(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
被験者における血管病変の評価方法であって、
前記被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、および
前記バイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、
前記バイオマーカー発現レベルが、前記基準値以下の場合は血管病変を有しない指標であるとし、前記基準値を超える場合は血管病変を有する指標であるとし、前記基準値は健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルであり、
前記血管病変が、血管肉腫であり、
前記バイオマーカーが、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択される、血管病変の評価方法。
【請求項２】
被験者における血管病変の評価方法であって、
前記被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、および
前記バイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、
治療的処置後の前記被験者から分離した生体試料中の前記バイオマーカー発現レベルが、前記基準値未満のときは血管病変を有しない指標であるとし、前記基準値以上のときは血管病変を有する指標であるとし、前記基準値は当該治療的処置前における同一被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルであり、
前記血管病変が、血管肉腫であり、
前記バイオマーカーが、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択される、血管病変の評価方法。
【請求項３】
前記バイオマーカーとして、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルを測定する、請求項１または２に記載の血管病変の評価方法。
【請求項４】
前記発現レベルの測定が、核酸増幅法、マイクロアレイ法、またはノーザンブロット法により行われる、請求項１〜３のいずれか１項に記載の血管病変の評価方法。
【請求項５】
前記生体試料中の内在性コントロール発現レベルを測定すること、および
当該内在性コントロール発現レベルにより補正した前記バイオマーカー発現レベルを前記基準値と比較する、請求項１〜４のいずれか１項に記載の血管病変の評価方法。
【請求項６】
前記生体試料が、血液、血漿、および血清からなる群から選択される、請求項１〜５のいずれか１項に記載の血管病変の評価方法。
【請求項７】
ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６であるバイオマーカーの検出物質を含む、血管肉腫評価用キット。
【請求項８】
前記検出物質が、核酸増幅用プライマー、またはプローブである、請求項７に記載の血管肉腫評価用キット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択されるバイオマーカーを用いた血管病変の評価方法および、当該バイオマーカーの検出物質を含む血管病変評価用キットに関する。
【背景技術】
【０００２】
近年、種々の疾病や障害を迅速かつ簡便に検出する手段として、バイオマーカーの利用開発が行われている。例えば、特許文献１には、卵巣癌を診断する方法として、ｍｉＲ−２１、ｍｉＲ−１４１、ｍｉＲ−２００ａ、ｍｉＲ−２００ｂ、ｍｉＲ−２００ｃ、ｍｉＲ−２０３、ｍｉＲ−２０５及びｍｉＲ−２１４からなる群より選択されるマイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）の量を指標とする発明が開示されている。
【０００３】
一方、血管病変は血管またはリンパ管の限局性のなんらかの病理学的変化、障害または疾患をいい、血管腫（Ｈｅｍａｎｇｉｏｍａ；血管増殖の結果、新生物に類似した腫瘤となったもの）や血管肉腫（Ｈｅｍａｎｇｉｏｓａｒｃｏｍａ；血管由来の未分化細胞からなる悪性新生物）などの良性または悪性の腫瘍や、アテローム性動脈硬化等の動脈硬化が挙げられる。このうち、血管肉腫は、ヒトでは稀ながら、イヌでは癌の５〜７％程度を占める主要な癌として知られている。血管肉腫は予後不良であり、早期発見手段の開発に対して強い要請がある。特許文献２には、ｍｉＲ−５０３、ｍｉＲ−１９３ｂ、ｌｅｔ−７ｅ、ｍｉＲ−４５１、ｍｉＲ−４２３ａ、およびｍｉＲ−５５１ｂからなる群から選択される１又は２つ以上のｍｉＲＮＡの発現量の増加を指標として哺乳動物の血管肉腫を検出する方法が記載されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００４】
【特許文献１】特開２０１０−５３４４８０号公報（国際公開第２００９／０１５３５７号に相当）
【特許文献２】特開２０１４−０８２９５３号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００５】
バイオマーカーを用いることで病理学的変化等を迅速かつ簡便に検出することが期待されるものの、従来のバイオマーカーでは、血管病変の評価において特異性および感度の点において十分でない場合があった。したがって、本発明は、血管肉腫をはじめとする血管病変を、特異的且つ高感度に検出する手段を提供することを課題とする。
【課題を解決するための手段】
【０００６】
本発明者らは、上記の問題を解決すべく、鋭意研究を行った。その結果、血管病変を罹患した患者では、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の少なくとも一方の発現レベルが上昇することを見出した。これにより、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択されるバイオマーカーを用いること、特に、ｍｉＲ−２１４とｍｉＲ−１２６とを組み合わせて用いることにより、特異的且つ高感度に血管病変を検出できることを見出し、本発明の完成に至った。
【発明の効果】
【０００７】
本発明によれば、特異的且つ高感度に血管病変を検出できる。
【図面の簡単な説明】
【０００８】
【図１】図１は、イヌ正常血管内皮細胞（ＣｎＡＯＥＣ細胞）ならびにイヌ血管肉腫由来培養細胞（Ｒｅ１２細胞、およびＵｄ６細胞）を用いて、培地に分泌されたバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルを測定した結果である。
【図２】図２は、健康群、非腫瘍性脾疾患群および血管肉腫罹患群のイヌから回収した血漿中のバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルを測定した結果である。
【図３】図３は、実施例２における試験データを、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６をそれぞれ独立したバイオマーカーとした場合の統計解析結果である。
【図４】図４は、健康群、非腫瘍性脾疾患群および血管肉腫罹患群の各個体におけるｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６の発現レベルを示す。
【図５】図５は、実施例２における試験データを、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６を組み合わせてバイオマーカーとした場合の統計解析結果である。
【図６】図６は、血管肉腫摘出前後における、血漿中のバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルを測定した結果である。
【図７】図７は、ヒト血管内皮細胞（ＨＭＥＣ１細胞）ならびにヒト血管肉腫由来培養細胞（ＩＳＯ−ＨＡＳ細胞、およびＨＡＭＯＮ細胞）を用いて、培地に分泌されたバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルを測定した結果である。
【発明を実施するための形態】
【０００９】
以下、本発明の実施の形態を説明する。なお、本発明は、以下の実施の形態のみには限定されない。
【００１０】
本明細書において、範囲を示す「Ｘ〜Ｙ」は「Ｘ以上Ｙ以下」を意味する。また、特記しない限り、操作および物性等の測定は室温（２０〜２５℃）／相対湿度４０〜５０％の条件で測定する。
【００１１】
本発明の第１の形態は、被験者における血管病変の評価方法であって、前記被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、および前記バイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、前記バイオマーカーが、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択される、血管病変の評価方法に関する。本発明によれば、特異的且つ高感度に血管病変を検出できる。なお、本明細書における「測定」には、定量、半定量および検出のいずれの概念も包含される。さらに、「発現レベルを測定する」ことには、ｍｉＲＮＡを直接的に測定する場合のほか、ＲＴ−ＰＣＲ等によりｍｉＲＮＡを一旦ｃＤＮＡへと変換した後に当該ｃＤＮＡを測定する場合のように、ｍＲＮＡを間接的に測定する場合も包含される。また、「検出物質」には、ｍｉＲＮＡに直接的にハイブリダイズして検出する物質のほか、ＲＴ−ＰＣＲ等によりｍｉＲＮＡを一旦ｃＤＮＡへと変換した後に当該ｃＤＮＡにハイブリダイズして検出する物質の両方を含む。
【００１２】
本発明においては、バイオマーカーとしてｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択されるｍｉＲＮＡ（マイクロＲＮＡ）を用いる。ｍｉＲＮＡは、細胞内在性の、２０〜２５塩基程度の非コードＲＮＡである。ｍｉＲＮＡは、ゲノムＤＮＡ上のｍｉＲＮＡ遺伝子から、まず数百〜数千塩基程度の長さの一次転写物（ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡ）として転写される。次いで、プロセシングを受けて約６０〜７０塩基程度のヘアピン構造を有するｐｒｅ−ｍｉＲＮＡとなる。その後、核から細胞質内に移り、さらにプロセシングを受けて２０〜２５塩基程度の二量体（ガイド鎖およびパッセンジャー鎖）からなる成熟ｍｉＲＮＡとなる。成熟ｍｉＲＮＡは、そのうちのガイド鎖（アンチセンス鎖）がＲＩＳＣ（ＲＮＡ−Ｉｎｄｕｃｅｄ  Ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ  Ｃｏｍｐｌｅｘ）と呼ばれるタンパク質と複合体を形成し、標的遺伝子のｍＲＮＡに作用することで、標的遺伝子の翻訳を阻害する働きをすることが知られている。
【００１３】
ある種の細胞は、タンパク質や核酸等の分子を脂質二重膜構造に内包した小胞を細胞外に分泌することが知られており、これらの小胞はマイクロベシクルやナノベシクル等として知られている。分泌された小胞は他の細胞と融合し、内包するタンパク質や核酸等の分子を当該他の細胞へ伝達する機能を果たしていると考えられている。小胞に内包される分子は細胞の種類によって相違すると考えられている。したがって、腫瘍細胞が分泌する小胞に特異的に内包される分子を指標として、腫瘍検出のためのバイオマーカーとして利用することも検討されている。小胞に内包される分子として、ある種のｍｉＲＮＡが細胞の種類特異的に含まれることも知られている。
【００１４】
一方、本発明者らは、障害を受けた血管内皮細胞（特に、血管内皮腫瘍細胞）が、細胞外へｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６を多く分泌することを見出した。本発明の技術的範囲を制限するものではないが、これは、障害を受けた血管内皮細胞（特に、血管内皮腫瘍細胞）が、他の細胞へのシグナルとしてｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６を利用しており、その伝達手段として分泌する小胞内にこれらの分子が含まれているためではないかと考えられる。なお、本発明で発現レベルの測定対象や検出物質の検出対象とされるｍｉＲＮＡは、ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡ、ｐｒｅ−ｍｉＲＮＡ（ｐｒｉ−ｍｉＲＮＡ、およびｐｒｅ−ｍｉＲＮＡを、「前駆体ｍｉＲＮＡ」とも称する。）および成熟ｍｉＲＮＡのいずれであってもよいが、好ましくは成熟ｍｉＲＮＡである。
【００１５】
本明細書における「被験者」は、ｍｉＲ−２１４および／またはｍｉＲ−１２６を発現するヒトおよび非ヒト動物を含む動物であれば特に制限されないが、例えば、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウマ、ウシ、ブタ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ等の哺乳動物であることが好ましい。測定対象であるｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６は、上記のような多くの哺乳動物において存在が確認されている。このうち、本発明にかかる血管病変の評価方法は、ヒトまたはイヌに対して好適に用いられる。例として、ヒトおよびイヌの成熟ｍｉＲ−２１４（配列番号１）および成熟ｍｉＲ−１２６（配列番号２）配列を示す。成熟ｍｉＲ−２１４および成熟ｍｉＲ−１２６のヌクレオチド配列は、ヒトおよびイヌを含む哺乳類で共通である。
【００１６】
【化１】
0006609444.tif 000002
【００１７】
本発明において用いられる「生体試料」は、被験者から生体外に取出された細胞、組織または体液、例えば生検、穿刺吸引物、剥離物、細胞浸出液など、を意味する。特に限定されないが、より具体的には、例えば、尿、粘液、唾液、涙、血液、血漿、血清、痰、脊髄液、胸水、乳頭吸引物、リンパ液、気道液、腸液、泌尿生殖管液、母乳、精液、脳脊髄液、気管系内体液、腹水、嚢胞性腫瘍体液、および羊水液が例示できるが、入手の容易さの観点から血液、血漿、および血清からなる群から選択されることが好ましい。生体試料の分離方法は、本技術分野において従来公知の手段により行えばよい。
【００１８】
本明細書において「血管病変」とは、血管またはリンパ管の限局性の病理学的変化、障害または疾患をいい、特に限定されるものではないが、例えば、血管腫（例えば、血管芽腫、血管内皮腫、血管外皮腫、毛細血管性血管腫、乳児毛細血管性血管腫、海綿状血管腫、蔓状血管腫、硬化性血管腫、老年性血管腫、クモ状血管腫、イチゴ状血管腫、疣贅状血管腫、リンパ管腫、蛇行性血管腫）、血管肉腫（例えば、悪性血管内皮腫、悪性血管外皮腫、カポジ肉腫）、アテローム性動脈硬化、肥厚性動脈硬化、高血圧性動脈硬化、血管内膜炎、冠状動脈疾患、脳卒中、心筋梗塞、再狭窄、および糖尿病性血管障害等が例示できる。本発明は特に、血管腫または血管肉腫の検出に好適に用いられ、より好ましくは、血管肉腫の検出に用いられる。
【００１９】
本発明においては、バイオマーカーとしてｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の少なくとも一方を用いるが、好ましくは、特異性および感度を顕著に向上できるという観点から、バイオマーカーとして、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルを測定する。バイオマーカーの発現レベルの測定には、従来公知の定量的・半定量的手法が採用でき、例えば、発現レベルの測定は、核酸増幅法、マイクロアレイ法、またはノーザンブロット法により行われてもよい。より好ましくは、配列特異性の高さの観点から、核酸増幅法によって発現レベルの測定が行われる。以下、代表的な発現レベルの測定方法として核酸増幅法、ノーザンブロット法、およびマイクロアレイ法についてさらに説明するが、発現レベルの測定方法が下記に限定されるものではない。
【００２０】
核酸増幅法を用いる場合は、バイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の成熟ｍｉＲＮＡに相当する領域（例えば、連続する７〜２５残基）を含むように設定したプライマーを用いる核酸増幅法により、バイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の成熟ｍｉＲＮＡの塩基配列を含むＲＮＡまたはそのｃＤＮＡの部分領域を特異的に増幅し、増幅産物を測定することを含む。ここで、「領域に設定した」とは、ストリンジェントな条件下でその領域とハイブリダイズするという意味であり、バイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）のガイド鎖に対するリバース側プライマーを用いる場合と、フォワード側プライマーを用いる場合の両者が包含される。ストリンジェントな条件とは、特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいい、例えば成書に記載の条件（サムブルック（Ｓａｍｂｒｏｏｋ）ら編、「モレキュラークローニング，ア  ラボラトリーマニュアル  第２版」、１９８９年、コールドスプリングハーバーラボラトリー、特に１１．４５節“Ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ  ｆｏｒ  Ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ  ｏｆ  Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ  ｐｒｏｂｅｓ”等）にしたがって決定でき、特に制限されない。ストリンジェントな条件は、塩濃度、温度、およびその他の条件によって決まり、例えば、塩濃度が低いほど、温度が高いほど、ストリンジェンシーは高くなり、プライマーとＲＮＡ（または、そのｃＤＮＡ）とがハイブリダイゼーションしにくくなる。塩濃度は、一般に、ＳＳＣ溶液（ＮａＣｌ＋クエン酸三ナトリウム）の濃度を調節することによって調節され、ストリンジェントな塩濃度は、例えば、ＮａＣｌ約２５０ｍＭ以下およびクエン酸三ナトリウム約２５ｍＭ以下である。ストリンジェントな温度は、一般に、完全ハイブリッドの融解温度（Ｔｍ）より１５〜２５℃低い温度であり、例えば、約３０℃以上である。溶液に有機溶媒（例えばホルムアミド）を加えることにより、温度を下げることができる。その他の条件としては、ハイブリダイゼーション時間、洗浄剤（例えば、ＳＤＳ）の濃度、およびキャリアーＤＮＡの存否等であり、これらの条件を組み合わせることによって、様々なストリンジェンシーを設定することができる。好ましい例として、２５０ｍＭ  ＮａＣｌ、２５ｍＭ  クエン酸三ナトリウム、１％  ＳＤＳ、５０％  ホルムアミド、２００μｇ／ｍＬの変性サケ精子ＤＮＡの条件で、４２℃の温度によりハイブリダイゼーションを行う。また、ハイブリダイゼーション後の洗浄の条件もストリンジェンシーに影響する。この洗浄条件もまた、塩濃度および温度によって定義され、塩濃度の減少と温度の上昇によって洗浄のストリンジェンシーは増加する。好ましい例として、１５ｍＭ  ＮａＣｌ、１．５ｍＭクエン酸三ナトリウムおよび０．１％  ＳＤＳの条件で、６８℃の温度にて洗浄を行う。また、「特異的に増幅する」とは、ｍｉＲ−２１４またはｍｉＲ−１２６のいずれか一方の成熟ｍｉＲＮＡの塩基配列を含むＲＮＡまたはそのｃＤＮＡの部分領域は増幅されるが、当該測定対象であるｍｉＲ−２１４またはｍｉＲ−１２６以外の成熟ｍｉＲＮＡの塩基配列を含むＲＮＡまたはそのｃＤＮＡの部分領域��増幅されないことを意味する。なお、プライマーのサイズは特に限定されないが、通常１３〜３０塩基程度であり、好ましくは１５〜２５塩基程度である。
【００２１】
テンプレートとなるＲＮＡの部分領域と同じ塩基配列（ただしｕはｔになる）を有するＤＮＡ（ｃＤＮＡ）を得る好ましい例として、逆転写ＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）が挙げられる。ＲＴ−ＰＣＲでは、生体試料からＲＮＡを常法により抽出し、逆転写酵素の作用によりＲＮＡをテンプレートとして第一鎖ｃＤＮＡを生成させ、さらにこの第一鎖ｃＤＮＡをテンプレートとして相補鎖を生成させて、二本鎖ｃＤＮＡを得る。次いで、得られた二本鎖ｃＤＮＡをテンプレートとしてＰＣＲを行い、該ｃＤＮＡまたはその部分領域を増幅する。ＲＴ−ＰＣＲ自体は周知の技術であり、そのためのキットや装置も市販されているため、容易に実施することができる。
【００２２】
なお、ＲＴ−ＰＣＲを行う場合、最初のＲＮＡの抽出時に混入するゲノムＤＮＡに含まれる偽遺伝子を鋳型とする増幅が起きる場合がある。従って、用いるプライマーセットは、このような偽遺伝子に起因する増幅が起きないプライマーを選択したセットであることが好ましい。偽遺伝子に起因する増幅が起きるか否かは、例えば、そのプライマーセットを用い、ゲノムＤＮＡをテンプレートとしてＰＣＲを行った場合に、ｃＤＮＡを鋳型としてＰＣＲを行った場合と同じサイズの増幅産物のみが生成するか否かにより判定することができる。
【００２３】
核酸増幅の一般的な手法が、ＰＣＲである。ＰＣＲ自体は常法に従って行うことができる。そして、ＰＣＲによる増幅後に、増幅産物の発現レベルを測定する。かような発現レベルの測定も、常法により行うことができる。さらに、増幅産物の電気泳動バンドの蛍光強度測定や、太さの目視判定のような、簡易定量または半定量も「測定」の概念に包含される。発現レベルの測定は、例えば逆転写産物を電気泳動にかけ、増幅バンドを検出することにより行うこともできる。また、蛍光標識したヌクレオチド三リン酸の存在下にＰＣＲを行うことによって逆転写産物を蛍光標識し、増幅バンドの蛍光強度を測定することによっても、発現レベルを測定できる。さらに、電気泳動パターンをナイロンやニトロセルロースからなるメンブレンに転写し、逆転写産物にハイブリダイズする標識プローブをハイブリダイズさせて、標識を検出または定量する（ＰＣＲ−サザン（Ｓｏｕｔｈｅｒｎ）法）によっても行うことができる。さらには、逆転写産物にハイブリダイズするプローブを固相化し、上記増幅工程を標識ヌクレオチド三リン酸の存在下に行い、固相化プローブに逆転写産物を結合させ、固相に結合された逆転写産物を測定することによっても行うことができる。これらはいずれも常法であり、周知の知見が適宜参照されうる。
【００２４】
上述したＲＴ−ＰＣＲの逆転写産物を用いて、リアルタイムＰＣＲ（定量ＰＣＲ）によりバイオマーカーの発現レベルを測定してもよい。あるいは、上記の逆転写反応とリアルタイムＰＣＲ（定量ＰＣＲ）による定量を同一チューブ内で行う、いわゆるワンステップＲＴ−ＰＣＲによってバイオマーカーの発現レベルを測定してもよい。リアルタイムＰＣＲ（定量ＰＣＲ）は蛍光色素を用いた従来公知の手法で行えばよく、ＴａｑＭａｎ（登録商標）プローブ法およびインターカレータ法（ＳＹＢＲ（登録商標）  Ｇｒｅｅｎ  Ｉ）のいずれであってもよい。配列特異性の高さから、本発明においては、好ましくは、ＴａｑＭａｎ（登録商標）プローブ法によってバイオマーカーの発現レベルを測定する。
【００２５】
以上、本発明の測定方法をＰＣＲ法によりおこなう場合を例に挙げて詳細に説明したが、本発明の測定方法は、上述したプライマーを用いてバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の成熟ｍｉＲＮＡの塩基配列を含むＲＮＡまたはそのｃＤＮＡの部分領域の増幅を行う方法であれば、他の核酸増幅法を利用するものであってもよい。
【００２６】
バイオマーカーの発現レベルの測定は、ノーザンブロット法により行ってもよい。ノーザンブロット法に用いるプローブは、バイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の成熟ｍｉＲＮＡに相当する領域（例えば、連続する７〜２５残基）を含むように設定したプローブである。プローブは、上記のプライマーと同様、検出対象であるバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）とストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なものであり、例えば、検出対象と、７０％以上（例えば、８０％以上、９０％以上、９２％以上、９５％以上、９９％以上、１００％）相補的であり得る。プローブは検出対象であるバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）とストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なものであれば特に制限されず、ＤＮＡプローブやＲＮＡプローブのいずれであってもよく、あるいは、ＬＮＡ（登録商標）などの架橋化した核酸など化学修飾されたもの、非天然塩基（人工塩基）を含むものでもよい。プローブ長さは、例えば、５〜３０残基であり、好ましくは１０〜２５残基である。プローブは、放射線標識、蛍光色素、ジゴキシゲニン（ＤＩＧ）、ビオチン、酵素等の標識化物質によって検出可能に標識化されたものである。
【００２７】
ノーザンブロットは本技術分野において周知の手法により実施することができる。詳細には、生体試料から抽出したＲＮＡをゲル電気泳動によって分画し、ニトロセルロースメンブレンやナイロンメンブレン等のメンブレンに転写する。次いで、メンブレンを前述のプローブ存在下、緩衝液中でインキュベートする。その後、プローブの標識を検出することによって、プローブとハイブリダイズしたｍｉＲＮＡを検出できる。発現レベルの測定はバンド強度を数値化すればよく、例えば、放射性物質で標識したプローブを使用する場合はオートラジオグラフィー等の手法により行えばよい。
【００２８】
バイオマーカーの発現レベルの測定は、マイクロアレイ法により行ってもよい。マイクロアレイに用いるプローブは、検出対象であるバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）とストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能な、上記したようなものである。同一の検出対象に対してハイブリダイズする複数のプローブを、同一のアレイに別々のスポットとして配置してもよい。
【００２９】
アレイ技法は公知で、遺伝子発現を解析するために用いられている（Ｃｈｅｅ，Ｍ．ｅｔ  ａｌ．（１９９６）Ｓｃｉｅｎｃｅ，．２７４，６１０−６１３）。例えば、ポリＬ−リジン等による表面処理がなされたガラス、プラスチック、ポリマー、ラテックス、金属などの基材に、上記のプローブが位置指定可能に配置される。プローブの配置は、スポッターやアレイヤーによってプローブを付着させてもよく、または、光リソグラフィーやインクジェットプリント等の手段により基材上でプローブを合成してもよい。
【００３０】
本発明にかかる評価方法では、以上により測定した生体試料におけるバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルを、基準値と比較する。
【００３１】
ある実施形態では、基準値は、健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルである。当該基準値は、複数（例えば、５〜１０００個体）の健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルの平均値または中央値であり得る。この場合、バイオマーカー発現レベルが、基準値以下のときは血管病変を有しない指標であるとし、基準値を超えるときは血管病変を有する指標であるとすることができ、基準値は健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルである。さらなる実施形態では、基準値は、健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベル（または、複数（例えば、５〜１０００個体）の健常な個体から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルの平均値または中央値）を１．２倍（あるいは、１．５倍）した値である。
【００３２】
ある実施形態では、基準値は、同一の被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルであり得る。例えば、血管病変を罹患した被験者において、治療的処置（例えば、投薬、外科的処置）前における生体試料中のバイオマーカー発現レベルを基準値として、治療的処置（例えば、投薬、外科的処置）を施した後の同一被験者について、本発明により血管病変の検出を行ってもよい。この場合、治療的処置後の被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルが、基準値未満のときは血管病変を有しない指標であるとし、基準値以上のときは血管病変を有する指標であるとし、基準値は治療的処置前における同一被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルである。別の実施形態では、基準値は、同一の被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを０．８倍（あるいは、０．６倍）した値である。医学的に適切な治療的処置は、当業者において適宜選択され、公知である。バイオマーカー発現レベルは被験者における血管病変を評価する指標となるため、本発明の一実施形態では、被験者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、およびバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、バイオマーカーがｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択される、被験者における血管病変のデータ取得方法が提供される。別の実施形態では、血管病変患者から分離した生体試料中のバイオマーカー発現レベルを測定すること、およびバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含み、バイオマーカーがｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択される、血管病変患者の治療を管理する方法が提供される。
【００３３】
本発明においては、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択されるバイオマーカーの少なくとも一方について測定した発現レベルを基準値と比較することにより血管病変の評価を行ってもよいが、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の両者について測定した発現レベルをそれぞれ基準値と比較することにより血管病変の評価を行うことが、特異性および感度が顕著であるという観点から好ましい。このとき、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の少なくとも一方の発現レベルが基準値以下（または、基準値未満）の場合は血管病変を有しない指標であるとし、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルがともに基準値を超える（または、基準値以上の）場合は血管病変を有する指標であることができる。これにより、バイオマーカーとしての特異性が高くなる。あるいは、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルがともに基準値以下（または、基準値未満）の場合は血管病変を有しない指標であるとし、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の少なくとも一方の発現レベルが基準値を超える（または、基準値以上の）場合は血管病変を有する指標であることができる。これにより、バイオマーカーとしての検出感度が高くなる。あるいは、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルがともに基準値以下（または、基準値以上の）の場合を病態レベル１（健常）、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の少なくとも一方の発現レベルが基準値を超える（または、基準値以上の）場合をレベル２、ならびにｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルがともに基準値を超える（または、基準値以上の）場合をレベル３として、血管病変の病態を段階的に評価するために使用することもできる。以上の判断手法は、評価の目的に応じて選択して使用することができる。
【００３４】
本発明の一実施形態では、上記のバイオマーカーの測定値を補正するため、バイオマーカー発現レベルの測定に用いる同一生体試料中の内在性コントロール発現レベルをさらに測定してもよい。すなわち、本発明の一実施形態では、生体試料中の内在性コントロール発現レベルを測定すること、および内在性コントロール発現レベルにより補正したバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することを含む。内在性コントロール発現レベルにより補正したバイオマーカー発現レベルを基準値と比較することで、より信頼性の高い評価を行うことができる。内在性コントロールの発現レベルは、上記のバイオマーカー発現レベルと同一の方法により測定することができる。なお、本実施形態では、基準値として用いられる発現レベルも、同様にして内在性コントロール発現レベルにより補正した値である。
【００３５】
内在性コントロールとしては、β−アクチン、ＧＡＰＤＨ（グリセルアルデヒド３リン酸デヒドロゲナーゼ）、ＨＰＲＴ１（ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ１）、５Ｓ  ｒＲＮＡ等のハウスキーピング遺伝子を用いてもよいが、測定試料の調製が容易であるという観点から、好ましくは、ｌｅｔ−７ａ、ｍｉＲ−１６、ＲＮＵ４８、Ｕ６、Ｕ４７、ＲＮＵ６Ｂ、ｓｎｏＲＮＡ２０２、ｓｎｏＲＮＡ２３４、ＲＮＵ２４、ＲＮＵ３８Ｂ、またはＺ３０等の低分子ＲＮＡまたはそのｃＤＮＡである。これらの内在性コントロールは、測定される生体試料によって適宜選択され得る。
【００３６】
内在性コントロール発現レベルによりバイオマーカー発現レベルを補正するためには、検出されたバイオマーカーの測定値を、検出された内在性コントロールの測定値で除し、算出された値をバイオマーカー発現レベルとして用いればよい。
【００３７】
本発明の第２の形態は、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択されるバイオマーカーの検出物質を含む、血管病変評価用キットに関する。本発明によれば、特異的且つ高感度に血管病変を検出できる。
【００３８】
本発明に用いられる「バイオマーカーの検出物質」は、核酸増幅法、ノーザンブロット法、およびマイクロアレイ法等のｍｉＲＮＡの発現レベルの測定に用いられる検出物質であり、例えば、上記のような核酸増幅用プライマー、およびプローブが例示できる。当該キットは、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６からなる群から選択される少なくとも一方のバイオマーカーについての検出物質を含む。好ましくは、上記のようにｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の両者の発現レベルを測定することによりバイオマーカーとしての特異性および感度を顕著に向上できることから、キットは、バイオマーカーの検出物質として、ｍｉＲ−２１４検出物質およびｍｉＲ−１２６検出物質を含む。より好ましくは、本発明にかかるキットは、上記の内在性コントロール検出物質をさらに含む。
【００３９】
キットの形態は乾燥状態でもよく、検出物質が溶液に溶解された状態でもよい。あるいは、マイクロアレイの基材、マイクロタイタープレート、または樹脂もしくは金属製のビーズ等を担体として、当該担体に検出物質が固定化された状態でもよい。また、キットは、上記の検出物質に加えて、逆転写酵素、ＤＮＡポリメラーゼ（例えば、Ｔａｑポリメラーゼ）、ｄＮＴＰ、オリゴｄＴプライマー、ランダムプライマー、ＲＮａｓｅ阻害剤、ＲＮａｓｅＨ、標識化物質、緩衝液等を含めて測定用キットにすることもできる。さらに、本発明の評価方法を実行するために使用できる各種機器や、使用説明書を含んでもよい。
【実施例】
【００４０】
本発明の効果を、以下の実施例および比較例を用いて説明する。ただし、本発明の技術的範囲が以下の実施例のみに制限されるわけではない。
【００４１】
《実施例１》
イヌ正常血管内皮細胞（ＣｎＡＯＥＣ細胞）およびイヌ血管肉腫由来培養細胞（Ｒｅ１２細胞、およびＵｄ６細胞）を用いて、培養中に培地に分泌されたバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ＲＮＵ６Ｂ）の発現レベルを測定した。
【００４２】
（細胞培養）
イヌ正常血管内皮細胞（ＣｎＡＯＥＣ細胞）は、ＣＥＬＬ  ＡＰＰＬＩＣＡＴＩＯＮＳ社より購入した。
【００４３】
イヌ血管肉腫由来培養細胞（Ｒｅ１２細胞、およびＵｄ６細胞）は以下のように調製した。すなわち、血管肉腫に罹患した２個体のイヌから採取した腫瘍細胞を、ヌードマウスの皮下に１×１０６ｃｅｌｌ／匹となるように移植した。移植処置から２〜４週間後、形成された腫瘍を摘出し、細胞培養用のフラスコにて１０％（ｖ／ｖ）の熱不活化ＦＢＳ（シグマ−アルドリッチ株式会社）を添加したＤＭＥ培地中で腫瘍細胞を培養した。その後、腫瘍細胞集団から細胞株のクローニングを行い、２個体からそれぞれ増殖活性の高かった株として、Ｒｅ１２細胞およびＵｄ６細胞を単離した。
【００４４】
なお、細胞の培養は、３７℃のインキュベーター（９５％空気／５％ＣＯ２）内で行った。
【００４５】
（マーカーの測定）
１×１０６ｃｅｌｌ／ｍｌの濃度で６ウェルプレートに播種した細胞を、上記条件で４８時間培養した。次いで、培養後の培地をすべて回収し、ＮｕｃｌｅｏＳｐｉｎ  ｍｉＲＮＡ（タカラバイオ株式会社）を用いて低分子ＲＮＡを回収した。ＰｒｉｍｅＳｃｒｉｐｔ（登録商標）ＲＴ  ｒｅａｇｅｎｔ  ｋｉｔ（タカラバイオ株式会社）を用いて、回収したＲＮＡの逆転写反応を行い、得られたｃＤＮＡをバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ＲＮＵ６Ｂ；ＲＮＡ，  Ｕ６Ｂ  ｓｍａｌｌ  ｎｕｃｌｅａｒ）の発現レベル測定用試料とした。
【００４６】
バイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ＲＮＵ６Ｂ）の発現レベル測定は、ＴａｑＭａｎ（登録商標）プローブを用いた定量ＰＣＲ法により行った。具体的には、反応試薬としてＰｒｅｍｉｘ  ＥＸ  Ｔａｑ（Ｐｒｏｂｅ  ｑＰＣＲ）（タカラバイオ株式会社）を用い、７５００リアルタイムＰＣＲシステム（アプライドバイオシステムズ）により測定を行った。また、プライマーセットおよびプローブとして、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＭｉｃｒｏＲＮＡ  Ａｓｓａｙｓ（アプライドバイオシステムズ）を用いた。
【００４７】
内在性コントロール（ＲＮＵ６Ｂ）発現レベルで補正したバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）発現レベルを、結果を図１に示す。図１に示す通り、正常血管内皮細胞（ＣｎＡＯＥＣ細胞）と比べて、血管肉腫由来培養細胞ではｍｉＲ−２１４の培地への分泌量が多かった。また、血管肉腫由来培養細胞のうち、Ｒｅ１２細胞は、ｍｉＲ−１２６の分泌量も多かった。
【００４８】
《実施例２》
イヌの健康群（ｎ＝１０）、非腫瘍性脾疾患群（ｎ＝９）、および血管肉腫罹患群（ｎ＝１０）から、それぞれ３〜４ｍｌの血液を採血管（エチレンジアミン四酢酸−２ナトリウム処理）に回収した。血液から速やかに血漿を回収し、使用時まで−８０℃にて保管した。血漿サンプルからＮｕｃｌｅｏＳｐｉｎ  ｍｉＲＮＡ（タカラバイオ株式会社）を用いて低分子ＲＮＡを回収した。内在性コントロールとしてｍｉＲ−１６を用いた以外は実施例１と同様の手法により、バイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）の発現レベルを測定した。
【００４９】
内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）発現レベルで補正したバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）発現レベルについての結果を、図２に示す（Ｃｏｎｔｒｏｌ：イヌ健康個体群、ＮＮＳ：イヌ非腫瘍性脾疾患群、ＨＳＡ：イヌ血管肉腫罹患群）。図２Ａに示す通り、血管肉腫罹患群では、ｍｉＲ−２１４および／またはｍｉＲ−１２６の血漿中で高い発現レベルを示す個体が多かった。血管肉腫罹患群においては、ＨＳＡ３のようにｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の発現レベルがともに高い個体；ＨＳＡ１０のようにｍｉＲ−２１４の発現レベルが高く、ｍｉＲ−１２６の発現レベルがやや高い個体；ＨＳＡ９のようにｍｉＲ−２１４の発現レベルが低く、ｍｉＲ−１２６の発現レベルが高い個体、等が確認された。
【００５０】
図２Ａの結果について、スティール法により統計解析を行った結果を図２Ｂに示す（図２Ｂ中、「＊＊」は統計的有意差があることを示す。）。図２Ｂに示す通り、血管肉腫罹患群では、健康群や非腫瘍性脾疾患群と比較して、血漿中でのバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルが上昇していた。
【００５１】
上記結果を医療統計解析ソフトＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ６（グラフパッドソフトウェア社）にて解析した結果を図３Ａ（ｍｉＲ−２１４）およびＢ（ｍｉＲ−１２６）に示す。図３において、縦軸（Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ％）はバイオマーカーとしての感度（値が高いほど、偽陰性を示す確率が低いことを示す）を、横軸（Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ％）はバイオマーカーとしての特異性（値が高いほど、偽陽性を示す確率が低いことを示す）を示す。図３において、ＡＵＣ（曲線下面積）が大きいほど、信頼度が高いことを示す。ＡＵＣ（曲線下面積）は０．９以上であればよいが、特異性および感度の観点から、０．９５以上が好ましい（最大値：１．０）。図３に示す通り、ｍｉＲ−２１４（ＡＵＣ＝０．９）およびｍｉＲ−１２６（ＡＵＣ＝０．９４）は、血管病変の検出に利用し得ることが分かる。
【００５２】
内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）発現レベルで補正したｍｉＲ−２１４発現レベルを横軸に、内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）発現レベルで補正したｍｉＲ−１２６発現レベルを縦軸にプロットした結果を図４に示す。図４に示す通り、血管肉腫罹患群の個体では、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の少なくとも一方について、発現量が多くなる傾向にあった。さらに、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の両者を組み合わせてバイオマーカーとした場合について、医療統計解析ソフトＧｒａｐｈＰａｄ  Ｐｒｉｓｍ６（グラフパッドソフトウェア社）にて解析した結果を図５に示す。図５に示す通り、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の両者を組み合わせることにより、ｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６をそれぞれ単独でバイオマーカーとして用いた場合と比べて、特異性および感度において一層優れた血管病変バイオマーカーとなる（ＡＵＣ＝０．９７）ことが分かる。
【００５３】
《実施例３》
実施例２で用いた血管肉腫罹患群のうち３個体について、腫瘍摘出手術を行った。腫瘍摘出手術前後における血漿中のバイオマーカーの発現レベルを測定した。具体的には、血管肉腫罹患個体であるＨＳＡ３、ＨＳＡ６およびＨＳＡ８から、手術当日を０日目として、初診時から術前日までに採血した。それぞれの個体から腫瘍摘出手術を行い、２０日目（ＨＳＡ３）、２１日目（ＨＳＡ６）または１５日目（ＨＳＡ８）に再度採血した。回収した血液から血漿を調製し、上記と同様の手法によりバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）の発現レベルを測定した。
【００５４】
腫瘍摘出手術前後での、血漿中の内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）発現レベルで補正したバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）発現レベルを、図６に示す（図６Ａ：ｍｉＲ−２１４、  図６Ｂ：ｍｉＲ−１２６、縦軸は対数表示）。なお、図６において、「ＦＣ」の下の数値はＦｏｌｄ−Ｃｈａｎｇｅ（倍率変化；手術前における発現レベルを１としたときの、手術後における発現レベル）を意味する。また、図６中、「＊＊」は統計的有意差があることを示す。
【００５５】
図６に示す通り、ＨＳＡ３およびＨＳＡ６については、血漿中のバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）の発現レベルが低下していた。一方、ＨＳＡ８についてはｍｉＲ−１２６の発現レベルに低下傾向が認められるものの、ｍｉＲ−２１４はほとんど変動が認められなかった。したがって、血管病変のバイオマーカーとしてｍｉＲ−２１４およびｍｉＲ−１２６の両者について発現レベルを測定することで、より高感度な血管病変の評価が可能であることが分かる。
【００５６】
《実施例４》
ヒト血管内皮細胞（ＨＭＥＣ１細胞）およびヒト血管肉腫由来培養細胞（ＩＳＯ−ＨＡＳ細胞、およびＨＡＭＯＮ細胞）を用いて、培養中に培地に分泌されたバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）の発現レベルを測定した。
【００５７】
（細胞培養）
ＨＭＥＣ１細胞（ヒト血管内皮細胞）は、ＭＣＤＢ１３１培地（１０ｎｇ／ｍｌ  ＥＧＦ、１μｇ／ｍｌハイドロコルチゾン、１０ｍＭグルタミン、１０％（ｖ／ｖ）ウシ胎児血清を含む）にて培養した。ＩＳＯ−ＨＡＳ細胞（ヒト血管肉腫由来培養細胞、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｃａｎｃｅｒ  （１９９９），８１（２）３０５〜３０８参照）は、ＤＭＥ培地（１５％（ｖ／ｖ）ウシ胎児血清、５０％（ｖ／ｖ）ＩＳＯＳ−１細胞培養上清（１５％（ｖ／ｖ）ウシ胎児血清を含むＤＭＥ培地でＩＳＯＳ−１細胞を３〜４日培養し、０．２２μｍフィルタでろ過して回収）を含む）にて培養した。ＨＡＭＯＮ細胞（ヒト血管肉腫由来培養細胞、Ｊｏｕｒｎａｌ  ｏｆ  Ｄｅｒｍａｔｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  （２０１３），７０（２），１１６〜１２２参照）は、ＤＭＥ培地（牛胎児血清１０％を含む）にて培養した。
【００５８】
（マーカーの測定）
１〜２×１０５ｃｅｌｌ／ｍｌの濃度で６ウェルプレートに播種した細胞を、３７℃のインキュベーター（９５％空気／５％ＣＯ２）内で４８時間培養した。培養後の培地を回収し、以下のプライマーおよびプローブを用いて実施例１、２に準じてバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）および内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）の発現レベルを測定した。
【００５９】
内在性コントロール（ｍｉＲ−１６）発現レベルで補正したバイオマーカー（ｍｉＲ−２１４、ｍｉＲ−１２６）発現レベルを、結果を図７に示す。図７に示す通り、ヒト血管内皮細胞（ＨＭＥＣ１細胞）と比べて、ヒト血管肉腫由来培養細胞はｍｉＲ−２１４の培地への分泌が多かった。また、血管肉腫由来培養細胞のうち、ＨＡＭＯＮ細胞は、ｍｉＲ−１２６の分泌量も多かった。
【図１】
0006609444.tif 000003
【図２】
0006609444.tif 000004
【図３】
0006609444.tif 000005
【図４】
0006609444.tif 000006
【図５】
0006609444.tif 000007
【図６】
0006609444.tif 000008
【図７】
0006609444.tif 000009
【配列表】
0006609444000001.app