【手続補正書】
【提出日】平成24年7月6日(2012.7.6)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験体においてアルツハイマー病を診断する方法であって、前記被験体からの組織サンプルまたは体液サンプルにおいて少なくとも2つの差異的に発現するタンパク質の存在、非存在または発現の程度を検出することを含み、前記少なくとも2つのタンパク質は、図6、図7、図8または図12で示されたものより選択される方法。
【請求項２】
アルツハイマー病の性質または程度を測定する、請求項1に記載の方法。
【請求項３】
時間の経過にともなうアルツハイマー病の進行を測定する、請求項2に記載の方法。
【請求項４】
ヒトまたは動物被験体において、アルツハイマー病の性質または程度を測定する方法であって、以下の工程：
（a）差異的なレベルのアルツハイマー病症状を示す被験体由来のまたはそのような被験体を表す関連組織若しくは体液サンプルにおいて、少なくとも2つのタンパク質が差異的に発現するというパラダイムを確立する工程；
（b）前記被験体に由来する組織サンプルまたは体液サンプルにおける差異的に発現するタンパク質の存在、非存在または発現の程度を測定する工程；
（c）そのような測定と臨床情報の間の事前の相関関係を参考にして、アルツハイマー病の性質または程度と前記測定とを関連づける工程;
を含み、前記少なくとも2つのタンパク質は、図6、7、8または12で示されたものより選択される方法。
【請求項５】
アルツハイマー病の重篤度を測定する、請求項4に記載の方法。
【請求項６】
アルツハイマー病の継続期間を測定する、請求項4または5に記載の方法。
【請求項７】
組織または体液サンプルは、尿、血液、血漿、血清、唾液または脳脊髄液サンプルである、請求項1から6のいずれか一項に記載の方法。
【請求項８】
対照被験体のものと比較して、前記タンパク質の発現の増加を検出する、請求項1から7のいずれか一項に記載の方法。
【請求項９】
対照被験体のものと比較して、前記タンパク質の発現の減少を検出する、請求項1から7のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１０】
差異的に発現するタンパク質に対する特異的抗体を用いて、サンプル中に前記タンパク質に特異的な自己抗体を検出することにより、またはマススペクトロメトリー法により、前記タンパク質を検出する、請求項1から9のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１１】
差異的に発現するタンパク質を二次元ゲル電気泳動を使用して検出する、請求項1から9のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１２】
前記サンプルを固相支持体に固定化する、請求項10に記載の方法。
【請求項１３】
4つ以上の差異的に発現するタンパク質を検出することを含む、請求項1から12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１４】
アルツハイマー病を緩和する最も適切且つ有効な治療を予測するため、及びその治療の成果をモニターするために、アルツハイマー病に罹患した個体の組織サンプルまたは体液サンプル中の差異的に発現するタンパク質のパターンを用いる、請求項13に記載の方法。
【請求項１５】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6に示される、登録番号P01023のアルファ-2-マクログロブリン前駆体を含む請求項1から14のいずれか一項に記載の方法。
【請求項１６】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6に示されるスポット177に見られる、登録番号P01834の免疫グロブリンλ鎖C領域をさらに含む、請求項15に記載の方法。
【請求項１７】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6に示されるスポット165に見られる血清アルブミン前駆体アイソフォームをさらに含む、請求項16に記載の方法。
【請求項１８】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6、図7、図8または図12に示される１つまたは複数の以下のタンパク質またはその断片：アポリポプロテインA-IV前駆体、アポリポプロテインC-III前駆体、トランスシレチン、ガレクチン7、補体タンパクC4前駆体、補因子H、S100カルシウム結合タンパク質またはセルロプラスミン、ヒストン2B、免疫グロブリンλ鎖C領域、フィブリノーゲンγ鎖前駆体、インター-α-トリプシン重鎖H4前駆体、補体タンパクC3前駆体、クラステリン前駆体、γ若しくはβアクチン、ハプトグロビン前駆体、または図６のスポット番号2、14、15、123、165、176、184に見られる血清アルブミン前駆体アイソフォームをさらに含む、請求項15に記載の方法。
【請求項１９】
前記断片はアポリポプロテインA-IVの270-309残基、補体タンパクC4の680-1446-1744残基を含む、または前記断片はSDS-PAGEで28kDaの断片として移動するアポリポプロテインA-IVのN末断片である、請求項１8に記載の方法。
【請求項２０】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6、図7または図12に示される1つまたは複数の以下のタンパク質またはその断片：α-2-マクログロブリン、免疫グロブリンα-1鎖C、アポリポプロテインA-IV、補因子Hの1つ、あるいは図６のスポット2に見られる血清アルブミン前駆体をさらに含む、請求項1に記載の方法。
【請求項２１】
アルツハイマー病を治療するのにおける有効性を判定するための薬剤のスクリーニング方法であって、以下の工程：
スクリーニングされる薬剤で治療を受けたアルツハイマー症状を示す被験体由来のまたはそのような被験体を表す関連組織若しくは体液サンプルにおいて、差異的に発現するタンパク質の存在、非存在若しくは発現の程度を測定する工程
を含む方法。
【請求項２２】
前記工程の前に、アルツハイマー病症状を示す被験体及び健常被験体由来のまたはそのような被験体を表す関連組織若しくは体液において、少なくとも2つのタンパク質が差異的に発現するというパラダイムを確立する工程をさらに含む、請求項21に記載の方法。
【請求項２３】
前記差異的に発現するタンパク質の発現を、健常被験体のものに移行させる場合、その薬剤を選択する、請求項21または22に記載の方法。
【請求項２４】
前記タンパク質の発現を、健常被験体のものまで移行させる場合、その薬剤を選択する、請求項22に記載の方法。
【請求項２５】
アルツハイマー病を治療するのにおける有効性を判定するための薬剤のスクリーニング方法であって、以下の工程：
スクリーニングされる薬剤で治療を受けたアルツハイマー病症状を示す被験体被験体由来のまたはそのような被験体を表す関連組織若しくは体液サンプルの、経時的に入手した、前記サンプル中の、差異的に発現する少なくとも2つのタンパク質の存在、非存在若しくは発現の程度を測定する工程;
を含み、前記少なくとも2つのタンパク質が図6、図7、図8または図12に示されたものより選択される方法。
【請求項２６】
前記工程の前に、以下の工程：
アルツハイマー病症状を示す被験体及び健常被験体由来のまたはそのような被験体を表す関連組織若しくは体液サンプルにおいて、少なくとも1つのタンパク質が差異的に発現するというパラダイムを確立する工程；並びに
アルツハイマー病症状を示す被験体及び健常被験体由来のまたはそのような被験体を表す関連組織若しくは体液サンプルにおいて、前記差異的に発現するタンパク質の発現が経時的に相違することを確立する工程であって、前記差異的に発現するタンパク質の発現における変化を経時的に防ぐまたは減速する場合、その薬剤を選択する工程；
をさらに含む、請求項25に記載の方法。
【請求項２７】
差異的なレベルのタンパク質発現を示す被験体は、
(a)健常被験体とアルツハイマー病症状を示す被験体；並びに
(b)前記薬剤で治療を受けていないアルツハイマー病症状を示す被験体と前記薬剤の治療を受けたアルツハイマー病症状を示す被験体；
を含む、請求項21から26のいずれか一項に記載の方法。
【請求項２８】
前記薬剤で治療を受けた及び受けていない健常被験体から得られたサンプルにおいて、最適なレベルのタンパク質発現は観察されない、請求項27に記載の方法。
【請求項２９】
アルツハイマー病症状を示す被験体は、アルツハイマー病に罹患したヒト患者である、請求項21から26のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３０】
アルツハイマー病症状を示す被験体は、突然変異型アミロイド前駆体タンパク質（APP）トランスジェニックマウス、プレセニリン1（PS-1）トランスジェニックマウス、APP/PS-1ダブルトランスジェニックマウス、及び／またはグリコーゲンシンターゼキナーゼ・トランスジェニックマウスであり、健常被験体は野生型マウスである、請求項21から26のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３１】
組織または体液サンプルは、脳組織サンプルである、請求項30に記載の方法。
【請求項３２】
組織または体液サンプルは、尿、血液、血漿、血清、唾液または脳脊髄液サンプルである、請求項30または31に記載の方法。
【請求項３３】
関連組織またはそのタンパク質含有抽出物について実施する二次元ゲル電気泳動を用いることによりパラダイムを確立する、請求項4、24または28のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３４】
関連組織またはそのタンパク質含有抽出物のSELDI分析を用いることによりパラダイムを確立する、請求項4、22または26のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３５】
差異的に発現するタンパク質は、図6、図7、図8及び図12に示される、登録番号P15924であるデスモプラキン以外の1つまたは複数のタンパク質、またはそのげっ歯類同等物を含む、請求項21から34のいずれか一項に記載の方法。
【請求項３６】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6、図7、図8または図12に示される1つまたは複数の以下のタンパク質またはその断片：アポリポプロテインA-IV前駆体、アポリポプロテインC-III前駆体、トランスシレチン、ガレクチン7、補体タンパクC4前駆体、ヒストン2B、免疫グロブリンλ鎖C領域、フィブリノーゲンγ鎖前駆体、補因子H、インター-α-トリプシン重鎖H4前駆体、補体タンパクC3前駆体、クラステリン前駆体、γ若しくはβアクチン、ハプトグロビン前駆体、または図６のスポット番号 No.2、14、15、123、165、176、184に見られる血清アルブミン前駆体アイソフォーム、またはそのげっ歯類同等物をさらに含む、請求項35に記載の方法。
【請求項３７】
前記断片はアポリポプロテインA-IVのアミノ酸270-309残基、または補体タンパクC4の1446-1744残基、またはそのげっ歯類同等物を含む、請求項36に記載の方法。
【請求項３８】
前記差異的に発現するタンパク質が、図6、図7または図12に示される1つまたは複数の以下のタンパク質またはその断片：α-2-マクログロブリン、免疫グロブリンα-1鎖C、アポリポプロテインA-IV、補因子H、あるいは図6のスポット2に見られる血清アルブミン前駆体の一つ以上、またはそのげっ歯類同等物をさらに含む、請求項36に記載の方法。
【請求項３９】
請求項21から38のいずれか一項に記載の方法を用いて薬剤を同定することを含み、その薬剤を製造し、且つ製薬組成物を供給するのに適当な担体でそれを製剤化するさらなる工程を含む、製薬組成物を作製する方法。
【請求項４０】
アルツハイマー病被験体及び健常被験体からの関連組織または体液サンプルにおいて、差異的に発現するタンパク質を同定する方法であって、以下の工程：
i）組織サンプル若しくは体液サンプル、またはそこからのタンパク質を含む抽出物を、固相支持体に固定化する工程；
ii）固定化したタンパク質を表面増強レーザー脱離飛行時間質量分析法により分析する工程；
iii）アルツハイマー病被験体及び健常被験体間の、タンパク質発現の差を検出するために得られたスペクトルを比較する工程；
を含む方法。
【請求項４１】
組織または体液サンプルは、血液、血清または脳脊髄液サンプルである、請求項40に記載の方法。
【請求項４２】
前記方法で同定された差異的に発現するタンパク質を単離する工程をさらに含む、請求項40または41に記載の方法。
【請求項４３】
前記単離されたタンパク質を特徴づけする工程をさらに含む、請求項42に記載の方法。