(57)【要約】  本発明は、電位依存性ナトリウムチャネルＮａｖ１．７をエンコードするＳＣＮ９Ａなどの、電位依存性ナトリウムイオンチャネルをエンコードする核酸に相補的であるオリゴヌクレオチド（オリゴマー）に関する。本発明のオリゴヌクレオチドは、Ｎａｖ１．７などの電位依存性ナトリウムイオンチャネルの発現を阻害することができ、疼痛の予防または治療に有用である。【特許請求の範囲】
【請求項１】
１０〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドであって、配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補的を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、細胞内のＮａｖ１．７およびＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる発現を阻害することができ、前記連続ヌクレオチド配列が、ヒトＮａｖ１．７およびヒトＮａｖ１．８の両方の標的核酸に相補的である、オリゴヌクレオチド。
【請求項２】
前記連続ヌクレオチド配列が、以下からなる群から選択される配列番号１の領域に少なくとも９０％相補的、例えば１００％相補的である、請求項１に記載のオリゴヌクレオチド：
852  -  865 ;  2091  -  2104 ;  2620  -  2633 ;  2675  -  2692 ;  3441  -  3454 ;  3882  -  3921 ;  3970  -  3983 ;  4532  -  4553 ;  4814  -  4827 ;  5068  -  5082 ;  5167  -  5182 ;  5184  -  5198 ;  5430  -  5444 ;  5466  -  5502 ;  5511  -  5529 ;  5544  -  5585 ;  5610  -  5633 ;  5644  -  5662 ;  5695  -  5717 ;  6067  -  6085 ;  6087  -  6100 ;  6117  -  6130 ;  6859  -  6873 ;  6998  -  7019 ;  7033  -  7053 ;  7089  -  7121 ;  7131  -  7152 ;  7155  -  7184 ;  7206  -  7221 ;  7254  -  7271 ;  7273  -  7295 ;  7297  -  7315 ;  7381  -  7414 ;  7456  -  7475 ;  7478  -  7499 ;  7509  -  7522 ;  7618  -  7632 ;  8388  -  8401 ;  8508  -  8529 ;  8538  -  8562 ;  8596  -  8610 ;  8612  -  8638 ;  8655  -  8677 ;  8693  -  8715 ;  8944  -  8957 ;  9534  -  9547 ;  9914  -  9928 ;  10068  -  10081 ;  10252  -  10265 ;  10363  -  10376 ;  10402  -  10415 ;  10626  -  10640 ;  11437  -  11450 ;  11879  -  11901 ;  11981  -  11994 ;  12145  -  12158 ;  12980  -  12993 ;  13998  -  14011 ;  15098  -  15111 ;  15628  -  15642 ;  15749  -  15792 ;  15801  -  15821 ;  15847  -  15863 ;  15869  -  15911 ;  15931  -  15959 ;  15972  -  15985 ;  16019  -  16037 ;  16039  -  16052 ;  16740  -  16753 ;  17660  -  17676 ;  17696  -  17731 ;  17761  -  17774 ;  17800  -  17827 ;  17851  -  17871 ;  17878  -  17896 ;  17906  -  17967 ;  18825  -  18843 ;  19063  -  19080 ;  19821  -  19834 ;  19932  -  19983 ;  20024  -  20039 ;  20045  -  20062 ;  20090  -  20125 ;  20153  -  20183 ;  20196  -  20212 ;  20288  -  20301 ;  20416  -  20435 ;  20481  -  20494 ;  20715  -  20728 ;  20739  -  20756 ;  20808  -  20826 ;  20830  -  20843 ;  20847  -  20874 ;  20892  -  20905 ;  20932  -  20959 ;  21684  -  21697 ;  22764  -  22780 ;  22819  -  22836 ;  22856  -  22869 ;  22880  -  22907 ;  22979  -  22992 ;  23370  -  23383 ;  23917  -  23930 ;  25007  -  25020 ;  26048  -  26068 ;  26104  -  26160 ;  26170  -  26200 ;  26224  -  26238 ;  26270  -  26301 ;  26618  -  26635 ;  26843  -  26878 ;  26915  -  26932 ;  26945  -  26958 ;  26961  -  26978 ;  27013  -  27027 ;  27068  -  27085 ;  27218  -  27231 ;  27927  -  27941 ;  28777  -  28795 ;  29103  -  29116 ;  29389  -  29403 ;  29985  -  29998 ;  30360  -  30374 ;  30376  -  30390 ;  30768  -  30782 ;  32173  -  32206 ;  32237  -  32251 ;  32260  -  32274 ;  32334  -  32360 ;  32569  -  32583 ;  32597  -  32611 ;  32749  -  32763 ;  33254  -  33268 ;  33299  -  33314 ;  33492  -  33506 ;  34233  -  34247 ;  34360  -  34375 ;  34562  -  34576 ;  34689  -  34703 ;  35106  -  35135 ;  35142  -  35169 ;  35259  -  35275 ;  35280  -  35308 ;  35333  -  35346 ;  35382  -  35470 ;  35477  -  35490 ;  35494  -  35534 ;  35883  -  35896 ;  36784  -  36797 ;  37504  -  37518 ;  39690  -  39704 ;  40005  -  40018 ;  41020  -  41037 ;  41749  -  41762 ;  43000  -  43013 ;  43043  -  43061 ;  44274  -  44287 ;  44297  -  44312 ;  44707  -  44720 ;  45664  -  45677 ;  46383  -  46397 ;  46412  -  46439 ;  46690  -  46703 ;  47443  -  47456 ;  47692  -  47707 ;  48415  -  48429 ;  48575  -  48597 ;  48608  -  48628 ;  48637  -  48650 ;  48657  -  48672 ;  48712  -  48728 ;  48798  -  48811 ;  48826  -  48840 ;  51683  -  51720 ;  51734  -  51752 ;  51759  -  51776 ;  51795  -  51825 ;  51897  -  51910 ;  52031  -  52044 ;  53317  -  53332 ;  53975  -  53988 ;  54189  -  54210 ;
54303  -  54316 ;  54334  -  54347 ;  54425  -  54438 ;  54463  -  54492 ;  54557  -  54573 ;  54618  -  54639 ;  55625  -  55639 ;  55821  -  55834 ;  56023  -  56036 ;  56641  -  56655 ;  56689  -  56703 ;  57413  -  57427 ;  59206  -  59219 ;  59282  -  59313 ;  59328  -  59353 ;  59360  -  59382 ;  59384  -  59413 ;  59444  -  59461 ;  59505  -  59540 ;  59566  -  59580 ;  60084  -  60097 ;  60292  -  60305 ;  61606  -  61619 ;  62447  -  62460 ;  62763  -  62776 ;  63174  -  63187 ;  63859  -  63874 ;  64171  -  64184 ;  64462  -  64475 ;  64623  -  64671 ;  64800  -  64817 ;  64858  -  64873 ;  64875  -  64902 ;  64928  -  64949 ;  64959  -  64983 ;  64985  -  65003 ;  65044  -  65065 ;  65078  -  65113 ;  65115  -  65169 ;  65171  -  65186 ;  65188  -  65238 ;  65240  -  65294 ;  65323  -  65365 ;  65368  -  65438 ;  65448  -  65512 ;  65517  -  65611 ;  65619  -  65640 ;  65692  -  65712 ;  65714  -  65765 ;  65767  -  65840 ;  65842  -  65894 ;  65920  -  65973 ;  65985  -  66014 ;  66025  -  66042 ;  66074  -  66091 ;  66101  -  66120 ;  66156  -  66182 ;  66216  -  66232 ;  66266  -  66282 ;  66284  -  66301 ;  66324  -  66346 ;  66366  -  66382 ;  66406  -  66423 ;  66440  -  66469 ;  66480  -  66495 ;  67055  -  67089 ;  67091  -  67113 ;  67128  -  67170 ;  67186  -  67202 ;  67231  -  67256 ;  67258  -  67294 ;  67310  -  67333 ;  67336  -  67351 ;  67597  -  67616 ;  67754  -  67768 ;  67862  -  67875 ;  68793  -  68806 ;  69042  -  69055 ;  69686  -  69699 ;  70176  -  70193 ;  70622  -  70635 ;  70756  -  70769 ;  71228  -  71241 ;  71564  -  71577 ;  71926  -  71941 ;  73372  -  73386 ;  74239  -  74252 ;  74809  -  74822 ;  74848  -  74880 ;  74890  -  74941 ;  74963  -  74993 ;  75005  -  75027 ;  75037  -  75066 ;  75075  -  75092 ;  76262  -  76276 ;  76615  -  76628 ;  76940  -  76953 ;  77233  -  77246 ;  78634  -  78647 ;  78772  -  78825 ;  78867  -  78888 ;  78890  -  78909 ;  78914  -  78940 ;  78955  -  78986 ;  78989  -  79024 ;  79026  -  79039 ;  79041  -  79056 ;  79058  -  79075 ;  80011  -  80024 ;  80858  -  80871 ;  81031  -  81044 ;  81088  -  81101 ;  81166  -  81179 ;  82854  -  82868 ;  83250  -  83263 ;  83621  -  83636 ;  83781  -  83796 ;  83848  -  83861 ;  83867  -  83885 ;  83887  -  83921 ;  83927  -  83950 ;  83986  -  84001 ;  84015  -  84040 ;  84060  -  84073 ;  84075  -  84097 ;  84168  -  84183 ;  84302  -  84319 ;  84335  -  84348 ;  84368  -  84390 ;  84419  -  84453 ;  84480  -  84501 ;  84503  -  84518 ;  84534  -  84547 ;  84549  -  84567 ;  84569  -  84583 ;  84653  -  84667 ;  84693  -  84708 ;  84740  -  84771 ;  84776  -  84795 ;  84824  -  84839 ;  84855  -  84873 ;  84878  -  84894 ;  84896  -  84911 ;  85017  -  85038 ;  85059  -  85076 ;  85079  -  85102 ;  85113  -  85126 ;  85147  -  85194 ;  85252  -  85267 ;  85281  -  85294 ;  85359  -  85378 ;  85470  -  85486 ;  85668  -  85682 ;  85713  -  85734 ;  85771  -  85793 ;  85825  -  85838 ;  85842  -  85873 ;  85876  -  85902 ;  86132  -  86151 ;  86303  -  86316 ;  86438  -  86468 ;  86489  -  86522 ;  86524  -  86548 ;  86554  -  86570 ;  86575  -  86588 ;  86603  -  86618 ;  86636  -  86651 ;  86676  -  86689 ;  86717  -  86741 ;  86776  -  86803 ;  86965  -  86978 ;  87641  -  87654 ;  87707  -  87720 ;  87826  -  87839 ;  87845  -  87858 ;  87879  -  87910 ;  88019  -  88059 ;  88602  -  88616 ;  89155  -  89168 ;  89484  -  89497 ;  89866  -  89879 ;  90038  -  90051 ;  92157  -  92170 ;  92940  -  92953 ;  93333  -  93348 ;  93404  -  93418 ;  93488  -  93511 ;  94835  -  94851 ;  96790  -  96805 ;  98015  -  98029 ;  98877  -  98892 ;  98918  -  98931 ;  100403  -  100426 ;  100436  -  100456 ;  100462  -  100475 ;  100492  -  100534 ;  100562  -  100588 ;  100607  -  100627 ;  100653  -  100667 ;  100671  -  100685 ;  102125  -  102138 ;  102391  -  102404 ;  102992  -  103005 ;  104110  -  104128 ;  104153  -  104171 ;  104224  -  104243 ;  104336  -  104349 ;  105025  -  105038 ;  105219  -  105240 ;  105260  -  105273 ;  105287  -  105300 ;  105321  -  105336 ;  105353  -  105367 ;  105417  -  105431 ;  105462  -  105478 ;  105777  -  105793 ;  106242  -  106256 ;  107381  -  107403 ;  107554  -  107567 ;  107801  -  107814 ;  108248  -  108261 ;  108503  -  108517 ;  108882  -  108899 ;  108928  -  108944 ;  109070  -  109086 ;  109294  -  109307 ;  109411  -  109427 ;  109935  -  109950 ;  110122  -  110145 ;  110196  -  110210 ;  110366  -  110379 ;  110512  -  110525 ;  110563  -  110576 ;  110690  -  110705 ;  111068  -  111083 ;  111506  -  111520 ;  111626  -  111639 ;  111974  -  111987 ;  112693  -  112706 ;  112899  -  112912 ;  113806  -  113819 ;  114115  -  114128 ;  115700  -  115713 ;  116267  -  116280 ;  116833  -  116846 ;  117447  -  117461 ;  117562  -  117575 ;  117932  -  117945 ;  118556  -  118569 ;  118652  -  118665 ;  119346  -  119359 ;  120785  -  120798 ;  120858  -  120890 ;  120974  -  120988 ;  122466  -  122479 ;  123217  -  123231 ;  123785  -  123798 ;  124982  -  124997 ;  125621  -  125634 ;  126633  -  126646 ;  127044  -  127057 ;  127066  -  127090 ;  127108  -  127130 ;  127196  -  127211 ;  127244  -  127265 ;  127269  -  127296 ;  127322  -  127335 ;  128260  -  128275 ;  128300  -  128318 ;  128339  -  128360 ;  128363  -  128381 ;  128394  -  128422 ;  128425  -  128444 ;  128822  -  128848 ;  130000  -  130013 ;  131029  -  131042 ;  131184  -  131197 ;  131926  -  131939 ;  133001  -  133014 ;  133472  -  133493 ;  134969  -  134982 ;  135682  -  135697 ;  136759  -  136791 ;  136794  -  136829 ;  136858  -  136871 ;  137867  -  137883 ;  138425  -  138438 ;  138521  -  138534 ;  138969  -  138983 ;  139291  -  139320 ;  139337  -  139422 ;  139436  -  139471 ;  139515  -  139544 ;  139550  -  139581 ;  140314  -  140327 ;  140582  -  140596 ;  141239  -  141252 ;  142647  -  142660 ;  142816  -  142829 ;  143236  -  143274 ;  144208  -  144246 ;  144250  -  144275 ;  144308  -  144322 ;  144326  -  144340 ;
144348  -  144387 ;  144393  -  144415 ;  144431  -  144454 ;  145603  -  145618 ;  146615  -  146628 ;  147007  -  147020 ;  147063  -  147076 ;  147108  -  147121 ;  147267  -  147280 ;  147455  -  147468 ;  147480  -  147531 ;  147545  -  147597 ;  147601  -  147615 ;  147618  -  147641 ;  147644  -  147668 ;  147679  -  147706 ;  147708  -  147755 ;  147972  -  147998 ;  148303  -  148316 ;  149483  -  149496 ;  150121  -  150136 ;  151760  -  151773 ;  152089  -  152102 ;  152533  -  152546 ;  152616  -  152630 ;  152825  -  152838 ;  152956  -  152972 ;  153029  -  153059 ;  153061  -  153076 ;  153093  -  153114 ;  153125  -  153177 ;  153181  -  153198 ;  153211  -  153253 ;  153255  -  153289 ;  153301  -  153341 ;  153359  -  153376 ;  153381  -  153395 ;  153398  -  153417 ;  153421  -  153442 ;  153461  -  153476 ;  153483  -  153504 ;  153507  -  153532 ;  153577  -  153596 ;  153603  -  153627 ;  153629  -  153643 ;  153805  -  153819 ;  154379  -  154401 ;  154483  -  154501 ;  154535  -  154552 ;  154586  -  154602 ;  154823  -  154840 ;  154918  -  154931 ;  156311  -  156324 ;  156466  -  156484 ;  156521  -  156535 ;  156576  -  156590 ;  156614  -  156629 ;  156654  -  156678 ;  156707  -  156721 ;  156723  -  156753 ;  156777  -  156798 ;  156833  -  156849 ;  156871  -  156885 ;  156984  -  157019 ;  157078  -  157111 ;  157154  -  157170 ;  157192  -  157217 ;  157236  -  157289 ;  157293  -  157307 ;  157338  -  157375 ;  157412  -  157426 ;  157430  -  157443 ;  157561  -  157588 ;  157593  -  157619 ;  157628  -  157655 ;  157673  -  157739 ;  158005  -  158018 ;  158258  -  158278 ;  158422  -  158435 ;  158522  -  158545 ;  158694  -  158708 ;  159274  -  159292 ;  159346  -  159360 ;  159590  -  159603 ;  159859  -  159872 ;  159968  -  159981 ;  160208  -  160223 ;  160251  -  160267 ;  161102  -  161115 ;  161187  -  161332 ;  161337  -  161386 ;  161388  -  161502 ;  161618  -  161631 ;  162043  -  162056 ;  162561  -  162575 ;  163052  -  163065 ;  163084  -  163097 ;  164109  -  164123 ;  164923  -  164938 ;  164958  -  164980 ;  165017  -  165032 ;  165034  -  165047 ;  165049  -  165063 ;  165065  -  165079 ;  165134  -  165149 ;  165185  -  165224 ;  165467  -  165483 ;  165516  -  165529 ;  165587  -  165604 ;  165608  -  165621 ;  165644  -  165665 ;  165697  -  165718 ;  165720  -  165748 ;  165750  -  165774 ;  165777  -  165836 ;  165838  -  165852 ;  165862  -  165946 ;  165948  -  165980 ;  166005  -  166050 ;  166060  -  166102 ;  166122  -  166160 ;  166163  -  166218 ;  166220  -  166239 ;  166254  -  166307 ;  166312  -  166359 ;  166366  -  166391 ;  166508  -  166522 ;  167252  -  167265 ;  167319  -  167332 ;  168224  -  168237 ;  168272  -  168313 ;  168334  -  168348 ;  168356  -  168394 ;  168416  -  168447 ;  168477  -  168491 ;  168503  -  168519 ;  168541  -  168579 ;  169037  -  169052 ;  169342  -  169366 ;  169376  -  169400 ;  169411  -  169424 ;  169435  -  169460 ;  169496  -  169517 ;  169519  -  169540 ;  169555  -  169573 ;  169600  -  169629 ;  169631  -  169653 ;  169655  -  169695 ;  169697  -  169722 ;  169729  -  169782 ;  169791  -  169807 ;  169831  -  169847 ;  169850  -  169883 ;  169898  -  169925 ;  169937  -  169954 ;  169959  -  169980 ;  169982  -  170005 ;  170007  -  170021 ;  170036  -  170058 ;  170069  -  170097 ;  170105  -  170136 ;  170138  -  170232 ;  170247  -  170309 ;  170311  -  170347 ;  170350  -  170385 ;  170395  -  170418 ;  170434  -  170466 ;  170469  -  170483 ;  170485  -  170503 ;  170509  -  170532 ;  170534  -  170562 ;  170568  -  170585 ;  170624  -  170641 ;  170654  -  170675 ;  170685  -  170709 ;  170712  -  170731 ;  170745  -  170758 ;  170778  -  170791 ;  170859  -  170892 ;  170948  -  170969 ;  171019  -  171059 ;  171070  -  171086 ;  171090  -  171123 ;  171465  -  171478 ;  171526  -  171539 ;  171571  -  171584 ;  171645  -  171660 ;  172651  -  172670 ;  172985  -  172999 ;  173795  -  173808 ;  174279  -  174304 ;  174323  -  174355 ;  175105  -  175123 ;  175143  -  175166 ;  175221  -  175241 ;  175350  -  175364 ;  175493  -  175506 ;  175707  -  175793 ;  175804  -  175849 ;  175854  -  175941 ;  175944  -  176027 ;  176245  -  176258 ;  176323  -  176337 ;  176620  -  176636 ;  176719  -  176732 ;  179965  -  179994 ;  180044  -  180060 ;  180072  -  180104 ;  180136  -  180149 ;  180208  -  180225 ;  180266  -  180280 ;  and 180634  -  180647。
【請求項３】
配列番号５１２、５１３、５１４、５１５、５１６、５１７、５１８、５１９、５２０、５２１、５２２、５２３、５２４、５２５、５５７、５５８、５５９、５６０、５７７、５７９、５８３、６３８、および５８７からなる群から選択される配列に存在する、少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオシドを含む、請求項１または２のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項４】
前記連続ヌクレオチド配列中の１つ以上のヌクレオシドが、２’糖修飾ヌクレオシドである、請求項１〜３のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項５】
前記１つ以上の２’糖修飾ヌクレオシドが、２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メチル−ＲＮＡ、２’−アルコキシ−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メトキシエチル−ＲＮＡ、２’−アミノ−ＤＮＡ、２’−フルオロ−ＤＮＡ、アラビノ核酸（ＡＮＡ）、２’−フルオロ−ＡＮＡおよびＬＮＡヌクレオシドからなる群から独立して選択される、請求項３に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項６】
前記オリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列が、１つ以上のＬＮＡヌクレオシドを含む、請求項１〜４のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項７】
前記連続ヌクレオチド配列中の少なくとも１つのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項１〜５のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項８】
ｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡなどのＲＮＡｉ薬であるか、またはその一部を形成する、請求項１〜６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項９】
アンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項１〜６のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
【請求項１０】
前記連続ヌクレオチド配列内のすべてのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項９に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項１１】
前記オリゴヌクレオチドが、ヒトＲＮａｓｅＨ１などのＲＮａｓｅＨを動員することができる、請求項９または１０に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項１２】
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列が、式５’−ＦＧ−Ｆ’−３’のギャップマーなどのギャップマーからなるか、またはそれを含み、式中、領域Ｇが、ＲＮａｓｅＨを動員することができるヌクレオチドの連続配列を含む領域であり、領域ＦおよびＦ’が、それぞれ少なくとも１つの２’糖修飾ヌクレオシドを含む、請求項９〜１１のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項１３】
領域Ｇが、６〜１６のＤＮＡヌクレオシドを含み、領域ＦおよびＦ’の少なくとも１つが、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドを含むか、または領域ＦおよびＦ’の両方が、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドを含む、請求項１２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【請求項１４】
以下のＣＭＰ  ＩＤからなる群から選択されるアンチセンスオリゴヌクレオチド：
50_1 ; 51_1 ; 52_1 ; 53_1 ; 54_1 ; 55_1 ; 56_1 ; 57_1 ; 58_1 ; 59_1 ; 60_1 ; 61_1 ; 62_1 ; 63_1 ; 64_1 ; 65_1 ; 66_1 ; 67_1 ; 68_1 ; 69_1 ; 70_1 ; 71_1 ; 72_1 ; 73_1 ; 74_1 ; 75_1 ; 76_1 ; 77_1 ; 78_1 ; 79_1 ; 80_1 ; 81_1 ; 82_1 ; 83_1 ; 84_1 ; 85_1 ; 86_1 ; 87_1 ; 88_1 ; 89_1 ; 90_1 ; 91_1 ; 92_1 ; 93_1 ; 94_1 ; 95_1 ; 96_1 ; 97_1 ; 98_1 ; 99_1 ; 100_1 ; 101_1 ; 102_1 ; 103_1 ; 104_1 ; 105_1 ; 106_1 ; 107_1 ; 108_1 ; 109_1 ; 110_1 ; 111_1 ; 112_1 ; 113_1 ; 114_1 ; 115_1 ; 116_1 ; 117_1 ; 118_1 ; 119_1 ; 120_1 ; 121_1 ; 122_1 ; 123_1 ; 124_1 ; 125_1 ; 126_1 ; 127_1 ; 128_1 ; 129_1 ; 130_1 ; 131_1 ; 132_1 ; 133_1 ; 134_1 ; 135_1 ; 136_1 ; 137_1 ; 138_1 ; 139_1 ; 140_1 ; 141_1 ; 142_1 ; 143_1 ; 144_1 ; 145_1 ; 146_1 ; 147_1 ; 148_1 ; 149_1 ; 150_1 ; 151_1 ; 152_1 ; 153_1 ; 154_1 ; 155_1 ; 156_1 ; 157_1 ; 158_1 ; 159_1 ; 160_1 ; 161_1 ; 162_1 ; 163_1 ; 164_1 ; 165_1 ; 166_1 ; 167_1 ; 168_1 ; 169_1 ; 170_1 ; 171_1 ; 172_1 ; 173_1 ; 174_1 ; 175_1 ; 176_1 ; 177_1 ; 178_1 ; 179_1 ; 180_1 ; 181_1 ; 182_1 ; 183_1 ; 184_1 ; 185_1 ; 186_1 ; 187_1 ; 188_1 ; 189_1 ; 190_1 ; 191_1 ; 192_1 ; 193_1 ; 194_1 ; 195_1 ; 196_1 ; 197_1 ; 198_1 ; 199_1 ; 200_1 ; 201_1 ; 202_1 ; 203_1 ; 204_1 ; 205_1 ; 206_1 ; 207_1 ; 208_1 ; 209_1 ; 210_1 ; 211_1 ; 212_1 ; 213_1 ; 214_1 ; 215_1 ; 216_1 ; 217_1 ; 218_1 ; 219_1 ; 220_1 ; 221_1 ; 222_1 ; 223_1 ; 224_1 ; 225_1 ; 226_1 ; 227_1 ; 228_1 ; 229_1 ; 230_1 ; 231_1 ; 232_1 ; 233_1 ; 234_1 ; 235_1 ; 236_1 ; 237_1 ; 238_1 ; 239_1 ; 240_1 ; 241_1 ; 242_1 ; 243_1 ; 244_1 ; 245_1 ; 246_1 ; 247_1 ; 248_1 ; 249_1 ; 250_1 ; 251_1 ; 252_1 ; 253_1 ; 254_1 ; 255_1 ; 256_1 ; 257_1 ; 258_1 ; 259_1 ; 260_1 ; 261_1 ; 262_1 ; 263_1 ; 264_1 ; 265_1 ; 266_1 ; 267_1 ; 268_1 ; 269_1 ; 270_1 ; 271_1 ; 272_1 ; 273_1 ; 274_1 ; 275_1 ; 276_1 ; 277_1 ; 278_1 ; 279_1 ; 280_1 ; 281_1 ; 282_1 ; 283_1 ; 284_1 ; 285_1 ; 286_1 ; 287_1 ; 288_1 ; 289_1 ; 290_1 ; 291_1 ; 292_1 ; 293_1 ; 294_1 ; 295_1 ; 296_1 ; 297_1 ; 298_1 ; 299_1 ; 300_1 ; 301_1 ; 302_1 ; 303_1 ; 304_1 ; 305_1 ; 306_1 ; 307_1 ; 308_1 ; 309_1 ; 310_1 ; 311_1 ; 312_1 ; 313_1 ; 314_1 ; 315_1 ; 316_1 ; 317_1 ; 318_1 ; 319_1 ; 320_1 ; 321_1 ; 322_1 ; 323_1 ; 324_1 ; 325_1 ; 326_1 ; 327_1 ; 328_1 ; 329_1 ; 330_1 ; 331_1 ; 332_1 ; 333_1 ; 334_1 ; 335_1 ; 336_1 ; 337_1 ; 338_1 ; 339_1 ; 340_1 ; 341_1 ; 342_1 ; 343_1 ; 344_1 ; 345_1 ; 346_1 ; 347_1 ; 348_1 ; 349_1 ; 350_1 ; 351_1 ; 352_1 ; 353_1 ; 354_1 ; 355_1 ; 356_1 ; 357_1 ; 358_1 ; 359_1 ; 360_1 ; 361_1 ; 362_1 ; 363_1 ; 364_1 ; 365_1 ; 366_1 ; 367_1 ; 368_1 ; 369_1 ; 370_1 ; 371_1 ; 372_1 ; 373_1 ; 374_1 ; 375_1 ; 376_1 ; 377_1 ; 378_1 ; 379_1 ; 380_1 ; 381_1 ; 382_1 ; 383_1 ; 384_1 ; 385_1 ; 386_1 ; 387_1 ; 388_1 ; 389_1 ; 390_1 ; 391_1 ; 392_1 ; 393_1 ; 394_1 ; 395_1 ; 396_1 ; 397_1 ; 398_1 ; 399_1 ; 400_1 ; 401_1 ; 402_1 ; 403_1 ; 404_1 ; 405_1 ; 406_1 ; 407_1 ; 408_1 ; 409_1 ; 410_1 ; 411_1 ; 412_1 ; 413_1 ; 414_1 ; 415_1 ; 416_1 ; 417_1 ; 418_1 ; 419_1 ; 420_1 ; 421_1 ; 422_1 ; 423_1 ; 424_1 ; 425_1 ; 426_1 ; 427_1 ; 428_1 ; 429_1 ; 430_1 ; 431_1 ; 432_1 ; 433_1 ; 434_1 ; 435_1 ; 436_1 ; 437_1 ; 438_1 ; 439_1 ; 440_1 ; 441_1 ; 442_1 ; 443_1 ; 444_1 ; 445_1 ; 446_1 ; 447_1 ; 448_1 ; 449_1 ; 450_1 ; 451_1 ; 452_1 ; 453_1 ; 454_1 ; 455_1 ; 456_1 ; 457_1 ; 458_1 ; 459_1 ; 460_1 ; 461_1 ; 462_1 ; 463_1 ; 464_1 ; 465_1 ; 466_1 ; 467_1 ; 468_1 ; 469_1 ; 470_1 ; 471_1 ; 472_1 ; 473_1 ; 474_1 ; 475_1 ; 476_1 ; 477_1 ; 478_1 ; 479_1 ; 480_1 ; 481_1 ; 482_1 ; 483_1 ; 484_1 ; 485_1 ; 486_1 ; 487_1 ; 488_1 ; 489_1 ; 490_1 ; 491_1 ; 492_1 ; 493_1 ; 494_1 ; 495_1 ; 496_1 ; 497_1 ; 498_1 ; 499_1 ; 500_1 ; 501_1 ; 502_1 ; 503_1 ; 504_1 ; 505_1 ; 506_1 ; 507_1 ; 508_1 ; 509_1 ; 510_1 ; 511_1 ; 512_1 ; 512_2 ; 512_3 ; 513_1 ; 513_2 ; 513_3 ; 513_4 ; 514_1 ; 514_2 ; 514_3 ; 514_4 ; 515_1 ; 515_2 ; 515_3 ; 515_4 ; 515_5 ; 515_6 ; 516_1 ; 516_2 ; 516_3 ; 516_4 ; 516_5 ; 516_6 ; 516_7 ; 517_1 ; 517_2 ; 517_3 ; 517_4 ; 517_5 ; 517_6 ; 517_7 ; 517_8 ; 518_1 ; 518_2 ; 518_3 ; 518_4 ; 518_5 ; 518_6 ; 519_1 ; 519_2 ; 519_3 ; 519_4 ; 519_5 ; 519_6 ; 520_1 ; 520_2 ; 520_3 ; 520_4 ; 520_5 ; 521_1 ; 521_2 ; 521_3 ; 521_4 ; 521_5 ; 522_1 ; 522_2 ; 522_3 ; 522_4 ; 523_1 ; 523_2 ; 523_3 ; 523_4 ; 523_5 ; 524_1 ; 525_1 ; 526_1 ; 527_1 ; 528_1 ; 529_1 ; 530_1 ; 531_1 ; 532_1 ; 533_1 ; 534_1 ; 535_1 ; 536_1 ; 537_1 ; 538_1 ; 539_1 ; 540_1 ; 541_1 ; 542_1 ; 543_1 ; 544_1 ; 545_1 ; 546_1 ; 547_1 ; 548_1 ; 549_1 ; 550_1 ; 551_1 ; 552_1 ; 553_1 ; 554_1 ; 555_1 ; 556_1 ; 557_1 ; 558_1 ; 559_1 ; 560_1 ; 561_1 ; 562_1 ; 563_1 ; 564_1 ; 565_1 ; 566_1 ; 567_1 ; 568_1 ; 569_1 ; 570_1 ; 571_1 ; 572_1 ; 573_1 ; 574_1 ; 575_1 ; 576_1 ; 577_1 ; 578_1 ; 579_1 ; 580_1 ; 581_1 ; 582_1 ; 583_1 ; 584_1 ; 585_1 ; 586_1 ; 587_1 ; 588_1 ; 589_1 ; 590_1 ; 591_1 ; 592_1 ; 593_1 ; 594_1 ; 595_1 ; 596_1 ; 597_1 ; 598_1 ; 599_1 ; 600_1 ; 601_1 ; 602_1 ; 603_1 ; 604_1 ; 605_1 ; 606_1 ; 607_1 ; 608_1 ; 609_1 ; 610_1 ; 611_1 ; 612_1 ; 613_1 ; 614_1 ; 615_1 ; 616_1 ; 617_1 ; 618_1 ; 619_1 ; 620_1 ; 621_1 ; 622_1 ; 623_1 ; 624_1 ; 625_1 ; 626_1 ; 627_1 ; 628_1 ; 629_1 ; 630_1 ; 631_1 ; 632_1 ; 633_1 ; 634_1 ; 635_1 ; 636_1 ; 637_1 ; 638_1 ; 639_1 ; 640_1; 641_1; 642_1, 643_1, 644_1, 645_1, 646_1, 647_1, 648_1, 649_1 and 650_1。
【請求項１５】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドと、前記オリゴヌクレオチドに共有結合している少なくとも１つのコンジュゲート部分とを含むコンジュゲート。
【請求項１６】
請求項１〜１４のいずれか一項に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド、または請求項１５に記載のコンジュゲートの薬学的に許容される塩。
【請求項１７】
１〜１４のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたは請求項１５のコンジュゲートまたは請求項１６の塩、ならびに薬学的に許容される希釈剤、溶媒、担体、塩および／またはアジュバントを含む医薬組成物。
【請求項１８】
ＳＣＮ９Ａを発現している標的細胞におけるＳＣＮ９Ａ発現を調節するためのインビボ、またはインビトロ方法であって、請求項１〜１４のいずれか一項のオリゴヌクレオチド、または請求項１５のコンジュゲート、または請求項１６もしくは１７の医薬塩もしくは組成物を有効量で前記細胞に投与することを含む方法。
【請求項１９】
ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａを発現している標的細胞においてＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａの発現を阻害するための、請求項１８に記載の方法であって、請求項１〜１４のいずれか一項のアンチセンスオリゴヌクレオチド、または請求項１５のコンジュゲート、または請求項１６もしくは１７の医薬塩もしくは組成物を有効量で前記細胞に投与することを含む方法。
【請求項２０】
疼痛を患っている、または罹患する可能性があるヒトなどの対象の疼痛を治療または予防するための方法であって、治療的または予防的に有効な量の請求項１〜１４のいずれか一項のアンチセンスオリゴヌクレオチド、または請求項１５のコンジュゲート、または請求項１６もしくは１７の医薬塩もしくは組成物を、前記疼痛を予防または緩和するように投与することを含む方法。
【請求項２１】
前記疼痛が、
ｉ）慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛もしくは侵害受容性疼痛、または
ｉｉ）糖尿病性神経障害、癌、脳神経痛、帯状疱疹後神経痛および術後神経痛からなる群から選択される障害によって引き起こされる、もしくはそれに関連する疼痛、または
ｉｉｉ）遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）もしくは発作性激痛症（ＰＥＰＤ）もしくは三叉神経痛によって引き起こされる、もしくはそれに関連する疼痛、または
ｉｖ）神経障害による疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性疼痛の一般的な治療（例えば、神経の減圧）、もしくは神経障害性疼痛（例えば、糖尿病性神経障害）、内臓痛、もしくは混合性疼痛のいずれである、請求項２０の方法。
【請求項２２】
医療薬で使用するための、請求項１〜１４のいずれか一項のオリゴヌクレオチド、または請求項１５に記載のコンジュゲート、または請求項１６もしくは１７の医薬塩もしくは組成物。
【請求項２３】
請求項２１のパートｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、またはｉｖ）によって定義された疼痛などの疼痛の治療または予防または緩和に使用するための、請求項１〜１４のいずれか一項のオリゴヌクレオチド、または請求項１５に記載のコンジュゲート、または請求項１６もしくは１７の医薬塩もしくは組成物。
【請求項２４】
請求項２１のパートｉ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）、またはｉｖ）によって定義された疼痛などの疼痛の治療または予防または緩和用の薬剤を調製するための、請求項１〜１４のいずれか一項のオリゴヌクレオチド、または請求項１５に記載のコンジュゲート、または請求項１６もしくは１７の医薬塩もしくは組成物の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、電位依存性ナトリウムチャネルＮａｖ１．７をエンコードする、ＳＣＮ９Ａなどの、電位依存性ナトリウムイオンチャネルをエンコードする核酸に相補的であるオリゴヌクレオチド（オリゴマー）に関する。本発明のオリゴヌクレオチドは、Ｎａｖ１．７などの電位依存性ナトリウムイオンチャネルの発現を阻害することができ、疼痛の予防または治療に有用である。
【背景技術】
【０００２】
電位依存性ナトリウムチャネル（Ｎａｖ）は、興奮性組織で重要な役割を果たし、それらの活性化および開放が、活動電位の初期段階をもたらす。開放、閉鎖、および不活性化状態を経るＮａｖのサイクル、ならびに他のイオンチャネルの活動との厳密に振り付けられた関係は、細胞内イオン濃度の絶妙な制御につながる。
【０００３】
Ｎａｖ１．７は、関係する電位活性化イオンチャネルであり、ほぼ小細胞末梢感覚神経だけに発現する。感覚ニューロンにＮａｖ１．７の条件付きノックアウトを含むマウスは、抗侵害受容性表現型を示した（Ｎａｓｓａｒ  ｅｔ  ａｌ．、２００４、Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ．２００４  Ａｕｇ  ２４；１０１（３４）：１２７０６−１１）。ヒトの疼痛感覚におけるＮａｖ１．７の役割は、自発性疼痛症候群である遺伝性肢端紅痛症（ＩＥＭ）（Ｙａｎｇ  ｅｔ  ａｌ．、Ｊ  Ｍｅｄ  Ｇｅｎｅｔ．２００４；４１（３）：１７１−４）と、発作性激痛症（ＰＥＰＤ）（Ｆｅｒｔｌｅｍａｎ  ｅｔ  ａｌ．、Ｊ  Ｎｅｕｒｏｌ  Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ  Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ．２００６  Ｎｏｖ；７７（１１）：１２９４−５）と、これらの患者のＮａｖ１．７の機能獲得型変異（Ｃｕｍｍｉｎｓ  ｅｔ  ａｌ．、Ｊ  Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．２００４；２４（３８）：８２３２−８２３６）との関係によって証明された。Ｎａｖ１．７へのさらなる裏付けは、先天性無痛症を引き起こす機能喪失型変異の特定によって生じた（Ｃｏｘ  ｅｔ  ａｌ．、Ｎａｔｕｒｅ  ＡＡＡ．２００６；７１２１：８９４−８）。これらの発見により、Ｎａｖ１．７モジュレーターを特定するための多くの小分子創薬プログラムが始まったが、高い選択性および優れたＰＫ／ＰＤ特性を備える優れた化合物の発見は困難であるように見える。
【０００４】
米国特許出願公開第２０１６０２４２０８号は、Ｎａｖ１．７に対するヒト抗体を開示している。
【０００５】
国際公開第０２０８３９４５号は、乳癌の治療に使用するための、ＳＣＮ５Ａ、および場合によりＳＣＮ９Ａの特定の領域に対するアンチセンス配列を有する合成オリゴヌクレオチドに言及している。
【０００６】
米国特許出願公開第２００７／２１２６８５号は、鎮痛剤を特定する方法に言及し、ＳＣＮ９Ａの細胞中の遺伝子発現または遺伝子転写物レベルを調節する特定の化合物が、アンチセンス核酸を含むことに言及している。
【０００７】
米国特許出願公開第２０１０２７３８５７Ａ号は、Ｎａｖ１．７チャネルをエンコードする、そうでなければＮａｖ１．７チャネルの機能を阻害するアミノ酸配列の発現を抑制するｓｉＲＮＡ分子の局所投与による疼痛治療に使用される方法、配列、および核酸分子に言及し、Ｎａｖ１．７チャネルレベルおよび／または機能の局所抑制は、後根神経節の末梢感覚ニューロンで発生することを報告している。
【０００８】
国際公開第１２１６２７３２号は、ナトリウムチャネル、具体的には電位依存性ナトリウムチャネルを調節するための新規のスクリーニングアッセイに関する。
【０００９】
韓国特許出願公開第２０１１００８７４３６号は、ＳＣＮ９Ａアンチセンスオリゴヌクレオチドを開示している。
【００１０】
Ｍｏｈａｎ  ｅｔ  ａｌ．、Ｐａｉｎ（２０１８）Ｖｏｌｕｍｅ  １５９・Ｎｕｍｂｅｒ  １、ｐ１３９  −  １４９は、Ｎａｖ１．７を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを開示し、脊髄および後根神経節（ＤＲＧ）におけるＡＳＯの薬力学的活性を特徴付ける。
【００１１】
国際公開第１８０５１１７５号は、ヒトＳＣＮ９Ａ  ｐｒｅ−ｍＲＮＡの一部を標的とするＳＣＮ９Ａアンチセンスペプチド核酸オリゴヌクレオチドを開示している。ペプチド核酸誘導体は、細胞内でＳＣＮ９Ａ  ｍＲＮＡのスプライスバリアントを強力に誘導し、Ｎａｖ１．７活性が関与する疼痛または状態を安全に治療するのに役立つ。
【００１２】
したがって、疼痛の予防または治療などのために、ヒトのＳＣＮ９Ａなど、核酸をエンコードする電位依存性ナトリウムイオンチャネルの発現の阻害に有効な、アンチセンスオリゴヌクレオチド治療薬が必要とされている。
【００１３】
発明の目的
本発明は、Ｎａｖ１．７を発現している細胞においてＮａｖ１．７の発現を阻害することができるＳＣＮ９Ａを標的とする、ＬＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドを提供する。本発明はさらに、Ｎａｖ１．８を発現している細胞におけるＮａｖ１．８の発現を阻害するＳＣＮ１０Ａを標的とする、オリゴヌクレオチドを提供する。いくつかの態様では、本発明は、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ核酸標的の両方を標的とするオリゴヌクレオチドを提供する。本発明のオリゴヌクレオチドは、疼痛の予防または治療に使用することができる。本発明は、アンチセンスオリゴヌクレオチドなどのヒトＮａｖ１．７のオリゴヌクレオチド阻害剤、またはｓｉＲＮＡもしくはｓｈＲＮＡなどのＲＮＡｉ薬によって標的化され得るヒトＮａｖ１．７  ｐｒｅ−ｍＲＮＡ上の有利な標的部位配列をさらに提供する。
【発明の概要】
【００１４】
本発明は、ＳＣＮ９ＡまたはＳＣＮ１０Ａなど、核酸をエンコードする電位依存性ナトリウムイオンチャネルをエンコードする核酸、またはいくつかの実施形態では、ＳＣＮ９Ａ（Ｎａｖ１．７核酸標的）およびＳＣＮ１０Ａ（Ｎａｖ１．８核酸標的）の両方を標的とするオリゴヌクレオチドに関する。
【００１５】
本発明のオリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり得る。
【００１６】
本発明のオリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ９ＡまたはＳＣＮ１０Ａなどの標的核酸の発現を阻害することができるか、またはいくつかの実施形態では、前記標的核酸を発現している細胞において、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａの両方の発現を阻害することができる。好適には、細胞で発現される標的核酸は、カニクイザル細胞またはブタ細胞などの哺乳動物細胞、または好ましくはヒトＳＣＮ９ＡまたはヒトＳＣＮ１０Ａ  ｍＲＮＡまたはｐｒｅ‐ｍＲＮＡ配列であり得る。
【００１７】
あるいは、本発明のオリゴヌクレオチドは、哺乳動物もしくはヒト細胞などの細胞においてＮａｖ１．７もしくはＮａｖ１．８の発現を阻害することができるか、またはいくつかの実施形態では、カニクイザル細胞もしくはブタ細胞などの哺乳動物細胞、好ましくはヒト細胞においてＮａｖ１．７もしくはＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる。細胞は、標的電位依存性ナトリウムイオンチャネルタンパク質を発現している。
【００１８】
本発明はさらに、ＳＣＮ９Ａ発現の阻害のために相補的オリゴヌクレオチドを標的化するのに有用である、ヒトＳＣＮ９Ａ  ｐｒｅ‐ｍＲＮＡの標的配列を提供する。
【００１９】
有利には、本発明のオリゴヌクレオチドは、ＬＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチドなどのアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
【００２０】
本発明は、１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンスオリゴヌクレオチド（例えば、ＬＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチド）を提供し、これは、配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【００２１】
本発明は、１０〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドを提供し、これは、配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、細胞におけるＮａｖ１．７およびＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる発現を阻害できる。ここで連続するヌクレオチド配列は、ヒトＮａｖ１．７およびヒトＮａｖ１．８標的核酸、例えば配列番号１および配列番号６５１としてそれぞれ示される標的核酸に相補的である。
【００２２】
本発明は、ヒトＮａｖ１．７標的核酸およびヒトＮａｖ１．８標的核酸に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、細胞内のＮａｖ１．７またはＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる発現を阻害できる、１０〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、配列番号１に対して１００％相補的であり、配列番号６５１に対して少なくとも９０％相補的、例えば有利には１００％相補的である。
【００２３】
本発明は、１０〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドであって、配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、細胞内のＮａｖ１．７またはＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる発現を阻害できるオリゴヌクレオチドを提供する。ここで、連続ヌクレオチド配列は、配列番号１に対して１００％相補的であり、配列番号６５１に対して少なくとも９０％相補的、例えば１００％相補的である。
【００２４】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２、５１３、５１４、５１５、５１６、５１７、５１８、５１９、５２０、５２１、５２２、５２３、５２４、５２５、５５７、５５８、５５９、５６０、５７７、５７９、５８３、６３８、および５８７からなる群から選択される配列に存在する、少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオシドを含む。
【００２５】
本発明は、以下のＣＭＰ  ＩＤ：
50_1;51_1;52_1;53_1;54_1;55_1;56_1;57_1;58_1;59_1;60_1;61_1;62_1;63_1;64_1;65_1;66_1;67_1;68_1;69_1;70_1;71_1;72_1;73_1;74_1;75_1;76_1;77_1;78_1;79_1;80_1;81_1;82_1;83_1;84_1;85_1;86_1;87_1;88_1;89_1;90_1;91_1;92_1;93_1;94_1;95_1;96_1;97_1;98_1;99_1;100_1;101_1;102_1;103_1;104_1;105_1;106_1;107_1;108_1;109_1;110_1;111_1;112_1;113_1;114_1;115_1;116_1;117_1;118_1;119_1;120_1;121_1;122_1;123_1;124_1;125_1;126_1;127_1;128_1;129_1;130_1;131_1;132_1;133_1;134_1;135_1;136_1;137_1;138_1;139_1;140_1;141_1;142_1;143_1;144_1;145_1;146_1;147_1;148_1;149_1;150_1;151_1;152_1;153_1;154_1;155_1;156_1;157_1;158_1;159_1;160_1;161_1;162_1;163_1;164_1;165_1;166_1;167_1;168_1;169_1;170_1;171_1;172_1;173_1;174_1;175_1;176_1;177_1;178_1;179_1;180_1;181_1;182_1;183_1;184_1;185_1;186_1;187_1;188_1;189_1;190_1;191_1;192_1;193_1;194_1;195_1;196_1;197_1;198_1;199_1;200_1;201_1;202_1;203_1;204_1;205_1;206_1;207_1;208_1;209_1;210_1;211_1;212_1;213_1;214_1;215_1;216_1;217_1;218_1;219_1;220_1;221_1;222_1;223_1;224_1;225_1;226_1;227_1;228_1;229_1;230_1;231_1;232_1;233_1;234_1;235_1;236_1;237_1;238_1;239_1;240_1;241_1;242_1;243_1;244_1;245_1;246_1;247_1;248_1;249_1;250_1;251_1;252_1;253_1;254_1;255_1;256_1;257_1;258_1;259_1;260_1;261_1;262_1;263_1;264_1;265_1;266_1;267_1;268_1;269_1;270_1;271_1;272_1;273_1;274_1;275_1;276_1;277_1;278_1;279_1;280_1;281_1;282_1;283_1;284_1;285_1;286_1;287_1;288_1;289_1;290_1;291_1;292_1;293_1;294_1;295_1;296_1;297_1;298_1;299_1;300_1;301_1;302_1;303_1;304_1;305_1;306_1;307_1;308_1;309_1;310_1;311_1;312_1;313_1;314_1;315_1;316_1;317_1;318_1;319_1;320_1;321_1;322_1;323_1;324_1;325_1;326_1;327_1;328_1;329_1;330_1;331_1;332_1;333_1;334_1;335_1;336_1;337_1;338_1;339_1;340_1;341_1;342_1;343_1;344_1;345_1;346_1;347_1;348_1;349_1;350_1;351_1;352_1;353_1;354_1;355_1;356_1;357_1;358_1;359_1;360_1;361_1;362_1;363_1;364_1;365_1;366_1;367_1;368_1;369_1;370_1;371_1;372_1;373_1;374_1;375_1;376_1;377_1;378_1;379_1;380_1;381_1;382_1;383_1;384_1;385_1;386_1;387_1;388_1;389_1;390_1;391_1;392_1;393_1;394_1;395_1;396_1;397_1;398_1;399_1;400_1;401_1;402_1;403_1;404_1;405_1;406_1;407_1;408_1;409_1;410_1;411_1;412_1;413_1;414_1;415_1;416_1;417_1;418_1;419_1;420_1;421_1;422_1;423_1;424_1;425_1;426_1;427_1;428_1;429_1;430_1;431_1;432_1;433_1;434_1;435_1;436_1;437_1;438_1;439_1;440_1;441_1;442_1;443_1;444_1;445_1;446_1;447_1;448_1;449_1;450_1;451_1;452_1;453_1;454_1;455_1;456_1;457_1;458_1;459_1;460_1;461_1;462_1;463_1;464_1;465_1;466_1;467_1;468_1;469_1;470_1;471_1;472_1;473_1;474_1;475_1;476_1;477_1;478_1;479_1;480_1;481_1;482_1;483_1;484_1;485_1;486_1;487_1;488_1;489_1;490_1;491_1;492_1;493_1;494_1;495_1;496_1;497_1;498_1;499_1;500_1;501_1;502_1;503_1;504_1;505_1;506_1;507_1;508_1;509_1;510_1;511_1;512_1;512_2;512_3;513_1;513_2;513_3;513_4;514_1;514_2;514_3;514_4;515_1;515_2;515_3;515_4;515_5;515_6;516_1;516_2;516_3;516_4;516_5;516_6;516_7;517_1;517_2;517_3;517_4;517_5;517_6;517_7;517_8;518_1;518_2;518_3;518_4;518_5;518_6;519_1;519_2;519_3;519_4;519_5;519_6;520_1;520_2;520_3;520_4;520_5;521_1;521_2;521_3;521_4;521_5;522_1;522_2;522_3;522_4;523_1;523_2;523_3;523_4;523_5;524_1;525_1;526_1;527_1;528_1;529_1;530_1;531_1;532_1;533_1;534_1;535_1;536_1;537_1;538_1;539_1;540_1;541_1;542_1;543_1;544_1;545_1;546_1;547_1;548_1;549_1;550_1;551_1;552_1;553_1;554_1;555_1;556_1;557_1;558_1;559_1;560_1;561_1;562_1;563_1;564_1;565_1;566_1;567_1;568_1;569_1;570_1;571_1;572_1;573_1;574_1;575_1;576_1;577_1;578_1;579_1;580_1;581_1;582_1;583_1;584_1;585_1;586_1;587_1;588_1;589_1;590_1;591_1;592_1;593_1;594_1;595_1;596_1;597_1;598_1;599_1;600_1;601_1;602_1;603_1;604_1;605_1;606_1;607_1;608_1;609_1;610_1;611_1;612_1;613_1;614_1;615_1;616_1;617_1;618_1;619_1;620_1;621_1;622_1;623_1;624_1;625_1;626_1;627_1;628_1;629_1;630_1;631_1;632_1;633_1;634_1;635_1;636_1;637_1;638_1;639_1;640_1および641_1からなる群から選択されるか、または642_1;643_1;644_1;645_1;646_1;647_1;648_1;649_1;および650_1から選択される群から選択されるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【００２６】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、５１，５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，４５３，２２２，４１０，１０４，４６０，４３９，２５５，４８９，２０３，３９８，１７１，４０７，１７２，４１２，３２１，３０５，３２８，１２０，４３４，４４９，３５０，４８７，１４６，４２０，４２６，３５２，１５０，３１６，３５３，４６９，３０６，３８４，１５５，４５０，２７９，２６７，３３７，１８４，４５９，３６０，７５，４６８，１８０，２４５，３８７，３４５，９８，４３５，２９５，３６９，２１８，１８２，４４８，３００，４８１，４２７，２０７，３６７，２４０，２３１，３６４，３５５，４３１，４９７，３９７，４６５，２７１，５０２，１５１，１７８，４９９，４２１，１３１，３０９，４９１，２６１，１２１，１２８，８４，３０４，２６４，４９３，１８５，２３７，１３９，４４１，１６９，１６０，１０２，２９６，１６４，３６２，５００，および１００からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００２７】
本発明は、細胞内でヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号６４２、６４３、６４４、６４５、６４６、６４７、６４８、６４９、および６５０からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００２８】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００２９】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号６４２〜６５０からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３０】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３１】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号６４２〜６５０からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３２】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるアンチセンスギャップマーオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される配列の少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３３】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号６４２〜６５０からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３４】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるアンチセンスギャップマーオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される配列の少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３５】
本発明は、細胞内のヒトＳＮＣ９Ａの発現を阻害することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供し、ここでオリゴヌクレオチドは、配列番号６４２〜６５０からなる群から選択される配列の少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００３６】
本発明は、本発明によるアンチセンスオリゴヌクレオチドと、前記オリゴヌクレオチドに共有結合した少なくとも１つのコンジュゲート部分とを含むコンジュゲートを提供する。
【００３７】
本発明は、１０〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドであって、配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば、１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、細胞内のＮａｖ１．７またはＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる、発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを提供する。
【００３８】
本発明は、１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンスオリゴヌクレオチドであって、配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば、１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、細胞内のＮａｖ１．７またはＮａｖ１．８の両方の発現を阻害することができる、発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドを提供する。
【００３９】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列番号５１２、５１３、５１４、５１５、５１６、５１７、５１８、５１９、５２０、５２１、５２２、５２３、５２４、５２５、５５７、５５８、５５９、５６０、５７７、５７９、５８３、６３８、および５８７からなる群から選択される配列に存在する少なくとも１０、または少なくとも１２の連続ヌクレオシドを含む、連続ヌクレオチド配列を含む。
【００４０】
本発明のいくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列番号５１２、５１３、５１４、５１５、５１６、５１７、５１８、５１９、５２０、５２１、５２２、５２３、５２４、５２５、５５７、５５８、５５９、５６０、５７７、５７９、５８３、６３８、および５８７からなる群から選択される配列に存在する、少なくとも１４の連続ヌクレオシドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【００４１】
本発明は、本発明によるアンチセンスオリゴヌクレオチドの医薬的に許容される塩、または本発明によるコンジュゲートを提供する。
【００４２】
本発明は、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたは本発明のコンジュゲートと、医薬的に許容される希釈剤、溶媒、担体、塩および／またはアジュバントとを含む医薬組成物を提供する。
【００４３】
本発明は、ＳＣＮ９Ａを発現している標的細胞でのＳＣＮ９Ａ発現を阻害するためのインビボまたはインビトロ方法を提供し、前記方法は、本発明のオリゴヌクレオチドまたは本発明のコンジュゲートまたは本発明の医薬塩もしくは組成物を、前記細胞に有効量で投与することを含む。
【００４４】
本発明は、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａを発現している標的細胞でのＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ発現を阻害するためのインビボまたはインビトロ方法を提供し、前記方法は、本発明のオリゴヌクレオチドまたは本発明のコンジュゲートまたは本発明の医薬塩もしくは組成物を、前記細胞に有効量で投与することを含む。
【００４５】
本発明は、疼痛を患っている、または罹患する可能性があるヒトなどの対象の疼痛を治療または予防するための方法を提供し、方法は、疼痛を予防または緩和するように、治療的または予防的に有効な量の本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、または本発明のコンジュゲート、または本発明の医薬塩もしくは組成物を投与することを含む。
【００４６】
本発明は、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたは本発明のコンジュゲートまたは本発明の医薬塩もしくは組成物を、医療薬で使用するために提供する。
【００４７】
本発明は、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたは本発明のコンジュゲートまたは本発明の医薬塩もしくは組成物を、疼痛の治療または予防または緩和に使用するために提供する。
【００４８】
本発明は、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたは本発明のコンジュゲートまたは本発明の医薬塩もしくは組成物の、疼痛の治療、予防または緩和用の薬剤の調製における使用を提供する。
【００４９】
いくつかの実施形態では、疼痛は、慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛、または侵害受容性疼痛である。
【００５０】
いくつかの実施形態では、疼痛は、糖尿病性神経障害、癌、脳神経痛、帯状疱疹後神経痛および術後神経痛からなる群から選択される障害によって引き起こされるか、またはそれらに関連する。
【００５１】
いくつかの実施形態では、疼痛は、遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）または発作性激痛症（ＰＥＰＤ）または三叉神経痛によって引き起こされるか、またはそれらに関連する。
【００５２】
いくつかの実施形態では、疼痛は、神経障害による疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性疼痛の一般的な治療（例えば、神経の減圧）、または神経障害性疼痛（例えば、糖尿病性神経障害）、内臓痛、または混合性疼痛でもある。
【００５３】
定義
オリゴヌクレオチド
本明細書で使用される用語「オリゴヌクレオチド」は、当業者に一般的に理解されているように、２つ以上の共有結合したヌクレオシドを含む分子として定義される。そのような共有結合ヌクレオシドは、核酸分子またはオリゴマーとも称され得る。オリゴヌクレオチドは通常、固相化学合成、その後の精製および単離によって研究室内で作製される。オリゴヌクレオチドの配列に言及する場合、共有結合したヌクレオチドまたはヌクレオシドの、核酸塩基部分の配列もしくは順序、またはその修飾に言及される。本発明のオリゴヌクレオチドは、人工であり、化学的に合成され、典型的には精製または単離される。本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば２’糖修飾ヌクレオシドなど、１つ以上の修飾ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含んでもよい。
【００５４】
本発明のオリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであっても、または標的核酸を標的とするｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖など、ｓｉＲＮＡの一部を形成してもよい。有利には、オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、またはその連続ヌクレオチド配列で使用するためのアンチセンスオリゴヌクレオチドの有利な設計には、ギャップマーが含まれる。
【００５５】
ＲＮＡｉ薬
本明細書で交換可能に使用される用語「ｉＲＮＡ」、「ＲＮＡｉ薬」、「ｉＲＮＡ薬」、および「ＲＮＡ干渉薬」は、本明細書のＲＮＡヌクレオシドを含み、ＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）経路を通じてＲＮＡ転写物の標的切断を媒介する薬剤を指す。ｉＲＮＡは、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）としてのプロセスを通じて、ｍＲＮＡの配列特異的分解を指示する。ｉＲＮＡは、細胞、例えば対象（哺乳動物の対象など）内の細胞における標的核酸の発現を調節、例えば阻害する。ＲＮＡｉ薬には、単鎖ＲＮＡｉ薬および二本鎖ｓｉＲＮＡ、および短ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）が含まれる。本発明のオリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列は、ＲＮＡｉ薬の形態であっても、またはｓｉＲＮＡもしくはｓｈＲＮＡなど、ＲＮＡｉ薬の一部を形成してもよい。本発明のいくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列は、ｓｉＲＮＡなどのＲＮＡｉ薬である。
【００５６】
ｓｉＲＮＡ
ｓｉＲＮＡという用語は、低分子干渉リボ核酸ＲＮＡｉ薬を指し、短鎖干渉ＲＮＡまたはサイレンシングＲＮＡとしても当技術分野で知られている、二本鎖ＲＮＡ分子の部類である。ｓｉＲＮＡは通常、センス鎖（パッセンジャー鎖とも呼ばれる）およびアンチセンス鎖（ガイド鎖とも呼ばれる）を含み、各鎖は１７〜３０ヌクレオチド長、通常は１９〜２５ヌクレオシド長であり、アンチセンス鎖は、標的核酸（適切には成熟ｍＲＮＡ配列）に対して相補的、例えば完全に相補的であり、センス鎖は、センス鎖およびアンチセンス鎖が二重鎖または二重鎖領域を形成するように、アンチセンス鎖に相補的である。ｓｉＲＮＡ鎖が平滑末端二重鎖を形成しても、または有利には、センス鎖およびアンチセンス鎖の３’末端が、例えば１、２または３ヌクレオシドの３’オーバーハングを形成してもよい。いくつかの実施形態では、センス鎖およびアンチセンス鎖の両方が、２ｎｔ  ３’オーバーハングを有する。したがって、二重鎖領域は、１７〜２５ヌクレオチド長、例えば２１〜２３ヌクレオチド長であり得る。
【００５７】
細胞内に入ると、アンチセンス鎖は、標的核酸の標的分解または標的阻害を媒介するＲＩＳＣ複合体に組み込まれる。ｓｉＲＮＡは、典型的には、ＲＮＡヌクレオシドに加えて修飾ヌクレオシドを含むか、またはいくつかの実施形態では、ｓｉＲＮＡ鎖のすべてのヌクレオチドが修飾され得る（センス。ＬＮＡ（例えば国際公開第２００４０８３４３０号、国際公開第２００７０８５４８５号を参照）、２’フルオロ、２’−Ｏ−メチルまたは２’−Ｏ−メトキシエチルなどの２’糖修飾ヌクレオシドをｓｉＲＮＡに組み込むことができる。いくつかの実施形態では、ｓｉＲＮＡのパッセンジャー鎖は、不連続であり得る（例えば、国際公開第２００７１０７１６２号を参照）。ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖のシード領域で生じる、熱的に不安定化するヌクレオチドの組み込みは、ｓｉＲＮＡのオフターゲット活性を低下させるのに有用であると報告されている（例えば、国際公開第１８０９８３２８号を参照）。
【００５８】
いくつかの実施形態では、本発明のｓｉＲＮＡなどのｄｓＲＮＡ薬は、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、センス鎖の実質的にすべてのヌクレオチドが修飾を含む。アンチセンス鎖の実質的にすべてのヌクレオチドが修飾を含むか、またはセンス鎖の実質的にすべてのヌクレオチド、およびアンチセンス鎖の実質的にすべてのヌクレオチドが修飾を含む。さらに他の実施形態では、センス鎖のすべてのヌクレオチドが修飾を含む。アンチセンス鎖のすべてのヌクレオチドが修飾を含むか、またはセンス鎖のすべてのヌクレオチド、およびアンチセンス鎖のすべてのヌクレオチドが修飾を含む。
【００５９】
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオチドは、デオキシヌクレオチド、３’末端デオキシチミン（ｄＴ）ヌクレオチド、２’−０−メチル修飾ヌクレオチド、２’−フルオロ修飾ヌクレオチド、２’−デオキシ修飾ヌクレオチド、ロックドヌクレオチド、アンロックドヌクレオチド、配座固定ヌクレオチド（ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌｌｙ  ｒｅｓｔｒｉｃｔｅｄ  ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）、拘束エチルヌクレオチド、脱塩基ヌクレオチド、２’−アミノ修飾ヌクレオチド、２’−Ｏ−アリル修飾ヌクレオチド、２’−Ｃ−アルキル修飾ヌクレオチド、２’−ヒドロキシ修飾ヌクレオチド、２’−メトキシエチル修飾ヌクレオチド、２’−Ｏ−アルキル修飾ヌクレオチド、モルホリノヌクレオチド、ホスホルアミデート、ヌクレオチドを含む非天然塩基、非結合ヌクレオチド、テトラヒドロピラン修飾ヌクレオチド、１，５−アンヒドロヘキシトール修飾ヌクレオチド、シクロヘキセニル修飾ヌクレオチド、ホスホロチオエート基を含むヌクレオチド、メチルホスホネート基を含むヌクレオチド、５＊−リン酸を含むヌクレオチド、５’−リン酸模造物を含むヌクレオチド、グリコール修飾ヌクレオチド、および２−０−（Ｎ−メチルアセトアミド）修飾ヌクレオチド、ならびにそれらの組み合わせからなる群から独立して選択され得る。適切なｓｉＲＮＡは、アンチセンス鎖の５’末端に、５’リン酸基または５’−リン酸模造物を含む。いくつかの実施形態では、アンチセンス鎖の５’末端は、ＲＮＡヌクレオシドである。
【００６０】
一実施形態では、ｄｓＲＮＡ薬は、少なくとも１つのホスホロチオエート、またはメチルホスホネートヌクレオチド間結合をさらに含む。
【００６１】
ホスホロチオエートまたはメチルホスホネートのヌクレオチド間結合は、一方または両方の鎖（例えば、アンチセンス鎖またはセンス鎖）の３’末端にあり得る。あるいは、ホスホロチオエートまたはメチルホスホネートのヌクレオシド間結合は、一方または両方の鎖（例えば、アンチセンス鎖またはセンス鎖）の５’末端にあり得る。あるいは、ホスホロチオエートまたはメチルホスホネートのヌクレオシド間結合は、一方または両方の鎖（例えば、アンチセンス鎖またはセンス鎖）の５’末端および３’末端の両方にあり得る。いくつかの実施形態では、残りのヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。
【００６２】
ｄｓＲＮＡ薬は、リガンドをさらに含み得る。いくつかの実施形態では、リガンドは、センス鎖の３’末端にコンジュゲートされている。
【００６３】
生体内分布のために、ｓｉＲＮＡは、例えば、標的リガンドにコンジュゲートされ得、かつ／または脂質ナノ粒子へと配合され得る。
本発明の他の態様は、治療的使用に適したｓｉＲＮＡ分子など、これらのｄｓＲＮＡを含む医薬組成物、および本発明のｓｉＲＮＡなどのｄｓＲＮＡ分子を投与することによって、例えば本明細書に開示される様々な病状の治療のために、標的遺伝子の発現を阻害する方法に関する。
【００６４】
アンチセンスオリゴヌクレオチド
本明細書で使用される用語「アンチセンスオリゴヌクレオチド」は、標的核酸、特に標的核酸上の連続配列にハイブリダイズすることによって、標的遺伝子の発現を調節することができるオリゴヌクレオチドとして定義される。アンチセンスオリゴヌクレオチドは本質的に二本鎖ではなく、したがってｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡではない。好ましくは、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは単鎖である。本発明の単鎖オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長にわたって内部（ｉｎｔｒａ）または相互（ｉｎｔｅｒ）の自己相補性の程度が５０％未満である限り、ヘアピンまたは分子間二重鎖構造（同じオリゴヌクレオチドの２分子間の二重鎖）を形成できることが理解される。
【００６５】
有利には、本発明の単鎖アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＲＮＡヌクレオシド（２’−ＯＨ非修飾リボース）を含まない。
【００６６】
有利には、本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば２’糖修飾ヌクレオシドなどの１つ以上の修飾ヌクレオシドまたはヌクレオチドを含む。さらに、修飾されていないヌクレオシドがＤＮＡヌクレオシドであることは有利である。ＬＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチドは、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドの見地から、非常に有利である。
【００６７】
連続ヌクレオチド配列
用語「連続ヌクレオチド配列」は、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの領域を指す。この用語は、本明細書で用語「連続核酸塩基配列」および用語「オリゴヌクレオチドモチーフ配列」と互換的に使用される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの全ヌクレオチドは、連続ヌクレオチド配列を構成する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ギャップマー領域（本明細書では式Ｆ−Ｇ−Ｆ’によって示される）などの連続ヌクレオチド配列を含み、任意選択で、さらなるヌクレオチド、例えば、連続ヌクレオチド配列に官能基を付加するのに使用され得るヌクレオチドリンカー領域を含み得る。ヌクレオチドリンカー領域は、標的核酸に相補的であっても相補的でなくてもよい。
【００６８】
ヌクレオチド
ヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドの構成単位であり、本発明の目的のために、天然に存在するヌクレオチドおよび天然に存在しないヌクレオチドの両方を含む。本来、ＤＮＡおよびＲＮＡヌクレオチドなどのヌクレオチドは、リボース糖部分、核酸塩基部分および１つ以上のリン酸基（ヌクレオシドに存在しない）を含む。ヌクレオシドおよびヌクレオチドはまた、「単位」または「モノマー」と互換的に称されてもよい。
【００６９】
修飾ヌクレオシド
本明細書で使用される用語「修飾ヌクレオシド」または「ヌクレオシド修飾」は、等価なＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドと比較して、糖部分または（核酸）塩基部分の１つ以上の修飾の導入によって修飾されたヌクレオシドを指す。好ましい実施形態では、修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。用語、修飾ヌクレオシドはまた、本明細書で用語「ヌクレオシド類似体」または修飾「単位」または修飾「モノマー」と互換的に使用されてもよい。非修飾ＤＮＡまたはＲＮＡ糖部分を有するヌクレオシドは、本明細書でＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドと称される。ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドの塩基領域における修飾を有するヌクレオシドは、それらがＷａｔｓｏｎ  Ｃｒｉｃｋ塩基対合が可能であれば、依然として一般にＤＮＡまたはＲＮＡと称される。
【００７０】
修飾ヌクレオシド間結合
用語「修飾ヌクレオシド間結合」は、２つのヌクレオシドを互いに共有結合する、ホスホジエステル（ＰＯ）結合以外の結合として、当業者に一般的に理解されるように定義される。したがって、本発明のオリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間結合を含み得る。いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を増大させる。天然に存在するオリゴヌクレオチドの場合、ヌクレオシド間結合は、隣接するヌクレオシド間のホスホジエステル結合を形成するリン酸基を含む。修飾ヌクレオシド間結合は、インビボ使用のためのオリゴヌクレオチドの安定化に特に有用であり、本発明のオリゴヌクレオチドのＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドの領域、例えばギャップマーオリゴヌクレオチドのギャップ領域Ｇ内、ならびに領域ＦおよびＦ’などの修飾ヌクレオシドの領域におけるヌクレアーゼ切断から保護する役割を果たし得る。
【００７１】
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、天然ホスホジエステルから修飾された１つ以上のヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列におけるヌクレオシド間結合の、少なくとも５０％が修飾されており、オリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列におけるヌクレオシド間結合の、例えば少なくとも６０％、例えば少なくとも７０％、例えば少なくとも７５％、例えば少なくとも８０％、または例えば少なくとも９０％が修飾されている。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド、またはその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の全部が修飾されている。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドを非ヌクレオチド官能基、例えばコンジュゲートに結合するヌクレオシドは、ホスホジエステルであり得ることが認識されるであろう。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド、またはその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の全部が、ヌクレアーゼ耐性ヌクレオシド間結合である。
【００７２】
本発明のオリゴヌクレオチドでは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を使用することが有利である。
【００７３】
ホスホロチオエートヌクレオシド間結合は、そのヌクレアーゼ耐性、有益な薬物動態および製造の容易さのために特に有用である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の少なくとも５０％が、ホスホロチオエートであり、オリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の、例えば少なくとも６０％、例えば少なくとも７０％、例えば少なくとも７５％、例えば少なくとも８０％、または例えば少なくとも９０％がホスホロチオエートである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド、またはその連続ヌクレオチド配列のヌクレオシド間結合の全部がホスホロチオエートである。
【００７４】
有利には、オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列のすべてのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートであるか、またはオリゴヌクレオチドのすべてのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合である。
【００７５】
欧州特許第２７４２１３５号に開示されているように、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、他のヌクレオシド間結合（ホスホジエステルおよびホスホロチオエート以外）、例えばアルキルホスホネート／メチルホスホネートヌクレオシド間結合を含み得ることが認識され、これは欧州特許第２７４２１３５号によれば、例えば別のＤＮＡホスホロチオエートのギャップ領域内で耐性であり得る。
【００７６】
核酸塩基
核酸塩基という用語は、ヌクレオシドおよびヌクレオチドに存在するプリン（例えばアデニンおよびグアニン）およびピリミジン（例えばウラシル、チミンおよびシトシン）部分を含み、これらは核酸ハイブリダイゼーションにおいて水素結合を形成する。本発明の文脈において、核酸塩基という用語は、天然に存在する核酸塩基とは異なり得るが、核酸ハイブリダイゼーション中に機能性である修飾核酸塩基も包含する。この文脈において、「核酸塩基」は、天然に存在する核酸塩基、例えばアデニン、グアニン、シトシン、チミジン、ウラシル、キサンチンおよびヒポキサンチンと、天然に存在しないバリアントとの両方を指す。そのようなバリアントは、例えばＨｉｒａｏ  ｅｔ  ａｌ（２０１２）Ａｃｃｏｕｎｔｓ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ｖｏｌ  ４５  ｐａｇｅ  ２０５５およびＢｅｒｇｓｔｒｏｍ（２００９）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｓｕｐｐｌ．３７  １．４．１に記載されている。
【００７７】
いくつかの実施形態では、核酸塩基部分は、プリンまたはピリミジンを修飾プリンまたはピリミジン、例えば置換プリンまたは置換ピリミジン、例えばイソシトシン、シュードイソシトシン、５−メチルシトシン、５−チアゾロ−シトシン、５−プロピニル−シトシン、５−プロピニル−ウラシル、５−ブロモウラシル５−チアゾロ−ウラシル、２−チオ−ウラシル、２’チオ−チミン、イノシン、ジアミノプリン、６−アミノプリン、２−アミノプリン、２，６−ジアミノプリンおよび２−クロロ−６−アミノプリンから選択される核酸塩基（ｎｕｃｌｅｏｂａｓｅｄ）に変えることにより修飾される。
【００７８】
核酸塩基部分は、各々の対応する核酸塩基の文字コード、例えばＡ、Ｔ、Ｇ、ＣまたはＵにより示され、各文字は、等価な機能の修飾核酸塩基を場合により含み得る。例えば、例示のオリゴヌクレオチドにおいて、核酸塩基部分は、Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃおよび５−メチルシトシンから選択される。場合により、ＬＮＡギャップマーについて、５−メチルシトシンＬＮＡヌクレオシドが使用され得る。
【００７９】
修飾オリゴヌクレオチド
修飾オリゴヌクレオチドという用語は、１つ以上の糖修飾ヌクレオシドおよび／または修飾ヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドを説明する。キメラオリゴヌクレオチドという用語は、修飾ヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを説明するために文献で使用されている用語である。
【００８０】
相補性
用語「相補性」は、ヌクレオシド／ヌクレオチドのＷａｔｓｏｎ−Ｃｒｉｃｋの塩基対合の能力を説明する。Ｗａｔｓｏｎ−Ｃｒｉｃｋ塩基対は、グアニン（Ｇ）−シトシン（Ｃ）およびアデニン（Ａ）−チミン（Ｔ）／ウラシル（Ｕ）である。オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を有するヌクレオシドを含んでもよく、例えば５−メチルシトシンは度々シトシンの代わりに使用され、したがって相補性という用語は、非修飾および修飾核酸塩基の間のＷａｔｓｏｎ  Ｃｒｉｃｋ塩基対合を包含することが理解されるであろう（例えばＨｉｒａｏ  ｅｔ  ａｌ（２０１２）Ａｃｃｏｕｎｔｓ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｃａｌ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ｖｏｌ  ４５  ｐａｇｅ  ２０５５およびＢｅｒｇｓｔｒｏｍ（２００９）Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｓｕｐｐｌ．３７  １．４．１を参照されたい）。
【００８１】
本明細書で使用される用語「％相補性」は、連続ヌクレオチド配列にわたって参照配列（例えば標的配列または配列モチーフ）と相補的である、核酸分子（例えばオリゴヌクレオチド）の連続ヌクレオチド配列のヌクレオチドの割合（パーセント）を指す。したがって、相補性のパーセンテージは、（標的配列５’−３’および３’−５’からのオリゴヌクレオチド配列と整列した場合）２つの配列の間で（Ｗａｔｓｏｎ  Ｃｒｉｃｋ塩基対から）相補的である整列した核酸塩基の数を数え、その数をオリゴヌクレオチドのヌクレオチドの総数で割り、１００を掛けることによって計算される。このような比較において、整列（塩基対を形成）しない核酸塩基／ヌクレオチドは、ミスマッチと称される。挿入および欠失は、連続ヌクレオチド配列の％相補性の計算において許容されない。相補性の決定において、核酸塩基の化学的修飾は、核酸塩基のＷａｔｓｏｎ  Ｃｒｉｃｋ塩基対合を形成する機能的能力が保持される限り、無視されることが理解されるであろう（例えば、５−メチルシトシンは、％同一性の計算の目的のために、シトシンと同一であると見なされる）。
【００８２】
「完全に相補的な」という用語は、１００％の相補性を指す。
【００８３】
同一性
本明細書で使用される用語「同一性」は、連続ヌクレオチド配列にわたって参照配列（例えば配列モチーフ）に同一である、核酸分子（例えばオリゴヌクレオチド）の連続ヌクレオチド配列のヌクレオチドの割合（パーセントで表される）を指す。したがって、同一性のパーセンテージは、（本発明の化合物の連続ヌクレオチド配列および参照配列において）２つの配列の間で同一の（一致する）整列した塩基の数を数え、その数をオリゴヌクレオチドのヌクレオチドの総数で割り、１００を掛けることにより計算される。したがって、同一性のパーセンテージ＝（一致×１００）／整列領域（例えば、連続ヌクレオチド配列）の長さ。挿入および欠失は、連続ヌクレオチド配列の同一性のパーセンテージの計算において許容されない。同一性の決定において、核酸塩基の化学的修飾は、核酸塩基がＷａｔｓｏｎ  Ｃｒｉｃｋ塩基対合を形成する機能的能力が保持される限り、無視されることが理解されるであろう（例えば、５−メチルシトシンは、％同一性の計算の目的のために、シトシンと同一であると見なされる）。
【００８４】
ハイブリダイゼーション
本明細書で使用される用語「ハイブリダイズしている」または「ハイブリダイズする」は、２つの核酸鎖（例えば、オリゴヌクレオチドおよび標的核酸）が対向する鎖上の塩基対の間で水素結合を形成することにより二重鎖を形成することとして理解するべきである。２つの核酸鎖の間の結合の親和性は、ハイブリダイゼーションの強度である。これは、度々、オリゴヌクレオチドの半分が標的核酸と二重鎖を形成する温度として定義される、融解温度（Ｔｍ）の観点から説明される。生理学的条件では、Ｔｍは、親和性に厳密に比例しない（Ｍｅｒｇｎｙ  ａｎｄ  Ｌａｃｒｏｉｘ，２００３，Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ  １３：５１５−５３７）。標準状態ギブス自由エネルギーΔＧ°は、結合親和性をより正確に表し、ΔＧ°＝−ＲＴｌｎ（Ｋｄ）によって反応の解離定数（Ｋｄ）に関連付けられ、ここでＲは気体定数であり、Ｔは絶対温度である。したがって、オリゴヌクレオチドと標的核酸との反応の非常に低いΔＧ°は、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の強いハイブリダイゼーションを反映する。ΔＧ°は、水性濃度が１Ｍ、ｐＨが７、温度が３７℃である反応に関連したエネルギーである。標的核酸に対するオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションは、自発的反応であり、自発的反応の場合のΔＧ°は、ゼロ未満である。ΔＧ°は、例えば、Ｈａｎｓｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，１９６５，Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍ．３６−３８およびＨｏｌｄｇａｔｅ  ｅｔ  ａｌ．，２００５，Ｄｒｕｇ  Ｄｉｓｃｏｖ  Ｔｏｄａｙに記載されているような等温滴定熱量測定（ＩＴＣ）法の使用により、実験的に測定することができる。当業者は、ΔＧ°測定のために市販の装置が入手可能であることを知るであろう。ΔＧ°は、ＳａｎｔａＬｕｃｉａ，１９９８，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  ＵＳＡ．９５：１４６０−１４６５に記載されているように、Ｓｕｇｉｍｏｔｏ  ｅｔ  ａｌ．，１９９５，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ３４：１１２１１−１１２１６およびＭｃＴｉｇｕｅ  ｅｔ  ａｌ．，２００４，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ４３：５３８８−５４０５に記載されている適切に誘導した熱力学パラメータを使用して、最近接モデルを用いることにより数値的に推定することもできる。ハイブリダイゼーションによってその意図された核酸標的を調節する可能性を有するために、本発明のオリゴヌクレオチドは、１０〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドについて−１０ｋｃａｌ未満の推定ΔＧ°値で標的核酸にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ハイブリダイゼーションの程度または強度は、標準状態ギブス自由エネルギーΔＧ°により測定される。オリゴヌクレオチドは、８〜３０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドについて−１０ｋｃａｌの範囲未満、例えば−１５ｋｃａｌ未満、例えば−２０ｋｃａｌ未満、および例えば−２５ｋｃａｌ未満の推定ΔＧ°値で標的核酸にハイブリダイズし得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、−１０〜−６０ｋｃａｌ、例えば−１２〜−４０、例えば−１５〜−３０ｋｃａｌまたは−１６〜−２７ｋｃａｌ、例えば−１８〜−２５ｋｃａｌの推定ΔＧ°値で標的核酸にハイブリダイズする。
【００８５】
標的核酸
本発明によれば、標的核酸は、哺乳動物またはヒトの電位依存性ナトリウムイオンチャネルをエンコードする核酸であり、例えば遺伝子、ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、およびｐｒｅ‐ｍＲＮＡ、成熟ｍＲＮＡまたはｃＤＮＡ配列であり得る。
【００８６】
したがって、標的は、標的核酸と称され得る。本発明のオリゴヌクレオチドは、例えばヒトＳＣＮ９Ａ標的核酸など、哺乳動物のエクソン領域を標的とし得るか、または、例えばヒトＳＣＮ９Ａ  ｐｒｅ−ｍＲＮＡなど、哺乳動物のイントロン領域を標的とし得る（表１を参照）。
【表１】
2021527437.tif 000002
【００８７】
ＥＮＳＥＭＢＬによると、少なくとも１３のヒトＳＣＮ９Ａ転写物バリアントがある。したがって、標的核酸は、配列番号４〜１６からなる群から選択されるＳＣＮ９Ａ転写物（ｍＲＮＡ）であり得る。
【表２】
2021527437.tif 000003
【００８８】
好適には、標的核酸は、Ｎａｖ１．７タンパク質、特に、ヒト、サル、およびブタのＮａｖ１．７エンコード転写物にｍＲＮＡおよびｐｒｅ−ｍＲＮＡ配列を提供する哺乳動物Ｎａｖ１．７、例えばヒトＮａｖ１．７（例えば、表２および３を参照）をエンコードし得る。
【００８９】
いくつかの実施形態では、標的核酸は、配列番号１、２、および３または天然に存在するそれらのバリアントからなる群から選択される（例えば、哺乳動物のＮａｖ１．７タンパク質をエンコードする配列）いくつかの実施形態では、標的核酸は、配列番号４〜１６からなる群から選択される転写物バリアントなどの、ＳＣＮ９Ａの転写バリアントである。
【００９０】
本発明のオリゴヌクレオチドを研究または診断に使用する場合、標的核酸は、ＤＮＡまたはＲＮＡに由来するｃＤＮＡまたは合成核酸であり得る。
【００９１】
インビボまたはインビトロでの適用の場合、本発明のオリゴヌクレオチドは、典型的には、ＳＣＮ９Ａ標的核酸を発現している細胞において、標的核酸、例えば、ＳＣＮ９Ａ標的核酸の発現を阻害することができる。本発明のオリゴヌクレオチドの核酸塩基の連続配列は、オリゴヌクレオチドをコンジュゲートなど任意の官能基に連結し得るヌクレオチドベースのリンカー領域、または他の非相補的末端ヌクレオチド（例えば、領域Ｄ’またはＤ’’）を任意に除いて、オリゴヌクレオチドの全長にわたって測定された場合、ＳＣＮ９Ａ標的核酸に相補的、例えば完全に相補的である。標的核酸は、いくつかの実施形態では、メッセンジャーＲＮＡ（成熟ｍＲＮＡまたはｐｒｅ‐ｍＲＮＡなど）などのＲＮＡまたはＤＮＡであり得る。
【００９２】
いくつかの実施形態では、標的核酸は、哺乳動物Ｎａｖ１．７タンパク質をエンコードするＲＮＡまたはＤＮＡ、例えば、ヒトＳＣＮ９Ａ  ｐｒｅ‐ｍＲＮＡ配列などのヒトＳＣＮ９Ａ標的、例えば配列番号１として開示されているもの、またはヒトＳＣＮ９Ａ成熟ｍＲＮＡ、例えば配列番号２として開示されているものである。例示的な標的核酸に関するさらなる情報は、表２および表３に提供される。
【表３】
2021527437.tif 000004
Ｆｗｄ＝フォワード鎖  ゲノム座標は、ｐｒｅ‐ｍＲＮＡ配列（ゲノム配列）を提供する。ＮＣＢＩ参照は、ｍＲＮＡ配列（ｃＤＮＡ配列）を提供する。
＊アメリカ国立生物工学情報センター参照配列データベースは、ゲノム、転写物およびタンパク質を含む、包括的で統合された、冗長性のない、十分に注釈が付けられた参照配列のセットである。これはｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｒｅｆｓｅｑ．で主催されている。
【表４】
2021527437.tif 000005
【００９３】
いくつかの実施形態では、標的核酸は、ヒトＳＣＮ１０Ａ  ｐｒｅｍＲＮＡ転写物、例えば、ＮＣＢＩ  Ｇｅｎｂａｎｋ参照番号：ＮＭ＿００６５１４．３  ＧＩ：６９３０７３５６９，ＮＭ＿００１２９３３０７．２  ＧＩ：６９３０７２６４５、およびＮＭ＿００１２９３３０６．２  ＧＩ：６９３０６４３４９（参照により本明細書に組み込まれる）からなる群から選択されるＳＣＮ１０Ａ標的核酸である。
【００９４】
標的配列
本明細書で使用される用語「標的配列」は、標的核酸に存在するヌクレオチドの配列を指し、これは本発明のオリゴヌクレオチドに相補的な核酸塩基配列を含む。いくつかの実施形態では、標的配列は、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列に相補的な核酸塩基配列を有する標的核酸上の領域からなる。標的核酸のこの領域は、互換的に標的ヌクレオチド配列、標的配列または標的領域と称され得る。いくつかの実施形態では、標的配列は、単一オリゴヌクレオチドの相補的配列よりも長く、例えば本発明のいくつかのオリゴヌクレオチドに標的にされ得る標的核酸の好ましい領域を表し得る。
【００９５】
本発明のオリゴヌクレオチドは、本明細書に記載の標的配列などの標的核酸に相補的であるか、またはハイブリダイズする連続ヌクレオチド配列を含む。有利には、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、少なくとも１０の連続塩基にわたって、より有利には少なくとも１２の連続塩基にわたって標的核酸に対して１００％相補的であり、より有利には、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチドは、連続ヌクレオチド配列の全長にわたって、標的核酸に対して１００％相補的である。
【００９６】
本発明によれば、連続ヌクレオチド配列は、１０〜３０ヌクレオチド、例えば１２〜３０、例えば１４〜２０、例えば１５〜１８の連続ヌクレオチドである。
【００９７】
本発明はまた、本発明のオリゴヌクレオチドによって標的化され得る、配列番号１に存在する標的配列（サブ配列）を提供する。したがって、本発明のオリゴヌクレオチドのオリゴヌクレオチドは、標的配列に少なくとも９０％相補的、有利には完全に相補的である（連続ヌクレオチド配列の全長にわたって測定される）連続ヌクレオチド配列を含み得る。
【００９８】
本発明のいくつかの有利な実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、Ｎａｖ１．７およびＮａｖ１．８標的配列の両方を標的とする。参照ヒトＮａｖ１．８  ｐｒｅ−ｍＲＮＡ配列は、本明細書において配列番号６５１として提供される（上記のＳＣＮ１０Ａ  ｐｒｅｍＲＮＡ転写物情報も参照のこと）。Ｎａｖ１．７およびＮａｖ１．８の両方を標的とする化合物は、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａの両方を発現している細胞において、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａの両方の発現を好適に阻害することができる。
【００９９】
標的配列リスト１
いくつかの実施形態では、標的配列は、617-630;852-868;963-976;1039-1053;1070-1085;1375-1388;1512-1526;1689-1702;2673-2691;3189-3202;3275-3290;3900-3921;4132-4145;4795-4808;4941-4955;5165-5182;5359-5372;5430-5444;5453-5529;5544-5588;5608-5675;5695-5717;5719-5732;5765-5809;5896-5909;6019-6032;6066-6085;6151-6164;6167-6180;6357-6370;6629-6657;6859-6872;6959-6972;6998-7019;7032-7056;7060-7079;7085-7098;7102-7129;7131-7152;7156-7185;7233-7247;7254-7271;7273-7295;7297-7317;7381-7412;7456-7499;7502-7522;7527-7561;7575-7592;8087-8100;8438-8454;8475-8490;8502-8515;8531-8572;8592-8610;8612-8635;8653-8677;8700-8715;8726-8741;9093-9106;9333-9346;9386-9399;9446-9463;9468-9481;9535-9550;9592-9606;10627-10643;10767-10780;11442-11458;11489-11502;11712-11725;11797-11810;11822-11843;11879-11901;12017-12030;12302-12315;13542-13555;13740-13754;14186-14199;14451-14464;15059-15072;15354-15367;15747-15789;15800-15824;15851-15864;15869-15911;15931-15959;15987-16005;16019-16037;16039-16053;16066-16079;16136-16158;16245-16258;16304-16317;16486-16499;16680-16693;16753-16766;16962-16975;16983-16998;17032-17045;17146-17167;17536-17550;17574-17587;17634-17647;17660-17676;17696-17711;17713-17739;17741-17755;17758-17783;17805-17827;17830-17846;17851-17875;17878-17893;17905-17967;18802-18816;18829-18843;18857-18870;18991-19005;19024-19037;19475-19488;19943-19967;19969-19984;19992-20043;20045-20072;20090-20150;20153-20183;20196-20213;20298-20312;20422-20436;20481-20494;20739-20752;20774-20790;20808-20826;20830-20843;20848-20866;20883-20905;20928-20950;21042-21055;21084-21097;21680-21693;21781-21805;21952-21965;22150-22163;22764-22782;22797-22810;22823-22836;22880-22909;22914-22927;22978-22992;23917-23930;25991-26006;26018-26031;26047-26071;26091-26113;26123-26160;26171-26208;26270-26309;26404-26418;26446-26460;26621-26634;26688-26701;26842-26876;26961-26978;27014-27027;27034-27049;27126-27154;27744-27759;27792-27805;28740-28754;29019-29033;29068-29081;30376-30389;30808-30821;30935-30948;31683-31696;32174-32204;32260-32273;32313-32326;32334-32360;32596-32609;32722-32735;33245-33258;33261-33274;33376-33389;33925-33938;34197-34212;35003-35016;35106-35126;35150-35169;35388-35402;35517-35530;35626-35639;35894-35908;36515-36530;36742-36755;36832-36845;37259-37272;37648-37673;37819-37832;38077-38093;38215-38228;39849-39862;40022-40035;41312-41326;41753-41766;42181-42198;42208-42231;42583-42596;42939-42957;43053-43092;43465-43478;44750-44763;46413-46426;46577-46590;46944-46957;46972-46985;47548-47566;47670-47685;47688-47709;47728-47745;48575-48597;48600-48614;48616-48630;48713-48730;48922-48946;49929-49942;50292-50308;50709-50722;50875-50888;51576-51589;51695-51720;51734-51753;51755-51776;51796-51830;51842-51856;52867-52883;53956-53969;53975-53988;54188-54213;54393-54406;54463-54487;54707-54723;55116-55129;55840-55855;55961-55975;56298-56311;56785-56798;57416-57429;58378-58391;58394-58410;58626-58639;58670-58684;58837-58851;59251-59264;59294-59320;59328-59351;59353-59417;59419-59434;59471-59490;59505-59531;59566-59585;59722-59744;59949-59962;60076-60092;60094-60110;60120-60184;60210-60266;60281-60303;60306-60368;60370-60413;60415-60444;60458-60474;60476-60565;60572-60614;60620-60633;60635-60655;60678-60692;60731-60750;60762-60784;60786-60802;60805-60822;60824-60839;60847-60863;60865-60882;60884-60932;60934-60980;61025-61065;61067-61081;61122-61144;61154-61169;61171-61191;61193-61209;61221-61258;61260-61288;61298-61315;61325-61384;61416-61443;61445-61460;61469-61500;61505-61544;61562-61612;61622-61651;61661-61675;61677-61691;61693-61710;61712-61738;61741-61773;61775-61789;61791-61837;61839-61873;61875-61888;61897-61935;61937-61950;61958-61999;62003-62019;62021-62041;62043-62064;62085-62104;62135-62160;62162-62184;62186-62204;62220-62233;62235-62260;62267-62281;62289-62305;62307-62361;62364-62412;62416-62431;62438-62464;62480-62496;62540-62562;62569-62631;62649-62698;62730-62752;62762-62788;62798-62837;62855-62868;62875-62888;62890-62903;62910-62923;62925-62940;62957-62972;62980-63008;63013-63046;63050-63111;63135-63151;63166-63238;63266-63279;63290-63344;63346-63390;63392-63409;63411-63425;63427-63451;63465-63537;63575-63592;63594-63618;63624-63643;63676-63700;63719-63758;63775-63804;63820-63861;63863-63888;63890-63906;63908-63934;63942-63956;63975-64000;64002-64015;64035-64052;64054-64072;64078-64095;64101-64132;64144-64174;64176-64286;64288-64367;64378-64397;64399-64476;64478-64502;64504-64529;64542-64597;64610-64684;64686-64703;64718-64751;64756-64769;64920-64944;65067-65112;65129-65144;65146-65169;65193-65223;65240-65268;65349-65395;65439-65479;65517-65531;65533-65580;65593-65611;65622-65640;65682-65705;65714-65758;65805-65823;65842-65875;65880-65902;65907-65943;65945-65983;65985-66004;66006-66019;66074-66091;66152-66169;66171-66195;66246-66264;66266-66282;66315-66356;66366-66379;66381-66397;66424-66438;66440-66466;66468-66495;66510-66569;66571-66589;66591-66643;66645-66673;66681-66715;66723-66745;66750-66770;66784-66806;66818-66836;66838-66888;66898-66929;66944-66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【０１００】
標的配列リスト２
いくつかの実施形態では、標的配列は、852-868;1070-1085;1512-1526;2673-2691;3900-3921;5165-5182;5430-5444;5610-5624;5765-5809;5896-5909;6859-6872;6998-7017;7165-7178;7297-7317;8726-8739;9386-9399;11712-11725;11823-11843;11882-11901;14186-14199;15749-15785;15931-15944;16137-16150;17146-17166;17916-17967;20196-20213;20422-20435;20481-20494;20883-20900;21042-21055;22764-22781;22978-22992;25991-26004;26180-26193;26621-26634;26688-26701;26842-26876;27744-27759;30376-30389;32174-32204;35003-35016;35388-35402;36516-36529;41753-41766;42185-42198;43053-43066;46413-46426;48933-48946;50295-50308;51695-51709;54188-54212;54463-54482;55841-55854;55961-55975;57416-57429;58396-58410;58671-58684;59251-59264;59294-59308;60959-60973;61339-61354;61631-61644;63172-63189;64225-64251;64254-64280;64300-64332;64340-64367;64399-64421;64423-64442;64462-64476;64478-64502;64625-64671;64720-64733;65457-65479;65963-65978;66330-66343;66660-66673;66754-66770;67055-67079;67231-67245;67778-67791;68135-68148;68548-68566;68629-68642;68665-68678;68821-68834;68925-68938;68943-68974;68991-69043;69140-69153;69223-69236;69263-69276;69393-69417;69419-69438;69440-69461;69500-69514;69598-69612;70079-70126;70128-70145;70147-70162;70164-70186;70188-70217;70344-70359;70377-70390;70716-70732;70742-70762;71359-71373;71390-71406;71481-71494;71548-71566;71599-71614;71655-71729;71731-71788;71790-71824;71834-71847;71856-71903;71929-71945;71947-71991;71995-72010;72047-72065;72101-72130;72154-72172;72273-72288;72518-72532;72622-72639;72652-72666;72753-72776;72981-72994;73174-73188;73239-73253;73659-73672;73760-73779;73820-73833;74025-74038;74127-74154;74849-74865;75190-75204;75601-75614;75831-75844;75987-76000;76430-76443;76547-76564;77078-77092;77442-77456;77740-77753;78041-78054;78625-78644;78682-78696;78772-78808;78955-78970;79466-79479;79545-79558;80688-80704;81031-81048;81360-81417;81429-81443;81527-81542;81555-81580;81707-81720;81924-81939;82166-82179;82376-82389;82670-82695;82709-82729;82745-82761;82763-82777;83468-83484;83512-83529;83671-83685;83848-83861;84565-84580;85147-85163;85464-85477;85607-85620;86283-86298;86341-86354;86371-86387;86776-86789;87084-87097;87209-87223;87237-87265;87341-87354;87383-87399;87404-87442;87464-87489;87503-87534;87579-87593;87677-87690;87826-87843;87877-87908;88033-88048;88393-88409;88574-88588;89078-89091;89442-89469;89475-89521;89523-89536;89595-89617;89780-89793;89896-89909;89927-89945;90609-90622;90887-90900;90964-90977;91076-91091;91173-91191;91193-91218;91220-91247;91310-91324;91326-91347;91360-91383;91409-91425;91484-91556;91565-91579;91639-91665;91790-91803;91955-91968;92064-92077;92289-92302;92387-92401;92434-92457;92580-92593;92753-92771;93022-93035;93402-93423;93634-93650;93845-93862;94044-94059;94090-94103;94296-94318;94798-94811;95141-95155;95400-95413;95418-95431;95436-95460;95463-95506;95510-95548;95550-95596;95613-95626;95632-95645;95768-95781;95843-95863;95888-95902;96058-96071;96469-96487;96591-96606;96664-96681;96785-96799;96871-96886;97126-97145;97149-97164;97221-97258;97298-97313;97325-97344;97358-97372;97686-97699;97701-97720;97731-97756;97776-97795;97848-97867;97913-97929;98097-98110;98352-98365;98598-98616;98646-98670;98672-98688;98735-98751;98759-98772;98783-98811;98813-98847;98879-98910;98912-98949;98972-99003;99005-99037;99221-99234;99804-99818;99870-99884;100038-100052;100346-100359;100404-100421;100567-100581;101224-101238;101663-101676;101783-101798;102325-102342;102490-102504;102643-102657;102815-102828;103063-103076;103078-103100;103110-103123;103160-103185;103244-103260;103265-103296;103376-103395;103487-103515;103560-103581;103583-103601;103655-103668;103810-103823;104053-104068;104110-104127;104595-104608;104676-104690;104845-104868;104886-104904;105220-105239;105412-105431;105786-105800;106108-106121;106851-106864;107384-107403;107506-107521;107670-107683;107778-107794;108395-108408;109411-109427;110200-110215;110617-110630;111065-111079;111133-111149;111376-111389;112034-112047;113468-113481;113560-113574;115512-115528;115628-115651;116119-116132;116171-116186;116321-116334;116602-116619;116668-116682;116705-116720;116749-116778;116793-116819;116839-116860;116922-116939;116966-116982;117046-117059;117183-117201;117779-117792;117922-117939;117948-117968;117970-117983;118089-118107;118218-118233;118825-118838;119198-119218;119245-119263;119374-119388;119654-119667;120076-120089;120540-120556;120859-120882;121515-121528;121538-121551;122088-122107;122407-122422;122516-122530;122827-122841;122843-122860;122982-122995;123083-123099;123170-123184;123186-123203;123218-123247;123300-123326;123369-123393;123521-123534;123628-123645;123896-123909;123918-123936;124093-124107;124154-124169;124171-124190;124602-124615;124689-124702;124981-124997;125140-125158;125593-125606;125752-125765;126258-126272;126383-126396;127155-127168;127319-127332;127589-127605;127657-127676;127862-127875;128818-128847;128856-128871;128976-128991;129107-129121;129671-129685;130005-130025;130049-130063;130689-130706;130732-130745;131020-131034;131103-131118;131846-131861;132413-132426;132719-132733;132841-132856;133295-133308;133324-133337;133395-133412;133414-133432;133444-133469;133471-133484;133565-133579;133667-133684;134235-134248;134730-134743;134833-134846;135091-135106;135161-135175;135451-135464;135497-135517;135588-135603;135640-135656;135728-135741;136146-136159;136413-136429;136758-136782;137502-137520;137557-137574;137690-137708;137730-137748;137774-137793;137813-137838;137844-137862;137873-137896;138185-138198;138671-138684;138800-138813;139896-139910;139950-139963;140058-140081;140195-140211;140291-140304;140312-140326;140453-140466;140756-140769;141209-141222;141238-141255;141297-141312;141622-141639;142152-142174;142262-142281;142358-142371;142537-142559;142561-142583;142615-142637;142639-142681;142717-142730;143077-143090;143169-143182;143236-143266;143268-143283;143354-143368;143616-143646;144061-144074;144430-144458;144589-144603;144783-144796;144982-144995;145194-145208;145718-145731;145737-145754;145770-145793;145907-145924;146150-146166;146220-146235;146238-146251;146600-146629;146695-146736;146846-146864;146987-147002;147054-147079;147087-147103;147111-147128;147144-147163;147171-147185;147222-147272;147282-147295;147297-147318;147727-147755;148194-148209;148302-148316;148752-148767;149049-149067;149195-149210;149237-149250;149295-149313;149325-149338;149353-149419;149421-149457;149473-149486;149682-149700;149786-149799;149849-149868;150328-150341;150452-150465;150701-150714;150865-150880;151556-151571;151577-151590;151700-151713;151837-151855;151906-151921;152173-152186;152613-152631;152770-152785;152957-152970;153028-153074;153221-153235;153359-153376;153806-153819;153972-153986;153993-154006;154283-154296;154586-154602;154608-154621;154627-154641;154780-154796;154914-154927;155159-155172;155749-155762;155884-155900;156707-156721;156960-156976;156993-157018;157200-157216;157289-157306;157573-157591;158033-158046;158733-158747;158826-158842;159019-159032;159090-159107;159149-159162;159203-159225;159339-159361;159882-159896;160203-160224;160434-160447;160513-160526;161476-161502;162507-162542;163573-163590;164410-164423;164923-164938;165090-165103;165465-165484;165967-165980;166254-166274;166504-166519;167830-167844;168140-168153;168545-168576;169037-169050;169288-169301;169542-169555;169725-169739;169760-169774;170045-170058;170257-170273;170552-170566;170979-170995;171222-171235;171388-171401;171425-171449;171489-171511;171518-171551;171565-171581;171586-171605;171637-171651;171778-171808;171834-171850;171852-171880;171924-171937;171939-171964;171966-171983;171985-171998;172011-172034;172036-172053;172070-172083;172182-172195;172702-172717;173158-173171;173187-173200;173429-173442;173497-173510;173754-173767;173788-173801;173820-173835;173864-173881;173940-173953;174154-174167;174275-174288;174701-174740;174782-174795;174816-174829;175351-175364;175398-175412;175434-175447;175493-175506;175985-176026;176167-176219;176245-176285;176317-176348;176382-176402;176404-176423;176449-176469;176515-176555;176662-176678;176683-176708;176716-176735;176767-176801;176803-176816;176830-176846;176869-176915;176927-176948;176950-176981;176989-177008;177022-177047;177064-177078;177103-177140;177181-177206;177235-177248;177253-177269;177282-177308;177349-177366;177419-177438;177476-177498;177594-177610;177631-177658;177795-177813;177866-177886;177928-177941;177943-177957;178012-178030;178218-178231;178268-178282;178781-178795;178809-178826;179174-179187;179213-179227;179287-179306;179358-179382;179500-179519;179696-179709;180302-180316;180340-180357;180378-180393;180395-180410;180438-180454;180462-180480;180582-180596;180634-180658;180679-180693;180699-180726;および180753-180771からなる群から選択される配列番号１の領域である。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、上記に記載された標的配列の１つに存在する少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む。
【０１０１】
標的配列リスト３
いくつかの実施形態では、標的配列は、852-865;2091-2104;2620-2633;2675-2692;3441-3454;3882-3921;3970-3983;4532-4553;4814-4827;5068-5082;5167-5182;5184-5198;5430-5444;5466-5502;5511-5529;5544-5585;5610-5633;5644-5662;5695-5717;6067-6085;6087-6100;6117-6130;6859-6873;6998-7019;7033-7053;7089-7121;7131-7152;7155-7184;7206-7221;7254-7271;7273-7295;7297-7315;7381-7414;7456-7475;7478-7499;7509-7522;7618-7632;8388-8401;8508-8529;8538-8562;8596-8610;8612-8638;8655-8677;8693-8715;8944-8957;9534-9547;9914-9928;10068-10081;10252-10265;10363-10376;10402-10415;10626-10640;11437-11450;11879-11901;11981-11994;12145-12158;12980-12993;13998-14011;15098-15111;15628-15642;15749-15792;15801-15821;15847-15863;15869-15911;15931-15959;15972-15985;16019-16037;16039-16052;16740-16753;17660-17676;17696-17731;17761-17774;17800-17827;17851-17871;17878-17896;17906-17967;18825-18843;19063-19080;19821-19834;19932-19983;20024-20039;20045-20062;20090-20125;20153-20183;20196-20212;20288-20301;20416-20435;20481-20494;20715-20728;20739-20756;20808-20826;20830-20843;20847-20874;20892-20905;20932-20959;21684-21697;22764-22780;22819-22836;22856-22869;22880-22907;22979-22992;23370-23383;23917-23930;25007-25020;26048-26068;26104-26160;26170-26200;26224-26238;26270-26301;26618-26635;26843-26878;26915-26932;26945-26958;26961-26978;27013-27027;27068-27085;27218-27231;27927-27941;28777-28795;29103-29116;29389-29403;29985-29998;30360-30374;30376-30390;30768-30782;32173-32206;32237-32251;32260-32274;32334-32360;32569-32583;32597-32611;32749-32763;33254-33268;33299-33314;33492-33506;34233-34247;34360-34375;34562-34576;34689-34703;35106-35135;35142-35169;35259-35275;35280-35308;35333-35346;35382-35470;35477-35490;35494-35534;35883-35896;36784-36797;37504-37518;39690-39704;40005-40018;41020-41037;41749-41762;43000-43013;43043-43061;44274-44287;44297-44312;44707-44720;45664-45677;46383-46397;46412-46439;46690-46703;47443-47456;47692-47707;48415-48429;48575-48597;48608-48628;48637-48650;48657-48672;48712-48728;48798-48811;48826-48840;51683-51720;51734-51752;51759-51776;51795-51825;51897-51910;52031-52044;53317-53332;53975-53988;54189-54210;54303-54316;54334-54347;54425-54438;54463-54492;54557-54573;54618-54639;55625-55639;55821-55834;56023-56036;56641-56655;56689-56703;57413-57427;59206-59219;59282-59313;59328-59353;59360-59382;59384-59413;59444-59461;59505-59540;59566-59580;60084-60097;60292-60305;61606-61619;62447-62460;62763-62776;63174-63187;63859-63874;64171-64184;64462-64475;64623-64671;64800-64817;64858-64873;64875-64902;64928-64949;64959-64983;64985-65003;65044-65065;65078-65113;65115-65169;65171-65186;65188-65238;65240-65294;65323-65365;65368-65438;65448-65512;65517-65611;65619-65640;65692-65712;65714-65765;65767-65840;65842-65894;65920-65973;65985-66014;66025-66042;66074-66091;66101-66120;66156-66182;66216-66232;66266-66282;66284-66301;66324-66346;66366-66382;66406-66423;66440-66469;66480-66495;67055-67089;67091-67113;67128-67170;67186-67202;67231-67256;67258-67294;67310-67333;67336-67351;67597-67616;67754-67768;67862-67875;68793-68806;69042-69055;69686-69699;70176-70193;70622-70635;70756-70769;71228-71241;71564-71577;71926-71941;73372-73386;74239-74252;74809-74822;74848-74880;74890-74941;74963-74993;75005-75027;75037-75066;75075-75092;76262-76276;76615-76628;76940-76953;77233-77246;78634-78647;78772-78825;78867-78888;78890-78909;78914-78940;78955-78986;78989-79024;79026-79039;79041-79056;79058-79075;80011-80024;80858-80871;81031-81044;81088-81101;81166-81179;82854-82868;83250-83263;83621-83636;83781-83796;83848-83861;83867-83885;83887-83921;83927-83950;83986-84001;84015-84040;84060-84073;84075-84097;84168-84183;84302-84319;84335-84348;84368-84390;84419-84453;84480-84501;84503-84518;84534-84547;84549-84567;84569-84583;84653-84667;84693-84708;84740-84771;84776-84795;84824-84839;84855-84873;84878-84894;84896-84911;85017-85038;85059-85076;85079-85102;85113-85126;85147-85194;85252-85267;85281-85294;85359-85378;85470-85486;85668-85682;85713-85734;85771-85793;85825-85838;85842-85873;85876-85902;86132-86151;86303-86316;86438-86468;86489-86522;86524-86548;86554-86570;86575-86588;86603-86618;86636-86651;86676-86689;86717-86741;86776-86803;86965-86978;87641-87654;87707-87720;87826-87839;87845-87858;87879-87910;88019-88059;88602-88616;89155-89168;89484-89497;89866-89879;90038-90051;92157-92170;92940-92953;93333-93348;93404-93418;93488-93511;94835-94851;96790-96805;98015-98029;98877-98892;98918-98931;100403-100426;100436-100456;100462-100475;100492-100534;100562-100588;100607-100627;100653-100667;100671-100685;102125-102138;102391-102404;102992-103005;104110-104128;104153-104171;104224-104243;104336-104349;105025-105038;105219-105240;105260-105273;105287-105300;105321-105336;105353-105367;105417-105431;105462-105478;105777-105793;106242-106256;107381-107403;107554-107567;107801-107814;108248-108261;108503-108517;108882-108899;108928-108944;109070-109086;109294-109307;109411-109427;109935-109950;110122-110145;110196-110210;110366-110379;110512-110525;110563-110576;110690-110705;111068-111083;111506-111520;111626-111639;111974-111987;112693-112706;112899-112912;113806-113819;114115-114128;115700-115713;116267-116280;116833-116846;117447-117461;117562-117575;117932-117945;118556-118569;118652-118665;119346-119359;120785-120798;120858-120890;120974-120988;122466-122479;123217-123231;123785-123798;124982-124997;125621-125634;126633-126646;127044-127057;127066-127090;127108-127130;127196-127211;127244-127265;127269-127296;127322-127335;128260-128275;128300-128318;128339-128360;128363-128381;128394-128422;128425-128444;128822-128848;130000-130013;131029-131042;131184-131197;131926-131939;133001-133014;133472-133493;134969-134982;135682-135697;136759-136791;136794-136829;136858-136871;137867-137883;138425-138438;138521-138534;138969-138983;139291-139320;139337-139422;139436-139471;139515-139544;139550-139581;140314-140327;140582-140596;141239-141252;142647-142660;142816-142829;143236-143274;144208-144246;144250-144275;144308-144322;144326-144340;144348-144387;144393-144415;144431-144454;145603-145618;146615-146628;147007-147020;147063-147076;147108-147121;147267-147280;147455-147468;147480-147531;147545-147597;147601-147615;147618-147641;147644-147668;147679-147706;147708-147755;147972-147998;148303-148316;149483-149496;150121-150136;151760-151773;152089-152102;152533-152546;152616-152630;152825-152838;152956-152972;153029-153059;153061-153076;153093-153114;153125-153177;153181-153198;153211-153253;153255-153289;153301-153341;153359-153376;153381-153395;153398-153417;153421-153442;153461-153476;153483-153504;153507-153532;153577-153596;153603-153627;153629-153643;153805-153819;154379-154401;154483-154501;154535-154552;154586-154602;154823-154840;154918-154931;156311-156324;156466-156484;156521-156535;156576-156590;156614-156629;156654-156678;156707-156721;156723-156753;156777-156798;156833-156849;156871-156885;156984-157019;157078-157111;157154-157170;157192-157217;157236-157289;157293-157307;157338-157375;157412-157426;157430-157443;157561-157588;157593-157619;157628-157655;157673-157739;158005-158018;158258-158278;158422-158435;158522-158545;158694-158708;159274-159292;159346-159360;159590-159603;159859-159872;159968-159981;160208-160223;160251-160267;161102-161115;161187-161332;161337-161386;161388-161502;161618-161631;162043-162056;162561-162575;163052-163065;163084-163097;164109-164123;164923-164938;164958-164980;165017-165032;165034-165047;165049-165063;165065-165079;165134-165149;165185-165224;165467-165483;165516-165529;165587-165604;165608-165621;165644-165665;165697-165718;165720-165748;165750-165774;165777-165836;165838-165852;165862-165946;165948-165980;166005-166050;166060-166102;166122-166160;166163-166218;166220-166239;166254-166307;166312-166359;166366-166391;166508-166522;167252-167265;167319-167332;168224-168237;168272-168313;168334-168348;168356-168394;168416-168447;168477-168491;168503-168519;168541-168579;169037-169052;169342-169366;169376-169400;169411-169424;169435-169460;169496-169517;169519-169540;169555-169573;169600-169629;169631-169653;169655-169695;169697-169722;169729-169782;169791-169807;169831-169847;169850-169883;169898-169925;169937-169954;169959-169980;169982-170005;170007-170021;170036-170058;170069-170097;170105-170136;170138-170232;170247-170309;170311-170347;170350-170385;170395-170418;170434-170466;170469-170483;170485-170503;170509-170532;170534-170562;170568-170585;170624-170641;170654-170675;170685-170709;170712-170731;170745-170758;170778-170791;170859-170892;170948-170969;171019-171059;171070-171086;171090-171123;171465-171478;171526-171539;171571-171584;171645-171660;172651-172670;172985-172999;173795-173808;174279-174304;174323-174355;175105-175123;175143-175166;175221-175241;175350-175364;175493-175506;175707-175793;175804-175849;175854-175941;175944-176027;176245-176258;176323-176337;176620-176636;176719-176732;179965-179994;180044-180060;180072-180104;180136-180149;180208-180225;180266-180280、および180634-180647からなる群から選択される配列番号１の領域である。オリゴヌクレオチド、例えば、配列番号１のこれらの領域を標的（標的配列リスト３）とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＳＣＮ１０Ａ核酸標的をさらに標的とし得る。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、上記に記載された標的配列の１つに存在する少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む。
【０１０２】
標的配列リスト４
いくつかの有利な実施形態では、標的配列は、99525-99542;70094-70110;133396-133411;20666-20682;103244-103261;20666-20683;103244-103262;147238-147253;171787-171803;171787-171803;147238-147253;171788-171803;103244-103260;103244-103262;130009-130025;103244-103261;98600-98616;103244-103262;171788-171803;103244-103261;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;20666-20683;97712-97728;75261-75277;75260-75276;97713-97730;75261-75277;97712-97729;20666-20683;97712-97729;20666-20683;4426-4443;75260-75276;97715-97731;20666-20683;97712-97728;4427-4443;20666-20683;97712-97729;89475-89493;99308-99324;13076-13094;87509-87527;103272-103290;82676-82692;99526-99543;82675-82691;87510-87528;97704-97720;82675-82691;89477-89495 および13076-13094からなる群から選択される配列番号１の領域である。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、上記に記載された標的配列の１つに存在する少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む。
【０１０３】
標的配列リスト５
いくつかの有利な実施形態では、標的配列は、Ｅ１；Ｅ２；Ｅ３；Ｅ４；Ｅ５；Ｅ６；Ｅ７；Ｅ８；Ｅ９；Ｅ１０；Ｅ１１；Ｅ１２；Ｅ１３；Ｅ１４；Ｅ１５；Ｅ１６；Ｅ１７；Ｅ１８；Ｅ１９；Ｅ２０；Ｅ２１；Ｅ２２；Ｅ２３；Ｅ２４；Ｅ２５；Ｅ２６；およびＥ２７からなる群から選択される配列番号１のエクソン領域である。
【０１０４】
標的配列リスト６
いくつかの有利な実施形態では、標的配列は、Ｉ１；Ｉ２；Ｉ３；Ｉ４；Ｉ５；Ｉ６；Ｉ７；Ｉ８；Ｉ９；Ｉ１０；Ｉ１１；Ｉ１２；Ｉ１３；Ｉ１４；Ｉ１５；Ｉ１６；Ｉ１７；Ｉ１８；Ｉ１９；Ｉ２０；Ｉ２１；Ｉ２２；Ｉ２３；Ｉ２４；Ｉ２５；およびＩ２６からなる群から選択される配列番号１のイントロン領域である。
【０１０５】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、標的配列、例えば、標的配列リスト１、２、３、４、５および６に提示されるものから選択される標的配列に存在する、少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む。
【０１０６】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、標的配列、例えば、標的配列リスト１、２、３、４、５および６に提示されるものから選択される標的配列に存在する、少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、標的配列、例えば、標的配列リスト１、２、３、４、５および６に提示されるものから選択される標的配列に存在する、少なくとも１５の連続ヌクレオチドを含む。
【０１０７】
有利な標的領域
いくつかの実施形態では、本発明は、配列番号１７〜４９からなる群から選択される配列に１００％相補的である、少なくとも１２ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む本発明によるオリゴヌクレオチドを提供する。
【０１０８】
いくつかの実施形態では、本発明は、配列番号１７〜４９からなる群から選択される配列に１００％相補的である、少なくとも１４ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む本発明によるオリゴヌクレオチドを提供する。
【表５】
2021527437.tif 000006
【０１０９】
標的細胞
本明細書で使用される用語「標的細胞」は、標的核酸を発現している細胞を指す。いくつかの実施形態では、標的細胞は、インビボまたはインビトロであり得る。いくつかの実施形態では、標的細胞は、哺乳動物細胞、例えばブタ細胞もしくはげっ歯類細胞、例えばマウス細胞もしくはラット細胞、または霊長類細胞、例えばサル細胞もしくはヒト細胞である。
【０１１０】
いくつかの実施形態では、標的細胞は、Ｃ線維細胞などの後根神経節細胞、または体性感覚細胞であり得る。
【０１１１】
インビトロ評価の場合、標的細胞は、ＡＴＣＣ（ＣＲＬ−２１３７）から入手可能であり、実施例に示すようにインビトロスクリーニングに使用され得る、ＳＫ−Ｎ−ＡＳ神経芽細胞腫細胞などの確立された細胞株であり得る。他の例示的な標的細胞には、ｓｈ−ｓｙ５ｙ細胞（同じくＡＴＣＣ、ＣＲＬ−２２６６から入手可能）、またはヒトもしくはブタＩＰＳＣに由来するニューロン細胞、またはブタ一次ニューロンもしくはヒト一次ニューロンなどの一次ニューロン（後根神経節から単離された一次ニューロンなど）が含まれ、これらはインビトロスクリーニングにも使用され得る。
【０１１２】
有利には、標的細胞は、ＳＣＮ９Ａ標的を発現する。
【０１１３】
標的の阻害
本発明のオリゴヌクレオチドは、ヒトＳＣＮ９Ａ（配列番号１によってエンコードされるヒトＮａｖ１．７など）を発現している細胞において、ヒトＳＣＮ９Ａの発現をダウンレギュレート（阻害）することができる。ＳＣＮ９Ａの阻害が、細胞内のＮａｖ１．７タンパク質の阻害をもたらし、これは、Ｎａｖ１．７のタンパク質レベルまたはＮａｖ１．７活性アッセイによって判定され得る。
【０１１４】
したがって、本発明のオリゴヌクレオチドは、有利にはヒトＮａｖ１．７（配列番号１によってエンコードされるヒトＮａｖ１．７など）を発現している細胞において、ヒトＮａｖ１．７の発現をダウンレギュレート（阻害）することができる。
【０１１５】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、標的の発現を阻害またはダウンレギュレートすることにより、それを調節することができる。好ましくは、そのような調節は、標的の正常な発現レベルと比較して少なくとも２０％、より好ましくは、標的の正常な発現レベルと比較して少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、または少なくとも９０％の阻害をもたらす。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ＡＴＣＣ（ＣＲＬ−２１３７）から入手可能なＳＫ−Ｎ−ＡＳ神経芽細胞腫細胞での、５μＭオリゴヌクレオチドのジムノティック（ｇｙｍｎｏｔｉｃ）適用後、インビトロでＳＣＮ９Ａ  ｍＲＮＡの発現レベルを少なくとも５０％、または６０％阻害できる可能性がある。ジムノティック（ｇｙｍｎｏｔｉｃ）送達を使用した好適な方法の実施例を参照されたい。いくつかの実施形態では、本発明の化合物は、上記のようにＳＫ−Ｎ−ＡＳ神経芽細胞腫細胞に対して５μＭオリゴヌクレオチドを使用して、ＳＣＮ９Ａタンパク質の発現レベルをインビトロで少なくとも７０％阻害できる可能性がある。
【０１１６】
好適には、実施例は、ＳＣＮ９Ａ阻害を測定するために使用され得るアッセイを提供する。
【０１１７】
天然に存在するバリアント
用語「天然に存在するバリアント」は、標的核酸と同じ遺伝子座に由来するが、例えば、同じアミノ酸をエンコードする多数のコドンを引き起こす遺伝コードの縮重のために、またはｐｒｅ‐ｍＲＮＡの選択的スプライシング、または多型、例えば単一ヌクレオチド多型（ＳＮＰ）の存在に起因して異なり得るＳＣＮ９ＡまたはＳＣＮ１０Ａ遺伝子または転写物のバリアント、および対立遺伝子バリアントを指す。オリゴヌクレオチドに対する十分な相補的な配列の存在に基づいて、本発明のオリゴヌクレオチドは、したがって、標的核酸およびその天然に存在するバリアントを標的とし得る。
【０１１８】
いくつかの実施形態では、天然に存在するバリアントは、哺乳動物ＳＣＮ９ＡまたはＳＣＮ１０Ａ標的核酸、例えば配列番号１、２および３からなる群から選択される標的核酸に対して少なくとも９５％、例えば少なくとも９８％、または少なくとも９９％相同性を有する。いくつかの実施形態では、天然に存在するバリアントは、配列番号１として提示されるものなど、ヒトＳＣＮ９Ａ標的核酸に対して少なくとも９９％相同性を有する。
【０１１９】
発現の調節
本明細書で使用される「発現の阻害」という用語は、オリゴヌクレオチドの投与前の標的核酸または標的タンパク質の量と比較した場合に、標的核酸または標的タンパク質のレベルを低下させるオリゴヌクレオチドの能力の総称として理解されるべきである。作用機構に応じて、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸のレベルを低下させ得ること（例えば、ＲＮａｓｅＨ切断を介して）、または、例えば、スプライススイッチングまたはｐｒｅ‐ＲＮＡの調節を介して、標的核酸の機能性を低下（または機能性を変化）させ得ることが理解されるだろう。
【０１２０】
発現の阻害などの調節は、対照実験を参照することによって判定され得る。対照は、生理食塩水組成物で処理された個体もしくは標的細胞、または非標的化オリゴヌクレオチド（モック）で処理された個体もしくは標的細胞であると一般的に理解されている。
【０１２１】
調節の１つのタイプは、例えばｍＲＮＡの分解または転写の遮断により、標的または標的核酸の発現を阻害、ダウンレギュレート、低減、抑制、除去、停止、遮断、防止、減少、低下、回避または終了する、オリゴヌクレオチドの能力である。
【０１２２】
高親和性修飾ヌクレオシド
高親和性修飾ヌクレオシドは、修飾されたヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドに組み込まれると、例えば、融解温度（Ｔｍ）によって測定されるように、その相補的標的に対するオリゴヌクレオチドの親和性を高める。本発明の高親和性修飾ヌクレオシドは、好ましくは、修飾ヌクレオシドあたり＋０．５〜＋１２℃、より好ましくは＋１．５〜＋１０℃、最も好ましくは＋３〜＋８℃の融解温度の上昇をもたらす。多数の高親和性修飾ヌクレオシドが当技術分野にて既知であり、例えば、多くの２’置換ヌクレオシドおよびロックド核酸（ＬＮＡ）が含まれる（例えば、Ｆｒｅｉｅｒ＆Ａｌｔｍａｎｎ；Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９７，２５，４４２９−４４４３  ａｎｄ  Ｕｈｌｍａｎｎ；Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，２０００，３（２），２９３−２１３を参照されたい）。
【０１２３】
糖修飾
本発明のオリゴマーは、修飾された糖部分、即ち、ＤＮＡおよびＲＮＡに見られるリボース糖部分と比較した場合の糖部分の修飾を有する１つ以上のヌクレオシドを含み得る。
【０１２４】
リボース糖部分の修飾を有する多数のヌクレオシドが、親和性および／またはヌクレアーゼ耐性などのオリゴヌクレオチドの特定の特性を改善することを主な目的として作製されている。
【０１２５】
そのような修飾には、例えばヘキソース環（ＨＮＡ）または二環式環（典型的には、リボース環（ＬＮＡ）のＣ２とＣ４炭素の間にバイラジカル架橋を有する）、または典型的にはＣ２とＣ３炭素の間の結合を欠く非結合リボース環（例えば、ＵＮＡ）で置き換えることにより、リボース環構造が修飾されているものが含まれる。他の糖修飾ヌクレオシドには、例えばビシクロヘキソース核酸（国際公開第２０１１／０１７５２１号）または三環式核酸（国際公開第２０１３／１５４７９８号）が含まれる。修飾ヌクレオシドには、例えばペプチド核酸（ＰＮＡ）の場合には、糖部分が非糖部分で置き換えられているヌクレオシド、またはモルホリノ核酸も含まれる。
【０１２６】
糖修飾には、リボース環上の置換基を水素以外の基、またはＤＮＡおよびＲＮＡヌクレオシドに天然に存在する２’−ＯＨ基に変更することによる修飾も含まれる。置換基は、例えば２’、３’、４’または５’位で導入され得る。
【０１２７】
２’糖修飾ヌクレオシド
２’糖修飾ヌクレオシドは、２’位にＨまたは−ＯＨ以外の置換基を有し（２’置換ヌクレオシド）、または２’炭素とリボース環の第２の炭素との間に架橋を形成できる２’結合バイラジカル、例えばＬＮＡ（２’−４’バイラジカル架橋）を含むヌクレオシドである。
【０１２８】
実際、２’糖置換ヌクレオシドの開発には多くの注目が集まっており、多くの２’置換ヌクレオシドが、オリゴヌクレオチドに組み込まれた際に有益な特性を有することが見出されている。例えば、２’修飾糖は、向上された結合親和性、および／または増大されたヌクレアーゼ耐性をオリゴヌクレオチドに提供することができる。２’置換修飾ヌクレオシドの例は、２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メチル−ＲＮＡ、２’−アルコキシ−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メトキシエチル−ＲＮＡ（ＭＯＥ）、２’−アミノ−ＤＮＡ、２’−フルオロ−ＲＮＡおよび２’−Ｆ−ＡＮＡヌクレオシドである。さらなる例については、例えばＦｒｅｉｅｒ＆Ａｌｔｍａｎｎ；Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄ  Ｒｅｓ．，１９９７，２５，４４２９−４４４３およびＵｈｌｍａｎｎ；Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ  ｉｎ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ，２０００，３（２），２９３−２１３、およびＤｅｌｅａｖｅｙ  ａｎｄ  Ｄａｍｈａ，Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ａｎｄ  Ｂｉｏｌｏｇｙ  ２０１２，１９，９３７を参照されたい。以下は、いくつかの２’置換修飾ヌクレオシドの説明である。
【化１】
2021527437.tif 000007
【０１２９】
本発明に関連して、２’置換糖修飾ヌクレオシドは、ＬＮＡのような２’架橋ヌクレオシドを含まない。
【０１３０】
ロックド核酸ヌクレオシド（ＬＮＡヌクレオシド）
「ＬＮＡヌクレオシド」は、前記ヌクレオシドのリボース糖環のＣ２’とＣ４’を結合するバイラジカル（「２’−４’架橋」とも称される）を含む２’修飾ヌクレオシドであり、これはリボース環の立体配座を制限または固定する。これらのヌクレオシドは、文献にて架橋核酸または二環式核酸（ＢＮＡ）とも称されている。リボースのコンフォメーションの固定は、ＬＮＡが相補的ＲＮＡまたはＤＮＡ分子のオリゴヌクレオチドに組み込まれる場合、ハイブリダイゼーションの親和性の向上（二重鎖安定化）に関連している。これは通常、オリゴヌクレオチド／補完二重鎖の融解温度を測定することにより決定され得る。
【０１３１】
非限定的な、例示的なＬＮＡヌクレオシドは、国際公開第９９／０１４２２６号、国際公開第００／６６６０４号、国際公開第９８／０３９３５２号、国際公開第２００４／０４６１６０号、国際公開第００／０４７５９９号、国際公開第２００７／１３４１８１号、国際公開第２０１０／０７７５７８号、国際公開第２０１０／０３６６９８号、国際公開第２００７／０９００７１号、国際公開第２００９／００６４７８号、国際公開第２０１１／１５６２０２号、国際公開第２００８／１５４４０１号、国際公開第２００９／０６７６４７号、国際公開第２００８／１５０７２９号、Ｍｏｒｉｔａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．１２，７３−７６，Ｓｅｔｈ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．２０１０，Ｖｏｌ  ７５（５）ｐｐ．１５６９−８１，ａｎｄ  Ｍｉｔｓｕｏｋａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ２００９，３７（４），１２２５−１２３８，ａｎｄ  Ｗａｎ  ａｎｄ  Ｓｅｔｈ，Ｊ．Ｍｅｄｉｃａｌ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ２０１６，５９，９６４５−９６６７に開示されている。
【０１３２】
さらなる非限定的な、例示的ＬＮＡヌクレオシドは、スキーム１に開示されている。
スキーム１：
【化２】
2021527437.tif 000008
【０１３３】
特定のＬＮＡヌクレオシドは、β−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ、６’−メチル−β−Ｄ−オキシＬＮＡ、例えば（Ｓ）−６’−メチル−β−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ（ＳｃＥＴ）およびＥＮＡである。
【０１３４】
特定の有利なＬＮＡは、β−Ｄ−オキシ−ＬＮＡである。
【０１３５】
本明細書に記載される化合物は、数個の不斉中心を含むことができ、光学的に純粋なエナンチオマー、例えばラセミ体などのエナンチオマーの混合物、ジアステレオ異性体の混合物、ジアステレオ異性体ラセミ体またはジアステレオ異性体ラセミ体の混合物として存在することができる。
【０１３６】
用語「不斉炭素原子」は、４つの異なる置換基を有する炭素原子を意味する。Ｃａｈｎ−Ｉｎｇｏｌｄ−Ｐｒｅｌｏｇ則によれば、不斉炭素原子は、「Ｒ」または「Ｓ」立体配置のものであり得る。
【０１３７】
医薬的に許容される塩
「医薬的に許容される塩」という用語は、生物学的にまたは別様に望ましくないものではない、遊離塩基または遊離酸の生物学的有効性および特性を保有する塩を指す。塩は、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、リン酸などの無機酸、特に塩酸、および酢酸、プロピオン酸、グリコール酸、ピルビン酸、シュウ酸、マレイン酸、マロン酸、コハク酸、フマル酸、酒石酸、クエン酸、安息香酸、ケイ皮酸、マンデル酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸、Ｎ−アセチルシステインなどの有機酸と共に形成される。加えて、これらの塩は、無機塩基または有機塩基を遊離酸に加えることにより調製され得る。無機塩基から誘導される塩には、ナトリウム、カリウム、リチウム、アンモニウム、カルシウム、マグネシウム塩が含まれるがこれらに限定されない。有機塩基から誘導される塩には、第１級、第２級、および第３級アミン、天然に存在する置換アミンを含む置換アミン、環式アミンおよび塩基性イオン交換樹脂、例えばイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ジエチルアミン、トリエチルアミン、トリプロピルアミン、エタノールアミン、リシン、アルギニン、Ｎ−エチルピペリジン、ピペリジン、ポリアミン樹脂の塩が含まれるがこれらに限定されない。式（Ｉ）の化合物は、双性イオンの形態で存在することもできる。特に好ましくは、式（Ｉ）の化合物の医薬的に許容される塩は、塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸およびメタンスルホン酸の塩である。
【０１３８】
保護基
用語「保護基」は、単独または組み合わせで、化学反応が他の非保護の反応性部位で選択的に行われ得るように、多官能化合物の反応性部位を選択的に遮断する基を意味する。保護基は、除去することができる。例示的な保護基は、アミノ保護基、カルボキシ保護基またはヒドロキシ保護基である。
【０１３９】
ヌクレアーゼ媒介分解
ヌクレアーゼ媒介分解は、相補的なヌクレオチド配列と二重鎖を形成するときに、そのような配列の分解を媒介することができるオリゴヌクレオチドを指す。
【０１４０】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的核酸のヌクレアーゼ媒介分解を介して機能し得、ここで本発明のオリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼ、特にエンドヌクレアーゼ、好ましくはＲＮａｓｅＨなどのエンドリボヌクレアーゼ（ＲＮａｓｅ）を動員することができる。ヌクレアーゼ媒介機構を介して機能するオリゴヌクレオチド設計の例は、典型的には少なくとも５または６の連続ＤＮＡヌクレオシドの領域を含み、親和性増強ヌクレオシド、例えばギャップマー、ヘッドマーおよびテイルマーが片側または両側に隣接するオリゴヌクレオチドである。
【０１４１】
ＲＮａｓｅＨの活性および動員
アンチセンスオリゴヌクレオチドのＲＮａｓｅＨ活性は、相補的ＲＮＡ分子と二重鎖を形成するときにＲＮａｓｅＨを動員する、その能力を指す。国際公開第０１／２３６１３号は、ＲＮａｓｅＨ活性を決定するインビトロ方法を提供し、これはＲＮａｓｅＨを動員する能力の決定に使用され得る。典型的には、オリゴヌクレオチドは、相補的な標的核酸配列が提供された場合、ｐｍｏｌ／ｌ／分で測定して、試験されている修飾オリゴヌクレオチドと同じ塩基配列を有するが、ＤＮＡモノマーのみを含み、オリゴヌクレオチドの全モノマー間にホスホロチオエート結合を有するオリゴヌクレオチドを使用し、また国際公開第０１／２３６１３号（参照により本明細書に組み込まれる）の実施例９１〜９５により提供される方法論を使用したときに決定された初期率の少なくとも５％、例えば少なくとも１０％または２０％超を有する場合に、ＲＮａｓｅＨを動員することができると見なされる。ＲＨａｓｅ  Ｈ活性の測定に使用するために、組換えヒトＲＮａｓｅＨ１がＬｕｂｉｏ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ＧｍｂＨ，Ｌｕｃｅｒｎｅ，Ｓｗｉｔｚｅｒｌａｎｄから入手可能である。
【０１４２】
ギャップマー
本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、またはその連続ヌクレオチド配列は、ギャップマーであり得、ギャップマーオリゴヌクレオチドまたはギャップマー設計とも呼ばれ得る。アンチセンスギャップマーは、通常、ＲＮａｓｅ媒介分解を介して標的核酸を阻害するのに使用される。ギャップマーオリゴヌクレオチドは、少なくとも３つの区別される構造領域、５’−フランク、ギャップおよび３’−フランク、Ｆ−Ｇ−Ｆ’を５’−＞３’配向で含む。「ギャップ」領域（Ｇ）は、オリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅＨを動員することを可能にする、連続ＤＮＡヌクレオチドの伸長を含む。ギャップ領域は、１つ以上の糖修飾ヌクレオシド、有利には高親和性糖修飾ヌクレオシドを含む５’フランク領域（Ｆ）、および１つ以上の糖修飾ヌクレオシド、有利には高親和性糖修飾ヌクレオシドを含む３’フランク領域（Ｆ’）が隣接する。領域ＦおよびＦ’の１つ以上の糖修飾ヌクレオシドは、標的核酸に対するオリゴヌクレオチドの親和性を増強する（即ち、これは親和性増強糖修飾ヌクレオシドである）。いくつかの実施形態では、領域ＦおよびＦ’の１つ以上の糖修飾ヌクレオシドは、２’糖修飾ヌクレオシド、例えばＬＮＡおよび２’−ＭＯＥから独立して選択される、例えば高親和性２’糖修飾である。
【０１４３】
ギャップマー設計において、ギャップ領域のほとんどの５’および３’ヌクレオシドはＤＮＡヌクレオシドであり、各々、５’（Ｆ）または３’（Ｆ’）領域の糖修飾ヌクレオシドに隣接して配置されている。フランクはさらに、ギャップ領域から最も遠い端、即ち５’フランクの５’末端および３’フランクの３’末端に、少なくとも１つの糖修飾ヌクレオシドを有することによって定義されてもよい。
【０１４４】
領域Ｆ−Ｇ−Ｆ’は、連続ヌクレオチド配列を形成する。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチド、またはその連続ヌクレオチド配列は、式Ｆ−Ｇ−Ｆ’のギャップマー領域を含んでもよい。
【０１４５】
ギャップマー設計Ｆ−Ｇ−Ｆ’の全長は、例えば１２〜３２ヌクレオシド、例えば１３〜２４、例えば１４〜２２ヌクレオシド、例えば１４〜１７、例えば１６〜１８ヌクレオシドであってもよい。
【０１４６】
例として、本発明のギャップマーオリゴヌクレオチドは、以下の式、
Ｆ１−８−Ｇ６−１６−Ｆ’１−８、例えば
Ｆ１−８−Ｇ８−１６−Ｆ’２−８によって表すことができる。
【０１４７】
ただし、ギャップマー領域Ｆ−Ｇ−Ｆ’の全長は、少なくとも１２、例えば少なくとも１４ヌクレオチド長であることを条件とする。
【０１４８】
本発明の一態様では、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列は、式５’−Ｆ−Ｇ−Ｆ’−３’のギャップマーからなるか、またはそれを含み、ここで、領域ＦおよびＦ’は独立して、１〜８、例えば２〜６、例えば３〜４の２’糖修飾ヌクレオシドを含むか、またはそれからなる。ここで、領域Ｆの３’末端（領域ＧのＤＮＡヌクレオシドに隣接して）に位置する少なくとも１つの２’糖修飾ヌクレオシド、および領域Ｆ’の５’末端に位置する（領域ＧのＤＮＡヌクレオシドに隣接して位置する）少なくとも１つの２’糖修飾ヌクレオシドが存在し、Ｇは、ＲＮａｓｅＨを動員することができる６〜１６のヌクレオシドの領域、例えば６〜１６のＤＮＡヌクレオシド、例えば１０〜１５の連続ＤＮＡヌクレオチド、例えば１０〜１４の連続ＤＮＡヌクレオチド、例えば１１〜１５の連続ＤＮＡヌクレオチド、例えば１３〜１５の連続ＤＮＡヌクレオチドの領域である。
【０１４９】
ＬＮＡギャップマー
ＬＮＡギャップマーは、領域ＦおよびＦ’のいずれか一方または両方がＬＮＡヌクレオシドを含むか、またはＬＮＡヌクレオシドからなるギャップマーである。β−Ｄ−オキシギャップマーは、領域ＦおよびＦ’のいずれか一方または両方がβ−Ｄ−オキシＬＮＡヌクレオシドを含むか、またはβ−Ｄ−オキシＬＮＡヌクレオシドからなるギャップマーである。
【０１５０】
いくつかの実施形態では、ＬＮＡギャップマーは、式：［ＬＮＡ］１−５−［領域Ｇ］−［ＬＮＡ］１−５のものであり、式中、領域Ｇは、ギャップマー領域Ｇの定義で定義した通りである。
【０１５１】
ＭＯＥギャップマー
ＭＯＥギャップマーは、領域ＦおよびＦ’がＭＯＥヌクレオシドからなるギャップマーである。いくつかの実施形態では、ＭＯＥギャップマーは、設計［ＭＯＥ］１−８−［領域Ｇ］−［ＭＯＥ］１−８、例えば［ＭＯＥ］２−７−［領域Ｇ］５−１６−［ＭＯＥ］２−７、例えば［ＭＯＥ］３−６−［領域Ｇ］−［ＭＯＥ］３−６のものであり、領域Ｇは、ギャップマーの定義で定義した通りである。５−１０−５設計（ＭＯＥ−ＤＮＡ−ＭＯＥ）を有するＭＯＥギャップマーは、当技術分野で広く使用されている。
【０１５２】
混合ウイングギャップマー
混合ウイングギャップマーは、領域ＦおよびＦ’の一方または両方が、２’置換ヌクレオシド、例えば２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ単位、２’−Ｏ−メチル−ＲＮＡ、２’−アミノ−ＤＮＡ単位、２’−フルオロ−ＤＮＡ単位、２’−アルコキシ−ＲＮＡ、ＭＯＥ単位、アラビノ核酸（ＡＮＡ）単位および２’−フルオロ−ＡＮＡ単位から独立して選択される２’置換ヌクレオシド、例えばＭＯＥヌクレオシドを含むＬＮＡギャップマーである。領域ＦおよびＦ’の少なくとも一方、または領域ＦおよびＦ’の両方が少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドを含むいくつかの実施形態では、領域ＦおよびＦ’の残りのヌクレオシドは、ＭＯＥおよびＬＮＡからなる群から独立して選択される。領域ＦおよびＦ’の少なくとも一方、または領域ＦおよびＦ’の両方が少なくとも２つのＬＮＡヌクレオシドを含むいくつかの実施形態では、領域ＦおよびＦ’の残りのヌクレオシドは、ＭＯＥおよびＬＮＡからなる群から独立して選択される。いくつかの混合ウイング実施形態では、領域ＦおよびＦ’の一方または両方が、１つ以上のＤＮＡヌクレオシドをさらに含んでもよい。
【０１５３】
混合ウイングギャップマーの設計は、国際公開第２００８／０４９０８５号および国際公開第２０１２／１０９３９５号に開示されている。
【０１５４】
交互フランクギャップマー
フランク領域は、ＬＮＡおよびＤＮＡヌクレオシドの両方を含み得、それらがＬＮＡ−ＤＮＡ−ＬＮＡヌクレオシドの交互のモチーフを含むので、「交互フランク」と呼ばれる。このような交互フランクを含むギャップマーは、「交互フランクギャップマー」と呼ばれる。したがって「交互フランクギャップマー」は、フランクの少なくとも１つ（ＦまたはＦ’）が、ＬＮＡヌクレオシドに加えてＤＮＡを含むＬＮＡギャップマーオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、領域ＦもしくはＦ’の少なくとも１つ、または領域ＦおよびＦ’の両方は、ＬＮＡヌクレオシドおよびＤＮＡヌクレオシドの両方を含む。そのような実施形態では、フランク領域ＦもしくはＦ’、またはＦおよびＦ’の両方は、少なくとも３つのヌクレオシドを含み、Ｆおよび／またはＦ’領域の５’および３’のほとんどのヌクレオシドは、ＬＮＡヌクレオシドである。
【０１５５】
交互フランク領域は、最大３つの連続ＤＮＡヌクレオシド、例えば１〜２つまたは１つまたは２つまたは３つの連続ＤＮＡヌクレオシドを含み得る。
【０１５６】
オリゴヌクレオチドにおける領域Ｄ’またはＤ”
本発明のオリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列、例えばギャップマーＦ−Ｇ−Ｆ’、ならびにさらなる５’および／または３’ヌクレオシドを含み、またはそれからなり得る。さらなる５’および／または３’ヌクレオシドは、標的核酸に完全に相補的であってもよく、または完全に相補的でなくてもよい。このようなさらなる５’および／または３’ヌクレオシドは、本明細書で領域Ｄ’およびＤ”と称され得る。
【０１５７】
領域Ｄ’またはＤ”の追加は、連続ヌクレオチド配列、例えばギャップマーをコンジュゲート部分または他の官能基に連結することを目的として用いられ得る。連続ヌクレオチド配列をコンジュゲート部分に連結するのに使用する場合、生体切断可能なリンカーとしての役割を果たし得る。あるいは、それはエキソヌクレアーゼ保護を提供するために、または合成もしくは製造を容易にするために使用され得る。
【０１５８】
領域Ｄ’およびＤ”は、各々、領域Ｆの５’末端または領域Ｆ’の３’末端に結合されて、以下の式Ｄ’−Ｆ−Ｇ−Ｆ’、Ｆ−Ｇ−Ｆ’−Ｄ”またはＤ’−Ｆ−Ｇ−Ｆ’−Ｄ”の設計を生成することができる。この場合、Ｆ−Ｇ−Ｆ’はオリゴヌクレオチドのギャップマー部分であり、領域Ｄ’またはＤ”は、オリゴヌクレオチドの別個の部分を構成する。
【０１５９】
領域Ｄ’またはＤ”は、独立して、１、２、３、４または５個の追加のヌクレオチドを含み、またはそれからなり、標的核酸に相補的であっても、または相補的でなくてもよい。ＦまたはＦ’領域に隣接するヌクレオチドは、ＤＮＡまたはＲＮＡまたはこれらの塩基修飾バージョンなどの糖修飾ヌクレオチドではない。Ｄ’およびＤ”領域は、ヌクレアーゼ感受性の生体切断可能なリンカーとしての役割を果たし得る（リンカーの定義を参照されたい）。いくつかの実施形態では、追加の５’および／または３’末端ヌクレオチドは、ホスホジエステル結合で連結され、ＤＮＡまたはＲＮＡである。領域Ｄ’およびＤ”としての使用に好適なヌクレオチドベースの生体切断可能なリンカーは、国際公開第２０１４／０７６１９５号に開示されており、これは例としてホスホジエステル結合ＤＮＡジヌクレオチドを含む。ポリオリゴヌクレオチド構築物における生体切断可能なリンカーの使用は、国際公開第２０１５／１１３９２２号に開示されており、それらは複数のアンチセンス構築物（例えば、ギャップマー領域）を単一のオリゴヌクレオチド内で結合するのに使用されている。
【０１６０】
一実施形態において、本発明のオリゴヌクレオチドは、ギャップマーを構成する連続ヌクレオチド配列に加えて、領域Ｄ’および／またはＤ”を含む。
【０１６１】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、以下の式により表すことができる。
Ｆ−Ｇ−Ｆ’、特にＦ１−８−Ｇ６−１６−Ｆ’２−８
Ｄ’−Ｆ−Ｇ−Ｆ’、特にＤ’１−３−Ｆ１−８−Ｇ６−１６−Ｆ’２−８
Ｆ−Ｇ−Ｆ’−Ｄ’’、特にＦ１−８−Ｇ６−１６−Ｆ’２−８−Ｄ’’１−３
Ｄ’−Ｆ−Ｇ−Ｆ’−Ｄ’’、特にＤ’１−３−Ｆ１−８−Ｇ６−１６−Ｆ’２−８−Ｄ’’１−３
【０１６２】
いくつかの実施形態では、領域Ｄ’と領域Ｆとの間に位置するヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。いくつかの実施形態では、領域Ｆ’と領域Ｄ”の間に位置するヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル結合である。
【０１６３】
コンジュゲート
本明細書で使用されるコンジュゲートという用語は、非ヌクレオチド部分に共有結合したオリゴヌクレオチドを指す（コンジュゲート部分または領域Ｃまたは第３の領域）。
【０１６４】
１つ以上の非ヌクレオチド部分に対する本発明のオリゴヌクレオチドのコンジュゲーションは、例えば、オリゴヌクレオチドの活性、細胞分布、細胞取り込み、または安定性に影響を及ぼすことにより、オリゴヌクレオチドの薬理学を改善することができる。いくつかの実施形態では、コンジュゲート部分は、オリゴヌクレオチドの細胞分布、バイオアベイラビリティ、代謝、排泄、浸透性、および／または細胞取り込みを改善することにより、オリゴヌクレオチドの薬物動態特性を調節または向上させる。特に、コンジュゲートは、オリゴヌクレオチドを特定の器官、組織または細胞型に標的化し、それにより、その器官、組織または細胞型におけるオリゴヌクレオチドの有効性を増強し得る。同時に、コンジュゲートは、非標的細胞型、組織または器官内のオリゴヌクレオチドの活性を低下させるのに役立ち得る（例えば、非標的細胞型、組織または器官内のオフ標的活性または活性）。
【０１６５】
一実施形態では、非ヌクレオチド部分（コンジュゲート部分）は、炭水化物、細胞表面受容体リガンド、原薬、ホルモン、親油性物質、ポリマー、タンパク質、ペプチド、毒素（例えば、細菌毒素）、ビタミン、ウイルスタンパク質（例えば、キャプシド）またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
【０１６６】
リンカー
リンケージまたはリンカーは、１つ以上の共有結合を介して、対象の化学基またはセグメントを別の化学基またはセグメントに連結する、２つの原子間の接続である。コンジュゲート部分は、直接または連結部分（例えば、リンカーまたはテザー）を介してオリゴヌクレオチドに付着させることができる。リンカーは、第３の領域、例えばコンジュゲート部分（領域Ｃ）を、第１の領域、例えば標的核酸（領域Ａ）に相補的なオリゴヌクレオチドまたは連続ヌクレオチド配列に共有結合する役割を果たす。
【０１６７】
本発明のいくつかの実施形態では、本発明のコンジュゲートまたはオリゴヌクレオチドコンジュゲートは、場合により、標的核酸に相補的なオリゴヌクレオチドまたは連続ヌクレオチド配列（領域Ａまたは第１の領域）の間に位置するリンカー領域（第２の領域または領域Ｂおよび／または領域Ｙ）と、コンジュゲート部分（領域Ｃまたは第３の領域）とを含み得る。
【０１６８】
領域Ｂは、哺乳動物の体内で通常遭遇するまたは遭遇するものに類似した条件下で切断可能である生理学的に不安定な結合を含み、またはそれからなる生体切断可能なリンカーを指す。生理学的に不安定なリンカーが化学的変換（例えば、切断）を受ける条件には、ｐＨ、温度、酸化もしくは還元条件または薬剤などの化学条件、および哺乳動物細胞で見られるまたは遭遇するものに類似した塩濃度が含まれる。哺乳動物の細胞内条件には、タンパク質分解酵素または加水分解酵素またはヌクレアーゼなどの哺乳動物細胞に通常存在する酵素活性の存在も含まれる。一実施形態では、生体切断可能なリンカーは、Ｓ１ヌクレアーゼ切断の影響を受けやすい。好ましい実施形態では、ヌクレアーゼ感受性リンカーは、１〜１０のヌクレオシド、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０のヌクレオシド、より好ましくは２〜６のヌクレオシド、最も好ましくは少なくとも２つの連続したホスホジエステル結合、例えば少なくとも３または４または５の連続したホスホジエステル結合を含む、２〜４の結合したヌクレオシドを含む。好ましくは、ヌクレオシドは、ＤＮＡまたはＲＮＡである。ホスホジエステルを含む生体切断可能なリンカーは、国際公開第２０１４／０７６１９５号（参照により本明細書に組み込まれる）により詳細に記載されており、本明細書の領域Ｄ’またはＤ”も参照されたい。
【０１６９】
領域Ｙは、必ずしも生体切断可能ではないが、主にコンジュゲート部分（領域Ｃまたは第３の領域）をオリゴヌクレオチド（領域Ａまたは第１の領域）に共有結合させるのに役立つリンカーを指す。領域Ｙリンカーは、エチレングリコール、アミノ酸単位またはアミノアルキル基などの繰り返し単位の鎖構造またはオリゴマーを含み得る。本発明のオリゴヌクレオチドコンジュゲートは、領域要素Ａ−Ｃ、Ａ−Ｂ−Ｃ、Ａ−Ｂ−Ｙ−Ｃ、Ａ−Ｙ−Ｂ−ＣまたはＡ−Ｙ−Ｃで構成され得る。いくつかの実施形態では、リンカー（領域Ｙ）は、例えばＣ６〜Ｃ１２アミノアルキル基を含むＣ２〜Ｃ３６アミノアルキル基などのアミノアルキルである。好ましい実施形態では、リンカー（領域Ｙ）は、Ｃ６アミノアルキル基である。
【０１７０】
治療
本明細書で使用される用語「治療」は、既存の疾患（例えば、本明細書で言及される疾患または障害）の治療、または疾患の予防（ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ）、即ち予防（ｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ）の両方を指す。したがって、本明細書で言及される治療は、いくつかの実施形態では、予防的であり得ることが認識されるであろう。
【０１７１】
いくつかの実施形態では、治療は、慢性疼痛を患っている、または慢性疼痛を患うと予想される（予防的治療）対象に対して行われる。
【発明を実施するための形態】
【０１７２】
本発明のオリゴヌクレオチド
本発明は、ＳＣＮ９ＡもしくはＳＣＮ１０Ａ、またはＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａの両方などの核酸をエンコードする電位依存性ナトリウムイオンチャネルを阻害することができるオリゴヌクレオチドに関する。
【０１７３】
本発明は、Ｎａｖ１．７もしくはＮａｖ１．８、またはＮａｖ１．７もしくはＮａｖ１．８の両方などの電位依存性ナトリウムイオンチャネルの発現を阻害することができるオリゴヌクレオチドに関する。Ｎａｖ１．７およびＮａｖ１．８（または場合によりＮａｖ１．９）の両方を標的とするオリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａの転写物（または場合によりＳＣＮ１１Ａ）間の同一性、または高い配列類似性を有する領域を選択することによって設計され得る。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ転写物の両方を標的とし得、ここで、オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ転写物の一方に完全に相補的であり、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ転写物のもう片方に対して単一のミスマッチしか有さない。いくつかの実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、連続ヌクレオチド配列の同じ位置にあるＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ転写物の両方に対する単一のミスマッチを含む。いくつかの実施形態では、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ転写物の一方または両方に対するミスマッチの部位に、ユニバーサル塩基を含めることが有用である。
【０１７４】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０Ａ転写物の両方を標的とし得、ここで、オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物の一方に完全に相補的であり、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物のもう片方に対して単一のミスマッチしか有さない。いくつかの実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、連続ヌクレオチド配列の同じ位置にあるＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物の両方に対する単一のミスマッチを含む。いくつかの実施形態では、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物の一方または両方に対するミスマッチの部位に、ユニバーサル塩基を含めることが有用である。
【０１７５】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ９ＡおよびＳＣＮ１０ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物を標的とし得、ここで、オリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、ＳＣＮ９Ａ、ＳＣＮ１０ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物の一つに完全に相補的であり、ＳＣＮ９Ａ、ＳＣＮ１０ＡおよびＳＣＮ１１Ａ転写物のその他に対して単一のミスマッチしか有さない。ヒトＳＣＮ１１Ａ  ｐｒｅ−ｍＲＮＡ転写物は、ＥＮＳＧ０００００１６８３５６（ＥｎｓｅｍｂｌバージョンＥＮＳＧ０００００１６８３５６．１１）として開示されている。
【０１７６】
調節は、電位依存性ナトリウムイオンチャネルをエンコードする標的核酸にハイブリダイズすることによって達成することができる。標的核酸は、配列番号１、２、および３からなる群から選択される配列など、哺乳動物ＳＣＮ９ＡまたはＳＣＮ１０Ａ配列であり得る。
【０１７７】
本発明のオリゴヌクレオチドは、ＳＣＮ９ＡまたはＳＣＮ１０Ａを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的核酸に存在する標的配列に相補的である。適切な標的領域は、本明細書に開示されている（例えば、標的配列リスト１、２、３、および４を参照のこと）。
【０１７８】
特定の図示された標的配列は、配列番号１７〜４９である。
【０１７９】
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、配列番号１の選択された標的配列Ｉ１〜Ｉ２６などのＳＣＮ９Ａ標的核酸配列のイントロン領域に、少なくとも９０％相補的、例えば完全に相補的である。
【０１８０】
いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、配列番号１の選択された標的配列Ｅ１〜Ｅ２７などのＳＣＮ９Ａ標的核酸配列のエクソン領域に、少なくとも９０％相補的、例えば完全に相補的である。
【０１８１】
連続ヌクレオチド配列
いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号５０〜６４１からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１８２】
いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号５０〜６４１からなる群から選択される配列と同一である、少なくとも１２ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１８３】
いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号５０〜６４１からなる群から選択される配列と同一である、少なくとも１４ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１８４】
同一性の決定では、特に明記しない限り、完全な同一性を意味し、配列番号５０〜６４１からなる群から選択される配列と同一である連続ヌクレオチド配列を含む本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドの同一性が、連続ヌクレオチド配列の全長にわたって測定される。いくつかの実施形態では、本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、配列番号５０〜６４１からなる群から選択される配列を含む。
【０１８５】
アンチセンスオリゴヌクレオチドは、参照配列に非修飾塩基が示されている修飾塩基を含み得、例えば、Ｔの代わりにＵ塩基を使用しても、Ｃの代わりに５−メチルシトシンを使用してもよいことが理解されよう。
【表６】
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【０１８６】
本発明は、配列番号５０〜６４１からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【０１８７】
本発明は、配列番号６４２〜６５０からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【０１８８】
本発明は、配列番号５０〜６４１または配列番号６４２−６５０からなる群から選択される配列と同一である、少なくとも１２の連続ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【０１８９】
本発明は、配列番号５０〜６４１または配列番号６４２−６５０からなる群から選択される配列と同一である、少なくとも１４の連続ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。
【０１９０】
いくつかの実施形態では、配列番号５０〜６４１または配列番号６４２〜６５０を参照して、Ｔは、ＴまたはＵ核酸塩基のいずれかを表し得、Ｃは、Ｃまたは５−メチルＣ核酸塩基を表し得る。
【０１９１】
いくつかの実施形態では、配列番号５０〜６４１または配列番号６４２〜６５０を参照して、Ｔは、Ｔ核酸塩基であり、Ａは、Ａ核酸塩基であり、Ｇは、Ｇ核酸塩基であり、Ｃは、Ｃまたは５−メチルＣ核酸塩基を表すことができる。
【０１９２】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチド配列または連続ヌクレオチド配列は、配列番号１に存在する、対応する標的核酸領域（標的配列）に１００％相補的である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド配列または連続ヌクレオチド配列は、配列番号１および配列番号２に存在する、対応する標的核酸領域に対して１００％相補的である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド配列、連続ヌクレオチド配列は、配列番号１、２および３に存在する、対応する標的核酸領域に対して１００％相補的である。
【０１９３】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的配列番号リスト１のいずれかの領域から選択される、対応する標的配列に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する、１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１９４】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的配列番号リスト２のいずれかの領域から選択される、対応する標的配列に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する、１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１９５】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的配列番号リスト３のいずれかの領域から選択される、対応する標的配列に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する、１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１９６】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的配列番号リスト４のいずれかの領域から選択される、対応する標的配列に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する、１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１９７】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列番号１７〜４９から選択される、対応する標的配列に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する、１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む。
【０１９８】
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、99525-99542;70094-70110;133396-133411;20666-20682;103244-103261;20666-20683;103244-103262;147238-147253;171787-171803;171787-171803;147238-147253;171788-171803;103244-103260;103244-103262;130009-130025;103244-103261;98600-98616;103244-103262;171788-171803;103244-103261;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;70094-70110;20666-20683;97712-97728;75261-75277;75260-75276;97713-97730;75261-75277;97712-97729;20666-20683;97712-97729;20666-20683;4426-4443;75260-75276;97715-97731;20666-20683;97712-97728;4427-4443;20666-20683;97712-97729;89475-89493;99308-99324;13076-13094;87509-87527;103272-103290;82676-82692;99526-99543;82675-82691;87510-87528;97704-97720;82675-82691;89477-89495 および13076-13094からなる群から選択される配列番号１の標的配列に対して少なくとも９０％の相補性、例えば、１００％の相補性を有する、１２〜２２ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含み、またはそれからなる。そのようなオリゴヌクレオチドは、ＬＮＡギャップマーなどのギャップマーであり得る。
【０１９９】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、３０１、３１１、３１２、３２３、３４２、３４３、および３９４からなる群から選択される配列を含まない。
【０２００】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、３０１、３１１、３１２、３２３、３４２、３４３、および３９４からなる群から選択される配列と同一である１０以上の連続ヌクレオチドの配列を含まない。
【０２０１】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、３０１、３１１、３１２、３２３、３４２、３４３、および３９４からなる群から選択される配列と同一である１２以上の連続ヌクレオチドの配列を含まない。
【０２０２】
ミスマッチ
有利には、本発明のオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列は、標的核酸配列、例えば配列番号１、例えば標的配列リスト１、２、３および４または配列番号１７〜４９に開示されるものから選択される標的配列に対し、完全に相補的である。
【０２０３】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間のミスマッチを含む。ミスマッチにもかかわらず、標的核酸へのハイブリダイゼーションは、ＳＣＮ９Ａ発現の所望の調節を示すのに尚十分であり得る。ミスマッチから生じる結合親和性の低下は、オリゴヌクレオチド内のヌクレオチド数の増加、および／または標的への結合親和性を増加させることができる修飾ヌクレオシド、例えばオリゴヌクレオチド配列内に存在する、ＬＮＡを含む２’糖修飾ヌクレオシドの数の増加により有利に補償され得る。
【０２０４】
本出願に記載される態様は、配列番号１対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む、１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンスオリゴヌクレオチドに関する。連続ヌクレオチド配列は、同じ長さであるか、またはいくつかの実施形態ではアンチセンスオリゴヌクレオチドよりも短くてもよい（オリゴヌクレオチドの配列は連続ヌクレオチド配列を含み得るか、またはそれからなり得る）ことが一般に理解される。
【０２０５】
オリゴヌクレオチドの長さ
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、１０〜３０ヌクレオチド長、例えば１１〜２８、例えば１０〜２２、例えば１２〜２２、例えば１４〜２０、例えば１５から２０、例えば１６から１８、例えば１７から２０または１８から２０の連続ヌクレオチド長を含むか、またはそれからなる。好ましい実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１７〜２０ヌクレオチド長を含むか、またはそれからなる。
【０２０６】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列は、２４以下のヌクレオチド、例えば２２以下のヌクレオチド、例えば２０以下のヌクレオチド、例えば１７、１８、１９または２０ヌクレオチドを含むか、またはそれからなる。本明細書で提供されるいずれの範囲も、範囲の終点を含むことを理解するべきである。したがって、オリゴヌクレオチドが１０〜３０ヌクレオチドを含むと記される場合、１０ヌクレオチドおよび３０ヌクレオチドの両方が含まれる。
【０２０７】
いくつかの実施形態では、連続ヌクレオチド配列は、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０連続ヌクレオチド長を含み、またはそれからなる。
【０２０８】
修飾オリゴヌクレオチド
本発明のオリゴヌクレオチドは、修飾オリゴヌクレオチドである−すなわち、それは、非修飾ＲＮＡまたは非修飾ＤＮＡ以外の修飾ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオチドを含む。
【０２０９】
連続核酸塩基配列（モチーフ配列）は、例えばヌクレアーゼ耐性および／または標的核酸に対する親和性を増大させるために修飾され得ることが理解される。
【０２１０】
修飾ヌクレオシド（高親和性修飾ヌクレオシドなど）がオリゴヌクレオチド配列に組み込まれるパターンは、一般にオリゴヌクレオチド設計と称される。
【０２１１】
本発明のオリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドおよびＤＮＡヌクレオシドを用いて設計される。高親和性修飾ヌクレオシドを用いることが有利である。
【０２１２】
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド、例えば少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５または少なくとも１６の修飾ヌクレオシドを含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１〜１０の修飾ヌクレオシド、例えば２〜９の修飾ヌクレオシド、例えば３〜８の修飾ヌクレオシド、例えば４〜７の修飾ヌクレオシド、例えば６または７の修飾ヌクレオシドを含む。適切な修飾は、「修飾ヌクレオシド」、「高親和性修飾ヌクレオシド」、「糖修飾」、「２’糖修飾」およびロックド核酸（ＬＮＡ）の「定義」セクションに記載されている。
【０２１３】
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１つ以上の糖修飾ヌクレオシド、例えば２’糖修飾ヌクレオシドを含む。好ましくは、本発明のオリゴヌクレオチドは、２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メチル−ＲＮＡ、２’−アルコキシ−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メトキシエチル−ＲＮＡ、２’−アミノ−ＤＮＡ、２’−フルオロ−ＤＮＡ、アラビノ核酸（ＡＮＡ）、２’−フルオロ−ＡＮＡおよびＬＮＡヌクレオシドからなる群から独立して選択される、１つ以上の２’糖修飾ヌクレオシドを含む。修飾ヌクレオシドの１つ以上がロックド核酸（ＬＮＡ）である場合、有利である。
【０２１４】
さらなる実施形態では、オリゴヌクレオチドまたは連続ヌクレオチド配列は、少なくとも１つの修飾されたヌクレオシド間結合、例えば少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。適切なヌクレオシド間結合は、「修飾ヌクレオシド間結合」の「定義」セクションに記載されている。連続ヌクレオチド配列内のヌクレオシド間結合の少なくとも７５％、例えばすべてがホスホロチオエートヌクレオシド間結合であれば有利である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの連続配列中の全ヌクレオチド間結合がホスホロチオエート結合である。
【０２１５】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシド、例えば１、２、３、４、５、６、７または８個のＬＮＡヌクレオシド、例えば２〜６個のＬＮＡヌクレオシド、例えば３〜７個のＬＮＡヌクレオシド、４〜８個のＬＮＡヌクレオシド、または３、４、５、６、７もしくは８個のＬＮＡヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドの少なくとも７５％、例えば修飾ヌクレオシドの８０％、例えば８５％、例えば９０％がＬＮＡヌクレオシドである。尚さらなる実施形態では、オリゴヌクレオチドの全修飾ヌクレオシドがＬＮＡヌクレオシドである。さらなる実施形態では、オリゴヌクレオチドは、β−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ、および以下のＬＮＡヌクレオシドの１つ以上：β−Ｄまたはα−Ｌ立体構造のいずれかのチオ−ＬＮＡ、アミノ−ＬＮＡ、オキシ−ＬＮＡ、ＳｃＥＴおよび／またはＥＮＡ、またはそれらの組み合わせの両方を含んでもよい。さらなる実施形態では、全ＬＮＡシトシン単位は、５−メチル−シトシンである。オリゴヌクレオチドまたは連続ヌクレオチド配列のヌクレアーゼ安定性にとって、ヌクレオチド配列の５’末端に少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドと３’末端に少なくとも２つのＬＮＡヌクレオシドがあることが有利である。
【０２１６】
本発明の実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ヒトＲＮａｓｅＨ１などのＲＮａｓｅＨを動員することができる。
【０２１７】
本発明において、有利な構造設計は、例えば、「ギャップマー」、「ＬＮＡギャップマー」、「ＭＯＥギャップマー」および「混合ウイングギャップマー」「交互フランクギャップマー」の「定義」セクションに記載されているギャップマー設計である。ギャップマー設計には、均一フランク、混合ウイングフランク、交互フランク、およびギャップブレーカー設計のギャップマーが含まれる。本発明において、本発明のオリゴヌクレオチドが、領域ＦおよびＦ’が独立して１〜８のヌクレオシドを含み、そのうちの１〜５が、２’糖修飾されてＦおよびＦ’領域の５’および３’末端を定義するＦ−Ｇ−Ｆ’設計を有するギャップマーであり、Ｇが、ＲＮａｓｅＨを動員することができる６〜１６のヌクレオシド間の領域であれば、有利である一実施形態では、Ｇ領域は、６〜１６の連続するＤＮＡヌクレオシドからなる。さらなる実施形態では、領域ＦおよびＦ’はそれぞれ、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドを含む。
【０２１８】
すべての場合において、Ｆ−Ｇ−Ｆ’設計は、「オリゴヌクレオチドの領域Ｄ’またはＤ’’」の「定義」セクションで説明されているように、領域Ｄ’および／またはＤ’をさらに含み得る。いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、ギャップマー領域の５’または３’末端に、１、２または３のホスホジエステル結合ヌクレオシドユニット、例えば、ＤＮＡユニットを有する。
【０２１９】
オリゴヌクレオチド
本発明のいくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、以下のＣＭＰ−ＩＤ番号：
50_1;51_1;52_1;53_1;54_1;55_1;56_1;57_1;58_1;59_1;60_1;61_1;62_1;63_1;64_1;65_1;66_1;67_1;68_1;69_1;70_1;71_1;72_1;73_1;74_1;75_1;76_1;77_1;78_1;79_1;80_1;81_1;82_1;83_1;84_1;85_1;86_1;87_1;88_1;89_1;90_1;91_1;92_1;93_1;94_1;95_1;96_1;97_1;98_1;99_1;100_1;101_1;102_1;103_1;104_1;105_1;106_1;107_1;108_1;109_1;110_1;111_1;112_1;113_1;114_1;115_1;116_1;117_1;118_1;119_1;120_1;121_1;122_1;123_1;124_1;125_1;126_1;127_1;128_1;129_1;130_1;131_1;132_1;133_1;134_1;135_1;136_1;137_1;138_1;139_1;140_1;141_1;142_1;143_1;144_1;145_1;146_1;147_1;148_1;149_1;150_1;151_1;152_1;153_1;154_1;155_1;156_1;157_1;158_1;159_1;160_1;161_1;162_1;163_1;164_1;165_1;166_1;167_1;168_1;169_1;170_1;171_1;172_1;173_1;174_1;175_1;176_1;177_1;178_1;179_1;180_1;181_1;182_1;183_1;184_1;185_1;186_1;187_1;188_1;189_1;190_1;191_1;192_1;193_1;194_1;195_1;196_1;197_1;198_1;199_1;200_1;201_1;202_1;203_1;204_1;205_1;206_1;207_1;208_1;209_1;210_1;211_1;212_1;213_1;214_1;215_1;216_1;217_1;218_1;219_1;220_1;221_1;222_1;223_1;224_1;225_1;226_1;227_1;228_1;229_1;230_1;231_1;232_1;233_1;234_1;235_1;236_1;237_1;238_1;239_1;240_1;241_1;242_1;243_1;244_1;245_1;246_1;247_1;248_1;249_1;250_1;251_1;252_1;253_1;254_1;255_1;256_1;257_1;258_1;259_1;260_1;261_1;262_1;263_1;264_1;265_1;266_1;267_1;268_1;269_1;270_1;271_1;272_1;273_1;274_1;275_1;276_1;277_1;278_1;279_1;280_1;281_1;282_1;283_1;284_1;285_1;286_1;287_1;288_1;289_1;290_1;291_1;292_1;293_1;294_1;295_1;296_1;297_1;298_1;299_1;300_1;301_1;302_1;303_1;304_1;305_1;306_1;307_1;308_1;309_1;310_1;311_1;312_1;313_1;314_1;315_1;316_1;317_1;318_1;319_1;320_1;321_1;322_1;323_1;324_1;325_1;326_1;327_1;328_1;329_1;330_1;331_1;332_1;333_1;334_1;335_1;336_1;337_1;338_1;339_1;340_1;341_1;342_1;343_1;344_1;345_1;346_1;347_1;348_1;349_1;350_1;351_1;352_1;353_1;354_1;355_1;356_1;357_1;358_1;359_1;360_1;361_1;362_1;363_1;364_1;365_1;366_1;367_1;368_1;369_1;370_1;371_1;372_1;373_1;374_1;375_1;376_1;377_1;378_1;379_1;380_1;381_1;382_1;383_1;384_1;385_1;386_1;387_1;388_1;389_1;390_1;391_1;392_1;393_1;394_1;395_1;396_1;397_1;398_1;399_1;400_1;401_1;402_1;403_1;404_1;405_1;406_1;407_1;408_1;409_1;410_1;411_1;412_1;413_1;414_1;415_1;416_1;417_1;418_1;419_1;420_1;421_1;422_1;423_1;424_1;425_1;426_1;427_1;428_1;429_1;430_1;431_1;432_1;433_1;434_1;435_1;436_1;437_1;438_1;439_1;440_1;441_1;442_1;443_1;444_1;445_1;446_1;447_1;448_1;449_1;450_1;451_1;452_1;453_1;454_1;455_1;456_1;457_1;458_1;459_1;460_1;461_1;462_1;463_1;464_1;465_1;466_1;467_1;468_1;469_1;470_1;471_1;472_1;473_1;474_1;475_1;476_1;477_1;478_1;479_1;480_1;481_1;482_1;483_1;484_1;485_1;486_1;487_1;488_1;489_1;490_1;491_1;492_1;493_1;494_1;495_1;496_1;497_1;498_1;499_1;500_1;501_1;502_1;503_1;504_1;505_1;506_1;507_1;508_1;509_1;510_1;511_1;512_1;512_2;512_3;513_1;513_2;513_3;513_4;514_1;514_2;514_3;514_4;515_1;515_2;515_3;515_4;515_5;515_6;516_1;516_2;516_3;516_4;516_5;516_6;516_7;517_1;517_2;517_3;517_4;517_5;517_6;517_7;517_8;518_1;518_2;518_3;518_4;518_5;518_6;519_1;519_2;519_3;519_4;519_5;519_6;520_1;520_2;520_3;520_4;520_5;521_1;521_2;521_3;521_4;521_5;522_1;522_2;522_3;522_4;523_1;523_2;523_3;523_4;523_5;524_1;525_1;526_1;527_1;528_1;529_1;530_1;531_1;532_1;533_1;534_1;535_1;536_1;537_1;538_1;539_1;540_1;541_1;542_1;543_1;544_1;545_1;546_1;547_1;548_1;549_1;550_1;551_1;552_1;553_1;554_1;555_1;556_1;557_1;558_1;559_1;560_1;561_1;562_1;563_1;564_1;565_1;566_1;567_1;568_1;569_1;570_1;571_1;572_1;573_1;574_1;575_1;576_1;577_1;578_1;579_1;580_1;581_1;582_1;583_1;584_1;585_1;586_1;587_1;588_1;589_1;590_1;591_1;592_1;593_1;594_1;595_1;596_1;597_1;598_1;599_1;600_1;601_1;602_1;603_1;604_1;605_1;606_1;607_1;608_1;609_1;610_1;611_1;612_1;613_1;614_1;615_1;616_1;617_1;618_1;619_1;620_1;621_1;622_1;623_1;624_1;625_1;626_1;627_1;628_1;629_1;630_1;631_1;632_1;633_1;634_1;635_1;636_1;637_1;638_1;639_1;640_1;および641_1を有するオリゴヌクレオチド化合物の群から選択される。
【０２２０】
本発明のいくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ＣＭＰ−ＩＤ番号：６４２＿１、６４３＿１、６４４＿１、６４５＿１、６４６＿１、６４７＿１、６４８＿１、６４９＿１および６５０＿１を有するオリゴヌクレオチド化合物の群から選択される。
【０２２１】
いくつかの実施形態では、本発明は、ＣＭＰ−ＩＤ−番号：５０＿１〜６４１＿１からなる群から選択される化合物を提供する。
【０２２２】
いくつかの実施形態では、本発明は、ＣＭＰ−ＩＤ−番号：６４２＿１、６４３＿１、６４４＿１、６４５＿１、６４６＿１、６４７＿１、６４８＿１、６４９＿１および６５０＿１からなる群から選択される化合物を提供する。
【０２２３】
これらの化合物は、実施例セクションの最後にある化合物の表に記載されており、インビトロでジムノティック送達（ｇｙｍｎｏｔｉｃ  ｄｅｌｉｖｅｒｙ）を通じてＳＣＮ９Ａを阻害する、それらの能力について試験された。
【０２２４】
以下の化合物は、ＳＣＮ９Ａ発現を少なくとも４０％阻害した。
51_1,59_1,127_1,161_1,67_1,106_1,72_1,124_1,163_1,99_1,125_1,110_1,65_1,94_1,64_1,57_1,136_1,158_1,159_1,356_1,197_1,132_1,83_1,76_1,130_1,135_1,77_1,186_1,105_1,445_1,325_1,265_1,200_1,288_1,346_1,86_1,281_1,339_1,256_1,289_1,414_1,286_1,241_1,82_1,475_1,91_1,50_1,97_1,322_1,148_1,443_1,251_1,451_1,179_1,466_1,357_1,109_1,472_1,471_1,376_1,413_1,270_1,379_1,416_1,311_1,411_1,368_1,333_1,347_1,152_1,89_1,380_1,390_1,429_1,63_1,90_1,415_1,199_1,503_1,476_1,92_1,268_1,371_1,302_1,485_1,205_1,274_1,122_1,419_1,470_1,498_1,156_1,478_1,393_1,312_1,287_1,96_1,226_1,71_1,137_1,365_1,58_1,370_1,280_1,385_1,442_1,134_1,463_1,140_1,440_1,230_1,310_1,479_1,363_1,340_1,495_1,467_1,444_1,418_1,338_1,335_1,496_1,196_1,317_1,341_1,406_1,330_1,173_1,377_1,474_1,482_1,282_1,266_1,73_1,257_1,342_1,190_1,492_1,87_1,188_1,456_1,372_1,417_1,404_1,239_1,206_1,433_1,486_1,175_1,461_1,56_1,408_1,334_1,504_1,453_1,222_1,410_1,104_1,460_1,439_1,255_1,489_1,203_1,398_1,171_1,407_1,172_1,412_1,321_1,305_1,328_1,120_1,434_1,449_1,350_1,487_1,146_1,420_1,426_1,352_1,150_1,316_1,353_1,469_1,306_1,384_1,155_1,450_1,279_1,267_1,337_1,184_1,459_1,360_1,75_1,468_1,180_1,245_1,387_1,345_1,98_1,435_1,295_1,369_1,218_1,182_1,448_1,300_1,481_1,427_1,207_1,367_1,240_1,231_1,364_1,355_1,431_1,497_1,397_1,465_1,271_1,502_1,151_1,178_1,499_1,421_1,131_1,309_1,491_1,261_1,121_1,128_1,84_1,304_1,264_1,493_1,185_1,237_1,139_1,441_1,169_1,160_1,102_1,296_1,164_1,362_1,500_1,および100_1。
【０２２５】
以下の化合物は、ＳＣＮ９Ａ発現を少なくとも５０％阻害した。
51_1,59_1,127_1,161_1,67_1,106_1,72_1,124_1,163_1,99_1,125_1,110_1,65_1,94_1,64_1,57_1,136_1,158_1,159_1,356_1,197_1,132_1,83_1,76_1,130_1,135_1,77_1,186_1,105_1,445_1,325_1,265_1,200_1,288_1,346_1,86_1,281_1,339_1,256_1,289_1,414_1,286_1,241_1,82_1,475_1,91_1,50_1,97_1,322_1,148_1,443_1,251_1,451_1,179_1,466_1,357_1,109_1,472_1,471_1,376_1,413_1,270_1,379_1,416_1,311_1,411_1,368_1,333_1,347_1,152_1,89_1,380_1,390_1,429_1,63_1,90_1,415_1,199_1,503_1,476_1,92_1,268_1,371_1,302_1,485_1,205_1,274_1,122_1,419_1,470_1,498_1,156_1,478_1,393_1,312_1,287_1,96_1,226_1,71_1,137_1,365_1,58_1,370_1,280_1,385_1,442_1,134_1,463_1,140_1,440_1,230_1,310_1,479_1,363_1,340_1,495_1,467_1,444_1,418_1,338_1,335_1,496_1,196_1,317_1,341_1,406_1,330_1,173_1,377_1,474_1,482_1,282_1,266_1,73_1,257_1,342_1,190_1,492_1,87_1,188_1,456_1,372_1,417_1,404_1,239_1,206_1,433_1,486_1,175_1,461_1,56_1,408_1,334_1,504_1,453_1,222_1,410_1,104_1,460_1,439_1,255_1,489_1,203_1,398_1,171_1,407_1,172_1,412_1,321_1,305_1,328_1,120_1,434_1,449_1,350_1,487_1,146_1,420_1,426_1,352_1,150_1,316_1,353_1,469_1,306_1,384_1,155_1,450_1,279_1,267_1,337_1,184_1,459_1,360_1,75_1,468_1,180_1,245_1,387_1,345_1,98_1,435_1,295_1,369_1,218_1,182_1,448_1,300_1,481_1,427_1,207_1。
【０２２６】
以下の化合物は、ＳＣＮ９Ａ発現を少なくとも６０％阻害した。
51_1,59_1,127_1,161_1,67_1,106_1,72_1,124_1,163_1,99_1,125_1,110_1,65_1,94_1,64_1,57_1,136_1,158_1,159_1,356_1,197_1,132_1,83_1,76_1,130_1,135_1,77_1,186_1,105_1,445_1,325_1,265_1,200_1,288_1,346_1,86_1,281_1,339_1,256_1,289_1,414_1,286_1,241_1,82_1,475_1,91_1,50_1,97_1,322_1,148_1,443_1,251_1,451_1,179_1,466_1,357_1,109_1,472_1,471_1,376_1,413_1,270_1,379_1,416_1,311_1,411_1,368_1,333_1,347_1,152_1,89_1,380_1,390_1,429_1,63_1,90_1,415_1,199_1,503_1,476_1,92_1,268_1,371_1,302_1,485_1,205_1,274_1,122_1,419_1,470_1,498_1,156_1,478_1,393_1,312_1,287_1,96_1,226_1,71_1,137_1,365_1,58_1,370_1,280_1,385_1,442_1,134_1,463_1,140_1,440_1,230_1,310_1,479_1,363_1,340_1,495_1,467_1,444_1,418_1,338_1,335_1,496_1,196_1,317_1,341_1,406_1,330_1,173_1,377_1,474_1,482_1,282_1,266_1,73_1,257_1,342_1,190_1,492_1,87_1,188_1,456_1,372_1,417_1,404_1,239_1,206_1,433_1,486_1,175_1,461_1,56_1,408_1,334_1,504_1,および453_1。
【０２２７】
以下の化合物は、ＳＣＮ９Ａ発現を少なくとも７０％阻害した。
51_1,59_1,127_1,161_1,67_1,106_1,72_1,124_1,163_1,99_1,125_1,110_1,65_1,94_1,64_1,57_1,136_1,158_1,159_1,356_1,197_1,132_1,83_1,76_1,130_1,135_1,77_1,186_1,105_1,445_1,325_1,265_1,200_1,288_1,346_1,86_1,281_1,339_1,256_1,289_1,414_1,286_1,241_1,82_1,475_1,91_1,50_1,97_1,322_1,148_1,443_1,251_1,451_1,179_1,466_1,357_1,109_1,472_1,471_1,376_1,413_1,270_1,379_1,416_1,311_1,411_1,368_1,333_1,347_1,152_1,89_1,380_1,390_1,429_1,63_1,90_1,415_1,199_1,503_1,476_1,92_1,268_1,371_1,302_1,485_1,205_1,274_1。
【０２２８】
以下の化合物は、ＳＣＮ９Ａ発現を少なくとも８０％阻害した。
51_1,59_1,127_1,161_1,67_1,106_1,72_1,124_1,163_1,99_1,125_1,110_1,65_1,94_1,64_1,57_1,136_1,158_1,159_1,356_1,197_1,132_1,83_1,76_1,130_1,135_1,77_1,186_1,105_1,445_1,および325_1。
【０２２９】
以下の化合物は、ＳＣＮ９Ａ発現を少なくとも９０％阻害した。
51_1,59_1,127_1,161_1,67_1,106_1,72_1,124_1,163_1,99_1,125_1,および110_1。
【０２３０】
化合物ＩＤで識別される化合物において、大文字はβ−Ｄ−オキシＬＮＡヌクレオシドであり、小文字はＤＮＡヌクレオシドであり、すべてのＬＮＡ  Ｃは５−メチルシトシンであり、すべてのヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０２３１】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５０；５１；５２；５３；５４；５５；５６；５７；５８；５９；６０；６１；６２；６３；６４；６５；６６；６７；６８；６９；７０；７１；７２；７３；７４；７５；７６；７７；７８；７９；８０；８１；８２；８３；８４；８５；８６；８７；８８；８９；９０；９１；９２；９３；９４；９５；９６；９７；９８；９９；１００；１０１；１０２；１０３；１０４；１０５；１０６；１０７；１０８；１０９；１１０；１１１；１１２；１１３；１１４；１１５；１１６；１１７；１１８；１１９；１２０；１２１；１２２；１２３；１２４；１２５；１２６；１２７；１２８；１２９；１３０；１３１；１３２；１３３；１３４；１３５；１３６；１３７；１３８；１３９；１４０；１４１；１４２；１４３；１４４；１４５；１４６；１４７；１４８；１４９；１５０；１５１；１５２；１５３；１５４；１５５；１５６；１５７；１５８；１５９；１６０；１６１；１６２；１６３；１６４；１６５；１６６；１６７；１６８；１６９；１７０；１７１；１７２；１７３；１７４；１７５；１７６；１７７；１７８；１７９；１８０；１８１；１８２；１８３；１８４；１８５；１８６；１８７；１８８；１８９；１９０；１９１；１９２；１９３；１９４；１９５；１９６；１９７；１９８；１９９；２００；２０１；２０２；２０３；２０４；２０５；２０６；２０７；２０８；２０９；２１０；２１１；２１２；２１３；２１４；２１５；２１６；２１７；２１８；２１９；２２０；２２１；２２２；２２３；２２４；２２５；２２６；２２７；２２８；２２９；２３０；２３１；２３２；２３３；２３４；２３５；２３６；２３７；２３８；２３９；２４０；２４１；２４２；２４３；２４４；２４５；２４６；２４７；２４８；２４９；２５０；２５１；２５２；２５３；２５４；２５５；２５６；２５７；２５８；２５９；２６０；２６１；２６２；２６３；２６４；２６５；２６６；２６７；２６８；２６９；２７０；２７１；２７２；２７３；２７４；２７５；２７６；２７７；２７８；２７９；２８０；２８１；２８２；２８３；２８４；２８５；２８６；２８７；２８８；２８９；２９０；２９１；２９２；２９３；２９４；２９５；２９６；２９７；２９８；２９９；３００；３０１；３０２；３０３；３０４；３０５；３０６；３０７；３０８；３０９；３１０；３１１；３１２；３１３；３１４；３１５；３１６；３１７；３１８；３１９；３２０；３２１；３２２；３２３；３２４；３２５；３２６；３２７；３２８；３２９；３３０；３３１；３３２；３３３；３３４；３３５；３３６；３３７；３３８；３３９；３４０；３４１；３４２；３４３；３４４；３４５；３４６；３４７；３４８；３４９；３５０；３５１；３５２；３５３；３５４；３５５；３５６；３５７；３５８；３５９；３６０；３６１；３６２；３６３；３６４；３６５；３６６；３６７；３６８；３６９；３７０；３７１；３７２；３７３；３７４；３７５；３７６；３７７；３７８；３７９；３８０；３８１；３８２；３８３；３８４；３８５；３８６；３８７；３８８；３８９；３９０；３９１；３９２；３９３；３９４；３９５；３９６；３９７；３９８；３９９；４００；４０１；４０２；４０３；４０４；４０５；４０６；４０７；４０８；４０９；４１０；４１１；４１２；４１３；４１４；４１５；４１６；４１７；４１８；４１９；４２０；４２１；４２２；４２３；４２４；４２５；４２６；４２７；４２８；４２９；４３０；４３１；４３２；４３３；４３４；４３５；４３６；４３７；４３８；４３９；４４０；４４１；４４２；４４３；４４４；４４５；４４６；４４７；４４８；４４９；４５０；４５１；４５２；４５３；４５４；４５５；４５６；４５７；４５８；４５９；４６０；４６１；４６２；４６３；４６４；４６５；４６６；４６７；４６８；４６９；４７０；４７１；４７２；４７３；４７４；４７５；４７６；４７７；４７８；４７９；４８０；４８１；４８２；４８３；４８４；４８５；４８６；４８７；４８８；４８９；４９０；４９１；４９２；４９３；４９４；４９５；４９６；４９７；４９８；４９９；５００；５０１；５０２；５０３；５０４；５０５；５０６；５０７；５０８；５０９；５１０；５１１；５１２；５１３；５１４；５１５；５１６；５１７；５１８；５１９；５２０；５２１；５２２；５２３；５２４；５２５；５２６；５２７；５２８；５２９；５３０；５３１；５３２；５３３；５３４；５３５；５３６；５３７；５３８；５３９；５４０；５４１；５４２；５４３；５４４；５４５；５４６；５４７；５４８；５４９；５５０；５５１；５５２；５５３；５５４；５５５；５５６；５５７；５５８；５５９；５６０；５６１；５６２；５６３；５６４；５６５；５６６；５６７；５６８；５６９；５７０；５７１；５７２；５７３；５７４；５７５；５７６；５７７；５７８；５７９；５８０；５８１；５８２；５８３；５８４；５８５；５８６；５８７；５８８；５８９；５９０；５９１；５９２；５９３；５９４；５９５；５９６；５９７；５９８；５９９；６００；６０１；６０２；６０３；６０４；６０５；６０６；６０７；６０８；６０９；６１０；６１１；６１２；６１３；６１４；６１５；６１６；６１７；６１８；６１９；６２０；６２１；６２２；６２３；６２４；６２５；６２６；６２７；６２８；６２９；６３０；６３１；６３２；６３３；６３４；６３５；６３６；６３７；６３８；６３９；６４０；および６４１からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３２】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号６４２、６４３、６４４、６４５、６４６、６４７、６４８、６４９および６５０からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３３】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，４５３，２２２，４１０，１０４，４６０，４３９，２５５，４８９，２０３，３９８，１７１，４０７，１７２，４１２，３２１，３０５，３２８，１２０，４３４，４４９，３５０，４８７，１４６，４２０，４２６，３５２，１５０，３１６，３５３，４６９，３０６，３８４，１５５，４５０，２７９，２６７，３３７，１８４，４５９，３６０，７５，４６８，１８０，２４５，３８７，３４５，９８，４３５，２９５，３６９，２１８，１８２，４４８，３００，４８１，４２７，２０７，３６７，２４０，２３１，３６４，３５５，４３１，４９７，３９７，４６５，２７１，５０２，１５１，１７８，４９９，４２１，１３１，３０９，４９１，２６１，１２１，１２８，８４，３０４，２６４，４９３，１８５，２３７，１３９，４４１，１６９，１６０，１０２，２９６，１６４，３６２，５００，および１００からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３４】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，４５３，２２２，４１０，１０４，４６０，４３９，２５５，４８９，２０３，３９８，１７１，４０７，１７２，４１２，３２１，３０５，３２８，１２０，４３４，４４９，３５０，４８７，１４６，４２０，４２６，３５２，１５０，３１６，３５３，４６９，３０６，３８４，１５５，４５０，２７９，２６７，３３７，１８４，４５９，３６０，７５，４６８，１８０，２４５，３８７，３４５，９８，４３５，２９５，３６９，２１８，１８２，４４８，３００，４８１，４２７，および２０７からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３５】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，および４５３からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３６】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１，５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，および２７４からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３７】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１、５９、１２７、１６１、６７、１０６、７２、１２４、１６３、９９、１２５、１１０、６５、９４、６４、５７、１３６、１５８、１５９、３５６、１９７、１３２、８３、７６、１３０、１３５、７７、１８６、１０５、４４５、および３２５からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３８】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２３９】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される配列の、少なくとも１３または少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２４０】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２４１】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、選択される配列の少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２４２】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、選択される配列の少なくとも１５の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２４３】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、選択される配列を含むかまたはそれからなる連続ヌクレオチド配列を含む。
【０２４４】
製造方法
さらなる態様では、本発明は、ヌクレオチド単位を反応させ、それによってオリゴヌクレオチドに構成される共有結合された連続ヌクレオチド単位を形成することを含む、本発明のオリゴヌクレオチドを製造する方法を提供する。好ましくは、この方法は、ホスホラミダイト化学を使用する（例えば、Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ  ｅｔ  ａｌ，１９８７，Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ  ｖｏｌ．１５４，ｐａｇｅｓ  ２８７−３１３を参照のこと）。さらなる実施形態では、この方法は、連続ヌクレオチド配列を結合（ｃｏｎｊｕｇａｔｉｎｇ）部分（リガンド）と反応させて、コンジュゲート部分をオリゴヌクレオチドに共有結合させることをさらに含む。さらなる態様では、本発明のオリゴヌクレオチドまたは結合オリゴヌクレオチドを医薬的に許容される希釈剤、溶媒、担体、塩および／またはアジュバントと混合することを含む、本発明の組成物を製造する方法が提供される。
【０２４５】
医薬塩
本発明による化合物は、それらの医薬的に許容される塩の形態で存在し得る。「医薬的に許容される塩」という用語は、本発明の化合物の生物学的有効性および特性を保持し、適切な非毒性の有機もしくは無機酸または有機もしくは無機塩基から形成される従来の酸付加塩または塩基付加塩を指す。酸付加塩には、例えば、塩酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、硫酸、スルファミン酸、リン酸および硝酸などの無機酸に由来するもの、ならびにｐ−トルエンスルホン酸、サリチル酸、メタンスルホン酸、シュウ酸、コハク酸、クエン酸、リンゴ酸、乳酸、フマル酸などの有機酸に由来するものが含まれる。塩基付加塩には、アンモニウム、カリウム、ナトリウム、および第四級アンモニウム水酸化物、例えばテトラメチルアンモニウム水酸化物から誘導されるものが含まれる。医薬化合物の塩への化学修飾は、化合物の物理的および化学的安定性、吸湿性、流動性、および溶解性を向上させるために、薬剤師によく知られている手法である。これは例えば、Ｂａｓｔｉｎ，Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｐｒｏｃｅｓｓ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ＆Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ  ２０００，４，４２７−４３５またはＡｎｓｅｌ，Ｉｎ：Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｄｏｓａｇｅ  Ｆｏｒｍｓ  ａｎｄ  Ｄｒｕｇ  Ｄｅｌｉｖｅｒｙ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，６ｔｈ  ｅｄ．（１９９５），ｐｐ．１９６および１４５６−１４５７に記載されている。例えば、本明細書で提供される化合物の医薬的に許容される塩は、ナトリウム塩であり得る。
【０２４６】
さらなる態様では、本発明は、アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはそのコンジュゲートの医薬的に許容される塩を提供する。好ましい実施形態では、医薬的に許容される塩は、ナトリウムまたはカリウム塩である。
【０２４７】
医薬組成物
さらなる態様では、本発明は、前述のオリゴヌクレオチドおよび／またはオリゴヌクレオチドコンジュゲートまたはその塩のいずれかと、医薬的に許容される希釈剤、担体、塩および／またはアジュバントとを含む医薬組成物を提供する。医薬的に許容される希釈剤には、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）が含まれ、医薬的に許容される塩には、ナトリウム塩およびカリウム塩が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、医薬的に許容される希釈剤は、滅菌リン酸緩衝生理食塩水または滅菌炭酸ナトリウム緩衝液である。
【０２４８】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、医薬的に許容される希釈剤中の溶液、例えばＰＢＳまたは炭酸ナトリウム緩衝液に溶解された形態である。オリゴヌクレオチドは、溶液中に予め配合されても、またはいくつかの実施形態では、医薬的に許容される希釈剤に投与前に溶解され得る乾燥粉末（例えば、凍結乾燥粉末）の形態であってもよい。適切には、例えば、オリゴヌクレオチドは、０．１〜１００ｍｇ／ｍｌ、例えば、１〜１０ｍｇ／の濃度で医薬的に許容される希釈剤に溶解され得る。
【０２４９】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、０．５〜１００ｍｇ、例えば１ｍｇ〜５０ｍｇ、または２〜２５ｍｇの単位用量で処方される。
【０２５０】
本発明のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドコンジュゲートは、医薬組成物または製剤の調製のために、医薬的に許容される活性または不活性物質と混合されてもよい。医薬組成物の調製のための組成物および方法は、限定されるものではないが、投与経路、疾患の程度、または投与される用量を含む多くの基準に依存する。
【０２５１】
溶液などの医薬組成物は、従来の滅菌技術によって滅菌されても、または滅菌フィルタにかけられてもよい。得られた溶液は、そのまま使用するために包装するか、または凍結乾燥することができ、凍結乾燥された調製物は、投与前に滅菌水性担体と組み合わされる。調製物のｐＨは、典型的には３〜１１、より好ましくは５〜９または６〜８、最も好ましくは７〜８、例えば７〜７．５であろう。得られた固体形態の組成物は、錠剤またはカプセルの密封パッケージなどのように、各々が上記の薬剤または薬剤群の固定量を含む複数の単回用量単位で包装することができる。固体形態の組成物はまた、局所適用可能なクリームまたは軟膏用に設計された絞り出し可能なチューブなど、量に柔軟性のある容器に包装することもできる。
【０２５２】
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドコンジュゲートはプロドラッグである。特にオリゴヌクレオチドコンジュゲートに関して、プロドラッグが作用部位、例えば標的細胞に送達されると、コンジュゲート部分はオリゴヌクレオチドから切断される。
【０２５３】
用途
本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば、診断、治療および予防のための研究試薬として利用され得る。
【０２５４】
研究では、そのようなオリゴヌクレオチドを使用して、細胞（例えば、インビトロ細胞培養）および実験動物におけるＮａｖ１．７、またはいくつかの態様ではＮａｖ１．８タンパク質の合成を特異的に調節し、それにより標的の機能分析、または治療的介入用標的としての有用性の評価を容易にすることができる。典型的には、標的調節は、タンパク質を生成するｍＲＮＡを分解または阻害し、それによりタンパク質形成を防止することによって、またはタンパク質を生成する遺伝子もしくはｍＲＮＡのモジュレーターを分解もしくは阻害することによって達成される。
【０２５５】
本発明のオリゴヌクレオチドを研究または診断に使用する場合、標的核酸は、ＤＮＡまたはＲＮＡに由来するｃＤＮＡまたは合成核酸であり得る。
【０２５６】
本発明は、ＳＣＮ９Ａを発現している標的細胞におけるＳＣＮ９Ａ発現を調節するためのインビボまたはインビトロ方法を提供し、前記方法は、本発明のオリゴヌクレオチドを前記細胞に有効量で投与することを含む。
【０２５７】
いくつかの実施形態では、標的細胞は、哺乳動物細胞、特にヒト細胞である。標的細胞は、インビトロ細胞培養物または哺乳動物の組織の一部を形成するインビボ細胞であってよい。好ましい実施形態では、標的細胞は、後根神経節などの末梢神経系に存在する。
【０２５８】
診断では、オリゴヌクレオチドを使用して、ノーザンブロッティング、ｉｎ−ｓｉｔｕハイブリダイゼーションまたは同様の技術により、細胞および組織におけるＳＣＮ９Ａ発現を検出および定量することができる。
【０２５９】
治療への応用
本発明のオリゴヌクレオチド、または本発明のコンジュゲート、塩もしくは医薬組成物は、慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛、または侵害受容性疼痛などの疼痛の予防または治療のために、動物またはヒトに投与することができる。本発明のオリゴヌクレオチド、または本発明のコンジュゲート、塩もしくは医薬組成物は、局所鎮痛剤として使用してもよい。
【０２６０】
本発明のオリゴヌクレオチド、または本発明のコンジュゲート、塩もしくは医薬組成物によって治療され得る疼痛は、末梢神経系における疼痛シグナルを伴う疼痛であり得る。重要な末梢成分に関連する、疼痛を伴う適応症には、例えば、糖尿病性神経障害、癌、脳神経痛、帯状疱疹後神経痛、および術後神経痛が含まれる。
【０２６１】
本発明のオリゴヌクレオチド、コンジュゲート、組成物または塩を使用して予防、治療または改善することができる疼痛は、例えば、遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）、発作性激痛症（ＰＥＰＤ）、三叉神経痛、神経障害性疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性の一般的治療（例えば、神経の減圧）、神経障害性疼痛（例えば、糖尿病性神経障害）、内臓痛、または混合性疼痛に関連する疼痛からなる群から選択され得る。
【０２６２】
本発明は、慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛、または侵害受容性疼痛などの疼痛の予防または治療に使用するための、本発明のオリゴヌクレオチド、コンジュゲート、組成物または塩を提供する。
【０２６３】
本発明はさらに、慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛、または侵害受容性疼痛などの疼痛の治療または予防用の薬剤を製造するための、本発明のオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチドコンジュゲートまたは医薬組成物の使用に関する。
【０２６４】
本発明は、局所鎮痛剤として使用するための、本発明のオリゴヌクレオチド、コンジュゲート、組成物または塩を提供する。
【０２６５】
本発明は、局所鎮痛薬の製造のための、本発明のオリゴヌクレオチド、コンジュゲート、組成物または塩の使用を提供する。
【０２６６】
本発明は、遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）、発作性激痛症（ＰＥＰＤ）、三叉神経痛、神経障害性疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性の一般的な治療（例えば、神経の減圧）、神経障害性疼痛（例えば、糖尿病性神経障害）、内臓痛、または混合性疼痛関連する疼痛の予防または治療に使用するための、本発明のオリゴヌクレオチド、コンジュゲート、組成物または塩を提供する。
【０２６７】
本発明はさらに、遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）、発作性激痛症（ＰＥＰＤ）、三叉神経痛、神経障害性疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性の一般的な治療（例えば、神経の減圧）、神経障害性疼痛（例えば、糖尿病性神経障害）、内臓痛、または混合性疼痛に関連する疼痛の治療または予防用薬剤の製造のための、本発明のオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチドコンジュゲートまたは医薬組成物の使用に関する。
【０２６８】
治療方法
本発明は、疼痛を患っているまたは罹患する可能性が高いヒトなどの対象の疼痛を治療または予防するための方法を提供し、方法は、治療的または予防的に有効な量の本発明のオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチドコンジュゲートまたは医薬組成物を、慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛、または侵害受容性疼痛などの疼痛を患っている、または罹患しやすい対象に投与することを含む。
【０２６９】
例として、糖尿病性神経障害、癌、脳神経痛、帯状疱疹後神経痛および術後神経痛からなる群から選択される適応症を患う対象の治療方法であり得る。
【０２７０】
本発明の方法は、遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）、発作性激痛症（ＰＥＰＤ）、三叉神経痛、神経障害性疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性一般的治療（例えば、減圧）、神経障害性疼痛（例えば糖尿病性神経障害）、内臓痛、または混合性疼痛に関連する疼痛などの疼痛を治療および緩和するための方法であり得る。
【０２７１】
本発明の方法は、Ｎａｖ１．７、またはいくつかの態様ではＮａｖ１．７およびＮａｖ１．８によって媒介される疼痛に対する治療または予防のために、好ましく使用される。
【０２７２】
投与
本発明のオリゴヌクレオチドまたは医薬組成物は、非経口投与によって投与することができる。
【０２７３】
いくつかの実施形態では、投与経路は、皮下または静脈内である。
【０２７４】
いくつかの実施形態では、投与経路は、静脈内、皮下、筋肉内、脳内、硬膜外、脳室内、眼内、髄腔内投与、または経椎間孔投与からなる群から選択される。
【０２７５】
いくつかの有利な実施形態では、投与は、髄腔内投与、または硬膜外投与または経椎間孔投与による。
【０２７６】
有利には、本発明のオリゴヌクレオチドまたは医薬組成物は、髄腔内に投与される。
【０２７７】
本発明はまた、疼痛を予防または治療するための、髄腔内投与用の剤形である薬剤の製造のための、本発明のオリゴヌクレオチドまたはそのコンジュゲート、例えば本発明の医薬塩もしくは組成物などの使用を提供する。
【０２７８】
本発明はまた、疼痛の予防または治療のための、髄腔内投与用の剤形である薬剤を製造するための、記載された本発明のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドコンジュゲートの使用を提供する。
【０２７９】
本発明はまた、本発明のオリゴヌクレオチド、または本発明の医薬塩もしくは組成物など、そのコンジュゲートを、髄腔内投与用の剤形である、疼痛の予防または治療のための薬剤として使用するために提供する。
【０２８０】
本発明はまた、髄腔内投与用の剤形である、疼痛の予防または治療のための薬剤として使用するための、本発明のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチドコンジュゲートを提供する。
【０２８１】
併用療法
いくつかの実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチドコンジュゲートまたは医薬組成物は、別の治療剤との併用治療で使用するためのものである。治療剤は、例えば、上記の疾患または障害の標準的な治療であり得る。いくつかの実施形態では、本発明の化合物は、本発明の化合物または組成物の投与と同時にまたは独立して投与され得る小分子鎮痛薬と組み合わせて使用される。本発明の化合物と小分子鎮痛薬との併用療法の利点は、小分子鎮痛薬は、鎮痛活性を急速に開始し、典型的には作用の持続期間が短い（数時間〜数日）のに対し、本発明の化合物は、作用の開始は遅いが（典型的に数日または１週間以上）、作用の持続期間が長い（数週間〜数か月、例えば２か月以上、３か月以上、または４か月以上）ことである。
【０２８２】
実施形態−以下は、本発明の例示的な実施形態のリストである。
【０２８３】
１．配列番号１に対して少なくとも９０％の相補性、例えば１００％の相補性を有する１０〜３０ヌクレオチド長の連続ヌクレオチド配列を含む、１０〜３０ヌクレオチド長のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２８４】
２．連続ヌクレオチド配列が、標的配列リスト１に示される配列からなる群から選択される配列番号１の領域に少なくとも９０％相補的、例えば１００％相補的である、実施形態２のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２８５】
３．連続ヌクレオチド配列が、標的配列リスト２に示される配列からなる群から選択される配列番号１の領域に少なくとも９０％相補的、例えば１００％相補的である、実施形態１または２のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２８６】
４．連続ヌクレオチド配列が、標的配列リスト３からなる群から選択される配列番号１の領域に少なくとも９０％相補的、例えば１００％相補的である、実施形態１〜３のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２８７】
５．連続ヌクレオチド配列が、標的リスト４からなる群から選択される配列番号１の領域に少なくとも９０％相補的、例えば１００％相補的である、実施形態１〜４のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２８８】
６．連続ヌクレオチド配列が、配列番号１７〜４９からなる群から選択される配列中に存在する少なくとも１０の連続ヌクレオチドに１００％相補的である配列を含む、実施形態１〜５のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２８９】
７．連続ヌクレオチド配列が、配列番号１７〜４９からなる群から選択される配列中に存在する少なくとも１２の連続ヌクレオチドに１００％相補的である配列を含む、実施形態１〜５のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９０】
８．連続ヌクレオチド配列が、配列番号１７〜４９からなる群から選択される配列に存在する少なくとも１４の連続ヌクレオチドに１００％相補的である配列を含む、実施形態１〜６のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９１】
９．連続ヌクレオチド配列が、配列番号１７〜４９からなる群から選択される配列に１００％相補的である、実施形態１〜７のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９２】
１０．連続ヌクレオチド配列が、配列番号５０〜６４１または６４２〜６５０からなる群から選択される配列に存在する少なくとも１０の連続ヌクレオチドを含む、実施形態１〜９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９３】
１１．連続ヌクレオチド配列が、配列番号５０〜６４１または６４２〜６５０からなる群から選択される配列に存在する少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む、実施形態１〜９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９４】
１２．連続ヌクレオチド配列が、配列番号５０〜６４１または６４２〜６５０からなる群から選択される配列に存在する少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含む、実施形態１〜９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９５】
１３．連続ヌクレオチド配列が、配列番号５０〜６４１または６４２〜６５０からなる群から選択される配列である、実施形態１〜９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９６】
１４．連続ヌクレオチド配列中の１つ以上のヌクレオシドが、２’糖修飾ヌクレオシドである、実施形態１〜１３のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９７】
１５．１つ以上の２’糖修飾ヌクレオシドが、２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メチル−ＲＮＡ、２’−アルコキシ−ＲＮＡ、２’−Ｏ−メトキシエチル−ＲＮＡ、２’−アミノ−ＤＮＡ、２’−フルオロ−ＤＮＡ、アラビノ核酸（ＡＮＡ）、２’−フルオロ−ＡＮＡおよびＬＮＡヌクレオシドからなる群から独立して選択される、実施形態１４のオリゴヌクレオチド。
【０２９８】
１６．アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列が、１つ以上のＬＮＡヌクレオシドを含む、実施形態１〜１５のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０２９９】
１７．連続ヌクレオチド配列中の少なくとも１つのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１〜１６のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３００】
１８．連続ヌクレオチド配列内のすべてのヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１〜１７のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０１】
１９．オリゴヌクレオチドが、ヒトＲＮａｓｅＨ１などのＲＮａｓｅＨを動員することができる、実施形態１〜１８のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０２】
２０．アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列が、式５’−Ｆ−Ｇ−Ｆ’−３’のギャップマーなどのギャップマーからなるか、またはそれを含み、式中、領域Ｇは、ＲＮａｓｅＨを動員することができるヌクレオチドの連続配列を含む領域であり、領域ＦおよびＦ’はそれぞれ、少なくとも１つの２’糖修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１〜１９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０３】
２１．領域Ｇが、６〜１６のＤＮＡヌクレオシドを含み、領域ＦおよびＦ’の少なくとも１つが、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドを含むか、または領域ＦおよびＦ’の両方が、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオシドを含む、実施形態２０に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０４】
２２．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、以下のＣＭＰ  ＩＤ：
50_1;51_1;52_1;53_1;54_1;55_1;56_1;57_1;58_1;59_1;60_1;61_1;62_1;63_1;64_1;65_1;66_1;67_1;68_1;69_1;70_1;71_1;72_1;73_1;74_1;75_1;76_1;77_1;78_1;79_1;80_1;81_1;82_1;83_1;84_1;85_1;86_1;87_1;88_1;89_1;90_1;91_1;92_1;93_1;94_1;95_1;96_1;97_1;98_1;99_1;100_1;101_1;102_1;103_1;104_1;105_1;106_1;107_1;108_1;109_1;110_1;111_1;112_1;113_1;114_1;115_1;116_1;117_1;118_1;119_1;120_1;121_1;122_1;123_1;124_1;125_1;126_1;127_1;128_1;129_1;130_1;131_1;132_1;133_1;134_1;135_1;136_1;137_1;138_1;139_1;140_1;141_1;142_1;143_1;144_1;145_1;146_1;147_1;148_1;149_1;150_1;151_1;152_1;153_1;154_1;155_1;156_1;157_1;158_1;159_1;160_1;161_1;162_1;163_1;164_1;165_1;166_1;167_1;168_1;169_1;170_1;171_1;172_1;173_1;174_1;175_1;176_1;177_1;178_1;179_1;180_1;181_1;182_1;183_1;184_1;185_1;186_1;187_1;188_1;189_1;190_1;191_1;192_1;193_1;194_1;195_1;196_1;197_1;198_1;199_1;200_1;201_1;202_1;203_1;204_1;205_1;206_1;207_1;208_1;209_1;210_1;211_1;212_1;213_1;214_1;215_1;216_1;217_1;218_1;219_1;220_1;221_1;222_1;223_1;224_1;225_1;226_1;227_1;228_1;229_1;230_1;231_1;232_1;233_1;234_1;235_1;236_1;237_1;238_1;239_1;240_1;241_1;242_1;243_1;244_1;245_1;246_1;247_1;248_1;249_1;250_1;251_1;252_1;253_1;254_1;255_1;256_1;257_1;258_1;259_1;260_1;261_1;262_1;263_1;264_1;265_1;266_1;267_1;268_1;269_1;270_1;271_1;272_1;273_1;274_1;275_1;276_1;277_1;278_1;279_1;280_1;281_1;282_1;283_1;284_1;285_1;286_1;287_1;288_1;289_1;290_1;291_1;292_1;293_1;294_1;295_1;296_1;297_1;298_1;299_1;300_1;301_1;302_1;303_1;304_1;305_1;306_1;307_1;308_1;309_1;310_1;311_1;312_1;313_1;314_1;315_1;316_1;317_1;318_1;319_1;320_1;321_1;322_1;323_1;324_1;325_1;326_1;327_1;328_1;329_1;330_1;331_1;332_1;333_1;334_1;335_1;336_1;337_1;338_1;339_1;340_1;341_1;342_1;343_1;344_1;345_1;346_1;347_1;348_1;349_1;350_1;351_1;352_1;353_1;354_1;355_1;356_1;357_1;358_1;359_1;360_1;361_1;362_1;363_1;364_1;365_1;366_1;367_1;368_1;369_1;370_1;371_1;372_1;373_1;374_1;375_1;376_1;377_1;378_1;379_1;380_1;381_1;382_1;383_1;384_1;385_1;386_1;387_1;388_1;389_1;390_1;391_1;392_1;393_1;394_1;395_1;396_1;397_1;398_1;399_1;400_1;401_1;402_1;403_1;404_1;405_1;406_1;407_1;408_1;409_1;410_1;411_1;412_1;413_1;414_1;415_1;416_1;417_1;418_1;419_1;420_1;421_1;422_1;423_1;424_1;425_1;426_1;427_1;428_1;429_1;430_1;431_1;432_1;433_1;434_1;435_1;436_1;437_1;438_1;439_1;440_1;441_1;442_1;443_1;444_1;445_1;446_1;447_1;448_1;449_1;450_1;451_1;452_1;453_1;454_1;455_1;456_1;457_1;458_1;459_1;460_1;461_1;462_1;463_1;464_1;465_1;466_1;467_1;468_1;469_1;470_1;471_1;472_1;473_1;474_1;475_1;476_1;477_1;478_1;479_1;480_1;481_1;482_1;483_1;484_1;485_1;486_1;487_1;488_1;489_1;490_1;491_1;492_1;493_1;494_1;495_1;496_1;497_1;498_1;499_1;500_1;501_1;502_1;503_1;504_1;505_1;506_1;507_1;508_1;509_1;510_1;511_1;512_1;512_2;512_3;513_1;513_2;513_3;513_4;514_1;514_2;514_3;514_4;515_1;515_2;515_3;515_4;515_5;515_6;516_1;516_2;516_3;516_4;516_5;516_6;516_7;517_1;517_2;517_3;517_4;517_5;517_6;517_7;517_8;518_1;518_2;518_3;518_4;518_5;518_6;519_1;519_2;519_3;519_4;519_5;519_6;520_1;520_2;520_3;520_4;520_5;521_1;521_2;521_3;521_4;521_5;522_1;522_2;522_3;522_4;523_1;523_2;523_3;523_4;523_5;524_1;525_1;526_1;527_1;528_1;529_1;530_1;531_1;532_1;533_1;534_1;535_1;536_1;537_1;538_1;539_1;540_1;541_1;542_1;543_1;544_1;545_1;546_1;547_1;548_1;549_1;550_1;551_1;552_1;553_1;554_1;555_1;556_1;557_1;558_1;559_1;560_1;561_1;562_1;563_1;564_1;565_1;566_1;567_1;568_1;569_1;570_1;571_1;572_1;573_1;574_1;575_1;576_1;577_1;578_1;579_1;580_1;581_1;582_1;583_1;584_1;585_1;586_1;587_1;588_1;589_1;590_1;591_1;592_1;593_1;594_1;595_1;596_1;597_1;598_1;599_1;600_1;601_1;602_1;603_1;604_1;605_1;606_1;607_1;608_1;609_1;610_1;611_1;612_1;613_1;614_1;615_1;616_1;617_1;618_1;619_1;620_1;621_1;622_1;623_1;624_1;625_1;626_1;627_1;628_1;629_1;630_1;631_1;632_1;633_1;634_1;635_1;636_1;637_1;638_1;639_1;640_1;および641_1からなる群から選択されるか;または 642_1;643_1;644_1;645_1;646_1;647_1;648_1;649_1;650_1からなる群から選択される化合物である、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０５】
２３．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５１，５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，４５３，２２２，４１０，１０４，４６０，４３９，２５５，４８９，２０３，３９８，１７１，４０７，１７２，４１２，３２１，３０５，３２８，１２０，４３４，４４９，３５０，４８７，１４６，４２０，４２６，３５２，１５０，３１６，３５３，４６９，３０６，３８４，１５５，４５０，２７９，２６７，３３７，１８４，４５９，３６０，７５，４６８，１８０，２４５，３８７，３４５，９８，４３５，２９５，３６９，２１８，１８２，４４８，３００，４８１，４２７，２０７，３６７，２４０，２３１，３６４，３５５，４３１，４９７，３９７，４６５，２７１，５０２，１５１，１７８，４９９，４２１，１３１，３０９，４９１，２６１，１２１，１２８，８４，３０４，２６４，４９３，１８５，２３７，１３９，４４１，１６９，１６０，１０２，２９６，１６４，３６２，５００，および１００からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０６】
２４．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，４５３，２２２，４１０，１０４，４６０，４３９，２５５，４８９，２０３，３９８，１７１，４０７，１７２，４１２，３２１，３０５，３２８，１２０，４３４，４４９，３５０，４８７，１４６，４２０，４２６，３５２，１５０，３１６，３５３，４６９，３０６，３８４，１５５，４５０，２７９，２６７，３３７，１８４，４５９，３６０，７５，４６８，１８０，２４５，３８７，３４５，９８，４３５，２９５，３６９，２１８，１８２，４４８，３００，４８１，４２７，および２０７からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０７】
２５．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，２７４，１２２，４１９，４７０，４９８，１５６，４７８，３９３，３１２，２８７，９６，２２６，７１，１３７，３６５，５８，３７０，２８０，３８５，４４２，１３４，４６３，１４０，４４０，２３０，３１０，４７９，３６３，３４０，４９５，４６７，４４４，４１８，３３８，３３５，４９６，１９６，３１７，３４１，４０６，３３０，１７３，３７７，４７４，４８２，２８２，２６６，７３，２５７，３４２，１９０，４９２，８７，１８８，４５６，３７２，４１７，４０４，２３９，２０６，４３３，４８６，１７５，４６１，５６，４０８，３３４，５０４，および４５３からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０８】
２６．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，３２５，２６５，２００，２８８，３４６，８６，２８１，３３９，２５６，２８９，４１４，２８６，２４１，８２，４７５，９１，５０，９７，３２２，１４８，４４３，２５１，４５１，１７９，４６６，３５７，１０９，４７２，４７１，３７６，４１３，２７０，３７９，４１６，３１１，４１１，３６８，３３３，３４７，１５２，８９，３８０，３９０，４２９，６３，９０，４１５，１９９，５０３，４７６，９２，２６８，３７１，３０２，４８５，２０５，および２７４からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３０９】
２７．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５１、５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，１１０，６５，９４，６４，５７，１３６，１５８，１５９，３５６，１９７，１３２，８３，７６，１３０，１３５，７７，１８６，１０５，４４５，ａｎｄ  ３２５，ｓｕｃｈ  ａｓ  ａ  ｃｏｍｐｏｕｎｄ  ｓｅｌｅｃｔｅｄ  ｆｒｏｍ  ｔｈｅ  ｇｒｏｕｐ  ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ  ｏｆ  ５１，５９，１２７，１６１，６７，１０６，７２，１２４，１６３，９９，１２５，および１１０からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３１０】
２８．アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号５１２〜６４１からなる群から選択される化合物からなる群から選択される配列の、少なくとも１０または少なくとも１２の連続ヌクレオチドを含む連続ヌクレオチド配列を含む、実施形態１〜２１のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３１１】
２９．アンチセンスオリゴヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列が、選択された配列の少なくとも１４の連続ヌクレオチドを含むか、または選択された配列からなる、実施形態２３〜２８のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
【０３１２】
３０．実施形態１〜２９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドと、前記オリゴヌクレオチドに共有結合した、少なくとも１つのコンジュゲート部分とを含むコンジュゲート。
【０３１３】
３１．実施形態１〜２９のいずれか１つに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチドの、または実施形態３０に記載のコンジュゲートの医薬的に許容される塩。
【０３１４】
３２．実施形態１〜２９のアンチセンスオリゴヌクレオチドまたは実施形態３０のコンジュゲートと、医薬的に許容される希釈剤、溶媒、担体、塩および／またはアジュバントとを含む医薬組成物。
【０３１５】
３３．ＳＣＮ９Ａを発現している標的細胞におけるＳＣＮ９Ａ発現を調節するための、インビボまたはインビトロの方法であって、前記方法は、実施形態１〜２９のいずれか１つのアンチセンスオリゴヌクレオチド、または実施形態３０のコンジュゲート、または実施形態３１もしくは３２の医薬塩もしくは組成物を前記細胞に有効量で投与することを含む。
【０３１６】
３４．疼痛を患っている、または罹患する可能性があるヒトなどの対象の疼痛を治療または予防するための方法であって、治療的または予防的に有効な量の実施形態１〜２９のいずれか１つのアンチセンスオリゴヌクレオチド、または実施形態３０のコンジュゲート、または実施形態３１もしくは３２の医薬塩もしくは組成物を、疼痛を予防または緩和するように投与することを含む方法。
【０３１７】
３５．実施形態３４の方法であって、疼痛が、
ｉ）慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、自発性疼痛もしくは侵害受容性疼痛、または
ｉｉ）糖尿病性神経障害、癌、脳神経痛、帯状疱疹後神経痛および術後神経痛からなる群から選択される障害によって引き起こされる、もしくはそれに関連する疼痛、または
ｉｉｉ）遺伝性肢端紅痛症（ＥＩＭ）もしくは発作性激痛症（ＰＥＰＤ）もしくは三叉神経痛によって引き起こされる、もしくはそれに関連する疼痛、または
ｉｖ）神経障害による疼痛（ｎｅｕｒｏｐｈａｔｈｉｃ  ｐａｉｎ）、慢性疼痛、侵害受容性疼痛一般的な治療（例えば、神経の減圧）、もしくは神経障害性疼痛（例えば、糖尿病性神経障害）、内臓痛、もしくは混合性疼痛のいずれかである方法。
【０３１８】
３６．医療薬で使用するための、実施形態１〜２９のいずれか１つのオリゴヌクレオチド、または実施形態３０によるコンジュゲート、または実施形態３１もしくは３２の医薬塩もしくは組成物。
【０３１９】
３７．実施形態３５のパートＩ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）またはｉｖ）に定義される疼痛などの疼痛の治療または予防または緩和に使用するための、実施形態１〜２９のいずれか１つのオリゴヌクレオチド、または実施形態３０によるコンジュゲート、または実施形態３１もしくは３２の医薬塩もしくは組成物。
【０３２０】
３８．実施形態３５のパートＩ）、ｉｉ）、ｉｉｉ）またはｉｖ）に定義される疼痛などの疼痛の治療、予防または緩和用の薬剤を調製するための、実施形態１〜２９のいずれか１つのオリゴヌクレオチド、または実施形態３０によるコンジュゲート、または実施形態３１もしくは３２の医薬塩もしくは組成物の使用。
【実施例】
【０３２１】
オリゴヌクレオチドの合成
化合物は化合物表に記載されており、核酸塩基配列、配列番号１の相補的標的配列領域（開始および終了）、ギャップマー設計、Ｔｍ（ｄＧ）、および化合物による処理後の細胞内における残留ｍＲＮＡのレベルも示されている。（下記の実施例１を参照）
【０３２２】
オリゴヌクレオチドの合成は、当技術分野で一般に知られている。以下は、適用できるプロトコルである。本発明のオリゴヌクレオチドは、使用する装置、支持体および濃度によって、わずかに異なる方法で生成されている場合がある。
【０３２３】
オリゴヌクレオチドは、Ｏｌｉｇｏｍａｋｅｒ  ４８でホスホラミダイトアプローチを１μｍｏｌスケールで使用して、ウリジンユニバーサル支持体上で合成される。合成の最後に、水性アンモニアを６０℃で５〜１６時間使用して、オリゴヌクレオチドを固体支持体から切断する。オリゴヌクレオチドは逆相ＨＰＬＣ（ＲＰ−ＨＰＬＣ）または固相抽出によって精製され、ＵＰＬＣによって特徴付けられ、分子量はさらにＥＳＩ−ＭＳによって確認される。
【０３２４】
オリゴヌクレオチドの伸長：
β−シアノエチル−ホスホルアミダイト（ＤＮＡ−Ａ（Ｂｚ）、ＤＮＡ−Ｇ（ｉｂｕ）、ＤＮＡ−Ｃ（Ｂｚ）、ＤＮＡ−Ｔ、ＬＮＡ−５−メチル−Ｃ（Ｂｚ）、ＬＮＡ−Ａ（Ｂｚ）、ＬＮＡ−Ｇ（ｄｍｆ）、またはＬＮＡ−Ｔ）のカップリングは、アセトニトリル中の０．１Ｍの５’−Ｏ−ＤＭＴ保護アミダイト溶液、および活性剤として、アセトニトリル（０．２５Ｍ）中のＤＣＩ（４，５−ジシアノイミダゾール）を使用して行われる。最終サイクルでは、所望の修飾を有するホスホラミダイト、例えばコンジュゲート基を結合するためのＣ６リンカー、またはそのようなコンジュゲート基を使用できる。ホスホルチオエート結合を導入するためのチオール化は、水素化キサンタン（アセトニトリル／ピリジン９：１中０．０１Ｍ）を使用することにより行われる。ホスホジエステル結合は、ＴＨＦ／ピリジン／水７：２：１中の０．０２Ｍヨウ素を使用して導入できる。残りの試薬は、オリゴヌクレオチド合成に通常使用される試薬である。
【０３２５】
固相合成後のコンジュゲーションでは、固相合成の最後のサイクルで市販のＣ６アミノリンカーホルフォラミダイトを使用でき、脱保護および固体支持体からの切断後、アミノ結合脱保護オリゴヌクレオチドが単離される。コンジュゲートは、標準的な合成方法を使用した官能基の活性化によって導入される。
【０３２６】
ＲＰ−ＨＰＬＣによる精製：
粗化合物は、Ｐｈｅｎｏｍｅｎｅｘ  Ｊｕｐｉｔｅｒ  Ｃ１８  １０μ  １５０ｘ１０ｍｍカラムでの分取ＲＰ−ＨＰＬＣにより精製される。０．１Ｍ酢酸アンモニウムｐＨ８およびアセトニトリルを、５ｍＬ／分の流速で緩衝液として使用する。収集された画分は凍結乾燥されて、精製された化合物が典型的には白色固体として得られる。
【０３２７】
略記：
ＤＣＩ  ４，５−ジシアノイミダゾール
ＤＣＭ：ジクロロメタン
ＤＭＦ：ジメチルホルムアミド
ＤＭＴ：４，４’−ジメトキシトリチル
ＴＨＦ：テトラヒドロフラン
Ｂｚ：ベンゾイル
Ｉｂｕ：イソブチリル
ＲＰ−ＨＰＬＣ：逆相高速液体クロマトグラフィー
【０３２８】
Ｔｍアッセイ
オリゴヌクレオチドとＲＮＡ標的（リン酸結合、ＰＯ）二重鎖は、５００ｍｌのＲＮａｓｅフリー水で３ｍＭに希釈され、５００ｍｌの２ｘ  Ｔｍ緩衝液（２００ｍＭ  ＮａＣｌ、０．２ｍＭ  ＥＤＴＡ、２０ｍＭリン酸、ｐＨ７．０）と混合される。この溶液を９５℃で３分間加熱した後、室温で３０分間アニーリングする。二重鎖の融解温度（Ｔｍ）は、ＰＥ  Ｔｅｍｐｌａｂソフトウェア（Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ）を使用して、ペルチェ温度プログラマーＰＴＰ６を備えたＬａｍｂｄａ  ４０  ＵＶ／ＶＩＳ分光光度計で測定される。温度を２０℃から９５℃に上昇させ、次いで２５℃に低下させ、２６０ｎｍでの吸収を記録する。一次導関数と、融解およびアニーリングの両方の極大値を使用して、二重鎖Ｔｍを評価する。
【０３２９】
実施例１  オリゴヌクレオチドを使用した、ＳＫ−Ｎ−ＡＳヒト細胞株におけるＮａｖ１．７のインビトロ低減。
ヒトＮａｖ１．７を標的とするＬＮＡ修飾オリゴヌクレオチドを、ＡＴＣＣ（ＣＲＬ−２１３７）から取得したヒトＳＫ−Ｎ−ＡＳ神経芽細胞腫細胞でのＮａｖ１．７  ｍＲＮＡ発現を低減する能力について試験した。ＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞（ＥＣＡＣＣ−９４０９２３０２）は、ベンダーのガイドラインに従って、０．１  ｍＭ非必須アミノ酸（ＮＥＡＡ）およびウシ胎児血清を最終濃度１０％まで補充したダルベッコ改変イーグル培地で培養した。細胞は、活性蒸発インキュベーター（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｃ１０）内で、３７℃、５％ＣＯ２、９５％湿度で培養した。細胞を９５ｕｌのＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞培養培地に、ウェル（９６ウェルプレート）あたり９３００細胞の密度で播種し、インキュベーター内で２４時間付着させた。その後、ＰＢＳ（５．０  μｌ）で最終濃度５  μＭまで希釈したオリゴを、予め作成した９６ウェル希釈プレートから細胞培養物に添加した。細胞培養プレートをインキュベーター内で９６時間インキュベートした。
【０３３０】
インキュベーション後、培地を除去して細胞を回収した後細胞溶解し、メーカーのプロトコルに従って、ＱＩＡＧＥＮ  ＲＮｅａｓｙ  ９６  Ｋｉｔ（ｃａｔ  ７４１８１）を使用してＲＮＡ精製を行った。ワンステップｑＰＣＲ反応の前に、ＲＮＡを水で１０倍に希釈した。ワンステップｑＰＣＲ反応のために、ｑＰＣＲ−ｍｉｘ（ＱｕａｎｔａＢｉｏのｑＳｃｒｉｐｔ（商標）ＸＬＴ  Ｏｎｅ−Ｓｔｅｐ  ＲＴ−ｑＰＣＲ  ＴｏｕｇｈＭｉｘ（登録商標）Ｌｏｗ  ＲＯＸ、カタログ番号９５１３４−５００）およびＱＰＣＲを二重ＱＰＣＲとして、Ｎａｖ１．７（Ｈｓ．ＰＴ．５８．２０９８９２４３）およびＧＵＳＢ（Ｈｓ．ＰＴ．５８ｖ．２７７３７５３８）用のＩｎｔｅｇｒａｔｅｄ  ＤＮＡ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓのアッセイを使用して実行した。
【０３３１】
次に、反応物をｑＰＣＲプレート（ＭＩＣＲＯＡＭＰ（登録商標）ｏｐｔｉｃａｌ  ３８４ウェル、４３０９８４９）内で混合した。播種後、プレートにＲＴで１分間に１０００ｇのクイックスピンを与え、Ｖｉｉａ（商標）７システム（Ａｐｐｌｉｅｄ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｔｈｅｒｍｏ）に移し、以下のＰＣＲ条件を使用した。５０℃で１５分間；９５℃で３分間；９５℃で５秒間、１．６℃／秒の温度低下、６０℃で４５秒間を４０サイクル。ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）Ｒｅａｌ＿ｔｉｍｅ  ＰＣＲソフトウェアを使用してデータを分析し、デルタデルタＣｔ法（数量＝２  ＾（−Ｃｔ）＊１０００００００００）で数量を計算した。量は、同じウェルで実行されるハウスキーピング遺伝子アッセイ（ＧＵＳＢ）の計算された量に正規化する。相対目標数量＝ＱＵＡＮＴＩＴＹ＿ｔａｒｇｅｔ／ＱＵＡＮＴＩＴＹ＿ｈｏｕｓｅｋｅｅｐｉｎｇ（ＲＮＡノックダウン）は、同じプレート上のすべてのＰＢＳ処理ウェルの平均で除することにより、各ウェルについて計算した。正規化目標数量＝Ｒｅｌａｔｉｖｅ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｑｕａｎｔｉｔｙ  ／  ［ｍｅａｎ］  Ｒｅｌａｔｉｖｅ  Ｔａｒｇｅｔ  Ｑｕａｎｔｉｔｙ］＿ｐｂｓ＿ｗｅｌｌｓ）＊  １００。
【０３３２】
配列番号５１２〜６４１に基づく化合物は、上記のアッセイで評価されている。
【０３３３】
目標ノックダウンデータは、次の化合物表に示されている。
【０３３４】
化合物表では、モチーフ配列は、オリゴヌクレオチドに存在する核酸塩基の連続配列を表す。
【０３３５】
設計とは、ギャップマー設計Ｆ−Ｇ−Ｆ  ’を指し、ここでＧは、ＤＮＡヌクレオシドの領域であり、ＦおよびＦ’は、ＬＮＡヌクレオシドの領域である。
【０３３６】
オリゴヌクレオチド化合物は、モチーフ配列の特定の設計を表す。大文字はβ−Ｄ−オキシＬＮＡヌクレオシドを表し、小文字はＤＮＡヌクレオシドを表し、すべてのＬＮＡ  Ｃは５−メチルシトシンであり、すべてのヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
【０３３７】
実施例２  オリゴヌクレオチドを使用した、改変ＳＫ−Ｎ−ＡＳヒト細胞株（Ｎａｖ１．８のＣＲＩＳＰＲ活性化）におけるＮａｖ１．８単独の、またはＮａｖ１．７の低減と組み合わせたインビトロ低減。
ＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞におけるＮａｖ１．８発現の活性化：
ＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞に、ｈＣＭＶ−Ｂｌａｓｔ−ｄＣａｓ９−ＶＰＲ（＃ＶＣＡＳ１１９１８、Ｄｈａｒｍａｃｏｎ）をコード化するレンチウイルス粒子を０．５  ＭＯＩで形質導入し、ブラストサイジン２  ｕｇ／ｍｌで１０日間選択した。続いて、ｄＣａｓ９−ＶＰＲタンパク質を安定して発現するＳＫ−Ｎ−ＡＳを操作して、Ｎａｖ１．８に特異的なｓｇＲＮＡを発現させた。簡単に説明すると、Ｕ６プロモーターによって駆動される発現カセットがｇＢｌｏｃｋとして合成され、続いてＰｉｇｇｙＢａｃベクター（＃ＰＢ５１１Ｂ−１、Ｓｙｓｔｅｍ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）にサブクローニングされた。ベクターの同一性は、サンガーシーケンシングで検証されている。Ｎａｖ１．８に特異的なｓｇＲＮＡを発現するＵ６駆動カセットの安定した統合は、メーカーの指示に従って、トランスポザーゼ発現プラスミド（＃ＰＢ２１０ＰＡ−１、Ｓｙｓｔｅｍ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用して得た。細胞を安定して発現するｓｇＲＮＡの選択は、２  ｕｇ／ｍｌのピューロマイシンの存在下で１０日間行った。
【０３３８】
Ｎａｖ１．８の活性化に使用されるｓｇＲＮＡ配列は、ＧＧＣＡＡＧＣＴＧＴＣＡＣＣＴＣＴＣＴＧ（配列番号６５２）である。
【０３３９】
Ｕ６プロモーター−ｓｇＲＮＡの完全な配列は、以下の通りである。
【０３４０】
ＧＡＧＧＧＣＣＴＡＴＴＴＣＣＣＡＴＧＡＴＴＣＣＴＴＣＡＴＡＴＴＴＧＣＡＴＡＴＡＣＧＡＴＡＣＡＡＧＧＣＴＧＴＴＡＧＡＧＡＧＡＴＡＡＴＴＡＧＡＡＴＴＡＡＴＴＴＧＡＣＴＧＴＡＡＡＣＡＣＡＡＡＧＡＴＡＴＴＡＧＴＡＣＡＡＡＡＴＡＣＧＴＧＡＣＧＴＡＧＡＡＡＧＴＡＡＴＡＡＴＴＴＣＴＴＧＧＧＴＡＧＴＴＴＧＣＡＧＴＴＴＴＡＡＡＡＴＴＡＴＧＴＴＴＴＡＡＡＡＴＧＧＡＣＴＡＴＣＡＴＡＴＧＣＴＴＡＣＣＧＴＡＡＣＴＴＧＡＡＡＧＴＡＴＴＴＣＧＡＴＴＴＣＴＴＧＧＣＴＴＴＡＴＡＴＡＴＣＴＴＧＴＧＧＡＡＡＧＧＡＣＧＡＡＡＣＡＣＣＧＧＧＣＡＡＧＣＴＧＴＣＡＣＣＴＣＴＣＴＧＧＴＴＴＴＡＧＡＧＣＴＡＧＡＡＡＴＡＧＣＡＡＧＴＴＡＡＡＡＴＡＡＧＧＣＴＡＧＴＣＣＧＴＴＡＴＣＡＡＣＴＴＧＡＡＡＡＡＧＴＧＧＣＡＣＣＧＡＧＴＣＧＧＴＧＣＴＴＴＴＴＴＴ（配列番号６５３）
【０３４１】
ヒトＮａｖ１．８単独、または二重特異性化合物としてのＮａｖ１．７も標的とするＬＮＡ修飾オリゴヌクレオチドを、ＡＴＣＣ（ＣＲＬ−２１３７）から取得したヒトＳＫ−Ｎ−ＡＳ神経芽細胞腫細胞における、それぞれのｍＲＮＡ標的の発現を低減させる能力について試験した。ＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞（ＥＣＡＣＣ−９４０９２３０２）は、上記のようにＣＲＩＳＰＲ活性化（ＣＲＩＳＰＲａ）を使用してＮａｖ１．８の転写が活性化されている。改変ＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞は、ベンダーガイドラインに従って、ブラストサイジン（２．５μｇ／ｍｌ）およびピューロマイシン（１μｇ／ｍｌ）で、０．１  ｍＭの非必須アミノ酸（ＮＥＡＡ）、ウシ胎児血清を最終濃度１０％までに補充したダルベッコ改変イーグル培地で親細胞株を培養した。細胞は、活性蒸発インキュベーター（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｃ１０）内で、３７℃、５％ＣＯ２、９５％湿度で培養した。細胞を１９０ｕｌのＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞培養培地に、ウェル（９６ウェルプレート）あたり１０，０００細胞の密度で播種し、インキュベーター内で４時間付着させた。その後、オリゴをあらかじめ作製した９６ウェル希釈プレートで所望の濃度に希釈し、細胞培養プレートにそれの１０μｌを加えて最終濃度を１０μＭにした。細胞培養プレートをインキュベーター内で７２時間インキュベートした。
【０３４２】
インキュベーション後、培地を除去して細胞を回収した後細胞溶解し、メーカーのプロトコルに従って、ＱＩＡＧＥＮ  ＲＮｅａｓｙ  ９６  Ｋｉｔ（ｃａｔ  ７４１８１）を使用してＲＮＡ精製を行った。ワンステップｑＰＣＲ反応の前に、ＲＮＡを水で１０倍に希釈した。ワンステップｑＰＣＲ反応のために、ｑＰＣＲ−ｍｉｘ（ＱｕａｎｔａＢｉｏのｑＳｃｒｉｐｔ（商標）ＸＬＴ  Ｏｎｅ−Ｓｔｅｐ  ＲＴ−ｑＰＣＲ  ＴｏｕｇｈＭｉｘ（登録商標）Ｌｏｗ  ＲＯＸ、カタログ番号９５１３４−５００）およびＱＰＣＲを二重ＱＰＣＲとして、Ｎａｖ１．７（Ｈｓ．ＰＴ．５８．２０９８９２４３）、Ｎａｖ１．８（Ｈｓ．ＰＴ．５８．２３２２００９０）およびＧＵＳＢ（Ｈｓ．ＰＴ．５８ｖ．２７７３７５３８）用のＩｎｔｅｇｒａｔｅｄ  ＤＮＡ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓのアッセイを使用して実行した。
【０３４３】
結果
以下の表は、Ｎａｖ１．７（ＳＣＮ９ａ）およびＮａｖ１．８（ＳＣＮ１０ａ）の両方を標的とする二重特異性化合物を示す。
【０３４４】
効果は、ＰＢＳ対照と比較した残留標的ＲＮＡ（ＧＵＳＢに正規化）としてここに提供される。
【０３４５】
試験は、通常のＳＫ−Ｎ−ＡＳ細胞、およびＮａｖ１．８のＣＲＩＳＰＲａに続くＳＫ−Ｎ−ＡＳにおいて実施した。
【表７】
2021527437.tif 000024
【表８】
2021527437.tif 000025
2021527437.tif 000026
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2021527437.tif 000037
2021527437.tif 000038
2021527437.tif 000039
【配列表】
2021527437000001.app
【国際調査報告】
2021527437.tif 000040
2021527437.tif 000041
2021527437.tif 000042
2021527437.tif 000043
2021527437.tif 000044
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