(57)【要約】  本発明は、乳酸菌などの腸管免疫誘導に有用な物質を効率的に腸管内に取り込むことのできる手段を提供することを課題とする。  本発明によれば、ラクトバチルス属乳酸菌に共通するペプチドモチーフを含む表層蛋白質(S-layer protein）を含む、腸管における物質取り込み促進剤、該取り込み促進剤と腸管取り込み対象物質との複合体、該複合体を含む飲食品または医薬品、ならびに被検乳酸菌の菌体表層におけるS-layer proteinの発現量を測定することを含む、腸管内移行能が高い乳酸菌のスクリーニング方法が提供される。【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記の式（I）〜(VI)に示すアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含み、かつウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質又はその断片を含有する、腸管における物質取り込み促進剤。
式(I)：Asn-Thr-Asn-Thr-Asn-Ala-Lys-Tyr-Asp-Val-Asp-Val-Thr-Pro-Ser-Val-Ser-Ala-X1-Ala （式(I)中、X1はValまたはIleを表す)
式(II)：Gly-X2-Leu-Thr-Gly-X3-Ile-Ser-Ala-Ser-Tyr-Asn-Gly-Lys-X4-Tyr-Thr-Ala Asn-Leu （式(II)中、X2はAsnまたはSerを表し、X3はThrまたはSerを表し、X4はThrまたはSerを表す)
式(III)：Tyr-Thr-Val-Thr-Val-X5-Asp-Val-Ser-Phe-Asn-Phe-Gly-Ser-Glu-Asn-Ala- Gly-Lys （式(III)中、X5はAsnまたはProを表す)
式(IV)：Val-Val-Ala-Ala-Ile-X6-Ser-Lys-Tyr-Phe-Ala-Ala-Gln-Tyr-Ala(式(IV)中、X6はAsnまたはThrを表す)
式(V)：His-Thr-Phe-Thr-Val-Asn-Val-Lys-Ala-Thr-Ser-Asn-X7-Asn-X8-Lys-Ser-Ala Thr-Leu-Pro-Val (式(V)中、X7はThrまたはValを表し、X8はGlyまたはSerを表す)
式(VI)：Val-Thr-Val-Pro-Asn-Val-Ala-Glu-Pro-Thr-Val-X9-Ser-Val-Ser-Lys (式(VI)中、X9はAlaまたはProを表す)
【請求項２】
前記式(I)〜(VI)で示されるアミノ酸配列において、１〜１０個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含み、かつウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質を含有する、請求項１に記載の腸管における物質取り込み促進剤。
【請求項３】
前記表層蛋白質が、ラクトバチルス・アシドフィルス(Lactobacillus acidophilus)、ラクトバチルス・ヘルベティカス（Lactobacillus helveticus）、ラクトバチルス・クリスパタス(Lactobacillus crispatus）、ラクトバチルス・アミロボラス（Lactobacillus amylovorus）、またはラクトバチルス・ガリナルム(Lactobacillus gallinarum）由来のS-layer proteinである、請求項１または２に記載の腸管における物質取り込み促進剤。
【請求項４】
前記表層蛋白質がラクトバチルス・アシドフィルス由来のSlpA蛋白質である、請求項１〜３のいずれかに記載の腸管における物質取り込み促進剤。
【請求項５】
前記ラクトバチルス・アシドフィルス由来のSlpA蛋白質が以下の(a)〜(c)のいずれかの蛋白質である、請求項４に記載の腸管における物質取り込み促進剤。
(a)  配列番号７に示すアミノ酸配列からなる蛋白質
(b)  配列番号７に示すアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなる蛋白質
(c)  配列番号７に示すアミノ酸配列と９０％以上の配列同一性を有する蛋白質
【請求項６】
請求項１〜５のいずれかに記載の腸管における物質取り込み促進剤と腸管取り込み対象物質との複合体。
【請求項７】
前記腸管取り込み対象物質が食品成分である、請求項６に記載の複合体。
【請求項８】
前記食品成分が乳酸菌である、請求項７に記載の複合体。
【請求項９】
前記腸管取り込み対象物質が医薬品成分である、請求項６に記載の複合体。
【請求項１０】
前記医薬品成分が粘膜ワクチン抗原である、請求項９に記載の複合体。
【請求項１１】
請求項６〜１０のいずれかに記載の複合体を含む組成物。
【請求項１２】
飲食品、医薬品または動物用飼料である、請求項１１に記載の組成物。
【請求項１３】
被検乳酸菌の菌体表層における、下記式(I)〜(VI)で示されるアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含む蛋白質の発現量を測定することを含む、腸管内移行能が高い乳酸菌のスクリーニング方法。
式(I)：Asn-Thr-Asn-Thr-Asn-Ala-Lys-Tyr-Asp-Val-Asp-Val-Thr-Pro-Ser-Val-Ser-Ala-X1-Ala （式(I)中、X1はValまたはIleを表す)
式(II)：Gly-X2-Leu-Thr-Gly-X3-Ile-Ser-Ala-Ser-Tyr-Asn-Gly-Lys-X4-Tyr-Thr-Ala Asn-Leu （式(II)中、X2はAsnまたはSerを表し、X3はThrまたはSerを表し、X4はThrまたはSerを表す)
式(III)：Tyr-Thr-Val-Thr-Val-X5-Asp-Val-Ser-Phe-Asn-Phe-Gly-Ser-Glu-Asn-Ala- Gly-Lys （式(III)中、X5はAsnまたはProを表す）
式(IV)：Val-Val-Ala-Ala-Ile-X6-Ser-Lys-Tyr-Phe-Ala-Ala-Gln-Tyr-Ala(式(IV)中、X6はAsnまたはThrを表す)
式(V)：His-Thr-Phe-Thr-Val-Asn-Val-Lys-Ala-Thr-Ser-Asn-X7-Asn-X8-Lys-Ser-Ala Thr-Leu-Pro-Val (式(V)中、X7はThrまたはValを表し、X8はGlyまたはSerを表す)
式(VI)：Val-Thr-Val-Pro-Asn-Val-Ala-Glu-Pro-Thr-Val-X9-Ser-Val-Ser-Lys (式(VI)中、X9はAlaまたはProを表す)
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、乳酸菌由来の表層タンパク質を含有する、腸管における物質取り込み促進剤に関する。
【背景技術】
【０００２】
外界からの異物の侵入に対する防御システムとして免疫系が存在している。その中でも腸管免疫系は最も大きな免疫系であり、免疫系全体の60%の免疫細胞や抗体から構成されている。腸管には、パイエル板（Payer's Patch; PP)、粘膜固有層(Lamina Propria, LP)、粘膜固有層リンパ球(Lamina Propria Lymphocytes, LPL)、腸管上皮間細胞リンパ球（Intraepithelial Lymphocytes, IEL)、腸管上皮細胞(Intestinal Epithelial Cell, IEC)、クリプトパッチ(Cryptopatch, CP)などで構成される腸管関連リンパ組織(gut-associated lymphoid tissue, GALT)が存在し、腸管は体内最大の免疫器官となっている。なかでもパイエル板の管腔側を覆う濾胞上皮細胞(Follicle Associated Epithelium, FAE)に存在するM細胞（Microfold cell)は、病原微生物を含む抗原取り込みに特化した細胞であり、樹状細胞などの各種免疫担当細胞に抗原を受け渡すことで、その後の免疫応答が誘導される。そのため、抗原取り込みの門戸であるM細胞を標的にすれば、効率良く免疫細胞に働きかけることが期待される。【０００３】
これまで、M細胞への効果的な抗原送達のために、Yersinia菌由来のinvasinやReovirusのσ1 proteinなどのように病原体がM細胞に侵入する際に働くリガンドを用いる方法が提案されている（非特許文献１〜３）。しかしながら、病原体のような食経験のない材料由来の成分は安全性に不安が残り、体内へ取り込ませるには不適切であるという問題がある。そのため、食経験が豊富で安全性の高い材料由来の成分を用いたM細胞をターゲットとしたデリバリーシステムが望まれている。【０００４】
一方、乳酸菌は腸内環境を整えたり、腸管免疫系に働きかけたりする機能を有する微生物菌体（プロバイオティクス）であり、乳酸菌飲料やヨーグルトなどの日常的に摂取する食品の機能性成分として利用されている。プロバイオティクス乳酸菌もまた、パイエル板上のM細胞により腸管内に取り込まれ、M細胞の下部（パイエル板内）に存在する樹状細胞に存在するToll様受容体(TLR)やNod様受容体（NLR）に作用することによって、T細胞の活性化、腸管上皮細胞の増殖、IgA産生の促進、炎症の抑制など様々な免疫応答が起こることが推察されている。従って、プロバイオティクス乳酸菌の利用においてもその腸管への効率的な取り込み手段の確立が必須となる。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【０００５】
【非特許文献１】Hussan N., Florence A.T., Pharm. Res., 15, 153-156 (1998)
【非特許文献２】Wu Y., Wang X., Csencsits K.L., Haddad A., Walters N., Pascual D.W., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 98, 9318-9323 (2001)
【非特許文献３】Wang X., Hone D.M., Haddad A., Shata M.T., Pascual D.W., J. immunol., 171, 4717-4725 (2003)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００６】
従って、本発明は、乳酸菌などの腸管免疫誘導に有用な物質を効率的に腸管内に取り込むことのできる手段を提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本発明者らは上記課題を解決すべき鋭意研究を重ねた結果、ラクトバチルス・アシドフィルス（Lactobacillus acidophilus）L-92株の表層蛋白質（SlpA蛋白質）が、M細胞に発現しているウロモジュリン蛋白質（Umod）への当該乳酸菌株の結合とM細胞からの取り込み促進に関与することを見出した。また、SlpA蛋白質を結合させた蛍光ビーズのパイエル板内への取り込み量を調べた結果、有意にその取り込み量が増加することを確認し、SlpA蛋白質は腸管への新規なデリバリー分子として用いることができるという知見を得た。さらに、乳酸菌の菌体表層におけるSlpA蛋白質のアミノ酸配列に存在するラクトバチルス属乳酸菌に共通するペプチドモチーフを有する蛋白質の発現の有無を指標とすれば、腸管への取り込みに優れた乳酸菌をin vitroで簡易にスクリーニングできるという知見も得た。本発明はかかる知見により完成されたものである。【０００８】
即ち、本発明は以下の発明を包含する。
(1)  下記の式（I）〜(VI)に示すアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含み、かつウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質又はその断片を含有する、腸管における物質取り込み促進剤。
式(I)：Asn-Thr-Asn-Thr-Asn-Ala-Lys-Tyr-Asp-Val-Asp-Val-Thr-Pro-Ser-Val-Ser-Ala-X1-Ala （式(I)中、X1はValまたはIleを表す)
式(II)：Gly-X2-Leu-Thr-Gly-X3-Ile-Ser-Ala-Ser-Tyr-Asn-Gly-Lys-X4-Tyr-Thr-Ala Asn-Leu （式(II)中、X2はAsnまたはSerを表し、X3はThrまたはSerを表し、X4はThrまたはSerを表す)
式(III)：Tyr-Thr-Val-Thr-Val-X5-Asp-Val-Ser-Phe-Asn-Phe-Gly-Ser-Glu-Asn-Ala- Gly-Lys （式(III)中、X5はAsnまたはProを表す)
式(IV)：Val-Val-Ala-Ala-Ile-X6-Ser-Lys-Tyr-Phe-Ala-Ala-Gln-Tyr-Ala (式(IV)中、X6はAsnまたはThrを表す)
式(V)：His-Thr-Phe-Thr-Val-Asn-Val-Lys-Ala-Thr-Ser-Asn-X7-Asn-X8-Lys-Ser-Ala Thr-Leu-Pro-Val (式(V)中、X7はThrまたはValを表し、X8はGlyまたはSerを表す)
式(VI)：Val-Thr-Val-Pro-Asn-Val-Ala-Glu-Pro-Thr-Val-X9-Ser-Val-Ser-Lys (式(VI)中、X9はAlaまたはProを表す)
(2)  前記式(I)〜(VI)で示されるアミノ酸配列において、１〜１０個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含み、かつウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質を含有する、(1)に記載腸管における物質取り込み促進剤。
(3) 前記表層蛋白質が、ラクトバチルス・アシドフィルス(Lactobacillus acidophilus)、ラクトバチルス・ヘルベティカス（Lactobacillus helveticus）、ラクトバチルス・クリスパタス(Lactobacillus crispatus）、ラクトバチルス・アミロボラス（Lactobacillus amylovorus）、またはラクトバチルス・ガリナルム(Lactobacillus gallinarum）由来のS-layer proteinである、(1)または(2)に記載の腸管における物質取り込み促進剤。
(4)  前記表層蛋白質がラクトバチルス・アシドフィルス由来のSlpA蛋白質である、(1)〜(3)のいずれかに記載の腸管における物質取り込み促進剤。
(5)  前記ラクトバチルス・アシドフィルス由来のSlpA蛋白質が以下の(a)〜(c)のいずれかの蛋白質である、(4)に記載の腸管における物質取り込み促進剤。
(a)  配列番号７に示すアミノ酸配列からなる蛋白質
(b)  配列番号７に示すアミノ酸配列において１若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列からなる蛋白質
(c)  配列番号７に示すアミノ酸配列と９０％以上の配列同一性を有する蛋白質
(6)  (1)〜(5)のいずれかに記載の腸管における物質取り込み促進剤と腸管取り込み対象物質との複合体。
(7)  前記腸管取り込み対象物質が食品成分である、(6)に記載の複合体。
(8)  前記食品成分が乳酸菌である、(7)に記載の複合体。
(9)  前記腸管取り込み対象物質が医薬品成分である、(6)に記載の複合体。
(10)  前記医薬品成分が粘膜ワクチン抗原である、(9)に記載の複合体。
(11)  (6)〜(10)のいずれかに記載の複合体を含む組成物。
(12)  飲食品、医薬品または動物用飼料である、(11)に記載の組成物。
(13)  被検乳酸菌の菌体表層における、下記式(I)〜(VI)で示されるアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含む蛋白質の発現量を測定することを含む、腸管内移行能が高い乳酸菌のスクリーニング方法。
式(I)：Asn-Thr-Asn-Thr-Asn-Ala-Lys-Tyr-Asp-Val-Asp-Val-Thr-Pro-Ser-Val-Ser-Ala-X1-Ala （式(I)中、X1はValまたはIleを表す)
式(II)：Gly-X2-Leu-Thr-Gly-X3-Ile-Ser-Ala-Ser-Tyr-Asn-Gly-Lys-X4-Tyr-Thr-Ala Asn-Leu （式(II)中、X2はAsnまたはSerを表し、X3はThrまたはSerを表し、X4はThrまたはSerを表す)
式(III)：Tyr-Thr-Val-Thr-Val-X5-Asp-Val-Ser-Phe-Asn-Phe-Gly-Ser-Glu-Asn-Ala- Gly-Lys （式(III)中、X5はAsnまたはProを表す)
式(IV)：Val-Val-Ala-Ala-Ile-X6-Ser-Lys-Tyr-Phe-Ala-Ala-Gln-Tyr-Ala (式(IV)中、X6はAsnまたはThrを表す)
式(V)：His-Thr-Phe-Thr-Val-Asn-Val-Lys-Ala-Thr-Ser-Asn-X7-Asn-X8-Lys-Ser-Ala Thr-Leu-Pro-Val (式(V)中、X7はThrまたはValを表し、X8はGlyまたはSerを表す)
式(VI)：Val-Thr-Val-Pro-Asn-Val-Ala-Glu-Pro-Thr-Val-X9-Ser-Val-Ser-Lys (式(VI)中、X9はAlaまたはProを表す)【０００９】
本願は、２０１４年５月２９日に出願された日本国特許出願２０１４−１１１６８１号の優先権を主張するものであり、該特許出願の明細書に記載される内容を包含する。
【発明の効果】
【００１０】
本発明の腸管における物質取り込み促進剤の有効成分である乳酸菌由来の表層蛋白質（S-layer protein）は、腸管M細胞への結合活性および腸管M細胞からの物質取り込み促進活性を有する。従って、本発明の腸管における物質取り込み促進剤は、有用乳酸菌や粘膜ワクチン抗原などの腸管取り込み量を増加させることでき、その結果、効果的かつ確実に腸管免疫へと働きかけることで、アレルギー症状の抑制やインフルエンザなどの粘膜感染症防御が可能となる。また、本発明の腸管における物質取り込み促進剤は、乳酸菌由来の蛋白質を有効成分とするので、安全性が高い。
【図面の簡単な説明】
【００１１】
【図１】図１は、被検乳酸菌株(L-92株、CP23株、LiCl-L92株)の免疫染色結果を示す(白く見える部分が染色されたSlpA）。
【図２】図２は、被検乳酸菌株(L-92株、CP23株、LiCl-L92株)のUmod結合率を示す[Dunnet t-Test, L-92株(n=9), CP23株(n=12), LiCl-L92株(n=12), **: p<0.01]。
【図３】図３は、被検乳酸菌株（L-92株、抗SlpA抗体処理したL-92株）のUmod結合率を示す[Student t-Test (n=9), #: p<0.1]。
【図４】図４は、被検乳酸菌株（L-92株、CP23株、LiCl-L92株)のM細胞への取り込み量を示す[Mann-Whitney U test, L-92株 vs CP23株(n=3), L-92株 vs LiCl-L92株 (n=4), *: p<0.05, **: p<0.01]。
【図５】図５は、蛍光ビーズ（SlpA結合、BSA結合）のM細胞への取り込み量を示す[Student t-Test (n=4), *: p<0.05]。
【図６】図６は、ラクトバチルス・アシドフィルス(L.acidophilus)、ラクトバチルス・ヘルベティカス（L.helveticus）、ラクトバチルス・ガセリ（L.gasseri)のS-layer proteinのマルチプルアライメント解析結果を示す（モチーフ１〜６：Umod結合性の高いラクトバチルス・アシドフィルス(L.acidophilus)、ラクトバチルス・ヘルベティカス（L.helveticus）が共通して保有し、逆にUmod結合性が低いラクトバチルス・ガセリ（L.gasseri)が保有しないペプチドモチーフ）。
【図７】図７は、マルチプルアライメント解析により決定されたウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質（S-layer protein）に共通するペプチドモチーフの構造式(I)〜(VI)を示す。
【図８】図８は、ウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質（S-layer protein）に共通するペプチドモチーフのアミノ酸配列に対応する部分のラクトバチルス・アシドフィルス(L.acidophilus)、ラクトバチルス・ヘルベティカス（L.helveticus）、ラクトバチルス・クリスパタス(L.crispatus）、ラクトバチルス・アミロボラス（L.amylovorus）、ラクトバチルス・ガリナルム(L.gallinarum）のアミノ酸配列を示す（式(I)〜(VI)のアミノ酸配列の上の数字が1：L.acidophilus、L.helveticus、L.crispatus、L.amylovorus、L.gallinarumの5菌種に共通するアミノ酸、当該数字が2：L.acidophilus、L.helveticus、L.crispatusの3菌種に共通するアミノ酸、当該数字が3: L.acidophilus、L.helveticusの2菌種に共通するアミノ酸を意味する)。
【発明を実施するための形態】
【００１２】
１．腸管における物質取り込み促進剤
本発明の腸管における物質取り込み促進剤は、下記式(I)〜(VI)で示されるアミノ酸配列からなるペプチドモチーフの少なくとも１種を含み、かつウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質（以下、本表層蛋白質を「S-layer protein」と称する）又はその断片を含有する。
式(I)：Asn-Thr-Asn-Thr-Asn-Ala-Lys-Tyr-Asp-Val-Asp-Val-Thr-Pro-Ser-Val-Ser-Ala-X1-Ala（式(I)中、X1はValまたはIleを表す) (配列番号１）
式(II)：Gly-X2-Leu-Thr-Gly-X3-Ile-Ser-Ala-Ser-Tyr-Asn-Gly-Lys-X4-Tyr-Thr-Ala Asn-Leu（式(II)中、X2はAsnまたはSerを表し、X3はThrまたはSerを表し、X4はThrまたはSerを表す) (配列番号２）
式(III)：Tyr-Thr-Val-Thr-Val-X5-Asp-Val-Ser-Phe-Asn-Phe-Gly-Ser-Glu-Asn-Ala- Gly-Lys （式(III)中、X5はAsnまたはProを表す) (配列番号３）
式(IV)：Val-Val-Ala-Ala-Ile-X6-Ser-Lys-Tyr-Phe-Ala-Ala-Gln-Tyr-Ala (式(IV)中、X6はAsnまたはThrを表す) (配列番号４）
式(V)：His-Thr-Phe-Thr-Val-Asn-Val-Lys-Ala-Thr-Ser-Asn-X7-Asn-X8-Lys-Ser-Ala Thr-Leu-Pro-Val (式(V)中、X7はThrまたはValを表し、X8はGlyまたはSerを表す) (配列番号５）
式(VI)：Val-Thr-Val-Pro-Asn-Val-Ala-Glu-Pro-Thr-Val-X9-Ser-Val-Ser-Lys (式(VI)中、X9はAlaまたはProを表す) (配列番号６）
【００１３】
また、S-layer proteinに含まれるペプチドモチーフは、ウロモジュリン（Umod)蛋白質に対する結合活性を有する限り変異を有していてもよく、例えば、前記式(I)〜(VI)で示されるアミノ酸配列において、１〜１０個、好ましくは１〜７個、より好ましくは１〜５個、もっとも好ましくは１〜３個のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されていてもよい。ここで、アミノ酸の置換としては、保存的アミノ酸置換が好ましく、保存的アミノ酸置換は、例えば構造的、電気的、極性もしくは疎水性などの性質が類似したアミノ酸間の置換を意味する。このような性質は、例えばアミノ酸側鎖の類似性で分類することも可能である。例えば、塩基性側鎖を有するアミノ酸（リシン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（アスパラギン酸、グルタミン酸）、脂肪族側鎖を有するアミノ酸（アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン）、水酸基含有側鎖を有するアミノ酸（セリン、トレオニン、チロシン）、アミド含有側鎖を有するアミノ酸（アスパラギン、グルタミン）を挙げることができる。
【００１４】
本発明において用いるS-layer proteinとしては、ラクトバチルス・アシドフィルス(Lactobacillus acidophilus)、ラクトバチルス・ヘルベティカス（Lactobacillus helveticus）、ラクトバチルス・クリスパタス(Lactobacillus crispatus）、ラクトバチルス・アミロボラス（Lactobacillus amylovorus）、またはラクトバチルス・ガリナルム(Lactobacillus gallinarum）由来のS-layer proteinが好ましい。
【００１５】
なかでもラクトバチルス・アシドフィルス（Lactobacillus acidophilus）L-92株の表層に存在するS-layer protein A (以下、「SlpA蛋白質」という)がより好ましい。SlpA蛋白質は、分子量43.6kDa、等電点が10.4の蛋白質で、これまで防御、細胞の形質維持、分子やイオン吸着や接着などの機能を有することが知られている（FEMS Microbiol. Rev. 29:511-529)。
【００１６】
本発明は、これまで知られていないSlpA蛋白質の機能である、小腸パイエル板の上皮細胞層に存在するM細胞に発現している蛋白質の一つであるウロモジュリン（Umod)蛋白質（以下、単に「Umod」という記載する場合がある）への結合活性およびM細胞からの物質取り込み促進活性を利用するものである。これまで乳酸菌の表層蛋白質の物質結合性については、Lactobacillus acidophilus(NCFM)のSlpAがC型レクチンであるDC−SIGNに結合すること（Konstantinov SR et al., S layer protein A of Lactobacillus acidophilus NCFM regulates immature dendritic cell and T cell functions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2008 Dec 9;105(49):19474-9)、Lactobacillus crispatus (JCM 5810) のS-layer proteinであるCbsAがタイプI型、V型コラーゲンに結合すること（Sillanpaa J et al., Characterization of the collagen-binding S-layer protein CbsA of Lactobacillus crispatus. J Bacteriol. 2000 Nov;182(22):6440-50)について報告があるが、腸管M細胞上の蛋白質に結合するという報告はない。
【００１７】
SlpA蛋白質は、配列番号７に示すアミノ酸配列からなる蛋白質であるが、SlpA蛋白質が有するUmodへの結合活性およびM細胞からの物質取り込み促進活性を有する限り、その変異蛋白質であってもよく、上記アミノ酸配列の部分配列を有する蛋白質(部分ペプチド）であってもよい。
【００１８】
変異蛋白質としては、例えば、配列番号７に示すアミノ酸配列において、1から数個のアミノ酸が欠失、置換、又は付加されたアミノ酸配列からなる蛋白質が挙げられる。ここで、「１から数個」の範囲は、部位特異的突然変異誘発法等の公知の変異蛋白質作製法により欠失、置換、若しくは付加できる程度の数をいい、前記の活性を保持する限り、その個数は制限されないが、１〜３０個、好ましくは１〜２０個、より好ましくは１〜１０個、最も好ましくは１〜５個をいう。ここで、アミノ酸置換としては、前述の保存的アミノ酸置換が挙げられる。また、変異蛋白質としては、配列番号７に示すアミノ酸配列に対して９０％以上の同一性を有するアミノ酸配列からなる蛋白質であってもよい。ここで、「９０％以上の同一性」とは、好ましくは９５％以上、より９７％以上、最も好ましくは９８％以上の配列の同一性をいう。アミノ酸配列の同一性は、FASTA検索やBLAST検索により決定することができる。また、ここにいう「変異」は、主には公知の変異蛋白質作製法により人為的に導入された変異を意味するが、天然に存在する同様の変異であってもよい。
【００１９】
本発明に用いるSlpA蛋白質は、配列番号７に示すアミノ酸配列に基づいて化学合成する方法によって作成してもよく、また、遺伝子組換え技術により作成してもよい。遺伝子組換え技術による場合は、例えば、配列番号７に示すアミノ酸配列をコードする遺伝子を含む発現ベクターを作成し、この発現ベクターで適当な宿主細胞を形質転換することにより形質転換体を得、この形質転換体を培養し、その培養物から目的のタンパク質を大量生産することができる。発現ベクターの作製及び宿主細胞への導入は、公知の方法に従って行うことができる。
【００２０】
宿主細胞には、原核生物及び真核生物のいずれの細胞も用いることができる。例えば、原核生物の宿主細胞として一般的に用いられるものとしては、大腸菌や枯草菌等が挙げられる。また真核生物の細胞としては、例えば、酵母細胞等を挙げることができる。
【００２１】
宿主細胞への発現ベクターの導入は、公知の方法で行うことができ、たとえば、リン酸カルシウム法、リポソーム法、エレクトロポレーション法、パーティクルガン法等が挙げられる。
【００２２】
形質転換細胞で発現させた蛋白質を単離精製するためには、公知の分離操作を組み合わせて行うことができる。例えば、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティ−クロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー、吸着クロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー等の各種クロマトグラフィー法や、これらと塩析、限外ろ過、ゲルろ過、透析、尿素などの変性剤や界面活性剤による処理、遠心分離、超音波処理、酵素消化等を組み合わせた方法が挙げられる。
【００２３】
本発明のウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有するラクトバチルス属の乳酸菌の表層蛋白質の断片とは、上記で定義した「S-layer protein」の断片であって、ウロモジュリン（Umod)蛋白質に対して結合活性を有している限りその長さに限定はないが、例えば、S-layer proteinを構成するアミノ酸配列の少なくとも２０個以上、好ましくは５０個以上、より好ましくは１００個以上のアミノ酸配列を有する断片が挙げられる。
【００２４】
２．腸管における物質取り込み促進剤と腸管取り込み対象物質との複合体
本発明の腸管における物質取り込み促進剤は、腸管取り込み対象物質（以下、「対象物質」という）との複合体を形成させることにより、該対象物質を腸管内に効率的に取り込ませることができる。対象物質としては、腸管から取り込まれた場合に生体内で活性を示す物質であればよく、例えば、食品成分や医薬品成分などが挙げられる。特に、腸管免疫誘導効果を有する食品成分や医薬品成分が好ましく、例えば、乳酸菌や粘膜ワクチン抗原などが挙げられる。
【００２５】
乳酸菌は、生菌であっても死菌であっても良い。また、死菌の場合は破砕されたものでもよい。菌体の破砕は、当技術分野で公知の方法及び機器を使用して、例えば物理的破砕、酵素溶解処理等によって行うことができる。物理的破砕は、湿式（菌体懸濁液の状態で処理）又は乾式（菌体粉末の状態で処理）のいずれで行ってもよく、ホモゲナイザー、ボールミル、ビーズミル、ダイノミル、遊星ミル等を使用した撹拌により、ジェットミル、フレンチプレス、細胞破砕機等を使用した圧力により、或いは、フィルター濾過により行うことができる。酵素溶解処理は、例えばリゾチームなどの酵素を用いて菌体の細胞壁を破壊することができる。
【００２６】
本発明の複合体において、腸管における物質取り込み促進剤は対象物質に共有結合または非共有結合した状態であればよく、結合手段としては特に限定はされない。
【００２７】
例えば、対象物質がS-layer proteinをその菌体表層に有さない乳酸菌の場合、上記腸管における物質取り込み促進剤を直接又は適当な架橋剤（リンカー）を介して該乳酸菌菌体の表層に結合させることにより複合体を形成させることができる。複合体の形成方法としては、例えば、取り込み対象となる乳酸菌菌体の表層に存在する蛋白質（糖鎖受容体蛋白質など）のアミノ基、カルボキシル基、スルフヒドリル基、好ましくはアミノ基を標的とし、これらの基と結合できる反応性官応基をもつ蛋白質架橋剤を用いる方法が挙げられる。蛋白質架橋剤は、グルタルアルデヒド、EDAC（1-Ethyl-3-(3-dimetylaminopropyl) carbodimide, hydrochloride）、DSP（Dithiobis(succinimidyl propionate)）、DCC（N,N'-Dicyclohexylcarbodiimide）などの市販品を利用すればよい。
【００２８】
あるいは、乳酸菌菌体の細胞壁への非共有結合に関与するアンカーモチーフ(例えばCWBDモチーフ、LysMモチーフ、GWモチーフ）とS-layer proteinとを連結させることにより乳酸菌菌体の表層にS-layer proteinを固定化させる方法、または乳酸菌菌体の細胞壁への共有結合に関与するアンカーモチーフ（例えばLPXTGモチーフ）をS-layer proteinと連結させて強制発現させる方法、乳酸菌菌体の表層に局在するいずれかのタンパク質とS-layer proteinを蛋白質架橋化酵素（トランスグルタミナーゼ）を用いてペプチド結合させる方法なども用いることができる。
【００２９】
また、対象物質が粘膜ワクチン抗原である場合は、上記腸管における物質取り込み促進剤を直接又は適当なキャリアを介して粘膜ワクチン抗原に結合させることにより複合体を形成することができる。具体的には、取り込み対象となる粘膜ワクチン抗原とS-layer proteinとの融合蛋白質を作成する方法、粘膜ワクチン抗原を封入したキャリアに反応基を導入してS-layer proteinを結合させる方法などを用いることができる。キャリアとしては、例えば、リポソーム、マイクロスフェアーまたはナノスフェアー、PLGA（ポリ乳酸・グリコール酸）等の生分解性キャリア、ヒアルロン酸やキチン等からなる粘膜付着性キャリア等が挙げられる。
【００３０】
S-layer proteinと粘膜ワクチン抗原との融合タンパク質は、公知の遺伝子組換え技術により製造することができる。例えば、S-layer proteinをコードする遺伝子と粘膜ワクチン抗原タンパク質をコードする遺伝子とを人工的に連結した融合遺伝子を作製し、当該融合遺伝子を、発現ベクターのプロモーターの下流に挿入し、適当な宿主細胞に導入して発現させることにより取得することができる。融合タンパク質において、S-layer proteinと粘膜ワクチン抗原との結合順序は限定されない。また、粘膜ワクチン抗原タンパク質をコードする遺伝子の塩基配列情報は、公知のデータベース（GenBank等）から取得することができる。また、公知の方法を用いて目的遺伝子をクローニングし、塩基配列解析を行うことで塩基配列情報を取得することができる。 
【００３１】
また、上記キャリアとして例えばリポソームを用いる場合、そのリポソームの脂質組成やサイズ、およびS-layer proteinの結合方法は特に限定されない。リポソーム作製には、ホスファチジルコリン、コレステロール、ポリエチレングリコール結合脂質などに加え、S-layer protein結合用に脂質末端カルボキシル基もしくはマレイミド基を有する脂質を使用する。リポソーム内への抗原の封入は公知の凍結融解法、逆相蒸発法、水和法などにより行うことができる。作製した抗原内封リポソームにS-layer proteinを加え、ペプチド縮合反応もしくはSH基反応系によりリポソームとS-layer proteinとの結合体を作製することができる。
【００３２】
３．腸管における物質取り込み促進剤と腸管取り込み対象物質との複合体を含む組成物
上記の複合体は、適当な添加物とともに飲食品、医薬品や動物用飼料などの組成物に配合することができる。ここで、医薬品には、ヒト用医薬品のみならず、動物用医薬品をも包含するものとする。また、動物用飼料には、家畜（ブタ、ウシ等）用の飼料、愛玩動物（犬、猫等）用のペットフードをも包含するものとする。
【００３３】
腸管取り込み対象物質が乳酸菌である複合体は、飲食品に配合できる。本発明において、飲食品とは、健康食品、機能性食品、栄養補助食品、または特定保健用食品を含む意味で用いられる。飲食品の種類としては、例えば、ヨーグルトやチーズ、乳酸菌入り飲料などの乳製品、漬物などが最適である。飲食品の形態は、食用に適した形態、例えば、固形状、液状、顆粒状、粒状、粉末状、カプセル（硬カプセル、軟カプセル）状、クリーム状、ペースト状のいずれであってもよい。特に、健康食品および機能性食品に適した形状として、タブレット状、カプセル状、顆粒状、粉末状が例示できる。例えば、タブレット状の健康食品の製造は、上記のような手法にて本発明の腸管における物質取り込み促進剤を結合させた乳酸菌を配合した処方物を一定の形状に圧縮するか、または水もしくはアルコールのような溶媒で湿潤させた練合物を一定の形状にするか、あるいは、一定の型に流し込んで成型することにより行なうことができる。
【００３４】
腸管取り込み対象物質が粘膜ワクチン抗原である複合体は、医薬品、特には、粘膜ワクチン製剤に配合することができる。この場合、免疫反応を増強するためのアジュバントと一緒に配合してもよい。アジュバンドとしては、例えば、水酸化アルミニウム、BCG、リン酸アルミニウム、キーホールリンペットヘモシアニン、ジニトロフェノール、デキストラン、TLRリガンド（例、リポ多糖（LPS）、CpG）が挙げられる。
【００３５】
粘膜ワクチン抗原は、粘膜免疫応答を誘導しうる限り特に限定されないが、典型的には、粘膜感染症の病原体由来の抗原である。粘膜感染症の病原体はウイルスであってもよく細菌であってよい。ウイルスとしては、例えば、インフルエンザウイルス、ヒト免疫不全ウイルス（HIV）、水痘ウイルス、麻疹ウイルス、風疹ウイルス、ポリオウイルス、ロタウイルス、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、重症急性呼吸器感染症候群(SARS)ウイルス等が挙げられるが、これらに限定はされない。また、細菌としては、例えば、百日咳菌、髄膜炎菌、インフルエンザｂ型菌、肺炎球菌、結核菌等が挙げられるが、これらに限定はされない。これらの病原体由来の抗原は、天然物由来であってもよいし、遺伝子組換等の手法により人為的に作製されたものであってもよい。
【００３６】
また、上記ワクチン抗原には、減感作療法に用いるアレルゲンも含まれる。アレルゲンワクチンとは、生体にアレルゲンを投与することにより、アレルゲンに対するIgG抗体を生産させてアレルギーの原因となるIgEの作用をブロックし、あるいは生体内でアレルゲンに特異的な１型ヘルパーT細胞（Th1細胞）を増加させ、アレルギー症状に関与する２型ヘルパーT細胞（Th2細胞）を減少させるためのワクチンをいい、減感作によりアレルギー症状を抑制することができる。アレルゲンの種類は、特に限定はされないが、食物アレルゲン（カゼイン、ラクトアルブミン、ラクトグロブリン、オボムコイド、オボアルブミン、コンアルブミン等）、ハウスダストアレルゲン(ダニ類アレルゲン等）、花粉アレルゲン（スギ花粉アレルゲン、ブタクサアレルゲン、カモガヤアレルゲン等）、動物の体毛等のアレルゲンなどが挙げられる。
【００３７】
４．腸管内移行能が高い乳酸菌のスクリーニング方法
本発明はまた、SlpA蛋白質のUmodへの結合活性およびM細胞からの物質取り込み促進活性に基づき、被検乳酸菌の菌体表層におけるS-layer proteinの発現量を測定することを含む、腸管内移行能が高い乳酸菌のスクリーニング方法を提供する。
【００３８】
S-layer proteinは、そのままで用いてもよいが、任意の標識物質で標識されたものを用いることもできる。標識物質としては、蛍光物質、放射性同位体（例えば、125Ｉ、３H、14C、35S等）、化学発光物質、ビオチン、マーカータンパク質、またはペプチドタグなどを例示することができる。マーカータンパク質としては、例えば、抗体のFc領域、アルカリフォスファターゼ、またはHRP(Horse radish peroxidase)などが挙げられる。またペプチドタグとしては、例えば、FLAG、6または10個のHis（ヒスチジン）残基からなる6×Hisまたは10×His、インフルエンザ凝集素（HA）の断片などが挙げられる。
【００３９】
本発明において、「腸管内移行能」とは、腸管M細胞に接着し、M細胞内に移行し、M細胞内の基底膜を経てパイエル板内に到達する能力をいう。
【００４０】
本発明のスクリーニング方法において、被検乳酸菌の菌体表層におけるS-layer proteinの発現量は、標準サンプルとの比較などにより絶対量を測定してもよいが、必ずしもS-layer proteinの絶対的な量を測定する必要はなく、対照となる乳酸菌の菌体表層におけるS-layer proteinとの相対的な関係を明らかにできれば評価としては十分である。
【００４１】
S-layer proteinの発現量の測定は、公知の蛋白質発現解析方法に従って行うことができる。典型的には、S-layer proteinに対する抗体を用いた免疫学的測定法が挙げられる。免疫学的測定法としては、特に制限はなく、従来公知の方法、例えば酵素免疫測定法(EIA法)、ラテックス凝集法、免疫クロマトグラフィー法、ウエスタンブロット法、放射免疫測定法(RIA法)、蛍光免疫測定法(FIA法)、ルミネッセンス免疫測定法、スピン免疫測定法、抗原抗体複合体形成に伴う濁度を測定する比濁法、抗体固相膜電極を利用し抗原との結合による電位変化を検出する酵素センサー電極法、免疫電気泳動法などを採用することができる。これらの中でもEIA法またはウエスタンブロット法が好ましい。なお、EIA法には、競合的酵素免疫測定法や、サンドイッチ酵素結合免疫固相測定法(サンドイッチELISA法)等が包含される。 
【００４２】
上記測定に用いられるS-layer proteinに対する抗体は、当業者に周知の方法を用いて得ることができる。抗体は、ポリクローナル抗体、あるいはモノクローナル抗体のいずれであってもよい。また、抗体としては、抗体の活性フラグメントであってもよい。活性フラグメントとしては、F(ab')2、Fab'、Fab、Fvなどが挙げられる。例えば、S-layer proteinに対するポリクローナル抗体は、抗原を感作した哺乳動物（例えば、ウサギ、ラット、マウスなど）から血液を採取し、この血液から公知の方法により血清を分離する。ポリクローナル抗体としては、ポリクローナル抗体を含む血清を使用することができる。また、モノクローナル抗体を得るには、上記抗原を感作した哺乳動物から抗体産生細胞（脾臓細胞、リンパ節細胞など）を取り出して骨髄腫細胞などと細胞融合させる。こうして得られたハイブリドーマをクローニングして、その培養物から抗体を回収しモノクローナル抗体とすることができる。
【００４３】
S-layer proteinの検出には、これらの抗体を適宜標識すればよい。標識物質は、前記の酵素、放射性同位体、蛍光色素を使用することができる。また、抗体を標識せずに、該抗体に特異的に結合する物質、例えば、プロテインAやプロテインGを標識して間接的に検出することもできる。
【００４４】
被検乳酸菌は、ラクトバチルス属、ラクトコッカス属、ビフィドバクテリウム属、ロイコノストック属、ストレプトコッカス属、エンテロコッカス属、ペディオコッカス属、ワイセラ属、オエノコッカス属等に属するいずれの乳酸菌株であってもよい。ラクトバチルス属に属する乳酸菌としては、ラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・ブレビス、ラクトバチルス・カゼイ、ラクトバチルス・デルブリュッキイ、ラクトバチルス・ファーメンタム、ラクトバチルス・ヘルベティカス、ラクトバチルス・ケフィア、ラクトバチルス・パラカゼイ、ラクトバチルス・プランタラム、ラクトバチルス・ブルガリカス、ラクトバチルス・ラムノーサス、ラクトバチルス・サリバリウス、ラクトバチルス・ジョンソニー、ラクトバチルス・ガセリ、ラクトバチルス・アミロボラス、ラクトバチルス・クリスパタス、ラクトバチルス・ガリナルム等が挙げられる。ラクトコッカス属に属する乳酸菌としては、ラクトコッカス・ラクティス、ラクトコッカス・プランタラム、ラクトコッカス・ラフィノラクティス等が挙げられる。ビフィドバクテリウム属に属する乳酸菌としては、ビフィドバクテリウム・インファンティス、ビフィドバクテリウム・ブレーベ、ビフィドバクテリウム・ロンガム、ビフィドバクテリウム・シュードロンガム、ビフィドバクテリウム・ビフィダム、ビフィドバクテリウム・アニマリス、ビフィドバクテリウム・アドレセンティス、ビフィドバクテリウム・カテニュラータム、ビフィドバクテリウム・シュードカテニュラータム等が挙げられる。ロイコノストック属に属する乳酸菌としては、ロイコノストック・ラクティス、ロイコノストック・メセンテロイデス等が挙げられる。ストレプトコッカス属に属する乳酸菌としては、ストレプトコッカス・サーモフィルス、ストレプトコッカス・ラクティス等が挙げられる。エンテロコッカス属に属する乳酸菌としては、エンテロコッカス・フェーカリス、エンテロコッカス・デュランス、エンテロコッカス・フェシウム等が挙げられる。ペディオコッカス属に属する乳酸菌としては、ペディオコッカス・ペントサセウス等が挙げられる。ワイセラ属に属する乳酸菌としては、ワイセラ・チバリア、ワイセラ・コンフューザ、ワイセラ・ハロトレランス等が挙げられる。オエノコッカス属に属する乳酸菌としては、オエノコッカス・オエニ等が挙げられる。
【実施例】
【００４５】
以下、実施例によって本発明を更に具体的に説明するが、これらの実施例は本発明を限定するものでない。【００４６】
（実施例１）乳酸菌株のSlpA定量
(1)乳酸菌株の調製
実験には、Lactobacillus acidophilus L-92株、Lactobacillus acidophilus CP23株を用いた。各菌株をMRS培地（Difco）にて37℃、20時間静置培養した後、PBSにて3回洗菌し、PBSに懸濁した。【００４７】
L-92株のLiCl処理は、L-92株をPBSにて2回洗菌した後、上清を除去し、5 MのLiCl（Wako）溶液中で室温・静置にて一定時間インキュベートすることにより行った。インキュベート後、再度PBSで2回洗菌した後、PBSに再懸濁した。【００４８】
(2) 免疫染色
菌体懸濁液10μlをスライドガラスに塗布し乾燥させた後、アルコールランプにて火炎固定した。Mouse anti-SlpA （clone 383）（１.4 mg/ml）をPBSにて100倍希釈し、スライドグラスに載せた。室温にて2〜3時間反応させた後、PBSにてスライドグラスを3回洗浄した。さらに、Cy3-ストレプトアビジン（Cy3-conjugated Streptavidin、ImmunoResearch Labolatories, INC.、No.016-160-084）をPBSにて200倍希釈して、スライドグラスに載せた。室温にて2〜3時間反応させた後、PBSにてスライドグラスを3回洗浄した。【００４９】
カバーガラスをかけて封入した後、蛍光顕微鏡で観察し、目視により蛍光強度を確認した。結果を図１に示す。【００５０】
L-92株は菌体の表面がSlpAで覆われていたが、CP23株は表面に局在するSlpAが少ないことが示された。さらに、LiCl処理したL-92株も、表面のSlpAはほとんど除去されていることが示された（図１）。【００５１】
（実施例２) 乳酸菌株のUmod結合性の評価
(1)乳酸菌株の調製
実験には、実施例１と同様にして調製したL-92株、CP23株、LiCl処理したL-92株を用いた。L-92株の抗SlpA抗体処理は、抗SlpA抗体を終濃度140μg/mlとなるように溶解したPBS溶液にL-92株を懸濁し、4℃で一晩、穏やかに振とうすることによって行った。【００５２】
(2) Umod結合試験(in vitro結合アッセイ)
L-92株、CP23株、LiCl処理したL-92株(LiCl-L92)、及び抗SlpA抗体処理したL-92株についてUmod結合性を調べた。
まず、ヒトIgG1のFcドメインにマウスUmod蛋白質（配列番号８の1-616位）をつなげて発現させた融合蛋白質（Fc-mUmod）を、Hase K. et al., Uptake through glycoprotein 2 of FimH1 bacteria by M cells initiates mucosal immune response, Nature 2009, 462:226-31の記載に従って作製した。mUmod（マウスUmod）配列（配列番号９）を増幅させるためのプライマーとしてForwardプライマー：5’-CGCAGATCTACCATGGGGATCCCTTTGACC-3’（配列番号１０）およびReverse プライマー：5’-CGCGTCGACCTTGGACACTGAGGCCTGG-3’（配列番号１１）を用い、制限酵素BglIIとSalIを用いてFcドメインを挿入したpcDNA3ベクター（invitrogen）にクローニングした。【００５３】
Fc-mUmodをクローニングしたベクターを、ヒト胎児腎細胞由来HEK293T細胞に導入し、7-10日培養した。上清中に分泌されたFc-mUmod蛋白質を回収し、HiTrap protein AHP affinity column（GE Healthcare）を用いて精製した。【００５４】
次に、Fc-mUmod蛋白質およびコントロールFc蛋白質としてhIgGを、5μg/mlになるようにPBSにて希釈したものを96穴プレートに50μlアプライし、4℃にて一晩固相化した。各ウェルを200μlのPBSにて3回洗浄した後、1% BSA/PBS溶液を200μlアプライして室温にて2時間ブロッキングした。ブロッキング溶液を除去した後、106 cells/50μl となるようにPBSにて懸濁した被検乳酸菌の菌体を、50μlずつアプライし、室温にて2時間インキュベートした。各ウェルを200μlのPBSにて5回洗浄した後、PBSを完全に除去した。【００５５】
NucleoSpinTM Tissue（Takara）を用いて、プレートに結合した菌体からDNAを抽出した。方法は付属のプロトコルに従った。抽出したDNAを鋳型として、16S rRNA遺伝子をターゲットとするユニバーサルプライマー（F:5’-AACTGGAGGAAGGTGGGGAT-3’（配列番号１２)、R:5’-AGGAGGTGATCCAACCGCA-3’（配列番号１３））を用いてリアルタイムPCRを行い、Fc-mUmodおよびhIgGに結合した菌数を定量した。方法はSYBRTM Premix Ex TaqTM II (Tli RNaseH Plus )（Takara）に付属のプロトコルに従った。【００５６】
Fc-mUmodに結合した菌数からhIgGに結合した菌数を引いた値をUmod結合数とした。各菌株のUmod結合数は、L-92株の結合数を100％とし、それに対する比率で示した。結果を図２および３に示す。【００５７】
表層蛋白質SlpAが少ないCP23株、LiCl処理によってSlpAを除去したL-92株は、SlpAを多量に有するL-92株と比較してUmod結合性が有意に低かった（図２）。また、L-92株を抗SlpA抗体で処理すると、Umod結合性が減少傾向を示した（図３）。これらの結果より、L-92株のUmod結合性にはSlpAが関与することが示唆された。【００５８】
（実施例３) 乳酸菌株のM細胞への取り込み量の評価
(1)乳酸菌株の調製
実験には、実施例１と同様にして調製したL-92株、CP23株、LiCl処理したL-92株を用いた。【００５９】
(2)ループアッセイ
L-92株、CP23株、LiCl処理したL-92株は、Cy3 Mono-Reactive Dye Pack（GE Healthcare）によって蛍光標識し、109 cells/mlとなるようにPBSに懸濁した。手順はメーカーの推奨プロトコルに従った。C57BL/6Jマウスを数時間絶食させた後、イソフルラン麻酔下において開腹し、小腸パイエル板の両側を糸で縛り、菌体溶液を100μlずつ（108 cellsずつ）ループ部位に注入した。1時間インキュベートした後に頚椎脱臼にてマウスを安楽死させた。【００６０】
(3) 免疫染色
パイエル板を切り出し、1 x HBSS（GIBCO）にて洗浄した後、BD Cytofix/CytopermTM（BD Bioscience）にて固定し、Perm/WashTM Buffer 10x（BD Bioscience）をmilliQ水で1x に希釈し、Saponin from Quillaja bark（SIGMA）を終濃度0.1%となるように添加した洗浄液にてよく洗い、洗浄液に0.2%となるようにBSAを懸濁させたブロッキング溶液でブロッキングを行った。【００６１】
Rat anti-mouse GP2 IgG2a （clone 2F11-C3）（1.0 mg/ml）を100倍となるようにブロッキング溶液に希釈した一次抗体溶液中でインキュベートし、洗浄液にてよく洗い、次にAlexa FluorTM 488 goat anti-rat IgG (H+L)（Invitrogen）（2.0 mg/ml）を200倍となるようにブロッキング溶液に希釈した二次抗体溶液中でインキュベートした。PBSにてよく洗浄した組織をホールマウントし、観察に用いた。【００６２】
(4)M細胞への取り込み量比較
共焦点顕微鏡Leica SP2 AOBS Conforcal and Multiphoton（Leica）にて濾胞上皮領域を撮影し、Alexa 488により免疫染色されたM細胞と、Cy3標識された菌体が重なっている部分を、「M細胞に取り込まれている菌体」としてカウントした。Image J（http://rsb.info.nih.gov/ij/download.htmlよりダウンロード）を用いて、濾胞上皮部分の面積を測定し、面積あたりでM細胞に取り込まれている菌体量（Cy3+M cells/PP dome area (cells/mm2)）を算出した。【００６３】
各菌株のM細胞への取り込み量は、L-92株の取り込み量を100％とし、それに対する比率で示した。結果を図４に示す。Umod結合性の低いCP23株およびLiCl-L92株は、L-92株と比較するとM細胞への取り込み性が有意に減少した。よって、L-92株のM細胞への取り込みにSlpAが関与することが示唆された。【００６４】
（実施例４) SlpA結合担体のM細胞への取り込み量の評価
(1)SlpAの単離精製
Lactobacillus acidophilus L-92株を5MのLiCl中で30分インキュベートし、SlpAを抽出した。遠心して菌体を除去した後、透析チューブ（20/32吋、日本メデカルサイエンス）を用いてPBS溶液にて透析し、SlpAを得た。SDS-PAGEおよびCBB染色により単一のバンドが得られたことを確認した。【００６５】
(2)蛍光ビーズへの蛋白質結合
2色の蛍光ビーズ（FluoSpheres（登録商標）calboxylate-modified microspheres 1.0 mm, orange / yellow-green（Invitrogen））に(1)で単離精製したSlpAまたはBSAを共有結合させた。EDAC[1-Ethyl-3-(3-dimetylaminopropyl) carbodimide, hydrochloride] （同仁化学研究所）を用い、手順はメーカーの推奨プロトコルに従った。【００６６】
(3)ループアッセイ
インキュベート時間を２時間とする以外は、実施例３に記載のとおり行った。【００６７】
(4)パイエル板取り込み量比較
パイエル板を切り出し、1xHBSS（GIBCO）にて洗浄した後、O.C.T.compound（Sakura Fintek USA）を用いて凍結ブロックを作成した。クリオスタットLEICA CM1850を用いて5mm厚さの凍結切片を作成し、パイエル板内部に取り込まれているビーズの数を蛍光顕微鏡にて観察および測定した。1マウスあたり6〜12切片を観察し、平均を求めた。【００６８】
SlpAを結合させた蛍光ビーズとBSAを結合させた蛍光ビーズのパイエル板への取り込み量の比較を図５に示す。SlpAを結合させることによりM細胞からの取り込み量を促進することが確認された。【００６９】
（実施例５）各種乳酸菌株のUmod結合性の評価
(1)被検乳酸菌の調製
実験には、ラクトバチルス属に属する乳酸菌約２０株を用いた。各菌株は、実施例１と同様に、MRS培地（Difco）にて37℃、20時間静置培養した後、PBSにて3回洗菌し、PBSに懸濁した。【００７０】
(2) Umod結合試験（in vitro結合アッセイ）
各菌株のUmod結合性の評価は、実施例２と同様に実施した。【００７１】
被検乳酸菌１４株のUmod結合数の算出結果を表１に示す。Fc-mUmodに結合した菌数からhIgGに結合した菌数を引いた値をUmod結合数とした。【００７２】
【表１】
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【００７３】
表１に示されるように、Umod結合数は、ラクトバチルス属の中でも菌種や菌株の違いによって異なることが確認された。【００７４】
（実施例６）乳酸菌の菌体表層におけるS-layer proteinのアミノ酸配列に存在する共通配列の検討
実施例５の結果を踏まえ、S-layer proteinのマルチプルアライメント解析をClutalW（http://clustalw.ddbj.nig.ac.jp/）を用いて行った。具体的にはゲノム情報の利用が可能なラクトバチルス属に属する菌種の中で、実施例５において比較的にUmod結合性が高いことが確認されたラクトバチルス・アシドフィルス（gi|58336516|ref|YP_193101.1| S-layer protein [Lactobacillus acidophilus NCFM]）、およびラクトバチルス・ヘルベティカス（gi|550820440|emb|CDI42266.1| Surface layer protein [Lactobacillus helveticus CIRM-BIA 953]）が共通して保有し、逆にUmod結合性が低いことが確認されたラクトバチルス・ガセリ（gi|1619598|emb|CAA69725.1| aggregation promoting protein [Lactobacillus gasseri]）が保有しない配列を特定した。【００７５】
アライメント解析の結果を図６に示す。Umod結合性の高いラクトバチルス・アシドフィルスおよびラクトバチルス・ヘルベティカスが共通して保有し、逆にUmod結合性が低かったラクトバチルス・ガセリが保有しない配列として、式(I)〜式(VI)が特定された（図７）。【００７６】
また、ラクトバチルス・アシドフィルスおよびラクトバチルス・ヘルベティカスに加え、ゲノム情報が利用可能であった他のラクトバチルス属の菌種の中から、ラクトバチルス・アシドフィルスの近縁種として考えられるラクトバチルス・クリスパタス（gi|113967820|gb|ABI49168.1| SlpB [Lactobacillus crispatus]）、ラクトバチルス・アミロボラス（gi|385816784|ref|YP_005853174.1| s-layer protein [Lactobacillus amylovorus GRL1118]）およびラクトバチルス・ガリナルム（gi|51242255|gb|AAT99079.1| LgsF [Lactobacillus gallinarum]）を選択して解析した。【００７７】
図８に、式(I)〜式(VI)で示されるアミノ酸配列と、それに対応する部分のラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・ヘルベティカス、ラクトバチルス・クリスパタス、ラクトバチルス・アミロボラス、ラクトバチルス・ガリナルムのアミノ酸配列を示す（配列番号１４〜４３）。これら5菌種においては、式(V)が最も共通性が高く、式(VI)が最も共通性が低いことがわかった。
【産業上の利用可能性】
【００７８】
本発明は、プロバイオティクス飲食品や粘膜ワクチンなどの医薬品の製造分野において利用できる。【００７９】
本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願をそのまま参考として本明細書に組み入れるものとする。
【図１】
2015182470.tif 000003
【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【配列表】
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【国際調査報告】
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