(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
組織試料用の顕微鏡スライドであって、
試料固定領域を有する第１の主面を備える細長い平面状の基板であって、試料固定領域内に、組織試料が固定され得る基板と、
試料固定領域に隣接する第１の位置で第１の主面上に固定された第１の陽性対照試料と、
試料固定領域に隣接する第２の位置で第１の主面上に固定された第２の陽性対照試料と、
試料固定領域に隣接する第３の位置で第１の主面上に固定された第３の陽性対照試料と
を含み、
第１の位置及び第２の位置の間を伸びる線分が前記試料固定領域を通過し、第２の位置及び第３の位置の間を伸びる線分が前記試料固定領域を通過し、且つ、第３の位置及び第１の位置の間を伸びる線分が前記試料固定領域を通過する、顕微鏡スライド。
【請求項２】
組織試料用の顕微鏡スライドであって、
試料固定領域を有する第１の主面を備える細長い平面状の基板であって、試料固定領域内に、組織試料が固定され得る基板と、
試料固定領域に隣接する第１及び第２の位置で第１の主面上にそれぞれ固定された、共通の第１のバイオマーカーを含む第１及び第２の陽性対照試料のペアと、
試料固定領域に隣接する第３及び第４の位置で第１の主面上にそれぞれ固定された、共通の第２のバイオマーカーを含む第３及び第４の対照試料のペアと
を含み、
前記第２のバイオマーカーは、前記第１のバイオマーカーとは異なり、または、前記第１のバイオマーカーと同一で信号レベルが異なり、
前記第１及び第２の位置は試料固定領域を挟んで正反対に位置し、且つ、前記第３及び第４の位置は試料固定領域を挟んで正反対に位置する、顕微鏡スライド。
【請求項３】
試料固定領域に隣接する第４の位置で第１の主面上に固定された第４の陽性対照試料をさらに含み、第１の位置、第２の位置、第３の位置及び第４の位置の間に伸びる線分がそれぞれ前記試料固定領域を通過する、請求項１記載の顕微鏡スライド。
【請求項４】
複数の前記陽性対照試料が、試料固定領域の周囲に沿って均等に離間されている、請求項１乃至３のいずれか１項記載の顕微鏡スライド。
【請求項５】
ａ）２つ以上の陽性対照試料が、試料固定領域の全周囲を囲む連続的な線を形成し、
ｂ）陽性対照試料が、細胞ペレット、対照組織試料、又は生体材料を担持する担体からなる群から選択され、
ｃ）陽性対照試料及び組織試料が同じバイオマーカーを含んでおり、
ｄ）第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料が、共通してバイオマーカーを含み、
ｅ）第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料が、異なるバイオマーカー含み、対照が、組織試料が分析されるときに両方とも検出可能であり、
ｆ）対照試料のそれぞれが、２つ以上の異なる種類のバイオマーカーを含み、
ｇ）スライドが、組織固定領域の周りに３つ以上の対照試料を含み、組織固定領域の部分を挟んで配置された、対照試料の少なくとも２つが、共通のバイオマーカーを含み、、
ｈ）異なる量のバイオマーカーを含む対照試料が、顕微鏡スライド上に含まれ、同様の対照試料のペアが組織固定領域の一部分を挟んで配置されるように少なくともペアとして配され、
ｉ）対照思料の少なくとも１つが、試料固定領域よりも高い位置にあり、及び／又は
ｊ）試料固定領域に隣接する位置で第１の主面上に固定された１つ以上の陰性対照試料をさらに含む、請求項１記載の顕微鏡スライド。
【請求項６】
対照試料のそれぞれが、スライド基板の組織固定領域の部分を挟んで配置された別の対照に対応するペアを成す関連バイオマーカーを含むバイオマーカーを含む、請求項１記載の顕微鏡スライド。
【請求項７】
２つのペアを成す関連バイオマーカーが、同じバイオマーカーであるか、或いは異なっていて、組織試料が分析されるときに両方とも検出可能である、請求項６記載の顕微鏡スライド。
【請求項８】
対照試料の少なくとも１つが、試料固定領域よりも高い位置にある、請求項１乃至請求項７のいずれか１項記載の顕微鏡スライド。
【請求項９】
対照試料が配置されている位置で第１の主面上に配置された１以上の支持プラットフォームをさらに備え、支持プラットフォームが、第１の主面よりも高い位置にある支持面を備え、１以上の対照試料が、支持面に固定されているか、或いは試料固定領域が、平面状の凹領域をさらに備え、基板に、平面状の凹領域と第１の主面の開口とを流体連通するように延在する凹部が形成されている、請求項８記載の顕微鏡スライド。
【請求項１０】
分析される組織試料を受けるように適合された、請求項１乃至請求項９のいずれか１項記載の顕微鏡スライドを備え、スライドが、実行される分析に関係する表示を含むラベルを受けるようにさらに適合されている、キット。
【請求項１１】
請求項１乃至請求項９のいずれか１項記載の顕微鏡スライドを作製する方法であって、
顕微鏡スライド上に陽性対照試料の薄層を移動させて固定するステップを含む方法。
【請求項１２】
陽性対照試料が、細胞ペレットを含む、請求項１１記載の方法。
【請求項１３】
移動ステップが、
ａ）接触印刷すること、
ｂ）マイクロディスペンス技術によって、溶融したワックス溶液中の一定分量の、ホルマリンで固定した細胞ペレットをスライド上に加えること、又は
ｃ）ホルマリンで固定されてパラフィン包埋された細胞のスライドサイズのブロックを切片にすることと、顕微鏡スライド上にブロックを移動させること、及び請求項１乃至請求項９のいずれか１項記載の顕微鏡スライドを作製するためにブロックの一部を除去すること
を含む、請求項１１記載の方法。
【請求項１４】
請求項１乃至請求項９のいずれか１項記載の顕微鏡スライドを染色するステップと、
陽性対照試料を検出するステップと
を含む、分析方法。
【請求項１５】
ａ）陽性対照試料の位置のすべてからの信号の存在が、染色品質の確認をもたらすか、
ｂ）陽性対照試料の位置のすべてからの信号の存在が、染色品質のリアルタイムの確認をもたらすか、
ｃ）陽性対照試料のある位置からの信号の不在が、染色の失敗を示すか、
ｄ）スライドが、試料固定領域に隣接する位置で第１の主面上に固定された１つ以上の陰性対照試料をさらに含み、陰性対照試料のある位置からの信号の存在が、染色の失敗を示すか、或いは
ｅ）顕微鏡スライドが、組織試料をさらに含む、請求項１４記載の方法。
【請求項１６】
陽性対照試料が、細胞ペレットであり、検出ステップが、細胞ペレットを含まない、画像の部分をマスクすること及び細胞ペレットの各細胞の内部のマーカーの局在を明らかにすることを含む、請求項１４記載の方法。
【請求項１７】
細胞ペレットの各細胞の核及び各細胞の各核の周りの環状領域の輪郭を描く、２つの区画への画像分割を実行するステップをさらに含む、請求項１６記載の方法。
【請求項１８】
視野内の細胞ペレットの各細胞の両方の区画における各マーカーの平均染色を測定するステップ及び全体の視野メトリックを生成するためにこれらの細胞レベルメトリックを集約するステップをさらに含み、視野メトリックが、知られている細胞核マーカーの平均細胞核発現を含む、請求項１７記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
本発明は、分子病理学の分野に関する。より具体的には、本発明は、顕微鏡スライド上の組織試料の高品質染色を確保するための装置及び方法に関する。
【背景技術】
【０００２】
組織診断は、患者ケアにとってより重要になってきており、処理量に対して高まる需要を満たすためにこれまで以上の自動化を必要としている。自動化された免疫染色技術は、大部分のＩＨＣ研究室で広く使用されている。機器は、手作業の免疫染色工程（抗原回収、抗体及び溶液の適用、インキュベーション、並びに洗浄などの重要なステップを含む）を模倣するように設計されている。様々なシステムが、様々な度合いの柔軟性及びスライド能力を有しているが、これらの目標は、同じである、すなわち、エラーを最小限に抑え、高い品質の染色を実現して、一貫した解釈が患者試料から引き出され得るようにすることである。
【０００３】
しかしながら、これらの自動染色器におけるエンジニアリング対照ツールの準備にもかかわらず、染色溶液の不正確な分注及び気泡又は厚い、密でない、もしくは折り畳まれた組織切片の存在に起因する患者試料の不完全な範囲（これは、結果的に分析にとって偽陰性の不均一な染色という問題を発生させる）という問題を有することは珍しくない。例えば、Ｓｈｉ，Ｓ−Ｒ．，Ｔａｙｌｏｒ，Ｃ．Ｒ．，Ａｎｔｉｇｅｎ  Ｒｅｔｒｉｅｖａｌ  Ｉｍｍｕｎｏｈｉｓｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ  Ｂａｓｅｄ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ａｎｄ  Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ，２０１０，Ｗｉｌｅｙ，Ｓｉｎｇａｐｏｒｅを参照のこと。さらに、市場に出回っている一般的な自動染色器は、染色領域を約５０ｍｍの長さに制限している。ある製造業者のカバーガラス技術は、染色領域を２１×５０ｍｍに制限している。別の製造業者の液体ボルテックス空気混合プロトコルは、２５×５０ｍｍの染色領域を取り扱う。現在、これらの特定の染色領域内の組織切片全体が均一に又は完全に染色されていることを検証する対照方法は存在しない。
【０００４】
現在、スライド上の組織の不十分な染色は、過去に照らして識別されるのみである。多くのそれほど明白でない現象は、これまで気付かれ得なかった。ＤａｋｏのＨｅｒｃｅｐＴｅｓｔ（商標）は、バッチ対照として染色の実施のそれぞれに含まれた、０、１＋、及び３＋の染色強度スコアを有する３つのペレット状の、ホルマリンで固定されてパラフィン包埋されたヒト乳癌細胞株を含む別々のスライドを含む。しかしながら、バッチ対照は、バッチ内で個別のスライドのそれぞれにおける染色の欠陥を識別することができない。
【０００５】
別の以前の手法では、患者試料切片は、陽性又は陰性の組織又は細胞の対照を既に含むスライドの上に調製される。これらの組織の由来は、機関に応じて様々であり、それらの染色挙動は、患者変動性に起因してバッチ間で異なる。図１に示されているように、従来技術は、平面状の基板２であって、その上に組織試料３及び細胞対照４が固定される基板２を有する組織試料スライド１を提供している。細胞対照４の形態は、試料と基板２の一方の長手方向端部５との間の領域でスライドに固定された細胞ペレットである。図２は、癌マーカーＩＨＣアッセイのための細胞対照４’ａ〜４’ｉの９ドットアレイを含む、従来技術の別の組織試料スライド１’（メリーランド州ロックビルのＢｉｏ−Ｑｕｉｃｋ  Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎによって販売されている）を描いている（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｂｉｏ−ｑｕｉｃｋ．ｃｏｍ／ｑｃ−ｄｏｔｓ％Ｃ２％ＡＥ−ｃａｎｃｅｒ−ａｒｒａｙ−ｃａ−ｃｏｎｔｒｏｌ−ｓｌｉｄｅｓ）。細胞対照４’ａ〜４’ｉは、陽性及び陰性の対照を含み得るが、それぞれ、互いに異なる対照として示されている。スライド１’は、細胞ペレットのアレイを含んでいるが、単一の細胞ペレットを含むスライドと同様の情報を提供する。すなわち、細胞ペレットマーカーは、分析中の組織試料から受信される信号の較正にもっぱら使用される。スライド１と同様に、スライド１’では、試料と基板２’の一方の長手方向端部５’との間に対照４’ａ〜４’ｉが配置されており、このため、対照４’ａ〜４’ｉは、試料のサイズ及びオペレータの技能に応じて患者の試料の近く又は遠くに位置し得る。それゆえ、組織の片側のみへのこれらの対照の配置は、組織試料自体が完全かつ均一に染色されたか否かにについての信頼できる指標を提供しない。
【０００６】
したがって、当該技術は、組織試料の全体が完全かつ均一に染色されたことを保証する方法において対照を使用するスライドを欠いている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【０００７】
【特許文献１】米国特許出願公開第２０１３／０３３８０１４号明細書
【発明の概要】
【０００８】
本発明は、試料固定領域に隣接する陽性対照試料を有する顕微鏡スライドを提供する。これらのスライドは、組織試料の分析（病理染色など）に適しており、染色品質のリアルタイムの確認をもたらす。陽性対照試料又は陽性対照は、組織試料の分析中に検出され得る１つ以上のバイオマーカーを含む。したがって、陽性対照の染色の不足は、染色の失敗のリアルタイムの識別をもたらす。随意に、さらに陰性対照試料が、スライド上に含まれてもよい。陰性対照試料又は陰性対照は、陽性対照に見られる１つ以上のバイオマーカーを含まない。したがって、陰性対照の染色もまた、染色の失敗のリアルタイムの識別をもたらす。
【０００９】
このように、一態様において、本発明は、染色される組織試料用の顕微鏡スライドを提供する。顕微鏡スライドは、細長い実質的に平面状の基板を含み、この基板は、組織試料が固定され得る試料固定領域を有する第１の主面を含む。スライドは、試料固定領域に隣接する第１の位置で第１の主面上に固定された第１の陽性対照試料及び試料固定領域に隣接する第２の位置で第１の主面上に固定された第２の陽性対照試料をさらに含む。第１の位置及び第２の位置は、第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料の染色の品質が組織試料の染色の品質の指標となるように離間されている。
【００１０】
別の態様において、本発明は、染色される組織試料用の顕微鏡スライドを提供する。顕微鏡スライドは、細長い実質的に平面状の基板を含み、この基板は、組織試料が固定され得る試料固定領域を有する第１の主面を含む。スライドは、試料固定領域に隣接する第１の位置で第１の主面上に固定された第１の陽性対照試料及び試料固定領域に隣接する第２の位置で第１の主面上に固定された第２の陽性対照試料を含む。第１の位置及び第２の位置は、試料固定領域の少なくとも一部が基板の長手方向軸線に沿って第１の位置と第２の位置との間に延在するように離間されている。
【００１１】
さらに別の態様において、本発明は、本発明の顕微鏡スライドを作製する方法であって、顕微鏡スライド上の第１の位置及び第２の位置に陽性対照試料の薄層を移動させて固定するステップを含み、第１の位置及び第２の位置が、第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料の染色の品質が組織試料の染色の品質の指標となるように離間されている方法を提供する。
【００１２】
さらに別の態様において、本発明は、分析の方法であって、第１の位置及び第２の位置にそれぞれ配置された陽性対照試料のための検出手段によって本発明の顕微鏡スライドを染色するステップを含む方法を提供する。第１の位置及び第２の位置は、陽性対照試料の染色の品質が組織試料の染色の品質の指標となるように離間されており、少なくとも第１の位置及び第２の位置から陽性対照試料が検出される。
【図面の簡単な説明】
【００１３】
【図１】スライドの組織固定領域に隣接する位置に対照として細胞ペレットを有する、従来技術のスライドを描いている。
【図２】スライドの組織固定領域に隣接する位置に多数の細胞ペレットを有する、従来技術の別のスライドを描いている。
【図３】スライドの組織固定領域の部分を挟んで配置された細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係るスライドを描いている。
【図４】組織固定領域の部分を挟んで配置された細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係る別のスライドを描いている。
【図５】スライドの両側の縁部に沿って互いに組織固定領域の両側に配置された細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係るさらに別のスライドを描いている。
【図６】細胞ペレットが長手方向に互いに離間され、かつスライドの長手方向軸線から横方向に離間されている、図５のスライドの代替的な実施形態を描いている。
【図７】スライドの組織固定領域の周りに配置された３つの細胞ペレットを有する、本発明の別の実施形態を描いている。
【図８】スライドの組織固定領域の周りに配置された４つの細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係るさらに別のスライドを描いている。
【図９】互いに組織固定領域を挟んで配置された異なる細胞ペレットのペアを有する、本発明の実施形態に係るさらに別のスライドを描いている。
【図１０】スライドの両側の縁部に沿って組織固定領域に隣接して配置された異なる細胞ペレットの多数のペアを有する、本発明の実施形態に係るさらに別のスライドを描いている。
【図１１】実質的に均等に離間された細胞ペレットによって周囲に境界が形成されている組織固定領域を有する、本発明の実施形態に係る代替的なスライドを描いている。
【図１２】異なる種類のペレットによって周囲に境界が形成されている組織固定領域を有する、本発明の実施形態に係る別の代替的なスライドを描いている。
【図１３】スライド上の組織固定領域の周りに８つの細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係るスライドを描いている。
【図１４】本発明の実施形態に係るさらに別の代替的なスライドを描いており、ここでは、スライドの組織固定領域の周りに配置された細胞ペレットがさらに、顕微鏡スライドの第１の主面上の支持プラットフォーム上に配されている。
【図１５】スライドの組織固定領域の周りに配置された細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係るさらに別の代替的なスライドを描いており、ここでは、組織試料は、平面状の凹領域内の、顕微鏡スライドの第１の主面上に固定されている。
【図１６】スライドの組織固定領域の周りに配置された細胞ペレットを有する、本発明の実施形態に係るさらに別の代替的なスライドを描いており、ここでは、顕微鏡スライドは、試料固定領域よりも高い位置にある実質的に平面状のラベル領域をさらに備える。
【図１７】本発明の実施形態に係るスライドを作製するためのシステムを描いている。
【発明を実施するための形態】
【００１４】
本発明は、スライドに固定された組織試料の適切な染色についてより高い確信をもたらす革新的な対照試料レイアウトを備える顕微鏡スライドを提供する。本発明のスライドは、組織試料の自動化された染色及び分析に適している。本発明の顕微鏡スライドは、特に、組織試料の自動化された、複数ラウンドの多重分析に適している。これらのスライドは、組織の画像化／分析中の、染色品質の確認を可能にする。また、これらのスライドは、染色のすべてのラウンドが完了した後に、染色の各ラウンド後に形成された画像の評価によって染色品質を確認することを可能にする。一部の実施形態では、本明細書に開示されている顕微鏡スライド及び方法は、特に、組織化学、免疫染色、免疫組織化学、免疫アッセイ、免疫蛍光、又は蛍光インサイツハイブリダイゼーションに適用可能であり得る。
【００１５】
図３に示されているように、本発明の第１の態様は、顕微鏡スライド１０であって、これに固定される組織試料１５を染色するための顕微鏡スライド１０を提供する。スライド１０は、試料固定領域１６（その周辺は仮想線によって示されている）を有する第１の主面１４を有する細長い実質的に平面状の基板１２を含み、試料固定領域１６内には、組織試料１５が固定され得る。スライド１０は、試料固定領域１６に隣接する第１の位置で第１の主面１４上に固定された第１の陽性対照試料２０ａ及び試料固定領域１６に隣接する第２の位置で第１の主面１４上に固定された第２の陽性対照試料２０ｂをさらに用意している。第１の位置及び第２の位置は、第１の陽性対照試料２０ａ及び第２の陽性対照試料２０ｂの染色の品質が組織試料１５の染色の品質の指標となるように離間されている。すなわち、対照試料２０ａ及び２０ｂが、組織試料１５と基板１２の長手方向縁部１７ａ及び１７ｂのそれぞれとの間に配置されているため、組織試料１５の染色後の、対照試料２０ａ及び２０ｂの両方における信号の検出は、染色範囲が基板１２の両方の端部を含んでいたこと、すなわち、単一の隣接部に配置された単一の対照試料のみが染色を示す場合に比べて組織試料１５の完全な染色のより良い表徴を示す。基板の組織固定領域の周りに多数の陽性対照試料を配することによって、本発明は、組織試料の周りの対照がそれぞれ染色されたことを示すときに完全な組織染色のより大きな確信をもたらす。陽性対照試料からの検出信号の欠如は、組織試料の完全な染色の失敗の指標となる。対照試料の染色は、染色の各ラウンド後の、基板上の組織の画像化中に明らかとなり、これにより、組織自体が適切に染色されたことのリアルタイムの確信がもたらされる。さらに、画像が、その後の分析のために保持されるとき、本発明は、さらなる評価が是認される場合に対照試料染色の記録の提供を可能にする。
【００１６】
望ましくは、第１の位置及び第２の位置は、試料固定領域１６の少なくとも一部が基板１２の長手方向軸線に沿って第１の位置と第２の位置との間に延在するように離間される。用語「基板１２の長手方向軸線」は、基板１２の細長い長さに沿って両側の端部１７ａ及び１７ｂの間に中心を通って伸びる直線を意味する。本説明のために、基板１２の長手方向軸線は、主面１４に沿って伸びるとさらに考えられる。したがって、試料固定領域１６の少なくとも一部が、これらの位置の間に長手方向に延在するように、これらには長手方向の間隔がある。本明細書で説明されるように、第１の位置及び第２の位置のこのような長手方向の間隔は、これらの位置の間に横方向の間隔をさらに含んでもよい。すなわち、この場合、これらの位置の少なくとも一方が、長手方向軸線と基板１２の細長い縁部１８ａ又は１８ｂとの間に離間される。これらの実施形態のそれぞれにおいて、第１の位置及び第２の位置は、一方又は両方が長手方向軸線から横方向にも離間される場合であってもスライドの長手方向軸線に沿って離間されると考えられる。本発明の各実施形態に関して、対照試料２０ａ及び２０ｂの間に伸びる直線は、試料固定領域１６を横切る。本発明では、組織試料１５の適切な染色の確信は、組織試料の部分が２つの対照試料間の直線に沿って配置される場合にさらに高くなり得ると考えられている。
【００１７】
本発明では、顕微鏡スライド１０の基板１２は、組織の染色及び分析に適した材料（実験室用ガラス製品に適したガラスなど）から形成されると考えられている。基板１２は、望ましくは、実質的に平面状の部材であり、以下で注目する特定の実施形態を除いて、主面１４は、望ましくは平面である。基板１２は、矩形形状を有するものとして描かれているが、本発明では、基板１２は、非直線状の縁部又は単一の連続的な非直線状の縁部を有する円形形状又は他の形状を有してもよいとさらに考えられている。
【００１８】
本発明の顕微鏡スライドのすべての実施形態に関して、組織固定領域は、図示のその周辺を示す仮想線（点線）によって示されている。本発明では、実際の組織固定領域が、主面上の線によって、又は主面にエッチングされた極小の溝によって指定されてもよいと考えられてはいるが、線は、スライド基板の主面上に見えなくてもよい。さらに、組織固定領域の形状は、一般的に、実質的に矩形として示されているが、組織固定領域の周囲の境界の形状は、分析される組織試料（又はその一部）を含むのに十分な表面積を提供する任意の形状（楕円形又は円形など）であってもよい。本発明では、基板の主面上の対照試料の位置は、組織試料が本発明に従って適切に配置されて固定されるべきである領域をユーザに示すと考えられている。同様に、患者組織試料は、概ね楕円形の形状によって示されているが、患者試料は、任意の形状（円形、正方形、矩形、又は不規則な形など）であってもよいと考えられる。患者試料の形状は、本発明の態様に影響を及ぼさない。陽性対照試料のレイアウトは、所望の効果（すなわち、患者試料の染色変動性の制御）を得るために患者試料の寸法及び形態に応じて調整されてもよい。
【００１９】
さらに、本発明では、本発明によって用いられる陽性対照試料は、望ましくは、細胞ペレット、対照組織試料、又は生体材料（細胞ホモジネート、ペプチド、タンパク質、及びＤＮＡなど）を担持する担体から選択されると考えられている。担体は、粒子、ゲル、又は他の形態であってもよい。患者の組織試料は、切片にされて、これらのスライド上に置かれ得るが、これに関して陽性対照試料は、染色の失敗（不均一な染色溶液の分注など）のリアルタイムの識別をもたらし、また、大きな組織試料のための染色境界に関する顧慮をもたらす。
【００２０】
第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料は、好ましくは、共通して１以上のバイオマーカー（すなわち、マーカー）を含む。バイオマーカー又はマーカーによって、これが検出手段によって検出され得る細胞成分を含むことが意味されている。例示的な細胞成分は、タンパク質、核酸分子、又は炭水化物を含む。好ましくは、この共通のバイオマーカーは、組織試料を検出するのと同じ検出手段によって検出され得る。或いは、第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料は、異なるバイオマーカーを含んでもよい。本発明では、両方の陽性対照試料が、何らかの検出手段によって両方とも検出可能な限り、本発明の目標、すなわち、染色の失敗の識別は達成されると考えられている。したがって、本発明では、第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料が、共通のバイオマーカーを含む限り、同じであるか、又は同じ細胞株から形成された細胞ペレットを含むことは必須ではないと考えられている。或いは、第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料が、完全に異なるバイオマーカーを含む場合であっても、染色の失敗は、対照が、組織試料が分析されるときに両方とも検出され得る限り、本方法を用いて識別され得る。
【００２１】
本発明では、各陽性対照試料自体が、２つ以上の異なる種類のバイオマーカー（例えば、抗原）を含んでもよいとさらに考えられている。各細胞株が、様々な検出手段によって検出され得る限り、本発明では、異なる種類の抗原を発現する細胞株が、細胞ペレットを作製するために互いに混合されてもよいとさらに考えられている。これらの陽性対照試料は、特に、多重実験に有用である。したがって、第１のマーカーは、両方の陽性対照試料において、多重実験の第１のラウンドのための陽性対照として検出される。第２のマーカーは、両方の陽性対照試料において、多重実験の第２のラウンドのための陽性対照として検出される、等々。
【００２２】
したがって、本発明の対照試料中に用意される各マーカーは、スライド基板の組織固定領域の部分を挟んで配置される、対応するペアを成す関連マーカーを含むことが理解される。上述したように、ペアを成す関連マーカーは、同じであってもよい。或いは、ペアを成す関連マーカーは、組織試料が分析されるときに両方とも検出され得る限り、異なるバイオマーカーであってもよい。
【００２３】
図４に示されているように、本発明は、顕微鏡スライド１１０をさらに提供する。なお、ここでは、同じ番号は、本発明の他の実施形態と同じ構成要素を示している。本発明のすべての実施形態に関して、適用される組織試料には、常に「１５」の番号が付けられている。用語「同じ番号」は、スライドの異なる実施形態の同じ構成要素であって、それらの符号の最後の二桁を共有する同じ構成要素が、一般的に互いに同様であることを示している。同様に、符号に同じ最後の二桁を有する構成要素が、さらに添え字によって示されている場合があるが、添え字は、これらの構成要素が構造又は構成において実質的に同じだが、別々に配されていることを示している。
【００２４】
スライド１１０は、平面状の主面１１４を有する実質的に平面状の基板１１２を含む。主面１１４は、試料固定領域１１６を含み、そこには、組織試料１５が、従来の手段によって固定されてもよい。スライド１１０は、第１の陽性対照試料１２０ａ及び第２の陽性対照試料及び１２０ｂを含み、第１の陽性対照試料１２０ａ及び第２の陽性対照試料及び１２０ｂは、それぞれ、主面１１４の第１の位置及び第２の位置に配されている。第１の陽性対照試料１２０ａは、試料固定領域１１６と基板１１２の第１の長手方向縁部１１７ａとの間にあり、第２の陽性対照試料１２０ｂは、試料固定領域１６の脇に横方向に配置されている。「の脇に横方向に配置される」によって、位置が、基板１１２の細長い軸線に対して横方向の直線に沿って、試料固定領域１１６と基板１１２の横方向縁部１１８ａ及び１１８ｂの一方との間に配置されることが意味されている。
【００２５】
図５に示されているように、本発明では、顕微鏡スライド２１０であって、第１の陽性対照試料２２０ａ及び第２の陽性対照試料２２０ｂを固定するための第１の位置及び第２の位置が、主面２１４上の試料固定領域２１６の両側にあるように、すなわち、これらの位置が、試料固定領域２１６を挟んで実質的に横方向に離間されるように設計された顕微鏡スライド２１０がさらに考えられている。前と同様に、同じ番号は、本発明の同じ構成要素を示している。図５に示されているように、対照試料２２０ａが、試料１５と基板２１２の縁部２１８ａとの間に配置されている一方で、対照試料２２０ｂは、試料１５と基板２１２の縁部２１８ｂとの間に対向して配置されている。
【００２６】
図６は、本発明の別の顕微鏡スライド３１０を描いている。スライド３１０は、第１の主面３１４を含む実質的に平面状の基板３１２を含み、第１の主面３１４は、分析される組織試料を受けるための組織試料固定領域３１６を有する。スライド３１０は、第１の対照試料３２０ａ及び第２の対照試料３２０ｂをさらに含み、第１の対照試料３２０ａ及び第２の対照試料３２０ｂは、それぞれ、表面３１４上の第１の位置及び第２の位置に配置されている。第１の位置及び第２の位置は、基板の長手方向軸線に沿って長手方向に離間され、かつ長手方向軸線から横方向に（又は長手方向軸線のどちらか一方の側に）離間されている。すなわち、対照試料３２０ａは、長手方向端部３１７ａ及び縁部３１８ｂのより近くに配置されている対照試料３２０ｂに対して、長手方向端部３１７ｂ及び縁部３１８ａのより近くに配置されているように示されている。第１の位置及び第２の位置は、互いに試料固定領域３１６を挟んで実質的に対角線上に位置する、すなわち、試料固定領域３１６を挟んで長手方向かつ横方向に離間されている。なお、本発明では、用語「対角線上に」は、２つの位置の間に引かれた直線が、組織試料の境界を形成する多面体の２つの互いに隣接しない縁部を通過すると言われ得ることを単に示すと考えられている。
【００２７】
図７は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド４１０を描いており、ここでは、同じ番号は、同じ構成要素を表している。スライド４１０は、第１の主面４１４を含む実質的に平面状の基板４１２を含み、第１の主面４１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域４１６を有する。スライド４１０は、第１の対照試料４２０ａ、第２の対照試料４２０ｂ、及び第３の対照試料４２０ｃをさらに含み、第１の対照試料４２０ａ、第２の対照試料４２０ｂ、及び第３の対照試料４２０ｃは、それぞれ、表面４１４上の第１の位置、第２の位置、及び第３の位置に配置されている。対照試料４２０ａ、４２０ｂ、及び４２０ｃの長手方向及び横方向の間隔は、望ましくは、３つの位置の間に伸びる線分がそれぞれ試料固定領域４１６を通過することを保証するものである。本発明では、対照試料の２つが、それらの間の線分が試料固定領域４１６を通過しないように互いに隣接して配置されてもよいとさらに考えられている。とはいえ、３つの対照試料は、３つすべてが染色の証拠となるときに完全な組織染色のさらなる確信をもたらすために主面４１４上で共通の縦座標を共有しないことが望ましい。
【００２８】
対照試料４２０ａ〜４２０ｃは、同じバイオマーカーを含むものとして示されているが、本発明では、組織固定領域の周りに３つ以上の対照試料を配する実施形態に関して、これらの対照試料のそれぞれが、本発明から逸脱することなくバイオマーカーの異なる組合せをさらに提供し得ることがさらに考えられている。限定としてではなく例示として、第１の対照試料は、バイオマーカー「Ｘ」及び「Ｙ」を含んでもよく、第２の対照試料は、バイオマーカー「Ｙ」及び「Ｚ」を含んでもよく、さらに、第３の対照試料は、バイオマーカー「Ｚ」及び「Ｘ」を含む。本発明に従って組織固定領域の周りに３つのこのような別個の対照試料を用いることによって、ペアを成すバイオマーカー「Ｘ」、「Ｙ」、及び「Ｚ」は、組織試料を対象とする染色についてのより高い度合いの確信をもたらし得る。このように、用いられる各対照試料が、１つ以上の他の対照試料と同じ組成を有することが望ましい場合がある一方で、対照試料中のバイオマーカーの組合せは、組織固定領域の周りの対照試料のバイオマーカーの配分が、本発明に従って組織固定領域の部分を挟んで配置される２つ以上のバイオマーカーを提供する限り変更されてもよい。
【００２９】
図８は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド５１０を描いている。スライド５１０は、第１の主面５１４を含む実質的に平面状の基板５１２を含み、第１の主面５１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域５１６を有する。スライド５１０は、第１の陽性対照試料５２０ａ、第２の陽性対照試料５２０ｂ、第３の陽性対照試料５２０ｃ、及び第４の陽性対照試料５２０ｄをさらに含み、第１の陽性対照試料５２０ａ、第２の陽性対照試料５２０ｂ、第３の陽性対照試料５２０ｃ、及び第４の陽性対照試料５２０ｄは、それぞれ、表面５１４上の第１の位置、第２の位置、第３の位置、及び第４の位置に配置されている。対照試料５２０ａ、５２０ｂ、５２０ｃ、及び５２０ｄの長手方向及び横方向の間隔は、望ましくは、４つの位置の間に伸びる線分がそれぞれ試料固定領域５１６を通過することを保証するものである。本発明では、対照試料の２つ又は３つが、それらの間の線分が試料固定領域５１６を通過しないように互いに隣接して配置されてもよいとさらに考えられている。とはいえ、４つの対照試料は、４つすべてが染色の証拠となるときに完全な組織染色のさらなる確信をもたらすために主面５１４上で共通の縦座標を共有しないことが望ましい。
【００３０】
当業者によって理解されるように、本発明では、特定の実施形態では、２つ以上の陽性対照試料が、試料固定領域の全周囲を囲む実質的に連続的な線を形成してもよいとさらに考えられている。このように、試料固定領域の周囲に境界を形成するために使用される対照試料の正確な数及び間隔は、要求に応じて選択されてもよい。
【００３１】
図９に示されているように、本発明では、顕微鏡スライド６１０であって、第１の陽性対照試料６２０ａ及び第２の陽性対照試料６２０ｂを固定するための第１の位置及び第２の位置に加えて、顕微鏡スライド６１０が、第３の対照試料６２２ａ及び第４の対照試料６２２ｂを固定するための第３の位置及び第４の位置をさらに含むように設計された顕微鏡スライド６１０がさらに考えられている。前と同様に、同じ番号は、本発明の同じ構成要素を示している。図９に示されているように、第１の陽性対照試料６２０ａ及び第２の陽性対照試料６２０ｂは、同じ検出手段によって検出され得る共通のバイオマーカーを含む。本発明では、第３の対照試料６２２ａ及び第４の対照試料６２２ｂは、対照試料６２０ａ及び６２０ｂとは異なる共通のバイオマーカーを含んでもよいと考えられている。或いは、第３の対照試料６２２ａ及び第４の対照試料６２２ｂは、信号レベルは異なるが第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料と同じバイオマーカーを含んでもよい。また、第３の対照試料６２２ａ及び第４の対照試料６２２ｂは、第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料と同程度に陰性対照としての役割を果たしてもよい。
【００３２】
図９に示されているように、スライド６１０は、第１の主面６１４を含む実質的に平面状の基板６１２を含み、第１の主面６１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域６１６を有する。第１の位置及び第２の位置は、基板の長手方向軸線に沿って長手方向に離間され、かつ長手方向軸線から横方向に（すなわち、長手方向軸線のどちらか一方の側に）又は長手方向軸線に対して離間されている。すなわち、対照試料６２０ａは、長手方向端部６１７ｂ及び縁部６１８ｂのより近くに配置されている対照試料６２０ｂに対して、長手方向端部６１７ａ及び縁部６１８ａのより近くに配置されているように示されている。第１の位置及び第２の位置は、互いに試料固定領域６１６を挟んで実質的に正反対に位置する、すなわち、試料固定領域６１６を挟んで長手方向に離間されている。とはいえ、本発明では、正確な位置は、領域６１６を挟んで互いに正確に対向するように幾何学的に制限される必要はないと考えられている。同様に、第３の位置及び第４の位置は、基板の長手方向軸線に沿って長手方向に離間され、かつ長手方向軸線から横方向に（又は長手方向軸線のどちらか一方の側に）離間されている。すなわち、対照試料６２２ａは、長手方向端部６１７ｂ及び縁部６１８ａのより近くに配置されている対照試料６２２ｂに対して、長手方向端部６１７ａ及び縁部６１８ｂのより近くに配置されているように示されている。第３の位置及び第４の位置は、互いに試料固定領域６１６を挟んで実質的に正反対に位置する、すなわち、試料固定領域６１６を挟んで長手方向に離間されている。とはいえ、本発明では、正確な位置は、領域６１６を挟んで互いに正確に対向するように幾何学的に制限される必要はないと考えられている。
【００３３】
図１０に示されているように、本発明では、顕微鏡スライド７１０であって、第１の陽性対照試料７２０ａ及び第２の陽性対照試料７２０ｂを固定するための第１の位置及び第２の位置並びに第３の対照試料７２２ａ及び第４の対照試料７２２ｂを固定するための第３の位置及び第４の位置に加えて、顕微鏡スライド７１０が、第５の対照試料７２４ａ及び第６の対照試料７２４ｂを固定するための第５の位置及び第６の位置をさらに含むように設計された顕微鏡スライド７１０がさらに考えられている。前と同様に、同じ番号は、本発明の他の実施形態の同じ構成要素を示している。図１０に示されているように、第１の陽性対照試料７２０ａ及び第２の陽性対照試料７２０ｂは、同じ検出手段によって検出され得る共通のバイオマーカーを含む。本発明では、第３の対照試料７２２ａ及び第４の対照試料７２２ｂが、第１の対照試料７２０ａ及び第２の対照試料７２０ｂとは異なる共通のバイオマーカーを含んでもよいこと、並びに、第５の対照試料７２４ａ及び第６の対照試料７２４ｂが、さらに異なる共通のバイオマーカーを含んでもよいことが考えられている。或いは、第３の対照試料７２２ａ及び第４の対照試料７２２ｂ並びに第５の対照試料７２４ａ及び第６の対照試料７２４ｂは、信号レベルは異なるが第１の陽性対照試料及び第２の陽性対照試料と同じバイオマーカーを含んでもよい。また、第３の対照試料７２２ａ及び第４の対照試料７２２ｂのペア並びに第５の対照試料７２４ａ及び第６の対照試料７２４ｂのペアの一方が、陰性対照としての役割を果たしてもよい。
【００３４】
図１０に示されているように、スライド７１０は、第１の主面７１４を含む実質的に平面状の基板７１２を含み、第１の主面７１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域７１６を有する。第１の位置及び第２の位置は、基板の長手方向軸線に沿って長手方向に離間され、かつ長手方向軸線から横方向に（又は長手方向軸線のどちらか一方の側に）離間されている。すなわち、対照試料７２０ａは、長手方向端部７１７ｂ及び縁部７１８ｂのより近くに配置されている対照試料７２０ｂに対して、長手方向端部７１７ａ及び縁部７１８ａのより近くに配置されているように示されている。第１の位置及び第２の位置は、互いに試料固定領域７１６を挟んで実質的に正反対に位置する、すなわち、試料固定領域７１６を挟んで長手方向に離間されている。とはいえ、本発明では、正確な位置は、領域７１６を挟んで互いに正確に対向するように幾何学的に制限される必要はないと考えられている。
【００３５】
第３の陽性対照試料７２２ａ及び第４の陽性対照試料７２２ｂを固定するための第３の位置及び第４の位置は、主面７１４上の試料固定領域７１６の両側にある。すなわち、これらの位置は、試料固定領域７１６を挟んで実質的に横方向に離間されている。対照試料７２２ａが、試料１５と基板７１２の縁部７１８ａとの間に配置されている一方で、対照試料７２２ｂは、試料１５と基板７１２の縁部７１８ｂとの間に対向して配置されている。
【００３６】
第１の位置及び第２の位置と同様に、第５の位置及び第６の位置は、基板の長手方向軸線に沿って長手方向に離間され、かつ長手方向軸線から横方向に（又は長手方向軸線のどちらか一方の側に）離間されている。すなわち、対照試料７２４ａは、長手方向端部７１７ａ及び縁部７１８ｂのより近くに配置されている対照試料７２４ｂに対して、長手方向端部７１７ｂ及び縁部７１８ａのより近くに配置されているように示されている。第５の位置及び第６の位置は、互いに試料固定領域７１６を挟んで実質的に正反対に位置する、すなわち、試料固定領域７１６を挟んで長手方向に離間されている。とはいえ、本発明では、正確な位置は、領域７１６を挟んで互いに正確に対向するように幾何学的に制限される必要はないと考えられている。
【００３７】
上記の図９及び図１０並びに以下の図１２に示されているように、異なる量のバイオマーカー（例えば、抗原レベル）（前に述べた異なる種類のバイオマーカーとは対照的に）を含む２つ以上の陽性対照試料が、顕微鏡スライド上に含まれてもよい。このような実施形態では、対照試料の種類のそれぞれは、同じ対照試料のペアが、組織固定領域の一部分を挟んで配置されるように少なくともペアとして用意される。例えば、異なるレベルの抗原発現を有する異なる細胞株が、個々の細胞ペレットを作製するために選択されてもよい。或いは、異なる量の細胞を有する同じ細胞株が、異なる細胞ペレットを作製するために選択されてもよい。これらの細胞ペレットは、試料固定領域の周りに所定のパターンで配置されてもよい。このように、対照は、低レベル、中レベル、又は高レベルの特定のバイオマーカーを含んでもよい。或いは、対照は、ゼロレベル、中レベル、又は高レベルの特定のバイオマーカーを含んでもよい。これらの対照試料は、定量化され、結果が、それらの予想される細胞の発現レベル又は量と比較されてもよい。これらの結果は、顕微鏡スライド表面にわたって十分かつ均一な範囲が存在するか否か、又は、試料抗原が適切に回収されたか否か（特に、大きな組織試料のための酵素抗原回収方法において）を判定することができる。
【００３８】
他の実施形態では、２つ以上の異なる種類のバイオマーカー（例えば、抗原）を含む陽性対照試料が、顕微鏡スライド上に含まれる。また、これらの実施形態では、陽性対照試料のそれぞれは、異なる抗原レベルを含んでもよい。例えば、異なるレベルのタンパク質発現を有する異なる細胞株が、個々の細胞ペレットを作製するために選択されてもよい。或いは、異なる種類の抗原を含む細胞株が選択され、異なる細胞ペレットのそれぞれが、異なる量の細胞を含むようにされてもよい。これらの細胞ペレットは、試料固定領域の周りに所定のパターンで配置されてもよい。これらの陽性対照試料は、定量化され、結果が、それらの予想される発現レベルと比較されてもよい。
【００３９】
多重実験に関して、多数の細胞ペレットが、すべてのマーカーに及ぶ染色強度の範囲を確保するために使用されてもよい。このような場合、対照は、すべてのマーカーに関して空間パターンの推定を可能にするように設計されたパターンでスライド上に選択されて配列されてもよい。
【００４０】
異なるバイオマーカーレベル又は異なる種類のバイオマーカーを有する陽性対照試料に加えて、さらに陰性対照試料が加えられてもよい。それゆえ、特定の実施形態では、本発明の顕微鏡スライドは、陽性対照試料及び陰性対照試料の両方を含んでもよい。したがって、本発明の顕微鏡スライドは、試料固定領域に隣接する位置で第１の主面上に固定された１つ以上の陰性対照試料を含んでもよい。
【００４１】
表１は、本発明の特定の実施形態に従って細胞ペレット対照を作製することに有用な例示的な細胞株を提示している。細胞株は、異なるレベルのＨＥＲ２発現を有する。
【００４２】
【表１】
0006540686.tif 000002
図１１は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド８１０を描いている。前と同様に、同じ番号は、同じ構成要素を示している。スライド８１０は、第１の主面８１４を含む実質的に平面状の基板８１２を含み、第１の主面８１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域８１６を有する。スライド８１０は、８つの対照試料８２０ａ〜８２０ｈをさらに含み、８つの対照試料８２０ａ〜８２０ｈは、それぞれ、表面８１４上の８つの位置に配置されている。図１１に示されているように、顕微鏡スライド８１０は、実質的に均等に離間されている細胞ペレットによって周囲に境界が形成された組織固定領域を含む。
【００４３】
図１２は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド９１０を描いており、ここでは、同じ番号は、同じ構成要素を示している。スライド９１０は、第１の主面９１４を含む実質的に平面状の基板９１２を含み、第１の主面９１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域９１６を有する。スライド９１０は、８つの対照試料９２０ａ〜９２０ｄ及び９２２ａ〜９２２ｄをさらに含み、８つの対照試料９２０ａ〜９２０ｄ及び９２２ａ〜９２２ｄは、それぞれ、表面９１４上の８つの位置に交互に配置されている。図１２に示されているように、顕微鏡スライド９１０は、実質的に均等に離間されている細胞ペレットによって周囲に境界が形成された組織固定領域を含む。望ましくは、陽性対照試料９２０ａ〜９２０ｄは、同じ検出手段によって検出され得る共通のバイオマーカーを含む。同様に、対照試料９２２ａ〜９２２ｄは、９２０ａ〜９２０ｄの共通のバイオマーカーとは異なる共通のバイオマーカーを含んでもよい。或いは、対照試料９２２ａ〜９２２ｄは、検出レベルは異なるが陽性対照試料と同じバイオマーカーを含んでもよい。また、対照試料９２２ａ〜９２２ｄは、陽性対照試料９２０ａ〜９２０ｄに対して陰性対照としての役割を果たしてもよい。
【００４４】
図１３は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド１０１０を描いている。スライド１０１０は、第１の主面１０１４を含む実質的に平面状の基板１０１２を含み、第１の主面１０１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域１０１６を有する。スライド１０１０は、８つの陽性対照試料１０２０ａ〜１０２０ｈをさらに含み、８つの陽性対照試料１０２０ａ〜１０２０ｈは、それぞれ、表面１０１４上の８つの位置に配置されている。図１３に示されているように、対照試料１０２０ａ、１０２０ｈ、及び１０２０ｇは、組織試料１５と長手方向縁部１０１７ａとの間に配置されており、長手方向縁部１０１７ａと平行な線分を形成している。また、対照試料１０２０ｈは、実質的に対照試料１０２０ａ及び１０２０ｇの中間に配置されている。同様に、対照試料１０２０ｃ、１０２０ｄ、及び１０２０ｅは、組織試料１５と長手方向縁部１０１７ｂとの間に配置されており、長手方向縁部１０１７ｂと平行な線分を形成している。また、対照試料１０２０ｄは、実質的に対照試料１０２０ｃ及び１０２０ｅの中間に配置されている。
【００４５】
図１３に示されているように、対照試料１０２０ｂは、実質的に対照試料１０２０ａ及び１０２０ｃの中間に配置されている。対照試料１０２０ａ、１０２０ｂ、及び１０２０ｃは、組織試料１５と縁部１０１８ａとの間に配置されており、実質的に、縁部１０１８ａと平行な線分を形成している。対照試料１０２０ｆは、実質的に対照試料１０２０ｅ及び１０２０ｇの中間に配置されている。対照試料１０２０ｅ、１０２０ｆ、及び１０２０ｇは、組織試料１５と縁部１０１８ｂとの間に配置されており、実質的に、縁部１０１８ｂと平行な線分を形成している。
【００４６】
図１４は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド１１１０を描いており、ここでは、同じ番号は、同じ構成要素を示している。スライド１１１０は、第１の主面１１１４を含む実質的に平面状の基板１１１２を含み、第１の主面１１１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域１１１６を有する。スライド１１１０は、試料固定領域１１１６の周りに配置された８つの陽性対照試料１１２０ａ〜１１２０ｈをさらに含む。さらに、スライド１１１０は、主面１１１４に固定された実質的に平面状のプラットフォーム１１３０ａ〜１１３０ｈを含み、プラットフォーム１１３０ａ〜１１３０ｈはそれぞれ、実質的に平面状のプラットフォーム面１１３２ａ〜１１３２ｈをそれぞれ有する。したがって、プラットフォーム面１１３２ａ〜１１３２ｈのそれぞれは、それぞれ、その上に対照試料１１２０ａ〜１１２０ｈをそれぞれ支持している。プラットフォーム面１１３２ａ〜１１３２ｈは、第１の主面１１１４よりも高い位置にあり、このため、対照試料１１２０ａ〜１１２０ｈがそれぞれ、成功した染色を示す場合に、組織試料１５も同様に適切に染色されたことのさらにより大きな確信が得られる（特に、スライド１１１０が染色中に表を上に向けて配置されている（すなわち、第１の主面１１１４が上を向いている）ときに）。望ましくは、プラットフォーム１１３０ａ〜１１３０ｈは、組織試料よりも大きな厚さを有するが、本発明では、どんな厚さであっても染色の確信度の向上がもたらされると考えられている。
【００４７】
対照試料１１２０ａ、１１２０ｈ、及び１１２０ｇ（並びにプラットフォーム１１３０ａ、１１３０ｈ、及び１１３０ｇ）は、組織試料１５と長手方向縁部１１１７ａとの間に配置されており、長手方向縁部１１１７ａと平行な線分を形成している。また、対照試料１１２０ｈは、実質的に対照試料１１２０ａ及び１１２０ｇの中間に配置されている。同様に、対照試料１１２０ｃ、１１２０ｄ、及び１１２０ｅ（並びにプラットフォーム１１３０ｃ、１１３０ｄ、及び１１３０ｅ）は、組織試料１５と長手方向縁部１１１７ｂとの間に配置されており、実質的に、長手方向縁部１１１７ｂと平行な線分を形成している。また、対照試料１１２０ｄは、実質的に対照試料１１２０ｃ及び１１２０ｅの中間に配置されている。
【００４８】
対照試料１１２０ｂは、実質的に対照試料１１２０ａ及び１１２０ｃの中間に配置されている。対照試料１１２０ａ、１１２０ｂ、及び１１２０ｃは、組織試料１５と縁部１１１８ａとの間に配置されており、縁部１１１８ａと平行な線分を形成している。対照試料１１２０ｆは、実質的に対照試料１１２０ｅ及び１１２０ｇの中間に配置されている。対照試料１１２０ｅ、１１２０ｆ、及び１１２０ｇは、組織試料１５と縁部１１１８ｂとの間に配置されており、実質的に、縁部１１１８ｂと平行な線分を形成している。
【００４９】
図１５は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド１２１０を描いており、ここでは、同じ番号は、同じ構成要素を示している。スライド１２１０は、貼り付けられた平面状の基板プラットフォーム１２４０を含む実質的に平面状の基板１２１２を含む。貼り付けられた基板プラットフォームは、プラットフォーム面１２４２及び基板１２１２の第１の主面１２１４への開放された入口（ｏｐｅｎ  ｒｅｇｉｓｔｒｙ）のアパーチャ１２５０を含む。主面１２１４は、アパーチャ１２５０を介して露出されている、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域１２１６を含む。スライド１２１２は、プラットフォーム面１２４２上の、アパーチャ１２５０の周りに配置された８つの陽性対照試料１２２０ａ〜１２２０ｈをさらに含む。アパーチャ１２５０及び第１の主面１２１４は、組織試料を固定するための平面状の凹領域を形成している。図１５に示されているように、対照試料１２２０ａ、１２２０ｈ、及び１２２０ｇは、組織試料１５と長手方向縁部１２１７ａとの間に配置されており、実質的に、長手方向縁部１２１７ａと平行な線分を形成している。また、対照試料１２２０ｈは、実質的に対照試料１２２０ａ及び１２２０ｇの中間に配置されている。同様に、対照試料１２２０ｃ、１２２０ｄ、及び１２２０ｅは、組織試料１５と長手方向縁部１２１７ｂとの間に配置されており、実質的に、長手方向縁部１２１７ｂと平行な線分を形成している。また、対照試料１２２０ｄは、実質的に対照試料１２２０ｃ及び１２２０ｅの中間に配置されている。
【００５０】
対照試料１２２０ｂは、実質的に対照試料１２２０ａ及び１２２０ｃの中間に配置されている。対照試料１２２０ａ、１２２０ｂ、及び１２２０ｃは、組織試料１５と縁部１２１８ａとの間に配置されており、縁部１２１８ａと平行な線分を形成している。対照試料１２２０ｆは、実質的に対照試料１２２０ｅ及び１２２０ｇの中間に配置されている。対照試料１２２０ｅ、１２２０ｆ、及び１２２０ｇは、組織試料１５と縁部１２１８ｂとの間に配置されており、縁部１２１８ｂと平行な線分を形成している。本発明では、基板プラットフォーム１２４０には、染色後に試料固定領域１２１６から染色剤を排液することを補助するためにアパーチャ１２５０と基板１２１２の縁部とを流体連通するように延在する細長い溝（図示せず）がさらに形成されてもよいとさらに考えられている。スライド１２１０が、主面１２１４が上向きの状態で染色されるとき、試料固定領域１２１６とプラットフォーム面１２４２との相対高さは、対照試料１２２０ａ〜１２２０ｈのすべてが、それらが染色されたことを示す場合に組織試料１５の適切な染色のさらなる確信をもたらす。
【００５１】
図１６は、本発明のさらに別の顕微鏡スライド１３１０を描いており、ここでは、同じ番号は、同じ構成要素を示している。スライド１３１０は、第１の主面１３１４を含む実質的に平面状の基板１３１２を含み、第１の主面１３１４は、分析される組織試料１５を受けるための組織試料固定領域１３１６を有する。スライド１３１０は、８つの陽性対照試料１３２０ａ〜１３２０ｈをさらに含み、８つの陽性対照試料１３２０ａ〜１３２０ｈは、それぞれ、図１３のスライド１０１０について説明されているのと概ね同様の、表面１３１４上の８つの位置に配置されている。スライド１３１０は、主面１３１４に固定されたラベル１３６０をさらに備える。ラベル１３６０は、ラベル面１３６２を含み、ラベル面１３６２上には、スライド、組織試料、又は染色工程に関係する情報などの表示が印刷されている。このような表示はさらに、表面１３６２上に印刷されたバーコードか、又はそこに固定された別のラベルのバーコードによって提供されてもよい。図１６に示されているように、ラベル１３６０は、長手方向縁部１３１７ａと対照試料１３２０ａ、１３２０ｈ、及び１３２０ｇとの間に位置している。本発明では、ラベル１３６０と同様のラベルが、本発明を具体化したスライド上に設けられてもよいと考えられている。
【００５２】
別の態様において、本発明は、組織試料分析のためのキットを提供する。キットは、本発明の特定の実施形態に係る１つ以上の顕微鏡スライドを含む。スライドは、分析される組織試料を受けるように適合されている。望ましくは、スライドは、実行される分析に関係する表示を含むラベルを受けるようにさらに適合される。また、キットは、スライドについての情報を提供し、スライドの適切な使用法を指示するユーザマニュアルを含んでもよい。
【００５３】
別の態様において、本発明は、本発明の態様に係る顕微鏡スライドを作製する方法であって、陽性対照試料の薄層を顕微鏡スライド上の少なくとも第１の位置及び第２の位置に移動させて固定するステップを含む方法を提供する。好ましくは、使用されるスライドは、帯電したスライドである。好ましくは、陽性対照試料の薄層を顕微鏡スライド上に移動させて固定するステップの後に、その後のベーキングステップが含まれる。
【００５４】
特定の実施形態では、薄層の対照試料は、約５ミクロンの試料の切片である。
【００５５】
特定の実施形態では、陽性対照試料は、細胞ペレットを含む。好ましくは、細胞ペレットは、溶融したパラフィンワックス中に懸濁された、ホルマリンで固定した細胞を含む。
【００５６】
図１７は、本発明の顕微鏡スライドに対照試料を固定するためのシステム１５００を描いている。システム１５００は、実質的に平面状のプリントヘッド面１５８４を有するスタンプ１５８２を含み、プリントヘッド面１５８４は、そこから突出する１つ以上のプリントヘッド１５８６を有する。プリントヘッド１５８６は、スライドの主面上に堆積されるある量の対照試料材料を保持するための平面を形成している。システム１５００は、溶融したパラフィンワックス及びホルマリンで固定した細胞ペレットの懸濁液を含むリザーバ１５８８にプリントヘッド１５８６を浸漬させる。細胞ペレットは、プリントヘッド１５８６に付着する。次に、システム１５００は、スライド１５１０の主面１５１４にスタンプ１５８２を移動させる。スタンプ１５８２は、主面１５１４への細胞ペレットの移動をもたらすために表面１５１４に接触される。プリントヘッド１５８６は、スライド１５１０の試料固定領域１５１６の周りの、本発明の対照試料に対応する位置に細胞ペレットを堆積させるようにプリント面１５８４に配列されている。当該技術分野で周知のように、スライドは、細胞ペレットの移動をより良く可能にするために帯電されてもよい。さらに、本発明では、次にスライドは、対照試料を適所に固定するためにベーキングされると考えられている。本発明では、スライドの試料固定領域の周りの他の利用可能な位置に、異なるマーカーを含む対照試料を堆積させるために異なる配列のプリントヘッドを有する異なるプリントヘッドが用いられてもよいとさらに考えられている。一般的に、堆積される細胞の厚さは、細胞の単分子層に関して約５ミクロンのオーダーであり、これは、スライドに固定される組織切片の厚さと概ね同等である。この接触印刷方法は、処理量が高く、単純で、低コストである。
【００５７】
本発明のスライド上に対照試料を堆積させるための他の方法は、限定のためではなく例示のために、溶融したワックス溶液中の一定分量の、ホルマリンで固定した細胞ペレットをスライド上に加えるマイクロディスペンス技術を使用することを含む。或いは、対照試料の細胞は、スライドサイズのブロックでホルマリンで固定されてパラフィン包埋されてもよい。ブロックからのスライス全体が、スライド上に配置され、後に、試料固定領域が、機械的又は化学的な手段によって刻出されてもよい。或いはさらに、ブロックは、スライドの試料固定領域の形状のアパーチャを形成して、試料固定領域の周囲の外形部のみがスライドに適用されるようにするために中抜きされてもよい。
【００５８】
別の態様において、本発明は、分析の方法を提供する。
【００５９】
一実施形態では、分析の方法は、陽性対照試料のための検出手段によって本発明の実施形態に係る顕微鏡スライドを染色するステップと、少なくとも第１の位置及び第２の位置から陽性対照試料を検出するステップとを含む。
【００６０】
特定の実施形態では、陽性対照試料のすべての位置からの信号の存在は、染色品質のリアルタイムの確認をもたらす。したがって、陽性対照試料のある位置からの信号の不在は、染色の失敗を示す。
【００６１】
特定の実施形態では、スライドは、試料固定領域１６に隣接する位置で第１の主面上に固定された１つ以上の陰性対照試料をさらに含み、この場合、陰性対照試料のある位置からの信号の存在は、染色の失敗を示す。
【００６２】
特定の実施形態では、顕微鏡スライドは、組織試料をさらに含む。
【００６３】
特定の実施形態では、陽性対照試料は、細胞ペレットであり、検出ステップは、細胞ペレットを含まない、画像の部分をマスクすること及び細胞ペレットの各細胞の内部のマーカーの局在を明らかにする（ａｃｃｏｕｎｔ  ｆｏｒ）ことを含む。好ましくは、本方法は、細胞ペレットの各細胞の核及び各細胞の各核の周りの環状領域の輪郭を描く、２つの区画への画像分割を実行するステップをさらに含む。好ましくは、本方法は、視野内の細胞ペレットの各細胞の両方の区画における各マーカーの平均染色を測定するステップ及び全体の視野メトリックを生成するためにこれらの細胞レベルメトリックを集約するステップをさらに含む。視野メトリックは、知られている細胞核マーカーの平均細胞核発現を含んでもよい。より好ましくは、本方法は、線形統計モデルの係数を調べることによってアーチファクトを検出するステップ及び線形統計モデルを用いて空間染色アーチファクトを推定するステップをさらに含み、この場合、応答は、各細胞ペレットに関する視野レベルの染色メトリックであり、予測器は、スライドの２つの空間次元である。さらにより好ましくは、本方法は、不均一な染色プロファイルを推定して取り去ることに適したモデルを使用することによって小さな空間アーチファクトを補正するステップをさらに含む。
【００６４】
本発明の特定の実施形態について示し、説明してきたが、本発明の教示から逸脱することなく変更及び修正が行われ得ることは、当業者には明らかであろう。以上の説明及び添付図面に記載されている主題は、限定としてではなく例示としてのみ提示されている。本発明の実際の範囲は、従来技術に基づくその適切な観点から考慮された場合の以下の特許請求の範囲において規定されることが意図されている。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【図５】
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【図６】
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【図７】
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【図８】
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【図９】
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【図１０】
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【図１１】
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【図１２】
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【図１３】
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【図１４】
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【図１５】
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【図１６】
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【図１７】
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