(57)【要約】  本発明は、下記配列番号１または２： （配列番号１）  ５’- AUUUCGUUGUGGGUUUCCACC -３’（配列番号２）  ５’- UGUUAUCCCUGCUGUCACAGG -３’で表されるＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制配列を含む、以下の（Ａ）または（Ｂ）の一本鎖核酸分子：（Ａ）領域（Ｘ）、リンカー領域（Ｌｘ）および領域（Ｘｃ）のみからなり、５’側から３’側にかけて、前記領域（Ｘｃ）、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記領域（Ｘ）の順で配置され、前記リンカー領域（Ｌｘ）が、ピロリジン骨格およびピペリジン骨格の少なくとも一方を含む非ヌクレオチド構造を有し、かつ前記領域（Ｘ）および前記領域（Ｘｃ）の少なくとも一方が、上記発現抑制配列を含む；（Ｂ）領域（Ｘｃ）、リンカー領域（Ｌｘ）、領域（Ｘ）、領域（Ｙ）、リンカー領域（Ｌｙ）および領域（Ｙｃ）を、５’側から３’側にかけてこの順序で含み、前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｙ）とが連結して、内部領域（Ｚ）を形成し、前記領域（Ｘｃ）が、前記領域（Ｘ）と相補的であり、前記領域（Ｙｃ）が、前記領域（Ｙ）と相補的であり、かつ前記リンカー領域（Ｌｘ）およびリンカー領域（Ｌｙ）が、ピロリジン骨格およびピペリジン骨格の少なくとも一方を含む非ヌクレオチド構造を有し、前記内部領域（Ｚ）が、上記発現抑制配列を含む；を提供する。
2016098782.tif 000002
【特許請求の範囲】
【請求項１】
下記配列番号１または２： 
（配列番号１）  ５’- AUUUCGUUGUGGGUUUCCACC -３’
（配列番号２）  ５’- UGUUAUCCCUGCUGUCACAGG -３’
で表されるＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制配列を含む、以下の（Ａ）または（Ｂ）の一本鎖核酸分子：
（Ａ）領域（Ｘ）、リンカー領域（Ｌｘ）および領域（Ｘｃ）のみからなり、
５’側から３’側にかけて、前記領域（Ｘｃ）、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記領域（Ｘ）の順で配置され、
前記リンカー領域（Ｌｘ）が、ピロリジン骨格およびピペリジン骨格の少なくとも一方を含む非ヌクレオチド構造を有し、
かつ前記領域（Ｘ）および前記領域（Ｘｃ）の少なくとも一方が、上記発現抑制配列を含む；
（Ｂ）領域（Ｘｃ）、リンカー領域（Ｌｘ）、領域（Ｘ）、領域（Ｙ）、リンカー領域（Ｌｙ）および領域（Ｙｃ）を、５’側から３’側にかけてこの順序で含み、
前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｙ）とが連結して、内部領域（Ｚ）を形成し、
前記領域（Ｘｃ）が、前記領域（Ｘ）と相補的であり、
前記領域（Ｙｃ）が、前記領域（Ｙ）と相補的であり、
かつ前記リンカー領域（Ｌｘ）およびリンカー領域（Ｌｙ）が、ピロリジン骨格およびピペリジン骨格の少なくとも一方を含む非ヌクレオチド構造を有し、
前記内部領域（Ｚ）が、上記発現抑制配列を含む。
【請求項２】
前記リンカー領域（Ｌｘ）および（Ｌｙ）が、下記式（Ｉ）で表わされる、請求項１記載の一本鎖核酸分子。
【化１】
2016098782.tif 000008
前記式中、
Ｘ１およびＸ２は、それぞれ独立して、Ｈ２、Ｏ、ＳまたはＮＨであり；
Ｙ１およびＹ２は、それぞれ独立して、単結合、ＣＨ２、ＮＨ、ＯまたはＳであり；
Ｒ３は、環Ａ上のＣ−３、Ｃ−４、Ｃ−５またはＣ−６に結合する水素原子または置換基であり；
Ｌ１は、ｎ個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、ＯＨ、ＯＲａ、ＮＨ２、ＮＨＲａ、ＮＲａＲｂ、ＳＨ、もしくはＳＲａで置換されても置換されていなくてもよく、または、
Ｌ１は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
ただし、Ｙ１が、ＮＨ、ＯまたはＳの場合、Ｙ１に結合するＬ１の原子は炭素であり、ＯＲ１に結合するＬ１の原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず；
Ｌ２は、ｍ個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、ＯＨ、ＯＲｃ、ＮＨ２、ＮＨＲｃ、ＮＲｃＲｄ、ＳＨもしくはＳＲｃで置換されても置換されていなくてもよく、または、
Ｌ２は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
ただし、Ｙ２が、ＮＨ、ＯまたはＳの場合、Ｙ２に結合するＬ２の原子は炭素であり、ＯＲ２に結合するＬ２の原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず；
Ｒａ、Ｒｂ、ＲｃおよびＲｄは、それぞれ独立して、置換基または保護基であり；
ｌは、１または２であり；
ｍは、０〜３０の範囲の整数であり；
ｎは、０〜３０の範囲の整数であり；
環Ａは、前記環Ａ上のＣ−２以外の１個の炭素原子が、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよく、
前記環Ａ内に、炭素−炭素二重結合または炭素−窒素二重結合を含んでもよく、
前記領域（Ｘｃ）および前記領域（Ｘ）は、それぞれ、−ＯＲ１−または−ＯＲ２−を介して、前記リンカー領域（Ｌｘ）に結合し、
前記領域（Ｙｃ）および前記領域（Ｙ）は、それぞれ、−ＯＲ１−または−ＯＲ２−を介して、前記リンカー領域（Ｌｙ）に結合し、
ここで、Ｒ１およびＲ２は、存在しても存在しなくてもよく、存在する場合、Ｒ１およびＲ２は、それぞれ独立して、ヌクレオチド残基または前記構造（Ｉ)である。
【請求項３】
前記領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）および前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）が、下記式（３）または式（５）の条件を満たす、請求項１または２に記載の一本鎖核酸分子。
Ｘ＞Ｘｃ  ・・・（３）
Ｘ＝Ｘｃ  ・・・（５）
【請求項４】
前記領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）および前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）が、下記式（１１）の条件を満たす、請求項３記載の一本鎖核酸分子。
Ｘ−Ｘｃ＝１、２または３  ・・・（１１）
【請求項５】
前記（Ｂ）において、前記領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）、前記領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）、前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）および前記領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）が、下記式（２）の条件を満たす、請求項１から４のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
Ｚ≧Ｘｃ＋Ｙｃ  ・・・（２）
【請求項６】
前記（Ｂ）において、前記領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）、前記（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）、前記領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）および前記領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）が、下記（ａ）〜（ｄ）のいずれかの条件を満たす、請求項１から５のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子：
（ａ）下記式（３）および（４）の条件を満たす。
Ｘ＞Ｘｃ  ・・・（３）
Ｙ＝Ｙｃ  ・・・（４）
（ｂ）下記式（５）および（６）の条件を満たす。
Ｘ＝Ｘｃ  ・・・（５）
Ｙ＞Ｙｃ  ・・・（６）
（ｃ）下記式（７）および（８）の条件を満たす。
Ｘ＞Ｘｃ  ・・・（７）
Ｙ＞Ｙｃ  ・・・（８）
（ｄ）下記式（９）および（１０）の条件を満たす。
Ｘ＝Ｘｃ  ・・・（９）
Ｙ＝Ｙｃ  ・・・（１０）
【請求項７】
前記（ａ）〜（ｄ）において、前記領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）と前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）の差、前記領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）と前記領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）の差が、下記条件を満たす、請求項６に記載の一本鎖核酸分子。
（ａ）下記式（１１）および（１２）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝１、２または３  ・・・（１１）
Ｙ−Ｙｃ＝０              ・・・（１２）
（ｂ）下記式（１３）および（１４）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝０              ・・・（１３）
Ｙ−Ｙｃ＝１、２または３  ・・・（１４）
（ｃ）下記式（１５）および（１６）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝１、２または３  ・・・（１５）
Ｙ−Ｙｃ＝１、２または３  ・・・（１６）
（ｄ）下記式（１７）および（１８）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝０              ・・・（１７）
Ｙ−Ｙｃ＝０              ・・・（１８）
【請求項８】
前記（Ｂ）において、前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）が、１〜１１塩基である、請求項１から７のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項９】
前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）が、１〜７塩基である、請求項８に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１０】
前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）が、１〜３塩基である、請求項８に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１１】
前記（Ｂ）において、前記領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）が、１〜１１塩基である、請求項１から１０のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１２】
前記領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）が、１〜７塩基である、請求項１１記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１３】
前記領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）が、１〜３塩基である、請求項１１記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１４】
前記（Ａ）において、前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）が、１９塩基〜３０塩基である、請求項１から４のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１５】
前記（Ａ）において、塩基数の合計が４０塩基以上である、請求項１から４のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１６】
前記（Ｂ）において、塩基数の合計が５０塩基以上である、請求項１から１３のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１７】
ＲＮＡ分子である、請求項１から１６のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１８】
少なくとも１つの修飾された残基を含む、請求項１から１７のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項１９】
標識物質を含む、請求項１から１８のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項２０】
安定同位体を含む、請求項１から１９のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項２１】
配列番号５または６の塩基配列からなる、請求項１から４、１４、１５および１７から２０のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項２２】
配列番号１１または１２の塩基配列からなる、請求項１から１３、１６から２０のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子。
【請求項２３】
請求項１から２２のいずれか一項に記載の一本鎖核酸分子を含む、ＴＧＦ-β１遺伝子の発現抑制剤。
【請求項２４】
請求項１から２２のいずれか一項に記載の核酸分子を含む医薬。
【請求項２５】
肺線維症または急性肺傷害の治療用である、請求項２４記載の医薬。
【請求項２６】
ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制する方法であって、
請求項１から２２のいずれか一項に記載の核酸分子を使用することを特徴とする発現抑制方法。
【請求項２７】
前記核酸分子を、細胞、組織または器官に投与する工程を含む、請求項２６記載の発現抑制方法。
【請求項２８】
前記核酸分子を、ｉｎ  ｖｉｖｏまたはｉｎ  ｖｉｔｒｏで投与する、請求項２７記載の発現抑制方法。
【請求項２９】
請求項１から２２のいずれか一項に記載の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする肺線維症の治療方法。
【請求項３０】
請求項１から２２のいずれか一項に記載の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする急性肺傷害の治療方法。
【請求項３１】
ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制のための、請求項１から２２のいずれか一項に記載の核酸分子の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制する核酸分子、それを含む組成物およびその用途に関する。
【背景技術】
【０００２】
肺線維症は、過剰なコラーゲンと他の細胞マトリックスの蓄積により肺組織が線維化する疾患である。肺線維症の中でも特発性肺線維症は、中間生存期間が平均3年、5年生存率が２０〜４０％の慢性難治性疾患である。【０００３】
急性肺傷害は、急性呼吸障害の一種であり、肺浸潤陰影を示す急性呼吸不全である。急性肺傷害の病態は、肺毛細血管内皮細胞および肺胞壁細胞障害が原因となる透過性亢進による肺水腫である。この間質性肺水腫、肺胞性肺水腫および肺虚脱によって、死腔換気率が増大し、低酸素血症が発生する。【０００４】
肺線維症や急性肺傷害については、効果的な治療法がないのが現状であり、有効な治療薬の開発が望まれている。肺線維症や急性肺傷害の発症には、ＴＧＦ−β１の発現が関与していることが報告されていることから、この遺伝子発現を抑制する試みがなされている（特許文献１−５、非特許文献１−６）。【０００５】
遺伝子の発現を抑制する技術として、例えば、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）が知られている。ＲＮＡ干渉による遺伝子の発現抑制は、例えば、短い二本鎖のＲＮＡ分子を、細胞等に投与することによって、実施されるのが一般的である。前記二本鎖のＲＮＡ分子は、通常、ｓｉＲＮＡ（ｓｍａｌｌ  ｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇ  ＲＮＡ）と呼ばれる。前記ＴＧＦ−β１遺伝子の発現について、ｓｉＲＮＡの研究が行われているが、より効果的な核酸分子の提供が望まれている。
近年、本出願人らはｓｉＲＮＡに代わるより効果的な一本鎖核酸分子を新たに見出している（特許文献６、７、非特許文献７）。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００６】
【特許文献１】国際公開第２００７／１０９０９７号
【特許文献２】国際公開第２００３／０３５０８３号
【特許文献３】特開２００７−１１９３９６号
【特許文献４】特表２００９−５１６５１７号
【特許文献５】国際公開第２０１２／０５０１８１号
【特許文献６】国際公開第２０１２／００５３６８号
【特許文献７】国際公開第２０１２／０１７９１９号
【非特許文献】
【０００７】
【非特許文献１】Ｗａｎｇら，Ｊ  Ｐｌａｓｔ  Ｒｅｃｏｎｓｔｒ  Ａｅｓｔｈｅｔ  Ｓｕｒｇ，１１９３−１１９９，６０，２００７
【非特許文献２】Ｈｗａｎｇら，Ｅｘｐ  Ｍｏｌ  ｐａｔｈｏｌ，４８−５４，８１，２００６
【非特許文献３】Ｔａｋａｂａｔａｋｅら，Ｇｅｎｅ  Ｔｈｅｒ，９６５−９７３，１２，２００５
【非特許文献４】Ｘｕら，Ｈｅｐａｔｏｂｉｌｉａｒｙ  Ｐａｎｃｒｅａｔ  Ｄｉｓ  Ｉｎｔ，３００−３０８，２００９
【非特許文献５】Ｌｉｕら，Ｂｉｏｔｈｅｃｈｎｏｌ  Ｌｅｔｔ，１６０９−１６１５，２７，２００５
【非特許文献６】Ｇａｂａｚｚａら、Ａｍ  Ｊ  Ｒｅｓｐｉｒ  Ｃｅｌｌ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ.  ３９７−４０６，４６，２０１２
【非特許文献７】Ｈａｍａｓａｋｉら，ＰＬｏＳ  ＯＮＥ，  ７（８），ｅ４２６５５，ｄｏｉ：１０．１３７１，２０１２
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００８】
そこで、本発明は、先の発明で見出した前記核酸分子の構造に基づき、肺線維症や急性肺傷害等のＴＧＦ−β１の発現が関与している疾患の治療に有効な核酸分子、およびこれを用いた医薬の提供を目的とする。
【課題を解決するための手段】
【０００９】
前記目的を達成するために、本発明のＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制用核酸分子は、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制配列として、下記のいずれかのヌクレオチド配列を含むことを特徴とする。
（配列番号１）  ５’- AUUUCGUUGUGGGUUUCCACC-３’
（配列番号２）  ５’- UGUUAUCCCUGCUGUCACAGG-３’【００１０】
本発明の組成物は、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制するための組成物であって、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。【００１１】
本発明の組成物は、薬学的組成物であって、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。【００１２】
本発明の発現抑制方法は、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制する方法であって、前記本発明の核酸分子を使用することを特徴とする。【００１３】
本発明の肺線維症の治療方法は、前記本発明の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする。【００１４】
本発明の急性肺傷害の治療方法は、前記本発明の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする。
【発明の効果】
【００１５】
本発明の核酸分子によれば、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制が可能である。このため、本発明は、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現が原因となる疾患、例えば、肺線維症および急性肺傷害等の治療に有効である。
【図面の簡単な説明】
【００１６】
【図１】図１は、本発明の核酸分子の一例を示す模式図である。
【図２】図２は、本発明の核酸分子のその他の例を示す模式図である。
【図３】図３は、本発明の核酸分子のその他の例を示す模式図である。
【図４】図４は、本発明の核酸分子のその他の例を示す模式図である。
【図５】図５は、本発明の実施例１におけるＴＧＦ−β１量の相対値を示すグラフである。
【図６】図６は、本発明の実施例２におけるＢＡＬＦ中のタンパク質量を示すグラフである。
【図７】図７は、本発明の実施例３におけるハイドロキシプロリン量を示すグラフである。
【発明を実施するための形態】
【００１７】
本明細書で使用する用語は、特に言及しない限り、当該技術分野で通常用いられる意味で用いることができる。
【００１８】
１．ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制用核酸分子
本発明の核酸分子は、前述のように、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制用であって、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制配列として、下記のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする。
（配列番号１）  ５’- AUUUCGUUGUGGGUUUCCACC -３’
（配列番号２）  ５’- UGUUAUCCCUGCUGUCACAGG -３’
【００１９】
前記発現抑制配列は、例えば、前記ヌクレオチド配列からなる配列でもよいし、前記ヌクレオチド配列を含む配列でもよい。
【００２０】
前記発現抑制配列の長さは、特に制限されず、例えば、１８〜３２塩基長であり、好ましくは１９〜３０塩基長であり、より好ましくは１９、２０、２１塩基長である。本発明において、例えば、塩基数の数値範囲は、その範囲に属する正の整数を全て開示するものであり、例えば、「１〜４塩基」との記載は、「１、２、３、４塩基」の全ての開示を意味する（以下、同様）。
【００２１】
本発明の一本鎖核酸分子は、例えば、さらに、前記発現抑制配列とアニーリング可能な相補配列を有することが好ましい。前記相補配列は、例えば、前記発現抑制配列と同じ鎖にあり、１つの一本鎖から構成される一本鎖核酸分子を形成する。
【００２２】
前記相補配列は、例えば、前記発現抑制配列とアニーリング可能であればよい。前記相補配列は、例えば、前記発現抑制配列と、１００％の相補性を示す配列でもよいし、アニーリング可能な範囲で１００％未満の相補性を示す配列でもよい。前記相補性は、特に制限されず、例えば、９０％〜１００％、９３％〜１００％、９５％〜１００％、９８％〜１００％、９９％〜１００％等が例示できる。
【００２３】
前記相補配列は、例えば、下記のヌクレオチド配列を含むものが例示できる。
（配列番号３）5’- UGGAAACCCACAACGAAAUCU-3’
（配列番号４）5’- UGUGACAGCAGGGAUAACACA-3’
【００２４】
以下、前記配列番号３または４のヌクレオチド配列をｓヌクレオチド配列という。
【００２５】
前記相補配列は、例えば、前記ｓヌクレオチド配列からなる配列でもよいし、前記ｓヌクレオチド配列を含む配列でもよい。
【００２６】
前記相補配列の長さは、特に制限されず、例えば、１８〜３２塩基長であり、好ましくは１９〜３０塩基長であり、より好ましくは１９、２０、２１塩基長である。
【００２７】
前記発現抑制配列と前記相補配列はそれぞれ、例えば、リボヌクレオチド残基のみからなるＲＮＡ分子でもよいし、リボヌクレオチド残基の他に、デオキシリボヌクレオチド残基を含むＲＮＡ分子でもよい。
【００２８】
一本鎖核酸分子
前記核酸分子は、例えば、前記発現抑制配列と前記相補配列とが、直接的に連結している形態および間接的に連結している形態があげられる。前記直接的な連結は、例えば、ホスホジエステル結合による連結があげられる。前記間接的な連結は、例えば、リンカー領域を介した連結があげられる。前記発現抑制配列と前記相補配列との連結順序は、特に制限されず、例えば、前記発現抑制配列の３’末端と前記相補配列の５’末端とが連結してもよく、前記発現抑制配列の５’末端と前記相補配列の３’末端とが連結してもよく、好ましくは前者である。前記リンカー領域は、例えば、ヌクレオチド残基から構成されてもよいし、非ヌクレオチド残基から構成されてもよく、前記ヌクレオチド残基および非ヌクレオチド残基から構成されてもよい。前記ヌクレオチド残基は、例えば、リボヌクレオチド残基およびデオキシリボヌクレオチド残基があげられる。
【００２９】
以下に、前記一本鎖核酸分子の具体例を例示するが、本発明は、これには制限されない。
【００３０】
前記一本鎖核酸分子の第１形態として、５’側領域および３’側領域が、互いにアニーリングして二重鎖構造（ステム構造）を形成する分子があげられる。これは、ｓｈＲＮＡ（ｓｍａｌｌ  ｈａｉｒｐｉｎ  ＲＮＡまたはｓｈｏｒｔ  ｈａｉｒｐｉｎ  ＲＮＡ）の形態とも言える。ｓｈＲＮＡは、ヘアピン構造をとっており、一般的に、一つのステム領域と一つのループ領域とを有する。
【００３１】
本形態の核酸分子は、例えば、領域（Ｘ）、リンカー領域（Ｌｘ）および領域（Ｘｃ）を含み、前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｘｃ）との間に、前記リンカー領域（Ｌｘ）が連結された構造をとる。そして、前記領域（Ｘｃ）が、前記領域（Ｘ）と相補的である構造が好ましく、具体的には、前記領域（Ｘ）および前記領域（Ｘｃ）のうち、一方が、前記発現抑制配列を含み、他方が、前記相補配列を含むことが好ましい。前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｘｃ）は、それぞれ、前記発現抑制配列および前記相補配列のいずれかを有するため、例えば、分子内アニーリングにより、ステム構造を形成でき、前記リンカー領域（Ｌｘ）がループ構造となる。
【００３２】
前記核酸分子は、例えば、５’側から３’側にかけて、前記領域（Ｘｃ）、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記領域（Ｘ）を、前記順序で有してもよいし、３’側から５’側にかけて、前記領域（Ｘｃ）、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記領域（Ｘ）を、前記順序で有してもよい。前記発現抑制配列は、例えば、前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｘｃ）のいずれに配置してもよく、前記相補配列の上流側、すなわち、前記相補配列よりも５’側に配置することが好ましい。
【００３３】
本形態の核酸分子の一例を、図１の模式図に示す。図１（Ａ）は、各領域の順序の概略を示す模式図であり、図１（Ｂ）は、前記核酸分子が、前記分子内において二重鎖を形成している状態を示す模式図である。図１（Ｂ）に示すように、前記核酸分子は、前記領域（Ｘｃ）と前記領域（Ｘ）との間で、二重鎖が形成され、前記Ｌｘ領域が、その長さに応じてループ構造をとる。図１は、あくまでも、前記領域の連結順序および二重鎖を形成する各領域の位置関係を示すものであり、例えば、各領域の長さ、前記リンカー領域（Ｌｘ）の形状等は、これに制限されない。
【００３４】
前記核酸分子において、前記領域（Ｘｃ）および前記領域（Ｘ）の塩基数は、特に制限されない。以下に各領域の長さを例示するが、本発明は、これには制限されない。
【００３５】
前記核酸分子において、前記領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）と前記領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）との関係は、例えば、下記（３）または（５）の条件を満たし、前者の場合、具体的には、例えば、下記（１１）の条件を満たす。
Ｘ＞Ｘｃ  ・・・（３）
Ｘ−Ｘｃ＝１〜１０、好ましくは１、２または３、
より好ましくは１または２      ・・・（１１）
Ｘ＝Ｘｃ  ・・・（５）
【００３６】
前記領域（Ｘ）または前記領域（Ｘｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記領域は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の塩基数は、例えば、前述の通りである。前記発現抑制配列を含む領域は、例えば、前記発現抑制配列の５’側および／または３’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、１〜３１塩基であり、好ましくは、１〜２１塩基であり、より好ましくは、１〜１１塩基である。
【００３７】
前記領域（Ｘｃ）の塩基数は、特に制限されない。前記領域（Ｘ）が、前記発現抑制配列を含む場合、Ｘｃの下限は、例えば、１９塩基である。その上限は、例えば、５０塩基であり、好ましくは３０塩基であり、より好ましくは２５塩基である。前記領域（Ｘｃ）の塩基数の具体例は、例えば、１９塩基〜５０塩基であり、好ましくは、１９塩基〜３０塩基、より好ましくは１９塩基〜２５塩基である。
【００３８】
前記領域（Ｘ）の塩基数は、特に制限されない。その下限は、例えば、１９塩基であり、好ましくは２０塩基であり、より好ましくは２１塩基である。その上限は、例えば、５０塩基であり、より好ましくは４０塩基であり、さらに好ましくは３０塩基である。
【００３９】
前記リンカー領域（Ｌｘ）は、それ自体の領域内部において、自己アニーリングを生じない構造であることが好ましい。
【００４０】
前記リンカー領域（Ｌｘ）が、前述のようにヌクレオチド残基を含む場合、その長さは、特に制限されない。前記リンカー領域（Ｌｘ）は、例えば、前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｘｃ）とが二重鎖を形成可能な長さであることが好ましい。前記リンカー領域（Ｌｘ）の塩基数は、その下限が、例えば、１塩基であり、好ましくは２塩基であり、より好ましくは３塩基であり、その上限が、例えば、１００塩基であり、好ましくは８０塩基であり、より好ましくは５０塩基である。
【００４１】
前記核酸分子の全長は、特に制限されない。前記核酸分子において、前記塩基数の合計（全長の塩基数）は、下限が、例えば、３８塩基であり、好ましくは４２塩基であり、より好ましくは５０塩基であり、さらに好ましくは５１塩基であり、特に好ましくは５２塩基であり、その上限は、例えば、３００塩基であり、好ましくは２００塩基であり、より好ましくは１５０塩基であり、さらに好ましくは１００塩基であり、特に好ましくは８０塩基である。前記核酸分子において、前記リンカー領域（Ｌｘ）を除く塩基数の合計は、下限が、例えば、３８塩基であり、好ましくは４２塩基であり、より好ましくは５０塩基であり、さらに好ましくは５１塩基であり、特に好ましくは５２塩基であり、上限が、例えば、３００塩基であり、好ましくは２００塩基であり、より好ましくは１５０塩基であり、さらに好ましくは１００塩基であり、特に好ましくは８０塩基である。
【００４２】
前記一本鎖核酸分子の第２形態として、５’側領域および３’側領域が、それぞれ別個に分子内アニーリングして、２つの二重鎖構造（ステム構造）を形成する分子があげられる。
【００４３】
本形態の核酸分子は、例えば、５’側から３’側にかけて、５’側領域（Ｘｃ）、内部領域（Ｚ）および３’側領域（Ｙｃ）を、前記順序で含み、前記内部領域（Ｚ）が、内部５’側領域（Ｘ）および内部３’側領域（Ｙ）が連結して構成され、前記５’側領域（Ｘｃ）が、前記内部５’側領域（Ｘ）と相補的であり、前記３’側領域（Ｙｃ）が、前記内部３’側領域（Ｙ）と相補的である構造が好ましい。そして、前記内部領域（Ｚ）、前記５’側領域（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）の少なくとも一つが、前記発現抑制配列を含むことが好ましい。具体的には、前記内部領域（Ｚ）の前記内部５’側領域（Ｘ）が前記発現抑制配列を有する場合、前記５’側領域（Ｘｃ）が前記相補配列を有することが好ましく、前記内部領域（Ｚ）の前記内部３’側領域（Ｙ）が前記発現抑制配列を有する場合、前記３’側領域（Ｙｃ）が前記相補配列を有することが好ましい。また、前記５’側領域（Ｘｃ）が前記発現抑制配列を有する場合、前記内部領域（Ｚ）の前記内部５’側領域（Ｘ）が前記相補配列を有することが好ましく、前記３’側領域（Ｙｃ）が前記発現抑制配列を有する場合、前記内部領域（Ｚ）の前記内部３’側領域（Ｙ）が前記相補配列を有することが好ましい。
【００４４】
前記核酸分子において、前記５’側領域（Ｘｃ）は、前記内部５’側領域（Ｘ）と相補的であり、前記３’側領域（Ｙｃ）は、前記内部３’側領域（Ｙ）と相補的である。このため、５’側において、前記領域（Ｘｃ）が前記領域（Ｘ）に向かって折り返し、前記領域（Ｘｃ）と前記領域（Ｘ）とが、自己アニーリングによって、二重鎖を形成可能であり、また、３’側において、前記領域（Ｙｃ）が前記領域（Ｙ）に向かって折り返し、前記領域（Ｙｃ）と前記領域（Ｙ）とが、自己アニーリングによって、二重鎖を形成可能である。
【００４５】
前記内部領域（Ｚ）は、前述のように、前記内部５’領域（Ｘ）と前記内部３’領域（Ｙ）が連結されている。前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｙ）は、例えば、直接的に連結され、その間に介在配列を有していない。前記内部領域（Ｚ）は、前記５’側領域（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）との配列関係を示すために、「前記内部５’側領域（Ｘ）と前記内部３’側領域（Ｙ）が連結して構成される」と表わすものであって、前記内部領域（Ｚ）において、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記３’側領域（Ｙｃ）とが、例えば、前記核酸分子の使用において、別個の独立した領域であることを限定するものではない。すなわち、例えば、前記内部領域（Ｚ）が、前記発現抑制配列を有する場合、前記内部領域（Ｚ）において、前記領域（Ｘ）と前記領域（Ｙ）とにわたって、前記発現抑制配列が配置されてもよい。
【００４６】
前記核酸分子において、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記内部５’側領域（Ｘ）とは、例えば、直接連結してもよいし、間接的に連結してもよい。前者の場合、直接的な連結は、例えば、ホスホジエステル結合による連結があげられる。後者の場合、例えば、前記領域（Ｘｃ）と前記領域（Ｘ）との間に、リンカー領域（Ｌｘ）を有し、前記リンカー領域（Ｌｘ）を介して、前記領域（Ｘｃ）と前記領域（Ｘ）とが連結している形態があげられる。
【００４７】
前記核酸分子において、前記３’側領域（Ｙｃ）と前記内部３’側領域（Ｙ）とは、例えば、直接連結してもよいし、間接的に連結してもよい。前者の場合、直接的な連結は、例えば、ホスホジエステル結合による連結があげられる。後者の場合、例えば、前記領域（Ｙｃ）と前記領域（Ｙ）との間に、リンカー領域（Ｌｙ）を有し、前記リンカー領域（Ｌｙ）を介して、前記領域（Ｙｃ）と前記領域（Ｙ）とが連結している形態があげられる。
【００４８】
前記核酸分子は、例えば、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）の両方を有してもよいし、いずれか一方を有してもよい。後者の場合、例えば、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記内部５’側領域（Ｘ）との間に前記リンカー領域（Ｌｘ）を有し、前記３’側領域（Ｙｃ）と前記内部３’側領域（Ｙ）との間に前記リンカー領域（Ｌｙ）を有さない、つまり、前記領域（Ｙｃ）と前記領域（Ｙ）とが直接連結された形態があげられる。また、後者の場合、例えば、前記３’側領域（Ｙｃ）と前記内部３’側領域（Ｙ）との間に前記リンカー領域（Ｌｙ）を有し、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記内部５’側領域（Ｘ）との間に前記リンカー領域（Ｌｘ）を有さない、つまり、前記領域（Ｘｃ）と前記領域（Ｘ）とが直接連結された形態があげられる。
【００４９】
前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）は、それぞれ、それ自体の領域内部において、自己アニーリングを生じない構造であることが好ましい。
【００５０】
本形態の核酸分子について、前記リンカー領域を有さない一例を、図２の模式図に示す。図２（Ａ）は、前記核酸分子について、５’側から３’側に向かって、各領域の順序の概略を示す模式図であり、図２（Ｂ）は、前記核酸分子が、前記分子内において二重鎖を形成している状態を示す模式図である。図２（Ｂ）に示すように、前記核酸分子は、前記５’側領域（Ｘｃ）が折り返し、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記内部５’側領域（Ｘ）との間で二重鎖が形成され、前記３’側領域（Ｙｃ）が折り返し、前記３’側領域（Ｙｃ）と前記内部３’側領域（Ｙ）との間で二重鎖が形成される。図２は、あくまでも、各領域の連結順番および二重鎖を形成する各領域の位置関係を示すものであり、例えば、各領域の長さ等は、これに制限されない。
【００５１】
前記核酸分子について、前記リンカー領域を有する一例を、図３の模式図に示す。図３（Ａ）は、一例として、前記核酸分子について、５’側から３’側に向かって、各領域の順序の概略を示す模式図であり、図３（Ｂ）は、前記核酸分子が、前記分子内において二重鎖を形成している状態を示す模式図である。図３（Ｂ）に示すように、前記核酸分子は、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記内部５’側領域（Ｘ）との間、前記内部３’側領域（Ｙ）と前記３’側領域（Ｙｃ）との間で、二重鎖が形成され、前記Ｌｘ領域および前記Ｌｙ領域が、ループ構造をとる。図３は、あくまでも、各領域の連結順番および二重鎖を形成する各領域の位置関係を示すものであり、例えば、各領域の長さ等は、これに制限されない。
【００５２】
前記核酸分子において、前記５’側領域（Ｘｃ）、前記内部５’側領域（Ｘ）、前記内部３’側領域（Ｙ）および前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数は、特に制限されず、例えば、以下の通りである。
【００５３】
前記５’側領域（Ｘｃ）は、前述のように、例えば、前記内部５’側領域（Ｘ）の全領域に相補的でもよい。この場合、前記領域（Ｘｃ）は、例えば、前記領域（Ｘ）と同じ塩基長であり、前記領域（Ｘ）の５’末端から３’末端の全領域に相補的な塩基配列からなることが好ましい。前記領域（Ｘｃ）は、より好ましくは、前記領域（Ｘ）と同じ塩基長であり、且つ、前記領域（Ｘｃ）の全ての塩基が、前記領域（Ｘ）の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補的であることが好ましい。なお、これには制限されず、例えば、前述のように、１ないし数（2、3、4もしくは5）塩基が非相補的でもよい。
【００５４】
また、前記５’側領域（Ｘｃ）は、前述のように、例えば、前記内部５’側領域（Ｘ）の部分領域に相補的でもよい。この場合、前記領域（Ｘｃ）は、例えば、前記領域（Ｘ）の部分領域と同じ塩基長であり、すなわち、前記領域（Ｘ）よりも、１塩基以上短い塩基長の塩基配列からなることが好ましい。前記領域（Ｘｃ）は、より好ましくは、前記領域（Ｘ）の前記部分領域と同じ塩基長であり、且つ、前記領域（Ｘｃ）の全ての塩基が、前記領域（Ｘ）の前記部分領域の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補的であることが好ましい。前記領域（Ｘ）の前記部分領域は、例えば、前記領域（Ｘ）における、５’末端の塩基（１番目の塩基）から連続する塩基配列からなる領域（セグメント）であることが好ましい。
【００５５】
前記３’側領域（Ｙｃ）は、前述のように、例えば、前記内部３’側領域（Ｙ）の全領域に相補的でもよい。この場合、前記領域（Ｙｃ）は、例えば、前記領域（Ｙ）と同じ塩基長であり、前記領域（Ｙ）の５’末端から３’末端の全領域に相補的な塩基配列からなることが好ましい。前記領域（Ｙｃ）は、より好ましくは、前記領域（Ｙ）と同じ塩基長であり、且つ、前記領域（Ｙｃ）の全ての塩基が、前記領域（Ｙ）の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補であることが好ましい。なお、これには制限されず、例えば、前述のように、１ないし数（2、3、4もしくは5）塩基が非相補的でもよい。
【００５６】
また、前記３’側領域（Ｙｃ）は、前述のように、例えば、前記内部３’側領域（Ｙ）の部分領域に相補的でもよい。この場合、前記領域（Ｙｃ）は、例えば、前記領域（Ｙ）の部分領域と同じ塩基長であり、すなわち、前記領域（Ｙ）よりも、１塩基以上短い塩基長の塩基配列からなることが好ましい。前記領域（Ｙｃ）は、より好ましくは、前記領域（Ｙ）の前記部分領域と同じ塩基長であり、且つ、前記領域（Ｙｃ）の全ての塩基が、前記領域（Ｙ）の前記部分領域の全ての塩基と相補的である、つまり、例えば、完全に相補であることが好ましい。前記領域（Ｙ）の前記部分領域は、例えば、前記領域（Ｙ）における、３’末端の塩基（１番目の塩基）から連続する塩基配列からなる領域（セグメント）であることが好ましい。
【００５７】
前記核酸分子において、前記内部領域（Ｚ）の塩基数（Ｚ）と、前記内部５’側領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）および前記内部３’側領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）との関係、前記内部領域（Ｚ）の塩基数（Ｚ）と、前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）との関係は、例えば、下記式（１）および（２）の条件を満たす。
Ｚ＝Ｘ＋Ｙ      ・・・（１）
Ｚ≧Ｘｃ＋Ｙｃ  ・・・（２）
【００５８】
本発明の核酸分子において、前記内部５’側領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）と前記内部３’側領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）の長さの関係は、特に制限されず、例えば、下記式のいずれの条件を満たしてもよい。
Ｘ＝Ｙ  ・・・（１９）
Ｘ＜Ｙ  ・・・（２０）
Ｘ＞Ｙ  ・・・（２１）
【００５９】
前記核酸分子において、前記内部５’側領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）、前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）、前記内部３’側領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）および前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）の関係は、例えば、下記（ａ）〜（ｄ）のいずれかの条件を満たす。
（ａ）下記式（３）および（４）の条件を満たす。
Ｘ＞Ｘｃ  ・・・（３）
Ｙ＝Ｙｃ  ・・・（４）
（ｂ）下記式（５）および（６）の条件を満たす。
Ｘ＝Ｘｃ  ・・・（５）
Ｙ＞Ｙｃ  ・・・（６）
（ｃ）下記式（７）および（８）の条件を満たす。
Ｘ＞Ｘｃ  ・・・（７）
Ｙ＞Ｙｃ  ・・・（８）
（ｄ）下記式（９）および（１０）の条件を満たす。
Ｘ＝Ｘｃ  ・・・（９）
Ｙ＝Ｙｃ  ・・・（１０）
【００６０】
前記（ａ）〜（ｄ）において、前記内部５’側領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）と前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数（Ｘｃ）の差、前記内部３’側領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）と前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数（Ｙｃ）の差は、例えば、下記条件を満たすことが好ましい。
（ａ）下記式（１１）および（１２）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝１〜１０、好ましくは１、２、３または４、
より好ましくは１、２または３      ・・・（１１）
Ｙ−Ｙｃ＝０              ・・・（１２）
（ｂ）下記式（１３）および（１４）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝０              ・・・（１３）
Ｙ−Ｙｃ＝１〜１０、好ましくは１、２、３または４、
より好ましくは１、２または３      ・・・（１４）
（ｃ）下記式（１５）および（１６）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝１〜１０、好ましくは、１、２または３、
より好ましくは１または２          ・・・（１５）
Ｙ−Ｙｃ＝１〜１０、好ましくは、１、２または３、
より好ましくは１または２          ・・・（１６）
（ｄ）下記式（１７）および（１８）の条件を満たす。
Ｘ−Ｘｃ＝０              ・・・（１７）
Ｙ−Ｙｃ＝０              ・・・（１８）
【００６１】
前記（ａ）〜（ｄ）の核酸分子について、それぞれの構造の一例を、図４の模式図に示す。図４は、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）を含む核酸分子であり、（Ａ）は、前記（ａ）の核酸分子、（Ｂ）は、前記（ｂ）の核酸分子、（Ｃ）は、前記（ｃ）の核酸分子、（Ｄ）は、前記（ｄ）の核酸分子の例である。図４において、点線は、自己アニーリングにより二重鎖を形成している状態を示す。図４の核酸分子は、前記内部５’側領域（Ｘ）の塩基数（Ｘ）と前記内部３’側領域（Ｙ）の塩基数（Ｙ）を、前記式（２０）の「Ｘ＜Ｙ」として表わすが、これには制限されず、前述のように、前記式（１９）の「Ｘ＝Ｙ」でも、前記式（２１）の「Ｘ＞Ｙ」でもよい。また、図４は、あくまでも、前記内部５’側領域（Ｘ）と前記５’側領域（Ｘｃ）との関係、前記内部３’側領域（Ｙ）と前記３’側領域（Ｙｃ）との関係を示す模式図であり、例えば、各領域の長さ、形状等は、これには制限されず、また、リンカー領域（Ｌｘ）およびリンカー領域（Ｌｙ）の有無も、これには制限されない。
【００６２】
前記（ａ）〜（ｃ）の核酸分子は、例えば、前記５’側領域（Ｘｃ）と前記内部５’側領域（Ｘ）、および、前記３’側領域（Ｙｃ）と前記内部３’側領域（Ｙ）が、それぞれ二重鎖を形成することによって、前記内部領域（Ｚ）において、前記５’側領域（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）のいずれともアライメントできない塩基を有する構造であり、二重鎖を形成しない塩基を有する構造ともいえる。前記内部領域（Ｚ）において、前記アライメントできない塩基（二重鎖を形成しない塩基ともいう）を、以下、「フリー塩基」という。図４において、前記フリー塩基の領域を、「Ｆ」で示す。前記領域（Ｆ）の塩基数は、特に制限されない。前記領域（Ｆ）の塩基数（Ｆ）は、例えば、前記（ａ）の核酸分子の場合、「Ｘ−Ｘｃ」の塩基数であり、前記（ｂ）の核酸分子の場合、「Ｙ−Ｙｃ」の塩基数であり、前記（ｃ）の核酸分子の場合、「Ｘ−Ｘｃ」の塩基数と「Ｙ−Ｙｃ」の塩基数との合計数である。
【００６３】
他方、前記(ｄ)の核酸分子は、例えば、前記内部領域（Ｚ）の全領域が、前記５’側領域（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）とアライメントする構造であり、前記内部領域（Ｚ）の全領域が二重鎖を形成する構造ともいえる。なお、前記（ｄ）の核酸分子において、前記５’側領域（Ｘｃ）の５’末端と前記３’側領域（Ｙｃ）の３’末端は、未連結である。
【００６４】
前記核酸分子について、各領域の長さを以下に例示するが、本発明は、これには制限されない。
【００６５】
前記５’側領域（Ｘｃ）、前記３’側領域（Ｙｃ）、および前記内部領域（Ｚ）における前記フリー塩基（Ｆ）の塩基数の合計は、前記内部領域（Ｚ）の塩基数となる。このため、前記５’側領域（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）の長さは、例えば、前記内部領域（Ｚ）の長さ、前記フリー塩基の数（Ｆ）およびその位置に応じて、適宜決定できる。
【００６６】
前記内部領域（Ｚ）の塩基数は、例えば、１９塩基以上である。前記塩基数の下限は、例えば、１９塩基であり、好ましくは２０塩基であり、より好ましくは２１塩基である。前記塩基数の上限は、例えば、５０塩基であり、好ましくは４０塩基であり、より好ましくは３０塩基である。前記内部領域（Ｚ）の塩基数の具体例は、例えば、１９塩基、２０塩基、２１塩基、２２塩基、２３塩基、２４塩基、２５塩基、２６塩基、２７塩基、２８塩基、２９塩基、または、３０塩基である。
【００６７】
前記内部領域（Ｚ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記内部領域（Ｚ）は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の塩基数は、例えば、前述の通りである。前記内部領域（Ｚ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記発現抑制配列の５’側および／または３’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、１〜３１塩基であり、好ましくは、１〜２１塩基であり、より好ましくは、１〜１１塩基であり、さらに好ましくは、１〜７塩基である。
【００６８】
前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数は、例えば、１〜２９塩基であり、好ましくは１〜１１塩基であり、より好ましくは１〜７塩基であり、さらに好ましくは１〜４塩基であり、特に好ましくは１塩基、２塩基、３塩基である。前記内部領域（Ｚ）または前記３’側領域（Ｙｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、例えば、このような塩基数が好ましい。具体例として、前記内部領域（Ｚ）の塩基数が、１９〜３０塩基（例えば、１９塩基）の場合、前記５’側領域（Ｘｃ）の塩基数は、例えば、１〜１１塩基であり、好ましくは１〜７塩基であり、より好ましくは１〜４塩基であり、さらに好ましくは１塩基、２塩基、３塩基である。
【００６９】
前記５’側領域（Ｘｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記５’側領域（Ｘｃ）は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の長さは、例えば、前述の通りである。前記５’側領域（Ｘｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記発現抑制配列の５’側および／または３’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、１〜１１塩基であり、好ましくは、１〜７塩基である。
【００７０】
前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数は、例えば、１〜２９塩基であり、好ましくは１〜１１塩基であり、より好ましくは１〜７塩基であり、さらに好ましくは１〜４塩基であり、特に好ましくは１塩基、２塩基、３塩基である。前記内部領域（Ｚ）または前記５’側領域（Ｘｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、例えば、このような塩基数が好ましい。具体例として、前記内部領域（Ｚ）の塩基数が、１９〜３０塩基（例えば、１９塩基）の場合、前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数は、例えば、１〜１１塩基であり、好ましくは１〜７塩基であり、より好ましくは１〜４塩基であり、さらに好ましくは１塩基、２塩基、３塩基である。
【００７１】
前記３’側領域（Ｙｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記３’側領域（Ｙｃ）は、例えば、前記発現抑制配列のみから構成される領域でもよいし、前記発現抑制配列を含む領域でもよい。前記発現抑制配列の長さは、例えば、前述の通りである。前記３’側領域（Ｙｃ）が前記発現抑制配列を含む場合、前記発現抑制配列の５’側および／または３’側に、さらに付加配列を有してもよい。前記付加配列の塩基数は、例えば、１〜１１塩基であり、好ましくは、１〜７塩基である。
【００７２】
前述のように、前記内部領域（Ｚ）、前記５’側領域（Ｘｃ）および前記３’側領域（Ｙｃ）の塩基数は、例えば、前記式（２）の「Ｚ≧Ｘｃ＋Ｙｃ」で表わすことができる。具体例として、「Ｘｃ＋Ｙｃ」の塩基数は、例えば、前記内部領域（Ｚ）と同じ、または、前記内部領域（Ｚ）より小さい。後者の場合、「Ｚ−（Ｘｃ＋Ｙｃ）」は、例えば、１〜１０、好ましくは１〜４、より好ましくは１、２または３である。前記「Ｚ−（Ｘｃ＋Ｙｃ）」は、前記内部領域（Ｚ）における前記フリー塩基の領域（Ｆ）の塩基数（Ｆ）に相当する。
【００７３】
前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）が、前述のようにヌクレオチド残基を含む場合、その長さは、特に制限されない。前記リンカー領域（Ｌｘ）は、例えば、前記内部５’側領域（Ｘ）と前記５’側領域（Ｘｃ）とが二重鎖を形成可能な長さであることが好ましく、前記リンカー領域（Ｌｙ）は、例えば、前記内部３’側領域（Ｙ）と前記３’側領域（Ｙｃ）とが二重鎖を形成可能な長さであることが好ましい。前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）の長さは、例えば、同じでも異なってもよく、また、その塩基配列も、同じでも異なってもよい。前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）の塩基数は、その下限が、例えば、１塩基であり、好ましくは２塩基であり、より好ましくは３塩基であり、その上限が、例えば、１００塩基であり、好ましくは８０塩基であり、より好ましくは５０塩基である。前記各リンカー領域の塩基数は、具体例として、例えば、１〜５０塩基、１〜３０塩基、１〜２０塩基、１〜１０塩基、１〜７塩基、１〜４塩基等が例示できるが、これには制限されない。
【００７４】
前記核酸分子の全長は、特に制限されない。前記核酸分子において、前記塩基数の合計（全長の塩基数）は、下限が、例えば、３８塩基であり、好ましくは４２塩基であり、より好ましくは５０塩基であり、さらに好ましくは５１塩基であり、特に好ましくは５２塩基であり、その上限は、例えば、３００塩基であり、好ましくは２００塩基であり、より好ましくは１５０塩基であり、さらに好ましくは１００塩基であり、特に好ましくは８０塩基である。前記核酸分子において、前記リンカー領域（Ｌｘ）およびリンカー領域（Ｌｙ）を除く塩基数の合計は、下限が、例えば、３８塩基であり、好ましくは４２塩基であり、より好ましくは５０塩基であり、さらに好ましくは５１塩基であり、特に好ましくは５２塩基であり、上限が、例えば、３００塩基であり、好ましくは２００塩基であり、より好ましくは１５０塩基であり、さらに好ましくは１００塩基であり、特に好ましくは８０塩基である。
【００７５】
本形態の核酸分子は、例えば、５’末端と３’末端とが、結合してもよいし、未結合でもよい。前者の場合、本形態の核酸分子は、環状の一本鎖核酸分子である。後者の場合、本形態の核酸分子は、例えば、両末端の未結合を維持できることから、５’末端が非リン酸基であることが好ましい。
【００７６】
前記一本鎖核酸分子の第３形態として、前記リンカー領域が、非ヌクレオチド構造である分子があげられる。
【００７７】
本形態は、前記第１形態および前記第２形態の核酸分子において、前記リンカー領域（Ｌｘ）および／または前記リンカー領域（Ｌｙ）が、非ヌクレオチド構造を有する以外は、前述の説明を援用できる。
【００７８】
前記非ヌクレオチド構造は、特に制限されず、例えば、ポリアルキレングリコール、ピロリジン骨格、ピペリジン骨格等があげられる。前記ポリアルキレングリコールは、例えば、ポリエチレングリコールがあげられる。
【００７９】
前記ピロリジン骨格は、例えば、ピロリジンの５員環を構成する炭素が、１個以上、置換されたピロリジン誘導体の骨格でもよく、置換される場合、例えば、Ｃ−２の炭素以外の炭素原子であることが好ましい。前記炭素は、例えば、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよい。前記ピロリジン骨格は、例えば、ピロリジンの５員環内に、例えば、炭素−炭素二重結合または炭素−窒素二重結合を含んでもよい。前記ピロリジン骨格において、ピロリジンの５員環を構成する炭素および窒素は、例えば、水素が結合してもよいし、後述するような置換基が結合してもよい。前記リンカー領域（Ｌｘ）は、前記領域（Ｘ）および前記領域（Ｘｃ）と、前記リンカー領域（Ｌｙ）は、前記領域（Ｙ）および前記領域（Ｙｃ）と、例えば、前記ピロリジン骨格のいずれの基を介して結合してもよく、好ましくは、前記５員環のいずれか１個の炭素原子と窒素であり、好ましくは、前記５員環の２位の炭素（Ｃ−２）と窒素である。前記ピロリジン骨格としては、例えば、プロリン骨格、プロリノール骨格等があげられる。前記プロリン骨格およびプロリノール骨格等は、例えば、生体内物質およびその還元体であるため、安全性にも優れる。
【００８０】
前記ピペリジン骨格は、例えば、ピペリジンの６員環を構成する炭素が、１個以上、置換されたピペリジン誘導体の骨格でもよく、置換される場合、例えば、Ｃ−２の炭素以外の炭素原子であることが好ましい。前記炭素は、例えば、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよい。前記ピペリジン骨格は、例えば、ピペリジンの６員環内に、例えば、炭素−炭素二重結合または炭素−窒素二重結合を含んでもよい。前記ピペリジン骨格において、ピペリジンの６員環を構成する炭素および窒素は、例えば、水素基が結合してもよいし、後述するような置換基が結合してもよい。前記リンカー領域（Ｌｘ）は、前記領域（Ｘ）および前記領域（Ｘｃ）と、前記リンカー領域（Ｌｙ）は、前記領域（Ｙ）および前記領域（Ｙｃ）と、例えば、前記ピペリジン骨格のいずれの基を介して結合してもよく、好ましくは、前記６員環のいずれか１個の炭素原子と窒素であり、より好ましくは、前記６員環の２位の炭素（Ｃ−２）と窒素である。
【００８１】
前記リンカー領域は、例えば、前記非ヌクレオチド構造からなる非ヌクレオチド残基のみを含んでもよいし、前記非ヌクレオチド構造からなる非ヌクレオチド残基と、ヌクレオチド残基とを含んでもよい。
【００８２】
前記リンカー領域は、例えば、下記式（Ｉ）で表わされる。
【００８３】
【化１】
2016098782.tif 000003
【００８４】
前記式（Ｉ）中、例えば、
Ｘ１およびＸ２は、それぞれ独立して、Ｈ２、Ｏ、ＳまたはＮＨであり；
Ｙ１およびＹ２は、それぞれ独立して、単結合、ＣＨ２、ＮＨ、ＯまたはＳであり；
Ｒ３は、環Ａ上のＣ−３、Ｃ−４、Ｃ−５またはＣ−６に結合する水素原子または置換基であり、
Ｌ１は、ｎ個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、ＯＨ、ＯＲａ、ＮＨ２、ＮＨＲａ、ＮＲａＲｂ、ＳＨ、もしくはＳＲａで置換されても置換されていなくてもよく、または、
Ｌ１は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
ただし、Ｙ１が、ＮＨ、ＯまたはＳの場合、Ｙ１に結合するＬ１の原子は炭素であり、ＯＲ１に結合するＬ１の原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず；
Ｌ２は、ｍ個の原子からなるアルキレン鎖であり、ここで、アルキレン炭素原子上の水素原子は、ＯＨ、ＯＲｃ、ＮＨ２、ＮＨＲｃ、ＮＲｃＲｄ、ＳＨもしくはＳＲｃで置換されても置換されていなくてもよく、または、
Ｌ２は、前記アルキレン鎖の一つ以上の炭素原子が、酸素原子で置換されたポリエーテル鎖であり、
ただし、Ｙ２が、ＮＨ、ＯまたはＳの場合、Ｙ２に結合するＬ２の原子は炭素であり、ＯＲ２に結合するＬ２の原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接せず；
Ｒａ、Ｒｂ、ＲｃおよびＲｄは、それぞれ独立して、置換基または保護基であり；
ｌは、１または２であり；
ｍは、０〜３０の範囲の整数であり；
ｎは、０〜３０の範囲の整数であり；
環Ａは、前記環Ａ上のＣ−２以外の１個の炭素原子が、窒素、酸素、硫黄で置換されてもよく、
前記環Ａ内に、炭素−炭素二重結合または炭素−窒素二重結合を含んでもよく、
前記領域（Ｘｃ）および前記領域（Ｘ）は、それぞれ、−ＯＲ１−または−ＯＲ２−を介して、前記リンカー領域（Ｌｘ）に結合し、
前記領域（Ｙｃ）および前記領域（Ｙ）は、それぞれ、−ＯＲ１−または−ＯＲ２−を介して、前記リンカー領域（Ｌｙ）に結合し、
ここで、Ｒ１およびＲ２は、存在しても存在しなくてもよく、存在する場合、Ｒ１およびＲ２は、それぞれ独立して、ヌクレオチド残基または前記構造（Ｉ)である。
【００８５】
前記式（Ｉ）中、Ｘ１およびＸ２は、例えば、それぞれ独立して、Ｈ２、Ｏ、ＳまたはＮＨである。前記式（Ｉ）中において、Ｘ１がＨ２であるとは、Ｘ１が、Ｘ１の結合する炭素原子とともに、ＣＨ２（メチレン基）を形成することを意味する。Ｘ２についても同様である。
【００８６】
前記式（Ｉ）中、Ｙ１およびＹ２は、それぞれ独立して、単結合、ＣＨ２、ＮＨ、ＯまたはＳである。
【００８７】
前記式（Ｉ）中、環Ａにおいて、ｌは、１または２である。ｌ＝１の場合、環Ａは、５員環であり、例えば、前記ピロリジン骨格である。前記ピロリジン骨格は、例えば、プロリン骨格、プロリノール骨格等があげられ、これらの二価の構造が例示できる。ｌ＝２の場合、環Ａは、６員環であり、例えば、前記ピペリジン骨格である。環Ａは、環Ａ上のＣ−２以外の１個の炭素原子が、窒素、酸素または硫黄で置換されてもよい。また、環Ａは、環Ａ内に、炭素−炭素二重結合または炭素−窒素二重結合を含んでもよい。環Ａは、例えば、Ｌ型およびＤ型のいずれでもよい。
【００８８】
前記式（Ｉ）中、Ｒ３は、環Ａ上のＣ−３、Ｃ−４、Ｃ−５またはＣ−６に結合する水素原子または置換基である。Ｒ３が前記置換基の場合、置換基Ｒ３は、１でも複数でも、存在しなくてもよく、複数の場合、同一でも異なってもよい。
【００８９】
置換基Ｒ３は、例えば、ハロゲン、ＯＨ、ＯＲ４、ＮＨ２、ＮＨＲ４、ＮＲ４Ｒ５、ＳＨ、ＳＲ４またはオキソ基（＝Ｏ）等である。
【００９０】
Ｒ４およびＲ５は、例えば、それぞれ独立して、置換基または保護基であり、同一でも異なってもよい。前記置換基は、例えば、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、ハロアルキル、アリール、ヘテロアリール、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルケニル、シクロアルキルアルキル、シクリルアルキル、ヒドロキシアルキル、アルコキシアルキル、アミノアルキル、ヘテロシクリルアルケニル、ヘテロシクリルアルキル、ヘテロアリールアルキル、シリル、シリルオキシアルキル等があげられる。以下、同様である。置換基Ｒ３は、これらの列挙する置換基でもよい。
【００９１】
前記保護基は、例えば、反応性の高い官能基を不活性に変換する官能基であり、公知の保護基等があげられる。前記保護基は、例えば、文献（J.  F.  W.  McOmie,  「Protecting  Groups  in  Organic  Chemistry」  Prenum  Press,  London  and  New  York,  1973）の記載を援用できる。前記保護基は、特に制限されず、例えば、ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル基（ＴＢＤＭＳ）、ビス（２−アセトキシエチルオキシ）メチル基（ＡＣＥ）、トリイソプロピルシリルオキシメチル基（ＴＯＭ）、１−（２−シアノエトキシ）エチル基（ＣＥＥ）、２−シアノエトキシメチル基（ＣＥＭ）およびトリルスルフォニルエトキシメチル基（ＴＥＭ）、ジメトキシトリチル基（ＤＭＴｒ）等があげられる。Ｒ３がＯＲ４の場合、前記保護基は、特に制限されず、例えば、ＴＢＤＭＳ基、ＡＣＥ基、ＴＯＭ基、ＣＥＥ基、ＣＥＭ基およびＴＥＭ基等があげられる。この他にも、後述する［化５］のシリル含有基もあげられる。以下、同様である。
【００９２】
前記式（Ｉ）中、Ｌ１は、ｎ個の原子からなるアルキレン鎖である。前記アルキレン炭素原子上の水素原子は、例えば、ＯＨ、ＯＲａ、ＮＨ２、ＮＨＲａ、ＮＲａＲｂ、ＳＨ、もしくはＳＲａで置換されてもよいし、置換されていなくてもよい。または、Ｌ１は、前記アルキレン鎖の１つ以上の炭素原子が酸素原子で置換されたポリエーテル鎖でもよい。前記ポリエーテル鎖は、例えば、ポリエチレングリコールである。なお、Ｙ１が、ＮＨ、ＯまたはＳの場合、Ｙ１に結合するＬ１の原子は炭素であり、ＯＲ１に結合するＬ１の原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接しない。つまり、例えば、Ｙ１がＯの場合、その酸素原子とＬ１の酸素原子は隣接せず、ＯＲ１の酸素原子とＬ１の酸素原子は隣接しない。
【００９３】
前記式（Ｉ）中、Ｌ２は、ｍ個の原子からなるアルキレン鎖である。前記アルキレン炭素原子上の水素原子は、例えば、ＯＨ、ＯＲｃ、ＮＨ２、ＮＨＲｃ、ＮＲｃＲｄ、ＳＨもしくはＳＲｃで置換されてもよいし、置換されていなくてもよい。または、Ｌ２は、前記アルキレン鎖の１つ以上の炭素原子が酸素原子で置換されたポリエーテル鎖でもよい。なお、Ｙ２が、ＮＨ、ＯまたはＳの場合、Ｙ２に結合するＬ２の原子は炭素であり、ＯＲ２に結合するＬ２の原子は炭素であり、酸素原子同士は隣接しない。つまり、例えば、Ｙ２がＯの場合、その酸素原子とＬ２の酸素原子は隣接せず、ＯＲ２の酸素原子とＬ２の酸素原子は隣接しない。
【００９４】
Ｌ１のｎおよびＬ２のｍは、特に制限されず、それぞれ、下限は、例えば、０であり、上限も、特に制限されない。ｎおよびｍは、例えば、前記リンカー領域（Ｌｘ）または（Ｌｙ）の所望の長さに応じて、適宜設定できる。ｎおよびｍは、例えば、製造コストおよび収率等の点から、それぞれ、０〜３０が好ましく、より好ましくは０〜２０であり、さらに好ましくは０〜１５である。ｎとｍは、同じでもよいし（ｎ＝ｍ）、異なってもよい。ｎ＋ｍは、例えば、０〜３０であり、好ましくは０〜２０であり、より好ましくは０〜１５である。
【００９５】
Ｒａ、Ｒｂ、ＲｃおよびＲｄは、例えば、それぞれ独立して、置換基または保護基である。前記置換基および前記保護基は、例えば、前述と同様である。
【００９６】
前記式（Ｉ）において、水素原子は、例えば、それぞれ独立して、Ｃｌ、Ｂｒ、ＦおよびＩ等のハロゲンに置換されてもよい。
【００９７】
前記領域（Ｘｃ）および前記領域（Ｘ）は、前記リンカー領域（Ｌｘ）に、前記領域（Ｙｃ）および前記領域（Ｙ）は、前記リンカー領域（Ｌｙ）に、例えば、それぞれ、−ＯＲ１−または−ＯＲ２−を介して、結合する。ここで、Ｒ１およびＲ２は、存在しても存在しなくてもよい。Ｒ１およびＲ２が存在する場合、Ｒ１およびＲ２は、それぞれ独立して、ヌクレオチド残基または前記式（Ｉ)の構造である。Ｒ１および／またはＲ２が前記ヌクレオチド残基の場合、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）は、例えば、ヌクレオチド残基Ｒ１および／またはＲ２を除く前記式（Ｉ）の構造からなる前記非ヌクレオチド残基と、前記ヌクレオチド残基とから形成される。Ｒ１および／またはＲ２が前記式（Ｉ）の構造の場合、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）は、例えば、前記式（Ｉ）の構造からなる前記非ヌクレオチド残基が、２つ以上連結された構造となる。前記式（Ｉ）の構造は、例えば、１個、２個、３個または４個含んでもよい。このように、前記構造を複数含む場合、前記（Ｉ）の構造は、例えば、直接連結されてもよいし、前記ヌクレオチド残基を介して結合してもよい。他方、Ｒ１およびＲ２が存在しない場合、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）は、例えば、前記式（Ｉ）の構造からなる前記非ヌクレオチド残基のみから形成される。
【００９８】
前記領域（Ｘｃ）および前記領域（Ｘ）、ならびに、前記領域（Ｙｃ）および前記領域（Ｙ）と、前記−ＯＲ１−および−ＯＲ２−との結合の組合せは、特に制限されず、例えば、以下のいずれかの条件があげられる。
条件（１）
前記領域（Ｘｃ）は、−ＯＲ２−を介して、前記領域（Ｘ）は、−ＯＲ１−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合し、
前記領域（Ｙｃ）は、−ＯＲ１−を介して、前記領域（Ｙ）は、−ＯＲ２−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合する。
条件（２）
前記領域（Ｘｃ）は、−ＯＲ２−を介して、前記領域（Ｘ）は、−ＯＲ１−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合し、
前記領域（Ｙｃ）は、−ＯＲ２−を介して、前記領域（Ｙ）は、−ＯＲ１−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合する。
条件（３）
前記領域（Ｘｃ）は、−ＯＲ１−を介して、前記領域（Ｘ）は、−ＯＲ２−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合し、
前記領域（Ｙｃ）は、−ＯＲ１−を介して、前記領域（Ｙ）は、−ＯＲ２−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合する。
条件（４）
前記領域（Ｘｃ）は、−ＯＲ１−を介して、前記領域（Ｘ）は、−ＯＲ２−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合し、
前記領域（Ｙｃ）は、−ＯＲ２−を介して、前記領域（Ｙ）は、−ＯＲ１−を介して、前記式（Ｉ）の構造と結合する。
【００９９】
前記式（Ｉ）の構造は、例えば、下記式（Ｉ−１）〜式（Ｉ−９）が例示でき、下記式において、ｎおよびｍは、前記式（Ｉ）と同じである。下記式において、ｑは、０〜１０の整数である。
【０１００】
【化２】
2016098782.tif 000004
【０１０１】
前記式（Ｉ−１）〜（Ｉ−９）において、ｎ、ｍおよびｑは、特に制限されず、前述の通りである。具体例として、前記式（Ｉ−１）において、ｎ＝８、前記（Ｉ−２）において、ｎ＝３、前記式（Ｉ−３）において、ｎ＝４または８、前記（Ｉ−４）において、ｎ＝７または８、前記式（Ｉ−５）において、ｎ＝３およびｍ＝４、前記（Ｉ−６）において、ｎ＝８およびｍ＝４、前記式（Ｉ−７）において、ｎ＝８およびｍ＝４、前記（Ｉ−８）において、ｎ＝５およびｍ＝４、前記式（Ｉ−９）において、ｑ＝１およびｍ＝４があげられる。前記式（Ｉ−４）の一例（ｎ＝８）を、下記式（Ｉ−４ａ）に、前記式（Ｉ−６）の一例（ｎ＝５、ｍ＝４）を、下記式（Ｉ−６ａ）に示す。
リンカー領域Ｌｘが下記式（Ｉ−６ａ）に示す構造である第１形態の本発明の核酸分子の好ましい実施態様として、配列番号５または６で表される塩基配列からなる核酸分子を挙げることができる。また、リンカー領域ＬｘおよびＬｙが下記式（Ｉ−６ａ）に示す構造である第２形態の本発明の核酸分子の好ましい実施態様として、配列番号１１または１２で表される塩基配列からなる核酸分子を挙げることができる。
ＰＨＲ−０００１（配列番号５）
5’-UGGAAACCCACAACGAAAUCUCC-Ｌｘ-GGAGAUUUCGUUGUGGGUUUCCACC -3’  
ＰＨＲ−０００２（配列番号６）
5’-UGUGACAGCAGGGAUAACACACC-Ｌｘ-GGUGUGUUAUCCCUGCUGUCACAGG -3’
ＰＫＲ−０００１（配列番号１１）
5’-GUGGAAACCCACAACGAAAUCUCC-Ｌｘ-GGAGAUUUCGUUGUGGGUUUCCACCC-Ｌｙ-G-3’ 
ＰＫＲ−０００２（配列番号１２）
5’-CUGUGACAGCAGGGAUAACACACC-Ｌｘ-GGUGUGUUAUCCCUGCUGUCACAGGC-Ｌｙ-G-3’
【０１０２】
【化３】
2016098782.tif 000005
【０１０３】
本発明の核酸分子の構成単位は、特に制限されず、例えば、ヌクレオチド残基があげられる。前記ヌクレオチド残基は、例えば、リボヌクレオチド残基およびデオキシリボヌクレオチド残基があげられる。前記ヌクレオチド残基は、例えば、修飾されていない非修飾ヌクレオチド残基および修飾された修飾ヌクレオチド残基があげられる。本発明の核酸分子は、例えば、前記修飾ヌクレオチド残基を含むことによって、ヌクレアーゼ耐性を向上し、安定性を向上可能である。また、本発明の核酸分子は、例えば、前記ヌクレオチド残基の他に、さらに、非ヌクレオチド残基を含んでもよい。
【０１０４】
本発明の核酸分子において、前記リンカー以外の領域の構成単位は、それぞれ、前記ヌクレオチド残基が好ましい。前記各領域は、例えば、下記（１）〜（３）の残基で構成される。
（１）非修飾ヌクレオチド残基
（２）修飾ヌクレオチド残基
（３）非修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
【０１０５】
本発明の核酸分子において、前記リンカー領域の構成単位は、特に制限されず、例えば、前記ヌクレオチド残基および前記非ヌクレオチド残基があげられる。前記リンカー領域は、例えば、前記ヌクレオチド残基のみから構成されてもよいし、前記非ヌクレオチド残基のみから構成されてもよいし、前記ヌクレオチド残基と前記非ヌクレオチド残基から構成されてもよい。前記リンカー領域は、例えば、下記（１）〜（７）の残基で構成される。
（１）非修飾ヌクレオチド残基
（２）修飾ヌクレオチド残基
（３）非修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
（４）非ヌクレオチド残基
（５）非ヌクレオチド残基および非修飾ヌクレオチド残基
（６）非ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
（７）非ヌクレオチド残基、非修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基
【０１０６】
本発明の核酸分子が、前記リンカー領域（Ｌｘ）および前記リンカー領域（Ｌｙ）の両方を有する場合、例えば、両方の構成単位が同じでもよいし、異なってもよい。具体例として、例えば、両方のリンカー領域の構成単位が前記ヌクレオチド残基である形態、両方のリンカー領域の構成単位が前記非ヌクレオチド残基である形態、一方の領域の構成単位が前記ヌクレオチド残基であり、他方のリンカー領域の構成単位が非ヌクレオチド残基である形態等があげられる。
【０１０７】
本発明の核酸分子は、例えば、前記ヌクレオチド残基のみから構成される分子、前記ヌクレオチド残基の他に前記非ヌクレオチド残基を含む分子等があげられる。本発明の核酸分子において、前記ヌクレオチド残基は、前述のように、例えば、前記非修飾ヌクレオチド残基のみでもよいし、前記修飾ヌクレオチド残基のみでもよいし、前記非修飾ヌクレオチド残基および前記修飾ヌクレオチド残基の両方でもよい。前記核酸分子が、前記非修飾ヌクレオチド残基と前記修飾ヌクレオチド残基を含む場合、前記修飾ヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「１もしくは数個」であり、具体的には、例えば、１〜５個、好ましくは１〜４個、より好ましくは１〜３個、最も好ましくは１または２個である。本発明の核酸分子が、前記非ヌクレオチド残基を含む場合、前記非ヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「１もしくは数個」であり、具体的には、例えば、１〜８個、１〜６個、１〜４個、１、２または３個である。
【０１０８】
前記核酸分子が、例えば、前記非修飾リボヌクレオチド残基の他に前記修飾リボヌクレオチド残基を含む場合、前記修飾リボヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「１もしくは数個」であり、具体的には、例えば、１〜５個、好ましくは１〜４個、より好ましくは１〜３個、最も好ましくは１または２個である。前記非修飾リボヌクレオチド残基に対する前記修飾リボヌクレオチド残基は、例えば、リボース残基がデオキシリボース残基に置換された前記デオキシリボヌクレオチド残基でもよい。前記核酸分子が、例えば、前記非修飾リボヌクレオチド残基の他に前記デオキシリボヌクレオチド残基を含む場合、前記デオキシリボヌクレオチド残基の個数は、特に制限されず、例えば、「１もしくは数個」であり、具体的には、例えば、１〜５個、好ましくは１〜４個、より好ましくは１〜３個、最も好ましくは１または２個である。
【０１０９】
本発明の核酸分子は、例えば、標識物質を含み、前記標識物質で標識化されてもよい。前記標識物質は、特に制限されず、例えば、蛍光物質、色素、同位体等があげられる。前記標識物質は、例えば、ピレン、ＴＡＭＲＡ、フルオレセイン、Ｃｙ３色素、Ｃｙ５色素等の蛍光団があげられ、前記色素は、例えば、Ａｌｅｘａ４８８等のＡｌｅｘａ色素等があげられる。前記同位体は、例えば、安定同位体および放射性同位体があげられ、好ましくは安定同位体である。前記安定同位体は、例えば、被ばくの危険性が少なく、専用の施設も不要であることから取り扱い性に優れ、また、コストも低減できる。また、前記安定同位体は、例えば、標識した化合物の物性変化がなく、トレーサーとしての性質にも優れる。前記安定同位体は、特に制限されず、例えば、２Ｈ、１３Ｃ、１５Ｎ、１７Ｏ、１８Ｏ、３３Ｓ、３４Ｓおよび３６Ｓがあげられる。
【０１１０】
本発明の核酸分子は、前述のように、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制ができる。このため、本発明の核酸分子は、例えば、ＴＧＦ−β１遺伝子が原因となる疾患の治療剤として使用できる。本発明において、「治療」は、例えば、前記疾患の予防、疾患の改善、予後の改善の意味を含み、いずれでもよい。前記疾患は、急性肺傷害；間質性肺炎/肺線維症；ＣＯＰＤ（chronic  obstructive  pulmonary  disease：慢性閉塞性肺疾患）；気管支喘息等があげられる。
【０１１１】
本発明の核酸分子の使用方法は、特に制限されず、例えば、前記ＴＧＦ−β１遺伝子を有する投与対象に、前記核酸分子を投与すればよい。
【０１１２】
前記投与対象は、例えば、細胞、組織または器官があげられる。前記投与対象は、例えば、ヒト、ヒトを除く非ヒト哺乳類等の非ヒト動物があげられる。前記投与は、例えば、ｉｎ  ｖｉｖｏでもｉｎ  ｖｉｔｒｏでもよい。前記細胞は、特に制限されず、例えば、Ａ５４９、ＨｅＬａ、２９３、ＣＯＳ７等の各種培養細胞、ＥＳ細胞、ｉＰＳ細胞等の多能性幹細胞、造血幹細胞等の体性幹細胞、前記多能性幹細胞もしくは体性幹細胞から分化誘導された各種培養細胞、初代培養細胞等の生体から単離した細胞等があげられる。
【０１１３】
本発明の核酸分子の使用に関しては、後述する本発明の組成物、発現抑制方法および治療方法等の記載を参照できる。
【０１１４】
本発明の核酸分子は、前述のように、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制可能であることから、例えば、医薬品、診断薬および農薬、ならびに、農薬、医学、生命科学等の研究ツールとして有用である。
【０１１５】
２．ヌクレオチド残基
前記ヌクレオチド残基は、例えば、構成要素として、糖、塩基およびリン酸を含む。前記ヌクレオチド残基は、前述のように、例えば、リボヌクレオチド残基およびデオキシリボヌクレオチド残基があげられる。前記リボヌクレオチド残基は、例えば、糖としてリボース残基を有し、塩基として、アデニン（Ａ）、グアニン（Ｇ）、シトシン（Ｃ）およびＵ（ウラシル）を有し、前記デオキシリボース残基は、例えば、糖としてデオキシリボース残基を有し、塩基として、アデニン（Ａ）、グアニン（Ｇ）、シトシン（Ｃ）およびチミン（Ｔ）を有する。
【０１１６】
前記ヌクレオチド残基は、未修飾ヌクレオチド残基および修飾ヌクレオチド残基があげられる。前記未修飾ヌクレオチド残基は、前記各構成要素が、例えば、天然に存在するものと同一または実質的に同一であり、好ましくは、人体において天然に存在するものと同一または実質的に同一である。
【０１１７】
前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、前記未修飾ヌクレオチド残基を修飾したヌクレオチド残基である。前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、前記未修飾ヌクレオチド残基の構成要素のいずれが修飾されてもよい。本発明において、「修飾」は、例えば、前記構成要素の置換、付加および／または欠失、前記構成要素における原子および／または官能基の置換、付加および／または欠失であり、「改変」ということができる。前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、天然に存在するヌクレオチド残基、人工的に修飾したヌクレオチド残基等があげられる。前記天然由来の修飾ヌクレオチド残基は、例えば、リンバックら（Ｌｉｍｂａｃｈ  ｅｔ  ａｌ．、１９９４、Ｓｕｍｍａｒｙ：ｔｈｅ  ｍｏｄｉｆｉｅｄ  ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ  ｏｆ  ＲＮＡ、Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．２２：２１８３〜２１９６）を参照できる。また、前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、前記ヌクレオチドの代替物の残基でもよい。
【０１１８】
前記ヌクレオチド残基の修飾は、例えば、リボース−リン酸骨格（以下、リボリン酸骨格）の修飾があげられる。
【０１１９】
前記リボリン酸骨格において、例えば、リボース残基を修飾できる。前記リボース残基は、例えば、２’位炭素を修飾でき、具体的には、例えば、２’位炭素に結合する水酸基を、水素またはフルオロ等のハロゲンに置換できる。前記２’位炭素の水酸基を水素に置換することで、リボース残基をデオキシリボースに置換できる。前記リボース残基は、例えば、立体異性体に置換でき、例えば、アラビノース残基に置換してもよい。
【０１２０】
前記リボリン酸骨格は、例えば、非リボース残基および／または非リン酸を有する非リボリン酸骨格に置換してもよい。前記非リボリン酸骨格は、例えば、前記リボリン酸骨格の非荷電体があげられる。前記非リボリン酸骨格に置換された、前記ヌクレオチドの代替物は、例えば、モルホリノ、シクロブチル、ピロリジン等があげられる。前記代替物は、この他に、例えば、人工核酸モノマー残基があげられる。具体例として、例えば、ＰＮＡ（ペプチド核酸）、ＬＮＡ（Ｌｏｃｋｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ）、ＥＮＡ（２’−Ｏ，４’−Ｃ−Ｅｔｈｙｌｅｎｅｂｒｉｄｇｅｄ  Ｎｕｃｌｅｉｃ  Ａｃｉｄ）等があげられ、好ましくはＰＮＡである。
【０１２１】
前記リボリン酸骨格において、例えば、リン酸基を修飾できる。前記リボリン酸骨格において、糖残基に最も隣接するリン酸基は、αリン酸基と呼ばれる。前記αリン酸基は、負に荷電し、その電荷は、糖残基に非結合の２つの酸素原子にわたって、均一に分布している。前記αリン酸基における４つの酸素原子のうち、ヌクレオチド残基間のホスホジエステル結合において、糖残基と非結合である２つの酸素原子は、以下、「非結合（ｎｏｎ−ｌｉｎｋｉｎｇ）酸素」ともいう。他方、前記ヌクレオチド残基間のホスホジエステル結合において、糖残基と結合している２つの酸素原子は、以下、「結合（ｌｉｎｋｉｎｇ）酸素」という。前記αリン酸基は、例えば、非荷電となる修飾、または、前記非結合酸素における電荷分布が非対称型となる修飾を行うことが好ましい。
【０１２２】
前記リン酸基は、例えば、前記非結合酸素を置換してもよい。前記酸素は、例えば、Ｓ（硫黄）、Ｓｅ（セレン）、Ｂ（ホウ素）、Ｃ（炭素）、Ｈ（水素）、Ｎ（窒素）およびＯＲ（Ｒは、アルキル基またはアリール基）のいずれかの原子で置換でき、好ましくは、Ｓで置換される。前記非結合酸素は、例えば、両方が置換されていることが好ましく、より好ましくは、両方がＳで置換される。前記修飾リン酸基は、例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホロセレネート、ボラノホスフェート、ボラノホスフェートエステル、ホスホネート水素、ホスホロアミデート、アルキルまたはアリールホスホネート、およびホスホトリエステル等があげられ、中でも、前記２つの非結合酸素が両方ともＳで置換されているホスホロジチオエートが好ましい。
【０１２３】
前記リン酸基は、例えば、前記結合酸素を置換してもよい。前記酸素は、例えば、Ｓ（硫黄）、Ｃ（炭素）およびＮ（窒素）のいずれかの原子で置換でき、前記修飾リン酸基は、例えば、Ｎで置換した架橋ホスホロアミデート、Ｓで置換した架橋ホスホロチオエート、およびＣで置換した架橋メチレンホスホネート等があげられる。前記結合酸素の置換は、例えば、本発明の核酸分子の５’末端ヌクレオチド残基および３’末端ヌクレオチド残基の少なくとも一方において行うことが好ましく、５’側の場合、Ｃによる置換が好ましく、３’側の場合、Ｎによる置換が好ましい。
【０１２４】
前記リン酸基は、例えば、前記リン非含有のリンカーに置換してもよい。前記リンカーは、例えば、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチル、カルバメート、アミド、チオエーテル、エチレンオキサイドリンカー、スルホネート、スルホンアミド、チオホルムアセタール、ホルムアセタール、オキシム、メチレンイミノ、メチレンメチルイミノ、メチレンヒドラゾ、メチレンジメチルヒドラゾ、およびメチレンオキシメチルイミノ等を含み、好ましくは、メチレンカルボニルアミノ基およびメチレンメチルイミノ基を含む。
【０１２５】
本発明の核酸分子は、例えば、３’末端および５’末端の少なくとも一方のヌクレオチド残基が修飾されてもよい。前記修飾は、例えば、３’末端および５’末端のいずれか一方でもよいし、両方でもよい。前記修飾は、例えば、前述の通りであり、好ましくは、末端のリン酸基に行うことが好ましい。前記リン酸基は、例えば、全体を修飾してもよいし、前記リン酸基における１つ以上の原子を修飾してもよい。前者の場合、例えば、リン酸基全体の置換でもよいし、欠失でもよい。
【０１２６】
前記末端のヌクレオチド残基の修飾は、例えば、他の分子の付加があげられる。前記他の分子は、例えば、前述のような標識物質、保護基等の機能性分子があげられる。前記保護基は、例えば、Ｓ（硫黄）、Ｓｉ（ケイ素）、Ｂ（ホウ素）、エステル含有基等があげられる。前記標識物質等の機能性分子は、例えば、本発明の核酸分子の検出等に利用できる。
【０１２７】
前記他の分子は、例えば、前記ヌクレオチド残基のリン酸基に付加してもよいし、スペーサーを介して、前記リン酸基または前記糖残基に付加してもよい。前記スペーサーの末端原子は、例えば、前記リン酸基の前記結合酸素、または、糖残基のＯ、Ｎ、ＳもしくはＣに、付加または置換できる。前記糖残基の結合部位は、例えば、３’位のＣもしくは５’位のＣ、またはこれらに結合する原子が好ましい。前記スペーサーは、例えば、前記ＰＮＡ等のヌクレオチド代替物の末端原子に、付加または置換することもできる。
【０１２８】
前記スペーサーは、特に制限されず、例えば、−（ＣＨ２）ｎ−、−（ＣＨ２）ｎＮ−、−（ＣＨ２）ｎＯ−、−（ＣＨ２）ｎＳ−、Ｏ（ＣＨ２ＣＨ２Ｏ）ｎＣＨ２ＣＨ２ＯＨ、無塩基糖、アミド、カルボキシ、アミン、オキシアミン、オキシイミン、チオエーテル、ジスルフィド、チオ尿素、スルホンアミド、およびモルホリノ等、ならびに、ビオチン試薬およびフルオレセイン試薬等を含んでもよい。前記式において、ｎは、正の整数であり、ｎ＝３または６が好ましい。
【０１２９】
前記末端に付加する分子は、これらの他に、例えば、色素、インターカレート剤（例えば、アクリジン）、架橋剤（例えば、ソラレン、マイトマイシンＣ）、ポルフィリン（ＴＰＰＣ４、テキサフィリン、サッフィリン）、多環式芳香族炭化水素（例えば、フェナジン、ジヒドロフェナジン）、人工エンドヌクレアーゼ（例えば、ＥＤＴＡ）、親油性担体（例えば、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、１−ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、１，３−ビス−Ｏ（ヘキサデシル）グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、１，３−プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、Ｏ３−（オレオイル）リトコール酸、Ｏ３−（オレオイル）コール酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジン）およびペプチド複合体（例えば、アンテナペディアペプチド、Ｔａｔペプチド）、アルキル化剤、リン酸、アミノ、メルカプト、ＰＥＧ（例えば、ＰＥＧ−４０Ｋ）、ＭＰＥＧ、［ＭＰＥＧ］２、ポリアミノ、アルキル、置換アルキル、放射線標識マーカー、酵素、ハプテン（例えば、ビオチン）、輸送／吸収促進剤（例えば、アスピリン、ビタミンＥ、葉酸）、合成リボヌクレアーゼ（例えば、イミダゾール、ビスイミダゾール、ヒスタミン、イミダゾールクラスター、アクリジン−イミダゾール複合体、テトラアザマクロ環のＥｕ３＋複合体）等があげられる。
【０１３０】
本発明の核酸分子は、前記５’末端が、例えば、リン酸基またはリン酸基アナログで修飾されてもよい。前記リン酸基は、例えば、５’一リン酸（(HO)2(O)P-O-5’）、５’二リン酸（(HO)2(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’）、５’三リン酸（(HO)2(O)P-O-(HO)(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’）、５’−グアノシンキャップ（７−メチル化または非メチル化、7m-G-O-5’-(HO)(O)P-O-(HO)(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’）、５’−アデノシンキャップ（Ａｐｐｐ）、任意の修飾または非修飾ヌクレオチドキャップ構造（N-O-5’-(HO)(O)P-O-(HO)(O)P-O-P(HO)(O)-O-5’）、５’一チオリン酸（ホスホロチオエート：(HO)2(S)P-O-5’）、５’一ジチオリン酸（ホスホロジチオエート：(HO)(HS)(S)P-O-5’）、５’−ホスホロチオール酸（(HO)2(O)P-S-5’）、硫黄置換の一リン酸、二リン酸および三リン酸（例えば、５’−α−チオ三リン酸、５’−γ−チオ三リン酸等）、５’−ホスホルアミデート（(HO)2(O)P-NH-5’、(HO)(NH2)(O)P-O-5’）、５’−アルキルホスホン酸（例えば、RP(OH)(O)-O-5’、(OH)2(O)P-5’-CH2、Ｒはアルキル（例えば、メチル、エチル、イソプロピル、プロピル等））、５’−アルキルエーテルホスホン酸（例えば、RP(OH)(O)-O-5’、Ｒはアルキルエーテル（例えば、メトキシメチル、エトキシメチル等））等があげられる。
【０１３１】
前記ヌクレオチド残基において、前記塩基は、特に制限されない。前記塩基は、例えば、天然の塩基でもよいし、非天然の塩基でもよい。前記塩基は、例えば、天然由来でもよいし、合成品でもよい。前記塩基は、例えば、一般的な塩基、その修飾アナログ等が使用できる。
【０１３２】
前記塩基は、例えば、アデニンおよびグアニン等のプリン塩基、シトシン、ウラシルおよびチミン等のピリミジン塩基があげられる。前記塩基は、この他に、イノシン、チミン、キサンチン、ヒポキサンチン、ヌバラリン（ｎｕｂｕｌａｒｉｎｅ）、イソグアニシン（ｉｓｏｇｕａｎｉｓｉｎｅ）、ツベルシジン（ｔｕｂｅｒｃｉｄｉｎｅ）等があげられる。前記塩基は、例えば、２−アミノアデニン、６−メチル化プリン等のアルキル誘導体；２−プロピル化プリン等のアルキル誘導体；５−ハロウラシルおよび５−ハロシトシン；５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシン；６−アゾウラシル、６−アゾシトシンおよび６−アゾチミン；５−ウラシル（プソイドウラシル）、４−チオウラシル、５−ハロウラシル、５−（２−アミノプロピル）ウラシル、５−アミノアリルウラシル；８−ハロ化、アミノ化、チオール化、チオアルキル化、ヒドロキシル化および他の８−置換プリン；５−トリフルオロメチル化および他の５−置換ピリミジン；７−メチルグアニン；５−置換ピリミジン；６−アザピリミジン；Ｎ−２、Ｎ−６、およびＯ−６置換プリン（２−アミノプロピルアデニンを含む）；５−プロピニルウラシルおよび５−プロピニルシトシン；ジヒドロウラシル；３−デアザ−５−アザシトシン；２−アミノプリン；５−アルキルウラシル；７−アルキルグアニン；５−アルキルシトシン；７−デアザアデニン；Ｎ６，Ｎ６−ジメチルアデニン；２，６−ジアミノプリン；５−アミノ−アリル−ウラシル；Ｎ３−メチルウラシル；置換１，２，４−トリアゾール；２−ピリジノン；５−ニトロインドール；３−ニトロピロール；５−メトキシウラシル；ウラシル−５−オキシ酢酸；５−メトキシカルボニルメチルウラシル；５−メチル−２−チオウラシル；５−メトキシカルボニルメチル−２−チオウラシル；５−メチルアミノメチル−２−チオウラシル；３−（３−アミノ−３−カルボキシプロピル）ウラシル；３−メチルシトシン；５−メチルシトシン；Ｎ４−アセチルシトシン；２−チオシトシン；Ｎ６−メチルアデニン；Ｎ６−イソペンチルアデニン；２−メチルチオ−Ｎ６−イソペンテニルアデニン；Ｎ−メチルグアニン；Ｏ−アルキル化塩基等があげられる。また、プリンおよびピリミジンは、例えば、米国特許第３，６８７，８０８号、「Ｃｏｎｃｉｓｅ  Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ  Ｏｆ  Ｐｏｌｙｍｅｒ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  Ａｎｄ  Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ」、８５８〜８５９頁、クロシュビッツ  ジェー  アイ（Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ  Ｊ．Ｉ．）編、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ  ＆  Ｓｏｎｓ、１９９０、およびイングリッシュら（Ｅｎｇｌｉｓｃｈら）、Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ  Ｃｈｅｍｉｅ、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｅｄｉｔｉｏｎ、１９９１、３０巻、ｐ．６１３に開示されるものが含まれる。
【０１３３】
前記修飾ヌクレオチド残基は、これらの他に、例えば、塩基を欠失する残基、すなわち、無塩基のリボリン酸骨格を含んでもよい。また、前記修飾ヌクレオチド残基は、例えば、米国仮出願第６０／４６５，６６５号（出願日：２００３年４月２５日）、および国際出願第ＰＣＴ／ＵＳ０４／０７０７０号（出願日：２００４年３月８日）に記載される残基が使用でき、本発明は、これらの文献を援用できる。
【０１３４】
３．本発明の核酸分子の合成方法
本発明の核酸分子の合成方法は、特に制限されず、従来公知の方法が採用できる。前記合成方法は、例えば、遺伝子工学的手法による合成法、化学合成法等があげられる。遺伝子工学的手法は、例えば、インビトロ転写合成法、ベクターを用いる方法、ＰＣＲカセットによる方法があげられる。前記ベクターは、特に制限されず、プラスミド等の非ウイルスベクター、ウイルスベクター等があげられる。前記化学合成法は、特に制限されず、例えば、ホスホロアミダイト法およびＨ−ホスホネート法等があげられる。前記化学合成法は、例えば、市販の自動核酸合成機を使用可能である。前記化学合成法は、一般に、アミダイトが使用される。前記アミダイトは、特に制限されず、市販のアミダイトとして、例えば、ＲＮＡ  Ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅｓ（２’−Ｏ−ＴＢＤＭＳｉ、商品名、三千里製薬）、ＡＣＥアミダイトおよびＴＯＭアミダイト、ＣＥＥアミダイト、ＣＥＭアミダイト、ＴＥＭアミダイト等があげられる。
【０１３５】
４．発現ベクター
本発明の発現ベクターは、前記本発明の核酸分子をコードするＤＮＡを含むことを特徴とする。本発明の発現ベクターは、前記ＤＮＡを含むことが特徴であり、その他の構成は、何ら制限されない。本発明の発現ベクターは、例えば、ベクターに発現可能なように前記ＤＮＡが挿入されている。前記ＤＮＡを挿入するベクターは、特に制限されず、例えば、一般的なベクターが使用でき、ウイルスベクターおよび非ウイルスベクター等があげられる。前記非ウイルスベクターは、例えば、プラスミドベクターがあげられる。
【０１３６】
５．ＴＧＦ−β１発現抑制剤および医薬
本発明の発現抑制剤（または発現抑制用組成物）は、前述のように、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制するための製剤（または組成物）であり、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。本発明の発現抑制剤（または発現抑制組成物）は、前記本発明の核酸分子を含むことが特徴であり、その他の構成は、何ら制限されない。即ち、該核酸分子単独であってもよいし、使用目的に応じてそれぞれ許容される添加物をさらに含んでもよい。本発明の発現抑制剤（または発現抑制用組成物）は、例えば、発現抑制用試薬ということもできる。
【０１３７】
本発明によれば、例えば、前記ＴＧＦ−β１遺伝子が存在する対象に投与することで、前記ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制を行うことができる。
【０１３８】
また、本発明の医薬（または薬学的組成物）は、前述のように、前記本発明の核酸分子を含むことを特徴とする。本発明の医薬（または薬学的組成物）は、前記本発明の核酸分子を含むことが特徴であり、その他の構成は何ら制限されない。即ち、該核酸分子単独であってもよいし、薬学上許容される添加物をさらに含んでもよい。
【０１３９】
本発明によれば、例えば、前記ＴＧＦ−β１遺伝子が原因となる疾患の患者に投与することで、前記遺伝子の発現を抑制し、前記疾患を治療できる。前記疾患は、例えば、前述の通りであって、急性肺傷害、間質性肺炎/肺線維症等があげられる。本発明において、「治療」は、前述のように、例えば、前記疾患の予防、疾患の改善、予後の改善の意味を含み、いずれでもよい。
【０１４０】
本発明の発現抑制剤（または発現抑制用組成物）および医薬（または薬学的組成物）（以下、「本発明の剤／組成物」という）は、その使用方法は、特に制限されず、例えば、前記ＴＧＦ−β１遺伝子を有する投与対象に、前記核酸分子を投与すればよい。
【０１４１】
前記投与対象は、例えば、細胞、組織または器官があげられる。前記投与対象は、例えば、ヒト、ヒトを除く非ヒト哺乳類等の非ヒト動物があげられる。前記投与は、例えば、ｉｎ  ｖｉｖｏでもｉｎ  ｖｉｔｒｏでもよい。前記細胞は、特に制限されず、例えば、前述のような細胞等があげられる。
【０１４２】
前記投与方法は、特に制限されず、例えば、投与対象に応じて適宜決定できる。前記投与対象が培養細胞の場合、例えば、トランスフェクション試薬を使用する方法、エレクトロポレーション法等があげられる。
【０１４３】
本発明の剤／組成物は、上述のとおり、本発明の核酸分子のみを含んでもよいし、さらにその他の添加物を含んでもよい。前記添加物は、特に制限されず、例えば、薬学的に許容された添加物が好ましい。前記添加物の種類は、特に制限されず、例えば、投与対象の種類に応じて適宜選択できる。
【０１４４】
本発明の組成物において、前記核酸分子は、例えば、前記添加物と複合体を形成してもよい。前記添加物は、例えば、複合化剤ということもできる。前記複合体形成により、例えば、前記核酸分子を効率よくデリバリーすることができる。前記核酸分子と前記複合化剤との結合は、特に制限されず、例えば、非共有結合があげられる。前記複合体は、例えば、包接複合体があげられる。
【０１４５】
前記複合化剤は、特に制限されず、ポリマー、シクロデキストリン、アダマンチン等があげられる。前記シクロデキストリンは、例えば、線状シクロデキストリンコポリマー、線状酸化シクロデキストリンコポリマー等があげられる。
【０１４６】
前記添加剤は、この他に、例えば、担体、標的細胞への結合物質、縮合剤、融合剤、賦形剤等があげられる。
【０１４７】
６．発現抑制方法
本発明の発現抑制方法は、前述のように、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現を抑制する方法であって、前記本発明の核酸分子を使用することを特徴とする。本発明の発現抑制方法は、前記本発明の核酸分子を使用することが特徴であって、その他の工程および条件は、何ら制限されない。
【０１４８】
本発明の発現抑制方法は、例えば、前記ＴＧＦ−β１遺伝子が存在する対象に、前記核酸分子を投与する工程を含む。前記投与工程により、例えば、前記投与対象に前記核酸分子を接触させる。前記投与対象は、例えば、細胞、組織または器官があげられる。前記投与対象は、例えば、ヒト、ヒトを除く非ヒト哺乳類等の非ヒト動物があげられる。前記投与は、例えば、ｉｎ  ｖｉｖｏでもｉｎ  ｖｉｔｒｏでもよい。
【０１４９】
本発明の発現抑制方法は、例えば、前記核酸分子を単独で投与してもよいし、前記核酸分子を含む前記本発明の組成物を投与してもよい。前記投与方法は、特に制限されず、例えば、投与対象の種類に応じて適宜選択できる。
【０１５０】
７．治療方法
本発明の疾患の治療方法は、前述のように、前記本発明の核酸分子を、患者に投与する工程を含むことを特徴とする。本発明の治療方法は、前記本発明の核酸分子を使用することが特徴であって、その他の工程および条件は、何ら制限されない。本発明が対象とする疾患は、例えば、前述の通りであって、急性肺傷害、間質性肺炎/肺線維症等があげられる。
【０１５１】
本発明の治療方法は、例えば、前記本発明の発現抑制方法等を援用できる。前記投与方法は、特に制限されず、例えば、経口投与および非経口投与のいずれでもよい。
本発明の治療方法における本発明の核酸分子の投与量は、前記疾患の治療上有効な量であれば特に制限されず、疾患の種類、重症度、投与対象の動物種、齢、体重、薬物受容性、投与経路等によって異なるが、通常、成人１回あたり約０．０００１〜約１００ｍｇ／ｋｇ、例えば約０．００１〜約１０ｍｇ／ｋｇ、好ましくは約０．００５〜約５ｍｇ／ｋｇであり得る。当該量を、例えば、１日３回〜２週間に１回、好ましくは１日〜１週間に１回の間隔で投与することができる。
【０１５２】
８．核酸分子の使用
本発明の使用は、前記ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制のための、前記本発明の核酸分子の使用である。
本発明はまた、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制、あるいは肺線維症または急性肺傷害の治療における使用のための、本発明の核酸分子を提供する。
本発明はまた、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制剤、あるいは肺線維症または急性肺傷害の治療剤の製造のための、本発明の核酸分子の使用を提供する。
【０１５３】
以下、実施例等により、本発明を詳しく説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
【実施例】
【０１５４】
（実施例１）Ａ５４９細胞における一本鎖核酸分子のＴＧＦ−β１遺伝子発現抑制効果
（１）一本鎖核酸分子の合成
以下に示す一本鎖核酸分子を、ホスホロアミダイト法に基づき、ＡＢＩ３９００核酸合成機（商品名、アプライドバイオシステムス）により合成した。前記合成には、ＲＮＡアミダイトとして、ＥＭＭアミダイト（国際公開第２０１３／０２７８４３号）を用いた（以下、同様）。前記アミダイトの脱保護は、定法に従った。合成した一本鎖核酸分子は、ＨＰＬＣによる精製後、それぞれ凍結乾燥した。【０１５５】
一本鎖核酸分子として、前記配列番号１で表わされる発現抑制配列を有するＰＨＲ−０００１およびＰＫＲ−０００１、並びに前記配列番号２で表わされる発現抑制配列を有するＰＨＲ−０００２およびＰＫＲ−０００２を、それぞれ上記のように合成した。ＰＨＲ−０００１およびＰＨＲ−０００２におけるＬｘ、並びにＰＫＲ−０００１およびＰＫＲ−０００２におけるＬｘおよびＬｙは、それぞれリンカー領域であり、Ｌ−プロリンジアミドアミダイトを用いて下記構造式とした。各配列において、下線部は、ヒトＴＧＦ−β１遺伝子発現抑制配列である。
ＰＨＲ−０００１（配列番号５）
5’-UGGAAACCCACAACGAAAUCUCC-Ｌｘ-GGAGAUUUCGUUGUGGGUUUCCACC -3’  
ＰＨＲ−０００２（配列番号６）
5’-UGUGACAGCAGGGAUAACACACC-Ｌｘ-GGUGUGUUAUCCCUGCUGUCACAGG -3’
ＰＫＲ−０００１（配列番号１１）
5’-GUGGAAACCCACAACGAAAUCUCC-Ｌｘ-GGAGAUUUCGUUGUGGGUUUCCACCC-Ｌｙ-G-3’ 
ＰＫＲ−０００２（配列番号１２）
5’-CUGUGACAGCAGGGAUAACACACC-Ｌｘ-GGUGUGUUAUCCCUGCUGUCACAGGC-Ｌｙ-G-3’【０１５６】
【化４】
2016098782.tif 000006
【０１５７】
（２）ＴＧＦ−β１遺伝子発現量の測定
前記各一本鎖核酸分子を、２０μｍｏｌ／Ｌとなるように、注射用蒸留水（大塚製薬）に溶解した。【０１５８】
細胞は、Ａ５４９細胞（ＤＳファーマバイオメディカル）を使用した。培地は、１０％ＦＢＳを含むＤＭＥＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用した。培養条件は、３７℃、５％ＣＯ２下とした。【０１５９】
まず、細胞を２４穴プレートに、４×１０４細胞／４００μＬ培地／ウェルとなるように播種した。その後、前記一本鎖核酸分子を（Ａ）トランスフェクション試薬ＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅＲＮＡｉＭＡＸ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用い、前記トランスフェクション試薬の添付プロトコールに従って、トランスフェクションした。具体的には、前記ウェルあたりの組成を以下のように設定し、トランスフェクションを行った。下記組成において、（Ｂ）は、Ｏｐｔｉ−ＭＥＭ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）、（Ｃ）は、２０μｍｏｌ／Ｌ  前記一本鎖核酸分子溶液であり、両者をあわせて９８．５μＬ添加した。なお、前記ウェルにおいて、前記一本鎖核酸分子の最終濃度は、０．１、１ｎｍｏｌ／Ｌとした。【０１６０】
【表１】
2016098782.tif 000007
【０１６１】
トランスフェクション後、前記ウェル中の細胞を２４時間培養した後、ＲＮｅａｓｙ  Ｍｉｎｉ  Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ）を用い、添付のプロトコールに従って、ＲＮＡを回収した。次に、Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ  Ｆｉｒｓｔ  Ｓｔｒａｎｄ  ｃＤＮＡ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ  Ｋｉｔ（Ｒｏｃｈｅ）を用い、添付のプロトコールに従って、前記ＲＮＡからｃＤＮＡを合成した。そして、以下に示すように、合成した前記ｃＤＮＡを鋳型としてＰＣＲを行い、ＴＧＦ−β１遺伝子発現量および内部標準であるβ−アクチン遺伝子発現量を測定した。前記ＴＧＦ−β１遺伝子発現量は、前記β−アクチン遺伝子発現量により補正した。【０１６２】
前記ＰＣＲは、試薬としてＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒ４８０  ＳＹＢＲ  Ｇｒｅｅｎ  Ｉ  Ｍａｓｔｅｒ（Ｒｏｃｈｅ）、機器としてＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒ４８０（Ｒｏｃｈｅ）を用いた（以下、同様）。前記ＴＧＦ−β１遺伝子およびβ−アクチン遺伝子の増幅には、それぞれ、以下のプライマーセットを使用した。
ＴＧＦ−β１遺伝子用ＰＣＲプライマーセット
（配列番号７）  5’-TTGTGCGGCAGTGGTTGAGCCG-3’
（配列番号８）  5’-GAAGCAGGAAAGGCCGGTTCATGC-3’
β−アクチン遺伝子用プライマーセット
（配列番号９）  5’-GCCACGGCTGCTTCCAGCTCCTC-3’
（配列番号１０）  5’-AGGTCTTTGCGGATGTCCACGTCAC-3’ 【０１６３】
なお、コントロール１として、前記培養液に前記（Ｂ）液１００μＬのみを添加した細胞についても、遺伝子発現量を測定した（−）。また、コントロール２として、トランスフェクションにおいて、前記一本鎖核酸分子溶液を未添加とし、前記（Ａ）１．５μＬと前記（Ｂ）とを合計１００μＬ添加した以外は、同様にして処理した細胞についても、遺伝子発現量を測定した（ｍｏｃｋ）。【０１６４】
補正後のＴＧＦ−β１遺伝子の発現量について、コントロール（−）の細胞における発現量を１として、各一本鎖核酸分子を導入した細胞での発現量の相対値を求めた。【０１６５】
（３）結果
図５に示すように、本発明の一本鎖核酸分子は、濃度依存的な強い遺伝子発現抑制活性を示した。【０１６６】
（実施例２）肺線維症および急性肺傷害併発モデルマウスにおける急性肺傷害抑制効果
肺線維症自然発症モデルマウス（非特許文献６および７記載のヒトＴＧＦ−β１トランスジェニックマウス、以下ＴＧマウスと呼ぶ）を用いて、肺線維症および急性肺傷害併発モデルを作製し、本発明の核酸分子の急性肺傷害抑制の効果を確認した。前記効果の確認は、気管支肺胞洗浄液（ＢＡＬＦ: bronchoalveolar lavage fluid）中のタンパク量を指標として、BCA Protein Assay Kit（Thermo社製）のプロトコールに従って行った。【０１６７】
（１）核酸分子溶液およびＬＰＳ溶液の調製
核酸分子として、前記実施例１で合成したＰＨＲ−０００１およびＰＫＲ−０００１を使用した。これらの核酸分子を、それぞれ２０ μｇ／７５ μＬとなるように滅菌生理食塩水に溶解して、核酸分子溶液を調製した。
他方、リポ多糖（ＬＰＳ）を、１００ μｇ／７５ μＬとなるように滅菌生理食塩水に溶解して、ＬＰＳ溶液を調製した。【０１６８】
（２）肺線維症および急性肺傷害併発モデルマウスへの投与
まず、前記核酸分子溶液７５μＬを、ＭｙｃｒｏＳｐｒａｙｅｒ（ＭＳＡ−２５０−Ｍ：ＰＥＮＮＣＥＮＴＵＲＹ社製）を用いてマウスに気管内投与をした。核酸分子の気管内投与の翌日に、前記マウスの気管内に、前記ＬＰＳ溶液７５μＬを同様に気管内投与して、肺傷害を誘発させた。【０１６９】
前記核酸分子溶液に対するネガティブコントロールとして、滅菌生理食塩水７５ μＬを用いた。【０１７０】
以下に、各投与群を示す。各投与群において、５匹の雄マウスを使用した。
・投与群１
滅菌生理食塩水７５ μＬ投与の翌日、ＬＰＳ溶液７５ μＬ投与
・投与群２
核酸分子溶液７５ μＬの投与の翌日、ＬＰＳ溶液７５ μＬ投与【０１７１】
（３）気管支肺胞洗浄液（ＢＡＬＦ）のサンプリングおよび細胞数タンパク量測定
前記ＬＰＳ溶液または滅菌生理食塩水の気管内投与翌日、前記マウスに２％イソフルランにより麻酔をし、全採血・安楽死させたのち、頸部表皮切開・結合組織剥離して気管を露出させ、静脈留置用のカテーテルを挿入し、９ｍｍ程度進めたところで固定した。カテーテルと１ｍＬシリンジと結合させ、滅菌生理食塩水２ｍＬを３回に分けてゆっくり加え、ＢＡＬＦサンプルとして回収した。
前記ＢＡＬＦサンプルについて、遠心上清をBCA Protein Assay Kit（Thermo社製）のプロトコールに従ってタンパク量を測定した。【０１７２】
（４）結果
その結果を図６に示す。滅菌生理食塩水を投与した投与群１と比較して、本発明の一本鎖核酸分子ＰＨＲ−０００１（図６Ａ）またはＰＫＲ−０００１（図６Ｂ）を投与した投与群２では、いずれもＢＡＬＦにおけるタンパク質量の増加が有意に抑制された。このことから、本発明の一本鎖核酸分子は急性肺傷害の発症を抑制することが示唆された。【０１７３】
（実施例３）肺線維症自然発症モデルマウスにおける肺線維化抑制効果
前記肺線維症自然発症モデルマウスを用いて、本発明の核酸分子の肺線維化抑制効果を確認した。前記効果の確認は、肺組織中のハイドロキシプロリン量を指標として、非特許文献７記載の方法に従って行った。【０１７４】
（１）核酸分子溶液の調製
実施例の核酸分子として、前記実施例１で合成したＰＨＲ−０００１を使用した。
ＰＨＲ−０００１を、２０μｇ／７５μＬとなるように滅菌生理食塩水に溶解して、核酸分子溶液を調製した。【０１７５】
（２）肺線維症自然発症モデルマウスへの核酸分子の投与
前記核酸分子溶液を、ＭｙｃｒｏＳｐｒａｙｅｒ(R)（ＭＳＡ−２５０−Ｍ：ＰＥＮＮＣＥＮＴＵＲＹ社製）を用いて１回／週、計４回マウスに気管内投与をした。
前記核酸分子溶液に対するネガティブコントロールとして、滅菌生理食塩水７５μＬを用いた。【０１７６】
以下に、各投与群を示す。各投与群において、５匹の雄マウスを使用した。
・投与群１
ＴＧマウスに、滅菌生理食塩水７５ μＬ投与
・投与群２
ＴＧマウスに、２０ μｇ／７５ μＬ核酸分子溶液７５ μＬ（核酸投与量:１ ｍｇ／ｋｇマウス体重）投与【０１７７】
（３）肺組織のサンプリング
最初の投与から４週間後、前記マウスに、２％イソフルランにより麻酔をし、採血後肺右葉を摘出した。【０１７８】
（４）肺組織中のハイドロキシプロリン量の測定
前記肺右葉を、ビーズ式細胞破砕装置（ＭＳ−１００：トミー精工社製）を用いてホモジネートした。前記ホモジネートを１１０℃で一晩インキュベートして乾燥させたのち、再度ビーズ式細胞破砕装置を用いて粉砕した。その後、蒸留水１００ ｍｌにゆっくりかき混ぜながら濃塩酸１００ ｍｌを少しずつ注いで調製した６Ｎ  ＨＣｌを２ｍＬ加え、粉砕した肺右葉の懸濁液をあらかじめ重量を測定しておいたスクリュー管に移し、蓋をして１１０℃で一晩、ドラフト内でインキュベートした。その後、蓋を外し１１０℃で一晩、ドラフト内でインキュベートして乾燥させた。そこに２ｍＬのＰＢＳを加え６０℃で１時間インキュベートし、フィルター濾過したものを、ハイドロキシプロリン量測定用サンプルとした。測定は、非特許文献７に記載の方法に従って行った。【０１７９】
（５）結果
その結果を図７に示す。滅菌生理食塩水を投与した投与群１と比較して、本発明の一本鎖核酸分子ＰＨＲ−０００１を投与した投与群２ではハイドロキシプロンリン量が有意に抑制された。このことから、本発明の一本鎖核酸分子ＰＨＲ−０００１はｉｎ  ｖｉｖｏにおいて肺線維化を抑制することが示唆された。  【０１８０】
以上、実施形態を参照して本願発明を説明したが、本願発明は、上記実施形態に限定されるものではない。本願発明の構成や詳細には、本願発明のスコープ内で当業者が理解しうる様々な変更をすることができる。【０１８１】
この出願は、２０１４年１２月１５日付で日本国出願された特願２０１４−２５３１４８および特願２０１４−２５３１４９、並びに、２０１５年６月１７日付で日本国に出願された特願２０１５−１２１６４４および特願２０１５−１２１６４７を基礎としており、ここで言及することによりそれらの内容はすべて本明細書に包含される。
【産業上の利用可能性】
【０１８２】
本発明の一本鎖核酸分子によれば、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現抑制が可能である。このため、本発明は、ＴＧＦ−β１遺伝子の発現が原因となる疾患、例えば、肺線維症および急性肺傷害等の治療に有効である。
【図１】
2016098782.tif 000009
【図２】
2016098782.tif 000010
【図３】
2016098782.tif 000011
【図４】
2016098782.tif 000012
【図５】
2016098782.tif 000013
【図６】
2016098782.tif 000014
【図７】
2016098782.tif 000015
【配列表】
2016098782000001.app
【国際調査報告】
2016098782.tif 000016
2016098782.tif 000017
2016098782.tif 000018
2016098782.tif 000019