(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
対象におけるがんを評価するための方法であって、
対象から得られた生体サンプルを提供すること、ここで前記生体サンプルは全血、血清および血漿からなる群から選択される、と、
生体サンプル中におけるモエシンのＣ末端セグメントのレベルを検出することを含み、
対象の生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、対象ががんを発症していること、または対象ががんを発症する可能性が高いことを示す、方法。
【請求項２】
Ｃ末端セグメントがヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７からなる、請求項１に記載の方法。
【請求項３】
ヒトモエシンが、配列番号２に記載のアミノ酸配列を有する、請求項２に記載の方法。
【請求項４】
Ｃ末端セグメントが、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の領域からの少なくとも２０個の連続したアミノ酸残基を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項５】
Ｃ末端セグメントが、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の領域からの少なくとも５０個の連続したアミノ酸残基を含む、請求項１に記載の方法。
【請求項６】
生体サンプル中におけるモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、前記サンプルとモエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬とを接触させることにより検出される、請求項１に記載の方法。
【請求項７】
前記試薬が、モエシンのＣ末端セグメントに結合する抗体またはこの抗体断片である、請求項６に記載の方法。
【請求項８】
前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項７に記載の方法。
【請求項９】
対象の生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、参照サンプルから検出したモエシンのＣ末端セグメントの参照レベルと比較される、請求項１に記載の方法。
【請求項１０】
モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルと比べて、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが高いことが、対象ががんを発症していること、または対象ががんを発症する可能性が高いことを示す、請求項９に記載の方法。
【請求項１１】
生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも２倍である、請求項９に記載の方法。
【請求項１２】
生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも５倍である、請求項９に記載の方法。
【請求項１３】
参照サンプルが、腫瘍を有さない対象に由来する、請求項１０に記載の方法。
【請求項１４】
前記がんが、副腎皮質癌、星状細胞腫、基底細胞癌、胆管がん、膀胱がん、骨肉腫、脳幹神経膠腫、乳がん、子宮頸がん、結腸がん、皮膚、ユーイング肉腫、網膜芽細胞腫、胃がん、神経膠腫、頭頸部がん、心臓がん、肝がん、ホジキンリンパ腫、眼球内黒色腫、膵島細胞癌、腎がん、白血病、肺がん、黒色腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣がん、膵がん、前立腺がん、網膜芽細胞腫からなる群から選択される、請求項１に記載の方法。
【請求項１５】
モエシンのＣ末端セグメントから本質的になる、がんを評価するためのバイオマーカー。
【請求項１６】
ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の内の少なくとも２０個の連続したアミノ酸残基を含む、請求項１５に記載のバイオマーカー。
【請求項１７】
ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の内の少なくとも５０個の連続したアミノ酸残基を含む、請求項１５に記載のバイオマーカー。
【請求項１８】
モエシンのＣ末端セグメントがヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７からなる、請求項１５に記載のバイオマーカー。
【請求項１９】
モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬を含む、対象におけるがんを評価するためのキット。
【請求項２０】
前記試薬が抗体である、請求項１９に記載のキット。
【請求項２１】
対象におけるがんを評価するためのバイオマーカーとしてのモエシンのＣ末端セグメントの使用。
【請求項２２】
対象におけるがんを評価するための検出剤を製造するための、モエシンのＣ末端セグメントの使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
関連出願
本出願は、その全体が参照により本明細書に援用される「ｍｅｔｈｏｄ  ａｎｄ  ｂｉｏｍａｒｋｅｒ  ｆｏｒ  ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ  ｃａｎｃｅｒ」という表題で２０１４年４月２２日に出願されたＰＣＴ出願第ＰＣＴ／ＣＮ２０１４／０７５９４６号に関し、それに基づく優先権の利益を主張する。
【０００２】
本出願は概して、がんに関する分子生物学および細胞生物学および検出試薬の分野に関する。
【背景技術】
【０００３】
がんは、無秩序な細胞増殖を伴う広範囲のグループの疾患である。がんでは、細胞は無秩序に分裂して増殖し、悪性腫瘍を形成し、この悪性腫瘍は、身体の近接部位に侵入する可能性もある。がん細胞は、リンパ系または血流を介して身体の遠位部位にも伝播する可能性がある。ヒトを罹患させる２００種超の異なる既知のがんが存在する。
【０００４】
がんを多くの方法で検出することができ、これらの方法として、ある特定の徴候および症状の存在、スクリーニングテストまたは医用撮像が挙げられる。徴候もしくは症状の出現によりまたはスクリーニングを介して、大部分のがんは初期に認識される。しかしながら、これらの方法は通常、確定診断には至らず、病理学者による組織サンプルの検査が必要である。病理学的検査は、時間がかかり、侵入的であることが多い。したがって、がんを検出する新たな方法を開発することが必要とされ続けている。
【０００５】
ＥＲＭタンパク質ファミリには、エズリン、ラディキシンおよびモエシンが含まれる。ＥＲＭタンパク質は細胞膜中で主に発現され、アクチンリッチな細胞表面構造中で濃縮される。ＥＲＭタンパク質は、細胞膜とアクチンベースの細胞骨格との間の構造的リンカーとして作用する。ＥＲＭタンパク質は、高程度の種間および分子間の相同性を共有する。ＥＲＭタンパク質は、典型的には下記の３つのドメイン：バンド４．１タンパク質との相同性のためにＦＥＲＭドメイン（バンド４．１、エズリン、ラディキシン、モエシン相同性ドメイン）と呼ばれるＮ末端ドメイン、中央のらせんドメインおよびＣ末端ドメインを有する。Ｃ末端ドメインはＦアクチンに結合するが、Ｎ末端ドメインは細胞膜中の接着分子との結合に関与する（Ｌｏｕｖｅｔ−Ｖａｌｌｅｅ（２０００））。いくつかの証拠によれば、ＥＲＭタンパク質のＮＨ2末端ドメインおよびＣＯＯＨ末端ドメインが細胞質中で分子内および／または分子間結合し、これらの結合により内在性膜タンパク質およびアクチンフィラメントへの結合能力がそれぞれ抑制されることが示されている（Ｋｅｎ  Ｈａｙａｓｈｉら、Ｊ．Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉ．１１２：１１４９〜１１５８（１９９９））。
【０００６】
モエシンは、フィロポディア中に、ならびに細胞間認識および細胞間シグナル伝達ならびに細胞運動にとって重要なその他の膜突起中に局在化される（Ｌｏｕｖｅｔ−Ｖａｌｌｅｅ、Ｂｉｏｌ．Ｃｅｌｌ  ９２：３０５〜１６（２０００）を参照されたい）。ヒトモエシンタンパク質は５７７個のアミノ酸を含み、典型的には下記の３つのドメイン：Ｎ末端ＦＥＲＭドメイン、中央のらせんドメインおよびＣ末端ドメインからなる。更に、ヒトモエシンタンパク質は、マウスモエシンおよびウシモエシン等のその他の種からのモエシンとの高程度の配列相同性を共有する（Ｓａｔｏら、Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉ．Ｊ．１０３：１３１〜１４３（１９９２））。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【０００７】
本出願の発明者らは、驚くべきことに、完全長のモエシンタンパク質ではなくモエシンのＣ末端セグメントのレベルの上昇が、がんの存在または発症と関連していることを発見した。したがって、本出願は、がんの存在または発症を評価する方法、がんの存在または発症を評価するためのバイオマーカーおよびキットならびにそのようなバイオマーカーおよびキットの使用を提供する。本出願はまた、がんを処置する方法も提供する。
【０００８】
一態様では、本出願は、対象におけるがんの存在または発症を評価するための方法であって、対象の生体サンプルを得ること、生体サンプル中におけるモエシンのＣ末端セグメントのレベルを検出することを含み、対象の生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、対象ががんを発症していること、または対象ががんを発症する可能性が高いことを示す、方法を提供する。
【０００９】
一部の実施形態では、がんの存在または発症を評価する方法で使用するＣ末端セグメントは、モエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７からなる。ある特定の実施形態では、モエシンは、配列番号２に記載のアミノ酸配列を有するヒトモエシンである。一部の実施形態では、Ｃ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の領域からの少なくとも２０個の連続したアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、Ｃ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の領域からの少なくとも５０個の連続したアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、Ｃ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜４８７、４８８〜５０１または５０２〜５７７を含む。
【００１０】
一部の実施形態では、生体サンプル中のモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、このサンプルと、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬とを接触させることにより検出される。一部の好ましい実施形態では、この試薬は、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する抗体またはこの抗体断片である。一部の実施形態では、この抗体はモノクローナル抗体である。
【００１１】
一部の実施形態では、対象の生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが、参照サンプルから検出したモエシンのＣ末端セグメントの参照レベルと比較される。一部の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルと比べて、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが高いことは、対象ががんを発症していること、または対象ががんを発症する可能性が高いことを示す。生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、１５倍または２０倍である。一部の実施形態では、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは好ましくは、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも２倍である。一部の実施形態では、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも５倍である。一部の実施形態では、参照サンプルは腫瘍を有さない対象に由来しており、この腫瘍を有さない対象とは、臨床的に検出可能な腫瘍を有さない対象のことである。
【００１２】
一部の実施形態では、生体サンプルは、全血、血清および血漿からなる群から選択される。一部の実施形態では、生体サンプルは尿または唾液である。
【００１３】
一部の実施形態では、がんは、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、肛門がん、虫垂がん、星状細胞腫、基底細胞癌、胆管がん、膀胱がん、骨肉腫、脳幹神経膠腫、脳がん、小脳星状細胞腫、上衣腫、髄芽腫、乳がん、気管支腺腫、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、消化管カルチノイド腫瘍、子宮頸がん、慢性気管支炎、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性疾患、慢性閉塞性肺疾患、結腸がん、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、肺気腫、子宮内膜がん、上衣腫、ユーイング肉腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管がん、網膜芽細胞腫、胆嚢がん、胃がん（ｇａｓｔｒｉｃ  ｃａｎｃｅｒ）、神経膠腫、ヘアリーセル白血病、頭頸部がん、心臓がん、肝がん、ホジキンリンパ腫、下咽頭がん、眼球内黒色腫、島細胞癌、カポジ肉腫、腎がん、喉頭がん、白血病、肺がん、黒色腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣がん、膵がん、副甲状腺がん、陰茎がん、形質細胞性白血病、胸膜肺芽腫、前立腺がん、直腸がん、腎細胞がん、網膜芽細胞腫、軟部肉腫、子宮肉腫、皮膚がん、扁平上皮細胞癌、胃がん（ｓｔｏｍａｃｈ  ｃａｎｃｅｒ）、咽頭がん、甲状腺がん、子宮がん、膣がん、外陰がんからなる群から選択される。
【００１４】
別の態様では、本出願は、モエシンのＣ末端セグメントから本質的になる、がんの存在または発症を評価するためのバイオマーカーを提供する。一部の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７からなる。一部の実施形態では、このバイオマーカーは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の内の少なくとも２０個の連続したアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、このバイオマーカーは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の内の少なくとも５０個の連続したアミノ酸残基を含む。一部の実施形態では、このバイオマーカーは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の内の少なくとも１０個、１５個、２０個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個、５０個、５５個、６０個、６５個、７０個、７５個、８０個、８５個、９０個、９５個または１００個の連続したアミノ酸残基を含む。本出願はまた、対象におけるがんの存在または発症を評価するためのバイオマーカーとしてのモエシンのＣ末端セグメントの使用、および対象におけるがんを評価するための検出剤を製造するための、モエシンのＣ末端セグメントの使用も提供する。一部の実施形態では、Ｃ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜４８７、４８８〜５０１または５０２〜５７７を含む。一部の実施形態では、ヒトモエシンは、配列番号２に記載のアミノ酸配列を有する。
【００１５】
別の態様では、本出願は、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬を含む、対象におけるがんの存在または発症を評価するためのキットを提供する。一部の実施形態では、この試薬は抗体である。一部の実施形態では、この試薬はモノクローナル抗体またはその断片である。
【００１６】
別の態様では、本出願は、対象におけるがんを治療する方法であって、モエシンのＣ末端セグメントの機能を特異的に調節する試薬と、薬学的に許容される添加剤とを含む医薬組成物を対象に投与することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、この試薬は、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する。一部の実施形態では、この試薬は抗体である。一部の実施形態では、この試薬はモノクローナル抗体またはその断片である。別の態様では、本出願は、対象におけるがんを治療するための薬剤を製造するためのモエシンのＣ末端セグメントの使用を提供する。
【図面の簡単な説明】
【００１７】
【図１】完全長のヒトモエシンタンパク質をコードするｃＤＮＡ配列（配列番号１）を示す図である。
【図２】完全長のヒトモエシンタンパク質のアミノ酸配列（配列番号２）を示す図である。
【図３】ヒトモエシンタンパク質の４７１〜５７７位のアミノ酸残基のアミノ酸配列（配列番号３）を示す図である。
【図４】がん患者および健康な個体（正常）のサンプルにおけるＣ末端モエシンセグメントの濃度を示すグラフである。
【発明を実施するための形態】
【００１８】
本開示をより詳細に説明する前に、本開示は説明された特定の実施形態に限定されず、したがって当然のことながら多様であり得ることが理解されるものとする。また、本開示の範囲は添付した特許請求の範囲によってのみ限定され得るため、本明細書で使用される用語は個々の実施形態を説明することのみを目的とし、限定することを意図しないことも理解されるものとする。値の範囲が記載されている場合、この範囲の上限値および下限値の間にある各値（別途文脈が明確に指示しない限り下限値の単位の１０分の１まで）、および述べられた範囲中の任意のその他の述べられた値またはその間にある値が本開示に包含されることが理解される。これらのより小さい範囲の上限値および下限値は、独立してそのより小さい範囲に包含される場合があり、また、述べられた範囲内で具体的に限界のいずれかが除外される場合も本開示に包含される。述べられた範囲が限界の一方または両方を含む場合、これらの述べられた限界のいずれかまたは両方を除外する範囲も本開示に含まれる。
【００１９】
別途定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本開示が属する分野の当業者により通常理解されるのと同じ意味を有する。Ｓｉｎｇｌｅｔｏｎら、Ｄｉｃｔｉｏｎａｒｙ  ｏｆ  Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ  ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ第２版、Ｊ．Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ（Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．１９９４）およびＭａｒｃｈ、Ａｄｖａｎｃｅｄ  Ｏｒｇａｎｉｃ  Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｒｅａｃｔｉｏｎｓ、Ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ  ａｎｄ  Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ第４版、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ（Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ、Ｎ．Ｙ．１９９２）は、本出願で使用される多くの用語の一般的な指針を当業者に提供する。本明細書に記載されているものと類似のまたは等価のあらゆる方法および材料を本開示の実施または試験で使用することもできるが、本明細書では好ましい方法および材料が記載されている。
【００２０】
本明細書で引用される全ての刊行物および特許は、個々の刊行物または特許が参照により援用されると具体的におよび個々に示されたのと同様に参照により本明細書に援用され、引用される刊行物と関連して方法および／または材料を開示するために、および説明するために参照により本明細書に援用される。いずれの刊行物の引用もそれ自体の開示は本出願日前であるが、開示が先であることにより本開示がそのような刊行物に先行する権利はないということの承認として解釈すべきではない。更に、記載された刊行物の日付は、独立して確認する必要があるかもしれない実際の刊行日とは異なる可能性がある。
【００２１】
本開示を読む際には当業者に明らかなように、本明細書に記載されているおよび図示されている個々の実施形態それぞれは、本開示の範囲または趣旨から逸脱することなくその他のいくつかの実施形態のいずれかの特徴と容易に分離され得るまたは組み合わされ得る別々の構成要素および特徴を有する。記載されたあらゆる方法を、記載した事象の順序で実施することができる、または論理的に可能である任意のその他の順序で実施することができる。
【００２２】
本開示の実施形態は、別途指示されない限り、化学の技法、固体化学、無機化学、有機化学、物理化学、分析化学、材料化学、生化学、生物学、分子生物学、組換えＤＮＡ技法、薬理学、画像処理等を用いることができ、これらは当業界の技術範囲内である。そのような技法は文献中に完全に説明されており、この文献として、「Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ」、第２版（Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９）、「Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ」（Ｍ．Ｊ．Ｇａｉｔ編、１９８４）、「Ａｎｉｍａｌ  Ｃｅｌｌ  Ｃｕｌｔｕｒｅ」（Ｒ．Ｉ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙ編、１９８７）、「Ｍｅｔｈｏｄｓ  ｉｎ  Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ」シリーズ（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）、「Ｃｕｒｒｅｎｔ  Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ  ｉｎ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｂｉｏｌｏｇｙ」（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌら編、１９８７および定期的な改訂）、「ＰＣＲ：Ｔｈｅ  Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ  Ｃｈａｉｎ  Ｒｅａｃｔｉｏｎ」、（Ｍｕｌｌｉｓら編、１９９４）が挙げられる。本出願で用いられるプライマー、ポリヌクレオチドおよびポリペプチドを、当業界公知の標準的技法を使用して生成することができる。
【００２３】
本開示の実施形態を詳細に説明する前に、別途指示されない限り、本開示は特定の材料、試薬、反応材料、製造プロセス等に限定されず、したがって多様であり得ることが理解されるものとする。本明細書で使用される用語は個々の実施形態を説明することのみを目的とし、限定することを意図するものではないことも理解されるものとする。本開示では、異なる順序が論理的に可能である場合には異なる順序でステップを実行することも可能である。
【００２４】
下記の実施形態は、本明細書で開示されているおよび特許請求されている方法ならびにバイオマーカーおよびキットの使用をどのようにして実施するかの完全な開示および説明を当業者に提供するために提示される。数字（例えば量、温度等）に関して正確を期すために努力が払われているが、ある程度の誤差および偏差を考慮すべきである。
【００２５】
本明細書および添付した特許請求の範囲で使用する場合、単数形「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」および「その（ｔｈｅ）」は、別途文脈が明確に指示しない限り、同じものの複数形を含むことに留意しなければならない。そのため、例えば「化合物（ａ  ｃｏｍｐｏｕｎｄ）」への言及は複数の化合物を含む。本明細書および後続の特許請求の範囲では、反対の意図が明らかでない限り下記の意味を有すると定義すべきである多くの用語が言及されるだろう。
【００２６】
本出願は、がんの存在または発症を評価する方法、がんの存在または発症を評価するためのバイオマーカーおよびキット、ならびにそのようなバイオマーカーおよびキットの使用を提供する。本出願はまた、がんを処置する方法も提供する。
【００２７】
がんの存在または発症を評価する方法
本出願の第１の態様は、対象におけるがんの存在または発症を評価するための方法を提供する。この方法は、対象の生体サンプルを得ること、およびこの生体サンプル中におけるモエシンのＣ末端セグメントのレベルを検出することを含む。対象の生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは、この対象ががんを発症していること、またはこの対象ががんを発症する可能性が高いことを示す。
【００２８】
用語「評価する」または「評価」は本明細書で使用する場合、がんを罹患している対象からのサンプルと、がんを罹患していない対象からのサンプルとを識別する能力、または転移に入る前の異なるステージのがんを発症している対象からのサンプルを識別する能力に関する。ある特定の実施形態では、この評価は、対象が腫瘍を有するか否かの決定に関する。ある特定の実施形態では、この評価は、対象の腫瘍が減少しているかどうか、またはより重症化しているかどうかの決定に関する。ある特定の実施形態では、この評価は、治療の臨床的利益の見込みを評価するのに役立つことができる。ある特定の実施形態では、この評価は、患者が処置（例えば特定の治療薬による処置）後に好転するかどうかおよび／またはこの好転の可能性に関することができる。本出願の評価する方法を臨床的に使用することにより、あらゆる個々の患者に最適な処置モダリティを選択して処置を決断することができる。本出願の評価する方法は、ある治療レジメン後（例えば、例えば所与の治療薬または組合せの投与、外科的介入、ステロイド処置等を含む所与の治療レジメン後）の患者の長期生存が期待できるかどうかの評価での有益なツールであることができる。
【００２９】
当業者が理解するように、識別することまたは識別は、分析するサンプルの１００％で正確であることを目的とすることはできない。しかしながら、分析するサンプルの統計的に有意な量が正確に分類されることが求められる。当業者は、様々な統計学的ツールの使用により、限定されないが例えば信頼区間の決定により、ｐ値の決定により、スチューデント検定により、またはフィッシャーの識別関数（Ｆｉｓｈｅｒ’ｓ  ｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｉｎｇ  ｆｕｎｃｔｉｏｎ）により、統計的に有意である量を確定することができる。詳細はＤｏｗｄｙおよびＷｅａｒｄｅｎ、Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ  ｆｏｒ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ、Ｊｏｈｎ  Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ、Ｎｅｗ  Ｙｏｒｋ  １９８３で見出される。ある特定の実施形態では、信頼区間は、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９７％、少なくとも９８％または少なくとも９９％である。ある特定の実施形態では、ｐ値は０．１未満、０．０５未満、０．０１未満、０．００５未満または０．０００１未満である。ある特定の実施形態では、本出願により、分析する集団のある特定の群の対象の少なくとも５０％、少なくとも５５％、少なくとも６０％、少なくとも６５％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％または少なくとも９５％でがんを正確に検出することが可能になる。
【００３０】
「生体サンプル」は本明細書で使用する場合、例えば物理的特性、生化学的特性、化学的特性および／または生理学的特性に基づいて、特徴を明らかにするおよび／または同定する細胞実体（ｃｅｌｌｕｌａｒ  ｅｎｔｉｔｙ）および／またはその他の分子実体を含む目的の対象から得られるまたはこの対象に由来する生物学的組成物を意味する。生体サンプルとして、対象の細胞、組織、器官および／または体液が挙げられるがこれらに限定されず、この生体サンプルは、当業者に既知のあらゆる方法により得られる。ある特定の実施形態では、生体サンプルは液体サンプルである。ある特定の実施形態では、この液体サンプルは、全血、血漿または血清である。好ましくは、この液体サンプルは血清である。
【００３１】
用語「対象」は本明細書で使用する場合、動物を意味しており、好ましくは哺乳動物を意味しており、より好ましくはヒトを意味する。用語「対象」は、あらゆる態様において限定することを目的とせず、あらゆる年齢、性別および健康状態であることができる。
【００３２】
用語「モエシン」は、ＬａｎｋｅｓおよびＦｕｒｔｈｍａｙｒ（１９９１）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，８８：８２９７〜８３０１に記載されているように、膜組織化伸張スパイクタンパク質（ｍｅｍｂｒａｎｅ−ｏｒｇａｎｉｚｉｎｇ  ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ  ｓｐｉｋｅ  ｐｒｏｔｅｉｎ）を表す。モエシンポリペプチドのアミノ酸配列を、Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ等の公共のデータベースで見出すことができる。ポリペプチドおよびタンパク質という用語は、本出願全体を通して互換的に使用される。ある特定の実施形態では、モエシンはヒトモエシンである。完全長のヒトモエシンタンパク質は、配列番号２に記載のアミノ酸配列を有する５７７個のアミノ酸ポリペプチドである。ヒトモエシンタンパク質は、マウスモエシンおよびウシモエシン等のその他の種に由来するモエシンと高度の配列相同性を共有する（Ｓａｔｏら、Ｃｅｌｌ  Ｓｃｉ．Ｊ．１０３：１３１〜１４３（１９９２）。
【００３３】
「モエシンのＣ末端セグメント」は、モエシンタンパク質のＣ末端尾部ドメインまたはＣ末端尾部ドメインの一部を意味する。モエシンのＣ末端尾部ドメインは、野生型モエシンタンパク質においてこのタンパク質のカルボキシ末端に構造的に最も近いならびにアクチンフィラメントへの結合およびアクチンフィラメントとの相互作用に機能的に関与する部分を意味する。モエシンのＣ末端尾部ドメインは正電荷を帯びており、伸張した蛇行構造をとる。具体的には、この用語は、ヒトモエシンタンパク質の最後の約１０７個のアミノ酸残基を意味する。ある特定の文献では、同じドメインがＣ−ＥＲＭ関連ドメイン（Ｃ−ＥＲＭＡＤ）としても知られており、このＣ−ＥＲＭ関連ドメインは本明細書での定義に含まれる（Ｂｒｅｔｓｃｈｅｒ他（１９９５））。Ｃ末端ドメインの最後の３４個のアミノ酸残基はＥＲＭタンパク質の間で高度に保存されており、Ｆ−アクチンへの結合用の領域を形成する。具体的には、「モエシンのＣ末端セグメント」という用語は、ヒトモエシンタンパク質の最後の約１０７個のアミノ酸残基内のアミノ酸配列の少なくとも１０個、１５個、２０個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個、５０個、５５個、６０個、６５個、７０個、７５個、８０個、８５個、９０個、９５個または１００個の連続したアミノ酸残基を有するポリペプチドを含む。ある特定の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントは、配列番号３に記載のヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７からなる。好ましくは、モエシンのＣ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の領域からの少なくとも２０個の連続したアミノ酸残基を含む。より好ましくは、Ｃ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７の領域からの少なくとも５０個の連続したアミノ酸残基を含む。
【００３４】
用語「モエシンのＣ末端セグメントのレベル」は本明細書で使用する場合、サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントの量または濃度を意味する。用語「検出」は本明細書で使用する場合、モエシンのＣ末端セグメントの量または濃度を測定するあらゆる方法を意味する。検出方法は半定量的または定量的であることができる。測定を直接的にまたは間接的に行うことができる。直接的な測定は、ペプチド自体から得られるシグナルおよびサンプル中に存在するペプチドの分子の数と直接相関するシグナルの強度に基づくペプチドの量および濃度の測定に関する。そのようなシグナル（本明細書において強度シグナルと呼ばれる場合もある）を、例えばペプチドの具体的な物理的特性または化学的特性の強度値を測定することにより得ることができる。間接的な測定として、二次成分（即ち、ペプチド自体ではないもしくはポリペプチド自体ではない成分）または生物学的読み取りシステム（例えば測定可能な細胞応答、リガンド、標識もしくは酵素反応生成物）から得られるシグナルの測定が挙げられる。
【００３５】
本出願によれば、モエシンのＣ末端セグメントのレベルの検出を、サンプル中のペプチドの量を測定するためのあらゆる適切な手段により達成することができる。ある特定の実施形態では、検出方法として、標識された分子を様々なサンドイッチ、競合またはその他のアッセイフォーマットで利用することができる免疫アッセイ装置および免疫アッセイ方法が挙げられる。前記アッセイは、目的のペプチドの存在または非存在を示すシグナルを生じさせることができる。更に、シグナル強度は、好ましくは、サンプル中に存在する目的のペプチドの量と直接的にまたは間接的に（例えば反比例で）相関することができる。更に適切な方法として、正確な分子量またはＮＭＲスペクトル等の目的のペプチドに特異的な物理的特性または化学的特性の測定が挙げられる。適切な検出方法として、バイオセンサー、イムノアッセイと接続された光学装置、バイオチップ、分析装置、例えば質量分析計、ＮＭＲ分析器またはクロマトグラフィー装置も挙げることができる。更に、適切な検出方法として、マイクロプレートＥＬＩＳＡをベースとする方法、全自動イムノアッセイまたはロボットイムノアッセイ（例えばＥＬＥＣＳＹＳ分析器で使用可能）、ＣＢＡ（酵素コバルト結合アッセイ、例えばＲｏｃｈｅ−Ｈｉｔａｃｈｉ分析器で使用可能）、およびラテックス凝集アッセイ（例えばＲｏｃｈｅ−Ｈｉｔａｃｈｉ分析器で使用可能）を挙げることもできる。ある特定の実施形態では、サンプル中のペプチドから得られる特異的な強度シグナルを測定することにより、目的のペプチドのレベルを検出する。上記に記載したように、そのようなシグナルは、目的のペプチドに特異的な質量スペクトルまたはＮＭＲスペクトルで観測される、目的のペプチドに特異的なｍ／ｚ（質量対電荷の比）変数で観測されるシグナル強度であることができる。
【００３６】
ある特定の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントのレベルが、サンプルと、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬とを接触させることにより検出される。この試薬の結合により、強度シグナルを生成することができる。本出願に係る結合として、共有結合および非共有結合の両方が挙げられる。本出願に係るモエシンのＣ末端セグメントに結合する試薬は、あらゆる化合物であることができ、例えば、本明細書に記載のモエシンのＣ末端セグメントに結合するペプチド、ポリペプチド、核酸または小分子であることができる。ある特定の実施形態では、結合する試薬として、抗体、核酸、ペプチドまたはポリペプチド（例えば、ペプチドの受容体もしくは結合パートナーまたはこのペプチドへの結合ドメインを含むこれらの断片）、およびアプタマー（例えば核酸アプタマーもしくはペプチドアプタマー）が挙げられる。そのような試薬を調製する方法は当業界公知である。例えば、適切な抗体またはアプタマーの同定および製造も商業用供給業者により提供される。当業者は、そのような試薬の親和性または特異性がより高い誘導体を開発する方法に精通している。例えば、ランダム変異を核酸、ペプチドまたはポリペプチドに導入することができる。次いで、この誘導体を、当業界公知のスクリーニング手順（例えばファージディスプレイ）に従って、結合に関して試験することができる。
【００３７】
本出願に係る特異的結合とは、試薬が、分析するサンプル中に存在する別のペプチド、ポリペプチドまたは物質と実質的に結合（「交差反応」）すべきではないことを意味する。好ましくは、特異的に結合するペプチドまたはポリペプチドは、あらゆるその他の関連するペプチドまたはポリペプチドと比べて少なくとも３倍高い親和性で結合すべきであり、より好ましくは少なくとも１０倍高い親和性で結合すべきであり、更により好ましくは少なくとも５０倍高い親和性で結合すべきである。例えばウェスタンブロット上でのサイズに従って、またはサンプル中に比較的豊富に存在することによって、非特異的結合を依然として識別することができるおよび明白に測定することができる場合には、非特異的結合を許容することができる。試薬の結合を、当業界公知のあらゆる方法により測定することができる。好ましくは、前記方法は半定量的または定量的である。適切な方法として下記が挙げられる。（１）試薬の結合を例えばＮＭＲまたは表面プラズモン共鳴により直接的に測定することができる：（２）試薬が目的のペプチドの酵素活性の基質としての役割も果たす場合、酵素反応生成物を測定することができる（例えば、切断された基質の量を例えばウェスタンブロットで測定することにより、プロテアーゼの量を測定することができる）。あるいは、試薬が酵素特性自体を示すことができ、ペプチドが結合した試薬を、強度シグナルの生成により検出を可能にする適切な基質と接触させることができる。酵素反応生成物を測定するために、好ましくは、基質の量を飽和状態にする。反応前に、検出可能な標識で基質を標識することもできる。好ましくは、サンプルを十分な期間にわたり基質と接触させる。十分な期間とは、検出可能な（好ましくは測定可能な）量の生成物を生成するのに必要な時間を意味する。生成物の量の測定の代わりに、所与の（例えば検出可能な）量の生成物の出現に必要な時間を測定することができる。（３）試薬を、試薬の検出および測定を可能にする標識に共有的にまたは非共有的に連結させることができる。標識を直接的なまたは間接的な方法で行うことができる。直接的な標識として、標識の試薬への直接的な（共有的なまたは非共有的な）連結が挙げられる。間接的な標識として、二次試薬の一次試薬への（共有的なまたは非共有的な）結合が挙げられる。この二次試薬は一次試薬に特異的に結合すべきである。前記二次試薬を、適切な標識と連結させることができる、および／または、この二次試薬は、この二次試薬に結合する三次試薬の標的（受容体）であることができる。二次試薬、三次試薬またはより高次の試薬を使用してシグナル強度を高めることが多い。適切な二次試薬およびより高次の試薬として、抗体、二次抗体および公知のストレプトアビジン−ビオチンシステム（Ｖｅｃｔｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．）を挙げることができる。試薬または基質に、当業界公知であるように、１種または複数種の「タグを付与する」こともできる。更に、そのようなタグは、より高次の試薬の標的であることができる。適切なタグとして、ビオチン、ジゴキシゲニン、Ｈｉｓ−Ｔａｇ、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ、ＦＬＡＧ、ＧＦＰ、ｍｙｃタグ、イ���フルエンザＡウイルスヘムアグルチニン（ＨＡ）、マルトース結合タンパク質等が挙げられる。ペプチドまたはポリペプチドの場合、タグは好ましくはＮ末端および／またはＣ末端に存在する。
【００３８】
適切な標識とは、適切な検出法で検出可能なあらゆる標識のことである。典型的な標識として、金粒子、ラテックスビーズ、アクリダンエステル（ａｃｒｉｄａｎ  ｅｓｔｅｒ）、ルミノール、ルテニウム、酵素的に活性な標識、放射性標識、磁気標識（常磁性標識および超常磁性標識等の例えば「磁気ビーズ」）ならびに蛍光標識が挙げられる。酵素的に活性な標識として、例えば西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼおよびこれらの誘導体が挙げられる。検出に適した基質として、ジ−アミノ−ベンジジン（ＤＡＢ）、３，３’−５，５’−テトラメチルベンジジン、ＮＢＴ−ＢＣＩＰ（４−ニトロブルーテトラゾリウムクロリドおよび５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−ホスフェート、Ｒｏｃｈｅ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓから既製ストック溶液として入手可能）、ＣＤＰ−Ｓｔａｒ（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）、ＥＣＦ（Ａｍｅｒｓｈａｍ  Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ）が挙げられる。適切な酵素−基質の組合せにより、有色反応生成物、蛍光または化学発光を生じさせることができ、これらを（例えば感光フィルムまたは適切なカメラシステムを使用して）当業界公知の方法に従って測定することができる。酵素反応の測定に関しては、上記の基準を同様に適用する。
【００３９】
典型的な蛍光標識として、蛍光タンパク質（例えばＧＦＰおよびこの誘導体）、Ｃｙ３、Ｃｙ５、テキサスレッド、フルオレセインおよびＡｌｅｘａ色素（例えばＡｌｅｘａ  ５６８）が挙げられる。更なる蛍光標識が例えばＭｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｐｒｏｂｅｓ（オレゴン州）から入手可能である。また、蛍光標識としての量子ドットの使用も考慮される。典型的な放射性標識として、３５Ｓ、１２５Ｉ、３２Ｐ、３３Ｐ等が挙げられる。放射性標識を、既知のおよび適切なあらゆる方法（例えば感光フィルムまたは蛍光体撮像装置）で検出することができる。本出願に係る適切な測定法として、沈降（特に免疫沈降）、電気化学発光（電気的に生成される化学発光）、ＲＩＡ（ラジオイムノアッセイ）、ＥＬＩＳＡ（酵素結合免疫吸着アッセイ）、サンドイッチ酵素免疫試験、電気化学発光サンドイッチ免疫アッセイ（ＥＣＬＩＡ）、解離増強ランタニド蛍光免疫アッセイ（ＤＥＬＦＩＡ）、シンチレーション近接アッセイ（ＳＰＡ）、濁度測定、比濁分析、ラテックス増強濁度測定もしくは比濁分析、または固相免疫試験も挙げられる。当業界公知の更なる方法（例えば、ゲル電気泳動、２Ｄゲル電気泳動、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル電気泳動（ＳＤＳ−ＰＡＧＥ）、ウェスタンブロッティングおよび質量分析）を、単独でまたは上記の標識もしくはその他の検出法と組み合わせて使用することができる。
【００４０】
ある特定の好ましい実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬は、抗体または抗体断片である。本明細書で言及される抗体として、ポリクローナル抗体およびモノクローナル抗体の両方、多価抗体、多特異性抗体（例えば二重特異性抗体）ならびにこれらの断片、例えば単鎖抗体、抗原またはハプテンに結合可能であるＦｖ断片、Ｆａｂ断片およびＦ（ａｂ）２断片が挙げられる。
【００４１】
ある特定の実施形態では、抗体は好ましくはモノクローナル抗体である。モノクローナル抗体は特異性が高く、単一種の抗原を対象とする。ある特定の実施形態では、モノクローナル抗体として、標的結合性ポリペプチド配列を含む抗体であって、この標的結合性ポリペプチド配列が、複数種のポリペプチド配列からの単一標的結合性ポリペプチド配列の選択を含むプロセスにより得られた、抗体が典型的には挙げられる。例えば、この選択プロセスは、複数種のクローン（例えばハイブリドーマクローン、ファージクローンまたは組換えＤＮＡクローンのプール）からの特有のクローンの選択であることができる。選択された標的結合性配列を、例えば標的への親和性を改善する、標的結合性配列をヒト化する、細胞培養での産生を改善する、ｉｎ  ｖｉｖｏでの免疫原性を低減する、多重特異性抗体を生成する等のために、更に改変することができ、改変された標的結合性配列を含む抗体も本発明のモノクローナル抗体であることを理解すべきである。目的の抗体が結合する抗原上のエピトープに結合する抗体をスクリーニングするために、Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ａ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ  Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ  Ｓｐｒｉｎｇ  Ｈａｒｂｏｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ、ＨａｒｌｏｗおよびＤａｖｉｄ  Ｌａｎｅ編（１９８８）に記載されているアッセイ等の所定の交差ブロッキングアッセイを実施することができる。
【００４２】
ある特定の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントのレベルは、下記のように検出することができる：（ａ）上記に詳述したモエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬を含む固体支持体と、モエシンのＣ末端セグメントを含むサンプルとを接触させる、および（ｂ）この支持体に結合しているモエシンのＣ末端セグメントの量を測定する。核酸、ペプチド、ポリペプチド、抗体およびアプタマーからなる群から好ましくは選択される試薬は、好ましくは、固定化された状態で固体キャリア上に存在する。試薬を多種多様なキャリアに結合させることができる。公知のキャリアの例として、ガラス、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリプロピレン、ポリエチレン、ポリカーボネート、デキストラン、ナイロン、アミロース、天然セルロースおよび改質セルロース、ポリアクリルアミド、アガロースおよび磁鉄鉱が挙げられる。キャリアの性質は、本発明の目的のために可溶性または不溶性であることができる。前記試薬をキャリアに取り付ける／固定するのに適した方法は公知であり、この方法として、イオン性相互作用、疎水性相互作用、共有結合性相互作用等が挙げられるがこれらに限定されない。本出願に係るアレイとして「懸濁液アレイ」を使用することも考慮される（Ｎｏｌａｎ  ２００２、Ｔｒｅｎｄｓ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２０（１）：９〜１２）。そのような懸濁液アレイでは、キャリア（例えばマイクロビーズまたはマイクロスフェア）は懸濁状態で存在する。このアレイは、様々な試薬を保有する様々なマイクロビーズまたはマイクロスフェア（これらは標識された可能性がある）からなる。例えば固相化学および感光性保護基に基づいてそのようなアレイを生成する方法が一般に知られている（米国特許第５，７４４，３０５号）。
【００４３】
ある特定の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントのレベルは、本出願で定義したように対象から得た血液サンプルで検出される。好ましくは、そのような検出をＥＬＩＳＡで行う。
【００４４】
ある特定の実施形態では、対象の生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは、参照サンプルから検出したモエシンのＣ末端セグメントの参照レベルと比較される。
【００４５】
用語「比較する」は本明細書で使用する場合、分析する生体サンプルに含まれるモエシンのＣ末端セグメントのレベルと適切な参照サンプルのレベルとを比較することを包含する。この用語は本明細書で使用する場合、対応するパラメーターまたは値の比較を意味しており、例えば、絶対量を絶対参照量と比較する、濃度を参照濃度と比較する、または試験サンプルから得た強度シグナルを参照サンプルの同じタイプの強度シグナルと比較することが理解されるものとする。比較を手動でまたはコンピュータを使用して実行することができる。コンピュータを使用して比較する場合、コンピュータプログラムにより、測定した量の値と、データベースに保存されている適切な参照に対応する値とを比較することができる。このコンピュータプログラムにより、比較の結果を更に評価することができ、所望の評価が適切な出力フォーマットで自動的に提供される。検出したモエシンのＣ末端セグメントのレベルと適切な参照レベルとの比較に基づいて、前記対象におけるがんの評価が可能である。
【００４６】
したがって、用語「参照レベル」は本明細書で使用する場合、対象におけるがんの存在または発症の確定または除外を可能にする閾値レベルを意味する。例えば、サンプルのモエシンのＣ末端セグメントのレベルが参照レベルと比べて高い場合、このサンプルは、がんを発症しているまたはがんを発症する可能性が高いと見なされ得る。モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルは１種または複数種の参照サンプルに由来することができ、この参照レベルは、目的のサンプルを試験するための実験と同時に行われる実験から得られる。あるいは、参照レベルをデータベースで得ることができ、このデータベースには、データ、基準または１種もしくは複数種のサンプルもしくは疾患参照サンプルからのレベルが収集されている。ある特定の実施形態では、データ、基準またはレベルのそのような収集物を、これらを１種または複数種のサンプルからのデータとの比較を目的として使用することができるように正規化する。「正規化する」または「正規化」とは、測定の生データが、その他のそのように正規化されたデータと直接比較することができるデータに変換されるプロセスのことである。正規化を使用することにより、アッセイ毎に変動し得る因子によって引き起こされるアッセイに特異的な誤差（例えば、負荷される量、結合効率、検出感度およびその他の様々な誤差の変動）が克服される。ある特定の実施形態では、参照データベースは、１種または複数種の参照サンプル由来のモエシンのＣ末端セグメントの濃度ならびに／またはその他の実験室データおよび臨床データを含む。ある特定の実施形態では、参照データベースは、参照サンプルと同じ条件下で試験した対照サンプルのモエシンのＣ末端セグメントのレベル（例えば、モエシンのＣ末端セグメントの既知の量）の割合として各々正規化されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルを含む。モエシンのＣ末端セグメントのそのように正規化されたレベルと比較するために、試験サンプルのモエシンのＣ末端セグメントのレベルも測定し、試験サンプルと同じ条件下で試験した対照サンプルのモエシンのＣ末端セグメントのレベルの割合として算出する。ある特定の実施形態では、健康な対象および／または腫瘍を有さない対象（即ち、がんを有さないことが分かっている対象）から得られた参照サンプルからの参照レベルデータをコンパイルすることにより、参照データベースを確立する。ある特定の実施形態では、がんの処置下の個体由来の参照サンプルのからの参照レベルデータをコンパイルすることにより、参照データベースを確立する。ある特定の実施形態では、例えばモエシンのＣ末端セグメントの様々なレベルにより証明されたがんの様々なステージでの個体由来の参照サンプルからのデータをコンパイルすることにより、参照データベースを確立する。
【００４７】
当業者は、所望の感度および特異性に従って参照レベルを選択することができる。適切な参照レベルを決定する手段は当業者に既知であり、例えば、参照レベルを、臨床研究に従って受信者曲線（Ｒｅｃｅｉｖｅｒ−Ｏｐｅｒａｔｏｒ−Ｃｕｒｖｅ）（ＲＯＣ）から決定することができる。
【００４８】
一部の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルと比べて、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルが高いことは、対象ががんを発症していること示す、または対象ががんを発症する可能性が高いことを示す。好ましくは、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも２倍である。より好ましくは、生体サンプルで検出されたモエシンのＣ末端セグメントのレベルは、モエシンのＣ末端セグメントの参照レベルの少なくとも５倍である。
【００４９】
本出願において「可能性が高い」とは本明細書で使用する場合、参照サンプルが得られる対象と比較して、対象ががんを発症する見込みのレベルで５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％またはより高い全体的な増加を意味する。
【００５０】
用語「がん」は本明細書で使用する場合、無秩序の細胞増殖を伴う広範囲のグループの疾患を意味する。がんの例として、急性リンパ性白血病、急性骨髄性白血病、副腎皮質癌、肛門がん、虫垂がん、星状細胞腫、基底細胞癌、胆管がん、膀胱がん、骨肉腫、脳幹神経膠腫、脳がん、小脳星状細胞腫、上衣腫、髄芽腫、乳がん、気管支腺腫、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、消化管カルチノイド腫瘍、子宮頸がん、慢性気管支炎、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、慢性骨髄増殖性疾患、慢性閉塞性肺疾患、結腸がん、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、肺気腫、子宮内膜がん、上衣腫、ユーイング肉腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管がん、網膜芽細胞腫、胆嚢がん、胃がん（ｇａｓｔｒｉｃ  ｃａｎｃｅｒ）、神経膠腫、ヘアリーセル白血病、頭頸部がん、心臓がん、肝がん、ホジキンリンパ腫、下咽頭がん、眼球内黒色腫、島細胞癌、カポジ肉腫、腎がん、喉頭がん、白血病、肺がん、黒色腫、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫、卵巣がん、膵がん、副甲状腺がん、陰茎がん、形質細胞性白血病、胸膜肺芽腫、前立腺がん、直腸がん、腎細胞がん、網膜芽細胞腫、軟部肉腫、子宮肉腫、皮膚がん、扁平上皮細胞癌、胃がん（ｓｔｏｍａｃｈ  ｃａｎｃｅｒ）、咽頭がん、甲状腺がん、子宮がん、膣がん、外陰がんが挙げられるがこれらに限定されない。
【００５１】
バイオマーカーおよびキット
本出願の別の態様は、モエシンのＣ末端セグメントはＣ末端セグメントの一部から本質的になる、がんを評価するためのバイオマーカーを提供する。
【００５２】
本明細書で使用する場合、「バイオマーカー」は、対象中での正常なプロセスもしくは異常なプロセスまたは対象の疾患もしくはその他の状態の徴候を示すまたはこの徴候である標的分子を意味する。バイオマーカーは通常、実験室アッセイおよび医用撮像等の様々な方法により検出可能および測定可能である。
【００５３】
ある特定の実施形態では、本出願のバイオマーカーは、モエシンのＣ末端セグメントの少なくとも２０個の連続したアミノ酸残基を含む。ある特定の実施形態では、本出願のバイオマーカーは、モエシンのＣ末端セグメントの少なくとも５０個の連続したアミノ酸残基を含む。ある特定の実施形態では、モエシンのＣ末端セグメントは、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７からなる。
【００５４】
別の態様では、本出願は、対象におけるがんの存在または発症を評価するためのバイオマーカーとしてのモエシンのＣ末端セグメントの使用を提供する。
【００５５】
別の態様では、本出願は、対象におけるがんの存在または発症を評価するための検出剤を製造するための、モエシンのＣ末端セグメントの使用に関する。
【００５６】
別の態様では、本出願は、対象におけるがんを評価するためのキットであって、サンプル中に存在するモエシンのＣ末端セグメントのレベルを検出するための手段を含むキットを提供する。このキットは、サンプル中に存在するモエシンのＣ末端セグメントのレベルの検出に適したあらゆる手段を使用することができる。ある特定の実施形態では、このキットは、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する試薬を含む。用語「試薬」および「特異的に結合する」は本出願において上記で開示されている。好ましい実施形態では、この試薬は抗体である。
【００５７】
ある特定の実施形態では、このキットは、本出願で定義したように対象におけるがんの評価に関して任意の測定結果を解釈するためのユーザーズマニュアルを更に含むことができる。具体的には、そのようなマニュアルは、測定したレベルがどのような種類の評価に対応するかについての情報を含むことができる。更に、そのようなユーザーズマニュアルは、モエシンのＣ末端セグメントのレベルを検出するためのキットの構成要素の正確な使用に関する指示を提供することができる。ある特定の実施形態では、検出手段およびキットの指示マニュアルを単一の容器内に設けることができる。
【００５８】
がんを処置する方法
本出願の別の態様は、対象におけるがんを治療するための方法に関する。この方法は、モエシンのＣ末端セグメントの機能を特異的に調節する試薬と、薬学的に許容される添加剤とを含む医薬組成物を対象に投与することを含む。
【００５９】
用語「処置する」とは本明細書で使用する場合、処置される対象の疾患または状態の自然経過を変更しようとする臨床的介入を意味しており、臨床病理の予防のためにまたは臨床病理の経過中に実施され得る。処置の望ましい効果として、疾患または状態の発症または再発の予防、症状の軽減、疾患または状態のあらゆる直接的なまたは間接的な病理学的帰結の縮小、疾患または状態の進行速度の低下、病状の改善または緩和、および寛解または予後の改善が挙げられる。
【００６０】
用語「調節する」とは本明細書で使用する場合、モエシンのＣ末端セグメントの機能をコントロールすることおよび制御することを意味する。例えば、試薬は、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合して、その他の分子との相互作用からＣ末端セグメントを隔離することができる。別の例では、試薬は、Ｃ末端セグメントと、このＣ末端セグメントの相互作用パートナー（例えば、通常はモエシンのＣ末端尾部ドメインが結合する接着分子）との結合に関して競合することができる。別の例では、試薬は、Ｃ末端セグメントの特性が変更されるようにＣ末端セグメントを修飾（例えばリン酸化）することができる。更に別の例では、試薬は、モエシンのＣ末端セグメントを分解して対象から除去することができる。
【００６１】
ある特定の実施形態では、試薬は、モエシンのＣ末端セグメントに特異的に結合する。好ましい実施形態では、この試薬は抗体である。より好ましくは、この試薬はモノクローナル抗体またはその断片である。ある特定の実施形態では、この試薬は、所望の抗原特異性を示す非ヒトドナー抗体のアミノ酸配列がヒトアクセプター抗体の配列と結合しているヒト化ハイブリッド抗体である。ドナー配列は通常、少なくともドナーの抗原結合性アミノ酸残基を含むが、ドナー抗体のその他の構造的におよび／または機能的に関連したアミノ酸残基を更に含んでもよい。そのようなハイブリッドを、当業界公知のいくつかの方法により調製することができる。
【００６２】
ある特定の実施形態では、この試薬は、接着分子、細胞膜、またはモエシンのＣ末端ドメインが通常結合するその他の細胞成分もしくは分子成分への結合に関して、モエシンのＣ末端セグメントを競合することができる。好ましい実施形態では、この試薬は、モエシンのＣ末端セグメントまたはそのバリアントから本質的になる単離ペプチドである。
【００６３】
用語「単離」は本明細書で使用する場合、下記のペプチドまたはヌクレオチドを意味する：１）天然では通常伴うもしくは相互作用する成分を実質的に含まない、または２）天然培地で見られる場合、人間の介入により改変されているおよび／もしくは元々は有さない細胞に導入されている。
【００６４】
用語「バリアント」は本明細書で使用する場合、同一の生理学的効果、代謝効果もしくは免疫学的効果を有するまたは目的のペプチド（もしくはヌクレオチド）と同じように使用される、目的のペプチド（またはヌクレオチド）と実質的に相同なペプチド（またはヌクレオチド）を意味する。ペプチドバリアントとして、翻訳後の改変により生じるペプチドも挙げられ、この改変として、目的のペプチドのグリコシル化、リン酸化またはメチル化が挙げられるがこれらに限定されない。
【００６５】
本明細書で使用する場合、ペプチド（またはヌクレオチド）バリアントは、ペプチドバリアントのアミノ酸（またはヌクレオチドバリアントの核酸）の配列が目的のペプチド（またはヌクレオチド）のアミノ酸（または核酸）の配列と少なくとも７０％同一である場合に、目的のペプチド（またはヌクレオチド）と「実質的に相同」である。ある特定の実施形態では、そのような配列同一性は少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％または少なくとも９９％である。
【００６６】
ペプチド配列またはヌクレオチド配列に関する用語「同一性」は、必要に応じて、配列同一性の割合最大化を達成するための、および配列同一性の一部としての保存的な置換を全く考慮しない、配列のアラインメントおよびギャップの導入の後での、目的のペプチド中のまたはヌクレオチド中のアミノ酸残基または核酸残基と同一であるバリアント配列中のアミノ酸残基または核酸残基の割合として定義される。配列同一性の割合を決定するためのアラインメントを当業界の技術範囲内である様々な方法で達成することができ、例えば、ＢＬＡＳＴソフトウェア、ＢＬＡＳＴ−２ソフトウェア、ＡＬＩＧＮソフトウェアまたはＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア等の公的に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用して達成することができる。当業者は、比較される完全長の配列全体にわたり最大のアラインメントを達成するのに必要なあらゆるアルゴリズム等の、アラインメントを測定するのに適したパラメーターを決定することができる。
【００６７】
ある特定の実施形態では、試薬は、配列番号３のアミノ酸配列との少なくとも７０％のアミノ酸配列同一性を有するモエシンのＣ末端セグメントのバリアントである。ある特定の実施形態では、試薬は、配列番号３のアミノ酸配列との少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％または少なくとも９９％のアミノ酸配列同一性を有するモエシンのＣ末端セグメントのバリアントである。
【００６８】
用語「添加剤」は本明細書で使用する場合、剤形の調製を容易にするためにまたは活性成分の放出を適応させるために含まれる、化学的におよび薬学的に不活性の成分を意味する。添加剤として、結合剤、崩壊剤、賦形剤（または希釈剤）、流動促進剤、潤滑剤、香料、甘味料および色素が挙げられるがこれらに限定されない。添加剤は、製剤のその他の成分に適合するおよびこの製剤の受容者に過度に有害ではいという意味で薬学的に許容され、活性剤のあらゆる望ましくない副作用も軽減することもできる。Ｗａｎｇら、Ｊ．Ｐａｒｅｎｔ．Ｄｒｕｇ  Ａｓｓｎ．，３４（６）：４５２〜４６２（１９８０）（参照により本明細書に援用される）を参照されたい。本発明に係る組成物での使用に適した例示的な医薬品添加剤が、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ＆Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙｍ、第２１版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ  Ｗｉｌｌｉａｍｓ＆Ｗｉｌｋｉｎｓ（２００６）、Ｐｈｙｓｉｃｉａｎ’ｓ  Ｄｅｓｋ  Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ、第６４版、Ｔｈｏｍｓｏｎ  ＰＤＲ（２０１０）、およびＨａｎｄｂｏｏｋ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｅｘｃｉｐｉｅｎｔｓ、第６版、Ｒａｙｍｏｎｄ  Ｃ．Ｒｏｗｅら編、Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ  Ｐｒｅｓｓ（２００９）に列挙されており、これらは参照により本明細書に援用される。
【００６９】
「有効量」は、所望の治療結果または予防結果を達成するのに（必要な投与量でおよび必要な期間にわたり）有効な量を意味する。本出願の試薬の有効量は、対象の病状、年齢、性別および体重ならびに試薬の対象中で所望の応答を誘発する能力等の因子に従って変動し得る。有効量はまた、試薬の毒性または悪影響を治療上有益な効果が上回る量である。有効量および投与の適切な投与量または投与経路の決定法は当業者に公知である。
【００７０】
別の態様では、本出願は、対象におけるがんを治療するための薬剤を製造するためのモエシンのＣ末端セグメントまたはそのバリアントの使用に関する。
【００７１】
別の態様では、本出願は、ヒトモエシンのアミノ酸残基４７１〜５７７をコードする単離ヌクレオチド配列またはそのバリアントに関する。
【００７２】
下記の実施例は、本出願を説明するために提示されている。下記の実施例は、いかなる形でも限定することを意図していない。
【実施例１】
【００７３】
モエシンのＣ末端セグメントまたはモエシンのＮ末端セグメントに結合するモノクローナル抗体の調製
モエシンのＣ末端セグメントに対するモノクローナル抗体を、従来のハイブリドーマ法を使用して調製することができる。配列番号３の配列を有するモエシンのＣ末端セグメントを生成するために、ＰＣＲを使用して、図３に示す配列番号３に記載のＣ末端セグメントに対応するｃＤＮＡ断片を増幅させる。
【００７４】
ＰＣＲで増幅させたＣ末端セグメントモエシンＤＮＡ断片を、ｐＥＴ３２ａ（＋）およびｐＥＴ２８ａ（＋）から選択される発現ベクター中にクローニングする。次いで、構築したベクターを使用して、培養および発現のための大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）宿主細胞株ＢＬ２１（ＤＥ３）を形質転換させる。Ｃ末端ドメイン用に構築した発現系を制限酵素消化とその後のシークエンシングとにより検証して、Ｃ末端セグメントの発現用の正しいリーディングフレームを確認する。
【００７５】
十分な培養後に、Ｃ末端セグメントが発現されている宿主細胞を回収し、標準的なタンパク質の発現および精製プロトコルに従ってＣ末端セグメントを集めて精製する。得られたタンパク質断片をＳＤＳ−ＰＡＧＥでアッセイし、このタンパク質断片の同一性および純度を確認する。
【００７６】
次いで、発現されたＣ末端セグメントを使用して、ＢＡＬＢ／Ｃマウスを使用する従来のハイブリドーマ法に従って、モエシンのＣ末端セグメントに対するモノクローナル抗体を作る。
【００７７】
ハイブリドーマ法はＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ、Ｎａｔｕｒｅ、２５６：４９５（１９７５）により初めて説明されており、この文献はその全体が参照により本出願に援用される。典型的なハイブリドーマ法では、マウス（例えばＢＡＬＢ／Ｃマウス）を抗原（例えば、上記に記載した、発現されたモエシンのＣ末端セグメント）で免疫付与し、次いで、この免疫付与したマウスからの脾細胞を骨髄腫細胞と融合させる。この融合細胞を、ハイブリドーマの増殖を選択的に可能にする培地中で回収し、生存可能なハイブリドーマコロニーを生じさせる。十分な時間後に、上清を、ＥＬＩＳＡ検定、および抗原（例えばＣ末端セグメント）を使用する免疫組織化学アッセイでスクリーニングする。陽性細胞を、更なるサブクローニングのために選択する。選択したクローンを限界希釈によりサブクローニングする。全てのクローンがＥＬＩＳＡ陽性となるまでサブクローニングを実施する。次いで、陽性クローンを選択して、抗原に対してモノクローナル抗体を生成するハイブリドーマを得る。
【００７８】
モエシンタンパク質のＮ末端セグメントに対する抗体を同様の方法で調製する。抗体の調製に使用するモエシンのＮ末端セグメントは、本明細書に記載の配列番号２のアミノ酸残基１〜２９７としてのアミノ酸配列を有しており、上記に記載したように遺伝子操作法を使用して調製され得る。
【００７９】
完全長のまたはセグメントのモエシンタンパク質に対する抗体も市販されている。
【実施例２】
【００８０】
がんの患者の血清でのモエシンタンパク質の特異的セグメントの検出
様々ながんの患者から血清サンプルまたは血漿サンプルを採取し、化学発光酵素免疫アッセイを使用して、Ｎ末端セグメント（アミノ酸残基１〜２９７）およびＣ末端セグメント（アミノ酸残基４７１〜５７７）等のヒトモエシンの特異的セグメントの存在に関して試験した。簡潔に言うと、セグメントに特異的に結合する抗体をコーティングしたプレートへの結合を競合させるために、ビオチン標識Ｎ末端セグメントまたはビオチン標識Ｃ末端モエシンセグメントでサンプルを希釈した。次いで、酵素（西洋ワサビペルオキシダーゼ）標識ストレプトアビジンを添加してビオチンに結合させた。洗浄後、発光シグナルを発現させて、プレートに結合した酵素標識ストレプトアビジンを測定した。この発光シグナルは、サンプル中のＮ末端セグメントまたはＣ末端セグメントの濃度に反比例していた。
【００８１】
材料および方法
最初に、天然状態で抗体を保存することができる条件下で、ポリスチレンマイクロウェルプレートのウェルに、モエシンタンパク質のＮ末端セグメントまたはＣ末端セグメントに対する高純度の抗体をコーティングした。具体的には、ＥＬＩＳＡプレート（ＬＵＭＩＴＲＡＣ（商標）６００  ９６−ウェルの白色の免疫プレート、Ｇｒｅｉｎｅｒ  ６５５０７４）の各マイクロウェルを、１２〜１６時間にわたり２℃〜８℃にて、モエシンのＮ末端セグメントまたはＣ末端セグメントに対する抗体  約１００ｎｇと共にインキュベートした。次いで、このプレートをＰＢＳで１回洗浄した後、保存して後に使用するために、ブロッキング溶液でブロックして真空乾燥した。
【００８２】
サンプル中におけるＮ末端モエシンセグメントの存在を測定するために、転移性肉腫を有すると臨床的に診断された患者または転移性肉腫を有さないと診療的に診断された患者から血清サンプルまたは血漿サンプルを採取して調製した。健康な個体からも対照としてサンプルを採取した。ＥＺ−Ｌｉｎｋ（商標）ＮＨＳ−ＰＥＧ４−Ｂｉｏｔｉｎｙｌａｔｉｏｎ  Ｋｉｔ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、製品番号２１４５５）で調製したビオチン標識Ｎ末端モエシンセグメント２０ｎｇ／ｍｌを含むＰＢＳ−Ｔ緩衝液（０．０５％（ｖ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ−２０）を使用して、サンプルを希釈した。次いで、希釈したサンプル１００μｌを各ウェルに添加し、サンプル中に存在するビオチン標識Ｎ末端モエシンセグメントまたはあらゆるＮ末端モエシンセグメントを、各ウェル中で固定化された抗体に結合させた。ＰＢＳ−Ｔ緩衝液を使用して、未結合の（ビオチン標識されているまたは未標識の）Ｎ末端モエシンセグメントを洗い流した。次いで、ストレプトアビジン−ＨＲＰ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ  Ｌｉｆｅ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、ＳＡ１００−０１）を各ウェルに添加して、マイクロウェルに付着しているビオチン標識Ｎ末端モエシンセグメントに結合させた。あらゆる未結合のストレプトアビジンＨＲＰを洗い流した後、化学発光基質（ＳｕｐｅｒＳｉｇｎａｌ  ＥＬＩＳＡ  Ｆｅｍｔｏ  Ｍａｘｉｍｕｍ  Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ  Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ、Ｐｉｅｒｃｅ  ３７０７４）を添加し、ルミノメーター（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ  Ｌｕｍｉｎｏｓｋａｎ  Ａｓｃｅｎｔ）により発光シグナルを検出して測定した。
【００８３】
上記と同様の方法を使用して、Ｃ末端モエシンセグメントの存在を測定した。
【００８４】
発明者らはまた、サンドイッチＥＬＩＳＡ法も使用して、サンプル中での完全長のモエシンタンパク質の存在を確認した。簡潔に言うと、Ｎ末端モエシンセグメントに対する抗体がコーティングされたプレートを、上記に記載したように調製した。次いで、ビオチン標識Ｎ末端モエシンセグメントを混合することなく、サンプルをプレートに添加した。未結合のタンパク質を洗浄した後、Ｃ末端モエシンタンパク質に対する抗体を各マイクロウェルに添加して、完全長のモエシンタンパク質の存在を検出した。
【００８５】
統計的分析のために、スチューデントのｔ検定（両側）を用いて、様々な群間のＮ末端モエシンセグメントまたはＣ末端モエシンセグメントの濃度の差異を評価した。この差異は、ｐ＜０．０５である場合に統計的に有意であった。
【００８６】
結果
図４および表１に示すように、がんの患者からのサンプルは、健康な個体と比べて有意に高い濃度のＣ末端モエシンセグメントを含んでいた（ｐ＜０．０１）。これに対して、がんの患者でのＮ末端モエシンセグメントの濃度は健康な個体と比べて統計的に有意に高くはなかった（ｐ＝０．１７）。これらのサンプルでは、完全長のモエシンタンパク質を検出しなかった。
【００８７】
表２に示すように、Ｃ末端モエシンセグメントをがん患者からの７０．８％のサンプルで検出したが、健康な個体からは１２．５％のサンプルでのみ検出した。対照的に、Ｎ末端モエシンセグメントをがん患者からの８７．５％のサンプルで検出し、健康な個体からの７５％のサンプルで検出した。
【００８８】
したがって、Ｃ末端モエシンセグメントの存在を、がんのバイオマーカーとして使用することができる。
【００８９】
【表１】
0006609570.tif 000002
【００９０】
【表２】
0006609570.tif 000003
【００９１】
具体的な実施形態（この内の一部は好ましい実施形態である）を参照して本発明を具体的に示して説明したが、本明細書で開示した本出願の趣旨および範囲から逸脱することなく、形態および詳細の様々な変更を行うことができることを当業者は理解していると予想される。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【配列表】
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