(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
セルロース分解性微生物を用いた酵素カクテルの産生方法であって、
次の２つの段階、
・  炭素性増殖溶液の存在下、閉鎖リアクタ内での、前記微生物の増殖段階ａ）、
・  炭素性基質の濃度が２５０〜４００ｇ／Ｌの範囲である炭素性産生溶液を供給して行われる前記酵素カクテルの産生段階であって、前記炭素性産生溶液が炭素性インデューサ基質を含む段階ｂ）、
を含む方法において、
前記炭素性インデューサ基質が、リグノセルロース材料の前処理の工程から得られる液体残渣のみからなり、前記液体残渣は、Ｃ５糖オリゴマーと、Ｃ５及びＣ６糖モノマーと、糖モノマー分解生成物とからなり、前記液体残渣は殺菌も除毒もｐＨ調整をせずに用いられ、
前記液体残渣のＣ５糖オリゴマーが前記液体残渣中に存在する糖全体の１〜５０重量％を占め、且つ前記炭素性産生溶液中に存在する糖全体の０．３重量％〜１０重量％の範囲を占め、前記セルロース分解性微生物はトリコデルマリーセイ種に属することを特徴とする、方法。
【請求項２】
前記段階ａ）において使用される炭素性増殖溶液は、反応体積１リットル当たり１０〜９０ｇの範囲の炭素性基質の初期濃度を有する、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
前記前処理工程は、予め前記リグノセルロース材料に硫酸水溶液を含浸させることを伴う、酸加水分解、酸蒸解、又は蒸気爆砕である、請求項１又は請求項２に記載の方法。
【請求項４】
前記液体残渣は、前記液体残渣の殺菌も除毒もｐＨ調整もせずに用いられる、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
【請求項５】
前記段階b)において、前記インデューサ基質に他の非インデューサ炭素性基質が加えられる、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項６】
前記他の非インデューサ炭素性基質は、グルコース、キシロース、及びサッカロースから、単独で又は混合物として選択される、請求項５に記載の方法。
【請求項７】
前記炭素性産生溶液は、液体残渣と、グルコース、キシロース、及びサッカロースから、単独で又は混合物として選択される少なくとも１つの非インデューサ炭素性基質とからなり、前記液体残渣は、リグノセルロース材料の前処理工程から得られ、且つ殺菌も除毒もｐＨ調整もせずに用いられ、前記液体残渣はＣ５糖オリゴマーと、Ｃ５及びＣ６糖モノマーと、糖モノマー分解生成物とからなり、Ｃ５糖オリゴマーは前記液体残渣中に存在する糖全体の１〜５０重量％を占め、及び前記炭素性産生溶液中に存在する糖全体の少なくとも０．３重量％を占める、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
【請求項８】
段階ｂ）のために炭素性産生溶液を供給するための具体的な流量は、１時間当たり微生物１グラム当たり炭素性基質３５〜６５ｍｇの範囲である、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、セルロース分解酵素及びヘミセルロース分解酵素の産生(production)に関し、特に、セルロース材料又はリグノセルロース材料からのエタノールの産生に関連した上記産生に関する。
【背景技術】
【０００２】
１９７０年代以来、構成多糖類の発酵性糖への加水分解を経由した、リグノセルロース材料のエタノールへの転換が、膨大な研究の焦点となってきた。研究対象となり得る例としては、the National Renewable Energy Laboratoryによる参考文献（非特許文献１）がある。
【０００３】
リグノセルロース材料は、セルロース材料（即ち９０重量％超のセルロースから構成される）及び／又はリグノセルロース（即ちセルロースと、本質的にペントース及びヘキソースにより構成される多糖類であるヘミセルロースと、さらに、フェノール化合物を主体とした複雑な構造及び大きな分子量を有する巨大分子であるリグニンと、により構成される）である。
【０００４】
木材、わら、トウモロコシの穂軸が最も広く使用されているリグノセルロース材料であるが、他の供給源、専用の森林の栽培、アルコール性糖（alcoholigenic sugar）及び穀類植物の残渣、製紙産業由来の生成物及び残渣、並びにリグノセロース材料の転換生成物を使用してもよい。それらは大抵、およそ３５％〜５０％のセルロース、２０％〜３０％のヘミセルロース、及び１５％〜２５％のリグニンによって構成される。
【０００５】
リグノセルロース材料のエタノールへの生化学的変換プロセスは、物理化学的な前処理工程と、それに続く、酵素カクテルを使用した酵素的加水分解工程と、遊離した糖のエタノール発酵の工程（エタノール発酵と酵素的加水分解とは同時に行われてもよい）と、エタノールの精製工程とを含む。
【０００６】
酵素カクテルは、セルロース分解酵素（セルラーゼとしても知られる）及び／又はヘミセルロース分解酵素の混合物である。セルロース分解酵素は、エンドグルカナーゼ、エキソグルカナーゼ、及びセロビアーゼの３つの主要なタイプの活性を有し、セロビアーゼはβグルコシダーゼとしても知られる。ヘミセルロース分解酵素は特に、キシラナーゼ活性を有する。
【０００７】
酵素的加水分解は有効であり、温和な条件下で行われる。一方で、酵素のコストは未だに高く、リグノセルロース材料のエタノールへの転換のコストの２０％〜５０％を占めている。このため、このコストを削減するために以下のような膨大な研究、即ち、まず、高産生性の微生物を選択し、前記酵素の産生方法を改良することによる酵素産生の最適化について、そして次には、前処理工程を最適化し、これらの酵素の特異的活性を改良し、そして酵素的加水分解工程の実施を最適化することによる、加水分解における酵素量の削減について、研究が行われてきた。
【０００８】
最近の１０年間の間に、作用機構の理解及び酵素カクテルの発現を目的として膨大な研究が行われてきた。この狙いは、微生物を改変することによってリグノセルロース材料の加水分解に最も適したカクテルを排出させる(excrete)ことである。
【０００９】
酵素カクテルの工業産生に最も広く利用されているセルロース分解性の微生物は真菌Trichoderma reesei.（トリコデルマリーセイ）である。インデューサ(inducer)炭素性基質、例えばセルロースの存在下で、野生株は、セルロースの加水分解に最も好適であると考えられる酵素カクテルの排出能を有する。リグノセルロース材料の加水分解に不可欠な性質を有する他のタンパク質、例えばキシラナーゼもまた、トリコデルマリーセイによって産生される。インデューサ基質の存在は、セルロース分解性及び／又はヘミセルロース分解性の酵素の発現にとって不可欠である。炭素性基質の性質は、酵素カクテルの組成に大きな影響を及ぼす。このことはキシロースの場合にも当てはまり、キシロースは、セルロース又はラクトースといった炭素性インデューサ基質と関連づけられた場合に、キシラーゼ活性と呼ばれる活性を著しく改善することができる。
【００１０】
ラクトースは依然として、酵素カクテルの産生のための工業的方法において最も適切な基質のひとつである。しかしながら、そのコストは大幅にばらつき、酵素の価格のおよそ３分の１から３分の２を占めている。炭素性基質としてラクトースを使用する場合には、酵素カクテルの産生方法は炭素の外的供給源に依存する。このため、リグノセルロース材料の生化学的変換プロセスから得られる炭素性基質が使用できれば、大きな進歩となる。
【００１１】
特許文献１には、前処理済みのリグノセルロース材料由来のモノマー形態のヘミセルロース・フラクションからの抽出物を、セルロース分解性微生物の増殖及び酵素の産生のための、非インデューサ炭素性基質として使用し得ることが開示されている。酵素の産生の場合には、セルラーゼを産生するためのインデューサ炭素性基質（ラクトース又はセルビオース）と混合する必要がある。
【００１２】
特許文献２及び特許文献３には、セルラーゼの産生のため、並びに炭素の主要な供給源のために、インデューサ糖を含有する炭素性基質を使用する、トリコデルマリーセイからの酵素カクテルの産生について記載されている。この特許出願には、セルラーゼの産生を誘導するためには、３重量％のインデューサ糖で十分であることが記載されている。セルラーゼの産生量は、産生溶液中でキシロースを単独で使用する例と比較して４倍を超えて増加する。インデューサ糖としては、セルロースの加水分解により製造することが可能であるモノ、ジ、及びオリゴ糖（Ｃ６糖）が記載されている。主な炭素供給源はヘミセルロースから、又は合成キシロースから得られる、モノ-、ジ、及びオリゴ糖を含む集合体である。
【００１３】
特許文献４は、セルロース分解性及び／又はヘミセルロース分解性の酵素の産生方法を開示している。インデューサ基質は、グルコース又はセルロース加水分解産物と、ラクトースと、キシロース又はへミセルロース加水分解産物溶液との混合物であり、これらの３つのグループの構成成分を各々少なくとも１０重量％有するものである。この文献では、インデューサ基質が上記に列挙した構成成分以外の他の糖を含まないことが示され、セルロース加水分解産物はセルロースの加水分解から得られたグルコースであり、ヘミセルロース加水分解産物はＣ５糖の溶液である。
【００１４】
特許文献５には、培地に溶解される酸素の圧力の変動を調整することに基づく、セルラーゼの産生方法について記載されている。この文献の開示によると、炭素性インデューサ基質は、ラクトース、キシロース、セルビオース、ソホース、単糖の発酵後に得られる残渣、及び／又は水溶性ペントース、即ち水溶性Ｃ５糖の粗抽出物から選択される。
【００１５】
非特許文献２は、セルロースの酸加水分解により生成されるオリゴ糖による誘導を教示しており、Ｃ６糖オリゴマーにより構成される前記加水分解産物は、Ｃａ（ＯＨ）２の溶液によって塩基性となされた後、中和される。Ｃ６オリゴマー、特にセルビオースが果たすインデューサの役割もまた公知である。
【先行技術文献】
【特許文献】
【００１６】
【特許文献１】欧州特許出願公開第１  ６９０  ９４４号明細書
【特許文献２】国際公開第０９／０２６７１６号パンフレット
【特許文献３】国際公開第０９／００６１４８６号パンフレット
【特許文献４】仏国特許第２  ９６２  ４４４号明細書
【特許文献５】欧州特許出願公開第２  ３７１  ９５０号明細書
【非特許文献】
【００１７】
【非特許文献１】Process Design and Economics for Biochemical Conversion of Lignocellulosic Biomass to Ethanol, Humbird et al., NREL/TP-5100-57764, May 2011)（リグノセルロースバイオマスのエタノールへの生化学的変換のためのプロセス設計及び経済）
【非特許文献２】Cellulase Production by Continuous Culture of Trichoderma reesei Rut C30 using acid hydrolysate prepared to retain more oligosaccharides for induction, Lo et al., Bioresource Technology 101 (2010) 717-723（誘導のためにより多くのオリゴ糖を残すように調製された酸加水分解産物を使用したトリコデルマリーセイＲｕｔＣ３０の連続培養によるセルラーゼの産生）
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【００１８】
本発明の目的の１つは、容易に入手可能であり、リグノセルロース材料の加水分解のために適切な活性を有する酵素カクテルを産生できる、インデューサ炭素の新規な供給源を提案することである。特許文献１に比較して、本発明は、オリゴマーをも含有するヘミセルロース・フラクションの有利な使用について特許請求しており、このことは、インデューサ基質の添加をしなくて済むということを意味している。特許文献２と比較して、本発明は、加水分解すべきバイオマスの処理のために特に有効である酵素の混合物の発現に特に適した、非合成炭素の単一の供給源の使用を推奨している。本発明はまた、内部で副生成物をアップグレードすることを可能にする。
【課題を解決するための手段】
【００１９】
本発明は、リグノセルロース材料の前処理からの液体残渣を酵素カクテルの産生を誘導するためのインデューサ炭素性基質として使用することを特徴とする、セルロース分解性微生物による酵素カクテルの産生方法に関する。 
【発明の効果】
【００２０】
本発明の利点の１つは、リグノセルロース材料の変換のための生化学的プロセスに対する外部由来の炭素性基質の添加を削減又は省略できることである。他の利点は、酵素カクテルの産生のための前記生化学的変換プロセスからの液体残渣をアップグレードできることである。このようなアップグレードは、廃棄又は保存の前に再処理する必要のある流出物の生成量を削減できるということを意味する。
【００２１】
インデューサオリゴマーを含有する液体残渣が酵素カクテルを産生するようにアップグレードされるので、前記カクテルのコストを削減できる。
【００２２】
本発明の方法の更なる利点は、生化学的変換プロセスにおいて変換される前処理済みリグノセルロース材料の酵素的加水分解に特に好適な酵素カクテルを産生できることである。特に、得られる酵素のセルラーゼ活性に対してＣ５オリゴマーが及ぼすプラスの効果が見出されている。
【発明を実施するための形態】
【００２３】
本発明は、セルロース分解性微生物を用いた酵素カクテルの産生方法であって、
次の２つの段階、
・  炭素性増殖溶液の存在下、閉鎖リアクタ内での、前記微生物の増殖段階ａ）、
・  炭素性基質の濃度が１５０〜４００ｇ／Ｌの範囲である炭素性産生溶液を供給して行われる前記酵素カクテルの産生段階であって、前記炭素性産生溶液が炭素性インデューサ基質を含む段階ｂ）、
を含む方法において、
前記炭素性インデューサ基質が、リグノセルロース材料の前処理工程から得られる液体残渣であって、前記液体残渣は殺菌又はｐＨ調整せずに用いられ、前記液体残渣のＣ５糖オリゴマーが前記液体残渣中に存在する糖全体の少なくとも１重量％を占め、且つ前記炭素性産生溶液中に存在する糖全体の少なくとも０．３重量％を占めることを特徴とする、方法である。
【００２４】
好ましくは、前記段階ａ）において使用される炭素性増殖溶液は、反応体積１リットル当たり１０〜９０ｇの範囲の炭素性基質の初期濃度を有する。
【００２５】
好ましくは、前記前処理工程は、予め前記リグノセルロース材料に硫酸水溶液を含浸させることを伴う、酸加水分解、酸蒸解、又は蒸気爆砕(steam explosion)である。
【００２６】
好ましくは、前記液体残渣は、前記液体残渣の殺菌もｐＨ調整をせずに用いられる。より好ましくは、前記液体残渣は、前記液体残渣の殺菌も除毒もｐＨ調整もせずに用いられる。
【００２７】
好ましくは、Ｃ５糖オリゴマーは、前記液体残渣中に存在する糖全体の１重量％〜５０重量％の範囲を占める。
【００２８】
好ましくは、前記インデューサ炭素性基質は、単独で、又は少なくとも１つの他の非インデューサ炭素性基質との混合物として用いられる。 
【００２９】
好ましくは、前記他の非インデューサ炭素性基質は、グルコース、キシロース、及びサッカロースから、単独で又は混合物として選択される。
【００３０】
好ましくは、前記炭素性産生溶液は、液体残渣と、グルコース、キシロース、及びサッカロースから、単独で又は混合物として選択される少なくとも１つの非インデューサ炭素性基質とからなり、前記液体残渣は、リグノセルロース材料の前処理工程から得られ、且つ殺菌も除毒もｐＨ調整もせずに用いられ、前記液体残渣は、Ｃ５糖オリゴマーと、Ｃ５及びＣ６糖モノマーと、糖モノマー分解生成物とからなり、Ｃ５糖オリゴマーは前記液体残渣中に存在する糖全体の少なくとも１重量％を占め、及び前記炭素性産生溶液中に存在する糖全体の少なくとも０．３重量％を占める。
【００３１】
好ましくは、段階ｂ）のために炭素性産生溶液を供給するための具体的な流量は、１時間当たり微生物１グラム当たり３５〜６５ｍｇの炭素性基質の範囲である。
【００３２】
好ましくは、セルロース分解性微生物は、トリコデルマ属、アスペルギルス属、ペニシリウム属、又はスエヒロタケ属に属する真菌株から選択される。
【００３３】
好ましくは、セルロース分解性微生物はトリコデルマリーセイ種に属する。
【００３４】
酵素カクテルの前記産生方法は液内培養(submerged culture)を用いて行われる。用語「液内培養」とは、液体培地内での培養を意味する。
【００３５】
本発明の酵素カクテルの産生方法において使用されるセルロース分解性微生物は、例えばトリコデルマ属(Trichoderma)、アスペルギルス属(Aspergillus)、ペニシリウム属(Penicillium)、又はスエヒロタケ属(Schizophyllum)に属する、好ましくはトリコデルマリーセイ種に属する、セルロース分解性真菌株である。最も性能を発揮する工業的菌株は、突然変異選択方法によって酵素カクテルを改良するように変性されたトリコデルマリーセイ種に属する菌株、例えばＩＦＰ  ＣＬ８４７株（仏国特許第２  ５５５  ８０３号）等である。遺伝子組換え技術によって改良された菌株もまた使用し得る。これらの菌株は、それらの増殖及び酵素の産生に適合する条件下で攪拌され通気された(aerated)リアクタ内で培養される。
【００３６】
用語「炭素性基質」は、炭素性溶液中に含まれる全ての糖類を意味する。
【００３７】
本発明の方法の前記段階ａ）において使用される前記微生物のための炭素性増殖基質は、溶解性の工業的糖から、好ましくは、グルコース、キシロース、リグノセルロース材料の酵素的加水分解からの糖モノマーをエタノール発酵した後に得られる液体残渣、及び前処理されたリグノセルロース材料から得られるモノマーの形態のヘミセルロース・フラクションからの抽出物から選択され、単独で又は混合物として使用される、炭素性基質を有利には含む、水溶液である。その性質に応じて、前記炭素性増殖溶液は、殺菌する前に閉鎖リアクタに導入されるか、別途殺菌されて、リアクタの殺菌後に閉鎖リアクタに導入される。
【００３８】
好ましくは、前記炭素性増殖溶液は、前記段階ａ）において、反応体積１リットル当たり１０〜９０ｇの炭素性基質の範囲の初期濃度で使用される。
【００３９】
好ましくは、前記段階ａ）は、３０〜７０時間の範囲、好ましくは３０〜４０時間の範囲の時間にわたり行われる。
【００４０】
好ましくは、前記段階ａ）は、ｐＨ４．８及び温度２７℃で操作される。
【００４１】
好ましくは、前記段階ａ）は、閉鎖され且つ通気及び攪拌されたリアクタ内で行われる。通気は、０．１〜１の範囲、好ましくは０．３〜０．７の範囲のＶＶＭ（空気の体積流量（Ｎｍ３／分）をｍ３単位の反応体積で除したもの) を得るように、より好ましくは０．５のＶＶＭを得るように、調節される。攪拌は、理論的飽和の２０％〜８０％の範囲、好ましくは３０％〜５０％の範囲、及びより好ましくは４０％の値の溶解酸素の分圧を得るようになされる。
【００４２】
本発明の前記段階ｂ）において使用される前記微生物の産生のための炭素性溶液は、インデューサ炭素性基質を含む水溶液である。前記インデューサ炭素性基質は、Ｃ５糖オリゴマーを含むリグノセルロース材料の前処理工程から得られる液体残渣である。
【００４３】
本発明によれば、前記Ｃ５糖オリゴマーは、前記炭素性産生溶液中に含有される糖全体の少なくとも０．３重量％を占める。好ましくは、前記Ｃ５糖オリゴマーは、前記炭素性産生溶液中に含有される糖全体の０．３重量％〜５０重量％の範囲、好ましくは０．３重量％〜２０重量％の範囲、より好ましくは０．３重量％〜１０重量％の範囲、 及び更により好ましくは０．３重量％〜６重量％の範囲を占める。
【００４４】
好ましくは、前記インデューサ炭素性基質は、単独で、又は少なくとも１つの他の非インデューサ炭素性基質との混合物として用いられる。
【００４５】
好ましくは、前記他の非インデューサ炭素性基質は、非インデューサ糖から選択され、好ましくはグルコース、サッカロース、及びキシロースから、単独で又は混合物として選択される。極めて好ましくは、前記他の炭素性基質はグルコース及びサッカロースから、単独で又は混合物として選択される。
【００４６】
本発明によれば、本発明の前記段階ｂ）において使用される前記炭素性産生溶液は、炭素性産生溶液１リットル当たり１５０〜４００ｇの炭素性基質の濃度で調製される。前記段階ｂ）のために炭素性産生溶液を供給するための具体的な流量は、有利には１時間当たり微生物１グラム当たり３５〜６５ｍｇの炭素性基質、好ましくは１時間当たり微生物１グラム当たり３５〜４５ｍｇの炭素性基質の範囲である。
【００４７】
好ましくは、前記段階ｂ）は、少なくとも３０時間以上、好ましくは少なくとも１００時間以上の時間にわたり行われる。
【００４８】
好ましくは、前記段階ｂ）は３〜５．５の範囲のｐＨで、２０℃〜３０℃の範囲の温度で操作される。
【００４９】
好ましくは、前記段階ｂ）は、通気され且つ攪拌されたリアクタ内で行われる。通気は、０．１〜１の範囲、好ましくは０．３〜０．７の範囲のＶＶＭが得られるように、及びより好ましくは０．５のＶＶＭが得られるように調節される。攪拌は２０％〜８０％の範囲、好ましくは３０％〜５０％の範囲、さらにより好ましくは４０％の値の溶解酸素の分圧を得るようになされる。
【００５０】
前記段階ｂ）は、当業者には公知の供給バッチ及びケモスタット法(chemostat modes)に従って行ってよい。
【００５１】
前記段階ｂ）で使用される炭素性産生溶液中のインデューサ炭素性基質として使用されるＣ５糖オリゴマーは、リグノセルロース材料の前処理工程から得られる液体残渣中に含まれる。
【００５２】
リグノセルロース材料の前処理のための前記工程を使用して、セルロース・フラクションの酵素的加水分解に対する感受性を改善することができる。前記前処理工程は、例えば蒸気爆砕工程等の物理的前処理工程、又は化学的若しくは物理化学的工程である。好ましくは、前記前処理工程は、酸又は塩基前処理工程であり、例えば、前記材料にアルカリ水溶液を予め含浸させることを伴う、アルカリ加水分解、アルカリ蒸解、又は蒸気爆砕等である。好ましくは、前記前処理工程は、酸前処理工程であり、好ましくは前記材料に硫酸水溶液を予め含浸させることを伴う、酸加水分解、酸蒸解、又は蒸気爆砕である。極めて好ましくは、前処理工程は蒸気爆砕である。
【００５３】
前記前処理からの流出物を、固体残渣からなる相及び液体残渣からなる相の２つの相に分離する。前記分離は、当業者に公知の任意の手段により達成され得る。一例として、前記分離は、遠心分離、フィルタープレス、デカンタージュ、又は液体相及び固体相の分離を可能にする任意の他の技術的手段により達成され得る。
【００５４】
酸前処理の場合、操作条件（酸の量、湿度、温度、圧力、時間）は、当業者により、前処理されるリグノセルロース材料及び採用される技術に応じて調節される。前記操作条件は、例えば、麦わらよりもススキに対してより厳しくなる。これらの調節は、分解生成物（特にフルフラール、５−ＨＭＦ）の形成を最小限に抑えつつ、モノマーの形態の、ヘミセルロースの完全な加水分解をもたらすことを意図している。この目的のため前処理工程を、２つの段階、即ちＣ５糖オリゴマーを遊離するための第１段階と、それに続くこの遊離オリゴマーからモノマーを生成するための段階とに細分してもよい。（非特許文献１）。
【００５５】
本発明によると、前記前処理工程は、当業者に公知の手段を用いて、液体残渣がＣ５糖オリゴマーを含むように操作される。
【００５６】
前記前処理工程から液体残渣中のＣ５糖オリゴマーを得るために、前記前処理工程で採用される酸の量を削減することができる。前記前処理工程が操作される温度及び／又は圧力を、モノマーのみを遊離させるように最適化された条件と比較して低下させることも可能である。
【００５７】
本発明によれば、リグノセルロース材料の前処理工程から得られる前記液体残渣中に含まれる前記Ｃ５糖オリゴマーは、前記液体残渣中に存在する糖全体の１重量％〜１００重量％、好ましくは１重量％〜５０重量％の範囲、及びより好ましくは１重量％〜３０重量％の範囲を占める。
【００５８】
前記前処理工程から得られたＣ５糖オリゴマーを含有する前記液体残渣は、前記液体残渣を殺菌したり前記残渣のｐＨを調整したりする必要なしに、インデューサ炭素の供給源として使用される。
【００５９】
好ましい実施形態では、「固体」と称されるフラクションに相当する前処理されたリグノセルロース材料は、酵素的加水分解工程において加水分解される。この工程からの流出物は次いで、酵素的加水分解産物の糖モノマーのエタノール発酵工程において処理される。これらの処理は同じ装置又は異なる装置内で行われ得る。
【００６０】
他の好ましい実施形態では、発酵工程と加水分解工程の少なくとも一部とが同時に行われる。これは、例えば、酵素的加水分解工程中にエタノール酵母を加えることによって、達成される。
【００６１】
以下の実施例は、本発明を例示するが、本発明の範囲を限定するものではない。
実施例１（本発明によらない）：グルコースによる酵素カクテルの産生
実施例１は、炭素性産生基質としてグルコースを用いた培養を提示する。それはセルラーゼ産生のリプレッサである。この実施例は、低度の酵素産生をもたらした。
【００６２】
機械的に攪拌されるリアクタ内で酵素カクテルを産生した。無機培地（４Ｎと称する）は以下の組成を有していた：ＫＯＨ  １．６６ｇ／Ｌ、８５％Ｈ３ＰＯ４  ２ｍＬ／Ｌ、（ＮＨ４）２ＳＯ４  ２．８ｇ／Ｌ、ＭｇＳＯ４・７Ｈ２Ｏ  ０．６ｇ／Ｌ、ＣａＣｌ２  ０．６ｇ／Ｌ、ＭｎＳＯ４  ３．２ｍｇ／Ｌ、ＺｎＳＯ４・７Ｈ２Ｏ  ２．８ｍｇ／Ｌ、ＣｏＣｌ２・１０Ｈ２Ｏ  ４．０ｍｇ／Ｌ、ＦｅＳＯ４・７Ｈ２Ｏ  １０ｍｇ／Ｌ、Ｃｏｒｎ  Ｓｔｅｅｐ  １．２ｇ／Ｌ、消泡剤  ０．５ｍＬ／Ｌ。
液体予備培養
炭素性増殖基質としてグルコースを３０ｇ／Ｌの濃度で用いた予備培養によって、微生物（トリコデルマリーセイＣＬ８４７株）を増殖させた。この予備培養の無機培地はｐＨを緩衝するために５ｇ／Ｌのフタル酸カリウムを追加した４Ｎ培地とした。接種菌の増殖を３日間続け、攪拌されるインキュベーター中で３０℃にて行った。残存グルコース濃度が１５ｇ／Ｌ未満となったら、リアクタへの移し替えを行った。
増殖段階
４Ｎ培地を含有するリアクタを１２０℃で２０分間殺菌した。グルコース炭素性増殖基質を、１２０℃から２０分間殺菌してから、無菌方法で３０ｇ／Ｌの濃度を生ずるようにリアクタに加えた。リアクタにトリコデルマリーセイＣＬ８４７株の液体予備培養物を１０％（ｖ／ｖ）となるように接種した。操作条件は、温度２７℃及びｐＨ４．８（５．５ｍｏｌ／Ｌアンモニアを用いて調整）であった。通気は０．５ＶＶＭとし、攪拌を、ｐＯ２（溶解酸素の圧力）に応じて２００〜８００ｒｐｍに強め、ｐＯ２を３０％に維持した。
産生段階
リアクタの炭素性増殖基質が消費されたら、２５０ｇ／Ｌのグルコース炭素性産生基質を１時間当たり微生物１ｇ当たり３５〜４５ｍｇの流量で１６４時間連続注入した。操作条件は、温度２５℃及びｐＨ４（５．５ｍｏｌ／Ｌのアンモニアを用いて調整、このアンモニアはまた排出されるタンパク質の合成に必要な窒素を提供する）とした。溶解酸素含有量は攪拌を調節することによって３０％に維持された。
【００６３】
酵素の産生は、ろ過又は遠心分離によって微生物を分離した後ローリー法（Lawry method）及び標準ＢＳＡを用いて細胞外(extracellular)酵素をアッセイすることによってモニタリングした。測定されたセルロース分解活性を以下の通りであった。
・  エンドグルカナーゼ及びエキソグルカナーゼ酵素カクテルの全体的な活性をアッセイするためのろ紙活性（ＦＰＵ：フィルターペーパーユニット）、
・  特異的活性のためのアリールβグルコシダーゼ活性。
【００６４】
ＦＰＵ活性は、Ｗｈａｔｍａｎ  ｎ°１ろ紙（ＩＵＰＡＣバイオテクノロジカルコミッション（IUPAC biotechnological commission）により推奨される手順））により、初期濃度５０ｇ／Ｌで測定した。６０分で２ｇ／Ｌのグルコースの当量を遊離する（比色分析法）分析対象の酵素溶液のサンプルを決定した。ろ紙活性の原理は、ＤＮＳアッセイ（ジニトロサリチル酸）（ＩＵＰＡＣバイオテクノロジカルコミッションにより推奨される手順）によってＷｈａｔｍａｎ  ｎ°１ろ紙から得られる還元糖の量を決定することである。
【００６５】
アリールβグルコシダーゼ活性を決定するために使用された基質は、パラニトロフェニル−β−Ｄ−グロコピラノシド（ＰＮＰＧ）であった。それはβグルコシダーゼによって開裂してパラニトロフェノールを遊離する。
【００６６】
アリールβグルコシダーゼ活性の１単位は、１分当たりＰＮＰＧから１μｍｏｌのパラニトロフェノールを生成するのに必要な酵素の量として定義され、ＩＵ／ｍｌで表される。
【００６７】
特異的活性は、ＩＵ／ｍｌで表される活性をタンパク質の濃度で割ることによって得られる。それらはＩＵ／ｍｇで表される。
【００６８】
実施例１の最終的なマッシュ(mash)の分析測定により、以下のような結果が得られた。
【００６９】
【表１】
0006581904.tif 000002
【００７０】
実施例２（本発明によらない）：キシロースによる酵素の産生
実施例２は、炭素性産生基質としてキシロースを用いた培養を提示する。それはセルラーゼ産生のリプレッサである。この実施例は低度の酵素産生をもたらした。
【００７１】
実施例１と同様の条件下で酵素を産生した。増殖段階の炭素性基質はラクトースとし、産生段階では純粋なキシロースとした。
【００７２】
３０時間の増殖後、最初の基質を消費した後、２５０ｇ／Ｌのキシロース溶液を１時間当たり細胞１ｇ当たり３５ｍｇの流量で１６４時間連続注入した。
【００７３】
最終マッシュの分析測定を行い、以下の結果が得られた。
【００７４】
【表２】
0006581904.tif 000003
【００７５】
実施例３（本発明によらない）：ラクトースによる酵素の産生
実施例３は、炭素性産生基質としてラクトースを用いた培養を提示する。それはセルラーゼ産生のインデューサである。この実施例は高活性酵素の高い産生をもたらす。
【００７６】
実施例１と同様の条件下で酵素を産生した。増殖段階及び産生段階の炭素性基質を純粋なラクトースとした。ラクトースはセルラーゼ産生の重要なインデューサである。それは、セルラーゼの産生において最も広く使用されている工業的基質である。
【００７７】
３０時間の増殖後、最初の基質を消費した後、２５０ｇ／Ｌの供給バッチ溶液を１時間当たり細胞１ｇ当たり３５ｍｇの流量で１６４時間連続注入した。
【００７８】
最終マッシュの分析測定を行い、以下の結果を得た。
【００７９】
【表３】
0006581904.tif 000004
【００８０】
実施例４(本発明による)：Ｃ５糖オリゴマーを含有する液体残渣１００％による産生
実施例４は、 炭素性産生基質として液体残渣を使用した培養を提示する。この実施例は、酵素の産生と、実施例１及び２で得られるものよりも高い活性とをもたらした。そのことはつまり、単独で用いられた液体残渣がセルラーゼの産生を誘導することを示している。それは、特許文献２に記載されているものと同様な効果をもたらすが、液体残渣以外のインデューサ溶液は添加していない。
【００８１】
実施例１と同様の条件下で酵素産生を行った。増殖段階の炭素性基質は、グルコースとした。産生段階の炭素性基質は、「液体残渣」として既知の、前処理後に得られる液体・フラクションとした。これは、０．６５％のＨ２ＳＯ４を含浸させてから１４．５バールで２分間蒸気爆砕(steam explosion)し、その後液相／固相分離をすることより前処理されたススキ(miscanthus)から得た。
【００８２】
その組成は以下の通りであった。
【００８３】
【表４】
0006581904.tif 000005
【００８４】
それを３００ｇ／Ｌに濃縮した。３０時間の増殖後、最初の基質を消費した後、濃縮されたヘミセルロース加水分解産物を１時間当たり細胞１ｇ当たり３５ｍｇの流量で連続注入した。
【００８５】
最終マッシュの分析測定により以下の結果が得られた。
【００８６】
【表５】
0006581904.tif 000006
【００８７】
実施例５（本発明による）：異なる割合のオリゴマーを含む２つの異なる液体残渣による産生
実施例５は、炭素性産生基質として液体残渣をそれぞれ使用した２つの培養を提示する。この実施例は、酵素の産生と、及び実施例１及び２で得られるものよりも高い活性とをもたらした。そのことはＣ５糖オリゴマーの含有が、得られる酵素の量及び活性にプラスの効果をもたらすということを示している。
【００８８】
麦わらを蒸気爆砕して２つの別個の液体残渣を得た。蒸気爆砕の操作条件は１４．５バールで２分間とした。０．６４％のＨ２ＳＯ４を予め含浸させた麦わらから液体残渣Ｃ１を得た。０．３２％のＨ２ＳＯ４を予め含浸させた麦わらから液体残渣Ｃ２を得た。
【００８９】
液体残渣Ｃ２は、麦わらの含浸に使用した酸の量がより少なかったことに起因して、麦わらからのヘミセルロースの加水分解から得られたオリゴマーを、加水分解産物Ｃ１と比較して高い割合で含有していた。
【００９０】
液体残渣Ｃ１及びＣ２の組成を、以下の表に詳しく示す。
【００９１】
【表６】
0006581904.tif 000007
【００９２】
モノマーはグルコース、キシロース、アラビノース、マンノース、ガラクトース、及びラムノースの合計に相当する。オリゴマーは、Ｃ５糖オリゴマー(例えば、キシロビオース、キシロトリオース、キシロアラビノース)の合計に相当する。分解糖(degraded sugars)は、フルフラール、５ＨＭＦ、レブリン酸、及びギ酸の合計に相当する。
【００９３】
２５０ｇ／Ｌの合計糖濃度が得られるようにグルコースをＣ１及びＣ２加水分解産物に溶解することによって２つの供給バッチ溶液を調製した。
【００９４】
実施例１と同様の条件下で実験を行った。
【００９５】
得られた最終マッシュの分析測定により、以下の結果を得た。
【００９６】
【表７】
0006581904.tif 000008
【００９７】
ヘミセルロース・フラクションから得られるオリゴマーをより多く含有していた供給バッチ溶液Ｃ２は、供給バッチ溶液Ｃ１よりも多くのタンパク質の生成をもたらし、酵素活性もより良好であった。この実施例では、酵素産生は、リグノセルロースバイオマスからのエタノールの製造プロセスのみから得ることが可能な炭素源を用いて行われ、グルコースはセルロース加水分解産物によって置き換えることが可能である。
実施例６（本発明によらない）：Ｃ５糖オリゴマーを含有しない液体残渣（ヘミセルロース分解性加水分解産物）による産生
実施例６は、実施例５の液体残渣Ｃ２から出発した場合、酵素の産生を誘導するのが実際にＣ５糖オリゴマーである、ということを示している。
【００９８】
実施例５の溶液Ｃ２を最初に酸加水分解に供してオリゴマーをモノマーに加水分解した。新しい溶液Ｃ３の組成は以下の通りであった。
【００９９】
【表８】
0006581904.tif 000009
【０１００】
培養には実施例５と同様の条件を使用した。供給バッチ溶液は、２５０ｇ／Ｌの全糖濃度が得られるようにグルコースをＣ３に溶解することによって調製した。最終マッシュの分析測定により、以下の結果が得られた。
【０１０１】
【表９】
0006581904.tif 000010
【０１０２】
この実施例は、ヘミセルロース性オリゴマーが存在しない場合には、液体残渣はセルラーゼの産生を誘導しないということを示している。