(57)【要約】  本明細書において、幾つかの実施形態では、治療タンパク質の改善された発現及び細胞標的化のための配列を含む、改善された遺伝子治療ベクター及び使用方法が提供される。【選択図】図１
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【特許請求の範囲】
【請求項１】
（ａ）治療タンパク質をコードする核酸配列と、
（ｂ）カチオン非依存性マンノース６−リン酸（Ｍ６Ｐ）受容体（ＣＩ−ＭＰＲ）に高親和性で結合するペプチドをコードする核酸配列と、
を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクター。
【請求項２】
前記ペプチドがバリアントＩＧＦ２（ｖＩＧＦ２）ペプチドである、請求項１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３】
前記ｖＩＧＦ２ペプチドが、配列番号１と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含み、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、５５位、及び６５位からなる群から選択される１つ以上の位置での少なくとも１つの置換を有する、請求項２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項４】
前記少なくとも１つの置換が、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、及びＫ６５Ｒからなる群から選択される、請求項３に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項５】
前記ｖＩＧＦ２ペプチドが、配列番号１の２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、及び５５位からなる群から選択される２つ以上の位置での少なくとも２つの置換を含む、請求項３〜４のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６】
前記少なくとも２つの置換が、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、及びＫ６５Ｒからなる群から選択される、請求項５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７】
前記ｖＩＧＦ２ペプチドが、配列番号１の１位のＮ末端欠失を含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８】
前記ｖＩＧＦ２ペプチドが、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失を含む、請求項７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９】
前記ｖＩＧＦ２ペプチドが、天然のＩＧＦ２ペプチドと比較してインスリン受容体及びＩＧＦ１Ｒに対する減少した親和性を有するか、または親和性を有さない、請求項１〜８のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０】
前記ｖＩＧＦ２ペプチドが、細胞内のリソソームへの前記治療タンパク質の取り込みを促進することができる、請求項９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１】
前記治療タンパク質が、遺伝的障害を有する対象において前記遺伝的障害に関連する不完全なタンパク質または欠損したタンパク質の代わりとなることができる、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２】
遺伝的障害が、リソソーム貯蔵障害である、請求項１１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１３】
前記遺伝的障害が、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、ＣＤＫＬ５欠損症、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される、請求項１１または請求項１２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１４】
前記遺伝的障害が、ポンペ病である、請求項１１または請求項１２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１５】
前記遺伝的障害が、神経セロイドリポフスチン症である、請求項１１または請求項１２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１６】
前記治療タンパク質が、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群から選択される酵素を含む、請求項１〜１５のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１７】
前記治療タンパク質が、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である、請求項１６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１８】
前記治療タンパク質が、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼである、請求項１６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１９】
前記核酸構築物が、翻訳開始配列を更に含む、請求項１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２０】
前記翻訳開始配列が、コザック配列を含む、請求項１９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２１】
前記コザック配列が、配列ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含み、Ｘ１及びＸ２の各々が任意のヌクレオチドである、請求項２０に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２２】
Ｘ１がＡを含む、請求項２１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２３】
Ｘ２がＧを含む、請求項２１または請求項２２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２４】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項２１または請求項２２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２５】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む、請求項２０〜２４のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２６】
前記コザック配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項２０に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２７】
前記コザック配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項２０または請求項２６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２８】
前記核酸構築物が、シグナルペプチドであって、前記シグナルペプチドを有さない前記治療タンパク質と比較して前記治療タンパク質の分泌を増加させることができる前記シグナルペプチドをコードするシグナル核酸配列を更に含む、請求項１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項２９】
前記シグナルペプチドが、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される、請求項２８に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３０】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項２９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３１】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３２】
前記シグナルペプチドが、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドを含む、請求項２８に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３３】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項３２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３４】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２を含む、請求項３２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３５】
前記ｖＩＧＦ２核酸配列が、治療タンパク質をコードする前記核酸配列の５’側に存在する、請求項１〜３４のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３６】
前記ｖＩＧＦ２核酸配列が、治療タンパク質をコードする前記核酸配列の３’側に存在する、請求項１〜３４のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３７】
前記核酸構築物が、前記ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列と治療タンパク質をコードする前記核酸配列との間にリンカーペプチドをコードするリンカー配列を更に含む、請求項１〜３６のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３８】
前記リンカーペプチドが、配列番号１８〜２１、配列番号３３、または配列番号３７を含む、請求項３７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項３９】
前記遺伝子治療ベクターが、ウイルスベクターである、請求項１〜３８のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項４０】
前記ウイルスベクターが、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノウイルスベクター、またはヘルペスウイルスベクターである、請求項３９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項４１】
治療上有効量の請求項１〜４０のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項４２】
前記賦形剤が、非イオン性、低浸透圧の化合物、緩衝液、ポリマー、塩、またはこれらの組み合わせを含む、請求項４１に記載の医薬組成物。
【請求項４３】
遺伝的障害を処置する必要がある対象に、請求項１〜４０のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクターまたは請求項４１もしくは請求項４２に記載の医薬組成物を投与することを含む、遺伝的障害を処置する方法。
【請求項４４】
前記遺伝的障害がリソソーム貯蔵障害である、請求項４３に記載の方法。
【請求項４５】
前記遺伝的障害が、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、ＣＤＫＬ５欠損症、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される、請求項４３または請求項４４に記載の方法。
【請求項４６】
前記遺伝的障害がポンペ病である、請求項４３または請求項４４に記載の方法。
【請求項４７】
前記遺伝的障害が神経セロイドリポフスチン症である、請求項４３または請求項４４に記載の方法。
【請求項４８】
前記投与が、クモ膜下腔内に、眼内に、硝子体内に、網膜に、静脈内に、筋肉内に、脳室内に、大脳内に、小脳内に、側脳室内に、実質内に、皮下に、またはこれらの組み合わせで行われる、請求項４３〜４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項４９】
前記投与がクモ膜下腔内に行われる、請求項４３〜４７のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５０】
遺伝的障害を処置するのに使用するための、請求項１〜４０のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項５１】
遺伝的障害の処置のための薬剤の調製に使用するための、請求項１〜４０のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む、医薬組成物。
【請求項５２】
前記遺伝的障害がリソソーム貯蔵障害である、請求項５０または５１に記載の医薬組成物。
【請求項５３】
前記遺伝的障害が、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される、請求項５０〜５２のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項５４】
前記遺伝的障害がポンペ病である、請求項５０〜５３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項５５】
前記遺伝的障害が神経セロイドリポフスチン症である、請求項５０〜５３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項５６】
前記組成物が、クモ膜下腔内、眼内、硝子体内、網膜、静脈内、筋肉内、脳室内、大脳内、小脳内、または皮下投与用に製剤化される、請求項５０〜５５のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項５７】
前記組成物がクモ膜下腔内投与用に製剤化される、請求項５０〜５６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項５８】
５’から３’の順序で、
（ａ）翻訳開始配列と、
（ｂ）治療タンパク質をコードする核酸配列と、
を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクター。
【請求項５８】
前記翻訳開始配列が、コザック配列を含む、請求項５８に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項５９】
前記コザック配列が、配列ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含み、Ｘ１及びＸ２の各々が任意のヌクレオチドである、請求項５８に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６０】
Ｘ１がＡを含む、請求項５９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６１】
Ｘ２がＧを含む、請求項５９または請求項６０に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６２】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項５８〜６１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６３】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む、請求項５８〜６２のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６４】
前記コザック配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項５８に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６５】
前記コザック配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項５８または請求項６４に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６６】
前記核酸構築物が、シグナルペプチドであって、前記シグナルペプチドを有さない前記治療タンパク質と比較して前記治療タンパク質の分泌を増加させることができる前記シグナルペプチドをコードするシグナル核酸配列を更に含む、請求項５８〜６５のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６７】
前記シグナルペプチドが、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される、請求項６６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６８】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項６９】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７０】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７１】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２のアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７２】
前記核酸構築物が、内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）を更に含む、請求項５８〜７１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７３】
前記ＩＲＥＳが、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳである、請求項７２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７４】
前記ＩＲＥＳが、配列番号１２と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項７２または請求項７３に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７５】
前記ＩＲＥＳが、配列番号１２を含む、請求項７３または請求項７４に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７６】
５’から３’の順序で、
（ａ）シグナルペプチドをコードする核酸配列と、
（ｂ）治療タンパク質をコードする核酸配列と、
を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクターであって、前記シグナルペプチドが、前記シグナルペプチドを有さない前記治療タンパク質と比較して前記治療タンパク質の分泌を増加させることができる、前記遺伝子治療ベクター。
【請求項７７】
前記シグナルペプチドが、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される、請求項７６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７８】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項７７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項７９】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項７７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８０】
前記シグナルペプチドが、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドを含む、請求項７６〜７９のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８１】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項８０に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８２】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２を含む、請求項８０に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８３】
前記核酸構築物が、翻訳開始配列を更に含む、請求項７６〜８２のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８４】
前記翻訳開始配列がＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含むコザック配列を含み、Ｘ１及びＸ２の各々、請求項８３に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８５】
Ｘ１がＡを含む、請求項８４に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８６】
Ｘ２がＧを含む、請求項８４または請求項８５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８７】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項８４〜８６のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８８】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む、請求項８４〜８７のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項８９】
前記翻訳開始配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項８３に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９０】
前記翻訳開始配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項８３または請求項８９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９１】
前記核酸構築物が、内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）を更に含む、請求項７６〜９０のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９２】
前記ＩＲＥＳが、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳ、ピコルナウイルスＩＲＥＳ、アフトウイルスＩＲＥＳ、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスＩＲＥＳ、Ａ型肝炎ＩＲＥＳ、Ｃ型肝炎ＩＲＥＳ、ペスチウイルスＩＲＥＳ、クリパウイルス（Ｃｒｉｐａｖｉｒｕｓ）ＩＲＥＳ、Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ  ｐａｄｉウイルスＩＲＥＳ、及びマレック病ウイルスＩＲＥＳからなる群から選択されるＩＲＥＳを含む、請求項９１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９３】
前記ＩＲＥＳが、配列番号１２と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項９１または請求項９２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９４】
前記ＩＲＥＳが配列番号１２を含む、請求項９１〜９３のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９５】
５’から３’の順序で、
（ａ）内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）と、
（ｂ）治療タンパク質をコードする核酸配列と、
を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクター。
【請求項９６】
前記ＩＲＥＳが、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳ、ピコルナウイルスＩＲＥＳ、アフトウイルスＩＲＥＳ、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスＩＲＥＳ、Ａ型肝炎ＩＲＥＳ、Ｃ型肝炎ＩＲＥＳ、ペスチウイルスＩＲＥＳ、クリパウイルス（Ｃｒｉｐａｖｉｒｕｓ）ＩＲＥＳ、Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ  ｐａｄｉウイルスＩＲＥＳ、及びマレック病ウイルスＩＲＥＳからなる群から選択されるＩＲＥＳを含む、請求項９５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９７】
前記ＩＲＥＳが、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳである、請求項９６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９８】
前記ＩＲＥＳが、配列番号１２と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項９６または請求項９７に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項９９】
前記ＩＲＥＳが配列番号１２を含む、請求項９６〜９８のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１００】
前記核酸構築物が、翻訳開始配列を更に含む、請求項９５〜９９のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０１】
前記翻訳開始配列が、ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含むコザック配列を含み、Ｘ１及びＸ２の各々が任意のヌクレオチドである、請求項１００に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０２】
Ｘ１がＡを含む、請求項１０１に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０３】
Ｘ２がＧを含む、請求項１０１または請求項１０２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０４】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項１０１〜１０３のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０５】
前記コザック配列が、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む、請求項１０１〜１０４のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０６】
前記翻訳開始配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項１００に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０７】
前記翻訳開始配列が、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む、請求項１００または請求項１０６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０８】
前記核酸構築物が、シグナルペプチドであって、前記シグナルペプチドを有さない前記治療タンパク質と比較して前記治療タンパク質の分泌を増加させることができる前記シグナルペプチドをコードするシグナル核酸配列を更に含む、請求項９５〜１０７のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１０９】
前記シグナルペプチドが、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される、請求項１０６に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１０】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項１０９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１１】
前記ＢｉＰシグナルペプチドが、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１０９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１２】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項１０９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１３】
前記Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドが、配列番号３２を含む、請求項１０９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１４】
前記核酸構築物が、ＩＧＦ２ペプチドをコードする核酸配列を更に含む、請求項５８〜１１３のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１５】
前記ＩＧＦ２ペプチドが、配列番号１〜１１、配列番号３０〜３１、配列番号３４、及び配列番号３５からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含むｖＩＧＦ２ペプチドである、請求項１１４に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１６】
前記ＩＧＦ２ペプチドが、配列番号１〜１１、配列番号３０〜３１、配列番号３４、及び配列番号３５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むｖＩＧＦ２ペプチドである、請求項１１４に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１７】
前記ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列が、治療タンパク質をコードする前記核酸配列の５’側に存在する、請求項１１４〜１１６のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１８】
前記ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列が、治療タンパク質をコードする前記核酸配列の３’側に存在する、請求項１１４〜１１６のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１１９】
前記核酸構築物が、前記ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列と治療タンパク質をコードする前記核酸配列との間にリンカーペプチドをコードするリンカー配列を更に含む、請求項１１４〜１１８のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２０】
前記リンカーペプチドが、配列番号１８〜２１、配列番号３３、または配列番号３７と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む、請求項１１９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２１】
前記リンカーペプチドが、配列番号１８〜２１、配列番号３３、または配列番号３７を含む、請求項１１９に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２２】
前記治療タンパク質が、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群から選択される、請求項５８〜１２１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２３】
前記治療タンパク質が、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である、請求項１２２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２４】
前記酵素が、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼである、請求項１２２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２５】
前記治療タンパク質が、遺伝的障害を有する対象において前記遺伝的障害に関連する不完全なタンパク質または欠損したタンパク質の代わりとなることができる、請求項１２２に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２６】
前記遺伝的障害が、リソソーム貯蔵障害である、請求項１２５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２７】
前記遺伝的障害が、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される、請求項１２５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２８】
前記遺伝的障害が、ポンペ病である、請求項１２５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１２９】
前記遺伝的障害が、神経セロイドリポフスチン症である、請求項１２５に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１３０】
前記遺伝子治療ベクターが、ウイルスベクターである、請求項５８〜１２９のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１３１】
前記ウイルスベクターが、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノウイルスベクター、またはヘルペスウイルスベクターである、請求項１３０に記載の遺伝子治療ベクター。
【請求項１３２】
（ｉ）治療上有効量の、請求項５８〜１３１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター、及び（ｉｉ）薬学的に許容される担体または賦形剤、を含む医薬組成物。
【請求項１３３】
前記担体または賦形剤が、非イオン性、低浸透圧の化合物、緩衝液、ポリマー、塩、またはこれらの組み合わせを含む、請求項１３２に記載の医薬組成物。
【請求項１３４】
遺伝的障害を処置する必要がある対象に、請求項５８〜１３１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクターまたは請求項１３２もしくは請求項１３３に記載の医薬組成物を投与することを含む、遺伝的障害を処置する方法。
【請求項１３５】
前記遺伝的障害がリソソーム貯蔵障害である、請求項１３４に記載の方法。
【請求項１３６】
前記遺伝的障害が、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される、請求項１３４または請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３７】
前記遺伝的障害がポンペ病である、請求項１３４または請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３８】
前記遺伝的障害が神経セロイドリポフスチン症である、請求項１３４または請求項１３５に記載の方法。
【請求項１３９】
前記投与が、クモ膜下腔内に、静脈内に、筋肉内に、脳室内に、大脳内に、小脳内に、側脳室内に、実質内に、眼に、皮下に、またはこれらの組み合わせで行われる、請求項１３４〜１３８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４０】
前記投与がクモ膜下腔内に行われる、請求項１３４〜１３９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項１４１】
遺伝的障害を処置するのに使用するための、請求項５８〜１３１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む医薬組成物。
【請求項１４２】
遺伝的障害の処置のための薬剤の調製に使用するための、請求項５８〜１３１のいずれか１項に記載の遺伝子治療ベクター及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む、医薬組成物。
【請求項１４３】
前記遺伝的障害がリソソーム貯蔵障害である、請求項１４１または１４２に記載の医薬組成物。
【請求項１４４】
前記遺伝的障害が、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される、請求項１４１〜１４３のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１４５】
前記遺伝的障害がポンペ病である、請求項１４１〜１４４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１４６】
前記遺伝的障害が神経セロイドリポフスチン症である、請求項１４１〜１４４のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１４７】
前記組成物が、クモ膜下腔内、静脈内、筋肉内、脳室内、大脳内、小脳内、眼、または皮下投与用に製剤化される、請求項１４１〜１４６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１４８】
前記組成物がクモ膜下腔内投与用に製剤化される、請求項１４１〜１４６のいずれか１項に記載の医薬組成物。
【請求項１４９】
（ａ）治療タンパク質をコードする核酸配列と、
（ｂ）前記治療タンパク質のエンドサイトーシスを増加させるペプチドをコードする核酸配列と、を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクター。
【請求項１５０】
前記治療タンパク質のエンドサイトーシスを増加させる前記ペプチドが、ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドである、請求項１４９に記載の遺伝子治療ベクター。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
相互参照
本出願は、２０１８年４月３０日に出願の米国仮出願番号第６２／６６４，７４１号；２０１８年６月２２日に出願の米国仮出願番号第６２／６８８，６４０号；及び２０１８年１０月１０日に出願の米国仮出願番号第６２／７４４，０６８号の利益を主張し、これらの出願の各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【０００２】
遺伝的障害は、遺伝的変異またはゲノムの遺伝子コード領域で発生する新たな変異により生じる。場合によっては、かかる遺伝的障害は、当該遺伝的障害を有する個体において変異した遺伝子によってコードされるタンパク質の投与によって処置される。しかしながら、タンパク質の投与が、それが必要とされる器官、細胞、または細胞小器官へのタンパク質の到達を必ずしももたらさないため、かかる処置は、課題を抱えている。更にこの処置は、多くの場合、週２回の注入も必要とし、これは、一回の処置で持続する寛解を提供することができる遺伝子治療では必要とされない。従って、遺伝子治療は、遺伝的障害の現在利用可能な処置法と比較して改善した結果を提供する可能性を有する。
【発明の概要】
【０００３】
本明細書において、遺伝子治療を使用した遺伝的障害の処置のための組成物及び方法が提供される。また本明細書において、遺伝子治療ベクターによって提供される治療タンパク質のタンパク質発現を改善するための、ならびにその細胞取り込みまたは送達及び細胞内または細胞小器官標的化を増加させるための、遺伝子治療において使用される遺伝子治療ベクター構成要素及び方法も提供される。
【０００４】
ある種の態様では、遺伝子治療ベクター、例えば、５’から３’の順で、（ａ）翻訳開始配列及び（ｂ）治療タンパク質をコードする核酸配列、を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクターが提供される。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列は、コザック配列を含む。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列及び治療タンパク質をコードする核酸配列は重複していてもよく、その結果、翻訳開始配列の最後の３ヌクレオチドは治療タンパク質の開始コドンでもある。幾つかの実施形態では、コザック配列は、配列ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含み、ここで、Ｘ１及びＸ２の各々は任意のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、Ｘ１は、Ａを含む。幾つかの実施形態では、Ｘ２は、Ｇを含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）の配列と、１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含み、ここで、最後の３ヌクレオチド（ＡＴＧ）は、治療タンパク質の開始コドンでもある。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、シグナルペプチドであって、当該シグナルペプチドを有さない治療タンパク質と比較して治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該シグナルペプチドをコードする核酸配列を更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択される配列と、５アミノ酸以下、４アミノ酸以下、３アミノ酸以下、２アミノ酸以下、または１アミノ酸異なる。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号３２の配列と、５アミノ酸以下、４アミノ酸以下、３アミノ酸以下、２アミノ酸以下、または１アミノ酸異なる。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳである。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、配列番号１２と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、配列番号１２を含む。
【０００５】
更なる態様では、５’から３’の順序で、（ａ）シグナルペプチドをコードする核酸配列及び（ｂ）治療タンパク質をコードする核酸配列、を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクターであって、当該シグナルペプチドが、当該シグナルペプチドを有さない当該治療タンパク質と比較して、当該治療タンパク質の分泌を増加させることができる、当該遺伝子治療ベクターが提供される。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択される配列と、５アミノ酸以下、４アミノ酸以下、３アミノ酸以下、２アミノ酸以下、または１アミノ酸異なる。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号３２の配列と、５アミノ酸以下、４アミノ酸以下、３アミノ酸以下、２アミノ酸以下、または１アミノ酸異なる。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、翻訳開始配列を更に含む。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列は、ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含むコザック配列を含み、ここで、Ｘ１及びＸ２の各々は任意のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、Ｘ１は、Ａを含む。幾つかの実施形態では、Ｘ２は、Ｇを含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）の配列と、１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳ、ピコルナウイルスＩＲＥＳ、アフトウイルスＩＲＥＳ、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスＩＲＥＳ、Ａ型肝炎ＩＲＥＳ、Ｃ型肝炎ＩＲＥＳ、ペスチウイルスＩＲＥＳ、クリパウイルス（Ｃｒｉｐａｖｉｒｕｓ）ＩＲＥＳ、Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ  ｐａｄｉウイルスＩＲＥＳ、及びマレック病ウイルスＩＲＥＳからなる群から選択されるＩＲＥＳを含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、配列番号１２と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、配列番号１２を含む。
【０００６】
更なる態様では、５’から３’の順序で、（ａ）内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）及び（ｂ）治療タンパク質をコードする核酸配列、を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクターが提供される。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳ、ピコルナウイルスＩＲＥＳ、アフトウイルスＩＲＥＳ、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスＩＲＥＳ、Ａ型肝炎ＩＲＥＳ、Ｃ型肝炎ＩＲＥＳ、ペスチウイルスＩＲＥＳ、クリパウイルス（Ｃｒｉｐａｖｉｒｕｓ）ＩＲＥＳ、Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ  ｐａｄｉウイルスＩＲＥＳ、及びマレック病ウイルスＩＲＥＳからなる群から選択されるＩＲＥＳを含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳである。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、配列番号１２と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＩＲＥＳは、配列番号１２を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、翻訳開始配列を更に含む。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列は、ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含むコザック配列を含み、ここで、Ｘ１及びＸ２の各々は任意のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、Ｘ１は、Ａを含む。幾つかの実施形態では、Ｘ２は、Ｇを含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、シグナルペプチドであって、当該シグナルペプチドを有さない治療タンパク質と比較して治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該シグナルペプチドをコードするシグナル核酸配列を更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２を含む。
【０００７】
幾つかの実施形態では、本明細書において提供される核酸構築物のいずれかは、ＣＩ−ＭＰＲと高親和性で選択的に結合するペプチドをコードする核酸配列を更に含み、ここで、治療タンパク質及びＣＩ−ＭＰＲに選択的に結合するペプチドは、融合タンパク質として発現される。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、ＣＩ−ＭＰＲヌクレオチド配列に選択的に結合するペプチドをコードする核酸と治療タンパク質をコードする核酸配列との間にリンカーペプチドをコードする配列を更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドの配列は、治療ペプチドの配列もしくはＣＩ−ＭＰＲに選択的に結合するペプチドの配列と、またはその両方と重複していてもよい。幾つかの実施形態では、ＣＩ−ＭＰＲに高親和性で結合するペプチドは、バリアントＩＧＦ２ペプチド（ｖＩＧＦ２）である。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、細胞への取り込みを促進する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１〜１１からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号２〜１１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列は、治療タンパク質をコードする核酸配列の５’側に存在する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列は、治療タンパク質をコードする核酸配列の３’側に存在する。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列と治療タンパク質をコードする核酸配列との間にリンカーペプチドをコードする配列を更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドは、配列番号１８〜２１、配列番号３３、または配列番号３７と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドは、配列番号１８〜２１、配列番号３３、または配列番号３７を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、リソソーム貯蔵障害に関連する。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、リソソーム酵素またはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノ��リカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１及び２（それぞれＰＰＴ１及びＰＰＴ２）が含まれるパルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ（ＰＰＴ）である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、ＣＤＫＬ５欠乏障害、嚢胞性線維症、α及びβサラセミア、鎌形赤血球貧血、マルファン症候群、脆弱Ｘ症候群、ハンチントン病、ヘモクロマトーシス、先天性難聴（無症候性）、テイサックス病、家族性高コレステロール血症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、シュタルガルト病、アッシャー症候群、コロイデレミア、色盲、Ｘ連鎖性網膜分離症、血友病、ウィスコット・アルドリッチ症候群、Ｘ連鎖性慢性肉芽腫症、芳香族Ｌ−アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、劣性栄養障害性表皮水泡症、α１アンチトリプシン欠損症、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群（ＨＧＰＳ）、ヌーナン症候群、Ｘ連鎖性重症複合免疫不全症（Ｘ−ＳＣＩＤ）からなる群から選択される遺伝的障害に関連する。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、ＣＤＫＬ５、コネキシン２６、ヘキソサミニダーゼＡ、ＬＤＬ受容体、ジストロフィン、ＣＦＴＲ、β−グロブリン、ＨＦＥ、ハンチントン、ＡＢＣＡ４、ミオシンＶＩＩＡ（ＭＹＯ７Ａ）、Ｒａｂエスコートタンパク質−１（ＲＥＰ１）、環状ヌクレオチド依存性チャネルβ３（ＣＮＧＢ３）、レチノスキシン１（ＲＳ１）、ヘモグロビンサブユニットβ（ＨＢＢ）、第ＩＸ因子、ＷＡＳ、シトクロムＢ−２４５β鎖、ドーパ脱炭酸酵素（ＤＤＣ）、ＶＩＩ型コラーゲンα１鎖（ＣＯＬ７Ａ１）、セルピンファミリーＡメンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ＬＭＮＡ、ＰＴＰＮ１１、ＳＯＳ１、ＲＡＦ１、ＫＲＡＳ、及びＩＬ２受容体γ遺伝子からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、遺伝的障害を有する対象において当該遺伝的障害に関連する不完全なタンパク質または欠損したタンパク質の代わりとなることができる。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファ��リー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、及びシンドラー病ＩＩ型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アクチベーター欠損症、ＧＭ２ガングリオシドーシス；ＧＭ２ガングリオシドーシスＡＢ異型；α−マンノシドーシス（２型、中等症型；３型、新生児期、重症型）；β−マンノシドーシス；リソソーム酸性リパーゼ欠損症；シスチン症（遅発性の若年または思春期腎障害型；小児腎障害型）；シャナリン・ドルフマン症候群；ミオパチーを伴う中性脂質蓄積症；ＮＬＳＤＭ；ダノン病；ファブリー病；ファブリー病ＩＩ型、遅発型；ファーバー病；ファーバー脂肪性肉芽腫症；フコシドーシス；ガラクトシアリドーシス（ノイラミニダーゼ及びβ−ガラクトシダーゼの複合欠損症）；ゴーシェ病；ＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩＣ型ゴーシェ病；ゴーシェ病、非典型、サポシンＣ欠損による；ＧＭ１ガングリオシドーシス（遅発乳児型／若年型ＧＭ１ガングリオシドーシス；成人型／慢性ＧＭ１ガングリオシドーシス）；グロボイド細胞白質ジストロフィー、クラッベ病（遅発乳児型；若年型；成人型）；クラッベ病、非典型、サポシンＡ欠損による；異染性白質ジストロフィー（若年型；成人型）；部分的セレブロシドスルファターゼ欠損症；偽性アリルスルファターゼＡ欠損症；サポシンＢ欠損による異染性白質ジストロフィー；ムコ多糖症障害：ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー症候群；ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー・シャイエ症候群；ＭＰＳ  Ｉ、シャイエ症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；サンフィリポ症候群Ａ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＡ；サンフィリポ症候群Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＢ；サンフィリポ症候群Ｃ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＣ；サンフィリポ症候群Ｄ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＤ；モルキオ症候群、Ａ型／ＭＰＳ  ＩＶＡ；モルキオ症候群、Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＶＢ；ＭＰＳ  ＩＸ／ヒアルロニダーゼ欠損症；ＭＰＳ  ＶＩ／マロトー・ラミー症候群；ＭＰＳ  ＶＩＩ／スライ症候群；ムコリピドーシスＩ型、シアリドーシスＩＩ型；Ｉ細胞病、ルロイ病（Ｌｅｒｏｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、ムコリピドーシスＩＩ型；偽性ハーラー病ポリジストロフィー／ムコリピドーシスＩＩＩ型；ムコリピドーシスＩＩＩＣ型／ＭＬ  ＩＩＩ  γ；ムコリピドーシスＩＶ型；多重スルファターゼ欠損症；ニーマン・ピック病（Ｂ型；Ｃ１型／慢性神経細胞障害型；Ｃ２型；Ｄ型／Ｎｏｖａ  Ｓｃｏｔｉａｎ型）；神経セロイドリポフスチン症：ＣＬＮ６病（非典型の遅発乳児型、遅発型異型、早期若年型）；Ｂａｔｔｅｎ−Ｓｐｉｅｌｍｅｙｅｒ−Ｖｏｇｔ病／若年型ＮＣＬ／ＣＬＮ３病；フィンランド異型遅発乳児型ＣＬＮ５病；ヤンスキー・ビールショースキー病／遅発乳児型ＣＬＮ２病／ＴＰＰ１病；クーフス病／成人型ＮＣＬ／ＣＬＮ４病（Ｂ型）；北部癲癇／遅発乳児型異型ＣＬＮ８病；Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病／乳児型ＣＬＮ１病／ＰＰＴ病；ポンペ病（グリコーゲン蓄積症ＩＩ型）；遅発性ポンペ病；濃化異骨症；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；シンドラー病（ＩＩＩ型／中間型、可変的）；神崎疾患；サラ病；乳児型遊離シアル酸蓄積症（ＩＳＳＤ）；進行性ミオクローヌス癲癇を伴う脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡＰＭＥ）；テイサックス病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；若年性テイサックス病；遅発性テイサックス病；クリスチャンソン症候群；Ｌｏｗｅ眼脳腎症候群；シャルコー・マリー・トゥース病４Ｊ型、ＣＭＴ４Ｊ；
Ｙｕｎｉｓ−Ｖａｒｏｎ症候群；両側性側頭後頭葉多小脳回（ＢＴＯＰ）；Ｘ連鎖性高カルシウム尿腎結石症、デント病１型；ならびにデント病２型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ポンペ病である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、神経セロイドリポフスチン症である。幾つかの実施形態では、神経セロイドリポフスチン症は、乳児型ＮＣＬ（Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病）、遅発乳児型ＮＣＬ（ヤンスキー・ビールショースキー病）、バッテン病、成人型ＮＣＬ（クーフス病）、フィンランド遅発乳児型ＮＣＬ、遅発乳児型異型ＮＣＬ、ＣＬＮ７、ＣＬＮ８、トルコ遅発乳児型ＮＣＬ、ＮＣＬ９型、及びＣＬＮ１０からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝子治療ベクターは、ウイルスベクターである。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノウイルスベクター、またはヘルペスウイルスベクターである。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、ＡＡＶベクターである。幾つかの実施形態では、ＡＡＶベクターは、末端逆位配列（ＩＴＲ）を含む。幾つかの実施形態では、ＡＡＶベクターは、ＡＡＶ１ベクター、ＡＡＶ２ベクター、ＡＡＶ３ベクター、ＡＡＶ４ベクター、ＡＡＶ５ベクター、ＡＡＶ６ベクター、ＡＡＶ７ベクター、ＡＡＶ８ベクター、ＡＡＶ９ベクター、ＡＡＶｒｈＳベクター、ＡＡＶｒｈ１０ベクター、ＡＡＶｒｈ３３ベクター、ＡＡＶｒｈ３４ベクター、ＡＡＶｒｈ７４ベクター、ＡＡＶ／Ａｎｃ８０ベクター、ＡＡＶＰＨＰ．Ｂベクター、ＡＡＶｈｕ６８ベクター、及びＡＡＶ−ＤＪベクターからなる群から選択される。
【０００８】
ある種の態様では、（ａ）治療タンパク質をコードする核酸配列及び（ｂ）ＣＩ−ＭＰＲに高親和性で結合するペプチドをコードする核酸配列、を含む遺伝子治療ベクターなどの遺伝子治療ベクターが提供される。幾つかの実施形態では、ペプチドは、バリアントＩＧＦ２（ｖＩＧＦ２）ペプチドである。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１と少なくとも９０％同一であり、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、５５位、及び６５位からなる群から選択される１つ以上の位置での少なくとも１つの置換を有するアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも１つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、及びＫ６５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、及び５５位からなる群から選択される２つ以上の位置での少なくとも２つの置換を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも２つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、及びＬ５５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｎ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜２位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜３位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失、ならびにＥ６Ｒ、Ｙ２７Ｌ、及びＫ６５Ｒの置換を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失及びＥ６Ｒ及びＹ２７Ｌの置換を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜５位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜６位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜７位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、天然のＩＧＦ２ペプチドと比較してインスリン受容体及びＩＧＦ１Ｒに対する減少した親和性を有するか、または親和性を有さない。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、細胞への治療タンパク質の取り込みを促進することができる。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、リソソームへの治療タンパク質の取り込みを促進することができる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、遺伝的障害を有する対象において当該遺伝的障害に関連する不完全なタンパク質または欠損したタンパク質の代わりとなることができる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、リソソーム酵素またはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、及びシンドラー病ＩＩ型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アクチベーター欠損症、ＧＭ２ガングリオシドーシス；ＧＭ２ガングリオシドーシスＡＢ異型；α−マンノシドーシス（２型、中等症型；３型、新生児期、重症型）；β−マンノシドーシス；リソソーム酸性リパーゼ欠損症；シスチン症（遅発性の若年または思春期腎障害型；小児腎障害型）；シャナリン・ドルフマン症候群；ミオパチーを伴う中性脂質蓄積症；ＮＬＳＤＭ；ダノン病；ファブリー病；ファブリー病ＩＩ型、遅発型；ファーバー病；ファーバー脂肪性肉芽腫症；フコシドーシス；ガラクトシアリドーシス（ノイラミニダーゼ及びβ−ガラクトシダーゼの複合欠損症）；ゴーシェ病；ＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩＣ型ゴーシェ病；ゴーシェ病、非典型、サポシンＣ欠損による；ＧＭ１ガングリオシドーシス（遅発乳児型／若年型ＧＭ１ガングリオシドーシス；成人型／慢性ＧＭ１ガングリオシドーシス）；グロボイド細胞白質ジストロフィー、クラッベ病（遅発乳児型；若年型；成人型）；クラッベ病、非典型、サポシンＡ欠損による；異染性白質ジストロフィー（若年型；成人型）；部分的セレブロシドスルファターゼ欠損症；偽性アリルスルファターゼＡ欠損症；サポシンＢ欠損による異染性白質ジストロフィー；ムコ多糖症障害：ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー症候群；ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー・シャイエ症候群；ＭＰＳ  Ｉ、シャイエ症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；サンフィリポ症候群Ａ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＡ；サンフィリポ症候群Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＢ；サンフィリポ症候群Ｃ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＣ；サンフィリポ症候群Ｄ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＤ；モルキオ症候群、Ａ型／ＭＰＳ  ＩＶＡ；モルキオ症候群、Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＶＢ；ＭＰＳ  ＩＸ／ヒアルロニダーゼ欠損症；ＭＰＳ  ＶＩ／マロトー・ラミー症候群；ＭＰＳ  ＶＩＩ／スライ症候群；ムコリピドーシスＩ型、シアリドーシスＩＩ型；Ｉ細胞病、ルロイ病（Ｌｅｒｏｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、ムコリピドーシスＩＩ型；偽性ハーラー病ポリジストロフィー／ムコリピドーシスＩＩＩ型；ムコリピドーシスＩＩＩＣ型／ＭＬ  ＩＩＩ  γ；ムコリピドーシスＩＶ型；多重スルファターゼ欠損症；ニーマン・ピック病（Ｂ型；Ｃ１型／慢性神経細胞障害型；Ｃ２型；Ｄ型／Ｎｏｖａ  Ｓｃｏｔｉａｎ型）；神経セロイドリポフスチン症：ＣＬＮ６病（非典型の遅発乳児型、遅発型異型、早期若年型）；Ｂａｔｔｅｎ−Ｓｐｉｅｌｍｅｙｅｒ−Ｖｏｇｔ病／若年型ＮＣＬ／ＣＬＮ３病；フィンランド異型遅���乳児型ＣＬＮ５病；ヤンスキー・ビールショースキー病／遅発乳児型ＣＬＮ２病／ＴＰＰ１病；クーフス病／成人型ＮＣＬ／ＣＬＮ４病（Ｂ型）；北部癲癇／遅発乳児型異型ＣＬＮ８病；Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病／乳児型ＣＬＮ１病／ＰＰＴ病；ポンペ病（グリコーゲン蓄積症ＩＩ型）；遅発性ポンペ病；濃化異骨症；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；シンドラー病（ＩＩＩ型／中間型、可変的）；神崎疾患；サラ病；乳児型遊離シアル酸蓄積症（ＩＳＳＤ）；進行性ミオクローヌス癲癇を伴う脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡＰＭＥ）；テイサックス病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；若年性テイサックス病；遅発性テイサックス病；クリスチャンソン症候群；Ｌｏｗｅ眼脳腎症候群；シャルコー・マリー・トゥース病４Ｊ型、ＣＭＴ４Ｊ；Ｙｕｎｉｓ−Ｖａｒｏｎ症候群；両側性側頭後頭葉多小脳回（ＢＴＯＰ）；Ｘ連鎖性高カルシウム尿腎結石症、デント病１型；ならびにデント病２型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ポンペ病である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、神経セロイドリポフスチン症である。幾つかの実施形態では、神経セロイドリポフスチン症は、乳児型ＮＣＬ（Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病）、遅発乳児型ＮＣＬ（ヤンスキー・ビールショースキー病）、バッテン病、成人型ＮＣＬ（クーフス病）、フィンランド遅発乳児型ＮＣＬ、遅発乳児型異型ＮＣＬ、ＣＬＮ７、ＣＬＮ８、トルコ遅発乳児型ＮＣＬ、ＮＣＬ９型、及びＣＬＮ１０からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、可溶性リソソーム酵素である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群から選択される酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼは、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１（ＰＰＴ１）または２（ＰＰＴ２）である。幾つかの実施形態では、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼは、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１である。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、翻訳開始配列を更に含む。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列は、コザック配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、配列ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含み、ここで、Ｘ１及びＸ２の各々は任意のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、Ｘ１は、Ａを含む。
幾つかの実施形態では、Ｘ２は、Ｇを含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、シグナルペプチドであって、当該シグナルペプチドを有さない治療タンパク質と比較して治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該シグナルペプチドをコードする核酸配列を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、シグナルペプチドであって、天然のシグナルペプチドを有する治療タンパク質と比較して治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該シグナルペプチドをコードする核酸配列を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、非天然シグナルペプチドであって、治療タンパク質の天然のシグナルペプチドと比較して、治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該非天然シグナルペプチドをコードする核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２核酸配列は、治療タンパク質をコードする核酸配列の５’側に存在する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２核酸配列は、治療タンパク質をコードする核酸配列の３’側に存在する。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列と治療タンパク質をコードする核酸配列との間にリンカーペプチドをコードする配列を更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドは、配列番号１８〜２１または配列番号３３を含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療ベクターは、ウイルスベクターである。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、またはヘルペスウイルスベクターである。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、ＡＡＶベクターである。幾つかの実施形態では、ＡＡＶベクターは、末端逆位配列（ＩＴＲ）を含む。幾つかの実施形態では、ＡＡＶベクターは、ＡＡＶ１ベクター、ＡＡＶ２ベクター、ＡＡＶ３ベクター、ＡＡＶ４ベクター、ＡＡＶ５ベクター、ＡＡＶ６ベクター、ＡＡＶ７ベクター、ＡＡＶ８ベクター、ＡＡＶ９ベクター、ＡＡＶｒｈＳベクター、ＡＡＶｒｈ１０ベクター、ＡＡＶｒｈ３３ベクター、ＡＡＶｒｈ３４ベクター、ＡＡＶｒｈ７４ベクター、ＡＡＶ／Ａｎｃ８０ベクター、ＡＡＶＰＨＰ．Ｂベクター、ＡＡＶｈｕ６８ベクター、及びＡＡＶ−ＤＪベクターからなる群から選択される。
【０００９】
（ａ）治療タンパク質をコードする核酸配列及び（ｂ）当該治療タンパク質のエンドサイトーシスを増加させるペプチドをコードする核酸配列、を含む核酸構築物を含む遺伝子治療ベクター。幾つかの実施形態では、治療タンパク質のエンドサイトーシスを増加させるペプチドは、ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドである。幾つかの実施形態では、ペプチドは、バリアントＩＧＦ２（ｖＩＧＦ２）ペプチド、ＨＩＲＭａｂ、もしくはＴｆＲＭａｂ、または細胞を標的とするその他のペプチドもしくはタンパク質である。幾つかの実施形態では、ペプチドは、ｖＩＧＦ２である。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１と少なくとも９０％同一であり、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、５５位、及び６５位からなる群から選択される１つ以上の位置での少なくとも１つの置換を有するアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも１つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、及びＫ６５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、少なくとも１つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ及びＬ５５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、及び５５位からなる群から選択される２つ以上の位置での少なくとも２つの置換を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも２つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、及びＬ５５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｎ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜６位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜２位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜３位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失、ならびにＥ６Ｒ、Ｙ２７Ｌ、及びＫ６５Ｒの置換を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失、ならびにＥ６Ｒ及びＹ２７Ｌの置換を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜５位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜６位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜７位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、天然のＩＧＦ２ペプチドと比較して、カチオン非依存性Ｍ６Ｐ受容体（ＣＩ−ＭＰＲ）に対する増加した特異性を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、細胞内のリソソームへの治療タンパク質の取り込みを促進することができる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、遺伝的障害を有する対象において当該遺伝的障害に関連する不完全なタンパク質または欠損したタンパク質の代わりとなることができる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、リソソーム酵素またはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、及びシンドラー病ＩＩ型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アクチベーター欠損症、ＧＭ２ガングリオシドーシス；ＧＭ２ガングリオシドーシスＡＢ異型；α−マンノシドーシス（２型、中等症型；３型、新生児期、重症型）；β−マンノシドーシス；リソソーム酸性リパーゼ欠損症；シスチン症（遅発性の若年または思春期腎障害型；小児腎障害型）；シャナリン・ドルフマン症候群；ミオパチーを伴う中性脂質蓄積症；ＮＬＳＤＭ；ダノン病；ファブリー病；ファブリー病ＩＩ型、遅発型；ファーバー病；ファーバー脂肪性肉芽腫症；フコシドーシス；ガラクトシアリドーシス（ノイラミニダーゼ及びβ−ガラクトシダーゼの複合欠損症）；ゴーシェ病；ＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩＣ型ゴーシェ病；ゴーシェ病、非典型、サポシンＣ欠損による；ＧＭ１ガングリオシドーシス（遅発乳児型／若年型ＧＭ１ガングリオシドーシス；成人型／慢性ＧＭ１ガングリオシドーシス）；グロボイド細胞白質ジストロフィー、クラッベ病（遅発乳児型；若年型；成人型）；クラッベ病、非典型、サポシンＡ欠損による；異染性白質ジストロフィー（若年型；成人型）；部分的セレブロシドスルファターゼ欠損症；偽性アリルスルファターゼＡ欠損症；サポシンＢ欠損による異染性白質ジストロフィー；ムコ多糖症障害：ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー症候群；ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー・シャイエ症候群；ＭＰＳ  Ｉ、シャイエ症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；サンフィリポ症候群Ａ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＡ；サンフィリポ症候群Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＢ；サンフィリポ症候群Ｃ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＣ；サンフィリポ症候群Ｄ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＤ；モルキオ症候群、Ａ型／ＭＰＳ  ＩＶＡ；モルキオ症候群、Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＶＢ；ＭＰＳ  ＩＸ／ヒアルロニダーゼ欠損症；ＭＰＳ  ＶＩ／マロトー・ラミー症候群；ＭＰＳ  ＶＩＩ／スライ症候群；ムコリピドーシスＩ型、シアリドーシスＩＩ型；Ｉ細胞病、ルロイ病（Ｌｅｒｏｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、ムコリピドーシスＩＩ型；偽性ハーラー病ポリジストロフィー／ムコリピドーシスＩＩＩ型；ムコリピドーシスＩＩＩＣ型／ＭＬ  ＩＩＩ  γ；ムコリピドーシスＩＶ型；多重スルファターゼ欠損症；ニーマン・ピック病（Ｂ型；Ｃ１型／慢性神経細胞障害型；Ｃ２型；Ｄ型／Ｎｏｖａ  Ｓｃｏｔｉａｎ型）；神経セロイドリポフスチン症：ＣＬＮ６病（非典型の遅発乳児型、遅発型異型、早期若年型）；Ｂａｔｔｅｎ−Ｓｐｉｅｌｍｅｙｅｒ−Ｖｏｇｔ病／若年型ＮＣＬ／ＣＬＮ３病；フィンランド異型遅発乳児型ＣＬＮ５病；ヤンスキー・ビールショースキー病／遅発乳児型ＣＬＮ２病／ＴＰＰ１病；クーフス病／成人型ＮＣＬ／ＣＬＮ４病（Ｂ型）；北部癲癇／遅発乳児型異型ＣＬＮ８病；Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病／乳児型ＣＬＮ１病／ＰＰＴ病；ポンペ病（グリコーゲン蓄積症ＩＩ型）；遅発性ポンペ病；濃化異骨症；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；シンドラー病（ＩＩＩ型／中間型、可変的）；神崎疾患；サラ病；乳児型遊離シアル酸蓄積症（ＩＳＳＤ）；進行性ミオクローヌス癲癇を伴う脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡＰＭＥ）；テイサックス病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；若年性テイサックス病；遅発性テイサックス病；クリスチャンソン症候群；Ｌｏｗｅ眼脳腎症候群；シャルコー・マリー・トゥース病４Ｊ型、ＣＭＴ４Ｊ；Ｙｕｎｉｓ−Ｖａｒｏｎ症候群；両側性側頭後頭葉多小脳回（ＢＴＯＰ）；
Ｘ連鎖性高カルシウム尿腎結石症、デント病１型；ならびにデント病２型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ポンペ病である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、神経セロイドリポフスチン症である。幾つかの実施形態では、神経セロイドリポフスチン症は、乳児型ＮＣＬ（Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病）、遅発乳児型ＮＣＬ（ヤンスキー・ビールショースキー病）、バッテン病、成人型ＮＣＬ（クーフス病）、フィンランド遅発乳児型ＮＣＬ、遅発乳児型異型ＮＣＬ、ＣＬＮ７、ＣＬＮ８、トルコ遅発乳児型ＮＣＬ、ＮＣＬ９型、及びＣＬＮ１０からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、可溶性リソソーム酵素またはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群から選択される酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼは、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１（ＰＰＴ１）または２（ＰＰＴ２）である。幾つかの実施形態では、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼは、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１である。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、翻訳開始配列を更に含む。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列は、コザック配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、配列ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含み、こ���で、Ｘ１及びＸ２の各々は任意のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、Ｘ１は、Ａを含む。幾つかの実施形態では、Ｘ２は、Ｇを含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも９０％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、シグナルペプチドであって、当該シグナルペプチドを有さない治療タンパク質と比較して治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該シグナルペプチドをコードするシグナル核酸配列を更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２核酸配列は、治療タンパク質をコードする核酸配列の５’側に存在する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２核酸配列は、治療タンパク質をコードする核酸配列の３’側に存在する。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、ｖＩＧＦ２ヌクレオチド配列と治療タンパク質をコードする核酸配列との間にリンカーペプチドをコードするリンカー配列を更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドは、配列番号１８〜２１または配列番号３３を含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療ベクターは、ウイルスベクターである。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、またはヘルペスウイルスベクターである。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、ＡＡＶベクターであ���。幾つかの実施形態では、ＡＡＶベクターは、末端逆位配列（ＩＴＲ）を含む。幾つかの実施形態では、ＡＡＶベクターは、ＡＡＶ１ベクター、ＡＡＶ２ベクター、ＡＡＶ３ベクター、ＡＡＶ４ベクター、ＡＡＶ５ベクター、ＡＡＶ６ベクター、ＡＡＶ７ベクター、ＡＡＶ８ベクター、ＡＡＶ９ベクター、ＡＡＶｒｈＳベクター、ＡＡＶｒｈ１０ベクター、ＡＡＶｒｈ３３ベクター、ＡＡＶｒｈ３４ベクター、ＡＡＶｒｈ７４ベクター、ＡＡＶ／Ａｎｃ８０ベクター、ＡＡＶＰＨＰ．Ｂベクター、ＡＡＶｈｕ６８ベクター、及びＡＡＶ−ＤＪベクターからなる群から選択される。
【００１０】
更なる態様では、（ｉ）治療上有効量の本明細書における遺伝子治療ベクターのいずれか、及び（ｉｉ）薬学的に許容される担体または賦形剤、を含む医薬組成物が提供される。幾つかの実施形態では、担体または賦形剤は、非イオン性、低浸透圧の化合物、緩衝液、ポリマー、塩、またはこれらの組み合わせを含む。
【００１１】
更なる態様では、本明細書において提供される遺伝子治療ベクターのいずれかまたは本明細書において提供される医薬組成物のいずれかを遺伝的障害を処置する必要がある対象に投与することを含む、遺伝的障害を処置する方法が提供される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、及びシンドラー病ＩＩ型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アクチベーター欠損症、ＧＭ２ガングリオシドーシス；ＧＭ２ガングリオシドーシスＡＢ異型；α−マンノシドーシス（２型、中等症型；３型、新生児期、重症型）；β−マンノシドーシス；リソソーム酸性リパーゼ欠損症；シスチン症（遅発性の若年または思春期腎障害型；小児腎障害型）；シャナリン・ドルフマン症候群；ミオパチーを伴う中性脂質蓄積症；ＮＬＳＤＭ；ダノン病；ファブリー病；ファブリー病ＩＩ型、遅発型；ファーバー病；ファーバー脂肪性肉芽腫症；フコシドーシス；ガラクトシアリドーシス（ノイラミニダーゼ及びβ−ガラクトシダーゼの複合欠損症）；ゴーシェ病；ＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩＣ型ゴーシェ病；ゴーシェ病、非典型、サポシンＣ欠損による；ＧＭ１ガングリオシドーシス（遅発乳児型／若年型ＧＭ１ガングリオシドーシス；成人型／慢性ＧＭ１ガングリオシドーシス）；グロボイド細胞白質ジストロフィー、クラッベ病（遅発乳児型；若年型；成人型）；クラッベ病、非典型、サポシンＡ欠損による；異染性白質ジストロフィー（若年型；成人型）；部分的セレブロシドスルファターゼ欠損症；偽性アリルスルファターゼＡ欠損症；サポシンＢ欠損による異染性白質ジストロフィー；ムコ多糖症障害：ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー症候群；ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー・シャイエ症候群；ＭＰＳ  Ｉ、シャイエ症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；サンフィリポ症候群Ａ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＡ；サンフィリポ症候群Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＢ；サンフィリポ症候群Ｃ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＣ；サンフィリポ症候群Ｄ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＤ；モルキオ症候群、Ａ型／ＭＰＳ  ＩＶＡ；モルキオ症候群、Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＶＢ；ＭＰＳ  ＩＸ／ヒアルロニダーゼ欠損症；ＭＰＳ  ＶＩ／マロトー・ラミー症候群；ＭＰＳ  ＶＩＩ／スライ症候群；ムコリピドーシスＩ型、シアリドーシスＩＩ型；Ｉ細胞病、ルロイ病（Ｌｅｒｏｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、ムコリピドーシスＩＩ型；偽性ハーラー病ポリジストロフィー／ムコリピドーシスＩＩＩ型；ムコリピドーシスＩＩＩＣ型／ＭＬ  ＩＩＩ  γ；ムコリピドーシスＩＶ型；多重スルファターゼ欠損症；ニーマン・ピック病（Ｂ型；Ｃ１型／慢性神経細胞障害型；Ｃ２型；Ｄ型／Ｎｏｖａ  Ｓｃｏｔｉａｎ型）；神経セロイドリポフスチン症：ＣＬＮ６病（非典型の遅発乳児型、遅発型異型、早期若年型）；Ｂａｔｔｅｎ−Ｓｐｉｅｌｍｅｙｅｒ−Ｖｏｇｔ病／若年型ＮＣＬ／ＣＬＮ３病；フィンランド異型遅発乳児型ＣＬＮ５病；ヤンスキー・ビールショースキー病／遅発乳児型ＣＬＮ２病／ＴＰＰ１病；クーフス病／成人型ＮＣＬ／ＣＬＮ４病（Ｂ型）；北部癲癇／遅発乳児型異型ＣＬＮ８病；Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病／乳児型ＣＬＮ１病／ＰＰＴ病；ポンペ病（グリコーゲン蓄積症ＩＩ型）；遅発性ポンペ病；濃化異骨症；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；シンドラー病（ＩＩＩ型／中間型、可変的）；神崎疾患；サラ病；乳児型遊離シアル酸蓄積症（ＩＳＳＤ）；進行性ミオクローヌス癲癇を伴う脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡＰＭＥ）；テイサックス病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；若年性テイサックス病；遅発性テイサックス病；クリスチャンソン症候群；Ｌｏｗｅ眼脳腎症候群；シャルコー・マリー・トゥース病４Ｊ型、ＣＭＴ４Ｊ；Ｙｕｎｉｓ−Ｖａｒｏｎ症候群；両側性側頭後頭葉多小脳回（ＢＴＯＰ）；Ｘ連鎖性高カルシウム尿腎結石症、デント病１型；ならびにデント病２型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、ＣＤＫＬ５欠損症、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ポンペ病である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、神経セロイドリポフスチン症である。幾つかの実施形態では、神経セロイドリポフスチン症は、乳児型ＮＣＬ（Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病）、遅発乳児型ＮＣＬ（ヤンスキー・ビールショースキー病）、バッテン病、成人型ＮＣＬ（クーフス病）、フィンランド遅発乳児型ＮＣＬ、遅発乳児型異型ＮＣＬ、ＣＬＮ７、ＣＬＮ８、トルコ遅発乳児型ＮＣＬ、ＮＣＬ９型、及びＣＬＮ１０からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、投与は、クモ膜下腔内に、眼内に、硝子体内に、網膜に、静脈内に、筋肉内に、脳室内に、大脳内に、小脳内に、側脳室内に、実質内に、眼に、皮下に、またはこれらの組み合わせで行われる。幾つかの実施形態では、投与は、クモ膜下腔内に行われる。幾つかの実施形態では、投与は、眼内に、硝子体内に、または網膜に行われる。
【００１２】
更なる態様では、遺伝的障害を処置するのに使用するための、本明細書における遺伝子治療ベクターのいずれか及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む医薬組成物が提供される。更なる態様では、遺伝的障害の処置のための薬剤の調製に使用するための、本明細書における遺伝子治療ベクターのいずれか及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む医薬組成物が提供される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、及びシンドラー病ＩＩ型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アクチベーター欠損症、ＧＭ２ガングリオシドーシス；ＧＭ２ガングリオシドーシスＡＢ異型；α−マンノシドーシス（２型、中等症型；３型、新生児期、重症型）；β−マンノシドーシス；リソソーム酸性リパーゼ欠損症；シスチン症（遅発性の若年または思春期腎障害型；小児腎障害型）；シャナリン・ドルフマン症候群；ミオパチーを伴う中性脂質蓄積症；ＮＬＳＤＭ；ダノン病；ファブリー病；ファブリー病ＩＩ型、遅発型；ファーバー病；ファーバー脂肪性肉芽腫症；フコシドーシス；ガラクトシアリドーシス（ノイラミニダーゼ及びβ−ガラクトシダーゼの複合欠損症）；ゴーシェ病；ＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩＣ型ゴーシェ病；ゴーシェ病、非典型、サポシンＣ欠損による；ＧＭ１ガングリオシドーシス（遅発乳児型／若年型ＧＭ１ガングリオシドーシス；成人型／慢性ＧＭ１ガングリオシドーシス）；グロボイド細胞白質ジストロフィー、クラッベ病（遅発乳児型；若年型；成人型）；クラッベ病、非典型、サポシンＡ欠損による；異染性白質ジストロフィー（若年型；成人型）；部分的セレブロシドスルファターゼ欠損症；偽性アリルスルファターゼＡ欠損症；サポシンＢ欠損による異染性白質ジストロフィー；ムコ多糖症障害：ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー症候群；ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー・シャイエ症候群；ＭＰＳ  Ｉ、シャイエ症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；サンフィリポ症候群Ａ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＡ；サンフィリポ症候群Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＢ；サンフィリポ症候群Ｃ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＣ；サンフィリポ症候群Ｄ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＤ；モルキオ症候群、Ａ型／ＭＰＳ  ＩＶＡ；モルキオ症候群、Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＶＢ；ＭＰＳ  ＩＸ／ヒアルロニダーゼ欠損症；ＭＰＳ  ＶＩ／マロトー・ラミー症候群；ＭＰＳ  ＶＩＩ／スライ症候群；ムコリピドーシスＩ型、シアリドーシスＩＩ型；Ｉ細胞病、ルロイ病（Ｌｅｒｏｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、ムコリピドーシスＩＩ型；偽性ハーラー病ポリジストロフィー／ムコリピドーシスＩＩＩ型；ムコリピドーシスＩＩＩＣ型／ＭＬ  ＩＩＩ  γ；ムコリピドーシスＩＶ型；多重スルファターゼ欠損症；ニーマン・ピック病（Ｂ型；Ｃ１型／慢性神経細胞障害型；Ｃ２型；Ｄ型／Ｎｏｖａ  Ｓｃｏｔｉａｎ型）；神経セロイドリポフスチン症：ＣＬＮ６病（非典型の遅発乳児型、遅発型異型、早期若年型）；Ｂａｔｔｅｎ−Ｓｐｉｅｌｍｅｙｅｒ−Ｖｏｇｔ病／若年型ＮＣＬ／ＣＬＮ３病；フィンランド異型遅発乳児型ＣＬＮ５病；ヤンスキー・ビールショースキー病／遅発乳児型ＣＬＮ２病／ＴＰＰ１病；クーフス病／成人型ＮＣＬ／ＣＬＮ４病（Ｂ型）；北部癲癇／遅発乳児型異型ＣＬＮ８病；Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病／乳児型ＣＬＮ１病／ＰＰＴ病；ポンペ病（グリコーゲン蓄積症ＩＩ型）；遅発性ポンペ病；濃化異骨症；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；シンドラー病（ＩＩＩ型／中間型、可変的）；神崎疾患；サラ病；乳児型遊離シアル酸蓄積症（ＩＳＳＤ）；進行性ミオクローヌス癲癇を伴う脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡＰＭＥ）；テイサックス病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；若年性テイサックス病；遅発性テイサックス病；クリスチャンソン症候群；Ｌｏｗｅ眼脳腎症候群；シャルコー・マリー・トゥース病４Ｊ型、ＣＭＴ４Ｊ；Ｙｕｎｉｓ−Ｖａｒｏｎ症候群；両側性側頭後頭葉多小脳回（ＢＴＯＰ）；Ｘ連鎖性高カルシウム尿腎結石症、デント病１型；ならびにデント病２型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、ＣＤＫＬ５欠損症、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ポンペ病である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、神経セロイドリポフスチン症である。幾つかの実施形態では、神経セロイドリポフスチン症は、乳児型ＮＣＬ（Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病）、遅発乳児型ＮＣＬ（ヤンスキー・ビールショースキー病）、バッテン病、成人型ＮＣＬ（クーフス病）、フィンランド遅発乳児型ＮＣＬ、遅発乳児型異型ＮＣＬ、ＣＬＮ７、ＣＬＮ８、トルコ遅発乳児型ＮＣＬ、ＮＣＬ９型、及びＣＬＮ１０からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、組成物は、クモ膜下腔内、眼内、硝子体内、網膜、静脈内、筋肉内、脳室内、大脳内、小脳内、眼、または皮下投与用に製剤化される。幾つかの実施形態では、組成物は、クモ膜下腔内投与用に製剤化される。幾つかの実施形態では、組成物は、神経変性障害を処置するためのクモ膜下腔内投与用に製剤化される。幾つかの実施形態では、組成物は、眼、硝子体内、または網膜投与用に製剤化される。
【００１３】
本明細書において、（ａ）治療タンパク質；（ｂ）カチオン非依存性マンノース６−リン酸（Ｍ６Ｐ）受容体（ＣＩ−ＭＰＲ）に高親和性で結合するペプチド；及び（ｃ）当該治療タンパク質とＣＩ−ＭＰＲに結合する当該ペプチドとの間のリンカーを含む、ポリペプチドをコードする核酸構築物を含む遺伝子治療ベクターが提供される。幾つかの実施形態では、ペプチドは、バリアントＩＧＦ２（ｖＩＧＦ２）ペプチドである。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１と少なくとも９０％同一であり、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、５５位、及び６５位からなる群から選択される１つ以上の位置での少なくとも１つの置換を有するアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも１つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、及びＫ６５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、５５位、６５位からなる群から選択される２つ以上の位置での少なくとも２つの置換を含む。幾つかの実施形態では、少なくとも２つの置換は、配列番号１のＥ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、Ｋ６５Ｒからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号１の１〜４位のＮ末端欠失を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、天然のＩＧＦ２ペプチドと比較してインスリン受容体及びＩＧＦ１Ｒに対する減少した親和性を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、細胞への治療タンパク質の取り込みを促進することができる。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、リソソームへの治療タンパク質の取り込みを促進することができる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、遺伝的障害を有する対象において当該遺伝的障害に関連する不完全なタンパク質または欠損したタンパク質の代わりとなることができる。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）、及び神経セロイドリポフスチン症からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ポンペ病である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ＣＬＮ１病である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、可溶性リソソーム酵素またはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、リソソーム酵素またはその酵素的に活性な断片を含み、ここで、リソソーム酵素は、α−ガラクトシダーゼＡ、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、サイクリン依存性キナーゼ様５、及びα−グルコシダーゼからなる群から選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼまたはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ−１またはその酵素的に活性な断片である。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、翻訳開始配列を更に含む。幾つかの実施形態では、翻訳開始配列は、コザック配列を含む。幾つかの実施形態では、核酸構築物は、シグナルペプチドであって、当該シグナルペプチドを有さない治療タンパク質と比較して治療タンパク質の分泌を増加させることができる当該シグナルペプチドをコードする核酸配列を更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドから選択される。幾つかの実施形態では、ＢｉＰシグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、配列番号３１の配列を含む。幾つかの実施形態では、構築物は、配列番号３６を含む。幾つかの実施形態では、ポリペプチドは、配列番号２３を含む。幾つかの実施形態では、構築物は、配列番号３８を含む。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２は、ポリペプチドのＮ末端に存在する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２は、ポリペプチドのＣ末端に存在する。幾つかの実施形態では、リンカーペプチドは、配列番号１８〜２１または配列番号３３を含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療ベクターは、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノウイルスベクター、及びヘルペスウイルスベクターからなる群から選択されるウイルスベクターである。
【００１４】
ある種の態様では、バリアントＩＧＦ２ペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質などの融合タンパク質が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７、本明細書において「２ＧＳ」とも称される）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を含む核酸によってコードされる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、コザック配列を含む核酸によってコードされる。
【００１５】
更なる態様では、シグナルペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質であって、当該シグナルペプチドが、翻訳後、細胞からの分泌の際に除去される、当該融合タンパク質が提供される。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を含む核酸によってコードされる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、コザック配列を含む核酸によってコードされる。
【００１６】
更なる態様では、治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸配列であって、当該融合タンパク質が、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を含む核酸によってコードされる、当該核酸配列が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、コザック配列を含む核酸によってコードされる。
【００１７】
更なる態様では、治療タンパク質を含む融合タンパク質であって、コザック配列を含む核酸によってコードされる当該融合タンパク質が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を含む核酸によってコードされる。
【００１８】
更なる態様では、バリアントＩＧＦ２ペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸などの融合タンパク質をコードする核酸が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含��。
【００１９】
更なる態様では、シグナルペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸が提供される。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。
【００２０】
更なる態様では、治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該核酸が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む��
【００２１】
更なる態様では、治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コザック配列を更に含む当該核酸が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。
【００２２】
更なる態様では、（ａ）バリアントＩＧＦ２ペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチ��イルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。
【００２３】
更なる態様では、（ａ）シグナルペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物が提供される。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチ��イルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。
【００２４】
更なる態様では、（ａ）治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；及び（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物であって、当該核酸がコオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む、当該組成物が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス��アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。
【００２５】
更なる態様では、（ａ）治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；及び（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物であって、当該核酸がコザック配列を更に含む、当該組成物が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス��アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。
【００２６】
更なる態様では、（ａ）バリアントＩＧＦ２ペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロ��イルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、個体由来の細胞がエクスビボで処理され、エクスビボでの処理後に個体に投与される。
【００２７】
更なる態様では、（ａ）シグナルペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法が提供される。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロ��イルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、個体由来の細胞がエクスビボで処理され、エクスビボでの処理後に個体に投与される。
【００２８】
更なる態様では、（ａ）治療タンパク質及び標的化ペプチドを含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法であって、当該核酸がコオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該方法が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター��に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、個体由来の細胞がエクスビボで処理され、エクスビボでの処理後に個体に投与される。
【００２９】
更なる態様では、（ａ）治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸；及び（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法であって、当該核酸がコザック配列を更に含む当該方法が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイ��スコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、個体由来の細胞がエクスビボで処理され、エクスビボでの処理後に個体に投与される。
【００３０】
更なる態様では、バリアントＩＧＦ２ペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸を含む細胞を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、��たはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、細胞は、個体に由来する。
【００３１】
更なる態様では、シグナルペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸を含む細胞を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法が提供される。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、��たはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、細胞は、個体に由来する。
【００３２】
更なる態様では、治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸を含む細胞を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法であって、当該核酸がコオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該方法が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コザック配列を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウ��ルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、リポソーム、ナノ粒子、または細胞貫通ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、細胞は、個体に由来する。
【００３３】
更なる態様では、治療タンパク質を含む融合タンパク質をコードする核酸を含む細胞を投与することを含む、個体の遺伝的障害を処置する方法であって、当該核酸がコザック配列を更に含む当該方法が提供される。幾つかの実施形態では、核酸は、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカーを更に含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。幾つかの実施形態では、リンカーは、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）、ＧＧＧＧＳ（配列番号１９）、ＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２０）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＳ（配列番号２１）、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号３７）、またはＧＧＳＧＳＧＳＴＳ（配列番号３３）のアミノ酸配列を含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、シグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチドを含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、バリアントＩＧＦ２ペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−ガラクトシダーゼ（ＡまたはＢ）、β−ガラクトシダーゼ、β−ヘキソサミニダーゼ（ＡまたはＢ）、ガラクトシルセラミダーゼ、アリルスルファターゼ（ＡまたはＢ）、β−グルコセレブロシダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、リソソーム酸性リパーゼ、リソソーム酵素である酸性スフィンゴミエリナーゼ、ホルミルグリシン生成酵素、イズロニダーゼ（例えば、α−Ｌ）、アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドＮ−アセチルトランスフェラーゼ、グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）、ヘパランＮ−スルファターゼ、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）、イズロン酸−２−スルファターゼ、ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ、Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ、グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ、β−グルクロニダーゼ、ヒアルロニダーゼ、α−Ｎ−アセチルノイラミニダーゼ（シアリダーゼ）、ガングリオシドシアリダーゼ、ホスホトランスフェラーゼ、α−グルコシダーゼ、α−Ｄ−マンノシダーゼ、β−Ｄ−マンノシダーゼ、アスパルチルグルコサミニダーゼ、α−Ｌ−フコシダーゼ、バッテニン（ｂａｔｔｅｎｉｎ）、パルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ、及び他のバッテン病関連タンパク質（例えば、セロイドリポフスチン症神経タンパク質６）、またはそれらの酵素的に活性な断片からなる群のうちの少なくとも１つの酵素を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、α−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、Ｎ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ＮＡＧＬＵ）である。幾つかの実施形態では、核酸は、プロモーターを更に含む。幾つかの実施形態では、核酸は、ウイルスベクター内に含まれる。幾つかの実施形態では、ウイルスベクターは、レトロウイルス、アデノウ��ルス、アデノ随伴ウイルス、レンチウイルス、またはヘルペスウイルスを含む。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤。幾つかの実施形態では、遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤は、ウイルスコートタンパク質を含む。幾つかの実施形態では、ウイルスコートタンパク質は、水疱性口炎ウイルスコートタンパク質、アデノウイルスコートタンパク質、アデノ随伴ウイルスコートタンパク質、マウス白血病ウイルスコートタンパク質、ＨＩＶコートタンパク質、及びインフルエンザウイルスコートタンパク質からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、シンドラー病ＩＩ型、アデノシンデアミナーゼ欠損重症複合免疫不全症（ＡＤＡ−ＳＣＩＤ）、及び慢性肉芽腫症（ＣＧＤ）からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、細胞は、個体に由来する。
【００３４】
更に本明細書において、天然のシグナルペプチド、ＥＲタンパク質切断ドメイン、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質であって、コザック配列を含む核酸によってコードされる当該融合タンパク質が提供される。
【００３５】
加えて、本明細書において、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及びα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質であって、コザック配列を含む核酸によってコードされる当該融合タンパク質が提供される。
【００３６】
加えて、本明細書において、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質であって、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を含む核酸によってコードされる当該融合タンパク質が提供される。
【００３７】
加えて、本明細書において、天然のシグナルペプチド、ＥＲタンパク質切断ドメイン、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸が提供される。
【００３８】
加えて、本明細書において、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コザック配列を更に含む当該核酸が提供される。
【００３９】
加えて、本明細書において、バリアントＩＧＦ２ペプチド及びα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該核酸が提供される。
【００４０】
加えて、本明細書において、（ａ）天然のシグナルペプチド、ＥＲタンパク質切断ドメイン、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物が提供される。
【００４１】
加えて、本明細書において、（ａ）結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コザック配列を更に含む当該核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物が提供される。
【００４２】
加えて、本明細書において、（ａ）バリアントＩＧＦ２ペプチド及びα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物が提供される。
【００４３】
加えて、本明細書において、（ａ）天然のシグナルペプチド、ＥＲタンパク質切断ドメイン、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体のポンペ病を処置する方法が提供される。
【００４４】
加えて、本明細書において、（ａ）結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コザック配列を更に含む当該核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体のポンペ病を処置する方法が提供される。
【００４５】
加えて、本明細書において、（ａ）バリアントＩＧＦ２ペプチド及びα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該核酸；ならびに（ｂ）遺伝子治療に好適な緩衝液または賦形剤、を含む組成物を投与することを含む、個体のポンペ病を処置する方法が提供される。
【００４６】
加えて、本明細書において、天然のシグナルペプチド、ＥＲタンパク質切断ドメイン、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及び天然のシグナルペプチドを欠くα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸を含む細胞を投与することを含む、個体のポンペ病を処置する方法が提供される。
【００４７】
加えて、本明細書において、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、バリアントＩＧＦ２ペプチド、及びα−グルコシダーゼまたはその酵素的に活性な断片を含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コザック配列を更に含む当該核酸を含む細胞を投与することを含む、個体のポンペ病を処置する方法が提供される。
【００４８】
加えて、本明細書において、バリアントＩＧＦ２ペプチド及びα−グルコシダーゼを含む融合タンパク質をコードする核酸であって、コオロギ麻痺ウイルス内部リボソーム進入配列（ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ）を更に含む当該核酸を含む細胞を投与することを含む、個体のポンペ病を処置する方法が提供される。
【００４９】
参照による組み込み
本明細書に記載の全ての刊行物、特許、及び特許出願は、各個別の刊行物、特許、または特許出願が参照により組み込まれることが具体的に、かつ個々に示されているかのような程度まで、参照により本明細書に組み込まれる。
【００５０】
特許出願ファイルは、少なくとも１つのカラーで製作された図面を含む。カラー図面（複数可）を有する本特許出願のコピーは、要請及び必要な手数料の支払いに応じて、特許庁により提供される。本開示の特徴及び効果は、本開示の原理が利用される例示的実施形態を記載している以下の発明を実施するための形態、及び以下の添付の図面を参照することにより理解されよう。
【図面の簡単な説明】
【００５１】
【図１】Ｍ６Ｐを有する及び有さないアルグルコシダーゼ−αであるｒｈＧＡＡのＧＡＡ活性を示す。図１は、ＣＩ−ＭＰＲに結合することができる市販のＥＲＴの割合を示す。第１のピークは、Ｍ６Ｐを含有する任意のグリカンを欠くｒｈＧＡＡであり、従って、取り込まれ、リソソームに送達されることが不可能である。第２のピークは、少なくとも１つのリン酸化グリカンを含有する画分であり、細胞に取り込まれ、グリコーゲンの加水分解のためにリソソームに送達される可能性を有する。
【図２】ＩＧＦ２ならびにモノ及びビスリン酸化オリゴ糖に対する異なる結合ドメインを含むＣＩ−ＭＰＲの構造を示す。
【図３】成熟ヒトＩＧＦ２ペプチドの配列及び構造を示す。部位特異的アミノ酸置換は、他の受容体の結合に影響を及ぼすことが提唱されている。
【図４】表面プラズモン共鳴によって測定される野生型ＩＧＦ２（ｗｔＩＧＦ２）ペプチドのＣＩ−ＭＰＲへの結合を示す。
【図５】表面プラズモン共鳴によって測定されるバリアントＩＧＦ２（ｖＩＧＦ２）ペプチドのＣＩ−ＭＰＲへの結合を示す。
【図６】ＩＧＦ２／ＣＩ−ＭＰＲへの結合を増加させるためにｖＩＧＦ２をアルグルコシダーゼαに追加することの利点を示す。
【図７】ＩＧＦ２／ＣＩ−ＭＰＲへの結合を増加させるためにｖＩＧＦ２を組換えヒトＮ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ｒｈＮＡＧＬＵ）に追加することの利点を示す。
【図８】野生型ヒトＩＧＦ２のインスリン受容体への結合を示す。
【図９】ｖＩＧＦ２のインスリン受容体への検出可能な結合を示さない。
【図１０】野生型ＩＧＦ２のインスリン様増殖因子１受容体への結合を示す。
【図１１】ｖＩＧＦ２ペプチドのインスリン様増殖因子１受容体への野生型ＩＧＦ２と比較して減少した結合を示す。
【図１２】天然のｈＧＡＡ及び改変されたｈＧＡＡをコードする遺伝子治療発現カセットの２つの例を示す。天然のｈＧＡＡは、不十分なリン酸化を有し、これにより、不十分なＣＩＭＰＲ結合及び細胞取り込みをもたらす。改変されたｈＧＡＡは、改善されたＣＩＭＰＲ結合のために追加されたエレメント（ｖＩＧＦ２）、ｖＩＧＦ２−ＧＡＡタンパク質のＣＩＭＰＲとの立体障害を低減する２ＧＳリンカー、及び分泌を改善するためのＢｉＰシグナルペプチドを有する。
【図１３】組換えヒトＰＰＴ１（ＰＰＴ１−１）を発現する細胞、ｖＩＧＦ２標的化ドメインを有する組換えヒトＰＰＴ１（ＰＰＴ１−２）を発現する細胞、ならびにｖＩＧＦ２標的化ドメイン及びＢｉＰシグナル配列を有する組換えヒトＰＰＴ１（ＰＰＴ１−２９）を発現する細胞由来のＰＰＴ１のウエスタンブロットを示す。
【図１４】ＰＰＴ１構築物のＣＩ−ＭＰＲへの結合を示す。
【図１５】改変されたｈＧＡＡまたは天然のｈＧＡＡを発現するＣＨＯ細胞の馴化培地のＧＡＡ活性を示す。
【図１６】ＧＡＡノックアウトマウスでの遺伝子治療の４週間のマウス研究の研究デザインを示す。
【図１７】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの血漿ＧＡＡ活性を示す。
【図１８】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスにおいて測定されたＧＡＡレベルを示す。
【図１９】示されるように処置されたマウスから得られた血漿試料由来のｒｈＧＡＡの細胞表面受容体結合を示す。
【図２０】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの前脛骨筋のＧＡＡ活性及び四頭筋グリコーゲン／組織病理診断スコアを示す。
【図２１】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの前脛骨筋のグリコーゲン（ＰＡＳ）染色を示す。
【図２２】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの前脛骨筋のｈＧＡＡ免疫組織染色を示す。
【図２３】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの脳及び脊髄の脳ＧＡＡ活性、脳グリコーゲン、及び脊髄グリコーゲン／組織病理診断スコアを示す。
【図２４】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの脳のグリコーゲン（ＰＡＳ）染色を示す。
【図２５】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの脳幹及び脈絡叢のｈＧＡＡ免疫組織染色を示す。
【図２６】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの脊髄のグリコーゲン（ＰＡＳ）染色を示す。
【図２７】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの脊髄のｈＧＡＡ免疫組織染色を示す。
【図２８】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの四頭筋のＧＡＡ活性及びグリコーゲン／組織病理診断スコア化を示す。
【図２９】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの四頭筋のグリコーゲン（ルクソール／ＰＡＳ）染色を示す。
【図３０】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの四頭筋のｈＧＡＡ免疫組織染色を示す。
【図３１】無処置の野生型（「正常」）マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの三頭筋のＧＡＡ活性及び組織病理診断スコア化を示す。
【図３２】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの三頭筋のグリコーゲン（ルクソール／ＰＡＳ）染色を示す。
【図３３】無処置の野生型マウスまたは示されるように遺伝子治療ベクターもしくはビヒクルを投与されたＧＡＡノックアウトマウスの三頭筋のｈＧＡＡ免疫組織染色を示す。
【発明を実施するための形態】
【００５２】
単一遺伝子による遺伝的障害の遺伝子治療は、幾つかは幼い時に現れ得る悲惨な症状を有し、場合により、生涯にわたる能力障害をもたらす疾患または障害の有望な１回限りの処置を提供する。リソソーム貯蔵障害などの遺伝的神経障害は、多くの場合、疾患または障害状態において不完全であるか、または欠損しているタンパク質の活性型である治療タンパク質を患者に投与する酵素補充療法で処置される。しかしながら、現行の治療法には、頻繁な処置、治療タンパク質に対する免疫反応の発生、及び治療タンパク質を患部組織、細胞、または細胞内区画に標的化することの困難さを含む課題がある。遺伝子治療は、処置の回数の減少及び持続性の効能を含む利点を提供する。
【００５３】
本明細書において、より多くの治療タンパク質をそれが必要とされる所に提供し、これにより、処置の有効性を改善するなどの改善を遺伝子治療に提供する、遺伝子治療ベクターのための構成要素が提供される。本明細書において、かかる課題は、治療タンパク質の発現及び細胞取り込みまたは送達及び細胞内または細胞小器官標的化を改善することによって対処される。本明細書において提供される具体的なツールまたは構成要素としては、分泌を増加させるためのシグナルペプチド（例えば、結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチド）及び治療タンパク質のエンドサイトーシスを増加させるペプチド（例えば、細胞取り込み及びリソソーム送達を増加させるための、ＣＩ−ＭＰＲに高親和性で結合するペプチド）が挙げられるが、これらに限定されない。かかるペプチドは、遺伝子治療ベクターによりコードされる治療タンパク質に融合される。幾つかの実施形態では、ペプチドは、ＩＧＦ２（インスリン様増殖因子２）ペプチドまたはそのバリアントである。本明細書において提供される遺伝子治療ベクターは、幾つかの実施形態では、遺伝子治療の有効性を最適化するための、ＣＩ−ＭＰＲに高親和性で結合するペプチドに融合された治療タンパク質をコードする核酸を含むことが意図される。
【００５４】
酵素補充遺伝子治療のための遺伝子治療構築物が設計された。コザック配列またはＣｒＰＶ  ＩＲＥＳなどのＩＲＥＳ配列が挙げられるが、これらに限定されない、構築物の５’末端に存在する翻訳開始配列、続いて、ＧＡＡシグナルペプチドのうちの１つ以上から選択されるシグナルペプチドをコードする核酸、アンチトリプシンインヒビターをコードする核酸、及びＢｉＰ配列をコードする核酸。これらに続いて、ｖＩＧＦ−２、ＨＩＲＭａｂ、もしくはＴｆＲＭａｂ、または他の細胞標的化ペプチドもしくはタンパク質であり得る細胞標的化ドメインをコードする核酸が含まれる。遺伝子治療構築物は、リンカーをコードする核酸及び補正酵素またはその酵素的に活性な断片をコードする核酸を更に含み、ここで、当該リンカーは、細胞標的化ドメインを当該補正酵素またはその酵素的に活性な断片に連結している。好適な補正酵素としては、α−グルコシダーゼ（ＧＡＡ）、α−ガラクトシダーゼ（ＧＬＡ）、イズロニダーゼ（ＩＤＵＡ）、イズロン酸−２−スルファターゼ（ＩＤＳ）、ＰＰＴ１、またはこれらの酵素的に活性な断片、及び個体において欠損していることが発見された他の酵素が挙げられるが、これに限定されない。
【００５５】
治療タンパク質の細胞内標的化
ほとんどのリソソームタンパク質のＮ結合糖鎖は、マンノース６−リン酸（Ｍ６Ｐ）と称される特殊な糖鎖構造を含有するように修飾される。Ｍ６Ｐは、膜結合型Ｍ６Ｐ受容体を介したリソソームタンパク質のリソソームへの輸送を可能にする生物学的シグナルである。リソソーム貯蔵障害の酵素補充療法は、治療タンパク質のリソソームへの取り込み及び送達のためにＭ６Ｐ受容体を利用する。Ｃｅｒｅｚｙｍｅ（登録商標）及び組換えヒトＧＣａｓｅの他のバージョンが含まれる、Ｍ６Ｐ受容体を利用しないある種の治療薬は、タンパク質のグリカン上の末端マンノースに結合することが可能なマンノース受容体を利用し、リソソームに送達する。ある種の酵素補充治療薬が直面している問題は、酵素治療薬に存在するＭ６Ｐの量が少ないことにより、治療効果を達成するためにより高用量を必要とすることである。これにより、注入時間がかなり長くなり、治療薬に対する免疫反応が生じる確率が高くなり、薬物の需要が高くなり、タンパク質の製造の増加が必要となり、これにより、コストの増加をもたらされる。
【００５６】
ＣＩ−ＭＰＲは、血液循環からＭ６Ｐ含有リソソーム酵素を捕捉する。この受容体は、Ｍ６Ｐ及びインスリン様増殖因子に対する異なる結合ドメイン（ドメイン１〜３及び７〜９、図２を参照のこと）を有し、従って、ＩＧＦ２／マンノース６−リン酸受容体またはＩＧＦ２／ＣＩ−ＭＰＲとしても知られている。この受容体は、Ｍ６ＰまたはＩＧＦ２またはＩＧＦ２バリアントを含有する酵素補充治療薬を標的化するために利用され得る。インスリン様増殖因子を含むこれらのリガンドに対するこの受容体の結合親和性を、表１に提供する。注目すべきことに、ＩＧＦ２ペプチドは、モノまたはビスリン酸化オリゴ糖より高い、ＣＩ−ＭＰＲに対する結合親和性を有する。
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【００５７】
遺伝子治療のための治療融合タンパク質
本明細書において、遺伝子治療ベクターから産生される治療融合タンパク質が提供される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、融合タンパク質をコードする遺伝子治療ベクターを形質導入された細胞により分泌される。幾つかの実施形態では、形質導入された細胞は、組織または器官（例えば、肝臓）内に存在する。細胞から分泌されると、融合タンパク質は患者の血管系によって輸送され、関心対象の組織に到達する。幾つかの実施形態では、治療融合タンパク質は、改善された分泌を有するように改変される。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、対応する治療タンパク質または治療タンパク質を含むが、シグナルペプチドを欠く融合タンパク質と比較して、分泌レベルを改善するためのシグナルペプチドを含む。
【００５８】
幾つかの実施形態では、提供される遺伝子治療ベクターは、治療タンパク質の送達に関する遺伝子治療に伴う問題に対処するように改変される。例えば、一部の例では、例えば、治療タンパク質の必要とされる部位への分配を妨げる物理的及び／または生物学的バリアにより、不十分な量の治療タンパク質が治療タンパク質を必要とする細胞に送達される場合、遺伝子治療は、患者の身体内で十分な量の治療タンパク質を生成するだけで意図した処置を達成しない場合がある。従って、たとえ遺伝子治療が、高濃度の治療タンパク質で血液または組織を飽和点まで氾濫させることができても、遺伝子治療は十分な治療効果がない場合がある。加えて、思わしくないクリアランス経路により、大部分の治療タンパク質が除去され得る。たとえ治療タンパク質が血管系から組織（例えば、筋繊維）内の間隙に輸送されても、適切な治療効果は保証されない。リソソーム貯蔵障害の効果的な処置のためには、意味のある有効性をもたらすために、治療上有効量の治療タンパク質が、細胞のエンドサイトーシス及びリソソーム送達を経なければならない。本開示は、処置のための治療タンパク質の標的細胞へのエンドサイトーシスを可能にし、これにより、効果的な処置をもたらすペプチドを含む融合タンパク質をコードする遺伝子治療ベクターを提供することによって、これらの問題に取り組む。幾つかの実施形態では、エンドサイトーシスを可能にするペプチドは、ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドである。幾つかの実施形態では、ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドは、ｖＩＧＦ２ペプチドである。
【００５９】
本明細書において、処置のための治療タンパク質の標的細胞へのエンドサイトーシスを可能にするペプチドを含む融合タンパク質をコードする遺伝子治療ベクターが提供される。幾つかの実施形態では、遺伝子治療ベクターは、治療タンパク質及びＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドを含む融合タンパク質をコードする。かかる融合タンパク質は、遺伝子治療ベクターから発現された際、酵素補充治療薬などの治療タンパク質をそれらが必要とされる細胞に標的化し、かかる細胞への送達またはかかる細胞による細胞取り込みを増加させ、治療タンパク質を細胞内位置（例えば、リソソーム）に標的化する。幾つかの実施形態では、ペプチドはＩＧＦ２ペプチドまたはそのバリアントであり、これらは治療タンパク質をリソソームに標的化することができる。幾つかの実施形態では、本明細書における融合タンパク質は、分泌を増加させるシグナルペプチド、例えば、ＢｉＰシグナルペプチドまたはＧａｕｓｓｉａシグナルペプチドも更に含む。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、リンカー配列を含む。幾つかの実施形態では、本明細書における融合タンパク質をコードする核酸は、内部リボソーム進入配列を含む。
【００６０】
本明細書において、ｖＩＧＦ２ペプチドを含む遺伝子治療用の治療タンパク質が提供される。例示的なタンパク質を以下の表２で提供する。
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【００６１】
本明細書において提供される融合タンパク質の構成要素を以下に更に記載する。
【００６２】
ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチド（例えば、ｖＩＧＦ２ペプチド）
本明細書において、ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドが提供される。かかるペプチド及び治療タンパク質を含む融合タンパク質は、遺伝子治療ベクターから発現された際、治療タンパク質をそれが必要とされる細胞に標的化し、かかる細胞による細胞取り込みを増加させ、治療タンパク質を細胞内位置（例えば、リソソーム）に標的化する。幾つかの実施形態では、ペプチドは、治療ペプチドのＮ末端に融合される。幾つかの実施形態では、ペプチドは、治療タンパク質のＣ末端に融合される。幾つかの実施形態では、ペプチドは、ｖＩＧＦ２ペプチドである。一部のｖＩＧＦ２ペプチドは、ＣＩ−ＭＰＲに対する高親和性の結合を維持する一方で、それらのＩＧＦ１受容体、インスリン受容体、及びＩＧＦ結合タンパク質（ＩＧＦＢＰ）に対する親和性は、減少しているか、または除去されている。従って、一部のバリアントＩＧＦ２ペプチドは、ｗｔ  ＩＧＦ２と比較して、実質的により選択的であり、低減された安全性リスクを有する。本明細書におけるｖＩＧＦ２ペプチドとしては、配列番号３１のアミノ酸配列を有するものが挙げられる。バリアントＩＧＦ２ペプチドとしては、ｗｔ  ＩＧＦ２（配列番号１）と比較して、６位、２６位、２７位、４３位、４８位、４９位、５０位、５４位、５５位、または６５位に異なるアミノ酸を有するものが更に挙げられる。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｅ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、Ｌ５５Ｒ、及びＫ６５Ｒからなる群から選択される１つ以上の置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｅ６Ｒの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｆ２６Ｓの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｙ２７Ｌの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｖ４３Ｌの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｆ４８Ｔの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｒ４９Ｓの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｓ５０Ｉの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ａ５４Ｒの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｌ５５Ｒの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｋ６５Ｒの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｅ６Ｒ、Ｆ２６Ｓ、Ｙ２７Ｌ、Ｖ４３Ｌ、Ｆ４８Ｔ、Ｒ４９Ｓ、Ｓ５０Ｉ、Ａ５４Ｒ、及びＬ５５Ｒの置換を有する配列を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、Ｎ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、１アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、２アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、３アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、４アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、４アミ��酸のＮ末端欠失ならびにＥ６Ｒ、Ｙ２７Ｌ、及びＫ６５Ｒの置換を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、４アミノ酸のＮ末端欠失ならびにＥ６Ｒ及びＹ２７Ｌの置換を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、５アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、６アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、７アミノ酸のＮ末端欠失を有する。幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２ペプチドは、７アミノ酸のＮ末端欠失ならびにＹ２７Ｌ及びＫ６５Ｒの置換を有する。
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【００６３】
内部リボソーム進入配列
本明細書において、翻訳開始のボトルネックを回避することによって遺伝子発現を増加させるための内部リボソーム進入配列（ＩＲＥＳ）を更に含む、障害を治療するのに有用な遺伝子治療構築物が提供される。遺伝子治療のために発現を最適化するのに好適な内部リボソーム進入配列としては、コオロギ麻痺ウイルス（ＣｒＰＶ）ＩＲＥＳ、ピコルナウイルスＩＲＥＳ、アフトウイルスＩＲＥＳ、カポジ肉腫関連ヘルペスウイルスＩＲＥＳ、Ａ型肝炎ＩＲＥＳ、Ｃ型肝炎ＩＲＥＳ、ペスチウイルスＩＲＥＳ、クリパウイルス（Ｃｒｉｐａｖｉｒｕｓ）ＩＲＥＳ、Ｒｈｏｐａｌｏｓｉｐｈｕｍ  ｐａｄｉウイルスＩＲＥＳ、マレック病ウイルスＩＲＥＳ、及び他の好適なＩＲＥＳ配列が挙げられるが、これらに限定されない。幾つかの実施形態では、遺伝子治療構築物は、ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳを含む。幾つかの実施形態では、ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳは、ＡＡＡＡＡＴＧＴＧＡＴＣＴＴＧＣＴＴＧＴＡＡＡＴＡＣＡＡＴＴＴＴＧＡＧＡＧＧＴＴＡＡＴＡＡＡＴＴＡＣＡＡＧＴＡＧＴＧＣＴＡＴＴＴＴＴＧＴＡＴＴＴＡＧＧＴＴＡＧＣＴＡＴＴＴＡＧＣＴＴＴＡＣＧＴＴＣＣＡＧＧＡＴＧＣＣＴＡＧＴＧＧＣＡＧＣＣＣＣＡＣＡＡＴＡＴＣＣＡＧＧＡＡＧＣＣＣＴＣＴＣＴＧＣＧＧＴＴＴＴＴＣＡＧＡＴＴＡＧＧＴＡＧＴＣＧＡＡＡＡＡＣＣＴＡＡＧＡＡＡＴＴＴＡＣＣＴＧＣＴ（配列番号１２）の核酸配列を有する。幾つかの実施形態では、ＣｒＰＶ  ＩＲＥＳ配列は、配列番号１２と少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％同一である。
【００６４】
シグナルペプチド
幾つかの実施形態では、本明細書において提供される遺伝子治療構築物は、遺伝子治療構築物で形質導入された細胞からの治療タンパク質の分泌を改善するシグナルペプチドを更に含む。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、治療タンパク質のタンパク質プロセシングを改善し、新生ポリペプチド−リボソーム複合体のＥＲへの移動を促進し、適切な翻訳時修飾及び翻訳後修飾を確実にする。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、（ｉ）シグナル翻訳開始配列の上流位置、（ｉｉ）翻訳開始配列と治療タンパク質との間、または（ｉｉｉ）治療タンパク質の下流位置に存在する。遺伝子治療構築物に有用なシグナルペプチドとしては、ＨＳＰ７０タンパク質ファミリー（例えば、ＨＳＰＡ５、熱ショックタンパク質ファミリーＡメンバー５）の結合免疫グロブリンタンパク質（ＢｉＰ）シグナルペプチド、及びＧａｕｓｓｉａシグナルペプチド、ならびにこれらのバリアントが挙げられるが、これらに限定されない。これらのシグナルペプチドは、シグナル認識粒子に対する極めて高い親和性を有する。ＢｉＰ及びＧａｕｓｓｉａのアミノ酸配列の例を以下の表５に提供する。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択される配列と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を有する。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号１３〜１７からなる群から選択される配列と、５アミノ酸以下、４アミノ酸以下、３アミノ酸以下、２アミノ酸以下、または１アミノ酸異なる。
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【００６５】
ＢｉＰシグナルペプチド−シグナル認識粒子（ＳＲＰ）相互作用は、ＥＲへの移動を促進する。この相互作用を図２０に示す。
【００６６】
Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、Ｇａｕｓｓｉａ  ｐｒｉｎｃｅｐｓのルシフェラーゼに由来し、このシグナルペプチドに融合された治療タンパク質のタンパク質合成及び分泌の増加を導く。幾つかの実施形態では、Ｇａｕｓｓｉａシグナルペプチドは、配列番号３２と少なくとも９０％同一なアミノ酸配列を有する。幾つかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号３２と、５アミノ酸以下、４アミノ酸以下、３アミノ酸以下、２アミノ酸以下、または１アミノ酸異なる。
【００６７】
リンカー
幾つかの実施形態では、本明細書において提供される遺伝子治療構築物は、標的化ペプチドと治療タンパク質との間にリンカーを含む。幾つかの実施形態では、かかるリンカーは、正しい間隔を維持し、ｖＩＧＦ２ペプチドと治療タンパク質との間の立体的な衝突を軽減する。幾つかの実施形態では、リンカーは、反復するグリシン残基、反復するグリシン−セリン残基、及びこれらの組み合わせを含む。幾つかの実施形態では、リンカーは、５〜２０アミノ酸、５〜１５アミノ酸、５〜１０アミノ酸、８〜１２アミノ酸、または約５、６、７、８、９、１０、１１、１２、もしくは１３アミノ酸から構成される。本明細書における遺伝子治療構築物に好適なリンカーとしては、以下の表６に提供されるものが挙げられるが、これらに限定されない。
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【００６８】
翻訳開始配列
本明細書において提供される遺伝子治療構築物は、コザック配列などのｍＲＮＡ翻訳の開始を助ける翻訳開始配列を有する核酸を含む。本明細書において意図されるコザック配列は、（ｇｃｃ）ＲｃｃＡＴＧＧ（配列番号２７）のコンセンサス配列を有し、ここで、小文字はこの位置で最もよく見られる塩基を意味し、この塩基は一様でなく、大文字はごくまれにしか変化しない高度に保存された塩基を示す。Ｒは、プリン（アデニンまたはグアニン）がその位置で常に観察されることを示す。括弧（ｇｃｃ）の配列は意義不明である。幾つかの実施形態では、コザック配列は、配列ＡＸ１Ｘ２ＡＴＧＡ（配列番号２８）を含み、ここで、Ｘ１及びＸ２の各々は任意のヌクレオチドである。幾つかの実施形態では、Ｘ１は、Ａを含む。幾つかの実施形態では、Ｘ２は、Ｇを含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）の配列と、１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、本明細書において提供されるコザック配列は、ＡＡＧＡＴＧＡ（配列番号２９）の配列を有する。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＧＣＡＡＧＡＴＧ（配列番号４４）を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）と少なくとも８５％同一な核酸配列を含む。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）の配列と１または２ヌクレオチド異なる。幾つかの実施形態では、コザック配列は、ＣＡＣＣＡＴＧ（配列番号４７）を含む。
【００６９】
治療タンパク質
本明細書において提供される遺伝子治療構築物は、個体におけるタンパク質の非存在または不完全なタンパク質をもたらす遺伝的欠陥に起因する遺伝的障害を処置するための治療タンパク質をコードする核酸を含む。遺伝子治療構築物から発現される治療タンパク質は、存在しないか、または不完全なタンパク質の代わりとなる。従って、治療タンパク質は、個体における処置を必要とする遺伝的欠陥に基づいて選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、構造タンパク質である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、酵素である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、調節タンパク質である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、受容体である。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、ペプチドホルモンである。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、サイトカインまたはケモカインである。
【００７０】
幾つかの実施形態では、本明細書における遺伝子治療構築物は、リソソーム貯蔵障害を有する個体において遺伝的欠陥を有する酵素などの酵素をコードする。幾つかの実施形態では、遺伝子治療構築物は、リソソーム酵素、例えば、グリコシダーゼ、プロテアーゼ、またはスルファターゼをコードする。幾つかの実施形態では、本明細書において提供される遺伝子治療構築物によりコードされる酵素としては、α−Ｄ−マンノシダーゼ；Ｎ−アスパルチル−β−グルコサミニダーゼ；β−ガラクトシダーゼ；セラミダーゼ；フコシダーゼ；ガラクトセレブロシダーゼ；アリルスルファターゼＡ；Ｎ−アセチルグルコサミン−１−ホスホトランスフェラーゼ；イズロン酸スルファターゼ；Ｎ−アセチルグルコサミニダーゼ；アセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドアセチルトランスフェラーゼ；Ｎーアセチルグルコサミン６−スルファターゼ；β−グルクロニダーゼ；ヒアルロニダーゼ；シアリダーゼ；スルファターゼ；スフィンゴミエリナーゼ；酸性β−マンノシダーゼ；カテプシンＫ；３−ヘキソサミニダーゼＡ；β−ヘキソサミニダーゼＢ；α−Ｎ−アセチルガラクトサミニダーゼ；シアリン；ヘキソサミニダーゼＡ；β−グルコシダーゼ；α−イズロニダーゼ；α−ガラクトシダーゼＡ；β−グルコセレブロシダーゼ；リソソーム酸性リパーゼ；グリコサミノグリカンα−Ｌ−イズロノヒドロラーゼ（ｉｄｕｒｏｎｏｈｙｄｒｏｌａｓｅ）；イズロン酸−２−スルファターゼ；Ｎ−アセチルガラクトサミン−６−スルファターゼ；グリコサミノグリカンＮ−アセチルガラクトサミン４−スルファターゼ；α−グルコシダーゼ；ヘパランスルファミダーゼ；ＮＡＤＰＨオキシダーゼのｇｐ−９１サブユニット；アデノシンデアミナーゼ；サイクリン依存性キナーゼ様５；及びパルミトイル化タンパク質チオエステラーゼ１が挙げられるが、これらに限定されない。幾つかの実施形態では、本明細書において提供される遺伝子治療構築物によりコードされる酵素は、α−グルコシダーゼを含む。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、ＣＤＫＬ５欠乏障害、嚢胞性線維症、α及びβサラセミア、鎌形赤血球貧血、マルファン症候群、脆弱Ｘ症候群、ハンチントン病、ヘモクロマトーシス、先天性難聴（無症候性）、テイサックス病、家族性高コレステロール血症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、シュタルガルト病、アッシャー症候群、コロイデレミア、色盲、Ｘ連鎖性網膜分離症、血友病、ウィスコット・アルドリッチ症候群、Ｘ連鎖性慢性肉芽腫症、芳香族Ｌ−アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、劣性栄養障害性表皮水泡症、α１アンチトリプシン欠損症、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群（ＨＧＰＳ）、ヌーナン症候群、Ｘ連鎖性重症複合免疫不全症（Ｘ−ＳＣＩＤ）からなる群から選択される遺伝的障害に関連する。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、ＣＤＫＬ５、コネキシン２６、ヘキソサミニダーゼＡ、ＬＤＬ受容体、ジストロフィン、ＣＦＴＲ、β−グロブリン、ＨＦＥ、ハンチントン、ＡＢＣＡ４、ミオシンＶＩＩＡ（ＭＹＯ７Ａ）、Ｒａｂエスコートタンパク質−１（ＲＥＰ１）、環状ヌクレオチド依存性チャネルβ３（ＣＮＧＢ３）、レチノスキシン１（ＲＳ１）、ヘモグロビンサブユニットβ（ＨＢＢ）、第ＩＸ因子、ＷＡＳ、シトクロムＢ−２４５β鎖、ドーパ脱炭酸酵素（ＤＤＣ）、ＶＩＩ型コラーゲンα１鎖（ＣＯＬ７Ａ１）、セルピンファミリーＡメンバー１（ＳＥＲＰＩＮＡ１）、ＬＭＮＡ、ＰＴＰＮ１１、ＳＯＳ１、ＲＡＦ１、ＫＲＡＳ、及びＩＬ２受容体γ遺伝子からなる群から選択される。
【００７１】
遺伝子治療ベクターの例
【００７２】
遺伝子治療ベクター及び組成物
本明細書において、ＤＮＡなどの核酸がｖＩＧＦ２融合物などのシグナルペプチドを任意に有する治療融合タンパク質をコードする遺伝子治療ベクターが提供される。遺伝子治療ベクターは、内部リボソーム進入配列を任意に含む。レンチウイルスなどのレトロウイルスに由来するベクターは、それらが導入遺伝子の長期の安定した組込み及び娘細胞におけるその伝播を可能にするため、長期の遺伝子導入を達成するのに好適なツールである。レンチウイルス及びアデノ随伴ウイルスベクターは、マウス白血病ウイルスなどの腫瘍レトロウイルスに由来するベクターと比較して、それらが肝実質細胞及び神経細胞などの非増殖細胞に形質導入することができるという点で更なる利点を有する。それらは、免疫原性が低いという更なる利点も有する。
【００７３】
本明細書における例示的な遺伝子治療ベクターは、治療タンパク質及びｖＩＧＦ２ペプチドを含む治療融合タンパク質をコードする。例示的な融合タンパク質のアミノ酸配列をコードする核酸を以下の表７に提供する。
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【００７４】
幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２融合物またはシグナルペプチド融合物などの本明細書において提供される所望の治療融合タンパク質をコードし、内部リボソーム進入配列を任意に有する核酸を含むベクターは、アデノ随伴ウイルスベクター（Ａ５／３５）である。
【００７５】
幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２融合物などの所望の治療融合タンパク質をコードし、内部リボソーム進入配列を任意に有する核酸は、多数の種類のベクターにクローニングされる。例えば、幾つかの実施形態では、核酸は、プラスミド、ファージミド、ファージ誘導体、動物ウイルス、及びコスミドが含まれるが、これらに限定されないベクターにクローニングされる。特に関心対象となるベクターとしては、発現ベクター、複製ベクター、プローブ生成ベクター、及び配列決定ベクターが挙げられる。
【００７６】
更に、幾つかの実施形態では、ｖＩＧＦ２融合物またはシグナルペプチド融合物などの治療融合タンパク質をコードし、内部リボソーム進入配列を任意に有する発現ベクターは、ウイルスベクター形態で細胞に提供される。ウイルスベクター技術は、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，ｖｏｌｕｍｅｓ  １−４，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ、ならびにウイルス学及び分子生物学の他のマニュアルに記載されている。ベクターとして有用なウイルスとしては、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルス、及びレンチウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。一般に、好適なベクターは、少なくとも１種の生物において機能する複製開始点、プロモーター配列、便利な制限エンドヌクレアーゼ部位、及び１つ以上の選択マーカーを含有する（例えば、ＷＯ０１／９６５８４；ＷＯ０１／２９０５８；及び米国特許第６，３２６，１９３号）。
【００７７】
また本明細書において、遺伝子導入のための組成物及びシステムも提供される。多数のウイルスベースのシステムが、哺乳動物細胞への遺伝子導入のために開発されてきた。例えば、レトロウイルスは、遺伝子送達システムに便利なプラットフォームを提供する。幾つかの実施形態では、選択された遺伝子は、好適な技術を使用してベクターに挿入され、レトロウイルス粒子にパッケージングされる。次いで、組換えウイルスは、単離され、インビボまたはエクスビボで対象の細胞に送達される。多数のレトロウイルスシステムが遺伝子治療に好適である。幾つかの実施形態では、アデノウイルスベクターが使用される。多数のアデノウイルスベクターが遺伝子治療に好適である。幾つかの実施形態では、アデノ随伴ウイルスベクターが使用される。多数のアデノ随伴ウイルスが遺伝子治療に好適である。一実施形態では、レンチウイルスベクターが使用される。
【００７８】
本明細書において提供される遺伝子治療構築物は、ベクター（または遺伝子治療発現ベクター）であって、関心対象の遺伝子がクローニングされているか、または当該ベクターのヌクレオチド配列が関心対象の遺伝子の（構成的または幾つかの方法で調節された）発現を可能にするような様式で関心対象の遺伝子を含む、当該ベクターを含む。本明細書において提供されるベクター構築物は、関心対象の組織に送達することができ、関心対象の選択された組織における関心対象の遺伝子の発現を提供する任意の好適な遺伝子発現ベクターを含む。
【００７９】
幾つかの実施形態では、ベクターは、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターであり、これは、ＡＡＶベクターの血液脳関門を通過する能力及び神経組織の形質導入能力のためである。本明細書において提供される方法では、任意の血清型のＡＡＶを使用することが意図される。ある種の実施形態では、使用されるウイルスベクターの血清型は、ＡＡＶ１ベクター、ＡＡＶ２ベクター、ＡＡＶ３ベクター、ＡＡＶ４ベクター、ＡＡＶ５ベクター、ＡＡＶ６ベクター、ＡＡＶ７ベクター、ＡＡＶ８ベクター、ＡＡＶ９ベクター、ＡＡＶｒｈＳベクター、ＡＡＶｒｈ１０ベクター、ＡＡＶｒｈ３３ベクター、ＡＡＶｒｈ３４ベクター、ＡＡＶｒｈ７４ベクター、ＡＡＶ／Ａｎｃ８０ベクター、ＡＡＶＰＨＰ．Ｂベクター、ＡＡＶｈｕ６８ベクター、ＡＡＶ−ＤＪベクター、及び遺伝子治療に好適な他のものからなる群から選択される。
【００８０】
ＡＡＶベクターは、哺乳動物に対して非病原性であるＤＮＡパルボウイルスである。簡潔には、ＡＡＶベースのベクターは、ウイルスゲノムの９６％を占めるｒｅｐ及びｃａｐウイルス遺伝子が除去され、ウイルスのＤＮＡ複製、パッケージング、及び組込みを開始するために使用される２つの隣接する１４５ｂｐの末端逆位配列（ＩＴＲ）が残されている。
【００８１】
更なる実施形態は、ＡＡＶ１ベクター、ＡＡＶ２ベクター、ＡＡＶ３ベクター、ＡＡＶ４ベクター、ＡＡＶ５ベクター、ＡＡＶ６ベクター、ＡＡＶ７ベクター、ＡＡＶ８ベクター、ＡＡＶ９ベクター、ＡＡＶｒｈＳベクター、ＡＡＶｒｈ１０ベクター、ＡＡＶｒｈ３３ベクター、ＡＡＶｒｈ３４ベクター、ＡＡＶｒｈ７４ベクター、ＡＡＶ／Ａｎｃ８０ベクター、ＡＡＶＰＨＰ．Ｂベクター、ＡＡＶ−ＤＪベクター、及び遺伝子治療に好適な他のものを作製するための、他の血清型カプシドの使用を含む。任意に、ＡＡＶウイルスカプシドは、ＡＡＶ２／９、ＡＡＶ９、ＡＡＶｒｈＳ、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶＡｎｃ８０、またはＡＡＶ  ＰＨＰ．Ｂである。
【００８２】
追加のプロモーターエレメント、例えば、エンハンサーは、転写開始の頻度を調節する。典型的には、これらは開始部位の３０〜１１０ｂｐ上流の領域に存在するが、多数のプロモーターが、開始部位の下流にも機能的エレメントを含むことが示されている。しばしば、プロモーターエレメント間の間隔には柔軟性があり、その結果、エレメントが互いに対して逆位になったり移動したりしてもプロモーター機能は保持される。チミジンキナーゼ（ｔｋ）プロモーターでは、多くの場合、活性の減衰を起こすことなく、プロモーターエレメント間の間隔が５０ｂｐまで隔てられる。プロモーターによっては、個々のエレメントが協調的に、または独立して、転写を活性化するように見える。
【００８３】
哺乳動物Ｔ細胞において、ｖＩＧＦ２融合物またはシグナルペプチド融合物などの、内部リボソーム進入配列を任意に有する治療融合タンパク質、導入遺伝子を発現させることができるプロモーターの例は、ＥＦ１ａプロモーターである。天然のＥＦ１ａプロモーターは、アミノアシルｔＲＮＡのリボソームへの酵素による送達を担う伸長因子１複合体のαサブユニットの発現を駆動する。ＥＦ１ａプロモーターは、哺乳動物発現プラスミドに広く使用され、レンチウイルスベクターにクローニングされた導入遺伝子からの発現を駆動するのに効果的であることを示してきた（例えば、Ｍｉｌｏｎｅ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．１７（８）：１４５３−１４６４（２００９）を参照のこと）。プロモーターの別の例は、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）最初期プロモーター配列である。このプロモーター配列は、機能的に連結された任意のポリヌクレオチド配列の高レベルの発現を駆動させることができる強力な構成的プロモーター配列である。しかしながら、ニワトリβアクチンプロモーター、Ｐ５４６プロモーター、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）初期プロモーター、マウス乳癌ウイルス（ＭＭＴＶ）、ヒト免疫不全症ウイルス（ＨＩＶ）末端反復配列（ＬＴＲ）プロモーター、ＭｏＭｕＬＶプロモーター、トリ白血病ウイルスプロモーター、エプスタイン・バーウイルス最初期プロモーター、ラウス肉腫ウイルスプロモーター、ならびに限定されるものではないが、アクチンプロモーター、ミオシンプロモーター、伸長因子−１ａプロモーター、ヘモグロビンプロモーター、及びクレアチンキナーゼプロモーターなどのヒト遺伝子プロモーターが含まれるがこれらに限定されない、他の構成的プロモーター配列も場合により使用される。更に、遺伝子治療ベクターは、構成的プロモーターの使用に限定されることを意図しない。誘導性プロモーターも本明細書において意図される。誘導性プロモーターの使用は、機能的に連結されているポリヌクレオチド配列の発現を、かかる発現が所望される場合にはオンにすることができ、または発現が所望されない場合には発現をオフにすることができる分子スイッチを提供する。誘導性プロモーターの例としては、メタロチオネインプロモーター、糖質コルチコイドプロモーター、プロゲステロンプロモーター、及びテトラサイクリン誘導プロモーターが挙げられるが、これらに限定されない。
【００８４】
ｖＩＧＦ融合物またはシグナルペプチド融合物などの、内部リボソーム進入配列またはその一部を任意に有する治療融合タンパク質の発現を評価する目的で、細胞に導入される発現ベクターは、多くの場合、ウイルスベクターによってトランスフェクトまたは感染させようとする細胞集団からの発現細胞の同定及び選択を容易にするための選択マーカー遺伝子もしくはレポーター遺伝子またはその両方を含有する。他の態様では、選択マーカーは、多くの場合、別個のＤＮＡ断片が保有しており、同時トランスフェクション手順に使用される。選択マーカー遺伝子及びレポーター遺伝子のいずれも、場合により、宿主細胞における発現を可能にするための適切な調節配列と隣接している。有用な選択マーカーとしては、例えば、ｎｅｏなどの抗生物質耐性遺伝子が挙げられる。
【００８５】
細胞に遺伝子を導入し、発現させるための方法及び組成物は、本明細書における方法に好適である。発現ベクターに関連して、ベクターは、宿主細胞、例えば、哺乳動物細胞、細菌細胞、酵母細胞、または昆虫細胞に、当技術分野における任意の方法によって容易に導入される。例えば、発現ベクターは、物理的、化学的、または生物学的手段によって宿主細胞に導入される。
【００８６】
宿主細胞にポリヌクレオチドを導入するための物理的方法及び組成物としては、リン酸カルシウム沈殿法、リポフェクション、微粒子銃法、マイクロインジェクション、遺伝子銃法、エレクトロポレーションなどが挙げられる。ベクター及び／または外因性核酸を含む細胞を作製するための方法は、本明細書における方法に好適である（例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ  ｅｔ  ａｌ．，２０１２，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ，ｖｏｌｕｍｅｓ  １−４，Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｐｒｅｓｓ，ＮＹを参照のこと）。宿主細胞にポリヌクレオチドを導入するための１つの方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションである。
【００８７】
ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入するための化学的手段及び組成物としては、コロイド分散系、例えば、高分子複合体、ナノカプセル、マイクロスフェア、ビーズ、ならびに水中油型エマルション、ミセル、混合ミセル、核酸−脂質粒子、及びリポソームが含まれる脂質ベースの系が挙げられる。インビトロ及びインビボで送達媒体として使用するための例示的なコロイド系は、リポソーム（例えば、人工膜小胞）である。核酸標的化送達の最先端の他の方法、例えば、標的化ナノ粒子によるポリヌクレオチドの送達または他の好適なサブミクロンサイズの送達系が利用可能である。
【００８８】
非ウイルス送達系が利用される場合には、例示的な送達媒体は、リポソームである。宿主細胞への核酸の（インビトロ、エクスビボ、またはインビボ）導入のための脂質製剤の使用が意図される。別の態様では、核酸は脂質と会合している。幾つかの実施形態では、脂質と会合した核酸は、リポソームの水性内部に封入されるか、リポソームの脂質二重層内に分散されるか、リポソーム及びオリゴヌクレオチドの両方と会合している連結分子を介してリポソームに付着されるか、リポソーム内に封じ込められるか、リポソームと複合体化されるか、脂質を含有する溶液中に分散されるか、脂質と混合されるか、脂質と組み合わされるか、懸濁物として脂質に含有されるか、ミセル中に含有されるか、もしくはこれと複合体化されるか、または別様に脂質と会合される。脂質、脂質／ＤＮＡ、または脂質／発現ベクターが会合した組成物は、溶液中でのいかなる特定の構造にも限定されない。例えば、幾つかの実施形態では、それらは二重層構造中に、ミセルとして、または「崩壊した」構造として存在する。あるいは、それらは単純に溶液中に散在しており、おそらくサイズまたは形状が均一でない凝集物を形成している。脂質とは、幾つかの実施形態では、天然に存在する脂質または合成脂質である脂肪性物質のことである。例えば、脂質としては、細胞質中に天然に存在する脂肪小滴、ならびに長鎖脂肪族炭化水素及びそれらの誘導体を含む化合物のクラス、例えば、脂肪酸、アルコール、アミン、アミノアルコール、及びアルデヒドが挙げられる。
【００８９】
使用に好適な脂質は、民間の供給元から入手される。例えば、幾つかの実施形態では、ジミリスチルホスファチジルコリン（「ＤＭＰＣ」）は、Ｓｉｇｍａ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，Ｍｏ．から入手され；幾つかの実施形態では、ジアセチルホスファート（「ＤＣＰ」）は、Ｋ  ＆  Ｋ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ（Ｐｌａｉｎｖｉｅｗ，Ｎ．Ｙ．）から入手され；幾つかの実施形態では、コレステロール（「Ｃｈｏｌ」）は、Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ−Ｂｅｈｒｉｎｇから入手され；ジミリスチルホスファチジルグリセロール（「ＤＭＰＧ」）及び他の脂質は、多くの場合、Ａｖａｎｔｉ  Ｐｏｌａｒ  Ｌｉｐｉｄｓ、Ｉｎｃ．（Ｂｉｒｍｉｎｇｈａｍ、Ａｌａ．）から入手される。クロロホルムまたはクロロホルム／メタノール中の脂質の貯蔵溶液は、多くの場合、約−２０℃で保存される。クロロホルムは、メタノールよりも容易に蒸発するため、唯一の溶媒として使用される。「リポソーム」とは、閉じた脂質二重層または凝集物の生成によって形成される、種々の単層及び多重層の脂質媒体を包含する総称である。リポソームは、多くの場合、リン脂質二重層膜及び内部の水性媒質を有する小胞構造を有することを特徴とする。多重膜リポソームは、水性媒質によって隔てられた複数の脂質層を有する。それらはリン脂質を過剰量の水性溶液中に懸濁させると自発的に形成される。脂質成分は自己再配列を起こし、その後に閉鎖構造の形成が起こり、水及び溶解溶質を脂質二重層の間に封じ込める（Ｇｈｏｓｈ  ｅｔ  ａｌ．，１９９１  Ｇｌｙｃｏｂｉｏｌｏｇｙ  ５：５０５−１０）。しかし、溶液中で通常の小胞構造とは異なる構造を有する組成物も包含される。例えば、幾つかの実施形態では、脂質はミセル構造をとるか、または単に脂質分子の不均一な凝集物として存在する。また、リポフェクタミン−核酸複合体も意図される。
【００９０】
外因性核酸を宿主細胞に導入するために使用される方法、または本明細書において提供される、内部リボソーム進入配列を任意に有するｖＩＧＦ２融合物もしくはシグナルペプチド融合物などの治療融合タンパク質を細胞に曝露させるために使用される方法に関係なく、種々のアッセイが宿主細胞における組換えＤＮＡ配列の存在を確認するために実施されることが意図される。かかるアッセイとしては、例えば、本明細書における方法に好適な「分子生物学的」アッセイ、例えば、サザンブロッティング及びノーザンブロッティング、ＲＴ−ＰＣＲ及びＰＣＲ；「生化学的」アッセイ、例えば、免疫学的手段（ＥＬＩＳＡ及びウェスタンブロット）による、または本発明の範囲内に含まれる作用物質を同定するための本明細書に記載されるアッセイによる、特定のペプチドの存在または非存在の検出が挙げられる。
【００９１】
本開示は、ｖＩＧＦ２融合物またはシグナルペプチド融合物などの治療融合タンパク質をコードし、内部リボソーム進入配列を任意に有する核酸分子を含むベクターを更に提供する。一態様では、治療融合タンパク質ベクターは、細胞に直接形質導入されることが可能である。一態様では、ベクターは、クローニングベクターまたは発現ベクター、例えば、１種以上のプラスミド（例えば、発現プラスミド、クローニングベクター、小環状ＤＮＡ、ミニベクター、二重微小染色体）、レトロウイルスベクター構築物、及びレンチウイルスベクター構築物が含まれるが、これらに限定されないベクターである。一態様では、ベクターは、哺乳動物細胞においてｖＩＧＦ２−治療融合タンパク質構築物を発現することができる。一態様では、哺乳動物細胞は、ヒト細胞である。
【００９２】
使用及び処置する方法
また本明細書において、本明細書において開示される、治療融合タンパク質（例えば、ｖＩＧＦ２融合物またはシグナルペプチド融合物またはシグナルペプチド−ｖＩＧＦ２融合物）をコードし、内部リボソーム進入配列を任意に有する核酸を個体に投与することを含む、遺伝子治療を使用した遺伝的障害を処置する方法も提供される。本明細書における方法を使用した処置に好適な遺伝的障害には、突然変異遺伝子による発現の欠如または機能不全タンパク質の発現を引き起こす、ゲノムにおける１つ以上の変異によって引き起こされた個体の障害が含まれる。
【００９３】
また本明細書において、本明細書において開示される、治療融合タンパク質（例えば、ｖＩＧＦ２融合物またはシグナルペプチド融合物またはシグナルペプチド−ｖＩＧＦ２融合物）をコードし、内部リボソーム進入配列を任意に有する核酸を含む遺伝子治療ベクターなどの遺伝子治療ベクター及び薬学的に許容される担体または賦形剤を含む、遺伝的障害の処置のための薬剤の調製に使用するための医薬組成物が提供される。
【００９４】
本明細書における方法による処置に好適な遺伝的障害としては、軟骨発育不全症、α−１アンチトリプシン欠損症、抗リン脂質抗体症候群、常染色体優性多発性嚢胞腎、シャルコー・マリー・トゥース病、結腸癌、ネコ鳴き症候群、クローン病、嚢胞性線維症、ダーカム病、デュアン症候群、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、第Ｖ因子ライデン血栓性素因（Ｆａｃｔｏｒ  Ｖ  Ｌｅｉｄｅｎ  Ｔｈｒｏｍｂｏｐｈｉｌｉａ）、家族性高コレステロール血症、家族性地中海熱、脆弱Ｘ症候群、ゴーシェ病、ヘモクロマトーシス、血友病、全前脳症、ハンチントン病、クラインフェルター症候群、マルファン症候群、筋緊張性ジストロフィー、神経線維腫症、ヌーナン症候群、骨形成不全症、パーキンソン病、フェニルケトン尿症、ポーランド症候群、ポルフィリン症、早老症、網膜色素変性症、重症複合免疫不全症（ＳＣＩＤ）、鎌状赤血球症、脊髄性筋萎縮症、テイサックス病、サラセミア、トリメチルアミン尿症、ターナー症候群、口蓋心臓顔面症候群、ＷＡＧＲ症候群、またはウィルソン病が挙げられるが、これらに限定されない。幾つかの実施形態では、遺伝的障害は、ＣＤＫＬ５欠損症、嚢胞性線維症、α及びβサラセミア、鎌形赤血球貧血、マルファン症候群、脆弱Ｘ症候群、ハンチントン病、ヘモクロマトーシス、先天性難聴（無症候性）、テイサックス病、家族性高コレステロール血症、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、シュタルガルト病、アッシャー症候群、コロイデレミア、色盲、Ｘ連鎖性網膜分離症、血友病、ウィスコット・アルドリッチ症候群、Ｘ連鎖性慢性肉芽腫症、芳香族Ｌ−アミノ酸デカルボキシラーゼ欠損症、劣性栄養障害性表皮水泡症、α１アンチトリプシン欠損症、ハッチンソン・ギルフォード早老症候群（ＨＧＰＳ）、ヌーナン症候群、Ｘ連鎖性重症複合免疫不全症（Ｘ−ＳＣＩＤ）からなる群から選択される。
【００９５】
幾つかの実施形態では、本明細書において提供される方法を使用した処置に好適な遺伝的障害は、リソソーム貯蔵障害である。幾つかの実施形態では、本明細書において、リソソーム貯蔵障害は、欠損した酵素または不完全な酵素を患者に送達するための遺伝子治療を使用して処置される。幾つかの実施形態では、本明細書における方法は、酵素をそれが必要とされる細胞に送達するために、ｖＩＧＦ２に融合された当該酵素またはシグナルペプチドに融合された当該酵素を患者に送達する。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アスパルチルグルコサミン尿症、バッテン病、シスチン症、ファブリー病、ゴーシェ病Ｉ型、ゴーシェ病ＩＩ型、ゴーシェ病ＩＩＩ型、ポンペ病、テイサックス病、サンドホフ病、異染性白質ジストロフィー、ムコリピドーシスＩ型、ムコリピドーシスＩＩ型、ムコリピドーシスＩＩＩ型、ムコリピドーシスＩＶ型、ハーラー病、ハンター病、サンフィリポ病Ａ型、サンフィリポ病Ｂ型、サンフィリポ病Ｃ型、サンフィリポ病Ｄ型、モルキオ病Ａ型、モルキオ病Ｂ型、マロトー・ラミー病、スライ病、ニーマン・ピック病Ａ型、ニーマン・ピック病Ｂ型、ニーマン・ピック病Ｃ１型、ニーマン・ピック病Ｃ２型、シンドラー病Ｉ型、及びシンドラー病ＩＩ型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、リソソーム貯蔵障害は、アクチベーター欠損症、ＧＭ２ガングリオシドーシス；ＧＭ２ガングリオシドーシスＡＢ異型；α−マンノシドーシス（２型、中等症型；３型、新生児期、重症型）；β−マンノシドーシス；アスパルチルグルコサミン尿症；リソソーム酸性リパーゼ欠損症；シスチン症（遅発性の若年または思春期腎障害型；小児腎障害型）；シャナリン・ドルフマン症候群；ミオパチーを伴う中性脂質蓄積症；ＮＬＳＤＭ；ダノン病；ファブリー病；ファブリー病ＩＩ型、遅発型；ファーバー病；ファーバー脂肪性肉芽腫症；フコシドーシス；ガラクトシアリドーシス（ノイラミニダーゼ及びβ−ガラクトシダーゼの複合欠損症）；ゴーシェ病；ＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩ型ゴーシェ病；ＩＩＩＣ型ゴーシェ病；ゴーシェ病、非典型、サポシンＣ欠損による；ＧＭ１ガングリオシドーシス（遅発乳児型／若年型ＧＭ１ガングリオシドーシス；成人型／慢性ＧＭ１ガングリオシドーシス）；グロボイド細胞白質ジストロフィー、クラッベ病（遅発乳児型；若年型；成人型）；クラッベ病、非典型、サポシンＡ欠損による；異染性白質ジストロフィー（若年型；成人型）；部分的セレブロシドスルファターゼ欠損症；偽性アリルスルファターゼＡ欠損症；サポシンＢ欠損による異染性白質ジストロフィー；ムコ多糖症障害：ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー症候群；ＭＰＳ  Ｉ、ハーラー・シャイエ症候群；ＭＰＳ  Ｉ、シャイエ症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；ＭＰＳ  ＩＩ、ハンター症候群；サンフィリポ症候群Ａ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＡ；サンフィリポ症候群Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＢ；サンフィリポ症候群Ｃ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＣ；サンフィリポ症候群Ｄ型／ＭＰＳ  ＩＩＩＤ；モルキオ症候群、Ａ型／ＭＰＳ  ＩＶＡ；モルキオ症候群、Ｂ型／ＭＰＳ  ＩＶＢ；ＭＰＳ  ＩＸ／ヒアルロニダーゼ欠損症；ＭＰＳ  ＶＩ／マロトー・ラミー症候群；ＭＰＳ  ＶＩＩ／スライ症候群；ムコリ��ドーシスＩ型、シアリドーシスＩＩ型；Ｉ細胞病、ルロイ病（Ｌｅｒｏｙ  ｄｉｓｅａｓｅ）、ムコリピドーシスＩＩ型；偽性ハーラー病ポリジストロフィー／ムコリピドーシスＩＩＩ型；ムコリピドーシスＩＩＩＣ型／ＭＬ  ＩＩＩ  γ；ムコリピドーシスＩＶ型；多重スルファターゼ欠損症；ニーマン・ピック病（Ｂ型；Ｃ１型／慢性神経細胞障害型；Ｃ２型；Ｄ型／Ｎｏｖａ  Ｓｃｏｔｉａｎ型）；神経セロイドリポフスチン症：ＣＬＮ６病（非典型の遅発乳児型、遅発型異型、早期若年型）；Ｂａｔｔｅｎ−Ｓｐｉｅｌｍｅｙｅｒ−Ｖｏｇｔ病／若年型ＮＣＬ／ＣＬＮ３病；フィンランド異型遅発乳児型ＣＬＮ５病；ヤンスキー・ビールショースキー病／遅発乳児型ＣＬＮ２病／ＴＰＰ１病；クーフス病／成人型ＮＣＬ／ＣＬＮ４病（Ｂ型）；北部癲癇／遅発乳児型異型ＣＬＮ８病；Ｓａｎｔａｖｕｏｒｉ−Ｈａｌｔｉａ病／乳児型ＣＬＮ１病／ＰＰＴ病；ポンペ病（グリコーゲン蓄積症ＩＩ型）；遅発性ポンペ病；濃化異骨症；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；サンドホフ病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；シンドラー病（ＩＩＩ型／中間型、可変的）；神崎疾患；サラ病；乳児型遊離シアル酸蓄積症（ＩＳＳＤ）；進行性ミオクローヌス癲癇を伴う脊髄性筋萎縮症（ＳＭＡＰＭＥ）；テイサックス病／ＧＭ２ガングリオシドーシス；若年性テイサックス病；遅発性テイサックス病；クリスチャンソン症候群；Ｌｏｗｅ眼脳腎症候群；シャルコー・マリー・トゥース病４Ｊ型、ＣＭＴ４Ｊ；Ｙｕｎｉｓ−Ｖａｒｏｎ症候群；両側性側頭後頭葉多小脳回（ＢＴＯＰ）；Ｘ連鎖性高カルシウム尿腎結石症、デント病１型；及びデント病２型からなる群から選択される。幾つかの実施形態では、治療タンパク質は、リソソーム貯蔵障害に関連し、治療タンパク質は、ＧＭ２活性化タンパク質；α−マンノシダーゼ；ＭＡＮ２Ｂ１；リソソームβ−マンノシダーゼ；グリコシルアスパラギナーゼ；リソソーム酸性リパーゼ；シスチノシン；ＣＴＮＳ；ＰＮＰＬＡ２；リソソーム関連膜タンパク質２；α−ガラクトシダーゼＡ；ＧＬＡ；酸性セラミダーゼ；α−Ｌ−フコシダーゼ；防御タンパク質／カテプシンＡ；酸性β−グルコシダーゼ；ＧＢＡ；ＰＳＡＰ；β−ガラクトシダーゼ−１；ＧＬＢ１；ガラクトシルセラミドβ−ガラクトシダーゼ；ＧＡＬＣ；ＰＳＡＰ；アリルスルファターゼＡ；ＡＲＳＡ；α−Ｌ−イズロニダーゼ；イズロン酸２−スルファターゼ；ヘパランＮ−スルファターゼ；Ｎ−α−アセチルグルコサミニダーゼ；ヘパランアセチルＣｏＡ：α−グルコサミニドアセチルトランスフェラーゼ；Ｎ−アセチルグルコサミン６−スルファターゼ；ガラクトサミン−６−硫酸スルファターゼ；β−ガラクトシダーゼ；ヒアルロニダーゼ；アリルスルファターゼＢ；β−グルクロニダーゼ；ノイラミニダーゼ；ＮＥＵ１；Ｎ−アセチルグルコサミン−１−ホスホトランスフェラーゼのγサブユニット；ムコリピン−１；スルファターゼ修飾因子−１；酸性スフィンゴミエリナーゼ；ＳＭＰＤ１；ＮＰＣ１；及びＮＰＣ２からなる群から選択される。
【００９６】
幾つかの実施形態では、本明細書における方法による処置は、治療タンパク質をコードする遺伝子を、当該治療タンパク質を必要とする細胞に送達する。幾つかの実施形態では、処置は、個体の全ての体細胞に遺伝子を送達する。幾つかの実施形態では、処置は、標的とされる細胞において欠陥遺伝子の代わりとなる。幾つかの実施形態では、治療タンパク質を発現するようにエクスビボで処理された細胞が、個体に送達される。
【００９７】
本明細書において開示される障害の遺伝子治療は、長い時間の注入処置を必要としないため、酵素補充療法を含む従来の処置法より優れた処置結果を提供する。加えてそれは、酵素補充療法を受けている個体が多くの場合経験する治療タンパク質に対する免疫反応を、個体が発症するリスクを低減する。
【００９８】
定義
本明細書で使用する場合、「エクスビボ遺伝子治療」とは、患者の細胞が、例えば、治療遺伝子を発現させるために対象の外で遺伝子改変される方法を指す。新たな遺伝子情報を有する細胞は、次いで、それらが由来する対象に戻される。
【００９９】
本明細書で使用する場合、「インビボ遺伝子治療」とは、治療遺伝子（複数可）を保有するベクターが対象に直接投与される方法を意味する。
【０１００】
本明細書で使用する場合、「融合タンパク質」及び「治療融合タンパク質」は、本明細書において互換的に使用され、治療タンパク質に連結された少なくとも１つの追加のタンパク質、ペプチド、またはポリペプチドを有する当該治療タンパク質を指す。一部の例では、融合タンパク質は、化学リンカーなしに、２つ以上のタンパク質またはその断片のそれぞれのペプチド鎖でのペプチド結合により共有結合で連結された、当該２つ以上のタンパク質またはその断片を含有する単一のタンパク質分子である。幾つかの実施形態では、融合タンパク質は、治療タンパク質、及びシグナルペプチド、融合タンパク質のエンドサイトーシスを増加させるペプチド、またはその両方を含む。幾つかの実施形態では、エンドサイトーシスを増加させるペプチドは、ＣＩ−ＭＰＲに結合するペプチドである。
【０１０１】
本明細書で使用する場合、「ベクター」または「遺伝子治療ベクター」は、本明細書において互換的に使用され、細胞に治療遺伝子を送達する遺伝子治療送達媒体または担体を指す。遺伝子治療ベクターは、遺伝子治療に使用するのに好適な任意のベクター、例えば、核酸ポリマー（ポリペプチドまたはそのバリアントをコードする）の患者の標的細胞（例えば、感覚ニューロン）への治療的送達に好適な任意のベクターである。幾つかの実施形態では、遺伝子治療ベクターは、治療タンパク質または治療融合タンパク質をコードする核酸を、当該治療タンパク質または融合物が発現され、分泌される細胞に送達する。ベクターは、任意の種類のものであり得、例えば、ベクターは、プラスミドベクターまたは小環状ＤＮＡであり得る。典型的には、ベクターはウイルスベクターである。これらには、アデノウイルスなどの遺伝子が無効化されたウイルス及びリポソームなどの非ウイルスベクターが含まれる。例えば、ウイルスベクターは、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、レトロウイルス、レンチウイルス、単純ヘルペスウイルス、またはアデノウイルスに由来し得る。ＡＡＶ由来のベクター。このベクターは、ＡＡＶゲノムまたはその誘導体を含み得る。
【０１０２】
本明細書で使用する場合、「構築物」は、治療タンパク質または融合タンパク質をコードし、翻訳開始配列またはＩＲＥＳ配列などの追加の配列を任意に含む核酸分子または配列を指す。
【０１０３】
本明細書で使用する場合、「プラスミド」は、染色体ＤＮＡと独立して細胞内で複製する、環状の二本鎖単位のＤＮＡを指す。
【０１０４】
本明細書で使用する場合、「プロモーター」は、酵素であるＲＮＡポリメラーゼが結合し、ＤＮＡのＲＮＡへの転写を開始するＤＮＡ上の部位を指す。
【０１０５】
本明細書で使用する場合、「身体治療」は、細胞における遺伝子発現の操作が、患者にとって補正的であるが、次世代に遺伝しない方法を指す。体細胞には、人体の全ての非生殖細胞が含まれる。
【０１０６】
本明細書で使用する場合、「体細胞」は、生殖細胞を除く身体の全ての細胞を指す。
【０１０７】
本明細書で使用する場合、「指向性」は、ウイルスなどのベクターの特定の細胞または組織型に対する選択性を指す。様々な因子が、ベクターの特定の細胞に感染する能力を決定する。例えば、ウイルスは、細胞に入るために特異的な細胞表面受容体に結合しなければならない。典型的に、必要な受容体を細胞が発現しない場合、ウイルスはその細胞に感染することができない。
【０１０８】
用語「形質導入」は、レシピエント細胞による機能的ポリペプチドの発現をもたらす、本開示の複製欠損性ｒＡＡＶによる、治療タンパク質をコードする核酸のインビボまたはインビトロのいずれかでの標的細胞への投与／送達を指すために使用される。本開示のｒＡＡＶなどの遺伝子治療ベクターによる細胞の形質導入は、ｒＡＡＶによりコードされるポリペプチドまたはＲＮＡの持続発現をもたらす。従って、本開示は、治療タンパク質をコードするｒＡＡＶなどの遺伝子治療ベクターを、クモ膜下腔内、網膜内、眼内、硝子体内、脳室内、実質内、もしくは静脈内経路、またはこれらの任意の組み合わせにより対象に投与／送達する方法を提供する。「クモ膜下腔内」送達は、脳または脊髄のクモ膜下の空間への送達を指す。幾つかの実施形態では、クモ膜下腔内投与は、大槽内投与によるものである。
【０１０９】
用語「レシピエント」、「個体」、「対象」、「宿主」、及び「患者」は、本明細書において互換的に使用され、幾つかの例では、診断、処置、または治療が望まれる任意の哺乳動物対象、特にヒトを指す。処置のための「哺乳動物」は、哺乳動物と分類される任意の動物を指し、ヒト、飼育動物及び家畜、ならびに実験動物、動物園動物、競技動物、または愛玩動物、例えば、イヌ、ウマ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、マウス、ラット、ウサギ、モルモット、サルなどが含まれる。幾つかの実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【０１１０】
本明細書で使用する場合、用語「処置」、「処置すること」、「症状を改善すること」などは、幾つかの例では、障害の少なくとも１つの側面または指標を、統計的に有意な様式で、または臨床的に有意な様式で、阻害するか、減弱するか、低減するか、予防するか、または変化させることを含む、治療効果を得ることを目的として、薬剤を投与すること、または手順を実施することを指す。用語「改善する」または「処置する」は、基礎となる状態の治癒を明言または意味しない。本明細書で使用する場合、「処置」または「改善する」（など）は、哺乳動物、特にヒトを処置することを含み得、（ａ）障害を易発症し得るが、まだそれを有すると診断されていない対象において障害または障害の症状が発生することを予防すること（例えば、一次障害に関連し得るか、またはそれにより引き起こされ得る障害を含む）；（ｂ）障害を阻害すること、すなわち、その発症を抑制すること；（ｃ）障害を緩和すること、すなわち、障害の退縮を引き起こすこと；及び（ｄ）障害の少なくとも１つの症状を改善すること、を含み得る。処置することは、寛解；寛解傾向；症状の減弱もしくは障害の状態が患者にとってより許容可能なものになること；変性もしくは衰弱の速度の緩徐化；または変性の最終段階がより消耗性でないものになることなどの任意の客観的または主観的パラメーターが含まれる、障害の処置または改善または予防における成功の任意の兆候を指し得る。症状の処置または改善は、医師による検査の結果が含まれる、１つ以上の客観的または主観的パラメーターに基づく。従って、用語「処置する」には、障害に関連する症状または状態の発症を、予防もしくは遅延させるか、軽減するか、または抑制もしくは阻害するための、本発明の化合物または薬剤の投与が含まれる。用語「治療効果」は、対象における障害、障害の症状、または障害の副次的な影響の減少、除去、または予防を指す。
【０１１１】
用語「親和性」は、分子とその結合パートナーまたは受容体との間の結合の強さを指す。
【０１１２】
本明細書で使用する場合、語句「高親和性」は、例えば、ＣＩ−ＭＰＲに結合するかかるペプチドを含有する治療融合物が、当該ペプチドのない治療タンパク質のＣＩ−ＭＰＲに対する親和性より約１００〜１，０００倍または５００〜１，０００倍高いＣＩ−ＭＰＲに対する親和性を有することを指す。幾つかの実施形態では、親和性は、当該ペプチドなしと比べて少なくとも１００倍、少なくとも５００倍、または少なくとも１０００倍高い。例えば、治療タンパク質及びＣＩ−ＭＰＲが相対的に等しい濃度で混合されている場合、高親和性のペプチドは、得られる複合体の高い濃度へと平衡を移動させるように結合可能なＣＩ−ＭＰＲに結合する。
【０１１３】
本明細書で使用する場合、「分泌」は、細胞からのタンパク質の、例えば、関心対象の組織または治療タンパク質の作用部位に運ばれるための血流への放出を指す。遺伝子治療産物が器官の間隙に分泌される場合、分泌は、隣接する細胞の交差補正を可能にすることができる。
【０１１４】
本明細書で使用する場合、「送達」は、薬物送達を意味する。幾つかの実施形態では、送達プロセスは、薬物物質（例えば、遺伝子治療ベクターから産生された治療タンパク質または融合タンパク質）を、細胞の外側（例えば、血液、組織、または間隙）から薬物物質の治療活性の標的細胞に輸送すること意味する。
【０１１５】
本発明で使用する場合、「改変すること」または「タンパク質改変」は、所望の特性または特定の構造を有するタンパク質の合成をもたらすように、タンパク質をコードする適切な核酸配列を提供することによるタンパク質の構造の操作を指す。
【０１１６】
幾つかの例では、「治療上有効量」は、障害を処置するために対象に投与する場合に、その障害の処置を達成するのに十分である量を意味する。
【０１１７】
本明細書で使用する場合、「約」数値という用語は、その数値より１０％小さい数値からその数値より１０％大きい数値にわたる範囲を指し、その数値自体などの範囲内の値を含む。
【０１１８】
本発明で使用する場合、請求項の１つまたは複数の要素を「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」という用語は、それらの要素を指すが、追加の１つまたは複数の要素を含むことを除外しない。
【実施例】
【０１１９】
以下の実施例は、本発明の種々の実施形態を例示するために提供され、本発明をいかようにも限定することを意図しない。本発明の実施例は、本明細書に記載の方法と共に、本明細書にて好ましい実施形態を表し、例示であり、本発明の範囲の限定を意図しない。特許請求の範囲により定義される本発明の要旨の範囲内に包含される変更及び他の使用を、当業者は思いつくであろう。
【０１２０】
実施例１：バリアントＩＧＦ２ペプチドのＣＩ−ＭＰＲ受容体への結合
野生型ＩＧＦ２及びバリアントＩＧＦ２（ｖＩＧＦ２）のＣＩ−ＭＰＲ受容体への結合を測定するために、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）実験をＢｉａｃｏｒｅを使用して実施した。野生型ヒト成熟ＩＧＦ２ペプチド（ｗｔ  ＩＧＦ２）は、配列番号１に記載の配列を有する。ｖＩＧＦ２配列は、それが残基１〜４を欠き、以下の変異：Ｅ６Ｒ、Ｙ２７Ｌ、及びＫ６５Ｒを含むという点でｗｔ  ＩＧＦ２と異なる。ｖＩＧＦ２は、以下のアミノ配列を有する：ＳＲＴＬＣＧＧＥＬＶＤＴＬＱＦＶＣＧＤＲＧＦＬＦＳＲＰＡＳＲＶＳＲＲＳＲＧＩＶＥＥＣＣＦＲＳＣＤＬＡＬＬＥＴＹＣＡＴＰＡＲＳＥ（配列番号３１）。ｖＩＧＦ２は、配列ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）を有するＮ末端リンカーも有する。連結した配列は、ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＲＴＬＣＧＧＥＬＶＤＴＬＱＦＶＣＧＤＲＧＦＬＦＳＲＰＡＳＲＶＳＲＲＳＲＧＩＶＥＥＣＣＦＲＳＣＤＬＡＬＬＥＴＹＣＡＴＰＡＲＳＥ（配列番号４３）である。図４は、予想通り、野生型ＩＧＦ２ペプチドがＣＩ−ＭＰＲ受容体に高親和性（０．２ｎＭ）で結合することを示す。図５は、バリアントＩＧＦ２ペプチド（ｖＩＧＦ２）もＣＩ−ＭＰＲ受容体に高親和性（０．５ｎＭ）で結合することを示す。これらのデータは、ｖＩＧＦ２ペプチドが、治療薬をリソソームに標的化するための意図したＣＩ−ＭＰＲ受容体に対する高親和性を有することを示す。
【０１２１】
潜在的副作用を評価するために、ＳＰＲを利用して、インスリン受容体へのペプチド結合を測定した。インスリンは、インスリン受容体に高親和性で結合する（約８ｎＭ；データ非表示）。野生型ＩＧＦ２及びｖＩＧＦ２を試験し、ここで、ｖＩＧＦ２は、配列ＳＲＴＬＣＧＧＥＬＶＤＴＬＱＦＶＣＧＤＲＧＦＬＦＳＲＰＡＳＲＶＳＲＲＳＲＧＩＶＥＥＣＣＦＲＳＣＤＬＡＬＬＥＴＹＣＡＴＰＡＲＳＥ（配列番号３１）を有し、配列ＧＧＧＧＳＧＧＧＧ（配列番号１８）を有するＮ末端リンカーを有した。図８は、野生型ＩＧＦ２が相対的に高い親和性（約１００ｎＭ）でインスリン受容体にも結合することを示す。Ｂｉｏｍａｒｉｎ／Ｚｙｓｔｏｒ  ＩＧＦ２−ＧＡＡ融合タンパク質（ＢＭＮ−７０１）由来のＩＧＦ２ペプチドも、インスリン受容体に高親和性で結合し、臨床試験において低血糖を引き起こすことが示された。図９は、ｖＩＧＦ２ペプチドのインスリン受容体への測定可能な結合を示さない。これらのデータは、ｖＩＧＦ２ペプチドが、ｗｔ  ＩＧＦ２ペプチド融合物と比較して優れた安全性プロファイルを付与することを示す。
【０１２２】
ｖＩＧＦ２ペプチドのＩＧＦ１受容体との相互作用を特徴付けるために、同様のＳＰＲ結合解析を利用した。図１０は、野生型ＩＧＦ２ペプチドが、相対的に高い親和性（約１００ｎＭ）でＩＧＦ１受容体に結合することを示す。図１１は、ｖＩＧＦ２ペプチドのＩＧＦ１受容体への測定可能な結合を示さず、これは、ｗｔ  ＩＧＦ２と比較して改善した安全性プロファイルを示す。
2021521851.tif 000024
【０１２３】
実施例２：ｖＩＧＦ２は、低親和性リガンドをＣＩ−ＭＰＲに対して高親和性のＥＲＴに変える
ｖＩＧＦ２ペプチドがＣＩ−ＭＰＲに対する親和性を改善することができるかどうか決定するために、Ｎ末端リンカー（配列番号１８）を有するｖＩＧＦ２ペプチド（配列番号３１）をアルグルコシダーゼ−αに化学的に結合させた（本明細書においてｖＩＧＦ２−アルグルコシダーゼ−αと称される）。図６に示すように、ＣＩ−ＭＰＲでコーティングした９６ウェルＥＬＩＳＡプレートでのＣＩ−ＭＰＲプレート結合アッセイを使用して、アルグルコシダーゼ−α及びｖＩＧＦ２−アルグルコシダーゼ−αの結合親和性を直接比較した。結合した酵素の活性を測定する前に結合していない酵素を洗い流した。異なる濃度の両方の酵素製剤を、遊離ＷＴ  ＩＧＦ２ペプチドと共に、またはそれなしで使用した。ｖＩＧＦ２は、ＣＩ−ＭＰＲに対する親和性を大幅に改善した。更に、ｖＩＧＦ２−アルグルコシダーゼ−αの結合は、遊離ＷＴ  ＩＧＦ２によって阻害され、このことは、結合がＩＧＦ２依存的であったことを示す（データ非表示）。ｖＩＧＦ２ペプチドの結合は、ＧＡＡ酵素活性を障害しなかった。
【０１２４】
ｖＩＧＦ２を組換えヒトＮ−アセチル−α−Ｄ−グルコサミニダーゼ（ｒｈＮＡＧＬＵ）と結合させた。ペプチドが非リガンドをＣＩ−ＭＰＲに対する高親和性リガンドに変えることができるかどうか決定するために、Ｍ６Ｐを欠くリソソーム酵素であるＲｒｈＮＡＧＬＵ。この実験では、ＣＩ−ＭＰＲをコーティングしたプレートを利用するＣＩ−ＭＰＲプレート結合アッセイを使用して、ｒｈＮＡＧＬＵ及びｖＩＧＦ２−ｒｈＮＡＧＬＵを直接比較した。結合した酵素の活性を測定する前に結合していない酵素を洗い流した。異なる濃度の両方の酵素製剤を、遊離ｖＩＧＦ２ペプチドと共に、またはそれなしで使用した。図７に示すように、ｖＩＧＦ２−ｒｈＮＡＧＬＵは、ｖＩＧＦ２を欠くｒｈＮＡＧＬＵより顕著に高いＣＩ−ＭＰＲに対する親和性を有する。更に、ｖＩＧＦ２−ｒｈＮＡＧＬＵの結合は、遊離ｖＩＧＦ２ペプチドによって阻害され、このことは、受容体結合がＩＧＦ２ペプチドに特異的であったことを示した。これらの結果は、ｖＩＧＦ２ペプチドが、リソソームへの薬物の標的化を改善するために利用できることを示す。
【０１２５】
実施例３：筋芽細胞によるｖＩＧＦ２−ＧＡＡ融合タンパク質の取り込み
ｖＩＧＦ２−ＧＡＡ融合タンパク質（実施例１〜２におけるものと同じ配列）を投与し、Ｌ６筋芽細胞による酵素の取り込みを測定した。図６は、ｒｈＧＡＡ及びＭ６Ｐ−ＧＡＡと比較したｖＩＧＦ２−ｒｈＧＡＡの優れた取り込みを示す。従って、ｖＩＧＦ２は、ＧＡＡを細胞に標的化するのに有効である。
【０１２６】
実施例４：遺伝子治療により送達されるＥＲＴのための構築物
２つの異なる構築物を図１２に示す。上のパネルにあるのが、コザック配列及び天然のシグナルペプチド（配列番号４５）を有する組換えヒトＧＡＡをコードする核酸を含有する、「天然のｈＧＡＡ」（配列番号４５）をコードする構築物である。中間のパネルにあるのが、「改変されたｈＧＡＡ」（配列番号２３）をコードする構築物、コザック−ＢｉＰ−ｖＩＧＦ２−２ＧＳ−ＧＡＡである。この構築物は、コザック配列、ＢｉＰシグナルペプチドをコードする核酸、配列番号３１に記載の配列を有するｖＩＧＦ２ペプチドをコードする核酸、ならびに未熟なプロセシング及びｖＩＧＦ２の除去を予防するためにＮ末端の６０アミノ酸が除去された組換えヒトＧＡＡ（配列番号４６）をコードする核酸がその後に続く、２ＧＳリンカー（配列番号１８）をコードする核酸を特徴とする。
【０１２７】
実施例５：遺伝子治療構築物の増強された分泌
改変されたｈＧＡＡは、より多く分泌され、細胞取り込み及びリソソーム標的化に適切な細胞表面受容体と相互作用することができる
以下でより詳細に記載される改変されたｈＧＡＡまたは天然のｈＧＡＡを発現するＣＨＯを培養し、馴化培地をＧＡＡ活性の測定のために採取した。図１５は、改変されたｈＧＡＡ及び天然のｈＧＡＡの相対的活性を示し、これは、改変されたｈＧＡＡが天然のｈＧＡＡと比較して増加した活性を有することを示し、改変されたｈＧＡＡのより効率的な分泌を示す。
【０１２８】
実施例６：馴化培地でのＰＰＴ１の解析
ＰＰＴ１構築物のクローニング
ＰＰＴ１構築物を、ＣＭＶプロモーターを含有するｐｃＤＮＡ３．１発現ベクター（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ  ｃａｔ＃Ｖ７９０２０）にクローニングした。試験した構築物には、ＰＰＴ１−１（ＷＴ−ＰＰＴ１）（配列番号２４）；ＰＰＴ１−２（ＷＴ−ｖＩＧＦ２−ＰＰＴ１）（配列番号２５）；ＰＰＴ１−２９（ＢｉＰ２ａａ−ｖＩＧＦ２−ＰＰＴ１）（配列番号２６）が含まれた。
【０１２９】
ＰＰＴ１の分泌及び結合
ＰＰＴ１構築物がＨＥＫ２９３Ｔ細胞で３日間一過性に発現され、ＰＰＴ１が培地に分泌された。分泌されたＰＰＴ１をウェスタンブロッティングにより定量化し、ＣＩ−ＭＰＲへの結合を確立された方法を使用して分析した。分泌されたＰＰＴ１を図１３に示す。ＣＩ−ＭＰＲへの結合を図１４に示す。
【０１３０】
実施例７：ポンペ病の動物モデルでの遺伝子治療ベクターの試験
【０１３１】
ポンペ病の遺伝子治療：前臨床概念実証研究デザイン
【０１３２】
前臨床研究を、構築物の最初の比較のために高用量を使用して、ＧＡＡノックアウト（ＧＡＡ  ＫＯ）マウスで実施した。構築物を図１２に示す。マウスにビヒクルまたは２種の構築物（天然のｈＧＡＡまたは改変されたｈＧＡＡ）のうちの１種を投与した。マウスは、５ｅ１１ｇｃ／マウス（約２．５ｅ１３ｇｃ／ｋｇ）で投与された。ＧＡＡノックアウトマウスを生後２ヶ月の時点で使用した。正常（野生型）マウスを対照として使用した。研究デザインの概略を図１６に示す。
【０１３３】
ポンペ病の遺伝子治療：血漿
【０１３４】
図に示すように、血漿を野生型（正常）マウスまたはビヒクルもしくは遺伝子治療ベクターを投与されたＧＡＡ  ＫＯマウスから採取し、ＧＡＡ活性及び細胞表面への結合を測定した。データを図１７、図２７、及び図１９に要約する。同程度の高いＧＡＡレベルが、遺伝子治療ベクターを投与されたマウスで観察された（図１７、図１８）。しかしながら、細胞標的化によるより多くの受容体結合が、改変された構築物で観察された（図１９）。
【０１３５】
ポンペ病の遺伝子治療：四頭筋
【０１３６】
正常（野生型）マウス及び処置されたＧＡＡ  ＫＯマウスにおけるＧＡＡ活性及びグリコーゲン蓄積／細胞質空胞化を評価した（図２８）。四頭筋におけるＧＡＡ活性は、野生型より約２０倍高かった。グリコーゲン（ＰＡＳ）染色（図２９）及び免疫組織染色（図３０）も評価した。免疫組織染色は、改変されたｈＧＡＡの野生型と比較してより高いリソソーム標的化を示した。ＰＡＳ染色法によるとグリコーゲンの低減は、改変されたｈＧＡＡでより一定していた。
【０１３７】
ポンペ病の遺伝子治療：三頭筋
【０１３８】
正常（野生型）マウス及び処置されたＧＡＡ  ＫＯマウスにおけるＧＡＡ活性及びグリコーゲン蓄積／細胞質空胞化を評価した（図３１）。ＧＡＡ活性は、野生型より約１０〜１５倍高かった。免疫組織染色及びグリコーゲン（ＰＡＳ）染色も評価した（図３２及び図３３）。免疫組織染色は、改変されたｈＧＡＡの野生型ＧＡＡと比較してより高いリソソーム標的化を示した。ＰＡＳ染色法により測定されるように、グリコーゲンの低減は、改変されたｈＧＡＡでより一定していた。
【０１３９】
ポンペ病の遺伝子治療：前脛骨筋（Ｔａ）
【０１４０】
正常（野生型）マウス及び処置されたＧＡＡ  ＫＯマウスにおけるＧＡＡ活性及びグリコーゲン蓄積／細胞質空胞化を評価した（図２０）。ＴＡにおけるＧＡＡ活性は、野生型より約１５〜２０倍高かった。免疫組織染色及びグリコーゲン（ＰＡＳ）も評価した（図２１及び図２２）。免疫組織染色は、改変されたｈＧＡＡの野生型ＧＡＡと比較してより高いリソソーム標的化を示した。グリコーゲンレベルは野生型のレベルに近かった。ＰＡＳ染色法によるとグリコーゲンの低減は、改変されたｈＧＡＡでより一定していた。
【０１４１】
ポンペ病の遺伝子治療：脳及び脊髄
【０１４２】
正常（野生型）マウス及び処置されたＧＡＡ  ＫＯマウスにおけるＧＡＡ活性、グリコーゲン量、及びグリコーゲン蓄積／細胞質空胞化を評価した（図２３）。脳におけるＧＡＡ活性は、野生型より約５倍低かった。免疫組織染色及びグリコーゲン（ＰＡＳ）も評価した（図２４、図２５、図２６、図２７）。免疫組織染色は、一部の細胞の直接的形質導入が起こる可能性があることを示した。しかしながら、天然の構築物ではグリコーゲンクリアランスは、ほとんどまたは全く達成されなかった。改変された構築物では、活性が野生型のわずか２０％であっても、グリコーゲンレベルは野生型レベルに近かった。脊髄のＰＡＳ染色は、天然の構築物によるグリコーゲンクリアランスをほとんどまたは全く示さなかった。改変された構築物では、野生型に近いグリコーゲンレベルが運動ニューロンを含む前角において観察された。免疫組織染色は、脊髄神経細胞における直接的形質導入を実証した。脈絡叢及び神経細胞によって産生される改変されたｈＧＡＡは、脊髄における交差補正によりグリコーゲンを低減することができたが、天然のｈＧＡＡではグリコーゲンの低減がほとんど観察されなかった。
【０１４３】
結論
【０１４４】
全体として、この実施例におけるデータは、改変された遺伝子治療構築物が、脳及び脊髄における効果を含め、従来の処置において使用される野生型ＧＡＡと比較して組織への取り込み及びグリコーゲンの低減を劇的に改良することを実証した。
【０１４５】
実施例８：動物試験プロトコール
ＡＡＶｈｕ６８ベクターを、Ｐｅｎｎ  Ｖｅｃｔｏｒ  Ｃｏｒｅにより、記載の通りに作製し、力価測定した（Ｌｏｃｋ，Ａｌｖｉｒａ  ｅｔ  ａｌ．２０１０，“Ｒａｐｉｄ，ｓｉｍｐｌｅ，ａｎｄ  ｖｅｒｓａｔｉｌｅ  ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ  ｏｆ  ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ  ａｄｅｎｏ−ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ  ｖｉｒａｌ  ｖｅｃｔｏｒｓ  ａｔ  ｓｃａｌｅ．”Ｈｕｍ  Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ  ２１（１０）：１２５９−１２７１）。
【０１４６】
Ｃ５７ＢＬ／６／１２９バックグラウンドのＧａａノックアウトポンペ病マウス（Ｍｕｓ  ｍｕｓｃｕｌｕｓ）を、Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｌａｂｓで購入した（ｓｔｏｃｋ＃００４１５４、６ｎｅｏマウスとしても公知）。
【０１４７】
０．１ｍＬ中の５×１０１１ＧＣ（約２．５×１０１３ＧＣ／ｋｇ）のＡＡＶｈｕ６８．ＣＡＧ．ｈＧＡＡ（天然のｈＧＡＡ（配列番号４５）または改変されたｈＧＡＡ（配列番号３８）を含む）を側尾静脈を介して投与したマウスを、ベクター投与後の７日目及び２１日目に血清単離のために採血し、注射の２８日後に最終採血（血漿単離のため）し、失血により安楽死させた。直後に組織を脳から始めて採取した。
【０１４８】
ＧＡＡ活性
血漿を５．６ｍＭの４−ＭＵ−α−グルコピラノシド（ｐＨ４．０）と混合し、３７℃で３時間インキュベートした。反応を０．４Ｍの炭酸ナトリウム（ｐＨ１１．５）で停止させた。相対蛍光単位（ＲＦＵ）をＶｉｃｔｏｒ３蛍光光度計を使用して測定した（励起３５５ｎｍ及び発光４６０ｎｍ）。ｎｍｏｌ／ｍＬ／ｈｒを単位とする活性を、４−ＭＵの検量線から内挿法により計算した。個々の組織試料における活性は、ホモジネート中の総タンパク質含有量に基づいて更に正規化した。
【０１４９】
ＬＣ／ＭＳによるＧＡＡシグネチャペプチド
血漿を１００％のメタノールで沈殿させ、遠心分離した。上澄みを廃棄した。ペレットに、内部標準として安定同位体標識されたｈＧＡＡに特有のペプチドを加え、トリプシンで再懸濁し、３７℃で１時間インキュベートした。消化を１０％のギ酸で停止させた。トリプシンペプチドをＣ−１８逆相クロマトグラフィーにより分離し、ＥＳＩ質量分析により同定及び定量化した。総ＧＡＡ血漿濃度をシグネチャペプチド濃度から計算した。
【０１５０】
細胞表面受容体結合アッセイ
９６ウェルプレートを受容体でコーティングし、洗浄し、ＢＳＡでブロッキングした。ＡＡＶにより処置されたマウスからの２８日目の血漿を、連続希釈し、減少する一連の濃度を得、結合させた受容体と共にインキュベートした。インキュベーション後、プレートを洗浄して、任意の結合していないｈＧＡＡを除去し、４−ＭＵ−α−グルコピラノシドを３７℃で１時間添加した。反応を１．０Ｍのグリシン（ｐＨ１０．５）で停止させ、ＲＦＵをＳｐｅｃｔｒａｍａｘ蛍光光度計（励起３７０ｎｍ及び発光４６０ｎｍ）により読み取った。各試料のＲＦＵを、４−ＭＵの検量線から内挿法によって活性（ｎｍｏｌ／ｍＬ／ｈｒ）に変換した。非線形回帰をＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍを使用して行った。
【０１５１】
組織学的検査
組織をホルマリン固定し、パラフィン包埋した。筋肉スライドをＰＡＳで染色し、ＣＮＳスライドをルクソールファストブルー／過ヨウ素酸シッフ（ＰＡＳ）で染色した。委員会認定の獣医病理学者（ＪＨ）が、組織スライドを盲検的に評価した。グリコーゲン蓄積及び細胞質空胞化を有する細胞の全体での百分率の半定量的推定を、調査したスライドガラスに対して行った。０〜４のスコアを下表に記載するように付けた。
2021521851.tif 000025
【０１５２】
免疫組織染色（ＩＨＣ）
本発明者らは、抗ヒトＧＡＡ抗体（Ｓｉｇｍａ  ＨＰＡ０２９１２６）を使用して免疫染色されたスライドガラスにより、導入遺伝子の発現及び細胞局在を調査した。
【０１５３】
実施例９：組織学的検査（組織処理）プロトコール及びポンペ病の動物モデルでの結果
【０１５４】
全ての組織を１０％のＮＢＦ（中性緩衝ホルマリン）で固定した。アッセイ（ＰＡＳ及びＩＨＣ）は、当分野において定型的に使用されている。
【０１５５】
四頭筋及び三頭筋のＰＡＳ染色（図２９及び図３２）。組織を１０％のＮＢＦで固定し、パラフィン中に包埋した。切片を１％の過ヨウ素酸で後固定し、シッフ試薬で染色した。その後、切片をヘマトキシリンで対比染色した。グリコーゲンは、マゼンタ色の凝集体（リソソームに結合）または分散した淡紅色（細胞質性）に見え、核は青色である。画像に基づき、かつ各々が群の代表であると仮定して、グリコーゲンクリアランスの観点での順位序列は、改変されたｈＧＡＡ＞天然のｈＧＡＡである。改変されたｈＧＡＡ構築物は、残りと比較してより画像全体にわたる染色をもたらし、ｖＩＧＦ２のＣＩ−ＭＰＲへの結合により媒介されるＧＡＡタンパク質の改善したエンドサイトーシスを示した。
【０１５６】
脊髄のＰＡＳ染色（図２６）。組織を１０％のＮＢＦで固定した。１％の過ヨウ素酸での後固定は、パラフィン包埋の前または後に行うことができた。切片をシッフ試薬で染色し、おそらくメチレンブルーで対比染色した。グリコーゲンは、マゼンタ色の凝集体（リソソームに結合）に見え、神経線維は青色に見える。画像は、脊髄の前角及び運動ニューロンにおけるグリコーゲン蓄積に焦点を合わせた。改変されたｈＧＡＡは、グリコーゲンの低減において構築物間で最も有効であるように思われた。
【０１５７】
ＧＡＡのＩＨＣ（図２２、図２５、図２７、図３０、及び図３５）。組織を１０％のＮＢＦで固定し、パラフィン中に包埋した。切片を抗ＧＡＡ一次抗体と共にインキュベートし、続いて、一次抗体を認識し、酵素タグであるＨＲＰを保有する二次抗体と共にインキュベートした。その後、酵素反応が実施され、褐色の沈殿生成物が形成された。次いで、切片をヘマトキシリンで対比染色した。構築物は、筋繊維（図３１）へのＧＡＡの取り込みを示した。改変されたｈＧＡＡ＞天然のｈＧＡＡ。ＢｉＰ−ｖＩＧＦ２構築物は、残りと比較して画像全体にわたってより分散した染色を有した。
【０１５８】
他のベクターと比較して、改変されたｈＧＡＡは、筋繊維内に点紋様の外見を有するより多くのＧＡＡ  ＩＨＣシグナルをもたらし、はるかに効果的なリソソーム標的化を示した（図２２）。
【０１５９】
概して、改変されたｈＧＡＡは、種々の組織において組織取り込み、リソソーム標的化、及びグリコーゲンの低減における構築物間での優位性を一貫して実証した。
【０１６０】
本発明の好ましい実施形態が本明細書において示され、かつ記載されたが、かかる実施形態が例示のみを目的として提供されていることは当業者にとって明らかである。当業者は、本発明を逸脱しない範囲で多数の変形形態、変更、及び置換をすぐに思いつくであろう。本明細書に記載の実施形態の種々の代替形態を使用することができることを理解すべきである。下記の特許請求の範囲は本発明の範囲を規定し、この特許請求の範囲の範囲内の方法及び構成ならびそれらの等価物はそれによって包含されることが意図される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１８】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２５】
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【図２６】
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【図２７】
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【図２８】
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【図２９】
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【図３０】
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【図３１】
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【図３２】
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【図３３】
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【国際調査報告】
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