【手続補正書】
【提出日】平成24年7月30日(2012.7.30)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
単離された哺乳動物メタニューモウイルス（ＭＰＶ）であって、前記哺乳動物メタニューモウイルスがパラミクソウイルス科（Paramyxoviridae）のニューモウイルス亜科（Pneumovirinae）に属するマイナスセンス１本鎖ＲＮＡウイルスであり、かつ、前記単離された哺乳動物メタニューモウイルスのＮタンパク質のアミノ酸配列が配列番号３６６に示すアミノ酸配列に対して少なくとも９０％同一であり、その配列同一性はＮタンパク質の全長に対して決定されるものであり、（ｉ）前記ウイルスの少なくとも１つの領域が、哺乳動物メタニューモウイルスの異なる分離株由来の類似の領域に置き換えられており、又は、（ｉｉ）前記ウイルスの少なくとも１つの領域が、哺乳動物メタニューモウイルスの異なる分離株由来の類似の領域に置き換えられており、かつ、前記ウイルスの少なくとも１つの領域が除去されている、哺乳動物メタニューモウイルス。
【請求項２】
前記領域の長さが、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド（ｎｔ）、少なくとも１０ｎｔ、少なくとも２５ｎｔ、少なくとも５０ｎｔ、少なくとも７５ｎｔ、少なくとも１００ｎｔ、少なくとも２５０ｎｔ、少なくとも５００ｎｔ、少なくとも７５０ｎｔ、少なくとも１ｋｂ、少なくとも１．５ｋｂ、少なくとも２ｋｂ、少なくとも２．５ｋｂ、少なくとも３ｋｂ、少なくとも４ｋｂ、又は少なくとも５ｋｂである、請求項１に記載のウイルス。
【請求項３】
前記領域が、Ｎ遺伝子、Ｐ遺伝子、Ｍ遺伝子、Ｆ遺伝子、Ｍ２遺伝子、Ｍ２−１ ＯＲＦ、Ｍ２−２ ＯＲＦ、ＳＨ遺伝子、Ｇ遺伝子、Ｌ遺伝子、リーダー領域、トレーラー領域、又は非コード領域の断片である、請求項１に記載のウイルス。
【請求項４】
前記領域が、Ｎ遺伝子、Ｐ遺伝子、Ｍ遺伝子、Ｆ遺伝子、Ｍ２遺伝子、Ｍ２−１ ＯＲＦ、Ｍ２−２ ＯＲＦ、ＳＨ遺伝子、Ｇ遺伝子、Ｌ遺伝子、リーダー領域、トレーラー領域、又は非コード領域である、請求項１に記載のウイルス。
【請求項５】
前記ウイルスが弱毒化されている、請求項１、２、又は３に記載のウイルス。
【請求項６】
以下のアミノ酸位置、すなわち、Ｆタンパク質のアミノ酸９９位から１０２位までのＲＱＳＲ、Ｌタンパク質のアミノ酸４５６位のＰｈｅ、Ｌタンパク質のアミノ酸７４９位のＧｌｕ、Ｌタンパク質のアミノ酸１２４６位のＴｙｒ、Ｌタンパク質のアミノ酸１０９４位のＭｅｔ、及び、Ｌタンパク質のアミノ酸７４６位のＬｙｓの１つ又は複数に、少なくとも１つの改変をもたらす少なくとも１つの遺伝子組換えを含む弱毒化ｈＭＰＶ。
【請求項７】
前記遺伝子組換えが欠失、置換、又は付加である、請求項６に記載の弱毒化ウイルス。
【請求項８】
少なくとも１つの遺伝的改変が、１コドンあたり２又は３ヌクレオチドの置換又は欠失からなる、請求項６に記載の弱毒化ウイルス。
【請求項９】
弱毒化哺乳動物メタニューモウイルスであって、前記哺乳動物メタニューモウイルスのゲノム中の少なくとも１つのオープンリーディングフレームの位置が変化している、弱毒化哺乳動物メタニューモウイルス。
【請求項１０】
前記オープンリーディングフレームが、Ｎタンパク質、Ｐタンパク質、Ｍタンパク質、Ｆタンパク質、Ｍ２タンパク質、ＳＨタンパク質、Ｇタンパク質、又はＬタンパク質をコードする、請求項９に記載の弱毒化哺乳動物メタニューモウイルス。
【請求項１１】
サンプル中の哺乳動物メタニューモウイルスを検出する方法であって、選択される第２の核酸に対しストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする第１の核酸と、サンプルとを接触させることを含み、第２の核酸の配列が、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、又は配列番号２１である、上記方法。
【請求項１２】
サンプル中の哺乳動物メタニューモウイルスを検出する方法であって、配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一である、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一である、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一である、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一である、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一である、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一である、又は配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一であるタンパク質をコードする第２の核酸に対しストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズする第１の核酸と、前記サンプルとを接触させることを含む方法。
【請求項１３】
サンプル中の哺乳動物メタニューモウイルスを検出する方法であって、タンパク質、又はタンパク質の断片を特異的に認識する抗体又はそのフラグメントと、前記サンプルとを接触させることを含み、前記タンパク質の配列が、配列番号３７４、配列番号３５８、配列番号３１４、配列番号３３８、配列番号３４６、配列番号３３０、配列番号３２２、配列番号３８２、配列番号３６６、配列番号３２４、配列番号３６８、配列番号３７６、配列番号３６０、配列番号３１６、配列番号３４０、配列番号３４８、配列番号３８４、配列番号３３２、配列番号３２５、配列番号３６９、配列番号３７７、配列番号３６１、配列番号３１７、配列番号３４１、配列番号３４９、配列番号３８５、配列番号３３３、配列番号３２３、配列番号３６７、配列番号３７５、配列番号３５９、配列番号３１５、配列番号３３９、配列番号３４７、配列番号３８３、又は配列番号３３１である、上記方法。
【請求項１４】
サンプル中の哺乳動物メタニューモウイルスを検出する方法であって、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一である、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一である、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一である、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一である、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一である、配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一である、又は配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一であるタンパク質又はタンパク質の断片を特異的に認識する抗体又はそのフラグメントと、前記サンプルとを接触させることを含む方法。
【請求項１５】
哺乳動物のＭＰＶ感染を血清学的に検出する方法であって、前記哺乳動物から得たサンプル中における、ＭＰＶ又はその構成要素に対して特異的な抗体又はそのフラグメントの存在を、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一である、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一である、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一である、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一である、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一である、配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一である、又は配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一であるタンパク質又はタンパク質の断片と、前記サンプルとを反応させることによって検出することを含み、前記ウイルスが、シチメンチョウ鼻気管炎ウイルス（ＴＲＴＶ）に関連するよりも、Ｉ−２６１４としてＣＮＣＭ（パリ）に寄託されたウイルス分離株に、系統学上より密接に関連している、上記方法。
【請求項１６】
哺乳動物のＭＰＶ感染を血清学的に検出する方法であって、前記哺乳動物から得たサンプル中における、ＭＰＶ又はその構成要素に対して特異的な抗体又はそのフラグメントの存在を、ＭＰＶ又はその構成要素と前記サンプルとを反応させることによって検出することを含み、前記ウイルスが、シチメンチョウ鼻気管炎ウイルス（ＴＲＴＶ）に関連するよりも、Ｉ−２６１４としてＣＮＣＭ（パリ）に寄託されたウイルス分離株に、系統学上より密接に関連している、上記方法。
【請求項１７】
サンプル中のＭＰＶを検出する方法であって、核酸又はその断片と、前記サンプルとを接触させることを含み、前記核酸が、配列番号３７８、配列番号３６２、配列番号３１８、配列番号３４２、配列番号３５０、配列番号３２６、配列番号３３４、配列番号３８６、配列番号３７０、配列番号３７９、配列番号３６３、配列番号３１９、配列番号３４３、配列番号３５１、配列番号３２７、配列番号３３５、配列番号３８７、配列番号３７１、配列番号３８０、配列番号３６４、配列番号３２０、配列番号３４４、配列番号３５２、配列番号３２８、配列番号３３６、配列番号３８８、配列番号３７２、配列番号３８１、配列番号３６５、配列番号３２１、配列番号３４５、配列番号３５３、配列番号３２９、配列番号３３７、配列番号３８９、配列番号３７３、又は配列番号３５７である、上記方法。
【請求項１８】
サンプル中のＭＰＶを検出する方法であって、核酸又はその断片と、前記サンプルとを接触させることを含み、前記核酸が、配列番号８４〜１１８、配列番号１５４〜２３３、配列番号３１８〜３２１、配列番号３２６〜３２９、配列番号３３４〜３３７、配列番号３４２〜３４５、配列番号３５０〜３５７、配列番号３６２〜３６５、配列番号３７０〜３７３、配列番号３７８〜３８１、及び配列番号３８６〜３８９からなる群より選択される、上記方法。
【請求項１９】
前記断片の長さが、少なくとも１０、少なくとも１５、少なくとも２０、少なくとも２５、少なくとも５０、少なくとも７５、少なくとも１００、少なくとも１５０、少なくとも２５０、少なくとも５００、少なくとも７５０、又は少なくとも１０００ヌクレオチドである、請求項１７又は１８に記載の方法。
【請求項２０】
サンプル中の哺乳動物メタニューモウイルスを検出する方法であって、第３の核酸に対しストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下でそれぞれハイブリダイズする第１の核酸及び第２の核酸と、前記サンプルとを接触させることを含み、第３の核酸が、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、及び配列番号２１、又はその断片である、上記方法。
【請求項２１】
哺乳動物のＭＰＶ感染を検出する方法であって、前記哺乳動物のサンプル中で、ＭＰＶ又はその構成要素の存在を、Ｆ、Ｌ、Ｎ、Ｍ、Ｐ、Ｍ２、Ｇ、及びＳＨからなる群より選択されるＭＰＶタンパク質を特異的に認識する抗体と、前記サンプルとを接触させることによって決定することを含む方法。
【請求項２２】
ヒトのＭＰＶ感染を検出する方法であって、ヒトのサンプル中で、ＭＰＶ又はその構成要素の存在を、Ｆ、Ｌ、Ｎ、Ｍ、Ｐ、Ｍ２、Ｇ、及びＳＨからなる群より選択されるｈＭＰＶタンパク質を特異的に認識する抗体と、前記サンプルとを接触させることによって決定することを含む方法。
【請求項２３】
ＭＰＶを検出するためのキットであって、前記ウイルスが、シチメンチョウ鼻気管炎ウイルス（ＴＲＴＶ）に関連するよりも、Ｉ−２６１４としてＣＮＣＭ（パリ）に寄託されたウイルス分離株に、系統学上より密接に関連しており、配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一、又は配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一であるタンパク質を、１つ又は複数の容器の中に含むキット。
【請求項２４】
タンパク質を検出する手段をさらに含む、請求項２３に記載のキット。
【請求項２５】
ＭＰＶを検出するためのキットであって、前記ウイルスが、シチメンチョウ鼻気管炎ウイルス（ＴＲＴＶ）に関連するよりも、Ｉ−２６１４としてＣＮＣＭ（パリ）に寄託されたウイルス分離株に、系統学上より密接に関連しており、配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一、又は配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一であるタンパク質に特異的に結合する抗体を１つ又は複数の容器の中に含むキット。
【請求項２６】
前記抗体を検出する手段をさらに含む、請求項２５に記載のキット。
【請求項２７】
ＭＰＶを検出するためのキットであって、前記ウイルスが、シチメンチョウ鼻気管炎ウイルス（ＴＲＴＶ）に関連するよりも、Ｉ−２６１４としてＣＮＣＭ（パリ）に寄託されたウイルス分離株に、系統学上より密接に関連しており、配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一、又は配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一であるタンパク質をコードする核酸又はその断片を１つ又は複数の容器の中に含むキット。
【請求項２８】
ＭＰＶを検出するためのキットであって、前記ウイルスが、シチメンチョウ鼻気管炎ウイルス（ＴＲＴＶ）に関連するよりも、Ｉ−２６１４としてＣＮＣＭ（パリ）に寄託されたウイルス分離株に、系統学上より密接に関連しており、配列番号３７８、配列番号３６２、配列番号３１８、配列番号３４２、配列番号３５０、配列番号３２６、配列番号３３４、配列番号３８６、配列番号３７０、配列番号３７９、配列番号３６３、配列番号３１９、配列番号３４３、配列番号３５１、配列番号３２７、配列番号３３５、配列番号３８７、配列番号３７１、配列番号３８０、配列番号３６４、配列番号３２０、配列番号３４４、配列番号３５２、配列番号３２８、配列番号３３６、配列番号３８８、配列番号３７２、配列番号３８１、配列番号３６５、配列番号３２１、配列番号３４５、配列番号３５３、配列番号３２９、配列番号３３７、配列番号３８９、配列番号３７３、配列番号３５７、配列番号３１４、及び配列番号２２〜８３からなる核酸の群から選択される核酸に対して少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は少なくとも９９．５％同一である１つ又は複数の核酸又はその断片を含むキット。
【請求項２９】
前記核酸又はその断片を検出する手段をさらに含む、請求項２７又は２８に記載のキット。
【請求項３０】
哺乳動物のＭＰＶ感染を診断する診断薬の製造のための、配列番号３７４に対して少なくとも７０％同一である、配列番号３５８に対して少なくとも９０％同一である、配列番号３１４に対して少なくとも８２％同一である、配列番号３３８に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３４６に対して少なくとも６０％同一である、配列番号３３０に対して少なくとも８５％同一である、配列番号３２２に対して少なくとも２０％同一である、配列番号３８２に対して少なくとも３０％同一である、又は配列番号３６６に対して少なくとも９０％同一であるタンパク質の使用。
【請求項３１】
哺乳動物のＭＰＶ感染を診断する診断薬の製造のための、ＭＰＶ又はその構成要素の使用。
【請求項３２】
哺乳動物のＭＰＶ感染を診断する診断薬の製造のための、Ｆ、Ｌ、Ｎ、Ｍ、Ｐ、Ｍ２、Ｇ、及びＳＨからなる群より選択されるＭＰＶタンパク質を特異的に認識する抗体の使用。
【請求項３３】
哺乳動物のＭＰＶ感染を診断する診断薬の製造のための、Ｆ、Ｌ、Ｎ、Ｍ、Ｐ、Ｍ２、Ｇ、及びＳＨからなる群より選択されるｈＭＰＶタンパク質を特異的に認識する抗体の使用。
【請求項３４】
単離された哺乳動物メタニューモウイルスであって、前記哺乳動物メタニューモウイルスがパラミクソウイルス科（Paramyxoviridae）のニューモウイルス亜科（Pneumovirinae）に属するマイナスセンス１本鎖ＲＮＡウイルスであり、かつ、前記単離された哺乳動物メタニューモウイルスのＮタンパク質のアミノ酸配列が配列番号３６６に示すアミノ酸配列に対して少なくとも９０％同一であり、その配列同一性はＮタンパク質の全長に対して決定されるものであり、前記哺乳動物メタニューモウイルスのＭ２遺伝子が除去されている、哺乳動物メタニューモウイルス。