襲的な方法及び組成物が、本明細書に記載されている。胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を対象から得て、グリカンマイクロアレイで選別して、ＧＬＦに含有された免疫グロブリン、とりわけ免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）による疾患特異的グリカン結合パターンを明らかにする。疾患特異的グリカン結合パターンは、最高強度又は最低強度でＧＬＦ中の免疫グロブリンにより結合されている、マイクロアレイにおける疾患特異的グリカン又はグリカンのサブセット、並びにこの疾患特異的グリカンサブセット内に見出される少なくとも１つ以上のグリカンモチーフを含む。
2021520493.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象において膵がん又はこの素因を診断する方法であって、
前記対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記ＧＬＦを複数のグリカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出し、前記グリカン結合パターンが膵がん又はこの素因に関連することと、
を含む方法。
【請求項２】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む、請求項１又は請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記少なくとも１個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている、請求項２〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６】
前記少なくとも２個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている、請求項３に記載の方法。
【請求項７】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０ＲＦＵを超える結合強度を有する、請求項２〜６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、少なくとも９０パーセンタイルのグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項２〜７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
前記少なくとも１個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている、請求項２〜４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
前記少なくとも２個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている、請求項３に記載の方法。
【請求項１１】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、７ＲＦＵ以下の結合強度を有する、請求項２〜４、９又は１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０パーセンタイル以下のグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項２〜４、９、１０又は１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３】
前記グリカンモチーフがＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである、請求項４に記載の方法。
【請求項１４】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項２〜８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される、請求項９〜１２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５で含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８】
前記複数のグリカンが外因性グリカンである、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９】
前記複数のグリカンが内因性炭水化物がん抗原を含まない、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２０】
前記複数のグリカンが炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２１】
前記膵がんが、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２２】
前記膵がんが膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である、請求項１〜２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２３】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管に瀉下を誘導することをさらに含む、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２４】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管を清浄することをさらに含む、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２５】
前記洗浄組成物が経口投与される、請求項２３又は請求項２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記洗浄組成物が、溶液である又は前記対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である、請求項２３〜２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２７】
前記洗浄組成物が、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む、請求項２３〜２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記洗浄組成物が、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む、請求項２３〜２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２９】
前記試料から前記ＧＬＦを分離することをさらに含む、請求項１〜２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
前記ＧＬＦが、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない、請求項１〜２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合が、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される、請求項１〜３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３２】
対象において膵がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンを検出する方法であって、
前記対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記ＧＬＦを複数のグリカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出し、それによって前記グリカン結合パターンを検出することと、
を含む方法。
【請求項３３】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む、請求項３２又は請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む、請求項３２〜３４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
前記少なくとも１個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている、請求項３２〜３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３７】
前記少なくとも２個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている、請求項３４に記載の方法。
【請求項３８】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０ＲＦＵを超える結合強度を有する、請求項３３〜３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３９】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、少なくとも９０パーセンタイルのグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項３３〜３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４０】
前記少なくとも１個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている、請求項３３〜３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４１】
前記少なくとも２個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている、請求項３４又は請求項３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４２】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、７ＲＦＵ以下の結合強度を有する、請求項３３〜３５、４０又は４１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４３】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０パーセンタイルのグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項３３〜３５、４０、４１又は４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４４】
前記グリカンモチーフがＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである、請求項３５に記載の方法。
【請求項４５】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項３３〜３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４６】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される、請求項４０〜４３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４７】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む、請求項３２〜４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４８】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５で含む、請求項３２〜４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４９】
前記複数のグリカンが外因性グリカンである、請求項３２〜４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５０】
前記複数のグリカンが内因性炭水化物がん抗原を含まない、請求項３２〜４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５１】
前記複数のグリカンが炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない、請求項３２〜５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５２】
前記膵がんが、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される、請求項３２〜５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５３】
前記膵がんが膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である、請求項３２〜５２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５４】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管に瀉下を誘導することをさらに含む、請求項３２〜５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５５】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管を清浄することをさらに含む、請求項３２〜５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５６】
前記洗浄組成物が経口投与される、請求項５４又は請求項５５に記載の方法。
【請求項５７】
前記洗浄組成物が、溶液である又は前記対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である、請求項５４〜５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５８】
前記洗浄組成物が、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む、請求項５４〜５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５９】
前記洗浄組成物が、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む、請求項５４〜５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６０】
前記試料から前記ＧＬＦを分離することをさらに含む、請求項３２〜５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６１】
前記ＧＬＦが、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない、請求項３２〜６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６２】
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合が、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される、請求項３２〜６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６３】
対象における膵がんの進行又は膵がん治療の有効性を、膵がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンにより評価又はモニタリングする方法であって、
前記対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記ＧＬＦを複数のグリカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出し、それによって前記グリカン結合パターンを検出することと、
を含む方法。
【請求項６４】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む、請求項６３又は請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む、請求項６３〜６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６７】
前記少なくとも１個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている、請求項６４〜６６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６８】
前記少なくとも２個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている、請求項６５に記載の方法。
【請求項６９】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０ＲＦＵを超える結合強度を有する、請求項６７又は請求項６８に記載の方法。
【請求項７０】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、少なくとも９０パーセンタイルのグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項６３〜６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７１】
前記少なくとも１個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている、請求項６４〜６６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７２】
前記少なくとも２個のグリカンが、膵がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている、請求項６５に記載の方法。
【請求項７３】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、７ＲＦＵ以下の結合強度を有する、請求項６４〜６６、７１又は７２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７４】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０パーセンタイル以下のグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項６４〜６６、７１、７２又は７３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７５】
前記グリカンモチーフがＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである、請求項６６に記載の方法。
【請求項７６】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項６４〜７０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７７】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される、請求項７１〜７４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７８】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む、請求項６３〜７７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７９】
前記グリカン結合パターンが、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５で含む、請求項６３〜７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８０】
前記複数のグリカンが外因性グリカンである、請求項６３〜７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８１】
前記複数のグリカンが内因性炭水化物がん抗原を含まない、請求項６３〜８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８２】
前記複数のグリカンが炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない、請求項６３〜８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８３】
前記膵がんが、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される、請求項６３〜８２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８４】
前記膵がんが膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である、請求項６４〜８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８５】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管に瀉下を誘導することをさらに含む、請求項６４〜８４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８６】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管を清浄することをさらに含む、請求項６４〜８４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８７】
前記洗浄組成物が経口投与される、請求項８５又は請求項８６に記載の方法。
【請求項８８】
前記洗浄組成物が、溶液である又は前記対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である、請求項８５〜８７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８９】
前記洗浄組成物が、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む、請求項８５〜８８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９０】
前記洗浄組成物が、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む、請求項８５〜８９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９１】
前記試料から前記ＧＬＦを分離することをさらに含む、請求項６４〜９０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９２】
前記ＧＬＦが、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない、請求項６４〜９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９３】
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合が、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される、請求項６４〜９２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９４】
前記ＧＬＦに存在する前記グリカン結合パターンのレベルを基準レベルと比較することをさらに含み、前記基準レベルが、早期の予め決定された期間に検出及び測定されたＧＬＦに存在するグリカン結合パターンのレベルである、請求項６４〜９３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９５】
対象において胃腸（ＧＩ）管がん又はこの素因を診断する方法であって、
前記対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記ＧＬＦを複数のグリカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出し、前記グリカン結合パターンが前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連することと、
を含む方法。
【請求項９６】
前記グリカン結合パターンが、前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む、請求項９５に記載の方法。
【請求項９７】
前記グリカン結合パターンが、前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む、請求項９５又は請求項９６に記載の方法。
【請求項９８】
前記グリカン結合パターンが、前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む、請求項９５〜９７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９９】
前記少なくとも１個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている、請求項９６〜９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１００】
前記少なくとも２個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている、請求項９９に記載の方法。
【請求項１０１】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０ＲＦＵを超える結合強度を有する、請求項９６〜１００のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０２】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、少なくとも９０パーセンタイルのグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項９６〜１０１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０３】
前記少なくとも１個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている、請求項９６〜９８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０４】
前記少なくとも２個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている、請求項９７に記載の方法。
【請求項１０５】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、７ＲＦＵ以下の強度を有する、請求項９６、９７、９８、１０３又は１０４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０６】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０パーセンタイル以下のグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項９６、９７、９８、１０３，１０４又は１０５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０７】
前記ＧＩ管がんが膵がんである、請求項９５〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０８】
前記膵がんが、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される、請求項９５〜１０７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０９】
前記膵がんが膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である、請求項９５〜１０８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１０】
前記ＧＩ管がんが結腸がんである、請求項９５〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１１】
前記ＧＩ管がんが結腸腺腫である、請求項９５〜１０６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１２】
前記グリカンモチーフがＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである、請求項９８に記載の方法。
【請求項１１３】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項９６〜１０２及び１０７〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１４】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される、請求項１０３〜１０９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１５】
前記グリカンモチーフが、以下：
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
のうちの１つ以上である、請求項９８に記載の方法。
【請求項１１６】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項９６〜１０２及び１１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１７】
前記グリカンモチーフが、以下：
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
のうちの１つ以上である、請求項９８に記載の方法。
【請求項１１８】
前記少なくとも１個のグリカンが、
Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２）Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項９６〜１０２及び１１１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１９】
前記グリカン結合パターンが、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む、請求項９５〜１１８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２０】
前記グリカン結合パターンが、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５で含む、請求項９５〜１１９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２１】
前記複数のグリカンが外因性グリカンである、請求項９５〜１２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２２】
前記複数のグリカンが内因性炭水化物がん抗原を含まない、請求項９５〜１２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２３】
前記複数のグリカンが炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない、請求項９５〜１２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２４】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管に瀉下を誘導することをさらに含む、請求項９５〜１２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２５】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管を清浄することをさらに含む、請求項９５〜１２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２６】
前記洗浄組成物が経口投与される、請求項１２４又は請求項１２５に記載の方法。
【請求項１２７】
前記洗浄組成物が、溶液である又は前記対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である、請求項１２４〜１２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２８】
前記洗浄組成物が、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む、請求項１２４〜１２７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２９】
前記洗浄組成物が、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む、請求項１２４〜１２８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３０】
前記試料から前記ＧＬＦを分離することをさらに含む、請求項９５〜１２９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３１】
前記ＧＬＦが、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない、請求項９５〜１３０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３２】
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合が、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される、請求項９５〜１３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３３】
対象において胃腸（ＧＩ）管がん若しくはこの素因に関連するグリカン結合パターンを検出する又はＧＩ管がんの進行若しくはＧＩがん治療の有効性を評価若しくはモニタリングする方法であって、
前記対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記ＧＬＦを複数のグリカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出し、それによって前記グリカン結合パターンを検出することと、
を含む方法。
【請求項１３４】
前記グリカン結合パターンが、前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む、請求項１３３に記載の方法。
【請求項１３５】
前記グリカン結合パターンが、前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む、請求項１３３又は請求項１３４に記載の方法。
【請求項１３６】
前記グリカン結合パターンが、前記ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む、請求項１３３〜１３５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３７】
前記少なくとも１個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている、請求項１３４〜１３６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１３８】
前記少なくとも２個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている、請求項１３７に記載の方法。
【請求項１３９】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０ＲＦＵを超える結合強度を有する、請求項１３４〜１３８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４０】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、少なくとも９０パーセンタイルのグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項１３４〜１３９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４１】
前記少なくとも１個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている、請求項１３４〜１３６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４２】
前記少なくとも２個のグリカンが、前記ＧＩ管がん患者の前記ＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている、請求項１４１に記載の方法。
【請求項１４３】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、７ＲＦＵ以下の結合強度を有する、請求項１３４〜１３６、１４１又は１４２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４４】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、１０パーセンタイル以下のグリカンＩｇＡ結合強度である、請求項１３４〜１３６、１４１、１４２又は１４３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４５】
前記ＧＩ管がんが膵がんである、請求項１３３〜１４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４６】
前記膵がんが、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される、請求項１３３〜１４５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４７】
前記膵がんが膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である、請求項１３３〜１４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４８】
前記ＧＩ管がんが結腸がんである、請求項１３３〜１４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４９】
前記ＧＩ管がんが結腸腺腫である、請求項１３３〜１４４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５０】
前記グリカンモチーフがＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである、請求項１３６に記載の方法。
【請求項１５１】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項１３３〜１３９及び１４５〜１４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５２】
前記少なくとも１個のグリカンが、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される、請求項１４１〜１４７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５３】
前記グリカンモチーフが、以下：
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
のうちの１つ以上である、請求項１３６に記載の方法。
【請求項１５４】
前記少なくとも１個のグリカンが、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項１３３〜１３９及び１４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５５】
前記グリカンモチーフが、以下：
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
のうちの１つ以上である、請求項１３６に記載の方法。
【請求項１５６】
前記少なくとも１個のグリカン又は前記少なくとも２個のグリカンが、
Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２）Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される、請求項１３３〜１３９及び１４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５７】
前記グリカン結合パターンが、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む、請求項１３３〜１５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５８】
前記グリカン結合パターンが、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５で含む、請求項１３３〜１５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１５９】
前記複数のグリカンが外因性グリカンである、請求項１３３〜１５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６０】
前記複数のグリカンが内因性炭水化物がん抗原を含まない、請求項１３３〜１５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６１】
前記複数のグリカンが炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない、請求項１３３〜１６０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６２】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管に瀉下を誘導することをさらに含む、請求項１３３〜１６１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６３】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管を清浄することをさらに含む、請求項１３３〜１６２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６４】
前記洗浄組成物が経口投与される、請求項１６２又は請求項１６３に記載の方法。
【請求項１６５】
前記洗浄組成物が、溶液である又は前記対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である、請求項１６２〜１６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６６】
前記洗浄組成物が、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む、請求項１６２〜１６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６７】
前記洗浄組成物が、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む、請求項１６２〜１６６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６８】
前記試料から前記ＧＬＦを分離することをさらに含む、請求項１３３〜１６７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６９】
前記ＧＬＦが、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない、請求項１３３〜１６８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７０】
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合が、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される、請求項１３３〜１６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１７１】
胃腸（ＧＩ）管がんに関連するグリカンを同定する方法であって、
ＧＩ管がんを患っている少なくとも１体の対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記ＧＬＦを複数のグリカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出し、それによって前記グリカンを同定することと、
を含む方法。
【請求項１７２】
前記ＧＩ管がんが膵がんである、請求項１７１に記載の方法。
【請求項１７３】
前記ＧＩ管がんが膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である、請求項１７１又は請求項１７２に記載の方法。
【請求項１７４】
前記ＧＩ管がんが結腸がんである、請求項１７１に記載の方法。
【請求項１７５】
前記ＧＩ管がんが結腸腺腫である、請求項１７１に記載の方法。
【請求項１７６】
前記グリカンが、グリカンモチーフＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃを含む、請求項１７２又は請求項１７３に記載の方法。
【請求項１７７】
前記グリカンがグリカンモチーフを含み、前記グリカンモチーフが、以下：
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
のうちの１つ以上である、請求項１７４に記載の方法。
【請求項１７８】
前記グリカンがグリカンモチーフを含み、前記グリカンモチーフが、以下：
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
のうちの１つ以上である、請求項１７５に記載の方法。
【請求項１７９】
前記グリカン結合パターンが、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む、請求項１７１〜１７８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８０】
前記グリカン結合パターンが、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５で含む、請求項１７１〜１７９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８１】
前記複数のグリカンが外因性グリカンである、請求項１７１〜１８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８２】
前記複数のグリカンが内因性炭水化物がん抗原を含まない、請求項１７１〜１８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８３】
前記複数のグリカンが炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない、請求項１７１〜１８２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８４】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管に瀉下を誘導することをさらに含む、請求項１７１〜１８３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８５】
前記対象に洗浄組成物を投与し、それによって前記対象の胃腸管を清浄することをさらに含む、請求項１７１〜１８４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８６】
前記洗浄組成物が経口投与される、請求項１８４又は請求項１８５に記載の方法。
【請求項１８７】
前記洗浄組成物が、溶液である又は前記対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である、請求項１８４〜１８６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８８】
前記洗浄組成物が、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む、請求項１８４〜１８７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１８９】
前記洗浄組成物が、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む、請求項１８４〜１８８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９０】
前記試料から前記ＧＬＦを分離することをさらに含む、請求項１７１〜１８９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９１】
前記ＧＬＦが、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない、請求項１７１〜１９０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９２】
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合が、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される、請求項１７１〜１９１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９３】
少なくとも１体の対照対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、前記ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むことと、
前記少なくとも１体の対照対象のＧＬＦを複数のグルカンと接触させることと、
前記ＩｇＡと前記複数のグリカンとの結合を検出することと、
前記少なくとも１体の対照対象のＧＬＦと比較して、前記ＧＩ管がんを有する少なくとも１体の対象のＧＬＦに有意に異なるレベルで結合する少なくとも１個のグリカンを同定することと、
をさらに含む、請求項１７１〜１９２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９４】
ＧＩ管がんを患っている複数の対象からＧＬＦを含む試料を得ることを含む、請求項１７１〜１９３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１９５】
複数の対照対象からＧＬＦを含む試料を得ることを含む、請求項１９３又は１９４に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本出願は、２０１８年４月３日出願の米国仮出願第６２／７６１，７１１号の優先権を主張し、この開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本開示は、膵がん及び結腸／結腸直腸がんなどのがんの検出及び予後のための非侵襲的又は最小侵襲的な方法に関する。
【背景技術】
【０００３】
胃腸（ＧＩ）及び肝胆道管、並びにＧＩ管に関連する臓器／組織に関わる障害には、胃がん、食道がん、肝がん及び膵がんなどのがんが含まれる。特に、膵がん（例えば、膵臓腺癌）は、主に膵管の細胞に生じる、膵臓における悪性増殖である。この疾患は、９番目に一般的ながん形態であるが、男性及び女性のがんによる死因では、それぞれ４番目及び５番目である。膵臓のがんは、常にほぼ致死的であり、５年生存率は３％未満である。
【０００４】
膵がんの最も一般的な症状には、黄疸、腹痛及び体重減少が含まれ、これらは、他の存在する因子と共に、多くの場合に本質的に非特異的である。したがって、腫瘍増殖の初期に膵がんを診断することは、多くの場合に困難であり、広範囲の診断精密検査を必要とし、多くの場合に診査手術の際に偶発的に発見される。超音波内視鏡検査は、膵がんの診断に利用可能な非外科的技術の一例である。しかし、小さな腫瘍、同様に限局性膵炎から膵がんへの分化も、高い信頼性で検出することは困難である。圧倒的多数の膵がん患者は、現在、腫瘍が既に膵臓を超えて周囲臓器に浸潤している及び／又は広範囲に転移している後期に、診断を受けている。後期での疾患の検出は大多数の患者において一般的であり、多くの場合に死をもたらす進行性疾患を有すると診断され、少数の患者のみにしか、初期疾患が検出されていない。
【０００５】
理想的には、バイオマーカー検出は、目的の臓器に特異的に関連する生検組織又は体液などの試料を利用する。膵臓に直接分泌されるので、膵液がこのことに適している。しかし、この液は侵襲的な方法によってのみ得ることができる。膵がん、並びにＧＩ管に関連する障害及び疾患を診断する侵襲的技術は、不便であり、対象を重大なリスクに曝すことになる。胃腸管又は関連臓器／組織の障害を有する患者を同定する非侵襲的な方法は、国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ２０１１／０５１２６９及び同ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０５６８４７に記載されており、これらの開示は、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。いずれにしても、膵がん及び結腸／結腸直腸がんなどの、初期に検出することが困難であるがんの検出及び予後のための、追加的な方法の必要性が依然として存在する。
【０００６】
グリカンベースがんバイオマーカーの文脈の範囲内では、血清に見出された炭水化物抗原１９−９（ＣＡ１９−９）が、膵がんの最先端にいる。しかし、膵がんのスクリーニング検査用にＣＡ１９−９を使用することは、全く推奨されていない。例えば、ＣＡ１９−９による評価は、大きな腫瘍を有する膵がん患者を含む多くの症例において正常であると誤認したり（偽陰性）又はがんを全く有さない人々おいて異常に上昇したりする（擬陽性）傾向を有する。したがって、ＣＡ１９−９の主な使用は、膵がん管理用の代替バイオマーカーである。さらに、ＣＡ１９−９の上昇は、抗原が多くのＧＩ管がん（例えば、結腸直腸がん、食道がん、肝細胞癌）において上昇し、他の非がんＧＩ管疾患（例えば、膵炎、硬変、胆管閉塞症）においても上昇し得るので、膵がんに特異的ではない。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】国際出願公開第２０１１／０５１２６９号
【特許文献２】国際出願公開第２０１１／０５６８４７号
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００８】
（発明の要旨）
一態様において、本開示は、対象において膵がん又はこの素因を診断する方法であって、対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出し、グリカン結合パターンが膵がん又はこの素因に関連することによる方法に関する。
【０００９】
ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む。一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む。
【００１０】
ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである。
【００１１】
一部の実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている。一部の実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、１０ＲＦＵを超える強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定した強度において少なくとも９０又は９５パーセンタイルである。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【００１２】
一部の実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている。一部の実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、７ＲＦＵ以下の強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定したすべての強度において１０又は５パーセンタイル以下である。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される。
【００１３】
一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む。一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５を有する少なくとも１個のグリカンを含む。
【００１４】
ある特定の実施形態において、複数のグリカンは外因性グリカンである。一実施形態において、複数のグリカンは内因性炭水化物がん抗原を含まない。一実施形態において、複数のグリカンは炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない。
【００１５】
一部の実施形態において、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍（ｎｏｎ−ｓｅｃｒｅｔｉｎｇ  ｉｓｌｅｔ  ｔｕｍｏｒｓ  ｏｆ  ｔｈｅ  ｐａｎｃｒｅａｓ）からなる群から選択される。一実施形態において、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である。
【００１６】
一部の実施形態において、本発明の方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管に瀉下（ｐｕｒｇａｔｉｏｎ）を誘導することを含む。一部の実施形態において、本発明の方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管を清浄することを含む。一実施形態において、洗浄組成物は経口投与される。
【００１７】
一実施形態において、洗浄組成物は、溶液である又は対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である。
【００１８】
ある特定の実施形態において、洗浄組成物は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム（ｍｏｎｏｂａｓｉｃ  ｓｏｄｉｕｍ  ｐｈｏｓｐｈａｔｅ）、第二リン酸ナトリウム（ｄｉｂａｓｉｃ  ｓｏｄｉｕｍ  ｐｈｏｓｐｈａｔｅ）、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む。
【００１９】
一部の実施形態において、洗浄組成物は、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む。
【００２０】
一部の実施形態において、本発明の方法は、試料からＧＬＦを分離することをさらに含む。一部の実施形態において、ＧＬＦは、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない。一部の実施形態において、本方法は、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを除去することを伴う。
【００２１】
一部の実施形態において、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合は、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される。
【００２２】
別の態様において、本開示は、対象において膵がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンを検出する方法であって、対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【００２３】
上記に記載されたグリカン結合パターンを検出する方法ついてのすべての実施形態は、対象において膵がん又はこの素因を診断する方法として上記に記載されている。
【００２４】
別の態様において、本開示は、対象における膵がんの進行又は膵がん治療の有効性を、膵がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンにより評価又はモニタリングする方法であって、対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【００２５】
上記に記載された膵がんの進行又は膵がん治療の有効性を評価又はモニタリングする方法ついてのすべての実施形態は、対象において膵がん又はこの素因を診断する方法として上記に記載されている。
【００２６】
さらなる態様において、本開示は、対象において胃腸（ＧＩ）管がん又はこの素因を診断する方法であって、対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出し、グリカン結合パターンがＧＩ管がん又はこの素因に関連することによる方法に関する。
【００２７】
一部の実施形態において、ＧＩ管癌は、膵がんである。一実施形態において、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌、小細胞癌、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）、膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）、インスリノーマ、グルカゴン産生腫瘍、ソマトスタチン産生腫瘍、ガストリン産生腫瘍、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される。一実施形態において、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である。
【００２８】
一部の実施形態において、ＧＩ管癌は、結腸がんである。一部の実施形態において、ＧＩ管癌は、結腸腺腫である。
【００２９】
ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む。一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、ＧＩ管がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む。
【００３０】
ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである。
【００３１】
一部の実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている。一部の実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、１０ＲＦＵを超える強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定した強度において少なくとも９０又は９５パーセンタイルである。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【００３２】
一部の実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている。一部の実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、７ＲＦＵ以下の強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定した強度において１０又は５パーセンタイル以下である。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される。
【００３３】
ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、結腸がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、以下のうちの１つ以上である。
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ。
【００３４】
一部の実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、結腸がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている。一部の実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、結腸がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、１０ＲＦＵを超える強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定したすべての強度において９０パーセンタイルである。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【００３５】
ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、結腸腺腫又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、以下のうちの１つ以上である。
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ。
【００３６】
一部の実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、結腸腺腫患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている。一部の実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、結腸がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、１０ＲＦＵを超える強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定したすべての強度において９０パーセンタイルである。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２）Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【００３７】
一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、ＧＩ管がんに関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む。一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５を有する少なくとも１個のグリカンを含む。
【００３８】
ある特定の実施形態において、複数のグリカンは外因性グリカンである。一実施形態において、複数のグリカンは内因性炭水化物がん抗原を含まない。一実施形態において、複数のグリカンは炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない。
【００３９】
一部の実施形態において、本発明の方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管に瀉下を誘導することを伴う。一部の実施形態において、本発明の方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管を清浄することを伴う。一実施形態において、洗浄組成物は経口投与される。
【００４０】
一実施形態において、洗浄組成物は、溶液である又は対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である。
【００４１】
ある特定の実施形態において、洗浄組成物は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む。
【００４２】
一部の実施形態において、洗浄組成物は、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む。
【００４３】
一部の実施形態において、本発明の方法は、試料からＧＬＦを分離することを含む。一部の実施形態において、ＧＬＦは、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない。一部の実施形態において、本方法は、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを除去することを伴う。
【００４４】
一部の実施形態において、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合は、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される。
【００４５】
別の態様において、本開示は、対象において胃腸（ＧＩ）管がん若しくはこの素因に関連するグリカン結合パターンを検出する又はＧＩ管がんの進行若しくはＧＩがん治療の有効性を評価若しくはモニタリングする方法であって、対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【００４６】
上記に記載されたグリカン結合パターンを検出する方法ついてのすべての実施形態は、対象においてＧＩ管がん又はこの素因を診断する方法として上記に記載されている。
【００４７】
なお別のさらなる態様において、本開示は、胃腸（ＧＩ）管がんに関連するグリカンを同定する方法であって、ＧＩ管がんを患っている少なくとも１体の対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカンを同定することによる方法に関する。
【００４８】
一部の実施形態において、ＧＩ管癌は、膵がんである。一実施形態において、ＧＩ管がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である。一実施形態において、グリカンは、グリカンモチーフのＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃを含む。
【００４９】
別の実施形態において、ＧＩ管癌は、結腸がんである。一実施形態において、グリカンは、グリカンモチーフ、例えば以下のうちの１つ以上を含む。
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ。
【００５０】
別の実施形態において、ＧＩ管癌は、結腸腺腫である。一実施形態において、グリカンは、グリカンモチーフ、例えば以下のうちの１つ以上を含む。
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ。
【００５１】
一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、ＧＩがんに関連する少なくとも１個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６で含む。一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５を有する少なくとも１個のグリカンを含む。
【００５２】
ある特定の実施形態において、複数のグリカンは外因性グリカンである。一実施形態において、複数のグリカンは内因性炭水化物がん抗原を含まない。一実施形態において、複数のグリカンは炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９を含まない。
【００５３】
一部の実施形態において、本発明の方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管に瀉下を誘導することを含む。一部の実施形態において、本発明の方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管を清浄することを含む。一実施形態において、洗浄組成物は経口投与される。
【００５４】
一実施形態において、洗浄組成物は、溶液である又は対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である。
【００５５】
ある特定の実施形態において、洗浄組成物は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む。
【００５６】
一部の実施形態において、洗浄組成物は、
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は
硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム、又は
第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物
を含む。
【００５７】
一部の実施形態において、本発明の方法は、試料からＧＬＦを分離することをさらに伴う。一部の実施形態において、ＧＬＦは、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない。一部の実施形態において、本方法は、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを除去することを伴う。
【００５８】
一部の実施形態において、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合は、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される。
【００５９】
一部の実施形態において、グリカンを同定する本方法は、少なくとも１体の対照対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、対照対象のＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、少なくとも１体の対照対象のＧＬＦを複数のグルカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグルカンとの結合を検出し、少なくとも１体の対照対象のＧＬＦと比較して、ＧＩ管がんを有する少なくとも１体の対象のＧＬＦに有意に異なるレベルで結合する少なくとも１個のグリカンを同定することをさらに含む。一部の実施形態において、グリカンを同定する本方法は、複数の対照対象からＧＬＦを含む試料を得ることを含む。
【００６０】
一部の実施形態において、グリカンを同定する本方法は、ＧＩ管がんを患っている複数の対象からＧＬＦを含む試料を得ることを含む。
【図面の簡単な説明】
【００６１】
【図１】健康な対象、並びにＰＤＡＣ、結腸腺腫及び結腸がん患者から収集した胃腸洗浄液（ＧＬＦ）中にＩｇＡが大きな割合のタンパク質を表すことをそれぞれ示す、４つの円グラフを描写する。各グラフにおけるＩｇＡの割合は、質量分析により決定して、各試料群において同定された上位２０個のタンパク質に関して示されている。各円グラフは、本明細書に記載されている研究において試験されたそれぞれの条件による複合的なスペクトルカウントの結果（ｃｏｍｐｏｓｉｔｅ  ｓｐｅｃｔｒａｌ  ｃｏｕｎｔｉｎｇ  ｒｅｓｕｌｔｓ）を表している。これらのデータは、試験されたすべての条件においてＩｇＡが極めて豊富であることを示している。
【図２】スペクトルカウント及びＬＣ−ＭＳ／ＭＳデータを使用して決定して、グリカンアレイに対して選別するために使用された２０個の試料におけるＩｇＡ組成をそれぞれ示す２０個の棒グラフを描写する。この情報は、ＩｇＡが多くの場合にＧＬＦのタンパク質含有量の大きな部分を構成すること、並びに全体的なＩｇＡレベルが、条件（健康な対象、ＰＤＡＣ、結腸腺腫及び結腸がんの患者）の間で有意に変動しないことを示している。
【図３Ａ】膵がん患者から収集したＧＬＦ試料中におけるＩｇＡのグリカン結合プロファイルを、研究した他のすべての非ＰＤＡＣ条件の組み合わせ（健康な対象、結腸腺腫患者、結腸がん患者の組み合わせ。）と比較して描写する。
【図３Ｂ】ＰＤＡＣ患者のＩｇＡが特定のグリカン（すなわち、グリカンＩＤ番号３３７〜３４３）に非常に高い強度で結合する、目的の特定領域の詳細図である。
【図３Ｃ】膵がん患者から収集したＧＬＦ試料におけるＩｇＡのグリカン結合プロファイルを、健康、結腸腺腫及び結腸がん患者と比較して描写する。
【図４Ａ】健康対象、並びに膵がん患者、結腸腺腫患者及び結腸がん患者との差動的グリカン相互作用を実証するヒートマップであり、選択されたグリカンへの反応性が各患者試料によって提示されている。
【図４Ｂ】ＩｇＡ反応性が非ＰＤＡＣ患者と比べてＰＤＡＣ患者において増加した、４つの最も統計的に有意なグリカンを列挙している。
【図５Ａ】健康対象及び膵がん患者から収集されたＧＬＦ試料中のＩｇＡが最高の結合強度で結合しているグリカンを描写しており、これらのグリカンの関連モチーフが破線枠内に概説されている。
【図５Ｂ】結腸腺腫患者及び結腸がん患者から収集されたＧＬＦ試料中のＩｇＡが最高の結合強度で結合しているグリカンを描写しており、これらのグリカンの共通モチーフが破線枠内に概説されている。
【図５Ｃ】健康対象及び膵がん患者から収集されたＧＬＦ試料中のＩｇＡが最低の結合強度で結合しているグリカンを描写しており、これらのグリカンの共通モチーフが破線枠内に概説されている。
【図５Ｄ】結腸腺腫患者及び結腸がん患者から収集されたＧＬＦ試料中のＩｇＡが最低の結合強度で結合しているグリカンを描写しており、これらのグリカンの関連モチーフが破線枠内に概説されている。
【図６】グリカンＩＤ番号３７の反応性についての感受性及び特異性を示す受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線である。
【発明を実施するための形態】
【００６２】
本開示は、胃腸洗浄液（ＧＬＦ）において見出される免疫グロブリン、特に免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）が、例えば、免疫グロブリンを含有するＧＬＦがグリカンマイクロアレイに対して選別されるときに、疾患特異的グリカン結合パターンを明らかにすることができる、特に胃腸（ＧＩ）管に関連する疾患、特にＧＩ管がんを明らかにすることができるという予想外の発見に、少なくとも部分的に基づいている。抗体による炭水化物又はグリカン結合が抗体によるペプチド標的化と比較してはるかに理解が不十分である技術の現状を考慮すると、この発見は、とりわけ重要である。
【００６３】
これらの態様において、本開示において提案されているように、複数の外因性グリカンに対して対象のＧＬＦから免疫グロブリンを選別することは、膵がんバイオマーカーとしてのＣＡ１９−９の使用などの現存する技術より明らかに有利であり、それは、本発明の方法が目的の臓器に対してより特異的である又は局在化されている試料を利用するからである。さらに、本発明の方法は高い特異性を提供し、したがって異なるタイプのＧＩ管がんを識別するための改善された能力を可能にする。
【００６４】
高度に特異的であり高い感受性のある身体自体の免疫系を利用するこの手法は、膵がん（例えば、ＰＤＡＣ）、結腸がん、結腸腺腫及び他のＧＩ管がんの早期の特異的な信頼性のある検出を可能にする新しい独特の手法を提供する。
【００６５】
定義
本明細書において特に定義されない限り、本発明に関連する科学及び技術用語は、当業者に一般に理解される意味を有する。これらの用語の意味及び範囲は明確であるべきである。しかし、あらゆる潜在的意味不確定の事象では、本明細書に提供されている定義が、あらゆる辞書の定義又は非本質的な定義の先例となる。さらに、文脈から必要とされない限り、単数形、例えば、「ａ」又は「ａｎ」により特徴付けられるものは複数を含む。本出願において、「又は（ｏｒ）」の使用は、特に記述されない限り「及び／又は（ａｎｄ／ｏｒ）」を意味する。
【００６６】
用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は、本明細書で使用されるとき、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」又は「により特徴付けられる（ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚｅｄ  ｂｙ）」と同義語であり、包括的又は開放型であり、追加の非列挙要素又は方法ステップを除外しない。
【００６７】
本明細書に使用される成分、反応条件等の量を表すすべての数字は、すべての場合において用語「約」により修飾されていると理解されるべきである。したがって、特に指示のない限り、本明細に記載されている数値パラメーターは、得られることが求められる望ましい特性に応じて変わり得る近似値である。少なくとも本出願の優先権を主張する任意の出願における任意の請求項の範囲への均等論の適用を限定する試みとしてではなく、各数値パラメーターは、有効桁数を踏まえて、通常の四捨五入の手法を適用することによって解釈されるべきである。典型的には、本明細書で使用されるとき、用語「約」は、測定可能な値、例えば量、一時的持続期間等を指す場合、特定の値からの±２０％又は±１０％、より好ましくは±５％、さらにより好ましくは±１％、なおより好ましくは±０．１％の変動を包含し、このような変動は本開示の方法の実施に適している。
【００６８】
本明細書で使用されるとき、用語「対象」は、ヒト及び獣医対象を含む非ヒト動物を指す。用語「非ヒト動物」には、すべての脊椎動物、例えば、非ヒト霊長類、マウス、ウサギ、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ニワトリ、両生類及び爬虫類などの哺乳動物及び非哺乳動物が含まれる。好ましい実施形態において、対象はヒトである。
【００６９】
用語「対照対象」又は「健康対象」は、本明細書で使用されるとき、膵がん及び／又はＧＩ管がん、例えば結腸がんを罹患していない健康対象を指す。用語「対照試料」は、本明細書で使用されるとき、任意の臨床的に関連する対照試料を指し、例えば、膵がん及び／又はＧＩ管がん、例えば結腸がんを罹患していない健康対象のＧＬＦ試料、評価される対象より重度ではない又は進行が遅い膵がん及び／又はＧＩ管がん、例えば結腸がん有する対象のＧＬＦ試料、他のタイプのがん又は疾患を有する対象のＧＬＦ試料等が含まれる。対照試料は、１体以上の対象に由来するＧＬＦ試料を含むことができる。対照試料は、評価される対象の早期時点で作製されたＧＬＦ試料であってもよい。例えば、対照試料は、膵がん及び／又はＧＩ管がん、例えば結腸がんの発症前、疾患の初期段階、又は治療若しくは治療の一部の投与前に、対象から採取されたＧＬＦ試料であり得る。対照試料は、膵がん及び／又はＧＩ管がん、例えば結腸がんの動物モデル又はこの動物モデルに由来する組織若しくは細胞系からのＧＬＦ試料であってもよい。
【００７０】
特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、対照レベルと比較される。用語「対照レベル」は、ＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの許容された又は予め決定された結合を指し、試験される対象に由来するＧＬＦ試料における少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフのレベルとの比較に使用される。一実施形態において、対照レベルは、遅い疾患進行を有する対象のＧＬＦ試料中のＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの結合レベルに基づいている。別の実施形態において、細胞に結合していないＦＲαの対照レベルは、速い疾患進行を有する対象のＧＬＦ中のＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの結合レベルに基づいている。別の実施形態において、ＦＲαの対照レベルは、罹患していない、すなわち、病気に罹っていない対象、すなわち、膵がん又はＧＩ管がんを有さない対象のＧＬＦ試料中のＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの結合レベルに基づいている。なお別の実施形態において、ＦＲαの対照レベルは、膵がん又はＧＩ管がんの療法の投与前の、対象のＧＬＦ試料中のＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの結合レベルに基づいている。別の実施形態において、ＦＲαの対照レベルは、試験化合物と接触していない、膵がん又はＧＩ管がんを有する対象のＧＬＦ試料中のＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの結合レベルに基づいている。別の実施形態において、ＦＲαの対照レベルは、試験化合物と接触している、膵がん又はＧＩ管がんを有さない対象のＧＬＦ試料中のＩｇＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフの結合レベルに基づいている。
【００７１】
一実施形態において、対照は、例えば健康対象からのＧＬＦ試料の免疫グロブリンＡへの少なくとも１個のグリカン又はグリカンモチーフ結合の平均レベルを使用することが予め決定されている対照などの標準化された対照である。
【００７２】
本明細書で使用されるとき、「患者」は、医師により膵がん若しくは任意の他の胃腸管がん、又はこれらの素因を有すると診断されている対象を指す。この用語は、膵がん又は任意の他の胃腸管がんを患っている患者集団を指し、例えばＧＬＦ試料を得ることができ、これから、基準グリカン結合パターン又はグリカン結合パターンの基準レベルを予め決定することができる。
【００７３】
用語「がん」又は「腫瘍」は、当該技術において良く知られており、例えば、制御されない繁殖、不死、転移潜在性、急速な増殖及び繁殖速度、並びにある特徴的な形態的特性などの発がん性細胞（ｃａｎｃｅｒ−ｃａｕｓｉｎｇ  ｃｅｌｌｓ）に典型的な特徴を有する細胞の対象における存在を指す。がん細胞は、多くの場合に腫瘍の形態であるが、そのような細胞は対象内に単独で存在し得る又は白血病細胞などの非腫瘍形成性がん細胞であり得る。本明細書で使用されるとき、用語「がん」には、前悪性と悪性のがんが含まれる。
【００７４】
本明細書で使用されるとき、用語「素因」は、特定の医学的状態を患いやすいこと又は患う傾向を指し、遺伝的要因及び生活習慣的要因が含まれる。
【００７５】
本明細書で使用されるとき、「胃腸管」又は「ＧＩ管」は、ヒト及び他の動物の体内の臓器系であり、食物を摂取し、消化して抽出し、エネルギー及び栄養素を吸収し、残存廃棄物を糞便として排泄する。ＧＩ管には、口と肛門の間のすべての構造体が含まれ、主な消化臓器、すなわち、胃、小腸（十二指腸、空腸、回腸を含む。）及び大腸（盲腸、結腸、直腸、肛門管を含む。）が含まれる連続通路を形成している。本明細書で使用されるとき、ＧＩ管は消化臓器（舌、唾液腺、膵臓、肝臓、胆嚢、胆道）も指す。この管を前腸、中腸及び後腸に分けることもでき、各区分の発生学的起源を反映している。
【００７６】
本明細書で使用されるとき、「胃腸管がん」又は「ＧＩ管がん」は、上記に定義された任意のＧＩ管臓器のがんを指し、好ましくは、胃（すなわち、胃がん。）、肝臓（肝細胞癌を含む。）、膵臓（膵管腺癌を含む。）、食道、結腸（結腸がん、結腸腺腫、結腸直腸がんを含む。）、直腸、胆管又は系、小腸及び大腸のがんである。
【００７７】
本明細書で使用されるとき、「膵臓」は、当該技術において認識される臓器を指す。膵臓は、結合組織により一緒に保持されている複数の細胞タイプの集合体を構成する臓器を指し、複数の細胞には、腺房細胞、管細胞及び島細胞が含まれるが、これらに限定されない。「腺房」は、リパーゼなどの多くの酵素を産生し、これらは十二指腸中の食物を消化するために必要である。腺房により産生されたこれらの酵素は、管と呼ばれる小さなチャンネルにより十二指腸に運ばれる。典型的には、管細胞は、血管細胞及び神経細胞に近接して結合組織により所定の場所に保持されている。ランゲルハウス島は、典型的には膵臓の外分泌腺房ユニットの間に包埋されている。島内分泌細胞の例は、インスリンの作用に対抗するするグルカゴンを分泌するアルファ細胞であり、一方、ベータ細胞はインスリンを分泌し、炭水化物代謝の制御を助ける。
【００７８】
本明細書で使用されるとき、用語「膵がん」は、当該技術において認識される疾患を指し、膵臓を含む組織に起源するがんが含まれる。様々な実施形態において、膵がんは、外分泌膵がん、膵嚢胞性新生物又は膵内分泌腫瘍である。
【００７９】
特定の実施形態において、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、腺扁平上皮癌、扁平上皮癌、巨細胞癌、腺房細胞癌及び小細胞癌からなる群から選択される外分泌膵がんである。
【００８０】
特定の実施形態において、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）、例えば切除可能な膵管腺癌（ＰＤＡＣ）であり、膵臓の外分泌構成成分内で生じる。本明細書で使用されるとき、腺を形成する細胞（空間を囲む細胞の集合体）から構成される良性（非癌性）腫瘍を指す「腺腫」に対して、「腺癌」は、癌性腫瘍を指す。本明細書で使用されるとき、「膵管腺癌細胞」は、膵臓の管内層を形成する能力を有する又は管内層を起源とする癌性細胞を指す。膵管腺癌細胞は、膵臓内に見出されることがあり、腺を形成する又は任意の臓器内に転移細胞として見出されることがある若しくはリンパ系の血流内に見出されることがある。本明細書で使用されるとき、「管細胞」は、膵臓を参照すると、膵臓内から膵臓外へ出ている管の管内層を形成する若しくは形成する能力を有する、又は管内層を起源とする任意の細胞を指す。
【００８１】
別の実施形態において、膵がんは、膵内分泌腫瘍であり、島細胞腫瘍、膵臓内分泌腫瘍（ＰＥＴ）及び膵神経内分泌腫瘍（ＰＮＥＴ）としても知られており、島細胞から生じる。特定の実施形態において、膵がんは、インスリノーマ（すなわち、インスリン産生細胞から生じる。）、グルカゴン産生腫瘍（すなわち、グルカゴン産生細胞から生じる。）、ソマトスタチン産生腫瘍（すなわち、ソマスタチン産生細胞から生じる。）、ガストリン産生腫瘍（すなわち、ガストリン産生細胞から生じる。）、ＶＩＰ産生腫瘍（血管作動性腸ペプチド産生細胞から生じる。）及び膵臓の非分泌性島腫瘍からなる群から選択される内分泌膵がんである。
【００８２】
本明細書で使用されるとき、用語「免疫グロブリン」（Ｉｇ）及び「抗体」（Ａｂ）は、主に形質細胞により産生される大きなＹ字形ポリペプチド分子のクラスを指し、免疫系の一部である又は任意のペプチドフラグメント若しくはその抗原結合フラグメントである。免疫グロブリンは、標的抗原、例えば病原体又はがん細胞の標的抗原、例えば、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、炭水化物、グリカン、多糖、ポリヌクレオチド、脂質又は前述の組み合わせを、免疫グロブリン分子の可変領域内の少なくとも１つの抗原認識部位によって認識し、それに特異的に結合する。免疫グロブリンは、免疫グロブリンの５つの主なクラス：ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ及びＩｇＭ、又はこれらのサブクラス（アイソタイプ）（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１及びＩｇＡ２）のいずれかであり、これらの重鎖定常ドメインの固有性に基づいて、それぞれアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ及びミューと参照され得る。免疫グロブリンの異なるクラスは、異なっている周知のサブユニット構造及び三次元配置を有する。
【００８３】
本明細書で使用されるとき、用語「グリカン」及び「多糖」は、国際純正及び応用化学連合（ＩＵＰＡＣ）により定義され、同義語は、グリコシドにより連結している又はグリコシド結合を介して連結している多数の直鎖又は分枝鎖単糖からなる化合物を意味する。しかし、実際には、本明細書で使用されるとき、用語「グリカン」は伸長して、炭水化物が唯一のオリゴ糖である場合でも、糖たんぱく質、糖脂質又はプロテオグリカンなどの複合糖質の炭水化物部分と称される。αとβのグリコシド結合は、糖類におけるアノマー位の相対立体化学（Ｒ又はＳ）及びＣ１から最も遠い立体中心によって区別される。α−グリコシド結合は、両方の炭素が同じ立体化学を有する場合に形成され、一方、β−グリコシド結合は、２個の炭素が異なる立体化学を有する場合に生じる。本明細書で使用されるとき、説明されたグリコシド結合の相対的な立体化学を示す「α」及び「β」は、また代替としてそれぞれ「ａ」及び「ｂ」と表される（例えば、表１を参照すること。）。世界中のグリカン科学者により当該技術において実施されるものと一致するように、グリカンは、三次元グリカン符号命名法（Ｓｙｍｂｏｌ  Ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ  ｆｏｒ  Ｇｌｙｃａｎｓ）（ＳＮＦＧ）フォーマット（例えば、図４Ｂ、５Ａ、５Ｂを参照すること。）により又はＩＵＰＡＣ短縮線形文字命名法（ＩＵＰＡＣ  ｃｏｎｄｅｎｓｅｄ  ｌｉｎｅａｒ  ｔｅｘｔ  ｎｏｍｅｎｃｌａｔｕｒｅ）（例えば、表１、特許請求の範囲及び明細書の記載全体を参照すること。）により本明細書において表現又は定義されており、免疫グロブリンにより認識及び結合されるグルカンの能力を実質的に変更しない追加の末端リンカー又はスペーサー構造を含む（例えば、表２を参照すること。）。単糖は、ヘキソース、ペントース、テトロース、ヘプトース、デオキシ糖、ジデオキシ糖、アミノ糖、ウロン酸、シアル酸等にさらに分類され得る。一般的な単糖及びこれらのコードには、Ｄ−グルコース（Ｇｌｃ）、Ｄ−ガラクトース（Ｇａｌ）、Ｌ−ガラクトース（ＬＧａｌ）、Ｄ−マンノース（Ｍａｎ）、Ｄ−フコース（Ｆｕｃ）、Ｌ−フコース（ＬＦｕｃ）、Ｎ−アセチル−Ｄ−グルコサミン（ＧｌｃＮａｃ）、Ｎ−アセチル−Ｄ−ガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、ノイラミン酸（Ｎｅｕ）、Ｎ−アセチルノイラミン酸（Ｎｅｕ５Ａｃ）、Ｄ−グルクロン酸（ＧｌｃＡ）、Ｄ−ガラクツロン酸（ＧａｌＡ）、Ｄ−マンヌロン酸（ｍａｎｎｕｒｏｎｉｃ  ａｃｉｄ）（ＭａｎＡ）等が含まれるが、これらに限定されない。グリカン構造に示されている数字は、符号又は文字の命名号を使用しているかにかかわらず、単糖において、どの炭素原子にグリコシド結合が形成されているかを示す。
【００８４】
本明細書で使用されるとき、「外因性グリカン」は、体内で産生されないグリカンを指し、例えば、グリカンアレイにおけるグリカンを指す。「内因性グリカン」は、体内で産生されるグリカンを指し、例えば、細胞表面及び細胞表面抗原に結合しているグリカンを指す。
【００８５】
「内因性炭水化物がん抗原」、例えば、炭水化物がん抗原ＣＡ１９−９は、がん又は腫瘍マーカーとして機能を果たすことができるグリカンであり、がん又は腫瘍細胞に発現されるグリカンが含まれる。
【００８６】
本明細書で使用されるとき、「グリカンモチーフ」は、少なくとも複数のグリカン、例えば、少なくとも２個、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７語、少なくとも８語、少なくとも９個又は少なくとも１０個のグリカンにおいて高度に保存されている、グリカン又は多糖内の単一の単糖、二糖構造若しくは配列、又は短オリゴ糖構造又は配列（例えば、グリコシド連結した３、４、５、６、７、８、９若しくは１０個の単糖を含む。）を指す。一部の実施形態において、共通のグリカンモチーフを除いて、これらのグリカンは、膵がん又はＧＩ管がん患者のＧＬＦに見出される免疫グロブリン、例えばＩｇＡによって、本発明の方法で試験又は選別されたすべてのグリカンのうちで最高の強度又は最低の強度で結合されているという点において別の共通性を共有する。
【００８７】
本明細書で使用されるとき、「グリカン結合パターン」又は「グリカン結合プロファイル」は、ＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）が付される少なくとも１個のグリカン又はグリカンの特定のサブセットの結合を指し、ここでグリカンは、例えば、このグリカンの特定のサブセットの結合強度が最高であると予め決定されている及び特定の医学的状態又はこの素因に独特である、特定の医学的状態（例えば、膵がん若しくはＧＩ管がん。）又はこの素因に関連する。このグリカンの特定のサブセットの同定及び前決定は、例えば、実施例３及び４に記載されている方法及び技術を使用して実施してもよいが、これらに限定されない。換言すると、本明細書で使用されるとき、「グリカン結合パターン」は、膵がん、又は胃腸（ＧＩ）管がん、例えば本明細書に定義されているように結腸がん、又はＧＩ管の他の非がん疾患などの、特定の医学的状態又はこの素因を示す。一部の実施形態において、グリカン結合パターンは、疾患特異的免疫シグネチャー（ｉｍｍｕｎｏｓｉｇｎａｔｕｒｅ）としての機能を果たし、特定の疾患を有する患者のＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）のグリカン結合は、疾患（例えば、腫瘍、がん細胞）への独特の疾患特異的免疫応答に起因して、健康対象及び他の疾患の患者と異なっている。代替的に又は組み合わせて、グリカン結合パターンは、ＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）が付される少なくとも１個のグリカン又はグリカンの特定のサブセットを含み、このグリカンの特定のサブセットの結合強度は、特定の医学的状態又はこの素因に、例えば最低の強度で結合することによって関連している。ある特定の実施形態において、グリカン結合パターンは、特定の医学的状態（例えば、膵がん、結腸がん若しくは他のＧＩ管がん。）又はこの素因に関連しているグリカンモチーフをさらに含み、例えば、グリカンモチーフは、最高の結合強度を有するグリカンのうちの少なくともいくつかにおいて及び／又は最低の結合強度を有するグリカンのうちの少なくともいくつかにおいて観察される。
【００８８】
本明細書で使用されるとき、「洗浄組成物」は、対象の胃腸管に瀉下を誘導する１種以上の活性成分を有する組成物である。そのような胃腸洗浄組成物は、腸又は結腸直腸の手術を受ける患者のＳ状結腸鏡検査、結腸内視鏡検査、Ｘ線検査、準備のための下部胃腸管調合剤として使用される。一部の実施形態において、洗浄組成物は瀉下を誘導することができ、それによって胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料又はＧＬＦ試料の収集を可能にする。洗浄組成物の様々な実施形態が本明細書において別々に考察されている。
【００８９】
したがって、本明細書で使用されるとき、「胃腸洗浄液を含む／含有する試料」又は「ＧＬＦを含む／含有する試料」又は「胃腸洗浄液試料」又は「ＧＬＦ試料」は、胃腸管が洗浄組成物の投与によって瀉下又は清浄された結果、胃腸管を介して対象の身体から排出される主に流体の形態又は液体の形態の試料を指す。
【００９０】
本明細書で使用されるとき、用語「胃腸洗浄液」又は「ＧＬＦ」は、ＧＬＦ試料に見出される大量の流体又は液体（例えば、１０ｍＬを超える、好ましくは２０ｍＬを超える、５０ｍＬを超える、１００ｍＬを超える。）を通常は指し、物理的な形態（すなわち、固体又は半固体に対して液体である。）の観点のみならず、当該物質の源の観点からも、固体若しくは半固体糞便物、又は他の任意の直腸流出液と異なっている。特に、ＧＬＦの源は、対象に投与された洗浄組成物であり、一方、糞便物又は直腸流出液の源は、対象により摂取された食物である。本開示による結腸洗浄液は、ＧＬＦと同義語である。
【００９１】
ＧＬＦは、糞便タンパク質及び免疫グロブリンと別個のものであり異なっている、免疫グロブリン（特に、ＩｇＡ）及び他のタンパク質が豊富である。ＧＬＦ試料が対象から最初に得られるとき、タンパク質及び免疫グロブリンを含むＧＬＦは、糞便物、糞便タンパク質及び糞便タンパク質から、例えば、未精製ＧＬＦ試料を相対的に非常に高い速度（例えば、１０，０００ｇを超える、１５，０００ｇを超える、２０，０００ｇを超える、３０，０００ｇを超える。）により、任意選択で比較的短時間（例えば、１０分未満、５分未満）にわたって遠心分離することによって分離され得る。
【００９２】
ＧＬＦは、また、対象に投与された洗浄組成物の化学組成をほぼ維持しており、ポリエチルグリコール（ＰＥＧ）、電解質、ｐＨバランサー、塩等が含まれ得る。これらの物質はＧＬＦタンパク質及び免疫グロブリンを損傷及び変性から保護することを助け、したがって、これらの構造的及び機能的特性を可能な限り保存する。
【００９３】
ＧＬＦ試料を得る方法は、当該技術でよく知られている。例えば、腸手術を受ける患者のＳ状結腸鏡検査、結腸内視鏡検査、Ｘ線検査、準備などの医学的手順及び／又は診断手順の前、最中又は後に、腸及び結腸が十分に瀉下及び清浄されることが重要である。一部の実施形態において、ＧＬＦ試料は、対象により自己収集される。上記に記載されたＧＬＦ中に既に存在する保護物質に加えて、酵素阻害剤及び変性剤を使用してＧＬＦの品質を保存してもよい。一部の実施形態において、試料のｐＨを調整して、試料の安定化を助けることができる。
【００９４】
本発明の方法
本開示によると、本発明の方法は、膵がんの診断及び予後の方法、並びに胃腸（ＧＩ）管がんの診断及び予後の方法を含む。膵臓及びＧＩ管の他の非がん疾患の診断及び予後の方法も、本明細書において考慮される。
【００９５】
膵がん
膵がんの診断方法
第１の態様において、本開示は、膵がん又はこの素因を診断する（すなわち、対象が膵がん又はこの素因に罹患しているかを評価する。）方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出し、グリカン結合パターンが膵がん又はこの素因に関連することによる方法に関する。
【００９６】
第２の態様において、本開示は、対象において膵がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンを検出する方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【００９７】
膵がんの予後の方法
第３の態様において、本開示は、膵がんの進行又は膵がん治療の有効性を、対象の膵がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンにより評価又はモニタリングする方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【００９８】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む。一実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む。本明細書で使用されるとき、用語「少なくとも２個」は、２個以上、好ましくは２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個を指す。本明細書で使用されるとき、用語「少なくとも１個」は、１個以上を指し、本明細書に定義されている「少なくとも２個」を包含する。一実施形態において、グリカン結合パターンは、膵がん又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである。
【００９９】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、少なくとも１個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡに最高の強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも２個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高及び二番目に高い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、８、９、１０又は１１ＲＦＵを超える強度を有する。特定の実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、１０ＲＦＵを超える強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定したすべての強度において少なくとも７５、８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８又は９９パーセンタイルであり、膵がん、結腸がん又はＧＩ管がんと関連する。一実施形態において、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【０１００】
追加的又は代替的に、ある特定の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、グリカン結合パターンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡに最低の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンをさらに含む。一実施形態において、少なくとも１個又は少なくとも２個のグリカンは、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低及び二番目に低い強度で結合することが予め決定されている。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、１０ＲＦＵ以下、９ＲＦＵ以下、８ＲＦＵ以下、７ＲＦＵ以下又は６ＲＦＵ以下の強度を有する。一実施形態において、少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を測定したすべての強度において少なくとも２５、２０、１５、１０、９、８、７、６、５、４、３、２又は１パーセンタイ未満である。一実施形態において、膵がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカン又は少なくとも２個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される。
【０１０１】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、グリカン結合パターンは、それぞれ膵がん又はＧＩ管がん、例えば結腸がんに関連する少なくとも１個又は少なくとも２個のグリカンを統計的に有意な検定ｐ値の≦１．００ｅ−６、例えば、１．００ｅ−６、１．００ｅ−７、≦１．００ｅ−７、１．００ｅ−８又は≦１．００ｅ−８で含む。
【０１０２】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、グリカン結合パターンは、膵がん又はＧＩ管がん、例えば結腸がんに関連し、それぞれ受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線の曲線下面積（ＡＵＣ）値の少なくとも０．９５、例えば、０．９５、０．９６、０．９７又は０．９９を有する少なくとも１個又は少なくとも２個のグリカンを含む。医学的診断において知られているように、ＡＵＣ−ＲＯＣ値の１は、技術、方法、ツール、機器又はバイオマーカー等の感受性及び特異性の両方の観点から完全な診断を示す。
【０１０３】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＩｇＡはＩｇＡ１である。別の実施態様において、ＩｇＡはＩｇＡ２である。なお別の実施形態において、ＩｇＡはＩｇＡ１とＩｇＡ２の混合物である。一実施形態において、ＩｇＡは、ＧＬＦ中の総タンパク質含有量の少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも２５％、少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％又は少なくとも９０％を表す。
【０１０４】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は本明細に記載されている第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、複数のグリカンは外因性グリカンである。一実施形態において、複数のグリカンは内因性がん抗原を含まない。一実施形態において、複数のグリカンはがん抗原ＣＡ１９−９を含まない。
【０１０５】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２又は３の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、膵がんは、上記に列挙された膵がんサブタイプのリストから選択されるうちのいずれか１つである。一実施形態において、上記に記載された第１、２又は３の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、膵がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である。
【０１０６】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、本方法は、対象に洗浄組成物を投与し、それによって対象の胃腸管に瀉下を誘導すること及び／又は対象の胃腸管を清浄することをさらに含む。一実施形態において、洗浄組成物は経口投与される。一実施形態において、洗浄組成物は、溶液である又は対象に投与される前に溶媒で再構成される固体組成物である。一部の実施形態において、洗浄組成物は、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、硫酸マグネシウム、硫酸ナトリウム、硫酸カリウム、クエン酸マグネシウム、クエン酸ナトリウム、クエン酸カリウム、アスコルビン酸、クエン酸、ピコスルフェートナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、ビサコジル、酸化マグネシウム、リン酸マグネシウム、リン酸カリウム、リン酸ナトリウム、第一リン酸ナトリウム、第二リン酸ナトリウム、酒石酸水素カリウム、炭酸マグネシウム、水酸化マグネシウム、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、炭酸アンモニウム、これらの無水物形態、これらの水和物又はこれらの組み合わせからなる群から選択される活性成分を含む。さらなる実施形態において、洗浄組成物は、約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、硫酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は約３０００〜約４０００の分子量を有するＰＥＧ、重炭酸ナトリウム、塩化ナトリウム及び塩化カリウム、又は硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム及び硫酸カリウム（例えば、ＳＵＰＲＥＰ（登録商標））、又は第一リン酸ナトリウム及び第二リン酸ナトリウム若しくはこれらの水和物を含む。経口投与に適しており、本発明の方法（すなわち、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法であり、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含む。）における使用に適している他の洗浄組成物が、下記により詳細に考察される。
【０１０７】
ある特定の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、本方法は試料からＧＬＦを分離することをさらに含む。ＧＬＦ試料からＧＬＦを分離する技術は上記に記載されている。
【０１０８】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＬＦは、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを含まない。一部の実施形態において、本方法は、固体又は半固体糞便物、糞便タンパク質及び糞便免疫グロブリンを試料から除去するステップをさらに含む。
【０１０９】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＬＦ  ＩｇＡと複数のグリカンとの結合は、イムノアッセイ、化学発光アッセイ、蛍光アッセイ、比色アッセイ又は質量分析アッセイを使用して検出及び測定される。一実施形態において、複数の免疫グロブリンと複数のグリカンとの結合は、実施例４に記載されているように、ＬＣ−ＭＳ／ＭＳとイムノアッセイの技術の組み合わせを使用して検出及び測定される。
【０１１０】
一部の実施形態では、上記に記載された第１、２若しくは３の態様のいずれか１つ、又は下記に記載される第４、５、６若しくは７の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、本方法は、例えば、ＧＬＦに存在するグリカン結合パターンのレベルを対照レベルと比較することをさらに含み、対照レベルは、健康対象のＧＬＦに存在するグリカン結合パターンの予め決定されたレベルである。
【０１１１】
一部の実施形態では、上記に記載された第３の態様又は下記に記載される第６の態様による方法において、本方法は、ＧＬＦに存在するグリカン結合パターンのレベルを基準レベルと比較することをさらに含み、基準レベルは、早期の予め決定された期間において、例えば、対象が膵がん、ＧＩ管がん若しくはこの素因を最初に診断される早期において、又は治療レジメン等の早期において、例えば、２週間、４週間、８週間、３か月、６か月、１２か月、１８か月若しくは２４か月前、又は３、５若しくは１０年前に検出及び測定される、ＧＬＦに存在するグリカン結合パターンのレベルである。
【０１１２】
胃腸（ＧＩ）管がん
胃腸（ＧＩ）管がんの診断方法
第４の態様において、本開示は、胃腸（ＧＩ）管がん又はこの素因を診断する（すなわち、対象がＧＩ管がん又はこの素因に罹患しているかを評価する。）方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出し、グリカン結合パターンが胃腸（ＧＩ）管がん又はこの素因に関連することによる方法に関する。
【０１１３】
第５の態様において、本開示は、対象の胃腸（ＧＩ）管がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンを検出する方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【０１１４】
胃腸（ＧＩ）管がんの予後の方法
第６の態様において、本開示は、胃腸（ＧＩ）管がんの進行又は胃腸（ＧＩ）管がん治療の有効性を、対象の胃腸（ＧＩ）管がん又はこの素因に関連するグリカン結合パターンにより評価又はモニタリングする方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカン結合パターンを検出することによる方法に関する。
【０１１５】
一部の実施形態では、上記に記載された第４、５又は６の態様のいずれか１つによる方法において、グリカン結合パターンは、ＧＩ管がん、例えば結腸がん若しくは結腸腺腫又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンを含む。一実施形態において、グリカン結合パターンは、ＧＩがん、例えば結腸がん若しくは結腸腺腫又はこの素因に関連する少なくとも２個のグリカンを含む。一実施形態において、グリカン結合パターンは、ＧＩ管がん、例えば結腸がん若しくは結腸腺腫又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンに見出されるグリカンモチーフを含む。一実施形態において、少なくとも１個のグリカンは、ＧＩ管がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている。代替的又は追加的に、ＧＩ管がん、例えば結腸がん若しくは結腸腺腫又はこの素因に関連する少なくとも１個のグリカンは、ＧＩ管がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている。
【０１１６】
ある特定の実施形態では、第４、５又は６の態様のいずれか１つによる方法において、本明細書に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＩ管がんは、上記に定義された任意のＧＩ管臓器の任意のがんである。一実施形態では、第４、５又は６の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＩ管がんは、膵がんである。一実施形態では、第４、５又は６の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＩ管がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である。一実施形態において、膵がん又はＰＤＡＣ患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、グリカンモチーフのＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃを含む。一実施形態において、膵がん又はＰＤＡＣ患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４Ｇｌｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【０１１７】
一実施形態において、膵がん又はＰＤＡＣ患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最低の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、
ＧｌｃＮＡｃβ１−６Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
ＧｌｃＡ、
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）（６Ｓ）Ｇｌｃ及び
Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎα１−６（Ｍａｎα１−３）Ｍａｎ
からなる群から選択される。
【０１１８】
一部の実施形態では、第４、５又は６の態様のいずれか１つによる方法において、本明細に記載されているこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＩ管がんは、結腸がんである。一実施形態において、結腸がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される１個以上のグリカンモチーフを含む。
【０１１９】
一実施形態において、結腸がん患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧａｌＮＡｃ；
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【０１２０】
ある特定の実施形態では、第４、５又は６の態様のいずれか１つによる方法において、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、ＧＩ管がんは、結腸腺腫である。一実施形態において、結腸腺腫患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される１個以上のグリカンモチーフを含む。
【０１２１】
一実施形態において、結腸腺腫患者のＧＬＦ中のＩｇＡと最高の強度で結合することが予め決定されている少なくとも１個のグリカンは、
Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｆｕｃα１−２Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２）Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−６（Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−２Ｍａｎα１−３）Ｍａｎβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−４ＧｌｃＮＡｃ；及び
Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ
からなる群から選択される。
【０１２２】
グリカンを同定する方法
第７の態様において、本開示は、胃腸（ＧＩ）管がんに関連するグリカンを同定する方法であって、（ｉ）対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、（ｉｉ）ＧＬＦを複数のグリカンと接触させること、（ｉｉｉ）ＩｇＡと複数のグリカンとの結合を検出し、それによってグリカンを同定することによる方法に関する。本方法は、少なくとも１体の対照対象から胃腸洗浄液（ＧＬＦ）を含む試料を得て、ＧＬＦが免疫グロブリンＡ（ＩｇＡ）を含むこと、少なくとも１体の対照対象のＧＬＦを複数のグルカンと接触させること、ＩｇＡと複数のグルカンとの結合を検出すること、少なくとも１体の対照対象のＧＬＦと比較して、ＧＩ管がんを有する少なくとも１体の対象のＧＬＦに有意に異なるレベルで結合する少なくとも１個のグリカンを同定することをさらに伴う。
【０１２３】
本明細書で使用されるとき、「差」又は「有意に異なるレベル」は、広範囲に、試験試料と対象試料におけるＩｇＡ−グリカン結合のレベルにおける任意の臨床的に関連する差（増加若しくは減少を含む。）及び／又は統計的に有意な差を指す。例示的な実施形態において、差は、受信者動作特性（ＲＯＣ）分析を使用して決定されたカットオフ値に基づいて選択され、その例が実施例に提示されている。最適なカットオフ値は、用いるアッセイ方法及び条件に応じて変わり得る。他の実施形態において、差は、グリカンＩｇＡ結合のレベルを決定する方法の検出限界より大きくなければならない。差は、評価方法の少なくとも標準誤差より大きいことが好ましく、好ましくは、評価方法の標準偏差の少なくとも約２倍、約３倍、約４倍、約５倍、約６倍、約７倍、約８倍、約９倍、約１０倍、約１５倍、約２０倍、約２５倍、約１００倍、約５００倍、約１０００倍又はそれ以上の差である。差は、任意の適切なパラメトリック（ｐａｒａｍｅｔｒｉｃ）又はノンパラメトリック（ｎｏｎｐａｒａｍｅｔｒｉｃ）記述統計又は比較を含む、任意の適切な比較により評価することができる。例えば、結合レベルの「増加」は、ＲＯＣ分析を使用して決定されたカットオフ値を超えるレベルを指すことができる。対照対象からのＧＬＦのＩｇＡの結合レベルを、２、より好ましくは約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約１００％、約１５０％、約２００％、約３００％、約４００％、約５００％、約６００％、約７００％、約８００％、約９００％又は約１０００％超える、ＧＩ管がん対象からのＧＬＦのＩｇＡの結合レベルを指すこともできる。増加は、対照対象からのＧＬＦのＩｇＡの平均結合レベルを、好ましくは少なくとも約１．５、より好ましくは約２、約３、約４、約５以上の標準偏差で上回る、試験試料におけるレベルを指すこともできる。同様に、ＧＩ管がん対象からのＧＬＦのＩｇＡの結合レベルの「減少」は、ＲＯＣ分析を使用して決定されたカットオフ値を超えないレベルを指すことができる。対照対象からの試料における結合レベルの約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％又は約９０％未満のレベルを指すこともできる。減少は、対照対象からのＧＬＦのＩｇＡの平均結合レベルを、好ましくは少なくとも約１．５、より好ましくは約２、約３、約４、約５以上の標準偏差で下回る、試験試料におけるレベルを指すこともできる。
【０１２４】
第７の態様の特定の実施形態において、本方法は、ＧＩ管がんを患っている複数の対象のＧＬＦを含む試料を得ること及び／又は複数の対照対象のＧＬＦを含む試料を得ることを伴う。
【０１２５】
第７の態様による方法の一部の実施形態において、ＧＩ管がんは、膵がんである。一実施形態において、ＧＩ管がんは、膵管腺癌（ＰＤＡＣ）である。一実施形態において、グリカンはグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃである。
【０１２６】
第７の態様による方法の一部の実施形態において、ＧＩ管がんは、結腸がんである。一実施形態において、グリカンはグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、以下のうちの１つ以上である。
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ、
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃ）及び
Ｇａｌα１−３Ｇａｌβ１−４（Ｆｕｃα１−３）ＧｌｃＮＡｃ。
【０１２７】
第７の態様による方法の一部の実施形態において、ＧＩ管がんは、結腸腺腫である。一実施形態において、グリカンはグリカンモチーフを含む。一実施形態において、グリカンモチーフは、以下のうちの１つ以上である。
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃβ１−３Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ及び
Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃ。
【０１２８】
洗浄組成物
一般に、経口投与用の洗浄組成物は、硫酸塩、重炭酸塩、塩化物、リン酸塩又はクエン酸塩のナトリウム、カリウム及びマグネシウム塩などの電解質の溶液を含む。一部のそのような組成物は、ポリエチレングリコールを含んでもよく、ポリエチレングリコールは非吸収性等張剤として作用することができる。一般的な組成物は、ポリエチレングリコールを電解質溶液と共に含み、任意選択でビサコジル又はアスコルビン酸も含み、組成物は、硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム又は硫酸カリウムなどの硫酸塩を含む。一部の実施形態において、経口洗浄液は、クエン酸マグネシウムを含むことができる。一部の実施形態において、経口洗浄液は、ピコスルフェートナトリウムを含むことができる。ポリエチレングリコールを電解質溶液と共に含む経口洗浄溶液の組成物の一例は、ＧＯＬＹＴＥＬＹ（Ｂｒａｉｎｔｒｅｅ  Ｌａｂｓ．Ｉｎｃ．）である。ＧＯＬＹＴＥＬＹは、以下のように処方される。５９ｇのポリエチレングリコール、５．６８ｇの硫酸ナトリウム、１．６９ｇの重炭酸ナトリウム、１．４６ｇの塩化ナトリウム、０．７４５ｇの塩化カリウム及び１リットルにする水。ＧＯＬＹＴＥＬＹの摂取は、対象における水と電解質のバランスに最小限の変化を有しながら、多量の液体糞便を生じる。ポリエチレングリコールを電解質溶液と共に含む経口洗浄組成物の別の例は、ＮＵＬＹＴＥＬＹ（Ｂｒａｉｎｔｒｅｅ  Ｌａｂｓ．Ｉｎｃ．）である。ポリエチレングリコールを電解質溶液及びビサコジルと共に含む例示的な経口洗浄組成物は、ＨＡＬＦＬＹＴＥＬＹ（Ｂｒａｉｎｔｒｅｅ  Ｌａｂｓ．Ｉｎｃ．）である。硫酸ナトリウム、硫酸マグネシウム又は硫酸カリウムなどの硫酸塩を含む例示的な経口洗浄組成物は、ＳＵＰＲＥＰ（Ｂｒａｉｎｔｒｅｅ  Ｌａｂｓ．Ｉｎｃ．）である。ポリエチレングリコールを電解質溶液及びアスコルビン酸と共に含む経口洗浄溶液の例示的な組成物は、ＭＯＶＩＰＲＥＰ（Ｓａｌｉｘ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．）である。
【０１２９】
ポリエチレングリコールは、大量のポリエチレングリコールが大容量の希釈塩溶液で投与される場合に、経口洗浄組成物として有効である。通常、約２５０〜４００ｇのポリエチレングリコールが、約４Ｌの電解質水中溶液で対象に投与される。ポリエチレングリコールの経口投与は、腸管運動をある期間、例えば一晩にわたって生じるために使用することができる。必要とされる用量は変わるが、８ｏｚの水中における約１０〜１００ｇのポリエチレングリコールが有効であり得る。約６８〜８５ｇのポリエチレングリコールが、おびただしい下痢を有することなく一晩の腸管運動を生じるのに有効であり得る。ポリエチレングリコールの等張液中の溶液の容量が、浸透性緩下薬の有効量であり得る。約０．５Ｌ〜約４Ｌの容量が有効であり得る。好ましくは、有効容量は、約１．５Ｌ〜約２．５Ｌである。２Ｌの等張溶液の経口投与が有効である。
【０１３０】
経口洗浄組成物のさらなる例には、ポリエチレングリコールなどの浸透性緩下薬を伴う非リン酸塩の高張溶液が含まれる（その全体が参照として組み込まれる、米国特許出願第２００９０２５８０９０号）。リン酸塩を除外した硫酸塩の混合物、例えば、以下の硫酸塩のＮａ２ＳＯ４、ＭｇＳＯ４及びＫ２ＳＯ４のうちの１つ以上の有効量が有効であり得る（例えば、ＳＵＰＲＥＰ）。一部の実施形態は、約０．１ｇ〜約２０．０ｇのＮａ２ＳＯ４を含み、約１．０ｇ〜１０．０ｇのＮａ２ＳＯ４が有用であり得る。約０．０１〜約４０．０ｇのＭｇＳＯ４の投与量が有効であり得る。約０．１ｇ〜約２０．０ｇのＮａ２ＳＯ４の用量も有利に使用され、１．０〜１０．０ｇの投与量も同様であり得る。約０．０１ｇ〜約２０．０ｇのＫ２ＳＯ４の投与量が、瀉下を生じるのに有効であり、約０．１ｇ〜約１０．０ｇ及び約０．５ｇ〜約５．０ｇのＫ２ＳＯ４の用量も有用であり得る。ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの浸透性緩下薬の添加は、上記の塩混合物の有効性を改善することができる。約１．０ｇ〜約１００ｇのＰＥＧのＰＥＧ用量が有効である。約１０．０ｇ〜約５０ｇのＰＥＧの用量も有効であり、約３４ｇの用量も同様である。投与の容易さのため、上記の塩混合物を都合の良い容量の水に溶解することができる。１リットル未満の容量の水が大部分の対象によって十分に耐容され得る。混合物を任意の少量の水に溶解することができ、１００〜５００ｍＬの容量が有用である。有効用量を分割して、患者に２回以上の投与により適切な期間にわたって投与してもよい。一般に、有効用量の２つの等しい部分の用量の６〜２４時間隔てた投与が、十分な瀉下を生じる。一部の実施形態は、経口洗浄組成物の投与の前及び最中に、確定された期間にわたって通常の経口摂取の休止を含む。
【０１３１】
一部の洗浄組成物は、ビサコジルなどの緩下薬を含む。一部の実施形態では、緩下薬を洗浄組成物と共に対象に同時投与することができる。理解されるように、そのような同時投与には、例えば、対象に洗浄組成物を投与する数時間前までの緩下薬の投与、対象への洗浄組成物の投与を伴う緩下薬の投与、又は対象に洗浄組成物を投与した数時間後までの緩下薬の投与が含まれ得る。緩下薬の例及びこれらの有効用量には、アロエ、２５０〜１０００ｍｇ；ビサコジル、約５〜８０ｍｇ；カサンスラノール、３０〜３６０ｍｇ；カスカラ芳香族流エキス剤、２〜２４ｍｌ；カスカラサグラダ樹皮、３００〜４０００ｍｇ；カスカラサグラダエキス剤、３００〜２０００ｍｇ；カスカラサグラダ流エキス剤、０．５〜５．０ｍｌ；ヒマシ油、１５〜２４０ｍｌ；ダンスロン、７５〜３００ｍｇ；デヒドロコール酸、２５０〜２０００ｍｇ；フェノールフタレイン、３０〜１０００ｍｇ；センノシドＡ及びＢ、１２〜２００ｍｇ及びピコスルフェート、１〜１００ｍｇが含まれる。
【０１３２】
洗浄組成物のさらなる例には、濃縮リン酸塩の水溶液が含まれる。リン酸塩濃縮物の水溶液は、ＧＩ管の腔内含有物に浸透効果を生じ、腸の瀉出は、身体から結腸への水及び電解質の大量の流入によって生じる。１つの例示的な組成物は、４８０ｇ／Ｌの第一リン酸ナトリウム及び１８０ｇ／Ｌの第二リン酸ナトリウムを安定化された緩衝水溶液中に含む（ＦＬＥＥＴ’Ｓ  ＰＨＯＳＰＨＯ−ＳＯＤＡ、Ｃ．Ｓ．Ｆｌｅｅｔ  Ｃｏ．，Ｉｎｃ．）。対象は、典型的には、２〜３ｏｚの用量のこの組成物を、３〜１２時間の間隔を置いて、合計６オンス（１８０ｍｌ）で摂取することが必要である。
【０１３３】
ＧＬＦ免疫グロブリンによるグリカン結合の検出及び定量化の技術、並びにグリカン結合パターンの決定の技術
イムノアッセイの例には、本明細書に記載されているラジオイムノアッセイ、酵素結合免疫測定（ＥＬＩＳＡ）及び２抗体サンドイッチアッセイが含まれるが、これらに限定されない。競合及び非競合イムノアッセイフォーマットを含む様々なイムノアッセイフォーマット、抗原捕捉アッセイ及び２抗体サンドイッチアッセイも有用である（その全体が参照により組み込まれる、Ｓｅｌｆ  ａｎｄ  Ｃｏｏｋ、（１９９６）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．７：６０〜６５頁）。一部の実施形態は、１つ以上のグリカン捕捉アッセイを含む。グリカン捕捉アッセイにおいて、ＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）は、固相に結合され、グリカンは、固定化された免疫グロブリンに個別に又は混合物として添加される。非結合タンパク質が洗浄により除去された後、結合グリカンの量を、望ましい場合は例えばラジオアッセイを使用して定量化することができる（その全体が参照として組み込まれる、Ｈａｒｌｏｗ  ａｎｄ  Ｌａｎｅ、（１９８８）Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ  Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ：Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）。イムノアッセイを、抗体過剰の条件下で実施して又は抗原競合として実施して、ＧＬＦ免疫グロブリンによるグリカン結合のレベルを定量化することができる。
【０１３４】
ある特定の実施形態において、ＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）によるグリカンの結合は、化学発光検出を使用して検出及び／又は測定することができる。例えば、ある特定の実施形態において、生物学的試料、例えばＧＬＦ試料に存在するＩｇＡに特異的な抗−抗体、及びＧＬＦに含有され、化学発光標識で標識されたＩｇＡに特異的な抗体を使用して、ＧＬＦに存在する免疫グロブリンによるグリカン結合を検出する。任意の化学発光標識及び検出系を本方法に使用することができる。化学発光二次抗体は、Ａｍｅｒｓｈａｍなどの様々な供給元から商業的に得ることができる。化学発光二次抗体を検出する方法は、当該技術において知られている。
【０１３５】
蛍光検出も、本明細書に提供されたある特定の方法においてＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）によるグリカン結合の検出に有用であり得る。有用な蛍光色素には、ＤＡＰＩ、フルオレセイン、ヘキスト３３２５８、Ｒ−フィコシアニン、Ｂ−フィコエリトリン、Ｒ−フィコエリトリン、ローダミン、テキサスレッド及びリサミンが含まれる。フルオレセイン若しくはローダミン標識抗体、又はフルオレセイン若しくはローダミン標識二次抗体は、例えば、免疫グロブリンが複数のグリカンと接触した又は複数のグリカンに暴露された後にＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）に結合するため、本発明の方法に有用であり得る。
【０１３６】
ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）も、本明細書に提供されたある特定の方法に有用であり得る。そのようなアッセイは当該技術においてよく知られている。ラジオイムノアッセイは、例えば、１２５Ｉ標識一次又は二次抗体によって実施することができる（Ｈａｒｌｏｗ  ａｎｄ  Ｌａｎｅ、ｓｕｐｒａ、１９８８年）。
【０１３７】
検出可能な試薬からのシグナルは、例えば、色素産生基質から色を検出する分光光度計、１２５Ｉの検出用のガンマ計数管などの放射線を検出する放射線計数管、又はある特定の波長の光に存在する蛍光を検出する蛍光計を使用して分析することができる。酵素結合アッセイが使用される場合、標的分子量の定量化分析は、ＥＭＡＸ  Ｍｉｃｒｏｐｌａｔｅ  Ｒｅａｄｅｒ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｄｅｖｉｃｅｓ；Ｍｅｎｌｏ  Ｐａｒｋ，Ｃａｌｉｆ．）などの分光光度計を、製造会社の使用説明書に従って使用して実施することができる。本発明のアッセイを、望ましい場合には自動化すること又はロボットにより実施することができ、複数の試料からのシグナルを同時に検出することができる。
【０１３８】
一部の実施形態において、望ましい場合には自動化され得る、キャピラリー電気泳動に基づいたイムノアッセイ（ＣＥＩＡ）を使用して、ＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）によるグリカンの結合を検出及び／又は測定することができる。イムノアッセイを、例えば、Ｓｃｈｍａｌｚｉｎｇ及びＮａｓｈａｂｅｈ（Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ、１９９７年、１８：２１８４〜９３頁）、並びにＢａｏ（Ｊ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．Ｂ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｓｃｉ．、１９９７年、６９９：４６３〜８０頁）に記載されているレーザー誘起蛍光と共に使用することもできる。フローインジェクションリポソームイムノアッセイ及びリポソーム免疫センサーなどのリポソームイムノアッセイを、Ｒｏｎｇｅｎ  ｅｔ  ａｌ．（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ、１９９７年、２０４：１０５〜１３３頁）に提示されているある特定の方法に従って使用し、ＧＬＦ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＡ）によるグリカンの結合レベルを検出及び決定することもできる。
【０１３９】
ＧＬＦ免疫グロブリン又はこのフラグメントによるグリカンの結合についての特に有用な分析方法は、質量分析である（米国特許出願第２０１０／０２７９３８２号）。多数の質量分析ベース定量化プロテオミクス法が開発されており、各試料に含有されたタンパク質を同定し、試料においてそれぞれ同定されたタンパク質の相対的存在度を決定する（Ｆｌｏｒｙ  ｅｔ  ａｌ．、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．、２００２年、２０：Ｓ２３〜２９頁；Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ，Ｊ．Ａｍ．Ｓｏｃ．Ｍａｓｓ  Ｓｐｅｃｔｒｏｍ．、２００３年、１４：６８５〜６９５頁；Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ，Ｊ．Ｉｎｆｅｃｔ．Ｄｉｓ．、２００３年、１８７  Ｓｕｐｐｌ  ２：Ｓ３１５〜３２０頁（２００３）；Ｐａｔｔｅｒｓｏｎ  ａｎｄ  Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ、Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．、２００３年、３３  Ｓｕｐｐｌ、３１１〜３２３頁；Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ  ａｎｄ  Ｍａｎｎ、Ｎａｔｕｒｅ、  ２００３年  ４２２：１９８〜２０７頁；Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ，Ｒ．ａｎｄ  Ｃｒａｖａｔｔ、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．、２００２年、２０：Ｓ１〜２頁；Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ  ａｎｄ  Ｇｏｏｄｌｅｔｔ、Ｃｈｅｍ．Ｒｅｖ．、２００１年、１０１：２６９〜２９５頁（２００１）；Ｔａｏ  ａｎｄ  Ａｅｂｅｒｓｏｌｄ、Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１４：１１０〜１１８頁（２００３））。一般に、ＧＬＦ免疫グロブリンは標識されて、元の試料を確認する同位体シグネチャーを取得し、正確な質量分析定量化の基礎を提供する。次いで、異なる同位体シグネチャーを有する試料を組み合わせ、典型的には、多次元クロマトグラフィータンデム質量分析により分析する。次いで、得られた衝突誘起解離（ＣＩＤ）スペクトルをペプチド配列に割り当て、各試料においてそれぞれ検出されたタンパク質の相対的存在度を、同一配列における異なって同位体標識されたペプチドの相対的シグナル強度に基づいて計算する。
【０１４０】
一部の実施形態は、ＧＬＦのタンパク質及び／又はタンパク質分画の濃縮を含むことができる。方法の例には、タンパク質沈殿、クロマトグラフィー、例えば、逆相クロマトグラフィー、サイズ除外クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、液体クロマトグラフィー、並びに親和性捕捉、差次的抽出法（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ  ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ  ｍｅｔｈｏｄ）及び遠心分離が含まれ得る。タンパク質及び／又はタンパク質分画は、トップダウンプロテオミクス（ｔｏｐ−ｄｏｗｎ  ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ）などのインタクトプロテイン法（ｉｎｔａｃｔ  ｐｒｏｔｅｉｎ  ｍｅｔｈｏｄ）又はＳＤＳ−ＰＡＧＥなどのゲルクロマトグラフィーを使用してさらに検査することができる。
【０１４１】
キット
第１、２、３、４、５、６又は７の態様のいずれか１つによる方法の任意の１つを実施するためのキット、系又は組成物も、上記に記載されたこれらの方法の任意の１つ以上の実施形態を含めて、本開示において考慮される。キットは、少なくとも、本明細書に定義されている洗浄組成物及びこの任意の実施形態、並びに、選別されたグリカンに免疫グロブリンが結合した後にＧＬＦ  ＩｇＡを認識し、これに結合する薬剤を含む。換言すると、本開示のキットは、ＧＬＦ  ＩｇＡ−グリカン複合体を認識する薬剤を含み、ここでグリカンは内因性抗原ではない。キットの他の構成部分には、対象からＧＬＦ試料を収集する容器が含まれ得る。ＧＬＦを収集する容器は、ＧＬＦ又は糞便試料等を捕捉する便器用のインサートを含むことができる。一部の実施形態において、容器は、ＧＬＦタンパク質及び免疫グロブリンを安定化及び／又は保存する物質、例えば、１種以上の酵素阻害剤、変性剤及び／又は単離プロテアーゼ阻害剤を含むことができる。さらなる実施形態において、キットは試料を収集する及び／又はアッセイを実施するための取扱説明書を含む。
【０１４２】
他の疾患
本明細書に記載されている任意の方法及び組成物を、胃腸管の他の非がん疾患の診断及び予後に適用することができる。疾患の非限定例には、胃腸管膵炎、膵臓腺癌、胃腸神経内分泌腫瘍、胃腺癌、結腸腺癌、肝細胞癌、胆管癌、胆嚢腺癌、潰瘍性大腸炎及びクローン病の非がん疾患が含まれる。一部の疾患は、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）に関係する。本明細書で使用されるとき、用語「炎症性腸疾患」は、胃腸管の少なくとも一部における炎症により特徴付けられる幅広いクラスの疾患を指すことができる。ＩＢＤの症状には、腸管の炎症が含まれ、腹部疝痛及び持続性の下痢をもたらし得る。炎症性腸疾患には、潰瘍性大腸炎（ＵＣ）、クローン病（ＣＤ）、分類不能大腸炎（ｉｎｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｅ  ｃｏｌｉｔｉｓ）、慢性大腸炎、非連続性又は突発性疾患（ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕｏｕｓ  ｏｒ  ｐａｔｃｈｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、回腸の炎症、結腸外炎症、陰窩の破裂に応答した肉芽腫性炎症、アフタ性潰瘍、貫壁性炎症、顕微鏡的大腸炎、憩室炎及び空置大腸炎（ｄｉｖｅｒｓｉｏｎ  ｃｏｌｉｔｉｓ）が含まれる。疾患のさらなる例には、セリアックスプルー（ｃｅｌｉａｃ  ｓｐｒｕｅ）、吸収不良障害、並びに消化管、肝臓、膵臓及び胆樹（ｂｉｌｉａｒｙ  ｔｒｅｅ）の他の状態が含まれる。
【実施例】
【０１４３】
以下の実施例は、健康対象から、並びに膵がん及び結腸がんを有する患者から収集したＧＬＦ試料に見出される、特にＩｇＡの例示的な免疫グロブリングリカン結合研究を実施するのに使用される物質及び方法（実施例１〜３）、並びにこれらの研究の結果（実施例４〜８）を記載する。
【０１４４】
実施例１−ＧＬＦの収集方法
胃腸洗浄液試料を３人の健常者、２人の結腸がん患者及び１人の良性結腸腺腫の患者から、日常的な大腸内視鏡検査の際に老廃物として収集し、１４人の患者からＰＤＡＣの診断が確認され、ステージＩＡ〜ＩＶの範囲であった。ＰＤＡＣ試料を施設内審査委員会（Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ  Ｒｅｖｉｅｗ  Ｂｏａｒｄ）（ＩＲＢ）による承認の前に収集した。非ＰＤＡＣ試料は、流体がすべての大腸内視鏡検査の前に廃棄される老廃物であるのでＩＲＢの承認を必要としなかった（ＩＲＢ免除）。すべての試料を、腸調合溶液ＳｕＰｒｅｐ（Ｂｒａｉｎｔｒｅｅ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．）を使用して収集して、調合溶液による偏りを排除した。未精製ＧＬＦ試料を、廃棄ラインからトラップの使用により収集し、長期間の保管のために直ぐに処理した。保管する前に、試料を１２０×Ｇにより４℃で２５分間遠心分離して、任意の大粒子を除去した。次いで、得られた上澄みを１１，０００×Ｇによる遠心分離で回転して、試料をさらに清澄にして、任意の残留微細破片を除去した。Ｒｏｃｋｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（Ｃｌｉｎ．Ｔｒａｎｓｌ．Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ．、２０１６年、７、ｅ１７４）。次いで、ＧＬＦのアリコート（１．８ｍＬ）を−８０℃で保管した。上記に記載された未希釈ＧＬＦの盲検試料を、グリカンアレイ選別のためにドライアイスを入れてＣｏｎｓｏｒｔｉｕｍ  ｏｆ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ｇｌｙｃｏｍｉｃｓ（ＣＦＧ、ｗｗｗ．ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｇｌｙｃｏｍｉｃｓ．ｏｒｇ）に提供した。
【０１４５】
実施例２−ＧＬＦのＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析
液体クロマトグラフィータンデム質量分析（ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ）をＴｈｅｒｍｏＳｃｉｅｎｔｉｆｉｃのＬＴＱ−ＯｒｂｉＴｒａｐ  ＸＬ機器により実施した。すべての試料を三重レプリカ技術で行った。ペプチドを、逆相Ｃ１８カラム及びＡｇｉｌｅｎｔ  １２００  Ｓｅｒｉｅｓ  ＬＣ系を２時間勾配で使用して分離した。機器による方法を、ＯｒｂｉＴｒａｐによる完全ＭＳスキャン及び上位５個のペプチドのフラグメンテーションを含むデータ依存型取得に設定した。プロダクトイオン（ｐｒｏｄｕｃｔ  ｉｏｎ）を線形イオントラップによりスキャンした。適用範囲の増加を、４５ｓのダイナミックエクスクルージョンウインドウ（ｄｙｎａｍｉｃ  ｅｘｃｌｕｓｉｏｎ  ｗｉｎｄｏｗ）を使用して得た。
【０１４６】
生データを、Ｍａｓｃｏｔ  Ｄｉｓｔｉｌｌｅｒを使用してＭａｓｃｏｔジェネリックファイル（ｇｅｎｅｒｉｃ  ｆｉｌｅｓ）に変換し、抗体構成成分を含む非重複特別仕様ヒトＮＣＢＩ基準データベース（ＲｅｆＮＣＢＩｎｒ）に対してＭａｓｃｏｔを使用して検索した。検索パラメーターは、２個の欠損切断を可能にする半トリプティック消化（ｓｅｍｉ−ｔｒｙｐｔｉｃ  ｄｉｇｅｓｔｉｏｎ）、１０ｐｐｍ（ｐｐｍ）のペプチド耐容性及び０．６Ｄａ（Ｄａ）のＭＳ／ＭＳ耐容性を含んだ。スペクトル計数を、ＩｇＡ組成物の決定のために同定された上位２０個のタンパク質に使用した。
【０１４７】
実施例３−グリカンアレイ分析
この研究に使用したグリカンマイクロアレイは、ＣＦＧからのものであった。使用したすべてのアレイは、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド誘導体化ガラススライドに共有結合的に連結された６０９個の独特のグリカン構造を６個のレプリカで含む、バージョン５．２であり、Ｂｌｉｘｔ  ｅｔ  ａｌ．により以前に詳述されている（２００４年、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．、１０１：１７０３３〜１７０３８頁）。アレイに存在するグリカンは、様々な範囲の天然に生じる構造及び合成的に組み立てられた構造の両方を提示する。本研究に使用されたＣＦＧバーション５．２マイクロアレイにおける６０９個のグリカンの構造は、修正ＩＵＰＡＣ短縮線形文字命名法を使用して、下記の表１に提示されている。表２は、グリカンに結合したスライド結合リンカーの構造を提示する。
【０１４８】
グリカン結合を可能にするため、１％ＢＳＡを有する未精製ＧＬＦをマイクロアレイで標準的な時間にわたってインキュベートし、続いてＦＩＴＣ蛍光標識二次抗体（ヤギ抗ヒトＩｇＡ、ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｃａｔ＃：３１５７７）と共にインキュベートした。ＩｇＡ結合は、スライドにおける各グリカンのＦＩＴＣシグナルをスキャンすることによって決定した。それぞれ個別の構造の最高及び最低値を排除し、残った４つの値を平均化し、構造毎に試料当たりの相対蛍光単位（ＲＦＵ）で報告した。
【０１４９】
【表１】
2021520493.tif 000003
2021520493.tif 000004
2021520493.tif 000005
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2021520493.tif 000021
【０１５０】
【表２】
2021520493.tif 000022
2021520493.tif 000023
【０１５１】
実施例４−統計分析
統計分析を、ＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ（ＧｒａｐｈＰａｄ  ＳｏｆｔｗａｒｅＩｎｃ．、バージョン６．０）の使用により実施した。図式は、Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ  Ｅｘｃｅｌ  ２００７とＧｒａｐｈＰａｄの両方を使用して生成した。データは、ＩｇＡの濃度のばらつきのため、各値を試料の中央値で割って正規化した。統計的比較は、ＧｒａｐｈＰａｄによる両側独立ｔ検定（ｔｗｏ−ｔａｉｌｅｄ  ｕｎｐａｉｒｅｄ  ｔ−ｔｅｓｔ）を使用して実施した。曲線下面積（ＡＵＣ）値もＧｒａｐｈＰａｄを使用して決定した。
【０１５２】
実施例５−ＧＬＦのＬＣ−ＭＳ／ＭＳ分析及びＧＬＦに優勢なＩｇＡの同定
ＧＬＦに実施した予備処理は、ＩｇＡが、液体クロマトグラフィータンデム質量分析（ＬＣ−ＭＳ／ＭＳ）によるスペクトル計数によって決定すると、タンパク質含有量の大きな分画を含むことを明らかにした。これらのデータを図１に示す。本研究は、ＰＤＡＣ患者のＩｇＡの結合プロファイルに焦点を合わせている。ＰＤＡＣグリカン免疫シグネチャーが独特であることを示すため、様々な他の条件を調査することが必要であった。調査した条件は、ＰＤＡＣ（ｎ＝１４）、健康対照（ｎ＝３）、結腸がん（ｎ＝２）及び結腸腺腫（ｎ＝１）であった。潜在的な交絡疾患は、別の限局性がん及びその潜在的に前癌性病変に焦点を合わせるためであった。これらの非ＰＤＡＣ試料は、選択的標的化がＰＤＡＣ特異的である及び疾患に関連する特異的抗グリカン抗体に関連すると思われることを示すために使用した。図２に示されている、この研究に使用された２０個の試料それぞれのＩｇＡ組成物は、条件間の全体的な抗体レベルの変化を示していない。
【０１５３】
正常な状況下では、ＩｇＡのレベルは、図１に示された質量分析データに基づいて他のタンパク質と比較すると依然として非常に高い。抗体の増加は疾患状態の際に生じる可能性があるが、ＧＬＦにおける全体的な組成を変更する変化には十分ではないと思われる。上昇は、親和性成熟ＩｇＡを産生し始めたクローンのサブセットのみと思われる。この特異的ＩｇＡにおける提唱された急上昇が、この本明細書の処理に利用されている。図３Ａ〜３Ｃのデータは、実施例６においてより詳細に考察され、ＧＬＦ中に極めて豊富にあるＩｇＡが機能的でもあることを示している。
【０１５４】
ＩｇＡレベルがＧＬＦ中において高いので、この免疫応答ベース手法は、ＧＬＦのみならず、ＩｇＥ及びＩｇＤなどの全体的な免疫系においても低い存在度で見出される免疫グロブリンに焦点を合わせる他のものより実践的である。ＩｇＧは、循環中に最も存在度がある抗体であるが、粘膜表面では存在度が非常に低いか存在していない。ＩｇＡは、腸の上皮バリアを横断して能動的に輸送される。ＭＳデータは、ＧＬＦにおいてＩｇＧの量が非常に少ないことを確認している。血液タンパク質が存在するときにＩｇＧがＧＬＦ中に最も豊富に見られ、このことは出血を示している。存在するＩｇＧはアレイのグリカンに結合し得るが、ＩｇＡ−グリカンと競合する場合は、シグナルが見られない。ＩｇＧがＧＬＦに存在する場合であっても、ＩｇＡ結合を検出するために抗ＩｇＡ抗体を使用したので、ＩｇＧ−グリカン結合は、ＩｇＡシグナルに関連するノイズを形成するべきではない。本明細書に提示されているデータは、精製ＩｇＡからのものではなく、希釈又は未精製ＧＬＦからのものである。ＩｇＧ及びＩｇＡは、ＭＳによって区別され、抗ＩｇＧ又は抗ＩｇＡ二次抗体によりグリカンアレイにおいて区別され得る。抗ＩｇＡ二次抗体のみをアレイに使用した。
【０１５５】
この研究は、ＧＬＦが、がん又はがんの潜在的な原因をもたらす特定のＩｇＡを含有した妥当な培地であるかを、本発明者たちが知ることを可能にした。この研究に使用したグリカンアレイは限定された資源であり、この使用には、Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ  ｏｆ  Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ  Ｇｌｙｃｏｍｉｃｓ（ＣＦＧ）運営委員会により、申請毎に最大１０個の試料のバッチが割り当てられていた。
【０１５６】
患者のＧＬＦをプールすることも可能であるが、本発明者たちが大きな数を検査できたとしても、このことは試料セットにおけるこれらの標的化ＩｇＡの傾向を複雑にし得る。したがって、グリカン標的を個別の患者で観察することがより望ましく、他の結果によって遮蔽されなかった。
【０１５７】
実施例６−複数の条件で異なるＩｇＡ−グリカン結合プロファイル
これらの患者試料のそれぞれを、６０９個の特有のグリカン構造で構成されたＣＦＧ（ｗｗｗ．ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｇｌｙｃｏｍｉｃｓ．ｏｒｇ）グリカンアレイｖ５．２で選別した。全体的なグリカン結合を図３Ａに提示し、拡大した目的領域を図３Ｂに提示する。すべての試料を、同じ相対蛍光単位（ＲＦＵ）値の中央値に正規化し、ｙ軸に示した。高いＲＦＵ値は、特定の構造へのＩｇＡ結合の増加に対応する。理論に束縛されるものではないが、本発明者たちは、測定されたＲＦＵ値が、グリカンに関連するＩｇＡ免疫グロブリン分子の量に対応し、同時に１個以上の特定のグリカンへのＩｇＡの結合親和性に対応すると考える。したがって、ＲＦＵ値は、グリカン構造に結合するＩｇＡの増加と共に増加することができ、グリカン構造へのＩｇＡの結合親和性の増加と共に増加することもできる。プロットのｘ軸は、各数字が独特のグリカン構造を表している６０９個の個別の炭水化物構造である。図３Ｃにおいて、それぞれの条件における全結合量を同じ条件のすべての試料で一緒に平均した。このことは、それぞれの条件における全体的なＩｇＡ−グリカン免疫シグネチャーを示すための助けとなる。
【０１５８】
図３Ｃから目視により明らかなように、患者のＩｇＡにより結合されたグリカンの全体的なシグネチャーは、対象の診断によって異なっている。患者群間及び患者群内の差及び共通点をさらに調査するため、ヒートマップを生成した。ヒートマップは、これらのデータの簡単な視覚的解釈を可能にし、結合量の差は色のスペクトルによって表されている。いくつかの別個のグループ分けが図４Ａの目視検査によって明かである。ＰＤＡＣ患者の抗体は、健康、結腸がん及び結腸腺腫の患者と異なる構造セットと反応すると思われる。他の条件と比較して、ＰＤＡＣ患者が増加した反応性を示す構造セットがあり、ＰＤＡＣ患者が低減した結合を示す別のセットがある。
【０１５９】
これらの観察がＰＤＡＣと他の条件との違いをもたらすので興味深い。加えて、潜在的な交絡条件を有する患者の数は少ないが、ＰＤＡＣに特異的に関連する特有のシグネチャーがあると思われる。このことは、この研究における重要な統制であり、他のＧＩ管がん及び対照からＰＤＡＣを区別する能力は、応答が疾患特異的である可能性を示している。
【０１６０】
独特のシグネチャーも疾患特異的であると思われる。特に、図３Ａ〜３Ｃに描写されているように、特有の結合プロファイルは、ＩｇＡのような親和性成熟抗体が炭水化物に結合できるという証拠を増やしている。腸ＩｇＡが結合する多くの標的が様々なグリカン構造を含むことが期待される、全体的に広い結合スペクトルが存在する。加えて、アレイプラットフォームは、他のエピトープを模倣する構造体であるミミトープ（ｍｉｍｉｔｏｐｅ）を含有してもよく、抗体の元の標的ではないことがあるグリカンへの反応をもたらす。
【０１６１】
実施例７−ＰＤＡＣにおけるＩｇＡ反応性及び非ＩｇＡ反応性グリカンとグリカンモチーフとの構造関係性
実施例４に概説されたように、両側ｔ検定を使用して、ＰＤＡＣ患者試料と非ＰＤＡＣ患者試料を個別のグリカン構造について比較した。単糖組成物及び連結、並びに全体的なグリカン構造を、上位８個のｐ≦１．２７ｅ−６で最も有意に異なる構造により十分に調査した。８個の構造のセットのスライド番号は、グリカンＩＤ番号：３３７、３３８、３４０、１９４、２９１、３１４、２０２、３４２である（ｐ値の増加順に列挙）。群は、ＰＤＡＣ患者に増加した結合を示す４個の構造（グリカンＩＤ番号：３３７、３３８、３４０、３４２）及び減少した結合を有する４個の構造（グリカンＩＤ番号：１９４、２９１、３１４、２０２）を含有した。
【０１６２】
グリカンを検査すると、ＰＤＡＣ患者のＩｇＡ結合が増加した構造類似性が明らかになった。構造３３７、３４０、３４２及び３３８が図４Ｂに示されている。ＰＤＡＣ患者で類似した結合は、特に粘膜関連リンパ組織（ＭＡＬＴ）ＩｇＡにおいて、ＰＤＡＣに関連する免疫性反応があるという強力な示唆である。終止モチーフのＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃが３３７、３４０、３４２及び３３８に存在し、結果の一貫性及び特異性をさらに増やしている。このモチーフが腸内に存在するかは不明であるが、この構造は可能な起源と共に実施例８で考察される。炭水化物は、ＰＤＡＣ発生の際の免疫応答を誘発する別の実体と抗原類似性を共有し得る。
【０１６３】
実施例８−複数の条件におけるＩｇＡ−グリカン結合パターン分析
異なる条件を提示している各試料群において最高及び最低の結合強度を実証したグリカンの、構造比較を実施した。上位１０個の最高及び最低強度のバインダーを構造類似性について検査し、最も有効なものが構造的に関連したグリカンモチーフを示すように図５Ａ〜５Ｂに配置した。各グリカンのＩｇＡ結合の感受性及び特異性は、受信者動作特性（ＲＯＣ）曲線のフォーマットで示されている。例えば、図６のグリカンＩＤ番号３３７（構造については表１を参照すること。）のＰＤＡＣのＧＬＦ  ＩｇＡ結合のＲＯＣ曲線は、特異性と選択性の組み合わせでは曲線下面積（ＡＵＣ）値の０．９５を示し、個別には８６％の特異性及び１００％の選択性を示す。
【０１６４】
グリカンで観察された特有のパターンは、破線の枠によって区別されている。各試料群は、共通パターンをなにも示さなかった健康試料における最高強度のバインダーを除いて、最高強度のバインダーであったグリカンに著しい差を明らかにした。
【０１６５】
最低強度のバインダーは、各試料群内で特有のパターンを示した。またこの傾向は試料群にわたって存在し、最も注目すべきは末端シアル酸（Ｎｅｕ５Ａｃ）の存在であった。Ｎｅｕ５Ａｃへの反応性の欠如は、ＩｇＧ−グリカン相互作用を試験する類似したグリカンアレイを使用して考証されており、Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ  ｅｔ  ａｌ．（２０１５年、Ｓｃｉ．Ｔｒａｎｓｌ．Ｍｅｄ．、７、２６９ｒａ１）により報告されている。末端Ｎｅｕ５Ａｃ残基は、ヒト糖タンパク質において一般的である。Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ  ｅｔ  ａｌ．が記述しているように、「事実、Ｎｅｕ５Ａｃは、ヒト組織の多くの糖タンパク質及び糖脂質の末端部分として遍在的に発現している自己抗原である」。免疫耐容性は、本研究のＩｇＡ及び以前に報告されているＩｇＧ研究などのクラス変換抗体の発生に役割を果たす可能性がある。この耐容性自己免疫条件が発生しないことが予測される。Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ  ｅｔ  ａｌ．により公表された末端シアル酸への反応性の欠如を示す同様の結果は重要であり、本研究の健康患者が、非ＰＤＡＣ試料で本明細書に示された結果を裏付ける同じ特徴を示したからである。
【０１６６】
他の条件に対してＰＤＡＣ患者で異なって反応すると思われる構造は、ＧｌｃＮＡｃα１−４Ｇａｌβ１−４ＧｌｃＮＡｃであり、上記の実施例７で既に同定されている。Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ（ｃｓｄｂ．ｇｌｙｃｏｓｃｉｅｎｃｅ．ｒｕ）によると、モチーフは、腸に一般に見出される細菌種であるプロテウス・ミラビリス（Ｐｒｏｔｅｕｓ  ｍｉｒａｂｉｌｉｓ）のリポ多糖の構成成分である。
【０１６７】
本発明の多数の実施形態が前述の実施例に記載されているが、基本的な実施例を変更して、本開示の化合物及び方法を利用する他の実施形態を提供できることが明かである。したがって、本開示の範囲は、例として表されている特定の実施形態ではなく、添付の特許請求の範囲により定義されることが理解される。
【０１６８】
本出願の全体にわたって引用されたすべての参考文献（対応する補足材料を伴う参考文献、発行特許、公開特許出願及び同時継続特許出願を含む。）の内容は、これらの全体が参照により本明細書に明確に組み込まれる。特に定義されない限り、本明細書に使用されるすべての技術及び科学用語は、当業者により一般的に知られている意味と一致する。
【図１】
2021520493.tif 000024
【図２】
2021520493.tif 000025
【図３Ａ】
2021520493.tif 000026
【図３Ｂ】
2021520493.tif 000027
【図３Ｃ】
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【図４Ａ】
2021520493.tif 000029
【図４Ｂ】
2021520493.tif 000030
【図５Ａ】
2021520493.tif 000031
【図５Ｂ】
2021520493.tif 000032
【図５Ｃ】
2021520493.tif 000033
【図５Ｄ】
2021520493.tif 000034
【図６】
2021520493.tif 000035
【国際調査報告】
2021520493.tif 000036
2021520493.tif 000037