(57)【要約】  治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、がんを有する対象に治療用化合物を投与することと、対象から試料を得ることと、対象からの試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、対象の試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと比較して変化する場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２、または化合物３である、方法。【選択図】図１
2021525362.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化１】
2021525362.tif 000149
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項２】
治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化２】
2021525362.tif 000150
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項３】
治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化３】
2021525362.tif 000151
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項４】
治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）前記対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料に前記治療用化合物を投与することと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化４】
2021525362.tif 000152
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項５】
治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）前記対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料に前記治療用化合物を投与することと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化５】
2021525362.tif 000153
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項６】
治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）前記対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料に前記治療用化合物を投与することと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化６】
2021525362.tif 000154
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項７】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも高い、請求項１〜３または４〜６に記載の方法。
【請求項８】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも低い、請求項１〜３または４〜６に記載の方法。
【請求項９】
がんを治療する方法であって、
（ａ）前記がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された前記対象に、治療上有効な量の前記治療用化合物を投与することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化７】
2021525362.tif 000155
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１０】
がんを治療する方法であって、
（ａ）前記がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された前記対象に、治療上有効な量の前記治療用化合物を投与することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化８】
2021525362.tif 000156
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１１】
がんを治療する方法であって、
（ａ）前記がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された前記対象に、治療上有効な量の前記治療用化合物を投与することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化９】
2021525362.tif 000157
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１２】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも高い、請求項９〜１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも低い、請求項９〜１１に記載の方法。
【請求項１４】
治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、参照試料から得られた前記バイオマーカーの前記レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化１０】
2021525362.tif 000158
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１５】
治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、参照試料から得られた前記バイオマーカーの前記レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化１１】
2021525362.tif 000159
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１６】
治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、参照試料から得られた前記バイオマーカーの前記レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化１２】
2021525362.tif 000160
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１７】
治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）前記対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料に前記治療用化合物を投与することと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、参照試料から得られた前記バイオマーカーの前記レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化１３】
2021525362.tif 000161
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１８】
治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）前記対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料に前記治療用化合物を投与することと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、参照試料から得られた前記バイオマーカーの前記レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化１４】
2021525362.tif 000162
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項１９】
治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）前記対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料に前記治療用化合物を投与することと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、参照試料から得られた前記バイオマーカーの前記レベルと異なる場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化１５】
2021525362.tif 000163
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項２０】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも高い、請求項１４〜１６または請求項１７〜１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも低い、請求項１４〜１６または請求項１７〜１９に記載の方法。
【請求項２２】
対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルを、参照試料から得られた前記バイオマーカーのレベルと比較することであって、前記バイオマーカーレベルの変化が、前記対象において前記がんを治療することにおける前記治療用化合物の前記有効性を示す、前記比較することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化１６】
2021525362.tif 000164
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項２３】
対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルを、参照試料から得られた前記バイオマーカーのレベルと比較することであって、前記バイオマーカーレベルの変化が、前記対象において前記がんを治療することにおける前記治療用化合物の前記有効性を示す、前記比較することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化１７】
2021525362.tif 000165
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項２４】
対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）前記対象に前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）前記対象から試料を得ることと、
（ｃ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルを、参照試料から得られた前記バイオマーカーのレベルと比較することであって、前記バイオマーカーレベルの変化が、前記対象において前記がんを治療することにおける前記治療用化合物の前記有効性を示す、前記比較することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化１８】
2021525362.tif 000166
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項２５】
前記参照レベルと比較して前記バイオマーカーの増加したレベルが、前記対象において前記がんを治療することにおける前記治療用化合物の前記有効性を示す、請求項２２〜２４に記載の方法。
【請求項２６】
前記参照レベルと比較して前記バイオマーカーの減少したレベルが、前記対象において前記がんを治療することにおける前記治療用化合物の前記有効性を示す、請求項２２〜２４に記載の方法。
【請求項２７】
前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された前記対象に、治療上有効な量の前記治療用化合物を投与することをさらに含む、請求項１〜８及び１４〜２１のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
治療上有効な量の第２の活性剤またはサポートケア療法を投与することをさらに含む、請求項９〜１３及び２７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
前記第２の活性剤が、大分子、小分子、または細胞療法を含む群から選択され、前記第２の活性剤が、任意で、メルファラン、ビンクリスチン、シクロホスファミド、エトポシド、ドキソルビシン、ベンダムスチン、プロテアソーム阻害剤、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤、ＢＥＴ阻害剤、ＢＣＬ２阻害剤、ＭＣＬ−１阻害剤、コルチコステロイド、デキサメタゾン、抗体、チェックポイント阻害剤、及びＣＡＲ細胞を含む群から選択される、請求項２８に記載の方法。
【請求項３０】
前記参照試料が、前記対象に前記治療用化合物を投与する前に前記対象から得られ、前記参照試料が、前記試料と同じ由来源からのものである、請求項１〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記参照試料が、前記がんを有しない健康な対象から得られ、前記参照試料が、前記試料と同じ由来源からのものである、請求項１〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３２】
前記参照試料が、前記治療用化合物ではない抗がん化合物を受けている対象から得られ、前記参照試料が、前記試料と同じ由来源からのものである、請求項１〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３３】
前記抗がん化合物が、レナリドマイド、ポマリドマイド、またはその誘導体を含む群から選択される、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
前記がんが、多発性骨髄腫（ＭＭ）である、請求項１〜３３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３５】
前記ＭＭが、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
前記バイオマーカーが、セレブロン（ＣＲＢＮ）である、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３７】
前記バイオマーカーが、ＣＲＢＮ関連タンパク質である、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３８】
前記バイオマーカーが、アポトーシス経路において機能を有する、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３９】
前記バイオマーカーが、細胞周期経路において機能を有する、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４０】
前記バイオマーカーが、Ｔ細胞活性化において機能を有する、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記バイオマーカーが循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）である、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
前記バイオマーカーが、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）である、請求項１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４３】
前記バイオマーカーが、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、及びＩＲＦ４からなる群から選択される、請求項３７に記載の方法。
【請求項４４】
前記バイオマーカーが、切断型カスパーゼ−１（ｃ−カスパーゼ−１）、切断型カスパーゼ−３（ｃ−カスパーゼ−３）、切断型カスパーゼ−７（ｃ−カスパーゼ−７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ  ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、及び血清遊離軽鎖からなる群から選択される、請求項３８に記載の方法。
【請求項４５】
前記バイオマーカーの前記レベルが、末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼｄＵＴＰニックエンドラベリング（ＴＵＮＥＬ）によって測定される、請求項３８に記載の方法。
【請求項４６】
前記バイオマーカーの前記レベルが、アネキシンＶ及び７−ＡＡＤによって測定される、請求項３８に記載の方法。
【請求項４７】
前記バイオマーカーの前記レベルが、アネキシンＶ及びヨウ化プロピジウム（ＰＩ）によって測定される、請求項３８に記載の方法。
【請求項４８】
前記バイオマーカーが、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１（ｐ２１）、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１Ｂ（ｐ２７）、及び網膜芽細胞腫タンパク質（ｐＲｂ１）からなる群から選択される、請求項３９に記載の方法。
【請求項４９】
前記バイオマーカーが、インターロイキン−２（ＩＬ−２）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）、インターフェロンガンマ（ＩＦＮγ）、及びＴ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性からなる群から選択される、請求項４０に記載の方法。
【請求項５０】
前記バイオマーカーの前記レベルが、組織像によって測定される、請求項４２に記載の方法。
【請求項５１】
前記バイオマーカーが、ＩＫＺＦ１である、請求項４３に記載の方法。
【請求項５２】
前記バイオマーカーが、ＩＫＺＦ３である、請求項４３に記載の方法。
【請求項５３】
前記バイオマーカーが、ＺＦＰ９１である、請求項４３に記載の方法。
【請求項５４】
前記バイオマーカーが、ｃ−ＭＹＣである、請求項４３に記載の方法。
【請求項５５】
前記バイオマーカーが、ＩＲＦ４である、請求項４３に記載の方法。
【請求項５６】
前記バイオマーカーが、切断型カスパーゼ−３（ｃ−カスパーゼ−３）である、請求項４４に記載の方法。
【請求項５７】
前記バイオマーカーが、切断型カスパーゼ−１（ｃ−カスパーゼ−１）である、請求項４４に記載の方法。
【請求項５８】
前記バイオマーカーが、切断型カスパーゼ−７（ｃ−カスパーゼ−７）である、請求項４４に記載の方法。
【請求項５９】
前記バイオマーカーが、切断型ＰＡＲＰである、請求項４４に記載の方法。
【請求項６０】
前記バイオマーカーが、サバイビンである、請求項４４に記載の方法。
【請求項６１】
前記バイオマーカーが、ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）である、請求項４４に記載の方法。
【請求項６２】
前記バイオマーカーが、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）である、請求項４４に記載の方法。
【請求項６３】
前記バイオマーカーが、ｐ２１である、請求項４８に記載の方法。
【請求項６４】
前記バイオマーカーが、ｐ２７である、請求項４８に記載の方法。
【請求項６５】
前記バイオマーカーが、ｐＲｂ１である、請求項４８に記載の方法。
【請求項６６】
前記バイオマーカーが、可溶性ＣＤ２５（ｓＣＤ２５）である、請求項４９に記載の方法。
【請求項６７】
前記バイオマーカーが、ＩＬ−２である、請求項４９に記載の方法。
【請求項６８】
前記バイオマーカーが、ＴＮＦαである、請求項４９に記載の方法。
【請求項６９】
前記バイオマーカーが、ＩＦＮγである、請求項４９に記載の方法。
【請求項７０】
前記バイオマーカーが、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性である、請求項４９に記載の方法。
【請求項７１】
前記バイオマーカーの前記レベルが、参照レベルよりも高い、請求項１〜６９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７２】
前記バイオマーカーの前記レベルが、参照レベルよりも低い、請求項１〜６９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項７３】
前記バイオマーカーが、前記ＴＣＲのＤＮＡ配列決定によって測定される、請求項７０に記載の方法。
【請求項７４】
再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化１９】
2021525362.tif 000167
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項７５】
再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化２０】
2021525362.tif 000168
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項７６】
再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化２１】
2021525362.tif 000169
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項７７】
治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化２２】
2021525362.tif 000170
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項７８】
治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化２３】
2021525362.tif 000171
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項７９】
治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）前記試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化２４】
2021525362.tif 000172
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項８０】
前記バイオマーカーが、ＣＲＢＮである、請求項７４〜７９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８１】
前記試料中の前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーの前記参照レベルよりも低い場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することを含む、請求項８０に記載の方法。
【請求項８２】
前記バイオマーカーが、前記試料中で検出可能である場合、前記対象を、前記治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することを含む、請求項８０に記載の方法。
【請求項８３】
前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーのタンパク質レベルを決定することによって測定される、請求項１〜８２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８４】
前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーのｍＲＮＡレベルを決定することによって測定される、請求項１〜８２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８５】
前記バイオマーカーの前記レベルが、前記バイオマーカーのｃＤＮＡレベルを決定することによって測定される、請求項１〜８２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８６】
前記バイオマーカーが、ＤＮＡ配列決定によって決定される、請求項１〜８２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８７】
前記バイオマーカーが、ＲＮＡ配列決定（ＲＮＡ−ｓｅｑ）によって決定される、請求項１〜８２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８８】
前記試料内のタンパク質を、前記バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合する第１の抗体と接触させることを含む、請求項８３に記載の方法。
【請求項８９】
（ａ）前記第１の抗体に結合した前記バイオマーカータンパク質を、検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、前記第２の抗体が、前記バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合し、前記第２の抗体が、前記第１の抗体とは異なる前記バイオマーカータンパク質上のエピトープに免疫特異的に結合する、前記接触させることと、
（ｂ）前記バイオマーカータンパク質に結合した前記第２の抗体の存在を検出することと、
（ｃ）前記第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいて、前記バイオマーカータンパク質の量を決定することと、をさらに含む、請求項８８に記載の方法。
【請求項９０】
（ａ）前記バイオマーカータンパク質に結合した前記第１の抗体を、検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、前記第２の抗体が、前記第１の抗体に免疫特異的に結合する、前記接触させることと、
（ｂ）前記第１の抗体に結合した前記第２の抗体の存在を検出することと、
（ｃ）前記第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいて、前記バイオマーカータンパク質の量を決定することと、をさらに含む、請求項８８に記載の方法。
【請求項９１】
多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）前記対象に、ある投薬量の前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で前記対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）前記１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって前記投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物１：
【化２５】
2021525362.tif 000173
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項９２】
多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）前記対象に、ある投薬量の前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で前記対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）前記１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって前記投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物２：
【化２６】
2021525362.tif 000174
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項９３】
多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）前記対象に、ある投薬量の前記治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で前記対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）前記１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって前記投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
前記治療用化合物が、化合物３：
【化２７】
2021525362.tif 000175
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、前記方法。
【請求項９４】
前記バイオマーカーが、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択される、請求項９１〜９３に記載の方法。
【請求項９５】
前記バイオマーカーが、ＩＫＺＦ１である、請求項９４に記載の方法。
【請求項９６】
前記バイオマーカーが、ＩＫＺＦ３である、請求項９４に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、２０１８年５月２３日に出願された米国仮出願第６２／６７５，７３２、及び２０１８年９月２７日に出願された米国仮出願６２／７３７，７７２の利益を主張し、それらが参照によりそれらの全体において本明細書に組み込まれる。
【０００２】
１．技術分野
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル、またはエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、もしくはその薬学的に許容される塩に対する臨床感受性及び治療応答を予測及びモニタリングする際の、ＣＲＢＮ、アイオロス（ＩＫＺＦ３）、イカロス（ＩＫＺＦ１）、ジンクフィンガータンパク質９１（ＺＦＰ９１）、ｃ−Ｍｙｃ、インターフェロン調節因子４（ＩＲＦ４）、腫瘍免疫マーカー（可溶性ＣＤ２５、サイトカイン；腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）；Ｔ細胞活性化、Ｔ細胞受容体クローン性）、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）、可溶性ＢＣＭＡ（ｓＢＣＭＡ）、アポトーシスマーカー（切断型カスパーゼ−１、切断型カスパーゼ−７、切断型カスパーゼ−３、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、ＴＵＮＥＬ、遊離軽鎖（ＦＬＣ））、及び細胞周期マーカー（ｐ２１、ｐ２７、ｐＲｂ１）などの、ある特定のバイオマーカーを使用する方法、及びそれらを使用して多発性骨髄腫を治療、予防または管理するための方法である。また、本明細書に記載されるのは、多発性骨髄腫を治療、予防または管理するための方法で使用するための、４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、もしくは薬学的に許容される塩である。また、ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、応答する可能性が高い患者を特定する方法、患者の応答性を予測する方法、投薬量を決定する方法、または疾患を治療することにおける化合物の有効性を決定する方法である。
【背景技術】
【０００３】
２．背景技術
多発性骨髄腫（ＭＭ）は、骨髄中の形質細胞のがんである。通常、形質細胞は、抗体を産生し、免疫機能において重要な役割を果たす。しかし、これらの細胞の制御されていない成長は、骨痛及び骨折、貧血、感染症、ならびに他の合併症を引き起こす。多発性骨髄腫は、２番目に一般的な血液悪性腫瘍であるが、多発性骨髄腫の正確な原因は不明なままである。多発性骨髄腫は、血液、尿、臓器中に、Ｍタンパク質及び他の免疫グロブリン（抗体）、アルブミン、ならびにベータ−２−ミクログロブリンを含むが、これらに限定されない高レベルのタンパク質を引き起こすが、骨髄腫細胞がこれらのタンパク質を分泌しない（非分泌性骨髄腫と呼ばれる）一部の患者（推定１％〜５％）を除く。パラプロテインとしても知られるモノクローナルタンパク質の略であるＭタンパク質は、骨髄腫形質細胞によって産生される特に異常なタンパク質であり、多発性骨髄腫を有するほぼすべての患者の血液または尿中に見いだされ得るが、非分泌性骨髄腫を有する患者またはその骨髄腫細胞が重鎖と共に免疫グロブリン軽鎖を産生する患者を除く。
【０００４】
骨痛を含む骨格症状は、多発性骨髄腫の最も臨床的に顕著な症状の１つである。悪性形質細胞は、カルシウムを骨から浸出させ、それによって溶解性病変を引き起こす破骨細胞刺激因子（ＩＬ−１、ＩＬ−６、及びＴＮＦを含む）を放出する。高カルシウム血症がもう一つの症状である。サイトカインとも称される破骨細胞刺激因子は、アポトーシス、すなわち骨髄腫細胞の死を妨げる。患者の５０％は、診断時に放射線学的に検出可能な骨髄腫関連骨格病変を有する。多発性骨髄腫の他の一般的な臨床症状は、多発性神経障害、貧血、過粘稠、感染症、及び腎不全を含む。
【０００５】
現在の多発性骨髄腫療法は、患者における多発性骨髄腫細胞を根絶するための手術、幹細胞移植、化学療法、免疫療法、及び／または放射線治療のうちの１つ以上を含み得る。現在の治療アプローチのすべては、患者に対する顕著な欠点を呈する。
【０００６】
過去１０年間で、新規治療剤、特にレナリドマイド及びポマリドマイドなどの免疫調節薬は、多発性骨髄腫患者における奏効率を顕著に向上させ、無増悪生存期間（ＰＦＳ）及び全生存期間（ＯＳ）を延長した。しかしながら、多発性骨髄腫を有する一部の患者では、これらの患者が完全奏効（ＣＲ）を達成した後でさえも、骨髄（ＢＭ）形態、免疫固定を伴うタンパク質電気泳動、及び軽鎖定量の感度を下回る持続的なレベルの残存病変が存在し、最終的には疾患の再発を引き起こす可能性がある。
【０００７】
従来の療法に伴う毒性及び／または副作用を低減または回避しながら、多発性骨髄腫が、新たに診断されたか、または標準治療に難治性である患者を含む、多発性骨髄腫を治療、予防及び管理するための安全かつ効果的な化合物及び方法に対する顕著な必要性が存在する。
【発明の概要】
【０００８】
３．発明の概要
一態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１】
2021525362.tif 000003
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０００９】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化２】
2021525362.tif 000004
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１０】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化３】
2021525362.tif 000005
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化４】
2021525362.tif 000006
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１２】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化５】
2021525362.tif 000007
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１３】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化６】
2021525362.tif 000008
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であり、試料中のバイオマーカーのレベルは、バイオマーカーの参照レベルよりも高い。他の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であり、試料中のバイオマーカーのレベルは、バイオマーカーの参照レベルよりも低い。
【００１５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に、治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化７】
2021525362.tif 000009
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１６】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に、治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化８】
2021525362.tif 000010
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１７】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に、治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化９】
2021525362.tif 000011
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００１８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であり、試料中のバイオマーカーのレベルは、バイオマーカーの参照レベルよりも高い。他の実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であり、試料中のバイオマーカーのレベルは、バイオマーカーの参照レベルよりも低い。また、本明細書で提供されるのは、上記のようながんを治療するための方法における使用のための化合物１、化合物２及び／または化合物３である。
【００１９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化１０】
2021525362.tif 000012
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２０】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化１１】
2021525362.tif 000013
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２１】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化１２】
2021525362.tif 000014
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２２】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化１３】
2021525362.tif 000015
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２３】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化１４】
2021525362.tif 000016
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２４】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化１５】
2021525362.tif 000017
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であり、試料中のバイオマーカーのレベルは、バイオマーカーの参照レベルよりも高い。他の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であり、試料中のバイオマーカーのレベルは、バイオマーカーの参照レベルよりも低い。
【００２６】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化１６】
2021525362.tif 000018
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化１７】
2021525362.tif 000019
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２８】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１８】
2021525362.tif 000020
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００２９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であり、参照レベルと比較してバイオマーカーの増加したレベルは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングする方法であり、参照レベルと比較してバイオマーカーの減少したレベルは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。
【００３０】
いくつかの実施形態では、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法は、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に、治療上有効な量の治療用化合物を投与することをさらに含む。追加的な実施形態では、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法は、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に、治療上有効な量の治療用化合物を投与することをさらに含む。
【００３１】
本明細書で提供される方法のいずれか１つのいくつかの実施形態では、参照試料は、対象に治療用化合物を投与する前に対象から得られ、参照試料は、試料と同じ由来源からのものである。
【００３２】
本明細書で提供される方法のいずれか１つのいくつかの実施形態では、参照試料は、がんを有しない健康な対象から得られ、参照試料は、試料と同じ由来源からのものである。
【００３３】
本明細書で提供される方法のいずれか１つのいくつかの実施形態では、参照試料は、該治療用化合物ではない抗がん化合物を受けている対象から得られ、参照試料は、試料と同じ由来源からのものである。特定の実施形態では、参照試料は、治療用化合物ではない抗がん化合物を受けている対象から得られ、参照試料は、試料と同じ由来源からのものであり、抗がん化合物は、レナリドマイド、ポマリドマイド、またはその誘導体を含む群から選択される。
【００３４】
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、がんは、多発性骨髄腫（ＭＭ）である。いくつかの特定の実施形態では、ＭＭは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である。一実施形態では、ＭＭは、レナリドマイド抵抗性ＭＭである。別の実施形態では、ＭＭは、ポマリドマイド抵抗性ＭＭである。いくつかの実施形態では、ＭＭは、新たに診断されたＭＭである。いくつかの実施形態では、ＭＭは、移植適格ＭＭである。他の実施形態では、ＭＭは、移植不適格ＭＭである。
【００３５】
本明細書で提供される方法のある特定の実施形態では、バイオマーカーは、セレブロン（ＣＲＢＮ）である。本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ関連タンパク質である。
【００３６】
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシス経路において機能を有する。本明細書で提供される方法のさらに他の実施形態では、バイオマーカーは、細胞周期経路において機能を有する。本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、Ｔ細胞活性化において機能を有する。本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）である。
【００３７】
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）である。
【００３８】
いくつかの特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ関連タンパク質であり、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、及びＩＲＦ４からなる群から選択される。いくつかの特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１である。別の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ３である。さらに別の実施形態では、バイオマーカーは、ＺＦＰ９１である。さらに別の実施形態では、バイオマーカーは、ｃ−ＭＹＣである。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＲＦ４である。
【００３９】
他の実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有し、切断型カスパーゼ−１（ｃ−カスパーゼ−１）、切断型カスパーゼ−３（ｃ−カスパーゼ−３）、切断型カスパーゼ−７（ｃ−カスパーゼ−７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ  ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、及び血清遊離軽鎖からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、切断型カスパーゼ−３（ｃ−カスパーゼ−３）である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、切断型カスパーゼ−１（ｃ−カスパーゼ−１）である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、切断型カスパーゼ−７（ｃ−カスパーゼ−７）である。別の実施形態では、バイオマーカーは、切断型ＰＡＲＰである。さらに別の実施形態では、バイオマーカーは、サバイビンである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、サバイビンである。他の実施形態では、バイオマーカーは、ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）である。
【００４０】
さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有し、末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼｄＵＴＰニックエンドラベリング（ＴＵＮＥＬ）によって測定される。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有し、アネキシンＶ及び７−ＡＡＤによって測定される。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有し、アネキシンＶ及びヨウ化プロピジウム（ＰＩ）によって測定される。
【００４１】
本明細書で提供される方法の他の実施形態では、バイオマーカーは、細胞周期において機能を有し、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１（ｐ２１）、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１Ｂ（ｐ２７）、及び網膜芽細胞腫タンパク質（ｐＲｂ１）からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ｐ２１である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ｐ２７である。さらに別の実施形態では、バイオマーカーは、ｐＲｂ１である。
【００４２】
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、Ｔ細胞活性化において機能を有し、インターロイキン−２（ＩＬ−２）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）、インターフェロンガンマ（ＩＦＮγ）、及びＴ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性からなる群から選択される。他の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＬ−２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、ＴＮＦαである。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＦＮγである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性であり、バイオマーカーは、ＴＣＲのＤＮＡ配列決定によって測定される。いくつかの特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ｔ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーのレベルは、組織像によって測定される。
【００４３】
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーのレベルは、参照レベルよりも高い。
【００４４】
本明細書で提供される方法のさらに他の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、参照レベルよりも低い。
【００４５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化１９】
2021525362.tif 000021
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００４６】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化２０】
2021525362.tif 000022
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００４７】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化２１】
2021525362.tif 000023
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００４８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化２２】
2021525362.tif 000024
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００４９】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化２３】
2021525362.tif 000025
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００５０】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化２４】
2021525362.tif 000026
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００５１】
多発性骨髄腫を有する対象の治療用化合物に対する応答性を予測する方法の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮである。多発性骨髄腫を有する対象の治療用化合物に対する応答性を予測する方法のある特定の実施形態では、方法は、試料中のバイオマーカーのレベルが、検出され、参照試料よりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することを含む。多発性骨髄腫を有する対象の治療用化合物に対する応答性を予測する方法のいくつかの実施形態では、方法は、試料中のバイオマーカーが検出可能である場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することを含む。いくつかの特定の実施形態では、ＭＭは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である。一実施形態では、ＭＭは、レナリドマイド抵抗性ＭＭである。別の実施形態では、ＭＭは、ポマリドマイド抵抗性ＭＭである。
【００５２】
本明細書で提供される方法のいずれか１つのいくつかの実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのタンパク質レベルを決定することによって測定される。本明細書で提供される方法のいずれか１つの他の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのｍＲＮＡレベルを決定することによって測定される。本明細書で提供される方法のいずれか１つのさらなる実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのｃＤＮＡレベルを決定することによって測定される。本明細書で提供される方法のいずれか１つのある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＤＮＡ配列決定によって決定される。本明細書で提供される方法のいずれか１つの他の実施形態では、バイオマーカーは、ＲＮＡ配列決定（ＲＮＡ−ｓｅｑ）によって決定される。
【００５３】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのタンパク質レベルを決定することによって測定され、試料内のタンパク質を、バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合する第１の抗体と接触させることを含む。他の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのタンパク質レベルを決定することによって測定され、試料内のタンパク質を、バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合する第１の抗体と接触させることを含み、
（ａ）第１の抗体に結合したバイオマーカータンパク質を、検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、第２の抗体は、バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合し、第２の抗体は、第１の抗体とは異なるバイオマーカータンパク質上のエピトープに免疫特異的に結合する、接触させることと、
（ｂ）バイオマーカータンパク質に結合した第２の抗体の存在を検出することと、
（ｃ）第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいて、バイオマーカータンパク質の量を決定することと、をさらに含む。
【００５４】
さらに別の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのタンパク質レベルを決定することによって測定され、試料内のタンパク質を、バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合する第１の抗体と接触させることを含み、
（ａ）バイオマーカータンパク質に結合した第１の抗体を、検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、第２の抗体が、第１の抗体に免疫特異的に結合する、接触させることと、
（ｂ）第１の抗体に結合した第２の抗体の存在を検出することと、
（ｃ）第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいて、バイオマーカータンパク質の量を決定することと、をさらに含む。
【００５５】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象に、ある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化２５】
2021525362.tif 000027
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００５６】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象に、ある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化２６】
2021525362.tif 000028
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００５７】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象に、ある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化２７】
2021525362.tif 000029
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【００５８】
多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択される。多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法のいくつかの特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１である。多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法のさらに別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ３である。
【００５９】
いくつかの実施形態では、がんを治療する方法は、治療上有効な量の別の第２の活性剤またはサポートケア療法を投与することをさらに含む。ある特定の実施形態では、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法は、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することをさらに含み、また、治療上有効な量の第２の活性剤またはサポートケア療法を投与することをさらに含む。追加的な実施形態では、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法は、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することをさらに含み、また、治療上有効な量の第２の活性剤またはサポートケア療法を投与することをさらに含む。特定の実施形態では、第２の活性剤は、大分子、小分子、または細胞療法からなる群から選択され、第２の活性剤は、任意で、メルファラン、ビンクリスチン、シクロホスファミド、エトポシド、ドキソルビシン、ベンダムスチン、プロテアソーム阻害剤、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤、ＢＥＴ阻害剤、ＢＣＬ２阻害剤、ＭＣＬ−１阻害剤、コルチコステロイド、デキサメタゾン、抗体、チェックポイント阻害剤、及びＣＡＲ細胞を含む群から選択される。
【００６０】
本明細書で提供されるいくつかの実施形態では、本明細書で提供される化合物は、本明細書で提供される疾患のいずれかを治療、予防及び／またはモニタリングするための任意の方法で使用され得る。
【図面の簡単な説明】
【００６１】
４．図面の簡単な説明
【図１】化合物２及び化合物３が、時間及び濃度依存的様式でＡｉｏｌｏｓタンパク質を分解したことを、例示する。Ｅｎｈａｎｃｅｄ  ＰｒｏＬａｂｅｌ（ｅＰＬ）タグ付きＡｉｏｌｏｓを発現するＤＦ１５細胞を、化合物２（三角形）または化合物３（正方形）と共に、示された濃度で４５分、９０分、または３時間インキュベートした。次いで、細胞抽出物を生成し、Ａｉｏｌｏｓ−ｅＰＬタンパク質の量をｅＰＬ発光アッセイによって決定した。
【００６２】
【図２】化合物２が、ポマリドマイド抵抗性細胞においてさえ、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓを分解し、デキサメタゾンと相乗作用して、ＩＲＦ４及びｃ−ＭＹＣを分解することを、例示する。ポマリドマイド感受性（ＯＰＭ２）または抵抗性（ＯＰＭ２−Ｐ１）細胞を、ビヒクル対照（ＤＭＳＯ）、ポマリドマイド、または化合物２を単独で、または１０もしくは１００ｎＭのデキサメタゾンと組み合わせて用いて７２時間治療した。ＣＲＬ４ＣＲＢＮ  Ｅ３ユビキチンリガーゼ基質であるＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓ、ならびにそれらの下流エフェクターであるｃ−Ｍｙｃ及びＩＲＦ４を、測定した。チューブリンは、ローディングコントロールである。
【００６３】
【図３】化合物２が、ポマリドマイド抵抗性細胞においてさえ、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓを分解し、デキサメタゾンと相乗作用して、アポトーシスを誘導することを、例示する。ポマリドマイド感受性（ＯＰＭ２）または抵抗性（ＯＰＭ２−Ｐ１）細胞を、ビヒクル対照（ＤＭＳＯ）、ポマリドマイド、または化合物２を単独で、または１０もしくは１００ｎＭのデキサメタゾンと組み合わせて用いて７２時間治療した。ＣＲＬ４ＣＲＢＮ  Ｅ３ユビキチンリガーゼ基質であるＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓ、ならびにアポトーシス経路タンパク質であるＢＩＭ、切断型ＰＡＲＰ、切断型カスパーゼ−３、及び切断型カスパーゼ−７の誘導を、測定した。チューブリンは、ローディングコントロールである。
【００６４】
【図４】化合物２が、Ｉｋａｒｏｓ、Ａｉｏｌｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４の分解を誘導したことを、例示し、このことは、アポトーシスタンパク質である切断型カスパーゼ３、及び細胞周期停止タンパク質であるｐ２１の誘導と相関する。示された濃度で化合物２と共にインキュベートされたＯＰＭ２親細胞のイムノブロット分析が、示される。アクチンは、ローディングコントロールである。
【００６５】
【図５Ａ】ＣＲＢＮが、Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの化合物２媒介性分解に必要であることを、例示する。示されているのは、ＤＭＳＯ、ポマリドマイド、または化合物２と共に０．１μＭで４時間インキュベートされた、ＤＦ１５Ｒ及びＤＦ１５Ｒ−ヒトＣＲＢＮＷＴ細胞からの抽出物のセレブロン、Ｉｋａｒｏｓ、及びＡｉｏｌｏｓの免疫ブロットである。チューブリンは、ローディングコントロールである。
【００６６】
【図５Ｂ】Ｉｋａｒｏｓが、ｃ−Ｍｙｃ及びＩＲＦ４の化合物２媒介性下方調節、ならびにアポトーシスの誘導に必要であることを、例示する。示されているのは、野生型ＯＰＭ２細胞または安定化したＩｋａｒｏｓ、Ａｉｏｌｏｓ、もしくはＺＦＰ９１変異体を過剰発現するＯＰＭ２細胞からの抽出物の免疫ブロットである。細胞を、ＤＭＳＯまたは示された濃度の化合物２と共に５日間インキュベートした。
【００６７】
【図６】化合物２が濃度依存的様式でＩｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓを分解し、ポマリドマイド抵抗性多発性骨髄腫細胞においてアポトーシス及び細胞周期停止を誘導したことを、例示する。示されているのは、化合物２と共に（図６Ａ）４時間または（図６Ｂ）７２時間インキュベートされたポマリドマイド抵抗性ＭＭ細胞（Ｈ９２９−１０５１）のイムノブロット分析である。
【００６８】
【図７】化合物２がＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解延長を誘導することを、例示する。化合物２への１回の持続曝露後の（図７Ａ）Ｈ９２９−１０５１及び（図７Ｂ）ＯＰＭ２−Ｐ１０細胞モデルにおけるジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）対照のパーセンテージとしてのＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解が、示される。これらのデータは、データポイントあたり１つの試料を用いた単一の実験からのものである。
【００６９】
【図８】化合物２が、１５分間の曝露後にＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解延長を誘導したことを、例示する。化合物２をＨ９２９−１０５１細胞と共に１５分間インキュベートし、Ａｉｏｌｏｓ（左パネル）及びＩｋａｒｏｓ（右パネル）の分解を測定した。データは、データポイントあたり１つの試料を使用した単一の実験からのものである。ｙ軸は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）対照の対応するタンパク質のレベルのパーセンテージとして表されるＡｉｏｌｏｓまたはＩｋａｒｏｓの量を表す。ｘ軸は、時間（ｔｉｍｅ）を時間（ｈｏｕｒ）で示す。
【００７０】
【図９】化合物２への６時間の曝露からのウォッシュアウト後のＡｉｏｌｏｓレベルの回復に、ほぼ１６０時間が必要であったことを、例示する。化合物２をＨ９２９−１０５１細胞と共に６時間インキュベートし、Ａｉｏｌｏｓの分解を測定した。これらのデータは、データポイントあたり１つの試料を用いた単一の実験からのものである。垂直の青い点線は、データを化合物２オントリートメント（垂直の線の左）とウォッシュアウト後のセグメント（垂直の線の右）とに分割する。結果は、０．０１（赤）または０．１μＭの化合物２（青）との６時間のインキュベーションを含み、その後に続く合計１６０時間のＯＰＭ２−Ｐ１０細胞（左）及びＨ９２９−１０５１細胞（右）のＡｉｏｌｏｓレベルについて示される。
【００７１】
【図１０】化合物２への持続的であるが一過性ではない曝露が多発性骨髄腫細胞においてアポトーシスを誘導したことを、例示する。レナリドマイド抵抗性ＭＭ細胞モデル（Ｈ９２９−１０５１［上段］及びポマリドマイド抵抗性ＭＭ細胞モデルＯＰＭ２−Ｐ１０［下段］）における化合物２治療によるアポトーシス誘導が示される。これらのデータは、データポイントあたり１つの試料を用いた単一の実験からのものである。
【００７２】
【図１１】ポマリドマイドではなく、化合物２が、低ＣＲＢＮタンパク質レベルを有するものを含む、レナリドマイド及びポマリドマイド抵抗性の多発性骨髄腫細胞株において抗増殖活性を呈することを、例示する。低ＣＲＢＮを有する獲得抵抗性のヒト多発性骨髄腫細胞株に対する抗増殖効果が、示される。細胞株を、（図１１Ａ）ポマリドマイドまたは（図１１Ｂ）化合物２で５日間治療し、ＩＣ５０値を、ＡＴＰ決定アッセイ（ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ）を使用して評価した。対照割合を、バックグラウンドを差し引き、ＤＭＳＯ対照（対照の１００％）に正規化することによって計算した。
【００７３】
【図１２】は、デキサメタゾン（ＤＥＸ）＋化合物２がアポトーシスを誘導することを、例示する。レナリドマイド抵抗性多発性骨髄腫細胞株（Ｈ９２９−１０５１）において、デキサメタゾンを単独で、または化合物２、レナリドマイドもしくはポマリドマイドと組み合わせて用いた７２時間治療後のアポトーシスの誘導を、カスパーゼ−Ｇｌｏ  ３／７を使用して測定した。
【００７４】
【図１３】最大３日間の毎日の短い化合物２曝露が、ＣＤ３４＋細胞においてＩｋａｒｏｓ分解を誘導することを、例示する。化合物２への毎日の短い曝露に続くＩｋａｒｏｓ分解を、フローサイトメトリーによって測定した。健康なドナー骨髄に由来するＣＤ３４＋細胞を、１４日目に開始して連続する１日間（１４日目）、２日間（１５日目）、または３日間（１６日目）、化合物２に２、４、及び６時間曝露した。Ｉｋａｒｏｓ含有量のパーセンテージ（ＤＭＳＯ対照に対して正規化された）が、示される。曝露期間の終わりに、化合物２を除去し、細胞を化合物２の非存在下でインキュベートした（回復期間）。Ｉｋａｒｏｓを、１９、２１、及び２３日目の回復中にフローサイトメトリーによって測定した。データは、２人のドナーの結果の平均として示される。
【００７５】
【図１４】連続する３日間の化合物２への６時間曝露に続くＩｋａｒｏｓの分解及び回復を、例示する。健康なドナーからのＣＤ３４＋骨髄由来細胞を、１０日目に開始して連続する３日間のそれぞれで、化合物２に６時間曝露した。ＤＭＳＯと比較したＩｋａｒｏｓ阻害のパーセンテージが、示される。培養物を、化合物２の非存在下で１３日目から２２日目までインキュベートした。Ｉｋａｒｏｓを、各曝露の完了後及び回復中の隔日に、フローサイトメトリーによって測定した。
【００７６】
【図１５】化合物２への連続５日間の６時間曝露に続くＩｋａｒｏｓの分解及び回復を、例示する。ＣＤ３４＋骨髄由来細胞を、１０日目に開始して連続する５日間のそれぞれで、化合物２へ曝露した。ＤＭＳＯ対照と比較したイカロス阻害のパーセンテージが、示される。培養物を、化合物２の非存在下で１５日目から２２日目までインキュベートした。Ｉｋａｒｏｓを、各曝露の完了後（１０〜１４日目）及び回復中の隔日（１７、２０、及び２２日目）に、フローサイトメトリーによって測定した。
【００７７】
【図１６】治療スキーム、及び化合物２への曝露後のＩｋａｒｏｓ阻害（点線）と好中球分化（実線）との間の相関を、例示する。（図１６Ａ）健康なドナーからのＣＤ３４＋骨髄由来細胞を、エクスビボで培養し、刺激して、ＩＶ期の成熟好中球へと発達させた。（図１６Ｂ）培養物を、３日間のそれぞれ（１０、１１、及び１２日目）で６時間、異なる濃度の化合物２へ曝露し、次いで、２２日目まで、化合物２へさらに曝露することなく培養した。１ｎＭ（正方形）、１０ｎＭ（上向きの三角形）、及び１００ｎＭ（下向きの三角形）の化合物２の曝露に続くＤＭＳＯ対照（円形）と比較したＩｋａｒｏｓ阻害のパーセンテージが、右のｙ軸（破線）に示される。ＩＶ期の細胞のパーセンテージが、左のｙ軸（実線）に示される。影付きの領域は、化合物２への曝露を伴う３日間を表す。
【００７８】
【図１７】化合物２が、ヒト末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を直接活性化して、濃度依存的様式でＫ５６２赤骨髄球性白血病細胞を溶解することを、例示する。（図１７Ａ）化合物２またはＤＭＳＯと共にプレインキュベートされているヒトＰＢＭＣと共培養されたＫ５６２細胞の代表的な蛍光活性化セルソーティングプロット。（図１７Ｂ）化合物２で治療されたＰＢＭＣとの共培養後のＫ５６２細胞におけるアポトーシス応答。アポトーシスを、化合物２で７２時間治療したＰＢＭＣと２４時間共培養した後、Ｋ５６２細胞でＰＩ及びアネキシンＶ染色によって測定した。データは平均として示され、エラーバーは平均の標準誤差を表す。
【００７９】
【図１８】免疫細胞が、化合物２によって直接活性化されて、レナリドマイド感受性及びレナリドマイド抵抗性の多発性骨髄腫細胞株を溶解することを、例示する。（図１８Ａ）化合物２で前治療されたＰＢＭＣとの２４時間共培養後のＮＣＩ−Ｈ９２９細胞におけるアポトーシス応答。（図１８Ｂ）化合物２で前治療されたＰＢＭＣとの２４時間共培養後のＨ９２９−１０５１細胞におけるアポトーシス応答。
【００８０】
【図１９】多発性骨髄腫細胞が共培養の前にレナリドマイド、ポマリドマイド、または化合物２で前治療される場合、化合物で予備刺激された免疫細胞が増強された腫瘍細胞死滅を示すことを、例示する。化合物で予備刺激された免疫細胞は、ＭＭ単一培養物（左）と比較して、（図１９Ａ）Ｈ９２９細胞、（図１９Ｂ）Ｈ９２９−１０５１細胞、（図１９Ｃ）ＯＰＭ２細胞、及び（図１９Ｄ）ＯＰＭ２  Ｐ１０細胞における共培養モデル（右）において、増強された腫瘍細胞死滅を示し、ＰＢＭＣ生存率（中央）に対する効果はほとんどない。
【００８１】
【図２０】化合物２が、７２時間で、レナリドマイドまたはポマリドマイドよりも、抗ＣＤ３抗体ビーズ刺激ＰＢＭＣからのインターロイキン−２産生の誘導に対してより大きな効力を実証することを、例示する。化合物２、レナリドマイド（ＬＥＮ）、またはポマリドマイド（ＰＯＭ）で７２時間治療した後の、抗ＣＤ３抗体ビーズ刺激ＰＢＭＣからのインターロイキン−２（ＩＬ−２）産生の誘導。
【００８２】
【図２１】化合物２がエフェクターサイトカインの強力な誘導因子であることを、例示する。化合物２、ポマリドマイド（ＰＯＭ）、またはレナリドマイド（ＬＥＮ）での２４時間の治療時のエフェクターサイトカイン誘導の測定。（図２１Ａ）ＩＬ−２、（図２１Ｂ）ＩＦＮ−γ、及び（図２１Ｃ）ＴＮＦ−α。示されているデータは、３人または４人のドナーからの平均であり、ＤＭＳＯ対照に対する変化倍率として表される。エラーバーは、平均の標準誤差（ＳＥＭ）を表す。
【００８３】
【図２２】化合物２がＣＤ４＋Ｔ細胞においてＩｋａｒｏｓの分解を誘導することを例示する。化合物２（ひし形）、レナリドマイド（ＬＥＮ、丸形）、またはポマリドマイド（ＰＯＭ、正方形）での（図２２Ａ）２４時間、（図２２Ｂ）４８時間、または（図２２Ｃ）７２時間の治療後のＣＤ４＋Ｔ細胞におけるＩｋａｒｏｓ分解の測定。示されているデータは、２人のドナーからの平均であり、ＤＭＳＯ対照に対して正規化されたＭＦＩとして表される。
【００８４】
【図２３】化合物２と組み合わせたデキサメタゾン（ＤＥＸ）が、抗ＣＤ３抗体刺激ＰＢＭＣからのインターロイキン−２（ＩＬ−２）産生を低減させることを例示する。（図２３Ａ）レナリドマイド（ＬＥＮ）単独もしくはデキサメタゾン併用後、（図２３Ｂ）ポマリドマイド（ＰＯＭ）単独もしくはデキサメタゾン併用後、または（図２３Ｃ）化合物２単独もしくはデキサメタゾン併用後の抗ＣＤ３抗体刺激ＰＢＭＣからのインターロイキン−２産生。
【００８５】
【図２４】化合物２が、（図２４Ａ）毎日１回（ＱＤ）１〜１０、１５〜２４／２８のスケジュールの後の、または（図２４Ｂ）毎日２回（ＢＩＤ）１〜３、１５〜１７／２８のスケジュールの後の、再発性／難治性の多発性骨髄腫患者の末梢血からのＣＤ３＋Ｔ細胞においてＡｉｏｌｏｓ分解を誘導することを例示する。
【００８６】
【図２５】化合物２が、（図２５Ａ）毎日１回（ＱＤ）１〜１０、１５〜２４／２８のスケジュールの後の、または（図２５Ｂ）毎日２回（ＢＩＤ）１〜３、１５〜１７／２８のスケジュールの後の、再発性／難治性の多発性骨髄腫患者の末梢血からのＣＤ３＋Ｔ細胞においてＩｋａｒｏｓ分解を誘導することを例示する。
【００８７】
【図２６】再発性／難治性の多発性骨髄腫患者からのＣＤ１３８＋形質細胞におけるバイオマーカー発現に対する化合物２の効果を例示する。（図２６Ａ）Ａｉｏｌｏｓ、（図２６Ｂ）Ｉｋａｒｏｓ、（図２６Ｃ）ＺＦＰ９１、（図２６Ｄ）ｃ−Ｍｙｃ、及び（図２６Ｅ）ＩＲＦ４。
【００８８】
【図２７】再発性／難治性の多発性骨髄腫患者における可溶性ＢＣＭＡ（ｓＢＣＭＡ）発現に対する化合物２の効果を例示する。
【００８９】
【図２８】再発性／難治性の多発性骨髄腫患者における血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）に対する化合物２の効果を例示する。
【発明を実施するための形態】
【００９０】
５．発明の詳細な説明
本明細書で提供される方法は、部分的に、生体試料中のある特定の分子（例えば、ｍＲＮＡ、ｃＤＮＡ、もしくはタンパク質）または悪性細胞（例えば、循環腫瘍細胞（ＣＴＣ））の変化したレベル、例えば、増加したレベル及び／または減少したレベルが、治療用化合物（例えば、化合物１、化合物２、化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログもしくは薬学的に許容される塩）に対するＭＭを有するまたは有する疑いのある対象の応答性を予測するために使用され得る、という発見に基づく。
【００９１】
５．１  定義
本明細書で使用される場合、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」及び「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語は、互換的に使用され得る。「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」及び「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語は、記載された特徴または成分の存在を参照されるように指定することとして解釈されるが、１つ以上の特徴もしくは成分、またはその群の存在または追加を妨げるものではない。追加的に、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」及び「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語は、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」という用語によって包含される例を含むことが意図される。したがって、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」という用語は、本発明のより特定の実施形態を提供するために、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」及び「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語の代わりに使用され得る。
【００９２】
「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」という用語は、対象物が、それを構成する少なくとも９０％、９５％、９７％、９８％、または９９％の記載された特徴または成分を有することを、意味する。別の実施形態では、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ）」という用語は、達成される技術的効果に不可欠ではないものを除いて、任意の後続の列挙の範囲から任意の他の特徴または成分を除外する。
【００９３】
本明細書で使用される場合、「または」という用語は、任意の１つまたは任意の組み合わせを意味する包括的な「または」として解釈される。したがって、「Ａ、Ｂ、またはＣ」は、以下、「Ａ、Ｂ、Ｃ、Ａ及びＢ、Ａ及びＣ、Ｂ及びＣ、Ａ、Ｂ及びＣ」のいずれかを意味する。この定義の例外は、要素、機能、ステップ、または行為の組み合わせが、なんらかの形で本質的に相互に排他的である場合にのみ生じる。
【００９４】
一般に、一実施形態の技術教示は、本明細書で提供される任意の他の実施形態に開示されるものと組み合わせられ得る。
【００９５】
本明細書で使用される場合、「がん」という用語は、固形がん及び血液由来がんを含むが、これらに限定されない。「がん」及び「がん性」という用語は、調節されていない細胞成長を典型的に特徴とする哺乳動物における生理学的状態を指すか、または説明する。がんは、造血器及びリンパ組織のがんであり得る。造血器悪性腫瘍は、血液、骨髄、リンパ、及びリンパ系に影響するがんを指す。
【００９６】
本明細書で使用される「多発性骨髄腫」は、悪性形質細胞を特徴とする血液学的状態を指し、以下の障害を含む：意義不明の単クローン性ガンマグロブリン血症（ＭＧＵＳ）；低リスク、中リスク、及び高リスクの多発性骨髄腫；新たに診断された多発性骨髄腫（低リスク、中リスク、及び高リスクの新たに診断された多発性骨髄腫を含む）；移植適格及び移植不適格の多発性骨髄腫；くすぶり型（無痛性）多発性骨髄腫（低リスク、中リスク、及び高リスクのくすぶり型多発性骨髄腫を含む）；活動性多発性骨髄腫；孤立性形質細胞腫；髄外性形質細胞腫；形質細胞白血病；中枢神経系多発性骨髄腫；軽鎖骨髄腫；非分泌性骨髄腫；免疫グロブリンＤ骨髄腫；ならびに免疫グロブリンＥ骨髄腫；及びサイクリンＤ転座などの遺伝的異常を特徴とする多発性骨髄腫（例えば、ｔ（４１１；１４）（ｑ１３；ｑ３２）；ｔ（６；１４）（ｐ２１；３２）；ｔ（１２；１４）（ｐ１３；ｑ３２））またはｔ（６，２０））；ＭＭＳＥＴ転座（例えば、ｔ（４；１４）（ｐ１６；ｑ３２））；ＭＡＦ転座（例えば、ｔ（１４；１６）（ｑ３２；ｑ３２）；ｔ（２０；２２）；ｔ（１６；２２）（ｑ１１；ｑ１３）；またはｔ（１４；２０）（ｑ３２；ｑ１１））；または他の染色体因子（例えば、１７ｐ１３または染色体１３の欠失；ｄｅｌ（１７／１７ｐ）、非高二倍性、及びｇａｉｎ（１ｑ））。
【００９７】
本明細書で使用される場合、別段示されない限り、「治療する」、「治療すること」及び「治療」という用語は、治療される疾患または状態、例えば、多発性骨髄腫に伴う症状の重症度を軽減または低減することを指す。
【００９８】
「予防」という用語は、特定の疾患または障害、例えば、多発性骨髄腫の症状の阻害を含む。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫の家族歴を有する患者は、予防レジメンの候補である。一般に、「予防すること」という用語は、特に多発性骨髄腫のリスクがある患者への、症状発生前の薬剤の投与を指す。
【００９９】
本明細書で使用される場合、別段示されない限り、「管理すること」という用語は、多発性骨髄腫などの特定の疾患または障害の再発を、それを患った患者において予防すること、疾患または障害を患った患者が寛解し続ける時間を延長すること、患者の死亡率を低減すること、及び／または管理されている疾患または状態に伴う症状の重症度の低減または回避を維持することを包含する。
【０１００】
本明細書で使用される場合、「対象」または「患者」は、動物、典型的に、ヒト患者などのヒトを含む哺乳動物である。
【０１０１】
本明細書に記載される場合、「健康な対象」という用語は、多発性骨髄腫を有しない任意の個体である。いくつかの実施形態では、「健康な対象」は、既存の医学的状態を有しない。
【０１０２】
本明細書で使用される場合、別段指定されない限り、化合物の「治療上有効な量」及び「有効量」は、疾患、例えば、多発性骨髄腫の治療、予防及び／もしくは管理に治療上の利点を提供するか、または治療される疾患もしくは障害に伴う１つ以上の症状を遅延させるか、もしくは最小化するのに十分な量を指す。「治療上有効な量」及び「有効量」という用語は、全体的な療法を改善する、疾患もしくは障害の症状もしくは病因を低減もしくは回避する、または別の治療剤の治療上の有効性を増強する量を包含できる。
【０１０３】
「応答性」または「応答する」という用語は、治療に関して使用される場合、治療されている疾患、例えば、ＭＭの症状を抑制または減少することにおける治療の有効性の程度を指す。例えば、「応答性の増加」という用語は、細胞または対象の治療に関して使用される場合、当技術分野で既知の任意の方法を使用して測定された場合、参照治療（例えば、同じ細胞もしくは対象の、または異なる細胞もしくは対象の）と比較して、疾患の症状を抑制または減少することにおける有効性の増加を指す。ある特定の実施形態では、有効性の増加は、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、または少なくとも約５０％である。
【０１０４】
化合物での治療に関してなされる場合の「感受性（ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ）」または「感受性（ｓｅｎｓｉｔｉｖｅ）」という用語は、治療されている腫瘍または疾患の進行を抑制または減少させることにおける化合物の有効性の程度を指す相対的な用語である。例えば、化合物に関連して細胞または腫瘍の治療に関して使用される場合の「感度の増加」という用語は、腫瘍治療の有効性の少なくとも約５％以上の増加を指す。
【０１０５】
「難治性」または「抵抗性」という用語は、患者が、集中的治療後でさえも、自身のリンパ系、血液及び／または造血組織（例えば、骨髄）に残存がん細胞（例えば、多発性骨髄腫細胞）を有する状況を指す。多発性骨髄腫の文脈において、「難治性または抵抗性」という用語は、患者が、集中的治療後でさえも、骨髄に残存骨髄腫細胞及び／または残存正常細胞を有する状況を指す。難治性疾患は、療法に対して非応答性である（最小奏効を達成できないか、または進行性疾患の発症）か、または最後の投与からおよそ６０日以内に進行する疾患であることが、理解される。
【０１０６】
「再発性」という用語は、療法後にがんの寛解があった患者が、自身のリンパ系、血液、及び／または造血組織（例えば、骨髄）におけるがん細胞（例えば、多発性骨髄腫細胞）の再発ならびに正常血液細胞の減少を有する状況を指す。
【０１０７】
がんまたはがん関連疾患の改善は、完全奏効（ＣＲ）または部分奏効（ＰＲ）として特徴づけることがでる。「完全奏効」は、以前に異常であったＸ線検査、骨髄、及び脳脊髄液（ＣＳＦ）、または異常なモノクローナルタンパク質測定値の正常化を伴う、臨床的に検出可能な疾患の非存在を指す。「部分奏効」は、新しい病変が存在せず、すべての測定可能な腫瘍量（すなわち、対象に存在する悪性細胞の数、または腫瘍塊の測定された体積もしくは異常なモノクローナルタンパク質の量）の少なくとも約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、または約９０％の減少を指す。「治療」という用語は、完全奏効及び部分奏効の両方を企図する。
【０１０８】
がんの文脈において、阻害は、とりわけ、疾患進行の阻害、腫瘍成長の阻害、原発性腫瘍の低減、腫瘍関連症状の軽減、腫瘍分泌因子の阻害、原発性または続発性腫瘍の出現の遅延、原発性または続発性腫瘍の発達の鈍化、原発性または続発性腫瘍の発生の減少、疾患の続発的効果の遅延またはその重症度の減少、腫瘍成長の停止及び腫瘍の退縮、無増悪期間（ＴＴＰ）の増加、無増悪生存期間（ＰＦＳ）の増加、全生存期間（ＯＳ）の増加によって評価され得る。ＯＳは、本明細書中で使用される場合、治療開始から任意の原因による死亡までの時間を意味する。ＴＴＰは、本明細書中で使用される場合、治療開始から腫瘍進行までの時間を意味する。ＴＴＰは、死亡を含まない。一実施形態では、ＰＦＳは、治療開始から腫瘍進行または死亡までの時間を意味する。一実施形態では、ＰＦＳは、化合物の最初の投与から、疾患進行の最初の発生または任意の原因による死亡までの時間を意味する。一実施形態では、ＰＦＳ率は、カプランマイヤー推定を使用して算出される。無事象生存期間（ＥＦＳ）は、治療開始から、疾患進行、任意の理由による治療中止、または死亡を含む、任意の治療失敗までの時間を意味する。一実施形態では、全奏効率（ＯＲＲ）は、奏効を達成した患者のパーセンテージを意味する。一実施形態では、ＯＲＲは、完全奏効及び部分奏効を達成した患者のパーセンテージの合計を意味する。一実施形態では、ＯＲＲは、ＩＭＷＧ  Ｕｎｉｆｏｒｍ  Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｃｒｉｔｅｒｉａに従って、自身の最良奏効が部分奏効（ＰＲ）以上である患者のパーセンテージを意味する。一実施形態では、奏効期間（ＤｏＲ）は、奏効を達成してから再発または疾患進行までの時間である。一実施形態では、ＤｏＲは、部分奏効（ＰＲ）以上の奏効を達成してから再発または疾患進行までの時間である。一実施形態では、ＤｏＲは、奏効が最初に文書で記録されてから進行性疾患または死亡が最初に文書で記録されるまでの時間である。一実施形態では、ＤｏＲは、部分奏効（ＰＲ）以上の奏効が最初に文書で記録されてから進行性疾患または死亡が最初に文書で記録されるまでの時間である。一実施形態では、奏効までの期間（ＴＴＲ）は、化合物の最初の投与から奏効が最初に文書で記録されるまでの時間を意味する。一実施形態では、ＴＴＲは、化合物の最初の投与から、部分奏効（ＰＲ）以上の奏効が最初に文書で記録されるまでの時間を意味する。極端な場合、完全阻害は、本明細書中で、予防または化学予防と称される。この文脈において、「予防」という用語は、臨床的に明らかながんの発生を完全に予防すること、または前臨床的に明白なステージのがんの発生を予防することのいずれかを含む。また、この定義によって包含されることを意図するのは、悪性細胞への形質転換の予防、または前悪性細胞から悪性細胞への進行の停止もしくは反転である。これは、がんを発症するリスクがあるものの予防的治療を含む。
【０１０９】
多発性骨髄腫の文脈において、奏効は、奏効及び微小残存病変評価についてのＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｍｙｅｌｏｍａ  Ｗｏｒｋｉｎｇ  Ｇｒｏｕｐ（ＩＭＷＧ）コンセンサス基準を使用して評価され得る（Ｒａｊｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ，２０１１，１１７（１８）：４６９１−５、Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｌａｎｃｅｔ  Ｏｎｃｏｌ．，２０１６，１７（８）：ｅ３２８−ｅ３４６）。基準は、以下のように要約され得る（さらなる詳細は、Ｌａｎｃｅｔ  Ｏｎｃｏｌ．，２０１６，１７（８）：ｅ３２８−ｅ３４６において入手可能である）。
【表１】
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2021525362.tif 000034
ＲＤ＝微小残存病変。ＮＧＦ＝次世代フロー。ＮＧＳ＝次世代シーケンシング。ＦＬＣ＝遊離軽鎖。Ｍタンパク質＝骨髄腫タンパク質。ＳＰＤ＝測定された病変の最大垂直直径の積和。ＣＲＡＢ特徴＝カルシウム上昇、腎不全、貧血、溶解性骨病変。ＦＣＭ＝フローサイトメトリー。ＳＵＶｍａｘ＝最大の標準化された取り込み値。１８Ｆ−ＦＤＧ  ＰＥＴ＝１８Ｆ−フルオロデオキシグルコースＰＥＴ。
【０１１０】
本明細書中で使用される場合、「導入療法」は、疾患に対して与えられる最初の治療、またはがんなどの疾患の完全寛解を誘導する目的で与えられる最初の治療を指す。導入療法は、単独で使用される場合、最良の利用可能な治療として受け入れられているものである。残存がんが検出された場合、患者は、再導入と呼ばれる別の化学療法コースで治療される。患者が導入療法後に完全寛解にある場合、追加的な地固め療法及び／または維持療法が、寛解を延長するか、または可能性として患者を治癒するために与えられる。
【０１１１】
本明細書中で使用される場合、「地固め療法」は、寛解が最初に達成された後、疾患に対して与えられる治療を指す。例えば、がんに対する地固め療法は、がんが最初の治療後に消失した後、与えられる治療である。地固め療法は、放射線療法、幹細胞移植、またはがん薬物療法を用いた治療を含み得る。地固め療法はまた、強化療法及び寛解後療法とも称される。
【０１１２】
本明細書中で使用される場合、「維持療法」は、寛解または最良の奏効が達成された後に、再発を予防するか、または遅延させるために、疾患に対して与えられる治療を指す。維持療法は、化学療法、ホルモン療法、または標的療法を含み得る。
【０１１３】
本明細書で使用される場合、「参照レベル」という用語は、個体からの試料中のバイオマーカーの試験レベルを評価するために使用されるバイオマーカーの対照レベルを意味することが意図される。参照レベルは、正常な対象からの試料中の正常な参照レベル、または疾患状態対象からの疾患参照レベルであり得る。正常参照レベルは、非疾患の１対象または複数の対象におけるバイオマーカーの発現量である。疾患状態参照レベルは、疾患または状態について陽性と診断された対象におけるバイオマーカーの発現量である。参照レベルはまた、ステージ特異的参照レベルであり得る。ステージ特異的参照レベルは、疾患または状態の進行の所定のステージに特徴的なバイオマーカーのレベルを指す。参照レベルはまた、治療前、または治療中の異なる時間でのバイオマーカーの発現量であり得る。例えば、参照レベルは、治療前の骨髄におけるバイオマーカーの発現量であり得る。別の例では、参照レベルは、治療中または治療後のある時点での血液中のバイオマーカーの発現であり得る。
【０１１４】
「可能性が高い」または「可能性」という用語は、事象の確率の増加を指す。患者の応答性に関して使用される場合の「可能性が高い」という用語は、一般に、患者が治療用化合物に応答するであろうという確率の増加を企図する。患者の応答性に関して使用される場合の「可能性が高い」という用語はまた、一般に、患者が治療用化合物に応答するであろうという確率の増加を証明できる、ｍＲＮＡまたはタンパク質発現などのバイオマーカーの増加を意味し得る。
【０１１５】
「予測する」または「予測すること」という用語は、本明細書で使用される場合、一般に、事前に決定するか、またはわかることを意味する。例えば、治療の応答性を「予測する」ために使用される場合、「予測すること」という用語は、がん治療に対して応答するか、または応答しない可能性が、開始時に、治療を開始する前に、または治療期間が実質的に進行する前に決定され得ることを意味できる。
【０１１６】
「モニタリング」または「モニタリングすること」という用語は、本明細書で使用される場合、一般に、活動の監視、監督、規制、見張り、追跡、または調査監視を指す。例えば、「化合物の有効性をモニタリングする」という用語は、患者または腫瘍細胞培養物においてがんを治療することにおける有効性を追跡することを指す。同様に、「モニタリング」という用語は、個人で、または臨床試験のいずれかにおいて患者のコンプライアンスに関連して使用される場合、患者が処方されたとおりに試験されている薬を実際に服用していることを追跡または確認することを指す。モニタリングは、例えば、ｍＲＮＡまたはタンパク質バイオマーカーの発現を追従することによって実行され得る。
【０１１７】
本明細書で使用される場合、「Ｔ細胞活性化」及び「活性化Ｔ細胞」という用語は、腫瘍細胞死を誘導することができるエフェクターＴ細胞への休止ナイーブＴ細胞の細胞活性化を意味することが意図される。Ｔ細胞活性化は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）／ＣＤ３複合体の抗原との相互作用によって開始され得る。例示的な活性化Ｔ細胞は、細胞増殖、サイトカイン分泌、及び／またはエフェクター機能を含むがこれらに限定されない細胞応答を呈する。本出願の文脈において、Ｔ細胞活性化は、化合物１、化合物２、または化合物３での治療によって誘導され得る。
【０１１８】
本明細書で使用される場合、「Ｔ細胞活性化関連サイトカイン」という用語は、活性化Ｔ細胞によって分泌される、またはその分泌が休止ナイーブＴ細胞と比較して活性化Ｔ細胞を増加させる、多数の因子のうちのいずれかを指す。Ｔ細胞活性化関連サイトカインの非限定的な例は、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、及びＴＮＦαを含む。
【０１１９】
「調節する」という用語は、本明細書で使用される場合、活性または機能を増強または減少させることなどの、分子または生物学的機能の活性を制御することを指す。
【０１２０】
「生物学的マーカー」または「バイオマーカー」は、その検出が、例えば、がんの存在などの特定の生物学的状態を示す物質である。例示的なバイオマーカーは、個別に決定され得る。いくつかのバイオマーカーが同時に測定され得ることが、理解される。当業者は、「バイオマーカー」が、治療に対する応答、または治療に対する患者の応答の可能性と相関し得るｍＲＮＡ発現のレベルの変化を示すことを、理解するであろう。バイオマーカーは、ｍＲＮＡまたはｃＤＮＡなどの核酸であり得る。バイオマーカーはまた、タンパク質であり得る。バイオマーカーの特定の例は、末梢血中を循環している１つ以上の腫瘍細胞（すなわち、循環腫瘍細胞、ＣＴＣ）である。バイオマーカーはまた、遺伝子の構造または配列の変化であって、ＤＮＡにおける単一の塩基単位の改変、または遺伝子もしくは染色体のより大きなセクションの欠失、挿入、または再配列によって引き起こされるバリアント形態を生じるものである。
【０１２１】
追加の例示的な「バイオマーカー」は、治療に対する応答、または治療に対する患者の応答の可能性と相関し得るポリペプチドまたはタンパク質発現のレベルの変化を示すものである。バイオマーカーは、ポリペプチドもしくはタンパク質、またはその断片であり得る。特定のタンパク質の相対的レベルは、当技術分野で既知の方法によって決定することができる。例えば、イムノブロット、酵素結合免疫吸着法（ＥＬＩＳＡ）などの抗体ベースの方法、または他の方法が使用され得る。
【０１２２】
「ポリペプチド」及び「タンパク質」という用語は、本明細書で互換的に使用される場合、ペプチド結合を通じて連結した、連続した配列にある３つ以上のアミノ酸のポリマーを指す。「ポリペプチド」という用語は、タンパク質、タンパク質断片、タンパク質類似体、オリゴペプチドなどを含む。「ポリペプチド」という用語はまた、本明細書で使用される場合、ペプチドを指すことができる。ポリペプチドを構成するアミノ酸は、天然由来であり得るか、または合成されたものであり得る。ポリペプチドは、生体試料から精製され得る。ポリペプチド、タンパク質またはペプチドはまた、修飾されたポリペプチド、タンパク質及びペプチド、例えば、糖ポリペプチド、糖タンパク質もしくは糖ペプチド、またはリポポリペプチド、リポタンパク質もしくはリポペプチドを包含する。
【０１２３】
「抗体」、「免疫グロブリン」、または「Ｉｇ」という用語は、本明細書で互換的に使用される場合、完全に組み立てられた抗体及び抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体断片を包含する。本明細書で提供される抗体は、合成抗体、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、組換え産生抗体、多重特異性抗体（二重特異性抗体を含む）、ヒト抗体、ヒト化抗体、キメラ抗体、イントラボディ、単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）（例えば、単一特異性、二重特異性などを含む）、ラクダ化抗体、Ｆａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）断片、ジスルフィド結合Ｆｖ（ｓｄＦｖ）、抗イディオタイプ（抗Ｉｄ）抗体、及び上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片を含むが、これらに限定されない。特に、本明細書で提供される抗体は、免疫グロブリン分子及び免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、ＣＲＢＮ抗原に免疫特異的に結合する抗原結合部位を含有する抗原結合ドメインまたは分子（例えば、抗ＣＲＢＮ抗体の１つ以上の相補性決定領域（ＣＤＲ））を含む。免疫グロブリンは、重鎖及び軽鎖から構成され得る。本明細書で提供される抗体は、免疫グロブリン分子の任意のクラス（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、及びＩｇＡ）、または任意のサブクラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、及びＩｇＡ２）のものであり得る。いくつかの実施形態では、抗ＣＲＢＮ抗体は、完全ヒトモノクローナルＣＲＢＮ抗体などの完全ヒトである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される抗体は、ＩｇＧ抗体、またはそのサブクラス（例えば、ヒトＩｇＧ１またはＩｇＧ４）である。他の実施形態では、本明細書で提供される抗体は、免疫グロブリン分子及び免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、カスパーゼ−３、ＢＣＭＡ、遊離カッパ軽鎖、または遊離ラムダ軽鎖に免疫特異的に結合する抗原結合部位を含有する、抗原結合ドメインまたは分子を含む。
【０１２４】
「免疫グロブリン軽鎖」または「軽鎖」という用語は、抗体の小さなポリペプチドサブユニットを指す。軽鎖は、ラムダ軽鎖またはカッパ軽鎖であり得る。軽鎖が重鎖に結合している場合、軽鎖は、「結合軽鎖」と呼ばれる。軽鎖が重鎖に結合していない場合、それらは、「遊離軽鎖（ＦＬＣ）」と呼ばれる。遊離軽鎖が患者の血清または血漿中に検出され得る場合、それらは、「血清遊離軽鎖」または「血漿遊離軽鎖」と呼ばれる。「血清遊離軽鎖」は「可溶性遊離軽鎖」とも呼ばれることが、さらに理解される。血清または血漿中の遊離軽鎖の量は、疾患が多発性骨髄腫である場合、疾病負荷の量に比例することが、当業者によって理解される。遊離軽鎖のレベル、または遊離軽ラムダに対する遊離軽カッパの比は、骨髄腫のモニタリングまたは診断のために使用され得ることも、理解される。例えば、化合物２で治療されている、多発性骨髄腫を有する患者の血清における遊離軽鎖カッパ対遊離軽鎖ラムダの以上に高いレベルの減少が、化合物２での治療の有効性をモニタリングするために使用され得る。同様に、レナリドマイドなどの異なる化合物で治療されている患者における遊離軽鎖の増加は、治療に対する抵抗性を示し得、化合物１、化合物２、または化合物３に対する応答の予測因子として役立つことができる。
【０１２５】
「抗原結合ドメイン」、「抗原結合領域」、「抗原結合断片」という用語、及び類似の用語は、抗原と相互作用し、抗原に対するその特異性及び親和性を結合剤に付与するアミノ酸残基を含む抗体の部分（例えば、ＣＤＲ）を指す。抗原結合領域は、げっ歯類（例えば、ウサギ、ラット、またはハムスター）及びヒトなどの任意の動物種に由来し得る。いくつかの実施形態では、抗原結合領域は、ヒト起源のものである。
【０１２６】
「エピトープ」という用語は、本明細書で使用される場合、抗体の１つ以上の抗原結合領域に結合することができ、哺乳動物（例えば、ヒト）などの動物において抗原性または免疫原性活性を有し、免疫応答を誘発することができる、抗原の表面上の局在領域を指す。免疫原性活性を有するエピトープは、動物において抗体応答を誘発するポリペプチドの部分である。抗原活性を有するエピトープは、当技術分野で周知の任意の方法、例えば、本明細書に記載のイムノアッセイによって決定されるように、抗体が免疫特異的に結合するポリペプチドの部分である。抗原性エピトープは、必ずしも免疫原性である必要がない。エピトープは、通常、アミノ酸または糖側鎖などの分子の化学的に活性な表面集団からなり、特定の三次元構造特徴ならびに特定の電荷特徴を有する。エピトープに寄与するポリペプチドの領域はポリペプチドの連続したアミノ酸であり得るか、またはエピトープはポリペプチドの２つ以上の隣接しない領域から一緒に由来し得る。エピトープは、抗原の三次元表面特徴であることもあれば、そうでない場合もある。
【０１２７】
「セレブロン」または「ＣＲＢＮ」という用語、及び同様の用語は、ヒトＣＲＢＮタンパク質（例えば、それぞれがその全体の参照によって本明細書に組み込まれる、ヒトＣＲＢＮアイソフォーム１、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＰ＿０５７３８６、またはヒトＣＲＢＮアイソフォーム２、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＮＰ＿００１１６６９５３、）などの任意のＣＲＢＮのアミノ酸配列を含むポリペプチド（「ポリペプチド」、「ペプチド」及び「タンパク質」は、本明細書では互換的に使用される）と、そのＳＮＰバリアントを含む、関連するポリペプチドと、を指す。関連するＣＲＢＮポリペプチドは、ある特定の実施形態において、ＣＲＢＮ活性を保持し、及び／または抗ＣＲＢＮ免疫応答を生成するのに十分であるアレルバリアント（例えば、ＳＮＰバリアント）、スプライスバリアント、断片、誘導体、置換バリアント、欠失バリアント、挿入バリアント、融合ポリペプチド、及び種間ホモログを含む。
【０１２８】
本明細書で使用される場合、「セレブロン関連タンパク質」または「ＣＡＰ」という用語は、直接または間接的に、セレブロン（ＣＲＢＮ）と相互作用するか、またはセレブロンに結合するタンパク質を指す。例えば、この用語は、セレブロンに直接結合する任意のタンパク質、ならびにＣＲＢＮ経路の間接的な下流エフェクターである任意のタンパク質を指す。例示的なＣＡＰは、ＣＲＢＮの基質、例えば、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１などのＣＲＢＮに関与するＥ３ユビキチンリガーゼ複合体のタンパク質基質、またはｃ−Ｍｙｃ、もしくはＩＲＦ４などのその下流エフェクタータンパク質である。
【０１２９】
本明細書で使用される場合、「セレブロンモジュレーター化合物」という用語は、ＣＲＢＮに結合し、その活性または基質特異性を改変する化合物を指す。例えば、セレブロンモジュレーター化合物の結合は、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ＩＲＦ４、またはｃ−ＭＹＣの分解を増加させ得る。例示的なセレブロンモジュレーター化合物は、レナリドマイド、ポマリドマイド、または類似の化合物であり得るが、これらに限定されない。
【０１３０】
本明細書で使用される場合、「変異」という用語は、バリアント（「変異体」とも呼ばれる）を生じる、遺伝子の構造の任意の変化を指す。遺伝子の変異は、ＤＮＡにおける単一塩基の改変、または遺伝子もしくは染色体のより大きなセクションの欠失、挿入、もしくは再配列によって引き起こされ得る。いくつかの実施形態では、変異は、機能または結果として生じるタンパク質に影響し得る。例えば、タンパク質のコード領域におけるＤＮＡの単一ヌクレオチドの変異（すなわち、点変異）は、異なるアミノ酸をコードするコドン（すなわち、ミスセンス変異）を生じ得る。この異なるアミノ酸は、化合物またはその誘導体がタンパク質に結合するか、及び／またはタンパク質を阻害することができないように、タンパク質の構造を改変し得る。
【０１３１】
「Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性」という用語は、所定の抗原に特異的なＴ細胞受容体を有するＴ細胞のクローンの開発を可能にするための、Ｔ細胞受容体遺伝子の生殖細胞系列構成の独特の構成への体細胞改変を指す。Ｔ細胞受容体遺伝子（アルファ、ベータ、デルタ、及びガンマ）は、体細胞的に再配列されて、ヘテロ二量体の細胞表面Ｔ細胞受容体を産生することができる。体細胞ＴＣＲ遺伝子再配列は、多様なクローン（ポリクローナル）の拡大、または単一のＴＣＲ再配列パターンを有するＴ細胞集団のモノクローナル拡大を生じ得る。ＴＣＲクローン性は、ＰＣＲ、サザンブロッティング、またはＴＣＲの配列決定（例えば、次世代シーケンシング）などの標準的な分子生物学的技法によって決定され得る。
【０１３２】
「可溶性」という用語は、細胞外空間（例えば、血清）にあり、細胞の表面上にない生体分子の形態を指す。「可溶性Ｂ細胞成熟抗原」、「可溶性ＢＣＭＡ（ｓＢＣＭＡ）」、「可溶性ＣＤ２５」、または「可溶性ＩＬ−２受容体（ｓＩＬ−２Ｒ）」という用語は、タンパク質の放出形態である可溶性タンパク質を指し、血清中に存在する。
【０１３３】
「発現される」または「発現」という用語は、本明細書で使用される場合、遺伝子の２本の核酸鎖のうちの１本の領域と少なくとも部分的に相補的であるＲＮＡ核酸分子を与える、遺伝子からの転写を指す。「発現される」または「発現」という用語はまた、本明細書で使用する場合、タンパク質、ポリペプチドまたはその一部を与える、ＲＮＡ分子からの翻訳を指す。
【０１３４】
「レベル」という用語は、バイオマーカー分子の量、蓄積、または速度を指す。レベルは、例えば、遺伝子によってコードされたメッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）の量もしくは合成速度、遺伝子によってコードされたポリペプチドもしくはタンパク質の量もしくは合成速度、または細胞もしくは生体液中に蓄積された生体分子の量もしくは合成速度によって表され得る。「レベル」という用語は、定常状態または非定常状態の条件下で決定された、試料中の分子の絶対量または分子の相対量を指す。
【０１３５】
「上方調節」されるｍＲＮＡは、一般に、所定の治療または条件下で増加する。「下方調節」されるｍＲＮＡは、一般に、所定の治療または条件に応答した、ｍＲＮＡの発現レベルの減少を指す。いくつかの状況では、ｍＲＮＡレベルは、所定の治療または条件の際に不変のままであり得る。患者試料からのｍＲＮＡは、薬物で治療された場合、無治療対照と比較して、「上方調節」され得る。この上方調節は、例えば、比較対照ｍＲＮＡレベルの、約５％、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約１００％、約２００％、約３００％、約５００％、約１，０００％、約５，０００％、またはそれ以上の増加であり得る。あるいは、ｍＲＮＡは、ある特定の化合物または他の薬剤の投与に応答して、「下方制御」され得る、すなわち、より低いレベルで発現され得る。下方調節されたｍＲＮＡは、例えば、比較対照ｍＲＮＡレベルの約９９％、約９５％、約９０％、約８０％、約７０％、約６０％、約５０％、約４０％、約３０％、約２０％、約１０％、約１％、またはそれ以下のレベルで存在し得る。
【０１３６】
同様に、患者試料からのポリペプチドまたはタンパク質バイオマーカーのレベルは、薬物で治療された場合、無治療対照と比較して、増加し得る。この増加は、比較対照タンパク質レベルの、約５％、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約１００％、約２００％、約３００％、約５００％、約１，０００％、約５，０００％、またはそれ以上であり得る。あるいは、タンパク質バイオマーカーのレベルは、ある特定の化合物または他の薬剤の投与に応答して、減少し得る。この減少は、例えば、ポリペプチドまたはタンパク質の比較対照レベルの約９９％、約９５％、約９０％、約８０％、約７０％、約６０％、約５０％、約４０％、約３０％、約２０％、約１０％、約１％、またはそれ以下のレベルで存在し得る。
【０１３７】
加えて、患者試料からのＣＴＣのレベルは、ある特定の化合物または他の薬剤の投与に応答して、減少し得る。この減少は、例えば、ＣＴＣの比較対照レベルの、約９９％、約９５％、約９０％、約８０％、約７０％、約６０％、約５０％、約４０％、約３０％、約２０％、約１０％、約１％、またはそれ以下のレベルで存在し得る。
【０１３８】
ＴＣＲのＤＮＡ配列、またはＴＣＲクローン性はまた、未治療の対照と比較して、薬物で治療された場合に増加し得る。体細胞ＴＣＲ遺伝子再配列は、多様なクローン（ポリクローナル）の拡大、または単一のＴＣＲ再配列パターンを有するＴ細胞集団のモノクローナル拡大を生じることができる。特定のクローンのこの増加は、比較対照ＴＣＲクローン性の、約５％、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、約１００％、約２００％、約３００％、約５００％、約１，０００％、約５，０００％、またはそれ以上であり得る。
【０１３９】
「決定すること」、「測定すること」、「評価すること（ｅｖａｌｕａｔｉｎｇ）」、「評価すること（ａｓｓｅｓｓｉｎｇ）」、及び「アッセイすること」という用語は、本明細書で使用される場合、一般に、任意の形態の測定を指し、要素が存在するかどうかを決定することを含む。これらの用語は、定量的及び／または定性的な決定を含む。評価することは、相対的または絶対的であり得る。「その存在を評価すること」は、存在するものの量を決定すること、ならびにそれが存在するか、または非存在であるかを決定することを含み得る。
【０１４０】
「核酸」及び「ポリヌクレオチド」という用語は、ヌクレオチド、例えば、デオキシリボヌクレオチドもしくはリボヌクレオチドからなる任意の長さのポリマー、または２つの天然に生じる核酸のものと類似した配列特異的様式で天然に生じる核酸とハイブリダイズできる、例えば、ワトソン・クリック塩基対相互作用に関与する、合成により製造された化合物を説明するために、本明細書で互換的に使用される。ポリヌクレオチド配列の文脈において本明細書で使用される場合、「塩基（ｂａｓｅｓ）」（または「塩基（ｂａｓｅ）」）という用語は、「ヌクレオチド（ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ）」（または「ヌクレオチド（ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）」）、すなわち、ポリヌクレオチドのモノマーサブユニットと同義である。「ヌクレオシド」及び「ヌクレオチド」という用語は、既知のプリン及びピリミジン塩基のみならず、修飾されている他の複素環式塩基を含有する部分も含むことが意図される。そのような修飾は、メチル化プリンまたはピリミジン、アシル化プリンまたはピリミジン、アルキル化リボースまたは他の複素環を含む。加えて、「ヌクレオシド」及び「ヌクレオチド」という用語は、従来のリボース及びデオキシリボース糖のみならず、他の糖を含有する部分も含む。修飾ヌクレオシドまたはヌクレオチドはまた、糖部分に対する修飾を含み、例えば、ヒドロキシル基のうちの１つ以上がハロゲン原子または脂肪族基で置き換えられているか、エーテルまたはアミンなどとして官能化されている。「類似体」は、模倣体、誘導体であるとして、類似の構造を有するとして、または他の似た用語として、文献で認識されている構造的特徴を有する分子を指し、例えば、非天然ヌクレオチドを組み込んでいるポリヌクレオチド、２’−修飾ヌクレオシドなどのヌクレオチド模倣体、ペプチド核酸、オリゴマーヌクレオシドホスホナート、及び保護基または連結部分などの置換基が付加されている任意のポリヌクレオチドを含む。
【０１４１】
「相補的」という用語は、ポリヌクレオチドの配列に基づく、ポリヌクレオチド間の特異的な結合を指す。本明細書で使用される場合、第１のポリヌクレオチド及び第２のポリヌクレオチドは、それらがストリンジェントな条件下でのハイブリダイゼーションアッセイにおいて互いに結合し合う場合、例えば、それらがハイブリダイゼーションアッセイにおいて所定のレベルまたは検出可能なレベルのシグナルを生み出す場合、相補的である。ポリヌクレオチドの部分は、それらが従来の塩基対規則（例えば、ＡはＴ（またはＵ）と対合し、ＧはＣと対合する）に従う場合、互いに相補的であるが、ミスマッチ、挿入または欠失した配列の小さな領域（例えば、約３塩基未満）は存在し得る。
【０１４２】
２つの核酸配列の文脈における「配列同一性」または「同一性」は、指定された比較ウィンドウにわたって最大一致のために整列した場合に同じである２つの配列における残基を指し、付加、欠失、及び置換を考慮できる。
【０１４３】
ポリヌクレオチドの文脈において、様々な文法形態の「実質的な同一性」または「相同」という用語は、一般に、ポリヌクレオチドが、参照配列と比較して、所望の同一性、例えば、少なくとも６０％の同一性、少なくとも７０％の同一性、少なくとも８０％の同一性、少なくとも９０％の同一性、及び少なくとも９５％の同一性を有する配列を含むことを意味する。ヌクレオチド配列が実質的に同一であるという別の指標は、２つの分子がストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズするかどうかである。
【０１４４】
「単離された」及び「精製された」という用語は、物質（ｍＲＮＡ、ＤＮＡ、またはタンパク質など）が、それが含まれる試料の相当部分を占めるように、すなわち、典型的に、その天然または未単離の状態で見いだされる物質の部分よりも大きいように、その物質を単離することを指す。典型的に、試料の相当部分は、例えば、試料の、約１％超、約２％超、約５％超、約１０％超、約２０％超、約５０％超、またはそれ以上、通常は最大約９０％〜１００％を含む。例えば、単離されたｍＲＮＡの試料は、典型的に、少なくとも約１％の総ｍＲＮＡを含み得る。ポリヌクレオチドを精製するための技法は、当技術分野で周知であり、例えば、ゲル電気泳動、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、フローソーティング、及び密度による沈降を含む。
【０１４５】
本明細書で使用される場合、「結合した」という用語は、直接的または間接的な結合を示す。化学的構造の文脈において、「結合した（ｂｏｕｎｄ）」（または「結合した（ｂｏｎｄｅｄ）」）は、２つの部分を直接連結するか、２つの部分を間接的に連結する（例えば、連結基または分子の任意の他の介在部分を介した）化学結合の存在を指し得る。化学結合は、共有結合、イオン結合、配位錯体、水素結合、ファンデルワールス相互作用もしくは疎水性スタッキングであり得るか、または複数のタイプの化学結合の特徴を呈し得る。ある特定の例では、「結合した」は、結合が直接的である実施形態と、結合が間接的である実施形態とを含む。
【０１４６】
「試料」という用語は、本明細書で使用される場合、典型的には、目的の１つ以上の成分を含有する、必然的ではないが、流体形態の物質または物質の混合物に関する。
【０１４７】
「生体試料」は、本明細書で使用される場合、生体組織もしくは体液由来の試料を含む、生物対象から得られた、インビボまたはインサイツで得られた、到達したか、または収集された試料を指す。生体試料はまた、前がん性またはがんの細胞または組織を含有する生物対象の領域からの試料を含む。そのような試料は、哺乳動物から単離された臓器、組織、及び細胞であり得るが、これらに限定されない。例示的な生体試料は、細胞溶解物、細胞培養物、細胞株、組織、口腔組織、胃腸組織、臓器、細胞小器官、生体液、血液試料、尿試料、皮膚試料などを含むが、これらに限定されない。好ましい生体試料は、全血、部分精製血液、ＰＢＭＣ、及び骨髄コア生検、骨髄穿刺液、単離された骨髄単核細胞、循環腫瘍細胞などを含む組織生検を含むが、これらに限定されない。
【０１４８】
「循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）」という用語は、本明細書で使用される場合、骨髄中の腫瘍細胞から脱落した、末梢血中に検出される多発性骨髄腫細胞を指す。いくつかの実施形態では、ＣＴＣは、応答及び予後のためのバイオマーカーとして役立ち得る。他の実施形態では、ＭＭにおけるＣＴＣの変異の展望は、バイオマーカーであり得る。
【０１４９】
「分析物」という用語は、本明細書で使用される場合、試料の既知または未知の成分を指す。
【０１５０】
「捕捉物質」という用語は、本明細書で使用される場合、薬剤が均質な混合物からのｍＲＮＡまたはタンパク質と結合し、かつそれを濃縮されることを可能にするのに十分である相互作用を通じて、ｍＲＮＡまたはタンパク質と結合する薬剤を指す。
【０１５１】
「プローブ」という用語は、本明細書で使用される場合、特異的標的ｍＲＮＡバイオマーカー配列を対象とする捕捉物質を指す。したがって、プローブセットの各プローブは、それぞれの標的ｍＲＮＡバイオマーカーを有する。プローブ／標的ｍＲＮＡ二本鎖は、プローブをその標的ｍＲＮＡバイオマーカーにハイブリダイズさせることによって形成される構造である。
【０１５２】
「核酸プローブ」または「オリゴヌクレオチドプローブ」という用語は、通常、水素結合を形成することによる相補的塩基対合を通じて、本明細書で提供されるｍＲＮＡバイオマーカーなどの相補的配列の標的核酸に結合することができる核酸を指す。本明細書で使用される場合、プローブは、天然塩基（例えば、Ａ、Ｇ、ＣまたはＴ）または修飾塩基（７−デアザグアノシン、イノシンなど）を含み得る。加えて、プローブ内の塩基は、それがハイブリダイゼーションに干渉しない限り、ホスホジエステル結合以外の結合によって連結され得る。プローブは、ハイブリダイゼーション条件のストリンジェンシーに応じて、プローブ配列との完全な相補性を欠く標的配列と結合できることが、当業者によって理解されるであろう。プローブは、好ましくは、タグ、例えば、発色団、発光団、色素源で直接標識されるか、またはストレプトアビジン複合体が後に結合できるビオチンで間接的に標識され得る。プローブの有無についてアッセイすることによって、目的の標的ｍＲＮＡバイオマーカーの有無を検出できる。
【０１５３】
「ストリンジェントなアッセイ条件」という用語は、アッセイにおいて所望のレベルの特異性を提供するのに十分に相補的な核酸の結合対、例えば、プローブ及び標的ｍＲＮＡの結合対を産生するのに適合する一方で、所望の特異性を提供するのに十分に相補的でない結合メンバーの間の結合対の形成に対して一般に不適合である条件を指す。「ストリンジェントなアッセイ条件」という用語は、一般に、ハイブリダイゼーション条件と洗浄条件との組み合わせを指す。
【０１５４】
核酸に関する「標識」または「検出可能な部分」は、核酸と連結した場合、例えば、分光学的手段、光化学的手段、生化学的手段、免疫化学的手段または化学的手段によって、核酸を検出可能にする組成物を指す。例示的な標識は、放射性同位体、磁気ビーズ、金属ビーズ、コロイド粒子、蛍光色素、酵素、ビオチン、ジゴキシゲニン、ハプテンなどを含むが、これらに限定されない。「標識された核酸またはオリゴヌクレオチドプローブ」は、一般に、核酸またはプローブの存在が、核酸またはプローブに結合した標識の存在を検出することによって検出され得るように、リンカーもしくは化学結合のいずれかを通じた共有結合、またはイオン結合、ファンデルワールス力、静電引力、疎水性相互作用、もしくは水素結合のいずれかを通じた非共有結合によって標識に結合したものである。
【０１５５】
「ポリメラーゼ連鎖反応」または「ＰＣＲ」という用語は、本明細書で使用される場合、一般に、例えば、米国特許第４，６８３，１９５号に記載されるように、少量の核酸、ＲＮＡ及び／またはＤＮＡが増幅される手順を指す。一般に、オリゴヌクレオチドプライマーが設計され得るように、目的の領域の末端からのまたはそれを超えた配列情報が、利用可能である必要がある。これらのプライマーは、増幅される鋳型の反対側の鎖と同一または類似の配列であろう。２つのプライマーの５’末端ヌクレオチドは、増幅された物質の末端と一致し得る。ＰＣＲは、特定のＲＮＡ配列、全ゲノムＤＮＡからの特定のＤＮＡ配列、及び全細胞ＲＮＡから転写されたｃＤＮＡ、バクテリオファージ配列、またはプラスミド配列などを増幅するために使用され得る。概要については、Ｍｕｌｌｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｓｙｍｐ．Ｑｕａｎｔ．Ｂｉｏｌ．１９８７，５１：２６３−２７３；ＰＣＲ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（Ｓｔｏｃｋｔｏｎ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ，Ｅｒｌｉｃｈ，ｅｄ．，１９８９）を参照されたい。
【０１５６】
「サイクル数」または「ＣＴ」という用語は、本明細書でＰＣＲ法に関して使用される場合、蛍光レベルが所定の設定閾値レベルを超えるＰＣＲサイクル数を指す。ＣＴ測定は、例えば、元の試料のｍＲＮＡレベルを概算するために使用され得る。ＣＴ測定は、しばしば「ｄＣＴ」または「ＣＴの差異」スコアの観点において使用され、その際、１つの核酸のＣＴが別の核酸のＣＴから減算される。
【０１５７】
本明細書で使用される場合、「化合物」及び「治療用化合物」という用語は、互換的に使用され、化合物１、化合物２、化合物３、またはそれらのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログまたは薬学的に許容される塩を含む。
【０１５８】
「互変異性体」は、本明細書で使用される場合、互いに平衡状態にある、化合物の異性体形態を指す。異性体形態の濃度は、化合物が見いだされる環境に依存し、例えば、化合物が固体であるか、または有機溶液もしくは水溶液中にあるのかどうかということに応じて異なり得る。例えば、水溶液中では、ピラゾールは、以下の異性体形態を呈することができ、これらは、互いの互変異性体と称される：
【化２８】
2021525362.tif 000035
【０１５９】
本明細書で使用され、別段示されない限り、「薬学的に許容される塩」という用語は、限定されないが、Ｎ，Ｎ’−ジベンジルエチレンジアミン、クロロプロカイン、コリン、アンモニア、ジエタノールアミン及び他のヒドロキシアルキルアミン、エチレンジアミン、Ｎ−メチルグルカミン、プロカイン、Ｎ−ベンジルフェネチルアミン、１−パラ−クロロベンジル−２−ピロリジン−１’−イルメチル−ベンズイミダゾール、ジエチルアミン及び他のアルキルアミン、ピペラジン及びトリス（ヒドロキシメチル）アミノメタンなどのアミン塩、限定されないが、リチウム、カリウム及びナトリウムなどのアルカリ金属塩、限定されないが、バリウム、カルシウム及びマグネシウムなどのアルカリ土類金属塩、限定されないが、亜鉛などの遷移金属塩、ならびに限定されないが、リン酸水素ナトリウム及びリン酸二ナトリウムなどの他の金属塩を含み、また、限定されないが、塩酸塩及び硫酸塩などの鉱酸の塩、ならびに限定されないが、酢酸塩、乳酸塩、リンゴ酸塩、酒石酸塩、クエン酸塩、アスコルビン酸塩、コハク酸塩、酪酸塩、吉草酸塩、フマル酸塩及び有機スルホン酸塩などの有機酸の塩を含む。
【０１６０】
別段記載されない限り、化合物が、代替の互変異性体、位置異性体、及び／または立体異性体形態をとり得る場合、すべての代替異性体は、特許請求される対象物の範囲内に包含されることが意図される。例えば、化合物が２つの互変異性体形態のうち１つを有することができる場合、両方の互変異性体が本明細書中に包含されることが意図される。
【０１６１】
したがって、本明細書で提供される化合物は、鏡像異性的に純粋であり得るか、または立体異性体もしくはジアステレオマー混合物であり得る。本明細書で使用される場合、別段示されない限り、「立体異性体的に純粋」という用語は、化合物の１つの立体異性体を含み、その化合物の他の立体異性体を実質的に含まない組成物を意味する。例えば、１つのキラル中心を有する化合物の立体異性体的に純粋な組成物は、化合物の逆のエナンチオマーを実質的に含まないであろう。２つのキラル中心を有する化合物の立体異性体的に純粋な組成物は、化合物の他のジアステレオマーを実質的に含まないであろう。典型的な、立体異性体的に純粋な化合物は、その化合物の１つの立体異性体を約８０重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約２０重量％未満、より好ましくは、その化合物の１つの立体異性体を約９０重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約１０重量％未満、さらにより好ましくは、その化合物の１つの立体異性体を約９５重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約５重量％未満、ならびに最も好ましくは、その化合物の１つの立体異性体を約９７重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約３重量％未満含む。立体異性体的に純粋な化合物は、本明細書で使用される場合、その化合物の１つの立体異性体を約８０重量％超、より好ましくは、その化合物の１つの立体異性体を約９０重量％超、さらにより好ましくは、その化合物の１つの立体異性体を約９５重量％超、及び最も好ましくは、その化合物の１種の立体異性体を約９７重量％超含む。本明細書で使用される場合、別段示されない限り、「立体異性体的に富化された」という用語は、化合物の１つの立体異性体を約６０重量％超、好ましくは、約７０重量％超、より好ましくは、化合物の１つの立体異性体を約８０重量％超含む組成物を意味する。本明細書で使用される場合、別段示されない限り、「鏡像異性的に純粋」という用語は、１つのキラル中心を有する化合物の立体異性体的に純粋な組成物を意味する。同様に、「立体異性体的に富化された」という用語は、１つのキラル中心を有する化合物の立体異性体的に富化された組成物を意味する。本明細書で使用される場合、立体異性体またはジアステレオマー混合物は、化合物の２つ以上の立体異性体を含む組成物を意味する。化合物の典型的な立体異性体混合物は、その化合物の１つの立体異性体を約５０重量％、及びその化合物の他の立体異性体を約５０重量％含むか、またはその化合物の１つの立体異性体を約５０重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約５０重量％未満含むか、またはその化合物の１つの立体異性体を約４５重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約５５重量％未満含むか、またはその化合物の１つの立体異性体を約４０重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約６０重量％未満含むか、またはその化合物の１つの立体異性体を約３５重量％超、及びその化合物の他の立体異性体を約６５重量％未満を含む。
【０１６２】
本明細書で提供される化合物はキラル中心を含有できることを、理解されたい。そのようなキラル中心は、（Ｒ）もしくは（Ｓ）構成のいずれかであり得るか、またはそれらの混合物であり得る。本明細書で提供される化合物のキラル中心はインビボでエピマー化を受ける場合があることを、理解されたい。したがって、当業者は、（Ｒ）形態の化合物の投与が、インビボでエピマー化を受ける化合物について、（Ｓ）形態の化合物の投与と同等であることを認識するであろう。
【０１６３】
光学的に活性な（＋）及び（−）、（Ｒ）及び（Ｓ）、または（Ｄ）及び（Ｌ）異性体は、キラルシントンもしくはキラル試薬を使用して調製され得るか、またはキラル定常相に対するクロマトグラフィーなどの従来の技法を使用して分割され得る。
【０１６４】
本明細書の記載において、化学名と化学構造との間になんらかの不一致がある場合、構造が優先される。
【０１６５】
化合物が１つ以上の原子で非天然の割合の原子同位体を含有できることにも、留意されたい。例えば、化合物は、例えば、三重水素（３Ｈ）、ヨウ素１２５（１２５Ｉ）、硫黄３５（３５Ｓ）、もしくは炭素１４（１４Ｃ）などの放射性同位体で放射標識され得るか、または重水素（２Ｈ）、炭素１３（１３Ｃ）、もしくは窒素１５（１５Ｎ）などで同位体的に富化され得る。本明細書で使用される場合、「アイソトポログ（ｉｓｏｔｏｐｏｌｏｇ）」または「アイソトポログ（ｉｓｏｔｏｐｏｌｏｇｕｅ）」は、同位体的に富化された化合物である。「同位体的に富化された」という用語は、その原子の天然の同位体組成とは異なる同位体組成を有する原子を指す。「同位体的に富化された」はまた、原子の天然の同位体組成とは異なる同位体組成を有する少なくとも１つの原子を含有する化合物を指すことができる。「同位体組成」という用語は、所定の原子について存在する各同位体の量を指す。放射標識及び同位体的に富化された化合物は、治療剤、例えば、がん及び炎症治療剤、研究試薬、例えば、結合アッセイ試薬、ならびに診断薬剤、例えば、インビボ造影剤として有用である。本明細書に記載される化合物のすべての同位体変形は、放射性であるか否かにかかわらず、本明細書で提供される実施形態の範囲内に包含されることが意図される。いくつかの実施形態では、化合物のアイソトポログが提供され、例えば、アイソトポログは、重水素、炭素１３、または窒素１５に富む化合物である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるアイソトポログは、重水素に富む化合物である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される同位体は、重水素に富む化合物であり、重水素化はキラル中心で起こる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、化合物１の化合物のアイソトポログであり、重水素化はキラル中心で起こる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、化合物２のアイソトポログであり、重水素化はキラル中心で起こる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、化合物３のアイソトポログであり、重水素化はキラル中心で起こる。
【０１６６】
示される構造とその構造に与えられた名称との間に不一致がある場合、示される構造に優先順位が与えられることに、留意されたい。加えて、構造または構造の一部の立体化学が、例えば、太字または破線で示されていない場合、構造または構造の一部は、そのすべての立体異性体を包含するものと解釈される。
【０１６７】
本明細書に記載される場合、「第２の活性剤」という用語は、生物学的に活性である任意の追加的な治療を指す。第２の活性剤は、造血成長因子、サイトカイン、抗がん剤、抗生物質、ｃｏｘ−２阻害剤、免疫調節剤、免疫抑制剤、コルチコステロイド、がん抗原に特異的に結合する治療抗体、またはその薬理学的に活性な変異体もしくは誘導体であり得ることが、理解される。
【０１６８】
「支持ケア療法剤」という用語は、化合物１、化合物２または化合物３、あるいはそのエナンチオマーまたはエナンチオマー、互変異性体、アイソトポログもしくは薬学的に許容される塩の混合物での治療からの有害作用を治療、予防または管理する任意の物質を指す。「サポートケア療法」という用語は、主に患者の体力及び／または快適さを維持することに向けられる任意の治療剤を指すことが、理解される。例示的なサポートケア療法は、疼痛管理、静脈内輸液、及び等張食塩水、ブドウ糖食塩水、または平衡晶質液などの電解質支持のための療法を含むが、これらに限定されない。
【０１６９】
「生物学的療法」という用語は、臍帯血、幹細胞、成長因子などの生物学的治療剤の投与を指す。
【０１７０】
「共投与」及び「組み合わせて」という用語は、１つ以上の治療剤（例えば、本明細書で提供される化合物、及び別の抗多発性骨髄腫剤、抗がん剤または支持ケア剤）を、同時に、一斉に、または特定の時間制限なく順次のいずれかで投与することを含む。一実施形態では、薬剤は、細胞または患者の体に同時に存在するか、または生物学的効果もしくは治療効果を同時に及ぼす。一実施形態では、治療剤は、同じ組成物または単位剤形中にある。別の実施形態では、治療剤は、別の組成物または単位剤形中にある。
【０１７１】
本明細書で使用される場合、「免疫特異的に結合する」、「免疫特異的に認識する」、「特異的に結合する」、及び「特異的に認識する」という用語は、抗体の文脈における類似の用語であり、抗原／エピトープに結合する分子を指す。それは、そのような結合は当業者によって理解されるからである。標的構造またはそのサブユニットに特異的に結合する抗体は、標的構造ファミリー外の生体分子と交差反応しない。いくつかの実施形態では、抗体または抗体断片は、１０−７Ｍ、１０−８Ｍ、１０−９Ｍ、１０−１０Ｍ、または１０−１１Ｍより高い、１０−８Ｍ〜１０−１１Ｍ、１０−９Ｍ〜１０−１０Ｍ、または１０−１０Ｍ〜１０−１１Ｍの特異的親和性で選択された抗原に結合する。例えば、抗原に特異的に結合する分子（例えば、抗体）は、例えば、イムノアッセイ、または当技術分野で既知の他のアッセイによって決定される場合、一般に、より低い親和性で他のペプチドまたはポリペプチドに結合し得る。特定の実施形態では、抗原に特異的に結合する分子は、他のタンパク質と交差反応しない。
【０１７２】
本明細書に記載される場合、「検出可能な標識」という用語は、タンパク質の検出または単離／精製を助けるための抗体への特定のタグの付加を指す。標識のタイプの例は、放射性同位元素、フルオロフォア（例えば、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、フィコエリトリン（ＰＥ））、化学発光、酵素レポーター、及び元素粒子（例えば、金粒子）を含むが、これらに限定されない。検出は、直接的または間接的であり得る。光学的方法は、顕微鏡法（共焦点及び非共焦点の両方）、画像化法、及び非画像化法を含む。電気化学的方法は、ボルタンメトリー法及び電流測定法を含む。無線周波数法は、多極共鳴分光法を含む。
【０１７３】
「約」または「およそ」という用語は、当業者によって決定される特定の値についての許容誤差を意味し、これは、値がどのように測定または決定されるかに部分的に依存する。ある特定の実施形態では、「約」または「およそ」という用語は、１、２、３または４標準偏差内であることを意味する。ある特定の実施形態では、「約」または「およそ」という用語は、所定の値または範囲の５０％、２０％、１５％、１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％、０．５％または０．０５％内であることを意味する。
【０１７４】
本明細書で提供される実施形態の実践は、別段示されていない限り、当業者の技術の範囲内である、分子生物学、微生物学、及び免疫学の従来の技法を用いるであろう。そのような技法は、文献中で充分に説明されている。参考のための特に好適なテキストの例は、以下を含む：Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（２ｄ  ｅｄ．１９８９）、Ｇｌｏｖｅｒ，ｅｄ．，ＤＮＡ  Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ｖｏｌｕｍｅｓ  Ｉ  ａｎｄ  ＩＩ（１９８５）、Ｇａｉｔ，ｅｄ．，Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（１９８４）、Ｈａｍｅｓ  ＆  Ｈｉｇｇｉｎｓ，ｅｄｓ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ（１９８４）、Ｈａｍｅｓ  ＆  Ｈｉｇｇｉｎｓ，ｅｄｓ．，Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  ａｎｄ  Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ（１９８４）、Ｆｒｅｓｈｎｅｙ，ｅｄ．，Ａｎｉｍａｌ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅ：Ｉｍｍｏｂｉｌｉｚｅｄ  Ｃｅｌｌｓ  ａｎｄ  Ｅｎｚｙｍｅｓ（ＩＲＬ  Ｐｒｅｓｓ，１９８６）、Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｃｅｌｌ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｌｏｎｄｏｎ）、Ｓｃｏｐｅｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎ  Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ  Ｖｅｒｌａｇ，Ｎ．Ｙ．，２ｄ  ｅｄ．１９８７）、及びＷｅｉｒ  ＆  Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ，ｅｄｓ．，Ｈａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌｕｍｅｓ  Ｉ−ＩＶ（１９８６）。
【０１７５】
５．２  バイオマーカー及びその使用方法
本明細書で提供される方法は、部分的に、化合物治療時のある特定のバイオマーカーの検出可能な増加または減少が、所定の治療、例えば、以下のセクション５．７で説明される化合物１、化合物２、もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログもしくは薬学的に許容される塩などの化合物に応答する、ＭＭを有する対象において観察されるという発見、ならびにこれらのバイオマーカーのレベルが、治療に対する対象の応答性を予測するために使用され得るという発見に基づく。いくつかの実施形態では、バイオマーカーのレベルは、化合物１、化合物２、または化合物３に対する応答を予測することができる。いくつかの実施形態では、化合物は、本明細書に記載される通りである。ある特定の実施形態では、化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。一実施形態では、化合物は、化合物１である。別の実施形態では、化合物は、化合物２である。さらに別の実施形態では、化合物は、化合物３である。
【０１７６】
一態様によれば、本発明は、本明細書で提供される疾患を治療、予防、及び／または管理する方法における使用のための化合物１、化合物２または化合物３に関する。
【０１７７】
セクション６の実施例で説明され、図に示されるように、ある特定のタンパク質、分子、ｍＲＮＡ、または細胞組成物のレベルは、化合物１、化合物２、または化合物３での治療に応答して変化する。これらのバイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、Ｂｃｌ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲｂ１、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγ、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）、Ｔ細胞抗原受容体（ＴＣＲ）クローン性、及び循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）を含む。加えて、実施例及び図は、ある特定のタンパク質の発現が化合物１、化合物２、または化合物３での治療後に変化し、治療への応答を予測するための、及び／または化合物１、化合物２、または化合物３での治療に応答する可能性が高い患者を選択するためのバイオマーカーとして役立つことができることを示す。これらのバイオマーカーは、ＣＲＢＮを含む。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるバイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、Ｂｃｌ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲｂ１、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγ、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）、Ｔ細胞抗原受容体（ＴＣＲ）クローン性、及び循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）からなる群から選択される。本明細書で提供されるバイオマーカーのそれぞれは、様々なアイソフォーム、リン酸化形態、切断形態、修飾形態、及びそれらのスプライシングバリアントを含む。例えば、カスパーゼ−３は切断形態のカスパーゼ−３を含み、カスパーゼ−１は切断形態のカスパーゼ−１を含み、カスパーゼ−７は切断形態のカスパーゼ−７を含み、ＰＡＲＰは切断型ＰＡＲＰを含み、ｐＲｂ１はリン酸化ｐＲｂ１を含む。したがって、いくつかの実施形態では、これらのバイオマーカーのアイソフォーム、リン酸化形態、切断形態、修飾形態、及び／またはスプライシングバリアントのレベルは、化合物治療に応答して増加または減少し、したがって、バイオマーカーのこれらのアイソフォーム、リン酸化形態、切断形態、修飾形態、及び／またはスプライシングバリアントは、患者の応答を予測するために使用され得る。
【０１７８】
ＩＫＡＲＯＳファミリージンクフィンガー１（ＩＫＺＦ１、Ｉｋａｒｏｓとしても知られる）及びＩＫＡＲＯＳファミリージンクフィンガー３（ＩＫＺＦ３、Ａｉｏｌｏｓとしても知られる）は、リンパ球発達の調節に関与する造血器特異的転写因子である。ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３の発現は、胎児及び成人の血リンパ球新生系に制限されており、リンパ球分化の調節因子として機能する。遺伝子発現の調節は、Ｉｋａｒｏｓホモ二量体、Ｉｋａｒｏｓ／Ａｉｏｌｏｓヘテロ二量体、及びＡｉｏｌｏｓホモ二量体に関与する。ヒトＩｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの複数のアイソフォームは、正常Ｂ細胞と白血病Ｂ細胞の両方で見いだされている。非ＤＮＡ結合アイソフォームは、主に細胞質に見いだされ、ドミナントネガティブ因子として機能すると考えられている。いくつかのドミナントネガティブアイソフォームの過剰発現は、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）などのＢ細胞悪性腫瘍に関連している。
【０１７９】
カスパーゼ−１、−３、及び−７は、カスパーゼファミリーのメンバーである。カスパーゼ−３は、カスパーゼ−７、ならびにカスパーゼ−６、及び−９を切断及び活性化する。カスパーゼ７の切断は、細胞死の刺激時に起こり、アポトーシスを誘導する。カスパーゼ−３自体は、カスパーゼ−８、−９、及び−１０によって処理される。エフェクターカスパーゼであるカスパーゼ−３、−６、及び−７は、細胞内タンパク質の宿主をタンパク質分解的に分解して、細胞アポトーシスを実施する。カスパーゼ−３は、アポトーシスシグナル伝達事象が起こった後、イニシエーターカスパーゼによって切断されるまで、実質的に活性を有しない。同様に、Ｐｒｏ−カスパーゼ−１は、切断時に活性なカスパーゼ−１に変換され、カスパーゼ−１はまた、いくつかの形態のアポトーシスに関与する。加えて、ポリ（ＡＤＰ−リボース）ポリメラーゼ（ＰＡＲＰ）は、カスパーゼによって切断され得る。例えば、ＰＡＲＰは、アポトーシス中にカスパーゼ−３によって切断されることが知られている。ＰＡＲＰは、分化、増殖、腫瘍の形質転換などの、様々な重要な細胞プロセスを調節することに関与するタンパク質のファミリーである。ＰＡＲＰはまた、ＤＮＡ損傷からの細胞回復に関与する分子事象を調節する。カスパーゼ活性化は、サバイビンによって阻害され得、それによってアポトーシスを予防する。アポトーシスの促進に関与する別のタンパク質は、Ｂｃｌ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）である。アポトーシスはまた、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）によって促進され得る。したがって、いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−１（ｃ−カスパーゼ−１）、切断型カスパーゼ−３（ｃ−カスパーゼ−３）、切断型カスパーゼ−７（ｃ−カスパーゼ−７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、及び血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）は、アポトーシスを示すバイオマーカーである。
【０１８０】
本明細書で提供される様々な方法のある特定の実施形態では、バイオマーカーは、例えば、タンパク質間相互作用（例えば、ある特定のＣＲＢＮ基質またはその下流エフェクター）を通じて、または様々な細胞経路（例えば、シグナル伝達経路）を通じて、セレブロン（ＣＲＢＮ）によって直接または間接的に影響されるタンパク質である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ関連タンパク質（ＣＡＰ）である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質のｍＲＮＡである。他の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質のｃＤＮＡである。タンパク質ＣＲＢＮの少なくとも２つのアイソフォームが存在し、それぞれ４４２アミノ酸長及び４４１アミノ酸長である。
【０１８１】
実施例で説明されるように、化合物１〜３での治療は、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４のレベルを減少させる（例えば、図４）。したがって、ＣＲＢＮ関連タンパク質のレベルを検出することは、有効性をモニタリングすること、応答を予測すること、応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定すること、がんを治療すること、治療用化合物に対する応答である可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定すること、及び多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整することにおいて、役立つことができる。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＣＲＢＮ関連タンパク質であり、治療用化合物は化合物１である。他の実施形態では、バイオマーカーはＣＲＢＮ関連タンパク質であり、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＣＲＢＮ関連タンパク質であり、治療用化合物は化合物３である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４からなる群から選択されるＣＲＢＮ関連タンパク質である。ある特定の特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４からなる群から選択されるＣＲＢＮ関連タンパク質であり、治療用化合物は化合物１である。ある特定の特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４からなる群から選択されるＣＲＢＮ関連タンパク質であり、治療用化合物は化合物２である。ある特定の特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４からなる群から選択されるＣＲＢＮ関連タンパク質であり、治療用化合物は化合物３である。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１またはＩＫＺＦ３などのＩＫＡＲＯＳファミリーメンバージンクフィンガー転写因子である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は化合物１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は化合物２である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は化合物３である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は化合物１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は化合物２である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は化合物３である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＺＦＰ９１であり、治療用化合物は化合物１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩ  ＺＦＰ９１であり、治療用化合物は化合物２である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＺＦＰ９１であり、治療用化合物は化合物３である。さらに別の特定の実施形態では、バイオマーカーはｃ−Ｍｙｃであり、治療用化合物は化合物１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはｃ−Ｍｙｃであり、治療用化合物は化合物２である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはｃ−Ｍｙｃであり、治療用化合物は化合物３である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＲＦ４であり、治療用化合物は化合物１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＲＦ４であり、治療用化合物は化合物２である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＲＦ４であり、治療用化合物は化合物３である。他の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、またはＩＲＦ４の結合パートナー、その下流エフェクター、またはそれによって影響される細胞経路における因子である。
【０１８３】
実施例で説明されるように、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、及びｓＦＬＣなどのアポトーシス経路におけるタンパク質のレベルは、治療用化合物１〜３と共に変化する。例えば、化合物１〜３での治療は、多発性骨髄腫細胞中のｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ−１、ｃ−カスパーゼ−７、切断型ＰＡＲＰ、ＢＩＭ、及びｓＦＬＣのレベルを増加でき、それによってアポトーシスを示す。化合物１〜３での治療はまた、サバイビンのレベルを減少でき、それによってアポトーシスを示す。アポトーシスを検出することは、有効性をモニタリングすること、応答を予測すること、応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定すること、がんを治療すること、治療用化合物に対する応答である可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定すること、及び多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整することにおいて、役立つことができる。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシス経路において機能を有する。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはアポトーシス経路において機能を有し、治療用化合物は化合物１である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはアポトーシス経路において機能を有し、治療用化合物は化合物２である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはアポトーシス経路において機能を有し、治療用化合物は化合物３である。
【０１８４】
特定の実施形態では、バイオマーカーはアポトーシス経路において機能を有し、切断型カスパーゼ１（ｃ−カスパーゼ１）、切断型カスパーゼ３（ｃ−カスパーゼ３）、切断型カスパーゼ７（ｃ−カスパーゼ７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ  ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、及び血清遊離軽鎖からなる群から選択される。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシス経路において機能を有し、切断型カスパーゼ１（ｃ−カスパーゼ１）、切断型カスパーゼ３（ｃ−カスパーゼ３）、切断型カスパーゼ７（ｃ−カスパーゼ７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ  ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、及び血清遊離軽鎖からなる群から選択され、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシス経路において機能を有し、切断型カスパーゼ１（ｃ−カスパーゼ１）、切断型カスパーゼ３（ｃ−カスパーゼ３）、切断型カスパーゼ７（ｃ−カスパーゼ７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ  ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、及び血清遊離軽鎖からなる群から選択され、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシス経路において機能を有し、切断型カスパーゼ１（ｃ−カスパーゼ１）、切断型カスパーゼ３（ｃ−カスパーゼ３）、切断型カスパーゼ７（ｃ−カスパーゼ７）、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ  ＢＣＬ−２様タンパク質１１（ＢＩＭ）、及び血清遊離軽鎖からなる群から選択され、治療用化合物は化合物３である。特定の実施形態では、切断型カスパーゼ−３を含むカスパーゼ−３のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−３を含むカスパーゼ−３のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−３を含むカスパーゼ−３のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−１を含むカスパーゼ−１のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−１を含むカスパーゼ−１のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−１を含むカスパーゼ−１のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−７を含むカスパーゼ−７のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−７を含むカスパーゼ−７のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−７を含むカスパーゼ−７のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、切断型カスパーゼ−７を含むカスパーゼ−７のレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。いくつかの実施形態では、切断型ＰＡＲＰを含むＰＡＲＰのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形���では、切断型ＰＡＲＰを含むＰＡＲＰのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、切断型ＰＡＲＰを含むＰＡＲＰのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。いくつかの実施形態では、サバイビンのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、サバイビンのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、サバイビンのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。いくつかの実施形態では、ＢＩＭのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、ＢＩＭのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、ＢＩＭのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。加えて、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）及びＣＴＣのレベルの変化は、治療用化合物１〜３と共に変化する。例えば、化合物１〜３での治療は、血液または血清／血漿中に検出されるｓＦＬＣの量を減少できる。したがって、いくつかの実施形態では、ｓＦＬＣはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、ｓＦＬＣはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、ｓＦＬＣはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。同様に、化合物１〜３での治療は、末梢血中に検出されるＣＴＣの量を減少できる。したがって、いくつかの実施形態では、末梢血中のＣＴＣのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、末梢血中のＣＴＣのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、末梢血中のＣＴＣのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。化合物１〜３での治療はまた、多発性骨髄腫患者からの血清中に検出される可溶性ＢＣＭＡ（ｓＢＣＭＡ）の量を減少できる。したがって、いくつかの実施形態では、ｓＢＣＭＡのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、ｓＢＣＭＡのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、ｓＢＣＭＡのレベルはバイオマーカーであり、治療用化合物は化合物３である。
【０１８５】
末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼｄＵＴＰニックエンドラベリング（ＴＵＮＥＬ）は、アポトーシス中に生成された二本鎖ＤＮＡ切断において３’−ヒドロキシル末端を標識することによってＤＮＡ断片化を検出するための方法である。それは、当技術分野で既知の一般的な方法である（Ｄａｒｚｙｎｋｉｅｗｉｃｚ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ，２００８，４４（３）：２５０−２５４）。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＴＵＮＥＬによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＴＵＮＥＬによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＴＵＮＥＬによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物３である。
【０１８６】
アポトーシスはまた、アネキシンＶ及び７−ＡＡＤ、またはアネキシンＶ及びヨウ化プロピジウム（ＰＩ）によって測定され得る。アネキシンＶ（またはアネキシンＡ５）は、カルシウム依存的様式でホスファチジルセリン（ＰＳ）に結合する細胞内タンパク質のアネキシンファミリーのメンバーである。ＰＳは、通常、健康な細胞において原形質膜の細胞内リーフレット上でのみ見いだされるが、初期アポトーシス中に、膜の非対称性は失われ、ＰＳは外部リーフレットに移動する。次いで、蛍光色素標識アネキシンＶは、アポトーシス細胞を特異的に標的とし、特定するために使用され得る。アネキシンＶ結合は、単独で、アポトーシス細胞と壊死細胞とを区別できない。壊死細胞とアポトーシス細胞とを区別するのに役立てるために、７−アミノ−アクチノマイシンＤ（７−ＡＡＤ）またはＰＩ溶液が、使用され得る。初期アポトーシス細胞は７−ＡＡＤ及びＰＩを除外する一方で、後期のアポトーシス細胞及び壊死細胞は、それらがＤＮＡに結合する核へのこれらの色素の通過により、陽性染色されるであろう。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーはアネキシンＶ／７−ＡＡＤによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはアネキシンＶ／７−ＡＡＤによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはアネキシンＶ／７−ＡＡＤによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物３である。他の実施形態では、バイオマーカーは、アネキシンＶ／ＰＩによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物１である。さらに別の実施形態では、バイオマーカーは、アネキシンＶ／ＰＩによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アネキシンＶ／ＰＩによるアポトーシスの検出であり、治療用化合物は化合物３である。
【０１８７】
いくつかの実施形態では、免疫応答の調節を検出することは、有効性をモニタリングすること、応答を予測すること、応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定すること、がんを治療すること、治療用化合物に応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定すること、及び多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整することにおいて、役立つことができる。例えば、以下のセクション６における実施例は、治療用化合物１〜３を用いた、共培養モデルにおける増強されたＴ細胞媒介性腫瘍細胞溶解（実施例１１）、エフェクターＴ細胞の活性化（実施例１２）、Ｔ細胞の活性化及び増殖（実施例１６）を説明している。したがって、いくつかの実施形態では、Ｔ細胞活性化は、化合物１での治療のためのバイオマーカーであり得る。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞活性化は、化合物２での治療のためのバイオマーカーであり得る。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞活性化は、化合物３での治療のためのバイオマーカーであり得る。
【０１８８】
いくつかの特定の実施形態では、Ｔ細胞活性化は、治療用化合物での治療のためのバイオマーカーであり得、バイオマーカーは、インターロイキン−２（ＩＬ−２）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）、インターフェロンガンマ（ＩＦＮγ）、及びＴ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性からなる群から選択される。例えば、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、化合物１〜３での治療後のＴ細胞受容体（ＴＣＲ）クローン性である。いくつかの特定の実施形態では、ＴＣＲクローン性はバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物１である。いくつかの特定の実施形態では、ＴＣＲクローン性はバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物２である。いくつかの特定の実施形態では、ＴＣＲクローン性はバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物３である。
【０１８９】
さらに、サイトカインの放出は、Ｔ細胞機能の多くの側面にとって中心的に重要である。例えば、ＩＬ−２は、活性化Ｔ細胞の長期成長に不可欠である強力なＴ細胞成長因子である。ＴＮＦα及びＩＦＮγなどの他のサイトカインの分泌は、腫瘍細胞を死滅させる際のエフェクターＴ細胞機能を促進できる。したがって、サイトカインを検出することは、Ｔ細胞活性化を示すことができる。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＩＬ−２であり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＩＬ−２であり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＩＬ−２であり、治療用化合物は化合物３である。他の実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＴＮＦαであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＴＮＦαであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＴＮＦαであり、治療用化合物は化合物３である。さらに別の実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＩＦＮγであり、治療用化合物は化合物１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＩＦＮγであり、治療用化合物は化合物２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーはＩＦＮγであり、治療用化合物は化合物３である。
【０１９０】
循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）は、多発性骨髄腫の予後を示し、末梢血からの関連する変異の特定を含むＣＴＣの特徴付けは、疾病負荷を示すことができ、治療への応答を予測し得る（Ｍｉｓｈｉｍａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｅｌｌ  Ｒｅｐ．，２０１７，１９（１）：２１８−２２４、Ｌｏｈｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉ  Ｔｒａｎｓｌ  Ｍｅｄ．，２０１６，；８（３６３）：３６３ｒａ１４７）。したがって、いくつかの実施形態では、末梢血中のＣＴＣはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物１、化合物２、または化合物３である。いくつかの特定の実施形態では、末梢血中のＣＴＣはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物１である。いくつかの特定の実施形態では、末梢血中のＣＴＣはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物２である。いくつかの特定の実施形態では、末梢血中のＣＴＣはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物３である。他の実施形態では、ＣＴＣの変異プロファイルは、化合物１、化合物２、または化合物３での治療に対する応答を予測するためのバイオマーカーであり得る。いくつかの特定の実施形態では、ＣＴＣの変異プロファイルはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物１である。いくつかの特定の実施形態では、ＣＴＣの変異プロファイルはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物２である。いくつかの特定の実施形態では、ＣＴＣの変異プロファイルはバイオマーカーであり得、治療用化合物は化合物３である。
【０１９１】
がん細胞における細胞周期の進行を阻害することは、がんの進行を予防する効果的な手段であり得る。実施例６で説明されるように、化合物２は、多発性骨髄腫細胞においてＧ１細胞周期停止及びアポトーシスを誘導できる。細胞周期経路のメンバーを検出することは、有効性をモニタリングすること、応答を予測すること、応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定すること、がんを治療すること、治療用化合物に対する応答である可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定すること、及び多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整することにおいて、役立つことができる。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、細胞周期経路において機能を有する。ある特定の特定の実施形態では、バイオマーカーは細胞周期経路において機能を有し、治療用化合物は化合物１である。他の特定の実施形態では、バイオマーカーは細胞周期経路において機能を有し、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは細胞周期経路において機能を有し、治療用化合物は化合物３である。
【０１９２】
ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、細胞周期経路において機能を有し、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１（ｐ２１）、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１Ｂ（ｐ２７）、及び網膜芽細胞腫タンパク質（ｐＲｂ１）からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１（ｐ２１）、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１Ｂ（ｐ２７）、及び網膜芽細胞腫タンパク質（ｐＲｂ１）からなる群から選択され、治療用化合物は化合物１である。他の実施形態では、バイオマーカーは、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１（ｐ２１）、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１Ｂ（ｐ２７）、及び網膜芽細胞腫タンパク質（ｐＲｂ１）からなる群から選択され、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１（ｐ２１）、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子１Ｂ（ｐ２７）、及び網膜芽細胞腫タンパク質（ｐＲｂ１）からなる群から選択され、治療用化合物は化合物３である。特定の実施形態では、バイオマーカーはｐ２１であり、治療用化合物は化合物１である。他の実施形態では、バイオマーカーはｐ２１であり、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーはｐ２１であり、治療用化合物は化合物３である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはｐ２７であり、治療用化合物は化合物１である。他の実施形態では、バイオマーカーはｐ２７であり、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーはｐ２７であり、治療用化合物は化合物３である。特定の実施形態では、バイオマーカーはｐＲｂ１であり、治療用化合物は化合物１である。他の実施形態では、バイオマーカーはｐＲｂ１であり、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーはｐＲｂ１であり、治療用化合物は化合物３である。
【０１９３】
セクション６の実施例で説明されるように、治療用化合物は、細胞が、低減したが検出可能なレベルのＣＲＢＮを有する場合でさえも、レナリドマイド及びポマリドマイドなどのセレブロンモジュレーターに対する獲得抵抗性を有する多発性骨髄腫細胞の増殖を阻害できる（実施例８）。したがって、いくつかの実施形態では、低減したレベルのＣＲＢＮは、治療用化合物に応答する可能性が高いと対象を診断するためのバイオマーカーであり、治療用化合物は、化合物１である。他の実施形態では、低減したレベルのＣＲＢＮは、治療用化合物に応答する可能性が高いと対象を診断するためのバイオマーカーであり、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の実施形態では、低減したレベルのＣＲＢＮは、治療用化合物に応答する可能性が高いと対象を診断するためのバイオマーカーであり、治療用化合物は、化合物３である。治療用化合物に対する多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法のいくつかの実施形態では、方法は、試料中のバイオマーカーが検出可能である場合、治療用化合物に応答する可能性が高いと対象を診断することを含む。いくつかの特定の実施形態では、ＭＭは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である。一実施形態では、ＭＭは、レナリドマイド抵抗性ＭＭである。別の実施形態では、ＭＭは、ポマリドマイド抵抗性ＭＭである。
【０１９４】
バイオマーカーはまた、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整するのに有用であり得る。例えば、治療用化合物での治療後にＩＫＺＦ１などのバイオマーカーの増加を検出することは、対象がより頻繁な投与または延長した期間の治療を必要とすることを示すことができる。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整するためのものであり、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択される。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択され、治療用化合物は化合物１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択され、治療用化合物は化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択され、治療用化合物は化合物３である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は化合物１である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は化合物２である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は化合物３である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は化合物１である。他の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は化合物２である。さらに他の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は化合物３である。
【０１９５】
いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、１つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、１つ以上のバイオマーカーを含む。ある特定の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、２つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、２つ以上のバイオマーカーを含む。他の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、３つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、３つ以上のバイオマーカーを含む。ある特定の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、４つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、４つ以上のバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、５つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、５つ以上のバイオマーカーを含む。他の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、６つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、６つ以上のバイオマーカーを含む。さらに他の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、７つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されるバイオマーカーは、７つ以上のバイオマーカーを含む。ある特定の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、８つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、８つ以上のバイオマーカーを含む。他の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、９つのバイオマーカーを含む。いくつかの実施形態では、測定されたバイオマーカーは、９つ以上のバイオマーカーを含む。別の実施形態では、測定されたバイオマーカーは、１０個以上のバイオマーカーを含む。
【０１９６】
また、本明細書で提供されるのは、バイオマーカー、例えば、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、またはＴＣＲクローン性を、本明細書で提供される化合物に対する予測因子または予後因子として使用する、がんの治療または管理のための方法である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、本明細書で提供される１つ以上のバイオマーカー、例えば、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、またはＴＣＲクローン性のレベルを、予測因子または予後因子として使用する、化合物での治療のための複数の多発性骨髄腫患者をスクリーニングまたは特定するための方法である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、バイオマーカー（例えば、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、またはＴＣＲクローン性）レベルを予測因子または予後因子として使用して、本明細書で提供される化合物での療法に対してより高い応答率を有する患者を選択するための方法である。ある特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。一実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の実施形態では、化合物は、化合物２である。別の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０１９７】
一態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化２９】
2021525362.tif 000036
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０１９８】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化３０】
2021525362.tif 000037
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０１９９】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化３１】
2021525362.tif 000038
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２００】
本発明の別の態様では、対象に投与されている治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である。
【０２０１】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化３２】
2021525362.tif 000039
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０２】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化３３】
2021525362.tif 000040
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０３】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化３４】
2021525362.tif 000041
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０４】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０５】
別の実施形態では、対象が治療用化合物に応答する可能性が高いと診断された場合、本明細書で提供される方法は、治療上有効な量の治療用化合物を対象に投与することをさらに含む。
【０２０６】
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化３５】
2021525362.tif 000042
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化３６】
2021525362.tif 000043
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化３７】
2021525362.tif 000044
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２０９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩であって、がんを治療する方法は、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含む、
がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である。
【０２１０】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、方法は、治療用化合物を投与するステップを含むか、またはさらに含む。他の実施形態では、本明細書で提供されるのは、本明細書で提供される方法を使用して選択された患者を選択的に治療するための方法である。
【０２１１】
本明細書で提供される方法の一実施形態は、患者に化合物１、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む、本明細書に記載のバイオマーカーに基づいて選択される多発性骨髄腫患者を治療することを含む。
【０２１２】
本明細書で提供される方法の別の実施形態は、患者に化合物２、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む、本明細書に記載のバイオマーカーのレベルに基づいて選択される多発性骨髄腫患者を治療する方法をさらに含む。
【０２１３】
本明細書で提供される方法のさらに別の実施形態では、患者に化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む、本明細書に記載のバイオマーカーのレベルに基づいて選択される多発性骨髄腫患者を治療する方法をさらに含む。
【０２１４】
本明細書で提供される方法の別の実施形態では、本明細書で提供される化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を患者に投与することを含む、本明細書に記載のバイオマーカーのレベルに基づいて選択される患者における多発性骨髄腫を予防する方法をさらに含む。
【０２１５】
本明細書で提供される方法のさらに別の実施形態では、本明細書で提供される化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を患者に投与することを含む、本明細書に記載のバイオマーカーのレベルに基づいて多発性骨髄腫を管理する方法をさらに含む。
【０２１６】
本明細書で提供される方法の一実施形態は、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、本明細書に記載のバイオマーカーのレベルに基づいて患者のＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｕｎｉｆｏｒｍ  Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｃｒｉｔｅｒｉａ  ｆｏｒ  Ｍｕｌｔｉｐｌｅ  Ｍｙｅｌｏｍａ（ＩＵＲＣ）（Ｄｕｒｉｅ  ＢＧ，ｅｔ  ａｌ．，Ｌｅｕｋｅｍｉａ，２００６，２０（９）：１４６７−７３を参照されたい）で評価された治療応答を誘導するための方法をさらに含む。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者においてＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｕｎｉｆｏｒｍ  Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｃｒｉｔｅｒｉａ  ｆｏｒ  Ｍｕｌｔｉｐｌｅ  Ｍｙｅｌｏｍａ（ＩＵＲＣ）によって決定された、ストリンジェントな完全奏効、完全奏効、または非常に良好な部分奏効を達成するための方法である。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者において全生存期間、無増悪生存期間、無事象生存期間、無増悪期間、または無病生存期間の増加を達成するための方法である。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者において全生存期間の増加を達成するための方法である。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者において無増悪生存期間の増加を達成するための方法である。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者において無事象生存期間の増加を達成するための方法である。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もし��は薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者において無増悪期間の増加を達成するための方法である。別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、有効量の本明細書に記載の化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を多発性骨髄腫を有する患者に投与することを含む、患者において無病生存期間の増加を達成するための方法である。
【０２１７】
また、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫に対して以前に治療されているが、標準療法に対して非応答性である患者、ならびに以前に治療されていない患者を治療することをさらに含む方法である。さらに包含されるのは、多発性骨髄腫を治療しようとして手術を受けたことがある患者、ならびに受けたことがない患者を治療する方法である。また、本明細書で提供されるのは、以前に移植療法を受けたことがある患者、ならびに受けたことがない患者を治療する方法である。
【０２１８】
本明細書で提供される方法のいくつかの実施形態は、再発性、難治性、または抵抗性である多発性骨髄腫の治療をさらに含む。本明細書で提供される方法は、再発性、難治性、または抵抗性である多発性骨髄腫の予防を含む。本明細書で提供される方法は、再発性、難治性、または抵抗性である多発性骨髄腫の管理を含む。いくつかのそのような実施形態では、骨髄腫は、原発性、続発性、三次性、四重または五重に再発した多発性骨髄腫である。一実施形態では、本明細書で提供される方法は、微小残存病変（ＭＲＤ）を低減、維持、または排除する。一実施形態では、本明細書で提供される方法は、治療上有効な量の本明細書に記載の化合物を投与することによる、意義不明の単クローン性ガンマグロブリン血症（ＭＧＵＳ）、低リスク、中リスク、及び高リスクの多発性骨髄腫、新たに診断された多発性骨髄腫（低リスク、中リスク、及び高リスクの新たに診断された多発性骨髄腫を含む）、移植適格及び移植不適格の多発性骨髄腫、くすぶり型（無痛性）多発性骨髄腫（低リスク、中リスク、及び高リスクのくすぶり型多発性骨髄腫を含む）、活動性多発性骨髄腫、孤立性形質細胞腫、髄外性形質細胞腫、形質細胞白血病、中枢神経系多発性骨髄腫、軽鎖骨髄腫、非分泌性骨髄腫、免疫グロブリンＤ骨髄腫、ならびに免疫グロブリンＥ骨髄腫などの様々なタイプの多発性骨髄腫を、治療、予防、及び管理することを包含する。別の実施形態では、本明細書で提供される方法は、治療上有効な量の本明細書に記載の化合物を投与することによる、サイクリンＤ転座（例えば、ｔ（４１１；１４）（ｑ１３；ｑ３２）；ｔ（６；１４）（ｐ２１；３２）；ｔ（１２；１４）（ｐ１３；ｑ３２）；またはｔ（６；２０））；ＭＭＳＥＴ転座（例えば、ｔ（４；１４）（ｐ１６；ｑ３２））；ＭＡＦ転座（例えば、ｔ（１４；１６）（ｑ３２；ｑ３２）；ｔ（２０；２２）；ｔ（１６；２２）（ｑ１１；ｑ１３）；またはｔ（１４；２０）（ｑ３２；ｑ１１））；または他の染色体因子（例えば、１７ｐ１３または染色体１３の欠失；ｄｅｌ（１７／１７ｐ）、非高二倍性、及びｇａｉｎ（１ｑ））などの、遺伝的異常を特徴とする多発性骨髄腫を治療、予防または管理することを包含する。一実施形態では、方法は、治療上有効な量の化合物１、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む。別の実施形態では、方法は、治療上有効な量の化合物２、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む。別の実施形態では、方法は、治療上有効な量の化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む。
【０２１９】
一実施形態では、高リスクの多発性骨髄腫は、第１の治療の１２か月以内に再発する多発性骨髄腫である。さらに別の実施形態では、高リスクの多発性骨髄腫は、遺伝的異常、例えば、１つ以上のｄｅｌ（１７／１７ｐ及びｔ（１４；１６）（ｑ３２；ｑ３２）を特徴とする多発性骨髄腫である。
【０２２０】
いくつかのそのような実施形態では、多発性骨髄腫は、移植適格の新たに診断された多発性骨髄腫である。別の実施形態では、多発性骨髄腫は、移植不適格の新たに診断された多発性骨髄腫である。さらに他の実施形態では、多発性骨髄腫は、初期治療に続く早期進行（例えば、１２か月未満）を特徴とする。さらに他の実施形態では、多発性骨髄腫は、自家幹細胞移植に続く早期進行（例えば、１２か月未満）を特徴とする。別の実施形態では、多発性骨髄腫は、ポマリドマイドに対して難治性である。いくつかのそのような実施形態では、多発性骨髄腫は、ポマリドマイドに対して難治性であると予測される（例えば、分子特徴付けによって）。別の実施形態では、多発性骨髄腫は、３つ以上の治療に対して再発性または難治性であり、プロテアソーム阻害剤（例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、イキサゾミブ、オプロゾミブ、またはマリゾミブ）及び免疫調節化合物（例えば、サリドマイド、レナリドマイド、及びポマリドマイド）へ曝露されたか、またはプロテアソーム阻害剤及び免疫調節化合物に対して二重難治性である。さらに他の実施形態では、多発性骨髄腫は、例えば、ＣＤ３８モノクローナル抗体（ＣＤ３８  ｍＡｂ、例えば、ダラツムマブまたはイサツキシマブ）、プロテアソーム阻害剤（例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、イキサゾミブ、またはマリゾミブ）、及び免疫調節化合物（例えば、サリドマイド、レナリドマイド、及びポマリドマイド）を含む３つ以上の前の治療に対して再発性または難治性であるか、またはプロテアソーム阻害剤もしくは免疫調節化合物及びＣＤ３８  ｍＡｂに対して二重難治性である。さらに他の実施形態では、多発性骨髄腫は三重難治性であり、例えば、多発性骨髄腫は、本明細書に記載されるように、プロテアソーム阻害剤（例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、イキサゾミブ、オプロゾミブまたはマリゾミブ）、免疫調節化合物（例えば、サリドマイド、レナリドマイド、及びポマリドマイド）、及び１つの他の活性剤に対して難治性である。
【０２２１】
本明細書で提供される方法のある特定の実施形態は、腎機能障害と共に再発性／難治性の多発性骨髄腫を有する患者に、治療上有効な量の化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む、腎機能障害またはその症状を有する患者における再発性／難治性の多発性骨髄腫を含む多発性骨髄腫を、治療、予防、及び／または管理する方法をさらに含む。
【０２２２】
本明細書で提供される方法のある特定の実施形態は、多発性骨髄腫を有する虚弱な患者に、治療上有効な量の化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することを含む、虚弱な患者における再発性または難治性多発性骨髄腫またはその症状を含む多発性骨髄腫を、治療、予防、及び／または管理する方法をさらに含む。いくつかのそのような実施形態では、虚弱な患者は、導入療法に対する不適応性、またはデキサメタゾン治療に対する不耐性を特徴とする。いくつかのそのような実施形態では、虚弱な患者は、例えば、６５歳より高齢な高齢者である。
【０２２３】
ある特定の実施形態では、化合物の治療上または予防上有効な量は、約約０．０１〜約２５ｍｇ／日、約０．０１〜約１０ｍｇ／日、約０．０１〜約５ｍｇ／日、約０．０１〜約２ｍｇ／日、約０．０１〜約１ｍｇ／日、約０．０１〜約０．５ｍｇ／日、約０．０１〜約０．２５ｍｇ／日、約０．１〜約２５ｍｇ／日、約０．１〜約１０ｍｇ／日、約０．１〜約５ｍｇ／日、約０．１〜約２ｍｇ／日、約０．１〜約１ｍｇ／日、約０．１〜約０．５ｍｇ／日、約０．１〜約０．２５ｍｇ／日、約０．５〜約２５ｍｇ／日、約０．５〜約１０ｍｇ／日、約０．５〜約５ｍｇ／日、約０．５〜約２ｍｇ／日、約０．５〜約１ｍｇ／日、約１〜約２５ｍｇ／日、約１〜約１０ｍｇ／日、約１〜約５ｍｇ／日、約１〜約２．５ｍｇ／日、または約１〜約２ｍｇ／日からである。一実施形態では、化合物１、化合物２または化合物３の治療上または予防上有効な量は、約０．１ｍｇ／日〜約０．４ｍｇ／日である。
【０２２４】
ある特定の実施形態では、治療上または予防上有効な量は、約０．１、約０．２、約０．３、約０．４、約０．５、約０．６、約０．７、約０．８、約０．９、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１５、約２０、または約２５ｍｇ／日である。いくつかのそのような実施形態では、治療上または予防上有効な量は、約０．１、約０．２、約０．３、約０．４、約０．５、約０．６または約０．７ｍｇ／日である。
【０２２５】
一実施形態では、本明細書に記載されている状態に対する、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩の推奨される毎日の用量範囲は、約０．１ｍｇ〜約２５ｍｇ／日の範囲内にあり、好ましくは、単一の１日１回用量として、または１日を通して数回に分割された用量で与えられる。他の実施形態では、投薬量は、約０．１〜約１０ｍｇ／日の範囲に及ぶ。１日あたりの特定の用量は、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５ｍｇ／日を含む。１日あたりのより特定の用量は、０．１、０．２、０．３、０．４、または０．５ｍｇ／日を含む。
【０２２６】
特定の実施形態では、推奨される開始投薬量は、０．１、０．２、０．３、０．４、０．５、１、２、３、４、５、１０、１５、２０、または２５ｍｇ／日であり得る。別の実施形態では、推奨される開始投薬量は、０．１、０．２、０．３、０．４、または０．５ｍｇ／日であり得る。用量は、１、２、３、４、または５ｍｇ／日に漸増され得る。
【０２２７】
ある特定の実施形態では、治療上または予防上有効な量は、約０．００１〜約５ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約４ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約３ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約２ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約１ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約０．０５ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約０．０４ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約０．０３ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約０．０２ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約０．０１ｍｇ／ｋｇ／日、約０．００１〜約０．００５ｍｇ／ｋｇ／日である。
【０２２８】
投与された用量はまた、ｍｇ／ｋｇ／日以外の単位で表され得る。例えば、非経口投与のための用量は、ｍｇ／ｍ２／日として表され得る。当業者は、対象の身長もしくは体重のいずれかまたは両方から用量をｍｇ／ｋｇ／日からｍｇ／ｍ２／日に変換する方法を容易に理解するであろう（ｗｗｗ．ｆｄａ．ｇｏｖ／ｃｄｅｒ／ｃａｎｃｅｒ／ａｎｉｍａｌｆｒａｍｅ．ｈｔｍを参照されたい）。例えば、６５ｋｇのヒトに対する１ｍｇ／ｋｇ／日という用量は、３８ｍｇ／ｍ２／日におよそ等しい。
【０２２９】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法のうちの１つで治療される患者は、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩の投与前に、多発性骨髄腫療法で治療されていない。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法のうちの１つで治療される患者は、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩の投与前に、多発性骨髄腫療法で治療されている。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法のうちの１つで治療される患者は、抗多発性骨髄腫療法に対する薬物抵抗性を発達させている。いくつかのそのような実施形態では、患者は、１つ、２つ、または３つの抗多発性骨髄腫療法に対する抵抗性を発達させており、療法は、ＣＤ３８モノクローナル抗体（ＣＤ３８  ｍＡｂ、例えば、ダラツムマブまたはイサツキシマブ）、プロテアソーム阻害剤（例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、イキサゾミブ、またはマリゾミブ）、及び免疫調節化合物（例えば、サリドマイド、レナリドマイド、及びポマリドマイド）から選択される。
【０２３０】
本明細書で提供される方法は、患者の年齢に関係なく患者を治療することを包含する。いくつかの実施形態では、対象は、１８歳以上である。他の実施形態では、対象は、１８、２５、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、または７０歳超である。他の実施形態では、対象は、６５歳未満である。他の実施形態では、対象は、６５歳超である。一実施形態では、対象は、６５歳より高齢な対象などの、高齢の多発性骨髄腫対象である。一実施形態では、対象は、７５歳より高齢な対象などの、高齢の多発性骨髄腫対象である。
【０２３１】
治療される疾患及び対象の状態に応じて、本明細書で提供される化合物１もしくは化合物２、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、経口、非経口（例えば、筋肉内、腹腔内、静脈内、ＣＩＶ、大槽内注射もしくは注入、皮下注射、または埋入）、吸入、経鼻、膣内、直腸、舌下、または局所（例えば、経皮または局部）投与経路によって投与され得る。本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、各投与経路について適切な、薬学的に許容される賦形剤、担体、アジュバント及びビヒクルを有する好適な投薬量単位で、単独でまたは一緒に製剤化され得る。
【０２３２】
一実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、経口投与される。別の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、非経口投与される。さらに別の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、静脈内投与される。
【０２３３】
本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、例えば、単一ボーラス注射、または経口錠剤もしくは丸剤のなどの単一用量として、あるいは、例えば、経時的な持続注入または経時的な分割ボーラス用量など経時的に、送達され得る。本明細書に記載される化合物は、必要な場合、例えば、患者が疾患安定もしくは退縮を経験するまで、または患者が疾患進行もしくは許容できない毒性を経験するまで、反復投与され得る。疾患安定またはその欠如は、Ｘ線、ＣＡＴ、ＰＥＴ、またはＭＲＩスキャン及び他の一般的に受け入れられた評価モダリティを使用して画像化されている、患者症状の評価、身体検査、腫瘍の視覚化などの、当技術分野で既知の方法によって決定される。
【０２３４】
本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、毎日１回（ＱＤ）投与され得るか、または毎日２回（ＢＩＤ）、毎日３回（ＴＩＤ）、及び毎日４回（ＱＩＤ）などの複数の毎日の用量へと分割され得る。加えて、投与は、持続的（すなわち、連続する日について毎日（ｄａｉｌｙ）、または毎日（ｅｖｅｒｙ  ｄａｙ））、間欠的に、例えば、サイクルで（すなわち、数日間、数週間、または数か月の休薬を含む）あり得る。本明細書で使用される場合、「毎日」という用語は、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩などの治療用化合物が、毎日１回または２回以上、例えば、ある期間、投与されることを意味することが意図される。「持続的」という用語は、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩などの治療用化合物が、少なくとも７日から５２週間の中断されない期間、毎日投与されることを意味することが意図される。本明細書で使用される「間欠的」または「間欠的に」という用語は、規則的または不規則的間隔のいずれかで、停止及び開始することを意味することが意図される。例えば、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩の間欠的投与は、週あたり１〜６日間の投与、サイクルでの投与（例えば、連続する２〜８週間についての毎日の投与、次いで、最大１週間の無投与を伴う休止期間）、または隔日での投与である。本明細書で使用される「サイクリング」という用語は、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩などの治療用化合物が、毎日または休止期間を伴い持続的に投与されることを意味することが意図される。いくつかのそのような実施形態では、投与は、２〜６日間、１日１回であり、次いで、５〜７日間無投与を伴う休止期間である。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、投与の頻度は、毎日の用量から毎月の用量までの範囲にある。ある特定の実施形態では、投与は、１日１回、１日２回、１日３回、１日４回、隔日１回、週２回、週１回、２週間毎に１回、３週間毎に１回、または４週間毎に１回である。一実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、１日１回投与される。別の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、１日２回投与される。さらに別の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、１日３回投与される。さらに別の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、１日４回投与される。
【０２３６】
一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大２０日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大１５日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大７日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大５日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大４日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。一実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、休止期間が続く最大３日の投与期間を含む治療サイクルで投与される。
【０２３７】
一実施形態では、治療サイクルは、休止期間が続く最大１４日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、休止期間が続く最大７日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、休止期間が続く最大５日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、休止期間が続く最大４日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、休止期間が続く最大３日の投与期間を含む。
【０２３８】
一実施形態では、休止期間は、約２日から最大約１１日である。一実施形態では、休止期間は、約２日から最大約１０日である。一実施形態では、休止期間は、約２日である。一実施形態では、休止期間は、約３日である。一実施形態では、休止期間は、約４日である。一実施形態では、休止期間は、約５日である。一実施形態では、休止期間は、約６日である。別の実施形態では、休止期間は、約７日である。別の実施形態では、休止期間は、約８日である。別の実施形態では、休止期間は、約９日である。別の実施形態では、休止期間は、約１０日である。別の実施形態では、休止期間は、約１１日である。
【０２３９】
一実施形態では、治療サイクルは、約２日から最大約１０日の休止期間が続く最大１５日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、約２日から最大約１０日の休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、約２日から最大約１０日の休止期間が続く最大７日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、約２日から最大約１０日の休止期間が続く最大５日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、約１０日から最大約１５日の休止期間が続く最大３日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、約３日から最大約１５日の休止期間が続く最大３日の投与期間を含む。
【０２４０】
一実施形態では、治療サイクルは、７日の休止期間が続く最大１５日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、５日の休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、４日の休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、３日の休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２日の休止期間が続く最大１０日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、７日の休止期間が続く最大７日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、５日の休止期間が続く最大５日の投与期間を含む。一実施形態では、治療サイクルは、１１日の休止期間が続く最大３日の投与期間を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、９日の休止期間が続く最大５日の投与期間を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２日の休止期間が続く最大５日の投与期間を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、４日の休止期間が続く最大３日の投与期間を含む。
【０２４１】
一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜５日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜１０日目での化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜２１日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、７日サイクルの１〜５日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、７日サイクルの１〜７日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜１０日目及び１５〜２４日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１８日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜７日目及び１５〜２１日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜５日目及び１５〜１９日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１７日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。
【０２４２】
一実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜１４日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜４日目及び８〜１１日目での化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。一実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜５日目及び８〜１２日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜５日目及び１１〜１５日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜５日目、８〜１２日目及び１５〜１９日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜４日目、８〜１１日目及び１５〜１８日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜４日目、８〜１０日目及び１５〜１７日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜３日目及び８〜１１日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。別の実施形態では、治療サイクルは、２１日サイクルの１〜３日目及び１１〜１３日目での治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３の投与を含む。
【０２４３】
本明細書に記載の任意の治療サイクルは、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、またはそれ以上のサイクルを反復され得る。ある特定の例では、本明細書に記載される治療サイクルは、１〜約２４のサイクル、約２〜約１６のサイクル、または約２〜約４のサイクルを含む。ある特定の例では、本明細書に記載される治療サイクルは、１〜約４のサイクルを含む。ある特定の実施形態では、サイクル１〜４は、すべて２８日サイクルである。いくつかの実施形態では、治療上有効な量の化合物１、化合物２または化合物３は、１〜１３の２８日のサイクルで（例えば、約１年）投与される。ある特定の例では、サイクリング療法はサイクルの数に限定されず、療法は疾患進行まで続けられる。サイクルは、ある特定の例では、本明細書に記載の投与期間及び／または休止期間の持続期間を変化させることを含む。
【０２４４】
一実施形態では、治療サイクルは、化合物１、化合物２または化合物３を、１日１回投与される、約０．１ｍｇ／日、０．２ｍｇ／日、０．３ｍｇ／日、０．４ｍｇ／日、０．５ｍｇ／日、０．６ｍｇ／日、０．７ｍｇ／日、０．８ｍｇ／日、０．９ｍｇ／日、１．０ｍｇ／日、５．０ｍｇ／日、または１０ｍｇ／日の投薬量で投与することを含む。一実施形態では、治療サイクルは、化合物１、化合物２または化合物３を、１日１回投与される、約０．１ｍｇ／日、０．２ｍｇ／日、０．３ｍｇ／日、０．４ｍｇ／日、０．５ｍｇ／日、０．６ｍｇ／日、０．７ｍｇ／日、または０．８ｍｇ／日の投薬量で投与することを含む。いくつかのそのような実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜１０日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、または０．５ｍｇの投薬量で１日１回投与することを含む。いくつかのそのような実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜１０日目及び１５〜２４日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、または０．５ｍｇの投薬量で１日１回投与することを含む。いくつかのそのような実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜１０日目及び１５〜２４日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．１ｍｇの投薬量で１日１回投与することを含む。他の実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜３日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、または０．５ｍｇの投薬量で１日２回投与することを含む。他の実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１９日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、または０．５ｍｇの投薬量で１日２回投与することを含む。他の実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１７日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．１ｍｇ、０．２ｍｇ、０．３ｍｇ、０．４ｍｇ、または０．５ｍｇの投薬量で１日２回投与することを含む。他の実施形態では、治療サイクルは、２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１７日目に、化合物１、化合物２または化合物３を、約０．２ｍｇの投薬量で１日２回投与することを含む。１つのそのような実施形態では、化合物は、サイクル１の１〜３日目（朝と夕方）、１４日目（夕方のみ）、１５日目及び１６日目（朝と夕方）、ならびに１７日目（朝のみ）に投与される。
【０２４５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化３８】
2021525362.tif 000045
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２４６】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化３９】
2021525362.tif 000046
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２４７】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化４０】
2021525362.tif 000047
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２４８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２４９】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化４１】
2021525362.tif 000048
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５０】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化４２】
2021525362.tif 000049
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５１】
さらに別の実施形態では、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化４３】
2021525362.tif 000050
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法。
【０２５２】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５３】
投与レジメンは、バイオマーカーのレベルに従って、患者の応答またはその欠如に調整され得ることが、理解される。例えば、患者が好中球減少症であるか、または患者が応答しない場合、投薬量は、調整され得る。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象にある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１：
【化４４】
2021525362.tif 000051
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５４】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象にある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化４５】
2021525362.tif 000052
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５５】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象にある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化４６】
2021525362.tif 000053
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５６】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、化合物が、対象に投与されており、
（ａ）対象から得られた１つ以上の試料中のバイオマーカーのレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することを含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２５７】
いくつかの実施形態では、異なる時点は、治療用化合物での治療前に得られた参照試料と、治療用化合物での治療中の異なる時間に対象から得られた１つ以上の試料と、を含み得る。他の実施形態では、異なる時点は、治療中に得られた参照試料と、治療用化合物での治療中のより後の時間に採取された１つ以上の試料と、を含み得る。さらに別の実施形態では、異なる時点は、治療前に採取された参照試料と、治療後に採取された試料と、を含み得る。
【０２５８】
また、本明細書で提供されるのは、バイオマーカー（例えば、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、またはＴＣＲクローン性）を使用して、治療用化合物に対する患者の応答性、または治療用化合物の有効性を予測またはモニタリングする方法である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、またはＴＣＲクローン性などの予測因子または予後因子を使用して、治療用化合物に対するがん（例えば、多発性骨髄腫）を有する対象または有する疑いのある対象の応答性を予測するための方法である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、予測因子または予後因子として、バイオマーカー（例えば、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、またはＴＣＲクローン性）レベルを使用して、治療用化合物での対象におけるがん（例えば、多発性骨髄腫）の治療の有効性をモニタリングするための方法である。ある特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。一実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の実施形態では、化合物は、化合物２である。別の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０２５９】
したがって、いくつかの態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化４７】
2021525362.tif 000054
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２６０】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化４８】
2021525362.tif 000055
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２６１】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化４９】
2021525362.tif 000056
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２６２】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０２６３】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化５０】
2021525362.tif 000057
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２６４】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化５１】
2021525362.tif 000058
またはその互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２６５】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化５２】
2021525362.tif 000059
またはその互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２６６】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である。
【０２６７】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、試料中のバイオマーカーのレベルは、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルよりも高い。本明細書で提供される様々な方法の他の実施形態では、試料中のバイオマーカーのレベルは、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルよりも低い。
【０２６８】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化５３】
2021525362.tif 000060
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２６９】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、
治療用化合物が、化合物２：
【化５４】
2021525362.tif 000061
またはその互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２７０】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化５５】
2021525362.tif 000062
またはその互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２７１】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、
治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、薬学的に許容される塩、もしくは多形である、方法である。
【０２７２】
いくつかの実施形態では、参照レベルと比較して増加したレベルは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。例えば、参照に対する、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、ＢＩＭ、ＴＵＮＥＬ、アネキシンＶ／７−ＡＡＤ、アネキシンＶ／ＰＩ、ｐ２１、ｐ２７、遊離軽鎖、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγ、またはＴＣＲクローン性の増加は、対象における多発性骨髄腫を治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。他の実施形態では、参照レベルと比較して減少したレベルは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。例えば、参照に対する、Ａｉｏｌｏｓ（ＩＫＺＦ３）、Ｉｋａｒｏｓ（ＩＫＺＦ１）、ＣＴＣ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ホスホ−Ｒｂ１の減少は、対象における多発性骨髄腫を治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。
【０２７３】
バイオマーカーのレベルは参照レベルに相対的であることが、理解される。したがって、いくつかの実施形態では、参照レベルと比較して減少したレベルは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。例えば、多発性骨髄腫患者からの参照に対する、健康な患者からのｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、ＢＩＭ、ＴＵＮＥＬ、アネキシンＶ／７−ＡＡＤ、アネキシンＶ／ＰＩ、ｐ２１、ｐ２７、遊離軽鎖、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγ、またはＴＣＲクローン性の減少は、対象における多発性骨髄腫を治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。他の実施形態では、参照レベルと比較して増加したレベルは、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。例えば、多発性骨髄腫患者からの参照に対して、健康な患者からのＡｉｏｌｏｓ（ＩＫＺＦ３）、Ｉｋａｒｏｓ（ＩＫＺＦ１）、ＣＴＣ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ホスホ−Ｒｂ１の増加は、対象における多発性骨髄腫を治療することにおける治療用化合物の有効性を示す。
【０２７４】
本明細書の他の箇所で論じられるように、本明細書に包含されるのは、限定されないが、手術、化学療法、放射線療法、生物学的療法、及び免疫療法を含む従来の療法に伴う有害作用または望ましくない効果を低減、治療、及び／または予防する方法である。本明細書で提供される化合物、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩、及び他の活性成分は、本明細書に記載のバイオマーカーを使用して特定された患者に、従来の療法に伴う有害作用の発生前、発生中、または発生後に投与され得る。
【０２７５】
本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、本明細書に記載される多発性骨髄腫の治療及び／または予防に有用な他の治療剤と組み合わされ得るか、または組み合わせて使用され得る。
【０２７６】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、方法は、患者に、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を、１つ以上の第２の活性剤、及び任意で放射線療法、輸血、または手術と組み合わせて投与することを含む。
【０２７７】
本明細書で使用される場合、「組み合わせて」という用語は、２つ以上の療法（例えば、１つ以上の予防剤及び／または治療剤）の使用を含む。しかしながら、「組み合わせて」という用語の使用は、療法（例えば、予防剤及び／または治療剤）が疾患または障害を有する患者に投与される順序を制限しない。対象への第２の療法（例えば、予防剤または治療剤）の投与前（例えば、５分前、１５分前、３０分前、４５分前、１時間前、２時間前、４時間前、６時間前、１２時間前、２４時間前、４８時間前、７２時間前、９６時間前、１週間前、２週間前、３週間前、４週間前、５週間前、６週間前、８週間前または１２週間前）に、第２の療法の投与と同時に、または第２の療法の投与後（例えば、５分後、１５分後、３０分後、４５分後、１時間後、２時間後、４時間後、６時間後、１２時間後、２４時間後、４８時間後、７２時間後、９６時間後、１週間後、２週間後、３週間後、４週間後、５週間後、６週間後、８週間後または１２週間後）に、第１の療法（例えば、本明細書で提供される化合物などの予防剤または治療剤、例えば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩）が、投与され得る。三重療法もまた、四重療法のように、本明細書に企図される。一実施形態では、第２の療法は、デキサメタゾンである。
【０２７８】
化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩、及び１つ以上の第２の活性剤の患者への投与は、同じまたは異なる投与経路によって、同時にまたは順次起こり得る。特定の活性剤に用いられる特定の投与経路の好適性は、活性剤自体（例えば、それが血流に入る前に分解することなく経口投与され得るかどうか）に依存するであろう。
【０２７９】
化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩の投与経路は、第２の療法の投与経路とは無関係である。一実施形態では、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、経口投与される。別の実施形態では、化合物１、化合物２または化合物３は、静脈内投与される。したがって、これらの実施形態によれば、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、経口投与または静脈内投与され、第２の療法は、経口投与、非経口投与、腹腔内投与、静脈内投与、動脈内投与、経皮投与、舌下投与、筋肉内投与、直腸投与、経口腔投与、鼻腔内投与、リポソーム投与、吸入を介して投与、膣内投与、眼内投与、カテーテルもしくはステントによる局部送達を介して投与、皮下投与、脂肪内投与、関節内投与、髄腔内投与され得るか、または徐放剤形で投与され得る。一実施形態では、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩、及び第２の治療は、同じ投与様式によって、経口または静脈内投与される。別の実施形態では、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、１つの投与様式によって、例えば、静脈内によって投与されるが、第２の薬剤（抗多発性骨髄腫剤）は、別の投与様式、例えば、経口によって投与される。
【０２８０】
一実施形態では、第２の活性剤は、静脈内または皮下に、約１〜約１０００ｍｇ、約５〜約５００ｍｇ、約１０〜約３５０ｍｇ、または約５０〜約２００ｍｇの量で毎日１回または２回投与される。第２の活性剤の特定の量は、使用される特定の薬剤、治療及び／または管理される多発性骨髄腫のタイプ、疾患の重症度及びステージ、ならびに本明細書で提供される、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩、及び患者に一斉に投与される任意の任意選択の追加的な活性剤の量に依存するであろう。
【０２８１】
１つ以上の第２の活性成分または薬剤は、本明細書で提供される方法及び組成物において、化合物１、化合物２または化合物３と一緒に使用され得る。第２の活性剤は、大分子（例えば、タンパク質）、小分子（例えば、合成無機、有機金属、または有機分子）、または細胞療法（例えば、ＣＡＲ細胞）であり得る。
【０２８２】
本明細書に記載の方法及び組成物で使用され得る第２の活性剤の例は、メルファラン、ビンクリスチン、シクロホスファミド、エトポシド、ドキソルビシン、ベンダムスチン、プロテアソーム阻害剤（例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、イキサゾミブ、オプロゾミブまたはマリゾミブ）、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤（例えば、パノビノスタット、ＡＣＹ２４１）、ＢＥＴ阻害剤（例えば、ＧＳＫ５２５７６２Ａ、ＯＴＸ０１５、ＢＭＳ−９８６１５８、ＴＥＮ−０１０、ＣＰＩ−０６１０、ＩＮＣＢ５４３２９、ＢＡＹ１２３８０９７、ＦＴ−１１０１、Ｃ９００１０、ＡＢＢＶ−０７５、ＢＩ８９４９９９、ＧＳ−５８２９、ＧＳＫ１２１０１５１Ａ（Ｉ−ＢＥＴ−１５１）、ＣＰＩ−２０３、ＲＶＸ−２０８、ＸＤ４６、ＭＳ４３６、ＰＦＩ−１、ＲＶＸ２１３５、ＺＥＮ３３６５、ＸＤ１４、ＡＲＶ−７７１、ＭＺ−１、ＰＬＸ５１１７、ＥＰ１１３１３及びＥＰ１１３３６）、ＢＣＬ２阻害剤（例えば、ベネトクラクスまたはナビトクラクス）、ＭＣＬ−１阻害剤（例えば、ＡＺＤ５９９１、ＡＭＧ１７６、ＭＩＫ６６５、Ｓ６４３１５、またはＳ６３８４５）、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン）、デキサメタゾン；抗体（例えば、エロツズマブなどのＣＳ１抗体、ダラツムマブイサツキシマブなどのＣＤ３８抗体、またはＧＳＫ２８５７９１６もしくはＢＩ  ８３６９０９などのＢＣＭＡ抗体もしくは抗体コンジュゲート）、チェックポイント阻害剤（本明細書に記載される）、またはＣＡＲ細胞（本明細書に記載される）のうちの１つ以上を含む。
【０２８３】
一実施形態では、本明細書に記載の方法及び組成物において、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩と一緒に使用される第２の活性剤は、デキサメタゾンである。
【０２８４】
いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１日目及び８日目に４ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１、４、８及び１１日目に４ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、及び１５日目に４ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、４、８、１１、１５及び１８日目に４ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、１５、及び２２日目に４ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、１０、１５、及び２２日目に４ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、３、１５、及び１７日目に４ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、３、１４、及び１７日目に４ｍｇの用量で投与される。
【０２８５】
いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１日目及び８日目に８ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１、４、８及び１１日目に８ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、及び１５日目に８ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、４、８、１１、１５及び１８日目に８ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、１５、及び２２日目に８ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、１０、１５、及び２２日目に８ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、３、１５、及び１７日目に８ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、３、１４、及び１７日目に８ｍｇの用量で投与される。
【０２８６】
いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１日目及び８日目に１０ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１、４、８及び１１日目に１０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、及び１５日目に１０ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、４、８、１１、１５及び１８日目に１０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、１５、及び２２日目に１０ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、１０、１５、及び２２日目に１０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、３、１５、及び１７日目に１０ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、３、１４、及び１７日目に１０ｍｇの用量で投与される。
【０２８７】
いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１日目及び８日目に２０ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１、４、８及び１１日目に２０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、及び１５日目に２０ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、４、８、１１、１５及び１８日目に２０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、１５、及び２２日目に２０ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、１０、１５、及び２２日目に２０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、３、１５、及び１７日目に２０ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、３、１４、及び１７日目に２０ｍｇの用量で投与される。
【０２８８】
いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１日目及び８日目に４０ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２１日サイクルの１、４、８及び１１日目に４０ｍｇの用量で投与される。いくつかの実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、及び１５日目に４０ｍｇの用量で投与される。そのような一実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、１０、１５、及び２２日目に４０ｍｇの用量で投与される。いくつかの他の実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、４、８、１１、１５及び１８日目に４０ｍｇの用量で投与される。他のそのような実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、８、１５、及び２２日目に４０ｍｇの用量で投与される。他のそのような実施形態では、デキサメタゾンは、２８日サイクルの１、３、１５、及び１７日目に４０ｍｇの用量で投与される。１つのそのような実施形態では、デキサメタゾンは、サイクル１の１、３、１４、及び１７日目に４０ｍｇの用量で投与される。
【０２８９】
別の実施形態では、本明細書に記載の方法及び組成物において、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩と一緒に使用される第２の活性剤は、ボルテゾミブである。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の方法及び組成物において、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩と一緒に使用される第２の活性剤は、ダラツムマブである。いくつかのそのような実施形態では、方法は、追加的にデキサメタゾンの投与を含む。いくつかの実施形態では、方法は、本明細書に記載のプロテアソーム阻害剤、本明細書に記載のＣＤ３８阻害剤及び本明細書に記載のコルチコステロイドと共に、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩の投与を含む。
【０２９０】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩は、チェックポイント阻害剤と組み合わせて投与される。一実施形態では、１つのチェックポイント阻害剤が、本明細書で提供される方法に関連して、化合物１、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩と組み合わせて使用される。別の実施形態では、２つのチェックポイント阻害剤が、本明細書で提供される方法に関連して、化合物１、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩と組み合わせて使用される。さらに別の実施形態では、３つ以上のチェックポイント阻害剤が、本明細書で提供される方法に関連して、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくはその薬学的に許容される塩と組み合わせて使用される。
【０２９１】
本明細書で使用される場合、「免疫チェックポイント阻害剤」または「チェックポイント阻害剤」という用語は、１つ以上のチェックポイントタンパク質を完全にまたは部分的に低減するか、それらを阻害するか、それらに干渉するか、またはそれらを調節する分子を指す。特定の理論によって限定されることなく、チェックポイントタンパク質は、Ｔ細胞活性化または機能を調節する。多数のチェックポイントタンパク質、例えば、ＣＴＬＡ−４ならびにそのリガンドＣＤ８０及びＣＤ８６と、リガンドＰＤ−Ｌｌ及びＰＤ−Ｌ２を有するＰＤ−１とが、知られている（Ｐａｒｄｏｌｌ，Ｎａｔｕｒｅ  Ｒｅｖｉｅｗｓ  Ｃａｎｃｅｒ，２０１２，１２，２５２−２６４）。これらのタンパク質は、Ｔ細胞応答の共刺激性または阻害性相互作用を担うと思われる。免疫チェックポイントタンパク質は、自己寛容、ならびに生理学的免疫応答の持続期間及び程度を調節し維持すると思われる。免疫チェックポイント阻害剤は、抗体を含むか、または抗体から誘導される。
【０２９２】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＣＴＬＡ−４阻害剤である。一実施形態では、ＣＴＬＡ−４阻害剤は、抗ＣＴＬＡ−４抗体である。抗ＣＴＬＡ−４抗体の例は、すべてが全体において本明細書に組み込まれる米国特許第５，８１１，０９７号、同第５，８１１，０９７号、同第５，８５５，８８７号、同第６，０５１，２２７号、同第６，２０７，１５７号、同第６，６８２，７３６号、同第６，９８４，７２０号、及び同第７，６０５，２３８号に記載されるものを含むが、これらに限定されない。一実施形態では、抗ＣＴＬＡ−４抗体は、トレメリムマブ（別名、チシリムマブまたはＣＰ−６７５，２０６としても知られる）である。別の実施形態では、抗ＣＴＬＡ−４抗体は、イピリムマブ（ＭＤＸ−０１０またはＭＤＸ−１０１としても知られる）である。イピリムマブは、ＣＴＬＡ−４に結合する完全ヒトモノクローナルＩｇＧ抗体である。イピリムマブは、Ｙｅｒｖｏｙ（商標）という商品名で販売されている。
【０２９３】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１阻害剤である。ＰＤ−ｌ／ＰＤ−Ｌ１阻害剤の例は、すべてが全体において本明細書に組み込まれる米国特許第７，４８８，８０２号、同第７，９４３，７４３号、同第８，００８，４４９号、同第８，１６８，７５７号、同第８，２１７，１４９号、ならびにＰＣＴ特許出願公開第ＷＯ２００３０４２４０２号、同第ＷＯ２００８１５６７１２号、同第ＷＯ２０１００８９４１１号、同第ＷＯ２０１００３６９５９号、同第ＷＯ２０１１０６６３４２号、同第ＷＯ２０１１１５９８７７号、同第ＷＯ２０１１０８２４００号、及び同第ＷＯ２０１１１６１６９９号に記載されるものを含むが、これらに限定されない。
【０２９４】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＰＤ−１阻害剤である。一実施形態では、ＰＤ−１阻害剤は、抗ＰＤ−１抗体である。一実施形態では、抗ＰＤ−１抗体は、ＢＧＢ−Ａ３１７、ニボルマブ（ＯＮＯ−４５３８、ＢＭＳ−９３６５５８、またはＭＤＸ１１０６としても知られる）、またはペンブロリズマブ（ＭＫ−３４７５、ＳＣＨ９００４７５、またはランブロリズマブとしても知られる）である。一実施形態では、抗ＰＤ−１抗体は、ニボルマブである。ニボルマブは、ヒトＩｇＧ４抗ＰＤ−１モノクローナル抗体であり、Ｏｐｄｉｖｏ（商標）という商品名で販売されている。別の実施形態では、抗ＰＤ−１抗体は、ペンブロリズマブである。ペンブロリズマブは、ヒト化モノクローナルＩｇＧ４抗体であり、Ｋｅｙｔｒｕｄａ（商標）という商品名で販売されている。さらに別の実施形態では、抗ＰＤ−１抗体は、ヒト化抗体であるＣＴ−０１１である。単独で投与されたＣＴ−０１１は、再発時に急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）を治療することにおいて応答を示すことができなかった。さらに別の実施形態では、抗ＰＤ−１抗体は、融合タンパク質であるＡＭＰ−２２４である。別の実施形態では、ＰＤ−１抗体は、ＢＧＢ−Ａ３１７である。ＢＧＢ−Ａ３１７は、Ｆｃガンマ受容体Ｉに結合する能力が特異的に操作されており、かつ高い親和性及び優れた標的特異性を伴うＰＤ−１に対する独自の結合シグネチャを有する、モノクローナル抗体である。
【０２９５】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＰＤ−Ｌ１阻害剤である。一実施形態では、ＰＤ−Ｌ１阻害剤は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体である。一実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＭＥＤＩ４７３６（デュルバルマブ）である。別の実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、ＢＭＳ−９３６５５９（ＭＤＸ−１１０５−０１としても知られる）である。さらに別の実施形態では、ＰＤ−Ｌ１阻害剤は、アテゾリズマブ（ＭＰＤＬ３２８０Ａ、及びＴｅｃｅｎｔｒｉｑ（登録商標）としても知られる）である。
【０２９６】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＰＤ−Ｌ２阻害剤である。一実施形態では、ＰＤ−Ｌ２阻害剤は、抗ＰＤ−Ｌ２抗体である。一実施形態では、抗ＰＤ−Ｌ２抗体は、ｒＨＩｇＭ１２Ｂ７Ａである。
【０２９７】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、リンパ球活性化遺伝子３（ＬＡＧ−３）阻害剤である。一実施形態では、ＬＡＧ−３阻害剤は、可溶性Ｉｇ融合タンパク質であるＩＭＰ３２１である（Ｂｒｉｇｎｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，２００７，１７９，４２０２−４２１１）。別の実施形態では、ＬＡＧ−３阻害剤は、ＢＭＳ−９８６０１６である。
【０２９８】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、Ｂ７阻害剤である。一実施形態では、Ｂ７阻害剤は、Ｂ７−Ｈ３阻害剤またはＢ７−Ｈ４阻害剤である。一実施形態では、Ｂ７−Ｈ３阻害剤は、抗Ｂ７−Ｈ３抗体であるＭＧＡ２７１である（Ｌｏｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．，２０１２，３８３４）。
【０２９９】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＴＩＭ３（Ｔ細胞免疫グロブリンドメイン及びムチンドメイン３）阻害剤である（Ｆｏｕｒｃａｄｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，２０１０，２０７，２１７５−８６、Ｓａｋｕｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．，２０１０，２０７，２１８７−９４）。
【０３００】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＯＸ４０（ＣＤ１３４）アゴニストである。一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗ＯＸ４０抗体である。一実施形態では、抗ＯＸ４０抗体は、抗ＯＸ−４０である。別の実施形態では、抗ＯＸ４０抗体は、ＭＥＤＩ６４６９である。
【０３０１】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＧＩＴＲアゴニストである。一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗ＧＩＴＲ抗体である。一実施形態では、抗ＧＩＴＲ抗体は、ＴＲＸ５１８である。
【０３０２】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＣＤ１３７アゴニストである。一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗ＣＤ１３７抗体である。一実施形態では、抗ＣＤ１３７抗体は、ウレルマブである。別の実施形態では、抗ＣＤ１３７抗体は、ＰＦ−０５０８２５６６である。
【０３０３】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＣＤ４０アゴニストである。一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗ＣＤ４０抗体である。一実施形態では、抗ＣＤ４０抗体は、ＣＦ−８７０，８９３である。
【０３０４】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、組換えヒトインターロイキン−１５（ｒｈＩＬ−１５）である。
【０３０５】
一実施形態では、チェックポイント阻害剤は、ＩＤＯ阻害剤である。一実施形態では、ＩＤＯ阻害剤は、ＩＮＣＢ０２４３６０である。別の実施形態では、ＩＤＯ阻害剤は、インドキシモドである。
【０３０６】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される併用療法は、本明細書に記載のチェックポイント阻害剤（同じまたは異なるクラスのチェックポイント阻害剤を含む）のうちの２つ以上を含む。さらに、本明細書に記載の併用療法は、本明細書に記載の疾患を治療するために適切であり、かつ当技術分野で理解される、本明細書に記載の１つ以上の第２の活性剤と組み合わせて使用され得る。
【０３０７】
ある特定の実施形態では、化合物１、化合物２または化合物３は、それらの表面（例えば、修飾された免疫細胞）上の１つ以上のキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現する１つ以上の免疫細胞と組み合わせて使用され得る。一般に、ＣＡＲは、第１のタンパク質（例えば、抗原結合タンパク質）からの細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む。ある特定の実施形態では、細胞外ドメインが、腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）または腫瘍特異的抗原（ＴＳＡ）などの標的タンパク質に結合すると、シグナルは、例えば、標的タンパク質を発現する細胞を標的とし、死滅させるために、免疫細胞を活性化する細胞内シグナル伝達ドメインを介して生成される。
【０３０８】
細胞外ドメイン：ＣＡＲの細胞外ドメインは、目的の抗原に結合する。ある特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、該抗原に結合する受容体、または受容体の一部を含む。ある特定の実施形態では、細胞外ドメインは、抗体もしくはその抗原結合部分を含むか、または抗体もしくはその抗原結合部分である。特定の実施形態では、細胞外ドメインは、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）ドメインを含むか、または一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）ドメインである。一本鎖Ｆｖドメインは、例えば、可撓性リンカーによってＶＨに連結されたＶＬを含み得、該ＶＬ及びＶＨは、該抗原に結合する抗体からのものである。
【０３０９】
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のポリペプチドの細胞外ドメインによって認識される抗原は、腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）または腫瘍特異的抗原（ＴＳＡ）である。様々な特定の実施形態では、腫瘍関連抗原または腫瘍特異的抗原は、Ｈｅｒ２、前立腺幹細胞抗原（ＰＳＣＡ）、アルファ−フェトタンパク質（ＡＦＰ）、がん胎児性抗原（ＣＥＡ）、がん抗原−１２５（ＣＡ−１２５）、ＣＡ１９−９、カルレチニン、ＭＵＣ−１、Ｂ細胞成熟抗原（ＢＣＭＡ）、上皮膜タンパク質（ＥＭＡ）、上皮腫瘍抗原（ＥＴＡ）、チロシナーゼ、メラノーマ−２４関連抗原（ＭＡＧＥ）、ＣＤ１９、ＣＤ２２、ＣＤ２７、ＣＤ３０、ＣＤ３４、ＣＤ４５、ＣＤ７０、ＣＤ９９、ＣＤ１１７、ＥＧＦＲｖＩＩＩ（上皮成長因子バリアントＩＩＩ）、メソテリン、ＰＡＰ（前立腺酸性ホスファターゼ）、プロステイン、ＴＡＲＰ（Ｔ細胞受容体ガンマ代替リーディングフレームタンパク質）、Ｔｒｐ−ｐ８、ＳＴＥＡＰＩ（前立腺の６回膜貫通上皮抗原１）、クロモグラニン、サイトケラチン、デスミン、グリア線維性酸性タンパク質（ＧＦＡＰ）、総嚢胞性疾患液体タンパク質（ＧＣＤＦＰ−１５）、ＨＭＢ−４５抗原、タンパク質メラン−Ａ（Ｔリンパ球によって認識されるメラノーマ抗原；ＭＡＲＴ−Ｉ）、ｍｙｏ−Ｄ１、筋特異的アクチン（ＭＳＡ）、ニューロフィラメント、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）、胎盤アルカリホスファターゼ、シナプトフィシス、チログロブリン、甲状腺転写因子−１、二量体形態のピルビン酸キナーゼアイソエンザイムＭ２型（腫瘍Ｍ２−ＰＫ）、異常なｒａｓタンパク質、または異常なｐ５３タンパク質であるが、これらに限定されない。ある特定の他の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインによって認識されるＴＡＡまたはＴＳＡは、インテグリンαｖβ３（ＣＤ６１）、ガラクチン、またはＲａｌ−Ｂである。
【０３１０】
ある特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインによって認識されるＴＡＡまたはＴＳＡは、がん／精巣（ＣＴ）抗原、例えば、ＢＡＧＥ、ＣＡＧＥ、ＣＴＡＧＥ、ＦＡＴＥ、ＧＡＧＥ、ＨＣＡ６６１、ＨＯＭ−ＴＥＳ−８５、ＭＡＧＥＡ、ＭＡＧＥＢ、ＭＡＧＥＣ、ＮＡ８８、ＮＹ−ＥＳ０−１、ＮＹ−ＳＡＲ−３５、ＯＹ−ＴＥＳ−１、ＳＰＡＮＸＢＩ、ＳＰＡ１７、ＳＳＸ、ＳＹＣＰＩ、またはＴＰＴＥである。
【０３１１】
ある特定の他の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインによって認識されるＴＡＡまたはＴＳＡは、炭水化物またはガングリオシド、例えば、ｆｕｃ−ＧＭＩ、ＧＭ２（腫瘍胎児抗原−免疫原性−１、ＯＦＡ−Ｉ−１）；ＧＤ２（ＯＦＡ−Ｉ−２）、ＧＭ３、ＧＤ３などである。
【０３１２】
ある特定の他の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインによって認識されるＴＡＡまたはＴＳＡは、アルファ−アクチニン−４、Ｂａｇｅ−１、ＢＣＲ−ＡＢＬ、Ｂｃｒ−Ａｂｌ融合タンパク質、ベータ−カテニン、ＣＡ  １２５、ＣＡ  １５−３（ＣＡ  ２７．２９＼ＢＣＡＡ）、ＣＡ  １９５、ＣＡ  ２４２、ＣＡ−５０、ＣＡＭ４３、Ｃａｓｐ−８、ｃｄｃ２７、ｃｄｋ４、ｃｄｋｎ２ａ、ＣＥＡ、ｃｏａ−ｌ、ｄｅｋ−ｃａｎ融合タンパク質、ＥＢＮＡ、ＥＦ２、エプスタインバーウイルス抗原、ＥＴＶ６−ＡＭＬ１融合タンパク質、ＨＬＡ−Ａ２、ＨＬＡ−Ａｌｌ、ｈｓｐ７０−２、ＫＩＡＡ０２０５、Ｍａｒｔ２、Ｍｕｍ−１、２、及び３、ｎｅｏ−ＰＡＰ、ミオシンクラスＩ、ＯＳ−９、ｐｍｌ−ＲＡＲα融合タンパク質、ＰＴＰＲＫ、Ｋ−ｒａｓ、Ｎ−ｒａｓ、トリオースリン酸イソメラーゼ、Ｇａｇｅ  ３，４，５，６，７、ＧｎＴＶ、Ｈｅｒｖ−Ｋ−ｍｅｌ、Ｌａｇｅ−１、ＮＡ−８８、ＮＹ−Ｅｓｏ−１／Ｌａｇｅ−２、ＳＰ１７、ＳＳＸ−２、ＴＲＰ２−Ｉｎｔ２、ｇｐ１００（Ｐｍｅｌ１７）、チロシナーゼ、ＴＲＰ−１、ＴＲＰ−２、ＭＡＧＥ−ｌ、ＭＡＧＥ−３、ＲＡＧＥ、ＧＡＧＥ−ｌ、ＧＡＧＥ−２、ｐ１５（５８）、ＲＡＧＥ、ＳＣＰ−１、Ｈｏｍ／Ｍｅｌ−４０、ＰＲＡＭＥ、ｐ５３、ＨＲａｓ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ、Ｅ２Ａ−ＰＲＬ、Ｈ４−ＲＥＴ、ＩＧＨ−ＩＧＫ、ＭＹＬ−ＲＡＲ、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）抗原Ｅ６及びＥ７、ＴＳＰ−１８０、ＭＡＧＥ−４、ＭＡＧＥ−５、ＭＡＧＥ−６、ｐ１８５ｅｒｂＢ２、ｐ１８０ｅｒｂＢ−３、ｃ−ｍｅｔ、ｎｍ−２３Ｈ１、ＰＳＡ、ＴＡＧ−７２−４、ＣＡ  １９−９、ＣＡ  ７２−４、ＣＡＭ  １７．１、ＮｕＭａ、Ｋ−ｒａｓ、１３−カテニン、Ｍｕｍ−１、ｐ１６、ＴＡＧＥ、ＰＳＭＡ、ＣＴ７、テロメラーゼ、４３−９Ｆ、５Ｔ４、７９１Ｔｇｐ７２、１３ＨＣＧ、ＢＣＡ２２５、ＢＴＡＡ、ＣＤ６８＼ＫＰ１、Ｃ０−０２９、ＦＧＦ−５、Ｇ２５０、Ｇａ７３３（ＥｐＣＡＭ）、ＨＴｇｐ−１７５、Ｍ３４４、ＭＡ−５０、ＭＧ７−Ａｇ、ＭＯＶ１８、ＮＢ＼７０Ｋ、ＮＹ−Ｃ０−１、ＲＣＡＳ１、ＳＤＣＣＡＧ１６、ＴＡ−９０、ＴＡＡＬ６、ＴＡＧ７２、ＴＬＰ、またはＴＰＳである。
【０３１３】
様々な特定の実施形態では、腫瘍関連抗原または腫瘍特異的抗原は、Ｓ．Ａｎｇｕｉｌｌｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｌｅｕｋｅｍｉａ（２０１２），２６，２１８６−２１９６に記載されるような、ＡＭＬ関連腫瘍抗原である。
【０３１４】
他の腫瘍関連抗原及び腫瘍特異的抗原は、当業者に既知である。
【０３１５】
キメラ抗原受容体を構築するのに有用なＴＳＡ及びＴＡＡに結合する受容体、抗体、及びｓｃＦｖは、当技術分野で既知であり、それらをコードするヌクレオチド配列もまた当技術分野で既知である。
【０３１６】
ある特定の特定の実施形態では、キメラ抗原受容体の細胞外ドメインによって認識される抗原は、一般にＴＳＡまたはＴＡＡであると見なされないが、そうであっても腫瘍細胞に関連する、または腫瘍によって引き起こされる損傷に関連する抗原である。ある特定の実施形態では、例えば、抗原は、例えば、成長因子、サイトカイン、もしくはインターロイキン、例えば、成長因子、サイトカイン、または血管新生もしくは血管形成に関連するインターロイキンである。そのような成長因子、サイトカイン、またはインターロイキンは、例えば、血管内皮成長因子（ＶＥＧＦ）、塩基性線維芽細胞成長因子（ｂＦＧＦ）、血小板由来成長因子（ＰＤＧＦ）、肝細胞成長因子（ＨＧＦ）、インスリン様成長因子（ＩＧＦ）、またはインターロイキン−８（ＩＬ−８）を含み得る。腫瘍はまた、腫瘍に局在する低酸素環境も作成できる。したがって、他の特定の実施形態では、抗原は、低酸素関連因子、例えば、ＨＩＦ−１α、ＨＩＦ−１β、ＨＩＦ−２α、ＨＩＦ−２β、ＨＩＦ−３α、またはＨＩＦ−３βである。腫瘍はまた、正常組織に対して局在的損傷を引き起こし、損傷関連分子パターン分子として知られる分子（ＤＡＭＰ；アラーミンとしても知られる）の放出を引き起こすことができる。したがって、ある特定の他の特定の実施形態では、抗原は、ＤＡＭＰ、例えば、熱ショックタンパク質、クロマチン関連タンパク質高移動度群ボックス１（ＨＭＧＢ１）、Ｓ１００Ａ８（ＭＲＰ８、カルグラニュリンＡ）、Ｓ１００Ａ９（ＭＲＰ１４、カルグラニュリンＢ）、血清アミロイドＡ（ＳＡＡ）であるか、または、デオキシリボ核酸、アデノシン三リン酸、尿酸、もしくはヘパリン硫酸である。
【０３１７】
ある特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞外ドメインは、リンカー、スペーサー、またはヒンジポリペプチド配列、例えば、ＣＤ２８からの配列またはＣＴＬＡ４からの配列によって、ポリペプチドの膜貫通ドメインに連結されている。膜貫通ドメインは、任意の膜貫通タンパク質の膜貫通ドメインから得ることができるか、またはそれに由来し得、そのような膜貫通ドメインのすべてまたは一部を含み得る。特定の実施形態では、膜貫通ドメインは、例えば、ＣＤ８、ＣＤ１６、サイトカイン受容体、及びインターロイキン受容体、または成長因子受容体などから得ることができるか、またはそれに由来し得る。
【０３１８】
ある特定の実施形態では、ＣＡＲの細胞内ドメインは、Ｔ細胞の表面上で発現し該Ｔ細胞の活性化及び／または増殖の引き金を引くタンパク質の細胞内ドメインもしくはモチーフであるか、あるいはそれを含む。そのようなドメインまたはモチーフは、ＣＡＲの細胞外部分への抗原の結合に応答して、Ｔリンパ球の活性化に必要である一次抗原結合シグナルを伝送することができる。典型的に、このドメインまたはモチーフは、ＩＴＡＭ（免疫受容体チロシン系活性化モチーフ）を含むか、またはＩＴＡＭである。ＣＡＲに好適なＩＴＡＭ含有ポリペプチドは、例えば、ゼータＣＤ３鎖（ＣＤ３ζ）またはそのＩＴＡＭ含有部分を含む。特定の実施形態では、細胞内ドメインは、ＣＤ３ζ細胞内シグナル伝達ドメインである。他の特定の実施形態では、細胞内ドメインは、リンパ球受容体鎖、ＴＣＲ／ＣＤ３複合体タンパク質、Ｆｅ受容体サブユニット、またはＩＬ−２受容体サブユニットからのものである。ある特定の実施形態では、ＣＡＲは、追加的に、例えば、ポリペプチドの細胞内ドメインの一部として、１つ以上の共刺激性ドメインまたはモチーフを含む。１つ以上の共刺激性ドメインまたはモチーフは、共刺激性ＣＤ２７ポリペプチド配列、共刺激性ＣＤ２８ポリペプチド配列、共刺激性ＯＸ４０（ＣＤ１３４）ポリペプチド配列、共刺激性４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）ポリペプチド配列、または共刺激性誘導性Ｔ細胞共刺激性（ＩＣＯＳ）ポリペプチド配列、または他の共刺激性ドメインもしくはモチーフ、またはそれらの任意の組み合わせのうちの１つ以上であり得るか、あるいはそれらを含み得る。
【０３１９】
ＣＡＲはまた、Ｔ細胞生存モチーフを含み得る。Ｔ細胞生存モチーフは、抗原による刺激後のＴリンパ球の生存を促進する任意のポリペプチド配列またはモチーフであり得る。ある特定の実施形態では、Ｔ細胞生存モチーフは、ＣＤ３、ＣＤ２８、ＩＬ−７受容体の細胞内シグナル伝達ドメイン（ＩＬ−７Ｒ）、ＩＬ−１２受容体の細胞内シグナル伝達ドメイン、ＩＬ−１５受容体の細胞内シグナル伝達ドメイン、ＩＬ−２１受容体の細胞内シグナル伝達ドメイン、または形質転換成長因子β（ＴＧＦβ）受容体の細胞内シグナル伝達ドメインであるか、またはそれらに由来する。
【０３２０】
ＣＡＲを発現する修飾された免疫細胞は、例えば、Ｔリンパ球（Ｔ細胞、例えば、ＣＤ４＋Ｔ細胞またはＣＤ８＋Ｔ細胞）、細胞傷害性リンパ球（ＣＴＬ）、またはナチュラルキラー（ＮＫ）細胞であり得る。本明細書で提供される組成物及び方法で使用されるＴリンパ球は、ナイーブＴリンパ球またはＭＨＣ制限Ｔリンパ球であり得る。ある特定の実施形態では、Ｔリンパ球は、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）である。ある特定の実施形態では、Ｔリンパ球は、腫瘍生検から単離されているか、または腫瘍生検から単離されたＴリンパ球から増殖されている。ある特定の他の実施形態では、Ｔ細胞は、末梢血、臍帯血、またはリンパ液から単離されているか、または末梢血、臍帯血、もしくはリンパ液から単離されたＴリンパ球から増殖されている。ＣＡＲを発現する修飾された免疫細胞を生成するために使用される免疫細胞は、当技術分野で認められた常法、例えば、血液収集、それに続くアフェレシス、及び任意で抗体媒介性の細胞の単離またはソーティングを使用して単離され得る。
【０３２１】
修飾された免疫細胞は、好ましくは、修飾された免疫細胞が投与される個体にとって自家性である。ある特定の他の実施形態では、修飾された免疫細胞は、修飾された免疫細胞が投与される個体と同種である。同種Ｔリンパ球またはＮＫ細胞が修飾されたＴリンパ球を調製するために使用される場合、個体における移植片対宿主疾患（ＧＶＨＤ）の可能性を低減するであろうＴリンパ球またはＮＫ細胞を選択することが好ましい。例えば、ある特定の実施形態では、ウイルス特異的Ｔリンパ球は、修飾されたＴリンパ球の調製のために選択される。そのようなリンパ球は、任意のレシピエント抗原に結合する著しく低減した天然能力を有することが予想され、したがって、任意のレシピエント抗原によって活性化されるであろう。ある特定の実施形態では、同種Ｔリンパ球のレシピエント媒介性拒絶は、１つ以上の免疫抑制剤、例えば、シクロスポリン、タクロリムス、シロリムス、シクロホスファミドなどの宿主への共投与によって低減し得る。
【０３２２】
Ｔリンパ球、例えば、未修飾Ｔリンパ球、またはＣＤ３及びＣＤ２８を発現するＴリンパ球、またはＣＤ３ζシグナル伝達ドメイン及びＣＤ２８共刺激性ドメインを含むポリペプチドを含むＴリンパ球は、ＣＤ３及びＣＤ２８に対する抗体、例えば、ビーズに結合した抗体を使用して増殖され得る。例えば、米国特許第５，９４８，８９３号、同第６，５３４，０５５号、同第６，３５２，６９４号、同第６，６９２，９６４号、同第６，８８７，４６６号、及び同第６，９０５，６８１号を参照されたい。
【０３２３】
修飾された免疫細胞、例えば、修飾されたＴリンパ球は、所望される場合、修飾された免疫細胞の実質的にすべての死滅を可能にする「自殺遺伝子」または「安全スイッチ」を任意で含み得る。例えば、修飾されたＴリンパ球は、ある特定の実施形態では、ガンシクロビルとの接触時に、修飾されたＴリンパ球の死を引き起こす、ＨＳＶチミジンキナーゼ遺伝子（ＨＳＶ−ＴＫ）を含み得る。別の実施形態では、修飾されたＴリンパ球は、誘導性カスパーゼ、例えば、誘導性カスパーゼ９（ｉｃａｓｐａｓｅ９）、例えば、カスパーゼ９と特定の小分子医薬品を使用した二量体化を可能にするヒトＦＫ５０６結合タンパク質との融合タンパク質を含む。Ｓｔｒａａｔｈｏｆ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ  １  ０５（１１）：４２４７−４２５４（２００５）を参照されたい。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される化合物１、化合物２または化合物３は、様々なタイプまたはステージの多発性骨髄腫を有する患者に、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）Ｔ細胞と組み合わせて投与される。ある特定の実施形態では、併用におけるＣＡＲ  Ｔ細胞は、Ｂ細胞成熟抗原（ＢＣＭＡ）を標的とし、より特定の実施形態では、ＣＡＲ  Ｔ細胞は、ｂｂ２１２１またはｂｂ２１２１７である。いくつかの実施形態では、ＣＡＲ  Ｔ細胞は、ＪＣＡＲＨ１２５である。
【０３２４】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、参照試料は、対象に治療用化合物を投与する前に対象から得られ、対照試料は、試料と同じ由来源からのものである。本明細書で提供される様々な方法の他の実施形態では、参照試料は、がんを有しない健康な患者から得られ、対照試料は、試料と同じ由来源からのものである。
【０３２５】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、がんは血液由来がんである。ある特定の実施形態では、血液由来がんは、転移性である。本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、がんは、多発性骨髄腫である。
【０３２６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、様々なタイプのがんを治療、予防、または管理することを包含する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、様々なタイプのがんを治療または予防することを包含する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、本明細書で提供されるがんなどの様々なタイプのがんを治療することを包含する。一実施形態では、本明細書で提供される方法は、治療上有効な量の化合物１、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することによって多発性骨髄腫を治療、予防、または管理することを包含する。一実施形態では、本明細書で提供される方法は、治療上有効な量の化合物２、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することによって多発性骨髄腫を治療、予防、または管理することを包含する。一実施形態では、本明細書で提供される方法は、治療上有効な量の化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を投与することによって多発性骨髄腫を治療、予防、または管理することを包含する。
【０３２７】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、腎機能障害を有する患者におけるがんを治療、予防、または管理する方法である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、疾患、老化、または他の患者因子によるものであるが、これらに限定されない、腎機能障害を有する患者に対して適切な用量調節を提供する方法である。
【０３２８】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療上有効な量の化合物１、化合物２、もしくは化合物３、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を、腎機能障害と共に再発性／難治性のＭＭを有する患者に、単独でまたは第２の活性剤と組み合わせて投与することを含む、腎機能障害またはその症状を有する患者における再発性／難治性ＭＭを含む、ＭＭを治療、予防、または管理する方法である。いくつかの実施形態では、方法は、本明細書で提供される化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩を、腎機能障害を有する患者における再発性／難治性のＭＭを治療、予防、または管理するのに有効な量で第２の活性剤と組み合わせて対象に投与するステップを含む。ある特定の実施形態では、化合物は、化合物１である。ある特定の実施形態では、化合物は、化合物２である。ある特定の実施形態では、化合物は、化合物３である。
【０３２９】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーのレベルは、化合物治療と共に減少する。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、可溶性ＢＣＭＡ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｐＲＢ１からなる群から選択され、バイオマーカーのレベルは、治療用化合物での治療前の参照レベルと比較して、減少する。
【０３３０】
他の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、化合物治療と共に増加する。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、カスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、及びＴＣＲクローン性からなる群から選択され、バイオマーカーのレベルは、治療用化合物での治療前の参照レベルと比較して、増加する。
【０３３１】
本明細書で提供される様々な方法のある特定の実施形態では、バイオマーカーは、例えば、タンパク質間相互作用（例えば、ある特定のＣＲＢＮ基質またはその下流エフェクター）を通じて、または様々な細胞経路（例えば、シグナル伝達経路）を通じて、ＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ関連タンパク質（ＣＡＰ）である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質のｍＲＮＡである。他の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質のｃＤＮＡである。
【０３３２】
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化５６】
2021525362.tif 000063
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３３】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化５７】
2021525362.tif 000064
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３４】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化５８】
2021525362.tif 000065
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３５】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化５９】
2021525362.tif 000066
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化６０】
2021525362.tif 000067
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化６１】
2021525362.tif 000068
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３３９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４０】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化６２】
2021525362.tif 000069
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化６３】
2021525362.tif 000070
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４２】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化６４】
2021525362.tif 000071
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４３】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２または化合物３であって、がんを治療する方法は、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルが、バイオマーカーの参照レベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、
がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２または化合物３である。
【０３４４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化６５】
2021525362.tif 000072
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化６６】
2021525362.tif 000073
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化６７】
2021525362.tif 000074
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物３もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化６８】
2021525362.tif 000075
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３４９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化６９】
2021525362.tif 000076
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５０】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化７０】
2021525362.tif 000077
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルが、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと異なる場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５２】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化７１】
2021525362.tif 000078
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５３】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化７２】
2021525362.tif 000079
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｄ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、
治療用化合物が、化合物３：
【化７３】
2021525362.tif 000080
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーがＣＡＰである、決定することと、
（ｂ）試料中のバイオマーカーのレベルを、参照試料から得られたバイオマーカーのレベルと比較することであって、バイオマーカーレベルの変化が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５６】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、及びＩＲＦ４からなる群から選択されるＣＡＰである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１またはＩＫＺＦ３などのＩｋａｒｏｓファミリーメンバーである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ３である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＺＦＰ９１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３の結合パートナー、それらの下流エフェクター、またはそれらに影響を与えた細胞経路における因子である。例えば、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１またはＩＫＺＦ３の結合パートナー、その下流エフェクター、またはそれにより影響される細胞経路における因子である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＲＦ４などのＩＫＺＦ１の下流エフェクターである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＲＦ４などのＩＫＺＦ３の下流エフェクターである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ｃ−ＭＹＣなどのＩＫＺＦ１の下流エフェクターである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ｃ−ＭＹＣなどのＩＫＺＦ３の下流エフェクターである。
【０３５７】
実施例に示されるように、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、可溶性ＢＣＭＡ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｐＲＢ１などのバイオマーカーのレベルは、化合物１、化合物２、または化合物３の治療に応答して参照と比較して減少する。したがって、いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、可溶性ＢＣＭＡ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、及びｐＲＢ１からなる群から選択され、バイオマーカーのレベルは、化合物１、化合物２、または化合物３の治療に応答して減少する。したがって、本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、可溶性ＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｐＲＢ１、またはそれによって影響を受けたタンパク質（または因子）であり、バイオマーカーのレベルは、参照レベルよりも低い。
【０３５８】
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ＳＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ＳＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化７４】
2021525362.tif 000081
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３５９】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化７５】
2021525362.tif 000082
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６０】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化７６】
2021525362.tif 000083
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６１】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６２】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化７７】
2021525362.tif 000084
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６３】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化７８】
2021525362.tif 000085
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化７９】
2021525362.tif 000086
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化８０】
2021525362.tif 000087
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化８１】
2021525362.tif 000088
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化８２】
2021525362.tif 000089
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３６９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２または化合物３であって、がんを治療する方法は、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１を決定することと、
（ｃ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含む、
がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２または化合物３である。
【０３７０】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１である、決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化８３】
2021525362.tif 000090
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１である、決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化８４】
2021525362.tif 000091
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７２】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１である、決定することと、
（ｄ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化８５】
2021525362.tif 000092
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７３】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１である、決定することと、
（ｂ）試料中のレベルＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１が、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルが、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化８６】
2021525362.tif 000093
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルが、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化８７】
2021525362.tif 000094
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルが、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化８８】
2021525362.tif 000095
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルが、参照試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを、参照試料から得られたＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの減少が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化８９】
2021525362.tif 000096
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３７９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを、参照試料から得られたＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの減少が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化９０】
2021525362.tif 000097
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３８０】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを、参照試料から得られたＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの減少が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化９１】
2021525362.tif 000098
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３８１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを決定することと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルを、参照試料から得られたＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＣＴＣ、ｓＢＣＭＡ、ＴＩＬ、サバイビン、血清遊離軽鎖、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、またはｐＲＢ１のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの減少が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物２、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３８２】
本明細書に記載の方法の特定の実施形態では、参照試料は、治療用化合物での治療前の試料である。
【０３８３】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＣＲＢＮであり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＣＲＢＮであり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３８４】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、がんは、多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ１であり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３８５】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、がんは、多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＫＺＦ３であり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３８６】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＣＴＣであり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＣＴＣであり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３８７】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＴＩＬであり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＴＩＬであり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３８８】
特定の実施形態では、バイオマーカーはサバイビンであり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはサバイビンであり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３８９】
特定の実施形態では、バイオマーカーは血清遊離軽鎖であり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーは血清遊離軽鎖であり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３９０】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＺＦＰ９１であり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＺＦＰ９１であり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３９１】
特定の実施形態では、バイオマーカーはｃ−ＭＹＣであり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはｃ−ＭＹＣであり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３９２】
特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＲＦ４であり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＩＲＦ４であり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３９３】
特定の実施形態では、バイオマーカーはｐＲＢ１であり、がんは多発性骨髄腫（ＭＭ）である。特定の実施形態では、バイオマーカーはｐＲＢ１であり、治療用化合物は、化合物１、化合物２、または化合物３である。特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物１である。別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物２である。さらに別の特定の実施形態では、治療用化合物は、化合物３である。
【０３９４】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるバイオマーカーは、細胞周期において機能を有する。他の実施形態では、本明細書で提供されるバイオマーカーは、Ｔ細胞活性化において機能を有する。
【０３９５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象からがん細胞を含む試料を得ることと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化９２】
2021525362.tif 000099
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３９６】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象からがん細胞を含む試料を得ることと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化９３】
2021525362.tif 000100
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３９７】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象からがん細胞を含む試料を得ることと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化９４】
2021525362.tif 000101
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３９８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である多発性骨髄腫を有し、治療用化合物に応答する可能性が高い対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０３９９】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象からがん細胞を含む試料を得ることと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化９５】
2021525362.tif 000102
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４００】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象からがん細胞を含む試料を得ることと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化９６】
2021525362.tif 000103
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０１】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象からがん細胞を含む試料を得ることと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｃ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化９７】
2021525362.tif 000104
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０２】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のＣＲＢＮのレベルを検出することと、
（ｂ）試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０３】
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がん細胞におけるＣＲＢＮレベルを検出し、試料中のＣＲＢＮのレベルが、検出可能であり、ＣＲＢＮの参照レベルよりも低い場合、対象を治療用化合物に応答する可能性が高いと診断する方法である。いくつかの実施形態では、ＭＭは、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である。一実施形態では、ＭＭは、レナリドマイド抵抗性ＭＭである。別の実施形態では、ＭＭは、ポマリドマイド抵抗性ＭＭである。セクション６の実施例で説明されるように、化合物２はまた、ＰＢＭＣ、ＣＤ４＋及びＣＤ８＋Ｔ細胞において免疫調節特性を有する。したがって、本明細書で提供される方法の一実施形態では、ＣＲＢＮはがん細胞において検出可能でなく、ＣＲＢＮは免疫細胞において検出可能であり、患者は化合物１に応答する。本明細書で提供される方法の別の実施形態では、ＣＲＢＮはがん細胞において検出可能でなく、ＣＲＢＮは免疫細胞において検出可能であり、患者は化合物２に応答する。本明細書で提供される方法のさらに別の実施形態では、ＣＲＢＮはがん細胞において検出可能でなく、ＣＲＢＮは免疫細胞において検出可能であり、患者は化合物１に応答する。
【０４０４】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象にある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、または両方のレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化９８】
2021525362.tif 000105
の化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０５】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象にある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、または両方のレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化９９】
2021525362.tif 000106
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０６】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、多発性骨髄腫を有する対象を治療用化合物で治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象にある投薬量の治療用化合物を投与することと、
（ｂ）異なる時点で対象から１つ以上の試料を得ることと、
（ｃ）１つ以上の試料中のＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、または両方のレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１００】
2021525362.tif 000107
の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０７】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物で多発性骨髄腫を有する対象を治療するための投薬量を決定または調整する方法であって、
（ａ）対象から得られた１つ以上の試料中のＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、または両方のレベルを決定し、それによって投薬量が、適切であるか、または調整を必要とするかどうかを決定することを含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３の化合物、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４０８】
いくつかの他の特定の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、化合物治療と共に増加する。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、カスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、及びＴＣＲクローン性からなる群から選択され、バイオマーカーのレベルは、治療用化合物での治療前の参照試料中のレベルと比較して、増加する。いくつかの実施形態では、バイオマーカーはアポトーシスにおいて機能を有し、バイオマーカーのレベルは、治療用化合物での治療前の参照試料中のレベルと比較して、増加する。他の実施形態では、バイオマーカーはＴ細胞活性化において機能を有し、バイオマーカーのレベルは、治療用化合物での治療前の参照試料中のレベルと比較して、増加する。
【０４０９】
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１０１】
2021525362.tif 000108
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１０】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１０２】
2021525362.tif 000109
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１１】
さらに別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１０３】
2021525362.tif 000110
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１２】
別の実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｂ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１３】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１０４】
2021525362.tif 000111
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１０５】
2021525362.tif 000112
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１０６】
2021525362.tif 000113
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性を決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１０７】
2021525362.tif 000114
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１０８】
2021525362.tif 000115
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法であって、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１０９】
2021525362.tif 000116
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４１９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩であって、がんを治療する方法は、
（ａ）がんを有する対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、
（ｄ）対象に治療上有効な量の治療用化合物を投与することと、を含む、
がんを治療する方法での使用のための化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である。
【０４２０】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性である、決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルが、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１１０】
2021525362.tif 000117
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性である、決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルが、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１１１】
2021525362.tif 000118
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２２】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性である、決定することと、
（ｄ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１１２】
2021525362.tif 000119
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２３】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のバイオマーカーのレベルを決定することであって、バイオマーカーが、試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性である、決定することと、
（ｂ）試料中のレベルカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性が、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルが、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１１３】
2021525362.tif 000120
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２５】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルが、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１１４】
2021525362.tif 000121
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２６】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から試料を得ることと、
（ｂ）試料に治療用化合物を投与することと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルが、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１１５】
2021525362.tif 000122
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２７】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測する方法であって、
（ａ）対象から得られた試料に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルが、参照試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルよりも高い場合、対象を、治療用化合物に応答する可能性が高いと診断することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２８】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを、参照試料から得られたカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの増加が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１１６】
2021525362.tif 000123
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４２９】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを、参照試料から得られたカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの増加が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１１７】
2021525362.tif 000124
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４３０】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象に治療用化合物を投与することと、
（ｂ）対象から試料を得ることと、
（ｃ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｄ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを、参照試料から得られたカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの増加が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１１８】
2021525362.tif 000125
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４３１】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、対象に投与されている治療用化合物での対象におけるがんの治療の有効性をモニタリングする方法であって、
（ａ）対象から得られた試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを決定することと、
（ｂ）試料中のカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルを、参照試料から得られたカスパーゼ１、カスパーゼ−３、カスパーゼ７、ＰＡＲＰ、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、ＩＬ２、ｐ２１、ｐ２７、ＢＩＭ、またはＴＣＲクローン性のレベルと比較することであって、参照レベルと比較したレベルの増加が、対象においてがんを治療することにおける治療用化合物の有効性を示す、比較することと、を含み、治療用化合物が、化合物１、化合物２もしくは化合物３、またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、方法である。
【０４３２】
本明細書に記載の方法の特定の実施形態では、参照試料は、治療用化合物での治療前の試料である。
【０４３３】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのタンパク質レベルを決定することによって測定される。
【０４３４】
本明細書で提供される様々な方法の他の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのｍＲＮＡレベルを決定することによって測定される。
【０４３５】
本明細書で提供される様々な方法のさらに他の実施形態では、バイオマーカーのレベルは、バイオマーカーのｃＤＮＡレベルを決定することによって測定される。
【０４３６】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、治療用化合物は、以下のセクション５．７で説明される化合物である。
【０４３７】
いくつかの実施形態では、治療用化合物は化合物１であり、がんはＭＭである。いくつかの実施形態では、治療用化合物は化合物２であり、がんはＭＭである。他の実施形態では、治療用化合物は化合物３であり、がんはＭＭである。
【０４３８】
いくつかの実施形態では、患者もしくは対象の応答性、または治療の有効性は、がんを有する患者の全生存期間（ＯＳ）、完全寛解率（ＣＲＲ）、客観的奏効率（ＯＲＲ）、無増悪期間、無再発生存期間（ＲＦＳ）、無増悪生存期間（ＰＦＳ）、無事象生存期間、寛解持続期間、奏効期間及び／または寛解／奏効までの時間によって決定される。一実施形態では、がんは、血液癌である。ある特定の実施形態では、ＯＲＲは、完全寛解（ＣＲ）（すなわち、形態学的無白血病状態、形態学的ＣＲ、細胞遺伝学的ＣＲ、分子的ＣＲ及び不完全な血液の回復を伴う形態学的ＣＲ）と、部分寛解のすべての奏効を含む。
【０４３９】
他の実施形態では、本明細書で提供される様々な方法は、がん、例えば、血液癌を有する患者の全生存期間（ＯＳ）、完全寛解率（ＣＲＲ）、客観的奏効率（ＯＲＲ）、無増悪期間、無再発生存期間（ＲＦＳ）、無増悪生存期間（ＰＦＳ）、無事象生存期間、寛解持続期間、奏効期間及び／または寛解／奏効までの時間を増加させるためのものである。
【０４４０】
本明細書で提供される他の実施形態は、本明細書で提供される方法のいずれかでの使用のための化合物１、化合物２または化合物３である。
【０４４１】
５．３  バイオマーカーを検出及び定量化する方法
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、試料内のタンパク質を、バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合する第１の抗体と接触させることを含む、生体試料からのバイオマーカー、例えば、ＣＲＢＮ、ＣＲＢＮによって直接もしくは間接的に影響されるタンパク質、または化合物１、化合物２、もしくは化合物３に薬力学（ＰＤ）応答を示すタンパク質（例えば、可溶性ＢＣＭＡ）のタンパク質レベルを検出及び定量化する方法である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、（ｉ）第１の抗体に結合したバイオマーカータンパク質を検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、第２の抗体が、バイオマーカータンパク質に免疫特異的に結合し、第２の抗体が、第１の抗体とは異なるバイオマーカー上のエピトープに免疫特異的に結合する、接触させることと、（ｉｉ）バイオマーカータンパク質に結合した第２の抗体の存在を検出することと、（ｉｉｉ）第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいてバイオマーカータンパク質の量を決定することと、をさらに含む。他の実施形態では、本明細書で提供される方法は、（ｉ）第１の抗体に結合したバイオマーカータンパク質を検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、第２の抗体が、第１の抗体に免疫特異的に結合する、接触させることと、（ｉｉ）第１の抗体に結合した第２の抗体の存在を検出することと、（ｉｉｉ）第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいてバイオマーカータンパク質の量を決定することと、をさらに含む。
【０４４２】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、方法は、二重染色免疫組織化学を使用して、ＣＲＢＮまたはＣＲＢＮによって直接もしくは間接的に影響されるタンパク質などのバイオマーカーのレベルを決定することを含む。二重染色免疫組織化学アッセイにおいて、本明細書で提供されるバイオマーカー及び別のがんバイオマーカーは、本明細書で提供されるバイオマーカーを標的とする第１の標識抗体と、がんバイオマーカーを標的とする第２の標識抗体と、を使用して同時に検出される。そのようなアッセイは、本明細書で提供されるバイオマーカーを検出及び測定するための特異性、精度、及び感度を改善できる。いくつかの実施形態では、がんバイオマーカーは、ＭＭバイオマーカーである。
【０４４３】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、方法は、ＤＮＡを配列決定することを含む。例えば、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定する方法、ならびに治療用化合物に対する多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測する方法である。セレブロンモジュレーター化合物での初期治療に抵抗性である患者は、ＣＲＢＮにおいて変異を有することができる。重要なことに、実施例に示されるように、レナリドマイドまたはポマリドマイドなどのセレブロンモジュレーターに抵抗性である細胞は、依然として化合物１、化合物２、または化合物３に感受性でありうる。したがって、いくつかの実施形態では、方法は、変異についてＣＲＢＮのＤＮＡを配列決定して、治療用化合物に対する応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定することを含み、治療用化合物は、化合物１である。いくつかの実施形態では、方法は、変異についてＣＲＢＮのＤＮＡを配列決定して、治療用化合物に対する応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定することを含み、治療用化合物は、化合物２である。いくつかの実施形態では、方法は、変異についてＣＲＢＮのＤＮＡを配列決定して、治療用化合物に対する応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定することを含み、治療用化合物は、化合物３である。他の実施形態では、方法は、変異についてＣＲＢＮのＤＮＡを配列決定して、治療用化合物に対する多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測することを含み、治療用化合物は、化合物１である。他の実施形態では、方法は、変異についてＣＲＢＮのＤＮＡを配列決定して、治療用化合物に対する多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測することを含み、治療用化合物は、化合物２である。他の実施形態では、方法は、変異についてＣＲＢＮのＤＮＡを配列決定して、治療用化合物に対する多発性骨髄腫を有する対象の応答性を予測することを含み、治療用化合物は、化合物３である。
【０４４４】
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、Ｔ細胞活性化を検出するためのものである。いくつかの実施形態では、ＴＣＲのＤＮＡは、化合物１、化合物２、または化合物３での治療後に配列決定され得る。Ｔ細胞の活性化は、それらのＴＣＲの特定の遺伝子再配列を伴うＴ細胞の集団のクローナル拡大を生じることができる。再配列は、ＤＮＡ配列決定によって決定され得る。したがって、本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、方法バイオマーカーはＴＣＲクローン性であり、ＴＣＲクローン性は、ＴＣＲのＤＮＡ配列決定によって測定される。
【０４４５】
したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、（ｉ）試料内のタンパク質を、本明細書で提供されるバイオマーカーに免疫特異的に結合する第１の抗体と接触させることであって、第１の抗体が第１の検出可能な標識と結合している、接触させることと、（ｉｉ）試料内のタンパク質を、がんバイオマーカーに免疫特異的に結合する第２の抗体と接触させることであって、第２の抗体が第２の検出可能な標識と結合している、接触させることと、（ｉｉｉ）タンパク質に結合した第１の抗体及び第２の抗体の存在を検出することと、（ｉｖ）第１の抗体中の検出可能な標識の量に基づいて本明細書で提供されるバイオマーカーのレベルを決定し、第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいてがんバイオマーカーのレベルを決定することと、を含む。いくつかの実施形態では、がんバイオマーカーは、ＭＭバイオマーカーである。
【０４４６】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、生体試料からのバイオマーカー、例えば、ＡｉｏｌｏｓもしくはＩｋａｒｏｓ、または本明細書で提供される任意の他のバイオマーカーのタンパク質レベルを検出及び定量化する方法であって、（ｉ）バイオマーカータンパク質を第１の抗体と接触させることと、（ｉｉ）第１の抗体に結合したバイオマーカータンパク質を、検出可能な標識を有する第２の抗体と接触させることであって、第２の抗体が第１の抗体に免疫特異的に結合する、接触させることと、（ｉｉｉ）バイオマーカータンパク質との複合体に結合した第２の抗体の存在を検出することと、（ｉｖ）フローサイトメトリー（例えば、ＦＡＣＳ）を使用して、第２の抗体中の検出可能な標識の量に基づいてバイオマーカータンパク質の量を決定することと、を含む、方法である。ＡｉｏｌｏｓまたはＩｋａｒｏｓなどのバイオマーカータンパク質レベルの検出及び定量化は、がん細胞及び非がん細胞（例えば、ＣＤ３＋Ｔ細胞）において実行され得ることが、さらに理解される。例えば、Ａｉｏｌｏｓ及び／またはＩｋａｒｏｓの発現は、化合物１、化合物２、または化合物３での治療前、治療中、及び／または治療後のＣＤ３＋Ｔ細胞中のフローサイトメトリーによって測定され得る。いくつかの実施形態では、がんバイオマーカーは、ＭＭバイオマーカーである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＴＣである。
【０４４７】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、生体試料からのバイオマーカー発現、例えば、ＣＲＢＮ、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ−３、ならびにＴＩＬなどのバイオマーカー発現を評価する方法であって、（ｉ）化合物１、化合物２、または化合物３での治療前、治療中、及び／または治療後に骨髄穿刺液試料を収集することと、（ｉｉ）各試料から血餅を生成することと、（ｉｉｉ）例えば、ホルマリン中で血餅を固定することと、（ｉｖ）血餅パラフィン、または凍結包埋培地（例えば、ＯＣＴ）を包埋することと、（ｖ）免疫染色のために包埋された試料を切片化することと、（ｖｉ）切片に対して免疫組織化学（ＩＨＣ）を実行することと、（ｖｉｉ）顕微鏡によって染色された試料を視覚化することと、（ｖｉｉｉ）バイオマーカー発現を評価することと、を含む、方法である。
【０４４８】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、生体試料からのバイオマーカーとして腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）を検出及び定量化する方法であって、（ｉ）組織学的検体をヘマトキシリン及びエオシン（Ｈ＆Ｅ）で染色することと、（ｉｉ）光学顕微鏡を使用してＴＩＬを視覚化することと、（ｉｉｉ）形態及び染色に基づいてＴＩＬを検出することと、（ｉｖ）腫瘍の内側を染色する（すなわち、浸潤する）リンパ球の量に基づいてＴＩＬのレベルを決定することと、を含む、方法である。
【０４４９】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、生体試料からのバイオマーカー、例えば、ＣＲＢＮまたは本明細書で提供されるバイオマーカーのＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ、総ＲＮＡ、または低分子ＲＮＡ）レベルを検出及び定量化する方法であって、（ａ）試料からＲＮＡを得ることと、（ｂ）ＲＮＡを、ＲＮＡ中の配列に特異的に結合するプライマーと接触させて、該ＲＮＡに相補的な配列を有する第１のＤＮＡ分子（すなわち、ｃＤＮＡ）を生成することと、（ｃ）バイオマーカーをコードする遺伝子のセグメントに対応するｃＤＮＡを増幅することと、（ｄ）増幅されたＤＮＡの量に基づいてバイオマーカーのＲＮＡレベルを決定することと、を含む、方法である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、生体試料からのバイオマーカーのＲＮＡを配列決定する（ＲＮＡ−ｓｅｑ）方法であって、（ａ）試料からＲＮＡを単離することと、（ｂ）リボソームＲＮＡ（ｒＲＮＡ）を枯渇させること、３’ポリアデニル化（ポリ（Ａ））尾部を有するＲＮＡについて富化することの両方、またはどちらでもない、（ｃ）ＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写することと、（ｄ）ｃＤＮＡを配列決定することと、を含む、方法である。いくつかの実施形態では、バイオマーカー（複数可）は、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ１、ｃ−カスパーゼ−３、ｃ−カスパーゼ７、切断型ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ｓＦＬＣ、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲＢ１、可溶性ＢＣＭＡ、ＣＴＣ、ＴＩＬ、ＩＬ−２、ＩＦＮγ、ＴＮＦα、及びＴＣＲのクローン性などの、本明細書で提供される他のバイオマーカー（複数可）と組み合わせて評価される。
【０４５０】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、アポトーシスにおいて機能を有する１つ以上のバイオマーカーを検出及び定量化する方法である。アポトーシスを検出するための様々な方法があることは、当業者によく知られている。１つの方法は、アポトーシスの特徴であるＤＮＡ断片化の検出に関与する。末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼｄＵＴＰニックエンドラベリング（ＴＵＮＥＬ）は、ＤＮＡ断片を検出するための確立された方法である。したがって、本明細書で提供される様々な方法のある特定の実施形態では、バイオマーカーはアポトーシスにおいて機能を有し、バイオマーカーのレベルは、末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラーゼｄＵＴＰニックエンドラベリング（ＴＵＮＥＬ）によって測定される。
【０４５１】
アポトーシスの初期の事象のうちの１つは、原形質膜の内側から表面への膜ホスファチジルセリン（ＰＳ）の転流を含む。Ｃａ２＋依存性リン脂質結合タンパク質であるアネキシンＶは、ＰＳに対して高い親和性を有し、蛍光色素標識アネキシンＶは、フローサイトメトリーを使用して曝露されたＰＳの検出のために使用され得る。ＤＮＡに結合する蛍光挿入剤の使用は、初期アポトーシス細胞と後期のアポトーシス細胞との間の識別をさらに促進できる。初期のアポトーシス細胞である細胞は、７−アミノアクチノマイシンＤ（７−ＡＡＤ）及びヨウ化プロピジウム（ＰＩ）などの蛍光挿入剤を除外するだろうが、後期のアポトーシス細胞は、これらの色素がＤＮＡに結合する核へのこれらの色素の通過により、陽性染色されるであろう。７−ＡＡＤ及びＰＩは、高いＤＮＡ結合定数を有し、無傷の細胞によって効率的に除外される。したがって、本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、バイオマーカーはアポトーシスにおいて機能を有し、バイオマーカーのレベルはアネキシンＶ及び７−ＡＡＤによって測定される。本明細書で提供される様々な方法の他の実施形態では、バイオマーカーはアポトーシスにおいて機能を有し、バイオマーカーのレベルはアネキシンＶ及びヨウ化プロピジウム（ＰＩ）によって測定される。
【０４５２】
本明細書で提供される様々な方法のある特定の実施形態では、２つ以上のステップが、順次実行される。本明細書で提供される方法の他の実施形態では、２つ以上のステップが、並行して（例えば、同時に）実行される。
【０４５３】
Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、切断型カスパーゼ−３、可溶性ＢＣＭＡ（ｓＢＣＭＡ）、可溶性ＦＬＣ（ｓＦＬＣ）、活性化Ｔ細胞関連サイトカイン、またはそれらの組み合わせなどの、バイオマーカーのタンパク質レベルを検出及び定量化する方法のために本明細書で提供される例示的なアッセイは、ウエスタンブロット分析、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）（例えば、サンドイッチＥＬＩＳＡ）、免疫組織化学（ＩＨＣ）、及び蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）などの、イムノアッセイである。例として、いくつかの実施形態では、血清試料は、化合物１、化合物２、または化合物３での治療前、治療中、及び／または治療後に収集され得、ｓＢＣＭＡは、ＥＬＩＳＡによって測定され得る。Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＣＲＢＮ、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、活性化Ｔ細胞関連サイトカイン、またはそれらの組み合わせなどのバイオマーカーのＲＮＡレベルを検出及び定量化する方法のために本明細書で提供される例示的なアッセイは、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、例えば、定量的ＲＴ−ＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）、及びＲＮＡ−Ｓｅｑである。
【０４５４】
５．４．対象、試料、及び細胞のタイプ
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々な方法は、対象または個人（例えば、患者）からの試料（例えば、生体試料）を使用する。対象は、がん（例えば、多発性骨髄腫）を有する患者などの患者であり得る。対象は、哺乳動物、例えば、ヒトであり得る。対象は、男性または女性であり得、成人、子供、または幼児であり得る。試料は、がん（例えば、ＭＭ）が活性である期間中、またはがん（例えば、ＭＭ）が非活性である際に、一度に分析され得る。ある特定の実施形態では、対象からの２つ以上の試料を得ることができる。
【０４５５】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される試料は、対象からの体液を含む。体液の非限定的な例は、血液（例えば、全血）、血漿、羊膜液、水性体液、胆汁、骨髄、耳垢、カウパー液、射精前液、乳び、糜汁、女性射出液、間質液、リンパ液、月経分泌物、母乳、粘液、胸膜液、膿、唾液、皮脂、精液、血清、汗、涙、尿、膣分泌液、嘔吐物、水、糞便、体内液（脳及び脊髄を取り巻く脳脊髄液を含む）、滑膜液、細胞内液（細胞内側の体液）、及び硝子体液（眼球内の体液）を含む。いくつかの実施形態では、試料は、血液試料である。血液試料は、例えば、Ｉｎｎｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．，ＰＣＲ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，１９９０）に記載される従来の技法を使用して得ることができる。白血球は、従来の技法または市販のキット、例えば、ＲｏｓｅｔｔｅＳｅｐキット（Ｓｔｅｉｎ  Ｃｅｌｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｖａｎｃｏｕｖｅｒ，Ｃａｎａｄａ）を使用して血液試料から分離され得る。白血球の亜集団、例えば、単核細胞、Ｂ細胞、Ｔ細胞、単球、顆粒球、またはリンパ球は、従来の技法、例えば、磁気活性化セルソーティング（ＭＡＣＳ）（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃ，Ａｕｂｕｒｎ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）または蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）（Ｂｅｃｔｏｎ  Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，Ｓａｎ  Ｊｏｓｅ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）を使用してさらに単離され得る。
【０４５６】
一実施形態では、血液試料は、約０．１ｍＬ〜約１０．０ｍＬ、約０．２ｍＬ〜約７ｍＬ、約０．３ｍＬ〜約５ｍＬ、約０．４ｍＬ〜約３．５ｍＬ、または約０．５ｍＬ〜約３ｍＬである。別の実施形態では、血液試料は、約０．３、約０．４、約０．５、約０．６、約０．７、約０．８、約０．９、約１．０、約１．５、約２．０、約２．５、約３．０、約３．５、約４．０、約４．５、約５．０、約６．０、約７．０、約８．０、約９．０、または約１０．０ｍＬである。
【０４５７】
いくつかの実施形態では、血液試料は、エクスビボＴ細胞活性化アッセイのために、抗ＣＤ３抗体を含有するＴｒｕＣｕｌｔｕｒｅチューブに引き込まれる。
【０４５８】
いくつかの実施形態では、骨髄試料は、約０．１ｍＬ〜約１０．０ｍＬ、約０．２ｍＬ〜約７ｍＬ、約０．３ｍＬ〜約５ｍＬ、約０．４ｍＬ〜約３．５ｍＬ、または約０．５ｍＬ〜約３ｍＬである。別の実施形態では、血液試料は、約０．３、約０．４、約０．５、約０．６、約０．７、約０．８、約０．９、約１．０、約１．５、約２．０、約２．５、約３．０、約３．５、約４．０、約４．５、約５．０、約６．０、約７．０、約８．０、約９．０、または約１０．０ｍＬである。
【０４５９】
いくつかの実施形態では、本方法で使用される試料は、生検（例えば、腫瘍生検）を含む。生検は、任意の臓器または組織、例えば、皮膚、肝臓、肺、心臓、結腸、腎臓、骨髄、歯、リンパ節、毛、脾臓、脳、乳房、または他の臓器からのものであり得る。当業者に既知の任意の生検技法、例えば、開放生検、閉鎖生検、コア生検、切開生検、切除生検、または細針吸引生検が、対象から試料を単離するために使用され得る。
【０４６０】
一実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される試料は、対象が疾患または障害に対する治療を受ける前に、対象から得られる。いくつかの実施形態では、試料は、化合物１、化合物２、または化合物３以外の療法での治療を受けた後、かつ対象が化合物１、化合物２、または化合物３での治療を受ける前に、対象から得られる。特定の実施形態では、試料は、疾患が再発した後、または患者が、化合物１、化合物２、もしくは化合物３以外の療法に対して難治性の状態である後に対象から得られる。別の実施形態では、試料は、対象が疾患または障害に対する治療を受けている間に対象から得られる。別の実施形態では、試料は、対象が疾患または障害に対する治療を受けた後に対象から得られる。様々な実施形態では、治療は、化合物（例えば、化合物１、化合物２、または化合物３）を対象に投与することを含む。
【０４６１】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される試料は、がん（例えば、ＭＭ）細胞などの複数の細胞を含む。そのような細胞は、任意のタイプの細胞、例えば、幹細胞、血液細胞（例えば、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ））、リンパ球、Ｂ細胞、Ｔ細胞、単球、顆粒球、免疫細胞、またはがん細胞を含み得る。
【０４６２】
特定の細胞集団は、市販の抗体（例えば、Ｑｕｅｓｔ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ（Ｓａｎ  Ｊｕａｎ  Ｃａｐｉｓｔｒａｎｏ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）またはＤａｋｏ（Ｄｅｎｍａｒｋ）からの抗体）の組み合わせを使用して得ることができる。
【０４６３】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法における細胞は、ＰＢＭＣである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される試料は、疾患組織から、例えば、がん（例えば、ＭＭ）を有する個体からのものである。
【０４６４】
ある特定の実施形態では、細胞株は、化合物の効果を評価するため、作用機序を試験するため、またはバイオマーカーの参照レベルを確立するためなどの疾患モデルとして使用される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される細胞は、がん（例えば、ＭＭ）細胞株からのものである。一実施形態では、ＭＭ細胞株は、ＤＦ１５細胞株である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、レナリドマイド及びポマリドマイドに対して抵抗性であるようにされたＤＦ１５細胞株（ＤＦ１５Ｒ）である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、ＮＣＩ−Ｈ９２９である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、レナリドマイドに対して抵抗性であるようにされたＮＣＩ−Ｈ９２９（ＮＣＩ−Ｈ９２９−１０５１）である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、ポマリドマイドに対して抵抗性であるようにされたＮＣＩ−Ｈ９２９（ＮＣＩ−Ｈ９２９−Ｐ０１）である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、ＯＰＭ２である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、１００ｎＭのポマリドマイドに対して抵抗性であるようにされたＯＰＭ２細胞株（ＯＰＭ２−Ｐ０１）である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、１μＭのポマリドマイドに対して抵抗性であるようにされたＯＰＭ２細胞株（ＯＰＭ２−Ｐ１）である。別の実施形態では、ＭＭ細胞株は、１０μＭのポマリドマイドに対して抵抗性であるようにされたＯＰＭ２細胞株（ＯＰＭ２−Ｐ１０）である。
【０４６５】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法は、個体からの細胞における遺伝子再配列を検出するのに有用である。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法は、化合物１、化合物２、または化合物３での治療後のＴＣＲ遺伝子再配列を検出するのに有用である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される細胞の数は、単一の細胞から約１０９個の細胞の範囲に及ぶことができる。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法で使用される細胞の数は、約１×１０４、約５×１０４、約１×１０５、約５×１０５、約１×１０６、約５×１０６、約１×１０７、約５×１０７、約１×１０８、約５×１０８、または約１×１０９であり得る。
【０４６６】
対象から収集される細胞の数及びタイプは、例えば、フローサイトメトリー、セルソーティング、免疫細胞化学（例えば、組織特異的抗体または細胞マーカー特異的抗体での染色）、蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）、磁気活性化セルソーティング（ＭＡＣＳ）などの標準的な細胞検出技法を使用して細胞表面マーカーの変化を測定することによって、ヘマトキシリン及びエオシン（Ｈ＆Ｅ）染色腫瘍切片の評価によって、光学顕微鏡もしくは共焦点顕微鏡を使用する細胞の形態の検査によって、及び／またはＰＣＲ及び遺伝子発現プロファイリングなどの当技術分野で周知の技法を使用して遺伝子発現の変化を測定することによって、モニタリングされ得る。これらの技法は、１つ以上の特定のマーカーに対して陽性である細胞を特定するためにも使用され得る。
【０４６７】
ある特定の実施形態では、細胞のサブセットは、本明細書で提供される方法で使用される。細胞の特定の集団を選別及び単離する方法は、当技術分野で周知であり、細胞のサイズ、形態、Ｈ＆Ｅ染色、細胞内マーカーまたは細胞外マーカーに基づくことができる。そのような方法は、フローサイトメトリー、フローソーティング、ＦＡＣＳ、磁気セルソーティングなどのビーズベースの分離、サイズベースの分離（例えば、ふるい、障害物の配列またはフィルター）、Ｈ＆Ｅ染色、マイクロフルイディクスデバイスでのソーティング、抗体ベースの分離、沈降、親和性吸着、親和性抽出、密度勾配遠心分離、レーザーキャプチャーマイクロダイセクションなどを含むが、これらに限定されない。蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）は、細胞を含む粒子の蛍光特性に基づいて粒子を分離するための周知の方法である（Ｋａｍａｒｃｈ，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｅｎｚｙｍｏｌ．１９８７，１５１：１５０−１６５）。個々の粒子の蛍光部分のレーザー励起は、混合物から正の粒子及び負の粒子の電磁分離を可能にする僅かな電荷を生じる。一実施形態では、細胞表面マーカー特異的な抗体またはリガンドは、別個の蛍光標識で標識される。細胞は、セルソーターを通じて処理され、使用される抗体に結合する能力に基づいた細胞の分離を可能にする。ＦＡＣＳ選別された粒子は、分離及びクローニングを促進するために、９６ウェルまたは３８４ウェルプレートの個々のウェルに直接入れられ得る。
【０４６８】
一実施形態では、ＤＮＡ、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）またはタンパク質は試料から精製され、バイオマーカーの有無はＤＮＡもしくはＲＮＡ配列、遺伝子発現、またはタンパク質発現を分析することによって測定される。ある特定の実施形態では、バイオマーカーの有無は、次世代シーケンシング（ＮＧＳ）、ＲＮＡ配列決定（ＲＮＡ−ｓｅｑ）、蛍光インサイツハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）、マイクロアレイ、フローサイトメトリー、免疫組織化学、または免疫蛍光法によって測定される。他の実施形態では、バイオマーカーの有無は、ＥＬＩＳＡまたは当技術分野で既知の他の同様の方法によって測定される。
【０４６９】
５．５  試料中のｍＲＮＡレベルを検出する方法
ｍＲＮＡレベルを分析、検出、または定量するいくつかの方法が、当技術分野で既知である。例示的な方法は、ノーザンブロット、ＲＮＡ−ｓｅｑ、リボヌクレアーゼ保護アッセイ、ＰＣＲベースの方法などを含むが、これらに限定されない。バイオマーカー（例えば、ＣＲＢＮまたはＣＲＢＮによって直接もしくは間接的に影響されるタンパク質のｍＲＮＡ、あるいはその断片）のｍＲＮＡ配列は、ｍＲＮＡ配列に少なくとも部分的に相補的であるプローブを調製するために使用され得る。次いで、プローブは、ＰＣＲベースの方法、ノーザンブロッティング、ディップスティックアッセイなどの任意の好適なアッセイを使用して、試料中のｍＲＮＡを検出するために使用され得る。
【０４７０】
他の実施形態では、生体試料における化合物活性について試験するための核酸アッセイが、調製され得る。アッセイは、典型的に、固体支持体と、支持体と接触している少なくとも１つの核酸と、を含み、核酸は、バイオマーカー（例えば、ＣＲＢＮまたはＣＲＢＮによって直接もしくは間接的に影響されるタンパク質）のｍＲＮＡなどの、患者における化合物治療中の発現を改変したｍＲＮＡの少なくとも一部に対応する。アッセイはまた、試料中のｍＲＮＡの改変された発現を検出するための手段を有することができる。
【０４７１】
アッセイ方法は、所望のｍＲＮＡ情報のタイプに応じて変化し得る。例示的な方法は、ノーザンブロット及びＰＣＲベースの方法（例えば、ｑＲＴ−ＰＣＲ）を含むが、これらに限定されない。ｑＲＴ−ＰＣＲなどの方法はまた、試料中のｍＲＮＡの量を正確に定量することができる。
【０４７２】
任意の好適なアッセイプラットフォームは、試料中のｍＲＮＡの存在を決定するために使用され得る。例えば、アッセイは、ディップスティック、膜、チップ、ディスク、試験紙、フィルター、マイクロスフェア、スライド、マルチウェルプレートまたは光ファイバーの形態であり得る。アッセイシステムは、ｍＲＮＡに対応する核酸が結合している固体支持体を有することができる。固体支持体は、例えば、プラスチック、シリコン、金属、樹脂、ガラス、膜、粒子、沈殿物、ゲル、ポリマー、シート、球体、多糖、キャピラリー、フィルム、プレート、またはスライドを含み得る。アッセイ成分は、ｍＲＮＡを検出するためのキットとして、一緒に調製及びパッケージ化され得る。
【０４７３】
核酸は、所望の場合、標識されたｍＲＮＡの集団を作製するために標識され得る。一般に、試料は、当技術分野で周知である方法を使用して（例えば、ＤＮＡリガーゼ、ターミナルトランスフェラーゼを使用して、またはＲＮＡ骨格を標識することなどによってなど）標識され得る。例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｈｏｒｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ，３ｒｄ  ｅｄ．１９９５）、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．，３ｒｄ  ｅｄ．２００１）を参照されたい。いくつかの実施形態では、試料は、蛍光標識で標識される。例示的な蛍光色素は、キサンテン色素、フルオレセイン色素、（例えば、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、６−カルボキシフルオレセイン（ＦＡＭ）、６カルボキシ−２’，４’，７’，４，７−ヘキサクロロフルオレセイン（ＨＥＸ）、６−カルボキシ−４’，５’−ジクロロ−２’，７’−ジメトキシフルオレセイン（ＪＯＥ））、ローダミン色素（例えば、ローダミン１１０（Ｒ１１０）、Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’−テトラメチル−６−カルボキシローダミン（ＴＡＭＲＡ）、６−カルボキシ−Ｘ−ローダミン（ＲＯＸ）、５−カルボキシローダミン６Ｇ（Ｒ６Ｇ５またはＧ５）、６−カルボキシローダミン６Ｇ（Ｒ６Ｇ６またはＧ６））、シアニン色素（例えば、Ｃｙ３、Ｃｙ５及びＣｙ７）、Ａｌｅｘａ色素（例えば、Ａｌｅｘａ−ｆｌｕｏｒ−５５５）、クマリン、ジエチルアミノクマリン、ウンベリフェロン、ベンズイミド色素（例えば、Ｈｏｅｃｈｓｔ３３２５８）、フェナントリジン色素（例えば、Ｔｅｘａｓ  Ｒｅｄ）、エチジウム色素、アクリジン色素、カルバゾール色素、フェノキサジン色素、ポルフィリン色素、ポリメチン色素、ＢＯＤＩＰＹ色素、キノリン色素、ピレン、フルオレセインクロロトリアジニル、エオシン色素、テトラメチルローダミン、リサミン、ナフトフルオレセインなどを含むが、これらに限定されない。
【０４７４】
いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡ配列は、本明細書で提供されるバイオマーカーの少なくとも１つのｍＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲｂ１、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγのｍＲＮＡ、またはその断片からなる群から選択される。
【０４７５】
一実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲｂ１、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγのｍＲＮＡ、またはその断片からなる群から選択される。一実施形態では、ｍＲＮＡは、ＣＲＢＮ  ｍＲＮＡである。別の実施形態では、ｍＲＮＡは、ＩＫＺＦ１  ｍＲＮＡである。さらに別の実施形態では、ｍＲＮＡは、ＩＫＺＦ３  ｍＲＮＡである。別の実施形態では、ｍＲＮＡは、ｃ−ＭＹＣ  ｍＲＮＡである。さらに別の実施形態では、ｍＲＮＡは、ＩＲＦ４  ｍＲＮＡである。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ＺＦＰ９１である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ｐ２１である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ｐ２７である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ｐＲｂ１である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、カスパーゼ−１である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、カスパーゼ−３である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、カスパーゼ−７である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ＰＡＲＰである。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、サバイビンである。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ＢＩＭである。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ＩＬ−２である。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ＴＮＦαである。いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡは、ＩＦＮγである。核酸は、固体支持体上の特定のアドレス指定可能な位置に存在し得、各々、細胞または患者において治療時に差次的に発現されるｍＲＮＡ配列の少なくとも一部に対応する。
【０４７６】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、対照での治療に対して、細胞または患者における化合物での治療時に差次的に発現される複数のｍＲＮＡ配列である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、化合物での治療時に２つの異なる細胞集団間で差次的に発現される複数のｍＲＮＡ配列である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、化合物１、化合物２、または化合物３での治療に応答して、ＣＤ１３８＋細胞とＣＤ１３８−細胞との間で差次的に発現される複数のｍＲＮＡ配列である。
【０４７７】
典型的なｍＲＮＡアッセイ方法は、１）表面結合対象プローブを得るステップと、２）特異的結合を提供するのに十分な条件で、ｍＲＮＡの集団を表面結合プローブにハイブリダイズさせるステップと、（３）表面結合プローブに特異的に結合しない核酸を除去するためのハイブリダイゼーション後洗浄のステップと、（４）ハイブリダイズしたｍＲＮＡを検出するステップと、を含むことができる。これらのステップのそれぞれで使用される試薬と、それらの使用のための条件は、特定の用途に応じて変化し得る。
【０４７８】
ハイブリダイゼーションは、好適なハイブリダイゼーション条件下で実施され得、条件は、所望によってストリンジェンシーが異なり得る。典型的な条件は、相補的な結合メンバー間、すなわち、表面結合対象プローブと試料中の相補的ｍＲＮＡとの間の固体表面上にプローブ／標的複合体を産生するのに十分である。ある特定の実施形態では、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件が、用いられ得る。
【０４７９】
ハイブリダイゼーションは、典型的に、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で実行される。標準的なハイブリダイゼーション技法（例えば、試料中の標的ｍＲＮＡのプローブに対する特異的結合を提供するのに十分な条件下）は、Ｋａｌｌｉｏｎｉｅｍｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ  １９９２，２５８：８１８−８２１及び国際特許出願公開第ＷＯ９３／１８１８６号に記載されている。一般的技法に対するいくつかの手引きが、利用可能であり、例えば、Ｔｉｊｓｓｅｎ，Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ｗｉｔｈ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｐｒｏｂｅｓ，Ｐａｒｔｓ  Ｉ  ａｎｄ  ＩＩ（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ａｍｓｔｅｒｄａｍ  １９９３）である。インサイツハイブリダイゼーションに好適な技法の説明については、Ｇａｌｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１９８１，２１：４７０−４８０、Ａｎｇｅｒｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｇｅｎｅｔｉｃ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｍｅｔｈｏｄｓ，Ｖｏｌ  ７，ｐｇｓ  ４３−６５（Ｐｌｅｎｕｍ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｓｅｔｌｏｗ  ａｎｄ  Ｈｏｌｌａｅｎｄｅｒ，ｅｄｓ．１９８５）を参照されたい。温度、塩濃度、ポリヌクレオチド濃度、ハイブリダイゼーション時間、洗浄条件のストリンジェンシーなどを含む適切な条件の選択は、試料の由来源、捕捉物質の同一性、予想される相補性の程度などを含む実験設計に依存し、当業者のための日常的な実験の要素として決定され得る。
【０４８０】
当業者は、代替的ではあるが、同等のハイブリダイゼーション及び洗浄条件が、同様のストリンジェンシーの条件を提供するために使用され得ることを、容易に認識するであろう。
【０４８１】
ｍＲＮＡハイブリダイゼーション手順の後、表面に結合したポリヌクレオチドは、典型的に、未結合の核酸を除去するために洗浄される。洗浄は、任意の簡便な洗浄プロトコルを使用して実行され得、洗浄条件は、典型的に、上記のように、ストリンジェントである。次いで、プローブに対する標的ｍＲＮＡのハイブリダイゼーションは、標準的な技法を使用して検出される。
【０４８２】
ＰＣＲベースの方法などの他の方法はまた、ＣＲＢＮまたはＣＲＢＮによって直接もしくは間接的に影響されるタンパク質の発現を検出するために使用され得る。ＰＣＲ法の例は、参照によって全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第６，９２７，０２４号に見いだされ得る。ＲＴ−ＰＣＲ法の例は、参照によって全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第７，１２２，７９９号に見いだされ得る。蛍光インサイツＰＣＲの方法は、参照によって全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第７，１８６，５０７号に記載されている。
【０４８３】
いくつかの実施形態では、定量的逆転写−ＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）は、ＲＮＡ標的の検出及び定量化の両方のために使用され得る（Ｂｕｓｔｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｓｃｉ．２００５，１０９：３６５−３７９）。ｑＲＴ−ＰＣＲによって得られる定量的結果は、一般に、定性的データよりも有益である。したがって、いくつかの実施形態では、ｑＲＴ−ＰＣＲベースのアッセイは、細胞ベースのアッセイ中にｍＲＮＡレベルを測定するのに有用であり得る。ｑＲＴ−ＰＣＲ法はまた、患者療法をモニタリングするのに有用である。ｑＲＴ−ＰＣＲベースの方法の例は、例えば、参照によって全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第７，１０１，６６３号に見いだされ得る。
【０４８４】
通常の逆転写酵素ＰＣＲ及びアガロースゲルによる分析とは対照的に、ｑＲＴ−ＰＣＲは、定量的結果を生じる。ｑＲＴ−ＰＣＲのさらなる利点は、使用の相対的な容易さ及び簡便さである。Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ７５００などのｑＲＴ−ＰＣＲのための機器は、市販されており、ＴａｑＭａｎ（登録商標）配列検出化学物質などの試薬も、市販されている。例えば、ＴａｑＭａｎ（登録商標）遺伝子発現アッセイは、製造業者の使用説明書に従って使用され得る。これらのキットは、ヒト、マウス、及びラットのｍＲＮＡ転写産物の迅速な、信頼できる検出及び定量化のための、事前製剤化された遺伝子発現アッセイである。例示的なｑＲＴ−ＰＣＲプログラムは、例えば、５０℃で２分間、９５℃で１０分間、４０サイクルの１５秒間９５℃、次いで、６０℃で１分間である。
【０４８５】
特定のアンプリコン蓄積に関連する蛍光シグナルが閾値と交差するサイクル数（ＣＴと称される）を決定するために、データは、例えば、比較ＣＴ相対定量算出方法を使用することに対して、７５００リアルタイムＰＣＲシステム配列検出ソフトウェアを使用して、分析され得る。この方法を使用すると、出力は、発現レベルの変化倍率として表される。いくつかの実施形態では、閾値レベルは、ソフトウェアによって自動的に決定されるように選択され得る。いくつかの実施形態では、閾値レベルは、ベースラインを上回るが、増幅曲線の指数関数的成長領域内にあるには十分低いように設定される。
【０４８６】
いくつかの実施形態では、ｍＲＮＡの発現は、ＲＮＡを配列決定すること（ＲＮＡ−Ｓｅｑ）によって決定される。ＲＮＡ−Ｓｅｑについての技法は当業者に周知であり、方法は、Ｗａｅｒｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ．，２０１１，７５９：１２５−１３２、Ｗｉｌｈｅｌｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ，２０１０，５（２）：２５５−６６、及びＨｏｅｉｊｍａｋｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ．，２０１３，９２３：２２１−３９に記載されている。簡単に言えば、典型的なＲＮＡ−ｓｅｑ方法は、（１）ＲＮＡを単離するステップと、（２）リボソームＲＮＡを枯渇させるステップと、（３）ｃＤＮＡ合成ステップと、（４）Ｎｅｘｔ−Ｇｅｎ配列決定によってｃＤＮＡを配列決定するステップと、を含むことができる。
【０４８７】
５．６  試料中のポリペプチドまたはタンパク質レベルを検出する方法
いくつかのタンパク質検出及び定量化方法は、ＣＲＢＮ、またはＡｉｏｌｏｓやＩｋａｒｏｓなどのＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質などの、バイオマーカーのレベルを測定するために使用され得る。任意の好適なタンパク質定量化方法が、使用され得る。いくつかの実施形態では、抗体ベースの方法が、使用される。使用され得る例示的な方法は、イムノブロッティング（ウエスタンブロット）、ＥＬＩＳＡ）、免疫組織化学、フローサイトメトリー、蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）、サイトメトリービーズアレイ、質量分析などを含むが、これらに限定されない。直接的ＥＬＩＳＡ、間接的ＥＬＩＳＡ、及びサンドイッチＥＬＩＳＡを含む、いくつかのタイプのＥＬＩＳＡが、一般的に使用される。
【０４８８】
いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４、ｐ２１、ｐ２７、ｐＲｂ１、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、ＩＬ−２、ＴＮＦα、ＩＦＮγ、可溶性ＢＣＭＡ、遊離ラムダ軽鎖、及び遊離カッパ軽鎖のタンパク質からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮによって直接または間接的に影響されるタンパク質である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮタンパク質である。特定の実施形態では、バイオマーカーはＣＲＢＮであり、それはＩＨＣによって検出される。別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＣＲＢＮ、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ−３、及び／またはＴＩＬであり、ＩＨＣによって測定される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓからなる群から選択され、ＦＡＣＳによって検出される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓからなる群から選択され、ＥＬＩＳＡによって検出される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、サバイビン、ＢＩＭ、遊離ラムダ軽鎖、及び遊離カッパ軽鎖からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、遊離ラムダ軽鎖、及び遊離カッパ軽鎖からなる群から選択される。特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、Ｉｋａｒｏｓである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ｃ−ＭＹＣである。特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＲＦ４である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、切断型カスパーゼ−３である。別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＺＦＰ９１である。さらに別の特定の実施形態では、バイオマーカーは、ｐ２１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ｐ２７である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ｐ２７である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ｐＲｂ１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、カスパーゼ−１である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、カスパーゼ−３である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、カスパーゼ−７である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＰＡＲＰである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、サバイビンである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＢＩＭである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＬ−２である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ｐ２７である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＴＮＦαである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＦＮγである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、可溶性ＢＣＭＡである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、遊離ラムダ軽鎖、及び���離カッパ軽鎖である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、遊離ラムダ軽鎖である。特定の実施形態では、バイオマーカーは、遊離カッパ軽鎖である。
【０４８９】
５．７  化合物
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、化合物は、４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（化合物１）：
【化１１９】
2021525362.tif 000126
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である。
【０４９０】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、化合物は、（Ｓ）−４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（化合物２）：
【化１２０】
2021525362.tif 000127
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である。
【０４９１】
本明細書で提供される様々な方法のいくつかの実施形態では、化合物は、（Ｒ）−４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（化合物３）：
【化１２１】
2021525362.tif 000128
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である。
【０４９２】
本明細書で提供される様々な化合物は、キラル中心を含有でき、エナンチオマーの混合物（例えば、ラセミ混合物）またはジアステレオマーの混合物として存在できる。本明細書で提供される方法は、そのような化合物の立体異性体的に純粋な形態、ならびにそれらの形態の混合物の使用を包含する。例えば、特定の化合物のエナンチオマーの等量または不等量を含む混合物が、本明細書で提供される方法で使用され得る。これらの異性体は、不斉合成され得るか、またはキラルカラムもしくはキラル分割剤などの標準的な技法を使用して分割され得る。Ｊａｃｑｕｅｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｅｎａｎｔｉｏｍｅｒｓ，Ｒａｃｅｍａｔｅｓ  ａｎｄ  Ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎｓ（Ｗｉｌｅｙ−Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，１９８１）、Ｗｉｌｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ  １９７７，３３：２７２５−２７３６、Ｅｌｉｅｌ，Ｓｔｅｒｅｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ｃａｒｂｏｎ  Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ（ＭｃＧｒａｗ−Ｈｉｌｌ，ＮＹ，１９６２）、Ｗｉｌｅｎ，Ｔａｂｌｅｓ  ｏｆ  Ｒｅｓｏｌｖｉｎｇ  Ａｇｅｎｔｓ  ａｎｄ  Ｏｐｔｉｃａｌ  Ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎｓ，ｐ．２６８（Ｅｌｉｅｌ，ｅｄ．，Ｕｎｉｖ．ｏｆ  Ｎｏｔｒｅ  Ｄａｍｅ  Ｐｒｅｓｓ，Ｎｏｔｒｅ  Ｄａｍｅ，ＩＮ，１９７２）を参照されたい。
【０４９３】
また、本明細書で提供されるのは、本明細書で提供される化合物の同位体的に富化された類似体である。薬物動態（「ＰＫ」）、薬力学（「ＰＤ」）、及び毒性プロファイルを改善するための医薬品の同位体富化（例えば、重水素化）は、いくつかのクラスの薬物で以前に実証されている。例えば、Ｌｉｊｉｎｓｋｙ  ｅｔ．ａｌ．，Ｆｏｏｄ  Ｃｏｓｍｅｔ．Ｔｏｘｉｃｏｌ．，２０：３９３（１９８２）、Ｌｉｊｉｎｓｋｙ  ｅｔ．ａｌ．，Ｊ．Ｎａｔ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．，６９：１１２７（１９８２）、Ｍａｎｇｏｌｄ  ｅｔ．ａｌ．，Ｍｕｔａｔｉｏｎ  Ｒｅｓ．３０８：３３（１９９４）、Ｇｏｒｄｏｎ  ｅｔ．ａｌ．，Ｄｒｕｇ  Ｍｅｔａｂ．Ｄｉｓｐｏｓ．，１５：５８９（１９８７）、Ｚｅｌｌｏ  ｅｔ．ａｌ．，Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，４３：４８７（１９９４）、Ｇａｔｅｌｙ  ｅｔ．ａｌ．，Ｊ．Ｎｕｃｌ．Ｍｅｄ．，２７：３８８（１９８６）、Ｗａｄｅ  Ｄ，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．Ｉｎｔｅｒａｃｔ．１１７：１９１（１９９９）を参照されたい。
【０４９４】
いずれの特定の理論によっても制限されるものではないが、薬物の同位体富化は、例えば、（１）望ましくない代謝産物を低減または排除するために、（２）親薬物の半減期を増加させるために、（３）所望の効果を達成するために必要とされる投与数を減少させるために、（４）所望の効果を達成するために必要な投与量を減少させるために、（５）いずれかが形成される場合、活性代謝産物の形成を増加させるために、ならびに／または（６）特定の組織における有害な代謝産物の産生を減少させるために、及び／もしくは併用療法が意図的であるか否かにかかわらず、併用療法のためのより有効な薬物及び／もしくはより安全な薬物を作成するために、使用され得る。
【０４９５】
原子のその同位体のうちの１つへの置換は、しばしば化学反応の反応速度の変化を生じる。この現象は、速度論的同位体効果（「ＫＩＥ」）として知られている。例えば、Ｃ−Ｈ結合が化学反応において律速ステップ（すなわち、最高の遷移状態エネルギーを有するステップ）中に壊される場合、その水素の重水素への置換は反応速度の減少を引き起こし、プロセスは遅くなるであろう。この現象は、重水素速度論的同位体効果（「ＤＫＩＥ」）として知られている。（例えば、Ｆｏｓｔｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｄｖ．Ｄｒｕｇ  Ｒｅｓ．，ｖｏｌ．１４，ｐｐ．１−３６（１９８５）、Ｋｕｓｈｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃａｎ．Ｊ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．，ｖｏｌ．７７，ｐｐ．７９−８８（１９９９）を参照されたい）。
【０４９６】
ＤＫＩＥの大きさは、Ｃ−Ｈ結合が壊される所定の反応の速度と、水素が重水素に置換される同じ反応の速度との間の比として表され得る。ＤＫＩＥは、約１（同位体効果なし）から、５０以上などの非常に大きな数の範囲に及び得、この反応は、水素が重水素に置換される場合、５０倍以上遅くなり得ることを意味する。特定の理論によって制限されるものではないが、高いＤＫＩＥ値は、不確定な原理の結果であるトンネリングとして知られている現象に部分的に起因し得る。トンネリングは、水素原子の小さな質量に起因しており、プロトンが関与する遷移状態が必要とされる活性化エネルギーの非存在下で時々形成され得るために起こる。重水素は水素よりも大きな質量を有しているため、統計学的に、この現象を受ける確率ははるかに低い。
【０４９７】
三重水素（「Ｔ」）は、研究、核融合炉、中性子発生装置、及び放射性医薬品で使用される、水素の放射性同位体である。三重水素は、核において２つの中性子を有し、３に近い原子量を有する水素原子である。三重水素は、天然には、環境中に非常に低濃度で起こり、最も一般的にはＴ２Ｏとして見いだされる。三重水素は、ゆっくりと崩壊し（半減期＝１２．３年）、ヒトの皮膚の外層に浸透できない低エネルギーのベータ粒子を放出する。内部被曝が、この同位体に伴う主な危険であるが、それは、顕著な健康リスクをもたらすのには多量に摂取されなければならない。重水素と比較して、より少ない量の三重水素が、危険なレベルに到達する前に消費されなければならない。水素の三重水素（「Ｔ」）への置換は、重水素よりさらにより強い結合を生じ、数値上より大きな同位体効果を与える。
【０４９８】
同様に、限定されないが、炭素の１３Ｃまたは１４Ｃ、硫黄の３３Ｓ、３４Ｓ、または３６Ｓ、窒素の１５Ｎ、及び酸素の１７Ｏまたは１８Ｏを含む、他の元素の同位体の置換は、同様の速度論的同位体効果を提供するであろう。
【０４９９】
動物の身体は、治療剤などの外来物質をその循環系から排除する目的のために様々な酵素を発現する。そのような酵素の例は、腎排泄のためにこれらの外来物質と反応し、これらの外来物質をより極性の中間体または代謝産物に変換するための、チトクロムＰ４５０酵素（「ＣＹＰ」）、エステラーゼ、プロテアーゼ、リダクターゼ、デヒドロゲナーゼ、及びモノアミンオキシダーゼを含む。薬学的化合物の最も一般的な代謝反応のうちのいくつかは、炭素−水素（Ｃ−Ｈ）結合の、炭素−酸素（Ｃ−Ｏ）または炭素−炭素（Ｃ−Ｃ）パイ結合のいずれかへの酸化が関与する。得られた代謝産物は、生理学的条件下で安定または不安定であり得、親化合物と比較して実質的に異なる薬物動態、薬力学、ならびに急性及び長期毒性プロファイルを有し得る。多くの薬物に対して、そのような酸化は迅速である。結果として、これらの薬物は、しばしば複数のまたは高い毎日の用量の投与を必要とする。
【０５００】
本明細書で提供される化合物のある特定の位置での同位体富化は、天然同位体組成を有する類似の化合物と比較して、本明細書で提供される化合物の薬物動態、薬理学、及び／または毒性学プロファイルに影響する検出可能なＫＩＥを産生できる。一実施形態では、重水素富化は、代謝中のＣ−Ｈ結合切断の部位に対して実行される。
【０５０１】
標準的な生理学的、薬理学的、及び生化学的手順が、化合物を試験して、所望の抗増殖性活性を保有するものを特定するために利用可能である。
【０５０２】
そのようなアッセイは、結合アッセイ、放射能組込みアッセイなどの生化学的アッセイ、ならびに様々な細胞ベースのアッセイを含む。
本明細書で提供される化合物は、当業者に既知の方法により、ならびに本明細書の実施例セクションで説明されるものと同様の手順及びそれらの日常的な修正に従って調製することができる。
【０５０３】
前述の詳細な説明及び付随する実施例は、例示であるに過ぎず、本対象物の範囲に対する限定であると解釈されるべきではないことが、理解される。開示された実施形態に対する様々な変更及び修正が当業者に明らかとなるであろう。限定されないが、本明細書で提供される化学構造、置換基、誘導体、中間体、合成、製剤及び／または使用方法に関連するものを含むそのような変更及び修正は、その主旨及び範囲から逸脱することなく行われ得る。本明細書で参照される米国特許及び刊行物は、参照により組み込まれる。
【０５０４】
５．８  薬学的組成物
本明細書で提供される薬学的組成物は、治療上有効な量の１つ以上の本明細書で提供される化合物と、任意で薬学的に許容される担体、希釈剤、または賦形剤とを含有する。
【０５０５】
化合物は、経口投与のための溶液、懸濁液、錠剤、分散型錠剤、丸剤、カプセル剤、散剤、徐放性製剤もしくはエリキシル剤などの好適な薬学的調製物へと、または眼部投与もしくは非経口投与のための滅菌溶液または懸濁液、ならびに経皮パッチ調製物及び乾燥粉末吸入物に製剤化され得る。典型的に、上記の化合物は、当技術分野で既知の技法及び手順を使用して薬学的組成物へと製剤化される（例えば、Ａｎｓｅｌ  Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ  ｔｏ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ，Ｓｅｖｅｎｔｈ  Ｅｄｉｔｉｏｎ  １９９９を参照されたい）。
【０５０６】
組成物において、有効な濃度の１つ以上の化合物または薬学的に許容される塩が、好適な薬学的担体またはビヒクルと混合される。ある特定の実施形態では、組成物中の化合物の濃度は、投与時に、多発性骨髄腫の症状及び／または進行のうちの１つ以上を治療、予防、または緩和する量の送達に有効である。
【０５０７】
典型的には、組成物は、単一投薬量投与のために製剤化される。組成物を製剤化するために、化合物の重量画分が、治療された状態が軽減または緩和されるような有効な濃度で、選択されたビヒクル中で、溶解、懸濁、分散または他の方法で混合される。本明細書で提供される化合物の投与に好適な薬学的担体またはビヒクルは、特定の投与様式に好適であることが当業者に既知の、任意のそのような担体を含む。
【０５０８】
加えて、化合物は、組成物中の唯一の薬学的活性成分として製剤化され得るか、または他の活性成分と組み合わされ得る。腫瘍標的化リポソームなどの組織標的化リポソームを含むリポソーム懸濁液も、薬学的に許容される担体として好適であり得る。これらは、当業者に既知の方法に従って調製され得る。例えば、リポソーム製剤は、当技術分野で既知のように調製され得る。簡単に言えば、多重層膜ベシクル（ＭＬＶ）などのリポソームは、フラスコの内側で卵ホスファチジルコリン及び脳ホスファチジルセリン（７：３モル比）を乾燥させることによって形成され得る。二価陽イオンを欠くリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）中の本明細書で提供される化合物の溶液が添加され、フラスコは脂質フィルムが分散するまで振盪される。結果として生じるベシクルは、カプセル化されていない化合物を除去するために洗浄され、遠心分離によってペレット化され、次いで、ＰＢＳ中に再懸濁される。
【０５０９】
活性化合物は、望ましくない副作用がなく、治療される患者に治療上の有用な効果を及ぼすのに十分な量で、薬学的に許容される担体中に含まれる。治療上有効な濃度は、本明細書に記載のインビトロ及びインビボ系で化合物を試験することによって経験的に決定され得、次いで、それからヒトに対する投薬量のために外挿され得る。
【０５１０】
薬学的組成物中の活性化合物の濃度は、活性化合物の吸収、組織分布、不活性化、代謝、及び排泄速度、化合物の物理化学的特徴、投薬量スケジュール、ならびに投与される量、ならびに当業者に既知の他の要因に依存するであろう。例えば、送達される量は、固形腫瘍及び血液由来腫瘍を含むがんの症状のうちの１つ以上を緩和するのに十分である。
【０５１１】
非経口、皮内、皮下、または局部適用のために使用される溶液または懸濁液は、以下の成分のうちのいずれかを含み得る：注射用水、生理食塩水、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール、ジメチルアセトアミド、または他の合成溶媒などの滅菌希釈剤、ベンジルアルコール及びメチルパラベンなどの抗微生物剤、アスコルビン酸及び重亜硫酸ナトリウムなどの抗酸化剤、エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）などのキレート剤、酢酸塩、クエン酸塩、及びリン酸塩などの緩衝液、ならびに塩化ナトリウムまたはデキストロースなどの等張性の調節のための薬剤。非経口調製物は、アンプル、ペン、使い捨てシリンジ、またはガラス、プラスチック、もしくは他の好適な材料から作製された単一もしくは複数用量バイアルに封入され得る。
【０５１２】
化合物が不十分な溶解度を呈する例では、化合物を可溶化するための方法が使用され得る。そのような方法は、当業者に既知であり、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）などの共溶媒を使用すること、ＴＷＥＥＮ（登録商標）などの界面活性剤を使用すること、または水性重炭酸ナトリウム中での溶解を含むが、これらに限定されない。
【０５１３】
化合物（複数可）の混合または添加時に、結果として生じる混合物は、溶液、懸濁液、エマルジョンなどであり得る。結果として得られる混合物の形態は、意図される投与様式及び選択された担体またはビヒクル中の化合物の溶解度を含む、いくつもの要因に依存する。有効な濃度は、治療される疾患、障害、または状態の症状を緩和するのに十分であり、経験的に決定され得る。
【０５１４】
薬学的組成物は、好適な量の化合物またはその薬学的に許容される塩を含有する錠剤、カプセル剤、丸剤、散剤、顆粒、滅菌非経口溶液または懸濁液、及び経口溶液または懸濁液、及び油水エマルジョンなどの単位剤形で、ヒト及び動物への投与のために提供される。薬学的、治療上の活性な化合物及びその塩は、単位剤形または複数の剤形で製剤化及び投与される。本明細書で使用される単位用量形態は、ヒト及び動物対象に好適であり、当該分野で知られているように個別にパッケージ化される物理的に別個の単位を指す。各単位用量は、必要とされる薬学的担体、ビヒクル、または希釈剤を伴って、所望の治療効果を生み出すのに十分な、事前決定された量の治療上の活性な化合物を含有する。単位用量形態の例は、アンプル及びシリンジならびに個別にパッケージ化された錠剤またはカプセル剤を含む。単位用量形態は、その一部分ずつまたは複数で投与され得る。複数用量形態は、単一容器にパッケージ化される、分割された単位用量形態で投与される複数の同一の単位剤形である。複数用量形態の例は、バイアル、錠剤もしくはカプセル剤のボトルまたはパイントもしくはガロンのボトルを含む。したがって、複数用量形態は、パッケージにおいて分割されない複数の単位用量である。
【０５１５】
０．００５％〜１００％の範囲の活性成分を含み、残りが非毒性担体である剤形または組成物が、調製され得る。経口投与のために、薬学的に許容される非毒性組成物は、例えば、薬学的グレードのマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、タルカム、セルロース誘導体、クロスカルメロースナトリウム、グルコース、ショ糖、炭酸マグネシウムまたはサッカリンナトリウムなどの、通常用いられる賦形剤のうちのいずれかの組み込みによって形成される。そのような組成物は、溶液、懸濁液、錠剤、カプセル剤、散剤、ならびに限定されないが、インプラント及びマイクロカプセル化送達系などの徐放性製剤と、コラーゲン、エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、ポリオルトエステル、ポリ乳酸などの生分解性、生体適合性ポリマーとを含む。これらの組成物の調製のための方法は、当業者に既知である。
【０５１６】
活性化合物または薬学的に許容される塩は、持続放出製剤またはコーティングなどの、身体からの迅速な排除に対して化合物を保護する担体を用いて調製され得る。
【０５１７】
組成物は、所望の特性の組み合わせを得るために他の活性化合物を含み得る。本明細書で提供される化合物、または本明細書に記載されるその薬学的に許容される塩はまた、有利に、酸化的ストレスに関連する疾患などの上記で参照される疾患または医学的状態のうちの１つ以上を治療する際に、当該分野で価値あることが知られる別の薬理学的薬剤と一緒に、治療または予防目的のために投与され得る。そのような併用療法は、本明細書で提供される治療の組成物及び方法のさらなる態様を構成することを、理解されたい。
【０５１８】
５．９  キット
一態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１２２】
2021525362.tif 000129
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５１９】
一態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１２３】
2021525362.tif 000130
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２０】
一態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、がんを有する対象を特定するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１２４】
2021525362.tif 000131
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２１】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含む、がんを治療するためのキットであって、治療用化合物が、化合物１：
【化１２５】
2021525362.tif 000132
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２２】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含む、がんを治療するためのキットであって、治療用化合物が、化合物２：
【化１２６】
2021525362.tif 000133
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２３】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含む、がんを治療するためのキットであって、治療用化合物が、化合物３：
【化１２７】
2021525362.tif 000134
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２４】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１２８】
2021525362.tif 000135
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２５】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１２９】
2021525362.tif 000136
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２６】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に対する、がんを有する対象またはがんを有する疑いのある対象の応答性を予測するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１３０】
2021525362.tif 000137
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２７】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、対象におけるがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングするためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１３１】
2021525362.tif 000138
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２８】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、対象におけるがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングするためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１３２】
2021525362.tif 000139
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５２９】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、対象におけるがんを治療することにおける治療用化合物の有効性をモニタリングするためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１３３】
2021525362.tif 000140
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５３０】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物１：
【化１３４】
2021525362.tif 000141
またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５３１】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物２：
【化１３５】
2021525362.tif 000142
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５３２】
さらに別の態様では、本明細書で提供されるのは、治療用化合物に応答する可能性が高い、多発性骨髄腫を有する対象を特定するためのキットであって、治療用化合物で治療されている試料中のバイオマーカーのレベルを検出するための手段を含み、治療用化合物が、化合物３：
【化１３６】
2021525362.tif 000143
またはその互変異性体、アイソトポログ、もしくは薬学的に許容される塩である、キットである。
【０５３３】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ＣＲＢＮである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ＣＲＢＮ関連タンパク質（ＣＡＰ）である。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、１つのＣＡＰを含む。他の実施形態では、バイオマーカーは、２つのＣＡＰを含む。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、３つのＣＡＰを含む。さらに他の実施形態では、バイオマーカーは、４つを含む。他の実施形態では、バイオマーカーは、５つ以上のＣＡＰを含む。
【０５３４】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ＩＫＺＦ１、ＩＫＺＦ３、ＺＦＰ９１、ｃ−ＭＹＣ、ＩＲＦ４からなる群から選択されるＣＡＰである。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１及びＩＫＺＦ３からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ１である。ある特定の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＫＺＦ３である。他の実施形態では、バイオマーカーは、ＺＦＰ９１である。さらに別の実施形態では、バイオマーカーは、ｃ−ＭＹＣである。他の実施形態では、バイオマーカーは、ＩＲＦ４である。
【０５３５】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有し、ＣＴＣ、カスパーゼ−１、カスパーゼ−３、カスパーゼ−７、ＰＡＲＰ、ＢＩＭ、サバイビン、血清遊離ラムダ軽鎖、及び血清遊離カッパ軽鎖からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、アポトーシスにおいて機能を有し、血清遊離ラムダ軽鎖、及び血清遊離カッパ軽鎖からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ＣＴＣである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、カスパーゼ−３である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、カスパーゼ−７である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、サバイビンである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ＢＩＭである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、カスパーゼ−１である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ＰＡＲＰである。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、血清遊離ラムダ軽鎖である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、血清遊離カッパ軽鎖である。
【０５３６】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、細胞周期において機能を有する。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、細胞周期において機能を有し、ｐ２１、ｐ２７、及びｐＲｂ１からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ｐ２１である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ｐ２７である。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、ｐＲｂ１である。
【０５３７】
さらに他の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、Ｔ細胞活性化に関連している。ある特定の実施形態では、本明細書で提供される様々なキットによって検出されるバイオマーカーは、Ｔ細胞活性化に関連し、Ｔ細胞活性化関連サイトカインＩＬ−２、ＴＮＦα、及びＩＦＮγからなる群から選択される。
【０５３８】
本明細書で提供される様々なキットのある特定の実施形態では、試料は、腫瘍生検、リンパ節生検、液体生検（例えば、血液）、または骨髄からの生検から得られる。
【０５３９】
本明細書で提供される様々なキットのいくつかの実施形態では、がんは、血液癌である。ある特定の実施形態では、血液癌は、多発性骨髄腫からなる群から選択される。ある特定の実施形態では、多発性骨髄腫は、再発性、難治性、または従来の療法に対して抵抗性である。
【０５４０】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、１つ以上のバイオマーカーのｍＲＮＡレベルを検出するためのキットである。ある特定の実施形態では、キットは、１つ以上のバイオマーカーのｍＲＮＡに特異的に結合する１つ以上のプローブを含む。ある特定の実施形態では、キットは、洗浄溶液をさらに含む。ある特定の実施形態では、キットは、ハイブリダイゼーションアッセイを実行するための試薬、ｍＲＮＡ単離または精製手段、検出手段、ならびに陽性対照及び陰性対照をさらに含む。ある特定の実施形態では、キットは、ｍＲＮＡからｃＤＮＡを生成するための試薬をさらに含む。ある特定の実施形態では、キットは、ｍＲＮＡから生成されたｃＤＮＡを配列決定するための試薬をさらに含む。ある特定の実施形態では、キットは、キットを使用するための説明書をさらに含む。キットは、家庭内用途、臨床用途、または研究用途に合わせて作られることができる。
【０５４１】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、１つ以上のバイオマーカーのタンパク質レベルを検出するためのキットである。ある特定の実施形態では、キットは、タンパク質バイオマーカーを認識する抗体でコーティングしたディップスティック、洗浄溶液、アッセイを実行するための試薬、タンパク質単離または精製手段、検出手段、ならびに陽性対照及び陰性対照を含む。ある特定の実施形態では、キットは、キットを使用するための説明書をさらに含む。キットは、家庭内用途、臨床用途、または研究用途に合わせて作られることができる。
【０５４２】
そのようなキットは、例えば、ディップスティック、膜、チップ、ディスク、試験紙、フィルター、マイクロスフェア、スライド、マルチウェルプレートまたは光ファイバーを用いることができる。キットの固体支持体は、例えば、プラスチック、シリコン、金属、樹脂、ガラス、膜、粒子、沈殿物、ゲル、ポリマー、シート、球体、多糖、キャピラリー、フィルム、プレート、またはスライドであり得る。生体試料は、例えば、細胞培養物、細胞株、組織、臓器、細胞小器官、生体液、血液試料、尿試料または皮膚試料であり得る。
【０５４３】
別の実施形態では、キットは、固体支持体と、支持体に結合した核酸であって、核酸が、ｍＲＮＡの少なくとも２０個、５０個、１００個、２００個、３５０個またはそれ以上の塩基と相補的である、核酸と、生体試料中のｍＲＮＡの発現を検出するための手段とを含む。
【０５４４】
特定の実施形態では、薬学的キットまたはアッセイキットは、容器中に化合物またはその薬学的組成物を含み、１つ以上の容器中にＲＮＡを単離するための成分をさらに含む。別の特定の実施形態では、薬学的キットまたはアッセイキットは、容器中に化合物または薬学的組成物を含み、１つ以上の容器中にＲＴ−ＰＣＲ、ｑＲＴ−ＰＣＲ、ディープシーケンシング、またはマイクロアレイを実施するための成分をさらに含む。
【０５４５】
ある特定の実施形態では、本明細書で提供されるキットは、定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）、マイクロアレイ、フローサイトメトリー、ＦＡＣＳ、ＦＩＳＨ、ＤＮＡ配列決定、ＲＮＡ配列決定、ヘマトキシリン及びエオシン（Ｈ＆Ｅ）染色、免疫組織化学、または免疫蛍光法による、バイオマーカーの発現を検出するための手段を用いる。他の実施形態では、バイオマーカーの発現は、ＥＬＩＳＡベースの方法または当技術分野で既知の他の同様の方法によって測定される。
【０５４６】
別の特定の実施形態では、薬学的キットまたはアッセイキットは、容器中に化合物またはその薬学的組成物を含み、１つ以上の容器中にタンパク質を単離するための成分をさらに含む。別の特定の実施形態では、薬学的キットまたはアッセイキットは、容器中に化合物または薬学的組成物を含み、１つ以上の容器中にフローサイトメトリーまたはＥＬＩＳＡを実施するための成分をさらに含む。
【０５４７】
別の態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書で提供されるバイオマーカーまたはバイオマーカーのサブセット（例えば、１、２、３、４、５、またはそれ以上のバイオマーカー）の１つ以上の遺伝子産物の存在量を測定するために必要な材料を供給する、バイオマーカーを測定するためのキットである。そのようなキットは、ＤＮＡ、ＲＮＡ、タンパク質、または細胞集団を測定するのに必要な材料及び試薬が含み得る。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、マイクロアレイを含み、マイクロアレイは、本明細書で提供されるバイオマーカーもしくはバイオマーカーのサブセットの１つ以上の遺伝子産物、またはそれらの任意の組み合わせにハイブリダイズするオリゴヌクレオチド及び／またはＤＮＡ及び／またはＲＮＡ断片から構成される。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、バイオマーカーもしくはバイオマーカーのサブセット、または両方のＲＮＡ産物またはＲＮＡ産物のｃＤＮＡコピーのいずれかのＰＣＲのためのプライマーを含み得る。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、ＰＣＲのためのプライマーならびにｑＰＣＲのためのプローブを含み得る。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、複数のプライマー及び複数のプローブを含み得、プローブのうちのいくつかは、本明細書で提供されるバイオマーカーまたはバイオマーカーのサブセットの複数の遺伝子産物を同時に測定することを可能にするように、異なるフルオロフォアを有する。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、ＲＮＡからｃＤＮＡを作成するための材料及び試薬をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、本明細書で提供されるバイオマーカーまたはバイオマーカーのサブセットのタンパク質産物に対して特異的な抗体を含み得る。そのようなキットは、生体試料からＲＮＡ及び／またはタンパク質を単離するための材料及び試薬を追加で含み得る。加えて、そのようなキットは、生体試料から単離されたＲＮＡからｃＤＮＡを合成するための材料及び試薬を含み得る。いくつかの実施形態では、そのようなキットは、患者が化合物に対して臨床的に感受性であるかどうかを予測するための、コンピュータ可読媒体に埋め込まれたコンピュータプログラム製品を含み得る。いくつかの実施形態では、キットは、使用説明書と共に、コンピュータ可読媒体に埋め込まれたコンピュータプログラム製品を含み得る。
【０５４８】
いくつかの実施形態では、そのようなキットは、本明細書で提供されるバイオマーカーまたはバイオマーカーのサブセットの１つ以上の核酸産物の発現を測定する。この実施形態によれば、キットは、本明細書で提供されるバイオマーカーまたはバイオマーカーのサブセットの特定の核酸産物の発現を測定するために必要である材料及び試薬を含み得る。例えば、マイクロアレイまたはＲＴ−ＰＣＲキットが、特定の条件のために製造され得、本明細書で提供されるバイオマーカーまたはバイオマーカーのサブセットの特定のＲＮＡ転写産物のレベルを測定するために必要なそれらの試薬及び材料のみを含み得、患者における血液癌が化合物に対して臨床的に感受性であるかどうかを予測する。あるいは、いくつかの実施形態では、キットは、本明細書で提供されるバイオマーカー以外の遺伝子の特定の核酸産物の発現を測定するために必要な材料及び試薬を含み得る。例えば、ある特定の実施形態では、キットは、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子のうちの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、またはそれ以上の発現レベルを測定するために必要な材料及び試薬を、本明細書で提供されるバイオマーカー以外の少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも３５、少なくとも４０、少なくとも４５、少なくとも５０、またはそれ以上の遺伝子の発現レベルを測定するために必要な試薬及び材料に加えて含む。他の実施形態では、キットは、本明細書で提供されるバイオマーカーのうちの少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも３５、少なくとも４０、少なくとも４５、少なくとも５０、またはそれ以上、及び本明細書で提供されるバイオマーカーではない１、２、３、４、５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１２５、１５０、１７５、２００、２２５、２５０、３００、３５０、４００、４５０、またはそれ以上の遺伝子の発現レベルを測定するために必要な試薬及び材料を含む。ある特定の実施形態では、キットは、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子のうちの少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも３５、少なくとも４０、少なくとも４５、少なくとも５０、またはそれ以上、及び本明細書で提供されるバイオマーカーではない１〜１０、１〜１００、１〜１５０、１〜２００、１〜３００、１〜４００、１〜５００、１〜１０００、２５〜１００、２５〜２００、２５〜３００、２５〜４００、２５〜５００、２５〜１０００、１００〜１５０、１００〜２００、１００〜３００、１００〜４００、１００〜５００、１００〜１０００、または５００〜１０００の遺伝子の発現レベルを測定するために必要な試薬及び材料を含む。
【０５４９】
核酸マイクロアレイキットの場合、キットは、一般に、固体支持体表面に結合したプローブを含む。１つのそのような実施形態では、プローブは、オリゴヌクレオチド、または１５０ヌクレオチド長〜８００ヌクレオチド長の範囲に及ぶプローブを含むより長いプローブのいずれかであり得る。プローブは、検出可能な標識で標識され得る。特定の実施形態では、プローブは、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子産物のうちの１つ以上に対して特異的である。マイクロアレイキットは、アッセイを実行するための使用説明書と、アッセイを実行することから生じるデータを解釈及び分析するための方法と、を含み得る。特定の実施形態では、キットは、患者における血液癌が化合物に対して臨床的に感受性であるかどうかを予測するための使用説明書を含む。キットはまた、ハイブリダイゼーション試薬及び／またはプローブが標的核酸配列にハイブリダイズする際に発生するシグナルを検出するために必要な試薬を含み得る。一般に、マイクロアレイキットのための材料及び試薬は、１つ以上の容器中にある。キットの各成分は、一般に、それ自体の好適な容器中にある。
【０５５０】
ある特定の実施形態では、核酸マイクロアレイキットは、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子のうちの１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、もしくはそれ以上、またはこれらの組み合わせの発現レベルを測定するために必要な材料及び試薬を、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子以外の少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも３５、少なくとも４０、少なくとも４５、少なくとも５０、またはそれ以上の遺伝子の発現レベルを測定するために必要な試薬及び材料に加えて含む。他の実施形態では、核酸マイクロアレイキットは、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子のうちの少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも３５、少なくとも４０、少なくとも４５、少なくとも５０、もしくはそれ以上、またはそれらの任意の組み合わせ、及び本明細書で提供されるバイオマーカーのものではない１，２，３，４，５，１０，１５，２０，２５，３０，３５，４０，４５，５０，５５，６０，６５，７０，７５，８０，８５，９０，９５，１００，１２５，１５０，１７５，２００，２２５，２５０，３００，３５０，４００，４５０、またはそれ以上の遺伝子の発現レベルを測定するために必要な試薬及び材料を含む。別の実施形態では、核酸マイクロアレイキットは、本明細書で提供されるバイオマーカーの遺伝子のうちの少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも３５、少なくとも４０、少なくとも４５、少なくとも５０、またはそれ以上、またはそれらの任意の組み合わせ、及び本明細書で提供されるバイオマーカーのものではない１〜１０、１〜１００、１〜１５０、１〜２００、１〜３００、１〜４００、１〜５００、１〜１０００、２５〜１００、２５〜２００、２５〜３００、２５〜４００、２５〜５００、２５〜１０００、１００〜１５０、１００〜２００、１００〜３００、１００〜４００、１００〜５００、１００〜１０００、または５００〜１０００の遺伝子の発現レベルを測定するために必要な試薬及び材料を含む。
【０５５１】
定量的ＰＣＲの場合、キットは、一般に、特定の核酸配列に対して特異的である、事前選択されたプライマーを含む。定量的ＰＣＲキットはまた、核酸を増幅するのに好適な酵素（例えば、Ｔａｑポリメラーゼなどのポリメラーゼ）、デオキシヌクレオチド、及び増幅反応に必要とされる緩衝液を含み得る。定量的ＰＣＲキットはまた、状態に関連するか、または状態を示す核酸配列に対して特異的なプローブを含み得る。プローブは、フルオロフォアで標識される場合もあれば、フルオロフォアで標識されない場合もある。プローブは、クエンチャー分子で標識される場合もあれば、クエンチャー分子で標識されない場合もある。いくつかの実施形態では、定量的ＰＣＲキットはまた、酵素（例えば、ＡＭＶ、ＭＭＬＶなどの逆転写酵素）及び逆転写のためのプライマーを含む、ＲＮＡを逆転写するのに適した成分を、逆転写反応に必要とされるデオキシヌクレオチド及び緩衝液と共に含む。定量的ＰＣＲキットの各成分は、一般に、それ自体の好適な容器中にある。したがって、これらのキットは、一般に、各々個々の試薬、酵素、プライマー及びプローブに好適な別個の容器を含む。さらに、定量的ＰＣＲキットは、反応を実行するための説明書と、反応を実行することから生じるデータを解釈及び分析するための方法とを含み得る。特定の実施形態では、キットは、多発性骨髄腫を有する患者または多発性骨髄腫を有する疑いのある患者が化合物に対して臨床的に感受性であるかどうかを予測するための説明書を含む。
【０５５２】
抗体ベースのキットの場合、キットは、例えば、（１）目的のペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質に結合する第１の抗体（固体支持体に結合している場合もあれば、または固体支持体に結合していない場合もある）と、任意で、（２）第１の抗体またはペプチド、ポリペプチド、もしくはタンパク質のいずれかに結合し、検出可能な標識（例えば、蛍光標識、放射性同位体、または酵素）にコンジュゲートされている第２の異なる抗体とを含み得る。特定の実施形態では、目的のペプチド、ポリペプチド、またはタンパク質は、状態（例えば、疾患）に関連するか、または状態を示す。抗体ベースのキットはまた、免疫沈降を実施するためのビーズを含み得る。抗体ベースのキットの各成分は、一般に、それ自体の好適な容器中にある。したがって、これらのキットは、一般に、各抗体及び試薬に好適な別個の容器を含む。さらに、抗体ベースのキットは、アッセイを実行するための使用説明書と、アッセイを実行することから生じるデータを解釈及び分析するための方法とを含み得る。特定の実施形態では、キットは、患者における血液癌が化合物に対して臨床的に感受性であるかどうかを予測するための使用説明書を含む。
【０５５３】
一実施形態では、本明細書で提供されるキットは、本明細書で提供される化合物、またはそのエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、アイソトポログもしくは薬学的に許容される塩を含む。キットは、限定されないが、本明細書に開示されるものを含む、追加の活性剤をさらに含み得る。
【０５５４】
本明細書で提供されるキットは、活性成分を投与するために使用されるデバイスをさらに含み得る。そのようなデバイスの例は、シリンジ、ドリップバッグ、パッチ及び吸入具を含むが、これらに限定されない。
【０５５５】
キットは、移植用の細胞または血液、ならびに１つ以上の活性成分を投与するために使用され得る薬学的に許容されるビヒクルをさらに含み得る。例えば、活性成分が非経口投与のために再構成されなければならない固体形態で提供される場合、キットは、活性成分が溶解されて、非経口投与に好適である微粒子を含まない滅菌溶液を形成することができる好適なビヒクルの密封容器を含み得る。薬学的に許容されるビヒクルの例は、注射用水ＵＳＰ、水性ビヒクル（限定されないが、塩化ナトリウム注射、リンゲル注射、デキストロース注射、デキストロース及び塩化ナトリウム注射、ならびに乳酸リンゲル注射など）、水混和性ビヒクル（限定されないが、エチルアルコール、ポリエチレングリコール、及びポリプロピレングリコールなど）、ならびに非水性ビヒクル（限定されないが、トウモロコシ油、綿実油、ピーナッツ油、ゴマ油、オレイン酸エチル、ミリスチン酸イソプロピル、及び安息香酸ベンジルなど）を含むが、これらに限定されない。
【０５５６】
本明細書で提供される方法及びキットのある特定の実施形態では、固体相支持体が、タンパク質を精製する、試料を標識する、または固相アッセイを実施するために使用される。本明細書に開示される方法を実施するのに好適な固相の例は、ビーズ、粒子、コロイド、単一表面、チューブ、マルチウェルプレート、マイクロタイタープレート、スライド、膜、ゲル、及び電極を含む。固相が微粒子材料（例えば、ビーズ）である場合、一実施形態では、それは、マルチウェルプレートのウェル中に分散して、固相支持体の並行処理を可能にする。
【０５５７】
例えば、限定されないが、核酸プライマー、固体支持体などの１つ以上の試薬に関して、上で列挙された実施形態の任意の組み合わせもまた、本明細書で提供される様々な方法及び／またはキットのうちのいずれかに関連して企図されることに、留意されたい。
【０５５８】
本発明のある特定の実施形態は、以下の非限定的な実施例によって例示される。
【実施例】
【０５５９】
６．実施例
以下の例は、別段詳細に説明される場合を除いて、当業者に周知かつ日常的である標準的な技法を使用して実施される。実施例は、単なる例示であることが意図される。
【０５６０】
実施例１：４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（化合物１）の合成。
【化１３７】
2021525362.tif 000144
２−アミノ−５−メトキシ−５−オキソペンタン酸。窒素下で脱水メタノール（２．５Ｌ）中の２アミノペンタン二酸（２５０ｇ、１．７０ｍｏｌ）の懸濁液に、トリメチルシリルクロリド（２７７ｇ、２．５５ｍｏｌ）を、３０分かけて添加した。結果として生じた透明な溶液を、室温（２０℃）で３０分間撹拌した。１Ｈ  ＮＭＲは、出発物質が完全に消費されたことを示した。反応混合物を、さらなる後処理なしで次のステップで使用した。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＣＤ３ＯＤ δ： ４．１７−４．１５（ｍ， １Ｈ）， ３．７１（ｓ， ３Ｈ）， ２．７０−２．６０（ｍ， ２Ｈ）， ２．３３−２．２５（ｍ， ２Ｈ）。
【０５６１】
２−（（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル）アミノ）−５−メトキシ−５−オキソペンタン酸。上記の溶液に、トリエチルアミン（２７５ｇ、２．７２ｍｏｌ）及び二炭酸ジ−ｔｅｒｔ−ブチル（４４７．３５ｇ、２．０５ｍｏｌ）を添加した。反応混合物を、２５℃で２時間撹拌した。溶液を濃縮乾固させ、次いで、水（２．５Ｌ）を添加して残留物を溶解させた。結果として生じた水相を、酢酸エチル（２００ｍＬ）で洗浄し、次いで、ＨＣｌ（１Ｎ）によってｐＨ＝３に酸性化させ、酢酸エチル（１Ｌ×３）で抽出した。組み合わせた有機層を、ブライン（８００ｍＬ）で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、濃縮して、２−（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニルアミノ）−５−メトキシ−５−オキソ−ペンタン酸（２５０ｇ、５６％収率、２つのステップ）を白色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＣＤ３ＯＤ δ： ４．１８−４．１１（ｍ， １Ｈ）， ３．６９（ｓ， ３Ｈ）， ２．４８−２．４３（ｍ， ２Ｈ）， ２．２１−２．１５（ｍ， １Ｈ）， １．９５−１．９１（ｍ， １Ｈ）， １．４６（ｓ， ９Ｈ）。
【０５６２】
５−アミノ−４−（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニルアミノ）−５−オキソ−ペンタン酸メチル。１，４ジオキサン（１．５Ｌ）中の２−（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニルアミノ）−５−メトキシ−５−オキソ−ペンタン酸（２００ｇ、７６５ｍｍｏｌ）の溶液に、二炭酸ジ−ｔｅｒｔ−ブチル（２６７ｇ、１．２２ｍｏｌ）及びピリジン（１２１ｇ、１．５３ｍｏｌ）を添加した。反応混合物を２５℃で３０分間撹拌した後、炭酸アンモニウム（１８２ｇ、２．３０ｍｏｌ）を、混合物に添加し、２５℃でさらに１６時間撹拌した。有機溶媒をロータリーエバポレーションによって除去し、残留物を、ＨＣｌ（６Ｍ）によってｐＨ＝３に酸性化させ、次いで、酢酸エチル（８００ｍＬ×３）で抽出した。組み合わされた有機層を、ブライン（８００ｍＬ）で洗浄し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過した。揮発性有機物を減圧下で除去して、５−アミノ−４−（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニルアミノ）−５−オキソ−ペンタン酸メチル（１８０ｇ、９０％収率）を白色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＣＤＣｌ３  δ： ６．５１（ｓ， １Ｈ），５．９４（ｓ， １Ｈ）， ５．４３（ｓ， １Ｈ）， ４．２１（ｓ， １Ｈ）， ３．６３（ｓ， ３Ｈ）， ２．５９−２．４０（ｍ， ２Ｈ）， ２．１５−２．１１（ｍ，１Ｈ）， １．９４−１．９０（ｍ， １Ｈ）， １．４２（ｓ， ９Ｈ）。
【０５６３】
４，５−ジアミノ−５−オキソ−ペンタン酸メチル塩酸塩。５−アミノ−４−（ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニルアミノ）−５−オキソ−ペンタン酸メチル（１８０ｇ、６９２ｍｍｏｌ）とＨＣｌ／酢酸エチル（３００ｍＬ、４Ｍ）との混合物を、２５℃で１２時間撹拌した。沈殿した固体を、真空濾過により収集し、酢酸エチル（５００ｍＬ）で洗浄して、４，５−ジアミノ−５−オキソ−ペンタン酸メチル塩酸塩（１３０ｇ、９５％収率）を白色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ＭＨｚ ＣＤ３ＯＤ δ： ４．００−３．９６（ｍ， １Ｈ），３．７０（ｓ， ３Ｈ）， ２．５９−２．５２（ｍ， ２Ｈ）， ２．２２−２．１３（ｍ， ２Ｈ）。
【０５６４】
３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸メチル。４つのバッチ（各々２００ｇ）を、並行して実行した。メタノール（４．０Ｌ）中の３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸（２００ｇ、１．３１ｍｏｌ）の溶液に、濃硫酸（４７．７ｇ、４８６ｍｍｏｌ）を、添加した。反応混合物を、６０℃で１７時間撹拌した。反応混合物を、８００ｍＬに濃縮した。結果として生じた混合物を、２０℃に冷却し、３０分かけてゆっくりと水（４００ｍＬ）に注いだ。水（１２００ｍＬ）を２０℃で３時間かけて添加し、結果として生じた混合物を２０℃で１時間撹拌した。沈殿した固体を、真空濾過（４つのバッチが組み合わされた）によって収集し、ｐＨ＞３になるまで水／メタノール（１０００ｍＬ、９：１）で３回洗浄した。固体を、４５℃にて真空下で乾燥して、灰色固体として３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸メチル（７００ｇ、８０．４％収率）を得た。
【０５６５】
３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−２−メチル−安息香酸メチル。２つのバッチ（各々２４０ｇ）を、並行して実行した。Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１．４０Ｌ）中の３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸メチル（２４０ｇ、１．４４ｍｏｌ）の溶液に、イミダゾール（２４６ｇ、３．６１ｍｏｌ）及びｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルクロリド（２３８ｇ、１．５８ｍｏｌ）を、５℃で添加した。添加後、混合物を、２０℃まで温め、６時間撹拌した。酢酸イソプロピル（１７００ｍＬ）を添加し、次いで、温度を３０℃未満に保ちながら、水（２０００ｍＬ）をゆっくりと添加した。結果として生じた混合物を撹拌し、有機相を分離した。組み合わされた有機相（２つのバッチが組み合わされた）を、水（１７００ｍＬ×３）で洗浄し、約１５００ｍＬ（ＫＦ＜０．０５％）に濃縮した。生成物を、酢酸イソプロピル溶液として保管し、さらなる精製なしに次のステップで使用した。
【０５６６】
２−（ブロモメチル）−３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−安息香酸メチル。２つのバッチ（各々約３７５ｇ）を、並行して実行した。３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−２−メチル−安息香酸メチル（約３７５ｇ、１．３４ｍｏｌ）の酢酸イソプロピル溶液に、Ｎ−ブロモスクシンイミド（２７４ｇ、１．５４ｍｏｌ）及びアゾビスイソブチロニトリル（４．４０ｇ、２６．８ｍｍｏｌ）を、添加した。反応混合物を、少なくとも１時間かけて７０℃に加熱し、７０℃で４時間撹拌した。反応混合物を、２０℃に冷却し、２０℃で少なくとも１時間保持した。固体（スクシンイミド）の２つのバッチを、濾過によって除去し、酢酸イソプロピル（７００ｍＬ）で洗浄した。濾液を、水（６０００ｍＬ）中の亜硫酸ナトリウム（７００ｇ）の溶液で、続いて水（１５００ｍＬ）によって洗浄した。有機層を、真空下４５℃で蒸留乾固させて、２−（ブロモメチル）−３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−安息香酸メチル（９２０ｇ、収率９５．５％）を濃橙色の油として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６ δ： ７．４５（ｄ， Ｊ＝６．８ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．３６（ｔ， Ｊ＝８．０ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．１３（ｔ， Ｊ＝７．２ Ｈｚ， １Ｈ）， ４．９５（ｓ， ２Ｈ）， １．０２（ｓ， ９Ｈ）， ０．２９（ｓ， ６Ｈ）。
【０５６７】
５−アミノ−４−［４−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸メチル。アセトニトリル（２．５０Ｌ）中の４，５−ジアミノ−５−オキソ−ペンタン酸メチル塩酸塩（７４．５ｇ、３７９ｍｍｏｌ）の撹拌溶液に、２−（ブロモメチル）−３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−安息香酸メチル（１２５ｇ、３４８ｍｍｏｌ）を、添加した。懸濁液に、ジイソプロピルエチルアミン（８９．９ｇ、６９６ｍｍｏｌ）を、添加漏斗を通じて１０分かけて添加し、次いで、混合物を、６０℃で１６時間撹拌した。反応混合物を、酢酸エチル（１．０Ｌ）で希釈し、ＨＣｌ（１Ｎ、１．０Ｌ）、重炭酸ナトリウム（飽和１．０Ｌ）及びブライン（１．０Ｌ）で連続して洗浄した。有機層を濃縮して、粗製の５−アミノ−４−［４−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸メチル（１０８ｇ、粗製）を淡黄色固体として得た。ＬＣＭＳ：ｍ／ｚ ４０７．３［Ｍ＋１］＋。
【０５６８】
５−アミノ−４−（４−ヒドロキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル）−５−オキソ−ペンタン酸メチル。Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（３５０ｍＬ）中の５−アミノ−４−［４−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸メチル（１０８ｇ、２６６ｍｍｏｌ）の撹拌冷溶液に、水（４０ｍＬ）中の炭酸カリウム（１４．７ｇ、１０６ｍｍｏｌ）を、５分かけて少しずつ添加した。結果として生じた反応混合物を、１５℃で１５時間撹拌した。反応混合物を氷浴中で冷却し、ＨＣｌ（１２Ｍ、１５ｍＬ）を０〜５℃でゆっくりと添加した。アセトニトリル（２００ｍＬ）を混合物に添加し、形成された固体を沈殿させた。懸濁液を、室温で１０分間撹拌し、濾過した。濾過ケーキを、酢酸エチル（２００ｍＬ×５）で洗浄して、生成物（５５ｇ）を得た。濾液を、高真空下で濃縮して、粗生成物（１００ｇ）を得て、ジクロロメタン（１．０Ｌ）に溶解させ、１５℃で１６時間放置した。白色固体を形成させて、濾過して５ｇの生成物を得た。固体を組み合わせて、５アミノ−４−（４−ヒドロキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル）−５−オキソ−ペンタン酸メチル（６０ｇ、７７％収率）を白色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６  δ： ７．５８（ｓ， １Ｈ）， ７．３１（ｔ， Ｊ＝８．０ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．１９−−７．１４（ｍ， ２Ｈ）， ７．０１（ｄ， Ｊ＝７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ４．７５−４．７１（ｍ， １Ｈ）， ４．５０（ｄ， Ｊ＝１７．６ Ｈｚ， １Ｈ），４．３２（ｄ， Ｊ＝１７．６ Ｈｚ， １Ｈ），３．５１（ｓ， ３Ｈ）， ２．２９−２．１８（ｍ， ３Ｈ）， ２．０９−１．９９（ｍ， １Ｈ）。
【０５６９】
５−アミノ−４−［４−［［４−（ブロモメチル）フェニル］メトキシ］−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸メチル。２つの反応（２５ｇ、８５．５ｍｍｏｌ）を並行して実行した。アセトニトリル（１Ｌ）中の１，４ビス（ブロモメチル）ベンゼン（６７．７ｇ、２５７ｍｍｏｌ）、炭酸カリウム（１１．８ｇ、８５．５ｍｍｏｌ）及び５−アミノ−４−（４−ヒドロキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル）−５−オキソ−ペンタン酸メチル（２５ｇ、８５．５ｍｍｏｌ）の混合物を、６０℃で１６時間撹拌した。２つのバッチを組み合わせ、混合物を、１５℃に冷却し、濾過した。濾液を濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィー（酢酸エチル中の５０％石油エーテルによって１００％酢酸エチルに溶出された）によって精製して、５−アミノ−４−［４−［［４−（ブロモメチル）フェニル］メトキシ］−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸メチル（５２ｇ、６３％収率）を白色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６  δ： ７．５９（ｓ， １Ｈ）， ７．５０−７．４４（ｍ， ５Ｈ）， ７．３２−７．２８（ｍ， ２Ｈ）， ７．１９（ｓ， １Ｈ）， ５．２６（ｓ， ２Ｈ）， ４．７９−４．７１（ｍ， ３Ｈ），４．５５（ｄ， Ｊ＝１７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ４．４３（ｄ， Ｊ＝１７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ３．５２（ｓ， ３Ｈ）， ２．３０−２．１９（ｍ， ３Ｈ）， ２．１０−２．０８（ｍ， １Ｈ）。
【０５７０】
３−［４−［［４−（ブロモメチル）フェニル］メトキシ］−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］ピペリジン−２，６−ジオン。２つの反応（２８．５ｇ、６０．０ｍｍｏｌ）を、並行して実行した。５−アミノ−４−［４−［［４−（ブロモメチル）フェニル］メトキシ］−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸メチル（２８．５ｇ、６０．０ｍｍｏｌ）を、テトラヒドロフラン（７２０ｍＬ）に溶解させ、溶液をドライアイス／アセトン浴中で−７０℃に冷却した。撹拌しながら、カリウムｔｅｒｔブトキシド（７．４ｇ、６６．０ｍｍｏｌ）を、透明な溶液に一度に添加した。反応混合物は淡黄色に変わり、撹拌を−７０℃でさらに２時間続けた。ＨＣｌの冷却溶液（１Ｎ、２６０ｍＬ）を、温度を−７０℃に維持しながら反応混合物に迅速に移した。混合物は直ちに乳白色に変わり、ドライアイス／アセトン浴を取り外した。混合物を、濃縮して、テトラヒドロフランのほとんどを除去した。反応混合物の濃縮時に、白色固体が、沈殿した。白色のスラリーを、水（５００ｍＬ）で希釈し、次いで、濾過した。フィルターケーキを、水（５００ｍＬ）で洗浄し、４０℃にて真空オーブン中で１２時間乾燥させ、次いで、酢酸エチル（５００ｍＬ）で洗浄した。バッチを組み合わせて、３−［４−［［４−（ブロモメチル）フェニル］メトキシ］−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］ピペリジン−２，６−ジオン（４９．８５ｇ、９３％）を淡黄色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６  δ： １０．９５（ｓ， １Ｈ）， ７．５１−７．４１（ｍ．， ５Ｈ），７．３５−７．２８（ｍ， ２Ｈ）， ５．２３（ｓ， ２Ｈ）， ５．１２−５．０７（ｍ， １Ｈ）， ４．７０（ｓ， ２Ｈ）， ４．４１（ｄ， Ｊ＝１７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ４．２５（ｄ， Ｊ＝１７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ２．９０−２．８４（ｍ， １Ｈ）， ２．５８−２．５３（ｍ，  １Ｈ）， ２．４４−２．４１（ｍ， １Ｈ）， １．９８−１．９５（ｍ， １Ｈ）。
【０５７１】
４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル。３−（４−（（４−（ブロモメチル）ベンジル）オキシ）−１−オキソイソインドリン−２−イル）ピペリジン−２，６−ジオン（５．０ｇ、１１．２８ｍｍｏｌ）を、３−フルオロ−４−（ピペラジン−１−イル）ベンゾニトリル（２．３１５ｇ、１１．２８ｍｍｏｌ）、ジイソプロピルエチルアミン（５．９１ｍｌ、３３．８ｍｍｏｌ）、及びアセトニトリル（１００ｍｌ）と共にフラスコに入れた。反応混合物を、４０℃で１８時間撹拌した。揮発性有機物を減圧下で除去し、標準的な方法による精製は、４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリルを提供した。１Ｈ ＮＭＲ（４００ ＭＨｚ， ＤＭＳＯ−ｄ６）δ１０．９７（ｓ， １Ｈ）， ７．６８（ｄｄ， Ｊ＝１．９６， １３．４５ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．５６（ｄｄ， Ｊ＝１．７７， ８．３８ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．４３−７．５２（ｍ， ３Ｈ）， ７．３０−７．３８（ｍ， ４Ｈ）， ７．１１（ｔ， Ｊ＝８．８０ Ｈｚ， １Ｈ）， ５．２４（ｓ， ２Ｈ）， ５．１１（ｄｄ， Ｊ＝５．１４， １３．３３ Ｈｚ， １Ｈ）， ４．３７−４．４６（ｍ， １Ｈ）， ４．２２−４．３０（ｍ， １Ｈ）， ３．５４（ｓ， ２Ｈ）， ３．１２−３．２３（ｍ， ４Ｈ）， ２．８４−２．９８（ｍ， １Ｈ）， ２．５２２．６２（ｍ， ５Ｈ）， ２．３６−２．４８（ｍ， １Ｈ）， １．９２−２．０４（ｍ， １Ｈ）。ＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ ５６８．２［Ｍ＋１］＋。Ｃ３２Ｈ３０ＦＮ５Ｏ４に対する分析計算値： Ｃ， ６７．７１；Ｈ， ５．３３；Ｎ， １２．３４。実測値： Ｃ， ６７．５０；Ｈ， ５．４４；Ｎ １２．３４。
【０５７２】
実施例２：（Ｓ）−４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（化合物２）の合成
【化１３８】
2021525362.tif 000145
【０５７３】
ｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−（ベンジルオキシカルボニルアミノ）−５−オキソ−ペンタン酸塩。１，４−ジオキサン（１．５０Ｌ）中の（２Ｓ）−２−（ベンジルオキシカルボニルアミノ）−５−ｔｅｒｔ−ブトキシ−５−オキソ−ペンタン酸（１５０ｇ、４４５ｍｍｏｌ）の溶液に、二炭酸ジ−ｔｅｒｔ−ブチル（１５５ｇ、７１１ｍｍｏｌ）、ピリジン（７０．３ｇ、８８９ｍｍｏｌ）及び重炭酸アンモニウム（１０５ｇ、１．３３ｍｏｌ）を、添加した。反応混合物を、１８℃で１６時間撹拌し、次いで濃縮した。残留物を酢酸エチル（５．０Ｌ）及び水（５．０Ｌ）に溶解させ、有機層を、分離し、ＨＣｌ（３．０ｍＬ、１Ｎ）、飽和重炭酸ナトリウム（３．０Ｌ）、ブライン（３．０Ｌ）で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、濃縮して、粗製のｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−（ベンジルオキシカルボニルアミノ）−５−オキソ−ペンタン酸塩（４５０ｇ、粗製）を白色固体として得て、さらなる精製なしで次のステップで使用した。１Ｈ ＮＭＲ ４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６ δ： ７．３５−７．３０（ｍ， ５Ｈ）， ７．０２（ｓ， １Ｈ）， ５．０１（ｄ， Ｊ＝３．２Ｈｚ， １Ｈ）， ３．９３−３．９０（ｍ， １Ｈ）， ２．２０（ｔ， Ｊ＝８．０ Ｈｚ， ２Ｈ）， １．８８−１．８４（ｍ， １Ｈ）， １．７２−１．６９（ｍ， １Ｈ）， １．３５（ｓ， ９Ｈ）。
【０５７４】
ｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−４，５−ジアミノ−５−オキソ−ペンタン酸塩。メタノール（１．０Ｌ）中のｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−（ベンジルオキシカルボニルアミノ）−５−オキソ−ペンタン酸塩（１１２ｇ、３３３ｍｍｏｌ）の溶液に、１０％パラジウム炭素（１５ｇ）を、窒素下で添加した。懸濁液を、真空下で脱気し、水素で数回パージした。混合物を、水素ガス（４０ｐｓｉ）下、３０℃で１６時間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を濃縮して、粗製のｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−４，５−ジアミノ−５−オキソ−ペンタン酸塩を無色の油として得た。１Ｈ ＮＭＲ ４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６ δ： ７．３０（ｓ， １Ｈ）， ６．９５（ｓ， １Ｈ）， ３．１０−３．０７（ｍ， １Ｈ）， ２．２７−２．２３（ｍ， ２Ｈ）， １．６９−１．７８（ｍ， １Ｈ）， １．５９−１．５５（ｍ， １Ｈ）， １．３８（ｓ， ９Ｈ）。
【０５７５】
３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸メチル。４つのバッチ（各々２００ｇ）を、並行して実行した。メタノール（４．０Ｌ）中の３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸（２００ｇ、１．３１ｍｏｌ）の溶液に、濃硫酸（４７．７ｇ、４８６ｍｍｏｌ）を、添加した。反応混合物を、６０℃で１７時間撹拌した。反応混合物を、８００ｍＬに濃縮した。結果として生じた混合物を、２０℃に冷却し、３０分かけてゆっくりと水（４００ｍＬ）に注いだ。水（１２００ｍＬ）を２０℃で３時間かけて添加し、結果として生じた混合物を２０℃で１時間撹拌した。沈殿した固体を、真空濾過（４つのバッチが組み合わされた）によって収集し、ｐＨ＞３になるまで水／メタノール（１０００ｍＬ、９：１）で３回洗浄した。固体を、４５℃にて真空下で乾燥して、灰色固体として３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸メチル（７００ｇ、８０．４％収率）を得た。１Ｈ ＮＭＲ： ４００ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６ δ： ９．７０（ｓ， １Ｈ）， ７．１８（ｔ， Ｊ＝６．８ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．０（ｔ， Ｊ＝７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．００（ｔ， Ｊ＝６．８ Ｈｚ， １Ｈ）， ３．８１（ｓ， ３Ｈ）， ２．２９（ｓ， ３Ｈ）。
【０５７６】
３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−２−メチル−安息香酸メチル。２つのバッチ（各々２４０ｇ）を、並行して実行した。Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１．４０Ｌ）中の３−ヒドロキシ−２−メチル−安息香酸メチル（２４０ｇ、１．４４ｍｏｌ）の溶液に、イミダゾール（２４６ｇ、３．６１ｍｏｌ）及びｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルクロリド（２３８ｇ、１．５８ｍｏｌ）を、５℃で添加した。添加後、混合物を、２０℃まで温め、６時間撹拌した。酢酸イソプロピル（１７００ｍＬ）を添加し、次いで、温度を３０℃未満に保ちながら、水（２０００ｍＬ）をゆっくりと添加した。結果として生じた混合物を撹拌し、続いて有機相を分離した。組み合わされた有機物（２つのバッチが組み合わされた）を、水（１７００ｍＬ×３）で洗浄し、約１５００ｍＬ（ＫＦ＜０．０５％）に濃縮した。生成物を、酢酸イソプロピル溶液として保管し、さらなる精製なしで次のステップで使用した。
【０５７７】
２−（ブロモメチル）−３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−安息香酸メチル。２つのバッチ（各々約３７５ｇ）を、並行して実行した。３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−２−メチル−安息香酸メチル（約３７５ｇ、１．３４ｍｏｌ）の酢酸イソプロピル溶液に、Ｎ−ブロモスクシンイミド（２７４ｇ、１．５４ｍｏｌ）及びアゾビスイソブチロニトリル（４．４０ｇ、２６．８ｍｍｏｌ）を、添加した。反応混合物を、少なくとも１時間かけて７０℃に加熱し、７０℃で４時間撹拌した。反応混合物を、２０℃に冷却し、２０℃で少なくとも１時間保持した。固体（スクシンイミド）の２つのバッチを、濾過によって除去し、酢酸イソプロピル（７００ｍＬ）で洗浄した。濾液を、水（６０００ｍＬ）中の亜硫酸ナトリウム（７００ｇ）の溶液で、続いて水（１５００ｍＬ）によって洗浄した。有機層を、真空下４５℃で蒸留乾固させて、２−（ブロモメチル）−３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−安息香酸メチル（９２０ｇ、収率９５．５％）を濃橙色の油として得た。１Ｈ ＮＭＲ： ４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６ δ： ７．４５（ｄ， Ｊ＝６．８ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．３６（ｔ， Ｊ＝８．０ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．１３（ｔ， Ｊ＝７．２ Ｈｚ， １Ｈ）， ４．９５（ｓ， ２Ｈ）， １．０２（ｓ， ９Ｈ）， ０．２９（ｓ， ６Ｈ）。
【０５７８】
ｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−［４−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸塩。アセトニトリル（４．０Ｌ）中のｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−４，５−ジアミノ−５−オキソ−ペンタン酸塩（１３０ｇ、６４３ｍｍｏｌ）の溶液に、２−（ブロモメチル）−３−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ安息香酸メチル（２１０ｇ、５８４ｍｍｏｌ）及びジイソプロピルエチルアミン（１１３ｇ、８７７ｍｍｏｌ）を、添加した。反応混合物を、５０℃で１６時間撹拌した。反応混合物を濃縮してアセトニトリルのほとんどを除去し、残留物をメチルｔｅｒｔ−ブチルエーテル（２．０Ｌ）及び水（１．５Ｌ）に溶解させ、有機層を飽和リン酸一カリウム（１．０Ｌ×２）、ブライン（１．０Ｌ）で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、濃縮して、粗製のｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−［４−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸塩（５２４ｇ）を得て、さらなる精製なしで次のステップで使用した。
【０５７９】
ｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−（４−ヒドロキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル）−５−オキソ−ペンタン酸塩。メタノール（２．０Ｌ）中のｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−［４−［ｔｅｒｔ−ブチル（ジメチル）シリル］オキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル］−５−オキソ−ペンタン酸塩（２７５ｇ、６１３ｍｍｏｌ）の溶液に、テトラブチルアンモニウムフルオリド三水和物（３８．７ｇ、１２３ｍｍｏｌ）を加えた。混合物を、１８℃で１６時間撹拌した。反応混合物を濃縮してほとんどのメタノールを除去し、残留物をジクロロメタン／水（３Ｌ／２Ｌ）に溶解させ、有機層をブライン（１．０Ｌ）で洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、濃縮して粗生成物を得て、シリカゲルカラムによって精製して、生成物（２６０ｇ）を得た。生成物をアセトニトリル（７５０ｍＬ）に添加し、混合物を、６０℃で２時間撹拌し、１８℃に冷却し、さらに２時間撹拌した。固体を濾過し、ケーキを、乾燥させて、ｔｅｒｔ−ブチル（４Ｓ）−５−アミノ−４−（４−ヒドロキシ−１−オキソ−イソインドリン−２−イル）−５−オキソ−ペンタン酸塩（２４８ｇ、６０．５％収率）を、灰色固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ ４００ ＭＨｚ ＤＭＳＯ−ｄ６  δ： １０．００（ｓ， １Ｈ）， ７．５４（ｓ， １Ｈ）， ７．２９（ｔ， Ｊ＝７．６ Ｈｚ， １Ｈ）， ７．１４（ｄ， Ｊ＝４．８ Ｈｚ， ２Ｈ）， ４．７２−４．６８（ｍ， １Ｈ）， ４．４９−４．２８（ｍ， ２Ｈ）， ２．１７−１．９７（ｍ， ４Ｈ）， １．３１（ｓ， ９Ｈ）。
【０５８０】
４−（４−（４−（クロロメチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル。１，４ビス（クロロメチル）ベンゼン（５１．２ｇ、２９２ｍｍｏｌ）を、アセトニトリル（１９５ｍＬ）及びＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１９５ｍＬ）と共にフラスコに入れた。反応混合物を、周囲温度ですべての固体が溶解するまで撹拌した。次いで、ジイソプロピルアミン（５１．１ｍＬ、２９２ｍｍｏｌ）を、３−フルオロ−４−（ピペラジン−１−イル）ベンゾニトリル（２０ｇ、９７ｍｍｏｌ）と共に添加した。反応物を、１時間６０℃に加熱した。アセトニトリルを、減圧下で除去した。残りの混合物を、酢酸エチル（１．０Ｌ）、水（７００ｍＬ）、及びブライン（３００ｍＬ）の間で分配した。有機層を分離し、水層を酢酸エチルで２回抽出した。揮発性有機物を、組み合わせ、減圧下で除去した。固体を、最小のジクロロメタンに溶解させ、シリカゲルカラム（３Ｌにわたるヘキサン中の０〜１００％酢酸エチル）上で精製した。所望の生成物を含有する画分を組み合わせ、揮発性有機物を減圧下で除去した。残留物を、最小量のジクロロメタンに溶解させ、シリカゲルカラム上で再度精製した（８００ｍＬにわたるヘキサン中の１０％アイソクラティック酢酸エチル、続いて４Ｌにわたるヘキサン中の２０〜８０％酢酸エチル）。所望の生成物を含有する画分を、組み合わせ、揮発性有機物を減圧下で除去して、４−（４−（４−（クロロメチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（２２．７ｇ、６６．０ｍｍｏｌ、６７．７％収率）を、オフホワイトの固体として得た。１Ｈ ＮＭＲ（４００  ＭＨｚ， ＣＤＣｌ３）δ ｐｐｍ ７．３３−７．３９（ｍ， ５  Ｈ）７．２９（ｄ， Ｊ＝１．９６ Ｈｚ， １ Ｈ）７．２５（ｄ， Ｊ＝１．９６ Ｈｚ， １ Ｈ）６．９１（ｔ， Ｊ＝８．５６ Ｈｚ， １ Ｈ）４．６０（ｓ， ２ Ｈ）３．５８（ｓ， ２ Ｈ）３．１９−３．２７（ｍ， ４ Ｈ）２．５８−２．６６（ｍ， ４ Ｈ）。ＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ ３４４．２［Ｍ＋１］＋。
【０５８１】
（Ｓ）−ｔｅｒｔ−ブチル５−アミノ−４−（４−（（４−（（４−（４−シアノ−２−フルオロフェニル）ピペラジン−１−イル）メチル）ベンジル）オキシ）−１−オキソイソインドリン−２−イル）−５−オキソペンタン酸塩。（Ｓ）−ｔｅｒｔ−ブチル５−アミノ−４−（４−ヒドロキシ−１−オキソイソインドリン−２−イル）−５−オキソペンタン酸塩（２２．０５ｇ、６５．９ｍｍｏｌ）を、４−（４−（４−（クロロメチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル（２２．６７ｇ、６５．９ｍｍｏｌ）、炭酸カリウム（１８．２３ｇ、１３２ｍｍｏｌ）、及びＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（３３０ｍＬ）と共にフラスコに入れた。反応混合物を、４５℃に１６時間加熱した。反応物を、酢酸エチル（５０ｍＬ）で希釈し、濾過した。濾液を、酢酸エチル（９００ｍＬ）及び水（６００ｍＬ）及びブライン（２００ｍＬ）で分配した。有機層を、単離し、水（６００ｍＬ）で分配した。有機層を単離し、すべての有機層を、組み合わせ、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、揮発性物質を減圧下で除去した。残留物をヘキサン中の２０％酢酸エチルで処理し、揮発性物質を減圧下で除去して、（Ｓ）−ｔｅｒｔ−ブチル５−アミノ−４−（４−（（４−（（４−（４−シアノ−２−フルオロフェニル）ピペラジン−１−イル）メチル）ベンジル）オキシ）−１−オキソイソインドリン−２−イル）−５−オキソペンタン酸塩（４４．０２ｇ、６８．６ｍｍｏｌ、１０４％収率）を、オフホワイトの固体として得た。一部のＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミドが残っているため、収量は、わずかに定量的を超えた。１Ｈ ＮＭＲ（４００ ＭＨｚ， ＣＤＣｌ３）δ ｐｐｍ ７．４３−７．４９（ｍ， ２ Ｈ）７．４０（ｓ， ４ Ｈ）７．３６（ｄｄ， Ｊ＝８．３８， １．２８ Ｈｚ， １ Ｈ）７．２９（ｄ， Ｊ＝１．９６ Ｈｚ， １ Ｈ）７．２６（ｄ， Ｊ＝１．８３ Ｈｚ， １ Ｈ）７．１１（ｄｄ， Ｊ＝７．６４， １．１６ Ｈｚ， １ Ｈ）６．９２（ｔ， Ｊ＝８．５０  Ｈｚ， １ Ｈ）６．２３ （ｂｒ ｓ， １ Ｈ）５．２４−５．３２（ｍ， １ Ｈ）５．１５ （ｓ， ２ Ｈ）４．８６−４．９４（ｍ， １ Ｈ）４．３８−４．５５（ｍ， ２ Ｈ）３．６１（ｓ， ２ Ｈ）３．１８−３．３２（ｍ， ４ Ｈ）２．５８−２．７０（ｍ， ４ Ｈ）２．０９−２．４７（ｍ， ４ Ｈ）１．４３（ｓ， ８ Ｈ）。ＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ ６４２．４［Ｍ＋１］＋。
【０５８２】
（Ｓ）−４−（４−（４−（（（２−（２，６−ジオキソピペリジン−３−イル）−１−オキソイソインドリン−４−イル）オキシ）メチル）ベンジル）ピペラジン−１−イル）−３−フルオロベンゾニトリル。（Ｓ）−ｔｅｒｔ−ブチル５−アミノ−４−（４−（（４−（（４−（４−シアノ−２−フルオロフェニル）ピペラジン−１−イル）メチル）ベンジル）オキシ）−１−オキソイソインドリン−２−イル）−５−オキソペンタン酸塩（１２．１ｇ、１８．８６ｍｍｏｌ）を、アセトニトリル（１８９ｍＬ）及びベンゼンスルホン酸（３．９６ｇ、２４．５１ｍｍｏｌ）と共にバイアルに入れた。反応混合物を、真空下に置き、窒素でパージした。これをもう一度繰り返し、次いで、混合物を窒素雰囲気下で一晩８５℃に加熱した。反応混合物を、ジクロロメタン（１０００ｍＬ）及び酢酸エチル（３００ｍＬ）を含む２つの分液漏斗に直接温かくして注いだ。この混合物に、重炭酸ナトリウムの飽和溶液（９００ｍＬ）、水（１００ｍＬ）、及びブライン（４５０ｍＬ）を、添加した。有機層を単離し、水層を、ジクロロメタン（８００ｍＬ）及び酢酸エチル（２００ｍＬ）で抽出した。組み合わされた有機相を、無水硫酸マグネシウム上で乾燥させ、濃縮した。標準的な方法による精製は、表題化合物を提供した。１Ｈ ＮＭＲ（４００ ＭＨｚ， ＤＭＳＯ−ｄ６）δ ｐｐｍ １０．９６（ｓ， １ Ｈ）７．６８（ｄｄ， Ｊ＝１３．４５， １．８３ Ｈｚ， １ Ｈ）７．５６（ｄｄ， Ｊ＝８．４４， １．８３ Ｈｚ， １ Ｈ）７．４３−７．５２（ｍ， ３ Ｈ）７．２９−７．３９（ｍ， ４ Ｈ）７．１１（ｔ， Ｊ＝８．８０ Ｈｚ， １ Ｈ）５．２４（ｓ， ２  Ｈ）５．１１（ｄｄ， Ｊ＝１３．２０， ５．１４ Ｈｚ， １ Ｈ）４．２２−４．４６（ｍ， ２ Ｈ）３．５４（ｓ， ２ Ｈ）３．１２−３．２２（ｍ， ４ Ｈ）２．８５−２．９７（ｍ， １ Ｈ）２．５３−２．６２（ｍ， ２ Ｈ）２．３８−２．４８（ｍ， ２ Ｈ）１．９３−２．０３（ｍ， １ Ｈ）。ＭＳ（ＥＳＩ）ｍ／ｚ ５６８．２［Ｍ＋１］＋。
【０５８３】
実施例３：化合物１、化合物２、及び化合物３は、多発性骨髄腫細胞において強力な抗増殖活性を有する
ＣＲＬ４ＣＲＢＮ  Ｅ３ユビキチンリガーゼによるＡｉｏｌｏｓタンパク質の破壊を促進する化合物２及び化合物３の相対的な有効性を、異なる時点（４５分、９０分、及び３時間）でＤＦ１５骨髄腫細胞において調査した。Ｅｎｈａｎｃｅｄ  ＰｒｏＬａｂｅｌ（ｅＰＬ）タグ付きＡｉｏｌｏｓを発現するＤＦ１５細胞を、化合物２または化合物３と共に４５分間、９０分間、または３時間インキュベートした。次いで、細胞抽出物を生成し、Ａｉｏｌｏｓ  ｅＰＬタンパク質の量をｅＰＬ発光アッセイによって決定した。表１に示される値は、濃度に対するＡｉｏｌｏｓ含有量について図１に示されるデータに対応する。結果は、Ａｉｏｌｏｓの時間依存的及び濃度依存的の喪失が両方のエナンチオマーによって誘導されたことを実証した（図１）。
表１：化合物２及び３はＡｉｏｌｏｓ分解を促進した
【表２】
2021525362.tif 000146
【０５８４】
まとめると、実験は、化合物２及び化合物３が時間依存的及び濃度依存的様式でＡｉｏｌｏｓを分解することを示した。データはまた、Ａｉｏｌｏｓ分解がこれらの化合物の有効性をモニタリングするための有効なバイオマーカーであることを実証する。
【０５８５】
実施例４：化合物２は、アポトーシス及び腫瘍生存に必須の因子の下方調節を誘導し、デキサメタゾンと相乗作用を示した
化合物２がデキサメタゾンと相乗作用を示すかどうかを決定するために、既知のＣＲＬ４ＣＲＢＮ  Ｅ３ユビキチンリガーゼ基質、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、及びＺＦＰ９１の喪失に対するデキサメタゾンを添加する効果を、ポマリドマイド感受性（ＯＰＭ２）または抵抗性（ＯＰＭ２−Ｐ１）骨髄腫細胞を使用して検査した。単独の、または化合物２と組み合わせたデキサメタゾンは、７２時間の処理後にＯＰＭ２及びＯＰＭ２−Ｐ１細胞中でＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解をもたらした（図２）。重要なことに、下流エフェクタータンパク質（ｃ−Ｍｙｃ及びＩＲＦ４）のより大きな喪失が、化合物２への１０または１００ｎＭのデキサメタゾンの添加で明白となった（図２）。さらに、アポトーシスマーカー（Ｂｃｌ−２相互作用メディエーター［ＢＩＭ］、切断型カスパーゼ−３、切断型カスパーゼ−７、及び切断型ポリ［アデノシン二リン酸リボース］ポリメラーゼ［ＰＡＲＰ］）の増加した誘導が、ウエスタンブロットによって測定して、７２時間で観察された（図３）。
【０５８６】
同様に、化合物２単独とのＯＰＭ２骨髄腫細胞の５日間のインキュベーションは、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓ、ならびにＺＦＰ９１の発現レベルを顕著に減少させた（図４）。Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの分解の後に、２つのさらなる非常に重要な転写因子であるｃ−Ｍｙｃ及びＩＲＦ４のレベルの低減が続いた（図４）。これらの因子の喪失または低減は、切断型カスパーゼ−３によって測定された、サイクリン依存性キナーゼ阻害因子ｐ２１の増加及びアポトーシスの誘導に関連していた（図４）。結果は、化合物２が、ＩＲＦ４及びｃ−Ｍｙｃを含む重要な多発性骨髄腫生存因子の発現を排除することを介してその抗腫瘍活性を誘発することを示唆する。
【０５８７】
まとめると、これらの結果は、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、及びＩＲＦ４、ならびに、Ｂｃｌ−２相互作用メディエーター（ＢＩＭ）、切断型カスパーゼ−３、切断型カスパーゼ−７、及び切断型ポリ（アデノシン二リン酸リボース）ポリメラーゼ（ＰＡＲＰ）、及びｐ２１などのアポトーシスマーカーは、化合物２での治療の有効性をモニタリングするためのバイオマーカーとして役立つことができることを示す。
【０５８８】
実施例５：セレブロン及びＩｋａｒｏｓ分解が化合物２の抗増殖活性に必要である
セレブロンが化合物２に対する反応を予測するためのバイオマーカーとして役立つことができるかどうかを判断するために、骨髄腫細胞株ＤＦ１５Ｒを、化合物２で処理した。ＤＦ１５Ｒ細胞株は、ポマリドマイドの持続投与（最大１００μＭ）によってレナリドマイド及びポマリドマイドに対する抵抗性を発生させ、検出可能なレベルのＣＲＢＮタンパク質を欠く多発性骨髄腫細胞株である。この細胞株の化合物２での処理は、ＩｋａｒｏｓまたはＡｉｏｌｏｓのいかなる分解も示さなかった（図５Ａ）。ＤＦ１５Ｒ細胞へのＣＲＢＮタンパク質の再導入は、Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの化合物２誘導の分解を再活性化した（図５Ａ）。これらの結果は、ＣＲＢＮが化合物２に対する応答を媒介することにおいて重要であることを示す。したがって、ＣＲＢＮレベルは、化合物２に対する、可能性のある応答を評価するためのバイオマーカーとして役立つことができる。
【０５８９】
化合物２は、Ｉｋａｒｏｓ、Ａｉｏｌｏｓ、及びＺＦＰ９１を下方調節することが示され（図４）、ＣＲＢＮは、Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの分解に必要であることが見いだされた（図５Ａ）。Ｉｋａｒｏｓ、Ａｉｏｌｏｓ、またはＺＦＰ９１の分解が、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、及びｐ２１に対する効果、または化合物２によって誘導されるアポトーシスに対する効果を担うかどうかを判断するために、すべての３つのタンパク質の安定化した変異体を生成し、ＯＰＭ２細胞中で１つずつ過剰発現させた（図５Ｂ）。
【０５９０】
安定化したＩｋａｒｏｓ変異体である、Ｉｋａｒｏｓ−Ｑ１４６ＨまたはＩｋａｒｏｓ−Ｇ１５１Ａの過剰発現の成功は、Ｉｋａｒｏｓの分解を予防し、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、ｐ２１、及び切断型カスパーゼ−３に対する化合物２誘導の効果を無効にした（図５Ｂ）。しかしながら、ＺＦＰ９１（Ｑ４００Ｈ）の安定化変異は、変異が化合物２の存在下での分解からタンパク質を効果的に保護することができたにもかかわらず、化合物２の効果を無効にすることができなかった（図５Ｂ）。
【０５９１】
細胞増殖に対する、安定化変異の効果もまた、測定した。下流タンパク質に対する効果と一致して、安定化されたＩｋａｒｏｓ変異体である、Ｉｋａｒｏｓ−Ｑ１４６ＨまたはＩｋａｒｏｓ−Ｇ１５１Ａの過剰発現は、化合物２の抗増殖効果を無効にした（表２）。具体的には、化合物２での処理時に細胞の増殖が５０％阻害される濃度は、親細胞（０．４８８ｎＭ）と比較して、安定化したＩｋａｒｏｓ変異体を過剰発現する細胞中で２００倍超（＞１００ｎＭ）増加した（表２）。ＺＦＰ９１を安定化することや、化合物２の抗増殖活性に対する感受性の低減における明らかな下流効果はなかった（図５Ｂ及び表２）。化合物２によるＭＭ細胞増殖の阻害に対するＡｉｏｌｏｓ分解の可能性のある寄与は、この特定のアッセイにおけるＩｋａｒｏｓと比較して、分解に対するＡｉｏｌｏｓのより非効率な安定化により、Ａｉｏｌｏｓ変異体を過剰発現する細胞中では確認できなかった。
【０５９２】
まとめると、これらの結果は、Ｉｋａｒｏｓ分解が化合物２の活性に必要であることをさらに実証し、Ｉｋａｒｏｓが化合物２の活性に対する重要なバイオマーカーであることを示す。
表２：ＯＰＭ２細胞の増殖の阻害
【表３】
2021525362.tif 000147
【０５９３】
実施例６：Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの化合物２誘導の分解は、多発性骨髄腫細胞におけるＧ１細胞周期停止及びアポトーシスと相関した
化合物２での治療に対する多発性骨髄腫細胞の機能的応答を評価するために、レナリドマイドに抵抗性である骨髄腫細胞株Ｈ９２９−１０５１を、化合物２で４時間（図６Ａ）または７２時間（図６Ｂ）処理した。化合物２の１ｎＭという低い濃度でのインキュベーションは、４時間以内にＩｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの強固な分解を促進した（図６Ａ）。
【０５９４】
一致して、化合物２での７２時間の処理後、ｐＲＢ１のリン酸化のかなりの減少、及びＨ９２９−１０５１細胞におけるＣＤＫ阻害剤ｐ２７のレベルの増加があった（図６Ｂ）。これらの事象は、サバイビンのレベルの減少、アポトーシス促進タンパク質Ｂｉｍエクストラロングアイソフォーム（ＢｉｍＥＬ）のレベルの劇的な増加、ならびにカスパーゼ−１、カスパーゼ−７、カスパーゼ−３、及びＰＡＲＰの切断を伴った（図６Ｂ）。結果は、レナリドマイド及び／またはポマリドマイド抵抗性細胞における化合物２の抗腫瘍活性が、Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓの分解により、細胞周期停止及びアポトーシスを引き起こすことを実証する。さらに、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓのほぼ完全かつ持続的な分解は、レナリドマイド及びポマリドマイドでの治療に抵抗性である細胞中でさえも、化合物２のインビトロ有効性を実証した（図１０）。これらの結果は、化合物２が細胞周期停止及びアポトーシスを誘導することと、Ｉｋａｒｏｓ、Ａｉｏｌｏｓ、ＩＲＦ４、ｃ−Ｍｙｃ、ｐ２７、ホスホ−Ｒｂ、ＢｉｍＥＬ、切断型カスパーゼ−１、切断型カスパーゼ−７、切断型カスパーゼ−３、及び切断型ＰＡＲＰの検出が、すべて化合物２での治療に対するバイオマーカーとして役立つことができることとを実証する。
【０５９５】
実施例７：化合物２はＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解を誘導し、骨髄腫細胞株においてアポトーシスを増加させた
Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解及び再発現、ならびにアポトーシスの誘導に対する化合物２の持続曝露の効果を、それぞれレナリドマイド及びポマリドマイドに抵抗性である多発性骨髄腫細胞株Ｈ９２９−１０５１及びＯＰＭ２−Ｐ１０において測定した。細胞株を、ウォッシュアウトを伴わなず、化合物２への単一の持続曝露で処理し、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓのレベルを、フローサイトメトリーによって測定した。処理後、細胞株に応じて、３〜６時間以内にＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの７０％超の分解があった（図７Ａ及び図７Ｂ）。基質の枯渇は、Ｈ９２９−１０５１細胞中において最大７０時間、ＯＰＭ２−Ｐ１０細胞において最大１００時間持続した（図７Ａ及び図７Ｂ）。濃度を０．１μＭに１０倍増加させると、さらなる分解はほとんどまたはまったく生じなかった（図７Ａ及び図７Ｂ）。
【０５９６】
Ｈ９２９−１０５１細胞では、Ａｉｏｌｏｓの分解は７５〜１００時間続いたが、Ｉｋａｒｏｓレベルの分解はより短い期間長くなった（図７Ａ及び図７Ｂ）。ＯＰＭ２−Ｐ１０細胞において、両方のタンパク質の分解は１５０時間超持続した（図７Ａ及び図７Ｂ）。
【０５９７】
Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解に対する化合物２へのＨ９２９−１０５１細胞の一過性の曝露の効果も評価した。０．１μＭの化合物２で１５分間の短い一過性の曝露は、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解を誘導した（図８）。分解の程度（２５％〜５０％）は完全でなかったが、曝露後２５〜５０時間続く延長した薬力学（ＰＤ）効果が見られた（図８）。
【０５９８】
化合物２曝露ならびにＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解の動態をさらに理解するために、ウォッシュアウトが後に続く化合物２（０．０１及び０．１μＭ）への６時間のより長い曝露を、調査した。化合物２での処理は、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの７０％超の分解を生み出した（図９）。単一の６時間の曝露後の化合物２のウォッシュアウトは、両方のタンパク質について分解からの迅速な回復を生じた（図９）。７５％超の基質回復が、０．０１μＭの化合物２へ曝露された細胞において２５時間までに、及び０．１μＭの化合物２へ曝露された培養物では７５〜１００時間以内に、見られた（図９）。
【０５９９】
アポトーシスの誘導に対するＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解の効果も評価した。化合物２の持続曝露で観察されたほぼ完全かつ延長した基質抑制は、ＭＭ細胞におけるアポトーシス誘導と一致した（図１０）。０．０１及び０．１μＭの化合物２への持続的な単一曝露は、Ｈ９２９−１０５１及びＯＰＭ２−Ｐ１０細胞におけるアポトーシスの誘導を引き起こした（５０〜７５時間以内）（図１０）。しかしながら、化合物２への１５分または６時間の一過性の曝露は、アポトーシスの誘導を妨げた（図１０）。
【０６００】
まとめると、これらの観察は、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの喪失の大きさ及び持続期間の両方が、試験されたＭＭ細胞モデルにおけるアポトーシス誘導の重要なメディエーターであることを示す。さらに、これらのデータは、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの使用、ならびに切断型カスパーゼ−３などのアポトーシスマーカーが、化合物２に対する応答に対するバイオマーカーであることを実証し、これらのバイオマーカーが、化合物１、化合物２、または化合物３の投薬量を決定または調整するのに有用であり得ることも示唆する。
【０６０１】
実施例８：化合物２は低ＣＲＢＮで獲得抵抗性を有する多発性骨髄腫細胞株の増殖を阻害した。
化合物２活性を、レナリドマイドまたはポマリドマイドに対する獲得抵抗性を、いずれかの化合物への持続曝露により獲得し、そのプロセスにおいて下方調節されたセレブロンレベルを獲得した骨髄腫細胞中で試験した（表２）。細胞を、５日間処理し、次いで、ＡＴＰ決定アッセイ（ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ）を使用して評価した。対照のパーセンテージを、バックグラウンドを差し引き、ＤＭＳＯ対照（対照の１００％）に正規化することによって計算した。レナリドマイドまたはポマリドマイドに対する獲得抵抗性を有する細胞株におけるセレブロンの相対的なパーセンテージを、ウエスタンブロットによって決定し、１００％とした親細胞株におけるＣＲＢＮレベルに対して表３に示す。
【０６０２】
図１１は、親系統（ＤＦ１５、ＮＣＩ−Ｈ９２９、及びＯＰＭ２）、レナリドマイド抵抗性細胞株（ＮＣＩ−Ｈ９２９−１０５１）、または５つのポマリドマイド抵抗性細胞株（ＮＣＩ−Ｈ９２９−Ｐ０１、ＯＰＭ２−Ｐ０１、ＯＰＭ２−Ｐ１、ＯＰＭ２−Ｐ１０及びＤＦ１５Ｒ）において化合物２及びポマリドマイドの活性を比較する濃度応答曲線のＩＣ５０を示す。
表３：薬剤感受性及び薬剤抵抗性の多発性骨髄腫細胞株におけるセレブロンタンパク質発現レベル
【表４】
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Ｎ／Ａ＝該当なし。Ｐｏｍ＝ポマリドマイド。＊バックグラウンドレベル（実際のＣＲＢＮではなく、ＣＲＢＮはこの細胞株に非存在である）
【０６０３】
ポマリドマイドまたはレナリドマイドに抵抗性であるようにされた細胞株の比較は、ＣＲＢＮタンパク質レベルが感受性のある親細胞株よりも低いことを実証した（表３）。増殖を、ＣｅｌｌＴｉｔｒｅ−Ｇｌｏ（登録商標）アッセイを使用して評価した。試験の結果は、細胞株は、５日後に培地に存在するＡＴＰレベルの定量的評価によって決定されるように、ＣＲＢＮレベルが低い獲得抵抗性の複数のモデルにおいてでさえ、化合物２に感受性であることを示す（図１１）。しかしながら、化合物２は、ＣＲＢＮ発現を欠くＤＦ１５Ｒ細胞株に対してほとんど抗増殖活性を示さなかった（図１１及び図５Ａ）。
【０６０４】
まとめると、これらのデータは、化合物２が、低いが検出可能なレベルのＣＲＢＮを伴う獲得抵抗性のモデルにおいて、非常に強力な抗多発性骨髄腫活性を有することを示す。したがって、検出可能なレベルのＣＲＢＮは、化合物２に対する患者の応答性を予測するためのバイオマーカーであり得る。
【０６０５】
実施例９：単独、及びデキサメタゾンと組み合わせた化合物２はレナリドマイド抵抗性多発性骨髄腫においてアポトーシスを誘導した。
デキサメタゾンを、単剤として、または化合物２と組み合わせてアポトーシスを誘導する能力について評価した。アポトーシスの誘導を、レナリドマイド抵抗性多発性骨髄腫細胞（Ｈ９２９−１０５１）中でカスパーゼ−Ｇｌｏを使用して測定した。デキサメタゾンを、音響ディスペンサーを使用して２０の濃度で分注した。プレートを密封し、翌日のために室温で保管した。アッセイのための化合物の最終濃度は、デキサメタゾン（０．８μＭ〜０．００００２μＭ）、及び化合物２（０．００１、０．０１、または０．１μＭ）であった。細胞を、マルチドロップディスペンサーを用いてアッセイプレートに分注し、２連のプレートをアッセイ用に作製した。アポトーシスの測定を、カスパーゼ−Ｇｌｏ  ３／７及びＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏアッセイを使用して化合物処理の７２時間後に行った。カスパーゼ−Ｇｌｏ  ３／７発光を、細胞数の差異を考慮するためにＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ発光に対して正規化した。処理された試料の変化倍率を、以下のように計算した：処理された試料の正規化されたカスパーゼ／正規化されたＤＭＳＯ対照の平均。
【０６０６】
単独、またはレナリドマイド、ポマリドマイド、もしくは化合物２との組み合わせたデキサメタゾンのアポトーシス活性を、カスパーゼ−３誘導によって測定した。結果は、化合物２がデキサメタゾンと相乗作用して細胞生存率を低減させ、濃度依存的様式でデキサメタゾンのアポトーシス能力を増強することを示した（図１２）。デキサメタゾン単独での処理に対する用量反応は、ＤＭＳＯ処理と比較して、カスパーゼ−３変化に従って、アポトーシスのわずかな増加を生じた（図１２）。対照的に、デキサメタゾン活性の開始は、化合物２の存在下で１対数移動した。３つの異なる濃度の化合物２での処理は、カスパーゼ−３によって測定すると、デキサメタゾンのアポトーシス活性を増強した（図１２）。さらに、化合物２の最低用量でさえ、アポトーシスの強力な誘導を生じた。わずか１０ｎＭのデキサメタゾンが、化合物２の細胞死滅能力を増強し、低ナノモルからナノモル未満の濃度の化合物２が、デキサメタゾンのアポトーシス効果を増強した（図１２）。このことは、デキサメタゾンと化合物２の組み合わせがレナリドマイド抵抗性多発性骨髄腫細胞のアポトーシスを誘導する能力を実証し、カスパーゼ−３の測定が化合物２での治療に対するバイオマーカーとして役立つことができることを実証する。
【０６０７】
実施例１０：成人好中球への骨髄前駆細胞の成熟に対する化合物２のエクスビボ効果
健康なドナー（ＨＤ）からの骨髄（ＢＭ）ＣＤ３４＋細胞のエクスビボ培養物を、使用して、好中球減少症に対する化合物２の効果を調査した。以前のデータは、本研究で利用されたアッセイシステムにおける未処理の対照レベルの少なくとも５０％への成熟好中球レベルの回復が、臨床的に顕著な好中球減少症の誘導の非存在またはそれからの回復のと相関することを示した。したがって、成熟好中球に対する化合物２の効果を、モニタリングした。
【０６０８】
Ｉｋａｒｏｓタンパク質レベルを、それぞれ、各曝露期間後、ならびに最後の曝露に続く３、５、及び７日に対応する１９、２１、及び２３日目にも、フローサイトメトリーによって分析した。健康なドナー骨髄からのＣＤ３４＋細胞を、異なる濃度の化合物２及び異なるインキュベーションスケジュールに曝露した。１４日目に開始して連続する１、２、または３日間の各々で、１、１０、及び１００ｎＭの濃度での２、４、及び６時間の化合物２曝露に続く（ＤＭＳＯ対照に対して正規化された）Ｉｋａｒｏｓ含有量のパーセンテージを測定した。曝露期間の終わりに、化合物２を除去し、細胞を化合物２の非存在下でインキュベートした（回復期間）。Ｉｋａｒｏｓを、化合物２でのインキュベーション後（１４〜１６日目）、ならびに１９、２１、及び２３日目の回復中に、フローサイトメトリーによって測定した。データを、２人のドナーについて収集し、図１３に示す。Ｉｋａｒｏｓレベルは、化合物２曝露中に減少し、薬物離脱に続き濃度依存的様式で回復し、異なる曝露スケジュールに関連して有意差は認められなかった（図１３）。Ｉｋａｒｏｓレベルは、ウォッシュアウトに続く少なくとも３日後に、正常に戻り始め、後期好中球前駆体の成熟が完全に回復するのに先立った。これらのデータは、後期好中球前駆体におけるＩｋａｒｏｓ分解が、化合物２のレシピエントにおける好中球減少症の重要なメディエーターであり得ることを示唆する。さらに、本知見は、Ｉｋａｒｏｓレベルの復帰が好中球前駆細胞の成熟の回復に先行することと、化合物２で治療されたＭＭ患者における好中球減少症の管理の成功が、適切な投与スケジュールの使用に伴い可能であり得ることとを示唆する。
【０６０９】
好中球前駆細胞の成熟との関係におけるイカロスの役割をさらに調査するために、イカロスタンパク質レベルを、化合物２への各曝露後及び最後の曝露に続いて隔日にフローサイトメトリーによって分析した。Ｉｋａｒｏｓは、すべての濃度及びすべての曝露スケジュールで化合物２への１回の曝露後に完全に分解した（図１４及び図１５）。化合物２への曝露の３日後、Ｉｋａｒｏｓの回復が、薬物ウォッシュアウトのわずか２４時間後に濃度依存的に始まり、１０日後に対照レベルに戻った（図１４、図１６Ｂ）。化合物２への５日間の曝露で、Ｉｋａｒｏｓの回復は、薬物ウォッシュアウトの３日後の１７日目に開始した（図１５）。対照レベルへの完全な回復は、１０ｎＭの濃度での最後の曝露後６日までに明白となったが、５０％超の回復が、１００ｎＭの濃度での化合物２曝露に続く８日までに明らかとなった（図１５）。
【０６１０】
データは、図１６Ｂに例示されるように、化合物２によって誘導されるＩｋａｒｏｓ分解が好中球前駆体の成熟の遮断を推進する要因であるという仮説と、Ｉｋａｒｏｓ回復の復帰が成熟好中球の回復に先行するという仮説を支持する。まとめると、データは、患者における好中球減少症の誘発及び好中球減少症からの回復が、毎日１回投与と比較して、化合物２のより集中的な投与（複数用量／日）によって悪影響を受けない場合があることを示唆する。
【０６１１】
実施例１１：化合物２は、健康なヒトドナーからの免疫細胞の抗腫瘍活性を増強した
健康なドナーから単離されたＰＢＭＣを、１×１０６細胞／ｍＬの密度で、１０％ＦＢＳを有するＲＰＭＩ  １６４０培地中で培養した。
【０６１２】
Ｋ５６２細胞を対数期に保ち、細胞密度及び生存率を、Ｖｉ−ＣＥＬＬ（登録商標）ＸＲ細胞生存率分析装置（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｃｏｕｌｔｅｒ，Ｂｒｅａ，ＣＡ）を使用したトリパンブルー排除によってモニタリングした。
【０６１３】
新たに単離されたヒトＰＢＭＣを、２０単位／ｍＬの濃度で組換えＩＬ−２と共に７２時間培養した。次いで、末梢血単核細胞を、遠沈し、新鮮なＲＰＭＩ完全培地中で２×１０６細胞／ｍＬに再懸濁させた。次いで、細胞を、示された濃度でＤＭＳＯまたは化合物２で処理し、さらに７２時間インキュベートした。次いで、ＰＢＭＣを、共培養の前に新鮮なＲＰＭＩ完全培地中で２回洗浄した。Ｋ５６２細胞を、１×１０６細胞／ｍＬの細胞密度に再懸濁させ、製造業者の使用説明書に従って１μＭのＣｅｌｌＴｒａｃｅ  ＣＦＳＥで染色した。次いで、標識されたＫ５６２細胞を、１×１０５細胞／ウェルで９６ウェル丸底プレートに播種した。次いで、末梢血単核細胞を、同じ９６ウェルプレートに１：１５比で三重に移し、３７℃で４時間インキュベートした。ＰＢＭＣ媒介性アポトーシスによる特定の標的細胞溶解を、製造業者の使用説明書に従ってアネキシンＶ−フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）及びヨウ化プロピジウム（ＰＩ）を使用して測定し、試料を、ＦＡＣＳアレイスキャン上で実行した。非標識Ｋ５６２細胞、ＣｅｌｌＴｒａｃｅ  ＣＦＳＥ標識Ｋ５６２細胞、及びアネキシンＶ−ＦＩＴＣ及びＰＩ標識非処理Ｋ５６２細胞を、対照として各アッセイに含めた。すべての骨髄腫細胞株を対数期に保ち、細胞密度及び生存率を、Ｖｉ−ＣＥＬＬ  ＸＲ細胞生存率分析装置を使用したトリパンブルー排除によってモニタリングした。９６ウェルディッシュを、抗ＣＤ３抗体（ＯＫＴ３、３μｇ／ｍＬ）でプレコートし、実験開始前に４℃で一晩インキュベートした。凍結したＰＢＭＣドナーを、１０％ＦＢＳを有するＲＰＭＩ培地中にて３７℃で２分間解凍し、細胞計数及び生存率を、Ｖｉ−ＣＥＬＬ（登録商標）（Ｂｅｃｋｍａｎ  Ｃｏｕｌｔｅｒ）上で測定した。末梢血単核細胞を、洗浄し、１×１０６細胞／ｍＬに希釈し、２００μＬの総体積で化合物治療プレートに分注した。細胞を、化合物と共に２時間インキュベートしてから抗ＣＤ３コーティングプレートに移し、３７℃でさらに７２時間インキュベートした。７２時間後、ＰＢＭＣを遠心分離し、細胞をＲＰＭＩ培地＋１０％ＦＢＳ中で２回洗浄した。非処理のＭＭ細胞株（Ｈ９２９及びＨ９２９−１０５１）を、製造業者の使用説明書に従ってＣｅｌｌＴｒａｃｅ  ＣＦＳＥで標識し、１００μＬの総体積でＵ底９６ウェルプレート中に０．１×１０６細胞／ｍＬの総濃度で再懸濁させた。末梢血単核細胞を、計数し、１：５の標的：エフェクター（Ｔ：Ｅ）比でＭＭ細胞に添加した。２４時間の共培養後、ＰＢＭＣ誘導性アポトーシスによる特定の標的細胞溶解を、製造業者の使用説明書に従ってアネキシンＶ−ＡＦ６４７及び７−ＡＡＤを使用して測定し、試料を、Ａｔｔｕｎｅ  ＮｘＴサイトメーター（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｆｉｓｈｅｒ）上で実行した。
【０６１４】
９６ウェルディッシュを、抗ＣＤ３抗体（ＯＫＴ３、３μｇ／ｍＬ）でプレコートし、実験開始前に４℃で一晩インキュベートした。凍結したＰＢＭＣドナー細胞を、１０％ＦＢＳを有するＲＰＭＩ培地中にて３７℃で２分間解凍し、細胞計数及び生存率をＶｉ−ＣＥＬＬ分析装置上で測定した。末梢血単核細胞を、洗浄し、１×１０６細胞／ｍＬに希釈し、２００μＬの総体積で化合物治療プレートに分注した。細胞を、化合物２と共に２時間インキュベートしてから抗ＣＤ３コーティングプレート上に移し、さらに７２時間インキュベートした。同時に、ＭＭ細胞株（ＮＣＩ−Ｈ９２９、Ｈ９２９−１０５１、ＯＰＭ２、ＯＰＭ２−Ｐ１０）を、０．１×１０６細胞／ｍＬの最終濃度に希釈し、製造業者の使用説明書に従ってＣｅｌｌＴｒａｃｅ  ＣＦＳＥで標識した。次いで、多発性骨髄腫細胞株を、化合物処理プレートに総量２００μＬで分注し、７２時間インキュベートした。７２時間後、ＰＢＭＣ及びＭＭ細胞を、計数し、１：５の最終Ｔ：Ｅ比でＵ底９６ウェルプレートに移した。２４時間の共培養後、ＰＢＭＣ媒介性アポトーシスによる特定の標的細胞溶解を、製造業者の使用説明書に従ってアネキシンＶ−ＡＦ６４７及び７−ＡＡＤを使用して測定し、試料を、Ａｔｔｕｎｅ  ＮｘＴサイトメーター上で実行した。
【０６１５】
共培養モデルを使用して、健康なドナーから採取されたＰＢＭＣの抗腫瘍活性に対する化合物２の直接的効果を決定した。ＩＬ−２活性化ＰＢＭＣの化合物２による処理は、濃度依存的様式で非処理のＫ５６２細胞の死滅を誘導した（図１７Ａ及び図１７Ｂ）。化合物２処理のＰＢＭＣ（ＩＣ５０＝５．９ｐＭ）は、強力に５０％の直接的Ｋ５６２細胞死滅を達成した。
【０６１６】
化合物２と共にインキュベートされたＰＢＭＣの抗ＭＭ細胞活性に対する化合物２の効果を、感受性細胞における応答と比較するために、抵抗性表現型を表す細胞株においてさらに検査した。異なる共培養モデルにおいて、ＰＢＭＣドナー細胞を、化合物２で２時間前処理してから、抗ＣＤ３抗体コーティングプレートで７２時間培養した。化合物２で処理された抗ＣＤ３抗体活性化ＰＢＭＣは、非処理のレナリドマイド感受性（ＮＣＩ−Ｈ９２９；ＩＣ５０＝０．００５μＭ）及びレナリドマイド抵抗性（Ｈ９２９−１０５１；ＩＣ５０＝０．０００２μＭ）ＭＭ細胞株の腫瘍細胞溶解の濃度依存的な増加を同程度示した（図１８Ａ及び図１８Ｂ）。ＰＢＭＣ媒介性アポトーシスによる同様のレベルの腫瘍細胞死滅が、レナリドマイド感受性及びレナリドマイド抵抗性の共培養腫瘍細胞に対して見られ、ＰＢＭＣがそれらの抵抗性表現型とは無関係に腫瘍細胞中でアポトーシスを誘導するように予備刺激されたことを示している。
【０６１７】
化合物２との免疫細胞のプレインキュベーションが、ＭＭ細胞の標的化及び溶解を増強したため、免疫媒介性死滅に対するそれらの感受性に対する化合物２とのＭＭ細胞のプレインキュベーションの効果も、調査した（図１９Ａ〜図１９Ｄ）。４つのＭＭ細胞株と抗ＣＤ３抗体活性化ＰＢＭＣを、別々に化合物２共に７２時間プレインキュベートした。抗ＣＤ３抗体活性化ＰＢＭＣ及びＭＭ株の両方が化合物２で前処理、続いて共培養された際、ＰＢＭＣ誘導のＭＭ細胞溶解に対する効果が、死滅応答の効力及び大きさの両方で増強された。免疫及び腫瘍細胞の共培養と単一のＭＭ細胞培養物からのＩＣ５０値を比較すると、化合物２は、ＮＣＩ−Ｈ９２９細胞の死滅を約７０００倍増強し、Ｈ９２９−１０５１細胞の死滅を約６０００倍増強した（図１９Ａ及び図１９Ｂ）。
【０６１８】
化合物２で処理されたＰＢＭＣは、非処理のＫ５６２及びＭＭ細胞株の腫瘍溶解を強力に誘導した。さらに、ＰＢＭＣ及びＭＭ細胞株の両方が化合物２で前処理された場合、腫瘍細胞死滅は大幅に強化され、化合物２が、細胞に対するその強力な自律効果に加えて、ＭＭ細胞株の免疫原性も増強し得ることを示している。まとめると、結果は、ＭＭ細胞に対する強力な細胞自律的及び免疫原性効果の組み合わせ、ならびにその免疫調節特性を示す。
【０６１９】
実施例１２：化合物２はエフェクターリンパ球及びサイトカインを活性化した
Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）活性化された健康なＰＢＭＣに対する化合物２の免疫調節活性を評価した。９人の健康なＰＢＭＣドナーからの細胞のパネルにおいて、７２時間の抗ＣＤ３抗体刺激の存在下での化合物２とのインキュベーションは、１４ｐＭの平均最大半量有効濃度（ＥＣ５０）でＩＬ−２分泌を誘導した（図２０）。このサイトカイン分泌の増加は、化合物２の導入後２４時間という早期で明白となり、化合物２によって誘導されるエフェクターサイトカイン産生のピークは、ＩＬ−２について５．５倍、インターフェロンガンマ（ＩＦＮ−γ）について４．５倍、及び腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦ−α）について２倍、ビヒクル対照よりも大きかった（それぞれ図２１Ａ〜図２１Ｃ）。これらのデータは、化合物２がＴ細胞を活性化でき、ＴＮＦ−α、ＩＦＮ−γ、ＩＬ−２などのサイトカインの分泌を刺激できることを実証する。さらに、これらのデータは、これらのサイトカインが、化合物２に応答して、活性化Ｔ細胞に対するバイオマーカーとして役立つことができることを示す。
【０６２０】
実施例１３：化合物２は、Ｔ細胞において基質分解を誘導した
７２時間の時間経過にわたるＣＤ４＋及びＣＤ８＋Ｔ細胞中のＩｋａｒｏｓの分解に対する化合物２の効果を調査した。エフェクターサイトカイン放出を誘導する化合物２の能力は、ＩＬ−２の既知の転写抑制因子であるＣＤ４＋Ｔ細胞中のＩｋａｒｏｓの分解と相関した（図２２Ａ〜図２２Ｃ）。ＣＤ４＋Ｔ細胞では、２４時間後、化合物２での処理は、強固なＩｋａｒｏｓ分解を示した（２４時間ＩＣ５０＝０．０００３μＭ）（図２２Ａ）。ＣＤ８＋Ｔ細胞集団では、効力もまた観察され、化合物２は０．０００５μＭの２４時間ＩＣ５０を表した（データ示さず）。Ｉｋａｒｏｓを分解する化合物２の能力はまた、ＣＤ４＋（図２２Ｂ及び図２２Ｃ）及びＣＤ８＋（データ示さず）Ｔ細胞集団の両方において、４８時間及び７２時間の時点で観察された。これらのデータは、化合物２がＴ細胞中のＩｋａｒｏｓを分解することを実証し、これはエフェクターサイトカイン放出の誘導と相関する。したがって、Ｉｋａｒｏｓ及びＡｉｏｌｏｓは、Ｔ細胞活性化のバイオマーカーとして役立つことができる。
【０６２１】
実施例１４：免疫調節／インターロイキン−２誘導に対するデキサメタゾンと組み合わせた化合物２の効果
ＩＬ−２を産生するＰＢＭＣの能力に対する、異なる濃度のデキサメタゾンと組み合わせた化合物２の効果を調査した。４人の健康なドナーからの末梢血単核細胞を、化合物２と共に２時間プレインキュベートした後、抗ＣＤ３抗体でコーティングされたビーズでさらに７２時間刺激した。１０ｎＭのデキサメタゾンと組み合わせて使用された場合、化合物２は、依然として、ビヒクル対照より少なくとも１０倍高いレベルまでＩＬ−２を誘導することができ、ピーク応答は、０．０１ｎＭの化合物２で達成された（図２３Ｃ）。しかしながら、より高いデキサメタゾン濃度（１００ｎＭ）との化合物２の組み合わせは、ベースラインを超えるＩＬ−２の誘導をほとんど示さなかった。
【０６２２】
まとめると、これらのデータは、化合物２の免疫調節活性が低レベル（１０ｎＭ）のデキサメタゾンの存在下で維持され、ＭＭ細胞の自律的死滅における劇的な相乗効果が化合物２で観察されたことを示す。
【０６２３】
実施例１５．バイオマーカーを使用した薬力学、有効性、及び予測評価
薬力学（ＰＤ）、有効性、及び予測エンドポイントは、患者の血液及び骨髄中の様々なバイオマーカーを分析することで評価され得る。評価されるバイオマーカーは、Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの分解；エクスビボ刺激時のサイトカインプロファイル；免疫細胞（例えば、Ｔ細胞）の表現型分析；ＣＲＢＮ、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、腫瘍浸潤リンパ球（ＴＩＬ）、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ３の発現レベル；細胞発生、変異、及びＴＣＲクローン性；可溶性ＢＣＭＡ、遊離軽鎖（ＦＬＣ）、及び循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）を含む。
【０６２４】
骨髄穿刺（ＢＭＡ）は、治療前、治療中、及び試験の終了時に患者から採取される。およそ６ｍＬのＢＭＡが採取され、臨床部位での１ｍＬの固定ＢＭＡ血餅が、バイオマーカーとしての、ＣＲＢＮ、Ａｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、ＺＦＰ９１、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ４、ｃ−カスパーゼ−３、ならびにＴＩＬの発現レベルを評価するために、免疫組織化学（ＩＨＣ）のために使用される。次いで、残りのＢＭＡは骨髄腫細胞を単離するためにＣＤ１３８＋選択に供され、ＣＤ１３８−及びＣＤ１３８＋画分が収集される。ＣＤ１３８＋細胞の一部は、蛍光インサイツハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）のために使用される。残りのＣＤ１３８＋細胞は、ＲＮＡ及びＤＮＡの単離及び分析、追加のＦＩＳＨ分析、ならびに生存可能な凍結ＣＤ１３８＋細胞のためのアリコートに優先順位付けされる。骨髄単核細胞（ＢＭＭＮＣ）は、フィコール密度勾配遠心分離によってＣＤ１３８−画分から単離される。ＣＤ１３８−ＢＭＭＮＣは、ＲＮＡ及びＤＮＡの単離及び分析、生存可能な凍結ＣＤ１３８−細胞免疫プロファイリング、ならびにＴＣＲクローン性のための凍結細胞ペレットのためのアリコートに優先順位付けされる。
【０６２５】
患者の全血もまた、分析される。末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、及び／または血清／血漿が、試料から単離される。全血はまた、いくつかのバイオマーカーの分析に対して直接使用される。
【０６２６】
全血の分析は、バイオマーカーとしてのＴ細胞活性化を決定するために使用され得る。すべてのスケジュールについて、スクリーニング時及び治療中に採血が行われる。血液は、Ｔ細胞を刺激するための抗ＣＤ３抗体を含有するＴｒｕＣｕｌｔｕｒｅチューブに採取される。チューブは、３７℃で４２±４時間インキュベートされる。培地が細胞から分離され、−７０℃で凍結される。試料は、インターフェロンガンマ（ＩＦＮγ）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）、インターロイキン−２（ＩＬ−２）などのＴ細胞活性化を示すサイトカインを含む、カスタムサイトカインパネル（Ｍｙｒｉａｄ  ＲＢＭ，Ｉｎｃ．）を使用して、Ｔ細胞活性化について分析される。
【０６２７】
血清が全血から単離され、可溶性ＢＣＭＡ（ｓＢＣＭＡ）が、すべてのサイクル及びスケジュール上で治療前と治療中にバイオマーカーとしてＥＬＩＳＡによって測定される。加えて、血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）が、ｓＢＣＭＡと同じ血清試料においてバイオマーカーとして測定される。ＦｒｅｅＬｉｔｅ試験が、カッパ軽鎖とラムダ軽鎖との間の比（ｋ／ｌ比）を測定するために使用される。
【０６２８】
全血から単離されたＰＢＭＣが、ＦＡＣＳ及び／またはＥＬＩＳＡによってバイオマーカーＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓのタンパク質発現について分析される。これらのバイオマーカーの発現レベルを測定するためのＰＢＭＣ単離は、すべてのスケジュールに登録されている患者に対して、１日目、治療中、ならびに試験の終了時に、実行される。
【０６２９】
加えて、ＰＢＭＣのバイオマーカー分析は、治療前及び治療中の全血試料を収集した後の免疫表現型検査を含む。免疫調節が、Ｔ細胞サブセット（ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、Ｔｒｅｇ、Ｔｅｆｆ、Ｔｍｅｍ）、Ｂ細胞、及びＮＫ細胞のＦＡＣＳアッセイによって評価される。
【０６３０】
最後に、末梢血に存在する循環腫瘍細胞（ＣＴＣ）の量が、バイオマーカーとして定量化される。ＣＴＣは、微小残存病変（ＭＲＤ）評価のために使用されるＦＡＣＳアッセイによって特定及び分析される。すべてのスケジュールについて、ＣＴＣは、１日目、及び治療中に血中で測定される。
【０６３１】
バイオマーカーは、化合物２の低用量デキサメタゾンとの併用活性を決定し、化合物２の投与スケジュールを評価するために使用される。加えて、他のセレブロンモジュレーター化合物と比較した、デキサメタゾンと組み合わせた化合物２の有効性が、バイオマーカーに従って評価される。まとめると、これらのバイオマーカーの評価は、患者選択を指示し、ガイダンスをスケジュールし、療法に対する応答を予測し、及び／または治療の有効性を決定することができる。
【０６３２】
実施例１６：再発性及び難治性の多発性骨髄腫の治療スケジュールを変更するためのバイオマーカーの使用
本明細書で提供されるバイオマーカーは、スケジュールを延長またはスケジュールを短縮することなど、治療が変更されるべきかどうかを決定するために使用され得る。Ａｉｏｌｏｓ／Ｉｋａｒｏｓ抑制、ならびにＴ細胞の活性化及び増殖の評価は、治療スケジュールに指針を与えることができる。
【０６３３】
最適な用量が達成されているかどうかを決定するために、血液が治療中に収集され、ＰＢＭＣが単離され、Ａｉｏｌｏｓ／Ｉｋａｒｏｓ抑制がＦＡＣＳによって測定される。１つのシナリオでは、アッセイバックグラウンドを超えるＡｉｏｌｏｓ／Ｉｋａｒｏｓ回復の量は、１５％未満である。加えて、ＩＨＣは、複数の用量レベルにわたる骨髄におけるＡｉｏｌｏｓ／Ｉｋａｒｏｓ抑制（ｒｅｐｒｅｓｓｉｏｎ）の相関が、骨髄Ａｉｏｌｏｓ抑制（ｓｕｐｐｒｅｓｓｉｏｎ）もまたアッセイフロアの１５％以内であることを支持することを示す。さらに、次の最も低い用量レベルと比較して、さらなるＰＤ応答はほとんどまたはまったくなく、ＰＤ効果が飽和していることを示唆している。Ｔ細胞の活性化及び増殖の測定は、血清／血漿中の可溶性ＣＤ２５の増加、ならびにＣＤ８＋及びＣＤ４＋細胞中のＫｉ６７の増加を評価することによって決定される。Ｔ細胞の活性化及び増殖が用量に伴いプラトーに達することと、Ｔｅｆｆ集団の喪失がないこととを示す結果は、最適な投薬量が達成されていることを示す。グレード３以上の好中球減少症の非存在は、ＰＤが最適化されていることを実証し、スケジュールが用量を増加させる代わりに延長され得ることを示す。このシナリオ下では、バイオマーカーは、最適な生物学的用量が達成され、スケジュールが変更なく継続できることを示す。
【０６３４】
あるいは、バイオマーカーデータは、スケジュールが変更を必要とすることを示す場合がある。異なるシナリオでは、投与スケジュールを用いた治療の結果が、回復したバイオマーカーＡｉｏｌｏｓ／Ｉｋａｒｏｓのタンパク質発現レベルがＰＢＭＣ及び／またはＢＭにおける治療中にバックグラウンドよりも１５％以上大きいことを示し得る。加えて、漸増用量でのＰＢＭＣ及び／またはＢＭにおけるバイオマーカーＡｉｏｌｏｓの発現抑制のプラトーの非存在が、観察され得る。さらに、バイオマーカーとしてのＴ細胞の活性化及び増殖の評価は、Ｔ細胞活性化が最大化されていないことを示す場合がある。このことは、ＰＤ効果が治療スケジュールＭＴＤで最適化されていないことを示唆する。許容できない好中球減少症の追加、及び治療中のＡＮＣにおける不完全または非存在である回復は、治療スケジュールで提供される休薬ウィンドウが十分な好中球成熟回復を可能にするのに不十分であることを示す。したがって、スケジュールは、回復ウィンドウを増加させ、用量の漸増を再開させるために短縮され得る。まとめると、これらの２つのシナリオは、バイオマーカーが、多発性骨髄腫に対するセレブロンモジュレーターでの患者治療のスケジューリングにおいて指示を与えることができることを実証する。
【０６３５】
実施例１７：患者選択のための、及びセレブロンモジュレーターで再発性及び難治性の多発性骨髄腫を治療するための予測マーカーとしてのバイオマーカーの使用
バイオマーカーはまた、患者選択を定義するため、及び化合物２、またはエナンチオマー、エナンチオマーの混合物、互変異性体、もしくは薬学的に許容される塩などのセレブロンモジュレーターでの再発性／難治性多発性骨髄腫の治療に対する応答または抵抗性を予測するために使用され得る。
【０６３６】
骨髄試料が、治療中のスクリーニング目的のために治療前に収集され、試験の終了時に収集される。およそ６ｍＬのＢＭＡが採取され、ＣＤ１３８分画が実行され得る。さらに、エクスビボでの薬物試験が、一次試料に対して実行され得る。エクスビボデータは、ＣＤ１３８集団から収集される臨床データと統合され得る。まとめると、バイオマーカーから収集されるデータは、化合物での治療のための患者選択を定義するのに役立つことができる。
【０６３７】
実施例１８：再発性及び難治性の多発性骨髄腫を有する対象におけるデキサメタゾンと組み合わせた化合物２の安全性、薬物動態及び予備的有効性を評価するための第１相多施設非盲検試験
適応症：再発性及び難治性の多発性骨髄腫（ＲＲＭＭ）。
【０６３８】
主目的：
【０６３９】
デキサメタゾンと組み合わせた化合物２の薬物動態（ＰＫ）、安全性／忍容性を評価し、その最大耐量（ＭＴＤ）／推奨パート２用量（ＲＰ２Ｄ）を、最低２つの化合物２投与スケジュールと併せて定義する。
【０６４０】
副次目的：
【０６４１】
デキサメタゾンと組み合わせた化合物２の予備的有効性を評価する。
【０６４２】
試験デザイン
【０６４３】
これは、ＲＲＭＭを有する対象においてデキサメタゾンと組み合わせた化合物２の安全性、ＰＫ／ＰＤ、及び予備的有効性を評価するための非盲検、多施設、国際的な第１相試験である。レナリドマイドまたはポマリドマイド、プロテアソーム阻害剤、及び抗ＣＤ３８抗体を含む少なくとも３つの前のレジメンで以前に治療されたＲＲＭＭ患者が、適格となる。
【０６４４】
本試験は２つのパートで実施される。パート１は、同時の標準用量のデキサメタゾンを伴う漸増用量の化合物２のＰＫ／ＰＤ及び安全性を評価し、最低２つの異なる投与スケジュールに従って投与される場合の組み合わせのためのＭＴＤ／ＲＰ２Ｄを決定する。パート２は、１つ以上の投与スケジュールについて、ＲＰ２Ｄでの化合物２に加えてデキサメタゾンのシングルアーム拡大コホート（複数可）からなる。安全性、ＰＫ及びＰＤの評価に加えて、すべての対象は、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｍｙｅｌｏｍａ  Ｗｏｒｋｉｎｇ  Ｇｒｏｕｐ（ＩＭＷＧ）Ｕｎｉｆｏｒｍ  Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｃｒｉｔｅｒｉａ（Ｒａｊｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ，２０１１，１１７（１８）：４６９１−５、Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｌａｎｃｅｔ  Ｏｎｃｏｌ．，２０１６，１７（８）：ｅ３２８−ｅ３４６）に従って毎月の応答評価を受け、疾患進行、耐えられない毒性、または医師もしくは対象の試験治療を中止する決定まで、試験治療を継続できる。
【０６４５】
本試験は、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｏｕｎｃｉｌ  ｏｎ  Ｈａｒｍｏｎｉｓａｔｉｏｎ（ＩＣＨ）Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ  Ｒｅｑｕｉｒｅｍｅｎｔｓ  ｆｏｒ  Ｒｅｇｉｓｔｒａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ  ｆｏｒ  Ｈｕｍａｎ  Ｕｓｅ／Ｇｏｏｄ  Ｃｌｉｎｉｃａｌ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ（ＧＣＰ）及び該当する規制要件に準拠して実施される。
【０６４６】
パート１（用量漸増）
【０６４７】
ＲＲＭＭを有する対象のコホートが、漸増用量の化合物２に加えて固定用量のデキサメタゾン（４０ｍｇ／用量、７５歳以上の対象では２０ｍｇ／用量）を、その安全性、ＭＴＤ／ＲＰ２Ｄ、及びＰＫ／ＰＤプロファイルを評価するために受ける。最低２つの異なる投与スケジュールが、パート１では評価され、第１のスケジュールは、各２８日サイクルで４日の無治療が後に続く連続する１０日の毎日１回（ＱＤ）投与２回からなる（２０／２８スケジュールと称される）。第２のスケジュールは、各サイクルで１１日の無研究治療が後に続く連続する３日間の毎日２回（ＢＩＤ）投与２回からなる（６／２８スケジュールと称される）。初期用量コホートは、２０／２８スケジュール上ＱＤで０．１ｍｇ／日の化合物２を受け、６／２８スケジュール上ＢＩＤで０．２ｍｇを受ける。投与スケジュール間の切り替えは認められない。２８日のサイクルあたり２回の数日の無治療が後に続く毎日（ＱＤ）または毎日２回（ＢＩＤ）の化合物２の投与を伴う追加の投与スケジュール（例えば、２８日サイクルあたり２回の９日の無治療が後に続く５日のＱＤもしくはＢＩＤの投与、または２８日サイクルあたり２回の７日の無治療が後に続く７日のＱＤもしくはＢＩＤの投与２回、及び２８日サイクルあたり７日の無治療が後に続く２１日の毎日の投与）は、初期の２０／２８及び６／２８スケジュールと、その後の試験されたスケジュールに関連した、安全性及びＰＫ／ＰＤの結果のレビューに続いて調査され得る。
【０６４８】
すべての投与スケジュールについて、サイクル１、すなわち１〜２８日目は、ＭＴＤ決定の目的のための用量制限毒性（ＤＬＴ）評価期間を構成する。被験者は、対象がサイクル１において２０／２８スケジュールで２０投与日のうち少なくとも１６投与日に、及び６／２８スケジュールで６投与日のうち少なくとも５投与日に（１０投与）（もしくは代替スケジュール上で処方された用量の少なくとも８０％で）化合物２の処方された用量を受けるか、またはＤＬＴを経験する場合、ＤＬＴについて評価可能となる。非ＤＬＴ評価可能な対象は、交換されるであろう。
【０６４９】
各スケジュールにおいて、３人以上の被験者のコホートが、外部の原因に明確かつ議論の余地なく帰すことができない２つのグレード２の治療下で発現する有害事象の発生まで、連続するコホートにおいて１００％増加量で増加する用量で化合物２を受ける。その後、５０％を超えない用量増加量が、第１のＤＬＴの発生まで続く。ロジスティック回帰を使用したベイズ用量漸増方法が、任意の投与スケジュールにおいて第１のＤＬＴの発生後、共変量として化合物２の割り当てられた用量、投与数／日（ＱＤ対ＢＩＤ）、及び各スケジュールについての連続投与日数を用いて利用される。
【０６５０】
被験者内用量漸増は、ＤＬＴ評価期間中には認められないが、サイクル２以降、化合物２の割り当てられた用量に忍容性を示す被験者は、割り当てられた投与スケジュール内で被験者の少なくとも１つのコホートによって適切に忍容性が示される最高用量レベルに漸増できる。
【０６５１】
パート２（コホート拡大）
【０６５２】
パート１の完了時に、化合物２に加えデキサメタゾンのシングルアームの拡大試験が、ＲＰ２Ｄ及びスケジュールでのその安全性、ＰＤ、及び有効性をさらに評価するために、１つ以上の投与スケジュール（複数可）あたり２０人の被験者において実施される。
【０６５３】
試験集団
【０６５４】
１８歳以上の年齢で、ＲＲＭＭを有し、自身の最後の治療法に対して難治性であり、レナリドマイドまたはポマリドマイド、プロテアソーム阻害剤、及び抗ＣＤ３８抗体を含む少なくとも３つの前のレジメンで以前に治療され、０〜２のＥａｓｔｅｒｎ  Ｃｏｏｐｅｒａｔｉｖｅ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ  Ｇｒｏｕｐ  Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ  Ｓｔａｔｕｓ（ＥＣＯＧ  ＰＳ）、測定可能な疾患、及び適切な骨髄、腎機能及び心臓機能を有する被験者が登録され得る。同種移植、非分泌性もしくはオリゴ分泌性ＭＭ、形質細胞白血病、または原発性難治性ＭＭの履歴を有する（すなわち、前の治療レジメンに対する少なくとも軽微な応答の履歴がない）被験者は、除外される。
【０６５５】
被験者の数
【０６５６】
北米及びヨーロッパからのＲＲＭＭを有するおよそ１２０人の被験者が登録する。およそ８０人の被験者が、パート１における各スケジュールについて同時のデキサメタゾンでのＭＴＤ／ＲＰ２Ｄを決定するために、２つの投与スケジュール（ＱＤまたはＢＩＤのいずれか）のうちの１つに割り当てられる。投与スケジュールあたり２０人の被験者（合計ｎ＝４０）が、デキサメタゾンと共にＭＴＤ／ＲＰ２Ｄで化合物２を受けるようにパート２に登録される。
【０６５７】
パート１に登録される被験者の数の推定は、以下の仮定に基づく。各スケジュールについてＭＴＤ／ＲＰ２Ｄで治療される、最低９人の対象を含む各投与スケジュールの４０人の被験者。パート２に登録される対象の数の推定は、投与スケジュールあたり２０人の被験者を仮定する。これらの推定は、コホートの実際の数、各投与スケジュールに登録されるコホートあたりの被験者（パート１）、及び追加の投与スケジュールがパート２で評価されるかどうかに基づいて修正され得る。
【０６５８】
選択基準
【０６５９】
被験者は、試験に登録されるために以下の基準を満たさなければならない。
【０６６０】
被験者は、インフォームドコンセントフォーム（ＩＣＦ）に署名した時点で１８歳以上である。
【０６６１】
被験者は、いかなる試験関連評価／手順も実行される前に、ＩＣＦを理解し、ＩＣＦに自主的に署名しなければならない。
【０６６２】
被験者は、試験の来院スケジュール及び他のプロトコル要件を進んで遵守し、それらを遵守することができる。
【０６６３】
０、１、または２のＥａｓｔｅｒｎ  Ｃｏｏｐｅｒａｔｉｖｅ  Ｏｎｃｏｌｏｇｙ  Ｇｒｏｕｐ（ＥＣＯＧ）パフォーマンスステータススコアである。
【０６６４】
被験者は、登録時にＭＭ及び測定可能な疾患の文書で記録された診断を有しなければならない。測定可能な疾患は次のように定義される。（ａ）ｓＰＥＰによる０．５ｇ／ｄＬ以上のＭタンパク質量、または（ｂ）ｕＰＥＰによる２００ｍｇ／２４時間以上の採尿、または（ｃ）測定可能な血清もしくは尿中Ｍタンパク質を有しない被験者において軽鎖及び異常なカッパ／ラムダ（κ／λ）比を伴った、１００ｍｇ／Ｌ超の血清ＦＬＣレベルまたは（ｄ）免疫グロブリンクラスＡ（ＩｇＡ）、骨髄腫を有する、疾患が定量的免疫グロブリン測定によってのみ確実に測定され得る被験者については、０．５０ｇ／ｄＬ以上の血清ＩｇＡレベル。
【０６６５】
すべての被験者は、（ａ）レナリドマイド、ポマリドマイド、プロテアソーム阻害剤、糖質コルチコイド及びＣＤ３８抗体の少なくとも２つの連続サイクルを含む少なくとも３つの前の抗骨髄腫レジメンを受けていなければならず（注：骨髄移植の有無にかかわらず、かつ維持療法の有無にかかわらず、誘導は１つのレジメンと見なされる）、（ｂ）自身の最後の骨髄腫療法の最後の投与時またはその６０日以内に、疾患進行が文書で記録されていなければならず、（ｃ）上記の基準（ａ及びｂ）に加えて、パート２に登録された被験者は、免疫調節剤（レナリドマイド及び／またはポマリドマイド）、糖質コルチコイド、プロテアソーム阻害剤、及びＣＤ３８抗体に難治性の疾患を有しなければならない。難治性は、療法に対して非応答性である（最小奏効を達成できないか、または進行性疾患の発症）か、または最後の投与から６０日以内に進行する疾患として定義される。
【０６６６】
被験者は以下の検査値を有しなければならない。（ａ）７日以上（ペグフィルグラスチムについては１４日以上）の成長因子支持を伴わない１．２５×１０９／Ｌ以上の絶対好中球計数（ＡＮＣ）。１．００×１０９／Ｌ以上のＡＮＣが、用量拡大コホート（パート２）について認められる。（ｂ）８ｇ／ｄＬ以上のヘモグロビン（Ｈｇｂ）。（ｃ）７日間以上輸血を伴わない７５×１０９／Ｌ以上の血小板（ｐｌｔ）。（ｄ）１３．５ｍｇ／ｄＬ以下（３．４ｍｍｏｌ／Ｌ以下）の補正された血清カルシウム。（ｅ）４５ｍＬ／／分以上の２４時間クレアチニンクリアランス（ＣｒＣｌ）。（ｆ）正常の上限（ＵＬＮ）の３倍以下のＡＳＴ／ＳＧＯＴ及びＡＬＴ／ＳＧＰＴ。（ｇ）文書で記録されたジルベール症候群を有する被験者について、ＵＬＮの１．５倍以下または３．０ｍｇ／ｄＬ未満の血清ビリルビン。（ｈ）７．５ｍｇ／ｄＬ（４４６μｍｏｌ／Ｌ）以下の尿酸。（ｉ）ＵＬＮの１．５倍未満のＰＴ／ＩＮＲ及びＵＬＮの１．５倍未満の部分トロンボプラスチン時間（ＰＴＴ）（治療的抗凝固を受けていない被験者について）。注：登録の３か月よりも前に発生した血栓塞栓性事象に対する療法を受けている被験者は、ワルファリン、低分子量ヘパリン、または他の承認された治療的抗凝固または抗血小板レジメンでの抗凝固の安定したレジメン上にある限り、適格である。
【０６６７】
妊娠可能な女性（ＦＣＢＰ）は、（ａ）試験療法を開始する前に試験責任医師によって検証された２つの陰性の妊娠試験を有しなければならない。妊娠可能な女性は、試験期間中、及び化合物２の中止後に、継続した妊娠試験を受けることに同意しなければならない。このことは、被験者が異性接触からの真の禁欲を実践する場合でさえも適用される。（ｂ）異性接触からの真の禁欲を約束する（月単位でレビューされ、出典が文書化されなければならない）か、またはインフォームドコンセントの時に被験者に提供される２つの信頼できる形態の避妊法を、化合物２を開始する２８日前、試験治療中（用量中断中を含む）、及び試験治療の中止後２８日間、中断なく使用かつそれらを遵守することに同意する。注：出産可能な女性（ＦＣＢＰ）は、１）ある時点で初潮を達成しており、２）子宮摘出術または両側卵巣摘出術を受けていないか、または３）少なくとも連続する２４か月間自然閉経後ではない（がん療法に続く無月経は妊娠可能性を除外しない）（すなわち、先行する連続する２４か月における任意の時点で月経を有していた）。
【０６６８】
男性被験者は、真の禁欲を実践する（月単位でレビューされなければならない）か、試験に参加している間（用量中断中でさえも）、及び化合物２の中止に続いて少なくとも３か月間、妊娠中の女性または妊娠可能な女性との性的接触中に、成功した精管切除を受けている場合であっても、インフォームドコンセントの時に被験者に提供されたコンドームを使用することに同意しなければならない。真の禁欲は、これが被験者の好ましく通常な生活様式に一致する場合に認められる。周期的禁欲（例えば、カレンダー法、排卵法、徴候体温法、排卵後法）及び膣外射精（ｉｎｔｅｒｒｕｐｔｕｓ）（膣外射精（ｗｉｔｈｄｒａｗａｌ））は、認められる避妊法でない。
【０６６９】
男性は、化合物２を受けている間、その中止後９０日間、精子を寄付することを控えるのに同意しなければならない。女性は、化合物２を受けている間、その中止後２８日間、卵子を寄付することを控えるのに同意しなければならない。
【０６７０】
すべての被験者は、化合物２を受けている間、及びその中止後２８日間、血液を寄付することを控えるのに同意しなければならない。
【０６７１】
除外基準
【０６７２】
以下のうちいずれの存在も、被験者を登録から除外する。
【０６７３】
被験者は、被験者が試験に参加することを妨げるであろう、顕著な医学的状態、検査値異常、または精神病を有する。
【０６７４】
被験者は、参加するならば被験者に許容されないリスクを課すであろう、検査値異常の存在を含むなんらかの状態を有する。
【０６７５】
被験者は、試験からのデータを解釈する能力を交絡させるなんらかの状態を有する。
【０６７６】
被験者は、非分泌性またはオリゴ分泌性の多発性骨髄腫を有する。
【０６７７】
被験者は、難治性原発性多発性骨髄腫を有する（すなわち、前の治療レジメンに対する少なくとも軽微な応答の履歴がない）。
【０６７８】
被験者は、形質細胞白血病または活動性軟髄膜骨髄腫症を有する。
【０６７９】
被験者は、文書で記録された、全身性軽鎖アミロイドーシスまたは多発性神経障害、臓器腫大、内分泌障害、単クローン性ガンマグロブリン血症、及び皮膚変化（ＰＯＥＭＳ）症候群を有する。
【０６８０】
被験者は、免疫グロブリンクラスＭ（ＩｇＭ）骨髄腫を有する。
【０６８１】
被験者は、同種骨髄移植の履歴を有する。
【０６８２】
被験者は、透析を受けている。
【０６８３】
グレード２以上の末梢神経障害を有する被験者。
【０６８４】
化合物２の吸収を顕著に変え得る胃腸疾患を有する被験者。
【０６８５】
被験者は、以下のいずれかを含む、心機能障害または臨床的に顕著な心疾患を有する。（ａ）スクリーニングでのＥＣＨＯまたはＭＵＧＡスキャンによって決定された４５％未満のＬＶＥＦ、（ｂ）スクリーニングでの完全な左脚ブロック、二枝ブロック、または他の臨床的に顕著な異常な心電図（ＥＣＧ）所見、（ｃ）ＦｒｅｄｅｒｉｃｉａのＱＴ補正式を使用した４８０ミリ秒（ｍｓ）超のＱＴｃ間隔を繰り返して示すことよって定義されるスクリーニングＥＣＧ上のＱＴ間隔の延長、トルサードドポアントの病歴またはトルサードドポアントについての現在のリスク因子（例えば、心不全、低カリウム血症、またはＱＴ延長症候群の家族歴）、及びＱＴ／ＱＴｃ間隔を延長する薬剤の同時投与、（ｄ）うっ血性心不全（Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  Ｈｅａｒｔ  ＡｓｓｏｃｉａｔｉｏｎクラスＩＩＩまたはＩＶ）、（ｅ）化合物２を開始する前６か月以内の心筋梗塞、（ｆ）狭心症のプリンツメタル異型を含む、不安定または管理不良である狭心症。
【０６８６】
強力なＣＹＰ３Ａモジュレーターの同時投与。
【０６８７】
被験者は、治験薬（例えば、抗ＰＤ−１、抗ＰＤ−Ｌ１）で、化合物２を開始する５半減期以下前に、以前全身性骨髄腫治療を受けた。被験者は、承認された骨髄腫療法（抗ＣＤ３８または抗ＳＬＡＭ−７などの治療用モノクローナル抗体を含む）へ、化合物２を開始する５半減期以下前または４週間以内のいずれか短い方で、以前曝露された。
【０６８８】
被験者は、化合物２を開始する前２週間以内に大きな手術を受けた。注：被験者は、最近の手術のいかなる臨床的に顕著な効果からも回復していなければならない。
【０６８９】
被験者は、妊娠中もしくは授乳中の女性であるか、または試験への参加中に妊娠するか卵子を提供しようと思っている。
【０６９０】
被験者は、既知のヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）感染を有する。
【０６９１】
被験者は、既知の活動性慢性Ｂ型またはＣ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ／ＨＣＶ）感染を有する。
【０６９２】
被験者は、継続した全身性治療を必要とする同時の第２のがんの履歴を有する。
【０６９３】
被験者は、被験者が３年間以上無病である場合、または被験者が既知の再発なく治癒目的で治療された以下の非侵襲性悪性腫瘍のうちの１つを有した場合を除き、ＭＭ以外の以前の悪性腫瘍の履歴を有する。（ａ）皮膚の基底細胞癌または扁平上皮癌、（ｂ）子宮頸部または乳房の上皮内癌、（ｃ）ステージ１の膀胱がん、（ｄ）悪性腫瘍または治癒目的で治療されている前立腺癌の腫瘍／リンパ節／転移（ＴＮＭ）分類を使用した腫瘍ステージ１ａまたは１ｂ（Ｔ１ａまたはＴ１ｂ）などの限局性前立腺癌の偶発的な組織学的所見。
【０６９４】
被験者は、サリドマイド、レナリドマイド、ポマリドマイド、またはデキサメタゾンに対するアナフィラキシーの履歴を有する。
【０６９５】
被験者は、化合物２またはデキサメタゾンの製剤に含有される賦形剤（賦形剤は、ジメチルシリル化シリカ、無水コロイド状二酸化ケイ素、マンニトール、フマル酸及びステアリン酸を含む）に対する、既知または疑いのある過敏症を有する。
【０６９６】
被験者は、化合物２を開始して１４日以内に以下のいずれかを受けている。（ａ）血漿アフェレシス、（ｂ）ＭＭ関連骨病変の症状緩和のための局所療法以外の放射線療法。
【０６９７】
被験者は、化合物２の第１の投与前の１４日以内に免疫抑制薬剤を受けている。以下は、この基準の例外である。（ａ）鼻腔内、吸入、局所または局部コルチコステロイド注射（例えば、関節内注射）、（ｂ）プレドニゾンまたは同等物の１０ｍｇ／日を超えない用量での全身性コルチコステロイド、（ｃ）過敏応答の前投薬としてのステロイド（例えば、コンピュータ断層撮影［ＣＴ］スキャン前投薬）。
【０６９８】
被験者は、静脈血栓塞栓症（ＶＴＥ）の予防が必要とされるプロトコルを受けることができないか、または進んで受けない。
【０６９９】
試験の長さ
【０７００】
試験参加の平均の被験者あたりの時間長は、およそ６か月と予想される。完全な登録は、完了するまでにおよそ２１か月かかると予想される（パート１で１８か月、及びパート２で３か月）。実薬治療及び治療後経過観察の完了は、さらに６〜１２か月かかることが予想される。試験全体は、およそ３３か月継続すると予想される。
【０７０１】
試験終了は、プロトコルに事前指定されるとおり、治療後経過観察が完了する最後の被験者の最後の来院の日付、あるいは一次、二次、及び／または予備分析に必要である最後の被験者からの最後のデータ点の受領の日付のいずれか遅い方と定義される。
【０７０２】
試験治療
【０７０３】
化合物２が、２０／２８スケジュール（または代替のＱＤスケジュール）に登録された被験者対してＱＤ、または６／２８スケジュール（または代替のＢＩＤスケジュール）に登録された被験者に対してＢＩＤのいずれかで、経口投与される。ＱＤ投与スケジュールに登録された被験者では、化合物２は、少なくとも６時間続く一晩の絶食後、少なくとも２４０ｍＬ（ミリリットル）の水と共に午前中に投与されなければならない。被験者は、各午前の用量後少なくとも２時間は、食物または他の薬剤の摂取を控えなければならない。ＢＩＤスケジュールに登録された被験者は、各用量日の第１の用量に対するＱＤスケジュールについて略述された前述の指示に従う。第２の用量は、午前の用量の１２±２時間後、食物摂取の少なくとも４時間後及び２時間前に投与されなければならない。
【０７０４】
両方の投与スケジュールについて、デキサメタゾンは、絶食状態で化合物２と共に、または化合物２の少なくとも２時間後に食物と共に投与され得る（両方が同時に与えられなければならないＰＫ評価日を除く）。
【０７０５】
重要な有効性評価の概要
【０７０６】
主要な有効性変数は、ＩＭＷＧ  Ｕｎｉｆｏｒｍ  Ｒｅｓｐｏｎｓｅ  Ｃｒｉｔｅｒｉａ（Ｒａｊｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ，２０１１，１１７（１８）：４６９１−５、Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｌａｎｃｅｔ  Ｏｎｃｏｌ．，２０１６，１７（８）：ｅ３２８−ｅ３４６）によって決定された、最高応答がＰＲ以上である被験者の割合として定義される最高の全奏効率（ＯＲＲ）である。被験者は、毎月応答評価を受ける。骨髄腫応答は、中央参照検査室において及び／または局所的に評価された（すなわち、形質細胞腫評価のための補正された血清カルシウム、コンピュータ断層撮影［ＣＴ］、ポジトロン放出断層撮影／コンピュータスキャン［ＰＥＴ／ＣＴ］または磁気共鳴画像法［ＭＲＩ］及び／または骨病変評価のためのＣＴ、ＰＥＴ／ＣＴ、ＭＲＩまたは骨格調査）、検査室調査（必要に応じて、血清タンパク質電気泳動［ｓＰＥＰ］、尿タンパク質電気泳動［ｕＰＥＰ］、免疫固定電気泳動［ＩＦＥ］、血清遊離軽鎖［ｓＦＬＣ］レベル、定量的免疫グロブリンＡ［ＩｇＡ］、形質細胞定量のための骨髄）に基づいて試験施設の治験担当医師によって決定される。追加の有効性変数は、奏効までの期間、奏効期間、無増悪生存期間を含む。
【０７０７】
妥当なベースライン及び少なくとも１つのベースライン後応答評価を有するすべての安全性被験者が、有効性分析に含まれる。治療が疾患進行以外の理由で中止された場合、被験者は、進行、同意の撤回、死亡、または新しい全身性抗骨髄腫療法の開始のいずれか早い方まで、指定された評価スケジュールに従って応答評価を継続するよう求められる。
【０７０８】
主要安全性評価の概要
【０７０９】
本試験の安全性変数は、治療に起因する有害事象（ＴＥＡＥ）及び身体所見／バイタルサインのベースラインからの変化、選択された検査分析物、ならびに１２誘導心電図（ＥＣＧ）を含む。追加の安全性指標は、試験治療（化合物２及びデキサメタゾンの両方）への曝露の程度、併用薬剤使用の評価、及び出産可能な女性（ＦＣＢＰ）の妊娠試験を含む。
【０７１０】
薬物動態評価の概要
【０７１１】
ＰＫプロファイル（初期用量及び定常状態）が、化合物２、そのＲ−エナンチオマー（化合物３）、及びデキサメタゾンについて評価される。曝露−応答分析が、ＲＰ２Ｄで化合物２の特定を支援するために、必要に応じて実施され得る。
【０７１２】
薬力学アセスメントの概要
【０７１３】
バイオマーカーが、ベースラインで、及び試験治療中の指定された時点で、血液及び骨髄において評価される。末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及び骨髄中の骨髄腫細胞におけるＡｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓのレベルのベースラインからの変化、末梢血及び骨髄の免疫表現型、ならびに炎症促進性サイトカイン（例えば、インターロイキン−２［ＩＬ−２］、インターフェロン−ガンマ［ＩＦＮ−γ］）のレベルが、用量とスケジュールの関数として評価される。ｓＦＬＣレベル及び可溶性Ｂ細胞成熟抗原（ｓＢＣＭＡ）、ならびに循環腫瘍細胞の縦断的定量が、早期治療効果を評価する手段として実行される。セレブロン及び下流マーカー（例えば、ｃ−Ｍｙｃ、ＩＲＦ−４）の発現のベースラインからの変化、ならびに骨髄腫細胞における遺伝子発現が、化合物２とデキサメタゾンに対する応答及び抵抗性の可能性のあるマーカーを特定する手段として評価される。最後に、ＭＲＤ検出が、完全奏効（ＣＲ）の確認のために骨髄評価を受ける被験者において実行される。
【０７１４】
奏効率（ＯＲＲ）の点推定及び両側９５％信頼区間が報告される。追加の有効性変数は、奏効期間、奏効までの期間、及び無増悪生存期間（ＰＦＳ）を含む。有効性アウトカムが、カテゴリ変数についての頻度作表、または事象発生時間変数についての記述統計を使用して要約される。有効性分析が、安全性及び有効性について評価可能な（ＳＥ）集団の両方について報告され、ＥＥ集団からの結果が主要であると見なされる。
【０７１５】
薬力学的分析の中間結果。
【０７１６】
Ａｉｏｌｏｓ発現を、２つの異なる投与スケジュール（２８日サイクルの１〜１０日目及び１５〜２４日目のＱＤ投与、ならびに２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１７日目のＢＩＤ投与）における化合物２治療前及び化合物２治療中に、ＣＤ３＋Ｔ細胞中のフローサイトメトリーによって測定した。図２４Ａ及び図２４Ｂに示されるように、Ａｉｏｌｏｓ分解は、用量依存的であり、両方のスケジュールにおいて化合物投与中断中に回復した。
【０７１７】
Ｉｋａｒｏｓ発現を、２つの異なる投与スケジュール（２８日サイクルの１〜１０日目及び１５〜２４日目のＱＤ投与、ならびに２８日サイクルの１〜３日目及び１５〜１７日目のＢＩＤ投与）における化合物２治療前及び化合物２治療中に、ＣＤ３＋Ｔ細胞中のフローサイトメトリーによって測定した。図２５Ａ及び図２５Ｂに示されるように、Ｉｋａｒｏｓ分解は、用量依存的であり、両方のスケジュールにおいて化合物投与中断中に回復した。
【０７１８】
骨髄穿刺液試料を、化合物２治療前及び化合物２治療中に採取した（サイクル１）。血餅を、各試料から作成し、ホルマリン固定パラフィン包埋ブロックへと処理した。免疫組織化学（ＩＨＣ）アッセイを使用して、バイオマーカー発現を評価した。ＩＨＣスコアを、陽性染色の割合（％）及び強度に基づいて決定した。図２６Ａ〜図２６Ｅに示されるように、化合物２は、腫瘍区画においてＡｉｏｌｏｓ、Ｉｋａｒｏｓ、及びＺＦＰ９１の分解を誘導した。Ａｉｏｌｏｓ及びＩｋａｒｏｓの下方調節は、ｃ−Ｍｙｃ及びＩＲＦ４の減少した発現を生じ、これは腫瘍細胞のアポトーシスを引き起こし、化合物２での治療に対する応答を示すために使用され得る。
【０７１９】
血清試料を、指定された時点で化合物２治療前及び化合物２治療中に採取した。ｓＢＣＭＡの発現を、ＥＬＩＳＡアッセイによって測定した。図２７に示されるように、ｓＢＣＭＡシグナルは、化合物２治療で減少した。１人の被験者からの試料はベースラインからｓＢＣＭＡの８０％超の減少を示し、被験者は治療に対する良好な応答を有した（最良部分奏効；ＶＧＰＲ）。効果の減少の程度及び持続期間は、化合物２での治療に対する応答を予測できる。
【０７２０】
血清試料を、指定された時点で化合物２治療前及び化合物２治療中に採取した。血清遊離軽鎖（ｓＦＬＣ）を、多発性骨髄腫の有効性測定として使用することができる。ｓＦＬＣの短い半減期は、疾病負荷に対する化合物治療の動的効果を追跡する機会を提供する。図２８に示されるように、ｓＦＬＣシグナルは、化合物２治療で減少し、腫瘍細胞の殺滅を示す。２人の被験者は、治療の第１のサイクル中にｓＦＬＣの８０％超の減少を示し、治療に対する良好な応答を有した（それぞれＰＲ及びＶＧＰＲ）。ベースラインからの減少の程度及び効果の持続期間が、化合物２での治療に対する応答を予測できる。
【０７２１】
上記の実施形態は、単に例示であることが意図され、当業者は、単なる日常的な実験を使用して、特定の化合物、材料、及び手順の多数の等価物を認識するか、または確認することができるであろう。そのような等価物はすべて、本発明の範囲内にあると見なされ、添付の特許請求の範囲により包含される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５Ａ】
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【図５Ｂ】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９Ａ】
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【図１９Ｂ】
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【図１９Ｃ】
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【図１９Ｄ】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３Ａ】
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【図２３Ｂ】
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【図２３Ｃ】
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【図２４Ａ】
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【図２４Ｂ】
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【図２５Ａ】
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【図２５Ｂ】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【国際調査報告】
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