(57)【要約】ＪＡＫインヒビターを含む治療に対する対象の反応性を予測するバイオマーカーが提供される。本明細書に記載のバイオマーカー、組成物、及び方法は、移植片対宿主病を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象に適切な処置様式を選択するのに有用である。【特許請求の範囲】
【請求項１】
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を処置する方法であって、ＪＡＫインヒビターを含む治療を前記ヒト対象に施すことを含み、（ｉ）前記ヒト対象が、前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、及びＤＲＡＸＩＮからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている、前記方法。
【請求項２】
前記ヒト対象が、（ｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、及びＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記ヒト対象が、（ｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、及びＭＢＬ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている、請求項１に記載の方法。
【請求項４】
前記ヒト対象が、（ｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）前記ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３及びＬＥＰからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を処置する方法であって、
前記ヒト対象から取得された生体試料を提供することと、
前記生体試料における、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、及びＤＲＡＸＩＮからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して増加した濃度を測定することと、
前記ヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すことと、を含む前記方法。
【請求項６】
前記生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、及びＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して増加した濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、を含む請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、及びＭＢＬ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して増加した濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、を含む請求項５に記載の方法。
【請求項８】
前記生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３及びＬＥＰからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して増加した濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、を含む請求項５に記載の方法。
【請求項９】
第２の治療薬が、前記ＪＡＫインヒビターと組み合わせて前記ヒト対象に投与される、請求項１または８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１０】
前記第２の治療薬が、コルチコステロイド、メトトレキサート、サイクロスポリン、ミコフェノール酸モフェチル、タクロリムス、シロリムス、エベロリムス、抗胸腺細胞グロブリン、アレムツズマブ、シクロホスファミド、イブルチニブ、イマチニブ、インフリキシマブ、エタナーセプト、トシリズマブ、アレムツズマブ、バシリキシマブ、ダクリズマブ、リツキシマブ、デニロイキンジフチトクス、ペントスタチン、シクロスポリン、サリドマイド、ハロフギノン、ヒドロキシクロロキン、または間葉系幹細胞である、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
前記第２の治療薬が、コルチコステロイドである、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
前記コルチコステロイドが、メチルプレドニゾロンまたはプレドニソンである、請求項１１に記載の方法。
【請求項１３】
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応を予測する方法であって、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療の前に前記対象から取得された生体試料を提供することと、
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、ＤＲＡＸＩＮ、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含み、
ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、またはＴＧＭ２のうちの少なくとも１種の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、またはＤＲＡＸＩＮのうちの少なくとも１種の、対照と比較して増加した濃度により、前記対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に反応することが予測される、前記方法。
【請求項１４】
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、ＣＲ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することを含み、
ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、またはＩＬ−１８Ｒ１のうちの少なくとも１種の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、またはＣＲ２のうちの少なくとも１種の、対照と比較して増加した濃度により、前記対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に反応することが予測される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１５】
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することを含み、
ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、またはＡＬＤＨ１Ａ１のうちの少なくとも１種の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、またはＭＢＬ２のうちの少なくとも１種の、対照と比較して増加した濃度により、前記対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に反応することが予測される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１６】
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することを含み、
ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、またはＳＰＩＮＫ１のうちの少なくとも１種の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３またはＬＥＰのうちの少なくとも１種の、対照と比較して増加した濃度により、前記対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に反応することが予測される、請求項１３に記載の方法。
【請求項１７】
前記対照が、事前に確立されたカットオフ値である、先行請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１８】
前記対照が、前記ＪＡＫインヒビターによる処置に反応しなかった１つ以上の対象から取得された１つまたは複数の試料における前記タンパク質の濃度である、請求項１〜１７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１９】
試料中のタンパク質の量を測定する方法であって、
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象から取得された生体試料を提供することと、
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、ＤＲＡＸＩＮ、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含む前記方法。
【請求項２０】
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、ＣＲ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することを含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２１】
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することを含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２２】
前記生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することを含む、請求項１９に記載の方法。
【請求項２３】
２０種以下のタンパク質の濃度が測定される、請求項１９〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２４】
１０種以下のタンパク質の濃度が測定される、請求項１９〜２２のいずれか１項に記載の方法。
【請求項２５】
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を処置する方法であって、
ＪＡＫインヒビターを含む治療を施す前に前記ヒト対象から取得された第１の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣ���１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、ＭＡＴＮ３、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施した後に前記ヒト対象から取得された第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１���、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、及びＭＡＴＮ３、からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定することと、を含む前記方法。
【請求項２６】
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施す前に前記ヒト対象から取得された前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施した後に前記ヒト対象から取得された前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、及びＧＰＮＭＢからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定することと、を含む請求項２���に記載の方法。
【請求項２７】
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施す前に前記ヒト対象から取得された前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施した後に前記ヒト対象から取得された前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、及びＫＩＭ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定することと、を含む請求項２５に記載の方法。
【請求項２８】
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施す前に前記ヒト対象から取得された前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施した後に前記ヒト対象から取得された前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、及びＣＣＬ２５からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定することと、を含む請求項２５に記載の方法。
【請求項２９】
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施す前に前記ヒト対象から取得された前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記ヒト対象に前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施すことと、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施した後に前記ヒト対象から取得された前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、及びＮＣＡＭ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定することと、を含む請求項２５に記載の方法。
【請求項３０】
第２の治療薬が、前記ＪＡＫインヒビターと組み合わせて前記ヒト対象に投与される、請求項２５〜２９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項３１】
前記第２の治療薬が、コルチコステロイド、メトトレキサート、サイクロスポリン、ミコフェノール酸モフェチル、タクロリムス、シロリムス、エベロリムス、抗胸腺細胞グロブリン、アレムツズマブ、シクロホスファミド、イブルチニブ、イマチニブ、インフリキシマブ、エタナーセプト、トシリズマブ、アレムツズマブ、バシリキシマブ、ダクリズマブ、リツキシマブ、デニロイキンジフチトクス、ペントスタチン、シクロスポリン、サリドマイド、ハロフギノン、ヒドロキシクロロキン、または間葉系幹細胞である、請求項３０に記載の方法。
【請求項３２】
前記第２の治療薬が、コルチコステロイドである、請求項３０に記載の方法。
【請求項３３】
前記コルチコステロイドが、メチルプレドニゾロンまたはプレドニソンである、請求項３２に記載の方法。
【請求項３４】
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）を有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応を同定する方法であって、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施す前に前記ヒト対象から取得された第１の生体試料を提供することと、
前記第１の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ���ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、ＭＡＴＮ３、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療を施した後に前記対象から取得された第２の生体試料を提供することと、
前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ���ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、ＭＡＴＮ３、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含み、
前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ���ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、及び／またはＭＡＴＮ３のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及び／またはＳＭＯＣ２のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度により、前記ヒト対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に対する治療反応を経験したことが示される、前記方法。
【請求項３５】
前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含み、
前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴのうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２及びＧＰＮＭＢのうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度により、前記ヒト対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に対する治療反応を経験したことが示される、請求項３４に記載の方法。
【請求項３６】
前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含み、
前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、及びＫＩＭ１のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度により、前記ヒト対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に対する治療反応を経験したことが示される、請求項３４に記載の方法。
【請求項３７】
前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含み、
前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、及びＣＣＬ２５のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度により、前記ヒト対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に対する治療反応を経験したことが示される、請求項３４に記載の方法。
【請求項３８】
前記第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、
前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することと、を含み、
前記第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または前記第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、及びＮＣＡＭ１のうちの少なくとも１種の、前記第１の生体試料と比較して増加した濃度により、前記ヒト対象が前記ＪＡＫインヒビターを含む前記治療に対する治療反応を経験したことが示される、請求項３４に記載の方法。
【請求項３９】
前記生体試料が、血液、血清、血漿、尿、脊髄液、唾液、涙液、または汗である、先行請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４０】
前記生体試料が、血液、血清、または血漿である、先行請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４１】
前記タンパク質の濃度が、免疫学的方法により測定される、先行請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４２】
前記免疫学的方法が、酵素結合免疫吸着測定法、酵素免疫測定法、放射免疫測定法、化学発光免疫測定法、電気化学発光免疫測定法、ラテックス免疫比濁法、ラテックス近赤外免疫比濁法、免疫クロマトグラフィーアッセイ、及びウェスタンブロット法からなる群から選択される、請求項４１に記載の方法。
【請求項４３】
前記タンパク質の濃度が、質量分析により測定される、請求項１〜４０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４４】
前記ＪＡＫインヒビターが、イタシチニブである、先行請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４５】
前記ＪＡＫインヒビターが、４−［３−（シアノメチル）−３−（３'，５'−ジメチル−１Ｈ，１'Ｈ−４，４'−ビピラゾール−１−イル）アゼチジン−１−イル］−２，５−ジフルオロ−Ｎ−［（１Ｓ）−２，２，２−トリフルオロ−１−メチルエチル］ベンズアミドもしくはその薬学的に許容される塩または（（２Ｒ，５Ｓ）−５−｛２−［（１Ｒ）−１−ヒドロキシエチル］−１Ｈ−イミダゾ［４，５−ｄ］チエノ［３，２−ｂ］ピリジン−１−イル｝テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−２−イル）アセトニトリルもしくはその薬学的に許容される塩である、請求項１〜４３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４６】
前記ＧｖＨＤが、急性ＧｖＨＤである、先行請求項のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４７】
前記ＧｖＨＤが、慢性ＧｖＨＤである、請求項１〜４５のいずれか１項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１８年４月１３日に出願の米国仮出願番号第６２／６５７，１９３号及び２０１８年１１月３０日に出願の米国仮出願番号第６２／７７３，３０８号の優先権を主張する。先行出願の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０００２】
本発明は、一般に、バイオマーカー及び移植片対宿主病に関する。
【背景技術】
【０００３】
移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）は、同種異系レシピエントに移植された免疫担当細胞がレシピエントの組織を攻撃する場合に起こる。多くの場合、皮膚、消化管上皮、及び肝臓の組織が標的となり、ＧｖＨＤの経過中に破壊され得る。この疾患は、骨髄移植などにおいて、免疫組織が移植されている場合に特に深刻な問題を生じる。ＧｖＨＤは、同種異系造血幹細胞移植後の２番目に多い死亡原因である。ＧｖＨＤは、心臓及び肝臓移植などの他の移植後でも起こり得る。
【０００４】
Ｊａｎｕｓキナーゼ（ＪＡＫ）インヒビターは、ＧｖＨＤの処置のための薬剤として開発されてきた。しかしながら、どんな治療薬でも、ＪＡＫインヒビターは、ＧｖＨＤを有する全ての対象において同程度に効果的ではない場合がある。ＪＡＫインヒビターによる処置から最も恩恵を受けることができるＧｖＨＤを有する対象を同定する手段及びＪＡＫインヒビターによる処置に対する治療反応を示す対象を同定する手段が必要とされる。
【発明の概要】
【０００５】
本出願は、ＧｖＨＤ対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応性を予測するバイオマーカー、及びＪＡＫインヒビターに対する治療反応を経験した対象を同定するバイオマーカーの同定に少なくとも部分的に基づく。処置前のある種のタンパク質（例えば、表１及び表２に列挙するタンパク質）のレベルは、ＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応性の有用な予測因子として同定される。加えて、処置経過中でのある種のタンパク質（例えば、表１３に列挙するタンパク質）のレベルの変化は、ＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応性の有用な識別子として同定される。従って、本明細書に記載のバイオマーカー及び組成物は、例えば、ＪＡＫインヒビターによる処置から恩恵を受けることができるか、または恩恵を受けた、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある患者または患者のサブセットを同定、層別化、及び／または選択するのに有用である。加えて、本明細書に記載の方法は、例えば、ＧｖＨＤに罹患しているか、それを有すると疑われるか、またはそれを発症するリスクがある対象に適切な処置様式（例えば、ＪＡＫインヒビターを含む治療）を選択するのに有用である。
【０００６】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を、ＪＡＫインヒビターを含む治療を当該ヒト対象に施すことにより処置する方法であって、当該ヒト対象が、（ｉ）当該ヒト対象から取得された生体試料における、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）当該ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、及びＤＲＡＸＩＮからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている、当該方法を特徴とする。
【０００７】
幾つかの実施形態では、ヒト対象は、（ｉ）ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、及びＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８種のタンパク質）の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている。
【０００８】
幾つかの実施形態では、ヒト対象は、（ｉ）ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６種のタンパク質）の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ及びＭＢＬ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、または３種のタンパク質）の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている。
【０００９】
幾つかの実施形態では、ヒト対象は、（ｉ）ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８種のタンパク質）の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３及びＬＥＰからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１種または２種のタンパク質）の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている。
【００１０】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を処置する方法であって、当該ヒト対象から取得された生体試料を提供すること、当該生体試料における、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、及びＤＲＡＸＩＮからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の、対照と比較して増加した濃度を測定すること、ならびに当該ヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、による当該方法も特徴とする。
【００１１】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、及びＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８種のタンパク質）の、対照と比較して増加した濃度を測定すること、ならびにヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、を含む。
【００１２】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６種のタンパク質）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、及びＭＢＬ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、または３種のタンパク質）の、対照と比較して増加した濃度を測定すること、ならびにヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、を含む。
【００１３】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８種のタンパク質）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３及びＬＥＰからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１種または２種のタンパク質）の、対照と比較して増加した濃度を測定すること、ならびにヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、を含む。
【００１４】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応を予測する方法であって、当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療前に当該対象から取得された生体試料を提供すること、ならびに生体試料における、ＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、ＤＲＡＸＩＮ、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、による当該方法も特徴とし、ここで、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、またはＴＧＭ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ��０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、またはＤＲＡＸＩＮのうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、対照と比較して増加した濃度により、当該対象が当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療に反応することが予測される。
【００１５】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、ＣＲ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定することを含み、ここで、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、またはＩＬ−１８Ｒ１のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、またはＣＲ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８種）の、対照と比較して増加した濃度により、対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。
【００１６】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９種のタンパク質）の濃度を測定することを含み、ここで、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、またはＡＬＤＨ１Ａ１のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６種）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＬＥＰ、またはＭＢＬ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、または３種）の、対照と比較して増加した濃度により、対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。
【００１７】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０種のタンパク質）の濃度を測定することを含み、ここで、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、またはＳＰＩＮＫ１のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８種）の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３またはＬＥＰのうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１または２種）の、対照と比較して増加した濃度により、対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。
【００１８】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、対照は、事前に確立されたカットオフ値である。
【００１９】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、対照は、ＪＡＫインヒビターによる処置に反応しなかった１つ以上の対象から取得された１つまたは複数の試料におけるタンパク質の濃度である。
【００２０】
本開示は、試料中のタンパク質の量を測定する方法であって、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象から取得された生体試料を提供すること、ならびに当該生体試料における、ＰＯＮ３、ＣＮＴＮ１、ＩＧＦＢＰ３、ＬＥＰ、Ｎｏｔｃｈ３、ＴＮ−Ｒ、ＨＳＤ１１Ｂ１、ＦＡＭ１９Ａ５、ＮＣＡＮ、Ｆ１１、ＧＤＦ−８、ＣＣＬ２８、ＧＡＬＮＴ１０、ＢＣＡＮ、ＴＩＭＰ４、ＣＲＩＳＰ２、ＣＤ２０７、ＷＮＴ９Ａ、ＭＢＬ２、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＴＷＥＡＫ、ＣＲ２、ＭＦＡＰ５、ＫＩＴ、ＧＨ、ＰＦＫＭ、ＣＤＳＮ、ＣＲＨ、ＧＣＰ５、ＫＬＫ６、ＤＲＡＸＩＮ、ＩＬ８、ＨＡＯＸ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＭＣＰ−３、ＣＥＳ１、ＭＦＧＥ８、ＰＬＸＮＢ１、ＴＮＦＲＳＦ１０Ａ、ＣＣＬ１５、ＳＥＭＡ４Ｃ、ＰＲＥＢ、ＮＦＡＴＣ３、ＣＣＬ１９、ＤＬＬ１、ＥＮＴＰＤ２、ＩＬ−４ＲＡ、ＥＰＨＡ２、ＦＯＳＢ、ＣＸＣＬ１０、ＶＡＭＰ５、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＭＶＫ、ＩＬ１２ＲＢ１、ＣＡＬＣＡ、ＡＨＣＹ、ＰＲＳＳ２、ＬＩＬＲＢ４、ＤＤＡＨ１、ＩＬ−１ｒａ、ＮＥＣＴＩＮ２、ＰＤＣＤ１、ＣＤ７４、ＰＤ−Ｌ１、ＲＥＧ３Ａ、ＣＡ５Ａ、Ｎ２ＤＬ−２、ＣＤＣＰ１、Ｕ−ＰＡＲ、ＳＩＧＬＥＣ７、ＡＮＧＰＴＬ４、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＳＰＩＮＫ１、ＨＴＲＡ２、ＰＲＤＸ６、ＩＬ−１ＲＴ２、ＩＧＦＢＰ−１、ＨＮＭＴ、ＴＲＡＩＬ−Ｒ２、ＣＸＡＤＲ、ＣＴＳＬ１、ＩＦＮ−γ−Ｒ１、ＩＬ−１８Ｒ１、ＫＲＴ１９、ＫＹＮＵ、及びＴＧＭ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定することによる、当該方法も特徴とする。
【００２１】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＧＨ、ＧＤＦ−８、ＥＮ−ＲＡＧＥ、ＣＲＩＳＰ２、ＣＲ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＣＥＳ１、ＲＥＧ３Ａ、ＫＹＮＵ、ＩＬ−４ＲＡ、ＣＤＣＰ１、ＭＶＫ、ＦＯＳＢ、ＮＦＡＴＣ３、Ｎ２ＤＬ−２、ＤＤＡＨ１、ＩＧＦＢＰ−１、ＡＬＤＨ３Ａ１、ＣＸＡＤＲ、ＰＬＸＮＢ１、ＣＤ７４、ＥＮＴＰＤ２、ＰＲＥＢ、ＣＣＬ１９、ＨＮＭＴ、ＨＴＲＡ２、ＩＬ−１ＲＴ２、及びＩＬ−１８Ｒ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定することを含む。
【００２２】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＢＬ２、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、ＳＰＩＮＫ１、ＥＮＰＰ７、ＡＣＥ２、ＣＴＳＬ１、ＰＲＳＳ２、ＣＸＣＬ１０、ＭＦＧＥ８、ＫＲＴ１９、及びＡＬＤＨ１Ａ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９種のタンパク質）の濃度を測定することを含む。
【００２３】
幾つかの実施形態では、本方法は、生体試料における、ＰＯＮ３、ＬＥＰ、ＭＣＰ−３、ＨＡＯＸ１、ＣＡ５Ａ、ＣＡＬＣＡ、ＩＬ８、ＳＵＬＴ２Ａ１、ＶＡＭＰ５、及びＳＰＩＮＫ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０種のタンパク質）の濃度を測定することを含む。
【００２４】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、５０、４０、３０、２０、１５、１０、または５種以下のタンパク質の濃度が測定される。
【００２５】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を処置する方法であって、ＪＡＫインヒビターを含む治療を施す前に前記ヒト対象から取得された第１の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５���ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、ＭＡＴＮ３、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、当該ヒト対象に当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療を施すこと、ならびに当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療を施した後に当該ヒト対象から取得された第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、��ＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、及びＭＡＴＮ３からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の当該第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩ��１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の当該第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定すること、による当該方法も特徴とする。
【００２６】
幾つかの実施形態では、本方法は、ＪＡＫインヒビターを含む治療を施す前にヒト対象から取得された第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、ヒト対象���ＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、ならびにＪＡＫインヒビターを含む治療を施した後にヒト対象から取得された第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ��、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、及びＧＰＮＭＢからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定すること、を含む。
【００２７】
幾つかの実施形態では、本方法は、ＪＡＫインヒビターを含む治療を施す前にヒト対象から取得された第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、ヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、ならびにＪＡＫインヒビターを含む治療を施した後にヒト対象から取得された第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、及びＫＩＭ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定すること、を含む。
【００２８】
幾つかの実施形態では、本方法は、ＪＡＫインヒビターを含む治療を施す前にヒト対象から取得された第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、ヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、ならびにＪＡＫインヒビターを含む治療を施した後にヒト対象から取得された第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、または１７種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、及びＣＣＬ２５からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、または７種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定すること、を含む。
【００２９】
幾つかの実施形態では、本方法は、ＪＡＫインヒビターを含む治療を施す前にヒト対象から取得された第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６種のタンパク質）の濃度を測定すること、ヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すこと、ならびにＪＡＫインヒビターを含む治療を施した後にヒト対象から取得された第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１１種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／またはＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、及びＮＣＡＭ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、または５種のタンパク質）の第１の生体試料と比較して増加した濃度を測定すること、を含む。
【００３０】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応を同定する方法であって、当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療を施す前に当該ヒト対象から取得された第１の生体試料を提供すること、当該第１の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７���ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、ＭＡＴＮ３、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療を施した後に当該対象から取得された第２の生体試料を提供すること、ならびに当該第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ��、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、ＭＡＴＮ３、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、Ｐ��ＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及びＳＭＯＣ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、による当該方法も特徴とし、ここで、当該第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、
ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、及び／またはＭＡＴＮ３のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の当該第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または当該第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及び／またはＳＭＯＣ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の当該第１の生体試料と比較して増加した濃度により、当該ヒト対象が当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療に対する治療反応を経験したことが示される。
【００３１】
幾つかの実施形態では、本方法は、第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、ならびに第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ���Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴからなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、を含み、ここで、第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、Ｉ��ＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、及びＲＥＬＴのうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、及びＧＰＮＭＢのうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の第１の生体試料と比較して増加した濃度により、ヒト対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応を経験したことが示される。
【００３２】
幾つかの実施形態では、本方法は、第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、ならびに第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、を含み、ここで、第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、及びＨＡＶＣＲ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ｈＫ１４、及びＫＩＭ１のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０種）の第１の生体試料と比較して増加した濃度により、ヒト対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応を経験したことが示される。
【００３３】
幾つかの実施形態では、本方法は、第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、ならびに第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種のタンパク質）の濃度を測定すること、を含み、ここで、第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、及びＣＮＴＮＡＰ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、または１７種）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、及びＣＣＬ２５のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、または７種）の第１の生体試料と比較して増加した濃度により、ヒト対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応を経験したことが示される。
【００３４】
幾つかの実施形態では、本方法は、第１の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６種のタンパク質）の濃度を測定すること、ならびに第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６種のタンパク質）の濃度を測定すること、を含み、ここで、第２の生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、及びＩＴＧＢ２のうちの少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、または１１種）の第１の生体試料と比較して減少した濃度、及び／または第２の生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、及びＮＣＡＭ１の少なくとも１種（例えば、少なくとも１、２、３、４、または５種）の第１の生体試料と比較して増加した濃度により、ヒト対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応を経験したことが示される。
【００３５】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を、ＪＡＫインヒビターを含む治療を当該ヒト対象に施すことによって処置する方法であって、当該ヒト対象が、（ｉ）当該ヒト対象から取得された生体試料における、ＭＣＰ−３、ＣＡ５Ａ、ＩＬ８、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ６、ＣＣＬ１９、ＣＴＳＬ１、ＡＣＥ２、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＫＹＮＵ、ＦＯＳＢ、ＡＬＤＨ３Ａ１、及びＤＤＡＨ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より低いベースライン濃度、及び／または（ｉｉ）当該ヒト対象から取得された生体試料における、ＰＯＮ３、ＳＣＦ、ＧＨ、ＳＲＣ、及びＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照より高いベースライン濃度を有することが以前に決定されている、当該方法も特徴とする。
【００３６】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象を処置する方法であって、当該ヒト対象から取得された生体試料を提供すること、当該生体試料における、ＭＣＰ−３、ＣＡ５Ａ、ＩＬ８、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ６、ＣＣＬ１９、ＣＴＳＬ１、ＡＣＥ２、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＫＹＮＵ、ＦＯＳＢ、ＡＬＤＨ３Ａ１、及びＤＤＡＨ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＳＣＦ、ＧＨ、ＳＲＣ、及びＣＲ２からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の、対照と比較して増加した濃度を測定すること、ならびに当該ヒト対象にＪＡＫインヒビターを含む治療を施すことによる当該方法も特徴とする。
【００３７】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応を予測する方法であって、当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療の前に当該対象から取得された生体試料を提供すること、ならびに生体試料における、ＰＯＮ３、ＳＣＦ、ＧＨ、ＳＲＣ、ＣＲ２、ＭＣＰ−３、ＣＡ５Ａ、ＩＬ８、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ６、ＣＣＬ１９、ＣＴＳＬ１、ＡＣＥ２、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＫＹＮＵ、ＦＯＳＢ、ＡＬＤＨ３Ａ１、及びＤＤＡＨ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することによる当該方法も特徴とし、ここで、ＭＣＰ−３、ＣＡ５Ａ、ＩＬ８、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ６、ＣＣＬ１９、ＣＴＳＬ１、ＡＣＥ２、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＫＹＮＵ、ＦＯＳＢ、ＡＬＤＨ３Ａ１、及び／またはＤＤＡＨ１の、対照と比較して減少した濃度、及び／またはＰＯＮ３、ＳＣＦ、ＧＨ、ＳＲＣ、及び／またはＣＲ２の、対照と比較して増加した濃度により、当該対象が当該ＪＡＫインヒビターを含む当該治療に反応することが予測される。
【００３８】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、対照は、事前に確立されたカットオフ値である。
【００３９】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、対照は、ＪＡＫインヒビターによる処置に反応しなかった１つ以上の対象から取得された１つまたは複数の試料におけるタンパク質の濃度である。
【００４０】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがあるヒト対象から取得された生体試料を提供すること、ならびに当該生体試料における、ＰＯＮ３、ＳＣＦ、ＧＨ、ＳＲＣ、ＣＲ２、ＭＣＰ−３、ＣＡ５Ａ、ＩＬ８、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ６、ＣＣＬ１９、ＣＴＳＬ１、ＡＣＥ２、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＫＹＮＵ、ＦＯＳＢ、ＡＬＤＨ３Ａ１、及びＤＤＡＨ１からなる群から選択される少なくとも１種のタンパク質の濃度を測定することによる、試料中のタンパク質の量を測定する方法も特徴とする。
【００４１】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、２０種以下のタンパク質の濃度が測定される。
【００４２】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、１０種以下のタンパク質の濃度が測定される。
【００４３】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、生体試料は、血液、血清、血漿、尿、脊髄液、唾液、涙液、または汗である。幾つかの実施形態では、生体試料は、血液、血清、または血漿である。
【００４４】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、タンパク質の濃度は、免疫学的方法により測定される。免疫学的方法は、例えば、酵素結合免疫吸着測定法、酵素免疫測定法、放射免疫測定法、化学発光免疫測定法、電気化学発光免疫測定法、ラテックス免疫比濁法、ラテックス近赤外免疫比濁法、免疫クロマトグラフィーアッセイ、またはウェスタンブロット法であり得る。
【００４５】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、タンパク質の濃度は、質量分析により測定される。
【００４６】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、イタシチニブである。
【００４７】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、４−［３−（シアノメチル）−３−（３'，５'−ジメチル−１Ｈ，１'Ｈ−４，４'−ビピラゾール−１−イル）アゼチジン−１−イル］−２，５−ジフルオロ−Ｎ−［（１Ｓ）−２，２，２−トリフルオロ−１−メチルエチル］ベンズアミドもしくはその薬学的に許容される塩または（（２Ｒ，５Ｓ）−５−｛２−［（１Ｒ）−１−ヒドロキシエチル］−１Ｈ−イミダゾ［４，５−ｄ］チエノ［３，２−ｂ］ピリジン−１−イル｝テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−２−イル）アセトニトリルもしくはその薬学的に許容される塩である。
【００４８】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、第２の治療薬がＪＡＫインヒビターと組み合わせてヒト対象に投与される。第２の治療薬は、例えば、コルチコステロイド（例えば、メチルプレドニゾロンまたはプレドニソン）、メトトレキサート、サイクロスポリン、ミコフェノール酸モフェチル、タクロリムス、シロリムス、エベロリムス、抗胸腺細胞グロブリン、アレムツズマブ、シクロホスファミド、イブルチニブ、イマチニブ、インフリキシマブ、エタナーセプト、トシリズマブ、アレムツズマブ、バシリキシマブ、ダクリズマブ、リツキシマブ、デニロイキンジフチトクス、ペントスタチン、シクロスポリン、サリドマイド、ハロフギノン、ヒドロキシクロロキン、または間葉系幹細胞であり得る。ＪＡＫインヒビター及び第２の治療薬は、同時または逐次的に投与され得る。
【００４９】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、ＧｖＨＤは、急性ＧｖＨＤである。
【００５０】
本明細書に記載の方法のいずれかの幾つかの実施形態では、ＧｖＨＤは、慢性ＧｖＨＤである。
【００５１】
用語「タンパク質のベースライン濃度」は、ＪＡＫインヒビターによる処置の開始前の対象におけるタンパク質の濃度を指す。
【００５２】
用語「減少した濃度」は、解析されているタンパク質の、対照または以前の試料におけるそのタンパク質の濃度より低い濃度を意味する。例えば、解析されているタンパク質の濃度は、対照におけるそのタンパク質の濃度と比べて、少なくとも１．５分の１、２分の１、３分の１、４分の１、５分の１、６分の１、７分の１、８分の１、９分の１、１０分の１、２０分の１、２５分の１、５０分の１、７５分の１、もしくは１００分の１であるか、または少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１，０００％、１，５００％、２，０００％、２，５００％、３，０００％、３，５００％、４，０００％、４，５００％、もしくは５，０００％低い。
【００５３】
用語「増加した濃度」は、解析されているタンパク質の、対照または以前の試料におけるそのタンパク質の濃度より高い濃度を意味する。例えば、解析されているタンパク質の濃度は、対照におけるそのタンパク質の濃度と比べて、少なくとも１．５、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、２５、５０、７５、もしくは１００倍高いか、または少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１，０００％、１，５００％、２，０００％、２，５００％、３，０００％、３，５００％、４，０００％、４，５００％、または５，０００％高い。
【００５４】
用語「治療に反応する」は、当該治療を施された対象が、提供されたＪＡＫインヒビター治療に対して有効反応を示すことを意味する。
【００５５】
特に定義しない限り、本明細書において使用される技術用語及び科学用語は全て、本発明が属する技術分野の当業者により一般的に理解される意味と同じ意味を有する。本明細書に記載されているものと類似または同等の方法及び材料を、本発明の実施または試験において使用することができるが、例示的な方法及び材料が以下に記載される。本明細書に記載の全ての刊行物、特許出願、特許、及び他の参考文献は、参照によりその全体が組み込まれる。矛盾する場合、定義を含め、本出願が優先する。材料、方法、及び例は例示にすぎず、限定することを意図しない。
【００５６】
本発明のその他の特徴及び利点は、以下の発明を実施するための形態及び特許請求の範囲により明らかとなるであろう。
【発明を実施するための形態】
【００５７】
本開示は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象をＪＡＫインヒビターにより処置するための方法及び組成物を提供する。本開示は、ＪＡＫインヒビターを含む治療を施すことが効果的でありそうな、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象を同定するための効果予測バイオマーカー（例えば、タンパク質発現レベル）を提供する。
【００５８】
移植片対宿主病
ＧｖＨＤは、ドナーのＴ細胞が宿主細胞上の遺伝的に既定されたタンパク質（ヒト白血球抗原が挙げられるがこれに限定されない）に反応する場合に起こる。急性ＧｖＨＤは、一般に、移植後の１００日目より前に起こると定義されるが、慢性ＧｖＨＤはそれ以降に起こる。
【００５９】
急性ＧｖＨＤの臨床症状は、皮膚、消化管、及び肝臓で起こる。皮膚は、急性ＧｖＨＤにおいて冒されることが最も多い器官であり、通常、多くの場合はドナー細胞の生着と同時に病変を示す最初の器官である。特徴的な斑点状丘疹は、そう痒性であり、身体全体に広がり得る。重症例では、皮膚は、水疱を形成し得、潰瘍化し得る。他の特徴としては、異常角化、リンパ球のエキソサイトーシス、異常角化表皮ケラチノサイトに隣接したサテライトリンパ球、及び真皮における血管周囲リンパ球浸潤が挙げられる。急性ＧｖＨＤの消化管病変は、通常、下痢として現れるが、嘔吐、食欲不振、及び／または腹痛としても現れ得る。ＧｖＨＤにより引き起こされる肝疾患の組織学的特徴は、リンパ球の血管内皮接着（ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌｉｔｉｓ）、門脈域のリンパ球浸潤、胆管周囲炎、及び胆管破壊である。
【００６０】
慢性ＧｖＨＤは、造血細胞移植後の遅発性非再発死亡の主な原因である。その症状は、進行型（例えば、急性ＧｖＨＤが慢性ＧｖＨＤに合併する）であり得るか、一時静止型（完全に消退するが、後に慢性ＧｖＨＤが続く急性ＧｖＨＤ）であり得るか、または新規発生型で起こり得る。レシピエントがより高齢であること及び急性ＧｖＨＤの病歴は、慢性ＧｖＨＤの最大のリスク因子である。慢性ＧｖＨＤの臨床徴候は、多くの場合、最初に頬粘膜に現れる。
【００６１】
ＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応性を予測する方法
発現レベルがＧｖＨＤを有する対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応性（例えば、疾患スコアの改善及び／または疾患の消退）を予測するのに有用である幾つかのタンパク質が、実施例において同定された。これらのタンパク質を表１及び２に列挙する。
【表１−１】
2021521442.tif 000002
【表１−２】
2021521442.tif 000003
【表２】
2021521442.tif 000004
【００６２】
表１に列挙する１種以上の（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４種の）タンパク質の、対照と比較して減少したタンパク質濃度により、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが示される／予測される。例えば、ＪＡＫインヒビターを含む治療による処置の前に対象から取得された生体試料における（対照と比較して）低濃度のＣＸＣＬ１０タンパク質により、当該対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。
【００６３】
表２に列挙する１種以上の（例えば、少なくとも１、２、３、４、または５種の）タンパク質の、対照と比較して増加したタンパク質濃度により、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが示される／予測される。例えば、ＪＡＫインヒビターを含む治療による処置の前に対象から取得された生体試料における（対照と比較して）増加した濃度のＰＯＮ３タンパク質により、当該対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。
【００６４】
表２に列挙する１種以上（例えば、少なくとも１、２、３、４、または５種）のタンパク質の、対照と比較して増加したタンパク質濃度と組み合わせた、表１に列挙する１種以上（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、または１４種）のタンパク質の、対照と比較して減少したタンパク質濃度により、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが示される／予測される。例えば、ＪＡＫインヒビターを含む治療による処置の前に対象から取得された生体試料における（対照と比較して）低濃度のＣＸＣＬ１０タンパク質及び（対照と比較して）増加した濃度のＰＯＮ３タンパク質により、当該対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。別の例では、ＪＡＫインヒビターを含む治療による処置の前に対象から取得された生体試料における（対照と比較して）低濃度のＭＣＰ−３、ＣＡ５Ａ、ＩＬ８、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ６、ＣＣＬ１９、ＣＴＳＬ１、ＡＣＥ２、ＡＬＤＨ１Ａ１、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＫＹＮＵ、ＦＯＳＢ、ＡＬＤＨ３Ａ１、及びＤＤＡＨ１タンパク質、ならびに（対照と比較して）増加した濃度のＰＯＮ３、ＳＣＦ、ＧＨ、ＳＲＣ、及びＣＲ２タンパク質により、当該対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応することが予測される。
【００６５】
幾つかの実施形態では、ＧｖＨＤは、急性ＧｖＨＤである。他の実施形態では、ＧｖＨＤは、慢性ＧｖＨＤである。
【００６６】
対照
前述したように、本発明の方法は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象由来の生体試料における、１種以上のタンパク質（例えば、表１及び／または表２に示した１種以上のタンパク質）の濃度を測定することを伴い得、ここで、対照と比較した１種以上のタンパク質の濃度により、ＪＡＫインヒビターを含む処置に対する対象の反応が予測される。ある種の実施形態では、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象由来の生体試料において、表１のタンパク質の濃度が対照より低い場合、当該対象は、ＪＡＫインヒビターを含む治療に反応する可能性が高いと同定される。他の実施形態では、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象由来の生体試料において、表２のタンパク質の濃度が対照より高い場合、当該対象は、ＪＡＫインヒビターを含む治療に反応する可能性が高いと同定される。本文脈中、用語「対照」には、ＪＡＫインヒビターを含む治療に反応しないことが既知の対象から取得される（同一組織型由来の）試料が含まれる。また、用語「対照」には、ＪＡＫインヒビターを含む治療に反応しないことが既知の対象から過去に取得され、治療反応性が予測されるべき対象から採取される試験試料との比較のための基準として将来使用される、（同一組織型由来の）試料も含まれる。特定の細胞型または組織の特定のタンパク質の「対照」発現レベル／濃度は、ＪＡＫインヒビターによる処置に反応しなかった同一種の１つ以上の（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１５、２０、２５、３０、３５、または４０以上の）対象におけるタンパク質発現の解析によって事前に確立され得る。次いで、この事前に確立された基準値（治療に反応しなかった複数の対象から得られた発現レベル／濃度の平均値または中央値であり得る）は、試験試料との比較においてタンパク質の「対照」濃度／発現レベルとして使用され得る。かかる比較において、解析されているタンパク質の発現レベルが事前に確立された基準より低い（表１）または高い（表２）場合、対象はＪＡＫインヒビターを含む治療に反応すると予測される。
【００６７】
代替的に、特定の細胞型または組織における特定のタンパク質の「対照」濃度は、ＪＡＫインヒビターによる処置に反応した１つ以上の対象におけるタンパク質発現の解析により事前に確立され得る。次いで、この事前に確立された基準値（治療に反応した複数の対象から得られた発現レベル平均値または中央値であり得る）は、試験試料との比較において「対照」発現レベルとして使用され得る。かかる比較において、解析されているタンパク質の濃度が、事前に確立された基準と同一または同等（例えば、少なくとも８５％であるが、１００％未満）である場合、対象はＪＡＫインヒビターを含む治療に反応すると予測される。
【００６８】
ある種の実施形態では、「対照」は、事前に確立されたカットオフ値である。カットオフ値は、通常、関心対象の治療に対する対象の反応性が予測されるとみなされる上限または下限のタンパク質濃度である。従って、本明細書に記載の方法及び組成物によれば、基準タンパク質濃度（例えば、表１または表２のタンパク質のもの）は、ＪＡＫインヒビターを含む治療に対する反応性が予測される上限または下限のカットオフ値として同定される。本明細書に記載の方法に使用するために決定されたカットオフ値は、例えば、公開された濃度範囲と比較され得るが、使用される方法及び患者集団に応じて個別化され得る。
【００６９】
幾つかの実施形態では、解析されているタンパク質の濃度は、対照におけるそのタンパク質の濃度と比較して減少している。例えば、解析されているタンパク質の濃度は、対照におけるそのタンパク質の濃度と比べて、少なくとも１．５分の１、２分の１、３分の１、４分の１、５分の１、６分の１、７分の１、８分の１、９分の１、１０分の１、２０分の１、２５分の１、５０分の１、７５分の１、もしくは１００分の１であるか、または少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１，０００％、１，５００％、２，０００％、２，５００％、３，０００％、３，５００％、４，０００％、４，５００％、もしくは５，０００％低い。
【００７０】
幾つかの実施形態では、解析されているタンパク質の濃度は、対照におけるそのタンパク質の濃度と比較して増加している。例えば、解析されているタンパク質の濃度は、対照におけるそのタンパク質の濃度と比べて、少なくとも１．５、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、２５、５０、７５、もしくは１００倍高いか、または少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、２００％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、１，０００％、１，５００％、２，０００％、２，５００％、３，０００％、３，５００％、４，０００％、４，５００％、または５，０００％高い。
【００７１】
ＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応性を同定する方法
ＪＡＫインヒビターによる処置に反応する対象において発現レベルが処置経過中に変化し、従って、ＧｖＨＤを有する対象のＪＡＫインヒビターを含む治療に対する治療反応性（例えば、疾患スコアにおける改善及び／または疾患の消退）を確認するのに有用である幾つかのタンパク質が、実施例において同定された。これらのタンパク質の同定を表１３に示す。
【００７２】
ＪＡＫインヒビターによる処置後に対象から取得された生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１、ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧ���ＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、及び／またはＭＡＴＮ３のうちの１種以上（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、ＪＡＫインヒビターによる処置前に当該対象から取得された生体試料におけるベースライン発現レベルと比較して減少したタンパク質濃度により、当該対象が当該ＪＡＫインヒビターに対する治療反応を経験したことが示される。
【００７３】
ＪＡＫインヒビターによる処置後に対象から取得された生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ＣＣＬ１１、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及び／またはＳＭＯＣ２のうちの１種以上（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、ＪＡＫインヒビターによる処置前に当該対象から取得された生体試料におけるベースライン発現レベルと比較して増加したタンパク質濃度により、当該対象が当該ＪＡＫインヒビターに対する治療反応を経験したことが示される。
【００７４】
ＪＡＫインヒビターによる処置後に対象から取得された生体試料における、ＴＭＰＲＳＳ１５、ＣＣＬ１１、ＦＡＭ３Ｂ、ＭＭＰ７、ＮＣＡＭ１、Ｇａｌ−３、ＣＣＬ２５、ＴＨＰＯ、ＣＣＬ１１、ｈＫ１４、ＫＩＭ１、Ｆｌｔ３Ｌ、ＰＬＩＮ１、ＳＰＯＮ２、Ｇａｌ−４、ＦＡＢＰ４、ＤＮＥＲ、ＧＡＬ、ＣＰＭ、ＶＷＣ２、ＰＰＹ、ＰＡＭ、ＰＶＲ、ＳＥＲＰＩＮＡ５、ＳＴ３ＧＡＬ１、ＣＳＴ５、ＣＥＳ２、ＣＮＤＰ１、ＣＸ３ＣＬ１、ＨＯ−１、ＰＲＥＬＰ、ＡＤＭ、ＶＳＩＧ２、ＦＡＢＰ２、ＣＥＡＣＡＭ５、ＳＬＩＴＲＫ２、ＭＣＰ−１、ＮＴＲＫ３、ＣＬＵＬ１、ＣＸＣＬ１６、ＳＣＦ、ＴＭＰＲＳＳ５、ＲＥＧ４、ｈＫ１１、ＳＣＧＢ３Ａ１、ＤＫＫＬ１、ＮＥＰ、ＣＰＡ２、Ｅｐ−ＣＡＭ、ＴＨＢＳ２、ＧＰＮＭＢ、ＩＴＧＢ５、ＧＴ、ＡＰＬＰ１、ＴＡＣＳＴＤ２、ＮＩＮＪ１、ＲＥＮ、ＧＣＧ、ＳＥＲＰＩＮＡ９、ＫＡＺＡＬＤ１、ＳＥＲＰＩＮＡ１２、ＰＯＤＸＬ、ＡＭＮ、ＩＧＦ１Ｒ、ＬＴＢＰ２、ＡＮＧＰＴＬ３、ＳＣＡＲＡ５、Ｂ４ＧＡＴ１、ＲＯＢＯ２、ＰＤＧＦＣ、ＣＡ１２、ＤＤＣ、ＥＤＩＬ３、ＸＰＮＰＥＰ２、ＰＲＴＧ、ＮＱＯ２、ＡＭＢＰ、ＥＲＢＢ２、ＩＬ６、ＭＣＰ−１、ＶＥＧＦＤ、ＧＤＦ−２、ＭＵＣ−１６、ＫＬＫ１０、ＦＡＭ３Ｃ、ｕＰＡ、ＡＧＲ２、ＭＥＴＲＮＬ、ＲＴＮ４Ｒ、ＩＧＦ２Ｒ、ＮＴＲＫ２、ＩＴＧＢ６、ＳＣＡＲＦ２、ＳＣＧＢ３Ａ２、ＲＧＭＢ、ＥＺＲ、ＰＲＯＣ、ＦＵＲＩＮ、ＰＩｇＲ、及び／またはＳＭＯＣ２のうちの１種以上（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、ＪＡＫインヒビターによる処置前に当該対象から取得された生体試料におけるベースライン発現レベルと比較して増加したタンパク質濃度と組み合わせた、ＪＡＫインヒビターによる処置後に当該対象から取得された生体試料における、ＩＮＰＰＬ１、ＬＡＴ２、ＣＬＥＣ７Ａ、ＰＰＰ１Ｒ９Ｂ、ＮＥＭＯ、ＳＨ２Ｂ３、ＢＣＲ、ＣＤ５、ＤＮＡＪＢ１、ＣＣＬ１７、ＩＴＧＢ２、ＢＡＮＫ１、ＴＰＳＡＢ１、ＹＥＳ１、ＬＡＭＰ３、ＧＭ−ＣＳＦ−Ｒ−α、ＣＮＴＮＡＰ２、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ１６３、ＴＸＬＮＡ、ＭＥＰＥ、ＢＡＣＨ１、ＭＡＸ、ＮＦＫＢＩＥ、ｈＯＳＣＡＲ、ＬＡＴ、ＰＴＰＲＪ、ＳＩＲＴ２、ＳＩＲＰＢ１、ＡＸＩＮ１、ＥＩＦ４Ｇ１、ＰＴＸ３、ＴＲＩＭ５、ＩＤＵＡ、ＮＣＦ２、ＳＥＬＰ、ＡＲＨＧＥＦ１２、ＣＡＳＰ−３、ＣＤ２７、ＭＡＰ４Ｋ５、ＤＡＰＰ１、ＰＲＤＸ５、ＴＬＴ−２、ＰＡＲＫ７、ＩＬ２−ＲＡ、ＦＯＸＯ１、ＳＴ１Ａ１、ＧＲＡＰ２、ＮＢＮ、ＣＤ９３、ＦＣＧＲ２Ａ、ＤＣＴＮ１、ＩＲＦ９、ＨＡＶＣＲ２、ＣＤ８４、ＳＴＸ８、ＬＹ９、ＺＢＴＢ１６、ＣＤ２００Ｒ１、ＴＯＰ２Ｂ、ＴＨＹ１、ＰＲＫＲＡ、ＩＴＧＢ１ＢＰ２、ＣＤ４８、ＣＤ２４４、ＨＣＬＳ１、ＭＰＯ、ＳＩＴ１、ＩＣＡＭ３、ＳＯＳＴ、ＤＤＸ５８、ＴＮＦ−Ｒ２、ＴＲＡＦ２、ＳＭＡＤ１、ＬＡＩＲ−２、ＰＩＫ３ＡＰ１、ＶＳＩＧ４、ＳＩＧＬＥＣ１０、ＣＤ６、ＳＫＡＰ１、ＦＣＲＬ５、ＣＤ１７７、ＫＬＲＤ１、ＥＲＢＢ２ＩＰ、ＭＩＬＲ１、ＭＩＦ、ＳＮＡＰ２３、ＮＵＢ１、ＴＩＧＡＲ、ＳＴＡＭＰＢ、ＤＳＣ２、ＬＡＩＲ１���ＦＫＢＰ１Ｂ、ＲＡＳＳＦ２、ＦＡＴＣ１、ＣＢＬ、ＩｇＧ  Ｆｃ受容体ＩＩ−ｂ、ＧＬＯ１、ＰＶＡＬＢ、ＳＣＡＭＰ３、ＳＬＡＭＦ８、ＳＴＸ１６、ＴＮＦ−Ｒ１、ＤＦＦＡ、ＰＰＰ１Ｒ２、ＡＮＧ−１、ＣＣＬ５、ＭＡＰ２Ｋ６、ＣＲＫＬ、ＣＤ３８、ＣＸＣＬ５、ＰＩＬＲＡ、ＩＲＡＫ１、ＣＡ１３、ＳＴＸ６、ＰＲＴＮ３、ＩＬ−５Ｒ−α、ＥＳＭ−１、ＥＧＬＮ１、ＣＬＥＣ１Ｂ、ＴＹＭＰ、ＳＮＡＰ２９、ＰＤＧＦサブユニットＡ、ＴＮＦＲＳＦ１１Ａ、ｇａｌ−８、ＧＣＮＴ１、ＳＴＫ４、ＴＮＣ、ＴＨＢＳ４、ＣＬＥＣ４Ｄ、ＳＩＧＬＥＣ６、ＷＡＳＦ１、ＷＡＳ、ＣＯＭＴ、ＲＥＴＮ、ＳＨ２Ｄ１Ａ、ＲＮＡＳＥ３、ＰＡＲ−１、ＣＤ６９、ＳＩＧＬＥＣ１、ＦＲ−γ、ＡＤＡＭ８、ＡＺＵ１、ＡＲＥＧ、ＳＤＣ４、ＤＣＴＮ２、ＢＩＤ、ＲＥＬＴ、ＣＬＥＣ５Ａ、ＡＰＥＸ１、ＰＳＰ−Ｄ、ＦＧＲ、ＳＥＬＥ、ＳＥＬＬ、ＭＥＳＤＣ２、ＩＱＧＡＰ２、ＣＲＴＡＭ、ＬＩＬＲＢ２、ＴＡＮＫ、ＣＰＸＭ１、ＡＲＳＢ、ＳＬＡＭＦ１、ＰＥＢＰ１、ＳＴＩＰ１、ＰＤＧＦサブユニットＢ、ＳＣＡＲＦ１、ＤＥＦＡ１、ＥＰＨＢ４、ＡＲＨＧＡＰ１、ＣＬＭ−１、ＤＡＢ２、ＬＹＮ、ＣＡＳＰ−８、ＡＰＢＢ１ＩＰ、ＡＮＸＡ１１、ＩＣＡＭ１、ＰＲＫＣＱ、ＶＣＡＭ１、ＨＤＧＦ、ＣＤ２ＡＰ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＣＬＥＣ１Ａ、ＴＮＦＲＳＦ１４、ＴＡＣＣ３、ＭＭＰ−１、ＮＲＰ１、ＺＢＴＢ１７、ＮＡＤＫ、ＰＬＸＮＡ４、ＭＭＰ−９、ＮＣＲ１、ＡＭＩＧＯ２、ＦＥＳ、ＣＤ７９Ｂ、ＴＮＸＢ、ＴＸＮＤＣ５、ＴＲＡＮＣＥ、ＡＲＧ１、ＰＣＤＨ１７、ＬＲＭＰ、Ｃ１ＱＴＮＦ１、ＣＬＭ−６、ＣＫＡＰ４、ＡＰＰ、ＰＧＬＹＲＰ１、ＬＩＬＲＡ５、ＣＬＥＣ１０Ａ、ＮＭＮＡＴ１、ＩＬ−６ＲＡ、ＡＴＧ４Ａ、ＴＩＭＰ１、ＣＯＣＨ、ＤＫＮ１Ａ、ＣＤ１Ｃ、ＤＥＣＲ１、ＤＡＧ１、ＩＧＦＢＰ−２、ＲＥＴ、ＧＳＡＰ、ＰＩＬＲＢ、ＣＬＥＣ６Ａ、ＰＥＣＡＭ−１、ＰＸＮ、ＡＤＧＲＧ１、ＤＰＰ７、ＴＤＲＫＨ、Ｓｉｇｌｅｃ−９、ＣＤ４０−Ｌ、ＶＥＧＦＣ、ＬＹＶＥ１、ＦＡＤＤ、ＦＣＲＬ１、ＥＧＦ、ＨＧＦ、ＧＺＭＨ、ＣＬＥＣ４Ｇ、ＬＹ７５、ＰＲＤＸ３、ＣＯＬ４Ａ１、ＣＥＡＣＡＭ８、ＳＥＭＡ７Ａ、ＮＵＤＴ５、ＦＣＲＬ６、ＰＡＰＰＡ、ＦＡＳＬＧ、ＧＲＮ、及び／またはＭＡＴＮ３のうちの１種以上（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種）の、ＪＡＫインヒビターによる処置前に当該対象から取得された生体試料におけるベースライン発現レベルと比較して減少したタンパク質濃度により、当該対象が当該ＪＡＫインヒビターに対する治療反応を経験したことが示される。
【００７５】
幾つかの実施形態では、ＧｖＨＤは、急性ＧｖＨＤである。他の実施形態では、ＧｖＨＤは、慢性ＧｖＨＤである。
【００７６】
生体試料
本明細書に記載の方法に好適な生体試料としては、関心対象のタンパク質を含む任意の生体液、細胞、組織、またはその画分が挙げられる。生体試料は、例えば、ヒト対象から取得される検体であり得、またはかかる対象に由来し得る。例えば、生体試料は、血液、血清、血漿、尿、脊髄液、唾液、涙液、もしくは汗などの生体液、または支持体（例えば、ガラス、ポリマー、または紙）上に吸着されたかかる試料であり得る。
【００７７】
生体試料は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象から取得され得る。ある種の実施形態では、対象は、急性ＧｖＨＤを有する。幾つかの実施形態では、対象は、慢性ＧｖＨＤを有する。
【００７８】
試料中の分子（例えば、タンパク質）の活性または完全性を維持する、試料を取得及び／または貯蔵するための方法は、当業者に公知である。例えば、生体試料は、試料中の分子を維持するか、またはその変化を最小限にする１種以上の追加の薬剤、例えば、緩衝剤及び／またはヌクレアーゼインヒビター、プロテアーゼインヒビター、及びホスファターゼインヒビターのうちの１種以上を含むインヒビターと更に接触させられ得る。
【００７９】
バイオマーカーの発現レベル／濃度の決定
遺伝子の存在または発現レベル（量）は、当該遺伝子のタンパク質発現のレベルを検出及び／または測定することによって決定され得る。
【００８０】
一実施形態では、遺伝子の発現は、当該遺伝子によりコードされるタンパク質の発現または濃度を検出及び／または測定することによって決定され得る。タンパク質発現／濃度を決定する方法は、当該技術分野において周知である。一般に使用される方法は、関心対象の標的タンパク質に特異的な抗体の使用を伴う。例えば、タンパク質発現を決定する方法としては、ウェスタンブロットまたはドットブロット解析、免疫組織染色（例えば、定量的免疫組織染色）、免疫細胞染色、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、酵素免疫スポット（ＥＬＩＳＰＯＴ；Ｃｏｌｉｇａｎ，Ｊ．Ｅ．，ｅｔ  ａｌ．，ｅｄｓ．（１９９５）  Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ．Ｗｉｌｅｙ，Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ）、放射免疫測定法、化学発光免疫測定法、電気化学発光免疫測定法、ラテックス免疫比濁法、ラテックス近赤外免疫比濁法、免疫クロマトグラフィーアッセイ、及び抗体アレイ解析（例えば、米国特許出願公開第２００３００１３２０８号及び同２００４１７１０６８号（これらの各々の開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）を参照のこと）が挙げられるが、これらに限定されない。
【００８１】
一つの例では、遺伝子（例えば、表１、表２、または表１３に示す遺伝子）のタンパク質発現の存在または量は、ウェスタンブロット法を使用して決定され得る。例えば、生体試料から調製され得る可溶化液または生体試料自体が、Ｌａｅｍｍｌｉ緩衝液と接触させられ得、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動法（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）に供され得る。次いで、サイズ毎に分離された、ＳＤＳ−ＰＡＧＥにより分離されたタンパク質は、フィルター膜（例えば、ニトロセルロース）に移され得、関心対象のタンパク質に特異的な、検出可能に標識された抗体を使用した免疫ブロット法に供され得る。結合した検出可能に標識された抗体の存在または量により、生体試料におけるタンパク質の存在または量が示される。
【００８２】
別の例では、免疫測定法が、遺伝子（例えば、表１、表２、または表１３に示す遺伝子）のタンパク質発現を検出及び／または測定するために使用され得る。上記のように、免疫測定法は、検出のために、検出部分（例えば、蛍光剤または酵素）を有する抗体を用いて実行され得る。生体試料由来のタンパク質は、固相マトリックス（例えば、マルチウェルアッセイプレート、ニトロセルロース、アガロース、セファロース、コード化粒子、または磁気ビーズ）に直接結合され得るか、または特異的結合対の第１のメンバー（例えば、ビオチンまたはストレプトアビジン）であって、当該特異的結合対の第２のメンバー（例えば、ストレプトアビジンまたはビオチン）に結合した際に固相マトリックスに付着する、当該特異的結合対の当該第１のメンバーに結合され得る。固相マトリックスへのかかる付着は、検出用抗体との接触の前に、タンパク質が生体試料の他の妨害成分または無関係な成分から精製されることを可能にし、その後の結合していない抗体の洗浄も可能にする。本明細書で上記したように、結合した検出可能に標識された抗体の存在または量により、生体試料におけるタンパク質の存在または量が示される。
【００８３】
抗体の形態に関して特に限定はなく、本開示には、モノクローナル抗体に加えて、ポリクローナル抗体が含まれる。タンパク質またはその断片（すなわち、表１、表２、または表１３のタンパク質またはその免疫学的断片）でウサギなどの動物を免疫することによって取得される抗血清に加えて、全てのクラスのポリクローナル及びモノクローナル抗体、ヒト抗体、遺伝子組換えによって作製されたヒト化抗体も含まれる。１種以上のバイオマーカーによりコードされるタンパク質に特異的な抗体または抗体断片は、ファージディスプレイなどのインビトロ法によっても生成され得る。更に、抗体は、それが本発明のバイオマーカーによりコードされるタンパク質に結合する限り抗体断片または改変抗体であってもよい。例えば、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ'）２、Ｆｖ、またはＨ鎖Ｆｖ及びＬ鎖Ｆｖがリンカーによって適切に連結されている単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）（Ｈｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８５：５８７９−５８８３，（１９８８））が、抗体断片として提供され得る。
【００８４】
抗体は、様々な分子、例えば、蛍光物質、放射性物質、及び発光性物質と結合され得る。かかる部分を抗体に結合させる方法は、すでに確立されており、当分野において慣習的である（例えば、米国特許第５，０５７，３１３号及び同５，１５６，８４０号を参照のこと）。
【００８５】
抗体の抗原結合活性を分析する方法の例としては、例えば、吸光度の測定、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、放射免疫測定法（ＲＩＡ）、及び／または免疫蛍光法が挙げられる。例えば、ＥＬＩＳＡを使用する場合、本発明のバイオマーカーによりコードされるタンパク質が、本開示の抗体でコーティングされたプレートに添加され、次いで、抗体試料、例えば、抗体産生細胞の培養液上清または精製抗体が添加される。次いで、アルカリホスファターゼ及びかかる酵素により標識されている、一次抗体を認識する二次抗体が添加され、プレートがインキュベートされ、洗浄され、抗原結合活性を評価するために、ｐ−ニトロフェニルリン酸などの酵素基質を添加した後に吸光度が測定される。タンパク質として、タンパク質断片、例えば、Ｃ末端を含む断片またはＮ末端を含む断片が使用され得る。本発明の抗体の活性を評価するために、ＢＩＡｃｏｒｅ（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）が使用され得る。
【００８６】
これらの方法を使用して、抗体と関心対象のタンパク質を含有すると推定される試料とが接触させられ、本発明のバイオマーカーによりコードされるタンパク質が、上述の抗体とタンパク質との間で形成された免疫複合体を検出または分析することによって検出または分析される。
【００８７】
質量分析ベースの定量アッセイ法、例えば、限定されるものではないが、安定同位体標識された内部標準と組み合わせた多重反応モニタリング（ＭＲＭ）ベースの手法は、タンパク質の定量的測定のための免疫測定法の代替法である。これらの手法は、抗体の使用を必要としない（例えば、Ａｄｄｏｎａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２７：６３３−６４１，２００９；Ｋｕｚｙｋ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ  Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ，８：１８６０−１８７７，２００９；Ｐａｕｌｏｖｉｃｈ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ  Ｃｌｉｎ．Ａｐｐｌ．，２：１３８６−１４０２，２００８を参照のこと）。加えて、ＭＲＭは、優れた多重化能力を提供し、多数のタンパク質の並行した同時定量化を可能にする。これらの方法の基礎理論は確立されており、低分子の薬物代謝及び薬物動態解析に幅広く利用されている。
【００８８】
幾つかの実施形態では、表１からの２種のタンパク質、３種のタンパク質、４種のタンパク質、５種のタンパク質、６種のタンパク質、７種のタンパク質、８種のタンパク質、９種のタンパク質、１０種のタンパク質、１１種のタンパク質、１２種のタンパク質、１３種のタンパク質、もしくは１４種のタンパク質、または少なくとも２種のタンパク質、少なくとも３種のタンパク質、少なくとも４種のタンパク質、少なくとも５種のタンパク質、少なくとも６種のタンパク質、少なくとも７種のタンパク質、少なくとも８種のタンパク質、少なくとも９種のタンパク質、少なくとも１０種のタンパク質、少なくとも１１種のタンパク質、少なくとも１２種のタンパク質、少なくとも１３種のタンパク質、もしくは少なくとも１４種のタンパク質の濃度が評価及び／または測定され得る。
【００８９】
幾つかの実施形態では、表２からの２種のタンパク質、３種のタンパク質、４種のタンパク質、もしくは５種のタンパク質、または少なくとも２種のタンパク質、少なくとも３種のタンパク質、少なくとも４種のタンパク質、もしくは少なくとも５種のタンパク質の濃度が評価及び／または測定され得る。
【００９０】
幾つかの実施形態では、表１３からの２種のタンパク質、３種のタンパク質、４種のタンパク質、５種のタンパク質、６種のタンパク質、７種のタンパク質、８種のタンパク質、９種のタンパク質、１０種のタンパク質、１１種のタンパク質、１２種のタンパク質、１３種のタンパク質、１４種のタンパク質、１５種のタンパク質、１６種のタンパク質、１７種のタンパク質、１８種のタンパク質、１９種のタンパク質、もしくは２０種のタンパク質、または少なくとも２種のタンパク質、少なくとも３種のタンパク質、少なくとも４種のタンパク質、少なくとも５種のタンパク質、少なくとも６種のタンパク質、少なくとも７種のタンパク質、少なくとも８種のタンパク質、少なくとも９種のタンパク質、少なくとも１０種のタンパク質、少なくとも１１種のタンパク質、少なくとも１２種のタンパク質、少なくとも１３種のタンパク質、少なくとも１４種のタンパク質、少なくとも１５種のタンパク質、少なくとも１６種のタンパク質、少なくとも１７種のタンパク質、少なくとも１８種のタンパク質、少なくとも１９種のタンパク質、もしくは少なくとも２０種のタンパク質の濃度が評価及び／または測定され得る。
【００９１】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、１５ｐｇ／ｍｌ未満、１０ｐｇ／ｍｌ未満、９ｐｇ／ｍｌ未満、８ｐｇ／ｍｌ未満、７ｐｇ／ｍｌ未満、６ｐｇ／ｍｌ未満、５ｐｇ／ｍｌ未満、４ｐｇ／ｍｌ未満、または３ｐｇ／ｍｌ未満であるＭＣＰ−３の濃度を測定することを含む。
【００９２】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、４５，０００ｐｇ／ｍｌ未満、４０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、３５，０００ｐｇ／ｍｌ未満、３０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、２５，０００ｐｇ／ｍｌ未満、２０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１５，０００ｐｇ／ｍｌ未満、または１０，０００ｐｇ／ｍｌ未満であるＲｅｇ３Ａの濃度を測定することを含む。
【００９３】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、４００ｐｇ／ｍｌ未満、３５０ｐｇ／ｍｌ未満、３００ｐｇ／ｍｌ未満、２５０ｐｇ／ｍｌ未満、または２００ｐｇ／ｍｌ未満であるＴＮＦＲＳＦ６Ｂの濃度を測定することを含む。
【００９４】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、３５０ｐｇ／ｍｌ超、４００ｐｇ／ｍｌ超、４５０ｐｇ／ｍｌ超、５００ｐｇ／ｍｌ超、６００ｐｇ／ｍｌ超、または６５０ｐｇ／ｍｌ超であるＳＣＦの濃度を測定することを含む。
【００９５】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、９００ｐｇ／ｍｌ未満、８００ｐｇ／ｍｌ未満、７００ｐｇ／ｍｌ未満、６００ｐｇ／ｍｌ未満、５００ｐｇ／ｍｌ未満、または４００ｐｇ／ｍｌ未満であるＣＸＣＬ１０の濃度を測定することを含む。
【００９６】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、４０ｐｇ／ｍｌ未満、３５ｐｇ／ｍｌ未満、３０ｐｇ／ｍｌ未満、２５ｐｇ／ｍｌ未満、２０ｐｇ／ｍｌ未満、１５ｐｇ／ｍｌ未満、または１０ｐｇ／ｍｌ未満であるＩＬ−８の濃度を測定することを含む。
【００９７】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、１４０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１３０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１２０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１１０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１００，０００ｐｇ／ｍｌ未満、９０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、８０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、または７０，０００ｐｇ／ｍｌ未満であるＳＴ２の濃度を測定することを含む。
【００９８】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、３，０００ｐｇ／ｍｌ未満、２，９００ｐｇ／ｍｌ未満、２，８００ｐｇ／ｍｌ未満、２，７００ｐｇ／ｍｌ未満、２，６００ｐｇ／ｍｌ未満、２，５００ｐｇ／ｍｌ未満、２，４００ｐｇ／ｍｌ未満、２，３００ｐｇ／ｍｌ未満、２，２００ｐｇ／ｍｌ未満、２，１００ｐｇ／ｍｌ未満、または２，０００ｐｇ／ｍｌ未満であるＣＡＬＣＡの濃度を測定することを含む。
【００９９】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、１２，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１１，５００ｐｇ／ｍｌ未満、１１，０００ｐｇ／ｍｌ未満、１０，５００ｐｇ／ｍｌ未満、１０，０００ｐｇ／ｍｌ未満、または９，５００ｐｇ／ｍｌ未満であるＴＮＦ−Ｒ１の濃度を測定することを含む。
【０１００】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、３．５ｐｇ／ｍｌ未満、３ｐｇ／ｍｌ未満、２．５ｐｇ／ｍｌ未満、２ｐｇ／ｍｌ未満、または１．５ｐｇ／ｍｌ未満であるＩＬ−６の濃度を測定することを含む。
【０１０１】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、１，０００ｐｇ／ｍｌ未満、９００ｐｇ／ｍｌ未満、８００ｐｇ／ｍｌ未満、７００ｐｇ／ｍｌ未満、６００ｐｇ／ｍｌ未満、または５００ｐｇ／ｍｌ未満であるＣＣＬ１９の濃度を測定することを含む。
【０１０２】
本明細書に記載の方法の幾つかの実施形態では、本方法は、１５０，０００ｐｇ／ｍｌ超、２００，０００ｐｇ／ｍｌ超、２５０，０００ｐｇ／ｍｌ超、３００，０００ｐｇ／ｍｌ超、３５０，０００ｐｇ／ｍｌ超、または４００，０００ｐｇ／ｍｌ超であるＰＯＮ３の濃度を測定することを含む。
【０１０３】
ＪＡＫインヒビター
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、ＪＡＫ１、ＪＡＫ２、ＪＡＫ３、及び／またはＴＹＫ２を阻害する化合物である。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、ＪＡＫ３及びＴＹＫ２と比較してＪＡＫ１及びＪＡＫ２に選択的である。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、ＪＡＫ２、ＪＡＫ３、及びＴＹＫ２と比較してＪＡＫ１に選択的である。例えば、本明細書に記載の化合物の幾つかまたはそれらの薬学的に許容される塩は、ＪＡＫ２、ＪＡＫ３、及びＴＹＫ２のうちの１つ以上と比較してＪＡＫ１を優先的に阻害する。幾つかの実施形態では、化合物または塩は、ＪＡＫ２と比較してＪＡＫ１を優先的に阻害する（例えば、＞１のＪＡＫ２／ＪＡＫ１  ＩＣ５０比を有する）。幾つかの実施形態では、化合物または塩は、ＪＡＫ２と比較して約１０倍よりＪＡＫ１に選択的である。幾つかの実施形態では、化合物または塩は、１ｍＭのＡＴＰでＩＣ５０を測定することにより計算される場合、ＪＡＫ２と比較して約３倍、約５倍、約１０倍、約１５倍、または約２０倍よりＪＡＫ１に選択的である。
【０１０４】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、３−シクロペンチル−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］プロパンニトリルである。
【０１０５】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、（３Ｒ）−３−シクロペンチル−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］プロパンニトリル（ルキソリチニブ；ＩＮＣＢ０１８４２４としても公知）である。
【０１０６】
３−シクロペンチル−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］プロパンニトリル及びルキソリチニブは、２００６年１２月１２日に出願された米国特許第７，５９８，２５７号（実施例６７）（参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載の手順により製造され得る。
【０１０７】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、（３Ｒ）−３−シクロペンチル−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］プロパンニトリルリン酸塩である。
【０１０８】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、バリシチニブ、トファシチニブ、オクラシチニブ、フィルゴチニブ、ガンドチニブ、レストールチニブ、モメロチニブ、パクリチニブ、ＰＦ−０４９６５８４２、ウパダシチニブ、ペフィシチニブ、フェドラチニブ、ククルビタシンＩ、ＡＴＩ−５０１（Ａｃｌａｒｉｓ）、ＡＴＩ−５０２（Ａｃｌａｒｉｓ）、ＪＴＥ０５２（Ｌｅｏ  Ｐｈａｒｍａ及びＪａｐａｎ  Ｔｏｂａｃｃｏ）、またはＣＨＺ８６８である。
【０１０９】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、同位体標識された化合物またはその薬学的に許容される塩であり得る。「同位体標識された」または「放射標識された」化合物は、１個以上の原子が、自然界に典型的に見出される（すなわち、天然に存在する）原子質量または質量数と異なる原子質量または質量数を有する原子により置き換えられているか、または置換されている本開示の化合物である。本開示の化合物に組み込まれ得る好適な放射性核種としては、２Ｈ（重水素の代わりにＤとも書かれる）、３Ｈ（三重水素の代わりにＴとも書かれる）、１１Ｃ、１３Ｃ、１４Ｃ、１３Ｎ、１５Ｎ、１５Ｏ、１７Ｏ、１８Ｏ、１８Ｆ、３５Ｓ、３６Ｃｌ、８２Ｂｒ、７５Ｂｒ、７６Ｂｒ、７７Ｂｒ、１２３Ｉ、１２４Ｉ、１２５Ｉ、及び１３１Ｉが挙げられるが、これらに限定されない。例えば、本開示の化合物における１個以上の水素原子は、重水素原子により置き換えられ得る（例えば、式（Ｉ）のＣ１〜６アルキル基の１個以上の水素原子は、−ＣＨ３の代わりに用いられる−ＣＤ３のように所望により重水素原子で置換され得る）。
【０１１０】
本明細書に記載の化合物の１個以上の構成原子は、天然または非天然存在度で原子の同位体と置き換えられ得るか、または置換され得る。幾つかの実施形態では、本発明の化合物は、少なくとも１個の重水素原子を含む。幾つかの実施形態では、本発明の化合物は、２個以上の重水素原子を含む。幾つかの実施形態では、本発明の化合物は、１〜２、１〜３、１〜４、１〜５、または１〜６個の重水素原子を含む。幾つかの実施形態では、化合物における全ての水素原子が、重水素原子により置き換えられ得るか、または置換され得る。
【０１１１】
有機化合物に同位体を組み込むための合成法は、当技術分野において公知である（Ａｌａｎ  Ｆ．ＴｈｏｍａｓによるＤｅｕｔｅｒｉｕｍ  Ｌａｂｅｌｉｎｇ  ｉｎ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ，Ｎ．Ｙ．，Ａｐｐｌｅｔｏｎ−Ｃｅｎｔｕｒｙ−Ｃｒｏｆｔｓ，１９７１；Ｊｅｎｓ  Ａｔｚｒｏｄｔ、Ｖｏｌｋｅｒ  Ｄｅｒｄａｕ、Ｔｈｏｒｓｔｅｎ  Ｆｅｙ、及びＪｏｃｈｅｎ  ＺｉｍｍｅｒｍａｎｎによるＴｈｅ  Ｒｅｎａｉｓｓａｎｃｅ  ｏｆ  Ｈ／Ｄ  Ｅｘｃｈａｎｇｅ，Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ．Ｉｎｔ．Ｅｄ．２００７，７７４４−７７６５；Ｊａｍｅｓ  Ｒ．ＨａｎｓｏｎによるＴｈｅ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  ｏｆ  Ｉｓｏｔｏｐｉｃ  Ｌａｂｅｌｌｉｎｇ，Ｒｏｙａｌ  Ｓｏｃｉｅｔｙ  ｏｆ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２０１１）。同位体標識化合物は、ＮＭＲスペクトロスコピー、代謝実験、及び／またはアッセイなどの様々な研究に使用され得る。
【０１１２】
より重い同位体、例えば、重水素での置換は、より高い代謝的安定性に起因するある種の治療上の利点、例えば、インビボ半減期の増加または必要投与量の減少をもたらし得、それ故に、幾つかの状況において好まれ得る（例えば、Ａ．Ｋｅｒｅｋｅｓ  ｅｔ．ａｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２０１１，５４，２０１−２１０；Ｒ．Ｘｕ  ｅｔ．ａｌ．Ｊ．Ｌａｂｅｌ  Ｃｏｍｐｄ．Ｒａｄｉｏｐｈａｒｍ．２０１５，５８，３０８−３１２を参照のこと）。特に、１つ以上の代謝部位での置換は、１つ以上の治療上の利点をもたらし得る。
【０１１３】
従って、幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、化合物であって、当該化合物における１個以上の水素原子が重水素原子により置き換えられている当該化合物、またはその薬学的に許容される塩である。
【０１１４】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、１個以上の水素原子が重水素原子により置き換えられているルキソリチニブまたはその薬学的に許容される塩である。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、米国特許第９，２４９，１４９号（これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）の化合物のいずれかまたはその薬学的に許容される塩である。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、ＣＴＰ−５４３またはその薬学的に許容される塩である。幾つかの実施形態では、本発明の化合物は、式Ｉ：
【化１】
2021521442.tif 000005
の化合物またはその薬学的に許容される塩であり、式中、
Ｒ１は、Ｈ及びＤから選択され、
各Ｒ２は、Ｈ及びＤから独立して選択され、ただし、共通の炭素に結合している各Ｒ２は同一であり、
各Ｒ３は、Ｈ及びＤから独立して選択され、ただし、共通の炭素に結合している各Ｒ３は同一であり、
Ｒ４は、Ｈ及びＤから選択され、
各Ｒ５は、同一であり、Ｈ及びＤから選択され、
Ｒ６、Ｒ７、及びＲ８は、それぞれＨ及びＤから独立して選択され、ただし、Ｒ１がＨであり、各Ｒ２及び各Ｒ３がＨであり、Ｒ４がＨであり、Ｒ６、Ｒ７、及びＲ８の各々がＨである場合、各Ｒ５は、Ｄである。
【０１１５】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、以下の表の化合物１００〜１３０から選択される式Ｉの化合物（式中、Ｒ６、Ｒ７、及びＲ８は、それぞれＨである）、またはその薬学的に許容される塩である。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、以下の表の化合物２００〜２３１から選択される式Ｉの化合物（式中、Ｒ６、Ｒ７、及びＲ８は、それぞれＤである）、またはその薬学的に許容される塩である。
【表３−１】
2021521442.tif 000006
【表３−２】
2021521442.tif 000007
【０１１６】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、１個以上の水素原子が重水素原子により置き換えられているバリシチニブまたはその薬学的に許容される塩である。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、米国特許第９，５４０，３６７号（これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）の化合物のいずれかまたはその薬学的に許容される塩である。
【０１１７】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、表３の化合物またはその薬学的に許容される塩である。表３の化合物は、選択的ＪＡＫ１インヒビター（ＪＡＫ２、ＪＡＫ３、及びＴＹＫ２と比較して選択的）である。
【表４−１】
2021521442.tif 000008
【表４−２】
2021521442.tif 000009
【表４−３】
2021521442.tif 000010
【表４−４】
2021521442.tif 000011
【表４−５】
2021521442.tif 000012
【表４−６】
2021521442.tif 000013
【表４−７】
2021521442.tif 000014
【表４−８】
2021521442.tif 000015
【０１１８】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、｛１−｛１−［３−フルオロ−２−（トリフルオロメチル）イソニコチノイル］ピペリジン−４−イル｝−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］アゼチジン−３−イル｝アセトニトリルまたはその薬学的に許容される塩である。
【０１１９】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、｛１−｛１−［３−フルオロ−２−（トリフルオロメチル）イソニコチノイル］ピペリジン−４−イル｝−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］アゼチジン−３−イル｝アセトニトリルアジピン酸塩である。
【０１２０】
｛１−｛１−［３−フルオロ−２−（トリフルオロメチル）イソニコチノイル］ピペリジン−４−イル｝−３−［４−（７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４−イル）−１Ｈ−ピラゾール−１−イル］アゼチジン−３−イル｝アセトニトリル及びそのアジピン酸塩の合成及び調製は、例えば、２０１１年３月９日に出願された米国特許公開第２０１１／０２２４１９０号、２０１２年９月６日に出願された米国特許公開第２０１３／００６００２６号、及び２０１４年３月５日に出願された米国特許公開第２０１４／０２５６９４１号に見出され得、これらの各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０１２１】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、４−［３−（シアノメチル）−３−（３'，５'−ジメチル−１Ｈ，１'Ｈ−４，４'−ビピラゾール−１−イル）アゼチジン−１−イル］−２，５−ジフルオロ−Ｎ−［（１Ｓ）−２，２，２−トリフルオロ−１−メチルエチル］ベンズアミドまたはその薬学的に許容される塩である。
【０１２２】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、４−［３−（シアノメチル）−３−（３'，５'−ジメチル−１Ｈ，１'Ｈ−４，４'−ビピラゾール−１−イル）アゼチジン−１−イル］−２，５−ジフルオロ−Ｎ−［（１Ｓ）−２，２，２−トリフルオロ−１−メチルエチル］ベンズアミドリン酸塩である。
【０１２３】
４−［３−（シアノメチル）−３−（３'，５'−ジメチル−１Ｈ，１'Ｈ−４，４'−ビピラゾール−１−イル）アゼチジン−１−イル］−２，５−ジフルオロ−Ｎ−［（１Ｓ）−２，２，２−トリフルオロ−１−メチルエチル］ベンズアミド及びそのリン酸塩の合成及び調製は、例えば、２０１４年５月１６日に出願された米国特許公開第ＵＳ２０１４／０３４３０３０号に見出され得、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０１２４】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、（（２Ｒ，５Ｓ）−５−｛２−［（１Ｒ）−１−ヒドロキシエチル］−１Ｈ−イミダゾ［４，５−ｄ］チエノ［３，２−ｂ］ピリジン−１−イル｝テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−２−イル）アセトニトリルまたはその薬学的に許容される塩である。
【０１２５】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、（（２Ｒ，５Ｓ）−５−｛２−［（１Ｒ）−１−ヒドロキシエチル］−１Ｈ−イミダゾ［４，５−ｄ］チエノ［３，２−ｂ］ピリジン−１−イル｝テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−２−イル）アセトニトリル一水和物である。
【０１２６】
（（２Ｒ，５Ｓ）−５−｛２−［（１Ｒ）−１−ヒドロキシエチル］−１Ｈ−イミダゾ［４，５−ｄ］チエノ［３，２−ｂ］ピリジン−１−イル｝テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−２−イル）アセトニトリルの合成ならびにその無水物形態及び一水和物形態の特徴付けは、２０１３年１０月３１日に出願された米国特許公開第２０１４／０１２１１９８号及び２０１５年４月２９日に出願された米国特許公開第２０１５／０３４４４９７号に記載されており、これらの各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０１２７】
幾つかの実施形態では、表３の化合物は、２０１１年３月９日に出願された米国特許公開第２０１１／０２２４１９０号、２０１４年５月１６日に出願された米国特許公開第２０１４／０３４３０３０号、２０１３年１０月３１日に出願された米国特許公開第２０１４／０１２１１９８号、２０１０年５月２１日に出願された米国特許公開第２０１０／０２９８３３４号、２０１０年８月３１日に出願された米国特許公開第２０１１／００５９９５１号、２０１１年１１月１８日に出願された米国特許公開第２０１２／０１４９６８１号、２０１１年１１月１８日に出願された米国特許公開第２０１２／０１４９６８２号、２０１２年６月１９日に出願された米国特許公開第２０１３／００１８０３４号、２０１２年８月１７日に出願された米国特許公開第２０１３／００４５９６３号、及び２０１３年５月１７日に出願された米国特許公開第２０１４／０００５１６６号に記載の合成手順により調製され、これらの各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【０１２８】
幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターは、２０１１年３月９日に出願された米国特許公開第２０１１／０２２４１９０号、２０１４年５月１６日に出願された米国特許公開第２０１４／０３４３０３０号、２０１３年１０月３１日に出願された米国特許公開第２０１４／０１２１１９８号、２０１０年５月２１日に出願された米国特許公開第２０１０／０２９８３３４号、２０１０年８月３１日に出願された米国特許公開第２０１１／００５９９５１号、２０１１年１１月１８日に出願された米国特許公開第２０１２／０１４９６８１号、２０１１年１１月１８日に出願された米国特許公開第２０１２／０１４９６８２号、２０１２年６月１９日に出願された米国特許公開第２０１３／００１８０３４号、２０１２年８月１７日に出願された米国特許公開第２０１３／００４５９６３号、及び２０１３年５月１７日に出願された米国特許公開第２０１４／０００５１６６号（これらの各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）の化合物またはそれらの薬学的に許容される塩から選択される。
【０１２９】
処置方法
本明細書において開示される方法は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象が、ＪＡＫインヒビターを含む治療に反応する可能性が高いか否か（例えば、疾患重症度の減少及び／または疾患の寛解／消退により証明されるように、疾患がより大きく改善する可能性が高いか否か）の評価を可能にする。ＪＡＫインヒビターに反応する可能性が高いＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象は、ＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）を投与され得る。逆に、ＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）に反応する可能性が低いＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象は、ＧｖＨＤの処置に適切な追加の治療を施され得る。
【０１３０】
本開示の方法は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症するリスクがある対象の、ＪＡＫインヒビターを含む処置から恩恵を受ける可能性が高い対象の群及びＪＡＫインヒビターを含む処置から恩恵を受ける可能性が低い対象の群への層別化も可能にする。ＪＡＫインヒビターによる処置が検討されているＧｖＨＤ対象のプールからかかる対象を選択する能力は、対象に効果的な処置を施すのに有益である。
【０１３１】
一実施形態では、ＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）により処置される対象は、ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症する可能性が高い。ある種の実施形態では、ＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）を含む治療により処置される対象は、急性ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症する可能性が高い。他の実施形態では、ＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）を含む治療により処置される対象は、慢性ＧｖＨＤを有するか、有すると疑われるか、または発症する可能性が高い。
【０１３２】
ＧｖＨＤを有する対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応する可能性が高い場合（上記のバイオマーカー（表１及び２を参照のこと）のうちの１種以上の濃度に基づく）、対象は有効量のＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）を投与され得る。ＪＡＫインヒビターの有効量は、例えば、患者の特徴（年齢、性別、体重、人種など）、疾患の進行、及び薬物の投与歴を考慮して、医療関係者により適切に決定され得る。対象がＪＡＫインヒビターを含む治療に反応する可能性が低い場合、対象はＪＡＫインヒビターを含まない治療を任意に施され得る。
【０１３３】
本方法は、ＧｖＨＤを発症するリスクがある個体にも適用され得る。かかる個体としては、（ｉ）移植（例えば、造血幹細胞移植）を受けたが、ＧｖＨＤを発症していない個体、または（ｉｉ）移植（例えば、造血幹細胞移植）を受ける準備をしている個体が挙げられる。
【０１３４】
対象がＪＡＫインヒビターに反応する可能性が高いか、または反応する可能性が低いかに基づく当該対象の層別化または選択の後に、医療従事者（例えば、医師）は、当該対象に適切な治療法を施し得る。ＪＡＫインヒビターを投与する方法は、当該技術分野において周知である。
【０１３５】
ＧｖＨＤを有し、ＪＡＫインヒビターに反応すると予測される対象が以前に１種以上の非ＪＡＫインヒビター治療を施されている場合、ＪＡＫインヒビターを含む治療は、以前に施された治療または現在施されている治療の代わりとなるか、またはそれを増強することができる。例えば、ＪＡＫインヒビターを含む治療により処置する際に、１種以上の非ＪＡＫインヒビター治療の施与が終了し得るか、または縮小され得る（例えば、より低レベルで施与される）。ＪＡＫインヒビターを含む治療を施すと共に、以前の治療の施与が維持され得る。幾つかの実施形態では、ＪＡＫインヒビターを含む治療のレベルが治療効果をもたらすのに十分なレベルに達するまで、以前の治療は維持され得る。
【０１３６】
本明細書に記載の方法に従ってＪＡＫインヒビター（例えば、イタシチニブ）により処置される対象は、ＧｖＨＤの処置に効果的である１種以上の追加の組成物との組み合わせで処置され得る。かかる併用療法において使用され得る組成物の例としては、コルチコステロイド（例えば、メチルプレドニゾロンまたはプレドニソン）、メトトレキサート、サイクロスポリン、ミコフェノール酸モフェチル、タクロリムス、シロリムス、エベロリムス、抗胸腺細胞グロブリン、アレムツズマブ、シクロホスファミド、イブルチニブ、イマチニブ、インフリキシマブ、エタナーセプト、トシリズマブ、アレムツズマブ、バシリキシマブ、ダクリズマブ、リツキシマブ、デニロイキンジフチトクス、ペントスタチン、シクロスポリン、サリドマイド、ハロフギノン、ヒドロキシクロロキン、及び間葉系幹細胞が挙げられる。
【０１３７】
以下は本発明の実施の例である。それらは、本発明の範囲を如何様にも限定すると解釈されるべきではない。
【実施例】
【０１３８】
実施例１：イタシチニブによる処置に対する完全反応者である急性移植片対宿主病を有する患者において発現が異なるタンパク質の同定
コルチコステロイドと組み合わせたイタシチニブでの急性移植片対宿主病（ＧｖＨＤ）の処置の試験に登録された個体から血漿試料を採取した。全ての対象は、血液悪性腫瘍のために、任意のドナー供給源（適合非血縁ドナー、同胞、ハプロタイプ一致ドナー）からの骨髄、末梢血幹細胞、または臍帯血を使用して同種異系造血幹細胞移植を最初に受けた。対象は、同種異系造血幹細胞移植に後発して、グレードＩＩＢ〜ＩＶＤの急性ＧｖＨＤの臨床的疑いを示した。全ての対象は、採血に同意した。
【０１３９】
採取したら、血漿試料を、＞１０００種のタンパク質の解析を可能にするＯＬＩＮＫ（商標）を使用した広範なプロテオミクスプロファイリングにかけた。イタシチニブ（ＩＮＣＢ０３９１１０）による処置に対する臨床反応に基づいて、試料を以下の群へと分類した。具体的には、試料を、処置の２８日目での対象の治療反応に基づいて、「完全反応者」（ＣＲ）、「部分／混合反応者」、または「進行／死亡」（ＰＤ／死亡）に分類した。
【０１４０】
血漿の広範なプロテオミクス解析により、対象のＣＲ群とＰＤ／死亡群との間で合計１１８種の発現が異なるタンパク質が同定された。発現が異なるタンパク質は、完全反応者コホートのベースラインと進行／死亡コホートのベースラインとの間で統計学的有意差（ｐ＜０．０５）及び少なくとも１．２の倍率変化を示したものであった。この実施例における倍率変化は、対象の完全反応者群と進行／死亡群との間のベースラインタンパク質発現レベルの変化を表す。ＣＲにおいて、ＰＤ／死亡と比較して５３種のタンパク質が増加し、６５種のタンパク質が減少した（表４）。下方調節されたタンパク質は、発現が経時的に減少したタンパク質であり、一方で上方調節されたタンパク質は、発現が経時的に増加したタンパク質である。処置前発現レベル（ベースライン）に対する処置後タンパク質発現レベルの比率である発現の倍率変化を各タンパク質について示す。１を超える値はベースラインからの増加を示し、一方で１未満の値はベースラインからの減少を示す。
【表５−１】
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【表５−２】
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【表５−３】
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【０１４１】
実施例２：処置経過中のタンパク質発現の特徴付け
実施例１の臨床試験に登録された個体から、血漿試料をベースライン時及び２８日目に採取した。処置によりベースラインから２８日目までの間に有意に調節されたタンパク質を表５に列挙する。試験期間全体を通して安定的に発現され、処置によりベースラインから２８日目までの間に有意に調節されなかったタンパク質を表６に列挙する。
【０１４２】
表５は、完全反応者において１日目（ベースライン）から２８日目までの間で変化したタンパク質の同定を示す。この実施例における倍率変化は、１日目（ベースライン）から２８日目までの間のタンパク質レベルの変化を表す。対応のあるｔ検定を使用して、１日目と２８日目との間でのタンパク質レベルの相対変化を比較した。表５は、治療反応のバイオマーカーの同定を示す。
【表６】
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【０１４３】
表６は、完全反応者においてベースライン（１日目）から２８日目までの間に変化しなかったタンパク質の同定を示す。従って、これらのタンパク質をベースライン予測バイオマーカーに指定する。
【表７−１】
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【表７−２】
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【０１４４】
実施例３：ＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２と相関するか、または相関しないタンパク質の同定
幾つかの炎症性メディエーターが同定されており、ステロイド処置された造血幹細胞移植を受けた対象における急性ＧｖＨＤのリスクの増加と関連付けられている。これらの炎症性メディエーターとしては、ＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２が挙げられる（Ｈａｒｔｗｅｌｌ  ｅｔ  ａｌ．，“Ａｎ  ｅａｒｌｙ−ｂｉｏｍａｒｋｅｒ  ａｌｇｏｒｉｔｈｍ  ｐｒｅｄｉｃｔｓ  ｌｅｔｈａｌ  ｇｒａｆｔ−ｖｅｒｓｕｓ−ｈｏｓｔ  ｄｉｓｅａｓｅ  ａｎｄ  ｓｕｒｖｉｖａｌ”，ＪＣＩ  Ｉｎｓｉｇｈｔ，２（３）：ｅ８９７９８）。実施例１の臨床試験に登録された対象由来の血漿試料を使用して、タンパク質を、ベースライン時のＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２レベルとのそれらの相関について評価した。相関は、ＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２と同様の変化または分布を示す潜在的バイオマーカーを意味する。表７は、ベースライン時にＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２と有意に相関する（ｐ＜０．１）タンパク質の同定を示す。表８は、ベースライン時にＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２と有意に相関しない（ｐ＞０．１）タンパク質の同定を示す。
【表８−１】
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【表８−２】
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【表９−１】
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【表９−２】
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【表９−３】
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【表９−４】
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【表９−５】
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【表９−６】
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【表９−７】
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【０１４５】
実施例４：ＧｖＨＤにおけるＪＡＫ阻害による有効治療反応を予測することができるタンパク質の選別
前述の実施例のデータにより、２８日目でのＣＲへの分類により証明される有効治療反応を予測する、ベースライン時の幾つかのタンパク質が同定された。表９（これに限定されるものではない）に列挙されるタンパク質は、（１）発現がＣＲとＰＤ／死亡処置群との間で異なり、（２）ベースラインから２８日目までの間で安定しており、かつ（３）ＲＥＧ３α、ＴＮＦＲ１、及びＳＴ２と相関しないことが分かった。
【表１０】
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【０１４６】
より厳密なカットオフ値である２（無名数）を使用して、予測タンパク質の数を更に減少させた（表１０）。
【表１１】
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【０１４７】
実施例５：イタシチニブによる処置に対する完全反応者である急性移植片対宿主病を有する患者において発現が異なるタンパク質の同定
イタシチニブのコルチコステロイドとの組み合わせが、並行コホート第１相試験において評価され、ステロイド未治療及びステロイド治療抵抗性の両方のａＧｖＨＤ患者で総合効果を改善した。広範なプロテオミクス解析により、併用療法に対する反応の予測バイオマーカー、予後バイオマーカー、及び薬力学バイオマーカーを同定した。
【０１４８】
ａＧｖＨＤを有する１０人のステロイド未治療対象及び１８人のステロイド治療抵抗性対象が臨床試験に登録された。処置前（スクリーニング／ベースライン）及び処置後の２８日目に血漿試料を２８人全ての対象から採取した。全ての対象は、登録及び試料採取前に書面による同意を提供した。Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｂｌｏｏｄ  ａｎｄ  Ｍａｒｒｏｗ  Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ（ＣＩＢＭＴＲ）の反応基準に基づいて２８日目に、対象を反応者及び非反応者に分類した。反応者には、完全反応者（ＣＲ；ｎ＝１０）、非常に良好な部分反応者（ＶＧＰＲ；ｎ＝１）、及び部分反応者（ＰＲ；ｎ＝８）が含まれた。非反応者には、混合反応者（ｎ＝２）及び進行／死亡（ＰＤ／死亡；ｎ＝７）が含まれた。
【０１４９】
対象に、２００ｍｇ（Ｎ＝１４）または３００ｍｇ（Ｎ＝１４）のいずれかのイタシチニブと組み合わせてコルチコステロイドを１日１回（ＱＤ）投与した。イタシチニブの２つの用量間で臨床反応に有意差がなかったため、両方のコホートからのデータを合わせた。標本サイズが限られているため、ステロイド未治療患者（Ｎ＝１０）及びステロイド治療抵抗性（Ｎ＝１８）患者を合わせて更に解析した。近接伸長アッセイを使用した１０００種超のタンパク質の広範なプロテオミクス解析が、ＯＬＩＮＫ  Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ（Ｗａｔｅｒｔｏｗｎ、ＭＡ）により、製造者により記載される通りに実施された。データを、ｌｏｇ２スケールの正規化したタンパク質発現（ＮＰＸ）として示す。統計的有意差を、対応のないｔ検定及び対応のあるｔ検定、一元配置共分散分析（ＡＮＯＶＡ）、ならびにピアソン相関を使用して評価した。Ｐ＜０．０５の場合に、有意性が与えられた。
【０１５０】
コホート間の少なくとも１．２の倍率変化を達成した、ベースライン時の完全反応者コホートと進行／死亡コホートとの間の有意差に基づいてタンパク質を同定した。表１１を参照のこと。一部の患者が２８日目の反応に基づいて再分類されたため、表１１は、実施例１の表４に元々示されたタンパク質の更新されたリストを示す。
【０１５１】
対象のＣＲ群とＰＤ／死亡群との間で合計１４６種の発現が異なるタンパク質が同定された。ＣＲにおいてＰＤ／死亡と比較して５７種のタンパク質が増加し、８９種のタンパク質が減少した。表１１を参照のこと。
【表１２−１】
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【表１２−２】
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【表１２−３】
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【０１５２】
ベースライン（１日目）から２８日目までの間に完全反応者において変化しなかった、合計８９種のタンパク質が表１１から同定された。表１２は、実施例２の表６に元々示されたタンパク質の更新されたリストを示す。これらのタンパク質をベースライン予測バイオマーカーに指定する。
【表１３−１】
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【表１３−２】
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【０１５３】
実施例６：処置経過中のタンパク質発現の特徴付け
ベースライン／スクリーニング時及び２８日目の血漿試料を評価することによってタンパク質発現の経時的な差を解析した。ＣＲ、ＶＧＰＲ、及びＰＲ患者（Ｎ＝１９）が含まれる反応者において、スクリーニング／ベースライン時から２８日目までの間に処置により有意に調節されたタンパク質が同定された。合計３５３種のタンパク質が同定された。これらを表１３に示す。ベースラインから２８日目までの間に、このリストからの１０５種のタンパク質が有意に増加し、２４８種のタンパク質が有意に減少した。表１３のタンパク質のリストには、実施例２の表５に含まれるタンパク質が含まれ、ＣＲ、ＶＧＰＲ、及びＰＲ患者において処置により調節されたタンパク質が含まれる。表１３は、治療反応のバイオマーカーの同定を示す。
【表１４−１】
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【表１４−２】
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【表１４−３】
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【表１４−４】
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【表１４−５】
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【表１４−６】
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【表１４−７】
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【０１５４】
実施例７：完全反応者及び進行／死亡集団における選別されたバイオマーカーのタンパク質発現レベル
ＭＣＰ−３（ＣＣＬ７）、Ｒｅｇ３Ａ、ＴＮＦＲＳＦ６Ｂ、ＳＣＦ、ＣＸＣＬ１０、ＩＬ−８、ＳＴ２、ＣＡＬＣＡ、ＴＮＦ−Ｒ１、ＩＬ−６、ＣＣＬ１９、ＩＬ−２Ｒａ、及びＰＯＮ３の標的化プロテオミクス解析を、ＯＬＩＮＫ近接伸長アッセイプラットフォームを使用して実施した。表１４は、完全反応者（ＣＲ）及び進行／死亡（ＰＤ／死亡）群内での各タンパク質の発現情報を提供する。表１４には、各タンパク質についての各群内でのタンパク質発現レベル（ｐｇ／ｍｌ）の中央値及び平均値、標準誤差、範囲、ならびにＣＲ群とＰＤ／死亡群との間の統計的有意差が含まれる。対応のないｔ検定を使用して群間の統計的有意差が同定された。
【表１５】
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【０１５５】
他の実施形態
本発明が発明を実施するための形態と共に記載されたが、上記は、例示することを意図しており、添付の特許請求の範囲の範囲によって定義される本発明の範囲を限定することを意図しない。他の態様、利点、及び改変は、以下の特許請求の範囲の範囲内である。
【国際調査報告】
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