(57)【要約】  ヌクレオシドの塩基部分が、少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環カルボニルもしくはチオカルボニル基で置換された式（Ｉ）の新規ヌクレオシドモノマー化合物を合成ユニットとして用いて、核酸オリゴマーを製造することにより、各反応毎のカラムクロマト精製を回避でき、３’方向へも５’方向へも塩基伸長ができ、核酸オリゴマーを、液相合成法により効率的に大量合成することができる。2014077292.tif 000235［式中、Ｘ、Ｒ１、Ｙ、Ｂａｓｅ、Ｚ、Ａｒ、Ｒ２、Ｒ３、ｎは請求項１に記載の意味を表す。］
2014077292.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記式（Ｉ）：
【化１】
2014077292.tif 000212
［式中、
ＸおよびＲ１は、それぞれ独立して、水素原子、またはヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｂａｓｅは、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｚは、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］
で表される化合物またはその塩。
【請求項２】
Ａｒ環が、さらに置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよいＣ６−１０芳香族炭化水素環である、請求項１に記載の化合物またはその塩。
【請求項３】
Ｒ２が、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基である、請求項１に記載の化合物またはその塩。
【請求項４】
Ｒ３が、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基である、請求項１に記載の化合物またはその塩。
【請求項５】
ｎが、１または２である、請求項１に記載の化合物またはその塩。
【請求項６】
下記（ａ０）および（ｂ０）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化２】
2014077292.tif 000213
［式中、
Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ０）の工程：
下記式（Ｉ）：
【化３】
2014077292.tif 000214
［式中、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示し、
ＸおよびＲ１は、それぞれ独立して、水素原子、またはヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｚは、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］
で表される化合物またはその塩を用いて下記式（ＩＶ’）：
【化４】
2014077292.tif 000215
［式中、
Ｒ１、Ｂａｓｅ、Ｚ、Ａｒ環、Ｒ２、Ｒ３、Ｑ、ｒ’およびｎは、それぞれ上記と同義を示し、
Ｙは、独立して上記と同義を示し、
Ｐｒ４は、独立して、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは、水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化５】
2014077292.tif 000216
[式中、Ｂａｓｅ、Ｚ、Ａｒ環、Ｒ２、Ｒ３およびｎは、それぞれ独立して上記と同義を示す。]を示す。］
で表わされる化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ０）の工程：
上記式（ＩＶ’）で表される化合物またはその塩を用いて上記式（ＩＩ）で表される化合物またはその塩を製造する工程。
【請求項７】
下記（ａ１）、（ｂ１）および（ｃ１）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化６】
2014077292.tif 000217
［式中、
Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ１）の工程：
核酸合成で使われるカップリング試薬の存在下に、
下記式（ＩＩＩ）：
【化７】
2014077292.tif 000218
［式中、
Ｘ１は、ヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｐｒ１は、独立して、保護されたヒドロキシ基を示し、
Ｐｒ２ａは、置換されたアミノ基を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化８】
2014077292.tif 000219
［式中、
Ｚは、独立して、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、独立して、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、独立して、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示し、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。]を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑおよびｒは、上記と同義を示す。］
で表わされる化合物またはその塩と、下記式（ＩＶ）：
【化９】
2014077292.tif 000220
［式中、Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を反応させて、下記式（Ｖ）：
【化１０】
2014077292.tif 000221
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ１）の工程：
上記（ａ１）の工程で製造される式（Ｖ）で表される化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、下記式（ＶＩ）：
【化１１】
2014077292.tif 000222
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｃ１）の工程：
上記（ｂ１）の工程により製造される式（ＶＩ）で表される化合物またはその塩を脱保護反応に付す工程。
【請求項８】
下記（ａ２）、（ｂ２）および（ｃ２）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化１２】
2014077292.tif 000223
［式中、
Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ２）の工程：
下記式（ＶＩＩ）：
【化１３】
2014077292.tif 000224
［式中、
Ｘ１は、ヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｐｒ１は、独立して、保護されたヒドロキシ基を示し、
Ｐｒ２ｂは、ハロゲン原子を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化１４】
2014077292.tif 000225
［式中、
Ｚは、独立して、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、独立して、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、独立して、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示し、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示す。］
で表される化合物またはその塩と、下記式（ＩＶ）：
【化１５】
2014077292.tif 000226
［式中、Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を反応させて、下記式（Ｖ）：
【化１６】
2014077292.tif 000227
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ２）の工程：
上記（ａ２）の工程で製造される式（Ｖ）で表される化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して下記式（ＶＩ）：
【化１７】
2014077292.tif 000228
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｃ２）の工程：
上記（ｂ２）の工程により製造される式（ＶＩ）で表される化合物またはその塩を脱保護反応に付す工程。
【請求項９】
下記（ａ３）、（ｂ３）および（ｃ３）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化１８】
2014077292.tif 000229
［式中、Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ３）の工程：
核酸合成で使われるカップリング試薬の存在下に、下記式（ＶＩＩＩ）：
【化１９】
2014077292.tif 000230
［式中、
Ｘ＋は、カチオンを示し、
Ｘ１は、ヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
Ｐｒ４は、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは保護されたヒドロキシ基を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化２０】
2014077292.tif 000231
［式中、
Ｚは、独立して、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、独立して、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、独立して、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示し、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示す。］
で表される化合物またはその塩と、下記式（ＩＸ）：
【化２１】
2014077292.tif 000232
［式中、Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を反応させて、下記式（Ｘ）：
【化２２】
2014077292.tif 000233
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ３）の工程：
上記（ａ３）の工程で製造される式（Ｘ）で表される化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、下記式（ＸＩ）：
【化２３】
2014077292.tif 000234
［式中、
Ｑ１は、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ｐｒ５は、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは、保護されていてもよいヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示し、
Ｐｒ６は、（ｉ）Ｑ１が酸素原子のときは、ヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑ１が硫黄原子のときは、ヒドロキシ基を示し、
その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程：
（ｃ３）の工程：上記（ｂ３）の工程により製造される式（ＸＩ）で表される化合物またはその塩を脱保護反応に付す工程。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、核酸の液相合成方法に関する。更に詳細には、本発明は、ヌクレオシドの塩基部分が、（ｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環カルボニル基もしくは（ｉｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環チオカルボニル基で置換された新規ヌクレオシドモノマー化合物、および該ヌクレオシドモノマー化合物を合成ユニットとして用いた、各反応毎のカラムクロマト精製が回避可能であり、効率的に大量合成できる核酸オリゴマーの製造方法に関する。また、本発明は液相中で上記核酸オリゴマーの製造を行う方法に関する。
[発明の背景]【０００２】
ゲノム創薬や遺伝子診断・治療などの最先端バイオ関連研究の急速な進歩・発展に伴い近年、ＤＮＡプローブ、ｓｉＲＮＡ、アンチセンスＤＮＡ、アンチセンスＲＮＡなどの核酸オリゴマーの利用が盛んにな行われている。上記核酸オリゴマー合成方法としてはホスホロアミダイト法による固相合成法が主に知られている。【０００３】
液相で核酸オリゴマーを合成する方法として、特許文献１には、ヌクレオシドの塩基部分に分子量分布を持つ親水性のポリマーであるポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を導入したヌクレオシド化合物を、末端出発原料またはビルディングブロックとして用い、中間生成物の分離・精製を容易にして、核酸オリゴマーを合成することが提案されている。非特許文献１には、ヌクレオシドの塩基部分であるアデニンが無置換のベンゾイル基で置換されたヌクレオチドのダイマーまたはトリマーを液相中での反応とカラムクロマト精製を繰り返すことにより合成し、これらをホスホロアミダイト法により結合させてカラムクロマト精製を行うことにより核酸オリゴマーを製造する方法が提案されている。また、非特許文献２には、ヌクレオシドの塩基部分であるチミンがｐ−メトキシベンゾイル基（ｐ−トルイル基）で置換されたヌクレオシドを用いて、液相にてリン酸トリエステル法を用い、各反応毎にカラムクロマト精製を行うことで核酸オリゴマーを製造する方法が提案されている。【０００４】
一方、特許文献２には、有機合成反応後の溶液組成や溶液温度の変化により液相状態から固相状態に変化する性質を有する化合物を有機合成試薬として用いて、反応後の副生物などの分離工程を容易に行うことが提案されている。そして、そのような有機合成試薬として、芳香族環上に疎水性保持基を有する化合物、例えば、炭素数が２２個のアルコキシ基であるドコシルオキシ基が２個置換したベンジルアミンなどが記載されており、ペプチド合成への利用などが提案されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００５】
【特許文献１】特開２０００−３２７６９４号公報
【特許文献２】特開２００９−１８５０６３号公報
【非特許文献】
【０００６】
【非特許文献１】Chen et al., Aust. J. Chem. 2010, 63, 227-235
【非特許文献２】Reese et al., NUCLEOSIDES & NUCLEOTIDES, 17(1-3), 451-470 (1998)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
現在、核酸オリゴマーの製造において主として使用されている製法は、固相合成法である。固相合成法は、容易に核酸オリゴマーの製造を達成しうるが、樹脂上で反応を行う都合上、反応場に制限があり、専用の合成機を必要とし、スケールを大きくすることが困難である。大量（例えば、バッチ当り数ｋｇを超える）の核酸オリゴマーを供給するには、汎用のリアクターを使用できる液相での合成が有効であるが、ｓｉＲＮＡやアンチセンス核酸などの核酸オリゴマーの合成に必要となる数十工程についてカラムクロマト精製が必要となる等の理由から、大量のオリゴＲＮＡを製造するのに相応しくない。また、例えば、約２０塩基程度からなるｓｉＲＮＡを合成する場合に、最終工程で合成が失敗となるリスクを考慮すると、例えば、２ないし１１塩基のビルディングブロックを用いてｓｉＲＮＡの合成を行うことが好ましいと考えられる。そのような合成においては３’方向へも、５’方向へも塩基伸張できる方法が必要となる。これまでに、各工程毎のカラムクロマト精製を行う必要がなく、かつ、３’方向へも５’方向へも塩基伸張できるオリゴＲＮＡなどの核酸オリゴマーの製造方法は知られていない。
したがって、本発明の課題は、各反応毎に未反応試薬や活性化剤などの除去が容易であってカラムクロマト精製などの煩雑な工程を回避でき、３’方向へも、５’方向へも塩基伸張ができ、ビルディングブロックを利用した核酸オリゴマーの合成を可能にする新規ヌクレオシドモノマー化合物およびそれを用いた核酸オリゴマーの製造方法等を提供することに在る。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
このような課題を解決するために本発明者らは鋭意研究した結果、ヌクレオシドの塩基部分が、(i)少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環カルボニル基もしくは(ii) 少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環チオカルボニル基で置換された新規ヌクレオシドモノマー化合物（または、該モノマー化合物を含むダイマー化合物やトリマー化合物等）を合成ユニットとして用いることにより、核酸モノマーや核酸オリゴマーとのカップリング反応の際の各反応毎のカラムクロマト精製を回避できることを見出した。また、上記新規ヌクレオシドモノマー化合物を用いることにより、３’方向へも、５’方向へも塩基を伸張させることが可能となるとなることを見出した。さらに、核酸オリゴマーを液相中で合成することにより効率的に大量合成できることを見出し、かかる知見に基づき更に研究を重ねた結果、本発明を完成させた。【０００９】
したがって、本発明は、
［１］．下記式（Ｉ）：
【化１】
2014077292.tif 000003
［式中、
ＸおよびＲ１は、それぞれ独立して、水素原子、またはヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｂａｓｅは、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｚは、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］
で表される化合物またはその塩；
［２］．Ａｒ環が、さらに置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよいＣ６−１０芳香族炭化水素環である、上記［１］に記載の化合物またはその塩；
［３］．Ｒ２が、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基である、上記［１］または［２］に記載の化合物またはその塩；
［４］．Ｒ３が、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基である、上記［１］ないし［３］のいずれかに記載の化合物またはその塩；
［５］．ｎが、１または２である、上記［１］ないし［４］のいずれかに記載の化合物またはその塩；【００１０】
［６］．下記（ａ０）および（ｂ０）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化２】
2014077292.tif 000004
［式中、
Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ０）の工程：
下記式（Ｉ）：
【化３】
2014077292.tif 000005
［式中、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示し、
ＸおよびＲ１は、それぞれ独立して、水素原子、またはヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｚは、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］
で表される化合物またはその塩を用いて下記式（ＩＶ’）：
【化４】
2014077292.tif 000006
［式中、
Ｒ１、Ｂａｓｅ、Ｚ、Ａｒ環、Ｒ２、Ｒ３、Ｑ、ｒ’およびｎは、それぞれ上記と同義を示し、
Ｙは、独立して上記と同義を示し、
Ｐｒ４は、独立して、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは、水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化５】
2014077292.tif 000007
[式中、Ｂａｓｅ、Ｚ、Ａｒ環、Ｒ２、Ｒ３およびｎは、それぞれ独立して上記と同義を示す。]を示す。］
で表わされる化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ０）の工程：
上記式（ＩＶ’）で表される化合物またはその塩を用いて上記式（ＩＩ）で表される化合物またはその塩を製造する工程；【００１１】
［７］．下記（ａ１）、（ｂ１）および（ｃ１）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化６】
2014077292.tif 000008
［式中、
Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ１）の工程：
核酸合成で使われるカップリング試薬の存在下に、
下記式（ＩＩＩ）：
【化７】
2014077292.tif 000009
［式中、
Ｘ１は、ヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｐｒ１は、独立して、保護されたヒドロキシ基を示し、
Ｐｒ２ａは、置換されたアミノ基を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化８】
2014077292.tif 000010
［式中、
Ｚは、独立して、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、独立して、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、独立して、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示し、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。]を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑおよびｒは、上記と同義を示す。］
で表わされる化合物またはその塩と、下記式（ＩＶ）：
【化９】
2014077292.tif 000011
［式中、Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を反応させて、下記式（Ｖ）：
【化１０】
2014077292.tif 000012
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ１）の工程：
上記（ａ１）の工程で製造される式（Ｖ）で表される化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、下記式（ＶＩ）：
【化１１】
2014077292.tif 000013
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｃ１）の工程：
上記（ｂ１）の工程により製造される式（ＶＩ）で表される化合物またはその塩を脱保護反応に付す工程；【００１２】
［８］．下記（ａ２）、（ｂ２）および（ｃ２）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化１２】
2014077292.tif 000014
［式中、
Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ２）の工程：
下記式（ＶＩＩ）：
【化１３】
2014077292.tif 000015
［式中、
Ｘ１は、ヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｐｒ１は、独立して、保護されたヒドロキシ基を示し、
Ｐｒ２ｂは、ハロゲン原子を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化１４】
2014077292.tif 000016
［式中、
Ｚは、独立して、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、独立して、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、独立して、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示し、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示す。］
で表される化合物またはその塩と、下記式（ＩＶ）：
【化１５】
2014077292.tif 000017
［式中、Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を反応させて、下記式（Ｖ）：
【化１６】
2014077292.tif 000018
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ２）の工程：
上記（ａ２）の工程で製造される式（Ｖ）で表される化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して下記式（ＶＩ）：
【化１７】
2014077292.tif 000019
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｃ２）の工程：
上記（ｂ２）の工程により製造される式（ＶＩ）で表される化合物またはその塩を脱保護反応に付す工程；および【００１３】
［９］．下記（ａ３）、（ｂ３）および（ｃ３）の工程を含む、下記式（ＩＩ）：
【化１８】
2014077292.tif 000020
［式中、Ｂａｓｅは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示し、
Ｙ１は、独立して、ヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
ｒ、ｒ’は、それぞれ独立して、０ないし１００の整数を示す。］
で表される化合物またはその塩の製造方法：
（ａ３）の工程：
核酸合成で使われるカップリング試薬の存在下に、下記式（ＶＩＩＩ）：
【化１９】
2014077292.tif 000021
［式中、
Ｘ＋は、カチオンを示し、
Ｘ１は、ヒドロキシ基の保護基を示し、
Ｑは、独立して、酸素原子、または硫黄原子を示し、
Ｐｒ４は、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは保護されたヒドロキシ基を示し、
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化２０】
2014077292.tif 000022
［式中、
Ｚは、独立して、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ａｒ環は、独立して、さらに下記置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示し、
Ｒ２は、独立して、下記置換基Ａ群から選択される置換基を示し、
Ｒ３は、独立して、下記置換基Ｂ群から選択される置換基を示し、
ｎは、１ないし４の整数を示し、
Ｂａｓｅは、上記と同義を示す。
置換基Ａ群：
（ｉ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基、
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基、
（ｉｖ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖ）    置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉ）  置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基、および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。
置換基Ｂ群：
（ｉ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基、
（ｉｉ）    ハロゲン原子、
（ｉｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基、
（ｉｖ）    ニトロ基、
（ｖ）      置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基、
（ｖｉ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基、
（ｖｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基、
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基、
（ｉｘ）    置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基、
（ｘ）      シアノ基、
（ｘｉ）    置換されていてもよいアミノ基、
（ｘｉｉ）  置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基、および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。］を示し、
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示す。］
で表される化合物またはその塩と、下記式（ＩＸ）：
【化２１】
2014077292.tif 000023
［式中、Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を反応させて、下記式（Ｘ）：
【化２２】
2014077292.tif 000024
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程；
（ｂ３）の工程：
上記（ａ３）の工程で製造される式（Ｘ）で表される化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、下記式（ＸＩ）：
【化２３】
2014077292.tif 000025
［式中、
Ｑ１は、酸素原子または硫黄原子を示し、
Ｐｒ５は、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは、保護されていてもよいヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示し、
Ｐｒ６は、（ｉ）Ｑ１が酸素原子のときは、ヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑ１が硫黄原子のときは、ヒドロキシ基を示し、
その他の記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する工程：
（ｃ３）の工程：上記（ｂ３）の工程により製造される式（ＸＩ）で表される化合物またはその塩を脱保護反応に付す工程；
に関するものである。
【発明の効果】
【００１４】
本発明は、ヌクレオシドの塩基部分が、（ｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環カルボニル基もしくは（ｉｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環チオカルボニル基などで置換された新規ヌクレオシド化合物を合成ユニットとして用いて、核酸オリゴマーを製造するものである。本発明を用いることにより、各反応毎のカラムクロマト精製を回避できる。また、本発明を用いれば、３’方向へも、５’方向へも塩基伸張をすることができる。本発明を用いることにより、核酸オリゴマーを、液相合成法により効率的に大量合成できる。本発明は、ｓｉＲＮＡ、アンチセンス核酸、ワクチンのアジュバントなどの核酸オリゴマーの製造に適用することができ、ゲノム創薬や遺伝子診断・治療などの分野において極めて有用なものである。
【発明を実施するための形態】
【００１５】
以下、本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物およびそれを用いた核酸オリゴマーの製造方法について詳細に説明する。
なお、本明細書中の各式において、特記しない限り、同一の記号は同一の意味を有する。
【００１６】
１．新規ヌクレオシドモノマー化合物
本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物は、下記式（Ｉ）：
【化２４】
2014077292.tif 000026
で表わされる。該ヌクレオシドモノマー化合物は、ヌクレオシドの塩基部分（Ｂａｓｅ）が、（ｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環（式（I）中、Ａｒで表される）カルボニル基もしくは（ｉｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環（式（Ｉ）中、Ａｒで表される）チオカルボニル基で置換されたものである。
【００１７】
ＸおよびＲ１は、それぞれ独立して、水素原子、またはヒドロキシ基の保護基を示す。
ヒドロキシ基の保護基としては、核酸のヒドロキシ基の保護基として通常使用されているものであればいずれの保護基も使用し得る。このような保護基としては、例えば、トリメチルシリル（ＴＭＳ）、トリエチルシリル、イソプロピルジメチルシリル、ｔ−ブチルジメチルシリル（ＴＢＤＭＳ）、（トリフェニルメチル）ジメチルシリル、ｔ−ブチルジフェニルシリル、メチルジイソプロピルシリル、メチルジ−ｔ−ブチルシリル、トリベンジルシリル、トリ−ｐ−キシリルシリル、トリイソプロピルシリル、トリフェニルシリルなどのシリル型保護基；トリチル、４−メトキシトリチル、４，４’−ジメトキシトリチル（ＤＭＴｒ）などのトリチル型保護基；テトラヒドロピラニル、３−ブロモテトラヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、４−メトキシテトラヒドロピラニル、４−メトキシテトラヒドロチオピラニル、４−メトキシテトラヒドロチオピラニルＳ，Ｓ−ジオキシド、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロチオフラニルなどの複素環型保護基；ベンジル、４−メトキシベンジル、２−ニトロベンジル、４−ニトロベンジル、４−シアノベンジルなどのベンジル型保護基；アセチル、トリクロロアセチル、トリフルオロアセチル、ブチリル、プロピオニル、ピバロイル、レブリニル、ペンタノイル、バレリル、オクタノイルなど脂肪族アシル型保護基；ベンゾイル、２−フルオロベンゾイル、２，６−ジクロロベンゾイル、２−トルオイル、２，４，６−トリメチルベンゾイルなどの芳香族アシル型保護基；２−（シアノエトキシ）エチル（ＣＥＥ）、シアノエトキシメチル（ＣＥＭ）などのエーテル型保護基；ジメチルカルバモイル、ジフェニルカルバモイルなどのカルバモイル型保護基が挙げられる。
これらのヒドロキシ基の保護基については、Wuts et al., Protective Groups in Organic Synthesis, 4th Edition, 2006, John Wiley & Sons, Inc. などを参照することができる。
【００１８】
Ｘとしてはヒドロキシ基の保護基が好ましく、トリチル型保護基がより好ましく、なかでもＤＭＴｒ基が特に好ましい。
Ｒ１としては、水素原子または脂肪族アシル型保護基が好ましく、水素原子またはレブリニル基がより好ましく、なかでもレブリニル基が特に好ましい。
【００１９】
Ｙは、保護されていてもよいヒドロキシ基、水素原子、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示す。
Ｙにおける保護されていてもよいヒドロキシ基のヒドロキシ基は、前記ヒドロキシ基の保護基で保護されていてもよい。
Ｙにおける置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基のＣ１−６アルコキシ基としては、メトキシ基、エトキシ基またはプロポキシ基などが挙げられる。該Ｃ１−６アルコキシ基は１ないし３個の置換基で置換されていてもよい。そのような置換基としては、例えば、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素などのハロゲン原子；ハロゲン原子、Ｃ１−６アルコキシ基またはシアノ基から選択される１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ６−１０アリールオキシ基（例えば、フェニルオキシまたはナフチルオキシ）；ビフェニルオキシ；ハロゲン原子、Ｃ１−６アルコキシ基またはシアノ基から選択される１ないし３個の置換基で置換されていてもよいで置換されていてもよいジＣ１−６アルキルアミノ基（例えば、ジメチルアミノ、ジエチルアミノまたはイソブチルアミノ）；またはシアノ基が挙げられる。
Ｙにおけるハロゲン原子としては、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素などを挙げることができる。
Ｙとしては、保護されたヒドロキシ基（好ましくは、トリチル型保護基で保護されたヒドロキシ基またはシリル型保護基で保護されたヒドロキシ基）、水素原子またはＣ１−６アルコキシ基（好ましくは、メトキシ基）が好ましく、保護されたヒドロキシ基（好ましくは、トリチル型保護基で保護されたヒドロキシ基またはシリル型保護基で保護されたヒドロキシ基）または水素原子がより好ましく、なかでもＴＢＤＭＳで保護されたヒドロキシ基が特に好ましい。
【００２０】
Ｂａｓｅは、ヌクレオシドの塩基部分を指し、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル、またはそれらの修飾体を示す。ここで、修飾体とは、塩基部分のアミノ基がアミノ基の保護基で保護されたものを意味する。ここで、アミノ基の保護基としては、核酸の塩基部分のアミノ基の保護基として通常使用されているものであればいずれの保護基も使用し得る。このようなアミノ基の保護基としては、例えば、１ないし３個のハロゲン原子またはＣ１−６アルコキシ基で置換されていてもよい脂肪族アシル基（例えば、アセチル、プロピオニル、ｎ−ブチリル、イソブチリル）；１ないし３個のハロゲン原子、Ｃ１−６アルキル基またはＣ１−６アルコキシ基で置換されていてもよい芳香族アシル基（例えば、ベンゾイル、４−メチルベンゾイルまたは４−メトキシベンゾイル）；Ｃ７−１２アラルキルアシル基（例えば、フェニルアセチル）；Ｃ１−６アルキル基で置換されていてもよいＣ６−１０アリーロキシ−アシル基（例えば、フェノキシアセチル、４−ｔ−ブチルフェノキシアセチルまたは４−イソプロピルフェノキシアセチル）；β脱離による除去が可能な、電子吸引基を有するエチル基（例えば、２−シアノエチル、２−（ｐ−ニトロフェニル）エチルまたは２−（ベンゼンスルホニル）エチル）；ジＣ１−６アルキルアミノメチレン基（例えば、ジメチルアミノメチレンまたはジブチルアミノメチレン）；β脱離による除去が可能な、電子吸引基を有するＣ１−６アルコキシ−カルボニル基（例えば、２−シアノエトキシカルボニル、２−（ｐ−ニトロフェニル）エトキシカルボニルまたは２−（ベンゼンスルホニル）エトキシカルボニル）が挙げられる。
Ｂａｓｅとしては、チミン、アデニン、グアニン、シトシンまたはウラシルが好ましく、チミン、シトシンまたはウラシルがより好ましく、チミンまたはウラシルがさらに好ましい。
【００２１】
Ｚは、酸素原子または硫黄原子を示す。
Ｚとしては、酸素原子が好ましい。
【００２２】
Ａｒ環は、Ｒ２およびＲ３以外にさらに置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよい芳香族炭化水素環を示す。ここで、芳香族炭化水素環としては、例えば、フェニル、ナフチルなどのＣ６−１０アリール基に対応する環（すなわち、Ｃ６−１０アレーン）を挙げることができる。
置換基Ｂ群は、
（ｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基（例えば、メチルオキシ、エチルオキシ、n-または iso-プロピルオキシ、n-, iso-, sec-, またはt-ブチルオキシ、ペンチルオキシ、ヘキシルオキシ、ヘプチルオキシ、オクチルオキシ、ノニルオキシ、デシルオキシ、ウンデシルオキシ、ドデシルオキシ、トリデシルオキシ、テトラデシルオキシ、ペンタデシルオキシ、ヘキサデシルオキシ、ヘプタデシルオキシ、オクタデシルオキシ、ノナデシルオキシ、イコシルオキシ、ヘンイコシルオキシ、ドコシルオキシまたはトリアコンチルオキシ）；
（ｉｉ）フッ素、塩素または臭素などのハロゲン原子；
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルキル基（例えば、メチル、エチル、n-または iso-プロピル、n-, iso-, sec-, またはt-ブチル、ペンチル、ヘキシル、ヘプチル、オクチル、ノニル、デシル、ウンデシル、ドデシル、トリデシル、テトラデシル、ペンタデシル、ヘキサデシル、ヘプタデシル、オクタデシル、ノナデシル、イコシルまたはトリアコンチル）；
（ｉｖ）ニトロ基；
（ｖ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルファニル基（例えば、メチルスルファニル、エチルスルファニル、n-若しくは iso-プロピルスルファニル、n-, iso-, sec-, 若しくはt-ブチルスルファニル、ペンチルスルファニル、ヘキシルスルファニル、ヘプチルスルファニル、オクチルスルファニル、ノニルスルファニル、デシルスルファニル、ウンデシルスルファニル、ドデシルスルファニル、トリデシルスルファニル、テトラデシルスルファニル、ペンタデシルスルファニル、ヘキサデシルスルファニル、ヘプタデシルスルファニル、オクタデシルスルファニル、ノナデシルスルファニル、イコシルスルファニル、ヘンイコシルスルファニル、ドコシルスルファニルまたはトリアコンチルスルファニル）；
（ｖｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルフィニル基（例えば、メチルスルフィニル、エチルスルフィニル、n-若しくは iso-プロピルスルフィニル、n-, iso-, sec-, 若しくはt-ブチルスルフィニル、ペンチルスルフィニル、ヘキシルスルフィニル、ヘプチルスルフィニル、オクチルスルフィニル、ノニルスルフィニル、デシルスルフィニル、ウンデシルスルフィニル、ドデシルスルフィニル、トリデシルスルフィニル、テトラデシルスルフィニル、ペンタデシルスルフィニル、ヘキサデシルスルフィニル、ヘプタデシルスルフィニル、オクタデシルスルフィニル、ノナデシルスルフィニル、イコシルスルフィニル、ヘンイコシルスルフィニル、ドコシルスルフィニルまたはトリアコンチルスルフィニル）；
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルキルスルホニル基（例えば、メチルスルホニル、エチルスルホニル、n-若しくは iso-プロピルスルホニル、n-, iso-, sec-, 若しくはt-ブチルスルホニル、ペンチルスルホニル、ヘキシルスルホニル、ヘプチルスルホニル、オクチルスルホニル、ノニルスルホニル、デシルスルホニル、ウンデシルスルホニル、ドデシルスルホニル、トリデシルスルホニル、テトラデシルスルホニル、ペンタデシルスルホニル、ヘキサデシルスルホニル、ヘプタデシルスルホニル、オクタデシルスルホニル、ノナデシルスルホニル、イコシルスルホニル、ヘンイコシルスルホニル、ドコシルスルホニルまたはトリアコンチルスルホニル）；
（ｖｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシロキシ基（例えば、トリメチルシロキシ、トリエチルシロキシ、トリ n-若しくは iso-プロピルシロキシ、ジメチル n-, iso-, sec-,若しくは ｔ−ブチルシロキシ、ジメチルシペンチルシロキシ、ジメチルヘキシルシロキシ、ジメチルヘプチルシロキシ、ジメチルオクチルシロキシ、ジメチルノニルシロキシ、ジメチルデシルシロキシ、ジメチルウンデシルシロキシ、ジメチルドデシルシロキシ、ジメチルトリデシルシロキシ、ジメチルテトラデシルシロキシ、ジメチルペンタデシルシロキシ、ジメチルヘキサデシルシロキシ、ジメチルヘプタデシルシロキシ、ジメチルオクタデシルシロキシ、ジメチルノナデシルシロキシ、ジメチルイコシルシロキシ、ジメチルヘンイコシルシロキシ、ジメチルドコシルシロキシ、ジメチルトリアコンチルシロキシ、トリデシルシロキシ、トリウンデシルシロキシ、トリドデシルシロキシ、トリトリデシルシロキシ、トリテトラデシルシロキシ、トリペンタデシルシロキシ、トリヘキサデシルシロキシ、トリヘプタデシルシロキシ、トリオクタデシルシロキシ、トリノナデシルシロキシ、トリイコシルシロキシ、トリヘンイコシルシロキシ、トリドコシルシロキシまたはトリトリアコンチルシロキシ）；
（ｉｘ）置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３０アルキルシリル基（例えば、トリメチルシリル、トリエチルシリル、トリプロピルシリル、ジメチルｔ−ブチルシリル、ジメチルシペンチルシリル、ジメチルヘキシルシリル、ジメチルヘプチルシリル、ジメチルオクチルシリル、ジメチルノニルシリル、ジメチルデシルシリル、ジメチルウンデシルシリル、ジメチルドデシルシリル、ジメチルトリデシルシリル、ジメチルテトラデシルシリル、ジメチルペンタデシルシリル、ジメチルヘキサデシルシリル、ジメチルヘプタデシルシリル、ジメチルオクタデシルシリル、ジメチルノナデシルシリル、ジメチルイコシルシリル、ジメチルヘンコシルシリル、ジメチルドコシルシリル、ジメチルトリアコンチルシリル、トリデシルシリル、トリウンデシルシリル、トリドデシルシリル、トリトリデシルシリル、トリテトラデシルシリル、トリペンタデシルシリル、トリヘキサデシルシリル、トリヘプタデシルシリル、トリオクタデシルシリル、トリノナデシルシリル、トリイコシルシリル、トリヘンイコシルシリル、トリドコシルシリルまたはトリトリアコンチルシリル）；
（ｘ）シアノ基；
（ｘｉ）置換されていてもよいアミノ基。好ましくは、Ｃ１−３０アルキル基でモノまたはジ置換されていてもよいアミノ基；
（ｘｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３２アルコキシ−カルボニル基（例えば、メチルオキシカルボニル、エチルオキシカルボニル、n-若しくは iso-プロピルオキシカルボニル、n-, iso-, sec-,若しくは t-ブチルオキシカルボニル、ペンチルオキシカルボニル、ヘキシルオキシカルボニル、ヘプチルオキシカルボニル、オクチルオキシカルボニル、ノニルオキシカルボニル、デシルオキシカルボニル、ウンデシルオキシカルボニル、ドデシルオキシカルボニル、トリデシルオキシカルボニル、テトラデシルオキシカルボニル、ペンタデシルオキシカルボニル、ヘキサデシルオキシカルボニル、ヘプタデシルオキシカルボニル、オクタデシルオキシカルボニル、ノナデシルオキシカルボニル、イコシルオキシカルボニル、ヘンイコシルオキシカルボニル、ドコシルオキシカルボニルまたはトリアコンチルオキシカルボニル）；および
（ｘｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１−３２アルキル−カルボニル基（例えば、メチルカルボニル、エチルカルボニル、n-若しくは iso-プロピルカルボニル、n-, iso-, sec-,若しくは t-ブチルカルボニル、ペンチルカルボニル、ヘキシルカルボニル、ヘプチルカルボニル、オクチルカルボニル、ノニルカルボニル、デシルカルボニル、ウンシイルカルボニル、ドデシルカルボニル、トリデシルカルボニル、テトラデシルカルボニル、ペンタデシルカルボニル、ヘキサデシルカルボニル、ヘプタデシルカルボニル、オクタデシルカルボニル、ノナデシルカルボニル、イコシルカルボニル、ヘンイコシルカルボニル、ドコシルカルボニルまたはトリアコンチルカルボニル）からなる。
Ａｒ環としては、さらに置換基Ｂ群から選択される置換基で置換されていてもよいＣ６−１０芳香族炭化水素環（アレーン）が好ましく、Ｃ６−１０アレーンがより好ましく、なかでもベンゼン環が特に好ましい。
【００２３】
Ｒ２は、置換基Ａ群から選択される置換基を示す。ここで、置換基Ａ群は、
（ｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基（例えば、デシルオキシ、ウンデシルオキシ、ドデシルオキシ、トリデシルオキシ、テトラデシルオキシ、ペンタデシルオキシ、ヘキサデシルオキシ、ヘプタデシルオキシ、オクタデシルオキシ、ノナデシルオキシ、イコシルオキシ、ヘンイコシルオキシ、ドコシルオキシまたはトリアコンチルオキシ）；
（ｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルキル基（例えば、デシル、ウンデシル、ドデシル、トリデシル、テトラデシル、ペンタデシル、ヘキサデシル、ヘプタデシル、オクタデシル、ノナデシル、イコシル、ヘンイコシル、ドコシルまたはトリアコンチル）；
（ｉｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルファニル基（例えば、デシルスルファニル、ウンデシルスルファニル、ドデシルスルファニル、トリデシルスルファニル、テトラデシルスルファニル、ペンタデシルスルファニル、ヘキサデシルスルファニル、ヘプタデシルスルファニル、オクタデシルスルファニル、ノナデシルスルファニル、イコシルスルファニル、ヘンイコシルスルファニル、ドコシルスルファニルまたはトリアコンチルスルファニル）；
（ｉｖ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルフィニル基（例えば、デシルスルフィニル、ウンデシルスルフィニル、ドデシルスルフィニル、トリデシルスルフィニル、テトラデシルスルフィニル、ペンタデシルスルフィニル、ヘキサデシルスルフィニル、ヘプタデシルスルフィニル、オクタデシルスルフィニル、ノナデシルスルフィニル、イコシルフィニル、ヘンイコシルスルフィニル、ドコシルスルフィニルまたはトリアコンチルスルフィニル）；
（ｖ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルスルホニル基（例えば、デシルスルホニル、ウンデシルスルホニル、ドデシルスルホニル、トリデシルスルホニル、テトラデシルスルホニル、ペンタデシルスルホニル、ヘキサデシルスルホニル、ヘプタデシルスルホニル、オクタデシルスルホニル、ノナデシルスルホニル、イコシルホニル、ヘンイコシルスルホニル、ドコシルスルホニルまたはトリアコンタチスルホニル）；
（ｖｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシロキシ基（例えば、ジメチルデシルシロキシ、ジメチルウンデシルシロキシ、ジメチルドデシルシロキシ、ジメチルトリデシルシロキシ、ジメチルテトラデシルシロキシ、ジメチルペンタデシルシロキシ、ジメチルヘキサデシルシロキシ、ジメチルヘプタデシルシロキシ、ジメチルオクタデシルシロキシ、ジメチルノナデシルシロキシ、ジメチルイコシルシロキシ、ジメチルヘンイコシルシロキシ、、ジメチルドコシルシロキシ、ジメチルトリアコンチルシロキシ、トリデシルシロキシ、トリウンデシルシロキシ、トリドデシルシロキシ、トリトリデシルシロキシ、トリテトラデシルシロキシ、トリペンタデシルシロキシ、トリヘキサデシルシロキシ、トリヘプタデシルシロキシ、トリオクタデシルシロキシ、トリノナデシルシロキシ、トリイコシルシロキシ、トリヘンイコシルシロキシ、トリドコシルシロキシまたはトリトリアコンチルシロキシ）；および
（ｖｉｉ）置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基。好ましくは、Ｃ１−６アルコキシ基、Ｃ６−１０アリール基、Ｃ６−１０アリールオキシ基、ハロゲン原子、ジＣ１−６アルキルアミノ基；シアノ基等から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ１０−３０アルキルシリル基（例えば、ジメチルデシルシリル、ジメチルウンデシルシリル、ジメチルドデシルシリル、ジメチルトリデシルシリル、ジメチルテトラデシルシリル、ジメチルペンタデシルシリル、ジメチルヘキサデシルシリル、ジメチルヘプタデシルシリル、ジメチルオクタデシルシリル、ジメチルノナデシルシリル、ジメチルイコシルシリル、ジメチルヘンイコシルシリル、ジメチルドコシルシリル、ジメチルトリアコンチルシリル、トリデシルシリル、トリウンデシルシリル、トリドデシルシリル、トリトリデシルシリル、トリテトラデシルシリル、トリペンタデシルシリル、トリヘキサデシルシリル、トリヘプタデシルシリル、トリオクタデシルシリル、トリノナデシルシリル、トリイコシルシリル、トリヘンイコシルシリル、トリドコシルシリルまたはトリトリアコンチルシリル）からなる。
Ｒ２としては、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基が好ましく、なかでもドコシルオキシ基、イコシルオキシ基、オクタデシルオキシ基、ヘキサデシルオキシ基またはテトラデシルオキシ基がより好ましく、オクタデシルオキシ基またはテトラデシルオキシ基がさらに好ましい。
【００２４】
Ｒ３は、独立して、上記した置換基Ｂ群から選択される置換基を示す。
Ｒ３としては、ハロゲン原子または置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基が好ましく、なかでもハロゲン原子、ドコシルオキシ基、イコシルオキシ基、オクタデシルオキシ基、ヘキサデシルオキシ基、またはテトラデシルオキシ基がより好ましく、フッ素原子、オクタデシルオキシ基またはテトラデシルオキシ基がさらに好ましい。
Ｒ３の別の好ましい態様としては、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基（好ましくは、ドコシルオキシ基、イコシルオキシ基、オクタデシルオキシ基、ヘキサデシルオキシ基またはテトラデシルオキシ基）が挙げられる。
【００２５】
ｎは、１ないし４の整数を示す。
ｎは、好ましくは１ないし３の整数であり、より好ましくは１または２である。
【００２６】
本発明の新規ヌクレオシドモノマーの好適な具体例としては以下が挙げられる：
式（Ｉ）において、
Ｘが、ヒドロキシ基の保護基（好ましくは、トリチル型保護基（特に、ＤＭＴｒ基））であり；
Ｒ１が、水素原子または脂肪族アシル型保護基（好ましくは、レブリニル基）であり；
Ｙが、保護されていてもよいヒドロキシ基（好ましくは、トリチル型保護基で保護されたヒドロキシ基またはシリル型保護基で保護されたヒドロキシ基（さらに好ましくは、ＴＢＤＭＳで保護されたヒドロキシ基））、水素原子、または置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基（好ましくは、メトキシ）であり；
Ｂａｓｅが、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、またはウラシル（好ましくは、チミン、シトシンまたはウラシル）であり；
Ｚが、酸素原子であり；
Ａｒ環が、Ｃ６−１０アレーン（好ましくは、ベンゼン環）であり；
Ｒ２が、置換されていてもよいＣ１０−３０アルコキシ基（好ましくは、ドコシルオキシ基、イコシルオキシ基、オクタデシルオキシ基、ヘキサデシルオキシ基またはテトラデシルオキシ基）であり；
Ｒ３が、独立して、ハロゲン原子または置換されていてもよいＣ１−３０アルコキシ基（例、ドコシルオキシ基、イコシルオキシ基、オクタデシルオキシ基、ヘキサデシルオキシ基、またはテトラデシルオキシ基）であり；
ｎが、１または２
である化合物またはその塩。
【００２７】
本発明の式（Ｉ）で表される化合物は、その塩の形態にあってもよい。そのような塩としては、例えば、硫酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩、リン酸塩、炭酸塩、重炭酸塩、フッ化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩などの無機酸塩；酢酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩、酒石酸塩、フマル酸塩、クエン酸塩などの有機カルボン酸塩；メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、トルエンスルホン酸塩、カンファースルホン酸塩などの有機スルホン酸塩；アスパラギン酸塩、グルタミン酸塩などのアミノ酸塩；四級アミン塩；ナトリウム塩、カリウム塩などのアルカリ金属塩；マグネシウム塩、カルシウム塩などのアルカリ土類金属塩が挙げられる。
【００２８】
以下に、本発明の式（Ｉ）および式（ＩＩ）で表される化合物の製造法について説明する。
以下の反応における、原料または製造中間体は、それぞれ塩であってもよい。そのような塩としては、本発明の式（Ｉ）で表される化合物の塩として例示したものが挙げられる。
【００２９】
また、以下の各反応において、原料化合物が置換基としてアミノ基、カルボキシル基、水酸基または水酸基を有する場合、これらの基は、一般的に用いられるような保護基が導入されていてもよい。この場合、反応後に、必要に応じて保護基を除去することにより目的化合物を得ることができる。
【００３０】
アミノ基の保護基としては、例えば、ホルミル基、それぞれ置換基を有していてもよい、Ｃ１−６アルキル−カルボニル基（例、アセチル、エチルカルボニル等）、フェニルカルボニル基、Ｃ１−６アルキルオキシ−カルボニル基（例、メトキシカルボニル、エトキシカルボニル、ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル（Ｂｏｃ）等）、アリルオキシカルボニル（Ａｌｌｏｃ）基、フェニルオキシカルボニル基、フルオレニルメトキシカルボニル（Ｆｍｏｃ）基、Ｃ７−１０アルキル−カルボニル基（例、ベンジルカルボニル等）、Ｃ７−１０アラルキル−オキシカルボニル基（例、ベンジルオキシカルボニル（Ｚ）等）、Ｃ７−１０アラルキル基（例、ベンジル等）、２−（トリメチルシリル）エトキシメチル（ＳＥＭ）基、トリチル基、フタロイル基、Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノメチレン基等が用いられる。これらの置換基としては、フェニル基、ハロゲン原子（例、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子等）、Ｃ１−６アルキル−カルボニル基（例、メチルカルボニル、エチルカルボニル、ブチルカルボニル等）、ニトロ基等が用いられ、置換基の数は１ないし３個程度である。
【００３１】
カルボキシル基の保護基としては、例えば、それぞれ置換基を有していてもよい、Ｃ１−６アルキル基（例、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル等）、アリル基、ベンジル基、フェニル基、トリチル基、トリアルキルシリル基等が用いられる。これらの置換基としては、ハロゲン原子（例、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子等）、ホルミル基、Ｃ１−６アルキル−カルボニル基（例、アセチル、エチルカルボニル、ブチルカルボニル等）、ニトロ基等が用いられ、置換基の数は１ないし３個程度である。
【００３２】
水酸基の保護基としては、例えば、それぞれ置換基を有していてもよい、Ｃ１−６アルキル基（例、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、ｔｅｒｔ−ブチル等）、Ｃ７−１０アラルキル基（例、ベンジル等）、ホルミル基、Ｃ１−６アルキル−カルボニル基（例、アセチル、エチルカルボニル等）、ベンゾイル基、Ｃ７−１０アラルキル−カルボニル基（例、ベンジルカルボニル等）、テトラヒドロピラニル基、フラニル基、シリル基等が用いられる。これらの置換基としては、ハロゲン原子（例、フッ素原子、塩素原子、臭素原子、ヨウ素原子等）、Ｃ１−６アルキル基（例、メチル、エチル、ｎ−プロピル等）、フェニル基、Ｃ７−１０アラルキル基（例、ベンジル等）、Ｃ１−６アルコキシ基（例、メトキシ、エトキシ、ｎ−プロポキシ等）、ニトロ基等が用いられ、置換基の数は１ないし４個程度である。
【００３３】
これらの保護基の導入あるいは除去は、自体公知の方法、例えば、Wiley-Interscience社、2006年刊、「Protective Groups in Organic Synthesis, 4thEd.」（Wuts et.al. 著）に記載の方法等に準じて行えばよい。
【００３４】
本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物は、例えば、下記式（ａ）：
【化２５】
2014077292.tif 000027
[式中、各記号は前記と同義を示す。]
で表わされる化合物と、下記式（ｂ）：
【化２６】
2014077292.tif 000028
[式中、Ｇは脱離基を示し、他の記号は前記と同義を示す。]
で表わされる化合物とを反応させることによって製造することができる。式（ｂ）においてＧで示される脱離基としては、ハロゲン原子；アセチルオキシ、プロピオニルオキシ、ブチリルオキシなどのＣ１−６アシルオキシ基；トリフルオロメタンスルホニルオキシなどのハロゲン化されていてもよいＣ１−６アルキルスルホニルオキシ基；フェニルスルホニルオキシなどのＣ６−１０アリールスルホニルオキシ基；アゾリル基などが挙げられる。式（ａ）の化合物は、公知または市販のヌクレオシド化合物から、自体公知の反応により製造することができる。また、式（ｂ）の化合物も、自体公知の方法（例えば、式（ｂ）においてＧがＯＨである化合物を、ハロゲン化反応に付す方法）により製造することができる。
【００３５】
式（ａ）の化合物と式（ｂ）の化合物の反応は、例えば、ピリジン、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、１,３−ジメチル−２−イミダゾリジノン、アセトン、塩化メチレン、クロロホルム、ジオキサン、アセトニトリル、ベンゼン、トルエン、ジエチルエーテル、テトラヒドロフラン、ｔ−ブチルメチルエーテルなどの反応を阻害しない溶媒中で、０℃から１００℃で５分間から７２時間反応させることにより行うことができる。本反応は、例えば、トリエチルアミン、トリブチルアミン、Ｎ，Ｎ’−ジイソプロピルエチルアミン、１，８−ジアザビシクロ[５．４．０]−７−ウンデセンなどの有機塩基；水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸水素ナトリウム、炭酸ナトリウム、炭酸セシウム、フッ化セシウムなどの無機塩基；ｎ−ブチルリチウム、リチウムジイソプロピルアミド、（ジエチルアミノ）リチウムなどの有機金属化合物；クロロトリメチルシラン、クロロトリエチルシランなどの反応促進剤の存在下に行うこともできる。
【００３６】
なお、式（Ｉ）で表される化合物またはその塩には、同位元素（例、３Ｈ、１４Ｃ、３５Ｓ、１２５Ｉ等）等で標識された化合物またはその塩も包含される。
また、１Ｈを２Ｈ（Ｄ）に変換した重水素変換体も、式（Ｉ）で表される化合物またはその塩に包含される。
さらに、式（Ｉ）で表される化合物またはその塩には、溶媒和物（例、水和物等）であっても、無溶媒和物（例、非水和物等）も包含される。
【００３７】
式（Ｉ）で表される化合物またはその塩は、核酸モノマーや核酸オリゴマーとのカップリング反応に使用できる。式（Ｉ）で表される化合物またはその塩を用いることにより、上記反応における各反応毎のカラムクロマト精製を回避して容易に生成物を精製する可能ことが可能となる。また各反応毎のカラムクロマト精製を回避することにより、優れた収率で精製物を回収することができる。また、式（Ｉ）で表される化合物またはその塩を用いることにより、３’方向へも、５’方向へも塩基を伸張させることが可能となるとなる。さらに、式（Ｉ）で表される化合物またはその塩を用いた液相合成法により、核酸オリゴマーを効率的に大量合成できる。なお、上記カップリング反応において式（Ｉ）で表される化合物またはその塩は１以上用いられていればよく、その数は限定されない。
【００３８】
なお、式（I）において、Ｒ２およびＲ３の一つが、スルファニル基、スルフィニル基、スルホニル基、シロキシ基またはシリル基である化合物も、式（I）で表される化合物と同様に製造し、核酸モノマーや核酸オリゴマーとのカップリング反応に使用することができる。
【００３９】
２．核酸オリゴマーの製造
本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物を用いて、核酸オリゴマーを製造することができる。このような核酸オリゴマーとしては、例えば、下記式（ＩＩ）：
【化２７】
2014077292.tif 000029
[式中、各記号は前記と同義を示す。]
で表される化合物またはその塩が挙げられる。式（ＩＩ）において、Ｙ１は、それぞれの構成単位において独立して、水素原子、ヒドロキシ基、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基、またはハロゲン原子を示す。Ｙ１における、置換されていてもよいＣ１−６アルコキシ基のＣ１−６アルコキシ基としては、前記Ｙとして例示したものが挙げられる。
Ｙ１は、好ましくは水素原子またはヒドロキシ基である。
Ｑは、好ましくは酸素原子または硫黄原子である。
ｒ、ｒ’は、それぞれ０ないし１００の整数、好ましくは０ないし３の整数である。
式（ＩＩ）で表される化合物またはその塩は、下記（ａ０）の工程および（ｂ０）の工程により製造することができる。
【００４０】
１）（ａ０）の工程：
下記式（Ｉ）：
【化２８】
2014077292.tif 000030
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を用いて、下記式（ＩＶ’）：
【化２９】
2014077292.tif 000031
[式中、各記号は前記と同意義を示す。]
で表わされる化合物またはその塩を製造する。式（ＩＶ’）において、Ｐｒ４は、独立して、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは、水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示す。
ここで、Ｐｒ４で示される保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基における保護基としては、例えば、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、イソブチル、ｓ−ブチル、ｔ−ブチル、ペンチル、イソペンチルなどのＣ１−６アルキル基；２−シアノエチル、２−シアノ−１，１−ジメチルエチルなどのシアノ化Ｃ１−６アルキル基；置換シリル基で置換されたエチル基（例、２−メチルジフェニルシリルエチル、２−トリメチルシリルエチル、２−トリフェニルシリルエチル）；２，２，２−トリクロロエチル、２，２，２−トリブロモエチル、２，２，２−トリフルオロエチルなどのハロゲン化Ｃ１−６アルキル基；エテニル、１−プロペニル、２−プロペニル、１−メチル−２−プロペニル、１−メチル−１−プロペニルなどのＣ２−６アルケニル基；シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシルなどのＣ３−６シクロアルキル基；Ｃ１−６アルキル基、ハロゲン原子およびニトロ基から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいシアノ化Ｃ１−６アルケニル基（例、２−シアノブテニル）；ベンジル、α−ナフチルメチル、β−ナフチルメチルなどのＣ７−11アラルキル基；Ｃ１−６アルキル基、ハロゲン原子およびニトロ基から選ばれる１ないし３個の置換基で置換されていてもよいＣ６−１０アリール基（例、フェニル、インデニル、ナフチル）が挙げられる。
好ましいＰｒ４としては、シアノ化Ｃ１−６アルキル基（なかでも、２−シアノエチルが好ましい）で保護されたヒドロキシ基が挙げられる。
式（ＩＶ’）においては、Ｑが酸素原子であり、かつ、Ｐｒ４が水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示す場合（なかでも、２−シアノエチルで保護されたヒドロキシ基が好ましい）が好ましい。
【００４１】
ＢａｓｅＷは、独立して、チミン、アデニン、グアニン、シトシン、ウラシル若しくはそれらの修飾体または下記式：
【化３０】
2014077292.tif 000032
[式中、各記号は前記と同意義を示す。]
で表わされる化合物またはその塩を示す。
ここで、修飾体としては、前記Ｂａｓｅとして例示したものが挙げられる。
【００４２】
（ａ０）の工程では、本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物を出発原料として、それらのモノマー化合物同士を、ホスホロアミダイト法、ジハロホスフィン誘導体を用いる方法、Ｈ−ホスホネート法などにより、カップリングさせて、２量体とし、必要に応じて酸化反応あるいは硫黄化反応に付した後、更に、同様のカップリングを繰り返し、あるいは、２量体や３量体などのオリゴマー同士をカップリングし、必要に応じて酸化反応あるいは硫黄化反応に付し、これらのカップリングを適当に組み合せて繰り返し、次いで、酸化反応あるいは硫黄化反応に付し、最後に、５’末端のヌクレオシド部分を、脱保護反応により５−ＯＨ体に変換することにより、式（ＩＶ’）で表される化合物またはその塩を製造することができる。これらの製造方法については、ホスホロアミダイト法、ジハロホスフィン誘導体を用いる方法、Ｈ−ホスホネート法などを例にとって、後に詳細に説明する。
【００４３】
２）（ｂ０）の工程：
（ｂ０）の工程では、（ａ０）の工程で得られた式（ＩＶ’）で表される化合物またはその塩と、更に、本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物あるいは、その２量体や３量体などのオリゴマーを、ホスホロアミダイト法、ジハロホスフィン誘導体を用いる方法、Ｈ−ホスホネート法などにより、カップリングさせて、必要に応じて酸化反応あるいは硫黄化反応に付し、同様のカップリングとその都度必要に応じて酸化反応あるいは硫黄化反応を行い、最後に、得られた核酸オリゴマー中の各ヌクレオシドの塩基部分に置換された下記式（ｃ）：
【化３１】
2014077292.tif 000033
[式中、各記号は前記と同意義を示す。]
で表わされる部分や塩基部分の保護基を除去し、また、必要に応じて、各ヌクレオシドの保護されたヒドロキシ基を、脱保護反応によりフリー体に変換することにより、式（ＩＩ）で表される化合物またはその塩を製造することができる。これらの製造方法については、ホスホロアミダイト法、ジハロホスフィン誘導体を用いる方法、Ｈ−ホスホネート法などを例にとって、後に詳細に説明する。
【００４４】
３．ホスホロアミダイト法による核酸オリゴマーの製造
本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物を用いて、ホスホロアミダイト法により、以下に説明する（ａ１）、（ｂ１）および（ｃ１）の工程を実施して、式（ＩＩ）で表される化合物またはその塩を製造することができる。なお、ホスホロアミダイト法による核酸オリゴマーの製造については、日本化学会編  第５版  実験化学講座１６  有機化合物ＩＶ  ２０１０年  ３７７−３８１頁などが参照される。
【００４５】
１）（ａ１）の工程
（ａ１）の工程では、核酸合成で使われるカップリング試薬の存在下に、下記式（ＩＩＩ）：
【化３２】
2014077292.tif 000034
[式中、各記号は前記と同意義を示す。]
で表される化合物またはその塩と、下記式（ＩＶ）：
【化３３】
2014077292.tif 000035
[式中、各記号は前記と同意義を示す。]
で表される化合物またはその塩とを反応させて、下記式（Ｖ）：
【化３４】
2014077292.tif 000036
[式中、各記号は前記と同意義を示す。]
で表される化合物またはその塩を製造する。
【００４６】
式（ＩＩＩ）において、Ｘ１はヒドロキシ基の保護基を示す。該ヒドロキシ基の保護基としては、前記ＸおよびＲ１におけるヒドロキシ基の保護基と同様のものが挙げられる。Ｘ１としては、トリチル型保護基が好ましく、なかでもＤＭＴｒが好ましい。
Ｐｒ１は、各構成単位において独立して、保護されたヒドロキシ基を示す。該ヒドロキシ基の保護基としては、例えば、前記Ｐｒ４におけるヒドロキシ基の保護基が挙げられる。Ｐｒ１は、好ましくはシアノ化Ｃ１−６アルキル基で保護されたヒドロキシ基であり、さらに好ましくは２−シアノエチルで保護されたヒドロキシ基である。
Ｐｒ２ａは、置換されたアミノ基を示す。該アミノ基は置換基でモノまたはジ置換されていてもよい。そのような置換基としては、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、ｔ−ブチル、ペンチル、ヘキシルなどのＣ１−６アルキル基を挙げることができる。Ｐｒ２ａの好ましい例として、ジメチルアミノ、ジエチルアミノ、ジプロピルアミノ、ジイソプロピルアミノ、ジブチルアミノを挙げることができる（なかでも、ジイソプロピルアミノが好ましい）。また、Ｐｒ２ａで示される置換されたアミノ基としては、モルホリニル、ピロリジニルなどの環状アミノ基も含まれる。
【００４７】
Ｐｒ３はヒドロキシ基の保護基を示し、該ヒドロキシ基の保護基としては、前記ＸおよびＲ１におけるヒドロキシ基の保護基が挙げられる。Ｐｒ３としては、脂肪族アシル型保護基が好ましく、なかでもレブリニル基が好ましい。
【００４８】
式（ＩＩＩ）で表される化合物またはその塩は、下記式（ｄ）：
【化３５】
2014077292.tif 000037
[式中、Ｘ１、Ｐｒ１、Ｑ、ＢａｓｅＷ、Ｙおよびｒは、上記と同義を示す。]
で表される化合物またはその塩と、下記式（ｅ）：
【化３６】
2014077292.tif 000038
[式中、Ｊは脱離基を示し、Ｐｒ１およびＰｒ２aは、上記と同義を示す。]
で表される化合物またはその塩とを反応させることにより得られる。Ｊで示される脱離基としては、上記Ｇとして例示した脱離基に加え、Ｃ１−６アルキル基で置換されていてもよいアミノ基（例、ジイソプロピルアミノ）が挙げられる。式（ｄ）で表される化合物またはその塩と式（ｅ）で表される化合物またはその塩との反応は、例えば、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、アセトン、塩化メチレン、クロロホルム、ジオキサン、アセトニトリル、ベンゼン、トルエン、テトラヒドロフラン、ｔｅｒｔ−ブチルメチルエーテルなどの反応を阻害しない溶媒中で、０℃から１００℃で５分間から７２時間反応させることによって行われる。本反応は、例えば、２，６−ルチジン、コリジン、ピリジン、トリエチルアミン、トリブチルアミン、１，８−ジアザビシクロ［５．４．０］−７−ウンデセンなどの有機塩基；水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、炭酸セシウム、フッ化セシウムなどの無機塩基；ｎ−ブチルリチウム、リチウムジイソプロピルアミド、（ジエチルアミノ）リチウムなどの有機金属塩基、１−メチルイミダゾールなどの反応促進剤の存在下でも行うことができる。
【００４９】
式（ＩＶ）の化合物またはその塩は、ｒ’が０の場合には、Ｘが水素原子である本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物をそのまま使用すればよい。ｒ’が１である式（ＩＶ）の化合物またはその塩は、Ｘが水素原子である本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物と、ｒが０である式（ＩＩＩ）の化合物またはその塩とを、以下に説明する（a１）の工程に付すことにより得られる。ｒ’が２以上である式（ＩＶ）の化合物またはその塩も、同様に、（a１）の工程を繰り返すことによって製造することができる。
【００５０】
（ａ１）の工程で用いる「核酸合成で使われるカップリング試薬」としては、ホスホロアミダイト法において通常使用されているカップリング試薬を挙げることができ、例えば、１Ｈ−テトラゾール、ジイソプロピルアンモニウムテトラゾール、５−（エチルチオ）−１Ｈ−テトラゾール、５−ベンゾイルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール、４，５−ジシアノイミダゾール、４，５−ジクロロイミダゾール、ヒドロキシベンズトリアゾール、１−ヒドロキシ−６−ニトロベンゾロリアゾール、イミダゾリニウムトリフレートを用いることができる。これらのカップリング試薬を用いて、式（ＩＩＩ）の化合物またはその塩と、式（ＩＶ）の化合物またはその塩とを、アセトニトリル、プロピオニトリル、ブチロニトリル等のアルキルニトリル；塩化メチレン、ジクロロメタン、１，１−ジクロロエタン、１，２−ジクロロエタン、トリクロロエタン等のハロゲン化アルカン；テトラヒドロフラン、ジオキサン、ジメトキシエタン等のエーテル；ジメチルホルムアミド；トルエンなどの適当な有機溶媒中で、−７０℃から８０℃好ましくは−５０℃から５０℃で、１０分から２４時間反応させることによりカップリング反応を実施することができる。本発明では、このカップリング反応は、液相で行うことができる。カップリング反応により、式（ＩＩＩ）の化合物またはその塩の３’末端のヌクレオシド部分の３’−ＯＨに導入されたホスホロアミダイト基と、式（ＩＶ）の化合物またはその塩の５’末端のヌクレオシド部分の５’−ＯＨとが反応して、式（Ｖ）の化合物またはその塩を得ることができる。
【００５１】
式（Ｖ）の化合物またはその塩は、その分子中に、上記した式（ｃ）で表わされる、疎水性基を有する構造部分を有しているため、液相での反応後に、溶媒への溶解性などを利用して、カラムクロマト精製を行うことなく、分離することができる。例えば、反応後に溶媒を濃縮し吸引濾過により分離することができる。
【００５２】
２）（ｂ１）の工程
（ｂ１）の工程では、上記（ａ１）の工程で得られた式（Ｖ）の化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して下記式（ＶＩ）：
【化３７】
2014077292.tif 000039
［式中、各記号は上記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する。
【００５３】
酸化反応には、核酸合成に通常使用される酸化反応を採用することができる。上記酸化反応として、例えば、塩素、臭素、ヨウ素などのハロゲン単体(なかでもヨウ素が好ましい)；ｔ−ブチルヒドロペルオキシド、ビス（トリメチルシリル）ペルオキシド、１，１−ジヒドロペルオキシシクロドデカン（特開２００８−１００９７６号公報）、ｍ−クロロ過安息香酸などの過酸化物；過酸化水素水、１０−（カンファースルホニル）オキサジリジン（M. Manaoharan. Y. Lu et al., Org. Lett., 2, 243 (2000)）、四酸化二窒素等の酸化剤を、ピリジン、水、アセトニトリル、テトラヒドロフランなどの単独溶媒もしくはこれらの任意の混合溶媒に、０．０１Ｍから２Ｍの濃度になるように溶解した溶液中で行う酸化反応が挙げられる。
【００５４】
硫黄化反応は、ホスホロチオエート結合を持つ修飾核酸の合成に通常使用されている硫黄化反応を採用することができる。上記硫黄化反応として、例えば、硫黄のピリジン懸濁液、硫黄の２，６−ルチジン懸濁液、硫黄のコリジン懸濁液、硫黄の二硫化炭素溶液、テトラエチルチウラムジスルフィド（ＴＥＴＤ）（H. Vu et al., Tetrahedron Lett., 32, 3005-3008 (1991)、Ｂｅａｕｇｅ試薬（R.P. Lyer et al., J. Am. Chem. Soc., 112, 1253-1254 (1990）、ローソン試薬、フェニルアセチルジスルフィドを用いた硫黄化反応が挙げられる。これらの硫黄化反応には、反応を阻害しない溶媒、例えば、Ｎ，Ｎ-ジメチルホルムアミド、トルエン、ジクロロメタン、クロロホルム、２，４，６−トリメチルピリジン、２，６−ルチジン、ピリジン、Ｎ−メチルピロリドン、アセトン、テトラヒドロフラン、アセトニトリルを用いることもできる。硫黄化反応は、例えば、−８０℃から１００℃好ましくは−１０℃から５０℃で５分間から２４時間程度、反応液を攪拌することにより実施できる。
【００５５】
酸化反応あるいは硫黄化反応により、５価のリン酸トリエステル結合を有する式（ＶＩ）の化合物またはその塩が得られる。酸化反応あるいは硫黄化反応の後に上記（ａ１）の工程において一部未反応の式（ＩＶ）の化合物またはその塩の５’−ＯＨ体が残存している場合には、必要に応じて、得られた溶液をキャッピング反応に付してもよい。キャッピング反応は、無水酢酸／４−ジメチルアミノピリジン系あるいは無水酢酸／ルチジン／Ｎ−メチルイミダゾール系のアシル化剤をキャッピング剤として用いる、通常の方法により実施することができる。
【００５６】
３）（ｃ１）の工程
（ｃ１）の工程では、上記（ｂ１）の工程で得られた式（ＶＩ）の化合物またはその塩を、脱保護反応に付して、目的とする式（ＩＩ）の化合物またはその塩を得る。この脱保護反応により、式（ＶＩ）の化合物またはその塩における、Ｘ１、Ｐｒ１およびＰｒ３のヒドロキシ基の保護基が脱離され、またＹがヒドロキシ基の保護基である場合、Ｙのヒドロキシ基の保護基が脱離され、ＢａｓｅＷが下記式：
【化３８】
2014077292.tif 000040
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
の場合に、Ｂａｓｅに結合した、少なくとも１つの疎水性基（―Ｒ２および―Ｒ３）を有する芳香族炭化水素環（Ａｒ）カルボニルもしくはチオカルボニル基が脱離され、同様に、３’末端側のヌクレオシド部分に結合した該カルボニルもしくはチオカルボニル基が脱離される。また、Ｂａｓｅが、チミン、アデニン、グアニン、シトシンまたはウラシルの修飾体、すなわち、チミン、アデニン、グアニン、シトシンまたはウラシルのアミノ基が保護されたものである場合には、これらのアミノ基の保護基も同様に脱離される。
【００５７】
脱保護反応は、通常の核酸合成に用いられる脱保護反応を採用することができる。例えば、脱保護剤として、濃アンモニア水、メチルアミン水溶液、エチルアミン水溶液、ジメチルアミン水溶液、ジエチルアミン水溶液、水酸化ナトリウム水溶液、炭酸カリウム水溶液などのアルカリ性水溶液と、反応を阻害しない有機溶媒、例えば、エタノール、メタノール、イソプロピルアルコールなどを任意の比率で混合した溶液；あるいは、例えば、メチルアミン、ｔ―ブチルアミン、トリエチルアミン、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン、１，８−ジアザビシクロ「５．４．０」ウンデカー７−エンなどの有機塩基を反応を阻害しない溶媒、例えば、エタノール、メタノール、イソプロピルアルコール、アセトニトリル、ジメチルスルホキシド、テトラヒドロフランの単独溶媒もしくは任意の比率の混合溶媒に溶解した溶液；あるいはフッ化テトラブチルアンモニウム、フッ化テトラブチルアンモニウムー酢酸、フッ化水素ピリジン、トリエチルアミン・三フッ化水素、トリフルオロ酢酸、ジクロロ酢酸、トリクロロ酢酸などを反応を阻害しない有機溶媒、例えば、ジクロロメタン、クロロホルム、１，２−ジクロロエタン、アセトニトリル、テトヒドロフラン、ジメチルスルホキシドなどに溶解した溶液；などを用いることができる。
【００５８】
かくして、ホスホロアミダイト法により、目的とする式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造することができる。本発明では、上記したとおり、各工程で用いる合成中間体が、疎水性基を有する構造部分を有しているため、液相での反応後に、各合成化合物を、溶媒への溶解性等を利用して、カラムクロマト精製を行うことなく、抽出の操作やろ過の操作などで分離することができる。例えば、反応後に溶媒を濃縮し吸引濾過により分離することができる。
【００５９】
４．ジハロホスフィン誘導体を用いる核酸オリゴマーの製造
本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物を用いて、ジハロホスフィン誘導体を用いる方法により、以下に説明する（ａ２）、（ｂ２）および（ｃ２）の工程を実施して、式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造することができる。なお、ジハロホスフィン誘導体を用いる核酸オリゴマーの製造については、日本化学会編  第４版  実験化学講座２２  金属錯体・遷移金属クラスター  １９９９年  ４２６−４３１頁などが参照される。
【００６０】
１）（ａ２）の工程
（ａ２）の工程では、下記式（ＶＩＩ）：
【化３９】
2014077292.tif 000041
［式中、Ｐｒ２ｂはハロゲン原子を示し、その他の各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩と、下記式（ＩＶ）：
【化４０】
2014077292.tif 000042
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩とを反応させて、下記式（Ｖ）：
【化４１】
2014077292.tif 000043
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する。
【００６１】
式（ＶＩＩ）において、Ｐｒ２ｂは、フッ素、塩素、臭素、ヨウ素などのハロゲン原子を示す。
【００６２】
式（ＶＩＩ）の化合物またはその塩は、下記式（ｄ）：
【化４２】
2014077292.tif 000044
[式中、Ｘ１、Ｐｒ１、Ｑ、ＢａｓｅＷ、Ｙおよびｒは、上記と同義を示す。]
で表される化合物またはその塩と、下記式（ｆ）
【化４３】
2014077292.tif 000045
[式中、Ｈａｌはハロゲン原子を示し、Ｐｒ１およびＰｒ２ｂは、上記と同義を示す。]
で表わされるホスファイト化剤を反応させることにより得られる。式（ｆ）のＨａｌのハロゲン原子の例としては、塩素が挙げられる。Ｐｒ２ｂのハロゲン原子としては、塩素が好ましい。上記ホスファイト化剤としては、例えば、２−シアノエチル＝ホスホロジクロリダイト、メチル＝ホスホロジクロリダイド、２，２，２−トリクロロエチル＝ホスホロジクロリダイド、２，２，２−トリクロロ−１，１−ジメチルエチル＝ホスホロジクロリダイド、アリル＝ホスホロジクロリダイドおよび２−クロロフェニル＝ホスホロジクロリダイドが挙げられる。
【００６３】
式（ｄ）の化合物またはその塩と、式（ｆ）で表されるホスファイト化剤との反応は、コリジン、２，６−ルチジンなどの反応促進剤の存在下に行うこともできる。式（ｄ）の化合物またはその塩と式（ｆ）で表されるホスファイト化剤との反応は、テトラヒドロフラン、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、アセトン、クロロホルム、ジクロロメタン、ジオキサン、t−ブチルメチルエーテル、アセトニトリル、ベンゼン、トルエンなどの反応を阻害しない溶媒中で、例えば、コリジン、２，６−ルチジンの存在下、−７８℃から５０℃で５分間から７２時間反応させることにより実施することができる。
【００６４】
かくして得られる式（ＶＩＩ）の化合物またはその塩と、式（ＩＶ）の化合物またはその塩との反応は、通常、上記した式（ｄ）の化合物またはその塩と式（ｆ）で表されるホスファイト化剤との反応後に、そのまま引き続いて、式（ＩＶ）の化合物またはその塩を加えて反応を継続することによって実施することができる。
このようにして、式（ｄ）の化合物またはその塩と、式（ｆ）のホスファイト化剤（例えば、メチル＝ホスホロジクロリダイド、２，２，２−トリクロロエチル＝ホスホロジクロリダイドなどのジハロホスフィン誘導体）を反応させて、式（ＶＩＩ）の化合物またはその塩を得て、引き続き、式（ＩＶ）の化合物またはその塩を反応させることにより、式（ＶＩＩ）の化合物またはその塩の３’末端のヌクレオシド部分の３’−ＯＨに導入されたホスファイト基と、式（ＩＶ）の化合物またはその塩の５’末端のヌクレオシド部分の５’−ＯＨが結合して、式（Ｖ）の化合物またはその塩を得ることができる。
【００６５】
ホスホロアミダイト法による核酸オリゴマーの製造において説明したように、式（Ｖ）の化合物またはその塩は、その分子中に、上記した式（ｃ）で表わされる、疎水性基を有する構造部分を有しているため、液相での反応後に、溶媒への溶解性などを利用して、カラムクロマト精製を行うことなく、分離することができる。例えば、反応後に溶媒を濃縮し吸引濾過により分離することができる。また、式（Ｖ）の化合物またはその塩を、単離することなく、そのまま、次の（ｂ２）の工程に付すこともできる。
【００６６】
２）（ｂ２）の工程
（ｂ２）の工程では、上記したホスホロアミダイト法の（ｂ１）の工程と同様に、上記（ａ２）の工程で得られた式（Ｖ）の化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、式（ＶＩ）の化合物またはその塩を製造する。酸化反応、硫黄化反応、その後に必要に応じて行うキャッピング反応は、上記したホスホロアミダイト法の（ｂ１）の工程で説明した方法と同様に行うことができる。
【００６７】
３）（ｃ２）の工程
（ｃ２）の工程では、上記したホスホロアミダイト法の（ｃ１）の工程と同様に、上記（ｂ２）の工程で得られた式（ＶＩ）の化合物またはその塩を、脱保護反応に付して、目的とする式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造する。脱保護反応は、ホスホロアミダイト法の（ｃ１）の工程で説明した方法と同様に行うことができる。
【００６８】
かくして、ジハロホスフィン誘導体を用いる方法により、目的とする式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造することができる。ジハロホスフィン誘導体を用いる方法においても、上記したとおり、各工程で用いる合成中間体が、疎水性基を有する構造部分を有しているため、液相での反応後に、各合成化合物を、カラムクロマト精製を行うことなく、分離することができる。例えば、反応後に溶媒を濃縮し吸引濾過により分離することができる。
【００６９】
５．Ｈ−ホスホネート法を用いる核酸オリゴマーの製造
本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物を用いて、Ｈ−ホスホネート法を用いる方法により、以下に説明する（ａ３）、（ｂ３）および（ｃ３）の工程を実施して、式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造することができる。
【００７０】
先ず、本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物を用いるＨ−ホスホネート法について、以下に、概略的な反応スキームを用いて、その概略を説明する。
以下の反応スキーム１に示すように、Ｈ−ホスホネート法は、化合物１のＨ−ホスホネートに対して、化合物２の５−ＯＨをピバロイルクロリドなどのカップリング試薬の存在下でカップリングさせることによる、核酸モノマーもしくは核酸オリゴマーユニット同士をＨ−ホスホネート構造により結合させる方法である。
【化４４】
2014077292.tif 000046
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
【００７１】
得られる化合物３は、反応スキーム２に示すように、化合物３は対応するリン酸エステルもしくはチオリン酸エステルへ誘導される。すなわち、化合物３に対してヨウ素等の酸化剤を用いて、直接酸化して化合物４へ誘導することができ、また、硫黄化（ＲＳは、保護されたチオール基を示す。該チオール基の保護基として、前記Ｐｒ４で示される保護されたチオール基における保護基と同一の保護基が挙げられる。）した化合物５から誘導することもできる。また、化合物３を直接硫黄化（酸化）して化合物６に誘導することもでき、化合物５から脱保護して化合物６へ誘導することもできる。
【化４５】
2014077292.tif 000047
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
【００７２】
これらの概略的説明を踏まえて、以下に、（ａ３）、（ｂ３）および（ｃ３）の工程を実施して、式（ＩＩ）の化合物またはその塩の核酸オリゴマーを製造する方法について説明する。なお、これらの方法については、Colin B. Reese et al., J. Chem. Soc., Perkin Trans. I, 1999, 1477-1468；Colin B. Reese et al., J. Chem. Soc., Perkin Trans. I, 2002, 2619-2633 などの文献が参照される。また、Ｈ−ホスホネート法を用いる核酸オリゴマーの製造については、日本化学会編  第５版  実験化学講座１６  有機化合物ＩＶ  ２０１０年  ３８１−３８４頁などが参照される。
【００７３】
１）（ａ３）の工程
（ａ３）の工程では、下記式（ＶＩＩＩ）：
【化４６】
2014077292.tif 000048
［式中、Ｘ＋は、カチオンを示し、
Ｐｒ４は、Ｑが酸素原子のときは、水素原子、保護されたヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示し、
その他の各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩と、核酸合成で使われるカップリング試薬の存在下に、下記式（ＩＸ）：
【化４７】
2014077292.tif 000049
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩とを反応させて、下記式（Ｘ）：
【化４８】
2014077292.tif 000050
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する。この工程（a３）は、上記反応スキーム１の反応に相当する。
【００７４】
式（ＶＩＩＩ）において、Ｘ＋は、カチオンを示し、カチオンとしては、例えば、置換されていてもよいアンモニウムイオンまたは金属イオンを挙げることができる。ここで、置換されたアンモニウムイオンとしては、例えば、メチルアンモニウムイオン、エチルアンモニウムイオン、イソブチルアンモニウムイオンなどのモノＣ１−６アルキルアンモニウムイオン；ジメチルアンモニウムイオン、ジエチルアンモニウムイオン、ジイソブチルアンモニウムイオンなどのジＣ１−６アルキルアンモニウムイオン；トリメチルアンモニウムイオン、トリエチルアンモニウムイオンなどのトリＣ１−６アルキルアンモニウムイオン；Ｎ−エチル−Ｎ−イソプロピルプロパン−２−アミニウムおよび３，４，５，６，７，８，９，１０−オクタヒドリド−２Ｈ−ピリミド［１，２−ａ］アゼピン−５−イウムが挙げられる。金属イオンとしては、例えば、ナトリウムイオン、カリウムイオン、リチウムイオンが挙げられる。
【００７５】
ここで、式（ＶＩＩＩ）の化合物は、Ｑが酸素原子のときには、例えば、以下の構造を有する。
【化４９】
2014077292.tif 000051
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
化合物７は、Ｐｒ４が水素原子、化合物８は、Ｐｒ４がシアノエチル基で保護されたヒドロキシ基、化合物９は、Ｐｒ４がシアノエチル基で保護されたチオール基である化合物にそれぞれ相当する。
Ｑが硫黄原子のときには、式（ＶＩＩＩ）の化合物は例えば以下の構造を有する。
【化５０】
2014077292.tif 000052
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
化合物１０は、Ｐｒ４がシアノエチル基で保護されたヒドロキシ基である化合物に相当する。
【００７６】
式（ＶＩＩＩ）の化合物またはその塩は、例えば下記式（ｇ）：
【化５１】
2014077292.tif 000053
[式中、Ｘ１、Ｐｒ４、Ｑ、ＢａｓｅＷおよびＹは、上記と同義を示す。]
で表される化合物またはその塩と、ｐ−トルイルＨ−ホスホネートのトリエチルアンモニウム塩などの塩とピバロイルクロライドなどの促進剤の存在下で、ピリジン中で、−７８℃〜５０℃好ましくは−７８℃〜１０℃で反応させることにより得ることができる。また、式（ｇ）の化合物またはその塩と、亜リン酸ジフェニル、ジ（ｔ−ブチル）Ｎ，Ｎ−ジエチルホスホロアミダイト、ジ（トリベンジルメチル）Ｎ，Ｎ−ジエチルホスホロアミダイト、ジ（２−トリメチルシリル−１，１−ジメチルエチル）Ｎ，Ｎ−ジエチルホスホロアミダイトなどのホスフィチル化剤とを反応させて、式（ｇ）の化合物またはその塩を、ホスフィチル化し、次いで、トリエチルアミン、トリブチルアミンなどの３級アミンあるいは水酸化カリウム、水酸化リチウムなどの水酸化アルカリ金属で処理することにより、３’−Ｈ−ホスホネートとして得ることができる。
【００７７】
式（ＩＸ）の化合物またはその塩は、ｒ’が０の場合には、Ｘが水素原子であり、Ｒ１がヒドロキシ基の保護基である本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物をそのまま使用すればよい。ｒ’が１である式（ＩＸ）の化合物またはその塩は、Ｘが水素原子である本発明の新規ヌクレオシドモノマー化合物と、ｒが０である式（ＩＩＩ）の化合物またはその塩とを、例えば、前記したホスホロアミダイト法によりカップリング反応に付して、次いで、酸化または硫黄化反応に付し、必要に応じて、例えば、シアノエチル基をなどの保護基をヒドロキシ基またはチオール基に導入することにより製造することができる。ｒ’が２以上である式（ＩＸ）の化合物またはその塩も、同様の反応を繰り返すことによって製造することができる。
【００７８】
（ａ３）の工程で用いる、核酸合成で使われるカップリング試薬としては、Ｈ−ホスホネート法において通常使用されているカップリング試薬を挙げることができ、例えば、ピバロイルクロリド、２−（ベンゾイルトリアゾール１−イルオキシ）―１，３−ジメチル−２−ピロリジン−１−イル−１，３，２−ジアザホスホリジリニウム  ヘキサフルオレート（ＢＯＭＰ）、Ｎ，Ｎ−ビス（２−オキサゾリジニル）ホスホニッククロリド（ＢｏｐＣｌ）、ベンゾイルクロライド、無水安息香酸を用いることができる。
これらのカップリング試薬を用いて、式（ＶＩＩＩ）の化合物またはその塩と、式（ＩＸ）の化合物またはその塩とを、塩化メチレン、クロロホルム、テトラヒドロフラン、ジオキサン、ジメトキシエタン、Ｎ，Ｎ−ジメチルホルムアミド、アセトニトリル、トルエン、ピリジンなどの適当な有機溶媒中で、−６０℃から１００℃好ましくは−２０から５０℃で、１０分から２４時間反応させることにより、カップリング反応を実施することができる。本発明では、このカップリング反応は、液相で行うことができる。カップリング反応により、式（ＶＩＩＩ）の化合物またはその塩の３’末端のヌクレオシド部分の３−ＯＨに導入された亜リン酸ジエステル基と、式（ＩＸ）の化合物またはその塩の５’末端のヌクレオシド部分のフリー体の５−ＯＨとが結合して、式（Ｘ）の化合物またはその塩を得ることができる。
【００７９】
２）（ｂ３）の工程
（ｂ３）の工程では、上記（ａ３）の工程で得られた式（Ｘ）の化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、下記式（ＸＩ）：
【化５２】
2014077292.tif 000054
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
で表される化合物またはその塩を製造する。
【００８０】
式（ＸＩ）において、Ｐｒ５は、（ｉ）Ｑが酸素原子のときは、保護されていてもよいヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑが硫黄原子のときは、保護されたヒドロキシ基を示し、Ｐｒ６は、（ｉ）Ｑ１が酸素原子のときは、ヒドロキシ基または保護されたチオール基を示し、（ｉｉ）Ｑ１が硫黄原子のときは、ヒドロキシ基を示す。ここで、保護されていてもよいヒドロキシ基および保護されたチオール基における保護基としては、前記Ｐｒ４について例示した保護基が同様に挙げられる。
Ｐｒ５は、好ましくは保護されたヒドロキシ基であり、なかでもシアノ化Ｃ１−６アルキル基で保護されたヒドロキシ基が好ましく、とりわけ２−シアノエチルで保護されたヒドロキシ基が好ましい。
Ｐｒ６は、好ましくは保護されたヒドロキシ基であり、なかでもシアノ化Ｃ１−６アルキル基で保護されたヒドロキシ基が好ましく、とりわけ２−シアノエチルで保護されたヒドロキシ基が好ましい。
【００８１】
（ｂ３）の工程では、上記したホスホロアミダイト法の（ｂ１）の工程と同様に、上記（ａ３）の工程で得られた式（Ｘ）の化合物またはその塩を、酸化反応あるいは硫黄化反応に付して、式（ＸＩ）の化合物またはその塩を製造する。酸化反応、硫黄化反応、その後に必要に応じて行うキャッピング反応は、上記したホスホロアミダイト法の（ｂ１）の工程で説明した方法と同様に行うことができる。
【００８２】
ここで、式（ＸＩ）の化合物におけるＰｒ５は、Ｐｒ４からＨ−ホスホネート構造を除いた置換基に相当する。Ｑ１が酸素原子のとき、式（ＸＩ）の化合物は、例えば、以下の構造（または、以下の構造に塩を付した構造）を有する。
【化５３】
2014077292.tif 000055
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
化合物１１は、Ｐｒ６がヒドロキシ基、化合物１２は、Ｐｒ６がチオール基、化合物１３は、Ｐｒ６がシアノエチル基で保護されたチオール基である化合物にそれぞれ相当する。
Ｑ１が硫黄原子のとき、式（ＸＩ）の化合物は、例えば、以下の構造（または、以下の構造に塩を付した構造）を有する。
【化５４】
2014077292.tif 000056
［式中、各記号は前記と同義を示す。］
化合物１２’は、Ｐｒ６がヒドロキシ基である化合物に相当する。
【００８３】
３）（ｃ３）の工程
（ｃ３）の工程では、上記したホスホロアミダイト法の（ｃ１）の工程と同様に、上記（ｂ３）の工程で得られた式（ＸＩ）の化合物またはその塩を、脱保護反応に付して、目的とする式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造する。脱保護反応は、上記したホスホロアミダイト法の（ｃ１）の工程で説明した方法と同様に行うことができる。
【００８４】
かくして、Ｈ−ホスホネート法により、目的とする式（ＩＩ）の化合物またはその塩を製造することができる。Ｈ−ホスホネート法においても、上記したとおり、各工程で用いる合成中間体が、疎水性基を有する構造部分を有しているため、液相での反応後に、各合成化合物を、カラムクロマト精製を行うことなく、分離することができる。例えば、反応後に溶媒を濃縮し吸引濾過により分離することができる。
【００８５】
なお、上記の核酸オリゴマーの製造方法の説明において、リン酸部位が不斉点を有する場合、核酸オリゴマーは光学活性体であっても、ラセミ体等、各光学活性体の混合物であってもよく、複数の不斉点を有する場合はジアステレオマー体の混合物でもよい。
【００８６】
このようにして製造した核酸オリゴマーは、例えばsiＲＮＡとして用いた場合には、抗腫瘍剤、抗ウイルス剤をはじめとした、「遺伝子の働きを阻害して疾病を治療する医薬品」としての有用性が期待される。上記核酸オリゴマーは、例えば緩衝剤及び／又は安定剤等の慣用の助剤を配合して非経口投与用製剤とすることができる。また、上記核酸オリゴマーに慣用の医薬用担体を配合して軟膏、クリーム、液剤、又は膏薬等の局所用製剤とすることもできる。
【００８７】
以下、実施例に基いて本発明を更に詳細に説明するが、本発明は、これらの実施例に限定されるものではない。
【実施例】
【００８８】
実施例１
３個のオクタデシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５））の合成
【化５５】
2014077292.tif 000057
【００８９】
（１）３個のオクタデシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ１））
【化５６】
2014077292.tif 000058
没食子酸メチル（９．２ｇ）と炭酸カリウム（１０３．７ｇ）に１，３−ジメチル−２−イミダゾリジノン（１７０ｍＬ）を加えて８０℃で３０分間攪拌した。これに１−ブロモオクタデカン（６９．１ｍＬ）を加えて８０℃で１２時間攪拌した。反応液に４０℃の温水を加えて懸濁した後、吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体をアセトニトリルとアセトン、メタノールで洗浄してＥ１で示した化合物（４８．０ｇ）を定量的に得た。【００９０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.25 (s, 2H), 3.99-4.03 (m, 6 H), 3.89 (s, 3 H), 1.78-1.84 (m, 4H), 1.71-1.77 (m, 2H), 1.44-1.50 (m, 6H), 1.20-1.38 (m, 84H), 0.88 (t, J = 7.0 Hz, 9H)【００９１】
（２）３個のオクタデシルオキシ基で置換された安息香酸（化合物（Ｅ２））の合成
【化５７】
2014077292.tif 000059
【００９２】
ナス型フラスコに化合物（Ｅ１）（２２．５ｇ）とエタノール（２２５ｍＬ）を量り、懸濁した。これに水酸化カリウム（１３．４ｇ）を添加し、８０℃で３時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、室温で１Ｍ塩酸（２４０ｍＬ）を添加し、３０分撹拌した。吸引濾過によって得られた固体を５０℃でメタノールに懸濁した後、吸引ろ取し、化合物（Ｅ２）を得た（２１．４ｇ、収率９６．７％）。【００９３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.32 (s, 2H), 4.04 (t, J = 6.5 Hz, 2H), 4.02 (t, J = 6.5 Hz, 4H), 1.78-1.86 (m, 4H), 1.71-1.78 (m, 2H), 1.43-1.52 (m, 6H), 1.21-1.40 (m, 84H), 0.88 (t, J = 7.0 Hz, 9H). 【００９４】
（３）３個のオクタデシルオキシ基で置換された安息香酸クロライド（化合物（Ｅ３））の合成
【化５８】
2014077292.tif 000060
【００９５】
ナス型フラスコに、化合物（Ｅ２）（１５ｇ）をトルエン（１２０ｍＬ）に懸濁し、塩化チオニル（３．５ｍＬ）と、Ｎ，Ｎ’−ジメチルホルムアミド（２．５ｍＬ）を加え、５０℃で２時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、化合物（Ｅ３）を得た（１５．１ｇ、収率９８．７％）。【００９６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.33 (s, 2H), 4.08 (t, J = 6.5 Hz, 2H), 4.02 (t, J = 6.5 Hz, 4H), 1.78-1.86 (m, 4H), 1.70-1.78 (m, 2H), 1.40-1.52 (m, 6H), 1.21-1.40 (m, 84H), 0.88 (t, J = 7.0 Hz, 9H).【００９７】
（４）ｄＴ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ４））の合成
【化５９】
2014077292.tif 000061
【００９８】
１−（（２Ｒ,４Ｓ,５Ｒ)−５−((ビス(４‐メトキシフェニル)（フェニル）メトキシ)メチル)−4−ヒドロキシテトラヒドロフラン−２−イル)−５−メチルピリミジン−２,４（１Ｈ,３Ｈ）−ジオン（１００ｇ）をテトラヒドロフラン（５００ｍＬ）に溶解し、レブリン酸（３３．０ｇ）とＮ，Ｎ’−ジメチルアミノピリジン２．２４ｇ（１８．４ｍｍｏｌ，０．１当量）と１−エチル−３−（３−ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（５３．８ｇ）を順に添加し、室温で９０分撹拌した。反応液に室温で１０％酢酸／トリエチルアミン水溶液（５００ｍＬ）と酢酸エチル（５００ｍＬ）を添加し、分液抽出した。有機層を減圧濃縮し、化合物（Ｅ４）（１３２．６ｇ、収率１１２．４％）を得た。【００９９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 9.93 (brs, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.40 (d, J = 7.3Hz, 2H), 7.26-7.33 (m, 6H), 7.20-7.26 (m, 1H), 6.84 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 6.46 (dd, J = 8.8, 5.7 Hz, 1H), 5.48 (d, J = 5.7 Hz, 1H), 4.15 (d, J = 1.6 Hz, 1H), 3.78 (s, 6H), 3.44-3.50 (m, 2H), 2.70-2.82 (m, 2H), 2.55-2.63 (m, 2H), 2.40-2.53 (m, 2H), 2.15-2.21 (m, 3H), 1.38 (s, 3H).【０１００】
（５）３個のオクタデシルオキシ基を有するｄＴ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５））の合成
【化６０】
2014077292.tif 000062
【０１０１】
化合物（Ｅ４）（８．１５ｇ）にピリジン（１００ｍＬ）、Ｎ，Ｎ’−ジイソプロピルエチルアミン（６．８３ｇ）、クロロトリメチルシラン（２．８７ｇ）を順に加え、室温で３０分撹拌した。混合液に３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）安息香酸クロリド（化合物（Ｅ３））（１０ｇ）を添加し、６０℃で３時間撹拌した。反応液に室温でメタノールを添加し、氷冷した。析出した固体を吸引ろ取し、化合物（Ｅ５）（１３．３ｇ、収率８１．１％）を得た。【０１０２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.71 (brs, 1H), 7.36-7.42 (d, J = 7.3 Hz, 2H), 7.23-7.34 (m, 7H), 7.13 (s, 2H), 6.86 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 6.38-6.46 (m, 1H), 5.48 (d, J = 5.4 Hz, 1H), 4.16 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 3.92-4.07 (m, 6H), 3.80 (s, 6H), 3.49 (br_s, 2H), 2.67-2.81 (m, 2H), 2.38-2.62 (m, 2H), 2.15-2.21 (m, 2H), 2.18 (s, 3H), 1.76-1.84 (m, 4H), 1.68-1.76 (m, 2H), 1.41-1.50 (m, 6H), 1.39 (s, 3H), 1.17-1.36 (m, 84H), 0.88 (t, J = 7.0 Hz, 9H).【０１０３】
実施例２
３個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ７））の合成
【化６１】
2014077292.tif 000063
【０１０４】
（１）Ｕ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ６））の合成
【化６２】
2014077292.tif 000064
【０１０５】
１−（（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−３−（（ｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）−４−ヒドロキシテトラヒドロフラン−２−イル）ピリミジン−２,４（１Ｈ,３Ｈ）−ジオン（１ｇ）をテトラヒドロフラン（５ｍＬ）に溶解した。これにレブリン酸（０．２７２ｇ）、Ｎ，Ｎ’−ジメチルアミノピリジン（０．０１８５ｇ）、１−エチル−３−（３−ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（０．４４４ｇ）を順に添加し、室温で１８時間撹拌した。反応液に室温で１０％酢酸／トリエチルアミン水溶液（１０ｍＬ）と酢酸エチル（１０ｍＬ）を添加し、分液抽出した。得られた有機層を減圧濃縮し、化合物（Ｅ６）（１．２１ｇ、収率１０５．７％）を得た。【０１０６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 9.02 (brs, 1H), 7.89 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 7.33-7.38 (m, 2H), 7.31 (t, J = 7.6 Hz, 2H), 7.22-7.28 (m, 5H), 6.85 (d, J = 8.2 Hz, 4H), 5.98 (d, J = 5.0 Hz, 1H), 5.34 (t, J = 4.6 Hz, 1H), 5.29 (d, J = 8.2 Hz, 1H), 4.50 (t, J = 5.0 Hz, 1H), 4.21-4.27 (m, 1H), 3.80 (s, 6H), 3.53 (dd, J = 11.1, 2.2 Hz, 1H), 3.44 (dd, J = 11.0, 1.9 Hz, 1H), 2.75-2.84 (m, 1H), 2.64-2.75 (m, 2H), 2.56-2.63 (m, 1H), 2.20 (s, 3H), 0.86 (s, 9H), 0.09 (s, 3H), 0.08 (s, 3H).【０１０７】
（２）３個のオクタデシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ７））の合成
【化６３】
2014077292.tif 000065
【０１０８】
化合物（Ｅ６）（１．６０ｇ）にピリジン（１５ｍＬ）、Ｎ，Ｎ’−ジイソプロピルエチルアミン（１．０２ｇ）、クロロトリメチルシラン（０．４３１ｇ）を順に添加し、室温で３０分撹拌した。混合液に３，４，５−トリ（オクタデシルオキシ）安息香酸クロリド（１．５ｇ）を添加し、６０℃で３時間撹拌した。反応液に室温でメタノールを添加した後、氷冷した。吸引ろ取し、化合物（Ｅ７）（２．３４ｇ、収率８８．５％）を得た。【０１０９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.98 (brd, J = 7.6 Hz, 1H), 7.35-7.41 (m, 2H), 7.32 (t, J = 7.6 Hz, 2H), 7.23-7.30 (m, 5H), 7.13 (s, 2H), 6.84-6.90 (m, 4H), 5.99 (d, J = 4.7 Hz, 1H), 5.31-5.45 (m, 2H), 4.54 (t, J = 4.9 Hz, 1H), 4.24 (brs, 1H), 4.04 (t, J = 6.6 Hz, 2H), 3.91-4.01 (m, 4H), 3.80 (d, J = 1.3 Hz, 6H), 3.56 (dd, J = 11.1, 2.2 Hz, 1H), 3.47 (dd, J = 11.1, 2.2 Hz, 1H), 2.74-2.83 (m, 1H), 2.64-2.73 (m, 2H), 2.53-2.61 (m, 1H), 2.19 (s, 3H), 1.75-1.83 (m, 4H), 1.69-1.75 (m, 2H), 1.45 (m, 6H), 1.17-1.36 (m, 84H), 0.88 (t, J = 7.3 Hz, 9H), 0.86 (s, 9H),0.09 (s, 3H), 0.08 (s, 3H).【０１１０】
実施例３
３個のテトラデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ８））の合成
【化６４】
2014077292.tif 000066
【０１１１】
（１）３個のテトラデシルオキシ基で置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ９））
【化６５】
2014077292.tif 000067
【０１１２】
没食子酸メチル（５．５ｇ）と炭酸カリウム（６２．２ｇ）に１，３−ジメチル−２−イミダゾリジノン（１００ｍＬ）を加えて８０℃で４５分間攪拌した。これに１−ブロモテトラデカン（２６．９ｍＬ）を加えて８０℃で１２時間攪拌した。反応液に水を加えて懸濁した後、吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を５０％アセトニトリル水溶液とアセトニトリルで洗浄して化合物（Ｅ９）（２２．６ｇ）を得た。【０１１３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.25 (2 H, s), 3.99-4.03 (6 H, m), 3.89 (3 H, s, COOMe), 1.71-1.84 (6 H, m), 1.44-1.50 (6 H, m), 1.23-1.38(60 H, br), 0.88 (9 H,t J = 7.0 Hz).【０１１４】
（２）３個のテトラデシルオキシ基で置換された安息香酸（化合物（Ｅ１０））の合成
【化６６】
2014077292.tif 000068
化合物（Ｅ９）（７．７ｇ）と水酸化カリウム（６．７ｇ）にエタノール（１００ｍＬ）を加えて８５℃で２時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、室温で１Ｎ塩酸（２１ｍＬ）を添加して３０分間撹拌した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水とアセトニトリルで洗浄して化合物（Ｅ１０）（８．２ｇ）を得た。【０１１５】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.19 (2 H, s), 3.96 (2 H, t J = 6.5 Hz), 3.91 (4 H, t J = 6.5 Hz), 1.70-1.76 (6 H, m), 1.37-1.49 (6 H, m), 1.21-1.35 (60 H, br), 0.88 (9 H, t J = 7.0 Hz).【０１１６】
（３）３個のテトラデシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ８））の合成
【化６７】
2014077292.tif 000069
【０１１７】
化合物（Ｅ１０）（５３２ｍｇ）に塩化チオニル（５．２ｍＬ）とＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１１０μＬ）を加え、５０℃で６．５時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、Ｎ，Ｎ，−ジイソプロピルエチルアミン（２ｍＬ）とピリジン（２．６ｍＬ）を加え、そこに化合物（Ｅ６）（１．５９ｇ）をピリジン（２ｍＬ）に溶解した溶液を加えて室温で２．５時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、０℃に冷却して析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（Ｅ８）（５９５ｍｇ）を得た。【０１１８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.98 (1 H, br d J = 7.5 Hz), 7.25-7.38 (9 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.85-6.88 (4 H, m), 5.99 (1 H, d J = 4.8 Hz), 5.33-5.39 (2 H, m), 4.53 (1 H,m), 4.26 (1 H, br), 3.94-4.08 (6 H, m), 3.81 (6 H, s), 3.43-3.57 (2 H, m), 2.51-2.82 (4 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.42-1.50 (6 H, m), 1.21- 1.34 (60 H, br), 0.85-0.89 (18 H, m), 0.06-0.09 (6 H, m).【０１１９】
実施例４
２個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１））の合成
【化６８】
2014077292.tif 000070
【０１２０】
（１）２個のオクタデシルオキシ基で置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ１２））の合成
【化６９】
2014077292.tif 000071
【０１２１】
３，５−ジヒドロキシ安息香酸メチル（５．０ｇ）と炭酸カリウム（４１．５ｇ）に１，３−ジメチル−２−イミダゾリジノン（１００ｍＬ）を加えて８０℃で２５分間攪拌した。これに１−ブロモオクタデカン（２７．６ｍＬ）を加えて７０℃で１４時間攪拌した。反応液に水を加えて攪拌した後、吸引ろ過にて析出物をろ取し、得られた固体を水とアセトニトリルで洗浄して化合物（Ｅ１２）（６．５ｇ）を得た。【０１２２】
（２）２個のオクタデシルオキシ基で置換された安息香酸（化合物（Ｅ１３））の合成
【化７０】
2014077292.tif 000072
【０１２３】
化合物（Ｅ１２）（６．８ｇ）と水酸化カリウム（６．７ｇ）にエタノール（１００ｍＬ）を加えて８５℃で２時間攪拌した。反応液を減圧下濃縮し、室温で１Ｎ塩酸（２１ｍＬ）を加えて３０分間攪拌した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水とアセトニトリルで洗浄して化合物（Ｅ１３）（６．５ｇ）を得た。【０１２４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.20 (2 H, d J = 2.2 Hz), 6.68 (1 H, t J 2.4 Hz), 3.97 (4 H, t J = 6.5 Hz), 1.75-1.81 (4 H, m), 1.42-1.48 (4 H, m), 1.21-1.36 (56 H, br), 0.88 (6 H, t J = 7.0 Hz).【０１２５】
（３）２個のオクタデシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１））の合成
【化７１】
2014077292.tif 000073
【０１２６】
化合物（Ｅ１３）（４６１ｍｇ）に塩化チオニル（５．２ｍＬ）とＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１１０μＬ）を加え、５０℃で４時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（２ｍＬ）とピリジン（２．６ｍＬ）を加え、そこに化合物（Ｅ６）（１．５９ｇ）をピリジン（２ｍＬ）に溶解した溶液を加えて５０℃で３時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、−３０℃に冷却して析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（Ｅ１１）（６５８ｍｇ）を得た。【０１２７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.96 (1 H, br d J = 8.4 Hz), 7.25-7.38 (9 H, m), 7.02 (2 H, br d J = 2.0 Hz), 6.85-6.88 (4 H, m),6.69 (1 H, br s), 5.99 (1 H, m), 5.40 (1 H, t J = 4.3 Hz), 5.34 (1 H, m), 4.54 (1 H, t J = 4.8 Hz), 4.24 (1 H, br), 3.95 (4 H, t J = 6.5 Hz), 3.81 (6 H, br s), 3.43-3.56 (2 H, m), 2.52-2.82 (4 H, m), 2.19, 2.17 (3 H, s), 1.74-1.79 (4 H, m), 1.41-1.47 (4 H, m), 1.22- 1.33 (56 H, br), 0.84-0.89 (15 H, m), 0.06-0.11 (6 H, m).【０１２８】
実施例５
１個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１４））の合成
【化７２】
2014077292.tif 000074
（１）１個のオクタデシルオキシ基で置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ１５））の合成
【化７３】
2014077292.tif 000075
【０１２９】
３−フルオロ−４−ヒドロキシ安息香酸メチル（８５１ｍｇ）と炭酸カリウム（３．５ｇ）に１，３−ジメチル−２−イミダゾリジノン（１０ｍＬ）を加えて７０℃で１５分間攪拌した後、１−ブロモオクタデカン（２．３ｍＬ）を加えて７０℃で１０時間攪拌した。反応液に水を加えて攪拌した後、吸引ろ過にて析出物をろ取し、得られた固体を水とアセトニトリルで洗浄して化合物（Ｅ１５）（２．０ｇ）を得た。【０１３０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.78-7.80 (1 H,m), 7.73 (1 H, dd J = 11.5, 2.3 Hz), 6.96 (1 H, t J = 8.0 Hz), 4.07 (2 H, t J = 6.3 Hz), 3.89 (3 H,s), 1.81-1.87 (2 H, m), 1.44-1.50 (2 H, m), 1.22-1.38 (28 H, br), 0.88 (3 H, t J = 7.0 Hz).【０１３１】
（２）１個のオクタデシルオキシ基で置換された安息香酸（化合物（Ｅ１６））の合成
【化７４】
2014077292.tif 000076
【０１３２】
化合物（Ｅ１５）（１．１ｇ）と水酸化カリウム（１．７ｇ）にエタノール（２０ｍＬ）を加えて８５℃で２時間攪拌した。反応液を減圧下濃縮し、室温で１Ｎ塩酸（５ｍＬ）を加えて３０分間攪拌した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水とアセトニトリルで洗浄して化合物（Ｅ１６）（１．１ｇ）を得た。【０１３３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.84-7.86 (1 H, m), 7.78 (1 H, dd J = 11.4, 1.9 Hz), 6.99 (1 H, t J = 8.5 Hz), 4.09 (2 H, t J = 6.6 Hz), 1.85 (2 H, m), 1.48 (2 H, m), 1.20-1.39 (28 H, br), 0.88 (3 H, t J = 7.0 Hz).【０１３４】
（３）１個のオクタデシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１４））の合成
【化７５】
2014077292.tif 000077
【０１３５】
化合物（Ｅ１６）（２８６ｍｇ）に塩化チオニル（５．２ｍＬ）とＮ，Ｎ−ジメチルホルムアミド（１１０μＬ）を加え、５０℃で５時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルエチルアミン（２ｍＬ）とピリジン（２．６ｍＬ）を加え、そこに化合物（Ｅ６）（１．５９ｇ）をピリジン（２．０ｍＬ）に溶解した溶液を加えて５０℃で１．５時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、−３０℃に冷却して析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（Ｅ１４）（３０９ｍｇ）を得た。【０１３６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.99 (1 H, br d J = 8.0), 7.61-7.85 (2 H, m), 7.24-7.38 (9 H, m), 6.94-7.01 (1 H, m), 6.84-6.88 (4 H, m), 5.96-5.98 (1 H, m), 5.26-5.40 (2 H, m), 4.55 (1 H, br t J = 4.9 Hz), 4.25 (1 H, br), 4.08-4.11 (2 H, m), 3.80-3.81 (6 H, m), 3.43-3.57 (2 H, m), 2.54-2.82 (4 H, m), 2.17-2.20 (3 H, m), 1.81-1.88 (2 H, m), 1.43-1.49 (2 H, m), 1.22- 1.39 (28 H, br), 0.86-0.89 (12 H, m), 0.11 (3 H, s), 0.08 (3H, s). 【０１３７】
実施例６
３個のヘキサデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５１））の合成
【化７６】
2014077292.tif 000078
【０１３８】
（１）３個のヘキサデシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ３５））の合成
【化７７】
2014077292.tif 000079
【０１３９】
没食子酸メチル（5.5 g）と炭酸カリウム（62.2 g）に1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン（100 mL）を加えて80℃で30分間攪拌した。これに1-ブロモヘキサデカン（30.2 mL）を加えて80℃で14時間攪拌した。反応液に水（300 mL）を加えて懸濁した後、吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体をアセトンの水溶液（１：１）で洗浄した。得られた白色固体をジクロロメタン（500 mL）に溶解させ、メタノールを加えて析出した固体を吸引ろ過によりろ取してE35で示した化合物（24.2 g、収率94%）を得た。【０１４０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.25 (2 H, s), 3.99-4.03 (6 H, m), 3.89 (3 H, s, COOMe), 1.71-1.84 (6 H, m), 1.44-1.50 (6 H, m), 1.23-1.38 (72 H, br), 0.88 (9 H,t J = 7.0 Hz).【０１４１】
（２）３個のヘキサデシルオキシ基が置換された安息香酸（化合物（Ｅ４０））の合成
【化７８】
2014077292.tif 000080
【０１４２】
E35で示した化合物(8.6 g)と水酸化カリウム(6.7 g)にエタノール(100 mL)を加えて8５℃で２．５時間撹拌した。反応液を室温へと冷却した後、水（200 mL）を加えて攪拌した。これに6 N塩酸(21 mL)を添加した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水（200 mL）とアセトニトリル（200 mL）で洗浄してE40で示した化合物（8.6 g）を定量的に得た。【０１４３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.25 (2 H, s), 3.96-4.01 (6 H, m), 1.71-1.81 (6 H, m), 1.42-1.50 (6 H, m), 1.21-1.36 (72 H, br), 0.88 (9 H, t J = 6.9 Hz).【０１４４】
（３）３個のヘキサデシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５１））の合成
【化７９】
2014077292.tif 000081
【０１４５】
化合物（E40）（590 mg）に塩化チオニル（5.2 mL）とN,N-ジメチルホルムアミド（110 μL）を加え、50℃で3.5時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン（2.0 mL）とピリジン（4.0 mL）を加え、そこに化合物（E6）（1.6 g）をピリジン（6 mL）とN,N-ジイソプロピルエチルアミン（1.0 mL）に溶解した溶液を加え、クロロトリメチルシラン（500 μL）を添加して60℃で5時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E51）（946 mg、収率85%）を得た。【０１４６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.98 (1 H, br d J = 8.0 Hz), 7.26-7.38 (9 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.85-6.88 (4 H, m), 5.99 (1 H, d J = 4.9 Hz), 5.34-5.38 (2 H, m), 4.53 (1 H, t J = 4.8 Hz), 4.26 (1 H, br), 3.94-4.08 (6 H, m), 3.81 (6 H, s), 3.44-3.57 (2 H, m), 2.54-2.82 (4 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.21- 1.35 (72 H, s), 0.85-0.89 (18 H,s), 0.09 (3 H, s), 0.08 (3H, s).【０１４７】
実施例７
３個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５２））の合成
【化８０】
2014077292.tif 000082
【０１４８】
（１）３個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ３６））の合成
【化８１】
2014077292.tif 000083
【０１４９】
没食子酸メチル（5.5 g）と炭酸カリウム（62.2 g）に1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン（140 mL）を加えて80℃で1時間攪拌した後70℃に冷却した。これに1-ブロモドコサン（38.6 g）を加えて70℃で14時間攪拌した。反応液に水（300 mL）を加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取し、水（300 mL）とアセトニトリル（200 mL）、アセトン（500 mL）、ジクロロメタン（200 mL）で洗浄してE36で示した化合物（28.6 g、収率86%）を得た。【０１５０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.25 (2 H, s), 3.99-4.03 (6 H, m), 3.89 (3 H, s, COOMe), 1.71-1.84 (6 H, m), 1.47 (6 H, m), 1.22-1.38 (108 H, br), 0.88 (9 H,t J = 9.0 Hz).【０１５１】
（２）３個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸（化合物（Ｅ４１））の合成
【化８２】
2014077292.tif 000084
【０１５２】
E36で示した化合物(11.1 g)と水酸化カリウム(6.7 g)にエタノール(100 mL)を加えて8５℃で２．５時間撹拌した。反応液を室温へと冷却した後、水（200 mL）を加えて攪拌した。これに6 N塩酸(21 mL)を添加した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水（300 mL）とアセトニトリル（200 mL）で洗浄してE41で示した化合物（10.8 g、収率99%）を得た。【０１５３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.28 (2 H, s), 3.99-4.04 (6 H, m), 1.71-1.85 (6 H, m), 1.44-1.50 (6 H, m), 1.22-1.36 (108 H, br), 0.88 (9 H, t J = 7.0 Hz).【０１５４】
（３）３個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸クロライド（化合物（Ｅ４６））の合成
【化８３】
2014077292.tif 000085
【０１５５】
ナス型フラスコに、化合物（E４１）(24.1 g)をトルエン(82 mL)に懸濁し、65℃で30分間攪拌した。塩化チオニル(14.5 mL)と、Ｎ，Ｎ’−ジメチルホルムアミド(3.4 mL)を加え、65℃で3.5時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、化合物（E46）(24.2g、収率99%)を得た。【０１５６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.32 (2 H, s), 4.08 (2 H, t J = 6.6 Hz), 4.02 (4 H, t J = 6.4 Hz), 1.79-1.85 (4 H, m), 1.71-1.77 (2 H, m), 1.43-1.50 (6 H, m), 1.21-1.37 (108 H, br), 0.88 (9 H, t J = 6.7 Hz).【０１５７】
（４）３個のドコシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５２））の合成
【化８４】
2014077292.tif 000086
【０１５８】
化合物（E6）（11.4 g）にピリジン（111 mL）、N，N’−ジイソプロピルエチルアミン（8.7 mL）、クロロトリメチルシラン（3.2 mL）を順に添加した。混合液に化合物（E46）（11.1 g）を添加し、60℃で5.5時間撹拌した。反応液に室温でメタノール（100 mL）を添加した後、氷冷した。析出した固体を吸引ろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E52）（16.4 g、収率89%）を得た。【０１５９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.99 (1 H, br), 7.25-7.38 (9 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.85-6.88 (4 H, m), 5.99 (1 H, d J = 4.8 Hz), 5.33-5.39 (2 H, m), 4.53 (1 H, br t J = 4.1 Hz), 4.26 (1 H, m), 3.95-4.07 (6 H, m), 3.81 (6 H, s), 3.46-3.57 (2 H, m), 2.52-2.82 (4 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.69-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.14- 1.34 (108 H, s), 0.85-0.89 (18 H,s), 0.09 (3 H, s), 0.08 (3H, s).【０１６０】
実施例８
２個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５３））の合成
【化８５】
2014077292.tif 000087
【０１６１】
（１）２個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ３７））の合成
【化８６】
2014077292.tif 000088
【０１６２】
メチル3,5-ジヒドロキシベンゾエート（5.0 g）と炭酸カリウム（41.5 g）に1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン（100 mL）を加えて80℃で30分間攪拌した。これに1-ブロモドコサン（25.7 g）を加えて80℃で14時間攪拌した。反応液に水（400 mL）を加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取し、アセトン（300 mL）とアセトニトリル（300 mL）で洗浄してE37で示した化合物（23.8 g）を定量的に得た。【０１６３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.15 (2 H, br d J = 2.1 Hz), 6.63 (1 H,t J = 6.4 Hz), 3.96 (4 H, t J = 6.3 Hz), 3.89 (3 H, s, COOMe), 1.74-1.80 (4 H, m), 1.41-1.47 (4 H, m), 1.23-1.37 (72 H, br), 0.88 (6 H,t J = 7.0 Hz).【０１６４】
（２）２個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸（化合物（Ｅ４２））の合成
【化８７】
2014077292.tif 000089
【０１６５】
E37で示した化合物(7.9 g)と水酸化カリウム(6.7 g)にエタノール(100 mL)を加えて8５℃で２．５時間撹拌した。反応液を室温へと冷却した後、水（200 mL）を加えて攪拌した。これに6 N塩酸(21 mL)を添加した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水（200 mL）とアセトニトリル（200 mL）で洗浄してE42で示した化合物（7.4 g、収率96%）を得た。【０１６６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.20 (2 H, br), 6.67 (1 H, br), 3.97 (4 H, br), 1.77 (4 H, br), 1.44 (4 H, br), 1.25 (72 H, br), 0.88 (6 H,br).【０１６７】
（３）２個のドコシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５３））の合成
【化８８】
2014077292.tif 000090
【０１６８】
化合物（E42）（540 mg）に塩化チオニル（5.2 mL）とN,N-ジメチルホルムアミド（110 μL）を加え、50℃で3時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン（2.0 mL）とピリジン（4.0 mL）を加え、そこに化合物（E6）（1.6 g）をピリジン（6 mL）とN,N-ジイソプロピルエチルアミン（1.0 mL）に溶解した溶液を加え、クロロトリメチルシラン（500 μL）を添加して60℃で5時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、氷冷して析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E53）（919 mg、収率87%）を得た。【０１６９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.97 (1 H, br d J = 8.5 Hz), 7.25-7.38 (9 H, m), 7.02 (2 H, br), 6.85-6.88 (4 H, m),6.69 (1 H, br s), 6.00 (1 H, d J = 4.7 Hz), 5.26-5.41 (2 H, m), 4.54 (1 H, t J = 5.0 Hz), 4.24 (1 H, br), 3.95 (4 H, t J = 6.3 Hz), 3.81 (6 H, br s), 3.43-3.56 (2 H, m), 2.52-2.82 (4 H, m), 2.19 (3 H, br s), 1.74-1.79 (4 H, m), 1.41-1.47 (4 H, m), 1.11- 1.35 (72 H, s), 0.84-0.89 (15 H, s), 0.11 (3 H, s), 0.08 (3 H, s).【０１７０】
実施例９
１個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５４））の合成
【化８９】
2014077292.tif 000091
【０１７１】
（１）１個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ３８））の合成
【化９０】
2014077292.tif 000092
【０１７２】
バニリン酸メチル（4.6 g）と炭酸カリウム（17.3 g）に1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン（80 mL）を加えて80℃で30分間攪拌した後70℃へ冷却した。これに1-ブロモドコサン（10.7 g）を加えて70℃で15時間攪拌した。反応液に水（300 mL）を加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取し、水とアセトニトリルで洗浄してE38で示した化合物（12.1 g、収率99%）を得た。 【０１７３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.65 (1 H, dd J = 8.5, 1.9 Hz), 7.54 (1 H, d J = 1.9 Hz), 6.87 (1 H, d J = 8.5 Hz), 4.06 (2 H, t J = 6.9 Hz), 3.89 (3 H, s), 3.9 (3 H, s), 1.86 (2 H, m), 1.46 (2 H, m), 1.21-1.39 (36 H, br), 0.88 (3 H,t J = 7.0 Hz).【０１７４】
（２）１個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸（化合物（Ｅ４３））の合成
【化９１】
2014077292.tif 000093
【０１７５】
E38で示した化合物(4.9 g)と水酸化カリウム(6.7 g)にエタノール(100 mL)を加えて8５℃で２．５時間撹拌した。反応液を室温へと冷却した後、水（200 mL）を加えて攪拌した。これに6 N塩酸(21 mL)を添加した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水（200 mL）とアセトニトリル（200 mL）で洗浄してE43で示した化合物（4.8 g）を定量的に得た。【０１７６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.72 (1 H, dd J = 8.5, 1.9 Hz), 7.58 (1 H, d J = 1.9 Hz), 6.89 (1 H, d J = 8.5 Hz), 4.08 (2 H, t J = 7.1 Hz), 3.92 (3 H, s), 1.84-1.90 (2 H, m), 1.42-1.50 (2 H, m), 1.13-1.37 (36 H, br), 0.88 (3 H, t J = 7.1 Hz).【０１７７】
（３）１個のドコシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５４））の合成
【化９２】
2014077292.tif 000094
【０１７８】
化合物（E43）（334 mg）に塩化チオニル（5.2 mL）とN,N-ジメチルホルムアミド（110 μL）を加え、50℃で3時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン（2.0 mL）とピリジン（4.0 mL）を加え、そこに化合物（E6）（1.6 g）をピリジン（6 mL）とN,N-ジイソプロピルエチルアミン（1.0 mL）に溶解した溶液を加え、クロロトリメチルシラン（500 μL）を添加して50℃で5時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、-30℃に冷却して析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E54）（684 mg、収率80%）を得た。【０１７９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.98 (1 H, br d J = 6.9 Hz), 7.6 (1 H, br d J = 1.9 Hz), 7.24-7.38 (10 H, m), 6.82-6.88 (5 H, m), 5.98 (1 H, d J = 5.0 Hz), 5.33-5.40 (2 H, m), 4.55 (1 H, br), 4.25 (1 H, br), 4.07 (2 H, t J = 6.8 Hz), 3.92 (3 H, s), 3.81 (6 H, br), 3.45-3.57 (2 H, m), 2.54-2.82 (4 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.83-1.88 (2 H, m), 1.42-1.49 (2 H, m), 1.21- 1.37 (36 H, br), 0.86-0.89 (12 H, m), 0.11 (3 H, s), 0.08 (3H, s).【０１８０】
実施例１０
１個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５５））の合成
【化９３】
2014077292.tif 000095
【０１８１】
（１）１個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ３９））の合成
【化９４】
2014077292.tif 000096
【０１８２】
メチル3-フルオ-4-ヒドロキシベンゾエート（850 mg）と炭酸カリウム（3.5 g）に1,3-ジメチル-2-イミダゾリジノン（10 mL）を加えて70℃で15分間攪拌した。これに1-ブロモドコサン（2.1 g）を加えて70℃で13時間攪拌した。反応液に水（200 mL）を加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリル（100 mL）で洗浄してE39で示した化合物（2.2 g、収率93%）を得た。 【０１８３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.79 (1 H,br d J = 8.6 Hz), 7.73 (1 H, dd J = 11.7, 2.0 Hz), 6.96 (1 H, t J = 8.3 Hz), 4.08 (2 H, t J = 6.6 Hz), 3.89 (3 H, s), 1.84 (2 H, m), 1.47 (2 H, m), 1.19-1.37 (36 H, br), 0.88 (3 H,t J = 7.0 Hz).【０１８４】
（２）１個のドコシルオキシ基が置換された安息香酸（化合物（Ｅ４４））の合成
【化９５】
2014077292.tif 000097
【０１８５】
E39で示した化合物(1.2 g)と水酸化カリウム(1.7 g)にエタノール(20 mL)を加えて8５℃で２．５時間撹拌した。反応液を室温へと冷却した後、水（80 mL）を加えて攪拌した。これに6 N塩酸(5 mL)を添加した。吸引ろ過により析出物をろ取し、得られた固体を水（50 mL）とアセトニトリル（50 mL）で洗浄してE44で示した化合物（1.2 g）を定量的に得た。【０１８６】
1H NMR (500 MHz, THF-d8)  δ 7.75-7.78 (1 H, m), 7.68 (1 H, dd J = 11.7, 2.0 Hz), 7.10 (1 H, t J = 8.5 Hz), 4.10 (2 H, t J = 6.6 Hz), 1.78-1.84 (2 H, m), 1.43-1.53 (2 H, m), 1.23-1.42 (36 H, br), 0.87-0.91 (3 H, m).【０１８７】
（３）１個のドコシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５５））の合成
【化９６】
2014077292.tif 000098
【０１８８】
化合物（E44）（327 mg）に塩化チオニル（5.2 mL）とN,N-ジメチルホルムアミド（110 μL）を加え、50℃で3時間攪拌した後、溶媒を減圧下留去し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン（2.0 mL）とピリジン（4.0 mL）を加え、そこに化合物（E6）（1.6 g）をピリジン（6 mL）とN,N-ジイソプロピルエチルアミン（1.0 mL）に溶解した溶液を加え、クロロトリメチルシラン（500 μL）を添加して50℃で4時間攪拌した後、メタノールを加えて濃縮し、-30℃に冷却して析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E55）（425 mg、収率50%）を得た。【０１８９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.99 (1 H, br d J = 7.7 Hz), 7.69 (1 H, br d J = 8.6 Hz), 7.63 (1 H, dd J = 11.2, 2.0 Hz), 7.24-7.38 (9 H, m), 6.97 (1 H, t J = 8.1 Hz), 6.85-6.88 (4 H, m), 5.98 (1 H, d J = 5.0 Hz), 5.40 (1 H, t J = 4.4 Hz), 5.34 (1 H, d J = 8.2 Hz), 4.55 (1 H, br t J = 5.0 Hz), 4.25 (1 H, br), 4.09 (2 H, t J = 6.7 Hz), 3.81 (6 H, br), 3.45-3.56 (2 H, m), 2.54-2.82 (4 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.81-1.87 (2 H, m), 1.43-1.49 (2 H, m), 1.21-1.39 (36 H, br), 0.85-0.90 (12 H, m), 0.11 (3 H, s), 0.08 (3H, s).【０１９０】
実施例１１
３個のヘキサデカイルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５６））の合成
【化９７】
2014077292.tif 000099
【０１９１】
（１）３個のヘキサデシルオキシ基で置換された安息香酸クロライド（化合物（Ｅ４５））の合成
【化９８】
2014077292.tif 000100
【０１９２】
ナス型フラスコに、化合物（E40）(2.5 g)をトルエン(11.2 mL)に懸濁し、65℃で30分間攪拌した。塩化チオニル(2.0 mL)と、Ｎ，Ｎ’−ジメチルホルムアミド(464 μL)を加え、65℃で3.5時間撹拌した。反応液を減圧濃縮し、化合物（E45）(2.5 g、収率97%)を得た。【０１９３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.33 (2 H, s), 4.08 (2 H, t J = 6.6 Hz), 4.02 (4 H, t J = 6.3 Hz), 1.79-1.85 (4 H, m), 1.71-1.77 (2 H, m), 1.44-1.51 (6 H, m), 1.21-1.37 (72 H, br), 0.88 (9 H, t J = 6.6 Hz).【０１９４】
（２）３個のヘキサデシルオキシ基を有するｄＴ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５６））の合成
【化９９】
2014077292.tif 000101
【０１９５】
化合物（E4）（1.9 g）にピリジン（22 mL）、N，N’−ジイソプロピルエチルアミン（1.7 mL）、クロロトリメチルシラン（640 μL）を順に添加した。混合液に化合物（E45）（1.7 g）を添加し、60℃で5.5時間撹拌した。反応液に室温でメタノールを添加して析出した固体を吸引ろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E56）（2.7 g、収率90%）を得た。【０１９６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.71 (1 H, br s), 7.38-7.41 (2 H, m), 7.24-7.33 (7 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.84-6.87 (4 H, m), 6.42 (1 H, dd J = 6.5, 8.4 Hz), 5.47 (1 H, br d J = 5.7 Hz), 4.15 (1 H, br), 3.95-4.05 (6 H, m), 3.80 (6 H, s), 3.49 (2 H, br), 2.69-2.80 (2 H, m), 2.42-2.61 (4 H, m), 2.17 (3 H, s), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.40 (3 H, s), 1.23-1.36 (72 H, br s), 0.88 (9 H, t J = 7.0 Hz).【０１９７】
実施例１２
３個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５７））の合成
【化１００】
2014077292.tif 000102
【０１９８】
（１）Ｕ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ４７））の合成
【化１０１】
2014077292.tif 000103
【０１９９】
100-mLナス型フラスコに3’-OH rU (2’-OMe) (3.00 g, 5.35 mmol), Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン (65 mg, 0.53 mmol), THF (15 mL)を量って溶解した後、レブリン酸（ 0.93 g, 8.03 mmol）を添加した。1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩(1.54 g, 8.03 mmol)を添加し、そのまま3.5 h撹拌した。THFを減圧下にて留去した後、EtOAc (40 mL)と0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (20 mL)を加え、分液した。有機層に0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (20 mL)を再度添加し、分液した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。有機層を減圧下にて濃縮し、乾固すると3’-OLev rU (2’-OMe) (3.61 g)が得られた。これをカラムクロマト精製 [Silicagel 60 (20 g), 5% Et3N contained EtOAc/n-hexane 0:95-95:0]した。有効区を減圧下にて濃縮し、乾固すると精3’-OLev rU (2’-OMe) (見かけ収量 3.85 g, 残留EtOAc 6.85%, Et3N 0.53%, n-hexane 2.28%, 水分 3.75%, 含量補正収量 3.34 g, 含量補正収率 94.7%)が得られた。
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 2.19 (3 H, s), 2.62 (2 H, t, J = 6.00 Hz), 2.72-2.79 (2 H, m), 3.46 (1 H, AB dd, J = 11.00, 2.50 Hz), 3.48 (3 H, s), 3.58 (1 H, AB dd, J = 11.00, 2.50 Hz), 3.80 (6 H, s), 4.08 (1 H, dd, J = 5.00, 2.40 Hz), 4.24 (1 H, dt, J = 8.00, 2.00, 2.00 Hz), 5.28 (1 H, brq, J = 5.50 Hz), 5.32 (1 H, d, J = 5.10 Hz), 6.03 (1 H, d, J = 4.00 Hz), 6.85 (4 H, dd, J = 8.50, 2.00 Hz), 7.24-7.32 (7 H, m), 7.37 (2 H, dd, J = 9.00, 1.50 Hz), 7.87 (1 H, d, J = 8.50 Hz), 8.2-9.0 (0.4 H, brs, NH).【０２００】
（２）３個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５７））の合成
【化１０２】
2014077292.tif 000104
【０２０１】
100-mL ナス型フラスコに3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoic acid（化合物(E2)） (1.000 g), toluene (3.5 mL)を量り、外温度70 ℃に加熱し、溶解した。DMF (0.17 mL), SOCl2 (0.71 mL)を順に添加し、外温度70 ℃にて2.5時間反応した。溶媒を減圧留去した。トルエン (10 mL)を加えて再度留去し、濃縮乾固する操作を2回実施すると溶媒を含む3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl chloride（化合物(E3)）の粉末 (2.12 g)が得られた。
別の50-mL ナス型フラスコに化合物（E47）(901 mg相当, 1.19 mmol), i-Pr2NEt (1.29 mL), pyridine (9 mL)を量り、溶解した。室温でクロロトリメチルシラン (0.48 mL), 3,4,5-tris(octadecyloxy)benzoyl chloride (1.55 g相当)を添加した。Pyridine (5 mL)で洗い込んだ。この混合物を外温度60 ℃にて3.5時間反応した。室温に冷却し、MeOH (15 mL)を滴下した。懸濁液を氷冷下にて0.5 h撹拌し、吸引ろ取した。紛体をMeOH (5 mLX7)で洗浄した。得られた紛体を減圧下、室温で18 h乾燥すると化合物（E57）(1.33 g, みかけ収率81.9%)が得られた。【０２０２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (9 H, t, J = 6.75 Hz), 1.22-1.39 (84 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.67-1.82 (6 H, m), 2.19 (3 H, s), 2.62 (2 H, t, J = 6.45 Hz), 2.73-2.81 (2 H, m), 3.46 (3 H, s), 3.48 (1 H, AB dd, J = 11.55, 1.90 Hz), 3.63 (1 H, AB dd, J = 11.30, 2.15 Hz), 3.808 (3 H, s), 3.808 (3 H, s), 3.99 (4 H, t, J = 6.60 Hz), 4.05 (2 H, t, J = 6.40 Hz), 4.10 (1 H, dd, J = 5.00, 3.00 Hz), 4.27 (1 H, brd, J = 6.80 Hz), 5.27 (1 H, brt, J = 5.75 Hz), 5.41 (1 H, d, J = 8.25 Hz), 6.00 (1 H, d, J = 2.90 Hz), 6.87 (4 H, dd, J = 11.85, 3.00 Hz), 7.13 (2 H, s), 7.24-7.33 (7 H, m), 7.38 (2 H, dd, J = 8.65, 1.40 Hz), 8.05 (1 H, brd, J = 7.85 Hz).【０２０３】
実施例１３
３個のドコシルオキシ基を有するアデニン（Ａ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５８））の合成
【化１０３】
2014077292.tif 000105
【０２０４】
（１）Ａ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ４８））の合成
【化１０４】
2014077292.tif 000106
【０２０５】
5’−O−（１，１−ビス（４−メトキシフェニル）−１−フェニルメチル）2'-O-tert-ブチルジメチルシリルアデノシン（5.0 g）をテトラヒドロフラン（21 mL）に溶解した。これにＮ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン（77 mg）とレブリン酸（973 μL）、1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（1.8 g）を順に加えて室温で75分間撹拌した後、Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン（56 mg）とレブリン酸（645 μL）、1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（1.2 g）を加えて室温でさらに1時間攪拌した。反応液に酢酸エチル（20 mL）と10%硫酸水素カリウム水溶液（75 mL）と水（40 mL）を添加し、分液抽出した。得られた有機層を10%炭酸水素ナトリウム水溶液（75 mL）で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。これを減圧濃縮し、化合物（E48）（5.6 g）を定量的に得た。【０２０６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 8.99 (1 H, br s), 8.74 (1 H, s), 8.23 (1 H, s), 8.03 (2 H, d J = 7.6 Hz), 7.60-7.63 (1 H, m), 7.52-7.55 (2 H, m), 7.43-7.46 (2 H, m), 7.21-7.34 (7 H, m), 6.81-6.84 (4 H, m), 6.12 (1 H, d J = 6.7 Hz), 5.48 (1 H, dd J = 5.2, 2.4 Hz), 5.13 (1 H, dd J = 5.1, 6.6 Hz), 4.32-4.34 (1 H, m), 3.78 (6 H, d J = 1.0 Hz), 3.40-3.57 (2 H, m), 2.60-2.84 (4 H, m), 2.20 (3 H, s), 0.73 (9 H, s), -0.20 (3 H, s), -0.27 (3 H, s).【０２０７】
（２）３個のドコシルオキシ基を有するＡ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５８））の合成
【化１０５】
2014077292.tif 000107
【０２０８】
化合物（E48）（75 mg）をピリジン（1.7 mL）とトルエン（1.7 mL）の混合溶液中に溶解させ、N，N’−ジイソプロピルエチルアミン（325 μL）、クロロトリメチルシラン（162 μL）を順に添加して室温で10分間攪拌した。化合物（E46）（95 mg）を添加し、50℃で21時間撹拌した。反応液を室温に冷却した後、モルホリン（219 μL）を加えて室温で2時間攪拌した後、でメタノール（100 mL）を添加して析出した固体を吸引ろ取し、メタノールで洗浄した。これを乾燥した後、移動相にトルエン/アセトニトリル/ピリジン（48/1/1）を用いてカラムクロマト精製し、化合物（E58）（98 mg、収率62%）を得た。【０２０９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.91 (1 H, br), 8.70 (1 H, s), 8.22, (1 H, s), 7.10-7.46 (11 H, m), 6.81-6.84 (4 H, m), 6.11 (1 H, d J = 6.6 Hz), 5.47 (1 H, dd J = 4.9, 2.8 Hz), 5.12-5.15 (1 H, m), 4.31-4.33 (1 H, m), 3.93-4.07 (6 H, m), 3.78 (6 H, d J = 1.5 Hz), 3.53-3.57 (1 H, m), 3.38-3.41 (1 H, m), 2.59-2.83 (4 H, m), 2.20 (3 H, s), 1.70-1.85 (6 H, m), 1.43-1.52 (6 H, m), 1.20-1.37 (108 H, br m), 0.88 (9 H, t J = 6.9 Hz), 0.74 (9 H, s), -0.02 (3 H, s), -0.26 (3 H, s).【０２１０】
実施例１４
３個のドコシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５９））の合成
【化１０６】
2014077292.tif 000108
【０２１１】
（１）Ｃ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ４９））の合成
【化１０７】
2014077292.tif 000109
【０２１２】
5’−O−（１，１−ビス（４−メトキシフェニル）−１−フェニルメチル）2'-O-tert-ブチルジメチルシリルシチジン（5.0 g）をテトラヒドロフラン（20 mL）に溶解した。これにＮ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン（80 mg）とレブリン酸（997 μL）、1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（1.9 g）を順に加えて室温で1.3時間撹拌した後、Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン（53 mg）とレブリン酸（665 μL）、1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（1.3 g）を加えて室温でさらに1.7時間攪拌した。反応液に酢酸エチル（20 mL）と10%硫酸水素カリウム水溶液（75 mL）と水（40 mL）を添加し、分液抽出した。得られた有機層を10%炭酸水素ナトリウム水溶液（60 mL）で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。これを減圧濃縮し、化合物（E49）（6.1 g）を定量的に得た。【０２１３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.86 (1 H, br), 8.48 (1 H, br), 7.90 (2 H, br d J = 6.9 Hz), 7.54-7.62 (1 H, m), 7.50-7.53 (2 H, m), 7.39-7.41 (2 H, m), 7.13-7.35 (8 H, m), 6.87-6.90 (4 H, m), 5.98 (1 H, d J = 2.5 Hz), 5.23 (1 H, dd J = 4.4, 7.4 Hz), 4.54-4.55 (1 H, m), 4.36-4.39 (1 H, m), 3.83 (6 H, s), 3.42-3.66 (2 H, m), 2.53-2.80 (4 H, m), 2.19 (3 H, s), 0.89 (9 H, s), 0.20 (3 H, s), 0.07 (3 H, s).【０２１４】
（２）３個のドコシルオキシ基を有するＣ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５９））の合成
【化１０８】
2014077292.tif 000110
【０２１５】
化合物（E49）（259 mg）をピリジン（3.0 mL）とトルエン（3.0 mL）の混合溶液中に溶解させ、N，N’−ジイソプロピルエチルアミン（191 μL）、クロロトリメチルシラン（95 μL）を順に添加して室温で10分間攪拌した。化合物（E46）（167 mg）を添加し、50℃で21時間撹拌した。反応液を室温に冷却した後、モルホリン（385 μL）を加えて室温で2時間攪拌した後、でメタノール（100 mL）を添加して析出した固体を吸引ろ取し、メタノールで洗浄した。これを乾燥した後、移動相にトルエン/ピリジン（100/1）を用いてカラムクロマト精製し、化合物（E59）（92 mg、収率34%）を得た。【０２１６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.70 (1 H, br), 8.44 (1 H, br s), 7.39-7.41 (2 H, m), 7.26-7.35 (8 H, m), 7.08 (2 H, br), 6.88 (4 H, m), 6.00 (1 H, d J = 2.6 Hz), 5.24 (1 H, dd J = 4.4, 6.9 Hz), 4.54 (1 H, dd J = 2.9, 2.8 Hz), 4.35-4.38 (1 H, m), 3.99-4.04 (6 H, m), 3.82 (6 H, s), 3.42-3.64 (2 H, m), 2.73-2.80 (1 H, m), 2.61-2.71 (2 H, m), 2.53-2.59 (1 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.71-1.86 (6 H, m), 1.42-1.51 (6 H, m), 1.21-1.36 (108 H, br s), 0.86-0.89 (18 H, m), 0.19 (3 H, s), 0.07 (3 H, s).【０２１７】
実施例１５
３個のドコシルオキシ基を有するグアニン（Ｇ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６０））の合成
【化１０９】
2014077292.tif 000111
【０２１８】
（１）Ｇ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ５０））の合成
【化１１０】
2014077292.tif 000112
【０２１９】
5’−O−（１，１−ビス（４−メトキシフェニル）−１−フェニルメチル）2'-O-tert-ブチルジメチルシリルグアノシン（5.0 g）をテトラヒドロフラン（21 mL）に溶解した。これにＮ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン（159 mg）とレブリン酸（1.33 mL）、1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（2.6 g）を順に加えて室温で2時間撹拌した後、Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノピリジン（79 mg）とレブリン酸（666 μL）、1-エチル-3-（3-ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド塩酸塩（1.3 g）を加えて室温でさらに2.5時間攪拌した。反応液に酢酸エチル（50 mL）と10%硫酸水素カリウム水溶液（75 mL）を添加し、分液抽出した。得られた有機層を10%炭酸水素ナトリウム水溶液（75 mL）で洗浄した後、無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。これを減圧濃縮し、化合物（E50）（5.8 g）を定量的に得た。【０２２０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 11.90 (1 H, br s), 7.78 (1 H, s), 7.59-7.62 (2 H, m), 7.38-7.43 (4 H, m), 7.20-7.28 (4 H, m), 6.77-6.83 (4 H, m), 5.69 (1 H, d J = 7.8 Hz), 5.53 (1 H, dd J = 3.6, 1.8 Hz), 5.39 (1 H, dd J = 5.8, 8.5 Hz), 4.19-4.21 (1 H, br m), 3.77 (6 H, d J = 9.7 Hz), 3.59 (1 H, dd J = 10.9, 1.7 Hz), 3.05 (1 H, dd J = 11.0, 2.5 Hz), 2.55-2.84 (5 H, m), 3.06 (3 H, s), 0.79 (3 H, d J = 7.0 Hz), 0.77 (9 H, s), 0.53 (3 H, d J = 6.9 Hz), 0.04 (3 H, s), -0.21 (3 H, s).【０２２１】
（２）３個のドコシルオキシ基を有するＧ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６０））の合成
【化１１１】
2014077292.tif 000113
【０２２２】
化合物（E50）（98 mg）をピリジン（1.7 mL）とトルエン（1.7 mL）の混合溶液中に溶解させ、N，N’−ジイソプロピルエチルアミン（287 μL）、クロロトリメチルシラン（143 μL）を順に添加して室温で10分間攪拌した。化合物（E46）（84 mg）を添加し、50℃で21時間撹拌した。反応液を室温に冷却した後、モルホリン（175 μL）を加えて室温で2時間攪拌した後、でメタノール（を添加して析出した固体を吸引ろ取し、メタノールで洗浄した。これを乾燥した後、移動相にトルエン/アセトニトリル/ピリジン（48/1/1）を用いてカラムクロマト精製し、化合物（E60）（57 mg、収率40%）を得た。【０２２３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.20 (1 H, br s), 8.46 (1 H, br s), 7.86 (1 H, s), 7.42-7.45 (2 H, m), 7.31-7.33 (4 H, m), 7.23-7.27 (3 H, m), 6.85 (2 H, s), 6.78-6.81 (4 H, m), 5.84 (1 H, d J = 6.2 Hz), 5.54 (1 H, dd J = 3.2, 4.9 Hz), 4.95 (1 H, dd J = 5.1, 6.1 Hz), 4.25-4.27 (1 H, br m), 3.92-4.04 (6 H, m), 3.75 (6 H, s), 3.49-3.52 (1 H, m), 3.27-3.30 (1 H, m), 2.58-2.80 (4 H, m), 2.18(3 H, s), 1.71-1.81 (6 H, m), 1.44-1.50 (6 H, m), 1.21-1.37 (108 H, br s), 0.88 (9 H, t J = 6.6 Hz), 0.78 (9 H, s), -0.01 (3 H, s), -0.15 (3 H, s).【０２２４】
実施例１６
３個のヘキサデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６１））の合成
【化１１２】
2014077292.tif 000114
【０２２５】
化合物（E51）（15.8 mg）をクロロホルム（200 μL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（200 μL）を加えた。ヒドラジン1水和物（2.0 μL）を加えて室温で60分間攪拌し、アセチルアセトン（8.4 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。室温でアセトニトリル（4 mL）を加えて攪拌し、-30℃に冷却した。析出物を遠心沈降してアセトニトリルで洗浄し、化合物（E61）（10.0 mg、収率67％）を得た。【０２２６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.05 (1 H, br d J = 8.2 Hz), 7.36-7.40 (2 H, m), 7.26-7.33 (7 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.85-6.87 (4 H, m), 5.96 (1 H, d J = 3.7 Hz), 5.39 (1  H, d J = 8.2 Hz), 4.36-4.42 (2 H, m), 4.12-4.14 (1 H, m), 3.94-4.05 (6 H, m), 3.81 (6 H, d J = 1.0 Hz), 3.54 (2 H, br), 2.25 (1 H, br), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.22-1.37 (72 H, br), 0.91 (9 H, s), 0.88 (9 H, t J = 6.9 Hz), 0.17 (3 H, br s), 0.16 (3 H, s).【０２２７】
実施例１７
３個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６２））の合成
【化１１３】
2014077292.tif 000115
【０２２８】
化合物（E7）（16.7 mg）をクロロホルム（200 μL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（200 μL）を加えた。ヒドラジン1水和物（2.0 μL）を加えて室温で60分間攪拌し、アセチルアセトン（8.4 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。室温でアセトニトリル（4 mL）を加えて攪拌し、-30℃に冷却した。析出物を遠心沈降してアセトニトリルで洗浄し、化合物（E62）（14.9 mg、収率95％）を得た。【０２２９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.06 (1 H, br d J = 7.8 Hz), 7.36-7.40 (2 H, m), 7.25-7.34 (7 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.85-6.88 (4 H, m), 5.96 (1 H, d J = 3.5 Hz), 5.39 (1  H, d J = 8.2 Hz), 4.36-4.42 (2 H, m), 4.12-4.14 (1 H, m), 3.94-4.05 (6 H, m), 3.81 (6 H, br), 3.54 (2 H, br), 2.25 (1 H, br), 1.69-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.21-1.36 (84 H, br), 0.91 (9 H, s), 0.88 (9 H, t J = 6.9 Hz), 0.17 (3 H, br s), 0.16 (3 H, s).【０２３０】
実施例１８
３個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６３））の合成
【化１１４】
2014077292.tif 000116
【０２３１】
化合物（E52）（110 mg）をトルエン（1 mL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（1 mL）を加えた。ヒドラジン1水和物（5.8 μL）を加えて室温で50分間攪拌し、アセチルアセトン（37 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。室温でメタノール（20 mL）を加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取してメタノールで洗浄して化合物（E63）（100 mg、収率96％）を得た。【０２３２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.04 (1 H, br d J = 8.1 Hz), 7.38-7.40 (2 H, m), 7.25-7.34 (7 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.84-6.87 (4 H, m), 5.96 (1 H, d J = 3.3 Hz), 5.39 (1  H, d J = 8.3 Hz), 4.37-4.41 (2 H, m), 4.11-4.13 (1 H, m), 3.94-4.05 (6H, m), 3.81 (6 H, d J = 1.0 Hz), 3.54 (2 H, br), 2.57 (1 H, br), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.23-1.36 (108 H, br), 0.91 (9 H, s), 0.88 (9 H, t J = 6.9 Hz), 0.17 (3 H, br s), 0.16 (3 H, s).【０２３３】
実施例１９
３個のオクタデシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６４））の合成
【化１１５】
2014077292.tif 000117
【０２３４】
化合物（E5）（50 mg）をジクロロメタン（1 mL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（1 mL）を加えた。ヒドラジン1水和物（2.3 μL）を加えて室温で30分間攪拌し、アセチルアセトン（10 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。室温でアセトニトリル（10 mL）を加えて攪拌した後、減圧濃縮し、これを2回繰り返した。懸濁液を0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取してアセトニトリルで洗浄して化合物（E64）（44.2 mg、収率95％）を得た。【０２３５】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.69 (1 H, br), 7.39-7.42 (2 H, m), 7.24-7.33 (7 H, m), 7.13 (2 H, s), 6.84-6.87 (4 H, dd J = 9.0, 1.5), 6.39 (1 H, t J = 7.0), 4.60 (1 H, m), 3.96-4.07 (7 H, m), 3.80 (6 H, s), 3.39-3.53 (2 H, m), 2.62 (1 H, br), 2.33-2.47 (2 H, m), 1.71-1.83 (6 H, m), 1.51 (3 H, br), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.21-1.35 (84 H, br), 0.88 (9 H, J = 7.0). 【０２３６】
実施例２０
３個のヘキサデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６５））の合成
【化１１６】
2014077292.tif 000118
【０２３７】
化合物（E51）（158 mg）に248 mM トリクロロ酢酸/トルエン溶液（5 mL）を加えて室温で10分間攪拌した後、メタノール（5 mL）を加えて攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、メタノール（50 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E65）（110 mg, 収率86％）を得た。【０２３８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.90 (1 H, br), 7.13 (2 H, s), 5.81-5.87 (1 H, m), 5.69 (1 H, br), 5.18 (1 H, br), 4.57 (1 H,br), 4.21-4.25 (1 H, m), 3.94-4.09 (7 H, m), 3.79 (1 H, br d J = 12.2 Hz), 2.54-2.87 (5 H, m), 2.20 (3 H, s), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.24-1.31 (72 H, br), 0.86-0.89 (18 H, m), 0.08 (3 H, s), 0.06 (3 H, s).【０２３９】
実施例２１
２個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６６））の合成
【化１１７】
2014077292.tif 000119
【０２４０】
化合物（E53）（151 mg）に248 mM トリクロロ酢酸/トルエン溶液（5 mL）を加えて室温で10分間攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、10 %メタノール/アセトニトリル溶液（80 mL）を加えて遠心沈降し、沈殿物をアセトニトリルで洗浄して化合物（E66）（110 mg, 収率91％）を得た。【０２４１】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.85 (1 H, br d J = 8.2 Hz), 7.02 (2 H, d J = 2.2 Hz), 6.70 (1 H, t J = 2.3 Hz), 5.85 (1 H, d J = 8.3 Hz), 5.66 (1 H, d J = 4.8 Hz), 5.2 (1 H, t J = 4.7 Hz), 4.59 (1 H, t J = 4.8 Hz), 4.21-4.24 (1 H, m), 3.91-3.99 (5 H, m), 3.77 (1 H, br d J = 12.6), 2.54-2.87 (5 H, m), 2.20 (3 H, s), 1.73-1.79 (4 H, m), 1.40-1.46 (4 H, m), 1.21- 1.35 (72 H, s), 0.86-0.89 (15 H, s), 0.08 (3 H, s), 0.06 (3 H, s).【０２４２】
実施例２２
３個のドコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６７））の合成
【化１１８】
2014077292.tif 000120
【０２４３】
化合物（E52）（11.0 g）に490 mM トリクロロ酢酸/トルエン溶液（150 mL）を加えて室温で10分間攪拌した後、メタノール（75 mL）を加えて5分間攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、アセトニトリル（75 mL）を加えて減圧濃縮した。メタノール（72 mL）と水（46 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（160 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E67）（9.3 g）を定量的に得た。【０２４４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)  δ 7.91 (1 H, br), 7.13 (2 H, s), 5.85 (1 H, d J = 8.2 Hz), 5.68 (1 H, br), 5.18 (1 H, br), 4.57 (1 H, br), 4.22-4.25 (1 H, br m), 3.94-4.09 (7 H, m), 3.77-3.80 (1 H, m), 2.54-2.87 (5 H, m), 2.20 (3 H, s), 1.69-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.22-1.36 (108 H, br), 0.86-0.89 (18 H, m), 0.08 (3 H, s), 0.06 (3 H, s).【０２４５】
実施例２３
３個のヘキサデシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６８））の合成
【化１１９】
2014077292.tif 000121
【０２４６】
化合物（E56）（2.6 g）に490 mM トリクロロ酢酸/トルエン溶液（44.3 mL）を加えて室温で10分間攪拌した後、メタノール（20 mL）を加えて攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、メタノール（100 mL）と水（3 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E68）（2.0 g, 収率99％）を得た。【０２４７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.65 (1 H, br), 7.11 (2 H, s), 6.26 (1 H, br), 5.34-5.37 (1 H, m), 4.10-4.12 (1 H, m), 3.89-4.05 (9 H, m), 2.71-2.82 (2 H, m), 2.52-2.62 (2 H, m), 2.43 (2 H, br), 2.19 (3 H, s), 1.97 (3 H, d, J = 1.3 Hz), 1.69-1.84 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.22-1.37 (72 H, br), 0.86-0.89 (9 H, m).【０２４８】
実施例２４
３個のオクタデシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ６９））の合成
【化１２０】
2014077292.tif 000122
【０２４９】
50-mL ナス型フラスコに化合物（E57）(500 mg)とtoluene (5 mL)を量り、溶解した。これにトリクロロ酢酸 (0.4 g)を添加し、室温で10分撹拌した。 メタノール (2.5 mL) を添加後、アセトニトリル(10 mL)を5分で滴下した後、15分間氷冷下にて撹拌した。 析出物を吸引ろ取し、5%メタノール含有アセトニトリル (5 mL)で5回洗浄した。得られた粉末を減圧下、40 ℃にて1.5時間乾燥すると化合物（E69）(379 mg, 収率88.2%)が得られた。【０２５０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (9 H, t, J = 6.80 Hz), 1.22-1.39 (84 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.67-1.82 (6 H, m), 2.20 (3 H, s), 2.59-2.86 (5 H, m), 3.46 (3 H, s), 3.80 (1 H, AB brd, J = 11.65 Hz), 3.97 (4 H, t, J = 6.45 Hz), 4.00 (1 H, AB dd, J = 11.65 Hz), 4.05 (2 H, t, J = 6.60 Hz), 4.18 (1 H, brs), 4.22-4.24 (1 H, brm), 5.25 (1 H, brm), 5.81 (1 H, brm), 5.86 (1 H, d, J = 8.22 Hz), 7.12 (2 H, s), 7.94 (1 H, brs).【０２５１】
実施例２５
２個のイコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１１））の合成
【化１２１】
2014077292.tif 000123
【０２５２】
（１）２個のイコシルオキシ基が置換された安息香酸メチルエステル（化合物（Ｅ１０７））の合成
【化１２２】
2014077292.tif 000124
【０２５３】
500-mLナス型フラスコに2,3-ジヒドロキシ安息香酸メチルエステル(4.65 g, 27.65 mmol), 炭酸カリウム(11.47 g, 82.96 mmol), DMF (250 mL)を量り、40 ℃で1 h攪拌した。次いでn-C20H41Br (24.99 g, 69.13 mmol)を添加し、70 ℃で8 h攪拌した。室温まで冷却し、市水 (250 mL)を添加し、懸濁液を2 h攪拌した。白色結晶を吸引ろ取し、市水(100 mL)で2回洗浄した。これを40 ℃で28 h減圧乾燥すると粗体(25.64 g)が得られた。これにMeOH (500 mL)を加え、外温80 ℃, 0.5 hにて懸濁液を攪拌した。これを冷却後、吸引ろ取し、MeOH (50 mL)で洗浄した。この操作を再度繰り返した。得られた白色結晶を40 ℃にて減圧乾燥すると2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸メチルエステル(E107, 19.15 g, 収率94.9%)が得られた。【０２５４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 7.05 Hz), 1.15-1.40 (68H, m), 1.40-1.51 (2H, m), 1.75-1.84 (2H, m), 3.89 (3H, s), 3.97 (2H, t, J = 6.40 Hz), 4.02 (2H, t, J = 6.70 Hz), 7.02 (1H, d, J = 6.30 Hz), 7.03 (1H, d, J = 3.15 Hz), 7.28 (1H, dd, J = 6.30, 3.15 Hz).【０２５５】
（２）２個のイコシルオキシ基が置換された安息香酸（化合物（Ｅ１０８））の合成
【化１２３】
2014077292.tif 000125
【０２５６】
1-L ナス型フラスコに2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸メチルエステル(E107, 18.0 g, 24.68 mmol), 水酸化カリウム (16.62 g, 296.21 mmol), EtOH (180 mL)を順に量り、85 ℃にて2 h反応した。冷却し、氷冷しながら2 M HCl (180 mL)を滴下した。そして市水(200 mL)を滴下した。結晶を吸引ろ取すると2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸(E108, 17.9 g, 収率101%)が得られた。【０２５７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 7.05 Hz), 1.10-1.40 (68H, m), 1.40-1.51 (2H, m), 1.82-1.86 (2H, m), 4.02 (2H, t, J = 6.40 Hz), 4.28 (2H, t, J = 6.85 Hz), 7.11-7.18 (2H, m), 7.72 (1H, dd, J = 8.70, 1.85 Hz), 11.63 (1H, brs).【０２５８】
（３）２個のイコシルオキシ基が置換された安息香酸クロライド（化合物（Ｅ１０９））の合成
【化１２４】
2014077292.tif 000126
500-mLナス型フラスコに2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸(E108, 10.00 g, 13.98 mmol), トルエン (70 mL), DMF (2.2 mL), 塩化チオニル(9.18 mL, 125.84 mmol)を順に混合し、アルゴン雰囲気下、70℃にて2 h反応した。溶媒を減圧留去し、トルエン (200 mL)で2回共沸した。最終的に減圧下にて濃縮乾固すると2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸クロライド(E109, 10.26 g, 収率100%)が得られた。【０２５９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 6.85 Hz), 1.10-1.40 (68H, m), 1.40-1.51 (2H, m), 1.77-1.84 (2H, m), 3.99 (2H, t, J = 6.40 Hz), 4.05 (2H, t, J = 6.70 Hz), 7.07-7.11 (2H, m), 7.49 (1H, dd, J = 7.30, 2.25 Hz).【０２６０】
（４）Ｕ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ１１０））の合成
【化１２５】
2014077292.tif 000127
【０２６１】
100-mLナス型フラスコに1-((2R,3R,4R,5R)-5-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-3-フルオロ-4-ヒドロキシテトラヒドロフラン-2-イル)ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン(3.00 g, 5.47 mmol), DMAP (67 mg, 0.55 mmol), THF (15 mL)を量って溶解した後、Levrinic acid (0.95 g, 8.20 mmol)を添加した。WSC.HCl (1.57 g, 8.20 mmol)を添加し、そのまま2.0 h撹拌した。THFを減圧下にて留去した後、EtOAc (40 mL)と0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (15 mL)を加え、分液した。有機層に0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (15 mL)を再度添加し、分液した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。有機層を減圧下にて濃縮し、乾固すると3’-OLev rU (2’-F) (E110, 3.61 g)が得られた。これをカラムクロマト精製 [Silicagel 60 (20 g), 5% Et3N contained EtOAc/n-hexane 0:95-95:0]した。有効区を減圧下にて濃縮し、乾固すると精3’-OLev rU (2’-F) (E110, 収量3.57 g, 収率 93.5%)が得られた。【０２６２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 2.19 (3H, s), 2.57-2.66 (2H, m), 2.67-2.84 (2H, m), 3.46 (1H, dd, J = 11.35, 2.50 Hz), 3.62 (1H, dd, J = 11.35, 2.30 Hz), 3.799 (3H, s), 3.800 (3H, s), 4.30 (1H, brd, J = 7.25 Hz), 5.22 (1H, dddd, 2JHF= 51.61 Hz, J = 4.50, 2.25, 2.25 Hz), 5.31-5.37 (1H, m), 5.34 (1H, d, J = 8.15 Hz), 6.11 (1H, dd, 3JHF = 16.10 Hz, J = 2.20 Hz), 6.85 (4H, dd, J = 8.95, 2.15 Hz), 7.24-7.37 (9H, m), 7.84 (1H, d, J = 8.20 Hz), 8.80 (1H, brs).
（５）２個のイコシルオキシ基を有するＵ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１１））の合成
【化１２６】
2014077292.tif 000128
【０２６３】
200-mL ナス型フラスコに化合物（E110）(1.23 g, 1.77 mmol), i-Pr2NEt (1.26 mL), pyridine (11 mL)を量り、溶解した。室温でTMSCl (0.56 mL), 2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸クロライド(E109, 0.828 g相当)を順に添加した。この混合物を外温度60 ℃にて3.5時間反応した。室温に冷却し、MeOH (72 mL)を滴下した。懸濁液を氷冷下にて0.5 h撹拌し、吸引ろ取した。紛体をMeOH (5 mLX7)で洗浄した。得られた紛体を減圧下、室温で18 h乾燥すると化合物(E111) (1.33 g, 収率81.9%)が得られた。【０２６４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 7.10 Hz), 1.00-1.40 (64H, m), 1.40-1.52 (2H, m), 1.53-1.75 (4H, m), 1.75-1.88 (2H, m), 2.18 (3H, s), 2.55-2.86 (4H, m), 3.46 (1H, dd, J = 11.40, 2.28 Hz), 3.64 (1H, dd, J = 11.40, 2.30 Hz), 3.801 (3H, s), 3.803 (3H, s), 3.95 (2H, t, J = 6.45 Hz), 3.99 (2H, t, J = 7.05 Hz), 4.28 (1H, brd, J = 7.40 Hz), 5.22 (1H, dddd, 2JHF= 51.56 Hz, J = 4.40, 2.10, 2.10 Hz), 5.32-5.38 (1H, m), 5.40 (1H, d, J = 8.25 Hz), 6.11 (1H, dd, 3JHF = 15.90 Hz, J = 2.05 Hz), 6.85 (4H, dd, J = 8.95, 1.95 Hz), 7.05-7.11 (2H, m), 7.23-7.33 (7H, m), 7.37 (2H, dd, J = 8.70, 1.50 Hz), 7.47 (1H, dd, J = 7.50, 2.05 Hz), 7.91 (1H, d, J = 8.25 Hz).【０２６５】
実施例２６
２個のイコシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１３））の合成
【化１２７】
2014077292.tif 000129
【０２６６】
（１）ｄＴ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ１１２））の合成
【化１２８】
2014077292.tif 000130
【０２６７】
100-mLナス型フラスコに1-((2R,3R,4R,5R)-5-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-4-ヒドロキシ-3-(2-メトキシエトキシ)テトラヒドロフラン-2-イル)-5-メチルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン(3.00 g, 4.85 mmol), DMAP (59 mg, 0.48 mmol), THF (15 mL)を量って溶解した後、Levrinic acid (0.85 g, 7.27 mmol)を添加した。WSC.HCl (1.39 g, 7.27 mmol)を添加し、そのまま2.0 h撹拌した。THFを減圧下にて留去した後、EtOAc (40 mL)と0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (30 mL)を加え、分液した。有機層に0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (30 mL)を再度添加し、分液した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。有機層を減圧下にて濃縮し、乾固すると3’-OLev rT (2’-OMOE) (E112, 3.13 g, 収率89.8%)が得られた。【０２６８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 1.36 (3H, d, J = 1.15 Hz), 2.19 (3H, s), 2.64-2.82 (4H, m), 3.28 (3H, s), 3.37 (1H, dd, J = 10.90, 2.35 Hz), 3.49-3.52 (3H, m), 3.66-3.71 (1H, m), 3.75-3.80 (1H, m), 3.79 (3HX2, s), 4.23-4.25 (1H, m), 4.45 (1H, t, J = 5.65 Hz), 5.41 (1H, dd, J = 5.25, 3.75 Hz), 6.08 (1H, d, J = 6.00 Hz), 6.85 (4H, dd, J = 8.65, 3.00 Hz), 7.22-7.31 (7H, m), 7.39 (2H, dd, J = 7.10, 1.50 Hz), 7.57 (1H, d, J = 1.15 Hz), 8.57 (1H, brs).【０２６９】
（２）２個のイコシルオキシ基を有するｄＴ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１３））の合成
【化１２９】
2014077292.tif 000131
【０２７０】
200-mL ナス型フラスコに化合物（E112）(1.27 g, 1.77 mmol), i-Pr2NEt (1.62 mL), pyridine (11 mL)を量り、溶解した。室温でTMSCl (0.54 mL), 2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸クロライド(E109, 0.828 g相当)を順に添加した。この混合物を外温度60 ℃にて1.5時間反応した。室温に冷却し、MeOH (55 mL)を滴下した。懸濁液を氷冷下にて0.5 h撹拌し、吸引ろ取した。紛体をMeOH (10 mLX2)で洗浄した。得られた紛体を減圧下、室温で18 h乾燥すると化合物（E113）(1.22 g, 収率74.4%)が得られた。【０２７１】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 6.80 Hz), 1.19-1.37 (64H, m), 1.37 (3H, d, J = 0.80 Hz), 1.43-1.48 (2H, m), 1.62-1.68 (4H, m), 1.77-1.83 (2H, m), 2.18 (3H, s), 2.60-2.78 (4H, m), 3.29 (3H, s), 3.37 (1H, dd, J = 7.53, 2.35 Hz), 3.49 (2H, t, J = 4.30Hz), 3.52 (1H, dd, J = 10.90, 2.35 Hz), 3.64-3.68 (1H, m), 3.76-3.79 (1H, m), 3.80 (3HX2, s), 3.94 (2H, t, J = 6.40 Hz), 3.99 (2H, t, J = 7.00 Hz), 4.22-4.24 (1H, m), 4.44 (1H, t, J = 5.30 Hz), 5.39 (1H, t, J = 4.85 Hz), 6.06 (1H, d, J = 6.00 Hz), 6.85 (4H, dd, J = 8.85, 1.80 Hz), 7.04-7.10 (2H, m), 7.23-7.32 (7H, m), 7.39 (2H, dd, J = 7.35, 1.40 Hz), 7.43 (1H, dd, J = 7.40, 2.05 Hz), 7.64 (1H, d, J = 1.05 Hz).【０２７２】
実施例２７
２個のイコシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１４））の合成
【化１３０】
2014077292.tif 000132
【０２７３】
300-mL ナス型フラスコに化合物（E4）(10.91 g, 15.95 mmol), i-Pr2NEt (10.31 g), pyridine (98 mL)を量り、溶解した。室温でTMSCl (5.07 mL), 2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸クロライド(E109, 7.46, 10.16 mmol)を順に添加した。この混合物を外温度60 ℃にて3.5時間反応した。室温に冷却し、MeOH (55 mL)を滴下した。懸濁液を氷冷下にて0.5 h撹拌し、吸引ろ取した。紛体をMeOH (50 mLX2)で洗浄した。得られた紛体を減圧下、室温で48 h乾燥すると化合物（E114）(11.09 g, 収率81.5%)が得られた。ろ液中の沈殿物を再度ろ取し、MeOH洗浄した。得られた紛体を減圧下、室温で18 h乾燥すると化合物（E114）(1.21 g, 収率8.9%)が得られた。【０２７４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 6.75 Hz), 1.18-1.39 (64H, m), 1.37 (3H, d, J = 0.90 Hz), 1.43-1.49 (2H, m), 1.62-1.68 (4H, m), 1.77-1.84 (2H, m), 2.17 (3H, s), 2.40-2.49 (2H, m), 2.49-2.56 (2H, m), 2.68-2.78 (2H, m), 3.45 (1H, dd, J = 10.65, 2.30 Hz), 3.50 (1H, dd, J = 10.65, 2.45 Hz), 3.80 (3HX2, s), 3.93-4.02 (4H, m), 4.11-4.12 (1H, m), 5.45-5.46 (1H, m), 6.41 (1H, dd, J = 5.80, 3.05 Hz), 6.84 (4H, dd, J = 9.00, 1.25 Hz), 7.05-7.11 (2H, m), 7.22-7.32 (7H, m), 7.40 (2H, dd, J = 8.65, 1.40 Hz) 7.46 (1H, dd, J = 7.15, 2.40 Hz), 7.66 (1H, d, J = 1.20 Hz).【０２７５】
実施例２８
２個のイコシルオキシ基を有するウラシル（Ｕ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１５））の合成
【化１３１】
2014077292.tif 000133
【０２７６】
50-mL ナス型フラスコに化合物（E111）(530 mg)とtoluene (2 mL)を量り、溶解した。これにトリクロロ酢酸 (0.4 g)を添加し、室温で10分撹拌した。 メタノール (2.5 mL) を添加後、アセトニトリル(10 mL)を5分で滴下した後、15分間氷冷下にて撹拌した。 析出物を吸引ろ取し、5%メタノール含有アセトニトリル (5 mL)で5回洗浄した。得られた粉末を減圧下、40 ℃にて1.5時間乾燥すると目的物 (E115, 440 mg, 収率107%)が得られた。【０２７７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 7.05 Hz), 1.00-1.40 (64H, m), 1.40-1.52 (2H, m), 1.53-1.75 (2H, m), 1.75-1.88 (2H, m), 2.0-2.35 (2H, brs), 2.19 (3H, s), 2.55-2.90 (4H, m), 3.79 (1H, dd, J = 12.70, 2.05 Hz), 3.94-4.01 (6H, m), 4.23-4.30 (1H, brm), 5.27-5.87 (2H, m), 5.83 (1H, d, J = 8.25 Hz), 5.90 (1H, dd, 3JHF = 16.70 Hz, J = 2.60 Hz), 7.08-7.11 (2H, m), 7.50 (1H, dd, J = 7.50, 2.10 Hz), 7.78 (1H, d, J = 8.20 Hz).【０２７８】
実施例２９
２個のイコシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１６））の合成
【化１３２】
2014077292.tif 000134
【０２７９】
50-mL ナス型フラスコに化合物（E113）(500 mg)とtoluene (5 mL)を量り、溶解した。これにトリクロロ酢酸 (0.4 g)を添加し、室温で10分撹拌した。 メタノール (2.5 mL) を添加後、アセトニトリル(10 mL)を5分で滴下した後、15分間氷冷下にて撹拌した。 ゲル状物を吸引ろ取し、メタノール (5 mL), 5%メタノール含有アセトニトリル (5 mL)で5回洗浄した。得られた粉末を減圧下、40 ℃にて1.5時間乾燥すると目的物 (E116, 256 mg, 収率65%)が得られた。【０２８０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 7.05 Hz), 1.19-1.37 (64H, m), 1.43-1.48 (2H, m), 1.62-1.68 (2H, m), 1.77-1.83 (2H, m), 1.94 (3H, d, J = 0.95 Hz), 2.05-2.30 (3H, m), 2.20 (3H, s), 2.63-2.84 (4H, m), 3.31 (3H, s), 3.45-3.48 (2H, m), 3.67-3.72 (2H, m), 3.74 (1H, dd, J = 12.65, 2.15 Hz), 3.90 (1H, dd, J = 12.65, 1.95 Hz), 3.93-3.98 (4H, m), 4.20-4.21 (1H, m), 4.48 (1H, t, J = 5.25 Hz), 5.29 (1H, t, J = 4.70 Hz), 5.64 (1H, d, J = 5.10 Hz), 7.05-7.11 (2H, m), 7.47 (1H, dd, J = 7.60, 2.00 Hz), 7.50 (1H, d, J = 1.00 Hz).【０２８１】
実施例３０
２個のイコシルオキシ基を有するデオキシチミン（ｄＴ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１１７））の合成
【化１３３】
2014077292.tif 000135
【０２８２】
50-mL ナス型フラスコに化合物（E114）(630 mg)とtoluene (2 mL)を量り、溶解した。これにトリクロロ酢酸 (0.5 g)を添加し、室温で10分撹拌した。 メタノール (2.5 mL) を添加後、アセトニトリル(10 mL)を5分で滴下した後、15分間氷冷下にて撹拌した。 析出物を吸引ろ取し、5%メタノール含有アセトニトリル (5 mL)で5回洗浄した。得られた粉末を減圧下、40 ℃にて1.5時間乾燥すると目的物 (E117, 518 mg, 101%)が得られた。【０２８３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 6.80 Hz), 1.18-1.39 (64H, m), 1.43-1.49 (2H, m), 1.62-1.68 (2H, m), 1.77-1.84 (2H, m), 1.95 (3H, d, J = 1.80 Hz), 2.36 (3H, s), 2.40-2.49 (2H, m), 2.49-2.56 (5H, m), 2.74-2.78 (2H, m), 3.89-3.91 (2H, m), 3.93-3.99 (4H, m), 4.07-4.09 (1H, m), 5.33-5.34 (1H, m), 6.23 (1H, t, J = 6.65 Hz), 7.16-7.18 (2H, m), 7.47 (1H, dd, J = 7.35, 2.25 Hz), 7.57 (1H, d, J = 1.15 Hz).【０２８４】
実施例３１
ホスホロアミダイト法を用いた５’方向への伸長による核酸オリゴマー（５’−ＡＣＧｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ３０））の合成
【化１３４】
2014077292.tif 000136
【０２８５】
（１）化合物（Ｅ５）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ１７））の合成
【化１３５】
2014077292.tif 000137
【０２８６】
実施例１(５)で示した化合物（Ｅ５）（３１０．４ｍｇ）に２４８ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（１０ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（８ｍＬ）を加えて攪拌した。反応液に１０％メタノール／アセトニトリル溶液を加えて濃縮した後０℃に冷却して、吸引ろ過により化合物（Ｅ１７）（２６５．９ｍｇ）を得た。【０２８７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.62 (1 H, br), 7.11 (2 H, s), 6.26 (1 H, br), 5.36 (1 H, m), 4.12 (1 H, m), 3.90-4.07 (8H, m), 2.98-3.12 (1 H, br), 2.77 (2 H, m), 2.58 (2 H, m), 2.43 (2 H, br), 2.20 (3 H, s), 1.97 (3 H, d, J = 1.0 Hz), 1.69-1.84 (6 H, m), 1.41-1.50 (6 H, m), 1.19-1.40 (84 H, br), 0.88 (9 H, t, J = 7.0 Hz).【０２８８】
（２）化合物（Ｅ１７）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸ダイマー（化合物（Ｅ１８）の合成
【化１３６】
2014077292.tif 000138
【０２８９】
化合物（Ｅ１７）（２５７．０ｍｇ）と（２Ｒ,３Ｓ,５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−５−（５−メチル−２,４−ジオキソ−３,４−ジヒドロピリミジン−１（２Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル （２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（２２３．４ｍｇ）にトルエン（１０ｍＬ）を加え室温で１時間攪拌した。これにアセトニトリル（１．５ｍＬ）に溶解した５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール（１４４．２ｍｇ）を加え、室温で２時間攪拌した。反応液にアセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により化合物（Ｅ１８）（３７９．３ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０２９０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ7.89, 7.97 (1 H, br), 7.44-7.61 (2 H, m), 7.39 (2 H, m), 7.28 (7 H, m), 7.13-7.18 (2 H, m), 6.78-6.87 (4 H, m), 6.28-6.46 (2 H, m), 5.19-5.30 (1 H, br m), 4.90-5.02 (1 H, br m), 3.91-4.29 (12 H, m), 3.76-3.81 (6 H, m), 3.33-3.57 (2 H, m), 2.21-3.14 (10 H, m), 2.17, 2.16 (3 H, s), 1.95 (3 H, s), 1.69-1.84 (6 H, m), 1.40-1.50 (9 H, br m), 1.19-1.38 (84 H, m), 0.88 (9 H, t, J = 6.8 Hz).【０２９１】
なお、上述の（２Ｒ,３Ｓ,５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−５−（５−メチル−２,４−ジオキソ−３,４−ジヒドロピリミジン−１（２Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル （２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイトは、自体公知の方法または後述するＥ３３の製造方法に準ずる方法を用いて、下式
【化１３７】
2014077292.tif 000139
で表される化合物またはその塩から製造することができる。【０２９２】
（３）化合物（Ｅ１８）の酸化による化合物（Ｅ１９）の合成
【化１３８】
2014077292.tif 000140
【０２９３】
化合物（Ｅ１８）（３４４．１ｍｇ）に０．０２  Ｍヨウ素／ピリジン溶液（１０ｍＬ）と水（５００μＬ）を加え、室温で４５分間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ１９）（３４６．５ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０２９４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.08 (1 H, br s), 7.44-7.57 (2 H, m), 7.36 (2 H, m), 7.19-7.34 (7 H, m), 7.17, 7.14 (2 H, s), 6.82-6.87 (4 H, m), 6.29-6.45 (2 H, m), 5.15-5.32 (2 H, m), 4.09-4.41 (6 H, m), 3.92-4.07 (6 H, m), 3.79-3.80 (6 H, m), 3.55 (1 H, m), 3.41, (1 H, m), 2.18-3.13 (10 H, m), 2.16 (3 H, m), 2.01 (3 H, m), 1.69-1.84 (6 H, m), 1.40-1.50 (9 H, br m), 1.10-1.39 (84 H, m), 0.88 (9 H, t, J = 6.8 Hz).【０２９５】
（４）化合物（Ｅ１９）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ２０））の合成
【化１３９】
2014077292.tif 000141
【０２９６】
化合物（Ｅ１９）（３２５．２ｍｇ）に２４８ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（１０ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（８ｍＬ）を加えて攪拌した。反応液に１０％メタノール／アセトニトリル溶液を加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ２０）（２８８．４ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０２９７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.03 (1 H, br s), 7.39-7.50 (2 H, m), 7.15, 7.13 (2 H, s), 6.26-6.40 (1 H, br), 6.07-6.21 (1 H, m), 5.15-5.37 (2 H, br m), 4.16-4.45 (6 H, m), 3.93-4.08 (6 H, m), 3.76-3.93 (2 H, m), 3.17-2.27 (11 H, br m), 2.19 (3 H, s), 2.02 (3 H, m), 1.92 (3 H, m), 1.69-1.84 (6 H, m), 1.40-1.50 (6 H, br m), 1.10-1.40 (84 H, m), 0.88 (9 H, t, J = 7.0 Hz).【０２９８】
（４−２）化合物（Ｅ１９）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ２０））の合成
ナス型フラスコに、０．２７Ｍ  ５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール／アセトニトリル溶液（２８．８ｍＬ）と（２Ｒ，３Ｓ，５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−５−（５−メチル−２，４−ジオキソ−３，４−ジヒドロピリミジン−１（２Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト／トルエン溶液（０．１２Ｍ，２３ｍＬ）と化学式（Ｅ１７）で示される化合物（２．３ｇ）をトルエン（１３．８  ｍＬ）に溶解した溶液とを順次添加し、室温で９０分撹拌した。反応液にアセトニトリルを添加し、氷冷した。吸引ろ取して得た湿結晶をトルエン（４．６ｍＬ）に懸濁させ、ヨウ素／水／ピリジン溶液（０．５８ｇ／０．０８２ｍｌ／０．７３ｇ混合溶液）を添加して室温で１５分撹拌した。反応液を減圧濃縮し、トルエンに置換した。そこに０．６７Ｍトリクロロ酢酸／トルエン溶液（２７．５ｍＬ）を添加し、室温で１０分撹拌した。反応溶液にメタノールを添加し、氷冷した。吸引ろ取し、上記化学式（Ｅ２０）で示した化合物（２．５ｇ）を得た。【０２９９】
（５）化合物（Ｅ２０）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸トリマー（化合物（Ｅ２１））の合成
【化１４０】
2014077292.tif 000142
【０３００】
化合物（Ｅ２０）（２７２．１ｍｇ）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）−５−（２−イソブチルアミド−６−オキソ−１Ｈ−プリン−９（６Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル （２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（２９１．１ｍｇ）にトルエン（１０ｍＬ）を加え、室温で５５分間攪拌した。これにアセトニトリル（１．５ｍＬ）に溶解した５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール（１４４．２ｍｇ）を加え、室温で２時間攪拌した。反応液にアセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により化合物（Ｅ２１）（４１１．９ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３０１】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ11.95-12.16 （1 H, m）, 7.82-7.91 (2 H,m), 7.20-7.55 (12 H, m), 7.13 (2 H, m), 6.79-6.87 (4 H, m), 6.30 (2 H, br), 5.75-5.89 (1 H, m), 4.47-5.33 (3 H, m), 4.07-4.44 (8 H, m), 3.90-4.06 (6 H, m), 3.74-3.81 (6 H, m), 1.94-3.55 (25 H, m), 1.68-1.83 (6 H, m), 1.40-1.51 (6 H, br m), 0.92-1.39 (93 H, m), 0.88 (9 H,m), 0.76-0.83 (9 H, m), -0.09 - -0.02 (3 H, m), -0.27 - -0.20 (3 H, m).【０３０２】
なお、上述の（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）−５−（２−イソブチルアミド−６−オキソ−１Ｈ−プリン−９（６Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル  （２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイトは、自体公知の方法または後述するＥ３３の製造方法に準ずる方法を用いて、下式
【化１４１】
2014077292.tif 000143
で表される化合物またはその塩から製造することができる。【０３０３】
（６）化合物（Ｅ２１）の酸化による化合物（Ｅ２２）の合成
【化１４２】
2014077292.tif 000144
【０３０４】
化合物（Ｅ２１）（３５３．７ｍｇ）をトルエン（４ｍＬ）に溶解させた後、０．０２Ｍヨウ素／ピリジン溶液（１０ｍＬ）と水（５００μＬ）を加え、室温で１５分間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ２２）（３６２．６ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３０５】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.11 （1 H, m）, 7.72-9.54 (2 H,m), 7.22-7.56 (12 H, m), 7.12-7.14 (2 H, m), 6.79-6.85 (4 H, m), 6.15-6.38 (2 H, br), 5.72-5.80 (1 H, m), 4.12-5.34 (14 H, m), 3.94-4.08 (6 H, m), 3.76-3.80 (6 H, m), 1.87-3.60 (22 H, m), 1.69-1.84 (6 H, m), 1.45 (6 H, br), 0.95-1.38 (93 H, m), 0.88 (9 H,m), 0.77 (9 H, m), -0.12 - -0.04 (3 H, m), -0.31 - -0.14 (3 H, m).【０３０６】
（７）化合物（Ｅ２２）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ２３））の合成
【化１４３】
2014077292.tif 000145
【０３０７】
化合物（Ｅ２２）（３６０．０ｍｇ）に２４８ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（１０ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（８ｍＬ）を加えて攪拌した。反応液に１０％メタノール／アセトニトリル溶液を加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ２３）（２９７．２ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３０８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.24-12.37 （1 H, m）, 9.68-11.28 (2 H,m), 7.44-7.70 (3H, m), 7.07-7.13 (2 H, m), 5.08-6.34 (6 H, m), 4.08-4.69 (11 H, m), 3.88-4.05 (9 H, m), 1.88-3.31 (23 H, m), 1.69-1.83 (6 H, m), 1.40-1.50 (6 H, br m), 0.99-1.39 (90 H, m), 0.86-0.89 (9 H, m), 0.68-0.80 (9 H, m), -0.24 - -0.21 (3 H, m), -0.47 - -0.40 (3 H, m).【０３０９】
（８）化合物（Ｅ２３）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸テトラマー（化合物（Ｅ２４）の合成
【化１４４】
2014077292.tif 000146
【０３１０】
化合物（Ｅ２３）（２８４．５ｍｇ）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（４−アセトアミド−２−オキソピリミジン−１（２Ｈ）−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（２７０．６ｍｇ）にトルエン（１０ｍＬ）を加え、室温で１０分間攪拌した。これにアセトニトリル（１．５ｍＬ）に溶解した５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール（１４４．２ｍｇ）を加え、室温で２時間攪拌した。反応液にアセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により化合物（Ｅ２４）（３６０．８ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３１１】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.14-12.22 （1 H, m）, 7.75-9.90 (3 H,m), 6.97-7.55 (15 H, m), 6.80-6.89 (4 H, m), 3.37-6.36 (39 H, m), 1.94-3.11 (26 H, m), 1.69-1.83 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m), 0.98-1.38 (93 H, m), 0.68-0.95 (27 H, m), -0.25 - -0.19 (12 H, m).【０３１２】
なお、上述の（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（４−アセトアミド−２−オキソピリミジン−１（２Ｈ）−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイトは、自体公知の方法または後述するＥ３３の製造方法に準ずる方法を用いて、下式
【化１４５】
2014077292.tif 000147
で表される化合物またはその塩から製造することができる。【０３１３】
（９）化合物（Ｅ２４）の酸化による化合物（Ｅ２５）の合成
【化１４６】
2014077292.tif 000148
【０３１４】
化合物（Ｅ２４）（２５８．２ｍｇ）をトルエン（４ｍＬ）に溶解させた後、０．０２Ｍヨウ素／ピリジン溶液（１０ｍＬ）と水（５００μＬ）を加え、室温で１５分間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ２５）（３３６．１ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３１５】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.15-12.23 （1 H, m）, 7.47-10.05 (4 H,m), 7.02-7.41 (14 H, m), 6.81-6.87 (4 H, m), 3.40-6.35 (39 H, m), 1.91-3.08 (26 H, m), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m), 0.96-1.39 (93 H, m), 0.68-0.95 (27 H, m), -0.30 - -0.20 (12 H, m).【０３１６】
（１０）化合物（Ｅ２５）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ２６））の合成
【化１４７】
2014077292.tif 000149
【０３１７】
化合物（Ｅ２５）（３２８．７ｍｇ）に２４８ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（１０ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（８ｍＬ）を加えて攪拌した。反応液に１０％メタノール／アセトニトリル溶液を加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ２６）（２９５．３ｍｇ）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３１８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.19-12.27 （1 H, br m）, 7.09-10.49 (9 H, br m), 3.67-6.39 (33 H, m), 1.88-3.09 (27 H, m), 1.70-1.84 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m), 1.00-1.38 (93 H, m), 0.67-0.94 (27 H, m), -0.30 - -0.27 (12 H, m).【０３１９】
（１１）化合物（Ｅ２６）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸ペンタマー（化合物（Ｅ２７）の合成
【化１４８】
2014077292.tif 000150
【０３２０】
化合物（Ｅ２６）（２５６．４ｍｇ）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（６−ベンズアミド−９Ｈ−プリン−９−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（２９６．５ｍｇ、３００μｍｏｌ）にトルエン（１０ｍＬ）を加え、室温で１０分間攪拌した。これにアセトニトリル（１．５ｍＬ）に溶解した５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール（１４４．２ｍｇ）を加え、室温で２時間攪拌した。反応液にアセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により化合物（Ｅ２７）（３３７．３ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３２１】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.03-12.23 （1 H, m）, 7.60-10.14 (7 H, br m), 7.05-7.55 (19 H, m), 6.79-6.87 (4 H, m), 1.90-6.42 (75 H, br m), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m), 1.04-1.36 (93 H, m), 0.85-0.93 (18 H, m), 0.69-0.78 (18 H, m), -0.35 - -0.23 (18 H, m).【０３２２】
（１２）化合物（Ｅ２７）の酸化による化合物（Ｅ２８）の合成
【化１４９】
2014077292.tif 000151
【０３２３】
化合物（Ｅ２７）（３２２．９ｍｇ）をトルエン（４ｍＬ）に溶解させた後、０．０２Ｍヨウ素／ピリジン溶液（１０ｍＬ）と水（５００μＬ）を加え、室温で１５分間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ２８）（３０８．４ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３２４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.10-12.25 （1 H, br m）, 7.77-10.07 (7 H, br m), 7.05-7.64 (19 H, m), 6.78-6.85 (4 H, m),1.90-6.39 (75 H, br m), 1.70-1.84 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m), 1.00-1.38 (93 H, m), 0.82-0.92 (18 H, m), 0.68-0.81 (18 H, m), -0.29 - -0.19 (18 H, br m).【０３２５】
（１３）化合物（Ｅ２８）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ２９））の合成
【化１５０】
2014077292.tif 000152
【０３２６】
化合物（Ｅ２８）（３２８．７ｍｇ）に２４８ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（１０ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した。反応液に１０％メタノール／アセトニトリル溶液を加えて濃縮した後０℃に冷却し、遠心分離により化合物（Ｅ２９）（２６９．０ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３２７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.14-12.27 （1 H, br m）, 7.23-10.08 (15 H,br m), 7.11-7.15 (2 H, m), 1.87-6.35 (70 H, br m), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m), 1.06-1.39 (93 H, m), 0.69-0.93 (36 H, m), -0.34 - -0.19 (18 H, m).【０３２８】
（１４）化合物（Ｅ２９）の脱保護による化合物（Ｅ３０）の合成
【化１５１】
2014077292.tif 000153
【０３２９】
化合物（Ｅ２９）（１６５．５ｍｇ）をエタノール（１．５ｍＬ）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（５ｍＬ）を加え４５℃で２５分間反応した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせてドライアイスで冷却した。トリエチルアミン三フッ化水素酸塩（７．５ｍＬ）を加えて４０℃で１３５分間反応させて、化合物（Ｅ３０）を含む反応溶液（２８．８ｇ）を得た。得られた反応溶液（４．６ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ３０）（４．１μｍｏｌ）を得た。得られた化合物（Ｅ３０）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０３３０】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  １５２４．３０  ［Ｍ  −  Ｈ］−【０３３１】
実施例３２
ホスホロアミダイト法を用いた３’方向への伸長による核酸オリゴマー（５’−ＧＵｄＴ−３’）（化合物（Ｅ３４））の合成
【化１５２】
2014077292.tif 000154
【０３３２】
（１）３個のオクタデシルオキシ基を有するｄＴ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５））からの核酸ダイマー（化合物（Ｅ３１））の合成
【化１５３】
2014077292.tif 000155
【０３３３】
化合物（Ｅ５）の代わりに、化合物（Ｅ７）（３５２．４ｍｇ）を用いて、実施例３１の（１）から（３）と同様の反応を行い、ダイマーブロック（化合物（Ｅ３１））をジアステレオマー混合物（４００．９ｍｇ）として得た。【０３３４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.18, 12.13 (1 H, s), 10.13, 9.55 (1 H, br s), 7.83-8.05, (2 H, m), 7.20-7.48 (9H, m), 7.13 (2 H, m), 6.82-6.86 (4 H, m), 6.39, 6.23 (1 H, d, J = 8.0, 8.5 Hz), 5.87-5.96 (2 H, m), 4.72-5.19 (3 H, br m), 3.90-4.56 (14 H, br m), 3.78-3.80 (6 H, m), 3.56-3.68 (1 H, br m), 3.17-3.54 (1 H, br m), 2.44-2.88 (6 H, m), 2.20 (3 H, s), 1.70-1.83 (6 H, m),1.45 (6 H, br m) 1.19-1.36 (90 H, m), 0.74-0.91 (27 H, m), -0.04 - -014 (9 H, m), -0.16 - -0.24 (3 H, s).【０３３５】
（２）化合物（Ｅ３１）の３’−ＯＨ体（化合物（Ｅ３２））の合成
【化１５４】
2014077292.tif 000156
【０３３６】
化合物（Ｅ３１）（３９６．７ｍｇ）をジクロロメタン（５ｍＬ）に溶解し、２０％酢酸／２，４，６−トリメチルピリジン溶液（５ｍＬ）を加え、ヒドラジン一水和物（１７μＬ）を加えて室温で１時間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により化合物（Ｅ３２）（３２９．２ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３３７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.16-12.20 (1 H, m), 10.10- 9.96 (1 H, br m), 7.77- 8.01 (2 H, m), 7.18-7.47 (9H, m), 7.12 (2 H, m), 6.83-6.87 (4 H, m), 6.35, 6.23 (1 H, d, J = 8.0, 8.0 Hz), 5.88-5.98 (2 H, m), 4.74-5.12 (2 H, m), 3.91-4.57 (14 H,br m), 3.79 (6 H, m), 3.17-3.65 (2 H, m), 2.03-2.77 (4 H, m), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.45 (6 H, br), 1.12-1.37 (90 H, m), 0.75-0.96 (27 H, m), 0.08-0.21 (6 H, m), -0.02 - -0.04 (3 H, m), -0.23 - -0.17 (3 H, m).【０３３８】
（３）化合物（Ｅ３２）の３’−ホスホロアミダイト体（化合物（Ｅ３３））の合成
【化１５５】
2014077292.tif 000157
【０３３９】
化合物（Ｅ３２）（３２２．９ｍｇ）をジクロロメタン（９．８ｍＬ）に溶解し、２，４，６−トリメチルピリジン（２７０μＬ）と１−メチルイミダゾール（９μＬ）、２−シアノエチルジイソプロピルクロロホスホロアミジド（２００μＬ）を加え、室温で２時間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により化合物（Ｅ３３）（３４１ｍｇ）をジアステレオマー混合物として得た。【０３４０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.14-12.23 (1 H, m), 9.71-10.45 (1 H, br m), 7.59-8.07 (2 H, m), 7.21-7.46 (9 H, m), 7.09-7.19 (2 H, m), 6.79-6.87 (4 H, m), 5.84-6.60 (3 H, m), 3.16-5.07 (28 H, br m), 1.97-2.85 (5 H, br m), 1.67-1.83 (6 H, br m),1.40-1.50 (6 H, br m) 1.09-1.39 (102 H, br m), 0.73-0.97 (27 H, m), -0.24 - -0.17 (12 H, m).【０３４１】
（４）核酸オリゴマー（５’−ＧＵｄＴ−３’）（化合物（Ｅ３４））の合成
【化１５６】
2014077292.tif 000158
【０３４２】
化合物（Ｅ３３）（３３１．０ｍｇ）と実施例３１に示した化合物（Ｅ１７）（５８．７ｍｇ）をジクロロメタン（３．８ｍＬ）に溶解し、これにアセトニトリル（１．５ｍＬ）に溶解した５−ベンジルメルカプト−１Ｈ−テトラゾール（３３．９ｍｇ）を加え、室温で５．５時間攪拌した。反応液にアセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により析出物（３７２ｍｇ）を得た。得られた析出物（３６３．９ｍｇ）をジクロロメタン（５ｍＬ）に溶解した後、０．０２Ｍヨウ素／ピリジン溶液（１０ｍＬ）と水（５００μＬ）を加え、室温で１５分間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後０℃に冷却し、吸引ろ過により析出物（３５５．６ｍｇ）を得た。得られた析出物（１１．０ｍｇ）に３％  トリクロロ酢酸／ジクロロメタン溶液（１ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した。反応液にアセトニトリルを加えて濃縮した後、１０％メタノール／アセトニトリル溶液を加えて０℃に冷却し、遠心分離により析出物（８．７ｍｇ）を得た。得られた析出物（７．４ｍｇ）をエタノール（５００μＬ）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（１．５ｍＬ）を加え４５℃で２５分間反応した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて０℃に冷却した。トリエチルアミン三フッ化水素酸塩（３２０μＬ）を加えて４０℃で７５分間反応させて、化合物（Ｅ３４）を含む反応溶液（５．９ｇ）を得た。得られた反応溶液（９６１ｍｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ３４）（３６ｎｍｏｌ）を得た。化合物（Ｅ３４）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  ８９２．１９  ［Ｍ  −  Ｈ＋］【０３４３】
実施例３３
ホスホロアミダイト法を用いた５’方向への伸長による核酸オリゴマー（５’−ＣＧＵＡＣＧＵ−３’）（化合物（Ｅ８８））の合成
【化１５７】
2014077292.tif 000159
【０３４４】
（１）化合物（Ｅ６７）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸ダイマー（化合物（Ｅ７６））の合成
【化１５８】
2014077292.tif 000160
【０３４５】
化合物（E67）（613.8 mg）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）−５−（２−イソブチルアミド−６−オキソ−１Ｈ−プリン−９（６Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル （２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（776.1 mg）にトルエン（10.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（2.0 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（231.0 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（8.0 mL）と水（500 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（18 mL）を加えて減圧濃縮し、さらにアセトニトリル（18 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（36 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、これをアセトニトリルで洗浄して化合物（E76）（934.4 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３４６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.17, 12.12 (1 H, s, s), 10.13, 9.54 (1 H, br, br), 8.03, 7.85 (1 H, br d J = 8.5 Hz, br d J = 8.5 Hz), 7.93 (1 H, s), 7.41-7.47 (2 H, m), 7.23-7.36 (7 H, m), 7.13 (2 H, br), 6.82-6.86 (4 H, m), 6.39, 6.22 (1 H, d J = 8.2 Hz, d J = 8.2 Hz), 5.87-5.96 (2 H, m), 5.18, 5.06 (2 H, br, br m), 4.92-4.95, 4.86 (1 H, m, br t J = 5.7 Hz), 4.72-4.75, 4.47-4.56 (2 H, m), 4.15-4.41 (5 H, m), 3.90-4.06 (7 H, m), 3.78-3.80 (6 H, m), 3.57-3.64 (1 H, m), 3.49-3.53, 3.27-2.29 (1 H, m, m), 2.45-2.88 (6 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.41-1.49 (6 H, m), 1.20-1.36 (114 H, br m), 0.86-0.89 (18 H, m), 0.76, 0.78 (9 H, s),0.12, 0.10 (3 H, s), 0.04, 0.03 (3 H, s), 0.00, -0.03 (3 H, s), -0.16, -0.24 (3 H, s).【０３４７】
（２）化合物（Ｅ７６）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ７７））の合成
【化１５９】
2014077292.tif 000161
【０３４８】
化合物（Ｅ７６）（918.5  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（9.5 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（4.8 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（9.5 mL）を加えて減圧濃縮した後、再度アセトニトリル（9.5 mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、メタノール（15.0 mL）と水（5.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（38.0 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E77）（767.6 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３４９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.20, 12.19 (1 H, br s, br s), 10.18, 9.67 (1 H, br, br), 8.33, 8.17 (1 H, s, br s) 8.00, 7.81 (1 H, br d J = 8.5 Hz, br d J = 7.6 Hz), 7.14, 7.13 (2 H, br s, br s), 6.40, 6.21 (1 H, d J = 8.2 Hz, d J = 8.2 Hz), 5.90-5.99 (2 H, m), 5.19-5.21 (2 H, m), 4.96-5.06, 4.62-4.85 (2 H, m, m), 4.36-4.64, (7 H, m), 3.87-4.06 (8 H, m), 2.31-2.89 (7 H, m), 2.19 (3 H, s), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.40-1.49 (6 H, m), 1.20-1.36 (114 H, br m), 0.86-0.89 (18 H, m), 0.73, 0.76 (9 H, s), 0.11, 0.09 (3 H, s), 0.05, 0.04 (3 H, s), -0.07, -0.08 (3 H, s), -0.22, -0.27 (3 H, s).【０３５０】
（３）化合物（Ｅ７７）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸トリマー（化合物（Ｅ７８））の合成
【化１６０】
2014077292.tif 000162
【０３５１】
化合物（E77）（755.6 mg）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（４−アセトアミド−２−オキソピリミジン−１（２Ｈ）−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（721.7 mg）にトルエン（10.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（2.0 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（231.0 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（8.0 mL）と水（500 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（18 mL）を加えて減圧濃縮し、さらにアセトニトリル（18 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（36 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、これをアセトニトリルで洗浄して化合物（E78）（1.03 g）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３５２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.18-12.21 (1 H, m), 10.46, 10.37, 10.01, 9.67 (1 H, br, br, br, br), 7.67-8.82 (3 H,m), 7.25-7.40 (9 H, m), 7.13, 7.15 (2 H, br s, br s), 6.94-7.12 (1 H, m), 6.83-6.88 (4 H, m), 5.76-6.24 (4 H, m), 3.95-5.37 (23 H, m),3.43-3.82 (9 H, m), 2.35-2.89 (9 H, m), 2.19-2.25 (6 H, s), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.41-1.49 (6 H, m), 1.14-1.36 (114 H, br m), 0.83-1.00 (27 H, m), 0.79, 0.77, 0.75, 0.74 (9 H, s), 0.03-0.29 (12 H, s), -0.06, -0.07, -0.08 (3 H, s), -0.19, -0.28, -0.29, -0.31 (3 H, s). 【０３５３】
（４）化合物（Ｅ７８）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ７９））の合成
【化１６１】
2014077292.tif 000163
【０３５４】
化合物（Ｅ７８）（1.01 ｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（8.7 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（4.4 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（8.7 mL）を加えて減圧濃縮した後、再度アセトニトリル（8.7 mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、メタノール（15.0 mL）と水（5.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（38.0 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E７９）（881.6 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３５５】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.24, 12.21 (1 H, br s, br s), 10.46, 10.43, 10.37, 9.95, 8.81 (1 H, br, br, br, br, br), 7.63-8.53 (3 H, m), 7.29-7.42  (1 H, m), 7.13, (2 H, br s), 3.52-6.23 (31 H, m), 2.44-2.91 (9 H, m), 2.19-2.24 (6 H, m), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.40-1.49 (6 H, m), 1.15-1.37 (114 H, br m), 0.84-0.93 (27 H, m), 0.78, 0.76, 0.74, 0.71 (9 H, s), 0.04-0.24 (12 H, s), -0.06-0.09 (3 H, m),-0.21, -0.28 (3 H, s, br s).【０３５６】
（５）化合物（Ｅ７９）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸テトラマー（化合物（Ｅ８０））の合成
【化１６２】
2014077292.tif 000164
【０３５７】
化合物（E７９）（876.0 mg）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（６−ベンズアミド−９Ｈ−プリン−９−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（790.6 mg）にトルエン（10.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（2.0 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（231.0 mg）を加え、室温で2.5時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（8.0 mL）と水（500 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（18 mL）を加えて減圧濃縮し、さらにアセトニトリル（18 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（36 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、これをアセトニトリルで洗浄して化合物（E８０）（1.19 g）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３５８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.13-12.22 (1 H, m), 8.61-10.48 (3 H, m), 7.74-8.36 (5 H, m), 7.43-7.63 (5 H, m), 7.13-7.36 (11 H, m), 6.79-6.85 (4 H, m), 3.96-6.32 (34 H, br m), 3.62-3.80 (9 H, m), 3.37-3.48 (1 H, m), 2.38-2.87 (11 H, m), 2.16-2.25 (6 H, m), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.41-1.49 (6 H, br m), 1.11-1.36 (114 H, br m), 0.83-0.93 (27 H, m), 0.68-0.78 (18 H, m), 0.01-0.22 (12 H, m), -0.09--0.02 (6 H, m), -0.33-0.17 (6 H, m).【０３５９】
（６）化合物（Ｅ８０）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ８１））の合成
【化１６３】
2014077292.tif 000165
【０３６０】
化合物（Ｅ８０）（590.0 ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（4.2 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（2.1 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（4.2 mL）を加えて減圧濃縮した後、再度アセトニトリル（4.2  mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、メタノール（7.5 mL）と水（2.5 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（19.0 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E８１）（499.7 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３６１】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.12-12.27 (1 H, m), 7.37-10.45 (13 H, m), 7.12-7.14 (2 H, br m), 3.78-6.31 (39 H, br m), 2.49-2.96 (11 H, m), 2.19-2.26 (6 H, m), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.42-1.49 (6 H, br m), 1.10-1.37 (114 H, br m), 0.85-0.92 (27 H, m), 0.71-0.78 (18 H, m), 0.02-0.22 (12 H, m), -0.16--0.01 (6 H, m), -0.36-0.19 (6 H, m).【０３６２】
（７）化合物（Ｅ８１）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸ペンタマー（化合物（Ｅ８２））の合成
【化１６４】
2014077292.tif 000166
【０３６３】
化合物（E８１）（473.2 mg）と(2R,3R,4R,5R)-2-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)-5-(2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)テトラヒドロフラン-3-イル (2-シアノエチル) ジイソプロピルホスホロアミダイト（344.4 mg）にトルエン（5 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（1 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（115.3 mg）を加え、室温で2.5時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（4.0 mL）と水（250 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（9 mL）を加えて減圧濃縮し、さらにアセトニトリル（9 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（18 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、これをアセトニトリルで洗浄して化合物（E８２）（586.7 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３６４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ12.13-12.22 (1 H, m), 7.16-10.51 (24 H, m), 7.13-7.14 (2 H, br m), 6.81-6.86 (4 H, m), 3.41-6.33 (54 H, br m), 2.50-2.88 (12 H, m), 2.14-2.24 (6 H, m), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.41-1.48 (6 H, br m), 1.11-1.37 (114 H, br m), 0.74-0.93 (54 H, m), -0.32-0.21 (30 H, m).【０３６５】
（８）化合物（Ｅ８２）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ８３））の合成
【化１６５】
2014077292.tif 000167
【０３６６】
化合物（Ｅ８２）（540.9  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（3.4 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（1.7 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（3.5 mL）を加えて減圧濃縮した後、再度アセトニトリル（3.5 mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、メタノール（7.5 mL）と水（1.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E８３）（479.0 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３６７】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.14-12.24 (1 H, m), 7.12-10.51 (17 H, m), 3.77-6.36 (49 H, br m), 2.49-2.92 (12 H, m), 2.15-2.24 (6 H, m), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.41-1.48 (6 H, br m), 1.05-1.38 (114 H, br m), 0.74-0.93 (54 H, m), -0.34-0.17 (30 H, m).【０３６８】
（９）化合物（Ｅ８３）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸ヘキサマー（化合物（Ｅ８４））の合成
【化１６６】
2014077292.tif 000168
【０３６９】
化合物（E８３）（464.1 mg）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）−５−（２−イソブチルアミド−６−オキソ−１Ｈ−プリン−９（６Ｈ）−イル）テトラヒドロフラン−３−イル （２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（388.1 mg）にトルエン（8.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（1.0 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（115.3 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（4.0 mL）と水（250 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（9 mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、アセトニトリル（18 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E８４）（578.6 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３７０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.12-12.30 (2 H, m), 7.11-10.56 (28 H, m), 6.76-6.87 (4 H, m), 3.21-6.32 (63 H, br m), 2.41-2.92 (14 H, m), 2.14-2.25 (6 H, m), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.41-1.50 (6 H, br m), 1.04-1.37 (120 H, br m), 0.68-0.93 (63 H, m), -0.38-0.24 (36 H, m).【０３７１】
（１０）化合物（Ｅ８４）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ８５））の合成
【化１６７】
2014077292.tif 000169
【０３７２】
化合物（Ｅ８４）（546.2  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（3.0 ｍＬ）を加えて室温で１５分間攪拌した後、メタノール（3.0 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（5.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、再度アセトニトリル（5.0 mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、メタノール（7.5 mL）と水（1.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E８５）（493.2 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３７３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.12-12.30 (2 H, m), 7.37-10.52 (17 H, m), 7.12-7.15 (2 H, br m), 3.76-6.16 (58 H, br m), 2.47-2.96 (14 H, m), 2.17-2.29 (6 H, m), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.40-1.49 (6 H, br m), 0.98-1.39 (120 H, br m), 0.61-0.94 (63 H, m), -0.43-0.20 (36 H, m).【０３７４】
（１１）化合物（Ｅ８５）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸ヘプタマー（化合物（Ｅ８６））の合成
【化１６８】
2014077292.tif 000170
【０３７５】
化合物（E８５）（469.6 mg）と（２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（４−アセトアミド−２−オキソピリミジン−１（２Ｈ）−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（360.8 mg）にトルエン（8.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（1.0 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（115.3 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（4.0 mL）と水（250 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（9 mL）を加えて減圧濃縮した。これに、アセトニトリル（18 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E８６）（496.0 mg、）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３７６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.22 (2 H, br), 6.93-10.56 (30 H, m), 6.77-6.88 (4 H, m), 3.38-6.18 (72 H, br m), 2.14-2.96 (22 H, m), 1.70-1.81 (9 H, m), 1.41-1.50 (6 H, br m), 1.04-1.37 (120 H, br m), 0.79-0.93 (72 H, m), -0.34-0.25 (42 H, m).【０３７７】
（１２）化合物（Ｅ８６）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ８７））の合成
【化１６９】
2014077292.tif 000171
【０３７８】
化合物（Ｅ８６）（476.0  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（3.0 ｍＬ）とトルエン（2.0 mL）を加えて室温で１５分間攪拌した後、メタノール（5.0 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（5 mL）を加えて減圧濃縮した後、再度アセトニトリル（5 mL）を加えて減圧濃縮した。さらに、メタノール（7.5 mL）と水（1.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E８７）（409.4 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３７９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.12-12.30 (2 H, m), 7.42-10.59 (19 H, m), 7.09-7.14 (2 H, br m), 3.60-6.38 (67 H, br m), 2.47-2.96 (16 H, m), 2.13-2.29 (6 H, m), 1.70-1.85 (9 H, m), 1.40-1.49 (6 H, br m), 0.99-1.39 (120 H, br m), 0.59-0.99 (72 H, m), -0.37-0.28 (42 H, m).【０３８０】
（１３）化合物（Ｅ８７）の脱保護による化合物（Ｅ８８）の合成
【化１７０】
2014077292.tif 000172
【０３８１】
化合物（Ｅ87）（5.5 ｍｇ）をエタノール（500 μL）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（1.5 ｍＬ）を加えて４５℃で30分間攪拌した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて氷浴中で冷却した。これにトリエチルアミン三フッ化水素酸塩（320 μＬ）を加えて４０℃で７５分間攪拌し、化合物（Ｅ８８）を含む反応溶液（5.0 ｇ）を得た。得た反応溶液（4.0ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ88）（0.23 μｍｏｌ）を得た。得た化合物（Ｅ88）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０３８２】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  1088.66  ［Ｍ  −  2Ｈ］２−【０３８３】
実施例３４
ホスホロアミダイト法を用いた５’方向への伸長による核酸オリゴマー（５’−ＡＣＧＵＡＣＧＵ−３’）（化合物（Ｅ９１））の合成
【化１７１】
2014077292.tif 000173
【０３８４】
（１）化合物（Ｅ８７）とホスホロアミダイト化合物とのカップリング反応による核酸オクタマー（化合物（Ｅ８９））の合成
【化１７２】
2014077292.tif 000174
【０３８５】
化合物（E８７）（348.1 mg）と  （２Ｒ,３Ｒ,４Ｒ,５Ｒ）−５−（６−ベンズアミド−９Ｈ−プリン−９−イル）−２−（（ビス（４−メトキシフェニル）（フェニル）メトキシ）メチル）−４−（（ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル）オキシ）テトラヒドロフラン−３−イル（２−シアノエチル）ジイソプロピルホスホロアミダイト（395.3 mg）にトルエン（8.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（1.0 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（115.3 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（4.0 mL）と水（250 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（9 mL）を加えて減圧濃縮し、さらに、アセトニトリル（18 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E８９）（395.8 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３８６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.21 (2 H, br), 6.75-10.56 (42 H, m), 3.34-6.18 (80 H, m), 2.14-2.96 (24 H, m), 1.70-1.81 (9 H, m), 1.40-1.50 (6 H, br m), 1.04-1.39 (120 H, br m), 0.64-0.96 (81 H, m), -0.38-0.22 (48 H, m).【０３８７】
（２）化合物（Ｅ８９）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ９０））の合成
【化１７３】
2014077292.tif 000175
【０３８８】
化合物（Ｅ８９）（57.1  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（250 μＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（20.0 mL）と水（5.0 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、これをメタノールで洗浄して化合物（E９０）（49.2 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３８９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.21 (2 H, br), 7.31-10.52 (27 H, br m), 7.13 (2 H, br), 3.64-6.16 (75 H, br m), 2.46-2.98 (18 H, br m), 2.14-2.29 (6 H, m), 1.66-1.95 (9 H, m), 1.39-1.51 (6 H, br m), 1.07-1.39 (120 H, br m), 0.68-0.96 (81 H, m), -0.35-0.22 (48 H, m).【０３９０】
（３）化合物（Ｅ９０）の脱保護による化合物（Ｅ９１）の合成
【化１７４】
2014077292.tif 000176
【０３９１】
化合物（Ｅ90）（48.3 ｍｇ）をエタノール（1.0 ｍＬ）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（3.0 ｍＬ）を加えて４５℃で20分間攪拌した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて氷浴中で冷却した。これにトリエチルアミン三フッ化水素酸塩（640  μＬ）を加えて４０℃で７５分間攪拌し、化合物（Ｅ91）を含む反応溶液（11.0 ｇ）を得た。得た反応溶液（5.0ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ91）（1.18 μｍｏｌ）を得た。得た化合物（Ｅ91）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０３９２】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  1253.18  ［Ｍ  −  2Ｈ］２−【０３９３】
実施例３５
Ｈ−ホスホネート法を用いた５’方向への伸長による核酸オリゴマー（５’−ｄＴｄＴｄＴｄＴＵ−３’）（化合物（Ｅ１００））の合成
【化１７５】
2014077292.tif 000177
【０３９４】
（１）化合物（Ｅ６７）とホスホネート化合物とのカップリング反応による核酸ダイマー（化合物（Ｅ９２））の合成
【化１７６】
2014077292.tif 000178
【０３９５】
化合物（E67）（153.4 mg）とトリエチルアンモニウム (2R,3S,5R)-2-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-5-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)テトラヒドロフラン-3-イル ホスホネート（106.5 mg）にトルエン（5.0 mL）とピリジン（5.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにピバロイルクロリド（61.6 μL）を加え、室温で75分間攪拌した後、アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した。再度アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した後、これに、アセトニトリル（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E92）（211.4 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３９６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.99, 7.62-7.72 (2 H, s, m), 7.55, 7.50 (1 H, d J = 1.3 Hz, br s), 7.23-7.38 (9 H, m), 7.12-7.20 (2 H, m), 6.82-6.86 (4 H, m), 6.44, 6.35-6.40 (1 H, dd J = 5.5, 8.6 Hz, m), 6.21, 6.22 (1 H, s), 5.82-5.86 ( 2 H, m), 5.22-5.27 (1 H, m), 5.08, 5.01 (1 H, t J = 5.8, t J = 5.2 Hz), 4.21-4.46 (5 H, m), 3.93-4.05 (6 H, m), 3.79 (6 H, br s), 3.51-3.56 (1 H, m), 3.37-3.44 (1 H, m), 2.40-2.82 (6 H, m), 2.13-2.20 (3 H, m), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.40-1.49 (9 H, m), 1.21-1.36 (108 H, br s), 0.85-0.89 (18 H, m), 0.07, 0.07, 0.06 (3 H, s), 0.03, 0.03 (3 H, s).
（２）化合物（Ｅ９２）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ９３））の合成
【化１７７】
2014077292.tif 000179
【０３９７】
化合物（Ｅ９２）（209.4  ｍｇ）に245  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（5.0 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（5.0 mL）を加えて5分間攪拌した。これにアセトニトリル（5.0 mL）を加えて減圧濃縮した。メタノール（4.0 mL）と水（1.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、さらに、メタノール（10 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E９３）（136.0 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０３９８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ7.40-8.25 (3 H, m), 7.12-7.15 (2 H, m), 6.11-6.28 (2 H, m), 5.80-5.93 ( 2 H, m), 5.25, (1 H, br m), 5.13, 5.10 (1 H, t J = 5.4 Hz, t J = 5.4 Hz), 4.46-4.48 (1 H, m), 4.14-4.42 (4 H, m), 3.78-4.06 (9 H, m), 2.42-2.87 (6 H, m), 2.20, 2.19 (3 H, s, s), 1.93, 1.92 (3 H, br d J = 1.2 Hz, br d J = 1.2 Hz), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.41-1.48 (6 H, m), 1.21-1.37 (108 H, br s), 0.85-0.90 (18 H, m), 0.07, 0.06 (3 H, s), 0.04 (3 H, s).
（３）化合物（Ｅ９３）とホスホネート化合物とのカップリング反応による核酸トリマー（化合物（Ｅ９４））の合成
【化１７８】
2014077292.tif 000180
【０３９９】
化合物（E93）（132.0 mg）とトリエチルアンモニウム (2R,3S,5R)-2-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-5-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)テトラヒドロフラン-3-イル ホスホネート（106.5 mg）にトルエン（5.0 mL）とピリジン（5.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにピバロイルクロリド（61.6 μL）を加え、室温で75分間攪拌した後、アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した。再度アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E94）（170.9 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４００】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.12-8.53 (16 H, m), 6.82-6.86 (4 H, m), 5.79-6.45 (6 H, m), 5.00-5.33 (3 H, m), 3.37-4.49 (22 H, m), 2.38-2.88 (8 H, m), 2.16-2.20 (3 H, m), 1.87-1.91 (3 H, br m), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.38-1.49 (9 H, m), 1.22-1.36 (108 H, br s), 0.85-0.89 (18 H, m), 0.02-0.08, (6 H, m).
（４）化合物（Ｅ９４）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ９５））の合成
【化１７９】
2014077292.tif 000181
【０４０１】
化合物（Ｅ９４）（161.7  ｍｇ）に245  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（5.0 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（5.0 mL）を加えて5分間攪拌した。アセトニトリル（15 mL）を加えて減圧濃縮した。メタノール（4.0 mL）と水（1.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（10 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E９５）（129.3 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４０２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.12-8.77 (7 H, m), 5.77-6.32 (6 H, m), 5.23-5.34 (2 H, br), 5.08-5.14 (1 H, m), 3.38-4.51 (17 H, m), 2.36-2.87 (8 H, m), 2.18-2.20 (3 H, m), 1.88-1.94 (6 H, m), 1.69-1.83 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.19-1.35 (108 H, br s), 0.84-0.90 (18 H, m), 0.03-0.08, (6 H, m).
（５）化合物（Ｅ９５）とホスホネート化合物とのカップリング反応による核酸テトラマー（化合物（Ｅ９６））の合成
【化１８０】
2014077292.tif 000182
【０４０３】
化合物（E95）（121.5 mg）とトリエチルアンモニウム (2R,3S,5R)-2-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-5-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)テトラヒドロフラン-3-イル ホスホネート（106.5 mg）にトルエン（5.0 mL）とピリジン（5.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにピバロイルクロリド（61.6 μL）を加え、室温で75分間攪拌した後、これにアセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した。再度アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E96）（146.8 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４０４】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.12-9.98 (18 H,br m), 6.81-6.87 (4 H, m), 5.75-6.45 (7 H,br m), 5.06-5.43 (4 H,br m), 3.32-4.54 (26 H, br m), 2.32-2.88 (10 H, br m), 2.16-2.21 (3 H, m), 1.60-1.94 (12 H, br m), 1.06-1.49 (117 H, m), 0.80-0.90 (18 H, m), 0.03-0.08 (6 H, m).
（６）化合物（Ｅ９６）の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ９７））の合成
【化１８１】
2014077292.tif 000183
【０４０５】
化合物（Ｅ９６）（128.8  ｍｇ）に245  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（5.0 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（5.0 mL）を加えて5分間攪拌した。アセトニトリル（15 mL）を加えて減圧濃縮した。メタノール（4.0 mL）と水（1.0 mL）を加えて減圧濃縮した後、メタノール（10 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E９７）（95.4 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４０６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.11-8.77 (9 H, br m), 5.72-6.30 (7 H, br m), 5.07-5.39 (4 H, br m), 3.70-4.51 (21 H,br m), 2.38-2.88 (10 H, br m), 2.17-2.21 (3 H, m), 1.83-1.94 (9 H, m), 1.69-1.82 (6 H, m), 1.40-1.49 (6 H, m), 1.19-1.38 (108 H, br s), 0.83-0.90 (18 H, m), 0.03-0.12, (6 H, m).
（７）化合物（Ｅ９７）とホスホネート化合物とのカップリング反応による核酸ペンタマー（化合物（Ｅ９８））の合成
【化１８２】
2014077292.tif 000184
【０４０７】
化合物（E97）（65.9 mg）とトリエチルアンモニウム (2R,3S,5R)-2-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-5-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)テトラヒドロフラン-3-イル ホスホネート（106.5 mg）にトルエン（5.0 mL）とピリジン（5.0 mL）を室温で加えて攪拌した。これにピバロイルクロリド（61.6 μL）を加え、室温で75分間攪拌し後、アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した。これに再度アセトニトリル（20 mL）を加えて減圧濃縮した後、アセトニトリル（40 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E98）（81.3 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４０８】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.12-9.69 (20 H, br m), 6.81-6.86 (4 H, m), 5.78-6.44 (8 H, br m), 5.06-5.42 (5 H, br m), 3.34-4.53 (30 H, br m), 2.34-2.87 (12 H, br m), 2.17-2.20 (3 H, m), 1.70-1.94 (15 H, br m), 1.07-1.49 (117 H, m), 0.81-0.90 (18 H, m), 0.02-0.12 (6 H, m).
（８）化合物（Ｅ９８）の亜リン酸エステルの酸化反応によるＰ−ＯＨ体（化合物（Ｅ９９））の合成
【化１８３】
2014077292.tif 000185
【０４０９】
化合物（E98）（44.8 mg）にTHF（2.0 mL）と0.1 M I2/ピリジン溶液（4.0 mL）と水 （150 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリルを加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E99）（45.6 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４１０】
（９）化合物（Ｅ９９）の脱保護による化合物（化合物（Ｅ１００））の合成
【化１８４】
2014077292.tif 000186
【０４１１】
化合物（Ｅ99）（40.5  ｍｇ）に245  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（2.0ｍＬ）とトルエン（1.0 mL）、THF（1.0 mL）を加えて室温で10分間攪拌した後、メタノール（2.0 mL）を加えて室温で5分間攪拌した。これにメタノール（10 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して生成物（34.3 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。得た生成物（27.3 ｍｇ）をエタノール（1.0 ｍＬ）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（3.0 ｍＬ）を加えて４５℃で20分間攪拌した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて氷浴中で冷却した。これにトリエチルアミン三フッ化水素酸塩（640  μＬ）を加えて４０℃で７５分間攪拌し、化合物（Ｅ100）を含む反応溶液（12.3 ｇ）を得た。得た反応溶液（5.7ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ100）（2.09 μｍｏｌ）を得た。得た化合物（Ｅ100）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０４１２】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  1459.25  ［Ｍ  −  Ｈ］−【０４１３】
実施例３６
ブロック合成法を用いた５’−側ブロック核酸オリゴマー（５’−ＣＧＵ−３’）と３’−側ブロック核酸オリゴマー（５’−ＡＣＧＵ−３’）からの核酸オリゴマー（５’−ＣＧＵＡＣＧＵ−３’）（化合物（Ｅ８８））の合成
【化１８５】
2014077292.tif 000187
【０４１４】
（１）５’−側ブロック核酸トリマー（５’−ＣＧＵ−３’）（化合物（Ｅ７８））の３’−ＯＨ体（化合物（Ｅ１０１））の合成
【化１８６】
2014077292.tif 000188
【０４１５】
化合物（E７８）（880.2 mg）をTHF（5.0 mL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（5.0 mL）を加えた。溶液を０℃に冷却した後、ヒドラジン1水和物（17.5 μL）を加えて０℃で120分間攪拌し、これに2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（5.0 mL）を加えて室温で60分間攪拌した。反応液にアセチルアセトン（200 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。室温でメタノールを加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E１０１）（768.4 mg）を得た。【０４１６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 12.25-12.20 (1 H, br), 10.45, 10.36, 10.01, 10.28, 10.26 (1 H, br, br, br, br), 8.65 (1 H, br), 8.32, 8.26, 8.21, 8.15 (1 H, d J = 6.9 Hz, d J = 6.9 Hz, d J = 7.9 Hz, d J = 7.6 Hz), 7.61-7.87 (2 H, m), 7.23-7.39 (9 H, m), 7.12-7.15 (2 H, m), 6.98-7.05 (1 H, m), 6.83-6.88 (4 H, m), 5.68-6.23 (4 H, m), 3.93-5.14 (23 H, m),3.40-3.83 (8 H, m), 2.39-2.91 (6 H, m), 2.16-2.25 (3 H, s), 1.70-1.84 (6 H, m), 1.39-1.51 (6 H, m), 1034-1.38 (114 H, br m), 0.86-0.93 (27 H, m), 0.75-0.79 (9 H, s), 0.10-0.21 (12 H, s), -0.06-0.03 (3 H, s), -0.27-0.18 (3 H, s). 【０４１７】
（２）５’−側ブロック核酸トリマー（５’−ＣＧＵ−３’）（化合物（Ｅ１０１））と３’−側ブロック核酸オリゴマー（５’−ＡＣＧＵ−３’）（化合物（Ｅ８１））とのカップリング反応による化合物（Ｅ８８）の合成
【化１８７】
2014077292.tif 000189
【０４１８】
化合物（Ｅ101）（170.2 ｍｇ）をクロロホルム（1.8  ｍＬ）に溶解し、２，４，６−トリメチルピリジン（40.0 μＬ）と１−メチルイミダゾール（2.9 μＬ）、２−シアノエチルジイソプロピルクロロホスホロアミジド（40.2 μＬ）を加え、室温で１時間攪拌した。これに化合物（E81）（64.6 mg）とアセトニトリル（900 μL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（104.0 mg）を加え、室温で2.5時間攪拌した。さらに反応液を50 ℃に加熱して2時間攪拌した後、反応液を室温へと冷却して0.1 M I2/ピリジン溶液（1.8 mL）と水（113 μL）を加えて室温で15分間攪拌した。これにアセトニトリルを加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して生成物（246.0 mg）を得た。この生成物（23.1 mg）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（300 μＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（1.7 mL）を加えて5分間攪拌した。析出した生成物を遠心沈降により回収（26.2 mg）した。回収した生成物（20.1 mg）をエタノール（1.0 ｍＬ）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（3.0 ｍＬ）を加えて４５℃で20分間攪拌した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて氷浴中で冷却した。これにトリエチルアミン三フッ化水素酸塩（640  μＬ）を加えて４０℃で７５分間攪拌し、化合物（Ｅ88）を含む反応溶液（12.0 ｇ）を得た。得た反応溶液（11.3ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ88）（0.18 μｍｏｌ）を得た。得た化合物（Ｅ88）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０４１９】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  1088.66  ［Ｍ  −  2Ｈ］２−【０４２０】
実施例３７
ブロック合成法による収束的な合成法を用いたブロック核酸オリゴマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）からの核酸オリゴマー（５’−ｄＴｄＴｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１０６））の合成
【化１８８】
2014077292.tif 000190
【０４２１】
（１）５’−側ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１９））の３’−ＯＨ体（化合物（Ｅ１０４））の合成
【化１８９】
2014077292.tif 000191
【０４２２】
化合物（E１９）（477.1 mg）をトルエン（4.2 mL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（4.2 mL）を加えて0 ℃に冷却した。これにヒドラジン1水和物（14.6 μL）を加えて0 ℃で120分間攪拌し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（4.2 mL）を加えてさらに60分間室温で攪拌した後、アセチルアセトン（200 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。これにメタノールを加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取してメタノールで洗浄して化合物（E１０４）（401.2 mg）を得た。【０４２３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.65, 8.50 (1 H, br, br s), 7.57, 7.55 (1 H, br d J =1.3 Hz, br d J = 1.0 Hz), 7.23-7.38 (10 H, m), 7.14, 7.12 (2 H, br, br s), 6.83-6.87 (4 H, m), 6.35-6.42 (1 H,m), 6.20-6.25 (1 H, m), 5.12-5.18 (1 H, m), 4.51-4.56, 4.43-4.48 (1 H, m), 4.15-4.37 (5 H, m), 3.93-4.08 (8 H, m), 3.77-3.80 (6 H, m), 3.53-3.58 (1 H, m), 3.38-3.42, (1 H, m), 2.23-2.94 (6 H, m), 1.92-1.99 (3 H, m), 1.69-1.82 (6 H, m), 1.40-1.49 (9 H, m), 1.10-1.38 (84 H, m), 0.85-0.90 (9 H, m).【０４２４】
（２）５’−側ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１０４））の３’−ホスホロアミダイト体（化合物（Ｅ１０５））の合成
【化１９０】
2014077292.tif 000192
【０４２５】
化合物（Ｅ１０４）（23.5  ｍｇ）をジクロロメタン（5.2  ｍＬ）に溶解し、２，４，６−トリメチルピリジン（155 μＬ）と１−メチルイミダゾール（6.2 μＬ）、２−シアノエチルジイソプロピルクロロホスホロアミジド（87.0  μＬ）を加え、室温で１時間攪拌した。アセトニトリルを加えて濃縮した後、吸引ろ過により化合物（E105）（250.9 mg）をジアステレオマー混合物として得た。【０４２６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.06 (1 H, br), 7.10-7.70 (11 H, m), 7.11,-7.18 (2 H, m), 6.82-6.86 (4 H, m), 6.22-6.46 (2 H, m), 5.19 (1 H, br), 3.37-4.60 (25 H, m), 2.16-2.85 (8 H, m), 1.91-1.97 (3 H, m), 1.68-1.82 (6 H, m), 1.12-1.50 (105 H, m), 0.85-0.90 (9 H, m).【０４２７】
（３）５’−側ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１０４））と３’−側ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ２０））とのカップリング反応による（化合物（Ｅ１０６））の合成
【化１９１】
2014077292.tif 000193
【０４２８】
化合物（E２０）（16.1 mg）と  化合物（E105）（80.5 mg）にトルエン（300 μL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（100 μL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（11.5 mg）を加え、室温で5時間攪拌した。0.1 M I2/ピリジン溶液（400 μL）と水（25 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（20 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して生成物（90.8 mg）を得た。得られた生成物（30.2 mg）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（500  μＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノールを加えて0℃に冷却し、析出した生成物（29.3 mg）を遠心沈降により回収した。回収した生成物（11.0 ｍｇ）をエタノール（500 μL）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（1.5 ｍＬ）を加えて４５℃で20分間攪拌した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて化合物（Ｅ106）を含む反応溶液（5.8 ｇ）を得た。この反応溶液（5.3 ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ106）（32.2 nmol）を得た。得た化合物（Ｅ106）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０４２９】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  1153.22  ［Ｍ  −  Ｈ］−【０４３０】
実施例３８
ブロック合成法による収束的な合成法を用いたブロック核酸オリゴマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）からの核酸オリゴマー（５’−ｄＴｄＴｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１０６））の合成
【化１９２】
2014077292.tif 000194
【０４３１】
（１）ｄＴ型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ５６））からの核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ７４））の合成
【化１９３】
2014077292.tif 000195
【０４３２】
化合物（E56）（233 mg）と5’-O-(4, 4’-ジメトキシトリチル)-2’-デオキシチミジン-N, N’-ジイソプロピルアミノシアノエチルホスホロアミダイト（233 mg）にトルエン（5 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（750 μL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（87 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。0.1 M I2ピリジン溶液（3 mL）と水（188 μL）を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリルを加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E74）（326 mg、収率89％）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４３３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.30, 8.10 (1 H, br, br s), 7.46-7.56 (2 H, m), 7.35-7.38 (2 H, m), 7.24-7.33 (7 H, m), 7.17, 7.14 (2 H, br, br s), 6.82-6.86 (4 H, m), 6.42, 6.38 (1 H, dd J = 5.5, 8.7 Hz, dd J = 8.7, 8.3 Hz), 6.32 (1 H, br), 5.16-5.31 (2 H, m), 4.15-4.38 (6 H, m), 3.96-4.05 (6 H, m), 3.80, 3.79 (6 H, s), 3.54-3.57 (1 H, m), 3.38-3.42, (1 H, m), 2.44-2.81 (9 H, m), 2.19-2.31 (1 H, m), 2.17 (3 H, d J = 1.9 Hz), 1.96 (3 H, m), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.41-1.48 (9 H, m), 1.23-1.35 (72 H, m), 0.88 (9 H, t, J = 6.9 Hz).【０４３４】
（２）ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ７４））の３’−ＯＨ体（化合物（Ｅ１０２））の合成
【化１９４】
2014077292.tif 000196
【０４３５】
化合物（E７４）（200.1 mg）をトルエン（1.9 mL）に溶解し、2,4,6-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（1.9  mL）を加えて0℃に冷却した。ヒドラジン1水和物（6.7 μL）を加えて0℃で120分間攪拌した後、トルエン（1.9 mL）と2,4,16-トリメチルピリジン/酢酸（4/1）溶液（1.9 mL）を加えて室温で60分間攪拌した。アセチルアセトン（100 μL）を加えて室温で5分間攪拌した。室温でメタノールを加えて攪拌した後、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E１０２）（180.0 mg）を得た。【０４３６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.31, 8.16 (1 H, br, br s), 7.57, 7.55 (1 H, br, br d J = 1.0 Hz), 7.23-7.38 (10 H, m), 7.14, 7.12 (2 H, br, br s), 6.85 (4 H, d J = 8.5 Hz), 6.35-6.42 (1 H,m), 6.19-6.24 (1 H, m), 5.13-5.17 (1 H, m), 4.53-4.55, 4.44-4.49 (1 H, m), 4.16-4.36 (5 H, m), 3.94-4.06 (8 H, m), 3.80 (6 H, s), 3.54-3.57 (1 H, m), 3.38-3.42, (1 H, m), 2.24-2.79 (6 H, m), 1.95 (3 H, s), 1.70-1.81 (6 H, m), 1.41-1.48 (9 H, m), 1.22-1.36 (72 H, m), 0.88 (9 H, t, J = 6.9 Hz).【０４３７】
（３）ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ７４））の５’−ＯＨ体（化合物（Ｅ１０３））の合成
【化１９５】
2014077292.tif 000197
【０４３８】
化合物（Ｅ７４）（127.5  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（1.8 ｍＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（1.8  mL）を加えて5分間攪拌した。メタノール（20 mL）0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E１０３）（97.6 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４３９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 8.30, 8.04 (1 H, br, s), 7.50, 7.47 (1 H, br, s), 7.41-7.42 (1 H, m), 7.15, 7.13 (2 H, s, s), 6.32 (1 H, m), 6.11-6.20 (1 H, m), 5.33-5.34, 5.27-5.30 (1 H, m), 5.17-5.21 (1 H, m), 4.29-4.41 (4 H, m), 4.21-4.25 (2 H, m), 3.97-4.05 (6 H, m), 3.80-3.94 (2 H, m), 2.72-2.86 (5 H, m), 2.47-2.62 (5 H, m), 2.33 (1 H, br), 2.20, 2.19 (3 H, d J = 2.2 Hz), 2.02, 2.00 (3 H, br s, br d J = 0.6 Hz), 1.92-1.93 (3 H, m),1.80-1.82 (6 H, m), 1.42-1.48 (6 H, m), 1.23-1.35 (72 H, m), 0.88 (9 H,m).【０４４０】
（３）ブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１０２））とブロック核酸ダイマー（５’−ｄＴｄＴ−３’）（化合物（Ｅ１０３））とのカップリング反応による化合物（Ｅ１０６）の合成
【化１９６】
2014077292.tif 000198
【０４４１】
化合物（Ｅ102）（34.5 ｍｇ）をクロロホルム（600  μＬ）に溶解し、２，４，６−トリメチルピリジン（13.3 μＬ）と１−メチルイミダゾール（1.0 μＬ）、２−シアノエチルジイソプロピルクロロホスホロアミジド（13.4 μＬ）を加え、室温で１時間攪拌した。これに化合物（E103）（15.2 mg）とアセトニトリル（300 μL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（34.7 mg）を加え、室温で4時間攪拌した後、0.1 M I2/ピリジン溶液（600 μL）と水1(37.5 μL）を加えて室温で15分間攪拌した。これにアセトニトリルを加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して生成物（51.9 mg）を得た。この生成物（26.7 mg）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（300 μＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノールを加えて5分間攪拌した。析出した生成物を遠心沈降により回収（24.9 mg）した。回収した生成物（17.3 mg）をエタノール（1.0 ｍＬ）中にけん濁し、４０％メチルアミン水溶液（3.0 ｍＬ）を加えて４５℃で20分間反応した後、固体成分をフィルターろ過により除いた。残渣をジメチルスルホキシドで洗浄し、洗液をろ液と合わせて化合物（Ｅ106）を含む反応溶液（11.4 ｇ）を得た。得た反応溶液（10.7ｇ）を陰イオン交換クロマトグラフィーを用いて精製し、化合物（Ｅ106）（0.79 μｍｏｌ）を得た。得た化合物（Ｅ106）についてＨＰＬＣ及びＥＳＩ−ＭＳにより同定した。【０４４２】
ＬＣ−ＥＳＩ−ＭＳ  ｍ／ｚ  1153.22  ［Ｍ  −  Ｈ］−【０４４３】
実施例３９
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ７０）の合成
【化１９７】
2014077292.tif 000199
【０４４４】
化合物（E65）（256 mg）と5’-O-(4, 4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-t-ブチルジメチルシリル-グアノシン-N2-イソブチリル-N, N’-ジイソプロピルシアノエチルホスホロアミダイト（485 mg）にジクロロメタン（10 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（1.5 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（135 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、アセトニトリル（60 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E70）（347 mg、収率81％）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４４５】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)δ 12.21, 12.14 (1 H, br s), 10.14, 9.88 (1 H, br), 8.30, 8.15 (1 H, br, br d J = 8.3 Hz), 7.93, 7.87 (1 H, s), 7.42-7.47 (2 H, m), 7.30-7.36 (6 H, m), 7.24-7.27 (1 H, m), 7.13, 7.12 (2 H, m), 6.84-6.87 (4 H, m), 6.42, 6.22 (1 H, d J = 8.4, d J = 7.9 Hz), 5.87-6.01 (1 H, d J = 3.9 Hz, d, J = 2.5 Hz), 5.93, 5,95 (1 H, d J = 8.9 Hz, d J = 7.4 Hz), 5.19, 5.13 (1 H, t J = 4.9 Hz, dd J = 4.5, 7.0 Hz), 4.66-4.72 (1 H, m), 4.51-4.60 (1 H, m), 3.76-4.42 (19 H, br m), 3.50-3.58 (1 H, m), 3.37-3.41 (1 H, m), 2.65-2.86 (4 H, m), 2.50-2.60, (2 H, m), 2.12-2.20 (4 H, m), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.39-1.48 (6 H, br m), 1.22-1.35 (72 H, br m), 0.76-0.89 (33 H, m), 0.11, 0.08 (3 H, s), 0.04, 0.02 (3 H, m), -0.04, -0.05 (3 H, s), -0.27, -0.28 (3 H, s). 【０４４６】
実施例４０
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ７１）の合成
【化１９８】
2014077292.tif 000200
【０４４７】
化合物（E70）（344 mg）に0.02 M ヨウ素/ピリジン溶液（8 mL）と水（400 μL）を加えて室温で15分間攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、アセトニトリル（40 mL）を加えて0 ℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取して化合物（E71）（218 mg、収率63％）をジアステレオマーの混合物として得た。
1H NMR (500 MHz, CDCl3)δ 12.19, 12.14 (1 H, s), 10.15, 9.57 (1 H, br), 8.03, 7.85 (1 H, br d J = 8.7 Hz, br d J = 7.9 Hz), 7.94, 7.93, (1 H, s), 7.40-7.47 (2 H, m), 7.23-7.37 (7 H. m), 7.13 (2 H, br), 6.82-6.87 (4 H, m), 6.39, 6.23 (1 H, d, J = 8.3, 8.3 Hz), 5.87-5.96 (2 H, m), 4.72-5.18 (3 H, br m), 3.90-4.56 (13 H, br m), 3.79-3.80 (6 H, m), 3.27-3.64 (2 H, m), 2.45-2.90 (6 H, m), 1.95-2.20 (4 H, br), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.45 (6 H, br m) 1.23-1.34 (72 H, br m), 0.75-0.91 (33 H, m), 0.12, 0.10 (3 H, s), 0.04, 0.02 (3 H, s), 0.01, -0.03 (3 H, s), -0.16, -0.24 (3 H, s).【０４４８】
実施例４１
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ７２）の合成
【化１９９】
2014077292.tif 000201
【０４４９】
化合物（E66）（133 mg）と5’-O-(4, 4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-t-ブチルジメチルシリル-グアノシン-N2-イソブチリル-N, N’-ジイソプロピルシアノエチルホスホロアミダイト（267 mg）にジクロロメタン（10 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（1.5 mL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（135 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、アセトニトリル（60 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E72）（181 mg、収率79％）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４５０】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)δ 12.20, 12.13 (1 H, br s), 10.15, 9.84 (1 H, br), 8.31, 8.13 (1 H, br, br d J = 7.7 Hz), 7.93, 7.87 (1 H, s), 7.43-7.46 (2 H, m), 7.24-7.36 (7 H, m), 7.01, 7.00 (2 H, br d J = 2.3 Hz, br d J = 2.1 Hz), 6.84-6.87 (4 H, m), 6.69-6.71 (1 H, m), 6.43, 6.22 (1 H, d J = 8.2 Hz, d J = 8.4 Hz), 5.83-6.04 (2 H, m), 5.31-5.21 (1 H, m), 4.64-4.71 (1 H, m), 4.52-4.60 (1 H, m), 3.76-4.41 (17 H, br m), 3.50-3.58 (1 H, m), 3.37-3.41 (1 H, m), 2.50-2.87 (6 H, m), 2.10-2.20, (4 H, m), 1.71-1.78 (4 H, m), 1.39-1.44 (4 H, br m), 1.22-1.35 (72 H, br m), 0.76-0.89 (30 H, m), 0.12, 0.09 (3 H, s), 0.04, 0.03 (3 H, s), -0.03, -0.05 (3 H, s), -0.27, (3 H, br).【０４５１】
実施例４２
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ７３）の合成
【化２００】
2014077292.tif 000202
【０４５２】
化合物（E72）（159 mg）に0.02 M ヨウ素/ピリジン溶液（3.8 mL）と水（192 μL）を加えて室温で15分間攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、アセトニトリル（50 mL）を加えて0 ℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取して化合物（E73）（141 mg、収率88％）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４５３】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)δ 12.17, 12.13 (1 H, s), 10.06, 9.56 (1 H, br), 8.02, 7.82 (1 H, br d J = 8.0 Hz, br d J = 8.9 Hz), 7.94, 7.93, (1 H, s), 7.40-7.47 (2 H, m), 7.24-7.37 (7 H. m), 7.00-7.02 (2 H, m), 6.82-6.86 (4 H, m), 6.69-6.71 (1 H, m), 6.38, 6.23 (1 H, d, J = 8.2 Hz, d J = 8.1 Hz), 5.87-5.96 (2 H, m), 4.71-5.20 (3 H, br m), 3.90-4.59 (11 H, m), 3.79-3.80 (6 H, m), 3.27-3.64 (2 H, m), 2.46-2.88 (6 H, m), 2.20 (3 H, s), 1.95-2.15 (1 H, br m), 1.72-1.79 (4 H, m), 1.39-1.45 (4 H, br m), 1.20-1.35 (72 H, br m), 0.76-0.89 (30 H, m), 0.12, 0.10 (3 H, s), 0.05, 0.03 (3 H, s), 0.01, -0.04 (3 H, s), -0.15, -0.24 (3 H, s).【０４５４】
実施例４３
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ７５）の合成
【化２０１】
2014077292.tif 000203
【０４５５】
化合物（E67）（174mg）と5’-O-(4, 4’-ジメトキシトリチル)-2’-O-t-ブチルジメチルシリル-グアノシン-N2-イソブチリル-N, N’-ジイソプロピルシアノエチルホスホロアミダイト（194 mg）にトルエン（2.5 mL）を室温で加えて攪拌した。これにアセトニトリル（500 μL）に溶解した5-ベンジルメルカプト-1H-テトラゾール（58 mg）を加え、室温で2時間攪拌した。2,4,6-トリメチルピリジン（1 mL）に溶解したビス（フェニルアセチル）ジスルフィド（67 mg）を加えて室温で30分間攪拌した後、アセトニトリル（50 mL）を加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E75）（233 mg、収率96％）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４５６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3)δ 12.17, 12.15 (1 H, s), 10.13, 9.86 (1 H, br), 8.13, 8.01 (1 H, d J = 8.0 Hz, br), 7.97, 7.94, (1 H, s), 7.43-7.49 (2 H, m), 7.29-7.39 (6 H. m), 7.23-7.28 (1 H, m), 7.14, 7.12 (2 H, br), 6.84-6.88 (4 H, m), 6.42, 6.24 (1 H, d, J = 8.3, 8.6 Hz), 5.85-5.96 (2 H, m), 5.17-5.20 (1 H, m), 5.07, 4.95 (1 H, dd J = 11.1, 5.3 Hz, dd J = 4.5, 7.5 Hz), 4.86-4.89, 4.74-4.77 (1 H, br m, br m), 3.75-4.52 (19 H, br m), 3.30-3.60 (2 H, m), 2.49-2.88 (6 H, m), 1.99-2.25 (4 H, br), 1.70-1.82 (6 H, m), 1.43-1.49 (6 H, br m) 1.21-1.35 (108 H, br m), 0.72-0.89 (33 H, m),0.12 (3 H, br), 0.04, 0.02 (3 H, br s), -0.03, -0.05 (3 H, s), -0.21, -0.26 (3 H, s).【０４５７】
実施例４４
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ１１８）の合成
【化２０２】
2014077292.tif 000204
【０４５８】
ジクロロ亜リン酸メチル（48.2 μL）を-78℃に冷却したTHF（500 μL）に加え、そこに１−（（２Ｒ,４Ｓ,５Ｒ)−５−((ビス(４‐メトキシフェニル)（フェニル）メトキシ)メチル)−4−ヒドロキシテトラヒドロフラン−２−イル)−５−メチルピリミジン−２,４（１Ｈ,３Ｈ）−ジオン（326.8 mg）と2,4,6-トリメチルピリジン（191.6 μL）をTHF（4.4 mL）に溶解した溶液を30分かけて-78℃下で滴下し、そのままさらに40分間攪拌した。これに化合物（E67）（43.5 mg）と2,4,6-トリメチルピリジン（10.6 μL）をTHF（350 μL）に溶解した溶液を加えて-78℃で2.5時間攪拌した後、室温下でさらに2時間攪拌した。この反応液にヨウ素（126.9 mg）と水（312μL）をピリジン（5 mL）に溶解した溶液を加えて室温で15分間攪拌した後、アセトニトリル（30 mL）加えて0℃に冷却し、析出した固体を吸引ろ過によりろ取し、アセトニトリルで洗浄して化合物（E118）（45.5 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４５９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 7.62-8.26 (2 H, br m), 7.57, 7.52 (1 H, br d J = 1.18 Hz, br s), 7.23-7.39 (9 H, m), 7.14, 7.19 (2 H, s, br s), 6.83-6.86 (4 H, m), 6.37-6.43 (1 H, m), 5.86-5.91 (2 H, m), 5.07-5.26 (2 H, m), 4.17-4.44 (5 H, m), 3.94-4.07 (6 H, m), 3.79-3.80 (9 H, m), 3.50-3.56 (1 H, m), 3.37-3.43 (1 H, m), 2.40-2.85 (6 H, m), 2.16, 2.14 (3 H, s), 1.69-1.82 (6 H, m), 1.40-1.49 (9 H, br m), 1.20-1.36 (108 H, br m),  0.86-0.90 (18 H, m), 0.02-0.07 (6 H, m).【０４６０】
実施例４５
核酸オリゴマーの合成におけるダイマー中間体（Ｅ１１９）の合成
【化２０３】
2014077292.tif 000205
【０４６１】
化合物（Ｅ118）（10.8  ｍｇ）に４９０  ｍＭトリクロロ酢酸／トルエン溶液（300 μＬ）を加えて室温で１０分間攪拌した後、メタノール（20.0 mL）と水（2.0 mL）を加えて0℃に冷却し、析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E119）（6.6 mg）をジアステレオマーの混合物として得た。【０４６２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ8.30, 8.16, 7.80, 7.71, 7.64, 7.42 (3 H, br, br, br, d J = 8.3 Hz, br d J = 8.3 Hz, dd J = 7.4, 0.9 Hz), 7.15, 7.13 (2 H, s), 6.18, 6.14 (1 H, t J = 7.3 Hz, br t J = 6.6 Hz), 5.84-5.94 (2 H, m), 5.10-5.17 (2 H, m), 4.43 (1 H, t J = 4.5 Hz), 4.20-4.41 (4 H, m), 3.78-4.06 (12 H, m), 2.47-2.86 (6 H, m), 2.19, 2.20 (3 H, s), 1.92 (3 H, dd J = 3.5, 1.0 Hz), 1.70-1.83 (6 H, m), 1.41-1.48 (6 H, m), 1.19-1.37 (108 H, br m), 0.86-0.89 (18 H, m), 0.07, 0.07 (3 H, s, s), 0.04 (3 H, s).【０４６３】
実施例４６
３個のオクタデシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１２１））の合成【０４６４】
（１）Ｃ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ１２０））の合成
【化２０４】
2014077292.tif 000206
【０４６５】
100-mLナス型フラスコにN-(1-((2R,3R,4R,5R)-5-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)-4-ヒドロキシ-3-メトキシテトラヒドロフラン-2-イル)-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル)アセトアミド (3.00 g, 4.99 mmol), DMAP (56 mg, 0.49 mmol), THF (30 mL)を量って溶解した後、Levrinic acid (0.87 g, 7.48 mmol)を添加した。WSC.HCl (1.43 g, 7.48 mmol)を添加し、そのまま2.0 h撹拌した。THFを減圧下にて留去した後、EtOAc (40 mL)と0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (30 mL)を加え、分液した。有機層に0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (30 mL)を再度添加し、分液した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、濾過した。有機層を減圧下にて濃縮し、乾固すると化合物（E120）(収量 3.41 g, 収率 97.7%)が得られた。【０４６６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 2.19 (3H, s), 2.25 (3H, s), 2.57-2.63 (2H, m), 2.71-2.78 (2H, m), 3.43 (1H, dd, J = 11.3, 2.2 Hz), 3.57 (3H, s), 3.67 (1H, dd, J = 11.7, 2.5 Hz), 3.82 (6H, s), 
4.08 (1H, dd, J = 4.7, 1.3 Hz), 4.33 (1H, dt, J = 8.6, 2.2 Hz), 5.12 (1H, dd, 8.8, 5.0 Hz), 6.05 (1H, d, J = 1.3 Hz), 6.83-6.90 (4H, m), 7.12 (1H, d, J = 7.3 Hz), 7.24-7.36 (7H, m), 7.36-7.40 (2H, m), 8.48 (1H, d, J = 7.5 Hz), 9.51 (1H, brs).【０４６７】
（２）３個のオクタデシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１２１））の合成
【化２０５】
2014077292.tif 000207
【０４６８】
100-mL ナス型フラスコに化合物（E120）(0.822 g相当, 1.06 mmol), i-Pr2NEt (0.682 g, 5.29 mmol), pyridine (7.5 mL)を量り、溶解した。室温でTMSCl (0.23 mL), 3,4,5-トリ(オクタデシロキシ)安息香酸クロライド (0.50 g相当)を順に添加した。この混合物を外温60 oCにて3時間撹拌した。室温に冷却した後、morpholine (1.40 mL)を添加し、室温で2 h撹拌した。MeOH (50 mL)を滴下し、得られた懸濁液を室温で0.5 h撹拌した後、吸引濾取した。濾取した紛体をMeOH (50 mL)で洗浄した。得られた紛体を減圧下、室温で18 h乾燥した後、移動相にトルエン/ピリジン（50/1）を用いてカラムクロマト精製し、化合物（E121）（0.400 g、収率48%）を得た。【０４６９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (9H, t, J = 7.0 Hz), 1.19-1.41 (84H, m), 1.43-1.53 (6H, m), 1.69-1.78 (2H, m), 1.79-1.88 (4H, m), 2.19 (3H, s), 2.59-2.65 (2H, m), 2.69-2.82 (2H, m), 3.45 (1H, dd, J = 11.3, 2.2 Hz), 3.59 (3H, s), 3.67 (1H, dd, J = 11.7, 1.3 Hz), 3.83 (6H, s), 3.98-4.06 (6H, m), 4.13 (1H, dd, J = 5.0, 1.5 Hz), 4.34 (1H, brd, J = 8.2 Hz), 5.17 (1H, dd, J =8.0, 1.5 Hz), 6.09 (1H, d, J = 1.3 Hz), 6.88 (4H, dd, J = 9.1, 2.2 Hz), 7.06 (1H, brs), 7.24-7.28 (2H, m), 7.30 (4H, dd, 8.8, 3.5 Hz), 7.34 (2H, t, J = 7.6 Hz), 7.37-7.42 (3H, m), 8.51 (1H, brs), 8.58 (1H, brs).【０４７０】
実施例４７
３個のオクタデシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１２３））の合成
【化２０６】
2014077292.tif 000208
【０４７１】
50-mL ナス型フラスコに化合物（E121） (0.400 g)を量り、そこにトルエン (4 mL)を加え、溶解した。トリクロロ酢酸（0.417 g）を加えて室温で10分間攪拌した後、メタノール（8 mL）を加えて攪拌した。反応液を減圧濃縮した後、メタノール（20 mL）を加えて0℃に冷却した。析出物を吸引ろ過によりろ取し、メタノールで洗浄して化合物（E123）（0.32 g, 収率99％）を得た。【０４７２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (9H, t, J = 7.0 Hz), 1.19-1.41 (84H, m), 1.43-1.53 (6H, m), 1.69-1.78 (2H, m), 1.79-1.88 (4H, m), 2.00-3.20 (1H, brs), 2.20 (3H, s), 2.60-2.72 (2H, m), 2.73-2.87 (2H, m), 3.54 (3H, s), 3.80 (1H, dd, J = 12.9, 1.9 Hz), 3.95-4.11 (7H, m), 4.30 (1H, brd, J = 6.0 Hz), 4.39 (1H, t, J = 4.3 Hz), 5.28 (1H, t, J = 5.5 Hz), 5.78 (1H, d, J = 3.8 Hz), 7.09 (2H, s), 7.57 (1H, brs), 8.25 (1H, d, J = 7.6 Hz), 8.85 (1H, brs).【０４７３】
実施例４８
２個のイコシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１２５））の合成【０４７４】
（１）Ｃ型のヌクレオシド（化合物（Ｅ１２４））の合成
【化２０７】
2014077292.tif 000209
【０４７５】
100-mLナス型フラスコにLevrinic acid (1.10 g, 9.47 mmol), DMAP (77 mg, 0.63 mmol), THF (20 mL), (2R,3S,5R)-5-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1(2H)-イル)-2-((ビス(4-メトキシフェニル)(フェニル)メトキシ)メチル)テトラヒドロフラン-3-イル 4-オキソペンタノアート (4.00 g, 6.31 mmol)を量って溶解した。WSC.HCl (1.82 g, 9.47 mmol)を添加し、そのまま2.0 h撹拌した。THFを減圧下にて留去した後、EtOAc (50 mL)と0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (40 mL)を加え、分液した。有機層に0.2 M AcOH・Et3N水溶液 (pH 7.0) (40 mL)を再度添加し、分液した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、ろ去した。有機層を減圧下にて濃縮し、乾固すると化合物（E124）(4.66 g, 収率101%)が得られた。【０４７６】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 2.20 (3H, s), 2.32-2.37 (1H, m), 2.53-2.64 (2H, m), 2.70-2.84 (4H, m), 3.44-3.50 (1H, m), 3.79 (3H, s), 3.80 (3H, s), 4.27 (1H, brdd, J = 5.65, 2.95 Hz), 5.41-5.44 (1H, m), 6.30 (1H, dd, J = 7.20, 6.00 Hz), 6.83-6.87 (4H, m), 7.21-7.32 (8H, m), 7.38 (2H, dd, J = 7.95, 0.65 Hz), 7.51 (2H, t like, J = 7.95 Hz), 7.61 (1H, t, J = 7.45 Hz), 7.90 (2H, d, J = 7.50 Hz), 8.15 (1H, d, J = 7.50 Hz), 8.05 (1H, brs).【０４７７】
（２）２個のイコシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１２５））の合成
【化２０８】
2014077292.tif 000210
【０４７８】
200-mL ナス型フラスコに化合物（E124） (0.75 g相当, 1.03 mmol), i-Pr2NEt (0.93 mL), pyridine (7 mL)を量り、溶解した。室温でTMSCl (0.33 mL), 2,3-ビス(イコシルオキシ)安息香酸クロライド (0.58 g, 0.79 mmol)を順に添加した。この混合物を外温度60 oCにて3.5時間反応した。室温に冷却し、モルホリン (1.45 mL)を添加し、1 h攪拌した。そしてMeOH (75 mL)を滴下し、得られた懸濁液を1.0 h撹拌した。析出物を吸引ろ取し、MeOH (10 mLX3)で洗浄した。得られた紛体を減圧下、40 oC にて1 h乾燥すると目的物(0.83 g)が得られた。これをカラムクロマト精製 [Silicagel 60 (9 g), 5% Et3N contained EtOAc/toluene 0:95 to 20:75]した。有効区を減圧濃縮すると黄土色の粉末化合物（E125） (0.72 g, 69% yield)が得られた。【０４７９】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 6.45 Hz), 0.90-1.55 (66H, m), 1.81-1.92 (6H, m), 2.20 (3H, s), 2.19-2.33 (1H, m), 2.57-2.61 (2H, m), 2.73-2.82 (3H, m), 3.46 (2H, d, J = 3.15 Hz), 3.79 (3H, s), 3.80 (3H, s), 3.99-4.02 (2H, m), 4.14-4.20 (2H, m), 4.24-4.29 (1H, m), 5.39-5.42 (1H, m), 6.32 (1H, dd, J = 7.30, 5.90 Hz), 6.82-6.87 (4H, m), 7.08-7.15 (2H, m), 7.21-7.34 (8H, m), 7.34-7.39 (2H, m), 7.66 (1H, dd, J = 7.70, 1.85 Hz), 8.09 (1H, d, J = 7.45 Hz), 10.69 (1H, brs).【０４８０】
実施例４９
２個のイコシルオキシ基を有するシトシン（Ｃ）型のヌクレオシドモノマー化合物（化合物（Ｅ１２６））の合成
【化２０９】
2014077292.tif 000211
【０４８１】
35-mL ナス型フラスコに化合物（E125） (170 mg)とtoluene (2 mL)を量り、溶解した。これにトリクロロ酢酸 (110 mg)を添加し、室温で10分撹拌した。 メタノール (0.5 mL) を添加後、アセトニトリル(15 mL)を滴下した後、10分間室温にて撹拌した。 生成した粉末を吸引ろ取し、5%メタノール含有アセトニトリル (5 mL)で3回洗浄した。得られた粉末を減圧下、室温にて2.5時間乾燥すると化合物（E126） (103 mg, 収率79%)が得られた。【０４８２】
1H NMR (500 MHz, CDCl3) δ 0.88 (6H, t, J = 7.05 Hz), 0.90-1.55 (66H, m), 1.80-1.91 (6H, m), 1.50-2.00 (1H, brs, OH), 2.20 (3H, s), 2.45-2.51 (1H, m), 2.57-2.68 (3H, m), 2.75-2.80 (2H, m), 3.89 (1H, AB dd, J = 11.95, 2.75 Hz), 3.97 (1H, AB dd, J = 11.95, 2.60 Hz), 3.98-4.01 (2H, m), 4.15-4.19 (3H, m), 5.35-5.38 (1H, m), 6.22 (1H, dd, J = 7.45, 6.05 Hz), 7.08-7.15 (2H, m), 7.63 (1H, d, J = 7.45 Hz), 7.66 (1H, dd, J = 7.75, 1.85 Hz), 8.16 (1H, d, J = 7.50 Hz), 10.72 (1H, brs).
【産業上の利用可能性】
【０４８３】
本発明は、ヌクレオシドの塩基部分が、（ｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環カルボニル基もしくは（ｉｉ）少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環チオカルボニル基などで置換された新規ヌクレオシド化合物を合成ユニットとして用いて、核酸オリゴマーを製造するものであり、各反応毎のカラムクロマト精製を回避でき、３’方向へも、５’方向へも塩基伸張ができ、核酸オリゴマーを、液相合成法により効率的に大量合成できる。したがって、本発明は、ｓｉＲＮＡ、アンチセンス核酸、ワクチンのアジュバントなどの核酸オリゴマーの製造に適用することができ、ゲノム創薬や遺伝子診断・治療などの分野において極めて有用なものである。
【国際調査報告】
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