(57)【要約】  本発明は、多様なヒト抗体を発現するトリB 細胞の提供を目的とする。本発明は、抗体軽鎖遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域及びヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA 配列の全部又は一部が挿入され、又はヒト抗体軽鎖可変領域及びヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA 配列の全部又は一部で置換され、並びに抗体重鎖遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域及びヒト抗体重鎖定常領域由来DNA 配列の全部又は一部が挿入され、又はヒト抗体重鎖可変領域及びヒト抗体重鎖定常領域由来DNA 配列の全部又は一部で置換され、並びに抗体軽鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA 配列2 以上が挿入され、又はヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA 配列2 以上で置換され、及び／又は抗体重鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA 配列2以上が挿入され、又はヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA 配列2 以上で置換されたトリB 細胞を解決手段とする。【特許請求の範囲】
【請求項１】
抗体軽鎖遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体重鎖遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体軽鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換され、および／または、抗体重鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換されたトリB細胞。
【請求項２】
抗体軽鎖偽遺伝子座において挿入され、または該抗体軽鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の数が、5以上であることを特徴とする請求項１に記載のトリB細胞。
【請求項３】
抗体重鎖偽遺伝子座において挿入され、または該抗体重鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の数が、5以上であることを特徴とする請求項１に記載のトリB細胞。
【請求項４】
抗体軽鎖偽遺伝子座において挿入、または該抗体軽鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の数が、15以上であることを特徴とする請求項１に記載のトリB細胞。
【請求項５】
抗体重鎖偽遺伝子座において挿入され、または該抗体重鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の数が、15以上であることを特徴とする請求項１に記載のトリB細胞。
【請求項６】
抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域由来DNA配列の位置が、ヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列が存在する位置の上流であり、および、抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域由来DNA配列の位置が、ヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列が存在する位置の上流であることを特徴とする請求項１乃至５のいずれかに記載のトリB細胞。
【請求項７】
抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域由来DNA配列および定常領域由来DNA配列の位置が、トリ抗体軽鎖可変領域および定常領域の位置よりも上流であり、および、抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域および定常領域の位置が、トリ抗体重鎖可変領域および定常領域の位置よりも上流であることを特徴とする請求項６に記載のトリB細胞。
【請求項８】
前記ヒト抗体重鎖がγ鎖であることを特徴とする請求項１乃至７のいずれかに記載のトリB細胞。
【請求項９】
前記ヒト抗体軽鎖がλ鎖またはκ鎖であることを特徴とする請求項１乃至８のいずれかに記載のトリB細胞。
【請求項１０】
前記トリB細胞が、細胞表面にヒト抗体を発現し、かつ培養液中にもヒト抗体を分泌する能力を有することを特徴とする請求項１乃至９のいずれかに記載のトリB細胞。
【請求項１１】
トリB細胞がDT40細胞であることを特徴とする請求項１乃至１０のいずれかに記載のトリB細胞。
【請求項１２】
クロマチンを弛緩させる処理を行った請求項１乃至１１のいずれかに記載のトリB細胞。
【請求項１３】
前記クロマチンを弛緩させる処理が、該トリB細胞中のヒストン脱アセチル化酵素の機能を低下または喪失させることである請求項１２に記載のトリB細胞。
【請求項１４】
前記ヒストン脱アセチル化酵素の機能を低下または喪失させる方法が、該トリB細胞中のヒストン脱アセチル化酵素遺伝子の発現を低下または喪失させることである請求項１３に記載のトリB細胞。
【請求項１５】
前記ヒストン脱アセチル化酵素がHDAC2であることを特徴とする請求項１４に記載のトリB細胞。
【請求項１６】
前記ヒストン脱アセチル化酵素の機能を低下または喪失させる方法がHDAC阻害剤で処理することを特徴とする請求項１３に記載のトリB細胞。
【請求項１７】
請求項１２乃至１６のいずれかに記載のトリB細胞からなる抗体産生細胞ライブラリー。
【請求項１８】
請求項１乃至１６のいずれかに記載のトリB細胞から抗体を作製する方法。
【請求項１９】
請求項１８に記載の方法により取得される抗体。
【請求項２０】
請求項１乃至１６のいずれかに記載のトリB細胞を作製するためのキット。
【請求項２１】
請求項１８に記載の方法により抗体を産生させるためのキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】  本発明は、ヒト抗体を産生する細胞に関する。より具体的には、ヒト抗体を産生するトリB細胞に関する。
【背景技術】
【０００２】  抗体は、生体物質の同定や機能解析などを行う上で有用であり、また、疾患の治療においても抗体の果たす役割は大きい。抗体は、生体内において特定の抗原と結合し、様々な生体内防御反応、例えば、抗体依存性細胞傷害（ADCC）活性や、補体依存性細胞傷害（CDC）活性を惹起して、生体にとっての「異物」を認識し、除去を行う。このような抗体の能力に着目し、抗体医薬の開発が近年盛んに行われるようになってきた。多種多様な疾患の治療を行うには、様々な標的抗原を認識する抗体を迅速、簡便に供給する必要がある。【０００３】  これまで、所望の物理的、生理的特徴を備えた抗体群を調製する手法として、モノクローナル抗体の作製技術が用いられてきた。モノクローナル抗体を作製する場合、一般的には、生体内免疫によって生じたB細胞をミエローマと融合させるハイブリドーマ法が用いられる。しかしながら、この方法には、生体内免疫の利用によって生じる免疫寛容の他、最終的な所望の抗体を取得するまでに時間と労力が掛かるなど、多くの問題が存在している。  免疫寛容の問題を克服する技術として、生体内免疫を利用しない方法が開発された。この方法は、ファージ粒子に種々の抗体の可変領域からなる1本鎖抗体（single chain valuable fragment: scFv）遺伝子を埋め込み、1本鎖抗体遺伝子産物をファージ上に提示させ、このファージによる1本鎖抗体ライブラリーから目的抗原への親和性を有するクローンを取得する方法で、ファージディスプレイ法と呼ばれている。この技術は、免疫寛容を回避する点では優れているが、ファージライブラリーから得られるクローンは1本鎖であるため、組換えDNA技術等により、2本鎖から成る完全型の抗体の調製を行う必要がある。また、1本鎖抗体を完全型抗体にする過程で親和性に変化を生じることもあり、可変領域配列の調整が必要な場合も少なくない。従って、時間と労力の点においては、生体内免疫による方法と比較して、格段に進展したとまでは言い難い。【０００４】  上記の既存のモノクローナル抗体作製技術の課題を克服した方法として、ADLibシステム（特許文献１および非特許文献１）およびADLibシステムをさらに改良した方法（特許文献２）が報告されている。ADLibシステムは、あらゆるタイプの抗原に対して、所望の結合特性を備えた多様な抗体を簡便に調製することが可能な技術である。この方法は、自律的に抗体遺伝子の多様化が進行したニワトリB細胞由来細胞株DT40によって構築される抗体ライブラリーから、所望の抗体を選択的に取得する技術である。ADLibシステムは、インビトロ系抗体作製技術の利点である免疫寛容の回避が可能である点、迅速にIgM型の完全抗体が得られる点において、従来の技術と比較して優れている。【０００５】  一般的に、抗体を動物やヒトに医薬品として投与する場合には、体内での免疫原性を最小化することを考慮し、その動物種の型に合わせることが求められる。そこで、DNA組換え技術を利用して、マウスなどで作製したモノクローナル抗体の定常領域をヒト型に置換したキメラ抗体や、抗体の抗原認識部位（complementarity determining region : CDR）をヒト抗体に移植したヒト化抗体が作製された。しかし、キメラ化・ヒト化の過程において親和性や機能に変化を生じることもあり、機能を保持したヒト化���体を作製できる確率は決して高いとはいえない。さらに、これらのキメラ抗体またはヒト化抗体は他の動物種に由来する領域が少ないため、元のモノクローナル抗体と比べて免疫原性は低いものの、抗原認識部位が免疫原性を持つため、抗抗体が現れるという問題点もあった。  そこで、マウスにヒト抗体遺伝子を遺伝子導入し、ヒト抗体を産生する動物の作製が試みられた。特許文献３では、ヒト抗体遺伝子を含む染色体断片のミクロセルをマウスES細胞に移植し、該ES細胞からキメラマウスを作製することで、ヒト抗体を発現するキメラマウスを作製している。また、非特許文献２では、マウス抗体遺伝子座のゲノムDNAを対応するヒト抗体遺伝子座のゲノムDNAと置換することで、ヒト抗体を発現するキメラマウスを作製している。いずれの方法においても、完全にヒト抗体遺伝子に由来する抗原認識部位を持つ抗体の取得が可能であるが、やはり生体内免疫を利用することから、最終的な所望の抗体を取得するまでに要する時間と労力の問題は残っている。【０００６】  以上のような状況において、ADLibシステムを使用する場合であっても、抗体医薬を調製するためには、ヒト由来のアミノ酸配列を持つ抗体をトリB細胞から産生させる方法が必要である。さらに、様々な疾患の治療を行うためには、多様な抗原認識特性を持つ抗体群を簡便に産生させる技術が必要となる。  しかしながら、マウスにヒト抗体遺伝子を導入して「ヒト化」する場合と異なり、トリB細胞を「ヒト化」する場合、抗体の多様化システムの相違が問題となる。なぜなら、トリ、ウサギ、ウシ、ヒツジなどの動物の場合、抗体可変領域の上流には、可変領域と類似した配列であってそれ自身は抗体遺伝子として発現していない偽遺伝子と呼ばれる配列が集まった領域があり、遺伝子変換と呼ばれる現象によって可変領域配列の全部または一部が偽遺伝子配列によって書き換えられることで、多様な配列が生み出されている。ヒトやマウスなどの動物においては、V(D)J組換えにより抗体の多様化が起こるのに対し、トリ、ウサギ、ウシ、ヒツジなどの動物においては、遺伝子変換という全く異なるメカニズムによって抗体の多様化が起きていることになる。さらに、偽遺伝子領域は非常に大量の繰り返し配列を含む構造になっていることもあり、当該領域の配列解析が非常に困難で、2015年３月時点においてもトリ抗体重鎖偽遺伝子領域は解読されていない。こういったメカニズムの相違や抗体遺伝子座の構造上の問題から、トリB細胞から所望のヒト抗体を産生させるシステムを構築することは非常に困難であると考えられていた。  こういった背景の下、DT40細胞の抗体遺伝子座に存在する可変領域および偽遺伝子領域をヒト由来の配列に置換した細胞株を作製したことが報告された（非特許文献３）。本文献においては、トリ抗体可変領域を蛍光タンパク質であるGreen Fluorescent Protein （GFP）およびCyan Fluorescent Protein （CFP）ならびにリコンビナーゼ認識部位であるattP配列を含む遺伝子配列に置換した後、リコンビナーゼを利用してヒト抗体可変領域および後述する偽遺伝子配列を挿入したDT40細胞を作製し、遺伝子変換が起きることを確認している（非特許文献３、４）。しかし、定常領域はトリ由来配列をそのまま利用しているため、発現する抗体分子はヒ��−トリのキメラ抗体であり、抗体の免疫原性は非常に高い。さらに、軽鎖はヒト由来のκ鎖とトリ由来のλ鎖との融合タンパクになっていることから、その抗体分子は天然のヒト抗体とは大きく異なっている。よって、ヒトの治療用抗体とするにはさらなるキメラ化の操作が必要であり、キメラ化・ヒト化の過程において親和性や機能が変化する可能性が残っていることは変わらない。また、ここで用いた偽遺伝子領域の配列は、軽鎖については、挿入したヒト抗体可変領域のそれぞれのCDR配列を1アミノ酸ずつTyrまたはTrpへ置換した人工配列の集合体であるminimalist libraryや、天然に存在するヒト抗体可変領域のバリアントに対してフレームワーク領域に変異を施したものを利用しており、重鎖については、挿入したヒト抗体可変領域のそれぞれのCDR配列を1アミノ酸ずつTyrまたはTrpへ置換した人工配列およびその変異配列で構成されている。これらは、少ない偽遺伝子で多様な抗原に対応することを目的として設計されたものであるが、該細胞における抗原特異的な抗体の取得については報告されていない。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】特許4214234号
【特許文献２】WO2008/047480
【特許文献３】WO97/07671
【非特許文献】
【０００８】
【非特許文献１】Seoら、Nature Biotech, Volume 23, pp731-735, 2005
【非特許文献２】Recombinant Antibodies for Immunotherapy, pp100-108, 2009, Cambridge Press
【非特許文献３】Schusserら、PLOS ONE, Volume 8 issue 11 e80108, 2013
【非特許文献４】Leightonら、Frontiers in Immunology, Volume 6 Article 126, 2015
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００９】  上記事情に鑑み、本発明の目的は、多様なヒト抗体を産生するトリB細胞を提供することである。  さらに、本発明の目的は、該トリB細胞から抗体を産生する方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【００１０】  発明者らは、多様なヒト抗体を産生する細胞の作製につき、鋭意研究を行った結果、トリB細胞の抗体軽鎖および重鎖遺伝子座において、ヒト抗体の軽鎖および重鎖の可変領域および定常領域の遺伝子を挿入または置換したところ、ヒト抗体を発現する形質転換細胞を得ることに成功した。また、発明者らは、さらに偽遺伝子として軽鎖・重鎖に複数個のヒト由来の抗体可変領域配列を挿入した形質転換細胞を作製し、この細胞をHDAC阻害剤処理したところ、本来のトリB細胞と同様に遺伝子変換が起きることを確認した。さらに、発明者らは、該細胞から抗原特異的なヒト抗体を産生させることに成功した。  すなわち、発明者らは、前記細胞を調製することで、該細胞から可変領域が種々に変更された抗体を取得できることを確認し、ヒト抗体であって、多様な抗体を産生させることに成功し、本発明を完成させるに至った。【００１１】  すなわち、本発明の以下の（１）〜（２１）である。（１）抗体軽鎖遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体重鎖遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体軽鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換され、および／または、抗体重鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換されたトリB細胞。（２）抗体軽鎖偽遺伝子座において挿入され、または該抗体軽鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の数が、5 以上であることを特徴とする上記（１）に記載のトリB細胞。（３）抗体重鎖偽遺伝子座において挿入され、または該抗体重鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の数が、5以上であることを特徴とする上記（１）に記載のトリB細胞。（４）抗体軽鎖偽遺伝子座において挿入、または該抗体軽鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の数が、15以上であることを特徴とする上記（１）に記載のトリB細胞。（５）抗体重鎖偽遺伝子座において挿入され、または該抗体重鎖偽遺伝子座の配列を置換する、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の数が、15以上であることを特徴とする上記（１）に記載のトリB細胞。（６）抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域由来DNA配列の位置が、ヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列が存在する位置の上流であり、および、抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域由来DNA配列の位置が、ヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列が存在する位置の上流であることを特徴とする上記（１）乃至（５）のいずれかに記載のトリB細胞。（７）抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域由来DNA配列および定常領域由来DNA配列の位置が、トリ抗体軽鎖可変領域および定常領域の���置よりも上流であり、および、抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域および定常領域の位置が、トリ抗体重鎖可変領域および定常領域の位置よりも上流であることを特徴とする上記（６）に記載のトリB細胞。（８）前記ヒト抗体重鎖がγ鎖であることを特徴とする上記（１）乃至（７）のいずれかに記載のトリB細胞。（９）前記ヒト抗体軽鎖がλ鎖またはκ鎖であることを特徴とする上記（１）乃至（８）のいずれかに記載のトリB細胞。（１０）前記トリB細胞が、細胞表面にヒト抗体を発現し、かつ培養液中にもヒト抗体を分泌する能力を有することを特徴とする上記（１）乃至（９）のいずれかに記載のトリB細胞。（１１）トリB細胞がDT40細胞であることを特徴とする上記（１）乃至（１０）のいずれかに記載のトリB細胞。（１２）クロマチンを弛緩させる処理を行った上記（１）乃至（１１）のいずれかに記載のトリB細胞。（１３）前記クロマチンを弛緩させる処理が、該トリB細胞中のヒストン脱アセチル化酵素の機能を低下または喪失させることである上記（１２）に記載のトリB細胞。（１４）前記ヒストン脱アセチル化酵素の機能を低下または喪失させる方法が、該トリB細胞中のヒストン脱アセチル化酵素遺伝子の発現を低下または喪失させることである上記（１３）に記載のトリB細胞。（１５）前記ヒストン脱アセチル化酵素がHDAC2であることを特徴とする上記（１４）に記載のトリB細胞。（１６）前記ヒストン脱アセチル化酵素の機能を低下または喪失させる方法がHDAC阻害剤で処理することを特徴とする上記（１３）に記載のトリB細胞。（１７）上記（１２）乃至（１６）のいずれかに記載のトリB細胞からなる抗体産生細胞ライブラリー。（１８）上記（１）乃至（１６）のいずれかに記載のトリB細胞から抗体を作製する方法。（１９）上記（１８）に記載の方法により取得される抗体。（２０）上記（１）乃至（１６）のいずれかに記載のトリB細胞を作製するためのキット。（２１）上記（１８）に記載の方法により抗体を産生させるためのキット。
【発明の効果】
【００１２】  本発明の細胞から、多様な抗原を認識するヒト抗体を簡便、かつ、迅速に取得することが可能となる。
【図面の簡単な説明】
【００１３】
【図１】DT40細胞の抗体軽鎖定常領域および抗体軽鎖可変領域を、ヒト由来抗体（IgG）軽鎖定常領域および抗体軽鎖可変領域で置換するためのターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。cpV1〜cpV3：トリ偽遺伝子
【図２】DT40細胞の抗体軽鎖偽遺伝子領域下流へ、遺伝子変換確認用配列（GC確認配列；ヒト抗体可変領域に由来する配列からなるヒト偽遺伝子。以下同じ。）を挿入するためのターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。cpV1〜cpV3：トリ偽遺伝子
【図３】DT40細胞の抗体軽鎖偽遺伝子領域の欠損、およびDT40細胞の抗体軽鎖偽遺伝子領域をGC確認配列で置換するためのターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。cpV25、cpV1：トリ偽遺伝子
【図４】DT40細胞の抗体重鎖定常領域および抗体可変領域を、ヒト由来抗体（IgG）重鎖定常領域および抗体重鎖可変領域で置換し、さらに、GC確認配列を挿入するためのターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図５】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体軽鎖可変領域および抗体軽鎖定常領域で置換する手順と、得られたDT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。cpV1〜cpV3：トリ偽遺伝子
【図６】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体軽鎖可変領域および抗体軽鎖定常領域遺伝子で置換し、さらに、DT40細胞の抗体軽鎖偽遺伝子領域の下流にGC確認配列を挿入するための手順と、得られたDT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。cpV1〜cpV3：トリ偽遺伝子、hpV1〜hpV2：ヒト偽遺伝子
【図７】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体軽鎖可変領域および抗体軽鎖定常領域遺伝子で置換し、さらに、DT40細胞の抗体軽鎖偽遺伝子領域を欠損させるための手順と、得られたDT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。cpV25、cpV1：トリ偽遺伝子
【図８】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体軽鎖可変領域および抗体軽鎖定常領域遺伝子で置換し、さらにDT40細胞の偽遺伝子領域をGC確認配列に置換するための手順と、得られたDT40細胞抗体軽鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。cpV25、cpV1：トリ偽遺伝子、hpV1、hpV2：ヒト偽遺伝子
【図９】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域に、ヒト由来抗体軽鎖遺伝子領域を挿入した細胞株、または、DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト抗体軽鎖遺伝子で置換した細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図１０】DT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体重鎖可変領域および抗体重鎖定常領域に変える手順と、得られたDT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。
【図１１】DT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体重鎖可変領域および抗体重鎖定常領域遺伝子に変え、さらに、DT40細胞の重鎖偽遺伝子領域の下流にGC確認配列を挿入するための手順と、得られたDT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域、および、使用したターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。hpV1、hpV2：ヒト偽遺伝子
【図１２】DT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体重鎖可変領域および抗体重鎖定常領域遺伝子に変え、さらに、DT40細胞の重鎖偽遺伝子領域の下流にGC確認配列を挿入した細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図１３】DT40細胞の抗体軽鎖の偽遺伝子領域を、ヒトIgλの可変領域由来配列から成る偽遺伝子（ヒト軽鎖偽遺伝子）で置換する手順と、得られたDT40細胞の抗体軽鎖領域、および、使用したターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図１４】DT40細胞の抗体重鎖定常領域を、ヒトIgG1の重鎖遺伝子領域に置換するためのターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図１５】DT40細胞の抗体重鎖可変領域に、ヒト由来抗体重鎖可変領域と5個のヒトIgγの可変領域由来配列から成る偽遺伝子（ヒト重鎖偽遺伝子）を導入するためのターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図１６】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体軽鎖可変領域および抗体軽鎖定常領域で置換し、ヒト軽鎖偽遺伝子配列（5個）を挿入する手順と、得られたDT40細胞抗体軽鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。cpV25、cpV1：トリ偽遺伝子
【図１７】DT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域に、ヒト由来抗体重鎖可変領域および抗体重鎖定常領域を導入し、ヒト重鎖偽遺伝子配列（5個）を挿入する手順と、得られたDT40細胞抗体重鎖遺伝子領域を模式的に示した図である。
【図１８】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域および抗体重鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体遺伝子に変え、ヒト軽鎖偽遺伝子配列（5個）を挿入した細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図１９】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体軽鎖可変領域および抗体軽鎖定常領域で置換し、ヒト重鎖偽遺伝子配列（15個）を挿入する手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。pV25、pV1：トリ偽遺伝子
【図２０】DT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域に、ヒト由来抗体重鎖可変領域および抗体重鎖定常領域を導入し、ヒト重鎖偽遺伝子配列（15個）を挿入する手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図２１】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域および抗体重鎖遺伝子領域を、ヒト由来抗体遺伝子領域に変え、ヒト軽鎖偽遺伝子配列（15個）を挿入したL15/H15細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図２２】図２１に示した結果について、誤りのあったデータを優先日前のデータに基づいて修正したものを示す。
【図２３】DT40細胞の抗体重鎖可変領域を、ヒト由来抗体重鎖可変領域で置換すると同時に、DT40細胞の抗体重鎖可変領域にRMCE用カセット配列を挿入する手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図２４】DT40細胞の抗体重鎖遺伝子領域に、ヒト重鎖偽遺伝子配列を30個挿入する手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図２５】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域および抗体重鎖遺伝子領域をヒト由来抗体遺伝子領域に変え、軽鎖にヒト軽鎖偽遺伝子配列を15個、重鎖にヒト重鎖偽遺伝子配列を30個挿入したL15/H30細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図２６】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域に、ヒト軽鎖偽遺伝子配列を30個挿入する手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図２７】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域および抗体重鎖遺伝子領域をヒト由来抗体遺伝子領域に変え、軽鎖にヒト軽鎖偽遺伝子配列を30個、重鎖にヒト重鎖偽遺伝子配列を30個挿入したL30/H30細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図２８】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域および抗体重鎖遺伝子領域をヒト由来抗体遺伝子領域に変え、軽鎖にヒト軽鎖偽遺伝子配列を30個、重鎖にヒト重鎖偽遺伝子配列を15個挿入したL30/H15細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図２９】RMCE法を利用して、L30/H15細胞株の抗体重鎖遺伝子領域に、ヒト重鎖偽遺伝子配列を順向きまたは逆向きに15個追加挿入して合計30個にする手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。図中、forおよびrevは、各々、順向き、逆向きを意味する。以下、他の図において同様。
【図３０】RMCE法を利用してL30/H15細胞株の抗体重鎖遺伝子領域に、順向きまたは逆向きにヒト重鎖偽遺伝子配列15個を追加挿入した細胞株（順向きはL30/H15f15f細胞株、逆向きはL30/H15r15f細胞株）が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図３１】L30/H15f15f細胞株およびL30/H15r15f細胞株の抗体重鎖遺伝子領域に、各々、ヒト重鎖偽遺伝子配列を順向きまたは逆向きに15個追加挿入して合計45個にする手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図３２】L30/H15f15f細胞株の抗体重鎖遺伝子領域に、順向きにヒト重鎖偽遺伝子配列15個を追加挿入した細胞株（L30/H15f15f15f細胞株）が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図３３】L30/H15r15f細胞株の抗体重鎖遺伝子領域に、逆向きにヒト重鎖偽遺伝子配列15個を追加挿入した細胞株（L30/H15r15r15f細胞株）が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図３４】RMCE法を利用して、L30/H15f15f15f細胞株およびL30/H15r15r15f細胞株の抗体重鎖遺伝子領域に、各々、ヒト重鎖偽遺伝子配列を順向きにまたは逆向きに15個追加挿入して合計60個にする手順と、用いたターゲティングベクターの構造を模式的に示した図である。
【図３５】DT40細胞の抗体軽鎖遺伝子領域にヒト軽鎖偽遺伝子配列30個を挿入し、抗体重鎖遺伝子領域にヒト重鎖偽遺伝子60個を挿入した細胞株が産生する抗体について、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図３６】TSA処理したL15/H15細胞株から、ADLibシステムを用いてPlexin A4タンパク質に結合する細胞集団を分離し、フローサイトメトリーにより解析した結果を示す。
【図３７】図３６のP5エリアの細胞集団に対してsingle cell sortingを行った後、96well plateに播種して培養し、各ウェルの細胞上清に対し、ELISA解析を行った結果を示す。横軸は、測定試料である細胞上清が由来する96well plateの各ウェル画分の番号を示す。Trypsin inhibitor:トリプシンインヒビター、SA：ストレプトアビジン、OA：オボアルブミン
【図３８】ウェスタンブロット法により、陽性クローンである#62および#20から分泌されている抗体の分析を行った。還元および非還元の条件でサンプルを処理し、ヤギ抗ヒトIgGγ抗体を用いてウェスタンブロッティングを行った結果を示す。
【図３９】ウェスタンブロット法により、陽性クローンである#62および#20から分泌されている抗体の分析を行った。還元および非還元の条件でサンプルを処理し、ヤギ抗ヒトIgGλ抗体を用いてウェスタンブロッティングを行った結果を示す。
【図４０】ウェスタンブロット法により、陽性クローンである#62および#20から分泌されている抗体の分析を行った。還元および非還元の条件でサンプルを処理し、ヤギ抗トリIgM抗体を用いてウェスタンブロッティングを行った結果を示す。
【図４１】TSA処理したL15/H15細胞株から、ADLibシステムを用いてHis-AP-hSema3Aに結合する細胞集団の1次スクリーニングの結果を示す。
【図４２】His-AP-hSema3Aに結合する細胞集団をモノクローン化した後に行った2次スクリーニングの結果を示す。
【図４３】ウェスタンブロット法により、2次スクリーニング後の陽性クローンから分泌されるHis-AP-hSema3A抗体の分析を行った。還元および非還元の条件でサンプルを処理し、ヤギ抗ヒトIgGγ抗体またはヤギ抗ヒトIgGλ抗体を用いてウェスタンブロッティングを行った結果を示す。
【図４４】TSA処理したL30/H45細胞株から、ADLibシステムを用いてIL-8に結合する細胞集団の1次スクリーニングの結果を示す。
【図４５】IL-8に結合する細胞集団をモノクローン化した後に行った2次スクリーニングの結果を示す。
【図４６】ウェスタンブロット法により、2次スクリーニング後の陽性クローンから分泌されるIL-8抗体の分析を行った。還元および非還元の条件でサンプルを処理し、ヤギ抗ヒトIgGγ抗体またはヤギ抗ヒトIgGλ抗体を用いてウェスタンブロッティングを行った結果を示す。
【発明を実施するための形態】
【００１４】  本発明の実施形態の１つは、抗体軽鎖遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体重鎖遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体軽鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換され、および／または、抗体重鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換されたトリB細胞である。  本発明のB細胞は、トリ由来の抗体産生B細胞であり、例えば、ニワトリ由来のDT40細胞を挙げることができる。その他にも、遺伝子変換によって抗体配列を多様化するシステムを有するウシ、ヒツジ、ウサギなどのB細胞も用いることができる。  また、本発明のトリB細胞は、その抗体軽鎖遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、その抗体重鎖遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体重鎖定常領域由来DNA配列の全部または一部で置換され、ならびに、抗体軽鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入、またはヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換され、および／または、抗体重鎖偽遺伝子座において、ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上が挿入され、またはヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列2以上で置換されている他、他の遺伝子領域等に変異や修飾が施されていてもよい。
【００１５】  ここで、抗体軽鎖遺伝子座とは、抗体の軽鎖可変領域および軽鎖定常領域をコードする遺伝子が存在する遺伝子座のことであり、抗体重鎖遺伝子座とは、抗体の重鎖可変領域および重鎖定常領域をコードする遺伝子が存在する遺伝子座のことである。  また、偽遺伝子とは、機能している遺伝子と類似の配列ではあるが、発現する遺伝子としては機能していないDNA配列のことをいう。トリの抗体軽鎖偽遺伝子座および重鎖偽遺伝子座は、各々、機能遺伝子が存在する抗体軽鎖遺伝子座および重鎖遺伝子座よりも上流に位置しており、遺伝子変換により多様性を生み出している。ヒトのゲノム中の抗体遺伝子座には偽遺伝子は存在しないが、本明細書においては、挿入されたヒト抗体可変領域と遺伝子変換を生じさせる目的でトリ抗体遺伝子座に導入された、ヒト抗体可変領域と類似の配列を持つDNA配列を「ヒト偽遺伝子」と総称する。
【００１６】  トリ抗体軽鎖遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体軽鎖遺伝子座の配列と置換されているヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来のDNA配列は、各々、ヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域の全ての配列であっても、あるいは、その一部の配列であってもよい。また、トリ抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の位置は、ヒト抗体軽鎖定常領域由来のDNA配列が挿入されている位置の上流であることが望ましい。  同様に、トリ抗体重鎖遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体重鎖遺伝子座の配列と置換されているヒト抗体重鎖可変領域およびヒト抗体定常領域由来のDNA配列は、各々、ヒト重鎖可変領域および重鎖定常領域の全ての配列であっても、あるいは、その一部の配列であってもよい。また、トリ抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の位置は、ヒト抗体重鎖定常領域由来のDNA配列が挿入されている位置の上流であることが望ましい。  また、トリ抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域およびヒト抗体軽鎖定常領域由来のDNA配列の位置は、トリ抗体軽鎖可変領域およびトリ抗体軽鎖定常領域の位置よりも上流であることが望ましい。同様に、トリ抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域および重鎖定常領域由来のDNA配列の位置は、トリ抗体重鎖可変領域および重鎖定常領域の位置よりも上流であることが望ましい。
【００１７】  本実施形態において、トリ抗体軽鎖偽遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体軽鎖偽遺伝子座のDNA配列と置換されているヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列（本明細書および図面においては、「ヒト軽鎖偽遺伝子配列」とも記載する）は、公知のヒト抗体軽鎖可変領域の配列を用いることができる。こういった配列情報は、たとえばV Base （http://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/vbase/list2.php）のようなウェブサイトからも入手することができる。このヒト軽鎖偽遺伝子配列は、ヒト抗体軽鎖可変領域のCDR1、CDR2、CDR3の全部またはその一部を含むDNA配列を使用することができるが、各CDRが、トリ抗体軽鎖遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体軽鎖遺伝子座の配列と置換されているヒト抗体軽鎖可変領域のDNA配列や他のヒト軽鎖偽遺伝子配列のCDRと同一でないことが望ましい。また、ヒト軽鎖偽遺伝子配列のフレームワーク（FW）領域については、トリ抗体軽鎖遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体軽鎖遺伝子の配列と置換されたヒト抗体軽鎖可変領域のそれと一致していることが望ましい。たとえば、抗体軽鎖可変領域として配列番号５のDNA配列を選択した場合、軽鎖偽遺伝子は配列番号６９〜配列番号８８および配列番号１２７〜配列番号１４１に示す配列などを組み合わせて使用することができる。  同様に、トリ抗体重鎖偽遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体重鎖偽遺伝子座の配列と置換されているヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列（本明細書および図面においては、「ヒト重鎖偽遺伝子配列」とも記載する）は、公知のヒト抗体重鎖可変領域の配列を用いることができる。こういった配列情報は、たとえばV Base（http://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/vbase/list2.php）のようなウェブサイトからも入手することができる。このヒト重鎖偽遺伝子配列は、ヒト抗体重鎖可変領域のCDR1、CDR2、CDR3の全部またはその一部を含むDNA配列を使用することができるが、各CDRが、トリ抗体重鎖遺伝子座に挿入され、またはトリ抗体重鎖遺伝子座の配列と置換されているヒト抗体重鎖可変領域のDNA配列や他のヒト重鎖偽遺伝子配列のCDRと同一でないことが望ましい。また、ヒト重鎖偽遺伝子配列のフレームワーク（FW）領域については、トリ重鎖抗体遺伝子座に挿入され、またはトリ重鎖抗体遺伝子座の配列と置換されたヒト抗体重鎖可変領域のそれと一致していることが望ましい。たとえば、抗体重鎖可変領域として配列番号３０のDNA配列を選択した場合、重鎖偽遺伝子は配列番号８９〜配列番号１０８、配列番号１２７〜配列番号１４１、配列番号１４７〜配列番号１６１および配列番号１６５〜配列番号１７９に示す配列などを組み合わせて使用することができる。
【００１８】  本実施形態において、トリ抗体軽鎖偽遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の位置は、トリ抗体軽鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体軽鎖可変領域より上流に位置することが望ましく、また、トリ抗体軽鎖偽遺伝子配列が残っている場合においては、トリ抗体軽鎖偽遺伝子領域より下流に位置していることが望ましい。同様に、トリ抗体重鎖偽遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の位置は、トリ抗体重鎖遺伝子座に挿入されているヒト抗体重鎖可変領域より上流に位置することが望ましく、また、トリ抗体重鎖偽遺伝子配列が残っている場合においては、トリ抗体重鎖偽遺伝子領域より下流に位置していることが望ましい。  また、本実施形態において、トリ抗体可変領域の上流に偽遺伝子として挿入または置換されるヒト抗体可変領域由来のDNA配列は、トリ抗体可変領域に挿入または置換されたヒト抗体可変領域配列と同じ向きでも逆向きでも、どちらでも利用可能である。
【００１９】  トリ抗体軽鎖偽遺伝子座に挿入され、または、トリ抗体軽鎖偽遺伝子座の偽遺伝子を置換する（置き換える）ヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列の数は、好ましくは、２以上、より好ましくは５以上、７以上、９以上、１１以上、１３以上、さらに好ましくは１５以上、２０以上、２５以上である。同様に、トリ抗体重鎖偽遺伝子座に挿入され、または、トリ抗体重鎖偽遺伝子座の偽遺伝子を置換する（置き換える）ヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列の数は、好ましくは、２以上、より好ましくは５以上、７以上、９以上、１１以上、１３以上、さらに好ましくは１５以上、２０以上、２５以上、もっとも好ましくは３０以上である。  なお、ここでいうヒト抗体軽鎖可変領域由来のDNA配列またはヒト抗体重鎖可変領域由来のDNA配列は、FW1, CDR1, FW2, CDR2, FW3, CDR3, FW4のいずれか1個を含み、可変領域にわたる領域に含まれる連続した一連の可変領域相同配列を以って1個として取り扱う。  本実施形態において、トリ抗体重鎖遺伝子座に挿入されるヒト抗体重鎖の種類は、γ鎖、ｓ鎖、α鎖、δ鎖、ε鎖のいずれであってもよいが、好ましくは、γ鎖である。また、トリ抗体軽鎖遺伝子座およびトリ抗体軽鎖偽遺伝子座に挿入されるヒト抗体軽鎖の種類は、λ鎖とκ鎖のいずれであってもよい。  本実施形態において、遺伝子導入を行ったトリB細胞を抗体ライブラリーとして利用するためには、該トリB細胞が細胞膜表面にヒト抗体を発現するのみでなく、培養液中にヒト抗体を分泌する能力を有することが好ましい。このためには、導入したヒト抗体遺伝子が転写される際に、生体における発現制御の機構に類似したalternative splicingが適切に起こる必要がある。そのため、定常領域の遺伝子導入においては、トリ抗体重鎖定常領域と完全に同じゲノム構造を利用することが理想的であるが、トリの当該ゲノム領域の塩基配列は2015年3月の時点で解読されていないため、これを用いることができない。本実施形態においてはマウス抗体重鎖ゲノム配列中のイントロン配列を利用し、その結果、細胞膜表面と分泌型の両方のヒト抗体を同時に発現させることに成功していることから、マウスやヒトなど、公知の哺乳類動物由来のイントロン配列で代用することも可能である。
【００２０】  本実施形態において、トリ抗体遺伝子座にヒト抗体遺伝子を挿入および／またはヒト抗体遺伝子で置換する方法としては、相同組換えを利用したノックイン法が用いられる。また、トリ抗体鎖遺伝子座の偽遺伝子領域にヒト抗体可変領域由来配列を挿入および／またはヒト抗体遺伝子で置換する方法としては、相同組換えを利用したノックイン法のほか、部位特異的組換えを利用したRecombinase mediated cassette exchange （RMCE）法が好ましく利用できる。
【００２１】  本実施形態で作製されるトリB細胞には、上述のように、ヒトの抗体遺伝子座由来のDNA配列を挿入またはヒトの抗体遺伝子座由来のDNA配列で置換した細胞の他、該細胞のヒト由来抗体軽鎖または重鎖可変領域に、さらに、多種多様な変異を導入したトリB細胞も含まれる。抗体の多様性は、可変領域が再編成されることで、多様な可変領域の配列が生じることによって達成される。よって、本実施形態で作製されるトリB細胞には、可変領域の再編成に必要な多様な変異を導入する処理が施されたトリB細胞も含まれる。ここで、可変領域の再編成に必要な変異を導入する方法は、例えば、XRCC2およびXRCC3を欠失させたB細胞を使用する方法（例えば、Cumber et al., Nature Biotech. 204:1129-1134 2002または特開2003-503750など）、AID遺伝子の発現を制御する方法（例えば、Kanayama et al., Nucleic Acids Res. 34:e10.,2006または特開2004-298072など）、あるいは、クロマチンを弛緩させて遺伝子変換を促進する方法（例えば、特許文献１、特許文献２または非特許文献１など）など、当該技術分野で公知の方法を利用することができる。とりわけ、好ましい方法は、クロマチンを弛緩させて遺伝子変換を促進させる方法である。
【００２２】  トリB細胞中のクロマチンを弛緩させる方法としては、例えば、トリB細胞中に内在するヒストン脱アセチル化酵素（HDAC）活性を何らかの方法で阻害して、該細胞内における遺伝子変換を著しく促進させる方法をあげることができる（詳細は、上記特許文献１、特許文献２または非特許文献１などを参照のこと）。細胞に内在するHDACの活性を阻害する方法として、HDAC阻害剤で、本発明のB細胞を処理する方法（特許文献１または非特許文献１を参照）やトリB細胞中のHDAC遺伝子の機能を低下または喪失させる方法（特許文献２を参照）などを使用することができる。HDAC阻害剤は、HDACの活性を阻害するものであれば特に限定されるものではなく、例えば、トリコスタチンＡ（TSA）、ブチル酸、バルプロ酸、suberoylanilide hydroxamic acid （SAHA）、CBHA（m-carboxycinnamic acid bis-hydroxamide）、PTACH、Apicidin、Scriptaid、M344、APHA compound 8、BML-210、Oxamflatin、MS-275、などが使用可能である。その他、可能であれば、活性阻害の対象であるHDACの不活性型タンパク質（ドミナントネガティブ）などを阻害物質として使用してもよい。  HDAC遺伝子の機能を低下または喪失させる場合、遺伝子機能を低下または喪失させる対象となるHDACのアイソフォームは、使用する抗体産生B細胞によっても異なるが、好ましくは、HDAC2遺伝子である（詳細は、特許文献２を参照のこと）。
【００２３】  前記実施形態に関連した本発明の実施形態には、本発明のトリB細胞からなる抗体産生細胞ライブラリーが含まれる。当該細胞ライブラリーとは、本発明のトリB細胞であって、様々な抗原に対する抗体を産生する該トリB細胞の集団のことである。本発明の上記実施形態に記載したトリB細胞は、トリ抗体偽遺伝子座にヒト由来の抗体可変領域由来のDNA配列を挿入等することで産生される抗体可変領域配列に多様性が生じ、また、クロマチンの弛緩等の処理により、さらに抗体可変領域の配列が多様化し、様々な抗原に対する抗体を産生し得る能力を持つ細胞である。  従って、本発明のトリB細胞を複数含む集団は、多様な抗原に対する抗体を産生する細胞集団であるということができる。
【００２４】  本発明の他の実施形態は、本発明のトリB細胞から抗体を産生する方法、および、調製された抗体である。  本発明のトリB細胞から産生される抗体は、ヒト型抗体であり、より好ましくは、ヒト抗体である。ヒト型抗体とは、産生される抗体の重鎖または軽鎖のアミノ酸配列に、トリ遺伝子由来の配列が一部含まれた抗体のことであり、ヒト抗体とは、産生される抗体の重鎖または軽鎖のアミノ酸配列が全てヒト遺伝子由来の配列である抗体のことである。  本発明のトリB細胞を該細胞に適した培養条件で培養を行うと、ヒト型抗体またはヒト抗体を産生する。DT40細胞のようなトリB細胞由来の細胞株においては、それほど高い効率ではないが、抗体遺伝子座において遺伝子変換が生じていることが知られている。従って、本発明のトリB細胞においても、遺伝子変換が生じており、ヒト由来の抗体遺伝子を挿入された抗体遺伝子座の遺伝子変換によって、産生される抗体の第一次の多様性が獲得されている。さらに、その上で、本発明のトリB細胞のクロマチンを弛緩させることにより、抗体遺伝子座における遺伝子変換効率をさらに上昇させることで、より多様な抗体を産生し得るトリB細胞の集団を調製することが可能である。このようなクロマチンの弛緩を利用して、所望の抗原特異性を示す抗体を産生するトリB細胞を選択するために、ADLibシステムを利用することができる。前述の抗体産生細胞ライブラリーは、ADLibシステムを利用することによっても調製が可能である（特許文献１または非特許文献１を参照のこと）。  また、特に、膜結合蛋白質に対する所望の抗体を取得する方法としては、ADLib  axCELL（antigen expressing cell）法を利用することができる（WO2010/064454）。
【００２５】  本発明の他の実施形態には、本発明のトリB細胞の作製または抗体を産生させるためのキットが含まれる。  トリB細胞を作製するためのキットとしては、トリB細胞を培養するために必要な培地や必要なサプリメントなどの他、トリB細胞の抗体遺伝子座等において、ヒト抗体遺伝子由来のDNA配列を挿入あるいは、ヒト抗体遺伝子由来のDNA配列で置換を行うためのベクターや、試薬類が含まれる。さらには、抗体産生細胞ライブラリーを調製するために必要な要素、例えば、HDAC阻害剤やHDAC遺伝子の機能低下または機能喪失を行うために必要な試薬類が含まれていてもよい。  さらに、抗体を産生するためのキットには、所望の抗原特異性を有する抗体を選択するための試薬類として、例えば、種々の抗原、磁気ビーズなどの他、磁気ビーズ調製用試薬、抗体選択に使用される標識抗体、ELISAなどの検査に必要なプレートなど、抗体の作製に必要と考えられるものであれば、いかなる物が含まれていてもよい。  以下に実施例を示してさらに詳細に説明するが、本発明は実施例により何ら限定されるものではない。
【実施例】
【００２６】遺伝子変換の確認１．ベクターの調製１−１．トリ抗体軽鎖（Igλ）の定常領域・可変領域の置換（human LC KI vector)  トリIgλの定常領域および可変領域を置換するために、図１に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を以下に示す。（１）ヒトIgλの可変領域および定常領域  ヒトバーキットリンパ腫細胞株Ramosから調製したcDNAを鋳型として、センスプライマー（TCCACCATGGCCTGGGCTCTG）（配列番号１）とアンチセンスプライマー（GTTGAGAACCTATGAACATTCTGTAGGGGCCAC）（配列番号２）とを用いたPCRにより、ヒト抗体軽鎖（Igλ）の可変領域および定常領域を増幅し、pGEM-T-Easy（プロメガ社）にクローニングし、pGEM-hIgG1-LCを得た。このプラスミドpGEM-hIgG1-LCを鋳型として、センスプライマー（ATTGGCGCGCCTCTCCAGGTTCCCTGGTGCAGGCACAGTCTGCCCTGACTCAGC）（配列番号３）とアンチセンスプライマー（TTCCATATGAGCGACTCACCTAGGACGGTCAGCTTGGTCC）（配列番号４）とを用いたPCRにより、ヒトIgλの可変領域（配列番号５）を得た。また、pGEM-hIgG1-LCを鋳型として、センスプライマー（ATTGGCGCGCCTCTGCCTCTCTCTTGCAGGTCAGCCCAAGGCTGCCCCCTC）（配列番号６）とアンチセンスプライマー（GGAATTCCATATGGAGTGGGACTACTATGAACATTCTGTAGGGG）（配列番号７）とを用いたPCRによりヒトIgλの定常領域（配列番号８）を得た。【００２７】（２） Left Arm  ニワトリB細胞株DT40のゲノムDNAを鋳型にして、センスプライマー（GAGATCTCCTCCTCCCATCC）（配列番号９）とアンチセンスプライマー（CAAAGGACACGACAGAGCAA）（配列番号１０）とを用いたPCRによりトリIgλの可変領域上流から定常領域下流までの領域を増幅した。電気泳動によりFunctional allele（機能性対立遺伝子）とNon-functional allele（非機能性対立遺伝子）に分離し、約8.0kbpのFunctional alleleを切り出し、pGEM-T-Easyにクローニングし、pGEM-cIgM-LCgenomeを得た。pGEM-cIgM-LCgenomeを鋳型にして、センスプライマー（TGTCTCGAGTGAAGGTCACCAAGGATGG））（配列番号１１）とアンチセンスプライマー（TTAAGCTTGGAGAGGAGAGAGGGGAGAA）（配列番号１２）とを用いたPCRにより、配列番号１３に示すLeft Armを得た。【００２８】（３）Center ArmpGEM-cIgM-LCgenomeの配列解析からトリIgλの可変領域と定常領域の間に位置するイントロン領域の配列を決定し、配列番号１４に示すCenter Arm（途中に、両端にloxP配列を有するブラストサイジン耐性遺伝子を挿入している）を合成した。【００２９】（４） Right Arm  pGEM-cIgM-LCgenomeを用いてトリIgλの定常領域の下流領域の配列を決定し、配列番号１５に示すRight Arm（途中に、両端にlox2272配列を有するネオマイシン耐性遺伝子を挿入している）を合成した。【００３０】（５） ターゲティングベクターの構築  pBluescriptに前記のLeft Arm、ヒトIgλ可変領域、Center Arm、ヒトIgλ定常領域、Right Armを図１に示す構造になるよう組み込み、human LC KI vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号１６に示す。【００３１】１−２．トリ抗体軽鎖（Igλ）の偽遺伝子領域下流へのノックイン（KI-C-IN vector）  トリIgλの偽遺伝子領域下流に、遺伝子変換を確認するための配列（GC確認配列；ヒトIgλの可変領域由来配列から成るヒト偽遺伝子。）（配列番号１７）を挿入するために、まず図２に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を以下に示す。（１）Left Arm  DT40のゲノムDNAを鋳型にし、センスプライマー（TTCTGTGAGCTGAGAAAAGGAGTGTA）（配列番��１８）とアンチセンスプライマー（CCTGCATTGTGGCACAGCGGGGTT）（配列番号１９）を用いて、可変領域のプロモーターより上流の4.3kb（偽遺伝子（pV）1〜3）をPCRで増幅した後、pCR4blunt-TOPO（ライフテクノロジーズ社）にクローニングし、pCR4-cIgM-LC pV1genomeを得た。この配列に基づき、pV1~3を含む領域（配列番号２０）をクローニングし、Left Armとした。（２）Right Arm  前項で得たpCR4-cIgM-LCpV1genomeの配列に基づき、pV1とプロモーターの間の領域（配列番号２１）にあたる部分をクローニングし、Right Armとした。（３）ターゲティングベクターの構築  pCR4blunt-TOPOに前記のLeft Arm、ネオマイシン耐性遺伝子、Right Armを図２に示す構造になるよう組み込み、KI-C-IN vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号２２に示す。【００３２】１−３．トリ抗体軽鎖（Igλ）の偽遺伝子領域下流へのGC確認配列の挿入（KI-C-IN-C vector）  トリIgλの偽遺伝子領域下流に、GC確認配列を挿入するために、図２に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を以下に示す。（１）GC確認用配列  上記１−１でクローニングしたヒトIgλの可変領域に基づき、それぞれのCDRに3塩基ずつ挿入した変異配列と3塩基ずつ欠損させた変異配列を設計し、それをトリIgλ偽遺伝子領域の非翻訳領域配列を用いて連結したGC確認用配列（配列番号１７）を合成した。（２）ターゲティングベクターの構築  上記１−２で作製したKI-C-IN vectorに、GC確認用配列を図２に示す構造になるよう組み込み、KI-C-IN-C vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号２３に示す。【００３３】１−４．トリ抗体軽鎖（Igλ）の偽遺伝子領域の欠損（KI-C-DE vector）  トリIgλの偽遺伝子領域を欠損させるために、図３に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を以下に示す。（１）Left Arm  DT40のゲノムDNAを鋳型にし、センスプライマー（CGCTTTGTACGAACGTTGTCACGT）（配列番号２４）とアンチセンスプライマー（TACCTGAAGGTCTCTTTGTGTTTTG）（配列番号２５）を用いて、pV25より上流の約3.0kbをPCRで増幅した後、pCR4blunt-TOPOにクローニングし、配列番号２６に示すLeft Armを得た。（２）Right Arm  上記１−２で調製したRight Armと同じものを用いた。（３）ターゲティングベクターの構築  pCR4blunt-TOPOに前記のLeft Arm、ネオマイシン耐性遺伝子、Right Armを図３に示す構造になるよう組み込み、KI-C-DE vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号２７に示す。【００３４】１−５．トリ抗体軽鎖（Igλ）の偽遺伝子領域をGC確認用配列に置換（KI-C-DE-C vector）  トリIgλの偽遺伝子領域を、GC確認用配列に置換するために、図３に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を以下に示す。（１）GC確認用配列  上記１−２で調製したGC確認用配列を用いた。（２）ターゲティングベクターの構築  上記１−３で作製したKI-C-DE vector に、前記のGC確認用配列を図３に示す構造になるよう組み込み、KI-C-DE-C vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号２８に示す。【００３５】１−６．トリ抗体重鎖（IgM）の定常領域・可変領域へのノックイン  トリIgM（IgM）の可変領域から定常領域μ１にかけての領域を、ヒト抗体重鎖（IgG1）に置換するために、図４に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を���下に示す。（１）ヒトIgG1定常領域  ヒトIgG1 を含むヒトゲノム染色体14 32.33のショットガンシークエンシングで得られた配列のうち、IgG1に相当する配列を取得した（アクセッション番号：NW_001838121.1）。４１５２０番塩基と４３１１７番塩基の間の配列から“IGH1”の”C_region”にあたるCH1, hinge, CH2, CH3, transmembrane domainの配列を抽出し、イントロンをマウスIgG2a由来の配列に置き換えた配列を設計し、合成によってヒトIgG1定常領域配列（配列番号２９）を得た。（２）ヒトIgG1可変領域  ヒトの生殖細胞由来のIgG1可変領域遺伝子の配列に基づいて、VH3-23, D5-12, JH1配列を連結した配列を設計し、トリ由来の分泌シグナル配列やスプライシングシグナル配列を付加して、ヒトIgG1可変領域（配列番号３０）とした。（３）Left Arm  DT40のゲノムDNAを鋳型にして、センスプライマー (TTCCCGAAGCGAAAGCCGCGT)（配列番号３１） とアンチセンスプライマー (ACTCACCGGAGGAGACGATGA)（配列番号３２）を用いて、トリIgM可変領域上流から可変領域にかけての領域をPCRで増幅し、約4.1kbpのフラグメントをクローニングし、pCR4 Blunt-TOPO-cIgM-HC pV1genomeを得た。この配列に基づき、3’側にVlox配列を付加したLeft Arm（配列番号３３）を設計・合成した。【００３６】（４）Center Arm 1  上記のLeft Armのクローニングの際にクローニングしたトリIgM可変領域上流から可変領域にかけての約4.1kbpの配列に基づきトリIgM可変領域上流の約1.4kbpに相当するCenter Arm 1を合成した（配列番号３４）。（５）Center Arm 2  DT40のゲノム DNAを鋳型にして、センスプライマー （GGGGATCCTGGGTCAGTCGAAGGGGGCG）（配列番号３５）とアンチセンスプライマー（GTGCGGCCGCCAAAAGCGGTAAAATCCACCC）（配列番号３６） を用いて、トリIgM可変領域下流の約4.3kbpをPCRで増幅した後クローニングし、配列番号３７に示すCenter Arm 2を得た。（６）Right Arm  DT40のゲノム DNAを鋳型にして、センスプライマー （CCAAACCACCTCCTGGTGTCC）（配列番号３８）とアンチセンスプライマー （CAAACCAAAACTACGGATTCTCTGACC）（配列番号３９）を用いて、トリIgM定常領域μ2を含む約0.9kbpをPCRで増幅した後クローニングし、配列番号４０に示すRight Armを得た。（７）ターゲティングベクターの構築  pBluescriptに前記のLeft Arm、マルチクローニングサイト、Center Arm1、ヒトIgG1可変領域、ブラストサイジン耐性遺伝子、Center Arm 2、ヒトIgG1定常領域、ネオマイシン耐性遺伝子、Right Armを図４に示す構造になるよう組み込み、human HC V-C vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号４１に示す。【００３７】１−７．トリ抗体重鎖（IgM）の定常領域・可変領域・偽遺伝子領域へのノックイン（human HC KI vector）  トリIgMの偽遺伝子領域下流から定常領域μ１にかけての領域に、遺伝子変換を確認するための配列（GC確認配列；ヒトIgγの可変領域由来配列から成るヒト偽遺伝子。）、ヒトIgG1可変領域およびヒトIgG1定常領域を挿入するために、図４に示すようなターゲティングベクターを作製した。それぞれのパーツの作製方法を以下に示す。（１）ヒトIgG1定常領域  上記１−６に記載したヒトIgG1定常領域配列を用いた。（２）ヒトIgG1可変領域  上記１−６に記載したヒトIgG1可変領域を用いた。（３）遺伝子変換確認用配列  上記１−６で設計したヒトIgγの可変領域に基づき、CDR1を1塩基欠損させ、CDR2を2塩基欠損させ、CDR3を1塩基挿入した変異配列を設計し、それをトリIgγ偽遺伝子領域の���翻訳領域配列を用いて連結したGC確認用配列（配列番号４２）を合成した。（４）Left Arm  上記１−６に記載したLeft Armを用いた。【００３８】（５）Center Arm 1  上記１−６に記載したCenter Arm 1を用いた。（６）Center Arm 2  上記１−６に記載したCenter Arm 2を用いた。（７）Right Arm  上記１−６に記載したRight Armを用いた。（８）ターゲティングベクターの構築  pBluescriptに前記のLeft Arm、GC確認用配列、Center Arm 1、ヒトIgG1可変領域、ブラストサイジン耐性遺伝子、Center Arm 2、ヒトIgG1定常領域、ネオマイシン耐性遺伝子、Right Armを図４に示す構造になるよう組み込み、human HC KI vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号４３に示す。【００３９】１−８．Creリコンビナーゼを発現するベクターの構築  前記で作製したベクターの薬剤耐性遺伝子は両端にloxP配列を付加した形でベクターに組み込んでいるため、遺伝子導入後にCre リコンビナーゼを作用させることで当該遺伝子を除去することができる。そこで、pEGFP-C1（BD Bioscience社、#6084-1）に、配列番号４４で示すCreリコンビナーゼ遺伝子を組み込み、配列番号４５に示すCre_EGFP-C1を作製した。【００４０】２．軽鎖をヒト配列に挿入・置換した細胞株の作製  宿主はニワトリのB細胞由来細胞株であるDT40を用いた。DT40の培養方法は以下の方法で行った。  CO2恒温槽を用いて、39.5℃、5 % CO2存在下で培養した。培地はIMDM （ライフテクノロジーズ社）を用い、9 % FBS、1 % ニワトリ血清、ペニシリン100単位/mL、ストレプトマイシン100μg/mL、モノチオグリセロール 50μMを加えて使用した。以下、特に断りがない限り、「培地」とは前記組成のものを指す。  軽鎖での遺伝子変換を評価するために、下表に示す5種類の細胞株を用意した。【表１】
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作製方法を以下に示す。
【００４１】２−１．可変領域・定常領域をヒト型に置換した細胞株の作製  上記１−１で調製したhuman LC KI vectorを制限酵素NotIで直鎖状にした後、DT40細胞にエレクトロポレーション法により遺伝子導入した。2 mg/mL のG418および10μg/mLのブラストサイジンを加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座で遺伝子の置換が起こっていた細胞株を選択した。その細胞株に、上記１−８で作製したCre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、フローサイトメトリーによるsingle cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行い、薬剤耐性遺伝子が除去されていることが確認できた細胞株37-3を得た。その後、上記１−２で作製したKI-C-IN vectorを制限酵素NotIで直鎖状にした後、細胞株37-3に遺伝子導入した。2 mg/mL のG418を加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座に遺伝子の挿入が起こっていた細胞株LP1を得た（図５）。【００４２】２−２．可変領域・定常領域をヒト型に置換し、さらにトリ偽遺伝子領域の下流に遺伝子変換確認用配列（GC配列）を挿入した細胞株の作製  上記１−３で調製したKI-C-IN-C vectorを制限酵素NotIで直鎖状にした後、前段で得られた細胞株37-3に遺伝子導入した。2 mg/mL のG418を加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座に遺伝子の挿入が起こっていた細胞株LP9を得た（図６）。【００４３】２−３．可変領域・定常領域をヒト型に置換し、さらにトリ偽遺伝子領域を欠損させた細胞株の作製  上記１−４で調製したKI-C-DE vectorを制限酵素NotIで直鎖状にした後、上記２−１で得られた細胞株37-3に遺伝子導入した。2 mg/mL のG418を加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座に遺伝子の挿入が起こっていた細胞株LP18を得た（図７）。【００４４】２−４．可変領域・定常領域をヒト型に置換し、さらにトリ偽遺伝子領域を遺伝子変換確認用配列（GC配列）に置換した細胞株の作製  上記１−５で調製したKI-C-DE-C vectorを制限酵素Not Iで直鎖状にした後、上記２−１で得られた細胞株37-3に遺伝子導入した。2 mg/mL のG418を加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座で遺伝子の置換が起こっていた細胞株LP20を得た（図８）。【００４５】３．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）３−１．フローサイトメトリーによる解析  上記２で作製した細胞株の細胞表面に発現している抗体の解析を行った。それぞれの細胞株を培養し、96ウェルプレート（Nunc社、249662）に5 × 105個ずつ分注し、150μLのFACS バッファー（0.3 % 牛血清アルブミン（BSA）を含むPBS）で2度洗浄した後、Goat anti-Chicken IgM-FITC conjugate（Bethyl社、A30-102F-20）、Goat Anti-Human IgG（Gamma chain specific）R-PE conjugate（Southern biotech社、A2040-09）またはGoat Anti-human lambda PE conjugate（Southern biotech社、2070-09）をFACSバッファーでそれぞれ1000倍、500倍、500倍に希釈した1次抗体液50μLを添加した。氷上暗所で30分インキュベートした後、150μLのFACS バッファーで2度洗浄し、FACS バッファーで1000倍希釈したPI溶液200μLを添加し、懸濁した。この懸濁液をフローサイトメトリー��析に供し、トリIgMおよびヒトIgγ（重鎖）またはヒトIgλ（軽鎖）の発現を解析したところ、図９に示すように、野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株のLP1、 LP9、LP18、LP20ではトリIgMおよびヒトIgλが発現していることを確認した。いずれの細胞株においても、遺伝子導入を行っていないIgγの発現は認められなかった。【００４６】３−２．ELISAによる解析  上記２で作製された細胞から培養上清中に分泌されているトリIgMおよびヒトIgG1の濃度の測定を行った。それぞれの細胞株を、ニワトリ血清を含まない培地で4 × 105 cells/mLに懸濁した後、24-well プレートに2 mLずつ播種し、3日間培養した後、培養液を回収し、0.22μm filterで濾過した後、測定に用いた。  IgGの測定方法は以下の通りである。1.0μg/mLのGoat anti-Human IgG-Fc affinity purified（Bethyl社、A80-104A）20μLをイムノ384ウェルプレートマキシソープ（Nunc社、464718）に分注し室温で1時間以上反応させ、プレートに固相化した。その後、洗浄液（0.05 % Tween20を含むPBS）で5回洗浄し、ブロッキング液（1 % BSAを含むPBS）50μLを加え、室温で30分間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、測定試料または標準物質となるHuman IgG1 Lambda-UNLB（SouthernBiotech社、0151L-01）を20μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、Goat anti-Human IgG-Fc HRP conjugated（Bethyl社、A80-104P）を1 % BSAおよび0.05 % Tween20を含むPBSで1000倍に希釈したものを20μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、TMB+（Dako社、S159985）20μLを加え、室温で3分発色反応させ、1 N硫酸20μLを加えて反応を停止させた。Infinite M1000（TECAN社）を用いて、450 nmの吸光度を測定した。  IgMの測定にはalphaLISAイムノアッセイ（Perkin Elmer社）のシステムを用いた。Goat anti-chicken IgM antibody （Bethyl社、A30-102A）をChromalinkTM Biotin Labeling Reagent（SoluLink Inc., #B1001-105）を用いてビオチン標識し、ビオチン化抗体を調製した。次に、Goat anti-chicken IgM antibody （Bethyl社、A30-102A）をUnconjugated AlphaLISAアクセプタービーズ（Perkin Elmer社）と結合させ、抗体結合Alpha Screenビーズを調製した。このビオチン標識抗体および抗体結合Alpha Screenビーズを、アッセイバッファー（1 % BSAを含むPBS）でそれぞれ4.5 nMおよび50μg/mLに希釈した後、等量を混合し、トリIgM濃度測定溶液とした。96ウェルプレート（Nunc社）において、トリIgM濃度測定溶液 20μLと測定試料または標準物質となるトリ血清（GIBCO社、16110） 5μLを混合した後、12.5μLずつをAlpha Plate-384（Perkin Elmer社）に分注した。室温で60分反応させた後、アッセイバッファーで80μg/mLに調製したAlphaScreen streptavidinドナービーズ（Perkin Elmer社）を12.5μL加え、室温遮光にて30分間反応させた。その後、EnSpire（Perkin Elmer社）を用いて解析を行った。  測定結果を表２に示す。野生型のDT40と同様に、形質転換株のLP1、LP9、LP18、LP20でもトリIgMが分泌されていることを確認した。【表２】
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【００４７】４．遺伝子変換の確認  上記３においてヒトIgλ（軽鎖）の発現を確認した細胞株を、2.5 ng/mLのTSAを含む培地で20日間培養した後、1 × 106個の細胞からゲノムDNAを抽出した。このゲノムDNAを鋳型とし、識別配列を付与したセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を増幅し、アガロースゲル抽出による精製を行った後、QIAGEN PCR Purification Kit（QIGEN社）を用いて濃縮した。ロシュ・ダイアグノスティックス社の次世代シークエンス解析システムを用いてこのサンプルの配列解析を行い、挿入したヒト偽遺伝子配列と同一の遺伝子配列が可変領域に存在するかどうかで遺伝子変換の有無を評価した。その結果を表３に示す。ヒト偽遺伝子配列を含まないLP1、LP18においては遺伝子変換が起こらなかったのに対し、ヒト偽遺伝子配列を持つLP9、LP20においては遺伝子変換が起こっていることを確認した。【表３】
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【００４８】５．重鎖をヒト配列に挿入・置換した細胞株の作製  重鎖での遺伝子変換を評価するために、表４に示す3種類の細胞株を用意した。【表４】
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作製方法を以下に示す。
【００４９】５−１．重鎖の可変領域・定常領域をヒト型に変換した細胞株の作製  上記１−６で得られたhuman HC V-C vectorを制限酵素SalIで直鎖状にした後、上記２−２で得られた細胞株37-3に遺伝子導入した。2 mg/mL のG418および10μg/mLのブラストサイジンを加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座で遺伝子の置換が起こっている細胞株T18を得た（図１０）。【００５０】５−２．重鎖の可変領域・定常領域をヒト型に変換し、偽遺伝子領域下流に遺伝子変換確認用配列（GC確認配列）を挿入した細胞株の作製  上記１−７で得られたhuman HC KI vectorを制限酵素SalIで直鎖状にした後、上記２−２で得られた細胞株37-3に遺伝子導入した。2 mg/mL のG418および10μg/mLのブラストサイジンを加えた培地で7〜10日間培養した。生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行い、目的の遺伝子座で遺伝子の置換が起こっている細胞株T11、T12を得た（図１１）。【００５１】６．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）６−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３−１に記載した方法に基づき、上記５で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図１２に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株であるT18、T11、T12においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した。【００５２】６−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載した方法に基づき、上記５で作製した細胞から培養上清中に分泌される抗体の濃度の測定を行った。その結果を表５に示す。６−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、ヒトIgG1を導入したT18, T11, T12はヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表５】
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【００５３】７．遺伝子変換の確認  上記６で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、センスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号４８）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCC ATCAGNNNNNNNNNNCGGTGACCAGGGTGCCCTG）（配列番号４９）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。その結果を表６に示す。ヒト偽遺伝子を含まないT18においては全く遺伝子変換が起こらなかったのに対し、ヒト偽遺伝子配列を持つT11、T12においては遺伝子変換が起こっていることを確認した。【表６】
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【００５４】軽鎖・重鎖に各5個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL5/H5細胞株の作製８．ベクターの調製８−１．トリ抗体（Igλ）偽遺伝子領域へのノックイン  トリIgλの偽遺伝子領域を、ヒトIgλの可変領域由来配列から成る偽遺伝子（ヒト軽鎖偽遺伝子）に置換するために、図１３に示すようなターゲティングベクターを作製した。作製方法を以下に示す。（１）ヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列（pVL5）の設計と作製  データベース上のヒトゲノムのV(D)J組換えを起こしていないイムノグロブリンλ軽鎖可変領域の遺伝子配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を各々5個選択し、１−１でクローニングしたIgλ可変領域のフレームワーク配列を組み合わせることで5個の配列pVL001（配列番号６９）、 pVL002（配列番号７０）、pVL003（配列番号７１）、pVL004（配列番号７２）およびpVL005（配列番号７３）を設計し、これらを含むヒト軽鎖偽遺伝子配列pVL5（配列番号５０）を設計し、遺伝子合成した。（２）ターゲティングベクターの作製  上記１−４で作製したKI-C-DE vectorを元に、GC確認用配列を前項のヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列pVL5に置換することで、human LCpV KI vectorを作製した。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号５１に示す。【００５５】８−２．トリ抗体重鎖（IgM）定常領域の置換  トリIgMの重鎖定常領域をヒトIgG1に置換するために、図１４に示すようなターゲティングベクターを作製した。作製方法を以下に示す。（１）ヒトIgG1定常領域  上記１−６で作製したヒトIgG1定常領域を用いた。（２）Left Arm  上記１−６で作製したCenter Arm 2を用いた。（３）Right Arm  上記１−６で作製したRight Armを用いた。（４）ターゲティングベクターの作製  pBluescriptに前記のLeft Arm、ヒトIgG1定常領域配列、ネオマイシン耐性遺伝子、Right Armを組み込み、human CH KI vectorを作製した。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号５２に示す。【００５６】８−３．トリIgM可変・偽遺伝子領域への挿入（１）ヒトIgG1可変領域  上記１−６で調製したヒトIgG1可変領域を用いた。（２）ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列（pVH5）の設計と作製  データベース上のヒトイムノグロブリン重鎖可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を各々5個選択し、上記１−６でクローニングした可変領域のフレームワーク配列を組み合わせることで5個の配列pVH001（配列番号８９）、pVH002（配列番号９０）、pVH003（配列番号９１）、pVH004（配列番号９２）およびpVH005（配列番号９３）を設計し、これらを含むヒト抗体重鎖偽遺伝子配列pVH5（配列番号５３）を設計し、遺伝子合成した。（３）Left Arm  上記１−６で調製したLeft Armを用いた。（４）Center Arm  上記１−６で調製したCenter Arm 1を用いた。（５）Right arm  上記１−６で調製したCenter Arm 2を用いた。確認されたRight Armの配列を配列番号５４に示す。（６）ターゲティングベクターの調製  pBluescriptに前記のLeft Arm、ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列pVH5、Center Arm、ヒトIgG1可変領域配列、ブラストサイジン耐性遺伝子、Right Armを組み込み、human pVH VH KI vectorを得た。当該ベクターの遺伝子配列を配列番号５５に示す。【００５７】９．トリ抗体軽鎖および重鎖の遺伝子座に各5個のヒト偽遺伝子を導入したL5/H5細胞株の作製  上記２−２で得られた細胞株37-3に、上記８−２で調製したhuman CH KI vector、上記８−３で調製したhuman pVH VH KI vector、上記８−１で調製したhuman LC pV KI vectorを遺伝子導入することで、L5/H5細胞株細胞株を作製した（図１５）。  制限酵素SalIで直鎖状にしたhuman CH KI vectorを37-3に遺伝子導入し、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  次に、制限酵素SacIで直鎖状にしたhuman pVH VH KI vectorを遺伝子導入し、10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  最後に、制限酵素NotIで直鎖状にしたhuman LC pV KI vectorを遺伝子導入し、2mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行ったところ、目的の遺伝子座で置換が起こっている細胞株B-B10およびJ-D3を得た（図１６、図１７）。【００５８】１０．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）１０−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３−１に記載した方法に基づき、上記９で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図１８に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株であるB-B10およびJ-D3においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した。【００５９】１０−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載されている方法に基づき、上記９で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表７に示す。１０−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株のB-B10およびJ-D3ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表７】
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【００６０】１１．遺伝子変換の確認  上記１０で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で42日間培養した細胞から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー （CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。B-B10での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析の結果をそれぞれ表８および表９に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においても挿入したヒト偽遺伝子由来の配列を含むクローンが確認され、遺伝子変換によって多様な配列が生み出されていることが示された。また、J-D3においても同様に、遺伝子変換によって多様な配列が生み出されていることを確認した。【表８】
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【表９】
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【００６１】トリ抗体の軽鎖・重鎖遺伝子座に各15個のヒト可変領域由来配列を挿入したL15/H15細胞株の作製１２．ベクターの調製１２−１．トリ抗体軽鎖（Igλ）可変・定常領域へのノックイン  上記１−１に記載した方法に基づき、図１９に示すターゲティング用ベクターLambda-VL-CL KI vector 2.0を作製した。（１）ヒトIgλの可変領域および定常領域  上記１−１で作製した可変領域および定常領域を用いた。（２）Left Arm  上記１−１で作製したLeft Armを用いた。（３）Center Arm  上記１−１で作製したCenter Armを用いた。（４）Right Arm  上記１−１で決定したトリ抗体軽鎖の定常領域の下流領域の配列に基づき、Right Armを合成した。（５）ターゲティングベクターの構築  pBluescriptに前記のLeft Arm、ヒトIgλ可変領域、Center Arm、ヒトIgλ定常領域、Right Armを図１９に示す構造になるよう組み込み、Lambda-VL-CL KI vector 2.0（配列番号５８）を得た。【００６２】１２−２．トリ抗体軽鎖（Igλ）偽遺伝子のノックアウト（１）ヒトIgλ可変領域  上記１−１に記載した可変領域配列を用いた。（２）Left Arm  上記１−２に記載したLeft Arm を用いた。（３）Center Arm  上記１−１に記載したLeft ArmをCenter Armとして用いた。（４）Right Arm  上記１−１に記載したCenter ArmをRight Armを用いた。（５）マルチクローニングサイト  ヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列pVL15を挿入するために、配列番号５９に示すマルチクローニングサイトを設計した。（６）ターゲティングベクターの構築  pUC19にLeft Arm、ネオマイシン耐性遺伝子、マルチクローニングサイト、Center Arm, ヒトIgλ可変領域、ブラストサイジン耐性遺伝子、Right Armを組み込み、図１９に示すようなターゲティングベクターpVL KI_pUC19_step5_BrRev（配列番号６０）を構築した。【００６３】１２−３．トリ抗体軽鎖（Igλ）偽遺伝子・可変領域へのノックイン（１）ヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列（pVL15）  データベース上のヒトイムノグロブリンλ可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を15個選択し、上記１−１でクローニングしたヒトIgλ可変領域のフレームワーク配列を組み合わせることで15個の配列pVL101（配列番号７４）、pVL102（配列番号７５）、pVL103（配列番号７６）、pVL104（配列番号７７）、pVL105（配列番号７８）、pVL106（配列番号７９）、pVL107（配列番号８０）、pVL108（配列番号８１）、pVL109（配列番号８２）、pVL110（配列番号８３）、pVL111（配列番号８４）、pVL112（配列番号８５）、pVL113（配列番号８６）、pVL114（配列番号８７）、pVL115（配列番号８８）を設計し、これらを含むヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列pVL15（配列番号６１）を設計し、遺伝子合成した。（２）ターゲティングベクターの構築  上記１２−２で作製したpVL KI_pUC19_step6_BrRevのマルチクローニングサイトに前項のヒト偽遺伝子配列pVL15を組み込み、図１９に示すようなターゲティングベクターpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#odd（配列番号６２）を構築した。【００６４】１２−４．トリ抗体重鎖（IgM）定常領域へのノックイン  上記８−２で作製したhuman CH KI vectorを用いた。【００６５】１２−５．トリ抗体重鎖（IgM）可変領域へのノックイン（１）ヒトIgG1可変領域  上記１−６に記載した可変領域配列を用いた。（２）Left Arm  上記１−６に記載したCenter Armを用いた。（３）Right Arm  上記１−６に記載したRight Armを用いた。（４）ターゲティングベクターの���築  pUC19にLeft Arm、ヒトIgG1可変領域、ブラストサイジン耐性遺伝子、Right Armを組み込み、図２０に示すようなターゲティングベクターH(X)0・hV(B)_074-009/No4（配列番号６３）を作製した。【００６６】１２−６．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へのノックイン（１）ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列（pVH15）  データベース上のヒトイムノグロブリン重鎖可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を15個選択し、上記１−６でクローニングしたヒトIgG1可変領域のフレームワーク配列を組み合わせることで15個の配列pVH101（配列番号９４）、pVH102（配列番号９５）、pVH103（配列番号９６）、pVH104（配列番号９７）、pVH105（配列番号９８）、pVH106（配列番号９９）、pVH107（配列番号１００）、pVH108（配列番号１０１）、pVH109（配列番号１０２）、pVH110（配列番号１０３）、pVH111（配列番号１０４）、pVH112（配列番号１０５）、pVH113（配列番号１０６）、pVH114（配列番号１０７）、pVH115（配列番号１０８）を設計し、これらを連結したヒト抗体重鎖偽遺伝子配列pVH15（配列番号６４）を設計し、遺伝子合成した。（２）Left Arm  上記１−６に記載したLeft Armを用いた。（３）Right Arm  上記１−６に記載したCenter Armを用いた。（４）マルチクローニングサイト  ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列を挿入するために、配列番号６５に示すマルチクローニングサイトを設計した。（５）Creリコンビナーゼによる部位特異的組換え（RMCE法）  偽遺伝子配列領域が長くなると、相同組換えによる導入効率が低下することが知られている。そこで、Creリコンビナーゼを用いて簡便に偽遺伝子配列を挿入することができるよう、RMCE法を利用することとした。そこで、loxm3 rev配列とloxm7 rev RE配列を含むRMCE用カセット配列を設計した。（６）ターゲティングベクターの構築  pUC19にLeft Arm、ネオマイシン耐性遺伝子、RMCE用カセット配列、マルチクローニングサイト、Right Arm、ヒトIgG1可変領域を組み込んだ後、マルチクローニングサイトにヒト抗体重鎖偽遺伝子領域pVH15を組み込むことで、図２０に示すようなターゲティングベクター pVH KI_pUC19_step3_pVH#odd_15pVH_RMCE（配列番号６６）を作製した。【００６７】１３．細胞株の作製  DT40細胞に、上記１２−１で調製したLambda-VL-CL KI vector 2.0、上記１２−２で調製したpVL KI_pUC19_step5_BrRev、上記１２−３で調製したpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#odd、上記１２−４で調製したhuman CH KI vector、上記１２−５で調製したH(X)0・hV(B)_074-009/No4および上記１２−６で調製したpVH KI_pUC19_step3_pVH#odd_15pVH_RMCEを遺伝子導入することで、細胞株を作製した。  まず、制限酵素SalIで直鎖状にしたhuman CH KI vectorを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  次に、制限酵素NotIで直鎖状にしたLambda-VL-CL KI vector 2.0をDT40に遺伝子導入し、10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェ���タイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  さらに、制限酵素NotIで直鎖状にしたpVL KI_pUC19_step5_BrRevを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418と10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  次に、制限酵素NotIで直鎖状にしたpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#oddを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418と10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  最後に、制限酵素ScaIで直鎖状にしたH(X)0・hV(B)_074-009/No4および制限酵素NotIで直鎖状にしたpVH KI_pUC19_step3_pVH#odd_15pVH_RMCEを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418および10μg/mLのブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されている細胞株A12-3、A12-4、A12-5、B7-3、B7-9およびB7-11を得た。【００６８】１４．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）１４−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記１３で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図２１および図２２に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株のA12-3、A12-4、A12-5、B7-3、B7-9およびB7-11においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した（図２１、２２）。なお、図２１は、A12-5のIgλのヒストグラムに誤りがあったため、優先日前に取得していた正しいデータに修正した図２２を添付した。【００６９】１４−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載されている方法に基づき、上記１３で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表１０に示す。１０−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株のA12-3、A12-4、A12-5、B7-3、B7-9およびB7-11ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表１０】
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【００７０】１５．遺伝子変換の確認  上記１０で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で21日間ないしは42日間培養した細胞から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。そのうち、TSA存在下で21日間培養したB7-11での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果をそれぞれ表１１および表１２に、TSA存在下で42日間培養したB7-11での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表１３および表１４に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においてもヒト偽遺伝子由来の配列を含むようなクローンが確認され、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることが示された。また、他の細胞株でも同様に、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることを確認した。【表１１】
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【表１２】
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【表１３】
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【表１４】
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【００７１】軽鎖に15個、重鎖に30個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL15/H30細胞株の作製１６．ベクターの調製１６−１．トリ抗体軽鎖（Igλ）可変・定常領域へのノックイン  上記１２−１で作製したLambda-VL-CL KI vector 2.0を用いた。１６−２．トリ抗体軽鎖（Igλ）偽遺伝子のノックアウト  上記１２−２で作製したpVL KI_pUC19_step5_BrRevを用いた。【００７２】１６−３．トリ抗体軽鎖（Igλ）偽遺伝子・可変領域へのノックイン  上記１２−３で作製したpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#oddを用いた。【００７３】１６−４．トリ抗体重鎖（IgM）定常領域へのノックイン  上記８−２で作製したhuman CH KI vectorを用いた。【００７４】１６−５．トリ抗体重鎖（IgM）可変領域のノックイン（１）ヒトIgG1可変領域  上記１−６に記載した可変領域配列を用いた。（２）Left Arm  上記１−６に記載したLeft Armを用いた。（３）Center Arm  上記１−６に記載したCenter Armを用いた。（４）Right Arm  上記１−６に記載したRight Armを用いた。（５）RMCE用カセット配列  上記１２−６で設計したRMCE用カセット配列を用いた。（６）ターゲティングベクターの構築  pUC19にLeft Arm、ネオマイシン耐性遺伝子、RMCE用カセット配列、Center Arm、ヒトIgG1可変領域、Right Armを組み込み、図２３に示すようなターゲティングベクターpVH KI_pUC19_step5_BsrRev_RMCE_cassette（配列番号１０９）を作製した。【００７５】１６−６．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へのノックイン（１）ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列（pVH30）  データベース上のヒトイムノグロブリン重鎖可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を30個選択し、上記１−６でクローニングしたヒトIgG1可変領域のフレームワーク配列を組み合わせることで30個の配列pVH101（配列番号９４）、pVH102（配列番号９５）、pVH103（配列番号９６）、pVH104（配列番号９７）、pVH105（配列番号９８）、pVH106（配列番号９９）、pVH107（配列番号１００）、pVH108（配列番号１０１）、pVH109（配列番号１０２）、pVH110（配列番号１０３）、pVH111（配列番号１０４）、pVH112（配列番号１０５）、pVH113（配列番号１０６）、pVH114（配列番号１０７）、ｐＶＨ１１５（配列番号１０８）、pVH116（配列番号１１０）、pVH117（配列番号１１１）、pVH118（配列番号１１２）、pVH119（配列番号１１３）、pVH120（配列番号１１４）、pVH121（配列番号１１５）、pVH122（配列番号１１６）、pVH123（配列番号１１７）、pVH124（配列番号１１８）、pVH125（配列番号１１９）、pVH126（配列番号１２０）、pVH127（配列番号１２１）、pVH128（配列番号１２２）、pVH129（配列番号１２３）、pVH130（配列番号１２４）を設計し、これらを連結したヒト抗体重鎖偽遺伝子配列pVH30（配列番号１２５）を設計し、遺伝子合成した。（２）Left Arm  上記１−６に記載したLeft Armを用いた。（３）Right Arm  上記１−６に記載したCenter Armを用いた。（４）マルチクローニングサイト  ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列を挿入するために、配列番号６５に示すマルチクローニングサイトを設計した。（５）ターゲティングベクターの構築  pUC19にLeft Arm、ネオマイシン耐性遺伝子、マルチクローニングサイト、Right Arm、ヒトIgG1可変領域を組み込んだ後、マルチクローニングサイトにヒト抗体重鎖偽遺伝子領域pVH30を組み込むことで、図２４に示すようなターゲティングベクター pVH KI_pUC19_step3_pVH#odd_even（配列番号１２６）を作製した。【００７６】１７．細胞株の作製  DT40細胞に、上記１２−１で調製したLambda-VL-CL KI vector 2.0、上記１２−２で調製したpVL KI_pUC19_step5_BrRev、上記１２−３で調製したpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#odd、上記１２−４で調製したhuman CH KI vector、上記１６−５で調製したpVH KI_pUC19_step5_BsrRev_RMCE_cassetteおよび上記１６−６で調製したpVH KI_pUC19_step3_pVH#odd_evenを遺伝子導入することで、細胞株を作製した。  まず、制限酵素SalIで直鎖状にしたhuman CH KI vectorを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  次に、制限酵素NotIで直鎖状にしたLambda-VL-CL KI vector 2.0をDT40に遺伝子導入し、10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  さらに、制限酵素NotIで直鎖状にしたpVL KI_pUC19_step5_BrRevを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418および10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  次に、制限酵素NotIで直鎖状にしたpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#oddを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418および10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  さらに、制限酵素NotIで直鎖状にしたpVH KI_ pUC19_ step5_ BsrRev_ RMCE_ cassetteを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418および10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されていることを確認した。  最後に、制限酵素NotIで直鎖状にしたpVH KI_pUC19_step3_pVH#odd_evenを遺伝子導入し、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されている細胞株#7-7、#11-3および#11-6を得た。【００７７】１８．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）１８−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記���６で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図２５に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株の#7-7、#11-3および#11-6においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した（図２５）。【００７８】１８−２．ELISAによる解析  上記１７で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。ヒトIgGの測定は上記３−２に記載されている方法に基づいて行った。トリIgMの測定法は以下の通りである。  1.0μg/mLのGoat anti-chicken IgM（Bethyl社、A30-102A）20μLをイムノ384ウェルプレートマキシソープ（Nunc社、464718）に分注し、室温で1時間以上反応させ、プレート上に固相化した。その後、洗浄液（0.05 % Tween20を含むPBS）で5回洗浄し、ブロッキング液（1 % BSAを含むPBS） 50μLを加え、室温で30分間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、測定試料または標準物質となるトリ血清（GIBCO社、16110）を20μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、Goat anti-chicken IgM HRP conjugated（Bethyl社、A30-102P）を1 % BSAおよび0.05 % Tween20を含むPBSで5000倍に希釈したものを20μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、TMB+（Dako社、S159985） 20μLを加え、室温で3分発色反応させ、1 N硫酸 20μLを加えて反応を停止させた。Infinite M1000（TECAN社）を用いて、450 nmの吸光度を測定した。  その結果を表１５に示す。１３−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株の#7-7、#11-3および#11-6ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表１５】
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【００７９】１９．遺伝子変換の確認  上記１０で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で42日間培養した細胞株から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。そのうち、#11-6での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表１６および表１７に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においても追加挿入したヒト偽遺伝子由来の配列を含むクローンが確認され、L15/H15細胞株よりさらに多様な配列が生み出されていることが示された。また、他の細胞株でも同様に、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることを確認した。【表１６】
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【表１７】
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【００８０】軽鎖に30個、重鎖に30個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL30/H30細胞株の作製２０．トリ抗体軽鎖（Igλ）偽遺伝子・可変領域へのノックイン（１）ヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列（pVL30）  データベース上のヒトイムノグロブリンλ可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を30個選択し、上記１−１でクローニングしたヒトIgλ可変領域のフレームワーク配列を組み合わせることで30個の配列pVL101（配列番号７４）、pVL102（配列番号７５）、pVL103（配列番号７６）、pVL104（配列番号７７）、pVL105（配列番号７８）、pVL106（配列番号７９）、pVL107（配列番号８０）、pVL108（配列番号８１）、pVL109（配列番号８２）、pVL110（配列番号８３）、pVL111（配列番号８４）、pVL112（配列番号８５）、pVL113（配列番号８６）、pVL114（配列番号８７）、pVL115（配列番号８８）、pVL116（配列番号１２７）、pVL117（配列番号１２８）、pVL118（配列番号１２９）、pVL119（配列番号１３０）、pVL120（配列番号１３１）、pVL121（配列番号１３２）、pVL122（配列番号１３３）、pVL123（配列番号１３４）、pVL124（配列番号１３５）、pVL125（配列番号１３６）、pVL126（配列番号１３７）、pVL127（配列番号１３８）、pVL128（配列番号１３９）、pVL129（配列番号１４０）、pVL130（配列番号１４１）を設計し、これらを含むヒト抗体軽鎖偽遺伝子配列pVL30（配列番号１４２）を設計し、遺伝子合成した。（２）ターゲティングベクターの構築  上記１６−２のpVL KI_pUC19_step6_BrRevのMulti-cloning siteに前項のヒト偽遺伝子配列pVL30を組み込み、図２６に示すようなターゲティングベクターpVL KI_pUC19_step6_BrRev_#odd+even（配列番号１４３）を構築した。【００８１】２１．細胞株の作製  上記１７で作製したL15/H30細胞株に、上記２０で調製したpVL KI_pUC19_step6_BrRev_ #odd+evenを遺伝子導入することで、細胞株を作製した。  制限酵素NotIで直鎖状にしたpVL KI_pUC19_step6_BrRev_ #odd+evenを遺伝子導入し、2 mg/mLのG418および10μg/mLのブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されている細胞株#7-7-48-5、#7-7-48-7および#7-7-48-10を得た。【００８２】２２．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）２２−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記２１で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図２７に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株の#7-7-48-5、#7-7-48-7および#7-7-48-10においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した（図２７）。【００８３】２２−２．ELISAによる解析  上記１８−２に記載されている方法に基づき、上記２１で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表１８に示す。１３−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株の#7-7-48-5、#7-7-48-7および#7-7-48-10ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表１８】
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【００８４】２３．遺伝子変換の確認  上記２２で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で42日間培養した細胞株から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー （CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー （CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー （CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。そのうち、 7-7-48-10での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表１９および表２０に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においても追加挿入したヒト偽遺伝子由来の配列を含むクローンが確認され、偽遺伝子の個数を増やすことでさらに多様な配列が生み出されていることが示された。また、他の細胞株でも同様に、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることを確認した。【表１９】
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【表２０】
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【００８５】軽鎖に30個、重鎖に15個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL30/H15細胞株の作製２４． 細胞株の作製  上記１７で作製したL15/H15細胞株A12-4に、上記２０で調製したpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#odd+evenを遺伝子導入することで、細胞株を作製した。  制限酵素NotIで直鎖状にしたpVL KI_pUC19_step6_BrRev_pVL#odd+evenを遺伝子導入し、2 mg/mLのG418および10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した。その後、Cre_pEGFP-C1を遺伝子導入し、cell sortingによりGFP陽性細胞を選別した後、PCRによるジェノタイピングを行って薬剤耐性遺伝子が除去されている細胞株A77-3およびA77-2を得た。【００８６】２５．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）２５−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記２４で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図２８に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株のA77-3およびA77-2においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した（図２８）。【００８７】２５−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載されている方法に基づき、上記２４で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表２１に示す。１３−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株のA77-3およびA77-2ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表２１】
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【００８８】RMCE法を利用して軽鎖に30個、重鎖に30個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL30/H15f15fおよびL30/H15r15f細胞株の作製２６． ベクターの作製２６−１．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へ、順向きに構築した偽遺伝子15個をさらに挿入（１）ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列（pVH15a）  上記１６で設計したpVH116、pVH117、pVH118、pVH119、pVH120、pVH121、pVH122、pVH123、pVH124、pVH125、pVH126、pVH127、pVH128、pVH129、pVH130を順向きで連結させたpVH15a（配列番号１４４）を作製した。（２）ベクターの構築  pUC57-Ampベクターに、loxm3 rev配列、Neomycin耐性遺伝子、SV40 early polyA terminator、SV40 polyadenylation region、loxP for RE配列、pVH15a（順向き）、loxm7 rev LE配列を挿入し、図２９に示すようなベクターRMCE_pVH1stKI_pVH15evenFor（配列番号１４５）を作製した。【００８９】２６−２．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へ、逆向きに構築した偽遺伝子15個をさらに挿入  pUC57-Ampベクターに、loxm3 rev配列、Neomycin耐性遺伝子、SV40 early polyA terminator、SV40 polyadenylation region、loxP for RE配列、pVH15a（逆向き）、loxm7 rev LE配列を挿入し、図２９に示すようなベクターRMCE_pVH1stKI_pVH15evenRev（配列番号１４６）を作製した。【００９０】２７．細胞株の作製  L30/H15f15f細胞株は、上記２４で作製したL30/H15細胞株に、上記２６−１で調製したRMCE_pVH1stKI_pVH15evenForを導入して作製した。  RMCE_pVH1stKI_pVH15evenFor をCre_pEGFP-C1とともに遺伝子導入して部位特異的組換えを誘導した後、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した細胞株1-6-1および1-7-3を得た。  L30/H15r15f細胞株は、上記２４で作製したL30/H15細胞株に、上記２６−２で調製したRMCE_pVH1stKI_pVH15evenRevを導入して作製した。  RMCE_pVH1stKI_pVH15evenRev をCre_pEGFP-C1とともに遺伝子導入して部位特異的組換えを誘導した後、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した細胞株2-1-1および7-3-2を得た。【００９１】２８．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）２８−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記２７で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図３０に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株の1-6-1、1-7-3、2-1-1および7-3-2においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した（図３０）。【００９２】２８−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載されている方法に基づき、上記２７で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表２２に示す。１３−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株の1-6-1、1-7-3、2-1-1および7-3-2ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表２２】
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【００９３】２９．遺伝子変換の確認  上記１０で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で42日間培養した細胞株から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー （CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー （CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー （CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー （CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。そのうち、1-6-1での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表２３および表２４に、7-3-2での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表２５および表２６に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においても追加挿入したヒト偽遺伝子由来の配列を含むクローンが確認され、L30/H30細胞株と同様に多様な配列が生み出されていることが示された。また、他の細胞株でも同様に、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることを確認した。【表２３】
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【表２４】
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【表２５】
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【表２６】
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【００９４】RMCE法を利用して軽鎖に30個、重鎖に45個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL30/H15f15f15fおよびL30/H15r15r15f細胞株の作製３０． ベクターの作製３０−１．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へ、順向きに構築した偽遺伝子15個をさらに挿入（１）ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列（pVH15b）  データベース上のヒトイムノグロブリン重鎖可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を新たに15個選択し、pVH131（配列番号１４７）、pVH132（配列番号１４８）、pVH133（配列番号１４９）、pVH134（配列番号１５０）、pVH135（配列番号１５１）、pVH136（配列番号１５２）、pVH137（配列番号１５３）、pVH138（配列番号１５４）、pVH139（配列番号１５５）、pVH140（配列番号１５６）、pVH141（配列番号１５７）、pVH142（配列番号１５８）、pVH143（配列番号１５９）、pVH144（配列番号１６０）、pVH145（配列番号１６１）を順向きで連結させたpVH15b（配列番号１６２）を作製した。【００９５】（２）ベクターの構築  pUC57-Ampベクターに、loxm3 rev配列、ブラストサイジン耐性遺伝子、SV40 early polyA terminator、SV40 polyadenylation region、loxm7 rev RE配列、pVH15b（順向き）、loxP for LE配列を挿入し、図３１に示すようなベクターpVH15B-ver3_RMCE2nd_For（配列番号１６３）を作製した。【００９６】３０−２．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へ、逆向きに構築した偽遺伝子15個をさらに挿入  pUC57-Ampベクターに、loxm3 rev配列、ブラストサイジン耐性遺伝子、SV40 early polyA terminator、SV40 polyadenylation region、loxm7 rev RE配列、pVH15b（逆向き）、loxP for LE配列を挿入し、図３１に示すようなベクターpVH15B-ver3_RMCE2nd_Rev（配列番号１６４）を作製した。【００９７】３１．細胞株の作製  L30/H15f15f15f細胞株は、上記２で作製したL30/H15f15f細胞株に、上記３０−１で調製したpVH15B-ver3_RMCE2nd_Forを導入して作製した。  pVH15B-ver3_RMCE2nd_For をCre_pEGFP-C1とともに遺伝子導入して部位特異的組換えを誘導した後、10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した細胞株2-1-3、2-1-11、1-n-1および2-n-3を得た。  L30/H15r15r15f細胞株は、上記２７で作製したL30/H15r15f細胞株に、上記２７−２で調製したpVH15B-ver3_RMCE2nd_Revを導入して作製した。  pVH15B-ver3_RMCE2nd_Rev をCre_pEGFP-C1とともに遺伝子導入して部位特異的組換えを誘導した後、10μg/mL のブラストサイジンを含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した細胞株4-1-5、4-1-7および3-1-11を得た。【００９８】３２．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）３２−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記３１で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図３２および図３３に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株の2-1-3、2-1-11、1-n-1、2-n-3（以上、図３２）、4-1-5、4-1-7および3-1-11（以上、図３３）においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した。【００９９】３２−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載されている方法に基づき、上記３１で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表２７��示す。１３−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株の2-1-3、2-1-11、1-n-1、2-n-3、4-1-5、4-1-7および3-1-11ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表２７】
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【０１００】３３．遺伝子変換の確認  上記１０で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で42日間培養した細胞株から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー（CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー（CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。そのうち、2-1-3での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表２８および表２９に、3-1-11での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表３０および表３１に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においても追加挿入したヒト偽遺伝子由来の配列を含むクローンが確認され、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることが示された。また、他の細胞株でも同様に、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることを確認した。【表２８】
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【表２９】
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【表３０】
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【表３１】
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【０１０１】RMCE法を利用して軽鎖に30個、重鎖に60個のヒト可変領域由来配列から成る偽遺伝子領域を挿入したL30/H15f15f15f15fおよびL30/H15r15r15r15f細胞株の作製３４． ベクターの作製３４−１．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へ、順向きに構築した偽遺伝子15個をさらに挿入（１）ヒト抗体重鎖偽遺伝子配列（pVH15c）  データベース上のヒトイムノグロブリン重鎖可変領域の配列に基づいてCDR1、CDR2、CDR 3の配列を新たに15個選択し、pVH146（配列番号１６５）、pVH147（配列番号１６６）、pVH148（配列番号１６７）、pVH149（配列番号１６８）、pVH150（配列番号１６９）、pVH151（配列番号１７０）、pVH152（配列番号１７１）、pVH153（配列番号１７２）、pVH154（配列番号１７３）、pVH155（配列番号１７４）、pVH156（配列番号１７５）、pVH157（配列番号１７６）、pVH158（配列番号１７７）、pVH159（配列番号１７８）、pVH160（配列番号１７９）を順向きで連結させたpVH15c（配列番号１８０）を作製した。（２）ベクターの構築  pUC57-Ampベクターに、loxm3 rev配列、ネオマイシン耐性遺伝子、SV40 early polyA terminator、SV40 polyadenylation region、loxP for RE配列、pVH15c（順向き）、loxm7 rev LE配列を挿入し、図３４に示すようなベクターpVH15A _RMCE1st_Fw（配列番号１８１）を作製した。【０１０２】３４−２．トリ抗体重鎖（IgM）偽遺伝子領域へ、逆向きに構築した偽遺伝子15個をさらに挿入  pUC57-Ampベクターに、loxm3 rev配列、ネオマイシン耐性遺伝子、SV40 early polyA terminator、SV40 polyadenylation region、loxP for RE配列、pVH15c（逆向き）、loxm7 rev LE配列を挿入し、図３４に示すようなベクターpVH15A _RMCE1st_Rv（配列番号１８２）を作製した。【０１０３】３５．細胞株の作製  L30/H15f15f15f15f細胞株は、上記３１で作製したL30/H15f15f15f細胞株に、上記３４−１で調製したpVH15A _RMCE1st_Fwを導入して作製した。  pVH15A _RMCE1st_Fw をCre_pEGFP-C1とともに遺伝子導入して部位特異的組換えを誘導した後、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した細胞株1n1-3, 1n1-4, 1n1-5を得た。L30/H15r15r15r15f細胞株は、上記３１で作製したL30/H15r15r15f細胞株に、上記３４−２で調製したpVH15A _RMCE1st_Rvを導入して作製した。【０１０４】  pVH15A _RMCE1st_Rv をCre_pEGFP-C1とともに遺伝子導入して部位特異的組換えを誘導した後、2 mg/mL のG418を含む培地で培養し、生育した細胞についてPCRによるジェノタイピングを行って目的の遺伝子座で置換が起こっていることを確認した細胞株3111-1を得た。【０１０５】３６．抗体発現の確認（フローサイトメトリー、ELISA）３６−１．フローサイトメトリーによる解析  上記３に記載した方法に基づき、上記３５で作製した細胞における抗体発現を確認した。その結果を図３５に示す。野生型のDT40ではトリIgMのみが発現しているのに対し、形質転換株の1n1-3、1n1-4、1n1-5および3111-1においてはトリIgMの発現が消失し、代わりにヒトIgγおよびIgλが発現していることを確認した（図３５）。【０１０６】３６−２．ELISAによる解析  上記３−２に記載されている方法に基づき、上記３５で作製された細胞から分泌されている抗体の測定を行った。その結果を表３２に示す。１３−１と同様、野生型のDT40ではトリIgMのみが分泌されているのに対し、形質転換株の1n1-3、1n1-4、1n1-5および3111-1ではヒトIgG1が分泌されていることを確認した。【表３２】
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【０１０７】３７．遺伝子変換の確認  上記１０で抗体発現を確認した細胞株を用いて、遺伝子変換の確認を行った。TSA存在下で42日間培養した細胞株から、上記４に記載した方法に基づいて抽出したゲノムDNAを鋳型として、識別配列を付与したセンスプライマー （CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNCAGGTTCCCTGGTGCAGGC）（配列番号４６）とアンチセンスプライマー （CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGGCTTGGTCCCTCCGCCGAA）（配列番号４７）とを用いたPCRにより軽鎖可変領域を、センスプライマー （CTATGCGCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCCGTCAGCGCTCTCT）（配列番号５６）と識別タグを付与したアンチセンスプライマー （CGTATCGCCTCCCTCGCGCCATCAGNNNNNNNNNNTGGGGGGGGTTCATATGAAG）（配列番号５７）とを用いたPCRにより重鎖可変領域を増幅した後、上記４に記載した方法に基づいて配列解析を行った。そのうち、1n1-3での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表３３および表３４に、3111-1での軽鎖および重鎖の可変領域の配列解析結果（上位10個）をそれぞれ表３５および表３６に示す。軽鎖と重鎖のいずれの可変領域においても追加挿入したヒト偽遺伝子由来の配列を含むクローンが確認され、より多様な配列が生み出されていることが示された。また、他の細胞株でも同様に、遺伝子変換により多様な配列が生み出されていることを確認した。【表３３】
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【表３４】
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【表３５】
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【表３６】
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【０１０８】抗体セレクション１３８．抗原の調製  抗原タンパク質として、Plexin A4を選択した。Plexin A4はPlexin A typeに属する分子で、感覚神経や交感神経の軸索伸展を制御する因子として知られている。  抗原にはPlexin A4のSemaドメインおよびPSI（Plexin-Semaphorin-Integrin）ドメインのC末端にFLAGタグを付加したもの（アミノ酸配列を配列番号６８に示す）を用いた。ACCESSION No. NM_020911およびACCESSION No. EAW83796に基づいて、配列番号６７に示す塩基配列を合成し、pCEP4（ライフテクノロジーズ社、V044-50）のEBNA-1遺伝子およびHygromycin耐性遺伝子を欠失させた発現ベクターに挿入し、Plexin A4発現ベクターを構築した。  得られたPlexin A4発現ベクターをFreeStyle 293 F細胞（ライフテクノロジーズ社、R790-07）にPEI（ポリエチレンイミン）を用いて導入し、発現させた。その際、別途EBNA-1遺伝子の発現ベクターも同時に導入した。発現は3Lスケール、培養は７日間行った。  FLAGタグを利用して培養上清中の目的タンパク質を精製した。XK16/20カラム（GEヘルスケア社、28-9889-37）にanti-M2-agarose樹脂（シグマ社、A2220）を2.5 mL充填し、D-PBS(-)（和光純薬、045-29795）で平衡化した後、培養上清をロードし、D-PBS(-)で洗浄した後0.1 mg/mLのFLAGペプチド（シグマ社、F3290）を含むD-PBS(-)で溶出した。280 nmの吸光度でモニターして、ピークに相当する画分を回収し、SDS-PAGEおよびCBB染色により回収されたタンパク質の分子量を確認し、目的タンパク質の分子量と一致することを確認した。  限外ろ過膜（アミコン社、UFC0801008）を用いて約24 mLの回収画分を2 mLに濃縮し、Hi Load 16/600 Superdex 200 pg（GEヘルスケア社、28-9893-35）を用いてゲルろ過クロマトグラフィーによる精製を行った。D-PBS(-)でカラムを平衡化した後、回収画分をロードし、D-PBS(-)で溶出した。280 nmの吸光度でモニターして、ピークに相当する画分を回収し、SDS-PAGEおよびCBB染色により回収されたタンパク質の分子量を確認した。【０１０９】３９．抗体の選択３９−１．抗原磁気ビーズの作製  磁気ビーズはDynabeads M-270 Carboxylic Acid（ライフテクノロジーズ社、14305D）およびDynabeads M-270 Epoxy（ライフテクノロジーズ社、14301）を用い、抗原との結合は解説書に従った。この際、磁気スタンドはMPC-S（ライフテクノロジーズ社、DBA13346）を用いた。Dynabeads M-270 Carboxylic Acidについては、ビーズ10μLを20μLの25mM MES （pH5.0）で3回洗浄した後、50 mg/mLのNHS溶液と50 mg/mLのEDC溶液を10μL ずつ加え、室温で30分反応させた後、20μLの25 mM MES （pH5.0）で2回洗浄した。この磁気ビーズ懸濁液から上清を除いた後、25 mM MES （pH5.0）で0.6 mg/mLに調製したPlexin A4タンパク質溶液を10μL添加し、4℃で一晩、回転攪拌しながら反応させた。上清を除いた後、クエンチングバッファー（50 mM Tris-HCl）20μLを加え、室温で15分間、回転攪拌しながら反応させた。Dynabeads M-270 Epoxyについては、ビーズ10μLを20μLの100 mM Na-phosphate bufferで3回洗浄した後、100 mM Na-phosphate bufferで0.45 mg/mlに調製したPlexin A4タンパク質溶液13.3μLならびに3 M 硫酸アンモニウムを含む100 mM Na-phosphate buffer 6.7μLを添加して懸濁し、37℃で一晩、回転攪拌しながら反応させた。２種類のビーズは上清を除いたのちにセレクションバッファー（1 % BSAを含むPBS）1 mLにまとめて懸濁し、同バッファーで３回洗浄した後、200μLのセレクションバッファーに懸濁して、セレクションに供した。【０１１０】３９−２．抗原磁気ビーズによるセレクション  L15/H15細胞株であるB7-3を、2.5 ng/mLのTSAを含む培地で3週間培養した後、約1 × 108個の細胞をセレクションバッファー10 mLにより洗浄し、上清を除いた後にセレクションバッファー1 mLで洗浄し、その後950μLのセレクションバッファーに懸濁した。この細胞懸濁液に、上記１７−１で調製した抗原磁気ビーズ50μLを加え、4℃で30分間、回転により攪拌しながら反応させた。KingFisher ml（Thermo社、5400050）を用い、0.5 mLのセレクションバッファーで3回洗浄した。その後回収した細胞を20 mLの培地で懸濁した後、9cmディッシュに播種し、CO2インキュベータ―で7日間培養した。【０１１１】３９−３．フローサイトメトリーによるスクリーニング  上記３９−２の細胞培養液を回収し、3 × 106個の細胞を1.5 mLチューブに分取して遠心により上清を除去し、1.5 mLのPBSで洗浄し、上清を除いた。EZ-Link（登録商標）NHS-PEG4-Biotinylation Kit（PIERCE社、21455）を用いてビオチン標識したPlexinA4タンパク質を調製し、1次染色液（2.5μg/mLのビオチン標識Plexin A4タンパク質溶液）を300μL添加し、4℃遮光にて60分静置した。遠心により上清を除き、500μL のPBSで2回洗浄した後、Goat Anti-Human IgG gamma chain specific R-FITC conjugated（Southern biotech社、 A2040-02）とStreptavidin PE conjugated（eBioscience社、12-4317-87）をバッファーでそれぞれ1000倍または500倍希釈になるよう調製した2次染色液を300μL添加し、4℃遮光にて60分静置した。遠心により上清を除き、500μL のPBSで2回洗浄した後、500μL のFACSバッファー（PBSで1000倍希釈したPI溶液（Invitrogen社、P3566）を含む）で懸濁した。このサンプルについてフローサイトメトリー解析を行った。その結果を図３６に示す。Plexin A4タンパク質とIgGγのシグナルがいずれも高いP5のエリアの細胞集団を確認した。【０１１２】３９−４．抗原固定ELISA法によるスクリーニング  上記３９−３の細胞培養上清を回収し、Plexin A4抗原を用いた抗原固定ELISA法により、Plexin A4抗原に反応するクローンのスクリーニングを行った。  まず、2.5μg/mLのPlexin A4抗原タンパク質および陰性対照であるトリプシンインヒビター（シグマ社、T6522）、ストレプトアビジン（ナカライテスク社、32243）またはオボアルブミン（シグマ社、A5503）の溶液20μLをイムノ384ウェルプレートマキシソープ （Nunc社、464718）に分注し、4℃で一晩反応させ、プレートに固相化した。その後、洗浄液（0.05 % Tween20を含むPBS）で3回洗浄し、ブロッキング液（1 % BSAを含むPBS）45μLを加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で3回洗浄し、測定試料を25μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で3回洗浄し、Goat anti-Human IgG-Fc HRP-conjugated（Bethyl社、A80-104P）をPBS緩衝液で2000倍に希釈したものを25μL加え、1時間反応させた。洗浄液で3回洗浄し、TMB+（Dako社、S159985）25μLを加え、5分発色反応させ、1 M硫酸25μLを加えて反応を停止させた。 Infinite M1000（TECAN社）を用いて、450 nmの吸光度を測定した。その結果を図３７に示す。ほとんどのクローンでPlexin A4に特異的に反応する抗体が産生されていることが示された。【０１１３】  上記３９−３に記載したフローサイトメトリーと上記３９−４に記載した抗原固定ELISA法を組み合わせたスクリーニングにより、Plexin A4に特異的に結合する陽性クローンを同定することができた。なお、B7-3以外に、L15/H30細胞株の#11-6、L30/H30細胞株の7-7-48-10���用いたセレクションにおいても、Plexin A4に特異的に結合する陽性クローンを同定することができた。【０１１４】４０．抗Plexin A4抗体の発現確認４０−１． ELISAによる解析  上記３９−５で同定した陽性クローンのうち、#62および#20について、培養上清中に分泌されているトリIgMおよびヒトIgG1の濃度の測定を行った。それぞれの細胞株を、ニワトリ血清を含まない培地で4 × 105 cells/mLに懸濁した後、24-well プレートに1 mLずつ播種し、3日間培養した後、培養液を回収し、0.22μm filterで濾過した後、測定に用いた。  IgGの測定方法は以下の通りである。PBSで1.0μg/mLに希釈調製したGoat anti-Human IgG-Fc affinity purified（Bethyl社、A80-104A）100μLを F96 マキシソープNuncイムノプレート（Nunc社、464718）に分注し4℃で1時間以上反応させ、プレートに固相化した。その後、洗浄液（0.05 % Tween20を含むPBS）で5回洗浄し、ブロッキング液（1 % BSAを含むPBS）200μLを加え、室温で95分間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、測定試料または標準物質となるHuman IgG1 Lambda-UNLB（SouthernBiotech社、0151L-01）を100μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、Goat anti-Human IgG-Fc HRP conjugated（Bethyl社、A80-104P）をPBSで1000倍に希釈したものを100μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で3回洗浄し、TMB+（Dako社、S159985）100μLを加え、室温で3分発色反応させ、1 M硫酸20μLを加えて反応を停止させた。 Infinite M1000（TECAN社）を用いて、450 nmの吸光度を測定した。  IgMの測定方法は以下の通りである。PBSで1.0μg/mLに希釈したGoat anti-chicken IgM （Bethyl社、A30-102A）100μLをF96マキシソープ Nuncイミュノプレート（Nunc社、439454）に分注し、4℃で一晩反応させ、プレート上に固相化した。その後、洗浄液（0.05 % Tween20を含むPBS）で5回洗浄し、ブロッキング液（1 % BSAを含むPBS）200μLを加え、室温で95分間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、測定試料または標準物質となるトリ血清（GIBCO社、16110）を100μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、Goat anti-chicken IgM HRP conjugated （Bethyl社、A30-102P）を1 % BSAおよび0.05 % Tween20を含むPBSで5000倍に希釈したものを100μL加え、室温で1時間反応させた。洗浄液で5回洗浄し、TMB+（Dako社、S159985）100μLを加え、室温で3分発色反応させ、1 N硫酸100μLを加えて反応を停止させた。 Infinite M1000（TECAN社）を用いて、450 nmの吸光度を測定した。  測定結果を表３７に示す。クローン#20およびクローン#62において、ヒトIgG1が分泌されていること、トリIgMの分泌はごくわずかであることを確認した。【０１１５】
【表３７】
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【０１１６】４０−２．ウェスタンブロット法による解析  ウェスタンブロット法により、１７−４で得られた抗原反応性抗体を産生する陽性クローンである#62および#20から分泌されている抗体の分析を行った。  それぞれの細胞株を、ニワトリ血清を含まない培地で4 × 105 cells/mLに懸濁した後、24-well プレートに1 mLずつ播種し、3日間培養した後、細胞株の培養液を回収し、0.22μmフィルター（ミリポア社、SLGV J13 SL）で濾過した。IgγおよびIgλの検出用にはProtein Aカラムで精製したサンプルを、IgMの検出用には精製前のサンプルを用いた。還元条件での検出に用いるサンプル（還元サンプル）については、トリス-SDS-βメルカプトエタノールサンプル処理液（コスモバイオ社、423437）を、非還元条件での検出に用いるサンプル（非還元サンプル）については、トリス-SDSサンプル処理液（コスモバイオ社、423420）をそれぞれ等量加えて混合した。その後、還元サンプルは98℃, 3分間、非還元サンプルは37℃、30分間反応させた後、4〜20%ポリアクリルアミドゲル（コスモバイオ社、414879）で電気泳動し、ナイロンメンブレンに転写後、ブロッキングバッファー（1 % BSAを含むPBS）でブロッキングし、1次抗体（Goat Anti-Human IgG-Fc Fragment Ab-HRP（Bethyl社、A80-104P）、Goat Anti-Human IgG Lambda-HRP（Southern Biotech社、2070-05）、Goat Anti-chicken IgM-HRP（Bethyl社、A30-102P）を反応させた。0.1 % Tween20を含むPBSで3回洗浄した後、ECL plus（GEヘルスケア社、RPN2132）による化学発光でトリIgM、ヒトIgγ（重鎖）、ヒトIgλ（軽鎖）を検出した。その結果を図３８〜図４０に示す。抗Igγ抗体でのウェスタンブロットでは、還元状態で55 kDa、非還元状態では約160 kDaのバンドが検出された（図３８）。抗Igλ抗体でのウェスタンブロットでは、還元状態で25 kDa、非還元状態では約160 kDaのバンドが検出された（図３９）。また、抗IgM抗体でのウェスタンブロットではシグナルが検出されなかった（図４０）。  これにより、得られた陽性クローンが産生する抗体が完全長のヒト抗体であることを確認した。【０１１７】抗体セレクション２４１．抗原の調製  抗原タンパク質として、Semaphorin 3A （Sema3A）を選択した。Sema3AはSema3ファミリーに属する分子で、感覚神経や交感神経の軸索伸展を制御する因子として知られている。  抗原にはSema3AのN末端にHisタグとヒトアルカリフォスファターゼ（AP）を付したHis-AP-hSema3A（配列番号１８３）を用いた。このタンパク質を発現する安定発現株HEK293は横浜市立大学医学部分子薬理神経生物学教室より提供された。  発現は4Lスケール、培養は4日間行った。Hisタグを利用して培養上清中の目的タンパク質を精製した。HisTrap EXCEL 5mL （GEヘルスケア社, 17-3712-06）をA液（20 mM Na-phosphate, 150 mM NaCl, 20 mM Imidazole（pH7.5））で平衡化した後、培養上清をロードし、A液で洗浄した。その後、A液からB液（20 mM Na-phosphate, 150 mM NaCl, 500 mM Imidazole（pH7.5））に25カラム容量で直線的に置き換わるグラジエントによって溶出した。280 nmの吸光度でモニターして、ピークに相当する画分を回収し、SDS-PAGEおよびCBB染色により回収されたタンパク質の分子量を確認し、目的タンパク質の分子量と一致することを確認した。  限外ろ過膜（アミコン社、UFC0801008）を用いて約80 mLの回収画分を1.5 mLにまで濃縮し、Hi Load 16/600 Superdex 200 pg（GEヘルスケア社, 28-9893-35）を用いてゲルろ過クロマトグラフィーによる精製を行った。溶出バッファー（50 mM Na-phosphate, 300 mM NaCl, 400 mM Arginine, pH7.0）でカラムを平衡化した後、回収画分をロードし、溶出バッファーで溶出した。280 nmの吸光度でモニターして、ピークに相当する画分を回収し、SDS-PAGEおよびCBB染色により回収されたタンパク質の分子量を確認した。次いで、溶離液中のアルギニンを除去するために、D-PBS(-)で２度目のゲルろ過クロマトグラフィーを行った。同様に280 nmの吸光度でモニターして、ピークに相当する画分を回収し、SDS-PAGEおよびCBB染色により回収されたタンパク質の分子量を確認した。【０１１８】４２．抗体の選択４２−１．抗原磁気ビーズの作製  磁気ビーズはDynabeads M-270 Carboxylic Acid（ライフテクノロジーズ社、14305D）、Dynabeads M-270 Epoxy（ライフテクノロジーズ社、14301）およびDynabeads His-Tag Isolation & Pulldown（ライフテクノロジーズ社、10103D）を用い、抗原との結合は解説書に従った。この際、磁気スタンドはMPC-S（ライフテクノロジーズ社、DBA13346）を用いた。Dynabeads M-270 Carboxylic Acidについては、ビーズ40μLを80μLの25 mM MES（pH5.0）で3回洗浄した後、50 mg/mLのNHS溶液と50 mg/mLのEDC溶液を40μL ずつ加え、室温で30分反応させた後、80μLの25 mM MES（pH5.0）で2回洗浄した。この磁気ビーズ懸濁液から上清を除いた後、ポジティブセレクション用には25 mM MES（pH5.0）で0.475 mg/mlに調製したHis-AP-hSema3Aタンパク質溶液を50.6μLを、ネガティブセレクション用には抗原溶液の代わりにPBSを使用して25 mM MES（pH 5.0）で希釈した溶液50.6μLを添加して懸濁し、4℃で一晩、回転攪拌しながら反応させた。上清を除いた後、クエンチングバッファー（50 mM Tris-HCl）80μLを加え、室温で15分間、回転攪拌しながら反応させた。Dynabeads M-270 Epoxyについては、ビーズ40μLを80μLの100 mM Na-phosphate bufferで3回洗浄した後、ポジティブセレクション用には100 mM Na-phosphate bufferで0.45 mg/mLに調製したHis-AP-hSema3Aタンパク質溶液53.3μLならびに3 M 硫酸アンモニウムを含む100 mM Na-phosphate buffer 26.7μLを、ネガティブセレクション用には抗原溶液の代わりにPBSを使用して25 mM MES（pH 5.0）で希釈した溶液53.3μLならびに3 M 硫酸アンモニウムを含む100 mM Na-phosphate buffer 26.7μLを添加して懸濁し、37℃で一晩、回転攪拌しながら反応させた。Dynabeads His-Tag Isolation & Pulldownについては、ビーズ8μLを80μLのPBSで3回洗浄した後、ポジティブセレクション用には抗原濃度4.49μMのHis-AP-hSema3Aタンパク質溶液101.9μL、ネガティブセレクション用には抗原溶液の代わりにPBSを101.9μL添加して懸濁し、4℃で10分間回転攪拌しながら反応させた。３種類のビーズは上清を除いたのちにセレクションバッファー（1 % BSAを含むPBS）1 mLにまとめて懸濁し、同バッファーで３回洗浄した後、200μLのセレクションバッファーに懸濁して、セレクションに供した。【０１１９】４２−２．抗原磁気ビーズによるセレクション  L15/H15細胞株であるB7-3を、2.5 ng/mLのTSAを含む培地で86日間培養した後、約1.5 × 107個の細胞をセレクションバッファー10 mLにより洗浄し、上清を除いた後にセレクションバッファー1 mLで洗浄し、その後950μLのセレクションバッファーに懸濁した。この細胞懸濁液に、上記３９−１で調製したネガティブセレクション用抗原磁気ビーズ50μLを加え、4℃で30分間、回転により攪拌しながら反応させた。KingFisher mL（Thermo社、5400050）を用いて磁気ビー���を取り除いた後、細胞懸濁液にポジティブセレクション用抗原磁気ビーズを50μL 加え、4℃で30分間回転拡販しながら反応させた。KingFisher mL（Thermo社、5400050）を用い、1.7 mLのセレクションバッファーで3回洗浄した。その後回収した細胞を20 mLの培地で懸濁した後、96ウェルプレート1枚に播種し、CO2インキュベータ―で培養した。【０１２０】４２−３．１次スクリーニング  上記４２−２の細胞培養液を回収し抗原固定ELISAにおける分泌IgGの抗原反応性に基づき、標的抗原に対して特異的に反応するクローンのスクリーニングを行った。PBSで2.5μg/mLに調製した抗原タンパク質および陰性対照抗原溶液（His-Ubiquitin, Ovalbumin, Streptavidin）20μLをイムノ384ウェルプレートマキシソープ（Nunc社、464718）に分注し、4℃で一晩反応させて固相化した。洗浄溶液（0.05 % Tween20を含むPBS）で5回洗浄し、ブロッキング溶液（1 % BSAを含むPBS）を 45μL加えて室温で115分間反応させた。洗浄溶液で5回洗浄し、培養上清を25μL加えて室温で130分間反応させた。洗浄溶液で5回洗浄し、ブロッキング溶液で2000倍に希釈したGoat anti-Human IgG-Fc HRP-conjugatedを25μL加えて室温で47分間反応させた。洗浄溶液で5回洗浄し、TMB+（Dako社、S159985）を25μL加えて5分反応させた。1 N硫酸を25μL加えて反応を停止させた後、マイクロプレートリーダーを用いて450 nmの吸光度を測定した（図４１）。吸光度0.1以上、S/N比5倍以上の細胞を陽性と判定し、2次スクリーニングに供した。【０１２１】４２−４．2次スクリーニング  上記４２−３の細胞培養上清を回収し、４２−３記載の方法に基づき抗原固定ELISAによる2次スクリーニングを行った。吸光度0.5以上、S/N比5倍以上の細胞を陽性と判定し、モノクローン化を行った。【０１２２】４２−５．モノクローン化後の1次スクリーニング  上記４２−４の細胞培養上清を回収し、４２−３記載の方法に基づき抗原固定ELISAによるスクリーニングを行った。吸光度0.2以上、S/N比5倍以上の細胞を陽性と判定し、2次スクリーニングに供した。【０１２３】４２−６．モノクローン化後の2次スクリーニング  上記４２−５の細胞培養上清を回収し、４２−３記載の方法に基づき抗原固定ELISAによるスクリーニングを行った。吸光度0.5以上、S/N比5倍以上の陽性クローン#64、#69および#77を選択した（図４２）。【０１２４】４３．抗His-AP-hSema3A抗体の発現確認４３−１． ELISAによる解析  上記４２−６で選択された陽性クローンのうち、#64について、培養上清中に分泌されているトリIgMおよびヒトIgG1の濃度の測定を行った。測定法は上記４０−１に従った。  測定結果を表３８に示す。野生型のDT40と同様に、陽性クローン#64からヒトIgGが分泌されていること、トリIgMの分泌は認められないことを確認した。【表３８】
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【０１２５】４３−２．ウェスタンブロット法による解析  ウェスタンブロット法により、上記４２−６で得られた抗原反応性抗体を産生する陽性クローン#64から分泌されている抗体の分析を行った。  それぞれの細胞株を、ニワトリ血清を含まない培地で4 × 105 cells/mLに懸濁した後、9cmディッシュに20 mL播種し、4日間培養した後、細胞株の培養液を回収し、0.22μmフィルター（ミリポア社、SLGV J13 SL）で濾過した。IgγおよびIgλの検出用にはProtein Aカラムで精製したサンプルを、IgMの検出用には精製前のサンプルを用いた。還元条件での検出に用いるサンプル（還元サンプル）については、トリス-SDS-βメルカプトエタノールサンプル処理液（コスモバイオ社、423437）を、非還元条件での検出に用いるサンプル（非還元サンプル）については、トリス-SDSサンプル処理液（コスモバイオ、423420）をそれぞれ等量加えて混合した。その後、還元サンプルは98℃, 3分間、非還元サンプルは37℃, 30分間反応させた後、XV PANTERA 5-20% T-HCL 10W（DRC、NXV-275HP）で電気泳動し、PVDF膜に転写後、ブロッキングバッファー（5 %スキムミルクおよび0.1 % Tween20を含むTBS）でブロッキングし、1次抗体（Goat Anti-Human IgG-Fc Fragment Ab-HRP（Bethyl社、A80-104P）、Goat Anti-Human IgG Lambda-HRP（Southern Biotech社、2070-05）を反応させた。0.1 % Tween20を含むTBSで3回洗浄した後、Luminata Forte Western HRP substrate（ミリポア社、WBLUF0100）による化学発光でトリIgM、ヒトIgγ（重鎖）、ヒトIgλ（軽鎖）を検出した。その結果を図４３に示す。抗Igγ抗体でのウェスタンブロットでは、還元状態で55 kDa（図４３Ａ）、非還元状態では約160 kDaのバンドが検出された（図４３Ｂ）。抗Igλ抗体でのウェスタンブロットでは、還元状態で25 kDa（図４３Ｃ）、非還元状態では約160 kDaのバンドが検出された（図４３Ｄ）。  これにより、得られた陽性クローンが産生する抗体が完全長のヒト抗体であることを確認した。【０１２６】抗体セレクション３４４．抗原の調製  抗原タンパク質として、IL-8を選択した。IL-8は、ケモカインの一種であり、好中球やTリンパ球に対して走化性を示し、白血球の血管内皮細胞への接着や好中球の機能を促進する活性を持つ。そのため、好中球の浸潤を伴う炎症疾患、関節リウマチなどに関与していると考えられている。  抗原は、セレクションにおいてはヒトIL-8（Immune TECH社、IT-401-003P）を、スクリーニングにおいては2種類のヒトIL-8（Immune TECH社、IT-401-003PおよびCELL Signaling Technology社、8921LF）を用いた。【０１２７】４５．抗体の選択４５−１．抗原磁気ビーズの作製  磁気ビーズはDynabeads M-270 Carboxylic Acid（ライフテクノロジーズ社, 14305D）、Dynabeads M-270 Epoxy（ライフテクノロジーズ社、14301）およびDynabeads His-Tag Isolation & Pulldown（ライフテクノロジーズ社、10103D）を用い、抗原との結合は解説書に従った。この際、磁気スタンドはMPC-S（ライフテクノロジーズ社、DBA13346）を用いた。Dynabeads M-270 Carboxylic Acidについては、ビーズ35μLを70μLの25 mM MES（pH5.0）で3回洗浄した後、50 mg/mLのNHS溶液と50 mg/mLのEDC溶液を35μL ずつ加え、室温で30分反応させた後、70μLの25 mM MES （pH5.0）で2回洗浄した。この磁気ビーズ懸濁液から上清を除いた後、ポジティブセレクション用には25 mM MES（pH5.0）で0.6 mg/mlに調製したIL-8（Immune TECH社、IT-401-003P）タンパク質溶液35μLを、ネガティブセレクション用には抗原��液の代わりにPBSを使用して25 mM MES（pH 5.0）で希釈した溶液35μLを添加して懸濁し、4℃で一晩、回転攪拌しながら反応させた。上清を除いた後、クエンチングバッファー（50mM Tris-HCl）70μLを加え、室温で15分間、回転攪拌しながら反応させた。Dynabeads M-270 Epoxyについては、ビーズ35μLを70μLの100 mM Na-phosphate bufferで3回洗浄した後、ポジティブセレクション用には100 mM Na-phosphate bufferで0.45 mg/mLに調製したIL-8タンパク質溶液46.7μLならびに3 M 硫酸アンモニウムを含む100 mM Na-phosphate buffer 23.3μLを、ネガティブセレクション用には抗原溶液の代わりにPBSを使用して100 mM Na-phosphate bufferで希釈した溶液46.7μLならびに3 M 硫酸アンモニウムを含む100 mM Na-phosphate buffer 23.3μLを添加して懸濁し、37℃で一晩、回転攪拌しながら反応させた。Dynabeads His-Tag Isolation & Pulldownについては、ビーズ7μLを70μLのPBSで3回洗浄した後、ポジティブセレクション用には抗原濃度5.75μMのIL-8タンパク質溶液70μL、ネガティブセレクション用には抗原溶液の代わりにPBSを70μL添加して懸濁し、4℃で210分間回転攪拌しながら反応させた。３種類のビーズは上清を除いたのちにセレクションバッファー（1 % BSAを含むPBS）1 mLにまとめて懸濁し、同バッファーで３回洗浄した後、700μLのセレクションバッファーに懸濁して、セレクションに供した。【０１２８】４５−２．抗原磁気ビーズによるセレクション  L30/H15f15f15f細胞株である2-1-3を、2.5 ng/mLのTSAを含む培地で45 日間培養した後、約1.5 × 107個の細胞をセレクションバッファー10 mLにより洗浄し、上清を除いた後にセレクションバッファー10 mLで洗浄し、その後950μLのセレクションバッファーに懸濁した。この細胞懸濁液に、上記３９−１で調製したネガティブセレクション用抗原磁気ビーズ50μLを加え、4℃で30分間、回転により攪拌しながら反応させた。KingFisher mL（Thermo社、5400050）を用いて磁気ビーズを取り除いた後、細胞懸濁液にポジティブセレクション用抗原磁気ビーズを50μL 加え、4℃で30分間回転攪拌しながら反応させた。KingFisher ml（Thermo社、5400050）を用い、1.7 mLのセレクションバッファーで3回洗浄した。その後回収した細胞を20 mLの培地で懸濁した後、96ウェルプレート1枚に播種し、CO2インキュベータ―で培養した。【０１２９】４５−３．スクリーニングおよび陽性クローンの同定  上記４２−３〜４２−６と同様に、2度のスクリーニング、モノクローン化、2度のスクリーニングを実施し、陽性クローン#117、#121および#123を得た。セレクション後の1次スクリーニングの結果を図４４に、モノクローン化後の2次スクリーニングの結果を図４５に示す。【０１３０】４６．抗IL-8抗体の発現確認４６−１． ELISAによる解析  上記４５−３で得られた抗原反応性抗体を産生する陽性クローンである#117および#121について、培養上清中に分泌されているトリIgMおよびヒトIgG1の濃度の測定を行った。測定法は上記４０−１に従った。  測定結果を表３９に示す。野生型のDT40と同様に、陽性クローン#117および#121からヒトIgGが分泌されていること、トリIgMの分泌は認められないことを確認した。【表３９】
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【０１３１】４６−２．ウェスタンブロット法による解析  ウェスタンブロット法により、#117, #121から分泌されている抗体の分析を行った。方法は上記４０−２に従った。  その結果を図４６に示す。抗Igγ抗体でのウェスタンブロットでは、還元状態で55 kDa（図４６Ａ）、非還元状態では約160 kDaのバンドが検出された（図４６Ｂ）。抗Igλ抗体でのウェスタンブロットでは、還元状態で25 kDa（図４６Ｃ）、非還元状態では約160 kDaのバンドが検出された（図４６Ｄ）。  これにより、得られた陽性クローンが産生する抗体が完全長のヒト抗体であることを確認した。
【産業上の利用可能性】
【０１３２】  本発明は、多様なヒト抗体を迅速に作製する方法に関するものである。抗体医薬の重要性に鑑み、今後の創薬、医療の分野において、所望の薬効を示すバイオ医薬品、特に抗体医薬の開発に際し、本発明が提供する技術は、極めて重要な役割を担うものとして期待される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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【図１９】
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【図２０】
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【図２３】
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【図２４】
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【図２６】
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【図２９】
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【図３１】
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【図３４】
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【図９】
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【図１２】
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【図１８】
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【図２１】
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【図２２】
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【図２５】
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【図２７】
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【図２８】
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【図３０】
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【図３２】
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【図３３】
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【図３５】
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【図３６】
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【図３７】
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【図３８】
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【図３９】
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【図４０】
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【図４１】
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【図４２】
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【図４３】
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【図４４】
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【図４５】
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【図４６】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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