(57)【要約】本発明は、操作された細胞およびそれを使用するための方法に関する。実施形態では、操作された細胞は、キメラ抗原受容体およびポリペプチドをコードする核酸を含み、キメラ抗原受容体は、癌細胞の表面上の２種類以上の抗原に特異的であり、ポリペプチドは、操作された細胞から分泌され得る抗体またはその断片を含む。【選択図】図１４
2021518104.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
キメラ抗原受容体およびポリペプチドをコードする核酸を含む操作された細胞であって、前記キメラ抗原受容体が、癌細胞の表面上の２種類以上の抗原に特異的であり、前記ポリペプチドが、前記操作された細胞から分泌され得る抗体またはその断片を含む、前記操作された細胞。
【請求項２】
Ｔ細胞またはＮＫ細胞を含む、請求項１に記載の操作された細胞。
【請求項３】
前記Ｔ細胞が、ＣＤ４＋、ＣＤ８＋、またはＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞の混合集団である、請求項２に記載の操作された細胞。
【請求項４】
前記２種類以上の抗原が、ＣＸＣＲ４およびクローディン４を含む、請求項１に記載の操作された細胞。
【請求項５】
前記キメラ抗原受容体が、配列番号１、２、３、４、５、６、７もしくは８を含むＶＨ、配列番号９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、もしくは１６を含むＶＬ、またはそれらの任意の組み合わせを含む、請求項１に記載の操作されたＴ細胞。
【請求項６】
前記キメラ抗原受容体が、
ＳＹＧＭＨ（配列番号１７）を含むＣＤＲ１、ＶＩＳＹＤＧＳＮＫＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号１８）を含むＣＤＲ２、ＤＬＶＡＡＡＧＴＡＦＤＩ（配列番号１９）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＴＧＴＩＳＤＶＧＧＨＮＦＶＳ（配列番号２０）を含むＣＤＲ１、ＥＶＴＫＲＰＡ（配列番号２１）を含むＣＤＲ２、ＳＳＹＧＧＳＮＤＶＩ（配列番号２２）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
ＳＮＦＶＡＷＮ（配列番号２３）を含むＣＤＲ１、ＲＴＹＹＲＳＲＷＹＮＤＹＡＶＳＶＱＳ（配列番号２４）を含むＣＤＲ２、ＧＱＨＳＧＦＤＦ（配列番号２５）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＴＧＮＳＮＮＶＧＮＱＧＡＡ（配列番号２６）を含むＣＤＲ１、ＲＮＮＮＲＰＳ（配列番号２７）を含むＣＤＲ２、およびＳＡＷＤＮＲＬＫＴＹＶ（配列番号２８）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
ＳＹＧＩＳ（配列番号２９）を含むＣＤＲ１、ＷＩＳＡＹＮＧＮＴＮＹＡＱＫＬＱＧ（配列番号３０）を含むＣＤＲ２、ＤＴＰＧＩＡＡＲＲＹＹＹＹＧＭＤＶ（配列番号３１）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＱＧＤＳＬＲＫＦＦＡＳ（配列番号３２）を含むＣＤＲ１、ＧＫＮＳＲＰＳ（配列番号３３）を含むＣＤＲ２、およびＮＳＲＤＳＲＤＮＨＱＶ（配列番号３４）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
ＳＹＰＭＨ（配列番号３５）を含むＣＤＲ１、ＶＩＳＳＤＧＲＮＫＹＹＰＤＳＶＫＧ（配列番号３６）を含むＣＤＲ２、およびＧＧＹＨＤＦＷＳＧＰＤＹ（配列番号３７）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＲＡＳＱＳＶＮＴＮＬＡ（配列番号３８）を含むＣＤＲ１、ＧＡＳＳＲＡＴ（配列番号３９）を含むＣＤＲ２、およびＱＨＹＧＳＳＰＬＴ（配列番号４０）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
ＳＹＡＭＳ（配列番号４１）を含むＣＤＲ１、ＮＩＫＱＤＧＳＥＫＹＹＶＤＳＶＫＧ（配列番号４２）を含むＣＤＲ２、およびＤＱＶＳＧＩＴＩＦＧＧＫＷＲＳＰＤＶ（配列番号４３）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＱＧＤＳＬＲＳＹＹＡＳ（配列番号４４）を含むＣＤＲ１、ＧＫＮＮＲＰＳ（配列番号４５）を含むＣＤＲ２、およびＮＳＲＳＧＳＱＲＶ（配列番号４６）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
ＮＹＧＬＨ（配列番号４７）を含むＣＤＲ１、ＶＩＳＨＤＧＴＫＫＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号４８）を含むＣＤＲ２、およびＤＧＧＹＣＳＧＧＲＣＹＳＹＧＭＤＶ（配列番号４９）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＳＧＳＲＳＮＩＧＳＮＴＶＮ（配列番号５０）を含むＣＤＲ１、ＴＮＮＱＲＰＳ（配列番号５１）を含むＣＤＲ２、およびＬＳＦＤＳＳＬＴＳＹＶ（配列番号５２）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
ＲＹＧＭＨ（配列番号５３）を含むＣＤＲ１、ＬＩＳＹＤＧＳＫＴＦＹＧＥＳＶＫＧ（配列番号５４）を含むＣＤＲ２、およびＡＴＶＴＴＤＧＹＹＹＭＤＶ（配列番号５５）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＳＧＳＲＳＮＩＧＧＮＴＶＮ（配列番号５６）を含むＣＤＲ１、ＡＮＮＱＲＰＳ（配列番号５７）を含むＣＤＲ２、およびＡＡＷＤＤＮＬＳＧＨＶＶ（配列番号５８）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ、
またはそれらの任意の組み合わせを含む、請求項１に記載の操作されたＴ細胞。
【請求項７】
前記キメラ抗原受容体が、
ＧＦＴＶ．．．．ＳＳＮＹ（配列番号５９）を含むＣＤＲ１、ＩＹＳＧ．．．ＧＳＴ（配列番号６０）を含むＣＤＲ２、およびＡＲＤＮＰＬＳＡＦＤＩ（配列番号６１）を含むＣＤＲ３を有するＶＨと、
ＱＳＩ．．．．．．ＮＳＷ（配列番号６２）を含むＣＤＲ１、ＫＡ．．．．．．．Ｓ（配列番号６３）を含むＣＤＲ２、およびＱＱＹＤＤＬＰＬＴ（配列番号６４）を含むＣＤＲ３を有するＶＬ
を含む、請求項１に記載の操作された細胞。
【請求項８】
前記分泌されたポリペプチドが、対象の免疫系を調節する、請求項１に記載の操作された細胞。
【請求項９】
前記分泌されたポリペプチドが、ＴＩＧＩＴ、ＣＡＩＸ、ＧＩＴＲ、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２．ＰＤ−１、またはＣＣＲ４に特異的な抗体を含む、請求項１に記載の操作された細胞。
【請求項１０】
前記抗体が、ＴＩＧＩＴに特異的である、請求項９に記載の操作された細胞。
【請求項１１】
前記分泌されたポリペプチドが、
配列：ＧＹＴＦ．．．．ＴＳＹＧ（配列番号６５）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＳＡＹ．．ＮＧＮＴ（配列番号６６）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＤＰＧＬＷＦＧＬＴＨＤＹＹＦＤＹ（配列番号６７）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３と、
配列ＳＳＮＩ．．．．ＧＳＮＴ（配列番号６８）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＲＮ．．．．．．．Ｎ（配列番号６９）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＡＡＷＤＤＳＲＳＧＰＶ（配列番号７０）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３、
配列：ＧＦＴＦ．．．．ＳＤＹＳ（配列番号７１）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＮＳＤ．．ＧＳＲＴ（配列番号７２）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＧＰＧＦＦＧＦＤＩ（配列番号７３）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、
配列ＲＳＮＩ．．．．ＧＲＮＳ（配列番号７４）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＳＮ．．．．．．．Ｎ（配列番号７５）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＡＡＷＤＡＲＬＴＧＰＬ（配列番号７６）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３、
配列：ＧＹＳＦ．．．．ＴＮＹＷ（配列番号７７）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＮＰＶ．．ＮＳＲＴ（配列番号７８）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＹＹＹＹＡＭＥＶ（配列番号７９）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、
配列ＳＳＮＩ．．．．ＧＳＮＴ（配列番号８０）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＲＮ．．．．．．．Ｎ（配列番号８１）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＥＡＷＤＤＳＬＮＧＰＶ（配列番号８２）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３、
配列：ＧＹＴＦ．．．．ＴＮＹＧ（配列番号８３）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＶＤＮＮ．．ＮＧＮＩ（配列番号８４）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＧＬＦＳＳＲＷＹＬＷＦＤＰ（配列番号８５）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３と、
配列ＳＳＤＶＧ．．．ＧＹＮＹ（配列番号８６）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＥＶ．．．．．．．Ｔ（配列番号８７）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＳＳＹＴＲＳＳＴＳＹＶＶ（配列番号８８）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３、
配列：ＧＧＴＦ．．．．ＳＳＹＡ（配列番号８９）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＬＰＭ．．ＦＧＳＴ（配列番号９０）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＧＲＤＩＶＡＰＳＮＳＧＦＤＶ（配列番号９１）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、
配列ＳＮＮＶ．．．．ＧＮＱＧ（配列番号９２）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＲＮ．．．．．．．Ｄ（配列番号９３）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＳＡＹＤＲＳＬＮＡＷＶ（配列番号９４）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３、
またはそれらの任意の組み合わせを含む、請求項１に記載の操作された細胞。
【請求項１２】
キメラ抗原受容体およびポリペプチドをコードする核酸であって、前記キメラ抗原受容体が、癌細胞の表面上の２種類以上の抗原に特異的であり、前記ポリペプチドが、操作された細胞から分泌され得る抗体またはその断片を含む、前記核酸。
【請求項１３】
前記２種類以上の抗原がＣＸＣＲ４およびクローディン４を含む、請求項１２に記載の核酸。
【請求項１４】
前記ポリペプチドが、ＴＩＧＩＴ、ＣＡＩＸ、ＧＩＴＲ、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２．ＰＤ−１、またはＣＣＲ４に特異的な抗体を含む、請求項１２に記載の核酸。
【請求項１５】
請求項１２に記載の核酸を含むベクター。
【請求項１６】
請求項１５に記載のベクターを含む細胞。
【請求項１７】
癌に罹患している対象を治療する方法であって、請求項１に記載の操作された細胞の治療上有効量を前記対象に投与することを含む、前記方法。
【請求項１８】
対象における癌の進行を低減させるまたは退縮を促進させる方法であって、請求項１に記載の操作された細胞の治療上有効量を前記対象に投与することを含む、前記方法。
【請求項１９】
対象における癌細胞の細胞増殖を低減させる方法であって、請求項１に記載の操作された細胞の治療上有効量を前記対象に投与することを含む、前記方法。
【請求項２０】
操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の殺傷能力を評価するための方法であって、
１つ以上のタイプの癌から細胞を得ることと、
前記細胞を染色するために、前記細胞を色素と混合することと、
プレートに前記細胞を播種することと、
前記混合物をある期間にわたってインキュベートすることと、
異なるＴ細胞タイプを前記混合物に追加して、第２の混合物を作製することと、
前記第２の混合物をある期間にわたって共培養することと、
前記操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の殺傷能力を評価することと
を含む、前記方法。
【請求項２１】
評価することが、前記プレートを走査および分析することを含む、請求項２０に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
この出願は、２０１８年３月１４日に出願された米国仮特許出願第６２／６４３，０４０号、および２０１８年４月１３日に出願された米国仮特許出願第６２／６５７，１５１号の優先権を主張し、それぞれの内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本明細書に引用されるすべての特許、特許出願、および刊行物は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。これらの刊行物の開示は、本明細書に記載され特許請求される本発明の日付の当業者に既知の最新技術をより完全に記載するために、参照により本出願に組み込まれる。
【０００３】
この特許開示は、著作権保護の対象となる、材料を含む。著作権所有者は、米国特許商標局の特許ファイルまたは記録に表れているように、特許文書または特許開示のいずれかによってファクシミリ複製に異議はないが、それ以外では、何であれすべての著作権を留保する。
【０００４】
政府の権益
この発明は、米国国立衛生研究所によって授与された助成金番号Ｔ３２−ＣＡ２０７０２１に基づく政府の支援を受けて行われた。政府は本発明に一定の権利を有する。
【０００５】
発明の分野
本発明は、操作された細胞およびそれを使用する方法を対象とする。実施形態では、操作された細胞は、キメラ抗原受容体およびポリペプチドをコードする核酸を含み、キメラ抗原受容体は、癌細胞の表面上の２種類以上の抗原に特異的であり、ポリペプチドは、操作された細胞から分泌され得る抗体またはその断片を含む。
【背景技術】
【０００６】
発明の背景
トリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）を標的にする治療法は存在しないため、化学療法が患者に対する唯一の治療法である。抗ＰＤ−Ｌ１のような免疫療法は、ＴＮＢＣの限定的な成功（１８％の奏効率）を示し、これは、既存の療法が効果的な治療ではないことを示している。
【発明の概要】
【０００７】
本発明の態様は、キメラ抗原受容体およびポリペプチドをコードする核酸を含む操作された細胞に向けられている。
【０００８】
実施形態では、操作された細胞は、操作されたＴ細胞である。非限定的な例は、細胞傷害性Ｔ細胞（ＴＣ、細胞傷害性Ｔリンパ球、ＣＴＬ、Ｔ−キラー細胞、細胞溶解性Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞またはキラーＴ細胞としても知られる）、ＣＤ４＋Ｔ細胞、ＮＫ細胞、およびＮＫＴ細胞を含む。
【０００９】
実施形態では、キメラ抗原受容体は、抗原認識ドメインおよびシグナル伝達および／または刺激ドメインを含む。
【００１０】
実施形態では、抗原認識ドメインは、細胞の表面上の２種類以上の抗原に特異的である。例えば、細胞は癌細胞である。例えば、抗原は、ＣＸＣケモカイン受容体タイプ４およびクローディン４を含む。実施形態では、キメラ抗原受容体（および／または抗原認識ドメイン）は、１つ以上の抗体断片を含む。実施形態では、キメラ抗原受容体はｓｃＦＶを含む。実施形態では、キメラ抗原受容体は、ＣＸＣケモカイン受容体タイプ４およびクローディン４を対象とする（標的とする）ｓｃＦｖを含む。
【００１１】
実施形態では、シグナル伝達および／または刺激ドメインは、ＣＤ２８、４１ＢＢ、ＣＤ３−ゼータ細胞内シグナル伝達ドメイン、またはそれらの断片を含む。
【００１２】
実施形態では、ポリペプチドは、操作された細胞から分泌され得る抗体またはその断片を含む。実施形態では、分泌されたポリペプチドは、対象の免疫系を調節する。
【００１３】
実施形態では、ポリペプチドは、ミニボディなどの抗体またはその断片を含む。抗体の非限定的な例には、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）、ヒト化抗体、完全ヒト抗体が含まれる。実施形態では、ポリペプチドは、単一特異性抗体、二重特異性抗体、三重特異性抗体、または多重特異性抗体を含む。抗体断片の非限定的な例は、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’−ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、ダイアボディ、直鎖状抗体、一本鎖抗体分子（例えば、ｓｃＦｖ）、抗体断片から形成された多重特異性抗体を含む。一実施形態では、本発明は、標的抗原に向けられた（および標的抗原に特異的な）ｓｃＦＶを含む。
【００１４】
実施形態では、ポリペプチドは、ＣＡＲを発現するものとは別個であるが、ＣＡＲと同じＤＮＡベクターの構成要素である発現構築物から発現される。実施形態では、ポリペプチドは、ＣＡＲを発現するものとは別個であり、ＣＡＲとは異なるＤＮＡベクターの構成要素である発現構築物から発現される。
【００１５】
実施形態では、構築物は、１つ以上のウイルスベクターにクローニングされる。非限定的な例は、レンチウイルスベクターを含む。
【００１６】
本発明の態様は、さらに癌に罹患している対象を治療する方法に向けられている。
【００１７】
本発明の態様は、さらに対象における癌の進行を低減させるかまたは癌の退縮を促進させる方法に向けられている。
【００１８】
なおさらに、本発明の態様は、対象における癌細胞の細胞増殖を減少させる方法に向けられている。
【００１９】
さらに、本発明の態様は、細胞、好ましくは癌細胞の細胞傷害性を誘導する方法に向けられている。
【００２０】
実施形態では、方法は、操作されたＴ細胞など、本明細書に記載の操作された細胞の治療上有効量を対象に投与することを含む。
【００２１】
他の実施形態では、この方法は、本明細書に記載の治療上有効量の分泌されたポリペプチドを対象に投与することを含む。
【００２２】
癌の非限定的な例には、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、および白血病が含まれる。そのような癌のより具体的な例には、扁平上皮癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃腸癌、膵臓癌、神経膠芽腫、子宮頸部癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、ヘパトーマ、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、肝癌、およびさまざまなタイプの頭頸部癌が含まれる。
【００２３】
実施形態では、癌は、トリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）を含む。
【００２４】
本発明の態様は、さらに、操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の殺傷能力（ｋｉｌｌｉｎｇ  ｃａｐａｂｉｌｉｔｙ）を評価するための方法に向けられている。
【００２５】
実施形態では、その方法は、１つ以上のタイプの癌から細胞を入手することと、細胞を染色するために、細胞を色素と混合することと、マルチウェルプレートに細胞を播種することと、混合物をある期間にわたってインキュベートすることと、異なるＴ細胞タイプを混合物に追加して、第２の混合物を作製することと、第２の混合物をある期間にわたって共培養することと、操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の殺傷能力を評価することと、を含む。実施形態では、評価することは、プレートを走査して分析することを含む。実施形態では、プレートは、明視野および青色蛍光チャネルを使用して分析することができる。
【００２６】
実施形態では、細胞は、１つ以上のタイプの癌細胞を含む。実施形態では、細胞は、腎臓（例えば、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞）、乳癌細胞（例えば、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１細胞、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８細胞、ＨＣＣ３８細胞）、および腎臓癌細胞（ｓｋ−ｒｃ−５９細胞）から単離された細胞のうちの１つ以上を含む。
【００２７】
実施形態では、色素は、ＶｉａＳｔａｉｎ（商標）トレーサーブルー色素を含む。
【００２８】
実施形態では、プレートは、４、６、８、１２、２４、４８、９６、または９６を超えるウェルを有するマルチウェルプレートを含む。
【００２９】
実施形態では、期間は、約２時間、４時間、６時間、８時間、１２時間、１６時間、２４時間、３６時間、４８時間、または４８時間より長い時間を指す。
【００３０】
本発明の他の目的および利点は、以下の記載から容易に明らかになるであろう。
【図面の簡単な説明】
【００３１】
【図１】抗ＣＸＣＲ４一本鎖可変断片を発現するバクテリオファージである２Ｎおよび６Ｒが、ＣＸＣＲ４陽性細胞に結合することを示す。バクテリオファージとして発現する、ＣＸＣＲ−４認識一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）の希釈系列が、ＣＸＣＲ４を発現する安定したＨＥＫ  ２９３Ｔ細胞に結合している。結合は、ＰＥ−抗Ｍ１３バクテリオファージ二次抗体を用いたフローサイトメトリー分析を使用して分析された。１２Ｇ５を除くすべてのｓｃＦｖは、Ｍａｒａｓｃｏ研究所で発見された。１２Ｇ５は、マウスハイブリドーマ由来の市販のＣＸＣＲ−４認識抗体である。
【図２】ＣＸＣＲ４標的化キメラ抗原受容体Ｔ細胞によるＣＸＣＲ−４発現細胞の特異的な細胞傷害性を、ＣＡＲ  Ｔ細胞添加後４０時間での標的細胞接着の測定により示す。［Ａ］ＣＡＲ遺伝子の模式図。リーダー配列は、膜発現のために細胞小胞体を介してＣＡＲをターゲティングする。ここでは、単一特異性ｓｃｆｖがＣＤ８ヒンジ、４１ＢＢ膜貫通、細胞内シグナル伝達ドメイン、およびＣＤ３ゼータシグナル伝達ドメインに融合している。第２の発現カセットでは、蛍光分子または免疫調節ミニボディまたは抗体のいずれかを発現させることができる。［Ｂ、Ｃ］それぞれ、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１  ＣＸＣＲ４標的細胞株またはＭＤＡ−ＭＢ−２３１（ＣＸＣＲ４なし）のＣＡＲ−Ｔ細胞による殺傷のための標的細胞接着の喪失。対照には、非形質導入Ｔ細胞（ｕｎ）および無関係のＣＡＲ（Ｇ３６）およびＴ細胞のない標的細胞（黒線）が含まれる。［Ｃ］ＭＤＡ−ＭＢ−２３１（灰色）およびＭＤＡ−ＭＢ−２３１−ＣＸＣＲ４発現標的細胞（黒色）の存在下でＣＡＲ−Ｔ細胞活性化を測定するＩＦＮ−γ酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）は、ＣＸＣＲ４発現標的細胞の存在下でのみＣＡＲ−Ｔ細胞の特異的活性化を示している。標的細胞／ＣＡＲの説明は上記のとおりである。
【図３】蛍光標識した標的細胞の定量化により、ＣＸＣＲ４標的化キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞によるＣＸＣＲ−４発現標的細胞の特異的細胞傷害性を示す。ｍＣａｒｄｉｎａｌ蛍光標識標的細胞ＭＤＡ−ＭＢ−２３１−ＣＸＣＲ４（上部グラフ）、またはＭＤＡ−ＭＢ−２３１（下部グラフ）の、それら単独（時間−１時間）、Ｔ細胞添加直後（０時間）、Ｔ細胞添加後２４時間および４８時間の時点における列挙である。ＢではなくＡでのみの２Ｎ、６Ｒ、Ｘ３３、およびＸ４８による２４時間および４８時間での標的細胞の喪失は、標的細胞上のＣＸＣＲ４の認識による特異的殺傷を示している。対照には、非形質導入Ｔ細胞（Ｕｎ）、無関係なＣＡＲ（Ｇ３６）、Ｔ細胞なし（細胞のみ）が含まれる。
【図４】クロストリジウム・パーフリンジェンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ  ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ）エンドトキシン（ＣＰＥ）−ＦＣ融合タンパク質は細胞上のクローディン４を認識することを示す。［Ａ］クロストリジウム・パーフリンジェンスエンドトキシンタンパク質の直線的模式図。細胞傷害性ドメイン（黒）、クローディン４標的化ドメイン（緑）、ＣＰＥ−ＦＣ融合で使用されるアミノ酸ドメイン（１８５−３１９）に下線が引かれている。［Ｂ］ＩｇＧ１ヒンジ（Ｈ）、ＣＨ２およびＣＨ３  ＦＣドメインに対してインフレームで発現されるクローディン４結合ドメインを有するＣＰＥ−ＦＣ融合タンパク質の直線的模式図。［Ｃ］プロテインＡカラムでの精製後の還元剤ありおよびなしのＣＰＥ−ＦＣのＳＤＳ−ＰＡＧＥ。［Ｄ］ＨＥＫ  ２９３（灰色）およびクローディン４をトランスフェクションしたＨＥＫ（黒色）に対する、ＣＰＥ−ＦＣおよびＦＩＴＣ抗ヒトＦＣ二次結合のフローサイトメトリー分析。
【図５】リードクローディン４（ｃｌｄｎ４）に特異的なｓｃＦｖ  ＥＫ０１がクローディン４発現細胞に結合することを示す。［Ａ］ＣＰＥ−ＦＣを用いたフローサイトメトリー染色によるＴＮＢＣ細胞株ＨＣＣ３８上のｃｌｄｎ４の分析。［Ｂ］クローディン４標的化ｓｃＦｖ  ＥＫ０１は、ＨＥＫと比較してＨＣＣ３８細胞に特異的に結合する。
【図６】二重特異性トリプルネガティブ乳癌ＣＡＲの分泌型ミニボディ／抗体の一部として、ＩｇおよびＩＴＩＭドメイン（ＴＩＧＩＴ）を有する抗Ｔ細胞免疫受容体を示す。バイオレイヤー干渉法を使用した、Ｈｉｓタグ付きＴＩＧＩＴに結合している、発見された抗ＴＩＧＩＴ抗体（ＴＩＧ１（赤）、ＴＩＧ６（緑））および市販の抗ＴＩＧＩＴ抗体ＭＡＢ７８９８（青）のセンサーグラム。解離率−ＴＩＧ１  ３．１２ｎＭ、ＴＩＧ６  １３．３ｎＭ。
【図７】Ｃｅｌｉｇｏを用いる、ＣＡＲ−Ｔ細胞との共培養における蛍光標的細胞の定量化を示す顕微鏡写真である。
【図８】エフェクターと標的（Ｅ：Ｔ）との比率１０：１での、非形質導入（Ｕｎ、黒）、無関係なＣＡＲ（ＩＲ、オレンジ）、ＣＸＣＲ４標的化ＣＡＲ（ＣＸ１〜４）との共培養におけるＭＤＡ−ＭＢ−２３１＋／−ＣＸＣＲ４標的細胞の列挙を示すグラフである。（ｎ＝２ドナー）
【図９】エフェクターと標的（Ｅ：Ｔ）との比率２：１での、非形質導入（Ｕｎ、黒）、無関係なＣＡＲ（ＩＲ、オレンジ）、ＣＸＣＲ４標的化ＣＡＲ（ＣＸ１〜４）との共培養におけるＭＤＡ−ＭＢ−２３１＋／−ＣＸＣＲ４標的細胞の列挙を示すグラフである。（ｎ＝２ドナー）
【図１０】ＣＸＣＲ４を標的としたＣＡＲによる殺傷のインビトロ評価を示す。グラフは、１０：１（Ｅ：Ｔ）でのＨＣＣ３８＋／−ＣＸＣＲ４の殺傷を示している。（ｎ＝２ドナー）
【図１１】ヒト化マウスモデルにおけるＴＮＢＣ異種移植片の免疫浸潤を示す。図１１Ａは、ＨＳＣ移植後１７週間のヒトＣＤ４５＋の割合を示すグラフである。図１１Ｂは、４つのＴＮＢＣ細胞株由来異種移植片（ｎ＝４）の腫瘍増殖を示すグラフである。図１１Ｃは、腫瘍におけるヒトＣＤ４５＋事象の割合を示すグラフである。図１１Ｄは、ＣＤ４５＋母集団に対するＣＤ３＋Ｔ細胞の割合（％）を示すグラフである。図１１Ｅは、ＣＤ４５＋母集団に対するＣＤ３＋骨髄細胞の割合（％）を示すグラフである。
【図１２】腫瘍の重量を示す表である。
【図１３】クローン２Ｎ、６Ｒ、Ｘ１８、Ｘ１９、Ｘ２０、Ｘ３３、Ｘ４８のアミノ酸配列を示す。太字で示された残基は、コンセンサスアミノ酸配列を表す。コンセンサス配列では、所与の位置に同じアミノ酸を有する４つ以上のクローンがそのアミノ酸として指定される。重鎖の可変領域（「ＶＨ」）と軽鎖の可変領域（「ＶＬ」）の両方に対する、フレームワーク領域１〜４（ＦＷ１〜４）、および相補性決定領域１〜３（ＣＤＲ１〜３）をクローンごとに示す。ＶＨおよびＶＬファミリーの指定も提供される。
【図１４】ヒトＣＸＣＲ４受容体のアミノ酸配列を示す模式図である。また、ヒトＣＸＣＲ４受容体のヘリカルホイール（上部）とセルペンチン図（下部）も提供されている。
【図１５】抗ＣＬＤＮ４クローンＥＫ０１のアミノ酸配列を示す。パネルＡは、抗ＣＬＤＮ４クローンＥＫ０１のアミノ酸配列を示す。パネルＢは、抗ＣＬＤＮ４クローンＥＫ０１のアミノ酸配列を生殖細胞系列と比較して示す。
【図１６】ＥＬＩＳＡアッセイにより決定された、新しいＰＭＰＬパニングからの３つの追加の抗ＴＩＧＩＴ抗体の同定を示す。ＥＬＩＳＡプレートを１μｇ／ｍｌの可溶性ＰＤ１で３７℃で２時間コーティングした。次にプレートを洗浄し、２％ＢＳＡ／ＰＢＳで３７℃で１時間ブロックした。ブロッキング溶液を除去し、抗体の３倍段階希釈を６μｇ／ｍｌから始めて各ウェル（１００μｌ）に加えた。次にプレートを穏やかに振盪しながら室温でインキュベートし、ＰＢＳ−Ｔで６回洗浄し、二次抗ヒトＦｃ−ＨＲＰ（１：１５０ｋ、Ｂｅｔｈｙｌ）を加えた。プレートを再び穏やかに振盪しながら室温で１時間インキュベートした後、ＰＢＳ−Ｔで６回洗浄した。ＴＭＢ基質を加え、プレートを３０℃で１０分間インキュベートして、ＨＲＰ反応を促進させた。次にシグナルをＴＭＢ停止液でクエンチし、４５０ｎｍで読み取った。試料Ｐ５−Ｅ１０とＰ６−Ｇ７は４連で実行され、Ｐ６−Ｇ７とＴＩＧ１は３連で実行された。
【図１７】抗ＴＩＧＩＴ抗体（ｓｏｌ  ｐｒｏｔｅｉｎ＆ＰＭＰＬ）のアミノ酸配列および生殖細胞アラインメントを示している。
【図１８】乳房細胞株におけるＣＸＣＲ４とＣＬＤ４の共発現を示している。本明細書に記載されるように、試験されたＴＮＢＣ細胞株は、異なるレベルのＣＸＣＲ４およびＣＬＤＮ４の内因性細胞表面発現を有する初代ＴＮＢＣ細胞株であるＤＵ４４７５およびＨＣＣ１１８７を含む。データには、フローサイトメトリーによって決定されたＣＸＣＲ４とＣＬＤＮ４の表面発現、Ｃｅｌｌｅｇｏで分析されたインビトロのＣＡＲＴによる殺傷アッセイ、およびヒト化マウスでのインビボ腫瘍増殖とフローサイトメトリーによるＴＩＬ分析が含まれる。
【図１９】ＤＵ４４７５およびＨＣＣ１１８７の内因性ＣＸＣＲ４およびクローディン４タンパク質発現のフローサイトメトリー分析を示す。ＣＬＤＮ４発現は、ＣＰＥ−ＦｃおよびＦＩＴＣ抗ヒトＦＣ二次抗体を用いて決定され、ＣＸＣＲ４発現は、抗ＣＸＣＲ４抗体、続いてＡＰＣコンジュゲート二次抗体を使用して決定された。
【図２０】Ｘ４８  ＣＡＲＴがＣＸＣＲ４発現細胞株ＨＣＣ１１８７およびＤＵ４４７５を殺傷することを示す。エフェクターと標的（Ｅ：Ｔ）との比率が１０：１および２：１での、非形質導入（Ｕｎ、青）、無関係なＣＡＲ（Ｇ３６、赤）、ＣＸＣＲ４標的化ＣＡＲ（Ｘ４８、緑）、Ｔ細胞なし（細胞のみ、黒）との共培養におけるＨＣＣ１１８７、ＤＵ４４７５、およびＭＤＡ−ＭＢ−２３１  ＋／−ＣＸＣＲ４標的細胞の細胞傷害性を示す。ｍＣａｒｄｉｎａｌ蛍光標識標的細胞の列挙は、Ｔ細胞添加直後（０時間）、Ｔ細胞添加後２４時間および４８時間でＣｅｌｅｇｏを用いて決定した。
【図２１】内因性発現ＣＸＣＲ４細胞株ＨＣＣ１１８７およびＤＵ  ４４７５と共培養したＣＡＲ−ＴによるＩＦＮ−γ産生を示す。ＭＤＡ−ＭＢ−２３１（青）、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１−ＣＸＣＲ４発現標的細胞（赤）、ＨＣＣ１１８７（緑）およびＤＵＣ４４７５（紫）の存在下でのＣＡＲ−Ｔ細胞活性化を測定するＩＦＮ−γ酵素結合免疫測定法（ＥＬＩＳＡ）は、ＣＸＣＲ４発現標的細胞の存在下でのみ、ＣＡＲ−Ｔ細胞の特異的な活性化を示す。標的細胞／ＣＡＲの説明は図２０と同じである。２３１  ＣＸＣＲ４−外因性遺伝子発現。
【図２２】ヒト化マウスモデルにおけるＨＣ１１８７腫瘍増殖を示す。本明細書に示されているのは、ヒト化マウスモデルにおけるＴＮＢＣ異種移植片の免疫浸潤である。パネルＡは、研究終了時（生着後３３日）の腫瘍画像を示している。パネルＢは、直径で測定した各マウス（ｎ＝５）の腫瘍増殖を示すグラフである。パネルＣは、ＨＣ１１８７  ＴＮＢＣ腫瘍対脾臓におけるヒトＣＤ４５＋事象および他の細胞亜集団事象の割合を示す。パネルＤは、腫瘍対脾臓におけるＣＤ３＋母集団についてのＰＤ−１＋、ＴＩＧＩＴ＋またはＴＩＧＩＴ＋／ＰＤ−１＋  Ｔ細胞の割合を示すグラフである。
【発明を実施するための形態】
【００３２】
発明の詳細な説明
トリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）は、臨床予後が不良の高悪性度の乳癌のサブタイプである。化学療法で治療している間の、高い再発率は新規のターゲティングされた療法の必要性を示している。
【００３３】
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞療法は、ＣＡＲの外因性発現によって患者のＴ細胞を、腫瘍細胞を殺傷するようにリダイレクトする。ＣＡＲは、抗体の抗原認識ドメインをＴ細胞受容体および共受容体の細胞内シグナル伝達ドメインに連結する、膜貫通型融合タンパク質であり得る。固形腫瘍は、ＣＡＲ−Ｔ療法に特有の課題を提示する。血液癌とは異なり、腫瘍に関連する標的タンパク質は腫瘍と健康な組織の間で過剰発現し、その結果、オンターゲット／オフ腫瘍の、Ｔ細胞による健康な組織の殺傷が起こる。さらに、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）における免疫抑制は、腫瘍の殺傷に向かうＣＡＲ−Ｔ細胞の活性化を制限する。
【００３４】
本発明は、ＴＮＢＣに対する抗体を分泌する操作されたキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞ファクトリに関する。理論に縛られることを望まないが、ＴＮＢＣなどの固形腫瘍の２種類の抗原を標的とする二重特異性ＣＡＲは、オンターゲット／オフ腫瘍のＴ細胞による殺傷を軽減し、チェックポイント遮断抗体の分泌によって腫瘍微小環境での抑制を取り除く。局所的な免疫回復に続いて、ＣＡＲ−Ｔ細胞とＴＭＥ内の他の細胞は相乗的に作用して、腫瘍を縮小させおよび排除する。
【００３５】
略語と定義
１つ以上の好ましい実施形態の詳細な説明が本明細書に提供されている。しかしながら、本発明が、さまざまな形式で具現化され得ることが、理解される。したがって、本明細書に開示された特定の詳細は、限定として解釈されるべきではなく、特許請求の範囲の根拠として、および当業者に本発明を任意の適切な方法で用いるように教示するための代表的な根拠として解釈されるべきである。
【００３６】
単数形「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈が明確に他のことを指示しない限り、複数の参照を含む。特許請求の範囲および／または明細書において「含む」という用語とともに使用されるときの「１つの（ａ）」または「１つの（ａｎ）」という単語の使用は、「１つ」を意味し得るが、「１つ以上」、「少なくとも１つ」および「１つ以上」の意味と両立する。
【００３７】
句「例えば」、「など」、「含む」などが本明細書で使用される場合は常に、他に明確に明記されない限り、句「限定することなく」が付随することが理解される。同様に、「一例」、「例示的」などは、非限定的であると理解される。
【００３８】
用語「実質的に」は、意図した目的に悪影響を与えない記述語からの逸脱を可能にする。記述用語は、単語「実質的に」が明確に列挙されていなくても、用語「実質的に」によって修正されることが理解される。
【００３９】
用語「含んでいる（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」および「含んでいる（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、ならびに「有している（ｈａｖｉｎｇ）」および「伴っている（ｉｎｖｏｌｖｉｎｇ）」（および同様に「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」、「有する（ｈａｓ）」、および「伴う（ｉｎｖｏｌｖｅｓ）」）などは、交換可能に使用され、同じ意味を有している。具体的には、用語それぞれは、「含んでいる（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」の一般的な米国特許法の定義と一致して定義され、それ故、非限定用語（ｏｐｅｎ  ｔｅｒｍ）の意味「少なくとも以下の（ａｔ  ｌｅａｓｔ  ｔｈｅ  ｆｏｌｌｏｗｉｎｇ）」であると解釈され、追加の特徴、限定、態様などを除外しないとも解釈される。したがって、例えば、「工程ａ、ｂ、およびｃを伴うプロセス」は、プロセスが少なくとも工程ａ、ｂおよびｃを含むことを意味している。用語「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」が使用される場合は常に、そのような解釈が文脈において無意味でない限り、「１以上」と理解される。
【００４０】
本明細書で使用される「約」という用語は、本明細書では、おおよそ、大まかに、およそ、またはその領域内を意味するために使用される。「約」という用語が数値範囲とともに使用される場合、それは、記載された数値の上および下の境界を拡張することによってその範囲を変更する。一般に、用語「約」は、本明細書では、数値を、記載された値の上下に２０パーセントの変動（上下）で変更するために使用される。
【００４１】
操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞療法は、ＣＡＲの外因性発現によって患者のＴ細胞を腫瘍細胞を殺傷するようにリダイレクトする。ＣＡＲは、抗体または断片の抗原認識ドメインをＴ細胞受容体および共受容体の細胞内シグナル伝達ドメインに連結する、膜貫通型融合タンパク質である。例えば、キメラ抗原受容体は、抗原特異的な抗体断片をＴ細胞共刺激ドメインとＣＤ３ゼータ細胞内シグナル伝達ドメインに融合させて、目的の細胞、例えば、腫瘍細胞上に提示された抗原へのＴ細胞のリダイレクションを可能にする。
【００４２】
本明細書における「抗体」という用語は、最も広い意味で使用され、免疫グロブリン分子および免疫グロブリン（Ｉｇ）分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、抗原と特異的に結合する（と免疫反応する）抗原結合部位を含む分子を指す。「特異的に結合する」または「と免疫反応する」は、所望の抗原の１つ以上の抗原決定基と反応し、他のポリペプチドと反応しない抗体を指すことができる。本発明の抗体には、ポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、完全ヒト、二重特異性、多重特異性、キメラ、ｄＡｂ（ドメイン抗体）、一本鎖抗体、Ｆａｂ、Ｆａｂ’およびＦ（ａｂ’）２断片、ｓｃＦｖ、ダイアボディ、ミニボディ、ｓｃＦｖ−Ｆｃ融合、およびＦａｂ発現ライブラリが含まれるが、これらに限定されない。反対の明示がない限り、本明細書でなされる「抗体（単数）」または「抗体（複数）」への言及は、それらが所望の抗原結合活性を示す限り、例えば、これらの分子の任意の（またはすべての）ものを包含する。
【００４３】
一本鎖Ｆｖ（「ｓｃＦｖ」）ポリペプチド分子は、共有結合的に連結されたＶＨ：：ＶＬヘテロダイマーであり、ペプチドをコード化するリンカーによって連結された、ＶＨをコード化する遺伝子およびＶＬをコード化する遺伝子を含む遺伝子融合体から発現できる。（Ｈｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９８８）Ｐｒｏｃ  Ｎａｔ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ  ８５（１６）：５８７９−５８８３を参照されたい）。自然に凝集しているが化学的に分離された、軽鎖および重鎖ポリペプチド鎖を、抗体Ｖ領域から、抗原結合部位の構造と実質的に同様の三次元構造に折り畳まれるｓｃＦｖ分子に変換するための化学構造を識別するための多くの方法が説明されている。例えば、米国特許第５，０９１，５１３号、同第５，１３２，４０５号、および同第４，９４６，７７８号を参照されたい。
【００４４】
二重特異性抗体とは、少なくとも２つの異なる抗原に対して結合特異性を有する抗体を指す。例えば、二重特異性抗体は、ヒト抗体またはヒト化抗体などのモノクローナル抗体であり得る。この場合、結合特異性の１つはＣＸＣＲ４および／またはクローディン４である。第２の結合標的は任意の他の抗原であり、有利なことに細胞表面タンパク質または受容体または受容体サブユニットである。たとえば、結合特異性の１つはＣＸＣＲ４に対するもので、第２の結合特異性はクローディン４に対するものである。
【００４５】
二重特異性抗体は、全長抗体または抗体断片（例えば、Ｆ（ａｂ’）２二重特異性抗体）として調製することができる。二重特異性抗体を作製する方法は当技術分野で知られている。例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第８，３２９，１７８号を参照されたい。
【００４６】
一般に、ヒトから得られる抗体分子は、分子中に存在する重鎖の性質が互いに異なる、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＥ、およびＩｇＤのクラスのいずれかに関連する。特定のクラスには、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２などのサブクラスもある。さらに、ヒトでは、軽鎖はカッパ鎖またはラムダ鎖であり得る。
【００４７】
「抗原結合部位」または「結合部分」という用語は、抗原結合に関与する免疫グロブリン分子の部分を指す。抗原結合部位は、重（「Ｈ」）鎖および軽（「Ｌ」）鎖のＮ末端可変（「Ｖ」）領域のアミノ酸残基によって形成される。「超可変領域」と呼ばれる、重鎖と軽鎖のＶ領域内の３つの高度に異なる区間（ｓｔｒｅｔｃｈ）は、「フレームワーク領域」または「ＦＲ」として知られるより保存された隣接区間の間に挿入される。したがって、「ＦＲ」という用語は、免疫グロブリンの超可変領域の間、およびそれに隣接して天然に見出されるアミノ酸配列を指す。抗体分子において、軽鎖の３つの超可変領域および重鎖の３つの超可変領域は、３次元空間で互いに対して配置されて、抗原結合表面を形成する。抗原結合表面は、結合した抗原の３次元表面に相補的であり、重鎖および軽鎖のそれぞれの３つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」と呼ばれる。
【００４８】
固形腫瘍は、ＣＡＲ−Ｔ療法に特有の課題を提示する。血液癌とは異なり、腫瘍に関連する標的タンパク質は腫瘍と健康な組織の間で過剰発現し、その結果、オンターゲット／オフ腫瘍の、Ｔ細胞による健康な組織の殺傷が起こる。さらに、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）における免疫抑制は、腫瘍の殺傷に向かうＣＡＲ−Ｔ細胞の活性化を制限する。本発明の態様は、これらの問題に対処する。例えば、実施形態は、（ａ）癌細胞上の２種類の抗原を標的にして、オンターゲット／オフ腫瘍のＴ細胞による殺傷を軽減し、および（ｂ）腫瘍微小環境における抑制を取り除くチェックポイント遮断抗体を分泌する、二重特異性ＣＡＲを含むＴ細胞を含む。
【００４９】
腫瘍の進行に関連する新たなメカニズムは免疫チェックポイント経路であり、これには、正常な条件下でＴ細胞の過剰な活性化を防いで、自己限定的な方法でＴ細胞の機能を可能にする、細胞相互作用が含まれる。回避メカニズムとして、多くの腫瘍は免疫チェックポイント分子の発現を刺激することができ、腫瘍の進行を抑制できないＴ細胞のアネルギー性表現型をもたらす。たとえば、新しい臨床データは、細胞傷害性Ｔリンパ球による癌細胞の殺傷を防止する、免疫チェックポイントとしての１つの阻害性リガンドと受容体のペアであるプログラム死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１、Ｂ７−Ｈ１およびＣＤ２７４）とプログラム死受容体１（ＰＤ−１、ＣＤ２７９）の重要性を強調している。ＰＤ１受容体は、Ｔ細胞、Ｂ細胞、ナチュラルキラー細胞（ＮＫ）、宿主組織などの多くの細胞型で発現している。ＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍および抗原提示細胞（ＡＰＣ）は、受容体ＰＤ−１への結合を介して細胞傷害性Ｔリンパ球のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）シグナル伝達を遮断でき、サイトカインの生成およびＴ細胞増殖を減少させる。ＰＤ−Ｌ１の過剰発現は多くの腫瘍タイプで見られ、ＣＤ８０（Ｂ７．１）を含む他のタンパク質との相互作用を通じて免疫抑制機能を媒介し、ＣＤ２８への結合を介してＴ細胞を活性化する能力をブロックする。
【００５０】
腫瘍指向性キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現するヒトリンパ球の遺伝子操作は、タンパク質抗原のプロセシングおよび提示の異常による腫瘍免疫回避メカニズムを迂回する抗腫瘍エフェクター細胞を生成できる。さらに、これらのトランスジェニック受容体は、タンパク質由来ではない腫瘍関連抗原を対象とすることができる。本発明の特定の実施形態では、少なくともＣＡＲを含むように改変されたリンパ球（ＣＡＲＴ）があり、本発明の特別な実施形態では、単一のＣＡＲが２種類以上の抗原を標的とする。いくつかの実施形態では、ＣＡＲＴは、例えば抗体またはサイトカインなどの１つ以上のポリペプチドを発現および分泌するようにさらに改変される。そのようなＣＡＲＴは、本明細書では、武装化（ａｒｍｅｄ）ＣＡＲＴまたはＣＡＲファクトリと呼ばれる。武装化ＣＡＲＴは、標的部位（すなわち、腫瘍部位）での局所的なポリペプチドの同時分泌を可能にする。
【００５１】
特定の腫瘍関連抗原に対する高親和性によって以前に選択された一本鎖可変抗体断片（ｓｃＦｖ）を含むキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）と呼ばれる改変ＴＣＲは、癌に対する強力な新しいアプローチである。ＣＡＲに提示されているｓｃＦｖは、ＣＤ３ζを含む細胞内シグナル伝達ブロックに連結されて、Ｔ細胞の活性化を誘導してから抗原に結合する。この構造は第一世代ＣＡＲに特徴的であり、ＣＤ２８、４−１ＢＢ、もしくはＯＸ４０のシグナル伝達共刺激エンドドメインをＣＤ３に連結する第２世代ＣＡＲ、またはＣＤ３ζに２つの要素をタンデムに連結する第３世代ＣＡＲ、に改善されたものである。これらのエンドドメインは、抗原提示細胞（ＡＰＣ）によるＴＣＲ認識中の完全なＴ細胞活性化に必要であり、ＣＡＲ−Ｔ細胞のサイトカイン産生と増殖を改善する。特有な腫瘍関連抗原を見つけることが困難なため、腫瘍の場所へのＴ細胞の非効率的なホーミングのため、体内でのＴ細胞の持続性の低下のため、および固形腫瘍の免疫抑制性微小環境のため、ＣＡＲＴ細胞の効果はこれまで固形腫瘍の治療に控えめであった。
【００５２】
特定の場合において、リンパ球は、キメラで、非天然であり、そして少なくとも部分的に人の手によって操作された受容体を含み得る。特定の場合において、操作されたキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）は、１、２、３、４、またはそれ以上の成分を有し、いくつかの実施形態では、１つ以上の成分が、リンパ球が１つ以上の腫瘍抗原含有癌細胞を標的にするまたはそれに結合するのを促進する。
【００５３】
本発明によるＣＡＲは、一般に、少なくとも１つの細胞外リガンド結合ドメインを含む少なくとも１つの膜貫通ポリペプチドと、少なくとも１つの細胞内シグナル伝達ドメインを含む１つの膜貫通ポリペプチドを含み、その結果ポリペプチドが一緒に集合してキメラ抗原受容体を形成する。本発明の態様で有用な例示的なＣＡＲには、例えばＰＣＴ／ＵＳ２０１５／０６７２２５に開示されているものが含まれる。
【００５４】
本明細書で使用される「細胞外リガンド結合ドメイン」という用語は、リガンドに結合することができるオリゴまたはポリペプチドを指すことができる。ドメインは、細胞表面分子と相互作用することができる。例えば、細胞外リガンド結合ドメインは、特定の疾患状態に関連する標的細胞上の細胞表面マーカーとして作用するリガンドを認識するように選択され得る。
【００５５】
特に、細胞外リガンド結合ドメインは、標的の抗原に対する抗体に由来する抗原結合ドメインまたは抗原認識ドメインを含み得る。抗原結合ドメインまたは抗原認識ドメインは、抗体断片であり得る。「抗体断片」は、無傷の抗体が結合する抗原に結合する無傷の抗体の一部を含む無傷の抗体以外の分子であり得る。抗体断片の例には、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’−ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、ダイアボディ、直鎖状抗体、一本鎖抗体分子（例えばｓｃＦｖ）、および抗体断片から形成された多重特異性抗体が含まれるがこれらに限定されない。図２を参照すると、例えば、一実施形態は、抗原認識ドメインとしてｓｃＦｖを有するＣＡＲを含む。
【００５６】
抗原認識ドメインは、目的の任意の抗原標的に向けることができる。実施形態では、目的の抗原標的は、癌細胞の表面などの細胞の表面上にある。抗原標的の非限定的な例は、ＣＸＣケモカイン受容体タイプ４（ＣＸＣＲ−４）および／またはクローディン４を含む。
【００５７】
非限定的な例として、標的の抗原は、腫瘍関連表面抗原、例えばＥｒｂＢ２（ＨＥＲ２／ｎｅｕ）、癌胎児性抗原（ＣＥＡ）、上皮細胞接着分子（ＥｐＣＡＭ）、上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）、ＥＧＦＲバリアントＩＩＩ（ＥＧＦＲｖＩＩＩ）、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ジシアロガングリオシドＧＤ２、管上皮ムチン、ｇｐ３６、ＴＡＧ−７２、スフィンゴ糖脂質、神経膠腫関連抗原、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、アルファフェトプロテイン（ＡＦＰ）、レクチン−反応性ＡＦＰ、チログロブリン、ＲＡＧＥ−１、ＭＮ−ＣＡ  ＩＸ、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、ＲＵ１、ＲＵ２（ＡＳ）、腸内カルボキシルエステラーゼ、ｍｕｔ  ｈｓｐ７０−２、Ｍ−ＣＳＦ、プロスターゼ（ｐｒｏｓｔａｓｅ）、プロスターゼ特異抗原（ＰＳＡ）、ＰＡＰ、ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＬＡＧＡ−１ａ、ｐ５３、プロスタイン（ｐｒｏｓｔｅｉｎ）、ＰＳＭＡ、生存（ｓｕｒｖｉｖｉｎｇ）およびテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原−１（ＰＣＴＡ−１）、ＭＡＧＥ、ＥＬＦ２Ｍ、好中球エラスターゼ、エフリンＢ２、ＣＤ２２、インスリン様成長因子（ＩＧＦ１）−Ｉ、ＩＧＦ−ＩＩ、ＩＧＦＩ受容体、中皮、腫瘍特異的ペプチドエピトープを示す主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）分子、５Ｔ４、ＲＯＲ１、Ｎｋｐ３０、ＮＫＧ２Ｄ、腫瘍間質抗原、フィブロネクチンのエクストラドメインＡ（ＥＤＡ）およびエクストラドメインＢ（ＥＤＢ）、およびテネイシンＣ（ＴｎＣ  Ａ１）および線維芽細胞関連タンパク質（ｆａｐ）のＡ１ドメイン、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ３３、ＣＤ３４、ＣＤ１３３、ＣＤ１３８、ＣＴＬＡ−４、Ｂ７−１（ＣＤ８０）、Ｂ７−２（ＣＤ８６）などの系譜特異的もしくは組織特異的な抗原、エンドグリン、主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）分子、ＢＣＭＡ（ＣＤ２６９、ＴＮＦＲＳＦ  １７）、またはウイルス特異表面抗原、例えばＨＩＶ特異抗原（ＨＩＶ  ｇｐ１２０など）、ＥＢＶ特異抗原、ＣＭＶ特異抗原、ＨＰＶ特異抗原、ラッセ（Ｌａｓｓｅ）ウイルス特異抗原、インフルエンザウイルス特異抗原、ならびにこれらの表面マーカーの任意の誘導体またはバリアントであり得る。
【００５８】
いくつかの実施形態では、ＣＡＲはＣＸＣＲ４および／またはクローディン４に特異的である。
【００５９】
実施形態では、前記細胞外リガンド結合ドメインは、可動性リンカーによって結合された標的抗原特異的モノクローナル抗体の軽鎖（ＶＬ）および重鎖（ＶＨ）可変断片を含む一本鎖抗体断片（ｓｃＦｖ）である。例えば、ｓｃＦｖ抗体はＣＸＣＲ４および／またはクローディン４に特異的である。
【００６０】
本発明によるＣＡＲの構築に有用な抗体の非限定的な例には、例えば、ＷＯ／２００５／０６０５２０、ＷＯ／２００６／０８９１４１、ＷＯ／２００７／０６５０２７、ＷＯ／２００９／０８６５１４、ＷＯ／２００９／０７９２５９、ＷＯ／２０１１／１５３３８０、ＷＯ／２０１４／０５５８９７、ＷＯ２０１５／１４３１９４、ＷＯ２０１５／１６４８６５、ＷＯ２０１３／１６６５００、およびＷＯ２０１４／１４４０６１、ＰＣＴ／ＵＳ２０１５／０５４２０２、ＰＣＴ／ＵＳ２０１５／０５４０１０、ＰＣＴ／ＵＳ２０１５／０６７２２５、およびＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０２６８００に開示されている抗体が含まれ、これらの内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【００６１】
ＣＡＲ−Ｔ、例えばＣＸＣケモカイン受容体タイプ４（ＣＸＣＲ−４）および／またはクローディン４に向けられたｓｃＦＶを構築するのに有用な抗原認識ドメインは、核酸（例えば、ＤＮＡ）を使用して合成、操作および／または産生することができる。抗原認識ドメインをコードするＤＮＡは、例えば、これらに限定されないがＣＤ２８および４１ＢＢおよびＣＤ３−ゼータ細胞内シグナル伝達ドメインなどの、免疫学的に関心対象である分子の、例えば、これらに限定されないが、ＣＤ８ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、共刺激ドメインなどの必要なＣＡＲ−Ｔ要素をコードするＤＮＡに対してインフレームでクローニングできる。たとえば、図２を参照されたい。
【００６２】
ＣＸＣＲ４
ケモカイン（ＣＸＣモチーフ）受容体４（「ＣＸＣＲ４」）（フーシン、ＬＥＳＴＲ、またはＨＵＭＳＴＲとしても知られている）は、通常は細胞膜内に埋め込まれているＧタンパク質共役型７回膜貫通型ドメインケモカイン受容体である。ＣＸＣＲ４は、最も特徴付けられたケモカイン受容体の１つである。ヒトＣＸＣＲ４受容体の３５２アミノ酸配列（ヘリカルホイールおよびセルペンチン図とともに）を図１４（上部および下部パネル）に示す。図１４の下部パネルに示すように、ＣＸＣＲ４は４つの異なる細胞外領域：Ｎ末端ドメイン、ＥＣＬ１、ＥＣＬ２、およびＥＣＬ３、によって特徴付けられる。
【００６３】
ＣＸＣＲ４は少なくとも、樹状細胞、ナイーブな非メモリＴ細胞、制御性Ｔ細胞、ニューロンおよびミクログリア、新鮮な初代単球、内皮細胞、好中球およびＢ細胞；乳癌細胞、腎細胞癌腫細胞、非小細胞肺癌細胞、前立腺癌細胞、および神経膠芽腫細胞を含むがこれらに限定されない腫瘍細胞、およびＣＤ３４＋造血幹細胞、で発現している。ＣＸＣＲ４は、白血球輸送、走化性、Ｂ細胞リンパ球新生および骨髄新生、幹細胞遊走、腫瘍または癌細胞の転移、腫瘍細胞の血管形成、消化管の血管新生、神経細胞および生殖細胞の遊走、および宿主細胞のＸ４指向性ＨＩＶ侵入、に不可欠である。（Ｌｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌ  ６：４５９−６９（２００４）、Ｈｅｒｎａｎｄｅｚ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．３４：７０−７４（２００３）、Ｎａｇａｓａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３８２：６３５−３８（１９９６）、Ｋｎａｕｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ４２１：２７９−８２（２００３）、Ｋｕｎｗａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ４２１：２２６−２７（２００３）、Ｃｏｎｎｏｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８５：６２１−２８（１９９７）およびＳｃａｒｌａｔｔｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．３：１２５９−６５（１９９７）を参照されたい）。
【００６４】
α−ケモカイン間質細胞由来因子（ＳＤＦ−１）（ＣＸＣＬ１２としても知られている）は、ＣＸＣＲ４の天然のリガンドである。ＳＤＦ−１αは、ケモカイン受容体を１つだけ有する唯一のケモカインである。（Ｉｍｉｔｏｌａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  １０１（５２）：１８１１７−２２（２００４）、Ｌｕ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ９９：２０９０−９５（２００２）を参照されたい）。ＣＸＣＲ４へのＳＤＦ−１の結合は、細胞侵入と遊走を制御するように機能する複数の経路を活性化する。（Ｂｅｎｏｖｉｃ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ  Ｃｅｌｌ  ６：４２９−３０（２００４）を参照されたい）。たとえば、ＣＸＣＲ４はそのリガンドの結合に応答して、免疫細胞の遊走と動員を引き起こす。さらに、このリガンドと受容体のペアは、神経系の発達にも役割を果たし得る。ＣＸＣＲ４へのＳＤＦ−１の結合は、造血発生と器官形成にも重要な役割を果たす。（Ｎａｇａｓａｗｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  ３８２：６３５（１９９６）を参照されたい）。ＣＸＣＲ４はまた、拮抗性ケモカイン、ヒトヘルペスウイルスＩＩＩ型によってコード化されるウイルス性マクロファージ炎症性タンパク質ＩＩ（ｖＭＩＰ−ＩＩ）によっても認識される。（Ｚｈｏｕ  ｅｔ  ａｌ．，９ｔｈ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  ｏｎ  Ｒｅｔｒｏｖｉｒｕｓｅｓ  ａｎｄ  Ｏｐｐｏｒｔｕｎｉｓｔｉｃ  Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎｓ，Ｓｅｓｓｉｏｎ  ３９  Ｐｏｓｔｅｒ  Ｓｅｓｓｉｏｎ，Ａｂｓｔｒａｃｔ  １８９−Ｍ（２００２）を参照されたい）。
【００６５】
本発明の実施形態は、抗ＣＸＣＲ４抗体を含むことができる。例示的な抗ＣＸＣＲ４抗体には、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第８，３２９，１７８号に記載されているものが含まれる。
【００６６】
例えば、抗ＣＸＣＲ４抗体は、ｍＡｂ１８、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２０、ｍＡＢ３３、ｍＡＢ４８、ｍＡｂ２Ｎ、またはｍＡｂ６Ｒを含むことができる。ｍＡｂ１８、ｍＡｂ１９、ｍＡｂ２０、ｍＡｂ３３、ｍＡｂ４８、ｍＡｂ２Ｎ、およびｍＡｂ６ＲのＶＨおよびＶＬ領域のアミノ酸配列が、図１３に提供される。図１３はまた、コンセンサス配列（例えば、太字の文字、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第８，３２９，１７８号も参照されたい）も提供する。このコンセンサスでは、４つ以上のクローンが所与位置に同じアミノ酸を持っている場合、コンセンサス内のその位置はそのアミノ酸によって指定される。抗ＣＸＣＲ４抗体は１２Ｇ５を含むこともできる。１２Ｇ５は、マウスハイブリドーマ由来の市販のＣＸＣＲ−４認識抗体である。
【００６７】
図１３に示すように、ｍＡｂ２Ｎ重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＳＹＧＭＨ（配列番号１７）を有し、ｍＡｂ２Ｎ重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＶＩＳＹＤＧＳＮＫＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号１８）を有し、ｍＡｂ２Ｎ重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列：ＤＬＶＡＡＡＧＴＡＦＤＩ（配列番号１９）を有し、ｍＡｂ２Ｎ軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列：ＴＧＴＩＳＤＶＧＧＨＮＦＶＳ（配列番号２０）を有し、ｍＡｂ２Ｎ軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＥＶＴＫＲＰＡ（配列番号２１）を有し、およびｍＡｂ２Ｎ軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＳＳＹＧＧＳＮＤＶＩ（配列番号２２）を有する。
【００６８】
さらに、図１３に示すように、ｍＡｂ６Ｒ重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＳＮＦＶＡＷＮ（配列番号２３）を有し、ｍＡｂ６Ｒ重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＲＴＹＹＲＳＲＷＹＮＤＹＡＶＳＶＱＳ（配列番号２４）を有し、ｍＡｂ６Ｒ重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列：ＧＱＨＳＧＦＤＦ（配列番号２５）を有し、ｍＡｂ６Ｒ軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＴＧＮＳＮＮＶＧＮＱＧＡＡ（配列番号２６）を有し、ｍＡｂ６Ｒ軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＲＮＮＮＲＰＳ（配列番号２７）を有し、およびｍＡｂ６Ｒ軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＳＡＷＤＮＲＬＫＴＹＶ（配列番号２８）を有する。
【００６９】
図１３にも示されるように、ｍＡｂ１８重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＳＹＧＩＳ（配列番号２９）を有し、ｍＡｂ１８重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＷＩＳＡＹＮＧＮＴＮＹＡＱＫＬＱＧ（配列番号３０）を有し、ｍＡｂ１８重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列：ＤＴＰＧＩＡＡＲＲＹＹＹＹＧＭＤＶ（配列番号３１）を有し、ｍＡｂ１８軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＱＧＤＳＬＲＫＦＦＡＳ（配列番号３２）を有し、ｍＡｂ１８軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＧＫＮＳＲＰＳ（配列番号３３）を有し、およびｍＡｂ１８軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＮＳＲＤＳＲＤＮＨＱＶ（配列番号：３４）を有する。
【００７０】
同様に、図１３に示すように、ｍＡｂ１９重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＳＹＰＭＨ（配列番号３５）を有し、ｍＡｂ１９重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＶＩＳＳＤＧＲＮＫＹＹＰＤＳＶＫＧ（配列番号３６）を有し、ｍＡｂ１９重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列：ＧＧＹＨＤＦＷＳＧＰＤＹ（配列番号３７）を有し、ｍＡｂ１９軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＲＡＳＱＳＶＮＴＮＬＡ（配列番号３８）を有し、ｍＡｂ１９軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＧＡＳＳＲＡＴ（配列番号３９）を有し、およびｍＡｂ１９軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＱＨＹＧＳＳＰＬＴ（配列番号４０）を有する。
【００７１】
図１３に示すように、ｍＡｂ２０重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＳＹＡＭＳ（配列番号４１）を有し、ｍＡｂ２０重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＮＩＫＱＤＧＳＥＫＹＹＶＤＳＶＫＧ（配列番号４２）を有し、ｍＡｂ２０重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列：ＤＱＶＳＧＩＴＩＦＧＧＫＷＲＳＰＤＶ（配列番号４３）を有し、ｍＡｂ２０軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＱＧＤＳＬＲＳＹＹＡＳ（配列番号４４）を有し、ｍＡｂ２０軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＧＫＮＮＲＰＳ（配列番号４５）を有し、およびｍＡｂ２０軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＮＳＲＳＧＳＱＲＶ（配列番号４６）を有する。
【００７２】
さらに、ｍＡｂ３３重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＮＹＧＬＨ（配列番号４７）を有し、ｍＡｂ３３重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＶＩＳＨＤＧＴＫＫＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号４８）を有し、ｍＡｂ３３重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列ＤＧＧＹＣＳＧＧＲＣＹＳＹＧＭＤＶ（配列番号４９）を有し、ｍＡｂ３３軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＳＧＳＲＳＮＩＧＳＮＴＶＮ（配列番号５０）を有し、ｍＡｂ３３軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＴＮＮＱＲＰＳ（配列番号５１）を有し、およびｍＡｂ３３軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＬＳＦＤＳＳＬＴＳＹＶ（配列番号：５２）を有する。
【００７３】
同様に、図１３にも示されているように、ｍＡｂ４８重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列：ＲＹＧＭＨ（配列番号５３）を有し、ｍＡｂ４８重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列：ＬＩＳＹＤＧＳＫＴＦＹＧＥＳＶＫＧ（配列番号５４）を有し、ｍＡｂ４８重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列：ＡＴＶＴＴＤＧＹＹＹＭＤＶ（配列番号５５）を有し、ｍＡｂ４８軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＳＧＳＲＳＮＩＧＧＮＴＶＮ（配列番号５６）を有し、ｍＡｂ４８軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列：ＡＮＮＱＲＰＳ（配列番号５７）を有し、およびｍＡｂ４８軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列：ＡＡＷＤＤＮＬＳＧＨＶＶ（配列番号５８）を有する。
【００７４】
実施形態では、抗ＣＸＣＲ４抗体は、配列番号１７、２３、２９、３５、４１、４７、もしくは５３のＣＤＲ１、配列番号１８、２４、３０、３６、４２、４８、もしくは５４のＣＤＲ２、および配列番号１９、２５、３１、３７、４３、４９、もしくは５５のＣＤＲ３、またはそれらの任意の組み合わせを含むＶＨを有する重鎖を含むことができる。
【００７５】
実施形態では、抗ＣＸＣＲ４抗体は、配列番号２０、２６、３２、３８、４４、５０、もしくは５６のＣＤＲ１、配列番号２１、２７、３３、３９、４５、５１、もしくは５７のＣＤＲ２、および配列番号２２、２８、３４、４０、４６、５２、もしくは５８のＣＤＲ３、またはそれらの任意の組み合わせを含むＶＬを有する軽鎖を含むことができる。
【００７６】
本発明はまた、一本鎖抗体を包含する。例えば、本発明は、ｓｃＦｖ  １８、１９、２０、３３、４８、２Ｎ、および６Ｒ、ならびに本明細書に開示された方法に従って同定された他の任意のｓｃＦｖを包含する。
【００７７】
クローディン４
クローディンは、多重遺伝子接着分子ファミリーに属し、細胞の密着結合に見られる膜貫通タンパク質である。これらのタンパク質は、上皮の細胞内空間を通過する分子の流れを制御する傍細胞バリアの確立に関与していると考えられている。クローディンは、細胞シグナル伝達リガンドにも結合するため、細胞の増殖と分化を調節すると考えられている。組織特異的な発現パターンを有する既知のクローディンは約２４個あり、それらのパターンまたは分布の変化は、癌を含むさまざまな疾患の病理に関与することが示唆されている。遺伝子発現プロファイリングにより、クローディン４は膵管腺癌で過剰発現しており、乳房、卵巣、前立腺、膀胱、消化管粘膜の正常組織でも発現していることが見出された。しかし、このタンパク質の発現レベルは原発性および転移性膵臓癌で有意に高いため、この癌の画像化のための早期マーカーまたは治療標的としてのクローディン４の使用の可能性が示唆された。［１２５Ｉ］Ａｎｔｉ−ｃｌａｕｄｉｎ  ４  ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｆｒｏｍ  Ｔｈｅ  ＭＩＣＡＤ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｔｅａｍ；Ｊｕｎｅ  ２８，２００７を参照されたい。
【００７８】
図１５に示すように、ＥＫ０１重鎖のＶＨ領域のＣＤＲ１は、配列ＧＦＴＶ．．．．ＳＳＮＹ（配列番号５９）を有し、ＶＨ領域のＣＤＲ２は、配列ＩＹＳＧ．．．ＧＳＴ（配列番号６０）を有し、および、ＶＨ領域のＣＤＲ３は、配列ＡＲＤＮＰＬＳＡＦＤＩ（配列番号６１）を有し、ＥＫ０１軽鎖のＶＬ領域のＣＤＲ１は、配列ＱＳＩ．．．．．．ＮＳＷ（配列番号６２）を有し、ＶＬ領域のＣＤＲ２は、配列ＫＡ．．．．．．．Ｓ（配列番号６３）を有し、およびＶＬ領域のＣＤＲ３は、配列ＱＱＹＤＤＬＰＬＴ（配列番号６４）を有する。
【００７９】
非限定的な例として、ラクダ科の単一ドメイン抗体断片または受容体リガンド、抗体結合ドメイン、抗体超可変ループまたはＣＤＲなど、ｓｃＦｖ以外の結合ドメインもリンパ球の事前定義されたターゲティングに使用できる。
【００８０】
好ましい実施形態では、該膜貫通ドメインは、該細胞外リガンド結合ドメインと該膜貫通ドメインとの間にストーク領域をさらに含む。本明細書で使用される「ストーク領域」という用語は、膜貫通ドメインを細胞外リガンド結合ドメインに連結するように機能する任意のオリゴまたはポリペプチドを意味することができる。特に、ストーク領域は、細胞外リガンド結合ドメインにより多くの柔軟性とアクセス性を提供するために使用される。ストーク領域は、最大３００アミノ酸、好ましくは１０〜１００アミノ酸、最も好ましくは２５〜５０アミノ酸を含み得る。ストーク領域は、ＣＤ８、ＣＤ４またはＣＤ２８の細胞外領域の全部または一部などの天然に存在する分子の全部または一部、または抗体定常領域の全部または一部に由来し得る。あるいは、ストーク領域は、天然に存在するストーク配列に対応する合成配列であってもよく、または完全に合成ストーク配列であってもよい。一実施形態では、該ストーク領域は、ヒトＣＤ８アルファ鎖の一部である。
【００８１】
本発明のＣＡＲのシグナル伝達ドメインまたは細胞内シグナル伝達ドメインは、細胞外リガンド結合ドメインの標的への結合後の細胞内シグナル伝達に関与し、免疫細胞の活性化および免疫応答をもたらす。換言すれば、シグナル伝達ドメインは、ＣＡＲが発現する免疫細胞の正常なエフェクター機能の少なくとも１つの活性化に関与している。例えば、Ｔ細胞のエフェクター機能は、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性またはヘルパー活性であり得る。したがって、「シグナル伝達ドメイン」という用語は、エフェクターシグナル機能シグナルを伝達し、細胞に特定の機能を実行するように指示するタンパク質の部分を指すことができる。
【００８２】
シグナル伝達ドメインは、抗原依存性の一次活性化を開始するものと、抗原非依存的に作用して二次または共刺激シグナルを提供するものとの、細胞質シグナル伝達配列の２つの異なるクラスを含むことができる。一次細胞質シグナル伝達配列は、ＩＴＡＭである免疫受容体活性化チロシンモチーフとして知られているシグナル伝達モチーフを含むことができる。ＩＴＡＭは、ｓｙｋ／ｚａｐ７０クラスのチロシンキナーゼの結合部位として機能するさまざまな受容体の細胞質内尾部に見られる明確に定義されたシグナル伝達モチーフである。本発明で使用されるＩＴＡＭの例には、非限定的な例として、ＴＣＲゼータ、ＦｃＲガンマ、ＦｃＲベータ、ＦｃＲイプシロン、ＣＤ３ガンマ、ＣＤ３デルタ、ＣＤ３イプシロン、ＣＤ５、ＣＤ２２、ＣＤ７９ａ、ＣＤ７９ｂおよびＣＤ６６ｄに由来するものが含まれ得る。好ましい実施形態では、ＣＡＲのシグナル伝達ドメインは、ＣＤ３ゼータシグナル伝達ドメイン、またはＦｃイプシロンＲＩベータまたはガンマ鎖の細胞質内ドメインを含むことができる。別の好ましい実施形態では、シグナル伝達は、ＣＤ２８および例えば４−１ＢＢまたはＯＸ４０などの）腫瘍壊死因子受容体（ＴＮＦｒ）によって提供される共刺激とともに、ＣＤ３ゼータによって提供される。
【００８３】
一実施形態では、本発明のＣＡＲの細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル分子を含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、タンデムに２、３、４またはそれ以上の共刺激分子を含む。共刺激分子は、効率的な免疫応答に必要な抗原受容体またはそのリガンド以外の細胞表面分子である。
【００８４】
「共刺激リガンド」は、Ｔ細胞上の同族の共刺激分子に特異的に結合し、それにより、例えば、ペプチドが搭載されたＭＨＣ分子とＴＣＲ／ＣＤ３複合体の結合によって提供される一次シグナルに加えて、増殖活性化、分化などを含むがこれらに限定されないＴ細胞応答を媒介するシグナルを提供する、抗原提示細胞上の分子を指すことができる。共刺激リガンドには、ＣＤ７、Ｂ７−１（ＣＤ８０）、Ｂ７−２（ＣＤ８６）、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、４−１ＢＢＬ、ＯＸ４０Ｌ、誘導性共刺激リガンド（ＩＣＯＳ−Ｌ）、細胞間接着分子（ＩＣＡＭ、ＣＤ３０Ｌ、ＣＤ４０、ＣＤ７０、ＣＤ８３、ＨＬＡ−Ｇ、ＭＩＣＡ、Ｍ１ＣＢ、ＨＶＥＭ、リンホトキシンベータ受容体、３／ＴＲ６、ＩＬＴ３、ＩＬＴ４、Ｔｏｌｌリガンド受容体とリガンドを結合するアゴニストまたは抗体、および特にＢ７−Ｈ３と特異的に結合するリガンドが含まれ得るが、これらに限定されない。共刺激リガンドは、とりわけ、Ｔ細胞上に存在する共刺激分子、例えば、限定されないが、ＣＤ２７、ＣＤ２８、４−ＩＢＢ、ＯＸ４０、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＰＤ−１、ＩＣＯＳ、リンパ球機能関連抗原−１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＣＤ７、ＬＴＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、Ｂ７−Ｈ３、ＣＤ８３と特異的に結合するリガンド、と特異的に結合する抗体も包含する。
【００８５】
「共刺激分子」は、共刺激リガンドと特異的に結合し、それにより、増殖などの、しかしそれに限定されない細胞による共刺激応答を媒介する、Ｔ細胞上の同族結合パートナーを指すことができる。共刺激分子には、ＭＨＣクラス１分子、ＢＴＬＡおよびトール（Ｔｏｌｌ）リガンド受容体が含まれるが、これらに限定されない。共刺激分子の例には、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ８、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＯＸ４０、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＰＤ−１、ＩＣＯＳ、リンパ球機能関連抗原−１（ＬＦＡ−１）、ＣＤ２、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、Ｂ７−Ｈ３、およびＣＤ８３と特異的に結合するリガンドなど、が含まれる。
【００８６】
別の特定の実施形態では、該シグナル伝達ドメインは、共刺激性ＴＮＦＲメンバーファミリーの細胞質内尾部であるＴＮＦＲ関連因子２（ＴＲＡＦ２）結合モチーフである。共刺激性ＴＮＦＲファミリーメンバーの細胞質尾部には、主要な保存モチーフ（Ｐ／Ｓ／Ａ）Ｘ（Ｑ／Ｅ）Ｅ）またはマイナーモチーフ（ＰＸＱＸＸＤ）からなるＴＲＡＦ２結合モチーフが含まれる（前記Ｘは任意のアミノ酸である）。ＴＲＡＦタンパク質は、受容体の三量体化に応答して、多くのＴＮＦＲの細胞内尾部に動員される。
【００８７】
キメラ抗原受容体は、抗原認識ドメインを、細胞シグナル伝達を調節する（すなわち刺激する）シグナル伝達ドメイン（刺激ドメインとも呼ばれる）に融合する。そのような刺激ドメインの非限定的な例は、ＣＤ２８、４１ＢＢ、および／またはＣＤ３−ゼータ細胞内シグナル伝達ドメインのものを含む。たとえば、図２を参照されたい。
【００８８】
適切な膜貫通ポリペプチドの際立った特徴は、免疫細胞、特にリンパ球細胞またはナチュラルキラー（ＮＫ）細胞の表面で発現し、所定の標的細胞に対する免疫細胞の細胞応答を誘導するために相互作用する能力を含む。細胞外リガンド結合ドメインおよび／またはシグナル伝達ドメインを含む本発明のＣＡＲの異なる膜貫通ポリペプチドは、一緒に相互作用して、標的リガンドとの結合後のシグナル伝達に関与し、免疫応答を誘発する。膜貫通ドメインは、天然由来または合成由来のいずれかに由来し得る。膜貫通ドメインは、任意の膜結合または膜貫通タンパク質に由来し得る。
【００８９】
本明細書で使用される「の一部」という用語は、分子の任意のサブセット、すなわちより短いペプチドを指すことができる。あるいは、ポリペプチドのアミノ酸配列機能的バリアントは、ポリペプチドをコードするＤＮＡの変異によって調製することができる。そのようなバリアントまたは機能的バリアントには、例えば、アミノ酸配列内の残基からの欠失、または挿入または置換が含まれる。最終構築物が所望の活性を有し、特に特異的な抗標的細胞性免疫活性を示すことを条件として、削除、挿入、および置換の任意の組み合わせを行って、最終構築物に到達してもよい。宿主細胞内の本発明のＣＡＲの機能性は、特定の標的が結合すると、該ＣＡＲのシグナル伝達能力を実証するのに適したアッセイで検出可能である。そのようなアッセイは、当業者に利用可能である。例えば、このアッセイは、カルシウムイオン放出の増加、細胞内チロシンリン酸化、イノシトールリン酸代謝回転、またはこのようにしてもたらされるインターロイキン（ＩＬ）２、インターフェロンガンマ、ＧＭ−ＣＳＦ、ＩＬ−３、ＩＬ−４の産生、の測定を含むアッセイなど、標的の結合時にトリガーされるシグナル伝達経路の検出を可能にする。
【００９０】
細胞
本発明の実施形態は、ＣＡＲを発現する細胞（すなわち、ＣＡＲＴ）を含む。細胞は、癌治療のためにＣＡＲを発現することができる免疫細胞、またはＣＡＲをコードする発現ベクターを保有する細菌細胞などの細胞を含む、任意の種類のものであり得る。本明細書中で使用される場合、用語「細胞」、「細胞株」、および「細胞培養物」は、交換可能に使用され得る。これらのすべての用語には、それらの子孫も含まれ、これは、あらゆる後続世代である。計画的または偶発性の突然変異のために、すべての子孫が同一ではない可能性があることが理解されている。異種核酸配列を発現する状況において、「宿主細胞」は、ベクターを複製し、および／またはベクターによってコードされる異種遺伝子を発現することができる真核細胞を指す。宿主細胞はベクターのレシピエントとして使用でき、使用されてきた。宿主細胞は、「トランスフェクト」または「形質転換」されてもよく、これは、外因性核酸が宿主細胞に移入または導入されるプロセスを指す。形質転換された細胞は、初代対象細胞およびその子孫を含む。本明細書中で使用される場合、用語「操作された」および「組換え」細胞または宿主細胞は、例えば、ベクターなどの外因性核酸配列が導入された細胞を指すことが意図される。したがって、組換え細胞は、組換えによって導入された核酸を含まない天然に存在する細胞と区別できる。本発明の実施形態では、宿主細胞は、細胞傷害性Ｔ細胞（ＴＣ、細胞傷害性Ｔリンパ球、ＣＴＬ、Ｔキラー細胞、細胞溶解性Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞またはキラーＴ細胞としても知られる）を含むＴ細胞であり、ＮＫ細胞およびＮＫＴ細胞もまた本発明に含まれる。
【００９１】
いくつかのベクターは、原核細胞および真核細胞の両方で複製および／または発現されることを可能にする制御配列を使用することができる。当業者は、上記の宿主細胞のすべてをインキュベートしてそれらを維持し、ベクターの複製を可能にする条件をさらに理解するであろう。また、ベクターの大規模生産、ならびにベクターによってコードされる核酸およびそれらの同族のポリペプチド、タンパク質、またはペプチドの生産を可能にする技術および条件も理解され、知られている。
【００９２】
細胞は、自己細胞、同系細胞、同種異系細胞、場合によっては異種細胞であってもよい。
【００９３】
多くの状況では、改変ＣＴＬを、治療の終了が望まれる場合、該細胞が腫瘍性になる場合、該細胞の存在後にその細胞が不在になることが関心対象である研究において、または他の事象において、殺傷できることが望ましい場合がある。この目的のために、誘導性自殺遺伝子など、制御された条件下で改変細胞を殺傷することができる特定の遺伝子産物の発現を提供することができる。
【００９４】
武装化ＣＡＲＴ
本発明はさらに、１つ以上のポリペプチドを分泌するように改変されたＣＡＲＴを含む。このようなＣＡＲＴは、ＣＡＲＴファクトリまたは武装化ＣＡＲＴと呼ばれる。ポリペプチドは、例えば、本明細書に記載される抗体またはその断片であり得る。例えば、ポリペプチドは、抗体またはサイトカインであり得る。実施形態では、抗体は、ＴＩＧＩＴ、ＣＡＩＸ、ＧＩＴＲ、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２．ＰＤ−１、またはＣＣＲ４に特異的である。
【００９５】
例えば、ＣＡＲをコードするものと同じＤＮＡベクター（例えば、抗原認識ドメイン）または第２の別個のベクターにあってよい第２の発現構築物は、目的の単一または複数の抗原に対して指向する、ミニボディ（ｓｃＦｖ−Ｆｃ）または抗体またはその断片をコードするのに使用でき、内部リボソーム侵入部位（ＩＲＥＳ）の後にクローニングすることができる。図２を参照すると、第２の発現カセットは、蛍光分子または免疫調節ミニボディのいずれかを含む。
【００９６】
武装化ＣＡＲＴには、標的部位、例えば腫瘍部位でポリペプチドを同時に分泌するという利点がある。図６、１６および１７を参照すると、例えば、武装化ＣＡＲＴは抗ＴＩＧＩＴ抗体またはその断片を分泌することができる。ＴＩＧＩＴは、抗腫瘍およびＣＤ８＋Ｔ細胞依存性免疫応答などの他のＴ細胞依存性慢性免疫応答を制限するＴ細胞共抑制受容体である。ＴＩＧＩＴは、活性化Ｔ細胞とナチュラルキラー（ＮＫ）細胞のサブセットに発現される。たとえば、ＴＩＧＩＴは腫瘍浸潤性Ｔ細胞で高度に発現している。癌モデルでは、ＴＩＧＩＴの抗体遮断がＣＤ８＋Ｔ細胞のエフェクター機能と腫瘍クリアランスの向上に寄与した。
【００９７】
実施形態では、武装化ＣＡＲＴの抗ＴＩＧＩＴ抗体は、図１７に記載される、１つ以上の抗ＴＩＧＩＴ抗体クローン（またはその断片、例えばＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、ＦＲ４、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、ＣＤＲ３、またはフレームワークおよび／またはその中のＣＤＲ領域の任意の組み合わせ）を含む。
【００９８】
例えば、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列：ＧＹＴＦ．．．．ＴＳＹＧ（配列番号６５）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＳＡＹ．．ＮＧＮＴ（配列番号６６）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＤＰＧＬＷＦＧＬＴＨＤＹＹＦＤＹ（配列番号６７）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、配列ＳＳＮＩ．．．．ＧＳＮＴ（配列番号６８）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＲＮ．．．．．．．Ｎ（配列番号６９）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＡＡＷＤＤＳＲＳＧＰＶ（配列番号７０）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３を含むことができる。
【００９９】
例えば、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列：ＧＦＴＦ．．．．ＳＤＹＳ（配列番号７１）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＮＳＤ．．ＧＳＲＴ（配列番号７２）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＧＰＧＦＦＧＦＤＩ（配列番号７３）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、配列ＲＳＮＩ．．．．ＧＲＮＳ（配列番号７４）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＳＮ．．．．．．．Ｎ（配列番号７５）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＡＡＷＤＡＲＬＴＧＰＬ（配列番号７６）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３を含むことができる。
【０１００】
例えば、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列：ＧＹＳＦ．．．．ＴＮＹＷ（配列番号７７）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＮＰＶ．．ＮＳＲＴ（配列番号７８）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＹＹＹＹＡＭＥＶ（配列番号７９）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、配列ＳＳＮＩ．．．．ＧＳＮＴ（配列番号８０）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＲＮ．．．．．．．Ｎ（配列番号８１）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＥＡＷＤＤＳＬＮＧＰＶ（配列番号８２）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３を含むことができる。
【０１０１】
例えば、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列：ＧＹＴＦ．．．．ＴＮＹＧ（配列番号８３）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＶＤＮＮ．．ＮＧＮＩ（配列番号８４）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＧＬＦＳＳＲＷＹＬＷＦＤＰ（配列番号８５）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、配列ＳＳＤＶＧ．．．ＧＹＮＹ（配列番号８６）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＥＶ．．．．．．．Ｔ（配列番号８７）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＳＳＹＴＲＳＳＴＳＹＶＶ（配列番号８８）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３を含むことができる。
【０１０２】
例えば、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列：ＧＧＴＦ．．．．ＳＳＹＡ（配列番号８９）を有するＶＨ領域のＣＤＲ１、配列：ＩＬＰＭ．．ＦＧＳＴ（配列番号９０）を有するＶＨ領域のＣＤＲ２、配列：ＡＲＧＲＤＩＶＡＰＳＮＳＧＦＤＶ（配列番号９１）を有するＶＨ領域のＣＤＲ３、配列ＳＮＮＶ．．．．ＧＮＱＧ（配列番号９２）を有するＶＬ領域のＣＤＲ１、配列：ＲＮ．．．．．．．Ｄ（配列番号９３）を有するＶＬ領域のＣＤＲ２、および配列：ＳＡＹＤＲＳＬＮＡＷＶ（配列番号９４）を有するＶＬ領域のＣＤＲ３を含むことができる。
【０１０３】
実施形態では、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列番号６５、７１、７７、８３、もしくは８９のＣＤＲ１、配列番号６６、７２、７８、８４、もしくは９０のＣＤＲ２、および配列番号６７、７３、７９、８５、もしくは９１のＣＤＲ３、またはそれらの任意の組み合わせを含むＶＨを有する重鎖を含み得る。
【０１０４】
実施形態では、抗ＴＩＧＩＴ抗体は、配列番号６８、７４、８０、８６、もしくは９２のＣＤＲ１、配列番号６９、７５、８１、８７、もしくは９３のＣＤＲ２、および配列番号７０、７６、８２、８８、もしくは９４のＣＤＲ３、またはそれらの任意の組み合わせを含むＶＬを有する軽鎖を含み得る。
【０１０５】
武装化ＣＡＲＴは、細胞内シグナル伝達ドメインの後に目的のポリペプチドをコードする核酸を含めることで構築できる。好ましくは、細胞内シグナル伝達ドメインと目的のポリペプチドとの間に配置された内部リボソーム侵入部位（ＩＲＥＳ）が存在する。当業者は、複数のＩＲＥＳ配列をタンデムで使用することにより、２つ以上のポリペプチドを発現できることを理解することができる。
【０１０６】
一実施形態では、本明細書に提示される方法および組成物は、例えばＴ細胞の消耗と戦うため、腫瘍微小環境においてポリペプチドを分泌する力を備えた、第２世代のＣＸＣＲ４および／またはクローディン４に対して特異性を有するＴ細胞などの標的特異的Ｔ細胞を提供する。
【０１０７】
ＣＴＬへの構築物の導入
ＣＡＲをコードする発現ベクターは、１つ以上のＤＮＡ分子または構築物として導入され得、そこには、該構築物（複数可）を含む宿主細胞の選択を可能にする、少なくとも１つのマーカーが存在してもよい。
【０１０８】
構築物は、遺伝子および調節領域が適宜単離、ライゲーション、適切なクローニング宿主においてクローニング、制限もしくは配列決定により分析され得る従来の方法、または他の便利な手段で調製することができる。特に、ＰＣＲを使用すると、機能単位の全部または一部を含む個々の断片を分離でき、「プライマー修復」、ライゲーション、インビトロ変異誘発などを適宜使用して、１つ以上の変異を導入できる。一旦完成し、適切な配列を有することが実証された構築物（複数可）は、次いで、任意の好都合な手段によってＣＴＬに導入され得る。構築物は、細胞への感染や形質導入のために、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、単純ヘルペスウイルス（ＨＳＶ）または他のウイルスのような、非複製型の欠陥のあるウイルスゲノム（レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターを含む）の中に組み込むおよびパッケージ化してもよい。構築物は、必要に応じて、トランスフェクションのためのウイルス配列を含み得る。あるいは、構築物は、融合、エレクトロポレーション、バイオリスティック法、トランスフェクション、リポフェクションなどによって導入されてもよい。宿主細胞は、構築物（複数可）を導入する前に培養物中で成長および増大（ｅｘｐａｎｄ）させ、その後、構築物（複数可）を導入するおよび構築物（複数可）を組み込むための適切な処理を行うことができる。次に、細胞を増大させ、構築物中に存在するマーカーによってスクリーニングする。首尾良く使用できるさまざまなマーカーには、ｈｐｒｔ、ネオマイシン耐性、チミジンキナーゼ、ハイグロマイシン耐性などがある。
【０１０９】
いくつかの例では、構築物が特定の遺伝子座に組み込まれることが望まれる場合、相同組換えのための標的部位を有し得る。例えば、）は、内因性遺伝子をノックアウトし、相同組換えについて当技術分野で知られている材料および方法を使用して、それを（同じ遺伝子座または他の場所で）構築物によってコードされる遺伝子で置き換えることができる。相同組換えのために、．ＯＭＥＧＡ．またはＯ−ベクターのいずれかを使用することができる。例えば、Ｔｈｏｍａｓ  ａｎｄ  Ｃａｐｅｃｃｈｉ，Ｃｅｌｌ（１９８７）５１，５０３−５１２；Ｍａｎｓｏｕｒ，ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ（１９８８）３３６，３４８−３５２、およびＪｏｙｎｅｒ，ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ（１９８９）３３８，１５３−１５６を参照されたい。
【０１１０】
構築物は、少なくともＣＡＲおよび任意選択で別の遺伝子をコードする単一のＤＮＡ分子、または１つ以上の遺伝子を有する異なるＤＮＡ分子として導入することができる。他の遺伝子には、例えば、治療分子または自殺遺伝子をコードする遺伝子が含まれる。構築物は、同時にまたは連続的に導入され得、それぞれが同じまたは異なるマーカーを有する。
【０１１１】
構築物ＤＮＡのストックの調製やトランスフェクションの実施に使用できる、細菌または酵母の複製起点、選択可能および／または増幅可能なマーカー、原核生物または真核生物での発現用のプロモーター／エンハンサー要素などの有用な要素を含むベクターは、当技術分野でよく知られており、多くは市販されている。
【０１１２】
使用方法
本発明の態様は、癌に罹患している対象を治療する方法に向けられている。
【０１１３】
本発明の態様は、さらに対象における癌の進行を停止または低減させるか、または癌の退縮を促進させる方法に向けられている。
【０１１４】
なおさらに、本発明の態様は、対象における癌細胞の細胞増殖を低減させる方法に向けられている。
【０１１５】
本発明の態様はまた、細胞の細胞傷害性を誘導する方法に向けられている。例えば、図２および図３を参照すると、ＣＸＣＲ−４発現細胞の特異的な細胞傷害性は、ＣＸＣＲ−４標的化キメラ抗原受容体Ｔ細胞によって誘導される。
【０１１６】
「癌」および「癌性」は、例えば、典型的には無秩序な細胞増殖を特徴とする哺乳動物の生理学的状態を指すか、または記述する。癌の例としては、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、および白血病が挙げられるが、これらに限定されない。そのような癌のより具体的な例には、扁平上皮癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃腸癌、膵臓癌、神経膠芽腫、子宮頸部癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、ヘパトーマ、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、肝癌、およびさまざまなタイプの頭頸部癌が含まれる。
【０１１７】
癌において、組織内の正常な細胞間相互作用は破壊され、腫瘍微小環境は増殖する腫瘍に対応するように進化する。腫瘍微小環境（ＴＭＥ）は、周囲の血管、免疫細胞、線維芽細胞、骨髄由来炎症細胞、リンパ球、シグナル伝達分子、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）などの構成要素を含む、腫瘍が存在する細胞環境を指す。腫瘍微小環境は複雑で、免疫系の影響を強く受ける。
【０１１８】
本発明は、とりわけ（本明細書に記載されているような）トリプルネガティブ乳癌のためのＣＡＲ−Ｔ細胞療法を提供する。腫瘍部位でのＣＡＲ−Ｔ細胞による単一特異性、二重特異性、または三重特異性ミニボディ、抗体、またはミニボディ／抗体融合タンパク質の分泌は、免疫抑制性腫瘍微小環境を変化させる（すなわち、調節する）ことにより、さらなる利益をもたらす可能性がある。
【０１１９】
実施形態では、方法は、癌に罹患している対象に、本明細書に記載の操作された細胞の治療上有効量を投与することを含む。治療上有効量は、癌の重症度と経過、以前の治療、対象の健康状態、体重、薬物への反応、および担当医師の判断に依存し得る。
【０１２０】
対象は、液性癌（すなわち、血液癌）および／または固形癌（すなわち、腫瘍）などの癌に罹患している可能性がある。癌は良性または悪性であり得、免疫系によって影響を受けるものであり得る。
【０１２１】
本明細書に記載される実施形態は、癌に罹患している対象を治療するように免疫系を調節することができる。「調節すること」は、阻害の上方制御、誘導、刺激、増強、および／または解放、ならびに阻害、減弱および／または下方制御または抑制を指すことができる。実施形態では、対象の免疫系の活性が調節されるか、癌細胞および／または腫瘍を取り囲む微小環境が調節されるか、あるいはその両方である。例えば、本明細書に記載の実施形態は、腫瘍細胞を殺傷するように免疫系を調節する（または免疫系による腫瘍細胞の殺傷を可能にする）よう、免疫抑制性腫瘍微小環境を変化させ、微小環境依存性免疫抑制を低減することができる。
【０１２２】
一実施形態は、臨床的予後が不良の高悪性度の乳癌のサブタイプ（例えば、固形腫瘍）であるトリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）に罹患している対象を治療する方法に向けられている。化学療法で治療している間の、高い再発率は新規のターゲティングされた療法の必要性を示している。本明細書に記載されるような免疫療法は、ＴＮＢＣのエキサイティングな治療選択肢を提示する。例えば、実施形態は、ＴＮＢＣ用の、免疫調節抗体を分泌するＣＡＲ  Ｔ細胞であるキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞ファクトリを、工学技術により作製することを含む。
【０１２３】
「個体」または「対象」は哺乳動物であり得る。哺乳動物には、家畜（例：牛、羊、猫、犬、馬）、霊長類（例：ヒトおよびサルなどの非人類霊長類）、ウサギ、げっ歯類（例：マウスおよびラット）が含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、個体または対象はヒトである。
【０１２４】
本発明による細胞は、癌の治療を必要とする患者の癌を治療するために使用することができる。別の実施形態では、本発明による該単離された細胞は、癌、自己免疫障害のウイルス感染の治療を必要とする患者における該治療のための医薬の製造において使用することができる。
【０１２５】
本発明は、治療を必要とする患者を治療する方法に依存し、該方法は、以下のステップのうちの少なくとも１つを含む：（ａ）本発明によるキメラ抗原受容体細胞を提供するステップ、および（ｂ）該患者に該細胞を投与するステップ。
【０１２６】
該治療は、寛解、治癒または予防であり得る。それは、自己免疫療法の一部または同種異系免疫療法治療の一部であり得る。自己とは、患者の治療に使用される細胞、細胞株または細胞集団が、該患者に由来またはヒト白血球抗原（ＨＬＡ）適合ドナーに由来することを意味する。同種異系とは、患者の治療に使用される細胞または細胞集団が、該患者に由来するのではなく、ドナーに由来することを意味する。
【０１２７】
本発明は、典型的にはドナーから得られるＴ細胞の非アロ反応性細胞への形質転換を可能にする限り、同種異系免疫療法に特に適している。これは、標準プロトコルの下で実行され得、必要な回数だけ複製され得る。得られた改変Ｔ細胞をプールして、１人または数人の患者に投与し、「既製の」治療用製品として利用可能にすることができる。
【０１２８】
開示された方法で使用できる細胞は、前項に記載されている。該治療は、癌と診断された患者を治療するために使用することができる。治療され得る癌には、血管新生されていない、またはまだ実質的に血管新生されていない腫瘍、ならびに血管新生腫瘍が含まれる。癌は、非固形腫瘍（例えば、血液腫瘍、例えば、白血病およびリンパ腫）を含んでよく、または固形腫瘍を含んでよい。本発明のＣＡＲで治療される癌のタイプには、癌腫、芽細胞腫、および肉腫、ならびに特定の白血病またはリンパ性悪性腫瘍、良性および悪性腫瘍、および悪性腫瘍、例えば、肉腫、癌腫、および黒色腫が含まれるが、これらに限定されない。成人腫瘍／癌および小児腫瘍／癌も含まれる。
【０１２９】
それは、抗体療法、化学療法、サイトカイン療法、樹状細胞療法、遺伝子療法、ホルモン療法、レーザー光線療法および放射線療法の群から選択される癌に対する１つ以上の療法と組み合わせた治療であり得る。
【０１３０】
本発明の実施形態によれば、該治療は、免疫抑制治療を受けている患者に投与することができる。実際、本発明は、好ましくは、そのような免疫抑制剤の受容体をコードする遺伝子の不活性化のために少なくとも１つの免疫抑制剤に対して耐性にされた細胞または細胞集団に依存する。この態様では、免疫抑制治療は、患者内で本発明によるＴ細胞の選択および拡大を助けるはずである。
【０１３１】
さらなる実施形態では、本発明の細胞組成物は、骨髄移植、フルダラビンなどの化学療法剤、体外照射療法（ＸＲＴ）、シクロホスファミド、またはＯＫＴ３やＣＡＭ  ＰＡＴＨなどの抗体のいずれかを使用するＴ細胞除去療法（Ｔ  ｃｅｌｌ  ａｂｌａｔｉｖｅ  ｔｈｅｒａｐｙ）と組み合わせて（例えば、前に、同時にまたは後に）患者に投与される。別の実施形態では、本発明の細胞組成物は、ＣＤ２０と反応する薬剤、例えばリツキサンなどのＢ細胞除去療法（Ｂ−ｃｅｌｌ  ａｂｌａｔｉｖｅ  ｔｈｅｒａｐｙ）後に投与される。例えば、一実施形態では、対象は、大量化学療法による標準治療を受け、その後末梢血幹細胞移植を受けることができる。特定の実施形態では、移植後、対象は、本発明の増大された免疫細胞の注入を受ける。さらなる実施形態では、増大された細胞は、手術の前または後に投与される。本明細書に記載される方法のうちのいずれかによって得られる該改変細胞は、宿主対移植片（ＨｖＧ）拒絶および移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）に対して治療を必要とする患者を治療するための本発明の特定の態様において使用でき、したがって、本発明の範囲には、宿主対移植片（ＨｖＧ）拒絶および移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）に対して治療を必要とする患者を治療する方法であって、不活化されたＴＣＲアルファおよび／またはＴＣＲベータ遺伝子を含む改変細胞の有効量を該患者に投与することにより該患者を治療することを含む、方法がある。
【０１３２】
細胞の投与
本発明は、典型的にはドナーから得られるＴ細胞の非アロ反応性細胞への形質転換を可能にする限り、同種異系免疫療法に特に適している。これは、標準プロトコルの下で実行され得、必要な回数だけ複製され得る。得られた改変Ｔ細胞をプールして、１人または数人の患者に投与し、「既製の」治療用製品として利用可能にすることができる。
【０１３３】
細胞の性質に応じて、細胞は多種多様な方法で宿主生物、例えば哺乳動物に導入することができる。特定の実施形態では、細胞は腫瘍の部位に導入することができるが、代替の実施形態では、細胞は癌に集中する（ｈｏｎｅ）か、または癌に集中するように改変される。使用される細胞の数は、様々な状況、導入の目的、細胞の寿命、使用されるプロトコル、例えば、投与回数、細胞が増殖する能力、組換え構築物の安定性などに依存する。細胞は、分散液として適用されてもよく、通常、目的の部位またはその近くに注入される。細胞は、生理学的に許容される媒体中にあってよい。
【０１３４】
いくつかの実施形態では、免疫認識を阻害するために細胞はカプセル化され、腫瘍の部位に配置される。
【０１３５】
細胞は所望に応じて投与できる。所望の応答、投与方法、細胞の寿命、存在する細胞の数に応じて、様々なプロトコルを使用することができる。投与回数は、少なくとも部分的に上記の要因に依存する。
【０１３６】
本発明による細胞または細胞集団の投与は、エアロゾル吸入、注射、摂取、輸血、インプラント術または移植を含む、任意の都合のよい方法で行うことができる。本明細書に記載の組成物は、皮下、皮内、腫瘍内、結節内、髄内、筋肉内、静脈内またはリンパ内注射、または腹腔内で患者に投与することができる。一実施形態では、本発明の細胞組成物は、好ましくは、静脈内注射によって投与される。
【０１３７】
細胞または細胞集団の投与は、好ましくは体重ｋｇ当たり１０４〜１０９個の細胞、好ましくは、１０５〜１０６個の細胞／ｋｇ体重の投与からなることができ、これらの範囲内の細胞数のすべての整数値を含む。細胞または細胞集団は、１回以上の用量で投与することができる。別の実施形態では、該有効量の細胞は、単回用量として投与される。別の実施形態では、該有効量の細胞は、ある期間にわたって２回以上の用量として投与される。投与のタイミングは、主治医の判断の範囲内であり、患者の臨床状態に依存する。細胞または細胞集団は、血液バンクまたはドナーなどの任意の供給源から得ることができる。個々の必要性は変化するが、特定の疾患または状態に対する所与の細胞型の有効量の最適範囲の決定は当技術の範囲内である。有効量は、治療的または予防的利益を提供する量を意味する。投与される投与量は、レシピエントの年齢、健康状態および体重、もしあれば同時治療の種類、治療の頻度および所望の効果の性質に依存するであろう。
【０１３８】
系は、リガンドに対する細胞応答、発現効率、および適切な場合には分泌レベル、発現産物の活性、患者の特定の必要性など、時間および状況、細胞の損失または個々の細胞の発現活性の結果としての細胞活性の損失率などによって変化し得る多くの変数に影響されることを理解されたい。したがって、個々の患者ごとに、集団全体に投与できる万能細胞があったとしても、各患者はその個人の適切な投与量についてモニターされることが期待され、患者をモニターするそのような慣行は当技術分野では日常的に行われている。
【０１３９】
核酸ベースの発現系
本発明のＣＡＲは、発現ベクターから発現させることができる。そのような発現ベクターを作製するための組換え技術は、当技術分野でよく知られている。
【０１４０】
本明細書に記載される「ＤＮＡベクター」とも呼ばれ得るＤＮＡ構築物は、ポリペプチドおよび／またはその断片を分泌するキメラ抗原受容体Ｔ細胞を形質導入および産生するために使用されるベクターにクローニングされ得る。例えば、ＤＮＡ構築物は、腫瘍部位で単一特異性、二重特異性、または三重特異性免疫調節抗体／ミニボディおよび／または抗体融合タンパク質を分泌するキメラ抗原受容体Ｔ細胞を形質導入および産生するために使用されるレンチウイルスの産生のためのレンチウイルスベクターにクローニングされ得る。
【０１４１】
ベクター
「ベクター」という用語は、核酸配列をそれが複製され得る細胞に導入するために挿入することができるキャリア核酸分子を指すために使用される。核酸配列は「外因性」であり得、これは、ベクターが導入される細胞にとって外来であるか、または配列が細胞内の配列と相同であるが、配列が通常見出されない宿主細胞核酸内位置にあることを意味する。ベクターには、プラスミド、コスミド、ウイルス（バクテリオファージ、動物ウイルス、および植物ウイルス）、人工染色体（ＹＡＣなど）が含まれる。当業者であれば、標準的な組換え技術を用いてベクターを構築するために十分な設備を有しているであろう（例えば、ともに参照により本明細書に組み込まれる、Ｍａｎｉａｔｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８およびＡｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，１９９４を参照されたい）。
【０１４２】
「発現ベクター」という用語は、転写され得るＲＮＡをコードする核酸を含む任意のタイプの遺伝子構築物を指す。いくつかの場合では、次に、ＲＮＡ分子はタンパク質、ポリペプチド、またはペプチドに翻訳される。他の場合では、これらの配列は、例えばアンチセンス分子またはリボザイムの産生において翻訳されない。発現ベクターは、特定の宿主細胞における作動可能に連結されたコード配列の転写およびおそらくは翻訳に必要な核酸配列を指す、様々な「制御配列」を含むことができる。転写および翻訳を支配する制御配列に加えて、ベクターおよび発現ベクターは、他の機能も果たす核酸配列を含み得、以下に記載される。
【０１４３】
プロモーターおよびエンハンサー
「プロモーター」は、転写の開始および速度が制御される核酸配列の領域である制御配列である。それは、ＲＮＡポリメラーゼおよび他の転写因子などの調節タンパク質および分子が結合して核酸配列の特定の転写を開始できる遺伝的要素を含み得る。「作動可能に配置された」、「作動可能に連結された」、「制御下」、および「転写制御下」という語句は、プロモーターが、その配列の転写開始および／または発現を制御するために、核酸配列に関して正しい機能的位置および／または方向にあることを意味する。
【０１４４】
プロモーターは一般に、ＲＮＡ合成の開始部位の位置を特定するように機能する配列を含む。これの最もよく知られている例はＴＡＴＡボックスであるが、例えば哺乳動物のターミナルデオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼ遺伝子のプロモーターやＳＶ４０後期遺伝子のプロモーターなど、ＴＡＴＡボックスのない一部のプロモーターでは、開始部位自体を覆う個別の要素自体が、開始場所を固定するのを助けている。追加のプロモーター要素は、転写開始の頻度を調節する。典型的には、これらは開始部位の上流３０  １１０ｂｐの領域に位置するが、いくつかのプロモーターは開始部位の下流にも機能的要素を含むことが示されている。コード配列をプロモーターの「制御下」に置くために、転写リーディングフレームの転写開始部位の５’末端を選択されたプロモーターの「下流」（すなわち、３’）に配置する。「上流」プロモーターがＤＮＡの転写を刺激し、コードされたＲＮＡの発現を促進する。
【０１４５】
多くの場合、プロモーター要素間の間隔は柔軟であり、そのため、要素が互いに反転したり移動したりしても、プロモーターの機能は維持される。ｔｋプロモーターでは、活性が低下し始める前に、プロモーター要素間の間隔を５０ｂｐまで広げることができる。プロモーターに応じて、個々の要素が協調的にまたは独立して機能して転写を活性化することができると思われる。プロモーターは、核酸配列の転写活性化に関与するシス作用性調節配列を指す「エンハンサー」と組み合わせて使用してもしなくてもよい。
【０１４６】
プロモーターは、コードセグメントおよび／またはエキソンの上流に位置する５プライム’非コード配列を単離することにより得ることができるように、核酸配列と自然に関連するものであってもよい。このようなプロモーターは、「内因性」と呼ばれ得る。同様に、エンハンサーは、その配列の下流または上流のいずれかに位置する、核酸配列と自然に関連するものであってもよい。あるいは、コード化核酸セグメントを組換えまたは異種プロモーターの制御下に配置することによって特定の利点が得られるが、これは、その自然環境において核酸配列と通常関連しないプロモーターを指す。組換えまたは異種エンハンサーはまた、その自然環境において核酸配列と通常関連しないエンハンサーも指す。そのようなプロモーターまたはエンハンサーは、他の遺伝子のプロモーターまたはエンハンサー、および他のウイルス、または原核細胞または真核細胞から単離されたプロモーターまたはエンハンサー、および「天然に存在しない」、すなわち異なる転写調節領域の異なる要素、および／または発現を変化させる突然変異を含むプロモーターまたはエンハンサーを含み得る。例えば、組換えＤＮＡ構築で最も一般的に使用されるプロモーターには、ラクタマーゼ（ペニシリナーゼ）、ラクトースおよびトリプトファン（ｔｒｐ）プロモーター系が含まれる。プロモーターおよびエンハンサーの核酸配列を合成的に生成することに加えて、配列は、本明細書に開示される組成物に関連して、ＰＣＲ．ＴＭ．を含む組換えクローニングおよび／または核酸増幅技術を使用して生成され得る（それぞれ参照により本明細書に組み込まれる米国特許第４，６８３，２０２号および第５，９２８，９０６号を参照）。さらに、ミトコンドリア、葉緑体などの非核オルガネラ内の配列の転写および／または発現を指示する制御配列も同様に使用できると考えられる。
【０１４７】
当然のことながら、発現のために選択された細胞小器官、細胞型、組織、器官、または生物におけるＤＮＡセグメントの発現を効果的に導くプロモーターおよび／またはエンハンサーを使用することが重要であろう。分子生物学の当業者は、タンパク質発現のためのプロモーター、エンハンサー、および細胞型の組み合わせの使用を一般に知っている（例えば、参照により本明細書に組み込まれるＳａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．１９８９を参照）。使用されるプロモーターは、構成的、組織特異的、誘導可能な、および／または組換えタンパク質および／またはペプチドの大規模生産に有利であるような、導入されたＤＮＡセグメントの高レベル発現を指示する適切な条件下で有用であり得る。プロモーターは、異種または内因性であり得る。
【０１４８】
さらに、プロモーター／エンハンサーの任意の組み合わせを使用して発現を促進することもできる。Ｔ３、Ｔ７またはＳＰ６細胞質発現系の使用は、別の可能な実施形態である。真核細胞は、適切な細菌ポリメラーゼが送達複合体の一部として、または追加の遺伝子発現構築物として提供される場合、特定の細菌プロモーターからの細胞質転写をサポートできる。
【０１４９】
組織特異的プロモーターまたは要素の同一性、ならびにそれらの活性を特徴付けるアッセイは、当業者に周知である。
【０１５０】
コード配列の効率的な翻訳には、特定の開始シグナルも必要になる場合がある。これらのシグナルには、ＡＴＧ開始コドンまたは隣接する配列が含まれる。ＡＴＧ開始コドンを含む外因性翻訳制御シグナルを提供する必要がある場合がある。当業者であれば、これを容易に決定し、必要なシグナルを提供することができるであろう。
【０１５１】
本発明の特定の実施形態において、内部リボソーム侵入部位（ＩＲＥＳ）要素の使用は、多重遺伝子、または多シストロン性の、メッセージを作製するために使用され、これらは、本発明において使用され得る。
【０１５２】
ベクターには、複数の制限酵素部位を含む核酸領域であるマルチクローニングサイト（ＭＣＳ）を含めることができ、これらのいずれも、標準的な組換え技術と組み合わせてベクターを消化するために使用できる。「制限酵素消化」は、核酸分子の特定の位置でのみ機能する酵素による核酸分子の触媒的切断を指す。これらの制限酵素の多くは市販されている。そのような酵素の使用は、当業者によって広く理解されている。多くの場合、ＭＣＳ内で切断する制限酵素を使用してベクターを線形化または断片化し、外来配列をベクターにライゲーションできるようにする。「ライゲーション」とは、２つの核酸断片間にホスホジエステル結合を形成するプロセスを指し、これは互いに隣接していてもいなくてもよい。制限酵素およびライゲーション反応を含む技術は、組換え技術の当業者によく知られている。
【０１５３】
スプライシング部位、終結シグナル、複製起点、および選択可能なマーカーも使用することができる。
【０１５４】
プラスミドベクター
特定の実施形態では、プラスミドベクターは、宿主細胞を形質転換するための使用が企図される。一般に、宿主細胞と適合性のある種に由来するレプリコンおよび制御配列を含むプラスミドベクターは、これらの宿主に関連して使用される。ベクターは通常、複製部位、ならびに形質転換細胞において表現型選択を提供することができるマーキング配列を保有する。非限定的な例では、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）は、大腸菌種に由来するプラスミドであるｐＢＲ３２２の誘導体を使用してしばしば形質転換される。ｐＢＲ３２２にはアンピシリンおよびテトラサイクリン耐性の遺伝子が含まれているため、形質転換された細胞を簡単に同定できる。ｐＢＲプラスミド、または他の微生物プラスミドもしくはファージはまた、例えば、微生物がそれ自体のタンパク質の発現のために使用することができるプロモーターを含むか、または含むように改変されなければならない。
【０１５５】
さらに、宿主微生物と適合性のあるレプリコンおよび制御配列を含むファージベクターは、これらの宿主と関連して形質転換ベクターとして使用され得る。例えば、ファージラムダＧＥＭ．ＴＭ．１１は、例えば、大腸菌ＬＥ３９２などの宿主細胞を形質転換するために使用することができる組換えファージベクターを作製する際に利用することができる。
【０１５６】
後で精製および分離または切断するためのグルタチオンＳトランスフェラーゼ（ＧＳＴ）可溶性融合タンパク質の生成に使用するための、さらに有用なプラスミドベクターには、ｐＩＮベクター（Ｉｎｏｕｙｅ  ｅｔ  ａｌ．，１９８５）、およびｐＧＥＸベクターが含まれる。他の適切な融合タンパク質は、ガラクトシダーゼ、ユビキチンなどを有するものである。
【０１５７】
発現ベクターを含む細菌宿主細胞、例えば、大腸菌は、任意の多くの適切な培地、例えば、ＬＢで増殖される。当業者に理解されるように、宿主細胞を特定のプロモーターに特異的な薬剤と接触させることにより、例えば培地にＩＰＴＧを添加することにより、またはインキュベーションを高温に切り替えることにより、特定のベクターにおける組換えタンパク質の発現を誘導することができる。細菌をさらに２〜２４時間培養した後、遠心分離により細胞を回収し、洗浄して残留培地を除去する。
【０１５８】
ウイルスベクター
受容体を介したエンドサイトーシスを介して細胞に感染する、細胞に侵入する、宿主細胞のゲノムに組み込む、ウイルス遺伝子を安定かつ効率的に発現する特定のウイルスの能力は、外来核酸の細胞（例、哺乳動物細胞）への導入のための魅力的な候補となっている。本発明の構成要素は、本発明の１つ以上のＣＡＲをコードするウイルスベクターであり得る。本発明の核酸を送達するために使用され得るウイルスベクターの非限定的な例は、以下に記載される。
【０１５９】
アデノウイルスベクター
核酸の送達のための特定の方法は、アデノウイルス発現ベクターの使用を含む。アデノウイルスベクターはゲノムＤＮＡへの組み込み能力が低いことが知られているが、この特徴は、これらのベクターによって得られる高い遺伝子導入効率によって相殺される。「アデノウイルス発現ベクター」は、（ａ）構築物のパッケージングをサポートするのに十分な、（ｂ）その中にクローニングされた組織または細胞特異的構築物を最終的に発現するのに十分なアデノウイルス配列を含む構築物を含むことを意味する。遺伝的構成またはアデノウイルスが、３６ｋｂ、直鎖状、二本鎖ＤＮＡウイルスであるという知識により、アデノウイルスＤＮＡの大きな断片を最大７ｋｂの外来配列で置換することができる（Ｇｒｕｎｈａｕｓ  ａｎｄ  Ｈｏｒｗｉｔｚ，１９９２）。
【０１６０】
ＡＡＶベクター
アデノウイルス支援トランスフェクションを使用して、核酸を細胞に導入することができる。アデノウイルス共役系（ａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ  ｃｏｕｐｌｅｄ  ｓｙｓｔｅｍ）を使用した細胞系でトランスフェクション効率の増加が報告されている（Ｋｅｌｌｅｈｅｒ  ａｎｄ  Ｖｏｓ，１９９４；Ｃｏｔｔｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９９２；Ｃｕｒｉｅｌ，１９９４）。アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）は、組み込みの頻度が高く、非分裂細胞に感染することができるため、本発明の細胞で使用するための魅力的なベクター系であり、したがって、例えば、組織培養（Ｍｕｚｙｃｚｋａ，１９９２）またはインビボで、哺乳動物細胞への遺伝子の送達に有用である。ＡＡＶは感染性の宿主範囲が広い（Ｔｒａｔｓｃｈｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８４；Ｌａｕｇｈｌｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８６；Ｌｅｂｋｏｗｓｋｉ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８；ＭｃＬａｕｇｈｌｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８）。ｒＡＡＶベクターの生成および使用に関する詳細は、米国特許第５，１３９，９４１号および第４，７９７，３６８号に記載されており、それぞれ参照により本明細書に組み込まれる。
【０１６１】
レトロウイルスベクター
レトロウイルスは、それらの遺伝子を宿主ゲノムに組み込むそれらの能力、大量の外来遺伝物質を導入すること、広範囲の種および細胞型に感染すること、および、特別な細胞株にパッケージ化されることにより、送達ベクターとして有用である（Ｍｉｌｌｅｒ，１９９２）。
【０１６２】
レトロウイルスベクターを構築するために、核酸（例えば、所望の配列をコードするもの）が、特定のウイルス配列の代わりにウイルスゲノムに挿入されて、複製欠損のあるウイルスを産生する。ビリオンを生成するためには、ｇａｇ、ｐｏｌ、およびｅｎｖ遺伝子を含むが、ＬＴＲおよびパッケージング構成要素を含まないパッケージング細胞株を構築する（Ｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８３）。レトロウイルスのＬＴＲおよびパッケージング配列とともに、ｃＤＮＡを含む組換えプラスミドが特別な細胞株に導入されると（たとえば、リン酸カルシウム沈殿などにより）、パッケージング配列により、組換えプラスミドのＲＮＡ転写物をウイルス粒子にパッケージ化でき、次にそれは培養培地に分泌される（Ｎｉｃｏｌａｓ  ａｎｄ  Ｒｕｂｅｎｓｔｅｉｎ，１９８８；Ｔｅｍｉｎ，１９８６；Ｍａｎｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９８３）。次に、組換えレトロウイルスを含む培地を収集し、任意で濃縮し、遺伝子導入に使用する。レトロウイルスベクターはさまざまな種類の細胞に感染することができる。しかしながら、組み込みおよび安定した発現には、宿主細胞の分裂が必要である（Ｐａｓｋｉｎｄ  ｅｔ  ａｌ．，１９７５）。
【０１６３】
レンチウイルスは複雑なレトロウイルスであり、一般的なレトロウイルス遺伝子であるｇａｇ、ｐｏｌ、およびｅｎｖに加えて、調節または構造機能を持つ他の遺伝子を含有する。レンチウイルスベクターは当技術分野でよく知られている（例えば、Ｎａｌｄｉｎｉ  ｅｔ  ａｌ．，１９９６；Ｚｕｆｆｅｒｅｙ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７；Ｂｌｏｍｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７、米国特許第６，０１３，５１６号および第５，９９４，１３６号を参照されたい）。レンチウイルスのいくつかの例には、ヒト免疫不全ウイルス：ＨＩＶ−１、ＨＩＶ−２およびサル免疫不全ウイルス：ＳＩＶが含まれる。レンチウイルスベクターは、ＨＩＶ病原性遺伝子を多重弱毒化することによって生成され、例えば、遺伝子ｅｎｖ、ｖｉｆ、ｖｐｒ、ｖｐｕおよびｎｅｆは削除されており、生物学的に安全なベクターになっている。
【０１６４】
組換えレンチウイルスベクターは非分裂細胞に感染することができ、インビボとエクスビボの両方で遺伝子導入と核酸配列の発現に使用できる。例えば、適切な宿主細胞がパッケージング機能、すなわちｇａｇ、ｐｏｌおよびｅｎｖ、ならびにｒｅｖおよびｔａｔを保有する２つ以上のベクターでトランスフェクトされている非分裂細胞に感染することができる組換えレンチウイルスは、米国特許第５，９９４，１３６号に記載され、参照により本明細書に組み込まれる。エンベロープタンパク質と、特定の細胞型の受容体に対してターゲティングするための抗体または特定のリガンドとの結合によって、組換えウイルスをターゲティングすることができる。例えば、特定の標的細胞上の受容体に対するリガンドをコードする別の遺伝子とともに、関心対象の配列（調節領域を含む）をウイルスベクターに挿入することにより、ベクターは今や標的特異的である。
【０１６５】
他のウイルスベクター
本発明では、他のウイルスベクターをワクチン構築物として使用することができる。ワクシニアウイルス（Ｒｉｄｇｅｗａｙ，１９８８；Ｂａｉｃｈｗａｌ  ａｎｄ  Ｓｕｇｄｅｎ，１９８６；Ｃｏｕｐａｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８）、シンドビスウイルス、サイトメガロウイルスおよび単純ヘルペスウイルスなどのウイルスに由来するベクターを使用することができる。これらは、さまざまな哺乳動物細胞にいくつかの魅力的な特徴を提供する（Ｆｒｉｅｄｍａｎｎ，１９８９；Ｒｉｄｇｅｗａｙ，１９８８；Ｂａｉｃｈｗａｌ  ａｎｄ  Ｓｕｇｄｅｎ，１９８６；Ｃｏｕｐａｒ  ｅｔ  ａｌ．，１９８８；Ｈｏｒｗｉｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，１９９０）。
【０１６６】
改変ウイルスを使用した送達
送達される核酸は、特異的結合リガンドを発現するように操作された感染性ウイルス内に収容されてもよい。したがって、ウイルス粒子は標的細胞の同族受容体に特異的に結合し、内容物を細胞に送達する。レトロウイルスベクターの特異的ターゲティングを可能にするために設計された新しいアプローチは、ウイルスエンベロープへのラクトース残基の化学的付加によるレトロウイルスの化学修飾に基づいて開発された。この改変により、シアロ糖タンパク質受容体を介した肝細胞の特異的感染が可能になる。
【０１６７】
組換えレトロウイルスのターゲティングのための別のアプローチが設計され、このアプローチでは、レトロウイルスエンベロープタンパク質に対するビオチン化抗体および特定の細胞受容体に対するビオチン化抗体が使用された。これらの抗体は、ストレプトアビジンを使用することにより、ビオチン成分を介して結合された（Ｒｏｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９）。主要組織適合性複合体クラスＩおよびクラスＩＩ抗原に対する抗体を使用して、彼らは、これらの表面抗原を保有するさまざまなヒト細胞の、エコトロピックウイルスによる感染を、インビトロで示した（Ｒｏｕｘ  ｅｔ  ａｌ．，１９８９）。
【０１６８】
ベクター送達と細胞形質転換
細胞のトランスフェクションまたは形質転換のための核酸送達に適した方法は、当業者に知られている。そのような方法には、エクスビボトランスフェクション、注射などによるＤＮＡの直接送達が含まれるが、これらに限定されない。当該技術分野で既知の技術の適用により、細胞は安定的にまたは一時的に形質転換され得る。
【０１６９】
エクスビボ形質転換
生体外で生体から取り出された真核細胞および組織をトランスフェクトする方法は、当業者に知られている。したがって、本発明の核酸を使用して、細胞または組織をエクスビボで取り出しおよびトランスフェクトすることができると考えられる。特定の態様では、移植された細胞または組織は、生物に配置され得る。好ましい面では、核酸は移植された細胞で発現される。
【０１７０】
本発明のキット
本明細書に記載される組成物のいずれもキットに含まれ得る。非限定的な例では、細胞治療で使用するための１つ以上の細胞、および／または細胞治療で使用するための１つ以上の細胞を生成するための、組換え発現ベクターを含む試薬を、キットに含めることができる。キットの構成要素は、適切な容器手段で提供される。
【０１７１】
キットの一部の構成要素は、水性媒体または凍結乾燥された形態のいずれかで包装され得る。キットの容器手段は、概して、構成成分が入れられ、好ましくは適切に分注され得る、少なくとも１つのバイアル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジまたは他の容器手段を含む。キットに２つ以上の構成成分がある場合、キットには通常、追加の構成要素を個別に配置できる第２の、第３の、またはその他の追加の容器も含まれる。しかしながら、構成要素の様々な組み合わせがバイアルに含まれてもよい。本発明のキットはまた、典型的には、商業的販売のために構成要素を厳重に封じ込めて含むための手段を含む。そのような容器は、所望のバイアルが保持される射出成形またはブロー成形プラスチック容器を含み得る。
【０１７２】
キットの構成要素が１つおよび／または複数の液体溶液で提供される場合、液体溶液は水溶液であり、無菌水溶液が特に有用である。場合によっては、容器手段自体がシリンジ、ピペット、および／または他の同様の装置であってもよく、そこから製剤を身体の感染領域に適用し、動物に注射し、および／またはキットの他の構成要素に適用および／または他の構成要素と混合することもできる。
【０１７３】
しかしながら、キットの構成要素は、乾燥粉末（複数可）として提供されてもよい。試薬および／または成分が乾燥粉末として提供される場合、粉末は、適切な溶媒の添加により再構成され得る。溶媒はまた、別の容器手段で提供され得ることが想定される。キットはまた、無菌の薬学的に許容される緩衝液および／または他の希釈剤を含むための第２の容器手段を含み得る。
【０１７４】
本発明の特定の実施形態では、細胞療法に使用される細胞はキットで提供され、場合によっては、細胞は本質的にキットの唯一の構成要素である。キットは、所望の細胞を作製するための試薬および材料を含み得る。特定の実施形態では、試薬および材料は、所望の配列を増幅するためのプライマー、ヌクレオチド、適切な緩衝液または緩衝液試薬、塩などを含み、場合によっては、試薬は、本明細書に記載のＣＡＲをコードするベクターおよび／またはＤＮＡを含み、および／またはそのための調節エレメントを含む。
【０１７５】
特定の実施形態では、個体から１つ以上の試料を抽出するのに適したキット内に１つ以上の装置が存在する。装置は、注射器、メスなどであり得る。
【０１７６】
本発明のいくつかの場合において、キットは、細胞療法の実施形態に加えて、例えば、化学療法、ホルモン療法、および／または免疫療法などの第２の癌療法も含む。キット（複数可）は、個体の特定の癌に合わせて調整することができ、個体のそれぞれの第２の癌療法を含むことができる。
【０１７７】
併用療法
本発明の特定の実施形態では、臨床的側面のための本発明の方法は、抗癌剤などの過剰増殖性疾患の治療に有効な他の薬剤と組み合わされる。「抗癌」剤は、例えば、癌細胞を殺傷すること、癌細胞のアポトーシスを誘導すること、癌細胞の増殖率を減少させること、転移の発生率または数を減少させること、腫瘍サイズを減少させること、腫瘍増殖を阻害すること、腫瘍または癌細胞への血液供給の減少させること、癌細胞または腫瘍に対する免疫応答の促進すること、癌の進行の防止または阻害すること、または癌を有する対象の寿命の延ばすことにより、対象の癌に悪影響を与えることができる、より一般的には、これらの他の組成物は、細胞の殺傷または増殖を阻害するのに有効な組み合わせ量で提供される。このプロセスは、癌細胞を、発現構築物および薬剤（複数可）または複数の因子（複数可）と同時に接触させることを含み得る。これは、細胞を単一の組成物または両方の薬剤を含む薬理学的製剤と接触させることによって、または同時に２つの異なる組成物（一方の組成物は発現構築物を含み、もう一方の組成物は第２の薬剤（複数可）を含む）または製剤と、細胞を接触させることによって達成できる。
【０１７８】
化学療法剤および放射線療法剤に対する腫瘍細胞の耐性は、臨床腫瘍学における主要な問題である。現在の癌研究の１つの目標は、化学療法と放射線療法を他の治療法と組み合わせることで、その効果を改善する方法を見つけることである。本発明との関連で、細胞療法は、化学療法、放射線療法、または免疫療法の介入、ならびにアポトーシス促進剤または細胞周期調節剤と併せて同様に使用できると考えられる。
【０１７９】
あるいは、本発明の治療は、数分から数週間の範囲の間隔で他の薬剤の治療に先行または後行することができる。他の薬剤と本発明が個別に適用される実施形態では、概して各送達の時間の間にかなりの期間が満了しないことを確実にし、その結果、薬剤および本発明の治療が、依然として細胞に対して有利に組み合わされた効果を発揮することができる。そのような場合、互いに約１２〜２４時間以内、より好ましくは互いに約６〜１２時間以内に両方のモダリティで細胞を接触させることができると考えられる。いくつかの状況では、治療期間を大幅に延長することが望ましい場合があるが、それぞれの投与の間に、数日（２、３、４、５、６または７）から数週間（１、２、３、４、５、６、７または８）が経過する。
【０１８０】
治療サイクルは必要に応じて繰り返されることが予想される。また、本発明の細胞療法と組み合わせて、様々な標準的な療法、ならびに外科的介入を適用することができると考えられる。
【０１８１】
化学療法
癌治療には、化学物質と放射線に基づく治療の両方を用いたさまざまな併用療法も含まれる。併用化学療法には、例えば、アブラキサン、アルトレタミン、ドセタキセル、ハーセプチン、メトトレキサート、ノバントロン、ゾラデックス、シスプラチン（ＣＤＤＰ）、カルボプラチン、プロカルバジン、メクロレタミン、シクロホスファミド、カンプトテシン、イホスファミド、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン、ニトロスウレア、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ブレオマイシン、プリコマイシン、マイトマイシン、エトポシド（ＶＰ１６）、タモキシフェン、ラロキシフェン、エストロゲン受容体結合剤、タキソール、ゲムシタビエン、ナベルビン、ファルネシルプロテインタンスフェラーゼ阻害剤、トランスプラチン（ｔｒａｎｓｐｌａｔｉｎｕｍ）、５−フルオロウラシル、ビンクリスチン、ビンブラスチンおよびメトトレキサート、または前述の任意の類似体もしくは誘導体のバリアント、およびこれらの組み合わせが含まれる。
【０１８２】
特定の実施形態では、個体に対する化学療法は、本発明と組み合わせて、例えば、本発明の投与の前、間、および／または後に採用される。
【０１８３】
放射線療法
ＤＮＡ損傷を引き起こしかつ広く使用されてきた他の要因には、γ線、Ｘ線として一般に知られているもの、および／または腫瘍細胞への放射性同位元素の誘導送達が含まれる。マイクロ波や紫外線照射など、他の形式のＤＮＡ損傷因子も考えられる。これらの要因のすべてが、ＤＮＡ、ＤＮＡの前駆体、ＤＮＡの複製と修復、染色体の組み立てと維持に広範囲の損傷を与える可能性が最も高い。Ｘ線の線量範囲は、長期間（３〜４週間）についての１日の線量５０〜２００レントゲンから、単回線量の２０００〜６０００レントゲンまでである。放射性同位元素の線量範囲は大きく異なり、同位元素の半減期、放出される放射線の強度と種類、新生細胞による取り込みに依存する。
【０１８４】
本明細書では、細胞に適用される場合の「接触」および「曝露」という用語は、治療用構築物および化学療法剤または放射線治療剤が標的細胞に送達される、または標的細胞と直接並置されるプロセスを説明するために使用される。細胞の殺傷または静止を達成するために、両方の薬剤は、細胞を殺傷するか、または細胞が分裂するのを防ぐのに有効な合計量で細胞に送達される。
【０１８５】
免疫療法
免疫療法は一般に、癌細胞を標的とするおよび破壊するために免疫エフェクター細胞および分子を使用することに依存する。免疫エフェクターは、例えば、腫瘍細胞の表面上のいくつかのマーカーに特異的な抗体であり得る。抗体単独で治療のエフェクターとして機能し得るか、他の細胞を動員して実際に細胞を殺傷し得る。抗体はまた、薬物または毒素（化学療法剤、放射性核種、リシンＡ鎖、コレラ毒素、百日咳毒素など）に結合され得、および単にターゲティング剤として機能し得る。あるいは、エフェクターは、腫瘍細胞標的と直接的または間接的に相互作用する表面分子を運ぶリンパ球であってもよい。様々なエフェクター細胞には、細胞傷害性Ｔ細胞およびＮＫ細胞が含まれる。
【０１８６】
したがって、本明細書に記載される本発明の療法以外の免疫療法は、本細胞療法と組み合わせて、併用療法の一部として使用され得る。併用療法の一般的なアプローチを以下に説明する。一般に、腫瘍細胞は、標的にしやすい、すなわち、他の細胞の大部分には存在しないいくつかのマーカーを持たなければならない。多くの腫瘍マーカーが存在し、これらのいずれもが、本発明の状況下で標的化に適している可能性がある。一般的な腫瘍マーカーには、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＣＴＬＡ４、癌胎児性抗原、前立腺特異抗原、泌尿器腫瘍関連抗原、胎児性抗原、チロシナーゼ（ｐ９７）、ｇｐ６８、ＴＡＧ−７２、ＨＭＦＧ、シアリルルイス抗原、ＭｕｃＡ、ＭｕｃＢ、ＰＬＡＰ、エストロゲン受容体、ラミニン受容体、ｅｒｂ  Ｂおよびｐ１５５が含まれる。
【０１８７】
遺伝子
さらに別の実施形態では、二次治療は、本発明の臨床的実施形態の前、後、または同時に治療用ポリヌクレオチドが投与される遺伝子治療である。細胞増殖の誘導物質、細胞増殖の阻害剤、またはプログラムされた細胞死の制御因子を含む、様々な発現産物が本発明に含まれる。
【０１８８】
手術
癌患者の約６０％は、予防的、診断的、病期診断的、治癒的および緩和的手術を含む、何らかの種類の手術を受ける。治癒的手術は、本発明の治療、化学療法、放射線療法、ホルモン療法、遺伝子療法、免疫療法および／または代替療法などの他の療法と組み合わせて使用できる癌治療である。
【０１８９】
治癒的手術には、癌性組織の全部または一部が物理的に除去され、切り取られ、および／または破壊される切除が含まれる。腫瘍切除とは、腫瘍の少なくとも一部を物理的に除去することを指す。腫瘍の切除に加えて、手術による治療には、レーザー手術、凍結手術、電気手術、および顕微鏡下手術（モース術）が含まれる。本発明は、表在癌、前癌、または付随的な量の正常組織の除去と組み合わせて使用され得ることがさらに企図される。
【０１９０】
すべての癌性細胞、組織、または腫瘍の一部を切除すると、体内に空洞が形成されることがある。治療は、灌流、直接注射、または追加の抗癌療法によるその部位への局所適用によって達成され得る。このような治療は、例えば、１、２、３、４、５、６、もしくは７日ごと、もしくは１、２、３、４、および５週間ごと、または１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、もしくは１２か月ごとに繰り返すことができる。これらの治療は、同様に様々な投与量であり得る。
【０１９１】
他の薬剤
治療の治療効果を改善するために、他の薬剤を本発明と組み合わせて使用することができると考えられる。これらの追加の薬剤には、免疫調節剤、細胞表面受容体とＧＡＰ結合の上方制御に影響を与える薬剤、細胞増殖抑制剤と分化剤、細胞接着阻害剤、またはアポトーシス誘導物質に対する過剰増殖細胞の感受性を高める薬剤が含まれる。免疫調節剤には腫瘍壊死因子、インターフェロンアルファ、ベータ、ガンマ；ＩＬ−２および他のサイトカイン；Ｆ４２Ｋおよび他のサイトカイン類似体；またはＭＩＰ−１、ＭＩＰ−１ベータ、ＭＣＰ−１、ＲＡＮＴＥＳ、およびその他のケモカインが含まれる。さらに、細胞表面受容体またはそれらのリガンド、例えばＦａｓ／Ｆａｓリガンド、ＤＲ４またはＤＲ５／ＴＲＡＩＬの上方制御は、過剰増殖細胞に対するオートクリンまたはパラクリン効果の確立により、本発明のアポトーシス誘導能力を増強すると考えられる。ＧＡＰ結合の数を増やすことによって細胞間シグナル伝達を増加させると、隣接する過剰増殖細胞集団に対する抗過剰増殖効果が増加する。他の実施形態では、細胞増殖抑制剤または分化剤を本発明と組み合わせて使用して、治療の抗過剰増殖効力を改善することができる。細胞接着阻害剤は、本発明の効力を改善すると考えられる。細胞接着阻害剤の例は、焦点接着キナーゼ（ＦＡＫ）阻害剤およびロバスタチンである。さらに、抗体ｃ２２５などのアポトーシスに対する過剰増殖細胞の感受性を高める他の薬剤を本発明と組み合わせて使用して、治効を改善することができると考えられる。
【０１９２】
操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の活性を評価する方法
本発明の態様は、さらに操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の殺傷能力を評価するための方法およびキットに向けられている。具体的には、実施形態は、癌細胞との共培養中のＣＡＲ  Ｔ細胞活性を決定するための免疫複合体分析方法およびキットに向けられている。まず、さまざまな標的癌細胞（例えば、ＨＥＫ２９３Ｔ、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８、ＨＣＣ３８、およびｓｋｒｃ５９）を色素（例えば、ＶｉａＳｔａｉｎ（商標）Ｔｒａｃｅｒ  Ｂｌｕｅ色素）で染色し、プレート（例えば、９６ウェルプレート）に播種し、ある期間（例えば、１２時間、または一晩）にわたってインキュベートする。次に、異なるＴ細胞タイプ（例えば、２つの異なるＴ細胞タイプ）をウェルに（例えば、エフェクターと標的（Ｅ：Ｔ）の比率が２０：１の比率で）追加し、ある期間（例えば、２４時間）にわたって共培養させる。最後に、（例えば、明視野および青色蛍光チャネルを使用して）プレートを走査して分析する。免疫複合体をコンフルエンス測定によって分析し、形質導入されていないＴ細胞の陰性対照と比較した。結果として、データプロットは、試験されたすべての標的細胞とエフェクター細胞の組み合わせについてＣＡＲ  Ｔ細胞の活性を表示した。イメージサイトメトリのプラットフォームを利用することで、エフェクター細胞と標的細胞間の相互作用を視覚的に確認できるため、精度の高いロバストな結果を得ることができる。
【実施例】
【０１９３】
実施例は、本発明のより完全な理解を促進するために以下に提供される。以下の実施例は、本発明を作製および実施する例示的な様式を例示する。しかしながら、本発明の範囲は、これらの実施例に開示されている特定の実施形態に限定されず、代わりの方法を使用して同様の結果を得ることができるため、例示のみを目的としている。
【０１９４】
実施例１
免疫調節抗体を分泌するＣＸＣＲ４およびクローディン４二重特異性キメラ抗原受容体Ｔ細胞療法
キメラ抗原受容体は、抗原特異的な抗体断片をＴ細胞共刺激ドメインおよびＣＤ３ゼータ細胞内シグナル伝達に融合させ、腫瘍細胞を含む目的の細胞上に提示された抗原へのＴ細胞のリダイレクションを可能にする。本発明は、ＣＸＣケモカイン受容体タイプ４およびクローディン４に向けられた一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を含むがこれらに限定されない抗体断片を組み合わせる。ｓｃＦＶをコードするＤＮＡは、例えば限定されないがＣＤ２８および４１ＢＢおよびＣＤ３−ゼータ細胞内シグナル伝達ドメインなどの免疫学的に関心対象である分子の、例えば限定されないがＣＤ８ヒンジ領域、膜貫通ドメイン、共刺激ドメインなどの必要なＣＡＲ−Ｔ要素をコードするＤＮＡに、インフレームでクローニングされる。さらに、同じＤＮＡベクターの第２の発現構築物では、目的の単一または複数の抗原に対するミニボディ（ｓｃＦｖ−Ｆｃ）または抗体が、内部リボソーム侵入部位（ＩＲＥＳ）の後にクローニングされる。これらのＤＮＡ構築物は、腫瘍部位で単一特異性、二重特異性、または三重特異性免疫調節抗体／ミニボディおよび／または抗体融合タンパク質を分泌するキメラ抗原受容体Ｔ細胞を形質導入および産生するために使用されるレンチウイルスの産生のためのレンチウイルスベクターにクローニングされる。
【０１９５】
トリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）を標的にする治療法は存在しないため、化学療法が患者に対する唯一の治療法である。抗ＰＤ＿Ｌ１のような免疫療法は、ＴＮＢＣでの成功が限られており（１８％の奏功率）、これらの療法だけでは効果的な治療ではないことを示唆している。本発明は、トリプルネガティブ乳癌のための最初のＣＡＲ−Ｔ細胞療法を提供するであろう。腫瘍部位でのＣＡＲ−Ｔ細胞による単一特異性、二重特異性、または三重特異性ミニボディ、抗体またはミニボディ／抗体融合タンパク質の分泌は、免疫抑制性腫瘍微小環境を変化させることにより、さらなる利益をもたらす可能性がある。
【０１９６】
実施例２
Ｃｅｌｉｇｏイメージサイトメータを使用するＣＡＲ  Ｔ細胞媒介性細胞傷害性のハイスループット免疫複合体分析法
癌免疫療法は、癌研究の分野で勢いを増している。併用免疫療法ならびにキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ技術の進歩により、さまざまな癌疾患と闘うための新しい方法が導入されている。操作されたＣＡＲ  Ｔ細胞の殺傷能力を評価するには、直接的な細胞媒介性細胞傷害性アッセイが必要である。従来、これらのアッセイは、標的の癌細胞がＣＡＲ  Ｔ細胞で殺傷された後に、放出されたクロム、カルセインＡＭ、または乳酸脱水素酵素（ＬＤＨ）分子の量を測定することによって行われている。これらの方法は大量の標的細胞を必要とし、ドナー一次サンプルを扱う場合には理想的でないかもしれない。さらに、それらは、ＣＡＲ  Ｔ細胞による殺傷中に形成された免疫複合体を具体的に分析することはできない。画像技術における最近の進歩により、これらの免疫複合体を評価するための新しい方法が開発された。本研究では、Ｃｅｌｉｇｏイメージサイトメータを使用して、癌細胞との共培養中にＣＡＲ  Ｔ細胞活性を測定する免疫複合体分析法を実証した。まず、さまざまな標的癌細胞（例えば、ＨＥＫ２９３Ｔ、ＭＤＡ−ＭＢ−２３１、ＭＤＡ−ＭＢ−４６８、ＨＣＣ３８、およびｓｋｒｃ５９）を色素（例えば、ＶｉａＳｔａｉｎ（商標）Ｔｒａｃｅｒ  Ｂｌｕｅ色素）で染色し、プレート（例えば、９６ウェルプレート）に播種し、ある期間（例えば、１２時間、または一晩）にわたってインキュベートする。次に、異なるＴ細胞タイプ（例えば、２つの異なるＴ細胞タイプ）をウェルに（例えば、エフェクターと標的（Ｅ：Ｔ）の比率が２０：１の比率で）追加し、ある期間（例えば、２４時間）にわたって共培養させる。最後に、（例えば、明視野および青色蛍光チャネルを使用して）プレートを走査して分析する。免疫複合体をコンフルエンス測定によって分析し、形質導入されていないＴ細胞の陰性対照と比較した。結果として、データプロットは、試験されたすべての標的細胞とエフェクター細胞の組み合わせについてＣＡＲ  Ｔ細胞の活性を表示した。イメージサイトメトリのプラットフォームを利用することで、エフェクター細胞と標的細胞間の相互作用を視覚的に確認できるため、精度の高いロバストな結果を得ることができる。従来の放出アッセイとは異なり、共培養アッセイ中に形成された免疫複合体を解析する能力は、エフェクター細胞の追加の重要な機能情報を提供できる。
【０１９７】
実施例３
トリプルネガティブ乳癌の二重特異性キメラ抗原受容体Ｔ細胞ファクトリ
トリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）は、臨床予後が不良の高悪性度の乳癌のサブタイプである。化学療法で治療している間の、高い再発率は新規のターゲティングされた療法の必要性を示している。免疫療法はＴＮＢＣのエキサイティングな治療法の選択肢を提示する。
【０１９８】
本明細書に記載される実施形態は、ＴＮＢＣ用の、免疫調節抗体を分泌するＣＡＲ  Ｔ細胞であるキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞ファクトリを、工学技術により作製することを含む。
【０１９９】
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞療法は、ＣＡＲの外因性発現によって患者のＴ細胞を、腫瘍細胞を殺傷するようにリダイレクトする。ＣＡＲは、抗体の抗原認識ドメインをＴ細胞受容体および共受容体の細胞内シグナル伝達ドメインに連結する、膜貫通型融合タンパク質である。固形腫瘍は、ＣＡＲ−Ｔ療法に特有の課題を提示する。血液癌とは異なり、腫瘍に関連する標的タンパク質は腫瘍と健康な組織の間で過剰発現し、その結果、オンターゲット／オフ腫瘍の、Ｔ細胞による健康な組織の殺傷が起こる。さらに、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）における免疫抑制は、腫瘍を死滅させるＣＡＲ−Ｔ細胞の活性化を制限する。
【０２００】
理論に縛られることを望まないが、ＴＮＢＣ上の２種類の抗原を標的とする二重特異性ＣＡＲは、オンターゲット／オフ腫瘍のＴ細胞による殺傷を軽減し、チェックポイント遮断抗体の分泌によって腫瘍微小環境での抑制を取り除く。局所的な免疫回復に続いて、ＣＡＲ−Ｔ細胞とＴＭＥ内の他の細胞は相乗的に作用して、腫瘍を縮小させおよび排除する。
【０２０１】
本発明者らの現在の研究では、ＣＡＲターゲティング部分として機能するように、ヒト一本鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を評価する。本発明者らは、インビトロで標的細胞を特異的に殺傷するためのｓｃＦｖの有効性を評価している。この研究では、本発明者らの二重特異性ＣＡＲの操作で使用されるリードｓｃＦｖを定義する。今後の研究では、ＴＮＢＣのヒト化マウスモデルでこの治療法を評価する予定である。
【０２０２】
実施例４
トリプルネガティブ乳癌の二重特異性ＣＡＲ  Ｔ細胞ファクトリ
トリプルネガティブ乳癌（ＴＮＢＣ）は、臨床予後が不良の高悪性度の乳癌のサブタイプである（１）。化学療法で治療している間の、高い再発率は新規のターゲティングされた療法の必要性を示している。免疫療法はＴＮＢＣのエキサイティングな治療法の選択肢を提示する。目標は、ＴＮＢＣ用の、免疫調節抗体を分泌するＣＡＲ  Ｔ細胞であるキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞ファクトリを、工学技術により作製することである（２）。固形腫瘍に対するＣＡＲは、オンターゲット／オフ腫瘍の殺傷および免疫抑制的腫瘍微小環境（ＴＭＥ、３）によって阻止される。理論に縛られることなく、ＴＮＢＣ上の２種類の抗原を標的とする二重特異性ＣＡＲは、オンターゲット／オフ腫瘍のＴ細胞による殺傷を軽減でき、チェックポイント遮断抗体の分泌によって、腫瘍微小環境での抑制を取り除くことができる。局所的な免疫回復に続いて、ＣＡＲ−Ｔ細胞とＴＭＥ内の他の細胞は相乗的に作用して、腫瘍を縮小させおよび排除できる。この治療法は、ＴＮＢＣのヒト化マウスモデルで評価される。
【０２０３】
目的：（１）ＣＡＲ−Ｔ細胞ターゲティングドメインとして、ＣＸＣＲ４認識一本鎖可変断片（ｓｃｆｖ）を評価し、（２）ヒト化マウスモデルにおけるＴＮＢＣ異種移植片の免疫浸潤を評価する。
【０２０４】
方法：
インビトロのＣＡＲ−Ｔによる殺傷
ＣＤ８＋Ｔ細胞はレンチウイルスを介してＣＡＲ遺伝子で形質導入された。安定した蛍光の、ＣＸＣＲ４形質導入された、ＴＮＢＣ細胞株を、ＣＡＲ  Ｔ細胞と共培養した。標的細胞は、Ｎｅｘｃｅｌｏｍ、Ｃｅｌｉｇｏイメージサイトメータを使用して数えられた。
【０２０５】
ヒト化マウスモデル
新生仔ＮＳＧ−ＳＧＭ３にヒト造血幹細胞を移植した。人為的な免疫系の生着は、１２〜２０週で確認された。４００万のＣＸＣＲ４形質導入ＴＮＢＣ細胞が乳房脂肪パッドに移植された。腫瘍の単一細胞懸濁液のフローサイトメトリー分析を行った。
【０２０６】
結論：２つのＣＸＣＲ４形質導入ＴＮＢＣ細胞株に対するさまざまな殺傷動態を有する、ＣＸＣＲ４を標的とする４つのＣＡＲが識別された。ＨＣＣ３８は、ヒト化マウスモデルで高度に免疫浸潤された異種移植片として同定された。
【０２０７】
その他の実施形態：
二重特異性ＣＡＲの開発
一実施形態では、標的細胞を殺傷するための第２の抗原に対して向けられたｓｃＦｖを評価することができる。別の実施形態では、二重特異性ＣＡＲを工学技術により作製することができる。次に、そのような二重特異性ＣＡＲ−Ｔファクトリの治療効果を試験することができる。
【０２０８】
マウスモデルの開発
一実施形態では、腫瘍および腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）のトランスクリプトーム分析を実施することができる。別の実施形態では、腫瘍微小環境のマルチパラメータＩＨＣを実施することができる。いくつかの実施形態では、浸潤は、第２の造血幹細胞（ＨＳＣ）ドナーで確認することができる。
【０２０９】
この実施例の参照文献：
１−Ｆｏｕｌｋｅｓ  ＷＤ，ｅｔ  ａｌ．（２０１０）Ｔｒｉｐｌｅ−ｎｅｇａｔｉｖｅ  ｂｒｅａｓｔ  ｃａｎｃｅｒ．Ｔｈｅ  Ｎｅｗ  Ｅｎｇｌａｎｄ  ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  ｍｅｄｉｃｉｎｅ．２０１０；３６３（２０）：１９３８−４８．
２−Ｓｕａｒｅｚ  ＥＲ，ｅｔ  ａｌ．（２０１６）Ｃｈｉｍｅｒｉｃ  ａｎｔｉｇｅｎ  ｒｅｃｅｐｔｏｒ  Ｔ  ｃｅｌｌｓ  ｓｅｃｒｅｔｉｎｇ  ａｎｔｉ−ＰＤ−Ｌ１  ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ  ｍｏｒｅ  ｅｆｆｅｃｔｉｖｅｌｙ  ｒｅｇｒｅｓｓ  ｒｅｎａｌ  ｃｅｌｌ  ｃａｒｃｉｎｏｍａ  ｉｎ  ａ  ｈｕｍａｎｉｚｅｄ  ｍｏｕｓｅ  ｍｏｄｅｌ．Ｏｎｃｏｔａｒｇｅｔ  ７（２３）：３４３４１−３４３５５．
３−Ｋｕｎｅｒｔ  Ａ，ｅｔ  ａｌ．（２０１８）Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ  Ｔ  ｃｅｌｌｓ  ｆｏｒ  ａｄｏｐｔｉｖｅ  ｔｈｅｒａｐｙ：  ｏｕｔｓｍａｒｔｉｎｇ  ｔｈｅ  ｔｕｍｏｒ．Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  ５１：１３３−１３９．
【０２１０】
実施例５
ＣＡＲ−Ｔによる殺傷
安定した蛍光の標的細胞株は、カルボキシル末端核局在化シグナルを有するｍＣａｒｄｉｎａｌを含むレンチウイルス構築物を用いた形質導入によって作製された。ｍＣａｒｄｉｎａｌ発現細胞は、フローサイトメトリーを使用して選別し、蛍光集団を濃縮した。アッセイウェルあたり３０００個の標的細胞をプレーティングした。
【０２１１】
ＣＡＲ−Ｔ細胞を作るために、健康なドナーからのＰＢＭＣからＣＤ８＋細胞を精製し、インターロイキン−２１およびＣＤ３／ＣＤ２８共刺激ビーズを含む培地で培養した。２４時間の培養後、Ｔ細胞を、指定のＣＡＲを含むレンチウイルスで形質導入した。５〜９日の培養後、ＣＡＲ−Ｔ細胞を、１０：１または２：１のＴ細胞（エフェクター）対標的（乳癌細胞株）で標的細胞と混合した。０、２４、および４８時間の時点で、Ｃｅｌｉｇｏイメージサイトメータを使用してアッセイを画像化し、蛍光標的細胞をカウントした。
【０２１２】
同等物
当業者であれば、ルーチンの実験以上のものを使用せずに、本明細書に具体的に記載された特定の物質および手順に対する多数の同等物を認識または確認できるであろう。そのような同等物は、本発明の範囲内であると考えられ、添付の特許請求の範囲に包含される。
【図１】
2021518104.tif 000003
【図２Ａ】
2021518104.tif 000004
【図２Ｂ】
2021518104.tif 000005
【図２Ｃ】
2021518104.tif 000006
【図２Ｄ】
2021518104.tif 000007
【図３】
2021518104.tif 000008
【図４】
2021518104.tif 000009
【図５】
2021518104.tif 000010
【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１Ａ】
2021518104.tif 000016
【図１１Ｂ】
2021518104.tif 000017
【図１１Ｃ】
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【図１１Ｄ】
2021518104.tif 000019
【図１１Ｅ】
2021518104.tif 000020
【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５−１】
2021518104.tif 000024
【図１５−２】
2021518104.tif 000025
【図１６】
2021518104.tif 000026
【図１７−１】
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【図１７−２】
2021518104.tif 000028
【図１７−３】
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【図１７−４】
2021518104.tif 000030
【図１７−５】
2021518104.tif 000031
【図１８】
2021518104.tif 000032
【図１９】
2021518104.tif 000033
【図２０−１】
2021518104.tif 000034
【図２０−２】
2021518104.tif 000035
【図２１】
2021518104.tif 000036
【図２２Ａ】
2021518104.tif 000037
【図２２Ｂ】
2021518104.tif 000038
【図２２Ｃ】
2021518104.tif 000039
【図２２Ｄ】
2021518104.tif 000040
【手続補正書】
【提出日】令和2年9月15日(2020.9.15)
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
2021518104000001.app
【国際調査報告】
2021518104.tif 000041
2021518104.tif 000042
2021518104.tif 000043
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