(57)【特許請求の範囲】
【請求項１】
軽鎖可変領域及び重鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変領域が、
配列番号６２の相補性決定領域軽鎖１（ＣＤＲＬ１）アミノ酸配列と、
配列番号６８のＣＤＲＬ２アミノ酸配列と、
配列番号７５のＣＤＲＬ３アミノ酸配列と、
を含み、前記重鎖可変領域が、
配列番号４４及び１６１からなる群より選択される相補性決定領域重鎖１（ＣＤＲＨ１）アミノ酸配列と、
配列番号４７のＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号５８のＣＤＲＨ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
【請求項２】
軽鎖可変アミノ酸配列と、重鎖可変アミノ酸配列とを含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変アミノ酸配列が、配列番号１４３を含み、前記重鎖可変アミノ酸配列が、配列番号１３３を含む、抗体又はその抗原結合断片。
【請求項３】
ＩｇＧ４重鎖定常領域とＩｇＧ４軽鎖定常領域とを更に含む、請求項１又は２に記載の単離抗体又はその抗原結合断片。
【請求項４】
前記重鎖定常領域が、配列番号１５９のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖定常領域が、配列番号１６０のアミノ酸配列を含む、請求項３に記載の単離抗体又はその抗原結合断片。
【請求項５】
表面プラズモン共鳴によって求めたとき、１×１０-7Ｍ以下のＫDでヒトＣＤ２７に結合する、請求項１から４のいずれか一項に記載の単離抗体又はその抗原結合断片。
【請求項６】
請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体又はその抗原結合断片を含む薬学的に許容できる配合を含む製品。
【請求項７】
請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体又はその抗原結合断片をコードする、単離核酸分子。
【請求項８】
請求項７に記載の単離核酸分子を含む単離核酸ベクター。
【請求項９】
請求項８に記載の単離核酸ベクターを含む、原核又は真核宿主細胞。
【請求項１０】
請求項９に記載の宿主細胞であって、ＣＯＳ−１、ＣＯＳ−７、ＨＥＫ２９３、ＢＨＫ２１、ＣＨＯ、ＢＳＣ−１、Ｈｅｐ  Ｇ２、６５３、ＳＰ２／０、２９３、ＨｅＬａ、骨髄腫若しくはリンパ腫細胞、又はこれらの任意の誘導体、不死化若しくは形質転換細胞から選択される少なくとも１つである、宿主細胞。
【請求項１１】
請求項７に記載の核酸分子をベクターに組み込み、宿主細胞、非ヒトトランスジェニック動物、又は形質転換植物を形質転換して抗体又はその抗原結合断片を発現させ、前記発現した抗体又はその抗原結合断片を回収することを含む、ＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片を生産する方法。
【請求項１２】
Ｔ細胞によって媒介されるＢ細胞の抗体産生を阻害するための医薬組成物であって、請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体又はその抗原結合断片を含み、前記医薬組成物は、被験体のＴ細胞の一部と有効な量の請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体又はその抗原結合断片とを接触させることを含む方法において使用するためのものであり、前記抗体又はその抗原結合断片が、ヒトＣＤ７０タンパク質又はヒトＣＤ７０タンパク質の一部の存在下でヒトＴ細胞におけるＣＤ２７の活性化を阻害する、医薬組成物。
【請求項１３】
前記被験体が、炎症性疾患に罹患している、請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項１４】
前記炎症性疾患が、全身性エリテマトーデスである、請求項１３に記載の医薬組成物。
【請求項１５】
前記被験体が、肺又は胸膜系の疾患、中枢又は末梢神経系の疾患、目又は視覚系の疾患、胃腸及び消化器系の疾患、心血管系の疾患、感染性疾患、及び寄生虫性感染症からなる群より選択される疾患に関連する抗原特異的体液性免疫反応を示す、請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項１６】
前記抗体又はその抗原結合断片が、前記被験体に全身投与される、請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項１７】
ナイーブＴ細胞の増殖を阻害するための医薬組成物であって、請求項１から５のいずれか一項に記載の抗体又はその抗原結合断片を含み、前記抗体又はその抗原結合断片が、ヒトＣＤ７０タンパク質又はヒトＣＤ７０タンパク質の一部の存在下でヒトＴ細胞におけるＣＤ２７の活性化を阻害する、医薬組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【０００１】
（関連出願の相互参照）
本発明は、ＣＤ２７タンパク質に対するヒト抗体、及びその使用に関し、より具体的には、ヒトＣＤ２７タンパク質に対するヒト抗体、及び炎症性疾患の治療におけるその使用に関する。
【背景技術】
【０００２】
（関連技術）
ＣＤ２７は、Ｉ型膜貫通タンパク質であり、Ｔ細胞、ナチュラルキラー細胞、並びに抗体を分泌するプラズマ細胞及びメモリーＢ細胞の大部分において表面抗原として発現するＴＮＦ受容体スーパーファミリーの一員（ＴＮＦＳＦ２７）である。ＣＤ７０は、腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリーメンバー７（ＴＮＦＳＦ７）とも呼ばれるサイトカインであり、ＣＤ２７の同族リガンドである。ＴＮＦＳＦリガンド−受容体相互作用は、Ｔ依存性Ｂ細胞分化を制御することができ（Ｊａｃｑｕｏｔ  Ｓ．２０００  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｒｅｓ．２１（１）：２３〜３０）、様々な細胞においてアポトーシス細胞死を誘導することができる。
【０００３】
ＣＤ２７：ＣＤ７０ライゲーションにより、カノニカル及び非カノニカルなＮＦ−ｋβシグナル伝達経路が活性化され、続いて、Ｂ及びＴ細胞の分化、プラズマ細胞の分化を刺激し、次いで、抗体が分泌される（Ｙａｍａｍｏｔｏ，Ｈ．１９９８  Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６１（９）：４７５３〜９）。また、ＣＤ２７をＯＸ４０と同時に刺激すると、４ー１ＢＢが、活性化Ｔ細胞の生存を促進し（Ｃｒｏｆｔ，Ｍ．２００３  Ｃｙｔｏｋｉｎｅ  Ｇｒｏｗｔｈ  Ｆａｃｔｏｒ  Ｒｅｖ．１４（３〜４）：２６５〜７３）、それによって、多数のエフェクター及びメモリーＴ細胞を制御し、ＩＬ−４及びＩＦＮガンマ等のサイトカインの産生を促進したり、ＩＬ２及びＩＬ−１２等の他のサイトカインの作用に対するＴ細胞の応答を調節したりすることによって、直接Ｔ細胞の機能を管理する。
【０００４】
ヒト及び動物における研究により、全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）（Ｄｏｅｒｎｅｒ  Ｔ  Ｌｕｐｕｓ  ２００４  １３（５）：２８３〜９）、関節リウマチ（Ｔａｋ，ＰＰ  ｅｔ  ａｌ．１９９６  ｃｌｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｉｍｍｕｎｏｐａｔｈｏｌ  ８０（２）：１２９〜３８）及び多発性硬化症（Ｈｉｎｔｚｅｎ  ＲＱ  ｅｔ  ａｌ．１９９１  Ｊ  Ｎｅｕｒｏｉｍｍｕｎｏｌ  ３５（１〜３）：２１１〜７）を含む様々な免疫関連疾患におけるＣＤ２７：ＣＤ７０経路の重要な役割が示唆されている。他方、ＣＤ７０は、悪性Ｂ細胞において様々な程度発現することが報告されており、ＣＤ７０：ＣＤ２７複合体は、抗腫瘍免疫を活性化し、腫瘍の成長を低減することによって抗腫瘍応答を媒介することができる（Ｂｏｒｓｔ  Ｊ，Ｈｅｎｄｒｉｋｓ  Ｊ  ａｎｄ  Ｘｉａｏ  Ｙ．２００５．Ｃｕｒｒ  Ｏｐｉｎ  Ｉｍｍｕｎｏｌ．１７（３）：２７５〜８１）。また、ＣＤ２７は、感染部位におけるＣＤ４＋及びＣＤ８＋Ｔ細胞の蓄積を管理することができる（Ｈｅｎｄｒｉｃｋｓ  ｅｔ  ａｌ．２０００  Ｎａｔｕｒｅ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  １，４３３〜４４０）。
【０００５】
ＣＤ７０は、正常な非造血細胞では発現しない。ＣＤ７０の発現は、一時的に抗原活性化Ｔ及びＢ細胞に制限されると考えられ、その発現は、抗原刺激が終わったときダウンレギュレートされる。動物モデルから得られた証拠は、ＣＤ７０が、例えば、関節リウマチ（Ｂｒｕｇｎｏｎｉ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７  Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｌｅｔｔ．５５：９９〜１０４）、乾癬性関節炎（Ｂｒｕｇｎｏｎｉ  ｅｔ  ａｌ．，１９９７，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｌｅｔｔ．５５：９９〜１０４）、及び狼瘡（Ｏｅｌｋｅ  ｅｔ  ａｌ．，２００４，Ａｒｔｈｒｉｔｉｓ  Ｒｈｅｕｍ．５０：１８５０〜６０）等の免疫疾患の原因である可能性があることを示唆している。免疫応答におけるその潜在的な役割に加えて、ＣＤ７０は、リンパ腫Ｂ細胞、ホジキン及びリード・ステルンベルグ細胞、神経起源の悪性細胞、並びに多数の癌腫を含む様々な形質転換細胞でも発現する。
【０００６】
国際公開第２００８／０５１４２４（Ｕｎｉｖ．Ｓｏｕｔｈ  Ｈａｍｐｔｏｎ）に記載されているアゴニストＣＤ２７結合抗体は、Ｔ細胞免疫を促進するために有用であると記載されており、このような抗体は、ＣＤ７０によって影響を受けなくする（阻害されなくする）結合エピトープを有する。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【０００７】
ＣＤ２７及び／又はＣＤ７０の変化に関するげっ歯類における研究では、この受容体リガンド相互作用の潜在的に重要な役割が立証されているが、特にＣＤ７０の非存在下でＣＤ２７発現細胞に対して望ましくないアゴニスト効果を発揮することなく、ＣＤ２７発現細胞に対して臨床的に有用な細胞毒性、細胞増殖抑制性、又は免疫調節性効果を発揮することができるヒトＣＤ２７に特異的なヒト抗体及び他のＣＤ２７：ＣＤ７０相互作用遮断剤を提供することが必要とされている。このような化合物は、腫瘍性細胞の発生又はＣＤ２７発現細胞によって媒介される免疫疾患の調節において有用な治療剤であり得る。
【課題を解決するための手段】
【０００８】
本発明は、宿主被験体の細胞、組織、又は器官におけるＣＤ２７〜ＣＤ７０相互作用に関連する活性を遮断することができるヒトＣＤ２７結合モノクローナル抗体を提供することである。宿主細胞において発現するための核酸によってコードされている例示的なＣＤ２７結合モノクローナル抗体のアミノ酸配列を提供する。更に、本発明のＣＤ２７モノクローナル抗体は、本発明の抗体が結合しているとき、ＣＤ７０型リガンドとのライゲーションによって駆動されるシグナル伝達及び下流の生物活性が妨げられる、ＣＤ２７の細胞外ドメインにおける少なくとも３つの非重複エピトープを定義する。
【０００９】
本発明の別の態様は、ＣＤ２７タンパク質の位置２１〜１９１の残基によって定義されるＣＤ２７タンパク質のエピトープと反応する単離抗ＣＤ２７抗体である。
【００１０】
本発明の別の態様は、例えば保存的置換等の下記配列の変異体を含む、配列番号７６、７８、８０、１０２〜１２６、１２８〜１３６、及び１４５〜１４７に示す配列から選択される重鎖可変領域配列と、配列番号７７、７９、８１〜１０１、１２７、１３７〜１４４、及び１４８に示す配列から選択される軽鎖可変領域配列とを有する単離抗体である。
【００１１】
本発明の更なる態様は、例えば保存的置換等の下記配列の変異体を含む、配列番号１〜７５及び１５１〜１５８に示す配列から選択される重鎖及び軽鎖ＣＤＲ配列を有する単離抗体である。
【００１２】
本発明の別の態様は、本発明の抗体をコードする単離ポリヌクレオチドである。
【００１３】
別の態様では、本発明は、抗体Ｃ２１７７及び／若しくはＣ２１８６又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体が結合するか、あるいは抗体Ｃ２１７７及び／若しくはＣ２１８６又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体とＣＤ２７タンパク質に対する結合について競合するタンパク質における、領域によって定義される共通エピトープに結合する抗体に関する。別の実施形態では、本発明は、抗体Ｃ２１９１又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体が結合するか、あるいは抗体Ｃ２１９１又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体とＣＤ２７タンパク質に対する結合について競合するタンパク質における、領域によって定義されるＣＤ２７の細胞外ドメインのエピトープに結合する抗体に関する。別の実施形態では、本発明は、抗体Ｃ２１９２又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体が結合するか、あるいは抗体Ｃ２１９２又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体とＣＤ２７タンパク質に対する結合について競合するタンパク質における、領域によって定義されるＣＤ２７の細胞外ドメインのエピトープに結合する抗体に関する。別の態様では、本発明は、Ｃ２７のＣＤ７０陽性細胞に対する結合を阻害する等、抗体Ｃ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２、又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体のうちの１つ以上によって発揮される他の機能的結合特性を有する、抗体Ｃ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２、又は表３０〜３９に記載のこれらから産生されるヒト抗体のうちの１つ以上に由来する抗体又はその断片を含む。
【００１４】
したがって、本発明の１つの態様は、改変（例えば、ヒト化又はヒト適応）重鎖及び軽鎖を含む改変抗体であって、
（１）前記改変重鎖可変領域が、マウス抗体Ｃ２１７７、Ｃ２１９１、Ｃ２１９２、及びＣ２１８６重鎖由来の１つ以上の相補性決定領域（ＣＤＲ）と、任意で１つ以上のヒトフレームワーク残基置換を有するヒトアクセプター抗体重鎖由来のフレームワークとを含むか、又は由来し、
（２）前記改変軽鎖可変領域が、マウス抗体Ｃ２１７７、Ｃ２１９１、Ｃ２１９２、及びＣ２１８６軽鎖由来の１つ以上の相補性決定領域と、任意で１つ以上のヒトフレームワーク残基置換を有するヒトアクセプター抗体軽鎖由来のフレームワークとを含み、
（３）前記改変抗体が、ヒトＣＤ２７に特異的に結合し、ＣＤ７０との相互作用に干渉する抗体に関する。
【００１５】
更なる実施形態では、改変抗体は、例えば、抗体Ｃ２１７７、Ｃ２１９１、Ｃ２１９２、及び／又はＣ２１８６の１つ以上のＣＤＲに対して９０％、９５％、９８％又は９９．５％同一であるもの等、１つ以上の置換又は欠失で更に改変される１つ以上のＣＤＲで構成されてもよい。
【００１６】
別の実施形態は、ＣＤ２７生物活性に関連する病態の治療又は予防であって、このような治療を必要としている被験体に、治療的に又は予防的に有効な量の本発明の抗体、その一部、又は本発明の抗体の混合物若しくはその一部を投与することによる治療又は予防に関する。
【００１７】
更なる実施形態では、本発明は、ワクチンの成分として抗原エピトープを含む。配列番号１の残基２１〜１９１の一部又は全ての細断片又は三次元アナログ、あるいはこれらの保存的変化を含む上記ポリペプチドエピトープをコードしているポリペプチド又はポリヌクレオチドは、本発明の抗体によって認識される。ポリペプチド及びポリヌクレオチドは、ＣＤ２７の生物活性に関連する病態と戦うか又は予防することができるＣＤ２７に対する抗体の産生を誘発するために宿主を能動的に免疫するのに有用である。
【００１８】
また、本発明は、治療的に又は予防的に有効な量の抗体又はその一部を投与することによるＣＤ２７の生物活性に関連する病態の治療又は予防において使用するための本発明の抗体を生産、精製、製剤化、及び包装する方法に関する。
【図面の簡単な説明】
【００１９】
【図１】Ｔ細胞の増殖に対するＣ２１７７抗体の効果を示すグラフである。
【図２】ＣＤ２７：Ｃ２１７７：Ｃ２１９１三元複合体の結晶構造を示す。ＣＤ２７断片のＮ及びＣ末端はラベル表示されている。Ｆａｂの重鎖は、軽鎖よりも濃い。
【図３】ＣＤ２７タンパク質ーＣ２１７７抗体の接触の図であり、ＣＤ２７タンパク質残基（エピトープ）は丸で、Ｃ２１７７抗体残基（パラトープ）は四角で囲まれている。
【図４】ＣＤ２７タンパク質ーＣ２１９１抗体の接触の図であり、ＣＤ２７タンパク質残基（エピトープ）は丸で、Ｃ２１９１抗体残基（パラトープ）は四角で囲まれている。
【発明を実施するための形態】
【００２０】
略語
ＣＤＲ−相補的決定領域；ＣＦＳＥ−カルボキシフルオセイン二酢酸サクシニミジルエステル；ＥＣＤ−細胞外ドメイン；ＦＲ−フレームワーク；Ｈ−重鎖；ＧｖＨＤ移植片対宿主病；Ｌ−軽鎖；ＩＦＮ−インターフェロン（ｇ，ガンマ）；Ｉｇ−免疫グロブリン；Ｍａｂ−モノクローナル抗体；ＭＭＰ−マトリックスメタロプロテアーゼ；ＰＢＭＣ−末梢血単核細胞；ＶＬ−可変軽鎖；ＶＨ−可変重鎖。
【００２１】
定義
本明細書で使用されるとき、「抗体」は、抗体全体、及びその任意の抗原結合断片又は短鎖を含む。したがって、抗体は、本発明の抗体の中に組み込むことのできる、重鎖若しくは軽鎖の少なくとも１つの相補性決定領域（ＣＤＲ）若しくはそのリガンド結合部、重鎖若しくは軽鎖可変領域、重鎖若しくは軽鎖定常領域、フレームワーク（ＦＲ）領域、又はこれらの任意の部分、あるいは結合タンパク質の少なくとも一部等が挙げられるが、これらに限定されない免疫グロブリン分子の少なくとも一部を含む、任意のタンパク質又はペプチド含有分子を含む。用語「抗体」は、抗体、その切断断片、特定部分及び変異体を更に含むことを意図し、これには抗体模倣薬が挙げられ、又は抗体の構造及び／若しくは機能を模倣する抗体の部分若しくはその特定断片若しくは一部を含み、単鎖及び単一ドメイン抗体並びにこれらの断片が挙げられる。機能的断片は、予め選択された標的に対する抗原結合断片を含む。抗体の「抗原結合部分」という用語に包含される結合断片の例は、（ｉ）Ｆａｂ断片、ＶＬ、ＶＨ、ＣＬ及びＣＨ、ドメインからなる一価断片；（ｉｉ）ヒンジ領域にてジスルフィド架橋により結合された２つのＦａｂ断片を含む二価断片であるＦ（ａｂ’）２断片；（ｉｉｉ）ＶＨ及びＣＨ、ドメインからなるＦｄ断片；（ｉｖ）抗体の単腕（single arm）のＶＬ及びＶＨドメインからなるＦｖ断片、（ｖ）ＶＨドメインからなるｄＡｂ断片（Ｗａｒｄ  ｅｔ  ａｌ．，（１９８９）Ｎａｔｕｒｅ  ３４１：５４４〜５４６）；並びに（ｖｉ）単離相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む。更に、Ｆｖ断片の２つのドメイン、ＶＬ及びＶＨは別個の遺伝子によりコードされているが、これらのドメインは組み換え方法を使用して合成リンカーにより連結することができ、合成リンカーは、ＶＬ及びＶＨ領域を対にして、一価分子を形成する単一タンパク質鎖（単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られる、例えば、Ｂｉｒｄ  ｅｔ  ａｌ．（１９８８）Ｓｃｉｅｎｃｅ２４２：４２３〜４２６、及びＨｕｓｔｏｎ  ｅｔ  ａｌ．（１９８８）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ  Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８５：５８７９〜５８８３を参照）として作製することを可能にする。このような単鎖抗体も、抗体の「抗原結合部分」という用語に包含されることを意図する。これらの抗体断片は、当業者に既知の従来の技術を使用して得られ、これらの断片はインタクト抗体と同一の方法で、有用性に関してスクリーニングされる。逆に、ｓｃＦｖコンストラクトのライブラリを使用して抗原結合能力に関してスクリーニングした後、従来の技術を使用して、ヒト生殖系列遺伝子配列をコードする他のＤＮＡにスプライスしてもよい。このようなライブラリの１つの例は、「ＨｕＣＡＬ：ヒトコンビナトリアル抗体ライブラリ」（Ｋｎａｐｐｉｋ，Ａ．ｅｔ  ａｌ．Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ（２０００）２９６（１）：５７〜８６）である。
【００２２】
用語「ＣＤＲ」は、抗原結合に関与する、又はその原因である、抗体の相補性決定領域又は超可変領域アミノ酸残基を指す。抗体のヒトＩｇＧサブタイプの超可変領域又はＣＤＲは、軽鎖可変ドメインにおける残基２４〜３４（Ｌ１）、５０〜５６（Ｌ２）、及び８９〜９７（Ｌ３）並びに重鎖可変ドメインにおける３１〜３５（Ｈ１）、５０〜６５（Ｈ２）、及び９５〜１０２（Ｈ３）由来のアミノ酸残基（Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．（１９９１  Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ  Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．）によって記載）及び／又は軽鎖可変ドメインにおける超可変ループ（すなわち、軽鎖可変ドメインにおける残基２６〜３２（Ｌ１）、５０〜５２（Ｌ２）及び９１〜９６（Ｌ３））並びに重鎖可変ドメインにおける２６〜３２（Ｈ１）、５３〜５５（Ｈ２）、又は５２〜５７の現在のＨ２  Ｃｈｏｔｈｉａ定義、及び９６〜１０１（Ｈ３）由来の残基（Ｃｈｏｔｈｉａ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１〜９１７（１９８７）に記載）を含む。
【００２３】
フレームワーク又はＦＲ１〜４残基は、超可変領域以外の括弧付の可変ドメイン残基である。より最近では、普遍的な番号付けシステムが開発され、広く採用されている（ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ  ＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ  ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ  ｓｙｓｔｅｍ（登録商標）（ＩＭＧＴ）（ＬａＦｒａｎｃ，ｅｔ  ａｌ．２００５．Ｎｕｃｌ  Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．３３：Ｄ５９３〜Ｄ５９７）。
【００２４】
本明細書において、ＣＤＲは、アミノ酸配列と、配列の番号付けによる軽鎖又は重鎖内の位置との両方の観点において言及される。免疫グロブリン可変ドメインの構造内のＣＤＲの「位置」が、種間で保存され、ループと呼ばれる構造に存在するとき、構造上の特徴に従って可変ドメイン配列を位置合わせする付番システムを使用することにより、ＣＤＲ及びフレームワーク残基は、容易に同定される。この情報は、ある種の免疫グロブリンから、典型的にヒト抗体由来のアクセプターフレームワークへのＣＤＲ残基のグラフト化及び置換に使用される。
【００２５】
用語「ＣＤ２７」は、ヒトＴＮＦ受容体スーパーファミリー（ＴＮＦＳＦ２７）、ヒト遺伝子９３９（ＣＤ２７遺伝子）の産物（ヒトＣＤ２７Ｌ受容体、ＭＧＣ２０３９３、Ｓ１５２、Ｔ１４、Ｔ細胞活性化抗原ＣＤ２７とも呼ばれる）を指し、Ｃ２７の変異体、アイソフォーム、及び種のホモログを全て含む。発現しているヒトＣＤ２７（ＮＣＢＩアクセッション番号ＮＰ＿００１２３３）は、Ｎ末端に２０アミノ酸の分泌シグナルを有する２６０アミノ酸長のポリペプチドである。したがって、本発明の抗体は、所定の場合では、ヒト以外の種由来のＣＤ２７と交差反応することができる。他の場合では、抗体は、ヒトＣＤ２７に対して完全に特異的であってもよく、種の又は他のタイプの交差反応性を示さない。ＣＤ２７の生物活性とは、１つ以上のリガンド、特に、ＣＤ７０ポリペプチド（ＴＮＦＳＦ７、ＮＰ＿００１２４３）、又はＳＩＶＡ等の他のリガンドによるＣＤ２７の活性化の結果として、ＣＤ２７受容体の結合及び／又は活性化から生じる任意の下流の活性を意味する。ＣＤ２７は、ＮＦ−κ−−β及びＭＡＰＫ８／ＪＮＫを活性化させるシグナルを伝達する。アダプタータンパク質ＴＲＡＦ２及びＴＲＡＦ５は、この受容体のシグナル伝達プロセスを媒介することが示されている。また、ＣＤ２７の生物活性は、ＣＤ２７の特定の短縮型又はＣＤ２７の断片の、それ自体生物活性を示すリガンドに対する結合の結果生じる場合もあり、例えば、完全長タンパク質の残基約２１〜１９１を含むポリペプチドは、ＣＤ７０に結合することができる。ＣＤ２７抗原の細胞質側末端の残基２１３〜２６０は、ＳＩＶＡタンパク質（アポトーシス誘導因子：ＣＤ２７ＢＰ；ＳＩＶＡ１、Ｓｉｖａ−１、ＮＰ＿００６４１８（１７５ａａ））；及びＳｉｖａ−２、ＳＩＶＡ２、ＮＰ＿０６８３５５（１１０ａａ）としても知られている）のＮ末端に結合する。
【００２６】
「エピトープ」という用語は、抗体に対する特異的結合が可能なタンパク質決定因子を意味する。エピトープは、通常、アミノ酸又は糖側鎖等の分子の化学的に活性な表面基からなり、通常、特定の３次元構造特性並びに特定の電荷特性を有する。立体構造エピトープと非立体構造エピトープとは、変性溶媒の存在下で前者に対する結合は失われるが、後者に対する結合は失われないという点で区別される。
【００２７】
「ヒト化」（再構成又はＣＤＲ移植とも呼ばれる）又は「改変」は、異種起源（一般的に、げっ歯類）由来のモノクローナル抗体（ｍＡｂ）の免疫原性を低下させ、親和性又はエフェクター機能（ＡＤＣＣ、補体活性化、Ｃ１ｑ結合）を改善するための確立された技術を含む。改変されたｍＡｂは、ファージディスプレイされたランダム化配列を用いて分子生物学の技術を用いて産生してもよく、又はデノボ合成してもよい。例えば、非ヒト種から組み込まれたＣＤＲ領域を有するヒト化抗体を構築するために、ＣＤＲの残基における保存的アミノ酸置換、及び非ヒトｍＡｂ由来の残基のヒトフレームワーク領域への逆置換（逆突然変異）等の変異を含むように設計してもよい。位置は、配列比較方法、コンセンサス配列分析、又は可変領域の３Ｄ構造の構造的分析により識別又は同定することができる。選択された候補の免疫グロブリン配列について、可能性の高い３次元立体構造を図示及び表示するコンピュータプログラムが利用可能である。これらの表示を調べることにより、候補の免疫グロブリン配列の機能における残基の役割として可能性の高いものの分析、すなわち候補の免疫グロブリンがその抗原に結合する能力に影響を及ぼす残基の分析が可能となる。この方法で又は単純な配列アラインメントアルゴリズム（例えば、Ｃｌｕｓｔａｌ  Ｗ）によって、ＦＲ（フレームワーク）残基は、ＶＢＡＳＥ又はＫａｂａｔ等の公的にアクセス可能なデータベースに見出される公知の抗体配列、及び標的抗原に対する親和性等の所望の抗体特性が得られるように最適化されているコンセンサス配列から選択することができる。抗体構造に関する公知のパラメータのデータセットが増加するにつれて、これら技術が洗練及び精密化される。ヒト化の別のアプローチは、ヒトｍＡｂでみられる最も一般的な残基を用いてげっ歯類配列の表面残基のみを変化させることであり、「リサーフェシング」又は「ベニアリング」と呼ばれている。多数のヒト及び非ヒトＩｇ配列が現在公知であり、自由に利用可能であり、当業者によって用いられている。例えば、ＩＭＧＴという名称で見出されるＬｅＦｒａｎｃにより開発されたデータベース及びツール；Ｕ．Ｓ．Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｃｅｎｔｅｒ  ｆｏｒ  Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ（ＮＣＢＩ）によって管理されているウェブサイト；Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐｔ．Ｈｅａｌｔｈ（１９８３）も現在大きく拡張され、オンラインで利用可能である。これらは、それぞれ、参照により本明細書に援用される。本発明の抗体のヒト化又は改変は、既知の任意の方法、又はヒト免疫グロブリン配列情報を用いて開発された方法により行うことができる。このような方法は、例えばＷｉｎｔｅｒの米国特許第６９８２３６１号、及びＢｏｗｄｉｓｈ  ｅｔ  ａｌ．の国際公開第０３／０２５０１９号に教示され、これらの内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【００２８】
本明細書で使用されるとき、ＫDは、解離定数、具体的には、所定の抗原についての抗体の解離定数ＫDを意味し、特定の標的に対する抗体の親和性の尺度である。高親和性抗体は、所定の抗原について、１０-8Ｍ以下、より好ましくは１０-9Ｍ以下、更に好ましくは１０-10Ｍ以下のＫDを有する。ＫDの逆数は、ＫA、会合定数である。本明細書で使用されるとき、用語「ｋdis」又は「ｋ2」又は「ｋd」は、特定の抗体−抗原相互作用の解離速度を指すよう意図されている。「ＫD」は、解離速度（ｋ2）（「オフ速度（ｋoff）とも呼ばれる）と会合速度（ｋ2）（又は「オン速度（ｋon）」）との比である。したがって、ＫDは、ｋ2／ｋ1又はｋoff／ｋonに等しく、モル濃度（Ｍ）として表現される。ここで、ＫＤが小さくなるほど、結合は強くなる。したがって、１０-6Ｍ（又は１マイクロＭ）のＫDは、１０-9Ｍ（又は１ｎＭ）に比べて弱い結合を表わす。これら値は、当該技術分野において公知の表面プラズモン共鳴及び／又はＫｉｎｅｘａ法を用いて計算することができる。
【００２９】
本明細書で使用するとき、「モノクローナル抗体」又は「モノクローナル抗体組成物」という用語は、単一分子組成物の抗体分子の調製物を意味する。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープの単一の結合特異性及び親和性を示す。この用語はまた、「組み換え抗体」及び「組み換えモノクローナル抗体」も含むが、その理由は、（ａ）動物、又は抗体分泌動物細胞と融合パートナーとの融合により調製されたハイブリドーマから単離された抗体、（ｂ）抗体を発現するよう形質転換された宿主細胞、例えばトランスフェクトーマから単離された抗体、（ｃ）組み換えの、ヒト又は他の種のコンビナトリアル抗体ライブラリから単離された抗体、並びに（ｄ）免疫グロブリン遺伝子配列を他のＤＮＡ配列にスプライスすることを含む任意の他の手段により調製、発現、作製又は単離された抗体等の全ての抗体は、組み換え手段により調製、発現、作製又は単離されるためである。本明細書で使用するとき、「単離抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に有しない抗体を指すことが意図される。しかしながら、ヒトＣＤ２７のエピトープ、アイソフォーム又は変異体に特異的に結合する単離抗体は、他の関連抗原、例えば他の種（例えば、ＣＤ２７種ホモログ）由来の抗原に対して交差反応性を有する場合がある。更に、単離抗体は、他の細胞物質及び／又は化学物質を実質的に含まない場合もある。本発明の１つの実施形態では、異なる特異性を有する「単離」モノクローナル抗体の組み合わせを、明確に規定された組成物中で混ぜ合わせる。
【００３０】
本明細書で使用するとき、「特異的な結合」、「免疫特異的な結合」及び「免疫特異的に結合する」は、所定の抗原に結合する抗体を指す。通常、抗体の結合における解離定数（ＫD）は１０-7Ｍ以下であり、抗体が所定の抗原と結合する際のＫDは、所定の抗原以外の非特異的抗原（例えば、ＢＳＡ、カゼイン、又は他の任意の特定のポリペプチド）と結合する際のＫDと比較して少なくとも２倍小さい。「抗原を認識する抗体」及び「抗原に特異的な抗体」という表現は、本明細書において、「抗原に特異的に結合する抗体」という用語と同義的に使用される。本明細書で使用するとき、「高度に特異的な」結合は、特定の標的エピトープに対する抗体の相対的なＫDが、他のリガンドに対する抗体の結合に関するＫDの少なくとも１０倍小さいことを意味する。
【００３１】
本明細書で使用するとき、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によりコードされている抗体クラス（例えば、ＩｇＭ又はＩｇＧ）を指す。幾つかの抗体のクラスは、更に、重鎖定常領域によってコードされ、また、抗体に対して生物学的機能を更に付与する定常領域ドメイン（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４）内の特定の残基におけるオリゴ糖によって更に修飾されているサブクラスを含む。例えば、ヒト抗体アイソタイプにおいて、ＩｇＧ１、ＩｇＧ３、及びわずかながらＩｇＧ２は、マウスＩｇＧ２ａ抗体と同様、エフェクター機能を呈する。
【００３２】
「エフェクター」機能又は「エフェクター陽性（effector positive）」は、抗体が抗原特異的結合ドメインとは異なるドメインを含み、前記ドメインが、受容体又は補体等の他の血液成分と相互作用して、例えばマクロファージの動員、及び抗体の抗原結合ドメインに結合した細胞の破壊をもたらす事象を引き起こすことができることを意味する。抗体は、エフェクター分子の結合により媒介される幾つかのエフェクター機能を有する。例えば、抗体に対する補体のＣ１成分の結合は、補体系を活性化させる。補体の活性化は、オプソニン作用と、細胞の病原体の溶解に重要である。補体の活性化は、炎症性応答を刺激し、また自己免疫過敏症にも関与し得る。更に、抗体は、Ｆｃ領域を介して細胞に結合し、抗体Ｆｃ領域上のＦｃ受容体部位が細胞上のＦｃ受容体（ＦｃＲ）と結合する。ＩｇＧ（γ受容体）、ＩｇＥ（η受容体）、ＩｇＡ（α受容体）及びＩｇＭ（μ受容体）を含む、抗体の異なるクラスに特異的な多数のＦｃ受容体が存在する。細胞表面上のＦｃ受容体に対する抗体の結合は、多数の重要で多様な生物学的応答を誘発し、前記生物学的応答としては、抗体被覆粒子の貪食及び破壊、免疫複合体のクリアランス、キラー細胞による抗体被覆標的細胞の溶解（抗体依存性細胞媒介性細胞傷害、又はＡＤＣＣと呼ばれる）、炎症性メディエーターの放出、胎盤通過、並びに免疫グロブリン産生の制御が挙げられる。
【００３３】
１．本発明の抗体の組成物
本発明のＣＤ２７中和抗体は、インビトロ、インサイチュ、及び／又はインビボにおいて少なくとも１つのＣＤ２７活性又はＣＤ７０結合を阻害、遮断、又は干渉し、ＣＤ２７活性又はリガンド結合を促進、刺激、誘導、又は作動させず、抗体結合が、ＣＤ２７−リガンドライゲーション、特に、宿主細胞におけるシグナル伝達等のＣＤ２７とＣＤ７０との相互作用の下流の効果を模倣することもない抗体である。また、好適なＣＤ２７中和抗体、特定の部分、又は変異体は、任意で、ＲＮＡ、ＤＮＡ、又はタンパク質の合成、タンパク質の放出、Ｔ細胞の活性化、Ｂ細胞の増殖又は分化、抗体の分泌、ＣＤ２７受容体のシグナル伝達、ＣＤ２７切断、ＣＤ２７−リガンド結合、ＣＤ２７又はＣＤ７０の誘導、合成、又は分泌等であるがこれらに限定されない少なくとも１つのＣＤ２７活性又は機能に影響を与えることもある。
【００３４】
本発明のＣＤ２７中和抗体のＣＤ２７：ＣＤ７０同時刺激経路遮断活性に関して、高いＴ又はＢ細胞エフェクター機能による自己免疫疾患の治療は、有益であり得る。
【００３５】
本発明は、ＣＤ７０によるＣＤ２７の活性化を阻害することができ、ＣＤ７０刺激の非存在下でＣＤ２７を自己活性化させることができない抗ヒトＣＤ２７モノクローナル抗体の発見に基づいている。このような抗体を分泌することができるハイブリドーマ及びトランスフェクトーマが作製された。ＮＦ−ｋβレポーター遺伝子アッセイを用いて、ＣＤ２７発現宿主細胞のＣＤ７０媒介性ＮＦ−ｋβレポーター活性化を阻害することができる幾つかの候補抗体を同定した。第２に、ＣＤ７０刺激の非存在下でＣＤ２７結合ルシフェラーゼレポーター形質転換細胞とともにインキュベートしたとき、抗体は、用量依存性アゴニスト活性を誘導することができないと特徴付けられた。第３に、抗体は、ＣＤ７０依存性ヒトナイーブＣＤ４  Ｔ細胞増殖を用量依存的に阻害することが立証された。第４に、作製されたＣＤ２７中和抗体は、用量依存的にヒト一次Ｂ細胞からのプラズマ細胞産生のＣＤ７０媒介刺激を減少させることができる。第５に、試験した抗ＣＤ２７抗体とともに一次Ｔ又はＢ細胞において用量依存的アゴニスト活性はほとんどみられなかった。
【００３６】
本発明の抗体は、ＣＤ２７：ＣＤ７０ライゲーションに干渉することができ、細胞培養物におけるＴ細胞のエフェクター機能及びＢ細胞のプラズマ細胞への分化の両方を阻害し、したがって、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、多発性硬化症、炎症性腸疾患、クローン病、慢性閉塞性肺疾患、又はＣＤ２７発現細胞集団の異常機能又は活性化に関連する他の症候群、病状、疾患、又は疾病が挙げられるが、これらに限定されない免疫介在疾患の治療に有益であり得る。本明細書に記載するＣＤ２７結合抗体は、ヒトＤＣ２７の細胞外ドメインにおける少なくとも３つの異なる領域を認識する。これは、抗体又は類似の機能遮断能を有する他の化合物のターゲティングに好適なＣＤ２７における複数の部位の更なる発見を示す。したがって、アミノ酸配列として本明細書に提供する抗体結合ドメインの発現及び精製は、更に、ＣＤ２７中和活性を示す新規分子を選択するための手段となり得るツールを提供する。
【００３７】
１つの実施形態では、抗ヒトＣＤ２７抗体は、配列番号７６〜１４４に示すアミノ酸配列を有する軽鎖可変（ＶＬ）又は重鎖可変（ＶＨ）領域を含む結合領域を有し、前記抗体又はその結合部分は、ＣＤ２７に免疫特異的に結合する。本発明の別の実施形態では、抗体又はその抗原結合部分は、ＣＤ２７タンパク質に結合し、更に、抗体は、本発明の抗体の特定の機能的特性を有し、前記特性は、例えば以下の通りである：
固定化ヒトＣＤ２７に結合する；
ＣＤ７０発現細胞に対するヒト可溶性ＣＤ２７の結合を阻害する；
０．５μｇ／ｍＬ未満のＩＣ５０におけるＮＦ−カッパＢレポーター遺伝子アッセイによって測定される、ヒトＣＤ７０媒介性ＣＤ２７シグナル伝達を阻害する；
ナイーブＴ細胞のＣＤ７０媒介性増殖を阻害する；
一次ヒトＢ細胞からのＣＤ７０媒介性形質芽球形成を阻害する；
Ｔ及びＢ一次細胞又は細胞株からのヒトＣＤ７０媒介性可溶性メディエーターの放出を阻害する；
１００ｎＭ（１０-7Ｍ）未満のＫdでヒトＣＤ２７に結合する；
ＣＤ７０刺激の非存在下でＣＤ２７シグナル伝達を最小限活性化する；並びに
配列番号７６〜１４４の可変領域配列のうちの１つ以上を有するＭａｂが結合し、配列番号７６〜１４４の可変領域配列のうちの１つ以上を有する同定されたＭａｂとの結合について競合する、ヒトＣＤ２７細胞外ドメインにおけるエピトープに結合する。
【００３８】
抗体の重鎖及び軽鎖のＣＤＲドメインが、抗原に対する抗体の結合特異性／親和性において特に重要な役割を果していることは当該技術分野において周知であるので、本明細書に開示する本発明の組み換え抗体は、好ましくは、配列番号１〜７５の重鎖及び軽鎖のＣＤＲのうちの１つ以上を含む。かかる抗体は、組み換えＤＮＡ技術の従来技術を使用して抗体をコードする（すなわち、１つ以上の）核酸分子を調製し、発現させることによって、又は任意の他の適切な方法を使用することによって、従来技術を使用して抗体の様々な部分（例えば、ＣＤＲ、フレームワーク）を一緒に化学的に連結させることにより調製できる。
【００３９】
１つの実施形態では、本発明のヒト抗体は、配列番号１〜７５の重鎖及び軽鎖のＣＤＲのうちの１つ以上の配列を有する。これらＣＤＲ配列に加えて、当業者は、ＣＤ２７に結合する抗体の能力を保持しながら（例えば、保存的置換）、正確なＣＤＲ配列から一部逸脱することが可能であるか又は望ましい場合があることを理解するであろう。したがって、別の実施形態では、ヒト抗体は、配列番号１〜７５に列挙するＣＤＲに対して例えば９０％、９５％、９８％又は９９．５％同一である１つ以上のＣＤＲで構成されてよい。
【００４０】
別の実施形態では、ＣＤ２７の産生に関連する疾患又は疾患の症状を治療、予防、又は寛解させる目的のために、ＣＤ２７タンパク質又はそれをコードしている核酸の残基２１〜１９１のうちのわずか５つから全てを含む本発明の抗体に結合しているエピトープを用いて、宿主において直接本発明の抗体を産生されるために被験体を免疫することができる。
【００４１】
２．ＣＤ２７中和抗体の作製
開示及び記載する抗体によって本明細書に例示される通り所望の生物活性スペクトルを呈するＣＤ２７中和抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ  ａｎｄ  Ｍｉｌｓｔｅｉｎ（１９７５）Ｎａｔｕｒｅ  ２５６：４９５の標準的な体細胞ハイブリダーゼーション技術（ハイブリドーマ法）を含む様々な技術によって作製することができる。ハイブリドーマ法では、マウス又はハムスター若しくはマカクザル等の他の適切な宿主動物を上記のように免疫して、免疫に用いられるタンパク質に特異的に結合する抗体を産生する又は産生し得るリンパ球を誘発する。あるいは、リンパ球はインビトロで免疫してもよい。次いで、リンパ球をポリエチレングリコール等の好適な融合剤を使用して骨髄腫細胞と融合させて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Ｇｏｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ，ｐｐ．５９〜１０３（Ａｃａｄｅｍｉｃ  Ｐｒｅｓｓ，１９８６））。
【００４２】
また、ＣＤ２７中和抗体は、任意で、本明細書に記載する及び／又は当該技術分野において公知である通り、ヒト抗体のレパートリーを産生することができるトランスジェニック動物（例えば、マウス、ラット、ハムスター、非ヒト霊長類等）の免疫によって作製することもできる。ヒト抗ＣＤ２７抗体を生成する細胞を、このような動物から単離し、本明細書に記載の方法等の好適な方法を用いて不死化してもよい。あるいは、抗体をコードする配列をクローニングし、好適なベクターに導入し、また本明細書に教示する方法及び当該技術分野において既知である方法により抗体の発現及び単離のために宿主細胞をトランスフェクトするために用いることができる。
【００４３】
生殖系列の構造においてヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）遺伝子座を有するトランスジェニックマウスを使用して、正常なヒト免疫系が耐性であるヒト自己抗原を含む様々な標的に対する高親和性完全ヒトモノクローナル抗体を単離する（Ｌｏｎｂｅｒｇ，Ｎ．ｅｔ  ａｌ．、米国特許第５５６９８２５号、同第６３００１２９号、及び１９９４，Ｎａｔｕｒｅ  ３６８：８５６〜９；Ｇｒｅｅｎ，Ｌ．ｅｔ  ａｌ．，１９９４，Ｎａｔｕｒｅ  Ｇｅｎｅｔ．７：１３〜２１、Ｇｒｅｅｎ，Ｌ．  ＆  Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ，１９９８，Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８８：４８３〜９５、Ｌｏｎｂｅｒｇ，Ｎ  ａｎｄ  Ｈｕｓｚａｒ，Ｄ．，１９９５，Ｉｎｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３：６５〜９３；Ｋｕｃｈｅｒｌａｐａｔｉ  ｅｔ  ａｌ．、米国特許第６７１３６１０号；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ，Ｍ．ｅｔ  ａｌ．，１９９１，Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２１：１３２３〜１３２６；Ｆｉｓｈｗｉｌｄ，Ｄ．ｅｔ  ａｌ．，１９９６，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１４：８４５〜８５１；Ｍｅｎｄｅｚ，Ｍ．ｅｔ  ａｌ．，１９９７，Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．１５：１４６〜１５６；Ｇｒｅｅｎ，Ｌ．，１９９９，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ  ２３１：１１〜２３；Ｙａｎｇ，Ｘ．ｅｔ  ａｌ．，１９９９，Ｃａｎｃｅｒ  Ｒｅｓ．５９：１２３６〜１２４３；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ，Ｍ．ａｎｄ  Ｔａｕｓｓｉｇ，Ｍ  Ｊ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８：４５５〜４５８，１９９７；Ｔｏｍｉｚｕｋａ  ｅｔ  ａｌ．、国際公開第０２０４３４７８号）。このようなマウスの内因性免疫グロブリン遺伝子座を分断又は欠失させ、内因性遺伝子によりコードされている抗体を産生する動物の能力を除去することができる。加えて、Ａｂｇｅｎｉｘ，Ｉｎｃ．（Ｆｒｅｅｍｏｎｔ，Ｃａｌｉｆ．）及びＭｅｄａｒｅｘ（Ｓａｎ  Ｊｏｓｅ，Ｃａｌｉｆ．）等の会社は、上述したような技術を使用して、選択された抗原に対するヒト抗体を提供する事業を行い得る。
【００４４】
別の実施形態では、ヒト抗体は、ファージライブラリから選択され、前記ファージは、ヒト免疫グロブリン遺伝子を含み、前記ライブラリは、例えば、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）、Ｆａｂ、又は対合若しくは不対抗体可変領域を示す幾つかの他のコンストラクトとしてヒト抗体結合ドメインを発現する（Ｖａｕｇｈａｎ  ｅｔ  ｌｏ  ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ  Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ  １４：３０９〜３１４（１９９６）：Ｓｈｅｅｔｓ  ｅｔ  ａｌ．ＰＩＴＡＳ（ＵＳＡ）９５：６１５７〜６１６２（１９９８））；Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ  ａｎｄ  Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２７：３８１（１９９１）；Ｍａｒｋｓ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２２：５８１（１９９１））。本発明のヒトモノクローナル抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子のライブラリをスクリーニングするためのファージディスプレイ法を用いて調製することもできる。ヒト抗体を単離するためのこのようなファージディスプレイ法は、当技術分野にて確立されている。例えば、Ｌａｄｎｅｒ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第５，２２３，４０９号、同第５，４０３，４８４号及び同第５，５７１，６９８号、Ｄｏｗｅｒ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第５，４２７，９０８号及び同第５，５８０，７１７号、ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第５，９６９，１０８号及び同第６，１７２，１９７号、並びにＧｒｉｆｆｉｔｈｓ  ｅｔ  ａｌ．の米国特許第５，８８５，７９３号、同第６，５２１，４０４号、同第６，５４４，７３１号、同第６，５５５，３１３号、同第６，５８２，９１５号及び同第６，５９３，０８１号を参照されたい。
【００４５】
免疫原性抗原の調製及びモノクローナル抗体の産生は、組み換えタンパク質産生等の任意の好適な技術を用いて実施してよい。免疫原性抗原は、精製タンパク質、又は全細胞若しくは細胞若しくは組織抽出物を含むタンパク質混合物の形態で動物に投与されてもよく、あるいは前記抗原は、動物の身体内で、前記抗原又はその一部をコードする核酸から新規に形成されてもよい。
【００４６】
本発明の単離核酸は、当技術分野にて周知のように、（ａ）組み換え方法、（ｂ）合成技術、（ｃ）精製技術、又はこれらの組み合わせを使用して作製することができる。モノクローナル抗体をコードするＤＮＡは、容易に単離され、当技術分野にて既知である方法を用いて配列決定される（例えば、マウス抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを用いることにより）。ハイブリドーマを作製する場合、かかる細胞は、かかるＤＮＡ源として機能し得る。あるいは、例えばファージ又はリボソームディスプレイライブラリ等のコード配列と翻訳産物とが連結しているディスプレイ技術を用いると、結合剤及び核酸の選択が簡略化される。ファージ選択後、ファージに由来する領域をコードする抗体を単離し、ヒト抗体又は任意の他の所望の抗原結合断片を含む抗体全体を作製するために用い、哺乳類細胞、昆虫細胞、酵母、及び細菌を含む任意の所望の宿主内で発現させることができる。
【００４７】
ヒト化抗体
本発明は、更に、ヒトＣＤ２７に結合するヒト化（改変又はヒト適応）免疫グロブリン（又は抗体）を提供する。免疫グロブリンのヒト化形態は、実質的にヒト免疫グロブリン由来の可変フレームワーク領域（アクセプター免疫グロブリンと呼ばれる）と、実質的にＣＤ２７に特異的に結合する非ヒトＭａｂ由来のＣＤＲとを有する。存在する場合、定常領域も、実質的にヒト免疫グロブリン由来である。ヒト化抗体は、ＣＤ２７について少なくとも約１０-6Ｍ（１μＭ）、約１０-7Ｍ（１００ｎＭ）以下のＫDを示す。ヒト化抗体の結合親和性は、そのヒト化抗体が由来するマウス抗体の結合親和性を上回る場合もあり、下回る場合もある。ＣＤ２７についてヒト化抗体の親和性の変化に影響を及ぼす、例えば、親和性を改善するために、ＣＤＲ残基又はヒト残基のいずれかを置換してもよい。
【００４８】
ヒト可変ドメインフレームワークが、ＣＤＲの起源であるマウス可変フレームワークと同一又は同様の立体構造をとる場合、マウスＣＤＲをヒト可変ドメインフレームワークに置換することにより、その正確な空間配向が維持される可能性が最も高い。これは、そのフレームワーク配列が、ＣＤＲが由来するマウス可変フレームワークドメインと高い程度の配列同一性を示すヒト抗体からヒト可変ドメインを得ることによって達成される。重鎖及び軽鎖可変フレームワーク領域は、同一又は異なるヒト抗体配列に由来することができる。ヒト抗体配列は、天然に存在するヒト抗体の配列であってもよく、又はヒト生殖系列免疫グロブリン配列に由来してもよく、又は数種のヒト抗体及び／若しくは生殖系列配列のコンセンサス配列であってもよい。
【００４９】
好適なヒト抗体配列は、マウス可変領域のアミノ酸配列と、既知のヒト抗体の配列とのコンピュータ比較により同定される。比較は重鎖と軽鎖について別々に行われるが、原理はそれぞれに関して類似している。
【００５０】
一例では、ＣＤ２７中和ｍＡｂのアミノ酸配列を用いて、公的な抗体配列データベースから蓄積したヒト抗体データベースにクエリーを行う。本明細書に開示又は記載する重鎖可変領域を用いて、最も高い配列同一性を有するヒト可変領域を見出すことができる。同様に、本明細書に開示又は記載する軽鎖可変領域を用いて、最も高い配列同一性を有するヒト可変領域を見出すことができる。マウスＭａｂドナー由来らの重鎖可変領域の１つのＣＤＲをコードする領域を選択されたヒト重鎖可変配列に移入し、ヒト可変領域のＣＤＲを置き換えたＤＮＡコンストラクトを、各マウス可変領域について調製する。
【００５１】
ヒト可変フレームワーク領域を有するマウスＣＤＲ領域の不自然な並置により、不自然な配座拘束を生じる場合があり、この拘束は所定のアミノ酸残基の置換により修正されない限り結合親和性の損失をもたらす。上述の通り、本発明のヒト化抗体は、実質的にヒト免疫グロブリン由来の可変フレームワーク領域と、実質的にマウス免疫グロブリン由来のＣＤＲとを含む（例えば、Ｃ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、又はＣ２１９２マウス抗体）。マウス抗体のＣＤＲ及び適切なヒトアクセプター免疫グロブリン配列を同定した後、次の工程は、もし存在する場合、これらの成分のどの残基を置換して、結果として得られるヒト化抗体の特性を最適化するべきかを決定することである。一般に、マウスによるヒトアミノ酸残基の置換は、マウス残基の導入がヒトにおいて抗体によるＨＡＭＡ応答の誘発の危険性を増大させるため、最小限にする必要がある。置換されるアミノ酸は、ＣＤＲ立体構造及び／又は抗原への結合に対する可能な影響に基づいて選択される。そのような可能な影響は、モデリング、特定の位置におけるアミノ酸の特性の検査、又は特定のアミノ酸の置換若しくは変異誘発の効果の経験的観察結果により検討することができる。経験的方法に関しては、所望の活性、結合親和性又は特異性をスクリーニングし得る変異体配列のライブラリを形成することが特に簡便であることが見出されている。このような変異体のライブラリを形成するための１つのフォーマットは、ファージディスプレイベクターである。あるいは、変異体は、可変ドメイン内の標的残基をコードする核酸配列を変動（varigation）させる他の方法を用いて生成することができる。
【００５２】
更なる置換が必要であるか否かを決定する他の方法と、置換されるアミノ酸残基の選択とは、コンピュータモデリングを用いて達成することができる。免疫グロブリン分子の３次元画像を作成するコンピュータハードウェア及びソフトウェアは広く入手可能である。一般に、分子モデルは、免疫グロブリン鎖又はそのドメインに関する解明された構造から出発して生成される。モデリングされる鎖のアミノ酸配列の、解明された３次元構造の鎖又はドメインとの類似性が比較され、最大の配列類似性を示す鎖又はドメインが分子モデル構成の出発点として選択される。解明された出発構造は、モデリングされている免疫グロブリン鎖又はドメイン内の実際のアミノ酸と、出発構造内のアミノ酸との間の差異を許容するよう変更される。次いで、変更された構造は、複合体免疫グロブリンに組み立てられる。最終的に、モデルは、エネルギー最小化し、また全部の原子が互いから適切な距離内に存在し、結合の長さと角度とが化学的に許容し得る限界内にあることを検証することにより精密化される。
【００５３】
通常、ヒト化抗体内のＣＤＲ領域は実質的に同一であり、より通常には、ＣＤＲ領域が由来するマウス抗体内の対応するＣＤＲ領域と同一である。通常所望されないが、時には、結果として得られるヒト化免疫グロブリンの結合親和性に相当な影響を与えることなく、ＣＤＲ残基の１つ以上の保存的アミノ酸置換を行うことが可能である。時折、ＣＤＲ領域の置換は、結合親和性を高めることができる。
【００５４】
上述の特定のアミノ酸置換以外に、ヒト化免疫グロブリンのフレームワーク領域は、通常、それが由来するヒト抗体のフレームワーク領域と実質的に同一であり、より通常は、同一である。勿論、フレームワーク領域内のアミノ酸のうちの多数は、抗体の特異性又は親和性にほとんど又は全く直接寄与しない。したがって、フレームワーク残基の多数の個々の保存的置換は、結果として得られるヒト化免疫グロブリンの特異性又は親和性に感知できるほどの変化を起こすことなく許容され得る。
【００５５】
コードの縮重により、多様な核酸配列が各免疫グロブリンアミノ酸配列をコードするであろう。所望の核酸配列は、デノボ（de nova）固相ＤＮＡ合成、又は所望のポリヌクレオチドの早期に調製された変異体のＰＣＲ変異誘発により生成され得る。本願に記載される抗体をコードする全ての核酸は、本発明に明白に含まれる。
【００５６】
上記のように産生されたヒト化抗体の可変セグメントは、典型的には、ヒト免疫グロブリン定常領域の少なくとも一部に連結する。抗体は、軽鎖及び重鎖定常領域の両方を含む。重鎖定常領域は、通常、ＣＨ１、ヒンジ、ＣＨ２、ＣＨ３、更にＣＨ４ドメインを含むことがある。
【００５７】
ヒト化抗体は、ＩｇＭ、ＩｇＧ、ＩｇＤ、ＩｇＡ及びＩｇＥを含む任意のクラスの抗体からの任意の種類の定常ドメインを含んでもよく、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４を含む任意のサブクラス（アイソタイプ）を含んでもよい。ヒト化抗体が細胞傷害活性を示すことが望ましい場合、定常ドメインは、通常、補体結合性定常ドメインであり、クラスは一般にＩｇＧ1である。かかる細胞毒性が望ましくないとき、定常ドメインは、ＩｇＧ2クラスであってもよい。ヒト化抗体は、２つ以上のクラス又はアイソタイプ由来の配列を含んでもよい。
【００５８】
場合により定常領域に結合されたヒト化軽鎖及び重鎖可変領域をコードする核酸は、発現ベクター内に挿入される。軽鎖及び重鎖は、同じ又は異なる発現ベクターにクローニングされ得る。免疫グロブリン鎖をコードするＤＮＡセグメントは、免疫グロブリンポリペプチドの発現を確実にする発現ベクター内の制御配列に操作可能に連結される。このような対照配列は、シグナル配列、プロモータ、エンハンサー、及び転写終結配列を含む（Ｑｕｅｅｎ  ｅｔ  ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ  ８６，１００２９（１９８９）；国際公開第９０／０７８６１号；Ｃｏ  ｅｔ  ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８，１１４９（１９９２）、これらは、全ての目的のために参照することにより全文が本明細書に援用される）。
【００５９】
治療用タンパク質の有効性は、望ましくない免疫反応によって制限され得る。非ヒトモノクローナル抗体は、ヒトでの免疫応答を誘発することができる、かなりの線形アミノ酸配列鎖と、局所的な構造コンフォメーションを有し得る。非ヒト抗体の免疫原性を低下させるための第１の試みは、ヒト−マウス抗体キメラを構築し、次いで、１９８０年代後半におけるこれらキメラをヒト化する方法に従うことであった（Ａｌｍａｇｒｏ  ａｎｄ  Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ  Ｂｉｏｓｃｉ  １３：１６１９〜１６３３，２００８に概説）。
【００６０】
最も頻繁に用いられるヒト化アプローチのうちの１つは、いわゆる「相補性決定領域（ＣＤＲ）移植」であり、これは、マウスのＣＤＲをヒト抗体フレームワーク領域（ＦＲ）に移植するものである。それにもかかわらず、この方法の適用は、多くの場合、抗原に対する結合が実質的に失われ、したがって、抗体に基づく薬物の効力が低下する。したがって、ヒトに注入されたときに、親非ヒト分子の結合及び生物物理学的プロファイルを保持すると同時に、最小限の免疫原性反応を誘発する抗体分子を作製するための、しっかりした設計原理を用いることが極めて重要である。
【００６１】
ＣＤ２７に対する結合特異性を有する２つのマウスモノクローナル抗体（ｍＡｂ）である２１７７及び２１９１のヒト化について記載する。米国特許出願公開第２００９０１１８１２７  Ａ１号（Ｒａｇｈｕｎａｔｈａｎ，Ｇ．）に開示されており、Ｆｒａｎｓｓｏｎ  ｅｔ  ａｌ（Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３９８：２１４〜２３１，２０１０）に更に例示されている、ヒトフレームワーク適応（ＨＦＡ）と呼ばれるＪａｎｓｓｅｎが独自に開発したヒト化技術の第１の工程を用いて、これら抗体のフレームワーク（ＦＲ）を、ヒト生殖系列遺伝子のＦＲによって置換した。この技術によって、親マウス抗体２１７７及び２１９１について測定された特性よりも優れた結合及び阻害特性を有するＣＤ２７に特異的なｍＡｂのセットが可能になる。
【００６２】
３．抗ＣＤ２７抗体を用いる方法
以下に詳細に記載する通り、本発明は、４つの単離モノクローナル抗体（Ｃ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２）がＣＤ２７の３つの非重複エピトープに結合し、インビトロ及び／又はインビボにおいてＣＤ２７阻害活性を示すことを示す。重大なことに、ＭＡｂの反応性は、ＣＤ２７とＣＤ７０との相互作用を用量依存的に遮断する能力、ＣＤ７０の存在下でＣＤ２７のシグナル伝達を低下させる能力、Ｔ細胞によるＩＬ−４及びＩＦＮｇ産生を低減する能力、並びにＣＤ７０依存性ヒトナイーブＣＤ４＋Ｔ細胞増殖、ＣＤ７０依存性Ｂ細胞増殖、及びプラズマ細胞産生を阻害する能力を含む。更に、単離抗体は、ＣＤ７０刺激の非存在下でＣＤ２７の活性化をほとんど誘導しない。
【００６３】
本発明に記載したようなモノクローナル抗体の特性を考慮すると、抗体又はその抗原結合断片は、ヒト及び動物におけるＣＤ２７に関連する症状を治療又は予防するための治療及び予防剤の両方として好適である。
【００６４】
一般的に、使用は、治療的に又は予防的に有効な量の、本発明の１つ以上のモノクローナル抗体若しくは抗原結合断片、又は同様の結合及び生物活性のスペクトルを有するように選択された抗体若しくは分子を、易発性被験体又はＣＤ２７活性が免疫疾患若しくは腫瘍の成長及び転移等の病理学的続発症を有することが知られている症状を示す者に投与することを含む。Ｆａｂ及びＦ（ａｂ’）２断片を含む、抗体の任意の活性型を投与することができる。
【００６５】
好ましくは、用いられる抗体は、ＭＡｂに対する免疫反応が、許容できないほど短い循環半減期を生じさせない、又は被験体において免疫反応を誘導するように、レシピエント種と適合する。投与されるＭＡｂは、細胞溶解又は細胞毒性メカニズムを使用して標的細胞集団を枯渇させるために、対象のＦｃ受容体への結合及びＡＤＣＣメカニズムの活性化等の幾つかの二次機能を示すか、又はそれらは、標的細胞集団を保存するために、これらの二次エフェクターを制限することにより、又はその欠失により遺伝子操作を受けてもよい。
【００６６】
個体の治療は、治療的に有効な量の本発明の抗体を投与することを含み得る。抗体は、以下に記載のようなキットで提供されてもよい。抗体は、例えば等量の混合物として投与されてもよく、又は個別に連続して提供されても、又は一度に投与されてもよい。レシピエント患者内でＣＤ２７に結合可能な抗体若しくはその断片、又はＣＤ２７から保護できる抗体を患者に提供する際、投与される薬剤の用量は、患者の年齢、体重、身長、性別、全身の健康状態、全身の医学的状態、既往歴等の要因に応じて変動するであろう。
【００６７】
同様の手法で、本発明のモノクローナル抗体の他の治療的使用は、本モノクローナル抗体のうちの１つに対する抗イディオタイプ抗体を使用する、患者の能動免疫化である。エピトープの構造を模倣する抗イディオタイプによる免疫は、活性抗ＣＤ２７応答を誘発することができた（Ｌｉｎｔｈｉｃｕｍ，Ｄ．Ｓ．ａｎｄ  Ｆａｒｉｄ，Ｎ．Ｒ．，Ａｎｔｉ−ｉｄｉｏｔｙｐｅｓ，Ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ，ａｎｄ  Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ  Ｍｉｍｉｃｒｙ（１９８８），ｐｐ  １〜５  ａｎｄ  ２８５〜３００）。
【００６８】
同様に、能動免疫は、ワクチンの成分として、１つ以上の抗原性及び／又は免疫原性エピトープを投与することにより誘導され得る。ワクチン接種は、予防的に又は治療的に、レシピエントがこの生物学的機能領域に対して保護抗体を産生できるのに十分な量を経口又は非経口的に投与することにより実施し得る。宿主は、純粋なペプチド断片、又は改変されたペプチドの抗原性／免疫原性ペプチドで能動免疫され得る。元来のタンパク質配列に対応していない１つ以上のアミノ酸を、元来のペプチド又は短縮型のペプチドのアミノ又はカルボキシル末端に添加してもよい。かかる追加のアミノ酸は、ペプチドを別のペプチド、大きな担体タンパク質、又は支持体に結合させるのに有用である。これらの目的に有用なアミノ酸としては、チロシン、リジン、グルタミン酸、アスパラギン酸、システイン、及びこれらの誘導体が挙げられる。別のタンパク質改変技術は、例えば、ＮＨ２−アセチル化又はＣＯＯＨ−末端アミド化を用いて、別のタンパク質又はペプチド分子又は支持体に、ペプチドを結合又は融合させる更なる手段を提供することもできる。
【００６９】
望ましくないＣＤ２７生物活性から保護することができる抗体は、ＣＤ２７に関連する症状又は病状を減退、回復、又は寛解させるのに十分な量がレシピエント被験体に提供されることを意図する。量は、薬剤の用量、投与経路等が、そのような応答に影響を与えるのに十分な場合、症状の軽減を達成するのに十分な、又は「治療的に有効な量」であると言われる。抗体投与に対する反応は、被験体の罹患組織、器官、又は細胞を分析することにより、又は画像化技術により、又は組織サンプルのエクスビボ分析により、測定され得る。剤の存在が、レシピエント患者の生理に検出可能な変化をもたらす場合、その剤は生理学的に重要である。
【００７０】
治療適用
本発明のＣＤ２７中和抗体、抗原結合断片、又はこれらの特定の変異体を用いて、ＣＤ２７又はＣＤ２７発現細胞によって媒介される、影響を受ける、又は調節される状態を診断する、モニタリングする、調節する、治療する、緩和する、発生の予防を補助する、又は症状を減退させる、細胞、組織、器官、又は動物（哺乳類及びヒトを含む）における効果を測定したり、効果を起こしたりすることができる。したがって、本発明は、当該技術分野において既知のように、又は本明細書に記載されているように、本発明の少なくとも１つのＣＤ２７抗体を用いて、細胞、組織、器官、動物、又は患者における少なくとも１つのＣＤ２７関連疾患を調節又は治療するための方法を提供する。具体的な適応症については以下に論述する。
【００７１】
免疫関連疾患
本発明は、関節リウマチ、若年性関節リウマチ、全身型若年性関節リウマチ、乾癬性関節炎、強直性脊椎炎（ankylosing spondilitis）、胃潰瘍、血清反応陰性関節症、変形性関節症、炎症性腸疾患、潰瘍性大腸炎、全身性エリテマトーデス、抗リン脂質症候群、虹彩毛様体炎／ブドウ膜炎／視神経炎、突発性肺線維症、全身性血管炎／ウェゲナー肉芽腫症、サルコイドーシス、精巣炎／精管復元術（vasectomy reversal procedure）、アレルギー性／アトピー性疾患、喘息、アレルギー性鼻炎、湿疹、アレルギー性接触性皮膚炎、アレルギー性結膜炎、過敏性肺炎、移植片、器官移植拒絶、移植片対宿主病、全身性炎症性応答症候群、敗血症症候群、グラム陽性菌敗血症、グラム陰性菌敗血症、培養陰性敗血症、真菌性敗血症、好中球減少性発熱、尿路性敗血症、髄膜炎菌血症、外傷／出血、やけど、電離放射線暴露、急性膵炎、成人呼吸窮迫症候群、関節リウマチ、アルコール性肝炎、慢性炎症性病態、サルコイドーシス、クローン病（Crohn's pathology）、鎌状赤血球貧血、糖尿病、ネフローゼ、アトピー性疾患、過敏反応、アレルギー性鼻炎、花粉症（hay fever）、通年性鼻炎、結膜炎、子宮内膜症、喘息、蕁麻疹、全身アナフィラキシー、皮膚炎、悪性貧血、溶血性疾患、血小板減少症、任意の器官又は組織の移植片拒絶、腎臓移植拒絶、心臓移植拒絶、肝臓移植拒絶、膵臓移植拒絶、肺移植拒絶、骨髄移植（ＢＭＴ）拒絶、移植皮膚拒絶、軟骨移植拒絶、骨移植片拒絶、小腸移植拒絶、胎児胸腺移植拒絶、副甲状腺移植拒絶、任意の器官又は組織の異種移植拒絶、同種移植片拒絶、抗受容体過敏反応、グレーブス病、レイノー病、Ｂ型インスリン抵抗性糖尿病、喘息、重症筋無力症、抗体介在細胞毒性、ＩＩＩ型過敏反応、全身性エリテマトーデス、ＰＯＥＭＳ症候群（多発ニューロパチー、臓器肥大、内分泌疾患、単クローン性γグロブリン血症、及び皮膚変化症候群）、抗リン脂質症候群、天疱瘡、強皮症、混合性結合組織病、特発性アジソン病、真性糖尿病、慢性活動性肝炎、原発性胆汁性肝硬変（primary billiary cirrhosis）、白斑、血管炎、ＭＩ心臓切開術後症候群（post-MI cardiotomy syndrome）、ＩＶ型過敏症、接触性皮膚炎、過敏性肺炎、同種移植片拒絶、細胞内微生物による肉芽腫、薬物感受性、代謝性／突発性、ウィルソン病、ヘモクロマトーシス（hemachromatosis）、α−１−抗トリプシン欠乏症、糖尿病性網膜症、橋本甲状腺炎、骨粗鬆症、視床下部−下垂体−副腎軸評価（hypothalamic-pituitary-adrenal axis evaluation）、原発性胆汁性肝硬変、甲状腺炎、脳脊髄炎、悪液質、嚢胞性線維症、新生児慢性肺疾患、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、家族性食血細胞性リンパ組織球症（familial hematophagocytic lymphohistiocytosis）、皮膚科学的症状、乾癬、脱毛症、ネフローゼ症候群、腎炎、糸球体腎炎、急性腎不全、血液透析、尿毒症、毒性、子癇前症、ＯＫＴ３療法、抗ＣＤ３療法、サイトカイン療法、化学療法、放射線療法（例えば喘息、貧血、悪液質等を含むがこれらに限定されない）、慢性サリチル酸塩中毒等のうちの少なくとも１つを含むがこれらに限定されない、細胞、組織、器官、動物、又は患者における免疫関連疾患を調節又は治療するための方法も提供する。
【００７２】
肺疾患
また、本発明は、例えば、肺炎、肺膿瘍、粉塵、ガス又は飛沫の形をした作用物質を原因とする職業性肺疾患、喘息、閉塞性繊維性細気管支炎、呼吸不全、過敏性肺炎（外因性アレルギー性肺胞炎）、アレルギー性気管支肺アスペルギルス症、及び薬物反応を含む肺の過敏性疾患、成人呼吸窮迫症候群（ＡＲＤＳ）、グッドパスチャー症候群、慢性閉塞性気道疾患（ＣＯＰＤ）、特発性間質性肺疾患、例えば特発性肺線維症及びサルコイドーシス、剥離性間質性肺炎、急性間質性肺炎、呼吸細気管支炎関連間質性肺疾患、気質性肺炎を伴う特発性閉塞性細気管支炎、リンパ球性間質性肺炎、ランゲルハンス細胞肉芽腫症、特発性肺ヘモジデリン沈着症、急性気管支炎、肺胞タンパク症、気管支拡張症、胸膜疾患、無気肺、嚢胞性線維症、及び肺腫瘍、並びに肺栓塞症における、関連若しくは付随細胞又はＣＤ２７の関与する細胞プロセスに対する免疫応答の調節が挙げられるが、これらに限定されない、細胞、組織、器官、動物、又は患者における肺又は胸膜疾患を調節又は治療するための方法を提供する。
【００７３】
悪性疾患
また、本発明は、白血病、急性白血病、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、Ｂ細胞、Ｔ細胞又はＦＡＢ  ＡＬＬ、急性骨髄性（myeloid）白血病（ＡＭＬ）、慢性骨髄性（myelocytic）白血病（ＣＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、ヘアリーセル白血病、骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、リンパ腫、ホジキン病、悪性リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、バーキットリンパ腫、多発性骨髄腫、原発性疾患又は転移性疾患としての固形腫瘍、カポジ肉腫、結腸直腸癌、膵癌、腎細胞癌、肺癌（中皮腫を含む）、乳癌、鼻咽頭癌、悪性組織球増加症、腫瘍随伴症候群／悪性の高カルシウム血症、腺癌、扁平細胞癌、肉腫、悪性黒色腫（特に、転移性黒色腫）、血管腫、転移性疾患、癌関連の骨吸収、癌関連の骨痛等のうちの少なくとも１つにおける、関連若しくは付随細胞又はＣＤ２７の関与する細胞プロセスに対する免疫応答の調節が挙げられるが、これらに限定されない、細胞、組織、器官、動物、又は患者における悪性疾患をの調節又は治療する方法を提供する。
【００７４】
心臓血管疾患
また、本発明は、心筋梗塞、うっ血性心不全、卒中、虚血発作、出血、動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症、再狭窄、糖尿病性動脈硬化性疾患（diabetic ateriosclerotic disease）、高血圧、動脈性高血圧、腎血管性高血圧、失神、ショック、心血管系の梅毒、心不全、肺性心、原発性肺高血圧、心不整脈、心房異所性拍動、心房粗動、心房細動（持続性又は発作性）、潅流後症候群、心肺バイパス炎症応答、無秩序型又は多源性心房頻拍、規則的狭ＱＲＳ頻拍（regular narrow QRS tachycardia）、固有不整脈（specific arrythmias）、心室細動、ヒス束不整脈（His bundle arrythmias）、房室ブロック、脚ブロック、心筋虚血性疾患、冠動脈疾病、狭心症、心筋梗塞、心筋症、拡張型うっ血性心筋症、拘束型心筋症、心臓弁膜症、心内膜炎、心膜疾患、心臓腫瘍、大動脈瘤又は末梢動脈瘤、大動脈解離、大動脈の炎症、腹部大動脈及びその分岐の閉塞、末梢血管疾患、閉塞性動脈疾患、末梢アテローム硬化性疾患、バージャー病、機能性末梢動脈疾患、レイノー現象及び疾患、先端チアノーゼ、先端紅痛症、静脈性疾患、静脈血栓症、渦静脈、動静脈フィスチュラ、リンパ浮腫（lymphederma）、脂肪性浮腫、不安定狭心症、再灌流傷害、ポンプ後症候群（post pump syndrome）、虚血再灌流障害等のうちの少なくとも１つにおける、関連若しくは付随細胞又はＣＤ２７の関与する細胞プロセスに対する免疫応答の調節が挙げられるが、これらに限定されない、細胞、組織、器官、動物、又は患者における心血管疾病を調節又は治療する方法を提供する。
【００７５】
神経系疾患
また、本発明は、神経変性疾患、多発性硬化症、片頭痛、エイズ痴呆症候群、脱髄性疾患、例えば、多発性硬化症及び急性横断性脊髄炎；錐体外路及び小脳疾患、例えば、皮質脊髄系の障害；大脳基底核の疾患又は小脳疾患；運動過剰症、例えば、ハンチントン舞踏病及び老年性舞踏病；薬剤誘発性運動障害、例えば、ＣＮＳドーパミン受容体遮断薬により誘発されるもの；運動低下性運動障害、例えば、パーキンソン病；進行性核上麻痺；小脳の構造病変；脊髄小脳変性症、例えば、脊髄性運動失調症、フリードライヒ失調症、小脳皮質変性症、多系統変性症（Ｍｅｎｃｅｌ、Ｄｅｊｅｒｉｎｅ−Ｔｈｏｍａｓ，Ｓｈｉ−Ｄｒａｇｅｒ、及びＭａｃｈａｄｏ−Ｊｏｓｅｐｈ）；全身性疾患（レフサム病、無βリポタンパク血症、運動失調症、毛細血管拡張症、及びミトコンドリア多系統疾患）；脱髄性コア疾患、例えば、多発性硬化症、急性横断性脊髄炎；及び運動単位の疾患、例えば、神経原性筋委縮症（前角細胞変性症、例えば、筋萎縮性側索硬化症、乳児脊髄性筋萎縮症、及び若年性脊髄性筋萎縮症）；アルツハイマー病；ダウン症候群；びまん性レヴィー小体病；レヴィー型老年性認知症；ウェルニッケ・コルサコフ症候群；慢性アルコール依存症；クロイツフェルト・ヤコブ病；亜急性硬化性全脳炎、ハレルフォルデン−スパッツ病；ボクサー認知症等のうちの少なくとも１つにおける、関連若しくは付随細胞又はＣＤ２７の関与する細胞プロセスに対する免疫応答の調節が挙げられるが、これらに限定されない、細胞、組織、器官、動物、又は患者における神経系疾患を調節又は治療する方法を提供する。所望により、少なくとも１つのＴＮＦ抗体又は特定部分又は変異体を含む有効量の組成物又は医薬組成物を、このような調節、治療又は療法を必要としている細胞、組織、器官、動物、又は患者に対し投与する工程を含むことができる。
【００７６】
ＣＤ２７中和抗体の他の治療的使用
上述の症状及び疾患に加えて、本発明はまた、例えば、肝臓線維症（アルコール性肝硬変、ウイルス性肝硬変、自己免疫性肝炎が挙げられるがこれらに限定されない）、肺線維症（強皮症、特発性肺線維症が挙げられるがこれらに限定されない）、腎臓線維症（強皮症、糖尿病性腎炎、糸球体腎炎、狼瘡腎炎を含むがこれらに限定されない）、皮膚線維症（強皮症、肥厚性及びケロイド瘢痕、火傷を含むがこれらに限定されない）、骨髄線維症、神経線維腫症、線維腫、腸線維症、及び外科手術の結果としての線維症癒着における、関連若しくは付随細胞又はＣＤ２７の関与する細胞プロセスに対する免疫応答を調節することによって、様々な病因の線維性状態を調節又は治療する方法を提供する。
【００７７】
また、本発明は、急性又は慢性細菌感染、細菌、ウイルス、及び真菌感染を含む急性及び慢性の寄生又は感染プロセス、ＨＩＶ感染／ＨＩＶ神経障害、髄膜炎、肝炎（Ａ、Ｂ、又はＣ等）、敗血症性関節炎、腹膜炎、肺炎、喉頭蓋炎、大腸菌、溶血性尿毒症症候群、マラリア、デング出血熱、リーシュマニア症、ハンセン病、毒素性ショック症候群、連鎖球菌筋炎、ガス壊疽、ヒト型結核菌、トリ型結核菌、ニューモシスティス・カリニ肺炎、骨盤内炎症性疾患、精巣炎又は精巣上体炎、レジオネラ、ライム病、Ａ型インフルエンザ、エプスタイン・バーウイルス、ウイルス関連血球貪食症候群、ウイルス性脳炎／無菌性髄膜炎等における、関連若しくは付随細胞又はＣＤ２７の関与する細胞プロセスに対する免疫応答を調節することによって、細胞、組織、器官、動物、又は患者における感染性疾患の症状を調節又は治療又は寛解する方法を提供する。
【００７８】
本願全体を通して引用した全ての参照文献（文献、発行済み特許、公開された特許出願、及び同時係属中の特許出願を含む）の内容は、参照することにより本明細書に全文が明示的に援用される。
【００７９】
本発明の他の特徴は、本発明を説明するために与えられ、本発明を限定することを意図するものではない例示的実施形態に関する以下の記載において明らかになるであろう。
【００８０】
４．医薬製剤
本発明は、薬学的に許容できる製剤中に少なくとも１つのＣＤ２７中和抗体を含む、Ｃ２７中和抗体の安定な製剤であって、好ましくは、水性リン酸緩衝生理食塩水又は混合塩溶液、並びに保存溶液及び製剤、並びに薬学的又は獣医学的使用に好適な多用途保存製剤である製剤を提供する。好適なビヒクル及びその製剤（他のヒトタンパク質、例えば、ヒト血清アルブミンを含む）は、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ  Ｓｃｉｅｎｃｅ  ａｎｄ  Ｐｒａｃｔｉｃｅ  ｏｆ  Ｐｈａｒｍａｃｙ，２１st  Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｔｒｏｙ，Ｄ．Ｂ．ｅｄ．，Ｌｉｐｉｎｃｏｔｔ  Ｗｉｌｌｉａｍｓ  ａｎｄ  Ｗｉｌｋｉｎｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ  ２００６，Ｐａｒｔ  ５に記載されている。
【００８１】
効果的な投与に好適な、薬剤的に許容できる組成物を形成するために、それらの組成物は、有効量の上述した化合物を、好適な量の担体ビヒクルと共に含有するであろう。更なる薬学的方法を使用して、作用の持続時間を制御することもできる。制御放出製剤は、化合物を複合体化する又は吸収するポリマーの使用を通して達成され得る。制御放出製剤により作用の持続時間を制御するための別の可能な方法は、ポリエステル、ポリアミノ酸、ヒドロゲル、ポリ（乳酸）、又はエチレン酢酸ビニルコポリマー等のポリマー物質の粒子に、本発明の化合物を組み込むことである。あるいは、これらの剤をポリマー物質に組み込む代わりに、例えば、界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えば、ヒドロキシメチルセルロース若しくはゼラチンマイクロカプセル及びポリ（メチルメタクリレート）−マイクロカプセル、又はコロイド状薬物送達系、例えば、リポソーム、アルブミン微小球、マイクロエマルション、ナノ粒子、及びナノカプセル、又はマクロエマルションに、これら物質を封入することも可能である。このような技術は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ、上記（２００６）に開示されている。
【００８２】
５．ＣＤ２７中和抗体の投与
本明細書に記載する安定又は保存製剤又は溶液における少なくとも１つのＣＤ２７中和抗体は、当該技術分野において周知の移植片、浸透圧ポンプ、カートリッジ、マイクロポンプ又は当業者が理解する他の手段において製剤を使用して、静脈内（Ｉ．Ｖ．）、筋肉内（Ｉ．Ｍ．）、皮下（Ｓ．Ｃ．）、経皮、肺内、経粘膜を含む様々な送達方法を介して本発明に従って患者に投与され得る。
【００８３】
ＣＤ２７中和抗体を投与する１つの方法では、輸液バッグを備える既に設置されているカテーテルから薬物物質を静脈内投与する。ＣＤ２７中和抗体は、ＩｍｍｕｎｏＧｅｎ，Ｉｎｃ．（Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，ＭＡ）によって供給されているもの等、２０ｍＬの使い捨てバイアル瓶で供給される。各バイアル瓶は、純水、ＵＳＰ中リン酸二水素カリウム（０．５７ｍｇ／ｍＬ）、リン酸一ナトリウム一水和物（０．２０ｍｇ／ｍＬ）、第二リン酸ナトリウム（０．５５５ｍｇ／ｍＬ）、及び塩化ナトリウム（８．１６ｍｇ／ｍＬ）で本質的に構成される緩衝溶液（ｐＨ  ６．５±０．５）中に、０．０５〜約２．０ｍｇ／ｍＬの濃度でタンパク質を含有する。薬物製品は、低タンパク質結合５μフィルターに通すことによって用量体積を輸液バッグに注入する際、２回前置濾過し、調製後８時間以内にインライン０．２２μｍフィルターを通して患者に投与される。注入後、確実に全薬物用量を送達するために、ｉ．ｖ．ラインを流体で洗い流さなければならない。
【００８４】
一般的に、抗体の全身投与量を投与する場合、約１ｎｇ／ｋｇ〜１００ｎｇ／ｋｇ、１００ｎｇ／ｋｇ〜５００ｎｇ／ｋｇ、５００ｎｇ／ｋｇ〜１μｇ／ｋｇ、１μｇ／ｋｇ〜１００μｇ／ｋｇ、１００μｇ／ｋｇ〜５００μｇ／ｋｇ、５００μｇ／ｋｇ〜１ｍｇ／ｋｇ、１ｍｇ／ｋｇ〜５０ｍｇ／ｋｇ、５０ｍｇ／ｋｇ〜１００ｍｇ／ｋｇ、１００ｍｇ／ｋｇ〜５００ｍｇ／ｋｇ（レシピエントの体重）の範囲の投与量の抗体をレシピエントに提供することが望ましいが、より少ない又はより多い投与量を投与してもよい。約１．０ｍｇ／ｋｇもの低投与量でも、多少の効果を示すことが予測される場合もある。好ましくは、約５ｍｇ／ｋｇが許容可能な投与量であるが、特に治療的使用では、最高約５０ｍｇ／ｋｇの投与量レベルも好ましい。あるいは、１μｇ〜１００μｇ、１ｍｇ〜１００ｍｇ、又は１ｇｍ〜１００ｇｍの範囲の量等、患者の体重を基準としない特定の量の抗体を投与してもよい。例えば、非経口、皮下、筋肉内、静脈内、関節内、気管支内、腹内、関節包内、軟骨内、洞内、腔内、小脳内、脳室内、結腸内、頚管内、胃内、肝内、心筋内、骨内、骨盤内、心膜内、腹腔内、胸膜内、前立腺内、肺内、直腸内、腎臓内、網膜内、脊髄内、液嚢内、胸郭内、子宮内、膀胱内、病巣内、ボーラス、膣内、直腸、口腔内、舌下、鼻腔内、又は経皮手段等の身体部分又は腔に対して部位特異的投与を行ってもよい。
【００８５】
治療は、単回投与スケジュール、又は好ましくは、治療の一次過程が、１〜１０回別個に投与され、次いで反応を維持又は強化するのに必要な次の時間間隔で他の投与量を投与し（例えば、第２の投与量を１〜４ヶ月間投与）、必要に応じて数ヶ月後次の投与を行う、複数回投与スケジュールで行われ得る。好適な治療スケジュールの例としては、（ｉ）０、１ヶ月及び６ヶ月、（ｉｉ）０、７日、及び１ヶ月、（ｉｉｉ）０及び１ヶ月、（ｉｖ）０及び６ヶ月、又は疾患症状を低減する、又は疾患の重篤度を低下させると予測される所望の反応を誘発するのに十分な他のスケジュールが挙げられる。
【００８６】
６．ＣＤ２７中和抗体を含む製品
本発明は、ＣＤ２７中和抗体、容器、及び前記容器上の又は前記容器に付随するラベル又は添付文書を含む、上記疾患の治療に有用な材料を含む製品を含む。製品は、好ましくは、任意で水性希釈剤中に所定の緩衝液及び／又は保存剤とともに少なくとも１つのＣＤ２７中和抗体の溶液を含む少なくとも１つのバイアル瓶を含有し、前記包装材料は、このような溶液が長期間にわたって保持され得ることを示すラベルを含む。本発明は、包装材料と、凍結乾燥ＣＤ２７中和抗体を含む第１のバイアル瓶と、所定の緩衝液及び／又は保存剤の水性希釈剤を含む第２のバイアル瓶とを含む製品であって、前記包装材料が、開業医又は患者に対してＣＤ２７中和抗体を水性希釈中で再構成して溶液を形成する方法を指示するラベルを含む製品を含んでよい。
【００８７】
好適な容器としては、例えば、瓶、バイアル瓶、シリンジ等が挙げられる。容器は、ガラス又はプラスチック等の様々な材料から形成してよい。容器は、無菌アクセスポートを有してよい（例えば、容器は、任意で皮下注射針によって穴を開けることができるストッパーを有する静脈注射用の溶液袋又はバイアル瓶であってよい）。
【００８８】
組成物中の少なくとも１つの活性剤は、ＣＤ２７中和抗体である。ラベル又は添付文書は、組成物が、ＳＬＥ等の選択適応症を治療するために用いられることを示す。本明細書における添付文書は、抗体又は組成物が、特定の疾患及び診断について本明細書に概説する通り、標準的な医療による治療に対して応答しない又はほとんど応答しない状態を治療するために用いられることを示してもよい。他の実施形態では、添付文書は、抗体、抗体コンジュゲート、又は組成物を用いて、ＣＤ２７が関与する細胞プロセスの免疫応答を調節する必要性によって特徴付けられる疾患を治療することができることを指示してもよい。
【００８９】
本発明の更なる別の態様は、生物学的試料中のＣＤ２７を検出するためのキットである。このキットは、ＣＤ２７のエピトープに結合する１つ以上の抗体と、ＣＤ２７に結合して免疫複合体を形成し、前記免疫複合体の形成を検出することによって免疫複合体の有無をサンプル中のＣＤ２７の有無と相関させることを目的とする前記抗体の使用についての指示書とを含む容器を含む。容器の例としては、複数のサンプル中のＣＤ２７を同時に検出できるマルチウェルプレートが挙げられる。
【００９０】
本発明は一般的な用語で説明したが、本発明の実施形態は、以下の実施例において更に開示される。
【実施例】
【００９１】
実施例１：ＣＤ２７試薬及び方法
ＣＤ２７結合モノクローナル抗体を作製及び試験するために、完全長のヒトＣＤ７０及びヒトＣＤ２７、並びにヒトＣＤ２７の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を表すタンパク質コンストラクトを作製した。
【００９２】
ヒトＣＤ２７（配列番号１４９）は、シグナルペプチド（残基１〜２０）、細胞外ドメイン（ＥＣＤ、残基２１〜１９１）、膜貫通ドメイン（ＴＭ、残基１９１〜２１２）、及び細胞内ドメイン（ＩＣＤ、残基２１３〜２６０）で構成される１型膜貫通タンパク質である。ヒトＣＤ７０（配列番号２）は、Ｎ末端から、細胞内ドメイン（ＩＣＤ、残基１〜１７）、膜貫通ドメイン（ＴＭ、残基１８〜３８）、及び細胞外ドメイン（ＥＣＤ、残基３９〜１９３）で構成される１９３アミノ酸長の２型膜貫通ポリペプチドである。完全なＣＤ７０コード配列を、ＨＥＫ  ２９３細胞の表面上でクローン的に発現させた。
【００９３】
ｍＡｂ  ＥＬＩＳＡ及びＰｒｏｔｅＯｎに基づく直接結合アッセイのために、ＣＤ２７  ＥＣＤのアミノ酸１〜１２１を、Ｃ末端にＨｉｓ６−タグペプチドを有するＨＥＫ  ２９３細胞で一時的に発現させ、金属イオンクロマトグラフィーによって精製した。ファージパニング及びＥＬＩＳＡアッセイのために、Ｃ末端にＨｉｓ６−タグを有するＥＣＤのアミノ酸１〜１７３をＨＥＫで発現させ、金属イオンクロマトグラフィーによって、次いで、Ｓｕｐｅｒｄｅｘ  ７５におけるサイズ排除クロマトグラフィーによって精製した。これらＣＤ２７タンパク質を両方とも、タンパク質におけるアミノ酸残基を標的とするＮＨＳ−エステルケミストリーを用いてビオチン化した。結晶化のために、Ｃ末端にＨｉｓ６−タグを有するアミノ酸１〜１０１をバキュロウイルス系で発現させ、Ｐｒｏｔｅｏｓｅ，Ｉｎｃ．による金属イオンクロマトグラフィーによって精製した。マウスの免疫のために、ＣＤ２７−Ｆｃタンパク質をＲ＆Ｄ  ｓｙｓｔｅｍｓから購入した。幾つかの研究のために、完全なＣＤ２７コード配列をＨＥＫ  ２９３細胞の表面上でクローン的に発現させた。
【００９４】
ヒトＣＤ２７及びヒトＣＤ７０  ｃＤＮＡクローンは、Ｏｐｅｎ  Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓから注文した。標準的な分子生物学の技術を用いて、発現コンストラクトを作製した。簡潔に述べると、ＣＤ２７及びＣＤ７０遺伝子のオープンリーディングフレームをＰＣＲで増幅し、制限エンドヌクレアーゼによる切断及びライゲーションを介して、又はリガーゼ非依存性クローニング（ＬＩＣ）を介して哺乳類の発現ベクターにクローニングした。完全長ＣＤ２７及びＣＤ７０遺伝子を発現ベクターにクローニングし、哺乳類細胞の表面上でクローン的に発現させた。ＣＤ２７の細胞外ドメインを哺乳類発現ベクターにクローニングし、ヘキサヒスチジンテールとともにＨＥＫ２９３細胞で一時的に発現させた。
【００９５】
実施例２：ＣＤ２７中和抗体の作製
マウス抗ヒトＣＤ２７抗体を、Ｋｏｈｌｅｒ及びＭｉｌｓｔｅｉｎ（１９７５）のハイブリドーマ法によって作製した。１０匹の１２〜１４週齢のＣ３Ｈ／ＨｅＪマウスをＣｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓから購入した。１日目に、最終体積１００μＬの、各０．３３×１０5ユニットのマウスインターフェロンアルファ及びベータ（Ｂｉｏｓｏｕｒｃｅ）と組み合わせた５０μｇのＨｕ  ＣＤ２７  Ｆｃ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて、マウスの尾の付け根（ＢＯＴ）に皮下免疫（ＳＱ）した。２日目及び３日目に、マウスにインターフェロンをＳＱ  ＢＯＴ注射した（１日目と同じ用量）。１４日目（融合のために脾臓を回収する４日前）に、ＰＢＳ中５０μｇの抗マウスＣＤ４０アゴニストＭａｂ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、ＭＡＢ４４０）と組み合わせた５０μｇのＨｕ  ＣＤ２７−ＦｃをＳＱ  ＢＯＴでマウスに追加免疫した。
【００９６】
力価評価のために、捕捉相ＥＩＡを実施した。簡潔に述べると、４℃で一晩、重炭酸バッファ中０．１マイクログラムのヤギ抗ｍｓ  Ｆｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈ）でプレート（Ｎｕｎｃ−Ｍａｘｉｓｏｒｐ）をコーティングした。ブロッキング及び洗浄工程後、血清の希釈物を添加し、プレートを室温で３０分間インキュベートした。洗浄工程後、ブロッキングバッファ中０．２５μｇ／ｍＬのビオチン化Ｈｕ  ＣＤ２７−ＥＣＤと共に室温で３０分間プレートをインキュベートし、室温で３０分間、０．４％  ＢＳＡ／ＰＢＳ中１；４０，０００希釈したＨＲＰ標識ストレプトアビジン（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈ）でプロービングした。上記の通りプレートを洗浄し、次いで、ＯＰＤ（Ｓｉｇｍａ  ｆａｓｔ  ｔａｂｓ）基質溶液を添加し、室温で１０分間インキュベートし、２５μＬ／ウェルで４Ｎ硫酸を添加することによって基質発色を停止させ、４９０ｎｍで吸光度を測定した。
【００９７】
非分泌ＢＡＬＢ／ｃマウス骨髄腫融合パートナーＦＯの細胞バンクをＡＴＣＣから購入した（＃  ＣＲＬ−１６４６）。１本の凍結バイアル瓶のＦＯ細胞を解凍し、１０％（ｖ／ｖ）ＦＢＳ（Ｈｙｃｌｏｎｅ）を添加したＧｌｕｔａｍａｘ（商標）（変法）培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を含むＤＭＥＭに再懸濁させた。細胞を増殖させ、凍結保存し、Ｃｈａｒｌｅｓ  Ｒｉｖｅｒ  Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓによって無菌且つマイコプラズマを含まないとみなされた。また、Ｃ１８３３Ａ（Ｃｅｎｔｏｃｏｒ）細胞株をこの融合で用いた。この細胞株は、ＦＯ細胞株におけるＣＨＯＰ遺伝子の発現をノックダウンすることによってインハウスで誘導したので、ジェネテシンによる選択下で成長させる必要がある。１０％（ｖ／ｖ）ＦＢＳ（Ｈｙｃｌｏｎｅ）及び５００μｇ／ｍＬのジェネテシン（Ｇｉｂｃｏ）を添加したＧｌｕｔａｍａｘ（商標）（変法）培地を含むＤＭＥＭ中で成長させたことを除いて、上記ＦＯの通り細胞を処理した。ＦＯ及びＣ１８３３Ａ細胞株は、両方とも、融合前に細胞を同期させた。簡潔に述べると、１．５〜２×１０８個の細胞を、０．２５％（ｖ／ｖ）ＦＢＳ（Ｈｙｃｌｏｎｅ）を添加したＧｌｕｔａｍａｘ（商標）（変法）培地を含むＤＭＥＭ  １８０ｍＬに播種し、３７℃で１３時間インキュベートした。最終ＦＢＳ濃度が１０％になるように更に２０ｍＬのＦＢＳを添加し、使用前に３７℃で更に１３時間インキュベートした。Ｃ１８３３Ａ細胞は、細胞同期プロセス全体を通して常にジェネテシン選択下であった。骨髄腫細胞をＰＢＳで洗浄し、計数し、Ｇｕａｖａ  Ｖｉａｃｏｕｎｔソフトウェアを介して生存率を測定（＞７８％）した後、融合させた。
【００９８】
融合の日、動物をＣＯ2窒息により安楽死させた。脾臓を無菌的に摘出し、抗生物質（ＰＳＡ）（Ｓｉｇｍａ）を含有する冷リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）１０ｍＬに浸漬した。
【００９９】
脾臓細胞の単一細胞懸濁液を調製し、ＲＢＣ溶解バッファ（Ｓｉｇｍａ）を用いてＲＢＣ溶解に供した。洗浄した細胞を、製造業者の指示書に従って、抗マウスＴｈｙ１．２、抗マウス／ヒトＣＤ１１ｂ、及び抗マウスＩｇＭ磁気ビーズ（それぞれ、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ  Ｂｉｏｔｅｃ  ＃１３０−０４９−１０１、１３０−１４９−６０１、及び１３０−０４７−３０１）を用いて磁気選別のために標識し、次いで、Ｄｅｐｌｅｔｅプログラムを実行することによってＡｕｔｏＭａｃｓ  Ｐｒｏ装置を用いて選別した。非標識（形質芽球Ｂ細胞リッチ）及び標識細胞画分を両方とも回収し、次いで、Ｇｕａｖａ  ＰＣＡを介して計数した。陽性標識細胞を廃棄した。ＦＯ及びＣ１８３３Ａ融合パートナーの両方に融合させるために、非標識細胞を半分に分けた。Ｄｅ  Ｓｔ．Ｇｒｏｔｈの方法に従って、マウス骨髄腫細胞対生存脾臓細胞の比１：１で融合を実施した（Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ．３５：１〜２１．１９８０）。簡潔に述べると、脾臓及び骨髄腫細胞を混合し、ペレット化し、５０ｍＬのＰＢＳで１回洗浄した。ペレットを、３０秒間かけて３７℃で１ｍＬのポリエチレングリコール（ＰＥＧ）溶液（２ｇのＰＥＧ分子量４０００、２ｍＬのＤＭＥＭ、及び０．４ｍＬのＤＭＳＯ）に再懸濁させた。次いで、細胞／融合混合物を、穏やかに撹拌しながら約６０秒間３７℃の水浴に浸漬した。１分間かけて３７℃のＤＭＥＭをゆっくりと添加することによって融合反応を停止させた。融合細胞を室温で５分間静置し、次いで、１５０×ｇで５分間遠心分離した。次いで、細胞を、ＨＡＴ培地［２０％  ＦＢＳ、５％  Ｏｒｉｇｅｎ、２５μｇ／ｍＬのゲンタマイシン（Ｓｉｇｍａ）、並びにＨＡＴ（１００μＭのヒポキサンチン、０．４μＭのアミノプテリン、及び１６μＭのチミジン（Ｓｉｇｍａ））を添加したＧｌｕｔａｍａｘ（商標）（変法）を含むＤＭＥＭ］に再懸濁させ、９６ウェル平底ポリスチレン組織培養プレート（Ｃｏｒｎｉｎｇ  ＃  ３９９７）又は〜２．２５μｇ／ｍＬのＡＦ４８８ヒトＣＤ２７（Ｊａｎｓｓｅｎ  Ｒｅｓｅａｒｃｈ  ＆  Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ、ＬＬＣ）を含有するメチルセルロース培地（ＳｔｅｍＣｅｌｌ  Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，ＭｅｄｉｕｍＤ  ｃａｔ＃  ０３８０４）に播種した。プレートを、７％  ＣＯ2とともに７〜１０日間、加湿した３７℃のインキュベータ内でインキュベートした。ＣｌｏｎｅｐｉｘＦＬを利用して又は白色光顕微鏡下でスクリーニングするために、メチルセルロースプレートからシングルコロニーを選択した。
【０１００】
実施例３：組み換えＭａｂの生物活性
マウス抗体由来の結合ドメインのＣＤ２７に結合する能力及びＣＤ２７の特定の生物活性を遮断する能力を、下記の通り様々なインビトロアッセイを用いて分析した。
【０１０１】
固相ＥＩＡを用いて、ヒトＣＤ２７に結合することができる抗体についてハイブリドーマ上清をスクリーニングした。プレート（Ｎｕｎｃ−Ｍａｘｉｓｏｒｐ  ＃４４６６１２）を、４℃で一晩、重炭酸バッファ中４μｇ／ｍＬのＦａｂヤギ抗ｈｕＦｃ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＃１０９−００６−０９８）で一晩かけてコーティングした。洗浄せずに、室温で１時間、ＰＢＳ中０．４％（ｗ／ｖ）ウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）２００μＬでウェルをブロッキングした。０．２％（ｗ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ２０を含有する０．１５Ｍの生理食塩水で洗浄した後、０．４％  ＢＳＡ／ＰＢＳ中ｈｕＣＤ２７−Ｆｃ  ５０μＬを室温で１時間かけてプレートに添加した。再度洗浄した後、５０μＬの未希釈ハイブリドーマ上清を、室温で３０分間、コーティングされたプレート上でインキュベートした。プレートを３回洗浄し、次いで、室温で３０分間、１：１０，０００希釈したヤギ抗マウスＦｃ  ＨＲＰ（Ｊａｃｋｓｏｎ  ＃  １１５−０３６−０７１）５０μＬとともにインキュベートした。プレートを再度洗浄し、力価評価のために上記の通り現像した。ハイブリドーマＭａｂの相対結合能を評価するために、連続希釈したハイブリドーマ上清（５μｇ／ｍＬの出発濃度に正規化）を含むＭａｘｉｓｏｒｐ  ３８４ウェルプレート（ＮＵＮＣ  ４６４７１８）を用いて類似のアッセイを実施した。このアッセイで３８６個の陽性ハイブリドーマが同定された。
【０１０２】
３８６個全てのＣＤ２７特異的ハイブリドーマを、ヒトＣＤ７０を内因的に発現することが見出されているＩＭ−９細胞、Ｂ−リンパ芽球様細胞株による生化学的結合アッセイを用いてｈｕＣＤ２７のｈｕＣＤ７０に対する結合を阻害する能力についてスクリーニングした。Ｍａｘｉｓｏｒｐプレート（ＶＷＲ  ＃  ６２４０９−３１４）を、２５０ナノグラム（ｎｇ）／ｍＬの組み換えヒトＣＤ２７／Ｆｃ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｃａｔ＃  ３８２−ＣＤ）でコーティングし、４℃で一晩インキュベートした。次の日、ブロッキングバッファ（Ｐｉｅｒｃｅ，Ｃａｔ＃３７５４３）でプレートをブロッキングし、次いで、Ｃａ＋＋又はＭｇ＋＋を含まないＰＢＳ、０．０１％  Ｔｗｅｅｎ−２０を含有する洗浄バッファＩで洗浄した。コントロール（ｈＣＤ２７に対するマウスＭＡＢ、Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｃａｔ＃  ＭＡＢ３８２；マウスＩｇＧ１アイソタイプコントロール、Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ、Ｃａｔ＃ＭＡＢ  ００２；マウスＩｇＧ２ａアイソタイプコントロール、Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｃａｔ＃  ＭＡＢ００３）を各プレートにおいてインキュベートした。５０μＬ／ウェルのハイブリドーマサンプル又はコントロールを、５０μＬ／ウェルの回収したＩＭ−９細胞、ヒトＢ−リンパ芽球様細胞株（ＡＴＣＣ、ＣＣＬ−１５９）と混合し、振盪せずに室温で１時間インキュベートした。インキュベートの最後に、プレートを洗浄バッファＩＩで洗浄して、全ての未結合細胞を除去し、次いで、５０μＬ／ウェルのＣｅｌｌ  Ｔｉｔｅｒ  Ｇｌｏ試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ、Ｃａｔ＃  Ｇ７５７１）で溶解させた。振盪しながら１０分間インキュベートした後、プレートをＥｎｖｉｓｉｏｎ（ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ、２１０２  Ｍｕｌｔｉｌａｂｅｌ  ｒｅａｄｅｒ）で読み取った。発生した発光シグナルは、存在するＡＴＰの量に比例し、ＣＤ２７結合によって捕捉されたウェル中に存在する生存細胞の数と直接相関する。生化学的結合アッセイの結果に基づいて、約５０％のＣＤ２７特異的クローンが中和されていた。
【０１０３】
中和クローンの中で重複を除くために、競合結合アッセイを実施して抗体を競合群に分類した。このアッセイでは、ハイブリドーマ上清を、パネルにおける各陽性ハイブリドーマを用いて捕捉及び検出試薬の両方として個々に評価した。互いに有効な捕捉／検出試薬を形成する抗体は、恐らく、ＣＤ２７タンパク質における空間的に離れているエピトープを認識するので、両抗体を同時に標的タンパク質に結合させることができる。パネル全体にわたって類似の活性パターンを呈するクローンの群は、恐らく、類似のエピトープに結合する。したがって、様々な群からクローンを選択することによって、様々なエピトープを認識する抗体が提供された。簡潔に述べると、３８４ウェルのＮｕｎｃ  Ｍａｘｉｓｏｒｐプレート（４６４７１８）を、４℃で一晩、コーティングバッファ中ヤギ抗マウスＦｃ（ＪＩＲ１１５−００５−０７１）でコーティングした。次いで、室温で３０分間、ＰＢＳ中０．４％  ＢＳＡでプレートをブロッキングした。この工程及び全ての後続工程では、ＰＢＳ、０．０２％  Ｔｗｅｅｎ−２０でプレートを洗浄する。２０μＬの上清を含む各ウェルの列（上清あたり１列）（初期スクリーニングでは未希釈上清を用いたが、サブクローンの再スクリーニングについては、上清（supes）を２μｇ／ｍＬのｍＡｂに正規化した）をコントロール（マウス抗ｈｕＣＤ２７、Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｃａｔ＃  ＭＡＢ３８２；マウスアイソタイプコントロールＣａｔ＃５５５４３９、Ｂｅｃｔｏｎ−Ｄｉｃｋｅｎｓｏｎ）と共に、次いで、室温で３０分間インキュベートした。洗浄した後、２５μＬの非標識Ｈｕ  ＣＤ２７−ＥＣＤ−Ｈｉｓ−ｔａｇをＰＢＳ＋１０％マウス血清（Ｂｉｏｒｅｃｌａｍａｔｉｏｎマウス血清ＣＤ−１  ｌｏｔ＃ＭＳＥＢＲＥＣ．１８５６５）中で０．３（又は正規化した濃度については０．８）μｇ／ｍＬに調製し、全てのウェルに添加し、次いで、室温で３０分間インキュベートし、次いで洗浄した。各上清をシングルカラムに滴下し、以下の通り調製した混合物２５μＬとともに室温で３０分間インキュベートした：（上清をヤギ抗マウスＦｃ  ＨＲＰ（Ｊａｃｋｓｏｎ  １１５−０３６−００８）とともにプレインキュベート、１５０μＬの１：１０００ヤギ抗マウスＦｃ  ＨＲＰを各１０００μＬの上清（一次スクリーニングの場合）又は２μｇ／ｍＬに調整した上清６００μＬ当たり９０μＬの１：２０００（サブクローンの再スクリーニングの場合）と混合することによって）。室温で３０分間インキュベートした後、１ｍＬ当たり２００μＬの１００％正常マウス血清を添加し、室温で更に３０分間インキュベートした。プレートを洗浄し、次いで、１００μＬ／ウェルのクエン酸リン酸基質溶液（０．１Ｍクエン酸及び０．２Ｍリン酸ナトリウム、０．０１％  Ｈ２Ｏ２、及び１ｍｇ／ｍＬ  ＯＰＤ）とともに室温で１５分間インキュベートした。２５μＬの４Ｎ硫酸を添加することによって基質の発色を停止させ、自動プレートリーダーを用いて４９０ｎｍで吸光度を測定した。このビニングアッセイにより、ｈｕＣＤ２７抗原における非重複結合部位を認識する３つの群が同定された。３つの群全てから選択された抗体を、抗体産生、精製、及び機能アッセイにおける更なる��験のためにスケールアップした。
【０１０４】
細胞のシグナル伝達の阻害
ＣＤ７０のＣＤ２７に対する結合は、転写因子ＮＦ−ｋβの下流の活性化を導くシグナル伝達を誘導する。ＮＦ−ｋβレポーターアッセイは、更に抗体を特性評価するために確立された。アッセイは、以下の２つの方法で実行した：（１）ＣＤ７０によって誘導されるＣＤ２７の活性化の中和による抗体拮抗作用の評価、及び（２）ＣＤ７０とのライゲーションなしのＣＤ２７シグナル伝達の活性化による抗体作動作用の評価。ＨＥＫ−２９３細胞を、ＮＦ−ｋβプロモータの制御下で、ヒトＣＤ２７及びルシフェラーゼコンストラクトの両方を含有するＤＮＡ合計３６ｎｇを用いてトランスフェクトした。ＨＥＫ−２９３トランスフェクタントを、９６ウェルプレート内の４０μＬのＦｒｅｅｓｔｙｌｅ培地（Ｇｉｂｃｏ）に、１ウェル当たり５×１０4細胞になるようにプレーティングした。ＣＤ２７中和ハイブリドーマｍＡｂの希釈物を、アッセイプレートの１：３希釈した最終濃度５０μｇ／ｍＬのＦｒｅｅｓｔｙｌｅ培地（Ｇｉｂｃｏ）に添加し、プレートを１時間３７℃（９５％  Ｏ2／５％  ＣＯ2）でインキュベートした。ハイブリドーマｍＡｂのＣＤ７０：ＣＤ２７シグナル伝達を中和する能力を試験するために、一定期間（terminally）放射線照射した（４０００ｒａｄ）ＨＥＫ−２９３Ｅ  ＣＤ７０エピソーム細胞を、ＣＤ２７トランスフェクタント細胞の数の２０％になるようにアッセイプレートに添加した。ハイブリドーマｍＡｂのアゴニスト活性を試験するために、ＣＤ７０エピソーム細胞の添加を省略した。アッセイプレートを３７℃（９５％  Ｏ2／５％  ＣＯ2）で一晩インキュベートし、製造業者の指示書に従ってＳｔｅａｄｙ−Ｇｌｏ（登録商標）Ｌｕｃｉｆｅｒａｓｅ  Ａｓｓａｙ  Ｓｙｓｔｅｍ（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いて発色させた。ＣＤ７０刺激の非存在下でＣＤ２７受容体の用量依存的アゴニスト活性をほとんど引き起こすことなくＣＤ７０媒介性ＣＤ２７シグナル伝達を用量依存的に遮断する４つのＣＤ２７中和ハイブリドーマｍＡｂ：２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２を、更なる特性評価のために選択した。ＮＦ−ｋβレポーター遺伝子アッセイにおけるＣＤ２７に対するＩＭ−９細胞の結合及びＣＤ７０媒介性シグナル伝達の遮断についてのＩＣ50を、これら４つの抗体について表１に要約する。ＮＦ−ｋβレポーター遺伝子アッセイにおけるアゴニズム活性は、最大試験濃度の抗体におけるＣＤ７０刺激の非存在下の無関係のアイソタイプコントロール抗体（ラットＥＭＰタンパク質に対するマウスＩｇＧ１）と比べたＣＤ２７シグナル伝達の増加倍数として示す。
【０１０５】
ＣＤ２７に対する親和性
２５℃における単量体可溶性ＣＤ２７について抗体Ｃ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２のＫDをＢｉａｃｏｒｅによって測定し、表１に報告する。ＢＩＡＣＯＲＥ  ３０００（ＢＩＡｃｏｒｅ，Ｉｎｃ．）表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）機器においてアッセイを実行した。０．００５％界面活性剤（ポリソルベート２０）を含有するダルベッコリン酸緩衝生理食塩水（ｐＨ  ７．４）においてサンプルを調製した。ヤギ抗マウスＦｃ特異的抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ  Ｉｍｍｕｎｏｒｅｓｅａｒｃｈ  ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ  Ｐｒｏｄ  ＃  １１５−００５−０７１）を、カルボキシメチルデキストランでコーティングされた金表面（ＣＭ−５チップ、Ｂｉａｃｏｒｅ）に共有結合させた。固定化前に、チップを５０ｍＭのＮａＯＨ、１００ｍＭのＨＣｌ、及び０．１％ドデシル硫酸ナトリウムで前処理し、前処理と前処理との間に脱イオン水を注入した。抗体を１０ｍＭの酢酸ナトリウムバッファ（ｐＨ  ４．５）で希釈し、アミンカップリング化学についての製造業者の指示書を用いてチップのカルボキシメチル化デキストラン表面に結合させた。表面上に残留する反応基を、エタノールアミンＨＣＬを使用して不活化した。Ｆｃドメインを介してｍＡｂをセンサ表面に捕捉した。漸増濃度（０．６〜１５０ｎＭ、４倍希釈系列）で注入したヒトＣＤ２７ＥＣＤの会合を３分間モニタリングし、解離を１０分間モニタリングした。捕捉表面のベースラインへの再生を、１００ｍＭのリン酸の３秒パルスを２回用いて最適化した。Ｓｃｒｕｂｂｅｒソフトウェアバージョン１．１ｇ（ＢｉｏＬｏｇｉｃ  Ｓｏｆｔｗａｒｅ）を用いてデータを処理した。データのダブルレファレンスサブトラクション（Double reference subtraction）を実施して、シグナル及び機器のノイズに対するバッファの寄与を補正した。処理したデータの動態解析をＢｉａｅｖａｌｕａｔｉｏｎ  ４．０．１ソフトウェア（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ  Ｂｉｏ−Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）を用いて実施した。結合プロファイルは、１：１結合モデルによって説明され、これはＣＤ２７の一価結合を示す。
【０１０６】
【表１】
0006487839.tif 000002
1  固定化ＣＤ２７に対するＩＭ−９細胞結合のｍＡｂ阻害についてのＩＣ50
2  レポーター遺伝子アッセイにおけるｍＡｂ阻害についてのＩＣ50
3  アイソタイプコントロール抗体と比べたレポーター遺伝子シグナルにおける倍数増加として測定した、ＣＤ７０の非存在下における５０ｕｇ／ｍＬのｍＡｂのアゴニスト活性。
【０１０７】
細胞増殖の阻害
抗ＣＤ３＋抗ＣＤ２８抗体を含む培養物において最適以下に活性化されたＴ細胞の増殖は、Ｔ細胞において発現しているＣＤ２７のＣＤ７０とのライゲーションによって強化される。４つのマウス中和抗体を、ＣＤ７０の存在下においてＴ細胞増殖を阻害する能力及びＣＤ７０の非存在下において増殖を誘導する能力について評価した。凍結ＣＤ４＋Ｔ細胞は、ＡｌｌＣｅｌｌｓ，ＬＬＣから購入した。細胞を解凍し、１０％  ＦＢＳ、１％  Ｌ−グルタミン、及び１％ペニシリン−ストレプトマイシンを含有するＩＭＤＭ培地に入れた。細胞をプレーティングする前に、抗ＣＤ３（ＯＫＴ３）抗体を４℃で一晩かけてＰＢＳ中１μｇ／ｍＬでＵ底プレートにコーティングした。細胞を計数し、１×１０6細胞／ｍＬの濃度にし、１×１０5細胞／ウェルでプレーティングした。可溶性抗ＣＤ２８を、１ウェル当たり１μｇ／ｍＬで二次活性化シグナルとして添加した。ヒトＣＤ７０又はベクターのみ（偽）でトランスフェクトした、放射線照射した（６０００ｒａｄ）ＨＥＫ細胞を、２×１０4細胞／ｍＬ（２０％）で適切なウェルに添加した。細胞を３日間刺激し、０．９μＣｉのチミジン［メチル−３Ｈ］を全てのサンプルウェルに添加し、前記細胞を１８〜２４時間インキュベートした。刺激から４日目に、ＰＥ  Ｆｉｌｔｅｒｍａｔｅ  Ｈａｒｖｅｓｔｅｒを用いて細胞をフィルタープレートに収集した。プレートを乾燥させ、３０μＬのＭｉｃｒｏＳｃｉｎｔＴＭ−２０を全てのサンプルウェルに添加した。プレートをＰＥ  ＴｏｐＣｏｕｎｔ  ＮＸＴで読み取り、データをＣＰＭとして収集した。抗体Ｃ２１７７は、ＣＤ７０媒介性Ｔ細胞増殖の用量依存的な阻害を示し、ＣＤ７０の非存在下において非常に弱い内因性アゴニスト活性を示す（図１）。Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２抗体についても同様の結果が観察された。これら抗体についてのＩＣ50及び最大阻害率（％）を表２に報告する。ＣＤ７０ライゲーションの非存在下において一貫した増殖の刺激を示した抗体はなく、これは、内因性アゴニスト活性が存在しないことを示す。
【０１０８】
更に、Ｃ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１、及びＣ２１９２抗体は、ＣＳＦＥアッセイで測定したとき、ＣＤ７０媒介性Ｔ細胞増殖の用量依存的な阻害を示し、ＣＤ７０刺激の非存在下では増殖に対する効果はなかった。凍結ＣＤ３＋Ｔ細胞は、ＡｌｌＣｅｌｌｓ，ＬＬＣから購入した。細胞を解凍し、１０％  ＦＢＳ、１％Ｌ−グルタミン、及び１％ペニシリン−ストレプトマイシンを含有するＩＭＤＭ培地に入れた。細胞を２．５ｍＭ  ＣＦＳＥ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）で予め標識し、ＦＢＳでクエンチし、Ｔ細胞培地で洗浄した。ＣＦＳＥは、細胞に受動的に拡散する色素であり、細胞内アミンと結合した際に高度に蛍光を発する。細胞分裂の際、各娘細胞は、親細胞のＣＦＳＥ標識の半分を含有するので、異なるＣＦＳＥ強度を有する細胞の数を追跡することによって細胞増殖をモニタリングすることができる。細胞の濃度を１×１０6細胞／ｍＬにし、１×１０5細胞／ウェルでプレーティングした。細胞をプレーティングする前に、抗ＣＤ３（ＯＫＴ３）抗体を４℃で一晩かけてＰＢＳ中０．５μｇ／ｍＬでＵ底プレートにコーティングした。可溶性抗ＣＤ２８を、１ウェル当たり０．１μｇ／ｍＬで二次活性化シグナルとして添加した。ヒトＣＤ７０又はベクターのみ（偽）でトランスフェクトした、放射線照射した（６０００ｒａｄ）ＨＥＫ細胞を、２×１０4細胞／ウェル（２０％）で適切なウェルに添加した。細胞を４日間刺激し、ＦＡＣＳ解析によって解析して、様々な強度レベルのＣＦＳＥ標識を含有する分裂細胞を計数する。
【０１０９】
形質芽球分化の阻害
一次ヒトＢ細胞を用いた形質芽球分化アッセイにおいて、ＣＤ２７中和抗体ｍＡｂについても試験した。正常ドナーの末梢血（ＡｌｌＣｅｌｌｓから入手）から陰性選択したＣＤ１９＋ヒトＢリンパ球を、１μｇ／ｍＬの抗ＣＤ４０抗体（クローンＭＡＢ８９、Ａｂｃａｍ）及び１００ｎｇ／ｍＬのインターロイキン２１（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）又は１ｕｇ／ｍＬの可溶性ヒト組み換えＣＤ４０リガンド及び２ｕｇ／ｍＬの「リガンド用エンハンサー」（両方ともＡｌｅｘｉｓ  Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｓ）及び１００ｎｇ／ｍＬのインターロイキン２１の存在下で、１ウェル当たり１０5個のＢ細胞で、９６ウェルプレートにおいて、６日間培養した。ＣＤ２７中和ハイブリドーマ又はアイソタイプコントロール抗体を、２×１０4個の放射線照射された（６０００ｒａｄ）ＣＤ７０発現ＨＥＫ  ２９３細胞又は偽トランスフェクトされたＨＥＫ  ２９３細胞の存在下又は非存在下で添加した。ＣＤ２７中和ハイブリドーマｍＡｂ及び一致するアイソタイプコントロールを、２５、２．５、及び０．２５μｇ／ｍＬで用いた。６日目に、細胞サンプルをフローサイトメトリーによって分析し、形質芽球の画分を前方散乱／高、ＩｇＤマイナス、ＣＤ３８明、ＣＤ２０低として同定した。ＣＤ２７中和ｍａｂの効果を、偽トランスフェクトされた細胞を含有する対応するＢ細胞培養物における形質芽球頻度に対して正規化した、ＣＤ７０発現細胞及びハイブリドーマｍＡｂを含有するＢ細胞培養物における形質芽球頻度として計算した。２．５μｇ／ｍＬのＣ２１７７、Ｃ２１８６、Ｃ２１９１又はＣ２１９２ｍＡｂによる阻害率（％）を表２に示す。ＣＤ７０刺激の非存在下におけるアゴニスト活性は、これらｍＡｂのいずれについても観察されなかった。
【０１１０】
【表２】
0006487839.tif 000003
【０１１１】
実施例４：エピトープマッピング及びグループ化
より慎重に初期ビニングを評価するために、精製中和ｍＡｂの一部及びＣＤ２７中和抗体、ＭＡＢ  ３８２（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて競合アッセイを実施した。簡潔に述べると、室温で２時間かけて、１ウェル当たり５μＬ（１０μｇ／ｍＬ）のＣＤ２７−Ｆｃキメラタンパク質（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｙｔｅｍｓ、Ｃａｔ＃  ３８２−ＣＤ）を、ＭＳＤ  ＨｉｇｈＢｉｎｄ  ｐｌａｔｅ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）にコーティングした。５％のＭＳＤブロッカーＡバッファ（Ｍｅｓｏ  Ｓｃａｌｅ  Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ，Ｇａｉｔｈｅｒｓｂｕｒｇ，ＭＤ）を各ウェルに添加し、室温で２時間インキュベートした。プレートを０．１Ｍ  ＨＥＰＥＳバッファ（ｐＨ  ７．４）で３回洗浄し、次いで、１０ｎＭの標識ＣＤ２７抗体と様々な濃度の競合抗体（１ｎＭ〜２μＭ）との混合物を添加した。抗体をＭＳＤ  Ｓｕｌｆｏ−Ｔａｇ（商標）ＮＨＳ−エステル、タンパク質の一級アミン基にカップリングして安定なアミド結合を形成するアミン反応性Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステルで標識した。室温で穏やかに振盪しながら２時間インキュベートした後、プレートを０．１Ｍ  ＨＥＰＥＳバッファ（ｐＨ  ７．４）で３回洗浄した。ＭＳＤ  Ｒｅａｄ  Ｂｕｆｆｅｒ  Ｔを蒸留水で希釈（４倍）し、１５０μＬ／ウェルの体積で分注した。ＭＳＤマイクロプレートの電極表面で電気化学刺激が開始された際に光を発するＳｕｌｆｏ−Ｔａｇ標識を通して電気化学発光を検出するＳＥＣＴＯＲ  Ｉｍａｇｅｒ  ６０００を用いてプレートを分析した。
【０１１２】
競合試験により、表３に要約する抗体について３つの競合群が定義され、これは、初期ビニングアッセイを確認するものである。Ｃ２１７９、Ｃ２１９２及びＭＡＢ３８２が、１つの群を構成し；Ｃ２１７７、Ｃ２１８２、Ｃ２１８６、及びＣ２１９３は、第２の群であり；Ｃ２１９１は、別の群を構成する。
【０１１３】
【表３】
0006487839.tif 000004
【０１１４】
実施例５：Ｘ線結晶解析によるエピトープ及びパラトープの同定
抗体Ｃ２１７７及びＣ２１９１の詳細なエピトープ及びパラトープを、三量体複合体としてＣＤ２７  ＥＣＤ断片（残基１〜１０１）を有する対応するＦａｂの共結晶化、及びＸ線結晶解析による構造決定によって決定した。Ｃ２１７７  Ｆａｂ及びＣ２１９１  ＦａｂのＨｉｇタグ付キメラバージョン（マウス可変ドメイン、ヒト定常ドメイン）をＨＥＫ２９３細胞で発現させ、親和性及びサイズ排除クロマトグラフィーを用いて精製した。ヒトＣＤ２７のＨｉｓタグ付ＥＣＤ断片（残基１〜１０１）を、アニオン交換クロマトグラフィーによって更に精製した。１：１．２５：１．２５のモル比でＣＤ２７と過剰のＦａｂとを混合することによって三元複合体ＣＤ２７：Ｃ２１７７  Ｆａｂ：Ｃ２１９１  Ｆａｂを調製した。複合体を４℃で２時間インキュベートし、サイズ排除クロマトグラフィーを用いて非複合体化種から分離し、２０ｍＭのＴｒｉｓ（ｐＨ  ８．５）、２５０ｍＭのＮａＣｌにおいて１２ｍｇ／ｍＬに濃縮した。複合体の結晶化を、２０℃のシッティングドロップ（sitting drops）における蒸気拡散法によって実施した。２４％  ＰＥＧ３３５０、０．２Ｍ塩化アンモニウム、０．１Ｍ  Ｔｒｉｓバッファ（ｐＨ  ８．５）から複合体の結晶を得た。Ｘ線データ収集については、１つの結晶を、２０％グリセロールを添加した結晶化溶液を含有する抗凍結剤溶液に数秒間浸漬し、１００Ｋの窒素流中で急速冷凍した。回折データを、Ｓａｔｕｒｎ  ９４４  ＣＣＤ検出器及びＸ−ｓｔｒｅａｍ  ２０００冷凍システム（Ｒｉｇａｋｕ）を備えるＲｉｇａｋｕ  ＭｉｃｒｏＭａｘＴＭ−００７ＨＦ  Ｘ線発生装置で、０．２５°ー画像当たり２分間曝露で２４０°の結晶回転にわたって収集し、プログラムＸＤＳを用いて処理した（Ｋａｂｓｃｈ  Ｗ．２０１０．Ａｃｔａ  Ｃｒｙｓｔａｌｌｏｇｒ．Ｄ６６：１２５〜１３２）。結晶は、以下の単位格子パラメータを有する単斜空間群Ｐ２１に属する：ａ＝１４１．１Å、ｂ＝５３．０Å、ｃ＝１４３．４Å、α＝９０°、β＝１１２．２°、γ＝９０°。
【０１１５】
三元複合体の結晶構造を３．５Åの解像度で決定し、２６％の結晶学的Ｒ因子まで精密にした。Ｃ２１７７及びＣ２１９１のＦａｂは、空間的に異なる非重複エピトープでＣ２７に結合する（図２）。Ｃ２１７７  Ｆａｂは、ＣＤ２７のＮ末端（細胞表面から遠位）部分に結合する。エピトープは、７００Å２をカバーし、９つの残基Ｋ５、Ｓ６、Ｐ８、Ｈ１１、Ｗ１３、Ｇ１６、Ｋ１７、Ｈ３６、Ｒ３７を含む（図３）。パラトープは、抗原と接触している（４Å以内）抗体残基として定義される。Ｃ２１７７パラトープは、ＶＬ由来の５つの残基（Ｙ３１、Ｙ３６、Ｙ５３、Ｎ５７、Ｎ９６）及びＶＨ由来の９つの残基（Ｓ３１、Ｗ３３、Ｙ５２、Ｄ５５、Ｄ５７、Ｙ１０１、Ｙ１０２、Ｄ１０４、Ｙ１０５）を含む（図３）。６つのＣＤＲ全てが、抗原認識に関与している。Ｈ３６及びＲ３７は、エピトープの中心残基である。これらは、ＶＬのＹ３１及びＶＨのＹ１０２に対して積み重ねられ、Ｈ３３６もＶＨのＤ１０４に対して塩橋を形成する。
【０１１６】
Ｃ２１９１  Ｆａｂは、「側」面でＣＤ２７に結合し（図２）、表面の８００Å２をカバーする。エピトープは、１０個の残基：Ｆ２８、Ｄ４３、Ｐ４４、Ｉ４６、Ｐ４７、Ｇ４８、Ｖ４９、Ｈ６０、Ｓ６３、Ｈ６６を含む。Ｃ２１９１パラトープは、ＶＬ由来の７つの残基（Ｙ３４、Ｆ３６、Ｙ５３、Ｌ５４、Ｒ９６、Ｌ９８、Ｗ１００）及びＶＨ由来の８つの残基（Ｓ３１、Ｙ３２、Ｙ５０、Ｎ５７、Ｙ５９、Ｒ１００、Ｇ１０１、Ｎ１０２）を含む（図４）。抗体−抗原相互作用は、ＣＤ２７の残基４４〜４９とＶＬ  ＣＤＲの疎水性パッチとの間の疎水性相互作用によって支配される。
【０１１７】
Ｃ２１７７及びＣ２１９１エピトープの位置が異なることは、これら抗体の作用機序が異なることを示唆する。Ｃ２１９１は、恐らく、ＣＤ２７の「側」面における重複エピトープについてＣＤ７０  ＥＣＤと直接競合する。Ｃ２１７７抗体は、対照的に、同じエピトープについて競合するのではなく、ＣＤ２７及びＣＤ７０を有する細胞のアプローチを妨げる。この観察結果は、Ｃ２１９１は、可溶性ＣＤ７０  ＥＣＤのＣＤ２７への結合を妨げるが、Ｃ２１７７は妨げないという事実によって支持される。
【０１１８】
実施例６：ヒトリンパ球応答の抗体調節
免疫不全マウスモデルＮＯＤ／ＳＣＩＤ−ＩＬ２Ｒγnull（ＮＳＧ）マウスは、Ｔ細胞応答によるヒト免疫系コントロールの局面を研究するために開発された（Ｍａｒｋｕｓ  Ｇ  Ｍａｎｚ  ＆  Ｊａｍｅｓ  Ｐ  Ｄｉ  Ｓａｎｔｏ  Ｒｅｎａｉｓｓａｎｃｅ  ｆｏｒ  ｍｏｕｓｅ  ｍｏｄｅｌｓ  ｏｆ  ｈｕｍａｎ  ｈｅｍａｔｏｐｏｉｅｓｉｓ  ａｎｄ  ｉｍｍｕｎｏｂｉｏｌｏｇｙ  Ｎａｔｕｒｅ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ  １０，１０３９〜１０４２（２００９））。ヒトＰＢＭＣの免疫低下（ＮＳＧ）マウスへの養子移入を使用して、ヒト細胞移植及び／又は増殖に対する抗ＣＤ２７抗体の効果を評価した。このモデルは、抗体産生及びＴ細胞媒介応答に対する標的ヒトＣＤ２７の効果を評価することを可能にする。
【０１１９】
抗体Ｃ２１７７及びＣ２１９１を、細胞移入の時点、続いて、３週間の間１週間に２回投与した。２１日目に、マウスを屠殺し、細胞を血液及び脾臓から精製し、次いで、フローサイトメトリーによって特性評価した。ＣＴＬＡ４−Ｉｇ（Ｏｒｅｎｃｉａ，ＢＭＳ）を、免疫抑制についてのポジティブコントロールとして含めた。ヒト細胞移植／増加を、血液及び脾臓サンプル中のヒトＣＤ４５+の存在を評価することによって測定した。
【０１２０】
マウスを念入りにモニタリングし、動物福祉指針に従ってＸＧＶＨ症状に基づいて屠殺の時間を決めた。抗ＣＤ２７処理の効果を評価するために用いた実験情報は、以下を含んでいた：体重（週２回）、ＸＧＶＨの観察可能な徴候（週２回）、例えば、体位、活性レベル、毛づくろい、皮膚病変（特に、目及び耳の周囲）、１〜５のスコアシステムを用いる、ヒト細胞サブセットの絶対数、並びに（１）注入されたヒトＰＢＭＣ、（２）マウスＰＢ（週１回）及び（３）脾臓及び骨髄のフローサイトメトリー解析を用いる活性化状態；肝臓、腎臓、肺、及び脾臓等の標的器官におけるヒト浸潤のレベルを決定するためのＥＬＩＳＡ、並びに屠殺時、組織学又は免疫組織化学を用いる血清、脾臓、及びＢＭ中の合計ヒトＩｇ、ＩｇＭ、及びＩｇＧの測定。
【０１２１】
処理群は、以下の通りであった：
１．ＰＢＭＣ（２０００万〜４０００万細胞／マウス、ｉ．ｐ．）
２．ＰＢＭＣ＋ＣＴＬＡ４−Ｉｇ（１０ｍｇ／ｋｇ）
３．ＰＢＭＣ＋アイソタイプコントロール抗体、２×／週、３週間
４．ＰＢＭＣ＋抗ＣＤ２７抗体、２×／週、３週間
【０１２２】
１０ｍｇ／ｋｇの抗ＣＤ２７  ｍＡｂ、Ｃ２１７７、及びＣ２１９１（ヒトＩｇＧ4（ａｌａ／ａｌａ，ｓｅｒ−＞ｐｒｏ）スカフォールドにキメラ化したハイブリドーマ抗体）を投与したマウスは、ＰＭＢＣ単独、又は血液若しくは脾臓サンプルから単離したＰＭＢＣ中アイソタイプコントロールと比べて、統計的に有意に少ないＣＤ４５+細胞を有していた。
【０１２３】
実施例７：Ｃ２１７７及びＣ２１９１Ｍａｂのヒトフレームワーク適応
抗体Ｃ２１７７及びＣ２１９１からヒトＦＲに抗原特異性を移入させるために用いた抗原結合部位及び領域を、Ｒａｇｈｕｎａｔｈａｎ  Ｇ．による米国特許出願公開第２００９０１１８１２７  Ａ１号（２００９年）に概説の通り再分類した。簡潔に述べると、抗原結合領域は、様々な用語を用いて定義されている（Ａｌｍａｇｒｏ  ａｎｄ  Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ  Ｂｉｏｓｃｉ  １３：１６１９〜１６３３，２００８に考察されている）。用語「相補性決定領域（ＣＤＲ）」は、配列の変動性に基づいている（Ｗｕ  ａｎｄ  Ｋａｂａｔ，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１３２：２１１〜２５０，１９７０）。ＶHに３つ（Ｈ−ＣＤＲ１、Ｈ−ＣＤＲ２、Ｈ−ＣＤＲ３）及びＶLに３つ（Ｌ−ＣＤＲ１、Ｌ−ＣＤＲ２、Ｌ−ＣＤＲ３）の６つのＣＤＲが存在する（Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ  Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．，１９９１）。「超可変領域」、「ＨＶＲ」、又は「ＨＶＬ」は、Ｃｈｏｔｈｉａ及びＬｅｓｋによって定義されている通り、構造中における可変である抗体可変ドメインの領域を指す（Ｃｈｏｔｈｉａ  ａｎｄ  Ｌｅｓｋ，Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１〜９１７，１９８７）。ＶＨに３つ（Ｈ１、Ｈ２、及びＨ３）及びＶＬに３つ（Ｌ１、Ｌ２、及びＬ３）の６つのＨＶＲが存在する。
【０１２４】
ＨＦＡ法では、非ヒト抗体の特異性をヒトＦＲ（ＨＦＲ）に移入するために標的とされる領域は、ＶHのＣＤＲ−１に対応する領域を除いて、Ｋａｂａｔ（Ｋａｂａｔ  ｅｔ  ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ  Ｐｒｏｔｅｉｎｓ  ｏｆ  Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ  Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ  Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ  Ｈｅａｌｔｈ  Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ  Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ  ｏｆ  Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．，１９９１）によって定義されているＣＤＲであるこの領域の場合、ＣＤＲとＨＶＬとの組み合わせ（延長したＶHのＣＤＲ−１）を非ヒト抗体からヒトＦＲ（表３０、３１、３４、３５に提供）に移入する。更に、より短い移入されたＣＤＲ−Ｈ２を含む変異体（Ｋａｂａｔ−７と呼ばれる［Ｒａｇｈｕｎａｔｈａｎ  Ｇ．米国特許出願公開第２００９０１１８１２７  Ａ１号（２００９年）］）を作製し、試験する。
【０１２５】
ヒトＦＲの選択
抗原結合部位には含まれないＶ領域の領域として定義されるヒトＦＲを、機能的ヒト生殖系列ＩＧＨＶ、ＩＧＫＶ、ＩＧＫＪ、及びＩＧＨＪ遺伝子のレパートリーから選択した。ヒト生殖系列遺伝子配列のレパートリーは、ＩＭＧＴデータベース（Ｋａａｓ、ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．３２，Ｄ２０８〜Ｄ２１０，２００４；Ｌｅｆｒａｎｃ  Ｍ．−Ｐ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，３３，Ｄ５９３〜Ｄ５９７，２００５）をサーチし、２００７年１０月１日現在で全ての「０１」アレルをコンパイルすることによって得た。このコンパイルから、重複する遺伝子（アミノ酸レベルで１００％同一）及び不対システイン残基を有するものをコンパイルから取り除いた。
【０１２６】
ＨＦＲについてのヒト配列の初期選択は、ＦＲ−１〜３並びにＨ−ＣＤＲ−１及びＨ−ＣＤＲ−２を含むマウスＶH領域の全長に対するヒトＩＧＨＶ生殖系列遺伝子の配列類似性に基づいていた。次の段階では、ＣＤＲの長さ、及びマウス配列のＣＤＲとヒト配列のＣＤＲとの間の配列類似性の両方を考慮したスコアを用いて、選択されたヒト配列に順位序列をつけた。標準的な突然変異マトリクス、例えば、ＢＬＯＳＵＭ  ６２置換マトリクス（Ｈｅｎｉｋｏｆｆ  ａｎｄ  Ｈｅｎｉｋｏｆｆ，Ｐｒｏｃ  Ｎａｔｌ  Ａｃａｄ  Ｓｃｉ  Ｕ  Ｓ  Ａ．８９，１０９１５〜９，１９９２）を、マウス配列のＣＤＲとヒト配列のＣＤＲとのアラインメントを採点するために用い、ＣＤＲループに挿入及び／又は欠失が存在していた場合、大きなペナルティを適用した。ＦＲ−４は、ＩＧＨＪ生殖系列遺伝子とマウス抗体Ｃ２１７７及びＣ２１９１配列との配列類似性に基づいて選択した（Ｋａａｓ，ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．３２，Ｄ２０８〜Ｄ２１０，２００４；Ｌｅｆｒａｎｃ  Ｍ．−Ｐ  ｅｔ  ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ  Ｒｅｓ．，３３，Ｄ５９３〜Ｄ５９７，２００５）。類似の手順を用いて、ＶLについてヒトＦＲを選択した。ＩＧＶＫ、生殖系列遺伝子を、ＦＲ  １〜３及びＬ−ＣＤＲ１〜３を選択するために用いた。ＩＧＪＫ生殖系列遺伝子を、ＦＲ−４を選択するために用いた。
【０１２７】
配列基準に加えて、Ｆｖ断片についての３Ｄホモロジーモデルを、Ａｃｃｅｌｒｙｓ、Ｉｎｃ製のプログラムスイートにおけるからＭｏｄｅｌｅｒ（Ｓａｌｉ  ａｎｄ  Ｂｌｕｎｄｅｌｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２３４：７７９，１９９３）を用いて構築した。このモデルを、ＣＤＲの特性評価及び発現性の傾向評価を含むＨＦＲ変異体の分析に利用した。ＨＦＲ変異体を選択するための更なる検討事項は、露出しているメチオニン及びトリプトファン残基の数を最小化し、潜在的なＮ−グリコシル化部位を除去し、インシリコで最高の発現プロファイルを有するヒト生殖系列を支持することであった（ｄｅ  Ｗｉｌｄｔ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１８５：８９５，１９９９）。
【０１２８】
経路１のフレームワーク適応及びＣ２１７７の最適化のために、６つのＶH及び４つのＶLＨＦＲ変異体がライブラリに含まれていた。ＶH及びＶL  ＨＦＲ変異体をコンビナトリアルに対合させて、全てのＨＦＲ変異体をＣ２１７７の対応物Ｖ領域＋親Ｃ２１７７自体と対合させる２４個のＨＦＲ変異体対＋１０個のコントロールを得、合計３５の組み合わせが得られた。Ｃ２１９１についても同様に、５つのＶH及び４つのＶL  ＨＦＲ変異体をコンビナトリアルに対合させて、合計３０個の変異体について、Ｃ２１９１の対応物Ｖ領域＋親Ｃ２１９１親自体と対合した全てのＨＦＲ  Ｖ変異体を組み合わせて２０個のＨＦＲ＋９個のコントロールを得た。選択された可変ドメインをコードしているＤＮＡを標準的な方法を用いて組み換えて、ヒトＩｇＧ１及びカッパ定常領域を有する完全ＭＡｂを組み立てた。得られるＣ２１７７の参照キメラ抗体（Ｍ４０と命名）は、可変ドメインＨ７及びＬ１８を含んでいた。対応するＣ２１９１のキメラ抗体（Ｍ４１と命名）は、可変領域Ｈ１０及びＬ２０を含んでいた。ｍＡｂを、４８ウェルプレートにおいて、ＨＥＫ２９３Ｅ細胞で一時的に発現させた。培養物から得られた上清流体を、トランスフェクションの９６時間後に発現及び結合活性について試験した。分泌されたｍＡｂの発現レベルを、Ｏｃｔｅｔ技術を用いて評価して、ＰｒｏｔｅｉｎＡバイオセンサーに対する抗体結合の速度を測定した。公知の抗体濃度の標準的なサンプルに対する比較によって、発現レベルを定量した。１００μｇ／ｍＬから始まる同一アイソタイプの抗体の１：２連続希釈物からなる８点標準曲線を構築した。バイオセンサーをスペント培地で１０分間水和させ、標準及び未知サンプルの結合速度を２分間測定した。５パラメータ重み付け用量応答等式及び初期傾斜結合速度アルゴリズムを用いてデータを解析した。発現が＞１μｇ／ｍＬであるサンプルをスペント培地で１μｇ／ｍＬに希釈し、一点ＥＬＩＳＡを用いてスクリーニングした。このＥＬＩＳＡでは、９６ウェル黒色ｍａｘｉｓｏｒｐプレートを、４℃で一晩、炭酸−重炭酸バッファ（ｐＨ  ９．４）で希釈した３μｇ／ｍＬのヤギ抗ヒトＩｇＧ  ＦＣ  ５０μＬでコーティングし、次いで、洗浄バッファ（０．０５％  Ｔｗｅｅｎ−２０を含むＰＢＳ）で３回洗浄し、３００μＬのＳｔａｒｔｉｎｇＢｌｏｃｋ（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）溶液で１時間ブロッキングし、次いで、前述の通り洗浄した。サンプル又は標準をスペント培地で１００ｎｇ／ｍＬに希釈し、振盪しながら１時間室温で５０μＬをアッセイプレートに添加した。プレートを２回洗浄し、５０μＬ／ウェルのＨｉｓタグ付ヒトＣＤ２７  ＥＣＤを、アッセイバッファ（１％  ＦＢＳ及び０．０５％  Ｔｗｅｅｎ−２０を含むＰＢＳ）で希釈した６０ｎｇ／ｍＬで添加し、室温で１時間インキュベートした。洗浄後、アッセイバッファで１：２０００希釈した５０μＬ／ウェルのＱｉａｇｅｎペルオキシダーゼコンジュゲート化ペンタヒスチジンを添加し、振盪しながら室温で１時間インキュベートした。ＢＭ  ＣｈｅｍｉＬｕｍ基質（ＢＭ  Ｃｈｅｍｉｌｕｍ，ＰＯＤ，Ｒｏｃｈｅ）を、製造業者の指示書に従って混合し、最後の洗浄後に５０μＬをプレートに添加し��。１０分後、プレートをＰｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ  Ｅｎｖｉｓｉｏｎ  Ｒｅａｄｅｒで読み取った。
【０１２９】
Ｃ２１７７コンビナトリアルライブラリーをスクリーニングした結果は、全てのＶ領域が様々な強度でＣＤ２７に結合することを示した。幾つかのＨＦＲ変異体からは、親Ｃ２１７７よりも高い結合シグナルが得られたが、他は、親と同程度か又は親よりも低い結合を示した。全てのＶＬが、検出可能なレベルで抗原に結合し、許容可能であるが、親よりも低いレベルで発現したＨＦＲ変異体の結合に影響を与えなかった。２４個のＣ２１７７ＨＦＲ抗体（ＶＨ、ＶＬ組み合わせ）は、ＣＤ２７結合及び>１μｇ／ｍＬの発現を示した。
【０１３０】
Ｃ２１９１コンビナトリアルライブラリーをスクリーニングした結果は、１つを除いて全てのＶＨが様々な強度でＣＤ２７に結合することを示した。このＶＨとの対合を除いて、全てのＶＬは、ＣＤ２７への結合を示した。幾つかのＨＦＲ変異体からは、親Ｃ２１７７よりも高い結合シグナルが得られたが、他は、親と同程度か又は親よりも低い結合を示した。１７個のＣ２１９１  ＨＦＲ抗体（ＶＨ、ＶＬ組み合わせ）は、ＣＤ２７結合及び＞１μｇ／ｍＬの発現を示した。
【０１３１】
ＥＬＩＳＡによって測定したＣＤ２７についての相対結合親和性に基づいて、パイロットスケールの発現及び精製のために１５個のＣ２１７７及び１１個のＣ２１９１変異体を選択した。パイロットスケールの発現は、７５０ｍＬの体積でＣＨＯ−Ｓ細胞において一時的に行った。回収した上清をプロテインＡクロマトグラフィーで精製し、精製タンパク質を、それらの親和性及び機能活性について評価した。
【０１３２】
ＨＦＲＣ  ２１７７ヒトＭＡｂ変異体の親和性は、ＰｒｏｔｅＯｎ  ＸＰＲ３６タンパク質相互作用アレイシステム（Ｂｉｏｒａｄ）を用いて表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）によって測定した。ＣＤ２７の会合及び解離の速度を各変異体について測定した。アミンカップリング化学についての製造業者の指示書を用いて、ＧＬＣチップ（Ｂｉｏｒａｄ）の表面にヤギ抗ヒトＩｇＧ（Ｆｃ）抗体を共有結合させることによって、バイオセンサー表面を調製した。約５，０００ＲＵ（応答単位）の抗体を固定化した。速度実験を、２５℃でランニングバッファ（ＰＢＳ、０．０１％  Ｐ２０、０．０１％  ＢＳＡ）中で実施した。３００ｎＭで始まるヒトＣＤ２７  ＥＣＤの１：３連続希釈物をランニングバッファで調製した。約３５０  ＲＵのｍＡｂを、センサチップの各チャンネルに捕捉した。アイソタイプが一致している抗体コントロールをチャンネル６に固定化し、レファレンス表面として用いた。ｍＡｂの捕捉後、３分間、３０μＬ／分で抗原を注入（会合相）し、次いで、１０分間バッファを流した（解離相）。チップ表面を、１００μＬ／分で０．８５％リン酸を注入することによって再生した。機器のソフトウェアにおいてデータを処理した。分析物の注入についてのレファレンスを引いた曲線からバッファ注入によって作成した曲線を減じることによって、レファレンスデータのダブルレファレンスサブトラクションを実施した。データの動態解析は、グローバルフィットを用いる１：１  Ｌａｎｇｍｕｉｒ結合モデルを用いて実施した。各ｍＡｂの結果を、Ｋa（オン合速度）、Ｋd（オフ速度）、ＫD（平衡解離定数）、及び活性率の形式で報告した。Ｃ２１７７  ＨＦＲ変異体の親和性は、親Ｍ４０  ｍＡｂに類似しており、全ての変異体についてＫDが３倍未満の変化を示した。同様に、ＨＦＲ  Ｃ２１９１ヒトｍＡｂ変異体の親和性は、親Ｍ４１  ｍＡｂと２倍未満の差を示した。
【０１３３】
ルシフェラーゼレポーターアッセイにおけるＮＦｋＢのＣ７０媒介性誘導の阻害によって、ＨＦＲ変異体の生物活性を測定した。ＨＥＫ細胞をＮＦｋＢ誘導性ルシフェラーゼ発現ベクターｐＧＬ４−３２−ＮＦｋＢ−Ｌｕｃ２（Ｐｒｏｍｅｇａ）でトランスフェクトし、ＣＤ２７発現プラスミド又は空ベクターをＦｒｅｅｓｔｙｌｅ発現培地（Ｇｉｂｃｏ，＃１２３３８）中で一晩インキュベートした。次の日、細胞を、４０μＬ及び５０，０００細胞／ウェルで９６ウェル培養プレートにプレーティングした。次いで、４０μＬの抗体又はコントロールを、３０μｇ／ｍＬで始めてインウェル（in-well）濃度で終わる１：３の連続希釈物を用いて細胞に添加し、１〜２時間インキュベートした。このインキュベート中、刺激用にＣＤ７０エピソーム細胞を調製する。簡潔に述べると、標準的な細胞培養技術を用いて接着細胞を再懸濁させ、２５μｇ／ｍＬのマイトマイシンＣとともに１時間インキュベートして、細胞増殖を停止させた。インキュベート後、ＣＤ７０＋細胞を培地で洗浄し、希釈し、１０，０００細胞／ウェルで４０μＬを添加した。プレートを一晩インキュベートした。次の日、製造業者の指示書に従ってＳｔｅａｄｙ  Ｇｌｏ試薬（Ｐｒｏｍｅｇａ）を調製し、１ウェル当たり１２０μＬを添加した。振盪しながら２０分間室温でプレートをインキュベートした。Ｐｅｒｋｉｎ  Ｅｌｍｅｒ  Ｅｎｖｉｓｉｏｎ  Ｒｅａｄｅｒで発光を測定した。Ｃ２１７７  ＨＦＲ変異体のＩＣ50は、互いに及びＭ４０親ＭＡｂと類似しており、０．１１ｎＭ〜０．２１ｎＭの範囲であった。Ｃ２１９１  ＨＦＲ変異体のＩＣ50も互いに及びＭ４１親と類似しており、０．１３ｎＭ〜１．３９ｎＭの範囲であった。
【０１３４】
親和性、生物活性、及び生物物理学的特性の考察により、親和性成熟について、可変領域Ｈ２８（配列番号１１１）及びＬ３５（配列番号８２）を含んでいたＣ２１７７変異体Ｍ６９と、可変領域Ｈ３１（配列番号１３１）及びＬ４２（配列番号１４０）を含んでいたＣ２１９１変異体Ｍ９１とが選択された。Ｍ４０親及びそのＭ６９  ＨＦＲ変異体、並びにＭ４１親及びそのＭ９１変異体について、ＫD、精製収量、細胞培養上清についてＣＤ２７  ＥＣＤへの結合（「ＥＬＩＳＡ」）、ＣＤ７０によるＣＤ２７媒介性ＮＦκβ応答の阻害（ＩＣ50）の要約を表４に示す。
【０１３５】
【表４】
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【０１３６】
実施例８：Ｃ２１７７  ＨＦＲ  ＭＡＢ  Ｍ６９の最適化
Ｍ６９は、ヒトＣＤ２７  ＥＣＤに対して約１ｎＭの親和性を有し、Ｃ２１７７及びＨＦ親Ｃ２７Ｍ４０と同じＣＤＲを含有する。Ｍ６９の最適化は、親和性を上昇させ、プロセスにおいて導入又は同定されるＰＴＭ部位を除去するための複数のライブラリを含んでいた。
【０１３７】
実施例９に記載の通り、ＨＦＲ及びＣ２１７７の最適化のためのパラレルファージディスプレイライブラリアプローチにより、ＣＤＲ−Ｈ２の位置５２ａのプロリンにおける多様性が同定された。この位置は、ライブラリの設計においてランダム化されていなかった。Ｃ２１７７及びＣ２１９１  ＦａｂとＣＤ２７との共構造（実施例５）は、Ｐ５２ａが抗原結合に直接関与していないことを示す。それにもかかわらず、この位置における突然変異は、ＣＤＲ−Ｈ２ループの立体構造を変化させることができ、周囲の残基Ｄ２７によってＣＤ２７とのより最適な相互作用を可能にする。したがって、ＮＮＫ突然変異誘発を用いてＰ５２ａ並びにその隣接する残基Ｙ５２、Ｇ５３、及びＤ５４をランダムに多様化させるようにライブラリを設計した（ライブラリＣ２７Ｈ２８Ｌ２）。また、経路２の最適化では、ＣＤＲ−Ｌ１におけるＹ３２のＦへの突然変異が、結合の改善を示した。したがって、第２のライブラリは、Ｙ３２と同じ構造面に存在する残基Ｙ３０ａ、Ｄ３０ｄ、Ａ５０における多様性とともに、Ｙ３２におけるランダム多様性を有するように設計した（ライブラリＣ２７Ｌ３５Ｌ２）。
【０１３８】
更に、完全なＣＤＲ−Ｈ３及びＣＤＲ−Ｌ１ループを、多様性の制限されているライブラリを用いて評価した。表５及び６は、これらライブラリの設計を示す。
【０１３９】
【表５】
0006487839.tif 000006
【０１４０】
【表６】
0006487839.tif 000007
【０１４１】
制限酵素部位に軽微な修正を加えた以外、国際公開第２００９／０８５４６２号、Ｓｈｉ  ｅｔ  ａｌ，Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３９７：３８５〜３９６（２０１０）、及びＴｏｒｎｅｔｔａ  ｅｔ  ａｌ．Ｊ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  Ｍｅｔｈｏｄｓ  ３６０：３９〜４６（２０１０）に記載の通り、ＦａｂライブラリをｐＩＸファージＦａｂディスプレイシステムにおいて構築した。これらライブラリを、より遅いオフ速度又はより早いオン速度について選択することによって親和性を上昇させることを目的とする、国際公開第２００９／０８５４６２号及びＳｈｉ  ｅｔ  ａｌ，Ｊ  Ｍｏｌ  Ｂｉｏｌ  ３９７：３８５〜３９６（２０１０）に記載の通り、当該技術分野において公知のパニングスキームに従ってビオチン化ＣＤ２７−ＥＣＤに対してパニングした。ヘルパーファージ感染によってファージを作製した。ビーズ／抗原／ファージ複合体を形成するためにビーズを添加することによって、結合剤を回収した。最終洗浄の後、指数関数的に成長しているＴＧ−１大腸菌細胞の感染により、ファージをレスキューした。ファージを再度作製し、更なる一連のパニングに供した。
【０１４２】
フォローアップスクリーニングのために、ファージパニングラウンドのグリセロールストックからＤＮＡを調製し、ｐＩＸ遺伝子をＮｈｅｌ／Ｓｐｅｌ切断によって切断した。ライゲーション後、ＤＮＡをＴＧ−１細胞に形質転換し、ＬＢ／寒天培地上で一晩成長させた。次の日、コロニーを採取し、一晩成長させ、この培養物を、（ｉ）Ｖ領域のコロニーＰＣＲ及び配列決定、及び（ｉｉ）Ｆａｂ産生の誘導に用いた。Ｆａｂを産生するため、一晩培養物を新しい培地で１０〜１００倍に希釈し、３７℃で５〜６時間成長させた。ＩＰＴＧを含有する新鮮培地を添加することによってＦａｂ産生を誘導し、培養物を３０℃にて一晩成長させた。次の日、培養物を回転沈降させ、可溶性Ｆａｂタンパク質を含有する上清を、ＦａｂのＥＬＩＳで用いた。ＥＬＩＳＡのために、可溶性Ｆａｂタンパク質を、ポリクローナル抗Ｆｄ（ＣＨ１）抗体によってプレートに捕捉した。洗浄及びブロッキング後、ビオチン化ヒトＣＤ２７  ＥＣＤを０．２ｎＭの濃度で添加した。この濃度は、全プレートに対照として存在した親Ｆａｂを１００％結合と定義した場合の親の結合率として定義された、Ｆａｂ変異体のランク付けを可能にする。ビオチン化ＣＤ２７  ＥＣＤは、ＨＲＰコンジュゲート化ストレプトアビジン及びプレートリーダーにおける化学発光読み取りによって検出した。この濃度のＣＤ２７では、親Ｆａｂに対して正規化されたＦａｂ変異体のランク付けが可能である。この基準によって、Ｍ６９  Ｆａｂに比べて１００％以上でヒトＣＤ２７に結合する１０本の重鎖及び６本の軽鎖が選択された。
【０１４３】
ＣＤＲ−Ｈ２ライブラリー（Ｃ２７Ｈ２８Ｌ２）から、位置５２における親のＹが主に選択され、これは、この残基の優先性を示す。位置５２ａでは、最良の結合活性を有するＦａｂの中でも、ＰはＡ、Ｓ、Ｖ、及びＧ残基で置換された。位置５３では、親のＧがＲ及びＮとともに選択された。位置５４では、親のＤのみが回収されたこのライブラリから９つのクローン（表７）を、発現及びｍＡｂとしての特性評価のためにＩｇＧベクターにサブクローニングした。
【０１４４】
【表７】
0006487839.tif 000008
【０１４５】
ＣＤＲ−Ｈ３ライブラリー（Ｃ２７Ｈ２８Ｌ３）の場合、回収された唯一の多様性は、Ｓ９５Ａ及びＡ１０１Ｇであった。両方の突然変異を含有するこのライブラリ由来の１つのクローン（表８）を、発現及びｍＡｂとしての特性評価のためにＩｇＧベクターにサブクローニングした。
【０１４６】
【表８】
0006487839.tif 000009
【０１４７】
４つの位置のＬ−ＣＤＲ１ライブラリー（Ｃ２７Ｌ３５Ｌ２）について、位置３０ａは、親のＹ及びＷの富化を示した。位置３０ｄでは、残基Ｓ、Ｈ、及びＥは、親のＤとともに富化されていた。位置３２では、親のＹは、Ｆ及びＷで置換されていた。位置５０では、Ｔは、親のＡよりも好ましかった。一般的に、最良のクローンは、親に比べてより疎水性の側鎖を有していた。このライブラリ由来の５つのクローン（表９）を、発現及びｍＡｂとしての特性評価のためにＩｇＧベクターにサブクローニングした。
【０１４８】
多様性の制限されている完全ＣＤＲ−Ｌ１ライブラリ（Ｃ２７Ｌ３５Ｌ３）について、Ｙ３２である親がＦに変化していることだけを除いて上記４つの位置ＶＬライブラリに類似している配列が１つだけ回収された。この完全ＣＤＲ−Ｌ１ライブラリは、位置３２にＦを含んでいなかったので、回収されたクローンは、恐らく４つの位置のＶＬライブラリからのコンタミであった。このクローン（Ｌ２５５）を発現及びｍＡｂとしての特性評価のためにＩｇＧベクターにサブクローニングした（表９）。
【０１４９】
【表９】
0006487839.tif 000010
【０１５０】
６個の変異体軽鎖は、１０個の変異体重鎖と対合して、ＨＥＫ２９３Ｅ細胞で発現していた６０の組み合わせが得られた。上清を、発現レベル、ＥＬＩＳＡによって測定したときのヒトＣＤ２７  ＥＣＤへの結合、及びＰｒｏｔｅＯｎ機器で測定したときの親和性についてスクリーニングした。全ての変異体の発現レベルは、スクリーニング目的に十分であった。親和性は、一部の変異体について４０倍以下増加した。２つのｍＡｂ  Ｍ５９６及びＭ６００を、更なる突然変異誘発について選択して、翻訳後修飾の潜在部位を除去した。これらｍＡｂについてＶＨ及びＶＬ鎖の組み合わせを表１０に示す。抗体は、これら軽鎖における２つの残基のみが異なる。
【０１５１】
【表１０】
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【０１５２】
Ｍ５９６は、３つの位置で親分子Ｍ６９と異なる：ＣＤＲ−Ｈ２におけるＰ５２ａＡ、ＣＤＲ−Ｌ１におけるＹ３２Ｗ、及びＣＤＲ−Ｌ２におけるＡ５０Ｔ。Ｍ６００は、２つの位置でＭ６９と異なる：ＣＤＲ−Ｈ２におけるＰ５２ａＡ及びＣＤＲ−Ｌ１におけるＹ３２Ｆ。
【０１５３】
３つの共有されている潜在的翻訳後修飾部位をＭ５９６及びＭ６００で同定した。ＣＤＲ−Ｈ２の位置Ｎ５８に潜在的Ｎ−結合グリコシル化部位が存在し、それぞれ「ＤＧ」及び「ＤＳ」によってコードされているＣＤＲ−Ｈ２及びＣＤＲ−Ｌ１に２つの潜在的異性化部位が存在する。更に、Ｍ５９６は、酸化を受けやすい場合があるＣＤＲ−Ｌ１における非生殖系列トリプトファン残基を含有する。
【０１５４】
グリコシル化リスクを取り除くために、３つの個々の単一置換をＮ５９及びＳ６０で作製した（表１１）。コンストラクトをＨＥＫ２９３Ｅ細胞で発現させ、ＰｒｏｔｅＯｎ機器を用いてＣＤ２７に対する親和性について上清を評価した。変異体の全てが、親に近い親和性を有しており、それぞれ、Ｍ５９６及びＭ６００について２５ｐＭ及び４９ｐＭであった。両方ともＭ６００に由来する変異体Ｍ６８０及びＭ６７８を、異性化部位を除去するための更なる置換の評価のために選択した。変異体Ｍ６８０及びＭ６７８は、それぞれ位置６０及び５８にＡを有し、Ｍ５９６親に存在していたＣＤＲ−Ｌ１におけるトリプトファンを有していないという更なる利点を有している。
【０１５５】
【表１１】
0006487839.tif 000012
【０１５６】
Ｍ６７８及びＭ６８０における潜在的異性化部位を突然変異させることの影響を評価するために、小さなライブラリを設計して平行して両部位を除去した。各突然変異を、重鎖のＣＤＲ−Ｈ２又は共通の軽鎖のＣＤＲ−Ｌ１に個々に置換し、次いで、コンビナトリアルライブラリーで対合させた。このライブラリの多様性を表１２に示す。
【０１５７】
【表１２】
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【０１５８】
これらｍＡｂを発現させ、グリコシル化部位変異体について親和性を評価した。ＣＤＲ−Ｌ１の潜在的異性化部位におけるＤ３４Ｅ突然変異は、親和性を一貫して２倍上昇させたので、この部位の除去は成功していた。ＣＤＲ−Ｈ２の潜在的異性化部位におけるＤ５４Ｅ突然変異は、親和性を１０倍超低下させた。しかし、Ｇ５５Ａ突然変異は、親和性にほとんど影響を与えなかった。変異体Ｍ７０３及びＭ７０６は、Ｍ６００親の親和性を保持し、ＰＴＭ由来の機能に対する影響のリスクが低下していた。表１３は、ＰＴＭリスク評価の各段階からの選択された変異体、その重鎖及び軽鎖の対合、親和性、並びにＣＤＲにおける配列改変を示す。潜在的グリコシル化部位を除去するために選択した突然変異に下線を引く。２つの潜在的異性化部位を除去するための突然変異を太字にし、二重下線を引く。
【０１５９】
【表１３】
0006487839.tif 000014
【０１６０】
実施例９：組み合わせられたＨＦＲ及びＣ２１７７  ｍＡｂの最適化
このアプローチでは、制限されたセットのＨＦＲ変異体を、発現のためのＦａｂフォーマット、ｐＩＸディスプレイ、及び結合において評価し、次いで、最良の候補を最適化に進めた。Ｃ２１７７由来のＣＤＲを、２つの重鎖ＶＨ５−５１（配列番号１０２  Ｈ２４）及びＶＨ１−４６（配列番号１０６Ｈ２５）並びに２つの軽鎖Ｖｋ４−１及びＶｋ０１２（配列番号９０Ｌ３６）にヒトフレームワーク適応させた。これらＨＦＡ可変ドメインを、Ｆａｂ  ｐＩＸファージディスプレイベクターにおけるヒトＣＨ１及びＣｋ定常領域とＦａｂとの２×２マトリクスにおいて対合させた。ＶＨ１−４６／Ｖｋ０１２変異体（Ｍ５５、Ｈ２５／Ｌ３６）は、ＣＤ２７への結合及び良好なディスプレイ特性を示し、親和性成熟ライブラリの構築のために選択された。
【０１６１】
ｐＩＸファージディスプレイのためのＦａｂライブラリを、実施例８に記載の通り構築した。ＣＤ２７とＣ２１９１及びＣ２１７７との実験的共構造（実施例５）に基づいて、抗体パラトープ内及び周囲のＣＤＲ残基において多様性ライブラリを設計した。ＣＤＲ  Ｌ１、Ｌ３、及びＨ２に変異の重点を置いた。個々のＣＤＲ内の合計４〜６個の残基を、全２０アミノ酸をコードしているＮＮＫコドンを用いて多様化した。各ライブラリのサイズは、≦６×１０7変異体と推定され、これは、標準的なライブラリ制限エンドヌクレアーゼクローニング技術を用いて網羅することができる。表１４は、様々なＣＤＲライブラリにおいて完全多様化に供した残基を示す。
【０１６２】
【表１４】
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【０１６３】
ファージコートタンパク質ＩＸにディスプレイされるＦａｂライブラリを、ビオチン化ｈＣＤ２７ＥＣＤ／Ｆｃに対してパニングした。変異体のプラスミドライブラリーのヘルパーファージ感染によってファージを作製した。ビーズ／抗原／ファージ複合体を形成するためにストレプトアビジンでコーティングされた磁気ビーズを添加することによって、結合剤を回収した。最後の洗浄後、指数関数的に成長しているＭＣ１０６１Ｆ’大腸菌細胞の感染によってファージをレスキューした。ファージを再度作製し、更なる一連のパニングに供した。選択されたクローンから可溶性Ｆａｂを作製し、経路１について記載した通り結合活性を評価した。ＣＤＲ−Ｌ１及びＣＤＲ−Ｌ２ライブラリからのみヒットが得られた。これら２つのライブラリ由来の２１クローンは、親ＨＦＲ  Ｆａｂを超える結合を示した。多様化配列においてＣ又はＭを含有するクローンを廃棄した。更なる特性評価のために、ＩｇＧ４ＳＰＡＡａ／カッパバックグラウンドにおいて発現させるために１０個のＦａｂを変換した。ＩｇＧ４ＰＡＡ重鎖は、ヒンジ領域におけるセリンからプロリンへの置換（Ａｎｇａｌ  ｅｔ  ａｌ．，Ｍｏｌ  Ｉｍｍｕｎｏｌ  ３０：１０５（１９９３）及びＣＨ２の２つの位置におけるアラニン置換（ＭＬ  Ａｌｅｇｒｅ  ｅｔ  ａｌ，Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ；５７：１５３７〜４３（１９９４））を含有するヒトＩｇＧ４である。ｍＡｂを、Ｆａｂのレプリカとして、及び重鎖と軽鎖との組み合わせのマトリクスとしてＨＥＫ２９３Ｅ細胞で産生させた。培養物上清を用いてＰｒｏｔｅＯｎ機器で親和性を測定した（表１５）。ＣＤＲ−Ｈ２におけるＰ５２ａからＱ（Ｍ１５８）又はＳ（Ｍ１５７）への突然変異は、親ｍＡｂ（Ｍ１５９）に比べてＫDを６倍低下させた。ＣＤＲ−Ｌ１（Ｍ１４９）におけるＹ３６Ｆ突然変異は、ＫDを４倍低下させ、Ｇ３３Ｈの付加及びＤ３４Ｅ突然変異（Ｍ１５５）は、ＫDを６倍低下させた。Ｐ５２Ｓ突然変異とＹ３６Ｆ（Ｍ１６０）又はＹ３６Ｆ＋Ｇ３３Ｈ及びＤ３４Ｅとの組み合わせは、ＫDを２０倍（１００ｐＭに）低下させた。更なる特性評価のために、Ｍ１５８、Ｍ１６０、及びＭ１６６における置換の組み合わせを選択した。
【０１６４】
【表１５】
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【０１６５】
Ｍ１５８、Ｍ１６０、及びＭ１６６タンパク質を７５０ｍＬのＨＥＫ２９３細胞培養物中で産生し、精製し、ＢｉａｃｏｒｅにおいてＣＤ２７ーＨｉｓに対する結合反応速度について分析した。ＫD値は、粗上清を用いてＰｒｏｔｅＯｎによって測定したものよりも約１ｌｏｇ高かったが、互いに同じ値を示した（表１６）。
【０１６６】
【表１６】
0006487839.tif 000017
【０１６７】
オリジナルのＨＦＡの組み合わせを再評価したとき、ＶＨ５−５１適応ＶＨは、ＶＨ１−４６スカフォールドよりも２倍低いＫDを示した。Ｈ−ＣＤＲ２におけるＰ５２ａＳ突然変異をＶＨ５−５１  ＶＨに導入し、Ｈ２２１を作製した。Ｈ２２１は、ＨＦＡ親ｍＡｂ（Ｍ１５９）由来のＬ２２０、Ｌ２１９、及びＬ２１７、並びにそれぞれ、親和性の改善された変異体Ｍ１６０及びＭ１６６で発現して、ｍＡｂ  Ｍ１７１、Ｍ１６９、及びＭ１７０を作製した。精製ｍＡｂにおけるＢＩＡｃｏｒｅ反応速度測定は、対応するＶＨ１−４６変異体に比べてＫDの２倍の改善を示した（表１６及び１７を比較）。
【０１６８】
【表１７】
0006487839.tif 000018
【０１６９】
Ｍ１６０、Ｍ１６９、及びＭ１７０の配列解析により、Ｈ１９６及びＨ２２１のＣＤＲ−Ｈ２におけるＤ５４〜Ｇ５５における潜在的異性化部位、並びにＮ６１〜Ｇ６２における潜在的脱アミド部位を同定した。更に、潜在的異性化部位をＬ２１９のＣＤＲ−Ｌ１内のＤ３４において同定した。突然変異を導入してこれら部位を除去し、活性に対する影響を評価した（表１８）。精製ｍＡｂを、ＰｒｏｔｅＯｎにおいてＣＤ２７−Ｈｉｓに対する親和性について分析した。突然変異は、ＫDに対して効果を有しなかった又は正の効果を有していた。例えば、Ｍ６６８及びＭ６７１は、両方とも、それぞれ、その親ｍＡｂであるＭ１６０及びＣＭ１６９よりもほぼ２倍低いＫDを有していた。
【０１７０】
【表１８】
0006487839.tif 000019
【０１７１】
実施例１０：Ｃ２１９１  ＨＦＲ  ｍＡｂ  Ｍ９１の最適化
Ｍ９１（Ｈ３１／Ｌ４２）の最適化のために適用した方法は、以下を除いて実施例８に記載の通りであった。ヒトＣｈ１及びＣｋ定常領域を有するＦａｂフォーマットにおけるＣ２１９１親ＶＨ及びＶＬ領域を用いて、Ｃ２１９１のＣＤＲのアラニン／生殖系列スキャンをＦａｂフォーマットで実施して、ＣＤ２７との相互作用に重要な位置を評価した。ライブラリは、ＣＤＲにおける残基をアラニン又は対応する生殖系列配列に存在する残基で置換していた。モデリング、及び後に決定された構造に基づいて、溶媒曝露が低いか又はなかったので、ＣＤＲにおける幾つかの位置を除外した（実施例５）。推定体細胞突然変異をマウス生殖系列アミノ酸に復帰突然変異させて、抗体親和性に対するその寄与を評価した。簡潔に述べると、マウスＶ領域をＦａｂ  ｐＩＸディスプレイベクターにクローニングし、親のビオチン化ヒトＣＤ２７−ＥＣＤタンパク質に対する結合をＥＬＩＳＡによって検証した。単一突然変異（ライブラリーの設計に従って）を部位特異的突然変異誘発によって導入した（本質的にＳｔｒａｔａｇｅｎｅ（Ｌａ  Ｊｏｌｌａ，ＣＡ，ＵＳＡ）によって記載の通り実施した）。配列を確認した突然変異体を入念に選んで新たなプレートに移し、親Ｆａｂ及びネガティブコントロールＦａｂとともに成長させた。最後の単一アミノ酸置換変異体を大腸菌で作製し、次いで、発現及びＥＬＩＳＡによるＣＤ２７結合についてスクリーニングした。親クローンについて発現及び結合シグナルを平均し、１．０に設定し、突然変異体のシグナルを親に対して正規化した。２つの形態の抗原をＥＬＩＳＡで用いた：ＣＤ２７  ＥＣＤ（１〜１７３残基）及びＣＤ２７  ＥＣＤ−Ｆｃキメラ（Ｒ＆Ｄ  Ｓｙｓｔｅｍｓ）。
【０１７２】
共結晶構造に加えてこのスキャンの結果から、親和性成熟ライブラリの設計の基礎が得られた。重鎖の場合、変異体について選択された位置は、Ｈ−ＣＤＲ１におけるＴ３３並びにＣＤＲ−Ｈ２におけるＹ５０、Ｓ５２、Ｓ５２ａ、Ｎ５６及びＹ５８であった（表２３）。Ｔ３３は、接触残基ではないが、Ｔ３３Ａ突然変異は、結合を改善した。位置Ｓ５２及びＳ５２ａは、接触残基でないが、スキャンにおける置換は、若干の結合増加を示した。位置５０及び５８におけるチロシンは、両方とも接触残基であり、これら部位における置換は、実施例１１に記載の平行最適化経路において選択された。位置Ｎ５６は、アラニン／生殖系列スキャンでは評価されなかったが、接触部位であり、結晶構造においてＴ３３、Ｓ５２、及びＳ５２ａに隣接している。軽鎖の場合、変異体について選択された位置は、ＣＤＲ−Ｌ１におけるＴ３０ａ、Ｓ３０ｂ、Ｇ３０ｃ、及びＹ３０ｄ、並びにＣＤＲ−Ｌ２におけるＬ５０及びＮ５３であった（表２３）。これら残基はいずれも直接抗原に接触しないが、接触している残基に隣接しており、スキャンが結合に対して実質的に負の影響を有していた。Ｌ５０Ａ突然変異は、結合に対して中程度の効果を有しており、結晶構造では、恐らく抗原と接触しているＣＤＲ−Ｌ２における唯一の残基である。更に、Ｎ５３は、制限された多様化について選択された。２つの平行ライブラリを構築し、１つのライブラリでは、Ｙ３０ｄがＷに突然変異し、別のライブラリでは、Ｙ３０ｄがＹとして保持されていた。その理由は、Ｗは、パラトープをより疎水性にすることができるので、発現可能性が低いためである。以下の表１９及び２０は、Ｍ９１についてのＶＨ及びＶＬ親和性成熟ライブラリ設計を示す。
【０１７３】
【表１９】
0006487839.tif 000020
【０１７４】
【表２０】
0006487839.tif 000021
*  この位置にＹ又はＷを含有する２つの別個のライブラリを作製した。
【０１７５】
ファージコートタンパク質ＩＸにディスプレイされたＦａｂライブラリをビオチン化ＣＤ２７−ＥＣＤに対してパニングした。Ｃ２１９１の親キメラＦａｂと同じか又はより多くＣＤ２７に対して結合する合計１２個の重鎖変異体及び１２個の軽鎖変異体を選択した。１４４の組み合わせとしてＨＥＫ２９３Ｅ細胞で産生した変異体をＩｇＧ１／カッパ抗体に変換し、培養物上清をＰｒｏｔｅＯｎによって結合について評価した。幾つかの変異体について親和性の著しい上昇（＞１００倍）が観察された。１４４のＶＨとＶＬとの対合のうち、８つを更なる特性評価のために選択した（表２１）。これらｍＡｂを３つのサブクラスに分類した：第１群の変異体は、４つの異なる軽鎖と対合する同じ重鎖（Ｈ２２７、配列番号１３３）を有するが、第２群及び第３群は、それぞれ、２つの異なる重鎖と対合する１つの軽鎖を有する。４つの選択された軽鎖は、ＣＤＲ−Ｌ１において多様化している４つの位置全てで変動していた（ＲＡＳＫＳＶＳＸ1Ｘ2Ｘ3Ｘ4ＳＦＭＨ）（配列番号１５８）（式中、Ｘ1は、Ａ、Ｅ、Ｈ、又はＬであり；Ｘ2は、Ｄ、Ｇ、Ｖ、又はＷであり；Ｘ3は、Ｇ又はＲであり；Ｘ4は、Ｗ又はＹである）。また、これらは、ＣＤＲ−Ｌ２において多様化している両位置で変動していた（Ｘ1ＡＳＸ2ＬＥＳ）（配列番号：１７１）（式中、Ｘ1は、Ｌ又はＶであり、Ｘ2は、Ｋ、Ｎ、又はＲである）。ＣＤＲ−Ｌ３は、Ｌ４２配列（配列番号１４０）から変化しておらず、ＱＨＳＲＥＬＰＷＴである。
【０１７６】
【表２１】
0006487839.tif 000022
【０１７７】
７５０ｍＬの体積のＨＥＫ２９３Ｅ細胞において一時的に発現させることによって、これら８つの変異体を作製した。回収した上清をプロテインＡクロマトグラフィーを介して精製し、各変異体をＳＤＳ−ＰＡＧＥ及びＳＥ−ＨＰＬＣによって分析して、サンプルの純度及び精製サンプルにおけるモノマーの割合を求めた。変異体は全て９０％超の純度を有し、９０％超がモノマーであった。抗体の会合特性を評価するために、各精製変異体について相互作用クロマトグラフィーを実施することによって保持係数（ｋ’）を決定した（Ｊａｃｏｂｓ  ＳＡ、Ｗｕ  ＳＪ，Ｆｅｎｇ  Ｙ，Ｂｅｔｈｅａ  Ｄ  ＆  Ｏ’Ｎｅｉｌ  ＫＴ（２０１０）  Ｃｒｏｓｓ−ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ  ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ：ａ  ｒａｐｉｄ  ｍｅｔｈｏｄ  ｔｏ  ｉｄｅｎｔｉｆｙ  ｈｉｇｈｌｙ  ｓｏｌｕｂｌｅ  ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ  ａｎｔｉｂｏｄｙ  ｃａｎｄｉｄａｔｅｓ．Ｐｈａｒｍ  Ｒｅｓ  ２７，６５〜７１）。この方法では、サンプル抗体をヒトＩｇＧとカップリングしているカラムに通し、コントロール抗体に対する保持について評価した。簡潔に述べると、５０ｍｇのヒトＩｇＧ（Ｓｉｇｍａ  Ａｌｄｒｉｃｈ）を、製造業者の指示書に従って１ｍＬのＮＨＳ−セファロースカラム（ＧＥ  Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）にカップリングさせた。０．１Ｍ  Ｔｒｉｓ（ｐＨ  ８）、０．５Ｍ  ＮａＣｌで洗浄することによってカップリングしていないＩｇＧを除去し、未反応のＮＨＳ基を同じバッファでブロッキングした。Ｐｉｅｒｃｅ’ｓ  Ｃｏｏｍａｓｓｉｅ  Ｐｌｕｓアッセイキット（Ｔｈｅｒｍｏ  Ｐｉｅｒｃｅ）を使用して、非反応カップリングバッファ及び洗浄液中に残留しているタンパク質濃度を測定し、固定化前のタンパク質の量から減じることによって、カップリング効率を求めた。また、樹脂にＩｇＧをコンジュゲートさせなかったこと以外同じプロトコールを用いて、コントロールカラムを調製した。コントロールカラムは、まず、０．１ｍＬ／分の流速でＰＢＳ（ｐＨ  ７）で平衡化した後、Ｄｉｏｎｅｘ  ＵｌｔｉＭａｔｅ  ３０００  ＨＰＬＣに通した。まず２０μＬのタンパク質原液を注入して、非特異的結合部位を確実にブロックし、次いで、２０μＬの１０％アセトンを注入して、カラムの完全性を確認した。分析するサンプルを、ＰＢＳ（ｐＨ  ７）で０．１ｍｇ／ｍＬに希釈した。２０μＬの各サンプルを各カラムに注入し、０．１ｍＬ／分で３０分間通した。保持時間を記録し、各変異体の保持係数（ｋ’）を計算した。ＩｇＧ及びブランクカラムにおける保持時間の差としてｋ’値を計算した。全ての変異体を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ及びＳＥ−ＨＰＬＣに基づいて純度９０％超に精製した。全てのｋ’値は、０．３未満であると計算され、これは、良好な溶液特性を示す（表２２）。
【０１７８】
【表２２】
0006487839.tif 000023
【０１７９】
８つの変異体ｍＡｂ及びＨＦＲ親を、ＢＩＡｃｏｒｅによるＣＤ２７  ＥＣＤに対する親和性及びκβレポーターアッセイにおけるＩＣ50について評価した。速度定数及び親和性をＢＩＡｃｏｒｅにより測定した。表２３は、これら変異体において収集したデータを要約する。初期小培養上清から測定したときの発現及びＣＤ２７に対する結合についてのＥＬＩＳＡシグナルもこの表に含まれる。
【０１８０】
【表２３】
0006487839.tif 000024
【０１８１】
実施例１１：組み合わせたＨＦＲ及びＣ２１９１  ｍＡｂの最適化
このアプローチでは、制限されたセットのＨＦＲ変異体を、発現のためのＦａｂフォーマット、ｐＩＸディスプレイ、及び結合において評価し、次いで、最良の候補を最適化に進めた。Ｃ２１９１由来のＣＤＲは、２つの重鎖（ＶＨ３−２３及びＶＨ３−１１）及び２つの軽鎖（Ｖｋ４−１及びＶｋ０１２）にヒトフレームワーク適応した。これらＨＦＡ可変ドメインを、Ｆａｂ  ｐＩＸファージディスプレイベクターにおけるヒトＣＨ１及びＣｋ定常領域とＦａｂとの２×２マトリクスにおいて対合させた。ＶＨ３−２３／Ｖｋ０１２変異体（Ｈ３９（配列番号１４５））及びＬ４０（配列番号１３７）は、ＣＤ２７への結合及び良好なディスプレイ特性を示し、親和性成熟ライブラリの構築のために選択された。このＦａｂを「親」と呼ぶ。
【０１８２】
改善された親和性について抗体を選択するために、Ｈ３９のＣＤＲ−Ｈ３を除く全てのＣＤＲにおける複数の残基を、ＮＮＫ縮重コドンを用いて完全に多様化した（表２４）。各ＣＤＲライブラリを別々に構築し、親和性成熟変異体を選択するためにファージパニングに供した。
【０１８３】
【表２４】
0006487839.tif 000025
【０１８４】
ＣＤＲ−Ｈ２、ＣＤＲ−Ｌ１、又はＣＤＲ−Ｌ２に多様性を有するＣ２１９１ライブラリから、単一点ＥＬＩＳＡにおいて測定したとき、親ＨＦＲ  Ｆａｂに比べてヒトＣＤ２７への結合が改善されている５０個の独自のＦａｂが得られた。これらクローンを多点ＥＬＩＳＡにおいて更にランク付けし、更に特性評価するために１７個のクローンをヒトＩｇＧ４ａｌａａｌａ／カッパへの変換について選択した（表２５）。
【０１８５】
【表２５】
0006487839.tif 000026
【０１８６】
ＩｇＧ１／ｋ  ｍＡｂをＦａｂのレプリカとして、並びに重鎖及び軽鎖可変領域のマトリクスとして構築し（表２６）、親和性及び溶液特性について試験した。親ＦａｂのｍＡｂ形態は、Ｍ１３１と表される。Ｍ１４１及びＭ４０８を更なる特性評価のために選択した。
【０１８７】
【表２６】
0006487839.tif 000027
【０１８８】
実施例１２：親和性成熟ｍＡｂの特性評価
親Ｃ２１７７及びＣ２１９１ハイブリドーマ抗体に由来する選択された親和性成熟ｍＡｂのコドンを最適化し、重鎖及び軽鎖の二重発現のために異なるベクターに導入し、ＣＨＯ−ＧＳ細胞培養物で発現させ、更なる特性評価のために精製した。上記実施例に記載の成熟変異体に関連するこれら抗体のＩＤを表２７に示す。
【０１８９】
【表２７】
0006487839.tif 000028
【０１９０】
ＢｉａｃｏｒｅによるＫD分析及びＮＦ−κβレポーター遺伝子アッセイで測定したＩＣ50について、これらｍＡｂの要約データを以下に示す（表２８及び２９）。このＮＦ−κβレポーターアッセイについて、ＨＥＫ−２９３Ｆ細胞を、ＮＦ−κβプロモータの制御下でヒトＣＤ２７及びルシフェラーゼコンストラクトを含有する合計３６ｎｇのＤＮＡでトランスフェクトした。ＨＥＫ−２９３Ｆトランスフェクタントを、９６ウェルプレートの４０μＬのＦｒｅｅｓｔｙｌｅ培地（Ｇｉｂｃｏ）に５×１０4細胞／ウェルでプレーティングした。抗ＣＤ２７ハイブリドーマｍＡｂの希釈物を、アッセイプレートの、１：３希釈した５０μｇ／ｍＬの最終濃度のＦｒｅｅｓｔｙｌｅ培地に添加し、プレートを３７℃（５％  ＣＯ2）で１時間インキュベートした。ｍＡｂがＣＤ７０：ＣＤ２７シグナル伝達を中和する能力を試験するために、一定期間放射線照射した（４０００ｒａｄ）ＨＥＫ−２９３Ｅ  ＣＤ７０エピソーム細胞を、ＣＤ２７トランスフェクタント細胞の数の２０％でアッセイプレートに添加した。ハイブリドーマｍＡｂのアゴニスト活性を試験するために、ＣＤ７０エピソーム細胞の添加を省略した。アッセイプレートを３７℃（５％  ＣＯ2）で一晩インキュベートし、製造業者の指示書に従ってＳｔｅａｄｙ−Ｇｌｏ（登録商標）ルシフェラーゼアッセイシステム（Ｐｒｏｍｅｇａ）を用いて発色させた。
【０１９１】
【表２８】
0006487839.tif 000029
【０１９２】
【表２９】
0006487839.tif 000030
【０１９３】
ＣＤＲ及びＶ領域の配列
【０１９４】
【表３０】
0006487839.tif 000031
【０１９５】
配列番号１５１について、Ｘ1は、Ｆ又はＹであり；Ｘ2は、Ａ、Ｇ、Ｓ、又はＶであり；Ｘ3は、Ｇ、Ｎ、又はＲであり；Ｘ4は、Ａ又はＧであり；Ｘ5は、Ａ又はＮであり；Ｘ6は、Ａ又はＳである。
【０１９６】
【表３１】
0006487839.tif 000032
【０１９７】
配列番号１５２について、Ｘ1は、Ｐ、Ｑ、又はＳであり；Ｘ2は、Ａ又はＧであり；Ｘ3は、Ａ又はＮであり；Ｘ4は、Ｇ又はＱである。
【０１９８】
【表３２】
0006487839.tif 000033
【０１９９】
配列番号１５３について、Ｘ1は、Ｗ又はＹであり；Ｘ2は、Ｄ、Ｅ、Ｓ、又はＨであり；Ｘ3は、Ｆ、Ｗ、又はＹである。
配列番号１５４について、Ｘ1は、Ａ、Ｅ、Ｔ、又はＶである。
【０２００】
【表３３】
0006487839.tif 000034
【０２０１】
配列番号１５５について、Ｘ1は、Ａ、Ｆ、Ｖ、Ｗ、又はＹであり；Ｘ2は、Ｇ、Ｈ、Ｎ、Ｒ、又はＳであり；Ｘ3は、Ｄ、Ｅ、Ｓ、又はＴであり；Ｘ4は、Ｆ、Ｌ、又はＹである。
【０２０２】
【表３４】
0006487839.tif 000035
【０２０３】
配列番号１５６について、Ｘ1は、Ｈ又はＹであり；Ｘ2は、Ｄ又はＳであり；Ｘ3は、Ａ、Ｅ、Ｒ、又はＳであり；Ｘ4は、Ｉ、Ｗ、又はＹである。
【０２０４】
【表３５】
0006487839.tif 000036
【０２０５】
配列番号１５７について、Ｘ1は、Ａ、Ｔ、Ｖ、又はＹであり；Ｘ2は、Ｄ又はＳであり；Ｘ3は、Ｇ、Ｈ、Ｒ、又はＳであり；Ｘ4は、Ａ、Ｎ、Ｑ、Ｒ、又はＳであり；Ｘ5は、Ｈ、Ｌ、Ｗ、又はＹである。
【０２０６】
【表３６】
0006487839.tif 000037
【０２０７】
配列番号１５８について、Ｘ1は、Ａ、Ｅ、Ｈ、Ｌ、Ｔ、又はＹであり；Ｘ2は、Ｄ、Ｇ、Ｉ、Ｓ、Ｖ、又はＷであり；Ｘ3は、Ｇ又はＲであり；Ｘ4は、Ｗ又はＹである。
【０２０８】
【表３７】
0006487839.tif 000038
【０２０９】
タンパク質及び抗体可変領域配列
【０２１０】
【表３８−１】
0006487839.tif 000039
【０２１１】
【表３８−２】
0006487839.tif 000040
【０２１２】
【表３８−３】
0006487839.tif 000041
【０２１３】
【表３８−４】
0006487839.tif 000042
【０２１４】
【表３８−５】
0006487839.tif 000043
【０２１５】
【表３９−１】
0006487839.tif 000044
【０２１６】
【表３９−２】
0006487839.tif 000045
【０２１７】
【表４０】
0006487839.tif 000046
【０２１８】
【表４１】
0006487839.tif 000047
【０２１９】
【表４２】
0006487839.tif 000048
本発明は、以下の態様を包含し得る。
［１］
軽鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変領域が、
配列番号５９〜６６及び１５８からなる群より選択される相補性決定領域軽鎖１（ＣＤＲＬ１）アミノ酸配列と、
配列番号６７〜７４からなる群より選択されるＣＤＲＬ２アミノ酸配列と、
配列番号７５のＣＤＲＬ３アミノ酸配列とを含む抗体又はその抗原結合断片と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［２］
上記［１］に記載の単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、
配列番号４２〜４５及び１６１からなる群より選択されるＣＤＲＨ１アミノ酸配列と、
配列番号４６〜５７、１５６、及び１５７からなる群より選択されるＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号５８のＣＤＲＨ３と、
を含む重鎖可変領域を更に含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［３］
重鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記重鎖可変領域が、
配列番号４２〜４５及び１６１からなる群より選択される相補性決定領域重鎖１（ＣＤＲＨ１）と、
配列番号４６〜５７、１５６、及び１５７からなる群より選択されるＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号５８のＣＤＲＨ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［４］
軽鎖可変領域及び重鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であ
って、前記軽鎖可変領域が、
配列番号５９〜６６及び１５８からなる群より選択されるＣＤＲＬ１アミノ酸配列と、
配列番号６７〜７４からなる群より選択されるＣＤＲＬ２アミノ酸配列と、
配列番号７５のＣＤＲＬ３アミノ酸配列と、
を含み、前記重鎖可変領域が、
配列番号４２〜４５からなる群より選択されるＣＤＲＨ１アミノ酸配列と、
配列番号４６〜５７、１５６、及び１５７からなる群より選択されるＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号５８のＣＤＲＨ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［５］
軽鎖可変領域及び重鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変領域が、
配列番号６２のＣＤＲＬ１アミノ酸配列と、
配列番号６８のＣＤＲＬ２アミノ酸配列と、
配列番号７５のＣＤＲＬ３アミノ酸配列と、
を含み、前記重鎖可変領域が、
配列番号４４及び１６１からなる群より選択されるＣＤＲＨ１アミノ酸配列と、
配列番号４７のＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号５８のＣＤＲＨ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［６］
軽鎖可変アミノ酸配列と、重鎖可変アミノ酸配列とを含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変アミノ酸配列が、配列番号１４３を含み、前記重鎖可変アミノ酸配列が、配列番号１３３を含む抗体又はその抗原結合断片。
［７］
ＩｇＧ４重鎖定常領域とＩｇＧ４軽鎖定常領域とを更に含む、上記［６］に記載の単離抗体。
［８］
前記重鎖定常領域が、配列番号１５９のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖定常領域が、配列番号１６０のアミノ酸配列を含む、上記［７］に記載の単離抗体。
［９］
固定化ＣＤ２７細胞外ドメインに対する結合によって求めたとき、上記［６］に記載の抗体によって結合しているエピトープに結合する単離ヒトＣＤ２７中和抗体又はその抗原結合断片。
［１０］
表面プラズモン共鳴によって求めたとき、１×１０-7Ｍ以下のＫDでヒトＣＤ２７に結合する、上記［６］に記載の単離抗体。
［１１］
（ｉ）上記［６］に記載の抗体又は抗原結合部分をコードしているヌクレオチド配列、（ｉｉ）配列番号１６３の軽鎖ヌクレオチド配列及び／又は配列番号１６４の重鎖ヌクレオチド配列、又は（ｉｉｉ）配列番号１４３の軽鎖可変領域のアミノ酸配列及び／又は配列番号１３３の重鎖可変領域のアミノ酸配列をコードしているヌクレオチド配列からなる群より選択される単離核酸分子。
［１２］
上記［１１に記載の単離核酸分子を含む単離核酸ベクター。
［１３］
上記［１２］に記載の単離核酸ベクターを含む、原核又は真核宿主細胞。
［１４］
上記［１３］に記載の宿主細胞であって、ＣＯＳ−１、ＣＯＳ−７、ＨＥＫ２９３、ＢＨＫ２１、ＣＨＯ、ＢＳＣ−１、Ｈｅｐ  Ｇ２、６５３、ＳＰ２／０、２９３、ＨｅＬａ、骨髄腫若しくはリンパ腫細胞、又はこれらの任意の誘導体、不死化若しくは形質転換細胞から選択される少なくとも１つである、宿主細胞。
［１５］
上記［１１］に記載の核酸分子をベクターに組み込み、宿主細胞、トランスジェニック動物、又は形質転換植物を形質転換して抗体を発現させ、前記発現した抗体を回収することを含む、ＣＤ２７抗体を生産する方法。
［１６］
被験体のＴ細胞の一部と有効な量の上記［６］に記載の抗体又は抗原結合部分とを接触させることを含み、前記抗体又はその抗原結合部分が、ヒトＣＤ７０タンパク質又はヒトＣＤ７０タンパク質の一部の存在下で前記ヒトＴ細胞におけるＣＤ２７の活性化を阻害する、Ｔ細胞によって媒介されるＢ細胞の抗体産生を阻害する方法。
［１７］
前記被験体が、炎症性疾患に罹患している、上記［１６］に記載の方法。
［１８］
前記炎症性疾患が、全身性エリテマトーデスである、上記［１７］に記載の方法。
［１９］
前記被験体が、肺又は胸膜系の疾患、中枢又は末梢神経系の疾患、目又は視覚系の疾患、胃腸及び消化器系の疾患、心血管系の疾患、感染性疾患、及び寄生虫性感染症からなる群より選択される疾患に関連する抗原特異的体液性免疫反応を示す、上記［１６］に記載の方法。
［２０］
前記抗体又はその抗原結合部分が、前記被験体に全身投与される、上記［１６］に記載の方法。
［２１］
組織を有効な量の上記［６］に記載の抗体又は抗原結合部分に接触させることを含み、前記抗体又は抗原結合部分が、ヒトＣＤ７０タンパク質又はヒトＣＤ７０タンパク質の一部の存在下で前記ヒトＴ細胞におけるＣＤ２７の活性化を阻害する、ナイーブＴ細胞の増殖を阻害する方法。
［２２］
上記［６］に記載の抗体を含む薬学的に許容できる配合を含む製品。
［２３］
抗体Ｃ２１７７、ＣＤ２１８６、ＣＤ２１９１、及びＣＤ２１９２からなる群より選択される抗体によって結合しているヒトＣＤ２７タンパク質におけるエピトープに結合する抗体可変領域を含む、単離ヒト抗体又はその抗原結合断片。
［２４］
抗体Ｃ２１７７、ＣＤ２１８６、ＣＤ２１９１、及びＣＤ２１９２からなる群より選択される抗体と、ヒトＣＤ２７タンパク質への結合について競合する抗体可変領域を含む、単離ヒト抗体又はその抗原結合断片。
［２５］
軽鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変領域が、
配列番号２４〜３６、１５３、及び１５５からなる群より選択される相補性決定領域軽鎖１（ＣＤＲＬ１）アミノ酸配列と、
配列番号３７〜４０及び１５４からなる群より選択されるＣＤＲＬ２アミノ酸配列と、
配列番号４１のＣＤＲＬ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［２６］
重鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記重鎖可変領域が、
配列番号１及び２からなる群より選択される相補性決定領域重鎖１（ＣＤＲＨ１）アミノ酸配列と、
配列番号３〜２２、１５１、及び１５２からなる群より選択されるＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号２３及び１６２からなる群より選択されるＣＤＲＨ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又その抗原結合断片。
［２７］
軽鎖可変領域及び重鎖可変領域を含む単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片であって、前記軽鎖可変領域が、
配列番号２４〜３６、１５３、及び１５５からなる群より選択される相補性決定領域軽鎖１（ＣＤＲＬ１）アミノ酸配列と、
配列番号３７〜４０及び１５４からなる群より選択されるＣＤＲＬ２アミノ酸配列と、
配列番号４１のＣＤＲＬ３アミノ酸配列と、
を含み、前記重鎖可変領域が、
配列番号１及び２からなる群より選択されるＣＤＲＨ１アミノ酸配列と、
配列番号３〜２２、１５１、及び１５２からなる群より選択されるＣＤＲＨ２アミノ酸配列と、
配列番号２３及び１６２からなる群より選択されるＣＤＲＨ３アミノ酸配列と、
を含む、前記抗体又はその抗原結合断片。
［２８］
配列番号１３７〜１４４及び１４８からなる群より選択される軽鎖可変アミノ酸配列を含む、単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片。
［２９］
配列番号１２８〜１３６及び１４５〜１４７からなる群より選択される重鎖可変アミノ酸配列を更に含む、上記［２８］に記載の単離抗体又はその抗原結合断片。
［３０］
配列番号１２８〜１３６及び１４５〜１４７からなる群より選択される重鎖可変アミノ酸配列を含む、単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片。
［３１］
配列番号８２〜１０１からなる群より選択される軽鎖可変アミノ酸配列を含む、単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片。
［３２］
配列番号１０２〜１２５からなる群より選択される重鎖可変アミノ酸配列を更に含む、上記［３１］に記載の単離抗体又はその抗原結合断片。
［３３］
配列番号１０２〜１２５からなる群より選択される重鎖可変アミノ酸配列を含む、単離ヒトＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片。
［３４］
配列番号７７、７９、８１、及び１２７からなる群より選択される軽鎖可変アミノ酸配列を含む、単離ＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片。
［３５］
配列番号７６、７８、８０、及び１２６からなる群より選択される重鎖可変アミノ酸配列を更に含む、上記［３４］に記載の単離抗体又は抗原結合断片。
［３６］
配列番号７６、７８、８０、及び１２６からなる群より選択される重鎖可変アミノ酸配列を含む、単離ＣＤ２７抗体又はその抗原結合断片。
［３７］
本明細書に記載されたいずれかの発明。
【図１】
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【図２】
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【図３】
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【図４】
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【配列表】
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