【手続補正書】
【提出日】平成23年11月25日(2011.11.25)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号１４に記載のアミノ酸配列の１〜３０１番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号１４に記載のアミノ酸配列の１〜３０１番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号１４に記載のアミノ酸配列の１〜３０１番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項２】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号４に記載のアミノ酸配列の１〜４７５番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号４に記載のアミノ酸配列の１〜４７５番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号４に記載のアミノ酸配列の１〜４７５番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項３】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号６に記載のアミノ酸配列の１〜３９１番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号６に記載のアミノ酸配列の１〜３９１番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号６に記載のアミノ酸配列の１〜３９１番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項４】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号８に記載のアミノ酸配列の１〜３７６番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号８に記載のアミノ酸配列の１〜３７６番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号８に記載のアミノ酸配列の１〜３７６番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項５】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号１０に記載のアミノ酸配列の１〜２２１番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号１０に記載のアミノ酸配列の１〜２２１番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号１０に記載のアミノ酸配列の１〜２２１番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項６】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号１２に記載のアミノ酸配列の１〜３１９番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号１２に記載のアミノ酸配列の１〜３１９番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号１２に記載のアミノ酸配列の１〜３１９番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項７】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号２に記載のアミノ酸配列の１〜３０６番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号２に記載のアミノ酸配列の１〜３０６番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ；
（iii）配列番号２に記載のアミノ酸配列の１〜３０６番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むエンドグルカナーゼ。
【請求項８】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号１６に記載のアミノ酸配列の１〜４５８番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号１６に記載のアミノ酸配列の１〜４５８番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むβ−グルコシダーゼ；
（iii）配列番号１６に記載のアミノ酸配列の１〜４５８番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むβ−グルコシダーゼ。
【請求項９】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるタンパク質：
（ｉ）配列番号１８に記載のアミノ酸配列の１〜４５７番の配列を含むタンパク質；
（ii）配列番号１８に記載のアミノ酸配列の１〜４５７番の配列において、１もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、及び／又は付加されたアミノ酸配列を含むβ−グルコシダーゼ；
（iii）配列番号１８に記載のアミノ酸配列の１〜４５７番の配列と７０％以上の同一性を有するアミノ酸配列を含むβ−グルコシダーゼ。
【請求項１０】
糸状菌由来である、請求項１〜９のいずれか一項に記載のタンパク質。
【請求項１１】
糸状菌がアクレモニウム・セルロリティカス（Acremonium cellulolyticus）に属する糸状菌である、請求項１０に記載のタンパク質。
【請求項１２】
請求項１〜９のいずれか一項に記載のタンパク質をコードする塩基配列を含む、ポリヌクレオチド。
【請求項１３】
配列番号１に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項１４】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項７に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号１に記載の塩基配列の１３６〜１４３７番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号１に記載の塩基配列の１３６〜１４３７番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項１５】
請求項１４に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項１６】
イントロン配列が、配列番号１に記載の塩基配列の２３３〜２９１番、３５１〜４２５番、５７９〜６３１番、６９７〜７５４番、又は、８５３〜９０７番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項１５に記載のＤＮＡ。
【請求項１７】
請求項１３〜１６のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項１８】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号１に記載の塩基配列の１３６〜２１６番の配列である、請求項１７に記載のＤＮＡ。
【請求項１９】
配列番号３に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項２０】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項２に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号３に記載の塩基配列の１２８〜１６１５番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号３に記載の塩基配列の１２８〜１６１５番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項２１】
請求項１９〜２０のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項２２】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号３に記載の塩基配列の１２８〜１８７番の配列である、請求項２１に記載のＤＮＡ。
【請求項２３】
配列番号５に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項２４】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項３に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号５に記載の塩基配列の１６９〜１５９８番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号５に記載の塩基配列の１６９〜１５９８番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項２５】
請求項２４に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項２６】
イントロン配列が、配列番号５に記載の塩基配列の２５４〜３０９番、４０６〜４６１番、又は、１３７２〜１４５０番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項２５に記載のＤＮＡ。
【請求項２７】
請求項２３〜２６のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項２８】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号５に記載の塩基配列の１６９〜２３１番の配列である、請求項２７に記載のＤＮＡ。
【請求項２９】
配列番号７に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項３０】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項４に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号７に記載の塩基配列の７０〜１３７６番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号７に記載の塩基配列の７０〜１３７６番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項３１】
請求項３０に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項３２】
イントロン配列が、配列番号７に記載の塩基配列の４５１〜５００番、又は、７６５〜８３０番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項３１に記載のＤＮＡ。
【請求項３３】
請求項２９〜３２のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項３４】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号７に記載の塩基配列の７０〜１２９番の配列である、請求項３３に記載のＤＮＡ。
【請求項３５】
配列番号９に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項３６】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項５に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号９に記載の塩基配列の１４１〜９７４番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号９に記載の塩基配列の１４１〜９７４番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項３７】
請求項３６に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項３８】
イントロン配列が、配列番号９に記載の塩基配列の５５１〜６０９番、又は、８３１〜８９４番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項３７に記載のＤＮＡ。
【請求項３９】
請求項３５〜３８のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項４０】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号９に記載の塩基配列の１４１〜１８５番の配列である請求項３９に記載のＤＮＡ。
【請求項４１】
配列番号１１に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項４２】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項６に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号１１に記載の塩基配列の１１４〜１２３０番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号１１に記載の塩基配列の１１４〜１２３０番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項４３】
請求項４２に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項４４】
イントロン配列が、配列番号１１に記載の塩基配列の１８３〜２３２番、又は、２９９〜３５７番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項４３に記載のＤＮＡ。
【請求項４５】
請求項４１〜４４のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項４６】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号１１に記載の塩基配列の１１４〜１６１番の配列である、請求項４５に記載のＤＮＡ。
【請求項４７】
配列番号１３に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項４８】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項１に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号１３に記載の塩基配列の１２４〜１１４３番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号１３に記載の塩基配列の１２４〜１１４３番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつエンドグルカナーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項４９】
請求項４８に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項５０】
イントロン配列が、配列番号１３に記載の塩基配列の２２５〜２７５番の配列である、請求項４９に記載のＤＮＡ。
【請求項５１】
請求項４７〜５０のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項５２】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号１３に記載の塩基配列の１２４〜１８６番の配列である、請求項５１に記載のＤＮＡ。
【請求項５３】
配列番号１５に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項５４】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項８に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号１５に記載の塩基配列の２３８〜１８８７番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号１５に記載の塩基配列の２３８〜１８８７番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつβ−グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項５５】
請求項５４に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項５６】
イントロン配列が、配列番号１５に記載の塩基配列の７８４〜８５０番、１１３８〜１２０５番、又は、１７０３〜１７５６番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項５５に記載のＤＮＡ。
【請求項５７】
請求項５３〜５６のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項５８】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号１５に記載の塩基配列の２３８〜３２１番の配列である、請求項５７に記載のＤＮＡ。
【請求項５９】
配列番号１７に記載の塩基配列、又はその改変配列を含む、ＤＮＡ。
【請求項６０】
以下の（ｉ）、（ii）、及び（iii）から選択されるＤＮＡ：
（ｉ）請求項９に記載のタンパク質をコードするＤＮＡ；
（ii）配列番号１７に記載の塩基配列の６６〜１７６５番の配列を含むＤＮＡ；
（iii）配列番号１７に記載の塩基配列の６６〜１７６５番の配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件でハイブリダイズし、かつβ−グルコシダーゼ活性を有するタンパク質をコードするＤＮＡ。
【請求項６１】
請求項６０に記載のＤＮＡから、イントロン配列を除去したＤＮＡ。
【請求項６２】
イントロン配列が、配列番号１７に記載の塩基配列の１４９〜２１１番、４０４〜４６０番、９３４〜９８８番、又は、１５７５〜１６２６番の配列から選択される１以上の配列を含む配列である、請求項６１に記載のＤＮＡ。
【請求項６３】
請求項５９〜６２のいずれか一項に記載のＤＮＡから、シグナル配列をコードする塩基配列を除去したＤＮＡ。
【請求項６４】
シグナル配列をコードする塩基配列が、配列番号１７に記載の塩基配列の６６〜２２７番の配列である、請求項６３に記載のＤＮＡ。
【請求項６５】
請求項１２〜６４のいずれか一項に記載のＤＮＡを含む、発現ベクター。
【請求項６６】
請求項６５に記載の発現ベクターで形質転換された、宿主細胞。
【請求項６７】
宿主細胞が酵母又は糸状菌である、請求項６６に記載の宿主細胞。
【請求項６８】
酵母が、サッカロミセス（Saccharomyces）属、ハンゼヌラ（Hansenula）属又はピキア（Pichia）属に属するものである、請求項６７に記載の宿主細胞。
【請求項６９】
酵母が、サッカロミセス・セレビシエ（Saccharomyces cerevisiae）である、請求項６８に記載の宿主細胞。
【請求項７０】
糸状菌が、フミコーラ（Humicola）属、アスペルギルス（Aspergillus）属、トリコデルマ（Trichoderma）属、フザリウム（Fusarium）又はアクレモニウム（Acremonium）属に属するものである、請求項６７に記載の宿主細胞。
【請求項７１】
糸状菌が、アクレモニウム・セルロリティカス（Acremonium cellulolyticus）、フミコーラ・インソレンス（Humicola insolens）、アスペルギルス・ニガー（Aspergillus niger）もしくはアスペルギルス・オリゼー（Aspergillus oryzae）、トリコデルマ・ビリデ（Trichoderma viride）、又はフザリウム・オキシスポーラム（Fusarium oxysporum）である、請求項７０に記載の宿主細胞。
【請求項７２】
請求項１２〜６４のいずれか一項に記載のＤＮＡに対応する遺伝子を、相同組み換えにより欠損させたアクレモニウム（Acremonium）属の糸状菌。
【請求項７３】
糸状菌がアクレモニウム・セルロリティカス（Acremonium cellulolyticus）である、請求項７２に記載の糸状菌。
【請求項７４】
請求項６６〜７３のいずれか一項に記載の宿主細胞を培養し、その宿主及び／又はその培養物から請求項１〜９のいずれか一項に記載のタンパク質を採取する工程を含む、前記タンパク質の製造法。
【請求項７５】
請求項７４に記載の方法で生産された、タンパク質。
【請求項７６】
請求項１〜９及び７５のいずれか一項に記載のタンパク質を含む、セルラーゼ調製物。
【請求項７７】
バイオマスを糖化する処理方法であって、セルロース含有バイオマスを、請求項１〜９及び７５のいずれか一項に記載のタンパク質、又は請求項７６に記載のセルラーゼ調製物と接触させる工程を含む、方法。
【請求項７８】
セルロース含有繊維の処理方法であって、セルロース含有繊維を、請求項１〜９及び７５のいずれか一項に記載のタンパク質、又は請求項７６に記載のセルラーゼ調製物と接触させる工程を含む、方法。
【請求項７９】
古紙を脱インキ薬品により処理して脱インキを行う工程において、請求項１〜９及び７５のいずれか一項に記載のタンパク質、又は請求項７６に記載のセルラーゼ調製物を用いることを特徴とする古紙の脱インキ方法。
【請求項８０】
紙パルプのろ水性の改善方法であって、紙パルプを、請求項１〜９及び７５のいずれか一項に記載のタンパク質、又は請求項７６に記載のセルラーゼ調製物で処理する工程を含む、方法。
【請求項８１】
動物飼料の消化能を改善する方法であって、動物飼料を、請求項１〜９及び７５のいずれか一項に記載のタンパク質、又は請求項７６に記載のセルラーゼ調製物で処理する工程を含む、方法。