(57)【要約】本明細書で提供するのは、対象におけるＳＣＮ２Ａの発現を低減させるための方法、化合物、及び組成物である。そのような方法、化合物、及び組成物は、必要としている対象におけるＳＣＮ１Ａ関連疾患または障害（例えば、ドラベ症候群）を治療する、予防する、遅延させる、または改善するのに有用である。【特許請求の範囲】
【請求項１】
ＳＣＮ１Ａ脳症の治療を必要とする対象における前記ＳＣＮ１Ａ脳症を治療する方法であって、ヒトＳＣＮ２Ａ遺伝子のプレｍＲＮＡ転写物またはｍＲＮＡ転写物の標的領域の等長部分に少なくとも８０％の相補性を有する１０連続核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、１０〜８０ヌクレオシド長の一本鎖オリゴヌクレオチドを含む化合物を、前記ＳＣＮ１Ａ脳症を治療するのに十分な量及び期間で前記対象に投与することを含む、前記方法。
【請求項２】
前記ヒトＳＣＮ２Ａ遺伝子の発現を減少させる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記オリゴヌクレオチドが、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＰ＿０６６２８７．２のアミノ酸配列をコードするＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡの一部分に相補的な核酸塩基配列を含む、前記核酸塩基配列から本質的になる、もしくは前記核酸塩基配列からなるか、またはＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿０２１００７．２の核酸塩基配列を含む、請求項１または２に記載の方法。
【請求項４】
前記オリゴヌクレオチドが、１つもしくは複数の修飾糖、１つもしくは複数の修飾ヌクレオシド間結合、及び／または１つもしくは複数の修飾核酸塩基を含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記オリゴヌクレオチドが、１つまたは複数の修飾糖を含む、請求項４に記載の方法。
【請求項６】
前記１つまたは複数の修飾糖の各々が独立に、二環式糖、２’−Ｏ−メトキシエチル（２ＭＯＥ）修飾糖、２’−Ｏ−メトキシ（２−ＯＭｅ）修飾糖、２’−メトキシ修飾糖、２’−Ｏ−アルキル修飾糖、拘束エチル（ｃＥｔ）修飾糖、固定化糖、及び非固定化糖からなる群から選択される、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記オリゴヌクレオチドが、前記オリゴヌクレオチドの全長にわたって２ＭＯＥ修飾糖を有する、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記オリゴヌクレオチドが、１つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項４〜７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項９】
前記修飾されたヌクレオシド間結合の１つまたは複数が、修飾ホスフェートを含む、請求項８に記載の方法。
【請求項１０】
前記修飾ホスフェートの各々が独立に、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロアミデート、ホスホロジアミデート、チオホスホロアミデート、チオホスホロジアミデート、メチルホスホネート、ホスホロモルホリデート、及びホスホロピペラジデートからなる群から選択される、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記オリゴヌクレオチドが、前記オリゴヌクレオチドの全長にわたってホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１２】
前記オリゴヌクレオチドが、前記オリゴヌクレオチドの全長にわたってホスホロジアミデートモルホリノヌクレオシド間結合を有する、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
前記オリゴヌクレオチドが、１つまたは複数の修飾核酸塩基を含む、請求項４〜１２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４】
前記修飾核酸塩基が、５−メチルシトシン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、６−メチルアデニン、６−メチルグアニン、２−プロピルアデニン、２−プロピルグアニン、２−チオウラシル、２−チオチミン、２−チオシトシン、５−ハロウラシル、５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロアデニン、８−アミノアデニン、８−チオールアデニン、８−チオアルキルアデニン、８−ヒドロキシルアデニン、８−ハログアニン、８−アミノグアニン、８−チオールグアニン、８−チオアルキルグアニン、８−ヒドロキシルグアニン、５−ブロモウラシル、５−トリフルオロメチルウラシル、５−ブロモシトシン、５−トリフルオロメチルシトシン、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、２−フルオロアデニン、８−アザグアニン、８−アザアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、及び３−デアザアデニンからなる群から選択される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記修飾核酸塩基が５−メチルシトシンである、請求項１４に記載の方法。
【請求項１６】
各シトシンが５−メチルシトシンである、請求項１５に記載の方法。
【請求項１７】
前記修飾オリゴヌクレオチドが、
結合したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
結合したヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
結合したヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント；
を含み、前記ギャップセグメントが、前記５’ウィングセグメントと前記３’ウィングセグメントの間に直接隣接して位置しており、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドが修飾糖を含む、請求項４〜１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
前記オリゴヌクレオチドが、１２〜４０の核酸塩基からなる、請求項１〜１６のいずれかに１項に記載の方法。
【請求項１９】
前記オリゴヌクレオチドが、１６〜３０の核酸塩基からなる、請求項１８に記載の方法。
【請求項２０】
前記対象の神経細胞におけるＳＣＮ２Ａの発現を阻害することを含む、請求項１〜１９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２１】
前記ＳＣＮ１Ａ脳症が、てんかん、熱性けいれんを有する全般てんかん、家族性熱性けいれん、早期乳児てんかん性脳症６、及びドラベ症候群からなる群から選択される、請求項１〜２０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２２】
前記ＳＣＮ１Ａ脳症がドラベ症候群である、請求項２１に記載の方法。
【請求項２３】
前記化合物が、髄腔内、髄内、または脳室内に投与される、請求項１〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
ＳＣＮ２Ａの発現の減少が治療効果をもたらす、請求項１〜２３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２５】
前記ＳＣＮ１Ａ脳症の１つまたは複数の症状を低減させる、請求項１〜２４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２６】
前記ＳＣＮ１Ａ脳症の１つまたは複数の症状が、長期の発作、頻繁な発作、行動及び発達の遅延、運動及びバランスの問題、整形外科的状態、言語遅延及び発声の問題、成長及び栄養の問題、睡眠困難、慢性感染症、感覚統合障害、自律神経系の乱れ、片頭痛、ならびに発汗からなる群から選択される、請求項２５に記載の方法。
【請求項２７】
前記オリゴヌクレオチドが、ＳＣＮ１ＡプレｍＲＮＡまたはｍＲＮＡよりも、ＳＣＮ２ＡプレｍＲＮＡまたはｍＲＮＡに対して選択的である、請求項１〜２６のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２８】
ＳＣＮ１Ａの発現を実質的に低減させない、請求項１〜２７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２９】
前記対象が、ＳＣＮ１Ａに機能獲得型変異を有する、請求項１〜２８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３０】
前記対象が、ＳＣＮ１Ａに機能喪失型変異を有する、請求項１〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願との相互参照
本出願は、２０１８年８月２日に出願された米国仮特許出願第６２／７６５，３４４号の利益を主張するものである。上に参照された出願の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０００２】
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩ形式で電子的に提出された配列表を含み、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。２０１９年９月２３日に作成された上記ＡＳＣＩＩコピーは、ＰＲＸ−０５７  ＷＯ＿ＳＬ．ｔｘｔという名称であり、２，２３５バイトのサイズである。
【０００３】
本明細書で提供するのは、対象（例えば、ヒト）におけるナトリウム電位依存性チャネルアルファサブユニット２（ＳＣＮ２Ａ）の発現を低減させるのに有用な方法、化合物、及び組成物である。また、本明細書で提供するのは、対象におけるナトリウム電位依存性チャネルアルファサブユニット１（ＳＣＮ１Ａ）に関連する疾患または状態を治療するのに有用であり得るＳＣＮ２Ａアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含む方法、化合物、及び組成物である。そのような方法、化合物、及び組成物は、例えば、ドラベ症候群などのＳＣＮ１Ａ関連脳症を治療する、予防する、遅延させる、または改善するために有用であり得る。
【背景技術】
【０００４】
電位依存性ナトリウムチャネルアルファサブユニット１（ＳＣＮ１Ａ）遺伝子は、ヒト染色体２の長（ｑ）腕の２４．３の位置にあり、脳に発現し、神経シグナル伝達に関与する電位依存性ナトリウムチャネルのアルファサブユニットであるＮａＶ１．１をコードする。ＳＣＮ１Ａの変異は、てんかん、熱性けいれんを有する全般てんかん、家族性熱性けいれん、片頭痛、早期乳児てんかん性脳症６、ドラベ症候群（乳児期の重度のミオクローヌスてんかん）、及び他のＳＣＮ１Ａ関連脳症に関連している可能性がある。しかしながら、ＳＣＮ１Ａ変異が有害作用を引き起こすメカニズムは当技術分野で十分に理解されておらず、ＳＣＮ１Ａ脳症を治療する満足できる方法は利用できない。よって、これらのＳＣＮ１Ａ関連障害を治療するのに有用な新たな方法が依然として必要とされている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００５】
本明細書で提供するのは、ドラベ症候群（乳児期の重度のミオクローヌスてんかん（ＳＭＥＩ））、てんかん、熱性けいれんを有する全般てんかん、家族性熱性けいれん、片頭痛、及び早期乳児てんかん性脳症６を含めたＳＣＮ１Ａ脳症などの電位依存性ナトリウムチャネルアルファサブユニット１（ＳＣＮ１Ａ）関連疾患を治療するために、電位依存性ナトリウムチャネルアルファサブユニット２（ＳＣＮ２Ａ）の発現を調節するための組成物、化合物、及び方法である。
【０００６】
一態様では、本発明は、ＳＣＮ１Ａ脳症の治療を必要とする対象におけるＳＣＮ１Ａ脳症を治療する方法であって、ヒトＳＣＮ２Ａ遺伝子のプレｍＲＮＡ転写物またはｍＲＮＡ転写物の標的領域の等長部分に少なくとも８０％の相補性を有する１０連続核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、１０〜８０ヌクレオシド長の一本鎖オリゴヌクレオチドを含む化合物を、該ＳＣＮ１Ａ脳症を治療するのに十分な量及び期間で該対象に投与することによる方法を特徴とする。
【０００７】
幾つかの実施形態において、該方法は、ヒトＳＣＮ２Ａ遺伝子の発現を減少させる。
【０００８】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＰ＿０６６２８７．２のアミノ酸配列をコードするＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡの一部分に相補的な核酸塩基配列を含む、該核酸塩基配列から本質的になる、もしくは該核酸塩基配列からなるか、またはＧｅｎＢａｎｋ受託番号ＮＭ＿０２１００７．２の核酸塩基配列を含む。
【０００９】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数の修飾糖、１つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合、及び／または１つまたは複数の修飾核酸塩基を含む。
【００１０】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数の修飾糖を含む。
【００１１】
幾つかの実施形態において、１つまたは複数の修飾糖の各々は独立に、二環式糖、２’−Ｏ−メトキシエチル（２ＭＯＥ）修飾糖、２’−Ｏ−メトキシ（２−ＯＭｅ）修飾糖、２’−メトキシ修飾糖、２’−Ｏ−アルキル修飾糖、拘束エチル（ｃＥｔ）修飾糖、固定化糖、及び非固定化糖からなる群から選択される。
【００１２】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長にわたって２ＭＯＥ修飾糖を有する。
【００１３】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合を含む。
【００１４】
幾つかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合の１つまたは複数は、修飾ホスフェートを含む。
【００１５】
幾つかの実施形態において、修飾ホスフェートの各々は独立に、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロアミデート、ホスホロジアミデート、チオホスホロアミデート、チオホスホロジアミデート、メチルホスホネート、ホスホロモルホリデート、及びホスホロピペラジデートからなる群から選択される。
【００１６】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長にわたってホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する。
【００１７】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長にわたってホスホロジアミデートモルホリノヌクレオシド間結合を有する。
【００１８】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数の修飾核酸塩基を含む。
【００１９】
幾つかの実施形態において、修飾核酸塩基は、５−メチルシトシン、５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、６−メチルアデニン、６−メチルグアニン、２−プロピルアデニン、２−プロピルグアニン、２−チオウラシル、２−チオチミン、２−チオシトシン、５−ハロウラシル、５−ハロシトシン、５−プロピニルウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロアデニン、８−アミノアデニン、８−チオールアデニン、８−チオアルキルアデニン、８−ヒドロキシルアデニン、８−ハログアニン、８−アミノグアニン、８−チオールグアニン、８−チオアルキルグアニン、８−ヒドロキシルグアニン、５−ブロモウラシル、５−トリフルオロメチルウラシル、５−ブロモシトシン、５−トリフルオロメチルシトシン、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、２−フルオロアデニン、８−アザグアニン、８−アザアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、及び３−デアザアデニンからなる群から選択される。
【００２０】
幾つかの実施形態において、修飾核酸塩基は、５−メチルシトシンである。
【００２１】
幾つかの実施形態において、各シトシンは、５−メチルシトシンである。
【００２２】
幾つかの実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、
結合したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
結合したヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
結合したヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント；
を含み、該ギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に直接隣接して位置しており、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、修飾糖を含む。
【００２３】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１２〜４０（例えば、１６〜３０）の核酸塩基からなる。
【００２４】
幾つかの実施形態において、該方法は、対象の神経細胞におけるＳＣＮ２Ａの発現を阻害することを含む。
【００２５】
幾つかの実施形態において、ＳＣＮ１Ａ脳症は、てんかん、熱性けいれんを有する全般てんかん、家族性熱性けいれん、片頭痛、早期乳児てんかん性脳症６、及びドラベ症候群からなる群から選択される。
【００２６】
幾つかの実施形態において、ＳＣＮ１Ａ脳症はドラベ症候群である。
【００２７】
幾つかの実施形態において、該化合物は、髄腔内、髄内、または脳室内に投与される。
【００２８】
幾つかの実施形態において、ＳＣＮ２Ａの発現の減少が治療効果をもたらす。
【００２９】
幾つかの実施形態において、該方法は、ＳＣＮ１Ａ脳症の１つまたは複数の症状を低減させる。
【００３０】
幾つかの実施形態において、ＳＣＮ１Ａ脳症の１つまたは複数の症状は、長期の発作、頻繁な発作、行動及び発達の遅延、運動及びバランスの問題、整形外科的状態、言語遅延及び発声の問題、成長及び栄養の問題、睡眠困難、慢性感染症、感覚統合障害、自律神経系の乱れ、ならびに発汗からなる群から選択される。
【００３１】
幾つかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ１ＡプレｍＲＮＡまたはｍＲＮＡよりもＳＣＮ２ＡプレｍＲＮＡまたはｍＲＮＡに対して選択的である。
【００３２】
幾つかの実施形態において、該方法は、ＳＣＮ１Ａの発現を実質的に低減させない。
【００３３】
幾つかの実施形態において、対象は、ＳＣＮ１Ａに機能獲得型変異を有する。
【００３４】
幾つかの実施形態において、対象は、ＳＣＮ１Ａに機能喪失型変異を有する。
【００３５】
定義
特に示さない限り、以下の用語は、以下の意味を有する。
【００３６】
「２’−デオキシヌクレオシド」は、天然に存在するデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）に見出されるような２’−Ｈ（Ｈ）フラノシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。特定の実施形態において、２’−デオキシヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含み得るか、またはＲＮＡ核酸塩基（ウラシル）を含み得る。
【００３７】
「２’−Ｏ−メトキシエチル」（２’−ＭＯＥ及び２’−Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３とも称される）とは、フラノシル環の２’位でのＯ−メトキシ−エチル修飾を指す。２’−Ｏ−メトキシエチル修飾糖は、修飾糖である。
【００３８】
「２’−ＭＯＥヌクレオシド」（２’−Ｏ−メトキシエチルヌクレオシドとも称される）は、２’−ＭＯＥ修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
【００３９】
「２’−置換ヌクレオシド」または「２−修飾ヌクレオシド」は、２’−置換または２’−修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用する場合、糖部分に関する「２’−置換」または「２−修飾」は、ＨまたはＯＨの代わりに少なくとも１つの２’−置換基を含む糖部分を意味する。
【００４０】
「３’標的部位」とは、特定の化合物の最も３’側のヌクレオチドに相補的な標的核酸のヌクレオチドを指す。
【００４１】
「５’標的部位」とは、特定の化合物の最も５’側のヌクレオチドに相補的な標的核酸のヌクレオチドを指す。
【００４２】
「５−メチルシトシン」は、５位に結合したメチル基を有するシトシンを意味する。
「約」とは、値の±１０％以内を意味する。例えば、「化合物はＳＣＮ２Ａの約７０％の阻害に影響を与えた」と述べられているならば、それは、ＳＣＮ２Ａレベルが６０％〜８０％の範囲内で阻害されることが含意される。
【００４３】
「投与」または「投与すること」とは、本明細書で提供する化合物または組成物を対象に導入して、その意図された機能を行う経路を指す。使用することができる投与経路の例として、髄腔内、髄内、脳室内、及び皮下、静脈内、または筋肉内注射または注入など非経口投与が挙げられるが、これらに限定されない。
【００４４】
「同時に投与される」または「共投与」は、２つ以上の化合物が、患者において両方の薬理効果が現れる任意の様式で投与されることを意味する。同時投与は、両方の化合物が、単一の医薬組成物で、同じ剤形で、同じ投与経路によって、または同時に投与されることを必要としない。両方の化合物の効果は、必ずしも同時に現われなくてもよい。効果は、ある期間の重複しか必要とせず、必ずしも同一の期間でなくてもよい。同時投与または共投与は、並行投与または逐次投与を包含する。
【００４５】
「改善」とは、関連疾患、障害、または状態の少なくとも１つの指標、兆候、または症状の好転または軽減を指す。特定の実施形態において、改善には、状態または疾患の１つまたは複数の指標の進行または重症度の遅延または緩徐化が含まれる。指標の進行または重症度は、当業者に公知の主観的尺度または客観的尺度によって決定することができる。
【００４６】
「アンチセンス活性」とは、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに起因する任意の検出可能及び／または測定可能な活性を意味する。特定の実施形態において、アンチセンス活性は、標的核酸またはそのような標的核酸によってコードされるタンパク質の量または発現が、該標的に対するアンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルと比較して減少することである。
【００４７】
「アンチセンス化合物」は、オリゴヌクレオチド、及び任意選択でコンジュゲート基または末端基などの１つまたは複数の追加の特徴物を含む化合物を意味する。アンチセンス化合物の例として、一本鎖及び二本鎖化合物、例えば、オリゴヌクレオチド、リボザイム、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｓＲＮＡ、及び占有に基づく化合物が挙げられる。
【００４８】
「アンチセンス阻害」とは、アンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベルと比較した、標的核酸に相補的なアンチセンス化合物の存在下での標的核酸レベルの低減を意味する。
【００４９】
「アンチセンスメカニズム」とは、ハイブリダイゼーションの結果または効果が、例えば、転写またはスプライシングを含む細胞機構の失速を伴う標的分解または標的占有のいずれかであるような、化合物と標的核酸とのハイブリダイゼーションを伴うすべてのメカニズムである。
【００５０】
「アンチセンスオリゴヌクレオチド」とは、標的核酸またはその領域もしくはセグメントに相補的な核酸塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを意味する。特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的核酸またはその領域もしくはセグメントに特異的にハイブリダイズすることができる。
【００５１】
「運動失調」とは、体の動きの完全な制御の喪失を意味する。
【００５２】
「二環式ヌクレオシド」または「ＢＮＡ」とは、二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。「二環式糖」または「二環式糖部分」は、２つの環を含む修飾糖部分を意味し、ここで、第２の環は、第１の環における原子の２つを接続する架橋を介して形成され、それによって二環式構造が形成される。特定の実施形態において、二環式糖部分の第１の環は、フラノシル部分である。特定の実施形態において、二環式糖部分は、フラノシル部分を含まない。
【００５３】
「分岐基」とは、少なくとも３つの基への共有結合を形成することができる少なくとも３つの位置を有する原子団を意味する。特定の実施形態において、分岐基は、コンジュゲートリンカー及び／または切断可能部分を介してテザーリガンドをオリゴヌクレオチドに接続するための複数の反応部位を提供する。
【００５４】
化合物における「化学修飾」は、化合物中のユニットのいずれかの化学反応による置換または変化を表す。「修飾ヌクレオシド」とは、独立に、修飾糖部分及び／または修飾核酸塩基を有するヌクレオシドを意味する。「修飾オリゴヌクレオチド」とは、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合、修飾糖、及び／または修飾核酸塩基を含むオリゴヌクレオチドを意味する。
【００５５】
「化学的に別個の領域」とは、化合物のある領域であって、同じ化合物の別の領域とは何らかの点で化学的に異なる領域を指す。例えば、２’−Ｏ−メトキシエチルヌクレオチドを有する領域は、２’−Ｏ−メトキシエチル修飾を有さないヌクレオチドを有する領域とは化学的に別個である。
【００５６】
「キメラアンチセンス化合物」とは、少なくとも２つの化学的に別個の領域であって、各位置が複数のサブユニットを有する領域を有するアンチセンス化合物を意味する。
【００５７】
「切断可能な結合」とは、分割することができる任意の化学結合を意味する。特定の実施形態において、切断可能な結合は、アミド、ポリアミド、エステル、エーテル、ホスホジエステルの一方もしくは両方のエステル、リン酸エステル、カルバメート、ジスルフィド、またはペプチドの中から選択される。
【００５８】
「切断可能な部分」は、生理学的条件下で、例えば、細胞、動物、またはヒトの内部で切断される原子の結合または原子団を意味する。
【００５９】
オリゴヌクレオチドに関して「相補的な」とは、２つの核酸塩基配列を反対方向に整列させたときに、そのようなオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列またはその１つもしくは複数の領域が、別のオリゴヌクレオチドもしくは核酸またはそれらの１つもしくは複数の領域の核酸塩基配列とマッチすることを意味する。核酸塩基のマッチまたは相補的な核酸塩基は、本明細書に記載する場合、特に指定のない限り、次の対：アデニン（Ａ）とチミン（Ｔ）、アデニン（Ａ）とウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）とグアニン（Ｇ）、及び５−メチルシトシン（ｍＣ）とグアニン（Ｇ）に限られる。相補的なオリゴヌクレオチド及び／または核酸は、各ヌクレオシドで核酸塩基相補性を有する必要はなく、１つまたは複数の核酸塩基のミスマッチを含んでもよい。対照的に、オリゴヌクレオチドに関して「完全に相補的」または「１００％相補的」とは、そのようなオリゴヌクレオチドが、いずれの核酸塩基のミスマッチも有することなく、各ヌクレオシドで核酸塩基のマッチを有することを意味する。
【００６０】
オリゴヌクレオチドとの関連での「連続的な」とは、互いに直接隣接するヌクレオシド、核酸塩基、糖部分、またはヌクレオシド間結合を指す。例えば、「連続的な核酸塩基」とは、配列中で互いに直接隣接する核酸塩基を意味する。
【００６１】
「認知症」とは、記憶、判断、思考を損なう知的機能の継続的な喪失を意味する。
【００６２】
「設計すること」または「〜するように設計された」とは、選択された核酸分子と特異的にハイブリダイズする化合物を設計するプロセスを指す。
【００６３】
「希釈剤」とは、薬理学的活性を欠くが、医薬として必要であるか、または望ましい組成物中の成分を意味する。例えば、注射される組成物中の希釈剤は、液体、例えば、生理食塩溶液であり得る。
【００６４】
「異なるように修飾されている」とは、修飾の不在を含む、互いに異なる化学修飾または化学置換基を意味する。よって、例えば、ＭＯＥヌクレオシドと非修飾ＤＮＡヌクレオシドは、ＤＮＡヌクレオシドが修飾されていなくても「異なるように修飾されている」。同様に、ＤＮＡ及びＲＮＡは、両方ともに天然に存在する非修飾ヌクレオシドであっても「異なるように修飾されている」。同じであるが、異なる核酸塩基を含むヌクレオシドは、異なるように修飾されていない。例えば、２’−ＯＭｅ修飾糖及び非修飾アデニン核酸塩基を含むヌクレオシドと２’−ＯＭｅ修飾糖及び非修飾チミン核酸塩基を含むヌクレオシドは、異なるように修飾されていない。
【００６５】
「用量」とは、単回投与で提供されるか、または特定の期間に提供される化合物または医薬品の特定の分量を意味する。特定の実施形態において、用量は、２つ以上のボーラス、錠剤、または注射で投与されてもよい。例えば、特定の実施形態において、皮下投与が所望される場合、所望の用量が、単回注射では容易に収容できない体積を必要とすることがある。そのような実施形態において、２回以上の注射を使用して所望の用量を実現してもよい。特定の実施形態において、用量は、対象における注射部位反応を最低限に抑えるために、２回以上の注射で投与されてもよい。他の実施形態において、化合物または医薬品は、注入によって長期間にわたって、または連続して投与される。用量は、１時間、１日、１週間、または１か月当たりの医薬品の量で提示されてもよい。
【００６６】
「投薬レジメン」は、１つまたは複数の所望される効果を実現するように設計された用量の組み合わせである。
【００６７】
「二本鎖化合物」とは、互いに相補的で二本鎖を形成する２つのオリゴマー化合物を含み、前記２つのオリゴマー化合物の１つがオリゴヌクレオチドを含む化合物を意味する。
【００６８】
「有効量」とは、化合物の量であって、その化合物を必要としている対象において所望される生理学的結果を達成するのに十分な量を意味する。有効量は、治療しようとする対象の健康及び身体状態、治療しようとする対象の分類群、組成物の製剤、対象の医学的状態の評価、ならびに他の関連要因に応じて対象間で変動し得る。
「効力」とは、所望される効果を生み出す能力を意味する。
【００６９】
「Ｅｎｓｅｍｂｌ  ＩＤ」は、選択された真核生物ゲノムの自動アノテーションを生成し、維持するソフトウェアシステムを開発するためのＥＭＢＬ−ＥＢＩとＷｅｌｌｃｏｍｅ  Ｔｒｕｓｔ  Ｓａｎｇｅｒ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅによる共同プロジェクトである、Ｅｎｓｅｍｂｌによって遺伝子配列に割り当てられた文字及び数字からなる識別番号である。Ｅｎｓｅｍｂｌアノテーションは、特定のゲノム内の遺伝子位置を特定するのに役立ち、別の種のゲノム上で同等の遺伝子を構成するために使用することができる。
【００７０】
「てんかん」は、脳内のニューロンの活動が慢性的に乱されるようになる中枢神経系障害である。場合によっては、発作、異常な行動、感覚の期間、そして時には意識の喪失を引き起こすことがある。場合によっては、ミオクローヌス、認知障害、学習障害、または小児における発育遅延を含めた他の症状を引き起こすこともある。場合によっては、ある患者では死に至ることがある。場合によっては、幾つかの形態のてんかんは、進行性の神経変性疾患に関連する。てんかんを有する多くの人は、２つ以上の症状を有する。
【００７１】
「発現」には、遺伝子によってコードされた情報を、細胞内に存在して動作する構造に変換するすべての機能が含まれる。そのような構造として、転写及び翻訳の産物が挙げられるが、これらに限定されない。
【００７２】
「ギャップマー」とは、１つまたは複数のヌクレオシドを有する外側領域の間に位置する、リボヌクレアーゼＨ切断を支援する複数のヌクレオシドを有する内側領域を含むオリゴヌクレオチドであって、内側領域を構成するヌクレオシドが、外側領域を構成するヌクレオシド（１つまたは複数）とは化学的に別個であるオリゴヌクレオチドを意味する。内側領域は「ギャップ」と呼ばれることがあり、外側領域は「ウィング」と呼ばれることがある。
【００７３】
「ＳＣＮ１Ａ」とは、ヒト電位依存性ナトリウムチャネルアルファサブユニット１を意味し、ＳＣＮ１Ａの任意の核酸を指す。例えば、特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａには、ＳＣＮ１ＡをコードするＤＮＡ配列、ＳＣＮ１ＡをコードするＤＮＡ（イントロン及びエクソンを含むゲノムＤＮＡを含む）から転写されたＲＮＡ配列が含まれる。該標的は、大文字で参照されることも、小文字で参照されることもある。
【００７４】
「ＳＣＮ２Ａ」は、ヒトナトリウム電位依存性チャネルアルファサブユニット２を意味し、ＳＣＮ２Ａの任意の核酸を指す。例えば、特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａには、ＳＣＮ２ＡをコードするＤＮＡ配列、ＳＣＮ２ＡをコードするＤＮＡ（イントロン及びエクソンを含むゲノムＤＮＡを含む）から転写されたＲＮＡ配列が含まれる。該標的は、大文字で参照されることも、小文字で参照されることもある。
【００７５】
「ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤」は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を分子レベルで特異的に阻害することができる任意の作用剤を指す。例えば、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤には、核酸（アンチセンス化合物を含む）、ペプチド、抗体、小分子、及びＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる他の作用剤が含まれる。
【００７６】
「ハイブリダイゼーション」とは、オリゴヌクレオチド及び／または核酸のアニーリングを意味する。特定のメカニズムに限定されないが、最も一般的なハイブリダイゼーションのメカニズムは水素結合を伴い、これは相補的な核酸塩基間のワトソン−クリック型、フーグスティーン型、または逆フーグスティーン型の水素結合であってもよい。特定の実施形態において、相補的核酸分子として、アンチセンス化合物及び核酸標的が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、相補的核酸分子として、オリゴヌクレオチド及び核酸標的が挙げられるが、これらに限定されない。
【００７７】
「直接隣接する」とは、同じ種類の直接隣接する要素の間に介在する要素がないことを意味する（例えば、直接隣接する核酸塩基の間に介在する核酸塩基がない）。
【００７８】
「対象」とは、処置または治療のために選択されたヒトまたは非ヒトの動物を意味する。
【００７９】
「発現または活性を阻害すること」とは、非処置または対照試料における活性の発現と比較して発現または活性が低減するかまたは阻止されることを指し、必ずしも発現または活性の完全な排除を示すわけではない。
【００８０】
「ヌクレオシド間結合」とは、オリゴヌクレオチドにおいて隣接するヌクレオシド間の共有結合を形成する基または結合を意味する。「修飾ヌクレオシド間結合」とは、天然に存在するホスフェートヌクレオシド間結合以外の任意のヌクレオシド間結合を意味する。非ホスフェート結合は、本明細書では修飾ヌクレオシド間結合と呼ばれる。
【００８１】
「脳室内投与」とは、脳室系への投与を意味する。
【００８２】
「腹腔内投与」とは、注入または注射による腹膜内への投与を意味する。
「髄内投与」とは、脊髄、延髄、または骨髄腔内への投与を意味する。
【００８３】
「髄腔内投与」とは、脊柱管内またはくも膜下腔内に、脳脊髄液（ＣＳＦ）に到達するように投与することを意味する。
【００８４】
「静脈内投与」とは、静脈内への投与を意味する。
【００８５】
「延長オリゴヌクレオチド」とは、本明細書に開示するオリゴヌクレオチド、例えば、親オリゴヌクレオチドに対して１つまたは複数の追加ヌクレオシドを有するものである。
【００８６】
「結合したヌクレオシド」とは、ヌクレオシド間結合によって一緒に結合した隣接するヌクレオシドを意味する。
【００８７】
「ミスマッチ」また「非相補的な」とは、第１及び第２のオリゴヌクレオチドが整列しているときに、第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸の対応する核酸塩基と相補的でない第１のオリゴヌクレオチドの核酸塩基を意味する。例えば、限定するものではないが、ユニバーサル核酸塩基、イノシン、及びヒポキサンチンを含めた核酸塩基は、少なくとも１つの核酸塩基とハイブリダイズすることができるが、それでも、それがハイブリダイズした核酸塩基に関してミスマッチまたは非相補的である。別の例として、第１及び第２のオリゴヌクレオチドが整列しているときに、第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸の対応する核酸塩基とハイブリダイズすることができない第１のオリゴヌクレオチドの核酸塩基は、ミスマッチまたは非相補的な核酸塩基である。
【００８８】
「調節すること」とは、細胞、組織、器官、または生物の特徴を変化させるまたは調整することを指す。例えば、ＳＣＮ２Ａを調節することは、細胞、組織、器官または生物におけるＳＣＮ２Ａのレベルを増加または減少させることを意味し得る。「モジュレーター」は、細胞、組織、器官、または生物に変化をもたらす。例えば、ある化合物は、細胞、組織、器官または生物におけるＳＣＮ２Ａの量を減少させるＳＣＮ２Ａのモジュレーターであり得る。
【００８９】
「ＭＯＥ」とは、メトキシエチルを意味する。
【００９０】
「モノマー」とは、オリゴマーの単一ユニットを指す。モノマーには、ヌクレオシド及びヌクレオチドが含まれるが、これらに限定されない。
【００９１】
「モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドにおける、非修飾及び／または修飾糖部分、核酸塩基、及び／またはヌクレオシド間結合のパターンを意味する。
【００９２】
「ミオクローヌス」とは、身体の一部または全身に不定の期間影響を与え得る、繰り返される、常同的な不随意の筋肉の引きつりまたは単収縮のエピソードを意味する。
【００９３】
「天然の」または「天然に存在する」とは、天然に見出されることを意味する。
【００９４】
「非二環式修飾糖」または「非二環式修飾糖部分」とは、糖の２つの原子間に第２の環を形成するような架橋を形成しない修飾、例えば置換基を含む修飾糖部分を意味する。
【００９５】
「核酸」とは、モノマーヌクレオチドから構成される分子を指す。核酸には、リボ核酸（ＲＮＡ）、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ）、一本鎖核酸、及び二本鎖核酸が含まれるが、これらに限定されない。
【００９６】
「核酸塩基」とは、別の核酸の塩基と対合することができる複素環部分を意味する。本明細書で使用する場合、「天然に存在する核酸塩基」とは、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）、ウラシル（Ｕ）、及びグアニン（Ｇ）である。「修飾核酸塩基」とは、化学的に修飾された天然に存在する核酸塩基である。「ユニバーサル塩基」または「ユニバーサル核酸塩基」とは、天然に存在する核酸塩基及び修飾核酸塩基以外の核酸塩基であり、任意の核酸塩基と対合することができる。
【００９７】
「核酸塩基配列」とは、いかなる糖またはヌクレオシド間結合からも独立した、核酸またはオリゴヌクレオチドにおける連続する核酸塩基の順序を意味する。
【００９８】
「ヌクレオシド」とは、核酸塩基及び糖部分を含有する化合物を意味する。核酸塩基及び糖部分は各々独立に、修飾されていないか、または修飾されている。「修飾ヌクレオシド」とは、修飾核酸塩基及び／または修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。修飾ヌクレオシドには、核酸塩基を欠く、脱塩基ヌクレオシドが含まれる。
【００９９】
「オリゴマー化合物」とは、単一のオリゴヌクレオチド、及び任意選択により１つまたは複数の追加の特徴物、例えばコンジュゲート基または末端基を含む化合物を意味する。
【０１００】
「オリゴヌクレオチド」とは、結合したヌクレオシドのポリマーであって、そのヌクレオシドの各々が互いに独立に、修飾されていても修飾されていなくてもよいものを意味する。特に示さない限り、オリゴヌクレオチドは、８〜８０の結合したヌクレオシドからなる。「修飾オリゴヌクレオチド」とは、少なくとも１つの糖、核酸塩基、またはヌクレオシド間結合が修飾されている、オリゴヌクレオチドを意味する。「非修飾オリゴヌクレオチド」は、いずれの糖、核酸塩基、またはヌクレオシド間修飾も含まないオリゴヌクレオチドを意味する。
【０１０１】
「親オリゴヌクレオチド」とは、類似の配列であるが、長さ、モチーフ、及び／または化学が異なる、より多くのオリゴヌクレオチドの設計の基礎として、その配列が使用されるオリゴヌクレオチドを意味する。新しく設計されたオリゴヌクレオチドは、親オリゴヌクレオチドと同じまたは重複する配列を有し得る。
【０１０２】
「非経口投与」とは、注射または注入による投与を意味する。非経口投与には、皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与、または頭蓋内投与、例えば、髄腔内もしくは脳室内投与が含まれる。
【０１０３】
「医薬として許容される担体または希釈剤」とは、対象（例えば、ヒト）への投与に使用するのに適した任意の物質を意味する。例えば、医薬として許容される担体は、滅菌水溶液、例えば、ＰＢＳまたは注射用水であり得る。
【０１０４】
「医薬として許容される塩」とは、オリゴマー化合物またはオリゴヌクレオチドなどの化合物の生理学的に及び医薬として許容される塩、すなわち、親化合物の所望される生物活性を保持し、かつそれに所望されない毒物学的影響を付与しない塩を意味する。
【０１０５】
「医薬品」とは、対象に投与されたときに治療的利益をもたらす化合物を意味する。
【０１０６】
「医薬組成物」とは、対象への投与に適した物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は、１つもしくは複数の化合物またはその塩と滅菌水溶液とを含んでもよい。
【０１０７】
「ホスホロチオエート結合」とは、非架橋酸素原子の１つが硫黄原子と置きかえられた修飾ホスフェート結合を意味する。ホスホロチオエートヌクレオシド間結合は、修飾ヌクレオシド間結合である。
【０１０８】
「リン部分」とは、リン原子を含む原子団を意味する。特定の実施形態において、リン部分には、モノ−、ジ−、もしくはトリ−ホスフェート、またはホスホロチオエートが含まれる。
【０１０９】
「部分（ｐｏｒｔｉｏｎ）」とは、核酸の所定の数の連続する（すなわち、結合した）核酸塩基を意味する。特定の実施形態において、一部分は、標的核酸の所定の数の連続する核酸塩基である。特定の実施形態において、一部分は、オリゴマー化合物の所定の数の連続する核酸塩基である。
【０１１０】
「予防する」とは、数分から無期限の期間、疾患、障害、もしくは状態の発症、発病、もしくは進行を遅延させるか、または未然に防ぐことを指す。
【０１１１】
「プロドラッグ」とは、対象に投与されると、体内またはその細胞内で別の形態に代謝される、体外の形態の化合物を意味する。特定の実施形態において、代謝された形態は、化合物（例えば、薬物）の活性な形態、またはより活性な形態である。典型的には、体内でのプロドラッグの変換は、細胞もしくは組織に存在する酵素（複数可）（例えば、内因性またはウイルス性酵素）または化学物質（複数可）の作用によって、及び／または生理学的条件によって促進される。
【０１１２】
「低減させる」とは、程度、サイズ、量、または数を小さくすることを意味する。
【０１１３】
「ＲｅｆＳｅｑ番号」は、配列に割り当てられた文字と数字の一意の組み合わせであり、その配列が特定の標的転写物（例えば、標的遺伝子）のためのものであることを示す。標的遺伝子に関するそのような配列及び情報（総称して、遺伝子記録）は、遺伝子配列データベースに見出すことができる。遺伝子配列データベースには、ＮＣＢＩ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅデータベース、ＧｅｎＢａｎｋ、Ｅｕｒｏｐｅａｎ  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ａｒｃｈｉｖｅ、及び日本ＤＮＡデータバンク（後者の３つはＩｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ｄａｔａｂａｓｅ  Ｃｏｌｌａｂｏｒａｔｉｏｎ（ＩＮＳＤＣ）を形成する）が含まれる。
【０１１４】
「領域」とは、少なくとも１つの特定可能な構造、機能、または特性を有する標的核酸の一部分と定義される。
【０１１５】
「ＲＮＡｉ化合物」とは、少なくとも部分的に、ＲＩＳＣまたはＡｇｏ２を介して作用するが、リボヌクレアーゼＨを介さずに作用して、標的核酸及び／または標的核酸によってコードされるタンパク質を調節するアンチセンス化合物を意味する。ＲＮＡｉ化合物として、二本鎖ｓｉＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）、及びマイクロＲＮＡ模倣物を含めたマイクロＲＮＡが挙げられるが、これらに限定されない。
【０１１６】
「セグメント」とは、核酸内の領域のさらに小さな部分または下位部分と定義される。
【０１１７】
「発作」とは、脳に影響を与えるおそれのある多くの色々な障害及び状態の症状である。「発作」は、典型的には、脳の損傷または疾患または障害に起因する、脳内のニューロン間の電気通信の乱れによって引き起こされる。発作は色々な形態を取り、色々な様式で色々な人々に影響を与え得る。発作中に発生する可能性のある一般的な身体的変化は、発話困難、嚥下不能、よだれ、繰り返されるまばたき、凝視、筋緊張の動きの欠如、振戦の悪化、単収縮、またはけい動、硬直または緊張した筋肉、自動症と呼ばれる、顔、腕、または脚を含む繰り返される意図のない動き、けいれん、尿または便の制御の喪失、発汗、皮膚色の変化（蒼白または紅潮）、瞳孔の散大、咬舌、呼吸困難、心臓の動悸である。幾つかの実施形態において、発作は軽度である。他の実施形態において、発作は、完全な不能状態であるか、または死に至るおそれがある。異常な脳活動は、脳波（ＥＥＧ）の異常な所見によって記録されることがよくある。
【０１１８】
「副作用」とは、治療に起因する、所望される作用以外の生理的病害及び／または状態を意味する。特定の実施形態において、副作用として、注射部位反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝臓毒性、腎臓毒性、中枢神経系異常、ミオパシー、及び倦怠感が挙げられる。例えば、血清中のアミノトランスフェラーゼレベルの増加は、肝臓毒性または肝機能異常を示し得る。例えば、ビリルビンの増加は、肝臓毒性または肝機能異常を示し得る。
【０１１９】
化合物に関する「一本鎖」とは、その化合物がただ１つのオリゴヌクレオチドを有することを意味する。「自己相補的な」とは、それ自体に少なくとも部分的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを意味する。１つのオリゴヌクレオチドからなる化合物であって、その化合物のオリゴヌクレオチドが自己相補的である化合物は、一本鎖化合物である。一本鎖化合物は、相補的化合物に結合して二本鎖を形成することができることもある。
【０１２０】
「部位」とは、標的核酸内の固有の核酸塩基位置として定義される。
【０１２１】
「特異的にハイブリダイズ可能」とは、オリゴヌクレオチドと標的核酸の間に十分な程度の相補性を有して所望される効果を誘発する一方で、非標的核酸に対して最小限の効果を示すか、または効果を示さないオリゴヌクレオチドを指す。特定の実施形態において、特異的なハイブリダイゼーションは、生理学的条件下で起こる。
【０１２２】
標的核酸を「特異的に阻害する」とは、標的核酸の発現を低減または阻止する一方で、非標的核酸の減少に対してより少ないか、最小限の効果を示すか、または全く効果を示さないことを意味し、必ずしも標的核酸の発現の完全な排除を示すわけではない
【０１２３】
「標準細胞アッセイ」とは、実施例に記載するアッセイ（複数可）及びその合理的な変形を意味する。
【０１２４】
「標準的なｉｎ  ｖｉｖｏ実験」とは、実施例（複数可）に記載する手順（複数可）及びその合理的な変形を意味する。
【０１２５】
「対象」とは、ヒト、または非ヒト動物、例えば、限定するものではないが、マウス、ラット、ウサギ、イヌ、ネコ、ブタ、ならびに非ヒト霊長類、例えば、限定するものではないが、サル及びチンパンジーを指す。
【０１２６】
「糖部分」とは、非修飾糖部分または修飾糖部分を意味する。「非修飾糖部分」または「非修飾糖」とは、ＲＮＡに見出されるような２’−ＯＨ（Ｈ）フラノシル部分（「非修飾ＲＮＡ糖部分」）、またはＤＮＡに見出されるような２’−Ｈ（Ｈ）部分（「非修飾ＤＮＡ糖部分」）を意味する。非修飾糖部分は、１’、３’、及び４’位の各々に１つの水素、３’位に１つの酸素、５’位に２つの水素を有する。「修飾糖部分」または「修飾糖」とは、修飾フラノシル糖部分または糖代用物を意味する。「修飾フラノシル糖部分」とは、非修飾糖部分の少なくとも１つの水素の代わりに非水素置換基を含むフラノシル糖を意味する。特定の実施形態において、修飾フラノシル糖部分は２’−置換糖部分である。そのような修飾フラノシル糖部分には、二環式糖及び非二環式糖が含まれる。
【０１２７】
「糖代用物」とは、オリゴヌクレオチドにおいて別の基（例えばヌクレオシド間結合、コンジュゲート基、または末端基）に核酸塩基を結合することができる、フラノシル糖部分以外を有する修飾糖部分を意味する。糖代用物を含む修飾ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチド内の１つまたは複数の位置に組み込むことができ、そのようなオリゴヌクレオチドは、相補的なオリゴマー化合物または核酸にハイブリダイズすることができる。
【０１２８】
「皮下投与」とは、皮膚の直下への投与を意味する。
【０１２９】
「標的遺伝子」とは、標的をコードする遺伝子を指す。
【０１３０】
「標的とする」とは、所望される効果を誘発するための、化合物の標的核酸への特異的ハイブリダイゼーションを意味する。
【０１３１】
「標的核酸」、「標的ＲＮＡ」、「標的ＲＮＡ転写物」、及び「核酸標的」はすべて、本明細書に記載する化合物によって標的とすることができる核酸を意味する。
【０１３２】
「標的領域」とは、１つまたは複数の化合物に標的化される標的核酸の一部分を意味する。
【０１３３】
「標的セグメント」とは、本明細書に記載する化合物に標的化される標的核酸のヌクレオチドの配列を意味する。「５’標的部位」とは、標的セグメントの最も５’側のヌクレオチドを指す。「３’標的部位」とは、標的セグメントの最も３’側のヌクレオチドを指す。
【０１３４】
「末端基」とは、オリゴヌクレオチドの末端に共有結合した化学基または原子団を意味する。
【０１３５】
「治療的有効量」とは、対象に治療的利益をもたらす化合物、医薬品、または組成物の量を意味する。
【０１３６】
「治療する」とは、対象における疾患、障害、または状態の改変または好転をもたらすために、化合物または医薬組成物を対象に投与することを指す。
【図面の簡単な説明】
【０１３７】
【図１】１Ａ〜１Ｂは、ＳＣＮ２Ａ  Ｒ１８８２Ｑ変異についてヘテロ接合性であるマウスにおける、Ｐ１５（すべての処置群でｎ＝３）（図１Ａ）及びＰ３５（ＡＳＯ  １  ｎ＝４、ＡＳＯ  ２  ｎ＝４、ＡＳＯ  ３  ｎ＝１、非処置  ｎ＝３）（図１Ｂ）でのＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡレベルの変化を示すグラフである。倍率変化は、年齢が一致する非処置の野生型に対して正規化した。すべてのマウスはＰ１〜Ｐ２で注射した。
【図２】年齢が一致する非処置のＳｃｎ１ａ  ＲＸヘテロ接合性マウスに対して正規化したＳｃｎ２ａ  ｍＲＮＡの低減率（パーセンテージ）を示すグラフである。ｍＲＮＡは、Ｐ１５で測定した。Ｎ＝処置群当たり３つの脳試料。
【図３】Ｓｃｎ１ａについてヘテロ接合性であるマウスにおける、Ｓｃｎ２ａダウンレギュレート性ＡＳＯ（５μｇ）またはスクランブルＡＳＯ（５０μｇ）での注射後の生存率（％）を示すグラフである。すべてのマウスはＰ１で注射し、４５日間追跡した。
【図４−１】スクランブルＡＳＯまたはｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯで処置されたＳｃｎ１ａ  ＲＸマウスのＰ２１での体重を示すグラフである。スクランブルについてはＮ＝１５、ＡＳＯについてはＮ＝１８。
【図４−２】スクランブルＡＳＯまたはｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯで処置されたＳｃｎ１ａ  ＲＸマウスのＰ４５での体重を示すグラフである。スクランブルについてはＮ＝１５、ＡＳＯについてはＮ＝１８。
【図５】Ｓｃｎ１ａについてヘテロ接合性であるマウスにおける、Ｓｃｎ２ａダウンレギュレート性ＡＳＯ（５μｇ；ｎ＝９）またはスクランブルＡＳＯ（５０μｇ；ｎ＝１７）での注射後の発作の数を示すグラフである。すべてのマウスはＰ１で注射した。
【発明を実施するための形態】
【０１３８】
前述の一般的な説明と以下の詳細な説明はいずれも例示及び説明に過ぎず、特許請求の範囲のように実施形態を制限するものではないことが理解されるべきである。本明細書において、単数形の使用は、特に明記しない限り複数形を含む。本明細書で使用する場合、「または」の使用は、特に記載しない限り「及び／または」を意味する。さらに、「含むこと（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」及び「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」などの他の形態の使用は、限定的ではない。
【０１３９】
本明細書で使用する節の見出しは、単に構成目的のものであり、記載する主題を限定するものと解釈されるべきではない。限定するものではないが、特許、特許出願、記事、書籍、論文、ならびにＧｅｎＢａｎｋ及びＮＣＢＩ参照配列記録を含めた、本出願に引用されるすべての文書、または文書の一部分は、参照により、本明細書で考察する文書の一部分だけでなくその全体が本明細書に明示的に組み込まれる。
【０１４０】
本明細書に含有される実施例の各配列番号に記載される配列は、糖部分、ヌクレオシド間結合、または核酸塩基に対するいかなる修飾とも無関係であることが理解される。したがって、配列番号によって定義された化合物は、独立に、糖部分、ヌクレオシド間結合、または核酸塩基に対する１つ以上の修飾を含んでもよい。ＩＳＩＳ番号（ＩＳＩＳ＃）によって記載される化合物は、核酸塩基配列、化学修飾、及びモチーフの組み合わせを示す。
【０１４１】
本発明は、ＳＣＮ２Ａ遺伝子を標的とするオリゴヌクレオチドがＳＣＮ１Ａ脳症を有する対象を治療するのに有用であるという発見に部分的に基づいている。したがって、本発明は、ＳＣＮ２Ａ遺伝子を標的とするオリゴヌクレオチドを投与することによって、対象におけるＳＣＮ１Ａ脳症を予防及び治療するための方法を特徴とする。
【０１４２】
特定の実施形態
特定の実施形態は、化合物または組成物を対象に投与することによる、対象におけるＳＣＮ１Ａ脳症（例えば、ドラベ症候群）またはその症状を調節するための方法、化合物、及び組成物であって、該化合物または組成物がＳＣＮ２Ａモジュレーターを含む方法を提供する。ＳＣＮ２Ａを調節すると、ＳＣＮ１Ａ脳症またはその症状を治療する、予防する、改善する、または遅延させるためにＳＣＮ２Ａの発現が低減するように、ＳＣＮ２Ａのレベルまたは発現を減少させることができる。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａモジュレーターは、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、核酸（アンチセンス化合物が含まれる）、ペプチド、抗体、小分子、及びＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる他の作用剤である。特定の実施形態において、対象はヒトである。
【０１４３】
幾つかの特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ１ＡプレｍＲＮＡまたはｍＲＮＡよりもＳＣＮ２ＡプレｍＲＮＡまたはｍＲＮＡに対して選択的である。特定の実施形態において、該方法は、ＳＣＮ１Ａの発現を実質的に低減させない。特定の実施形態において、対象は、ＳＣＮ１Ａに機能獲得型変異を有する。特定の実施形態において、対象は、ＳＣＮ１Ａに機能喪失型変異を有する。
【０１４４】
本明細書に開示する特定の実施形態は、ＳＣＮ２Ａモジュレーターを含む化合物または組成物を提供する。そのような化合物または組成物は、ＳＣＮ１Ａ脳症（例えば、ドラベ症候群）またはその症状を治療する、予防する、改善する、またはその発症遅延させるのに有用である。特定の実施形態において、化合物は、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ポリペプチド、抗体、小分子または他の作用剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａを標的とする核酸である。特定の実施形態において、核酸は一本鎖である。特定の実施形態において、核酸は二本鎖である。特定の実施形態において、化合物または組成物は、アンチセンス化合物を含む。前述の実施形態のいずれかにおいて、化合物または組成物は、オリゴマー化合物を含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａを標的とするオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、一本鎖である。特定の実施形態において、化合物は、デオキシリボヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物は、リボヌクレオチドを含み、二本鎖である。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、修飾オリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、一本鎖である。
【０１４５】
前述の実施形態のいずれかにおいて、化合物は、８〜８０、１０〜３０、１２〜５０、１３〜３０、１３〜５０、１４〜３０、１４〜５０、１５〜３０、１５〜５０、１６〜３０、１６〜５０、１７〜３０、１７〜５０、１８〜２２、１８〜２４、１８〜３０、１８〜５０、１９〜２２、１９〜３０、１９〜５０、または２０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含むことができる。
特定の実施形態において、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシド間結合は、修飾ヌクレオシド間結合である。特定の実施形態において、少なくとも１つのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。特定の実施形態において、ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合及びリン酸エステル結合である。
【０１４６】
特定の実施形態において、前述のオリゴヌクレオチドのいずれかは、少なくとも１つの修飾糖を含む。特定の実施形態において、少なくとも１つの修飾糖は、２’−Ｏ−メトキシエチル基を含む。特定の実施形態において、少なくとも１つの修飾糖は、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’基、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’基、または４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’基などの二環式糖である。
【０１４７】
特定の実施形態において、前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、５−メチルシトシンである。
【０１４８】
特定の実施形態において、化合物または組成物は、ａ）結合したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；ｂ）結合したヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及びｃ）結合したヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含む修飾オリゴヌクレオチドを含む。ギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置しており、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、修飾糖を含む。特定の実施形態において、少なくとも１つのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合である。特定の実施形態において、少なくとも１つのシトシンは、５−メチルシトシンである。
【０１４９】
特定の実施形態において、化合物は、１２〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物は、アンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、化合物は一本鎖である。特定の実施形態において、化合物は二本鎖である。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１２〜３０の結合ヌクレオシド長である。
【０１５０】
特定の実施形態において、本明細書に開示する化合物または組成物は、医薬として許容される担体または希釈剤をさらに含む。
【０１５１】
特定の実施形態において、化合物または組成物は、第２の作用剤と共投与される。特定の実施形態において、化合物及び第２の作用剤は同時に投与される。
【０１５２】
特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａを標的とする本明細書に記載する化合物及び組成物は、細胞におけるＳＣＮ２Ａの発現を阻害する方法に使用することができる。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａを標的とする本明細書に記載する化合物及び組成物は、ＳＣＮ１Ａ関連疾患または障害（例えば、限定するものではないが、ドラベ症候群）を治療する、予防する、遅延させる、または改善する方法に使用することができる。
【０１５３】
特定の適応症
本明細書で提供する特定の実施形態は、対象におけるＳＣＮ１Ａに関連する疾患を治療する、予防する、または改善するのに有用であり得る、ＳＣＮ２Ａを標的とする化合物または組成物を投与することによる、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害する方法に関する。特定の実施形態において、そのような化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む。特定の実施形態において、化合物は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物を含む。特定の実施形態において、化合物は、ＳＣＮ２Ａに標的化された修飾オリゴヌクレオチドを含む。
【０１５４】
特定の実施形態において、細胞におけるＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害する方法は、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む化合物または組成物に該細胞を接触させ、それによって該細胞におけるＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することを含む。特定の実施形態において、細胞はニューロンである。特定の実施形態において、細胞は脳組織内にある。特定の実施形態において、細胞は、ＳＣＮ１Ａ障害に関連する疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーを有するか、またはそれらを有するリスクがある対象の脳組織内にある。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、熱性けいれんを有する全般てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、家族性熱性けいれんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、早期乳児てんかん性脳症６である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子、または他の作用剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、化合物または組成物は、８〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、二本鎖であり得る。
【０１５５】
特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａに関連する１つまたは複数の疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーを治療する、予防する、それらの発症を遅延させる、それらの進行を緩徐化する、または改善する方法は、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む化合物または組成物を対象に投与することを含む。特定の実施形態において、対象におけるＳＣＮ１Ａ関連疾患または障害に関連する疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーを治療する、予防する、それらの発症を遅延させる、それらの進行を緩徐化する、または改善する方法は、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む化合物または組成物を対象に投与して、それによって該疾患を治療する、予防する、それらの発症を遅延させる、それらの進行を緩徐化する、または改善することを含む。特定の実施形態において、対象は、疾患、障害、状態、症状、もしくは生理学的マーカーを有する、または有するリスクがあると特定される。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、熱性けいれんを有する全般てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、家族性熱性けいれんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、早期乳児てんかん性脳症６である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、対象に非経口的に投与される。特定の実施形態において、非経口投与は、脳室内投与である。特定の実施形態において、非経口投与は、髄腔内投与である。特定の実施形態において、非経口投与は、皮下投与である。特定の実施形態において、対象はヒトである。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子または他の作用剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物を含む。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、二本鎖であり得る。
【０１５６】
特定の実施形態において、対象において発作の低減、ミオクローヌスもしくは筋けいれんの減少、歩行困難（末梢神経障害）、けい縮の緩和、認知症の低減、その発症の予防、もしくはその治療、言語障害の緩和、幻視の低減、もしくはその発症の予防、進行性神経変性の治療、低減、もしくはその発症の予防、膀胱の機能を制御する神経への損傷の治療、低減、その発症の予防、筋緊張低下の軽減、筋緊張の好転、肝腫大の低減、もしくはその発症の予防、心臓欠陥の低減、もしくはその発症の予防、細胞内のポリグルコサン小体の蓄積の低減もしくは予防、認知衰退の好転もしくは予防、及び運動失調の低減、またはそれらの組み合わせの方法は、該対象にＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む化合物または組成物を投与することを含む。特定の実施形態において、細胞はニューロンである。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における発作が低減する。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象におけるミオクローヌスまたは筋けいれんが減少する。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における歩行困難が緩和される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における末梢神経障害が緩和される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象におけるけい縮が緩和される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における認知症が低減する、その発症が予防される、または治療される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における言語障害が緩和される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における幻視が低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における進行性神経変性が治療される、低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における膀胱の機能を制御する神経への損傷が治療される、低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における筋緊張低下が治療される、低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における筋緊張が好転する。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、認知衰退が好転する、または予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における運動失調が治療される、または低減する。特定の実施形態において、該化合物または組成物を投与すると、長期の発作、頻繁な発作、行動及び発達の遅延、運動及びバランスの問題、整形外科的状態、言語遅延及び発声の問題、成長及び栄養の問題、睡眠困難、慢性感染症、感覚統合障害、自律神経系の乱れ、ならびに発汗の１つまたは複数が治療される、低減する、または予防される。特定の実施形態において、対象は、ＳＣＮ１Ａに関連する疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーを有する、または有するリスクがあると特定される。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、熱性けいれんを有する全般てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、家族性熱性けいれんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は早期乳児てんかん性脳症６である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、対象に非経口的に投与される。特定の実施形態において、非経口投与は、脳室内投与である。特定の実施形態において、非経口投与は、髄腔内投与である。特定の実施形態において、投与は、髄内投与である。特定の実施形態において、非経口投与は、皮下投与である。特定の実施形態において、対象はヒトである。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子または他の作用剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、化合物または組成物は、８〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、二本鎖であり得る。
【０１５７】
特定の実施形態において、本明細書に開示する化合物または組成物を投与すると、発作が減少する；ミオクローヌスもしくは筋けいれんが減少する；歩行困難が緩和される；けい縮が緩和される；認知症が低減する、その発症が予防される、もしくは治療される；言語障害が緩和される；幻視が低減する、もしくはその発症が予防される；進行性神経変性が治療される、低減する、もしくはその発症が予防される；膀胱機能を制御する神経への損傷が治療される、低減する、もしくはその発症が予防される；筋緊張低下が軽減する、筋緊張が好転する、認知衰退が好転する；及び運動失調が低減する；またはそれらが組み合わされる。特定の実施形態において、発作は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、ミオクローヌスまたは筋けいれんは独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、歩行困難は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％緩和された。特定の実施形態において、けい縮は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、言語障害は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％緩和された。特定の実施形態において、幻視は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、進行性神経変性は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、認知症の進行は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、膀胱機能の神経損傷は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、筋緊張低下は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、認知衰退は、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、運動失調は独立に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも３５％、少なくとも４０％、少なくとも４５％、または少なくとも５０％低減した。特定の実施形態において、細胞はニューロンである。
【０１５８】
特定の実施形態は、療法に使用するための本明細書に記載する化合物及び組成物を提供する。特定の実施形態は、ＳＣＮ１Ａに関連する１つまたは複数の疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーの治療、予防、それらの発症の遅延、それらの進行の緩徐化、または改善に使用するための、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む化合物または組成物に関する。特定の実施形態は、ＳＣＮ１Ａ疾患もしくは障害、またはその症状もしくは生理学的マーカーの治療、予防、それらの発症の遅延、それらの進行の緩徐化、または改善に使用するための化合物または組成物に関する。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、熱性けいれんを有する全般てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、家族性熱性けいれんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、早期乳児てんかん性脳症６である。
【０１５９】
特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子、または他の作用剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、化合物または組成物は、８〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、二本鎖であり得る。
【０１６０】
特定の実施形態は、対象における発作の低減、ミオクローヌスもしくは筋けいれんの減少、歩行困難の緩和、認知症の低減、その発症の予防、もしくは治療、言語障害の緩和、幻視の低減、もしくはその発症の予防、進行性神経変性の治療、低減、もしくはその発症の予防、膀胱機能を制御する神経への損傷の治療、低減、もしくはその発症の予防、筋緊張低下の軽減、筋緊張の好転、認知衰退の好転もしくは予防、及び運動失調の低減、またはそれらの組み合わせに使用するための、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤を含む化合物または組成物に関する。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における発作が低減する。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象におけるミオクローヌスまたは筋けいれんが減少する。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における歩行困難が緩和される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における認知症が低減する、その発症が予防される、または治療される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における言語障害が緩和される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における幻視が低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における進行性神経変性が治療される、低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における膀胱の機能を制御する神経への損傷が治療される、低減する、またはその発症が予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における筋緊張低下が治療される、低減する、または予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における筋緊張が好転する。特定の実施形態において、細胞はニューロンである。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、認知衰退が好転する、または予防される。特定の実施形態において、化合物または組成物を投与すると、対象における運動失調が治療され、低減する。特定の実施形態において、該対象は、ＳＣＮ１Ａに関連する疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーを有する、または有するリスクがあると特定される。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、熱性けいれんを有する全般てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、家族性熱性けいれんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は早期乳児てんかん性脳症６である。特定の実施形態において、対象はヒトである。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子、または他の作用剤である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ特異的阻害剤は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、化合物または組成物は、８〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物は、二本鎖であり得る。
【０１６１】
特定の実施形態は、療法用の医薬の製造または調製のための、本明細書に記載する化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、ＳＣＮ１Ａに関連する１つまたは複数の疾患、障害、状態、症状、または生理学的マーカーを治療する、予防する、発症を遅延する、進行を緩徐化する、または改善するための医薬の製造または調製における、本明細書に記載する化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態において、本明細書に記載する通りの化合物または組成物は、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害を治療する、改善する、遅延させる、または予防するための医薬の製造または調製に使用される。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患または障害は、ドラベ症候群である。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、熱性けいれんを有する全般てんかんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、家族性熱性けいれんである。特定の実施形態において、ＳＣＮ１Ａ疾患は、早期乳児てんかん性脳症６である。特定の実施形態において、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子、または他の作用剤を含む。特定の実施形態において、化合物は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物を含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、８〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物または組成物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物または組成物は、二本鎖であり得る。
【０１６２】
特定の実施形態は、ＳＣＮ１Ａの疾患または障害を有する、または有するリスクのある対象における、発作の低減、ミオクローヌスもしくは筋けいれんの減少、歩行困難の緩和、認知症の低減、その発症の予防、もしくは治療、言語障害の緩和、幻視の低減、もしくはその発症の予防、進行性神経変性の治療、低減、もしくはその発症の予防、膀胱機能を制御する神経への損傷の治療、低減、もしくはその発症の予防、筋緊張低下の軽減、筋緊張の好転、認知衰退の好転もしくは予防、及び運動失調の低減、またはそれらの組み合わせのための医薬の製造または調製のための、化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態において、細胞はニューロンである。特定の実施形態は、対象における発作の低減のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象におけるミオクローヌスもしくは筋けいれんの減少のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における歩行困難の緩和のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における認知症の低減、その発症の予防、または治療のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における言語障害の緩和のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における幻視の低減、またはその発症の予防のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における進行性神経変性の治療、低減、またはその発症の予防のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における膀胱機能を制御する神経への損傷の治療、低減、またはその発症の予防のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における筋緊張低下の治療、低減、または予防のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における筋緊張の好転のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態は、対象における運動失調の低減のための医薬の製造または調製における化合物または組成物の使用に関する。特定の実施形態において、細胞はニューロンである。特定の実施形態において、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａの発現または活性を阻害することができる核酸、ペプチド、抗体、小分子、または他の作用剤を含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物またはオリゴマー化合物を含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、８〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、化合物または組成物は、１０〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物または組成物は、一本鎖であり得る。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物または組成物は、二本鎖であり得る。
【０１６３】
前述の方法または使用のいずれかにおいて、化合物または組成物は、ＳＣＮ２Ａに標的化されたアンチセンス化合物を含むことができる。特定の実施形態において、化合物は、オリゴヌクレオチド、例えば、８〜８０の結合したヌクレオシド、１０〜３０の結合したヌクレオシド、１２〜３０の結合したヌクレオシド、または２０の結合したヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合、少なくとも１つの修飾糖、及び／または少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、修飾糖は二環式糖または２’−Ｏ−メトキシエチルであり、修飾核酸塩基は５−メチルシトシンである。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、結合したデオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；結合したヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び結合したヌクレオシドからなる３’ウィングセグメントを含み、該ギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に直接隣接して位置しており、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、修飾糖を含む。特定の実施形態において、化合物は、１２〜８０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含むことができる。特定の実施形態において、化合物は、アンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、化合物は一本鎖である。特定の実施形態において、化合物は二本鎖である。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１２〜３０の結合ヌクレオシド長である。特定の実施形態において、本明細書に開示する化合物または組成物は、医薬として許容される担体または希釈剤をさらに含む。
【０１６４】
前述の方法または使用のいずれかにおいて、化合物または組成物は、１２〜３０の結合ヌクレオシド長の修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなり、該修飾オリゴヌクレオチドは、
結合した２’−デオキシヌクレオシドからなるギャップセグメント；
結合したヌクレオシドからなる５’ウィングセグメント；及び
結合したヌクレオシドからなる３’ウィングセグメント；
を含み、該ギャップセグメントは、５’ウィングセグメントと３’ウィングセグメントの間に位置しており、各ウィングセグメントの各ヌクレオシドは、修飾糖を含む。
【０１６５】
前述の方法または使用のいずれかにおいて、化合物または組成物は、非経口的に投与することができる。例えば、特定の実施形態において、化合物または組成物は、注射または注入によって投与することができる。非経口投与には、皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、腹腔内投与、または頭蓋内投与が含まれる。特定の実施形態において、化合物または組成物は、第２の作用剤と共投与される。特定の実施形態において、化合物及び第２の作用剤は同時に投与される。前述の方法または使用のいずれかにおいて、化合物または組成物は、髄腔内に投与することができる。前述の方法または使用のいずれかにおいて、化合物または組成物は、髄内に投与することができる。前述の方法または使用のいずれかにおいて、化合物または組成物は、脳室内に投与することができる。
【０１６６】
特定の化合物
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、アンチセンス化合物である。特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、オリゴマー化合物を含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、標的核酸のものと相補的な核酸塩基配列を有する。
【０１６７】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、標的核酸のものと相補的な核酸塩基配列を有する。
【０１６８】
特定の実施形態において、化合物またはアンチセンス化合物は一本鎖である。そのような一本鎖化合物またはアンチセンス化合物は、オリゴマー化合物を含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、そのようなオリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは修飾されている。特定の実施形態において、一本鎖アンチセンス化合物またはオリゴマー化合物のオリゴヌクレオチドは、自己相補的な核酸塩基配列を含む。
【０１６９】
特定の実施形態において、化合物は二本鎖である。そのような二本鎖化合物は、標的核酸に相補的な領域を有する第１の修飾オリゴヌクレオチドと、第１の修飾オリゴヌクレオチドに相補的な領域を有する第２の修飾オリゴヌクレオチドとを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、ＲＮＡオリゴヌクレオチドである。そのような実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド内のチミン核酸塩基は、ウラシル核酸塩基によって置きかえられている。特定の実施形態において、化合物は、コンジュゲート基を含む。特定の実施形態において、各修飾オリゴヌクレオチドは、１２〜３０の結合ヌクレオシド長である。
【０１７０】
特定の実施形態において、化合物は二本鎖である。そのような二本鎖化合物は、標的核酸に相補的な領域を有する第１のオリゴマー化合物と、第１のオリゴマー化合物に相補的な領域を有する第２のオリゴマー化合物とを含む。そのような二本鎖化合物の第１のオリゴマー化合物は、典型的には、修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。そのような二本鎖化合物の第２のオリゴマー化合物のオリゴヌクレオチドは、修飾されていても、修飾されていなくてもよい。二本鎖化合物のオリゴマー化合物は、非相補的なオーバーハングヌクレオシドを含んでもよい。
【０１７１】
一本鎖及び二本鎖化合物の例として、オリゴヌクレオチド、ｓｉＲＮＡ、オリゴヌクレオチドを標的とするマイクロＲＮＡ、及び一本鎖ＲＮＡｉ化合物、例えば、低分子ヘアピン型ＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、一本鎖ｓｉＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）、及びマイクロＲＮＡ模倣物が挙げられるが、これらに限定されない。
【０１７２】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、５’から３’方向に書かれた場合に標的化される標的核酸の標的セグメントの逆相補体を含む核酸塩基配列を有する。
【０１７３】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１０〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１２〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１２〜２２の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１４〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１４〜２０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１５〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１５〜２０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１６〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１６〜２０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１７〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１７〜２０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１８〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１８〜２１の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１８〜２０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、２０〜３０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。言い換えれば、そのようなオリゴヌクレオチドはそれぞれ、１２〜３０の結合したサブユニット、１４〜３０の結合したサブユニット、１４〜２０のサブユニット、１５〜３０のサブユニット、１５〜２０のサブユニット、１６〜３０のサブユニット、１６〜２０のサブユニット、１７〜３０のサブユニット、１７〜２０のサブユニット、１８〜３０のサブユニット、１８〜２０のサブユニット、１８〜２１のサブユニット、２０〜３０のサブユニット、または１２〜２２の結合したサブユニットである。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１４の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１６の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１７の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１８の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１９の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、２０の結合サブユニット長のオリゴヌクレオチドを含む。他の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、８〜８０、１２〜５０、１３〜３０、１３〜５０、１４〜３０、１４〜５０、１５〜３０、１５〜５０、１６〜３０、１６〜５０、１７〜３０、１７〜５０、１８〜２２、１８〜２４、１８〜３０、１８〜５０、１９〜２２、１９〜３０、１９〜５０、または２０〜３０の結合したサブユニットのオリゴヌクレオチドを含む。そのような特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、もしくは８０の結合サブユニット長、または上の値の任意の２つによって規定される範囲のオリゴヌクレオチドを含む。幾つかの実施形態において、結合したサブユニットは、ヌクレオチド、ヌクレオシド、または核酸塩基である。
【０１７４】
特定の実施形態において、化合物は、短縮または切断されてもよい。例えば、単一のサブユニットは、５’末端から欠失されても（５’トランケーション）、あるいは３’末端から欠失されてもよい（３’トランケーション）。ＳＣＮ２Ａ核酸に標的化された短縮またはトランケートされた化合物は、該化合物の５’末端から欠失した２つのサブユニットを有しても、あるいは３’末端から欠失した２つのサブユニットを有してもよい。あるいは、欠失したヌクレオシドが、化合物全体に分散してもよい。
【０１７５】
単一の追加サブユニットが延長された化合物に存在するとき、追加サブユニットは、該化合物の５’末端に位置しても、３’末端に位置してもよい。２つ以上の追加サブユニットが存在するとき、例えば、２つのサブユニットが化合物の５’末端に付加された（５’付加）、あるいは３’末端に付加された（３’付加）化合物において、付加されたサブユニットは互いに隣接してもよい。あるいは、付加されたサブユニットは、化合物全体に分散してもよい。
【０１７６】
活性を排除することなくオリゴヌクレオチドなどの化合物の長さを増加もしくは減少したり、及び／またはミスマッチの塩基を導入することが可能である（Ｗｏｏｌｆ  ｅｔ  ａｌ．（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８９：７３０５−７３０９，１９９２；Ｇａｕｔｓｃｈｉ  ｅｔ  ａｌ．  Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ  Ｉｎｓｔ．９３：４６３−４７１，Ｍａｒｃｈ  ２００１；Ｍａｈｅｒ  ａｎｄ  Ｄｏｌｎｉｃｋ  Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ．Ｒｅｓ．１６：３３４１−３３５８，１９８８）。しかしながら、オリゴヌクレオチド配列、化学的性質、及びモチーフの小さな変化が、臨床開発に必要とされる多くの特性の１つまたは複数の大きな相違を生じることがあるように思われる（Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．，５２，１０，２００９；Ｅｇｌｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，１３３，１６６４２，２０１１）。
【０１７７】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は干渉ＲＮＡ化合物（ＲＮＡｉ）であり、これは二本鎖ＲＮＡ化合物（低分子干渉ＲＮＡまたはｓｉＲＮＡとも呼ばれる）及び一本鎖ＲＮＡｉ化合物（またはｓｓＲＮＡ）を含む。そのような化合物は、標的核酸を分解及び／または隔離するために、ＲＩＳＣ経路を少なくとも部分的に介して働く（よって、マイクロＲＮＡ／マイクロＲＮＡ模倣化合物を含む）。本明細書で使用する場合、ｓｉＲＮＡという用語は、配列特異的ＲＮＡｉ、例えば、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、低分子ヘアピン型ＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、低分子干渉オリゴヌクレオチド、低分子干渉核酸、低分子干渉修飾オリゴヌクレオチド、化学修飾ｓｉＲＮＡ、転写後遺伝子サイレンシングＲＮＡ（ｐｔｇｓＲＮＡ）、及びその他を媒介することができる核酸分子を説明するために使用される他の用語と同等であることを意味する。加えて、本明細書で使用する場合、ＲＮＡｉという用語は、転写後遺伝子サイレンシング、翻訳阻害、またはエピジェネティクスなどの配列特異的ＲＮＡ干渉を説明するために使用される他の用語と同等であることを意味する。
【０１７８】
特定の実施形態において、二本鎖化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸の標的領域に相補的な核酸塩基配列を含む第１の鎖と、第２の鎖とを含む。特定の実施形態において、二本鎖化合物は、リボヌクレオチドを含み、該リボヌクレオチドにおいて、第１の鎖がチミン（Ｔ）の代わりにウラシル（Ｕ）を有し、標的領域に相補的である。特定の実施形態において、二本鎖化合物は、（ｉ）ＳＣＮ２Ａ核酸の標的領域に相補的な核酸塩基配列を含む第１の鎖と、（ｉｉ）第２の鎖とを含む。特定の実施形態において、二本鎖化合物は、糖における２’位がハロゲン（フッ素基など；２’−Ｆ）を含有するか、またはアルコキシ基（メトキシ基など；２’−ＯＭｅ）を含有する、１つまたは複数の修飾ヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、二本鎖化合物は、少なくとも１つの２’−Ｆ糖修飾及び少なくとも１つの２’−ＯＭｅ糖修飾を含む。特定の実施形態において、少なくとも１つの２’−Ｆ糖修飾及び少なくとも１つの２’−ＯＭｅ糖修飾は、ｄｓＲＮＡ化合物の鎖に沿った少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０の連続する核酸塩基に対して交互するパターンで配置される。特定の実施形態において、二本鎖化合物は、隣接するヌクレオチド間に、天然に存在するホスホジエステル結合以外の１つ以上の結合を含む。そのような結合の例として、ホスホラミド、ホスホロチオエート、及びホスホロジチオエート結合が挙げられる。二本鎖化合物はまた、米国特許第６，６７３，６６１号に教示されているような化学的に修飾された核酸分子であってもよい。他の実施形態において、ｄｓＲＮＡは、例えば２０００年４月１９日に出願されたＷＯ００／６３３６４に開示されるような、１つまたは２つのキャップ鎖を含有する。特定の実施形態において、二本鎖化合物の第１の鎖はｓｉＲＮＡガイド鎖であり、二本鎖化合物の第２の鎖はｓｉＲＮＡパッセンジャー鎖である。特定の実施形態において、二本鎖化合物の第２の鎖は、第１の鎖に相補的である。特定の実施形態において、二本鎖化合物の各鎖は、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、または２３の結合したヌクレオシドからなる。
【０１７９】
特定の実施形態において、本明細書に記載する一本鎖化合物は、本明細書に記載するＳＣＮ２Ａに標的化されたオリゴヌクレオチド配列のいずれかを含むことができる。特定の実施形態において、そのような一本鎖化合物は、一本鎖ＲＮＡｉ（ｓｓＲＮＡｉ）化合物である。特定の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸の標的領域に相補的な核酸塩基配列を含む。特定の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、チミン（Ｔ）の代わりにウラシル（Ｕ）が存在するリボヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸の標的領域に相補的な核酸塩基配列を含む。特定の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、糖における２’位がハロゲン（フッ素基など；２’−Ｆ）を含有するか、またはアルコキシ基（メトキシ基など；２’−ＯＭｅ）を含有する、１つまたは複数の修飾ヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、少なくとも１つの２’−Ｆ糖修飾及び少なくとも１つの２’−ＯＭｅ糖修飾を含む。特定の実施形態において、少なくとも１つの２’−Ｆ糖修飾及び少なくとも１つの２’−ＯＭｅ糖修飾は、ｓｓＲＮＡｉ化合物の鎖に沿った少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０の連続する核酸塩基に対して交互するパターンで配置される。さらに他の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、隣接するヌクレオチド間に、天然に存在するホスホジエステル結合以外の１つ以上の結合を含む。そのような結合の例として、ホスホラミド、ホスホロチオエート、及びホスホロジチオエート結合が挙げられる。ｓｓＲＮＡｉ化合物はまた、米国特許第６，６７３，６６１号に教示されているような化学的に修飾された核酸分子であってもよい。他の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉは、例えば２０００年４月１９日に出願されたＷＯ００／６３３６４に開示されるようなキャップ鎖を含有する。特定の実施形態において、ｓｓＲＮＡｉ化合物は、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、または２３の結合したヌクレオシドからなる。
【０１８０】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の修飾オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数の不斉中心を有しており、よって、（Ｒ）もしくは（Ｓ）、糖のアノマーなどのαもしくはβ、またはアミノ酸などの（Ｄ）もしくは（Ｌ）のように、鏡像異性体、ジアステレオ異性体、及び絶対立体化学の観点から定義することができる他の立体異性体配置が生じる。本明細書で提供する修飾オリゴヌクレオチドには、特に指定のない限り、それらのラセミ体、及び光学的に純粋な形態を含めた、すべてのそのような考えられる異性体が含まれる。同様に、全てのシス異性体及びトランス異性体ならびに互変異性型も含まれる。
【０１８１】
特定のメカニズム
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、アンチセンス化合物である。特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、オリゴマー化合物を含む。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、標的核酸にハイブリダイズして、少なくとも１つのアンチセンス活性をもたらすことができる。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、１つまたは複数の標的核酸に選択的に影響を与える。そのような選択的化合物は、１つまたは複数の標的核酸にハイブリダイズして１つまたは複数の所望されるアンチセンス活性をもたらし、かつ１つまたは複数の非標的核酸にハイブリダイズしないかまたは所望されない相当なアンチセンス活性をもたらすように１つまたは複数の非標的核酸にハイブリダイズしない、核酸塩基配列を含む。
【０１８２】
特定のアンチセンス活性において、本明細書に記載する化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、標的核酸を切断するタンパク質が動員される。例えば、本明細書に記載する特定の化合物は、標的核酸のリボヌクレアーゼＨ媒介性切断をもたらす。リボヌクレアーゼＨは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼである。そのようなＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖におけるＤＮＡは、非修飾ＤＮＡである必要はない。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、リボヌクレアーゼＨ活性を誘発するのに十分に「ＤＮＡ様」である。さらに、特定の実施形態において、ギャップマーのギャップ内に１つまたは複数の非ＤＮＡ様ヌクレオシドが容認される。
【０１８３】
特定のアンチセンス活性において、本明細書に記載する化合物または該化合物の一部分は、ＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）に取り込まれ、最終的に標的核酸の切断がもたらされる。例えば、本明細書に記載する特定の化合物は、アルゴノートによる標的核酸の切断をもたらす。ＲＩＳＣに取り込まれる化合物は、ＲＮＡｉ化合物である。ＲＮＡｉ化合物は、二本鎖（ｓｉＲＮＡ）であっても、一本鎖（ｓｓＲＮＡ）であってもよい。
【０１８４】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物が標的核酸にハイブリダイズしても、標的核酸を切断するタンパク質が動員されない。そのような特定の実施形態において、化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、標的核酸のスプライシングが改変される。特定の実施形態において、化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、標的核酸とタンパク質または他の核酸の間の結合相互作用が阻害される。そのような特定の実施形態において、化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、標的核酸の翻訳が改変される。
【０１８５】
アンチセンス活性は、直接的に観察されても、間接的に観察されてもよい。特定の実施形態において、アンチセンス活性の観察または検出は、そのような標的核酸によってコードされる標的核酸もしくはタンパク質の量の変化、核酸もしくはタンパク質のスプライスバリアントの比率の変化、及び／または細胞もしくは動物における表現型の変化の観察または検出を含む。
【０１８６】
標的核酸、標的領域、及びヌクレオチド配列
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、標的核酸は、内因性ＲＮＡ分子である。そのような特定の実施形態において、標的核酸は、イントロン、エクソン、及び非翻訳領域を含めた、ｍＲＮＡ及びプレｍＲＮＡから選択される。特定の実施形態において、標的核酸は、プレｍＲＮＡである。そのような特定の実施形態において、標的領域は、全体がイントロン内にある。特定の実施形態において、標的領域は、イントロン／エクソンジャンクションにまたがる。特定の実施形態において、標的領域は、少なくとも５０％イントロン内にある。
【０１８７】
ＳＣＮ２Ａをコードするヒト遺伝子配列は、当技術分野で記載されている（ＨＧＮＣ：１０５８８；Ｅｎｔｒｅｚ  Ｇｅｎｅ：６３２６；Ｅｎｓｅｍｂｌ：ＥＮＳＧ０００００１３６５３１；ＯＭＩＭ：１８２３９０；ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ：Ｑ９９２５０）。よって、ＳＣＮ２ＡのｍＲＮＡ転写物は、プレｍＲＮＡを含めて、ＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡまたはＮＡＶ１．２  ｍＲＮＡと呼ぶことができる。ＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡには、例えば、ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＰ＿０６６２８７．２（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ  ＮＭ＿０２１００７．２、ＧＩ：９３１４１２０９）をコードする配列だけでなく、他のｍＲＮＡスプライス／転写物バリアント（例えば、ＧｅｎＢａｎｋ受託番号：ＮＭ＿００１０４０１４３．１、ＧＩ：９３１４１２１３；ＮＭ＿００１０４０１４２．１、ＧＩ：９３１４１２１１；または他の既知のバリアント）が含まれる。よって、ＳＣＮ２ＡのｍＲＮＡ転写物は、プレｍＲＮＡを含めて、ＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡまたはＮＡＶ２．１  ｍＲＮＡと呼ぶことができる。
【０１８８】
ＳＣＮ１Ａをコードするヒト遺伝子配列は、当技術分野で記載されている（ＨＧＮＣ：１０５８５；Ｅｎｔｒｅｚ  Ｇｅｎｅ  ６３２３；Ｅｎｓｅｍｂｌ：ＥＮＳＧ０００００１４４２８５；ＯＭＩＭ：１８２３８９；ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ：Ｐ３５４９８）。よって、ＳＣＮ１ＡのｍＲＮＡ転写物は、プレｍＲＮＡを含めて、ＳＣＮ１Ａ  ｍＲＮＡまたはＮＡＶ１．１  ｍＲＮＡと呼ぶことができる。
【０１８９】
ハイブリダイゼーション
幾つかの実施形態において、本明細書に開示する化合物とＳＣＮ２Ａ核酸の間でハイブリダイゼーションが起こる。最も一般的なハイブリダイゼーションのメカニズムは、核酸分子の相補的核酸塩基間での水素結合（例えばワトソン−クリック型、フーグスティーン型または逆フーグスティーン型水素結合）を伴う。
【０１９０】
ハイブリダイゼーションは、様々な条件下で起こり得る。ハイブリダイゼーション条件は配列依存的であり、ハイブリダイズさせようとする核酸分子の性質及び組成によって決定される。
【０１９１】
配列が標的核酸に特異的にハイブリダイズ可能であるかどうかを決定する方法は、当技術分野で周知である。特定の実施形態において、本明細書で提供する化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸に特異的にハイブリダイズ可能である。
【０１９２】
相補性
オリゴヌクレオチドは、２つの核酸塩基配列を反対方向に整列させたときに、そのようなオリゴヌクレオチドまたはその１つもしくは複数の領域の核酸塩基配列が別のオリゴヌクレオチドもしくは核酸またはその１つもしくは複数の領域の核酸塩基配列とマッチするとき、別の核酸と相補的と言われる。核酸塩基マッチまたは相補的核酸塩基は、本明細書で記載する場合、特に指定のない限り、アデニン（Ａ）とチミン（Ｔ）、アデニン（Ａ）とウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）とグアニン（Ｇ）、及び５−メチルシトシン（ｍＣ）とグアニン（Ｇ）に限られる。相補的なオリゴヌクレオチド及び／または核酸は、各ヌクレオシドで核酸塩基相補性を有する必要はなく、１つまたは複数の核酸塩基のミスマッチを含んでもよい。そのようなオリゴヌクレオチドが、核酸塩基のミスマッチなしに各ヌクレオシドで核酸塩基のマッチを有する場合、オリゴヌクレオチドは完全に相補的であるか、または１００％相補的である。
【０１９３】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、アンチセンス化合物である。特定の実施形態において、化合物は、オリゴマー化合物を含む。化合物とＳＣＮ２Ａ核酸の間の非相補的核酸塩基は、該化合物がそのまま標的核酸に特異的にハイブリダイズすることができるならば容認されてもよい。さらに、化合物は、介在するまたは隣接するセグメントがハイブリダイゼーション事象に関与しないように、ＳＣＮ２Ａ核酸の１つまたは複数のセグメントにわたってハイブリダイズすることができる（例えば、ループ構造、ミスマッチ、またはヘアピン構造）。
【０１９４】
特定の実施形態において、本明細書で提供する化合物またはその特定部分は、ＳＣＮ２Ａ核酸、標的領域、標的セグメント、その特定部分に少なくとも７０％、８０％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％相補的である。標的核酸に対する化合物の相補性の割合（パーセント）は、常法を使用して決定することができる。
【０１９５】
例えば、化合物の２０の核酸塩基のうち１８の核酸塩基が標的領域に相補的であり、したがって特異的にハイブリダイズするのであれば、９０パーセントの相補性となるであろう。この例では、残りの非相補的核酸塩基は、クラスター化していても、そこに相補的核酸塩基が散在していてもよく、互いにまたは相補的核酸塩基と連続している必要はない。したがって、標的核酸と完全に相補的な２つの領域と隣接する４つの非相補的核酸塩基を有する１８核酸塩基長の化合物は、標的核酸に対して７７．８％の総相補性を有し、したがって本発明の範囲に包含されることとなる。化合物と標的核酸の領域との相補性の割合（パーセント）は、当技術分野で公知のＢＬＡＳＴプログラム（ベーシック・ローカル・アラインメント・サーチ・ツール）及びＰｏｗｅｒＢＬＡＳＴプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９９０，２１５，４０３  ４１０；Ｚｈａｎｇ  ａｎｄ  Ｍａｄｄｅｎ，Ｇｅｎｏｍｅ  Ｒｅｓ．，１９９７，７，６４９  ６５６）を慣例的に使用して決定することができる。相同性、配列同一性、または配列相補性の割合（パーセント）は、例えば、ＳｍｉｔｈとＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズム（Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．，１９８１，２，４８２  ４８９）を使用するＧａｐプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ  Ｓｅｑｕｅｎｃｅ  Ａｎａｌｙｓｉｓ  Ｐａｃｋａｇｅ，Ｖｅｒｓｉｏｎ  ８  ｆｏｒ  Ｕｎｉｘ（登録商標），Ｇｅｎｅｔｉｃｓ  Ｃｏｍｐｕｔｅｒ  Ｇｒｏｕｐ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  Ｐａｒｋ，Ｍａｄｉｓｏｎ  Ｗｉｓ．）により、デフォルト設定を使用して決定することができる。
【０１９６】
特定の実施形態において、本明細書中に記載する化合物またはその特定部分は、標的核酸またはその特定部分に完全に相補的（すなわち１００％相補的）である。例えば、化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸、またはその標的領域もしくは標的セグメントもしくは標的配列に完全に相補的であり得る。本明細書で使用する場合、「完全に相補的」とは、化合物の各核酸塩基が、標的核酸の対応する核酸塩基と正確に塩基対合することができることを意味する。例えば、２０核酸塩基の化合物は、該化合物に完全に相補的な標的核酸の対応する２０核酸塩基部分が存在する限り、４００核酸塩基長の標的配列に完全に相補的である。完全に相補的は、第１及び／または第２の核酸の特定部分に関して使用することもできる。例えば、３０核酸塩基の化合物のうちの２０核酸塩基部分は、４００核酸塩基長の標的配列に「完全に相補的」であり得る。３０核酸塩基の化合物のうちの２０核酸塩基部分は、標的配列が対応する２０核酸塩基部分（各核酸塩基が、該化合物の２０核酸塩基部分に相補的であるもの）を有するならば、標的配列に完全に相補的である。同時に、その３０核酸塩基の化合物全体は、該化合物の残りの１０核酸塩基も標的配列に相補的であるかどうかに応じて、標的配列に対して完全に相補的である場合も、そうでない場合もある。
【０１９７】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、標的核酸に対して１つまたは複数のミスマッチした核酸塩基を含む。そのような特定の実施形態において、そのようなミスマッチによって標的に対するアンチセンス活性は低減するが、非標的に対する活性は、より大きく低減する。よって、そのような特定の実施形態において、化合物の選択性が向上する。特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチド内に特異的に位置する。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップ領域の５’末端から１、２、３、４、５、６、７、または８位にある。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップ領域の３’末端から９、８、７、６、５、４、３、２、１位にある。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、ウィング領域の５’末端から１、２、３、または４位にある。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、ウィング領域の３’末端から４、３、２、または１位にある。特定の実施形態において、ミスマッチは、ギャップマーモチーフを有さないオリゴヌクレオチド内に特異的に位置する。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、オリゴヌクレオチドの５’末端から１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２位にある。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、オリゴヌクレオチドの３’末端から２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２位にある。
【０１９８】
非相補的核酸塩基の場所は、化合物の５’末端であっても３’末端であってもよい。あるいは、非相補的核酸塩基（１つまたは複数）は、化合物の内部位置にあってもよい。２つ以上の非相補的核酸塩基が存在する場合、それらは連続して（すなわち結合して）もよいし、不連続であってもよい。一実施形態において、非相補的核酸塩基は、ギャップマーオリゴヌクレオチドのウィングセグメント内に位置する。
【０１９９】
特定の実施形態において、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０核酸塩基長、または最大１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０核酸塩基長の本明細書に記載する化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸などの標的核酸またはその特定部分に対して、４つ以下、３つ以下、２つ以下、または１つ以下の非相補的核酸塩基（複数可）を含む。
【０２００】
特定の実施形態において、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０核酸塩基長、または最大１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０核酸塩基長の本明細書に記載する化合物は、ＳＣＮ２Ａ核酸などの標的核酸またはその特定部分に対して、６つ以下、５つ以下、４つ以下、３つ以下、２つ以下、または１つ以下の非相補的核酸塩基（複数可）を含む。
【０２０１】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物には、標的核酸の一部分に相補的なものも含まれる。本明細書で使用する場合、「部分（ｐｏｒｔｉｏｎ）」とは、標的核酸のある領域またはセグメント内の所定の数の連続する（すなわち結合した）核酸塩基を指す。「部分（ｐｏｒｔｉｏｎ）」は、化合物の所定の数の連続する核酸塩基も指すこともある。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも８核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも９核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１０核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１１核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１２核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１３核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１４核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１５核酸塩基部分に相補的である。特定の実施形態において、化合物は、ある標的セグメントの少なくとも１６核酸塩基部分に相補的である。ある標的セグメントの少なくとも９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０核酸塩基部分もしくはそれ以上の核酸塩基部分、またはこれらの値のうちの任意の２つによって画定される範囲に相補的な化合物も企図される。
【０２０２】
同一性
本明細書で提供する化合物は、ある特定ヌクレオチド配列、配列番号、もしくは特定のＩｓｉｓ番号によって表される化合物、またはその一部分にも所定の同一性の割合（％）を有し得る。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、アンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドである。本明細書で使用する場合、化合物は、同じ核酸塩基対合能を有するならば、本明細書に開示する配列と同一である。例えば、ウラシルとチミジンはどちらもアデニンと対合するので、開示したＤＮＡ配列中のチミジンの代わりにウラシルを含有するＲＮＡは、該ＤＮＡ配列と同一であるとみなされることとなる。本明細書に記載する化合物の短縮型及び延長型、ならびに本明細書で提供する化合物に対して非同一塩基を有する化合物も企図される。非同一塩基は互いに隣接してもよいし、化合物全体に分散していてもよい。化合物の同一性の割合（パーセント）は、比較対象である配列に対して同一塩基対合を有する塩基の数に従って計算される。
【０２０３】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物またはその一部分は、本明細書に開示する化合物もしくは配列番号、またはその一部分の１つまたは複数と、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％同一である。特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物またはその一部分は、ある特定ヌクレオチド配列、配列番号、もしくは特定のＩｓｉｓ番号によって表される化合物、またはその一部分と、約７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、もしくは９９％、またはそのような値の間の任意のパーセンテージで同一であり、それにおいて該化合物は、１つまたは複数のミスマッチした核酸塩基を有するオリゴヌクレオチドを含む。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、オリゴヌクレオチドの５’末端から１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２位にある。そのような特定の実施形態において、ミスマッチは、オリゴヌクレオチドの３’末端から２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２位にある。
【０２０４】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、アンチセンス化合物である。特定の実施形態において、化合物の一部分は、標的核酸の等長部分と比較される。特定の実施形態において、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５核酸塩基部分が、標的核酸の等長部分と比較される。
【０２０５】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、オリゴヌクレオチドである特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの一部分は、標的核酸の等長部分と比較される。特定の実施形態において、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、または２５核酸塩基部分が、標的核酸の等長部分と比較される。
【０２０６】
特定の修飾化合物
特定の実施形態において、本明細書に記載の化合物は、結合したヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチド（ＲＮＡまたはＤＮＡ）であっても、修飾オリゴヌクレオチドであってもよい。修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾ＲＮＡまたはＤＮＡに対して少なくとも１つの修飾を含む（すなわち、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド（修飾糖部分及び／または修飾核酸塩基を含む）及び／または少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む）。
【０２０７】
Ａ．  修飾ヌクレオシド
修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分もしくは修飾核酸塩基、または修飾糖部分と修飾核酸塩基の両方を含む。
【０２０８】
１．  修飾糖部分
特定の実施形態において、修飾糖部分は、非二環式修飾糖部分である。特定の実施形態において、修飾糖部分は、二環式または三環式糖部分である。特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代用物である。そのような糖代用物は、他のタイプの修飾糖部分の置換に対応する１つまたは複数の置換を含んでもよい。
【０２０９】
特定の実施形態において、修飾糖部分は、２’、４’及び／または５’位の置換基（これらに限定されない）を含めた１つまたは複数の非環式置換基を有するフラノシル環を含む非環式修飾糖部分である。特定の実施形態において、非二環式修飾糖部分の１つまたは複数の非環式置換基は、分岐状である。非二環式修飾糖部分に適した２’−置換基の例として、２’−Ｆ、２’−ＯＣＨ３（「ＯＭｅ」または「Ｏ−メチル」）、及び２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＯＣＨ３（「ＭＯＥ」）が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、２’−置換基は、ハロ、アリル、アミノ、アジド、ＳＨ、ＣＮ、ＯＣＮ、ＣＦ３、ＯＣＦ３、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０アルコキシ、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０置換アルコキシ、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０アルキル、Ｏ−Ｃ１〜Ｃ１０置換アルキル、Ｓ−アルキル、Ｎ（Ｒｍ）−アルキル、Ｏ−アルケニル、Ｓ−アルケニル、Ｎ（Ｒｍ）−アルケニル、Ｏ−アルキニル、Ｓ−アルキニル、Ｎ（Ｒｍ）−アルキニル、Ｏ−アルキレニル−Ｏ−アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、Ｏ−アルカリル、Ｏ−アラルキル、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、またはＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）（式中、各Ｒｍ及びＲｎは独立に、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のＣ１〜Ｃ１０アルキルである）、ならびにＣｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，５３１，５８４；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８５９，２２１；及びＣｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，００５，０８７に記載される２’−置換基の中から選択される。これらの２’−置換基の特定の実施形態は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ（ＮＯ２）、チオール、チオアルコキシ、チオアルキル、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルの中から独立に選択される１つまたは複数の置換基でさらに置換されていてもよい。直鎖状非二環式修飾糖部分に適した４’−置換基の例として、アルコキシ（例えば、メトキシ）、アルキル、及びＭａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２０１５／１０６１２８に記載されるものが挙げられるが、これらに限定されない。非二環式修飾糖部分に適した５’−置換基の例として、５’−メチル（ＲまたはＳ）、５’−ビニル、及び５’−メトキシが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態において、非二環式修飾糖は、２つ以上の非架橋糖置換基、例えば、２’−Ｆ−５’−メチル糖部分、ならびにＭｉｇａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ  ２００８／１０１１５７及びＲａｊｅｅｖ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２０１３／０２０３８３６に記載される修飾糖部分及び修飾ヌクレオシドを含む。
【０２１０】
特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドまたは２’−非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＮＨ２、Ｎ３、ＯＣＦ３、ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）３ＮＨ２、ＣＨ２ＣＨ＝ＣＨ２、ＯＣＨ２ＣＨ＝ＣＨ２、ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、Ｏ（ＣＨ２）２Ｏ（ＣＨ２）２Ｎ（ＣＨ３）２、及びＮ置換アセトアミド（ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ））（式中、各Ｒｍ及びＲｎは独立に、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のＣ１〜Ｃ１０アルキルである）から選択される直鎖状２’−置換基を含む糖部分を含む。
【０２１１】
特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドまたは２’−非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＦ３、ＯＣＨ３、ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（ＣＨ３）２、Ｏ（ＣＨ２）２Ｏ（ＣＨ２）２Ｎ（ＣＨ３）２、及びＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）ＣＨ３（「ＮＭＡ」）から選択される直鎖状２’−置換基を含む糖部分を含む。
【０２１２】
特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドまたは２’−非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＨ３、及びＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３から選択される直鎖状２’−置換基を含む糖部分を含む。
【０２１３】
非二環式修飾糖部分などの修飾糖部分を含むヌクレオシドは、そのヌクレオシドの糖部分における置換（複数可）の位置（複数可）によって参照される。例えば、２’−置換または２−修飾糖部分を含むヌクレオシドは、２’−置換ヌクレオシドまたは２−修飾ヌクレオシドと呼ばれる。
【０２１４】
特定の修飾糖部分は、第２の環を形成して二環式糖部分をもたらす架橋糖置換基を含む。そのような特定の実施形態において、二環式糖部分は、４’フラノース環原子と２’フラノース環原子の間に架橋を含む。そのような４’から２’へ架橋する糖置換基の例として、４’−ＣＨ２−２’、４’−（ＣＨ２）２−２’、４’−（ＣＨ２）３−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’（「ＬＮＡ」）、４’−ＣＨ２−Ｓ−２’、４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’（「ＥＮＡ」）、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’（Ｓ配置のときに「拘束エチル」または「ｃＥｔ」と呼ばれる）、４’−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−２’、４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−２’、４’−ＣＨ（ＣＨ２ＯＣＨ３）Ｏ−２’（「拘束ＭＯＥ」または「ｃＭＯＥ」）及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，３９９，８４５、Ｂｈａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５６９，６８６、Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，７４１，４５７、及びＳｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０２２，１９３を参照されたい）、４’−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ３）−Ｏ−２’及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，２８３を参照されたい）、４’−ＣＨ２−Ｎ（ＯＣＨ３）−２’及びその類似体（例えば、Ｐｒａｋａｓｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，４２５を参照されたい）、４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−２’（例えば、Ａｌｌｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，６９６，３４５、及びＡｌｌｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，１２４，７４５を参照されたい）、４’−ＣＨ２−Ｃ（Ｈ）（ＣＨ３）−２’（例えば、Ｚｈｏｕ，  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００９，７４，１１８−１３４を参照されたい）、４’−ＣＨ２−Ｃ−（＝ＣＨ２）−２’  、及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，４２６を参照されたい）、４’−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’、４’−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’、４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’、及び４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’（式中、各Ｒ、Ｒａ、及びＲｂは独立に、Ｈ、保護基、またはＣ１〜Ｃ１２アルキルである）（例えば、Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，４２７，６７２を参照されたい）が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２１５】
特定の実施形態において、そのような４’から２’への架橋は、以下から独立に選択される１〜４つの結合基を独立に含む：−  Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−Ｏ−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ−、−Ｃ（＝ＮＲａ）−、−Ｃ（＝Ｏ）−、−Ｃ（＝Ｓ）−、−Ｏ−、−Ｓｉ（Ｒａ）２−、−Ｓ（＝  Ｏ）ｘ−、及び−Ｎ（Ｒａ）−；
（式中、
ｘは、０、１、または２であり、
ｎは、１、２、３、または４であり、
各Ｒａ及びＲｂは独立に、Ｈ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ５〜Ｃ２０アリール、置換Ｃ５〜Ｃ２０アリール、複素環基、置換複素環基、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、Ｃ５〜Ｃ７脂環式基、置換Ｃ５〜Ｃ７脂環式基、ハロゲン、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）２−Ｊ１）、またはスルホキシル（Ｓ（＝Ｏ）−Ｊ１）であり；各Ｊ１及びＪ２は独立に、Ｈ、Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１〜Ｃ１２アルキル、Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルケニル、Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２〜Ｃ１２アルキニル、Ｃ５〜Ｃ２０アリール、置換Ｃ５〜Ｃ２０  アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、複素環基、置換複素環基、Ｃ１〜Ｃ１２アミノアルキル、置換Ｃ１〜Ｃ１２アミノアルキル、または保護基である）。
【０２１６】
追加的な二環式糖部分は当技術分野で公知であり、例えば：Ｆｒｅｉｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，２５（２２），４４２９−４４４３、Ａｌｂａｅｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００６，７１，７７３１−７７４０、Ｓｉｎｇｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．，１９９８，４，４５５−４５６；Ｋｏｓｈｋｉｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９８，５４，３６０７−３６３０；Ｗａｈｌｅｓｔｅｄｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，２０００，９７，５６３３−５６３８；Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９８，８，２２１９−２２２２；Ｓｉｎｇｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９８，６３，１００３５−１００３９；Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００１７，１２９，８３６２−８３７９；Ｅｌａｙａｄｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ  Ｉｎｖｅｎｓ．Ｄｒｕｇｓ，２００１，２，５５８−５６１；Ｂｒａａｓｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．，２００１，８，１−７；Ｏｒｕｍ  ｅｔ  ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ  Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．，２００１，３，２３９−２４３；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，０５３，２０７、Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，２６８，４９０、Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．Ｕ．Ｓ．６，７７０，７４８、Ｉｍａｎｉｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．ＲＥ４４，７７９；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，７９４，４９９、Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，６７０，４６１；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，０３４，１３３、Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８０，６４４；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０３４，９０９；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，１５３，３６５；Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５７２，５８２；及びＲａｍａｓａｍｙ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，５２５，１９１、Ｔｏｒｓｔｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ  ２００４／１０６３５６、Ｗｅｎｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ９１９９９／０１４２２６；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２００７／１３４１８１；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５４７，６８４；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，６６６，８５４；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８８，７４６；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，７５０，１３１；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０３０，４６７；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２６８，９８０；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５４６，５５６；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５３０，６４０；Ｍｉｇａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．９，０１２，４２１；Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５０１，８０５；並びに米国特許出願公開であるＡｌｌｅｒｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２００８／００３９６１８及びＭｉｇａｗａ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２０１５／０１９１７２７を参照されたい。
【０２１７】
特定の実施形態において、二環式糖部分及びそのような二環式糖部分を組み込むヌクレオシドは、異性体配置によってさらに定義される。例えば、ＬＮＡヌクレオシド（本明細書に記載するもの）は、α−Ｌ配置であっても、β−Ｄ配置であってもよい。
【化１】
2021535204.tif 000002
【０２１８】
α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）またはα−Ｌ−ＬＮＡ二環式ヌクレオシドはオリゴヌクレオチドに組み込まれ、アンチセンス活性を示した（Ｆｒｉｅｄｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００３，２１，６３６５−６３７２）。本明細書では、二環式ヌクレオシドの一般的な説明には両方の異性体配置が含まれる。特定の二環式ヌクレオシド（例えばＬＮＡまたはｃＥｔ）の位置が本明細書での例示的な実施形態で特定される場合、特に指定のない限り、それらはβ−Ｄ配置である。
【０２１９】
特定の実施形態において、修飾糖部分は、１つまたは複数の非架橋糖置換基及び１つまたは複数の架橋糖置換基を含む（例えば５’−置換及び４’−２’架橋糖）。
【０２２０】
特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代用物である。そのような特定の実施形態において、糖部分の酸素原子は、例えば、硫黄、炭素または窒素原子で置きかえられる。そのような特定の実施形態において、そのような修飾糖部分は、本明細書に記載する通りの架橋及び／または非架橋置換基も含む。例えば、特定の糖代用物は、４’−硫黄原子ならびに２’位（例えば、Ｂｈａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，８７５，７３３、及びＢｈａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，９３９，６７７を参照されたい）及び／または５’位での置換を含む。
【０２２１】
特定の実施形態において、糖代用物は５原子以外を有する環を含む。例えば、特定の実施形態において、糖代用物は６員のテトラヒドロピラン（「ＴＨＰ」）を含む。そのようなテトラヒドロピランは、さらに修飾または置換されていてもよい。そのような修飾テトラヒドロピランを含むヌクレオシドとして、以下が挙げられるが、これらに限定されない：ヘキシトール核酸（「ＨＮＡ」）、アニトール核酸（「ＡＮＡ」）、マンニトール核酸（「ＭＮＡ」）（例えば、Ｌｅｕｍａｎｎ，ＣＪ．Ｂｉｏｏｒｇ．＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２００２，１０，８４１−８５４を参照されたい）、フルオロＨＮＡ：
【化２】
2021535204.tif 000003
（「Ｆ−ＨＮＡ」、例えば、Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８８，９０４；Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，４４０，８０３；Ｓｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．；及びＳｗａｙｚｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．９，００５，９０６を参照されたい；Ｆ−ＨＮＡは、Ｆ−ＴＨＰまたは３’−フルオロテトラヒドロピランと呼ぶこともできる）、及び次式のさらなる修飾ＴＨＰ化合物を含むヌクレオシド：
【化３】
2021535204.tif 000004
（式中、独立に、前記修飾ＴＨＰヌクレオシドの各々について：Ｂｘは、核酸塩基部分であり；Ｔ３及びＴ４は各々独立に、修飾ＴＨＰヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に結合するヌクレオシド間結合基であるか、またはＴ３及びＴ４の一方が、修飾ＴＨＰヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に結合するヌクレオシド間結合基であり、Ｔ３及びＴ４の他方が、Ｈ、ヒドロキシル保護基、結合されたコンジュゲート基、または５’もしくは３’末端基であり；ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７は各々独立に、Ｈ、Ｃ１〜Ｃ６アルキル、置換Ｃ１〜Ｃ６アルキル、Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２〜Ｃ６アルケニル、Ｃ２〜Ｃ６アルキニル、または置換Ｃ２〜Ｃ６アルキニルであり；Ｒ１及びＲ２の各々は独立に、水素、ハロゲン、置換または非置換のアルコキシ、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、ＮＪ３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、及びＣＮの中から選択され、式中、Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＪ１であり、各Ｊ１、Ｊ２、及びＪ３は独立に、ＨまたはＣ１〜Ｃ６アルキルである）。
【０２２２】
特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７が各々Ｈである修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７の少なくとも１つは、Ｈ以外である。特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６及びｑ７の少なくとも１つは、メチルである。特定の実施形態において、Ｒ１及びＲ２の１つがＦである修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の実施形態において、Ｒ１はＦであり、かつＲ２はＨであり、特定の実施形態において、Ｒ１はメトキシであり、かつＲ２はＨであり、特定の実施形態において、Ｒ１はメトキシエトキシであり、かつＲ２はＨである。
【０２２３】
特定の実施形態において、糖代用物は、６つ以上の原子及び２つ以上のヘテロ原子を有する環を含む。例えば、モルホリノ糖部分を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドにおけるそれらの使用が報告されている（例えば、Ｂｒａａｓｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００２，４１，４５０３−４５１０及びＳｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６９８，６８５；Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１６６，３１５；Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１８５，４４４；ならびにＳｕｍｍｅｒｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，０３４，５０６を参照されたい）。ここで使用する場合、「モルホリノ」という用語は、以下の構造を有する糖代用物を意味する。
【０２２４】
【化４】
2021535204.tif 000005
特定の実施形態において、モルホリノは、例えば上記モルホリノ構造に様々な置換基を付加するかまたは該構造から様々な置換基を改変することによって、修飾されてもよい。そのような糖代用物は、本明細書において「修飾モルホリノ」と呼ばれる。
【０２２５】
特定の実施形態において、糖代用物は非環式部分を含む。そのような非環式糖代用物を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドの例として、ペプチド核酸（「ＰＮＡ」）、非環式ブチル核酸（例えば、Ｋｕｍａｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２０１３，１１，５８５３−５８６５を参照されたい）、ならびにＭａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＷＯ２０１１／１３３８７６に記載されるヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。
【０２２６】
修飾ヌクレオシドに使用することができる多くの他の二環式糖及び三環糖ならびに糖代用物の環系は、当技術分野で公知である。
【０２２７】
２．修飾核酸塩基
核酸塩基（または塩基）の修飾または置換は、天然に存在するまたは合成的に修飾されていない核酸塩基と構造的に区別可能であるが、さらに機能的に交換可能である。天然核酸塩基と修飾核酸塩基は両方とも、水素結合に関与することができる。そのような核酸塩基修飾は、ヌクレアーゼ安定性、結合親和性、または幾つかの他の有益な生物学的特性を本明細書に記載する化合物に付与することができる。
【０２２８】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾核酸塩基を含む１つまたは複数のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む１つまたは複数のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、脱塩基ヌクレオシドと呼ばれる、核酸塩基を含まない１つまたは複数のヌクレオシドを含む。
【０２２９】
特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、アルキルまたはアルキニル置換ピリミジン、アルキル置換プリン、ならびにＮ−２、Ｎ−６及びＯ−６置換プリンから選択される。特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、２−アミノプロピルアデニン、５−ヒドロキシメチルシトシン、５−メチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、６−Ｎ−メチルグアニン、６−Ｎ−メチルアデニン、２−プロピルアデニン、２−チオウラシル、２−チオチミン及び２−チオシトシン、５−プロピニル（Ｃ≡Ｃ−ＣＨ３）ウラシル、５−プロピニルシトシン、６−アゾウラシル、６−アゾシトシン、６−アゾチミン、５−リボシルウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、８−アミノ、８−チオール、８−チオアルキル、８−ヒドロキシル、８−アザ及び他の８−置換プリン、５−ハロ、特に、５−ブロモ、５−トリフルオロメチル、５−ハロウラシル、及び５−ハロシトシン、７−メチルグアニン、７−メチルアデニン、２−Ｆ−アデニン、２−アミノアデニン、７−デアザグアニン、７−デアザアデニン、３−デアザグアニン、３−デアザアデニン、６−Ｎ−ベンゾイルアデニン、２−Ｎ−イソブチリルグアニン、４−Ｎ−ベンゾイルシトシン、４−Ｎ−ベンゾイルウラシル、５−メチル４−Ｎ−ベンゾイルシトシン、５−メチル４−Ｎ−ベンゾイルウラシル、ユニバーサル塩基、疎水性塩基、乱交雑塩基、サイズ拡張塩基、及びフッ素化塩基から選択される。さらなる修飾核酸塩基として、三環式ピリミジン、例えば１，３−ジアザフェノキサジン−２−オン、１，３−ジアザフェノチアジン−２−オン、及び９−（２−アミノエトキシ）−１，３−ジアザフェノキサジン−２−オン（Ｇ−クランプ）が挙げられる。修飾核酸塩基として、プリンまたはピリミジン塩基が、他の複素環、例えば、７−デアザ−アデニン、７−デアザグアノシン、２−アミノピリジン、及び２−ピリドンに置きかえられている塩基を挙げることもできる。さらなる核酸塩基として、Ｍｅｒｉｇａｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．３，６８７，８０８に開示されるもの、Ｔｈｅ  Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  Ｏｆ  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ａｎｄ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ，Ｊ．Ｉ．，Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，１９９０，８５８−８５９；Ｅｎｇｌｉｓｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ  Ｃｈｅｍｉｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１，３０，６１３；Ｓａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ  １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．ａｎｄ  Ｌｅｂｌｅｕ，Ｂ．，Ｅｄｓ．，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，１９９３，２７３−２８８に開示されるもの；及びＣｈａｐｔｅｒｓ  ６  ａｎｄ  １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｄｒｕｇ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｒｏｏｋｅ  Ｓ．Ｔ．，Ｅｄ．，ＣＲＣ  Ｐｒｅｓｓ，２００８，１６３−１６６  ａｎｄ  ４４２−４４３に開示されるものが挙げられる。
【０２３０】
上記の特定の修飾核酸塩基ならびに他の修飾核酸塩基の調製を教示する出版物として、Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２００３／０１５８４０３、Ｍａｎｏｈａｒａｎ  ｅｔ  ａｌ．，ＵＳ２００３／０１７５９０６；Ｄｉｎｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．４，８４５，２０５；Ｓｐｉｅｌｖｏｇｅｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１３０，３０２；Ｒｏｇｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１３４，０６６；Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１７５，２７３；Ｕｒｄｅａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，３６７，０６６；Ｂｅｎｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４３２，２７２；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４３４，２５７；Ｇｍｅｉｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５７，１８７；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５９，２５５；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４８４，９０８；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５０２，１７７；Ｈａｗｋｉｎｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５２５，７１１；Ｈａｒａｌａｍｂｉｄｉｓ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５５２，５４０；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５８７，４６９；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５９４，１２１；Ｓｗｉｔｚｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５９６，０９１；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６１４，６１７；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６４５，９８５；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６８１，９４１；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８１１，５３４；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，７５０，６９２；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，９４８，９０３；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５８７，４７０；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５７，１９１；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，７６３，５８８；Ｆｒｏｅｈｌｅｒ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８３０，６５３；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８０８，０２７；Ｃｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，６，１６６，１９９；及びＭａｔｔｅｕｃｃｉ  ｅｔ  ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，００５，０９６が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２３１】
特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ核酸に標的化された化合物は、１つまたは複数の修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、５−メチルシトシンである。特定の実施形態において、各シトシンは５−メチルシトシンである。
【０２３２】
修飾ヌクレオシド間結合
ＲＮＡ及びＤＮＡの天然に存在するヌクレオシド間結合は、３’から５’へのホスホジエステル結合である。特定の実施形態において、１つまたは複数の修飾（すなわち天然に存在しない）ヌクレオシド間結合を有する本明細書に記載する化合物は、例えば、強化された細胞取り込み、核酸標的に対する強化された親和性、及びヌクレアーゼの存在下での増加した安定性といった望ましい特性のために、天然に存在するヌクレオシド間結合を有する化合物よりも選択されることが多い。
【０２３３】
特定の実施形態において、ＳＣＮ２Ａ核酸に標的化された化合物は、１つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合である。特定の実施形態において、化合物の各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２３４】
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。修飾ヌクレオシド間結合を有するオリゴヌクレオチドには、リン原子を保持するヌクレオシド間結合だけでなく、リン原子を有さないヌクレオシド間結合も含まれる。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合として、ホスホジエステル、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホラミデート、及びホスホロチオエートが挙げられるが、これらに限定されない。リン含有及び非リン含有結合を調製する方法は、周知である。
【０２３５】
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、任意のヌクレオシド間結合を使用して一緒に結合してもよい。２つの主なクラスのヌクレオシド間結合基は、リン原子の存在または不在によって定義される。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合として、ホスホジエステル結合（「Ｐ＝Ｏ」）（非修飾または天然に存在する結合とも呼ばれる）を含有するホスフェート、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホロアミデート、及びホスホロチオエート（「Ｐ＝Ｓ」）、及びホスホロジチオエート（「ＨＳ−Ｐ＝Ｓ」）が挙げられるが、これらに限定されない。代表的な非リン酸含有ヌクレオシド間結合基として、メチレンメチルイミノ（−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−ＣＨ２−）、チオジエステル、チオノカルバメート（−Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）（ＮＨ）−Ｓ−）；シロキサン（−Ｏ−ＳｉＨ２−Ｏ−）；及びＮ，Ｎ’−ジメチルヒドラジン（−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｎ（ＣＨ３）−）が挙げられるが、これらに限定されない。修飾ヌクレオシド間結合は、天然のリン酸結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を改変する（通常は増大させる）ために使用することができる。特定の実施形態において、キラル原子を有するヌクレオシド間結合は、ラセミ混合物として、または別々の鏡像異性体として調製することができる。代表的なキラルヌクレオシド間結合として、アルキルホスホネート及びホスホロチオエートが挙げられるが、これらに限定されない。リン含有及び非リン含有ヌクレオシド間結合の調製方法は、当業者には周知である。
【０２３６】
中性ヌクレオシド間結合として、限定するものではないが、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ＭＭＩ（３’−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−５’）、アミド−３（３’−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）−５’）、アミド−４（３’−ＣＨ２−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝Ｏ）−５’）、ホルムアセタール（３’−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−５’）、メトキシプロピル、及びチオホルムアセタール（３’−Ｓ−ＣＨ２−Ｏ−５’）が挙げられる。さらなる中性ヌクレオシド間結合として、シロキサン（ジアルキルシロキサン）、カルボン酸エステル、カルボキサミド、スルフィド、スルホン酸エステル、及びアミドを含めた非イオン性結合が挙げられる（例えば、Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ  Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ  ｉｎ  Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ；Ｙ．Ｓ．Ｓａｎｇｈｖｉ  ａｎｄ  Ｐ．Ｄ．Ｃｏｏｋ，Ｅｄｓ．，ＡＣＳ  Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ  Ｓｅｒｉｅｓ  ５８０；Ｃｈａｐｔｅｒｓ  ３  ａｎｄ  ４，４０−６５を参照されたい）。さらなる中性ヌクレオシド間結合として、混合したＮ、Ｏ、Ｓ、及びＣＨ２成分部分を含む非イオン性結合が挙げられる。
【０２３７】
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、所定のパターンまたは修飾ヌクレオシド間結合モチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された修飾ヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、ヌクレオシド間結合は、ギャップ化モチーフで配置される。そのような実施形態において、２つのウィング領域の各々におけるヌクレオシド間結合は、ギャップ領域におけるヌクレオシド間結合とは異なる。特定の実施形態において、ウィングにおけるヌクレオシド間結合はホスホジエステルであり、ギャップにおけるヌクレオシド間結合はホスホロチオエートである。ヌクレオシドモチーフは独立に選択されるため、ギャップ化ヌクレオシド間結合モチーフを有するそのようなオリゴヌクレオチドは、ギャップ化ヌクレオシドモチーフを有しても有さなくてもよく、もしギャップ化ヌクレオシドモチーフを有するならば、ウィング長とギャップ長は同じであってもなくてもよい。
【０２３８】
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、交互のヌクレオシド間結合モチーフを有する領域を含む。特定の実施形態において、本発明のオリゴヌクレオチドは、均一に修飾されたヌクレオシド間結合の領域を含む。そのような特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合によって均一に結合された領域を含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートによって均一に結合される。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル及びホスホロチオエートから選択される。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル及びホスホロチオエートから選択され、少なくとも１個のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートである。
【０２３９】
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも６個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも８個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１０個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも６個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも１個のブロックを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも８個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも１個のブロックを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１０個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも１個のブロックを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１２個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも１個のブロックを含む。そのような特定の実施形態において、少なくとも１個のそのようなブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端に位置する。そのような特定の実施形態において、少なくとも１個のそのようなブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端から３ヌクレオシド以内に位置する。
【０２４０】
特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数のメチルホスホネート（ｍｅｔｈｙｌｐｈｏｓｐｏｎａｔｅ）結合を含む。特定の実施形態において、ギャップマーヌクレオシドモチーフを有するオリゴヌクレオチドは、１つまたは２つのメチルホスホネート結合を除くすべてのホスホロチオエート結合を含む結合モチーフを含む。特定の実施形態において、１つのメチルホスホネート結合は、ギャップマーヌクレオシドモチーフを有するオリゴヌクレオチドの中央のギャップにある。
【０２４１】
特定の実施形態において、ヌクレアーゼ耐性を維持するように、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びホスホジエステルヌクレオシド間結合の数を調整することが望ましい。特定の実施形態において、ヌクレアーゼ耐性を維持するように、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合の数及び位置ならびにホスホジエステルヌクレオシド間結合の数及び位置を調整することが望ましい。特定の実施形態において、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合の数を減少させることができ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合の数を増加させることができる。特定の実施形態において、ヌクレアーゼ耐性を維持したままで、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合の数を減少させることができ、ホスホジエステルヌクレオシド間結合の数を増加させることができる。特定の実施形態において、ヌクレアーゼ耐性を保持しながら、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合の数を減少させることが望ましい。特定の実施形態において、ヌクレアーゼ耐性を保持しながら、ホスホジエステルヌクレオシド間結合の数を増加させることが望ましい。
【０２４２】
Ｂ．特定のモチーフ
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。オリゴヌクレオチドは、モチーフ、例えば、非修飾及び／または修飾糖部分、核酸塩基、及び／またはヌクレオシド間結合のパターンを有することができる。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖を含む１つまたは複数の修飾ヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む１つまたは複数の修飾ヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１つまたは複数の修飾ヌクレオシド間結合を含む。そのような実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの修飾、非修飾、及び異なるように修飾された糖部分、核酸塩基、及び／またはヌクレオシド間結合が、パターンまたはモチーフを画定する。特定の実施形態において、糖部分、核酸塩基、及びヌクレオシド間結合のパターンは、各々互いに独立している。よって、修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ、及び／またはヌクレオシド間結合モチーフによって表現することができる（本明細書で使用する場合、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列とは無関係に核酸塩基への修飾を表現する）。
【０２４３】
１．特定の糖モチーフ
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、該オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って所定のパターンまたは糖モチーフで配置された１つまたは複数のタイプの修飾糖及び／または非修飾糖部分を含む。場合によっては、そのような糖モチーフは、本明細書で考察される糖修飾のいずれかを含むが、これらに限定されない。
【０２４４】
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、ギャップマーモチーフを有する領域を含むかまたはそれからなり、ギャップマーモチーフは、２つの外部領域または「ウィング」と、中央もしくは内部領域または「ギャップ」とを含む。ギャップマーモチーフの３つの領域（５’−ウィング、ギャップ、及び３’−ウィング）は、ヌクレオシドの連続した配列を形成し、ウィングの各々のヌクレオシドの糖部分の少なくとも一部は、ギャップのヌクレオシドの糖部分の少なくとも一部とは異なる。具体的には、少なくとも、ギャップに最も近い各ウィングのヌクレオシド（５’−ウィングの最も３’側のヌクレオシド及び３’−ウィングの最も５’側のヌクレオシド）の糖部分が、隣接するギャップヌクレオシドの糖部分とは異なり、そのようにしてウィングとギャップの間の境界（すなわち、ウィング／ギャップジャンクション）を画定する。特定の実施形態において、ギャップ内の糖部分は、互いに同一である。特定の実施形態において、ギャップは、該ギャップの１つまたは複数の他のヌクレオシドの糖部分とは異なる糖部分を有する１つまたは複数のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、２つのウィングの糖モチーフは、互いに同一である（対称性ギャップマー）。特定の実施形態において、５’−ウィングの糖モチーフは、３’−ウィングの糖モチーフとは異なる（非対称性ギャップマー）。
【０２４５】
特定の実施形態において、ギャップマーのウィングは、１〜５のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウィングは、２〜５のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのウィングは、３〜５のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのヌクレオシドは、すべて修飾ヌクレオシドである。
【０２４６】
特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、７〜１２のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、７〜１０のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、８〜１０のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、１０のヌクレオシドを含む。特定の実施形態において、ギャップマーのギャップの各ヌクレオシドは、非修飾２’ーデオキシヌクレオシドである。
【０２４７】
特定の実施形態において、ギャップマーはデオキシギャップマーである。そのような実施形態において、各ウィング／ギャップジャンクションのギャップ側のヌクレオシドは非修飾２’−デオキシヌクレオシドであり、各ウィング／ギャップジャンクションのウィング側のヌクレオシドは修飾ヌクレオシドである。そのような特定の実施形態において、ギャップの各ヌクレオシドは、非修飾２’−デオキシヌクレオシドである。そのような特定の実施形態において、各ウィングの各ヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである。
【０２４８】
そのような特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、完全に修飾された糖モチーフを有し、ここで、該修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。そのような特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、完全に修飾された糖モチーフを有する領域を含むかまたはそれからなり、ここで、該領域の各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、完全に修飾された糖モチーフを有する領域を含むかまたはそれからなり、ここで、完全に修飾された領域内の各ヌクレオシドは同じ修飾糖部分を含み、これを本明細書では均一に修飾された糖モチーフと呼ぶ。特定の実施形態において、完全に修飾されたオリゴヌクレオチドは、均一に修飾されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態において、均一に修飾されたものの各ヌクレオシドは、同じ２’−修飾を含む。
【０２４９】
２．  特定の核酸塩基モチーフ
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、該オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って所定のパターンまたはモチーフで配置された修飾及び／または非修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態において、各核酸塩基は、修飾されている。特定の実施形態において、核酸塩基はいずれも修飾されていない。特定の実施形態において、各プリンまたは各ピリミジンは、修飾されている。特定の実施形態において、各アデニンは、修飾されている。特定の実施形態において、各グアニンは、修飾されている。特定の実施形態において、各チミンは、修飾されている。特定の実施形態において、各ウラシルは、修飾されている。特定の実施形態において、各シトシンは、修飾されている。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチド内のシトシン核酸塩基の一部または全部は、５−メチルシトシンである。
【０２５０】
特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基のブロックを含む。そのような特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端にある。特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端の３ヌクレオシド以内にある。特定の実施形態において、ブロックは、ブロックは、オリゴヌクレオチドの５’末端にある。特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの５’末端の３ヌクレオシド以内にある。
【０２５１】
特定の実施形態において、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを含む。そのような特定の実施形態において、修飾核酸塩基を含む１つのヌクレオシドは、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチドの中央ギャップ内にある。そのような特定の実施形態において、前記ヌクレオシドの糖部分は、２’−デオキシリボシル部分である。特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、２−チオピリミジン及び５−プロピンピリミジンから選択される。
【０２５２】
３．  特定のヌクレオシド間結合モチーフ
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、該オリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って所定のパターンまたはモチーフで配置された修飾及び／または非修飾ヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態において、本質的に各ヌクレオシド間結合基は、ホスフェートヌクレオシド間結合（Ｐ＝Ｏ）である。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、ホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）である。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は独立に、ホスホロチオエート及びホスフェートヌクレオシド間結合から選択される。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドの糖モチーフはギャップマーであり、ギャップ内のヌクレオシド間結合はすべて修飾されている。そのような特定の実施形態において、ウィング内のヌクレオシド間結合の一部または全部は、非修飾ホスフェート結合である。特定の実施形態において、末端ヌクレオシド間結合は修飾されている。
【０２５３】
Ｃ．  特定の修飾オリゴヌクレオチド
特定の実施形態において、本明細書に記載する化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態において、上記修飾（糖、核酸塩基、ヌクレオシド間結合）が、修飾オリゴヌクレオチド内に組み込まれている。特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、その修飾、モチーフ、及び全長によって特徴付けられる。特定の実施形態において、そのようなパラメータは各々互いに独立している。よって、特に示さない限り、ギャップマー糖モチーフを有するオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、修飾されていても修飾されていなくてもよく、糖修飾のギャップマー修飾パターンに従っていても従っていなくてもよい。例えば、糖ギャップマーのウィング領域内のヌクレオシド間結合は、互いに同じであっても異なっていてもよく、糖モチーフのギャップ領域のヌクレオシド間結合と同じであっても異なっていてもよい。同様に、そのような糖ギャップマーオリゴヌクレオチドは、糖修飾のギャップマーパターンとは独立に、１つまたは複数の修飾核酸塩基を含んでもよい。さらに、場合によっては、オリゴヌクレオチドは、全長または範囲、及び２つ以上の領域（例えば、指定された糖修飾を有するヌクレオシドの領域）の長さまたは長さの範囲によって表現され、そのような場合では、指定範囲外の全長を有するオリゴヌクレオチドとなる数を各範囲で選択することが可能であり得る。そのような場合、両方の要素が満たされなければならない。例えば、特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１５〜２０の結合したヌクレオシドからなり、かつ３つの領域、Ａ、Ｂ及びＣからなる糖モチーフを有し、ここで、領域Ａは、指定された糖モチーフを有する２〜６の結合したヌクレオシドからなり、領域Ｂは、指定された糖モチーフを有する６〜１０の結合したヌクレオシドからなり、領域Ｃは、指定された糖モチーフを有する２〜６の結合したヌクレオシドからなる。そのような実施形態は、Ａ及びＣがそれぞれ６の結合したヌクレオシドからなり、Ｂが１０の結合したヌクレオシドからなるような修飾オリゴヌクレオチドを含まない（これらのヌクレオシドの数がＡ、Ｂ及びＣに関する要件内に許容されているにもかかわらず）。何故なら、そのようなオリゴヌクレオチドの全長が２２であり、これは修飾オリゴヌクレオチドの全長の上限（２０）を超えるからである。本明細書において、オリゴヌクレオチドの表現が１つまたは複数のパラメータに関して記載されていないならば、そのようなパラメータは限定されない。したがって、ギャップマー糖モチーフを有するとのみ表現され、さらに表現されていない修飾オリゴヌクレオチドは、任意の長さ、ヌクレオシド間結合モチーフ、及び核酸塩基モチーフを有することができる。特に示さない限り、すべての修飾は、核酸塩基配列から独立している。
【０２５４】
医薬組成物を製剤化するための組成物及び方法
本明細書に記載する化合物は、医薬組成物または製剤を調製するために、医薬として許容される活性または不活性物質と混合されてもよい。医薬組成物を製剤化するための組成物及び方法は、投与経路、疾患の程度、または投与しようとする用量（これらに限定されない）を含めた幾つもの基準に依存する。
【０２５５】
特定の実施形態において、本発明は、１つもしくは複数の化合物またはその塩を含む医薬組成物を提供する。特定の実施形態において、化合物は、アンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。そのような特定の実施形態において、医薬組成物は、医薬として許容される適切な希釈剤または担体を含む。特定の実施形態において、医薬組成物は、滅菌生理食塩溶液及び１種または複数の化合物を含む。特定の実施形態において、そのような医薬組成物は、滅菌生理食塩溶液と及び種または複数の化合物からなる。特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。特定の実施形態において、医薬組成物は、１種または複数の化合物及び滅菌水を含む。特定の実施形態において、医薬組成物は、１種または複数の化合物及び滅菌水からなる。特定の実施形態において、滅菌水は、医薬品グレードの水である。特定の実施形態において、医薬組成物は、１種または複数の化合物及びリン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）を含む。特定の実施形態において、医薬組成物は、１種または複数の化合物及び滅菌ＰＢＳからなる。特定の実施形態において、滅菌ＰＢＳは医薬品グレードのＰＢＳである。医薬組成物を製剤化するための組成物及び方法は、投与経路、疾患の程度、または投与しようとする用量（これらに限定されない）を含めた幾つもの基準に依存する。
【０２５６】
ＳＣＮ２Ａ核酸に標的化された本明細書に記載する化合物は、該化合物を医薬として許容される適切な希釈剤または担体と組み合わせることによって、医薬組成物に利用することができる。特定の実施形態において、医薬として許容される希釈剤は、注射に適した滅菌水などの水である。したがって、一実施形態において、本明細書に記載する方法で用いられるのは、ＳＣＮ２Ａ核酸に標的化された化合物及び医薬として許容される希釈剤を含む医薬組成物である。特定の実施形態において、医薬として許容される希釈剤は水である。特定の実施形態において、化合物は、本明細書で提供する修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【０２５７】
本明細書で提供する化合物を含む医薬組成物は、ヒトを含めた動物に投与したときに、生物学的に活性な代謝産物またはその残基を（直接的または間接的に）提供することができる、任意の医薬として許容される塩、エステルもしくはそのようなエステルの塩、または任意の他のオリゴヌクレオチドを包含する。特定の実施形態において、化合物は、アンチセンス化合物またはオリゴマー化合物である。特定の実施形態において、化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。したがって、例えば、本開示はまた、化合物の医薬として許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの医薬として許容される塩、及び他の生物学的等価物に関する。医薬として許容される適切な塩として、ナトリウム塩及びカリウム塩が挙げられるが、これらに限定されない。
【０２５８】
プロドラッグは、体内で内因性ヌクレアーゼによって切断されて活性化合物を形成する化合物の一方または両方の末端における追加的なヌクレオシドの組み込みを含むことができる。
【０２５９】
特定の実施形態において、化合物または組成物は、医薬として許容される担体または希釈剤をさらに含む。
【０２６０】
特定の実施形態の利点
本明細書で提供するのは、ＳＣＮ１Ａ関連疾患もしくは状態（例えば、ドラベ症候群）またはその生理学的マーカーを治療する、遅延させる、予防する、及び／または改善することができる、ＳＣＮ２Ａ核酸を調節するための初めての方法及び組成物である特定の実施形態では、ＳＣＮ１Ａ関連疾患または状態（例えば、ドラベ症候群）を有する対象における発作の減少、ミオクローヌスもしくは筋けいれんの減少、歩行困難の緩和、認知症の低減、その発症の予防、もしくは治療、言語障害の緩和、幻視の低減、もしくはその発症の予防、進行性神経変性の治療、低減、もしくはその発症の予防、運動失調の低減、またはそれらの組み合わせのための、ＳＣＮ２Ａ阻害剤（例えば、ＳＣＮ２Ａをコードする核酸を標的とするオリゴヌクレオチド）が初めて提供される。
【実施例】
【０２６１】
非限定的な開示及び参照による組み込み
本明細書に記載する特定の化合物、組成物及び方法について、特定の実施形態に従って具体的に説明してきたが、以下の実施例は、本明細書に記載の化合物を例示するために提供するに過ぎず、同化合物を限定することを意図するものではない。本出願に挙げる参考文献の各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【０２６２】
実施例１：ＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡはＬＮＡによって低減した
ＬＮＡを滅菌蒸留水で１０μｇ／μｌに溶解し、使用するまで−３０°Ｃで保存した。使用したＬＮＡの配列を以下の表１及び２に示す。
【表１】
2021535204.tif 000006
【表２】
2021535204.tif 000007
【０２６３】
新生仔脳室内（ＩＣＶ）注射
すべての試験は、「実験動物の取り扱いと使用に関する指針（Ｇｕｉｄｅ  ｆｏｒ  ｔｈｅ  Ｃａｒｅ  ａｎｄ  Ｕｓｅ  ｏｆ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ａｎｉｍａｌｓ）」に従って実施し、Ｆｌｏｒｅｙ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ  Ａｎｉｍａｌ  Ｅｔｈｉｃｓ  Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって承認された。Ｓｃｎ２ａ  Ｒ１８８２Ｑ変異についてヘテロ接合性である仔を有する妊娠中のＩＣＲマウスは、Ｃｙａｇｅｎによって作製された。マウスは、１２時間のライトオン／オフサイクルを有する温度調節された室内で維持し、食物及び液体を自由に摂取させた。
【０２６４】
注射の前に仔（Ｐ２）を視覚的に検査して、乳白色斑が存在することを確認した。砕いた氷に囲まれた小さなプラスチック容器に仔を４〜５分間入れることによって凍結麻酔を誘導し、指趾への圧刺激応答を使用して麻酔の深さを決定した。ＬＮＡ（１０μｇ／μｌ）を、３２Ｇ針を備えた１０μｌの注射器（Ｈａｍｉｌｔｏｎ）に装填した。仔の皮膚表面を８０％エタノール綿棒で滅菌し、矢状縫合の外側約０．７〜１．０ｍｍ、ラムダから頭側０．７〜１．０ｍｍの位置に注射部位をマーカーで標識した。頭蓋骨表面に垂直な角度で針を皮膚表面の２ｍｍ下に挿入した。２μｌの体積のＬＮＡ（２０μｇ）をゆっくりと右室に注入した。回復させるために、動きが観察されるまで、マウスをヒートブロック（摂氏３２度）上に５〜１０分間静置した。ホームケージに戻す前に、子殺しのリスクを最小限に抑えるために仔を寝藁でこすった。
【０２６５】
ＬＮＡ処理マウスの右大脳半球をＰ１５及びＰ３５で採取し、次いで液体窒素で急速凍結した。ＴＲＩｚｏｌ試薬（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を使用して全ＲＮＡを単離した。最初の均質化のために半球あたり１ｍｌのＴＲＩｚｏｌを使用し、ＲＮＡの単離は製造業者のプロトコルに従って行った。その後、５０μｌの反応において試料当たり最大２０μｇの全ＲＮＡを製造業者の使用説明書に従って１μｌのデオキシリボヌクレアーゼ（ＤＮＡフリーデオキシリボヌクレアーゼ処理及び除去キット；ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で処理し、続いて、供給された不活性化試薬（ＤＮＡフリーデオキシリボヌクレアーゼ処理及び除去キット；ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を使用してデオキシリボヌクレアーゼを除去した。ｃＤＮＡを作製するために、試料当たり５００  ｎｇの全ＲＮＡを、製造業者のプロトコルに従ってオリゴ（ｄＴ）１５プライマーを使用してＭ−ＭＬＶ逆転写酵素（両方ともＰｒｏｍｅｇａ）によって逆転写した。続いて、試料当たり２０  ｎｇのｃＤＮＡを、定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）におけるテンプレートとして使用した。ｑＲＴ−ＰＣＲ反応液は、製造業者の使用説明書に従ってＧｏＴａｑ  ｑＰＣＲ  ＭａｓｔｅｒＭｉｘ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を使用して調製し、反応は、ＶｉｉＡ  ７システム（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）のＭｉｃｒｏＡｍｐ  Ｆａｓｔ−Ｏｐｔｉｃａｌ  ９６ウェル反応プレート（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）内で行った。ｑＲＴ−ＰＣＲの実行中、９５°Ｃで１０分間の初期プレインキュベーションに続いて、４０回の増幅サイクル（９５°Ｃで１５秒間、６０°Ｃで６０秒間）を行った。最後に、融点分析を行って（９５°Ｃで１５秒間、６０°Ｃで６０秒間、０．０５°Ｃ／秒の速度で９５°Ｃに加熱）、増幅産物の融解温度を決定した。プライマー配列（５’−３’）は次の通りであった：ＴＧＣＴＧＴＧＣＧＧＡＡＡＴＣＴＧＣＣ（ＳＣＮ２Ａフォワードプライマー）（配列番号７）；ＣＧＧＡＴＧＣＴＣＡＡＧＡＧＡＧＡＣＴＧＧ（ＳＣＮ２Ａリバースプライマー）（配列番号８）；ＧＡＧＧＴＧＣＴＧＣＴＧＡＴＧＴＧＣ（ＲＰＬ３２フォワードプライマー）（配列番号９）；ＧＧＣＧＴＴＧＧＧＡＴＴＧＧＴＧＡＣＴ（ＲＰＬ３２リバースプライマー）（配列番号１０）。ｑＲＴ−ＰＣＲデータは、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ  Ｒｅａｌ  Ｔｉｍｅ  ＰＣＲソフトウェアｖ１．３（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を使用して分析した。定量的発現分析のために、ＳＣＮ２Ａの発現をハウスキーピング遺伝子ＲＰＬ３２の発現に対して正規化した（２＾ΔＣＴ法；Ｐｆａｆｆｌｅｔ  ａｌ．．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．  Ｒｅｓ．２９（９）：ｅ４５，２００１）。次いで、ＡＳＯ処理マウスにおける正規化されたＳＣＮ２Ａの発現を、年齢を一致させた非処置の対照におけるＳＣＮ２Ａの発現に対して正規化した（２＾ΔΔＣＴ）。
【０２６６】
３つすべてのＬＮＡ（ＡＳＯ  １、ＡＳＯ  ２、及びＡＳＯ  ３）は、注射後１３日でＳｃｎ２ａ  ｍＲＮＡレベルを２〜３分の一に低減させた（図１Ａ）。同様のレベルの低減がＰ３５で観察され（図１Ｂ）、これにより、ＬＮＡがＣＳＦ中で安定であり、最低１か月間Ｓｃｎ２ａ  ｍＲＮＡをダウンレギュレートするのに有効であったことが示される。
【０２６７】
実施例２：ＳＣＮ１Ａヘテロ接合性マウスの生存率及び発作からのＳＣＮ２Ａ  ＡＳＯの評価
【０２６８】
背景
ＳＣＮ１Ａ  Ｒ１４０７Ｘマウスモデル（Ｓｃｎ１ａ  ＲＸ）は、ドラベ症候群として知られる早期発症型の重度のてんかんの主要な疾患の特徴を厳密に反映している。Ｒ１４０７Ｘ変異についてヘテロ接合性であるマウスは、早死及び自発性発作を有する。Ｓｃｎ１ａ遺伝子は、主に抑制性ニューロンで発現する電位依存性ナトリウムチャネル、Ｎａｖ１．１をコードする。電気生理学的分析により、Ｒ１４０７Ｘを発現するニューロンは高周波活動電位発火を維持できず、それにより脱抑制が起こり、その結果、脳の興奮性が亢進することが明らかになった。したがって、脳の一般的な興奮性亢進を低減させることができる戦略は、ドラベ症候群の治療に役立つ可能性がある。初期発生の間の脳の興奮性の重要な調節因子は、ＳＣＮ２Ａ遺伝子によってコードされる別の電位依存性ナトリウムチャネルアイソフォーム、Ｎａｖ１．２である。
【０２６９】
Ｎａｖ１．２の機能を低減させる方法は、アンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を使用してＳＣＮ２Ａ遺伝子を標的にすることである。ＡＳＯは、目的の遺伝子発現を制御するように設計された一本鎖ＤＮＡ／ＲＮＡオリゴヌクレオチドである。マウスＳＣＮ１Ａ遺伝子をダウンレギュレートするように特異的に設計されたＡＳＯをＳＣＮ１Ａ  ＲＸマウスモデルに適用し、生存率、自発性発作の数、脳波（ＥＥＧ）によって効力を評価した。
【０２７０】
方法
定量的遺伝子発現分析（ＲＴ−ｑＰＣＲ）
製造業者のプロトコル（Ｔｈｅｒｍｏｆｉｓｈｅｒ，ＵＳＡ）に従ってＴｒｉｚｏｌ試薬を使用して、全ＲＮＡをマウス脳組織から単離した。混入しているゲノムＤＮＡは、デオキシリボヌクレアーゼ処理（ＤＮＡフリー試薬、Ａｍｂｉｏｎ  ／  Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，  ＵＳＡ）で除去した。マウス（Ｆ：ＴＧＣＴＧＴＧＣＧＧＡＡＡＴＣＴＧＣＣ（配列番号７）、Ｒ：ＣＧＧＡＴＧＣＴＣＡＡＧＡＧＡＧＡＣＴＧＧ（配列番号８））ＳＣＮ２Ａターゲティングプライマーは、ゲノムＤＮＡとｃＤＮＡの増幅を区別するためにイントロンに及ぶように設計した。ＲＴ−ｑＰＣＲ用に、Ｍｕｒｉｎｅ  Ｍｏｌｏｎｅｙ  Ｌｅｕｋａｅｍｉａ  Ｖｉｒｕｓ  Ｒｅｖｅｒｓｅ  Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔａｓｅ  （Ｐｒｏｍｅｇａ，  ＵＳＡ）を使用してオリゴ−ｄＴ  プライム化ｃＤＮＡを５００ｎｇの全ＲＮＡから合成した。ＧｏＴａｑ  ｑＰＣＲマスターミックス（Ｐｒｏｍｅｇａ，  ＵＳＡ）を使用したＶｉｉＡ  ７  Ｒｅａｌ−Ｔｉｍｅ  ＰＣＲ  ＳｙｓｔｅｍでのＲＴ−ｑＰＣＲを、製造業者のプロトコルに従って行った。２ＤＤＣｔ法を使用して参照遺伝子ＲＰＬ３２に対して正規化することによって、相対的な遺伝子発現値を得た。
【０２７１】
新生仔脳室内注射
ＳＣＮ１Ａ  ＲＸの仔に、５μｇのマウスＳＣＮ２Ａアンチセンスオリゴヌクレオチド（ｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯ）または陰性対照である５０μｇのスクランブルＡＳＯを、生後（Ｐ）１日目に脳室内（ｉｃｖ）経路を介して投与した。仔を凍結麻酔し、次いでＡＳＯを装填した注射針（３２Ｇ，  Ｈａｍｉｌｔｏｎ）をラムダと右眼の中間に挿入した。注射深度は皮膚表面下２ｍｍで、合計２μｌのｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯを右室に投与した。
【０２７２】
発作の監視
ＳＣＮ１Ａ  ＲＸマウスをホームケージでグループ化して飼育し、Ｐ２１からＰ２８まで２４時間の映像監視下に置いた。映像を２人の実験者で検閲し、Ｒａｃｉｎｅスコア４を超える発作を記録した。群の平均の発作は、処置群当たりの発作の総数を処置群中のマウスの数で割ることによって算出した。
【０２７３】
脳波記録法（ＥＥＧ）
ＳＣＮ１Ａ  ＲＸマウス（Ｐ３０〜３５）を１〜３％のイソフルランで麻酔した。マウスを、頭蓋骨表面がラムダとブレグマの間で水平になるように定位固定装置（Ｋｏｐｆ）に入れた。４つの硬膜外電極を脳表面に配置し、適所に歯科用セメントで固定した。ＥＥＧ記録の前にマウスを４〜７日間回復させた。大脳皮質の活動を２４時間監視した（ＰｉｎｎａｃｌｅＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）。記録中、マウスは、ケージ内を自由に動くことができ、餌と水は自由に与えられた。
【０２７４】
結果
ＡＳＯ投与によるＳｃｎ２ａ  ｍＲＮＡの低減
ｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯ（５μｇ）またはスクランブルＡＳＯ（５０μｇ）を、Ｐ１にＳｃｎ１ａＲＸ仔の右室に注入した。Ｓｃｎ２ａのｍＲＮＡレベルは、ＡＳＯ投与の１４日後に評価した。予想通り、スクランブルＡＳＯは、Ｓｃｎ２ａ  ｍＲＮＡの発現に影響を与えなかった。ｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯで処置されたマウスから収集された脳は、Ｓｃｎ２ａ  ｍＲＮＡレベルの７８．１５±１．８７％の低減を示した（図２）。スクランブルＡＳＯで処置されたＳｃｎ１ａ  ＲＸマウスでは、Ｐ２１での生存率は７６．４７％であった。ｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯで処置されたＳｃｎ１ａ  ＲＸマウスでは、Ｐ２１までに死亡は観察されなかった（図３）。体重は、Ｐ２１及びＰ４５で、スクランブルＡＳＯ処置Ｓｃｎ１ａ  ＲＸマウスとｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯ処置Ｓｃｎ１ａ  ＲＸマウスで同様であった（図４Ａ〜４Ｂ）。実験エンドポイント（Ｐ４５）までに、生存率はスクランブルＡＳＯとｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯでそれぞれ２９．４１％及び９４．４４％であった。
【０２７５】
ＡＳＯはＳｃｎ１ａ  ＲＸマウスモデルの生存率及び発作表現型を向上させる
頻繁な発作は、ドラベ症候群の消耗性の特徴であり、よって発作エピソードは治療効力の極めて重要なマーカーである。Ｓｃｎ１ａ  ＲＸマウスを、それらの処置に応じてグループ化して飼育し、Ｐ２１からＰ２８まで２４時間の映像監視下に置いた（図５）。映像を検閲し、Ｒａｃｉｎｅ  スコア４を超える発作を記録した。自発性発作は、スクランブルＡＳＯで処置されたＳｃｎ１ａ  ＲＸマウスと比較して、５μｇのｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯによって有意に低減した。
【０２７６】
この試験からの結果によって、ドラベ症候群のマウスモデルにおけるｍＳｃｎ２ａ  ＡＳＯの顕著な治療効力が実証された。疾患マウスモデルの寿命が延び、自発性発作の表現型が有意に向上した。
【０２７７】
実施例３：ＳＣＮ２Ａ  ＡＳＯでのｉｎ  ｖｉｔｒｏでのＳＣＮ２Ａの翻訳の減少
ＳＣＮ２Ａを天然に発現するヒトＳＨ−ＳＹ５Ｙ細胞を、適切な細胞培養で維持し、培養する。ＳＨ−ＳＹ５Ｙ細胞は、ＳＣＮ２Ａ遺伝子を標的とする２０ｍｅｒのアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理する。ＲＮＡレベル及びタンパク質レベルは、別々の濃度応答及び時間経過実験で測定する。ＲＮＡレベルは、ノーザンブロッティング、ＲＴ−ＰＣＲ、及び／または定量的ＰＣＲ分析によって測定できる。タンパク質レベルは、ウエスタンブロッティング分析によって測定される。
【０２７８】
実施例４：ＳＣＮ２Ａ  ＡＳＯの投与によるドラベ症候群の治療
ドラベ症候群を有するヒト患者をＡＳＯ治療のために選択する。全体にホスホロチオエート結合を有し、すべての糖部分が２ＭＯＥ修飾された、ＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡを標的とする２０ｍｅｒのアンチセンスオリゴヌクレオチドを合成する。ＡＳＯは、ヒトへの投与に適合した適切な賦形剤に溶解させる。溶解したＡＳＯを含有する溶液を、ＡＳＯ溶液が罹患した神経細胞と相互作用するように、患者の神経細胞に注射する。ＡＳＯは神経細胞にトランスフェクトされ、標的細胞におけるＳＣＮ２Ａの翻訳を改変し、ＳＣＮ２Ａタンパク質を減少させる。ＳＣＮ２Ａタンパク質の減少を測定するために、定量的アッセイ（例えば、ウエスタンブロット）を行う。免疫組織化学的検査及び免疫金染色は、神経細胞におけるＳＣＮ２Ａの低減を直接視覚化するために使用する。患者は、ＡＳＯ治療の投与後、ドラベ症候群に関連する症状の低減を測定するために、広範囲にわたる定期的な検査を受ける。
【０２７９】
実施例５：ＳＣＮ２Ａ  ＡＳＯの投与によるドラベ症候群の予防
ドラベ症候群の遺伝子マーカーであるＳＣＮ１Ａ変異を有するヒト患者をＡＳＯ治療のために選択する。全体にホスホロチオエート結合を有し、すべての糖部分が２ＭＯＥ修飾された、ＳＣＮ２Ａ  ｍＲＮＡを標的とする２０ｍｅｒのアンチセンスオリゴヌクレオチドを合成する。ＡＳＯは、ヒトへの投与に適合した適切な賦形剤に溶解させる。溶解したＡＳＯを含有する溶液を、ＡＳＯ溶液が罹患した神経細胞と相互作用するように、患者の神経細胞に注射する。ＡＳＯは神経細胞にトランスフェクトされ、標的細胞におけるＳＣＮ２Ａの翻訳を改変し、ＳＣＮ２Ａタンパク質を減少させる。ＳＣＮ２Ａタンパク質の減少を測定するために、定量的アッセイ（例えば、ウエスタンブロット）を行う。免疫組織化学的検査及び免疫金染色は、神経細胞におけるＳＣＮ２Ａの低減を直接視覚化するために使用される。患者は、ＡＳＯ治療の投与後にドラベ症候群の発症に関連する症状の発症があるかどうかを観察するために、広範囲にわたる定期的な検査を受ける。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４−１】
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【図４−２】
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【図５】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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