【手続補正書】
【提出日】平成24年4月5日(2012.4.5)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
女性の卵巣癌の診断方法であって、女性から採取した尿中のメソセリン／巨核球可能化因子族（ＭＭＰＦＦ）ペプチド(mesothelin/megakaryocyte potentiating factor family
peptide)の発生を査定することを含んで構成され、それにより尿中のＭＭＰＦＦペプチドの発生が女性の卵巣癌にかかっていることの示唆とすることを特徴とする方法。
【請求項２】
請求項１に記載の方法であって、前記卵巣癌は上皮卵巣癌であることを特徴とする方法。
【請求項３】
請求項１に記載の方法であって、前記卵巣癌は間質卵巣癌であることを特徴とする方法。
【請求項４】
請求項１に記載の方法であって、前記卵巣癌は幹細胞卵巣癌であることを特徴とする方法。 
【請求項５】
請求項１に記載の方法であって、尿中におけるＭＭＰＦＦペプチドの発生は特にＭＭＰＦＦペプチドと結合する第１抗体と尿を接触させ、ＭＭＰＦＦペプチドが前記第１抗体と結合したかどうかを査定することによって査定することを特徴とする方法。
【請求項６】
請求項５に記載の方法であって、尿を第１抗体と接触させる前に尿を遠心分離機にかけて沈殿物があればそれをそこから殆ど取り除くことを特徴とする方法。
【請求項７】
請求項５に記載の方法であって、第１抗体は担体と結合していることを特徴とする方法。
【請求項８】
請求項７に記載の方法であって、前記担体はプラスチック容器であることを特徴とする方法。
【請求項９】
請求項８に記載の方法であって、前記容器はマルチウエルプレートであることを特徴とする方法。
【請求項１０】
請求項９に記載の方法であって、前記プレートはロボット装置による自動分析に適合するようになっているものであることを特徴とする方法。
【請求項１１】
請求項５に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドと第１抗体との結合は、尿と前記第１抗体の接触の後、特にＭＭＰＦＦペプチドと結合する第２抗体と第１抗体を接触させ、第１と第２の抗体が一緒に局在しているかを査定することによって査定することを特徴とする方法。
【請求項１２】
請求項１１に記載の方法であって、前記尿は、第１抗体と第２抗体の接触前少なくとも１０分間第１抗体と接触していることを特徴とする方法。
【請求項１３】
請求項１１に記載の方法であって、前記尿は、第１抗体と第２抗体の接触前少なくとも６０分間第１抗体と接触していることを特徴とする方法。
【請求項１４】
請求項１１に記載の方法であって、第２抗体は検出可能にラベル付けしてあることを特徴とする方法。
【請求項１５】
請求項１４に記載の方法であって、前記第２抗体は酵素、放射性核種、発蛍光団、及び発色団を構成する群から選択された化合物と連接していることを特徴とする方法。
【請求項１６】
請求項１１に記載の方法であって、第２抗体は配位子に連接しており、第１及び第２抗体の局在が、第２抗体と(i) 配位子と結合する受容体と（ii）検出可能ラベル、から構成される化合物との接触によって査定されることを特徴とする方法。
【請求項１７】
請求項１６に記載の方法であって、前記ラベルは酵素、放射性核種、発蛍光団、及び発色団を構成する群から選択されていることを特徴とする方法。
【請求項１８】
請求項１６に記載の方法であって、前記配位子はビオチンであり前記受容体はアビジンであることを特徴とする方法。
【請求項１９】
請求項１８に記載の方法であって、前記アビジンはストレプタビジン(streptavidin)であることを特徴とする方法。
【請求項２０】
請求項１９に記載の方法であって、前記ラベルは酵素であることを特徴とする方法。 
【請求項２１】
請求項２０に記載の方法であって、前記酵素は西洋わさびペルオキシダーゼ(horseradish
peroxidase)であることを特徴とする方法。
【請求項２２】
請求項２１に記載の方法であって、第１及び第２抗体の局在は３、３’、５、５’−テトラメチルベンジジンであることを特徴とする方法。
【請求項２３】
請求項５に記載の方法であって、第１抗体と尿を接触させた後に、第１抗体と第１抗体をラベル付けした担体とを接触させ、尿と接触させた第１抗体と結合するラベル付けした配位子の量と、尿と接触させなかった等量の第１抗体と結合するラベル付けした配位子の量を比較することを特徴とする方法。
【請求項２４】
請求項２３に記載の方法であって、ラベル付けした配位子はＭＭＰＦＦペプチドと同じアミノ酸配列を有していることを特徴とする方法。
【請求項２５】
請求項２４に記載の方法であって、ラベル付けした配位子のグリコシル化状態はＭＭＰＦＦペプチドのグリコシル化状態と同じであることを特徴とする方法。
【請求項２６】
請求項１に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドはグリコシル化されていることを特徴とする方法。
【請求項２７】
請求項１に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号１から５よりなる群から選択された１つの配列の少なくとも１０の連続する残基から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項２８】
請求項２７に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号１から５よりなる群から選択された１つの配列の少なくとも２０の連続する残基から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項２９】
請求項２７に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号１から５よりなる群から選択された１つの配列の少なくとも５０の連続する残基から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項３０】
請求項２７に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号１から５よりなる群から選択された１つの配列の少なくとも２００の連続する残基から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項３１】
請求項２７に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号１から５よりなる群から選択された１つの配列から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項３２】
請求項２７に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号４の少なくとも１０の連続的残基から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項３３】
請求項２７に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドのアミノ酸配列は、配列ＩＤ番号５の少なくとも１０の連続的残基から構成されていることを特徴とする方法。
【請求項３４】
請求項１に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドは、少なくとも２０の連続アミノ酸残基の部分からなり、その部分のアミノ酸配列は配列ＩＤ番号１から５よりなる群から選択された１つの配列の２０の連続残基に対し少なくとも９０％同じであることを特徴とする方法。
【請求項３５】
請求項３４に記載の方法であって、ＭＭＰＦＦペプチドは、少なくとも２０の連続アミノ酸残基の部分からなり、その部分のアミノ酸配列は配列ＩＤ番号４と５よりなる群から選択された１つの配列の２０の連続残基に対し少なくとも９０％同じであることを特徴とする方法。
【請求項３６】
請求項１に記載の方法であって、更に、女性の尿中の第２卵巣癌マーカーの発生の査定を含んで構成され、尿中の前記第２マーカーの発生もまた女性が卵巣癌にかかっていることの示唆であることを特徴とする方法。
【請求項３７】
請求項３６に記載の方法であって、前記第２の卵巣癌マーカーは尿ゴナドトロピンペプチド（urinary gonadotropin peptide)、システインプロテイナーゼ(cysteine proteinase)、ネオプテリン(neopterin)、及び腫瘍関連トリプシン抑制剤(tumor-associated trypsin inhibitor)よりなる群から選択されたものであることを特徴とする方法。
【請求項３８】
請求項１に記載の方法であって、更に、女性の血清中の第２卵巣癌マーカーの発生の査定を含んで構成され、血清中の前記第２マーカーの発生もまた女性が卵巣癌にかかっていることの示唆であることを特徴とする方法。
【請求項３９】
請求項３８に記載の方法であって、前記第２卵巣癌マーカーはＣＡ１２５、癌性胎児抗原(carcinoembryonic antigen）、血管内皮成長因子（vascular endothelial growth factor）、腫瘍関連トリプシン抑制剤(tumor-associated trypsin inhibitor)、ＣＤ４４スプライス変形体（splice variants)、抗マリグニン抗体(anti-malignin antibody)、乳酸脱水素酵素（lactate dehydrogenase)、アルファーヒドロキシ酪酸脱水素酵素 (alpha-hydroxybutyrate dehydrogenase)、ＣＡ１９−９、組織ポリペプチド抗原(tissue polypeptide antigen)、及びシアリルＴＮよりなる群から選択されたものであることを特徴とする方法。
【請求項４０】
請求項３８に記載の方法であって、前記第２の卵巣癌マーカーはＣＡ１２５であることを特徴とする方法。
【請求項４１】
請求項１に記載の方法はさらに女性の血清中のＭＭＰＦＦペプチドの発生の査定を含んで構成され、血清中の前記ＭＭＰＦＦペプチドの発生もまた女性が卵巣癌にかかっていることの示唆であることを特徴とする方法。
【請求項４２】
女性が卵巣癌になった可能性を査定する方法であって、その方法は女性から採取した尿中のメソセリン／巨核球可能化因子族（ＭＭＰＦＦ）ペプチド(mesothelin/megakaryocyte potentiating factor family peptide)の発生を査定することを含んで構成され、尿中にＭＭＰＦＦペプチドが発生するということは、その女性が、尿中にＭＭＰＦＦの発生がなくその他では同じ女性に較べてより卵巣癌になりやすいことを示唆するものであることを特徴とする方法。
【請求項４３】
女性の卵巣癌の治療の効果を査定する方法であって、治療後の女性から採取した尿中のメソセリン／巨核球可能化因子族（ＭＭＰＦＦ）ペプチド(mesothelin/megakaryocyte potentiating factor family peptide)の量を査定し、その量と手術前その女性から採取した尿中のＭＭＰＦＦペプチドの量を比較することから構成され、手術後の尿中のＭＭＰＦＦペプチドの量がより少なくなっていれば手術が効果的であったことを示していることを特徴とする方法。
【請求項４４】
女性から採取した尿中のメソセリン／巨核球可能因子族（ＭＭＰＦＦ）ペプチド(mesothelin/megakaryocyte potentiating factor family peptide)の発生を査定するキットであって、そのキットは配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選定された一つの配列の少なくとも１０の連続する残基を含んで構成されるＭＭＰＦＦペプチドと結合するための第１薬剤と、尿を浄化する装置と、浄化した尿と前記第１薬剤を接触することを記述する使用説明書から構成されていることを特徴とするキット。
【請求項４５】
請求項４４に記載のキットであって、前記第１薬剤は抗体であることを特徴とするキット。
【請求項４６】
請求項４５に記載のキットであって、前記抗体は薄い金属フィルムに結合されていることを特徴とするキット。
【請求項４７】
請求項４６に記載のキットであって、前記フィルムは表面プラズモン共鳴装置内の分析に用いられることを特徴とするキット。
【請求項４８】
請求項４４に記載のキットであって、更に、ＭＭＰＦＦペプチドが前記第１薬剤との結合を査定するための第２薬剤を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項４９】
請求項４８に記載のキットであって、前記第２薬剤は前記第１薬剤の検出可能にラベルをつけた配位子であることを特徴とするキット。
【請求項５０】
請求項４９に記載のキットであって、前記第１薬剤は抗体で前記配位子はＭＭＰＦＦペプチドであることを特徴とするキット。
【請求項５１】
請求項４９に記載のキットであって、前記配位子は酵素、放射性核種、発蛍光団、及び発色団よりなる群から選択された化合物でラベル付けされていることを特徴とするキット。
【請求項５２】
請求項４８に記載のキットであって、前記第２薬剤は検出可能にラベル付けした抗体であることを特徴とするキット。
【請求項５３】
請求項５２に記載のキットであって、前記抗体はビオチン化した抗体であることを特徴とするキット。
【請求項５４】
請求項５２に記載のキットであって、前記抗体は酵素、放射性核種、発蛍光団、及び発色団よりなる群から選択された化合物でラベル付けされていることを特徴とするキット。
【請求項５５】
請求項４８に記載のキットであって、前記第１薬剤は検出可能にラベル付けされている抗体と結合するエピトープとは異なるＭＭＰＦＦのエピトープと結合する抗体であることを特徴とするキット。 
【請求項５６】
請求項４４に記載のキットであって、前記装置は女性から採取した尿サンプルを遠心分離する装置であることを特徴とするキット。
【請求項５７】
請求項４４に記載のキットであって、前記第１薬剤は担体に結合されていることを特徴とするキット。 
【請求項５８】
請求項５７に記載のキットであって、前記担体はプラスチックの容器であることを特徴とするキット。
【請求項５９】
請求項５８に記載のキットであって、前記容器はマルチウエルプレートであることを特徴とするキット。
【請求項６０】
請求項５９に記載のキットであって、前記プレートはロボット装置による自動分析に適合するように作製されたものであることを特徴とするキット。
【請求項６１】
請求項５８に記載のキットであって、前記第１薬剤は抗体であることを特徴とするキット。
【請求項６２】
請求項６１に記載のキットであって、前記第２薬剤は第２抗体であることを特徴とするキット。
【請求項６３】
請求項６２に記載のキットであって、前記第２抗体は配位子に連接されていることを特徴とするキット。
【請求項６４】
請求項６３に記載のキットであって、更に、（i）前記配位子と結合する受容体と（ii）検出可能なラベルを含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項６５】
請求項６４に記載のキットであって、ラベルは酵素、放射性核種、発蛍光団、及び発色団よりなる群から選択された化合物でラベル付けされていることを特徴とするキット。
【請求項６６】
請求項６５に記載のキットであって、前記配位子はビオチンであり、前記受容体はアビジンであることを特徴とするキット。
【請求項６７】
請求項６６に記載のキットであって、前記アビジンはストレプタビジン(streptavidin)であることを特徴とするキット。
【請求項６８】
請求項６７に記載のキットであって、前記ラベルは酵素であることを特徴とするキット。
【請求項６９】
請求項６８に記載のキットであって、前記酵素は西洋からしペルオキシダーゼ(horseradish peroxidase)であることを特徴とするキット。
【請求項７０】
請求項６９に記載のキットであって、更に、３、３’、５、５’−テトラメチルベンジジンを含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７１】
請求項４４に記載のキットであって、更に、対照例としてのＭＭＰＦＦペプチドを含んで構成され、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選ばれたひとつの配列の少なくとも１０の連続する残基を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７２】
請求項７１に記載のキットであって、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選ばれたひとつの配列の少なくとも２０の連続する残基を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７３】
請求項７１に記載のキットであって、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選ばれたひとつの配列の少なくとも５０の連続する残基を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７４】
請求項７１に記載のキットであって、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選ばれたひとつの配列の少なくとも２００の連続する残基を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７５】
請求項７１に記載のキットであって、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選ばれたひとつの配列を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７６】
請求項７１に記載のキットであって、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号４の少なくとも１０の連続する残基を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７７】
請求項７１に記載のキットであって、対照例ペプチドのアミノ酸配列は配列ＩＤ番号５の少なくとも１０の連続する残基を含んで構成されていることを特徴とするキット。
【請求項７８】
請求項４４に記載のキットであって、更に、少なくとも２０の連続するアミノ酸残基の部分を含んで構成される対照例ペプチドを含み、その部分のアミノ酸配列は配列ＩＤ番号３から５よりなる群から選択された配列の２０の連続する残基と少なくとも９０％同一であることを特徴とするキット。
【請求項７９】
請求項７８に記載のキットであって、前記対照例ペプチドは少なくとも２０の連続するアミノ酸残基の部分を含んで構成され、その部分のアミノ酸配列は配列ＩＤ番号４と５よりなる群から選択された配列の２０の連続する残基と少なくとも９０％同一であることを特徴とするキット。
【請求項８０】
請求項４４に記載のキットであって、更に、女性の尿中の第２卵巣癌マーカーの発生を査定する試薬を含んで構成されることを特徴とするキット。
【請求項８１】
請求項８０に記載のキットであって、前記第２の卵巣癌マーカーは尿ゴナドトロピンペプチド（urinary gonadotropin peptide)、システインプロテイナーゼ(cysteine proteinase)、ネオプテリン(neopterin)、腫瘍関連トリプシン抑制剤(tumor-associated trypsin
inhibitor)よりなる群から選択されたものであることを特徴とするキット。
【請求項８２】
請求項４４に記載のキットであって、更に、女性の血清中の第２卵巣癌マーカーの発生を査定する試薬を含んで構成されることを特徴とするキット。
【請求項８３】
請求項８２に記載のキットであって、前記第２卵巣癌マーカーはＣＡ１２５、癌性胎児抗原(carcinoembryonic antigen）、血管内皮成長因子（vascular endothelial growth factor）、腫瘍関連トリプシン抑制剤(tumor-associated trypsin inhibitor)、ＣＤ４４スプライス変形体（splice variants)、抗マリグニン抗体(anti-malignin antibody)、乳酸脱水素酵素（lactate dehydrogenase)、アルファーヒドロキシ酪酸脱水素酵素(alpha-hydroxybutyrate dehydrogenase)、ＣＡ１９−９、組織ポリペプチド抗原(tissue polypeptide antigen)、及びシアリルＴＮよりなる群から選択されたものであることを特徴とするキット。
【請求項８４】
請求項８３に記載のキットであって、前記第２の卵巣癌マーカーはＣＡ１２５であることを特徴とするキット。