(57)【要約】本発明は、肺傷害または肺疾患を治療及び予防するための細菌株を含む組成物を提供する。【選択図】図２
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
肺傷害または肺疾患を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物。
【請求項２】
前記肺傷害または肺疾患が、炎症によって媒介される、請求項１に記載の使用のための組成物。
【請求項３】
前記組成物が、肺組織の炎症を抑制する、または、肺傷害もしくは肺疾患に起因する損傷を抑制する、請求項１または請求項２に記載の使用のための組成物。
【請求項４】
前記肺傷害または肺疾患が：
（ａ）喘息；
（ｂ）急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）；または
（ｃ）慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、
である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項５】
前記喘息が：
（ａ）軽度または中等度の喘息；
（ｂ）アレルギー性喘息であって、任意に、原因アレルゲンが、花粉、イエダニ、ペットの鱗屑、カビ、または、ゴキブリの粒状物である前記アレルギー性喘息；または
（ｃ）非アレルギー性喘息、
である、請求項４（ａ）に記載の使用のための組成物。
【請求項６】
前記肺傷害または肺疾患が、喘息ではない、請求項１〜３のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項７】
前記肺傷害または肺疾患が、アレルギー性、非アレルギー性、好酸球性、及び、好中球性喘息のいずれでもない、請求項１〜３のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項８】
前記組成物が、慢性炎症、及び、気管支や細気管支などの気道の制限を抑制する、請求項４（ａ）または請求項５に記載の使用のための組成物。
【請求項９】
前記組成物が、肺組織での好中球性炎症、出血、浮腫、壊死、及び、無気肺の１または２以上を抑制し、任意に、前記組成物が、肺組織での好中球性炎症、出血、浮腫、壊死、及び、無気肺のすべてを抑制する、請求項１〜８のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項１０】
前記細菌株が、配列番号１に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％が同一である１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する、請求項１〜９のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項１１】
前記細菌株が、配列番号１の１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項１２】
前記組成物が、Ｄｅｕｔｓｃｈｅ  Ｓａｍｍｌｕｎｇ  ｖｏｎ  Ｍｉｋｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｅｎ（Ｇｅｒｍａｎ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）に、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ、または、その派生物を含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項１３】
（ａ）前記組成物が、経口投与用である；
（ｂ）前記組成物が、薬学的に許容される１または２以上の賦形剤または担体を含む；
（ｃ）前記細菌株が、凍結乾燥されている；及び／または
（ｄ）前記細菌株が、生存可能である、
請求項１〜１２のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項１４】
前記細菌株が、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる、請求項１３（ｄ）に記載の使用のための組成物。
【請求項１５】
前記組成物が：
（ａ）Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種である単一株；または
（ｂ）微生物コンソーシアムの一部としてのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株、
を含む、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の使用のための組成物。
【請求項１６】
請求項１〜１５のいずれか１項に記載の組成物を含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の使用のための食品。
【請求項１７】
請求項１〜１５のいずれか１項に記載の組成物を含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の使用のためのワクチン組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、哺乳動物の消化管から単離した細菌株を含む組成物、及び、疾患の治療における当該組成物の使用の分野に属する。
【背景技術】
【０００２】
ヒトの腸は、子宮内では無菌と考えられているが、出生直後に様々な母体微生物、及び、環境微生物に曝される。その後、微生物のコロニー形成と遷移の動的期間が生じることとなり、このものは、分娩様式、環境、食事、及び、宿主遺伝子型などの因子による影響を受け、これらの因子のすべてが、特に、生後早期において、腸内微生物叢の組成に影響を及ぼす。その後、微生物叢は、安定して成人様になる［１］。ヒト腸内微生物叢は、１５００を超える様々なファイロタイプを含んでおり、そこでは、２つの主要な細菌分類（門）、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ、及び、Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓが、存在度レベルにおいて多数派を占めている［２〜３］。ヒト腸での細菌コロニー形成から生じる良好な共生関係は、広範な代謝的、構造的、保護的、及び、その他の有益な機能をもたらしてきた。コロニー形成が認められた腸での代謝活性の改善は、その他の難消化性の食事成分が、副生成物の放出と共に分解を受けて、宿主に重要な栄養源と、さらなる健康効果とを提供することを確実ならしめる。同様に、腸内微生物叢の免疫学的重要性は、よく認識されており、共生細菌の導入後に機能的に再構成される、正常に機能していない免疫系を有する無菌動物において実証されている［４〜６］。
【０００３】
微生物叢組成の劇的な変化は、胃腸障害、例えば、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）に関して報告がされている。例えば、ＩＢＤ患者では、ＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍクラスターＸＩＶａ菌と、ＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍクラスターＸＩ（Ｆ．ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）のレベルが低下する一方で、Ｅ．ｃｏｌｉの数が増えており、このことは、腸内の共生菌と病原菌のバランスの変化を示唆している［７〜１１］。
【０００４】
特定の細菌株が、動物の腸や、その他の組織に及ぼし得る潜在的にポジティブな効果の認識において、様々な株が、様々な疾患の治療での使用に向けて提案がなされている（例えば、［１２〜１５］を参照されたい）。大部分のＬａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ、及び、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ株を含めた数多くの株が、様々な腸障害の治療のために使用することを提案されている（レビューについては［１６］を参照されたい）。Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株もまた、腸障害の治療のために使用することが提案されている［１７〜１９］。属Ｂｌａｕｔｉａの株も、消化器系の微生物バランスの調節のために使用することを提案されており［２０］、そして、特定の種を、腸から離間した全身性疾患の治療のために使用することが提案されている［２１］。しかしながら、異なる細菌株と異なる疾患との間の関係、ならびに、全身レベルでの腸やその他の組織、及び、特定のタイプの疾患に関係する特定の細菌株の正確な影響の特徴決定は進んでいない。
【０００５】
腸細菌を使用した新規の治療の開発を可能ならしめる特徴決定がされた腸細菌の潜在的効果が待望されている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、肺傷害（lung injury）または肺疾患（lung disease）を治療するための新規の治療法を開発した。特に、本発明者らは、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株が、肺傷害または肺疾患の治療に有効であることを突き止めた。実施例で実証した通り、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株を含む組成物を投与すると、リポ多糖（ＬＰＳ）が誘発した肺傷害のマウスモデルでの肺組織の炎症を抑制（reduce）する。したがって、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株を含む組成物は、肺傷害または肺疾患を治療し得る。
【０００７】
第１の態様では、本発明は、肺傷害または肺疾患を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を提供する。本発明は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を、それを必要とする患者に対して投与することを含む、肺傷害または肺疾患を治療する方法も提供する。さらに、本発明は、肺傷害または肺疾患の治療のための薬剤の製造のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物の使用を提供する。
【０００８】
好ましい実施形態では、本発明は、肺傷害または肺疾患を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を提供しており、肺傷害または肺疾患は、炎症が媒介する。好ましい実施形態では、本発明は、肺傷害または肺疾患を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を提供しており、組成物は、肺組織の炎症を抑制する。好ましい実施形態では、本発明は、喘息を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を提供する。好ましい実施形態では、本発明は、急性呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を提供する。好ましい実施形態では、本発明は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）を治療する方法における使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む組成物を提供する。
【０００９】
Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの細菌株の１６ｓ  ｒＲＮＡ配列に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％が同一である１６ｓ  ｒＲＮＡ配列を有し得る。配列番号１に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％が同一である１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する細菌株など、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株に密接に関連する株も、本発明において使用し得る。その他の実施形態では、組成物での細菌株は、配列番号１に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％が同一である１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する。好ましくは、本発明での使用のための細菌株は、配列番号１で示す１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する。最も好ましくは、本発明での使用のための組成物での細菌株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株である。受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株の派生物（derivative）も使用し得る。
【００１０】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、経口投与用である。本発明の株の経口投与は、肺傷害または肺疾患の治療に有効である。また、経口投与は、患者及び開業医にとって使い易く、また、腸への送達、及び／または、腸の部分的または全体的なコロニー形成を可能ならしめる。
【００１１】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、１または２以上の薬学的に許容される賦形剤または担体を含む。
【００１２】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、凍結乾燥した細菌株を含む。また、本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の凍結乾燥細菌株を含むこともできる。凍結乾燥は、細菌の送達を可能にする安定した組成物を調製する上で効果的かつ使い易い技術である。
【００１３】
特定の実施形態では、本発明は、上記した組成物を含む食品を提供する。
【００１４】
特定の実施形態では、本発明は、上記した細菌株を含むワクチン組成物を提供する。
【００１５】
加えて、本発明は、肺傷害または肺疾患を治療する方法を提供するものであって、同方法は、それを必要とする患者に対して、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの細菌株を含む組成物を投与することを含む。
【図面の簡単な説明】
【００１６】
【図１】グループ１〜６の体重；データは、平均±ＳＥＭとして表している。
【図２】グループ１〜６の組織病理学的スコア分析。肺切片の好中球性炎症、出血、浮腫、壊死、及び、無気肺を、それぞれ、０〜４のスケールでスコアを定めた。グループ１〜６のそれぞれに関して、平均総組織病理学的スコアを示している。＄＄＄＄及び＊＊＊＊：ｐ＜０．０００１対媒体（vehicle）グループ。∧∧及び＃＃：ｐ＜０．０１対媒体グループ。
【図３Ａ−３Ｂ】肺の代表的な組織病理学的画像。Ａ：マウス１．１×１０；正常な肺（合計スコアは０）；Ｂ：マウス４．３、ｘ１０（合計スコアは３）；気管支周囲、血管周囲、及び、肺胞内に分布する炎症性凝集体；Ｃ：マウス５．８、ｘ１０（合計スコアは２）；４．３に関する上記した炎症性変化；Ｄ及びＥ：マウス６．６、ｘ１０及びｘ４０（合計スコアは５）；気管支周囲、血管周囲、及び、肺胞内の炎症；高出力は、壁のフィブリノイド壊死と、激しい肺胞内炎症の領域に隣接する浸潤性顆粒球とを伴う変性動脈血管を示している；Ｆ：マウス６．１０、ｘ１０（合計スコアは５）；広範な肺胞内出血があるが、炎症の変化は最小限である；Ｇ：マウス７．１０、ｘ１０（合計スコアは３）；多発性炎症性変化；Ｈ：マウス８．８、ｘ１０（合計スコアは２）；多発性炎症性変化。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
細菌株
本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の細菌株を含む。実施例は、この種の細菌が、肺傷害または肺疾患、特に、炎症が媒介する肺傷害または肺疾患の治療に有用であることを実証している。
【００１８】
属Ｂｌａｕｔｉａは、グラム反応陽性の非運動性細菌であり、球形または楕円形のいずれかであり、すべてがグルコース発酵の主要な最終生成物として酢酸を生成する偏性嫌気性菌である［２２］。
【００１９】
Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ（従来は、Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓと称していた）は、哺乳動物の腸から単離される、偏性嫌気性で、胞子形成しない球桿菌であり、そして、Ｈ２／ＣＯ２を、ヒトの栄養に重要となり得る酢酸塩へと代謝する。Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａのタイプの株は、Ｓ５ａ３３＝ＪＣＭ１４６５６である。Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株Ｓ５ａ３６の１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列のＧｅｎＢａｎｋ受託番号は、Ｘ９５６２４．１である（配列番号１として本明細書に開示した）。この例示的なＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株は、［２２］及び［２３］に記載されている。Ｓ５ａ３３株、及び、Ｓ５ａ３６株は、健常な対象の糞便試料から単離した株の２つのサブクローンに相当する。これらは、同一の形態、生理機能、及び、代謝を示し、そして、同一の１６Ｓ  ｒＲＮＡ配列を有している。そのため、一部の実施形態では、本発明での使用のためのＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａは、配列番号１の１６Ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する。
【００２０】
受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ細菌を実施例において試験しており、本明細書では、株ＢＨまたはＢｌａｕｔｉｘとも称する。株ＢＨは、本発明の好ましい株である。株ＢＨを、２００１年５月１０日に受託番号ＤＳＭ  １４２９４で「Ｓ５ａ３３」として、Ｄｅｕｔｓｃｈｅ  Ｓａｍｍｌｕｎｇ  ｖｏｎ  Ｍｉｋｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｅｎ  ［Ｇｅｒｍａｎ  Ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ  Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ］（Ｍａｓｃｈｅｒｏｄｅｒ  Ｗｅｇ  １ｂ，３８１２４  Ｂｒａｕｎｓｃｈｗｅｉｇ，Ｇｅｒｍａｎｙ）に寄託した。寄託者は、ＩＮＲＡ  Ｌａｂｏｒａｔｏｉｒｅ  ｄｅ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｉｅ  ＣＲ  ｄｅ  Ｃｌｅｒｍｏｎｔ−Ｆｅｒｒａｎｄ／Ｔｈｅｉｘ  ６３１２２  Ｓａｉｎｔ  Ｇｅｎｅｓ  Ｃｈａｍｐａｎｅｌｌｅ，Ｆｒａｎｃｅであった。寄託物の所有権は、譲渡により、４Ｄ  Ｐｈａｒｍａ  Ｐｌｃに渡った。４Ｄ  Ｐｈａｒｍａ  Ｐｌｃは、合意により、４Ｄ  Ｐｈａｒｍａ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｌｉｍｉｔｅｄが、本出願で寄託した生物材料に関わることを許可しており、また、公衆が利用可能である寄託した当該材料に対して、その無条件かつ取消不能な承認を付与している。ＤＳＭ  １４２９４寄託物は、［２０］に記載されている。
【００２１】
実施例で試験した株と近縁の細菌株も、肺傷害または肺疾患、特に、炎症が媒介する肺傷害または肺疾患の治療に有効であることが期待されている。特定の実施形態では、本発明での使用のための細菌株は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの細菌株の１６ｓ  ｒＲＮＡ配列に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％同一である１６ｓ  ｒＲＮＡ配列を有する。好ましくは、細菌株は、配列番号１で表される１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有する。最も好ましくは、細菌株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株である。
【００２２】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌のバイオタイプを含む。受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した株のバイオタイプは、同じ、または、非常に類似した生理学的及び生化学的特性を有する近縁の株である。バイオタイプは、起源のＤＳＭ  １４２９４と同等の免疫調節活性を有する。したがって、バイオタイプは、肺傷害または肺疾患、特に喘息、ＡＲＤＳ、または、ＣＯＰＤなど、炎症が媒介する肺傷害または肺疾患の治療に効果的である。
【００２３】
バイオタイプは、実施例に記載している培養及び投与プロトコルを使用して同定し得る、実施例に示されている効果と同等の肺傷害または肺疾患に対する効果を誘発する。特に、バイオタイプは、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌に匹敵する肺の炎症の抑制を誘発する。
【００２４】
受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌のバイオタイプであり、かつ、本発明での使用に好適である株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌のその他のヌクレオチド配列を配列決定して同定し得る。例えば、実質的に全ゲノムを配列決定することができ、また、本発明での使用のためのバイオタイプ株は、その全ゲノムの少なくとも８０％（例えば、少なくとも８５％、９０％、９５％、または、９９％、または、そのゲノム全体）で、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％の配列同一性を有し得る。例えば、一部の実施形態では、バイオタイプ株は、そのゲノムの少なくとも９８％で、少なくとも９８％の配列同一性、または、そのゲノムの９９％で、少なくとも９９％の配列同一性を有する。バイオタイプ株を同定するために使用するその他の好適な配列は、ｈｓｐ６０、または、反復配列、例えば、ＢＯＸ、ＥＲＩＣ、（ＧＴＧ）５、もしくは、ＲＥＰ［２４］を含み得る。バイオタイプ株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌の対応する配列に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％の配列同一性を有する配列を有し得る。一部の実施形態では、バイオタイプ株は、配列番号１の１６ｓ  ｒＲＮＡ配列に対して、少なくとも９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、または、９９．９％の配列同一性を有する１６ｓ  ｒＲＮＡ遺伝子配列を有し得る。
【００２５】
あるいは、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌のバイオタイプであり、かつ、本発明での使用に好適な株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４の寄託物、ならびに、制限断片分析、及び／または、ＰＣＲ分析を使用して、例えば、蛍光増幅断片長多型分析（ＦＡＦＬＰ）、及び、反復ＤＮＡ要素（ｒｅｐ）−ＰＣＲフィンガープリント、または、タンパク質プロファイリング、または、部分１６Ｓまたは２３ｓ  ｒＤＮＡ配列決定を使用して同定し得る。好ましい実施形態では、そのような技術を使用して、その他のＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株を同定し得る。
【００２６】
特定の実施形態では、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌のバイオタイプであり、かつ、本発明での使用に好適な株とは、増幅リボソームＤＮＡ制限分析（ＡＲＤＲＡ）で分析するとき、例えば、Ｓａｕ３ＡＩ制限酵素（例示的な方法、及び、ガイダンスについては、例えば［２５］を参照されたい）を使用するとき、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌と同じパターンを付与する株である。あるいは、バイオタイプ株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌と同じ炭水化物発酵パターンを有する株として同定される。
【００２７】
一部の実施形態では、本発明で使用する細菌株は：
（ｉ）α−グルコシダーゼ、及び、アルカリホスファターゼの一方または双方に関して陽性である；及び／または
（ｉｉ）ウラーゼ、アルギニンジヒドロラーゼ、α−ガラクトシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ６リン酸、β−グルコシダーゼ、α−アラビノシダーゼ、β−グルクロニダーゼ、Ｎ−アセチル−β−グルコサミニダーゼ、マンノース発酵、ラフィノース発酵、グルタミン酸デカルボキシラーゼ、α−フコシダーゼ、硝酸塩の還元、インドール産生、アルギニンアリールアミダーゼ、プロリンアリールアミダーゼ、ロイシルグリシンアリールアミダーゼ、フェニルアラニンアリールアミダーゼ、ロイシンアリールアミダーゼ、ピログルタミン酸アリールアミダーゼ、チロシンアリールアミダーゼ、アラニンアリールアミダーゼ、グリシンアリールアミダーゼ、ヒスチジンアリールアミダーゼ、グルタミルグルタミン酸アリールアミダーゼ、及び、セリンアリールアミダーゼの少なくとも１つ（例えば、少なくとも２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、２６個、または、すべて）に関して陰性であり；
好ましくは、炭水化物、アミノ酸、及び、硝酸塩代謝のアッセイ、及び、任意に、アルカリホスファターゼ活性のアッセイ、より好ましくは、Ｒａｐｉｄ  ＩＤ  ３２Ａ分析によって（好ましくは、ｂｉｏＭｅｒｉｅｕｘのＲａｐｉｃ  ＩＤ  ３２Ａシステムを使用して）決定する。
【００２８】
本発明の組成物、及び、方法において有用であるその他のＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株、例えば、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌のバイオタイプを、実施例で実証したアッセイなど、あらゆる適切な方法または戦略を使用して同定し得る。特に、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌と同様の成長パターン、代謝型、及び／または、表面抗原を有する細菌株は、本発明において有用であり得る。有用な株は、ＤＳＭ  １４２９４株に匹敵する微生物叢調節活性を有する。特に、バイオタイプ株は、実施例に記載している効果と同等の肺傷害または肺疾患に対する効果を誘発し、このものは、実施例に記載している培養及び投与プロトコルを使用して同定し得る。
【００２９】
本発明の特に好ましい株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株である。この株は、実施例で試験を行い、そして、肺傷害または肺疾患の治療に効果が認められた例示的なＢＨ株である。そのため、本発明は、特に、本明細書に記載した傷害及び疾患の治療での使用のための細胞、例えば、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株の細胞、例えば、単離細胞、または、その派生物を提供する。
【００３０】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌の派生物を含む。受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した株の派生物は、娘株（後代）、または、オリジナル株から培養した（サブクローニングした）株とし得る。本発明の株の派生物は、生物活性を損なわずに、例えば、遺伝子レベルで修飾し得る。特に、本発明の派生株（derivative strain）は、治療的に活性である。派生株は、起源のＤＳＭ  １４２９４株と同等の免疫調節活性を有する。派生物株は、起源のＤＳＭ  １４２９４株に匹敵する微生物叢調節活性を有する。したがって、派生物株は、肺傷害または肺疾患、特に、喘息、ＡＲＤＳ、または、ＣＯＰＤなど、炎症が媒介する肺傷害または肺疾患の治療に効果的である。
【００３１】
派生株は、実施例に記載している培養及び投与プロトコルを使用して同定し得る、実施例に記載している効果と同等の肺傷害または肺疾患に対する効果をもたらす。特に、派生株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した細菌と同等の肺炎症に対する効果をもたらす。ＤＳＭ  １４２９４株の派生物は、一般的には、ＤＳＭ  １４２９４株のバイオタイプとなる。
【００３２】
細菌株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した株と同じ安全性と治療効果特性とを有する株でもあり、そして、そのような細胞は、本発明に包含される。したがって、組成物は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した株ではないが、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託した株と同じ安全性と治療効果特性とを有するＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株を含むことができる。株の安全性は、例えば、抗生物質に対する株の耐性を試験して、例えば、抗生物質に対する潜在的耐性と伝染性耐性とを区別して確立することができる。株の安全性は、インビトロでの株の病原性、例えば、毒素産生レベルを評価して確立することもできる。その他の安全性試験として、ラット及びマウスモデルでの細菌株の急性または慢性の毒性試験がある。株の治療効果は、関連するモデルを使用して、インビトロ及びインビボで、細菌株の機能特性を評価して確立することができる。
【００３３】
好ましい実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、生存可能であり、かつ、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる。好ましくは、本明細書に開示した組成物は、本発明の細菌株を用いて、腸への送達、及び／または、腸に部分的または全体的にコロニー形成を可能ならしめるために、胃腸管に投与する。換言すれば、細菌は、胃腸管の一部またはすべての部分にコロニーを形成し得る、及び／または、そのようなコロニー形成は、一過性または永続的とし得る。
【００３４】
より具体的には、一部の実施形態では、「腸の全体的なコロニー形成」とは、細菌が、腸のすべての部分（すなわち、小腸、大腸、及び、直腸）にコロニーを形成する、ことを意味する。加えて、または、その代替として、用語「全コロニー形成」とは、細菌が、腸の一部またはすべての部分に恒久的に生着する、ことを意味する。
【００３５】
一部の実施形態では、「腸の部分的なコロニー形成」とは、細菌が、腸のすべてではないが、一部にコロニーを形成する、ことを意味する。加えて、または、その代替として、用語「部分的なコロニー形成」とは、細菌が、腸の一部またはすべての部分に一時的に生着する、ことを意味する。
【００３６】
一時的な生着は、投与間隔の終了後に、定期的に（例えば、毎日）、本発明の細菌株の存在量を（例えば、糞便試料において）評価して、ウォッシュアウト期間、すなわち、投与間隔の終了時と、本発明の細菌株が検出不可能なレベルになる時点との間の期間を突き止めて、決定をすることができる。本発明の実施形態では、ウォッシュアウト期間は、１４日以下、１２日以下、１０日以下、７日以下、４日以下、３日以下、２日以下、または、１日以下である。
【００３７】
本発明の実施形態では、本発明の細菌は、大腸に一過的に生着する。
【００３８】
治療的使用
肺傷害または肺疾患
本発明の細菌組成物は、肺疾患または肺傷害の治療での使用に供する。本発明の細菌組成物は、肺疾患または肺傷害の予防にも供する。
【００３９】
実施例で実証した通り、本発明の細菌組成物は、肺の組織での炎症を効果的に抑制する。本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制する。したがって、本発明の組成物は、肺傷害または肺疾患、特に、炎症が媒介する肺傷害または肺疾患の治療において有用となり得る。特に、本発明の組成物は、肺の組織での炎症を抑制することで、肺傷害または肺疾患の治療において有用となり得る。特に、本発明の組成物は、肺傷害または肺疾患に起因する損傷を抑制することで、肺傷害または肺疾患の治療において有用となり得る。
【００４０】
肺傷害及び肺疾患は、高等生物でのガス交換を可能にする臓器及び組織に影響を与えるすべての病的状態を網羅している。肺傷害及び肺疾患は、例えば、上気道、下気道、気管、気管支、細気管支、肺胞、間質、胸膜、胸膜腔、及び、呼吸のための神経及び筋肉の内の１または２以上に影響を及ぼし得る。
【００４１】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、上気道に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、下気道に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管支に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、細気管支に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺胞に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、間質に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胸膜に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胸膜腔に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、呼吸のための神経及び筋肉に影響を与える肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。好ましくは、本発明の組成物は、喘息ではない肺傷害または肺疾患の治療での使用のためのものである。
【００４２】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳ、喘息、気管支拡張症、細気管支炎、気管支炎、慢性咳、ＣＯＰＤ、嚢胞性線維症、肺気腫、ヒトメタニューモウイルス（ｈＭＰＶ）感染症、インフルエンザ、汎発性インフルエンザ、ペルツ症、胸膜炎、胸膜腔疾患、肺炎、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、サルコイドーシス、重度の急性呼吸器症候群（ＳＡＲＳ）、結核、または、上気道感染症（一般的な風邪、副鼻腔炎、細気管支炎、咽頭炎、喉頭炎など）の治療での使用のためのものである。
【００４３】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管支拡張症の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、細気管支炎の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管支炎の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、慢性咳の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、嚢胞性線維症の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺気腫の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ｈＭＰＶの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、インフルエンザの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、汎発性インフルエンザの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、百日咳の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胸膜炎の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胸膜腔疾患の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺炎の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＲＳＶの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、サルコイドーシスの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＳＡＲＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、結核の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、一般的な風邪、副鼻腔炎、扁桃炎、咽頭炎、または、喉頭炎などの上気道感染症の治療での使用のためのものである。
【００４４】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、喘息に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、喘息に起因しない損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管支拡張症に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、細気管支炎に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管支炎に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、慢性咳に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、嚢胞性線維症に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺気腫に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ｈＭＰＶに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、インフルエンザに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、汎発性インフルエンザに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、百日咳に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胸膜炎に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胸膜腔疾患に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺炎に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＲＳＶに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、サルコイドーシスに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＳＡＲＳに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、結核に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、一般的な風邪、副鼻腔炎、扁桃炎、咽頭炎、または、喉頭炎などの上気道感染症に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。
【００４５】
実施例は、本発明の組成物による治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性炎症を抑制して、肺傷害または肺疾患を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、出血を減らして、肺傷害または肺疾患を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、浮腫を抑制して、肺傷害または肺疾患を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、壊死を抑制して、肺傷害または肺疾患を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、無気肺を抑制して、肺傷害または肺疾患を治療する。
【００４６】
喘息
本発明の細菌組成物は、喘息の治療での使用のためのものである。本発明の細菌組成物は、喘息の予防での使用のためのものでもある。
【００４７】
好ましい実施形態では、本発明の組成物は、喘息の治療での使用のためのものである。好ましい実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株を含み、かつ、喘息の治療での使用のためのものである。
【００４８】
実施例で実証した通り、本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制するので、本発明の組成物は、喘息の治療において有用であり得る。
【００４９】
喘息は、慢性的な炎症と、気道の制限（restriction）とを特徴とする疾患である。最も一般的には、喘息は、気管支と細気管支での慢性炎症を特徴としており、その結果、それらが狭窄してしまう。喘息の症状として、喘鳴、咳、胸部圧迫感、及び／または、息切れがある。症状は、特定の時間、例えば、夜間、早朝、または、運動後に、より深刻になる。
【００５０】
喘息は、主に、症状の重症度と頻度で分類する。例えば、喘息は、間欠性喘息、軽度の持続性喘息、中等度の持続性喘息、または、重度の持続性喘息に分類できる。喘息は、より単純に、軽度、中等度、または、重度に分類することもできる。喘息は、Ｔｈ２高喘息として公知のＴヘルパー２型リンパ球（Ｔｈ２）プロセスが媒介する炎症性事象のカスケードを生成するアレルゲンに起因するものとして、あるいは、Ｔｈ２が媒介するものではなく、非Ｔｈ２喘息、または、Ｔｈ２低喘息として公知のプロセスがもたらすものとして分類することもできる。非Ｔｈ２またはＴｈ２低喘息は、一般的には、吸入コルチコステロイド療法に反応しない。喘息は、症状が、アレルゲンに起因するか否かに基づいて、アレルギー性（別名、アトピー性、または、外因性）、または、非アレルギー性（別名、非アトピー性、または、内因性）に分類することもできる。アレルギー性喘息は、Ｔｈ２高喘息の一種である。非アレルギー性喘息は、非Ｔｈ２またはＴｈ２低喘息の一種である。
【００５１】
さらに、喘息は、様々なサブタイプに分類することができる。好中球性喘息、肥満関連喘息、喫煙関連喘息、及び、嚢胞性喘息は、すべて、非Ｔｈ２またはＴｈ２低喘息のサブタイプである。好中球性喘息は、非アレルギー性喘息、及び／または、重症喘息のサブタイプでもある。好酸球性喘息は、重度の喘息、アレルギー性喘息、及び／または、非アレルギー性喘息のサブタイプである。
【００５２】
好酸球性喘息は、末梢血、肺組織、及び、気道分泌物での好酸球数の増加を特徴とする。好中球性喘息は、コルチコステロイド治療に対する感度が小さくなり得る重症喘息である。このものは、末梢血、肺組織、及び、気道分泌物での好中球数の増加を特徴とする。
【００５３】
喘息に関する現在の治療として、一般的には、吸入器を介して投与する、薬剤の組み合わせがある。大抵の場合、個々の必要性に応じて、患者ごとに個別の治療計画を作成する。
【００５４】
通常、治療計画は、急性症状を治療する迅速緩和薬と、病態のさらなる悪化を防ぐ長期管理薬との両方を含む。喘息の治療のための新規の治療法が必要である。
【００５５】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、間欠性喘息、軽度の持続性喘息、中等度の持続性喘息、または、重度の持続性喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、重度、中等度、または、軽度の喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、Ｔｈ２高喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、非Ｔｈ２喘息、または、Ｔｈ２低喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、アレルギー性、アトピー性、または、外因性喘息の治療での使用のためのものである。原因となるアレルゲンは、花粉、ダニ、ペットの鱗屑（dander）、カビ（mould）、及び／または、ゴキブリの粒状物（cockroach particle）など、１または２以上の吸入アレルゲンとなる。一部の実施形態では、本発明の組成物は、アレルギー性、アトピー性、または、外因性喘息ではない喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、非アレルギー性、非アトピー性、または、内因性喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球性喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球性、及び、好中球性の両方の喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球性喘息ではない喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性喘息ではない喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球性喘息でも好中球性喘息でもない喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、肥満関連喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、喫煙関連喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、乏顆粒球型喘息の治療での使用のためのものである。
【００５６】
喘息は、特定の病態生理学的特徴によって特徴決定する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球性炎症反応が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性炎症反応が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、リンパ球の浸潤が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肥満細胞の活性化が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、上皮細胞損傷が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、気管支周囲浸潤が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、血管周囲浸潤が認められた喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、これらの病態生理学的特徴の内の２つ、３つ、４つ、または、４つ以上など、これらの病態生理学的特徴の内の１または２以上が認められる喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、これらの病態生理学的特徴の内の１または２以上を抑制する。特定の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球性、及び／または、好中球性炎症反応を抑制する。特定の実施形態では、本発明の組成物は、気管支周囲浸潤、及び／または、血管周囲浸潤を抑制する。
【００５７】
喘息の家族歴、ウイルス性呼吸器感染症、アレルギー、喫煙、肥満、大気汚染、特定の刺激性物質への職業的曝露、妊娠中の母親の喫煙と早産は、いずれも喘息の危険因子であると考えられている。一部の実施形態では、本発明の組成物は、喘息の危険因子を少なくとも１つ有する対象の喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、対象は、喘息の危険因子を２つ有する。一部の実施形態では、対象は、喘息の危険因子を３つ有する。一部の実施形態では、対象は、喘息の危険因子を４つ有する。一部の実施形態では、対象は、喘息の危険因子を５つ以上有する。一部の実施形態では、対象は、喘息の家族歴を有する。一部の実施形態では、対象は、ウイルス性呼吸器感染症を患っている／患ったことがある。一部の実施形態では、対象は、アレルギーを有する／有したことがある。一部の実施形態では、対象は、喫煙している／喫煙したことがある。一部の実施形態では、対象は、肥満である／肥満だったことがある。一部の実施形態では、対象は、大気汚染に曝されている／曝されたことがある。一部の実施形態では、対象は、職場で特定の刺激性物質、例えば、工業用粉塵、木粉、化学物質の煙、蒸気、及び／または、カビに曝されている／曝されたことがある。一部の実施形態では、対象の母親は、妊娠中に喫煙した。一部の実施形態では、対象は、早産で生まれた。
【００５８】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、アレルゲンに起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、アスピリンなどの非ステロイド性抗炎症薬への慢性曝露に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肥満に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、胃腸逆流症に対する慢性曝露に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、公害に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、タバコの煙に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、鼻炎に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ストレス、不安、及び／または、鬱病に起因する喘息の治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好酸球炎症、及び／または、好中球炎症に起因する喘息の治療での使用のためのものである。特定の実施形態では、治療をする患者は、例えば、採血または喀痰分析で、好中球または好酸球レベルが上昇している、または、同レベルの上昇が以前に認められていた。
【００５９】
実施例は、本発明の組成物を用いた治療が、肺組織の炎症を抑制することを示している。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺組織の炎症を抑制することで、喘息を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、慢性炎症、及び、気管支や細気管支などの気道の制限を抑制することで、喘息を治療する。
【００６０】
実施例は、本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制することを示している。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性炎症を抑制することで喘息を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、出血を減らすことで喘息を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、浮腫を抑制することで喘息を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、壊死を抑制することで喘息を治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、無気肺を抑制することで喘息を治療する。
【００６１】
実施例は、本発明の組成物を、傷害事象が発生する前に投与すると、喘息が治療でき、そして、回復を補助する上で有用であり得ることを実証している。喘息の治療での使用のための本発明の組成物は、例えば、喘息のリスクがあると判断した患者において、喘息の発症に先立って、対象に対して提供し得る。あるいは、喘息の治療での使用のための本発明の組成物は、対象が喘息に罹患している間に、対象に対して提供し得る。あるいは、喘息の治療での使用のための本発明の組成物は、喘息が発生した後、例えば、回復途中で提供し得る。
【００６２】
本発明の組成物を、新生児または妊婦に投与すると、新生児における喘息の発症を予防する上で有用となり得る。組成物は、小児の喘息の発症を予防する上で有用となり得る。本発明の組成物は、成人発症喘息を治療する上で有用となり得る。本発明の組成物は、喘息の症状を、管理または緩和する上で有用となり得る。
【００６３】
喘息の治療として、例えば、疾患の改善、症状の重症度の緩和、原因となる損傷の抑制、または、悪化の頻度、または、患者にとって問題である誘因の範囲の抑制を、実効ならしめることが挙げられる。
【００６４】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、喘息の改善の実効化での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、喘息の症状の重症度の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、喘息に起因する損傷の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、喘息の悪化の頻度の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、喘息患者にとって問題である誘因の範囲の抑制での使用のためのものである。
【００６５】
実施例で実証した通り、本発明の細菌組成物は、喘息の治療に有効となり得る。特定の実施形態では、組成物は、細菌培養物の形態とし得る。一部の実施形態では、組成物は、好ましくは、凍結乾燥物であり得る。
【００６６】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、第２の活性剤と組み合わせて使用するためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、気管支拡張剤と組み合わせて使用するためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、短時間作用型ベータ（β）２−アドレナリン受容体アゴニスト、長時間作用型ベータ２−アドレナリン受容体アゴニスト、抗コリン作用薬、コルチコステロイド、ロイコトリエン阻害薬、肥満細胞安定剤、抗ムスカリン薬、キサンチン、オマリズマブ、及び、免疫調節剤の１または２以上と組み合わせて使用するためのものである。本発明の組成物は、第２の活性剤に対する患者の反応を改善し得る。
【００６７】
ＡＲＤＳ
本発明の細菌組成物は、ＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。本発明の細菌組成物は、ＡＲＤＳの予防での使用のためのものでもある。
【００６８】
好ましい実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。好ましい実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株を含み、かつ、ＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。
【００６９】
実施例で実証した通り、本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制するので、本発明の組成物は、ＡＲＤＳの治療において有用であり得る。
【００７０】
ＡＲＤＳ、別名、急性肺傷害（ＡＬＩ）は、びまん性肺胞障害（ＤＡＤ）、及び、肺内皮細胞と上皮バリアとの攪乱に関連する急性炎症の障害である。ＡＲＤＳの初期段階では、微小血管内皮と肺胞上皮とから形成された肺胞毛細血管の透過性が高まり、これにより、タンパク質に富んだ液体が肺胞腔に流入する。したがって、ＡＲＤＳとは、肺における体液蓄積の一形態である。微小血管内皮、及び／または、肺胞上皮に損傷を与える誘因または事象が、ＡＲＤＳを引き起こす。肺胞毛細血管膜の完全性の喪失、過剰な経上皮好中球遊走、及び、炎症誘発性サイトカインの放出は、ＡＲＤＳでの炎症と肺傷害を深刻なものにする［２６］。しかしながら、ＡＲＤＳは、循環する好中球が無い場合に発症することができるので、好中球に依存しない経路も、ＡＲＤＳを引き起こすことができる［２７］。
【００７１】
ＡＲＤＳの症状は、大抵の場合、誘因事象から２時間以内に始まるが、１〜３日後に発生することもある。兆候や症状として、息切れ、速い呼吸、異常な換気に起因する血中低酸素レベル、低血圧、混乱、及び／また、は極度の疲労がある。
【００７２】
Ｔｈｅ  Ａｍｅｒｉｃａｎ−Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅは、１９９４年に、ＡＬＩ／ＡＲＤＳのコンセンサス定義の採用を推奨した。この定義は、吸気中の酸素分圧（ＦｉＯ２）に対する、患者の動脈血中の酸素分圧（ＰａＯ２）の比率に基づいている。この定義には、胸部Ｘ線写真での急性発症、びまん性両側肺浸潤、ＡＬＩでは、≦３００ｍｍＨｇ（４０ｋＰａ）、ＡＲＤＳでは、≦２００ｍｍＨｇ（≦２６．７ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比を必要としており、そして、左心房高血圧の臨床的証拠は求めていない［２８］。
【００７３】
しかしながら、ＡＲＤＳに関するこの国際的なコンセンサス基準は、その後、２０１２年に改訂が行われており、現在では、「Ｂｅｒｌｉｎ定義」または「Ｂｅｒｌｉｎ基準」として知られている。Ｂｅｒｌｉｎ基準は、従前の１９９４年のコンセンサス会議の定義を修正したものである。Ｂｅｒｌｉｎ基準では、ＡＲＤＳでは、次により特徴付けられる：
−  急性発症の肺傷害、明らかな臨床的発作から１週間以内であり、かつ、呼吸器症状の進行が認められる；
−  Ｘ線写真の変化（胸水、硬化、または、無気肺では十分な説明ができない両側の混濁）；
−  心不全、または、体液過剰では説明ができない呼吸不全；
−  ＰａＯ２／ＦｉＯ２比の減少。
【００７４】
Ｂｅｒｌｉｎ基準では、用語ＡＬＩの使用を推奨しておらず、代わりに、用語ＡＲＤＳの単独使用を提案しており、ＡＲＤＳは、動脈血酸素飽和度に応じて、軽度、中等度、または、重度に分類する。軽度のＡＲＤＳは、２０１〜３００ｍｍＨｇ（≦３９．９ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比として定義する；中等度のＡＲＤＳは、１０１〜２００ｍｍＨｇ（≦２６．６ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比として定義する；及び、重度のＡＲＤＳは、≦１００ｍｍＨｇ（≦１３．３ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比として定義する。Ｂｅｒｌｉｎ基準では、ＰａＯ２／ＦｉＯ２比を考慮して、５ｃｍ  Ｈ２Ｏの最小呼吸終末陽圧（ＰＥＥＰ）を必要とする。Ｂｅｒｌｉｎ基準は、ＡＲＤＳの臨床分類と研究分類の両方に関する現在の国際コンセンサスガイドラインを表している。
【００７５】
ＡＲＤＳの治療は、換気戦略と非換気戦略との両方で行う。今日まで、治療における最も重大な進歩は、人工呼吸器の改善に関連している。幾つかの研究と臨床試験は、数多くの薬理学的戦略が、ＡＲＤＳによる死亡率の低下に効果的ではないことを報告している（例えば、サーファクタント療法、吸入一酸化窒素、及び、コルチコステロイド）。ＡＲＤＳの治療のための新規の非換気戦略が待望されている。
【００７６】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、Ｔｈｅ  Ａｍｅｒｉｃａｎ−Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅが定義したＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、Ｔｈｅ  Ａｍｅｒｉｃａｎ−Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ  Ｃｏｎｆｅｒｅｎｃｅ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅが定義したＡＬＩの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＬＩの治療での使用のためのものであり、対象は、胸部Ｘ線写真にて、急性発症のびまん性両側肺浸潤が認められ、≦３００ｍｍＨｇ（４０ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比を示しているが、左心房高血圧の臨床的証拠は無い。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＬＩの治療での使用のためのものであり、対象は、胸部Ｘ線写真にて、急性発症のびまん性両側肺浸潤が認められ、≦２００ｍｍＨｇ（２６．７ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比を示しているが、左心房高血圧の臨床的証拠は無い。
【００７７】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｅｒｌｉｎ基準で定義したＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｅｒｌｉｎ基準で定義した、軽度、中等度、及び／または、重度のＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、対象が、２０１〜３００ｍｍＨｇ（≦３９．９ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比を示す、軽度のＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、対象が、１０１〜２００ｍｍＨｇ（≦２６．６ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比を示す、中等度のＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、対象が、≦１００ｍｍＨｇ（≦１３．３ｋＰａ）のＰａＯ２／ＦｉＯ２比を示す、重度のＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。
【００７８】
ＡＲＤＳは、特定の病態生理学的特徴によって特徴決定する［２９］。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺内皮細胞と上皮バリアとが攪乱されて、肺胞毛細血管膜の完全性を喪失させるＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺胞毛細血管バリアの透過性を高めるＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、肺胞毛細血管バリアの透過性が高まると、肺胞に流体が流入する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺組織のびまん性炎症によって特徴決定することができるＤＡＤが存在するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、炎症誘発性サイトカインの放出があるＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、過剰な経上皮好中球遊走が存在するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。その後、好中球は、活性化を受け、そして、活性酸素種やプロテアーゼなどの有毒な伝達物質を放出して、酸化的細胞損傷と炎症とを引き起こす。一部の実施形態では、本発明の組成物は、これらの病態生理学的特徴の内の２つ、３つ、４つ、または、５つ以上など、これらの病態生理学的特徴の内の１または２以上が存在するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。
【００７９】
敗血症、肺感染症、肺高血圧症、肺炎、誤嚥、外傷、膵炎、輸血、火傷、溺水、煙または有毒ガスの吸入、その他の吸入傷害、及び、薬物の過剰摂取のすべてを、ＡＲＤＳの危険因子と見なす。ＡＲＤＳの最高の発生率が、重症敗血症と複数回の輸血とに関連しているのに対し、最低の発生率は、外傷または薬物の過剰摂取の患者に関連している［３０］、［３１］。
【００８０】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳの少なくとも１つの危険因子を有する、または、有していた対象のＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、対象は、ＡＲＤＳに関する２つの危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＡＲＤＳに関する３つの危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＡＲＤＳに関する４つの危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＡＲＤＳに関する５つ以上の危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、敗血症を患っている、または、患っていた。一部の実施形態では、対象は、重症敗血症を患っている、または、患っていた。一部の実施形態では、対象は、肺感染症を患っている、または、患っていた。一部の実施形態では、対象は、肺高血圧症を患っている、または、患っていた。一部の実施形態では、対象は、肺炎を患っている、または、患っていた。一部の実施形態では、対象は、誤嚥をしている、または、していた。一部の実施形態では、対象は、外傷を負っている、または、負っていた。一部の実施形態では、対象は、膵炎を患っている、または、患っていた。一部の実施形態では、対象は、輸血を受けていた。一部の実施形態では、対象は、複数回の輸血、すなわち、１回以上、２回以上、３回以上、または、４回以上の輸血を受けていた。一部の実施形態では、対象は、火傷を負っている、または、負っていた。一部の実施形態では、対象には、溺水事象が認められる。一部の実施形態では、対象は、煙または有毒ガスを吸入している。一部の実施形態では、対象は、吸入傷害を有している、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、薬物の過剰摂取をしている。
【００８１】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、敗血症に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、重症敗血症に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺感染症に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺高血圧症に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺炎に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、誤嚥から生じるＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、外傷に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、膵炎に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、輸血に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、複数回の輸血、すなわち、１回以上、２回以上、３回以上、または、４回以上の輸血に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、火傷に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、溺水事故に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、吸入した煙または有毒ガスに起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、吸入傷害に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、薬物の過剰摂取に起因するＡＲＤＳの治療での使用のためのものである。
【００８２】
実施例は、本発明の組成物を用いた治療が、肺組織の炎症を抑制することを示している。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺組織の炎症を抑制して、ＡＲＤＳを治療する。
【００８３】
実施例は、本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制することを示している。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性炎症を抑制することでＡＲＤＳを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、出血を減らすことでＡＲＤＳを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、浮腫を抑制することでＡＲＤＳを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、壊死を抑制することでＡＲＤＳを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、無気肺を抑制することでＡＲＤＳを治療する。
【００８４】
実施例は、本発明の組成物を、傷害事象が発生する前に投与すると、ＡＲＤＳを治療し、そして、回復を補助する上で有用であり得ることを実証している。ＡＲＤＳの治療での使用のための本発明の組成物は、例えば、ＡＲＤＳのリスクがあると判断した患者において、ＡＲＤＳの発症に先立って、対象に対して提供し得る。あるいは、ＡＲＤＳの治療での使用のための本発明の組成物は、対象がＡＲＤＳに罹患している間に、対象に対して提供し得る。あるいは、ＡＲＤＳの治療での使用のための本発明の組成物は、ＡＲＤＳが発生した後、例えば、回復途中で提供し得る。
【００８５】
本発明の組成物を、新生児または妊婦に投与すると、新生児におけるＡＲＤＳの発症を予防する上で有用となり得る。組成物は、小児のＡＲＤＳの発症を予防する上で有用となり得る。本発明の組成物は、成人発症ＡＲＤＳを治療する上で有用となり得る。本発明の組成物は、ＡＲＤＳの症状を、管理または緩和する上で有用となり得る。
【００８６】
ＡＲＤＳの治療として、例えば、疾患の改善、症状の重症度の緩和、ＡＲＤＳに起因する損傷の抑制、または、悪化の頻度、または、患者にとって問題である誘因の範囲の抑制を、実効ならしめることが挙げられる。
【００８７】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳの改善の実効化での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、症状の重症度の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、ＡＲＤＳに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、悪化の頻度、または、患者にとって問題である誘因の範囲の抑制での使用のためのものである。
【００８８】
実施例で実証した通り、本発明の細菌組成物は、ＡＲＤＳの治療において有効であり得る。特定の実施形態では、組成物は、細菌培養物の形態とし得る。一部の実施形態では、組成物は、好ましくは、凍結乾燥物であり得る。
【００８９】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、第２の活性剤と組み合わせて使用するためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、非侵襲的換気、機械的換気、及び、保存的輸液管理と組み合わせて使用するためのものである。その他の第２の作用物質として、サーファクタント療法、吸入一酸化窒素、ケトコナゾール、シンバスタチン、イブプロフェン、抗生物質療法、及び、コルチコステロイドがある。本発明の組成物は、第２の活性剤に対する患者の反応を改善し得る。
【００９０】
ＣＯＰＤ
本発明の細菌組成物は、ＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。本発明の細菌組成物は、ＣＯＰＤの予防での使用のためのものでもある。
【００９１】
好ましい実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。好ましい実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ種の株を含み、かつ、ＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。
【００９２】
実施例で実証した通り、本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制するので、本発明の組成物は、ＣＯＰＤの治療において有用であり得る。
【００９３】
ＣＯＰＤは、長期的な呼吸の問題と、不十分な気流とを特徴とする進行性の疾患である。ＣＯＰＤの症状として、息切れ、咳、喘鳴、痰の生成、及び／または、胸部圧迫感などがある。ＣＯＰＤの発症以前に、慢性気管支炎や肺気腫が発症することがある。ＣＯＰＤは、一般的には、タバコの煙、大気汚染、職場にて刺激性物質に長期間にわたって曝されることで、肺に炎症反応が発生し、その結果、気道が狭くなり、最終的には、肺組織の破壊に至る。遺伝的素因も誘因である。
【００９４】
喘息とは異なり、気管支拡張薬は、ＣＯＰＤの効果的な治療法ではなく、効果もほとんどない。実際のところ、重症度の高い若年者のＣＯＰＤに限って言えば、肺移植または肺容積減少手術を除いて、ＣＯＰＤに関する公知の治療法は無い。代わりに、通常、ＣＯＰＤ患者に対しては、特定の症状の治療、及び／または、疾患の進行を遅延させる方法を提供する。例えば、酸素補給、非侵襲的換気、抗生物質、モルヒネ、呼吸リハビリテーション、インフルエンザ予防接種、及び、重症事例では、コルチコステロイドをＣＯＰＤ患者に提供して、ＣＯＰＤに関連する様々な症状を治療することができる。疾患の進行を遅延させための最善の方法は、原因として特定した刺激性物質を、患者に曝露することを抑制する、または、止めることである。例えば、通常、治療は、患者の禁煙を補助すること、または、職場や自宅での空気調節状態の改善に注力している。ＣＯＰＤの治療のための新規の治療法が待望されている。
【００９５】
家族歴、及び、様々な刺激性物質への長期間の曝露は、ＣＯＰＤの危険因子であると考えられている。一部の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤに関する少なくとも１つの危険因子を有する、または、有していた対象のＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、対象は、ＣＯＰＤに関する２つの危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＣＯＰＤに関する３つの危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＣＯＰＤに関する４つの危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＣＯＰＤに関する５つ以上の危険因子を有する、または、有していた。一部の実施形態では、対象は、ＣＯＰＤ、肺気腫、及び／または、慢性気管支炎の家族歴を有する。一部の実施形態では、対象は、喫煙している／喫煙したことがある。一部の実施形態では、対象は、換気の悪い箇所での調理火煙、特に、石炭またはバイオマス燃料から出る火煙、及び／または、都市の大気汚染、特に、排気ガスなどの大気汚染に曝されている。一部の実施形態では、対象は、職場において、工業用粉塵、木粉、化学粉塵、化学蒸気、及び／または、金型、特に、カドミウム、イソシアナート、シリカ粉塵、ガラス繊維粉塵、及び／または、溶接粉塵の１または２以上など、特定の刺激性物質に曝されていた。
【００９６】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺気腫に起因するＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、慢性気管支炎に起因するＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、喫煙に起因するＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、大気汚染物質への曝露に起因するＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、職場での刺激性物質への曝露に起因するＣＯＰＤの治療での使用のためのものである。
【００９７】
実施例は、本発明の組成物を用いた治療が、肺組織の炎症を抑制することを示している。一部の実施形態では、本発明の組成物は、肺組織の炎症を抑制して、ＣＯＰＤを治療する。
【００９８】
実施例は、本発明の組成物を用いた治療は、資格を有する組織病理学者による測定で認められたように、肺炎症の徴候を抑制することを示している。一部の実施形態では、本発明の組成物は、好中球性炎症を抑制することでＣＯＰＤを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、出血を減らすことでＣＯＰＤを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、浮腫を抑制することでＣＯＰＤを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、壊死を抑制することでＣＯＰＤを治療する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、無気肺を抑制することでＣＯＰＤを治療する。
【００９９】
実施例は、本発明の組成物が、傷害事象が発生する前に投与すると、ＣＯＰＤを治療し、そして、回復を補助する上で有用であり得ることを実証している。ＣＯＰＤの治療での使用のための本発明の組成物は、例えば、ＣＯＰＤのリスクがあると判断した患者において、ＣＯＰＤの発症に先立って、対象に対して提供し得る。あるいは、ＣＯＰＤの治療での使用のための本発明の組成物は、対象がＣＯＰＤに罹患している間に、対象に対して提供し得る。あるいは、ＣＯＰＤの治療での使用のための本発明の組成物は、ＣＯＰＤが発生した後、例えば、回復途中で提供し得る。
【０１００】
本発明の組成物を、新生児または妊婦に投与すると、新生児におけるＣＯＰＤの発症を予防する上で有用となり得る。組成物は、小児のＣＯＰＤの発症を予防する上で有用となり得る。本発明の組成物は、成人発症ＣＯＰＤを治療する上で有用となり得る。本発明の組成物は、ＣＯＰＤの症状を、管理または緩和する上で有用となり得る。
【０１０１】
ＣＯＰＤの治療として、例えば、疾患の改善、症状の重症度の緩和、起因する損傷の抑制、または、悪化の頻度、または、患者にとって問題である誘因の範囲の抑制を、実効ならしめることが挙げられる。
【０１０２】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤの改善の実効化における使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤの症状の重症度の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤに起因する損傷の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、ＣＯＰＤの悪化の頻度の抑制での使用のためのものである。特定の実施形態では、患者にとって問題である誘因の範囲の抑制での使用のためのものである。
【０１０３】
実施例で実証した通り、本発明の細菌組成物は、ＣＯＰＤの治療に有効となり得る。特定の実施形態では、組成物は、細菌培養物の形態とし得る。一部の実施形態では、組成物は、好ましくは、凍結乾燥物であり得る。
【０１０４】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、第２の活性剤と組み合わせて使用するためのものである。特定の実施形態では、本発明の組成物は、短時間作用型ベータ２−アドレナリン受容体アゴニスト、長時間作用型ベータ２−アドレナリン受容体アゴニスト、抗コリン作用薬、コルチコステロイド、ロイコトリエン阻害薬、肥満細胞安定剤、抗ムスカリン薬、キサンチン、オマリズマブ、及び、免疫調節剤の１または２以上と組み合わせて使用するためのものである。本発明の組成物は、第２の活性剤に対する患者の反応を改善し得る。
【０１０５】
投与の形態
好ましくは、本発明の組成物は、本発明の細菌株の腸への送達、及び／または、腸での部分的または全体的なコロニー形成を可能ならしめるために、胃腸管に投与すべきである。一部の実施形態では、用語「腸の全体的なコロニー形成」とは、細菌が、腸のすべての部分（すなわち、小腸、大腸、及び、直腸）でコロニーを形成したことを意味する。一部の実施形態では、「腸の部分的なコロニー形成」とは、細菌が、腸の全体ではないが、幾つかの部分にコロニーを形成したことを意味する。本発明のさらなる実施形態では、用語「全体的なコロニー形成」または「部分的なコロニー形成」とは、細菌が、それぞれ、永久的または一時的に腸内に滞留することを意味する。一般的に、本発明の組成物は、経口投与するが、それらは、直腸、鼻腔内、または、頬側もしくは舌下経路を介して投与し得る。
【０１０６】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、形態として、スプレー、または、ゲルとして投与し得る。
【０１０７】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、坐薬、例えば、肛門坐薬として、例えば、カカオ脂（ココアバター）、合成硬質脂肪（例えば、Ｓｕｐｐｏｃｉｒｅ、ｗｉｔｅｐｓｏｌ）、グリセロ−ゼラチン、ポリエチレングリコール、または、石鹸グリセリン組成物の形態で投与し得る。
【０１０８】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、チューブ、例えば、鼻腔栄養チューブ、経口胃チューブ、胃チューブ、経空腸チューブ（Ｊチューブ）、経皮的内視鏡下胃瘻造設術（ＰＥＧ）、または、ポート、例えば、胃、空腸、及び、その他の好適なアクセスポートへのアクセスを可能にする胸壁ポートを介して、胃腸管に投与する。
【０１０９】
本発明の組成物は、一度で投与し得るものであり、または、治療レジメンの一部として逐次的に投与し得る。特定の実施形態では、本発明の組成物は、毎日（１回、または、数回のいずれかで）投与すべきである。実施例は、投与が、肺傷害または肺疾患の治療において首尾良くコロニー形成すること、及び、臨床的利益を付与することを実証している。
【０１１０】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、定期的に、例えば、毎日、２日おきに、または、週１回、長期にわたって、例えば、少なくとも１週間、２週間、１ヶ月間、２ヶ月間、６ヶ月間、または、１年間投与する。投与は、腸での永久コロニーの形成を結果として生じ得ないものであり、そのため、長期にわたる定期的投与が、より大きな治療的利益を付与し得る、ことを実証している。
【０１１１】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、７日、１４日、１６日、２１日、もしくは、２８日間、または、７日、１４日、１６日、２１日、もしくは、２８日以内で投与する。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物は、１６日間投与する。一部の実施形態では、本発明の組成物は、１、２、３、４、５、または、６ヶ月間、６ヶ月以上、または、１年以上投与する。
【０１１２】
本発明の特定の実施形態では、本発明による治療は、患者の腸内微生物叢を評価して達成する。治療は、本発明の株を用いた送達、及び／または、部分的もしくは全体的なコロニー形成が達成されず、効能が認められない場合は反復し得るものであり、あるいは、治療は、送達、及び／または、部分的もしくは全体的なコロニー形成が成功しており、かつ、効能が認められる場合には中止し得る。
【０１１３】
特定の実施形態では、本発明の組成物は、妊娠中の動物、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトに対して、その子宮内の胎児、及び／または、新生児において発症する肺傷害または肺疾患を予防するために投与し得る。
【０１１４】
本発明の組成物は、肺傷害または肺疾患、あるいは、肺傷害または肺疾患に関連する疾患または病態であると診断された患者、または、肺傷害または肺疾患のリスクがあると同定された患者に対して投与し得る。
【０１１５】
本発明の組成物は、異常な腸内微生物叢を有するものと同定した患者に対して投与し得る。例えば、患者は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａによるコロニー形成が抑制されている、または、同コロニー形成が存在し得ない。
【０１１６】
本発明の組成物は、食品、例えば、栄養補助食品として投与し得る。
【０１１７】
一般的に、本発明の組成物は、ヒトの治療のためのものであるが、単胃哺乳動物、例えば、家禽、ブタ、ネコ、イヌ、ウマ、または、ウサギなどの動物の治療に使用し得る。本発明の組成物は、動物の成長と、パフォーマンスを向上させる上で有用であり得る。動物に投与する場合、経口胃管栄養法を使用し得る。
【０１１８】
一部の実施形態では、組成物の投与を受ける対象は、ヒト成人である。一部の実施形態では、組成物の投与を受ける対象は、ヒト乳児である。
【０１１９】
組成物
一般的に、本発明の組成物は、細菌を含む。本発明の好ましい実施形態では、組成物を、凍結乾燥形態で製剤する。例えば、本発明の組成物は、本発明の細菌株を含む顆粒、または、ゼラチンカプセル、例えば、硬質ゼラチンカプセルを含み得る。
【０１２０】
好ましくは、本発明の組成物は、凍結乾燥した細菌を含む。細菌の凍結乾燥は、確立された手順であり、関連するガイダンスは、例えば、参照文献［３２〜３４］において入手可能である。凍結乾燥組成物は、特に、有効となり得る。好ましい実施形態では、本発明の組成物は、凍結乾燥細菌を含み、かつ、肺傷害または肺疾患の治療のためのものである。
【０１２１】
あるいは、本発明の組成物は、生きている、活性な細菌培養物を含み得る。一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、不活性化していない、例えば、熱不活性化していない。一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、死滅させていない、例えば、熱死滅させていない。一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、弱毒化していない、例えば、熱弱毒化していない。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、死滅させていない、不活性化していない、及び／または、弱毒化していない。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、生きている。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、生存可能である。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物での細菌株は、生存しており、そして、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる。
【０１２２】
一部の実施形態では、組成物は、生存している細菌株と、死滅している細菌株との混合物を含む。
【０１２３】
好ましい実施形態では、本発明の組成物は、腸への細菌株の送達を可能ならしめるためにカプセル化する。カプセル化は、目標箇所に送達するまで、例えば、ｐＨの変化が引き起こし得る化学的または物理的刺激、例えば、圧力、酵素活性、または、物理的崩壊による破断を通じた劣化から組成物を保護する。あらゆる適切なカプセル化方法が、使用でき得る。例示的なカプセル化技術として、多孔質マトリクス内への取り込み、固体担体表面への付着または吸着、凝集または架橋剤を利用した自己会合、そして、微多孔質膜またはマイクロカプセルを用いた機械的封じ込めがある。本発明の組成物を調製する上で有用となり得るカプセル化についてのガイダンスは、例えば、参照文献［３５〜３６］において入手可能である。
【０１２４】
組成物は、経口で投与し得るものであり、錠剤、カプセル、または、粉末の形態とし得る。Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａは嫌気性菌であるので、カプセル化した製品が好ましい。
【０１２５】
本発明の組成物は、治療有効量の本発明の細菌株を含む。治療有効量の細菌株は、患者への有益な効果を発揮するのに十分である。治療有効量の細菌株は、患者の腸への送達、及び／または、部分的または全体的なコロニー形成を結果としてもたらすのに十分であり得る。
【０１２６】
例えば、ヒト成人に対する細菌の好適な１日量は、約１×１０３〜約１×１０１１個のコロニー形成単位（ＣＦＵ）；例えば、約１×１０７〜約１×１０１０ＣＦＵ；別の実施例では、約１×１０６〜約１×１０１０ＣＦＵ；別の実施例では、約１×１０７〜約１×１０１１ＣＦＵ；別の実施例では、約１×１０８〜約１×１０１０ＣＦＵ；別の実施例では、約１×１０８〜約１×１０１１ＣＦＵとし得る。
【０１２７】
特定の実施形態では、細菌の用量は、少なくとも１０９個の細胞／日、例えば、少なくとも１０１０個、少なくとも１０１１個、または、少なくとも１０１２個の細胞／日である。
【０１２８】
特定の実施形態では、組成物は、組成物の重量に対して、約１×１０６〜約１×１０１１ＣＦＵ／ｇの量の細菌株を含む。例えば、組成物は、約１×１０３〜約１×１０１１ＣＦＵ／ｇ；例えば、約１×１０７〜約１×１０１０ＣＦＵ／ｇ；別の例では、約１×１０６〜約１×１０１０ＣＦＵ／ｇ；別の例では、約１×１０７〜約１×１０１１ＣＦＵ／ｇ；別の例では、約１×１０８〜約１×１０１０ＣＦＵ／ｇ；別の例では、約１×１０８〜約１×１０１１ＣＦＵ／ｇ、約１×１０８〜約１×１０１０ＣＦＵ／ｇの細菌株を含み得る。用量は、例えば、１ｇ、３ｇ、５ｇ、または、１０ｇとし得る。
【０１２９】
組成物は、プロバイオティクスとして製剤し得る。プロバイオティクスは、適量を投与すると、宿主に健康上の利益をもたらす生きた微生物として、ＦＡＯ／ＷＨＯが定義している。
【０１３０】
一般的には、本発明の組成物などのプロバイオティクスは、少なくとも１つの適切なプレバイオティクス化合物と任意に組み合わせる。特定の実施形態では、本発明のプロバイオティクス組成物は、総重量組成に対して、約１〜約３０重量％（例えば、５〜２０重量％）の量のプレバイオティクス化合物を含む。公知のプレバイオティクスとして、イヌリンやトランスガラクトオリゴ糖などの市販品がある。
【０１３１】
プレバイオティック化合物は、通常、上部消化管において分解または吸収されない、非消化性炭水化物、例えば、オリゴ−もしくは多糖、または、糖アルコールである。炭水化物は：フラクト−オリゴ糖（または、ＦＯＳ）、短鎖フラクト−オリゴ糖、イヌリン、イソマルト−オリゴ糖、ペクチン、キシロ−オリゴ糖（または、ＸＯＳ）、キトサン−オリゴ糖（または、ＣＯＳ）、ベータ−グルカン、アラビアガム変性及び耐性デンプン、ポリデキストロース、Ｄ−タガトース、アカシアファイバ、イナゴマメ、オート麦、及び、シトラスファイバからなる群から選択し得る。ある態様では、プレバイオティクスは、短鎖フラクト−オリゴ糖（以下、本明細書では、ＦＯＳｓ−ｃ．ｃと略記する）であり；当該ＦＯＳｓ−ｃ．ｃ．は、一般的には、テンサイ糖の転換によって得られ、かつ、３のグルコース分子が結合しているサッカロース分子を含んでいる消化性炭水化物ではない。
【０１３２】
その他のプレバイオティクス化合物（例えば、ビタミンＣなど）を、脱酸素剤として含むことで、インビボでの送達、及び／または、部分的または全体的なコロニー形成、及び、生存を改善し得る。あるいは、本発明のプロバイオティック組成物は、食品または栄養製品、例えば、ミルクまたはホエイをベースとした発酵乳製品として、または、医薬製品として経口投与し得る。
【０１３３】
本発明の組成物は、薬学的に許容される賦形剤または担体を含み得る。そのような好適な賦形剤の例は、参照文献［３７］に認め得る。治療的使用のための許容可能な担体または希釈剤は、製薬分野において周知であり、例えば、参照文献［３８］に記載がある。好適な担体の例として、ラクトース、デンプン、グルコース、メチルセルロース、ステアリン酸マグネシウム、マンニトール、ソルビトールなどがある。好適な希釈剤の例として、エタノール、グリセロール、及び、水がある。医薬担体、賦形剤、または、希釈剤の選択は、意図する投与経路、及び、標準の薬務に照らして選択し得る。医薬組成物は、上記した担体、賦形剤、または、希釈剤として、または、これらに加えて、あらゆる好適な結合剤（複数可）、潤滑剤（複数可）、懸濁剤（複数可）、コーティング剤（複数可）、可溶化剤（複数可）を含み得る。好適な結合剤の例として、デンプン、ゼラチン、天然糖、例えば、グルコース、無水ラクトース、自由流動性ラクトース、ベータ−ラクトース、コーンシロップ、天然及び合成ガム、例えば、アカシア、トラガカント、または、アルギン酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロース、及び、ポリエチレングリコールがある。好適な潤滑剤の例として、オレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸マグネシウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウムなどがある。防腐剤、安定剤、染料、及び、香味剤も、医薬組成物に使用し得る。防腐剤の例として、安息香酸ナトリウム、ソルビン酸、システイン、及び、ｐ−ヒドロキシ安息香酸のエステルがあり、例えば、一部の実施形態では、防腐剤は、安息香酸ナトリウム、ソルビン酸、及び、ｐ−ヒドロキシ安息香酸のエステルから選択する。酸化防止剤、及び、懸濁剤も使用し得る。好適な担体のさらなる例は、サッカロースである。防腐剤のさらなる例は、システインである。
【０１３４】
本発明の組成物は、食品として提供し得る。例えば、食品は、例えば、栄養補助食品において、本発明の治療効果に加えて、栄養的利益を付与し得る。同様に、食品は、本発明の組成物の風味を良好ならしめ、または、組成物を、医薬組成物よりもむしろ、一般食料との類似性を高めることで、商品の魅力を高めて提供し得る。特定の実施形態では、本発明の組成物を、ミルクをベースとした製品として提供する。用語「ミルクをベースとした製品」とは、変動する脂肪分を有する、あらゆる液体または半固体のミルク−またはホエイをベースとした製品を意味する。ミルクをベースとした製品は、例えば、ウシのミルク、ヤギのミルク、ヒツジのミルク、スキムミルク、全乳、無処理の粉ミルク及びホエイ由来の還元乳、または、加工品、例えば、ヨーグルト、凝固ミルク、カード、酸乳、酸全乳、バターミルク、及び、その他の酸乳製品とし得る。別の重要な群として、ミルク飲料、例えば、ホエイ飲料、発酵乳、コンデンスミルク、乳幼児ミルク；フレーバーミルク、アイスクリーム；ミルク含有食品、例えば、スイーツがある。
【０１３５】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａを含み、そして、その他の種に由来する細菌を含まず、または、その他の種に由来する最小限の細菌、または、生物学的に無関係な量の細菌だけを含む。一部の実施形態では、本発明の組成物は、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの単一の株を含み、そして、その他の種に由来する細菌を含まず、または、その他の種に由来する最小限の、または、生物学的に無関係な量の細菌だけを含む。そのような組成物は、その他の種の生物を実質的に含まない培養物とし得る。一部の実施形態では、そのような組成物は、その他の種の生物を実質的に含まない凍結乾燥物であり得る。
【０１３６】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、２つ以上の細菌株を含む。例えば、一部の実施形態では、本発明の組成物は、同じ種に由来する２つ以上の（例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、１０個、１５個、２０個、２５個、３０個、３５個、４０個、または、４５個を超える）株を含み、そして、任意に、その他の種に由来する細菌を含まない。一部の実施形態では、本発明の組成物は、同じ種に由来する５０個未満（例えば、４５個、４０個、３５個、３０個、２５個、２０個、１５個、１２個、１０個、９つ、８つ、７つ、６つ、５つ、４つ、または、３つ未満）の株を含み、そして、任意に、その他の種に由来する細菌を含まない。一部の実施形態では、本発明の組成物は、同じ種に由来する１〜４０個、１〜３０個、１〜２０個、１〜１９個、１〜１８個、１〜１５個、１〜１０個、１〜９個、１〜８個、１〜７個、１〜６個、１〜５個、１〜４個、１〜３個、１〜２個、２〜５０個、２〜４０個、２〜３０個、２〜２０個、２〜１５個、２〜１０個、２〜５個、６〜３０個、６〜１５個、１６〜２５個、または、３１〜５０個の株を含み、そして、任意に、その他の種に由来する細菌を含まない。本発明は、上記したあらゆる組み合わせを含む。
【０１３７】
一部の実施形態では、組成物は、微生物コンソーシアムを含む。例えば、一部の実施形態では、組成物は、微生物コンソーシアムの一部としてＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ細菌株を含む。例えば、一部の実施形態では、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ細菌株は、腸においてインビボで共生的に生きることができる、その他の属に由来する１または２以上（例えば、少なくとも２つ、３つ、４つ、５つ、１０個、１５個、または、２０個）のその他の細菌株と併存する。例えば、一部の実施形態では、組成物は、異なる属に由来する細菌株と共に、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの細菌株を含む。別の例では、組成物は、属Ｂｌａｕｔｉａに由来する細菌株と共に、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの細菌株を含み、または、組成物は、属Ｂｌａｕｔｉａに由来する細菌株と、異なる属に由来する細菌株と共に、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａの細菌株を含む。一部の実施形態では、微生物コンソーシアムは、単一の生物、例えば、ヒトの糞便試料から得た２つ以上の細菌株を含む。一部の実施形態では、微生物コンソーシアムは、自然界では一緒には認められない。例えば、一部の実施形態では、微生物コンソーシアムは、少なくとも２つの異なる生物の糞便試料から得た細菌株を含む。一部の実施形態では、２つの異なる生物は、同種、例えば、２名の異なるヒトに由来する。一部の実施形態では、２つの異なる生物は、ヒト乳児、及び、ヒト成人である。一部の実施形態では、２つの異なる生物は、ヒト、及び、非ヒト哺乳動物である。
【０１３８】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株と同じ安全性と治療効能特性とを備えた細菌株をさらに含むが、同細菌株は、受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株ではなく、または、Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａではなく、もしくは、Ｂｌａｕｔｉａではない。
【０１３９】
本発明の組成物が、２つ以上の細菌株、種、または、属を含む一部の実施形態では、個々の細菌株、種、または、属を、別個の、同時の、または、逐次的な投与に供し得る。例えば、組成物は、２つ以上の細菌株、種、または、属のすべてを含み得る、または、細菌株、種、または、属は、別々に貯蔵し得る、また、別個の、同時の、または、逐次的な投与に供し得る。一部の実施形態では、２つ以上の細菌株、種、または、属を、別々に貯蔵しておくが、使用前に一緒に混合する。
【０１４０】
一部の実施形態では、本発明での使用のための細菌株は、ヒト成人の糞便から得る。本発明の組成物が、２つ以上の細菌株を含む一部の実施形態では、細菌株のすべてを、ヒト成人の糞便から得る、または、その他の細菌株が存在する場合には、最小限の量で存在する。細菌を、ヒト成人の糞便から得て、本発明の組成物で使用した後に培養し得る。
【０１４１】
一部の実施形態では、１または２以上のＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ細菌株は、本発明の組成物において、唯一の治療的活性剤（複数可）である。一部の実施形態では、組成物での細菌株（複数可）は、本発明の組成物において唯一の治療的活性剤（複数可）である。
【０１４２】
本発明による使用のための組成物は、必ずしも、販売承認を必要としない。
【０１４３】
特定の実施形態では、本発明は、上記した細菌株を凍結乾燥した上記した医薬組成物を提供する。特定の実施形態では、本発明は、上記した細菌株を噴霧乾燥した上記した医薬組成物を提供する。特定の実施形態では、本発明は、細菌株を凍結乾燥または噴霧乾燥しており、また、同細菌株が生きている上記した医薬組成物を提供する。特定の実施形態では、本発明は、細菌株を凍結乾燥または噴霧乾燥しており、また、同細菌株が生存している上記した医薬組成物を提供する。特定の実施形態では、本発明は、細菌株を凍結乾燥または噴霧乾燥しており、また、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる上記した医薬組成物を提供する。特定の実施形態では、本発明は、細菌株を凍結乾燥または噴霧乾燥しており、また、贈細菌株が生存しており、かつ、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる上記した医薬組成物を提供する。
【０１４４】
一部の事例では、凍結乾燥または噴霧乾燥した細菌株は、投与前に再構成する。一部の事例では、再構成は、本明細書に記載した希釈剤を使用して行う。
【０１４５】
本発明の組成物は、薬学的に許容される賦形剤、希釈剤、または、担体を含むことができる。
【０１４６】
特定の実施形態では、本発明は、本発明の細菌株；及び、薬学的に許容される賦形剤、担体、または、希釈剤を含み；細菌株は、それを必要とする対象に対して投与した場合に、障害を治療するのに十分な量であり；及び、当該障害が、肺傷害または肺疾患、特に、喘息、ＡＲＤＳ、または、ＣＯＰＤである、医薬組成物を提供する。
【０１４７】
特定の実施形態では、本発明は、細菌株の量が、組成物の重量に対して、グラム当たり、約１×１０３〜約１×１０１１個のコロニー形成単位である、上記した医薬組成物を提供する。
【０１４８】
特定の実施形態では、本発明は、上記した医薬組成物を提供するものであり、組成物を、５００ｍｇ〜１０００ｍｇの間、６００ｍｇ〜９００ｍｇの間、７００ｍｇ〜８００ｍｇの間、５００ｍｇ〜７５０ｍｇの間、または、７５０ｍｇ〜１０００ｍｇの間の用量で投与する。特定の実施形態では、本発明は、上記した医薬組成物を提供するものであり、当該医薬組成物での凍結乾燥細菌を、５００ｍｇ〜１０００ｍｇの間、６００ｍｇ〜９００ｍｇの間、７００ｍｇ〜８００ｍｇの間、５００ｍｇ〜７５０ｍｇの間、または、７５０ｍｇ〜１０００ｍｇの間の用量で投与する。
【０１４９】
特定の実施形態では、本発明は、上記した医薬組成物を提供するものであり、組成物を、経口、直腸、皮下、鼻、頬側、及び、舌下からなる群から選択する方法で投与する。
【０１５０】
特定の実施形態では、本発明は、ラクトース、デンプン、グルコース、メチルセルロース、ステアリン酸マグネシウム、マンニトール、及び、ソルビトールからなる群から選択する担体を含む、上記の医薬組成物を提供する。
【０１５１】
特定の実施形態では、本発明は、エタノール、グリセロール、及び、水からなる群から選択する希釈剤を含む、上記した医薬組成物を提供する。
【０１５２】
特定の実施形態では、本発明は、デンプン、ゼラチン、グルコース、無水ラクトース、自由流動性ラクトース、ベータ−ラクトース、トウモロコシ甘味料、アカシア、トラガカント、アルギン酸ナトリウム、カルボキシメチルセルロース、ポリエチレングリコール、オレイン酸ナトリウム、ステアリン酸ナトリウム、ステアリン酸マグネシウム、安息香酸ナトリウム、酢酸ナトリウム、及び、塩化ナトリウムからなる群から選択する賦形剤を含む、上記した医薬組成物を提供する。
【０１５３】
特定の実施形態では、本発明は、防腐剤、抗酸化剤、及び、安定剤の内の少なくとも１つをさらに含む、上記した医薬組成物を提供する。
【０１５４】
特定の実施形態では、本発明は、安息香酸ナトリウム、ソルビン酸、及び、ｐ−ヒドロキシ安息香酸のエステルからなる群から選択する防腐剤を含む、上記した医薬組成物を提供する。
【０１５５】
特定の実施形態では、本発明は、当該細菌株を凍結乾燥している、上記した医薬組成物を提供する。
【０１５６】
特定の実施形態では、本発明は、組成物を、約４℃または約２５℃で、密閉容器に貯蔵して、容器を５０％の相対湿度を有する雰囲気に置いた場合に、コロニー形成単位で測定した細菌株の少なくとも８０％が、少なくとも約１ヶ月、３ヶ月、６ヶ月、１年、１．５年、２年、２．５年、または、３年の期間の後にも残存している、上記した医薬組成物を提供する。
【０１５７】
一部の実施形態では、本発明の組成物は、本明細書に記載した組成物を含む密閉容器で提供する。一部の実施形態では、密閉容器は、小袋またはボトルである。一部の実施形態では、本発明の組成物は、本明細書に記載した組成物を含むシリンジで提供する。
【０１５８】
本発明の組成物は、一部の実施形態では、医薬製剤として提供し得る。例えば、組成物は、錠剤またはカプセルとして提供し得る。一部の実施形態では、カプセルは、ゼラチンカプセル（「ｇｅｌ−ｃａｐ」）である。カプセルは、硬質カプセル、軟質カプセルのいずれでも使用できる。一部の実施形態では、製剤は、軟質カプセルである。軟質カプセルは、カプセルシェルに存在する軟化剤、例えば、グリセロール、ソルビトール、マルチトール、及び、ポリエチレングリコールを添加することで、ある特定の弾性及び柔軟性を有し得るカプセルである。軟質カプセルは、例えば、ゼラチンまたはデンプンをベースとして製造し得る。ゼラチンをベースとした軟質カプセルは、様々な業者が市販している。例えば、経口または経直腸などの投与方法に応じて、軟質カプセルを、例えば、円形、楕円形、長方形、または、魚雷型などの様々な形状にすることができる。軟質カプセルは、従来のプロセス、例えば、Ｓｃｈｅｒｅｒプロセス、Ａｃｃｏｇｅｌプロセス、または、液滴または発泡プロセスなどで製造し得る。
【０１５９】
一部の実施形態では、本発明の組成物を、経口投与する。経口投与は、嚥下が関係した結果、化合物を、胃腸管に送り込むものであり、及び／または、頬側、舌側、または、舌下投与では、化合物を、口から直接に血流に乗せる。
【０１６０】
経口投与に適した医薬製剤として、固体プラグ、固体微粒子状物、半固体、及び、液体（多相、または、分散系を含む）、例えば、錠剤；多−またはナノ−粒子状物を含有する軟質または硬質カプセル、液体（例えば、水溶液）；エマルジョン、または、粉末；ロゼンジ（液体を充填したものを含む）；咀嚼剤；ゲル；急速分散剤形；フィルム；膣坐剤；スプレー；及び、頬側／粘膜接着パッチがある。
【０１６１】
一部の実施形態では、医薬製剤は、腸溶性製剤、すなわち、本発明の組成物を経口投与して腸に送達させることに適した胃耐性製剤（例えば、胃のｐＨに耐性を示すもの）である。腸溶性製剤は、組成物の細菌または別の成分が酸感受性である、例えば、胃条件下で分解しやすい場合に、特に有用となり得る。
【０１６２】
一部の実施形態では、腸溶性製剤は、腸溶性コーティングを含む。一部の実施形態では、製剤は、腸溶性コーティングした剤形である。例えば、製剤は、腸溶性コーティングした錠剤、または、腸溶性コーティングしたカプセルなどとし得る。腸溶性コーティングは、経口送達のための従来の腸溶性コーティング、例えば、錠剤、カプセルなどのための従来のコーティングとし得る。製剤は、フィルムコーティング、例えば、腸溶性ポリマー、例えば、酸不溶性ポリマーの薄膜層を含み得る。
【０１６３】
一部の実施形態では、腸溶性製剤は、本質的に腸溶性であり、例えば、腸溶性コーティングが無くとも胃耐性である。そのため、一部の実施形態では、製剤は、腸溶性コーティングを含まない腸溶性製剤である。一部の実施形態では、製剤は、熱ゲル化材料から作製したカプセルである。一部の実施形態では、熱ゲル化材料は、セルロース系材料、例えば、メチルセルロース、ヒドロキシメチルセルロース、または、ヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）である。一部の実施形態では、カプセルは、フィルム形成ポリマーを含まないシェルを含む。一部の実施形態では、カプセルは、シェルを含み、このシェルは、ヒドロキシプロピルメチルセルロースを含み、フィルム形成ポリマーは含まない（例えば、［３９］を参照されたい）。一部の実施形態では、製剤は、本質的に腸溶性のカプセル（例えば、ＣａｐｓｕｇｅｌのＶｃａｐｓ（登録商標））である。
【０１６４】
培養方法
本発明での使用のための細菌株は、例えば、参照文献［４０〜４２］で詳述されている標準的な微生物学的技術を使用して培養することができる。
【０１６５】
培養に使用する固体または液体培地は、例えば、ＹＣＦＡ寒天、または、ＹＣＦＡ培地とし得る。ＹＣＦＡ培地は（１００ｍｌ当たり、近似値）：Ｃａｓｉｔｏｎｅ（１．０ｇ）、酵母エキス（０．２５ｇ）、ＮａＨＣＯ３（０．４ｇ）、システイン（０．１ｇ）、Ｋ２ＨＰＯ４（０．０４５ｇ）、ＫＨ２ＰＯ４（０．０４５ｇ）、ＮａＣｌ（０．０９ｇ）、（ＮＨ４）２ＳＯ４（０．０９ｇ）、ＭｇＳＯ４・７Ｈ２Ｏ（０．００９ｇ）、ＣａＣｌ２（０．００９ｇ）、レザズリン（０．１ｍｇ）、ヘミン（１ｍｇ）、ビオチン（１μｇ）、コバラミン（１μｇ）、ｐ−アミノ安息香酸（３μｇ）、葉酸（５μｇ）、及び、ピリドキサミン（１５μｇ）を含み得る。
【０１６６】
ワクチン組成物での使用のための細菌株
本発明者らは、本発明の細菌株が、肺疾患または肺傷害の治療に有用であることを確認した。本発明の細菌組成物は、肺疾患または肺傷害の予防にも有用である。このことは、本発明の細菌株が、宿主免疫系に及ぼす影響の結果であり得る。したがって、本発明の組成物を、ワクチン組成物として投与すると、そのような疾患または障害の予防にも有用となり得る。特定のそのような実施形態では、本発明の細菌株は、生存可能である。特定のそのような実施形態では、本発明の細菌株は、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる。特定のそのような実施形態では、本発明の細菌株は、生存可能であり、かつ、腸に部分的または全体的にコロニーを形成することができる。その他の特定のそのような実施形態では、本発明の細菌株は、死滅する、不活化する、または、弱毒化し得る。特定のそのような実施形態では、組成物は、ワクチンアジュバントを含み得る。特定の実施形態では、組成物は、皮下注射などの注射投与用のものである。
【０１６７】
総則
本発明の実施は、特に断りのない限り、当該技術分野の範囲内で、化学、生化学、分子生物、免疫学、及び、薬理学の従来の方法を使用する。これらの技術は、文献において十分に説明されている。例えば、参照文献［４３〜５０］などを参照されたい。
【０１６８】
用語「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ（含む）」は、「ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ（含む）」、及び、「ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ（からなる）」を含んでおり、例えば、組成物が、Ｘを「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ（含む）」とは、Ｘだけで構成していることもあれば、さらなる別の要素、例えば、Ｘ＋Ｙを含み得る。
【０１６９】
数値ｘに関係する用語「約」は、任意のものであり、例えば、ｘ±１０％を意味する。
【０１７０】
単語「実質的に」は、「完全に」を排除するものではなく、例えば、Ｙを「実質的に含まない」組成物では、Ｙを全く含んでいない。必要に応じて、単語「実質的に」は、本発明の定義から省略し得る。
【０１７１】
２つのヌクレオチド配列間の配列同一性のパーセンテージに関する言及は、２つの配列を整列させて比較した場合に同じになるヌクレオチドのパーセンテージを意味する。このアラインメント、及び、パーセント相同性、または、配列同一性は、当該技術分野において公知のソフトウェアプログラム、例えば、参照文献［５１］のセクション７．７．１８に記載されているものを使用して決定し得る。好ましいアラインメントは、１２のギャップオープンペナルティ、及び、２のギャップエクステンションペナルティ、６２のＢＬＯＳＵＭマトリクスによるアフィンギャップ検索を使用して、Ｓｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムで決定する。Ｓｍｉｔｈ−Ｗａｔｅｒｍａｎ相同性検索アルゴリズムは、参照文献［５２］に開示されている。
【０１７２】
その他の利用可能なコンピュータプログラムは、ＢＬＡＳＴまたはＦＡＳＴＡであり、そこでは、２つの配列を、それぞれの残基の符合が最も多くなるように（一方または両方の配列の全長に沿って、または、一方または両方の配列の所定の部分に沿って）整列させる。これらのプログラムは、デフォルトの開始ペナルティと、デフォルトのギャップペナルティを提供し、そして、ＰＡＭ２５０［５３］などのスコアリングマトリックスを、コンピュータプログラムと組み合わせて使用することができる。例えば、同一性のパーセンテージは、次のように計算する：完全な一致の総数に１００を乗じ、次いで、一致したスパンでの長い方の配列の長さと、２つの配列を整列させるために短い配列に導入したギャップの数との合計値で割る。
【０１７３】
特に断りのない限り、多数のステップを含むプロセスまたは方法は、方法の開始時点または終了時点にさらなるステップを含み得る、または、さらなる介在するステップを含み得る。また、ステップは、必要に応じて、組み合わせ、省略し、または、別の順序で実施し得る。
【０１７４】
本発明の様々な実施形態を、本明細書に記載している。それぞれの実施形態で特定した特徴は、その他の特定した特徴と組み合わせることで、さらなる実施形態を提供し得ることが理解されよう。特に、好適な、一般的な、または、好ましい実施形態として、本明細書で特筆した実施形態は、（これらが互いに排他的である場合を除いて）互いに組み合わせ得る。
【０１７５】
本明細書で引用したすべての特許及び参考文献は、本明細書の一部を構成するものとして、それらの全内容を援用する。
【０１７６】
患者に対して作用物質を投与することを含む治療方法に関連して、当該治療方法における使用のための当該作用物質、ならびに、当該治療方法における当該作用物質の使用、及び、薬剤の製造での当該作用物質の使用をも含む。
【０１７７】
以下の実施例は、例示目的で提供したものに過ぎず、また、本発明の範囲を限定する意図は全く無い。
【実施例】
【０１７８】
発明を実施するための形態
実施例１−マウスモデルにおける肺傷害または肺疾患に関する影響
マウスに対して、本発明の細菌株を含む組成物を投与し、そして、十分に確立された炎症反応の誘因であるＬＰＳを接種した。肺でのＬＰＳに対する炎症反応は、肺傷害または肺疾患についてのモデルである。本発明の組成物で治療したマウスが示す炎症反応の大きさを、対照群と比較した。本発明の組成物は、肺組織の炎症を抑制することが認められており、このことは、それらが、肺疾患または肺傷害の治療に有用であり得ることを示した。
【０１７９】
治療スケジュール
以下に示すスケジュールに従って治療を行った：
【表１】
2021529816.tif 000003
投与量は、１００μｌ／マウスであった。ｎ／ａ：該当なし、ＳＩＤ：１日１回、ＰＯ：経口投与（強制経口投与）、ＬＰＳ：リポ多糖、ＩＮ：鼻腔内、ＩＶ：静脈内、ＷＦＩ：注射用水
【０１８０】
動物を取り扱う際に、治療グループが変わる度に手袋を交換し、そして、同じグループ内のそれぞれのケージに対して７０％エタノール溶液を噴霧して、汚染の危険性を最小限に抑えた。同じグループについて、毎日同じ時間に治療を行うことを回避するために、すべての治療は、無作為に、かつ、毎日交互に行った。
【０１８１】
成体の雌のＣ５７ＢＬ／６マウスを、体重に応じて６つの実験群（群１、２、３、４、５、６：１０匹のマウス／群）に無作為に分け、そして、１週間かけて順応させた。最初の投与日を、−１４日目（治療前のベースライン）とした。グループ２〜６については、表１に概説したように、無作為に毎日治療を行い、そして、同じグループが、毎日同じ時間に治療を行うことを回避するために、毎日交互に治療を行った。０日目に、グループ３〜６には、リポ多糖（ＬＰＳ、Ｓｉｇｍａ）を含む生理食塩水（ＮａＣｌ  ０．９％）を鼻腔内経路で投与した；グループ１と２には、生理食塩水（ＮａＣｌ  ０．９％）だけを、鼻腔内経路で投与した。鼻腔内投与は、イソフルラン麻酔下で行った。次いで、ＬＰＳ投与の６、１２、及び、２４時間後に、急性肺傷害の臨床的兆候について、マウスのスコア評価を行った。
【０１８２】
肺の解剖
グループ１〜６に関して、１日目に肺を解剖し、組織固定液に移してから、パラフィンワックスに包埋し、そして、組織病理学分析まで保存した。
【０１８３】
盲腸解剖
グループ１〜６に関して、１日目に、盲腸全体（及び、その内容物）と、以下のセクションの各々の２センチメートルを、Ｑｉａｇｅｎプレフィルドチューブ（５ｍｌ）に採り、４℃で、一晩保存し、次いで、−８０℃で保存した：十二指腸、空腸、盲腸上流の回腸、上行結腸、横行結腸、及び、下行結腸。
【０１８４】
体重
グループ１〜６に関して、−１４日目から１日目まで、週に３回、動物の体重を測定した。０日目と１日目にも、すべての動物の体重を測定した。動物の触診と取り扱いは、同じ動物を、同じ時点で取り扱うことを回避するために、毎日交互に、無作為に行った。
【０１８５】
糞便ペレット
グループ１〜６に関して、−１４日目と−２日目に、それぞれの動物から糞便ペレットを回収し、そして、直ちに急速凍結して、−８０℃で保存した。
【０１８６】
血液試料
グループ１〜６に関して、−１４日目と１日目に、それぞれの動物の尾（尾部）静脈から血液試料を回収し、半量をＥＤＴＡチューブに、そして、半量をリチウム−ヘパリンチューブに入れた。チューブを、２０００ｇ＋４℃で、１０分間、遠心分離し、次いで、血漿を、ピペットで取り出し、そして、２つに等分した。１日目に、終末血液試料を眼窩静脈叢から回収し、そして、ＥＤＴＡチューブに入れて、血漿を分離するために処理した。各時点で試料を回収する際に、群を無作為化した。試料を、−８０℃で保存した。
【０１８７】
株
受託番号ＤＳＭ  １４２９４で寄託したＢｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ細菌。凍結乾燥粉末として提供を受け、そして、再構成した。
【０１８８】
測定値
臨床観察
グループ１〜６に関して、０日目に、Ｔ＝０時間、６時間、１２時間で、そして、１日目に、Ｔ＝２４時間で、異常な姿勢（背を丸める）、異常な毛の状態（立毛）、及び、異常な活動レベル（活動の減少または増加）などの動物の臨床徴候についてスコアを定めた。
【０１８９】
肺の組織病理学
グループ１〜６に関して、肺切片を作成し、ヘマトキシリン及びエオシンで染色し、そして、資格を有する組織病理学者が、炎症の兆候についてスコアを定めた。肺のそれぞれのセット：１つの頭蓋葉と反対側の尾状葉とから２つの標準切片を採取した。スコアリングシステムは、Ｓｕｅｔａｌ［５４］のものを使用した。最も深刻な影響を受けた肺切片を、スコアリングした。好中球性炎症、出血、浮腫、壊死、及び、無気肺は、それぞれ、以下に示すスケールでスコアリングした。
（０）正常；
（１）０〜２５％の面積が影響を受けた；
（２）２５〜５０％の面積が影響を受けた；
（３）５０〜７５％の面積が影響を受けた；
（４）７５〜１００％の面積が影響を受けた。
【０１９０】
結果
グラム単位の体重を、図１に示す。図１の１日目に認められた体重の変動は、このモデルで予想した通りのものであった。データは、平均±ＳＥＭで表している。
【０１９１】
全体として、ＬＰＳ接種動物では、このモデルで予想したような組織病理学的変化は、大半の事例において、尾状葉よりも、頭蓋葉で深刻な影響を及ぼしていた。これらの変化として、気管支周囲、血管周囲、間質、及び、肺胞内分布にまで及ぶ好中球性炎症；限局性の肺胞内または血管周囲の出血、それに、限局性の無気肺及び肺気腫がある。
【０１９２】
グループ１及び２の未接種の動物の肺では、予想した通り、無視可能な病状は認められなかった。一元配置分散分析と、それに続くＤｕｎｎｅｔｔの事後検定で評価したところ、これらのグループと媒体グループとの差異は、有意であった（ｐ＜０．０００１）。残余のグループは、すべて、様々な程度の病理学的変化を示した；グループ３で、症状が最も重く、メチルプレドニゾロン（グループ４）、Ｂｌａｕｔｉｘ  ＦＤＰ（グループ５）、及び、Ｌｙｏｂｕｆｆｅｒ  ＦＤＰ（グループ６）のグループの重症度は低かった（図２）。一元配置分散分析と、それに続くＤｕｎｎｅｔｔの事後検定と、対応のない両側スチューデントのｔ検定のそれぞれで評価したところ、組織病理学のスコアは、メチルプレドニゾロン（ｐ＜０．０１）と、Ｂｌａｕｔｉｘ  ＦＤＰ（ｐ＜０．０１）のグループで大幅に改善した。メチルプレドニゾロンと、Ｂｌａｕｔｉｘ  ＦＤＰは、媒体と比較して、組織病理学的スコアを有意に低下していた。代表的な組織病理学的画像については、図３を参照されたい。
【０１９３】
実施例２：安定性試験
本明細書に記載した少なくとも１つの細菌株を含む本明細書に記載の組成物を、２５℃または４℃で、密閉容器に保存し、そして、容器を、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、９０％、または、９５％の相対湿度の雰囲気下に置く。１ヶ月、２ヶ月、３ヶ月、６ヶ月、１年、１．５年、２年、２．５年、または、３年後に、標準プロトコルで決定したコロニー形成単位で測定した場合に、細菌株の少なくとも５０％、６０％、７０％、８０％、または、９０％が残存する。
【０１９４】
配列
配列番号１（Ｂｌａｕｔｉａ  ｈｙｄｒｏｇｅｎｏｔｒｏｐｈｉｃａ株Ｓ５ａ３６  １６ＳリボソームＲＮＡ遺伝子、部分配列−Ｘ９５６２４．１）
1    gatgaacgct ggcggcgtgc ttaacacatg caagtcgaac gaagcgatag agaacggaga
61   tttcggttga agttttctat tgactgagtg gcggacgggt gagtaacgcg tgggtaacct
121  gccctataca gggggataac agttagaaat gactgctaat accgcataag cgcacagctt
181  cgcatgaagc ggtgtgaaaa actgaggtgg tataggatgg acccgcgttg gattagctag
241  ttggtgaggt aacggcccac caaggcgacg atccatagcc ggcctgagag ggtgaacggc
301  cacattggga ctgagacacg gcccaaactc ctacgggagg cagcagtggg gaatattgca
361  caatggggga aaccctgatg cagcgacgcc gcgtgaagga agaagtatct cggtatgtaa
421  acttctatca gcagggaaga aagtgacggt acctgactaa gaagccccgg ctaattacgt
481  gccagcagcc gcggtaatac gtaaggggca agcgttatcc ggatttactg ggtgtaaagg
541  gagcgtagac ggtttggcaa gtctgatgtg aaaggcatgg gctcaacctg tggactgcat
601  tggaaactgt cagacttgag tgccggagag gcaagcggaa ttcctagtgt agcggtgaaa
661  tgcgtagata ttaggaggaa caccagtggc gaaggcggcc tgctggacgg taactgacgt
721  tgaggctcga aagcgtgggg agcaaacagg attagatacc ctggtagtcc acgctgtaaa
781  cgatgaatac taggtgtcgg gtggcaaagc cattcggtgc cgcagcaaac gcaataagta
841  ttcccacctg gggagtacgt tcgcaagaat gaaactcaaa ggaattgacg gggacccgca
901  caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa gcaacgcgaa gaaccttacc aaatcttgac
961  atccctctga ccgggaagta atgttccctt ttcttcggaa cagaggagac aggtggtgca
1021 tggttgtcgt cagctcgtgt cgtgagatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct
1081 tattcttagt agccagcagg tagagctggg cactctaggg agactgccag ggataacctg
1141 gaggaaggtg gggatgacgt caaatcatca tgccccttat gatttgggct acacacgtgc
1201 tacaatggcg taaacaaagg gaagcgaagg ggtgacctgg agcaaatctc aaaaataacg
1261 tctcagttcg gattgtagtc tgcaactcga ctacatgaag ctggaatcgc tagtaatcgc
1321 gaatcagaat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta cacaccgccc gtcacaccat
1381 gggagtcagt aacgcccgaa gtcagtgacc caaccnaaag gagggagctg ccgaaggtgg
1441 gactgataac tggggtga
【０１９５】
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【図１】
2021529816.tif 000004
【図２】
2021529816.tif 000005
【図３Ａ】
2021529816.tif 000006
【図３Ｂ】
2021529816.tif 000007
【配列表】
2021529816000001.app
【国際調査報告】
2021529816.tif 000008
2021529816.tif 000009