(57)【要約】本発明は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９に特有である組換えＤＮＡ分子と、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトランスジェニックのトウモロコシ植物体、トウモロコシ植物体の一部、トウモロコシ種子、トウモロコシ細胞及び農産物と、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を使用し、検出する方法とを提供する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトランスジェニックのトウモロコシ植物は、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）に対して耐性を示す。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
配列番号１０、配列番号９、配列番号８、配列番号７、配列番号６、配列番号５、配列番号４、配列番号３、配列番号２、及び配列番号１から成る群から選択される配列を含む組換えＤＮＡ分子。
【請求項２】
前記組換えＤＮＡ分子が、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体、種子、または細胞に由来し、前記事象を含む種子の代表的な試料がＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１２４６３５として寄託されている、請求項１に記載の組換えＤＮＡ分子。
【請求項３】
前記組換えＤＮＡ分子がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体、細胞、種子、または植物体の一部にあり、前記事象を含む種子の代表的な試料がＡＴＣＣ  ＰＴＡ−１２４６３５として寄託されている、請求項１に記載の組換えＤＮＡ分子。
【請求項４】
前記組換えＤＮＡ分子が、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在についての診断に役立つアンプリコンである、請求項１に記載の組換えＤＮＡ分子。
【請求項５】
４つの発現カセットを含むＤＮＡ構築物であって
（ａ）第１の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）Ｅｒｉａｎｔｈｕｓ  ｒａｖｅｎｎａｅに由来するユビキチンのプロモーター、リーダー、イントロンと、（ＩＩ）ホスフィノトリシンＮ―アセチルトランスフェラーゼのコーディング配列と、（ＩＩＩ）Ｓｅｔａｒｉａ  ｉｔａｌｉｃａに由来するフルクトース−ビスリン酸アルドラーゼの３’ＵＴＲとを含み；
（ｂ）第２の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）Ｃｏｉｘ  ｌａｃｒｙｍａ−ｊｏｂｉ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のアルビノ及び淡緑色６葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（ＩＩＩ）ジカンバモノオキシゲナーゼのコーディング配列と、（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のメタロチオネイン様タンパク質の３’ＵＴＲとを含み；
（ｃ）第３の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）Ａｒｕｎｄｏ  ｄｏｎａｘ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のリンゴ酸脱水素酵素葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（ＩＩＩ）ＦＴ＿Ｔタンパク質のコーディング配列と、（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来の無頂端分裂組織タンパク質の３’ＵＴＲとを含み；
（ｄ）第４の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）ＣａＭＶ  ３５Ｓのプロモーターとリーダーと、（ＩＩ）Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ由来のクロロフィルａ／ｂ結合タンパクの質のリーダーと、（ＩＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のアクチン１のイントロンと、（ＩＶ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のＳｈｋＧ葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（Ｖ）Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ株ＣＰ４由来のグリホサート耐性５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼのコーディング配列と、（ＶＩ）Ｚｅａ  ｍａｙｓ由来の雄性組織特異的ｓｉＲＮＡの標的と、（ＶＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のグリシンリッチＲＮＡ結合タンパク質の３’ＵＴＲとを含む、
前記ＤＮＡ構築物。
【請求項６】
トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来するＤＮＡの試料において配列番号１０に特異的なＤＮＡプローブとして機能するのに十分な長さの配列番号１０の隣接ヌクレオチドを有するＤＮＡ分子。
【請求項７】
前記ＤＮＡプローブが配列番号１３を含む、請求項６に記載のＤＮＡ分子。
【請求項８】
第１のＤＮＡ分子と第２のＤＮＡ分子とを含む一対のＤＮＡ分子であって、前記第１及び第２のＤＮＡ分子はそれぞれ、配列番号１０の断片を含み、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するＤＮＡとの増幅反応において一緒に使用されるとき、ＤＮＡプライマーとして機能して、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を診断するのに役立つアンプリコンを生成する、前記一対のＤＮＡ分子。
【請求項９】
少なくとも１つのＤＮＡプライマーが配列番号７及び配列番号８から成る群から選択される配列の断片を含む、請求項８に記載の一対のＤＮＡ分子。
【請求項１０】
前記第１のＤＮＡ分子が配列番号１１を含み、前記第２のＤＮＡ分子が配列番号１２を含む、請求項８に記載の一対のＤＮＡ分子。
【請求項１１】
トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来するＤＮＡの試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する方法であって、前記方法が、
（ａ）試料を請求項６に記載のＤＮＡプローブと接触させることと；
（ｂ）前記試料及び前記ＤＮＡプローブをストリンジェントなハイブリッド形成条件に供することと；
（ｃ）前記試料における前記ＤＮＡ分子との前記ＤＮＡプローブのハイブリッド形成を検出することとを含み、
その際、前記ＤＮＡプローブの前記ＤＮＡ分子との前記ハイブリッド形成がＤＮＡの前記試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示す、前記方法。
【請求項１２】
トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来するＤＮＡの試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する方法であって、前記方法が、
（ａ）前記試料を請求項８に記載の一対のＤＮＡ分子と接触させることと；
（ｂ）配列番号１０、配列番号９、配列番号８、配列番号７、配列番号６、配列番号５、配列番号４、配列番号３、配列番号２、及び配列番号１から成る群から選択される配列を含むＤＮＡアンプリコンを生成するのに十分な増幅反応を実施することと；
（ｃ）前記ＤＮＡアンプリコンの存在を検出することと、を含み、
その際、前記ＤＮＡアンプリコンの存在が試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示す、前記方法。
【請求項１３】
トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来する試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する方法であって、前記方法が、
（ａ）トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体に前記試料を接触させることと；
（ｂ）前記試料における前記タンパク質への前記抗体の結合を検出することと、を含み、
その際、前記抗体の前記タンパク質への結合が試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示す、前記方法。
【請求項１４】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる第２のタンパク質に特異的な少なくとも第２の抗体をさらに含む、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出するためのキットであって、配列番号１０に特異的なＤＮＡプローブ、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の診断に役立つアンプリコンを生成する一対のＤＮＡプライマー、またはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体を含む、前記キット。
【請求項１６】
配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、及び配列番号１０から成る群から選択される配列を含むＤＮＡ分子を含む植物体、種子、細胞、植物体の一部、または商品生産物。
【請求項１７】
前記植物体、種子、細胞、または植物体の一部が、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対する耐性を含む、請求項１６に記載の植物体、種子、細胞、または植物体の一部。
【請求項１８】
前記植物体、種子、細胞、または植物体の一部がキザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート及びグリホサートに対して耐性がある、請求項１７に記載の植物体、種子、細胞、または植物体の一部。
【請求項１９】
作物栽培区域の雑草を防除する方法であって、
（ａ）前記作物栽培区域にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシを植えることと；
（ｂ）アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤の有効量を前記作物栽培区域またはその一部に施用して、トウモロコシに薬害を与えることなく雑草を防除することと、を含む、前記方法。
【請求項２０】
前記有効量の少なくとも１つの除草剤を施用することが、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤から成る群から選択される少なくとも２以上の除草剤を生育期全体にわたって施用することを含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記有効量の少なくとも１つの除草剤を施用することが、キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート及びグリホサート、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される除草剤を施用することを含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２２】
ジカンバの前記有効量が、生育期全体にわたる約０．５ポンド酸当量／エーカーから約２ポンド酸当量／エーカーまでのジカンバである、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
グルホシネートの前記有効量が生育期全体にわたる約０．４ポンド活性成分／エーカーから約１．５９ポンド活性成分／エーカーまでである、請求項２１に記載の方法。
【請求項２４】
２，４−Ｄの前記有効量が生育期全体にわたる約０．７５ポンド酸当量／エーカーから１．０ポンド酸当量／エーカーまでである、請求項２１に記載の方法。
【請求項２５】
ギザロホップの前記有効量が生育期全体にわたる約０．０３４ポンド活性成分／エーカーから約０．０８３ポンド活性成分／エーカーまでである、請求項２１に記載の方法。
【請求項２６】
ハロキシホップの前記有効量が生育期全体にわたる約０．０１８ポンド活性成分／エーカーから約０．０７ポンド活性成分／エーカーまでである、請求項２１に記載の方法。
【請求項２７】
区画にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む自生トウモロコシを防除する方法であって、除草剤として有効な量の少なくとも１つのシクロヘキサンジオン（ＤＩＭ）除草剤を施用することを含み、その際、前記除草剤の施用はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシの生育を阻止する、前記方法。
【請求項２８】
前記除草剤として有効な量の少なくとも１つのシクロヘキサンジオン（ＤＩＭ）除草剤を施用することが、クレトジム、セトキシジム及びトラルコキシジムから成る群から選択されるシクロヘキサンジオン（ＤＩＭ）除草剤を施用することを含む、請求項２７に記載の方法。
【請求項２９】
アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対する耐性を含む植物を生産する方法であって、
（ａ）トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物をそれ自体とまたは第２の植物と交配して種子を生産することと；
（ｂ）トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することと、を含む、前記方法。
【請求項３０】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することが、
（ａ）前記子孫種子を生育させて子孫植物を生産することと；
（ｂ）キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート及びグリホサート、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤の有効量で前記子孫植物を処理することと；
（ｃ）アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対して耐性がある子孫植物を選択することと、を含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３１】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することが、前記子孫種子に由来する試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出することを含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３２】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することが、前記子孫種子に由来する試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質の存在を検出することを含む、請求項２９に記載の方法。
【請求項３３】
雑種種子を生産する方法であって、
（ａ）配列番号１０を含む植物を生育させることと；
（ｂ）前記植物の雄性生殖組織が発達するのに先立って、またはその最中に有効量のグリホサートを施用し、それによって前記植物にて雄性不稔を誘導することと；
（ｃ）前記植物を第２の植物由来の花粉と受粉させることと；
（ｄ）前記植物から雑種種子を収穫することと、を含む、前記方法。
【請求項３４】
前記有効量のグリホサートを施用することが、前記発達に先立ってまたはその最中に約０．５ポンド酸当量／エーカーから約２．５ポンド酸当量／エーカーまでの有効量でグリホサートを施用することを含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３５】
前記有効量のグリホサートを施用することが、トウモロコシ植物発達のＶ４期、Ｖ５期、Ｖ６期、Ｖ７期、Ｖ８期、Ｖ９期、Ｖ１０期、Ｖ１１期、Ｖ１２期、Ｖ１３期及びＶ１４期から成る群から選択される発達期でグリホサートを施用することを含む、請求項３３に記載の方法。
【請求項３６】
前記雑種種子が配列番号１０を含む、請求項３３に記載の方法によって生産される雑種種子。
【請求項３７】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９について植物の接合性を判定する方法であって、
（ａ）トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在の診断に役立つ第１のアンプリコンとトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含まない野生型トウモロコシのゲノムＤＮＡの診断に役立つ第２のアンプリコンとを作り出すことができるプライマーのセットに前記植物由来のＤＮＡを含む試料を接触させることと；
（ｂ）核酸の増幅反応を実施することと；
（ｃ）第１のアンプリコン及び第２のアンプリコンを検出することと、を含み、その際、双方のアンプリコンの存在は前記試料がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヘテロ接合性であることを示し、第１のアンプリコンのみの存在は前記試料がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合性であることを示す、前記方法。
【請求項３８】
前記プライマーのセットが配列番号１１及び配列番号１２を含む、請求項３７に記載の方法。
【請求項３９】
アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対して耐性を含むトウモロコシ植物にて耐性を改善する方法であって、
（ａ）４つの発現カセットを含むＤＮＡ構築物を得ること、その際、
（ｉ）第１の発現カセットは操作可能な連結にて、（Ｉ）Ｅｒｉａｎｔｈｕｓ  ｒａｖｅｎｎａｅ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）ホスフィノトリシンＮ−アセチルトランスフェラーゼのコーディング配列と、（ＩＩＩ）Ｓｅｔａｒｉａ  ｉｔａｌｉｃａ由来のフルクトース−ビスリン酸アルドラーゼの３’ＵＲＬとを含み；
（ｉｉ）第２の発現カセットは操作可能な連結にて、（Ｉ）Ｃｏｉｘ  ｌａｃｒｙｍａ−ｊｏｂｉ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のアルビノ及び淡緑６葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（ＩＩＩ）ジカンバモノオキシゲナーゼのコーディング配列と、（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のメタロチオネイン様タンパク質の３’ＵＴＲとを含み；
（ｉｉｉ）第３の発現カセットは操作可能な連結にて、（Ｉ）Ａｒｕｎｄｏ  ｄｏｎａｘ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のリンゴ酸脱水素酵素葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（ＩＩＩ）ＦＴ＿Ｔタンパク質のコーディング配列と、（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来の無頂端分裂組織タンパク質の３’ＵＴＲとを含み；
（ｉｖ）第４の発現カセットは操作可能な連結にて、（Ｉ）ＣａＭＶ  ３５Ｓのプロモーター及びリーダーと、（ＩＩ）Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ由来のクロロフィルａ／ｂ結合タンパク質のリーダーと、（ＩＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のアクチン１のイントロンと、（ＩＶ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のＳｈｋＧ葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（Ｖ）Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐのＣＰ４株由来のグリホサート耐性の５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼのコーディング配列と、（ＶＩ）Ｚｅａ  ｍａｙｓ由来の雄性組織特異的なｓｉＲＮＡ標的と、（ＶＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のグリシンリッチＲＮＡ結合タンパク質の３’ＵＴＲとを含むことと；
（ｂ）トウモロコシ細胞のゲノムに前記ＤＮＡ構築物を挿入することと；
（ｃ）トウモロコシ細胞をトウモロコシ植物にて再生させることと；
（ｄ）前記ＤＮＡ構築物を含むトウモロコシ植物を選択することと、を含む、前記方法。
【請求項４０】
前記選択することが、キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート及びグリホサートから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤の有効量でトウモロコシ植物を処理することを含む、請求項３９に記載の方法。
【請求項４１】
トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞であって、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対する耐性を含み、請求項３９に記載の方法によって入手可能であり、その際、前記トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞は前記ＤＮＡ構築物を含む、前記トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は２０１８年２月２日出願の米国仮出願第６２／６２５，５３７号の優先権の利益を主張し、この開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０００２】
配列表の組み込み
４４．２ＫＢであり（ＭＳ  Ｗｉｎｄｏｗｓにおいて測定された）、２０１９年１月１７日に作成されたファイル名「ＭＯＮＳ４３０ＷＯ−ｓｅｑ．ｔｘｔ」中に含有されている配列表は、電子申請によって本明細書と共に提出され、参照により本明細書に組み込まれる。
【０００３】
発明の分野
本発明は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の組換えＤＮＡ分子に関する。本発明はまた、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトランスジェニックトウモロコシの植物体、一部、種子、細胞、及び農産物、ならびにトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトランスジェニックトウモロコシの植物体、一部、種子、細胞、及び農産物を使用し、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を検出する方法にも関する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトランスジェニックトウモロコシの植物体、一部、種子、及び細胞は、例えば、キザロホップやハロキシホップのようなアリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤；ジカンバ及び２，４−Ｄのような合成オーキシン；グルホシネートのようなグルタミン合成酵素の阻害剤；ならびにグリホサートのような５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤に対する耐性を示す。
【背景技術】
【０００４】
トウモロコシ（Ｚｅａ  ｍａｙｓ）は世界の多くの区域で重要な作物であり、作物生産における雑草防除のための除草剤の使用は十分に確立されたツールである。バイオテクノロジーの方法を使用して、導入遺伝子としても知られる異種遺伝子の発現に起因して特定の除草剤に対して耐性があるトランスジェニックトウモロコシを生産してきた。除草剤耐性形質は、単独で使用することができ、または別の除草剤に対する耐性もしくは害虫や病原体に対する抵抗性のような他の形質と組み合わせることができる。除草剤耐性形質の組み合わせは、栽培者の自由度を高め、困難な雑草を防除するための行動の複数の除草剤モードの使用を可能にする雑草防除の選択肢を提供することが望ましい。形質の組み合わせは、個々の形質を一緒に交配させることによって達成することができる。トウモロコシの個々の形質を一緒に交配し、精鋭で構成される生殖質の多様なプールと共に交配中にこの組み合わせを維持することは、時間と費用がかかるプロセスである。形質の組み合わせは、ゲノムの１つの場所または遺伝子座にて複数の形質を組み合わせることによっても達成でき、それによって交配プロセスが簡素化される。これを達成する方法の１つは複数の導入遺伝子を含有する単回のトランスジェニック挿入を介する。トウモロコシにおける単一遺伝子座での複数の除草剤耐性形質の組み合わせは、精鋭で構成される生殖質の多様なプールと共に交配中に維持するのにはるかに単純で安価な雑草防除における有用なツールを提供する。
【０００５】
トランスジェニックの植物体、一部、種子、または細胞における導入遺伝子の発現、したがってその有効性は、導入遺伝子の発現カセットで使用される要素やそれらの要素の相互作用のような多くの異なる因子によって影響を受けてもよい。これは、２以上の発現カセットを含有するトランスジェニック挿入についてさらに複雑であり、各発現カセットは、多重遺伝子トランスジェニック事象としても知られる別個の形質を付与する導入遺伝子を有する。商業的に有用な多遺伝子トランスジェニック事象は、トランスジェニック挿入における各導入遺伝子が各形質に必要な方法で発現することを必要とする。これを達成するために、個々の発現カセットが先ず設計され、植物体で試され、各形質について最良の発現カセットが選択される。次に、形質１つについて選択された発現カセットを１つの構築物にて他の形質（複数可）について選択された発現カセットと組み合わせ、その構築物を調べて、すべての発現カセットがうまく一緒に機能し、各導入遺伝子が適切に発現することを確認する。次いで、発現カセットの選択した組み合わせを単一のトランスジェニック挿入断片として使用して、何百もの多遺伝子トランスジェニック事象を作り出し、各事象は異なるゲノム位置における外来ＤＮＡの無作為挿入の結果である。
【０００６】
各トランスジェニック事象は独特である。次いで、複数世代の植物体を介して独特の事象を分析し、商業用途に優れた事象を選択する。トランスジェニックの植物体、一部、種子、または細胞における事象の成績、したがってその有効性はトランスジェニック挿入のゲノム位置によって影響を受けてもよい。事象は同じトランスジェニック挿入を有することができるが、それでも組織や発生段階にわたって、種々の生殖質にて、または特定の生育条件下で異なる導入遺伝子発現のレベル及び成績を有することができる。商業用途のための多遺伝子事象の生成は、厳密な分子特性評価、温室試験、及び複数年にわたる複数の場所での及び種々の条件下での野外試験を必要とするので、広範な農学、表現型、及び分子のデータが収集されてもよい。次いで、得られたデータを科学者や農学者が分析して、商業目的に有用である事象を選択しなければならない。次いで、商業的多遺伝子事象は、植物育種法を用いて、複数の除草剤耐性形質を有する単一の遺伝子座として新しい生殖質に遺伝子移入することができる。
【発明の概要】
【０００７】
本発明は、配列番号１０、配列番号９、配列番号８、配列番号７、配列番号６、配列番号５、配列番号４、配列番号３、配列番号２、及び配列番号１から成る群から選択される配列を含む組換えＤＮＡ分子を提供する。一実施形態では、組換えＤＮＡ分子は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体、種子、または細胞に由来し、事象を含む種子の代表的な試料はＡＴＣＣ受託番号ＰＴＡ−１２４６３５として寄託されている。別の実施形態では、組換えＤＮＡ分子はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体、細胞、種子、または植物体の一部にあり、事象を含む種子の代表的な試料はＡＴＣＣ  ＰＴＡ−１２４６３５として寄託されている。別の実施形態では、組換えＤＮＡ分子は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在の診断に役立つアンプリコンである。
【０００８】
本発明は、４つの発現カセットを含むＤＮＡ構築物を提供し、その際、第１の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）Ｅｒｉａｎｔｈｕｓ  ｒａｖｅｎｎａｅ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）ホスフィノトリシンＮ−アセチルトランスフェラーゼのコーディング配列と、（ＩＩＩ）Ｓｅｔａｒｉａ  ｉｔａｌｉｃａ由来のフルクトース−ビスリン酸アルドラーゼ３’ＵＴＲとを含み；第２の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）Ｃｏｉｘ  ｌａｃｒｙｍａ−ｊｏｂｉ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、イントロンと、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のアルビノ及び淡緑色６葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（ＩＩＩ）ジカンバモノオキシゲナーゼのコーディング配列と、（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のメタロチオネイン様タンパク質の３’ＵＴＲとを含み；第３の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）Ａｒｕｎｄｏ  ｄｏｎａｘ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロンと、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のリンゴ酸脱水素酵素葉緑体輸送ペプチドコーディング配列と、（ＩＩＩ）ＦＴ＿Ｔタンパク質コーディング配列と、（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来の無頂端分裂組織タンパク質の３’ＵＴＲとを含み；及び、第４の発現カセットは、操作可能な連結にて（Ｉ）ＣａＭＶ３５Ｓのプロモーター及びリーダーと、（ＩＩ）Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ由来のクロロフィルａ／ｂ結合タンパク質のリーダーと、（ＩＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のアクチン１のイントロンと、（ＩＶ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のＳｈｋＧ葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列と、（Ｖ）Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ株ＣＰ４由来のグリホサート耐性５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼのコーディング配列と、（ＶＩ）Ｚｅａ  ｍａｙｓ由来の男性組織特異的ｓｉＲＮＡの標的と、（ＶＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のグリシンリッチＲＮＡ結合タンパク質の３’ＵＴＲとを含む。
【０００９】
本発明は、トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来するＤＮＡの試料において配列番号１０に特異的なＤＮＡプローブとして機能するのに十分な長さの配列番号１０の隣接するヌクレオチドを有するＤＮＡ分子を提供する。１一実施形態では、ＤＮＡプローブは配列番号１３を含む。
【００１０】
本発明は、第１のＤＮＡ分子及び第２のＤＮＡ分子を含む一対のＤＮＡ分子を提供し、第１のＤＮＡ分子及び第２のＤＮＡ分子はそれぞれ、配列番号１０の断片を含み、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するＤＮＡとの増幅反応において一緒に使用されるとき、ＤＮＡプライマーとして機能して、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の診断に役立つアンプリコンを生成する。一実施形態では、少なくとも一方のＤＮＡプライマーは配列番号７及び配列番号８から成る群から選択される配列の断片を含む。別の実施形態では、第１のＤＮＡ分子は配列番号１１を含み、第２のＤＮＡ分子は配列番号１２を含む。
【００１１】
本発明は、トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来するＤＮＡの試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する方法を提供し、該方法は、試料をＤＮＡプローブと接触させることと、試料とＤＮＡプローブをストリンジェントなハイブリッド形成条件に供することと、試料にてＤＮＡプローブのＤＮＡ分子とのハイブリッド形成を検出することとを含み、その際、ＤＮＡプローブのＤＮＡ分子とのハイブリッド形成はＤＮＡの試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示す。
【００１２】
本発明は、トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来するＤＮＡの試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する方法を提供し、該方法は、ＤＮＡプライマーとして機能する一対のＤＮＡ分子に試料を接触させることと；配列番号１０、配列番号９、配列番号８、配列番号７、配列番号６、配列番号５、配列番号４、配列番号３、配列番号２、及び配列番号１から成る群から選択される配列を含むＤＮＡアンプリコンを生成するのに十分な増幅反応を実施することと；ＤＮＡアンプリコンの存在を検出することとを含み、その際、ＤＮＡアンプリコンの存在は試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示す。
【００１３】
本発明は、トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞に由来する試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する方法を提供し、該方法は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１以上のタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体と試料を接触させることと、試料におけるタンパク質への抗体の結合を検出することとを含み、その際、抗体のタンパク質への結合は試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示す。別の実施形態では、方法は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる第２のタンパク質に特異的な少なくとも第２の抗体と試料をさらに接触させることを含む。別の実施形態では、方法は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる第２のタンパク質及び第３のタンパク質にそれぞれ特異的な少なくとも第２の抗体及び第３の抗体と試料をさらに接触させることを含む。別の実施形態では、方法は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる第２のタンパク質、第３のタンパク質及び第４のタンパク質にそれぞれ特異的な少なくとも第２の抗体、第３の抗体及び第４の抗体と試料をさらに接触させることを含む。
【００１４】
本発明は、配列番号１０に特異的なＤＮＡプローブ、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の診断に役立つアンプリコンを生成する一対のＤＮＡプライマー、またはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体を含む、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出するためのキットを提供する。
【００１５】
本発明は、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８、配列番号９、及び配列番号１０から成る群から選択される配列を含むＤＮＡ分子を含む植物体、種子、細胞、植物体の一部、または商品生産物を提供する。一実施形態では、植物体、種子、細胞、または植物体の一部は、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対して耐性がある。別の実施形態では、植物体、種子、細胞、または植物体の一部は、キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ及びグルホシネートに対して耐性がある。
【００１６】
本発明は、作物栽培区域にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシを植えることと、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸合成酵素（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤の有効量を作物栽培区域またはその任意の部分に施用して、トウモロコシを傷つけることなく区域の雑草を防除することと、を含む、作物栽培区域にて雑草を防除する方法を提供する。一実施形態では、方法は、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤から成る群から選択される少なくとも２以上の除草剤を生育期にわたって施用することを含む。別の実施形態では、方法は、キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びグリホサート、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される除草剤を施用することを含む。一実施形態では、ジカンバの有効量は生育期にわたって約０．１ポンド酸当量／エーカーから約１６ポンド酸当量／エーカーである。一実施形態では、ジカンバの有効量は、生育期  にわたって約０．５ポンド酸当量／エーカーから約２ポンド酸当量／エーカーである。一実施形態では、グルホシネートの有効量は、生育期にわたって約０．１ポンド酸当量／エーカーから約１６ポンド酸当量／エーカーである。一実施形態では、グルホシネートの有効量は、生育期  にわたって約０．４ポンド酸当量／エーカーから約１．５９ポンド酸当量／エーカーである。一実施形態では、２，４−Ｄの有効量は生育期にわたって約０．１ポンド酸当量／エーカーから約１０ポンド酸当量／エーカーである。一実施形態では、２，４−Ｄの有効量は、生育期にわたって約０．７５ポンド酸当量／エーカーから約１．０ポンド酸当量／エーカーである。一実施形態では、ＦＯＰ除草剤の有効量は生育期にわたって約０．０１ポンド活性成分／エーカーから約１．０ポンド活性成分／エーカーである。一実施形態では、ＦＯＰ除草剤の有効量は生育期にわたって約０．０３４ポンド活性成分／エーカーから約０．０８３ポンド活性成分／エーカーのキザロホップである。一実施形態では、ＦＯＰ除草剤の有効量は生育期にわたって約０．０１８ポンド活性成分／エーカーから約０．０７ポンド活性成分／エーカーである。
【００１７】
本発明は、除草剤として有効な量の少なくとも１つのシクロヘキサンジオン（ＤＩＭ）除草剤を施用することを含む区域にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む自生トウモロコシを防除する方法を提供し、その際、除草剤の施用はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシの生育を阻止する。一実施形態では、シクロヘキサンジオン（ＤＩＭ）除草剤は、クレトジム、セトキシジム、及びトラコキシジムから成る群から選択される。
【００１８】
本発明は、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対して耐性がある植物を生産する方法を提供し、該方法はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物を自家受粉させ、または第２の植物と交配させ、種子を生産することと、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することと、を含む。一実施形態では、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することは、子孫種子を生育させて子孫植物を生産することと、キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びグリホサート、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤の有効量で子孫植物を処理することと、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤から成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対して耐性がある子孫植物を選択することと、による。一実施形態では、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することは、子孫種子に由来する試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出することによる。一実施形態では、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む子孫種子を同定することは、子孫種子に由来する試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質の存在を検出することによる。
【００１９】
本発明は、配列番号１０を含む植物を生育させることと、植物の雄性生殖組織の発達前または発達中に有効量のグリホサートを施用し、それによって植物の雄性不稔を誘導することと、第２の植物からの花粉で植物を受精させることと、植物から雑種種子を収穫することとを含む、雑種種子を生産する方法を提供する。一実施形態では、グリホサートは、発達前または発達中に約０．２５ポンド酸当量／エーカーから約１１．０ポンド酸当量／エーカーの有効量で施用される。一実施形態では、グリホサートは、発達前または発達中に１以上の施用にて合計約０．５ポンド酸当量／エーカーから約２．５ポンド酸当量／エーカーの有効量で施用される。一実施形態では、有効量のグリホサートは、トウモロコシ植物発達のＶ４期、Ｖ５期、Ｖ６期、Ｖ７期、Ｖ８期、Ｖ９期、Ｖ１０期、Ｖ１１期、Ｖ１２期、Ｖ１３期、及びＶ１４期から成る群から選択される発達段階で施用される。本発明は、配列番号１０を含む植物を生育させることと、植物の雄性生殖組織の発達前または発達中に有効量のグリホサートを施用し、それによって植物の雄性不稔を誘導することと、第２の植物体からの花粉で植物を受精させることと、植物から雑種種子を収穫することとを含む、配列番号１０を含み、且つ雑種種子を生産する方法を使用することによって生産される雑種種子を提供する。
【００２０】
本発明は、植物に由来するＤＮＡを含む試料を、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在の診断に役立つ第１のアンプリコン及びトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含まない野生型トウモロコシゲノムの診断に役立つ診断する第２のアンプリコンを生成することができるプライマーセットと接触させることと、核酸の増幅反応を行うことと、第１のアンプリコン及び第２のアンプリコンを検出することとを含む、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９について植物の接合性を判定する方法を提供し、その際、双方のアンプリコンの存在は試料がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヘテロ接合性であることを示し、第１のアンプリコンのみの存在は試料がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合性であることを示す。一実施形態では、プライマーのセットは、配列番号１１及び配列番号１２を含む。
【００２１】
本発明は、（ａ）第１の発現カセットが操作可能な連結で（Ｉ）Ｅｒｉａｎｔｈｕｓ  ｒａｖｅｎｎａｅ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロン、（ＩＩ）ホスフィノトリシンＮ−アセチルトランスフェラーゼのコーディング配列、及び（ＩＩＩ）Ｓｅｔａｒｉａ  ｉｔａｌｉｃａ由来のフルクトース−ビスリン酸アルドラーゼ３’ＵＴＲを含み；第２の発現カセットが操作可能な連結で（Ｉ）Ｃｏｉｘ  ｌａｃｒｙｍａ−ｊｏｂｉ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、イントロン、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のアルビノ及び淡緑色６葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列、（ＩＩＩ）ジカンバモノオキシゲナーゼコーディング配列、及び（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のメタロチオネイン様タンパク質の３’ＵＴＲを含み；第３の発現カセットが操作可能な連結で（Ｉ）Ａｒｕｎｄｏ  ｄｏｎａｘ由来のユビキチンのプロモーター、リーダー、及びイントロン、（ＩＩ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のリンゴ酸脱水素酵素葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列、（ＩＩＩ）ＦＴ＿Ｔタンパク質コーディング配列、及び（ＩＶ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来の無頂端分裂組織タンパク質の３’ＵＴＲを含み；ならびに、第４の発現カセットが操作可能な連結で（Ｉ）ＣａＭＶ３５Ｓのプロモーター及びリーダー、（ＩＩ）Ｔｒｉｔｉｃｕｍ  ａｅｓｔｉｖｕｍ由来のクロロフィルａ／ｂ結合タンパク質のリーダー、（ＩＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のアクチン１イントロン、（ＩＶ）Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ  ｔｈａｌｉａｎａ由来のＳｈｋＧ葉緑体輸送ペプチドのコーディング配列、（Ｖ）Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ株ＣＰ４由来のグリホサート耐性５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼのコーディング配列、（ＶＩ）Ｚｅａ  ｍａｙｓ由来の雄性組織特異的ｓｉＲＮＡ標的、及び（ＶＩＩ）Ｏｒｙｚａ  ｓａｔｉｖａ由来のグリシンリッチＲＮＡ結合タンパク質の３’ＵＴＲを含む、４つの発現カセットを含むＤＮＡ構築物を得ることと、（ｂ）トウモロコシ細胞のゲノムにＤＮＡ構築物を挿入することと、（ｃ）トウモロコシ植物体の中でトウモロコシ細胞を再生することと、（ｄ）ＤＮＡ構築物を含むトウモロコシ植物体を選択することとを含む、トウモロコシ植物体にてアリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対する耐性を改善する方法を提供する。一実施形態では、選択することは、キザロホップ、ハロキシホップ、ジカンバ、２，４−Ｄ、グルホシネート、またはグリホサートから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤の有効量でトウモロコシ植物を処理することによる。一実施形態では、本発明は、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤、合成オーキシン、グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノール��ルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤、またはそれらの任意の組み合わせから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤に対して耐性があり、且つ本方法によって入手できるトウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞を提供し、その際、トウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞はＤＮＡ構築物を含む。さらなる実施形態では、本方法によって産生されるトウモロコシ植物体、トウモロコシ種子、またはトウモロコシ細胞は配列番号１０を含む。
【図面の簡単な説明】
【００２２】
【図１】トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の配列を表す図である。横線は、配列番号１０と比べた配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、配列番号７、配列番号８及び配列番号９の位置に対応し；水平の矢印で標識したＳＱ５１０６２（配列番号１１）及びＳＱ５１０５３（配列番号１２）はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を検出するために使用できる一対のプライマーのおおよその位置を表し；横線で標識したＰＢ５０３７０（配列番号１３）はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を検出するのに使用できるＤＮＡプローブのおおよその位置を表す。
【図２】表１に記載されているように標識されたそれぞれの遺伝因子を持つ配列番号９と比較したトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の４つの発現カセットを表す図である。
【図３】本明細書に記載されているようなＭＯＮ８７４２９事象の作成、試験、特性評価、及び選択を表す図である。時間はすべて概算である。
【００２３】
配列の簡単な説明
配列番号１は、トウモロコシのゲノムＤＮＡと導入遺伝子挿入断片の５’接合部を表す３０ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。配列番号１は、配列番号１０のヌクレオチドの１０１５位〜１０４４位に対応する。
【００２４】
配列番号２は、トウモロコシのゲノムＤＮＡと導入遺伝子挿入断片の３’接合部を表す３０ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。配列番号２は、配列番号１０のヌクレオチドの１５０２３位〜１５０５２位に対応する。
【００２５】
配列番号３は、トウモロコシのゲノムＤＮＡと導入遺伝子挿入断片の５’接合部を表す６０ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。配列番号３は、配列番号１０のヌクレオチドの１０００位〜１０５９位に対応する。
【００２６】
配列番号４は、トウモロコシのゲノムＤＮＡと導入遺伝子挿入断片の３’接合部を表す６０ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。配列番号４は、配列番号１０のヌクレオチドの１５００８位〜１５０６７位に対応する。
【００２７】
配列番号５は、トウモロコシのゲノムＤＮＡと導入遺伝子挿入断片の５’接合部を表す１００ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。配列番号５は、配列番号１０のヌクレオチドの９８０位〜１０７９位に対応する。
【００２８】
配列番号６は、トウモロコシのゲノムＤＮＡと導入遺伝子挿入断片の３’接合部を表す１００ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。配列番号６は、配列番号１０のヌクレオチドの１４９８８位〜１５０８７位に対応する。
【００２９】
配列番号７は、５’隣接トウモロコシゲノムＤＮＡの１０２９ヌクレオチドと導入遺伝子挿入断片の５’末端の３２１ヌクレオチドとを表す１３５０ヌクレオチドＤＮＡ配列である。
【００３０】
配列番号８は、導入遺伝子挿入断片の３’末端の３８ヌクレオチドと５’隣接トウモロコシゲノムＤＮＡの１０３１ヌクレオチドとを表す１０６９ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。
【００３１】
配列番号９は、トウモロコシＭＯＮ８７４２９事象の導入遺伝子挿入断片に対応する１４００８ヌクレオチドのＤＮＡ配列である。
【００３２】
配列番号１０は、トウモロコシＭＯＮ８７４２９事象に対応する１６０６８ヌクレオチドのＤＮＡ配列であり；該配列は、１〜１０２９位の５’隣接ゲノムＤＮＡ配列と、１０３０〜１５０３７位のトランスジェニックＤＮＡ挿入断片と、１５０３８〜１６０６８位の３’隣接ゲノムＤＮＡ配列とを含有する。
【００３３】
配列番号１１は、ＳＱ５１０６２と呼ばれるプライマーに対応する２９ヌクレオチドのＤＮＡ配列であり、試料にてトウモロコシＭＯＮ８７４２９事象のＤＮＡを同定するのに使用され；それは配列番号１０の１５０３８位〜１５０６６位に対応する。
【００３４】
配列番号１２は、ＳＱ５１０５３と呼ばれるプライマーに対応する１７ヌクレオチドのＤＮＡ配列であり、試料にてトウモロコシＭＯＮ８７４２９事象のＤＮＡを同定するのに使用され；それは配列番号１０の１４９８７位〜１５００３位に対応する。
【００３５】
配列番号１３は、ＰＢ５０３７０と呼ばれるプローブに対応する１６ヌクレオチドのＤＮＡ配列であり、試料にてトウモロコシＭＯＮ８７４２９事象のＤＮＡを同定するのに使用され；それは、配列番号１０の１５００９位〜１５０２４位に対応する。
【発明の詳細な説明】
【００３６】
以下の定義及び方法は、本発明をより確実に定義し、本発明の実施において当業者を導くために提供される。特に明記されない限り、用語は、関連技術分野の当業者による従来の使用法に従って理解されるべきである。
【００３７】
植物の形質転換技法は、外来ＤＮＡ（トランスジェニックＤＮＡとも呼ばれる）を細胞のゲノムの染色体に無作為に挿入して、「トランスジェニック」細胞または「組換え」細胞とも呼ばれる遺伝子操作された細胞を生成するために使用される。この技法を使用して、多くの個々の細胞が形質転換され、ゲノムへの外来ＤＮＡの無作為な挿入のせいで、それぞれが独特のトランスジェニック事象を生じる。次いで、トランスジェニック植物は、各個々のトランスジェニック細胞から再生される。これは、そのゲノムの安定した部分として独自に挿入されたトランスジェニック事象を含有するトランスジェニック植物のあらゆる細胞を生じる。次いで、このトランスジェニック植物を使用して、それぞれが独特のトランスジェニック事象を含有する子孫植物を生産することができる。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は、（ｉ）４つの発現カセットを含むＤＮＡ構築物による数千のトウモロコシ細胞の形質転換（各発現カセットは、個別の試験とそれに続く他の３つの発現カセットと組み合わせた試験の後、選択されている）と、（ｉｉ）それぞれが独特のトランスジェニック事象を含有するトランスジェニック植物の個体群の再生と、（ｉｉｉ）数万の植物体を介した数千の事象についてのさまざまな遺伝的背景における分子特性、除草剤耐性の有効性、及び農業特性の試験と分析を含む厳格な多年事象の選択とによって生産される。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は、このようにして生産され、大規模な農業的商業目的に有用な独自に優れた事象として選択された。
【００３８】
本明細書で使用されるとき、「トランスジェニック事象」または「事象」は、当該技術分野で既知の植物形質転換法を使用して植物細胞のゲノムＤＮＡにトランスジェニックＤＮＡ分子を挿入する行為によって作り出されるＤＮＡ分子である。この挿入により、挿入された外来ＤＮＡ（「トランスジェニック挿入断片」と呼ばれる）と、挿入位置のいずれかの側にあるトランスジェニック挿入断片に直接隣接する、または「隣接する」ゲノムＤＮＡ（「隣接ＤＮＡ」と呼ばれる）とから成る新しいトランスジェニックゲノムＤＮＡ配列が作り出される。事象のＤＮＡ配列は、事象について独特で特異的であり、他の事象の配列または非形質転換トウモロコシのゲノムＤＮＡの配列のような他のＤＮＡ配列と比較すると容易に同定することができる。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は、配列番号１０として提供される新しい且つ独特のＤＮＡ配列を有し、それは配列番号９として提供されるトランスジェニック挿入断片配列と、それぞれ配列番号７及び配列番号８で提供される５’及び３’の隣接ＤＮＡ配列とを含有する。したがって、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は、トランスジェニックトウモロコシ細胞の染色体と事象を含む植物との一体となっている部分であるＤＮＡ分子であり、そのようなものとして静的であり、子孫細胞及び子孫植物に順送りされてもよい。
【００３９】
本発明はまた、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む初めて形質転換された細胞及び植物体の子孫も提供する。そのような子孫は、細胞組織培養によって、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシ植物の自殖によって、またはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシ植物とその事象を含有するまたは含有しない別の植物との間の有性異系交配によって生産されてもよい。そのような他の植物は、同じもしくは異なる事象（複数可）を含むトランスジェニック植物、または異なる品種由来のもののような非トランスジェニック植物であってもよい。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は、元の親から各世代を通じて子孫に渡される。
【００４０】
本明細書で使用されるとき、用語「トウモロコシ」は、Ｚｅａ  ｍａｙｓ（コーンもと呼ばれる）を意味し、Ｚｅａ  ｍａｙｓと交配することができるすべての植物品種を含む。
【００４１】
本発明は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を提供し、それは事象を含むトウモロコシの細胞、植物体、及び種子にキザロホップやハロキシホップのようなアリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤；ジカンバ及び２，４−Ｄのような合成オーキシン；グルホシネートのようなグルタミン合成酵素の阻害剤；ならびに５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤であるグリホサートに対する耐性を提供する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は４つの発現カセットを含有する。本明細書中で使用されるとき、「発現カセット」または「カセット」は、形質転換された細胞によって発現されるべきである別個の要素の組み合わせを含む組換えＤＮＡ分子である。表１は、配列番号１０に含有され、且つ図２で説明されるような要素のリストを提供する。
表１：トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の説明
【表１−１】
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【表１−２】
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【００４２】
本明細書で使用されるとき、「組換え」という用語は、通常は自然界には見いだされず、ヒトの介入によって作り出された非天然のＤＮＡ、タンパク質、または生物を指す。本明細書で使用されるとき、「組換えＤＮＡ分子」は、自然には一緒に存在しないであろう且つヒトの介入の結果であるＤＮＡ分子の組み合わせを含むＤＮＡ分子、例えば、互いに異種の少なくとも２つのＤＮＡ分子の組み合わせで構成されるＤＮＡ分子、例えば、導入遺伝子と導入遺伝子に隣接する植物ゲノムＤＮＡとを含むＤＮＡ分子である。組換えＤＮＡ分子の例は、配列番号１〜１０から選択される少なくとも１つの配列を含むＤＮＡ分子である。本明細書で使用されるとき、「組換え植物」は、通常自然界には存在しない、ヒトの介入の結果であり、トランスジェニックＤＮＡ分子を含有する植物である。そのようなゲノム改変の結果として、組換え植物は何か新しいものであり、関連する野生型植物とは明らかに異なる。組換え植物の例は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトウモロコシ植物である。
【００４３】
本明細書で使用されるとき、「導入遺伝子」という用語は、例えば、植物形質転換法によるヒトの介入の結果として、生物のゲノムに人工的に組み込まれたＤＮＡ分子を指す。導入遺伝子は生物にとって異種であってもよい。本明細書で使用されるとき、「トランスジェニック挿入断片」という用語は、植物形質転換技法によってトウモロコシゲノムに挿入されてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を生成する外来ＤＮＡを指す。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のトランスジェニック挿入断片の配列は、配列番号９として提供される。「トランスジェニック」という用語は、導入遺伝子を含むことを指し、例えば「トランスジェニック植物」は導入遺伝子を含む植物を指す。
【００４４】
本明細書で使用されるとき、「異種の」という用語は、通常、自然界での第２の分子または生物と関連していない第１の分子を指す。例えば、ＤＮＡ分子は、第１の種に由来し、第２の種のゲノムに挿入されてもよい。このようにして、ＤＮＡ分子はゲノムや生物にとって異種であろう。
【００４５】
本明細書で使用されるとき、「キメラ」という用語は、第１のＤＮＡ分子を第２のＤＮＡ分子に融合することによって生成される単一のＤＮＡ分子を指し、第１のＤＮＡ分子または第２のＤＮＡ分子のどちらも通常、他と融合したその構成では見いだされない。したがって、キメラＤＮＡ分子は、通常自然界には見いだされない新しいＤＮＡ分子である。キメラＤＮＡ分子の例は、配列番号１〜１０から選択される少なくとも１つの配列を含むＤＮＡ分子である。
【００４６】
本明細書で使用されるとき、「単離された」という用語は、そのネイティブな状態または天然の状態でそれに通常関連している他の分子から分子を分離することを指す。したがって、「単離された」という用語は、そのネイティブな状態または天然の状態でそれと関連している他のＤＮＡ分子（複数可）から分離されているＤＮＡ分子を指してもよい。そのようなＤＮＡ分子は、組換えＤＮＡ分子のような組換えられた状態で存在してもよい。したがって、その天然の状態から取り除かれ、それが通常関連しない別のＤＮＡ分子に融合されたＤＮＡ分子は、単離されたＤＮＡ分子であるということになる。そのような単離されたＤＮＡ分子は、組換えＤＮＡを作成すること、または細胞、植物体、または種子の染色体に外来ＤＮＡ分子を組み込むことのようなバイオテクノロジー技術の使用から生じ得る。
【００４７】
本発明は、ＤＮＡ分子及びそれらの対応するＤＮＡ配列を提供する。本明細書で使用されるとき、「ＤＮＡ」及び「ＤＮＡ分子」という用語は、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）分子を指す。ＤＮＡ分子は、ゲノム起源または合成起源のものであってもよく、５’（上流）末端から３’（下流）末端までの通常型による。本明細書で使用されるとき、「ＤＮＡ配列」という用語は、ＤＮＡ分子のヌクレオチド配列を指す。使用される専門語は、米国連邦規則集のタイトル３７、§１．８２２によって要求され、ＷＩＰＯ標準ＳＴ．２５（１９９８）、付録２、表１及び３の表に記載されているものである。慣例として、本発明のＤＮＡ配列及びその断片は２つの相補的ＤＮＡ配列鎖のうちの一方の鎖のみを参照して開示される。暗示及び意図により、ここで提供される配列の相補配列（相補鎖の配列）は、当該技術分野では逆相補配列とも呼ばれ、本発明の範囲内であり、請求される主題の範囲内にあることが明確に意図される。したがって、本明細書中で使用されるとき、配列番号１〜１０及びその断片への言及は、相補鎖及びその断片の配列を含み、それを指す。
【００４８】
本明細書で使用されるとき、「断片」という用語は、全体のさらに小さな小片を指す。例えば、配列番号１０の断片は、配列番号１０の完全配列のうち少なくとも約１０個の連続したヌクレオチド、少なくとも約１１個の連続したヌクレオチド、少なくとも約１２個の連続したヌクレオチド、少なくとも約１３個の連続したヌクレオチド、少なくとも約１４個の連続したヌクレオチドである配列を含む。少なくとも約１５の連続したヌクレオチド、少なくとも約１６の連続したヌクレオチド、少なくとも約１７の連続したヌクレオチド、少なくとも約１８の連続したヌクレオチド、少なくとも約１９の連続したヌクレオチド、少なくとも約２０の連続したヌクレオチド、少なくとも約２５の連続したヌクレオチド、少なくとも約３０の連続したヌクレオチド、少なくとも約３５の連続したヌクレオチド、少なくとも約４０の連続したヌクレオチド、少なくとも約４５の連続したヌクレオチド、少なくとも約５０の連続したヌクレオチド、少なくとも約６０の連続したヌクレオチド、少なくとも約７０の連続したヌクレオチド、少なくとも約８０の連続したヌクレオチド、少なくとも約９０の連続したヌクレオチド、または少なくとも約１００の連続したヌクレオチドである配列を含むことになる。
【００４９】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のトランスジェニック挿入断片のＤＮＡ配列は配列番号９として提供される。トランスジェニック挿入断片とトランスジェニック挿入断片の各側面に隣接するトウモロコシゲノムＤＮＡとのＤＮＡ配列は配列番号１０として提供される。隣接するＤＮＡの一部及びトランスジェニック挿入断片の５’末端のＤＮＡ配列は、配列番号１、配列番号３、配列番号５、及び配列番号７として提供される。隣接するＤＮＡの一部及びトランスジェニック挿入断片の３’末端のＤＮＡ配列は、配列番号２、配列番号４、配列番号６、及び配列番号８として提供される。
【００５０】
トランスジェニック挿入断片の一方の末端の隣接するトウモロコシゲノムＤＮＡへのホスホジエステル結合の結合による接続にまたがる領域のＤＮＡ配列は、本明細書では「接合部」と呼ばれる。接合部は、トランスジェニック挿入断片と隣接するＤＮＡとの１つの切れ目のない分子としての接続点である。一方の接合部はトランスジェニック挿入断片の５’末端で見いだされ、他方はトランスジェニック挿入断片の３’末端で見いだされ、本明細書ではそれぞれ５’接合部及び３’接合部と呼ぶ。「接合部配列」は、事象の５’または３’の接合部にわたる任意の長さのＤＮＡ配列を指す。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の接合部配列は、配列番号１０を使用して当業者に明らかである。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の接合部配列の例は、配列番号１〜８として提供されている。図１は、５’から３’に配置された配列番号１〜１０の物理的配置を図示する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の接合部配列は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体、種子、または細胞のゲノムの一部として存在してもよい。植物体、植物体の一部、種子、または細胞由来の試料における配列番号１〜８または１０のいずれか１以上の同定は、ＤＮＡがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトウモロコシから得られ、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在の診断に役立つことを示す。
【００５１】
本発明の植物体、種子、細胞、植物体の一部、及び商品生産物は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を示すＤＮＡ分子またはタンパク質分子の検出に使用されてもよい。提供されるのは、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出するためのプライマーまたはプローブのいずれかとして使用することができる例示的なＤＮＡ分子である。そのようなプライマーまたはプローブは、標的核酸配列に特異的であり、したがって、ここに記載されている方法によるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の同定に有用である。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在の検出は、核酸の熱増幅または核酸ハイブリッド形成技法（例えば、ノーザンブロッティング及びサザン解析）のような当該技術分野で既知の方法を使用することによって行われてもよい。
【００５２】
「プライマー」は、増幅反応を伴うアニーリング法またはハイブリッド形成法で使用するために設計されるＤＮＡ分子である。増幅反応は、鋳型ＤＮＡを増幅してアンプリコンを生成する試験管内反応である。本明細書中で使用されるとき、「アンプリコン」は、増幅技術を使用して合成されているＤＮＡ分子である。本発明のアンプリコンは、配列番号１〜１０の１以上またはその断片を含むＤＮＡ配列を有する。一対のプライマーは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）のような増幅反応においてトウモロコシのゲノムＤＮＡの試料のような鋳型ＤＮＡとともに使用してアンプリコンを生成してもよく、生成されたアンプリコンは、プライマーが鋳型とハイブリッド形成した２つの部位の間に位置する鋳型ＤＮＡの配列に相当するＤＮＡ配列を有する。プライマーは通常、相補的な標的ＤＮＡ鎖とハイブリッド形成して、プライマーと標的ＤＮＡ鎖との間に雑種を形成するように設計される。プライマーの存在は、標的ＤＮＡ鎖を鋳型として使用してプライマーの伸長を開始するためのポリメラーゼによる認識の点である。プライマー対は、それらの間のヌクレオチドセグメントを増幅する目的で二本鎖ヌクレオチドセグメントの反対側の鎖を結合する２つのプライマーの使用を指す。プライマー配列の例は、配列番号１１（ＳＱ５１０６２）及び配列番号１２（ＳＱ５１０５３）として提供されている。配列番号１１及び配列番号１２として提供されているプライマー対は第１のＤＮＡ分子及び第２のＤＮＡ分子として有用であり、その際、第１のＤＮＡ分子は配列番号１０のトランスジェニック挿入断片ＤＮＡ配列の断片であり、第２のＤＮＡ分子は配列番号１０の隣接ＤＮＡ配列の断片であり、それぞれトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するＤＮＡとの増幅反応にて一緒に使用されるとＤＮＡプライマーとして機能するのに十分な長さのものあり、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の診断に役立つアンプリコンを生じる。本発明のプライマー対は特定の実施形態では、第１のＤＮＡ分子及び第２のＤＮＡ分子を含むとして定義されてもよく、その際、第１のＤＮＡ分子は配列番号１０のトウモロコシゲノム部分の断片であり、第２のＤＮＡ分子は配列番号１０の導入遺伝子部分の断片であり、それぞれトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するＤＮＡとの増幅反応にて一緒に使用されるとＤＮＡプライマーとして機能するのに十分な長さのものであり、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の診断に役立つアンプリコンを生じる。
【００５３】
「プローブ」は、標的核酸の鎖に相補性であり、ハイブリッド形成検出法に有用である核酸分子である。本発明に係るプローブは、デオキシリボ核酸またはリボ核酸だけでなく、標的ＤＮＡ配列に特異的に結合するポリアミド及び他のプローブ物質も含み、そのような結合の検出は、標的ＤＮＡ配列の存在または非存在の検出に有用であることができる。プローブは、放射性同位元素、リガンド、化学発光剤、または酵素のような従来の検出可能な標識またはレポーター分子に付着させてもよい。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を検出するためのプローブとして有用な例示的なＤＮＡ配列は配列番号１３（ＰＢ５０３７０）として提供される。
【００５４】
プライマー及びプローブを設計する及び使用する方法は、当該技術分野で周知である。配列番号１〜１０の完全長または断片を含むＤＮＡ分子は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を検出するためのプライマー及びプローブとして有用であり、本明細書で提供されている配列を使用して当業者が容易に設計することができる。
【００５５】
標的配列と優先的にハイブリッド形成する能力を保持する、標的配列とは異なるプライマー及びプローブが従来の方法によって設計されてもよいけれども、本発明に係るプローブ及びプライマーは、標的配列と完全な配列同一性を有してもよい。核酸分子がプライマーまたはプローブとして機能するためには、それは採用される特定の溶媒及び塩濃度のもとで安定した二本鎖構造を形成できるように配列が十分に相補性であることのみを必要とする。任意の従来の核酸ハイブリッド形成法または増幅法を使用して、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９由来のトランスジェニックＤＮＡの存在を同定することができる。プローブ及びプライマーは一般に、長さが少なくとも約１１ヌクレオチド、少なくとも約１８ヌクレオチド、少なくとも約２４ヌクレオチド、または少なくとも約３０ヌクレオチド以上である。そのようなプローブ及びプライマーは、ストリンジェントなハイブリッド形成条件下で標的ＤＮＡ配列と特異的にハイブリッド形成する。従来のストリンジェントな条件は、ＭＲ  Ｇｒｅｅｎ及びＪ  Ｓａｍｂｒｏｏｋ、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  ｃｌｏｎｉｎｇ：ａ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  ｍａｎｕａｌ、４ｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ（２０１２）によって記載されている。本明細書で使用されるとき、２つの核酸分子は、２つの分子が逆平行の二本鎖核酸構造を形成することができるならば、互いに特異的にハイブリッド形成することができる。核酸分子は、完全な相補性を示すならば、もう１つの核酸分子の「相補体」である。本明細書で使用されるとき、整列したときに第１の分子のすべてのヌクレオチドが第２の分子のすべてのヌクレオチドに相補性であるならば、２つの分子は「完全な相補性」を示す。２つの分子は、少なくとも従来の「低ストリンジェントな」条件下で互いにアニーリングしたままにするのに十分な安定性で互いにハイブリッド形成できるならば、「最小限に相補性」である。同様に、分子は、従来の「高ストリンジェントな」条件下で互いにアニーリングしたままにするのに十分な安定性で互いにハイブリッド形成できるならば、「相補性」である。したがって、逸脱が二本鎖構造を形成する分子の能力を完全に排除しない限り、完全な相補性からのそのようなそのような逸脱は許容される。
【００５６】
ＤＮＡのハイブリッド形成を促進する適切なストリンジェントな条件、例えば、約４５℃での６×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）、その後の５０℃での２．０×ＳＳＣの洗浄は、当業者に既知であるか、またはＣｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９），６．３．１−６．３．６に見いだすことができる。例えば、洗浄工程における塩濃度は、５０℃での約２．０×ＳＳＣの低ストリンジェンシーから５０℃での約０．２×ＳＳＣの高ストリンジェンシーまで選択することができる。加えて、洗浄工程の温度は、室温（約２２℃）での低ストリンジェンシー条件から約６５℃での高ストリンジェンシー条件に上げることができる。温度と塩の双方を変更してもよいし、または温度もしくは塩濃度のいずれかを一定に保ってもよいが、他の変数を変更する。
【００５７】
提供されるのは、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出するための抗体を作成するのに使用することができるタンパク質である。そのような抗体は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされるタンパク質の１以上に対して特異的である。そのようなタンパク質をコードするＤＮＡ配列は配列番号１０で提供され、コーディング配列の開始位置と停止位置は表１に示されている。各タンパク質をコードするＤＮＡ配列及び配列によってコードされるタンパク質は、ここに記載されている方法によってトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出するための抗体を作成するのに有用である。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在の検出は、例えば、ウエスタンブロッティング、免疫沈降、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、検出可能な標識またはレポーター分子（例えば、放射性同位元素、リガンド、化学発光剤、酵素など）への抗体の結合、またはレポーター分子に対する酵素作用のような当該技術分野で既知のタンパク質検出技法を使用することによって行われてもよい。１つの方法は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされるＤＭＯ、ＰＡＴ、ＦＴ＿Ｔ、またはＣＰ４−ＥＰＳＰＳのタンパク質に結合する抗体と試料を接触させることと、次いで抗体結合の存在または非存在を検出することとを提供する。そのような抗体の結合は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる１以上のタンパク質の存在についての診断に役立つ。
【００５８】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出するためのタンパク質及び核酸の検出キットが提供されている。そのようなキットの多様性も、本明細書で開示されている組成物及び方法、ならびにタンパク質及び核酸の検出の技術分野で周知の方法を使用して開発することができる。タンパク質及び核酸の検出キットは、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と交配する方法に適用することができる。そのようなキットは、配列番号１〜１０の断片を含むプライマーもしくはプローブ、またはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされるタンパク質に特異的な抗体を含有する。
【００５９】
検出キットの一例は、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在または非存在を検出するのに有用なＤＮＡプローブとして機能するのに十分な長さの配列番号１０の隣接するヌクレオチドの少なくとも１つのＤＮＡ分子を含む。プローブとして使用するのに十分な例示的なＤＮＡ分子は、配列番号１３として提供されている配列を含むものである。他のプローブは当業者によって容易に設計されてもよい。検出キットの別の例は、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在または非存在を検出するのに有用なアンプリコンを生成するのに有用な少なくとも１つのプライマー対を含む。そのような方法はまた、アンプリコンまたはその断片の配列決定を含んでもよい。プライマー対としての使用に十分な例示的なＤＮＡ分子は、それぞれ配列番号１１及び配列番号１２として提供されている配列を含むものである。他のプライマー対は当業者によって容易に設計されてもよい。本発明のキットはまた任意で、本明細書に記載されている検出反応または診断反応を行うための試薬も含んでもよい。検出キットの別の例は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体を含む。例えば、そのようなキットは、細片の先端が水溶液と接触すると活性化される試薬を含む側方流動細片を利用してもよい。抗体産生に使用するのに十分な例示的なタンパク質は、配列番号１０として提供される配列によってコードされるもの、またはその任意の断片である。
【００６０】
本発明は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトウモロコシの植物体、子孫、種子、細胞、及び植物体の一部、ならびにこれらを使用して生産される商品生産物を提供する。本発明の植物体、子孫、種子、細胞、植物体の一部、及び商品生産物は、配列番号１〜８及び配列番号１０として提供されている配列の少なくとも１つを有する検出可能な量のＤＮＡを含有する。
【００６１】
本発明の植物体、子孫、種子、細胞、及び植物体の一部は、１以上の追加のトランスジェニック形質、特にトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトウモロコシ植物を追加のトランスジェニック形質（複数可）を含有する別の植物と交配することによって導入される形質も含有してもよい。そのような形質には、虫害抵抗性の向上、水利用効率の向上、収量成績の向上、耐乾性の向上、種子品質の向上、栄養品質の改善、雑種種子生産、及び／または除草剤耐性の向上が挙げられるが、これらに限定されず、形質はそのようなトランスジェニック形質を欠くトウモロコシ植物に関して測定される。
【００６２】
本発明の植物を使用して、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する子孫を生産してもよい。本明細書で使用されるとき、「子孫」には、配列番号１〜８及び配列番号１０から選択される少なくとも１つの配列を有するＤＮＡ分子を含む植物によって示され、先祖植物体から受け継がれたトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む任意の植物体、種子、及び細胞が含まれる。植物体、種子、及び細胞は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合型またはヘテロ接合型であってもよい。子孫植物は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトウモロコシ植物によって生産された種子から、またはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する花粉で受精させたトウモロコシ植物によって生産された種子から生育させてもよい。
【００６３】
本明細書で使用されるとき、本発明の「植物体の一部」は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体に由来する任意の部分である。植物体の一部には、組織試料、花粉、胚珠、鞘、花、根、茎、繊維、及び葉の全体または一部が挙げられるが、これらに限定されない。植物体の一部は成長できてもよいし、または成長できなくてもよい。
【００６４】
本発明は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物から生産される商品生産物を提供する。本発明の商品生産物は、配列番号１〜１０から成る群から選択されるＤＮＡ配列を含む検出可能な量のＤＮＡを含有する。本明細書で使用されるとき、「商品生産物」は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体、種子、細胞、または植物体の一部に由来する材料から構成される任意の組成物または生産物を指す。商品生産物には、加工された種子、穀物、植物体の一部、及び食べ物が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の商品生産物は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９に対応する検出可能な量のＤＮＡを含有するであろう。試料におけるこのＤＮＡの１以上の検出は、商品生産物の内容または供給源を決定するのに使用されてもよい。本明細書で開示されている検出方法を含む、ＤＮＡ分子の任意の標準的な検出方法が使用されてもよい。
【００６５】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤；合成オーキシン；グルタミン合成酵素の阻害剤、及び５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤に対する耐性を一緒に提供する４つの発現カセットを含有する。
【００６６】
本明細書で使用されるとき、アリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤（「ＦＯＰ除草剤（複数可）」と呼ばれる）には、クロジナホップ、クロジナホップ−エチル、クロジナホップ−プロパルギル、シハロホップ、シハロホップ−ブチル、ジクロホップ、ジクロホップメチル、ジクロホップ−Ｐ、ジクロホップ−Ｐ−メチル、フェノキサプロップ、フェノキサプロップ−Ｐ、フェノキサプロップ−Ｐ−エチル、フェンチアプロップ、フルアジホップ、フルアジホップ−ブチル、フルアジホップ−Ｐ、フルアジホップ−Ｐブチル、フルロキシピル、ハロキシホップ、ハロキシホップ．エトチル、ハロキシホップ−メチル、ハロキシホップ−Ｐ、ハロキシホップ−Ｐ−メチル、イソキサピリホップ、メタミホップ、プロパキザホップ、キザロホップ、キザラホップ−エチル、キザロホップ−Ｐ、キザラホップ−Ｐ−エチル、キザロホップ−Ｐ−テフリル、及びトリホップが挙げられるが、これらに限定されない。
【００６７】
本明細書で使用されるとき、合成オーキシンには、安息香酸除草剤、フェノキシ酸除草剤、アリールピコリネート除草剤、及びピリジニルオキシ酸除草剤が挙げられるが、これらに限定されない。安息香酸除草剤の例には、ジカンバ（３，６−ジクロロ−２−メトキシ安息香酸）、ジカンバ塩、ジカンバ−ブトチル、ジカンバ−ジグリコールアミン塩、ジカンバ−ジメチルアンモニウム、ジカンバ−ジメタノールアンモニウム、ジカンバージエタノールアンモニウム、ジカンバーイソプロピルアンモニウム、ジカンバーカリウム、ジカンバーナトリウム、ジカンバートロラミンが挙げられるが、これらに限定されない。フェノキシ酸除草剤の例は、２，４−Ｄ（２，４―ジクロロフェノキシ酢酸）、２，４−Ｄ―ブトチル、２，４−Ｄ―ブチル、２，４−Ｄ―コリン、２，４−Ｄ−ジメチルアンモニウム、２，４−Ｄ―ジオラミン、２，４−Ｄ―エチル、２，４−Ｄ−２−エチルヘキシル、２，４−Ｄ―イソブチル、２，４−Ｄ―イソオクチル、２，４−Ｄ−イソプロピル、２，４−Ｄ−イソプロピルアンモニウム、２，４−Ｄ−カリウム、２，４−Ｄ−ナトリウム、２，４−Ｄ−トリイソプロパノールアンモニウム、２，４−Ｄ−トロラミン、クロメプロップ、ジクロロプロップ、フェノプロップ、ＭＣＰＡ、ＭＣＰＡ−ブトチル、ＭＣＰＡ−ジメチルアンモニウム、ＭＣＰＡ−２−エチルヘキシル、ＭＣＰＡ−イソプロピルアンモニウム、ＭＣＰＡ−カリウム、ＭＣＰＡ−ナトリウム、ＭＣＰＡ−チオエチル、２，４−ＤＢ、ＭＣＰＢ、ＭＣＰＢ−メチル、ＭＣＰＢ−エチル−ナトリウム、及びメコプロップである。アリールピコリネート除草剤の例は、ハラウキシフェン、ハラウキシフェン−メチル、及びフロルピラウキシフェン−ベンジルである。ピリジニルオキシ酸除草剤の例は、トリクロピル、フルロキシピル、アミノピラリド、クロピラリド、及びピクロラムである。
【００６８】
本明細書で使用されるとき、グルタミン合成酵素の阻害剤には、ホスフィノトリシン、グルホシネート、グルホシネート塩、グルホシネートーアンモニウム、グルホシネートーナトリウム、グルホシネート−Ｐ，Ｌ−グルホシネート−アンモニウム、及びＬ−グルホシネート−ナトリウムが挙げられるが、これらに限定されない。
【００６９】
本明細書で使用されるとき、５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）の阻害剤には、グリホサート、グリホサート塩、グリホサート−イソプロピルアンモニウム、グリホサート−アンモニウム、グリホサート−ジメチルアンモニウム、グリホサート−トリメシウム（＝スルホサート）、グリホサート二アンモニウム、グリホサート−カリウム、及びグリホサート−ナトリウムが挙げられるが、これらに限定はされない。
【００７０】
本明細書で使用されるとき、「除草剤に耐性がある」または「除草剤耐性」または「耐性」は、１以上の除草剤（複数可）の存在または施用によって全体的にまたは部分的に影響を受けない能力、例えば、施用された場合除草剤の毒性作用に抵抗する能力を意味する。細胞、種子、または植物体は、１以上の除草剤（複数可）の存在下で少なくともある程度の正常な生育または表現型を維持できれば、「除草剤に耐性がある」、または「改善された耐性」を有する。形質は、野生型または対照の細胞、植物体、または種子と比較して、その存在が細胞、植物体、または種子への除草剤に対して改善された耐性を付与することができれば、除草剤耐性形質である。除草剤耐性形質を含む作物は、除草剤の存在下で生育し続けることができ、除草剤の存在による影響を最小限に抑えられてもよい。タンパク質の発現が野生型または対照の細胞、植物体、または種子と比較して、細胞、植物体、または種子への除草剤に対する改善された耐性を付与することができれば、タンパク質は「除草剤耐性」である。除草剤耐性タンパク質の例は、ホスフィノトリシン  Ｎ−アセチルトランスフェラーゼ、ジカンバモノオキシゲナーゼのコーディング配列、ＦＴ＿Ｔタンパク質、及びＡｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ  ｓｐ株ＣＰ４由来のグリホサート耐性５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼのコーディング配列である。除草剤耐性は、特定の除草剤に対する完全にまたは部分的に非感受性であってもよく、特定の除草剤に対するパーセント（％）耐性または非感受性として表されてもよい。
【００７１】
本明細書中で使用されるとき、「雑草」は、任意の望ましくない植物である。植物は一般に農業もしくは園芸の目的には望ましくないと見なされてもよく（例えば、Ａｍａｒａｎｔｈｕｓ種）、または特定の状況では望ましくないと見なされてもよい（例えば、自生植物としても知られる異なる種の圃場にある１つの種の作物）。雑草は当該技術分野で一般に知られており、地理、シーズン、生育環境、及び時間によって変化する。雑草種のリストは、農業及び科学の団体及び取り組み（例えば、アメリカ雑草学会、カナダ雑草学会、ブラジル雑草学会、国際雑草学会、及び除草剤耐性雑草の国際調査など）、政府機関（例えば、米国農務省、オーストラリア環境エネルギー省など）、及び産業と農民団体（例えば、全米コーン生産者協会など）から入手できる。
【００７２】
本発明は、（ｉ）キザロホップ及びハロキシホップのようなアリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤；（ｉｉ）ジカンバ及び２，４−Ｄのような合成オーキシン；（ｉｉｉ）グルホシネートのようなグルタミン合成酵素の阻害剤；及び（ｉｖ）５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）阻害剤グリホサートから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤を施用することによってトウモロコシ栽培区域にて雑草を防除する方法を提供し、その際、除草剤を施用する前、施用時、または施用した後にトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む種子または植物体が区域に植えられ、除草剤施用が雑草の生育を防止または抑制し、トウモロコシ植物体を傷つけない。植物生育区域は、除草剤施用時に雑草植物を含んでもよいし、または含まなくてもよい。本発明の方法で使用される除草剤（複数可）は、生育期の間に単独で、または１以上の除草剤（複数可）と組み合わせて施用することができる。本発明の方法で使用される除草剤（複数可）は、１以上の除草剤（複数可）と組み合わせて、時間的に（例えば、タンク混合物として、または逐次施用で）、空間的に（例えば、トウモロコシ種子の種まきの前後を含む生育期の間での異なる時間に）、またはその双方で施用することができる。例えば、区域にトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む種子を植えることと、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物を傷つけずに区域の雑草を防除する目的で、ジカンバ、グルホシネート、グリホサート、２，４−Ｄ、またはＦＯＰ除草剤の１以上の除草剤として有効な量を単独でまたは別の除草剤と組み合わせて生育期にわたって施用することとから成る雑草を防除する方法が提供される。除草剤（複数可）のこのような施用は、種まき前（絶滅目的を含めて、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する種子を植える前であればいつでも、すなわち、種子の成長に先立って出現するまたは生存する雑草に対する施用）、発芽前（トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する種子が植えられた後、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体が出現する前のいつでも）、または発芽後（トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体が出現した後のいつでも）であってもよい。１以上の除草剤または除草剤の組み合わせの複数回の施用、例えば、２回の施用（例えば、種まき前の施用と発芽後の施用、または発芽前の施用と発芽後の施用）、または３回以上の施用（例えば、種まき前の施用と２回の発芽後の施用）は生育期にわたって一緒にまたは個々に使用されてもよい。
【００７３】
本発明の方法を実践することにおける除草剤の施用は、推奨される商業的割合またはその任意の割合もしくは倍数、例えば、推奨される商業的割合の２倍であってもよい。除草剤の割合は、除草剤及び処方に応じて、１エーカー当たり１ポンド当たりの酸当量（ポンド酸当量／エーカー）または１エーカー当たり１ポンド当たりの活性成分（ポンド活性成分／エーカー）として表されてもよい。除草剤の施用は、推奨される商業的割合またはその割合もしくは倍数であってもよい。本明細書で提供されているような除草剤施用割合におけるエーカーの使用は、単に指示的であるにすぎず；本明細書で提供される任意の割合と同等の投与量での除草剤施用割合は、１エーカーよりも大きいまたは小さい区画に使用されてもよい。除草剤の施用は、（ｉ）キザロホップ及びハロキシホップのようなアリールオキシフェノキシプロピオン酸（ＦＯＰ）群のアセチルＣｏＡカルボキシラーゼ（ＡＣＣａｓｅ）の阻害剤；（ｉｉ）ジカンバ及び２，４−Ｄのような合成オーキシン；（ｉｉｉ）グルホシネートのようなグルタミン合成酵素の阻害剤；及び（ｉｖ）５−エノールピルビルシキミ酸−３−リン酸シンターゼ（ＥＰＳＰＳ）阻害剤グリホサートから成る群から選択される少なくとも１つの除草剤を含む。植物生育区域は除草剤施用時に雑草植物を含んでもよいし、または含まなくてもよい。雑草を防除する区域で使用するためのＦＯＰ除草剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．０１ポンド活性成分／エーカーから約１．０ポンド活性成分／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、キザロホップは約０．０３４ポンド活性成分／エーカーから約０．０８３ポンド活性成分／エーカーまでの割合で施用されてもよく、ハロキシホップは約０．０１８ポンド活性成分／エーカーから約０．０７ポンド活性成分／エーカーまでの割合で施用されてもよい）。雑草を防除する区域で使用するための合成オーキシンフェノキシ酸除草剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．１ポンド酸当量／エーカーから約１０ポンド酸当量／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、２，４−Ｄは約０．７５ポンド酸当量／エーカーから約１．０ポンド酸当量／エーカーまでの割合で施用されてもよい）。雑草を防除する区域で使用するための合成オーキシンピリジニルオキシ酸除草剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．０５ポンド酸当量／エーカーから約５．０ポンド酸当量／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、フルロキシピルは約０．１４ポンド酸当量／エーカーから約０．４９ポンド酸当量／エーカーまでの割合で施用されてもよい）。雑草を防除する区域で使用するための合成オーキシン安息香酸除草剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．１ポンド酸当量／エーカーから約１６ポンド酸当量／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、ジカンバは約０．５ポンド酸当量／エーカーから約２．０ポンド酸当量／エーカーまでの割合で施用されてもよい）。雑草を防除する区域で使用するためのグルタミン合成酵素阻害剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．１ポンド酸当量／エーカーから約１０ポンド酸当量／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、グルホシネートは約０．４ポンド活性成分／エーカーから約１．５９ポンド活性成分／エーカーまでの割合で施用されてもよい）。雑草を防除する区域で使用するためのＥＰＳＰＳ阻害剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．５ポンド酸当量／エーカーから約１２ポンド酸当量／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、グリホサートは約０．７５ポンド酸当量／エーカーから約２．２５ポンド酸当量／エーカーまでの割合で施用されてもよい）。
【００７４】
本発明は、除草剤として有効な量の少なくとも１つのシクロヘキサンジオン（ＤＩＭ）除草剤、例えば、クレトジム、セトキシジム、及びトラコキシジムを施用することによって作物栽培用の区域にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む自生トウモロコシを防除する方法を提供し、その際、除草剤の施用はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含むトウモロコシの生育を阻止する。自生トウモロコシを防除する区域で使用するためのＤＩＭ除草剤の除草剤として有効な量は、生育期にわたって約０．０３ポンド活性成分／エーカーから約２．７５ポンド活性成分／エーカーまでの範囲から成るべきである（例えば、クレトジムは約０．０６２５ポンド活性成分／エーカーから約０．１２５ポンド活性成分／エーカーまでを施用されてもよく、セトキシジムは約０．１８８ポンド活性成分／エーカーから約０．２８１ポンド活性成分／エーカーまでを施用されてもよい）。
【００７５】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体及び種子を生産する方法が提供されている。植物体は、当該技術分野で既知の任意の方法、例えば、ＷＲ  Ｆｅｈｒ，ｉｎ  Ｂｒｅｅｄｉｎｇ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｆｏｒ  Ｃｕｌｔｉｖａｒ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，Ｗｉｌｃｏｘ  Ｊ．ｅｄ．，Ａｍｅｒｉｃａｎ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ａｇｒｏｎｏｍｙ，Ｍａｄｉｓｏｎ  ＷＩ（１９８７）にて見いだすことができる一般に使用される育種法の記載を使用して交配してもよい。植物体は自家受粉（「自殖」としても知られる）または他家受粉（「交配」としても知られる）させてもよい。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体は、自家受粉させて、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合性である植物体の真の育種系統を生成してもよい。自殖は「近交系」として知られている子孫を生じ、遺伝的に均一である近交系を生成するために使用することができる。あるいは、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体を他花受粉（トランスジェニックまたは非トランスジェニックである別の植物体と交配）させて、変種または雑種の種子を生産してもよい。本発明の方法によって作製される種子及び子孫植物は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９が耐性を付与する１以上の除草剤の施用を使用して、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する子孫を選択してもよい。あるいは、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体または種子を選択するために診断方法を使用して子孫を分析してもよい。子孫は変種または雑種の植物体であってもよく；トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体によって生産された種子から、またはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物体由来の花粉で受精させた植物体によって生産された種子から生育させてもよく；トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合性またはヘテロ接合性であってもよい。
【００７６】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を使用して雑種種子を生産する方法が提供される。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体は、雄性生殖組織を除くすべての組織でグリホサート耐性タンパク質ＣＰ４−ＥＰＳＰＳの発現を有する。これは、植物組織及び雌性生殖組織におけるグリホサート耐性及び雄性生殖組織におけるグリホサート感受性を生じる。このグリホサート感受性を使用して、グリホサートの適切な施用を介して雄性不妊を誘発することができる。グリホサートは、植物にて供給源からシンク組織に移行する浸透性の除草剤である。トウモロコシにおけるグリホサート代謝の速度に起因して、雄性生殖組織の発達に先立つトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物への施用は、花粉の発達、花粉の脱落、または葯の突出を阻止してもよい。このグリホサート誘発性の雄性不稔を使用して、例えば、雑種種子生産の間に所与の交配にてメスとして使用されるトウモロコシ植物の雄しべを物理的に取り去る必要性を排除または低減することによって雑種種子生産の効率を高めることができる。
【００７７】
本発明は、（ａ）トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体を生育させることと；（ｂ）有効量のグリホサートを植物体に施用して雄性不稔を誘導し、その際、除草剤の施用は植物体の雄性生殖組織の発達前またはその最中であり、それによって植物体にて雄性不稔を誘導することと；（ｃ）第２の植物体由来の花粉で植物体を受精させることと；（ｄ）植物体から雑種種子を収穫することとを含む、雑種種子を生産する方法を提供する。一実施形態では、グリホサートは、発達前または発達中に１回以上の施用にて合計約０．２５ポンド酸当量／エーカーから約１１．０ポンド酸当量／エーカーまでの有効量で施用される。別の実施形態では、受精させる工程は、受動受精（例えば、風力受粉を介した）を可能にすることによって、機械的受粉もしくは手受粉のような他の手段によって、またはこれらの組み合わせによって達成されてもよい。除草剤の施用は、トウモロコシ植物の発達のＶ４期、Ｖ５期、Ｖ６期、Ｖ７期、Ｖ８期、Ｖ９期、Ｖ１０期、Ｖ１１期、Ｖ１２期、Ｖ１３期、及びＶ１４期から成る群から選択される段階のような雄性生殖組織の発達前にまたは発達中に１回以上の施用で施用してもよく、少なくとも花粉の発達、花粉の脱落、または葯の突出を阻止してもよい。雄性不稔は部分的であってもよく、または完全であってもよい。一実施形態では、グリホサートの有効量は、Ｖ４期からＶ８期まででまたは開花前の１００成長度単位（ＧＤＵ）までで施用される合計で約０．５ポンド酸当量／エーカーから約２．５ポンド酸当量／エーカーまで（１回の施用または２回以上にわけた施用）ということになる。
【００７８】
本発明の植物体、子孫、種子、細胞、及び植物体の一部は、１以上の追加のトウモロコシ形質（複数可）またはトランスジェニック事象、特にトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有するトウモロコシ植物を追加の形質（複数可）またはトランスジェニック事象を含有する別のトウモロコシ植物と交配することによって導入されるものも含有してもよい。そのような形質（複数可）には、虫害抵抗性の向上、水利用効率の向上、収量成績の向上、耐乾性の向上、種子品質の向上、栄養品質の改善、雑種種子生産、及び除草剤耐性が挙げられるが、これらに限定されず、形質はそのようなトランスジェニック形質を欠くトウモロコシ植物に関して測定される。トウモロコシのトランスジェニック事象は当業者に既知であり；例えば、そのような形質のリストは、米国農務省（ＵＳＤＡ）の動植物健康検査サービス（ＡＰＨＩＳ）によって提供され、ｗｗｗ．ａｐｈｉｓ．ｕｓｄａ．ｇｏｖでのそのＷｅｂサイトにて見いだすことができる。したがって、それぞれが１以上のトランスジェニック事象（複数可）を含む２つの親植物を交配し、子孫種子を収集し、２以上のトランスジェニック事象を含有する子孫の種子または植物を選択することによって、２以上のトランスジェニック事象を子孫の種子または植物体にて組み合わせることができ；次いで、これらの工程は、子孫にてトランスジェニック事象の望ましい組み合わせが達成されるまで繰り返されてもよい。親植物への戻し交配及び非トランスジェニック植物体との異系交配も、栄養繁殖と同様に企図されている。
【００７９】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む種子の代表的な試料の寄託はブダペスト条約に従って、１０８０１  Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｂｏｕｌｅｖａｒｄ，Ｍａｎａｓｓａｓ，Ｖｉｒｇｉｎｉａ  ＵＳＡ，Ｚｉｐ  Ｃｏｄｅ  ２０１１０にて住所を有するアメリカンタイプカルチャーコレクション（ＡＴＣＣ（登録商標））とで行われた。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む種子のＡＴＣＣ特許寄託指定（受託番号）はＰＴＡ−１２４６３５であり、寄託日は２０１８年１月１２日であった。寄託は、３０年間、または最後の請求から５年間、または特許の有効期間のどちらか長い方の期間、寄託機関で維持される。
【００８０】
本明細書で使用されるとき、「を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」という用語は、「を含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）が、これに限定されない」を意味する。
【実施例】
【００８１】
以下の実施例は、本発明をさらに完全に説明するために含まれる。要約されるのは、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の創出と最終的な選択のために必要とされる３５の発現構築物の構築と試験、１５，０００を超える独特の事象の生成、ならびに厳密な分子的試験、農学的試験、及び野外試験を介した７年間にわたる数十万の個々の植物の分析である。
【００８２】
開示されている特定の例において多くの修正を行うことができ、それでも同様の結果が得られることが当業者によって十分に理解されるべきである。化学的に及び生理学的にその双方に関連する特定の作用物質は、同一または類似の結果を達成しながら本明細書に記載される作用物質に置き換えられてもよい。当業者に明らかなそのような置換及び修正はすべて本発明の範囲内にあるとみなされる。
実施例１：発現カセット試験、構築物の設計、及びＲ０植物の試験
【００８３】
この実施例では、３５の異なる構築物のトウモロコシ植物体の設計及び試験を記載する。各構築物は４つの発現カセットを含有し、各発現カセットは異なる導入遺伝子を発現するために使用された。この試験は、トウモロコシで４つの導入遺伝子すべてを発現させるために使用する最良の構築物を選択するために行った。各構築物は、発現カセットの方向性と発現要素によって異なる独特の構成を有した。
【００８４】
さまざまな発現要素の組み合わせと導入遺伝子を持つ種々の個々の発現カセットを設計し、植物形質転換ベクターにクローニングし、トウモロコシ植物における形質有効性を調べて、最良の個々の発現カセットのプールを作り出した。この個々の発現カセットのプールを使用して、それぞれが４つの発現カセット（各発現カセットはＰＡＴ、ＤＭＯ、ＣＰ４−ＥＰＳＰＳ、またはＦＴの導入遺伝子を有する）を含有し、異なる発現カセットの４方向組み合わせを調べるのに使用できるように３５の異なる構築物を設計した。発現カセットの組み合わせは、発現要素、タンパク質のコーディング配列、及び方向性によって異なった。これは、２つのＰＡＴ発現カセット、６つのＤＭＯ発現カセット、５つのＦＴ発現カセット、１８のＣＰ４−ＥＰＳＰＳ発現カセットの試験を生じた。
【００８５】
３５の４発現カセット構築物を植物形質転換ベクターにクローニングし、これらのベクターを、当該技術分野で知られている方法を用いてＬＨ２４４トウモロコシ未成熟胚のＡｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍが介在する形質転換に使用し、それぞれ導入遺伝子のトウモロコシゲノムへの無作為挿入によって作られた１５，３２６の独特の形質転換事象を生成した。次いで、Ｒ０植物体をトランスジェニック細胞から再生し、生育とさらなる評価のために正常な表現型の特徴を持つ発根した植物体を土壌に移した。
【００８６】
１５，３２６のＲ０植物を、トランスジェニック挿入断片の単一のコピーを有し、ベクター骨格配列が存在しないことについて分析した。挿入断片の単一コピーを持つ植物を除草剤耐性の有効性試験に進めた。単一コピーのＲ０植物を、Ｖ１／Ｖ２生育期で散布されたキザロホップ（０．１６ポンド活性成分／エーカーのＡｓｓｕｒｅＩＩ（登録商標）除草剤）、続いてグルホシネート（０．９８ポンド酸当量／エーカーのＩｇｎｉｔｅ（登録商標）２８０除草剤）、ジカンバ（２．０ポンド酸当量／エーカーのＣｌａｒｉｔｙ（登録商標）除草剤）、または２，４−Ｄ（２．０ポンド酸当量／エーカーの２，４−Ｄ  Ａｍｉｎｅ４（登録商標）除草剤）（またはこれらのいずれかの組み合わせ）のタンクミックスに対する耐性について温室で評価した。＞３０％の損傷を示した植物は廃棄した。
【００８７】
３５の形質転換ベクターを使用して生成された最初の１５，３２６の独特の形質転換事象から、コピー数と除草剤散布データを分析した後、１，９４５の独特の事象を選択した。データを表２にて提供する。選択した事象のＲ０植物を自家受粉させてＲ１種子を生産し、または交配してＦ１種子を生成して、第１のシーズンの野外試験に進めた。
表２：第１のシーズンの野外試験の近交系の有効性
【表２】
2021508486.tif 000004
【００８８】
実施例２：第１のシーズンの野外試験
３５の構築物のそれぞれについてのＲ０分析から進められた事象と共に野外試験は長年にわたって実施され、野外試験の第１のシーズンにおける各構築物について植物体ごとに成績をセットとして分析した。したがって、各構築物は多くの独特の事象によって表された。これは、多数の構築物が第１のシーズンの野外試験で調べられるようにした一方で、第１のシーズンの試験を超えて進んだのは一番成績の良い構築物のみだった。（１）グルホシネート＋ジカンバ、キザロホップ、及び２，４−Ｄ耐性についての近交系の有効性、（２）ラウンドアップ交雑システム（ＲＨＳ）の有効性、及び（３）除草剤キザロホップ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びジカンバのさらに高い施用率に対する耐性に対する除草剤圧力試験についてＲ２植物（各事象についてホモ接合性）で別個の第１のシーズンの野外試験を行った。
【００８９】
グルホシネート＋ジカンバ、キザロホップ、及び２，４−Ｄについての除草剤耐性を評価するための植物の近交系有効性評価を実施した。除草剤処理は：０．８ポンド活性成分／エーカーのグルホシネート＋２．０ポンド酸当量／エーカーのジカンバ；０．１６ポンド活性成分／エーカーのキザロホップ；または２．０ポンド活性成分／エーカーの２，４−Ｄのタンクミックス施用から成った。区画は、除草剤処理の１０〜１４日後に０〜１００の尺度にて薬害について目視で格付けしたが、「０」は薬害なし、及び「１００」は完全な作物の破壊である。植物体の高さ（ＰＨＴ）、穂の高さ（ＥＨＴ）、５０％トウモロコシの毛までの日数（Ｓ５０Ｄ）、５０％花粉までの日数（Ｐ５０Ｄ）、殻の重量（ＳＨＷ）、試験重量（ＴＷＴ）、水分（ＭＳＴ）、及び穀物収量（ＹＬＤ）も収集した。すべてのデータを分散分析及びｐ＜０．０５での平均値分離に供した。同じ事象を含有する複数の植物体の全体的な平均が使用され、近交系有効性はグルホシネート＋ジカンバ、キザロホップ、及び２，４−Ｄについて、優秀（４）、良好（３）、普通（２）、または不良（１）、または該当なし（ＮＡ）として要約した。データを表３に示す。
表３：第１のシーズンの野外試験の近交系の有効性
【表３】
2021508486.tif 000005
【００９０】
植物のＲＨＳ有効性評価を実施して、近交系材料のグリホサート耐性及びグリホサート誘発雄穂不稔性における差異を同定した。単一の除草剤処理をスクリーニングに使用し、それは、Ｖ２に施用した１．５ポンド酸当量／エーカーのグリホサート、続いてほぼＶ８（８７５成長度日）、その後ほぼＶ１０（１０２５成長度日）に施用した０．７５ポンド酸当量／エーカーのグリホサートから成った。区画は、除草剤施用の１０〜１４日後の薬害％（ＣＩＰＶ２、ＣＩＰＶ８、ＣＩＰＶ１０、及びＣＩＰＶＴ）について０〜１００の尺度で目視にて格付けし、加えて、ＶＴ（雄穂の出現後）にて最終的な損傷を格付けした。区画は、トウモロコシの毛の出現率％［（ＳＥＳ９Ａ（Ｓ９０）及びＳＥＳ９Ｃ（Ｓ９０＋４日）ＳＥＳ９Ｅ（Ｓ９０＋８日）］及び葯突出％［（ＡＥＳ９Ａ（Ｓ９０）、ＡＥＳ９Ｃ（Ｓ９０＋４日）、及びＡＥＳ９Ｅ（Ｓ９０＋８日）］についても０から１００の同様の尺度で目視にて格付けし、「０」はトウモロコシの毛の出現または葯の突出がないことを示し、「１００」はトウモロコシの毛の完全な出現または葯の完全な突出を示す。近交系有効性評価のように、他の農業的パラメーターを収集した。同じ事象を含有する複数の植物の全体的な平均を使用し、グリホサート耐性、雄穂不稔性及び収量について、優秀（４）、良好（３）、普通（２）、または不良（１）、または該当なし（ＮＡ）として要約した。データを表４に示す。
表４：第１のシーズンの野外試験のＲＨＳ有効性
【表４】
2021508486.tif 000006
【００９１】
除草剤圧力試験を実施して、以下のように、除草剤キザロホップ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びジカンバのさらに高い施用率に対する構築物レベルの作物耐性を評価した。キザロホップ処理は、（１）ＶＥ〜Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した０．３２ポンド活性成分／エーカー（４Ｘ）でのキザロホップと０．２５％ｖ／ｖの非イオン性界面活性剤（ＮＩＳ）；（２）ＶＥ〜Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した０．６４ポンド活性成分／エーカー（８Ｘ）のキザロホップと０．２５％ｖ／ｖのＮＩＳ；または（３）ＶＥ〜Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した１．２８ポンド活性成分／エーカー（１６Ｘ）のキザロホップと０．２５％ｖ／ｖのＮＩＳから成った。２，４−Ｄ処理は、（１）ＶＥ〜Ｖ２、続いてＶ４、その後Ｖ８を施用した２ポンド活性成分／エーカーの２，４−Ｄアミンと０．２５％ｖ／ｖの非イオン性界面活性剤（ＮＩＳ）；（２）ＶＥ〜Ｖ２、続いてＶ４、その後Ｖ８を施用した４ポンド活性成分／エーカーの２，４−Ｄアミンと０．２５％ｖ／ｖのＮＩＳ；（３）ＶＥ〜Ｖ２、続いてＶ４、その後Ｖ８を施用した８ポンド活性成分／エーカーの２，４−Ｄアミンと０．２５％ｖ／ｖのＮＩＳ；または（４）ＶＥ〜Ｖ２、続いてＶ４、その後Ｖ８を施用した１６ポンド活性成分／エーカーの２，４−Ｄアミンと０．２５％ｖ／ｖのＮＩＳから成った。グルホシネート処理は、（１）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した１．０ポンド活性成分／エーカーのグルホシネート；（２）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した２．０ポンド活性成分／エーカーのグルホシネート；（３）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した４．０ポンド活性成分／エーカーのグルホシネート；または（４）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した８．０ポンド活性成分／エーカーのグルホシネートから成った。ジカンバ処理は、（１）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した２．０ポンドのジカンバ；（２）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した４．０ポンドのジカンバまたは（３）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した８．０ポンドのジカンバ、（４）Ｖ２に続いてＶ４、その後Ｖ８に施用した１６ポンドのジカンバから成った。区画は薬害について目視で格付けし、近交系有効性評価のように、農業的パラメーターを収集した。同じ事象を含有する複数の植物の全体的な平均を使用し、４つの除草剤のそれぞれについて、優秀（４）、良好（３）、普通（２）、または不良（１）、または該当なし（ＮＡ）として除草剤耐性の有効性を要約した。データを表５に提供する。
表５：第１のシーズンの野外試験の除草剤圧力試験
【表５】
2021508486.tif 000007
【００９２】
３５の構築物のそれぞれで生産されたＲ２植物の複合成績のデータは、（１）グルホシネート＋ジカンバ、キザロホップ、及び２，４−Ｄ耐性についての近交系有効性試験、（２）グリホサート耐性、雄穂不稔性、及び収量についてのＲＨＳ有効性試験、ならびに（３）除草剤キザロホップ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びジカンバのよりさらに高い施用率に対する耐性についての除草剤圧力試験についてまとめ、且つ分析した。このデータを使用して、調べた３５の構築物からの進行について３つの構築物（ＨＴ４−１４、ＨＴ４−３２、及びＨＴ４−３４）を選択した。これら３つの構築物についての事象を第２のシーズンの野外試験に進めた。
【００９３】
実施例３：分子分析
分子分析は進められた事象で野外試験と同時に行われた。ＤＮＡの増幅と配列決定を用いて、挿入配列、挿入コピー数、及び挿入における主鎖の非存在を確認した。各事象についてのトウモロコシゲノムにおける挿入部位をマッピングした。ノーザン解析を行って、ｐａｔ、ｄｍｏ、ｆｔ＿ｔ、ｃｐ４−ｅｐｓｐｓの遺伝子のｍＲＮＡ転写物を検出し、測定した。トランスジェニック植物から精製したＰＡＴ、ＤＭＯ、ＦＴ＿Ｔ、及びＣＰ４−ＥＰＳＰＳのタンパク質のＮ末端タンパク質の配列決定を行って、組換えタンパク質配列を確認した。ＰＡＴ、ＤＭＯ、ＦＴ＿Ｔ、及びＣＰ４−ＥＰＳＰＳのタンパク質を検出するためのウエスタンブロット解析は、トランスジェニック植物試料で行われた。Ｒ１植物由来のゲノムＤＮＡで詳細なサザン解析を実施し、コピー数及び主鎖の非存在を確認した。
【００９４】
実施例４：進んだ野外試験
構築物ＨＴ４−１４、ＨＴ４−３２、及びＨＴ４−３４についての第１のシーズンの野外試験から進んだ事象で、進んだ野外試験（第２のシーズンの試験以降）が長年にわたって行われた。各野外試験における各事象について多くの個々の植物の成績をセットとして分析した。したがって、各事象は多くの独特の植物によって表された。これにより、さまざまな場所や区域で、種々の特性について、多数の条件下にて各事象の成績を分析できるようになった。
【００９５】
野外試験は近交系植物（事象についてホモ接合性）及び雑種植物（事象について半接合性）で行い、（１）グルホシネート、ジカンバ、キザロホップ、及び２，４−Ｄ耐性の商業的割合についての形質有効性、（２）農業的成績、（３）ラウンドアップ交雑システム（ＲＨＳ）の有効性及びグリホサート、ならびに（４）除草剤キザロホップ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びジカンバのさらに高い施用率に対する耐性についての除草剤圧力試験を評価した。
【００９６】
野外シーズン１の試験では、構築物ＨＴ４−１４について３０の事象を調べ、構築物ＨＴ４−３２について４１の事象を調べ、構築物ＨＴ４−３４について２１の事象を調べた。これらの試験に由来する複合データを使用して、進歩について事象を選択した。野外シーズン２の試験では、ＨＴ４−１４構築物について１５の事象、ＨＴ４−３２構築物について３８の事象、ＨＴ４−３４構築物について３８の事象を調べた（この数には、そのシーズンの種子不足のために起因して野外シーズン１で調べなかった幾つかの事象が含まれた）。構築物ＨＴ４−１４についての事象は、実施例３に記載されているように分子分析によって特徴付けられ、このデータも事象を選択するのに使用された。これらの試験に由来する複合データとＨＴ４−１４構築物についての事象の詳細な分子特性評価を使用して、ＨＴ４−１４の構築物についての進歩に向けて３の事象を選択した。これらの試験の複合データを使用して、ＨＴ４−３２構築物についての進歩に向けて２４の事象を選択し、ＨＴ４−３４構築物についてのどんな事象も進めないことに決めた。野外シーズン３の試験では、構築物ＨＴ４−１４についての３つの事象及びＨＴ４−３４構築物についての２４の事象を調べた。これらの試験に由来する複合データを使用して、ＨＴ４−１４構築物についての進歩に向けて２つの事象を選択し、ＨＴ４−３２についてはどんな事象も進めないことに決めた。優れた事象を選択するために必要なデータを生成するために、野外シーズン４の試験を使用して、多数の場所で、さまざまな条件下で、雑種及び近交系の遺伝資源にて最終的な２つの事象を比較した。表６は、各シーズンの間で実施された野外試験にて各構築物について調べた独特の事象の数を提供する。
表６：進んだ野外試験の概要
【表６】
2021508486.tif 000008
【００９７】
農学的成績の野外試験は、形質有効性の野外試験と同じシーズンに実施した。野外試験はすべて、無作為化された完全なブロック設計を使用し、複数の場所で実施された。野外試験北米と南米の各地で行われた。有効性と農学的野外試験の双方について、野外試験のシーズン全体を通して農学的得点を収集し、シーズンの終了時に収量を決定した（有効性収率または農学的収率）。有効性野外試験を行って、除草剤施用後１０〜１４日での薬害を評価した。目標の薬害の採点は事象の進歩について１０％未満の得点だった。農業的野外試験については、区画は雑草を含まない状態に維持され、試験用除草剤はいずれも生育期には施用されなかった。雑種の農業的野外試験には、トランスジェニック雑種交配を行うのに使用された同じ親トウモロコシ系統を使用して生産されたが、トランスジェニック事象を含有していない比較可能な雑種（雑種対照）の対照が含まれた。近交系対照は、トランスジェニック近交系と比較可能な近交系であった。
【００９８】
野外試験のデータを比較するために、多くのシーズン、多くの場所の野外試験データにおける植物すべての集計を使用してメタ解析を実施した。例として、表７は、複数のシーズンにわたって、選択された２つのＨＴ４−１４の事象について観察が繰り返された反復（ｒｅｐｓ）の数と、各事象について各試験で調べた個々の植物の総数とを説明している。
表７：野外試験の反復
【表７】
2021508486.tif 000009
【００９９】
雑種の薬害採点の比較のために、複数の雑種有効性の野外試験のメタ解析を完了させた。例として、表８は、Ｖ８で採点された２つの選択されたＨＴ４−１４の事象（Ｖ８での分析はＶ２、Ｖ４、Ｖ６、及びＶ８での除草剤施用に由来する累積薬害を包含する）についての複数のシーズンにわたる薬害の採点を９５％信頼水準での統計的最小有意差（ＬＳＤ、ｐ＜０．０５）と共に提供する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と事象２を含有する植物は双方とも、これらの試験で良好に機能した。
表８：雑種有効性の野外試験に由来する薬害採点のメタ解析
【表８】
2021508486.tif 000010
【０１００】
ブッシェル／エーカー（Ｂｕ／ａｃ）としての収量の比較のために、複数の雑種有効性の野外試験のメタ解析を完了させた。例として、表９は、２つの選択されたＨＴ４−１４事象についての複数シーズンにわたる雑種由来の収量を９５％の信頼水準での統計的最小有意差（ＬＳＤ  ｐ＜０．０５）とともに提供する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と事象２を含有する植物は双方ともこれらの試験で良好に機能した。
表９：雑種有効性の野外試験に由来する収量のメタ解析
【表９】
2021508486.tif 000011
【０１０１】
商業的使用よりも高い施用率で施用した除草剤による圧力試験の野外試験は、単一のトランスジェニック事象を含有する雑種植物及び近交系植物で行った。除草剤グルホシネート（１．６〜６．４ポンド活性成分／エーカーの範囲にわたる）、ジカンバ（２．０〜１６ポンド活性成分／エーカーの範囲にわたる）、キザロホップ（０．３２〜１．２８ポンド活性成分／エーカーの範囲にわたる）、２，４−Ｄ（２．０〜８．０ポンド活性成分／エーカーの範囲にわたる）及びグリホサート（３．０ポンド酸当量／エーカー）は、除草剤耐性形質の有効性の圧力試験のための野外試験で施用された。シーズンの終了時に、雑種圧力試験の野外試験が収穫され、収量（Ｂｕ／ａｃ）が決定された。例として、表１０は、２つの選択されたＨＴ４−１４の事象についての異なる試験における雑種及び近交系に由来する収量データを９５％の信頼水準での統計的最小有意差（ＬＳＤ  ｐ＜０．０５）とともに提供する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と事象２を含有する植物は双方とも、除草剤処理すべてについての雑種及び近交系の収量試験で良好に機能した。結果は、さらなる野外試験により事象２を超えるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についての近交系収量の利点が同定され得ることを示唆した。
表１０：雑種／近交系の圧力試験有効性の野外試験からの収量
【表１０】
2021508486.tif 000012
【０１０２】
雑種の農業的野外試験を実施し、シーズン全体を通して農業測定を収集し、シーズンの終了時に農業収量を決定した。雑種対照と雑種の収量を比較するために、多くのシーズン、多くの場所での雑種の農業的野外試験にわたってメタ解析を使用した。例として、表１１は、２つの選択されたＨＴ４−１４の事象についての収量データ（Ｂｕ／ａｃ）を９５％の信頼水準での統計的最小有意差（ＬＳＤ  ｐ＜０．０５）とともに提供する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と事象２を含有する植物の双方はこれらの試験で良好に機能し、対照植物と比較した場合、これらの事象のいずれかを含有する植物について雑種収量に統計的差異は見いだされなかった。
表１１：雑種の農業的野外試験に由来する収量のメタ解析
【表１１】
2021508486.tif 000013
【０１０３】
近交系有効性の野外試験は、グリホサート耐性及びラウンドアップ交雑システム（ＲＨＳ）について行い、収量はシーズンの終了時に決定した。グリホサートは、雑草防除のために１．５ポンド酸当量／エーカーの割合で施用され、ほぼＶ８での０．７５ポンド酸当量／エーカーのグリホサートの２回の不稔性施用がそれに続き、その後ほぼＶ１０での０．７５ポンド酸当量／エーカーの施用が続いた。植物の収量を比較するために、多くのシーズン、多くの場所での近交系有効性の野外試験にわたってメタ解析を使用した。例として、表１２は、２つの選択されたＨＴ４−１４事象についての収量データ（Ｂｕ／ａｃ）を９５％の信頼水準での統計的最小有意差（ＬＳＤ  ｐ＜０．０５）とともに提供する。野外シーズン２及び野外シーズン３の試験は双方とも、事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と比較した場合、事象２を含有する植物での収量で統計的に有意な低下を示した。これらのデータは、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物の近交系有効性の収量試験にて優れた成績を示した。
表１２：グリコサート処理した近交系有効性の野外試験に由来する収量のメタ解析
【表１２】
2021508486.tif 000014
【０１０４】
近交系の農学的野外試験を行い、未処理の植物についてシーズンの終了時に収量を決定した。試験はトランスジェニック近交系と比較可能な近交系の対照を含んだ。多くのシーズン、多くの場所での近交系の農業的野外試験にわたるメタ解析を行って、対をなす対照とトランスジェニック近交系とについて収量を比較した。例として、表１３は、２つの選択されたＨＴ４−１４事象についての収量データ（Ｂｕ／ａｃ）を９５％の信頼水準での統計的最小有意差（ＬＳＤ  ｐ＜０．０５）とともに提供する。対照植物とトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物の間で近交系の農業収量に統計的な差異は見いだされなかった。対照的に、野外シーズン３の試験については、対照植物と事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物とを比較した場合、事象２を含有する植物における収量で統計的に有意な低下があった。これらのデータは、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物の近交系農業収量試験における優れた成績を示した。
表１３：近交系の農業的野外試験に由来する収量のメタ解析
【表１３】
2021508486.tif 000015
【０１０５】
アルゼンチンの４つの場所で雑種有効性試験を行い、グルホシネート、ジカンバ、キザロホップ、ハロキシホップ、２，４−Ｄ、及びグリホサートに対する植物体の耐性を評価した。ＭＯＮ８７４２９を含有する植物を、トウモロコシ事象ＭＯＮ８８０１７及びトウモロコシ事象ＭＯＮ８９０３４の双方を含有する植物と交配して、３つの事象すべて（ＭＯＮ８７４２９×ＭＯＮ８８０１７×ＭＯＮ８９０３４）を含有する子孫を生成した。除草剤処理は、（１）未処理の対照；（２）Ｖ２期で施用する０．４４８ｋｇ活性成分／ヘクタールのグルホシネートとその後のＶ６期での同じ施用；（３）Ｖ２期で施用する０．８９６ｋｇ活性成分／ヘクタールのグルホシネート、とその後のＶ６期での同じ施用；（４）Ｖ２期で施用する０．５６ポンド酸当量／エーカーのジカンバ、とその後のＶ６期での同じ施用；（５）Ｖ２期で施用する１．１２ポンド酸当量／エーカーのジカンバ、とその後Ｖ６期での同じ施用；（６）Ｖ２期で施用する０．０９ｋｇ酸当量／ヘクタールのキザロホップ、とその後のＶ６期での同じ施用；（７）Ｖ２期で施用する０．１８ｋｇ酸当量／ヘクタールのキザロホップとその後のＶ６期での同じ施用；（８）Ｖ２期で施用する０．１ｋｇ酸当量／ヘクタールのハロキシホップ、とその後のＶ６期での同じ施用；（９）Ｖ２期に施用する０．２ｋｇ酸当量／ヘクタールのハロキシホップ、とその後のＶ６期での同じ施用；（１０）Ｖ２期で施用する１．１２ポンド活性成分／エーカーでの２，４−Ｄ、とその後のＶ６期での同じ施用；（１１）Ｖ２期で施用する２．２４ポンド酸当量／エーカーの２，４−Ｄとその後のＶ６期での同じ施用；または（１２）Ｖ２期で施用す２．２４ポンド酸当量／エーカーのグリホサートとその後のＶ６期での同じ施用から成った。データ収集は、Ｖ２とＶ６での除草剤施用後１０〜１４日の薬害とＶＴでの最終採点、花粉５０％までの日数、トウモロコシの毛５０％までの日数、植物体の高さ、穂の高さ、殻の重量、試験重量、水分、及び穀物収量から成った。すべてのデータを分散分析及びｐ＜０．０５での平均値分離に供した。
【０１０６】
ＭＯＮ８７４２９×ＭＯＮ８８０１７×ＭＯＮ８９０３４を含有する植物の除草剤耐性は、調べたグリホサート、グルホシネート、ジカンバ、キザロホップ、ハロキシホップ、及び２，４−Ｄのすべての割合で優れていた（１０％未満の薬害）。除草剤の処理速度は、目視による薬害に関して差異を生じなかった。穂の高さは、標準の除草剤処理１２（２．２４ポンド酸当量／エーカーでのグリホサート）と比較して処理のいずれについても有意差はなかった。未処理の植物のそれに対する処理の範囲内でＭＯＮ８７４２９×ＭＯＮ８８０１７×ＭＯＮ８９０３４を含有する植物の植物体の高さまたは試験重量の有意な減少、穀物水分の増加、成熟の遅延（花粉またはトウモロコシの毛が５０％になるまでの日数の増加として測定）、穀物収量の低下はなかった。ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と雄性組織でグリホサート耐性を提供する事象を含有する植物（市販のトウモロコシ事象ＭＯＮ８８０１７またはＮＫ６０３など）との交配を介して生産された雑種植物は、商業的なラベル割合で施用した場合グリホサート、グルホシネート、ジカンバ、キザロホップ、ハロキシホップ、及び２，４−Ｄに対して優れた生育耐性を提供する。
【０１０７】
３年間の野外試験を用いて、クレトジムを使用したトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物の防除について調べた。これらの試験は、自生防除法にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物と共にＤＩＭ除草剤を使用することを評価した。植物を商業的なラベル割合にてクレトジムで処理し、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物の完全な防除が観察された。
【０１０８】
（１）グルホシネート、ジカンバ、キザロホップ、及び２，４−Ｄ耐性の商業的割合についての形質有効性、（２）農業的成績、（３）ラウンドアップ交雑システム（ＲＨＳ）の有効性及びグリホサート耐性、ならびに（４）除草剤キザロホップ、２，４−Ｄ、グルホシネート、及びジカンバのさらに高い施用率に対する耐性についての除草剤圧力試験を評価している分子分析から及び近交系植物と雑種植物による野外試験から蓄積したデータを、構築物ＨＴ４−１４、ＨＴ４−３２、及びＨＴ４−３４について調べた事象すべてに関して分析した。累積データの分析は、他の事象と比較してトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の全体的に優れた成績を実証し、この事象を商業目的で選択する結果となった。
【０１０９】
実施例５：トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の分子特性評価
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９は商業事象として選択される際、広範な分子特性評価に供された。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のトランスジェニック挿入断片は表１に記載されている要素及び配列を含有する。
【０１１０】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のＤＮＡ配列解析を行った。サザンブロット解析を行って、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物が、どんな形質転換ベクター主鎖も含まずにトランスジェニック挿入断片全体の単一の完全なコピーを含有することを確認した。隣接ＤＮＡは、挿入断片の５’及び３’末端の双方で配列決定し、それぞれの接合部は、配列捕捉、濃縮、配列決定、逆ＰＣＲ、及びゲノムウォーキング法を使用して決定した。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の隣接ＤＮＡの配列は、既知のトウモロコシゲノムの物理的アセンブリにマッピングした。挿入部位の配列情報は事象の染色体位置のバイオインフォマティクス分析に使用した。挿入部位の完全性は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の隣接領域に特異的なプライマーを使用して、野生型対立遺伝子全体のＰＣＲによって決定した。野生型挿入部位を使用して、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の導入遺伝子統合の独特の部位をトウモロコシ参照ゲノムにマッピングした。形質転換の間に導入遺伝子のどの領域にも変化または変異が導入されないことを保証するために、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のトランスジェニック挿入断片全体を植物から単離し、配列決定した。５’接合部、３’接合部、及びトランスジェニック挿入断片の配列情報は、配列番号１〜１０として本明細書で提供されている。
【０１１１】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の構築物を含む植物のＲＮＡ解析を行った。ノーザン解析は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物の穀物から単離した全ＲＮＡで行った。これによって、ｐａｔ、ｄｍｏ、ｆｔ＿ｔ、及びｃｐ４−ｅｐｓｐｓのｍＲＮＡ産物の転写物のサイズ及び数が確認された。ＣＰ４−ＥＰＳＰＳのＲＮＡ発現レベルも、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する植物組織由来の試料を用いたリアルタイムＰＣＲによって測定した。ｃＤＮＡ末端の迅速な増幅（ＲＡＣＥ）を使用してＣＰ４−ＥＰＳＰＳ切断産物を同定し、ＣＰ４−ＥＰＳＰＳ転写物の切断がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物の雄穂でのみ発生し、これがトウモロコシの内在性の雄性特異的な低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）によって配列特異的にもたらされることを確認した。低分子量ノーザン解析を実施して、雄穂以外の組織にてグリホサート耐性を損ない得るＣＰ４−ＥＰＳＰＳのｓｉＲＮＡがないことを実証した。
【０１１２】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の構築物を含む植物のタンパク質分析を行った。穀物から免疫精製したタンパク質抽出物を用いて、発現されたＰＡＴ、ＤＭＯ、ＦＴ＿Ｔ、及びＣＰ４−ＥＰＳＰＳタンパク質のＮ末端タンパク質配列決定を行い、本物のＮ末端アミノ酸配列を確認した。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する穀物からのタンパク質抽出物でウエスタンブロット解析を行い、ＰＡＴ、ＤＭＯ、ＦＴ＿Ｔ、及びＣＰ４−ＥＰＳＰＳのそれぞれについて、予想されるサイズの単一のタンパク質が生成されていることを確認した。ＥＬＩＳＡを用いて、ＰＡＴ、ＤＭＯ、ＦＴ＿Ｔ、及びＣＰ４−ＥＰＳＰＳのタンパク質について植物の葉、種子、根、及び花粉におけるタンパク質のレベルを決定した。
【０１１３】
実施例６：トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の検出
試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の検出は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、またはタンパク質の検出技法を使用して行うことができる。例示的な検出方法及び材料を以下に提供する。検出は、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在または非存在を判定してもよい。検出は、ゲノムＤＮＡの試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９（すなわち、半接合、ホモ接合、またはヘテロ接合）のゲノムコピーの数を示してもよい。
【０１１４】
事象特異的なエンドポイントであるＡｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（商標）ＴＡＱＭＡＮ（登録商標）熱増幅法（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を開発して、試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を同定した。エンドポイントアッセイで使用されるＤＮＡプライマーとプローブは、プライマーＳＱ５１０６２（配列番号１１）、ＳＱ５１０５３（配列番号１２）、及び６−ＦＡＭ（商標）標識プローブＰＢ５０３７０（配列番号１３）である。６−ＦＡＭは、ＤＮＡプローブに接続されたＡｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ  Ｃｉｔｙ，ＣＡ）の蛍光色素製品である。ＴＡＱＭＡＮ  ＭＧＢ（商標）プローブについては、Ｔａｑ  ＤＮＡポリメラーゼの５’エキソヌクレアーゼ活性が、蛍光色素分子と消光剤との間の５’末端からプローブを切断する。標的ＤＮＡ鎖とハイブリッド形成すると、消光剤と蛍光色素分子が蛍光シグナルを生成するのに十分に分離されるので、蛍光を放出する。ＳＱ５１０６２とＳＱ５１０５３はこれらの反応方法及びＰＢ５０３７０と共に使用される場合、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の診断に役立つＤＮＡアンプリコンを生成する。この分析用の対照には、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含有する陽性対照と、非トランスジェニックトウモロコシ由来の陰性対照と、鋳型ＤＮＡを含有しない陰性対照とを含めるべきである。さらに、ＰＣＲ反応の対照には最適には、トウモロコシのゲノムにおける単一コピー遺伝子に特異的な内部対照プライマー及び内部対照プローブを含めるべきである。これらのアッセイは、最高速度で実行されるＡｐｐｌｉｅｄ  ＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓＧｅｎｅＡｍｐ（登録商標）ＰＣＲシステム９７００（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）での使用のために最適化されるが、他の機器が使用されてもよい。
【０１１５】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を検出するためのＴＡＱＭＡＮ法で有用な条件の例は以下のとおりである。工程１：５μｌの最終容量に調整された１８メガオームの水。工程２：２×ユニバーサルマスターミックス（ｄＮＴＰ、酵素、緩衝液）２．２８μｌを１×最終濃度にする。工程３：０．０５μｌの事象プライマー１（ＳＱ５１０６２）と事象プライマー２（ＳＱ５１０５３）（１８メガオームの水に再懸濁して各プライマーを１００ｕＭの濃度にする）を０．９μＭの最終濃度にする。工程４：０．０１μｌの事象６−ＦＡＭ  ＭＧＢプローブＰＢ５０３７０（１８メガオームの水に１００μＭの濃度で再懸濁）を０．２μＭの最終濃度にする。工程５：０．０５μｌの内部対照プライマー１と内部対照プライマー２のミックス（１８メガオームの水に再懸濁して各プライマーを１００ｕＭの濃度にする）を０．９μＭの最終濃度にする。工程６：０．０１μｌの内部対照ＶＩＣ（商標）プローブ（１８メガオームの水に１００μＭの濃度で再懸濁）を０．２μＭの最終濃度にする。工程７：各試料について抽出されたＤＮＡ（鋳型）２．５μｌには、以下のそれぞれ１つが含まれる：（ａ）分析される葉試料；（ｂ）陰性対照（非トランスジェニックＤＮＡ）；（ｃ）陰性水対照（鋳型なし）；（ｄ）トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のＤＮＡを含有する陽性対照トウモロコシ。工程８：熱サイクラーの条件は以下のとおりである：９５℃で２０秒間を１サイクル；９５℃で３秒間、次に６０℃で２０秒間を４０サイクル；そして１０℃の最終サイクル。
【０１１６】
接合性アッセイを開発して、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物が事象または野生型対立遺伝子についてヘテロ接合性またはホモ接合性であるかどうかを判定する。本明細書で提供される配列情報を用いて増幅反応アッセイを設計することができる。例えば、そのようなＰＣＲアッセイには少なくとも３つのプライマー：プライマー１、プライマー２、及びプライマー３の設計が含まれ、プライマー１はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の３’側隣接のトウモロコシゲノムＤＮＡに特異的であり；プライマー２はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９トランスジェニック挿入断片に特異的であり；プライマー３は野生型対立遺伝子に特異的である。増幅反応でプライマー対として使用される場合、プライマー１とプライマー２はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９に特異的なＰＣＲアンプリコンを生成するであろう。増幅反応でプライマー対として使用される場合、プライマー１とプライマー３は、野生型対立遺伝子に特異的なＰＣＲアンプリコンを生成するであろう。トウモロコシのゲノムＤＮＡで実施されるＰＣＲ反応では、プライマー１＋プライマー２から生成された各ＰＣＲアンプリコン及びプライマー１＋プライマー３から生成された各ＰＣＲアンプリコンは、アンプリコンの配列とサイズが異なるであろう。３つのプライマーがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のホモ接合性植物から抽出されたＤＮＡでのＰＣＲ反応に含まれる場合、プライマー１＋プライマー２のアンプリコン（トウモロコシＭＯＮ８７４２９挿入断片に特異的）のみが生成されるであろう。３つのプライマーがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のヘテロ接合性植物から抽出されたＤＮＡでのＰＣＲ反応に含まれる場合、プライマー１＋プライマー２のアンプリコン（トウモロコシＭＯＮ８７４２９挿入に特異的）及びプライマー１＋プライマー３のアンプリコン（野生型対立遺伝子に特異的またはトウモロコシＭＯＮ８７４２９挿入なしに特異的）の双方が生成されるであろう。３つのプライマーがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヌルである（野生型である）植物から抽出されたＤＮＡでのＰＣＲ反応に含まれる場合、プライマー１＋プライマー３のアンプリコン（野生型対立遺伝子に特異的）のみが生成されるであろう。ＰＣＲ反応を用いて生成されるアンプリコンは、当該技術分野で知られている任意の方法を用いて同定されてもよいし、または区別されてもよい。
【０１１７】
トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてのもう１つの接合性アッセイはＴＡＱＭＡＮ熱増幅反応である。この種のアッセイについは、上述のようなプライマーに加えて、アッセイには２つの蛍光標識プローブが含まれる。プローブ１はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９に特異的であり、プローブ２はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９（野生型）についてヌルである（野生型）トウモロコシ植物に特異的であり、２つのプローブは異なる蛍光標識、例えば、６−ＦＡＭ標識またはＶＩＣ（商標）標識を含有する。ＴＡＱＭＡＮ反応で使用される場合、プライマー１＋プライマー２＋プローブ１はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９に特異的な第１の蛍光シグナルを生成し、プライマー１＋プライマー３＋プローブ２は野生型トウモロコシに特異的な第２の蛍光シグナルを生成するであろう。３つのプライマー及び２つのプローブがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合性植物から抽出されたＤＮＡとのＴＡＱＭＡＮ反応に含まれる場合、第１の蛍光シグナル（プライマー１＋プライマー２＋プローブ１に特異的な）のみが生成されるであろう。３つのプライマーがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９のヘテロ接合性植物から抽出されたＤＮＡとのＴＡＱＭＡＮ反応に含まれる場合、第１の蛍光シグナル（プライマー１＋プライマー２＋プローブ１に特異的な）及び第２の蛍光シグナル（プライマー１＋プライマー３＋プローブ２に特異的な）の双方が生成されるであろう。３つのプライマーがトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヌルである（野生型）植物から抽出されたＤＮＡとのＴＡＱＭＡＮ反応にて一緒に混合される場合、第２の蛍光シグナル（プライマー１＋プライマー３＋プローブ２に特異的な）のみが生成されるであろう。
【０１１８】
植物試料におけるトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９の存在を検出する別の方法はサザン解析である。当業者は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９に特異的なサザンハイブリッド形成プローブ（複数可）及びトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヌルである（野生型）トウモロコシ植物に特異的な第２のサザンハイブリッド形成プローブを設計する方法を理解するであろう。サザン解析では、第１のサザンハイブリッド形成プローブからのみ検出されるシグナルはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてホモ接合性植物を示し；第１のサザンハイブリッド形成プローブと第２のサザンハイブリッド形成プローブの双方から検出されるシグナルはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヘテロ接合性植物を示し；第２のサザンハイブリッド形成プローブからのみ検出されるシグナルはトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９についてヌルである（野生型）植物からＤＮＡが抽出されたことを示すであろう。
【０１１９】
検出キットの別の例は、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体を含む。例えば、そのようなキットは、細片の先端が水溶液と接触すると活性化される試薬を含む側方流動細片を利用してもよい。抗体産生に使用するのに十分な例示的なタンパク質は、配列番号１０として提供される配列によってコードされるもの、またはその任意の断片である。
【０１２０】
タンパク質検出法を開発して、試料がトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９を含む植物体、種子、細胞、または植物体の一部に由来するかどうかを判定する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質に特異的な少なくとも１つの抗体を用いて、試料にてトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされるタンパク質を検出する。トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる１以上のタンパク質に特異的な１以上の抗体を含む検出キットは、細片の先端が水溶液と接触すると活性化される試薬を含有する側方流動細片を利用してもよい。トウモロコシ組織の試料を粉砕し、水または水性緩衝液（例えば、界面活性剤とウシ血清アルブミンを含有するリン酸緩衝生理食塩水）を用いて分析のためにタンパク質を抽出してもよい。遠心分離に続いて、吸収性パッドを含有する側方流動細片にてサンドイッチ形式でＥＬＩＳＡ法を使用して水性上清を分析する。検出は、調べられる試料を含有する水溶液に細片の先端を浸すことによって活性化される。水溶液は毛細管作用によって細片に運ばれ、細片上にて金で標識した抗体を可溶化する。金で標識した抗体はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされる少なくとも１つのタンパク質に特異的であり、試料におけるそのタンパク質のエピトープに結合して、抗体・抗原複合体を形成する。次いで、金で標識した抗体・抗原複合体は細片上でニトロセルロース膜まで運ばれる。膜はトウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされるタンパク質上の第２の別個のエピトープに結合する不動化された抗体の試験ラインを含み、トウモロコシ事象ＭＯＮ８７４２９によってコードされるタンパク質が試料に存在すれば、試験細片を横切って一目瞭然のラインを出現させる。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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