(57)【要約】  本明細書では、ＯＸ４０に結合するＶＨＨ含有ポリペプチドが提供される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０に結合して作動するＶＨＨ含有ポリペプチドが提供される。ＶＨＨ含有ポリペプチドの使用も提供される。【選択図】図５
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドであって、前記ＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む、ポリペプチド。
【請求項２】
前記ＶＨＨドメインは、ヒト化されている、請求項１に記載のポリペプチド。
【請求項３】
前記ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）を含む、請求項１又は２に記載のポリペプチド。
【請求項４】
前記ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むＦＲ２及び配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項５】
前記ＶＨＨドメインは、配列番号９のアミノ酸配列を含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項６】
２つのＶＨＨドメインを含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項７】
３つのＶＨＨドメインを含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項８】
４つのＶＨＨドメインを含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項９】
前記ポリペプチドは、ＯＸ４０以外の第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインを含む、請求項１〜８のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１０】
前記第２の抗原は、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、及び４１ＢＢから選択される、請求項９に記載のポリペプチド。
【請求項１１】
前記第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインは、アンタゴニスト又はアゴニストである、請求項１０に記載のポリペプチド。
【請求項１２】
各ＶＨＨドメインは、ＯＸ４０に結合する、請求項５〜８のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１３】
各ＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む、請求項１２に記載のポリペプチド。
【請求項１４】
各ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）を含む、請求項１３に記載のポリペプチド。
【請求項１５】
各ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むＦＲ２及び配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を含む、請求項１３又は１４に記載のポリペプチド。
【請求項１６】
各ＶＨＨドメインは、配列番号９のアミノ酸配列を含む、請求項１３〜１５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１７】
前記ポリペプチドは、Ｆｃドメインを含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項１８】
前記Ｆｃドメインは、配列番号２５及び配列番号２６から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１７に記載のポリペプチド。
【請求項１９】
前記ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列を含む、請求項１〜７のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項２０】
前記ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列を含む、請求項１〜７及び請求項１７のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項２１】
配列番号１５のアミノ酸配列を含むＯＸ４０に結合するポリペプチド。
【請求項２２】
配列番号１５のアミノ酸配列からなるＯＸ４０に結合するポリペプチド。
【請求項２３】
生理学的条件下で二量体を形成する、請求項１〜２２のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項２４】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる、請求項１〜２３のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項２５】
前記ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる、請求項２４に記載のポリペプチド。
【請求項２６】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる、請求項２４又は２５に記載のポリペプチド。
【請求項２７】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる、請求項１〜２６のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項２８】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる、請求項２７に記載のポリペプチド。
【請求項２９】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる、請求項１〜２８のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３０】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる、請求項２９に記載のポリペプチド。
【請求項３１】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を増加させる、請求項１〜３０のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３２】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる、請求項３１に記載のポリペプチド。
【請求項３３】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる、請求項１〜３２のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３４】
前記ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる、請求項３３に記載のポリペプチド。
【請求項３５】
前記ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下で前記発現を増加させる、請求項２６〜３４のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３６】
前記増加は、少なくとも５人又は少なくとも１０人の異なる健康なヒトドナーのＴ細胞からの結果の平均として決定される、請求項２４〜３５のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３７】
ＯＸ４０の生物学的活性のアゴニストである、請求項１〜３６のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３８】
前記ＯＸ４０は、ヒトＯＸ４０である、請求項１〜３７のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項３９】
前記ポリペプチドは、１０ｎＭ未満、５ｎＭ未満、２ｎＭ未満、又は１ｎＭ未満の親和性（ＫＤ）でヒトＯＸ４０に結合する、請求項１〜３８のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項４０】
前記ポリペプチドは、１０ｎＭ未満、５ｎＭ未満、２ｎＭ未満、又は１ｎＭ未満の親和性（ＫＤ）でカニクイザルＯＸ４０に結合する、請求項１〜３９のいずれか一項に記載のポリペプチド。
【請求項４１】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
【請求項４２】
請求項１〜４２のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする単離された核酸。
【請求項４３】
請求項４２に記載の核酸を含むベクター。
【請求項４４】
請求項４２に記載の核酸又は請求項４３に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項４５】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドを発現する宿主細胞。
【請求項４６】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドを分泌する、請求項４４又は４５に記載の宿主細胞。
【請求項４７】
初代ヒト細胞である、請求項４４〜４６のいずれか一項に記載の宿主細胞。
【請求項４８】
初代ヒトＴ細胞である、請求項４７に記載の宿主細胞。
【請求項４９】
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）−Ｔ細胞である、請求項４４〜４８のいずれか一項に記載の宿主細胞。
【請求項５０】
請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドを生産する方法であって、前記ポリペプチドの発現に適した条件下で請求項４４〜４６のいずれか一項に記載の宿主細胞をインキュベートすることを含む、方法。
【請求項５１】
前記ポリペプチドを単離することを更に含む、請求項５０に記載の方法。
【請求項５２】
ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる方法であって、Ｔ細胞を請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドと接触させることを含む、方法。
【請求項５３】
ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる方法であって、Ｔ細胞を請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドと接触させることを含む、方法。
【請求項５４】
ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる方法であって、Ｔ細胞を請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドと接触させることを含む、方法。
【請求項５５】
ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を増加させる方法であって、Ｔ細胞を請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドと接触させることを含む、方法。
【請求項５６】
ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる方法であって、Ｔ細胞を請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチドと接触させることを含む、方法。
【請求項５７】
前記ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで存在する、請求項５２〜５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５８】
前記ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞は、ｉｎ  ｖｉｖｏで存在する、請求項５２〜５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項５９】
前記ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞は、Ｔｒｅｇ細胞の存在下にある、請求項５７又は５８に記載の方法。
【請求項６０】
前記増加は、少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍である、請求項５２〜５９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６１】
癌を治療する方法であって、癌を伴う被験体に請求項１〜４０のいずれか一項に記載のポリペプチド、請求項４１に記載の医薬組成物、又は請求項４７〜４９のいずれか一項に記載の宿主細胞を薬学的有効量、投与することを含む、方法。
【請求項６２】
前記癌は、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳癌及び中枢神経系癌、乳癌、腹膜癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸直腸癌、結合組織癌、消化器系癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌、胃腸癌、膠芽腫、肝癌、肝細胞癌、上皮内新生物、腎臓癌又は腎癌、喉頭癌、肝臓癌、肺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔癌、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌、肉腫、皮膚癌、扁平上皮癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌又は子宮内膜癌、泌尿器系癌、外陰癌、リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、低悪性度／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、小リンパ球（ＳＬ）ＮＨＬ、中悪性度／濾胞性ＮＨＬ、中悪性度びまん性ＮＨＬ、高悪性度免疫芽球性ＮＨＬ、高悪性度リンパ芽球性ＮＨＬ、高悪性度小型非分割細胞ＮＨＬ、巨大病変ＮＨＬ、マントル細胞リンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、ワルデンストレームマクログロブリン血症、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、有毛細胞白血病、並びに慢性骨髄芽球性白血病から選択される、請求項６１に記載の方法。
【請求項６３】
追加の療法剤を投与することを更に含む、請求項６１又は６２に記載の方法。
【請求項６４】
前記追加の療法剤は、抗癌剤である、請求項６３に記載の方法。
【請求項６５】
前記抗癌剤は、化学療法剤、抗癌生物製剤、放射線療法、ＣＡＲ−Ｔ療法薬、及び腫瘍溶解性ウイルスから選択される、請求項６４に記載の方法。
【請求項６６】
前記追加の療法剤は、抗癌生物製剤である、請求項６３〜６５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項６７】
前記抗癌生物製剤は、ＰＤ−１及び／又はＰＤ−Ｌ１を阻害する作用物質である、請求項６６に記載の方法。
【請求項６８】
前記抗癌生物製剤は、ニボルマブ、ピディリズマブ、ペンブロリズマブ、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、ＡＭＰ−２２４、ＢＭＳ−９３６５５９、ＡＭＰ−５１４、ＭＤＸ−１１０５、ＴＳＲ−０４２、ＳＴＩ−Ａ１０１０、及びＳＴＩ−Ａ１１１０から選択される、請求項６７に記載の方法。
【請求項６９】
前記抗癌生物製剤は、ＶＩＳＴＡ、ｇｐＮＭＢ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＨＬＡ２、ＣＤ７３、ＣＴＬＡ４、又はＴＩＧＩＴを阻害する作用物質である、請求項６６に記載の方法。
【請求項７０】
前記抗癌剤は、抗体である、請求項６６〜６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項７１】
前記抗癌生物製剤は、サイトカインである、請求項６６に記載の方法。
【請求項７２】
前記抗癌剤は、ＣＡＲ−Ｔ療法薬である、請求項６６に記載の方法。
【請求項７３】
前記抗癌剤は、腫瘍溶解性ウイルスである、請求項６６に記載の方法。
【請求項７４】
腫瘍切除及び／又は放射線療法を更に含む、請求項６１〜７３のいずれか一項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
［関連出願の相互参照］
本願は、２０１８年８月１３日付で出願された米国仮出願第６２／７１８，１０６号の優先権の利益を主張し、その全体があらゆる目的で引用することにより本明細書の一部をなす。
【０００２】
本発明は、ＯＸ４０結合性ポリペプチド、及びＯＸ４０結合性ポリペプチドを使用してＯＸ４０の生物学的活性を調節する方法に関する。そのような方法には、限定されるものではないが、癌を治療する方法が含まれる。幾つかの実施の形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、多価ＯＸ４０結合性ポリペプチドである。
【背景技術】
【０００３】
腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー（ＴＮＦＲＳＦ）には、構造的に関連する幾つかの細胞表面受容体が含まれる。多量体リガンドによる活性化は、これらの受容体の多くに共通する特徴であり、そのような活性化は、適切に活性化されると多くの病理において治療的有用性を有する。この受容体ファミリーの効果的なアゴニズムは、従来の二価抗体を使用して達成されるよりも高次のクラスター形成を必要とし得る。
【０００４】
ＯＸ４０（ＴＮＦＲＳＦ４、ＣＤ１３４）は、ＴＮＦ受容体スーパーファミリーのメンバーであり、Ｔ細胞活性化の２４時間〜７２時間後にＴ細胞の表面上で発現される。活性化されたＴ細胞に近接した抗原提示細胞はその表面上にＯＸ４０リガンド（ＯＸ４０Ｌ）を提示し、このリガンドがＴ細胞上のＯＸ４０に結合してクラスターを形成することで、共刺激シグナルが送られ、それによりＴ細胞の増殖が増加し、エフェクターＴ細胞の分化が増強される。したがって、ＯＸ４０の活性化は、例えばＴ細胞の生存及び機能を増強することにより、免疫応答を維持する働きがある。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
したがって、ＯＸ４０のより強力なアゴニストが治療上必要とされている。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本明細書では、ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドであって、ＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む、ポリペプチドが提供される。幾つかの実施の形態では、ＶＨＨドメインは、ヒト化されている。幾つかの実施の形態では、ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）を含む。幾つかの実施の形態では、ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むＦＲ２及び配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を含む。幾つかの実施の形態では、ＶＨＨドメインは、配列番号９のアミノ酸配列を含む。
【０００７】
幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、２つのＶＨＨドメインを含む。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、３つのＶＨＨドメインを含む。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、４つのＶＨＨドメインを含む。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ＯＸ４０以外の第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインを含む。幾つかのそのような実施の形態では、第２の抗原は、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、及び４１ＢＢから選択される。幾つかの実施の形態では、第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインは、アンタゴニスト又はアゴニストである。幾つかの実施の形態では、第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインは、ＶＨＨドメインである。
【０００８】
幾つかの実施の形態では、各ＶＨＨドメインは、ＯＸ４０に結合する。幾つかの実施の形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む。幾つかの実施の形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）を含む。幾つかの実施の形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号２２のアミノ酸配列を含むＦＲ２及び配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を含む。幾つかの実施の形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号９のアミノ酸配列を含む。
【０００９】
幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、Ｆｃドメインを含む。幾つかの実施の形態では、Ｆｃドメインは、配列番号２５及び配列番号２６から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施の形態では、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＯＸ４０に結合するポリペプチドが本明細書で提供される。幾つかの実施の形態では、配列番号１５のアミノ酸配列からなるＯＸ４０に結合するポリペプチドが本明細書で提供される。
【００１０】
様々な実施の形態では、本明細書で提供されるポリペプチドは、生理学的条件下で二量体を形成する。幾つかのそのような実施の形態では、ポリペプチドは、Ｆｃドメインを含む。
【００１１】
幾つかの実施の形態では、本明細書で提供されるポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。
【００１２】
幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。
【００１３】
幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。
【００１４】
幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる。
【００１５】
幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる。
【００１６】
様々な実施の形態では、ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でＣＤ２５、ＣＤ７１、及び／又はＩＦＮγの発現を増加させる及び／又はＮＦκＢシグナル伝達を増加させる。様々な実施の形態では、増加は、少なくとも５人又は少なくとも１０人の異なる健康なヒトドナーのＴ細胞からの結果の平均として決定される。
【００１７】
様々な実施の形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドは、ＯＸ４０の生物学的活性のアゴニストである。幾つかの実施の形態では、ＯＸ４０は、ヒトＯＸ４０である。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、１０ｎＭ未満、５ｎＭ未満、２ｎＭ未満、又は１ｎＭ未満の親和性（ＫＤ）でヒトＯＸ４０に結合する。幾つかの実施の形態では、ポリペプチドは、１０ｎＭ未満、５ｎＭ未満、２ｎＭ未満、又は１ｎＭ未満の親和性（ＫＤ）でカニクイザルＯＸ４０に結合する。
【００１８】
幾つかの実施の形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物が提供される。
【００１９】
幾つかの実施の形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドをコードする単離された核酸が提供される。幾つかの実施の形態では、核酸を含むベクターが提供される。幾つかの実施の形態では、核酸又はベクターを含む宿主細胞が提供される。幾つかの実施の形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドを発現する宿主細胞が提供される。幾つかの実施の形態では、宿主細胞はＯＸ４０結合性ポリペプチドを分泌する。幾つかの実施の形態では、宿主細胞は初代ヒト細胞である。幾つかの実施の形態では、宿主細胞はＴ細胞である。幾つかの実施の形態では、宿主細胞はキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）−Ｔ細胞である。
【００２０】
幾つかの実施の形態では、ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドを製造する方法であって、該ポリペプチドの発現に適した条件下で宿主細胞をインキュベートすることを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、上記方法は、ポリペプチドを単離することを更に含む。
【００２１】
幾つかの実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる方法であって、Ｔ細胞をＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドと接触させることを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる方法であって、Ｔ細胞をＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドと接触させることを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる方法であって、Ｔ細胞をＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドと接触させることを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる方法であって、Ｔ細胞をＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドと接触させることを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＮＦκＢシグナル伝達を増加させる方法であって、Ｔ細胞をＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドと接触させることを含む、方法が提供される。様々な実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞は、ｉｎ  ｖｉｔｒｏで存在する。様々な実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞は、ｉｎ  ｖｉｖｏで存在する。様々な実施の形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞は、Ｔｒｅｇ細胞の存在下にある。様々な実施の形態では、増加は、少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍である。
【００２２】
幾つかの実施の形態では、癌を治療する方法であって、癌を伴う被験体に本明細書で提供されるＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドを薬学的有効量、投与することを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、癌を治療する方法であって、癌を伴う被験体に本明細書で提供されるＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドを発現する宿主細胞を薬学的有効量、投与することを含む、方法が提供される。幾つかの実施の形態では、宿主細胞はＯＸ４０結合性ポリペプチドを分泌する。幾つかの実施の形態では、宿主細胞は、表面上にＯＸ４０結合性ポリペプチドを発現する。幾つかの実施の形態では、癌は、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳癌及び中枢神経系癌、乳癌、腹膜癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸直腸癌、結合組織癌、消化器系癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌、胃腸癌、膠芽腫、肝癌、肝細胞癌、上皮内新生物、腎臓癌又は腎癌、喉頭癌、肝臓癌、肺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔癌、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌、肉腫、皮膚癌、扁平上皮癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌又は子宮内膜癌、泌尿器系癌、外陰癌、リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、低悪性度／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、小リンパ球（ＳＬ）ＮＨＬ、中悪性度／濾胞性ＮＨＬ、中悪性度びまん性ＮＨＬ、高悪性度免疫芽球性ＮＨＬ、高悪性度リンパ芽球性ＮＨＬ、高悪性度小型非分割細胞ＮＨＬ、巨大病変ＮＨＬ、マントル細胞リンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、ワルデンストレームマクログロブリン血症、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、有毛細胞白血病、並びに慢性骨髄芽球性白血病から選択される。
【００２３】
幾つかの実施の形態では、癌を治療する方法は、追加の療法剤を投与することを更に含む。幾つかの実施の形態では、追加の療法剤は、抗癌剤である。幾つかの実施の形態では、抗癌剤は、化学療法剤、抗癌生物製剤、放射線療法、ＣＡＲ−Ｔ療法薬、及び腫瘍溶解性ウイルスから選択される。幾つかの実施の形態では、追加の療法剤は、抗癌生物製剤である。幾つかの実施の形態では、抗癌生物製剤は、ＰＤ−１及び／又はＰＤ−Ｌ１を阻害する作用物質である。幾つかの実施の形態では、抗癌生物製剤は、ニボルマブ、ピディリズマブ、ペンブロリズマブ、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、ＡＭＰ−２２４、ＢＭＳ−９３６５５９、ＡＭＰ−５１４、ＭＤＸ−１１０５、ＴＳＲ−０４２、ＳＴＩ−Ａ１０１０、及びＳＴＩ−Ａ１１１０から選択される。幾つかの実施の形態では、抗癌生物製剤は、ＶＩＳＴＡ、ｇｐＮＭＢ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＨＬＡ２、ＣＤ７３、ＣＴＬＡ４、又はＴＩＧＩＴを阻害する作用物質である。幾つかの実施の形態では、抗癌生物製剤は、抗体である。幾つかの実施の形態では、抗癌生物製剤は、サイトカインである。幾つかの実施の形態では、抗癌剤は、ＣＡＲ−Ｔ療法薬である。幾つかの実施の形態では、抗癌剤は、腫瘍溶解性ウイルスである。幾つかの実施の形態では、本明細書で提供される癌を治療する方法は、腫瘍切除及び／又は放射線療法を更に含む。
【図面の簡単な説明】
【００２４】
【図１】トランスフェクションされていないＨＥＫ２９３細胞への１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの非特異的結合を示す図である。
【図２Ａ−２Ｂ】１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの、ヒトＯＸ４０（Ａ）及びカニクイザルＯＸ４０（Ｂ）を発現するＣＨＯ細胞への結合を示す図である。
【図３Ａ−３Ｂ】六価３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ（それぞれ、Ｈｅｘ−１Ｄ１０ｖ１及びＨｅｘ−１Ｄ１０ｖ６とも呼ばれる）の、ヒトＯＸ４０を発現するＨＥＫ２９３細胞（Ａ）及びトランスフェクションされていないＨＥＫ２９３細胞（Ｂ）への結合を示す図である。
【図４】ＯＸ４０を発現し、ＯＸ４０応答エレメントの下流にルシフェラーゼ遺伝子を含むＪｕｒｋａｔ細胞における六価３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃによるルシフェラーゼ発現の活性化を示す図である。
【図５】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ、四価２×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ、及び二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃと接触された、ＯＸ４０を発現し、ＯＸ４０応答エレメントの下流にルシフェラーゼ遺伝子を含むＪｕｒｋａｔ細胞におけるルシフェラーゼ発現を示す図である。
【図６】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ及び二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃで共刺激された４人の異なるドナーからのＣＤ４＋Ｔ細胞（Ｌ５５６、Ｌｅｕｋｏ  ２０、Ｌｅｕｋｏ  ２２、及びＬｅｕｋｏ  ９）の用量依存的増殖を示す図である。
【図７】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ及び二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃで共刺激された４人の異なるドナーからのＣＤ４＋Ｔ細胞（Ｌ５５６、Ｌｅｕｋｏ  ２０、Ｌｅｕｋｏ  ２２、及びＬｅｕｋｏ  ９）上でのＣＤ２５＋発現の用量依存的増加を示す図である。
【図８】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ及び二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃで共刺激された４人の異なるドナーからのＣＤ４＋Ｔ細胞（Ｌ５５６、Ｌｅｕｋｏ  ２０、Ｌｅｕｋｏ  ２２、及びＬｅｕｋｏ  ９）上でのＣＤ７１＋発現の用量依存的増加を示す図である。
【図９】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ及び二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃで共刺激された４人の異なるドナーからのＣＤ４＋Ｔ細胞（Ｌ５５６、Ｌｅｕｋｏ  ２０、Ｌｅｕｋｏ  ２２、及びＬｅｕｋｏ  ９）から分泌されるＩＦＮγの用量依存的増加を示す図である。
【図１０】抗ＣＤ３抗体及び六価３×１Ｄ１０ｖ６−ＦｃによるヒトＴ細胞の共刺激後のＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ８＋Ｔ細胞の増加を示す図である（「抗体なし」は、六価３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃなしでの抗ＣＤ３抗体刺激を示す）。
【図１１】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃによる１０人の健康なドナーからのＴ細胞の共刺激後の、ＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖の増加（上部の２つのパネル）、ＣＤ２５＋ＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ２５＋ＣＤ８＋Ｔ細胞のパーセンテージの増加（中央の２つのパネル）、並びにＣＤ７１＋ＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ７１＋ＣＤ８＋Ｔ細胞のパーセンテージの増加（下部の２つのパネル）を示す図である。
【図１２】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃによる４人の健康なドナーからのＴ細胞の共刺激後の、細胞内ＩＦＮγ＋ＣＤ４＋Ｔ細胞及び細胞内ＩＦＮγ＋ＣＤ８＋Ｔ細胞のパーセンテージの増加を示す図である。
【図１３】六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでの処理がレスポンダーＣＤ４＋Ｔ細胞増殖のＴｒｅｇ媒介性の抑制を逆転させ、活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１を発現するＣＤ４＋Ｔ細胞のパーセンテージを増加させたことを示す図である。
【図１４Ａ−１４Ｂ】ＰＤ−１を標的とする抗体であるペンブロリズマブ及び六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ（Ｈｅｘ−１Ｄ１０ｖ６）の組み合わせが、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）におけるＩＬ−２産生を増強したことを示す図である。図１４Ａは、１０ｎＭのペンブロリズマブと様々な濃度の六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃとの組み合わせを示している。図１４Ｂは、１ｎＭの六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃと様々な濃度のペンブロリズマブとの組み合わせを示している。
【図１５】カニクイザルに投与された５ｍｇ／ｋｇ、２０ｍｇ／ｋｇ、又は６０ｍｇ／ｋｇの六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ（Ｈｅｘ−１Ｄ１０ｖ６）の薬物動態（ＰＫ）プロファイルを示す図である。全身的曝露が達成され、これは用量に比例して増加した。
【発明を実施するための形態】
【００２５】
本明細書に示される実施形態は、ＯＸ４０の活性を調節する多価ＯＸ４０結合性ポリペプチド、及び癌を治療する様々な方法におけるそれらの使用に関する。
【００２６】
定義及び様々な実施形態
本明細書に使用されるセクションの見出しは編成のみを目的とし、記載される主題を限定すると解釈されるものではない。
【００２７】
特許出願、特許公報、及びＧｅｎｂａｎｋアクセッション番号を含む本明細書で引用される全ての参考文献は、各個別の参考文献が、引用することによりその全体が本明細書の一部をなすと具体的かつ個別に示されているかのように、引用することにより本明細書の一部をなす。
【００２８】
本明細書に記載又は参照される技術及び手順は、一般に十分に理解されており、通常、例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3rd. edition (2001) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY (F. M. Ausubel, et al. eds., (2003))、the series METHODS IN ENZYMOLOGY (Academic Press, Inc.): PCR 2: A PRACTICAL APPROACH (M. J. MacPherson, B. D. Hames and G. R. Taylor eds. (1995))、Harlow and Lane, eds. (1988) ANTIBODIES, A LABORATORY MANUAL、及びANIMAL CELL CULTURE (R. I. Freshney, ed. (1987))、Oligonucleotide Synthesis (M. J. Gait, ed., 1984)、Methods in Molecular Biology, Humana Press、Cell Biology: A Laboratory Notebook (J. E. Cellis, ed., 1998) Academic Press、Animal Cell Culture (R. I. Freshney, ed., 1987)、Introduction to Cell and Tissue Culture (J. P. Mather and P. E. Roberts, 1998) Plenum Press、Cell and Tissue Culture Laboratory Procedures (A. Doyle, J. B. Griffiths, and D. G. Newell eds., 1993-8) J. Wiley and Sons、Handbook of Experimental Immunology (D. M. Weir and C. C. Blackwell, eds.）、Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (J. M. Miller and M. P. Calos, eds., 1987)、PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., eds., 1994）、Current Protocols in Immunology (J. E. Coligan et al. eds., 1991)、Short Protocols in Molecular Biology (Wiley and Sons, 1999)、Immunobiology (C. A. Janeway and P. Travers, 1997)、Antibodies (P. Finch, 1997)、Antibodies: A Practical Approach (D. Catty., ed., IRL Press, 1988-1989)、Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (P. Shepherd and C. Dean, eds., Oxford University Press, 2000)、Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow and D. Lane( Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999)、The Antibodies (M. Zanetti and J. D. Capra, eds., Harwood Academic Publishers, 1995)、及びCancer: Principles and Practice of Oncology (V. T. DeVita et al., eds., J.B. Lippincott Company, 1993)並びにそれらの最新版に記載される広く利用されている方法論等の当業者による慣例的な方法論を用いて使用される。
【００２９】
別段の規定がない限り、本開示に関連して使用される科学用語及び技術用語は、当業者によって一般に理解される意味を有するものとする。さらに、文脈により別段の要求がない限り、又は明白に特段の指示がない限り、単数名辞は複数を含み、複数名辞は単数を含むものとする。様々な出典又は参考文献の間での定義の矛盾については、本明細書に示される定義が優先される。
【００３０】
一般に、免疫グロブリン重鎖における残基の番号付けは、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)でのようなＥＵインデックスの番号付けである。「KabatでのようなＥＵインデックス」は、ヒトＩｇＧ１  ＥＵ抗体の残基番号付けを指す。
【００３１】
本明細書に記載される本発明の実施形態は、「からなる（consisting）」実施形態及び／又は「から本質的になる（consisting essentially of）」実施形態を含むと理解される。本明細書で使用される場合に、単数形（"a", "an", and "the"）は、特段の指示がない限り複数の参照を含む。本明細書での「又は」という用語の使用は、選択肢が互いに排他的であることを意味すると解釈されない。
【００３２】
本出願では、「又は」の使用は、明白に特段の指定がない限り又は当業者によって理解されない限り、「及び／又は」を意味する。多項従属請求項の文脈では、「又は」の使用は、２項以上の先行する独立請求項又は従属請求項を引用する。
【００３３】
「参照試料」、「参照細胞」、又は「参照組織」という語句は、少なくとも１つの未知の特徴を有する試料との比較として使用され得る少なくとも１つの既知の特徴を有する試料を示す。幾つかの実施形態では、参照試料は、陽性又は陰性の指標として使用され得る。参照試料を使用することで、未知の特徴を有する試料中に存在するタンパク質及び／又はｍＲＮＡのレベルに対して、例えば、健康な組織中に存在するタンパク質及び／又はｍＲＮＡのレベルを確立することができる。幾つかの実施形態では、参照試料は、同じ被験体に由来するが、試験される部分とは異なる被験体の部分に由来する試料である。幾つかの実施形態では、参照試料は、癌を取り囲む又は癌に隣接する組織領域に由来する試料である。幾つかの実施形態では、参照試料は、試験される被験体に由来するものではなく、対象の障害（例えば、特定の癌又はＯＸ４０関連障害）を有する又は有しないことが既知の被験体に由来する試料である。幾つかの実施形態では、参照試料は、同じ被験体に由来するものであるが、被験体が癌を発症する前の時点での試料である。幾つかの実施形態では、参照試料は、同じ被験体又は異なる被験体からの良性癌試料に由来する試料である。比較のために陰性参照試料が使用される場合に、陰性参照試料における対象の分子の発現レベル又は量は、当業者が本開示を考慮して、該分子が存在しない及び／又は低いレベルの該分子が存在することを認識するレベルを示す。比較のために陽性参照試料が使用される場合に、陽性参照試料における対象の分子の発現レベル又は量は、当業者が本開示を考慮して、或るレベルの該分子が存在することを認識するレベルを示す。
【００３４】
療法剤の投与から恩恵を受ける又は療法剤の投与に応答するという文脈において本明細書で使用される「便益」、「臨床的便益」、「応答性」、及び「治療的応答性」という用語は、様々なエンドポイント、例えば、減速及び完全な停止を含む疾患進行の或る程度の抑止、疾患エピソード及び／又は症状の数の減少、病変サイズの縮小、隣接する末梢器官及び／又は末梢組織内への疾患細胞浸潤の抑止（すなわち、減少、減速、又は完全な停止）、病気蔓延の抑止（すなわち、減少、減速、又は完全な停止）、障害に関連する１つ以上の症状の或る程度の軽減、治療後の無病提示、例えば無増悪生存期間の長さの増加、全生存期間の延長、より高い奏効率、及び／又は治療後の所与の時点での死亡率の低下を評価することによって推し量ることができる。「非応答性」又は「応答しない」被験体又は癌は、「応答する」という上記の条件を満たさないものである。
【００３５】
「核酸分子」、「核酸」、及び「ポリヌクレオチド」という用語は、区別なく使用され、ヌクレオチドのポリマーを指し得る。そのようなヌクレオチドのポリマーは、天然及び／又は非天然のヌクレオチドを含み、限定されるものではないが、ＤＮＡ、ＲＮＡ、及びＰＮＡを含み得る。「核酸配列」は、核酸分子又はポリヌクレオチドに含まれるヌクレオチドの線状配列を指す。
【００３６】
「ポリペプチド」及び「タンパク質」という用語は、アミノ酸残基のポリマーを指すために区別なく使用され、最小の長さに限定されない。そのようなアミノ酸残基のポリマーは、天然又は非天然のアミノ酸残基を含み、限定されるものではないが、ペプチド、オリゴペプチド、アミノ酸残基の二量体、三量体、及び多量体を含み得る。この定義には、完全長タンパク質及びその断片の両方が含まれる。これらの用語はまた、ポリペプチドの発現後修飾、例えば、グリコシル化、シアル化、アセチル化、リン酸化等を含む。さらに、本開示の目的で、「ポリペプチド」は、タンパク質が所望の活性を維持する限り、天然配列に対する欠失、付加、及び置換等の修飾（一般に性質について保存的）を含むタンパク質を指す。これらの修飾は、部位特異的突然変異誘発によるような意図的なものであり得る、又はタンパク質を産生する宿主の突然変異若しくはＰＣＲ増幅によるエラーによるような偶発的なものであり得る。
【００３７】
本明細書で使用される「ＯＸ４０」は、細胞内でのＯＸ４０前駆体のプロセシングから生ずるあらゆる天然の成熟ＯＸ４０を指す。この用語は、特段の指示がない限り、霊長類（例えば、ヒト及びカニクイザル又はアカゲザル）及び齧歯類（例えば、マウス及びラット）等の哺乳動物を含むあらゆる脊椎動物起源からのＯＸ４０を含む。この用語はまた、スプライス変異体又はアレル変異体等のＯＸ４０の天然に存在する変異体を含む。非限定的な例示的なヒトＯＸ４０アミノ酸配列は、例えば、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＣＡＥ１１７５７．１に示されている。配列番号１を参照。非限定的な例示的なカニクイザルのＯＸ４０アミノ酸配列は、例えば、ＮＣＢＩアクセッション番号ＸＰ＿００５５４５１７９に示されている。配列番号２を参照。
【００３８】
抗原又はエピトープに「特異的に結合する」という用語は、当該技術分野で十分に理解されている用語であり、そのような特異的な結合を決定する方法も当該技術分野で十分に知られている。別の細胞又は物質と反応又は会合するよりも特定の細胞又は物質とより頻繁に、より迅速に、より長い持続時間及び／又はより高い親和性で反応又は会合する場合に、分子は「特異的な結合」又は「優先的な結合」を示すと言及される。シングルドメイン抗体（ｓｄＡｂ）又はＶＨＨ含有ポリペプチドは、他の物質に結合するよりも高い親和性、アビディティーで、より容易に、及び／又はより長い持続時間で結合する場合に、標的に「特異的に結合」又は「優先的に結合」する。例えば、ＯＸ４０エピトープに特異的に又は優先的に結合するｓｄＡｂ又はＶＨＨ含有ポリペプチドは、他のＯＸ４０エピトープ又は非ＯＸ４０エピトープに結合するよりも高い親和性、アビディティーで、より容易に、及び／又はより長い持続時間でこのエピトープと結合するｓｄＡｂ又はＶＨＨ含有ポリペプチドである。また、この定義を解釈することにより、例えば、第１の標的に特異的又は優先的に結合するｓｄＡｂ又はＶＨＨ含有ポリペプチドが、第２の標的に特異的又は優先的に結合し得る又は結合し得ないことも理解される。したがって、「特異的な結合」又は「優先的な結合」は、排他的な結合を（含み得るものの）必ずしも必要としない。一般に、必ずしもそうとは限らないが、結合への言及は優先的な結合を意味する。「特異性」は、結合性タンパク質が抗原に選択的に結合する能力を指す。
【００３９】
本明細書で使用される場合に、ＯＸ４０の活性に関する「調節する」という用語は、ＯＸ４０の活性の変化を指す。幾つかの実施形態では、「調節する」とは、調節物質の不存在下でのＯＸ４０と比較したＯＸ４０活性の増加を指す。
【００４０】
本明細書で使用される場合に、「エピトープ」という用語は、抗原結合分子（例えば、ｓｄＡｂ又はＶＨＨ含有ポリペプチド）が結合する標的分子（例えば、タンパク質、核酸、炭水化物、又は脂質等の抗原）上の部位を指す。エピトープは、しばしば、アミノ酸、ポリペプチド、又は糖側鎖等の分子の化学的に活性な表面編成物を含み、特定の３次元構造的特徴及び特定の電荷特徴を有する。エピトープは、標的分子の連続残基及び／又は並置された非連続残基（例えば、アミノ酸、ヌクレオチド、糖、脂質部分）の両方から形成され得る。連続残基（例えば、アミノ酸、ヌクレオチド、糖、脂質部分）から形成されるエピトープは、通常、変性溶剤への曝露で保持されるが、三次フォールディングにより形成されるエピトープは、通常、変性溶剤による処理で失われる。エピトープは、限定されるものではないが、少なくとも３個、少なくとも５個、又は８個〜１０個の残基（例えば、アミノ酸又はヌクレオチド）を含み得る。幾つかの実施形態では、エピトープは、２０残基（例えば、アミノ酸又はヌクレオチド）未満、１５残基未満、又は１２残基未満の長さである。２つの抗体は、それらが抗原に対して競合的結合を示す場合に、抗原内の同じエピトープに結合し得る。幾つかの実施形態では、エピトープは、抗原結合分子上のＣＤＲ残基との或る特定の最小距離によって特定され得る。幾つかの実施形態では、エピトープは、上記距離によって特定され得て、抗原結合分子の残基と抗原残基との間の結合（例えば、水素結合）に関与するそれらの残基に更に限定され得る。エピトープは、様々なスキャンによっても同様に特定され得る。例えば、アラニンスキャン又はアルギニンスキャンは、抗原結合分子が相互作用し得る１つ以上の残基を示すことができる。明示的に示されない限り、エピトープとしての残基のセットは、特定の抗原結合分子に対するエピトープの一部であることから他の残基を除外するものではない。むしろ、そのようなセットの存在は、最小のエピトープの列（又は種類のセット）を示す。したがって、幾つかの実施形態では、エピトープとして特定された残基のセットは、抗原上のエピトープについての残基の排他的リストではなく、抗原に関連する最小のエピトープを示す。
【００４１】
「非線状エピトープ」又は「立体構造エピトープ」は、エピトープに特異的な抗原結合分子が結合する抗原性タンパク質内の非連続的なポリペプチド、アミノ酸及び／又は糖を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも１つの残基がエピトープの他の示された残基と非連続的であるが、１つ以上の残基が他の残基と連続的である場合もある。
【００４２】
「線状エピトープ」は、エピトープに特異的な抗原結合分子が結合する抗原性タンパク質内の連続的なポリペプチド、アミノ酸及び／又は糖を含む。幾つかの実施形態では、線状エピトープ内の残基の全てが、抗原結合分子によって直接的に結合される（又は結合に関与する）必要があるわけではないことに留意されたい。幾つかの実施形態では、線状エピトープは、事実上線状エピトープの配列からなるペプチドによる免疫化に由来し得る、又はタンパク質の残部から相対的に分離されたタンパク質の構造区間に由来し得る（こうして、抗原結合分子は、少なくとも主として、まさにその配列区間と相互作用し得る）。
【００４３】
「抗体」及び「抗原結合分子」という用語は、最も広い意味で区別なく使用され、限定されるものではないが、慣例的な抗体（典型的には、少なくとも１つの重鎖及び少なくとも１つの軽鎖を含む）、シングルドメイン抗体（ｓｄＡｂ、典型的には重鎖に類似している１つだけの鎖を含む）、ＶＨＨ含有ポリペプチド（少なくとも１つの重鎖のみの抗体可変ドメイン、すなわちＶＨＨを含むポリペプチド）、及び所望の抗原結合活性を示す限り上述のいずれかのフラグメントを含む抗体様抗原結合ドメインを含む様々なポリペプチドを包含する。幾つかの実施形態では、抗体は二量体化ドメインを含む。そのような二量体化ドメインには、限定されるものではないが、重鎖定常ドメイン（ＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２、及びＣＨ３を含み、ＣＨ１は典型的には、軽鎖定常ドメインＣＬと対をなす一方で、ヒンジは二量体化を介在する）及びＦｃドメイン（ヒンジ、ＣＨ２、及びＣＨ３を含み、ヒンジは二量体化を介在する）が含まれる。
【００４４】
抗体という用語には、限定されるものではないが、キメラ抗体、ヒト化抗体、及びラクダ（ラマを含む）、サメ、マウス、ヒト、カニクイザル等の様々な種の抗体も含まれる。
【００４５】
「シングルドメイン抗体」及び「ｓｄＡｂ」という用語は、軽鎖を有しない重鎖の可変ドメイン（又はＶＨＨ）のペア等の単一の単量体ドメインを有する抗体を指すために、本明細書では区別なく使用される。
【００４６】
本明細書で使用される「ＶＨＨ」又は「ＶＨＨドメイン」又は「ＶＨＨ抗原結合ドメイン」という用語は、ラクダ抗体又はサメ抗体等のシングルドメイン抗体の抗原結合部分を指す。幾つかの実施形態では、ＶＨＨは、ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、及びＦＲ４と表される３つのＣＤＲと４つのフレームワーク領域とを含む。幾つかの実施形態では、ＶＨＨは、ＶＨＨが実質的に抗原結合及び特異性を維持する限り、部分的なＦＲ１及び／又はＦＲ４のみを含むように又はそれらのフレームワーク領域の一方若しくは両方を欠くように、Ｎ末端又はＣ末端で切断されていてもよい。
【００４７】
「ＶＨＨ含有ポリペプチド」という用語は、少なくとも１つのＶＨＨドメインを含むポリペプチドを指す。幾つかの実施形態では、ＶＨＨポリペプチドは、２つ、３つ、又は４つ以上のＶＨＨドメインを含み、ここで、各ＶＨＨドメインは、同じ又は異なっていてもよい。幾つかの実施形態では、ＶＨＨ含有ポリペプチドは、Ｆｃドメインを含む。幾つかのそのような実施形態では、ＶＨＨポリペプチドは、二量体を形成し得る。ＶＨＨ含有ポリペプチドの非限定的な構造には、ＶＨＨ１−Ｆｃ、ＶＨＨ１−ＶＨＨ２−Ｆｃ、及びＶＨＨ１−ＶＨＨ２−ＶＨＨ３−Ｆｃが含まれ、ここで、ＶＨＨ１、ＶＨＨ２、及びＶＨＨ３は、同じ又は異なっていてもよい。そのような構造の幾つかの実施形態では、或るＶＨＨは、リンカーによって別のＶＨＨに連結され得る、又は或るＶＨＨは、リンカーによってＦｃに連結され得る。幾つかのそのような実施形態では、リンカーは、１個〜２０個のアミノ酸、好ましくは、主にグリシン及び任意にセリンから構成される１個〜２０個のアミノ酸を含む。幾つかの実施形態では、ＶＨＨ含有ポリペプチドがＦｃを含む場合に、それは二量体を形成する。したがって、構造ＶＨＨ１−ＶＨＨ２−Ｆｃは、それが二量体を形成する場合に、四価であるとみなされる（すなわち、二量体は４つのＶＨＨドメインを有する）。同様に、構造ＶＨＨ１−ＶＨＨ２−ＶＨＨ３−Ｆｃは、それが二量体を形成する場合に、六価であるとみなされる（すなわち、二量体は６つのＶＨＨドメインを有する）。
【００４８】
「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均一な抗体集団の抗体（ｓｄＡｂ又はＶＨＨ含有ポリペプチドを含む）を指す。すなわち、集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る天然に生じる可能性のある突然変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は非常に特異的であり、単一の抗原部位に対するものである。さらに、典型的には、異なる決定基（エピトープ）に対する異なる抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対する抗体である。したがって、モノクローナル抗体の試料は、抗原上の同じエピトープに結合することができる。「モノクローナル」という修飾成句は、抗体の実質的に均一な集団から得られる抗体の性質を示し、何らかの特定の方法による抗体の産生を必要とすると解釈されるべきではない。例えば、モノクローナル抗体は、Kohler and Milstein, 1975, Nature 256:495により最初に記載されたハイブリドーマ法によって作製され得る、又は米国特許第４，８１６，５６７号に記載されるような組換えＤＮＡ法によって作製され得る。モノクローナル抗体はまた、例えば、McCafferty et al., 1990, Nature 348:552-554に記載される技術を使用して作製されたファージライブラリーから単離され得る。
【００４９】
「ＣＤＲ」という用語は、少なくとも１つの当業者に対する特定様式によって定義される相補性決定領域を示す。幾つかの実施形態では、ＣＤＲは、Ｃｈｏｔｈｉａ番号付けスキーム、Ｋａｂａｔ番号付けスキーム、ＫａｂａｔとＣｈｏｔｈｉａとの組み合わせ、ＡｂＭ定義、及び／又は接触定義（contact definition）のいずれかに従って定義され得る。ＶＨＨは、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３と表される３つのＣＤＲを含む。
【００５０】
本明細書で使用される「重鎖定常領域」という用語は、少なくとも３つの重鎖定常ドメイン、すなわち、ＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２、及びＣＨ３を含む領域を指す。当然ながら、ドメイン内の機能を変えない欠失及び改変は、特段の指定がない限り、「重鎖定常領域」という用語の範囲内に含まれる。非限定的な例示的な重鎖定常領域には、γ、δ、及びαが含まれる。非限定的な例示的な重鎖定常領域には、ε及びμも含まれる。それぞれの重鎖定常領域は、１つの抗体アイソタイプに対応する。例えば、γ定常領域を含む抗体はＩｇＧ抗体であり、δ定常領域を含む抗体はＩｇＤ抗体であり、α定常領域を含む抗体はＩｇＡ抗体である。さらに、μ定常領域を含む抗体はＩｇＭ抗体であり、ε定常領域を含む抗体はＩｇＥ抗体である。或る特定のアイソタイプは、更にサブクラスに細分化され得る。例えば、ＩｇＧ抗体には、限定されるものではないが、ＩｇＧ１（γ１定常領域を含む）抗体、ＩｇＧ２（γ２定常領域を含む）抗体、ＩｇＧ３（γ３定常領域を含む）抗体、及びＩｇＧ４（γ４定常領域を含む）抗体が含まれ、ＩｇＡ抗体には、限定されるものではないが、ＩｇＡ１（α１定常領域を含む）抗体及びＩｇＡ２（α２定常領域を含む）抗体が含まれ、ＩｇＭ抗体には、限定されるものではないが、ＩｇＭ１及びＩｇＭ２が含まれる。
【００５１】
本明細書で使用される「Ｆｃ領域」は、ＣＨ２及びＣＨ３を含む重鎖定常領域の一部を指す。幾つかの実施形態では、Ｆｃ領域は、ヒンジ、ＣＨ２、及びＣＨ３を含む。様々な実施形態では、Ｆｃ領域がヒンジを含む場合に、ヒンジは、２つのＦｃ含有ポリペプチド間の二量体化を介在する。Ｆｃ領域は、本明細書で論じられる任意の抗体重鎖定常領域アイソタイプのものであり得る。幾つかの実施形態では、Ｆｃ領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、又はＩｇＧ４である。
【００５２】
本明細書で使用される「アクセプターヒトフレームワーク」は、本明細書で論じられるように、ヒト免疫グロブリンフレームワーク又はヒトコンセンサスフレームワークに由来する重鎖可変ドメイン（ＶＨ）フレームワークのアミノ酸配列を含むフレームワークである。ヒト免疫グロブリンフレームワーク又はヒトコンセンサスフレームワークに由来するアクセプターヒトフレームワークは、その同じアミノ酸配列を含むことができる、又はアミノ酸配列の変化を含み得る。幾つかの実施形態では、アミノ酸の変化の数は、ＶＨＨ等の単一の抗原結合ドメイン内の全てのヒトフレームワークにわたって１０個未満、又は９個未満、又は８個未満、又は７個未満、又は６個未満、又は５個未満、又は４個未満、又は３個未満である。
【００５３】
「親和性」は、分子（例えば、抗体又はＶＨＨ含有ポリペプチド）の単一の結合部位及びその結合相手（例えば、抗原）の間の非共有結合的相互作用の合計の強さを指す。分子Ｘのその相手Ｙに対する親和性又は見かけの親和性は、一般に、それぞれ解離定数（ＫＤ）又はＫＤ（見かけ）によって表すことができる。親和性は、本明細書に記載されている方法を含む、当該技術分野で既知の通常の方法（例えば、ＥＬＩＳＡ  ＫＤ、ＫｉｎＥｘＡ、フローサイトメトリー、及び／又は表面プラズモン共鳴デバイス等）によって測定され得る。このような方法には、限定されるものではないが、ＢＩＡｃｏｒｅ（商標）、Ｏｃｔｅｔ（商標）、又はフローサイトメトリーを要する方法が含まれる。
【００５４】
本明細書で使用される「ＫＤ」という用語は、抗原結合分子／抗原相互作用の平衡解離定数を指す。本明細書で「ＫＤ」という用語が使用される場合に、それには、ＫＤ及びＫＤ（見かけ）が含まれる。
【００５５】
幾つかの実施形態では、抗原結合分子のＫＤは、フローサイトメトリーによって、抗原発現細胞系統を使用し、各抗体濃度で測定された平均蛍光を非線形１サイト結合方程式（graphpad社のＰｒｉｓｍ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ）にフィッティングして測定される。幾つかのそのような実施形態では、ＫＤはＫＤ（見かけ）である。
【００５６】
「生物学的活性」という用語は、分子の任意の１つ以上の生物学的特性（ｉｎ  ｖｉｖｏで見られるように天然に存在するか、又は組換え手段によって提供される若しくは可能となるかどうか）を指す。生物学的特性には、限定されるものではないが、リガンドの結合、細胞増殖（Ｔ細胞増殖等）の誘導又は増加、及びサイトカインの発現の誘導又は増加が含まれる。
【００５７】
本明細書で使用される「ＯＸ４０活性」又はＯＸ４０の「生物学的活性」という用語には、ＯＸ４０タンパク質の任意の生物学的作用又は生物学的関連機能の少なくとも１つが含まれる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０活性には、ＯＸ４０がＯＸ４０リガンド（ＯＸ４０Ｌ）と相互作用又は結合する能力が含まれる。非限定的な例示的なＯＸ４０活性には、ＮＦκＢシグナル伝達の増加、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖の増加、Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現の増加、Ｔ細胞上でのＣＤ２５及び／又はＣＤ７１発現の増加、並びにエフェクターＴ細胞活性化及び増殖に対するＴｒｅｇ細胞の抑制活性の低下が含まれる。
【００５８】
「アゴニスト」抗体又は「活性化」抗体（ｓｄＡｂ又はＶＨＨ含有ポリペプチド等）は、標的抗原の生物学的活性を増加及び／又は活性化する抗体である。幾つかの実施形態では、アゴニスト抗体は、抗原に結合し、その生物学的活性を少なくとも約２０％、４０％、６０％、８０％、８５％以上増加させる。
【００５９】
「アンタゴニスト」抗体、「ブロッキング」抗体、又は「中和」抗体は、標的抗原の生物学的活性を低下及び／又は不活性化する抗体である。幾つかの実施形態では、中和抗体は、抗原に結合し、その生物学的活性を少なくとも約２０％、４０％、６０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９９％以上低下させる。
【００６０】
「親和性成熟」ＶＨＨ含有ポリペプチドは、ＶＨＨ含有ポリペプチドの抗原に対する親和性に改善をもたらす改変を有しない親ＶＨＨ含有ポリペプチドと比較して１つ以上のＣＤＲに１つ以上のそのような改変を有するＶＨＨ含有ポリペプチドを指す。
【００６１】
本明細書で使用される「ヒト化ＶＨＨ」は、１つ以上のフレームワーク領域が実質的にヒトフレームワーク領域で置き換えられたＶＨＨを指す。幾つかの場合には、ヒト免疫グロブリンの或る特定のフレームワーク領域（ＦＲ）残基が、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらに、ヒト化ＶＨＨは、当初のＶＨＨにもヒトフレームワーク配列にも見られないが、ＶＨＨ又はＶＨＨ含有ポリペプチドの性能をさらに改良及び最適化するために含まれる残基を含み得る。幾つかの実施形態では、ヒト化ＶＨＨ含有ポリペプチドは、ヒトＦｃ領域を含む。理解されるように、ヒト化配列は、その一次配列によって特定され得て、必ずしも抗体が作製された過程を示すわけではない。
【００６２】
「機能的Ｆｃ領域」は、天然配列のＦｃ領域の「エフェクター機能」を有する。例示的な「エフェクター機能」には、Ｆｃ受容体結合、Ｃｌｑ結合及び補体依存性細胞傷害作用（ＣＤＣ）、Ｆｃ受容体結合、抗体依存性細胞介在性細胞傷害作用（ＡＤＣＣ）、食作用、細胞表面受容体（例えば、Ｂ細胞受容体）の下方調節、並びにＢ細胞活性化等が含まれる。このようなエフェクター機能は、一般に、Ｆｃ領域を結合ドメイン（例えば、抗体可変ドメイン）と組み合わせることを要し、様々なアッセイを使用して評価することができる。
【００６３】
「天然配列のＦｃ領域」は、天然に見られるＦｃ領域のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含む。天然配列のヒトＦｃ領域には、天然配列のヒトＩｇＧ１  Ｆｃ領域（非Ａアロタイプ及びＡアロタイプ）、天然配列のヒトＩｇＧ２  Ｆｃ領域、天然配列のヒトＩｇＧ３  Ｆｃ領域、及び天然配列のヒトＩｇＧ４  Ｆｃ領域、並びにそれらの天然に存在する変異体が含まれる。
【００６４】
「変異型Ｆｃ領域」は、少なくとも１つのアミノ酸修飾により天然配列のＦｃ領域のアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、「変異型Ｆｃ領域」は、少なくとも１つのアミノ酸修飾により天然配列のＦｃ領域のアミノ酸配列とは異なるが、天然配列のＦｃ領域の少なくとも１つのエフェクター機能を保持するアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、変異型Ｆｃ領域は、天然配列のＦｃ領域又は親ポリペプチドのＦｃ領域と比較して、天然配列のＦｃ領域又は親ポリペプチドのＦｃ領域において、少なくとも１個のアミノ酸置換、例えば、約１個〜約１０個のアミノ酸置換、好ましくは、約１個〜約５個のアミノ酸置換を有する。幾つかの実施形態では、本明細書の変異型Ｆｃ領域は、天然配列のＦｃ領域及び／又は親ポリペプチドのＦｃ領域と少なくとも約８０％の配列同一性、それらと少なくとも約９０％の配列同一性、それらと少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、又は少なくとも約９９％の配列同一性を有する。
【００６５】
「Ｆｃ受容体」又は「ＦｃＲ」は、抗体のＦｃ領域に結合する受容体を記載している。幾つかの実施形態では、ＦｃγＲは、天然のヒトＦｃＲである。幾つかの実施形態では、ＦｃＲは、ＩｇＧ抗体（ガンマ受容体）に結合するものであり、ＦｃγＲＩサブクラス、ＦｃγＲＩＩサブクラス、及びＦｃγＲＩＩＩサブクラスの受容体であって、これらの受容体のアレル変異体及び選択的スプライシングされた形態を含む受容体を含む。ＦｃγＲＩＩ受容体には、ＦｃγＲＩＩＡ（「活性化受容体」）及びＦｃγＲＩＩＢ（「阻害受容体」）が含まれ、これらは同様のアミノ酸配列を有するが、主にその細胞質ドメインが異なる。活性化受容体ＦｃγＲＩＩＡは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ（ＩＴＡＭ）を含む。阻害受容体ＦｃγＲＩＩＢは、その細胞質ドメインに免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフ（ＩＴＩＭ）を含む（例えば、Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15:203-234 (1997)を参照）。ＦｃＲは、例えば、Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991)、Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994)、及びde Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 126:330-41 (1995)でレビューされている。将来特定されるものを含む他のＦｃＲは、本明細書では「ＦｃＲ」という用語によって包含される。例えば、「Ｆｃ受容体」又は「ＦｃＲ」という用語はまた、胎児性受容体ＦｃＲｎを含み、これは、母体のＩｇＧの胎児への移動（Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976)及びKim et al., J. Immunol. 24:249 (1994)）及び免疫グロブリンの恒常性の調節の役割を担う。ＦｃＲｎへの結合を測定する方法は既知である（例えば、Ghetie and Ward, Immunol. Today 18(12):592-598 (1997)、Ghetie et al., Nature Biotechnology, 15(7):637-640 (1997)、Hinton et al., J. Biol. Chem. 279(8):6213-6216 (2004)、国際公開第２００４／９２２１９号（Hintonら）を参照）。
【００６６】
本明細書で使用される「実質的に同様」又は「実質的に同じ」という用語は、当業者が２つ以上の値の間の差を、上記値によって測定される生物学的特徴の文脈内で生物学的意義及び／又は統計学的有意性が殆どない又は全くないとみなすような、２つ以上の数値の間の十分に高度な類似性を示す。幾つかの実施形態では、２つ以上の実質的に同様の値は、５％、１０％、１５％、２０％、２５％、又は５０％のいずれか１つの概数以下だけ異なる。
【００６７】
ポリペプチド「変異体」とは、配列をアラインメントし、必要に応じてギャップを導入して最大パーセントの配列同一性を達成した後に、配列同一性の部分として保存的置換を一切考慮せずに、天然配列のポリペプチドと少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有する生物学的に活性なポリペプチドを意味する。そのような変異体には、例えば、ポリペプチドのＮ末端又はＣ末端で１つ以上のアミノ酸残基が付加又は欠失されているポリペプチドが含まれる。幾つかの実施形態では、変異体は、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有する。幾つかの実施形態では、変異体は、少なくとも約９０％のアミノ酸配列同一性を有する。幾つかの実施形態では、変異体は、天然配列のポリペプチドと少なくとも約９５％のアミノ酸配列同一性を有する。
【００６８】
本明細書で使用される場合に、ペプチド配列、ポリペプチド配列、又は抗体配列に関する「パーセント（％）のアミノ酸配列同一性」及び「ホモロジー」は、配列をアラインメントし、必要に応じてギャップを導入して最大パーセントの配列同一性を達成した後に、配列同一性の部分として保存的置換を一切考慮せずに、特定のペプチド配列又はポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。パーセントのアミノ酸配列同一性を決定するためのアラインメントは、例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ−２、ＡＬＩＧＮ、又はＭＥＧＡＬＩＧＮ（商標）（DNASTAR社）ソフトウェア等の公的に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用して、当業者の技能の範囲内である様々な方法で達成され得る。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大のアラインメントを達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメーターを決定することができる。
【００６９】
アミノ酸置換には、限定されるものではないが、ポリペプチド中の或るアミノ酸を別のアミノ酸により置き換えることが含まれ得る。例示的な置換を表１に示す。アミノ酸置換を対象の抗体に導入し、産物を所望の活性、例えば、抗原結合の保持／改善、免疫原性の減少、又はＡＤＣＣ若しくはＣＤＣの改善についてスクリーニングすることができる。
【００７０】
【表１】
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【００７１】
共通の側鎖特性に従ってアミノ酸をグループ分けすることができる：
（１）疎水性：ノルロイシン、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、
（２）中性親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、
（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ、
（４）塩基性：Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、
（５）鎖の配向に影響する残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ、
（６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ
【００７２】
非保存的置換は、これらのクラスの１つのメンバーを別のクラスに交換することを伴う。
【００７３】
「ベクター」という用語は、宿主細胞内で増殖され得る、クローニングされたポリヌクレオチド（単数又は複数）を含むように操作することができるポリヌクレオチドを記載するために使用される。ベクターは、以下のエレメントのうちの１つ以上を含み得る：複製起点、対象のポリペプチドの発現を調節する１つ以上の調節配列（例えば、プロモーター及び／又はエンハンサー等）、及び／又は１つ以上の選択可能なマーカー遺伝子（例えば、抗生物質耐性遺伝子及び比色アッセイで使用することができる遺伝子、例えば、β−ガラクトシダーゼ等）。「発現ベクター」という用語は、宿主細胞において対象のポリペプチドを発現するために使用されるベクターを指す。
【００７４】
「宿主細胞」は、ベクター又は単離されたポリヌクレオチドのレシピエントであり得る又はレシピエントであった細胞を指す。宿主細胞は、原核細胞又は真核細胞であり得る。例示的な真核細胞には、霊長類動物細胞又は非霊長類動物細胞等の哺乳動物細胞、酵母等の真菌細胞、植物細胞、及び昆虫細胞が含まれる。非限定的な例示的な哺乳動物細胞には、限定されるものではないが、ＮＳＯ細胞、ＰＥＲ．Ｃ６（商標）細胞（Crucell社）、並びに２９３細胞及びＣＨＯ細胞、並びにそれらの派生物、例えば２９３−６Ｅ細胞、ＣＨＯ−ＤＧ４４細胞、ＣＨＯ−Ｋ１細胞、ＣＨＯ−Ｓ細胞、及びＣＨＯ−ＤＳ細胞が含まれる。宿主細胞には、単一の宿主細胞の子孫が含まれるが、自然突然変異、偶発突然変異、又は意図的突然変異のため、子孫は必ずしも当初の親細胞と完全に同一（形態又はゲノムＤＮＡ相補において）であるとは限らない。宿主細胞には、初代ヒト免疫細胞等の初代細胞も含まれる。
【００７５】
本明細書で使用される「単離された」という用語は、典型的に天然に一緒に見出される又は一緒に産生される成分の少なくとも幾つかから分離された分子を指す。例えば、ポリペプチドは、それを産生した細胞の成分の少なくとも一部から分離される場合に、「単離された」と称される。ポリペプチドが発現後に細胞によって分泌される場合に、ポリペプチドを含む上清を、それを産生した細胞から物理的に分離することは、ポリペプチドを「単離する」とみなされる。同様に、ポリヌクレオチドは、それが典型的に天然に見られるより大きなポリヌクレオチド（例えば、ＤＮＡポリヌクレオチドの場合に、ゲノムＤＮＡ又はミトコンドリアＤＮＡ等）の一部ではない場合に、又は例えば、ＲＮＡポリヌクレオチドの場合に、それを産生した細胞の成分の少なくとも一部から分離される場合に、「単離された」と称される。したがって、宿主細胞内のベクターに含まれるＤＮＡポリヌクレオチドは、「単離された」と称され得る。
【００７６】
「個体」及び「被験体」という用語は、動物、例えば哺乳動物を指すために本明細書では区別なく使用される。幾つかの実施形態では、限定されるものではないが、ヒト、齧歯類、サル、ネコ、イヌ、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、哺乳動物実験動物、哺乳動物家畜、哺乳動物競技用動物（sport animals）、及び哺乳動物ペットを含む哺乳動物を治療する方法が提供される。幾つかの例では、「個体」又は「被験体」は、疾患又は障害の治療を必要とする個体又は被験体を指す。幾つかの実施形態では、治療を受ける被験体は、被験体が治療に関連する障害を有する又は障害を患う十分なリスクがあると特定されたことを表す患者であり得る。
【００７７】
本明細書で使用される「疾患」又は「障害」は、治療が必要とされる及び／又は所望される状態を指す。
【００７８】
「腫瘍細胞」、「癌細胞」、「癌」、「腫瘍」、及び／又は「新生物」という用語は、特段の指定がない限り、本明細書では区別なく使用され、身体器官及び系の正常な機能を妨げる制御不能な増殖及び／又は異常な細胞生存の増加及び／又はアポトーシスの阻害を示す細胞（又は複数の細胞）を指す。この定義には、良性及び悪性の癌、ポリープ、過形成、並びに潜伏腫瘍又は微小転移が含まれる。
【００７９】
「癌」及び「腫瘍」という用語は、固形癌及び血液癌／リンパ腺癌を包含するとともに、異形成等の悪性腫瘍、前悪性腫瘍、及び良性腫瘍も包含する。また、この定義には、免疫系（例えば、免疫回避メカニズム及び免疫エスケープメカニズム）によって妨げられない異常な増殖を伴う細胞（例えば、ウイルス感染細胞）も含まれる。例示的な癌には、限定されるものではないが、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳癌及び中枢神経系癌、乳癌、腹膜癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸直腸癌、結合組織癌、消化器系癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌（胃腸癌を含む）、膠芽腫、肝癌、肝細胞癌、上皮内新生物、腎臓癌又は腎癌、喉頭癌、白血病、肝臓癌、肺癌（例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、及び肺扁平上皮癌）、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔癌（唇、舌、口、及び咽頭）、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌、肉腫、皮膚癌、扁平上皮癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌又は子宮内膜癌、泌尿器系癌、外陰癌、ホジキンリンパ腫及び非ホジキンリンパ腫を含むリンパ腫、並びにＢ細胞リンパ腫（低悪性度／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、小リンパ球（ＳＬ）ＮＨＬ、中悪性度／濾胞性ＮＨＬ、中悪性度びまん性ＮＨＬ、高悪性度免疫芽球性ＮＨＬ、高悪性度リンパ芽球性ＮＨＬ、高悪性度小型非分割細胞ＮＨＬ、巨大病変ＮＨＬを含む、マントル細胞リンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、及びワルデンストレームマクログロブリン血症、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、有毛細胞白血病、慢性骨髄芽球性白血病、並びにその他の癌腫及び肉腫、並びに移植後リンパ増殖性障害（ＰＴＬＤ）、並びに母斑症、浮腫（脳腫瘍に関連する浮腫等）及びメイグス症候群に関連する異常血管増殖が含まれる。
【００８０】
本明細書で使用される「非腫瘍細胞」という用語は、正常な細胞又は組織を指す。例示的な非腫瘍細胞には、限定されるものではないが、Ｔ細胞、Ｂ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、樹状細胞、単球、マクロファージ、上皮細胞、線維芽細胞、肝細胞、間質性腎臓細胞、線維芽細胞様滑膜細胞、骨芽細胞、及び乳房、骨格筋、膵臓、胃、卵巣、小腸、胎盤、子宮、精巣、腎臓、肺、心臓、脳、肝臓、前立腺、結腸、リンパ器官、骨に位置する細胞、及び骨由来の間葉系幹細胞が含まれる。本明細書で使用される「末梢に位置する細胞又は組織」という用語は、腫瘍細胞の近く及び／又は腫瘍微小環境内に位置しない非腫瘍細胞を指す。
【００８１】
本明細書で使用される「腫瘍微小環境内の細胞又は組織」という用語は、腫瘍細胞を取り囲む及び／又は腫瘍細胞に栄養を与える細胞、分子、細胞外マトリックス及び／又は血管を指す。例示的な腫瘍微小環境内の細胞又は組織には、限定されるものではないが、腫瘍血管系、腫瘍浸潤リンパ球、線維芽細網細胞、内皮前駆細胞（ＥＰＣ）、癌関連線維芽細胞、周皮細胞、他の間質細胞、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）の成分、樹状細胞、抗原提示細胞、Ｔ細胞、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ細胞）、マクロファージ、好中球、骨髄由来抑制細胞（ＭＤＳＣ）及び腫瘍の近位に位置する他の免疫細胞が含まれる。腫瘍細胞及び／又は腫瘍微小環境内に位置する細胞／組織を特定する方法は、本明細書で以下に記載されるように当該技術分野で十分に知られている。
【００８２】
幾つかの実施形態では、「増加」又は「減少」は、それぞれ、統計学的に有意な増加又は減少を指す。当業者に明らかであるように、「調節」はまた、試験作用物質が存在することを除き同じ条件と比較した、標的又は抗原のそのリガンド、結合相手、ホモ多量体形若しくはヘテロ多量体形へと会合する相手又は基質の１つ以上に対する親和性、アビディティー、特異性及び／又は選択性の変化（増加又は減少のいずれかであり得る）を引き起こすこと、標的又は抗原が存在する培地又は環境における１つ以上の条件（ｐＨ、イオン強度、補因子の存在等）に対する標的又は抗原の感受性の変化（増加又は減少のいずれかであり得る）を引き起こすこと、及び／又は細胞増殖若しくはサイトカイン産生を含み得る。これは、関与する標的に応じて、それ自体が既知の又は本明細書に記載される任意の適切な方法で及び／又は任意の適切なアッセイを使用して決定され得る。
【００８３】
本明細書で使用される場合に、「免疫応答」は、疾患（例えば、癌又は癌転移）の発症を抑止若しくは未然防止する又はその症状を改善するのに十分である細胞性免疫応答及び／又は体液性免疫応答を包含することが意図される。「免疫応答」は、自然免疫系及び獲得免疫系の両方の側面を包含し得る。
【００８４】
本明細書で使用される場合に、「治療」は、有益な又は所望の臨床結果を得るための手法である。本明細書で使用される「治療」は、ヒトを含む哺乳動物における疾患用の療法薬の任意の投与又は適用を対象とする。本開示の目的では、有益な又は所望の臨床結果には、限定されるものではないが、１つ以上の症状の緩和、疾患の程度の減少、疾患の進展（例えば、転移、例えば肺又はリンパ節への転移）の未然防止又は遅延、疾患の再発の未然防止又は遅延、疾患の進行の遅延又は減速、疾患状態の改善、疾患又は疾患の進行の抑止、疾患又はその進行の抑止又は減速、その発達の阻止、及び寛解（部分的でも全体的でも）のいずれか１つ以上が含まれる。「治療」には、増殖性疾患の病理学的結果の軽減も含まれる。本明細書で提供される方法は、治療のこれらの側面のいずれか１つ以上を企図している。上記に従って、治療という用語は、障害の全ての側面を１００パーセント除去する必要はない。
【００８５】
「改善する」とは、療法剤を投与しない場合と比べて、１つ以上の症状が軽減又は向上することを意味する。「改善」には、症状の持続期間が短縮又は減少することも含まれる。
【００８６】
「抗癌剤」という用語は、本明細書では、その最も広い意味で、１つ以上の癌の治療に使用される作用物質を指すために使用される。そのような作用物質の例示的なクラスには、限定されるものではないが、化学療法剤、抗癌生物製剤（サイトカイン、受容体細胞外ドメイン−Ｆｃ融合物、及び抗体等）、放射線療法、ＣＡＲ−Ｔ療法薬、治療用オリゴヌクレオチド（アンチセンスオリゴヌクレオチド及びｓｉＲＮＡ等）、及び腫瘍溶解性ウイルスが含まれる。
【００８７】
「生体試料」という用語は、生きている生き物又はかつて生きていた生き物からの或る量の物質を意味する。そのような物質には、限定されるものではないが、血液（例えば、全血）、血漿、血清、尿、羊水、滑液、内皮細胞、白血球、単球、他の細胞、器官、組織、骨髄、リンパ節、及び脾臓が含まれる。
【００８８】
「コントロール」又は「参照」という用語は、分析物を含まないことが既知の組成物（「ネガティブコントロール」）又は分析物を含むことが既知の組成物（「ポジティブコントロール」）を指す。ポジティブコントロールは、既知の濃度の分析物を含み得る。
【００８９】
「抑止」又は「抑止する」という用語は、任意の表現型特徴の減少若しくは停止、又はその特徴の発生率、程度、若しくは可能性の減少若しくは停止を指す。「低減する」又は「抑止する」とは、参照と比較して、活性、機能、及び／又は量を減少させる、低減する、又は停止することである。幾つかの実施形態では、「低減する」又は「抑止する」とは、１０％以上の全体的な減少を引き起こす能力を意味する。幾つかの実施形態では、「低減する」又は「抑止する」とは、５０％以上の全体的な減少を引き起こす能力を意味する。幾つかの実施形態では、「低減する」又は「抑止する」とは、７５％、８５％、９０％、９５％以上の全体的な減少を引き起こす能力を意味する。幾つかの実施形態では、上記の量は、或る期間にわたって、同じ期間にわたるコントロールに対して抑止又は減少される。
【００９０】
本明細書で使用される場合に、「疾患の発症を遅延させる」とは、疾患（癌等）の発症を遅らせる、妨げる、減速させる、遅滞させる、安定化させる、抑制する、及び／又は引き延ばすことを意味する。この遅延は、疾患の病歴及び／又は治療される個体に応じて、様々な長さの時間となり得る。当業者に明らかであるように、十分な又は大幅な遅延は、事実上、個体が疾患を発症しないという点で未然防止を包含し得る。例えば、転移の発生等の末期癌を遅延させることができる。
【００９１】
本明細書で使用される「未然防止」は、疾患の素因を有し得るが、まだ疾患と診断されていない被験体における疾患の発生又は再発に対する予防をもたらすことを含む。特段の指示がない限り、「低減する」、「抑止する」、又は「未然防止する」という用語は、全期間にわたる完全な未然防止を示すのではなく又は必要とするのではなく、測定される期間だけにわたる未然防止を示す又は必要とする。
【００９２】
物質／分子、アゴニスト又はアンタゴニストの「治療有効量」は、個体の疾患状態、年齢、性別、及び体重、並びに物質／分子、アゴニスト又はアンタゴニストが個体において所望の応答を誘発する能力等の要因によって変動し得る。治療有効量はまた、治療的に有益な作用が物質／分子、アゴニスト又はアンタゴニストの任意の有毒作用又は有害作用を上回る量である。治療有効量は、１回以上の投与で送達され得る。治療有効量は、必要な投与量で必要な時間にわたって、所望の治療的結果及び／又は予防的結果を達成するのに有効な量を指す。
【００９３】
「医薬製剤」及び「医薬組成物」という用語は、有効成分（複数の場合もある）の生物学的活性が有効になることを可能にするような形態であり、製剤を投与する被験体に対して許容不可能なほど有毒な追加の成分を含まない調剤を指す。そのような製剤は滅菌され得る。
【００９４】
「薬学的に許容可能な担体」は、被験体に投与するための「医薬組成物」を一緒に含む療法剤とともに使用される当該技術分野において慣用の非毒性の固体、半固体又は液体の充填剤、希釈剤、カプセル化材料、製剤補助剤、又は担体を指す。薬学的に許容可能な担体は、使用される投与量及び濃度でレシピエントに対して無毒であり、製剤の他の成分と適合性がある。薬学的に許容可能な担体は、使用される製剤にとって適切である。
【００９５】
１つ以上の更なる療法剤と「組み合わせて」の投与には、同時（併用）投与及び任意の順序での連続投与が含まれる。
【００９６】
「同時に」という用語は、本明細書では、２つ以上の療法剤の投与であって、投与の少なくとも一部が時間的に重複する、又は１つの療法剤の投与が他の療法剤の投与に対して短い期間に含まれる、又は両方の療法剤の治療効果が少なくとも或る期間にわたり重複する、投与を指すために使用される。
【００９７】
「連続的に」という用語は、本明細書では、２つ以上の療法剤の投与であって、時間的に重複しない、又は療法剤の治療効果が重複しない、投与を指すために使用される。
【００９８】
本明細書で使用される場合に、「〜と組み合わせて」は、或る治療法の施与に別の治療法を加えることを指す。したがって、「〜と組み合わせて」は、或る治療法を、個体に他の治療法を施す前、その間、又はその後に施すことを指す。
【００９９】
「添付文書」という用語は、治療製品の市販パッケージに通例含まれる使用説明書であって、そのような治療製品の使用に関する指示、使用法、投与量、投与、併用療法、禁忌及び／又は警告に関する情報を含む、使用説明書を指すために使用される。
【０１００】
「製造品」は、少なくとも１つの試薬、例えば、疾患若しくは障害（例えば、癌）の治療用の医薬、又は本明細書に記載されるバイオマーカーを特異的に検出するプローブを含む任意の製造物（例えば、パッケージ又は容器）又はキットである。幾つかの実施形態では、製造物又はキットは、本明細書に記載される方法を実施する単位として宣伝、配送、又は販売される。
【０１０１】
「標識」及び「検出可能な標識」という用語は、例えば、抗体又は抗原に結合されて、特異的結合ペアのメンバー間の反応（例えば、結合）を検出可能にする部分を意味する。特異的結合ペアの標識されたメンバーは、「検出可能に標識された」と称される。したがって、「標識された結合性タンパク質」という用語は、結合性タンパク質の特定をもたらす標識が組み込まれたタンパク質を指す。幾つかの実施形態では、標識は、視覚的に又は機器的手段により検出可能なシグナルを生成し得る検出可能なマーカー、例えば、放射性標識されたアミノ酸の組み込み又はマーキングされたアビジン（例えば、蛍光マーカー又は光学的方法若しくは比色法により検出され得る酵素活性を含むストレプトアビジン）によって検出され得るビオチニル部のポリペプチドへの結合である。ポリペプチドの標識の例には、限定されるものではないが、放射性同位体又は放射性核種（例えば、３Ｈ、１４Ｃ、３５Ｓ、９０Ｙ、９９Ｔｃ、１１１Ｉｎ、１２５Ｉ、１３１Ｉ、１７７Ｌｕ、１６６Ｈｏ、又は１５３Ｓｍ）、色素原、蛍光標識（例えば、ＦＩＴＣ、ローダミン、ランタニド蛍光体）、酵素標識（例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ）、化学発光マーカー、ビオチニル基、二次レポーターによって認識される予め決められたポリペプチドエピトープ（例えば、ロイシンジッパーペア配列、二次抗体のための結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ）、及びガドリニウムキレート等の磁性剤が含まれる。イムノアッセイに通常使用される標識の代表的な例には、光を発する部分、例えば、アクリジニウム化合物、及び蛍光を発する部分、例えば、フルオレセインが含まれる。この点について、その部分自体は検出可能に標識されていない場合もあるが、更に別の部分と反応すると検出可能になり得る。
【０１０２】
例示的なＯＸ４０結合性ポリペプチド
本明細書では、アゴニストのＯＸ４０結合性ポリペプチドが提供される。様々な実施形態では、アゴニストのＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインを含む。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるアゴニストのＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０に結合する１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、又は８つのＶＨＨドメインを含む。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるアゴニストのＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０に結合する１つ、２つ、３つ、又は４つのＶＨＨドメインを含む。そのようなＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０以外の１つ以上の標的タンパク質に結合する１つ以上の追加のＶＨＨドメインを含み得る。
【０１０３】
幾つかの実施形態では、アゴニストのＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのＶＨＨドメインと、Ｆｃドメインとを含む。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるアゴニストのＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０に結合する１つ、２つ、３つ、又は４つのＶＨＨドメインと、Ｆｃドメインとを含む。幾つかの実施形態では、Ｆｃドメインは、生理学的条件でＯＸ４０結合性ポリペプチドの二量体化を介在し、こうして二量体が形成されることにより、ＯＸ４０結合部位の数が２倍となる。例えば、ＯＸ４０に結合する３つのＶＨＨドメインと、Ｆｃ領域とを含むＯＸ４０結合性ポリペプチドは、単量体としては三価であるが、生理学的条件では、Ｆｃ領域が二量体化を介在することができ、こうしてＯＸ４０結合性ポリペプチドは、そのような条件下で六価の二量体として存在する。非限定的な例示的な六価ＯＸ４０結合性ポリペプチドには、３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃが含まれ、これらは、それぞれ、Ｈｅｘ−１Ｄ１０ｖ１及びＨｅｘ−１Ｄ１０ｖ６とも称される。特定の理論に縛られることを意図するものではないが、ＯＸ４０を通じた共刺激はＯＸ４０のクラスター形成によって改善されると考えられる。つまり、多価ＯＸ４０結合性ポリペプチド（四価又は六価等）は、一価又は二価のＯＸ４０結合性ポリペプチドよりも有効である。
【０１０４】
様々な実施形態では、ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む。幾つかの実施形態では、ＶＨＨドメインはヒト化されている。
【０１０５】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメインはヒト化され得る。ヒト化抗体（ＶＨＨ含有ポリペプチド等）は、治療分子として有用である。それというのも、ヒト化抗体は、抗体療法薬に対する免疫応答をもたらして療法薬の有効性を低下させ得る非ヒト抗体に対するヒト免疫応答を低減又は排除するからである。一般に、ヒト化抗体は、ＣＤＲ（又はその一部）が非ヒト抗体に由来し、ＦＲ（又はその一部）がヒト抗体配列に由来する１つ以上の可変ドメインを含む。ヒト化抗体はまた、任意に、ヒト定常領域の少なくとも一部を含む。幾つかの実施形態では、ヒト化抗体における幾つかのＦＲ残基は、例えば、抗体の特異性又は親和性を回復又は改善するために、非ヒト抗体（例えば、ＣＤＲ残基の元となる抗体）からの対応する残基で置換される。
【０１０６】
ヒト化抗体及びその作製方法は、例えば、Almagro and Fransson, (2008) Front. Biosci. 13: 1619-1633においてレビューされており、例えば、Riechmann et al., (1988) Nature 332:323-329、Queen et al., (1989) Proc. Natl Acad. Sci. USA 86: 10029-10033、米国特許第５，８２１，３３７号、米国特許第７，５２７，７９１号、米国特許第６，９８２，３２１号、及び米国特許第７，０８７，４０９号、Kashmiri et al., (2005) Methods 36:25-34、Padlan, (1991) Mol. Immunol. 28:489-498（「リサーフェイシング（resurfacing）」を記載している）、Dall'Acqua et al., (2005) Methods 36:43-60（「ＦＲシャッフリング（FR shuffling）」を記載している）、並びにOsbourn et al., (2005) Methods 36:61-68及びKlimka et al., (2000) Br. J. Cancer, 83:252-260（ＦＲシャッフリングに対する「ガイド選択（guided selection）」アプローチを記載している）で更に記載されている。
【０１０７】
ヒト化に使用され得るヒトフレームワーク領域には、限定されるものではないが、「ベストフィット（best-fit）」法を使用して選択されたフレームワーク領域（例えば、Sims et al. (1993) J. Immunol. 151 :2296を参照）、重鎖可変領域の特定のサブグループのヒト抗体のコンセンサス配列に由来するフレームワーク領域（例えば、Carter et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285、及びPresta et al. (1993) J. Immunol, 151:2623を参照）、ヒト成熟（体細胞突然変異した）フレームワーク領域又はヒト生殖細胞系フレームワーク領域（例えば、Almagro and Fransson, (2008) Front. Biosci. 13:1619-1633を参照）、及びＦＲライブラリーのスクリーニングから得られるフレームワーク領域（例えば、Baca et al., (1997) J. Biol. Chem. 272: 10678-10684、及びRosok et al., (1996) J. Biol. Chem. 271 :22611-22618を参照）が含まれる。典型的には、ＶＨＨのＦＲ領域をヒトＦＲ領域と置き換えることで、ヒト化ＶＨＨが作製される。幾つかの実施形態では、ヒトＦＲの或る特定のＦＲ残基を置き換えることで、ヒト化ＶＨＨの１つ以上の特性が改善される。そのような置き換えられた残基を有するＶＨＨドメインも、本明細書では更に「ヒト化」と称される。
【０１０８】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３と、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）とを含む。幾つかの実施形態では、ＶＨＨドメインは、配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を更に含む。
【０１０９】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、配列番号９のアミノ酸配列を含む少なくとも１つのＶＨＨドメインを含む。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、配列番号９のアミノ酸配列を含む１つ、２つ、３つ、又は４つのＶＨＨドメインを含む。
【０１１０】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０に結合する３つのＶＨＨドメインと、Ｆｃドメインとを含む。幾つかのそのような実施形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む。幾つかの実施形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３と、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）とを含む。幾つかの実施形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を更に含む。幾つかの実施形態では、各ＶＨＨドメインは、配列番号９のアミノ酸配列を含む。
【０１１１】
様々な実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドに含まれるＦｃドメインは、ヒトＦｃドメインである、又はヒトＦｃドメインに由来する。
【０１１２】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドに含まれるＦｃドメインは、ヒトＦｃドメインに由来し、ＩｇＧ１  Ｅ２３３、Ｌ２３４、及びＬ２３５に対応する３つのアミノ酸欠失を下部ヒンジに含み、本明細書で「Ｆｃ  ｘＥＬＬ」と称される。Ｆｃ  ｘＥＬＬポリペプチドはＦｃγＲと結合しないため、「エフェクターサイレント」又は「エフェクターヌル」と称されるが、幾つかの実施形態では、ｘＥＬＬ  ＦｃドメインはＦｃＲｎに結合するため、半減期の延長及びＦｃＲｎ媒介性リサイクリング（FcRn mediated recycling）と関連したトランスサイトーシスを伴う。
【０１１３】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドに含まれるＦｃドメインは、ヒトＦｃドメインに由来し、突然変異Ｍ２５２Ｙ及びＭ４２８Ｖを含み、本明細書で「Ｆｃ−ＹＶ」と称される。幾つかの実施形態では、そのような突然変異は、エンドソームの酸性ｐＨ（６．５近く）でＦｃＲｎへの結合を増強するのに対し、中性ｐＨ（約７．２）では検出可能な結合が失われることから、ＦｃＲｎ媒介性リサイクリングの増強及び半減期の延長が可能となる。
【０１１４】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドに含まれるＦｃドメインは、ヒトＦｃドメインに由来し、ヘテロ二量体化のために設計された突然変異を含み、本明細書において「ノブ」及び「ホール」と称される。幾つかの実施形態では、「ノブ」Ｆｃドメインは、突然変異Ｔ３６６Ｗを含む。幾つかの実施形態では、「ホール」Ｆｃドメインは、突然変異Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、及びＹ４０７Ｖを含む。幾つかの実施形態では、ヘテロ二量体化に使用されるＦｃドメインは、ヘテロ二量体Ｆｃペアの第１のメンバー上の突然変異Ｓ３５４Ｃ等の追加の突然変異を含み、この突然変異は、ヘテロ二量体Ｆｃペアの第２のメンバー上の対応する突然変異Ｙ３４９Ｃと非対称ジスルフィドを形成する。幾つかの実施形態では、ヘテロ二量体Ｆｃペアの一方のメンバーは、修飾Ｈ４３５Ｒ又はＨ４３５Ｋを含むことで、ＦｃＲｎ結合を維持しつつプロテインＡの結合を妨げる。幾つかの実施形態では、ヘテロ二量体Ｆｃペアの一方のメンバーは、修飾Ｈ４３５Ｒ又はＨ４３５Ｋを含むのに対して、ヘテロ二量体Ｆｃペアの第２のメンバーは、Ｈ４３５で修飾されていない。様々な実施形態では、ホールＦｃドメインは、修飾Ｈ４３５Ｒ又はＨ４３５Ｋを含むが（修飾がＨ４３５Ｒである場合に、場合によっては「ホール−Ｒ」と称される）、ノブＦｃドメインはそれを含まない。幾つかの場合には、ホール−Ｒ突然変異は、存在し得るホモ二量体ホールＦｃドメインに対するヘテロ二量体の精製を改善する。
【０１１５】
ＯＸ４０結合性ポリペプチドで使用され得る非限定的な例示的なＦｃドメインには、配列番号２５及び配列番号２６のアミノ酸配列を含むＦｃドメインが含まれる。
【０１１６】
幾つかの実施形態では、３つのＶＨＨドメインと、Ｆｃドメインとを含むＯＸ４０結合性ポリペプチドは、配列番号１４のアミノ酸配列と、そのアミノ酸配列のＣ末端に融合されたＦｃドメインとを含む。幾つかの実施形態では、３つのＶＨＨドメインと、Ｆｃドメインとを含むＯＸ４０結合性ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、配列番号１５のアミノ酸配列からなる。
【０１１７】
ＯＸ４０結合性ポリペプチドの例示的な活性
様々な実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＯＸ４０活性のアゴニストである。アゴニスト活性は、幾つかの実施形態では、本明細書の実施例に示される方法を使用して、例えばＪｕｒｋａｔ／ＯＸ４０レポーター細胞又は同様の細胞を使用して決定され得る。
【０１１８】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖の増加は、例えば、本明細書の実施例に示される方法等の当該技術分野における任意の方法によって決定され得る。非限定的な例示的なアッセイは以下の通りである。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞を１人以上の健康なヒトドナーから分離し、ＣｅｌｌＴｒａｃｅ  Ｖｉｏｌｅｔ（ＣＴＶ）で染色することができる。次いで、Ｔ細胞を抗ＣＤ３抗体及びＯＸ４０結合性ポリペプチドで共刺激した後に、ＦＡＣＳで分析する。ＣＴＶ染色の喪失は増殖を示す。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖の増加は、例えば、異なる健康なヒトドナーから分離されたＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を測定することによって、一連の実験又はプールされたＴ細胞からの平均として決定される。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖の増加は、少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞を使用して実施される実験からの、又は少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞のプールからの平均として決定される。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でさえもＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖を増加させる。
【０１１９】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる。ＣＤ２５発現はＴ細胞の活性化を示している。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現の増加は、例えば、本明細書の実施例に示される方法等の当該技術分野における任意の方法によって決定され得る。非限定的な例示的なアッセイは以下の通りである。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞を、１人以上の健康なヒトドナーから分離し、抗ＣＤ３抗体及びＯＸ４０結合性ポリペプチドで共刺激した後に、ＦＡＣＳによってＣＤ２５発現について分析することができる。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現の増加は、例えば、異なる健康なヒトドナーから分離されたＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を測定することによって、一連の実験又はプールされたＴ細胞からの平均として決定される。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現の増加は、少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞を使用して実施される実験からの、又は少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞のプールからの平均として決定される。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でさえもＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ２５発現を増加させる。
【０１２０】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる。ＣＤ７１発現はＴ細胞の活性化を示している。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を少なくとも１．５倍又は少なくとも２倍増加させる。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現の増加は、例えば、本明細書の実施例に示される方法等の当該技術分野における任意の方法によって決定され得る。非限定的な例示的なアッセイは以下の通りである。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞を、１人以上の健康なヒトドナーから分離し、抗ＣＤ３抗体及びＯＸ４０結合性ポリペプチドで共刺激した後に、ＦＡＣＳによってＣＤ７１発現について分析することができる。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現の増加は、例えば、異なる健康なヒトドナーから分離されたＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を測定することによって、一連の実験又はプールされたＴ細胞からの平均として決定される。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現の増加は、少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞を使用して実施される実験からの、又は少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞のプールからの平均として決定される。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でさえもＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＣＤ７１発現を増加させる。
【０１２１】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ  ｖｉｖｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる。ＩＦＮγ発現はＴ細胞の活性化を示している。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＩＦＮγ発現を少なくとも１．５倍、少なくとも２倍、少なくとも３倍、又は少なくとも５倍増加させる。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現の増加は、例えば、本明細書の実施例に示される方法等の当該技術分野における任意の方法によって決定され得る。非限定的な例示的なアッセイは以下の通りである。ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞を、１人以上の健康なヒトドナーから分離し、抗ＣＤ３抗体及びＯＸ４０結合性ポリペプチドで共刺激することができる。細胞内ＩＦＮγ発現を決定するために、細胞をペレット化し、検出可能な抗ＣＤ４抗体及び抗ＣＤ８抗体で表面標識する。次いで、細胞を固定して透過処理した後に、検出可能な抗ＩＦＮγ抗体で染色する。次に、ＩＦＮγ＋ＣＤ４＋細胞又はＩＦＮγ＋ＣＤ８＋細胞をＦＡＣＳによって検出する。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＩＦＮγ発現の増加は、例えば、異なる健康なヒトドナーから分離されたＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を測定することによって、一連の実験又はプールされたＴ細胞からの平均として決定される。幾つかの実施形態では、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現の増加は、少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞を使用して実施される実験からの、又は少なくとも５人若しくは少なくとも１０人の異なる健康なドナーからのＴ細胞のプールからの平均として決定される。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でさえもＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞におけるＩＦＮγ発現を増加させる。
【０１２２】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の抑制活性を低減又は減弱させる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞に対するＴｒｅｇ抑制活性を、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、又は少なくとも５０％低減させる。慣例的なＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞上でのＴｒｅｇ抑制活性の減少は、例えば、本明細書の実施例に示される方法等の当該技術分野における任意の方法によって決定され得る。非限定的な例示的なアッセイは以下の通りである。Ｔｒｅｇ及びＣＤ４＋Ｔ細胞を、健康なヒトドナーＰＢＭＣから分離した後に、増殖性細胞用蛍光色素で異なる様式で標識する。ＣＤ４＋Ｔ細胞を抗ＣＤ３抗体で刺激し、一方で、Ｔｒｅｇ細胞を本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドの存在下でインキュベートする。２つのＴ細胞集団を３日間共培養し、ＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖及び活性化をフローサイトメトリーでモニターする。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、例えば、Ｔｒｅｇ細胞の存在下であるが本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドの不存在下でのＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の活性化及び増殖と比較して、Ｔｒｅｇ細胞の存在下でＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の活性化及び増殖を増加させる。
【０１２３】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは多価であり、２つ以上のＯＸ４０結合ドメインを含む。様々な実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、又は８つのＯＸ４０結合ドメインを含む。幾つかのそのような実施形態では、ＯＸ４０結合ドメインの少なくとも１つ又は全ては同じである。幾つかのそのような実施形態では、ＯＸ４０結合ドメインの全ては、１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３（それぞれ、配列番号１０、配列番号１１、及び配列番号１２）を含む。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合ドメインの少なくとも１つ又は全ては、１Ｄ１０ｖ６のＶＨＨ（配列番号９）を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも１つのＯＸ４０結合ドメインは、１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ又はＶＨＨを含み、少なくとも１つのＯＸ４０結合ドメインは、１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ又はＶＨＨを含まない。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、多重特異性であり、ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのドメインと、別の抗原に結合する少なくとも１つのドメインとを含む。幾つかの実施形態では、第２の抗原は、ＰＤ１、ＰＤＬ１、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ、ＬＡＧ３、ＶＩＳＴＡ、ｇｐＮＭＢ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＨＬＡ２、ＣＤ７３、ＣＤ３９、４１ＢＢ、ＧＩＴＲ、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＨＶＥＭ、５Ｔ４、α−４インテグリン、α−Ｖインテグリン、α４β１インテグリン、α４β７インテグリン、ＡＧＲ２、抗Ｌｅｗｉｓ−Ｙ、アペリンＪ受容体、ＡＰＲＩＬ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、Ｂ７−Ｈ６、ＢＡＦＦ、ＢＴＬＡ、Ｃ５補体、Ｃ−２４２、ＣＡ９、ＣＡ１９−９（Ｌｅｗｉｓ  ａ）、炭酸脱水酵素９、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ６、ＣＤ９、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ３８、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ４１、ＣＤ４４、ＣＤ４４ｖ６、ＣＤ４７、ＣＤ５１、ＣＤ５２、ＣＤ５６、ＣＤ６４、ＣＤ７０、ＣＤ７１、ＣＤ７４、ＣＤ８０、ＣＤ８１、ＣＤ８６、ＣＤ９５、ＣＤ１１７、ＣＤ１２３、ＣＤ１２５、ＣＤ１３２（ＩＬ−２ＲＧ）、ＣＤ１３３、ＣＤ１３８、ＣＤ１６６、ＣＤ１７２Ａ、ＣＤ２４８、ＣＤＨ６、ＣＥＡＣＡＭ５（ＣＥＡ）、ＣＥＡＣＡＭ６（ＮＣＡ−９０）、ＣＬＡＵＤＩＮ−３、ＣＬＡＵＤＩＮ−４、ｃＭｅｔ、コラーゲン、Ｃｒｉｐｔｏ、ＣＳＦＲ、ＣＳＦＲ−１、ＣＴＬＡ−４、ＣＴＧＦ、ＣＸＣＬ１０、ＣＸＣＬ１３、ＣＸＣＲ１、ＣＸＣＲ２、ＣＸＣＲ４、ＣＹＲ６１、ＤＬ４４、ＤＬＫ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４、ＤＰＰ−４、ＤＳＧ１、ＥＤＡ、ＥＤＢ、ＥＧＦＲ、ＥＧＦＲｖｉｉｉ、エンドセリンＢ受容体（ＥＴＢＲ）、ＥＮＰＰ３、ＥｐＣＡＭ、ＥＰＨＡ２、ＥＰＨＢ２、ＥＲＢＢ３、ＲＳＶのＦタンパク質、ＦＡＰ、ＦＧＦ−２、ＦＧＦ８、ＦＧＦＲ１、ＦＧＦＲ２、ＦＧＦＲ３、ＦＧＦＲ４、フィブロネクチンのエクストラドメインＢ（ＥＤＢ）、ＦＬＴ−３、葉酸受容体α（ＦＲα）、ＧＡＬ３ＳＴ１、Ｇ−ＣＳＦ、Ｇ−ＣＳＦＲ、ＧＤ２、ＧＩＴＲ、ＧＬＵＴ１、ＧＬＵＴ４、ＧＭ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦＲ、ＧＰ  ＩＩｂ／ＩＩＩａ受容体、Ｇｐ１３０、ＧＰＩＩＢ／ＩＩＩＡ、ＧＰＮＭＢ���ＧＲＰ７８、ＨＥＲ２／ｎｅｕ、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＨＧＦ、ｈＧＨ、ＨＶＥＭ、ヒアルロニダーゼ、ＩＦＮα、ＩＦＮβ、ＩＦＮγ、ＩｇＥ、ＩｇＥ受容体（ＦｃｅＲＩ）、ＩＧＦ、ＩＧＦ１Ｒ、ＩＬ１Ｂ、ＩＬ１Ｒ、ＩＬ２、ＩＬ１１、ＩＬ１２、ＩＬ１２ｐ４０、ＩＬ−１２Ｒ、ＩＬ−１２Ｒβ１、ＩＬ１３、ＩＬ１３Ｒ、ＩＬ１５、ＩＬ１７、ＩＬ１８、ＩＬ２１、ＩＬ２３、ＩＬ２３Ｒ、ＩＬ２７／ＩＬ２７Ｒ（ｗｓｘ１）、ＩＬ２９、ＩＬ−３１Ｒ、ＩＬ３１／ＩＬ３１Ｒ、ＩＬ２Ｒ、ＩＬ４、ＩＬ４Ｒ、ＩＬ６、ＩＬ６Ｒ、インスリン受容体、Ｊａｇｇｅｄリガンド、Ｊａｇｇｅｄ  １、Ｊａｇｇｅｄ  ２、ＫＩＳＳ１−Ｒ、ＬＡＧ−３、ＬＩＦ−Ｒ、Ｌｅｗｉｓ  Ｘ、ＬＩＧＨＴ、ＬＲＰ４、ＬＲＲＣ２６、Ｌｙ６Ｇ６Ｄ、ＬｙＰＤ１、ＭＣＳＰ、メソテリン、ＭＲＰ４、ＭＵＣ１、ムチン−１６（ＭＵＣ１６、ＣＡ−１２５）、Ｎａ／Ｋ  ＡＴＰアーゼ、ＮＧＦ、ＮＥｃｔｉｎ  ４、ニカストリン、Ｎｏｔｃｈ受容体、Ｎｏｔｃｈ  １、Ｎｏｔｃｈ  ２、Ｎｏｔｃｈ  ３、Ｎｏｔｃｈ  ４、ＮＯＶ、ＯＳＭ−Ｒ、ＯＸ−４０、ＰＡＲ２、ＰＤＧＦ−ＡＡ、ＰＤＧＦ−ＢＢ、ＰＤＧＦＲα、ＰＤＧＦＲβ、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ホスファチジル−セリン、Ｐ１ＧＦ、ＰＳＣＡ、ＰＳＭＡ、ＰＳＧＲ、ＲＡＡＧ１２、ＲＡＧＥ、ＳＬＣ４４Ａ４、スフィンゴシン１ホスフェート、ＳＴＥＡＰ１、ＳＴＥＡＰ２、ＴＡＧ−７２、ＴＡＰＡ１、ＴＥＭ−８、ＴＧＦβ、ＴＩＧＩＴ、ＴＩＭ−３、ＴＬＲ２、ＴＬＲ４、ＴＬＲ６、ＴＬＲ７、ＴＬＲ８、ＴＬＲ９、ＴＭＥＭ３１、ＴＮＦα、ＴＮＦＲ、ＴＮＦＲＳ１２Ａ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ１、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、トランスフェリン、トランスフェリン受容体、ＴＲＫ−Ａ、ＴＲＫ−Ｂ、ｕＰＡＲ、ＶＡＰ１、ＶＣＡＭ−１、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＶＥＧＦＲ１、ＶＥＧＦＲ２、ＶＥＧＦＲ３、ＶＩＳＴＡ、ＷＩＳＰ−１、ＷＩＳＰ−２、及びＷＩＳＰ−３から選択される。幾つかの実施形態では、第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインは、アンタゴニスト又はアゴニストである。幾つかの実施形態では、第２の抗原に結合する少なくとも１つの結合ドメインは、ＶＨＨドメインである。
【０１２４】
本明細書では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを発現する操作された細胞が提供される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、細胞から分泌される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、シグナルペプチド、例えば、ポリペプチドの細胞による分泌を引き起こす抗体シグナルペプチド又は他のシグナル配列を含む。シグナルペプチド又はシグナルペプチドの一部は、分泌されるときにポリペプチドから切断され得る。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、細胞内の核酸によってコードされ、さらに、細胞によって発現及び分泌され得る。核酸は、典型的には、所望の条件下での発現に適した調節配列（例えば、プロモーター及び／又はエンハンサー等）を含む。核酸は、細胞のゲノム中に組み込まれていてもよく、又はゲノム外の核酸としても存在し得る。幾つかの実施形態では、細胞は、例えば、初代免疫細胞等の免疫細胞である。
【０１２５】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。ＣＡＲは、典型的には、Ｔ細胞等の細胞の表面上に発現される融合分子における抗原結合ドメイン等の細胞外標的化部分又は結合部分と、膜貫通ドメインと、１つ以上のシグナル伝達ドメインとを含む合成受容体である。したがって、ＣＡＲは、単一分子において抗原特異性とＴ細胞活性化特性とを兼ね備えている。第１世代のＣＡＲは典型的には、ＣＤ３ζの細胞質領域又はＦｃｌ受容体γ鎖をそれらのシグナル伝達ドメインとして含む。第１世代のＣＡＲは、卵巣癌、腎癌、リンパ腫、及び神経芽細胞腫を伴う患者における第Ｉ相臨床試験で試験されており、これらは中程度の奏効を誘導した（Sadelain et al., Curr Opin Immunol, 21 (2): 215-223, 2009でレビューされている）。ＣＤ２８及びＣＤ３ζ等の共刺激分子のシグナル伝達ドメインを含む第２世代のＣＡＲは、活性化シグナルと共刺激シグナルとの組み合わせに向けたデュアルシグナル伝達を提供する。第３世代のＣＡＲは、３つ以上のシグナル伝達ドメインを伴ってより複雑である（Sadelain et al., Cancer Discovery (3), 388-398, 2013及びDotti et al, Immuno. Rev, 257 (1), 1-36, 2014でレビューされている）。
【０１２６】
幾つかの実施形態では、ＣＡＲの細胞外結合部分は、ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメイン等の１つ以上の結合ドメインを含む。幾つかの実施形態では、細胞外結合部分は多価であり、ＯＸ４０に結合する２つ以上の結合ドメインを含む。様々な実施形態では、細胞外結合部分は、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、又は８つのＯＸ４０結合ドメインを含む。幾つかのそのような実施形態では、ＯＸ４０結合ドメインの少なくとも１つ又は全ては同じである。幾つかのそのような実施形態では、ＯＸ４０結合ドメインの全ては、１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３（それぞれ、配列番号１０、配列番号１１、及び配列番号１２）を含む。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合ドメインの少なくとも１つ又は全ては、１Ｄ１０ｖ６のＶＨＨ（配列番号９）を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも１つのＯＸ４０結合ドメインは、１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ又はＶＨＨを含み、少なくとも１つのＯＸ４０結合ドメインは、１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ又はＶＨＨを含まない。幾つかの実施形態では、細胞外結合部分は、多重特異性であり、ＯＸ４０に結合する少なくとも１つのドメインと、別の抗原に結合する少なくとも１つのドメインとを含む。幾つかの実施形態では、第２の抗原は、ＰＤ１、ＰＤＬ１、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ、ＬＡＧ３、ＶＩＳＴＡ、ｇｐＮＭＢ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＨＬＡ２、ＣＤ７３、ＣＤ３９、４１ＢＢ、ＧＩＴＲ、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＨＶＥＭ、５Ｔ４、α−４インテグリン、α−Ｖインテグリン、α４β１インテグリン、α４β７インテグリン、ＡＧＲ２、抗Ｌｅｗｉｓ−Ｙ、アペリンＪ受容体、ＡＰＲＩＬ、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４、Ｂ７−Ｈ６、ＢＡＦＦ、ＢＴＬＡ、Ｃ５補体、Ｃ−２４２、ＣＡ９、ＣＡ１９−９（Ｌｅｗｉｓ  ａ）、炭酸脱水酵素９、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ６、ＣＤ９、ＣＤ１１ａ、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２２、ＣＤ２４、ＣＤ２５、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ３３、ＣＤ３８、ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、ＣＤ４１、ＣＤ４４、ＣＤ４４ｖ６、ＣＤ４７、ＣＤ５１、ＣＤ５２、ＣＤ５６、ＣＤ６４、ＣＤ７０、ＣＤ７１、ＣＤ７４、ＣＤ８０、ＣＤ８１、ＣＤ８６、ＣＤ９５、ＣＤ１１７、ＣＤ１２３、ＣＤ１２５、ＣＤ１３２（ＩＬ−２ＲＧ）、ＣＤ１３３、ＣＤ１３８、ＣＤ１６６、ＣＤ１７２Ａ、ＣＤ２４８、ＣＤＨ６、ＣＥＡＣＡＭ５（ＣＥＡ）、ＣＥＡＣＡＭ６（ＮＣＡ−９０）、ＣＬＡＵＤＩＮ−３、ＣＬＡＵＤＩＮ−４、ｃＭｅｔ、コラーゲン、Ｃｒｉｐｔｏ、ＣＳＦＲ、ＣＳＦＲ−１、ＣＴＬＡ−４、ＣＴＧＦ、ＣＸＣＬ１０、ＣＸＣＬ１３、ＣＸＣＲ１、ＣＸＣＲ２、ＣＸＣＲ４、ＣＹＲ６１、ＤＬ４４、ＤＬＫ１、ＤＬＬ３、ＤＬＬ４、ＤＰＰ−４、ＤＳＧ１、ＥＤＡ、ＥＤＢ、ＥＧＦＲ、ＥＧＦＲｖｉｉｉ、エンドセリンＢ受容体（ＥＴＢＲ）、ＥＮＰＰ３、ＥｐＣＡＭ、ＥＰＨＡ２、ＥＰＨＢ２、ＥＲＢＢ３、ＲＳＶのＦタンパク質、ＦＡＰ、ＦＧＦ−２、ＦＧＦ８、ＦＧＦＲ１、ＦＧＦＲ２、ＦＧＦＲ３、ＦＧＦＲ４、フィブロネクチンエクストラドメインＢ（ＥＤＢ）、ＦＬＴ−３、葉酸受容体α（ＦＲα）、ＧＡＬ３ＳＴ１、Ｇ−ＣＳＦ、Ｇ−ＣＳＦＲ、ＧＤ２、ＧＩＴＲ、ＧＬＵＴ１、ＧＬＵＴ４、ＧＭ−ＣＳＦ、ＧＭ−ＣＳＦＲ、ＧＰ  ＩＩｂ／ＩＩＩａ受容体、Ｇｐ１３０、ＧＰＩＩＢ／ＩＩＩＡ、ＧＰＮＭＢ、ＧＲＰ７８、ＨＥＲ２／ｎｅｕ、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４、ＨＧＦ、ｈＧＨ、ＨＶＥＭ、ヒアルロニダーゼ、ＩＦＮα、ＩＦＮβ、ＩＦＮγ、ＩｇＥ、ＩｇＥ受容体（ＦｃｅＲＩ）、ＩＧＦ、ＩＧＦ１Ｒ、ＩＬ１Ｂ、ＩＬ１Ｒ、ＩＬ２、ＩＬ１１、ＩＬ１２、ＩＬ１２ｐ４０、ＩＬ−１２Ｒ、ＩＬ−１２Ｒβ１、ＩＬ１３、ＩＬ１３Ｒ、ＩＬ１５、ＩＬ１７、ＩＬ１８、ＩＬ２１、ＩＬ２３、ＩＬ２３Ｒ、ＩＬ２７／ＩＬ２７Ｒ（ｗｓｘ１）、ＩＬ２９、ＩＬ−３１Ｒ、ＩＬ３１／ＩＬ３１Ｒ、ＩＬ２Ｒ、ＩＬ４、ＩＬ４Ｒ、ＩＬ６、ＩＬ６Ｒ、インスリン受容体、Ｊａｇｇｅｄリガンド、Ｊａｇｇｅｄ  １、Ｊａｇｇｅｄ  ２、ＫＩＳＳ１−Ｒ、ＬＡＧ−３、ＬＩＦ−Ｒ、Ｌｅｗｉｓ  Ｘ、ＬＩＧＨＴ、ＬＲＰ４、ＬＲＲＣ２６、Ｌｙ６Ｇ６Ｄ、ＬｙＰＤ１、ＭＣＳＰ、メソテリン、ＭＲＰ４、ＭＵＣ１、ムチン−１６（ＭＵＣ１６、ＣＡ−１２５）、Ｎａ／Ｋ  ＡＴＰアーゼ、ＮＧＦ、ＮＥｃｔｉｎ  ４、ニカストリン、Ｎｏｔｃｈ受容体、Ｎｏｔｃｈ  １、Ｎｏｔｃｈ  ２、Ｎｏｔｃｈ  ３、Ｎｏｔｃｈ  ４、ＮＯＶ、ＯＳＭ−Ｒ、ＯＸ−４０、ＰＡＲ２、ＰＤＧＦ−ＡＡ、ＰＤＧＦ−ＢＢ、ＰＤＧＦＲα、ＰＤＧＦＲβ、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ホスファチジル−セリン、Ｐ１ＧＦ、ＰＳＣＡ、ＰＳＭＡ、ＰＳＧＲ、ＲＡＡＧ１２、ＲＡＧＥ、ＳＬＣ４４Ａ４、スフィンゴシン１ホスフェート、ＳＴＥＡＰ１、ＳＴＥＡＰ２、ＴＡＧ−７２、ＴＡＰＡ１、ＴＥＭ−８、ＴＧＦβ、ＴＩＧＩＴ、ＴＩＭ−３、ＴＬＲ２、ＴＬＲ４、ＴＬＲ６、ＴＬＲ７、ＴＬＲ８、ＴＬＲ９、ＴＭＥＭ３１、ＴＮＦα、ＴＮＦＲ、ＴＮＦＲＳ１２Ａ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ１、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、トランスフェリン、トランスフェリン受容体、ＴＲＫ−Ａ、ＴＲＫ−Ｂ、ｕＰＡＲ、ＶＡＰ１、ＶＣＡＭ−１、ＶＥＧＦ、ＶＥＧＦ−Ａ、ＶＥＧＦ−Ｂ、ＶＥＧＦ−Ｃ、ＶＥＧＦ−Ｄ、ＶＥＧＦＲ１、ＶＥＧＦＲ２、ＶＥＧＦＲ３、ＶＩＳＴＡ、ＷＩＳＰ−１、ＷＩＳＰ−２、及びＷＩＳＰ−３から選択される。幾つかの実施形態では、細胞外結合部分の１つ以上の抗原結合ドメインは、ｓｃＦｖ又はＶＨＨである。幾つかの実施形態では、細胞外結合部分は、十分な親和性で標的抗原に結合する又は結合することができるため、ＣＡＲは、療法において有用であり、例えば、標的抗原を発現する細胞又は組織を標的化するのに有用である。
【０１２７】
ＣＡＲの膜貫通ドメインは、典型的に原形質膜を横切る又は原形質膜を横切り得る若しくは原形質膜にまたがり得るドメインであり、このドメインは、細胞外抗原結合ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む内質部分に直接的又は間接的に（例えば、免疫グロブリンヒンジ配列等のスペーサーを介して）連結されている。幾つかの実施形態では、ＣＡＲの膜貫通ドメインは、膜貫通タンパク質（例えば、Ｉ型膜貫通タンパク質）の膜貫通領域、人工疎水性配列、又はそれらの組み合わせである。幾つかの実施形態では、膜貫通ドメインは、ＣＤ３ζドメイン又はＣＤ２８膜貫通ドメインを含む。他の膜貫通ドメインは当業者には明らかであり、本明細書で提供されるＣＡＲの実施形態に関連して使用され得る。
【０１２８】
本明細書で提供されるＣＡＲの細胞内シグナル伝達領域は、ＣＡＲの抗原結合ドメインの結合時に、例えば、抗原の結合時にＴ細胞にシグナルを伝達する１つ以上の細胞内シグナル伝達ドメインを含む。幾つかの実施形態では、細胞内領域は、ＩＴＡＭシグナル伝達ドメインである又はＩＴＡＭシグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインを含む。例示的な細胞内シグナル伝達ドメインには、例えば、Ｔ細胞受容体複合体のζ鎖又はそのホモログ（例えば、η鎖、ＦｃｓＲＩｙ鎖及びβ鎖、ＭＢ１（Ｉｇａ）鎖、Ｂ２９（Ｉｇ）鎖等）のいずれか、ヒトＣＤ３ζ鎖、ＣＤ３ポリペプチド（Δ、δ、及びε）、ｓｙｋファミリーチロシンキナーゼ（Ｓｙｋ、ＺＡＰ７０等）、ｓｒｃファミリーチロシンキナーゼ（Ｌｃｋ、Ｆｙｎ、Ｌｙｎ等）並びにＣＤ２、ＣＤ５、ＯＸ４０及びＣＤ２８等のＴ細胞伝達に関与する他の分子に由来するシグナル伝達ドメインが含まれる。特定の実施形態では、細胞内シグナル伝達領域は、ヒトＣＤ３ζ鎖に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
【０１２９】
幾つかの実施形態では、エンドドメインは、ＣＤ３ζシグナル伝達ドメインを含む。幾つかの実施形態では、ＣＤ３ζシグナル伝達ドメインは、配列番号２７に示されるアミノ酸の配列、又は配列番号２７に対して少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％以上の配列同一性を示し、Ｔ細胞シグナル伝達の活性を保持しているアミノ酸の配列を含む。
【０１３０】
幾つかの実施形態では、ＣＡＲの細胞内シグナル伝達領域は、共刺激分子に由来する細胞内シグナル伝達ドメインを更に含み得る。そのような例では、そのようなシグナル伝達ドメインは、例えば、抗原特異的結合後に、例えば、ＩＴＡＭ含有シグナル伝達ドメイン、例えばＣＤ３ζのみを含むＣＡＲと比較して、記憶細胞の増殖、生存及び／又は発達の増強を介してＣＡＲ−Ｔ細胞活性を増強し得る。幾つかの実施形態では、共刺激ドメインは、ＣＤ２８、ＣＤ１３７（４−ＩＢＢ）、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＤａｐＩＯ、ＣＤ２７、ＣＤ２、ＣＤ５、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１（ＣＤ１１ａ／ＣＤ１８）、Ｌｃｋ、ＴＮＦＲ−Ｉ、ＴＮＦＲ−ＩＩ、Ｆａｓ、ＣＤ３０、ＣＤ４０又はそれらの組み合わせから選択されるタンパク質から得られる機能的シグナル伝達ドメインである。特定の実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、ヒトタンパク質に由来する又はヒトタンパク質から得られる。幾つかの態様では、共刺激シグナル伝達ドメインは、ヒトＣＤ２８又はヒトＣＤ１３７（４−ＩＢＢ）に由来する又はそれらから得られる。
【０１３１】
幾つかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインはＣＤ２８又は４−１ＢＢに由来し、配列番号２８〜配列番号３１のいずれかに示されるアミノ酸の配列、又は配列番号２８〜配列番号３１に対して少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、若しくは９９％以上の配列同一性を示し、Ｔ細胞共刺激シグナル伝達の活性を保持しているアミノ酸の配列を含む。
【０１３２】
幾つかの実施形態では、ＣＡＲは、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとを連結するヒンジ領域又はスペーサー領域を更に含む。このヒンジ領域又はスペーサー領域を使用して、得られるＣＡＲの種々の長さ及び柔軟性を実現することができる。使用され得るヒンジ領域又はスペーサー領域の例には、限定されるものではないが、抗体のＦｃフラグメント、若しくはその断片若しくは誘導体、抗体のヒンジ領域、若しくはその断片若しくは誘導体、抗体のＣＨ２領域、抗体のＣＨ３領域、人工スペーサー配列、例えばペプチド配列、又はそれらの組み合わせが含まれる。他のヒンジ領域又はスペーサー領域は当業者には明らかであり、使用され得る。一実施形態では、ヒンジは、ＩｇＧ４ヒンジ又はＣＤ８Ａヒンジである。
【０１３３】
幾つかの実施形態では、スペーサー及び膜貫通ドメインは、例えば、配列番号３２〜配列番号３４に示される例示的な配列、又は配列番号３２〜配列番号３４に対して少なくとも８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上の配列同一性を示すアミノ酸の配列を有する、ＣＤ８に由来するヒンジ及び膜貫通ドメインである。
【０１３４】
また、本明細書では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを含むＣＡＲをコードするポリヌクレオチドを含む単離された核酸が提供される。幾つかの実施形態では、ＣＡＲをコードする第１の核酸は、ＯＸ４０結合性ポリペプチドをコードする第２の核酸からＩＲＥＳ又はリボソームスキップ配列（例えば、Ｔ２Ａ又はＰ２Ａ）等のビスシストロン性エレメントによって分離される。幾つかの態様では、コンストラクトは、細胞におけるＯＸ４０結合性ポリペプチド及び／又はＣＡＲの発現のための発現ベクターである。発現ベクターはウイルスベクターであり得る。ウイルスベクター技術は、当該技術分野で十分に知られており、例えば、Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York, 2013)に記載されている。哺乳動物細胞への遺伝子移入のために多くのウイルスベースのシステムが開発されてきた。例えば、アデノウイルスベクター等のレトロウイルスが使用される。一実施形態では、レンチウイルスベクターが使用される。
【０１３５】
更なる態様では、上記の１つ以上の核酸コンストラクトを含む分離された細胞又は細胞集団も提供される。また、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチド及び／又はＣＡＲを発現するように遺伝子改変された分離された細胞又は細胞集団も提供される。したがって、本明細書では、本明細書で提供されるＣＡＲを含み、それを何らか安定して発現し得る細胞を含む遺伝子操作された細胞が提供される。一実施形態では、細胞は、Ｔ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）、制御性Ｔ細胞、造血幹細胞、及び／又は多能性胚性幹細胞／多能性誘導幹細胞から選択される。幾つかの場合では、細胞はＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞等のＴ細胞である。幾つかの実施形態では、細胞は被験体に対して自家である。例えば、幾つかの実施形態では、Ｔ細胞は、ＣＡＲ核酸コンストラクトでの操作、例えばトランスフェクション又は形質導入のために、患者から分離され得る（初代Ｔ細胞とも称される）。
【０１３６】
例示的な方法では、初代Ｔ細胞はｅｘ  ｖｉｖｏで純化され（ＣＤ４＋細胞若しくはＣＤ８＋細胞又は両方）、抗ＣＤ３／抗ＣＤ２８でコーティングされたビーズ等のＴＣＲ／ＣＤ２８アゴニストで刺激され得る。２日又は３日の活性化過程の後に、ＣＡＲをコードする組換え発現ベクターは、標準的なレンチウイルス若しくはレトロウイルスの形質導入プロトコル又はプラスミドのエレクトロポレーション戦略を通じて、初代Ｔ細胞へと安定的に導入され得る。例えば、抗エピトープタグ又は天然の親分子と交差反応する抗体を使用するフローサイトメトリーによって、ＯＸ４０結合性ポリペプチドの分泌及び／又はＣＡＲ発現について、細胞をモニターすることができる。ＣＡＲを発現するＴ細胞を、抗エピトープタグ抗体でソーティングすることによって濃縮することができる、又は用途に応じて高発現若しくは低発現に関して濃縮することができる。
【０１３７】
ＯＸ４０結合性ポリペプチド及び／又はＣＡＲで操作されたＴ細胞を、様々な手段によって適切な機能についてアッセイすることができる。幾つかの場合には、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでの細胞傷害性、増殖、ＯＸ４０レポーターアッセイ、又はサイトカインアッセイ（例えば、ＩＦＮγ、ＩＬ−２、ＴＮＦα発現）を使用して、操作されたＴ細胞の機能を評価することができる。例示的な標準エンドポイントは、腫瘍系統の溶解のパーセント、操作されたＴ細胞の増殖、又は培養上清中のＩＦＮγタンパク質の発現である。幾つかの場合には、例えば抗原を介したＣＡＲの刺激時にＴ細胞の活性化を刺激する能力を、例えば、ＣＤ６９、ＣＤ４４若しくはＣＤ６２Ｌ等の活性化マーカーの発現、増殖及び／又はサイトカイン産生をモニターすることによって評価することができる。
【０１３８】
また、本明細書では、本明細書で提供される操作された細胞を被験体に投与することを含む、被験体における疾患又は病態、例えば癌を未然防止及び／又は治療する方法が提供される。一般的に、被験体は、疾患又は病態の治療を必要としている。薬学的活性量の本発明の細胞及び／又は医薬組成物。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを発現及び分泌する細胞が治療において使用される。幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを発現するＣＡＲで操作されたＴ細胞が治療に使用される。
【０１３９】
ポリペプチドの発現及び産生
ＯＸ４０結合性ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む核酸分子が提供される。したがって、様々な実施形態では、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３を含む、ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメインをコードする核酸分子が提供される。幾つかの実施形態では、配列番号１０のアミノ酸配列を含むＣＤＲ１、配列番号１１のアミノ酸配列を含むＣＤＲ２、及び配列番号１２のアミノ酸配列を含むＣＤＲ３と、配列番号２２のアミノ酸配列を含むフレームワーク２（ＦＲ２）とを含む、ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメインをコードする核酸分子が提供される。幾つかの実施形態では、核酸分子は、配列番号２３のアミノ酸配列を含むＦＲ３を更にコードする。幾つかの実施形態では、配列番号９のアミノ酸配列を含む少なくとも１つの、例えば、１つ、２つ、３つ、又は４つのＶＨＨドメインを含む、ＯＸ４０結合性ポリペプチドをコードする核酸分子が提供される。様々な実施形態では、核酸分子は、配列番号２５又は配列番号２６のＦｃドメイン等のＦｃドメインを更にコードする。幾つかの実施形態では、配列番号１４のアミノ酸配列と、そのアミノ酸配列のＣ末端に融合されたＦｃドメインとを含む、３つのＶＨＨドメインと、Ｆｃドメインとを含むＯＸ４０結合性ポリペプチドをコードする核酸分子が提供される。幾つかの実施形態では、配列番号１５のアミノ酸配列を含む又は配列番号１５のアミノ酸配列からなるＯＸ４０結合性ポリペプチドをコードする核酸分子が提供される。上述の実施形態のいずれかにおいて、核酸分子はまた、ＯＸ４０結合性ポリペプチドの分泌を指示するリーダー配列もコードすることができ、そのリーダー配列は、典型的には、これが分泌されたポリペプチド中に存在しないように切断される。リーダー配列は、天然の重鎖（又はＶＨＨ）リーダー配列であり得る、又は別の異種リーダー配列であり得る。
【０１４０】
核酸分子は、当該技術分野で慣用の組換えＤＮＡ技術を使用して構築され得る。幾つかの実施形態では、核酸分子は、選択された宿主細胞における発現に適した発現ベクターである。
【０１４１】
本明細書に記載されるＯＸ４０結合性ポリペプチドをコードする核酸を含むベクターが提供される。そのようなベクターには、限定されるものではないが、ＤＮＡベクター、ファージベクター、ウイルスベクター、レトロウイルスベクター等が含まれる。幾つかの実施形態では、ＣＨＯ細胞若しくはＣＨＯ由来細胞等の所望の細胞型、又はＮＳＯ細胞におけるポリペプチドの発現のために最適化されたベクターが選択される。例示的なそのようなベクターは、例えば、Running Deer et al., Biotechnol. Prog. 20:880-889 (2004)に記載されている。
【０１４２】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、細菌細胞等の原核細胞において、又は真菌細胞（酵母等）、植物細胞、昆虫細胞、及び哺乳類細胞等の真核細胞において発現され得る。そのような発現は、例えば、当該技術分野で既知の手順に従って実施され得る。ポリペプチドの発現に使用され得る例示的な真核細胞には、限定されるものではないが、ＣＯＳ７細胞を含むＣＯＳ細胞、２９３−６Ｅ細胞を含む２９３細胞、ＣＨＯ−Ｓ、ＤＧ４４、Ｌｅｃ１３  ＣＨＯ細胞及びＦＵＴ８  ＣＨＯ細胞を含むＣＨＯ細胞、ＰＥＲ．Ｃ６（商標）細胞（Crucell社）、並びにＮＳＯ細胞が含まれる。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、酵母において発現され得る。例えば、米国特許出願公開第２００６／０２７００４５号を参照。幾つかの実施形態では、特定の真核宿主細胞は、ポリペプチドに対して所望の翻訳後修飾を行うその能力に基づいて選択される。例えば、幾つかの実施形態では、ＣＨＯ細胞は、２９３細胞で産生される同じポリペプチドよりも高レベルのシアリル化を有するポリペプチドを産生する。
【０１４３】
所望の宿主細胞への１つ以上の核酸（ベクター等）の導入は、限定されるものではないが、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染等を含むあらゆる方法によって達成され得る。非限定的な例示的な方法は、例えばSambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press (2001)に記載されている。核酸は、任意の適切な方法に従って、所望の宿主細胞に一過的又は安定的にトランスフェクションされ得る。
【０１４４】
本明細書に記載される核酸又はベクターのいずれかを含む宿主細胞も提供される。幾つかの実施形態では、本明細書に記載されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを発現する宿主細胞が提供される。宿主細胞で発現されたＯＸ４０結合性ポリペプチドは、任意の適切な方法によって精製され得る。そのような方法には、限定されるものではないが、親和性マトリックス又は疎水性相互作用クロマトグラフィーの使用が含まれる。適切なアフィニティーリガンドには、ＲＯＲ１  ＥＣＤ及びＦｃ領域に結合する作用物質が含まれる。例えば、プロテインＡ、プロテインＧ、プロテインＡ／Ｇ、又は抗体アフィニティーカラムを使用して、Ｆｃ領域に結合することで、Ｆｃ領域を含むＯＸ４０結合性ポリペプチドを精製することができる。疎水性相互作用クロマトグラフィー、例えば、ブチルカラム又はフェニルカラムもまた、抗体等の幾つかのポリペプチドを精製するのに適切であり得る。イオン交換クロマトグラフィー（例えば、陰イオン交換クロマトグラフィー及び／又は陽イオン交換クロマトグラフィー）もまた、抗体等の幾つかのポリペプチドを精製するのに適切であり得る。混合モードクロマトグラフィー（例えば、逆相／陰イオン交換、逆相／陽イオン交換、親水性相互作用／陰イオン交換、親水性相互作用／陽イオン交換等）も、抗体等の幾つかのポリペプチドを精製するのに適切であり得る。ポリペプチドを精製する多くの方法が当該技術分野で知られている。
【０１４５】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、無細胞系において産生される。非限定的な例示的な無細胞系は、例えば、Sitaraman et al., Methods Mol. Biol. 498: 229-44 (2009)、Spirin, Trends Biotechnol. 22: 538-45 (2004)、Endo et al., Biotechnol. Adv. 21: 695-713 (2003)に記載されている。
【０１４６】
幾つかの実施形態では、上記の方法によって作製されたＯＸ４０結合性ポリペプチドが提供される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、宿主細胞において作製される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、無細胞系において作製される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは精製される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドを含む細胞培養培地が提供される。
【０１４７】
幾つかの実施形態では、上記の方法によって作製された抗体を含む組成物が提供される。幾つかの実施形態では、該組成物は、宿主細胞において作製されたＯＸ４０結合性ポリペプチドを含む。幾つかの実施形態では、該組成物は、無細胞系において作製されたＯＸ４０結合性ポリペプチドを含む。幾つかの実施形態では、該組成物は、精製されたＯＸ４０結合性ポリペプチドを含む。
【０１４８】
ＯＸ４０結合性ポリペプチドを使用して疾患を治療する例示的な方法
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドを投与することを含む、個体における疾患を治療する方法が提供される。このような疾患には、ＣＤ４＋Ｔ細胞及び／又はＣＤ８＋Ｔ細胞の増殖及び活性化の増加から恩恵を受けるあらゆる疾患が含まれる。幾つかの実施形態では、個体における癌を治療する方法が提供される。該方法は、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを有効量、個体に投与することを含む。そのような治療方法は、ヒト又は動物における治療方法であり得る。幾つかの実施形態では、ヒトを治療する方法が提供される。本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドを使用して治療することができる非限定的な例示的な癌には、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳癌及び中枢神経系癌、乳癌、腹膜癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸直腸癌、結合組織癌、消化器系癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌、胃腸癌、膠芽腫、肝癌、肝細胞癌、上皮内新生物、腎臓癌又は腎癌、喉頭癌、肝臓癌、肺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、黒色腫、骨髄腫、神経芽細胞腫、口腔癌、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌、肉腫、皮膚癌、扁平上皮癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌又は子宮内膜癌、泌尿器系癌、並びに外陰癌、リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、低悪性度／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、小リンパ球（ＳＬ）ＮＨＬ、中悪性度／濾胞性ＮＨＬ、中悪性度びまん性ＮＨＬ、高悪性度免疫芽球性ＮＨＬ、高悪性度リンパ芽球性ＮＨＬ、高悪性度小型非分割細胞ＮＨＬ、巨大病変ＮＨＬ、マントル細胞リンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、ワルデンストレームマクログロブリン血症、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、有毛細胞白血病、並びに慢性骨髄芽球性白血病が含まれる。
【０１４９】
ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、必要に応じて被験体に投与され得る。投与の頻度の決定は、治療される病態、治療される被験体の年齢、治療される病態の重症度、治療される被験体の全般的健康状態等の考慮に基づいて、主治医等の当業者によって行われ得る。幾つかの実施形態では、有効用量のＯＸ４０結合性ポリペプチドが被験体に１回以上投与される。幾つかの実施形態では、有効用量のＯＸ４０結合性ポリペプチドが、被験体に毎日、週に２回、毎週、２週間ごとに、月に１回等で投与される。有効用量のＯＸ４０結合性ポリペプチドが被験体に少なくとも１回投与される。幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドの有効用量は、少なくとも１ヶ月、少なくとも６ヶ月、又は少なくとも１年間にわたる複数回を含む複数回で投与され得る。
【０１５０】
幾つかの実施形態では、医薬組成物は、癌を治療（癌の予防を含む）する及び／又はＴ細胞増殖を増加させるのに有効な量で投与される。治療有効量は、典型的には、治療される被験体の体重、その被験体の身体的状態若しくは健康状態、治療される病態の広範さ、又は治療される被験体の年齢に依存する。一般に、抗体は、用量あたり約０．０５ｍｇ／ｋｇ（体重）〜約１００ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約１０μｇ／ｋｇ（体重）〜約１００ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約５０μｇ／ｋｇ（体重）〜約５ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約１００μｇ／ｋｇ（体重）〜約１０ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約１００μｇ／ｋｇ（体重）〜約２０ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約０．５ｍｇ／ｋｇ（体重）〜約２０ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約０．５ｍｇ／ｋｇ（体重）〜約１０ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約０．０５ｍｇ／ｋｇ（体重）〜約２０ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、用量あたり約０．０５ｍｇ／ｋｇ（体重）〜約１０ｍｇ／ｋｇ（体重）の範囲の量で投与され得る。幾つかの実施形態では、抗体は、約５ｍｇ／ｋｇ（体重）以下、例えば、４ｍｇ／ｋｇ未満、３ｍｇ／ｋｇ未満、２ｍｇ／ｋｇ未満、又は１ｍｇ／ｋｇ未満の範囲の抗体の量で投与され得る。
【０１５１】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、限定されるものではないが、静脈内、動脈内、非経口、腹腔内、又は皮下を含む様々な経路によってｉｎ  ｖｉｖｏで投与され得る。意図される用途に応じて、適切な製剤及び投与経路を選択することができる。
【０１５２】
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドを使用する療法処置は、Ｔ細胞の増殖及び／又は活性化を増加させることによって達成される。幾つかの実施形態では、Ｔ細胞の増殖及び／又は活性化の増加は、癌の成長を抑止する。
【０１５３】
医薬組成物
幾つかの実施形態では、ＯＸ４０結合性ポリペプチドを含む組成物は、多種多様な薬学的に許容可能な担体を含む製剤で提供される（例えば、Gennaro, Remington: The Science and Practice of Pharmacy with Facts and Comparisons: Drugfacts Plus, 20th ed. (2003)、Ansel et al., Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, 7th ed., Lippencott Williams and Wilkins (2004)、Kibbe et al., Handbook of Pharmaceutical Excipients, 3rd ed., Pharmaceutical Press (2000)を参照）。賦形剤、アジュバント、及び希釈剤を含む様々な薬学的に許容可能な担体が利用可能である。さらに、ｐＨ調整剤及び緩衝剤、張性調整剤、安定剤、湿潤剤等の様々な薬学的に許容可能な補助物質も利用可能である。非限定的な例示的な担体には、生理食塩水、緩衝生理食塩水、デキストロース、水、グリセロール、エタノール、及びそれらの組み合わせが含まれる。
【０１５４】
幾つかの実施形態では、医薬組成物は、少なくとも１０ｍｇ／ｍＬ、２０ｍｇ／ｍＬ、３０ｍｇ／ｍＬ、４０ｍｇ／ｍＬ、５０ｍｇ／ｍＬ、６０ｍｇ／ｍＬ、７０ｍｇ／ｍＬ、８０ｍｇ／ｍＬ、９０ｍｇ／ｍＬ、１００ｍｇ／ｍＬ、１２５ｍｇ／ｍＬ、１５０ｍｇ／ｍＬ、１７５ｍｇ／ｍＬ、２００ｍｇ／ｍＬ、２２５ｍｇ／ｍＬ、又は２５０ｍｇ／ｍＬの濃度でＯＸ４０結合性ポリペプチドを含む。
【０１５５】
併用療法
ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、単独で又は他の抗癌剤等の他の治療方式と組み合わせて投与され得る。ＯＸ４０結合性ポリペプチドは、他の治療方式の前、実質的にそれと同時に、又はその後に供給され得る（すなわち、同時に又は連続的に）。幾つかの実施形態では、本明細書に記載される治療方法は、放射線療法、化学療法、ワクチン接種、標的腫瘍療法、ＣＡＲ−Ｔ療法、腫瘍溶解性ウイルス療法、癌免疫療法、サイトカイン療法、外科的切除、クロマチン修飾、切除、冷却療法、腫瘍標的に対するアンチセンス剤、腫瘍標的に対するｓｉＲＮＡ剤、腫瘍標的に対するマイクロＲＮＡ剤若しくは抗癌剤／抗腫瘍剤、又は抗体、サイトカイン若しくは受容体細胞外ドメイン−Ｆｃ融合物等の生物製剤を施すことを更に含み得る。
【０１５６】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、第２の療法剤、例えば、ＰＤ−１療法薬と同時に与えられる。ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１療法薬の例には、ニボルマブ（BMS社）、ピディリズマブ（CureTech社、ＣＴ−０１１）、ペンブロリズマブ（Merck社）、デュルバルマブ（Medimmune/AstraZeneca社）、アテゾリズマブ（Genentech/Roche社）、アベルマブ（Pfizer社）、ＡＭＰ−２２４（Amplimmune社）、ＢＭＳ−９３６５５９、ＡＭＰ−５１４（Amplimmune社）、ＭＤＸ−１１０５（Merck社）、ＴＳＲ−０４２（Tesaro/AnaptysBio社、ＡＮＢ−０１１）、ＳＴＩ−Ａ１０１０（Sorrento Therapeutics社）、ＳＴＩ−Ａ１１１０（Sorrento Therapeutics社）、及びプログラム死−１（ＰＤ−１）又はプログラム死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）に対する他の作用物質が含まれる。
【０１５７】
幾つかの実施形態では、本明細書で提供されるＯＸ４０結合性ポリペプチドは、ＣＡＲ−Ｔ（キメラ抗原受容体Ｔ細胞）療法薬、腫瘍溶解性ウイルス療法薬、サイトカイン療法薬、及び／又はＶＩＳＴＡ、ｇｐＮＭＢ、Ｂ７Ｈ３、Ｂ７Ｈ４、ＨＨＬＡ２、ＣＤ７３、ＣＴＬＡ４、ＴＩＧＩＴ等の他のチェックポイント分子を標的とする作用物質と同時に与えられる。
【０１５８】
診断及び治療の非限定的な例示的な方法
幾つかの実施形態では、本明細書に記載される方法は、被験体及び／又は被験体（例えば、癌患者）からの検体を評価するのに有用である。幾つかの実施形態では、評価は、診断、予後診断、及び／又は治療への奏効のうちの１つ以上である。
【０１５９】
幾つかの実施形態では、本明細書に記載される方法は、タンパク質の存在、不存在、又はレベルを評価することを含む。幾つかの実施形態では、本明細書に記載される方法は、核酸の存在、不存在、又は発現のレベルを評価することを含む。これらの測定に本明細書に記載される組成物を使用することができる。例えば、幾つかの実施形態では、本明細書に記載される方法は、腫瘍の検体又は腫瘍から培養された細胞を、本明細書に記載される療法剤と接触させることを含む。
【０１６０】
幾つかの実施形態では、評価により、治療（本明細書に記載される抗体による治療を含む）が指示され得る。幾つかの実施形態では、評価により、切除後の補助療法を使用する又は差し控えることが指示され得る。補助治療とも呼ばれる補助療法は、一次治療、主治療、又は初回治療に加えてなされる治療である。非限定的な例として、補助療法は、全ての検出可能な疾患が取り除かれたが、潜在疾患のため再燃の統計的リスクが残っている場合に、通常は手術後になされる追加の治療であり得る。幾つかの実施形態では、上記抗体は、癌の治療における補助療法薬として使用される。幾つかの実施形態では、上記抗体は、癌の治療における単独補助療法薬として使用される。幾つかの実施形態では、本明細書に記載される抗体は、癌の治療における補助療法薬としては差し控えられる。例えば、患者が本明細書に記載される抗体に応答する可能性が低い又は最小限の応答しか有しない場合に、生活の質のために、及び無効な化学療法による不必要な毒性を避けるために、治療を施さないこともできる。このような場合に、緩和ケアが使用される場合がある。
【０１６１】
幾つかの実施形態では、切除前に術前補助療法薬として上記分子が投与される。幾つかの実施形態では、術前補助療法薬は、任意の手術の前に腫瘍を縮小及び／又はダウングレードする療法薬を指す。幾つかの実施形態では、術前補助療法薬は、手術前に癌患者に投与される化学療法薬を意味する。幾つかの実施形態では、術前補助療法薬は、手術前に癌患者に投与される抗体を意味する。術前補助化学療法薬が通常考慮される癌型には、例えば、乳癌、結腸直腸癌、卵巣癌、子宮頸癌、膀胱癌、及び肺癌が含まれる。幾つかの実施形態では、上記抗体は、癌の治療における術前補助療法薬として使用される。幾つかの実施形態では、その使用は切除前である。
【０１６２】
幾つかの実施形態では、本明細書に記載される方法で企図される腫瘍微小環境は、腫瘍血管系、腫瘍浸潤リンパ球、線維芽細網細胞、内皮前駆細胞（ＥＰＣ）、癌関連線維芽細胞、周皮細胞、他の間質細胞、細胞外マトリックス（ＥＣＭ）の成分、樹状細胞、抗原提示細胞、Ｔ細胞、制御性Ｔ細胞、マクロファージ、好中球、及び腫瘍の近位に位置する他の免疫細胞の１つ以上である。
【０１６３】
キット
本明細書に記載されるＯＸ４０結合性ポリペプチドのいずれか及び適切な包装を含む製造品及びキットも提供される。幾つかの実施形態では、本発明は、（ｉ）ＯＸ４０結合性ポリペプチドと、（ｉｉ）該キットを使用してＯＸ４０結合性ポリペプチドを個体に投与するための使用説明書とを含むキットを含む。
【０１６４】
本明細書に記載される組成物に適切な包装は、当該技術分野で知られており、例えば、バイアル（例えば、密封バイアル）、容器、アンプル、ボトル、広口瓶、フレキシブルな包装（例えば、密封マイラー又はプラスチックバッグ）等が含まれる。これらの製造品は、更に滅菌及び／又は密封され得る。本明細書に記載される組成物を含む単位剤形も提供される。これらの単位剤形は、単回又は多回単位剤形で適切な包装内で保存され得て、更に滅菌及び密封もされ得る。本発明のキットに提供される使用説明書は、典型的には、ラベル又は添付文書（例えば、キットに含まれる紙シート）に書かれた指示であるが、機械可読の指示（例えば、磁気記憶ディスク又は光学記憶ディスクに保持された指示）も許容可能である。抗体の使用に関する使用説明書は一般に、意図された治療又は工業的使用のための投与量、投与スケジュール、及び投与経路に関する情報を含む。キットは、個々の適切な治療を選択することの説明を更に含み得る。
【０１６５】
容器は、単位用量、バルク包装（例えば、多回用量包装）又はサブユニット用量であり得る。例えば、１週間、２週間、３週間、４週間、６週間、８週間、３ヶ月、４ヶ月、５ヶ月、６ヶ月、７ヶ月、８ヶ月、９ヶ月以上のいずれかの概数の期間等の長期間にわたって個体に効果的な治療をもたらすのに十分な用量の本明細書に開示される分子を含むキットも提供され得る。キットはまた、多回単位用量の分子及び使用説明書を含むことができ、薬局、例えば、病院薬局及び調剤薬局での保存及び使用に十分な量で包装され得る。幾つかの実施形態では、キットは、再構成、再懸濁、又は再水和することで、一般的に抗体の安定な水性懸濁液を形成することができる乾燥（例えば、凍結乾燥）組成物を含む。
【実施例】
【０１６６】
以下で論じられる実施例は、本発明を純粋に例示することが意図され、決して本発明を限定するとみなされるべきではない。これらの実施例は、以下の実験が、実施された全て又は唯一の実験であることを表すとは意図されない。使用される数値（例えば、量、温度等）に関して正確さを保証するための努力がなされたが、幾らかの実験誤差及び偏差が考慮に入れられるべきである。特段の指示が無い限り、部は重量部であり、分子量は平均分子量であり、温度は摂氏温度であり、圧力は大気圧であるか又は近大気圧である。
【０１６７】
実施例１：１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでは、１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃと比較して非特異的結合が低下する
ＯＸ４０に結合するＶＨＨドメインを含むシングルドメイン抗体（ｓｄＡｂ）は、以前に開発された。国際公開第２０１７／１２３６７３号を参照。ヒト化のためにｓｄＡｂ  １Ｄ１０を選択することで、１Ｄ１０ｖ１が得られた。同書物及び配列番号３を参照。
【０１６８】
非特異的結合を減らすために１Ｄ１０ｖ１を最適化した。その最適化により、ｓｄＡｂのＶＨＨドメインのＣＤＲ３における１つのアミノ酸及びフレームワーク領域２（ＦＲ２）における２つのアミノ酸の置換をもたらし、１Ｄ１０ｖ６（配列番号９）が得られた。１Ｄ１０ｖ６のＣＤＲ３（配列番号１２）は、１Ｄ１０ｖ１のＣＤＲ３（配列番号６）に対してＧからＡへの置換を有し、１Ｄ１０ｖ６のＦＲ２は、ＧＬからＥＲへの置換を有する（配列番号２２）。驚くべきことに、これらの置換によりｓｄＡｂの非特異的結合は減少したが、以下に記載されるように、ヒト及びカニクイザルＯＸ４０に対する親和性は保持された。
【０１６９】
二価ｓｄＡｂの非特異的結合を、高温ストレス後にフローサイトメトリーによって測定した。精製された１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを、２０ｍＭのＴｒｉｓ（ｐＨ８．０）、１５０ｍＭのＮａＣｌ、２％トレハロース、０．２％ＴＷＥＥＮ−２０へとバッファー交換し、５０℃で７日間インキュベートしてストレスを与えた。次いで、抗体を０．２μｍのＡｃｒｏｄｉｓｃシリンジフィルターを使用して濾過し、Ａ２８０測定により定量化した。ＨＥＫ２９３細胞は細胞表面上に測定可能なＯＸ４０を発現しないため、非特異的結合のためのコントロール細胞系統として使用した。１ウェル当たり３００００個の細胞を、温度ストレスを与えた１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ又は１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの希釈系列と一緒にインキュベートした。一次抗体と一緒にインキュベートした後に、二次抗ヒトＦｃ  Ａｌｅｘａ  Ｆｌｕｏｒ  ６４７を１／２０００希釈で使用し、その後、結合された抗体を、Intellicyte社のｉＱｕｅ  Ｐｌｕｓにおいてフローサイトメトリーによって測定し、蛍光を中央蛍光強度としてプロットした。図１に示されるように、１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃは、約３３ｎＭのｓｄＡｂから始まってトランスフェクションされていないＨＥＫ２９３細胞への非特異的結合を示し、その結合は、ｓｄＡｂ濃度が増加するにつれて劇的に増加した。それに対して、１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、１０００ｎＭのｓｄＡｂまではトランスフェクションされていないＨＥＫ２９３細胞に対して検出可能な結合を示さなかった。
【０１７０】
ｓｄＡｂのヒトＯＸ４０及びカニクイザルＯＸ４０への結合を、以下のように測定した。全長のヒトＯＸ４０又はカニクイザルＯＸ４０を発現する安定的にトランスフェクションされたＣＨＯ細胞を５００００個の細胞／ウェルで播種した。抗体を４００ｎＭから開始して１：３で段階希釈して力価測定し、抗ヒトＦｃ４８８二次抗体で検出した。Intellicyte社のｉＱｕｅアナライザーでフローサイトメトリー分析を行い、蛍光を平均蛍光強度としてプロットした。図２に示されるように、１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃと同等のヒトＯＸ４０（図２Ａ）及びカニクイザルＯＸ４０（図２Ｂ）への結合を示した。ヒトＯＸ４０及びカニクイザルＯＸ４０に対する１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの親和性（ＫＤ）は、それぞれ０．８１ｎＭ及び０．６６ｎＭであった。ヒトＯＸ４０及びカニクイザルＯＸ４０に対する１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃの親和性（ＫＤ）は、それぞれ０．８６ｎＭ及び０．７９ｎＭであった。
【０１７１】
実施例２：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでは、六価３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃと比較して非特異的結合が低下する
六価抗ＯＸ４０  ｓｄＡｂは、３つのＶＨＨドメインをＦｃに結合させることによって作製された。このポリペプチドは六価の二量体を形成する。六価３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ（配列番号８、Ｈｅｘ−１Ｄ１０ｖ１とも称される）及び六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ（配列番号１４、Ｈｅｘ−１Ｄ１０ｖ６とも称される）の非特異的結合を、以下のように測定した。３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを、２０ｍＭのＨｉｓ、１５０ｍＭのＮａＣｌ、０．０２％ＴＷＥＥＮ−２０のバッファー（ｐＨ９）中で、トランスフェクションされていないＨＥＫ２９３  ｆｒｅｅｓｔｙｌｅ細胞又は全長のＯＸ４０を発現する一過的にトランスフェクションされたＨＥＫ２９３  ｆｒｅｅｓｔｙｌｅ細胞と一緒に室温で４８時間インキュベートした。蛍光抗Ｆｃ特異的二次抗体を使用して、結合された３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを検出し、Intellicyte社のｉＱｕｅアナライザーを使用してフローサイトメトリーによって測定した。抗体の各濃度について平均蛍光強度をプロットした。
【０１７２】
図３に示されるように、３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、これらの条件下で同等の特異的結合を示し、見かけのＫＤはそれぞれ０．８２ｎＭ及び０．９０ｎＭであった（図３Ａ）。３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃは、トランスフェクションされていないＨＥＫ２９３細胞への非特異的結合を示したが、一方で、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは示さなかった（図３Ｂ）。
【０１７３】
実施例３：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、ＯＸ４０アゴニスト活性を保持する
上記のように、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでは、ＯＸ４０結合親和性を保持しながら、ＨＥＫ２９３細胞への非特異的結合が低下した。３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃのアゴニスト活性を以下のように確認した。
【０１７４】
解凍使用型（Thaw-and-Use）Ｊｕｒｋａｔ／ＯＸ４０レポーター細胞（Promega社）（第５継代）を液体窒素から取り出し、３７℃の水浴中で解凍した。この細胞はＯＸ４０を安定的に発現し、ＮＦκＢ応答エレメントの下流にルシフェラーゼレポーターを含む。細胞を優しく混ぜ、９ｍＬの予熱した培養培地（ＲＰＭＩ＋１０％ＦＢＳ）に移した。細胞を４００×ｇで５分間遠心分離し、５ｍＬのアッセイ培地（ＲＰＭＩ＋１０％ＦＢＳ）中で再懸濁した。細胞密度及び生存率を、トリパンブルー及びＴＣ２０全自動セルカウンターを使用して測定した。アッセイプレートの内側の６０ウェルに、細胞を６×１０４個の細胞／ウェルで５０μＬ／ウェルのアッセイ培地中で播種した。１００μＬ／ウェルのアッセイ培地を外側のウェルに加えた。２．５ｍＬのアッセイ培地を、アッセイプレートの各隅のリザーバーに加えた。
【０１７５】
３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃ及び３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを、濃度が所望の最高最終濃度の２倍となるようにアッセイ培地中で希釈した。９点の段階希釈（５倍、５倍、２倍、２倍、２倍、２倍、５倍、５倍）を行い、その際、最高濃度は５０ｎＭであり、最低濃度は０．００５ｎＭであった。したがって、最終的なアッセイ濃度は、最高２５ｎＭであり、最低０．００２５ｎＭであることとなる。抗体の希釈は９６ウェル希釈プレートにおいて行った。５０μＬ／ウェルの２×抗体希釈物をアッセイプレートに加えた。１ウェル当たりの最終アッセイ容量は１００μＬであった。アッセイプレートをプレート蓋で覆い、３７℃のＣＯ２インキュベーター中に６時間置いた。
【０１７６】
６時間のインキュベート後に、アッセイプレートをインキュベーターから取り出し、室温で１０分間置いた。１００μＬの再構成されたＢｉｏ−Ｇｌｏルシフェラーゼ試薬（Promega社）を、アッセイプレート内の細胞を含む各ウェルに添加した。アッセイプレートを室温で１０分間インキュベートした。１００μＬ／ウェルのアッセイプレートを白色の９６ウェルプレートに移して、相対発光単位（ＲＬＵ）を測定した。試薬の表に定義された設定（ＰＭＴ−最大範囲、ターゲット波−４７０ｎｍ）に従って、Molecular Devices社のＳｐｅｃｔｒａＭａｘ  Ｌプレートリーダー及びＳｏｆｔＭａｘ  Ｐｒｏ  ｖ５．４でプレートを読み取った。
【０１７７】
その実験結果は図４に示されている。最大結合（Ｂｍａｘ）及び５０％応答での酵素濃度（ＫＤ）は、３×１Ｄ１０ｖ６−ＦｃがＯＸ４０ルシフェラーゼレポーターアッセイにおいて３×１Ｄ１０ｖ１−Ｆｃと同等の活性を有することを示している。
【０１７８】
実施例４：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、優れたＯＸ４０アゴニスト活性を有する
六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃが二価型及び四価型（それぞれ配列番号１３及び配列番号１６）と比較して優れたＯＸ４０アゴニストであることを実証するために、実質的に実施例３に記載されるＯＸ４０ルシフェラーゼレポーターアッセイを使用した。
【０１７９】
その実験結果は図５に示されている。このアッセイでは、六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃが四価２×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃよりも優れていたことから、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃが優れたアゴニストであることを示している。二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、このアッセイで最小の活性を示した。
【０１８０】
実施例５：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、Ｔ細胞増殖を増加させる
ＰＢＭＣの分離：ＰＢＭＣを、以下のように密度勾配遠心分離を使用して、正常なヒトドナーの白血球アフェレーシス又は全血試料から分離した。血液試料をＰＢＳ／２％ＦＢＳ（１：２）で希釈し、３０ｍｌの希釈された血液を１５ｍｌのＬｙｍｐｈｏｐｒｅｐ（Stemcell Technologies社）密度勾配培地上に重層した。８００×ｇで３０分間遠心分離した後に、血漿とｌｙｍｐｈｏｐｒｅｐとの中間相にあるＰＢＭＣ層を取り出し、赤血球溶解バッファー（BioLegend社）を使用して残りの赤血球を室温で５分間溶解させた。細胞をＰＢＳ中で洗浄した後に、Ｃｒｙｏｓｔｏｒ  ＣＳ１０（Stemcell Technologies社）において１００×１０６個の細胞／ｍｌで新鮮凍結させた。
【０１８１】
Ｔ細胞濃縮：非Ｔ細胞集団を、ＣＤ１４、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ３６、ＣＤ５６、ＣＤ１２３、ＴＣＲγ／δに対するビオチン化された抗系譜マーカー抗体（BioLegend社）で室温にて２０分間標識した。次いで、磁性ストレプトアビジン粒子と一緒に室温で２０分間インキュベートすることにより、非Ｔ細胞集団を減少させた（５００μｌのビーズスラリーに加えて１００×１０６個当たり５００μｌの細胞懸濁液、マグネット上で２×８分間インキュベートする）。非結合細胞の上清はＴ細胞を含む。代替的に、ＥａｓｙＳｅｐヒトＴ細胞濃縮キット（Stemcell Technologies社）を製造業者の推奨に従って使用して、ＰＢＭＣ試料からＴ細胞を濃縮した。濃縮されたＣＤ４＋Ｔ細胞を得るために、濃縮されたＴ細胞を、ビオチン化された抗ＣＤ８抗体と一緒にインキュベートし、実質的に上記の磁性ストレプトアビジン粒子を使用して減少させた。
【０１８２】
Ｍ−４５０トシル活性化ビーズのコーティング：Ｔ細胞活性化アッセイ用の刺激物質ビーズを、製造業者の推奨コーティング手順に従って、４×１０８個のビーズ当たり２００μｇのマウス抗ヒトＣＤ３抗体（クローンＯＫＴ３、eBioscience社）でコーティングした。簡潔には、ビーズをバッファー１（０．１Ｍのリン酸ナトリウムバッファー、ｐＨ７．４〜８．０）中で１回洗浄した後に、チューブローテーターにおいて２００μｇの抗ヒトＣＤ３抗体を含むバッファー１中で室温にて１８時間インキュベートした。次いで、ビーズをバッファー２（ＰＢＳ、０．１％ＢＳＡ、２ｍＭのＥＤＴＡ  ｐＨ７．４）で４回洗浄した。ビーズをバッファー３（０．２ＭのＴｒｉｓ、０．１％ＢＳＡ、ｐＨ８．５）中で３７℃にて４時間インキュベートすることにより、遊離トシル基を不活性化させた。次いで、ビーズをバッファー２中で１回洗浄し、４００×１０６個のビーズ／ｍｌの濃度に再懸濁した。
【０１８３】
共刺激アッセイ：濃縮されたＣＤ４＋Ｔ細胞（４人の異なるドナーから）をＣｅｌｌＴｒａｃｅ  Ｖｉｏｌｅｔ（ＣＴＶ、Invitrogen社）により１：１０００の希釈率で標識した。次いで、細胞を丸底９６ウェルプレートにおいて１ウェル当たり２０００００個の細胞で三連にて播種し、１０００００個の抗ヒトＣＤ３抗体でコーティングされたビーズと混ぜ合わせた。培養物をインキュベートするとともに、５０ｎＭの最終濃度から開始して３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ又は二価１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを力価測定し、プレート全体にわたり１：５で力価測定した。最終培養物容量は１ウェル当たり２００μｌであり、細胞を３７℃／５％ＣＯ２で４日間インキュベートした。
【０１８４】
ＦＡＣＳ染色：Ｔ細胞培養の４日目に、細胞を１５０μＬのＦＡＣＳバッファー中で１回洗浄し、細胞ペレットを５０μｌの表面マーカー染色溶液（ＣＤ４、ＣＤ２５及びＣＤ７１に対する抗体とヨウ化プロピジウムとを含む）中に再懸濁した。細胞を室温で２０分間インキュベートした後に、最終洗浄し、ソニー株式会社のアナライザーのフローサイトメーターで分析した。Ｔ細胞集団の分析にＦｌｏｗＪｏソフトウェアを使用した。次いで、種々の活性化マーカーについての生の平均蛍光強度をエクスポートし、Ｅｘｃｅｌ及びＧｒａｐｈＰａｄ  ＰＲＩＳＭを使用して分析した。値をグラフ化し、力価測定曲線をフィッティングさせて、［アゴニスト］ｖｓ反応−−可変傾斜（４パラメータ）の非線形曲線フィットを使用して用量−反応関係を評価した。また、このフィットを使用して、各ドナーについての有効濃度（ＥＣ５０）を決定した。
【０１８５】
ＦＡＣＳゲーティング戦略：Ｔ細胞増殖のレベル及びＴ細胞亜集団での活性化マーカー発現のレベルを評価するために、以下のゲーティング戦略を使用した：細胞デブリをＦＳＣ／ＳＳＣでのサイズ排除によって除外し、死細胞をそれらのヨウ化プロピジウムの陽性シグナルに基づいて除外した。ＦＳＣ−Ａ／ＦＳＣ−Ｈでのダブレット及び凝集物の除外を使用して単一細胞を選択した。残りの細胞集団はＣＤ４＋であることが確認された。Ｔ細胞のみのコントロールと比較したＣｅｌｌＴｒａｃｅ  Ｖｉｏｌｅｔ（ＣＴＶ＋）染色の喪失は細胞増殖の現れであった。活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１のＭＦＩレベルの増加は、Ｔ細胞活性化の指標であった。
【０１８６】
ＩＦＮγ  ＥＬＩＳＡ及びデータ分析：４日目に細胞培養上清試料を採取し、−８０℃で保存した。細胞培養上清中のＩＦＮγのレベルを、ＩＦＮγ  ＥＬＩＳＡキットを使用して製造業者のプロトコルに従って測定した。簡潔には、ＥＬＩＳＡプレートを抗ＩＦＮγ捕捉抗体により４℃で一晩コーティングした。翌日、プレートをアッセイバッファー中で１時間ブロッキングした後に、細胞上清を２時間インキュベートした。試料をアッセイバッファー中で１：２５に希釈した。プレートをビオチン化検出抗体と一緒に１時間インキュベートし、続いて西洋ワサビペルオキシダーゼ結合ストレプトアビジン試薬と一緒にインキュベートすることにより、抗原結合を検出した。基質溶液を添加し、１５分間インキュベートした後に、ＨＲＰ活性を測定した。停止溶液を加えた後に、プレートをＥｍａｘプレシジョンマイクロプレートリーダーにおいて４５０ｎｍの波長で分析した。
【０１８７】
Ｅｍａｘプレシジョンマイクロプレートリーダーからの生の値を、このマイクロプレートリーダーのＳｏｆｔｍａｘ  Ｐｒｏ分析ソフトウェアを使用して分析した。検量線の吸光度値及び４パラメーターロジスティック回帰を使用して、ｐｇ／ｍｌ単位の試料ＩＦＮγレベルを計算した。分析された値をＥｘｃｅｌ（Microsoft社、バージョン１５．２７）にエクスポートして、更なるデータ分析をした。ＰＲＩＳＭ（GraphPad Software Inc.社、バージョン７．０ｃ）を使用して値をグラフ化し、力価測定曲線をフィッティングさせて、［アゴニスト］ｖｓ反応−−可変傾斜（４パラメータ）の非線形曲線フィットを使用して用量−反応関係を評価した。
【０１８８】
図６に示されるように、六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでの処理は４人の全てのドナーからのＣＤ４＋Ｔ細胞増殖の増加をもたらすが、二価の１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃではもたらされない。六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでの処理はまた、４人の全てのドナーにおいてより高いレベルの活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１をもたらした（図７及び図８）。分泌されたＩＦＮγレベルも３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでの処理時にはより高かった（図９）。共刺激の強度はドナーによって様々であったが、一般的に用量依存的であった。計算されたＥＣ５０値を、以下の表２にまとめる。
【０１８９】
【表２】
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【０１９０】
まとめると、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、ｉｎ  ｖｉｔｒｏでＴ細胞の抗ＣＤ３抗体媒介性の刺激を改善した。特定の理論に縛られることを意図するものではないが、このアッセイにおける効果的な共刺激には、例えば、六価３×１Ｄ１０ｖ６−ＦｃによるＯＸ４０のクラスター形成が必要とされるように思われた。
【０１９１】
実施例６：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、Ｔ細胞の共刺激及びＩＦＮγ産生を増強する
３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの存在下又は不存在下で、１０人の健康なヒトドナーからの濃縮されたＴ細胞を、最適以下の抗ＣＤ３抗体で刺激した。
【０１９２】
実施例５に実質的に記載されるように、ＰＢＭＣを１０人の健康なヒトドナーから分離し、Ｔ細胞集団を濃縮した。
【０１９３】
Ｔ細胞刺激：１０人の健康なドナーからの濃縮されたＴ細胞を解凍し、ＣＴＬ  ａｎｔｉ−ａｇｇｒｅｇａｔｅ培地を使用して２回洗浄した。Ｔ細胞を増殖色素ＣｅｌｌＴｒａｃｅ  Ｖｉｏｌｅｔ（ＣＴＶ）（ThermoFisher社）により３７℃で１０分間標識した。洗浄後に、Ｔ細胞を１０％ＦＢＳ及び１×抗生物質／抗真菌剤を補充したＲＰＭＩ中で１．５×１０６個の細胞／ｍｌに再懸濁し、平底９６ウェルプレートにおいて１ウェル当たり１００μｌで１５００００個のＴ細胞を添加した。Ｍ−４５０  Ｔｏｓｙｌａｃｔｉｖａｔｅｄ  Ｄｙｎａｂｅａｄｓ（ThermoFisher社）を、製造業者の指示に従って、２００μｇの抗ＣＤ３抗体（クローンＯＫＴ３、eBioscience社）で一晩コーティングした。抗ＣＤ３抗体でコーティングされたビーズを１ウェル当たり５０μｌで標識Ｔ細胞に１：２の比率で添加して、一次Ｔ細胞刺激を与えた。３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを５０μｌにて１０ｎＭの最終濃度で添加した。プレートを３７℃／５％ＣＯ２で３日間インキュベートし、フローサイトメトリーによって分析した。
【０１９４】
フローサイトメトリー：３日後に、Ｔ細胞を遠沈させ、ＦＡＣＳバッファー（ＰＢＳ／２％ＦＢＳ／０．０５％アジ化ナトリウム）中で、生存率マーカーのヨウ化プロピジウム（ＰＩ）と一緒に以下の蛍光標識抗体：ＣＤ４−ＰＥ、ＣＤ８−ＡＰＣ、ＣＤ２５−ＦＩＴＣ、及びＣＤ７１−ＰＥ／Ｃｙ７（Biolegend社）により室温で２０分間標識した。Ｔ細胞を洗浄し、７０μｌのＦＡＣＳバッファー中で再懸濁し、ソニー株式会社のＳＡ３８００スペクトルアナライザーを使用して分析した。Ｆｌｏｗｊｏソフトウェアを使用して、生存（ＰＩ−）ＣＤ４集団及びＣＤ８集団に対してゲーティングし、ＣＴＶ希釈によって決定される最低１回の分裂を経たＴ細胞に対してゲーティングすることによって、増殖を経た細胞のパーセンテージを決定した。活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１を発現するＣＤ４Ｔ細胞及びＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージを、刺激されていないＴ細胞集団と比較することによって決定した。データをMicrosoft社のＥｘｃｅｌにエクスポートし、Ｐｒｉｓｍを使用してグラフ化した。
【０１９５】
細胞内サイトカイン染色：細胞を遠沈させ、ＰＥ結合抗ＣＤ４抗体及びＡＰＣ結合抗ＣＤ８抗体と一緒にＺｏｍｂｉｅ  Ｒｅｄ生存率染色剤（BioLegend社）により、ＦＡＣＳバッファー（ＰＢＳ中の２％ＦＢＳ／０．１％アジ化ナトリウム）中で室温にて２０分間表面標識した。洗浄後に、細胞をＢＤ  Ｆｉｘ／Ｐｅｒｍバッファーで３０分間固定した。細胞を１×ＢＤ  Ｐｅｒｍ／Ｗａｓｈバッファーで洗浄し、Ｐｅｒｍ／Ｗａｓｈバッファー中のＰＥ／Ｃｙ７抗ＩＦＮγ抗体により室温で４５分間標識した。洗浄後に、細胞をＦＡＣＳバッファー中で再懸濁し、ソニー株式会社のＳＡ３８００スペクトルアナライザーで読み取った。ＣＤ４＋Ｔ細胞集団及びＣＤ８＋Ｔ細胞集団のデータ分析を、Ｆｌｏｗｊｏソフトウェアを使用して実施し、Ｐｒｉｓｍを使用してグラフ化した。
【０１９６】
試験された１０人の全てのドナーからのＴ細胞において、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ処理は、抗ＣＤ３抗体刺激に応答して増殖を経たＣＤ４＋Ｔ細胞及びＣＤ８＋Ｔ細胞のパーセンテージの大幅な増加をもたらした（図１０、図１１）。さらに、活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１を発現したＣＤ４Ｔ細胞及びＣＤ８Ｔ細胞のパーセンテージは、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ処理により増加した（図１１）。別の実験では、４人のドナーのより小さなサブセットが、両方のＴ細胞サブセットにおいて３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃでの処理後に細胞内ＩＦＮγレベルの増加を示した（図１２）。したがって、３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、Ｔ細胞に強力な共刺激シグナルを与えることから、活性化、増殖、及びエフェクター機能の増強をもたらす。
【０１９７】
実施例７：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、Ｔｒｅｇ媒介性のＣＤ４＋Ｔ細胞増殖の抑制を逆転させる
Ｔ細胞濃縮：ＥａｓｙＳｅｐ  Ｈｕｍａｎ  ＣＤ４＋ＣＤ１２７ｌｏｗＣＤ２５＋制御性Ｔ細胞分離キット（Stemcell社）を製造業者の指示に従って使用することにより、Ｔｒｅｇ及び慣用のＣＤ４＋Ｔ細胞を新鮮で健康なドナーＰＢＭＣから濃縮した。
【０１９８】
Ｔ細胞抑制アッセイ：２つの細胞集団を区別するために、濃縮されたＴｒｅｇ及びＣＤ４＋レスポンダーＴ細胞を、それぞれ増殖色素ＣｅｌｌＴｒａｃｅ  Ｖｉｏｌｅｔ（ＣＴＶ）及びＣＦＳＥにより３７℃で１０分間標識した。洗浄後に、Ｔｒｅｇ及びＣＤ４＋Ｔ細胞を１０％ＦＢＳ及び１×抗生物質／抗真菌剤を補充したＲＰＭＩ中で１．５×１０６細胞／ｍｌに再懸濁した。Ｔｒｅｇを５０μｌの容量で播種することで、９６ウェル丸底プレートにおいて７５０００個のＴｒｅｇ／ウェルを得た。１０ｎＭの抗ＯＸ４０の六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ、１０ｎＭの従来の（ＨＣ／ＬＣ）二価抗ＯＸ４０抗体の存在下で、又は抗体の不存在下で、Ｔｒｅｇを３７℃にて一晩インキュベートした。並行して、標識されたＣＤ４＋レスポンダーＴ細胞を、抗ＣＤ３でコーティングされたｄｙｎａｂｅａｄｓにより１：２のビーズ対Ｔ細胞比で３７℃にて一晩活性化した。翌日、Ｔｒｅｇのプレートを培地で２回洗浄して抗体を除去した。刺激されたレスポンダーＣＤ４＋Ｔ細胞を１００μｌの培地中に加えて、２つのＣＤ４＋レスポンダーＴ細胞ごとに１つのＴｒｅｇの比率でＴｒｅｇを含むプレートに１５００００個のＣＤ４＋Ｔ細胞／ウェルを供給した。六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃ又は従来の二価抗ＯＸ４０抗体を、１００μｌの培地において１０ｎＭの最終濃度で細胞のサブセットに二連で加え戻した。さらに、Ｔｒｅｇと一緒にインキュベートしなかったＣＤ４＋レスポンダーＴ細胞の群が含まれていた。プレートを３７℃／５％ＣＯ２で３日間インキュベートし、フローサイトメトリーによって分析した。
【０１９９】
フローサイトメトリー：３日後に、Ｔ細胞を遠沈させ、ＦＡＣＳバッファー（ＰＢＳ／２％ＦＢＳ／０．０５％アジ化ナトリウム）中で、生存率マーカーのヨウ化プロピジウム（ＰＩ）と一緒に以下の蛍光標識抗体：ＣＤ４−ＰＥ、ＣＤ２５−ＡＰＣ、及びＣＤ７１−ＰＥ／Ｃｙ７（Biolegend社）により室温で２０分間標識した。Ｔ細胞を洗浄し、７０μｌのＦＡＣＳバッファー中で再懸濁し、ソニー株式会社のＳＡ３８００スペクトルアナライザーを使用して分析した。Ｆｌｏｗｊｏソフトウェアを使用して、生存（ＰＩ−）ＣＦＳＥ＋レスポンダーＣＤ４＋又はＣＴＶ＋Ｔｒｅｇ集団に対してゲーティングし、ＣＦＳＥ希釈によって決定される最低１回の分裂を経たレスポンダーＴ細胞に対してゲーティングすることによって、増殖を経た細胞のパーセンテージを決定した。活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１を発現するレスポンダーＣＤ４＋Ｔ細胞のパーセンテージを、刺激されていないＴ細胞集団と比較することによって決定した。データをMicrosoft社のＥｘｃｅｌにエクスポートし、Ｐｒｉｓｍを使用してグラフ化した。
【０２００】
抗ＣＤ３でコーティングされたビーズで合計４日間刺激することで、レスポンダーＣＤ４＋Ｔ細胞の６６％の増殖が引き起こされた（図１３）。濃縮されたＴｒｅｇを培養物に添加することで、レスポンダーＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖の劇的な低下が引き起こされた（３４％の増殖）。１０ｎＭの六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃで処理することで、レスポンダーＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖のほぼ完全な回復が引き起こされた（６２％の増殖）。さらに、Ｔ細胞活性化マーカーＣＤ２５及びＣＤ７１の発現は、ＴｒｅｇなしのＣＤ４＋Ｔ細胞レスポンダーの実験群と同様のレベルに回復した。それに対して、従来の二価抗ＯＸ４０抗体による処理は、ＣＤ４＋Ｔ細胞の増殖を回復させることも、又は抗体なしの群と比較してＣＤ２５若しくはＣＤ７１の発現を増加させることもできなかった。
【０２０１】
実施例８：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃをペンブロリズマブと組み合わせると、Ｔ細胞活性化が増強される
ＴＣＲの結合後に、ＯＸ４０のような共刺激分子は、ＴＣＲシグナル伝達の減弱によりＴ細胞の活性化に対抗する負の調節分子と一緒に上方調節される。臨床的には、そのような経路の１つであるＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸の遮断は、この抑制性シグナルを緩和することにより、無応答の腫瘍特異的Ｔ細胞の機能の回復に成功することが分かっている。ＯＸ４０は、ＴＣＲシグナルと相乗作用する外因性共刺激シグナルをもたらす種々のメカニズムを介して、Ｔ細胞応答の増強という同様の結果を達成する。重複しないが補完的なこれらのメカニズムは、ＯＸ４０アゴニズムとチェックポイント遮断とを組み合わせることで、より大きな臨床的便益が達成されることを示唆している。
【０２０２】
同種異系の混合リンパ球反応（ＭＬＲ）は、Ｔ細胞の機能的調節を実証するために使用されるｉｎ  ｖｉｔｒｏアッセイであり、ｉｎ  ｖｉｔｒｏ由来の未成熟樹状細胞（ｉＤＣ）とＨＬＡミスマッチＴ細胞との混合物を利用して、ＴＣＲ依存性Ｔ細胞活性化が誘導される。六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃは、このアッセイで中程度の活性を有することが分かった（データは示していない）。六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの活性を抗ＰＤ−１抗体のペンブロリズマブと組み合わせて試験し、その組み合わせ物がＴ細胞活性化の増加を示すかどうかを確認した。
【０２０３】
ＣＤ４＋Ｔ細胞の分離：ＰＢＭＣを、実質的に以下のように密度勾配遠心分離を使用して、ヒトドナーの血液ロイコパックから分離した。血液試料をＰＢＳ／２％ＦＢＳ（１：２）で希釈し、３０ｍＬの希釈された試料を１５ｍＬのＬｙｍｐｈｏｐｒｅｐ（商標）密度勾配培地上に重層した。８００×ｇで３０分間遠心分離した後に、血漿とＬｙｍｐｈｏｐｒｅｐ（商標）との中間相にあるＰＢＭＣ層を収集し、赤血球溶解バッファーを使用して残りの赤血球を室温で７分間溶解させた。次いで、ＰＢＭＣを以下に記載されるように単球に関して濃縮した、又はＣｒｙｏＳｔｏｒ（商標）凍結保存培地中で１００×１０６個の細胞／ｍｌで凍結し、液体窒素中で保存した。ＥａｓｙＳｅｐ（商標）Ｈｕｍａｎ  ＣＤ４＋Ｔ細胞分離キット（Stemcell Technologies社）を製造業者の指示に従って用いて、ＣＤ４＋Ｔ細胞を新鮮な健康なドナーのＰＢＭＣから濃縮した。ＰＢＭＣを、２％ＦＢＳ及び１ｍＭのＥＤＴＡを含むＰＢＳ中で５０×１０６個の細胞／ｍＬで再懸濁した。ＣＤ４＋Ｔ細胞分離用カクテルを使用して、ＣＤ４＋Ｔ細胞をネガティブ濃縮した後に、ＥａｓｙＳｅｐ（商標）マグネット内でＤｅｘｔｒａｎ  ＲａｐｉｄＳｐｈｅｒｅｓ（商標）と一緒にインキュベートした。該マグネットにおいて２ラウンド濃縮した後に、ＣＤ４＋Ｔ細胞を計数し、ＰＢＳ／０．１％ＢＳＡ（ＣＴＶバッファー）で洗浄した。細胞をＣｅｌｌＴｒａｃｅ（商標）Ｖｉｏｌｅｔ色素（１：１０００）により、ＣＴＶバッファー中で１０×１０６個の細胞／ｍＬで３７℃にて１０分間標識した。標識された細胞をＰＢＳ／２％ＦＢＳで１回洗浄し、アッセイ培地（ＲＰＭＩ＋１０％ＦＢＳ＋ペニシリン、ストレプトマイシン、及びアンホテリシン）中で３．５×１０６個の細胞／ｍＬで再懸濁した。
【０２０４】
単球の濃縮及び未成熟樹状細胞（ｉＤＣ）の生成：ＣＤ１６の減少を伴わないネガティブ濃縮キットを使用して製造業者のプロトコル（ＣＤ１６の減少を伴わないＥａｓｙＳｅｐ（商標）ヒト単球濃縮キット、Stemcell Technologies社）に従って、ロイコパックドナーから分離されたＰＢＭＣから単球を濃縮した。簡潔には、抗系譜マーカーを認識する四量体抗体複合体で非単球集団を標識し、磁性粒子を使用して減少させた。非結合細胞の上清に単球が含まれていた。１０％ＦＢＳに加えてペニシリン、ストレプトマイシン及びアンホテリシン、５００Ｕ／ｍＬのＧＭ−ＣＳＦ、並びに２５０Ｕ／ｍＬのＩＬ−４を補充したＲＰＭＩ中で、単球を１×１０６細胞／ｍＬで培養した。緩く付着した細胞及び浮遊細胞を収集することによって７日目に未成熟樹状細胞（ｉＤＣ）を採取するまで、２日ごとに培地の半分を補充した。細胞をＰＢＳ中で洗浄した後に、ＣｒｙｏＳｔｏｒ（商標）において３×１０６個の細胞／ｍＬで新鮮凍結させた。このレジメンに従うｉＤＣ表現型の誘導は、ＦＳＣ／ＳＳＣでのサイズ除外を使用したフローサイトメトリーによって、集団の少なくとも６０％でＣＤ１４−ＣＤ１１ｃ＋ＨＬＡ−ＤＲ＋染色を検出することで確認された。
【０２０５】
混合リンパ球反応（ＭＬＲ）：単球由来の未成熟樹状細胞（ｉＤＣ）をアッセイ培地中で０．８×１０６個の細胞／ｍＬで再懸濁した。異なるドナーからの１．７５×１０５個のＣＤ４＋Ｔ細胞を５０μＬで懸濁し、９６ウェルのＵ型底プレートにおいて５０μＬで４×１０４個のｉＤＣと混合した。
【０２０６】
六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを１０ｎＭの初期アッセイ濃度で添加し、１０ｎＭのペンブロリズマブの一定のアッセイ濃度の存在下又は不存在下のいずれかで、プレート全体にわたり１：４で三連にて力価測定した。別の実験では、ペンブロリズマブを５０ｎＭの初期アッセイ濃度で添加し、１ｎＭの六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの一定のアッセイ濃度の存在下又は不存在下のいずれかで、プレート全体にわたり１：４で三連にて力価測定した。六価３×１Ｄ１０ｖ６Ｆｃの固定された濃度（１ｎＭ）は、Ｔ細胞共刺激アッセイで最大の活性を示した飽和抗体濃度に基づいて選択され、ペンブロリズマブ（１０ｎＭ）については、ＰＤ１／ＰＤ−Ｌ１遮断アッセイで最大のレポーター活性を示した飽和抗体濃度に基づいて選択された。全てのアッセイプレートを３７℃で７日間インキュベートした。
【０２０７】
ヒトＩＬ−２  ＥＬＩＳＡ：アッセイ上清のアリコートを３日目に収集し、Ｈｕｍａｎ  ＩＬ−２  ＥＬＩＳＡ  ＭＡＸ（商標）Ｄｅｌｕｘｅキット（Biolegend社）を製造業者の指示に従って使用してＥＬＩＳＡによって、ヒトＩＬ−２濃度を決定した。ＥＬＩＳＡ  ＭａｘｉＳｏｒｐプレートをヒトＩＬ−２捕捉抗体で一晩コーティングし、洗浄した後に、希釈バッファーで１時間ブロッキングした。検量線を１０００ｐｇ／ｍＬのＩＬ−２の初期濃度から二連で作成し、アッセイ上清試料を希釈バッファー中で１：５又は１：１０に希釈した。試料及び標準をＥＬＩＳＡプレート上で２時間インキュベートした後に、洗浄し、検出抗体と一緒に１時間インキュベートした。アッセイプレートを洗浄し、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）結合ストレプトアビジンと一緒に３０分間インキュベートした。最終洗浄工程の後に、捕捉されたヒトＩＬ−２を、供給された基質溶液を用いてＥＬＩＳＡプレート上で検出した。検出反応を、等容量の１ＭのＨＣｌにより１０分〜３０分後に止めた。ＥＭａｘ（商標）プレートリーダー（Molecular Devices社）において４５０ｎｍでの吸光度値を読み取り、ＭＬＲアッセイ上清中のヒトＩＬ−２の濃度を検量線から計算した。
【０２０８】
図１４Ａ及び図１４Ｂに示されるように、ペンブロリズマブと六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃとを組み合わせると、混合リンパ球反応（ＭＬＲ）においてＣＤ４＋Ｔ細胞からのＩＬ−２産生が増強した。これらの結果は、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１軸の遮断とＯＸ４０アゴニズムとを組み合わせることの利点を裏付けている。
【０２０９】
実施例９：六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの薬物動態特性の評価
療法剤の薬物動態（ＰＫ）特性及び毒物動態プロファイルは、用量／曝露の関係、クリアランス速度、及び安全性プロファイルを理解するために重要である。曝露の減弱及び／又はクリアランスプロファイルの加速は、非特異的相互作用、不十分な安定性、若しくは免疫原性による作用物質自体の不利益、又は毒性若しくは薬物動態の変化により証明されるような標的における不利益を明らかにし得る。典型的には、治療用抗体のＰＫ特性を、齧歯類及び／又は非ヒト霊長類で評価する。これらのモデルでの不十分なＰＫは、抗体の非特異的結合及び迅速なクリアランスの指標であり得る。
【０２１０】
六価３×１Ｄ１０ｖ６Ｆｃを、カニクイザル（１群当たり雄５匹及び雌５匹）に５ｍｇ／ｋｇ、２０ｍｇ／ｋｇ、及び６０ｍｇ／ｋｇで静脈注射を介して投与した。定量的ＥＬＩＳＡ法を使用して、実質的に以下のように、六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの血清濃度を測定した。マウスＦｃドメインに融合されたヒトＯＸ４０（ＯＸ４０−ｍＦｃ）の細胞外ドメインの組換え形態でマイクロプレートのウェルをプレコートした。ブロッキング及び洗浄、六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃの力価測定（検量線用）の後に、予め決められた濃度の六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃを含むコントロール試料、及び試験試料をウェルに添加し、インキュベートすることで、試料中に含まれる六価３×１Ｄ１０ｖ６Ｆｃを固定化されたＯＸ４０−ｍＦｃに結合させた。プレートを洗浄し、Ｆｃγフラグメントに特異的な西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）結合抗ヒトＩｇＧ二次抗体を添加して、プレートに結合された六価３×１Ｄ１０ｖ６Ｆｃを検出した。ＨＲＰ基質のテトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）を含む溶液をウェルに添加したところ、六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃに結合されたＨＲＰ結合抗ヒトＩｇＧ抗体の濃度に比例する比色シグナルが得られた。酸性溶液の添加によって反応を止め、４５０ｎｍでの吸光度を測定した。コントロール試料及び試験試料について、分光光度吸光度（光学密度（ＯＤ４５０）により定量化される）値の濃度への変換は、４−ＰＬ／ロジスティックモデルに従って回帰された同時に分析された検量線との比較によって実施した。この方法による血清中の六価３×１Ｄ１０ｖ６Ｆｃの定量下限（ＬＬＯＱ）は１００ｎｇ／ｍＬであった。
【０２１１】
用量範囲全体にわたって、性差なしに、全身曝露（Ｃｍａｘ及びＡＵＣ０−１６８ｈ）が達成され、これは用量に比例して増加した。５ｍｇ／ｋｇ〜６０ｍｇ／ｋｇの用量範囲全体にわたって、ノンコンパートメント解析を使用して、群全体にわたる平均Ｔ１／２は５５時間〜８９．７時間であり、クリアランス速度（ＣＬ）は０．６８３ｍＬ／ｈ／ｋｇ〜０．８３２ｍＬ／ｈ／ｋｇであり、そして定常状態での分布容積（Ｖｄｓｓ）は５５．９ｍＬ／ｋｇ〜８６．２ｍＬ／ｋｇであった。六価３×１Ｄ１０ｖ６−ＦｃのＰＫプロファイルは、図１５に示されている。
【０２１２】
これらの結果は、六価３×１Ｄ１０ｖ６−Ｆｃが治療用途に適した良好なＰＫプロファイルを有することを裏付けており、１Ｄ１０ｖ１により観察される非特異的結合が軽減されたことを示唆している。
【０２１３】
本開示は、本発明の趣旨又は本質的な特徴から逸脱することなく、他の特定の形態で具体化され得る。したがって、上述の実施形態は、全ての点で例示としてみなされるべきであって、本開示を限定するものとはみなされない。したがって、本開示の範囲は、上述の詳細な説明ではなく、添付の特許請求の範囲によって示されるため、特許請求の範囲の意味及び均等の範囲内にある全ての変更は、本明細書に含まれることが意図される。
【０２１４】
【表３】
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【図１】
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【図２Ａ】
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【図２Ｂ】
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【図３Ａ】
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【図３Ｂ】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４Ａ】
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【図１４Ｂ】
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【図１５】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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