(57)【要約】  本発明は、哺乳動物において体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するために、ロイテリサイクリンまたはその類似体を使用するための方法を提供する。特に抗生物質または生体異物治療を受けている対象のために、体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するためのプロバイオティクスとしてロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌を使用するための方法も、本明細書に提供される。【選択図】なし【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒトもしくは他の哺乳動物において体重増加を抑制する、または体重増加を元に戻す方法であって、臨床的に認められた投与経路を使用して体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するために、治療上有効量のロイテリサイクリンを投与することを含む、方法。
【請求項２】
前記ヒトまたは他の哺乳動物が、抗生物質または生体異物で治療されている、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記治療上有効量のロイテリサイクリンが、抗生物質または生体異物と同時投与される、請求項１および２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項４】
前記生体異物が、抗精神病薬である、請求項２〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５】
前記抗精神病薬が、リスペリドン、クロザピン、オランザピン、クエチアピン、セルチンドール、およびリチウムからなる群から選択される、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記抗生物質が、アモキシシリン、アンピシリン、セファドロキシル、セファレキシン、クリンダマイシン、ロラカルベフ、メトロニダゾール、ペニシリン、スルフィソキサゾール、トリメトロプリム、アモキシシリン−クラブラン酸塩、アンピシリン−スルバクタム、アジスロマイシン、セフォキシチン、セフタジジム、セフトリアキソン、セファクロル、セフジニル、セフェピム、セフィキシム、セフォタキシム、セフポドキシム、セフプロジル、セフチブテン、セフロキシム、シプロフロキサシン、ドキシサイクリン、ゲンタマイシン、イミペネム、レボフロキサシン、リネゾリド、ピペラシリン−タゾバクタム、スルファメトキサゾール−トリメトプリム、トブラマイシン、バンコマイシン、マクロライド系抗生物質：アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、クロルテトラサイクリン、プロカイン、オキシテトラサイクリン、タイロシン、バシトラシン、硫酸ネオマイシン、ストレプトマイシン、エリスロマイシン、リノマイシン、オレアンドマイシン、バンコマイシン、ビルギナマイシン、およびバンベルマイシンから選択される、請求項２〜３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７】
投与様式が、経口である、請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
【請求項８】
ヒトもしくは他の哺乳動物において体重増加を抑制する、または体重増加を元に戻す方法であって、臨床的に認められた投与経路を使用して体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するために、治療上有効量のラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ  ｒｅｕｔｅｒｉｉ）のロイテリサイクリン産生株を投与することを含む、方法。
【請求項９】
前記ロイテリサイクリン産生株が、Ｌ．ロイテリＬＴＨ２５８４である、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記ヒトまたは他の哺乳動物が、抗生物質または生体異物で治療されている、請求項８〜９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
前記治療上有効量のロイテリサイクリンが、抗生物質または生体異物と同時投与される、請求項８〜１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記生体異物が、抗精神病薬である、請求項１０または請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記抗精神病薬が、リスペリドン、クロザピン、オランザピン、クエチアピン、およびセルチンドールからなる群から選択される、請求項１２に記載の方法。
【請求項１４】
前記抗生物質が、アモキシシリン、アンピシリン、セファドロキシル、セファレキシン、クリンダマイシン、ロラカルベフ、メトロニダゾール、ペニシリン、スルフィソキサゾール、トリメトロプリム、アモキシシリン−クラブラン酸塩、アンピシリン−スルバクタム、アジスロマイシン、セフォキシチン、セフタジジム、セフトリアキソン、セファクロル、セフジニル、セフェピム、セフィキシム、セフォタキシム、セフポドキシム、セフプロジル、セフチブテン、セフロキシム、シプロフロキサシン、ドキシサイクリン、ゲンタマイシン、イミペネム、レボフロキサシン、リネゾリド、ピペラシリン−タゾバクタム、スルファメトキサゾール−トリメトプリム、トブラマイシン、バンコマイシン、マクロライド系抗生物質：アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、クロルテトラサイクリン、プロカイン、オキシテトラサイクリン、タイロシン、バシトラシン、硫酸ネオマイシン、ストレプトマイシン、エリスロマイシン、リノマイシン、オレアンドマイシン、バンコマイシン、ビルギナマイシン、およびバンベルマイシンから選択される、請求項１０または請求項１１に記載の方法。
【請求項１５】
投与様式が、経口である、請求項８に記載の方法。
【請求項１６】
ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４の溶解物。
【請求項１７】
ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４、または請求項１６に記載の溶解物と、医薬的に許容される担体と、を含む、医薬組成物。
【請求項１８】
Ｌ．ロイテリＬＴＨ２５８４以外の菌株のプロバイオティック細菌、またはその溶解物をさらに含む、請求項１７に記載の医薬組成物。
【請求項１９】
ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４が、前記組成物の総重量に基づいて、１グラムあたり少なくとも１，０００，０００コロニー形成単位の量で前記組成物中に存在する、請求項１７または１８に記載の医薬組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本特許出願は、２０１８年７月１６日に出願された米国仮特許出願第６２／６９８，６０１号の優先権の利益を主張しており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０００２】
連邦政府による資金提供を受けた研究開発の記載
該当せず。
【背景技術】
【０００３】
抗生物質および抗精神病薬を含む様々な薬の使用に伴う過度の体重増加は、健康全般への影響を考えると重要な問題である。望ましくない体重増加および代謝の変化は、患者が治療計画に従わない最も一般的な理由の一部であり、最終的には治療の失敗につながる。したがって、腸内微生物叢の変化に関連する体重増加を抑制または元に戻すためのより効果的な組成物および方法を特定および開発することが望ましいであろう。
【発明の概要】
【０００４】
第１の態様では、本明細書で提供されるのは、ヒトまたは他の哺乳動物の体重増加を抑制する、または体重増加を元に戻す方法である。この方法は、臨床的に認められた投与経路を使用して、体重増加を減少させる、または体重減少を誘発するために、治療上有効量のロイテリサイクリンを投与することを含むか、または本質的にそれからなり得る。ヒトまたは別の哺乳類は、抗生物質または生体異物で治療されている。治療上有効な量のロイテリサイクリンは、抗生物質または生体異物と同時投与することができる。生体異物は、抗精神病薬とすることができる。抗精神病薬は、リスペリドン、クロザピン、オランザピン、クエチアピン、セルチンドール、およびリチウムからなる群から選択することができる。抗生物質は、アモキシシリン、アンピシリン、セファドロキシル、セファレキシン、クリンダマイシン、ロラカルベフ、メトロニダゾール、ペニシリン、スルフィソキサゾール、トリメトロプリム、アモキシシリン−クラブラン酸塩、アンピシリン−スルバクタム、アジスロマイシン、セフォキシチン、セフタジジム、セフトリアキソン、セファクロル、セフジニル、セフェピム、セフィキシム、セフォタキシム、セフポドキシム、セフプロジル、セフチブテン、セフロキシム、シプロフロキサシン、ドキシサイクリン、ゲンタマイシン、イミペネム、レボフロキサシン、リネゾリド、ピペラシリン−タゾバクタム、スルファメトキサゾール−トリメトプリム、トブラマイシン、バンコマイシン、マクロライド系抗生物質：アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、クロルテトラサイクリン、プロカイン、オキシテトラサイクリン、タイロシン、バシトラシン、硫酸ネオマイシン、ストレプトマイシン、エリスロマイシン、リノマイシン、オレアンドマイシン、バンコマイシン、ビルギナマイシン、およびバンベルマイシンとすることができる。投与様式は、経口とすることができる。
【０００５】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、ヒトまたは他の哺乳動物の体重増加を抑制する、または体重増加を元に戻す方法である。この方法は、臨床的に認められた投与経路を使用して、体重増加を減少するかまたは体重減少を誘発するために、治療上有効量のラクトバチルス・ロイテリのロイテリサイクリン産生株を投与することを含むか、または本質的にそれからなり得る。ロイテリサイクリン産生株は、Ｌ．ロイテリＬＴＨ２５８４である可能性がある。ヒトまたは他の哺乳動物は、抗生物質または生体異物による治療を受けている可能性がある。治療上有効な量のロイテリサイクリンは、抗生物質または生体異物と同時投与することができる。生体異物は抗精神病薬である可能性がある。抗精神病薬は、リスペリドン、クロザピン、オランザピン、クエチアピン、およびセルチンドールからなる群から選択することができる。抗生物質は、アモキシシリン、アンピシリン、セファドロキシル、セファレキシン、クリンダマイシン、ロラカルベフ、メトロニダゾール、ペニシリン、スルフィソキサゾール、トリメトロプリム、アモキシシリン−クラブラン酸塩、アンピシリン−スルバクタム、アジスロマイシン、セフォキシチン、セフタジジム、セフトリアキソン、セファクロル、セフジニル、セフェピム、セフィキシム、セフォタキシム、セフポドキシム、セフプロジル、セフチブテン、セフロキシム、シプロフロキサシン、ドキシサイクリン、ゲンタマイシン、イミペネム、レボフロキサシン、リネゾリド、ピペラシリン−タゾバクタム、スルファメトキサゾール−トリメトプリム、トブラマイシン、バンコマイシン、マクロライド系抗生物質：アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、クロルテトラサイクリン、プロカイン、オキシテトラサイクリン、タイロシン、バシトラシン、硫酸ネオマイシン、ストレプトマイシン、エリスロマイシン、リノマイシン、オレアンドマイシン、バンコマイシン、ビルギナマイシン、およびバンベルマイシンとすることができる。投与様式は、経口とすることができる。
【０００６】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４またはその溶解物を含む医薬組成物である。医薬組成物は、Ｌ．ロイテリＬＴＨ２５８４以外の菌株のプロバイオティック細菌、またはその溶解物、および医薬的に許容される担体をさらに含むことができる。ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４は、組成物の総重量に基づいて、グラムあたり少なくとも１，０００，０００コロニー形成単位の量で組成物中に存在することができる。
【０００７】
さらなる態様では、本明細書に提供されるのは、ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４の溶解物である。
【図面の簡単な説明】
【０００８】
【図１】リスペリドン処置マウスでは、ラクトバチルス・ロイテリが選択的に枯渇していることを示している。糞便ＤＮＡからのショットガンメタゲノムシーケンスデータ（ＭｉＳｅｑ、２ｘ２５０、高収率）をＡｎｖｉ’ｏ視覚化プラットフォームで分析した。細菌ゲノムは、属または種レベルのいずれかに洗練され、遺伝子の類似性によってリング内のスライスとして順序付けられた（Ｈｉｄｄｅｎ  Ｍａｒｋｏｖ  Ｍｏｄｅｌによる階層的クラスタリング）。リスペリドン処置後に濃縮されたメタゲノム群は、対照（青）と比較して示されている（赤）。
【図２Ａ】図２は、ロイテリサイクリン産生株ＬＴＨ２５８４を補給すると、マウスの体重増加が抑制されることを示す。実験計画：Ｃ５７Ｂｌ／６Ｊ雌マウスは６週齢で到着し、２週間施設に順応させた（ｎ＝１０／群）。ベースラインの糞便は、内臓脂肪組織が採取された１５週間まで１日おきに収集された。
【図２Ｂ】対照動物（青）、ロイテリサイクリンを産生するＬ．ロイテリを受ける動物（緑）、またはロイテリサイクリンを産生するＬ．ロイテリ＋リスペリドンを受ける動物（マゼンタ）、またはロイテリサイクリンを産生することができないＬ．ロイテリ＋リスペリドンを受ける動物（赤）の体重増加が示されている。
【図２Ｃ】内臓脂肪パッドを各マウスから６４日目に解剖し、体重を測定し、定量化した。色分けは、図２Ｂの上記と同じである。ロイテリサイクリンを産生することができるＬ．ロイテリも受けたリスペリドン処置マウスからの脂肪パッドは、リスペリドン処置のみを受けた動物と比較して有意に減少した（Ｗｉｌｃｏｘｏｎ、＊ｐ＜０．０５）。
【図３】ランダムフォレストモデルは、主要分類群の変化に基づいて、オランザピン処置マウスならびにリスペリドンを分類する。
【図４】リスペリドン、ロイテリサイクリン、プロバイオティクス処置マウスの実際の体重増加に対する線形モデル（ＬＭ）予測。ランダム化されたトレーニングセットの動物は、黒で示され、テストセットの動物は、青で示されている。参考までに、最適な線（灰色の実線）およびｙ＝ｘの線（黒、破線）がある。スピアマンの順位相関を実行して、予測された重みの有意性を決定した（ｐ＝０．０００７４８）。
【図５】線形モデル（ＬＭ）は、オランザピン処置動物の体重増加を予測する（ｐ＜０．００００１）。
【図６】プロバイオティクス処置動物に見られるアッカーマンシア・ムシニフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ）のユニークな遺伝子の検出は、治療効果のＰＣＲベースのテストに適合させることができる。
【発明を実施するための形態】
【０００９】
本明細書で提供される組成物および方法は、少なくとも部分的に、ラクトバチルス・ロイテリのいくつかの菌株によって産生される低分子量抗菌剤であるロイテリサイクリンという本発明者らの驚くべき発見に基づいている。本発明は、哺乳動物において体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するために、ロイテリサイクリンまたはその類似体を使用するための方法を提供する。特に抗生物質または生体異物治療を受けている対象のために、体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するためのプロバイオティクスとしてロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌を使用するための方法も本明細書に提供される。人間の胃腸（ＧＩ）管に生息する微生物は、微生物の不在下での代謝の変化（すなわち、無菌（ＧＦ）動物）または微生物の摂動（すなわち、抗生物質治療または食事の調節）によって証明されるように、生体異物処理に関与している。特定の理論または作用機序に拘束されることなく、ロイテリサイクリン、その類似体、またはロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリの補給は、特に抗生物質または医薬品による治療を受けている対象において、有益な体重減少を誘発および／またはサポートし得ると考えられている。それは代謝を変化させ、体重増加または肥満に関連している。
【００１０】
したがって、第１の態様では、本明細書で提供されるのは、対象において体重増加を減少または元に戻す方法、または体重減少を誘発する方法である。この方法は、体重増加を阻害または元に戻すために有効量のロイテリサイクリンを患者に投与するステップを含むか、または本質的にそれからなる。本明細書において、「ロイテリサイクリン」という用語は、ラクトバチルス・ロイテリの特定の菌株によって産生され、それらから単離された、高度に疎水性の荷電テトラミン酸分子を指す。溶液中の主な互変異性体を参照すると、ロイテリサイクリンは、（５Ｒ）−１−（２−デセノイル）−２−ヒドロキシ−３−アセチル−５−イソブチル−Δ２−ピロリン−４−オン、Ｎ−アシル化テトラミン酸である。Ｎ−アルキルロイテリサイクリン類似体は、グラム陽性病原菌に対する活性およびロイテリサイクリンの他の機能特性を保持することが示されている。例えば、Ｙｅｎｄａｐａｌｌｙら、Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．５１、１４８７−１４９１（２００８）、Ｈｕｒｄｌｅら、Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ．５３，４０２８−４０３１（２００９）を参照。
【００１１】
場合によっては、この方法は、臨床的に認められた投与経路を使用して、体重増加を抑制する、または体重減少を誘発するために、治療上有効量のロイテリサイクリンを投与することを含む。
【００１２】
場合によっては、対象は、体重増加が既知の副作用である医薬品を含む、抗生物質または生体異物で治療されている。場合によっては、ロイテリサイクリンは、ロイテリサイクリンが投与される対象の非病的腸内細菌叢を保存するために、そのような抗生物質または生体異物の投与と同時（例えば、連続的または同時に）または投与後に投与することもできる。
【００１３】
本明細書において、「生体異物（xenobiotic）」という用語は、その生物の正常な代謝に外因性である、生物（例えば、ヒト、非ヒト哺乳動物）が曝露される化合物を指す。この用語には、合成薬物、低分子化合物、自然毒、食品添加物、環境汚染物質、抗生物質、および他の医薬品が含まれる。
【００１４】
本明細書において、「抗生物質」という用語は、感染性細菌および真菌などの特定の微生物を殺傷し、その増殖を阻害することができる化学療法物質を指す。抗生物質は、その作用機序（すなわち、細胞膜、細胞壁、または代謝上にある場合）、化学構造、活性のスペクトル（すなわち、グラム陰性菌またはグラム陽性菌を標的とする場合）、または投与様式（経口、静脈内、または局所）に基づいて分類される。
【００１５】
本明細書において、「抑制する（reducing）」という用語は、抗生物質または生体異物薬によって誘発されるか、またはそれらに関連する患者の体重増加の予防または抑制における成功の兆候を指す。体重増加の予防または抑制は、身体検査の結果などの客観的なパラメータに基づいて測定することができる。
【００１６】
本明細書において、「元に戻す（reversing）」という用語は、ロイテリサイクリンまたはその類似体の投与前に確立された抗生物質または生体異物に関連する体重減少を引き起こすことにおける成功の兆候を指す。すでに増加した体重の減少は、身体検査の結果などの客観的なパラメータに基づいて測定することができる。
【００１７】
投薬を受けている患者の体重増加に関連することが知られている医薬品には、抗生物質、抗精神病薬（例、リスペリドン、ハロペリドール、オランザピン、クロザピン、クエチアピン、セルチンドール、およびリチウム）、抗うつ薬（例、アミトリプチリン、パロキセチン、およびセルトラリン）、経口コルチコステロイド、ならびに糖尿病および前糖尿病（例えば、耐糖能障害の前糖尿病状態）またはそれに関連する合併症を治療するための薬物が含まれるが、これらに限定されない。場合によっては、本明細書で提供される方法および組成物は、リスペリドンまたはベンズイソキサゾール誘導体の化学クラスに属する別の非定型抗精神病薬などの抗精神病薬を服用している対象の体重増加を抑制するかまたは体重増加を元に戻すのに特に有利である。リスペリドンは、抗精神病薬を受けているマウスの腸内微生物叢を変化させ、非好気性の安静時代謝を抑制することが示されている（Ｂａｈｒ  ｅｔ  ａｌ．，ＥＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅ  ２：１７２５−１７３４（２０１５））。特に、Ｂａｈｒらは、リスペリドン処置が腸内微生物叢で観察された分類群の全体的な抑制をもたらし、嫌気性条件下での生物の成長を選択的に抑制したことを示した。体重増加を引き起こすことが知られている他の抗精神病薬には、クエチアピン（セロクエル）、パリペリドン（インヴェガ）、イロペリドン（ファナプト）、オランザピン（ジプレキサ）、アセナピン（サフリス）、ルラシドン（ラツーダ）が含まれるが、これらに限定されない。
【００１８】
家畜の体重増加を引き起こすことが知られており、動物飼料に使用される抗生物質には、クロルテトラサイクリン、プロカイン、ペニシリン、オキシテトラサイクリン、タイロシン、バシトラシン、ネオマイシン硫酸塩、ストレプトマイシン、エリスロマイシン、リノマイシン、オレアンドマイシン、バージナマイシン、およびバンベルマイシンが含まれるが、これらに限定されない。
【００１９】
マウスの体重増加を誘発することが知られている抗生物質には、クロルテトラサイクリン、ペニシリン、バンコマイシン、ペニシリンとバンコマイシンとの組み合わせ、ストレプトマイシン、およびシプロフロキサシンが含まれるが、これらに限定されない。
【００２０】
以下の抗生物質（カテゴリ別にリストされている）は、ヒトの体重増加と相関している。これらの関連性は、臨床試験では確立されていないが、成人または小児の抗生物質への曝露、およびレシピエントが後年に肥満を発症するリスクに関連している。長期または単回投与のいずれかでリストされている抗生物質のいずれかを服用すると、肥満を発症するリスクが１０〜１５％増加する。狭スペクトル抗生物質：アモキシシリン、アンピシリン、セファドロキシル、セファレキシン、クリンダマイシン、ロラカルベフ、メトロニダゾール、ペニシリン、スルフィソキサゾール、トリメトロプリム。広域抗生物質：アモキシシリン−クラブラン酸塩、アンピシリン−スルバクタムアジスロマイシン、セフォキシチン、セフタジジム、セフトリアキソン、セファクロル、セフジニル、セフェピム、セフィキシム、セフォタキシム、セフポドキシム、セフプロジル、セフチブテン、セフロキシム、セフロキシム、ピペラシリン−タゾバクタム、スルファメトキサゾール−トリメトプリム、トブラマイシン、バンコマイシン。マクロライド系抗生物質：アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン。
【００２１】
本明細書において、「肥満」は、それが健康に悪影響を与える可能性がある程度まで過剰な体脂肪が蓄積した病状を意味する。体脂肪の１つの測定値は、体重および身長を比較する測定値であるボディマス指数（ＢＭＩ）であり、肥満を、１ｍ２（身長２）あたり３０ｋｇ（体重）を超えると定義している。肥満は、様々な疾患、特に心臓病および２型糖尿病（Ｔ２Ｄ）の可能性を高める。
【００２２】
本発明の方法は、薬物誘発性の体重増加を含む体重増加を抑制または元に戻す。これを達成するのに適切なロイテリサイクリンまたはロイテリサイクリン類似体の量は、「治療上有効量」として定義される。本明細書において、「治療上有効量」は、障害、状態、または疾患を治療するために対象に投与された場合、障害、または状態、または疾患のそのような治療を行うのに十分な化合物または組成物の量を意味する。「治療上有効量」は、化合物または組成物、治療される障害、状態または疾患、重症度または障害、または治療される状態または疾患、対象の年齢および相対的健康、投与の経路および形態、主治医または獣医の判断、ならびに他の要因によって変動するだろう。この使用に有効な投与スケジュールおよび量、すなわち「投与計画」は、患者が使用している薬剤の種類、すでに発生した医薬品による体重増加の量、患者の体調、対象の年齢および相対的な健康状態、投与の経路および形態、主治医または獣医の判断、ならびに他の要因など、様々な要因によって異なる。患者の投与計画を計算する際には、投与様式も考慮される。
【００２３】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、適切な量のロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌を含むプロバイオティクス組成物、ならびに開示されたプロバイオティクス組成物を使用して、ヒト、馬、ラット、マウス、反芻動物、霊長類、サル、ハムスター、ウサギ、猫などのヒトおよび非ヒト哺乳動物において体重増加の抑制を誘発および維持するための方法である。本明細書において、「プロバイオティクス」という用語は、胃腸管における個体の微生物バランスを改善することによって、ヒト宿主を含む動物に有益に影響を与える生または死の微生物食品サプリメント、例えば、ラクトバチルス・ロイテリおよび他のラクトバチルスアシドフィルスを指す。つまり、プロバイオティクス微生物は、経口摂取したときに動物の消化器系細菌を変化させるのに役立つ。例えば、プロバイオティクス微生物は、経口摂取すると、宿主の胃腸管内の適切なバクテロイデス菌の集団を維持または増加させる。対象の胃腸管における適切なロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌の確立および増殖の成功は、特にヒトにおいて、有益な体重増加の抑制を誘発および／または支持し得ると考えられている。プロバイオティクス微生物は、経口摂取が中止された後でも、かなりの期間、消化器系で有効なままである。
【００２４】
ラクトバチルス・ロイテリは、ヒト、ラット、ブタ、ニワトリなどの脊椎動物の胃腸管に見られる数少ない内因性ラクトバチルス種の１つである。本明細書で提供される組成物および方法に好適なラクトバチルス・ロイテリのロイテリサイクリン産生株には、ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４、ラクトバチルス・ロイテリＴＭＷ１．１０６、ラクトバチルス・ロイテリ１．１１２、およびラクトバチルス・ロイテリ１．６５６が含まれるが、これらに限定されない。これらの菌株はそれぞれ、１９８８年、１９９４年、および１９９８年に同じ工業用サワードウから分離され、継続的な繁殖によって維持されてきた。好ましい実施形態において、ロイテリサイクリン産生細菌は、Ｌ．ロイテリＬＴＨ２５８４である。
【００２５】
また、本明細書には、ロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌またはその溶解物を含むプロバイオティック医薬組成物を投与する方法が提供される。そのような場合、本発明によるプロバイオティック細菌またはそれらの溶解物は、臨床使用のための医薬組成物として製剤化され得、かつ医薬的に許容される担体、希釈剤、またはアジュバントを含み得る。本明細書において、「溶解物」は、溶解を受けたプロバイオティクス細菌のサンプルを指す。溶解物は、本明細書に記載の方法において有用なプロバイオティクス細菌の１つ以上の可溶性代謝産物を含み得る。溶解は、例えば浸透圧剤または酵素の細菌への添加による化学的または物理的破壊によって、または例えば音波破壊による物理的圧力の適用によって起こり得る。溶解物は、プロバイオティクス細菌の細胞内容物を含む混合物であり得る。例えば、細胞壁または細胞膜の断片の１つ以上、タンパク質、核酸、炭水化物、および細胞小器官（破壊または無傷）。溶解物は、例えば水性媒体に懸濁することができる。
【００２６】
場合によっては、ロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌は、ロイテリサイクリン産生Ｌ．ロイテリが投与される対象において非病原性腸内細菌叢を維持するために、抗生物質または生体異物を必要とする対象に同時投与されるか、またはその投与後に投与される。
【００２７】
場合によっては、ロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ菌は、食品、人および動物のための医薬品、ならびに原料において、プロバイオティクスとして提供される。好ましくは、そのようなプロバイオティックロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ細菌は、適切なビヒクル（担体）と共に単独で、またはヒトまたは動物（例えば、家畜、家庭用ペット）の消費に好適な食品または他の組成物への添加剤として使用される。つまり、ロイテリサイクリン産生ラクトバチルス・ロイテリ菌は、プロバイオティクス細菌を含まない食品（これらの製品にもプロバイオティクス価値を与える目的で）と、すでにいくつかのプロバイオティクス細菌を含む食品（それらのプロバイオティクス価値を高めるおよび／または完了する目的）とに添加され得るので有用である。本明細書において、家畜には、ブタ、ウシ、ウマ、ヤギ、ヒツジなどが含まれ、家禽には、鶏肉などの家禽が含まれ、ペットには犬、猫などが含まれる。
【００２８】
本開示の目的のために、「治療すること」または「治療」という用語は、疾患、状態、または障害と闘うことを目的とした患者の管理およびケアを説明する。これらの用語は、予防的、すなわち予防的治療および緩和的治療の両方を包含する。治療には、症状または合併症の発症を予防するため、症状または合併症を軽減するため、または疾患、状態、または障害を排除するために、本明細書に記載の組成物の投与が含まれる。
【００２９】
本明細書において、「対象」は、記載された治療が意図される動物または患者を指す。例えば、本明細書で提供される方法に従って治療される対象は、例示であり、限定されないが、げっ歯類（例えば、マウス、ラット、モルモット）、ウサギ目（例えば、ウサギ、ウサギ）、奇蹄目（例えば、馬、ロバなど）、偶蹄目（例えば、豚、牛、羊）、肉食動物（例えば、猫、犬）、霊長類（例えば、類人猿、猿、ヒヒ、ヒト）、げっ歯類（例えば、マウス、ラット）、または霊長類（例えば、サル、ヒヒ、ヒト）のメンバーを含む哺乳動物である。例示的な実施形態では、対象はヒトである。「対象」という用語は、特定の年齢または性別を示すものではない。「それを必要とする対象」とは、治療を必要とする疾患または状態と診断された動物またはヒトの対象を意味する。
【００３０】
対象への任意の適切な経路または投与様式を、本明細書で提供される方法に従って使用することができる。例示的な実施形態では、ロイテリサイクリンまたはロイテリサイクリン産生細菌は、本明細書に記載の障害（例えば、体重増加）を治療および／または予防するために、医薬組成物として有効量で対象に投与される。場合によっては、医薬組成物は、ラクトバチルス・ロイテリＬＴＨ２５８４株のプロバイオティクス細菌を含む。場合によっては、プロバイオティクス細菌は溶解物の形で提供されることがある。場合によっては、プロバイオティクス細菌の溶解物を濾過ステップの精製に供して、細菌増殖培地または汚染物質などの他の成分を除去することができる。
【００３１】
本明細書において、「医薬組成物」という用語は、本明細書に記載の１つ以上の化合物、またはその医薬的に許容される塩と、生理学的に許容される担体および賦形剤などの他の化学成分との混合物を指す。医薬組成物の１つの目的は、生物への化合物の投与を容易にすることである。本明細書において、「医薬的に許容される担体」は、生物に重大な刺激を引き起こさず、投与された化合物の生物学的活性および特性を無効にしない担体または希釈剤を指す。「医薬的に許容される塩」とは、遊離塩基の生物学的有効性および特性を保持し、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸、リンゴ酸、マレイン酸、コハク酸、酒石酸、クエン酸などの無機または有機酸との反応によって得られる塩を指す。
【００３２】
本開示の医薬的に活性な組成物および剤形には、開示された医薬的に許容される塩、またはその医薬的に許容される多形、溶媒和物、水和物、脱水、共結晶、無水、またはアモルファス形態が含まれる。開示された化合物の特定の塩には、ナトリウム、リチウム、カリウム塩、およびそれらの水和物が含まれるが、これらに限定されない。医薬的に許容される塩およびそれらの調製および使用の方法の追加の例は、参照により本明細書に組み込まれるＨａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓａｌｔｓ：Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ、ａｎｄ  Ｕｓｅ（２００２）に提示されている。場合によっては、組成物は、それを必要とする対象に投与単位の形態で投与することができ、各個別の投与単位は、場合によっては医薬的に許容される担体と共に投与されたときに望ましい治療効果を引き出すように計算された所定量の活性成分または化合物を含む。本明細書において、「医薬的に許容される担体」という用語は、使用される投薬量および濃度でレシピエントに対して無毒である担体、賦形剤または安定化剤を言い、リン酸塩、クエン酸塩、および他の有機酸などの緩衝液；アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤；保存料（オクタデシジメチルベンジルアンモニウムクロリド；ヘキサメトニウムクロリド；ベンザルコニウムクロリド、ベンゼトニウムクロリド；フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール；メチルまたはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３−ペンタノール；およびｍ−クレゾールなど）；低分子量（約１０残基未満）のポリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン、免疫グロブリンなどのタンパク質；ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー；グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、またはリジンなどのアミノ酸；単糖、二糖、およびグルコース、マンノース、またはデキストリンを含む他の炭水化物；ＥＤＴＡなどのキレート剤；ショ糖、マンニトール、トレハロースまたはソルビトールなどの糖；ナトリウムなどの塩形成対イオン；金属錯体（例えば、Ｚｎ−タンパク質複合体）；および／またはＴＷＥＥＮ（登録商標）、ＰＬＵＲＯＮＩＣ（登録商標）またはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの非イオン性界面活性剤、を含む。インビボ投与に使用される製剤は、無菌でなければならない。これは、滅菌濾過膜による濾過によって容易に達成される。
【００３３】
プロバイオティクスの場合、プロバイオティクス細菌が対象の胃腸管内に到着するまでプロバイオティクス細菌を保護および保存するために、医薬的に許容される担体が特に重要である。
【００３４】
治療上有効な用量を決定するために、インビトロアッセイ（例えば、細胞培養）または実験動物において、化合物（例えば、ロイテリサイクリンまたはその類似体）の毒性および治療効果を評価することが有利であり得る。例えば、ＬＤ５０（すなわち、母集団の５０％に致死量）およびＥＤ５０（すなわち、母集団の５０％で治療上有効な用量）を決定することができる。これらの計算から、ヒトで使用するための投与量範囲を定式化することができる。投与量の範囲は、投与様式などの要因によって異なる。本明細書で提供される医薬組成物の治療上有効量は、対象の体重１ｋｇあたり約０．００１〜１００ｍｇの有効成分の範囲であり得る（例えば、約０．００１〜１００ｍｇ／ｋｇ体重、約０．１〜４０ｍｇ／ｋｇ体重、約１〜２０ｍｇ／ｋｇ体重）。場合によっては、医薬組成物の適切な用量は、組成物が投与される対象の身長および体重を使用して計算された、対象の体表面積に従って決定することができる。そのような場合、用量は、ｍ２あたりの組成物の特定の量として提供することができる（例えば、ｍｇ／ｍ２）。他の場合において、本明細書で提供される組成物に適切な投薬量および投薬量範囲は、薬物動態データ（すなわち、薬物代謝およびクリアランス）を使用して決定することができる。本明細書において、「薬物動態」は、薬物または医薬組成物が吸収され、分配され、代謝され、かつ体から排泄されるプロセスを指す。投与量の計算に関する追加情報は、Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｄｒｕｇ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ  Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ（２００２）、成人の健康なボランティアの治療薬の臨床試験における安全な開始用量の推定、米国食品医薬品局、ロックビル、メリーランド、米国に見出される。
【００３５】
上記のように、治療上有効な用量レベルは多くの要因に依存する。さらに、比較的低レベルで活性組成物の投与を開始し、所望の効果が達成されるまで投与量を増加させることは、当業者の技術の範囲内である。本明細書で提供される方法の有効性は、任意の適切な方法を使用して決定することができる。例えば、体重増加は、体脂肪率を測定する体重計および器具を含む、当技術分野で知られているいくつかの客観的で標準的な器具のいずれかを用いて決定および評価することができる。体重計の単純な器具は、すべての専門医療従事者によって日常的に使用されている。体脂肪率を測定するためのより洗練された機器は、皮膚のひだの方法論および体密度または電気抵抗の測定に基づいて動作する。
【００３６】
製剤は、単回（単位）用量のプロバイオティクス細菌またはその溶解物を含み得る。プロバイオティック細菌（無傷または溶解された）の好適な用量は、１０４〜１０１２の範囲のコロニー形成単位（ｃｆｕ）であり得、例えば、１０４〜１０１０、１０４〜１０８、１０６〜１０１２、１０６〜１０１０、または１０６〜１０８ｃｆｕのちの１つであり得る。いくつかの実施形態において、用量は、１日１回または２回投与され得る。
【００３７】
本開示の化合物の医薬単位剤形は、患者への経口、粘膜（例えば、鼻、舌下、膣、頬、または直腸）、非経口（例えば、ボーラス注射）、局所、または経皮投与に好適である。剤形の例には、錠剤；カプレット；硬ゼラチンカプセルおよび軟ゼラチンカプセルなどのカプセル；カシェ；トローチ（ｔｒｏｃｈｅｓ）；トローチ（ｌｏｚｅｎｇｅｓ）；分散剤；坐剤；軟膏；カタプラズマ（湿布）；ペースト；粉末；ドレッシング；クリーム；絆創膏；溶液；パッチ；エアロゾル（例えば、点鼻薬または吸入器）；ゲル；懸濁液（例えば、水性または非水性液体懸濁液、水中油型エマルジョン、または油中水型液体エマルジョン）、溶液、およびエリキシルを含む、患者への経口または粘膜投与に好適な液体剤形；患者への非経口投与に好適な液体剤形；患者への非経口投与に好適な液体剤形を提供するために再構成することができる無菌固体（例えば、結晶性またはアモルファス固体）が含まれるが、これらに限定されない。医薬組成物は、従来の製薬慣行に従って製剤化され得る（例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，２０ｔｈ  ｅｄｉｔｉｏｎ，２０００，ｅｄ．、Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ  Ｗｉｌｌｉａｍｓ＆Ｗｉｌｋｉｎｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ａｎｄ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ｅｄｓ．、Ｊ．Ｓｗａｒｂｒｉｃｋ  ａｎｄ  Ｊ．Ｃ．Ｂｏｙｌａｎ，１９８８−１９９９，Ｍａｒｃｅｌ  Ｄｅｋｋｅｒ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋを参照）。
【００３８】
本開示の組成物の組成物、形状、および剤形のタイプは、通常、それらの用途に応じて変化するであろう。例えば、疾患または障害の急性治療に使用される剤形は、同じ疾患または障害の慢性治療に使用される剤形よりも大量の活性成分、例えば、開示された化合物またはそれらの組み合わせを含み得る。同様に、非経口剤形は、同じ疾患または障害を治療するために使用される経口剤形よりも少量の有効成分を含み得る。本開示に含まれる特定の剤形が互いに異なるこれらおよび他の方法は、当業者には容易に明らかであろう。例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、第１８版、Ｍａｃｋ  Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ、Ｅａｓｔｏｎ、ＰＡ（１９９０）を参照。
【００３９】
臨床医、医師、および他の医療専門家は、本明細書で提供される方法に従って、それを必要とする対象に組成物を投与することができる。場合によっては、組成物の単回投与で十分な場合がある。他の場合において、組成物の複数回の投与は、様々な間隔で（例えば、週に１回、週に２回、毎日、毎月）、または他の適切な治療計画に従って行われる。治療期間は、本明細書で提供される組成物の投与が対象によって許容される限り、単回投与または定期的な複数回投与であり得る。
【００４０】
本発明が説明される前に、本発明は、記載された特定の方法論、プロトコル、および試薬に限定されず、これらは変化し得ることが理解される。本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的としており、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定することを意図するものではないこともまた理解されるべきである。
【００４１】
明細書および特許請求の範囲において、「含む」および「含む」という用語は、制限のない用語であり、「含むが、これらに限定されない」を意味すると解釈されるべきである。これらの用語には、「本質的にからなる」および「からなる」というより限定的な用語が含まれる。
【００４２】
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用されるように、単数形「１つ（ａ）」、「１つ（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈が明確に別段の指示をしない限り、複数形の参照を含む。同様に、「１つ（ａ）」（または「１つ（ａｎ）」）、「１つ以上」および「少なくとも１つ」という用語は、本明細書では交換可能に使用することができる。「含むこと（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含むこと（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「によって特徴付けられる」、および「有する」という用語は、交換可能に使用できることにも留意されたい。
【００４３】
「含むこと」、「そのような」、「例えば」などの用語は、例示的な実施形態を指すことを意図しており、本開示の範囲を限定するものではない。
【００４４】
別段の定義がない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載されているものと類似のまたは同等のいかなる方法および材料も本発明の実施またはテストに使用することができるが、好ましい方法および材料をここで説明する。本明細書で言及されるすべての刊行物は、本発明に関連して使用される可能性のある刊行物で報告される化学物質、細胞株、ベクター、動物、器具、統計分析、および方法論を説明および開示する目的で参照により本明細書に組み込まれる。本明細書で引用されるすべての参考文献は、当業者のレベルを示すものとして解釈されるべきである。本明細書中のいかなるものも、本発明が先行発明のおかげでそのような開示に先行する権利がないことを認めるものと解釈されるべきではない。
【００４５】
本発明のこれらおよび他の特徴、目的および利点は、以下の説明からよりよく理解されるようになるであろう。説明において、本明細書の一部を形成し、例示として本発明の好ましい実施形態が示されている添付の図面を参照する。好ましい実施形態の説明は、本発明をすべての修正、同等物、および代替物を網羅するように限定することを意図するものではない。したがって、本発明の範囲を解釈するために、本明細書に列挙された特許請求の範囲を参照されるべきである。
【実施例】
【００４６】
以下の実施例は、例示のみを目的として提供されており、本発明の範囲を限定することを意図するものではない。実際、本明細書に示され、説明されたものに加えて、本発明の様々な修正は、前述の説明および以下の例から当業者に明らかになり、添付の特許請求の範囲に含まれる。
【００４７】
例１−体重増加に対するリスペリドン治療の効果
ラクトバチルス・ロイテリがリスペリドン処置マウスで選択的に枯渇しているかどうかを判断するために、Ｃ５７ｂｌ／６Ｊ雌性マウスをリスペリドンで６０日間処置した。糞便ＤＮＡからのショットガンメタゲノムシーケンスデータ（ＭｉＳｅｑ、２ｘ２５０、高収率）をＡｎｖｉ’ｏ視覚化プラットフォームで分析した。細菌ゲノムは、属または種レベルのいずれかに洗練され、遺伝子の類似性によってリング内のスライスとして順序付けられた（隠れマルコフモデルによる階層的クラスタリング）。図１では、リスペリドン処置マウスのメタゲノムは赤色に着色され、対照マウスは青色に着色されている。図１に示すように、リスペリドンで６０日間処置されたＣ５７ｂｌ／６Ｊ雌性マウスは、統計的に有意な体重増加を示し、細菌組成に統計的に有意な差があった。薬物処置マウスからの糞便またはウイルス画分の移動は、対照と比較して体重増加を増強するのに十分であった。
【００４８】
体重増加に対するリスペリドン治療の効果をさらに調査するために、雌性マウスを、リスペリドン処置の有無にかかわらず、ロイテリサイクリンを産生するＬ．ロイテリで処置した。Ｃ５７Ｂｌ／６Ｊ雌性マウスは６週齢で到着し、２週間施設に順応させた（ｎ＝１０／群）（図２Ａ）。８週齢のＣ５７ＢＬ／６Ｊ雌性マウスは、３×１０８ＣＦＵのラクトバチルス・ロイテリ株ＬＴＨ２５８４（ロイテリサイクリン産生菌）または緩衝液（リン酸緩衝生理食塩水）のいずれかを含有する１００μＬを用いて、強制経口投与を介して毎日処置した。飲料水には、緩衝液またはリスペリドン（２０ｍｇ／ｍＬ）を補充した。ベースラインの糞便は、内臓脂肪組織が採取された１５週間まで１日おきに収集された。図２Ｂは、対照動物（緑）、ロイテリサイクリンを産生するＬ．ロイテリを受ける動物（青）、またはロイテリサイクリンを産生するＬ．ロイテリ＋リスペリドンを受ける動物（マゼンタ）、またはロイテリサイクリンを産生することができないＬ．ロイテリ＋リスペリドンを受ける動物（赤）の体重増加を示している。リスペリドンのみを受ける動物は、赤い線とほぼ同じであった（データは示していない）。リスペリドンおよびロイテリサイクリンを産生するＬ．ロイテリ（マゼンタ）で処置されたマウスの体重増加は、Ｗｉｌｃｏｘｏｎによって決定されたように、リスペリドンおよびロイテリサイクリンを産生する能力を欠くＬ．ロイテリを受ける動物（赤）と比較して、処置の６４日目で無効になり（＊ｐ＜０．０５）、それでも対照動物（緑）または細菌のみで処置されたマウス（青）と比較してある程度の体重増加を示した。
【００４９】
内臓脂肪パッドを各マウスから６４日目に解剖し、体重を測定し、定量化した。図２Ｃに示されるように、ロイテリサイクリンを産生することができるＬ．ロイテリも受けたリスペリドン処置マウスからの脂肪パッドは、リスペリドン処置のみを受けた動物と比較して有意に体重増加を抑制した（Ｗｉｌｃｏｘｏｎ、＊ｐ＜０．０５）。
【００５０】
考察。この例は、ロイテリサイクリンによる治療がリスペリドン治療に伴う体重増加を防ぐことを示している。これらのデータは、ロイテリサイクリンが減量剤として、またはいくつかの医薬的な治療に関連する体重増加を防止または無効にするために開発できることを示唆している。
【００５１】
例２−ランダムフォレストおよび線形モデルは抗精神病薬による体重増加を予測できる
リスペリドンで処置された動物およびロイテリサイクリンで処置された動物の微生物叢を特徴付ける一連の分類学的変化を特定した。ランダムフォレスト（ＲＦ）として知られる機械学習手法を使用して、これらの違いを使用して予測モデルを作製した。モデルの最小コンポーネントおよびそれらの相対的な重要性を図３に示す。このモデルは、オランザピンで治療された動物（ＡＵＣ＝０．９５）を含む、第２世代の抗精神病薬クラスの他の薬剤による体重増加を予測するためにも適用することができる。この結果は、１）リスペリドン治療による肥満の原因となる微生物叢の変化が他の抗精神病薬に反応して起こることも観察され、２）ロイテリサイクリンまたはロイテリサイクリン産生プロバイオティクス（Ｌ．ロイテリ株ＬＴＨ２５８４）のいずれかは、他の抗精神病薬からの肥満を治療するために使用され得ることを示す。
【００５２】
上記の観察された変化を使用して、リスペリドンで処置された動物の体重増加を予測する線形モデルを作製した。我々は、この線形モデルが、リスペリドンの使用、ロイテリサイクリン治療、およびプロバイオティクス株ＬＴＨ２５８４治療に関連する体重増加を予測することを発見した（図４、スピアマンの順位相関、ｐ＝０．０００７４８）。モデル構築およびモデル評価を実行する前に、トレーニングセットおよびテストセットを、ランダム化および分離した。オランザピンで処置した動物でこのモデルをテストしたところ、別の抗精神病薬に関連する体重増加を予測するのに同等の性能を発揮することがわかった（図５、スピアマンの順位相関、ｐ＜０．００００１）。リスペリドン、ロイテリサイクリン治療、およびオランザピン治療に関連する体重変化を特徴付けるのに重要であると特定された分類群は、治療反応および体重増加を予測するためのＰＣＲベースの診断に適合させることができる。
【００５３】
予測特異性を高めるために、遺伝子特異的な違いに基づいて、治療反応の分類子と、これらの治療（リスペリドンおよびロイテリサイクリン）に反応した体重増加の線形モデルと、を作製することができる。例えば、アッカーマンシア・ムシニフィラ（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ  ｍｕｃｉｎｉｐｈｉｌａ）株は、プロバイオティクスＬＴＨ２５８４で処置された動物と比較して、リスペリドンで処置された動物において特有の２６．１ｋｂのゲノムサインを有している。対照的に、アッカーマンシア・ムシニフィラは、ＬＴＨ２５８４プロバイオティクスで処置した動物に特有の３７．８ｋｂのストレッチ（図６）を持っている。ＰＣＲベースのテストを生成して、これらの遺伝子を特定し、治療効果を判断することができる。
【００５４】
最後に、我々は、サンプリング時に体重増加を報告した前糖尿病患者（ｎ＝４０）に対して健常ヒト対照（ｎ＝５０）で差別的に豊富であったヒトデータセット（糞便）において、２０個の遺伝子ロイテリサイクリン合成様遺伝子クラスタ（ｂｌａｓｔｐ、ｅ値＝＜０．０００５）を同定した。これらの遺伝子ならびに他の特定の遺伝子の傾向をランダムフォレストおよび線形モデルに組み込んで、ヒトの体重増加を予測することができる。これらのデータは、ロイテリサイクリン様分子がヒトで役割を果たしている可能性があることを示唆している。
【００５５】
本発明は、前述の実施例に限定されることを意図するものではなく、添付の特許請求の範囲内に入るようなすべてのそのような修正および変形を包含する。
【図１】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図２Ｃ】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【国際調査報告】
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