【手続補正書】
【提出日】平成24年8月22日(2012.8.22)
【手続補正１】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項１】
ヒト第１９番染色体短腕１９ｑ１３．１３に位置するインターフェロンλ２（IFNλ2）およびインターフェロンλ３（IFNλ3）遺伝子領域に存在する遺伝子多型であって、以下の群：
B）配列番号2で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（T>A）；
C）配列番号3で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>T）；
D）配列番号4で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>G）；
E）配列番号5で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（G>A）；
F）配列番号6で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（T>C）；
H）配列番号8で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
I）配列番号9で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>A）；
M）配列番号13で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>G）；
N）配列番号14で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
O）配列番号15で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>G）；
P）配列番号16で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>G）；
Q）配列番号17で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（TT>G）；
R）配列番号18で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（G>C）；
S）配列番号19で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>A）；
T）配列番号20で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
U）配列番号21で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（->CT）；
V）配列番号22で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
W）配列番号23で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>T）；
Y）配列番号25で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（->GA）；および
Z）配列番号26で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（AC>-）；
（但し、括弧内はメジャー対立遺伝子>マイナー対立遺伝子を示し、「-」は塩基の欠失を示す。）
から選択される少なくとも１つの遺伝子多型において、各マイナー対立遺伝子を検出し得るポリヌクレオチドを含んでなる、I型インターフェロンによる治療に対する感受性予測用試薬。
【請求項２】
各メジャー対立遺伝子を検出し得るポリヌクレオチドをさらに含む、請求項１に記載の試薬。
【請求項３】
各対立遺伝子を検出し得るポリヌクレオチドが、各配列番号で表わされる塩基配列において該対立遺伝子を含む１０〜２００の連続した塩基配列もしくはその相補鎖配列からなるIFNλ2又はIFNλ3の遺伝子断片と、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るプローブ、および／または該遺伝子断片を増幅し得るプライマーである、請求項１または２に記載の試薬。
【請求項４】
IFNλ2又はIFNλ3の遺伝子断片が１０〜５０の連続した塩基配列からなる、請求項３に記載の試薬。
【請求項５】
IFNλ2又はIFNλ3の遺伝子断片が１５〜３０の連続した塩基配列からなる、請求項３に記載の試薬。
【請求項６】
I型インターフェロンによる治療が適用され得る疾患の患者に対して、インターフェロン療法が有効であるかどうかを予測するために用いられる、請求項１〜５のいずれか１項に記載の試薬。
【請求項７】
I型インターフェロンによる治療が適用され得る疾患の患者がHCV感染患者である、請求項６に記載の試薬。
【請求項８】
HCV感染患者がHCV遺伝子型1b感染患者、HCV遺伝子型1a感染患者又はHCV遺伝子型2a感染患者である、請求項７に記載の試薬。
【請求項９】
HCV感染患者が東アジア人である、請求項１〜８のいずれか１項に記載の試薬。
【請求項１０】
（１）被験者由来の遺伝子サンプルを使用し、ヒト第１９番染色体短腕１９ｑ１３．１３に位置するインターフェロンλ２（IFNλ2）およびインターフェロンλ３（IFNλ3）遺伝子領域に存在する遺伝子多型であって、以下の群：
B）配列番号2で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（T>A）；
C）配列番号3で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>T）；
D）配列番号4で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>G）；
E）配列番号5で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（G>A）；
F）配列番号6で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（T>C）；
H）配列番号8で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
I）配列番号9で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>A）；
M）配列番号13で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>G）；
N）配列番号14で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
O）配列番号15で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>G）；
P）配列番号16で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>G）；
Q）配列番号17で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（TT>G）；
R）配列番号18で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（G>C）；
S）配列番号19で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>A）；
T）配列番号20で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
U）配列番号21で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（->CT）；
V）配列番号22で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（C>T）；
W）配列番号23で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（A>T）；
Y）配列番号25で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（->GA）；および
Z）配列番号26で表わされる塩基配列中第301番目の塩基における遺伝子多型（AC>-）；（但し、括弧内はメジャー対立遺伝子>マイナー対立遺伝子を示し、「-」は塩基の欠失を示す。）
から選択される少なくとも１つの遺伝子多型を試験する工程、および
（２）（１）の試験の結果、マイナー対立遺伝子の存在が認められた場合、被験者のI型インターフェロンによる治療に対する感受性が低いと判断する工程
を含む、被験者のI型インターフェロンによる治療に対する感受性の予測方法。
【請求項１１】
遺伝子サンプルが、ゲノムDNAまたはRNAを含む、請求項１０に記載の予測方法。
【請求項１２】
被験者が、I型インターフェロンによる治療が適用され得る疾患の患者である、請求項１０又は１１に記載の予測方法。
【請求項１３】
I型インターフェロンによる治療が適用され得る疾患の患者がHCV感染患者である、請求項１２に記載の予測方法。
【請求項１４】
HCV感染患者がHCV遺伝子型1b感染患者、HCV遺伝子型1a感染患者、又はHCV遺伝子型2a感染患者である、請求項１３に記載の予測方法。
【請求項１５】
被験者が、東アジア人である、請求項１０〜１４のいずれか１項に記載の予測方法。
【請求項１６】
（１）被験者由来の遺伝子サンプルを使用し、ヒト第１９番染色体短腕１９ｑ１３．１３に位置するインターフェロンλ２（IFNλ2）およびインターフェロンλ３（IFNλ3）遺伝子領域に存在する遺伝子多型であって、配列番号２７で表わされる塩基配列中第３０１番目の塩基における遺伝子多型を試験する工程、および
（２）（１）の試験の結果、メジャー対立遺伝子のホモ接合型遺伝子多型（TT）の存在が認められた場合、被験者のI型インターフェロンによる治療に対する感受性が高いと判断する工程
を含む、被験者のI型インターフェロンによる治療に対する感受性の予測方法。
【請求項１７】
被験者が、東アジア人である、請求項１６に記載の予測方法。